FI105482B - Menetelmä heterologisen proteiinin valmistamiseksi eukaryoottisessa isäntäsolussa - Google Patents
Menetelmä heterologisen proteiinin valmistamiseksi eukaryoottisessa isäntäsolussa Download PDFInfo
- Publication number
- FI105482B FI105482B FI925678A FI925678A FI105482B FI 105482 B FI105482 B FI 105482B FI 925678 A FI925678 A FI 925678A FI 925678 A FI925678 A FI 925678A FI 105482 B FI105482 B FI 105482B
- Authority
- FI
- Finland
- Prior art keywords
- sequence
- kex2
- yeast
- host cell
- protein
- Prior art date
Links
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 title claims description 125
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 title claims description 76
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 title description 18
- 238000012545 processing Methods 0.000 claims abstract description 9
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims description 72
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 claims description 64
- 239000013598 vector Substances 0.000 claims description 63
- 210000002472 endoplasmic reticulum Anatomy 0.000 claims description 58
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 claims description 56
- 101710118538 Protease Proteins 0.000 claims description 53
- 101150045458 KEX2 gene Proteins 0.000 claims description 49
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 26
- 230000014759 maintenance of location Effects 0.000 claims description 18
- IXKSXJFAGXLQOQ-XISFHERQSA-N WHWLQLKPGQPMY Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C1=CNC=N1 IXKSXJFAGXLQOQ-XISFHERQSA-N 0.000 claims description 17
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 claims description 11
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 claims description 9
- 102100039371 ER lumen protein-retaining receptor 1 Human genes 0.000 claims description 9
- 101000812437 Homo sapiens ER lumen protein-retaining receptor 1 Proteins 0.000 claims description 9
- 210000005253 yeast cell Anatomy 0.000 claims description 8
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 claims description 6
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims description 5
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims description 5
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims description 5
- 230000008569 process Effects 0.000 claims description 4
- 101710114386 Insulin-like protein Proteins 0.000 claims description 3
- 101100319895 Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) YAP3 gene Proteins 0.000 claims description 3
- 101100160515 Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) YPS1 gene Proteins 0.000 claims description 3
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims 1
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 abstract description 16
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 abstract description 11
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 abstract description 10
- 101710188975 Dibasic-processing endoprotease Proteins 0.000 abstract 2
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 67
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 48
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 48
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 22
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 19
- COYHRQWNJDJCNA-NUJDXYNKSA-N Thr-Thr-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O COYHRQWNJDJCNA-NUJDXYNKSA-N 0.000 description 19
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 18
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 17
- RLMISHABBKUNFO-WHFBIAKZSA-N Ala-Ala-Gly Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)NCC(O)=O RLMISHABBKUNFO-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 16
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 13
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 13
- 229960000723 ampicillin Drugs 0.000 description 12
- AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N ampicillin Chemical compound C1([C@@H](N)C(=O)N[C@H]2[C@H]3SC([C@@H](N3C2=O)C(O)=O)(C)C)=CC=CC=C1 AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N 0.000 description 12
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 12
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 12
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 11
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 11
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 10
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 9
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 9
- 241001131785 Escherichia coli HB101 Species 0.000 description 9
- 108010076504 Protein Sorting Signals Proteins 0.000 description 9
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 9
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 description 9
- 231100000219 mutagenic Toxicity 0.000 description 9
- 230000003505 mutagenic effect Effects 0.000 description 9
- 239000002243 precursor Substances 0.000 description 9
- 239000013615 primer Substances 0.000 description 9
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 8
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 8
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 8
- 229940124276 oligodeoxyribonucleotide Drugs 0.000 description 8
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 8
- 239000003623 enhancer Substances 0.000 description 7
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 7
- 239000000047 product Substances 0.000 description 7
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 7
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N Atomic nitrogen Chemical compound N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 6
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 6
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 108010050904 Interferons Proteins 0.000 description 6
- 102000014150 Interferons Human genes 0.000 description 6
- 241001138401 Kluyveromyces lactis Species 0.000 description 6
- 241000829100 Macaca mulatta polyomavirus 1 Species 0.000 description 6
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 6
- 210000002288 golgi apparatus Anatomy 0.000 description 6
- 229940079322 interferon Drugs 0.000 description 6
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 6
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 6
- 230000003362 replicative effect Effects 0.000 description 6
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 6
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 6
- 102100031181 Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase Human genes 0.000 description 5
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 5
- 239000000539 dimer Substances 0.000 description 5
- 239000000835 fiber Substances 0.000 description 5
- 108020004445 glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase Proteins 0.000 description 5
- 244000005700 microbiome Species 0.000 description 5
- 230000028327 secretion Effects 0.000 description 5
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 5
- 230000001131 transforming effect Effects 0.000 description 5
- INOZZBHURUDQQR-AJNGGQMLSA-N (2s)-2-[[(2s)-2-[[(2s)-2-[[(2s)-2-amino-3-(1h-imidazol-5-yl)propanoyl]amino]-3-carboxypropanoyl]amino]-4-carboxybutanoyl]amino]-4-methylpentanoic acid Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 INOZZBHURUDQQR-AJNGGQMLSA-N 0.000 description 4
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 4
- 108010070600 Glucose-6-phosphate isomerase Proteins 0.000 description 4
- 102000005731 Glucose-6-phosphate isomerase Human genes 0.000 description 4
- 108060003951 Immunoglobulin Proteins 0.000 description 4
- 102000035195 Peptidases Human genes 0.000 description 4
- 108091005804 Peptidases Proteins 0.000 description 4
- 239000004365 Protease Substances 0.000 description 4
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 4
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 4
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 4
- 230000003115 biocidal effect Effects 0.000 description 4
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 description 4
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 4
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 4
- 108010041601 histidyl-aspartyl-glutamyl-leucine Proteins 0.000 description 4
- 102000018358 immunoglobulin Human genes 0.000 description 4
- NOESYZHRGYRDHS-UHFFFAOYSA-N insulin Chemical compound N1C(=O)C(NC(=O)C(CCC(N)=O)NC(=O)C(CCC(O)=O)NC(=O)C(C(C)C)NC(=O)C(NC(=O)CN)C(C)CC)CSSCC(C(NC(CO)C(=O)NC(CC(C)C)C(=O)NC(CC=2C=CC(O)=CC=2)C(=O)NC(CCC(N)=O)C(=O)NC(CC(C)C)C(=O)NC(CCC(O)=O)C(=O)NC(CC(N)=O)C(=O)NC(CC=2C=CC(O)=CC=2)C(=O)NC(CSSCC(NC(=O)C(C(C)C)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(CC=2C=CC(O)=CC=2)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(C)NC(=O)C(CCC(O)=O)NC(=O)C(C(C)C)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(CC=2NC=NC=2)NC(=O)C(CO)NC(=O)CNC2=O)C(=O)NCC(=O)NC(CCC(O)=O)C(=O)NC(CCCNC(N)=N)C(=O)NCC(=O)NC(CC=3C=CC=CC=3)C(=O)NC(CC=3C=CC=CC=3)C(=O)NC(CC=3C=CC(O)=CC=3)C(=O)NC(C(C)O)C(=O)N3C(CCC3)C(=O)NC(CCCCN)C(=O)NC(C)C(O)=O)C(=O)NC(CC(N)=O)C(O)=O)=O)NC(=O)C(C(C)CC)NC(=O)C(CO)NC(=O)C(C(C)O)NC(=O)C1CSSCC2NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(NC(=O)C(CCC(N)=O)NC(=O)C(CC(N)=O)NC(=O)C(NC(=O)C(N)CC=1C=CC=CC=1)C(C)C)CC1=CN=CN1 NOESYZHRGYRDHS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 230000010354 integration Effects 0.000 description 4
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 4
- 235000019419 proteases Nutrition 0.000 description 4
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 4
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 4
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 4
- JBFQOLHAGBKPTP-NZATWWQASA-N (2s)-2-[[(2s)-4-carboxy-2-[[3-carboxy-2-[[(2s)-2,6-diaminohexanoyl]amino]propanoyl]amino]butanoyl]amino]-4-methylpentanoic acid Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)C(CC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN JBFQOLHAGBKPTP-NZATWWQASA-N 0.000 description 3
- OSJPPGNTCRNQQC-UWTATZPHSA-N 3-phospho-D-glyceric acid Chemical compound OC(=O)[C@H](O)COP(O)(O)=O OSJPPGNTCRNQQC-UWTATZPHSA-N 0.000 description 3
- 102000002260 Alkaline Phosphatase Human genes 0.000 description 3
- 108020004774 Alkaline Phosphatase Proteins 0.000 description 3
- OMLWNBVRVJYMBQ-YUMQZZPRSA-N Arg-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O OMLWNBVRVJYMBQ-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 3
- 241000701822 Bovine papillomavirus Species 0.000 description 3
- OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N Carbon Chemical compound [C] OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 241000701022 Cytomegalovirus Species 0.000 description 3
- 102000004961 Furin Human genes 0.000 description 3
- 108090001126 Furin Proteins 0.000 description 3
- 108090000723 Insulin-Like Growth Factor I Proteins 0.000 description 3
- 125000002842 L-seryl group Chemical group O=C([*])[C@](N([H])[H])([H])C([H])([H])O[H] 0.000 description 3
- NPBGTPKLVJEOBE-IUCAKERBSA-N Lys-Arg Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCNC(N)=N NPBGTPKLVJEOBE-IUCAKERBSA-N 0.000 description 3
- -1 PC1 Proteins 0.000 description 3
- 108010001014 Plasminogen Activators Proteins 0.000 description 3
- 102000001938 Plasminogen Activators Human genes 0.000 description 3
- 108020005038 Terminator Codon Proteins 0.000 description 3
- 102000003978 Tissue Plasminogen Activator Human genes 0.000 description 3
- 108090000373 Tissue Plasminogen Activator Proteins 0.000 description 3
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 3
- 238000001042 affinity chromatography Methods 0.000 description 3
- KOSRFJWDECSPRO-UHFFFAOYSA-N alpha-L-glutamyl-L-glutamic acid Natural products OC(=O)CCC(N)C(=O)NC(CCC(O)=O)C(O)=O KOSRFJWDECSPRO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108010068380 arginylarginine Proteins 0.000 description 3
- 210000002421 cell wall Anatomy 0.000 description 3
- 230000002759 chromosomal effect Effects 0.000 description 3
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 3
- 230000004186 co-expression Effects 0.000 description 3
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 3
- 108010016616 cysteinylglycine Proteins 0.000 description 3
- XYWBJDRHGNULKG-OUMQNGNKSA-N desirudin Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](CC=1NC=NC=1)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@H]1N(CCC1)C(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H]1N(CCC1)C(=O)[C@@H](NC(=O)CNC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H]1NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)CC)NC(=O)[C@@H]2CSSC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@H](C(NCC(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N2)=O)CSSC1)C(C)C)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H]1NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC=2C=CC(O)=CC=2)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)C(C)C)C(C)C)[C@@H](C)O)CSSC1)C(C)C)[C@@H](C)O)[C@@H](C)O)C1=CC=CC=C1 XYWBJDRHGNULKG-OUMQNGNKSA-N 0.000 description 3
- 108010073652 desirudin Proteins 0.000 description 3
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 3
- 238000010353 genetic engineering Methods 0.000 description 3
- 108010055341 glutamyl-glutamic acid Proteins 0.000 description 3
- 230000002209 hydrophobic effect Effects 0.000 description 3
- 108010089256 lysyl-aspartyl-glutamyl-leucine Proteins 0.000 description 3
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 3
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 3
- 229940127126 plasminogen activator Drugs 0.000 description 3
- 229960000187 tissue plasminogen activator Drugs 0.000 description 3
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 3
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 3
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 description 3
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 description 2
- 101710163881 5,6-dihydroxyindole-2-carboxylic acid oxidase Proteins 0.000 description 2
- 102000007469 Actins Human genes 0.000 description 2
- 108010085238 Actins Proteins 0.000 description 2
- FJVAQLJNTSUQPY-CIUDSAMLSA-N Ala-Ala-Lys Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN FJVAQLJNTSUQPY-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- ADSGHMXEAZJJNF-DCAQKATOSA-N Ala-Pro-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H](C)N ADSGHMXEAZJJNF-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- NLXLAEXVIDQMFP-UHFFFAOYSA-N Ammonia chloride Chemical compound [NH4+].[Cl-] NLXLAEXVIDQMFP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- OTZMRMHZCMZOJZ-SRVKXCTJSA-N Arg-Leu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O OTZMRMHZCMZOJZ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- JQFZHHSQMKZLRU-IUCAKERBSA-N Arg-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N JQFZHHSQMKZLRU-IUCAKERBSA-N 0.000 description 2
- UXHYOWXTJLBEPG-GSSVUCPTSA-N Asn-Thr-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O UXHYOWXTJLBEPG-GSSVUCPTSA-N 0.000 description 2
- MGSVBZIBCCKGCY-ZLUOBGJFSA-N Asp-Ser-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O MGSVBZIBCCKGCY-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 2
- 102000015081 Blood Coagulation Factors Human genes 0.000 description 2
- 108010039209 Blood Coagulation Factors Proteins 0.000 description 2
- 101100327917 Caenorhabditis elegans chup-1 gene Proteins 0.000 description 2
- OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N Calcium Chemical compound [Ca] OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N Chloroform Chemical compound ClC(Cl)Cl HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102000008186 Collagen Human genes 0.000 description 2
- 108010035532 Collagen Proteins 0.000 description 2
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101150094690 GAL1 gene Proteins 0.000 description 2
- 102100028501 Galanin peptides Human genes 0.000 description 2
- 108700028146 Genetic Enhancer Elements Proteins 0.000 description 2
- 108010021582 Glucokinase Proteins 0.000 description 2
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 2
- 102000002812 Heat-Shock Proteins Human genes 0.000 description 2
- 108010004889 Heat-Shock Proteins Proteins 0.000 description 2
- 102000005548 Hexokinase Human genes 0.000 description 2
- 108700040460 Hexokinases Proteins 0.000 description 2
- 101100121078 Homo sapiens GAL gene Proteins 0.000 description 2
- 241000701109 Human adenovirus 2 Species 0.000 description 2
- 102000004877 Insulin Human genes 0.000 description 2
- 108090001061 Insulin Proteins 0.000 description 2
- 102000048143 Insulin-Like Growth Factor II Human genes 0.000 description 2
- 108090001117 Insulin-Like Growth Factor II Proteins 0.000 description 2
- 102000014429 Insulin-like growth factor Human genes 0.000 description 2
- 102100037852 Insulin-like growth factor I Human genes 0.000 description 2
- 108010047761 Interferon-alpha Proteins 0.000 description 2
- 102000006992 Interferon-alpha Human genes 0.000 description 2
- XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N Iron Chemical compound [Fe] XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N L-leucine Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 2
- 101150007280 LEU2 gene Proteins 0.000 description 2
- XGDCYUQSFDQISZ-BQBZGAKWSA-N Leu-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O XGDCYUQSFDQISZ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 2
- NVGBPTNZLWRQSY-UWVGGRQHSA-N Lys-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN NVGBPTNZLWRQSY-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 2
- 102000003505 Myosin Human genes 0.000 description 2
- 108060008487 Myosin Proteins 0.000 description 2
- YBAFDPFAUTYYRW-UHFFFAOYSA-N N-L-alpha-glutamyl-L-leucine Natural products CC(C)CC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CCC(O)=O YBAFDPFAUTYYRW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101100293593 Neurospora crassa (strain ATCC 24698 / 74-OR23-1A / CBS 708.71 / DSM 1257 / FGSC 987) nar-1 gene Proteins 0.000 description 2
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 description 2
- 241001631646 Papillomaviridae Species 0.000 description 2
- ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N Phenol Chemical compound OC1=CC=CC=C1 ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102000001105 Phosphofructokinases Human genes 0.000 description 2
- 108010069341 Phosphofructokinases Proteins 0.000 description 2
- 102000012288 Phosphopyruvate Hydratase Human genes 0.000 description 2
- 108010022181 Phosphopyruvate Hydratase Proteins 0.000 description 2
- 239000002202 Polyethylene glycol Substances 0.000 description 2
- 102000013009 Pyruvate Kinase Human genes 0.000 description 2
- 108020005115 Pyruvate Kinase Proteins 0.000 description 2
- 108010079005 RDV peptide Proteins 0.000 description 2
- 102000003743 Relaxin Human genes 0.000 description 2
- 108090000103 Relaxin Proteins 0.000 description 2
- RDFQNDHEHVSONI-ZLUOBGJFSA-N Ser-Asn-Ser Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O RDFQNDHEHVSONI-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 2
- 102100032491 Serine protease 1 Human genes 0.000 description 2
- 108020004682 Single-Stranded DNA Proteins 0.000 description 2
- FWTFAZKJORVTIR-VZFHVOOUSA-N Thr-Ser-Ala Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O FWTFAZKJORVTIR-VZFHVOOUSA-N 0.000 description 2
- ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N Uracil Chemical compound O=C1C=CNC(=O)N1 ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102000003990 Urokinase-type plasminogen activator Human genes 0.000 description 2
- 108090000435 Urokinase-type plasminogen activator Proteins 0.000 description 2
- 150000007513 acids Chemical class 0.000 description 2
- 108010047495 alanylglycine Proteins 0.000 description 2
- 235000011130 ammonium sulphate Nutrition 0.000 description 2
- 108010062796 arginyllysine Proteins 0.000 description 2
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 2
- 239000003114 blood coagulation factor Substances 0.000 description 2
- 229940019700 blood coagulation factors Drugs 0.000 description 2
- 239000011575 calcium Substances 0.000 description 2
- 229910052791 calcium Inorganic materials 0.000 description 2
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 2
- 239000013611 chromosomal DNA Substances 0.000 description 2
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 2
- 229920001436 collagen Polymers 0.000 description 2
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 2
- YPHMISFOHDHNIV-FSZOTQKASA-N cycloheximide Chemical compound C1[C@@H](C)C[C@H](C)C(=O)[C@@H]1[C@H](O)CC1CC(=O)NC(=O)C1 YPHMISFOHDHNIV-FSZOTQKASA-N 0.000 description 2
- 230000007547 defect Effects 0.000 description 2
- VHJLVAABSRFDPM-QWWZWVQMSA-N dithiothreitol Chemical compound SC[C@@H](O)[C@H](O)CS VHJLVAABSRFDPM-QWWZWVQMSA-N 0.000 description 2
- 210000003527 eukaryotic cell Anatomy 0.000 description 2
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 2
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 2
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 2
- 108010049041 glutamylalanine Proteins 0.000 description 2
- 230000002414 glycolytic effect Effects 0.000 description 2
- 230000013595 glycosylation Effects 0.000 description 2
- 238000006206 glycosylation reaction Methods 0.000 description 2
- VPZXBVLAVMBEQI-UHFFFAOYSA-N glycyl-DL-alpha-alanine Natural products OC(=O)C(C)NC(=O)CN VPZXBVLAVMBEQI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000003102 growth factor Substances 0.000 description 2
- 229940088597 hormone Drugs 0.000 description 2
- 239000005556 hormone Substances 0.000 description 2
- 229940072221 immunoglobulins Drugs 0.000 description 2
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 2
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 2
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 2
- 229940125396 insulin Drugs 0.000 description 2
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 2
- 108010034529 leucyl-lysine Proteins 0.000 description 2
- 108010003700 lysyl aspartic acid Proteins 0.000 description 2
- 108010009298 lysylglutamic acid Proteins 0.000 description 2
- 108010054155 lysyllysine Proteins 0.000 description 2
- 230000035800 maturation Effects 0.000 description 2
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 2
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 2
- 239000000178 monomer Substances 0.000 description 2
- 231100000350 mutagenesis Toxicity 0.000 description 2
- 238000002703 mutagenesis Methods 0.000 description 2
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 description 2
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 2
- 230000008439 repair process Effects 0.000 description 2
- 210000003705 ribosome Anatomy 0.000 description 2
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 2
- 210000002955 secretory cell Anatomy 0.000 description 2
- 230000035939 shock Effects 0.000 description 2
- 238000002741 site-directed mutagenesis Methods 0.000 description 2
- 230000005030 transcription termination Effects 0.000 description 2
- 230000002103 transcriptional effect Effects 0.000 description 2
- 238000000844 transformation Methods 0.000 description 2
- 230000014621 translational initiation Effects 0.000 description 2
- 230000005945 translocation Effects 0.000 description 2
- 230000032258 transport Effects 0.000 description 2
- 108010087967 type I signal peptidase Proteins 0.000 description 2
- 241001529453 unidentified herpesvirus Species 0.000 description 2
- 241001430294 unidentified retrovirus Species 0.000 description 2
- 229960005356 urokinase Drugs 0.000 description 2
- 239000012138 yeast extract Substances 0.000 description 2
- XVZCXCTYGHPNEM-IHRRRGAJSA-N (2s)-1-[(2s)-2-[[(2s)-2-amino-4-methylpentanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]pyrrolidine-2-carboxylic acid Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O XVZCXCTYGHPNEM-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- NTUPOKHATNSWCY-PMPSAXMXSA-N (2s)-2-[[(2s)-1-[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]pyrrolidine-2-carbonyl]amino]-5-(diaminomethylideneamino)pentanoic acid Chemical compound C([C@@H](N)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 NTUPOKHATNSWCY-PMPSAXMXSA-N 0.000 description 1
- GZCWLCBFPRFLKL-UHFFFAOYSA-N 1-prop-2-ynoxypropan-2-ol Chemical compound CC(O)COCC#C GZCWLCBFPRFLKL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OWEGMIWEEQEYGQ-UHFFFAOYSA-N 100676-05-9 Natural products OC1C(O)C(O)C(CO)OC1OCC1C(O)C(O)C(O)C(OC2C(OC(O)C(O)C2O)CO)O1 OWEGMIWEEQEYGQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- XQJMXPAEFMWDOZ-UHFFFAOYSA-N 3exo-benzoyloxy-tropane Natural products CN1C(C2)CCC1CC2OC(=O)C1=CC=CC=C1 XQJMXPAEFMWDOZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-M Acetate Chemical compound CC([O-])=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 102000013563 Acid Phosphatase Human genes 0.000 description 1
- 108010051457 Acid Phosphatase Proteins 0.000 description 1
- 229920001817 Agar Polymers 0.000 description 1
- XCVRVWZTXPCYJT-BIIVOSGPSA-N Ala-Asn-Pro Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N XCVRVWZTXPCYJT-BIIVOSGPSA-N 0.000 description 1
- KXEVYGKATAMXJJ-ACZMJKKPSA-N Ala-Glu-Asp Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O KXEVYGKATAMXJJ-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- BEMGNWZECGIJOI-WDSKDSINSA-N Ala-Gly-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O BEMGNWZECGIJOI-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- VCSABYLVNWQYQE-UHFFFAOYSA-N Ala-Lys-Lys Natural products NCCCCC(NC(=O)C(N)C)C(=O)NC(CCCCN)C(O)=O VCSABYLVNWQYQE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OMDNCNKNEGFOMM-BQBZGAKWSA-N Ala-Met-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)NCC(O)=O OMDNCNKNEGFOMM-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- YCRAFFCYWOUEOF-DLOVCJGASA-N Ala-Phe-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)C)CC1=CC=CC=C1 YCRAFFCYWOUEOF-DLOVCJGASA-N 0.000 description 1
- OLVCTPPSXNRGKV-GUBZILKMSA-N Ala-Pro-Pro Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N1[C@H](C(O)=O)CCC1 OLVCTPPSXNRGKV-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- IPWKGIFRRBGCJO-IMJSIDKUSA-N Ala-Ser Chemical compound C[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H](CO)C([O-])=O IPWKGIFRRBGCJO-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- HOVPGJUNRLMIOZ-CIUDSAMLSA-N Ala-Ser-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](C)N HOVPGJUNRLMIOZ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-XLOQQCSPSA-N Alpha-Lactose Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)O[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-XLOQQCSPSA-N 0.000 description 1
- 241000352333 Amegilla alpha Species 0.000 description 1
- 208000031295 Animal disease Diseases 0.000 description 1
- 102100021253 Antileukoproteinase Human genes 0.000 description 1
- DBKNLHKEVPZVQC-LPEHRKFASA-N Arg-Ala-Pro Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(O)=O DBKNLHKEVPZVQC-LPEHRKFASA-N 0.000 description 1
- HKRXJBBCQBAGIM-FXQIFTODSA-N Arg-Asp-Ser Chemical compound C(C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)N)CN=C(N)N HKRXJBBCQBAGIM-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- XUUXCWCKKCZEAW-YFKPBYRVSA-N Arg-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N XUUXCWCKKCZEAW-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- OQCWXQJLCDPRHV-UWVGGRQHSA-N Arg-Gly-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O OQCWXQJLCDPRHV-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- ZATRYQNPUHGXCU-DTWKUNHWSA-N Arg-Gly-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)CNC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N)C(=O)O ZATRYQNPUHGXCU-DTWKUNHWSA-N 0.000 description 1
- NVCIXQYNWYTLDO-IHRRRGAJSA-N Arg-His-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CN=CN1)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N NVCIXQYNWYTLDO-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- QBQVKUNBCAFXSV-ULQDDVLXSA-N Arg-Lys-Tyr Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 QBQVKUNBCAFXSV-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- WKPXXXUSUHAXDE-SRVKXCTJSA-N Arg-Pro-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O WKPXXXUSUHAXDE-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- ZDOQDYFZNGASEY-BIIVOSGPSA-N Asn-Asp-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N)C(=O)O ZDOQDYFZNGASEY-BIIVOSGPSA-N 0.000 description 1
- DDPXDCKYWDGZAL-BQBZGAKWSA-N Asn-Gly-Arg Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N DDPXDCKYWDGZAL-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- OOWSBIOUKIUWLO-RCOVLWMOSA-N Asn-Gly-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O OOWSBIOUKIUWLO-RCOVLWMOSA-N 0.000 description 1
- JLNFZLNDHONLND-GARJFASQSA-N Asn-Leu-Pro Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N JLNFZLNDHONLND-GARJFASQSA-N 0.000 description 1
- FHETWELNCBMRMG-HJGDQZAQSA-N Asn-Leu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O FHETWELNCBMRMG-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 1
- GIQCDTKOIPUDSG-GARJFASQSA-N Asn-Lys-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N)C(=O)O GIQCDTKOIPUDSG-GARJFASQSA-N 0.000 description 1
- BSBNNPICFPXDNH-SRVKXCTJSA-N Asn-Phe-Cys Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N BSBNNPICFPXDNH-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- ATHZHGQSAIJHQU-XIRDDKMYSA-N Asn-Trp-Lys Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N ATHZHGQSAIJHQU-XIRDDKMYSA-N 0.000 description 1
