ES2645081T3 - Sistema para la preparación de muestras de PCR y para la configuración de la PCR - Google Patents

Sistema para la preparación de muestras de PCR y para la configuración de la PCR Download PDF

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Abstract

Procedimiento de configuración de una PCR, comprendiendo el procedimiento las etapas de proporcionar un dispositivo de carga (S1), siendo dicho dispositivo de carga para recibir unos tubos de muestra para configurar una PCR, proporcionar un dispositivo de sujeción de tubos (S2), en el que el dispositivo de carga comprende una primera sección de recepción, en el que la primera sección de recepción comprende por lo menos una primera y una segunda aberturas de recepción, en el que la primera abertura de recepción y la segunda abertura de recepción están adaptadas para recibir respectivamente un tubo de muestra; en el que el dispositivo de sujeción de tubos comprende por lo menos una primera abertura de recepción, comprendiendo además el procedimiento la etapa de fijar el dispositivo de sujeción de tubos al dispositivo de carga (S3); alinear la abertura de recepción del dispositivo de sujeción de tubos con una de la primera abertura de recepción y la segunda abertura de recepción del dispositivo de carga y cubrir simultáneamente la otra de la primera y la segunda aberturas de recepción (S4).

Description

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DESCRIPCION
Sistema para la preparacion de muestras de PCR y para la configuracion de la PCR.
Campo de la invencion
La presente invencion se refiere al diagnostico molecular. En particular, la presente invencion se refiere a un procedimiento de configuracion de una PCR.
Antecedentes de la invencion
La reaccion en cadena de la polimerasa (PCR) permite al investigador producir grandes cantidades de una secuencia de ADN especffica para el analisis posterior en un marco temporal relativamente corto. La PcR es actualmente una metodologfa preferente en aplicaciones de investigacion y en la deteccion de la presencia o ausencia de una molecula diana, por ejemplo en aplicaciones clfnicas y diagnosticas.
El progreso tecnico ha conducido a instrumentos de bancada de laboratorio compactos que permiten configuraciones de PCR de alta precision automatizadas. Se han automatizado sistemas roboticos de manipulacion de lfquidos para la configuracion de la PCR. Ademas, tambien se han automatizado procedimientos anteriores a la configuracion de la PCR, por ejemplo la extraccion y purificacion del material de acidos nucleicos a partir de la muestra que debe investigarse, por ejemplo muestras clfnicas, muestras ambientales, material para medicina forense, etc. La automatizacion de estos procedimientos ha conducido a una reduccion de los costes por personal de laboratorio y ha desempenado un papel en la prevencion de errores humanos que conducen a la contaminacion de los dispositivos y reactivos, etapas de pipeteado erroneas y en consecuencia resultados incorrectos, etc. El documento n° US 2003/211595 A1 da a conocer un procedimiento de configuracion de una PCR, en la que se proporciona una base ceramica con receptaculos para tubos de PCR y un elemento de soporte con aperturas para dichos tubos de PCR. Los tubos de PCR en primer lugar se introducen en las aperturas, que seguidamente se alinean con los receptaculos de la base ceramica. Sin embargo, existe una necesidad permanente de mejora de dichos procedimientos y dispositivos con el fin de eliminar cualquier riesgo potencial de contaminacion y/o resultados erroneos, asf como acelerar los procedimientos existentes, asf como acelerar los procedimientos existentes para ahorrar recursos y tiempo.
Sumario de la invencion
Existe una necesidad de proporcionar una configuracion mejorada de la PCR.
El objetivo de la presente invencion es resolver la materia objeto de la reivindicacion independiente 1. Se incorporan formas de realizacion y ventajas adicionales de la invencion en las reivindicaciones dependientes.
Se presenta un sistema para la preparacion de muestras de PCR y para la configuracion de la PCR. El sistema comprende un dispositivo de carga para la recepcion de tubos. A continuacion, en la presente memoria los tubos se denominan de manera general “tubos de muestra”, referida a cualquier tipo de recipiente que resulta adecuado para contener lfquidos y/o solidos utilizados en la preparacion o configuracion de la PCR. El dispositivo de carga comprende una primera seccion de recepcion y la primera seccion de recepcion comprende por lo menos una primera apertura de recepcion y una segunda apertura de recepcion. Ademas, la primera apertura de recepcion y la segunda apertura de recepcion estan adaptadas para recibir respectivamente un tubo de muestras. El sistema comprende ademas un dispositivo de sujecion de tubos para la union al dispositivo de carga. En otras palabras, el dispositivo de carga y el dispositivo de sujecion de tubos estan configurados en combinacion de manera que se facilita la union, la fijacion y/o el montaje del dispositivo de sujecion de los tubos en o al dispositivo de carga. Se proporciona una union entre el dispositivo de carga y el dispositivo de sujecion de los tubos de manera que el sistema presentado facilita la configuracion de la PCR y la preparacion de muestras de PCR totalmente automatizados para la PCR posterior. Con el proposito de la union, pueden proporcionarse medios de fijacion o medios de union tales como protrusiones, roscas o medios de acoplamiento cooperativos en el dispositivo de carga y/o dispositivo de sujecion de tubos de manera que se consiga la union deseada. Lo anterior se describe en mayor detalle a continuacion en la presente memoria.
La provision del dispositivo de sujecion de tubos permite al usuario cubrir las posiciones de tubo no utilizadas, es decir, las aperturas de recepcion no utilizadas, del dispositivo de carga. El dispositivo de carga puede realizarse en forma de, por ejemplo, un enfriador en bastidor “Thermorack”, por ejemplo un disco rotor de Thermorack, que puede utilizarse durante la configuracion totalmente automatizada de la PCR. Ademas, la combinacion del dispositivo de soporte de tubos y el dispositivo de carga proporcionan la posibilidad de indicar tipos de reactivo especfficos de ensayo mediante indicadores o elementos codificadores, tales como, por ejemplo, etiquetas de color o indicaciones de color, las cuales, segun la presente invencion, pueden proporcionarse en el dispositivo de sujecion de tubos. La utilizacion de elementos de codificacion especfficos en el dispositivo de sujecion de tubos incrementa la capacidad de utilizacion para el usuario y ademas incrementa la fiabilidad del procedimiento de PCR. En particular, se presenta un mecanismo a prueba de errores, de manera que el usuario situa los tubos de
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muestra en las posiciones correctas. En otras palabras, el sistema presentado ayuda al usuario o al dispositivo a situar el tubo de muestra en la posicion correcta en el dispositivo de carga. Ademas, la provision del dispositivo de sujecion de tubos en combinacion con el dispositivo de carga facilita una colocacion simultanea y/o una retirada simultanea de todos los tubos que deben colocarse en el dispositivo de carga. Ello podrfa acelerar la preparacion de las muestras de PCR y el procedimiento de configuracion de la PCR en gran medida.
Las ventajas anteriormente indicadas del aspecto de cubrir partes del dispositivo de carga, el aspecto de indicar mediante elementos codificantes y el aspecto de permitir la colocacion y retirada simultaneas de una pluralidad de tubos de muestra puede proporcionar especialmente ventajas durante la preparacion de las muestras de PCR y la configuracion de la PCR en el caso de que el dispositivo de carga se realice en forma de un rotor de Thermorack y un dispositivo de sujecion de tubos correspondientemente adaptado. El dispositivo de sujecion de tubos puede presentar una cantidad especffica de ensayo de aberturas de recepcion, las cuales se situan de manera especffica de ensayo y que pueden comprender elementos de codificacion especfficos de ensayo para los tubos de muestra que deben insertarse en el dispositivo.
De esta manera, el dispositivo de sujecion de tubos puede proporcionar una doble funcionalidad, tal como se describira posteriormente en la presente memoria. En primer lugar, el dispositivo de sujecion de tubos puede configurarse para unir reversiblemente el tubo o tubos de muestra que se utilizan para la preparacion de muestras de PCR y para la configuracion de la PCR, de manera que los tubos de muestra insertados puedan situarse y desplazarse mediante el desplazamiento del dispositivo de sujecion de tubos. En segundo lugar, el dispositivo de sujecion de tubos puede proporcionar una funcionalidad de cubierta, en la que las zonas del dispositivo de sujecion de tubos entre las aberturas de recepcion pueden utilizarse ventajosamente para cubrir y/o cerrar las aberturas de recepcion del dispositivo de carga que en casos particulares pueden no utilizarse.
Debe indicarse que el dispositivo de sujecion de tubos puede comprender una pluralidad de aberturas de recepcion y el dispositivo de carga puede comprender ademas una pluralidad de aberturas de recepcion de numero superior a dos. Lo anterior proporciona un sistema con posibilidades incrementadas de seleccion entre diversos numeros de diferentes ensayos que pueden llevarse a cabo en combinacion con dispositivos de sujecion de tubos especfficos de ensayo. Ello conlleva diferentes posibilidades de trayectos de pipeteado ventajosos para el sistema automatizado o el usuario. Debido al gran numero de aberturas de recepcion del dispositivo de carga y del dispositivo de sujecion de tubos, se facilitan las selecciones optimizadas de aberturas de recepcion descubiertas, de manera que se facilitan trayectos de pipeteado optimizados desde los tubos de muestra en las aberturas de recepcion hasta las camaras de reaccion de PCR. Lo anterior se explicara con mayor detalle con respecto a las figuras 1 a 7, posteriormente, en las que se describen trayectos especfficos de pipeteado, de manera que el usuario selecciona de entre la seleccion ventajosa de aberturas de recepcion mediante la combinacion del dispositivo de carga y el dispositivo de sujecion de tubos especffico.
El sistema presentado puede proporcionar la ventaja de pipetear directamente en la segunda seccion de recepcion del dispositivo de carga, en el que pueden proporcionarse camaras de reaccion de PCR. En el caso de que el dispositivo de carga se realice en forma de rotor de Thermorack, el pipeteado directamente en el rotor resulta facilitado por la presente invencion. Lo anterior puede apreciarse a partir de, por ejemplo, la figura 1. Ademas, la configuracion simultanea de extraccion de, por ejemplo, cuatro ensayos diferentes, puede resultar facilitada por el presente sistema. Ademas, la extraccion simultanea de ARN y ADN en la misma operacion resulta facilitada por la combinacion del dispositivo de carga y el dispositivo de sujecion de tubos.
El sistema puede comprender un dispositivo de carga y una pluralidad de diferentes dispositivos de sujecion de tubos especfficos de ensayo. Puede estar comprendido en el sistema presentado un reservorio de diferentes dispositivos de sujecion de tubos.
El dispositivo de sujecion de tubos puede ser una placa de sujecion de tubos.
Si se desea, la placa de sujecion de tubos puede realizarse con una forma esencialmente circular. Sin embargo, pueden ser posibles realizaciones de la placa de sujecion de tubos otras formas, tales como las formas rectangular o cuadratica. Ademas, el dispositivo de sujecion de tubos puede formarse a partir de un metal o de una aleacion, aunque tambien pueden utilizarse materiales polimericos u otros materiales que resultan adecuados para producir dicho dispositivo de sujecion de tubos.
