ES2555160A1 - Aptámeros específicos de TLR-4 y usos de los mismos - Google Patents

Aptámeros específicos de TLR-4 y usos de los mismos Download PDF

Info

Publication number
ES2555160A1
ES2555160A1 ES201430955A ES201430955A ES2555160A1 ES 2555160 A1 ES2555160 A1 ES 2555160A1 ES 201430955 A ES201430955 A ES 201430955A ES 201430955 A ES201430955 A ES 201430955A ES 2555160 A1 ES2555160 A1 ES 2555160A1
Authority
ES
Spain
Prior art keywords
tlr
aptamer
seo
complex
aptamers
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Granted
Application number
ES201430955A
Other languages
English (en)
Other versions
ES2555160B1 (es
Inventor
Ignacio LIZASOAIN HERNÁNDEZ
Víctor Manuel González Muñoz
Gerónimo Fernández Gómez-Chacón
María Ángeles MORO SÁNCHEZ
María Elena Martín Palma
Ana MORAGA YÉBENES
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Aptatargets SL
Original Assignee
Aptus Biotech S L
Aptus Biotech SL
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Priority to ES201430955A priority Critical patent/ES2555160B1/es
Application filed by Aptus Biotech S L, Aptus Biotech SL filed Critical Aptus Biotech S L
Priority to EP15732619.0A priority patent/EP3161139B1/en
Priority to SI201531392T priority patent/SI3161139T1/sl
Priority to CN201580034070.1A priority patent/CN106459980B/zh
Priority to MX2016016992A priority patent/MX2016016992A/es
Priority to CA2953020A priority patent/CA2953020C/en
Priority to AU2015279248A priority patent/AU2015279248B2/en
Priority to ES15732619T priority patent/ES2825106T3/es
Priority to BR112016030172-2A priority patent/BR112016030172B1/pt
Priority to JP2016575345A priority patent/JP6959738B2/ja
Priority to MA040283A priority patent/MA40283A/fr
Priority to US15/322,021 priority patent/US10196642B2/en
Priority to PT157326190T priority patent/PT3161139T/pt
Priority to PL15732619T priority patent/PL3161139T3/pl
Priority to CN202010953057.9A priority patent/CN112111495A/zh
Priority to RU2016152094A priority patent/RU2709718C9/ru
Priority to KR1020177001493A priority patent/KR102454682B1/ko
Priority to DK15732619.0T priority patent/DK3161139T3/da
Priority to PCT/EP2015/064277 priority patent/WO2015197706A1/en
Publication of ES2555160A1 publication Critical patent/ES2555160A1/es
Publication of ES2555160B1 publication Critical patent/ES2555160B1/es
Application granted granted Critical
Priority to ZA2017/00363A priority patent/ZA201700363B/en
Priority to US16/220,726 priority patent/US10808252B2/en
Priority to JP2020082070A priority patent/JP2020127422A/ja
Priority to US17/022,984 priority patent/US11591603B2/en
Priority to US18/156,936 priority patent/US20230279402A1/en
Expired - Fee Related legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/115Aptamers, i.e. nucleic acids binding a target molecule specifically and with high affinity without hybridising therewith ; Nucleic acids binding to non-nucleic acids, e.g. aptamers
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/70Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
    • A61K31/7088Compounds having three or more nucleosides or nucleotides
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K45/00Medicinal preparations containing active ingredients not provided for in groups A61K31/00 - A61K41/00
    • A61K45/06Mixtures of active ingredients without chemical characterisation, e.g. antiphlogistics and cardiaca
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K48/00Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy
    • A61K48/005Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy characterised by an aspect of the 'active' part of the composition delivered, i.e. the nucleic acid delivered
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K49/00Preparations for testing in vivo
    • A61K49/001Preparation for luminescence or biological staining
    • A61K49/0013Luminescence
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K49/00Preparations for testing in vivo
    • A61K49/04X-ray contrast preparations
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K51/00Preparations containing radioactive substances for use in therapy or testing in vivo
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P19/00Drugs for skeletal disorders
    • A61P19/02Drugs for skeletal disorders for joint disorders, e.g. arthritis, arthrosis
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P25/00Drugs for disorders of the nervous system
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P25/00Drugs for disorders of the nervous system
    • A61P25/30Drugs for disorders of the nervous system for treating abuse or dependence
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P25/00Drugs for disorders of the nervous system
    • A61P25/30Drugs for disorders of the nervous system for treating abuse or dependence
    • A61P25/36Opioid-abuse
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P27/00Drugs for disorders of the senses
    • A61P27/02Ophthalmic agents
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P29/00Non-central analgesic, antipyretic or antiinflammatory agents, e.g. antirheumatic agents; Non-steroidal antiinflammatory drugs [NSAID]
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/04Antibacterial agents
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P37/00Drugs for immunological or allergic disorders
    • A61P37/02Immunomodulators
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P43/00Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P9/00Drugs for disorders of the cardiovascular system
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P9/00Drugs for disorders of the cardiovascular system
    • A61P9/10Drugs for disorders of the cardiovascular system for treating ischaemic or atherosclerotic diseases, e.g. antianginal drugs, coronary vasodilators, drugs for myocardial infarction, retinopathy, cerebrovascula insufficiency, renal arteriosclerosis
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/113Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
    • C12N15/1138Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing against receptors or cell surface proteins
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/566Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor using specific carrier or receptor proteins as ligand binding reagents where possible specific carrier or receptor proteins are classified with their target compounds
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/68Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/68Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
    • G01N33/6893Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids related to diseases not provided for elsewhere
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/10Type of nucleic acid
    • C12N2310/16Aptamers
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/50Physical structure
    • C12N2310/53Physical structure partially self-complementary or closed
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2333/00Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
    • G01N2333/435Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from animals; from humans
    • G01N2333/705Assays involving receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2333/00Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
    • G01N2333/435Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from animals; from humans
    • G01N2333/705Assays involving receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • G01N2333/70596Molecules with a "CD"-designation not provided for elsewhere in G01N2333/705
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2800/00Detection or diagnosis of diseases
    • G01N2800/16Ophthalmology
    • G01N2800/164Retinal disorders, e.g. retinopathy
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2800/00Detection or diagnosis of diseases
    • G01N2800/28Neurological disorders
    • G01N2800/2871Cerebrovascular disorders, e.g. stroke, cerebral infarct, cerebral haemorrhage, transient ischemic event

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Neurology (AREA)
  • Neurosurgery (AREA)
  • Rheumatology (AREA)
  • Addiction (AREA)

Abstract

Aptámeros específicos de TLR-4 y usos de los mismos. La invención se refiere a un aptámero de ácido nucleico con capacidad de unirse específicamente e inhibir a TLR-4, a un complejo que comprende dicho aptámero y un grupo funcional, así como a composiciones farmacéuticas de los mismos. La invención también se refiere a usos y métodos para detectar TLR-4 y a usos y métodos para inhibir TLR-4. Por último, la invención también se refiere a un aptámero para su uso en la fabricación de un medicamento para el tratamiento de una patología caracterizada por un aumento de expresión de TLR4 y/o un aumento de activación de TLR-4.

