ES2345653T3 - Procedimiento para la construccion de un mutante. - Google Patents

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ES2345653T3 ES02741286T ES02741286T ES2345653T3 ES 2345653 T3 ES2345653 T3 ES 2345653T3 ES 02741286 T ES02741286 T ES 02741286T ES 02741286 T ES02741286 T ES 02741286T ES 2345653 T3 ES2345653 T3 ES 2345653T3
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Abstract

Procedimiento de producción de un mutante aleatorio de gen exógeno, en el que se introduce un constructo de ADN que comprende por lo menos los (a) a (d) siguientes en una célula animal y se produce el mutante de gen exógeno en la célula animal: (a) un promotor de VH, en el que dicho promotor de VH comprende la secuencia de SEC ID nº: 14; (b) un gen exógeno; (c) un intensificador de intrón, en el que la secuencia de ADN puede regular la transcripción y contiene la secuencia de región no expresada situada entre los exones del gen JH de cadena pesada y el gen Cμ; y (d) un intensificador que comprende los elementos hipersensibles a ADNasaI HS1, HS2, HS3b y HS4 del intensificador 3' de cadena pesada de inmunoglobulina, en el que la secuencia de ADN comprende las secuencias de ADN de las secuencias de SEC ID nº 1 y SEC ID nº 2.

Description

Procedimiento para la construcción de un mutante.
Campo técnico
La presente invención se refiere a un nuevo procedimiento para la producción de un mutante, que comprende introducir un constructo de ADN mejorado en células animales, el constructo de ADN, y un kit para producir un mutante de gen o para expresar un gen mutante.
Antecedentes de la técnica
Los seres vivos existentes actualmente han evolucionado durante un periodo de tiempo prolongado mediante mutagénesis y la selección de mutantes por parte del medio ambiente. La evolución general presenta una velocidad muy lenta y un avance requiere muchas generaciones. Por otra parte, en el caso de las células productoras de anticuerpos del sistema inmunológico, la mutagénesis y la selección por parte de antígenos se completan en una generación, y la generación siguiente no heredará la función adquirida. Esta velocidad de evolución tan rápida del sistema inmunológico se interpreta que se opone a las mutaciones de un microorganismo patogénico dependiente del medio ambiente.
El presente inventor previamente ha producido ratones transgénicos en los que se han introducido genes del enzima cloranfenicol acetiltransferasa de origen bacteriano, y ha demostrado que la mutación de un gen de anticuerpo se encuentra controlada por su promotor e intensificador, y la mutación de cualquier gen puede inducirse mediante el control con un promotor e intensificador de un gen de anticuerpo (Azuma T. et al., Int. Immunology 5(2):121-130, 1992).
El procedimiento para la producción de un mutante utilizado actualmente es uno de los métodos de producción de mutantes en los que se introduce convenientemente una mutación por deleción, inserción y/o adición en una secuencia de ADN deseada, es decir, mutagénesis sitio-específica para sustituir sitio-específicamente una determinada longitud de secuencias de ADN (Site-specific mutagenesis, Zoller et al., Nucleic Acids Res. 10:6487-6500, 1982; Zoller et al., Methods in Enzymol. 100:468-500, 1983). En la mutación por desapareamiento general utilizando un oligonucleótido sintetizado artificialmente como cebador, se sintetiza un oligonucleótido complementario consistente constituido por aproximadamente 20 bases con una mutación opcional en una secuencia de bases próxima a un sitio en el que debe inducirse una mutación, se híbrida el oligonucleótido con una ADN diana, produciendo de esta manera una ADN complementario al resto del ADN diana utilizando un ADN polimerasa. De esta manera resulta posible introducir una mutación deseada en un sitio deseado. Sin embargo, este método no puede inducir muchos mutantes simultáneamente.
En los demás sistemas de mutagénesis, se ha examinado la desaparición o la manifestación de una función específica en presencia de un compuesto que daña un gen (Myers et al., Science 232:613-618, 1986), mientras que se han utilizado además bacterias, etc. Sin embargo, estos métodos son fundamentalmente diferentes del método anteriormente indicado del presente inventor para la inducción de una mutación.
Se genera variación (diversidad) en la región IgV de ratones y seres humanos mediante la unión combinatorial de segmentos génicos V, D y J, que existen separadamente en la línea germinal, la deleción y adición de nucleótidos en la unión de estos segmentos durante la unión, y la hipermutación somática de los genes V-(D)-J unidos. La hipermutación somática se relaciona con la maduración de afinidad de los anticuerpos y se ha observado frecuentemente tras la estimulación de los antígenos dependientes de células T (TD) (Bothwell A.L.M. et al., Cell 24:625, 1981; Gearhart P.J. et al., Nature 291:29, 1981; Griffiths G.M. et al., Nature 312:271, 1984; Maizels N. et al., Cell 43:715, 1985; Wysocki L.T. et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 83:1847, 1986; Cumano A. et al., EMBO. J. 5:2459, 1986; Berek C. et al., Cell 67:1121, 1991; Taketani M. et al., Mol. Immunol. 32:983, 1995; Furukawa K. et al., Immunity 11:329, 1999:2-10). Los elementos de acción en cis responsables de la inducción de la hipermutación somática han sido identificados utilizando la cadena \kappa (O'Brien R.L. et al., Nature 326:405, 1987; Sharpe M.J. et al., Eur. J. Immunol. 20:1379, 1990; Sharpe M.J. et al., EMBO J. 10:2139, 1991; Betz A.G. et al., Cell 77:239, 1994; Yelamos J. et al., Nature 376:225, 1995; Peters A. et al., Immunity 4:57, 1996:11-16), la cadena \lambda (Klotz E. et al., J. Immunol. 157:4458, 1996:17) y ratones transgénicos de cadena H (Durdik J. et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 86:2346, 1989; Sohn J. et al., J. Exp. Med. 177:493, 1993; Tumas-Brundage, K.M. y Manser T., J. Exp. Med. 185:239, 1997:18-20).
Tal como se ha indicado anteriormente, el presente inventor preparó ratones transgénicos portadores del gen de la cloranfenicol acetiltransferasa (CAT), que se encuentra controlado por V_{H}17.2.25 (Loh D.Y. et al., Cell 33:85, 1983; Grosschedl R. y Baltimore D., Cell 41:885, 1985:22,23) y el intensificador del intrón J-C (en adelante abreviado E\mu) (Gillies S.D. et al., Cell 33:715, 1983; Banerji J. et al., Cell 33:729, 1983:24,25)/región de unión a matriz (en adelante abreviado MAR) (Forrester W.C. et al., Science 265:1221, 1994:26). Como resultado, se detectó hipermutación somática en CAT, pero no en el promotor V_{H} o en E\mu/MAR flanqueantes. Sin embargo, la frecuencia de mutación era aproximadamente 1/10 de la observada en V_{H}-D-J_{H} endógena, sugiriendo que estos elementos de acción en cis resultan críticos o importantes para la inducción de la hipermutación y que otros componentes, tales como C\gamma, C\alpha en situación 3' o el intensificador flanqueante de C\alpha (intensificador 3') (Pettersson S. et al., Nature 344:165, 1990; Dariavach P. et al., Eur. J. Immunol. 21:1499, 1991; Lieberson R. et al., EMBO. J. 14:6229, 1995:27-29) podrían ser responsables de hipermutación somática de elevada frecuencia (Sohn J. et al., J. Exp. Med. 177:493, 1993; Tumas-Brundage K.M. y Manser T., J. Exp. Med. 185:239, 1997; Giusti A.M. y Manser T., J. Exp. Med. 177:793, 1997:19,20,30).
Exposición de la invención
Con el fin de identificar el componente o componentes importantes para incrementar la frecuencia de hipermutación en el gen IgH, el presente inventor utilizó blastocitos deficientes en RAG-2 Gen de activación de recombinación: sistema de complemento de blastocisto proteína-2 de disposición génica, desarrollado por Chen et al. (Chen J. et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90:4528, 1993:31)). Se microinyectó una serie de constructos de transgén que diferían únicamente en la región 3'-flanqueante en blastocistos deficientes en RAG-2 para transfectar células madre embrionarias (en adelante abreviadas "células ES"). Los ratones quiméricos obtenidos en este sistema se inmunizaron con un antígeno dependiente de células T.
Como resultado, la frecuencia de la hipermutación somática en V_{H}-D-J_{H} del transgén reveló que la inserción de la región 3b sensible a la ADNasa I (en adelante, HS3b) y/o HS4 (Madisen L. y Groudine M., Genes Dev. 8:2212, 1994; Michaelson J.S. et al., Nucleic Acids Res. 23:975, 1995; Arulampalam V. et al., Immunol. Today 18:549, 1997:32-34) induce hipermutación somática aleatoria.