El dispositivo de sujecion de tubos comprende por lo menos una primera abertura de recepcion. Ademas, el dispositivo de sujecion de tubos puede unirse al dispositivo de carga de manera que la abertura de recepcion del dispositivo de sujecion de tubos se encuentre alineado con por lo menos una de entre la primera abertura de recepcion y la segunda abertura de recepcion del dispositivo de carga y simultaneamente cubre la otra de la primera y segunda aberturas de recepcion del dispositivo de carga.
De esta manera, en la configuracion adjunta, por lo menos una abertura de recepcion se encuentra cubierta y una no se encuentra cubierta. En otras palabras, dicha configuracion facilita cubrir, tapar y/o recubrir las aberturas de recepcion del dispositivo de carga que no se utilizan segun el ensayo deseado y/o segun el trayecto
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de pipeteado correspondiente seguido mediante un dispositivo automatizado de pipeteado, aspecto de la presente invencion que se describira en mayor detalle. El dispositivo de carga y el dispositivo de sujecion de tubos especffico de ensayo puede configurarse de manera que el dispositivo de sujecion de tubos cubra y/o recubra la abertura de recepcion no utilizada del dispositivo de carga. La combinacion facilita adicionalmente que la alineacion de la abertura de recepcion del dispositivo de sujecion de tubos se consiga con una de las aberturas de recepcion del dispositivo de carga. Debido a dicha alineacion, un tubo de muestra segun un ensayo especffico puede situarse o insertarse mediante las dos aberturas de recepcion alineadas y, de esta manera, puede introducirse en el dispositivo de carga para la posterior preparacion de muestras de PCR y configuracion de la PCR. En otras palabras, mediante el acoplamiento del dispositivo de sujecion de tubos al dispositivo de carga, se lleva a cabo una seleccion de la pluralidad de aberturas de recepcion del dispositivo de carga. Unicamente aquellas aberturas de recepcion de los dispositivos de carga que no se encuentran cubiertas por el dispositivo de sujecion de tubos que ha recibido las aberturas seran utilizadas segun el ensayo actualmente utilizado o deseado.
Dicha seleccion proporciona una capacidad de utilizacion mejorada para el personal de laboratorio y proporciona ademas una simplificacion de la preparacion de las muestras de PCR y de la configuracion de la PCR.
El sistema puede comprender por lo menos un tubo de muestras, en el que el tubo de muestra se une reversiblemente a la abertura de recepcion del dispositivo de sujecion de tubos.
En otras palabras, el sistema proporciona un dispositivo de sujecion de tubos que esta configurado de manera que uno o mas tubos de muestra son moviles y recepcionables por el dispositivo de carga y el dispositivo de sujecion de tubos mediante la alineacion de la abertura del dispositivo de sujecion tubos y una de entre la primera y la segunda aberturas de recepcion del dispositivo de carga. En consecuencia, el tubo de muestras, que se recibe, es sujetado por el dispositivo de sujecion de tubos unido al mismo de manera que el tubo es movil mediante el desplazamiento del dispositivo de sujecion de tubos. Mediante la union del dispositivo de sujecion de tubos al dispositivo de carga, el tubo de muestras sujeto es insertado en el dispositivo de carga. Para el fin de unir el tubo de muestras al dispositivo de sujecion de tubos, pueden proporcionarse medios de fijacion o cierre en el dispositivo de sujecion de tubos y/o el tubo de muestra. Por ejemplo, pueden utilizarse medios y fuerzas puramente mecanicos mediante el acoplamiento del cuello del tubo de muestra a la superficie circular de una abertura de recepcion del dispositivo de sujecion de tubos. Puede utilizarse una provision o adaptacion correspondiente de los diametros acoplados de las aberturas de recepcion y tubos de muestras.
Por ejemplo, el tubo de muestra puede ser recibido por el dispositivo de sujecion de tubos en una posicion colgante en la abertura de recepcion, tal como puede observarse en la figura 8, por ejemplo. Sin embargo, tambien pueden proporcionarse otros medios de cierre y union, tales como, por ejemplo, fuerzas magneticas, con el fin de unir el tubo de muestra al dispositivo de sujecion de tubos. Pueden utilizarse protrusiones o roscas correspondientes con el fin de acoplar el tubo de muestra y el dispositivo de sujecion de tubos para la union reversible deseada, que puede soltarse nuevamente si se desea.
Preferentemente, la primera seccion de recepcion del dispositivo de carga comprende una primera pluralidad de aberturas de recepcion para recibir un tubo de muestra y el dispositivo de sujecion de tubos comprende una segunda pluralidad de aberturas de recepcion para recibir un tubo de muestra. Ademas, en la posicion unida del dispositivo de sujecion de tubos en el dispositivo de carga, se alinea una parte de las aberturas de recepcion del dispositivo de carga con aberturas de recepcion correspondientes del dispositivo de sujecion de tubos y una parte remanente de las aberturas de recepcion del dispositivo de carga estan cubiertas por el dispositivo de sujecion de tubos.
Lo anterior puede observarse facilmente en, por ejemplo, las figuras 1, 8 y la secuencia de figuras 13 a 15, en que se muestra un dispositivo de carga con tres placas de sujecion de tubos diferentes para tres ensayos diferentes.
Preferentemente, esta comprendida una primera pluralidad de tubos de muestra situada para un primer ensayo de PCR y una segunda pluralidad de tubos de muestra situados para un segundo ensayo de PCR esta comprendida en el sistema. Ademas, el dispositivo de sujecion de tubos comprende una abertura de recepcion para cada tubo de muestras de manera que todos los tubos de muestra se unen reversiblemente al dispositivo de sujecion de tubos mediante la abertura de recepcion respectiva del dispositivo de sujecion de tubos.
En otras palabras, el dispositivo de sujecion de tubos proporciona dos secciones o segmentos mas o menos separados mediante los cuales los tubos de muestra del primer ensayo o para el primer ensayo estan separados de los tubos de ensayo para el segundo ensayo. En principio, lo anterior puede escalarse a cada pluralidad de ensayos de PCR, tal como, por ejemplo, una tercera pluralidad de tubos de muestra para un tercer ensayo de PCR, una cuarta pluralidad de tubos de muestra para un cuarto ensayo de PCR, una quinta pluralidad de tubos de muestra para un quinto ensayo de PCR, etc. El alcance de dicha realizacion no estara limitado a la inclusion del quinto ensayo de PCR sino que puede extenderse a un numero mayor si lo desea el usuario. Por lo tanto, mediante la combinacion del dispositivo de carga y el diseno del dispositivo de sujecion de tubos, todos los tubos
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de muestra necesarios y diferentes para una pluralidad de ensayos de PCR puede insertarse simultaneamente en el dispositivo de carga y/o pueden sacarse simultaneamente, es decir, de una vez, del dispositivo de carga. Lo anterior puede acelerar el procedimiento de preparacion de muestras de PCR y de configuracion de la PCR.
Preferentemente, el diametro de las aberturas de recepcion del dispositivo de sujecion de tubos es mayor que el diametro del tubo de muestras, y el diametro de las aberturas de recepcion del dispositivo de sujecion de tubos es menor que el diametro de los cuellos de los tubos de muestra.
Dicha disposicion facilita mediante unicamente la fuerza de la gravedad, que los tubos estan colgando en el dispositivo de sujecion de tubos debido al acoplamiento entre los bordes de las aberturas de recepcion y los cuellos de los tubos. De esta manera, los bordes pueden ser proporcionados por la superficie circular de las aberturas del dispositivo de sujecion de tubos. Si se desea, los elementos de borde adicionales pueden proporcionarse de manera que se consigue un acoplamiento reforzado entre los tubos y el dispositivo de sujecion de tubos. Se describen con respecto a la figura 2 posteriormente en la presente memoria, aspectos adicionales sobre la combinacion de diametros de las aberturas de recepcion y los tubos de muestra utilizados segun la presente invencion para la preparacion de muestras de PCR y la configuracion de la PCR.
Preferentemente, el dispositivo de sujecion de tubos comprende un elemento de codificacion para codificar la informacion sobre un proposito pretendido relacionado con la PCR de la abertura de recepcion.
Puede observarse un elemento de codificacion como elemento del sistema que se configura para proporcionar informacion, tal como, por ejemplo, informacion mecanica, optica, electronica o magnetica a un usuario o a un dispositivo sobre la abertura de recepcion respectiva del dispositivo de sujecion de tubos especffico de ensayo. Esta informacion puede detectarse mediante un dispositivo de lectura mecanico, optico, electronico o magnetico, tal como, por ejemplo, un escaner de codigo de colores, del sistema presentado. Ademas, pueden estar comprendidas abreviaturas como elemento codificante en una abertura de recepcion del dispositivo de sujecion de tubos. Un elemento codificante puede ser, por ejemplo, un patron mecanico, tal como lfneas de diferente forma en o en torno a una abertura de recepcion. Lo anterior puede observarse en la figura 1 o 2, por ejemplo. Un elemento de codificacion tambien puede ser un chip que puede leerse electronicamente o puede ser un codigo de color, tal como una superficie coloreada. Ademas, puede utilizarse texto o abreviaturas para indicar al usuario, que muestra debe situarse en la abertura de recepcion respectiva.
El sistema puede proporcionar tecnologfas de deteccion que permiten reconocer el elemento de codificacion y/o permiten leer la informacion. Mediante la realizacion de, por ejemplo, una comparacion de color entre un codigo de color sobre el dispositivo de sujecion de tubos y un codigo de color sobre una pluralidad de tubos de muestra, puede seleccionarse el tubo de muestra correcto basandose en la comparacion de colores. A continuacion, el tubo de muestra seleccionado puede insertarse en la abertura de recepcion correspondiente que presenta el mismo color que el elemento codificador.
El dispositivo de sujecion de tubos comprende un elemento de codificacion en cada abertura de recepcion para indicar que sustancia debe situarse en la abertura de recepcion respectiva mediante el tubo de muestra. Preferentemente, el elemento de codificacion es un codigo de color.
Los codigos de color tambien pueden considerarse etiquetas en el dispositivo de sujecion de tubos para indicar el tipo de reactivo de cada posicion, es decir, de cada abertura de recepcion, del dispositivo de sujecion de tubos. La presente realizacion del dispositivo de sujecion de tubos puede evitar la colocacion incorrecta de los tubos en localizaciones erroneas. Por ejemplo, el codigo de color puede proporcionarse en forma de un anillo con codigo de color en torno a la abertura de recepcion. El proposito relacionado con la PCR indicado mediante el elemento de codificacion puede ser, por ejemplo, “agua”, “control positivo”, “mezcla de cebador y sonda (PPM)”, “mezcla de cebadores y sondas de control de extraccion (ECPPM)” y “estandar cuantitativo (QS)”. Sin embargo, tambien pueden utilizarse otras indicaciones sin apartarse del alcance de la presente invencion. Ademas de codigos de color, pueden encontrarse comprendidas abreviaturas en cada abertura de recepcion del dispositivo de sujecion de tubos. Preferentemente, un codigo de color es una superficie coloreada del dispositivo de sujecion de tubos y en el que la superficie coloreada se encuentra proxima o en la abertura de recepcion respectiva. Lo anterior puede observarse, por ejemplo, en las figuras 1 y 9, a continuacion. Preferentemente, el dispositivo de carga es un Thermorack de PCR. El Thermorack de PCR puede insertarse en un termociclador despues de la preparacion de las muestras para PCR y llevar a cabo la configuracion de la PCR, mediante el sistema presentado. Tal como puede observarse en la figura 17, las camaras de reaccion de PCR que han sido preparadas durante el procedimiento de configuracion de la PCR pueden insertarse directamente mediante el dispositivo de carga en un dispositivo de sellado con lamina de aluminio. El dispositivo de carga presentado tambien facilita la insercion rapida y directa en un termociclador, en particular un termociclador de PCR, o tambien en un dispositivo de autoclave. Preferentemente, el dispositivo de carga y el dispositivo de sujecion de tubos presentan ambos una forma circular.
