ES2898695T3 - Derivados de benzoxaborol para el tratamiento de infecciones bacterianas - Google Patents

Derivados de benzoxaborol para el tratamiento de infecciones bacterianas Download PDF

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Abstract

Un compuesto que tiene una estructura que es: **(Ver fórmula)** en la que R4 se selecciona del grupo que consiste en halógeno, metilo, etilo, propilo, isopropilo, butilo, isobutilo, sec-butilo, metoxi, etoxi, propoxi, isopropoxi, butoxi, isobutoxi, y sec-butoxi; y en la que a es 2, 3 o 4; y R12 se selecciona del grupo que consiste en H, OH, NH2, metilo, etilo, -NHS(O)2CH3, ciano, -NHC(O)CH3, -NHC(O)NHCH2CH3, -C(O)NH2, -C(O)OH, 4-(metoxi)fenilo, bencilo, benzoxi, -NHC(O)OCH2Ph, -C(O)NHCH2CH2OH y -C(NH2)(NH); o una sal, hidrato o solvato de los mismos.

Description

DESCRIPCIÓN
Derivados de benzoxaborol para el tratamiento de infecciones bacterianas
Antecedentes de la invención
El aumento global de bacterias y otros microorganismos resistentes a antibióticos y antimicrobianos en general, plantea una gran amenaza. El despliegue de cantidades masivas de agentes antimicrobianos en la ecosfera durante los últimos 60 años ha introducido una poderosa presión selectiva para la aparición y propagación de patógenos resistentes a los antimicrobianos. Por lo tanto, existe la necesidad de descubrir nuevos antimicrobianos de amplio espectro, tal como antibióticos, útiles para combatir microorganismos, especialmente aquellos con resistencia a múltiples fármacos.
Moléculas que contienen boro, tales como 1-hidroxi-1,3-dihidro-benzo[c][1,2]oxaborol (también conocido como 1-hidroxi-benzo[c][1,2]oxaborol u oxaboroles o br. s.es borónicos cíclicos), útiles como antimicrobianos, se han descrito previamente, tal como en las solicitudes de patente de los Estados Unidos No. 12/142.692 (publicación de patente de los Estados Unidos No. 2009/0227541); 11/505.591 (publicación de patente de los Estados Unidos No. 2006/0234981) y 11/357.687 (publicación de patente de los Estados Unidos No. 2007/0155699). En términos generales, un 1-hidroxi-1,3-dihidro-benzo[c][1,2]oxaborol tiene la siguiente estructura y sistema de numeración de sustituyentes:
Figure imgf000002_0001
Sorprendentemente, ahora se ha descubierto que ciertas clases de 1-hidroxi-1,3-dihidro-benzo[c][1,2]oxaboroles son antibacterianos eficaces. Este y otros usos de estos 1-hidroxi-1,3-dihidro-benzo[c][1,2]oxaboroles se describen en el presente documento.
Sumario de la invención
En un primer aspecto, la invención proporciona un compuesto que tiene una estructura de acuerdo con la fórmula:
Figure imgf000002_0002
en la que R4 se selecciona del grupo que consiste en halógeno, metilo, etilo, propilo, isopropilo, butilo, isobutilo, secbutilo, metoxi, etoxi, propoxi, isopropoxi, butoxi, isobutoxi y sec-butoxi; y en la que a es 2, 3 o 4; y R12 se selecciona del grupo que consiste en H, OH, NH2, metilo, etilo, -NHS(O^CHa, ciano, -NHC(O)CHa, -NHC(O)NHCH2CH3, -C(O)NH2, -C(O)OH, 4-(metoxi)fenilo, bencilo, benzoxi, -NHC(O)OCH2Ph, -C(O)NHCH2CH2OH y -C(NH2)(NH); o una sal, hidrato o solvato de los mismos.
En un segundo aspecto, la invención proporciona una combinación que comprende: a) un compuesto de la invención, o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo; y b) un agente terapéuticamente activo.
En un tercer aspecto, la invención proporciona una formulación farmacéutica que comprende: a) un compuesto de la invención, o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo; y b) un excipiente farmacéuticamente aceptable.
En un cuarto aspecto, la invención proporciona un compuesto de la invención o una sal, hidrato o solvato farmacéuticamente aceptable del mismo, para uso en terapia.
En un quinto aspecto, la invención proporciona un compuesto de la invención o una sal, hidrato o solvato del mismo farmacéuticamente aceptable, para su uso en el tratamiento de una enfermedad causada por una infección por micobacterias.
En un sexto aspecto, la invención proporciona un compuesto de la invención o una sal, hidrato o solvato farmacéuticamente aceptable del mismo, para su uso en el tratamiento de tuberculosis.
En un séptimo aspecto, la invención proporciona una composición que comprende un primer estereoisómero de un compuesto de la invención, o una sal hidrato o solvato del mismo; y al menos un estereoisómero adicional del primer estereoisómero; en el que el primer estereoisómero está presente en un exceso enantiomérico de al menos un 80% con respecto a dicho al menos un estereoisómero adicional.
Breve descripción de los dibujos
La Figura 1 muestra datos biológicos de ejemplos de compuestos de la invención.
Descripción detallada de la invención
I. Definiciones y abreviaturas
Como se usa en el presente documento, las formas singulares "un", "uno, una" y "el, la" incluyen referencias en plural a menos que el contexto indique claramente lo contrario. Por ejemplo, la referencia a "un agente activo" incluye un único agente activo así como dos o más agentes activos diferentes en combinación. Debe entenderse que la presente enseñanza no se limita a las formas de dosificación específicas, vehículos o similares, descritos en el presente documento y, como tales, pueden variar.
Las abreviaturas utilizadas en este documento generalmente tienen su significado convencional dentro de las artes química y biológica.
Se han utilizado las siguientes abreviaturas: Ac es acetilo; AcOH es ácido acético; ACTBr es bromuro de cetiltrimetilamonio; AIBN es azobisisobutironitrilo o 2,2-azobisisobutironitrilo; ac. es acuoso; Ar es arilo; B2pin2 es bis (pinacolato)diboro; Bn es, en general, bencilo [véase Cbz para un ejemplo de una excepción]; (BnS)2 es disulfuro de bencilo; BnSH es bencil tiol o bencil mercaptano; BnBr es bromuro de bencilo; Boc es terc-butoxicarbonilo; Boc2O es dicarbonato de di-terc-butilo; Bz es, en general, benzoílo; BzOOH es peróxido de benzoílo; Cbz o Z es benciloxicarbonilo o carboxibencilo; CS2CO3 es carbonato de cesio; CSA es ácido canforsulfónico; CTAB es bromuro de cetiltrimetilamonio; Cy es ciclohexilo; DABCO es 1,4-diazabiciclo[2.2.2]octano; DCM es diclorometano o cloruro de metileno; DHP es dihidropirano; DIAD es azodicarboxilato de diisopropilo; DIEA o DIPEA es N,N-diisopropiletilamina; DMAP es 4-(dimetilamino)piridina; DME es 1,2-dimetoxietano; DMF es N,N-dimetilformamida; DMSO es dimetilsulfóxido; equiv. o eq. es equivalente; EtOAc es acetato de etilo; EtOH es etanol; Et2O es éter dietílico; EDCI es clorhidrato de N-(3-dimetilaminopropil)-N'-etilcarbodiimida; ELS es dispersión de luz por evaporación; equiv. o eq. es equivalente; h son horas; HATU es hexafluorofosfato de O-(7-azabenzotriazol-1-il)-N,N,N',N'-tetrametiluronio; HOBt es N-hidroxibenzotriazol; HCl es ácido clorhídrico; HPLC es cromatografía líquida de alta rendimiento; ISCO Companion es un equipo de cromatografía ultrarrápida automatizado con análisis de fracciones por absorción UV disponible a través de Presearch; KOAc o AcOK es acetato de potasio; K2CO3 es carbonato de potasio; LiAlH4 o LAH es hidruro de litio y aluminio; LDA es diisopropilamida de litio; LHMDS es bis(trimetilsilil)amida de litio; KHMDS es bis (trimetilsilil)amida de potasio; LiOH es hidróxido de litio; m-CPBA es ácido 3-cloroperoxibenzoico; MeCN o ACN es cianuro de metilo o cianometano o etanonitrilo o acetonitrilo, que son todos nombres para el mismo compuesto; MeOH es metanol; MgSO4 es sulfato de magnesio; mins o min son minutos; Mp o MP es punto de fusión; NaCNBH3 es cianoborohidruro de sodio; NaOH es hidróxido de sodio; Na2SO4 es sulfato de sodio; NBS es N-bromosuccinimida; NH4Cl es cloruro de amonio; NIS es N-yodosuccinimida; N2 es nitrógeno; NMM es N-metilmorfolina; n-BuLi es n-butillitio; durante la noche es O/N; PdCh (pddf) es 1,1'-bis(difenilfosfino)ferroceno]dicloropaladio (II); Pd/C es el catalizador conocido como paladio sobre carbono; Pd2(dba)3 es un catalizador organometálico conocido como tris (dibencilidenacetona)dipaladio (0); Ra Ni o Raney Ni es níquel Raney; Ph es fenilo; PMB es p-metoxibencilo; PrOH es 1-propanol; iPrOH es 2-propanol; POCh es óxido de cloruro de fósforo; PTSA es ácido para-toluenosulfónico; Pyr. o Pyr o Py, como se usa en este documento, significa piridina; RT o rt o r.t. es temperatura ambiente; sat. Saturado, Siamina o Si-NH2 es sílice con la función amina, disponible a través de SiliCycle; Si-pyr es sílice con la función piridilo, disponible a través de SiliCycle; TEA o Et3N es trietilamina; TFA es ácido trifluoroacético; Tf2O es anhídrido trifluorometanosulfónico; THF es tetrahidrofurano; TFAA es anhídrido trifluoroacético; THP es tetrahidropiranilo; TMSI es yoduro de trimetilsililo; H2O es agua; diNO2PhSO2Cl es cloruro de dinitrofenilsulfonilo; 3-F-4-NO2-PhSO2Cl es cloruro de 3-fluoro-4-nitrofenilsulfonilo; 2-MeO-4-NO2-PhSO2Cl es cloruro de 2-metoxi-4-nitrofenilsulfonilo; y (EtO)2POCH2COOEt es un br. s. trietílico del ácido fosfonoacético conocido como fosfonoacetato de trietilo.
"Compuesto de la invención", como se usa en el presente documento, se refiere a los compuestos discutidos en el presente documento, sales (por ejemplo, sales farmacéuticamente aceptables), solvatos e hidratos de estos compuestos.
El término "poli" como se usa en este documento significa al menos 2. Por ejemplo, un ión metálico polivalente es un ión metálico que tiene una valencia de al menos 2.
"Fracción" se refiere a un radical de una molécula que está unido al resto de la molécula.
El símbolo, ya sea que se utilice como enlace o se muestre perpendicularmente a un enlace, indica el punto en el que la fracción mostrada se une al resto de la molécula.
El término "alquilo", por sí mismo o como parte de otro sustituyente, significa, a menos que se indique lo contrario, un radical hidrocarbonado de cadena lineal o ramificada, o cíclico, o una combinación de los mismos, que puede ser completamente saturado, mono o poliinsaturado y puede incluir radicales di y multivalentes, que tienen el número de átomos de carbono designado (es decir, C1-C10 significa de uno a diez carbonos). En algunas realizaciones, el término "alquilo" significa una cadena lineal o ramificada, o combinaciones de las mismas, que pueden estar completamente saturadas, monoinsaturadas o poliinsaturadas y pueden incluir radicales di y multivalentes. Los ejemplos de radicales hidrocarbonados saturados incluyen, pero no se limitan a, grupos tales como metilo, etilo, n-propilo, isopropilo, n-butilo, t-butilo, isobutilo, sec-butilo, ciclohexilo, (ciclohexil)metilo, ciclopropilmetilo, homólogos e isómeros de, por ejemplo, npentilo, n-hexilo, n-heptilo, n-octilo y similares. Un grupo alquilo insaturado es uno que tiene uno o más dobles enlaces 0 triples enlaces. Los ejemplos de grupos alquilo insaturados incluyen, pero no se limitan a, vinilo, 2-propenilo, crotilo, 2-isopentenilo, 2-(butadienilo), 2,4-pentadienilo, 3-(1,4-pentadienilo), etinilo, 1 y 3-propinilo, 3-butinilo y los homólogos e isómeros superiores.
El término "alquileno" por sí mismo o como parte de otro sustituyente significa un radical divalente derivado de un alcano, como se ejemplifica, pero no se limita, por -CH2CH2CH2CH2-. Normalmente, un grupo alquilo (o alquileno) tendrá de 1 a 24 átomos de carbono, prefiriéndose en la invención aquellos grupos que tengan 10 o menos átomos de carbono. Un "alquilo inferior" o "alquileno inferior" es un grupo alquilo o alquileno de cadena más corta, que generalmente tiene ocho o menos átomos de carbono.
El término "alquenileno" por sí mismo o como parte de otro sustituyente significa un radical divalente derivado de un alqueno.
El término "cicloalquileno" por sí mismo o como parte de otro sustituyente significa un radical divalente derivado de un cicloalquilo.
El término "heteroalquileno" por sí mismo o como parte de otro sustituyente significa un radical divalente derivado de un heteroalcano.
El término "heterocicloalquileno" por sí mismo o como parte de otro sustituyente significa un radical divalente derivado de un heterocicloalcano.
El término "arileno" por sí mismo o como parte de otro sustituyente significa un radical divalente derivado de un arilo.
El término "heteroarileno" por sí mismo o como parte de otro sustituyente significa un radical divalente derivado de heteroarilo.
Los términos "alcoxi", "alquilamino" y "alquiltio" (o tioalcoxi) se usan en su sentido convencional, y se refieren a aquellos grupos alquilo unidos al resto de la molécula a través de un átomo de oxígeno, un grupo amino o un átomo de azufre, respectivamente.
El término "heteroalquilo", por sí mismo o en combinación con otro término, significa, a menos que se indique lo contrario, un radical hidrocarbonado cíclico o de cadena lineal o ramificada estable, o combinaciones de los mismos, que constan del número indicado de átomos de carbono y al menos un heteroátomo. En algunas realizaciones, el término "heteroalquilo", por sí mismo o en combinación con otro término, significa una cadena lineal o ramificada estable, o combinaciones de las mismas, que consisten en el número indicado de átomos de carbono y al menos un heteroátomo. En un ejemplo de realización, los heteroátomos pueden seleccionarse del grupo que consiste en B, O, N y S, y en el que los átomos de nitrógeno y azufre pueden opcionalmente oxidarse y el heteroátomo de nitrógeno opcionalmente puede cuaternizarse. El o los heteroátomos B, O, N y S se pueden colocar en cualquier posición interior del grupo heteroalquilo o en la posición en la que el grupo alquilo está unido al resto de la molécula. Los ejemplos incluyen, pero no se limitan a, -CH2-CH2-O-CH3, -CH2-CH2-NH-CH3, -CH2-CH2-N(CH3)-CH3, -CH2-S-CH2-CH3, -CH2-CH2, -S(O)-CH3, -CH2-CH2-S(O)2-CH3, -CH=CH-O-CH3, -CH2-CH=N-OCH3 y -CH=CH-N(CH3)-CH3. Hasta dos heteroátomos pueden ser consecutivos, como por ejemplo -CH2-NH-OCH3. De manera similar, el término "heteroalquileno" por sí mismo o como parte de otro sustituyente significa un radical divalente derivado de heteroalquilo, como se ejemplifica, pero no se limita por, -CH2-CH2-S-CH2-CH2-y -CH2-S-CH2-CH2-NH-CH2-. Para los grupos heteroalquileno, los heteroátomos también pueden ocupar uno o ambos extremos de la cadena (por ejemplo, alquilenoxi, alquilenodioxi, alquilenamino, alquilendiamino y similares). Además, para los grupos de enlace alquileno y heteroalquileno, la dirección en la que está escrita la fórmula del grupo de enlace no implica ninguna orientación del grupo de enlace. Por ejemplo, la fórmula -C(O)2R'- representa tanto -C(O)2R'- como -R'C(O)2-.
Los términos "cicloalquilo" y "heterocicloalquilo", por sí mismos o en combinación con otros términos, representan, a menos que se indique lo contrario, versiones cíclicas de "alquilo" y "heteroalquilo", respectivamente. Además, para el heterocicloalquilo, un heteroátomo puede ocupar la posición en la que el heterociclo está unido al resto de la molécula. Los ejemplos de cicloalquilo incluyen, pero no se limitan a, ciclopentilo, ciclohexilo, 1-ciclohexenilo, 3-ciclohexenilo, cicloheptilo y similares. Los ejemplos de heterocicloalquilo incluyen, pero no se limitan a, 1-(1,2,5,6-tetrahidropiridilo), 1 -piperidinilo, 2-piperidinilo, 3-piperidinilo, 4-morfolinilo, 3-morfolinilo, tetrahidrofuran-2-ilo, tetrahidrofuran-3-ilo, tetrahidrotien-2-ilo, tetrahidrotien-3-ilo, 1 -piperazinilo, 2-piperazinilo y similares.
Los términos "halo" o "halógeno", por sí mismos o como parte de otro sustituyente, significan, a menos que se indique lo contrario, un átomo de flúor, cloro, bromo o yodo. Además, se pretende que términos como "haloalquilo" incluyan monohaloalquilo y polihaloalquilo. Por ejemplo, el término "halo-alquilo (C1-C4)" incluye, pero no se limita a, trifluorometilo,2,2,2-trifluoroetilo, 4-clorobutilo, 3-bromopropilo y similares.
El término "arilo" significa, a menos que se indique lo contrario, un sustituyente aromático poliinsaturado que puede ser un solo anillo o múltiples anillos (preferiblemente de 1 o 2 o 3 anillos), que están fusionados entre sí o unidos covalentemente. El término "heteroarilo" se refiere a grupos (o anillos) arilo que contienen de uno a cuatro heteroátomos. En un ejemplo de realización, el heteroátomo se selecciona entre B, N, O y S, en el que los átomos de nitrógeno y azufre están opcionalmente oxidados y el átomo o átomos de nitrógeno están opcionalmente cuaternizados. Se puede unir un grupo heteroarilo al resto de la molécula a través de un heteroátomo. Los ejemplos no limitantes de grupos arilo y heteroarilo incluyen fenilo, 1-naftilo, 2-naftilo, 4-bifenilo, 1 -pirrolilo, 2-pirrolilo, 3-pirrolilo, 3- pirazolilo, 2-imidazolilo, 4-imidazolilo, pirazinilo, 2-oxazolilo, 4-oxazolilo, 2-fenil-4-oxazolilo, 5-oxazolilo, 3-isoxazolilo, 4- isoxazolilo, 5-isoxazolilo, 2-tiazolilo, 4-tiazolilo, 5-tiazolilo, 2-furilo, 3-furilo, 2-tienilo, 3-tienilo, 2-piridilo, 3-piridilo, 4-piridilo, 2-pirimidilo, 4-pirimidilo, 5-benzotiazolilo, purinilo, 2-bencimidazolilo, 5-indolilo, 1 -isoquinolilo, 5-isoquinolilo, 2-quinoxalinilo, 5-quinoxalinilo, 3-quinolilo y 6-quinolilo. Los sustituyentes para cada uno de los sistemas de anillos de arilo y heteroarilo indicados anteriormente se seleccionan del grupo de sustituyentes aceptables que se describen a continuación.
Por brevedad, el término "arilo" cuando se usa en combinación con otros términos (por ejemplo, ariloxi, ariltioxi, arilalquilo) incluye aquellos radicales en los que un grupo arilo está unido a través del siguiente resto de la molécula. Por lo tanto, el término "arilalquilo" pretende incluir aquellos radicales en los que un grupo arilo está unido a un grupo alquilo (por ejemplo, bencilo, 1-(3-nitrofenil)etilo y similares). Un sustituyente tal como bencilo o 1-(3-nitrofenil)etilo también puede representarse por "alquilo sustituido" en el que el radical etilo está sustituido con una fracción 3-nitrofenilo. El término "ariloxi" pretende incluir aquellos radicales en los que un grupo arilo está unido a un átomo de oxígeno. El término "ariloxialquilo" pretende incluir aquellos radicales en los que un grupo arilo está unido a un átomo de oxígeno que luego se une a un grupo alquilo (por ejemplo, fenoximetilo, 3-(1-naftiloxi)propilo y similares).
Por brevedad, el término "heteroarilo" cuando se usa en combinación con otros términos (por ejemplo, heteroariloxi, heteroariltioxi, heteroarilalquilo) incluye aquellos radicales en los que un grupo heteroarilo está unido a través de la siguiente fracción al resto de la molécula. Por tanto, el término "heteroarilalquilo" pretende incluir aquellos radicales en los que un grupo heteroarilo está unido a un grupo alquilo (por ejemplo, piridilmetilo y similares). El término "heteroariloxi" pretende incluir aquellos radicales en los que un grupo heteroarilo está unido a un átomo de oxígeno. El término "heteroariloxialquilo" pretende incluir aquellos radicales en los que un grupo arilo está unido a un átomo de oxígeno que luego se une a un grupo alquilo (por ejemplo, 2-piridiloximetilo y similares).
Cada uno de los términos anteriores (p. Ej., "alquilo", "heteroalquilo", "arilo" y "heteroarilo") pretende incluir formas tanto sustituidas como no sustituidas del radical indicado. Los sustituyentes preferidos para cada tipo de radical se proporcionan a continuación.
Los sustituyentes para los radicales alquilo y heteroalquilo (incluidos los grupos a menudo denominados alquileno, alquenilo, heteroalquileno, heteroalquenilo, alquinilo, cicloalquilo, heterocicloalquilo, cicloalquenilo y heterocicloalquenilo) se denominan genéricamente "sustituyentes del grupo alquilo", y puede ser uno o más de una variedad de grupos seleccionados de, pero no limitado a: -R', -OR', =O, =NR', =N-OR', -NR'R", -SR', - halógeno, -SiR'R"R"', -OC(O)R', -C(O)R', -CO2R', -CONR'R", -OC(O)NR'R", -NR"C(O)R', -NR'-C(O)NR"R"', -NR"C(O)2R', -NR -C(NR'R"R"')=NR"", -NR""-C(NR'R")=NR"', -S(O)R', -S(O)2R', -S(O)2NR'R", -NR"SO2R' , -CN, -NO2, -N3, -CH(Ph)2, fluoroalcoxi (C1-C4) y fluoroalquilo (C1-C4), en un número que va de cero a (2m'+1), en el que m' es el número total de átomos de carbono en dicho radical. R', R", R"', R"" y R...cada uno preferiblemente se refiere independientemente a hidrógeno, heteroalquilo sustituido o no sustituido, arilo sustituido o no sustituido, por ejemplo, arilo sustituido con 1 o 2 o 3 halógenos, grupos alquilo, alcoxi o tioalcoxi, o grupos arilalquilo, sustituidos o no sustituidos. Cuando un compuesto de la invención incluye más de un grupo R, por ejemplo, cada uno de los grupos R se selecciona independientemente como lo son cada grupo R', R", R"', R"" y R...cuando más de uno de estos grupos está presente. Cuando R' y R" están unidos al mismo átomo de nitrógeno, se pueden combinar con el átomo de nitrógeno para formar un anillo de 5, 6 o 7 miembros. Por ejemplo, -NR'R" significa que incluye, pero sin limitarse a, 1 -pirrolidinilo y 4-morfolinilo. A partir de la discusión anterior de sustituyentes, un experto en la técnica entenderá que el término "alquilo" pretende incluir grupos que incluyen átomos de carbono unidos a grupos distintos de los grupos de hidrógeno, tales como haloalquilo (por ejemplo, -CF3 y -CH2CF3) y acilo (por ejemplo, -C(O)CH3, -C(O)CF3, -C(O)CH2OCH3 y similares).
De forma similar a los sustituyentes descritos para el radical alquilo, los sustituyentes de los grupos arilo y heteroarilo se denominan genéricamente "sustituyentes del grupo arilo". Los sustituyentes se seleccionan entre, por ejemplo: -R', -OR', =O, =NR', =N-OR', -NR'R ", - SR', -halógeno, -SiR'R"R"', -OC(O)R', -C(O)R', -CO2R', -CONR'R", -OC(O)NR'R", - NR"C(O)R', -NR'-C(O)NR"R"', -NR"C(O)2R', -NR -C(NR'R"R'")=NR"", -NR""-C(NR'R")=NR"', -S(O)R', -S(O)2R', -S(O)2NR'R", -NR"SO2R', -CN, -NO2, -N3, -CH(Ph)2, fluoroalcoxi (C1-C4) y fluoroalquilo (C1-C4), en un número que va desde cero hasta el número total de valencias abiertas en el sistema de anillo aromático; y en el que R', R", R"', R"" y R....se seleccionan preferiblemente independientemente de hidrógeno, alquilo sustituido o no sustituido, heteroalquilo sustituido o no sustituido, arilo sustituido o no sustituido y heteroarilo sustituido o no sustituido. Cuando un compuesto de la invención incluye más de un grupo R, por ejemplo, cada uno de los grupos R se selecciona independientemente como lo son cada grupo R', R", R"', R"" y R"" cuando más de uno de estos grupos están presentes.
Dos de los sustituyentes en átomos adyacentes del anillo de arilo o heteroarilo pueden opcionalmente reemplazarse con un sustituyente de fórmula -TC(O)-(CRR')qU-, en la que T y U son independientemente -NR-, -O-, -CRR'- o un enlace sencillo, y q es un número entero de 0 a 3. Alternativamente, dos de los sustituyentes en átomos adyacentes del anillo arilo o heteroarilo pueden opcionalmente reemplazarse con un sustituyente de fórmula -A-(CH2)r-B-, en la que A y B son independientemente -CRR'-, -O-, -NR-, -S-, -S(O)-, -S(O)2-, -S(O)2NR'- o un enlace sencillo, y r es un número entero de 1 o 2 o 3 o 4. Uno de los enlaces sencillos del nuevo anillo así formado puede sustituirse opcionalmente por un enlace doble. Alternativamente, dos de los sustituyentes en átomos adyacentes del anillo arilo o heteroarilo pueden opcionalmente reemplazarse con un sustituyente de fórmula -(CRR')sX-(CR"R"')d-, en la que s y d son independientemente números enteros de 0 o 1 o 2 o 3, y X es -O-, -NR'-, -S-, -S(O)-, -S(O)2- o -S(O)2NR"". Los sustituyentes R, R', R" y R'" se seleccionan preferiblemente independientemente entre hidrógeno o alquilo (Ci o C2 o C3 o C4 o C5 o C6) sustituido o no sustituido.
"Anillo", como se usa en el presente documento, significa un cicloalquilo sustituido o no sustituido, heterocicloalquilo sustituido o no sustituido, arilo sustituido o no sustituido o heteroarilo sustituido o no sustituido. Un anillo incluye fracciones de anillos fusionadas. El número de átomos en un anillo se define típicamente por el número de miembros en el anillo. Por ejemplo, un "anillo de 5 a 7 miembros" significa que hay 5, 6 o 7 átomos en la disposición circundante. A menos que se especifique lo contrario, el anillo incluye opcionalmente un heteroátomo. Por tanto, el término "anillo de 5 a 7 miembros" incluye, por ejemplo, fenilo, piridinilo y piperidinilo. El término "anillo heterocicloalquilo de 5 a 7 miembros", por otro lado, incluiría piridinilo y piperidinilo, pero no fenilo. El término "anillo" incluye además un sistema de anillos que comprende más de un "anillo", en el que cada "anillo" se define independientemente como anteriormente.
Como se usa en este documento, el término "heteroátomo" incluye átomos distintos de carbono (C) e hidrógeno (H). Los ejemplos incluyen oxígeno (O), nitrógeno (N) azufre (S), silicio (Si) y boro (B).
El término "grupo saliente" significa un grupo funcional o átomo que puede ser desplazado por otro grupo funcional o átomo en una reacción de sustitución, tal como una reacción de sustitución nucleófila. A modo de ejemplo, los grupos salientes representativos incluyen grupos triflato, cloro, bromo y yodo; grupos éster sulfónicos, tales como mesilato, tosilato, brosilato, nosilato y similares; y grupos aciloxi, tales como acetoxi, trifluoroacetoxi y similares.
El símbolo "R" es una abreviatura general que representa un grupo sustituyente que se selecciona de grupos alquilo sustituido o no sustituido, heteroalquilo sustituido o no sustituido, arilo sustituido o no sustituido, heteroarilo sustituido o no sustituido, cicloalquilo sustituido o no sustituido y heterocicloalquilo sustituido o no sustituido.