- KWBQPGIYEZKDEG-FSPLSTOPSA-N Asn-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O KWBQPGIYEZKDEG-FSPLSTOPSA-N 0.000 description 1
- KDFQZBWWPYQBEN-ZLUOBGJFSA-N Asp-Ala-Asn Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N KDFQZBWWPYQBEN-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- XACXDSRQIXRMNS-OLHMAJIHSA-N Asp-Asn-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N)O XACXDSRQIXRMNS-OLHMAJIHSA-N 0.000 description 1
- WCFCYFDBMNFSPA-ACZMJKKPSA-N Asp-Asp-Glu Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O WCFCYFDBMNFSPA-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- FANQWNCPNFEPGZ-WHFBIAKZSA-N Asp-Asp-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O FANQWNCPNFEPGZ-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- VAWNQIGQPUOPQW-ACZMJKKPSA-N Asp-Glu-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O VAWNQIGQPUOPQW-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- WBDWQKRLTVCDSY-WHFBIAKZSA-N Asp-Gly-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O WBDWQKRLTVCDSY-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- HSPSXROIMXIJQW-BQBZGAKWSA-N Asp-His Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CNC=N1 HSPSXROIMXIJQW-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- ODNWIBOCFGMRTP-SRVKXCTJSA-N Asp-His-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O)CC1=CN=CN1 ODNWIBOCFGMRTP-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- RKNIUWSZIAUEPK-PBCZWWQYSA-N Asp-His-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CN=CN1)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N)O RKNIUWSZIAUEPK-PBCZWWQYSA-N 0.000 description 1
- OEDJQRXNDRUGEU-SRVKXCTJSA-N Asp-Leu-His Chemical compound N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)O OEDJQRXNDRUGEU-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- HKEZZWQWXWGASX-KKUMJFAQSA-N Asp-Leu-Phe Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 HKEZZWQWXWGASX-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- QNMKWNONJGKJJC-NHCYSSNCSA-N Asp-Leu-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O QNMKWNONJGKJJC-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 1
- VSMYBNPOHYAXSD-GUBZILKMSA-N Asp-Lys-Glu Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O VSMYBNPOHYAXSD-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- IDDMGSKZQDEDGA-SRVKXCTJSA-N Asp-Phe-Asn Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 IDDMGSKZQDEDGA-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- KRQFMDNIUOVRIF-KKUMJFAQSA-N Asp-Phe-His Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC2=CN=CN2)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N KRQFMDNIUOVRIF-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- GWWSUMLEWKQHLR-NUMRIWBASA-N Asp-Thr-Glu Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N)O GWWSUMLEWKQHLR-NUMRIWBASA-N 0.000 description 1
- PLOKOIJSGCISHE-BYULHYEWSA-N Asp-Val-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O PLOKOIJSGCISHE-BYULHYEWSA-N 0.000 description 1
- QOJJMJKTMKNFEF-ZKWXMUAHSA-N Asp-Val-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O QOJJMJKTMKNFEF-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 1
- 125000001433 C-terminal amino-acid group Chemical group 0.000 description 1
- 102000055006 Calcitonin Human genes 0.000 description 1
- 108060001064 Calcitonin Proteins 0.000 description 1
- 102000017631 Calcitonin-like Human genes 0.000 description 1
- 108050005865 Calcitonin-like Proteins 0.000 description 1
- 101710132601 Capsid protein Proteins 0.000 description 1
- 102100022641 Coagulation factor IX Human genes 0.000 description 1
- 101800000414 Corticotropin Proteins 0.000 description 1
- UUERSUCTHOZPMG-SRVKXCTJSA-N Cys-Asn-Tyr Chemical compound SC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 UUERSUCTHOZPMG-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- UDDITVWSXPEAIQ-IHRRRGAJSA-N Cys-Phe-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O UDDITVWSXPEAIQ-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- SRUKWJMBAALPQV-IHPCNDPISA-N Cys-Phe-Trp Chemical compound [H]N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(O)=O SRUKWJMBAALPQV-IHPCNDPISA-N 0.000 description 1
- CMYVIUWVYHOLRD-ZLUOBGJFSA-N Cys-Ser-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O CMYVIUWVYHOLRD-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- 102000015833 Cystatin Human genes 0.000 description 1
- FBPFZTCFMRRESA-KVTDHHQDSA-N D-Mannitol Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-KVTDHHQDSA-N 0.000 description 1
- 239000003155 DNA primer Substances 0.000 description 1
- 238000001712 DNA sequencing Methods 0.000 description 1
- 102000016928 DNA-directed DNA polymerase Human genes 0.000 description 1
- 108010014303 DNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- 101710088194 Dehydrogenase Proteins 0.000 description 1
- 108090000204 Dipeptidase 1 Proteins 0.000 description 1
- 241001492209 Echovirus E4 Species 0.000 description 1
- 102100031780 Endonuclease Human genes 0.000 description 1
- 108010042407 Endonucleases Proteins 0.000 description 1
- 102000003951 Erythropoietin Human genes 0.000 description 1
- 108090000394 Erythropoietin Proteins 0.000 description 1
- 108010076282 Factor IX Proteins 0.000 description 1
- 108700039691 Genetic Promoter Regions Proteins 0.000 description 1
- 108700007698 Genetic Terminator Regions Proteins 0.000 description 1
- CKRUHITYRFNUKW-WDSKDSINSA-N Glu-Asn-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)NCC(O)=O CKRUHITYRFNUKW-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- JVSBYEDSSRZQGV-GUBZILKMSA-N Glu-Asp-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O JVSBYEDSSRZQGV-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- MTAOBYXRYJZRGQ-WDSKDSINSA-N Glu-Gly-Asp Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O MTAOBYXRYJZRGQ-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- ZWQVYZXPYSYPJD-RYUDHWBXSA-N Glu-Gly-Phe Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 ZWQVYZXPYSYPJD-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 1
- RAUDKMVXNOWDLS-WDSKDSINSA-N Glu-Gly-Ser Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O RAUDKMVXNOWDLS-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- HILMIYALTUQTRC-XVKPBYJWSA-N Glu-Gly-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O HILMIYALTUQTRC-XVKPBYJWSA-N 0.000 description 1
- HKTRDWYCAUTRRL-YUMQZZPRSA-N Glu-His Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CN=CN1 HKTRDWYCAUTRRL-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- MWMJCGBSIORNCD-AVGNSLFASA-N Glu-Leu-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O MWMJCGBSIORNCD-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- SXGAGTVDWKQYCX-BQBZGAKWSA-N Glu-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O SXGAGTVDWKQYCX-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- BHXSLRDWXIFKTP-SRVKXCTJSA-N Glu-Met-His Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N BHXSLRDWXIFKTP-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- HZISRJBYZAODRV-XQXXSGGOSA-N Glu-Thr-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O HZISRJBYZAODRV-XQXXSGGOSA-N 0.000 description 1
- 102000004366 Glucosidases Human genes 0.000 description 1
- 108010056771 Glucosidases Proteins 0.000 description 1
- MFVQGXGQRIXBPK-WDSKDSINSA-N Gly-Ala-Glu Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O MFVQGXGQRIXBPK-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- CLODWIOAKCSBAN-BQBZGAKWSA-N Gly-Arg-Asp Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](NC(=O)CN)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O CLODWIOAKCSBAN-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- GGEJHJIXRBTJPD-BYPYZUCNSA-N Gly-Asn-Gly Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)NCC(O)=O GGEJHJIXRBTJPD-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- SCCPDJAQCXWPTF-VKHMYHEASA-N Gly-Asp Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O SCCPDJAQCXWPTF-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- IWAXHBCACVWNHT-BQBZGAKWSA-N Gly-Asp-Arg Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N IWAXHBCACVWNHT-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- XQHSBNVACKQWAV-WHFBIAKZSA-N Gly-Asp-Asn Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O XQHSBNVACKQWAV-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- JPWIMMUNWUKOAD-STQMWFEESA-N Gly-Asp-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)CN JPWIMMUNWUKOAD-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- QSVCIFZPGLOZGH-WDSKDSINSA-N Gly-Glu-Ser Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O QSVCIFZPGLOZGH-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- CUYLIWAAAYJKJH-RYUDHWBXSA-N Gly-Glu-Tyr Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 CUYLIWAAAYJKJH-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 1
- YTSVAIMKVLZUDU-YUMQZZPRSA-N Gly-Leu-Asp Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O YTSVAIMKVLZUDU-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- ULZCYBYDTUMHNF-IUCAKERBSA-N Gly-Leu-Glu Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O ULZCYBYDTUMHNF-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- UHPAZODVFFYEEL-QWRGUYRKSA-N Gly-Leu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)CN UHPAZODVFFYEEL-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- IGOYNRWLWHWAQO-JTQLQIEISA-N Gly-Phe-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CC1=CC=CC=C1 IGOYNRWLWHWAQO-JTQLQIEISA-N 0.000 description 1
- QAMMIGULQSIRCD-IRXDYDNUSA-N Gly-Phe-Tyr Chemical compound C([C@H](NC(=O)C[NH3+])C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C([O-])=O)C1=CC=CC=C1 QAMMIGULQSIRCD-IRXDYDNUSA-N 0.000 description 1
- GGLIDLCEPDHEJO-BQBZGAKWSA-N Gly-Pro-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)CN GGLIDLCEPDHEJO-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- HAOUOFNNJJLVNS-BQBZGAKWSA-N Gly-Pro-Ser Chemical compound NCC(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O HAOUOFNNJJLVNS-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- WCORRBXVISTKQL-WHFBIAKZSA-N Gly-Ser-Ser Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O WCORRBXVISTKQL-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- YXTFLTJYLIAZQG-FJXKBIBVSA-N Gly-Thr-Arg Chemical compound NCC(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N YXTFLTJYLIAZQG-FJXKBIBVSA-N 0.000 description 1
- YJDALMUYJIENAG-QWRGUYRKSA-N Gly-Tyr-Asn Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)CN)O YJDALMUYJIENAG-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- RIYIFUFFFBIOEU-KBPBESRZSA-N Gly-Tyr-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CC1=CC=C(O)C=C1 RIYIFUFFFBIOEU-KBPBESRZSA-N 0.000 description 1
- GBYYQVBXFVDJPJ-WLTAIBSBSA-N Gly-Tyr-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)NC(=O)CN)O GBYYQVBXFVDJPJ-WLTAIBSBSA-N 0.000 description 1
- YGHSQRJSHKYUJY-SCZZXKLOSA-N Gly-Val-Pro Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)CN YGHSQRJSHKYUJY-SCZZXKLOSA-N 0.000 description 1
- AFMOTCMSEBITOE-YEPSODPASA-N Gly-Val-Thr Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O AFMOTCMSEBITOE-YEPSODPASA-N 0.000 description 1
- KSOBNUBCYHGUKH-UWVGGRQHSA-N Gly-Val-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)CN KSOBNUBCYHGUKH-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- 102000000587 Glycerolphosphate Dehydrogenase Human genes 0.000 description 1
- 108010041921 Glycerolphosphate Dehydrogenase Proteins 0.000 description 1
- VPZXBVLAVMBEQI-VKHMYHEASA-N Glycyl-alanine Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)CN VPZXBVLAVMBEQI-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- 101150009006 HIS3 gene Proteins 0.000 description 1
- 102100021519 Hemoglobin subunit beta Human genes 0.000 description 1
- 108091005904 Hemoglobin subunit beta Proteins 0.000 description 1
- 241000700721 Hepatitis B virus Species 0.000 description 1
- 208000005176 Hepatitis C Diseases 0.000 description 1
- 241000709721 Hepatovirus A Species 0.000 description 1
- UOAVQQRILDGZEN-SRVKXCTJSA-N His-Asp-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O UOAVQQRILDGZEN-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- FDQYIRHBVVUTJF-ZETCQYMHSA-N His-Gly-Gly Chemical compound [O-]C(=O)CNC(=O)CNC(=O)[C@@H]([NH3+])CC1=CN=CN1 FDQYIRHBVVUTJF-ZETCQYMHSA-N 0.000 description 1
- VIJMRAIWYWRXSR-CIUDSAMLSA-N His-Ser-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 VIJMRAIWYWRXSR-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- HTOOKGDPMXSJSY-STQMWFEESA-N His-Tyr Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(O)=O)C1=CN=CN1 HTOOKGDPMXSJSY-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- 101000615334 Homo sapiens Antileukoproteinase Proteins 0.000 description 1
- 101000741445 Homo sapiens Calcitonin Proteins 0.000 description 1
- 101000976075 Homo sapiens Insulin Proteins 0.000 description 1
- 101000599951 Homo sapiens Insulin-like growth factor I Proteins 0.000 description 1
- 101000878605 Homo sapiens Low affinity immunoglobulin epsilon Fc receptor Proteins 0.000 description 1
- 101000950847 Homo sapiens Macrophage migration inhibitory factor Proteins 0.000 description 1
- KBDIBHQICWDGDL-PPCPHDFISA-N Ile-Thr-Leu Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)O)N KBDIBHQICWDGDL-PPCPHDFISA-N 0.000 description 1
- DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M Ilexoside XXIX Chemical compound C[C@@H]1CC[C@@]2(CC[C@@]3(C(=CC[C@H]4[C@]3(CC[C@@H]5[C@@]4(CC[C@@H](C5(C)C)OS(=O)(=O)[O-])C)C)[C@@H]2[C@]1(C)O)C)C(=O)O[C@H]6[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O6)CO)O)O)O.[Na+] DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M 0.000 description 1
- 108700005091 Immunoglobulin Genes Proteins 0.000 description 1
- 102100036532 Interferon alpha-8 Human genes 0.000 description 1
- 102000000589 Interleukin-1 Human genes 0.000 description 1
- 108010002352 Interleukin-1 Proteins 0.000 description 1
- 102000000588 Interleukin-2 Human genes 0.000 description 1
- 108010002350 Interleukin-2 Proteins 0.000 description 1
- 102000015696 Interleukins Human genes 0.000 description 1
- 108010063738 Interleukins Proteins 0.000 description 1
- FADYJNXDPBKVCA-UHFFFAOYSA-N L-Phenylalanyl-L-lysin Natural products NCCCCC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 FADYJNXDPBKVCA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N Lactose Natural products OC[C@H]1O[C@@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)C(O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N 0.000 description 1
- 241000880493 Leptailurus serval Species 0.000 description 1
- DLCOFDAHNMMQPP-SRVKXCTJSA-N Leu-Asp-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O DLCOFDAHNMMQPP-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- MYGQXVYRZMKRDB-SRVKXCTJSA-N Leu-Asp-Lys Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN MYGQXVYRZMKRDB-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- QNBVTHNJGCOVFA-AVGNSLFASA-N Leu-Leu-Glu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O QNBVTHNJGCOVFA-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- XVZCXCTYGHPNEM-UHFFFAOYSA-N Leu-Leu-Pro Natural products CC(C)CC(N)C(=O)NC(CC(C)C)C(=O)N1CCCC1C(O)=O XVZCXCTYGHPNEM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AIRUUHAOKGVJAD-JYJNAYRXSA-N Leu-Phe-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O AIRUUHAOKGVJAD-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- SVBJIZVVYJYGLA-DCAQKATOSA-N Leu-Ser-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O SVBJIZVVYJYGLA-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- XZNJZXJZBMBGGS-NHCYSSNCSA-N Leu-Val-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O XZNJZXJZBMBGGS-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 1
- CGHXMODRYJISSK-NHCYSSNCSA-N Leu-Val-Asp Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O CGHXMODRYJISSK-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 1
- YQFZRHYZLARWDY-IHRRRGAJSA-N Leu-Val-Lys Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN YQFZRHYZLARWDY-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N Leucine Natural products CC(C)CC(N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108091036060 Linker DNA Proteins 0.000 description 1
- 102100038007 Low affinity immunoglobulin epsilon Fc receptor Human genes 0.000 description 1
- 102000009151 Luteinizing Hormone Human genes 0.000 description 1
- 108010073521 Luteinizing Hormone Proteins 0.000 description 1
- YNNPKXBBRZVIRX-IHRRRGAJSA-N Lys-Arg-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O YNNPKXBBRZVIRX-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- NQCJGQHHYZNUDK-DCAQKATOSA-N Lys-Arg-Ser Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O)CCCN=C(N)N NQCJGQHHYZNUDK-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- DGAAQRAUOFHBFJ-CIUDSAMLSA-N Lys-Asn-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O DGAAQRAUOFHBFJ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- KPJJOZUXFOLGMQ-CIUDSAMLSA-N Lys-Asp-Asn Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)N KPJJOZUXFOLGMQ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- PHHYNOUOUWYQRO-XIRDDKMYSA-N Lys-Asp-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)N PHHYNOUOUWYQRO-XIRDDKMYSA-N 0.000 description 1
- QZONCCHVHCOBSK-YUMQZZPRSA-N Lys-Gly-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O QZONCCHVHCOBSK-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- VMTYLUGCXIEDMV-QWRGUYRKSA-N Lys-Leu-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN VMTYLUGCXIEDMV-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- XIZQPFCRXLUNMK-BZSNNMDCSA-N Lys-Leu-Phe Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)N XIZQPFCRXLUNMK-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- XOQMURBBIXRRCR-SRVKXCTJSA-N Lys-Lys-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN XOQMURBBIXRRCR-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- BXPHMHQHYHILBB-BZSNNMDCSA-N Lys-Lys-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O BXPHMHQHYHILBB-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- BOJYMMBYBNOOGG-DCAQKATOSA-N Lys-Pro-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O BOJYMMBYBNOOGG-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- AFLBTVGQCQLOFJ-AVGNSLFASA-N Lys-Pro-Arg Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O AFLBTVGQCQLOFJ-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- IOQWIOPSKJOEKI-SRVKXCTJSA-N Lys-Ser-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O IOQWIOPSKJOEKI-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- QVTDVTONTRSQMF-WDCWCFNPSA-N Lys-Thr-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H]([C@H](O)C)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN QVTDVTONTRSQMF-WDCWCFNPSA-N 0.000 description 1
- CAVRAQIDHUPECU-UVOCVTCTSA-N Lys-Thr-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O CAVRAQIDHUPECU-UVOCVTCTSA-N 0.000 description 1
- YQAIUOWPSUOINN-IUCAKERBSA-N Lys-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN YQAIUOWPSUOINN-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- FYYHWMGAXLPEAU-UHFFFAOYSA-N Magnesium Chemical compound [Mg] FYYHWMGAXLPEAU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-PICCSMPSSA-N Maltose Natural products O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)OC(O)[C@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-PICCSMPSSA-N 0.000 description 1
- 229930195725 Mannitol Natural products 0.000 description 1
- 108010038049 Mating Factor Proteins 0.000 description 1
- 239000000637 Melanocyte-Stimulating Hormone Substances 0.000 description 1
- 108010007013 Melanocyte-Stimulating Hormones Proteins 0.000 description 1
- OBVHKUFUDCPZDW-JYJNAYRXSA-N Met-Arg-Phe Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 OBVHKUFUDCPZDW-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- IMTUWVJPCQPJEE-IUCAKERBSA-N Met-Lys Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN IMTUWVJPCQPJEE-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- YJNDFEWPGLNLNH-IHRRRGAJSA-N Met-Tyr-Cys Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 YJNDFEWPGLNLNH-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 1
- 241000713862 Moloney murine sarcoma virus Species 0.000 description 1
- 101100059658 Mus musculus Cetn4 gene Proteins 0.000 description 1
- 108010079364 N-glycylalanine Proteins 0.000 description 1
- QQXLDOJGLXJCSE-UHFFFAOYSA-N N-methylnortropinone Natural products C1C(=O)CC2CCC1N2C QQXLDOJGLXJCSE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010047562 NGR peptide Proteins 0.000 description 1
- BQVUABVGYYSDCJ-UHFFFAOYSA-N Nalpha-L-Leucyl-L-tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(NC(=O)C(N)CC(C)C)C(O)=O)=CNC2=C1 BQVUABVGYYSDCJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 101100205189 Neurospora crassa (strain ATCC 24698 / 74-OR23-1A / CBS 708.71 / DSM 1257 / FGSC 987) leu-5 gene Proteins 0.000 description 1
- 239000000020 Nitrocellulose Substances 0.000 description 1
- 108700026244 Open Reading Frames Proteins 0.000 description 1
- 102000003982 Parathyroid hormone Human genes 0.000 description 1
- 108090000445 Parathyroid hormone Proteins 0.000 description 1
- 239000001888 Peptone Substances 0.000 description 1
- 108010080698 Peptones Proteins 0.000 description 1
- BJEYSVHMGIJORT-NHCYSSNCSA-N Phe-Ala-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 BJEYSVHMGIJORT-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 1
- FRPVPGRXUKFEQE-YDHLFZDLSA-N Phe-Asp-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O FRPVPGRXUKFEQE-YDHLFZDLSA-N 0.000 description 1
- UEHNWRNADDPYNK-DLOVCJGASA-N Phe-Cys-Ala Chemical compound C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@H](CC1=CC=CC=C1)N UEHNWRNADDPYNK-DLOVCJGASA-N 0.000 description 1
- WPTYDQPGBMDUBI-QWRGUYRKSA-N Phe-Gly-Asn Chemical compound N[C@@H](Cc1ccccc1)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O WPTYDQPGBMDUBI-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- DMEYUTSDVRCWRS-ULQDDVLXSA-N Phe-Lys-Arg Chemical compound NC(=N)NCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 DMEYUTSDVRCWRS-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- IPFXYNKCXYGSSV-KKUMJFAQSA-N Phe-Ser-Lys Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N IPFXYNKCXYGSSV-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- GMWNQSGWWGKTSF-LFSVMHDDSA-N Phe-Thr-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O GMWNQSGWWGKTSF-LFSVMHDDSA-N 0.000 description 1
- DXWNFNOPBYAFRM-IHRRRGAJSA-N Phe-Val-Cys Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=CC=C1)N DXWNFNOPBYAFRM-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- 102000004160 Phosphoric Monoester Hydrolases Human genes 0.000 description 1
- 108090000608 Phosphoric Monoester Hydrolases Proteins 0.000 description 1
- 108091000080 Phosphotransferase Proteins 0.000 description 1
- 241000224485 Physarum Species 0.000 description 1
- 102000004211 Platelet factor 4 Human genes 0.000 description 1
- 108090000778 Platelet factor 4 Proteins 0.000 description 1
- 229920002873 Polyethylenimine Polymers 0.000 description 1
- 241001505332 Polyomavirus sp. Species 0.000 description 1
- 108010076039 Polyproteins Proteins 0.000 description 1
- 241000183024 Populus tremula Species 0.000 description 1
- ZLMJMSJWJFRBEC-UHFFFAOYSA-N Potassium Chemical compound [K] ZLMJMSJWJFRBEC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- IWNOFCGBMSFTBC-CIUDSAMLSA-N Pro-Ala-Glu Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O IWNOFCGBMSFTBC-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- DXTOOBDIIAJZBJ-BQBZGAKWSA-N Pro-Gly-Ser Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O DXTOOBDIIAJZBJ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- MRYUJHGPZQNOAD-IHRRRGAJSA-N Pro-Leu-Lys Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 MRYUJHGPZQNOAD-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- AJNGQVUFQUVRQT-JYJNAYRXSA-N Pro-Pro-Tyr Chemical compound C([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H]1N(CCC1)C(=O)[C@H]1NCCC1)C1=CC=C(O)C=C1 AJNGQVUFQUVRQT-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- ITUDDXVFGFEKPD-NAKRPEOUSA-N Pro-Ser-Ile Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O ITUDDXVFGFEKPD-NAKRPEOUSA-N 0.000 description 1
- QKDIHFHGHBYTKB-IHRRRGAJSA-N Pro-Ser-Phe Chemical compound N([C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(O)=O)C(=O)[C@@H]1CCCN1 QKDIHFHGHBYTKB-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- ZMLRZBWCXPQADC-TUAOUCFPSA-N Pro-Val-Pro Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@@H]2CCCN2 ZMLRZBWCXPQADC-TUAOUCFPSA-N 0.000 description 1
- 102100027467 Pro-opiomelanocortin Human genes 0.000 description 1
- 102000014961 Protein Precursors Human genes 0.000 description 1
- 108010078762 Protein Precursors Proteins 0.000 description 1
- QIZDQFOVGFDBKW-DHBOJHSNSA-N Pseudotropine Natural products OC1C[C@@H]2[N+](C)[C@H](C1)CC2 QIZDQFOVGFDBKW-DHBOJHSNSA-N 0.000 description 1
- LCTONWCANYUPML-UHFFFAOYSA-M Pyruvate Chemical compound CC(=O)C([O-])=O LCTONWCANYUPML-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 108010053763 Pyruvate Carboxylase Proteins 0.000 description 1
- 102100039895 Pyruvate carboxylase, mitochondrial Human genes 0.000 description 1
- 108010054530 RGDN peptide Proteins 0.000 description 1
- 108090000783 Renin Proteins 0.000 description 1
- 102100028255 Renin Human genes 0.000 description 1
- 108020001027 Ribosomal DNA Proteins 0.000 description 1
- 241000714474 Rous sarcoma virus Species 0.000 description 1
- 206010039491 Sarcoma Diseases 0.000 description 1
- 108010086019 Secretin Proteins 0.000 description 1
- 102100037505 Secretin Human genes 0.000 description 1
- 229920005654 Sephadex Polymers 0.000 description 1
- 239000012507 Sephadex™ Substances 0.000 description 1
- HBZBPFLJNDXRAY-FXQIFTODSA-N Ser-Ala-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O HBZBPFLJNDXRAY-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- ZXLUWXWISXIFIX-ACZMJKKPSA-N Ser-Asn-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O ZXLUWXWISXIFIX-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- FIDMVVBUOCMMJG-CIUDSAMLSA-N Ser-Asn-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO FIDMVVBUOCMMJG-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- MESDJCNHLZBMEP-ZLUOBGJFSA-N Ser-Asp-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O MESDJCNHLZBMEP-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- KNCJWSPMTFFJII-ZLUOBGJFSA-N Ser-Cys-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O KNCJWSPMTFFJII-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- LAFKUZYWNCHOHT-WHFBIAKZSA-N Ser-Glu Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O LAFKUZYWNCHOHT-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- YRBGKVIWMNEVCZ-WDSKDSINSA-N Ser-Glu-Gly Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O YRBGKVIWMNEVCZ-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- WOUIMBGNEUWXQG-VKHMYHEASA-N Ser-Gly Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O WOUIMBGNEUWXQG-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- QBUWQRKEHJXTOP-DCAQKATOSA-N Ser-His-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O QBUWQRKEHJXTOP-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- ZIFYDQAFEMIZII-GUBZILKMSA-N Ser-Leu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O ZIFYDQAFEMIZII-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- OWCVUSJMEBGMOK-YUMQZZPRSA-N Ser-Lys-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)NCC(O)=O OWCVUSJMEBGMOK-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- LRZLZIUXQBIWTB-KATARQTJSA-N Ser-Lys-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O LRZLZIUXQBIWTB-KATARQTJSA-N 0.000 description 1
- ADJDNJCSPNFFPI-FXQIFTODSA-N Ser-Pro-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H](N)CO ADJDNJCSPNFFPI-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- XZKQVQKUZMAADP-IMJSIDKUSA-N Ser-Ser Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O XZKQVQKUZMAADP-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- HHJFMHQYEAAOBM-ZLUOBGJFSA-N Ser-Ser-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O HHJFMHQYEAAOBM-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- WLJPJRGQRNCIQS-ZLUOBGJFSA-N Ser-Ser-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O WLJPJRGQRNCIQS-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- SRSPTFBENMJHMR-WHFBIAKZSA-N Ser-Ser-Gly Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(O)=O SRSPTFBENMJHMR-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- SQHKXWODKJDZRC-LKXGYXEUSA-N Ser-Thr-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O SQHKXWODKJDZRC-LKXGYXEUSA-N 0.000 description 1
- PMTWIUBUQRGCSB-FXQIFTODSA-N Ser-Val-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O PMTWIUBUQRGCSB-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- 102000005157 Somatostatin Human genes 0.000 description 1
- 108010056088 Somatostatin Proteins 0.000 description 1
- 238000002105 Southern blotting Methods 0.000 description 1
- 101000879712 Streptomyces lividans Protease inhibitor Proteins 0.000 description 1
- QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-L Sulfate Chemical compound [O-]S([O-])(=O)=O QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- OUUQCZGPVNCOIJ-UHFFFAOYSA-M Superoxide Chemical compound [O-][O] OUUQCZGPVNCOIJ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 101150006914 TRP1 gene Proteins 0.000 description 1
- 239000004098 Tetracycline Substances 0.000 description 1
- JMQUAZXYFAEOIH-XGEHTFHBSA-N Thr-Arg-Cys Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)N)O JMQUAZXYFAEOIH-XGEHTFHBSA-N 0.000 description 1
- VIBXMCZWVUOZLA-OLHMAJIHSA-N Thr-Asn-Asn Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)N)O VIBXMCZWVUOZLA-OLHMAJIHSA-N 0.000 description 1