En consecuencia, puede organizarse una disposicion circular de camaras de reaccion de PCR en torno al dispositivo de carga, de manera que se facilite el pipeteado desde la parte central del dispositivo de carga de
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forma circular hacia la zona circunferencial del dispositivo de carga y dentro de las camaras de reaccion de PCR situadas en dicha region. Preferentemente, el dispositivo de carga comprende una segunda seccion de recepcion para recibir una pluralidad de camaras de reaccion de PCR.
Dichas camaras de reaccion para los reactivos de PCR pueden obtenerse de, por ejemplo, las figuras 1, 5, 8 y 13. Dichas camaras de reaccion de PCR tambien pueden encontrarse comprendidas en el sistema segun la presente invencion. La configuracion de PCR puede llevarse a cabo de manera que la combinacion lfquida deseada se proporcione dentro de las camaras de reaccion de PCR mediante el pipeteado de los reactivos necesarios a partir del tubo de muestra al interior de las camaras de reaccion de PCR. La combinacion de dispositivo de sujecion de tubos y el dispositivo de carga permite trayectos de pipeteado optimizados, que se explicaran con mayor detalle, por ejemplo, con respecto a las figuras 5 y 7, a continuacion. Como forma de realizacion adicional, la segunda seccion de recepcion puede ser una seccion circular en torno a la primera seccion de recepcion del dispositivo de carga. Lo anterior puede observarse en, por ejemplo, la figura 1. Preferentemente, el dispositivo de sujecion de tubos se expande horizontalmente a lo largo de un primer plano, en el que el primer plano presenta una forma circular y cubre un area circular del dispositivo de carga con la excepcion de por lo menos una abertura de recepcion del dispositivo de carga que esta alineado con una de las aberturas de recepcion del dispositivo de sujecion de tubos.
En principio, puede realizarse una pluralidad de aberturas de recepcion alineadas y una pluralidad de aberturas de recepcion cubiertas mediante la union del dispositivo de sujecion de tubos al dispositivo de carga. Partiendo de lo anterior, el experto en la materia claramente concebira la configuracion geometrica del dispositivo de sujecion de tubos para cubrir aberturas de recepcion especfficas del dispositivo de carga, mientras que se liberan, desbloquean o destapan simultaneamente otras aberturas de recepcion para poder recibir un tubo de muestra. Preferentemente, el dispositivo de sujecion de tubos comprende un asidero para que el usuario pueda asirlo. El asidero facilita la insercion y/o la retirada del dispositivo de carga respecto del dispositivo de sujecion de tubos.
Con el fin de facilitar y/o acelerar una preparacion de muestras para PCR y configuracion de la PCR totalmente automatizadas, puede proporcionarse un intercambio automatico de dispositivo de sujecion de tubos especffico de ensayo. Puede configurarse una unidad de asido para intercambiar varios dispositivos de sujecion de tubos especfficos de ensayo y para acoplarlos y desacoplarlos, respectivamente, del dispositivo de carga utilizado. El sistema presentado puede comprender un reservorio de diferentes dispositivos de sujecion de tubos. Preferentemente, el dispositivo de sujecion de tubos comprende un primer segmento superficial de un primer ensayo de PCR y comprende una segunda superficie de un segundo ensayo de PCR. El primer segmento superficial comprende una pluralidad de aberturas de recepcion y el segundo segmento superficial comprende una pluralidad de aberturas de recepcion. De esta manera, la primera abertura de recepcion y la segunda abertura de recepcion, tal como se han definido anteriormente, debe entenderse que se encuentran comprendidas en el primer y segundo segmentos superficiales. En otras palabras, el dispositivo de sujecion de tubos proporciona dos zonas separadas, en las que cada zona proporciona los tubos para muestra necesarios para proporcionar todos los reactivos para un ensayo especffico. Preferentemente, el primer segmento superficial comprende por lo menos un codigo de color que indica un primer color de una abertura de recepcion y el segundo segmento superficial comprende por lo menos un codigo de color que indica un codigo de color de una abertura de recepcion, en el que el primer y segundo colores son iguales. En general, el primer y segundo segmentos pueden comprender un elemento codificador, tal como se indica en la presente memoria. Preferentemente, el primer y segundo segmentos de ensayo de PCR del dispositivo de sujecion de tubos se disponen unos respecto a otros de una manera geometrica que se selecciona de entre el grupo que comprende: el primer segmento es un primer segmento de cfrculo y el segundo segmento es un segundo segmento de cfrculo; el primer y segundo segmentos estan divididos en el dispositivo de sujecion de tubos circular por una lfnea recta o por una lfnea curva que pasa por el centro del dispositivo de sujecion de tubos circular; las aberturas de recepcion del primer y segundo segmentos son simetricos respecto a un punto central del dispositivo de sujecion de tubos y cualquier combinacion de los mismos.
Por ejemplo, en la figura 1 puede observarse la division recta entre los dos segmentos, mientras que la division curvada entre el primer y segundo segmentos puede observarse en, por ejemplo, las figuras 2 y 11. La distribucion simetrica de puntos de la distribucion de aberturas de recepcion especfficas de ensayo tal como se muestra en, por ejemplo, la figura 5, puede proporcionar la posibilidad de trayectos de pipeteado mejorados, que se describe en mayor detalle con respecto a la figura 5. Preferentemente, cada abertura de recepcion del dispositivo de sujecion de tubos esta marcado con un codigo de color. Preferentemente, el dispositivo de sujecion de tubos comprende por lo menos un medio de union para la union reversible del dispositivo de sujecion de tubos al dispositivo de carga.
Pueden utilizarse unos medios de union tales como, por ejemplo, fuerzas magneticas o roscas. Preferentemente, los medios de union estan configurados para ser insertados en una abertura de recepcion del dispositivo de carga para estabilizar la union del dispositivo de sujecion de tubos al dispositivo de carga. Preferentemente, los medios de union pueden considerarse elementos de protrusion estabilizadores. El acoplamiento de protrusiones con cavidades de acoplamiento correspondientes, tales como, por ejemplo, aberturas de recepcion, en el
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dispositivo de carga puede presentarse segun dicha forma de realizacion ejemplar. Preferentemente, el sistema comprende una cubierta que se configura para cubrir simultaneamente el dispositivo de carga y el dispositivo de sujecion de tubos. Un sistema con la cubierta es autoclavable y resulta facil de descontaminar. En consecuencia, el sistema presenta un sistema autoclavable con una cubierta, un dispositivo de carga y un dispositivo de sujecion de tubos. La cubierta puede ser opticamente transparente u opticamente no transparente. La cubierta puede evitar la contaminacion cruzada durante el procedimiento de preparacion de las muestras para PCR en el sistema presentado. Preferentemente, la cubierta presenta esencialmente una forma circular y esta adaptada a la forma del dispositivo de sujecion de tubos y/o a la forma del dispositivo de carga. Preferentemente, el sistema comprende un escaner, en el que el escaner esta configurado para escanear por lo menos un elemento seleccionado de entre el grupo que comprende placa de elucion, reactivos de extraccion, reactivos de ensayo, tubos para muestra y cualquier combinacion de los mismos. El escaner esta configurado para transmitir datos escaneados a una unidad de calculo.
El escaner puede realizarse en forma de, por ejemplo, un escaner manual. En particular, el escaner puede configurarse para escanear codigos de barras utilizados para el transporte de informacion. Por lo tanto, la informacion de la muestra puede ser recogida por el escaner mediante, por ejemplo, el escaneo de codigos de barras y puede transmitirse a una unidad de calculo. La unidad de calculo puede crear datos para un termociclador de PCR en un formato de datos legibles por el termociclador. Lo anterior puede acelerar, ademas, el procedimiento completo de la PCR y puede resultar en un sistema de alto rendimiento para el usuario. El sistema puede comprender la unidad de calculo que esta configurada para generar la informacion de las muestras en un formato de datos legible por el termociclador.
De esta manera, la interconexion de los datos entre el sistema para la preparacion de muestras para PCR y para la configuracion de la PCR, por una parte, y el termociclador, por otra parte, tambien resulta posible. Preferentemente, el sistema comprende un termociclador, en el que el termociclador y la unidad de calculo se encuentran en comunicacion. El termociclador esta configurado para llevar a cabo automaticamente una PCR en una camara de reaccion de PCR recibida, basandose en la informacion de muestras recibida en formato de datos legible por el termociclador desde la unidad de calculo.
En este, puede existir una comunicacion inalambrica o por cable entre el termociclador y la unidad de calculo. De esta manera, puede utilizarse un sistema totalmente automatizado que proporciona la preparacion de muestras para PCR, la configuracion de la PCR y la realizacion de la PCR completa. Preferentemente, el dispositivo de sujecion de tubos presenta una configuracion especffica de ensayo con respecto a la distribucion geometrica de las aberturas de recepcion. Preferentemente, el sistema comprende un primer dispositivo de sujecion de tubos y un segundo dispositivo de sujecion de tubos, en el que los dispositivos de sujecion de tubos estan configurados de forma especffica de ensayo, respectivamente, y en el que la configuracion respectiva del primer dispositivo de sujecion de tubos es diferente de la del segundo dispositivo de sujecion de tubos con respecto a la distribucion de las aberturas de recepcion. Preferentemente, la primera seccion de recepcion esta situada centralmente en el dispositivo de carga. Ademas, el dispositivo de carga esta adaptado para recibir camaras de reaccion de PCR en la segunda seccion de recepcion situada exteriormente o fuera de la posicion central de la primera seccion de recepcion. Ademas, el dispositivo de sujecion de tubos esta configurado para un ensayo especffico con respecto a la distribucion geometrica de las aberturas de recepcion, de manera que se facilitan los trayectos rectos de pipeteado desde una abertura de recepcion con un elemento de codificacion para un tubo de muestras que contiene una concentracion especffica de una molecula diana hasta la segunda seccion de recepcion. Ademas, dicha disposicion facilita que los trayectos de pipeteado crucen las aberturas de recepcion cubiertas del dispositivo de carga unicamente.