Por cantidad "eficaz" de un fármaco, formulación o permeante se entiende una cantidad suficiente de un agente activo para proporcionar el efecto local o sistémico deseado. Una cantidad "tópicamente eficaz", "farmacéuticamente eficaz" o "terapéuticamente eficaz" se refiere a la cantidad de fármaco necesaria para lograr el resultado deseado.
El término "sal farmacéuticamente aceptable" pretende incluir una sal de un compuesto de la invención que se prepara con ácidos o bases relativamente no tóxicos, dependiendo de los sustituyentes particulares encontrados en los compuestos descritos en el presente documento. Cuando los compuestos de la invención contienen funciones relativamente ácidas, se pueden obtener sales de adición de bases poniendo en contacto la forma neutra de dichos compuestos con una cantidad suficiente de la base deseada, pura o en un disolvente inerte adecuado. Ejemplos de sales de adición de bases farmacéuticamente aceptables incluyen sodio, potasio, calcio, amonio, amino orgánico (tal como colina o dietilamina o aminoácidos como d-arginina, l-arginina, d-lisina o l-lisina) o sal de magnesio, o una sal similar. Cuando los compuestos de la invención contienen funciones relativamente básicas, se pueden obtener sales de adición de ácido poniendo en contacto la forma neutra de tales compuestos con una cantidad suficiente del ácido deseado, puro o en un disolvente inerte adecuado. Ejemplos de sales de adición de ácido farmacéuticamente aceptables incluyen las derivadas de ácidos inorgánicos como los ácidos clorhídrico, bromhídrico, nítrico, carbónico, monohidrogenocarbónico, fosfórico, monohidrogenofosfórico, dihidrogenofosfórico, sulfúrico, monohidrogenosulfúrico, yodhídrico o fosforoso y similares, así como las sales derivadas de ácidos orgánicos relativamente no tóxicos como acético, propiónico, isobutírico, maleico, malónico, benzoico, succínico, subérico, fumárico, láctico, mandélico, Itálico, bencenosulfónico, p-tolilsulfónico, cítrico, tartárico, metanosulfónico y similares. También se incluyen sales de aminoácidos como arginato y similares, y sales de ácidos orgánicos como ácidos glucurónico o galactunórico y similares (véase, por ejemplo, Berge et al., "Pharmaceutical Salts", Journal of Pharmaceutical Science 66: 1-19 (1977)). Ciertos compuestos específicos de la invención contienen funciones tanto básicas como ácidas que permiten que los compuestos se conviertan en sales de adición de base o de ácido.
Las formas neutras de los compuestos se regeneran preferiblemente poniendo en contacto la sal con una base o ácido y aislando los compuestos originales de la manera convencional. La forma original del compuesto se diferencia de las diversas formas de sal en ciertas propiedades físicas, como la solubilidad en disolventes polares.
Ciertos compuestos de la invención pueden existir en formas no solvatadas así como en formas solvatadas, incluidas formas hidratadas. En general, las formas solvatadas son equivalentes a las formas no solvatadas y están incluidas dentro del alcance de la invención. Ciertos compuestos de la invención pueden existir en múltiples formas cristalinas o amorfas.
Ciertos compuestos de la invención poseen átomos de carbono asimétricos (centros ópticos) o dobles enlaces; los racematos, diastereómeros, isómeros geométricos e isómeros individuales están incluidos dentro del alcance de la invención. Las representaciones gráficas de compuestos racémicos, ambiescalémicos y escalémicos o enantioméricamente puros usados en la presente invención se han tomado de Maehr, J. Chem. Ed. 1985, 62: 114­ 120. Las porciones sólidas y rotas se utilizan para indicar la configuración absoluta de un estereocentro a menos que se indique lo contrario. Cuando los compuestos descritos en este documento contienen dobles enlaces olefínicos u otros centros de asimetría geométrica, y a menos que se especifique lo contrario, se pretende que los compuestos incluyan isómeros geométricos tanto E como Z. Asimismo, se incluyen todas las formas tautoméricas.
Los compuestos de la invención pueden existir en formas geométricas o estereoisoméricas particulares. La invención contempla todos estos compuestos, incluidos los isómeros cis y trans, enantiómeros (-) y (+), enantiómeros (R) y (S), diastereómeros, isómeros (D), isómeros (L) , las mezclas racémicas de los mismos, y otras mezclas de los mismos, tales como mezclas enriquecidas enantiomérica o diastereoméricamente, que caen dentro del alcance de la invención. Pueden estar presentes átomos de carbono asimétricos adicionales en un sustituyente tal como un grupo alquilo. Se pretende que todos estos isómeros, así como mezclas de los mismos, estén incluidos en esta invención.
Los isómeros (R) y (S) ópticamente activos y los isómeros d y l pueden prepararse usando sintones quirales o reactivos quirales, o resolverse usando técnicas convencionales. Si, por ejemplo, se desea un enantiómero particular de un compuesto de la invención, se puede preparar mediante síntesis asimétrica, o mediante derivatización con un auxiliar quiral, en el que la mezcla diastereomérica resultante se separa y el grupo auxiliar se escinde para proporcionar los enantiómeros puros deseados. Alternativamente, cuando la molécula contiene un grupo funcional básico, tal como un grupo amino, o un grupo funcional ácido, tal como un grupo carboxilo, se pueden formar sales diastereoisómeras con un ácido o base ópticamente activo apropiado, seguido de la resolución de los diastereoisómeros así formados por cristalización fraccionada o medios cromatográficos conocidos en la técnica, y posterior recuperación de los enantiómeros puros. Además, la separación de enantiómeros y diastereómeros se logra frecuentemente usando cromatografía que emplea fases estacionarias quirales, opcionalmente en combinación con derivatización química (por ejemplo, formación de carbamatos a partir de aminas).
Los compuestos de la invención también pueden contener proporciones no naturales de isótopos atómicos en uno o más de los átomos que constituyen tales compuestos. Por ejemplo, los compuestos pueden marcarse radiactivamente con isótopos radiactivos, tales como, por ejemplo, tritio (3H), yodo 125 (125I) o carbono 14 (14C). Se pretende que todas las variaciones isotópicas de los compuestos de la invención, sean radiactivos o no, estén incluidas dentro del alcance de la invención.
El término "portador farmacéuticamente aceptable" o "vehículo farmacéuticamente aceptable" se refiere a cualquier formulación o medio portador que proporcione la administración adecuada de una cantidad eficaz de un agente activo como se define en el presente documento, no interfiera con la eficacia de la actividad biológica del agente activo, y que sea suficientemente no tóxico para el huésped o el paciente. Los vehículos representativos incluyen agua, aceites, tanto vegetales como minerales, bases para cremas, bases para lociones, bases para ungüentos y similares. Estas bases incluyen agentes de suspensión, espesantes, potenciadores de la penetración y similares. Su formulación es bien conocida por los expertos en cosmética y productos farmacéuticos tópicos. Se puede encontrar información adicional sobre los portadores en Remington: The Science and Practice of Pharmacy, vigésima primera Ed., Lippincott, Williams & Wilkins (2005).
El término "excipientes" se conoce convencionalmente por significar portadores, diluyentes y/o vehículos usados en la formulación de composiciones de fármacos eficaces para el uso deseado.
El término "infección microbiana" o "infección por un microorganismo" se refiere a cualquier infección de un tejido huésped por un agente infeccioso que incluye, entre otros, bacterias o protozoos (véase, por ejemplo, Harrison's Principles of Internal Medicine, páginas 93-98 (Wilson et al., Eds., décimo segunda ed. 1991); Williams et al., J. of Medicinal Chem. 42: 1481-1485 (1999)).
"Medio biológico", como se usa en el presente documento, se refiere a entornos biológicos tanto in vitro como in vivo. Los ejemplos de "medios biológicos" in vitro incluyen, pero no se limitan a, cultivo celular, cultivo de tejidos, homogeneizados, plasma y sangre. Las aplicaciones in vivo se realizan generalmente en mamíferos, preferiblemente humanos.
"Inhibir" y "bloquear" se usan indistintamente en el presente documento para referirse al bloqueo parcial o total de la enzima. En un ejemplo de realización, la enzima es un dominio de edición de una ARNt sintetasa.
El boro es capaz de formar enlaces covalentes o dativos adicionales con oxígeno, azufre o nitrógeno en algunas circunstancias de esta invención.
Las realizaciones de la invención también abarcan compuestos que son especies polivalentes o multivalentes, que incluyen, por ejemplo, especies tales como dímeros, trímeros, tetrámeros y homólogos superiores de los compuestos de uso en la invención o análogos reactivos de los mismos.
"Contraión de sal", como se usa en el presente documento, se refiere a iones cargados positivamente que se asocian con un compuesto de la invención cuando el boro está cargado total o parcialmente negativamente. Ejemplos de contraiones de sal incluyen H+, H3O+, amonio, potasio, calcio, magnesio (tal como colina o dietilamina o aminoácidos como d-arginina, l-arginina, d-lisina o l-lisina) y sodio.
Los compuestos que comprenden un boro unido a un carbono y tres heteroátomos (tales como tres oxígenos descritos en esta sección) pueden contener opcionalmente un boro totalmente cargado negativamente o un boro parcialmente cargado negativamente. Debido a la carga negativa, un contraión cargado positivamente puede asociarse con este compuesto, formando así una sal. Ejemplos de contraiones de sal incluyen H+, H3O+, amonio, potasio, calcio, magnesio (tal como colina o dietilamina o aminoácidos como d-arginina, l-arginina, d-lisina o l-lisina) y sodio. Las sales de los compuestos están implícitamente contenidas en las descripciones de estos compuestos.
II. Introducción
La invención proporciona nuevos compuestos de boro y métodos para la preparación de estas moléculas. La invención proporciona además compuestos para su uso en el tratamiento de infecciones bacterianas, matando o inhibiendo el crecimiento de microorganismos en parte o totalmente mediante el uso de los compuestos descritos en este documento. En otro aspecto, la invención es una combinación de un compuesto de la invención y otro agente terapéuticamente activo. En otro aspecto, la invención es una formulación farmacéutica que comprende un excipiente farmacéuticamente aceptable y un compuesto de la invención. En una realización, la invención es una formulación farmacéutica que comprende un compuesto de la invención, un antibiótico y un excipiente farmacéuticamente aceptable.
III. Composición de la materia
III. a.) Compuestos
En un aspecto, la invención proporciona un compuesto de la invención. En un ejemplo de realización, la invención proporciona un compuesto descrito en el presente documento, o una sal del mismo. En un ejemplo de realización, la sal de un compuesto descrito en el presente documento es una sal farmacéuticamente aceptable. En un ejemplo de realización, la invención proporciona un compuesto descrito en el presente documento, o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo. En un ejemplo de realización, la invención proporciona un compuesto descrito en una fórmula proporcionada en este documento. En un ejemplo de realización, la invención proporciona un compuesto descrito en el presente documento.
En un aspecto, la invención proporciona un compuesto que tiene una estructura que es:
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en la que R4 se selecciona del grupo que consiste en halógeno, metilo, etilo, propilo, isopropilo, butilo, isobutilo, secbutilo, metoxi, etoxi, propoxi, isopropoxi, butoxi, isobutoxi y sec-butoxi; y en la que a es 2, 3 o 4; y R12 se selecciona del grupo que consiste en H, OH, NH2, metilo, etilo, -NHS(O)2CH3, ciano, -NHC(O)CH3, -NHC(O)NHCH2CH3, -C(O)NH2, -C(O)OH, 4-(metoxi)fenilo, bencilo, benzoxi, -NHC(O)OCH2Ph, -C(O)NHCH2CH2OH y -C(NH2)(NH); o una sal, hidrato o solvato de los mismos.
En un ejemplo de realización, se proporciona un compuesto que tiene una estructura de acuerdo con la siguiente fórmula:
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en la que C* es un estereocentro de átomo de carbono que tiene una configuración que es (R) o (S). En un ejemplo de realización, el estereocentro C* está en la configuración (S).
En un ejemplo de realización, R4 se selecciona del grupo que consiste en metilo, etilo, propilo, isopropilo, butilo, isobutilo y sec-butilo. En un ejemplo de realización, R4 se selecciona del grupo que consiste en flúor, cloro, bromo y yodo. En un ejemplo de realización, R4 es cloro o bromo. En un ejemplo de realización, R4 es cloro.
En un ejemplo de realización, R4 se selecciona del grupo que consiste en metoxi, etoxi, propoxi, isopropoxi, butoxi, isobutoxi y sec-butoxi. En un ejemplo de realización, R4 es metoxi o etoxi. En un ejemplo de realización, R4 es metoxi. En un ejemplo de realización, a es 3.
En un ejemplo de realización, R4 es halógeno, a es 2 y R12 es H. En un ejemplo de realización, R4 es flúor, a es 2 y R12 es H. En un ejemplo de realización, R4 es cloro, a es 2 y R12 es H. En un ejemplo de realización, R4 es bromo, a es 2 y R12 es H.
En un ejemplo de realización, R4 es halógeno, a es 3 y R12 es H. En un ejemplo de realización, R4 es flúor, a es 3 y R12 es H. En un ejemplo de realización, R4 es cloro, a es 3 y R12 es H. En un ejemplo de realización, R4 es bromo, a es 3 y R12 es H. En un ejemplo de realización, R4 es como se describe en el presente documento, a es 2 y R12 es H. En un ejemplo de realización, el compuesto tiene una estructura que es
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En un ejemplo de realización, dicho alquilo es alquilo lineal o alquilo ramificado. En un ejemplo de realización, dicho heteroalquilo es heteroalquilo lineal o heteroalquilo ramificado.
En un ejemplo de realización, la invención proporciona especies polivalentes o multivalentes de los compuestos de la invención, que incluyen un dímero o un trímero. Otro ejemplo de realización de la invención proporciona un anhídrido de los compuestos de la invención. En otro ejemplo de realización, la invención proporciona especies polivalentes o multivalentes de los compuestos de la invención. En un ejemplo de realización, la invención proporciona un dímero de los compuestos descritos en este documento. En un ejemplo de realización, la invención proporciona un dímero de los compuestos descritos en este documento.
En un ejemplo de realización, la invención proporciona un anhídrido de los compuestos descritos en el presente documento. En un ejemplo de realización, la invención proporciona un anhídrido de los compuestos descritos en este documento.
En un ejemplo de realización, la invención proporciona un trímero de los compuestos descritos en este documento. En un ejemplo de realización, la invención proporciona un trímero de los compuestos descritos en este documento. Los compuestos de la invención pueden formar un hidrato con agua, solvatos con alcoholes tales como metanol, etanol, propanol y similares; aductos con compuestos amino, tales como amoniaco, metilamina, etilamina y similares; aductos con ácidos, tales como ácido fórmico, ácido acético y similares; complejos con etanolamina, quinolina, aminoácidos y similares.
En un ejemplo de realización, la invención proporciona un compuesto descrito en el presente documento, o una sal, hidrato o solvato del mismo, o una combinación de los mismos. En un ejemplo de realización, la invención proporciona un compuesto descrito en el presente documento, o una sal, hidrato o solvato del mismo. En un ejemplo de realización, la invención proporciona un compuesto descrito en el presente documento, o una sal del mismo. En un ejemplo de realización, la sal es una sal farmacéuticamente aceptable. En un ejemplo de realización, la invención proporciona un compuesto descrito en el presente documento, o un hidrato del mismo. En un ejemplo de realización, la invención proporciona un compuesto descrito en el presente documento, o un solvato del mismo. En un ejemplo de realización, la invención proporciona una sal de un compuesto descrito en el presente documento. En un ejemplo de realización, la invención proporciona una sal farmacéuticamente aceptable de un compuesto descrito en el presente documento. En un ejemplo de realización, la invención proporciona un hidrato de un compuesto descrito en este documento. En un ejemplo de realización, la invención proporciona un solvato de un compuesto descrito en el presente documento. En un ejemplo de realización, la invención proporciona un profármaco de un compuesto descrito en el presente documento. En un ejemplo de realización, la invención proporciona un compuesto como se describe en la Fig. 1, o una sal del mismo. En un ejemplo de realización, la invención proporciona un compuesto como se describe en la Fig. 1, o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo.
En un ejemplo de realización, alquilo es alquilo lineal. En otro ejemplo de realización, alquilo es alquilo ramificado.
En un ejemplo de realización, heteroalquilo es heteroalquilo lineal. En otro ejemplo de realización, heteroalquilo es heteroalquilo ramificado.
III. b) Combinaciones que comprenden agentes terapéuticos adicionales
Los compuestos de la invención también se pueden usar en combinación con agentes terapéuticos adicionales. Por lo tanto, la invención proporciona, en un aspecto adicional, una combinación que comprende un compuesto de la invención junto con al menos un agente terapéutico adicional, o una sal, hidrato o solvato del mismo. En un ejemplo de realización, el compuesto de la invención es un compuesto descrito en el presente documento, o una sal del mismo. En un ejemplo de realización, el agente terapéutico adicional es un compuesto de la invención. En un ejemplo de realización, el agente terapéutico adicional incluye un átomo de boro. En un ejemplo de realización, el agente terapéutico adicional no contiene un átomo de boro. En un ejemplo de realización, el agente terapéutico adicional es un compuesto descrito en las secciones III a) o b).
Cuando se usa un compuesto de la invención en combinación con un segundo agente terapéutico activo contra el mismo estado de enfermedad, la dosis de cada compuesto puede diferir de la que se usa cuando el compuesto se usa solo. Los expertos en la técnica apreciarán fácilmente las dosis apropiadas. Se apreciará que la cantidad de un compuesto de la invención requerida para su uso en el tratamiento variará con la naturaleza de la afección que se esté tratando y la edad y la condición del paciente y, en última instancia, quedará a discreción del médico o veterinario tratante.
En un ejemplo de realización, el agente terapéutico adicional es un agente antibacteriano. En un ejemplo de realización, el agente terapéutico adicional es un agente antituberculoso. En un ejemplo de realización, el agente terapéutico adicional es rifampicina. En un ejemplo de realización, el agente terapéutico adicional es isoniazida. En un ejemplo de realización, el agente terapéutico adicional es pirazinamida. En un ejemplo de realización, el agente terapéutico adicional es etambutol. En un ejemplo de realización, el agente terapéutico adicional es isoniazida. En un ejemplo de realización, el agente terapéutico adicional es estreptomicina. En un ejemplo de realización, el agente terapéutico adicional es un aminoglucósido. En un ejemplo de realización, el agente terapéutico adicional es amikacina o kanamicina. En un ejemplo de realización, el agente terapéutico adicional es un polipéptido. En un ejemplo de realización, el agente terapéutico adicional se selecciona del grupo que consiste en capreomicina, viomicina y enviomicina. En un ejemplo de realización, el agente terapéutico adicional es una fluoroquinolona. En un ejemplo de realización, el agente terapéutico adicional se selecciona del grupo que consiste en ciprofloxacina, levofloxacina y moxifloxacina. En un ejemplo de realización, el agente terapéutico adicional es una tioamida. En un ejemplo de realización, el agente terapéutico adicional es etionamida o protionamida. En un ejemplo de realización, el agente terapéutico adicional es cicloserina. En un ejemplo de realización, el agente terapéutico adicional es ácido paminosalicílico. En un ejemplo de realización, el agente terapéutico adicional se selecciona del grupo que consiste en rifabutina, linezolida, tioacetazona, tiorridazina, arginina, vitamina D y R207910. En un ejemplo de realización, el agente terapéutico adicional es un macrólido.
Los componentes individuales de tales combinaciones se pueden administrar de forma simultánea o secuencial en una forma de dosificación unitaria. La forma de dosificación unitaria puede ser una forma de dosificación unitaria o múltiple. En un ejemplo de realización, la invención proporciona una combinación en una forma de dosificación unitaria única. Un ejemplo de una forma de dosificación unitaria es una cápsula en la que tanto el compuesto de la invención como el agente terapéutico adicional están contenidos dentro de la misma cápsula. En un ejemplo de realización, la invención proporciona una combinación en una forma de dosificación de dos unidades. Un ejemplo de una forma de dosificación de dos unidades es una primera cápsula que contiene el compuesto de la invención y una segunda cápsula que contiene el agente terapéutico adicional. Por lo tanto, el término "unidad única" o "dos unidades" o "unidad múltiple" se refiere al objeto que ingiere el animal (por ejemplo, un ser humano), no a los componentes interiores del objeto. Los expertos en la técnica apreciarán fácilmente las dosis apropiadas de agentes terapéuticos conocidos.
Las combinaciones a las que se hace referencia en el presente documento pueden presentarse convenientemente para su uso en forma de formulación farmacéutica. Por lo tanto, un ejemplo de realización de la invención es una formulación farmacéutica que comprende a) un compuesto de la invención; b) un agente terapéutico adicional y c) un excipiente farmacéuticamente aceptable. En un ejemplo de realización, la formulación farmacéutica es una forma de dosificación unitaria. En un ejemplo de realización, la formulación farmacéutica es una forma de dosificación unitaria única. En un ejemplo de realización, la formulación farmacéutica es una forma de dosificación unitaria única que incluye un compuesto de la invención; un antibiótico y un excipiente farmacéuticamente aceptable. En un ejemplo de realización, la formulación farmacéutica es una forma de dosificación unitaria única que incluye un compuesto de la invención; un antibiótico y al menos un excipiente farmacéuticamente aceptable. En un ejemplo de realización, la formulación farmacéutica es una forma de dosificación de dos unidades. En un ejemplo de realización, la formulación farmacéutica es una forma de dosificación de dos unidades que comprende una primera forma de dosificación unitaria y una segunda forma de dosificación unitaria, en la que la primera forma de dosificación unitaria incluye a) un compuesto de la invención y b) un primer excipiente farmacéuticamente aceptable; y la segunda forma de dosificación unitaria incluye c) un agente terapéutico adicional y d) un segundo excipiente farmacéuticamente aceptable. En un ejemplo de realización, la formulación farmacéutica es una forma de dosificación de dos unidades que comprende una primera forma de dosificación unitaria y una segunda forma de dosificación unitaria, en la que la primera forma de dosificación unitaria incluye a) un compuesto de la invención y b) un primer excipiente farmacéuticamente aceptable; y la segunda forma de dosificación unitaria incluye c) un antibiótico y d) un segundo excipiente farmacéuticamente aceptable.
III. c) Preparación de compuestos que contienen boro
Los compuestos de uso en la invención se pueden preparar usando materiales de partida disponibles comercialmente, compuestos intermedios conocidos o usando los métodos de síntesis publicados en las referencias descritas, tal como la solicitud de patente de los Estados Unidos No. 12/142.692 (publicación de patente de los Estados Unidos 2009/0227541) y las publicaciones de patente de los Estados Unidos Nos. US20060234981, US20070155699 y US20070293457.
Los siguientes procedimientos generales se usaron como se indica para generar los ejemplos y se pueden aplicar, usando el conocimiento de un experto en la técnica, a otros compuestos apropiados para obtener análogos adicionales.
Esquema 1 de reacción general
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El esquema 1 describe una síntesis para los compuestos de (I), en la que R4 es flúor o cloro y los grupos que se representan en el esquema anterior como Y y R5 corresponden a los grupos equivalentes de los compuestos de la invención como se describió anteriormente. El compuesto de flúor o cloro de fórmula A, que puede prepararse o estar disponible comercialmente a través de Sigma-Aldrich, se hace reaccionar con una base fuerte (tal como n-BuLi, sec-BuLi o t-BuLi, 2 equiv.) seguido de inactivación con un agente de formilación (tal como DMF, dimetilformamida, formanilida, N-formilmorfolina, gran exceso) para producir el compuesto de fórmula B. Tratamiento del compuesto B con un agente desmetilante (típicamente BBr3, 2 equiv.) en un disolvente adecuado (diclorometano, THF) produce el fenol de fórmula C. El compuesto C puede reaccionar con un bromuro o mesilato correspondiente (1-1,5 equiv.) en presencia de una base (tal como KOtBu, K2CO3 o Cs2CO3, 1,5-2 equiv.) en un disolvente aprótico, tal como DMF o DMSO para producir el compuesto de fórmula D. El compuesto D puede convertirse en triflato E mediante la reacción con 1,2 equiv. de anhídrido trifluorometanosulfónico y piridina en diclorometano. La conversión de triflato E en boronato F se puede lograr mediante la reacción con bis(pinacolato)diborano (2 equiv.), KOAc (3 equiv.) y cantidad catalítica de PdCh(dppf) (4-8% en moles). La reacción del compuesto F con nitrometano (3 equiv.) en presencia de hidróxido de sodio (3 equiv.) en agua o THF produce el compuesto nitro de fórmula G. El compuesto G puede convertirse en el producto final de fórmula H por el método de reducción con Ni Raney (Ni Raney, 2 equiv. p/p, NH32,0 M en EtOH, EtOH absoluto).
Esquema 2 de reacción general
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El esquema 2 describe una síntesis para compuestos de (I), en la que R4 es cloro, y los grupos que se representan en el esquema anterior como Y y R5 corresponden a los grupos equivalentes de los compuestos de la invención como se describió anteriormente. El fenol o tiofenol de fórmula I, que puede prepararse o estar disponible comercialmente a través de Sigma-Aldrich, reacciona con una solución de bromo y una cantidad catalítica de polvo de hierro en ácido acético glacial para producir el compuesto sustituido con bromo de fórmula J. La alquilación de J se puede lograr al reaccionar con un bromuro en presencia de una base tal como carbonato de potasio en disolventes como DMF o acetonitrilo. La protección del aldehido K se puede conseguir sometiendo a reflujo con etilenglicol en tolueno, en presencia de una cantidad catalítica de ácido p-toluenosulfónico. La reacción del compuesto L con BuLi y borato de triisopropilo, seguida de tratamiento con ácido clorhídrico produce ácido borónico M. La reacción del compuesto M con nitrometano en presencia de hidróxido de sodio produce el compuesto nitro de fórmula N. El tratamiento de N con 1 equivalente de cloruro de sulfurilo produce el compuesto O sustituido con cloro. La reducción con Ni Raney del compuesto O en MeOH produce el producto final de fórmula P.
Esquema 3 de reacción general
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El esquema 3 describe una síntesis para compuestos de (I), en la que R4 es bromo, y los grupos que se representan en el esquema anterior como Y y R5 corresponden a los grupos equivalentes de los compuestos de la invención como se describió anteriormente. El compuesto de fórmula N, que se puede preparar de acuerdo con el Esquema 2, se puede reducir a la amina de fórmula S, mediante hidrogenación en presencia de hidróxido de paladio o reducción con Ni Raney como se describió anteriormente. La amina de fórmula S reacciona con un reactivo protector de N tal como anhídrido de Boc en presencia de una base como trietilamina en diclorometano para producir el compuesto protegido con Boc de fórmula T. El tratamiento de T con N-bromosuccinimida y cantidad catalítica de AIBN en acetonitrilo produce el compuesto sustituido con bromo de fórmula U. La desprotección del compuesto U en presencia de un ácido tal como HCl en dioxano proporcionará el compuesto final de fórmula U.
Esquema 4 de reacción general
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El esquema 4 describe una síntesis para compuestos de (I), en la que los grupos que se representan en el esquema anterior como Y, R4 y R5 corresponden a los grupos equivalentes de los compuestos de la invención como se describió anteriormente. El compuesto de fórmula N, que se puede preparar de acuerdo con el Esquema 2, se puede bromar con N-bromosuccinimida y una cantidad catalítica de AIBN en un disolvente tal como acetonitrilo para producir el bromuro de fórmula W. El acoplamiento de Stille de W con un compuesto de organoestaño tal como tetrametilestanano o tributil-fenil-estanano en presencia de Pd(Ph3P)4 catalítico en DMF proporciona el compuesto de fórmula X. El compuesto X se puede reducir hasta el compuesto final de fórmula Y mediante hidrogenación en presencia de paladio sobre carbono o reducción con Ni Raney como se describió anteriormente. Alternativamente, la reacción de Stille de W con un compuesto de organoestaño tal como viniltributilestaño en presencia de una cantidad catalítica de Pd(Ph3P)4 en DMF produce el compuesto de fórmula Z. Después de la reducción con Ni Raney del compuesto Z, hidrogenación adicional en presencia de paladio sobre carbono como se describió anteriormente proporcionará el compuesto final de fórmula AB.