- LGNBRHZANHMZHK-NUMRIWBASA-N Thr-Glu-Asp Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N)O LGNBRHZANHMZHK-NUMRIWBASA-N 0.000 description 1
- UDQBCBUXAQIZAK-GLLZPBPUSA-N Thr-Glu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O UDQBCBUXAQIZAK-GLLZPBPUSA-N 0.000 description 1
- BIYXEUAFGLTAEM-WUJLRWPWSA-N Thr-Gly Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O BIYXEUAFGLTAEM-WUJLRWPWSA-N 0.000 description 1
- SLUWOCTZVGMURC-BFHQHQDPSA-N Thr-Gly-Ala Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C)C(O)=O SLUWOCTZVGMURC-BFHQHQDPSA-N 0.000 description 1
- JQAWYCUUFIMTHE-WLTAIBSBSA-N Thr-Gly-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O JQAWYCUUFIMTHE-WLTAIBSBSA-N 0.000 description 1
- ODXKUIGEPAGKKV-KATARQTJSA-N Thr-Leu-Cys Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)N)O ODXKUIGEPAGKKV-KATARQTJSA-N 0.000 description 1
- VTVVYQOXJCZVEB-WDCWCFNPSA-N Thr-Leu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O VTVVYQOXJCZVEB-WDCWCFNPSA-N 0.000 description 1
- YOOAQCZYZHGUAZ-KATARQTJSA-N Thr-Leu-Ser Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YOOAQCZYZHGUAZ-KATARQTJSA-N 0.000 description 1
- IJVNLNRVDUTWDD-MEYUZBJRSA-N Thr-Leu-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O IJVNLNRVDUTWDD-MEYUZBJRSA-N 0.000 description 1
- BDYBHQWMHYDRKJ-UNQGMJICSA-N Thr-Phe-Met Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)O)N)O BDYBHQWMHYDRKJ-UNQGMJICSA-N 0.000 description 1
- NWECYMJLJGCBOD-UNQGMJICSA-N Thr-Phe-Val Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O NWECYMJLJGCBOD-UNQGMJICSA-N 0.000 description 1
- VBMOVTMNHWPZJR-SUSMZKCASA-N Thr-Thr-Glu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O VBMOVTMNHWPZJR-SUSMZKCASA-N 0.000 description 1
- UMFLBPIPAJMNIM-LYARXQMPSA-N Thr-Trp-Phe Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)C(=O)N[C@@H](CC3=CC=CC=C3)C(=O)O)N)O UMFLBPIPAJMNIM-LYARXQMPSA-N 0.000 description 1
- FYBFTPLPAXZBOY-KKHAAJSZSA-N Thr-Val-Asp Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O FYBFTPLPAXZBOY-KKHAAJSZSA-N 0.000 description 1
- 102000006601 Thymidine Kinase Human genes 0.000 description 1
- 108020004440 Thymidine kinase Proteins 0.000 description 1
- 108010046075 Thymosin Proteins 0.000 description 1
- 102000007501 Thymosin Human genes 0.000 description 1
- 102000005924 Triose-Phosphate Isomerase Human genes 0.000 description 1
- 108700015934 Triose-phosphate isomerases Proteins 0.000 description 1
- 239000007983 Tris buffer Substances 0.000 description 1
- TZNNEYFZZAHLBL-BPUTZDHNSA-N Trp-Arg-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O TZNNEYFZZAHLBL-BPUTZDHNSA-N 0.000 description 1
- PXYJUECTGMGIDT-WDSOQIARSA-N Trp-Arg-Leu Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O)=CNC2=C1 PXYJUECTGMGIDT-WDSOQIARSA-N 0.000 description 1
- OENGVSDBQHHGBU-QEJZJMRPSA-N Trp-Glu-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O OENGVSDBQHHGBU-QEJZJMRPSA-N 0.000 description 1
- DZIKVMCFXIIETR-JSGCOSHPSA-N Trp-Gly-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O DZIKVMCFXIIETR-JSGCOSHPSA-N 0.000 description 1
- KBUBZAMBIVEFEI-ZFWWWQNUSA-N Trp-His Chemical compound C([C@H](NC(=O)[C@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)N)C(O)=O)C1=CNC=N1 KBUBZAMBIVEFEI-ZFWWWQNUSA-N 0.000 description 1
- SGQSAIFDESQBRA-IHPCNDPISA-N Trp-Tyr-Asn Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC3=CC=C(C=C3)O)C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)N SGQSAIFDESQBRA-IHPCNDPISA-N 0.000 description 1
- 108060008682 Tumor Necrosis Factor Proteins 0.000 description 1
- LOOCQRRBKZTPKO-AVGNSLFASA-N Tyr-Glu-Asn Chemical compound NC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 LOOCQRRBKZTPKO-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- LMLBOGIOLHZXOT-JYJNAYRXSA-N Tyr-Glu-His Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CC2=CN=CN2)C(=O)O)N)O LMLBOGIOLHZXOT-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- KCPFDGNYAMKZQP-KBPBESRZSA-N Tyr-Gly-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O KCPFDGNYAMKZQP-KBPBESRZSA-N 0.000 description 1
- MVYRJYISVJWKSX-KBPBESRZSA-N Tyr-His-Gly Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC2=CN=CN2)C(=O)NCC(=O)O)N)O MVYRJYISVJWKSX-KBPBESRZSA-N 0.000 description 1
- ARJASMXQBRNAGI-YESZJQIVSA-N Tyr-Leu-Pro Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC2=CC=C(C=C2)O)N ARJASMXQBRNAGI-YESZJQIVSA-N 0.000 description 1
- NSGZILIDHCIZAM-KKUMJFAQSA-N Tyr-Leu-Ser Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)N NSGZILIDHCIZAM-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- WTTRJMAZPDHPGS-KKXDTOCCSA-N Tyr-Phe-Ala Chemical compound C[C@H](NC(=O)[C@H](Cc1ccccc1)NC(=O)[C@@H](N)Cc1ccc(O)cc1)C(O)=O WTTRJMAZPDHPGS-KKXDTOCCSA-N 0.000 description 1
- ZSXJENBJGRHKIG-UWVGGRQHSA-N Tyr-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 ZSXJENBJGRHKIG-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- KWKJGBHDYJOVCR-SRVKXCTJSA-N Tyr-Ser-Cys Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)N)O KWKJGBHDYJOVCR-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- NVJCMGGZHOJNBU-UFYCRDLUSA-N Tyr-Val-Phe Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC2=CC=C(C=C2)O)N NVJCMGGZHOJNBU-UFYCRDLUSA-N 0.000 description 1
- CVUDMNSZAIZFAE-UHFFFAOYSA-N Val-Arg-Pro Natural products NC(N)=NCCCC(NC(=O)C(N)C(C)C)C(=O)N1CCCC1C(O)=O CVUDMNSZAIZFAE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QPZMOUMNTGTEFR-ZKWXMUAHSA-N Val-Asn-Ala Chemical compound C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](C(C)C)N QPZMOUMNTGTEFR-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 1
- HZYOWMGWKKRMBZ-BYULHYEWSA-N Val-Asp-Asp Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N HZYOWMGWKKRMBZ-BYULHYEWSA-N 0.000 description 1
- VLOYGOZDPGYWFO-LAEOZQHASA-N Val-Asp-Glu Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O VLOYGOZDPGYWFO-LAEOZQHASA-N 0.000 description 1
- TZVUSFMQWPWHON-NHCYSSNCSA-N Val-Asp-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N TZVUSFMQWPWHON-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 1
- WDIGUPHXPBMODF-UMNHJUIQSA-N Val-Glu-Pro Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N WDIGUPHXPBMODF-UMNHJUIQSA-N 0.000 description 1
- ZHQWPWQNVRCXAX-XQQFMLRXSA-N Val-Leu-Pro Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N ZHQWPWQNVRCXAX-XQQFMLRXSA-N 0.000 description 1
- IJGPOONOTBNTFS-GVXVVHGQSA-N Val-Lys-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O IJGPOONOTBNTFS-GVXVVHGQSA-N 0.000 description 1
- MBGFDZDWMDLXHQ-GUBZILKMSA-N Val-Met-Ala Chemical compound C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCSC)NC(=O)[C@H](C(C)C)N MBGFDZDWMDLXHQ-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- YLBNZCJFSVJDRJ-KJEVXHAQSA-N Val-Thr-Tyr Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](Cc1ccc(O)cc1)C(O)=O YLBNZCJFSVJDRJ-KJEVXHAQSA-N 0.000 description 1
- HTONZBWRYUKUKC-RCWTZXSCSA-N Val-Thr-Val Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O HTONZBWRYUKUKC-RCWTZXSCSA-N 0.000 description 1
- BGTDGENDNWGMDQ-KJEVXHAQSA-N Val-Tyr-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N)O BGTDGENDNWGMDQ-KJEVXHAQSA-N 0.000 description 1
- 108700040099 Xylose isomerases Proteins 0.000 description 1
- 101150018582 YAP3 gene Proteins 0.000 description 1
- 101100053619 Yersinia enterocolitica yscF gene Proteins 0.000 description 1
- HCHKCACWOHOZIP-UHFFFAOYSA-N Zinc Chemical compound [Zn] HCHKCACWOHOZIP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000002378 acidificating effect Effects 0.000 description 1
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 1
- 239000012190 activator Substances 0.000 description 1
- 239000008272 agar Substances 0.000 description 1
- 230000002776 aggregation Effects 0.000 description 1
- 238000004220 aggregation Methods 0.000 description 1
- 108010087049 alanyl-alanyl-prolyl-valine Proteins 0.000 description 1
- 108010041407 alanylaspartic acid Proteins 0.000 description 1
- 108010005233 alanylglutamic acid Proteins 0.000 description 1
- 108010070944 alanylhistidine Proteins 0.000 description 1
- 102000015395 alpha 1-Antitrypsin Human genes 0.000 description 1
- 108010050122 alpha 1-Antitrypsin Proteins 0.000 description 1
- 229940024142 alpha 1-antitrypsin Drugs 0.000 description 1
- 235000019270 ammonium chloride Nutrition 0.000 description 1
- 150000003863 ammonium salts Chemical class 0.000 description 1
- BFNBIHQBYMNNAN-UHFFFAOYSA-N ammonium sulfate Chemical compound N.N.OS(O)(=O)=O BFNBIHQBYMNNAN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052921 ammonium sulfate Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000001166 ammonium sulphate Substances 0.000 description 1
- 239000003242 anti bacterial agent Substances 0.000 description 1
- 229940088710 antibiotic agent Drugs 0.000 description 1
- 239000003146 anticoagulant agent Substances 0.000 description 1
- 229940127219 anticoagulant drug Drugs 0.000 description 1
- 229940019748 antifibrinolytic proteinase inhibitors Drugs 0.000 description 1
- 108010091092 arginyl-glycyl-proline Proteins 0.000 description 1
- 108010077245 asparaginyl-proline Proteins 0.000 description 1
- 108010036999 aspartyl-alanyl-histidyl-lysine Proteins 0.000 description 1
- 108010069205 aspartyl-phenylalanine Proteins 0.000 description 1
- 108010068265 aspartyltyrosine Proteins 0.000 description 1
- 230000003190 augmentative effect Effects 0.000 description 1
- 239000011324 bead Substances 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N beta-D-glucose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N 0.000 description 1
- 102000006635 beta-lactamase Human genes 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-QUYVBRFLSA-N beta-maltose Chemical compound OC[C@H]1O[C@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-QUYVBRFLSA-N 0.000 description 1
- 230000002902 bimodal effect Effects 0.000 description 1
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 description 1
- 230000002051 biphasic effect Effects 0.000 description 1
- 238000009835 boiling Methods 0.000 description 1
- UDSAIICHUKSCKT-UHFFFAOYSA-N bromophenol blue Chemical compound C1=C(Br)C(O)=C(Br)C=C1C1(C=2C=C(Br)C(O)=C(Br)C=2)C2=CC=CC=C2S(=O)(=O)O1 UDSAIICHUKSCKT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 1
- 229960004015 calcitonin Drugs 0.000 description 1
- BBBFJLBPOGFECG-VJVYQDLKSA-N calcitonin Chemical compound N([C@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC=1NC=NC=1)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(N)=O)C(C)C)C(=O)[C@@H]1CSSC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N1 BBBFJLBPOGFECG-VJVYQDLKSA-N 0.000 description 1
- OSGAYBCDTDRGGQ-UHFFFAOYSA-L calcium sulfate Chemical class [Ca+2].[O-]S([O-])(=O)=O OSGAYBCDTDRGGQ-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 235000011132 calcium sulphate Nutrition 0.000 description 1
- 229940041514 candida albicans extract Drugs 0.000 description 1
- 150000001720 carbohydrates Chemical class 0.000 description 1
- 235000014633 carbohydrates Nutrition 0.000 description 1
- 150000004649 carbonic acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 230000003197 catalytic effect Effects 0.000 description 1
- 150000001768 cations Chemical class 0.000 description 1
- 230000010261 cell growth Effects 0.000 description 1
- 239000013592 cell lysate Substances 0.000 description 1
- 210000000170 cell membrane Anatomy 0.000 description 1
- 210000002230 centromere Anatomy 0.000 description 1
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 1
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 1
- 150000001805 chlorine compounds Chemical class 0.000 description 1
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 1
- 108010068597 corticostatin Proteins 0.000 description 1
- ZKALIGRYJXFMNS-XBDDSDALSA-N corticostatin Chemical compound OC(=O)CC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H]1N(CCC1)C(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H]1N(CCC1)C(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H]1N(CCC1)C(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C(C)C)C(C)C)C(C)C)CC1=CC=CC=C1 ZKALIGRYJXFMNS-XBDDSDALSA-N 0.000 description 1
- 229960000258 corticotropin Drugs 0.000 description 1
- IDLFZVILOHSSID-OVLDLUHVSA-N corticotropin Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC=1NC=NC=1)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO)C1=CC=C(O)C=C1 IDLFZVILOHSSID-OVLDLUHVSA-N 0.000 description 1
- 238000012258 culturing Methods 0.000 description 1
- 108050004038 cystatin Proteins 0.000 description 1
- 230000009089 cytolysis Effects 0.000 description 1
- 230000006378 damage Effects 0.000 description 1
- 230000007812 deficiency Effects 0.000 description 1
- 239000007857 degradation product Substances 0.000 description 1
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 1
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 1
- 238000000502 dialysis Methods 0.000 description 1
- 125000002228 disulfide group Chemical group 0.000 description 1
- 230000009977 dual effect Effects 0.000 description 1
- 108010031145 eglin proteinase inhibitors Proteins 0.000 description 1
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 1
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 1
- 238000006911 enzymatic reaction Methods 0.000 description 1
- 210000003743 erythrocyte Anatomy 0.000 description 1
- 229940105423 erythropoietin Drugs 0.000 description 1
- 238000012869 ethanol precipitation Methods 0.000 description 1
- 230000002964 excitative effect Effects 0.000 description 1
- 238000002270 exclusion chromatography Methods 0.000 description 1
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 1
- 239000013613 expression plasmid Substances 0.000 description 1
- 229960004222 factor ix Drugs 0.000 description 1
- 238000000855 fermentation Methods 0.000 description 1
- 230000004151 fermentation Effects 0.000 description 1
- 239000003527 fibrinolytic agent Substances 0.000 description 1
- 235000013305 food Nutrition 0.000 description 1
- 239000012737 fresh medium Substances 0.000 description 1
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010063718 gamma-glutamylaspartic acid Proteins 0.000 description 1
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 1
- 238000001502 gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 239000011521 glass Substances 0.000 description 1
- 108060003196 globin Proteins 0.000 description 1
- 108010057083 glutamyl-aspartyl-leucine Proteins 0.000 description 1
- 108010079547 glutamylmethionine Proteins 0.000 description 1
- 108010019832 glycyl-asparaginyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108010023364 glycyl-histidyl-arginine Proteins 0.000 description 1
- 108010077435 glycyl-phenylalanyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108010089804 glycyl-threonine Proteins 0.000 description 1
- 108010050848 glycylleucine Proteins 0.000 description 1
- 108010037850 glycylvaline Proteins 0.000 description 1
- STKYPAFSDFAEPH-LURJTMIESA-N glycylvaline Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN STKYPAFSDFAEPH-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 1
- 239000007952 growth promoter Substances 0.000 description 1
- 239000003630 growth substance Substances 0.000 description 1
- 208000010710 hepatitis C virus infection Diseases 0.000 description 1
- 108010085325 histidylproline Proteins 0.000 description 1
- 108010018006 histidylserine Proteins 0.000 description 1
- 229940045644 human calcitonin Drugs 0.000 description 1
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 1
- 230000002519 immonomodulatory effect Effects 0.000 description 1
- 238000003018 immunoassay Methods 0.000 description 1
- 230000002779 inactivation Effects 0.000 description 1
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 1
- 230000000977 initiatory effect Effects 0.000 description 1
- PBGKTOXHQIOBKM-FHFVDXKLSA-N insulin (human) Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H]1CSSC[C@H]2C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@H](C(N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC=3C=CC(O)=CC=3)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC=3C=CC(O)=CC=3)C(=O)N[C@@H](CSSC[C@H](NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CC=3C=CC(O)=CC=3)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CC=3NC=NC=3)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)CNC1=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O)=O)CSSC[C@@H](C(N2)=O)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)[C@@H](C)CC)[C@@H](C)CC)[C@@H](C)O)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C(C)C)C1=CN=CN1 PBGKTOXHQIOBKM-FHFVDXKLSA-N 0.000 description 1
- 102000006495 integrins Human genes 0.000 description 1
- 108010044426 integrins Proteins 0.000 description 1
- 108010047126 interferon-alpha 8 Proteins 0.000 description 1
- 229940047124 interferons Drugs 0.000 description 1
- 238000004255 ion exchange chromatography Methods 0.000 description 1
- 150000002500 ions Chemical class 0.000 description 1
- 229910052742 iron Inorganic materials 0.000 description 1
- 101150107787 kex1 gene Proteins 0.000 description 1
- 239000008101 lactose Substances 0.000 description 1
- 108010090333 leucyl-lysyl-proline Proteins 0.000 description 1
- 108010057821 leucylproline Proteins 0.000 description 1
- 230000000670 limiting effect Effects 0.000 description 1
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 1
- 229940040129 luteinizing hormone Drugs 0.000 description 1
- 108010017391 lysylvaline Proteins 0.000 description 1
- 230000012976 mRNA stabilization Effects 0.000 description 1
- 239000011777 magnesium Substances 0.000 description 1
- 229910052749 magnesium Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000019341 magnesium sulphate Nutrition 0.000 description 1
- WPBNNNQJVZRUHP-UHFFFAOYSA-L manganese(2+);methyl n-[[2-(methoxycarbonylcarbamothioylamino)phenyl]carbamothioyl]carbamate;n-[2-(sulfidocarbothioylamino)ethyl]carbamodithioate Chemical compound [Mn+2].[S-]C(=S)NCCNC([S-])=S.COC(=O)NC(=S)NC1=CC=CC=C1NC(=S)NC(=O)OC WPBNNNQJVZRUHP-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 239000000594 mannitol Substances 0.000 description 1
- 235000010355 mannitol Nutrition 0.000 description 1
- 239000000463 material Substances 0.000 description 1
- SKEFKEOTNIPLCQ-LWIQTABASA-N mating hormone Chemical compound C([C@@H](C(=O)NC(CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](CCS(C)=O)C(=O)NC(CC=1C=CC(O)=CC=1)C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C1=CN=CN1 SKEFKEOTNIPLCQ-LWIQTABASA-N 0.000 description 1
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 description 1
- 235000013372 meat Nutrition 0.000 description 1
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 1
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 1
- TWXDDNPPQUTEOV-FVGYRXGTSA-N methamphetamine hydrochloride Chemical compound Cl.CN[C@@H](C)CC1=CC=CC=C1 TWXDDNPPQUTEOV-FVGYRXGTSA-N 0.000 description 1
- 230000011278 mitosis Effects 0.000 description 1
- 238000000465 moulding Methods 0.000 description 1
- 229920001220 nitrocellulos Polymers 0.000 description 1
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- 235000015097 nutrients Nutrition 0.000 description 1
- 244000045947 parasite Species 0.000 description 1
- 239000000199 parathyroid hormone Substances 0.000 description 1
- 229960001319 parathyroid hormone Drugs 0.000 description 1
- 230000036961 partial effect Effects 0.000 description 1
- 239000000137 peptide hydrolase inhibitor Substances 0.000 description 1
- 235000019319 peptone Nutrition 0.000 description 1
- 210000001322 periplasm Anatomy 0.000 description 1
- 108010089198 phenylalanyl-prolyl-arginine Proteins 0.000 description 1
- 235000021317 phosphate Nutrition 0.000 description 1
- 239000010452 phosphate Substances 0.000 description 1
- 150000003013 phosphoric acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 102000020233 phosphotransferase Human genes 0.000 description 1
- 229920002401 polyacrylamide Polymers 0.000 description 1
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 description 1
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 description 1
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 description 1
- 239000011591 potassium Substances 0.000 description 1
- 229910052700 potassium Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000011151 potassium sulphates Nutrition 0.000 description 1
- OXCMYAYHXIHQOA-UHFFFAOYSA-N potassium;[2-butyl-5-chloro-3-[[4-[2-(1,2,4-triaza-3-azanidacyclopenta-1,4-dien-5-yl)phenyl]phenyl]methyl]imidazol-4-yl]methanol Chemical compound [K+].CCCCC1=NC(Cl)=C(CO)N1CC1=CC=C(C=2C(=CC=CC=2)C2=N[N-]N=N2)C=C1 OXCMYAYHXIHQOA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000001556 precipitation Methods 0.000 description 1
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 description 1
- 108010031719 prolyl-serine Proteins 0.000 description 1
- 108010029020 prolylglycine Proteins 0.000 description 1
- 230000009145 protein modification Effects 0.000 description 1
- 230000006337 proteolytic cleavage Effects 0.000 description 1
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 1
- 239000012264 purified product Substances 0.000 description 1
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 1
- 238000004007 reversed phase HPLC Methods 0.000 description 1
- 239000007320 rich medium Substances 0.000 description 1
- 101150116497 sacm1l gene Proteins 0.000 description 1
- 229960002101 secretin Drugs 0.000 description 1
- OWMZNFCDEHGFEP-NFBCVYDUSA-N secretin human Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(N)=O)[C@@H](C)O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](N)CC=1NC=NC=1)[C@@H](C)O)C1=CC=CC=C1 OWMZNFCDEHGFEP-NFBCVYDUSA-N 0.000 description 1
- 230000003248 secreting effect Effects 0.000 description 1
- 239000013049 sediment Substances 0.000 description 1
- 239000006152 selective media Substances 0.000 description 1
- 108010048818 seryl-histidine Proteins 0.000 description 1
- 108010007375 seryl-seryl-seryl-arginine Proteins 0.000 description 1
- 239000013605 shuttle vector Substances 0.000 description 1
- 239000011734 sodium Substances 0.000 description 1
- 229910052708 sodium Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000002415 sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 235000011152 sodium sulphate Nutrition 0.000 description 1
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 1
- NHXLMOGPVYXJNR-ATOGVRKGSA-N somatostatin Chemical compound C([C@H]1C(=O)N[C@H](C(N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CSSC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC=2C=CC=CC=2)C(=O)N[C@@H](CC=2C=CC=CC=2)C(=O)N[C@@H](CC=2C3=CC=CC=C3NC=2)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@H](C(=O)N1)[C@@H](C)O)NC(=O)CNC(=O)[C@H](C)N)C(O)=O)=O)[C@H](O)C)C1=CC=CC=C1 NHXLMOGPVYXJNR-ATOGVRKGSA-N 0.000 description 1
- 229960000553 somatostatin Drugs 0.000 description 1
- 125000006850 spacer group Chemical group 0.000 description 1
- 241000894007 species Species 0.000 description 1
- 230000006641 stabilisation Effects 0.000 description 1
- 238000011105 stabilization Methods 0.000 description 1
- 238000003756 stirring Methods 0.000 description 1
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 1
- 239000003774 sulfhydryl reagent Substances 0.000 description 1
- 230000009469 supplementation Effects 0.000 description 1
- 229960002180 tetracycline Drugs 0.000 description 1
- 229930101283 tetracycline Natural products 0.000 description 1
- 235000019364 tetracycline Nutrition 0.000 description 1
- 150000003522 tetracyclines Chemical class 0.000 description 1
- 108010061238 threonyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- LCJVIYPJPCBWKS-NXPQJCNCSA-N thymosin Chemical compound SC[C@@H](N)C(=O)N[C@H](CO)C(=O)N[C@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(C)C)C(=O)N[C@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(C)C)C(=O)N[C@H](CO)C(=O)N[C@H](CO)C(=O)N[C@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@H]([C@H](C)O)C(=O)N[C@H](C(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N[C@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N[C@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N[C@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(C)C)C(=O)N[C@H](C(C)C)C(=O)N[C@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](CCC(O)=O)C(O)=O LCJVIYPJPCBWKS-NXPQJCNCSA-N 0.000 description 1
- 239000011573 trace mineral Substances 0.000 description 1
- 235000013619 trace mineral Nutrition 0.000 description 1
- 230000005026 transcription initiation Effects 0.000 description 1
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 1
- 239000001226 triphosphate Substances 0.000 description 1
- 235000011178 triphosphate Nutrition 0.000 description 1
- UNXRWKVEANCORM-UHFFFAOYSA-N triphosphoric acid Chemical compound OP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O UNXRWKVEANCORM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N tris Chemical compound OCC(N)(CO)CO LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- CYHOMWAPJJPNMW-JIGDXULJSA-N tropine Chemical compound C1[C@@H](O)C[C@H]2CC[C@@H]1N2C CYHOMWAPJJPNMW-JIGDXULJSA-N 0.000 description 1
- 239000012137 tryptone Substances 0.000 description 1
- 108010029384 tryptophyl-histidine Proteins 0.000 description 1
- 102000003390 tumor necrosis factor Human genes 0.000 description 1
- 241000701447 unidentified baculovirus Species 0.000 description 1
- 229940035893 uracil Drugs 0.000 description 1
- VBEQCZHXXJYVRD-GACYYNSASA-N uroanthelone Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O)C(C)C)[C@@H](C)O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC=1NC=NC=1)NC(=O)[C@H](CCSC)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CNC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H]1N(CCC1)C(=O)[C@H](CS)NC(=O)CNC(=O)[C@H]1N(CCC1)C(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O)C(C)C)[C@@H](C)CC)C1=CC=C(O)C=C1 VBEQCZHXXJYVRD-GACYYNSASA-N 0.000 description 1
- 108010073969 valyllysine Proteins 0.000 description 1
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000001993 wax Substances 0.000 description 1
- 239000011701 zinc Substances 0.000 description 1
- 229910052725 zinc Inorganic materials 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
- C12N15/52—Genes encoding for enzymes or proenzymes
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K1/00—General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length
- C07K1/107—General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length by chemical modification of precursor peptides
- C07K1/113—General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length by chemical modification of precursor peptides without change of the primary structure
- C07K1/1133—General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length by chemical modification of precursor peptides without change of the primary structure by redox-reactions involving cystein/cystin side chains
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/575—Hormones
- C07K14/65—Insulin-like growth factors, i.e. somatomedins, e.g. IGF-1, IGF-2
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
- C12N15/62—DNA sequences coding for fusion proteins
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/48—Hydrolases (3) acting on peptide bonds (3.4)
- C12N9/50—Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25)
- C12N9/58—Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25) derived from fungi
- C12N9/60—Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25) derived from fungi from yeast
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P21/00—Preparation of peptides or proteins
- C12P21/06—Preparation of peptides or proteins produced by the hydrolysis of a peptide bond, e.g. hydrolysate products
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
- C07K2319/01—Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif
- C07K2319/02—Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif containing a signal sequence
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
- C07K2319/01—Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif
- C07K2319/04—Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif containing an ER retention signal such as a C-terminal HDEL motif
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
- C07K2319/70—Fusion polypeptide containing domain for protein-protein interaction
- C07K2319/74—Fusion polypeptide containing domain for protein-protein interaction containing a fusion for binding to a cell surface receptor
- C07K2319/75—Fusion polypeptide containing domain for protein-protein interaction containing a fusion for binding to a cell surface receptor containing a fusion for activation of a cell surface receptor, e.g. thrombopoeitin, NPY and other peptide hormones
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Zoology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Mycology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Endocrinology (AREA)
- Diabetes (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Saccharide Compounds (AREA)
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
- Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
Description
105482
Menetelmä heterologisen proteiinin valmistamiseksi eukaryoottisessa isäntäsolussa Tämä keksintö koskee uusia rekombinantti-DNA-5 molekyylejä, jotka koodaavat modifioitua, endoplasmisessa retikulumissa sijaitsevaa, "kaksiemäksistä, muokkaavaa endoproteaasia", ja mainitun endoplasmisessa retikulumissa sijaitsevan, "kaksiemäksisen, muokkaavan endoproteaasin” käyttöä heterologisten polypeptidien oikeaan muokkaamiseen 10 transformoiduissa eukaryoottisissa isännissä.
