JP6387387B2 - プロセスチューブおよび搬送用トレイ - Google Patents
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Description
増幅されると、標的核酸の存在または標的核酸の増幅産物(例えば、標的アンプリコンが)が検出でき、標的核酸および/または標的アンプリコンの存在が、標的(例えば、標的病原体、遺伝子変異、変化など)の存在を特定および/または定量化するために用いられる。しばしば、核酸増幅アッセイは複数のステップを含み、それらは、核酸の抽出および前処理と、核酸増幅と、標的核酸検出とを含み得る。
多くの核酸に基づく診断アッセイでは、分析される生物学、環境、または他の試料は、入手されると、処理のための試薬と混合される。このような処理は、生体試料から抽出された核酸を、プローブおよび蛍光物質など、増幅試薬および検出試薬と混合することを含み得る。増幅のために試料を処理することは、現在、時間がかかる労働集約的なステップである。
ある例では、プロセスチューブを収容するラックは、サーマルサイクラに直接的に配置され得る。しかしながら、この手法は、プロセスチューブが取り扱いおよび運搬の最中にラックで位置が変わる可能性があり、その結果、サーマルサイクラの加熱器と正確に並べられないことになる。また、研究技術者による介入が、チューブを位置合わせしてチューブをサーマルサイクラの加熱器に嵌め入れるために必要とされる。さらに、プロセスチューブがラックに堅固に連結されていない場合、プロセスチューブの印付けの最中に加工が取り外され、スタンプ装置によってラックから引っ張り上げられて外される可能性がある。
ここでの背景技術の詳述は、本明細書に記載されている本発明の文脈を説明するように意図されている。これは、言及される構成要素のいずれかが、請求項のいずれかの優先日において、公表されていること、公知されていること、または、共通の一般的な知識の一部であることを自認すると解釈されるものではない。
特定の実施形態では、首部の外側面が、プロセスチューブを通る長手軸線と平行であり得る。突出部は、頂部と、頂部から首部への上方傾斜部と、頂部から本体部への下方傾斜部とを備え得る。突出部における上方傾斜部の角度が、突出部における下方傾斜部の角度より急であり得る。プロセスチューブの環状隆条部は、上方面、下方面、および外側面を有し得る。突出部は、首部の外径より大きい外径を有し得る。環状隆条部は、突出部の外径より大きい外径を有し得る。プロセスチューブは、本体部の下に、プロセスチューブの底部を定める基部をさらに備え得る。
特定の実施形態は、チューブから側方に延び、上方面、下方面、および外面を備える環状隆条部を有するプロセスチューブを企図している。プロセスチューブは、環状隆条部の上方面から鉛直方向上方に延び、プロセスチューブに開口を定める最上環部を備え得る。プロセスチューブは、チューブにおける環状隆条部の下の位置で、プロセスチューブから側方に延びる環状突出部をさらに備え得る。突出部は、頂部と、上方傾斜部と、下方傾斜部とを有し得る。プロセスチューブは、環状隆条部と突出部との間の首部と、突出部の下の本体部と、チューブの底部を定める基部とを備え得る。
本明細書および添付の請求項で用いられているように、単数形「1つ(a)」、「および(and)」、および「その(the)」は、文脈が明確に指示していない場合、複数の指示対象を含んでいる。したがって、例えば、「1つの方法」との言及は、複数のこのような方法、および、当業者に知られているそのような方法の均等物などを含んでいる。
本明細書に記載されているプロセスチューブおよび搬送用トレイは、サーマルサイクラで使用する前に、プロセスチューブを準備、保管、および運搬する安全で効率的なシステムを提供するために、また、増幅の最中に、プロセスチューブをサーマルサイクラに正確に堅固に位置決めするために、一体的に用いられ得る。
図3Bは、例示の搬送用トレイ300に堅固に嵌まる複数のプロセスチューブストリップ100を示している。ひとたびプロセスチューブ102が搬送用トレイ300に堅固に挿入されると、例えば増幅試薬および検出試薬といったアッセイ試薬が、自動化された手法でプロセスチューブ102に加えられ得る。ある実施形態では、液体試薬が個々のプロセスチューブ102へとピペットで移すことができ、そして、搬送用トレイ300は、プロセスチューブ102の内部基底220の形に形成される固体塊として、液体試薬をプロセスチューブの底部で乾燥させるために、乾燥機に選択的に配置できる。ある実施形態では、液体試薬はプロセスチューブ102の下で乾燥されない。ある実施形態では、搬送用トレイ300の各々のプロセスチューブ102は、同一の試薬が沈殿されてもよい。他の実施形態では、プロセスチューブストリップ100のプロセスチューブ102の一部または各々は、異なる試薬または試料で満たされてもよい。
