BR112014028949B1

BR112014028949B1 - método para configurar uma pcr

Info

Publication number: BR112014028949B1
Application number: BR112014028949-2A
Authority: BR
Inventors: Xi Li; Quan Yuan; Yin Kum Ng
Original assignee: Vela Operations Singapore Pte. Ltd.
Priority date: 2012-05-24
Filing date: 2013-05-23
Publication date: 2021-05-18
Also published as: NO2855023T3; BR112014028949A2; EP2855023B1; EP2855023A1; CN105349402B; HK1218557A1; WO2013175425A1; PT2855023T; PL2855023T3; US9709584B2; CN105349402A; US20150168434A1; AU2013264777A1; AU2016204481B2; AU2016204481A1; CN104520003A; ES2645081T3; DK2855023T3; SG11201407273UA; GB201209136D0

Abstract

SISTEMA PARA PREPARAÇÃO DE AMOSTRA PCR E PARA CONFIGURAÇÃO PCR. A presente invenção se refere a um dispositivo e mé todo para preparação de amostra PCR e configuração PCR. A preparação de amostra PCR e a configuração PCR totalmente automatizadas são facilitadas. Uma combinação de um dispositivo de carregamento com uma pluralidade de dispositivos de retenção de tubo diferentes que são anexados ao dispositivo de carregamento, permite a rápida permuta dos reagentes específicos de teste para dentro de e para fora do dispositivo de carregamento. Códigos de cores podem provar a correção do teste realizado, com códigos de cores sendo fornecidos no dispositivo de retenção de tubo apresentado. A cobertura de posições de tubo de amostra não utilizadas do dispositivo de carregamento evita a introdução de tubo de amostra incorreta. O dispositivo de retenção de tubo permite a colocação e remoção simultâneas de todos os tubos de amostra necessários em ou do dispositivo de carregamento. Uma cobertura é apresentada para cobrir simultaneamente o dispositivo de carregamento e o dispositivo de retenção de tubo. Adicionalmente, a capacidade de uso de autoclave é alcançada pela cobertura. A cobertura pode evitar o transporte cruzado durante a preparação de amostra PCR. Adicionalmente, dados de (...)

Description

Campo da invenção

[0001] A presente invenção refere-se a diagnóstico molecular. Em particular, a presente invenção refere-se a um sistema para a preparação de amostra de PCR e para configuração de PCR, um método de preparação de uma PCR, e o uso de um dispositivo de retenção de tubo para configuração de PCR.

Fundamentos da invenção

[0002] A reação em cadeia de polimerase (PCR) permite que pesquisadores produzam grandes quantidades de uma sequência específica de DNA para análise posterior em um espaço de tempo relativamente curto. PCR é, hoje em dia, uma metodologia preferida em aplicações de pesquisa e na detecção da presença ou ausência de uma molécula alvo, por exemplo, em aplicações clinicas e de diagnóstico.

[0003] O progresso técnico tem levado a instrumentos de bancada compactos que permitem configurações PCR de alta precisão automatizadas. Os sistemas de manuseio de líquido robóticos têm sido automatizados para a configuração PCR. Adicionalmente, também os processos precedendo a configuração de PCR têm sido automatizados, por exemplo, a extração e purificação de material de ácido nucleico a partir de amostras a serem investigadas, por exemplo, amostras clínicas, amostras ambientais, material para medicina forense, etc. A automatização desses processos tem resultado em uma redução de custos devido ao pessoal de laboratório, e tem tido um papel na prevenção de erro humano que resulta na contaminação dos dispositivos e reagentes, etapas de pipetagem erradas e, consequentemente resultados incorretos, etc.

[0004] Existe, no entanto, uma necessidade permanente de se aperfeiçoar esses métodos e dispositivos a fim de se eliminar qualquer risco em potencial de contaminação e/ou resultados dúbios além de acelerar os métodos existentes para recursos seguros e tempo.

Sumário da invenção

[0005] Existe a necessidade de se fornecer uma preparação de amostra de PCR aperfeiçoada, por exemplo, a extração de ácidos nucleicos de uma amostra a ser investigada, e/ou para uma configuração de PCR aperfeiçoada.

[0006] O objetivo da presente invenção é solucionado pela presente mateira das reivindicações independentes. Modalidades e vantagens adicionais da invenção são incorporadas nas reivindicações dependentes.

[0007] As modalidades descritas pertencem de forma similar ao sistema para a preparação de amostra de PCR e configuração de PCR, o método de preparação de uma PCR, e o uso de um dispositivo de retenção de tubo. Efeitos sinergéticos podem surgir das diferentes combinações das modalidades apesar de poderem não ser descritos em detalhes posteriormente.

[0008] Adicionalmente, deve-se notar que todas as modalidades da presente invenção referentes a um método podem ser realizadas com a ordem de etapas como descrito. Não obstante, essa não precisa ser a única ordem e ordem essencial de etapas do método da presente invenção. Os versados na técnica coletam todos os tipos de ordens diferentes e combinações das etapas de método descritas aqui, a menos que explicitamente mencionado o contrário posteriormente.

[0009] De acordo com uma modalidade ilustrativa da invenção, um sistema para a preparação de amostra PCR e para a configuração PCR é apresentado. O sistema compreende um dispositivo de carregamento para o recebimento de tubos. Abaixo os tubos são geralmente referidos como "tubos de amostra", designando qualquer tipo de recipiente que seja adequado para assumir líquidos e/ou sólidos utilizados no preparo ou configuração de PCR. O dispositivo de carregamento compreende uma primeira seção de recebimento, e a primeira seção de recebimento compreende pelo menos uma primeira abertura de recebimento e uma segunda abertura de recebimento. Adicionalmente, a primeira abertura de recebimento e a segunda abertura de recebimento são adaptadas para receber respectivamente e um tubo de amostra. O sistema compreende adicionalmente um dispositivo de retenção de tubo para ser fixado ao dispositivo de retenção.

[0010] Em outras palavras, o dispositivo de carregamento e o dispositivo de retenção de tubo são configurados em combinação de modo que uma fixação, e/ou montagem do dispositivo de retenção de tubo em ou no dispositivo de carregamento seja facilitada. Essa fixação entre o dispositivo de carregamento e o dispositivo de retenção de tubo é fornecida de modo que uma configuração de PCR totalmente automatizada e uma preparação de amostra PCR para PCR subsequente sejam facilitadas pelo sistema apresentado. Para fins de fixação, o dispositivo de fixação ou meio de fixação como protuberâncias, roscas ou dispositivos de engate cooperativos podem ser fornecidos no dispositivo de carregamento e/ou o dispositivo de retenção de tubo de modo que a fixação desejada seja alcançada. Isso será descrito em maiores detalhes doravante.

[0011] O fornecimento do dispositivo de retenção de tubo permite que o usuário cubra as posições de tubo não utilizadas, isso é, as aberturas de recebimento não utilizadas, do dispositivo de carregamento. O dispositivo de carregamento pode ser consubstanciado, por exemplo, como um thermorack, por exemplo, um disco de rotor de thermorack, que pode ser utilizado durante a configuração de PCR totalmente automatizada. Adicionalmente, a combinação do dispositivo de retenção de tubo e dispositivo de carregamento fornece a possibilidade de indicação tipos de reagente específicos de ensaio pelos indicadores ou elementos de codificação, como, por exemplo, rótulos coloridos ou indicações de cor, que de acordo com a presente invenção, podem ser fornecidos no dispositivo de retenção de tubo. O uso de elementos de codificação específicos no dispositivo de retenção de tubo aumenta a praticidade para o usuário e aumenta adicionalmente a confiabilidade do processo PCR. Em particular, um mecanismo à prova de falha é apresentado, de modo que o usuário coloque os tubos de amostra na posição correta. Em outras palavras, o sistema apresentado auxilia o usuário ou um dispositivo na colocação do tubo de amostra na posição correta no dispositivo de carregamento. Adicionalmente, o fornecimento do dispositivo de retenção de tubo em combinação com o dispositivo de carregamento facilita uma colocação simultânea e/ou remoção simultânea de todos os tubos que devem ser posicionados no dispositivo de carregamento. Isso pode acelerar a preparação de amostra PCR e processo de configuração PCR demasiadamente.

[0012] As vantagens previamente descritas do aspecto das partes de cobertura do dispositivo de carregamento da presente invenção, o aspecto de indicação por meio de elementos de codificação da presente invenção, e o aspecto de permitir a colocação ou remoção simultâneas de uma pluralidade de tubos de amostra podem fornecer especialmente as vantagens durante a preparação de amostra PCR e configuração PCR quando dispositivo de carregamento é consubstanciado como um rotor thermorack e um dispositivo de retenção de tubo adaptado de forma correspondente. O dispositivo de retenção de tubo pode ter uma quantidade específica de ensaio de aberturas de recebimento, que são posicionadas de forma específica de ensaio e que pode compreender elementos de codificação específicos de ensaio para os tubos de amostra que devem ser inseridos na disposição.

[0013] O dispositivo de retenção de tubo pode, dessa forma, fornecer uma funcionalidade dupla, como será descrito posteriormente. Em primeiro lugar, o dispositivo de retenção de tubo pode ser configurado para fixar de forma removível o tubo ou tubos de amostra que são utilizados para a preparação de amostra PCR e para configuração PCR, de modo que os tubos de amostra inseridos possam ser posicionados e movidos por meio da movimentação do dispositivo de retenção de tubo. Em segundo lugar, o dispositivo de retenção de tubo pode fornecer uma funcionalidade de cobertura, visto que as áreas do dispositivo de retentor de tubo entre as aberturas de recebimento podem ser vantajosamente utilizadas para cobrir e/ou encerrar as aberturas de recebimento do dispositivo de carregamento que, em casos em particular, pode não ser utilizado.

[0014] Deve-se notar que nessa e em cada outra modalidade ilustrativa, o dispositivo de retenção de tubo pode compreender uma pluralidade de aberturas de recebimento, e o dispositivo de carregamento também pode compreender uma pluralidade de aberturas de recebimento maiores do que duas. Isso fornece um sistema com possibilidades aumentadas de escolha entre vários números de ensaios diferentes que podem ser realizados em combinação com os dispositivos de retenção de tubo específicos de ensaio. Isso resulta em diferentes possibilidades de percurso de pipetagem vantajosos para o sistema automatizado ou o usuário. Devido ao grande número de aberturas de recebimento do dispositivo de carregamento e do dispositivo de retenção de tubo, as seleções otimizadas de aberturas de recebimento não cobertas são facilitadas de modo que os percursos de pipetagem otimizados a partir dos tubos de amostra nas aberturas de recebimento para as câmaras de reação PCR sejam facilitados. Isso será explicado em maiores detalhes com relação às figuras de 1 a 7 a seguir, onde percursos de pipetagem específicos são descritos, de modo que o usuário colete da seleção vantajosa de aberturas de recebimento pela combinação do dispositivo de carregamento com o dispositivo de retenção de tubo específico de ensaio.

[0015] O sistema apresentado pode fornecer a vantagem de pipetagem direta dentro da segunda seção de recebimento do dispositivo de carregamento, onde as câmaras de reação PCR podem ser fornecidas. No caso de o dispositivo de carregamento ser consubstanciado como um rotor thermorack, a pipetagem direta dentro do rotor é facilitada pela presente invenção. Isso pode ser observado a partir de, por exemplo, a figura 1. Adicionalmente, a configuração de extração simultânea de, por exemplo, quatro ensaios diferentes pode ser facilitada pelo sistema apresentado. Adicionalmente, a extração simultânea de RNA e DNA na mesma rodada é facilitada pela combinação do dispositivo de carregamento e o dispositivo de retenção de tubo de acordo com a presente invenção.