Esquema 5 de reacción general: Separación quiral
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El esquema 5 describe un método para separar los compuestos (I) en sus isómeros enantioméricos, en los que R4 y los grupos que se representan en el esquema anterior como Y y R5 corresponden a los grupos equivalentes de los compuestos de la invención como se describió anteriormente. El compuesto de fórmula AC, que puede prepararse de acuerdo con el Esquema 1 o el Esquema 2 o el Esquema 3 o el Esquema 4, se puede convertir en el compuesto AD protegido con Boc mediante la reacción con un reactivo protector de N tal como anhídrido de Boc en presencia de base como trietilamina en diclorometano. El compuesto racémico AD se puede resolver mediante HPLC quiral usando una columna quiral tal como ChiralPak AD-H y SF CO2/metanol como eluyente. Dos compuestos recogidos son el enantiómero AE y el enantiómero AF. El análisis de la pureza enantiomérica de cada isómero se puede lograr usando una columna quiral como la columna ChiralPak AD. Los compuestos AE y AF protegidos con Boc se pueden convertir en los compuestos quirales finales AG y AH, por desprotección usando ácido tal como HCl en dioxano.
Esquema 6 de reacción general: Separación quiral
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El esquema 6 describe un método alternativo para separar compuestos quirales AI en sus isómeros enantioméricos, en los que R4 y los grupos que se representan en el esquema anterior como Y y R5 corresponden a los grupos equivalentes de los compuestos de la invención como se describió anteriormente. El compuesto de fórmula AI puede prepararse de acuerdo con el Esquema 1 o el Esquema 2 o el Esquema 3 o el Esquema 4. La separación de los dos enantiómeros se logró disolviendo el material racémico AI en un disolvente adecuado y aplicándolo a una columna quiral y sistema eluyente apropiados. Las muestras de enantiómero separadas recogidas se concentraron luego y se usaron en la siguiente etapa sin purificación adicional. Usando esta técnica, es posible lograr una gama de excesos enantioméricos de los enantiómeros separados. El compuesto nitro AJ y AK se puede convertir en los compuestos quirales finales AL y AM, respectivamente, mediante reducción con Ni Raney (Ni Raney, 2 equiv p/p, NH32,0 M en EtOH, EtOH absoluto).
IV. Ensayos
Las técnicas reconocidas en el arte de la genética y la biología molecular son útiles para identificar compuestos que se unen y/o inhiben una enzima, tal como una ARNt sintetasa. Además, estas técnicas son útiles para distinguir si un compuesto se une y/o inhibe un dominio particular de la enzima. Por ejemplo, para la leucil ARNt sintetasa (LeuRS), estas técnicas pueden distinguir si un compuesto se une y/o inhibe el dominio sintético, el dominio de edición o ambos dominios de edición y sintético. El gen leuS de Mycobacterium tuberculosis fue sintetizado por Genscript (Piscataway, NJ) usando codones optimizados de E. coli y la proteína se elaboró usando protocolos estándar de sobreexpresión de ARN polimerasa T7 y protocolos de purificación estándar.
IV. a) LeuRS
En un ejemplo de ensayo, se confirmó la actividad de un compuesto representativo contra el dominio de edición. Para identificar la diana de un nuevo compuesto antibacteriano que contiene boro, se aislaron mutantes en E. coli que mostraban resistencia al compuesto. La caracterización de mutantes mostró que tienen un aumento de 32 a 256 veces en la resistencia al compuesto sobre el tipo silvestre. Además, se demostró que los mutantes eran sensibles a varios agentes antibacterianos con modos de acción conocidos, lo que sugiere que la diana celular del compuesto es distinta de la diana de los otros agentes antibacterianos. El gen leuS de los mutantes se clonó en un plásmido y su resistencia se confirmó mediante CIM. Se secuenció el dominio de edición de estos mutantes y todas las mutaciones se localizaron en el dominio de edición de esta enzima.
Los ensayos para determinar si, y con qué eficacia, un compuesto particular se une y/o inhibe el dominio de edición de una ARNt sintetasa seleccionada también se exponen en este documento, y los expertos en la técnica pueden disponer fácilmente de ensayos adicionales. Brevemente, en un ejemplo de ensayo, se combinan un ARNt cargado incorrectamente y una ARNt sintetasa que es capaz de editar el ARNt cargado incorrectamente. La mezcla resultante se pone en contacto con el inhibidor putativo y se observa el grado de inhibición de la edición.
Otro ensayo usa la genética para mostrar que un fármaco funciona a través del dominio de edición. En este ensayo, el compuesto se prueba primero contra una cepa de células que sobreexpresan copias del gen de la ARNt sintetasa. El efecto del compuesto sobre la cepa que sobreexpresa se compara con una cepa de control para determinar si el compuesto es activo contra la sintetasa. Si la concentración mínima inhibitoria (CIM) es 2 veces mayor en la cepa con copias adicionales del gen de la sintetasa que la CIM del inhibidor contra una célula de tipo silvestre, se lleva a cabo un cribado genético adicional para determinar si el aumento de la resistencia se debe a mutaciones en el dominio de la edición. En este segundo cribado, la cepa de control se desafía contra una alta concentración del inhibidor. Las colonias que sobreviven al desafío se aíslan y el ADN de estas células se aísla. El dominio de edición se amplifica utilizando una enzima de PCR de corrección de pruebas y los cebadores apropiados. El producto de PCR se puede purificar utilizando procedimientos estándar. La secuencia de ADN mutante amplificada se compara con la de tipo silvestre. Si el ADN mutante tiene mutaciones en el dominio de edición, tales resultados sugerirían que el compuesto se une al dominio de edición y afecta la función de edición de la molécula a través de este dominio.
Generalmente, los compuestos a ensayar están presentes en los ensayos en intervalos de aproximadamente 1 pM a aproximadamente 100 mM, preferiblemente de aproximadamente 1 pM a aproximadamente 1 pM. Otros compuestos oscilan entre aproximadamente 1 nM y aproximadamente 100 nM, preferiblemente entre aproximadamente 1 nM y aproximadamente 1 pM.
Los efectos de los compuestos de prueba sobre la función de las enzimas también pueden medirse mediante cualquier cambio fisiológico adecuado. Cuando las consecuencias funcionales se determinan utilizando células o animales intactos, también se pueden medir una variedad de efectos como la liberación del transmisor, la liberación de hormonas, cambios transcripcionales en marcadores genéticos conocidos y no caracterizados, cambios en el metabolismo celular tales como el crecimiento celular o cambios de pH, y cambios en segundos mensajeros intracelulares tales como Ca2+ o nucleótidos cíclicos.
Utilizando los ensayos expuestos en este documento y otros fácilmente disponibles en la técnica, los expertos en la técnica podrán determinar fácil y rutinariamente otros compuestos y clases de compuestos que operan para unirse y/o inhibir el dominio de edición de ARNt sintetasas.
La presente divulgación proporciona un método para identificar un compuesto que se une a un dominio de edición de una ARNt sintetasa que comprende:
a) poner en contacto dicho dominio de edición con un compuesto de prueba en condiciones adecuadas para la unión; y b) detectar la unión de dicho compuesto de prueba a dicho dominio de edición. En un ejemplo de variante de la descripción, la detección de la unión de dicho compuesto comprende el uso de al menos un elemento detectable, isótopo o marcador químico unido a dicho compuesto. En un ejemplo de variante de la divulgación, el elemento, isótopo o marcador químico se detecta mediante una lectura fluorescente, luminiscente, radiactiva o de absorbancia. En un ejemplo de variante de la divulgación, el contacto de dicho compuesto de prueba con dicho dominio de edición también incluye el contacto adicional de dicho compuesto de prueba y dicho dominio de edición con un miembro seleccionado de AMP y una molécula con una adenosina terminal. En un ejemplo de variante de la divulgación, la ARNt sintetasa se deriva de la leucil ARNt sintetasa. En un ejemplo de variante de la divulgación, la ARNt sintetasa se deriva de una ARNt sintetasa mutada, en la que dicha ARNt sintetasa mutada comprende mutaciones de aminoácidos en un dominio de edición. En otro ejemplo de variante de la divulgación, en la que dicho dominio de edición de una ARNt sintetasa comprende la secuencia de aminoácidos de una secuencia peptídica descrita en el presente documento.
La presente divulgación también proporciona un método para identificar un compuesto que se une a un dominio de edición de una ARNt sintetasa, comprendiendo dicho ensayo: a) poner en contacto dicho dominio de edición de una ARNt sintetasa con dicho compuesto en condiciones adecuadas para la unión de dicho compuesto con dicho dominio de edición de una ARNt sintetasa; b) comparar una actividad biológica de dicho dominio de edición de una ARNt sintetasa que pone en contacto dicho compuesto con dicha actividad biológica cuando no se pone en contacto con dicho compuesto; y c) identificar dicho compuesto como que se une a dicho dominio de edición de una ARNt sintetasa si dicha actividad biológica de dicho dominio de edición de una ARNt sintetasa se reduce cuando se pone en contacto con dicho compuesto. En un ejemplo de variante de la divulgación, la actividad biológica es la hidrólisis de aminoácidos no afines. En otro ejemplo de variante de la divulgación, la hidrólisis de dicho aminoácido no afín se detecta mediante el uso de uno o más marcadores. En otro ejemplo de variante de la divulgación, los marcadores incluyen un radiomarcador, un marcador fluorescente, un anticuerpo o una combinación de los mismos. En otro ejemplo de variante de la divulgación, dichos marcadores pueden detectarse usando espectroscopía. En otro ejemplo de variante de la divulgación, dicho dominio de edición de una ARNt sintetasa se deriva de la leucil ARNt sintetasa.
La presente divulgación proporciona además un método para generar una molécula de ARNt con un aminoácido no afín que comprende: a) crear o aislar una ARNt sintetasa mutada con dominios de edición de aminoácidos alterados; y b) poner en contacto una molécula de ARNt con dicha ARNt sintetasa mutada y un aminoácido no afín. En otro ejemplo de variante de la divulgación, la ARNt sintetasa mutada contiene una o más mutaciones de aminoácidos en un dominio de edición. En otro ejemplo de variante de la divulgación, la ARNt sintetasa mutada no puede unirse a un compuesto de la invención. En otro ejemplo de variante de la divulgación, la ARNt sintetasa mutada es incapaz de unirse a un compuesto descrito en el presente documento, o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo. En otro ejemplo de variante de la divulgación, la ARNt sintetasa mutada es incapaz de unirse a un compuesto de acuerdo con una fórmula descrita en el presente documento, o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo.
La divulgación también proporciona una composición que comprende una o más moléculas de ARNt unidas a aminoácidos no afines, en la que dichas moléculas de ARNt se sintetizan usando una o más ARNt sintetasas mutadas aisladas de un microorganismo o una línea celular derivada de un microorganismo. En un ejemplo de variante de la divulgación, el microorganismo es una bacteria. En un ejemplo de variante de la divulgación, en la que dichas ARNt sintetasas mutadas contienen mutaciones de aminoácidos en sus dominios de edición.
V. Secuencias de aminoácidos y nucleótidos utilizadas en los ensayos
Las secuencias de aminoácidos y nucleótidos de uso en la divulgación se publican en referencias tales como la solicitud de patente de los Estados Unidos No. 12/142.692 (publicación de patente de los Estados Unidos No.
2009/0227541) y publicaciones de patente de los Estados Unidos Nos. US20060234981, US20070155699 y US20070293457. La secuencia del gen leuS de M. tuberculosis de codón optimizado es la siguiente: CATATGACCGAAAGCCCGACCGCAGGTCCGGGTGGTGTGCCGCGTGCGGATGA TGCAGATAGCGATGTGCCGCGTTATCGTTATACCGCGGAACTGGCGGCGCGTC TGGAACGTACCTGGCAGGAAAACTGGGCGCGTCTGGGCACCTTTAACGTGCCG AACCCGGTGGGTAGCCTGGCACCGCCGGATGGTGCAGCAGTGCCGGATGATAA ACTGTTTGTGCAGGATATGTTTCCGTATCCGAGCGGCGAAGGCCTGCATGTGG GCCATCCGCTGGGCTATATTGCGACCGATGTGTATGCGCGTTATTTTCGTATGG TGGGCCGTAACGTGCTGCATGCGCTGGGCTTTGATGCGTTTGGTCTGCCGGCGG AACAGTATGCGGTGCAGACCGGCACCCATCCGCGTACCCGTACCGAAGCGAAC GTGGTGAACTTTCGTCGTCAGCTGGGCCGTCTGGGCTTTGGCCATGATAGCCGT CGT AGCTTTAGC ACC ACCGATGT GGATTTTT ATCGTTGGACCC AGT GGATTTTT CTGCAGATTTATAACGCGTGGTTTGATACCACCGCGAACAAAGCGCGTCCGAT TAGCGAACTGGTGGCGGAATTTGAAAGCGGTGCACGTTGCCTGGATGGTGGTC GTGATTGGGCAAAACTGACCGCAGGTGAACGTGCGGATGTGATTGATGAATAT CGTCTGGTGTATCGTGCGGATAGCCTGGTGAACTGGTGCCCGGGTCTGGGTAC CGT GCT GGC AAACG AAG AAGT G ACC GC AG AT GGCC GT AGC G AT C GT GGC AAC TTTCCGGT GTTTCGT AAACGT CT GCGT C AGT GGATGAT GCGT ATTACCGCGT AT GCGGATCGTCTGCTGGATGATCTGGATGTGCTGGATTGGCCGGAACAGGTGAA AACCATGCAGCGTAACTGGATTGGCCGTAGCACCGGCGCGGTGGCGCTGTTTA GCGCGCGT GCGGCGAGCGAT GATGGCTTTG AAGTGGAT ATTGAAGT GTTT ACC ACCCGTCCGGATACCCTGTTTGGCGCGACCTATCTGGTGCTGGCGCCGGAACA TGATCTGGTGGATGAACTGGTGGCGGCAAGCTGGCCGGCAGGTGTGAACCCGC T GT GG AC CT AT GGC GGTGGT AC CCC GGGT G A AGC AATT GC AGC AT AT C GT C GT GCGATTGCGGCGAAAAGCGATCTGGAACGTCAGGAAAGCCGTGAAAAAACCG GCGTGTTTCTGGGCAGCTATGCGATTAACCCGGCGAACGGCGAACCGGTGCCG ATTTTTATTGCGGATTATGTGCTGGCGGGCTATGGCACCGGCGCGATTATGGCG GTGCCGGGCCATGATCAGCGTGATTGGGATTTTGCGCGTGCGTTTGGCCTGCCG ATTGTGGAAGTGATTGCAGGTGGAAACATTAGCGAAAGCGCGTATACCGGCGA T GGC ATTCTGGT GAAC AGCGATTAT CT GAACGGC AT GAGCGT GCCGGC AGC AA AACGTGCAATTGTGGATCGTCTGGAAAGCGCAGGTCGTGGTCGTGCACGTATT GAATTTAAACTGCGTGATTGGCTGTTTGCGCGTCAGCGTTATTGGGGCGAACC GTTTCCGATTGTGTATGATAGCGATGGCCGTCCGCATGCGCTGGATGAAGCGG CGCTGCCGGTGGAACTGCCGGATGTGCCGGATTATAGCCCGGTGCTGTTTGAT CCGGATGATGCGGATAGCGAACCGAGCCCGCCGCTGGCGAAAGCGACCGAAT GGGTGCATGTGGATCTGGATCTGGGCGATGGCCTGAAACCGTATAGCCGTGAT ACC AACGT GAT GCCGC AGTGGGCGGGC AGC AGCTGGT ATGAACT GCGTTAT AC CGATCCGCATAACAGCGAACGTTTTTGCGCGAAAGAAAACGAAGCGTATTGGA TGGGTCCGCGTCCGGCAGAACATGGTCCGGATGATCCGGGTGGTGTGGATCTG TATGTGGGCGGCGCGGAACATGCGGTGCTGCATCTGCTGTATAGCCGTTTTTGG C AT AAAGT GCT GTAT GAT CTGGGCC AT GT GAGC AGCCGT GAACCGTATCGTCG
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En otro aspecto, los compuestos de la invención se pueden utilizar para inhibir una enzima. En otro aspecto, los compuestos de la invención y/o combinaciones de la invención exhiben potencia contra microorganismos, tales como bacterias, y por lo tanto tienen el potencial de matar y/o inhibir el crecimiento de microorganismos. En otro aspecto, los compuestos de la invención y/o combinaciones de la invención exhiben potencia contra microorganismos, tales como bacterias, y por lo tanto tienen el potencial de lograr eficacia terapéutica en los animales descritos en este documento.
VI. a) LeuRS
En un ejemplo de realización, los compuestos de la invención exhiben la capacidad de inhibir el dominio de edición de ARNt sintetasas, tales como leucil ARNt sintetasa, de microorganismos, tales como bacterias, y por lo tanto tienen el potencial de ser usados como inhibidores de dominios de edición de ARNt sintetasas de microorganismos.
La divulgación también proporciona un método in vitro para inhibir el dominio de edición de una ARNt sintetasa que comprende poner en contacto una ARNt sintetasa con un compuesto de la invención, o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo, que inhibe el dominio de edición en condiciones en las que la ARNt sintetasa interactúa con su sustrato para formar un compuesto intermedio de aminoacil adenilato y, preferiblemente, para formar un ARNt cargado. Los expertos en la técnica conocen tales condiciones. En un ejemplo de realización, el compuesto tiene una estructura de acuerdo con una fórmula descrita en el presente documento. En un ejemplo de realización, el compuesto se describe en el presente documento, o una sal, hidrato o solvato del mismo, o una combinación de los mismos. En un ejemplo de realización, la invención proporciona un compuesto descrito en el presente documento, o una sal, hidrato o solvato del mismo. En un ejemplo de realización, la invención proporciona un compuesto descrito en el presente documento, o una sal del mismo. En un ejemplo de realización, la invención proporciona un compuesto descrito en el presente documento, o una sal del mismo. La ARNt sintetasa se pone en contacto con una cantidad de compuesto de la invención suficiente para producir como resultado una cantidad detectable de inhibición de ARNt sintetasa. Este método se puede realizar en una ARNt sintetasa que está contenida dentro de un organismo o que está fuera de un organismo. En un ejemplo de realización, el método se realiza en una ARNt sintetasa que está contenida dentro de un microorganismo o una célula microbiana que está dentro o sobre la superficie de un animal. En un ejemplo de realización, el animal es un ser humano. El método produce como resultado una disminución en la cantidad de ARNt cargado producido por la ARNt sintetasa que tiene un dominio de edición inhibido. En un ejemplo de realización, la inhibición tiene lugar en una célula, tal como una célula de microorganismo. En otro ejemplo de realización, la célula del microorganismo es una bacteria. En otro ejemplo de realización, la ARNt sintetasa es leucil ARNt sintetasa.
La divulgación proporciona un método para inhibir la conversión de una molécula de ARNt en una molécula de ARNt cargada. El método implica poner en contacto una ARNt sintetasa con un compuesto de la invención eficaz para inhibir la actividad de un dominio de edición de dicha ARNt sintetasa, en condiciones suficientes para inhibir dicha actividad, inhibiendo así dicha conversión. En un ejemplo de realización, el compuesto de la invención es un compuesto descrito en el presente documento, o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo. En un ejemplo de realización, la inhibición se produce dentro de una célula y la célula es una célula de microorganismo. En otro ejemplo de realización, la célula del microorganismo es una bacteria. En otro ejemplo de realización, la célula del microorganismo es una bacteria que se describe en el presente documento. En otro ejemplo de realización, la enzima es una leucil ARNt sintetasa de una bacteria descrita en el presente documento. En otro ejemplo de realización, la ARNt sintetasa es leucil ARNt sintetasa. En otro ejemplo de realización, el compuesto tiene una Kd, síntesis superior a 100 pM contra un dominio sintético de dicha ARNt sintetasa.
En determinadas realizaciones, el mecanismo de acción de un compuesto de la invención es inhibir la conversión de una molécula de ARNt en una molécula de ARNt cargada uniéndose y/o inhibiendo al menos el dominio de edición de la sintetasa. Los compuestos de uso en este método también pueden inhibir o bien interactuar con el dominio sintético (por ejemplo, el sitio activo del dominio sintético). En una realización actualmente preferida, el dominio de edición se inhibe selectivamente en presencia del dominio sintético. En una realización preferida, el dominio sintético está esencialmente no inhibido, mientras que el dominio de edición se inhibe al menos un 50%, preferiblemente al menos un 60%, más preferiblemente al menos un 70%, aún más preferiblemente, al menos un 80% e incluso aún más preferiblemente en al menos el 90% de la actividad de la ARNt sintetasa. En otra realización preferida, el dominio sintético se inhibe como máximo en un 50%, preferiblemente como máximo un 30%, preferiblemente como máximo un 20%, 10%, preferiblemente como máximo un 8%, más preferiblemente como máximo un 5%, aún más preferiblemente, como máximo 3% e incluso aún más preferiblemente como máximo 1%. La inhibición del dominio de edición produce una disminución en la cantidad de ARNt correctamente cargado que produce como resultado un retraso o la detención del crecimiento y la división celular.
En otro ejemplo de realización, la relación entre una concentración mínima de dicho compuesto que inhibe dicho dominio de edición y una concentración mínima de dicho compuesto que inhibe dicho dominio sintético de dicha ARNt sintetasa, representada como Kd, edición/KD, la síntesis es menor que uno. En otro ejemplo de realización, Kd, edición/KD, del compuesto es un miembro seleccionado entre menos de 0,5, menos de 0,1 y menos de 0,05.
VI. b) Inhibir el crecimiento de microorganismos o matar microorganismos
Los compuestos de la invención y/o combinaciones de la invención exhiben potencia contra microorganismos, tales como bacterias, y por lo tanto tienen el potencial de tratar y/o prevenir una infección por microorganismos, o matar y/o inhibir el crecimiento de microorganismos.
La divulgación también proporciona un método in vitro para matar y/o inhibir el crecimiento de un microorganismo, comprendiendo dicho método: poner en contacto dicho microorganismo con una cantidad eficaz de un compuesto de la invención, matando y/o inhibiendo así el crecimiento del microorganismo.
En un aspecto adicional, la invención proporciona un compuesto o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo, o una combinación de la invención para su uso en el tratamiento de una infección bacteriana en un animal. La divulgación proporciona un método para tratar una infección bacteriana que comprende administrar a un animal que padece la infección una cantidad eficaz de un compuesto de la invención, o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo, y una cantidad eficaz de un antibiótico o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo, tratando así la infección bacteriana.
En un aspecto adicional, la invención proporciona un compuesto o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo, o una combinación de la invención para su uso en la prevención de una infección bacteriana en un animal.
En un ejemplo de realización, el microorganismo es una bacteria. En un ejemplo de realización, el compuesto o combinación se describe en este documento, o una sal, hidrato o solvato del mismo, o una combinación de los mismos. En un ejemplo de realización, la invención proporciona un compuesto o combinación descritos en el presente documento, o una sal, hidrato o solvato del mismo. En un ejemplo de realización, la invención proporciona un compuesto o combinación descritos en este documento, o una sal del mismo. En otro ejemplo de realización, el compuesto o combinación de la invención es un compuesto o combinación descritos en este documento, o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo. En otro ejemplo de realización, el compuesto o compuesto de la combinación se describe mediante una fórmula enumerada en este documento, o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo. En un ejemplo de realización, el compuesto es parte de una combinación descrita en el presente documento. En un ejemplo de realización, el compuesto es parte de una formulación farmacéutica descrita en el presente documento. En otro ejemplo de realización, el contacto se produce en condiciones que permiten la entrada del compuesto en el organismo. Estas condiciones son conocidas por los expertos en la técnica y se describen en el presente documento.
En otro aspecto, el microorganismo se encuentra en el interior o en la superficie de un animal. En otro ejemplo de realización, el animal se describe en este documento. En otro ejemplo de realización, el animal es un ser humano.
En un ejemplo de realización, se trata y/o previene la infección por microorganismos, o se mata el microorganismo o se inhibe su crecimiento, mediante la administración oral del compuesto de la invención y/o la combinación de la invención. En un ejemplo de realización, se trata y/o se previene la infección por microorganismos, o se mata el microorganismo o se inhibe su crecimiento mediante la administración intravenosa del compuesto de la invención y/o la combinación de la invención.
En un ejemplo de realización, el microorganismo es una bacteria. En un ejemplo de realización, una infección es causada por y/o asociada con un microorganismo, particularmente una bacteria. En un ejemplo de realización, la bacteria es una bacteria grampositiva. En otro ejemplo de realización, la bacteria grampositiva se selecciona del grupo que consiste en especies de Staphylococcus, especies de Streptococcus, especies de Bacillus, especies de Mycobacterium, especies de Corynebacterium (especies de Propionibacterium), especies de Clostridium, especies de Actinomyces, especies de Enterococcus y especies de Streptomyces. En otro ejemplo de realización, la bacteria grampositiva se selecciona del grupo que consiste en Propionibacterium acnes, Staphylococcus aureus, Staphylococcus epidermidis, Staphylococcus saprophyticus, Staphylococcus haemolyticus, Streptococcus pyogenes, Streptococcus agaumrelactiae Bacillus anthracis, Corynebacterium diphtheria, Clostridium perfringens, Clostridium botulinum, Clostridium tetani y Clostridium difficile. En otro ejemplo de realización, la bacteria grampositiva se selecciona del grupo que consiste en Staphylococcus aureus, Staphylococcus epidermidis, Streptococcus pneumoniae, Streptococcus pyogenes, Enterococcus faecalis, Enterococcus faecium, Clostridium difficile y Propionibacter acnes. En otro ejemplo de realización, la bacteria es una bacteria gramnegativa. En otro ejemplo de realización, la bacteria gramnegativa se selecciona del grupo que consiste en especies de Acinetobacter, especies de Neisseria, especies de Pseudomonas, especies de Brucella, especies de Agrobacterium, especies de Bordetella, especies de Escherichia, especies de Shigella, especies de Yersinia, especies de Salmonella, especies de Klebsiella, especies de Enterobacter, especies de Haemophilus, especies de Pasteurella, especies de Streptobacillus, especies de espiroquetas, especies de Campylobacter, especies de Vibrio, especies de Helicobacter, especies de Bacteroides, especies de Citrobacter, especies de Proteus, especies de Providencia, especies de Serratia, especies de Stenotrophomonas y especies de Burkholderia. En otro ejemplo de realización, la bacteria gramnegativa se selecciona del grupo que consiste en especies de Acinetobacter, especies de Pseudomonas, especies de Escherichia, especies de Klebsiella, especies de Enterobacter, especies de Bacteroides, especies de Citrobacter, especies de Proteus, especies de Providencia, especies de Serratia, especies de Stenotrophomonas y especies de Burkholderia. En otro ejemplo de realización, la bacteria gramnegativa se selecciona del grupo que consiste en Neisseria gonorrhoeae, Neisseria meningitidis, Pseudomonas aeruginosa, Legionella pneumophila, Escherichia coli, Yersinia pestis, Haemophilus influenzae, Helicobacter pylori, Campylobacter fetus, Campylobacter jejuni, Vibrio cholerae, Vibrio parahemolyticus, Treponema pallidum, Rickettsia prowazekii, Rickettsia rickettsii, Chlamydia trachomatis, Chlamydia psittaci, Brucella abortus, Agrobacterium tumefaciens, Francisella tularensmann, Klebsiella pneumoniae, Enterobacter cloacae, Acinetobacter baumannii, Bacteroides fragilis, Citrobacter freundii, Proteus mirabilis, Providencia stuartii, Serratia marcescens, Stenotrophomonas maltophilia y Burkholderia cepacia. En otro ejemplo de realización, la bacteria gramnegativa se selecciona del grupo que consiste en Pseudomonas aeruginosa, Escherichia coli, Haemophilus influenzae, Klebsiella pneumoniae, Enterobacter cloacae, Acinetobacter baumannii, Bacteroides fragilis, Citrobacter freundii, Proteus mirabilis, Providencia stuartii, Serratia marcescens, Stenotrophomonas maltophilia y Burkholderia cepacia. En otro ejemplo de realización, la bacteria gramnegativa se selecciona del grupo que consiste en Enterobacter aerogenes, Enterobacter cloacae, Enterobacter sakazakii, Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Proteus mirabilis, Serratia marcescens y Citrobacter freundii. En otro ejemplo de realización, la bacteria gramnegativa son varias especies de Providencia.