Un objetivo de la presente invención consiste en proporcionar un procedimiento de producción para un mutante aleatorio, en el que se introduce en una célula animal un constructo de ADN en el que se encuentran ligados un promotor eucariótico modificado, una secuencia de ADN externa, un intensificador de intrón y un intensificador HS3/4 3'. Otro objetivo de la presente invención consiste en proporcionar un método para obtener un gen mutante mediante la expresión del constructo de ADN en una célula animal. Se ha descubierto un constructo de ADN para producir dicho mutante y un kit para producir un mutante de gen o para expresar el mutante, realizando de esta manera la presente invención. Además, un producto de expresión mutante obtenido a partir del sistema de expresión utilizando células animales implica que ha sido sometido al cribado de toxicidad frente a células animales.
La presente invención proporciona los ítems 1 a 6 siguientes:
Ítem 1. Un procedimiento de producción en una célula animal de un gen mutante aleatorio exógeno, en el que se introduce un constructo de ADN que comprende por lo menos los puntos (a)-(d) siguientes, y en el que se produce el mutante de gen exógeno en la célula animal:
(a)
un promotor de VH, en el que dicho promotor de V_{H} comprende la secuencia SEC ID nº 14,
(b)
un gen exógeno,
(c)
un intensificador de intrón, en el que la secuencia de ADN puede regular la transcripción y contiene la secuencia de región no expresada situada entre los exones del gen JH de cadena pesada y el gen C\mu, y
(d)
un intensificador que comprende los elementos hipersensibles a ADNasa I llamados HS1, HS2, HS3b y HS4 del intensificador 3' de la cadena pesada de inmunoglobulina, en el que la secuencia de ADN comprende las secuencias de ADN SEC ID nº 1 y SEC ID nº 2.
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Ítem 2: procedimiento de producción según el ítem 1, en el que la célula animal es una célula animal de una línea de células B.
Ítem 3: procedimiento de producción según el ítem 2, en el que la célula animal de una línea de células B se deriva de una línea celular de prelinfocitos B.
Ítem 4: procedimiento de producción según cualquiera de los ítems 1 a 3, que comprende además obtener un producto de expresión de dicho gen mutante mediante la expresión de dicho mutante de gen exógeno en la célula animal.
Ítem 5: un constructo de ADN para producir un mutante de gen exógeno, que comprende por lo menos:
(a)
un promotor de VH, en el que dicho promotor de VH comprende la secuencia SEC ID nº 14,
(b)
un gen exógeno,
(c)
un intensificador de intrón, en el que la secuencia de ADN puede regular la transcripción y contiene la secuencia de región no expresada situada entre los exones del gen JH de cadena pesada y el gen C\mu, y
(d)
un intensificador que comprende los elementos hipersensibles a ADNasa I llamados HS1, HS2, HS3b y HS4 del intensificador 3' de la cadena pesada de inmunoglobulina, en el que la secuencia de ADN comprende las secuencias de ADN SEC ID nº 1 y SEC ID nº 2.
\newpage
Ítem 6: un kit para el procedimiento de producción de un mutante de gen exógeno o para la producción de un producto de expresión de un gen mutante, que comprende un vector que presenta:
(a)
un promotor de VH, en el que dicho promotor de VH comprende la secuencia SEC ID nº 14,
(b)
un sitio de inserción de gen exógeno,
(c)
un intensificador de intrón, en el que la secuencia de ADN puede regular la transcripción y contiene la secuencia de región no expresada situada entre los exones del gen JH de cadena pesada y el gen C\mu, y
(d)
un intensificador que comprende los elementos hipersensibles a ADNasa I llamados HS1, HS2, HS3b y HS4 del intensificador 3' de cadena pesada de inmunoglobulina, en el que la secuencia de ADN comprende las secuencias de ADN SEC ID nº 1 y SEC ID nº 2,
con el fin de conseguir la expresión de una secuencia de ADN mutada que produce un mutante de gen exógeno.
Según la presente invención, se introduce un gen exógeno en el sistema controlado por el promotor e intensificador de un gen de anticuerpo, y por lo tanto puede obtenerse una agrupación génica que presenta mutaciones frecuentes y aleatorias, y se proporciona un procedimiento de producción de un mutante de línea celular animal en el que se introduce ampliamente una mutación en un péptido o proteína, resultando posible de esta manera mejorar y modificar una función de una proteína natural. Por ejemplo, resulta posible desarrollar un nuevo tipo de antibiótico que presenta una función mejorada contra bacterias resistentes a antibióticos, compuestos químicos agrícolas, o farmacéuticos peptídicos mejorados que presentan una mejor función, tal como interferón y hormona del crecimiento. Además, mediante la utilización de células animales, resulta posible llevar a cabo simultáneamente un cribado de toxicidad en células animales, y por lo tanto puede examinarse la toxicidad primaria y se consigue la creación rápida de diversos productos peptídicos que presentan una acción funcionalmente mejorada.
En adelante en la presente memoria, la representación de aminoácidos, péptidos, secuencias de bases, ácidos nucleicos y similares mediante abreviatura seguirá las disposiciones de IUPAC-IUB (IUPAC-IUB Communication on Biological Nomenclature, Eur. J. Biochem. 138:9, 1984), "Guideline for the preparation of specification and others containing a base sequence or an amino acid sequence" (editado por la oficina de patentes japonesa) y los símbolos convencionales de la técnica.
La síntesis del ADN, la construcción de constructo de ADN que contiene un gen exógeno (por ejemplo un vector de expresión), el método de preparación de una célula huésped transformada con el constructo de ADN y una proteína expresada secretada por una célula huésped, etc., pueden prepararse fácilmente u obtenerse de acuerdo con técnicas de ingeniería genética generales (Molecular Cloning, 2ª edición, Cold Spring Harbor Lab. Press, 1989; Continuation of Biochemical Experiment Course, Genetic Research Method I, II y III, Japanese Biochemical Society, 1986) o técnicas de recombinación génica (ver, por ejemplo, Science 224:1431, 1984; Biochem. Biophys. Res. Comm. 130:692, 1985; Proc. Natl. Acad. Sci. USA 80:5990, 1983).
En la presente invención, un mutante se refiere a un gen que comprende una secuencia de ADN de mutación aleatoria de un gen exógeno, o a un producto de expresión que presenta una secuencia de aminoácidos mutada codificada por un gen mutado aleatorio.
La producción mutante en una célula animal según la invención puede conseguirse mediante la preparación de un constructo de ADN proporcionado por la invención para la inducción de un mutante (ADN recombinante) que puede expresarse en una célula huésped que contiene un gen codificante de una proteína deseada, e introducir el constructo en la célula.
La expresión "introducir un constructo de ADN en una célula animal" se refiere a incorporar un gen exógeno en un genoma de una célula animal.
El producto de expresión del mutante se obtiene mediante cultivo de un transformante que contiene el mutante anteriormente indicado del gen exógeno y después recogiendo el producto a partir del cultivo resultante.
El constructo de ADN para la inducción del mutante proporcionado por la presente invención presenta una estructura que comprende por lo menos: (a) un promotor según se define en el ítem 5, anteriormente, (b) un gen exógeno, (c) un intensificador de intrón según se define en el ítem 5, anteriormente, y (d) un intensificador que contiene HS1, HS2, HS3b y HS4 en una región sensible a ADNasa I y que puede producirse fácilmente u obtenerse mediante una técnica de ingeniería genética general.
Para la preparación de cada gen (ADN) en la invención, el gen puede derivarse de un origen adecuado o sintetizarse químicamente.
Específicamente, la síntesis del ADN puede ser una síntesis química basada en el método de la fosforamidita o en el método del triéster, o puede llevarse a cabo en un sintetizador automático de oligonucleótidos disponible comercialmente. También puede prepararse un fragmento de doble cadena a partir de un producto de una sola cadena sintetizado químicamente mediante la síntesis de cadenas complementarias y la hibridación de estas cadenas entre sí bajo condiciones adecuadas, o mediante la utilización de una ADN polimerasa conjuntamente con una secuencia de cebador adecuada para la adición de una cadena complementaria.
Además, cada gen puede obtenerse mediante la síntesis de ADN tal como se ha indicado anteriormente, o mediante la preparación de una biblioteca de ADNc de acuerdo con un método ordinario a partir de un vector que contiene el gen, o de un origen adecuado en el que se expresa el gen, y seleccionando un clon deseado utilizando una sonda adecuada o un anticuerpo específico para el gen (Proc. Natl. Acad. Sci. USA 78:6613, 1981; Science 222:778, 1983, etc.).