[0016] De acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção, o sistema compreende um dispositivo de carregamento e uma pluralidade de diferentes dispositivos de retenção de tubo específicos de ensaio.

[0017] Um reservatório de dispositivos de retenção de tubo diferentes pode ser compreendido pelo sistema apresentado.

[0018] De acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção, o dispositivo de retenção de tubo é uma placa de retenção de tubo.

[0019] Se desejado, a placa de retenção de tubo pode ser consubstanciada com um formato essencialmente circular. No entanto, outros formatos como retangular ou quadrático podem ser modalidades possíveis da placa de retenção de tubo. Adicionalmente, o dispositivo de retenção de tubo pode ser formado a partir de um metal ou uma liga, mas também materiais poliméricos ou outros materiais que são adequados para a produção de tal dispositivo de retenção de tubo podem ser utilizados.

[0020] De acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção, o dispositivo de retenção de tubo compreende pelo menos uma primeira abertura de recebimento. Adicionalmente, o dispositivo de retenção de tubo é fixável ao dispositivo de carregamento de modo que a abertura de recebimento do dispositivo de retenção de tubo seja alinhada com pelo menos uma dentre a primeira abertura de recebimento e a segunda abertura de recebimento do dispositivo de carregamento e cobre simultaneamente a outra das primeira e segunda aberturas de recebimento do dispositivo de carregamento.

[0021] Dessa forma, na configuração fixada pelo menos uma abertura de recebimento é coberta e uma é descoberta. Em outras palavras, essa modalidade facilita a cobertura, fundição superior e/ou cobertura das aberturas de recebimento do dispositivo de carregamento que não são utilizadas de acordo com o ensaio pretendido e/ou de acordo com o percurso de pipetagem correspondente realizada por um dispositivo de pipetagem automatizado, aspectos da presente invenção que serão descritos em maiores detalhes. O dispositivo de carregamento e o dispositivo de retenção de tubo específico de ensaio podem ser dispostos juntos de modo que o dispositivo de retenção de tubo cubra e/ou proteja a abertura de recebimento não utilizada do dispositivo de carregamento. A combinação facilita adicionalmente esse alinhamento da abertura de recebimento do dispositivo de retenção de tubo com uma das aberturas de recebimento do dispositivo de carregamento. Devido a esse alinhamento, um tubo de amostra de acordo com um ensaio específico pode ser colocado ou inserido através de duas aberturas de recebimento alinhadas, e pode, dessa forma, ser colocado no dispositivo de carregamento para a preparação de amostra PCR subsequente e configuração PCR. Em outras palavras, pela fixação do dispositivo de retenção de tubo ao dispositivo de carregamento, uma seleção da pluralidade de aberturas de recebimento do dispositivo de carregamento é realizada. Apenas as aberturas de recebimento dos dispositivos de carregamento não são cobertas pelo dispositivo de retenção de tubo, aberturas de recebimento essas que devem ser utilizadas de acordo com o ensaio atualmente utilizado ou desejado.

[0022] Essa seleção fornece uma capacidade de uso aperfeiçoada do pessoal do laboratório e fornece adicionalmente uma simplificação da preparação de amostra PCR e configuração PCR.

[0023] De acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção, o sistema compreende pelo menos um dentre um tubo de amostra, onde o tubo de amostra é fixado de forma removível à abertura de recebimento do dispositivo de retenção de tubo.

[0024] Em outras palavras, o sistema fornece um dispositivo de retenção de tubo que é configurado de modo que um ou mais tubos de amostra sejam móveis e recebidos pelo dispositivo de carregamento e o dispositivo de retenção de tubo pelo alinhamento da abertura do dispositivo de retenção de tubo com uma das primeira e segunda aberturas de recebimento do dispositivo de carregamento. Consequentemente, o tubo de amostra, que é recebido, é mantido pelo dispositivo de retenção de tubo fixado ao mesmo de modo que o tubo seja movido pelo movimento do dispositivo de retenção de tubo. Pela fixação do dispositivo de retenção de tubo ao dispositivo de carregamento, o tubo de amostra mantido é inserido no dispositivo de carregamento. Para fins de fixação do tubo de amostra ao dispositivo de retenção de tubo, dispositivos de fixação podem ser fornecidos no dispositivo de retenção de tubo e/ou tubo de amostra. Por exemplo, meios puramente mecânicos e forças podem ser utilizados por meio de um engate do colar do tubo de amostra com a superfície circunferencial de uma abertura de recebimento do dispositivo de retenção de tubo. Um fornecimento ou adaptação correspondente dos diâmetros emaranhados das aberturas de recebimento e do tubo de amostra pode ser observado como outro aspecto da presente invenção. Por exemplo, o tubo de amostra pode ser recebido pelo dispositivo de retenção de tubo em uma posição pendente na abertura de recebimento, como pode ser percebido na figura 8, por exemplo. No entanto, outros meios de fixação podem ser fornecidos pela presente invenção, como, por exemplo, forças magnéticas, a fim de se fixar o tubo de amostra ao dispositivo de retenção de tubo. Como uma modalidade adicional, protuberâncias correspondentes ou roscas podem ser utilizadas a fim de engatar o tubo de amostra e o dispositivo de retenção de tubo para a fixação removível desejada, que pode ser liberada novamente, se desejado.

[0025] De acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção, a primeira seção de recebimento do dispositivo de carregamento compreende uma primeira pluralidade de aberturas de recebimento para receber um tubo de amostra, e o dispositivo de retenção de tubo compreende uma segunda pluralidade de aberturas de recebimento para receber um tubo de amostra. Adicionalmente, na posição fixada do dispositivo de retenção de tubo no dispositivo de carregamento uma parte das aberturas de recebimento do dispositivo de carregamento é alinhada com as aberturas de recebimento correspondentes do dispositivo de retenção de tubo e uma parte restante das aberturas de recebimento do dispositivo de carregamento é coberta pelo dispositivo de retenção de tubo.

[0026] Essa modalidade pode ser facilmente percebida a partir de, por exemplo, as figuras 1, 8 e a sequência de figuras de 13 a 15, onde um dispositivo de carregamento com três placas de retenção de tubo diferentes para três ensaios diferentes são ilustradas.

[0027] De acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção, uma primeira pluralidade de tubos de amostra posicionada para um primeiro ensaio PCR é compreendida, e uma segunda pluralidade de tubos de amostra posicionados para um segundo ensaio de PCR é compreendida pelo sistema. Adicionalmente, o dispositivo de retenção de tubo compreende uma abertura de recebimento para cada tubo de amostra de modo que todos os tubos de amostra sejam removivelmente fixados ao dispositivo de retenção de tubo por meio da abertura de recebimento respectiva para o dispositivo de retenção de tubo.

[0028] Em outras palavras, o dispositivo de retenção de tubo fornece duas seções ou segmentos mais ou menos separadas por meio das quais os tubos de amostra do primeiro ensaio ou para o primeiro ensaio são separados dos tubos de amostra para o segundo ensaio. A princípio, isso pode ser escalonado para cada um dentre a pluralidade de ensaios de PCR, como, por exemplo, uma terceira pluralidade de tubos de amostra para um terceiro ensaio PCR, uma quarta pluralidade de tubos de amostra para um quarto ensaio PCR, uma quinta pluralidade de tubos de amostra para um quinto ensaio PCR, e assim por diante. O escopo dessa modalidade não deve ser limitado à menção do quinto ensaio PCR, mas pode ser estendido até números maiores se desejável pelo usuário. Portanto, por meio da combinação do dispositivo de carregamento e o desenho do dispositivo de retenção de tubo, todos os tubos de amostra necessários e diferentes para uma pluralidade de ensaios PCR podem ser simultaneamente inseridos no dispositivo de carregamento e/ou podem ser simultaneamente removidos, isso é, de uma vez, do dispositivo de carregamento. Isso pode acelerar o procedimento de preparo de amostra PCR e configuração PCR.

[0029] De acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção, um diâmetro das aberturas de recebimento do dispositivo de retenção de tubo é maior do que um diâmetro do tubo de amostra, e onde o diâmetro das aberturas de recebimento do dispositivo de retenção de tubo é menor do que um diâmetro de um colar do tubo de amostra.

[0030] Essa modalidade facilita por meio de forças de gravidade apenas, que os tubos estejam pendentes no dispositivo de retenção de tubo devido a um engate entre os aros das aberturas de recebimento e os colares dos tubos. Aqui, os aros podem ser fornecidos pela superfície circunferencial das aberturas do dispositivo de retenção de tubo. Se desejado, elementos de aro adicionais podem ser fornecidos de modo que um engate reforçado entre os tubos e o dispositivo de retenção de tubo seja realizado. Aspectos adicionais sobre a combinação de diâmetro das aberturas de recebimento e os tubos de amostra utilizados de acordo com a presente invenção para o preparo de amostra de PCR e configuração de PCR serão descritos com relação à figura 2 posteriormente.

[0031] De acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção, o dispositivo de retenção de tubo compreende um elemento de codificação para codificar a informação referente a uma finalidade relacionada com PCR pretendida da abertura de recebimento.

[0032] Um elemento de codificação pode ser observado como um elemento do sistema que é configurado para fornecer informação, por exemplo, mecânica, ótica, eletrônica ou magnética para um usuário ou um dispositivo sobre a abertura de recebimento respectiva do dispositivo de retentor de tubo específico de ensaio. Essa informação pode ser detectada por um dispositivo de leitura mecânico, ótico, eletrônico ou magnético, como, por exemplo, um scanner de código de cor, do sistema apresentado. Adicionalmente, as abreviações podem ser compreendidas como elemento de codificação em uma abertura de recebimento do dispositivo de retentor de tubo. Um elemento de codificação pode, por exemplo, ser um padrão mecânico como linhas de formatos diferentes em ou em torno de uma abertura de recebimento. Isso pode ser percebido a partir das figuras 1 ou 2, por exemplo. Um elemento de codificação também pode ser um chip que pode ser lido eletronicamente ou pode ser um código de cores, como uma superfície colorida. Adicionalmente, o texto ou abreviações podem ser utilizados para indicar para o usuário, qual amostra deve ser posicionada na abertura de recebimento respectiva.

[0033] O sistema pode fornecer tecnologias de sensor que permitem o reconhecimento do elemento de codificação e/ou permite a leitura da informação. Pela realização, por exemplo, de uma comparação de cores entre um código de cores no dispositivo de retenção de tubo e um código de cores em uma pluralidade de tubos de amostra, o tubo de amostra correto pode ser selecionado com base na comparação de cores. Subsequentemente, o tubo de amostra selecionado pode ser inserido na abertura de recebimento correspondente possuindo a mesma cor que o elemento de codificação.

[0034] De acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção, o dispositivo de retenção de tubo compreende um elemento de codificação em cada abertura de recebimento para indicar qual substância deve ser posicionada na abertura de recebimento respectiva por meio do tubo de amostra.

[0035] De acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção, o elemento de codificação é um código de cores.