Tal como puede apreciarse en la figura 7, a continuacion, dicha distribucion de las aberturas de recepcion del dispositivo de sujecion de tubos facilita la utilizacion de trayectos de pipeteado directos desde las aberturas de recepcion hacia una zona circunferencial del dispositivo de sujecion de tubos, en el que unicamente se cruzan las secciones cubiertas del dispositivo de carga subyacente. Los trayectos de pipeteado estan indicados en la figura 7 mediante las flechas de lfnea discontinua. Lo anterior puede incrementar adicionalmente el nivel de seguridad de la realizacion de la preparacion de muestras para pCr y la configuracion de la PCR con el sistema presentado. Las aberturas de recepcion no utilizadas y cubiertas del dispositivo de carga no resultan contaminadas durante el procedimiento de pipeteado en el caso de que se seleccionen los trayectos de pipeteado tal como se muestra en la figura 7. Preferentemente, el dispositivo de sujecion de tubos comprende una pluralidad de aberturas de recepcion en las que se indica respectivamente la recepcion pretendida de un tubo de muestras que contiene una concentracion especffica de una molecula diana. Lo anterior puede ser cierto para como mfnimo una parte de la pluralidad de aberturas de recepcion. Las posiciones de las aberturas de recepcion estan configuradas de manera que un trayecto entre una zona central del dispositivo de sujecion de tubos y una zona periferica del dispositivo de sujecion de tubos cruza las aberturas de recepcion, en las que se indica una recepcion pretendida de un tubo de muestras con una concentracion especffica de una molecula diana, de baja concentracion a alta concentracion. En el contexto de la presente invencion, la expresion “zona de borde” no debe entenderse como comprendiendo necesariamente un borde. Una “zona de borde” tambien puede entenderse como una zona periferica o una zona lfmite. Dicha indicacion puede llevarse a cabo con un elemento codificador, una abreviatura o un codigo de color tal como se indica en la presente memoria. Lo anterior se
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describe en mayor detalle con respecto a la figura 5. Esta organizacion tambien puede reducir ventajosamente el riesgo de contaminacion de un segmento superficial del sistema durante el procedimiento de configuracion de la PCR. Preferentemente, el dispositivo de sujecion de tubos comprende una primera abertura de recepcion en la que se indica una recepcion pretendida de un tubo de muestras con una primera concentracion de una molecula diana. El dispositivo de sujecion de tubos comprende una segunda abertura de recepcion en la que se indica una recepcion pretendida de un tubo de muestras con una segunda concentracion de una molecula diana. Ademas, la primera y segunda aberturas de recepcion estan situadas unas respecto a otras de manera que se facilitan los trayectos rectos de pipeteado entre una zona central y una zona de borde del dispositivo de sujecion de tubos, pasando los trayectos las primeras y segundas aberturas de recepcion de bajas a altas concentraciones.
En consecuencia, se saca un primer dispositivo de sujecion de tubos del dispositivo de carga y se sustituye por un segundo dispositivo de carga con el fin de facilitar una configuracion adicional de la PCR con diferentes requisitos. En consecuencia, el dispositivo de carga puede combinarse con una pluralidad de diferentes dispositivos de sujecion de tubos. El procedimiento de la presente invencion comprende las etapas listadas en la reivindicacion 1. El procedimiento presentado de la presente invencion facilita la cobertura de las secciones de recepcion no utilizadas mediante la union del dispositivo de sujecion de tubos al dispositivo de carga. Ademas, el procedimiento puede utilizar la indicacion de los tipos de reactivo especfficos de ensayo mediante, por ejemplo, etiquetas de color o mediante otros indicadores de color. La combinacion del dispositivo de sujecion de tubos con el dispositivo de carga permite la colocacion simultanea de tubos para muestra y permite la retirada simultanea de tubos para muestra en particular de todos los tubos utilizados del dispositivo de carga.
Segun otra forma de realizacion ejemplificativa de la invencion, el procedimiento comprende ademas las etapas de unir extrafblemente un tubo de muestras al dispositivo de sujecion de tubos e insertar el tubo de muestras en una abertura de recepcion del dispositivo de carga mediante la union del dispositivo de sujecion de tubos al dispositivo de carga.
En otras palabras, la distribucion espacial de las aberturas de recepcion del dispositivo de sujecion de tubos esta adaptada a la distribucion espacial de las aberturas de recepcion del dispositivo de carga y se basa en los requisitos del ensayo al que se dedica la placa de sujecion de tubos. La etapa de union puede ser llevada a cabo por un usuario o con un dispositivo automatizado.
Segun otra forma de realizacion ejemplificativa de la invencion, el procedimiento comprende ademas la etapa de separar simultaneamente el dispositivo de sujecion de tubos y el tubo de muestras recibido por el dispositivo de carga desde el dispositivo de carga mediante el asido del dispositivo de sujecion de tubos y la retirada del dispositivo de sujecion de los tubos respecto del dispositivo de carga.
En otras palabras, todos los tubos para muestra utilizados en el dispositivo de carga pueden sacarse de una vez mediante el asido del dispositivo de sujecion de tubos y el desplazamiento del mismo alejandolo del dispositivo de carga. Por lo tanto, se proporciona una automatizacion mejorada de la colocacion mediante la presente invencion.
Segun otra forma de realizacion ejemplificativa de la invencion, el procedimiento comprende la etapa de sacar simultaneamente una primera pluralidad de tubos para muestra para un primer ensayo de PCR y una segunda pluralidad de tubos para muestra para un segundo ensayo de PCR de un dispositivo de carga mediante el asido del dispositivo de sujecion de tubos y la separacion del dispositivo de sujecion de tubos respecto del dispositivo de carga.
Dicha forma de realizacion enfatiza las capacidades de elevado rendimiento del procedimiento presentado, ya que puede prepararse una pluralidad de ensayos de PCR simultaneamente y pueden sacarse todos los tubos para muestra necesarios de una vez. Dicha forma de realizacion no se encuentra limitada a un primer y a un segundo ensayo de PCR sino que puede extenderse a un numero mas elevado de ensayos de PCR.
Segun otra forma de realizacion ejemplificativa de la invencion, el procedimiento comprende la etapa de insertar un elemento de protrusion estabilizador del dispositivo de sujecion de tubos en una abertura de recepcion del dispositivo de carga durante la union del dispositivo de sujecion de tubos al dispositivo de carga.
Con el fin de estabilizar la union y/o acoplamiento del dispositivo de sujecion de tubos en el dispositivo de carga, pueden utilizarse elementos de protrusion estabilizadores. A modo de nota general debe indicarse que pueden proporcionarse medios de union generales que durante la union del dispositivo de sujecion de tubos al dispositivo de carga crean la union mediante, por ejemplo, una conexion integrada, forma de cierre o mediante, por ejemplo, roscas o elementos correspondientes de acoplamiento.
Segun otra forma de realizacion ejemplificativa de la invencion, el procedimiento comprende la etapa de cubrir aberturas de recepcion no utilizadas del dispositivo de carga por el dispositivo de sujecion de tubos.
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Puede considerarse un aspecto importante de la invencion que otra abertura de recepcion diferente de la abertura de recepcion cubierta del dispositivo de carga se encuentre no cubierta, es decir, alineada con una abertura de recepcion del dispositivo de sujecion de tubos.
Segun otra forma de realizacion ejemplificativa de la invencion, el dispositivo de sujecion de tubos comprende por lo menos una primera abertura que presenta un codigo de color que indica un primer color y una segunda abertura que presenta un codigo de color que indica un segundo color. El procedimiento de la presente forma de realizacion comprende las etapas de proporcionar un tubo de muestras con un codigo de color que indica un tercer color, seleccionando la abertura de recepcion del dispositivo de sujecion de tubos que presenta el mismo color que el codigo de color del tubo de muestras e insertar el tubo de muestras en la abertura de recepcion seleccionada del dispositivo de sujecion de tubos.
En otras palabras, basandose en una comparacion de colores, se identifica la abertura de recepcion correcta del dispositivo de carga para el procedimiento de preparacion de muestras.
Segun otra forma de realizacion ejemplificativa de la invencion, el procedimiento comprende la etapa de cubrir el dispositivo de carga y el dispositivo de sujecion de tubos y tubos para muestra insertados mediante la colocacion de una cubierta en el dispositivo de carga, el dispositivo de sujecion de tubos y los tubos para muestra insertados.
Si se desea, puede alcanzarse la capacidad de autoclave mediante dicho procedimiento de cobertura. En otras palabras, el sistema presentado puede introducirse en un autoclave para llevar a cabo la descontaminacion. Si se desea, el dispositivo de carga y el dispositivo de sujecion de tubos y la cubierta pueden configurarse para resistir una presion elevada de vapor saturado a aproximadamente 121°C durante aproximadamente 15 a 20 minutos, que es tfpica de un autoclave.
Segun otra forma de realizacion ejemplificativa de la invencion, el procedimiento comprende la etapa de escanear datos de por lo menos un elemento, seleccionado de entre el grupo que comprende placa de elucion, reactivos de extraccion, reactivos de ensayo, tubos para muestra y cualquier combinacion de los mismos. El procedimiento comprende ademas la etapa de transmitir los datos escaneados a una unidad de calculo con fines de PCR.
El sistema de la presente invencion es capaz de reconocer y configurar la reaccion de PCR deseada en el dispositivo de carga en el que se ha dispuesto el dispositivo de sujecion de tubos. Puede proporcionarse una comunicacion inalambrica o por cable entre un escaner, por ejemplo un escaner manual, y una unidad de calculo que puede encontrarse comprendida en el sistema, o que puede encontrarse comprendida tambien en un ordenador que se encuentra en comunicacion con el sistema de la presente invencion. La unidad de calculo en cualquier caso puede proporcionarse en comunicacion con un termociclador, y dicha unidad puede generar informacion sobre la muestra en un formato de datos legible por el termociclador. Estos datos en formato de datos legible por el termociclador pueden transmitirse al termociclador e iniciar la PCR. Ademas, la realizacion de una PCR en una camara de reaccion de PCR recibida por el termociclador basandose en la informacion sobre la muestra recibida en formato de datos legible por el termociclador puede considerarse otra forma de realizacion ejemplificativa de la invencion. Pueden observarse aspectos adicionales de la presente forma de realizacion en las figuras 19 y 20.
Segun otra forma de realizacion ejemplificativa de la invencion, el procedimiento comprende la etapa de indicar en cada abertura de recepcion del dispositivo de sujecion de tubos que sustancia respectiva debe situarse en la abertura de recepcion respectiva.
Lo anterior puede llevarse a cabo con un elemento codificador. Dicha forma de realizacion garantiza que la configuracion o adaptacion especffica de ensayo de un dispositivo de sujecion de tubos es seguida por el usuario. En particular, el usuario reconocera la indicacion proporcionada en el dispositivo de sujecion de tubos y podra insertar facilmente el tubo de muestras correspondiente en la abertura de recepcion de una manera a prueba de errores. En otras palabras, se presenta un mecanismo a prueba de errores para el usuario, mediante el cual el usuario es guiado por el procedimiento de insercion de todos los tubos para muestra necesarios en el dispositivo de carga.
Segun otra forma de realizacion ejemplificativa de la invencion, la primera seccion de recepcion esta situada centralmente en el dispositivo de carga. Dicha forma de realizacion comprende la etapa de recepcion por el dispositivo de carga de camaras de reaccion de PCR en la segunda seccion de recepcion situada exteriormente respecto a la posicion central de la primera seccion de recepcion. Ademas, el procedimiento presentado comprende la etapa de pipetear a lo largo de un trayecto recto desde una abertura de recepcion con un elemento de codificacion en un tubo de muestras que contiene una concentracion especffica de una molecula diana en la segunda seccion de recepcion, cruzando el trayecto unicamente las aberturas de recepcion cubiertas del dispositivo de carga.
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Dicha forma de realizacion ventajosa de la presente invencion puede observarse en la figura 7, posteriormente. La configuracion de las aberturas de recepcion del dispositivo de sujecion de tubos se proporciona de manera que se facilita el pipeteado deseado a lo largo del trayecto recto hacia las camaras de reaccion de PCR recibidas en la segunda seccion circunferencial.