Description

APTÁMEROS ESPECíFICOS DE TLR-4 Y USOS DE LOS MISMOS
5 CAMPO DE LA INVENCiÓN
La presente invención proporciona aptámeros de ácido nucleico con capacidad de unirse específicamente e inhibir a TLR-4 y usos de los mismos.
10 ANTECEDENTES DE LA INVENCiÓN
Actualmente, se conoce que el Sistema Nervioso Central (SNC) responde, tanto ante las infecciones bacterianas como ante un daño cerebral, con una reacción inmune innata muy bien organizada. El sistema inmune innato tiene la capacidad de reconocer patrones
15 moleculares altamente conservados, a través, entre otros, de receptores de membrana de la familia "toll-like" (en inglés Toll-like receptors: TLR).
El TLR4 fue el primer TLR caracterizado en mamíferos. Se han descrito ligandos exógenos para este TLR, como el lipopolisacárido (LPS) de bacterias gram-negativas, el ácido
20 lipoteicoico (en inglés, lipoteichoic acid, L TA) de bacterias gram-positivas o la proteína F del virus respiratorio sincitial. Además, los ligandos endógenos más importantes son la HMBG1 , la HSP-60, de origen endógeno o derivada de Chlamydia pneumoniae, HPS-70, fibronectina, fibrinógeno, ácido hialurónico, etc., todas derivadas del daño tisular, celular y/o de los vasos del huésped. El TLR4 está implicado en gran cantidad de patologías de alta prevalencia,
25 como ictus o enfermedad cerebrovascular, infarto agudo de miocardio, sepsis, ateroesclerosis, esclerosis múltiple y artritis reumatoide entre otras.
La implicación de la inmunidad innata y, en particular, de los TLRs en múltiples patologías, ha supuesto un interés creciente por el desarrollo de agonistas y antagonistas de estos
30 receptores. Así, se han desarrollado agonistas para el posible tratamiento del cáncer, de enfermedades alérgicas, de infecciones y como coadyuvantes de vacunas. Por otra parte, antagonistas de TLRs se están estudiando en sepsis, en ateroesclerosis, en dolor crónico y en colitis; de hecho existen varios antagonistas, eritoran (fase 111), ibudilast (Av411; fase 11), anticuerpos NI-0101 (fase preclínica) que se están estudiando en estas patologías.
P201 430955
En el documento de patente WO 2006/138681 se describe un método para inhibir la
deleción intrahepática de células T activadas mediante la administración de un inhibidor de TLR-4, entre los que se mencionan los aptámeros específicos para TLR-4.
5 Roger y colaboradores (Roger et al., 2009, Proc Natl Acad Sci USA 106:2348-52) describen anticuerpos específicos para el dominio extracelular de TLR4. Estos anticuerpos confieren protección contra la sepsis letal de bacterias Gram negativas en ratones. También se sugiere la utilidad terapéutica de estos anticuerpos anti-TLR-4, dado que el tratamiento es efectivo cuando los anticuerpos son administrados hasta 4 h después de la exposición a
10 endotoxina y hasta 13 h después de la aparición de la infección por Escherichia coli.
Por lo tanto, existe una necesidad en la técnica de nuevas moléculas con capacidad de unirse específicamente e inhibir a TLR-4 y que sean útiles como agentes terapéuticos.
15 BREVE DESCRIPCiÓN DE LA INVENCiÓN
En un primer aspecto, la presente invención se refiere a un aptamero de acido nucleico con capacidad de unirse específicamente e inhibir a TLR-4, y que comprende una secuencia seleccionada del grupo que consiste en SEQ ID NO: 1 y SEO ID NO: 2 o una variante
20 funcionalmente equivalente de las mismas.
En otro aspecto, la presente invención se refiere a un complejo que comprende el aptámero de la invención y un grupo funcional
25 En otro aspecto, la presente invención se refiere al uso del aptámero de la invención o del complejo de la invención para detectar TLR-4.
En otro aspecto, la presente invención se refiere al uso in v;tro del aptámero de la invención
o del complejo de la invención para inhibir TLR-4.
En otro aspecto, la presente invención se refiere a un método in vitro para la detección de
TLR-4 en una muestra que comprende i) poner en contacto dicha muestra con un aptamero según la invención, o un complejo según la invención, 35 ii) separar el apta mero o complejo no unido a TLR-4, y
iii) detectar la presencia del aptámero o complejo unido al TLR-4 presente en la
muestra.
Método in vitro para inhibir TLR-4 en una muestra que comprende poner en contacto una
5 muestra que comprende TLR-4 con un aptámero según la invención, o un complejo según la
invención, en condiciones adecuadas inhibir TLR4.
Un aptámero de la invención para su uso en la fabricación de un medicamento para el
tratamiento de una patología caracterizada por un aumento de expresión de TLR4 y/o un
10 aumento de activación de TLR-4.
Una composición farmacéutica que comprende al menos un aptámero según la invención o
al menos un complejo según la invención, opcionalmente en combinación con uno o más
soportes, excipientes o solventes farmacéutica mente aceptables. 15 BREVE DESCRIPCiÓN DE LAS FIGURAS
Figura 1. Reconocimiento de la proteína TLR-4 por los aptámeros seleccionados mediante ELONA. La proteína TLR-4 humana recombinante (6xHIS-TLR-4) fue plaqueada a una 20 concentración de 100 ng/pocillo en placas de microtitulación de 96 pocillos e incubada a 4°C durante 16 h. Posteriormente, 20 pmoles de cada uno de los aptámeros marcados con digoxigenina fueron añadidos a cada pocillo y la placa fue incubada durante 1 ha 3rC. Por último, la placa fue incubada con anticuerpos anti-digoxigenina conjugados con peroxidasa y revelada usando ABTS. Como control positivo se utilizó un aptámero de ADN frente a Li
25 H2A (Martin et al., 2013, PLoS ONE 8: e78886). Todos los experimentos fueron realizados por triplicado.
Figura 2. Estructuras secundarias de los aptámeros TLRApt#1 R (SEa ID NO: 3), y TLRApt#4F (SEO ID NO: 4) predichas utilizando el programa mFold. En los recuadros 30 aparecen las guaninas que podrían formar parte de estru cturas G-cuadruplex predichas con el programa OGRS Mapper.
Figura 3. Unión de 105 aptomeros TLRApt#1 R (SEO ID NO: 3), y TLRApt#4F (SEO ID NO: 4) a hTLR-4 recombinante (A) y a la proteína TLR-4 expresada en células (B). Todos los 35 experimentos fueron hechos por triplicado.
Figura 4. Actividad antagonista de los aptámeros TLRApt#1 R (SEO ID NO: 3), y TLRApt#4F (SEQ ID NO: 4) sobre células HEK-Blue hTLR4 .. y el antagonista LPS-RS-UP (2 ng/~l; 20 ng) como controles, y Se aplicaron los aptámeros a una concentración de 20 nM (A) o a concentraciones finales de 0.2, 2, 20 Y 200 nM (B) o el antagonista control LPS-RS-UP (2 ng/~l; 20 ng). Como control, se utilizó el agonista LPS-EK-UP (0.02 ng/~I). Todos los experimentos fueron hechos por triplicado. Significancia estadistica ("P<0.05, .... P<0.01 y ......P<O.001 ).
Figura 5. Estructuras secundarias de los aptámeros TLRApt#1 R-T (SEO ID NO: 1), y TLRApt#4F-T (SEQ ID NO: 2) predichas utilizando el programa mFold. En los recuadros aparecen las guaninas que podrían formar parte de estructuras G-cuadruplex predichas con el programa OGRS Mapper.
Figura 6. Efecto de la inyección intraperitoneal de los aptámeros TLRApt#1 R Y TLRApt#4F en la reducción de la zona infartada en animales de experimentación. Ratones machos adultos C57BU10ScSn (WT; normal) y C57BL/10ScNJ (KO, carente de TLR4 funcional ), fueron sometidos a inducción de una isquemia focal cerebral mediante oclusión de la arteria cerebral media con ligadura. Los ratones fueron anestesiados con isoflurano y 24 horas después de MeAD, el tamaño del infarto se ha evaluado por MRI. Las imágenes resaltadas en T2 (T2WI) han sido adquiridas en un BIOSPEC BMT 47/40 operando a 4.7 T (BrukerMedical, Ettlingen, Alemania; MRI Unit, Instituto Pluridisciplinar, UCM) y el área dañada es cuantificada mediante Image J 1.41 (NIH, Bethesda, Washington). Significancia estadistica ('P<O.05).
DESCRIPCiÓN DETALLADA DE LA INVENCiÓN
Los autores de la presente invención han seleccionado y caracterizado dos moléculas que, debido a sus secuencias, son capaces de estructurarse tridimensional mente en unas determinadas condiciones de pH , temperatura y concentraciones salinas, lo que les confiere la capacidad de reconocer de forma específica a la proteína TLR-4 y modular su actividad. Estas moléculas pueden inhibir la respuesta celular mediada por el receptor TLR-4 in vivo y son capaces de reducir el tamaño del infarto en animales de experimentación, lo que les confiere un potencial papel terapéutico.
Aptámero específico de TLR-4
En un primer aspecto, la presente invención se refiere a un aptámero de ácido nucleico con
capacidad de unirse específicamente e inhibir a TLR-4, en lo sucesivo denominado el "aptámero de la invención", y que comprende una secuencia seleccionada del grupo que consiste en SEO ID NO: 1 (CCGGCACGGGACAAGGCGCGGGACGGCGTAGATCAGGTC GACACC) y SEO ID NO: 2 (GGTGTGCCAATAAACCATATCGCCGCGTIAGCATGTACTCG GTTGGCCCTAAATACGAG) o una variante funcionalmente equivalente de las mismas.
El término "aptámero", en el contexto de la presente invención, se refiere a cadenas de ácido nucleico monocatenarios que adoptan una estructura terciaria específica que les permite unirse a dianas moleculares con alta especificidad y afinidad , comparable a la de los anticuerpos monoclonales, a través de interacciones distintas a las de emparejamiento de bases de Watson-Crick clásicas.
El término "ácido nucleico", en el contexto de la presente invención, se refiere a cualquier tipo de ácido nucleico, como AON y ARN , ya variantes de los mismos, tales como el ácido peptidonucleico (APN, o en inglés "peptide nucleic acid" o PNA), el ácido nucleico bloqueado (ANB, o en inglés "Iocked nuc/eic acid" o LNA), así como combinaciones de los mismos, modificaciones de los mismos, que incluyen nucleótidos modificados, etc. Los términos "ácido nucleico" y "oligonucleótido" y "polinucleótido" se emplean indistintamente en el
contexto de la presente invención. Los ácidos nucleicos pueden purificarse a partir de fuentes naturales, producirse usando sistemas de expresión recombinantes y, opcionalmente, purificados, sintetizados químicamente, etc. Cuando sea apropiado, por ejemplo, en el caso de moléculas sintetizadas químicamente, los ácidos nucleicos pueden comprender análogos de nucleósidos tales como análogos que tienen bases modificadas químicamente o azúcares, modificaciones del esqueleto, etc. Una secuencia de ácido nucleico se representa en la dirección 5'-3' a menos que se indique lo contrario.
El término "TLR-4", en el contexto de la presente invención, se refiere al receptor de membrana de la familia "toll-like" 4. El receptor TLR-4 también puede denominarse como ARM010, C0284, TLR4 o hTOLL. En humanos, el receptor TLR-4 está recogido bajo el número de acceso en GenBank 000206.2 a 27 de mayo de 2014, y que está codificado por el gen TLR4 . Está formado por 839 aminoácidos, de los cuales los residuos 1-23 constituyen
la secuencia señal, los residuos 24-631 constituyen el dominio extracelular, los residuos 632-652 constituyen el dominio transmembrana y los residuos 653-839 constituyen el dominio citoplásmico.
P201 430955
En una realización particular, el aptámero tiene capacidad de unirse específicamente al dominio extracelular de TLR-4 (aminoácidos 24-631).
La presente invención contempla una aptámero que comprende una secuencia seleccionada del grupo que consiste en SEQ ID NO: 1 (CCGGCACGGGACAAGGCGCGGGACGGCGTA GATCAGGTCGACACC)ySEQIONO: 2(GGTGTGCCAATAAACCATATCGCCGCGTTAGC
ATGTACTCGGTTGGCCCTAAATACGAG) o una variante funcionalmente equivalente de las mismas.
La presente invención también contempla aptámeros de la invención que estén compuestos por ácidos nucleicos como ADN y ARN , así como por variantes y análogos de ácidos nucleicos y combinaciones de los mismos, modificaciones de los mismos, que incluyen, sin limitación, esqueletos de ácido nucleico modificado, enlaces de sustitución, nucleótidos modificados, y análogos de ribosa o desoxirribosa, nucleótidos modificados, etc. con una capacidad de unirse específicamente e inhibir a TLR-4 de al menos el 50%, al menos el 60%, al menos el 70%, al menos el 75%, al menos el 80%, al menos el 85%, al menos el 90%, al menos el 91 %, al menos el 92%, al menos el 93%, al menos el 94%, al menos el 95%, al menos el 96%, al menos el 97%, al menos el 98%, al menos el 99%, o al menos el 100% de la capacidad de unirse específicamente e inhibir a TLR-4 del aptámero de secuencia SEO ID NO: 1 o SEO ID NO: 2. Ejemplos no limitativos de variantes y análogos de ácidos nucleicos incluyen, sin limitación, APN, ANB Y ATN.
El término "variante de un ácido nucleico" o "análogo de un ácido nucleico", en el contexto de la presente invención, se refiere a variantes y análogos de ácidos nucleicos que incluyen, sin limitación, esqueletos de ácido nucleico modificado, enlaces de sustitución, nucleótidos modificados, y análogos de ribosa o desoxirribosa. Por ejemplo, variantes de ácidos nucleicos según la presente invención pueden comprender estructuras con esqueletos sintéticos análogos del esqueleto típico fosfodiéster. Estos incluyen, sin limitación, fosforotioato, fosforoditioato, metilfosfonato, fosforamidato, fosfotriéster de alquilo, sulfamato, 3'-tioacetal, metileno(metilimino), 3'-N-carbamato, carbamato de morfolino y ácidos nucleicos peptídicos (PNA), enlaces metilfosfonato o alternando metilfosfonato y fosfodiéster y bencilfosfonato.
Las variantes de un ácido nucleico también pueden contener uno o más enlaces "de sustitución", como se entiende generalmente en la técnica. Algunos de estos enlaces de sustitución son apolares y contribuyen a la proporcionar al aptámero de una capacidad de
difundirse a través de las membranas. Estos enlaces "de sustitución" se definen aquí como enlaces alternativos convencionales tales como fosforotioato o fosforamidato, y se sintetizan como se describe en la literatura comúnmente disponible. Grupos de unión alternativos incluyen, de manera no limitativa, realizaciones en las que un resto de fórmula P(O)S, ("Iioalo") , P(S)S ("dilioalo"), P(O)NR'" P(O)R', P(O)OR', CO, o CONR'" en donde R' es H (o una sal ) o un grupo alquilo de 1-12 átomos de C y R6 es un grupo alquilo de 1-9 átomos de C, que se unen a los nucleótidos adyacentes a través de -S-o de -0-. Enlaces ditioato se describen en la solicitud US 248517. La presente invención también contempla el uso de enlaces de sustitución que incluyen enlaces intemucleotídicos no basados en fósforo tales como 3'-tioformacetal, (-S-CH2-O-), formacetal (-O-CH2-O-) y enlaces internucleotídicos 3'amina (-NH-CH2-CH:d descritos en las solicitudes US 690786 y US 763130. Se pueden utilizar uno o más enlaces de sustitución en los aptámeros de la invención con el fin de facilitar aún más la unión a TLR-4 o para aumentar la estabilidad de los aptámeros frente a nucleasas, así como para conferir capacidad de permeación. No todos los enlaces dentro del mismo aptámero tienen que ser idénticos y, por tanto, la presente invención contempla aptámeros con todos los enlaces idénticos así como aptámeros con una variación en la composición de sus enlaces.
Asimismo, las variantes ácidos nucleicos según la presente invención también pueden contener formas análogas de ribosa o desoxirribosa que son bien conocidas en la técnica, incluyendo sin limitación azúcares sustituidos en 2' tales como 2'-O-metil-ribosa, 2'-f1uororibosa o 2'-azido-ribosa, análogos carbocíclicos de azúcares, azúcares a-anoméricos, azúcares epiméricos tales como arabinosa, xilosas o lixoses, azúcares de piranosa, azúcares de furanosa y sedoheptulosas. Los ácidos nucleicos también pueden contener ácido nucleico de treosa (ANT, o en inglés "threose nucleic acid" o TNA, también referido como oligonucleótidos alfa-treofuranosilos) (Véase, por ejemplo, Schong et al., Science 200017 de noviembre de 290 (5495): 1347-1351 ). En particular, la sustitución en la posición 2' del residuo de furanosa es particularmente importante con respecto a la mejora de la estabilidad nucleasa.
El término "nucleótido", en el contexto de la presente invención, se refiere a los monómeros que conforman los ácidos nucleicos. Los nucleótidos están formados por una pentosa, una base nitrogenada y un grupo fosfato, y están unidos mediante enlaces fosfodiéster. Los nucleótidos que forman parte de ADN y ARN se diferencian en la pentosa, siento ésta desoxirribosa y ribosa respectivamente. Las bases nitrogenadas, a su vez, se dividen en bases nitrogenadas purínicas, que son la adenina (A) y la guanina (G), y en bases
P201 430955
nitrogenadas pirimidínicas, que son la timina (T), la citosina (C) y el uracilo (U). La timina únicamente aparece en el AON , mientras que el uracilo únicamente en el ARN. La presente invención contempla el uso de nucleótidos modificados en el aptámero de la invención. El término "nucleótido modificado". en el contexto de la presente invención, se refiere a análogos conocidos de nucleótidos naturales, con propiedades de unión similares o mejoradas. Formas análogas de purinas y pirimidinas son bien conocidas en la técnica, e incluyen, sin limitación, aziridinilcitosina, 4-acetilcitosina, 5-fluorouracilo, 5-bromouracilo, 5carboximetilaminometil-2-tiouracilo, 5-carboximetilaminometiluracilo, inosina, isopenteniladenina, 1-metiladenina, 1-metilpseudouracilo, 1-metilguanina, 1-metilinosina, 2,2-dimetilguanina, 2-metiladenina, 2-metilguanina, 3-metilcitosina, 5-metilcitosina, Nsmetiladenina, 7-metilguanina, 5-metilaminometiluracilo, 5-metoxiaminometil-2-tiouracilo, beta-D-manosilqueosina, 5-metoxiuracilo, 2-metiltio-N-6-isopenteniladenina, éster metílico de ácido uraciI0-5-oxiacético, pseudouracilo, queosina, 2-tiocitosina, 5-metil-2-tiouracilo, 2tiouracilo, 4-tiouracilo, 5-metiluracilo, ácido uraciI0-5-oxiacético, y 2,6-diaminopurina. Además de los nucleótidos modificados anteriores, residuos de nucleótidos que carezcan de una purina o una pirimidina también se pueden incluir en la presente invención.
Además de las variantes anteriores, las variantes de ácido nucleico comprendidas en la invención también incluyen APN, ANB Y cadenas 5'-5' o 3'-3'. El término "ácido peptidonucleico" o "APN" o "PNA", en el contexto de la presente invención, se refiere a un oligonucleótido cuyo esqueleto se compone de unidades repetitivas de N-(2-aminoetil)glicina unidas por enlaces peptídicos, en donde las diferentes bases nitrogenadas están unidas a la cadena principal por un enlace de metileno (-CHT) y un grupo carbonilo (-(C=O)). El término "ácido nucleico bloqueado" o "ANB" o "LNA", en el contexto de la presente invención, se refiere a un nucleótido modificado de ARN cuyo resto de ribosa está modificado con un enlace adicional que conecta el oxígeno en 2' con el carbono en 4', bloqueando la ribosa en la conformación 3'-endo. El término "cadena 5'-5'" o "cadena 3'-3"', en el contexto de la presente invención, se refiere a oligonucleótidos en los cuales el nucleótido del extremos 3' o 5', respectivamente, está invertido.
Tal como se utiliza en la presente invención, el término "variante funcionalmente equivalente" se refiere a aptámeros con secuencias sustancialmente similares a SEO ID NO: 1 o SEO ID NO: 2 que mantienen su capacidad de unirse específicamente e inhibir a TLR-4. Una variante funcionalmente equivalente del aptámero de la invención puede ser una secuencia de ácido nucleico derivado de la SEO ID NO: 1 o SEO ID NO: 2 que comprende la adición, sustitución o modificación de uno o más nucleótidos. A modo de ilustración,
P201 430955
variantes funcionalmente equivalentes del aptámero de la invención incluyen secuencias que comprenden la adición de 1 nucleótido, 2 nucleótidos, 3 nucleótidos, 4 nucleótidos, 5 nucleótidos, 10 nucleótidos, 15 nucleótidos, 20 nucleótidos, 25 nucleótidos, 30 nucleótidos, 35 nucleótidos, 40 nucleótidos, 45 nucleótidos, 50 nucleótidos, 60 nucleótidos, 70 nucleótidos, 80 nucleótidos, 90 nucleótidos, 100 nucleótidos, 150 nucleótidos, 200 nucleótidos, al menos 500 nucleótidos, al menos 1000 nucleótidos o más en el extremo 5' de la secuencia SEO ID NO:1 o SEO ID NO: 2 yfo que comprenden la adición de 1 nucleótido, 2 nucleótidos, 3 nucleótidos, 4 nucleótidos, 5 nucleótidos, 10 nucleótidos, 15 nucleótidos, 20 nucleótidos, 25 nucleótidos, 30 nucleótidos, 35 nucleótidos, 40 nucleótidos, 45 nucleótidos, 50 nucleótidos, 60 nucleótidos, 70 nucleótidos, 80 nucleótidos, 90 nucleótidos, 100 nucleótidos, 150 nucleótidos, 200 nucleótidos, al menos 500 nucleótidos, al menos 1000 nucleótidos o más en el extremo 3' de la secuencia SEO ID NO:1 o SEO ID NO: 2, y que mantienen una capacidad de unirse específicamente e inhibir a TLR-4 de al menos el 50%, al menos el 60%, al menos el 70%, al menos el 75%, al menos el 80%, al menos el 85%, al menos el 90%, al menos el 91 %, al menos el 92%, al menos el 93%, al menos el 94%, al menos el 95%, al menos el 96%, al menos el 97%, al menos el 98%, al menos el 99%, o al menos el 100% de su capacidad de unirse específicamente e inhibir a TLR-4.
La presente invención también incluye aptámeros que comprenden secuencias de nucleótidos con una identidad de secuencia de al menos el 70%, al menos el 75%, al menos el 80%, al menos el 85%, al menos el 90%, al menos el 91 %, al menos el 92%, al menos el 93%, al menos el 94%, al menos el 95%, al menos el 96%, al menos el 97%, al menos el 98%, o al menos el 99% con las secuencias SEO ID NO:1 o SEO ID NO: 2 y que mantienen una capacidad de unirse específicamente e inhibir a TLR-4 de al menos el 50%, al menos el 60%, al menos el 70%, al menos el 75%, al menos el 80%, al menos el 85%, al menos el 90%, al menos el 91 %, al menos el 92%, al menos el 93%, al menos el 94%, al menos el 95%, al menos el 96%, al menos el 97%, al menos el 98%, al menos el 99%, o al menos el 100% de su capacidad de unirse específicamente e inhibir a TLR-4.
El término "identidad~, en el contexto de la presente invención, se refiere a la relación de similitud global entre moléculas de ácido nucleico, la cual se expresa en forma de un porcentaje de identidad. El cálculo del porcentaje de identidad de dos secuencias de ácidos nucleicos se puede realizar mediante la alineación de las dos secuencias para propósitos de comparación óptima, y es una función del número de posiciones idénticas compartidas por las secuencias, teniendo en cuenta el número de huecos y la longitud de cada hueco, que debe ser introducida para la alineación óptima de las dos secuencias. La comparación de
P201 430955
secuencias y la determinación del porcentaje de identidad entre dos secuencias se puede llevar a cabo utilizando un algoritmo matemático como el incorporado en el programa LALlGN (Goujon el al., 2010, Nucleic Acids Res 38(Web Server issue):W695-9).
El término "unión específica~ o "unión específica a TLR-4", en el contexto de la presente invención, se refiere a la asociación física no covalente entre dos moléculas, el aptámero de la invención y el receptor TLR-4. La unión entre el aptámero de la invención y el receptor TLR-4 se considera específica si la fuerza de la unión entre ambos es al menos 10 veces, al menos 15 veces, al menos 20 veces, al menos 25 veces, al menos 50 veces, al menos 75 veces o al menos 100 veces superior a la fuerza de la unión entre el aptámero de la invención y una molécula irrelevante. La unión entre el aptámero de la invención y el receptor TLR-4 también se considera específica si la constante de equilibrio de disociación Kd es 10.3 M o menor , 10-4 M o menor, 10-5 M o menor, 10.6 M o menor, 10.7 M o menor, 10-8
11 12
M o menor, 10-9 M o menor, 10. 10 M o menor, 10-M o menor, o 10. M o menor bajo las condiciones empleadas, por ejemplo, en condiciones fisiológicas, condiciones de cultivo de una célula o condiciones que permiten la supervivencia celular.
La capacidad del aptámero de la invención de unirse específicamente a TLR-4 puede ser determinada mediante una variedad de ensayos que están disponibles en la técnica. Preferiblemente, la capacidad de unión específica a TLR-4 del aptámero de la invención se determina mediante ensayos de unión in vitro, tales como el ensayo de oligonudeótido ligado a enzimas (en inglés "Enzyme-Linked OligoNucleotide Assay", ELONA), el ensayo por absorción por aptámero ligado a enzimas (en inglés "Enzyme-Linked Aptamer Sorbent Assay", ELASA), precipitación y PCR cuantitativa (qPCR), o por técnicas de fluorescencia tales como aptahistoquímica, aptacitoquímica, microscopía de fluorescencia o citometría de flujo. Asimismo, tanto la capacidad de unión específica a TLR-4 como la afinidad del aptámero por TLR-4 puede determinarse por técnicas ampliamente conocidas por el experto en la materia, tales como el ensayo de cambio de movilidad en gel (en inglés "gel mobility shift assay"), resonancia de plasmón superficial (en inglés "surface plasmon resonance", SPR), electroforesis capilar cinética y el ensayo de unión de fluorescencia. Brevemente, el ensayo de unión de fluorescencia consiste en la incubación de bolas magnéticas recubiertas de TLR-4 con diferentes concentraciones (por ejemplo, de O a 100 nM) del aptámero de la invención marcado (por ejemplo, con carboxifluoresceína, FAM), y la posterior elución y detección de los aptámeros unidos; las constantes de disociación (Kd) se calculan por análisis de ajuste no lineal.