En un ejemplo de realización, el microorganismo es una bacteria acidorresistente. En otro ejemplo de realización, la bacteria son varias especies de Mycobacterium. En otro ejemplo de realización, la bacteria es Mycobacterium avium. En otro ejemplo de realización, la bacteria es Mycobacterium avium-intracellulare. En otro ejemplo de realización, la bacteria es Mycobacterium kansasii. En otro ejemplo de realización, la bacteria es Mycobacterium leprae. En otro ejemplo de realización, la bacteria es Mycobacterium lepromatosis. En otro ejemplo de realización, la bacteria es Mycobacterium africanum. En otro ejemplo de realización, la bacteria es Mycobacterium canetti. En otro ejemplo de realización, la bacteria es Mycobacterium microti. En otro ejemplo de realización, la bacteria es Mycobacterium tuberculosis. En otro ejemplo de realización, la bacteria es Mycobacterium tuberculosis que es resistente a múltiples fármacos. En otro ejemplo de realización, la bacteria es Mycobacterium tuberculosis, que es ampliamente resistente a los fármacos. En otro ejemplo de realización, la bacteria es Mycobacterium tuberculosis que es resistente a la rifampicina. En otro ejemplo de realización, la bacteria es Mycobacterium tuberculosis que es resistente a la isoniazida. En otro ejemplo de realización, la bacteria es Mycobacterium tuberculosis que es resistente a kanamicina. En otro ejemplo de realización, la bacteria es Mycobacterium tuberculosis que es resistente a la capreomicina. En otro ejemplo de realización, la bacteria es Mycobacterium tuberculosis que es resistente a la amikacina.
En otro ejemplo de realización, la bacteria es una especie de Pseudomonas. En otro ejemplo de realización, la bacteria es Pseudomonas aeruginosa. En otro ejemplo de realización, la bacteria se selecciona del grupo que consiste en Pseudomonas aeruginosa, Acinetobacter baumannii, Stenotrophomonas maltophilia y Burkholderia cepacia. En otro ejemplo de realización, la bacteria es Acinetobacter baumannii. En otro ejemplo de realización, la bacteria es Stenotrophomonas maltophilia. En otro ejemplo de realización, la bacteria es Burkholderia cepacia. En otro ejemplo de realización, la bacteria es la especie Acinetobacter. En otro ejemplo de realización, la bacteria es Acinetobacter anitratus. En otro ejemplo de realización, la bacteria se selecciona del grupo que consiste en Enterobacter aerogenes, Enterobacter cloacae, Enterobacter sakazakii, E. coli, K. pneumoniae, P. mirabilis, Serratia marcescens, Citrobacter freundii varias especies de Providencia. En otro ejemplo de realización, la bacteria se selecciona del grupo que consiste en Enterobacter aerogenes, Enterobacter cloacae, Enterobacter sakazakii, E. coli, K. pneumoniae, P. mirabilis, Serratia marcescens, Citrobacter freundii, varias especies de Providencia, S. aureus, S neumonía, S. pyogenes, E. faecalis y E. faecium. En otro ejemplo de realización, la bacteria se selecciona del grupo que consiste en Pseudomonas aeruginosa, Acinetobacter baumannii, Stenotrophomonas maltophilia, Burkholderia cepacia. En otro ejemplo de realización, la bacteria se selecciona del grupo que consiste en S. aureus, S. pneumonia, S. pyogenes, E. faecalis y E. faecium. En otro ejemplo de realización, la bacteria se selecciona del grupo que consiste en el grupo Strep de Viridans. En otro ejemplo de realización, la bacteria se selecciona del grupo que consiste en Strep. mitis, Strep. mutans, Strep. oralis, Strep. sanguis, Strep. sobrinus y Strep. millari. En otro ejemplo de realización, la bacteria es S. pneumonia. En otro ejemplo de realización, la bacteria es H. influenzae. En otro ejemplo de realización, la bacteria es S. aureus. En otro ejemplo de realización, la bacteria es M. catarrhalis. En otro ejemplo de realización, la bacteria es M. pneumoniae. En otro ejemplo de realización, la bacteria es L. pneumoniae. En otro ejemplo de realización, la bacteria es C. pneumoniae. En otro ejemplo de realización, la bacteria es S. pyogenes. En otro ejemplo de realización, la bacteria es un anaerobio. En otro ejemplo de realización, la bacteria es una especie de Alcaligenes. En otro ejemplo de realización, la bacteria es B. cepacia. En otro ejemplo de realización, la bacteria se selecciona del grupo que consiste en Enterobacter cloacae, Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Proteus mirabilis, Providencia stuartii, Serratia marcescens y Citrobacter freundii. En otro ejemplo de realización, la bacteria es resistente a la meticilina. En otro ejemplo de realización, la bacteria es Staphylococcus aureus resistente a meticilina. En otro ejemplo de realización, la bacteria se selecciona del grupo que consiste en Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Staphylococcus aureus, Mycobacterium catarrhalis, Mycobacterium pneumoniae, Legionella pneumophila y Chlamydia pneumoniae. En otro ejemplo de realización, la bacteria se selecciona del grupo que consiste en Enterobacter cloacae, Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Proteus mirabilis, Serratia marcescens, Citrobacter freundii, Providencia stuartii, Pseudomonas aeruginosa, Acinetobacter baumannii, Stenotrophomonas maltophilia, Burkholderia cepacia, Staphylococcus aureus, Streptococcus pneumoniae, Streptococcus pyogenes, Enterococcus faecalis, y Enterococcus faecium. En otro ejemplo de realización, la bacteria se selecciona del grupo que consiste en Staphylococcus aureus, Staphylococcus epidermidis, Staphylococcus haemolyticus, Streptococcus pyogenes, Streptococcus agalactiae y Streptococcus pneumoniae.
En un ejemplo de realización, el microorganismo es una bacteria, que se selecciona del grupo que consiste en bacilos, que incluye especies de Bacillus, especies de Corynebacterium (también Propionibacterium) y especies de Clostridium; bacterias filamentosas, incluidas especies de Actinomyces y especies de Streptomyces; bacilos, tales como especies de Pseudomonas, especies de Brucella, especies de Agrobacterium, especies de Bordetella, especies de Escherichia, especies de Shigella, especies de Yersinia, especies de Salmonella, especies de Klebsiella, especies de Enterobacter, especies de Haemophilus, especies de Pasteurella y especies de Streptobacillus; especies de espiroquetas, especies de Campylobacter, especies de Vibrio; y bacterias intracelulares que incluyen especies de Rickettsiae y especies de Chlamydia.
VI. b) Infección por microorganismos
Los compuestos de la invención y/o combinaciones de la invención exhiben potencia contra microorganismos, tales como bacterias, y por lo tanto tienen el potencial de usarse para tratar y/o prevenir una infección por microorganismos, tal como una infección bacteriana.
En un aspecto adicional, la invención proporciona un compuesto o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo, o una combinación de la invención para su uso en el tratamiento de una infección bacteriana en un animal. La divulgación proporciona un método para tratar una infección bacteriana que comprende administrar a un animal que padece la infección una cantidad eficaz de un compuesto de la invención, o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo, y una cantidad eficaz de un antibiótico o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo, tratando así la infección bacteriana.
En un aspecto adicional, la invención proporciona un compuesto o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo, o una combinación de la invención para su uso en la prevención de una infección bacteriana en un animal. La divulgación proporciona un método para prevenir una infección bacteriana que comprende administrar a un animal una cantidad profiláctica de un compuesto de la invención, o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo, y una cantidad eficaz de un antibiótico, o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo, tratando así la infección bacteriana.
VI. c) Enfermedades
Los compuestos de la invención y/o combinaciones de la invención exhiben potencia contra microorganismos, tales como bacterias, y por lo tanto tienen el potencial de lograr eficacia terapéutica en los animales descritos en este documento.
En otro aspecto, la invención proporciona un compuesto o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo, o una combinación de la invención para su uso en el tratamiento y/o prevención de una enfermedad en un animal. En un ejemplo de realización, el compuesto se describe en el presente documento, o una sal, hidrato o solvato del mismo, o una combinación de los mismos. En un ejemplo de realización, la invención proporciona un compuesto descrito en el presente documento. En un ejemplo de realización, la invención proporciona un compuesto descrito en el presente documento, o una sal, hidrato o solvato del mismo. En un ejemplo de realización, la invención proporciona un compuesto descrito en el presente documento, o una sal del mismo. En otro ejemplo de realización, el compuesto de la invención es un compuesto descrito en el presente documento, o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo. En un ejemplo de realización, el compuesto es un compuesto descrito en el presente documento, o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo. En un ejemplo de realización, el compuesto está de acuerdo con una fórmula descrita en el presente documento, o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo. En un ejemplo de realización, el compuesto es parte de una combinación descrita en el presente documento. En un ejemplo de realización, el compuesto es parte de una formulación farmacéutica descrita en el presente documento. En otro ejemplo de realización, la enfermedad es una enfermedad sistémica. En otro ejemplo de realización, la enfermedad es una enfermedad tópica. En un ejemplo de realización, el animal al que se administra el compuesto no requiere de tratamiento con el compuesto.
En un ejemplo de realización, la enfermedad se trata mediante la administración oral de un compuesto de la invención y/o una combinación de la invención. En un ejemplo de realización, la enfermedad se trata mediante la administración intravenosa de un compuesto de la invención y/o una combinación de la invención. En un ejemplo de realización, la enfermedad se trata mediante la administración subcutánea de un compuesto de la invención y/o una combinación de la invención.
Enfermedades sistémicas
La invención proporciona un compuesto o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo, o una combinación de la invención para su uso en el tratamiento de una enfermedad sistémica.
En otro ejemplo de realización, la enfermedad está asociada con una bacteria descrita en el presente documento. En otro ejemplo de realización, la enfermedad está asociada con la infección por una bacteria grampositiva. En un ejemplo de realización, la enfermedad está asociada con una especie de Staphylococcus. En otro ejemplo de realización, la enfermedad se selecciona del grupo que consiste en neumonía, gastroenteritis, síndrome de choque tóxico, neumonía adquirida en la comunidad (CAP), meningitis, artritis séptica, infección del tracto urinario, bacteriemia, endocarditis, osteomielitis, infección de la piel y de la estructura de la piel. En un ejemplo de realización, la enfermedad está asociada con una especie de Streptococcus. En otro ejemplo de realización, la enfermedad se selecciona del grupo que consiste en faringitis estreptocócica, infecciones cutáneas, fascitis necrotizante, síndrome de choque tóxico, neumonía, otitis media y sinusitis. En un ejemplo de realización, la enfermedad está asociada con una especie de Actinomyces. En otro ejemplo de realización, la enfermedad es actinomicosis. En un ejemplo de realización, la enfermedad está asociada con una especie de Norcardia. En otro ejemplo de realización, la enfermedad es neumonía. En un ejemplo de realización, la enfermedad está asociada con una especie de Corynebacterium. En otro ejemplo de realización, la enfermedad es difteria. En un ejemplo de realización, la enfermedad está asociada con una especie de Listeria. En otro ejemplo de realización, la enfermedad es meningitis. En un ejemplo de realización, la enfermedad está asociada con una especie de Bacillus. En otro ejemplo de realización, la enfermedad es ántrax o intoxicación alimentaria. En un ejemplo de realización, la enfermedad está asociada con una especie de Clostridium. En otro ejemplo de realización, la enfermedad se selecciona del grupo que consiste en botulismo, tétanos, gangrena gaseosa y diarrea.
En un ejemplo de realización, la enfermedad está asociada con una especie de Mycobacterium. En un ejemplo de realización, la enfermedad está asociada con Mycobacterium tuberculosis. En un ejemplo de realización, la enfermedad está asociada con Mycobacterium kansasii. En un ejemplo de realización, la enfermedad está asociada con Mycobacterium avium-intracellulare. En otro ejemplo de realización, la enfermedad es lepra. En otro ejemplo de realización, la enfermedad es tuberculosis. En otro ejemplo de realización, la enfermedad es tuberculosis pulmonar. En otro ejemplo de realización, la enfermedad es tuberculosis extrapulmonar. En otro ejemplo de realización, la enfermedad está asociada con tuberculosis resistente a múltiples fármacos. En otro ejemplo de realización, la enfermedad está asociada con una tuberculosis altamente resistente a fármacos.
En otro ejemplo de realización, la enfermedad está asociada con la infección por una bacteria gramnegativa. En un ejemplo de realización, la enfermedad está asociada con una especie de Neisseria. En otro ejemplo de realización, la enfermedad se selecciona del grupo que consiste en meningitis, gonorrea, otitis extrema y foliculitis. En un ejemplo de realización, la enfermedad está asociada con una especie de Escherichia. En otro ejemplo de realización, la enfermedad se selecciona del grupo que consiste en diarrea, infecciones del tracto urinario, meningitis, sepsis y HAP. En un ejemplo de realización, la enfermedad está asociada con una especie de Shigella. En otro ejemplo de realización, la enfermedad se selecciona del grupo que consiste en diarrea, bacteriemia, endocarditis, meningitis y gastroenteritis. En un ejemplo de realización, la enfermedad está asociada con una especie de Salmonella. En otro ejemplo de realización, la enfermedad se selecciona del grupo que consiste en fiebre tifoidea, sepsis, gastroenteritis, endocarditis, sinusitis y meningitis. En un ejemplo de realización, la enfermedad está asociada con una especie de Yersinia. En otro ejemplo de realización, la enfermedad se selecciona del grupo que consiste en fiebre tifoidea, peste bubónica, fiebre entérica y gastroenteritis. En un ejemplo de realización, la enfermedad está asociada con una especie de Klebsiella. En otro ejemplo de realización, la enfermedad es sepsis o infección del tracto urinario. En un ejemplo de realización, la enfermedad está asociada con una especie de Proteus. En otro ejemplo de realización, la enfermedad es una infección del tracto urinario. En un ejemplo de realización, la enfermedad está asociada con una especie de Enterobacter. En otro ejemplo de realización, la enfermedad es una infección intrahospitalaria. En un ejemplo de realización, la enfermedad está asociada con una especie de Serratia. En otro ejemplo de realización, la enfermedad se selecciona del grupo que consiste en una infección del tracto urinario, infección de la piel y de la estructura de la piel y neumonía. En un ejemplo de realización, la enfermedad está asociada con una especie de Vibrio. En otro ejemplo de realización, la enfermedad es cólera o gastroenteritis. En un ejemplo de realización, la enfermedad está asociada con una especie de Campylobacter. En otro ejemplo de realización, la enfermedad es gastroenteritis. En un ejemplo de realización, la enfermedad está asociada con una especie de Helicobacter. En otro ejemplo de realización, la enfermedad es gastritis crónica. En un ejemplo de realización, la enfermedad está asociada con una especie de Pseudomonas. En otro ejemplo de realización, la enfermedad se selecciona del grupo que consiste en neumonía, osteomielitis, infecciones por quemaduras, sepsis, UTI, endocarditis, otitis e infecciones de la córnea. En un ejemplo de realización, la enfermedad está asociada con una especie de Bacteroides. En otro ejemplo de realización, la enfermedad es una enfermedad periodontal o neumonía por aspiración. En un ejemplo de realización, la enfermedad está asociada con una especie de Haemophilus. En otro ejemplo de realización, la enfermedad se selecciona del grupo que consiste en meningitis, epiglotitis, artritis séptica, sepsis, chancroide y vaginitis. En un ejemplo de realización, la enfermedad está asociada con una especie de Bordetella. En otro ejemplo de realización, la enfermedad es la tos ferina. En un ejemplo de realización, la enfermedad está asociada con una especie de Legionella. En otro ejemplo de realización, la enfermedad es neumonía o fiebre pontiac. En un ejemplo de realización, la enfermedad está asociada con una especie de Francisella. En otro ejemplo de realización, la enfermedad es tularemia. En un ejemplo de realización, la enfermedad está asociada con una especie de Brucella. En otro ejemplo de realización, la enfermedad es brucelosis. En un ejemplo de realización, la enfermedad está asociada con una especie de Pasteurella. En otro ejemplo de realización, la enfermedad es una infección cutánea. En un ejemplo de realización, la enfermedad está asociada con una especie de Gardnerella. En otro ejemplo de realización, la enfermedad es vaginitis. En un ejemplo de realización, la enfermedad está asociada con una especie de Spirochetes. En otro ejemplo de realización, la enfermedad es la sífilis o la enfermedad de Lyme. En un ejemplo de realización, la enfermedad está asociada con una especie de Chlamydia. En otro ejemplo de realización, la enfermedad es clamidia. En un ejemplo de realización, la enfermedad está asociada con una especie de Rickettsiae. En otro ejemplo de realización, la enfermedad es fiebre maculosa de las Montañas Rocosas o tifus.
En un ejemplo de realización, la enfermedad está asociada con Mycoplasma pneumoniae. En otro ejemplo de realización, la enfermedad es traqueobronquitis o neumonía ambulante. En un ejemplo de realización, la enfermedad está asociada con Ureaplasma urealyticum. En otro ejemplo de realización, la enfermedad es uretritis. En otro ejemplo de realización, la enfermedad es pielonefritis. En otro ejemplo de realización, la enfermedad es una infección intraabdominal. En otro ejemplo de realización, la enfermedad es neutropenia febril. En otro ejemplo de realización, la enfermedad es una infección pélvica. En otro ejemplo de realización, la enfermedad es bacteriemia. En otro ejemplo de realización, la enfermedad es septicemia.
En un ejemplo de realización, la enfermedad es una exacerbación aguda de la enfermedad pulmonar obstructiva crónica. En un ejemplo de realización, la enfermedad es una enfermedad pulmonar obstructiva crónica. En un ejemplo de realización, la enfermedad es faringitis. En un ejemplo de realización, la enfermedad es amigdalitis. En un ejemplo de realización, la enfermedad es la exacerbación aguda de la bronquitis crónica (AECB). En un ejemplo de realización, la enfermedad es cervicitis. En un ejemplo de realización, la enfermedad es una úlcera genital.
En un ejemplo de realización, para cualquiera de los métodos descritos en este documento, el animal se selecciona del grupo que consiste en humano, ganado, ciervo, reno, cabra, abeja, cerdo, oveja, caballo, vaca, toro, perro, conejillo de indias, jerbo, conejo, gato, camello, yak, elefante, avestruz, nutria, pollo, pato, ganso, gallina de Guinea, paloma, cisne y pavo. En otro ejemplo de realización, para cualquiera de los métodos descritos en este documento, el animal se selecciona del grupo que consiste en un ser humano, ganado, cabra, cerdo, oveja, caballo, vaca, toro, perro, cobaya, jerbo, conejo, gato, pollo y pavo. En otro ejemplo de realización, para cualquiera de los métodos descritos en este documento, el animal es un ser humano.
En un ejemplo de realización, para cualquiera de los métodos descritos en este documento, se puede utilizar un compuesto de la invención, una combinación de la invención, un compuesto descrito en este documento o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo, o una combinación descrita en este documento, y/o una formulación farmacéutica descrito en este documento.
VII. Formulación farmacéutica
En otro aspecto, la invención proporciona una formulación farmacéutica que comprende: a) un compuesto de la invención; y b) un excipiente farmacéuticamente aceptable. En un ejemplo de realización, el compuesto está de acuerdo con una fórmula descrita en el presente documento. En un ejemplo de realización, el compuesto está de acuerdo con un ejemplo descrito en este documento. En un ejemplo de realización, el compuesto de la invención es un compuesto descrito en el presente documento, o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo. En un ejemplo de realización, el compuesto de la invención es un compuesto descrito en el presente documento.
En un ejemplo de realización, el compuesto de la invención está presente en la formulación farmacéutica en una cantidad entre aproximadamente 0,0001% y aproximadamente 60% (p/p). En un ejemplo de realización, la cantidad está entre aproximadamente el 0,01% y aproximadamente el 10% (p/p). En un ejemplo de realización, la cantidad está entre aproximadamente el 0,1% y aproximadamente el 10% (p/p). En un ejemplo de realización, la cantidad está entre aproximadamente el 0,25% y aproximadamente el 6% (p/p). En un ejemplo de realización, la cantidad está entre aproximadamente el 0,5% y aproximadamente el 5% (p/p). En un ejemplo de realización, la cantidad está entre aproximadamente el 0,1% y aproximadamente el 1,0% (p/p). En un ejemplo de realización, la cantidad está entre aproximadamente el 1,0% y aproximadamente el 2,0% (p/p). En un ejemplo de realización, la cantidad está entre aproximadamente el 2,0% y aproximadamente el 3,0% (p/p). En un ejemplo de realización, la cantidad está entre aproximadamente el 3,0% y aproximadamente el 4,0% (p/p). En un ejemplo de realización, la cantidad está entre aproximadamente el 4,0% y aproximadamente el 5,0% (p/p).
Las formulaciones farmacéuticas de la invención pueden adoptar una variedad de formas adaptadas a la vía de administración elegida. Los expertos en la técnica reconocerán diversas metodologías de síntesis que pueden emplearse para preparar formulaciones farmacéuticas no tóxicas que incorporan los compuestos descritos en el presente documento. Los expertos en la técnica reconocerán una amplia variedad de disolventes no tóxicos farmacéuticamente aceptables que pueden usarse para preparar solvatos de los compuestos de la invención, tales como agua, etanol, propilenglicol, aceite mineral, aceite vegetal y dimetilsulfóxido (DMSO).
Las composiciones de la invención pueden administrarse por vía oral, tópica, parenteral, por inhalación o atomización o por vía rectal en formulaciones unitarias de dosificación que contienen portadores, adyuvantes y vehículos convencionales no tóxicos farmacéuticamente aceptables. Se entiende además que el mejor método de administración puede ser una combinación de métodos. Se prefiere particularmente la administración oral en forma de píldora, cápsula, elixir, jarabe, gragea, pastilla o similar. El término parenteral como se usa en este documento incluye inyecciones subcutánea, intradérmica, intravascular (por ejemplo, intravenosa), intramuscular, espinal, intratecal o técnicas de inyección o infusión similares.
Las formulaciones farmacéuticas que contienen compuestos de la invención se encuentran preferiblemente en una forma adecuada para uso oral, por ejemplo, como comprimidos, grageas, pastillas, suspensiones acuosas u oleosas, polvos o gránulos dispersables, emulsión, cápsulas duras o blandas o jarabes o elixires.
Las composiciones destinadas a uso oral se pueden preparar de acuerdo con cualquier método conocido en la técnica para la fabricación de formulaciones farmacéuticas, y dichas composiciones pueden contener uno o más agentes seleccionados del grupo que consiste en agentes edulcorantes, agentes saborizantes, agentes colorantes y agentes conservantes para proporcionar preparaciones farmacéuticamente elegantes y apetitosas. Los comprimidos pueden contener el ingrediente activo mezclado con excipientes no tóxicos farmacéuticamente aceptables que son adecuados para la fabricación de comprimidos. Estos excipientes pueden ser, por ejemplo, diluyentes inertes, tales como carbonato de calcio, carbonato de sodio, lactosa, fosfato de calcio o fosfato de sodio; agentes de granulación y desintegración, por ejemplo, almidón de maíz o ácido algínico; agentes aglutinantes, por ejemplo almidón, gelatina o goma arábiga; agentes lubricantes, por ejemplo, estearato de magnesio, ácido esteárico o talco; y extendedores y agentes de carga, tales como celulosa microcristalina. Los comprimidos pueden no estar recubiertos o pueden recubrirse mediante técnicas conocidas para retrasar la desintegración y la absorción en el tracto gastrointestinal y, por lo tanto, proporcionar una acción sostenida durante un período más largo. Por ejemplo, se puede emplear un material de retardo de tiempo tal como monoestearato de glicerilo o diestearato de glicerilo.
Las formulaciones para uso oral también se pueden presentar como cápsulas de gelatina dura en las que el ingrediente activo se mezcla con un diluyente sólido inerte, por ejemplo, carbonato de calcio, fosfato de calcio o caolín, o como cápsulas de gelatina blanda en las que el ingrediente activo se mezcla con agua o un medio oleoso, por ejemplo aceite de cacahuete, parafina líquida o aceite de oliva.
Las suspensiones acuosas contienen los materiales activos mezclados con excipientes adecuados para la fabricación de suspensiones acuosas. Dichos excipientes son agentes de suspensión, por ejemplo carboximetilcelulosa de sodio, metilcelulosa, hidroxipropilmetilcelulosa, alginato de sodio, polivinilpirrolidona, goma de tragacanto y goma arábiga; y agentes dispersantes o humectantes, que pueden ser un fosfátido natural, por ejemplo, lecitina, o productos de condensación de un óxido de alquileno con ácidos grasos, por ejemplo estearato de polioxietileno, o productos de condensación de óxido de etileno con alcoholes alifáticos de cadena larga, por ejemplo heptadecaetilenoxicetanol, o productos de condensación de óxido de etileno con br. s.es parciales derivados de ácidos grasos y un hexitol tal como monooleato de polioxietilensorbitol, o productos de condensación de óxido de etileno con br. s.es parciales derivados de ácidos grasos y anhídridos de hexitol, por ejemplo monooleato de polietilén sorbitán. Las suspensiones acuosas también pueden contener uno o más conservantes, por ejemplo etilo o p-hidroxibenzoato de n-propilo, uno o más agentes colorantes, uno o más agentes saborizantes y uno o más agentes edulcorantes, tales como sacarosa o sacarina.
Las suspensiones oleosas se pueden formular suspendiendo los ingredientes activos en un aceite vegetal, por ejemplo aceite de cacahuete, aceite de oliva, aceite de sésamo o aceite de coco, o en un aceite mineral tal como parafina líquida. Las suspensiones oleosas pueden contener un agente espesante, por ejemplo cera de abejas, parafina dura o alcohol cetílico. Pueden añadirse agentes edulcorantes como los expuestos anteriormente y agentes saborizantes para proporcionar preparaciones orales agradables. Estas composiciones pueden conservarse mediante la adición de un antioxidante como el ácido ascórbico.
Los polvos y gránulos dispersables adecuados para la preparación de una suspensión acuosa mediante la adición de agua proporcionan el ingrediente activo mezclado con un agente dispersante o humectante, un agente de suspensión y uno o más conservantes. Los agentes dispersantes o humectantes y los agentes de suspensión adecuados se ejemplifican por los ya mencionados anteriormente. Otros agentes dispersantes incluyen polímeros hidrófilos, electrolitos, TweenMR 60 u 80, PEG, polivinilpirrolidona (PVP; conocida comercialmente como PlasdoneMR) y los agentes dispersantes a base de carbohidratos tales como, por ejemplo, hidroxipropilcelulosa y éteres de hidroxipropilcelulosa (por ejemplo, HPC, HPC-SL y HPC-L), hidroxipropilmetilcelulosa y éteres de hidroxipropilmetilcelulosa (por ejemplo, HPMC K100, HPMC K4M, HPMC K15M y HPMC K100M), carboximetilcelulosa de sodio, metilcelulosa, hidroxietilcelulosa, ftalato de hidroxipropilmetilcelulosa, acetato estearato de hidroxipropilmetilcelulosa celulosa no cristalina, silicato de magnesio y aluminio, trietanolamina, alcohol polivinílico (PVA), copolímero de polivinilpirrolidona/acetato de vinilo (PlasdoneMR, por ejemplo, S-630), polímero de 4-(1,1,3,3-tetrametilbutil)-fenol con óxido de etileno y formaldehído (también conocido como tiloxapol), poloxámeros (por ejemplo, Pluronics F68MR, F88MR y F108MR, que son copolímeros de bloque de óxido de etileno y óxido de propileno); y poloxaminas (por ejemplo, Tetronic 9080, también conocido como Poloxamina 9080, que es un copolímero de bloque tetrafuncional derivado de la adición secuencial de óxido de propileno y óxido de etileno a etilendiamina (BASF Corporation, Parsippany, Nueva Jersey)). También pueden estar presentes excipientes adicionales, por ejemplo, agentes edulcorantes, saborizantes y colorantes.
Las formulaciones farmacéuticas de la invención también pueden estar en forma de emulsiones de aceite en agua y emulsiones de agua en aceite. La fase aceitosa puede ser un aceite vegetal, por ejemplo aceite de oliva o aceite de cacahuete, o un aceite mineral, por ejemplo parafina líquida o mezclas de estos. Los agentes emulsionantes adecuados pueden ser gomas de origen natural, por ejemplo goma arábiga o goma tragacanto; fosfátidos de origen natural, por ejemplo, soja, lecitina y ésteres o ésteres parciales derivados de ácidos grasos y hexitol; anhídridos, por ejemplo, monooleato de sorbitán; y productos de condensación de dichos ésteres parciales con óxido de etileno, por ejemplo monooleato de polioxietilensorbitán. Las emulsiones también pueden contener agentes edulcorantes y saborizantes.
Los jarabes y elixires se pueden formular con agentes edulcorantes, por ejemplo, glicerol, propilenglicol, sorbitol o sacarosa. Tales formulaciones también pueden contener un demulcente, un conservante y agentes saborizantes y colorantes. Las formulaciones farmacéuticas pueden estar en forma de suspensión acuosa u oleaginosa inyectable estéril. Esta suspensión se puede formular de acuerdo con la técnica conocida usando aquellos agentes dispersantes o humectantes y agentes de suspensión adecuados, que se han mencionado anteriormente. La preparación inyectable estéril también puede ser una solución o suspensión inyectable estéril en un diluyente o disolvente parenteralmente aceptable no tóxico, por ejemplo como una solución en 1,3-butanodiol. Entre los vehículos y disolventes aceptables que se pueden emplear se encuentran el agua, la solución de Ringer y la solución isotónica de cloruro de sodio. Además, los aceites fijos estériles se emplean convencionalmente como disolvente o medio de suspensión. Para este propósito, puede emplearse cualquier aceite fijo suave, incluidos mono o diglicéridos sintéticos. Además, los ácidos grasos como el ácido oleico encuentran uso en la preparación de inyectables.