[0036] Os códigos de cor também podem ser vistos como rótulos no dispositivo de retenção de tubo para indicar o tipo de reagente de cada posição, isso é, de cada abertura de recebimento, do dispositivo de retenção de tubo. Essa modalidade do dispositivo de retenção de tubo pode evitar a localização errada dos tubos em locais errados. Por exemplo, o código de cores pode ser fornecido como um anel codificado por cor em torno de uma abertura de recebimento. A finalidade relacionada com PCR indicada por meio do elemento de codificação pode, por exemplo, ser "água", "controle positivo", "mistura de primer e sonda (PPM)","mistura de primer de controle de extração e sonda (ECPPM)","padrão quantitativo (QS)". No entanto, outras indicações também podem ser utilizadas sem se distanciar do escopo da presente invenção. Em adição aos códigos de cor, abreviações podem ser compreendidas em cada abertura de recebimento do dispositivo de retentor de tubo.

[0037] De acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção, um código de cores é uma superfície colorida do dispositivo de retenção de tubo, e onde a superfície colorida está perto de ou na abertura de recebimento respectiva. Essa modalidade pode ser observada, por exemplo, a partir das figuras 1 e 9.

[0038] De acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção, o dispositivo de carregamento é um thermorack PCR.

[0039] O thermorack PCR pode ser inserido em um termociclador depois da preparação de amostra PCR e configuração PCR terem sido realizadas por meio do sistema apresentado. Como pode ser percebido a partir da figura 17, as câmaras de reação PCR que foram preparadas durante o processo de configuração PCR podem se inseridas diretamente por meio do dispositivo de carregamento em um dispositivo de vedação de folha. Além disso, a inserção rápida e direta em um termociclador, em particular um termociclador PCR, ou também em um dispositivo de autoclave é facilitado pelo dispositivo de carregamento apresentado.

[0040] De acordo com outra modalidade ilustrativa, o dispositivo de carregamento e o dispositivo de retenção de tubo possuem ambos um formato circular.

[0041] Consequentemente, uma disposição circular das câmaras de reação PCR podem ser localizadas em torno do dispositivo de carregamento, de modo que a pipetagem a partir da parte central do dispositivo de carregamento de formato circular na direção da região circunferencial do dispositivo de carregamento e para dentro das câmaras de reação PCR posicionadas seja facilitada.

[0042] De acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção, o dispositivo de carregamento compreende uma segunda seção de recebimento para o recebimento de uma pluralidade de câmaras de reação PCR.

[0043] Tais câmaras de reação para reagentes PCR podem ser observadas a partir de, por exemplo, figuras 1, 5, 8 e 13. Tais câmaras de reação de PCR também podem ser compreendidas pelo sistema de acordo com a presente invenção. A configuração de PCR pode ser realizada de modo que a combinação desejada de líquidos seja fornecida dentro das câmaras de reação PCR pela pipetagem dos reagentes necessários a partir do tubo de amostra para dentro das câmaras de reação de PCR. A combinação do dispositivo de retenção de tubo e dispositivo de carregamento permite percurso de pipetagem otimizados, que serão explicados em maiores detalhes, por exemplo, com relação às figuras 5 e 7 a seguir. Como uma modalidade adicional, a segunda seção de recebimento pode ser uma seção circunferencial em torno da primeira seção de recebimento do dispositivo de carregamento, Isso pode ser observado a partir de, por exemplo, a figura 1.

[0044] De acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção, o dispositivo de retenção de tubo expande horizontalmente ao longo de um primeiro plano, onde o primeiro plano possui um formato circular e cobre uma área circular do dispositivo de carregamento com a exceção de pelo menos uma abertura de recebimento do dispositivo de carregamento que é alinhada com uma das aberturas de recebimento do dispositivo de retenção de tubo.

[0045] A princípio, uma pluralidade de aberturas de recebimento alinhadas e uma pluralidade de aberturas de recebimento cobertas pode ser realizada pela fixação do dispositivo de retentor de tubo ao dispositivo de carregamento de acordo com a presente invenção. Começando a partir daí, os versados na técnica estão claramente cientes de como se configurar geometricamente o dispositivo de retenção de tubo a fim de cobrir as aberturas de recebimento específicas do dispositivo de carregamento, ao passo que simultaneamente outras aberturas de recebimento são liberadas, destravadas ou descobertas para poderem receber um tubo de amostra.

[0046] De acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção, o dispositivo de retenção de tubo compreende uma alça para ser agarrada por um usuário. A alça facilita a inserção e/ou remoção do dispositivo de retenção de tubo para dentro e/ou para fora do dispositivo de carregamento.

[0047] A fim de facilitar e/ou acelerar uma preparação de amostra PCR totalmente automatizada e configuração PCR, uma permuta automática dos dispositivos de retenção de tubo específicos de ensaio é fornecida pela presente invenção. Uma unidade de agarre pode ser configurada para permutar vários dispositivos de retenção de tubo específicos de ensaio e engata e desengata os mesmos respectivamente com o dispositivo de carregamento utilizado. Um reservatório de diferentes dispositivos de retentor de tubo pode ser compreendido pelo sistema apresentado.

[0048] De acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção, o dispositivo de retenção de tubo compreende um primeiro segmento de superfície de um primeiro ensaio PCR, e compreende uma segunda superfície de um segundo ensaio PCR. O primeiro segmento de superfície compreende uma pluralidade de aberturas de recebimento, e o segundo segmento de superfície compreende uma pluralidade de aberturas de recebimento. Assim, a primeira abertura de recebimento e a segunda abertura de recebimento, como previamente definidas, devem ser compreendidas como constituídas pelo primeiro e segundo segmentos de superfície da presente modalidade. Em outras palavras, o dispositivo de retenção de tubo fornece duas regiões separadas, onde cada região fornece tubos de amostra necessários para fornecer todos os reagentes para um ensaio específico.

[0049] De acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção, o primeiro segmento de superfície compreende pelo menos um código de cor indicando uma primeira cor de uma abertura de recebimento, e o segundo segmento de superfície compreende pelo menos um código de cor indicando um código de cores de uma abertura de recebimento, onde as primeira e segunda cores são iguais. Em geral, os primeiro e segundo segmentos podem compreender um elemento de codificação, como descrito aqui.

[0050] De acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção, os primeiro e segundo segmentos de ensaio PCR do dispositivo de retenção de tubo são dispostos um com relação ao outro de forma geométrica que é escolhida a partir do grupo que compreende: o primeiro segmento é um primeiro segmento do círculo e o segundo segmento é um segundo segmento do círculo, os primeiro e segundo segmentos são divididos em dispositivo de retenção de tubo circular por uma linha reta ou por uma linha curva passando por um centro do dispositivo de retenção de tubo circular, as aberturas de recebimento dos primeiro e segundo segmentos sendo simétricas a um ponto central do dispositivo de retenção de tubo, e qualquer combinação dos mesmos.

[0051] Por exemplo, a divisão reta entre os dois segmentos pode ser observada a partir da figura 1, ao passo que a divisão curva entre os primeiro e segundo segmentos pode ser observada a partir de, por exemplo, a figura 2 e a figura 11. A distribuição simétrica de ponto da distribuição de abertura de recebimento específica de ensaio como ilustrado, por exemplo, na figura 5, pode fornecer a possibilidade de percursos de pipetagem aperfeiçoados, que é descrita em maiores detalhes com relação à figura 5.

[0052] De acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção, cada abertura de recebimento do dispositivo de retenção de tubo é marcada com um código de cores.

[0053] De acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção, o dispositivo de retenção de tubo compreende pelo menos um dispositivo fixado para fixação liberável do dispositivo de retentor de tubo ao dispositivo de carregamento.

[0054] Os dispositivos de fixação, como, por exemplo, o uso de forças magnéticas ou roscas pode ser observado como no escopo dessa modalidade ilustrativa.

[0055] De acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção, os meios de fixação são configurados para serem inseridos em uma abertura de recebimento do dispositivo de carregamento para estabilizar a fixação do dispositivo de retenção de tubo no dispositivo de carregamento.

[0056] Em outra modalidade mais especificada, o dispositivo de fixação pode ser observado como elementos de protuberância estabilizadores. Protuberâncias de engate com recessos de engate correspondentes, como, por exemplo, aberturas de recebimento, no dispositivo de carregamento podem ser apresentados de acordo com essa modalidade ilustrativa.

[0057] De acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção, o sistema compreende uma cobertura que é configurada para cobrir simultaneamente o dispositivo de carregamento e o dispositivo de retenção de tubo.

[0058] De acordo com uma modalidade ainda mais especificada, um sistema com a cobertura é passível de autoclave e é fácil de ser descontaminado. Consequentemente, essa modalidade apresenta um sistema passível de autoclave com uma cobertura, um dispositivo de carregamento, e um dispositivo de retenção de tubo. A cobertura pode ser oticamente transparente ou oticamente não transparente. A cobertura pode evitar o transporte cruzado durante o processo de preparo de amostra PCR no sistema apresentado.

[0059] De acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção, a cobertura possui essencialmente um formato circular e é adaptada ao formato do dispositivo de retenção de tubo e/ou o formato do dispositivo de carregamento.

[0060] De acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção, o sistema compreende um scanner, onde o scanner é configurado para escanear pelo menos um elemento escolhido a partir do grupo que compreende a placa de elution, reagentes de extração, reagentes de ensaio, tubos de amostra e qualquer combinação dos mesmos. O scanner é configurado para transmitir dados escaneados para uma unidade de cálculo.

[0061] O scanner pode ser consubstanciado, por exemplo, como um scanner portátil. Em particular, o scanner pode ser configurado para escanear códigos de barra utilizados para transportar informação. Portanto, informação de amostra pode ser coletada pelo scanner através, por exemplo, de escaneamento de código de barra e pode ser transmitida para uma unidade de cálculo. A unidade de cálculo pode criar dados para um termociclador PCR em um formato de dados legível por termociclador. Isso pode acelerar adicionalmente o procedimento de PCR completo e pode resultar em um sistema de alto rendimento para o usuário.

[0062] De acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção, o sistema pode compreender a unidade de cálculo que é configurada para gerar informação de amostra em um formato de dados legíveis por termociclador.

[0063] Dessa forma, os dados de interface entre o sistema para o preparo de amostra PCR e para a configuração PCR por um lado e o termociclador por outro lado também são apresentados pela presente invenção.

[0064] De acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção, o sistema compreende o termociclador, onde o termociclador e a unidade de cálculo estão em comunicação um com o outro. O termociclador é configurado para realizar automaticamente um PCR em uma câmara de reação de PCR recebida com base na informação de amostra recebida no formato de dados legíveis por termociclador a partir da unidade de cálculo.

[0065] Assim, a comunicação sem ou com fio entre o termociclador e a unidade de cálculo pode ser utilizada de acordo com essa modalidade da presente invenção. Um sistema totalmente automatizado fornecendo o preparo de amostra PCR, a configuração PCR, e a realização de PCR total pode, dessa forma, ser apresentado pela presente invenção.

[0066] De acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção, o dispositivo de retenção de tubo recebe um ensaio específico com relação a uma distribuição geométrica das aberturas de recebimento.

[0067] De acordo com outra modalidade ilustrativa, o sistema compreende um primeiro dispositivo de retenção de tubo e um segundo dispositivo de retenção de tubo, onde os dispositivos de retenção de tubo são configurados de forma específica de ensaio respectivamente, e onde a configuração respectiva do primeiro dispositivo de retenção de tubo é diferente do segundo dispositivo de retenção de tubo com relação à distribuição de aberturas de recebimento.