Como origen de ADNc en lo expuesto anteriormente se proporcionan, a título ilustrativo, diversos tipos de células y tejidos en los que se expresa cada gen, células cultivadas derivadas de los mismos y similares. Además, la separación del ARN total a partir de estos orígenes, la separación y purificación de ARNm, la preparación y clonación de ADNc, etc., pueden llevarse a cabo según un método ordinario. En la presente invención pueden utilizarse bibliotecas de ADNc comercialmente disponibles, tales como la biblioteca de ADNc de Clontech Lab. Inc. Un método para cribar el gen a partir de una biblioteca de ADNc no se encuentra limitado, y puede llevarse a cabo según un método ordinario.
Específicamente, puede utilizarse un método de inmunocribado de las proteínas producidas por ADNc utilizando anticuerpos específicos contra las proteínas y seleccionando el clon de ADNc correspondiente, la hibridación de placas y la hibridación de colonias utilizando una sonda combinada selectivamente con una secuencia de ADN diana, una combinación de dichos métodos, etc.
En la presente invención puede utilizarse como sonda un ADN químicamente sintetizado basándose en la información de la secuencia de bases de cada gen, aunque también puede utilizarse satisfactoriamente un gen ya obtenido según la invención o un fragmento del mismo. Puede utilizarse un cebador de sentido o un cebador antisentido diseñados basándose en la información de la secuencia de bases del gen exógeno como una sonda para el cribado.
Se utiliza una secuencia parcial de nucleótidos correspondiente a la secuencia de ADN de cada gen a modo de la sonda anteriormente mencionada. La secuencia de nucleótidos puede contener por lo menos 15 bases en serie, preferentemente 20 bases en serie, más preferentemente 30 bases en serie, y todavía más preferentemente 50 bases en serie. Alternativamente, puede utilizarse como sonda un clon positivo que contenga dicha secuencia misma.
La amplificación de ADN/ARN mediante el método de PCR (Science 230:1350, 1985) puede utilizarse preferentemente para obtener un gen. Especialmente, en el caso de que resulte difícil obtener la longitud completa del ADNc a partir de la biblioteca, el método RACE (Rapid amplification of cDNA ends, Journal of Experimental Medicine 12(6):35, 1994), especialmente el método 5'-RACE (M.A. Frohman et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 8:8998, 1988), etc., puede adoptarse preferentemente.
En el caso de que se adopte el método de PCR, el cebador utilizado puede diseñarse basándose en la información de la secuencia de bases y sintetizarse de acuerdo con un método ordinario. El fragmento amplificado de ADN/ARN puede separarse y purificarse según un método ordinario tal como se ha indicado anteriormente, por ejemplo electroforesis en gel.
Las secuencias de los genes o diversos tipos de fragmentos de ADN obtenidos anteriormente pueden determinarse de acuerdo con un método ordinario, por ejemplo el procedimiento dideoxi (Proc. Natl. Acad. Sci. USA 74:5463, 1977) y el método de Maxam-Gilbert (Methods in Enzymology 65:499, 1980), o más fácilmente, utilizando un kit comercial de secuenciación y similar.
(b) Gen exógeno deseado
En los constituyentes del constructo de ADN anteriormente indicado, el ADN utilizado como (b) gen exógeno puede ser una secuencia de ADN exógeno derivada de un gen deseado, o una proteína expresada que forma una base para inducir un mutante. Alternativamente, el ADN utilizada como gen exógeno puede sintetizarse. La longitud del gen exógeno utilizado para el presente procedimiento de producción para un mutante puede ser de generalmente 4 kb o inferior, preferentemente de 3 kb o inferior, más preferentemente de aproximadamente 2 kb, aunque también puede utilizarse una secuencia de ADN exógeno que presente una longitud superior a 4 kb.
El gen exógeno no se encuentra especialmente limitado, en la medida en que muestre una actividad biológica tras su expresión. Por ejemplo, a título ilustrativo, hormona del crecimiento (GH), insulina, interferón, eritropoyetina, etc.
Para una comprobación más sencilla de la inserción del gen exógeno en un genoma de célula huésped, la secuencia de ADN del gen que debe utilizarse como un, según se denomina, marcador, puede unirse a la secuencia de ADN del gen exógeno (b) expuesto anteriormente.
Mediante la utilización de una parte o de la totalidad de las secuencias de bases del gen exógeno obtenido de esta manera, puede detectarse con especificidad la expresión del gen exógeno y su mutante en un individuo o en diversos tejidos.
Dicha detección puede llevarse a cabo según un método ordinario, por ejemplo la amplificación del ARN mediante RT-PCR (reacción en cadena de la polimerasa-transcripción inversa; E.S. Kawasaki et al., Amplification of RNA, en: PCR Protocol, A Guide to methods and applications, Academic Press, Inc., San Diego, 21-27, 1991), análisis de transferencia northern (Molecular Cloning, Cold Spring Harbor Lab., 1989), la detección a nivel celular utilizando RT-PCR in situ (Nucl. Acids Res. 21:3159-3166, 1993) e hibridación in situ, método NASBA (Nucleic acid sequence-based amplification, Nature 350:91-92, 1991) y los otros diversos métodos. Se ilustra preferentemente la detección mediante RT-PCR.
El fragmento de ADN del gen exógeno se proporciona en la forma de un fragmento de restricción cortado con un enzima de restricción adecuado, es decir, el gen exógeno (b) del constructo de ADN.
(a) Promotor
El promotor utilizado como un constituyente del constructo de ADN anteriormente mencionado es el promotor V_{H}17.2.25 (Gillies S.D. et al., Cell 33:715, 1983; Banerji J. et al., Cell 33:729, 1983).
(c) Intensificador de intrón
Un intensificador de intrón es una secuencia de ADN que puede regular la transcripción y que contiene la secuencia de región no expresada situada entre los exones del gen JH de cadena pesada y el gen C\mu. El intensificador de cadena pesada (intensificador de C\mu) de inmunoglobulina puede ilustrarse como (c) intensificador de intrón.
(d) Región sensible a desoxirribonucleasa I (ADNasa I)
Una región sensible a la ADNasa I es una región que se fragmenta al tratar el núcleo de una célula aislada con una concentración reducida de ADNasa I. Se conocen los genes de cadena pesada de inmunoglobulina HS1, HS2, HS3b y HS4. HS3b/4 es HS3b o HS4, o ambos. La presente invención se caracteriza porque se encuentran contenidas las regiones HS3b y HS4. En la presente invención se incluye HS1 y HS2 (a las que se hace referencia como 3'E), además de HS3b y HS4. Se ilustra a modo de un 3'EHS3b/4 una secuencia que no presenta secuencias de intrón, que comprende el fragmento XbaI (4,0 kb) a partir del intensificador 3' dado a conocer por Lieberson R. et al. (EMBO. J. 14:6229, 1995) y HS3 (1.182 pb) y HS4 (1.381 pb) procedente de MP11, dado a conocer por Madisen L. et al. (Genes Dev. 8:2212, 1994).
Conexión de cada gen (preparación de constructo de ADN)
El constructo de ADN de la invención puede prepararse, por ejemplo, mediante la inserción de cada uno de los genes anteriormente indicados en un vector de expresión adecuado de acuerdo con un método ordinario, por ejemplo mediante la inserción de cada elemento en un vector que presente un gen adecuado de resistencia a antibiótico. Específicamente, el constructo de ADN puede construirse mediante la inserción de promotor, gen exógeno, intensificador de intrón, región sensible a ADNasa I (incluyendo las secuencias de ADN de HS1, HS2, HS3b y HS4), que se cortan, extrayéndolas de un clon vector, ADN genómico o plásmido mediante un enzima de restricción opcional o se sintetizan, introduciéndolas en un vector utilizado para una línea celular animal que presenta un gen opcional de resistencia a un antibiótico.
Específicamente, la inserción puede llevarse a cabo de acuerdo con un método ordinario utilizando un enzima de restricción, una ligasa, etc.
En el vector de expresión recombinante deseado, puede construirse un intensificador de intrón y un intensificador 3'EHS3b/4 en la misma dirección, de extremo 5' a extremo 3', en la misma dirección, de extremo 3' a extremo 5', o en direcciones opuestas de extremo 5' a extremo 3' y de extremo 3' a extremo 5'.
En el constructo de ADN anteriormente indicado, el intervalo entre el promotor y el intensificador 3'EHS3b/4 situado entre un ADN exógeno puede presentar una longitud de entre 0,1 kb y 100 kb, preferentemente de entre 1 kb y 10 kb, más preferentemente de entre 2 kb y 5 kb.
Un ejemplo de un vector de expresión preferente es un vector retrovírico. Más específicamente, a título ilustrativo se proporcionan pIND (Invitrogen), pcDNA3.1/His (Invitrogen), pEGFP-N, pEGFP-C (Clontech), etc.