El término "inhibición de TLR-4", en el contexto de la presente invención, se refiere al bloqueo o disminución de la actividad de TLR-4, es decir, la transducción de la señal mediada por el receptor TLR-4. Se considera que la actividad de TLR-4 está inhibida por un agente inhibidor o antagonista cuando su actividad es de al menos el 95%, al menos el 90%, al menos el 85%, al menos el 80%, al menos el 75%, al menos el 70%, al menos el 65%, al menos el 60%, al menos el 55%, al menos el 50%, al menos el 45%, al menos el 40%, al menos el 35%, al menos el 30%, al menos el 25%, al menos el 20%, al menos el 15%, al menos el 10%, al menos el 5%, al menos el 1 %, o menor de la actividad de TLR-4 en presencia de su agonista natural LPS.
La capacidad del aptámero de la invención de inhibir a TLR-4 puede ser determinada mediante una variedad de ensayos que están disponibles en la técnica. Preferiblemente, la capacidad de inhibir a TLR-4 del aptámero de la invención se determina mediante ensayos in vitro con células que expresan TLR-4 recombinante y un gen reportero cuya expresión está asociada a la activación de TLR-4 recombinante. El experto en la materia reconocerá que existen múltiples variantes de este método, dependiendo de la célula y el gen recombinante empleados. Un ejemplo de este ensayo está recogido en los Ejemplos de la presente invención (sección "Materiales y métodos" y Ejemplo 2). Otras técnicas disponibles incluyen la determinación de los niveles de citoquinas inflamatorias, como IL-1 , IL-8, TNF-alfa e IL-1 2, liberadas por células que expresan TLR-4.
En una realización particular, el aptámero de la invención consiste en de entre 30 y 200 nucleótidos, preferiblemente entre 35 y 150 nucleótidos, más preferiblemente entre -40 y 100 nucleótidos, aún más preferiblemente entre 45 y 80 nucleótidos.
En otra realización particular, el aptámero de la invención comprende una secuencia seleccionada del grupo que consiste en SEO ID NO: 3 (GTIGCTCGTATTTAGGGCCACCG GCACGGGACAAGGCGCGGGACGGCGTAGATCAGGTCGACACCAGTCTICATCCGC) y SEO ID NO: 4 (GCGGATGAAGACTGGTGTGCCAATAAACCATATCGCCGCGTIAGCATGT ACTCGGTIGGCCCTAAATACGAGCAAC). La secuencia SEO ID NO: 3 es una variante funcionalmente equivalente de SEa ID NO: 1 y la secuencia SEa ID NO: 4 es una variante funcionalmente equivalente de SEa ID NO: 2.
En una realización particular, el ácido nucleico es AON. En otra realización particular, el ácido nucleico es ARN. En otra realización particular, el ácido nucleico es APN. En otra
realización particular, el ácido nucleico es ANB. En otra realización particular, el ácido nucleico es ATN.
En otra realización particular, el TLR-4 es un TLR-4 seleccionado del grupo formado por ratón, rata, conejo, cerdo, gato, perro, caballo, primate, y ser humano. En una realización preferida, el TLR-4 es un TLR-4 humano.
La producción del aptámero de la invención puede llevarse a cabo siguiendo métodos convencionales en la técnica. Ejemplos no limitativos de técnicas de producción de aptámeros incluyen técnicas enzimáticas, tales como la transcripción, sistemas de expresión recombinantes y síntesis química de fase sólida estándar (o de fase de solución), disponibles comercialmente. Cuando sea apropiado, por ejemplo, en el caso de que el aptámero de la invención comprenda variantes de ácidos nucleicos como las descritas anteriormente, análogos de nucleótidos tales como análogos que tienen bases o azúcares modificados químicamente, modificaciones del esqueleto, etc., el aptámero de la invención se producirá mediante síntesis química. Alternativamente, la expresión recombinante será la técnica preferida para la producción de aptámeros cuando estos tengan una longitud de 200 nucleótidos o mayor. Los aptámeros producidos por cualquiera de las técnicas anteriores pueden, opcionalmente, ser purificados por métodos bien conocidos en la técnica.
Complejo de la invención
Como el experto en la materia podrá apreciar, las características de pequeño tamaño, estabilidad y fácil producción del aptámero de la invención, hacen que éste pueda presentarse unido a una segunda molécula. Esto es particularmente ventajoso cuando la segunda molécula es un grupo funcional. El resultado de la unión del aptámero de la invención y un grupo funcional es un complejo que exhibe la combinación de funciones de ambos, es decir, un complejo con la capacidad de unirse específicamente e inhibir a TLR-4 y con la actividad asociada al grupo funcional.
Por tanto, en otro aspecto, la presente invención se refiere a un complejo, en lo sucesivo denominado el ucomplejo de la invención", que comprende un aptámero de ácido nucleico con capacidad de unirse específicamente e inhibir a TLR-4 y que comprende una secuencia seleccionada del grupo que consiste en SEQ ID NO: 1 y SEa ID NO: 2 o una variante funcionalmente equivalente de las mismas y un grupo funcional.
P201 430955
El término "aptámero" ha sido descrito en detalle en relación con las Definiciones y el Aptámero específico de TLR-4 (supra) y sus definiciones y particularidades aplican igualmente en el contexto del complejo de la invención.
El término "grupo funcional", en el contexto de la presente invención, se refiere a moléculas aptas para ejercer al menos una función. Dicha función incluye, sin limitación, la capacidad de unirse específicamente a TLR-4 o a otros receptores TLR, la capacidad de inhibir a TLR4 o a otros receptores TLR, la capacidad de ser detectable, tanto directa como indirectamente, la capacidad de inducir muerte celular, etc. Como el experto en la materia entenderá, un grupo funcional puede tener asociadas una o múltiples funciones. Ejemplos no limitativos de grupos funcionales incluyen reactivos detectables y fármacos. Estos grupos funcionales pueden ser actuar como agentes de imagen, fármacos, etc.
Por lo tanto, en una realización particular, el grupo funcional se selecciona de entre un reactivo detectable y un fármaco.
En otra realización particular, el grupo funcional es un reactivo detectable. El término "reactivo detectable", en el contexto de la presente invención, se refiere a reactivos con capacidad de ser detectables directa o indirectamente. Ejemplos de reactivos detectables indicados para la presente invención incluyen, sin limitación, radionúclidos, fluoróforos, proteínas y haptenos.
En una realización preferida, el reactivo detectable es un radionúclido. A este efecto, radionúclidos apropiados tienen utilidad en técnicas de diagnóstico por imagen, como técnicas de radioinmunodiagnóstico y tomografía de emisión de positrones (PET). Ejemplos no limitativos de radionúclidos incluyen isótopos de emisión gamma, tales como 99mTc, 1231 y 1111n, que pueden ser empleados en radioscintigrafía usando cámaras gamma o gamma cameras o tomografía por emisión de fotón único computarizada, así como emisores de positrones, tales como 18F, 64Cu, 68Ga, 86y , 1241, 213Si Y 211At, que pueden emplearse en PET,
o emisores beta, tales como 131 1, 9OY, 99mTc, 177Lu y 67CU". El experto en la materia apreciará que los radionúclidos también pueden emplearse con fines terapéuticos.
En otra realización preferida, el reactivo detectable es un fluoróforo. El término "fluoróforo", en el contexto de la presente invención, se refiere a un compuesto químico fluorescente que puede emitir luz después de ser excitado por una luz de longitud de onda diferente. Fluoróforos adecuados en la presente invención incluyen, sin limitación, Cy3, Cy2, Cy5, la
familia de marcadores fluorescentes Alexa Fluor® (Molecular Probes, Inc.), carboxifluoresceína (FAM) e isotiocianato de f1uoresceína (File).
En otra realización preferida, el reactivo detectable es una proteína. El término "proteína", en el contexto de la presente invención, se refiere a macromoléculas consistentes en una o más cadenas de aminoácidos. Las proteínas son responsables de llevar a cabo un grupo diverso de funciones celulares basándose en su habilidad de unir otras moléculas de manera específica. Las proteínas se pueden unir a otras proteínas así como a pequeñas moléculas sustrato. Ejemplos no limitativos de proteínas adecuadas para los propósitos de la presente invención incluyen, sin limitación, enzimas, proteínas fluorescentes, proteínas luminiscentes y antígenos.
En una realización aún más preferida, la proteína es una enzima. El término "enzima", en el contexto de la presente invención, se refiere a una proteína que funciona como un catalizador altamente selectivo, acelerando tanto la velocidad como la especificidad de la reacción metabólica para la cuál es específica. Ejemplos no limitativos de enzimas adecuadas para la invención incluyen, sin limitación, la peroxidasa de rábano (en inglés "horseradish peroxydase", HRP) y la fosfatasa alcalina. Como el experto en la materia apreciará, las enzimas adecuadas para su uso en la presente invención son detectables indirectamente gracias a su capacidad de catalizar la modificar un sustrato en un compuesto detectable por colorimetría, quimioluminiscencia o f1uorimetría. Ejemplos de sustratos adecuados incluyen, sin limitación, p-Nitrofenil fostato (PNPP), ácido 2,2'-azinobis[3etilbenzotiazolin-6-sulfónico] (ABTS), o-fenilenediamina (OPD), y 3,3',5,5'-tetrametilbenzidina (TMB).
Las proteínas bioluminiscentes o fotoproteínas son un caso particular de enzimas oxidativas que son capaces de llevar a cabo una reacción química de sus grupos prostéticos específicos, resultando en una emisión de luz sin necesidad de una excitación previa. Ejemplos no limitativos de proteínas bioluminiscentes incluyen la luciferasa de luciérnaga, la luciferasa de Renilla y la acuorina.
En otra realización aún más preferida, la proteína es una proteína fluorescente. El término "proteína fluorescente", en el contexto de la presente invención, se refiere a una proteína con capacidad emitir luz cuando se excita a una longitud de onda adecuada para su excitación. Ejemplos no limitativos de proteínas fluorescentes que pueden ser utilizadas en el complejo de la invención incluyen, sin limitación, GFP, GFPuv, BFP, CFP, YFP, EBFP2,
P201 430955
mCerulean, mCerulean3, mVenus, mTurquoise, T-Sapphire, citrine, amFP486, zFP506, zFP538, drFP, DsRed, mCherry, dTomato, mTFP1, TagRFP-T, mK02, mRuby, mKate, mAmetrine, REACh, R-ficoeritrina (R-PE) y Aloficocianina (APC).
En otra realización aún más preferida, la proteína es una proteína luminiscente. El término "proteína luminiscente", en el contexto de la presente invención, se refiere a una proteína capaz de emitir luz cuando se excita a una longitud de onda adecuada para su excitación. Ejemplos no limitativos de proteínas fluorescentes que pueden ser utilizadas en el complejo de la invención incluyen, sin limitación, las proteínas recogidas en la Tabla 1, junto con sus longitudes de onda de excitación y emisión correspondientes.
En otra realización aún más preferida, la proteína es un antígeno. El término "antígeno", en el contexto de la presente invención, se refiere a una molécula que induce una respuesta inmune en el cuerpo. Por tanto, un antígeno puede ser empleado para generar un anticuerpo que lo reconozca y se una específicamente a él. Ejemplos no limitativos de antígenos incluyen, entre otros, antígenos tumorales, tales como el antígeno carcinoembrionario (CEA), HER2, el antígeno específico de próstata (PSA) y el activador tisular del plasminógeno y sus variantes recombinantes como Activase®, así como antígenos bacterianos, alérgenos, etc. Como el experto en la materia apreciará, los antígenos adecuados para su uso en la presente invención son detectables indirectamente gracias a su capacidad de ser reconocidos específicamente por un anticuerpo.
En otra realización preferida, el reactivo detectable es un hapteno. El término "hapteno", en el contexto de la presente invención, se refiere a un grupo de compuestos químicos de pequeño tamaño molecular « 10,000 Da) que son antigénicos pero incapaces de inducir por si mismos una reacción inmunitaria específica. El acoplamiento químico de un hapteno a una proteína inmunógena grande, llamada portador, genera un conjugado hapteno-portador inmunógeno que sí es capaz de inducir una reacción inmunitaria específica. Ejemplos no limitativos de vitaminas incluyen biotina (vitamina B7), digoxigenina, dinitrofenol (DNP) y nitro-iodofenol (NIP). En una realización más preferida, la vitamina es biotina. El término "biotina", en el contexto de la presente invención, se refiere a una vitamina estable al calor, soluble en agua y alcohol, también denominada vitamina H y vitamina B7, caracterizada por unirse específicamente a avidina con la afinidad más alta descrita hasta la fecha de Kd = 10· 15 M. Como el experto en la materia apreciará, la biotina es detectable indirectamente gracias a su capacidad de ser reconocida específicamente por la avidina o variantes de la misma como estreptavidina y neutravidina.
En otra realización particular, el grupo funcional es un fármaco. El término ''fármaco», en el contexto de la presente invención, se refiere a una sustancia química empleada en el tratamiento, cura o prevención de una enfermedad o condición, como una patología caracterizada por un aumento de expresión de TLR-4 y/o un aumento de activación de TLR
4. El término "patología caracterizada por un aumento de expresión de TLR-4 y/o un aumento de activación de TLR-4" se describe en detalle en el contexto de los usos médicos de la invención y su definición y particularidades se incluyen aquí por referencia.
El experto en la materia sabrá inmediatamente cuáles son los agentes están indicados para el tratamiento de una enfermedad en particular. Casi todos los agentes que se indican para el tratamiento de una patología caracterizada por un aumento de expresión de TLR-4 y/o un aumento de activación de TLR-4 pueden estar comprendidos en el complejo de la invención, aunque los agentes antagonistas de TLR-4 y los agentes anti-inflamatorios son particularmente preferidos. Aunque se pueden utilizar numerosos tipos de fármacos en el contexto de la invención, en una realización preferida, la presente invención contempla que el fármaco se seleccione del grupo que incluye, sin limitación, antagonistas de TLR-4, tales como naloxona, naltrexona, LPS, idulilast, propentofilina, amitriptilina, quetotifeno, ciclobenzaprina, mianserina e imipramina; antiagregantes plaquetarios, tales como aspirina y clopidogrel; anti-coagulantes, tales como heparina, acenocumarol, warfarina, dabigatrán y rivaroxaban; y antioxidantes, tales como edaravona. Si bien ya se ha mencionado en el contexto de los reactivos detectables, el activador tisular del plasminógeno y sus variantes recombinantes pueden ser igualmente considerados como un fármaco por su acción trombolítica.
La presente invención contempla que el fármaco sea un ácido nucleico. Así, en una realización preferida el fármaco es un ácido nucleico. Ácidos nucleicos aptos como fármacos en el contexto del complejo de la invención incluyen ARN antisentido, ADN antisentido y ARN pequeños de interferencia, que posean la capacidad de silenciar la expresión de genes implicados en una patología caracterizada por un aumento de expresión de TLR-4 y/o un aumento de activación de TLR-4, que incluyen, sin limitación, los genes NFKB1 > RIPK3, IFNB1, LY96 (MD-2), IRF3, TLR3, TlRAP (Ma0, TlCAMl (TRIF), RIPK1, TRAF6, CDI4, TRA M, IKBKG (/KK-gamma), IFNA1 y TLR4. El término UARN antisentido", en el contexto de la presente invención, se refiere a un ARN monocatenario cuya secuencia de nucleótidos es complementaria para un ARN mensajero diana, interfiriendo por ello con la expresión del gen respectivo. El término "ADN antisentido", en el contexto de la presente invención, se
P201 430955
refiere a un ADN monocatenario cuya secuencia de nucleótidos es complementaria para un
ARN mensajero diana, interfiriendo o silenciando por ello con la expresión del gen respectivo. El término "ARN pequeño de interferencia" o "ARNip" o "siRNA (del inglés small interfering RNA"), en el contexto de la presente invención, se refiere a un ARN bicatenario con una longitud de 20 a 25 nucleótidos que es altamente específico para la secuencia de nucleótidos de su ARN mensajero diana, interfiriendo por ello con la expresión del gen respectivo.
La presente invención contempla que el fármaco sea un péptido. Así, en una realización preferida el fármaco es un péptido El término "péptido", en el contexto de la presente invención, se refiere a una cadena corta de aminoácidos unidos por enlaces peptídicos. El péptido comprenderá al menos 2 aminoácidos, al menos 3 aminoácidos, al menos 4 aminoácidos, al menos 5 aminoácidos, al menos 10 aminoácidos, al menos 15 aminoácidos, al menos 20 aminoácidos, al menos 30 aminoácidos ácidos, al menos 40 aminoácidos, al menos 50 aminoácidos, al menos 60 aminoácidos, o al menos 70 aminoácidos. Adecuados para los fines de esta invención son, entre otros, péptidos con capacidad de unirse a una diana y de inducir o inhibir la señalización celular. El término "péptido de unión a diana", en el contexto de la presente invención, se refiere a un péptido que comprende una región de unión a la diana. El término "péptido de señalización", en el contexto de la presente invención, se refiere a un péptido con la capacidad de provocar la señalización celular, tales como péptidos agonistas de los receptores de células. Las secuencias de aminoácidos adecuados para la unión de moléculas diana incluyen secuencias de consenso de reconocimiento molecular bien conocido en la técnica.
La unión entre un aptámero de la invención y un grupo funcional para generar el complejo de la invención puede llevarse a cabo mediante técnicas de conjugación ampliamente conocidas por el experto en la materia. El resultado es una unión covalente entre el aptámero de la invención y el grupo funcional. La conjugación puede implicar la unión de aminas primarias de los extremos 3' o 5' del aptámero de la invención al grupo funcional durante la síntesis química del aptámero. Alternativamente, la conjugación puede efectuarse mediante reacciones convencionales de reacción cruzada (en inglés "cross-linking"), que tienen la ventaja de la reactividad química mucho mayor de etiquetas de alquil-amina primarias frente a las aminas de arilo de los propios nucleótidos. Los métodos de conjugación son bien conocidos en la técnica y se basan en el uso de reactivos de reticulación (en inglés "cross-linking reagents"). Los reactivos de reticulación contienen al menos dos grupos reactivos, que se dirigen a grupos tales como aminas primarias,
sulfhidrilos, aldehídos, carboxilos, hidroxilos, azidas y así sucesivamente, en la molécula a ser conjugada. Los agentes de reticulación difieren en la especificidad química, la longitud del brazo espaciador, composición brazo espaciador, brazo espaciador de escisión, y la estructura. Por ejemplo, la conjugación de complejos según la invención puede llevarse a cabo directamente o a través de un resto enlazador, a través de uno o más grupos no funcionales en el aptámero y/o el grupo funcional, tales como grupos amina, carboxilo, fenilo, tiol o hidroxilo. Se puede lograr enlaces más selectivos mediante el uso de un enlazador heterobifuncional. Enlazadores convencionales pueden ser utilizados, tales como diisiocyanates, diisotiocianatos, bis (hidroxisuccinimida) ésteres, carbodiimidas, ésteres de maleimida-hidroxisuccinimida, glutaraldehído y similares, ° hidrazinas e hidrazidas, tales como 4-(4-N-maleimidofenil)hidrazida de ácido butírico (MPBH).
Otra aproximación consiste en el marcaje de los aptámeros durante la síntesis por PCR mediante el empleo de cebadores marcados, por ejemplo, con un fluoróforo. Para ello, existen diversas casas comerciales disponibles para el experto en la materia.
Adicionalmente, en la realización particular en la que el grupo funcional sea un radionúclido, la unión entre un aptámero según la invención y el radionúclido puede llevarse a cabo mediante coordinación química, en donde los átomos del aptámero implicados en la unión donan electrones al radionúclido. Las reacciones de coordinación son ampliamente conocidas en la técnica y dependerán del radionúclido y el grupo reacti vo implicado en el aptámero.
Usos in vitro de la invención
A. Usos in vitro para detectar TLR-4
La presente invención también contempla usos in vitro de un aptámero de ácido nucleico con capacidad de unirse específicamente e inhibir a TLR-4 y que comprende una secuencia seleccionada del grupo que consiste en SEQ ID NO: 1 y SEO ID NO: 2 o una variante funcionalmente equivalente de las mismas, y de un complejo que comprende un aptámero de ácido nucleico con capacidad de unirse específicamente e inhibir a TLR-4 y que comprende una secuencia seleccionada del grupo que consiste en SEO ID NO: 1 y SEO ID NO: 2 o una variante funcionalmente equivalente de las mismas y un grupo funcional, para detectar TLR-4.
Por lo tanto, en otro aspecto, la presente invención se refiere a un uso in vitro de un aptámero de ácido nucleico con capacidad de unirse específicamente e inhibir a TLR-4 y que comprende una secuencia seleccionada del grupo que consiste en SEO ID NO: 1 y SEO ID NO: 2 o una variante funcionalmente equivalente de las mismas para detectar TLR
4.
Así, la capacidad de un aptámero según la invención de unirse específicamente a TLR-4 puede ser explotada para la detección indirecta de TLR-4 a través del aptámero según la invención. Para este propósito, el experto en la materia reconocerá que es necesaria una posterior detección de dicho aptámero. Las técnicas de detección de aptámeros son ampliamente conocidas en la técnica e incluyen, por ejemplo, el empleo de anticuerpos o de sondas específicas frente al aptámero. De esta manera, una vez que el aptámero según la invención está unido a TLR-4, se aplicaría un anticuerpo o sonda específica para el aptámero, que a su vez pueden estar marcados con un reactivo detectable, o que pueden ser detectados de manera indirecta mediante un anticuerpo o sonda secundaria. La técnica empleada para detectar TLR4 dependerá entonces del tipo de reactivo detectable, pudiendo ser técnicas basadas, por ejemplo, en fluorimetría, colorimetría o radiactividad.
El término "sonda» o "sonda de hibridación", en el contexto de la presente invención, se refiere a un fragmento de ADN o ARN de longitud variable, generalmente entre 10 y 1000 bases de longitud, que se utiliza para detectar la presencia de ácidos nucleicos de cadena sencilla (ADN o ARN) que son complementarios a la secuencia en la sonda. La sonda se hibrida al ácido nucleico de cadena sencilla diana, cuya secuencia de bases permite el emparejamiento de bases debido a la complementariedad entre la sonda y el ácido nucleico diana. Para detectar la hibridación de la sonda a su secuencia diana, la sonda está marcada con un reactivo detectable, tales como un radionúclido, un fluoróforo o digoxigenina, entre otros.
La detección de TLR-4 con el aptámero de la invención se puede llevar a cabo mediante ensayos de unión in vitro, tales como el ensayo de oligonucleótido ligado a enzimas (en inglés "Enzyme-Linked OligoNucleotide Assay", ELONA), el ensayo por absorción por aptámero ligado a enzimas (en inglés "Enzyme-Linked Apfamer Sorbent Assay", ELASA), precipitación y PCR cuantitativa (qPCR), ensayo de cambio de movilidad en gel (en inglés "gel mobility shift assay"), Western Blotting, resonancia de plasmón superticial (en inglés "surface plasman resonance», SPR), electroforesis capilar cinética, el ensayo de unión de
P201 430955
fluorescencia, aptahistoquímica, aptacitoquímica, microscopía de fluorescencia o citometría de flujo.
En otra realización particular de los usos in vitro de la invención, la detección de TLR-4 se realiza mediante un método seleccionado del grupo que consiste en ELONA, aptacitoquímica, aptahistoquímica y citometría de flujo.