[0068] De acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção, a primeira seção de recebimento é posicionada de forma centralizada no dispositivo de carregamento. Adicionalmente, o dispositivo de carregamento é adaptado para receber as câmaras de reação PCR na segunda seção de recebimento posicionada fora da posição central da primeira seção de recebimento. Adicionalmente, o dispositivo de retenção de tubo é configurado para um ensaio específico com relação à distribuição geométrica das aberturas de recebimento, de modo que os percursos de pipetagem reta de uma abertura de recebimento com um elemento de codificação para um tubo de amostra contendo uma concentração específica de uma molécula alvo em uma segunda seção de recebimento são facilitados. Adicionalmente, essa modalidade facilita essas aberturas de recebimento cobertas de forma cruzada de percursos de pipetagem do dispositivo de carregamento apenas.

[0069] Como pode ser observado a partir da figura 7, tal distribuição de aberturas de recebimento do dispositivo de retenção de tubo facilita o uso de percursos de pipetagem direta a partir das aberturas de recebimento na direção de uma região circunferencial do dispositivo de retenção de tubo, onde apenas as seções cobertas do dispositivo de carregamento abaixo são cruzadas. Os percursos de pipetagem são indicados na figura 7 por setas de linha tracejada. Isso pode aumentar adicionalmente o nível de segurança da realização do preparo de amostra PCR e configuração PCR com o sistema apresentado. Aberturas de recebimento não utilizadas e cobertas do dispositivo de carregamento não são contaminadas durante o procedimento de pipetagem no caso de percursos de pipetagem serem escolhidos como ilustrado na figura 7.

[0070] De acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção, o dispositivo de retenção de tubo compreende uma pluralidade de aberturas de recebimento nas quais um recebimento pretendido de um tubo de amostra contendo uma concentração específica de uma molécula alvo é indicado respectivamente. Isso pode ser verdadeiro para pelo menos uma parte da pluralidade de aberturas de recebimento. As posições das aberturas de recebimento são configuradas de modo que um percurso entre uma região central do dispositivo de retenção de tubo, e uma região de borda do dispositivo de retenção de tubo cruze as aberturas de recebimento, de um recebimento pretendido de um tubo de amostra com uma concentração específica de uma molécula alvo é indicado, a partir da concentração baixa para a concentração alta.

[0071] No contexto da presente invenção, o termo "região de borda"não deve ser compreendido como uma borda estar necessariamente compreendida. Uma "região de borda"também pode ser compreendida como uma região periférica ou uma região limítrofe.

[0072] Para essa e todas as outras modalidades da presente invenção tal indicação pode ser feita por um elemento de codificação, uma abreviação ou um código de cores como descrito aqui. Essa modalidade ilustrativa será descrita em maiores detalhes com relação à modalidade da figura 5. Essa modalidade também pode reduzir vantajosamente o risco de contaminação de um segmento de superfície do sistema da presente invenção durante um processo de configuração PCR.

[0073] De acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção, o dispositivo de retenção de tubo compreende uma primeira abertura de recebimento na qual um recebimento pretendido de um tubo de amostra com uma primeira concentração de molécula alvo é indicado. O dispositivo de retenção de tubo compreende uma segunda abertura de recebimento na qual um recebimento pretendido de um tubo de amostra com uma segunda concentração de uma molécula alvo é indicado. Adicionalmente, as primeira e segunda aberturas de recebimento são posicionadas com relação uma à outra, de modo que os percursos de pipetagem retos de uma região central para uma região de borda do dispositivo de retenção de tubo sejam facilitados, percursos esses que passam as primeira e segunda aberturas de recebimento das concentrações baixas para altas.

[0074] Consequentemente, em uma modalidade ilustrativa adicional da invenção, um primeiro dispositivo de retenção de tubo é removido do dispositivo de carregamento e é substituído por um segundo dispositivo de carregamento a fim de facilitar uma configuração PCR adicional com exigências diferentes. Consequentemente, nessa e em todas as outras modalidades ilustrativas da invenção, o dispositivo de carregamento pode ser combinado com uma pluralidade de dispositivos de retenção de tubo diferentes.

[0075] De acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção, um método de preparo de um PCR é apresentado. O método compreende as etapas de fornecimento de um dispositivo de carregamento, fornecendo um dispositivo de retentor de tubo e fixando o dispositivo de retentor de tubo ao dispositivo de carregamento. Adicionalmente, o dispositivo de carregamento configurado para receber os tubos de amostra para configuração de uma PCR e o dispositivo de carregamento compreendem uma primeira seção de recebimento. A primeira seção de recebimento compreende pelo menos uma primeira e uma segunda aberturas de recebimento onde a primeira abertura de recebimento e a segunda abertura de recebimento são adaptadas para receber, respectivamente um tubo de amostra.

[0076] De acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção, o dispositivo de retenção de tubo compreende pelo menos uma primeira abertura de recebimento. O método dessa modalidade compreende adicionalmente a etapa de alinhamento da abertura de recebimento do dispositivo de retenção de tubo com uma dentre a primeira abertura de recebimento e a segunda abertura de recebimento do dispositivo de carregamento e, dessa forma, cobrindo simultaneamente a outra das primeira e segunda aberturas de recebimento. O método apresentado da presente invenção facilita a cobertura de seções de recebimento não utilizadas por meio da fixação do dispositivo de retentor de tubo ao dispositivo de carregamento. Adicionalmente, o método pode fazer uso da indicação de tipos de reagente específicos de ensaio, por exemplo, por rótulos coloridos ou por outros indicadores de cor. A combinação do dispositivo de retentor de tubo com o dispositivo de carregamento permite a colocação simultânea dos tubos de amostra e permite a remoção simultânea de tubos de amostra em particular de todos os tubos utilizados do dispositivo de carregamento.

[0077] De acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção, o método compreende adicionalmente as etapas de fixação removível de um tubo de amostra ao dispositivo de retenção de tubo e inserção do tubo de amostra a uma abertura de recebimento do dispositivo de carregamento pela fixação do dispositivo de retenção de tubo ao dispositivo de carregamento.

[0078] Em outras palavras, a distribuição espacial das aberturas de recebimento do dispositivo retentor de tubo é adaptada à distribuição espacial das aberturas de recebimento do dispositivo de carregamento e é baseada nas exigências do ensaio quanto ao qual a placa de retentor de tubo é dedicada. A etapa de fixação pode ser realizada por um usuário ou por um dispositivo automatizado.

[0079] De acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção, o método compreende adicionalmente a etapa de separar simultaneamente o dispositivo retentor de tubo e o tubo de amostra recebido pelo dispositivo de carregamento do dispositivo de carregamento agarrando-se o dispositivo retentor de tubo e removendo o dispositivo retentor de tubo do dispositivo de carregamento.

[0080] Em outras palavras, todos os tubos de amostra utilizados dentro do dispositivo de carregamento podem ser removidos de uma vez agarrando-se o dispositivo retentor de tubo e movendo o mesmo para longe do dispositivo de carregamento. Portanto, uma automação de colocação aperfeiçoada é fornecida pela presente invenção.

[0081] De acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção, o método compreende a etapa de remover simultaneamente uma primeira pluralidade de tubos de amostra para um primeiro ensaio PCR e uma segunda pluralidade de tubos de amostra para um segundo ensaio PCR do dispositivo de carregamento agarrando-se o dispositivo retentor de tubo e removendo o dispositivo retentor de tubo do dispositivo de carregamento.

[0082] Essa modalidade enfatiza as capacidades de alto rendimento do método apresentado, visto que uma pluralidade de ensaios PCR pode ser preparada simultaneamente e todos os tubos de amostra necessários podem ser removidos de uma vez. Essa modalidade não está limitada a um primeiro e um segundo ensaios PCR, mas pode ser estendida para um número maior de ensaios PCR.

[0083] De acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção, o método compreende a etapa de inserção de um elemento protuberante estabilizador do dispositivo retentor de tubo em uma abertura de recebimento do dispositivo de carregamento durante a fixação do dispositivo retentor de tubo no dispositivo de carregamento.

[0084] A fim de se estabilizar a fixação do dispositivo retentor de tubo no dispositivo de carregamento, elementos protuberantes estabilizantes podem ser utilizados. Como um comentário geral, deve-se notar que o dispositivo de fixação geral pode ser fornecido que, durante a fixação do dispositivo retentor de tubo ao dispositivo de carregamento cria a fixação através de, por exemplo, uma conexão integral, encerramento ou através de, por exemplo, roscas ou elementos de engate correspondentes.

[0085] De acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção, o método compreende a etapa de cobrir aberturas de recebimento não utilizadas do dispositivo de carregamento pelo dispositivo de retenção de tubo.

[0086] Pode ser observado como um aspecto importante da invenção que simultaneamente outra abertura de recebimento além da abertura de recebimento coberta do dispositivo de carregamento é descoberta, isso é, alinhada com uma abertura de recebimento do dispositivo de retenção de tubo.

[0087] De acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção, o dispositivo de retenção de tubo compreende pelo menos uma primeira abertura possuindo um código de cor indicando uma primeira cor e uma segunda abertura possuindo um código de cor indicando uma segunda cor. O método da modalidade apresentada compreende as etapas de fornecimento de um tubo de amostra com um código de cor indicando uma terceira cor, selecionando a abertura de recebimento do dispositivo de retenção de tubo que possui a mesma cor que o código de cor do tubo de amostra e inserindo o tubo de amostra dentro da abertura de recebimento selecionada do dispositivo de retenção de tubo.

[0088] Em outras palavras, com base em uma comparação de cor, a abertura de recebimento correta do dispositivo de carregamento para o processo do preparo de amostra é identificada.

[0089] De acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção, o método compreende a etapa de cobrir o dispositivo de carregamento e o dispositivo de retenção de tubo e tubos de amostra inseridos pela colocação de uma cobertura no dispositivo de carregamento, o dispositivo de retenção de tubo, e os tubos de amostra inseridos.

[0090] Se desejado, a capacidade de autoclave pode ser alcançada por esse processo de cobertura. Em outras palavras, o sistema apresentado pode ser localizado em um autoclave para realizar a descontaminação. Se desejado, o dispositivo de carregamento e o dispositivo de retenção de tubo e a cobertura podem ser configurados para suportar alta pressão de vapor saturado a aproximadamente 121 C por cerca de 15 a 20 minutos, o que é típico para um autoclave.

[0091] De acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção, o método compreende a etapa de escaneamento de dados de pelo menos um elemento, escolhido a partir do grupo que compreende placa de elution, reagentes de extração, reagentes de ensaio, tubos de amostra, e qualquer combinação dos mesmos. O método também compreende a etapa de transmissão de dados escaneados para uma unidade de cálculo para fins de PCR.

[0092] O sistema da presente invenção pode reconhecer e configurar a reação PCR desejada no dispositivo de carregamento ao qual o dispositivo de retenção de tubo foi disposto. Uma comunicação sem fio ou com fio pode ser fornecida entre um scanner, por exemplo, um scanner portátil, e uma unidade de cálculo que pode ser compreendida pelo sistema, ou que também pode ser compreendida por um computador que está em comunicação com o sistema da presente invenção. A unidade de cálculo em qualquer caso pode ser fornecida em comunicação com um termociclador e unidade essa que pode gerar informação de amostra em um formato de dados legíveis por termociclador. Esses dados no formato de dados legíveis por termociclador podem ser transmitidos para o termociclador para iniciar a PCR. Adicionalmente, a realização de uma PCR em uma câmara de reação PCR recebida pelo termociclador com base na informação de amostra recebida no formato de dados legíveis por termociclador pode ser observada como outra modalidade ilustrativa da invenção. Aspectos adicionais relacionados com essa modalidade podem ser observados a partir das figuras 19 e 20.