Un ejemplo del constructo de ADN que contiene: (a) promotor y (c) intensificador de intrón, es un vector de expresión que contiene un promotor de V_{H} y un intensificador de intrón según el presente inventor y otros (Azuma T. et al., Int. Immunology 5(2):121-130, 1993). Preferentemente se utiliza para la preparación del constructo de ADN.
En el vector de expresión anteriormente indicado que contiene un promotor y un intensificador de intrón, el promotor se sitúa en el lado 5' cadena arriba del gen exógeno ordinariamente inducido, y siguen, en orden, el gen exógeno y un intensificador de intrón.
En el caso de que el vector anteriormente indicado para la preparación del presente constructo de ADN que contiene un gen exógeno se modifique para que contenga un promotor, un sitio de clonación para la inserción del gen exógeno deseado, uno o más intensificadores necesarios para inducir la mutación (especialmente un intensificador de inmunoglobulina, así como un intensificador de intrón) y una región sensible a ADNasa I, resultará efectivo como constructo de ADN en un procedimiento de producción de un mutante de gen exógeno o en un kit para la producción de un producto de expresión de un gen mutante.
El presente constructo de ADN puede ser un ADN circular o un ADN lineal.
La comprobación de si se ha conseguido producir el presente constructo de ADN puede llevarse a cabo mediante un método ordinario, por ejemplo mediante el corte del constructo con un enzima de restricción y sometiéndolo a electroforesis, o mediante combinación de PCR, hibridación southern y secuenciación, etc.
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Procedimiento de producción de un mutante
En un procedimiento de producción de un gen exógeno, en primer lugar se introduce el constructo de ADN resultante del método anteriormente proporcionado, en una célula huésped adecuada con el fin de obtener un recombinante homólogo.
Entre los ejemplos de la célula huésped se incluyen organismos eucarióticos que comprenden células de un mamífero, levadura, planta o similar, aunque resultan preferibles las células animales de mamífero. Preferentemente se utilizan a modo de dicha célula, líneas celulares establecidas que deben transformarse conjuntamente con un determinante que puede provocar que la mutación resulte más efectiva, células COS de mono (Cell 23:175, 1981), oocitos de hámster chino, células HeLa, fibroblasto RatII, células epiteliales del canal alimentario y las células defectuosas en dihidrofolato reductasa correspondientes (Proc. Natl. Acad. Sci. USA 77:4216, 1980). En el caso de una línea celular establecida, resulta preferido utilizar, aunque de manera no limitativa, por ejemplo, células animales de una línea de células T o de células B, especialmente células animales de una línea de células pre-B, más específicamente células J558 y células J558L. En el caso de las células de levadura, se utilizan células de levadura pertenecientes al género Saccharomyces, etc. Además, también pueden utilizarse células de un cuerpo animal vivo como células huésped.
Como resultado de la introducción de un gen exógeno en el genoma de una célula huésped, puede obtenerse un transformante transformado con el constructo de ADN de la presente invención.
Dicha introducción del presente constructo de ADN en una célula puede llevarse a cabo de acuerdo con diversos métodos conocidos de la técnica de la introducción de ADN en una célula, por ejemplo el método de electroporación, el método de coprecipitación con fosfato cálcico, el método de liposoma, el método de DEAE-dextrano, el método de microinyección, la transducción vírica, etc. Preferentemente se utiliza el método de electroporación.
Son ejemplos de las células en las que se introduce el presente constructo de ADN, óvulo fertilizado, embrión, células germinales y similares. La introducción en células puede llevarse a cabo de acuerdo con un método ordinario.
Puede comprobarse si se ha obtenido un mutante o no mediante un método conocido, por ejemplo mediante el método de secuenciación aleatoria o mediante la determinación de la actividad del producto expresado por un gen exógeno y la selección de un gen cuya actividad sea diferente de la del gen exógeno. Alternativamente, puede seleccionarse basándose en una actividad estándar y el grado de la misma, o en si la actividad es alta o baja.
La forma aislada de la célula misma que contiene un gen aleatoriamente mutado transformado con el ADN exógeno de la invención puede ser un péptido mejorado que presente una función mejorada relacionada con el gen exógeno humano. Por lo tanto, puede utilizarse como farmacéutico para mejorar un estado de enfermedad o como sistema modelo para el estudio terapéutico.
El transformante resultante puede cultivarse de acuerdo con un método ordinario. Como resultado del cultivo, la proteína de la invención codificada por un mutante de un gen exógeno se expresa y se produce (se acumula, se secreta) intracelularmente, extracelularmente o sobre la membrana celular del transformante.
Pueden seleccionarse apropiadamente diversos cultivos comunes dependiendo de las células huésped adoptadas y utilizadas para el cultivo, y el cultivo puede llevarse a cabo bajo condiciones adecuadas para el crecimiento de la célula huésped.
La proteína recombinante de la invención obtenida de esta manera puede separarse y purificarse si se desea, mediante diversos procedimientos de separación utilizando propiedades físicas o químicas de la proteína recombinante (ver, por ejemplo, Biochemistry Data Book II, páginas 1.175 a 1.259, edición 1, publicación 1, publicada por Tokyo Kagaku Dojin (23 de junio de 1980); Biochemistry 25(25):8274, 1986; Eur. J. Biochem. 163:313, 1987, etc.).
Se ilustran específicamente como el procedimiento anterior, el procesamiento de reconstitución común, el procesamiento mediante precipitación de las proteínas [método de precipitación con sales, (salting out)], separación centrífuga, método del choque osmótico, ultrasonicación, ultrafiltración, cromatografía de tamiz molecular (filtración en gel), cromatografía de adsorción, cromatografía de intercambio iónico, cromatografía de afinidad, diversas cromatografías líquidas, tales como la cromatografía líquida de alto rendimiento (HPLC), la diálisis, y una combinación de las mismas. Por ejemplo, la cromatografía de afinidad utilizando una columna en la que se encuentran ligadas anticuerpos específicos a la proteína de la invención resulta particularmente preferente.
De esta manera, el presente vector de expresión recombinante se expresa en una célula animal, proporcionando un ADN exógeno, resultando en mutantes aleatorios codificados por dicho ADN. La frecuencia de mutantes aleatorios mediante el vector de expresión recombinante de la invención es de entre por lo menos aproximadamente 1x10^{-4} y aproximadamente 1x10^{-3}/pb/generación.
La presente invención proporciona un procedimiento de producción de un mutante que comprende un eucariota, especialmente una célula animal que contiene el vector recombinante anteriormente indicado que presenta un sitio de inserción de un ADN exógeno o un gen exógeno para conseguir la expresión de una secuencia de ADN introducida o un mutante génico.
Según el presente procedimiento de producción de un mutante, puede mejorarse un péptido que presenta una actividad antimicrobiana pero que no se encuentra disponible debido a su toxicidad para las células animales, proporcionando un péptido antimicrobiano que presenta una toxicidad reducida para las células animales y una actividad antimicrobiana más alta. De manera similar, resulta posible realizar un intento para mejorar o modificar las funciones de proteínas, tales como el interferón natural, la hormona del crecimiento y similares. Por lo tanto, puede proporcionarse un método útil para desarrollar compuestos químicos agrícolas o para mejorar la función de farmacéuticos o similares.
Además, la invención proporciona: un kit para un procedimiento de producción de un mutante de un gen exógeno, o para producir un producto de expresión de un gen mutante, que comprende un constructo de ADN que presenta un sitio insertable de un ADN exógeno o de un gen exógeno. Específicamente, el constructo de ADN comprende:
(a)
un promotor según se ha definido en el ítem 6, anteriormente,
(b)
un sitio de inserción de un gen exógeno,
(c)
un intensificador de intrón según se ha definido en el ítem 6, anteriormente,
(d)
un intensificador que comprende HS1, HS2, HS3b y HS4 en la región sensible a ADNasa I.
Según el presente kit para la producción de un mutante, puede proporcionarse un péptido antimicrobiano mejorado con toxicidad para células animales y una actividad antimicrobiana más alta, y farmacéuticos proteínas que presentan funciones mejoradas, tales como el interferón natural, la hormona del crecimiento y similares.
Breve descripción de los dibujos
La figura 1A muestra una vista esquemática de un transgén mutante IgH construido para generar ratones quiméricos.
En la figura 1B, se muestran mediante flechas las localizaciones y orientaciones de los cebadores utilizados para amplificar el ADNc.
La figura 2 indica la producción de C\mu productor de anticuerpos antiNP de células J558L transfectadas con los genes mutantes de IgH mostrados en la figura 1. Los sobrenadantes de células J558L transfectadas (1x10^{6} células/ml) cultivadas durante 12 horas se sometieron a ELISA utilizando placas recubiertas con NP_{9}-BSA para la estimación de la producción de anticuerpos.