Segun otra forma de realizacion ejemplificativa de la invencion, el procedimiento comprende las etapas de indicar en una pluralidad de aberturas de recepcion del dispositivo de sujecion de tubos una recepcion pretendida de un tubo de muestras que contiene una concentracion especffica de una molecula diana, respectivamente. Ademas, la etapa de pipeteado a lo largo de un trayecto entre una zona central del dispositivo de sujecion de tubos y una zona de borde del dispositivo de sujecion de tubos y, de esta manera, el cruce de las aberturas de recepcion en las que una recepcion pretendida de un tubo de muestras en el que se indica una concentracion especffica de la molecula diana se lleva a cabo de baja a alta concentracion.
En otras palabras, dicho procedimiento garantiza que se seleccionan los trayectos de pipeteado en combinacion con el dispositivo de sujecion de tubos subyacente con su distribucion de aberturas especffica de manera que se evita cruzar un tubo de muestras con una concentracion mas baja de la molecula diana que en donde se ha iniciado el procedimiento de pipeteado.
Segun otra forma de realizacion ejemplificativa de la invencion, el procedimiento comprende las etapas de indicar en una primera abertura de recepcion del dispositivo de sujecion de tubos una recepcion deseada de un tubo de muestras con una primera concentracion de una molecula diana, indicar en una segunda abertura de recepcion del dispositivo de sujecion de tubos una recepcion deseada de un tubo de muestras con una segunda concentracion de una molecula diana y proporcionar la primera y segunda aberturas de recepcion en el dispositivo de sujecion de tubos en posiciones relativas de manera que se faciliten los trayectos de pipeteado rectos desde una zona central a una zona de borde del dispositivo de sujecion de tubos resulten de concentraciones bajas a altas de la molecula diana.
Dichas caracterfsticas y otras caracterfsticas de la invencion resultaran evidentes y se aclararan a partir de las formas de realizacion descritas posteriormente en la presente memoria. Un elemento de programa informatico para la preparacion de muestras para PCR y para la configuracion de la PCR, al ser ejecutado por el procesador, se adapta para llevar acabo las etapas indicadas en la presente memoria y en las reivindicaciones. El elemento programa informatico presentado en la presente memoria puede ser parte de un programa informatico, pero tambien puede ser un programa entero por sf mismo. Por ejemplo, el elemento programa informatico puede utilizarse para actualizar un programa informatico ya existente para obtener la presente invencion. El medio legible por ordenador puede considerarse un medio de almacenamiento, tal como, por ejemplo, un lapiz USB, un CD, un DVD, un dispositivo de almacenamiento de datos, un disco duro o cualquier otro medio en el que puede almacenarse un elemento de programa tal como se ha indicado anteriormente.
Breve descripcion de los dibujos
En las figuras siguientes se describen formas de realizacion ejemplificativas de la invencion.
Las figuras 1 y 2 representan esquematicamente diferentes sistemas para la preparacion de muestras para PCR y para la configuracion de pCr para la utilizacion en la invencion.
La figura 3 representa esquematicamente un dispositivo de carga que puede utilizarse para la preparacion de una muestra para PCR y para la configuracion de la PCR segun otra forma de realizacion ejemplificativa de la invencion.
Las figuras 4 a 7 representan esquematicamente diferentes sistemas para la preparacion de muestras para PCR y para la configuracion de la PCR segun formas de realizacion ejemplificativas de la invencion.
La figura 8 representa esquematicamente un sistema con una cubierta para la utilizacion en otra forma de realizacion ejemplificativa de la invencion.
La figura 9 representa esquematicamente un dispositivo de sujecion de tubos que puede utilizarse para la preparacion de muestras para PCR y para la configuracion de la PCR segun otra forma de realizacion ejemplificativa de la invencion.
Las figuras 10 a 16 representan esquematicamente diferentes sistemas para la preparacion de muestras de PCR y para la configuracion de la pCr segun formas de realizacion ejemplificativas de la invencion.
La figura 17 representa esquematicamente un dispositivo de sellado que puede utilizarse en combinacion con la presente invencion.
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La figura 18 representa esquematicamente un esbozo de un sistema automatizado conocido para la
preparacion unicamente de muestras para PCR.
Las figuras 19 y 20 representan esquematicamente diferentes sistemas para la preparacion de muestras para
PCR y para la configuracion de la PCR segun formas de realizacion ejemplificativas de la invencion.
Las figuras 21 a 24 representan esquematicamente diagramas de flujo de diferentes procedimientos de
diferentes formas de realizacion ejemplificativas de la invencion.
En principio, las partes identicas estan provistas de los mismos sfmbolos de referencia en las figuras. Descripcion detallada de formas de realizacion
La figura 1 representa esquematicamente un sistema 100 para la preparacion de muestras para PCR y para la configuracion de la PCR. El sistema 100 comprende un dispositivo de carga 101 para recibir tubos para muestra
102 para la configuracion de una PCR. El dispositivo de carga comprende una primera seccion de recepcion, en la que la primera seccion de recepcion comprende por lo menos una primera abertura de recepcion y una segunda abertura de recepcion. En la figura 1, el dispositivo de sujecion de tubos 103 se muestra en la posicion unida al dispositivo de carga, de manera que no se muestran en la figura, la primera abertura de recepcion y la segunda abertura de recepcion del dispositivo de carga. Sin embargo, la primera y segunda aberturas de recepcion estan adaptadas respectivamente para recibir un tubo para muestra. Tal como puede observarse en la figura 1, comprende una gran pluralidad de aberturas de recepcion 105 de la placa de sujecion de tubos 104. Se muestra cada abertura de recepcion 105 de la placa de sujecion de tubos 104 con un tubo de muestras recibido e insertado 102. Tal como puede observarse en las dos partes divididas de la placa de sujecion de tubos 104, en la parte derecha se ilustra una primera pluralidad de tubos para muestra para un primer ensayo de PCR 108. Ademas, se ilustra a la izquierda en la figura 1 una segunda pluralidad de tubos para muestra de un segundo ensayo de PCR 109. Todos los tubos para muestra se encuentran unidos reversiblemente al dispositivo de sujecion de tubos mediante la abertura de recepcion respectiva.
Ademas, la placa de sujecion de tubos comprende un codigo de color 110 como forma de realizacion de un elemento de codificacion para indicar un proposito relacionado con la PCR de la abertura de recepcion de la placa de sujecion de tubos. Debido a que las figuras mostradas en la presente memoria son en blanco y negro, no puede apreciarse el color. Por ejemplo, puede utilizarse un color diferente para cada abertura de recepcion. Ademas, puede utilizarse un color diferente para cada abertura de recepcion pero las aberturas de recepcion de diferentes segmentos de ensayo 108, 109 aunque para el mismo tubo, es decir, de la muestra correspondiente, pueden utilizar el mismo color. Adicional o alternativamente, la informacion puede codificarse mediante la utilizacion de diferentes tipos de sfmbolo. Por ejemplo, en la figura 1, se muestran lfneas de puntos, lfneas de rayas y puntos, asf como diferentes lfneas discontinuas con diferentes distancias entre las lfneas, a modo de formas de realizacion ejemplificativas de elementos codificadores. Si se desea, pueden utilizarse todas en un mismo color, aunque tambien pueden utilizarse colores diferentes, tal como se ha indicado anteriormente. Lo mismo es cierto para las figuras 2, 4, 5, 6, 7 y 9 a 16. En dicha forma de realizacion, el dispositivo de carga 101 se realiza en forma de un Thermorack para PCR 111. Ademas, el dispositivo de carga mostrado comprende una segunda seccion de recepcion que recibe una pluralidad de camaras de reaccion de PCR 113. En dicha forma de realizacion, se ilustra una provision circular de una pluralidad de camaras de reaccion de PCR.
Ademas, la placa de sujecion de tubos 104 de la figura 1 comprende un elemento de codificacion en cada abertura de recepcion para indicar que sustancias deben situarse en la abertura de recepcion respectiva mediante el tubo para muestra. Tal como puede observarse en la figura 1, la placa de sujecion de tubos se encuentra marcada con abreviaturas ejemplificativas, tales como “ECPPM” para mezcla de cebador y sonda de control de extraccion, “PC” para control positivo, “PPM” para mezcla de cebador y sonda, y/o “QS” para estandar cuantitativo. Sin embargo, estas abreviaturas son solo formas de realizacion ejemplificativas de elementos codificadores utilizados en las aberturas de recepcion de la placa de sujecion de tubos. Ademas, puede observarse en la figura 1 que el dispositivo de carga y el dispositivo de sujecion de tubos presentan una forma circular 112.
La figura 2 muestra otro sistema 100 para la preparacion de muestras para PCR y para la configuracion de la PCR. El dispositivo de carga 101 se muestra con una pluralidad de aberturas de recepcion, tal como la primera abertura de recepcion 201 y la segunda abertura de recepcion 202. Ademas, el dispositivo de sujecion de tubos
103 tambien se muestra con una pluralidad de aberturas de recepcion 105. Mediante un movimiento hacia abajo el dispositivo de sujecion de tubos es fijable al dispositivo de carga de manera que la abertura de recepcion 105 del dispositivo de sujecion de tubos se encuentra alineado con por lo menos una de entre la primera abertura de recepcion 201 y la segunda abertura de recepcion 202 del dispositivo de carga y simultaneamente cubre la otra de entre la primera y segunda aberturas de recepcion del dispositivo de carga. Ademas, se muestran ejemplos adicionales de aberturas de recepcion 215 a 217 del dispositivo de sujecion de tubos. Ademas, se ilustra un tubo de muestras 102 en la figura 2 que puede insertarse en el dispositivo de sujecion de tubos e insertarse simultaneamente en el dispositivo de sujecion debido a la union de ambos elementos. El diametro 205, 208 de
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las aberturas de recepcion 105 del dispositivo de sujecion de tubos es mayor que el diametro 206 del tubo de muestras 102. Ademas, el diametro 205, 208 de las aberturas de recepcion 105 del dispositivo de sujecion de tubos es menor que el diametro 207 del collar 214 del tubo de muestras. Por lo tanto, se realiza una union entre el dispositivo de sujecion de tubos y el tubo de muestras debido a la insercion. Ademas, en la figura 2 se muestra un codigo de color 110 para indicar un proposito relacionado con la PCR de la abertura de recepcion del dispositivo de sujecion de tubos 103. El codigo de color es una superficie coloreada 209 del dispositivo de sujecion de tubos. Los codigos de color se muestran en la presente memoria simbolicamente como superficies circulares indicadas mediante diferentes lfneas discontinuas y lfneas de puntos y rayas. De esta manera, se utilizan diferentes sombreados o tramas. En ellos, las diferentes lfneas representan un tipo de elemento codificador, es decir, un color. Sin embargo, un anillo circunferencial en torno a la abertura de recepcion respectiva puede ser una forma de realizacion de dicho codigo de color de la presente invencion. Alternativamente, si se desea, las aberturas de recepcion pueden comprender tapas o laminas elasticas con cavidades de manera que puedan insertarse los tubos para muestra. En este caso, las superficies circulares con diferentes sombreados representan las tapas o laminas de diferente color.