[0093] De acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção, o método compreende a etapa de indicação em cada abertura de recebimento do dispositivo de retenção de tubo qual substância respectiva deve ser posicionada na abertura de recebimento respectiva.

[0094] Isso pode ser feito por um elemento de codificação. Essa modalidade garante que a configuração ou adaptação específica de ensaio de um dispositivo de retenção de tubo seja seguida pelo usuário. Em particular, o usuário reconhecerá a indicação fornecida no dispositivo de retenção de tubo e pode facilmente inserir o tubo de amostra correspondente na abertura de recebimento de forma à prova de falha. Em outras palavras, um mecanismo à prova de falhas para o usuário é apresentado, por meio do qual o usuário é orientado através do processo de inserção de todos os tubos de amostra necessários no dispositivo de carregamento.

[0095] De acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção, a primeira seção de recebimento é posicionada de forma centralizada no dispositivo de carregamento. Essa modalidade compreende a etapa de recebimento de câmaras de reação PCR pelo dispositivo de carregamento na segunda seção de recebimento posicionada externa a posição central da primeira seção de recebimento. Adicionalmente, o método apresentado compreende a etapa de pipetagem ao longo de um percurso reto de uma abertura de recebimento com um elemento de codificação para um tubo de amostra contendo uma concentração específica de uma molécula alvo para dentro da segunda seção de recebimento, percurso esse que cruza as aberturas de recebimento cobertas do dispositivo de carregamento apenas.

[0096] Essa modalidade vantajosa da presente invenção pode ser observada a partir da figura 7 a seguir. A configuração das aberturas de recebimento do dispositivo de retenção de tubo é fornecida de tal forma que a pipetagem desejada ao longo do percurso reto na direção das câmaras de reação PCR recebidas na segunda seção circunferencial é facilitada.

[0097] De acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção, o método compreende as etapas de indicação em uma pluralidade de aberturas de recebimento do dispositivo de retenção de tubo de um recebimento pretendido de um tubo de amostra contendo uma concentração específica de uma molécula alvo, respectivamente. Adicionalmente, a etapa de pipetagem ao longo de um percurso entre uma região central do dispositivo de retenção de tubo e uma região com borda do dispositivo de retenção de tubo e, dessa forma, cruzando as aberturas de recebimento onde um recebimento pretendido de um tubo de amostra com uma concentração específica da molécula alvo é indicado é realizada a partir da baixa concentração para a alta concentração.

[0098] Em outras palavras, esse método garante que os percursos de pipetagem sejam escolhidos em combinação com o dispositivo de retenção de tubo subjacente com sua distribuição de abertura específica de ensaio de modo que o cruzamento de um tubo de amostra com uma concentração menor de molécula alvo em comparação com a concentração onde o processo de pipetagem começou seja evitado.

[0099] De acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção, o método compreende as etapas de indicação em uma primeira abertura de recebimento do dispositivo de retenção de tubo de um recebimento pretendido de um tubo de amostra com uma primeira concentração de uma molécula alvo, indicando em uma segunda abertura de recebimento do dispositivo de retenção de tubo um recebimento pretendido de um tubo de amostra com uma segunda concentração de uma molécula alvo, e fornecendo as primeira e segunda aberturas de recebimento no dispositivo de retenção de tubo nas posições relativas uma à outra, de modo que os percursos de pipetagem reta de uma região central para uma região com borda do dispositivo de retenção de tubo sejam facilitados a partir das concentrações de molécula alvo de baixa para alta.

[00100] De acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção, o uso do dispositivo de retenção de tubo como definido em uma das modalidades previamente definidas para a configuração PCR é apresentado.

[00101] Esses e outras características da invenção se tornarão aparentes a partir de e elucidadas com referência às modalidades descritas posteriormente. De acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção, um elemento de programa de computador para preparo de amostra PCR e para a configuração PCR que, quando é executada por um processador, é adaptada para realizar as etapas como descrito aqui e nas reivindicações.

[00102] O elemento de programa de computador apresentado aqui pode ser parte de um programa de computador, mas também pode ser todo o programa propriamente dito. Por exemplo, o elemento de programa de computador pode ser utilizado para atualizar um programa de computador já existente para se chegar à presente invenção. O meio legível por computador pode ser observado como um meio de armazenamento, tal como, por exemplo, um USB, um CD, um DVD, um dispositivo de armazenamento de dados, um disco rígido, ou qualquer outro meio no qual um elemento de programa como o descrito acima possa ser armazenado.

Breve descrição dos desenhos

[00103] As modalidades ilustrativas da invenção serão descritas nos desenhos a seguir.

[00104] As figuras 1 e 2 ilustram de forma esquemática diferentes sistemas para a preparação de amostra PCR e para configuração PCR de acordo com as modalidades ilustrativas da invenção.

[00105] A figura 3 ilustra esquematicamente um dispositivo de carregamento que pode ser utilizado para uma preparação de amostra PCR e para configuração PCR de acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção.

[00106] As figuras de 4 a 7 ilustram de forma esquemática diferentes sistemas para a preparação de amostra PCR e para a configuração PCR de acordo com as modalidades ilustrativas da invenção.

[00107] A figura 8 ilustra esquematicamente um sistema com uma cobertura de acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção.

[00108] A figura 9 ilustra de forma esquemática um dispositivo de retenção de tubo que pode ser utilizado para a configuração PCR e para a preparação de amostra PCR de acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção.

[00109] As figuras de 10 a 16 ilustram de forma esquemática diferentes sistemas para a preparação de amostra PCR e para a configuração PCR de acordo com as modalidades ilustrativas da invenção.

[00110] A figura 17 ilustra de forma esquemática um dispositivo de escalonamento que pode ser utilizado em combinação com a presente invenção.

[00111] A figura 18 ilustra de forma esquemática uma rascunho do sistema automatizado conhecido para preparação de amostra PCR apenas.

[00112] As figuras 19 e 20 ilustram de forma esquemática diferentes sistemas para a preparação de amostra PCR e para a configuração PCR de acordo com as modalidades ilustrativas da invenção.

[00113] As figuras de 21 a 24 ilustram de forma esquemática os fluxogramas de diferentes métodos de diferentes modalidades ilustrativas da invenção.

[00114] A princípio, partes idênticas são fornecidas com os mesmos símbolos de referência nas figuras.

Descrição detalhada das modalidades

[00115] A figura 1 ilustra de forma esquemática um sistema 100 para a preparação de amostra PCR e para a configuração PCR. O sistema 100 compreende um dispositivo de carregamento 101 para receber tubos de amostra 102 para configuração de uma PCR. O dispositivo de carregamento compreende uma primeira seção de recebimento, onde a primeira seção de recebimento compreende pelo menos uma primeira abertura de recebimento e uma segunda abertura de recebimento. Na figura 1, o dispositivo de retenção de tubo 103 é ilustrado na posição fixada ao dispositivo de carregamento, de modo que a primeira abertura de recebimento e a segunda abertura de recebimento do dispositivo de carregamento não são ilustradas aqui. No entanto, as primeira e segunda aberturas de recebimento são respectivamente adaptadas para receber um tubo de amostra. Como pode ser observado na figura 1, uma grande pluralidade de aberturas de recebimento 105 da placa de retenção de tubo 104 é constituida. Cada abertura de recebimento 105 da placa de retenção de tubo 104 é ilustrada com um tubo de amostra recebido e inserido 102. Como pode ser observado a partir de duas partes divididas da placa de retenção de tubo 104, uma primeira pluralidade de tubos de amostra para um primeiro ensaio de PCR 108 é apresentada no lado direito. Adicionalmente, uma segunda pluralidade de tubos de amostra para um segundo ensaio de PCR 109 é apresentada no lado esquerdo da figura 1. Todos os tubos de amostra são fixados de forma removível ao dispositivo de retenção de tubo por meio da abertura de recebimento respectiva.

[00116] Adicionalmente, a placa retentora de tubo compreende um código de cores 110 como uma modalidade de um elemento de codificação para indicar a finalidade relacionada com PCR da abertura de recebimento da placa de retentor de tubo. Devido à ilustração em preto e branco das figuras ilustradas aqui, a cor não pode ser vista. Por exemplo, uma cor diferente para cada abertura de recebimento pode ser utilizada. Adicionalmente, uma cor diferente para cada abertura de recebimento pode ser utilizada, mas as aberturas de recebimento de diferentes segmentos de ensaio 108, 109, mas a mesmo tubo, isso é, a amostra correspondente, pode utilizar a mesma cor. Adicionalmente ou alternativamente, a informação pode ser codificada pela utilização de tipos diferentes de símbolos. Por exemplo, na figura 1, linhas pontilhadas, linhas pontilhadas e tracejadas além de linhas tracejadas diferentes com distâncias diferentes entre as linhas são ilustradas como modalidades ilustrativas de elementos de codificação. Se desejável, podem ser utilizadas todas em uma cor, mas também cores diferentes, como descrito acima, podem ser utilizadas. O mesmo é verdadeiro para as figuras 2, 4, 5, 6, 7 e 9 a 16. Nessa modalidade, o dispositivo de carregamento 101 é consubstanciado como um thermorack PCR 111. Adicionalmente, o dispositivo de carregamento ilustrado compreende uma segunda seção de recebimento recebendo uma pluralidade de câmaras de reação PCR 113. Nessa modalidade, um fornecimento circular de uma pluralidade de câmaras de reação PCR é apresentado.

[00117] Adicionalmente, a placa de retenção de tubo 104 da figura 1 compreende um elemento de codificação em cada abertura de recebimento para indicar quais substâncias devem ser posicionadas na abertura de recebimento respectiva por meio do tubo de amostra. Com pode ser observado a partir da figura 1, as abreviações ilustrativas são marcadas na placa de retenção de tubo, como "EC PPM" para mistura de primer e sonda de controle de extração, "PC" para controle positivo, "PPM" para mistura de primer e sonda e/ou "QS" para padrão quantitativo. No entanto, essas abreviações são apenas modalidades ilustrativas dos elementos de codificação utilizados nas aberturas de recebimento da placa de retentor de tubo. Adicionalmente, pode ser observado a partir da figura 1 que o dispositivo de carregamento e o dispositivo de retenção de tubo possuem um formato circular 112.