El término "ELONA" o "ensayo de oligonucleótido ligado a enzimas" (en inglés "EnzymeUnked OligoNucleotide Assay"), en el contexto de la presente invención, se refiere a una técnica análoga al inmunoensayo por absorción ligado a enzimas (en inglés ~Enzyme-Unked ImmunoSorbent Assay", ELlSA), en donde el anticuerpo que se emplea para detectar la molécula de interés, en este caso TLR-4, se intercambia por un aptámero de detección específico para dicha molécula. El ensayo ELlSA está basado en el uso de antígenos o anticuerpo marcados, por ejemplo con enzimas, de manera que los complejos formados entre el antígeno diana y el anticuerpo marcado son complejos enzimáticamente activos. Puesto que uno de los componentes, en este caso el antígeno, está inmovilizado en un soporte, los complejos antígeno:anticuerpo están inmovilizados al soporte y, por tanto, pueden ser detectados mediante la adición de un sustrato específico de la enzima. En el caso de ELONA, el aptámero de detección puede estar unido covalentemente a una enzima,
o puede en sí ser detectado por un anticuerpo secundario específico del aptámero que esté conjugado a una enzima. Dicha enzima cataliza la transformación de un sustrato específico para producir una señal visible. Esta técnica se puede modificar para intercambiar la enzima por otro reactivo detectable, como puede ser un f1uoróforo. En el presente documento se emplean los términos ELONA y ELASA, o ensayo por absorción por aptámero ligado a enzimas (en inglés "Enzyme-Unked Aptamer Sorbent Assay" ), indistintamente. En una realización preferida la detección de TLR-4 se realiza mediante ELONA.
De manera análoga, los términos "aptacitoguímica" y "aptahistoguímica", en el contexto de la presente invención, se refieren a técnicas análogas a la inmunocitoquímica e inmunohistoquímica para la detección de TLR-4 sobre células y cortes histológicos, respectivamente, en donde el anticuerpo que se emplea para detectar la molécula de interés, en este caso TLR-4, se intercambia por un aptámero específico para dicha molécula. El aptámero de detección puede estar unido covalentemente a una enzima, o puede en sí ser detectado por un anticuerpo secundario específico del aptámero que esté conjugado a una enzima. Dicha enzima cataliza la transformación de un sustrato específico para producir una señal visible. Esta técnica se puede modificar para intercambiar la enzima
por otro reactivo detectable, como puede ser un fluoróforo. En una realización preferida la detección de TLR-4 se realiza mediante aptacitoquímica. En otra realización preferida la detección de TLR-4 se realiza mediante aptahistoquímica.
Alternativamente, el experto en la materia reconocerá que estas técnicas (ELONA, aptacitoquímica, aptahistoquímica) se pueden adaptar para intercambiar el anticuerpo de detección por una sonda específica del aptámero.
El término "citometría de flujo", en el contexto de la presente invención, se refiere a una técnica de análisis celular que implica medir las características de dispersión de luz y fluorescencia que poseen las células conforme se las hace pasar a través de un rayo de luz. Además de la dispersión de la luz, si previamente a su análisis se coloca a las células en presencia de aptámeros marcados con moléculas fluorescentes, se pueden evaluar que células poseen los antígenos complementarios a los aptámeros usados. La detección de fluorescencia se realiza con citofluorímetros de flujo (los conocidos como "citómetros" o "FACS" (en inglés "Fluorescence-Activated Cell Sorter'). Esta técnica , al igual que las anteriores, se desarrolló inicialmente para su uso con anticuerpos marcados flu orescentemente pero se puede adaptar fácilmente para su uso con el aptámero de la invención.
Como el experto en la materia apreciará, un complejo que comprende un aptámero de ácido nucleico con capacidad de unirse específicamente e inhibir a TLR-4 y que comprende una secuencia seleccionada del grupo que consiste en SEO ID NO: 1 y SEO ID NO: 2 o una variante funcionalmente equivalente de las mismas y un reactivo detectable es particularmente ventajoso para detectar TLR-4, puesto que dicho reactivo detectable posibilita la detección del aptámero comprendido en el complejo cuando está unido a TLR-4. La técnica empleada para detectar TLR-4 dependerá del tipo de reactivo detectable, pudiendo ser técnicas basadas, por ejemplo, en fluorimetría, colorimetría o radiactividad.
Así, en otro aspecto, la presente invención se refiere un complejo que comprende un aptámero de ácido nucleico con capacidad de unirse específicamente e inhibir a TLR-4 y que comprende una secuencia seleccionada del grupo que consiste en SEO ID NO: 1 y SEO ID NO: 2 o una variante funcionalmente equivalente de las mismas y un grupo funcional para detectar TLR-4.
En una realización particular, el grupo funcional es un reactivo detectable.
P201 430955
En otra realización particular de los usos in vitro de la invención, la detección de TLR-4 se realiza mediante un método seleccionado del grupo que consiste en ELONA, aptacitoquímica, aptahistoquímica y citometría de flujo.
Los términos "aptámero", "TLR~", "complejo", "grupo funcionar, "reactivo detectable", "ELONA", "aptacitoquímica", "aptahistoquímica" y "citometría de flujo" han sido descritos en detalle anteriormente y sus definiciones y particularidades se incluyen aquí por referencia.
10 Dado que las técnicas de ELlSA, inmunocitoquímica, inmunohistoquímica y citometría de flujo son bien conocidas en la técnica, el experto en la materia podrá realizar las adaptaciones necesarias para intercambiar el anticuerpo por el aptámero o complejo según la invención sin necesidad de realizar una experimentación indebida.
15 B. Usos in vitro para inhibir TLR-4
Tal y como se ha descrito con anterioridad, un aptámero de ácido nucleico con capacidad de unirse especificamente e inhibir a TLR-4 y que comprende una secuencia seleccionada del grupo que consiste en SEO ID NO: 1 y SEO ID NO: 2 o una variante funcionalmente 20 equivalente de las mismas puede inhibir la actividad de TLR-4, reduciendo los niveles de citoquinas pro-inflamatorias liberadas como resultado de su activación . La presente invención también contempla usos in vitro de un aptámero de ácido nucleico con capacidad de unirse específicamente e inhibir a TLR-4 y que comprende una secuencia seleccionada del grupo que consiste en SEO ID NO: 1 y SEO ID NO: 2 o una variante funcionalmente
25 equivalente de las mismas, y de un complejo que comprende un aptámero de ácido nucleico con capacidad de unirse específicamente e inhibir a TLR-4 y que comprende una secuencia seleccionada del grupo que consiste en SEQ ID NO: 1 y SEO ID NO: 2 o una variante funcionalmente equivalente de las mismas y un grupo funcional, para inhibir TLR-4.
30 Por tanto, en otro aspecto, la presente invención se refiere a un uso in vitro de un aptámero de ácido nucleico con capacidad de unirse específicamente e inhibir a TLR-4 y que comprende una secuencia seleccionada del grupo que consiste en SEO ID NO: 1 y SEO ID NO: 2 o una variante funcionalmente equivalente de las mismas para inhibir TLR~.
35 En otro aspecto, la presente invención se refiere a un uso in vitro de un complejo que comprende un aptámero de ácido nucleico con capacidad de unirse específicamente e
inhibir a TLR-4 y que comprende una secuencia seleccionada del grupo que consiste en SEO ID NO: 1 y SEO ID NO: 2 o una variante funcionalmente equivalente de las mismas y un grupo funcional, para inhibir TLR-4.
5 Métodos in vitro de la invención
A. Métodos in vitro para la detección de TLR-4
En otro aspecto, la presente invención se refiere a un método in vitro para la detección de 10 TLR-4 en una muestra, en adelante "el primer método in vitro de detección de TLR-4 de la invención" que comprende
i) poner en contacto dicha muestra con un aptámero de ácido nucleico con capacidad de unirse específicamente e inhibir a TLR-4 y que comprende una secuencia seleccionada del grupo que consiste en SEO ID NO: 1 y SEO ID NO: 2
15 o una variante funcionalmente equivalente de las mismas, ii) separar el aptámero no unido a TLR-4, y iii) detectar la presencia del aptámero unido al TLR-4 presente en la muestra.
En una primera etapa, el primer método in vitro de detección de la invención comprende
20 poner en contacto dicha muestra con un aptámero de ácido nucleico con capacidad de unirse específicamente e inhibir a TLR-4 y que comprende una secuencia seleccionada del grupo que consiste en SEO ID NO: 1 y SEO ID NO: 2 o una variante funcionalmente equivalente de las mismas.
25 Los términos "aptámero" y "TLR-4~ han sido descritos en detalle anteriormente y sus definiciones y particularidades se incluyen aquí por referencia.
El término "muestra" o "muestra biológica", en el contexto de la presente invención, se refiere a un cultivo celular o al material biológico aislado de un sujeto. La muestra biológica
30 puede contener cualquier material biológico adecuado para detectar el biomarcador deseado y puede comprender células y/o material no celular del sujeto. La muestra se puede aislar de cualquier tejido adecuado o fluido biológico tal como, por ejemplo, sangre, plasma, suero, orina, líquido cefalorraquídeo (LCR), corazón, cerebro. Las muestras utilizadas para la detección de TLR-4 son preferiblemente fluidos biológicos.
P201 430955
De manera alternativa, las muestras son muestras de biofluidos. Los términos "fluido biológico" y "biofluido" se utilizan indistintamente en el presente documento y se refieren a fluidos acuosos de origen biológico. El biofluido se puede obtener de cualquier localización (tales como sangre, plasma, suero, orina, bilis, líquido cefalorraquídeo, humor vítreo o acuoso, o cualquier secreción corporal), un exudado (como el líquido obtenido de un absceso o cualquier otro sitio de infección o inflamación), o el líquido obtenido de una articulación (tal como una articulación normal o una articulación afectada por una enfermedad como la artritis reumatoide). Los biofluidos utilizados para la detección de TLR-4 son preferiblemente muestras de sangre, plasma, suero o líquido cefalorraquídeo.
El aptámero según la invención se aplica sobre la muestra en un tampón adecuado para permitir la unión del aptámero a las moléculas de TLR-4 que puedan estar presentes en la muestra. Ejemplos no limitativos de tampones adecuados para permitir la unión del aptámero de la invención y TLR-4 incluyen PBS, TBS, tampón fosfato y tampón citrato. Preferiblemente, estos tampones contienen 1mM MgCb. La cantidad de aptámero necesaria para detectar las moléculas de TLR-4 presentes en la muestra dependerá tanto del tamaño de la muestra como de la cantidad de TLR-4 presente en la misma, y se podrá determinar fácilmente por procedimientos de optimización que son habituales en la técnica. De manera orientativa, la concentración de aptámero es de al menos 1 fM, al menos 10 fM, al menos 100 fM, al menos 1 pM, al menos 10 pM, al menos 100 pM, al menos 1 nM, al menos 10 nM, al menos 100 nM, al menos 1 ~M, al menos 10 ~M, al menos 100 ~M o más. Preferiblemente, la concentración de aptámero es de entre 100 fM Y 1 ~M, más preferiblemente entre 1 pM Y 100 nM, aún más preferiblemente entre 100 pM Y 1 nM.
El aptámero se incuba con la muestra a una temperatura adecuada y durante un tiempo suficiente para permitir la unión del aptámero a las moléculas de TLR-4 que puedan estar presentes en la muestra. La temperatura es, preferiblemente, entre 20°C y 37°C. De manera orientativa, el aptámero se incubará con la muestra durante al menos 5 min, al menos 10 min, al menos 15 min, al menos, 20 min, al menos 30 min, al menos 60 min, al menos 120 min o más.
Una vez que el aptámero se ha unido a las moléculas de TLR-4 que puedan estar presentes en la muestra, en una segunda etapa la muestra se lava para eliminar las moléculas de aptámero que no se hayan unido a TLR-4.
En una tercera etapa se detecta la presencia del aptámero unido al TLR-4 presente en la muestra. Puesto que el aptámero de la invención no es en sí mismo una molécula detectable, la etapa de detección es una etapa de detección indirecta a través de una segunda molécula detectable que se une específicamente al aptámero. La detección del aptámero unido a TLR-4 puede llevarse a cabo con prácticamente cualquier anticuerpo o reactivo conocido que se una con alta afinidad al aptámero de la invención. No obstante, es preferible el uso de un anticuerpo específico frente al aptámero, por ejemplo, suero policlonal, sobrenadantes de hibridoma, anticuerpos monoclonales o humanizados y fragmentos de los mismos. Dicho anticuerpo específico del aptámero está convenientemente marcado con un reactivo detectable. El término "reactivo detectable" ha sido descrito en detalle anteriormente y su definición y particularidades se incluyen aquí por referencia. Dicho reactivo se puede detectar por medio de fluorimetría o colorimetría utilizando aparatos adecuados para el tipo de reactivos y el tipo de muestra, que son conocidos para el experto en la materia. A modo de ejemplo, la muestra con el aptámero unido a las moléculas de TLR-4 presentes se incuba con un anticuerpo específico del aptámero está conjugado con una enzima, en condiciones similares a las condiciones de incubación con el aptámero, y los complejos TLR-4-aptámero-anticuerpo se detectan con la adición de un sustrato que es convertido por la enzima a un producto detectable, por ejemplo, por medio de fluorimetría en un microscopio de fluorescencia o por colorimetría en un espectrofotómetro. Alternativamente, la detección se puede realizar de manera análoga mediante el empleo de una sonda específica del aptámero marcada convenientemente con un reactivo detectable. El experto en la materia reconocerá que el primer método in vitro de la invención puede llevarse a cabo como parte de técnicas de detección tales como ELONA, ELASA, precipitación y qPCR, ensayo de cambio de movilidad en gel, Western Blotting, resonancia de plasmón superficial, electroforesis capilar cinética, ensayo de unión de fluorescencia, aptahistoquímica, aptacitoquímica, microscopía de fluorescencia o citometría de flujo.
Alternativamente, el aptámero según la invención puede estar unido a un grupo funcional formando parte de un complejo según la invención. Por lo tanto, en otro aspecto, la presente invención se refiere a un método in vitro para la detección de TLR-4 en una muestra, en adelante "el segundo método in vitro de detección de TLR-4 de la invención", que comprende
i) poner en contacto dicha muestra con un complejo que comprende un aptámero de
ácido nucleico con capacidad de unirse específicamente e inhibir a TLR-4 y que
comprende una secuencia seleccionada del grupo que consiste en SEQ ID NO:
y SEa ID NO: 2 o una variante funcionalmente equivalente de las mismas y un
grupo funcional, ii) separar el aptámero o complejo no unido a TLR-4, y iii) detectar la presencia del complejo unido al TLR-4 presente en la muestra.
Los términos "aptamero", "TLR-4" y "muestra" han sido descritos en detalle anteriormente y sus definiciones y particularidades se incluyen aquí por referencia. De igual forma, las particularidades de la primera y segunda etapas del primer método in vitro de detección de la invención aplican también al segundo método in vitro de detección de la invención y se
10 incluyen igualmente por referencia.
La tercera etapa del segundo método in vitro de detección de la invención comprende detectar la presencia del complejo de la invención unido al TLR-4 presente en la muestra. La detección del complejo según la invención puede llevarse a cabo con prácticamente 15 cualquier anticuerpo o reactivo conocido que se una con alta afinidad al aptámero de la invención o al grupo funcional. La detección del aptámero de la invención se ha descrito en detalle en el contexto del primer método in vitro de detección de la invención. De igual manera , en relación con el grupo funcional , la detección también puede llevarse a cabo con prácticamente cualquier anticuerpo o reactivo conocido que se una con alta afinidad a dicho
20 grupo funcional. Por esta razón, es particularmente conveniente para el segundo método in vitro de detección de la invención que el grupo funcional sea un reactivo detectable.
En una realización particular el grupo funcional es un reactivo detectable seleccionado del grupo formado por radionúclidos, fluoróforos, proteínas y haptenos.
Los términos "radionúclido", "fluoróforo", "proteína detectable" y "hapteno" han sido descritos en detalle anteriormente y sus definiciones y particularidades se incluyen aquí por referencia.
30 Como apreciará el experto en la materia, los reactivos detectables contemplados por la presente invención se pueden dividir entre los reactivos que son directamente detectables por sí mismos, como los radionúclidos o los fluoróforos, y los reactivos que son indirectamente detectables, tales como las proteínas o los haptenos.
35 En una realización preferida, el reactivo detectable es un radionúclido y la detección se realiza por detección de la radiación emitida por el radionúclido. Dicha radiación dependerá
P201 430955
del tipo de radionúclido, pudiendo ser una emisión de partículas a, partículas ¡3 o emisión de
tipo y. A este efecto, son ampliamente conocidas las técnicas de detección adecuadas para los diferentes radionúclidos. A modo de ejemplo, la emisión emitida por 1231 puede ser detectada por una cámara gamma.
En otra realización preferida, el reactivo detectable es un fluoróforo y la detección se realiza por detección de la fluorescencia emitida por el fluoróforo. El empleo de un fluoróforo requiere la excitación previa del mismo con una longitud de onda dentro de su espectro de excitación, lo cual provoca una emisión a una longitud de onda diferente. Las longitudes de onda de excitación y de emisión de los fluoróforos contemplados en la presente invención forman parte del estado de la técnica. La fluorescencia emitida puede detectarse, por ejemplo, por técnicas de fluorimetría empleando un espectrofotómetro de fluorescencia o un microscopio de fluorescencia.
En otra realización preferida, el reactivo detectable es una proteína. Ésta se podrá detectar
dependiendo del tipo de proteína utilizada. Por ejemplo:
una enzima requiere la adición de su sustrato específico que será detectable por
colorimetría, quimioluminiscencia o fluorimetría;
una proteína fluorescente, al igual que un fluoróforo, requiere la excitación a una
longitud de onda adecuada para ser detectable por fluorimetría (por ejemplo, las
longitudes de onda recogidas en la Tabla 1);
un antígeno o un hapteno requiere un anticuerpo u otra molécula que lo reconozca
específicamente. Para poder ser detectado, dicho anticuerpo o molécula específica
para el antígeno/hapteno necesita estar marcado, por ejemplo, con una enzima, y la
detección dependerá del tipo de marcaje.
El experto en la materia reconocerá que el segundo método in vitro de la invención puede llevarse a cabo como parte de técnicas de detección tales como ELONA, ELASA, precipitación y qPCR, ensayo de cambio de movilidad en gel, Western Blotting, resonancia de plasmó n superficial, electroforesis capilar cinética, ensayo de unión de fluorescencia, aptahistoquímica, aptacitoquímica, microscopía de fluorescencia o citometría de flujo.
En una realización particular, la detección de TLR-4 se realiza por medio de fluorescencia.
B. Métodos in vitro para la inhibición de TLR-4
P201 430955
En otro aspecto, la presente invención se refiere a un método in vitre para inhibir TLR-4 en una muestra, en adelante "el primer método in vitro de inhibición de TLR-4 de la invención", que comprende poner en contacto una muestra que comprende TLR-4 con un aptámero de ácido nucleico con capacidad de unirse específicamente e inhibir a TLR-4 y que comprende una secuencia seleccionada del grupo que consiste en SEO ID NO: 1 y SEO ID NO: 2 o una variante funcionalmente equivalente de las mismas, en condiciones adecuadas inhibir TLR
4.
Los términos "aptámero", "TLR-4", "inhibición de TLR-4" y "muestra" han sido descritos en detalle anteriormente y sus definiciones y particularidades se incluyen aquí por referencia.
En una realización particular, el TLR-4 de la muestra está comprendido en células vivas.
El primer método in vitro de inhibición de TLR-4 de la invención comprende poner en contacto una muestra que comprende TLR-4 con un aptámero de acuerdo con la invención en condiciones adecuadas inhibir TLR-4. Para ello, el aptámero se aplica de la invención sobre la muestra y se debe unir a TLR-4.
El término "condiciones adecuadas inhibir TLR-4", en el contexto de la presente invención, se refiere a las condiciones de incubación que permiten la unión del aptámero de invención a TLR-4 y su posterior inhibición. Estas condiciones incluyen la composición del tampón en el que se aplica el aptámero de la invención sobre la muestra, la cantidad de aptámere, el tiempo de incubación y la temperatura de incubación. Ejemplos no limitativos de tampones adecuados para permitir la unión del aptámero de la invención a TLR-4 y su inhibición incluyen PBS, TBS, tampón fosfato y tampón citrato. Preferiblemente, estos tampones contienen 1mM MgCI2. La cantidad de aptámero necesaria para detectar las moléculas de TLR-4 presentes en la muestra dependerá tanto del tamaño de la muestra como de la cantidad de TLR-4 presente en la misma, y se podrá determinar fácilmente por procedimientos de optimización que son habituales en la técnica. De manera orientativa, la concentración de aptámero es de al menos 1 fM, al menos 10 fM, al menos 100 fM, al menos 1 pM, al menos 10 pM, al menos 100 pM, al menos 1 nM, al menos 10 nM, al menos 100 nM, al menos 1 IJM, al menos 10 IJM, al menos 100 IJM o más. Preferiblemente, la concentración de aptámero es de entre 100 fM Y 1 IJM, más preferiblemente entre 1 pM Y 100 nM, aún más preferiblemente entre 100 pM Y 1 nM.
P201 430955
El aptámero se incuba con la muestra a una temperatura adecuada y durante un tiempo suficiente para permitir la unión del aptámero a las moléculas de TLR-4 que puedan estar presentes en la muestra. La temperatura es, preferiblemente, entre 20°C y 37°C, más preferiblemente 37°C. De manera orientativa, el aptámero se incubará con la muestra
5 durante al menos 5 min, al menos 10 min, al menos 15 min, al menos, 20 min, al menos 30 min, al menos 60 min, al menos 120 min o más.
En otro aspecto, la presente invención se refiere a un método in vitro para inhibir TLR-4 en una muestra, en adelante "el segundo método in vitro de inhibición de TLR-4 de la
10 invención", que comprende poner en contacto una muestra que comprende TLR-4 con un complejo que comprende un aptámero de ácido nucleico con capacidad de unirse específicamente e inhibir a TLR-4 y que comprende una secuencia seleccionada del grupo que consiste en SEa ID NO: 1 y SEa ID NO: 2 o una variante funcionalmente equivalente de las mismas y un grupo funcional en condiciones adecuadas inhibir TLR-4.
Los términos "aptámero", "TLR-4", "inhibición de TLR-4", "muestra" y "condiciones adecuadas inhibir TLR-4" han sido descritos en detalle anteriormente y sus definiciones y
particularidades se incluyen aquí por referencia.
20 Usos médicos de la invención
Los autores de la presente invención han demostrado que el aptámero de la invención es capaz de bloquear o inhibir el volumen de infarto producido en un modelo de ictus inducido en animales de experimentación, como se describe en el Ejemplo 4. Por lo tanto, la 25 capacidad del aptámero de la invención de unirse específicamente e inhibir a TLR-4 hace que éste tenga una utilidad terapéutica. Es aparente que el efecto terapéutico obtenido con el aptámero de la invención puede ser complementado con un grupo funcional con actividad terapéutica, tal y como se ha descrito en el contexto del complejo de la invención En consecuencia, la presente invención contempla los usos médicos del aptámero de la
30 invención y del complejo de la invención
A. Usos médicos del aptámero de la invención
En otro aspecto, la presente invención se refiere un aptámero de ácido nucleico con 35 capacidad de unirse específicamente e inhibir a TLR-4 y que comprende una secuencia
P201 430955
seleccionada del grupo que consiste en SEO ID NO: 1 y SEa ID NO: 2 o una variante funcionalmente equivalente de las mismas para su uso en medicina.