La composición de la invención también se puede administrar en forma de supositorios, por ejemplo, para la administración rectal del fármaco. Estas composiciones se pueden preparar mezclando el fármaco con un excipiente no irritante adecuado que sea sólido a temperaturas ordinarias pero líquido a la temperatura rectal y, por lo tanto, se fundirá en el recto para liberar el fármaco. Tales materiales son manteca de cacao y polietilenglicoles.
Alternativamente, las composiciones se pueden administrar por vía parenteral en un medio estéril. El fármaco, dependiendo del vehículo y la concentración utilizados, puede suspenderse o disolverse en el vehículo. De manera ventajosa, se pueden disolver en el vehículo adyuvantes tales como anestésicos locales, conservantes y agentes tamponadores.
Para la administración a animales no humanos, la composición que contiene el compuesto terapéutico puede añadirse al pienso o al agua de bebida del animal. Además, será conveniente formular alimentos para animales y productos de agua potable para que el animal ingiera una cantidad apropiada del compuesto en su dieta. Además, será conveniente presentar el compuesto en una composición como una premezcla para la adición al agua de alimentación o de bebida. La composición también se puede añadir como complemento alimenticio o de bebida para seres humanos.
Los niveles de dosificación del orden de aproximadamente 5 mg a aproximadamente 250 mg por kilogramo de peso corporal por día y más preferiblemente de aproximadamente 25 mg a aproximadamente 150 mg por kilogramo de peso corporal por día, son útiles en el tratamiento de las afecciones indicadas anteriormente. La cantidad de ingrediente activo que puede combinarse con los materiales portadores para producir una única forma de dosificación variará dependiendo de la afección que se esté tratando y el modo particular de administración. Las formas unitarias de dosificación contendrán generalmente entre aproximadamente 1 mg y aproximadamente 500 mg de un ingrediente activo.
La frecuencia de dosificación también puede variar dependiendo del compuesto usado y la enfermedad particular tratada. Sin embargo, para el tratamiento de la mayoría de los trastornos, se prefiere un régimen de dosificación de 4 veces al día o menos. Sin embargo, se entenderá que el nivel de dosis específico para cualquier paciente en particular dependerá de una variedad de factores que incluyen la actividad del compuesto específico empleado, la edad, el peso corporal, la salud general, el sexo, la dieta, el momento de la administración, la vía de administración y velocidad de excreción, combinación de fármacos y la gravedad de la enfermedad particular que se somete a terapia.
Los compuestos preferidos de la invención tendrán propiedades farmacológicas deseables que incluyen, pero no se limitan a, biodisponibilidad oral, baja toxicidad, baja unión a proteínas séricas y semividas deseables in vitro e in vivo. Es necesaria la penetración de la barrera hematoencefálica para los compuestos utilizados para tratar trastornos del SNC, mientras que a menudo se prefieren niveles bajos de compuestos utilizados para tratar trastornos periféricos en el cerebro.
La cantidad de la composición requerida para su uso en el tratamiento variará no solo con el compuesto particular seleccionado, sino también con la vía de administración, la naturaleza de la afección que se está tratando y la edad y afección del paciente y, en última instancia, será a discreción del médico o especialista tratante.
En un ejemplo de realización, la composición farmacéutica descrita en este documento incluye un ingrediente activo adicional. En otro ejemplo de realización, el ingrediente activo adicional es un compuesto que ha sido aprobado para uso humano por la Administración de Drogas y Alimentos de los Estados Unidos. En otro ejemplo de realización, el ingrediente activo adicional es un agente inmunosupresor. En todavía otro ejemplo de realización, el ingrediente activo adicional se selecciona del grupo que consiste en corticosteroides, aminosalicilatos, azatioprina (6-mercaptopurina), metotrexato y ciclosporina, etanercept, infliximab, adalimumab, alefacept, efalizumab y anakinra.
En todavía otro ejemplo de realización, el ingrediente activo adicional se selecciona del grupo que consiste en betametasona, tacrolimus y pimecrolimus. En otro ejemplo de realización más, el ingrediente activo adicional se selecciona del grupo que consiste en un análogo de vitamina D activado y un arotinoide (un análogo de ácido retinoico aromático). En otro ejemplo de realización más, el ingrediente activo adicional es carcipotriol, tal como Tazorac (tazaroteno).
VII. a) Formulaciones tópicas
En una realización preferida, los compuestos descritos en el presente documento pueden administrarse mediante aplicación tópica. La administración tópica incluye, por ejemplo, las vías de administración transmucosa, transdérmica, ungual y transungueal. Las composiciones tópicas útiles en la presente invención se pueden convertir en una amplia variedad de tipos de productos. Estos incluyen, entre otros, lociones, cremas, geles, barras, aerosoles, ungüentos, pastas, espumas, mousses, mascarillas, ungüentos para los ojos, gotas para los ojos o los oídos, apósitos impregnados, toallitas, limpiadores que incluyen jabones, jabones corporales y champús, y productos de maquillaje, tales como bases, rubores, labiales y sombras de ojos, entre otros. Estos tipos de productos pueden comprender varios tipos de sistemas portadores que incluyen, pero no se limitan a, partículas, nanopartículas y liposomas. Si se desea, se pueden añadir agentes desintegrantes, tales como polivinilpirrolidona entrecruzada, agar o ácido algínico o una sal de los mismos tal como alginato de sodio. Las técnicas de formulación y administración se pueden encontrar en Remington: The Science and Practice of Pharmacy, citado más arriba. La formulación se puede seleccionar para maximizar la entrega a un sitio diana deseado en el cuerpo. Las formulaciones también pueden incluir varios colorantes convencionales, fragancias, espesantes, conservantes, humectantes, emolientes, demulcentes, excipientes solubilizantes, dispersantes, potenciadores de la penetración, agentes plastificantes, conservantes, estabilizadores, desemulsionantes, agentes humectantes, protectores solares, emulsionantes, humectantes, astringentes, desodorantes y similares, que se pueden añadir para proporcionar beneficios adicionales como, por ejemplo, mejorar la sensación y/o el aspecto de la preparación tópica.
Las lociones, que son preparaciones que se aplican a la piel, uñas, cabello, garra o superficie de la pezuña sin fricción, son típicamente preparaciones líquidas o semilíquidas en las que se dispersan sólidos, cerosos o líquidos finamente divididos. Las lociones contendrán típicamente agentes de suspensión para producir mejores dispersiones así como compuestos útiles para localizar y mantener el agente activo en contacto con la piel, uñas, cabello, garras o pezuñas, por ejemplo, metilcelulosa, carboximetilcelulosa de sodio, o similares.
Las cremas que contienen el agente activo para administración de acuerdo con la invención son emulsiones líquidas viscosas o semisólidas, ya sea aceite en agua o agua en aceite. Las bases en crema son lavables con agua y contienen una fase oleosa, un emulsionante y una fase acuosa. La fase oleosa está compuesta generalmente por vaselina o un alcohol graso, tal como alcohol cetílico o estearílico; la fase acuosa normalmente, aunque no necesariamente, excede en volumen a la fase oleosa y generalmente contiene un humectante. El emulsionante en una formulación de crema, como se explica en Remington: The Science and Practice of Pharmacy, citado anteriormente, es generalmente un tensioactivo no iónico, aniónico, catiónico o anfótero.
Los ungüentos, que son preparaciones semisólidas, se basan típicamente en vaselina u otros derivados del petróleo. Como apreciará el experto en la materia, la base de ungüento específica que se utilizará es una que proporcione un suministro óptimo del agente activo elegido para una formulación dada y, preferiblemente, proporcione también otras características deseadas, por ejemplo, emoliencia o similares. Al igual que con otros portadores o vehículos, una base de ungüento debe ser inerte, estable, no irritante y no sensibilizante. Como se explica en Remington: The Science and Practice of Pharmacy, vigésimo novena edición (Easton, Pa.: Mack Publishing Co., 1995), en las páginas 1399-1404, las bases para ungüentos pueden agruparse en cuatro clases: bases oleaginosas; bases emulsionables; bases para emulsión; y bases solubles en agua. Las bases de ungüentos oleaginosos incluyen, por ejemplo, aceites vegetales, grasas obtenidas de animales e hidrocarburos semisólidos obtenidos del petróleo. Las bases de ungüentos solubles en agua preferidas se preparan a partir de polietilenglicoles de peso molecular variable; de nuevo, se puede hacer referencia a Remington: The Science and Practice of Pharmacy, citado anteriormente, para obtener más información.
Las formulaciones útiles de la invención también abarcan atomizadores y aerosoles. Los aerosoles generalmente proporcionan el agente activo en una solución acuosa y/o alcohólica que se puede rociar sobre la piel, las uñas, el cabello, las garras o las pezuñas para su administración. Dichos atomizadores incluyen los formulados para proporcionar la concentración de la solución de agente activo en el sitio de administración después de la administración, por ejemplo, la solución de pulverización puede estar compuesta principalmente de alcohol u otro líquido volátil similar en el que se puede disolver el fármaco o el agente activo. Tras la administración a la piel, uñas, cabello, garras o pezuñas, el portador se evapora, dejando el agente activo concentrado en el sitio de administración. Se describen ejemplos de tecnología de aerosoles en las patentes de Estados Unidos Nos. 6.682.716; 6.716.415; 6.716.417; 6.783.753; 7.029.658; y 7.033.575.
Los ejemplos de excipientes solubilizantes incluyen ácidos grasos polietoxilados, diésteres de PEG-ácidos grasos, mezclas de monoésteres y diésteres de PEG-ácidos grasos, ésteres de ácidos grasos de polietilenglicol glicerol, productos de transesterificación de alcohol-aceite, ácidos grasos poliglicerizados, propilenglicol ésteres de ácidos grasos, mezclas de ésteres de propilenglicol-ésteres de glicerol, mono y diglicéridos, derivados de esterol y esteroles, ésteres de ácidos grasos de polietilenglicol y sorbitán, alquiléteres de polietilenglicol, ésteres de azúcares, alquilfenoles de polietilenglicol, copolímeros en bloque de polioxietilen-polioxipropileno, sorbitán ésteres de ácidos grasos, ésteres de ácidos grasos de alcoholes inferiores, tensioactivos iónicos, ésteres de tocoferol y ésteres de esterol.
Los ejemplos de realizaciones se resumen a continuación en el presente documento.
En un ejemplo de realización, de acuerdo con cualquiera de los párrafos anteriores, R4 es flúor.
En un ejemplo de realización, de acuerdo con cualquiera de los párrafos anteriores, R4 es bromo.
En un ejemplo de realización, de acuerdo con cualquiera de los párrafos anteriores, en el que dicho exceso enantiomérico es al menos del 92%.
En un ejemplo de realización, de acuerdo con cualquiera de los párrafos anteriores, en el que el estereocentro C* del primer estereoisómero está en una configuración (S).
En un ejemplo de realización, la invención proporciona una composición de acuerdo con cualquiera de los párrafos anteriores, en la que el estereocentro C* está en una configuración (S), y dicha composición está sustancialmente libre del enantiómero (R) del compuesto.
En un ejemplo de realización, la invención proporciona una formulación farmacéutica que comprende: (a) un compuesto de acuerdo con cualquiera de los párrafos anteriores, o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo; y (b) un excipiente farmacéuticamente aceptable.
En un ejemplo de realización, de acuerdo con cualquiera de los párrafos anteriores, la formulación está en forma de dosificación unitaria.
En un ejemplo de realización, de acuerdo con cualquiera de los párrafos anteriores, la formulación es para uso oral o tópico.
En un ejemplo de realización, la divulgación proporciona un método in vitro para inhibir una enzima, que comprende: poner en contacto la enzima con el compuesto de acuerdo con cualquiera de los párrafos anteriores, inhibiendo así la enzima.
En un ejemplo de realización, de acuerdo con cualquiera de los párrafos anteriores, la enzima es una ARNt sintetasa que comprende un dominio de edición.
En un ejemplo de realización, de acuerdo con cualquiera de los párrafos anteriores, la enzima es una leucil ARNt sintetasa.
En un ejemplo de realización, la divulgación proporciona un método in vitro para matar y/o prevenir el crecimiento de un microorganismo, que comprende: poner en contacto el microorganismo con una cantidad eficaz de un compuesto de acuerdo con cualquiera de los párrafos anteriores, o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo, matando de ese modo y/o previniendo el crecimiento del microorganismo.
En un ejemplo de realización, de acuerdo con cualquiera de los párrafos anteriores, el microorganismo es una bacteria. En un ejemplo de realización, de acuerdo con cualquiera de los párrafos anteriores, el microorganismo es Mycobacterium tuberculosis.
En un ejemplo de realización, la divulgación proporciona un método in vitro para inhibir el dominio de edición de una ARNt sintetasa, que comprende: poner en contacto la sintetasa con una cantidad eficaz de un compuesto de acuerdo con cualquiera de los párrafos anteriores, o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo, inhibiendo así la sintetasa.
En un ejemplo de realización, de acuerdo con cualquiera de los párrafos anteriores, la sintetasa es una leucil ARNt sintetasa.
En un ejemplo de realización, de acuerdo con cualquiera de los párrafos anteriores, la sintetasa es una leucil ARNt sintetasa de Mycobacterium tuberculosis.
La invención se ilustra adicionalmente mediante los Ejemplos que siguen. Los Ejemplos no pretenden definir o limitar el alcance de la invención.
Ejemplos
La RMN de protón se registra en el espectrómetro Varian AS 300 y los desplazamientos químicos se reportan como 8 (ppm) campo abajo desde el tetrametilsilano. Los espectros de masas se determinan en un Micromass Quattro II. El gen LeuRS de M. tuberculosis (secuencia de ADN enumerada en el presente documento) se preparó mediante GenScript y se clonó en el vector pET28a(+) de expresión de T7 en los sitios Ndel-Xhol. La sobreexpresión de LeuRS de M. tuberculosis a partir de este constructo generó una versión de LeuRS de M. tuberculosis con una etiqueta His en el terminal N, que utilizará los procedimientos estándar para la purificación de proteínas etiquetadas con His.
Ejemplo 1
A. 3-Aminometil-4-fluoro-7-(3-hidroxi-propoxi)-3H-benzo[c][1,2]oxaborol-1-ol; sal bis trifluoroacética
6-Fluoro-2,3-dimetoxi-benzaldehído
Figure imgf000028_0001
A una solución de 4-fluoro-1,2-dimetoxibenceno (20,0 g, 128,07 mmol) en THF anhidro (200 ml) bajo atmósfera de nitrógeno a -78 °C se le añadió gota a gota una solución 2,5 M en hexano de n-BuLi (102,4 ml, 256,14 mmol) durante 30 min y la mezcla de reacción se agitó adicionalmente a la misma temperatura durante 3 h. La mezcla de reacción se inactivó cuidadosamente con DMF (100 ml) de -65 °C a -40 °C y se dejó reposar durante la noche. Se añadió gota a gota HCl 2 N (300 ml) a -60 °C y la mezcla se agitó durante 30 min. Las dos capas se separaron y la capa acuosa se extrajo con EtOAc. Las capas orgánicas combinadas se lavaron con agua y salmuera, se secaron sobre MgSO4, se filtraron y se concentraron al vacío. La purificación se completó mediante cromatografía en columna ultrarrápida (EtOAc al 20%/hexano). Rendimiento 18,0 g (85%). RMN 1H (400 MHz, CLOROFORMO-d) 6 ppm 10,39 (s, 1 H), 7,09 (dd, J = 9,4, 5,1 Hz, 1 H), 6,84 (t, J = 9,6 Hz, 1 H) , 3,98 (s, 3 H), 3,88 (s, 3 H). RMN 19F (376 MHz, CLOROFORMO-d): -126 ppm.
6-Fluoro-2,3-dihidroxi-benzaldehído
Figure imgf000028_0002
A una solución de 6-fluoro-2,3-dimetoxi-benzaldehído (18,0 g, 97,74 mmol) en diclorometano anhidro (100 ml) bajo atmósfera de nitrógeno a -60 °C se le añadió gota a gota BBr3.OEt2 (195 ml, 195,48 mmol) durante 30 min y la solución se dejó calentar a ta y se agitó durante 4 h. La mezcla de reacción se enfrió a -60 °C y se le añadió gota a gota con cuidado HCl 2 N (250 ml). La mezcla se agitó a temperatura ambiente durante la noche. Las dos capas se separaron y la capa acuosa se extrajo con DCM. Las capas orgánicas combinadas se lavaron con agua, solución saturada de NaHCOa, agua y salmuera y se secó sobre MgSO4. El disolvente se eliminó al vacío para proporcionar el compuesto del título que se usó en la siguiente etapa sin purificación adicional. Rendimiento 11,15 g (74%). RMN 1H (400 MHz, CLOROFORMO-d) 6 ppm 11,53 (s, 1 H), 10,23 (s, 1 H), 7,11 (dd, J = 8,8, 5,3 Hz, 1 H), 6,57 (t, J = 9,6 Hz, 1 H), 5,48 (s, 1 H). RMN 19F (376 MHz, CLOROFORMO-d): -132 ppm.
3-(3-Benciloxi-propoxi)-6-fluoro-2-hidroxi-benzaldehído
Figure imgf000028_0003
A una solución de 6-fluoro-2,3-dihidroxi-benzaldehído (11,15 g, 71,42 mmol) en DMSO anhidro (88 ml) bajo atmósfera de nitrógeno se le añadieron secuencialmente t-butóxido de sodio (13,72 g, 142,84 mmol) y bencil-3-bromopropil éter (17,29 g, 78,56 mmol) y la mezcla de reacción se agitó a ta durante 18 h. La mezcla se diluyó con agua (400 ml) y se extrajo con EtOAc (4 x 100 ml). La capa orgánica combinada se lavó con agua y salmuera, se secó sobre MgSO4, se filtró y se concentró al vacío. La purificación se completó mediante cromatografía ultrarrápida (EtOAc al 20%/hexano). Rendimiento 11,5 g (77%). RMN 1H (400 MHz, CLOROFORMO-d) 6 ppm 11,62 (s, 1 H), 10,23 (s, 1 H), 7,42 - 7,16 (m, 5 H), 7,05 (dd, J = 8,8, 5,3 Hz, 1 H), 6,54 (t, J = 9,6 Hz, 1 H), 4,52 (s, 2 H), 4,13 (t, J = 6,3 Hz, 2 H), 3,68 ( t, J = 6,1 Hz, 2 H), 2,12 (quin, J = 6,2 Hz, 2 H). RMN 19F (376 MHz, CLOROFORMO-d): -132 ppm.
Éster 6-(3-benciloxi-propoxi)-3-fluoro-2-formil-fenílico del ácido trifluoro-metanosulfónico
Figure imgf000029_0001
Se añadió gota a gota anhídrido trifluorometanosulfónico (1,11 g, 3,94 mmol) a una solución de piridina (389 mg, 4,92 mmol) y 3-(3-benciloxi-propoxi)-6-fluoro-2-hidroxi-benzaldehído (1 g , 3,28 mmol) en CH2Ch (5 ml) a 0 °C (temperatura del baño). Después, la mezcla de reacción se dejó calentar a ta y se agitó hasta el consumo completo del material de partida (determinado por TLC). Luego se agregaron Et2O y HCl 2 N. La capa orgánica se separó y se lavó con solución saturada de NaHCO3 y luego salmuera. La capa orgánica se secó (Na2SO4) y se filtró a través de un tapón corto de gel de sílice, lavando con Et2O. El filtrado se concentró al vacío para producir 1,10 g del triflato deseado (rendimiento del 76%) que se utilizó directamente sin purificación adicional. RMN 1H (400 MHz, CLOROFORMO-d) 6 ppm 10,32 (s, 1 H), 7,44 - 7,21 (m, 7 H), 4,51 (s, 2 H), 4,18 (t, J = 6,1 Hz, 2 H), 3,68 (t, J = 5,7 Hz, 2 H), 2,14 (quin, J = 5,8 Hz, 2 H).
3-(3-Benciloxi-propoxi)-6-fluoro-2-(4,4,5,5-tetrametil-[1,3,2]dioxaborolan-2-il)-benzaldehído
Figure imgf000029_0002
A una solución de éster 6-(3-benciloxi-propoxi)-3-fluoro-2-formil-fenílico del ácido trifluoro-metanosulfónico (1,092 g, 2,50 mmol) en 1,4-dioxano anhidro (10 ml) se le añadió bis(pinacolato)diborano (953 mg, 3,75 mmol) y KOAc (736 mg, 7,50 mmol) a ta, luego se desgasificó con N2 durante 20 min. Se añadió PdCh(dppf) (46 mg, 8% en moles) y la solución resultante se agitó a 100 °C hasta que se completó la reacción. La solución se enfrió a ta, se filtró a través de Celite® o gel de sílice y se concentró al vacío. El residuo se recogió en EtOAc. Después, la capa orgánica se lavó con H2O y luego con salmuera, se secó (Na2SO4), se filtró y se concentró al vacío. El producto se purificó mediante cromatografía ultrarrápida (EtOAc al 20%/hexano) para producir 0,5 g del compuesto del título junto con destriflado en relación de producto de ~ 1:1 mediante un espectro de RMN H. RMN 1H (400 MHz, CLOROFORMO-d) 6 ppm 10,33 (s, 1 H), 7,41 -7,23 (m, 6 H), 7,19 (d, J = 9,4 Hz, 1 H), 4,57 -4,42 ( m, 2 H), 4,06 (t, J = 6,3 Hz, 2 H), 3,69 -3,64 (m, 2 H), 2,20 -2,00 (m, 2 H), 1,44 (s, 12 H); RMN 19F (376 MHz, CLOROFORMO-d) 6 ppm -73,72.
7-(3-Benciloxi-propoxi)-4-fluoro-3-nitrometil-3H-benzo[c][1,2]oxaborol-1-ol
Figure imgf000029_0003
Se añadió NaOH (48 mg, 1,20 mmol) a 3-(3-benciloxi-propoxi)-6-fluoro-2-(4,4,5,5-tetrametil-[1,3,2]dioxaborolan-2-il)-benzaldehído (500 mg, 1,2 mmol) en H2O (3 ml) a ta y la mezcla de reacción se agitó a ta durante 5 min. Se añadió gota a gota MeNO2 (219 mg, 3,6 mmol) y la mezcla se agitó a ta durante 16 h. La mezcla de reacción se acidificó con HCl 2 N y se extrajo con EtOAc. La fracción orgánica se lavó con H2O y luego con salmuera, se secó (MgSO4) y se concentró al vacío. La purificación se realizó mediante cromatografía ultrarrápida (EtOAc al 10-40%/hexano) para producir 120 mg del compuesto del título mediante un espectro de RMN 1H. RMN 1H (400 MHz, CLOROFORMO-d) 6 ppm 7,40 - 7,22 (m, 5 H), 7,11 (t, J = 8,8 Hz, 1 H), 6,81 (t, J = 8,6 Hz, 1 H) , 5,93 (dd, J = 9,0, 2,3 Hz, 1 H), 4,99 (dd, J = 13,1, 2,5 Hz, 1 H), 4,62 - 4,53 (m, 2 H), 4,43 (dd, J = 12,9, 9,0 Hz, 1 H), 4,19 - 4,01 (m, 2 H), 3,66 (dt, J = 15,9, 5,7 Hz, 2 H), 2,18 -1,94 (m, 2 H); RMN 19F (376 MHz, CLOROFORMO-d) 6 ppm -72,81 (s, 1 F); MS (ESI) m/z = 374 (M -1, negativo).
3-Aminometil-4-fluoro-7-(3-hidroxi-propoxi)-3H-benzo[c][1,2]oxaborol-1-ol; sal del ácido bis-trifluoroacético Una mezcla de 7-(3-benciloxi-propoxi)-4-fluoro-3-nitrometil-3H-benzo[c][1,2]oxaborol-1-ol (120 mg, 0,32 mmol) y Pd(OH)2 al 20% (120 mg, 1:1 p/p de sustrato con respecto al catalizador) en AcOH (10 ml) se agitó bajo una atmósfera de H2 (45-50 psi) en un agitador Parr. Una vez que se completó la reacción, la mezcla se filtró a través de Celite®. El filtrado se concentró al vacío para producir un material gomoso. El AcOH restante se eliminó mediante evaporación conjunta con tolueno (3 x) para producir la amina. La purificación por HPLC preparativa (CF3CO2H al 0,1% acuoso/CHaCN) produjo 12 mg del compuesto del título como un sólido blanco (rendimiento del 8,4%). RMN 1H (400 MHz, DMSO-da) 8 ppm 9,14 (br. s., 1 H), 8,02 (br. s., 3H), 7,25 (d, J = 7,8 Hz, 1H), 6,93 (d, J = 7,4 Hz, 1H), 5,43 (br. s., 1H), 4,55 (br. s., 1H), 4,07 (br. s., 2 H), 3,56 (br. s., 2 H), 3,42 - 3,37 (m, 1 H), 2,95 (br. s., 1 H), 1,86 (br. s., 2 H); RMN 19F (376 MHz, DMSO-d6) 8 ppm -73,90 (s, 6 F), -131,51 (s, 1 F); MS (ESI) m/z = 256 (M 1, positivo); pureza por HPLC: 95,65% (MaxPlot 200 - 400 nm), 96,63% (220 nm).
B. Clorhidrato de 3-(aminometil)-4-cloro-7-(3-hidroxipropoxi)benzo[c][1,2]oxaborol-1(3H)-ol
3-(3-Benciloxi-propoxi)-2-hidroxi-benzaldehído
Figure imgf000030_0001
Se añadió NaH (2,95 g, 72,4 mmol) a una solución enfriada con hielo de 2,3-dihidroxibenzaldehído (5,0 g, 36 mmol) en DMSO anhidro (45 ml). Luego se le añadió bencil-3-bromopropil éter (6,45 ml, 36,2 mmol) y la mezcla se agitó a ta durante 12 h. La mezcla se neutralizó usando HCl 1 N y luego se extrajo con EtOAc. La fracción orgánica se lavó con H2O y se concentró al vacío. El residuo se purificó mediante cromatografía ultrarrápida (8:2 de hexano/EtOAc) para producir el compuesto del título como un aceite marrón: rendimiento 8,40 g (81%). r Mn 1H (400 MHz, CDCh) 8 (ppm): 9,93 (s, 1 H), 7,36 - 7,23 (m, 6 H), 7,20 - 7,16 (m, 2 H), 6,98 - 6,91 (m, 1 H), 4,53 (s, 2 H), 4,19 (t, J = 6,2 Hz, 2 H), 3,70 (t, J = 6,1 Hz, 2 H), 2 ,19-2,16 (m, 2 H).
3-(3-Benciloxi-propoxi)-2-(4,4,5,5-tetrametil-[1,3,2]dioxaborolan-2-il)-benzaldehído
Figure imgf000030_0002
Se añadió gota a gota anhídrido trifluorometanosulfónico (4,60 ml, 27,9 mmol) a una solución de piridina (3,42 ml, 42,5 mmol) y 3-(3-benciloxi-propoxi)-2-hidroxibenzaldehído (7,6 g, 26 mmol) en CH2Ch (200 ml) a 0 °C (temperatura del baño). Después, la mezcla de reacción se dejó calentar a ta y se agitó hasta el consumo completo del material de partida (determinado por TLC). Luego se agregaron Et2O y HCl 2 N. La capa orgánica se separó y se lavó con solución saturada de NaHCO3 y luego salmuera. La capa orgánica se secó (Na2SO4) y se filtró a través de un tapón corto de gel de sílice, lavando con Et2O. El filtrado se concentró al vacío para producir 8,60 g del triflato deseado (rendimiento del 77%) que se usó directamente sin purificación adicional. RMN 1H (400 MHz, CDCh) 8 (ppm): 10,23 (s, 1 H), 7,54 - 7,47 (m, 1 H), 7,43 (t, J = 8,0 Hz, 1 H), 7,36 - 7,22 (m, 6 H), 4,52 (s, 2 H), 4,23 (t, J = 6,3 Hz, 2 H), 3,71 (t, J = 6,1 Hz, 2 H), 2,21 -2,17 (m, 2 H).