[00118] A figura 2 ilustra outro sistema 100 para a preparação de amostra PCR e para a configuração PCR de acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção. O dispositivo de carregamento 101 é ilustrado com uma pluralidade de aberturas de recebimento, como a primeira abertura de recebimento 201 e a segunda abertura de recebimento 202. Adicionalmente, o dispositivo de retenção de tubo 103 também é ilustrado com uma pluralidade de aberturas de recebimento 105. Por meio de um movimento descendente, o dispositivo de retenção de tubo é fixável ao dispositivo de carregamento de modo que a abertura de recebimento 105 do dispositivo de retenção de tubo seja alinhada com pelo menos uma dentre a primeira abertura de recebimento 201 e a segunda abertura de recebimento 202 do dispositivo de carregamento e cobre simultaneamente a outra das primeira e segunda aberturas de recebimento do dispositivo de carregamento. Além disso, modalidades ilustrativas adicionais das aberturas de recebimento 215 a 217 do dispositivo de retenção de tubo são ilustradas. Adicionalmente, um tubo de amostra 102 é apresentado na figura 2 que pode ser inserido no dispositivo de retenção de tubo e simultaneamente inserido no dispositivo de retenção devido à fixação de ambos os elementos. O diâmetro 205, 208 das aberturas de recebimento 105 do dispositivo de retenção de tubo é maior do que o diâmetro 206 do tubo de amostra 102. Adicionalmente, o diâmetro 205, 208 das aberturas de recebimento 105 do dispositivo de retenção de tubo é menor do que o diâmetro 207 do colar 214 do tubo de amostra. Portanto, um engate entre o dispositivo de retenção de tubo e o tubo de amostra é realizado devido à inserção. Adicionalmente, um código de cor 110 para indicar uma finalidade relacionada com PCR da abertura de recebimento do dispositivo de retenção de tubo 103 é ilustrado na figura 2. O código de cor é uma superfície colorida 209 do dispositivo de retenção de tubo. Os códigos de cor são ilustrados aqui simbolicamente como superfícies circulares indicadas por diferentes linhas tracejadas e linhas pontilhadas e tracejadas. Dessa forma, diferentes sombreamentos ou hatchings são utilizados. Aqui, diferentes linhas representam um tipo de elemento de codificação, isso é, uma cor. No entanto, um anel circunferencial em torno da abertura de recebimento respectiva pode ser uma modalidade de tal código de cor da presente invenção. Alternativamente, se desejado, as aberturas de recebimento podem compreender tampas ou folhas elásticas com cortes de modo que os tubos de amostra possam ser inseridos. Nessa modalidade, as superfícies circulares com diferentes sombreamentos representam tampas ou folhas de cores diferentes.

[00119] O sistema 100 da figura 2 compreende primeiro e segundo segmentos de ensaio PCR 210, 211 do dispositivo de retenção de tubo, e são dispostos um com relação ao outro de forma geométrica, de modo que os primeiro e segundo segmentos sejam divididos por uma linha curva 212 passando por um centro 213 do dispositivo de retenção de tubo circular. O primeiro segmento de superfície 210 e um segundo segmento de superfície 211 compreendem, respectivamente, uma pluralidade de aberturas de recebimento. A superfície colorida 209 como um código de cor pode ser fornecida de várias formas na abertura de recebimento respectiva. O dispositivo de carregamento 101 está na modalidade da figura 2 consubstanciado como um thermorack PCR 111. Na modalidade da figura 2, uma primeira abertura de recebimento 201 será alinhada com a abertura de recebimento 105 da placa de retenção de tubo 103 quando são fixadas juntas. Ademais, a segunda abertura de recebimento 202 será coberta pelo dispositivo de retenção de tubo. O mesmo é verdadeiro para aberturas de recebimento adicionais 202a e 202b que também são cobertas na posição fixada. No estado que é ilustrado na figura 2 onde o dispositivo de retenção de tubo ainda não está fixada ao dispositivo de carregamento, a primeira seção de recebimento 200 pode ser observada. Adicionalmente, uma pluralidade de câmaras de reação PCR 113 é ilustrada em uma região circunferencial do dispositivo de carregamento 101.

[00120] A figura 3 ilustra de forma esquemática um dispositivo de carregamento 101 que pode ser utilizado para a preparação de amostra PCR e para configuração PCR em combinação com várias modalidades da presente invenção. O dispositivo de carregamento 101 é consubstanciado como um thermorack para fins de PCR 111. A vista superior da figura 3 no dispositivo de carregamento permite uma vista dentro da região circunferencial na qual uma pluralidade de câmaras de reação de PCR 113 podem ser posicionadas. A primeira seção de recebimento 200 é ilustrada na figura 3. A primeira seção de recebimento 200 compreende a primeira abertura de recebimento 201 e a segunda abertura de recebimento 202. Dependendo da configuração do dispositivo de retenção de tubo específico de ensaio utilizado, ainda mais do que as 30 aberturas de recebimento ilustradas do dispositivo de carregamento 101 podem ser observadas do primeiro tipo de aberturas de recebimento e do segundo tipo de aberturas de recebimento. A princípio, o primeiro tipo de aberturas de recebimento é um que é alinhado com outra abertura de recebimento do dispositivo de retenção de tubo em uma posição anexada. O segundo tipo de aberturas de recebimento é um que é coberto pelo dispositivo de retenção de tubo. Isso é aplicável para todas as modalidades apresentadas aqui. Isso pode ser observado, por exemplo, a partir da figura 15 a seguir onde 12 aberturas de recebimento do dispositivo de carregamento são alinhadas com as aberturas de recebimento correspondentes do dispositivo de retenção de tubo. As aberturas de recebimento restantes do dispositivo de carregamento são cobertas pelo dispositivo de retenção de tubo. Como pode ser percebido a partir da numeração da região circunferencial, 72 câmaras de reação PCR podem ser localizadas em torno da primeira seção de recebimento 200. No entanto, o número de 72 é apenas uma modalidade ilustrativa e pode ser maior ou menor se desejado pelo usuário. Adicionalmente, as 30 aberturas de recebimento da figura 3 do dispositivo de carregamento ilustrado 101 podem ser configuradas para receber tubos de amostra de, por exemplo, 1,5 ml e/ou 0,5 ml. Adicionalmente, outros tubos de amostra também podem ser recebidos por aberturas de recebimento de mesmo formato ou de formatos diferentes.

[00121] De acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção, a figura 4 ilustra um sistema 100 para a preparação de amostras PCR e para a configuração de PCR com um dispositivo de retenção de tubo 103 que pode ser utilizado para um ensaio ou também para dois ensaios diferentes. Explicações referentes às abreviações PC, PPM, EC PPM, QS e outras apresentadas acima se aplicam mutatis mutandis também à figura 4. O dispositivo de carregamento 101 é ilustrado em uma configuração anexada com o dispositivo de retenção de tubo 103. O primeiro segmento de superfície 210 e o segundo segmento de superfície 211 são dispostos simetricamente com relação ao ponto central 213 do dispositivo de retenção de tubo circular 103. Os segmentos são separados por linha curva 212. Como pode ser percebido a partir da parte inferior da figura 4, a abertura de recebimento 105 do dispositivo de retenção de tubo é alinhada com a primeira abertura de recebimento 201 do dispositivo de carregamento 101. Em contraste com isso, a segunda abertura de recebimento 202 é coberta 405 pela superfície do dispositivo de retenção de tubo. A segunda abertura de recebimento é indicada apenas por uma linha tracejada. A característica de que o dispositivo de retenção de tubo cobre simultaneamente a segunda abertura de recebimento do dispositivo de carregamento é apresentada com o sinal de referência 405. Adicionalmente, o primeiro segmento de superfície 210 compreende pelo menos um código de cores 400 indicando uma primeira cor de uma abertura de recebimento do dispositivo de retenção de tubo. O segundo segmento compreende pelo menos um código de cor 401 indicando uma segunda cor de uma abertura de recebimento do dispositivo de retenção de tubo. Adicionalmente, as primeira e segunda cores são iguais. Códigos de cores adicionais 402 a 404 são ilustrados na figura 4.

[00122] A figura 5 apresenta outra modalidade ilustrativa de um sistema 100 de acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção. Um dispositivo de carregamento 101 é fornecido com uma pluralidade de câmaras de reação PCR 113. Adicionalmente, o primeiro segmento de superfície 210 e o segundo segmento de superfície 211, como já descrito com relação às figuras descritas precisamente, são apresentados. Como pode ser percebido a partir da figura 5, o dispositivo de retenção de tubo 103 compreende uma pluralidade de aberturas de recebimento onde um recebimento pretendido de um tubo de amostra contendo uma concentração específica de uma molécula alvo é indicado, respectivamente. Isso é indicado pelas abreviações QS1, QS2, QS3, QS4, e QS5. Essa abreviação significa o padrão quantitativo. As posições das aberturas de recebimento são configuradas no dispositivo de retenção de tubo ilustrado de modo que um percurso de pipetagem 500 de uma região central do dispositivo de retenção de tubo na direção de uma região de borda do dispositivo de retenção de tubo, isso é, onde as câmaras de PCR 113 são posicionadas, cruze apenas as aberturas de recebimento, onde um recebimento pretendido de um tubo de amostra com uma concentração específica de uma molécula alvo é indicado, a partir da baixa concentração para alta concentração. Isso pode aumentar adicionalmente a confiabilidade e capacidade de reprodução do ciclo PCR realizado subsequentemente. Em outras palavras, a modalidade apresentada da figura 5 posiciona as aberturas de recebimento para os tubos de amostra de solução de molécula alvo especificamente concentradas, de modo que os percursos de pipetagem direta 500 na direção das câmaras de reação PCR 113 sejam facilitados de tal forma que quando da pipetagem de um tubo de amostra com uma molécula alvo especificamente concentrada, apenas outros tubos de amostra com uma concentração mais alta são cruzados durante a pipetagem. Portanto, QS cruzará apenas de baixo para alto. Isso pode minimizar a contaminação cruzada durante a configuração PCR. Isso é uma vantagem da presente invenção. Em um aspecto adicional da presente invenção, um sistema com tal dispositivo de retenção de tubo e um programa de pipetagem realizando ou causando a pipetagem ao longo dos ditos percursos de pipetagem como descrito aqui em várias modalidades é apresentado.

[00123] Aí, o termo "de uma região central na direção de uma região de broca do dispositivo de retenção de tubo" deve ser compreendido como descrevendo os percursos de pipetagem direta que são movimentos externos diretos; começando, dessa forma, em uma primeira posição radial e terminando em uma segunda posição radial, onde a primeira posição radial é mais central do que a segunda posição radial.

[00124] De acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção, a figura 6 também ilustra um sistema 100 compreendendo um dispositivo de carregamento 101 e um dispositivo de retenção de tubo 103. Uma pluralidade de câmaras de reação PCR 113 pode ser localizada em uma seção que está externa a seção central. As primeiras aberturas de recebimento 201a a 201b são ilustradas. Adicionalmente, as segundas aberturas de recebimento 202, 202a a 202d também são ilustradas na figura 5. Dois alinhamentos ilustrativos são ilustrados com sinais de referência 105a, 201a, 105b e 201b, onde dois pares de aberturas de recebimento são alinhados quando o dispositivo de retenção de tubo 103. A modalidade apresentada pode, por exemplo, ser utilizada para ensaios onde o mesmo ensaio é utilizado em todas as 72 câmaras de reação PCR.

[00125] A figura 7 ilustra de forma esquemática um sistema 100 para a preparação de amostra PCR e configuração PCR que entre outras coisas compreende um dispositivo de carregamento 101 e uma placa de retenção de tubo 104. A primeira seção de recebimento do dispositivo de carregamento 101 é posicionada de forma centralizada, e as câmaras de reação PCR 113 são recebidas pelo dispositivo de carregamento em uma segunda seção de recebimento que é posicionada externa a posição central da primeira seção de recebimento. A configuração ilustrada da placa de retenção de tubo 104 facilita a pipetagem ao longo de percursos retos 500 a partir de uma abertura de recebimento com um elemento de codificação para um tubo de amostra contendo uma concentração específica de uma molécula alvo dentro da segunda seção de recebimento, percursos esses que apenas cruzam as aberturas de recebimento cobertas do dispositivo de carregamento. As aberturas de recebimento que são cobertas são ilustradas de forma ilustrativa com referência 600 e 601.