プロセスチューブ102がポート306へと押し込まれるとき、ポート306を通過した突出部212の下方傾斜部216の部分は、下方傾斜部216が長手軸線230に向かって傾斜されているため、ポート内部壁316と接しない。突出部212の下方傾斜部216は、下方傾斜部216が突出部212の頂部215に向かって上向きに延びるにつれて、徐々に幅広になる(外径が増加する)。下方傾斜部216の直径が幅広になるにつれて、プロセスチューブ102をポート306へと押すことに対する抵抗が大きくなる。したがって、プロセスチューブ102をポート306へと押し込むために加えられ得る力に対抗する抵抗力が発生させられる。プロセスチューブ102に対する抵抗力が増加し(および、プロセスチューブ102を押すために必要な力が増加し)、プロセスチューブ212がポート306内へとさらに下へと移動する。プロセスチューブ102に対する抵抗力は、突出部212の頂部215が最上部縁部318に達するまで増加し続ける。
隙間324は、固定領域200におけるプロセスチューブ102についての適応の点を提供する。隙間324は、プロセスチューブ102の首部228とポート内部壁316との間に主に存在するが、隙間324は、突出部212の上方傾斜部214に沿って、および、環状隆条部204の下方面210の一部に沿っても存在する。隙間324は、ポート最上部縁部318の丸くされた角がポート306とプロセスチューブ102の首部228との間に追加的な隔たりを提供するため、固定領域200の最上部分において若干拡大されている。隙間324は、プロセスチューブ102がポート306に固定されているときでさえ、プロセスチューブ102に搬送用トレイ300のポート306内におけるある程度の自由な動きを提供できる。
固体の試薬が、液体の試薬に加えて、または、液体の試薬の代わりに、プロセスチューブ102に加えられてもよいことも企図される。空のプロセスチューブ102と搬送用トレイ300とが最終使用者に提供でき、最終使用者が、核酸試料を加える前に、プロセスチューブ102に固体または液体の試薬を沈殿させることができることも企図される。
この例は、最終使用者に提供される、プロセスチューブ102を備えた搬送用トレイ300を準備するための具体的な過程を示している。
1.ポリプロピレンから形成された8個の連結されたプロセスチューブを収容する12個のプロセスチューブストリップを製造する。
2.ポリカーボネートから、8x12の配列で96個のポートを有する搬送用トレイを製造する。
3.12個のプロセスチューブストリップが搬送用トレイに配置される。
4.プロセスチューブストリップのプロセスチューブが、プロセスチューブの最上環部に力を加えることで、搬送用トレイのポートに固定される。
5.搬送用トレイの各々のプロセスチューブが、同じ特定の液体試薬で満たされる。
6.搬送用トレイが、プロセスチューブの試薬を乾燥するために加熱される。
7.プロセスチューブが、使用されることになるアッセイを指示するために、特定の色でホットスタンプされる。
8.搬送用トレイが、同じまたは異なる試薬を有する他の搬送用トレイと積み重ねられて梱包され、最終使用者へと出荷される。
9.最終使用者は、全部そろっている搬送用トレイをそのまま使用できる、または、搬送用トレイを減らし、1つもしくは複数の搬送用トレイを、様々な試薬の種類の個別のプロセスチューブストリップもしくはチューブの混合で再び増やすことができる。
この例は、搬送用トレイ300のポート306のプロセスチューブストリップ100を固定するために必要な力と、その後にプロセスチューブストリップ100をポート306から取り外すために必要な力とを決定するための試験の試験手順および結果を表している。
試験手順
1.搬送用トレイの段に1個のチューブのストリップを置く(搬送用トレイにまだ固定されていない)。
2.ゲージをオンにする。
3.ゲージが直立した位置の状態で、ゲージをゼロに設定する。
4.ゲージをクリアする。
5.「A」列で始まるストリップ内の各々のチューブを、ゲージが各々のチューブに鉛直から2〜3度までの若干の角度にある状態で、すべてのチューブが所定位置に嵌まるまでゆっくりと押し下げる。
6.ゲージの力の値と、挿入値としての段の数とを記録する。
7.メモリを消去するために消去ボタンを押す。
8.第2の段に第2のチューブのストリップを置く。ステップ5〜7を繰り返す。
9.残りのストリップ3〜12に対してステップ5〜7を繰り返す。
10.搬送用トレイを上下反転し、第1のストリップから最初に、チューブを「A」列で始まる搬送用トレイからゆっくりと押し出す。
11.力の値と、取り出し値としての段の数とを記録する。
12.メモリを消去するために消去ボタンを押す。
13.残りのプロセスチューブストリップに対してステップ10、11、および12を繰り返す。
14.搬送用トレイで12個のプロセスチューブストリップを再配置し、ステップ3〜13を繰り返す。
力試験の結果が表1に提供されている。表1は、搬送用トレイ300でプロセスチューブストリップ100のプロセスチューブ102のすべてを挿入および固定するために必要な力を示している。示すように、プロセスチューブストリップ100を搬送用トレイ300で固定するための平均挿入力は、1.18重量ポンドであり、平均取り外し力は0.60重量ポンドであった。