A una solución de éster 2-(3-benciloxi-propoxi)-6-formil-fenílico del ácido trifluorometanosulfónico (8,0 g, 19 mmol) en 1,4-dioxano anhidro (160 ml) se le añadió bis(pinacolato)diborano (9,71 g, 38,2 mmol) y KOAc (5,71 g, 57,4 mmol) a ta, luego se desgasificó con N2 durante 20 min. Se añadió PdCh(dppf) (1,39 g, 1,89 mmol) y la solución resultante se agitó a 100 °C hasta que se completó la reacción. La solución se enfrió a ta, se filtró a través de Celite® o gel de sílice y se concentró al vacío. El residuo se recogió en EtOAc. Después, la capa orgánica se lavó con H2O y luego con salmuera, se secó (Na2SO4), se filtró y se concentró al vacío. El producto se purificó mediante cromatografía ultrarrápida (9:1 de hexano/EtOAc) para producir 4,80 g del compuesto del título (rendimiento del 43%) junto con algo de contaminación con pinacol y se usó sin purificación adicional. RMN 1H (400 MHz, CDCh) 8 (ppm): 9,93 (s, 1H), 7,46 (t, J = 7,8 Hz, 1H), 7,41 - 7,36 (m, 1H), 7,35 - 7,24 (m, 5H), 7,08 (d, J = 7,8 Hz, 1H), 4,50 (s, 2H), 4,10 (t, J = 6,3 Hz, 2H), 3,67 (t, J = 6,3 Hz, 2H), 2,11 (quin, J = 6,2 Hz, 2H), 1,43 (s, 12H).
-(3-Benciloxi-propoxi)-3-nitrometil-3H-benzo[c][1,2]oxaborol-1-ol
Figure imgf000031_0001
Se añadió NaOH ac. (3,64 g, 83 mmol) a 3-(3-benciloxi-propoxi)-2-(4,4,5,5-tetrametil-[1,3,2]dioxaborolan-2-il)-benzaldehído (36 g, 91 mmol) en H2O (180 ml) y THF (50 ml) a ta, y la mezcla de reacción se agitó a ta durante 5 min. Se añadió gota a gota MeNO2 (16,6 g, 273 mmol) y la mezcla se agitó a ta durante 16 h. La mezcla de reacción se acidificó con HCl 2 N y se extrajo con EtOAc. La fracción orgánica se lavó con H2O y luego con salmuera, se secó (MgSO4) y se concentró al vacío. La purificación se realizó mediante cromatografía ultrarrápida (1:1 hexano/EtOAc) para producir 15,9 g del compuesto del título como un aceite amarillo claro (rendimiento del 50%). RMN 1H (400 MHz, DMSO-d6) 8 ppm: 9,05 (s, 1H), 7,44 (t , J = 7,8 Hz, 1H), 7,35 - 7,20 (m, 5H), 7,06 (d, J = 7,4 Hz, 1H), 6,88 (d, J = 8,2 Hz, 1H), 5,70 (dd, J = 9,4, 2,3 Hz, 1 H), 5,29 (dd, J = 13,7, 2,7 Hz, 1 H), 4,53 (dd, J = 13,3, 9,4 Hz, 1 H), 4,45 (s, 2 H), 4,11 (t, J = 6,1 Hz, 2H), 3,60 (t, J = 6,3 Hz, 2H), 2,04-1,91 (m, 2H); EM (ESI): m/z = 356 (M-1, negativo); pureza por HPLC: 99,35% (MaxPlot 200-400 nm), 97,32% (220 nm).
4-Cloro-7-(3-hidroxi-propoxi)-3-nitrometil-3H-benzo[c][1,2]oxaborol-1-ol
Figure imgf000031_0002
A 7-(3-benciloxi-propoxi)-3-nitrometil-3H-benzo[c][1,2]oxaborol-1-ol (1,1 g, 3,0 mmol) en AcOH glacial (10 ml) en un baño de agua fría se le añadió a SO2Ch (0,7 ml, 9,07 mmol) gota a gota durante un período de 5 minutos. La solución resultante se agitó durante 30 minutos a la misma temperatura y luego 1,5 ha temperatura ambiente. La solución se inactivó con hielo triturado y luego se diluyó con EtOAc (100 ml). La capa orgánica se lavó con agua, se secó sobre Na2SO4, se filtró y se concentró a presión reducida. Al residuo crudo en MeOH (20 ml) se le añadió Pd(OH)2 (10% p/p sobre carbono, 0,7 g), se le añadió HCl concentrado hasta que el pH fue 1 y el recipiente de reacción se presurizó a 40 psi con hidrógeno durante 30 minutos a temperatura ambiente. La mezcla resultante se filtró a través de un lecho corto de Celite® y se lavó con EtOAc. El filtrado se concentró al vacío, luego el residuo se purificó mediante cromatografía en columna de gel de sílice (EtOAc:Hex, 1:1) proporcionando el compuesto del título (0,2 g, 24% en 2 etapas). RMN 1H (400 MHz, DMSO-d6) 8 ppm 9,31 (br. s., 1 H), 7,49 (d, J = 8,2 Hz, 1 H), 6,98 (d, J = 8,6 Hz, 1 H), 5,76 (dd, J = 8,2, 2,7 Hz, 1 H), 5,33 (dd, J = 13,2, 2,3 Hz, 1 H), 4,70 (dd, J = 13,0, 8,4 Hz, 1 H), 4,55 (br. s., 1 H), 4,15 - 4,05 (m, 2 H), 3,61 - 3,55 (m, 2 H), 1,95 - 1,77 (m, 2 H).
Clorhidrato de 3-aminometil-4-cloro-7-(3-hidroxi-propoxi)-3H-benzo[c][1,2]oxaborol-1-ol
Figure imgf000031_0003
A 4-cloro-7-(3-hidroxi-propoxi)-3-nitrometil-3H-benzo[c][1,2]oxaborol-1-ol (105 mg, 0,35 mmol) en solución de amoniaco metanólico (2 M, 20 ml) se le añadió Ra/Ni (0,15 g, suspensión de níquel 2800 en agua) y el recipiente de reacción se presurizó a 40 psi con hidrógeno durante la noche a temperatura ambiente. La mezcla resultante se filtró a través de un lecho corto de Celite® y se lavó con EtOAc. El filtrado se concentró al vacío y al residuo se le añadió agua (1 ml), seguido de HCl concentrado a pH 1. La mezcla heterogénea se liofilizó proporcionando el compuesto del título (130 mg, cuantitativo) como un sólido blanco. RMN 1H (400 MHz, DMSO-d6) 8 ppm 9,14 (br. s., 1 h ), 8,36 (br. s., 3 H), 7,49 (d, J = 8,2 Hz, 1 H), 6,99 (d, J = 8,2 Hz, 1 H), 5,40 (d, J = 7,0 Hz, 1 H), 4,40 (br. s., 1 H), 4,10 (br. s., 2 H), 3,59 (br. s., 2 H), ~ 3,30 (oculto, 1H), 2,89 (br. s., 1 H), 1,89 (br. s., 2 H); MS (ESI) m/z = 272 (M 1, positivo); pureza por HPLC: 96,92% (MaxPlot 200 - 400 nm), 97,96% (220 nm).
C. 3-Aminometil-7-etoxi-4-fluoro-3H-benzo[c][1,2]-oxaborol-1-ol; clorhidrato
6-Fluoro-2,3-dimetoxi-benzaldehído
Figure imgf000032_0001
A una solución fría (-78 °C) de 4-fluoro-1,2-dimetoxibenceno (15,00 g, 96,05 mmol) en THF anhidro (150 ml) se le añadió n-BuLi (84,5 ml, 211,32 mmol, solución 2,5 M en hexanos) bajo atmósfera de nitrógeno y se agitó durante 3 h a -78 °C. Se detuvo la reacción con DMF (75 ml) a -65 °C, se le añadió gota a gota HCl 2 N (300 ml) y se agitó adicionalmente durante 30 min. Se observó separación de dos capas. La capa acuosa se extrajo con EtOAc. Las capas orgánicas combinadas se lavaron con agua, salmuera y se secaron sobre MgSO4. Se filtró la capa de acetato de etilo y se concentró al vacío. El compuesto del título se purificó mediante cromatografía en columna ultrarrápida usando hexanos puros, luego EtOAc al 10 y 20% en hexanos, lo que proporcionó 14,40 g (78,19 mmol, 82%) del compuesto del título como un sólido blanco. RMN 1H (400 MHz, DMSO-d6) 8 ppm 10,23 (s, 1 H), 7,36 (dd, J = 9,0, 5,1 Hz, 1 H), 7,03 (t, J = 9,6 Hz, 1 H) , 3,87 (s, 3 H), 3,83 (s, 3 H); RMN 19F (376 MHz, DMSO-d6) 8 ppm -131,68 --131,66 (m, IF).
6-Fluoro-2,3-dihidroxi-benzaldehído
Figure imgf000032_0002
A una solución fría (-78 °C) de 6-fluoro-2,3-dimetoxi-benzaldehído (4,50 g, 24,43 mmol) en diclorometano anhidro (30 ml) se le añadió BBr3 (1 M en DCM, 48,8 ml, 48,87 mmol) gota a gota (duración 30 min). La reacción se calentó a temperatura ambiente y se agitó durante 4 h. Se enfrió de nuevo a -78 °C y se le añadió gota a gota HCl 2 N (60 ml). La reacción se agitó durante la noche a temperatura ambiente y se extrajo con DCM. Las capas orgánicas combinadas se lavaron con agua, solución saturada de NaHCO3, salmuera y se secó sobre MgSO4. La filtración y eliminación del disolvente proporcionó 2,42 g (15,50 mmol, 64%) del compuesto del título como un sólido amarillo. Este se usó en la siguiente etapa sin purificación adicional. RMN 1H (400 MHz, DMSO-d6) 8 ppm 10,22 (s, 1 H), 7,04 (dd, J = 8,6, 5,5 Hz, 1 H), 6,61 (dd, J = 10,4, 8,8 Hz, 1 H); RMN 19F (376 MHz, DMSO-d6) 8 ppm -131,69 -- 131,65 (m, IF).
3-Etoxi-6-fluoro-2-hidroxi-benzaldehído
Figure imgf000032_0003
A una solución de 6-fluoro-2,3-dihidroxi-benzaldehído (1,00 g, 6,40 mmol) en DMSO seco (10 ml) se le añadió NaOBu* (1,23 g, 12,81 mmol) y bromuro de etilo (0,77 g, 7,04 mmol) bajo atmósfera de N2 y se agitó a TA durante 18 h. La mezcla resultante se diluyó con agua, se acidificó a pH ~ 6 con HCl 2 N y se extrajo con EtOAc (4 x 25 ml). Las capas orgánicas combinadas se lavaron con agua y salmuera y se secaron sobre MgSO4. La filtración y eliminación del disolvente a presión reducida proporcionó 1,05 g (5,70 mmol, 89%) del compuesto del título como un sólido amarillo. RMN 1H (400 MHz, CLOROFORMO-d) 8 ppm 10,24 (s, 1 H), 7,04 (dd, J = 8,8, 5,3 Hz, 1 H), 6,61 - 6,50 (m, 1 H), 4,09 (q, J = 7,0 Hz, 3 H), 1,46 (t, J = 7,0 Hz, 3 H); RMN 19F (376 MHz, CLOROFORMO-d) 8 ppm -132,19--132,15 (m, IF).
Éster 6-etoxi-3-fluoro-2-formil-fenílico del ácido trifluoro-metanosulfónico
Figure imgf000033_0001
A una solución fría (0 °C) de 3-etoxi-6-fluoro-2-hidroxi-benzaldehído (1,05 g, 5,70 mmol) en DCM seco (90 ml) se le añadió piridina (675 mg, 8,53 mmol) bajo atmósfera de nitrógeno y se agitó la mezcla de reacción a 0 °C durante 10 min. Luego se le añadió anhídrido tríflico (1,93 g, 6,84 mmol) lentamente y se continuó agitando durante 3 ha TA. Se diluyó la reacción con HCl 1 N (25 ml) y se extrajo con DCM (2 x 100 ml). La capa orgánica se lavó con agua y salmuera y se secó sobre MgSO4. Se filtró y concentró el filtrado. La purificación del residuo mediante cromatografía en columna ultrarrápida con acetato de etilo al 5% en hexanos produjo 1,12 g (3,54 mmol, 62%) del compuesto del título como un sólido blanco. RMN 1H (400 MHz, CLOROFORMO-d) 6 ppm 10,34 (s, 1 H), 7,31 - 7,13 (m, 2 H), 4,13 (q, J = 7,0 Hz, 2 H), 1,48 (t, J = 7,0 Hz, 3 H); RMN 19F (376 MHz, CLOROFORMO-d) 6 ppm - 128,15--128,11 (m, IF), -73,56 (s, 3F).
3-Etoxi-6-fluoro-2-(4,4,5,5-tetrametil-[1,3,2]dioxaborolan-2-il)-benzaldehído
Figure imgf000033_0002
Se desgasificó una solución de éster 6-etoxi-3-fluoro-2-formil-fenílico del ácido trifluorometanosulfónico (1,60 g, 5,05 mmol) en THF anhidro (50 ml) durante 40 min. Se añadió bis(pinacolato)diborano (3,85 g, 15,17 mmol), KOAc (1,50 g, 15,17 mmol) y PdCh(dppf) (296 mg, 8% en moles) y se agitó la reacción a 70 °C (temperatura del baño) durante 3 h. Otra adición de bis(pinacolato)diborano (1,40 g, 5,51 mmol) y calentamiento a 70 °C durante 2 h completó la reacción. La mezcla resultante se enfrió a temperatura ambiente y se filtró a través de un lecho corto de Celite®. Se concentró el filtrado. La purificación del residuo mediante cromatografía en columna ultrarrápida con hexanos y EtOAc al 5%/hexanos proporcionó 1,65 g del compuesto del título en forma de un sólido blanco. La RMN 1H confirma la presencia del compuesto del título pero con algunas impurezas. Se usó en la siguiente etapa sin purificación adicional. RMN 1H (400 MHz, CLOROFORMO-d) 6 ppm 10,29 (s, 1 H), 7,12 -6,97 (m, 2 H), 4,00 (q, J = 7,0 Hz, 2 H), 1,46 (s, 12 H), 1,41 (t, J = 6,8 Hz, 3 H); RMN 19F (376 MHz, CLOROFORMO-d) 6 ppm - 133,71--133,67 (m, IF).
7-Etoxi-4-fluoro-3-nitrometil-3H-benzo[c][1,2]oxaborol-1-ol
Figure imgf000033_0003
Se añadió 3-etoxi-6-fluoro-2-(4,4,5,5-tetrametil-[1,3,2]dioxaborolan-2-il)-benzaldehído (1,65 g, 5,61 mmol) a un solución de NaOH (225 mg, 5,60 mmol) en H2O (10 ml) y se agitó durante 10 min a TA. Se añadió nitrometano (1,03 g, 16,83 mmol) gota a gota y se agitó durante 4 ha TA. La mezcla de reacción se acidificó con HCl 4 N y se extrajo con acetato de etilo. La capa orgánica se lavó con agua, salmuera y se secó sobre MgSO4, se filtró y se concentró al vacío. La purificación del residuo mediante cromatografía en columna ultrarrápida con EtOAc al 10 al 40%/hexanos proporcionó 1,7 g de una mezcla de compuestos mediante un espectro de RMN 1H. Esta mezcla se usó en la siguiente etapa sin purificación adicional. RMN 1H (400 MHz, CLOROFORMO-d) 6 ppm 7,13 (t, J = 8,8 Hz, 1 H), 6,79 (dd, J = 8,8, 2,5 Hz, 1 H), 5,95 (d, J = 9,0 Hz, 1 H), 5,14 (s, 1 H), 5,01 (dd, J = 13,3, 2,3 Hz, 1 H), 4,44 (dd, J = 13,3, 9,0 Hz, 1 H), 4,10 (q, J = 6,8 Hz, 2 H), 1,45 (t, J = 6,8 Hz, 3 H); RMN 19F (376 MHz, CLOROFORMO-d) 6 ppm -131,00 --130,97 (m, 1F).
Éster terc-butílico del ácido 7-etoxi-4-fluoro-1-hidroxi-1,3-dihidro-benzo[c][1,2]oxaborol-3-ilmetil)-carbámico
Figure imgf000033_0004
A una solución fría (0 °C) de 7-etoxi-4-fluoro-3-nitrometil-3H-benzo[c][1,2]oxaborol-1-ol (500 mg, 1,96 mmol) en MeOH seco (20 ml) se le añadió (Boc)2O (856 mg, 3,92 mmol) seguido de NO2.6H2O (466 mg, 1,96 mmol) bajo atmósfera de nitrógeno. La mezcla de reacción se agitó bajo atmósfera de nitrógeno durante 20 min y se le añadió NaBH4 (445 mg, 11,76 mmol) en porciones y se dejó durante la noche a TA. Se evaporó el disolvente y se diluyó la reacción con 30 ml de acetato de etilo y se filtró a través de Celite. El filtrado se concentró y el residuo se purificó mediante cromatografía en columna ultrarrápida usando MeOH al 5%/DCM, pero se obtuvo una mezcla (950 mg) de productos que se usó en la siguiente etapa sin purificación adicional.
3-Aminometil-7-etoxi-4-fluoro-3H-benzo[c][1,2]oxaborol-1-ol; clorhidrato
Figure imgf000034_0001
Una solución de éster terc-butílico del ácido 7-etoxi-4-fluoro-1-hidroxi-1,3-dihidro-benzo[c][1,2]oxaborol-3-ilmetil)-carbámico (450 mg, 1,38 mmol) en HCl 4 M (en 1,4-dioxano, 15 ml) se agitó a TA durante la noche. El disolvente se eliminó a presión reducida. La recristalización en EtOAc/hexanos proporcionó 245 mg (0,93 mmol, 62%) del compuesto del título como un sólido blanco. RMN 1H (400 MHz, DMSO-d6) 8 ppm 9,15 (br. s., 1 H), 8,20 (br. s., 3 H), 7,26 (t, J = 9,0 Hz, 1 H), 6,95 - 6,85 (m, 1 H), 5,45 (d, J = 6,3 Hz, 1 H), 3,30 (oculto, 1 H), 4,05 (q, J = 6,9 Hz, 2 H), 2,89 (br. s., 1 H), 1,30 (t, J = 6,8 Hz, 3 H); RMN 19F (376 MHz, DMSO-d6) 8 ppm -131,68--131,66 (m, 1F); MS (ESI) m/z = 226 (M 1, positivo); pureza por HPLC: 91,87% (MaxPlot 200 - 400 nm), 90,33% (220 nm); analítico calculado para C1üH14BClFNO3-0,5 H2O: C 44,40%; H 5,59%; N 5,18%. Encontrado: C 44,30%; H 5,42%; N 5,50%.
D. 3-(Aminometil)-4-cloro-7-etoxibenzo[c][1,2]oxaborol-1(3H)-ol
2-Bromo-3-hidroxibenzaldehído
Figure imgf000034_0002
La suspensión de 3-hidroxibenzaldehído (5 g, 0,04 mol), polvo de hierro (172 mg, 3 mmol) y acetato de sodio (6,72 g, 0,08 mol) en ácido acético (40 ml) se calentó hasta que se obtuvo una solución transparente y luego se enfrió a temperatura ambiente. A esta mezcla se le añadió gota a gota una solución de bromo en ácido acético glacial (10 ml) durante 15 min. Después de la adición, la mezcla de reacción se agitó durante 2 h y luego se vertió en agua helada. La mezcla resultante se extrajo con diclorometano (3 x 50 ml). Los extractos combinados se secaron sobre Na2SO4 anhidro y se concentraron. El residuo se recristalizó en diclorometano para proporcionar el producto (2,3 g, rendimiento del 28%). RMN 1H (400 MHz, DMSO-d6) 810,30 (s, 1 H), 7,54 - 7,51 (m, 1 H), 7,39 - 7,35 (m, 1 H), 7,31 - 7,27 (m, 1 H), 5,90 (s, 1 H).
2-Bromo-3-etoxibenzaldehído
Figure imgf000034_0003
La suspensión de 2-bromo-3-hidroxibenzaldehído (120 g, 0,60 mol), K2CO3 (247 g, 1,79 mol) y bromoetano (135 ml, 1,79 mol) en DMF (700 ml) se agitó a 70 °C durante 3 h. Después de que la reacción se inactivó con agua (50 ml), la mezcla resultante se extrajo con EtOAc (3 x 60 ml). Las capas orgánicas combinadas se lavaron con agua (50 ml) y una solución acuosa de LiCl (50 ml), se secaron sobre Na2SO4 anhidro y se concentraron hasta sequedad al vacío. El residuo se purificó mediante cromatografía en columna sobre gel de sílice para producir el compuesto diana (128 g, rendimiento del 94%). RMN 1H (400 MHz, DMSO-d6) 8 10,45 (s, 1 H), 7,52 - 7,50 (d, 1 H), 7,38 - 7,34 (t, 1 H), 7,13 -7,10 (d, 1 H), 4 ,18-4,13 (m, 2 H), 1,53- 1,50 (m, 3 H).
-(2- Bromo-3-etoxifenil)-1,3-dioxolano
Figure imgf000035_0001
A una solución de 2-bromo-3-etoxibenzaldehído (128 g, 0,56 mol) y glicol (253 ml, 4,49 mol) en tolueno (600 ml) se le añadió ácido p-toluenosulfónico (10 g, 0,06 mol). El matraz de reacción tenía un condensador Dean y Stark unido y la mezcla de reacción se calentó a reflujo para eliminar el agua durante 4 h. Después, la mezcla de reacción se enfrió a temperatura ambiente y se concentró al vacío. El residuo se purificó mediante cromatografía en columna sobre gel de sílice para producir el compuesto diana (132 g, rendimiento 86%).
2-(1,3-Dioxolan-2-il)-6-etoxifenilboronato de diisopropilo
Figure imgf000035_0002
A la solución de 2-(2-bromo-3-etoxifenil)-1,3-dioxolano (132 g, 0,48 mol) en THF anhidro (500 ml) se le añadió gota a gota n-BuLi (2,5 M en THF, 386 mL, 0,97 mol) a -78 °C bajo protección de nitrógeno. La mezcla se agitó a -78 °C durante 2 h y luego se le añadió gota a gota borato de triisopropilo (227 ml, 0,97 mol). La mezcla resultante se agitó a esta temperatura durante 4 h. Después de que se inactivó la reacción mediante la adición de una solución acuosa saturada de NH4Cl (200 ml), la mezcla resultante se extrajo con EtOAc (3 x 300 ml). Las capas orgánicas combinadas se lavaron con agua (200 ml) y salmuera (200 ml), se secaron sobre Na2SO4 anhidro y se concentraron hasta sequedad. El residuo se purificó mediante cromatografía en columna sobre gel de sílice para producir el compuesto diana (136 g, rendimiento 87%).
Ácido 2-etoxi-6-formilfenilborónico
Figure imgf000035_0003
A la mezcla de 2-(1,3-dioxolan-2-il)-6-etoxifenilboronato de diisopropilo (136 g, 0,42 mol) en THF (500 ml) se le añadió HCl diluido (2 N, 200 ml) lentamente a temperatura ambiente con agitación. Después de agitar durante 1,5 h a temperatura ambiente, la mezcla de reacción basificó con una solución acuosa al 20% de NaOH a pH = 12 y luego se lavó con EtOAc (2 x 100 ml). La capa acuosa se acidificó usando el HCl diluido (2 N) a pH = 2 y luego se extrajo con EtOAc (3 x 100 ml). Las capas orgánicas combinadas se secaron sobre Na2SO4 anhidro y se concentraron hasta sequedad. El residuo se purificó mediante cromatografía en columna sobre gel de sílice para producir el compuesto diana como un sólido blanco (80 g, rendimiento 83%). RMN 1H (400 MHz, DMSO-d) 69,93 (s, 1 H), 7,92 (s, 2 H), 7,45 - 7,48 (m, 2 H), 7,23 - 7,28 (d, 1 H), 4,01 - 4,06 ( m, 2H), 1,69 - 1,20 (m, 3H).
7-Etoxi-3-(nitrometil)benzo[c][1,2]oxaborol-1(3H)-ol
Figure imgf000035_0004
La mezcla de ácido 2-etoxi-6-formilfenilborónico (80 g, 0,41 mol), NaOH (16,5 g, 0,41 mol) y CTAB (7,7 g, 20 mmol) en H2O (100 ml) y THF (500 ml) se agitó durante 0,5 h a temperatura ambiente. Después de la adición gota a gota de nitrometano (14 ml, 2,4 mol), la mezcla de reacción se agitó a temperatura ambiente durante 3 h. A continuación, se produjo la ciclación añadiendo el HCl diluido (2 N) a pH = 2 y luego se extrajo con EtOAc (3 x 300 ml). Las capas orgánicas combinadas se lavaron con salmuera (250 ml), se secaron sobre Na2SO4 anhidro y se concentraron hasta sequedad al vacío. El residuo se purificó mediante cromatografía en columna sobre gel de sílice para producir el compuesto diana como un sólido blanco (92 g, rendimiento del 94%). RMN 1H (400 MHz, DMSO-d6) 89,06 (s, 1 H), 7,46 - 7,43 (t, 1 H), 7,07 - 7,05 (d, 1 H), 6,89 - 6,87 (d, 1 H), 5,71 - 5,69 (m, 1 H), 5,31 - 5,27 (m, 1 H), 4,57 - 4,51 (m, 1 H), 4,12-4,07 (m, 2 H), 1,34- 1,30 (t, 3 H).
4-Cloro-7-etoxi-3-(nitrometil)benzo[c][1,2]oxaborol-1(3H)-ol
Figure imgf000036_0001
A una solución de 7-etoxi-3-(nitrometil)benzo[c][1,2]oxaborol-1(3H)-ol (42 g, 0,18 mol) en DMF (200 ml) a 80 °C se le añadió una solución de NCS (11,8 g, 0,18 mol) en DMF (50 ml) en 30 min. La reacción se inactivó con una solución acuosa de solución de LiCl (500 ml) y la mezcla resultante se extrajo con EtOAc (3 x 250 ml). Las capas orgánicas combinadas se secaron sobre Na2SO4 anhidro y se concentraron al vacío. El residuo se purificó mediante cromatografía en columna sobre gel de sílice para producir el compuesto como un sólido blanco (39,7 g, contaminado con regioisómero C6-C1 al 18%). Después, la mezcla se recristalizó en éter/PE (1/5) para producir el compuesto puro (28 g, rendimiento del 46,3%). RMN 1H (400 MHz, DMSO-d6) 89,32 (s, 1 H), 7,50 - 7,48 (d, 1 H), 6,98 - 6,96 (d, 1 H), 5 ,77-5,74 (d, 1 H), 5,35-5,31 (d, 1 H), 4 ,73-4,67 (m, 1 H), 4 ,12-4,07 (m, 2 H), 1,34- 1,28 (t, 3 H).
Clorhidrato de 3-(aminometil)-4-cloro-7-etoxibenzo[c][1,2]oxaborol-1(3H)-ol
Figure imgf000036_0002
Una mezcla de 4-cloro-7-etoxi-3-(nitrometil)benzo[c][1,2]oxaborol-1(3H)-ol (47 g, 0,17 mol), Ni Raney (2 g) y NH32 M en EtOH (40 ml) en EtOH (200 ml) se agitó en una atmósfera de H2 durante 2 h y luego se filtró. El filtrado se acidificó usando HCl 4,5 N en EtOH (100 ml). Después de agitar durante 30 min, la mezcla se concentró y el residuo se lavó con CH3CN (2 x 50 mL) para producir el producto como un sólido blanco (43 g, rendimiento 89%). RMN 1H (400 MHz, DMSO-d6) 89,13 (s, 1 H), 8,18 (s, 3 H), 7,50 - 7,51 (d, 1 H), 6,97 - 7,00 (d, 1 H), 5,36 - 5,39 (m, 1 H), 4,08 - 4,14 (m, 2 H), 3,55 - 3,59 (m, 1 H), 2,90 - 2,95 (m, 1 H), 1,33 - 1,36 (m, 3 H); MS (ESI) m/z = 242 [M H]+.