[00126] A figura 8 ilustra outra modalidade ilustrativa de um sistema 100 que compreende um dispositivo de carregamento 101, tubos de amostra 102, que são recebidos pelo dispositivo de retenção de tubo 103 no qual uma cobertura 801 pode ser localizada simultaneamente. A segunda seção de recebimento 800 é configurada para receber uma pluralidade de câmaras de reação PCR 113. A primeira seção de recebimento 200 alonga de forma circular e compreende uma pluralidade de seções de recebimento para receber os tubos de amostra 102. Devido a um movimento descendente indicado pela seta 802, a fixação do dispositivo de retenção de tubo 103 ao dispositivo de carregamento 101 e a cobertura são completadas. Como pode ser observado a partir da figura 8, a cobertura 801 compreende recessos em sua parede que correspondem às protuberâncias do dispositivo de carregamento 101. Os recessos e protuberâncias são configurados para engatar um ao outro, isso pode aperfeiçoar adicionalmente o encerramento ou possibilidade de travamento do dispositivo 100.

[00127] A figura 9 ilustra de forma esquemática um dispositivo de retenção de tubo 103 que compreende uma pluralidade de aberturas de recebimento para uma configuração PCR com base em dois ensaios. Uma pluralidade de superfícies coloridas 209 e constituida como códigos coloridos no dispositivo de retenção de tubo 103. Adicionalmente, meios de fixação 900, consubstanciados aqui como protuberâncias radiais, são compreendidos a fim de permitir a fixação do dispositivo no dispositivo de carregamento. Ademais, elementos de protuberância estabilizadores 901 a 904 são ilustrados configurados para serem inseridos em uma abertura de recebimento do dispositivo de carregamento para estabilizar a fixação do dispositivo de retenção de tubo 103 no dispositivo de carregamento (não ilustrado na figura 9).

[00128] A figura 10 ilustra um sistema 100 para a apresentação de amostra PCR e para a configuração PCR de acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção. Um dispositivo de carregamento 101 é apresentado na figura 10 além de um dispositivo de retenção de tubo 103. A pluralidade de câmaras PCR 113 é simbolicamente ilustrada pelos números 1, 24, 36, 48, 55, 60 e 72. Essa modalidade do dispositivo de retenção de tubo é configurada para ser utilizada simultaneamente para dois ensaios que são iguais. Em particular, um elemento de codificação "M1" para uma mistura de primer e sonda é compreendido, um elemento de codificação "M2" para uma mistura principal é compreendido, um elemento de codificação "M3" para a mistura RT ou manganês é compreendido, onde um elemento de codificação "PC" para o controle positivo é compreendido, onde um elemento de codificação "NC" para o controle negativo é compreendido, e onde um elemento de codificação "QS" para o padrão de quantificação é compreendido pelo dispositivo de retenção de tubo apresentado. Os códigos de cores respectivos podem ser utilizados que são diferentes para "M1", "M2", "M3", "PC", "NC", e "QS". No entanto, diferentes aberturas de recebimento de padrão de quantificação para o recebimento de concentrações diferentes de moléculas alvo podem ser indicadas com a mesma cor, mas com diferentes abreviações específicas de abertura adicionais. Em outras palavras, a modalidade apresentada pode ser fornecida com cinco aberturas de recebimento "QS" onde os tubos de amostra com uma concentração específica de moléculas alvo devem ser inseridos, onde as ditas aberturas são todas codificadas com um código de cor como o elemento de codificação possuindo ou indicando a mesma cor.

[00129] A figura 11 ilustra outra sistema 100 compreendendo um dispositivo de retenção de tubo para um ensaio ou também para dois ensaios diferentes. Como pode ser observado na figura 11, o dispositivo de retenção de tubo 103 fornece uma distribuição espacial de suas aberturas de recebimento que é simétrica ao ponto central 113. Adicionalmente, o primeiro segmento de superfície 210 e o segundo segmento de superfície 211, que indicam o espaço respectivo para dois ensaios diferentes, são ilustrados na figura 1. A linha em forma curva e de S 1101 divide os dois segmentos. A simetria pontual 1100 pode ser facilmente percebida a partir da vista superior da figura 11. Adicionalmente, as abreviações M1, M2, M3, PC, NC e QS são utilizadas de forma similar à descrita previamente na figura 10.

[00130] A figura 12 descreve outro sistema 100 para a preparação de amostra PCR e para a configuração PCR compreendendo um dispositivo de carregamento para o recebimento de tubos de amostra e um dispositivo de retenção de tubo 103 para ser fixado ao dispositivo de carregamento. Nessa vista superior da figura 12, o alinhamento das aberturas de recebimento 105a e 105b do dispositivo de retenção de tubo 103 com as aberturas de recebimento correspondentes 201a e 201b do dispositivo de carregamento é ilustrado. Adicionalmente, pode ser observado que as segundas aberturas de recebimento cobertas 202a e 202b são ilustradas como alusões, visto que são cobertas pelo plano do dispositivo de retenção de tubo. Tais alusões também são ilustradas nas figuras 4, 5, 6, 7, 10 e 11, no entanto, é claramente descrito aqui que tais alusões são apenas indicadas por razões de clareza. Em qualquer caso, tais aberturas de recebimento do dispositivo de carregamento são espacialmente cobertas pelo dispositivo de retenção de tubo. O centro 213 do dispositivo em formato circular é cruzado por duas linhas retas 1204 e 1205, de modo que uma configuração de quatro segmentos é gerado no dispositivo de retenção de tubo 103. Dessa forma, os quatro segmentos de um círculo com sinais de referência respectivos 1200 a 1203 são ilustrados na figura 12. Essa configuração pode ser utilizada para um ensaio ou também para dois ensaios diferentes.

[00131] A figura 13 ilustra outra modalidade ilustrativa de um sistema 100, compreendendo um dispositivo de carregamento 101 e dispositivo de retenção de tubo 103. Como uma alusão a segunda abertura de recebimento 202 do dispositivo de carregamento é apresentada com linhas tracejadas. Adicionalmente, os sinais de referência 105a a 105b são utilizados para as aberturas de recebimento do dispositivo de retenção de tubo 103, que são alinhadas com as aberturas de recebimento respectivas 201a a 201b do dispositivo de carregamento. Nessa disposição de quatro segmentos, as superfícies coloridas 209 são aberturas de recebimento utilizadas como códigos de cor para direcionar o movimento dos tubos de amostra para dentro da abertura de recebimento correta. As cores diferentes são indicadas aqui por meio de sinais diferentes, isso é, diferentes linhas tracejadas e linhas pontilhadas tracejadas. Uma pluralidade de câmaras PCR 113 é disposta em torno da parte central do dispositivo, de modo que uma pipetagem direta da região central na direção da região circunferencial, isso é, para dentro das câmaras PCR, é possível e facilitada pelo dispositivo apresentado. Adicionalmente, a uma alça 1300 para ser agarrada pelo usuário ou um dispositivo é ilustrada. A alça facilita a inserção e/ou remoção do dispositivo de retenção de tubo 103 para dentro e/ou para fora do dispositivo de carregamento. Portanto, uma mudança rápida e totalmente automatizada de diferentes dispositivos de retenção de tubo específicos de ensaio é apresentada.

[00132] A figura 14 ilustra na modalidade da figura 11 em uma vista em perspectiva depois que os tubos de amostra 102 foram inseridos no sistema 100. Adicionalmente, a alça 1300 é ilustrada na figura 14, também. Com referência às características e sinais de referência restantes, é os mesmos são referidos a outras figuras, particularmente à figura 11.

[00133] De acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção, a figura 16 ilustra um dispositivo 100 com uma alça 1300 para ser agarrada por um usuário ou um dispositivo automatizado. O dispositivo de retenção de tubo 103 é integrado ao dispositivo de carregamento. Um alinhamento das aberturas de recebimento do dispositivo de carregamento é alcançado para 12 aberturas de recebimento do dispositivo de retenção de tubo, a partir das quais 105a e 105b são marcadas com sinais de referência. O elemento 1500 pode ser observado como a placa base para o dispositivo de carregamento.

[00134] De acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção, a figura 16 ilustra um sistema para a preparação de amostra PCR e para a configuração PCR 100 que compreende o dispositivo de carregamento 101, que é coberto por cobertura transparente 801. Portanto, uma cobertura simultânea do dispositivo de carregamento 101 e o dispositivo de retenção de tubo 103 e os tubos de amostra inseridos 102 é alcançada. Bem em linha com a figura 15, o elemento 1500 é ilustrado também para a modalidade da figura 16.

[00135] A figura 17 ilustra o processo de inserção de uma pluralidade de câmaras de reação PCR 113 que foram preenchidas previamente e por meio do sistema da presente invenção. Um aparelho de vedação de calor 1700 é ilustrado a fim de fornecer uma vedação, como, por exemplo, o fornecimento de uma folha plástica nas ditas câmaras. O dispositivo de carregamento 101 é inserido no dispositivo 1700 enquanto transportando uma pluralidade de câmaras de reação PCR. Em outras palavras, o dispositivo de carregamento é adaptado para ser recebido por um dispositivo de vedação térmica.

[00136] A figura 18 ilustra um lab ware, como é conhecido na técnica. O dispositivo 1800 fornece 11 posições fro lab ware, A2, A3, B0-B4 e C1-C4.

[00137] A figura 19 fornece um dispositivo de preparação de amostra totalmente automatizada e de configuração PCR 1900 de acordo com outra modalidade ilustrativa da presente invenção. O dispositivo 199 compreende um sistema 100 como foi descrito antes com relação às figuras de 1 a 17 e será descrito posteriormente em maiores detalhes. Os dois componentes, o dispositivo de carregamento 101 e o dispositivo de retenção de tubo 103 são apresentados na figura 19. Adicionalmente, a cobertura 801 é ilustrada no lado esquerdo da figura 19. No total, o dispositivo 1900 fornece 12 posições utilizadas para lab wares. O dispositivo 100 facilita a preparação de amostra PCR e configuração PCR, que fornece uma PCR acelerada que um usuário pretende realizar. O dispositivo 1900 pode reconhecer e configurar a reação PCR no dispositivo 100 pela movimentação automática de todos os tubos de amostra necessários e líquidos a partir das áreas restantes do dispositivo 1900, por exemplo, através de pipetagem ou através de tubos de amostra de transporte para dentro do dispositivo 100. Ademais, o vídeo 1900 pode transportar e transferir automaticamente a cobertura 801 para a posição do sistema 100, de modo que o sistema seja coberto. Isso pode impedir o transporte cruzado potencial durante o processo de preparação de amostra PCR. Essa é uma vantagem adicional da presente invenção. Os percursos de pipetagem 500 descritos aqui podem ser realizados pelo sistema 1900. Um elemento de programa de computador correspondente é apresentado. Deve-se notar explicitamente que essa modalidade da figura 19 pode ser combinada com qualquer outra modalidade da invenção descrita aqui.