El sistema 100 de la figura 2 comprende un primer y segundo segmentos 210, 211 de ensayo de PCR del dispositivo de sujecion de tubos y se organizan unos respecto a otros de una manera geometrica, de manera que el primer y segundo segmentos esten divididos por una lfnea curvada 212 que pasa por un centro 213 del dispositivo circular de sujecion de tubos. El primer segmento superficial 210 y un segundo segmento superficial 211 comprenden, respectivamente, una pluralidad de aberturas de recepcion. La superficie coloreada 209 como codigo color puede proporcionarse en diversas formas en la abertura de recepcion respectiva. El dispositivo de carga 101 se realiza, en la forma de realizacion de la figura 2, como un Thermorack de PCR 111. En la figura 2, se alinea una primera abertura de recepcion 201 con la abertura de recepcion 105 de la placa de sujecion de tubos 103 cuando se unen entre si. Ademas, la segunda abertura de recepcion 202 resulta cubierta por el dispositivo de sujecion de tubos. Lo mismo es cierto para las aberturas de recepcion adicionales 202a y 202b, que tambien resultan cubiertas en la posicion unida. En el estado que se muestra en la figura 2, en el que el dispositivo de sujecion de tubos todavfa no ha sido unido al dispositivo de carga, puede observarse la primera seccion de recepcion 200. Ademas, se muestra una pluralidad de camaras de reaccion de PCR 113 en una zona circunferencial del dispositivo de carga 101.
La figura 3 muestra esquematicamente un dispositivo de carga 101 que puede utilizarse para la preparacion de muestras de PCR y para la configuracion de la PCR en el procedimiento de la presente invencion. El dispositivo de carga 101 esta realizado en forma de Thermorack con fines de PCR 111. La vista superior de la figura 3 sobre el dispositivo de carga permite una vista en la zona circunferencial en la que puede colocarse una pluralidad de camaras de reaccion de PCR 113. La primera seccion de recepcion 200 se muestra en la figura 3. La primera seccion de recepcion 200 comprende la primera abertura de recepcion 201 y la segunda abertura de recepcion 202. Dependiendo de la configuracion del dispositivo de sujecion de tubos especffico de ensayo, pueden observarse un numero todavfa mayor de las aberturas de recepcion mostradas 30 del dispositivo de carga 101 como del primer tipo de aberturas de recepcion y del segundo tipo de aberturas de recepcion. En principio, el primer tipo de aberturas de recepcion es el que se encuentra alineado con otra abertura de recepcion del dispositivo de sujecion de tubos en una posicion unida. El segundo tipo de aberturas receptores es el de las que resultan cubiertas por el dispositivo de sujecion de tubos. Lo anterior resulta aplicable a todas las formas de realizacion presentadas en la presente memoria. Lo anterior puede observarse, por ejemplo, a partir de la figura 15, posteriormente, en la que 12 aberturas de recepcion del dispositivo de carga se encuentran alineadas con las aberturas de recepcion correspondientes del dispositivo de sujecion de tubos. Las aberturas de recepcion restantes del dispositivo de carga resultan cubiertas por el dispositivo de sujecion de tubos. Tal como puede observarse a partir de la numeracion de la zona circunferencial, pueden colocarse 72 camaras de reaccion de PCR en torno de la primera seccion de recepcion 200. Sin embargo, el numero de 72 es meramente una forma de realizacion ejemplificativa y puede ser superior o inferior si lo desea el usuario. Ademas, las 30 aberturas de recepcion de la figura 3 del dispositivo de carga mostrado 101 puede configurarse para recibir tubos para muestra de, por ejemplo, 1,5 ml y/o 0,5 ml. Ademas, otros tubos para muestra pueden ser recibidos por aberturas de recepcion de la misma forma o de forma diferente.
La figura 4 muestra un sistema 100 para la preparacion de muestras para PCR y para la configuracion de la PCR con un dispositivo de sujecion de tubos 103 que puede utilizarse para un ensayo o tambien para dos ensayos diferentes. Las explicaciones referidas a las abreviaturas PC, PPM, EC PPM, QS y otras presentadas anteriormente tambien se aplican con las modificaciones pertinentes a la figura 4. El dispositivo de carga 101 se muestra en una configuracion unida con el dispositivo de sujecion de tubos 103. El primer segmento superficial 210 y el segundo segmento superficial 211 estan dispuestos simetricamente al punto central 213 del dispositivo de sujecion de tubos de forma circular 103. Los segmentos estan separados por la lfnea curvada 212. Tal como puede observarse en la parte inferior de la figura 4, la abertura de recepcion 105 del dispositivo de sujecion de tubos se encuentra alineada con la primera abertura de recepcion 201 del dispositivo de carga 101. En contraste con lo anterior, la segunda abertura de recepcion 202 se encuentra cubierta 405 por la superficie del dispositivo de sujecion de tubos. La segunda abertura de recepcion solo se encuentra indicada por una lfnea discontinua. El elemento del dispositivo de sujecion de tubos que cubre simultaneamente la segunda abertura de recepcion del dispositivo de carga se ilustra con el numero de referencia 405. Ademas, el primer segmento superficial 210
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comprende por lo menos un codigo de color 400 que indica un primer color de una abertura de recepcion del dispositivo de sujecion de tubos. El segundo segmento comprende por lo menos un codigo de color 401 que indica un segundo color de una abertura de recepcion del dispositivo de sujecion de tubos. Ademas, el primer y segundo colores son iguales. Los codigos de color adicionales 402 a 404 se muestran en la figura 4.
La figura 5 ilustra otro sistema 100 que puede utilizarse en otras formas de realizacion ejemplificativas de la invencion. Se proporciona un dispositivo de carga 101 con una pluralidad de camaras de reaccion de PCR 113. Ademas, se presentan el primer segmento superficial 210 y el segundo segmento superficial 211, tal como ya se han indicado con respecto a las figuras anteriormente indicadas. Tal como puede observarse en la figura 5, el dispositivo de sujecion de tubos 103 comprende una pluralidad de aberturas de recepcion en la que se indica, respectivamente, una recepcion pretendida de un tubo de muestras que contiene una concentracion especffica de una molecula diana. Lo anterior se indica mediante las abreviaturas QS1, QS2, QS3, QS4 y QS5. Esta abreviatura significa estandar cuantitativo. Las posiciones de las aberturas de recepcion estan configuradas en el dispositivo de sujecion de tubos mostrado de manera que un trayecto de pipeteado 500 desde una zona central del dispositivo de sujecion de tubos hacia una zona de borde del dispositivo de sujecion de tubos, es decir, en donde se colocan las camaras de PCR 113, cruza unicamente aberturas de recepcion, en donde se indica una recepcion pretendida de un tubo de muestras con una concentracion especffica de una molecula diana, de baja a alta concentracion. Lo anterior puede incrementar adicionalmente la fiabilidad y reproducibilidad del ciclo de PCR llevado a cabo posteriormente. En otras palabras, la forma de realizacion presentada de la figura 5 situa las aberturas de recepcion para los tubos para muestra de solucion de molecula diana de concentracion especffica de manera que los trayectos de pipeteado directo 500 hacia las camaras de reaccion de PCR 113 resultan facilitados de modo que durante el pipeteado desde un tubo de muestras con una molecula diana a concentracion especffica, solo se cruzan otros tubos para muestra con una concentracion mas alta. Por lo tanto, el QS solo cruzara de baja a alta concentracion. Lo anterior puede minimizar la contaminacion cruzada durante la configuracion de la PCR. Esta es una ventaja de la presente invencion. En la presente memoria se describe un sistema con dicho dispositivo de sujecion de tubos y un programa de pipeteado que lleva a cabo o causa el pipeteado a lo largo de dichos trayectos de pipeteado. En la presente memoria, la expresion “desde una zona central hacia una zona de borde del dispositivo de sujecion de tubos” debe entenderse como describiendo trayectos de pipeteado directo que son movimientos hacia afuera directos; de esta manera, partiendo de una primera posicion radial y finalizando en una segunda posicion radial, en la que la primera posicion radial es mas central que la segunda posicion radial.
La figura 6 representa ademas un sistema 100 que comprende un dispositivo de carga 101 y un dispositivo de sujecion de tubos 103. Puede situarse una pluralidad de camaras de reaccion de PCR 113 en una seccion que es exterior a la seccion central. Se muestran las primeras aberturas de recepcion 201a a 201b. Ademas, tambien se muestran en la figura 5 las segundas aberturas de recepcion 202, 202a a 202d. Se muestran dos alineaciones ejemplificativas con los numeros de referencia 105a, 201a, 105b y 201b, en las que se alinean dos parejas de aberturas de recepcion en el dispositivo de sujecion de tubos 103. La presente configuracion puede utilizarse, por ejemplo, para ensayos en los que se utiliza el mismo ensayo en la totalidad de las 72 camaras de reaccion de PCR.
La figura 7 representa esquematicamente muestra un sistema 100 para la preparacion de muestras de PCR y la configuracion de la PCR que comprende, entre otros, un dispositivo de carga 101 y una placa de sujecion de tubos 104.
La primera seccion de recepcion del dispositivo de carga 101 se encuentra situada centralmente y las camaras de reaccion de PCR 113 son recibidas por el dispositivo de carga en una segunda seccion de recepcion que esta situada exteriormente respecto a la posicion central de la primera seccion de recepcion. La configuracion mostrada de la placa de sujecion de tubos 104 facilita el pipeteado a lo largo de trayectos rectos 500 desde una abertura de recepcion con un elemento de codificacion de un tubo de muestras que contiene una concentracion especffica de una molecula diana a la segunda seccion de recepcion, en los que los trayectos solo cruzan aberturas de recepcion cubiertas del dispositivo de carga. Las aberturas de recepcion que se encuentran cubiertas se muestran a tftulo de ejemplo con los numeros de referencia 600 y 601.
La figura 8 representa otro ejemplo de un sistema 100 que comprende un dispositivo de carga 101, tubos para muestra 102 que son recibidos por el dispositivo de sujecion de tubos 103 sobre el que puede colocarse simultaneamente una cubierta 801. La segunda seccion de recepcion 800 esta configurada para recibir una pluralidad de camaras de reaccion de PCR 113. La primera seccion de recepcion 200 se alarga de manera circular y comprende una pluralidad de secciones de recepcion para recibir tubos para muestra 102. Debido al movimiento hacia abajo indicado por la flecha 802, se completa la union del dispositivo de sujecion de tubos 103 al dispositivo de carga 101 y la cobertura. Tal como puede observarse en la figura 8, la cubierta 801 comprende cavidades en la pared de la misma que se corresponden con protrusiones del dispositivo de carga 101. Las cavidades y las protrusiones estan configuradas para acoplarse entre sf. Lo anterior podrfa mejorar adicionalmente la posibilidad de cierre o bloqueo del dispositivo 100.
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La figura 9 muestra esquematicamente un dispositivo de sujecion de tubos 103 que comprende una pluralidad de aberturas de recepcion para una configuracion de PCR basada en dos ensayos. El dispositivo de sujecion de tubos 103 comprende una pluralidad de superficies de color 209 a modo de codigos de color. Ademas, estan comprendidos medios de union 900, realizados en la figura a modo de protrusiones radiales, con el fin de permitir la union del dispositivo en el dispositivo de carga. Ademas, se muestran elementos protuberantes estabilizadores 901 a 904 que estan configurados para ser insertados en una abertura de recepcion del dispositivo de carga para estabilizar la union del dispositivo de sujecion de tubos 103 en el dispositivo de carga (no representado en la figura 9).