La figura 3A muestra una reconstitución de los sistemas inmunológicos de ratones RAG-2^{-/-} por parte de células ES en ratones quiméricos A4-3, 2-1 y 2-3. Se midieron los niveles de IgM de ratón en ratones preinmunes mediante ELISA utilizando placas recubiertas con anticuerpo monoclonal antiIgM de ratón de rata y anticuerpo antiIgM de ratón de cabra marcado con POD.
La figura 3B muestra la medición de los niveles de IgM humana en sueros preinmunes o inmunes utilizando placas recubiertas con anticuerpo IgM antihumano de ratón y anticuerpo IgM de cabra marcado con POD. Los sueros inmunes se denominan TD.
Los antisueros de ratones Balb/c y de ratones RAG-2^{-/-} se utilizaron como controles en A, y se utilizó un sobrenadante de cultivo de J558L además de dichos sueros como controles en B.
La figura 3C muestra un análisis de la unión de los anticuerpos antiNP a placas recubiertas con anticuerpo antiNP_{9}-BSA. Los anticuerpos unidos se detectaron utilizando antiIgG de ratón marcado con POD.
La figura 3D muestra las proporciones de unión de antisueros procedentes de ratones quiméricos a placas recubiertas con NP_{1}-BSA o con NP_{12}-BSA.
La figura 4 muestra una amplificación específica de transgenes realizada mediante RT-PCR. Se amplificó ADNc preparado a partir de ARNm de células de bazo IgM^{-}B220^{+} procedentes de ratones quiméricos inmunizados con NP_{34}-CGG. Únicamente los ratones quiméricos proporcionaron bandas correspondientes a los transgenes (carriles 1 a 6) y los ratones C57BL/6 no proporcionaron dichas bandas (carril 7). También se muestra la célula J558L transfectante (carril 8) y la célula no transfectante (carril 9), a modo de controles positivos o negativos.
La figura 5 muestra una comparación entre la distribución y la frecuencia de hipermutación somática en constructos de transgén procedentes de células de bazo IgM^{-}B220^{+} (A) y de células B1 peritoneales (B).
La distribución y la frecuencia de hipermutación somática en constructos de transgén procedentes de dos ratones quiméricos se muestran separadamente en A. La escala en la parte inferior indica la posición del aminoácido, numerada según el método de Kabat et al.
Mejor modo de poner en práctica la invención
A continuación, se proporcionan ejemplos ilustrativos de la presente invención con mayor detalle, y no limitativos del alcance de la invención.
Ejemplo 1 1) Construcción de transgenes de IgH
Se construyó C\mu humano portador de cadena H de Ig (IgH) que presentaba diferentes regiones 3' flanqueantes.
Adquisición de fragmento que contiene promotor de V_{H} y fragmento que contiene E\mu/MAR
Se clonó mediante PCR un fragmento que contenía el promotor V_{H}17.2.25 (0,55 kb; SEC ID nº 14) con los enzimas de restricción KpnI y ApaI, y otro fragmento que contenía E\mu/MAR (1 kb) con los sitios de los enzimas de restricción XhoI y SalI, a partir del constructo [plásmido que presenta un gen de cloranfenicol acetiltransferasa (CAT) controlado por el promotor de V_{H} derivado de V_{H}17.2.25 y el intensificador de intrón (intensificador de intrón J-C/región de unión de matriz (abreviado E\mu/MAR)) entre los sitios de los enzimas de restricción XbaI y XhoI de pBluescript SK(+)], que el presente inventor preparó previamente para generar ratones transgénicos para CAT (Azuma T. et al., Int. Immunology 5(2):121-130, 1993).
Adquisición del fragmento génico V_{H}-D-J_{H}
También se clonó mediante PCR el fragmento génico V_{H}-D-J_{H} reorganizado (2,0 kb) que contenía los sitios de los enzimas de restricción ApaI y XhoI, utilizando un ADN genómico de A6, un hibridoma productor de anticuerpo monoclonal anti(4-hidroxi-3-nitorfenil)acetilo (en adelante denominado anticuerpo monoclonal antiNP) que se obtuvo a partir del ratón C57BL/6 (Tokyo Animal Center) (Taketani M. et al., Mol. Immunity 32:983, 1995; Furukawa K. et al., Immunity 11:329, 1999).
Éstos se clonaron en Bluescript II SK (de Stratagene), en orden: promotor de V_{H}, gen V_{H}-D-J_{H} y E\mu/MAR.
Adquisición del gen C\mu humano
Se obtuvo un fragmento XbaI de 6,9 kb del gen C\mu humano obtenido a partir de un clon fágico, CH.H.Ig\mu-24 (Takahashi N. et al., Nucleic Acids Res. 8:5983, 1980; Health Science Research Resources Bank).
Adquisición del intensificador 3'
Se obtuvo un plásmido (Lieberson R. et al., EMBO. J. 14:6229, 1995) que contenía el fragmento XbaI (4,0 kb) del intensificador 3' (en adelante denominado 3'E) de los doctores J. Manis y F. Alt (Harvard Medical School). Los fragmentos que contenían HS3b (1,2 kb), indicado como SEC ID nº 1, y HS4 (1,4 kb), indicado como SEC ID nº 2, se clonaron mediante PCR utilizando los cebadores indicados como SEC ID nº 3 a 6, y ADN genómico procedente de un linfoma de células B, MPC11 (Madisen L. y Groudine M., Genes Dev. 8:2212, 1994). En cada secuencia de cebador, se subraya el sitio de reconocimiento del enzima de restricción SpeI o XbaI.
SEC ID nº 3: HS3-S: 5'-TCTAGAACCACATGCGATCTAAGGGATATTGGGG-3'
SEC ID nº 4: HS3-anti SpeI: 5'-CAGGACTAGTGATCATTGAGCTCCGGCTCTAAC-3'
SEC ID nº 5: HS4-S XbaI: 5'-CTAGTCTAGACTGCAGACTCACTGTTCACCATG-3'
SEC ID nº 6: HS4-anti SpeI: 5'-GTGGACTAGTAAGCTTGGAGTTAGGTGGGTAGG-3'
Estos fragmentos se unieron al extremo 3' de 3'E, en orden: HS3b y HS4. Se unieron 3'E, HS3b y HS4 en tándem sin inserción de ninguna secuencia de intrón de Ig intermedia.
Utilizando cada uno de los fragmentos indicados anteriormente, se obtuvieron tres tipos de constructo: pvehc\Delta3'E (12 kpb), pvehc3'E (16 kpb) y pvehc3'EHS3b/4 (19 kpb) mediante una técnica de recombinación génica.
2) Características estructurales de los transgenes
Los constructos de transgén obtenidos en la presente invención contienen una región V codificada por V_{H}186.2 de ratón, y una V_{H} dominante implicada en la respuesta frente a los haptenos (4-hidroxi-3-nitrofenil)acetilo (Bothwell A.L.M. et al., Cell 24:625, 1981).
El gen V_{H}186.2-DFL16.1-J_{H}2 de ratón reorganizado a partir de A6, un hibridoma productor de anticuerpo monoclonal contra (4-hidroxi-3-nitrofenil)acetilo (Taketani M. et al., Mol. Immunity 32:983, 1995; Furukawa K. et al., Immunity 11:329, 1999) se ligó al gen C\mu humano, facilitando de esta manera una discriminación entre el transgén codificado y la cadena H de ratón endógena.
Además, debido a que la expresión de transgenes sobre la superficie de las células B podría modificar el desarrollo de las mismas, se eliminó el exón transmembranal de C\mu para impedir la expresión de los transgenes sobre la superficie celular. Los transgenes contenían únicamente C\mu, sin regiones génicas codificantes de otros isotipos de cadena H.
La totalidad de los tres tipos de constructo de transgén contenía promotor de V_{H} y E\mu/MAR procedentes de intrón J-C\mu de ratón como elementos de acción en cis, que habían sido utilizados para la construcción del transgén de la CAT (Azuma T. et al., Int. Immunol. 5:121, 1993). Por lo tanto, las diferencias de estructura de los transgenes se limitaban a la región 3' flanqueante (figura 1).
Uno de los constructos, pvehc\Delta3'E, no presentaba región intensificadora 3' y se encontraba regulado por el promotor de V_{H} y E\mu/MAR. Otro constructo, pvehc3'E, contenía intensificador 3' (Lieberson R. et al., EMBO. J. 14:6229, 1995) además de promotor de V_{H} y E\mu/MAR. El fragmento del enzima de restricción BamHI (4,0 kb) que contenía el intensificador 3' (3'E) se utilizó para la construcción del gen. La adición de HS3b y HS4 a pvehc3'E dio lugar a un constructo denominado pvehc3'EHS3b/4.