Keksinnön tausta
Farmaseuttisesti hyväksyttävien tai entsymaattisesti aktiivisten proteiinien tuotanto on avainalue 15 nopeasti kehittyvässä bioteknisessä teollisuudessa.
Rekombinantti-DNA-teknologian aikakauden alkamisen jälkeen paljon arvokkaita, heterologisia proteiineja on tuotettu eukaryoottisissa isäntäsoluissa ja eritetty eukaryootti-sista isäntäsoluista, jotka oli transformoitu sopivilla, 20 mainittuja proteiineja koodaavia DNA-sekvenssejä sisältävillä ekspressiovektoreilla. Yksi suurimmista ongelmista erittyvien proteiinien tuotannossa eukaryoottisissa eks- . . pressiojärjestelmissä on välttää väärinlaskostunutta, bio- • · · ’·*·’ logisesti inaktiivista tuotetta.
• ” 25 Nyt on yleisesti hyväksytty, että proteiinit, jotka on tarkoitettu erittymään eukaryoottisoluista, siir- • · :.· · tyvät endoplasmiseen retikulumiin (ER) signaalisekvenssin läsnäolon vuoksi, joka sekvenssi pilkotaan pois karkeapin- täisessä ER-membraanissa sijaitsevalla signaalipeptidaa- 30 sientsyymillä. Proteiini siirtyy sen jälkeen ER:sta Golgiin .···. ja Golgista peräisin olevien eritysrakkuloiden kautta • · solupinnalle (S. Pfeffer ja J. Rothman, Ann. Rev. Biochem.
*!* 56: 829 - 52, 1987) . Toinen tärkeä vaihe oikein muokattujen * · *.’·· ja oikein laskostaneiden proteiinien tuotannossa on propro- • · t 35 teiinien muuttaminen kypsiksi muodoiksi Golgin laitteessa . *·. ja eritysrakkuloissa. Proproteiinin irtoaminen tapahtuu niin kutsutussa kaksiemäksisessä paikassa, toisin sanoen paikassa, joka koostuu vähintään kahdesta emäksisestä • · 2 105482 aminohaposta. Muokkausta katalysoivat Golgin laitteessa sijaitsevat entsyymit, n. k. "kaksiemäksiset, muokkaavat endoproteaasit".
Tunnetaan erilaisia "kaksiemäksisiä, muokkaavia en-5 doproteaaseja", jotka osallistuvat proteiiniprekursoreiden muokkaamiseen, esimerkiksi nisäkäsproteaasit furiini, PC2, PCI ja PC3 sekä hiivan YAP3-geenin ja hiivan yscF:n tuote (myös nimetty KEX2-geenituotteeksi; tässä viitataan KEX2p:-hen) .
10 KEX2p osallistuu hiivan risteytymisen feromoni-a- tekijän kypsymiseen (J.Kurjan ja I. Hershkowitz, Cell 30: 933 - 943, 1982). α-tekijä tuotetaan 165-aminohappoprekur-sorina, joka muokataan solun pintaan siirtämisen aikana. Ensimmäisessä vaiheessa 19-aminohapposignaalisekvenssi 15 (pre-sekvenssi) pilkotaan pois signaalipeptidaasilla. Sen jälkeen prekursori glykosyloidaan, ja se siirtyy Golgiin, jossa 66-aminohappoprosekvenssi katkaistaan pois KEX2p:-llä. α-tekijän pre-pro-sekvenssi tunnetaan myös a-tekijän "johto"-sekvenssinä. Toinen proteaasi Golgin laitteessa, 20 toisin sanoen KEXl-geenituote, on vastuussa proteiinin lopullisesta kypsymisestä.
. . KEX2p:tä koodaa KEX2-geeni, ja se koostuu N-ter- • · · * minaalisesta katalyyttisestä alueesta, Ser/Thr-rikkaasta • · • " alueesta, membraanin välialueesta (spanning region)ja C- · a 25 terminaalisesta hännästä, joka on vastuussa sijainnista :.l i Golgissa. Mutantti KEX2p-entsyymi, jolta puuttuu 200 C- • terminaalista aminohappoa, mukaanlukien Ser/Thr-rikas alue, membraanin jännittävä alue ja C-terminaalinen häntä, pitää silti yllä KEX2p-proteaasitoimintaa, nimittäin pilkkomista •V. 30 emäksisen aminohappoparin, kuten Lys-Arg tai Arg-Arg, C- • · .·;·, terminaalisessa päässä [Fuller et ai., 1989, Proc. Natl.
Acad. Sei. £6, 1434 - 1438; Fuller et ai., 1989, Science :.ί.: 246, 482 - 485] .
· ·
Johtosekvenssejä, kuten hiivan α-tekijän johtosekvens-35 siä, käytetään laajalti erittyvien, heterologisten proteii- • · ( · .·. : nien tuotantoon eukaryoottisoluissa. Monissa tapauksissa kohdataan kuitenkin suuria vaikeuksia, koska tuotetaan 105482 3 huomattavia määriä biologisesti inaktiivisia proteiineja proteiinien väärinlaskostumisen ja aggregaation vuoksi, erityisesti sellaisten proteiinien tapauksessa, joilla on alhainen molekyylipaino.
5
Keksinnön kohde
Yllättäen on havaittu, että suurempi suhde biologisesti aktiivista, oikein laskostunutta, heterologista proteiinia inaktiiviseen väärinlaskostuneeseen proteiiniin 10 nähden tuotetaan isäntäsolussa, jos isäntäsolulla on "kaksiemäksinen, muokkaava endoproteaasi" -aktiivisuus endoplasmisessa retikulumissa (ER) .
Siten keksinnön kohteena on menetelmä heterologisen, biologisesti aktiivisen proteiinin valmistamiseksi, joka 15 menetelmä käsittää sellaisen isäntäsolun käytön, jolla on "kaksiemäksinen, muokkaava endoproteaasi" ER:ssä. Muita kohteita ovat sellaisen isäntäsolun aikaansaaminen, jolla on "kaksiemäksinen, muokkaava endoproteaasi" -variantti, joka sijaitsee ER:ssä, jolloin solu on transformoitu "kak-20 siemäksinen, muokkaava endoproteaasi" -varianttia koodaa-valla geenillä, lisäksi mainitun geenin sisältävän DNA-\\ molekyylin aikaansaaminen ja menetelmien aikaansaaminen :·.* mainitun DNA-molekyylin ja mainitun isäntäsolun valmista- miseksi.
25 : Keksinnön yksityiskohtainen kuvaus • · m ’· Ί Menetelmä heterologisen proteiinin valmistamiseksi • · · V * Keksintö koskee menetelmää heterologisen, biologises ti aktiivisen proteiinin valmistamiseksi, jota vapautuu : ·[: 3 0 isäntäsolussa proproteiinistä, jolloin mainittu prosessi käsittää sellaisen isäntäsolun käytön, jolla solulla on - · *. "kaksiemäksinen, muokkaava endoproteaasi" -aktiivisuus ER:- • · · ssä.
• · "Kaksiemäksinen, muokkaava endoproteaasi" -aktiivini· 35 suus tämän keksinnön mukaisessa merkityksessä on kahden :*·.· emäksisen aminohapon, esim. Arg-Arg, Arg-Lys, Lys-Arg tai
Lys-Lys, paikalle spesifisen endoproteaasin aktiivisuus, 105482 4 joka endoproteaasi sijaitsee luonnollisesti Golgin laitteessa ja osallistuu luonnollisesti proproteiinien tai polyproteiinien muokkaamiseen.
Termi "kaksiemäksinen, muokkaava endoproteaasi” si-5 saitaa eukaryoottiset entsyymit, kuten nisäkäslähteestä, esim. furiini, PC2, PCI, PC3 (Barr, Cell 66: 1-3, 1991), ja edullisesti hiivasta saadut entsyymit, kuten YAP3-endo-proteaasi [Egel-Mitani et ai., Yeast 6: 127 - 137 (1990)], ja edullisimmin S. cerevisiae -endoproteaasi KEX2p.
10 Keksinnön mukaisen "kaksiemäksisen, muokkaavan endo- proteaasin" biologisesti aktiiviset variantit eivät rajoitu Golgin laitteeseen, mutta sijaitsevat ER:ssä ER-retentiosignaalin vuoksi, joka on "kaksiemäksisen, muokkaavan endoproteaasin" retentioon ERtssä sopiva rakenne. 15 Luonnollisesti esiintyvät "kaksiemäksiset, muokkaavat endoproteaasit” kiinnittyvät Golgin laitteen tai eritysrak-kuloiden membraaniin membraaniankkurin, toisin sanoen hydrofobisen membraanin välisekvenssin, ansiosta. ER-reten-tiosignaalit pitää liittää proteiinin, toisin sanoen "kak-20 siemäksisen, muokkaavan endoproteaasin", c-päähän proteaa-sin sijoittamiseksi ERrään. Mainittua fuusioproteiinia, ·.·. joka koostuu proteaasista ja ER-retentiosignaalist.a, kutsu- • * i taan tästä lähtien "ER:ssä sijaitsevaksi, kaksiemäksiseksi, < · · ' . muokkaavaksi endoproteaasiksi".
• » i 25 Keksinnön mukaisessa edullisessa suoritusmuodossa ER- • 9 • · · *·· · retentiosignaali kiinnittyy "kaksiemäksisen, muokkaavan *. " endoproteaasin" liukoisen muodon, toisin sanoen "kaksiemäk- • ·· V ·’ sisen, muokkaavan endoproteaasin" variantin C-päähän, joka variantti ei ole kiinnittynyt solumembraaniin. Mainitulta 3 0 liukoiselta muodolta puuttuu hydrofobinen membraanin vä- ·'·*; lisekvenssi, mutta silti se pitää yllä tyypillistä entsy- maattista, "kaksiemäksistä, muokkaavaa" toimintaa.
I I I
;;;* Edullinen esimerkki tässä keksinnössä hyödyllisestä, • i '··* liukoisesta "kaksiemäksisestä, muokkaavasta endoproteaa- ·;· 35 sista" on liukoinen S. cerevisiae KEX2p, toisin sanoen
* « M
KEX2p-variantti, jolta puuttuu hydrofobinen, membraanien välinen, alueella Tyr679 - Met699 sijaitseva, sekvenssi 5 105482 [814-tähteen S. cerevisiae KEX2p -aminohapposekvenssi tunnetaan viitteestä K. Mizuno et ai., Biochem. Biophys. Res. Commun. 156. 246 - 254 (1988)]. Erityisesti keksinnön mukaisessa, liukoisessa KEX2p-endoproteaasissa, membraanin 5 sitoutumispaikka on poistettu selektiivisesti. Siten C-pää, joka alkaa esim. aminohapolla 700 (Lys), on yhä läsnä tai koko C-pää sisältäen membraanin sitoutumispaikan, toisin sanoen 136 - n. 200 aminohappoa C-päästä, on poistettu. Mainitut liukoiset KEX2p-proteiinit on kuvattu esi-10 merkiksi EP:ssä nro 327,377 tai viitteessä R. S. Fuller et ai., Proc. Natl. Acad. Sei. USA 86, 1434 - 1438 (1989).
Edullisin keksinnön mukainen "kaksiemäksinen, muokkaava endoproteaasi" on liukoinen KEX2p, jolla on sekvenssiluettelossa sekvenssin nro 1 alla kuvattu sekvenssi ja johon 15 tästä eteenpäin viitataan KEX2ps:llä.
ER-retentiosignaali on rakenne, joka määrää polypep-tidin sijainnin ER:ssä. Sijainti ER:ssä voi perustua spesifiseen kiinnittymiseen ER-membraaniin tai edullisesti liukoisen proteiinin kuljetuksen estämiseen Golgin lait-20 teeseen polypeptidin uudelleenkuljetuksella Golgin laitteen ja ER:n välisestä alueesta ER:n onteloon. Tässä kek-\\ sinnössä edullisesti, käytetyt ER-retentiosignaalit ovat ;·. jälkimmäistä tyyppiä, toisin sanoen sellaisia, jotka es- «Il tävät liukoisen proteiinin kuljetusta Golgin laitteeseen.
« % * 25 Edullinen esimerkki mainitusta ER-retentiosignaalis-
« · I
j ta on niin kutsuttu KDEL-sekvenssi (sekvenssi nro 3), joka t * « *· ’·’ on toiminnallinen nisäkässoluissa. Edullisempi on DDEL- *.* ’ sekvenssi (sekvenssi nro 4), joka on toiminnallinen hiivas sa Kluvveromvces lactis. ja edullisin on HDEL-sekvenssi • 30 (sekvenssi nro 2) , joka on toiminnallinen S. cerevisiaessa lYl ja K. lactiksessa.
t \# "ER:ssä sijaitsevan, kaksiemäksisen, muokkaavan en- • « « ..... f 9 doproteaasin" edullisiin muotoihin kuuluu ER-retentiosig- ’j·* naali-KDEL-sekvenssi, joka on kiinnittynyt nisäkässolun , \l‘ 35 "kaksiemäksiseen, muokkaavaan endoproteaasiin”, kuten furiiniin, PCl:een, PC2:een tai PC3:een (P. J. Barr, yl- lä), tai edullisesti sen liukoiseen varianttiin, tai myös • · 105482 6 S. cerevisiae KEX2p:hen, jonka viimeksi mainitun tiedetään olevan toiminnallinen nisäkässoluissa, tai edullisesti sen liukoiseen varianttiin. Jos kyseistä "ER:ssä sijaitsevaa, kaksiemäksistä, muokkaavaa endoproteaasia", esim. furiiniK-5 DEL-, PC1KDEL-, PC2KDEL-, PC3KDEL- tai KEX2pKDEL-entsyyme-jä, tuotetaan nisäkäsisäntäsolussa, joka on transformoitu heterologista proteiinia ilmentävällä geenillä, tuotetaan suurempi osuus oikeinlaskostunutta, eritettyä heterologista proteiinia.
10 Edullisimmin DDEL-retentiosignaali yhdistetään K.
lactis KEX2p -analogiin tai edullisesti sen liukoiseen varianttiin, tai S. cerevisiae KEX2p:hen tai edullisesti sen liukoiseen varianttiin, erityisesti KEX2ps:ään. S. cerevisiae KEX2p on toiminnallinen myös K. lactiksessa.
15 Mainittu KEX2pDDEL, joka on tuotettu K. lactis -isän-täsolussa, sallii oikeinlaskostuneen, eritetyn heterologi-sen proteiinin suuremman osuuden ilmentymisen.
Edullisimmin HDEL-retentiosignaali yhdistetään S. cerevisiae KEX2p:hen tai edullisesti sen liukoiseen va- 20 rianttiin, erityisesti KEX2ps:ään. Mainittu KEX2pHDEL-pro-teiini, joka on tuotettu K. lactis - tai edullisesti £L_ V. cerevisiae -isäntäsolussa. sallii oikeinlaskostuneen. eri- * i * "" ' ' • 4 ;·, tetyn heterologisen proteiinin suuremman osuuden ilmenty- i « misen.
• 4 4
( I I
25 Jotta voitaisiin tuottaa isäntäsolu, jossa "ER:ssä ( i « !·· j sijaitseva, kaksiemäksinen, muokkaava endoproteaasi" tuo- tetaan, isäntäsolu täytyy transformoida ekspressiokasetil- l.’ ' la, joka koodaa "ER:ssä sijaitsevaa, kaksiemäksistä, muok kaavaa endoproteaasia". Isäntäsolu, joka transformoidaan, | **.* 30 saattaa vielä sisältää intaktin endogeenisen geenin endo- geenistä, kaksiemäksistä, muokkaavaa endoproteaasia varten kromosomissa, toisin sanoen S. cerevisiae -järjestelmän ta- f 4 » ,*'! pauksessa KEX2pHDEL: llä transformoitava isäntäsolu voi olla i ''l*' KEX2+-solu, esim. kanta AB110. Kuitenkin vastaavaa endo- f 35 geenistä, kaksiemäksistä, muokkaavaa endoproteaasia koodaa-: '.i va geeni voidaan myös tuhota, toisin sanoen S. cerevisiae - 7 105482 järjestelmän tapauksessa isäntäsolu voi olla kex2~-solu. esim. kanta AB110 kex2".
Isäntäsolun transformoimiseen käytetään hybridivek-toreita, jotka huolehtivat "ER:ssä sijaitsevaa, kak-5 siemäksistä, muokkaavaa endoproteaasia" koodaavan eks-pressiokasetin replikaatiosta ja ekspressiosta. Nämä hyb-ridivektorit voivat olla ekstrakromosomaalisesti ylläpidettyjä vektoreita tai myös vektoreita, jotka integroidaan isäntägenomiin niin, että tuotetaan solu, joka on pysyvästi 10 transformoitu mainitulla ekspressiokasetilla. Sopivat, ekstrakromosomaalisesti ylläpidettävät vektorit ja myös vektorit, jotka integroivat nisäkässolujen tai hiivasolujen transformaation isäntägenomiin, tunnetaan hyvin alalla.
Hybridivektoreita voidaan saada mistä tahansa vekto-15 rista, joka on käyttökelpoinen geenitekniikan alalla, kuten viruksista, plasmideista tai kromosomaalisesta DNArsta, kuten SV40-johdannaista, Herpes-viruksista, papilloomavi-ruksista, retroviruksista, baculoviruksista tai hiivaplas-midien johdannaisista, esim. hiivan 2M~plasmidista.
20 Keksinnön mukaisen kloonatun DNA:n integraatiota ja ekspressiota varten on käytettävissä monia mahdollisia *.·. vektorijärjestelmiä. Periaatteessa kaikki vektorit, jotka ;·, replikoituvat ja/tai ilmentävät haluttua polypeptidi- geeniä, joka sisältyy keksinnön mukaiseen ekspressiokaset- • · ♦ 25 tiin valitussa isännässä, ovat sopivia. Vektori valitaan • « · ;·· j riippuen isäntäsoluista, joihin transformaatio kohdiste- • · · '· “ taan. Mainitut isäntäsolut ovat edullisesti nisäkässoluja • · · ·.* · (jos käytetään "kaksiemäksistä, muokkaavaa endoproteaasia, joka on toiminnallinen nisäkässoluissa) tai edullisemmin 30 hiivasoluja (jos käytetään "kaksiemäksistä, muokkaavaa endoproteaasia”, joka on toiminnallinen hiivasoluissa). *. Periaatteessa ekstrakromosomaalisesti ylläpidettävät, *;j; keksinnön mukaiset hybridivektorit käsittävät ekspres- • · ’”·* siokasetin ER:ssä sijaitsevan ’’kaksiemäksisen, muokkaavan •j* 35 endoproteaasin" ekspressiota varten ja replikaation alun tai autonomisesti replikoituvan sekvenssin.
* · 8 105482
Replikaation alku tai autonomisesti replikoituva sekvenssi (DNA-elementti, joka vertaa autonomisesti rep-likoituvia ominaisuuksia ekstrakromosomaalisiin elementteihin) annetaan käyttöön joko konstruoimalla vektori 5 sisältämään sellaisen eksogeenisen aloituskohdan, joka, nisäkäsvektorin tapauksessa, on saatu Simian-viruksesta (SV 40) tai muusta viruslähteestä, tai isäntäsolun kromosomaa-lisilla mekanismeilla.
Keksinnön mukainen hybridivektori saattaa sisältää 10 valikoivia markkereita riippuen transformoitavasta, valikoitavasta ja kloonattavasta isännästä. Mitä tahansa sellaista markkerigeeniä voidaan käyttää, joka helpottaa transformanttien valintaa markkerin fenotyyppisen ekspression ansiosta. Sopivia markkereita ovat erityisesti ne, 15 jotka ilmentävät antibioottista resistenssiä, esim. tetrasykliiniä tai ampisilliinia vastaan, tai geenit, jotka korjaavat isännän vikoja. Markkereina on mahdollista käyttää myös rakennegeenejä, joihin on liittynyt autonomisesti replikoituva segmentti, edellyttäen, että transformoi-20 tava isäntä on auksotrofinen markkerin ilmentämälle tuotteelle.
·.·. Edullisia, keksinnön mukaisten hybridivektorien val- ;·/ mistamiseksi sopivia vektoreita, toisin sanoen sellaisia • · · jotka käsittävät ekspressiokasetin ER:ssä sijaitsevan 25 "kaksiemäksisen, muokkaavan endoproteaasin" valmistamista ·;· j varten, ovat ne, jotka ovat sopivia replikaatioon ja eks- • · · ’· " pressioon S. cerevisiaessa ja sisältävät hiivan replikaati- • * * V · on aloituskohdan ja selektiivisen geneettisen markkerin hiivalle. Hybridivektorit, jotka sisältävät hiivan repli-: · : 30 kaation aloituskohdan, esim. kromosomaalisen, autonomisesti replikoituvan segmentin (ARS) , pysyy ekstrakromosomaali- • tsesti hiivasolun sisässä transformaation jälkeen ja repli- ;;; koituu autonomisesti mitoosin aikana. Myös hybridivektorei- • · ’·;·* ta, jotka sisältävät hiivan 2μ-ρΐ33ΐηΐ0ί-0ΝΑ: lie homologisia ;:· 35 sekvenssejä tai jotka sisältävät ARS:n ja kromosomaalisen sentromeerin sekvenssin, esim. CEN4:n, voidaan käyttää.
Edullisia ovat 2^-pohjaiset plasmidit, jotka sisältävät • · 9 105482 kokonaisen tai osittaisen s. cerevisiae 2M-plasmidisekvens-sin. Sopivia markkerigeenejä hiivalle ovat erityisesti ne, jotka antavat antibioottisen resistenssin isännälle, tai auksotrofisten hiivamutanttien tapauksessa geenit, jotka 5 korjaavat isännän vikoja. Vastaavat geenit antavat esim. resistenssin antibioottiselle sykloheksimidille tai ylläpitävät prototrofiaa auksotrofisessa hiivamutantissa, esim. URA2L-, LEII2-, HIS3- tai TRPl-geeni.
Edullisesti hybridivektorit sisältävät lisäksi 10 replikaation alun ja markkerigeenin bakteeri-isännälle, erityisesti E. col-ille, niin, että hybridivektoreiden ja niiden prekursoreiden konstruktio ja kloonaus voidaan tehdä E. colissa.
Keksinnön mukaisessa edullisimmassa suoritusmuo-15 dossa S. cerevisiaen kex2~-kanta transformoidaan joko ekstrakromosomaalisesti ylläpidetyllä plasmidilla tai integraatioplasmidilla, joka käsittää ekspressiokasetin liukoisen KEX2pHDEL:n ekspressiota varten.
"Ekspressiokasetti" ER:ssä sijaitsevan "kaksiemäk-20 sisen, muokkaavan endoproteaasin" ekspressiota varten tarkoittaa DNA-sekvenssiä, joka pystyy ilmentämään mainitun ;\\ polypeptidin ja joka käsittää promoottorin ja rakennegeenin ja, jos halutaan, transkriptionaalisen terminaattorin ja * · · mahdollisesti transkriptionaalisen enhanserin, ribosomaali- • · « 25 sen sitoutumispaikan ja/tai muita säätelysekvenssejä.
“· j Mainittu ekspressiokasetti saattaa sisältää joko • · · ' ” säätelyelementtejä, jotka ovat luonnollisesti sitoutuneet
• •I
*.* · vastaavaan "kaksiemäksinen, muokkaava endoproteaasi" -geeniin, heterologisia säätelyelementtejä tai molempien ! *: 30 yhdistelmän, toisin sanoen esim. homologisen promoottori- ja heterologisen terminaattorialueen.
• · · .*. Monia erilaisia promoottorisekvenssejä voidaan · · käyttää isäntäsolun luonteesta riippuen. Translaation aloi- • a tussekvenssit ovat esim. Shine-Dalgarno-sekvenssejä. : 35 Transkription aloitusta ja lopetusta sekä mRNA:n stabi- *:**: isointia varten välttämättömät sekvenssit saadaan yleen- 10 105482 sä viruksen tai eukaryoottisen cDNA:n ei-koodaavista 5'-alueista ja 3'-alueista, tässä järjestyksessä, esim. eks-pressioisännästä.
Esimerkit promoottoreista ovat kuten yllä, toisin 5 sanoen hiivan TRP1-, ADHI-, ADHII-, CYC1-, GAL1/10-, CUP1-, PH03- tai PH05-promoottori, tai promoottorit lämpöshokkiproteiineista tai glykolyyttiset promoottorit, kuten glyse-raldehydi-3-fosfaattidehydrogenaasi(GAP)promoottori(sisältäen 5'-typistetyn GAP:n) tai enolaasi-, 3-fosfoglyseraat-10 tikinaasi(PGK)-, heksokinaasi-, pyruvaattidekarboksylaasi-
, fosfofruktokinaasi-, glukoosi-6-fosfaatti-isomeraasi-, 3-fosfoglyseraattimutaasi, pyruvaattikinaasi-, triosefosfaat-ti-isomeraasi-, fosfoglukoosi-isomeraasi- ja gluko-kinaasigeenien promoottori, lisäksi α-tekijäpromoottori ja 15 hybridipromoottorit, kuten hybridien PH05-GAP tai ADH2-GAP
promoottorit tai hybridipromoottorit, jotka käyttävät lämpöshokkielementtejä.