La figura 10 representa un sistema 100 para la preparacion de muestras para PCR y para una configuracion de la PCR util en otra forma de realizacion ejemplificativa de la invencion. En la figura 10 se ilustra un dispositivo de carga 101, asf como un dispositivo de sujecion de tubos 103. La pluralidad de camaras de PCR 113 se muestra simbolicamente mediante los numeros de referencia 1, 24, 36, 48, 55, 60 y 72. La presente forma de realizacion del dispositivo de sujecion de tubos esta configurada para ser utilizada simultaneamente para dos ensayos que son iguales. En particular, esta comprendido un elemento de codificacion 'M1' para una mezcla de cebador y sonda; esta comprendido un elemento de codificacion 'M2' para una mezcla maestra; esta comprendido un elemento de codificacion 'M3' para una mezcla para RT o manganeso, en la que esta comprendido un elemento de codificacion 'PC', referido a 'control positivo', en el que esta comprendido un elemento de codificacion 'NC', referido a 'control negativo', y en la que un elemento de codificacion “QS” para cuantificacion estandar esta comprendido por el dispositivo de sujecion de tubos presentado. Pueden utilizarse codigos de color respectivos que son diferentes para 'M1', 'M2', 'M3', 'PC', 'NC' y 'QS'. Sin embargo, pueden indicarse con el mismo color diferentes aberturas de recepcion de estandar de cuantificacion para la recepcion de diferentes concentraciones de las moleculas diana aunque con diferentes abreviaturas adicionales especfficas de abertura. En otras palabras, la forma de realizacion presentada puede proporcionarse con cinco aberturas de recepcion 'QS' en las que deben insertarse los tubos para muestra con una concentracion especffica de moleculas diana, en el que la totalidad de dichas aberturas presentan un codigo de color como elemento codificado que presenta o indica el mismo color.
La figura 11 representa otro sistema 100 que comprende un dispositivo de sujecion de tubos para un ensayo o tambien para dos ensayos diferentes. Tal como puede observarse en la figura 11, el dispositivo de sujecion de tubos 103 proporciona una distribucion espacial de sus aberturas de recepcion que en la que los puntos son simetricos respecto al punto central 113. Ademas, en la figura 1 se muestran el primer segmento superficial 210 y el segundo segmento superficial 211, que indican el espacio respectivo para los dos ensayos diferentes. La lfnea curvada y en forma de S 1101 divide los dos segmentos. Puede observarse facilmente la simetrfa de los puntos 1100 a partir de la vista superior de la figura 11. Ademas, se utilizan de manera similar a la figura 10 anteriormente indicada las abreviaturas M1, M2, M3, PC, NC y QS.
La figura 12 describe otro sistema 100 para la preparacion de muestras de PCR y para la configuracion de la PCR, que comprende un dispositivo de carga para recibir tubos de muestra y un dispositivo de sujecion de tubos 103 para la union al dispositivo de carga. En dicha vista superior de la figura 12, se muestra la alineacion de las aberturas de recepcion 105a y 105b del dispositivo de sujecion de tubos 103 con las aberturas de recepcion correspondientes 201a y 201b del dispositivo de carga. Ademas, puede observarse que las segundas aberturas de recepcion cubiertas 202a y 202b se muestran como referencias, ya que se encuentran cubiertas por el plano del dispositivo de sujecion de tubos. Dichas referencias tambien se muestran en las figuras 4, 5, 6, 7, 10 y 11. Sin embargo, se describe claramente en la presente memoria que dichas referencias solo se indican en aras de la claridad. En cualquier caso, dichas aberturas de recepcion del dispositivo de carga estan espacialmente cubiertas por el dispositivo de sujecion de tubos. El centro 213 del dispositivo de forma circular esta cruzado por dos lfneas rectas, 1204 y 1205, de manera que se genera una configuracion de cuatro segmentos en el dispositivo de sujecion de tubos 103. De esta manera, se muestran en la figura 12 cuatro segmentos de un cfrculo con los numeros de referencia respectivos 1200 a 1203. Dicha configuracion puede utilizarse para un ensayo o tambien para dos ensayos diferentes.
La figura 13 muestra otro ejemplo de un sistema 100, que comprende un dispositivo de carga 101 y un dispositivo de sujecion de tubos 103. Como referencia, la segunda abertura de recepcion cubierta 202 del dispositivo de carga se ilustra con lfneas discontinuas. Ademas, los numeros de referencia 105a a 105b se utilizan para las aberturas de recepcion del dispositivo de sujecion de tubos 103, las cuales estan alineadas con las aberturas de recepcion respectivas 201a a 201b del dispositivo de carga. En dicha disposicion de cuatro segmentos, las superficies coloreadas 209 son las aberturas de recepcion, utilizadas como codigos de color para dirigir el movimiento de los tubos para muestra a la abertura de recepcion correcta. Los diferentes colores se indican en la figura mediante diferentes signos: diferentes lfneas discontinuas y lfneas de puntos y rayas. Una pluralidad de camaras de PCR 113 se dispone en torno a la parte central del dispositivo, de manera que resulta posible un pipeteado directo desde la zona central hacia la zona de borde, es decir, al interior de las camaras de PCR, y resulta facilitada por el dispositivo presentado. Ademas, se muestra un asidero 1300 para que el dispositivo pueda ser asido por el usuario. El asidero facilita la insercion y/o retirada del dispositivo de sujecion de tubos 103 en y/o del dispositivo de carga. Por lo tanto, se presenta un cambio totalmente automatizado y rapido de diferentes dispositivos de sujecion de tubos especfficos de ensayo.
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La figura 14 representa la configuracion de la figura 11 en una vista en perspectiva tras la insercion de los tubos para muestra 102 en el sistema 100. Ademas, en la figura 14 tambien se muestra el asidero 1300. Con respecto a las caracterfsticas y signos de referencia restantes, se hace referencia a las demas figuras, en particular a la figura 11.
Segun otra configuracion que puede utilizarse en la invencion, la figura 15 muestra un dispositivo 100 con un asidero 1300 para ser asido por el usuario o un dispositivo automatizado. El dispositivo de sujecion de tubos 103 esta integrado en el dispositivo de carga. Se consigue una alineacion de las aberturas de recepcion del dispositivo de carga para 12 aberturas de recepcion del dispositivo de sujecion de tubos, de entre los que 105a y 105b estan marcados con numeros de referencia. El elemento 1500 puede considerarse una placa de base para el dispositivo de carga.
Segun la configuracion, la figura 16 muestra un sistema para la preparacion de muestras para PCR y para la configuracion de PCR 100 que comprende el dispositivo de carga 101, que se cubre con la cubierta transparente 801. Por lo tanto, se consigue la cobertura simultanea del dispositivo de carga 101 y el dispositivo de sujecion de tubos 103 y los tubos para muestra insertados 102. Bien en lfnea con la figura 15, el elemento 1500 se muestra tambien para la forma de realizacion de la figura 16.
La figura 17 muestra el procedimiento de insercion de una pluralidad de camaras de reaccion de PCR 113 que han sido llenados previamente mediante el sistema de la presente invencion. Se muestra un aparato termosellador 1700 con el fin de proporcionar un sellado, tal como, por ejemplo, la provision de una pelfcula de plastico sobre dichas camaras. El dispositivo de carga 101 se inserta en el dispositivo 1700 que porta una pluralidad de camaras de reaccion de PCR. En otras palabras, el dispositivo de carga esta adaptado para poder ser recibido por un dispositivo de termosellado.
La figura 18 representa un equipo de laboratorio, tal como es conocido de la tecnica. El dispositivo 1800 proporciona 11 posiciones para el equipo de laboratorio: A2, A3, B0-B4 y C1-C4.
La figura 19 proporciona un dispositivo de preparacion 1900 de las muestras y de configuracion de la PCR totalmente automatizado que resulta util en otra forma de realizacion ejemplificativa de la presente invencion. El dispositivo 199 comprende un sistema 100 tal como ha sido descrito anteriormente con respecto a las figuras 1 a 17 y se describira posteriormente en la presente memoria en mayor detalle. Los dos componentes: el dispositivo de carga 101 y el dispositivo de sujecion de tubos 103, se ilustran en la figura 19. Ademas, la cubierta 801 se muestra en la parte izquierda de la figura 19. En total, el dispositivo 1900 proporciona 12 posiciones utilizadas para equipos de laboratorio. El dispositivo 100 facilita la preparacion de muestras para PCR y la configuracion de la PCR, que proporciona una PCR acelerada que un usuario pretende llevar a cabo. El dispositivo 1900 es capaz de reconocer y configurar la reaccion de PCR en el dispositivo 100 mediante el desplazamiento automatico de todos los tubos para muestra necesarios y los lfquidos de las areas restantes del dispositivo 1900, por ejemplo mediante pipeteado o mediante el transporte de los tubos para muestra al interior del dispositivo 100. Ademas, el dispositivo 1900 es capaz de transportar y transferir automaticamente la cubierta 801 a la posicion del sistema 100, de manera que el sistema resulta cubierto. Lo anterior puede evitar la potencial contaminacion cruzada durante el procedimiento de preparacion de las muestras para PCR. Esta es una ventaja adicional de la presente invencion. Los camiones de pipeteado 500 indicados en la presente memoria pueden ser llevados a cabo por el sistema 1900. Se presenta un elemento programa informatico correspondiente. Debe indicarse explfcitamente que puede utilizarse dicha configuracion de la figura 19 con cualquier otra forma de realizacion de la invencion dada a conocer en la presente memoria.
La figura 20 representa el dispositivo 1900, que ha sido descrito en detalle en referencia a la figura 19, anteriormente. En la figura esta comprendido el sistema 100. Mediante un procedimiento de, por ejemplo, escaneo de codigos de barras 2500, puede transferirse informacion de muestra a la unidad de calculo 2200 y/o al termociclador 2100, mostrados en la figura 20. Tambien se indica en la figura 20 que, tras la preparacion de las muestras de PCR y la configuracion de la PCR en el dispositivo 1900 mediante el sistema 100, puede proporcionarse una pelfcula de sellado 2000 sobre las camaras de PCR 113. Tal como puede observarse en la figura 20, el dispositivo de carga 101 se encuentra completamente sellado con las camaras de PCR 113 mediante una pelfcula 2000. El sistema presentado de la figura 20 proporciona software que es capaz de reconocer y configura la reaccion de PCR en el dispositivo de carga 101 del sistema 100. Puede iniciarse automaticamente una posterior PCR, basandose en la informacion recibida sobre las muestras. Para el escaneo del codigo de barras, puede proporcionarse un escaner, que no se muestra en la figura 20. Para el analisis de los datos, se muestra la tabla 2300, en la que se muestran los resultados detallados del analisis. Ademas, la figura insertada 2004 permite ilustrar graficamente los resultados obtenidos del procedimiento anteriormente descrito. Por lo tanto, el dispositivo 900 proporciona datos de interfaz entre el dispositivo de preparacion de las muestras para PCR y de configuracion de la PCR por una parte y el termociclador por la otra. La figura 21 muestra esquematicamente un diagrama de flujo de un procedimiento de preparacion de una PCR. El procedimiento comprende proporcionar un dispositivo de carga, en el que el dispositivo de carga esta destinado a la recepcion de los tubos para la configuracion de una PCR. Esta etapa se muestra como S1. La etapa S2 describe la
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provision de un dispositivo de sujecion de tubos. En esta, el dispositivo de carga comprende una primera seccion de recepcion que comprende por lo menos una primera y una segunda aberturas de recepcion. La primera abertura de recepcion y la segunda abertura de recepcion estan adaptadas para recibir, respectivamente, un tubo para muestra. El procedimiento comprende ademas la etapa de unir el dispositivo de sujecion de tubos al dispositivo de carga, que se indica como S3.