Los genes IgH endógenos contenían un elemento de acción en cis adicional denominado HS3a (Matthias P. y Baltimore D., Mol. Cell Biol. 13:1547, 1993), que presenta una secuencia de nucleótidos idéntica a las de HS3b, aunque se encontraba en una forma invertida (Arulampalam V. et al., Immunol. Today 18:549, 1997). Los constructos de transgén de la presente invención no contenían dicho elemento de acción en cis.
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Ejemplo 2 1) Transfección de genes IgH mutantes (Lundblad A. et al., Immunochemistry 9:535-544, 1972) en células J558L y producción de anticuerpos
Para estimar la actividad transcripcional de estos tres constructos, estos se transfectaron en una línea celular de plasmacitoma de ratón: las células J558L. Los constructos de gen IgH linearizados (10 \mug) que presentaban un sitio de reconocimiento del enzima de restricción NotI se sometieron a electroporación (Sahagaw B.G. et al., J. Immunol. 137:1066-1074, 1986) para introducirlos en células J558L conjuntamente con el plásmido pSV2-gpt (1,6 \mug) (Mulligan R.C. y Berg P., Science 209:1422-1427, 1980). Las condiciones específicas de la electroporación fueron las siguientes.
Instrumento: Gene Pulser (BIO-RAD Laboratories)
Condiciones:
Tampón: PBS
Células: J558L, 2x10^{7} células/ml en 0,5 ml de PBS
ADN linearizado: transgén IgH (10 \mug) y pSV2-gpt (1,6 \mug)
Condiciones de reacción: capacitancia (960 \muF), voltaje (350 v).
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Las células transfectadas se cultivaron a 37ºC en presencia de CO_{2} (5%) y de una mezcla de hipoxantina, xantina y ácido micofenólico (Sigma). Se llevó a cabo la dilución limitante de transformantes de un gen IgH resistente a fármaco, y se seleccionaron los clones basándose en la producción de anticuerpos. Específicamente, se midió mediante ELISA la producción de anticuerpo quimérico antiNP (figura 2).
Para el análisis cuantitativo de la producción de anticuerpos, se cultivaron algunos clones de transformante inducidos a partir de cada constructo de transgén durante 12 horas en una placa de fondo plano de 96 pocillos que incluía medio RPMI1640 (volumen total: 200 \mul; Nissui Pharmaceutical Co., Ltd.) y contenía suero de feto bovino al 10% (FCS), a una densidad de 2x10^{6} células/ml. El sobrenadante de cultivo diluido a diversas concentraciones con solución salina tamponada con fosfato (PBS) que contenía 1 mg/ml de albúmina de suero bovino (BSA) se analizó mediante ELISA utilizando una placa de polivinilo recubierta de NP_{9}-BSA. Se utilizó anticuerpo anticadena \lambda_{1} de ratón marcado con peroxidasa (POD) (Southern Biotech) o anticuerpo anticadena \mu humana (ZYMED) para detectar los anticuerpos unidos.
Se muestra el resultado en la figura 2.
Se diseñaron constructos de transgén codificantes de cadenas H quiméricas, que presentaban la región V_{H} de un anticuerpo monoclonal antiNP de ratón y la región C de Ig humana, que se esperaba que se ensamblasen con las cadenas \lambda_{1} de ratón y diesen lugar a anticuerpo antiNP quimérico.
Todos los constructos se transfectaron activamente en células J558L y produjeron anticuerpos antiNP mediante apareamiento con las cadenas \lambda_{1} endógenas. De entre estos constructos, pvehc\Delta3'e mostró una producción bastante débil en comparación con los demás. La adición de 3'E (pvehc3'E) resultó en un incremento significativo de la producción de anticuerpos; sin embargo, la adición posterior de HS3b y HS4 aparentemente no presentó ningún efecto sobre la producción de anticuerpo. Aunque se disponía de poca información sobre la dependencia de la transcripción del número de copia de cada ADN transfectado, el inventor partió de la premisa de que la cantidad de producción de anticuerpo reflejaba la actividad transcripcional de los constructos, que no difería significativamente en pvehc3'E y pvehc3'EHS3b/4.
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Ejemplo 3 1) Generación de ratones quiméricos
Para generar ratones quiméricos, el presente inventor utilizó por lo menos dos clones ES transfectados independientes para la microinyección en blastocistos de ratón RAG-2^{-/-}. El inventor también utilizó por lo menos dos constructos quiméricos de ratón/transgén para el análisis de la hipermutación somática. Las líneas celulares ES transfectadas y los ratones quiméricos utilizados en el presente experimento se muestran en la Tabla 1.
El fragmento EcoRI de pGKneo (1,5 kb, 1 \mug) y los tres tipos de constructos de transgén de IgH de cadena lineal (30 \mug) se electroporaron de la misma manera que en el Ejemplo 2 en 1x10^{7} células E14-1 (Kuhn R. et al., Science 254:707, 1991) utilizando un electroporador "Gene Pulser" de Bio-Rad.
A continuación, las células transfectadas se seleccionaron con G418 (150 \mug/ml, Gibco). Las colonias seleccionadas se cribaron mediante: PCR utilizando dos cebadores indicados como SEC ID nº 7 y 8 que pueden hibridarse con secuencias de ADN situadas en el promotor V_{H}17.2.25 y en J_{H}2, y mediante transferencia southern utilizando el gen C\mu humano como sonda, respectivamente.
SEC ID nº 7: 5'-GACTCAGGAGGACTCTAGTT-3'
SEC ID nº 8: 5'-GGTGTCCCTAGTCCTTCATG-3'
Se llevó a cabo la amplificación mediante PCR de 30 ciclos de 95ºC de 30 segundos, 65ºC durante 30 segundos y 72ºC durante 1 minuto. Se estimó mediante transferencia southern que el número de copia de pvehc3'E integrado era de entre 2 y 3. Se estimaron los números de copia de otros transgenes, pvehc\Delta3'E y pvehc3'EHS3b/4, mediante análisis de PCR utilizando ADN procedente de células ES transfectadas con pvehc3'E a modo de estándar.
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2) Producción de anticuerpos por parte de ratones quiméricos
Se inyectaron clones de células ES que contenían el transgén IgH en blastocistos de ratones RAG-2^{-/-} (Takahashi N. et al., Nucleic Acids Res. 8:5983, 1980) y se trasplantaron a úteros de madres nodrizas de la cepa ICR (de 8 a 12 semanas de edad, CLEA Japan Inc.). Se sometió a ensayo la complementariedad del sistema inmunológico respecto a células B y T originadas a partir de células ES en ratones quiméricos mediante citometría de flujo tras tinción de las células con anticuerpo antiCD3 marcado con PE o antiB220/SA-FITC-biotina.
Se utilizó anticuerpo de oveja anticadena \mu de ratón marcado con POD para la detección de los anticuerpos unidos. Para analizar los anticuerpos que presentaban C\mu humano, las placas se recubrieron con anticuerpo antiIgM humana de oveja (Southern Biotech) y anticuerpo monoclonal antiIgM humana marcado con POD (ZYMED) para la detección de los anticuerpos unidos. Se utilizaron como anticuerpos de control, sobrenadante de cultivo de J558L transformante, de IgM de Waldenström humano y del anticuerpo monoclonal IgM antiNP B4-3.
TABLA 1 Células ES y ratones quiméricos utilizados
1
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Se llevó a cabo un retrocruzamiento con el ratón C57BL/6 para examinar la transmisión germinal del transgén, y se extrajo el ADN de la cola del ratón resultante para analizar la generación de un ratón quimérico basado en si albergaba el transgén o no.
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3) Producción inmunológica y de anticuerpos
Con el fin de examinar si el sistema inmunológico se había reconstituido con los linfocitos derivados de las células ES, se midieron las cantidades de IgM en los sueros preinmunes de los ratones quiméricos A4-3, 2-1 y 2-3 mediante ELISA.
Se muestra el resultado en la figura 3A. Con independencia del tipo de transgén, las cantidades detectadas de IgM de ratón en todos los sueros de estos ratones eran similares, aunque más reducidas que las presentes en un ratón BALB/c normal.
A continuación, se preparó globulina \gamma NP_{34}-de pollo (NP_{34}-CGG) y NP-BSA que presentaba un valor de NP diferente, de la misma manera que en Azuma et al. (Azuma T. et al., Molec. Immunol. 24:287, 1987).
Se administró CFA (adyuvante completo de Freund: Difco, 100 \mug/ratón), incluyendo (4-hidroxi-3-nitrofenil)acetil-globulina \gamma de pollo (en adelante denominada NP_{34}-CGG), en ratones quiméricos, y se administró la misma cantidad de suero inmune adicional utilizando IFA (adyuvante incompleto de Freund). Tres días después de la administración final de PBS que incluía NP_{34}-CGG, se recolectaron los antisueros de los ratones inmunizados. A continuación, se sacrificaron los ratones y se obtuvieron muestras de tejido.