En otro aspecto, la presente invención se refiere a un aptámero de ácido nucleico con capacidad de unirse específicamente e inhibir a TLR4 y que comprende una secuencia seleccionada del grupo que consiste en SEO ID NO: 1 y SEa ID NO: 2 o una variante funcionalmente equivalente de las mismas para su uso en la fabricación de un medicamento para el tratamiento una patología caracterizada por un aumento de expresión de TLR-4 y/o un aumento de activación de TLR-4.
Alternativamente, se puede expresar como el uso de un aptámero de ácido nucleico con capacidad de unirse específicamente e inhibir a TLR-4 y que comprende una secuencia seleccionada del grupo que consiste en SEO ID NO: 1 y SEa ID NO: 2 o una variante funcionalmente equivalente de las mismas para su uso en el tratamiento de una patología caracterizada por un aumento de expresión de TLR-4 y/o un aumento de activación de TLR
4.
Alternativamente, se puede expresar como método in vivo de tratamiento de una patología caracterizada por un aumento de expresión de TLR-4 y/o un aumento de activación de TLR4 en un sujeto, que comprende la administración a dicho sujeto de una cantidad terapéuticamente efectiva de un aptámero de ácido nucleico con capacidad de unirse específicamente e inhibir a TLR-4 y que comprende una secuencia seleccionada del grupo que consiste en SEa ID NO: 1 y SEa ID NO: 2 o una variante funcionalmente equivalente de las mismas a dicho sujeto.
De acuerdo con la invención, un aptámero de ácido nucleico con capacidad de unirse específicamente e inhibir a TLR-4 y que comprende una secuencia seleccionada del grupo que consiste en SEa ID NO: 1 y SEa ID NO: 2 o una variante funcionalmente equivalente de las mismas se une específicamente a TLR-4 en la superficie de un célula diana. Al contactar el aptámero de la invención a TLR-4 inhibe su actividad, resultando en una reducción o interrupción en la liberación de citoquinas pro-inflamatorias tales como IL-1 , IL8, TNF-alfa e IL-12.
El término "aptámero" ha sido descrito en detalle en relación con las Definiciones y el Aptámero específico de TLR-4 (supra ) y sus definiciones y particularidades aplican igualmente en el contexto del complejo de la invención.
P201 430955
El término "tratamiento" o "terapia", en el contexto de la presente invención, se refiere a la intervención clínica en un intento de prevenir, curar, retrasar, reducir la gravedad de, o mejorar uno o más síntomas de la patología caracterizada por un aumento de expresión de TLR-4 y/o un aumento de activación de TLR-4, o con el fin de prolongar la supervivencia de un paciente más allá de lo esperado en la ausencia de tal tratamiento.
El término "célula diana", en el contexto de la presente invención, se refiere a la célula particular que expresa TLR-4, que incluye, entre otras, células del linaje mieloide como monocitos, macrófagos, células de microglía, granulocitos y células dendríticas inmaduras, así como células de otros linajes tales como neuronas, etc. En una realización particular, la célula diana es un monocito o un macrófago. En otra realización particular, la célula diana es una célula de microglía. En otra realización particular, la célula diana es un granulocito. En otra realización particular, la célula diana es una célula dendrítica inmadura. En otra realización particular, la célula diana es una neurona.
En una realización particular, la célula diana es una célula de mamifero. En otra realización preferida, la célula de mamífero es una célula humana.
El término "sujeto" o "individuo" se refiere a un miembro de una especie de mamífero, e
incluye, pero no se limita a animales domésticos, y los primates incluidos los seres humanos; el sujeto es preferiblemente un ser humano, hombre o mujer, de cualquier edad o raza.
El término "una cantidad terapéuticamente efectiva", en el contexto de la presente invención, se refiere a la cantidad del aptámero de la invención que se requiere para alcanzar una prevención, curación, retraso, reducción de la gravedad de, o mejora de uno o más síntomas apreciables de la patología caracterizada por un aumento de expresión de TLR-4 y/o un aumento de activación de TLR-4.
El término "patología caracterizada por un aumento de expresión de TLR-4 y/o un aumento de activación de TLR-4", en el contexto de la presente invención, se refiere a una patología en la que las células que expresan TLR-4 muestran un aumento de expresión de TLR-4 y/o un aumento de activación de TLR-4 con respecto a condiciones fisiológicas normales o de referencia o valores de referencia, y en la que dichas células están directa o indirectamente implicadas independientemente de que TLR-4 sea o no el responsable de la enfermedad.
Dado que la activación de TLR-4 produce una cascada de señalización que da como resultado la liberación de citoquinas inflamatorias como IL-1 , IL-8, TNF-alfa e IL-12, provocando inflamación y daño celular, la patología caracterizada por un aumento de
expresión de TLR-4 y/o un aumento de activación de TLR-4 puede estar caracterizada, además, por tener un componente inflamatorio.
En una realización particular, dicha patología caracterizada por un aumento de expresión de TLR-4 y/o un aumento de activación de TLR-4 se selecciona del grupo formado, entre otros, por ictus, infarto agudo de miocardio, sepsis, aterosclerosis, esclerosis múltiple, artritis reumatoide y drogadicción.
En una realización preferida, dicha patología caracterizada por un aumento de expresión de TLR-4 y/o un aumento de activación de TLR-4 es ictus. El término "ictus" o "enfermedad cerebrovascular" o "infarto cerebrar o "apoplejía", en el contexto de la presente invención, se refiere a una patología caracterizada por un déficit neurológico ocasionado por una disminución importante del flujo sanguíneo cerebral, de forma anormalmente brusca (ictus isquémico) o bien, por la hemorragia originada por la rotura de un vaso cerebral (ictus hemorrágico). En el ictus isquémico se pierde la irrigación sanguínea debido a la interrupción súbita e inmediata del flujo sanguíneo, lo que genera la aparición de una zona infartada debido a la oclusión de alguna de las arterias que irrigan la masa encefálica, ya sea por acumulación de fibrina o de calcio o por alguna anormalidad en los eritrocitos, pero generalmente es por ateroesclerosis o bien por un émbolo (embolia cerebral) que procede de otra localización, fundamentalmente el corazón u otras arterias. En el ictus hemorrágico, se produce la rotura de un vaso sanguíneo encefálico que, por una parte, priva de riego al área cerebral dependiente de esa arteria, pero por otra parte la sangre extravasada ejerce compresión sobre las estructuras cerebrales, incluidos otros vasos sanguíneos, lo que aumenta el área afectada.
En una realización preferida, dicha patología caracterizada por un aumento de expresión de TLR-4 y/o un aumento de activación de TLR-4 es infarto agudo de miocardio. El término "infarto agudo de miocardio" o "infarto" o "ataque al corazón", en el contexto de la presente invención, se refiere a una patología caracterizada por un riego sanguíneo insuficiente, con daño tisular, en una parte del corazón, producido por una obstrucción en una de las arterias coronarias. La isquemia o suministro deficiente de oxígeno que resulta de tal obstrucción produce la angina de pecho, que si se recanaliza precozmente no produce muerte del tejido
P201 430955
cardíaco, mientras que si se mantiene esta anoxia se produce la lesión del miocardio y finalmente la necrosis, es decir, el infarto.
En una realización preferida, dicha patología caracterizada por un aumento de expresión de TLR-4 y/o un aumento de activación de TLR-4 es sepsis. El término "sepsis" o "septicemia", en el contexto de la presente invención, se refiere al síndrome de respuesta inflamatoria sistémica (SRIS) provocado por una infección, generalmente grave. Esta reacción del organismo se produce como respuesta a la presencia de microorganismos patógenos en cualquier tejido o fluido del organismo, y está causada por la acción del propio sistema inmune, que libera sustancias pro-inflamatorias que ponen en marcha el SRIS. Se caracteriza por la presencia de al menos dos de los siguientes criterios: fiebre, hipertermia, taquipnea, taquicardia y leucocitosis.
En una realización preferida, dicha patología caracterizada por un aumento de expresión de TLR-4 y/o un aumento de activación de TLR-4 es aterosclerosis. El término "aterosclerosis", en el contexto de la presente invención, se refiere a un síndrome o patología caracterizado por el depósito e infiltración de sustancias lipídicas en las paredes de las arterias de mediano y grueso calibre. Las células de la pared arterial interpretan este depósito como una invasión y activan a los monocitos circulantes sistema inmune, que penetran en la pared de la arteria, se transforman en macrófagos y comienzan a fagocitar partículas de LDL generando un proceso inflamatorio. La inflamación provoca a su vez la multiplicación y migración de las células musculares lisas de la pared, que van produciendo estrechamientos de la luz arterial. Los engrosamientos concretos son denominados placa de ateroma. Es la forma más común de arteriosclerosis. Las enfermedades que forman el síndrome de ateroesclerosis y que se caracterizan por afectación de las arterias por placas de ate roma y en consecuencia obstrucción al flujo sanguíneo o isquemia son, dependiendo de la arteria del órgano afectado:
Cardiopatía isquémica, con su máximo representante el infarto agudo de miocardio,
en el corazón.
Enfermedad cerebrovascular, en forma de ictus o trombosis cerebral o hemorragia
cerebral, en el sistema nervioso central.
Claudicación intermitente, con su máxima gravedad de isquemia arterial aguda de
miembros inferiores.
Disfunción eréctil: Es la principal causa de impotencia en personas mayores de 40
35 años.
P201 430955
Colitis isquémica, es un área de inflamación (irritación e hinchazón) causada por
interferencia con el flujo sanguíneo al colon (intestino grueso), en las arterias de los
intestinos.
Aneurisma de aorta, con su máxima gravedad en la disección de aorta.
En una realización preferida, dicha patología caracterizada por un aumento de expresión de TLR-4 y/o un aumento de activación de TLR-4 es esclerosis múltiple. El término "esclerosis múltiple", en el contexto de la presente invención, se refiere a una patología caracterizada por la aparición de lesiones desmielinizantes, neurodegenerativas y crónicas del sistema
10 nervioso central. Actualmente se desconocen las causas que la producen aunque se ha demostrado la implicación de diversos mecanismos autoinmunes. En pacientes de esclerosis múltiple, los linfocitos cruzan la barrera hematoencefálica para atacar a la mielina, mientras que aparece un proceso inflamatorio facilitado por macrófagos y células de neuroglía.
15 En una realización preferida, dicha patología caracterizada por un aumento de expresión de TLR-4 y/o un aumento de activación de TLR-4 es artritis reumatoide. El término "artritis reumatoide", en el contexto de la presente invención, se refiere a una patología inflamatoria sistémica autoinmune, caracterizada por provocar una sinovitis persistente de las
20 articulaciones, produciendo su destrucción progresiva generando distintos grados de deformidad e incapacidad funcional. El proceso se inicia con la intervención de factores humorales y celulares, particularmente linfocitos T CD4, que generan moléculas mediadoras de la inflamación, atraen y activan células de la sangre periférica, produciendo proliferación y activación de los sinoviocitos, invadiendo y destruyendo el cartílago articular, el hueso
25 subcondral, tendones y ligamentos.
En una realización preferida, dicha patología caracterizada por un aumento de expresión de TLR-4 y/o un aumento de activación de TLR-4 es una drogadicción. El término "drogadicción" o "drogodependencia" o "farmacodependencia", en el contexto de la presente 30 invención, se refiere a un trastorno o patología causada por el frecuente uso de sustancias
adictivas llamadas drogas o fármacos. Según el CIE-10 (Organización Mundial de la Salud, 2005) para poder ser diagnosticada como tal, la drogodependencia ha de presentar tres o más de los siguientes criterios, que hacen referencia tanto a aspectos relacionados con la dependencia física como con la psicológica, en un periodo de 12 meses:
35 fuerte deseo de consumir la sustancia (en inglés craving), dificultades para controlar dicho consumo,
P201 430955
síndrome de abstinencia al interrumpir o reducir el consumo, tolerancia, abandono progresivo de intereses ajenos al consumo de la sustancia, inversión cada vez mayor de tiempo en actividades relacionadas con la obtención de
5 la sustancia o con la recuperación de sus efectos, persistencia en el uso de la sustancia a pesar de percibir de forma clara sus efectos perjudiciales.
Para la administración a un sujeto de un aptámero de ácido nucleico con capacidad de
10 unirse específicamente e inhibir a TLR-4 y que comprende una secuencia seleccionada del grupo que consiste en SEO ID NO: 1 y SEO ID NO: 2 o una variante funcionalmente equivalente de las mismas, dicho aptámero se formulará en una composición farmacéutica adecuada. Los detalles de dicha composición farmacéutica se discuten a continuación.
15 B. Usos médicos del complejo de la invención
Los complejos de acuerdo a la presente invención que comprenden un aptámero de ácido nucleico con capacidad de unirse específicamente e inhibir a TLR-4 y que comprende una secuencia seleccionada del grupo que consiste en SEO ID NO: 1 y SEO ID NO: 2 o una 20 variante funcionalmente equivalente de las mismas y un grupo funcional de acuerdo a la invención pueden comprender, como grupo funcional, un fármaco adecuado para el tratamiento de una patología caracterizada por un aumento de expresión de TLR-4 y/o un aumento de activación de TLR-4. De esta forma se logra por tanto el doble objetivo de (i) inhibir la actividad de TLR-4 y (ii) dirigir el fármaco de manera específica a su lugar de
25 acción.
Por lo tanto, en otro aspecto, la presente invención se refiere a un complejo que comprende un aptámero de ácido nucleico con capacidad de unirse específicamente e inhibir a TLR-4 y que comprende una secuencia seleccionada del grupo que consiste en SEO ID NO: 1 y
30 SEO ID NO: 2 o una variante funcionalmente equivalente de las mismas y un grupo funcional para su uso en medicina.
En otro aspecto, la presente invención se refiere a un complejo que comprende un aptámero de ácido nucleico con capacidad de unirse específicamente e inhibir a TLR-4 y que 35 comprende una secuencia seleccionada del grupo que consiste en SEO ID NO: 1 y SEO ID NO: 2 o una variante funcionalmente equivalente de las mismas y un grupo funcional para
P201 430955
su uso en la fabricación de un medicamento para el tratamiento de una patología
caracterizada por un aumento de expresión de TLR-4 y/o un aumento de activación de TLR
4.
Alternativamente, se puede expresar como el uso de un complejo que comprende un aptámero de ácido nucleico con capacidad de unirse específicamente e inhibir a TLR-4 y que comprende una secuencia seleccionada del grupo que consiste en SEQ ID NO: 1 y SEQ ID NO: 2 o una variante funcionalmente equivalente de las mismas y un grupo funcional para su uso en el tratamiento de una patología caracterizada por un aumento de expresión de TLR-4 y/o un aumento de activación de TLR-4.
Alternativamente, se puede expresar como método de tratamiento de una patología caracterizada por un aumento de expresión de TLR-4 y/o un aumento de activación de TLR4 en un sujeto, que comprende la administración a dicho sujeto de una cantidad terapéutica mente efectiva de un complejo que comprende un aptámero de ácido nucleico con capacidad de unirse específicamente e inhibir a TLR-4 y que comprende una secuencia seleccionada del grupo que consiste en SEQ ID NO: 1 y SEQ ID NO: 2 o una variante funcionalmente equivalente de las mismas y un grupo funcional a dicho sujeto.
De acuerdo con la invención, un complejo que comprende un aptámero de ácido nucleico con capacidad de unirse específicamente e inhibir a TLR-4 y que comprende una secuencia seleccionada del grupo que consiste en SEQ ID NO: 1 y SEQ ID NO: 2 o una variante funcionalmente equivalente de las mismas y un fármaco se une específicamente a TLR-4 en la superficie de un célula diana. Al contactar el aptámero de la invención a TLR-4 inhibe su actividad, resultando en una reducción o interrupción en la liberación de citoquinas proinflamatorias tales como IL-1, IL-8, TNF-alfa e IL-12, y el fármaco ejerce su función sobre la
célula o sobre el entorno donde se encuentra dicha célula.
Los términos "aptámero", "complejo", "grupo funcional", ''fármaco", "tratamiento", ~cantidad terapéuticamente efectiva", ~sujeto", "célula diana" y "patología caracterizada por un aumento de expresión de TLR-4 y/o un aumento de activación de TLR-4" han sido descritos en detalle anteriormente y sus definiciones y particularidades se incluyen aquí por
referencia.
Fármacos adecuados que pueden ser usados como grupos funcionales en los complejos formados con un aptámero de ácido nucleico con capacidad de unirse específicamente e
inhibir a TLR-4 incluyen, sin limitación, antagonistas de TLR-4, tales como naloxona, naltrexona, LPS, idulilast, propentofilina, amitriptilina, quetotifeno, ciclobenzaprina, mianserina e imipramina; antiagregantes plaquetarios, tales como aspirina y clopidogrel; anti-coagulantes, tales como heparina, acenocumarol, warfarina, dabigatrán y rivaroxaban; y antioxidantes, tales como edaravona; el activador tisular del plasminógeno y sus variantes recombinantes; ácidos nucleicos que posean la capacidad de silenciar la expresión de genes implicados en una patología caracterizada por un aumento de expresión de TLR-4 y/o un aumento de activación de TLR-4, tales como ARN antisentido, ADN antisentido y ARN pequeños de interferencia; péptidos, tales como péptidos de señalización y péptidos de unión a diana.
Composiciones farmacéuticas
Para la administración a un sujeto en necesidad del mismo de un aptámero de ácido nucleico con capacidad de unirse específicamente e inhibir a TLR-4 y que comprende una secuencia seleccionada del grupo que consiste en SEO ID NO: 1 y SEO ID NO: 2 o una variante funcionalmente equivalente de las mismas, o un complejo que comprende un aptámero de ácido nucleico con capacidad de unirse específicamente e inhibir a TLR-4 y que comprende una secuencia seleccionada del grupo que consiste en SEO ID NO: 1 y SEO ID NO: 2 o una variante funcionalmente equivalente de las mismas y un grupo funcional, dichos aptámeros y complejos se pueden formular en composiciones farmacéuticas adecuadas.
En otro aspecto, la presente invención se refiere a una composición farmacéutica , en adelante "la primera composición farmacéutica de la invención", que comprende al menos un aptámero de ácido nucleico con capacidad de unirse específicamente e inhibir a TLR-4 y que comprende una secuencia seleccionada del grupo que consiste en SEO ID NO: 1 y SEO ID NO: 2 o una variante funcionalmente equivalente de las mismas.
En una realización particular, la primera composición farmacéutica de la invención comprende además uno o más soportes, excipientes, o solventes farmacéuticamente aceptables.
En otro aspecto, la presente invención se refiere a una composición farmacéutica, en adelante "la segunda composición farmacéutica de la invención", que comprende al menos un complejo que comprende un aptámero de ácido nucleico con capacidad de unirse
P201 430955
específicamente e inhibir a TLR-4 y que comprende una secuencia seleccionada del grupo
que consiste en SEO ID NO: 1 y SEO ID NO: 2 o una variante funcionalmente equivalente de las mismas y un grupo funcional.
En una realización particular, la segunda composición farmacéutica de la invención comprende además uno o más soportes, excipientes, o solventes farmacéuticamente aceptables.
Las composiciones farmacéuticas proporcionadas por la presente invención pueden administrarse a un sujeto para el tratamiento de una patolog ía caracterizada por un aumento de expresión de TLR-4 y/o un aumento de activación de TLR-4.
Los términos "aptámero", "complejo", "grupo funcional", "fármaco", "tratamiento", "sujeto" y "patología caracterizada por un aumento de expresión de TLR-4 y/o un aumento de activación de TLR-4" han sido descritos en detalle anteriormente y sus definiciones y particularidades se incluyen aqui por referencia.
El término "soporte farmacéuticamente aceptable" o "excipiente farmacéuticamente aceptable" o "solvente farmacéuticamente aceptable", en el contexto de la presente invención, pretende incluir cualquiera y todos los disolventes, medios de dispersión, recubrimientos, agentes antibacterianos y antifúngicos, agentes retardan tes de la absorción e isotónicos, y similares, compatibles con la administración farmacéutica. El uso de tales soportes y vehículos en sustancias farmacéuticamente activas es bien conocido en la técnica. Excepto en la medida en que cualquier soporte convencional es incompatible con el compuesto activo, se contempla su uso en las composiciones de la invención. Los vehículos aceptables, excipientes, o estabilizadores aceptables no son tóxicos para el sujeto a las dosis y concentraciones empleadas, e incluyen tampones tales como fosfato, citrato, y otros ácidos orgánicos; antioxidantes incluyendo ácido ascórbico y metionina; conservantes (tales como cloruro de octadecildimetilbencil amonio, cloruro de hexametonio, cloruro de benzalconio, cloruro de bencetonio; fenol, butilo o alcohol bencílico; alquil para benos tales como metil o propil parabeno; catecol; resorcinol; ciclohexanol; 3-pentanol, y m-cresol); polipéptidos de bajo peso molecular (menos de aproximadamente 10 aminoácidos); proteínas, tales como albúmina de suero, gelatina, o inmunoglobulinas; polímeros hidrófilos tales como polivinilpirrolidona; aminoácidos tales como glicina, glutamina, asparagina, histidina, arginina o lisina; monosacáridos, disacáridos, y otros carbohidratos incluyendo la glucosa, manosa, o dextrinas; agentes quelantes tales como EOTA; azúcares tales como
sacarosa, manitol, trehalosa o sorbitol; contra-iones formadores de sales tales como sodio;
complejos metálicos (por ejemplo, complejos de Zn-proteína); y/o tensioactivos no iónicos tales como TWEEN'", PLURONICS'" o polietilenglicol (PEG).
También se pueden incorporar en la composición farmacéutica proporcionada por la presente invención compuestos activos suplementarios. Por lo tanto, en una realización particular, la composición farmacéutica proporcionada por la presente invención puede también contener más de un compuesto activo según sea necesario para la indicación particular que se trata, preferentemente aquellos con actividades complementarias que no afectan de manera adversa entre sí. Por ejemplo, puede ser deseable proporcionar además un agente quimioterapéutico, una citoquina, un agente analgésico, un agente antiinflamatorio o un agente inmunosupresor. La cantidad eficaz de dichos otros agentes activos depende, entre otras cosas, de la cantidad terapéutica de los aptámeros o de los complejos que están presentes en la composición farmacéutica, la naturaleza y la gravedad de la patología a tratar, el sujeto, etc.
En una forma de realización, el aptámero de ácido nucleico con capacidad de unirse específicamente e inhibir a TLR-4 y que comprende una secuencia seleccionada del grupo que consiste en SEO ID NO: 1 y SEO ID NO: 2 o una variante funcionalmente equivalente de las mismas, o el complejo de la invención, se formulan con vehículos que protegerán dichos productos frente a una eliminación rápida del cuerpo, tales como una formulación de liberación controlada, incluyendo implantes y sistemas de suministro microencapsulados. Se pueden utilizar polímeros biodegradables y biocompatibles, tales como etileno-acetato de vinilo, polianhídridos, ácido poliglicólico, colágeno, poliortoésteres, y ácido poliláctico. Los métodos para la preparación de tales formulaciones serán evidentes para los expertos en la técnica. Estos se pueden preparar de acuerdo con métodos conocidos por los expertos en la técnica, por ejemplo, como se describe en EE.UU. 4522, 811.
Las composiciones farmacéuticas proporcionadas por la presente invención pueden ser administradas a un sujeto mediante cualquier ruta de administración adecuada, como por ejemplo por vía parenteral.