Promoottorit, jotka ovat sopivia ekspressioon nisä-kässoluissa, on esimerkiksi saatu viruksista, kuten 20 SV40:stä, Rous sarcoma -viruksesta, adenovirus 2:sta, naudan papilloomaviruksesta, papovaviruksesta, sytomega-·.·. loviruksesta saadut promoottorit, tai ne on saatu nisä- kässoluista, kuten aktiini-, kollageeni-, myosiini- tai β- • · · ^ globiinigeenien promoottorit. Hiivan promoottorit voidaan • I f 25 yhdistää enhanserisekvenssien kanssa, kuten hiivan ylävir- • « « *';· ; rassa olevien aktivoivien sekvenssien (UAS) kanssa, ja • · * *· " nisäkässoluissa aktiiviset promoottorit voidaan yhdistää • · · *.* * virusenhansereiden tai sellulaaristen enhansereiden kanssa, kuten sytomegalovirus IE -enhansereiden, SV40-enhanserin, • · · • 30 immunoglobuliinigeenienhanserin tai muiden kanssa.
:T: Enhanserit ovat transkriptiota stimuloivia DNA-sek- p venssejä, jotka on saatu esim. viruksista, kuten Simian- « · · viruksesta, polyoomaviruksesta, naudan papilloomavirukses-ta tai Moloney sarcoma -viruksesta, tai genomilähteestä. 35 Enhanserisekvenssi voidaan saada myös Physarum polvcephalu-min ekstrakromosomaalisesta, ribosomaalisesta DNA:sta tai se voi olla hiivan hapanfosfataasi-PH05-geenin ylävirran • · ,, 105482 aktivaatiopaikka tai hiivan PH05, TRP, PH05-GAPDH-hybridi tai vastaava promoottori.
Keksinnön mukainen isäntäsolu, jolla on "kaksiemäk-sinen, muokkaava endoproteaasi" -aktiivisuus ER:ssä, on 5 käyttökelpoinen oikein muokattujen, heterologisten proteiinien valmistamiseksi. Tätä tarkoitusta varten ekspres-siokasetti haluttua heterologista proteiinia koodaavan geenin ilmentämiseksi täytyy tietenkin myös viedä isän-täsoluun. Mainittua ekspressiokasettia kutsutaan tässä 10 "tuotantogeeniksi".
Mainittu tuotantogeeni käsittää promoottorialueen, signaalipeptidiä koodaavan DNA-sekvenssin, joka voidaan pilkkoa pois signaalipeptidaasilla, pro-sekvenssiä koodaavan DNA-sekvenssin, joka voidaan pilkkoa pois halutus-15 ta heterologisesta geenituotteesta "kaksiemäksisellä, muokkaavalla endoproteaasilla", haluttua heterologista geenituotetta koodaavan DNA-sekvenssin, ja/tai transkription terminaattorialueen ja mahdollisesti transkription enhanserin, ribosomaalisen sitoutumispaikan ja/tai muita 20 säätelysekvenssejä. Signaalipeptidiä koodaavat alueet, pro- sekvenssi ja heterologinen proteiini ovat kiinni "raken-V. teessä", toisin sanoen signaalipeptidi liittyy rakennegee-
• * I
;!,* nin translaation jälkeen kovalenttisesti pro-sekvenssin N- päähän ja viimeksi mainittu liittyy geenin translaation « * « 25 jälkeen kovalenttisesti heterologisen proteiinin N-päähän.
< I i · Pro-sekvenssi voi olla mikä tahansa sekvenssi satun- • · • * · " naisesta fragmenttien genomikokoelmasta, joka voi toimia ··» V · molekulaarisena kaitsijana, toisin sanoen polypeptidi, joka cis- tai trans-tilassa voi vaikuttaa sopivan rakenteen :*·*: 3 0 muodostumiseen. Edullisesti se on satunnainen sekvenssi, joka sallii membraanin translokaation. Erityisen edullinen *. on α-tekijän pro-sekvenssi.
« · ·
Kuten yllä kuvatussa ekspressiokasetissa "kaksiemäk- « · '···' sisen, muokkaavan endoproteaasin" ekspressiota varten, ·:· 35 monia erilaisia säätelysekvenssejä voidaan käyttää isän- täsolun luonteesta riippuen. Esimerkiksi promoottorit, jotka ovat vahvoja ja samalla hyvin säädeltyjä, ovat • · 12 105482 käyttökelpoisimpia. Translaation aloitussekvenssit ovat esim. Shine-Dalgarno-sekvenssejä. Transkription aloitusta ja lopetusta sekä mRNA:n stabilisointia varten välttämättömät sekvenssit saadaan yleensä viruksen tai eukaryoot-5 tisen cDNA:n ei-koodaavista 5'-alueista ja 3'-alueista, tässä järjestyksessä, esim. ekspressioisännästä.
Tämän keksinnön mukaisessa merkityksessä signaali-peptidit ovat presekvenssejä, jotka ohjaavat halutun po-lypeptidin translokaation ER:ään, esim. α-tekijän signaali) lisekvenssi. Muita signaalisekvenssejä tunnetaan kirjallisuudesta, esim. ne, jotka on koottu viitteeseen von Heijne, G., Nucleic Acids Res. 14., 4683 (1986).
Esimerkit sopivista promoottoreista ovat kuten yllä, toisin sanoen hiivan TRP1-, ADHI-, ADHII-, CYC1-, GALl/lois , CUPl-, PH03- tai PH05-promoottori, tai promoottorit lämpöshokkiproteiineista tai glykolyyttiset promoottorit, kutenglyseraldehydi-3-fosfaattidehydrogenaasi (GAP) promoottori (sisältäen 5'-typistetyn GAP:n) tai enolaasi-, 3-fosfoglyseraattikinaasi (PGK)-, heksokinaasi-, pyruvaattide-20 karboksylaasi-, fosfofruktokinaasi-, glukoosi-6-fosfaatti-isomeraasi-, 3-fosfoglyseraattimutaasi-, pyruvaattikinaasi-, triosefosfaatti-isomeraasi-, fosfoglukoosi-isomeraasi- ja
* i I
glukokinaasigeenien promoottori, lisäksi a-tekijäpromootto- • < « ri ja hybridipromoottorit, kuten hybridien PH05-GAP tai
i f I
2 5 ADH2-GAP promoottorit tai hybridipromoottorit, jotka käyt-
< « I
tävät lämpöshokkielementtejä, tai promoottorit, jotka on • · 9 ’· *: saatu eukaryoottisista viruksista, kuten SV40:stä, Rous • · · * sarcoma -viruksesta, adenovirus 2:sta, naudan papilloomavi- ruksesta, papovaviruksesta, sytomegaloviruksesta saadut 30 promoottorit, tai nisäkässoluista saadut promoottorit, • · ·*·’; kuten aktiini-, kollageeni-, myosiini- tai j3-globiinigee- *. nien promoottorit. Eukaryoottiset promoottorit voidaan « · · yhdistää lisäävien sekvenssien kanssa, kuten hiivan ylävir- • ♦ *·;·’ ran aktivoivien sekvenssien (UAS) kanssa, vi- ·· 35 rusenhansereiden tai sellulaaristen enhansereiden kanssa, f · · · ;\j kuten sytomegalovirus IE -enhansereiden, SV40-enhanserin, • « immunoglobuliinigeenienhanserin tai muiden kanssa.
13 105482 ERrssä sijaitsevaa "kaksiemäksistä, muokkaavaa endo-proteaasia" koodaava ekspressiokasetti ja tuotantogeeni voivat käsittää samantyyppiset tai erityyppiset promoottorit. Esimerkiksi molempia voi säädellä indusoitavissa 5 oleva promoottori, joka sallii heterologisen proteiinin prekursorin ja sitä muokkaavan, ER:ssä sijaitsevan "kak-siemäksisen, muokkaavan endoproteaasin" yhteisen ekspression. —
Edullisessa keksinnön mukaisessa suoritusmuodossa 10 tuotantogeeni, joka on sopiva ekspressioon S. cerevisiae - solussa, joka solu sisältää ER:ssä sijaitsevan "kaksiemäk-sisen, muokkaavan endoproteaasin", edullisesti YAP3pH-DEL:n, edullisemmin KEX2pHDEL:n tai edullisimmin KEX2psH-DEL:n, käsittää rakennefuusiogeenin, joka koostuu hiivan 15 pro-sekvenssiä koodaavasta DNA-sekvenssistä, joka voidaan pilkkoa pois prekursorista hiivan "kaksiemäksisellä, muok-kaavalla endoproteaasilla", edullisesti S. cerevisiae a-tekijän johtosekvenssistä ja alavirran DNA-sekvenssistä, joka koodaa haluttua heterologista proteiinia, kun mainittu 20 fuusiogeeni on ekspression kontrollisekvenssien hallin nassa, jotka sekvenssit säätelevät transkriptiota ja translaatiota hiivassa.
« > < ··/ Heterologinen proteiini voi olla mikä tahansa biolo-
' H
gisesti mielenkiintoinen proteiini ja prokaryoottista tai
r I I
» I I
25 varsinkin eukaryoottista, erityisesti korkeampaa eukary- (tl - - | oottista, kuten nisäkäs- (mukaalukien eläimen ja ihmisen), • · · '· " alkuperää ja se on esimerkiksi entsyymi, jota voidaan • 4 · _____________ V * käyttää esimerkiksi ravintoaineiden tuottamiseen ja ent- symaattisten reaktioiden suorittamiseksi kemiassa tai :*·'*. 30 molekyylibiologiassa, tai proteiini, joka on käyttökel- poinen ja arvokas ihmis- ja eläinsairauksien hoitamisessa * tai niiden torjumisessa, esimerkiksi hormoni, polypeptidi, jolla on immunomodulatorisia, viruksia ja kasvaimia vastus- • · tavia ominaisuuksia, vasta-aine, virusantigeeni, veren 35 hyytymistekijä, fibrinolyyttinen aine, kasvua säätävä tekijä, lisäksi ruoka-aine ja vastaava.
• » 105482 14
Esimerkkejä mainituista proteiineista ovat hormonit, kuten sekretiini, tymosiini, relaksiini, kalsitoniini, luteinisoiva hormoni, lisäkilpirauhashormoni, adrenokor-tikotropiini, melanosyyttejä stimuloiva hormoni, β-lipo-5 tropiini, urogastroni, insuliini, kasvutekijät, kuten epi-dermaalinen kasvutekijä (EGF), insuliinin kaltainen kasvutekijä (IGF), esim. IGF-1 ja IGF-2, syöttösolun kasvutekijä, hermon kasvutekijä, gliasta saatu hermosolun kasvutekijä, verihiutalekasvutekijä (PDGF) tai transformoiva 10 kasvutekijä (TGF), kuten TGFB, kasvuhormonit, kuten ihmisen ja naudan kasvuhormonit, interleukiini, kuten inter-leukiini-l tai -2, ihmisen makrofaagi-migraatio-inhibiit-toritekijä (MIF), interferonit, kuten ihmisen a-interfe-roni, esim. interferoni-αΑ, aB, aD tai aF, 0-interferoni, 15 7-interferoni tai hybridi-interferoni, esim. αΑ-αϋ- tai aB- aD-hybridi-interferoni, varsinkin hybridi-interferoni BDBB, proteinaasi-inhibiittorit, kuten α^-antitrypsiini, SLPI ja vastaavat, hepatiittivirusantigeenit, kuten hepatiitti B -virus pinta- tai ydinantigeeni tai hepatiitti A -virusanti-20 geeni tai hepatiitti eiA-eiB -antigeeni, plasminogeeniakti-vaattorit, kuten kudosplasminogeeniaktivaattori tai uro-kinaasi, hybridiplasminogeeniaktivaattorit, kuten K2tuPA, :·. punkin antikoagulanttipeptidi (TAP) , kasvainkuolioteki jä, « , ,·, somatostatiini, reniini, immunoglobuliinit, kuten immunog-
« I I
25 lobuliinien D, E tai G kevyet tai painavat ketjut tai ihmi- • € « I - nen-hiiri-hybridi-immunoglobuliinit, immunoglobuliinin 5 *«' sitomistekijät, kuten immunoglobuliini E -sitomistekijä, • # · ** ‘ ihmisen kalsitoniinin kaltainen peptidi, veren hyytymis tekijät, kuten tekijä IX tai Ville, verihiutaletekijä 4, • * * : V 30 erytropoietiini, egliini, kuten egliini C, desulfatohiru-• · · s diini, kuten desulfatohirudiinivariantti HV1, HV2 tai PA, , .*. kortikostatiini, ekistatiini, kystatiinit, ihmisen supe- • * · roksididismutaasi, virustymidiinikinaasi, /?-laktamaasi tai • « glukoosi-isomeraasi. Edullisia ovat ihmisen α-interferoni, t 35 esim. interferoni aB tai hybridi-interferoni, erityisesti hybridi-interferoni BDBB (katso EP 205,404), ihmisen kudosplasminogeeniaktivaattori (t-PA), ihmisen yksiketjuinen, 15 105482 urokinaasityyppinen plasminogeeniaktivaattori (scu-PA), hybridiplasminogeeniaktivaattori K2tuPA (katso EP 277,313), ihmisen kalsitoniini, desulfatohirudiini, esim. variantti HVl, jopa vielä edullisemmat insuliinin kaltaiset prote-5 iinit, kuten insuliini, relaksiini, jopa vielä edullisempi insuliinin kaltainen kasvutekijä II ja erityisesti insuliinin kaltainen kasvutekijä I. Proteiinit, jotka sisältävät emäksisen aminohappoparin, kuten Arg-Arg, Lys-Arg, Lys-Lys ja Arg-Lys, asettuneena proteiinin pinnalle ja 10 siten vastaanottavaisena proteolyyttiselle pilkkomiselle, eivät sovellu keksinnön mukaiseen menetelmään ja ne täytyy muuttaa niin, että toinen peräkkäisistä emäksisistä aminohapoista korvataan toisella, ei-emäksisellä aminohapolla ilman, että vaikutetaan biologiseen aktiivisuuteen. 15 Tuotantogeenin ei välttämättä tarvitse sijaita sa massa vektorimolekyylissä kuin ERrssä sijaitsevaa "kak-siemäksistä, muokkaavaa endoproteaasia" koodaava geeni. Siinä tapauksessa, että viimeksi mainittu sijaitsee vektorissa, jota pidetään yllä ekstrakromosomaalisesti, 20 saattaa olla hyödyllistä, jos tuotantogeeni sijaitsee samassa vektorimolekyylissä.
,Y: Tuotantogeenin ekspressioon sopivia ekspressiovekto- « · reita ovat esim. myös ne, jotka on edellä kuvattu sopi-. viksi ER:ssä sijaitsevan "kaksiemäksisen, muokkaavan en- f · i 25 doproteaasin" ekspressioon, toisin sanoen vektorit, jotka *Γ 1 on saatu mistä tahansa geneettisen insinööritaidon alalla * tl käyttökelpoisesta vektorista, kuten viruksista, plasmi- » t · *·* * deista tai kromosomaalisesta DNA:sta, kuten SV40:n, Her pes-virusten, papilloomavirusten, retrovirusten, baculo- * * * : *.· 30 viruksen johdannaisista tai hiivaplasmidien johdannaisista, • * * V · esim. hiivan 2M-plasmidista. Edullisia ovat vektorit rep- . .·, likaatiota ja ekspressiota varten S. cerevisiaessa.
« t i y<' Edullisesti tämän keksinnön mukaiset hybridivektorit « < sisältävät myös replikaation alun ja markkerigeenin bak-35 teeri-isäntää varten, varsinkin E. colia. niin, että hyb-*·/<; ridivektoreiden ja niiden prekursoreiden konstruktio ja kloonaus voidaan suorittaa E. colissa.
ie 105482
Menetelmässä heterologisen, biologisesti aktiivisen proteiinin valmistamiseksi, joka menetelmä käsittää sellaisen isäntäsolun käytön, jolla on "kaksiemäksinen, muokkaava endoproteaasi" -aktiivisuus ER:ssä, keksinnön 5 mukaisesti (a) transformoidaan sopiva isäntäsolu hybridi-vektorilla, joka käsittää ER:ssä sijaitsevaa "kaksiemäk-sistä, muokkaavaa endoproteaasia" koodaavan ekspressio-kasetin, ja tuotantogeeniä koodaavalla hybridivektorilla tai (b) transformoidaan sopiva isäntäsolu hybridivektoril-10 la, joka käsittää sekä ER:ssä sijaitsevaa "kaksiemäksistä, muokkaavaa endoproteaasia” koodaavan ekspressiokasetin että tuotantogeenin tai (c) transformoidaan sopiva isäntäsolu, joka on pysyvästi transformoitu ER:ssä sijaitsevaa "kaksiemäksistä, muokkaavaa endoproteaasia” koodaavalla geenil-15 lä, tuotantogeeniä koodaavalla hybridivektorilla, viljellään transformoituja isäntäsoluja olosuhteissa, joissa ER:ssä sijaitsevaa "kaksiemäksistä, muokkaavaa endoproteaasia" koodaava geeni ja tuotantogeeni ilmentyvät, ja eristetään haluttu heterologinen polypeptidi kasvatusalustasta 20 tavanomaisten menetelmien mukaan.
Keksintö koskee ensisijaisesti menetelmää, jossa hiivakantaa, edullisemmin Saccharomvces cerevisiae -kanta, ··, esim. AB110 tai AB110 kex2”, ER:ssä sijaitsevaa hiivan < » » i«i "kaksiemäksistä, muokkaavaa endoproteaasia", esim. YAP3D- 25 DEL tai edullisesti YAP3HDEL tai edullisemmin KEX2pHDEL, '1' ^ edullisimmin KEX2p HDEL, käytetään insuliinin kaltaisen « * · 8 • ·· » I » » *t.· proteiinin, edullisesti IGF-2:n ^a edullisemmin IGF-l:n, J · · ·* * valmistamiseen, joka proteiini tuotetaan prekursorina, joka sisältää α-tekijän johtosekvenssin.
9« « : V 30 Transformaatio suoritetaan menetelmillä, jotka tun- 9 9 a V ! netaan alalla, esim. Hinnen et al.:n [Proc. Natl. Acad.
. ]·, Sei. USA 75, 1919 (1978)] kuvaaman menetelmän mukaisesti.
a « « Tämä menetelmä voidaan jakaa kolmeen vaiheeseen: 9 « 4 * * 9 * 35 (1) Poistetaan hiivasolun soluseinä tai sen osat.
a · * « · 9 9 9 • 9 17 105482 (2) Käsitellään "alastomat" hiivasolut (sferoplastit) ekspressiovektorilla PEG:n (polyetyleeniglykoli) ja Ca2+-ionien läsnäollessa.
(3) Regeneroidaan soluseinä ja valikoidaan transformoidut 5 solut kiinteällä agarpinnalla.
Transformoituja isäntäsoluja viljellään menetelmillä, jotka tunnetaan alalla, nestealustassa, joka sisältää hiilen, typen ja epäorgaanisten suolojen assimiloituvat 10 lähteet. Erilaisia hiilen lähteitä voidaan käyttää transformoitujen hiivasolujen viljelmään keksinnön mukaisesti. Esimerkkejä edullisista hiilen lähteistä ovat assimiloituvat hiilihydraatit, kuten glukoosi, maltoosi, mannitoli tai laktoosi, tai asetaatti, jota voidaan käyttää joko 15 yksinään tai sopivina seoksina. Esimerkkejä sopivista typ-pilähteistä ovat aminohapot, kuten casaminohapot, peptidit ja proteiinit ja niiden hajoamistuotteet, kuten tryptoni, peptoni tai lihauutteet, hiivauutteet, mallasuute ja myös ammoniumsuolat, esimerkiksi ammoniumkloridi, -sulfaatti tai 20 -nitraatti, joita voidaan käyttää joko yksistään tai sopivina seoksina. Epäorgaanisia suoloja, joita voidaan myös ,V; käyttää, ovat esimerkiksi natriumin, kaliumin, magnesiumin i < ja kalsiumin sulfaatit, kloridit, fosfaatit ja karbonaatit. Kasvatusalusta sisältää lisäksi esimerkiksi kasvua edistä- • i i 25 viä aineita, kuten hivenaineita, esimerkiksi rautaa, sink- i i T , kiä, mangaania ja vastaavia, ja edullisesti aineita, jotka X* panevat liikkeelle valintapaineen ja estävät sellaisten * · · '·’ ‘ solujen kasvua, jotka ovat menettäneet ekspressioplasmidin.
Siten esimerkiksi, jos hiivakantaa, joka on auksotrofinen ·« · ; V 3 0 esimerkiksi yhdessä perusaminohapossa, käytetään isäntämik- fli ΐ,ί ί ro-organismina, plasmidi sisältää edullisesti geenin, joka , X koodaa isännän puutteen täydentävää entsyymiä. Hiivakantaa • « I ___ 7 viljellään minimialustassa, josta puuttuu mainittu aminohappo.
i r. ] ' 35 Viljelyyn vaikuttavat prosessit, jotka tunnetaan *./.! alalla. Viljelyolosuhteet, kuten lämpötila, alustan pH- arvo ja fermentaatioaika, valitaan niin, että keksinnön 105482 18 mukaisesti valmistettujen heterologisten proteiinien maksimimäärä saavutetaan. Siten hiivakantaa viljellään edullisesti aerobisissa olosuhteissa uppoviljelmässä ravistaen tai sekoittaen lämpötilassa noin 20 - 40 °C, edulli-5 sesti noin 30 °C, ja pH-arvossa 5 - 8, edullisesti pH-arvossa 7, noin 4 - noin 96 tuntia, edullisesti kunnes keksinnön mukaisten proteiinien maksimisaannot saavutetaan. Kasvatusalusta valitaan niin, että saadaan aikaan valintapaine ja vain ne solut selviävät, jotka yhä sisäl-10 tävät geneettisen markkerin käsittävän hybridivektori-DNA:n. Siten esimerkiksi antibioottista ainetta lisätään kasvatusalustaan, kun hybridivektori sisältää vastaavan antibioottiresistenssigeenin.
Kun solutiheys on saavuttanut riittävän arvon, vil-15 jely keskeytetään ja tuotteen sisältävä kasvualusta erotetaan soluista, joihin voidaan lisätä tuore alusta ja käyttää jatkotuotantoon. Proteiini voi myös kerääntyä solujen sisään, varsinkin periplasmiseen tilaan. Viimeksi mainitussa tapauksessa ensimmäinen vaihe halutun proteii-20 nin talteenottamiseksi on proteiinin vapauttaminen solun sisästä. Soluseinä poistetaan ensin entsymaattisesti ha-v, jottaen glukosidaaseilla tai vaihtoehtoisesti soluseinä ;/ poistetaan käsittelemällä sitä kemikaaleilla, toisin sa noen tiolireagensseilla tai EDTA:11a, jotka lisäävät so-
< i I
« I I
25 luseinävaurioita, jolloin tuotettu proteiini vapautuu.
·;· j Saatu seos rikastetaan heterologisen proteiinin suhteen • · · *· ” tavanomaisilla menetelmillä, kuten poistamalla suurin osa • »t V · ei-proteiinimateriaalista käsittelemällä polyetyleeni- imiinillä, saostamalla proteiinit käyttäen ammoniumsul-:·’: 30 faattia, geelielektroforeesilla, dialyysillä, kromatogra- fialla, esimerkiksi ioninvaihtokromatografiällä (erityisen edullinen silloin, kun heterologiset proteiinit sisältävät • t · paljon happamia tai emäksisiä aminohappoja), koko-
< I
'•l'' ekskluusiokromatograf iällä, HPLC:llä tai käänteisfaasi- 35 HPLC:llä, molekyylilajittelulla sopivassa Sephadex®-pyl- väässä tai vastaavalla. Esipuhdistetun tuotteen lopullinen • · puhdistus tehdään esimerkiksi af f initeettikromatograf iällä, 19 105482 esimerkiksi vasta-aineaf f initeett ikromatogr af iällä, varsinkin monoklonaalisen vasta-aineen affiniteettikromatogra-fialla, jossa käytetään alalla tunnetuilla menetelmillä liukenemattomaan matriisiin sidottuja vasta-aineita.
5
Rekombinantti-DNA-molekvvlit
Keksintö koskee myös rekombinantti-DNA-molekyyliä, joka koodaa ekspressiokasettia ER:ssä sijaitsevaa "kak-siemäksistä, muokkaavaa endoproteaasia" varten, kuten 10 edellä on kuvattu. Keksintö koskee lisäksi hybridivekto-reita, jotka käsittävät mainitun rekombinantti-DNA-mole-kyylin.
Tämä keksintö koskee edullisesti rekombinantti-DNA-molekyyliä tai hybridivektoria, joka käsittää koodausalu-15 een KEX2p:lle, edullisesti liukoiselle KEX2p-variantille, edullisimmin KEX2ps:lle, joka on esitetty sekvenssiluettelossa sekvenssin nro 1 alla, ja ER-retentiosignaalille, edullisesti HDEL-sekvenssille, joka on esitetty sekvens-siluettelossa sekvenssin nro 2 alla. ER-retentiosignaalia 20 koodaava sekvenssi sijaitsee edullisesti alavirran suuntaan KEX2p-koodausalueesta. KEX2p, kun HDEL on liittynee-nä c-päähän, on tässä nimeltään KEX2pHDEL, vastaava ra-kennegeeni on KEX2HDEL.
• «I
Kuten edellä on mainittu, joitakin liukoisia KEX2p-25 variantteja tunnetaan kirjallisuudesta. Lisäksi keksinnön | mukaisia deleetiomutantteja voidaan valmistaa käyttäen • · * ' " alalla tunnettuja menetelmiä, esimerkiksi valmistamalla • · · V ' vastaava, mainittua mutanttia koodaava DNA, liittämällä se sopivaan vektori-DNA:hän ekspressiokontrollisekvenssin hai-
M I
• *ti 30 linnassa, transformoimalla sopivat isäntämikro-organismit muodostetulla ekspressiovektorilla, viljelemällä trans- . formoitua isäntämikro-organismia sopivassa kasvatusalus- • · · tässä ja eristämällä tuotettu mutantti. DNA, joka koodaa • « mitä tahansa mainittua mutanttia, voidaan valmistaa esi->t[r 35 merkiksi ottamalla plasmidi, joka sisältää KEX2p:tä koo-daavan DNA:n, ja (1) hajottamalla se restriktioentsyymil- • « lä, joka pilkkoo membraanin sitoutumiskohtaa koodaavan DNA- 20 105482 alueen sisällä tai 3':n (esim. EcoRI, BstXI tai Narl), hajottamalla pilkottu DNA sopivalla endonukleaasilla, esimerkiksi Bal31:llä, niin, että mainittu DNA-alue poistetaan, ja tekemällä linearisoidusta plasmidista uudelleen 5 rengas tasapäisten DNA-molekyylien ligaatiolla tai vastaavalla tai (2) valitsemalla tai luomalla (esim. paikkasuun-natulla mutageneesillä) yksi restriktiopaikka 5' ja yksi restriktiopaikka 3' membraanin sitoutumispaikkaa koodaavaan DNA-alueeseen (esim. PvuII ja Narl tai EcoRI; 3'-restrik-10 tiopaikka voi sijaita myös plasmidi-DNA:ssa KEX2-geenin translaation lopetussignaalin vieressä), hajottamalla plasmidi kahdella restriktioentsyymillä, jotka tunnistavat mainitut restriktiopaikat, ja muodostamalla linearisoidusta plasmidista uudelleen rengas tasapäisten DNA-molekyylien 15 ligaatiolla tai vastaavalla tai (3) poistamalla membraanin sitoutumiskohtaa koodaava DNA-alue käyttäen "lcop-out"-mutageneesiä tai (4) poistamalla kokonaan C-pää hajottamalla PvuII:11a KEX2:n tapauksessa ja muodostamalla linearisoidusta plasmidista uudelleen rengas tasapäisten DNA-20 molekyylien ligaatiolla tai vastaavalla. Kun KEX2:n DNA-sekvenssit tunnetaan (K. Mizumo et ai. edellä), sopiva . . mutageeninen oligonukleotidi voidaan helposti suunnitella • · ja sitä voidaan helposti käyttää mainitun DNA-alueen pois- • · : " tamiseksi, joka alue käyttää M13-kloonausjärjestelmää.