La forma de realizacion ejemplificativa de la figura 22 se basa en la forma de realizacion de la figura 21, mientras que estan comprendidas etapas adicionales del procedimiento. En particular, se une reversiblemente un tubo de muestras al dispositivo de sujecion de tubos en la etapa S5. Ademas, se muestra como etapa S4 la alineacion de la abertura de recepcion del dispositivo de sujecion de tubos a una de entre la primera abertura de recepcion y la segunda abertura de recepcion del dispositivo de carga, cubriendo simultaneamente de esta manera la otra de entre la primera y segunda aberturas de recepcion. Ademas, el tubo de muestras se inserta en la abertura de recepcion del dispositivo de carga mediante la union del dispositivo de sujecion de tubos al dispositivo de carga en la etapa S6. En consecuencia, se lleva a cabo inherentemente S3 mediante la etapa S6. Por lo tanto, la etapa S3 se indica entre parentesis en la figura 22.
La figura 23 representa dos diagramas de flujo diferentes de dos formas de realizacion ejemplificativas diferentes de la presente invencion. En la parte de la izquierda, se llevan a cabo las etapas S1 y S2 de una manera similar a la descrita con respecto a las figuras 21 y 22. En ambas formas de realizacion de la figura 23, el dispositivo de sujecion de tubos comprende por lo menos una primera abertura que presenta un codigo de color que indica un primer color, y una segunda abertura que presenta un codigo de color que indica un segundo color. Ademas, para ambas formas de realizacion de la figura 23, se proporciona un tubo de muestras con un codigo de color que indica un tercer color en la etapa S8. La primera forma de realizacion de la figura 23, ilustrada en la parte izquierda de la figura 23, selecciona a continuacion la abertura de recepcion del dispositivo de sujecion de tubos que presenta el mismo color que el codigo de color del tubo de muestras en la etapa S9. Ademas, el tubo de muestras se inserta en la abertura de recepcion seleccionada del dispositivo de sujecion de tubos en la etapa S10. Tras la etapa S10, el dispositivo de sujecion de tubos se une al dispositivo de carga en la etapa S3. Sin embargo, la segunda forma de realizacion de la figura 23, ilustrada en la parte derecha, proporciona otra secuencia de etapas del procedimiento, tal como se explicara posteriormente en la presente memoria. En primer lugar, la union del dispositivo de sujecion de tubos en el dispositivo de carga se genera en la etapa S3, despues de la cual la etapa de seleccionar la abertura de recepcion del dispositivo de sujecion de tubos que presenta el mismo color que el codigo de color del tubo de muestras se lleva a cabo con la etapa S9. Finalmente, el tubo de muestras se inserta en la abertura de recepcion seleccionada del dispositivo de sujecion de tubos en la etapa S10, mediante la insercion del tubo de muestras en el dispositivo unido.
Segun otra forma de realizacion ejemplificativa de la invencion, la figura 24 describe un diagrama de flujo de un procedimiento de preparacion de una PCR con varias etapas del procedimiento. Con respecto a las etapas S1 a S3, se hace referencia a las explicaciones referidas a las figuras 21 a 23. La forma de realizacion de la figura 24 proporciona ademas datos de escaneo de por lo menos un elemento, seleccionado de entre el grupo que comprende placa de elucion, reactivos de extraccion, reactivos de ensayo, tubos para muestra y cualquier combinacion de los mismos en la etapa S11. Ademas, los datos escaneados se transmiten a una unidad de calculo, por ejemplo la unidad de calculo 220 de la figura 20, para fines de PCR en la etapa S12. Dicha unidad de calculo genera informacion para muestra en un formato de datos legibles por termociclador en la etapa S13. En otras palabras, el dispositivo y el procedimiento de la presente invencion facilitan la provision de datos legibles por el termociclador sobre la configuracion de la PCR. La informacion de muestra en formato de datos legibles por el termociclador se transmite al termociclador en la etapa S14. La etapa de llevar a cabo una PCR en una camara de reaccion de PCR recibida por el termociclador, basandose en la informacion sobre las muestras recibida en el formato de datos legibles por el termociclador, se muestra con la etapa S15 en la figura 24.
El experto en la materia podra entender y llevar a cabo otras variaciones de las formas de realizacion dadas a conocer mediante la puesta en practica de la invencion reivindicada, a partir del estudio de los dibujos, la exposicion y las reivindicaciones adjuntas. En las reivindicaciones, el termino “comprendiendo” no excluye otros elementos o etapas y el artfculo indefinido “un” o “una” no excluye una pluralidad. Un unico procesador u otra unidad puede cumplir las funciones de varios items o etapas indicados en las reivindicaciones. El mero hecho de que se senalen determinadas medidas en diferentes reivindicaciones mutuamente dependientes no indica que una combinacion de dichas medidas no pueda utilizarse ventajosamente. Un programa informatico puede almacenarse/distribuirse en un medio adecuado, tal como un medio de almacenamiento optico o un medio de estado solido, suministrado junto con o como parte de otro hardware, aunque tambien puede distribuirse en otras formas, tales como Internet u otros sistemas de telecomunicacion por cable o inalambricos. Cualesquiera numeros de referencia en las reivindicaciones no deberian interpretarse como limitativos del alcance segun las reivindicaciones.

Claims (9)

  1. 5
    10
    15
    20
    25
    30
    35
    40
    45
    50
    55
    60
    65
    REIVINDICACIONES
    1. Procedimiento de configuracion de una PCR, comprendiendo el procedimiento las etapas de
    proporcionar un dispositivo de carga (S1), siendo dicho dispositivo de carga para recibir unos tubos de muestra para configurar una PCR,
    proporcionar un dispositivo de sujecion de tubos (S2),
    en el que el dispositivo de carga comprende
    una primera seccion de recepcion,
    en el que la primera seccion de recepcion comprende por lo menos una primera y una segunda aberturas de recepcion,
    en el que la primera abertura de recepcion y la segunda abertura de recepcion estan adaptadas para recibir respectivamente un tubo de muestra;
    en el que el dispositivo de sujecion de tubos comprende por lo menos una primera abertura de recepcion, comprendiendo ademas el procedimiento la etapa de fijar el dispositivo de sujecion de tubos al dispositivo de carga (S3);
    alinear la abertura de recepcion del dispositivo de sujecion de tubos con una de la primera abertura de recepcion y la segunda abertura de recepcion del dispositivo de carga y cubrir simultaneamente la otra de la primera y la segunda aberturas de recepcion (S4).
  2. 2. Procedimiento segun la reivindicacion 1, que comprende la etapa de extraer simultaneamente una primera pluralidad de tubos de muestra para un primer ensayo de PCR y una segunda pluralidad de tubos de muestra para un segundo ensayo de PCR del dispositivo de carga mediante el asido del dispositivo de sujecion de tubos y extrayendo el dispositivo de sujecion de tubos del dispositivo de carga.
  3. 3. Procedimiento segun una de las reivindicaciones 1 o 2, que comprende la etapa de cubrir las aberturas de recepcion no utilizadas del dispositivo de carga mediante el dispositivo de sujecion de tubos (S7).
  4. 4. Procedimiento segun una de las reivindicaciones 1 a 3,
    en el que el dispositivo de sujecion de tubos comprende por lo menos una primera abertura que presenta un codigo de color que indica un primer color y una segunda abertura que presenta un codigo de color que indica un segundo color,
    comprendiendo el procedimiento las etapas de
    proporcionar un tubo de muestras con un codigo de color que indica un tercer color (S8),
    seleccionar la abertura de recepcion del dispositivo de sujecion de tubos que presenta el mismo color que el codigo de color del tubo de muestra (S9), e
    insertar el tubo de muestra en la abertura de recepcion seleccionada del dispositivo de sujecion de tubos (S10).
  5. 5. Procedimiento segun una de las reivindicaciones 1 a 4, que comprende las etapas de
    escanear los datos de por lo menos un elemento seleccionado de entre el grupo que comprende placa de elucion, reactivos de extraccion, reactivos de ensayo, tubos de muestra y cualquier combinacion de los mismos (S11), y
    transmitir los datos escaneados a una unidad de calculo para finalidades de PCR (S12).
  6. 6. Procedimiento segun la reivindicacion 5, que comprende las etapas de
    generar informacion de muestras en un formato de datos legible por termociclador por la unidad de calculo (S13),
    5
    10
    15
    20
    25
    30
    35
    40
    transmitir la informacion de muestras a un termociclador (S14), y
    llevar a cabo una PCR en una camara de reaccion de PCR por el termociclador sobre la base de la informacion de muestras recibida en el formato de datos legible por termociclador (S15).
  7. 7. Procedimiento segun una de las reivindicaciones 1 a 6,
    en el que la primera seccion de recepcion esta situada centralmente, comprendiendo el procedimiento las etapas de
    recibir unas camaras de reaccion de PCR por el dispositivo de carga en una segunda seccion de recepcion situada exteriormente de la posicion central de la primera seccion de recepcion, y
    pipetear a lo largo de un trayecto recto desde una abertura de recepcion con un elemento de codificacion para un tubo de muestras que contiene una concentracion especffica de una molecula diana a la segunda seccion de recepcion, atravesando dicho trayecto las aberturas de recepcion cubiertas del dispositivo de carga unicamente.
  8. 8. Procedimiento segun cualquiera de las reivindicaciones 1 a 7, que comprende las etapas de
    indicar en una pluralidad de aberturas de recepcion del dispositivo de sujecion de tubos una recepcion prevista de un tubo de muestras que contiene una concentracion especffica de una molecula diana (QS 1, QS 2 y QS 3), respectivamente, y
    pipetear a lo largo de un trayecto entre una zona central del dispositivo de sujecion de tubos y una zona de borde del dispositivo de sujecion de tubos atravesando asf las aberturas de recepcion, en las que se indica una recepcion prevista de un tubo de muestras con una concentracion especffica de una molecula diana, de concentracion baja a concentracion elevada.
  9. 9. Procedimiento segun una de las reivindicaciones 1 a 8, que comprende las etapas de
    indicar en una primera abertura de recepcion del dispositivo de sujecion de tubos una recepcion prevista de un tubo de muestras con una primera concentracion de una molecula diana (QS 1),
    indicar en una segunda abertura de recepcion del dispositivo de sujecion de tubos una recepcion prevista de un tubo de muestras con una segunda concentracion de una molecula diana (QS 2), y
    proporcionar las primera y segunda aberturas de recepcion en el dispositivo de sujecion de tubos en unas posiciones relativas entre sf de manera que se facilitan unos trayectos rectos de pipeteado desde una zona central a una zona de borde del dispositivo de sujecion desde concentraciones de moleculas diana bajas a elevadas.
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