El término "parenteral", en el contexto de la presente invención, incluye la administración intravenosa, intraperitoneal, intramuscular, o subcutánea. La forma intravenosa de administración parenteral es generalmente preferida.
P201 430955
Además, las composiciones farmacéuticas proporcionadas por la presente invención se pueden administrar de forma adecuada por infusión de pulsos, por ejemplo, con dosis decrecientes del aptámero o del complejo de la invención. Preferiblemente, la dosificación se proporciona mediante inyecciones, más preferiblemente inyecciones intravenosas o subcutáneas, dependiendo en parte de si la administración es breve o crónica.
En otra realización particular, las composiciones farmacéuticas proporcionadas por la presente invención se pueden adaptar para la administración parenteral con la adición de soluciones estériles, suspensiones o productos liofilizados en la forma de dosificación adecuada. Las composiciones farmacéuticas adecuadas para uso inyectable incluyen soluciones acuosas estériles o dispersiones o polvos estériles para la preparación de soluciones o dispersiones inyectables estériles. Para la administración intravenosa, los vehículos adecuados incluyen solución salina fisiológica, agua bacteriostática CremophorEM (BASF, Parsippany, NJ) o tampón fosfato salino (PBS). En todos los casos, la composición debe ser estéril y fluida para facilitar la inyectabilidad. Debe ser estable en las condiciones de fabricación y almacenamiento y debe conservarse frente a la acción contaminante de microorganismos tales como bacterias y hongos. El vehículo puede ser un disolvente o medio de dispersión que contiene, por ejemplo, agua, etanol, un poliol farmacéuticamente aceptable como glicerol, propilenglicol, polietilenglicol líquido, y mezclas adecuadas de los mismos. La fluidez apropiada puede mantenerse, por ejemplo, mediante el uso de un recubrimiento tal como lecitina, mediante el mantenimiento del tamaño de partícula requerido en el caso de dispersión y por el uso de tensioactivos. La prevención de la acción de microorganismos puede lograrse mediante diversos agentes antibacterianos y antifúngicos, por ejemplo, parabenos, clorobutanol, fenol, ácido ascórbico, timerosal, y similares. En muchos casos, será preferible incluir en la composición agentes isotónicos, por ejemplo, azúcares, poli alcoholes tales como manitol, sorbitol, y cloruro de sodio. La absorción prolongada de las composiciones inyectables puede provocarse incluyendo en la composición un agente que retrase la absorción, por ejemplo, monoestearato de aluminio y/o gelatina.
Las soluciones inyectables estériles pueden prepararse incorporando la cantidad requerida del compuesto activo (por ejemplo, un aptámero o complejo de la invención) en un disolvente apropiado con uno o una combinación de los ingredientes enumerados anteriormente, según se requiera, seguido de esterilización por filtración. Generalmente, las dispersiones se preparan incorporando el compuesto activo en un vehículo estéril que contiene un medio de dispersión básico y los otros ingredientes requeridos de los
P201 430955
enumerados anteriormente. En el caso de polvos estériles para la preparación de soluciones inyectables estériles, los métodos preferidos de preparación son el secado al vacío y el secado por congelación que produce un polvo del ingrediente activo más cualquier ingrediente adicional deseado a partir de una solución previamente filtrada estéril del mismo.
En una realización particular, dicha composición farmacéutica se administra a través de vía intravenosa. Excipientes adecuados pueden ser utilizados, tales como agentes de carga, agentes tamponantes o tensioactivos. Las formulaciones mencionadas se prepararán usando métodos estándar tales como los descritos o contemplados en las farmacopeas española y estadounidense y textos de referencia similares.
Es especialmente ventajoso formular las composiciones farmacéuticas, a saber, las composiciones parenterales, en forma de unidad de dosificación para facilitar la administración y uniformidad de dosificación. Forma de unidad de dosificación como se usa en el presente documento se refiere a unidades físicamente discretas adecuadas como dosificaciones unitarias para el sujeto a tratar; conteniendo cada unidad una cantidad predeterminada de compuesto activo (un aptámero o complejo de la invención) calculada para producir el efecto terapéutico deseado en asociación con el vehículo farmacéutico requerido. La especificación para las formas unitarias de dosificación de la invención están dictadas por y dependen directamente de las características únicas del compuesto activo y el efecto terapéutico particular a conseguir, y las limitaciones inherentes en la técnica de composición de tal compuesto activo para el tratamiento de sujetos.
Los compuestos activos (aptámero o complejo de la invención) se administrarán típicamente una o más veces al día, por ejemplo 1, 2, 3 o 4 veces diarias, con dosis diarias totales típicas en el intervalo de 0,0001 a 1,000 mg/kg de peso corporal/día, preferiblemente de aproximadamente 0,001 a aproximadamente 100 mg/kg de peso corporal/día, más preferiblemente de aproximadamente 0,01 a 10 mg/kg de peso corporal/día. Las composiciones farmacéuticas se pueden formular con el fin de contener la cantidad deseada, tal como una cantidad terapéutica mente eficaz del aptámero o complejo de la invención.
Las composiciones farmacéuticas proporcionadas por la presente invención se pueden incluir en un recipiente, envase, o dispensador junto con instrucciones para su administración.
P201 430955
La invención se describe a continuación por medio de los siguientes ejemplos que son meramente ilustrativos y de ninguna manera limitantes para el alcance de la invención.
EJEMPLOS
Materiales y métodos
Librería de aptámeros Los inventores utilizaron la librería de aptámeros RND40 para llevar a cabo la selección de
10 aptámeros específicos frente a TLR-4, suministrada por IBA GmbH (Goettingen, Alemania). La librería inicial RND40 está teóricamente constituida por 1024 oligonucleótidos de ADN de cadena sencilla (ssADN) con secuencia fijas en los extremos, de 18 nucleótidos cada una donde hibridan los cebadores respectivos para su amplificación por PCR, y una región central de 40 bases de secuencia aleatoria. En las selecciones realizadas se han utilizado
15 1013 oligonucleótidos de esta librería.
6HIS-hTlR-4 recombinante La proteína correspondiente al dominio extracelular de la proteína TLR-4 humana, aminoácidos 24-631 , se generó de manera recombinante fusionada a una etiqueta de 6
20 histidinas en el extremo C-terminal, mediante expresión en baculovirus.
Células Las células HEK293T y HEK293TfTLR-4 se obtuvieron de Invivogen (San Diego, California, USA).
Selección con células HEK-293T-TLR4 1 HEK-293T. Para cada ronda de selección, se sembraron 8-10 x 105 células HEK-293T por triplicado en pocillos de placa P6, 24 h antes del ensayo de selección y se incubaron a 3rC, 5% CO2. A continuación, se añadió 1 nmol de aptámeros de la librería RND40 (o de la población aislada
30 en la ronda de selección anterior) en 100 ¡.JI PBS, previamente desnaturalizados a 95°C durante 10 min seguidos de una incubación a 4°C durante 10 min, se añadió 300 ¡.JI de medio DMEM (Dulbecco's modified Eagle's medium) suplementado con 10% suero bovino fetal, 100 Ulml penicilina, 100 ¡.Jg/ml estreptomicina y 25 ¡.Jg/ml amfotericina y se aplicaron sobre las células. Tras 1 h de incubación a 3rC, 5% CO2, se retiró el medio de cultivo con
35 los aptámeros no unidos, se lavaron las células 2 veces con PBS y se recuperaron en 500 ¡.JI de PBS mediante centrifugación a 1500 rpm. Las células se centrifugaron para retirar el
sobrenadante y se los aptámeros pegados a las células fueron amplificados por PCR.para
preparar suficiente cantidad para la siguiente ronda de selección.
La contra-selección sobre células HEK-293T de la librería de aptámeros RN040 se realizó
en la preparación previa de la población RN040 inicial y cada 3 rondas de selección, con la población aislada de la ronda de selección anterior. Para elio, se sembraron 8-1 0 x 105 células HEK-293T por triplicado en pocillos de placa P6, 24 h antes del ensayo de selección y se incubaron a 3rC, 5% COz. A continuación, se añadió 1 nmol de aptámeros de la librería RND40 (o de la población aislada en la ronda de selección anterior) en 100 ¡.JI PBS, previamente desnaturalizados a 95°C durante 10 min seguidos de una incubación a 4°C durante 10 min, se añadió 300 ¡.JI de medio DMEM (Oulbecco's modified Eagle's medium) suplementado con 10% suero bovino fetal, 100 U/mi penicilina, 100 ¡.Jg/ml estreptomicina y 25 ¡.Jg/ml amfotericina y se aplicaron sobre las células. Tras 1 h de incubación a 3rC, 5% COz , se retiró el medio de cultivo con los aptámeros no unidos para ser utilizados en rondas de selección sobre TLR-4.
Selección con proteína soluble hTLR-4 Para cada ronda de selección, se utiliza la librería RN040 enriquecida en una ronda de selección anterior. Se incubó 1 nmol de aptámeros con 7 ¡.Jg de 6xHIS-hTLR-4 (en una
relación de 10 moléculas de aptámero por 1 molécula hTLR-4), en buffer de aptámeros aptámeros (20 mM Tris-HCI, pH 7.4, 1 mM MgCI2, 150 mM NaCI, 5 mM KCI ), a 37'C durante 1 h con agitación. Posteriormente, se añadió la resina NTA-Ni (QIAGEN, Alemania) y se incubó a 4°C durante 1 h para capturar la proteína. Tras 3 lavados con buffer de aptámeros, se amplificaron las secuencias unidas por PCR para preparar suficiente cantidad para la siguiente ronda de selección.
La contraselección se realiza en las mismas condiciones que la selección pero en ausencia de proteína TLR-4 unida a la resina.
Amplificación de los aptámeros seleccionados. Los aptámeros seleccionados fueron resuspendidos en un volumen de 20 ¡.JI de agua destilada y se amplificaron mediante PCR usando los cebadores, que se corresponderán con las secuencias SEO ID NO: 5 (GCGGATGAAGACTGGTGT) y SEO ID NO: 6 (GTTGCTCGTATTTAGGGC) en las condiciones de 0.8 ~Mlcebador SEO ID NO: 5, 0.8
¡.JM/cebador SEa ID NO: 6, 200 mM dNTPs, 2 mM MgClz, 10 U Taq polimerasa (Biotools,
P201 430955
España) en un volumen final de 200 1-11 siguiendo el siguiente programa de amplificación:2
min a 9S' C; 1S ciclos de 30 s a 9S' C, 30 s a S6' C y 30 s a 72' C; y finalmenle S min a 72' C.
ELONA
S
Se determinó si los aptámeros seleccionados reconocían la proteína TLR-4. Para ello, se
añadieron 100 ng/pocillo de 6xHIS-TLR-4 recombinante a una placa de microtitulación de 96
pocillos y se incubaron a 4°C durante 16 h. Posteriormente, aptámeros individuales
marcados con digoxigenina en su extremo S· , fueron diluidos a una concentración S I-Ig/mL y
luego desnaturalizados durante 10 min a 9SoC y enfriados durante 10 min en hielo.
10
Después, 20 pmoles de cada uno de los aptámeros en 100 1-11 (200 nM) de tampón de
aptámeros fueron añadidos a cada pocillo y la placa fue incubada durante 1 h a 3rC. Por
último, la placa fue incubada con anticuerpos anti-digoxigenina conjugados con peroxidasa y
revelada usando ABTS. Como control positivo se utilizó un aptámero de ADN frente a Li
H2A (Martin el al., 2013, PLoS ONE 8: e78886).
1S
Ensayos de unión de los aptámeros a hTLR4 recombinante
Con objeto de analizar la capacidad de cada uno de los aptámeros identificados de unirse a
hTLR-4, se realizaron experimentos en los que hTLR4 fue unido a una resina Ni-NTA
previamente equilibrada, a través de la etiqueta de histidinas. A continuación, los complejos
20
resina:proteína conteniendo 1 pmol de TLR4 fueron incubados con 1 pmol de los aptámeros
TLRApt#1R (SEO ID NO: 3), TLRApt#2F, TLRApt#3R Y TLRApt#4F (SEO ID NO: 4)
previamente estructurados mediante desnaturalización térmica a 9SoC durante 10 min y
posterior renaturalización a 4°C durante 10 min. Después de incubar durante 10 min a 3rC,
se lavaron los complejos y se recuperaron los aptámeros con 1S0 mM imidazol disuelto en
2S
PBS con 1 mM MgCb. Los valores de aptámero unido a hTLR-4 se determinaron mediante
PCR cuantitativa (qPCR) usando los cebadores con las secuencias SEO ID NO: S y SEO ID
NO: 6 en un termociclador lOS (BioRad).
Ensayos de unión de los aptámeros a TLR-4 expresado en células
30
Con objeto de analizar la capacidad de los aptámeros identificados de unirse a la proteína
TLR-4 expresada en células HEK-293, se añadieron 20 pmoles de cada uno de los
aplámeros TLRApt#1 R (SEO ID NO: 3), TLRApt#2F, TLRApt#3R Y TLRApt#4F (SEO ID NO:
4) sobre un cultivo de células HEK-293-TLR4 sembradas a 20,000 células/pocillo en placas
de microtitulación de 96 pocillos a una densidad de 2 x 104 cel/pocillo, 2 días antes del inicio
3S
del ensayo. Después de incubar durante 30 min a 3r C, S% CO2 , las células se lavaron, se
P201 430955
recuperaron los aptámeros con 150 mM imidazol disuelto en PBS con 1 mM MgCI2, y se llevó a cabo qPCR para determinar los valores de Cl.
Ensayos de actividad frente al receptor hTLR-4. Para realizar estos ensayos, se utilizaron células HEK-Blue hTLR4 (lnvivogen, ref. hkbhtlr4), que expresan el receptor TLR4 humano, junto con las proteínas MD2 y CD14, las cuales se activan por la unión de su agonista, lipopolisacárido de Escherichia coN K12 (LPSEK). Para detectar la activación de TLR-4, esta línea celular contiene un gen reportero SEAP (fosfatasa alcalina embrionaria secretada, en inglés "secreted embrionic alkaline phosphatase") que está controlado por el promotor NF-kB, de modo que se expresa en respuesta a esta vía de señalización NF-kB, inducida por TLR-4. La enzima SEAP es secretada al medio de cultivo, y al añadir y metabolizar su sustrato comercial QUANTIBlue™ (Invivogen, San Diego, California, USA) provoca un cambio de color del medio de rojo a azul. Por otra parte, la molécula agonista control LPS-EK UP (Iipopolysaccharide de E. coli K12 Ultra Puro) y el antagonista LPS-RS UP (Lipopolysaccharide de R. sphaeroides Ultra Puro) se disuelven en 1mM MgCI2 en PBS estéril a concentraciones de 0.02 ng/IJL y 2 ng/!JL, respectivamente. Los aptámeros se preparan a concentraciones de 0.1, 1, 10 Y 100 ng/IJL en 1 mM CI2 Mg en PBS estéril, se desnaturalizan a 95c C durante 10 min y se estructuraron a 4c C durante 10 min.
Para el ensayo, se sembraron células HEK-Blue hTLR4 en placas de microtitulación de 96 pocillos a una densidad de 2 x 104 cel/pocillo, 3 días antes del inicio del ensayo en un volumen total de 200 IJI de medio DMEM suplementado con 10% suero bovino fetal , 100 U/mi penicilina, 100 !Jg/ml estreptomicina y 25 IJg/ml amfotericina. A continuación, se añadieron 20 ~I del agonista control LPS-EK-UP (0.02 ng/IJI). Tras 1 h de incubación a 37°C, se añadieron 10 !JI/pocillo de cada concentración de aptámeros (Concentraciones finales de 0.2, 2, 20 Y 200 nM o el antagonista control LPS-RS-UP (2 ng/~I; 20 ng). La activación del receptor hTLR4 se midió 24 h después utilizando 20 ~I del medio de cultivo al que se añaden 1 00 ~I de disolución Quanty-Blue a temperatura ambiente. El cambio de color del medio se mide por absorbancia a 630 nm.
Modelo animal de ictus Se utilizaron ratones machos adultos C57BL que pesaban 28 a 30 g. C57BU10ScNJ (antiguo nombre C57BU10ScCr), y los ratones C57BU10ScSn fueron adquiridos de The Jacksan Laboratory (Bar Harbar, Me, USA). La cepa murina C57BU10ScNJ no expresa TLR4 funcional por deleción del gen TLR4, y la cepa C57BU10ScSn no expresa ninguna
mutación en el gen TLR4 y es empleada como grupo control. Se utilizaron 4 ratones deficientes en TLR4 por grupo (C57BU10ScNJ) y 4 ratones control por grupo (C57BL/10ScSn). Todos los protocolos experimentales se ajustaron a las directrices del Comité de Bienestar Animal de la Universidad Complutense (siguiendo las directivas europeas 86/609/CEE y 32/2007/CE). Los animales se han alojado en condiciones normales de temperatura, humedad y ciclos de luz/oscuridad de 12 horas con libre acceso a comida y
agua.
La inducción de la isquemia focal cerebral se ha llevado a cabo mediante la oclusión de la arteria cerebral media (en inglés ~median cerebral arterial occlusion", MCAO) según las enseñanzas de Caso et al., 2007 (Caso et al., 2007, Circulation 115:1599-608). Brevemente, se induce una isquemia cerebral focal permanente por ligadura de la arteria carótida común (ACC) y oclusión de la arteria cerebral media distal ipsilateral (ACM). Para la ligadura de la ACC, se hace una incisión ventral-cervical parta aislar dicha arteria y ocluirla de forma permanente con ligadura. Para la oclusión de la ACM, se hace una incisión a 1 cm de la línea perpendicular que une el cantus lateral del ojo izquierdo y el canal auditivo externo y se retira el músculo temporal. Se hace un trepano para exponer la ACM que se ocluye por ligadura. Después de la cirugía, el cierre de las incisiones y la desinfección, los animales son devueltos a sus jaulas con acceso libre de agua y comida. Durante la cirugía se controlan las constantes del animal.
El daño cerebral se evaluó mediante imagen por Resonancia Magnética. Brevemente, los ratones fueron anestesiados con isoflurano y 24 horas después de MCAO, el tamaño del infarto se ha evaluado por MRI. Las imagenes resalladas en T2 (T2WI) han sido adquiridas en un BIOSPEC BMT 47/40 operando a 4.7 T (Bruker-Medical, Ettlingen, Germany; MRI Unit, Instituto Pluridisciplinar, UCM).
EJEMPLO 1: Selección de aptámeros específicos frente a TLR-4
Los inventores utilizaron la librería de aptameros RND40 para llevar a cabo la selección de aptameros específicos frente a TLR-4 suministrada por IBA GmbH (Goettingen, Alemania). La librería inicial RND40 esta constituida por oligonucleótidos (ssADN) con secuencia fijas en los extremos, de 18 nucleótidos cada una donde hibridan los cebadores respectivos para su amplificación por PCR, y una región central de 40 bases de secuencia aleatoria.
P201 430955
La librería inicial RND40 de 1013 aptámeros fue enriquecida en aptámeros específicos frente a hTLR-4. Como paso previo a la selección con TLR-4, se realizó un proceso de "contraselección" de la librería frente a la superficie o matriz donde se presenta la molécula diana (resina magnética, células de la misma línea que la que expresa la proteína diana, etc.).
EJEMPLO 2: Caracterización de los aptámeros seleccionados
Se identificaron los aptámeros seleccionados después de 6 rondas de selección siguiendo las siguientes estrategias: 10 a) Mediante clonación de la población de aptámeros en un plásmido con objeto de obtener aptámeros individuales, y posterior secuenciación Sanger. b) Mediante secuenciación masiva de la población de aptámeros obtenida, identificándose los aptámeros que aparecen más repetidos.
15 Las secuencias más representadas se sintetizaron químicamente por IBA GmbH (Goettingen, Alemania) y se estudió la afinidad y la actividad de cada uno de los aptámeros en ensayos de unión a proteína recombinante hTLR-4 o a células HEK-293-TLR-4, mediante ELONA, ensayos de unión de los aptámeros a la proteina TLR-4 recombinante y a TLR-4 expresado en células, ensayos de actividad frente al receptor hTLR-4
20 Los resultados de los ensayos de ELONA (Fig. 1) ponen de manifiesto que los aptámeros que se unen de forma más eficiente a la proteína hTLR-4 recombinante son los aptámeros TLRApt#1R (SEO ID NO: 3) y TLRApt#4F (SEO ID NO: 4). Mediante el mismo tipo de ensayo, se identificaron los aptámeros TLRApt#2F y TLRApt#3R. En la Figura 2 se
25 muestran las secuencias y estructuras secundarias más probables de los aptámeros TLRApt#1R (SEO ID NO: 3) y TLRApt#4F (SEO ID NO: 4) seleccionados, obtenidas utilizando el software mFold (Zuker M., 2003, Nucleic Acids Res 31 :3406-15).
La capacidad de unión de los aptámeros a hTLR-4 se determinó mediante incubación de los
30 aptámeros con una resina de Ni-NTA con hTLR-4 unido, recuperación y posterior amplificación por qPCR de los aptámeros unidos. Los resultados obtenidos muestran que todos los aptámeros seleccionados son capaces de unirse a la proteína hTLR-4 recombinante (Fig . 3A). En estos experimentos, un valor de et menor indica una mayor cantidad de aptámero unido a hTLR-4.
P201 430955
Con objeto de analizar la capacidad de los aptámeros identificados de unirse a la proteína TLR4 expresada en células HEK-293, 20 pmol (500 ng) de los aptámeros TLRApt#1 R (SEO ID NO: 3), TLRApt#2F, TLRApt#3R Y TLRApt#4F (SEO ID NO: 4) se añaden a un cultivo de células HEK-293-TLR4. Después de incubar durante 30 min, a 3rC, 5% CO2, se lavan las células, se recuperan y se hace qPCR con objeto de calcular los valores de Ct. En estos experimentos, un valor de Ct menor indica una mayor cantidad de aptámero unido a las células. Los resultados obtenidos muestran que los aptámeros seleccionados TLRApt#1 R (SEO ID NO: 3) y TLRApt#4F (SEO ID NO: 4) (Fig. 38) son los que se unen con mayor afinidad.
Posteriormente, se efectuaron ensayos de actividad frente al receptor hTLR-4 para determinar si los aptámeros seleccionados son capaces de afectar positiva (actividad agonista) o negativamente (actividad antagonista) la actividad del receptor TLR-4. Los resultados muestran que los aptámeros TLRApt#1 R (SEO ID NO: 3), TLRApt#2F, TLRApt#3R Y TLRApt#4F (SEO ID NO: 4) y tienen actividad antagonista in vitro (Fig. 4A).
A la vista de estos resultados, se realizaron curvas dosis-respuesta con objeto de determinar la concentración de cada aptámero a la que se obtiene el máximo efecto antagonista. A partir de los resultados obtenidos (Fig. 48) se puede concluir que las concentraciones a las que se observa el mejor efecto son 20 nM para TLRApt#1 R (SEO ID NO: 3) y 200 nM para TLRApt#4F (SEO ID NO: 4). Significancia estadística:', P<0.05; " , P<0.01 ; "', P<0.001 .
EJEMPLO 3: Optimización de los aptámeros antagonistas de TLR-4 para incrementar su actividad y estabilidad en modelos animales
Los aptámeros que han mostrado capacidad de inhibir el receptor TLR-4 han sido modificados mediante la eliminación de regiones concretas de su secuencia, con objeto de aumentar su estabilidad y/o resistencia a nucleasas. Para ello, se ha realizado un estudio de la estructura secundaría de los diferentes aptámeros utilizando el programa mFold (Zuker M., 2003, citado at supra ) y se ha analizado la capacidad de los aptámeros de formar estructuras G-quadruplex mediante el programa QGRS Mapper (Kikin et al., 2006, Nucleic Acids Res 34:W676-W682). De esta manera, se diseñaron y sintetizaron los aptámeros TLRApt#1 R-T (SEO ID NO: 1) Y TLRApt#4F-T (SEO ID NO: 2), correspondientes a los identificados en las primeras selecciones (Fig. 5).
P201 430955
EJEMPLO 4: Efecto de los aptámeros antagonistas de TLR-4 en un modelo animal de ictus
Se estudió la capacidad de los nuevos aptámeros optimizados para bloquear la respuesta 5 inflamatoria producida tras un episodio de ictus en un modelo animal de ictus, evaluando la capacidad de los aptámeros especificos de TLR-4 para disminuir la lesión cerebral.
Para ello, se utilizaron ratones macho adultos deficientes en TLR-4 (C57BU10ScNJ) y ratones control que expresan TLR-4 (C57BU10ScSn ), en los que se indujo isquemia focal 10 cerebral mediante la oclusión de la arteria cerebral media (MCAO). Los resultados obtenidos en los ratones que expresan de forma normal el TLR4 (ratones control) demuestran que los aptámeros producen una disminución de tamaño de la zona infartada que, en el caso del aptámero TLRApt#4F-T (SEQ ID NO: 2) es estadísticamente significativa. Por otra parte, los resultados obtenidos en ratones deficientes en TLR-4 muestran que no existe efecto del
15 aptámero TLRApt#4F-T (SEO ID NO: 2) sobre el que se obtiene cuando los ratones se tratan con el vehículo (Fig. 6). Este dato indica claramente que el efecto del aptámero TLRApt#4F-T (SEO ID NO: 2) se produce a través de TLR-4.
Conclusiones
20 Se han seleccionado los aptámeros TLRApt#lR (SEO ID NO: 3) y TLRApt#4F (SEO ID NO: 4) frente al dominio extracelular del receptor TLR-4, que reconocen el receptor TLR-4 humano, tanto en su forma recombinante soluble (in vitro), como integrado en la membrana de células HEK293 (in vivo). Los aptámeros TLRApt#lR (SEO ID NO: 3) y TLRApt#4F (SEO ID NO: 4) muestran un
25 efecto antagonista del receptor TLR-4. Se han obtenido aptámeros truncados TLRApt#1 R-T (SEO ID NO: 1) Y TLRApt#4F-T (SEO ID NO: 2) que mantienen la actividad antagonista de los aptámeros originales TLRApt#l R (SEO ID NO: 3) y TLRApt#4F (SEO ID NO: 4), respectivamente. El aptámero TLRApt#4F-T (SEO ID NO: 2) es capaz de reducir la zona infartada en un
30 modelo animal de ictus.
P201 430955