E. Sal 2,2,2-trifluoroacetato de 3-(aminometil)-4-bromo-7-etoxibenzo[c][1,2]oxaborol-1(3H)-ol
Sal clorhidrato de 3-(aminometil)-7-etoxibenzo[c][1,2]oxaborol-1(3H)-ol
Figure imgf000036_0003
A la solución de 7-etoxi-3-(nitrometil)benzo[c][1,2]oxaborol-1(3H)-ol (2 g, 8,43 mmol), Ni Raney (200 mg) y NH32 M en EtOH (10 ml) en etanol (35 ml) se agitó en una atmósfera de H2 durante 2 ha temperatura ambiente. La mezcla se filtró a través de un lecho de Celite y el filtrado se concentró al vacío. La amina cruda se disolvió en EtOAc (10 ml) y se le añadió inmediatamente HCl en Et2O (30 ml). Después de 1 h, la suspensión se filtró y el sólido resultante se lavó con acetonitrilo/hexanos (2:1, 2 x 20 ml) para producir el compuesto como un sólido blanco (1 g, rendimiento 57,2%). RMN 1H (400 MHz, DMSO-d6) 88,89 (s, 1 H), 8,22 (s, 3 H), 7,48-7,44 (t, 1 H), 7,06-7,04 (d, 1 H), 6,90-6,88 (d, 1H), 5,31 - 5,29 (m, 1H), 4,13-4,08 (m, 2H), 3,45 -3,39 (m, 1H), 2,80-2,78 (m, 1H), 1,36 - 1,33 (m, 3H); MS (ESI) m/z = 208 [M H]+.
(7-E toxi-1-h idroxi-1,3-d ih idrobenzo[c][1 ,2]oxaboro l-3-il)m etil-carbam ato de terc-butilo
Figure imgf000037_0001
A la mezcla de sal clorhidrato de 3-(aminometil)-7-etoxibenzo[c][1,2]oxaborol-1(3H)-ol (300 mg, 1,23 mmol) y trietilamina (622 mg, 6,16 mmol) en diclorometano (35 ml) a 0 °C se le añadió dicarbonato de di-terc-butilo (402,8 mg, 1,85 mmol) y la mezcla se agitó durante 2 h a temperatura ambiente. Después de que se inactivó la reacción con solución saturada de NaHCO3 (45 ml) y la mezcla resultante se extrajo con EtOAc (3 x 30 ml), las capas orgánicas combinadas se secaron sobre Na2SO4 anhidro y se concentraron al vacío. El residuo se purificó mediante cromatografía en columna ultrarrápida para producir el producto (320 mg, rendimiento 84,6%).
(4-Bromo-7-etoxi-1-hidroxi-1,3-dihidrobenzo[c][1,2]oxaborol-3-il)-metilcarbamato de terc-butilo
Figure imgf000037_0002
A la solución de (7-etoxi-1-hidroxi-1,3-dihidrobenzo[c][1,2]oxaborol-3-il)metilcarbamato de terc-butilo (250 mg, 0,81 mmol) y 1-bromopirrolidin-2,5-diona (173,9 mg, 0,98 mmol) en CH3CN (50 ml), se le añadió 2,2'-Azobis(2-metilpropionitrilo (10 mg) y la mezcla se agitó durante 1 ha 90 °C. Después, la mezcla de reacción se concentró a alto vacío y el residuo se purificó mediante HPLC preparativa para producir el producto (200 mg, rendimiento del 63,6%). RMN 1H (400 MHz, DIVISOR) 88,90 (s, 1H ), 7,55 - 7,53 (d, 1H), 6,85-6,82 (d, 1H), 5,08 - 5,07 (d, 1H), 4,11 -4,07 (m, 2H), 3,82 - 3,79 (d, 1H), 3,06 - 3,03 (m, 1 H), 1,39 (s, 9 H), 1,30 (t, 3 H); MS (ESI) m/z = 387 [M H]+.
Sal 2,2,2-trifluoroacetato de 3-(aminometil)-4-bromo-7-etoxibenzo[c][1,2]oxaborol-1(3H) -ol
Figure imgf000037_0003
La mezcla de (4-bromo-7-etoxi-1-hidroxi-1,3-dihidrobenzo[c][1,2]oxaborol-3-il)-metilcarbamato de terc-butilo (200 mg, 51,8 mmol) en ácido 2,2,2-trifluoroacético y diclorometano (1:1,20 ml) se agitó a temperatura ambiente durante 1 hora y se concentró hasta sequedad (baño de agua < 30 °C). El residuo se lavó con acetonitrilo (2 x 5 ml) y el sólido blanco se secó a alto vacío para producir el producto (190 mg, rendimiento 91,6%). RMN 1H (400 MHz, DMSO-d6) 89,12 (s, 1 H), 8,04 (s, 3 H), 7,65 - 7,62 (d, 1 H), 6,94 - 6,92 (d, 1 H), 5,27 - 5,25 ( m, 1 H), 4,13 - 4,08 (m, 2 H), 3,64 - 3,61 (m, 1 H), 2,99 - 2,92 (m, 1 H), 1,36 - 1,33 (t, 3 H); MS (ESI) m/z = 287 [M H]+.
F. Sal clorhidrato de 3-(aminometil)-7-etoxi-4-metilbenzo[c][1,2]oxaborol-1(3H)-ol
7-Etoxi-4-metil-3-(nitrometil)benzo[c][1,2]oxaborol-1(3H)-ol
Figure imgf000037_0004
Una mezcla de 4-bromo-7-etoxi-3-(nitrometil)benzo[c][1,2]oxaborol-1(3H)-ol (200 mg, 0,63 mmol), tetrametilestanano (341,7 mg, 1,90 mmol) y Pd(PPh3)4 (Cat. 20 mg) en DMF (35 ml) se agitó durante la noche a 90 °C bajo protección de N2. La reacción se detuvo añadiendo agua helada y la mezcla resultante se extrajo con acetato de etilo (3 x 30 ml). Los extractos combinados se secaron sobre Na2SO4 anhidro y se concentraron al vacío. El residuo se purificó mediante TLC preparativa para producir el producto (72 mg, rendimiento 45,3%). RMN 1H (400 MHz, DMSO-d6) 89,00 (s, 1 H), 7,23 - 7,21 (d, 1 H), 6,83 - 6,81 (d, 1 H), 5,77 - 5,75 (m, 1 H), 5,27 - 5,24 (m, 1 H), 4,50 - 4,44 (m, 1 H), 4,08 - 4,03 (m, 2 H), 2,25 (s, 3 H), 1,33 - 1,29 (t, 3 H).
Sal clorhidrato de 3-(aminometil)-7-etoxi-4-metilbenzo[c][1,2]oxaborol-1(3H)-ol
Figure imgf000038_0001
Una mezcla de 7-etoxi-4-metil-3-(nitrometil)benzo[c][1,2]oxaborol-1(3H)-ol (80 mg, 0,32 mmol), Ni Raney (50 mg) y NH3/EtOH (2 ml) en EtOH (10 ml) se agitó en una atmósfera de H2 durante 2 h y luego se filtró. El filtrado se acidificó usando HCl 4,5 N en EtOH (15 ml). Después de agitar durante 30 min, la mezcla se concentró al vacío y el residuo se lavó con CH3CN ( 2 x 3 mL) para producir el producto como un sólido blanco (39 mg, rendimiento 47,5%). RMN 1H (400 MHz, DMSO-da) 88,80 (s, 1 H), 8,15 (s, 3 H), 7,24-7,22 (d, 1 H), 6,83-6,81 (d, 1 H), 5,37-5,35 ( m, 1H), 4,08 -4,03 (m, 2H), 3 ,36-3,28 (m, 1H), 2,73-2,70 (m, 1H), 2,23 (s, 3H), 1,34- 1,30 (t, 3H); MS (ESI) m/z = 222 [M H]+.
G. 3-(Aminometil)-7-etoxi-4-etilbenzo[c][1,2]oxaborol-1(3H)-ol
7-Etoxi-3-(nitrometil)-4-vinilbenzo[c][1,2]oxaborol-1(3H)-ol
Figure imgf000038_0002
Una mezcla de 4-bromo-7-etoxi-3-(nitrometil)benzo[c][1,2]oxaborol-1(3H)-ol (900 mg, 2,85 mmol), viniltributilestaño (5,2 g, 53 mmol) y Pd(Ph3P)4 (230 mg, 0,2 mmol) en DMF (45 ml) se desgasificó durante 15 min con N2 y luego se agitó a 100 °C durante 30 min en un reactor de microondas (Biotage). Después de que la reacción se inactivó con agua helada, la mezcla resultante se extrajo con EtOAc (3 x 30 ml). Las capas orgánicas combinadas se lavaron con agua (20 ml) y salmuera (20 ml), se secaron sobre Na2SO4 anhidro y luego se concentraron hasta sequedad al vacío. El residuo se purificó mediante cromatografía en columna sobre gel de sílice para producir el compuesto (650 mg, rendimiento 87%). RMN 1H (400 MHz, DMSO-d6) 89,10 (s, 1 H), 7,64 - 7,66 (d, 1 H), 6,93 - 6,95 (d, 1 H), 6,77 - 6,84 (m, 1 H), 5,93-5,96 (d, 1H), 5,69-5,73 (d, 1H), 5,28-5,31 (d, 1H), 5,10-5,14 (d, 1H), 4,44-4,49 (m, 1H), 4,09-4,14 (m, 2H) ), 1,32 - 1,35 (m, 3H); MS (ESI) m/z = 264 [M H]+.
3-(Aminometil)-7-etoxi-4-vinilbenzo[c][1,2]oxaborol-1(3H)-ol
Figure imgf000038_0003
Una mezcla de 7-etoxi-3-(nitrometil)-4-vinilbenzo[c][1,2]oxaborol-1(3H)-ol (205 mg, 0,78 mmol), Ni Raney (50 mg) y NH32 M en EtOH (5 ml) en EtOH (10 ml) se agitó en una atmósfera de H2 durante 2 ha temperatura ambiente. La mezcla se filtró a través de un lecho de Celite y el filtrado se concentró al vacío. La amina cruda se disolvió en EtOAc (2 ml) y se le añadió inmediatamente HCl en Et2O (20 ml). Después de 1 h, la suspensión se filtró y el sólido resultante se usó directamente para la siguiente etapa sin purificación adicional.
-(Aminometil)-7-etoxi-4-etilbenzo[c][1,2]oxaborol-1(3H)-ol
Figure imgf000039_0001
Una suspensión de 3-(aminometil)-7-etoxi-4-vinilbenzo[c][1,2]oxaborol-1(3H)-ol (175 mg, 0,75 mmol) con Pd/C (40 mg) en EtOH (5 ml) se agitó en una atmósfera de H2 durante 2 ha temperatura ambiente. La mezcla se filtró a través de un lecho de Celite y el filtrado se concentró al vacío. La amina cruda se disolvió en EtOAc (2 ml) y se le añadió inmediatamente HCl en Et2O (15 ml). Después de 1 h, la suspensión se filtró y el sólido resultante se lavó con hexanos para producir el compuesto diana (23 mg, rendimiento 13%). RMN 1H (400 MHz, DMSO-d6) 88,81 (s, 1 H), 8,18 (s, 3 H), 7,31 -7,29 (d, 1 H), 6,68-6,88 (d, 1 H), 5,38-5,40 (d, 1H), 4,04-4,09 (d, 2H), 3,30-3,35 (m, 1H), 2,66-2,71 (m, 1H), 1,31 -1,34 (m, 3H), 1,15-1,17 (m, 3H) ; MS (ESI) m/z = 236 [M H]1.
I. Diclorhidrato de 7-(4-Aminobutoxi)-3-(aminometil)-4-clorobenzo[c][1,2]oxaborol-1(3H)-ol
4-hidroxibutilcarbamato de terc-butilo
Figure imgf000039_0002
Boc
A una mezcla de 4-aminobutan-1-ol (4,0 g, 45 mmol) y TEA (7,5 ml, 54 mmol) en DCM (200 ml) se le añadió (Boc)2O (10,2 g, 47,2 mmol). La mezcla de reacción se agitó durante 2 ha temperatura ambiente y luego se lavó con agua (2 x 150 ml) y la solución de ácido cítrico (100 ml). La capa orgánica se secó sobre Na2SO4 anhidro y se concentró para producir el producto en forma de 7,5 g de un aceite amarillo (rendimiento 88%).
Metanosulfonato de 4-(terc-butoxicarbonil)butilo
Figure imgf000039_0003
A una mezcla de 4-hidroxibutilcarbamato de terc-butilo (7,5 g, 40 mmol) y TEA (3,6 ml, 48 mmol) en DCM (100 ml) a 0 °C se le añadió gota a gota MsCl (6,6 ml, 48 mmol). La mezcla se agitó a temperatura ambiente durante 1 hora y luego se lavó con agua (2 x 100 ml) y la solución de ácido cítrico (100 ml). La capa orgánica se secó sobre Na2SO4 anhidro y se concentró para producir el producto como un aceite amarillo (10,0 g, rendimiento del 94%).
4-(2-Bromo-3-formilfenoxi)butilcarbamato de terc-butilo
Figure imgf000039_0004
A una mezcla de 2-bromo-3-hidroxibenzaldehído (3,0 g, 15 mmol) y metanosulfonato de terc-butoxicarbonilbutilo (4,8 g, 18 mmol) en DMF (40 ml) se le añadió K2CO3 (6,2 g, 45 mmol). La mezcla se agitó a 80 °C durante 45 min y se inactivó mediante la adición de una solución acuosa de LiCl (80 ml). La mezcla se extrajo con EtOAc (2 x 80 ml) y las capas orgánicas combinadas se secaron sobre Na2SO4 anhidro y luego se concentraron para producir el producto crudo como un aceite marrón (6,0 g).
4-(3-formil-2-(4,4,5,5-tetrametil-1,3,2-dioxaborolan-2-il)fenoxi)-butilcarbamato de terc-butilo
Figure imgf000039_0005
Una mezcla de 4-(2-bromo-3-formilfenoxi)butilcarbamato de terc-butilo (6,0 g, 16 mmol), KOAc (5,0 g, 48 mmol), (Pin)2B2 (7,7 g, 86 mmol) y Pb(dppf)Ch (1,25 g, 1,6 mmol) en dioxano (100 ml) se desgasificó durante 15 min con N2 y se calentó a reflujo durante 2 h bajo protección de N2. La mezcla se filtró y el filtrado se concentró al vacío. El residuo se purificó mediante cromatografía en gel de sílice para producir el producto como un aceite amarillo (3,5 g, rendimiento 55%).
4-(1-hidroxi-3-(nitrometil)-1,3-dihidrobenzo[c][1,2]oxa-borol-7-iloxi)butilcarbamato de terc-butilo
Figure imgf000040_0001
A una solución de 4-(3-formil-2-(4,4,5,5-tetrametil-1,3,2-dioxaborolan-2-il)-fenoxi)-butilcarbamato de terc-butilo (3,5 g, 8,3 mmol) y CTAB (cat.) En THF (50 ml) se le añadió MeNO2 (2,8 ml, 49 mmol), seguido de una solución acuosa de NaOH (0,36 g, 9,1 mmol) en H2O (5 ml). La mezcla se agitó a temperatura ambiente durante 45 min. La ciclación se consiguió añadiendo una solución de HCl 2 N hasta pH = 2 a 0 °C. La mezcla de reacción se extrajo con EtOAc (3 x 50 ml) y las capas orgánicas se secaron sobre Na2SO4 anhidro y luego se concentraron al vacío. El residuo se purificó mediante cromatografía en gel de sílice (PE:EtOAc = 3:1) para producir el producto como un aceite amarillo (1,7 g, rendimiento 53,6%). RMN 1H (400 MHz, DMSO-da) 89,05 (s, 1 H), 7,44 - 7,47 (t, 1 H), 7,06 - 7,08 (d, 1 H), 6,88 - 6,90 (d, 1 H), 9,86 ( t, 1H), 5,70 - 5,72 (m, 1H), 5,29 - 5,33 (m, 1H), 4,53 - 4,59 (m, 1H), 4,02 - 4,06 (t, 2H), 2,95 - 2,30 (m, 2H), 1,67 - 1,72 (m, 2 H), 1,52 - 1,57 (m, 2 H), 1,38 (s, 9 H).
4-(4-Cloro-1-hidroxi-3-(nitrometil)-1,3-dihidrobenzo[c][1,2]oxaborol-7-iloxi)butilcarbamato de terc-butilo
Figure imgf000040_0002
Una mezcla de 4-(1-hidroxi-3-(nitrometil)-1,3-dihidrobenzo[c][1,2]oxaborol-7-iloxi)-butilcarbamato de terc-butilo (640 mg, 1,7 mmol) en DMF (20 ml) se le añadió NCS (226 mg, 1,7 mmol) en DMF (5 ml). La mezcla se calentó a 80 °C durante 2 h. Después de que la reacción se inactivó con una solución acuosa de LiCl (100 ml), la mezcla resultante se extrajo con EtOAc (3 x 50 ml). Las capas orgánicas combinadas se secaron sobre Na2SO4 anhidro y se concentraron al vacío. El residuo se purificó mediante HPLC preparativa para producir el producto (280 mg, rendimiento del 67,5%). RMN 1H (400 MHz, DMSO-d6) 89,29 (s, 1 H), 7,47 - 7,49 (d, 1 H), 6,96 - 6,98 (d, 1 H), 6,80 (s, 1 H), 5,74- 5,77 ( m, 1H), 5,31 - 5,35 (m, 1H), 4,67-4,72 (m, 1H), 4 ,02-4,05 (m, 2H), 2 ,94-2,99 (m, 2H), 1,68­ 1,72 (m, 2H), 1,50 - 1,56 (m, 2 H), 1,36 (s, 9 H).
4-(3-(Aminometil)-4-cloro-1-hidroxi-1,3-dihidro-benzo[c][1,2]oxa-borol-7-iloxi)butilcarbamato de terc-butilo
Figure imgf000040_0003
Una mezcla de 4-(1-hidroxi-3-(nitrometil)-1,3-dihidrobenzo[c][1,2]oxaborol-7-il-oxi)-butilcarbamato de terc-butilo (410 mg, 1 mmol), Ni Raney (100 mg) y NH32 N en EtOH (3 ml) en EtOH (15 ml) se agitó en una atmósfera de H2 durante 2 h a temperatura ambiente. La mezcla se filtró a través de un lecho de Celite y el filtrado se concentró al vacío. El sólido resultante se utilizó directamente para la siguiente etapa.
Diclorhidrato de 7-(4-am inobutoxi)-3-(am inom etil)-4-dorobenzo[c][1 ,2 ]oxaboro l-1(3H )-o l
Figure imgf000041_0001
A una mezcla de 4-(3-(aminometil)-4-doro-1-hidroxi-1,3-dihidrobenzo[c]-[1,2]-oxa-borol-7-iloxi)butilcarbamato de tercbutilo en DCM (5 ml) se le añadió CF3COOH (2 ml) a temperatura ambiente. La mezcla de reacción se agitó durante 1 hora y se concentró al vacío. La amina cruda se disolvió en EtOAc (1 ml) y se le añadió inmediatamente HCl en Et2O (10 ml). Después de 1 h, la suspensión se filtró y el sólido resultante se lavó con hexanos para producir el compuesto diana como un sólido blanco (180 mg, rendimiento: 42%). RMN 1H (400 MHz, DMSO-d6) 89,16 (s, 1 H), 8,28 (s, 3 H), 8,03 (d, 3 H), 7,49-7,51 (d, 1 H), 6,99-7,01 (d, 1H), 5,38-5,40 (m, 1H), 4,05-4,08 (m, 2H), 3,56-3,59 (d, 1H), 2,84 - 2,91 (m, 3H), 1,71 -1,83 (m, 4H); MS (ESI) m/z = 285 [M H]1.
J. 3-(Aminometil)-7(3-aminopropoxi)-4-clorobenzo[c][1,2]oxaborol-1(3H)-ol
3-Bromopropilcarbamato de terc-butilo
Figure imgf000041_0002
A una mezcla de 3-bromopropan-1-amina (10,95 g, 50 mmol) y TEA (15,4 ml, 110 mmol) en DCM (100 ml) a 0 °C se le añadió (Boc)2O (11,4 g, 52,5 mmol). La mezcla de reacción se agitó a temperatura ambiente durante la noche y luego se lavó con agua (3 x 100 ml) y la solución de ácido cítrico (100 ml). La capa orgánica se secó sobre Na2SO4 anhidro y se concentró para producir el producto como un aceite amarillo (9,0 g, rendimiento del 76%).
3-(2-Bromo-3-formilfenoxi)propilcarbamato de terc-butilo
Figure imgf000041_0003
Una mezcla de 2-bromo-3-hidroxibenzaldehído (5 g, 24,9 mmol), metanosulfonato de 3-(terc-butoxicarbonilamino)-propilo (7,55 g, 30 mmol) y Cs2CO3 (24 g, 75 mmol) en DMF (60 ml) se agitó a 50 °C durante 3 h y se inactivó con agua (600 ml). La mezcla resultante se extrajo con EtOAc (3 x 60 ml) y las capas orgánicas combinadas se lavaron con salmuera (60 ml), se secaron sobre Na2SO4 anhidro y luego se concentraron al vacío. El residuo se purificó mediante cromatografía en columna sobre gel de sílice (PE/EtOAc = 10/1) para producir el producto (7,2 g, rendimiento 81%). RMN 1H (400 MHz, CDCh) 810,43 (s, 1 H), 7,53 (dd, J = 7,8 Hz, 1,6 Hz, 1 H), 7,37 (t, J = 7,8 Hz, 1 H), 7,12 (dd, J = 8,2 Hz, 1,6 Hz, 1 H), 5,16 (s, 1 H), 4,15 (t, J = 5,9 Hz, 2 H), 3,42 (m, 2 H), 2,10 (m, 2 H), 1,44 (s, 9 H); MS (ESI) m/z = 358 [M H]+.
3-(3-Formil-2-(4,4,5,5-tetrametil-1,3,2-dioxaborolan-2-il)-fenoxi)propilcarbamato de terc-butilo
Figure imgf000041_0004
Una solución de 3-(2-bromo-3-formilfenoxi)propilcarbamato de terc-butilo (7,1 g, 20 mmol), B2pin2 (10 g, 40 mmol), Pd(dppf)Cl2 (800 mg, 2 mmol) y KOAc (5,9 g, 60 mmol) en 1,4-dioxano (30 ml) se desgasificó con N2 y se agitó a 80 °C durante 5 h. La mezcla se enfrió a temperatura ambiente y se diluyó con EtOAc (100 ml). La capa orgánica se lavó con agua (50 mL) y salmuera (50 mL), se secó sobre Na2SO4 anhidro y luego se concentró. El residuo se purificó mediante cromatografía en gel de sílice (PE/EtOAc = 5/1) para producir el producto (3,1 g, rendimiento 38,3%). RMN 1H (400 MHz, CDCh) 89,95 (s, 1 H), 7,48 (t, J = 7,8 Hz, 1 H), 7,40 (m, 1 H), 7,09 (d, J = 8,2 Hz, 1 H), 4,76 (s, 1 H), 4,05 (t, J = 6,3 Hz, 2 H), 3,32 (m, 2 H), 2,00 (m, 2 H), 1,45 (s, 12 H), 1,43 (s, 9 H); MS (ESI) m/z = 406 [M H]+.
-(1-H idroxi-3-(n itrom etil)-1 ,3-dih id robenzo[c][1,2]oxaboro l-7-iloxi)-propilcarbam ato de terc-butilo
Figure imgf000042_0001
Una mezcla de 3-(3-formil-2-(4,4,5,5-tetrametil-1,3,2-dioxaborolan-2-il)fenoxi)propilcarbamato de terc-butilo (3,1 g, 8,47 mmol ), MeNO2 (775 mg, 12,7 mmol), CTAB (310 mg, 0,85 mmol) y NaOH (407 mg, 10 mmol) en THF (35 ml) y H2O (8 ml) se agitó a temperatura ambiente durante 3 h. La mezcla se ajustó a pH 2-3 usando HCl 2 N y luego se agitó durante 30 min. La mezcla se extrajo con EtOAc (2 x 80 mL). La capa orgánica se lavó con agua (30 ml) y salmuera (30 ml), se secó sobre Na2SO4 anhidro y luego se concentró. El residuo se purificó mediante cromatografía en columna sobre gel de sílice (PE/EtOAc = 5/1) para producir el producto (2 g, rendimiento 64,5%). RMN 1H (400 MHz, DMSO-da) 89,05 (s, 1 H), 7,47 (t, J = 7,8 Hz, 1 H), 7,07 (d, J = 7,4 Hz, 1 H), 6,91 (m, 2 H) ), 5,72 (dd, J = 9,0, 2,7 Hz, 1H), 5,31 (dd, J = 13,3, 2,7 Hz, 1H), 4,54 (dd, J = 13,3, 9,4 Hz, 1H), 4,05 (t, J = 6,3 Hz, 2 H), 3,09 (m, 2 H), 1,83 (m, 2 H), 1,37 (s, 9 H); MS (ESI) m/z = 367 [M H]+.
4-(4-Cloro-1-hidroxi-3-(nitrometil)-1,3-dihidrobenzo[c][1,2]oxaborol-7-iloxi)propilcarbamato de terc-butilo
Figure imgf000042_0002
A una mezcla de 4-(1-hidroxi-3-(nitrometil)-1,3-dihidrobenzo[c][1,2]oxaborol-7-il-oxi)propilcarbamato de terc-butilo (2,9 g, 8 mmol) en DMF (35 ml) se le añadió NCS (1,0 g, 8 mmol) en DMF (15 ml). La mezcla de reacción se calentó a 80 °C durante 2 h y luego se inactivó con una solución acuosa de LiCl (300 ml). La mezcla resultante se extrajo con EtOAc (3 x 100 ml). Las capas orgánicas combinadas se secaron sobre Na2SO4 anhidro y se concentraron al vacío. El residuo se purificó mediante HPLC preparativa para producir el producto en forma de un sólido de color blanco (480 mg, rendimiento del 15,2%). RMN 1H (400 MHz, DMSO-d6) 89,28 (s, 1 H), 7,49 - 7,51 (d, 1 H), 6,96 - 6,98 (d, 1 H), 6,85 (s, 1 H), 5,74- 5,77 ( m, 1H), 5,31 - 5,35 (m, 1H), 4,67-4,72 (m, 1H), 4 ,03-4,06 (m, 2H), 3,07-3,11 (m, 2H), 1,82­ 1,86 (m, 2H), 1,37 (s, 9 H); MS (ESI) m/z = 401 [M H]+.
3-(3-(Aminometil)-4-cloro-1-hidroxi-1,3-dihidro-benzo[c][1,2]oxa-borol-7-iloxi)propilcarbamato de terc-butilo
Figure imgf000042_0003
Una mezcla de 3-(4-cloro-1-hidroxi-3-(nitrometil)-1,3-dihidrobenzo[c][1,2]oxaborol-7-iloxi)propilcarbamato de tercbutilo (480 mg, 1,2 mmol), Ni Raney (500 mg) y NH32 M en EtOH (3 ml) en EtOH (15 ml) se agitó en una atmósfera de H2 durante 2 ha temperatura ambiente. La mezcla se filtró a través de un lecho de Celite y el filtrado se concentró al vacío. El sólido resultante se utilizó directamente para la siguiente etapa.
3-(Aminometil)-7-(3-aminopropoxi)-4-clorobenzo[c][1,2]oxaborol-1(3H)-ol
Figure imgf000042_0004
A una mezcla del 3-(3-(aminometil)-4-cloro-1-hidroxi-1,3-dihidrobenzo[c]-[1,2]oxaborol-7-iloxi)propilcarbamato de tercbutilo crudo en DCM (10 ml) se le añadió CF3COOH (2,0 ml) a 0 °C. La mezcla de reacción se agitó durante 1 hora y se concentró al vacío. La amina cruda se disolvió en EtOH (2 ml) y se le añadió inmediatamente HCl en Et2O (2 ml). Después de 1 h, la mezcla se concentró al vacío. El residuo se recristalizó con EtOH/Et2O para producir el compuesto diana (173,4 mg, rendimiento del 42%). RMN 1H (400 MHz, DMSO-da) 59,28 (s, 1 H), 8,36 (s, 3 H), 8,17 (s, 3 H), 7,50 - 7,52 (d, 1 H), 6,98 - 7,00 (d, 1H), 5,39 - 5,42 (m, 1H), 4,13 - 4,16 (m, 2H), 3,56 - 3,59 (d, 1H), 2,98 - 2,99 (m, 2H), 2,87 (s, 1H), 2 ,04-2,10 ( m, 2 H); MS (ESI) m/z = 271 [M H]+.