• · · 25 Siitä pitää huolehtia, että mutaation läpikäyneet KEX2- • · :.·: geenit liittyvät hiivan ER-retentiosignaalia koodaavaan • · :,*·· DNA-sekvenssiin. Mainittu DNA-sekvenssi voidaan viedä haluttuun paikkaan synteettisen linkkeri-DNA:n kautta tai se voidaan saada viereisestä vektori-DNA:sta. Edullisesti :·.*. 30 mutaation läpikäyneet KEX2-geenit sisältävät 3' -päässään • « kodonit, jotka koodaavat edellä määriteltyä HDEL-sekvens- • · · siä. Kaikki nämä menetelmät käyttävät tavanomaisia teknii-koita.
• · · Tämän keksinnön piirissä ovat myös rekombinantti-DNA- « 35 molekyylit, jotka käsittävät DNA-sekvenssit, jotka ovat * « « « : degeneroituneita sekvenssinumeroiden 1 ja 2 mukaisten DNA- • · · sekvenssien suhteen, toisin sanoen DNA-sekvensseiksi, jotka 21 105482 koodaavat samoja aminohapposekvenssejä, vaikkakin nukleotidit ovat vaihtuneet. Mainitut degeneroituneet DNA-sekvens-sit saattavat esimerkiksi sisältää restriktioentsyymin pilkkomispaikkoja.
5
Isäntäkannat Tämän keksinnön toinen näkökohta käsittää euka-ryoottiset isäntäsolut, edullisesti nisäkäs-, edullisemmin hiiva-, vielä edullisemmin K. lactis - ja edullisimmin 10 r-P-rp.vi siap -solut, jotka on transformoitu keksinnön mukaisella hybridivektorilla, joka sisältää ER:ssä sijaitsevaa "kaksiemäksistä, muokkaavaa endoproteaasia” koodaavan ekspressiokasetin. Keksintö koskee myös isäntäsoluja, jotka transformoidaan pysyvästi ER:ssä sijaitsevaa "kaksiemäk-15 sistä, muokkaavaa endoproteaasia” koodaavalla ekspres-siokasetilla, toisin sanoen jotka käsittävät mainitun re-kombinantin ekspressiokasetin integroituneena kromosomiin.
Sopivia isäntiä KEX2HDEL:ää koodaavan ekspressiokasetin integraatiota varten ovat esimerkiksi hiivan, 20 edullisesti S. cerevisiaen kex2'-mutantit. Menetelmässä transformoitujen isäntäsolujen valmistamiseksi transfor- :V; moidaan isäntäsoluja KEX2pHDEL-ekspressiokasetin sisältä- • « väliä integraatiovektorilla, kun ekspressiokasetti on minkä • ___________ ....
.tahansa olennaisen tai indusoitavissa olevan promoottorin
I l I
25 hallinnassa, edullisesti edellä määriteltyjen promoottorei- « · « | den tai KEX2-geenin promoottorin hallinnassa, ja valitaan • · · pysyvästi transformoidut solut. Stabiili integroiva trans-• · · — ' formaatio on alan tasoa ja se voidaan tehdä esimerkiksi menetelmällä, joka on raportoitu nisäkässoluille viitteessä ·· · -·-··- 30 P. L. Feigner et ai. , Proc. Natl. Acad. Sei USA 84: 7413 - 7417 (1987) tai viitteessä F. L. Graham et ai., Virology ; 52: 456 - 467 (1973) ja S. cerevisiae -soluille viitteessä .*./ R. Rothstein, Methods Enzymol. 194: 281 - 302 (1991) .
• · ”· Keksintö koskee erityisesti rekombinantti-DNA-mole- 35 kyylejä, hybridivektoreita, transformoituja isäntiä, pro-"·*: teiineja ja menetelmiä niiden valmistamiseksi ja menetelmää 105482 22 biologisesti aktiivisen proteiinin valmistamiseksi, kuten on kuvattu esimerkeissä.
Seuraavat esimerkit valaisevat keksintöä, mutta niitä ei pidä tulkita sitä rajoittavaksi.
5
Esimerkki 1: Liukoista KEX2p-varlanttia koodaavan. lyhennetyn KEX2-geenin konstruktio
Tarkoituksena saada liukoisen KEX2p-proteaasin aktiivisuus konstruoitiin mutantti KEX2-geeni, jolta puuttuu 10 600 emäsparia, jotka koodaavat C-pään 200 aminohappoa.
Typistetty geeni on KEX2-promoottorin hallinnassa, joka promoottori ylettyy -l:stä -502reen. Translaatio lopetetaan lopetuskodoniin (TAA), joka on lähtöisin pUC18-polylinkke-ristä.
15 Yksityiskohtaisesti plasmidi pUCl9 [Boehringer Mann heim GmbH, FRG] hajotetaan täydellisesti Hindlllrlla ja 2686 emäsparin fragmentti eristetään. Päät täydennetään ja fragmentti liitetään uudelleen. Osa ligaatioseoksesta lisätään kalsiumilla käsiteltyihin, transformaatioon kykeneviin 20 E. coli JM101 -soluihin [Invitrogen, San Diego, USA].
Kahtatoista transformoitua, ampisilliini-resistenttiä E. coli -transformanttia kasvatetaan 100 ^g/cm3 ampisilliinin • I i .! ' läsnäollessa. Plasmidi-DNA valmistetaan ja analysoidaan f « ' hajottamalla Hindlllrlla kuin myös BamHIrllä. Plasmidi,
I ( I
25 jolta puuttuu Hindlll-paikka, nimetään pUC19woHrksi.
:.l l 3207 emäsparin Ball-Ahalll KEX2 -fragmentti (saata- • · vissa hiivan kokonaisgenomi-DNArsta) varustetaan molemmista ··· V päistä BamHI-linkkereillä ja hajotetaan täydellisesti
BamHIrllä. Plasmidi pUC19woH katkaistaan täydellisesti ·**: 30 BamHIrllä, lineaarinen 2690 emäsparin fragmentti eristetään • · ja liitetään edellä kuvattuun BamHI KEX2 -fragmenttiin. Osa ligaatioseoksesta transformoidaan E. coli JM101 -solui- • · · '···' hin. Kahtatoista transformoitua, ampisilliiniresistenttiä pesäkettä kasvatetaan ampisilliinia sisältävässä (100 ·· 35 μg/cm3) LB-alustassa, plasmidi-DNA uutetaan ja analysoidaan • « · · .’.j BamHI-hajotuksi11a. Yksi klooni, jolla on odotetut restrik- • · 23 105482 tiofragmentit, valitaan ja nimetään pKS301brksi (talletettu DSM 6028:na).
Kahden mikrometrin hiivavektori pAB24, joka vastaa olennaisesti plasmidia pDP34 (talletettu DSM 4473 ma), 5 katkaistaan täydellisesti BamHI:llä ja lineaarinen pAB24- fragmentti eristetään. Plasmidi pKS301b hajotetaan Bam- HI:llä ja fragmentti, joka sisältää kokonaisen KEX2-qeenin.
eristetään ja liitetään linearisoituun hiivavektoriin pAB24. Osa ligaatioseoksesta transformoidaan E. coli JM101- 10 :een ja 12 positiivisen kloonin plasmidi-DNA tutkitaan
BamHI-hajotuksilla. Yksi klooni, jolla on odotetut restrik- tiofragmentit, nimetään pAB226:ksi.
Plasmidi pKS301b hajotetaan täydellisesti Sphlrllä,
PvuIIrlla ja Scalrllä. 2,37 ke:n SphI-PvuII-fragmentti, 15 joka sisältää KEX2-sekvenssit -502:sta +1843 reen ja osan pUC19-polylinkkeriä, eristetään. Plasmidi pUC18 [Boehringer
Mannheim, FRG] katkaistaan täydellisesti Sphlrllä ja Smalr- llä. 2660 emäsparin SphI-Smal pUC18 -fragmentti liitetään 2,37 ke: n SphI-PvuII KEX2 -fragmenttiin SphI/Sphl- ja 20 PvuII/Smal-ligaatiolla. PvuII/Smal-ligaatio johtaa 614 aminohappoa koodaavan KEX2 ORFrn fuusioon ORFrään pUC18- v sekvensseissä, joka ORF koodaa seitsemää lisäksi tulevaa C- » « « * terminaalista aminohappoa (-G-V-P-S-S-N-S) ja jota seuraa f · ' . lopetuskodoni (TAA). Osa ligaatioseoksesta transformoidaan • · · 25 E. coli JM101:een. Plasmidi-DNA eristetään am- • · « · · : pisilliiniresistenteistä E. coli -transformanteista ja • · analysoidaan hajottamalla Sphlrllä ja EcoRIrllä kuin myös ··· V · HindIII:lla. Yksi klooni, jolla on odotettu restriktio- kaava, nimetään pl8kexp:ksi. Sekvenssiluettelossa sek-·*·*: 30 venssin nro 1 alla esitetään ORF, joka koodaa liukoista
« I
KEX2p,:ää, jolla on KEX2:sta saatu DNA.
·. Plasmidi plSkexp katkaistaan täydellisesti PvuIIrlla, • · m '*!** Sallrllä ja Scalrllä. 2552 emäsparin Sall-PvuII-fragmentti, t · * joka sisältää KEX2-sekvenssit ulottuen -502:sta +1843 reen ··· 35 kuin myös 206 emäsparia pUC18-sekvenssejä, eristetään.
• · · «
Plasmidi pDP34 hajotetaan BamHIrllä ja linearisoidun plas-midin päät täydennetään. T4-polymeraasin inaktivoinnin 24 105482 jälkeen linearisoitu, täydennetty plasmidi katkaistaan Sällillä ja 11,78 kein fragmentti eristetään. pDP34 BamHI*-Sall -fragmentti (BamHI*i täydennetty BamHI) liitetään 2552 emäsparin Sall-PvuII-fragmenttiin Sall/Sall- ja BamHl’/Pvu-5 II-ligaatiolla. Osa ligaatioseoksesta transformoidaan transformaatioon kykeneviin E. coli JM101 -soluihin. Plas-midi-DNA uutetaan ampisilliiniresistenteistä soluista ja analysoidaan restriktioanalyysillä Sällillä, Ncolillä, Smallllä, Xbalillä, EcoRIillä. Yksi klooni, jolla on odoteli) tut restriktiofragmentit, nimetään pDPkexpiksi.
Esimerkki 2i pDPkexpHDELm konstruktio
Plasmidi plSkexp (katso esimerkki 1) koostuu typistetystä KEX2-geenistä, joka koodaa liukoista KEX2pitä 15 (KEX2ps) , insertoituna pUC18in polylinkkerialueeseen. DNA-sekvenssiä, joka koodaa KEX2p,in C-terminaalista päätä pl8kexpissä, seuraa Asp718 ja EcoRI-paikka (katso sekvenssi nro 1). Plasmidi katkaistaan Asp7l8illa ja EcoRIillä ja liitetään yhteen hybridisoitujen oligonukleotidien kanssa, 20 joilla on sekvenssinumerot li ja 12 ja jotka koodaavat HDEL-sekvenssiä ja kahta lopetuskodonia, jolloin saadaan . . ligaatiotuote plSkexpHDEL. Plasmidit plSkexp ja plSkexpHDEL
t t • · · * voidaan erottaa Sacl- ja Sfull-digestiolla. Polylinkkerin « « : " insertioalue sekvensoitiin plSkexpHDEL·. ssä.
25 Plasmidi plSkexpHDEL katkaistiin Sällillä, PvuIIilla • * ;.· · ja Scalillä ja 2572 emäsparin Sall-PvuII-fragmentti eris- ;.*·· tettiin.
ί|Γ: Plasmidi pDP34 katkaistiin BamHIillä ja kohesiiviset päät täydennettiin Klenow-polymeraasilla. Täydentämisen 30 jälkeen polymeraasi tuhottiin fenoli/kloroformi- ja kloro- • « ,···, formiuutoilla, joita seurasi saostaminen etanolista. Bam- • 4 ·
Hiillä katkaistu, täydennetty pDP34-fragmentti hajotettiin sen jälkeen Sällillä ja 11 780 emäsparin Sall-BamHI* (Bam- I I ( HI*.· täydennetty BamHI-paikka) eristettiin.
35 pl8kexpHDEL: stä eristetty 2572 Sall-PvuII-f ragmentti • · f i : liitettiin 11 780 emäsparin Sall-BamHI* pDP34 -fragment- • 1 f I i 25 105482 tiin. Sall/Sall:n ja PvuII/BamHI*:n liittäminen johti plasmidiin pDPkexpHDEL.
Esimerkki 3: IGF-l-ekspressiokasetin sisältävän hiivavek-5 torin konstruktio
Plasmidi pDP34 on E. coli - S. cerevisiae -sukkula-vektori, joka sisältää kokonaisen 2/x-sekvenssin, hiivan genomin URA3- ja d LEU2 -sekvenssit valittavissa olevina markkereina hiivalle ja pBR322-sekvenssit valintaa ja 10 lisääntymistä varten E. colissa [A. Hinnen, B. Meyhack ja J. Heim, in Yeast genetic engineering (P. J. Barr, A. J. Brake ja P. Valenzuela, toim., ss. 193 - 213 (1989), But-terworth Publishers, Stoneham]. pBR322:n (Boehringer Mannheim GmbH, Saksa] 276 emäsparin Sall-BamHI-fragmentti 15 liitetään eristettyyn, lineaariseen vektoriin Sällillä ja BamHI:llä hajottamisen jälkeen. Osa ligaatioseoksesta lisätään kalsiumilla käsiteltyihin, transformaatioon kykeneviin E. coli HB101 -soluihin [Invitrogen, San Diego, USA]. Neljää transformoitua, ampisilliiniresistenttiä E. coli -20 transformanttia kasvatetaan 100 /ig/cm3 ampisilliinin läsnäollessa. Plasmidi-DNA valmistetaan ja analysoidaan hajotta-·,·, maila Sall-BamHI: llä. Yksi plasmidi, jolla on odotetut
* » I
restriktiofragmentit, nimetään pDP34A:ksi. Ihmisen insu- ' , liininkaltaisen kasvutekijän 1 (IGF-1) geeniekspressioka- /;' 25 setti, ekspressioon hiivassa, liitetään pDP34A:n BamHI- - kohtaan. Ekspressiokasetin DNA-sekvenssi, • · m » « • · t
V Bamffl BamHI
V : GAPDH oFL IGF1 aFT
5’ |-1-1-1-1 3 , v 400 bp 255 bp 216 bp 275 bp
···; 30 X
• · N _ on esitetty sekvenssin nro 5 alla. Se käsittää BamHI: llä * . ............
pilkottavan linkkerin, jota seuraa S. cerevisiaen glyser- • * « ________2'.'._____ *·|·* aldehydi-3-fosfaattidehydrogenaasi (GAPDH) -promoottorimoin 400 emäsparin fragmentti, sen jälkeen S. cerevisiaen a-·«· 35 tekijä-johtosekvenssi, joka koodaa α-tekijän prekursorin 85:ttä ensimmäistä aminohappoa (J. Kurjan et ai., Cell 30: « · 933 - 943, 1982) ja jota välittömästi seuraa kemiallisesti ,. 105482 26 syntetisoitu IGF-l-geeni [G. T. Mullenbach, A. L. Choo, M.
S. Urdea, P. J. Barr, J. P. Merryweather, A. J. Brake ja P. Valenzuela, Fed. Proc. 42, 434 (abstr.) (1983)], noin 275 emäsparin S. cerevisiae α-tekijäterminaattori (aFT; Kurian 5 et ai., Cell 30: 933 - 943, 1982) ja toinen BamHI:llä pilkottava linkkeri. Osa ligaatioseoksesta transformoidaan E. coli HB101:een. Plasmidi-DNA kuudesta riippumattomasta transformantista analysoidaan Sällillä kuin myös BamHI:llä. Yksi klooni, jolla on ekspressiokasetin promoottori suun-10 nattuna 3' Sall-BamHI-fragmenttiin, on nimeltään pDP34A/GAPDH-aFL-IGFl-aFT.
Esimerkki 4: Kahden mutatoidun a-tekiiäiohtosekvenssin konstruktio 15 1146 emäsparin BamHI-fragmentti koostuu 400 emäsparin GAPDH-promoottorista, 255 emäsparin aFL-sekvenssistä, 216 emäsparin kemiallisesti syntetisoidusta IGF-l-geenistä (IGF-l-geeni ja kaksi lopetuskodonia) ja 275 emäsparin aFTistä, jotka on irrotettu pDP34A/GAPDH-aFL-IGFl-aFT:stä 20 (katso esimerkki 3). Se liitetään BamHI-.llä hajotettuun, bakteerisyntyisellä alkalisella fosfataasilla (Gibco-BRL, Basel, Sveitsi) käsiteltyyn faagivektorin M13mpl8 (Boeh- i · ’.V ringer Mannheim GmbH, Saksa) replikatiiviseen muotoon (RF) .
f 1 ! '· Osa ligaatioseoksesta transformoidaan E. coli HB101:een.
: 25 Plasmidi-DNA kuudesta plakista analysoidaan EcoRIillä, ·', BamHI:llä ja BamHI-Sall: llä. Yksi RF-klooni, jolla on «44 · .·. { sopivat restriktiofragmentit ja jolla on promoottori välit- • · ,*·. tömästi vektorin EcoRI-paikan vieressä, valitaan ja nime- • i » tään mpl8/BamHI/GAPDH-aFL-IGFl-aFT:ksi. Paikkakohdistettu . 30 mutageneesi käyttäen kaksialukemenetelmää [M. J. Zoller ja : · : M. Smith, Meth. m Enzymol. 154. 329 - 350 (1987)], ja 4 · * * mutageenista oligodesoksiribonukleotidi-aluketta, jolla on ί sekvenssinumero 6, antaa uuden aFL-sekvenssin muuttaen *)» aminohapot Ala20 Aspeiksi ja Pro21 Leu21:ksi. Yksisäikeinen « « r 35 DNA, joka on saatu yhdestä positiivisesta kloonista hybri- t f / disaation jälkeen radioaktiivisesti leimatulla mutageeni- # · > ' sella alukkeella, sekvensoidaan [F. Sanger, S. Nicklen ja 27 105482 A. R. Coulsen, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 74./ 5463 - 5467 (1977)] haluttujen mutaatioiden varmentamiseksi. Mutatoitu aFL on nimeltään aFLMut2 ja saatu faagi on nimeltään mpl8/-BamHI/GAPDH-aFLMut2-IGFl-aFT.
5 Paikkakohdistettu mutageneesi käyttäen neljää muta- geenista oligodeoksiribonukleotidi-aluketta, joilla on sekvenssinumerot 7, 8, 9 ja 10, antaa aFL-sekvenssin, jossa seuraavat aminohapot ovat vaihtuneet:
Ala13 Asn13:ksi, Gin32 Asn32:ksi, Pro34 ThrM:ksi, Gly40 Asn40:ksi, 10 Ly s76 Asn76:ksi ja Glu7® Thr7S:ksi.
Yksisäikeisen DNA-templaatin DNA-sekvensointi varmentaa kaikki mutaatiot.
Mutatoitu aFL-sekvenssi nimetään aFLGlG2G3G5:ksi ja faagi mpl8/BamHI/GAPDH-aFLGlG2G3G5-IGFl-aFT:ksi.
15
Esimerkki 5: Hiivavektorien, jotka sisältävät GAPDH-aFL-IGFl-orFT: n. GAPDH-aFLMut2-IGFl-aFT:n ia GAPDH-aFLGlG2G3G5-IGFl-aFT:n. konstruktio
Ainutlaatuisen Bglll-paikan luomiseksi vektorissa 20 pDP34A (katso esimerkki 3) plasmidi-DNA hajotetaan täydellisesti Sacl:llä ja 3'-ulkonemaa huuhdellaan T4 DNA -polymeraasilla (New England BioLabs, Beverly, MA, USA). Linearisoitu tasapäinen vektori pDP34A liitetään Bglll-
I I
!· '<· linkkereihin (Boehringer Mannheim GnbH, Saksa) . Linkkeri- : : 25 ligaation jälkeen vektori-DNA hajotetaan BglII:lla ja ; liitetään uudelleen. Plasmidi-DNA kuudesta ampisilliini- ti i j’·,· resistentistä transformantista, jotka on saatu uudelleen 9 · liitetyn seoksen osan transformaation jälkeen E. coli HB101:ssä, analysoidaan restriktioentsyymeillä Bglll-Sall .. . 30 ja Bglll-Scal. Yksi klooni, jolla on odotetut restrik- tiofragmentit, jotka vahvistavat Bglll-paikan luomisen i · t *·* ’ Sacl-paikan tilalle, nimetään pDP34B:ksi.
ij’* pDP34B hajotetaan täydellisesti BamHItllä ja käsi- tellään bakteeriperäisellä alkalisella fosfataasilla. Tätä \ 35 linearisoitua vektori-DNA:ta käytetään 1146 emäsparin
BamHI-fragmenttien subkloonaaraiseen, jotka fragmentit on » t *’" saatu pDP34A/GAPDH-aFL-IGFl-aFT:stä (katso esimerkki 3), 28 105482 mpl8/BamHI/GAPDH-aFLMut2-IGFl-a:FT:stä (katso esimerkki 4) ja mpl8/BamHI/GAPDH-arFLGlG2G3G5-IGFl-aFT:stä (katso esimerkki 4) . Ligaation jälkeen osa jokaisesta kolmesta ligaa-tioseoksesta transformoidaan E. coli HB101:ssä. Neljän 5 yksittäisen transformantin plasmidi-DNA jokaisesta kolmesta ligaatiosta analysoidaan Sali:llä BamHI-fragmenttien suuntauksen määrittämiseksi Sall-BaraHI pBR322 -fragmentin osalta. Plasmidit, jotka antavat 1147 emäsparin fragmentin pBR322-DNA:11a promoottorin 5'-päässä, valitaan ja nimetään 10 pDP34B/BamHI/GAPDH-aFL-IGFl-aFT:ksi, pDP3 4 B/BamHI/GAPDH- aFLMut2-IGFl-aFT:ksi ja pDP34B/BamHI/GAPDH-aFLGlG2G3G5- IGFl-aFT:ksi.
Esimerkki 6: Hiivavektoreiden konstruktio, jotka vektorit 15 sisältävät samassa plasmidissa ekspressiokasetit KEX2p:lle ia IGF-l:lle, jolla on villin tyypin α-tekiiän iohtoeritvs-sjanaali
Hiivavektori pDP34B (esimerkki 5) hajotetaan täydellisesti Bglllrlla ja käsitellään bakteeriperäisellä, al-20 kalisella fosfataasilla. Plasmidi pKS301 b (esimerkki 1) hajotetaan BamHI:llä ja noin 3210 emäsparin fragmentti, \\ joka sisältää kokonaisen KEX2-geenin, eristetään ja lii- • « · tetään linearisoituun vektoriin pDP34B. Osa ligaatioseok-sesta transformoidaan E. coli HB101:een ja neljän trans- I | i 25 formantin plasmidi-DNA tutkitaan restriktioanalyysillä • » t ; BamHI: llä ja BglII:lla. Yksi klooni, jolla on odotetut • # · '. *: restriktiofragmentit, tunnetaan pDP34B/KEX2 :na.
• · · V * pDP34B/KEX2 hajotetaan täydellisesti BamHI:llä ja käsitellään bakteerisyntyisellä, alkalisella fosfataasilla.
: 30 1146 emäsparin fragmentti, joka sisältää IGF-l-eks- pressiokasetin ja joka on eristetty pDP34A/GAPDH-aFL-IGFl- \ aFT:stä (esimerkki 3), liitetään linearisoituun vektoriin I**’ pDP34B/KEX2. Transformaation jälkeen neljän kloonin plasmi- * * 'l·' di-DNA analysoidaan Sali: llä ja BamHI-Bglll: llä. Yksi 35 klooni, jolla on promoottori IGF-l-ekspressiokasetissa 3' pBR322 Sall-BamHI -fragmenttiin ja KEX2-geeni vastakkaises- • · 29 105482 sa suunnassa IGF-l-kasetille, valitaan ja nimetään pDP34B/-KEX2 / GAPDH-aFL-IGFl-otFT: ksi.
Esimerkki 7: Hiivavektoreiden konstruktio, jotka vektorit 5 sisältävät samassa plasmidissa ekspressiokasetit KEX2p.:lle JA IGF-l:lle. jolla on villin tyypin α-tekiiän iohtoeritvs-sianaali
Sen jälkeen, kun plasmidi pDPkexp (esimerkki 1) on hajotettu Smal:llä, BamHI-linkkerit [Boehringer Mannheim 10 GmbH, Saksa] lisätään, jonka jälkeen seuraa hajotus Bam-HI:llä ja Scalrllä, mikä sallii noin 2560 emäsparin BamHI-fragmentin eristämisen. Tämä liitetään linearisoituun pDP34B:hen. Transformanttien plasmidi-DNA:n analyysi Bam-HI:llä ja BamHI-Bglll:11a antaa yhden kloonin, jolla on 15 odotetut restriktiofragmentit ja joka nimetään pDP34B/kexp:ksi.
IGF-l-ekspressiokasetti subkloonataan pDP34B/kexp:n BamHI-paikassa samalla tavalla kuin esimerkissä 6. Rest-riktioanalyysi Sällillä ja BamHI-Bglll:11a antaa erilaisia 20 klooneja, joilla on IGF-l-ekspressiokasetin promoottori 3' pBR322 Sall-BamHI -fragmenttiin ja liukoinen KEX2 vastakkaisessa suunnassa IGF-l-kasetille. Yksi sellainen klooni • t · valitaan ja nimetään pDP34B/kexp/GAPDH-aFL-IGFl-aFT:ksi.
• « • · · * · < 25 Esimerkki 8: Hiivavektoreiden konstruktio, jotka vektorit ;· j sisältävät samassa plasmidissa ekspressiokasetit KEX2p.H- *· *· DEL: lie ia IGF-1: lie." nolla on villin tyypin a-tekinän • I t V * iohtoeritvssiqnaali pDPkexpHDEL (katso esimerkki 2) hajotetaan BamHIrllä • · i • 30 ja noin 2580 emäsparia pitkän fragmentin eristämisen jäl- keen se liitetään linearisoituun pDP34B:hen. E. coli HB101 • -transformanttien plasmidi-DNA analysoidaan BamHI-Bglll:-11a. Yksi klooni, jolla on odotetut restriktiofragmentit, • t nimetään pDP34B/kexpHDEL:ksi.