Claims (14)

  1. REIVINDICACIONES
    1. Un aptámero de ácido nucleico con capacidad de unirse específicamente e inhibir a
    TLR-4, y que comprende una secuencia seleccionada del grupo que consiste en SEO 5 ID NO: 1 y SEQ ID NO: 2 o una variante funcionalmente equivalente de las mismas.
  2. 2. Aptámero según la reivindicación 1, en donde la secuencia se selecciona del grupo que consiste en SEO ID NO: 3 y SEO ID NO: 4.
    10 3. Aptámero según cualquiera de las reivindicaciones 10 2, en donde el ácido nucleico es ADN.
  3. 4.
    Aptámero según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3, en donde el TLR-4 es un TLR4 humano.
  4. 5.
    Un complejo que comprende el aptámero según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4 y un grupo funcional.
  5. 6. Complejo según la reivindicación 5, en donde el grupo funcional es un reactivo 20 detectable.
  6. 7. Uso in vitro de un aptámero según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4 o un complejo según cualquiera de las reivindicaciones 5 o 6 para detectar TLR-4.
    25 8. Uso según la reivindicación 7, en donde la detección de TLR-4 se realiza mediante un método seleccionado del grupo que consiste en ELONA, aptacitoquímica, aptahistoquímica y citometría de flujo.
  7. 9. Uso in vitro de un aptámero según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4 o un 30 complejo según cualquiera de las reivindicaciones 5 o 6 para inhibir TLR-4.
  8. 10. Método in vitro para la detección de TLR-4 en una muestra que comprende i) poner en contacto dicha muestra con un aptámero según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4, o un complejo según cualquiera de las reivindicaciones 5
    35 o 6, Y ii) separar el aptámero o complejo no unido a TLR-4,
    iii) detectar la presencia del aptámero o complejo unido al TLR-4 presente en la muestra.
  9. 11. Método según la reivindicación 10, en donde la detección se realiza por medio de 5 fluorescencia.
  10. 12. Método in vitro para inhibir TLR-4 en una muestra que comprende poner en contacto una muestra que comprende TLR-4 con un aptámero según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4, o un complejo según cualquiera de las reivindicaciones 5 o 6, en
    10 condiciones adecuadas inhibir TLR-4.
  11. 13. Método según cualquiera de las reivindicaciones 10 a 12, en donde la muestra es una muestra biológica de un sujeto.
    15 14. Método según la reivindicación 13, en donde el sujeto es un humano.
  12. 15. Un aptámero según las reivindicaciones 1 a 4 o un complejo según cualquiera de las reivindicaciones 5 o 6 para su uso en la fabricación de un medicamento para el tratamiento de una patología caracterizada por un aumento de expresión de TLR-4 y/o
    20 un aumento de activación de TLR-4 .
  13. 16. Aptámero o complejo para su uso según la reivindicación 15, en donde la patología caracterizada por un aumento de expresión y/o un aumento de activación de TLR-4 es ictus.
  14. 17. Una composición farmacéutica que comprende al menos un aptámero según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4 o al menos un complejo según cualquiera de las reivindicaciones 5 o 6, opcionalmente en combinación con uno o más soportes, excipientes o solventes farmacéuticamente aceptables.
ES201430955A 2014-06-24 2014-06-24 Aptámeros específicos de TLR-4 y usos de los mismos Expired - Fee Related ES2555160B1 (es)