K. Clorhidrato de (R)-3-(aminometil)-4-doro-7-etoxibenzo[c][1,2]oxaborol-1(3H)-ol y
L. Clorhidrato de (S)-3-(aminometil)-4-cloro-7-etoxibenzo[c][1,2]oxaborol-1(3H)-ol
Figure imgf000043_0001
((4-cloro-7-etoxi-1-hidroxi-1,3-dihidrobenzo[c][1,2]oxaborol-3-il)metil)carbamato de terc-butilo
Figure imgf000043_0002
Una solución de clorhidrato de 3-(aminometil)-4-cloro-7-etoxibenzo[c][1,2]oxaborol-1(3H)-ol (38,4 g, 0,16 mol) y Et3N (47,8 g, 0,47 mol) en CH2Ch (350 ml) a 0 °C se le añadió dicarbonato de di-terc-butilo (172 g, 0,79 mol) y la reacción se agitó durante 2 h a temperatura ambiente. Después de que la reacción se detuvo mediante la adición de una solución saturada de NaHCOa (100 ml) y la mezcla resultante se extrajo con EtOAc (3 x 120 ml). Las capas orgánicas combinadas se secaron sobre Na2SO4 y se concentraron al vacío. El residuo se purificó mediante cromatografía en columna de gel de sílice para producir el compuesto como un sólido blanco (27 g, rendimiento del 50%). RMN 1H (400 MHz, DMSO-d6) 58,92 (s, 1 H), 7,40-7,42 (d, 1 H), 6,88-6,90 (d, 1 H), 6,77-6,79 (m, 1 H), 5,15 -5,16 (d, 1 H), 4,06 - 4,13 (m, 2 H), 3,75 - 3,78 (d, 1 H), 3,03 - 3,08 (m, 1 H), 1,31 -1,34 (m, 12 H); MS (ESI) m/z = 286 [M H]+.
(S)-((4-cloro-7-hidroxi-1,3-dihidrobenzo[c][1,2]oxaborol-3-il)metil)carbamatode terc-butilo y (R)-((4-cloro-7-etoxi-1-hidroxi-1,3-dihidrobenzo[c][1,2]oxaborol-3-il) metil)carbamato de terc-butilo
Figure imgf000043_0003
Se redisolvieron 25,7 g de ((4-cloro-7-etoxi-1-hidroxi-1,3-dihidrobenzo[c][1,2]oxaborol-3-il)metil)carbamato de tercbutilo disueltos en acetonitrilo (10 mg/ml) mediante HPLC quiral usando ChiralPak AD-H (250 x 30 mm DI) y SF CO2/metanol como eluyente. El caudal es de 70 ml/min. La detección de UV se controló a 220 nm. Se recogieron dos picos y se evaporaron para producir 10,65 g de enantiómero A (isómero de elución más rápida) y 10,15 g de enantiómero B (isómero de elución más lenta). El análisis de las fracciones agrupadas utilizando un ChiralPak AD-3 (150 x 4,6 mm DI) y la misma fase móvil mostró enantiómero A con un tiempo de retención de 3,12 min y 98,7% ee, y enantiómero B con un tiempo de retención de 3,44 min y 98,5 % ee.
Clorhidrato de (R)-3-(aminometil)-4-cloro-7-etoxibenzo[c][1,2]oxaborol-1(3H)-ol
Figure imgf000044_0001
Se disolvió el enantiómero A (7,0 g, 20,5 mmol) en 30 ml de dioxano y se trató con HCl 4 M (26,7 ml, 106,6 mmol) en dioxano. La mezcla de reacción se agitó a temperatura ambiente durante la noche hasta que se completó la reacción indicado por LC/MS. Después de que se eliminó el dioxano al vacío y se le añadió éter dietílico, se recogió un sólido blanquecino y se secó a alto vacío. Este material se volvió a disolver en acetonitrilo y agua (1:1, v/v) y se liofilizó para producir 5,17 g del compuesto del título como un sólido blanquecino. RMN 1H (400 MHz, DMSO-d6) 89,11 (s, 1 H), 8,22 (s, 3 H), 7,47 (d, 1 H), 6,95 (d, 1 H), 5,34-5,37 (m, 1 H) ), 4,06-4,11 (m, 2H), 3,53- 3,56 (m, 1H), 2,89 (m, 1H), 1,30 - 1,34 (m, 3H); MS (ESI) m/z = 242,0 [M H]+.
Clorhidrato de (S)-3-(aminometil)-4-cloro-7-etoxibenzo[c][1,2]oxaborol-1(3H)-ol
Figure imgf000044_0002
Se disolvió el enantiómero B (7,0 g, 20,5 mmol) en 30 ml de dioxano y se trató con HCl 4 M (26,7 ml, 106,6 mmol) en dioxano. La mezcla de reacción se agitó a temperatura ambiente durante la noche hasta que se completó la reacción indicado por LC/MS. Después de que se eliminó el dioxano a vacío y se le añadió éter dietílico, se recogió un sólido blanquecino y se secó a alto vacío. Este material se volvió a disolver en acetonitrilo y agua (1:1, v/v) y se liofilizó para producir 5,23 g del compuesto del título como un sólido blanquecino. RMN 1H (400 MHz, DMSO-d6) 89,11 (s, 1 H), 8,25 (s, 3 H), 7,47 (d, 1 H), 6,95 (d, 1 H), 5,35 - 5,38 (m, 1 H), 4,06 - 4,11 (m, 2H), 3,53 - 3,56 (m, 1H), 2,88 (m, 1H), 1,30 - 1,33 (m, 3H); MS (ESI) m/z = 242,0 [M H]+.
M. Clorhidrato de (R)-3-(aminometil)-4-fluoro-7-etoxibenzo[c][1,2]oxaborol-1(3H)-ol y
N. Clorhidrato de (S)-3-(aminometil)-4-fluoro-7-etoxibenzo[c][1,2]oxaborol-1(3H)-ol
Figure imgf000044_0003
En n i m r A ((4-Fluoro-7-etoxi-1-hidroxi-1,3-dihidrobenzo[c][1,2]oxaborol-3-il)metil)carbamato de terc-butilo
Figure imgf000045_0001
Este compuesto se preparó a partir de clorhidrato de 3-aminometil-7-etoxi-4-fluoro-3H-benzo[c][1,2]-oxaborol-1-ol, usando un procedimiento similar al descrito anteriormente.
(S)-((4-fluoro-7-etoxi-1-hidroxi-1,3-dihidrobenzo[c][1,2]oxaborol-3-il)metil)carbamato de terc-butilo y (R)-((4-fluoro-7-etoxi-1-hidroxi-1,3-dihidrobenzo[c][1,2]oxaborol-3-il)metil) carbamato de terc-butilo
Figure imgf000045_0002
Se redisolvieron 4,5 g de ((4-fluoro-7-etoxi-1-hidroxi-1,3-dihidrobenzo[c][1,2]oxaborol-3-il)metil)carbamato de tercbutilo disueltos en etanol (100 mg/ml) mediante HPLC quiral usando columna ChiralCel OZ-H (250 x 30 mm DI) y SF CO2/hexano:etanol (1:1) como eluyente. El caudal es de 70 ml/min. La detección de UV se controló a 220 nm. Se recogieron dos picos y se evaporaron para producir 2,1 g de enantiómero A (isómero de elución más rápida) y 2,2 g de enantiómero B (isómero de elución más lenta). El análisis de las fracciones agrupadas utilizando ChiralCel OZ-H (150 x 4,6 mm DI) y SF CO2/etanol (0,05% DEA) como fase móvil mostró enantiómero A con un tiempo de retención de 2,66 min y 99,5% ee, y enantiómero B con un tiempo de retención de 3,31 min y 98,1% ee
Clorhidrato de (R)-3-(aminometil)-4-fluoro-7-etoxibenzo[c][1,2]oxaborol-1(3H)-ol
Figure imgf000045_0003
Se trató el enantiómero A (2,1 g) con 200 ml de HCl 1,6 N en MeOH y se agitó a temperatura ambiente durante 5 horas hasta que se completó la reacción indicado por LC/MS. Después de añadir agua (100 ml), el residuo se liofilizó durante la noche para producir 1,40 g del compuesto del título como un sólido blanquecino. RMN 1H (400 MHz, DMSO-d6) 8 ppm 9,16 (br. s., 1H), 8,34 (br. s., 3H), 7,26 (t, 1H), 6,70 -6,92 (m, 1H), 5,48 (d, 1 H), 4,06 (q, 2 H), 3,35 (m, 1 H), 2,88 (m, 1 H), 1,30 (t, 3 H); MS (ESI) m/z = 226,1 (M 1, positivo).
Clorhidrato de (S)-3-(aminometil)-4-fluoro-7-etoxibenzo[c][1,2]oxaborol-1(3H)-ol
Figure imgf000045_0004
Se trató el enantiómero B (2,1 g) con 200 ml de HCl 1,6 N en MeOH y se agitó a temperatura ambiente durante 5 horas hasta que se completó la reacción indicado por LC/MS. Después de añadir agua (100 ml), el residuo se liofilizó durante la noche para producir 1,43 g del compuesto del título como un sólido blanquecino. RMN 1H (400 MHz, DMSO-d6) 8 ppm 9,16 (br. s., 1H), 8,31 (br. s., 3 H), 7,26 (t, 1H), 6,70 - 6,92 (m, 1 H), 5,48 (d, 1 H), 4,06 (q, 2 H), 3,35 (m, 1 H), 2,88 (m, 1 H), 1,31 (t, 3 H); MS (ESI) m/z = 226,1 (M 1, positivo).
V. Clorhidrato de (S)-3-(aminometil)-4-bromo-7-etoxibenzo[c][1,2]oxaborol-1(3H)-ol
Etapa 1: (7-E toxi-1-h idroxi-1,3-d ih idrobenzo[c][1 ,2]oxaboro l-3-il)m etilcarbam ato de terc-butilo
Figure imgf000046_0001
A la mezcla de sal clorhidrato de 3-(aminometil)-7-etoxibenzo[c][1,2]oxaborol-1(3H)-ol (5,0 g, 20,5 mmol) y trietilamina (10,4 g, 103,0 mmol) en diclorometano (250 ml) a 0 °C se le añadió dicarbonato de di-terc-butilo (6,7 g, 30,8 mmol). La mezcla se agitó durante 4 ha temperatura ambiente. Después de que se inactivó la reacción con solución saturada de NaHCO3 (500 ml), la mezcla resultante se extrajo con EtOAc (3 x 300 ml) y las capas orgánicas combinadas se secaron sobre Na2SO4 anhidro y se concentraron al vacío. El residuo se purificó mediante cromatografía en columna ultrarrápida (2,5% a 5,0% de MeOH en DCM) para producir el producto (5,51 g, rendimiento 87%).
Etapa 2: (4-Bromo-7-etoxi-1-hidroxi-1,3-dihidrobenzo[c][1,2]oxaborol-3-il)-metilcarbamato de terc-butilo
Figure imgf000046_0002
A la solución de (7-etoxi-1-hidroxi-1,3-dihidrobenzo[c][1,2]oxaborol-3-il)metilcarbamato de terc-butilo (5,5 g, 17,9 mmol) y 1-bromopirrolidin-2,5-diona (3,8 g, 21,5 mmol) en CH3CN (1100 ml) se le añadió 2,2'-Azobis(2-metilpropionitrilo (220 mg). La mezcla se agitó durante 1 ha 90 °C. A continuación, la mezcla de reacción se concentró a alto vacío y el residuo se purificó mediante cromatografía de columna (2,5 a 5,0 % MeOH en DCM) para producir el producto (3,7 g, rendimiento del 54%). RMN 1H (300 MHz, DMSO-da) 8,90 (s, 1H), 7,55 - 7,53 (d, 1H), 6,85 - 6,82 (d, 1H), 5,08 - 5,07 (d, 1H), 4,11 - 4,07 (m, 2H), 3,82 - 3,79 (bd, 1H), 3,06 - 3,03 (m, 1H), 1,39 (s, 9H), 1,30 (t, 3H); MS (ESI) m/z = 387 [M H]+.
Etapa 3: Clorhidrato de (S)-3-(aminometil)-4-bromo-7-etoxibenzo[c][1,2]oxaborol-1(3H)-ol
Figure imgf000046_0003
La mezcla de (4-bromo-7-etoxi-1-hidroxi-1,3-dihidrobenzo[c][1,2]oxaborol-3-il)-metilcarbamato de terc-butilo (3,7 g, 9,6 mmol) en HCl 4 N en dioxano (12 ml, 48,0 mmol) se agitó a temperatura ambiente durante 2 h y luego se concentró hasta sequedad (baño de agua < 30 °C). El residuo se trituró con DCM/éter (1/10, 2 x 10 ml) y el sólido blanco se secó a alto vacío para producir el producto (2,96 g, rendimiento: 92%). RMN 1H (300 MHz, DMsO-d6) 9,11 (s, 1 H), 8,1 (bs, 3 H), 7,63-7,60 (d, 1 H), 6 ,92-6,89 (d, 1 H), 5,27-5,24 (m , 1H), 4 ,12-4,05 (m, 2H), 3,62-3,57 (m, 1H), 2,99-2,92 (m, 1H), 1,34- 1,30 (t, 3H); MS (ESI) m/z = 287 [M H]+.
Ejemplo 2
Prueba de CI50 de LeuRS
Los experimentos se realizaron en placas de microtitulación de 96 pocillos, usando mezclas de reacción de 80 pL que contenían HEPES-KOH 50 mM (pH 8,0), MgCh 30 mM y KCl 30 mM, [14C]leucina 13 pM (306 mCi/mmol, Perkin-Elmer), ARNt de E. coli total 15 pM (Roche, Suiza), BSA al 0,02% (p/v), DTT 1 mM, LeuRS 0,2 pM y ATP 4 mM a 30 °C. Las reacciones se iniciaron mediante la adición de ATP 4 mM. Después de 7 minutos, las reacciones se inactivaron y el ARNt se precipitó mediante la adición de 50 pl de TCA al 10% (p/v) y se transfirió a placas de filtro de membrana de nitrocelulosa de 96 pocillos (Millipore Multiscreen HTS, MSHAN4B50). A continuación, cada pocillo se lavó tres veces con 100 pl de TCA al 5%. A continuación, se secaron las placas de filtro bajo una lámpara de calor y se cuantificó el ARNtLeu con [14C]leucina precipitado mediante recuento de centelleo líquido usando un contador de centelleo líquido Wallac MicroBeta Trilux modelo 1450 (PerkinElmer, Waltham MA).
Para determinar la concentración de inhibidor que reduce la actividad enzimática en un 50% (CI50), se incubaron concentraciones crecientes de inhibidor con enzima LeuRS, ARNt y leucina durante 20 minutos. Las reacciones se iniciaron mediante la adición de ATP 4 mM y se detuvieron después de 7 minutos, luego se precipitaron y se contaron para cuantificar la radiactividad.
Los resultados de las pruebas bioquímicas para ejemplos de compuestos de la invención se proporcionan en la Fig. 1.
Ejemplo 3
Prueba de CIM antibacteriana
Todas las pruebas de CIM de bacterias siguieron las pautas del Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) para las pruebas antimicrobianas de bacterias aerobias Methods for Dilution Antimicrobial Susceptibility Tests for Bacteria That Grow Aerobically; Estándar aprobado - Séptima edición) (M07-A7) y bacterias anaeróbicas (Methods for Dilution Antimicrobial Susceptibility Tests for Bacteria That Grow Aerobically; Estándar aprobado- Séptima edición) (M11-A7).
Los resultados de la prueba de CIM antibacteriana para los ejemplos de compuestos de la invención se proporcionan en la Fig. 1.
Ejemplo 4
Ensayo Alamar Blue en microplaca (MABA)
El ensayo Alamar Blue en microplaca (MABA) se realizó esencialmente como describen Collins, L. et al., Antimicrob Agents Chemother 41: 1004-1009 (1997). Por ejemplo, microplacas negras de fondo transparente de 96 pocillos (placas de vista negra; Packard Instrument Company, Meriden, Connecticut) con los pocillos del perímetro exterior llenos de agua estéril para evitar la deshidratación en los pocillos experimentales. Se prepararon diluciones iniciales del fármaco en dimetilsulfóxido y se realizaron diluciones dobles posteriores en 0,1 ml de 7H9GC (sin Tween 80) en las microplacas. Los inóculos congelados se diluyeron inicialmente 1:20 en medio BACTEC 12B seguido de una dilución 1:50 en 7H9GC. La adición de 100 pl a los pocillos dio como resultado títulos bacterianos finales de entre 2,0 x 1055 y 5 x 104 UFC/ml para H37Rv y H37Ra, respectivamente. Los pocillos que contenían solo el fármaco se utilizaron para detectar la autofluorescencia de los compuestos, más los pocillos de control adicionales consistieron solo en bacterias (B) y solo en medio (M). Las placas se incubaron a 37 °C. A partir del día 4 de incubación, se añadieron 20 pl de solución Alamar Blue 10x (Alamar Biosciences/Accumed, Westlake, Ohio) y 12,5 pl de Tween 80 al 20% a un pocillo B y un pocillo M, y las placas se volvieron a incubar a 37 °C. Los pocillos se observaron a las 12 y 24 h para un cambio de color de azul a rosa y para una lectura mayor o igual a 50.000 unidades de fluorescencia (UF). La fluorescencia se midió en un fluorómetro de microplacas Cytofluor II (PerSeptive Biosystems, Framingham, MA) en modo de lectura inferior con excitación a 530 nm y emisión a 590 nm. Si los pocillos B se volvieron rosados a las 24 h, se le añadió reactivo a toda la placa. Si el pocillo permaneció azul o se midieron 50.000 UF, se analizaron pocillos M y B adicionales a diario hasta que se produjo un cambio de color, momento en el que se añadieron los reactivos a todos los pocillos restantes. A continuación, las placas se incubaron a 37 °C y los resultados se registraron 24 h después de la adición del reactivo. Las CIM visuales se definieron como la concentración más baja de fármaco que evitó un cambio de color. Para las CIM fluorométricas, se realizó una resta de fondo en todos los pocillos con una media de M pocillos por triplicado. El porcentaje de inhibición se definió como 1-(UF del pocillo de prueba/UF media de los pocillos B por triplicado) x 100. La concentración de fármaco más baja que efectúa una inhibición del 90% se consideró la CIM.
Los resultados de las pruebas bioquímicas para los ejemplos de compuestos de la invención se proporcionan en la Fig. 1.
Ejemplo 5
Ensayo de recuperación de bajo contenido de oxígeno (LORA)
El ensayo de recuperación de bajo contenido de oxígeno (LORA) se realizó esencialmente como lo describen Cho et al., Antimicrob Agents Chemother 51: 1380-1385 (2007). En todos los experimentos de LORA se usó un H37Rv de M. tuberculosis recombinante que porta luxAB en un plásmido, pFCA-luxAB. Se descongelaron alícuotas congeladas de un cultivo adaptado con bajo contenido de oxígeno, se diluyeron en caldo Middlebrook 7H12 (caldo Middlebrook 7H9 que contenía 1 mg/ml de Casitona, 5,6 pg/ml de ácido palmítico, 5 mg/ml de albúmina de suero bovino y 4 pg/ml de catalasa esterilizados por filtración) y se sonicó durante 15 s. Los cultivos se diluyeron para obtener una A570 de 0,03 a 0,05 y de 3.000 a 7.000 RLU por 100 pl. Esto corresponde a 5 x 105 a 2 x 106 UFC/ml. Se prepararon diluciones seriadas al doble en un volumen de 100 pl en placas de microtitulación negras de 96 pocillos y se añadieron 100 pl de la suspensión celular. Para LORA, los cultivos de microplacas se colocaron en condiciones anaeróbicas (concentración de oxígeno, menos de 0,16%) utilizando un modelo Anoxomat WS-8080 (MART Microbiology) y tres ciclos de evacuación y llenado con una mezcla de 10% de H2, 5% de CO2 y 85% de N2. Se colocó una tira indicadora anaeróbica dentro de la cámara para confirmar visualmente la eliminación de oxígeno. Las placas se incubaron a 37 °C durante 10 días y luego se transfirieron a una incubadora en condiciones gaseosas ambientales (aire enriquecido con 5% de CO2) para una "recuperación" de 28 horas. El día 11 (después de la recuperación aeróbica de 28 h), se transfirieron 100 pl de cultivo a placas de microtitulación blancas de 96 pocillos para la determinación de la luminiscencia. Una solución al 10% de aldehido n-decanal (Sigma) en etanol se diluyó en forma fresca 10 veces en PBS y se añadieron 100 pl a cada pocillo con un autoinyector. La luminiscencia se midió en un lector de múltiples etiquetas Victor2 (Perkin-Elmer Life Sciences) usando un tiempo de lectura de 1 s. La CMI se definió como la concentración de fármaco más baja que produce una inhibición de crecimiento del 90% en relación con el crecimiento de los controles sin fármaco.
Los resultados de las pruebas bioquímicas para ejemplos de compuestos de la invención se proporcionan en la Fig. 1.
Ejemplo 6
Experimentos de eficacia de tuberculosis in vivo
Los experimentos de eficacia de TB in vivo se realizaron esencialmente como se describe en Lenaerts et al., Antimicrob Agents Chemother 47: 783-785 (2003) con algunas modificaciones. Se expusieron ratones C57BL/6-Ifngtmlts (GKO) libres de patógenos específicos de interferón gamma altamente susceptibles (Jackson Laboratories, Bar Harbor, Maine) a una infección en aerosol de dosis baja con la cepa Erdman de M. tuberculosis en un sistema de exposición por inhalación Glas-Col como se describió previamente en Kelly et al., Antimicrob Agents Chemother 40: 2809-2812 (1996). Cada grupo de tratamiento consistió en cinco ratones para cada punto de tiempo. El tratamiento se inició 10 días después de la infección. Se sacrificó un grupo de control de ratones infectados al comienzo del tratamiento. Se sacrificó un segundo grupo de ratones infectados pero no tratados después de la interrupción del tratamiento a los 24 días. C y L se formularon en solución salina y E se formuló en 50% de agua/35% de PEG400/5% de PG, mientras que la rifampicina se formuló en 20% de ciclodextrina. Todos los compuestos se administraron mediante sonda oral. La rifampicina se dosificó a 10 mg/kg una vez al día en forma oral. C se dosificó a razón de 100 mg/kg dos veces al día en forma oral. E se dosificó a razón de 100 mg/kg dos veces al día en forma oral. L se dosificó a razón de 100 mg/kg una vez al día en forma oral. Una vez finalizada la terapia, los ratones se sacrificaron mediante inhalación de dióxido de carbono. Los pulmones se extrajeron asépticamente y se rompieron en un homogeneizador de tejidos. El número de organismos viables se determinó mediante dilución en serie de los homogeneizados en placas de agar nutritivo Middlebrook 7H11 (GIBCO BRL, Gaithersburg, MD). Las placas se incubaron a 37 °C al aire durante 4 semanas antes del recuento de colonias viables de M. tuberculosis (UFC).
El día 3, el grupo de control tenía una media de log10 de UFC/pulmón de 2,83 (0,40). El día 10, el grupo de control tenía un log10 de UFC/pulmón de 4,81 (0,08). El día 24, el grupo de control tenía un log10 de UFC/pulmón de 8,96 (0,14). El día 24, el grupo tratado con rifampicina tenía un log10 de UFC/pulmón de 6,16 (0,10). El día 24, el grupo tratado con C tenía un log10 de UFC/pulmón de 5,06 (0,26). El día 24, el grupo tratado con E tenía un log10 de UFC/pulmón de 2,73 (0,05). El día 24, el grupo tratado con L tenía un log10 de UFC/pulmón de 3,08 (0,06).
Ejemplo 7
Experimentos de eficacia de tuberculosis in vivo
Los experimentos de eficacia de TB in vivo se realizaron esencialmente como se describe en Lenaerts et al., Antimicrob Agents Chemother 47: 783-785 (2003) con algunas modificaciones. Unos ratones C57BL/6-Ifngtmlts (GKO) libres de patógenos específicos de interferón gamma altamente susceptibles (Jackson Laboratories, Bar Harbor, Maine) fueron expuestos a una infección en aerosol de dosis baja con la cepa Erdman de M. tuberculosis en un sistema de exposición por inhalación Glas-Col como se describió previamente en Kelly et al., Antimicrob Agents Chemother 40: 2809-2812 (1996). Cada grupo de tratamiento consistió en cinco ratones para cada punto de tiempo siguiente. El tratamiento se inició 13 días después de la infección. Se sacrificó un grupo de control de ratones infectados al comienzo del tratamiento. Se sacrificó un segundo grupo de ratones infectados pero no tratados después del cese del tratamiento a los 22 días. N se formuló en solución salina y E se formuló en 50% de agua/35% de PEG400/5% de PG, mientras que la isoniazida (INH) se formuló en agua destilada. Todos los compuestos se administraron mediante sonda oral. La INH se dosificó a 25 mg/kg una vez al día en forma oral. E se dosificó a 100 mg/kg una vez al día en forma oral. Se dosificó N a 100 mg/kg dos veces al día en forma oral. Una vez finalizada la terapia, los ratones se sacrificaron mediante inhalación de dióxido de carbono. Los bazos y los pulmones se extrajeron asépticamente y se rompieron en un homogeneizador de tejidos. El número de organismos viables se determinó mediante dilución en serie de los homogeneizados en placas de agar nutritivo Middlebrook 7H11 (GIBCO BRL, Gaithersburg, MD). Las placas se incubaron a 37 °C en aire ambiente durante 4 semanas antes del recuento de colonias viables de M. tuberculosis (UFC).
El día 13, el grupo de control tenía una media de log10 de UFC de 7,02 (0,08) para los pulmones y una media de log10 de UFC para los bazos de 3,99 (0,21). El día 22, el grupo de control tenía un log10 de UFC para pulmones de 7,82

Claims (15)

REIVINDICACIONES
1. Un compuesto que tiene una estructura que es:
Figure imgf000052_0001
en la que
R4 se selecciona del grupo que consiste en halógeno, metilo, etilo, propilo, isopropilo, butilo, isobutilo, sec-butilo, metoxi, etoxi, propoxi, isopropoxi, butoxi, isobutoxi, y sec-butoxi; y
en la que a es 2, 3 o 4; y
R12 se selecciona del grupo que consiste en H, OH, NH2, metilo, etilo, -NHS(O)2CH3, ciano, -NHC(O)CH3, -NHC(O)NHCH2CH3, -C(O)NH2, -C(O)OH, 4-(metoxi)fenilo, bencilo, benzoxi, -NHC(O)OCH2Ph, -C(O)NHCH2CH2OH y -C(NH2)(NH);
o una sal, hidrato o solvato de los mismos.
2. El compuesto de la reivindicación 1 o una sal, hidrato o solvato del mismo, que tiene una estructura que es:
Figure imgf000052_0002
en la que C* es un estereocentro de átomo de carbono que tiene una configuración que es (R) o (S).
3. El compuesto de la reivindicación 2 o una sal, hidrato o solvato del mismo, en el que el estereocentro C* está en una configuración (S).
4. El compuesto de la reivindicación 1 o una sal, hidrato o solvato del mismo, en el que R4 se selecciona del grupo que consiste en flúor, cloro, bromo y yodo.
5. El compuesto de la reivindicación 4 o una sal, hidrato o solvato del mismo, en el que R4 es cloro.
6. El compuesto de la reivindicación 1 a 3 o una sal, hidrato o solvato del mismo, en el que R4 se selecciona del grupo que consiste en metilo, etilo, propilo, isopropilo, butilo, isobutilo, sec-butilo.
7. El compuesto de la reivindicación 6 o una sal, hidrato o solvato del mismo, en el que R4 es metilo.
8. El compuesto de cualquiera de las reivindicaciones 1 a 6 o una sal, hidrato o solvato del mismo, en el que a es 2.
9. El compuesto de cualquiera de las reivindicaciones 1 a 6 o una sal, hidrato o solvato del mismo, en el que R12 es OH.
10. Una composición que comprende:
a) un primer estereoisómero del compuesto de una cualquiera de las reivindicaciones 2 a 9 o una sal, hidrato o solvato del mismo;
b) al menos un estereoisómero adicional del primer estereoisómero;
en el que el primer estereoisómero está presente en un exceso enantiomérico de al menos 80% con respecto a dicho al menos un estereoisómero adicional.
11. Una combinación que comprende el compuesto de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 9, o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo, junto con al menos otro agente terapéuticamente activo.
12. Una formulación farmacéutica que comprende:
a) el compuesto de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 9, o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo; y b) un excipiente farmacéuticamente aceptable.
13. Un compuesto o una sal, hidrato o solvato farmacéuticamente aceptable del mismo como se define en una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 9, para uso en terapia.
14. Un compuesto o una sal, hidrato o solvato farmacéuticamente aceptable del mismo como se define en una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 9, para uso en el tratamiento de una enfermedad causada por una infección por micobacterias.
15. Un compuesto o una sal, hidrato o solvato farmacéuticamente aceptable del mismo como se define en una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 9, para uso en el tratamiento de tuberculosis.
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