Se utilizaron placas recubiertas con NP_{1}-BSA o NP_{16}-BSA para medir la producción de anticuerpos antiNP y la maduración de afinidad de estos anticuerpos. Se utilizó anticuerpo de oveja antiIgG de ratón marcado con POD (ZYMED) para la detección de los anticuerpos.
Se utilizó el anticuerpo monoclonal antiNP F8 como control de anticuerpo inmaduro, y C6 como control de anticuerpo monoclonal maduro (Taketani M. et al., Mol. Immunol. 32:983, 1995; Furukawa K. et al., Immunity 11:329, 1999).
Se muestra el resultado en la figura 3B. No se detectó anticuerpo que expresa el gen C\mu humano codificado por los transgenes en los antisueros preinmunes o inmunes procedentes de ratones inmunizados con NP_{34}-CGG.
Se prepararon hibridomas productores de anticuerpo monoclonal antiNP (\gamma1\lambda1) a partir de ratones pvehc3'EHS3b/4 inmunizados con NP_{34}-CGG. Ninguno de dichos anticuerpos secretados expresaba C\mu humano; sin embargo, algunos de ellos sintetizaban cadena H intracelular que presentaba C\mu humano.
El resultado sugiere que los transgenes se habían transcrito y traducido en las células B de ratones quiméricos. Sin embargo, el nivel de los productos de cadena H secretados era inferior al nivel detectable.
A continuación, se examinó mediante ELISA la reacción de los anticuerpos de ratones quiméricos con el antígeno TD NP_{34}-CGG. Se muestra el resultado en la figura 3C. El valor del anticuerpo cambió, pero la totalidad de los ratones produjeron anticuerpos antiIgG, indicando que los sistemas inmunológicos responden a la producción de anticuerpos antiNP.
Además, la proporción de unión de dichos anticuerpos a NP_{1}-BSA, que se relaciona con la unión a NP_{16}-BSA, se examinó midiendo la maduración de afinidad. Se muestra el resultado en la figura 3D.
\newpage
Tal como se muestra en la figura 3D, un anticuerpo monoclonal F8 de control no mostró hipermutación somática y presentaba una constante de asociación (K_{a}) de 2x10^{5}/M con NP-Cap, y la proporción era de 0,29. Por otra parte, anticuerpo monoclonal C6 bien madurado que presentaba una K_{a} de 2x10^{7}/M (Furukawa K. et al., Immunity 11:329, 1999) presentaba una proporción de aproximadamente 1. La totalidad de los sueros procedentes de ratones quiméricos mostraba proporciones similares a las de C6; por lo tanto, la maduración de afinidad de los anticuerpos antiNP avanzó en un grado similar en la totalidad de los ratones quiméricos tras la inmunización con NP_{34}-CGG.
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Ejemplo 4 Clonación y secuenciación del gen V_{H}
Aunque se reconstituyó el sistema inmunológico en el ratón quimérico, resultó bastante difícil obtener una cantidad suficiente de células B IgG^{+} Pna^{hi}, que son populares como células de centro germinal derivadas de un único ratón quimérico. De acuerdo con lo expuesto anteriormente, tras la inmunización con NP_{34}-CGG, se separaron células de bazo IgM^{-}B220^{+} mediante citometría de flujo utilizando un FACS Vantage, que se esperaba que seleccionase las células B de memoria con cambio de isotipo.
La suspensión de células individuales procedente de bazos de ratones quiméricos inmunizados con NP_{34}-CGG se trató con 0,83% de cloruro amónico para inducir la hemolisis. En algunos experimentos, las células T también se trataron con anticuerpo antiThy1 (T24/40 y HO13.4) para inducir la hemolisis, y después se trataron con un complemento de conejo. Las células se tiñeron con anticuerpo antiCD45R/B220 marcado con ficoeritrina (PE) (molécula de superficie celular, PharMingen) o con antiIgM de ratón marcado con isotiocianato de fluoresceína (FITC)
(ZYMED).
Se tiñeron las células peritoneales con antiCD5 marcado con biotina/estreptavidina marcada con FITC (pherMingen) y antiCD45R(B220) marcado con PE.
Las células CD45R(B220)^{+}IgM^{-}, CD45R(B220)^{+}IgM^{+} o CD5^{+}CD45R(B220)^{+} se fraccionaron mediante cito-
metría de flujo en un separador celular activado por fluorescencia (FACS) Vantage (Becton, Dickinson and
Company).
Además, a modo de experimento de control, se obtuvieron células CD4+ y/o CD8+ a partir de timo tras la tinción y separación.
Se preparó ARN total a partir de células de bazo o peritoneales fraccionadas mediante la citometría anteriormente indicada, utilizando TRIzol (reactivo de preparación de ARN, GIBCO BRL) siguiendo las instrucciones del
fabricante.
Se preparó ADNc a partir de ARN total utilizando oligo(dT) como cebador y transcriptasa inversa Superscript II (GIBCO BRL). Cada una de las muestras de ADNc se amplificó mediante PCR utilizando: cebador V_{H}186.2 de secuencia SEC ID nº 9 y cebador de C\mu humano de secuencia SEC ID nº 10 para los transgenes; y cebador VH186.2 de secuencia SEC ID nº 9 y cebador de C\gamma1 de ratón de secuencia SEC ID nº 11 para los genes de Ig de ratón endógenos, respectivamente.
SEC ID nº 9: 5'-CATGCTCTTCTTGGCAGCAAC-3'
SEC ID nº 10: 5'-GCAGCCAACGGCCACGCTGC-3'
SEC ID nº 11: 5'-GGCCGAATTCCATGGAGTTAGTTTGGG-3'
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Se llevó a cabo la reacción de PCR bajo las condiciones siguientes: 95ºC durante 1 minuto, 62ºC durante 1 minuto y 72ºC durante 1 minuto durante 30 ciclos. Los productos de PCR de los transgenes y los genes endógenos de IgH de ratón se analizaron mediante electroforesis en gel de agarosa o se ligaron en pCR-2.1 (Invitrogen Corporation) utilizando un kit de clonación TA (Invitrogen Corporation) y se secuenciaron utilizando el cebador de M13 mostrado como secuencia SEC ID nº 12 (-20, Takara Bio Inc.), el cebador inverso de M13 mostrado como secuencia SEC ID nº 13 (Takara Bio Inc.) y el secuenciador de ADN Hitachi modelo 5500 (Hitachi Ltd.).
Tal como se muestra en la figura 4, se identificó la expresión de los fragmentos de anticuerpo que incluían transgenes.
\newpage
2) Hipermutación somática de transgenes en células B de bazo o peritoneales
Se estimó la frecuencia de mutación dividiendo el total de mutaciones por el total de bases de secuencia determinada. Se muestra el resultado en la Tabla 2.
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TABLA 2 Mutaciones en las secuencias de la región V de las células B IgM^{-} de bazo de ratones quiméricos
2
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Para la hipermutación somática en transgenes, se utilizaron cebadores para la hibridación con V_{H}186.2 o con C\mu humano. Se realizó la clonación y secuenciación del ADNc preparado mediante RT-PCR. Se muestra el resultado en la Tabla 3. Se muestra en la figura 5 la distribución y frecuencia de hipermutación somática entre constructos de transgén en células B de bazo.
La amplificación específica de los transgenes debido a la utilización combinada de los cebadores se observó únicamente en las células de bazo de ratones quiméricos, pero no en aquéllas procedentes de ratones C57BL/6 inmunizados con NP_{34}-CGG. Además, se observó que la totalidad de las secuencias presentaban una diversidad de uniones idéntica en CDR3 que es una característica del ADN de A6 utilizado para construir los transgenes.
Respecto al constructo génico pveh\Delta3'e, se observaron cambios de nucleótidos resultantes de la hipermutación somática en V_{H}186.2-DFL16.1-J_{H}2, aunque la frecuencia era baja. Se estimó que la frecuencia de mutación era de 0,17% (Tabla 2).
El constructo génico pvehc3'E mostró una distribución esencialmente similar de la hipermutación, aunque la frecuencia era ligeramente mayor que la de pvehc\Delta3'E (Tabla 2).
En el caso de pvehc3'EHS3b/4, en el que HS3b/4 se añade posteriormente al constructo génico pvehc3'E de la invención, la consecuencia fue la observación de un incremento drástico de la frecuencia de hipermutación somática en el gen V_{H}186.2-DFL16.2-J_{H}2 (figura 5). La totalidad de los clones de PCR secuenciados contenía cambios de nucleótidos a pesar del hecho de que se habían seleccionado aleatoriamente. Estos cambios de nucleótidos se encontraron con una frecuencia elevada en el área circundante a CDR2 (región hipervariable 2) y a CDR3 (figura 5 y Tabla 2).