Priority Applications (24)

Application Number Priority Date Filing Date Title
ES201430955A ES2555160B1 (es) 2014-06-24 2014-06-24 Aptámeros específicos de TLR-4 y usos de los mismos
CN202010953057.9A CN112111495A (zh) 2014-06-24 2015-06-24 Tlr-4特异性适配体及其应用
CN201580034070.1A CN106459980B (zh) 2014-06-24 2015-06-24 Tlr-4特异性适配体及其应用
MX2016016992A MX2016016992A (es) 2014-06-24 2015-06-24 Aptameros especificos de tlr-4 y usos de los mismos.
CA2953020A CA2953020C (en) 2014-06-24 2015-06-24 Aptamers specific for tlr-4 and uses thereof
AU2015279248A AU2015279248B2 (en) 2014-06-24 2015-06-24 Aptamers specific for TLR-4 and uses thereof
ES15732619T ES2825106T3 (es) 2014-06-24 2015-06-24 Aptámeros específicos para TLR-4 y usos de los mismos
BR112016030172-2A BR112016030172B1 (pt) 2014-06-24 2015-06-24 Aptâmeros específicos para tlr-4 e usos dos mesmos
JP2016575345A JP6959738B2 (ja) 2014-06-24 2015-06-24 Tlr−4特異的アプタマーおよびそれらの使用
SI201531392T SI3161139T1 (sl) 2014-06-24 2015-06-24 Aptameri, specifični za TLR-4 in njihove uporabe
US15/322,021 US10196642B2 (en) 2014-06-24 2015-06-24 Aptamers specific for TLR-4 and uses thereof
PT157326190T PT3161139T (pt) 2014-06-24 2015-06-24 Aptâmeros específicos para tlr-4 e usos dos mesmos
EP15732619.0A EP3161139B1 (en) 2014-06-24 2015-06-24 Aptamers specific for tlr-4 and uses thereof
PL15732619T PL3161139T3 (pl) 2014-06-24 2015-06-24 Aptamery swoiste wobec tlr-4 oraz ich zastosowania
MA040283A MA40283A (fr) 2014-06-24 2015-06-24 Aptamères spécifiques du récepteur tlr-4 et leurs utilisations
KR1020177001493A KR102454682B1 (ko) 2014-06-24 2015-06-24 Tlr-4에 특이적인 압타머 및 이의 용도
DK15732619.0T DK3161139T3 (da) 2014-06-24 2015-06-24 Tlr-4-specifikke aptamerer og anvendelser heraf
PCT/EP2015/064277 WO2015197706A1 (en) 2014-06-24 2015-06-24 Aptamers specific for tlr-4 and uses thereof
RU2016152094A RU2709718C9 (ru) 2014-06-24 2015-06-24 Аптамеры, специфические в отношении tlr-4, и их применение
ZA2017/00363A ZA201700363B (en) 2014-06-24 2017-01-17 Aptamers specific for tlr-4 and uses thereof
US16/220,726 US10808252B2 (en) 2014-06-24 2018-12-14 Aptamers specific for TLR-4 and uses thereof
JP2020082070A JP2020127422A (ja) 2014-06-24 2020-05-07 Tlr−4特異的アプタマーおよびそれらの使用
US17/022,984 US11591603B2 (en) 2014-06-24 2020-09-16 Aptamers specific for TLR-4 and uses thereof
US18/156,936 US20230279402A1 (en) 2014-06-24 2023-01-19 Aptamers Specific for TLR-4 and Uses Thereof

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
ES201430955A ES2555160B1 (es) 2014-06-24 2014-06-24 Aptámeros específicos de TLR-4 y usos de los mismos

Publications (2)

Publication Number Publication Date
ES2555160A1 true ES2555160A1 (es) 2015-12-29
ES2555160B1 ES2555160B1 (es) 2016-10-25

Family

ID=53496661

Family Applications (2)

Application Number Title Priority Date Filing Date
ES201430955A Expired - Fee Related ES2555160B1 (es) 2014-06-24 2014-06-24 Aptámeros específicos de TLR-4 y usos de los mismos
ES15732619T Active ES2825106T3 (es) 2014-06-24 2015-06-24 Aptámeros específicos para TLR-4 y usos de los mismos

Family Applications After (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
ES15732619T Active ES2825106T3 (es) 2014-06-24 2015-06-24 Aptámeros específicos para TLR-4 y usos de los mismos

Country Status (18)

Country Link
US (4) US10196642B2 (es)
EP (1) EP3161139B1 (es)
JP (2) JP6959738B2 (es)
KR (1) KR102454682B1 (es)
CN (2) CN112111495A (es)
AU (1) AU2015279248B2 (es)
BR (1) BR112016030172B1 (es)
CA (1) CA2953020C (es)
DK (1) DK3161139T3 (es)
ES (2) ES2555160B1 (es)
MA (1) MA40283A (es)
MX (1) MX2016016992A (es)
PL (1) PL3161139T3 (es)
PT (1) PT3161139T (es)
RU (1) RU2709718C9 (es)
SI (1) SI3161139T1 (es)
WO (1) WO2015197706A1 (es)
ZA (1) ZA201700363B (es)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN114152599A (zh) * 2021-12-01 2022-03-08 中国农业大学 一种基于双劈裂功能核酸变构的孔雀石绿生物传感器

Families Citing this family (11)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2015155178A1 (en) * 2014-04-07 2015-10-15 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) New method for producing outer membrane vesicles
ES2555160B1 (es) * 2014-06-24 2016-10-25 Aptus Biotech, S.L. Aptámeros específicos de TLR-4 y usos de los mismos
EP3484441A4 (en) 2016-07-15 2020-03-18 President and Fellows of Harvard College GLYCOLIPID COMPOSITIONS AND METHODS OF USE
EP3494994A1 (en) * 2017-12-07 2019-06-12 Universität zu Köln Combinations of ripk1- and ikk-inhibitors for the prevention or treatment of immune diseases
EP3856904A2 (en) * 2018-09-28 2021-08-04 Augmanity Nano Ltd Methods and compositions for selection of functional aptamers
SG11202102164PA (en) 2018-09-28 2021-04-29 Nutcracker Therapeutics Inc Tertiary amino lipidated cationic peptides for nucleic acid delivery
AU2019352901A1 (en) 2018-10-02 2021-05-27 WearOptimo Pty Ltd Measurement system
EP3969011A1 (en) * 2019-05-16 2022-03-23 Aptatargets, S.L. Treatment of tlr-4 mediated diseases and conditions with aptamers targeting tlr-4
CN111474336B (zh) * 2020-03-21 2023-07-28 南昌大学 一种铁氰化镍纳米粒化学发光适体传感器的制备方法及基于其检测8-OhdG的方法
WO2021257494A1 (en) * 2020-06-15 2021-12-23 President And Fellows Of Harvard College Methods for modulating tlr4 signaling
WO2024146930A1 (en) 2023-01-05 2024-07-11 Aptatargets, S.L. Aptoll molecules for the treatment of ischemic stroke and intracranial hemorrhages

Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2006138681A2 (en) * 2005-06-17 2006-12-28 University Of Rochester Methods and compositions for enhancing immune memory by blocking intrahepatic activated t cell deletion
WO2012118911A1 (en) * 2011-03-03 2012-09-07 Quark Pharmaceuticals, Inc. Oligonucleotide modulators of the toll-like receptor pathway

Family Cites Families (14)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US4522811A (en) 1982-07-08 1985-06-11 Syntex (U.S.A.) Inc. Serial injection of muramyldipeptides and liposomes enhances the anti-infective activity of muramyldipeptides
US5194599A (en) 1988-09-23 1993-03-16 Gilead Sciences, Inc. Hydrogen phosphonodithioate compositions
US5264562A (en) 1989-10-24 1993-11-23 Gilead Sciences, Inc. Oligonucleotide analogs with novel linkages
CA2092002A1 (en) 1990-09-20 1992-03-21 Mark Matteucci Modified internucleoside linkages
CN1250741C (zh) * 2000-02-03 2006-04-12 研究发展基金会 将分子识别转导成不同信号的信号适体
US20060257411A1 (en) * 2005-05-06 2006-11-16 Bruce Beutler Compositions and methods for modulating cells via CD14 and toll-like receptor 4 signaling pathway
CN101227922A (zh) * 2005-05-06 2008-07-23 斯克里普斯研究学院 经由CD14和Toll样受体4信号传导途径调节细胞的组合物和方法
FR2892730A1 (fr) * 2005-10-28 2007-05-04 Biomerieux Sa Methode pour detecter la presence ou le risque de developper un cancer
WO2007067733A2 (en) * 2005-12-09 2007-06-14 Massachusetts Institute Of Technology Compositions and methods to monitor rna delivery to cells
WO2008076804A2 (en) * 2006-12-13 2008-06-26 Case Western Reserve University Method of treating intrauterine inflammation
JP2012508012A (ja) 2008-11-04 2012-04-05 イデラ ファーマシューティカルズ インコーポレイテッド アンチセンスオリゴヌクレオチドによるToll様受容体4発現の調節
WO2010060030A1 (en) * 2008-11-24 2010-05-27 Arizona Board Of Regents, A Body Corporate Of The State Of Arizona Tlr ligand-nucleic acid nanostructure as a novel immune modulatory agent and method of using the same
CN103492572A (zh) * 2011-03-03 2014-01-01 夸克医药公司 用于治疗肺疾病和损伤的组合物和方法
ES2555160B1 (es) * 2014-06-24 2016-10-25 Aptus Biotech, S.L. Aptámeros específicos de TLR-4 y usos de los mismos

Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2006138681A2 (en) * 2005-06-17 2006-12-28 University Of Rochester Methods and compositions for enhancing immune memory by blocking intrahepatic activated t cell deletion
WO2012118911A1 (en) * 2011-03-03 2012-09-07 Quark Pharmaceuticals, Inc. Oligonucleotide modulators of the toll-like receptor pathway

Non-Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
Chang Y -C. et al. Identification and characterization of oligonucleotides that inhibit Toll-like receptor 2-associated immune responses. FASEB JOURNAL. 2009. Vol. 23, Nº 9. Páginas 3078-3088. ISSN 1530-6860 (electronic) *
Tomoya Watanabe et al. Isolation and Characterization of RNA aptamers specific for the Human Toll-like receptor 3 ectodomain. JUN 2009. Viva Origino. Vol. 37, páginas 10-18. *

Cited By (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN114152599A (zh) * 2021-12-01 2022-03-08 中国农业大学 一种基于双劈裂功能核酸变构的孔雀石绿生物传感器
CN114152599B (zh) * 2021-12-01 2023-10-13 中国农业大学 一种基于双劈裂功能核酸变构的孔雀石绿生物传感器

Also Published As

Publication number Publication date
DK3161139T3 (da) 2020-10-19
ZA201700363B (en) 2018-11-28
CN106459980B (zh) 2020-11-03
KR102454682B1 (ko) 2022-10-13
RU2709718C9 (ru) 2020-02-06
SI3161139T1 (sl) 2020-12-31
CA2953020A1 (en) 2015-12-30
AU2015279248A1 (en) 2017-01-12
JP6959738B2 (ja) 2021-11-05
US20230279402A1 (en) 2023-09-07
WO2015197706A1 (en) 2015-12-30
MX2016016992A (es) 2017-05-03
EP3161139B1 (en) 2020-07-22
CN106459980A (zh) 2017-02-22
ES2555160B1 (es) 2016-10-25
MA40283A (fr) 2017-05-03
US20210130830A1 (en) 2021-05-06
EP3161139A1 (en) 2017-05-03
ES2825106T3 (es) 2021-05-14
RU2709718C2 (ru) 2019-12-19
BR112016030172B1 (pt) 2022-11-01
AU2015279248B2 (en) 2021-03-11
CN112111495A (zh) 2020-12-22
RU2016152094A (ru) 2018-07-26
RU2016152094A3 (es) 2019-01-29
US11591603B2 (en) 2023-02-28
US20170130227A1 (en) 2017-05-11
US20190211334A1 (en) 2019-07-11
JP2017527260A (ja) 2017-09-21
KR20170021298A (ko) 2017-02-27
JP2020127422A (ja) 2020-08-27
US10196642B2 (en) 2019-02-05
PT3161139T (pt) 2020-10-23
BR112016030172A2 (pt) 2017-11-14
PL3161139T3 (pl) 2021-01-11
US10808252B2 (en) 2020-10-20
CA2953020C (en) 2023-01-10

Similar Documents

Publication Publication Date Title
ES2555160B1 (es) Aptámeros específicos de TLR-4 y usos de los mismos
US10760083B2 (en) DNA aptamer that binds to vWF
Wang et al. A targeted exosome therapeutic confers both CfDNA scavenging and macrophage polarization for ameliorating rheumatoid arthritis
US10160973B2 (en) Nucleic acid aptamers binding to vascular endothelial growth factor receptors
US20200181620A1 (en) Inhibitors of dek protein and related methods
US20210000981A1 (en) Conjugated polycationic polymers, methods of using the same and methods of treating autoimmune diseases, infectious diseases and acute radiation exposure
US20230050022A1 (en) Compositions and methods related to transferrin receptor-binding aptamers
JP7397446B2 (ja) Tnf関連炎症性疾患を治療または診断するtnf指向性アプタマーおよびその使用
US20210230599A1 (en) Stem-loop compositions and methods for inhibiting interleukin-8
JPWO2014148638A1 (ja) Il−17に対するアプタマー及びその使用
NET Synchronized integrin engagement and chemokine activation is crucial in neutrophil extracellular trap–mediated sterile inflammation
JP2011045339A (ja) TGF−βII型受容体に結合する核酸およびその使用
WO2014169043A1 (en) Anti-inflammatory agents and methods of using the same

Legal Events

Date Code Title Description
FG2A Definitive protection

Ref document number: 2555160

Country of ref document: ES

Kind code of ref document: B1

Effective date: 20161025

PC2A Transfer of patent

Owner name: APTATARGETS, S.L.

Effective date: 20171128

FD2A Announcement of lapse in spain

Effective date: 20220727