[00138] De acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção, a figura 20 ilustra o dispositivo 1900 que foi descrito em detalhes com relação à figura 19 anterior. Aqui, o sistema 100 é compreendido. Por um processo de, por exemplo, escaneamento de código de barras 2500, a informação de amostra pode ser transferida para a unidade de cálculo 2200 e/ou termociclador 2100, ilustrado na figura 20. Também é indicado na figura 20 que depois da preparação de amostra PCR e configuração PCR no dispositivo 1900 através do sistema 100, uma folha de vedação 2000 pode ser fornecida nas câmaras PCR 113. Como pode ser percebido a partir da figura 20, o dispositivo de carregamento 101 é completamente vedado juntamente com as câmaras PCR 113 por uma folha 2000. O sistema apresentado da figura 20 fornece software que pode reconhecer e configurar a reação de PCR no dispositivo de carregamento 101 do sistema 100. Uma PCR subsequente pode ser iniciada automaticamente, com base na informação de amostra recebida. Para a escaneamento de código de barra, um scanner pode ser fornecido, que não é ilustrado na figura 20. Para análise de dados, a tabela 2300 é ilustrada onde os resultados detalhados da análise são ilustrados. Adicionalmente, a figura 2004 integrada permite a ilustração gráfica dos resultados obtidos do processo descrito anteriormente. Portanto, o dispositivo 900 fornece a interface de dados entre o dispositivo de preparação de amostra PCR e configuração PCR por um lado e o termociclador por outro lado também é apresentado pela presente invenção.

[00139] A figura 21 ilustra de forma esquemática um fluxograma de um método de preparo de uma PCR. O método compreende o fornecimento de um dispositivo de carregamento, dispositivo de carregamento esse que serve para receber tubos de amostra para configuração de uma PCR. Essa etapa é ilustrada com S1. A etapa S2 descreve o fornecimento de um dispositivo de retenção de tubo. Aqui, o dispositivo de carregamento compreende uma primeira seção de recebimento que compreende pelo menos uma primeira e uma segunda aberturas de recebimento. A primeira abertura de recebimento e a segunda abertura de recebimento são adaptadas para receber respectivamente um tubo de amostra. O método compreende adicionalmente a etapa de fixação do dispositivo de retenção de tubo ao dispositivo de carregamento, que é indicada com S3.

[00140] A modalidade ilustrativa da figura 22 é baseada na modalidade da figura 21, ao passo que as etapas de método adicionais são compreendidas. Em particular, um tubo de amostra é fixado de forma removível ao dispositivo de retenção de tubo na etapa S5. Adicionalmente, o alinhamento da abertura de recebimento do dispositivo de retenção de tubo com uma das primeira abertura de recebimento e segunda abertura de recebimento do dispositivo de carregamento, dessa forma, cobrindo simultaneamente a outra das primeira e segunda aberturas de recebimento é ilustrado pela etapa S4. Adicionalmente, o tubo de amostra é inserido na abertura de recebimento do dispositivo de carregamento pela fixação do dispositivo de retenção de tubo ao dispositivo de carregamento na etapa S6. Consequentemente, S3 é inerentemente realizada pela etapa S6. Portanto, a etapa S3 é indicada por parênteses na figura 22.

[00141] A figura 23 ilustra dois fluxogramas diferentes de duas modalidades ilustrativas diferentes da presente invenção. No lado esquerdo, as etapas S1 e S2 são realizadas de forma similar à descrita previamente com relação às figuras 21 e 22. Em ambas as modalidades da figura 23, o dispositivo de retenção de tubo compreende pelo menos uma primeira abertura possuindo um código de cor indicando uma primeira cor, e uma segunda abertura possuindo um código de cor indicando uma segunda cor. Adicionalmente, para ambas as modalidades da figura 23, um tubo de amostra é fornecido com um código de cor indicando uma terceira cor na etapa S8. A primeira modalidade da figura 23 apresentada no lado esquerdo da figura 23, seleciona subsequentemente a abertura de recebimento do dispositivo de retenção de tubo que possui a mesma cor que oco digo de cor do tubo de amostra na etapa S9. Adicionalmente, o tubo de amostra é inserido na abertura de recebimento selecionada do dispositivo de retenção de tubo na etapa S10. Depois da etapa S10, o dispositivo de retenção de tubo é fixado ao dispositivo de carregamento na etapa S3. No entanto, a segunda modalidade da figura 3, apresentada no lado direito, fornece outra sequência de etapas de método, como será explicado posteriormente. Em primeiro lugar, a fixação do dispositivo de retenção de tubo ao dispositivo de carregamento é gerada na etapa S3, depois do que a etapa de seleção da abertura de recebimento do dispositivo de retenção que possui a mesma cor que o código de cor do tubo de amostra é realizada com a etapa S9. Finalmente, o tubo de amostra é inserido na abertura de recebimento selecionada do dispositivo de retenção de tubo na etapa S10, pela inserção do tubo de amostra na disposição fixada.

[00142] De acordo com outra modalidade ilustrativa da invenção, a figura 24 descreve um fluxograma de um método de preparação de uma PCR com várias etapas de método. Com relação às etapas S1 a S3, as mesmas são referidas às explicações das figuras 21 a 23. A modalidade da figura 24 fornece adicionalmente dados de escaneamento de pelo menos um elemento, escolhido a partir do grupo que compreende placa de elution, reagentes de extração, reagentes de ensaio, tubos de amostra e qualquer combinação dos mesmos na etapa S11. Adicionalmente, os dados escaneados são transmitidos para uma unidade de cálculo, por exemplo, a unidade de cálculo 220 da figura 20, para fins de PCR na etapa S12. A dita unidade de cálculo gera informação de amostra em um formato de dados legíveis por termociclador na etapa S13. Em outras palavras, o dispositivo e método da presente invenção facilitam o fornecimento de dados legíveis por termociclador sobre a configuração PCR. A informação de amostra no formato de dados legíveis por termociclador é transmitida para o termociclador na etapa S14. A etapa de realização de uma PCR em uma câmara de reação PCR recebida pelo termociclador, com base na informação de amostra recebida no formato de dados legíveis por termociclador é ilustrada com a etapa S15 na figura 24.

[00143] Outras variações das modalidades descritas podem ser compreendidas e realizadas pelos versados na técnica na prática da invenção reivindicada, a partir do estudo dos desenhos, da descrição e das reivindicações em anexo. Nas reivindicações o termo "compreendendo"não exclui outros elementos ou etapas e o artigo indefinido "um", "uma"não exclui uma pluralidade. Um único processador ou outra unidade pode corresponder às funções de vários itens ou etapas mencionados nas reivindicações. O mero fato de determinadas medidas serem recitadas em reivindicações dependentes mutuamente diferentes não indica que uma combinação dessas medidas não possa ser utilizada de forma vantajosa. Um programa de computador pode ser armazenado/distribuído em um meio adequado tal como um meio de armazenamento ótico ou um meio de estado sólido suprido em conjunto com ou como parte de outro hardware, mas também pode ser distribuído em outras formas, tal como através da Internet ou outros sistemas de telecomunicações com ou sem fio. Quaisquer sinais de referência nas reivindicações não devem ser considerados limitadores do escopo das reivindicações.

Claims

1. Método para configurar uma PCR, o método sendo CARACTERIZADO pelo fato de que compreende as etapas de: fornecer um dispositivo de carregamento (S1), cujo dispositivo de carregamento é para receber tubos de amostra para configurar uma PCR, fornecer um dispositivo de retenção de tubo (S2), em que o dispositivo de carregamento compreende: uma primeira seção de recebimento, em que a primeira seção de recebimento compreende pelo menos uma primeira e uma segunda abertura de recebimento, em que a primeira abertura de recebimento e a segunda abertura de recebimento são adaptadas para receber respectivamente um tubo de amostra; em que o dispositivo de retenção de tubo compreende pelo menos uma primeira abertura de recebimento, o método compreende ainda as etapas de: fixar o dispositivo de retenção de tubo ao dispositivo de carregamento (S3); alinhar a abertura de recebimento do dispositivo de retenção de tubo a uma dentre a primeira abertura de recebimento e a segunda abertura de recebimento do dispositivo de carregamento e, simultaneamente, cobrir a outra das primeira e segunda aberturas de recebimento (S4).

2. Método, de acordo com a reivindicação 1, CARACTERIZADO pelo fato de que compreende a etapa de remover simultaneamente uma primeira pluralidade de tubos de amostra para um primeiro ensaio PCR e uma segunda pluralidade de tubos de amostra para um segundo ensaio PCR do dispositivo de carregamento agarrando o dispositivo de retenção de tubo e removendo o dispositivo de retenção de tubo do dispositivo de carregamento.

3. Método, de acordo com a reivindicação 1 ou 2, CARACTERIZADO pelo fato de que compreende a etapa de cobrir as aberturas de recebimento não utilizadas do dispositivo de carregamento pelo dispositivo de retenção de tubo (S7).

4. Método, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 3, CARACTERIZADO pelo fato de que o dispositivo de retenção de tubo compreende pelo menos uma primeira abertura tendo um código de cor indicando uma primeira cor e uma segunda abertura tendo um código de cor indicando uma segunda cor, o método compreende as etapas de: fornecer um tubo de amostra com um código de cor indicando uma terceira cor (S8), selecionar a abertura de recebimento do dispositivo de retenção de tubo que tem a mesma cor que o código de cor do tubo de amostra (S9), e inserir o tubo de amostra na abertura de recebimento selecionada do dispositivo de retenção de tubo (S10).

5. Método, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 4, CARACTERIZADO pelo fato de que compreende as etapas de: escanear dados de pelo menos um elemento escolhido a partir do grupo que consiste em placa de eluição, reagentes de extração, reagentes de ensaio, tubos de amostra, e qualquer combinação dos mesmos (S11); e transmitir os dados escaneados para uma unidade de cálculo para fins de PCR (S12).

6. Método, de acordo com a reivindicação 5, CARACTERIZADO pelo fato de que compreende as etapas de: gerar informação da amostra em um formato de dados legíveis para termociclador pela unidade de cálculo (S13); transmitir a informação da amostra para um termociclador (S14); e realizar uma PCR em uma câmara de reação de PCR pelo termociclador com base na informação de amostra recebida no formato de dados legíveis para termociclador (S15).

7. Método, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 6, CARACTERIZADO pelo fato de que a primeira seção de recebimento é posicionada centralmente, o método compreende as etapas de: receber câmaras de reação PCR pelo dispositivo de carregamento em uma segunda seção de recebimento posicionada no exterior da posição central da primeira seção de recebimento, e pipetar ao longo de um percurso reto de uma abertura de recebimento com um elemento de codificação para um tubo de amostra contendo uma concentração específica de uma molécula alvo dentro da segunda seção de recebimento, cujo percurso cruza apenas as aberturas de recebimento cobertas do dispositivo de carregamento.

8. Método, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 7, CARACTERIZADO pelo fato de que compreende as etapas de: indicar em uma pluralidade de aberturas de recebimento do dispositivo de retenção de tubo um recebimento pretendido de um tubo de amostra contendo uma concentração específica de uma molécula alvo (QS 1, QS 2, QS 3), respectivamente, e pipetar ao longo de um percurso entre uma região central do dispositivo de retenção de tubo e uma região de borda do dispositivo de retenção de tubo cruzando, assim, as aberturas de recebimento, em que um recebimento pretendido de um tubo de amostra com uma concentração específica de uma molécula alvo é indicado, a partir da baixa concentração para a alta concentração.

9. Método, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 8, CARACTERIZADO pelo fato de que compreende as etapas de: indicar em uma primeira abertura de recebimento do dispositivo de retenção de tubo um recebimento pretendido de um tubo de amostra com uma primeira concentração de uma molécula alvo (QS 1), indicar em uma segunda abertura de recebimento do dispositivo de retenção de tubo um recebimento pretendido de um tubo de amostra com uma segunda concentração de uma molécula alvo (QS 2), e fornecer as primeira e segunda aberturas de recebimento no dispositivo de retenção de tubo em posições relativas uma à outra de modo que os percurso retos de pipetagem de uma região central para uma região de borda do dispositivo de retenção de tubo são facilitados a partir das concentrações de molécula alvo baixa para alta.