Claims (17)
- プロセスチューブであって、
前記プロセスチューブから側方に延び、上方面、下方面、および外面を備える環状隆条部と、
前記環状隆条部の前記上方面から鉛直方向上方に延び、前記プロセスチューブへの開口を定める最上環部と、
前記プロセスチューブにおける前記環状隆条部の下の位置で、前記プロセスチューブの外部から側方に延び、頂部、上方傾斜部、および下方傾斜部を備える環状突出部と、
前記環状隆条部と前記突出部との間の首部と、
前記突出部の下の本体部と、
前記プロセスチューブの底部を定める基部と、
を有し、
前記プロセスチューブの長手軸線に対する前記突出部における前記上方傾斜部の角度が、鋭角であって、前記プロセスチューブの長手軸線に対する前記突出部における前記下方傾斜部の角度よりも急である、
ことを特徴とするプロセスチューブと、
搬送用トレイと、
を備え、
前記搬送用トレイは、棚部と基部とを備え、
前記棚部は、前記棚部の最上部を貫く複数の楕円形のポートを備え、
前記複数の楕円形のポートは、内部壁を有し、
前記プロセスチューブは、前記搬送用トレイの1つの楕円形のポートに堅固に嵌まるように構成されている
ことを特徴とするシステム。 - 各々のポートは、幅直径より大きい長さ直径を備える
ことを特徴とする請求項1に記載のシステム。 - 前記プロセスチューブの前記突出部が、前記搬送用トレイの前記ポートの少なくとも前記幅直径より大きい外径を有する
ことを特徴とする請求項2に記載のシステム。 - 前記プロセスチューブの前記首部が、前記搬送用トレイの前記ポートの前記長さ直径および前記幅直径より小さい外径を有する
ことを特徴とする請求項2に記載のシステム。 - 前記プロセスチューブが前記搬送用トレイの前記ポートに堅固に嵌め入れられている
ことを特徴とする請求項1に記載のシステム。 - 前記プロセスチューブの前記環状隆条部の前記下方面が、前記棚部最上部の外部に載りかかり、前記突出部の前記上方傾斜部は、前記ポートの前記内部壁の底縁に載りかかる
ことを特徴とする請求項5に記載のシステム。 - 隙間が、前記プロセスチューブの前記首部と前記ポートの前記内部壁との間に存在する
ことを特徴とする請求項5に記載のシステム。 - 前記隙間が、前記プロセスチューブを、前記搬送用トレイの前記ポート内で傾かせることができる
ことを特徴とする請求項7に記載のシステム。 - 前記環状隆条部から側方に延びる平面状延在部をさらに備え、前記延在部が、前記プロセスチューブに印付けするための表面を提供する
ことを特徴とする請求項1に記載のシステム。 - 内部を貫く複数の楕円形のポートを備える搬送用トレイと、
プロセスチューブであって、環状隆条部、突出部、および、前記隆条部と前記突出部との間の首部、からなる前記プロセスチューブの外部の固定領域を有するプロセスチューブと、
を備え、
各ポートは、最上部縁部と、底縁と、内部壁と、を有しており、
前記突出部が、頂部と、前記頂部から前記首部への上方傾斜部と、前記頂部から本体部への下方傾斜部と、を有し、
前記プロセスチューブの長手軸線に対する前記突出部における前記上方傾斜部の角度が、鋭角であって、前記プロセスチューブの長手軸線に対する前記突出部における前記下方傾斜部の角度よりも急であり、
前記プロセスチューブは、前記搬送用トレイの1つの楕円形のポートに堅固に嵌まっていて、前記環状隆条部の底面が前記搬送用トレイの頂面に載りかかり、前記突出部の前記上方傾斜部が前記ポートの前記底縁に接触している
ことを特徴とするシステム。 - 前記搬送用トレイの前記ポートが、幅直径より大きい長さ直径を備える
ことを特徴とする請求項10に記載のシステム。 - 前記プロセスチューブの前記環状隆条部が、前記搬送用トレイの前記ポートの前記長さ直径および前記幅直径より大きい外径を有し、前記プロセスチューブの前記首部が、前記ポートの前記長さ直径および前記幅直径より小さい外径を有する
ことを特徴とする請求項11に記載のシステム。 - 前記プロセスチューブの前記突出部が、前記ポートの少なくとも前記幅直径より大きい外径を有する
ことを特徴とする請求項11に記載のシステム。 - 前記プロセスチューブが前記搬送用トレイの前記ポート内で傾くことができる
ことを特徴とする請求項10に記載のシステム。 - 前記プロセスチューブの断面は、円形である
ことを特徴とする請求項10に記載のシステム。 - 前記プロセスチューブの前記首部は、前記楕円形のポートに受容されており、
前記プロセスチューブの前記首部の外径は、一定の円の直径である
ことを特徴とする請求項10に記載のシステム。 - 前記プロセスチューブは、前記楕円形のポートに受容されており、
前記プロセスチューブは、前記楕円形のポートに対して回転方向の向きが決められている
ことを特徴とする請求項10に記載のシステム。
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