35 IGF-l-ekspressiokasetti subkloonataan pDP34B/kexp: n
BamHI-paikassa samalla tavalla kuin esimerkissä 6. Am- « · pisilliiniresistenttien E. coli HB101 -transformanttien 30 105482 plasmidi-DNA analysoidaan Sällillä ja BamHI-Bglll:11a. Yksi klooni, jolla on IGF-l-ekspressiokasetin promoottori 3' pBR322 Sall-BamHI -fragmenttiin ja liukoinen KEX2HDEL vastakkaisessa suunnassa IGF-l-kasetille, nimetään pDP34B-5 /kex2pHDEL/GAPDH-aFL-IGFl-aFT:ksi.
Esimerkki 9: Plasmidien pDP34B/KEX2/GAPDH-o;FLMut2-IGFl-aFT. pDP34B/kexp/GAPDH-aFLMut2-IGFl-aFT.
pDP34B/kexpHDEL/GAPDH-aFLMut2-IGFl-aFT. PDP34B/KEX2/GAPDH-10 aFLGlG2G3G5-IGFl-aFT. pDP34B/keXP/GAPDH-aFLGlG2G3G5-IGFl-aFT ia pDP34B/kexpHDEL/GAPDH-orFLGlG2G3G5-IGFl-aFT konstruktio Nämä plasmidit konstruoidaan tavalla, joka muistuttaa esimerkeissä 6, 7 ja 8 yksityiskohtaisesti esitettyjä 15 menetelmiä. Ekspressiokasetit, GAPDH-aFLMut2-IGFl-otFT:n ja GAPDH-aFLGlG2G3G5:n BamHI-fragmentit, eristetään pDP34B/BamHI/GAPDH-aFLMut2-IGFl-aFT:stä (katso esimerkki 5) ja pDP34B/BamHI/GAPDH-aFLGlG2G3G5-IGFl-aFT:stä (katso esimerkki 5) ja subkloonataan hiivavektoreissa, jotka jo 20 sisältävät KEX2- tai liukoinen KEX2- tai liukoinen KEX2H-DE^-geenit.
i t ';''' Esimerkki 10: Hiivakannan AB110 kex2-mutantin konstruktio 4 4 ; '' pKS301b (esimerkki 1) katkaistaan ainutlaatuisesta
4 4 I
M.' 25 Bglll-paikasta KEX2-aeenissä. Noin 2920 emäsparin Bglll- r i fragmentti plasmidista YEpl3 [J. Broach et ai., Gene £, 121 :,*·· - 133 (1979)] liitetään linearisoituun vektoriin pKS301b.
Osa ligaatioseoksesta transformoidaan E. coli HB10l:ssä. Plasmidi-DNA 12 ampisilliiniresistentistä transformantista 30 analysoidaan Hindlll-EcoRI: llä. Yksi klooni, jolla on • · odotetut fragmentit, nimetään pUC19/kex2: :LEU2 :ksi. Tällä • · » plasmidilla on KEX2-aeenin koodaussekvenssi katkaistuna toiminnallisella LEU2-aeenillä.
IM
:lt,: pUC19/kex2: : LEU2 hajotetaan BamHItllä lineaarisen 35 kex2::LEU2-fragmentin vapauttamiseksi. Hiivakantaa AB110 * t « · .·. : käytetään transformaatioon (esimerkki 11) linearisoidulla DNA:11a. Transformantit valitaan leusiiniprototrofiaa 31 105482 varten. Neljän LEU2 +-transformantin genomin DNA hajotetaan EcoRI-Hindlll:11a. Sen varmistamiseksi, että KEX2:n genomin kopio todella katkaistaan LEU2-geenillä, tehdään Southern blot -analyysi. Yksi hiivatransformantti, jolla on odotetut 5 restriktiofragmentit, nimetään AB110 kex2:ksi.
Esimerkki 11: S. cerevisiae -kantojen AB110 ia AB110 kex2~ transformaatio
Hiivatransformaatio suoritetaan kuten on kuvattu 10 viitteessä Klebe et ai. [Gene 25, 333 - 341 (1983)].
S. cerevisiae AB110 transformoidaan (katso esimerkki 12) plasmideilla, jotka on lueteltu jäljempänä, ja trans-formantit nimetään, kuten on esitetty: 15 Plasmidi Transforman- tin nimi pDP34B/GAPDH-aFL-IGFl-aFT (esim. 5) ylG 1 pDP34B/KEX2/GAPDH-aFL-IGFl-aFT (esim. 6) ylG 2 pDP34B/KEX2HDEL/GAPDH-aFL-IGFl-aFT (esim. 8) ylG 3 20 pDP34B/GAPDH-aFLMut2-IGFl-aFT (esim. 5) ylG 4 pDP34B/GAPDH-aFLGlG2G3G5-IGFl-aFT (esim. 5) ylG 5 « * t « I I |
Jokaisesta transformantista valitaan kolme pesäkettä ja ne
* I I
merkitään lisänumerolla (nimittäin ylG 1-1, ylG 1-2, ylG 1-25 3) .
; S. cerevisiae AB110 kex2' (katso esimerkki 10) trans- t · · ’· " formoidaan plasmideilla, jotka on koottu jäljempänä, ja • · · V : transformantit nimetään, kuten on esitetty: 30 Plasmidi Transforman- tin nimi * pDP34B/GAPDH-aFL-IGFl-aFT (esim. 5) ylG 6 • « · pDP34B/KEX2/GAPDH-c*FL-IGFl-aFT (esim. 6) ylG 7 pDP34B/KEX2/GAPDH-aFLMut2-IGFl-aFT (esim. 9) ylG 8 35 pDP34B/kexp/GAPDH-aFLMut2-IGFl-aFT (esim. 9) ylG 9 pDP34B/kexpHDEL/GAPDH-aFLMut2-IGFl-aFT (esim. 9) ylG 10 pDP34B/KEX2/GAPDH-aFLGlG2G3G5-IGFl-aFT (esim. 9) ylG 11 105482 32 pDP34B/kexp/GAPDH-aFLGlG2G3G5-IGFl-aFT (esim. 9) ylG 12 pDP34B/kexpHDEL/GAPDH-aFLGlG2G3G5-IGFl-aFT (esim.9)yIG 13
Jokaisesta transformantista valitaan kolme pesäkettä ja ne 5 merkitään lisänumerolla (nimittäin ylG 6-1, ylG 6-2, ylG 6- 3) .
Esimerkki 12: Hiivatransformanttien kasvu ravistettavissa pullovilielmissä ia IGF-l-proteiinin kvantitatiivi-10 nen/kvalitatiivinen määritys korkean erotuskyvyn neste-kromatoorafiällä fHPLCI ia Western blots -analyysillä S. cerevisiae AB110 (Mata, his 4-580, leu2, ura 3-52, pcp 4-3, [cir0]) on kuvattu muualla [P. J. Barr et ai., J. Biol. Chem. 263, 16 471 - 16 478 (1988)]. Rikasta alustaa, 15 joka sisältää 6,5 g/dm3 hiivauutetta, 4,5 g/dm3 casami-nohappoja ja 30 g/dm3 glukoosia, käytetään ei-selektiivise-nä esikasvatusalustana. IGF-1 ilmentyy pääviljelmässä, joka on urasiili-selektiivinen kasvualusta, joka sisältää 1,7 g/dm3 hiivan typpialustaa, johon on lisätty 30 g/dm3 glu-20 koosia, 8,5 g/dm3 casaminohappoja ja vaadittuja aminohappoja. Hiivatransformantteja (katso esimerkki 11) kasvatetaan 30 °C:n lämpötilassa ravistelijassa kierrosnopeudella 180 rpm 24 tuntia 20 cm3:n tilavuudessa esikasvatusalustaa ja • · . 72 tuntia 80 cm3:n tilavuudessa pääviljelmää.
25 Solujen osa otetaan talteen ja eritetty, aktiivinen ! monomeerinen IGF-1-molekyyli kasvatusalustassa määritetään • « · l”’ HPLC:llä ja ELISA: 11a [K. Steube et ai., Eur. J. Biochem.
198. 651 - 657 (1991)].
Kasvatettujen viljelmien osia sentrifugoidaan kaksi • · · : *.· 3 0 minuuttia 13 000 x g. Solut suspendoidaan uudelleen 3 x • * · ’ Laemmli-puskuriin [6 % SDS, 0,15 M Tris pH 6,8, 6 mM EDTA, . 30 % glyserolia, 0,05 % bromifenolisinistä] ja liuotetaan *** voimakkaalla ravistelulla lasihelmien kanssa, jota seuraa T näytteiden inkubointi kolmen minuutin ajan kiehuvassa 35 vesihauteessa. Solulysaatista saadut proteiinit erotetaan '/.j SDS-PAGE: 11a käyttäen 15%: ista polyakryyliamidigeeliä [U.K.
Laemmli, Nature 227. 680 - 685 (1970)]. Proteiinit "elekt- i 33 105482 roblotataan" nitroselluloosasuodattimiin puolikuivan blot-terin avulla [Sartorius GmbH, Saksa]. Siirretyt proteiinit osoitetaan anti-IGF-l-vasta-aineilla noudattaen Bio-Rad-immuunimäärityspakkauksen [Bio-Rad, Richmond, CA, USA] 5 suomaa menetelmää.
Esimerkki 13: Eritettyjen ia intrasellulaaristen IGF-1-
proteiini(el n vertaaminen HPLC:llä ia Western blot -analyysillä transformanteista vIG l. ylG 6 JA ylG 7 10 Eritettyä IGF-l:tä plasmidin pDP34B/GAPDH-aFL-IGFl-aFT
(katso esimerkki 5) transformanteista hiivakannoissa AB110 (transformantit ylG 1-1, ylG 1-2 ja ylG 1-3) ja AB110 kex2' (transformantit ylG 6-1, ylG 6-2 ja ylG 6-3) verrataan HPLCrllä ja tulokset on esitetty taulukossa 1.
15
Taulukko 1;
Transformantti HPLC-tulos ma/cm3 ylG 1-1 8 ylG 1-2 7 20 ylG 1-3 7 ylG 6-1 0 ylG 6-2 0 f · ylG 6-3 o 25 Transformanteista ylG 6-1, ylG 6-2 ja ylG 6-3 saadun int- :,· · rasellulaarisen proteiinin Western blot -analyysi osoittaa • · V·· IGF-l:tä siellä, missä aFL:n muokkausta ei ole tapahtunut.
·· Tulokset viittaavat siihen, että valmista IGF-l:tä ei erity alustaan hiivakannoista, joista puuttuu KEX2;n toi-30 minnallinen kopio kromosomista. Kun KEX2:n toiminnallinen • · kopio' viedään uudelleen plasmidissa, esim. pDP34/KEX2/-GAPDH-aFL-IGFl-aFT:ssä (katso esimerkki 6), hiivakantaan *·ί·* AB110 kex2 (transformantit ylG 7-1, ylG 7-2 ja ylG 7-3) , tn havaitaan taas eritettyä IGF-l:tä.
35 «Ml « * · • · ♦ • · 105482 34
Esimerkki 14: Eritetyn IGF-l-proteiinin vertaaminen HPLCillä ia ELISA;11a transformanteista vIG 1. ylG 2 ia vIG 3 HPLC mittaa aktiivisen, monomeerisen IGF-l:n määrää 5 supernatantissa. ELISA määrittää IGF-l-tyyppisten lajien kokonaismäärän supernatantissa. Monomeerin lisäksi ELISA määrittää intermolekulaaristen, disulfidisiltaisten dimee-rien ja multimeerien, väärinlaskotuneen IGF-l:n, hapetetun IGF-l:n ja muiden molekyylien määrän. Taulukko 3 esittää 10 eritetyn IGF-l:n HPLCtn tulokset ja ELISA-arvot transformanteista, jotka ilmentävät yhtäaikaa IGF-l:tä ja KEX2p:tä (ylGl ja yIG2), ja transformanteista, jotka ilmentävät yhtäaikaa IGF-l:tä ja liukoista KEX2HDELp:tä (ylG 3) . Tulokset on esitetty taulukossa 2.
15
Taulukko 2:
Transformantit HPLC-tulokset ELISA-arvot ma /cm3 ma /cm3 20 ylG l 9 98 ylG 2 8 92 ylG 3 9 27 « · < · ·' " Nämä tulokset ovat keskiarvoja, jotka on saatu kolmen '.i.: 25 yksittäisen kannan jokaisesta kolmesta transformaatiosta.
; Liukoisen KEX2HDEL:n ko-ekspressio osoittaa, että muiden • t !,*·· molekyylien kuin monomeerien muodostuminen on voimakkaasti :T: vähentynyt.
30 Esimerkki 15: Eritetyn IGF-l-proteiinin vertaaminen * · ,···. transformanteista ylG 1. vIG 4. ylG 8. ylG 9 ia ylG 10 • · · HPLC-analvvsillä \ί·* Mutatoitu johtosekvenssi aFLMut2 ei salli IGF-l:n * · · eritystä kannassa AB110. Glykosyloidut, muokkaamattomat 35 aFL-IGF-l-molekyylit akkumu loi tuvat solun sisään. Gly- • f · · : kosylaation luonteesta (vain ,,sisus"-glykosylaatiota ha- * «· vaittu) on ilmeistä, että nämä molekyylit eivät ole kul- 35 105482 keneet endoplasmisen retikulumin ulkopuolella mutaatioiden johdosta aFL-sekvenssissä. IGF-l:n ko-ekspressio käyttäen aFLMut2-erityssignaalia yhdessä KEX2-entsyymin kolmen eri muodon, KEX2:n, liukoisen KEX2:n ja liukoisen KEX2HDEL:n 5 kanssa AB110 kex2:ssa osoittaa, että liukoinen KEX2HDEL-proteiini eroaa kahdesta muusta.
Intrasellulaaristen IGF-l-tyyppisten proteiinien, transformanteista ylG 1, ylG 4, ylG 8, ylG 9 ja ylG 10,
Western blot -analyysi paljastaa, että vain liukoinen 10 KEX2HDEL-proteiini vapauttaa valmista IGF-l:tä intrasel-lulaarisesta poolista.
Esimerkki 16: Eritetyn IGF-l-proteiinin analyysi trans formanteista ylG 1. ylG 5. vIG 11, vIG 12 ia VlG 13 HPLC-15 analyysillä
Mutatoitu johtosekvenssi aFLGlG2G3G5 sallii IGF-l:n heikon erityksen kannassa AB110. Glykosyloimattomat, muokkaamattomat aFL-IGF-l-molekyylit akkumuloituvat solun sisään. Näyttää siltä, että näiltä molekyyleiltä puuttuu 20 aFL:n signaalisekvenssi, joka merkitsee sitä, että trans-lokaatio ER:ään on tapahtunut. Kuitenkaan pääsy ER:ään ei ole aiheuttanut kolmen mahdollisen sekvenssin (Asn-X-
( I
Ser/Thr) glykosylaatiota aFL:n pro-alueessa. IGF-l:n ko-, ekspressio yhdessä KEX2-entsyymin kolmen eri muodon > I f 25 (KEX2:n, liukoisen KEX2:n ja liukoisen KEX2HDEL:n) kanssa f I < ! AB110 kex2 : ssa osoittaa, että liukoinen KEX2HDEL-proteiini, I · t ” •m , , , . » · *,.1 joka ilmentyy ylG 13:ssa, on ainutlaatuinen siinä, että se • · » *·1 1 sallii enemmän valmista IGF-l:tä vapautua int- rasellulaarisesta poolista.
• · · : 30 f c1 · • · · ............
• · n ......
* * · · * ♦ · ·♦·
· i ...--=?·.==-:·=· L
f P
< t · 35 Esimerkki 17: Aikakoe monomeerisen IGF-l:n erityksen ki- netiikan tutkimiseksi hiivatransformanteista vIG 1. vIG 5 ia vIG 13 105482 36 aFL:n pro-alueen vapauttaminen IGF-l:stä ER:ssä Golgin sijasta saattaa vaikuttaa eri ajankohtina eritetyn monomee-risen IGF-l:n kokonaismäärään. On todennäköistä, että pro-alueella on tärkeä osuus muokkaamattoman IGF-l-proteiinin 5 viennin helpottamisessa ERrstä Golgiin. Tämän mahdollisuuden osoittamiseksi kolmea yksittäistä kantaa ylG l:stä, ylG 5:stä ja ylG 13:sta kasvatetaan ravistelupulloissa ja monomeerisen IGF-l:n eritys mitataan HPLCrllä ottamalla supernatantin osia hiivaviljelmistä 40, 48, 60 ja 72 tunnin 10 kuluttua. Keskiarvot, jotka saatiin kolmesta yksittäisestä kannasta (esim. ylG 1-1, ylG 1-2, ylG 1-3 ja ylG 5-1, ylG 5-2, ylG 5-3 ja ylG 13-1, ylG 13-2, ylG 13-3) kuuluen kuhunkin kolmesta transformaatiosta, ylG 1, ylG 5 ja ylG 13, on esitetty taulukossa 3.
15
Taulukko 3:
Kanta Eritetty IGF-1 fma/dm3) 40 h 48 h 60 h 72 h ylG 1 2,5 4 7 8,5 20 ylG 5 0,8 1 1,2 1,5 ylG 13 2,5 4,5 9,2 6 • · • · « • « ;. Esimerkki 18: Eritetyn IGF-1:n analyysi Western blot:11a • i i . ,, osoittaa liukoista KEX2HDEL-proteiinia käyttävien dimee- « I r .''! 25 risten muotojen olennaista vähenemistä I I ( ; Supernatantit ylG l:stä ja ylG 13:sta (esimerkki 17) 4 < t "· ]· on analysoitu Western blot: 11a ei-pelkistävissä ja pel- $ · · ’ kistävissä olosuhteissa.
Ajankohdilla 40, 48 ja 60 tuntia ei havaita IGF-1- * · · : 30 molekyylien, joilla on molekyylien välisiä disulfidisil- to ja, muodostumista, kun käytetään liukoista KEX2HDEL-proteiinia. Vain ajankohdalla 72 tuntia nähdään pienen • · · pieni määrä (tuskin näkyy blot:11a) dimeeristä IGF-1:tä.
f f
Kuitenkin kannat, jotka ilmentävät KEX2p:tä, osoittavat 35 dimeerejä jokaisella ajankohdalla. Nämä dimeerit voidaan : pelkistää ditiotreitolilla (DTT) viitaten siihen, että dimeerit ovat todellakin disulfidisidoksisia.
105482
Talletetut mikro-organismit
Seuraavat mikro-organismikannat on talletettu Budapestin sopimuksen mukaisesti Deutsche Sammlung von Mik-roorganismen (DSM) -talletuslaitoksessa, Mascheroder Weg 5 lb, D-3300 Braunschweig (talletuspäivät ja talletusnumerot on annettu):
Escherichia coli JM109/pDP34: 14. maaliskuuta 1988, DSM
10 4473.
Escherichia coli JM101/pKS301b: 25. kesäkuuta 1990, DSM
6028.
· • · i i i • · • · ¥ I ·
• » I
< ( l I « I « « • · I « « · • · · * · » · < » M * · * « · « · ' ♦ · # • · · « I I I · • · • · · * « » • · · • · « * · · • * ♦ ·«« « · 1
t t « . I
38 105482
Sekvenssiluettelo Sekvenssi nro l
Sekvenssityyppi: Polynukleotidi ja vastaava polypeptidi 5 Sekvenssin pituus: 1866 emäsparia Säikeisyys: kaksisäikeinen Topologia: lineaarinen Lähde: hiivan genomin DNA
Välitön koelähde: E. coli JM101/pKS301b (DSM6028) 10 Ominaisuudet: l:stä 1866:een koodausalue liukoiselle KEX2-: lie AT G AAA GTG AGG AAA TAT ATT ACT TTA TGC TTT TGG TGG 39
Met Lys Vai Arg Lys Tyr Ile Thr Leu Cys Phe Trp Trp 15 10 GCC TTT TCA ACA TCC GCT CTT GTA TCA TCA CAA CAA ATT 78
Ala Phe Ser Thr Ser Ala Leu Vai Ser Ser Gin Gin Ile 15 20 25 CCA TTG AAG GAC CAT ACG TCA CGA CAG TAT TTT GCT GTA 117
Pro Leu Lys Asp His Thr Ser Arg Gin Tyr Phe Ala Vai 30 35 GAA AGC AAT GAA ACA TTA TCC CGC TTG GAG GAA AT G CAT 156
Qlu Ser Asn Glu Thr Leu Ser Arg Leu Glu Glu Met His « · · ’;J0 45 50
« · A
• · * CCA AAT TGG AAA TAT GAA CAT GAT GTT CGA GGG CTA CCA 195 • e · ; '£ro Asn Trp Lys Tyr Glu His Asp Vai Arg Gly Leu Pro :Y: 55 60 65 • i « ’1'AAC CAT TAT GTT TTT TCA AAA GAG TTG CTA AAA TTG GGC 234 < TAsn His Tyr Vai Phe Ser Lys Glu Leu Leu Lys Leu Gly 70 75 i «
1 I I
• < i 39 1 0 5 4 8 2 AAA AGA TCA TCA TTA GAA GAG TTA CAG GGG GAT AAC AAC 279
Lys Arg Ser Ser Leu Glu Glu Leu Gin Gly Asp Asn Asn 80 85 90 GAC CAC ATA TTA TCT GTC CAT GAT TTA TTC CCG CGT AAC 312
Asp His lie Leu Ser Val His Asp Leu Phe Pro Arg Asn 95 100 GAC CTA TTT AAG AGA CTA CCG GTG CCT GCT CCA CCA ATG 351
Asp Leu Phe Lys Arg Leu Pro Val Pro Ala Pro Pro Met 105 110 115 GAC TCA AGC TTG TTA CCG GTA AAA GAA GCT GAG GAT AAA 390
Asp Ser Ser Leu Leu Pro Val Lys Glu Ala Glu Asp Lys 120 125 130 CTC AGC ΑΤΑ AAT GAT CCG CTT TTT GAG AGG CAG TGG CAC 429
Leu Ser lie Asn Asp Pro Leu Phe Glu Arg Gin Trp His 135 140 TTG GTC AAT CCA AGT TTT CCT GGC AGT GAT ATA AAT GTT 468 V, Leu Val Asn Pro Ser Phe Pro Gly Ser Asp lie Asn Val 145 150 155
« I
I i · ; CTT GAT CTG TGG TAC AAT AAT ATT ACA GGC GCA GGG GTC 507
Leu Asp Leu Trp Tyr Asn Asn lie Thr Gly Ala Gly Val .·:·! 160 165 • ♦ · v ., . GTG GCT GCC ATT GTT GAT GAT GGC CTT GAC TAC GAA AAT 54 6 J t ϋ *,.* Val Ala Ala lie Val Asp Asp Gly Leu Asp Tyr Glu Asn “ 170 175 180 • • · Ψ 9 Λ · ·** GAA GAC TTG AAG GAT AAT TTT TGC GCT GAA GGT TCT TGG 585 \ Glu Asp Leu Lys Asp Asn Phe Cys Ala Glu Gly Ser Trp 185 190 195 1 I I « I I • 4 105482 40 GAT TTC AAC GAC AAT ACC AAT TTA CCT AAA CCA AGA TTA 624
Asp Phe Asn Asp Asn Thr Asn Leu Pro Lys Pro Arg Leu 200 205 TCT GAT GAC TAC CAT GGT ACG AGA TGT GCA GGT GAA ATA 663
Ser Asp Asp Tyr His Gly Thr Arg Cys Ala Gly Glu lie 210 215 220 GCT GCC AAA AAA GGT AAC AAT TTT TGC GGT GTC GGG GTA 702
Ala Ala Lys Lys Gly Asn Asn Phe Cys Gly Vai Gly Val 225 230 GGT TAC AAC GCT AAA ATC TCA GGC ATA AGA ATC TTA TCC 741
Gly Tyr Asn Ala Lys lie Ser Gly lie Arg lie Leu Ser 235 240 245 GGT GAT ATC ACT ACG GAA GAT GAA GCT GCG TCC TTG ATT 780
Gly Asp lie Thr Thr Glu Asp Glu Ala Ala Ser Leu lie 250 255 260 /.'.TAT GGT CTA GAC GTA AAC GAT ATA TAT TCA TGC TCA TGG 819
4 I
;·. Tyr Gly Leu Asp Val Asn Asp lie Tyr Ser Cys Ser Trp
1 t I
265 270 4 I I 1 I I < I « i < • # c |GGT CCC GCT GAT GAC GGA AGA CAT TTA CAA GGC CCT AGT 858 t % · j )*Gly Pro Ala Asp Asp Gly Arg His Leu Gin Gly Pro Ser V : 275 280 285 GAC CTG GTG AAA AAG GCT TTA GTA AAA GGT GTT ACT GAG 897 iTs Asp Leu Val Lys Lys Ala Leu Val Lys Gly Val Thr Glu .)., 290 295 * · t ··· GGA AGA GAT TCC AAA GGA GCG ATT TAC GTT TTT GCC AGT 936
Gly Arg Asp Ser Lys Gly Ala lie Tyr Val Phe Ala Ser 300 305 310 I i Ϊ 4i 105482 GGA AAT GGT GGA ACT CGT GGT GAT AAT TGC AAT TAC GAC 975
Gly Asn Gly Gly Thr Arg Gly Asp Asn Cys Asn Tyr Asp 315 320 325 GGC TAT ACT AAT TCC ATA TAT.TCT ATT ACT ATT GGG GCT 1014
Gly Tyr Thr Asn Ser lie Tyr Ser lie Thr lie Gly Ala 330 335 ATT GAT CAC AAA GAT CTA CAT CCT CCT TAT TCC GAA GGT 1053 lie Asp His Lys Asp Leu His Pro Pro Tyr Ser Glu Gly 340 345 350 TGT TCC GCC GTC ATG GCA GTC ACG TAT TCT TCA GGT TCA 1092
Cys Ser Ala Val Met Ala Val Thr Tyr Ser Ser Gly Ser 355 360 GGC GAA TAT ATT CAT TCG AGT GAT ATC AAC GGC AGA TGC 1131
Gly Glu Tyr lie His Ser Ser Asp lie Asn Gly Arg Cys 365 370 375 AGT AAT AGC CAC GGT GGA ACG TCT GCG GCT GCT CCA TTA 1170 v.Ser Asn Ser His Gly Gly Thr Ser Ala Ala Ala Pro Leu
I I I
’ 380 385 390 < I lie /"GCT GCC GGT GTT TAC ACT TTG TTA CTA GAA GCC AAC CCA 1209 • · · ··· ^Ala Ala Gly Val Tyr Thr Leu Leu Leu Glu Ala Asn Pro :.**i 395 400 • « · * · ♦ • · · * AAC CTA ACT TGG AGA GAC GTA CAG TAT TTA TCA ATC TTG 124 8 i’**:Asn Leu Thr Trp Arg Asp Val Gin Tyr Leu Ser lie Leu • · 405 410'"' 415 e • I « ..