Los datos se obtuvieron de dos ratones quiméricos, correspondiendo a cada constructo de transgén mostrado en la figura 5, y presentaban una buena concordancia entre ellos. Resultaba evidente una elevada frecuencia de hipermutación en pvehc3'EHS3b/4. Sin embargo, la mutación se encontraba claramente ausente en las células B1 peritoneales del mismo ratón quimérico (figura 5).
\newpage
La Tabla 3 siguiente muestra las características de las sustituciones identificadas en los transgenes.
TABLA 3 Mutaciones en el gen IgH
3
Resulta evidente a partir de la comparación entre los transgenes de IgH que la transición de bases y la transversión de bases surgen con prácticamente la misma frecuencia.
Además, en la secuencia de locus denominada motivo RGYW (A/G, G, C/T, A/T) (Kabat E.A. et al., US National Institutes of Health, Bethesda, M.D., U.S.A., página 1.394, 1991; Rogozin I.B. et al., Biochim. Biophys. Acta. 11:1171, 1992), se ha analizado la aparición de hipermutación somática en el transgén V_{H}186.2. El gen de línea germinal V_{H}186.2 (294 pb) contenía el motivo RGYW/WRCY (93 pb), correspondiente a 32% del número total de bases, y la frecuencia de hipermutación somática en este motivo aparentemente era de 34%, que no es significativamente superior a la presente en otras regiones de V_{H}.
Aplicabilidad industrial
En los ejemplos anteriores, se utilizó un sistema de blastocistos RAG-2^{-/-} para preparar ratones quiméricos que alojaban transgenes de IgH con diferentes elementos de acción en cis.
El método de producción de la invención presenta algunas ventajas respecto a las técnicas convencionales de transgenes y resulta superior especialmente al transformar células ES de bajo número de copia del transgén. De hecho, se estimó mediante transferencia southern y PCR que el número de copia del transgén en células ES transformantes era de 3 o inferior en la mayoría de casos (Tabla 1).
Únicamente se encontraron números marginales de hipermutación en pvehc\Delta3'E y se confirmó el resultado de que los elementos de acción en cis, el promotor de V_{H} y E\mu/MAR no resultaban suficientes para inducir una frecuencia elevada de hipermutación. La adición de un fragmento intensificador 3' (4 kb) a pvehc\Delta3'E (pvehc3'E) resultó en un incremento de aproximadamente 30% de la frecuencia de hipermutación.
En la presente invención, se encontró que la frecuencia de expresión de hipermutación inducida se incrementaba mucho al introducir HS3b y HS4 en el extremo 3' del intensificador 3' de pvehc3'E, indicando que el constructo pvehc3'EHS3b/4 contiene todos los elementos necesarios para que se produzca la hipermutación somática. Los experimentos realizados clarifican que los motivos responsables de la hipermutación de elevada frecuencia se encuentran comprendidos dentro de una región HS3b/4 de 2,6 kb.
De esta manera, resulta posible proporcionar un vector de expresión recombinante para la inducción de un mutante aleatorio del transgén deseado. Además, resulta posible proporcionar un procedimiento de producción de un mutante aleatorio de elevada frecuencia obtenido mediante la expresión del vector de expresión recombinante en células animales. También resulta posible proporcionar un método para expresar un mutante aleatorio o un kit para la producción de un mutante aleatorio que comprende el vector de expresión recombinante y células animales.
<110> OTSUKA PHARMACEUTICAL CO., LTD. et al
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\vskip0.400000\baselineskip
<120> PRODUCTION PROCESS FOR MUTANT
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<130> f001jp
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<140>
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<141>
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\vskip0.400000\baselineskip
<150> 2001-191884
\vskip0.400000\baselineskip
<151> 2001-06-25
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\vskip0.400000\baselineskip
<160> 14
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<170> PatentIn Ver. 2.1
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<210> 1
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<211> 1182
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<212> ADN
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<213> Homo sapiens
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<400> 1
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5
6
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<210> 2
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<211> 1381
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<212> ADN
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<213> Homo sapiens
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<400> 2
7
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<210> 3
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<211> 34
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> Descripción de la secuencia artificial: cebador
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<400> 3
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tctagaacca catgcgatct aagggatatt gggg
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34
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<211> 33
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> Descripción de la secuencia artificial: cebador
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<400> 4
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caggactagt gatcattgag ctccggctct aac
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33
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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<223> Descripción de la secuencia artificial: cebador
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ctagtctaga ctgcagactc actgttcacc atg
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<213> Secuencia artificial
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<223> Descripción de la secuencia artificial: cebador
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gtggactagt aagcttggag ttaggtgggt agg
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33
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<210> 7
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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<223> Descripción de la secuencia artificial: cebador
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> Descripción de la secuencia artificial: cebador
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ggtgtcccta gtccttcatg
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20
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<210> 9
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> Descripción de la secuencia artificial: cebador
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<400> 9
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catgctcttc ttggcagcaa c
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21
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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<223> Descripción de la secuencia artificial: cebador
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gcagccaacg gccacgctgc
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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<223> Descripción de la secuencia artificial: cebador
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ggccgaattc catggagtta gtttggg
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27
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> Descripción de la secuencia artificial: M13 forward primer
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<400> 12
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ctctacagac acgggcc
\hfill
17
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<210> 13
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<211> 29
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> Descripción de la secuencia artificial: M13 reverse primer
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<400> 13
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aaaaagcttg gtgtccctag tccttcatg
\hfill
29
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<210> 14
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<211> 546
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> Descripción de la secuencia artificial: promoter
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<400> 14
8

Claims (6)

1. Procedimiento de producción de un mutante aleatorio de gen exógeno, en el que se introduce un constructo de ADN que comprende por lo menos los (a) a (d) siguientes en una célula animal y se produce el mutante de gen exógeno en la célula animal:
(a)
un promotor de V_{H}, en el que dicho promotor de V_{H} comprende la secuencia de SEC ID nº: 14;
(b)
un gen exógeno;
(c)
un intensificador de intrón, en el que la secuencia de ADN puede regular la transcripción y contiene la secuencia de región no expresada situada entre los exones del gen J_{H} de cadena pesada y el gen C\mu; y
(d)
un intensificador que comprende los elementos hipersensibles a ADNasaI HS1, HS2, HS3b y HS4 del intensificador 3' de cadena pesada de inmunoglobulina, en el que la secuencia de ADN comprende las secuencias de ADN de las secuencias de SEC ID nº 1 y SEC ID nº 2.
2. Procedimiento de producción según la reivindicación 1, en el que la célula animal es una célula animal de una línea de células B.
3. Procedimiento de producción según la reivindicación 2, en el que la célula animal de una línea de células B se deriva de una célula de una línea de linfocitos pre-B.
4. Procedimiento de producción según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3, que comprende además obtener un producto de expresión de dicho gen mutante mediante la expresión de dicho mutante de gen exógeno en la célula animal.
5. Constructo de ADN para la producción de un mutante de gen exógeno, que comprende por lo menos:
(a)
un promotor de V_{H}, en el que dicho promotor de V_{H} comprende la secuencia de SEC ID nº 14;
(b)
un gen exógeno;
(c)
un intensificador de intrón, en el que la secuencia de ADN puede regular la transcripción y contiene la secuencia de región no expresada situada entre los exones del gen J_{H} de cadena pesada y el gen C\mu; y
(d)
un intensificador que comprende los elementos hipersensibles a ADNasaI HS1, HS2, HS3b y HS4 del intensificador 3' de cadena pesada de inmunoglobulina, en el que la secuencia de ADN comprende las secuencias de ADN de las secuencias de SEC ID nº 1 y SEC ID nº 2.
6. Kit para el procedimiento de producción de un mutante de gen exógeno o la producción de un producto de expresión de un gen mutante, que comprende un vector que presenta:
(a)
un promotor de V_{H}, en el que dicho promotor de V_{H} comprende la secuencia de SEC ID nº 14;
(b)
un sitio de inserción de un gen exógeno;
(c)
un intensificador de intrón, en el que la secuencia de ADN puede regular la transcripción y contiene la secuencia de región no expresada situada entre los exones del gen J_{H} de cadena pesada y el gen C\mu; y
(d)
un intensificador que comprende los elementos hipersensibles a ADNasaI HS1, HS2, HS3b y HS4 del intensificador 3' de cadena pesada de inmunoglobulina, en el que la secuencia de ADN comprende las secuencias de ADN de las secuencias de SEC ID nº 1 y SEC ID nº 2,
con el fin de llevar a cabo la expresión de una secuencia de ADN mutada que produce un mutante de gen exógeno.
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