';;;'TCT GCG GTA GGG TTA GAA AAG AAC GCT GAC GGA GAT TGG 1287
Ser Ala Val Gly Leu Glu Lys Asn Ala Asp Gly Asp Trp ·· 420 425 ••1« I · • · · I « « • 42 105482 AGA GAT AGC GCC ATG GGG AAG AAA TAC TCT CAT CGC TAT 132 6
Arg Asp Ser Ala Met Gly Lys Lys Tyr Ser His Arg Tyr 430 435 440 GGC TTT GGT AAA ATC GAT GCC CAT AAG TTA ATT GAA ATG 1365
Gly Phe Gly Lys He Asp Ala His Lys Leu He Glu Met 445 450 455 TCC AAG ACC TGG GAG AAT GTT AAC GCA CAA ACC TGG TTT 14 04
Ser Lys Thr Trp Glu Asn Val Asn Ala Gin Thr Trp Phe 460 465 TAC CTG CCA ACA TTG TAT GTT TCC CAG TCC ACA AAC TCC 144 9
Tyr Leu Pro Thr Leu Tyr Val Ser Gin Ser Thr Asn Ser 470 475 480 ACG GAA GAG ACA TTA GAA TCC GTC ATA ACC AT A TCA GAA 1482
Thr Glu Glu Thr Leu Glu Ser Val He Thr He Ser Glu 485 490 AAA AGT CTT CAA GAT GCT AAC TTC AAG AGA ATT GAG CAC 1521 . .Lys Ser Leu Gin Asp Ala Asn Phe Lys Arg He Glu His !:V495 500 505 • · .i.’GTC ACG GTA ACT GTA GAT ATT GAT ACA GAA ATT AGG GGA 1560 :.: :Val Thr Val Thr Val Asp He Asp Thr Glu He Arg Gly 510 515 520 • · · • · · • · # ACT ACG ACT GTC GAT TTA ATA TCA CCA GCG GGG ATA ATT 1599 IV.Thr Thr Thr Val Asp Leu He Ser Pro Ala Gly He He • · 525 530 • · · TCA AAC CTT GGC GTT GTA AGA CCA AGA GAT GTT TCA TCA 1638 '...•Ser Asn Leu Gly Val Val Arg Pro Arg Asp Val Ser Ser .:. 535 540 545 « « l 105482 43 GAG GGA TTC AAA GAC TGG ACA TTC ATG TCT GTA GCA CAT 1677
Glu Gly Phe Lys Asp Trp Thr Phe Met Ser Val Ala His 550 555 TGG GGT GAG AAC GGC GTA GGT GAT TGG AAA ATC AAG GTT 1716
Trp Gly Glu Asn Gly Val Gly Asp Trp Lys lie Lys Val 560 565 570 AAG ACA ACA GAA AAT GGA CAC AGG ATT GAC TTC CAC AGT 1755
Lys Thr Thr Glu Asn Gly His Arg lie Asp Phe His Ser 575 580 585 TGG AGG CTG AAG CTC TTT GGG GAA TCC ATT GAT TCA TCT 1794
Trp Arg Leu Lys Leu Phe Gly Glu Ser lie Asp Ser Ser 590 595 AAA ACA GAA ACT TTC GTC TTT GGA AAC GAT AAA GAG GAG 1833
Lys Thr Glu Thr Phe Val Phe Gly Asn Asp Lys Glu Glu 600 605 610 *. VGTT GAA CCA GGG GTA CCG AGC TCG AAT TCG TAA 18 66 • '••Val Glu Pro Gly Val Pro Ser Ser Asn Ser : 615 620 • · * • · • · · • · · • · · · • · » · · * · · • « ·«» • · · • · · i * · · t · · • 1 • # ··« • · · • * · « « t t « « t
I I
• · « • · « « « · · • 9 44 105482
Sekvenssi nro 2
Sekvenssityyppi: DNA ja vastaava peptidi Sekvenssin pituus: 12 emäsparia 5 Säikeisyys: kaksisäikeinen Topologia: lineaarinen Lähde: hiivan genomin DNA Välitön koelähde: synteettinen
Ominaisuudet: koodausalue ER-retentiosignaalille HDEL
10 CAC GAC GAA TTA 12
His Asp Glu Leu
Sekvenssi nro 3 15 Sekvenssityyppi: peptidi
Sekvenssin pituus: 4 aminohappoa Topologia: lineaarinen Lähde: K. lactis
Ominaisuudet: ER-retentiosignaali DDEL
20
Asp Asp Glu Leu Sekvenssi nro 4 • |
Sekvenssityyppi: peptidi • 25 Sekvenssin pituus: 4 aminohappoa : Topologia: lineaarinen • Lähde: nisäkässolut • « · · • Ominaisuudet: ER-retentiosignaali KDEL • · • · ·
• · O
• · · 30 Lys Asp Glu Leu 45 105482
Ominaisuudet: Ekspressiokasetti IGF-l:n ekspressiota varten hiivassa l:stä 6:een: BamHI-restriktiokohta 6:sta 404:ään: S. cerevisiae GAPDH-promoottori 5 405:stä 659:ään: S. cerevisiae α-tekijän johtosekvens- si 660:stä 869:ään: IGF-l:tä koodaava alue 870:stä 876:een: kahta lopetuskodonia koodaava link- keri 10 877:stä 1152:een: S. cerevisiae α-tekijän terminaat- tori 1153:sta 1158:aan: BamHI-restriktiokohta • · • ♦ * • · * • ♦ · · • ·
• · A
• · ·
• V
• · · » » » • · ♦ « • · · • * · • · • · • « · • · · • · · t I 1 « 0 a · • « · • a a a • «aa » a « « « « aa a a 46 105482 GGATCCCCAG CTTAGTTCAT AGGTCCATTC TCTTAGCGCA 40 ACTACAGAGA ACAGGGGCAC AAACAGGCAA AAAACGGGCA 80 CAACCTCAAT GGAGTGATGC AACCTGCCTG GAGTAAATGA 120 TGACACAAGG CAATTGACCC ACGCATGTAT CTATCTCATT 160 TTCTTACACC TTCTATTACC TTCTGCTCTC TCTGATTTGG 200 AAAAAGCTGA AAAAAAAGGT TGAAACCAGT TCCCTGAAAT 240 TATTCCCCTA CTTGACTAAT AAGTATATAA AGACGGTAGG 280 TATTGATTGT AATTCTGTAA ATCTATTTCT TAAACTTCTT 320 AAATTCTACT TTTATAGTTA GTCTTTTTTT TAGTTTTAAA 360 ACACCAAGAA CTTAGTTTCG AATAAACACA CATAAACAAA 400 CACC ATG AGA TTT CCT TCA ATT TTT ACT GCA GTT TTA 437
Met Arg Phe Pro Ser Ile Phe Thr Ala Val Leu -85 -80 -75 TTC GCA GCA TCC TCC GCA TTA GCT GCT CCA GTC 470
Phe Ala Ala Ser Ser Ala Leu Ala Ala Pro Val -70 -65 * « '•V* AAC ACT ACA ACA GAA GAT GAA ACG GCA CAA ATT 503 · : Asn Thr Thr Thr Glu Asp Glu Thr Ala Gin lie •\;V -60 -55 • · • · « • · · ··· · CCG GCT GAA GCT GTC ATC GGT TAC TTA GAT TTA 536 * «
Pro Ala Glu Ala Val lie Gly Tyr Leu Asp Leu -50 -45 • · · • · GAA GGG GAT TTC GAT GTT GCT GTT TTG CCA TTT 569
• I
Glu Gly Asp Phe Asp Val Ala Val Leu Pro Phe -40 -35 * <
I I
• * f TCC AAC AGC ACA AAT AAC GGG TTA TTG TTT ΑΤΑ 602
• « I
Ser Asn Ser Thr Asn Asn Gly Leu Leu Phe lie " " -30 -25 -20 47 105482 AAT ACT ACT ATT GCC AGC ATT GCT GCT AAA GAA 635
Asn Thr Thr lie Ala Ser lie Ala Ala Lys Glu -15 -10 GAA GGG GTA CAG CTG GAT AAA AGA GGT CCA GAA 668
Glu Gly Val Gin Leu Asp Lys Arg Gly Pro Glu -5 1 ACC TTG TGT GGT GCT GAA TTG GTC GAT GCT TTG 701
Thr Leu Cys Gly Ala Glu Leu Val Asp Ala Leu 5 10 CAA TTC GTT TGT GGT GAC AGA GGT TTC TAC TTC 734
Gin Phe Val Cys Gly Asp Arg Gly Phe Tyr Phe 15 20 25 AAC AAG CCA ACC GGT TAC GGT TCT TCT TCT AGA 767
Asn Lys Pro Thr Gly Tyr Gly Ser Ser Ser Arg 30 35 AGA GCT CCA CAA ACC GGT ATC GTT GAC GAA TGT 800 ,y;Arg Ala Pro Gin Thr Gly lie Val Asp Glu Cys 40 45 • · • ( TGT TTC AGA TCT TGT GAC TTG AGA AGA TTG GAA 833 • · · m · · 'V !Cys Phe Arg Ser Cys Asp Leu Arg Arg Leu Glu 50 55 • · · » « · « ATG TAC TGT GCT CCA TTG AAG CCA GCT AAG TCT 866 ·· · ; ‘.'Met Tyr Cys Ala Pro Leu Lys Pro Ala Lys Ser :T: 60 65 :. GCT TGA TAAGTCGACT TTGTTCCCAC TGTACTTTTA 902
Ala ..:i' 70 · • · « « · t • · 105482 48 GCTCGTACAA AATACAATAT ACTTTTCATT TCTCCGTAAA 942 CAACATGTTT TCCCATGTAA TATCCTTTTC TATTTTTCGT 982 TCCGTTACCA ACTTTACACA TACTTTATAT AGCTATTCAC 1022 TTCTATACAC TAAAAAACTA AGACAATTTT AATTTTGCTG 1062 CCTGCCATAT TTCAATTTGT TATAAATTCC TATAATTTAT 1102 CCTATTAGTA GCTAAAAAAA GATGAATGTG AATCGAATCC 1142 TAAGAGAATT GGATCC 1158
Sekvenssi nro 6 10 Sekvenssityyppi: DNA Sekvenssin pituus: 31 Säikeisyys: yksisäikeinen Topologia: lineaarinen Lähde: synteettinen oligonukleotidi 15 Välitön koelähde: synteettinen
Ominaisuudet: mutageeninen oligodeoksiribonukleotidi-aluke GTAGTGTTGA CTAGATCTGC TAATGCGGAG G 31 20
Sekvenssi nro 7
Sekvenssityyppi: DNA
• «
Sekvenssin pituus: 25 emästä 25 Säikeisyys: yksisäikeinen : Topologia: lineaarinen • · k : Lähde: synteettinen oligonukleotidi
• ·· I
.·. : Välitön koelähde: synteettinen • · · t*..* Ominaisuudet: mutageeninen oligodeoksiribonukleotidi-aluke • e e * 30 GCGGAGGATGC GTTGAATAAA ACTGC 25 ·· · • · · • · • · V : Sekvenssi nro e
Sekvenssityyppi: DNA , 35 Sekvenssin pituus: 28 emästä Säikeisyys: yksisäikeinen · Topologia: lineaarinen I < i 49 105482 Lähde: synteettinen oligonukleotidi Välitön koelähde: synteettinen
Ominaisuudet: mutageeninen oligodeoksiribonukleotidi-aluke 5 CAGCTTCAGC AGTAATGTTT GCCGTTTC 28
Sekvenssi nro 9
Sekvenssityyppi: DNA Sekvenssin pituus: 21 emästä 10 Säikeisyys: yksisäikeinen Topologia: lineaarinen Lähde: synteettinen oligonukleotidi Välitön koelähde: synteettinen
Ominaisuudet: mutageeninen oligodeoksiribonukleotidi-aluke 15 ATCTAAGTAG TTGATGACAG C 21
Sekvenssi nro 10
20 Sekvenssityyppi: DNA
Sekvenssin pituus: 30 emästä Säikeisyys: yksisäikeinen Topologia: lineaarinen \V Lähde: synteettinen oligonukleotidi • * '· 25 Välitön koelähde: synteettinen
Ominaisuudet: mutageeninen oligodeoksiribonukleotidi-aluke • · · • · · ··· · : GCTGTACCCC GGTTTCGTTA GCAGCAATGC 30 » M • * • tl « « · * * * 30 Sekvenssi nro 11
.. . Sekvenssityyppi: DNA
III
. Sekvenssin pituus: 30 emästä i t · Säikeisyys: yksisäikeinen \ 'r Topologia: lineaarinen 35 Lähde: synteettinen oligonukleotidi \ Välitön koelähde: synteettinen f r r « · « I a f a · ( * a « • a 50 105482
Ominaisuudet: "HDEL":ää ja kahta lopetuskodonia koodaava oligodesoksiribonukleotidi; sisältää Sful-paikan.
GTACCGTTCG AACACGACGA ATTATAATAG 30 5
Sekvenssi nro 12
Sekvenssityyppi: DNA Sekvenssin pituus: 30 emästä Säikeisyys: yksisäikeinen 10 Topologia: lineaarinen Lähde: synteettinen oligonukleotidi Välitön koelähde: synteettinen
Ominaisuudet: sekvenssin nro 11 oligonukleotidia koodaavan HDEL:n kanssa hybridisoituva oligodeoksiribonukleotidi; 15 sisältää Sful-paikan.
AATTCTATTA TAATTCGTCG TGTTCGAACG 30 I i
( P
• r i
• I
I C .
• · • · » • · « • ·· « • t • · · • ·· • · • ·· • 1 f • « « • · · • ♦ 1 • « • « • » » « · « • ♦ · » * r * • < .
• 4 · 4 1 • « « ( 4 ( • 4 4 4 «444 4 • 41 • 4 4 • «
Claims (13)
1. Menetelmä heterologisen proteiinin valmistamiseksi eukaryoottisessa isäntäsolussa, tunnettu siitä, että 5 transformoidaan isäntäsolu nukleiinihapolla, joka koodaa sekä proteiinin pro-muotoa, joka käsittää pro-sekvenssin, että kaksiemäksistä, muokkaavaa endoproteaasia, joka kykenee poistamaan pro-sekvenssin ja on fuusioitunut endoplas-misen retikulumin retentiosignaaliin, ja viljellään isän-10 täsolua heterologisen proteiinin tuottamiseksi.
2. Patenttivaatimuksen 1 mukainen menetelmä, tunnettu siitä, että heterologista proteiinia ja kaksiemäksistä, muokkaavaa endoproteaasia koodaavat erilliset nukleiinihapot. 15
3. Patenttivaatimuksen 2 mukainen menetelmä, tunnettu siitä, että isäntäsolu transformoidaan pysyvästi kaksiemäksistä, muokkaavaa endoproteaasia koodaavalla nukleiinihapolla ja sen jälkeen transformoidaan vielä heterologista 20 proteiinia koodaavalla nukleiinihapolla.
4. Jonkin patenttivaatimuksista 1-3 mukainen menetelmä, • · I tunnettu siitä, että isäntäsolu on hiivasolu ja kak- ’ , siemäksinen, muokkaava endoproteaasi on KEX2 tai YAP3. • * « 25 • I • · ' ί·ί
· 5. Minkä tahansa edellä esitetyn patenttivaatimuksen mu- · · *. ·: kainen menetelmä, tunnettu siitä, että pro-sekvenssi on • M V * hiivan α-tekijän pro-sekvenssi.
6. Mikä tahansa edellä esitetyn patenttivaatimuksen mu- • M ·**'. kainen menetelmä, tunnettu siitä, että heterologinen pro- • · · ,* . teiini on biologisesti aktiivinen proteiini. • · · • ·· • « <« • r
'···' 7. Patenttivaatimuksen 6 mukainen menetelmä, tunnettu sii- : 35 tä, että biologisesti aktiivinen proteiini on insuliinin 4 « kaltainen proteiini. 105482
8. Rekombinantti-DNA-molekyyli, joka käsittää ekspressio-kasetin, joka koodaa endoplasmisen retikulumin retentio-signaaliin fuusioitunutta kaksiemäksistä, muokkaavaa endo-proteaasia. 5
9. Patenttivaatimuksen 8 mukainen rekombinantti DNA-mole-kyyli, tunnettu siitä, että kaksiemäksinen, muokkaava endoproteaasi on liukoinen.
10. Patenttivaatimuksen 8 mukainen rekombinantti-DNA-mole- kyyli, tunnettu siitä, että kaksiemäksinen, muokkaava endoproteaasi on KEX2, jolla on C-terminaalinen häntä HDEL, liukoinen KEX2, jonka aminohapposekvenssi on esitetty sekvenssissä n:o 1 ja jolla on C-terminaalinen häntä 15 HDEL, tai YAP3, jolla on C-terminaalinen häntä HDEL.
11. Hybridivektori, tunnettu siitä, että se käsittää jonkin patenttivaatimuksista 8-10 mukaisen rekombinantti-DNA-molekyylin. 20
12. Eukaryoottinen isäntäsolu, joka on transformoitu pa- • . tenttivaatimuksen 11 mukaisella vektorilla.
• « < • « • « • · • · : " 13. Patenttivaatimuksen 12 mukainen eukaryoottinen isän- * ♦ « ’···' 25 täsolu, tunnettu siitä, että se on stabiilisti trans- » · 9 • · < ί.ϊ i formoitu. • · • · · • ♦♦ • · • I* • ♦ ♦ • · · ·«« : : *♦· ··· • e • ♦ ·«· • · • · · • * · • · • m • · * « • M » « « « ♦ « « • » · « • 4 105482
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| EP91810984 | 1991-12-16 | ||
| EP91810984 | 1991-12-16 |
Publications (3)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| FI925678A0 FI925678A0 (fi) | 1992-12-14 |
| FI925678A FI925678A (fi) | 1993-06-17 |
| FI105482B true FI105482B (fi) | 2000-08-31 |
Family
ID=8208912
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| FI925678A FI105482B (fi) | 1991-12-16 | 1992-12-14 | Menetelmä heterologisen proteiinin valmistamiseksi eukaryoottisessa isäntäsolussa |
Country Status (17)
| Country | Link |
|---|---|
| US (2) | US5501975A (fi) |
| EP (1) | EP0548012B1 (fi) |
| JP (1) | JP3305781B2 (fi) |
| KR (1) | KR100270283B1 (fi) |
| AT (1) | ATE157703T1 (fi) |
| AU (1) | AU667852B2 (fi) |
| CA (1) | CA2085308C (fi) |
| DE (1) | DE69222013T2 (fi) |
| DK (1) | DK0548012T3 (fi) |
| ES (1) | ES2107520T3 (fi) |
| FI (1) | FI105482B (fi) |
| GR (1) | GR3025324T3 (fi) |
| IL (1) | IL104075A (fi) |
| MX (1) | MX9207291A (fi) |
| NO (1) | NO308619B1 (fi) |
| NZ (1) | NZ245469A (fi) |
| ZA (1) | ZA929711B (fi) |
Families Citing this family (16)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| GB9404270D0 (en) * | 1994-03-05 | 1994-04-20 | Delta Biotechnology Ltd | Yeast strains and modified albumins |
| US5807702A (en) * | 1995-02-27 | 1998-09-15 | Abbott Laboratories | Method for expressing phosphorylated recombinant human β-casein in a bacterial system |
| WO1996027017A1 (en) * | 1995-02-27 | 1996-09-06 | Abbott Laboratories | A method for expressing modified recombinant proteins in a bacterial system |
| US5942254A (en) * | 1995-02-27 | 1999-08-24 | Abbott Laboratories | Phosphorylated recombinant human β-casein expressed in a bacterial system |
| NZ303621A (en) * | 1995-02-27 | 1999-04-29 | Abbott Lab | A plasmid contains recombinant proteins such as human beta-casein with an encoded exogenous enzyme such as human kinase capable of phosphorylating recombinant beta-casein in a bacterial system |
| US5710044A (en) * | 1995-02-27 | 1998-01-20 | Abbott Laboratories | Plasmid for expressing phosphorylated recombinant proteins in a bacterial system |
| AT404838B (de) * | 1995-11-24 | 1999-03-25 | Immuno Ag | Herstellung von proteinen aus pro-proteinen durch fusionsproteine abgeleitet von furin oder furinanalogen |
| FR2751000B1 (fr) | 1996-07-12 | 1998-10-30 | Inst Nat Sante Rech Med | Adn specifiques des bacteries de l'espece neisseria meningitidis, leurs procedes d'obtention et leurs applications biologiques |
| JP4463988B2 (ja) * | 1998-11-06 | 2010-05-19 | ノボ ノルディスク ヘルス ケア アクチェンゲゼルシャフト | Ｖｉｉ因子の生産方法 |
| JP4092194B2 (ja) | 2000-06-30 | 2008-05-28 | フランダース インターユニバーシティ インスティテュート フォア バイオテクノロジー （ヴィーアイビー） | ピキアパストリス（ＰｉｃｈｉａＰａｓｔｏｒｉｓ）におけるタンパク質糖鎖修飾 |
| DE10221411B4 (de) * | 2002-05-14 | 2004-07-08 | GSF-Forschungszentrum für Umwelt und Gesundheit GmbH | Rekombinantes Fowlpox-Virus |
| US20040117874A1 (en) * | 2002-10-15 | 2004-06-17 | Jianjun Yang | Methods for accumulating translocated proteins |
| US7507573B2 (en) | 2003-11-14 | 2009-03-24 | Vib, Vzw | Modification of protein glycosylation in methylotrophic yeast |
| WO2006073472A2 (en) * | 2004-05-21 | 2006-07-13 | Mo Bio Laboratories, Inc. | Kits and processes for removing contaminants from nucleic acids in environmental and biological samples |
| US20080082338A1 (en) * | 2006-09-29 | 2008-04-03 | O'neil Michael P | Systems and methods for secure voice identification and medical device interface |
| US9926570B2 (en) | 2013-03-06 | 2018-03-27 | Glaxosmithkline Llc | Host cells and methods of use |
Family Cites Families (4)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| DE3685996T2 (de) * | 1985-06-11 | 1993-01-14 | Ciba Geigy Ag | Hybrid-interferone. |
| US5391485A (en) * | 1985-08-06 | 1995-02-21 | Immunex Corporation | DNAs encoding analog GM-CSF molecules displaying resistance to proteases which cleave at adjacent dibasic residues |
| FI100106B (fi) * | 1986-12-05 | 1997-09-30 | Novartis Ag | Menetelmä plasminogeenin yksisäikeisen yhdistelmäaktivaattorin valmist amiseksi |
| JP2643968B2 (ja) * | 1988-02-03 | 1997-08-25 | サントリー株式会社 | Ｋｅｘ２エンドプロテアーゼ及びその製造方法 |
-
1992
- 1992-12-08 AT AT92810964T patent/ATE157703T1/de active
- 1992-12-08 EP EP92810964A patent/EP0548012B1/en not_active Expired - Lifetime
- 1992-12-08 ES ES92810964T patent/ES2107520T3/es not_active Expired - Lifetime
- 1992-12-08 DK DK92810964.4T patent/DK0548012T3/da active
- 1992-12-08 DE DE69222013T patent/DE69222013T2/de not_active Expired - Lifetime
- 1992-12-10 AU AU30071/92A patent/AU667852B2/en not_active Expired
- 1992-12-13 IL IL10407592A patent/IL104075A/xx not_active IP Right Cessation
- 1992-12-14 NZ NZ245469A patent/NZ245469A/en unknown
- 1992-12-14 KR KR1019920024117A patent/KR100270283B1/ko not_active IP Right Cessation
- 1992-12-14 CA CA002085308A patent/CA2085308C/en not_active Expired - Lifetime
- 1992-12-14 FI FI925678A patent/FI105482B/fi not_active IP Right Cessation
- 1992-12-15 NO NO924847A patent/NO308619B1/no not_active IP Right Cessation
- 1992-12-15 ZA ZA929711A patent/ZA929711B/xx unknown
- 1992-12-15 MX MX9207291A patent/MX9207291A/es unknown
- 1992-12-15 JP JP33410492A patent/JP3305781B2/ja not_active Expired - Lifetime
-
1994
- 1994-10-24 US US08/328,961 patent/US5501975A/en not_active Expired - Lifetime
-
1995
- 1995-06-05 US US08/462,397 patent/US5618690A/en not_active Expired - Lifetime
-
1997
- 1997-11-07 GR GR970402966T patent/GR3025324T3/el unknown
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| AU667852B2 (en) | 1996-04-18 |
| AU3007192A (en) | 1993-06-17 |
| DK0548012T3 (da) | 1998-04-14 |
| ATE157703T1 (de) | 1997-09-15 |
| JP3305781B2 (ja) | 2002-07-24 |
| US5501975A (en) | 1996-03-26 |
| ES2107520T3 (es) | 1997-12-01 |
| FI925678A0 (fi) | 1992-12-14 |
| EP0548012A1 (en) | 1993-06-23 |
| MX9207291A (es) | 1993-07-01 |
| KR930013115A (ko) | 1993-07-21 |
| JPH06197787A (ja) | 1994-07-19 |
| EP0548012B1 (en) | 1997-09-03 |
| ZA929711B (en) | 1993-06-16 |
| DE69222013T2 (de) | 1998-01-29 |
| CA2085308A1 (en) | 1993-06-17 |
| DE69222013D1 (de) | 1997-10-09 |
| NO308619B1 (no) | 2000-10-02 |
| NO924847L (no) | 1993-06-17 |
| NO924847D0 (no) | 1992-12-15 |
| NZ245469A (en) | 1995-03-28 |
| FI925678A (fi) | 1993-06-17 |
| US5618690A (en) | 1997-04-08 |
| IL104075A (en) | 2003-01-12 |
| GR3025324T3 (en) | 1998-02-27 |
| CA2085308C (en) | 2003-12-02 |
| KR100270283B1 (ko) | 2000-11-01 |
| IL104075A0 (en) | 1993-05-13 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| FI105482B (fi) | Menetelmä heterologisen proteiinin valmistamiseksi eukaryoottisessa isäntäsolussa | |
| JP4341859B2 (ja) | 酵母での異種タンパク質の発現の方法 | |
| US5102789A (en) | Production of epideramal growth factor in pichia pastoris yeast cells | |
| US6500645B1 (en) | N-terminally extended proteins expressed in yeast | |
| AU624694B2 (en) | Yeast processing system comprising a negatively charged amino acid adjacent to the processing site | |
| JP3730255B2 (ja) | イーストにおいて発現されたｎ末端に伸長した蛋白質 | |
| CZ364196A3 (en) | Dna expression cassette, yeast expression vector, yeast cell and process for preparing a polypeptide in yeast | |
| JP2001527387A (ja) | 合成リーダーペプチド配列 | |
| IE66044B1 (en) | Improvements in the production of polypeptides | |
| FI94773C (fi) | Menetelmä trombiini-inhibiittorien tuottamiseksi | |
| EP0946735B1 (en) | N-terminally extended proteins expressed in yeast | |
| ES2242969T3 (es) | Vector para la expresion de proteinas con prolongacion n-terminal en celulas de levadura. | |
| EP1211314A2 (en) | Expression of a human insulin precursor in p. pastoris | |
| FI106720B (fi) | Fuusioproteiinien valmistus in vitro | |
| JP2990162B2 (ja) | ヒト酸性線維芽細胞成長因子の組成物、その製法、ｄｎａ構築物および酵母宿主細胞 | |
| NZ250442A (en) | Hybrid vectors and yeast cells and their use in the production of polypeptides | |
| RU2167939C2 (ru) | Способ продуцирования полипептида в дрожжах | |
| KR19990025486A (ko) | Yap3 유전자가 결손된 신규한 효모균주 및 그를 이용한 재조합 인체 부갑상선호르몬의 생산 |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| GB | Transfer or assigment of application |
Owner name: NOVARTIS AG |
|
| MA | Patent expired |