ES2343304T3 - Produccion de la forma lipidada de las lipoproteinas asociadas a peptidoglicano de bacterias gram-negativas. - Google Patents

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Abstract

Un plásmido que contiene un promotor estrechamente regulado, en el que dicho promotor está unido operativamente a una secuencia de ADN aislada y purificada que codifica una lipoproteína asociada a un peptidoglicano (LAP) de bacterias gram-negativas, en el que el promotor es un promotor inducible por arabinosa o un promotor T7.

Description

Producción de la forma lipidada de las lipoproteínas asociadas a peptidoglicano de bacterias gram-negativas.
Campo de la invención
La presente invención se refiere a la expresión de la forma lipidada de la proteína asociada a peptidoglicano de bacterias gram-negativas y al uso de esta proteína lipidada recombinante en composiciones antigénicas.
Antecedentes de la invención
Las paredes celulares de las bacterias gram-negativas contienen restos reticulados conocidos como peptidoglicanos. Diversas bacterias gram-negativas producen proteínas que están unidas covalentemente a los peptidoglicanos. Dicha proteína se denomina lipoproteína asociada a peptidoglicano (LAP). Las LAP están presentes como parte del locus tol en diversas bacterias gram-negativas,, incluyendo Legionella pneumophila (entrada a bibliografía 1), Escherichia coli (2), Haemophilus ducreyi (3), Campylobacter jejuni (4), Pseudomonas putida (5), Brucella abortus (6), Pseudomonas aeruginosa, Klebsiella aerogenes, Serratia marcescens, Proteus vulgaris, Salmonella typhimurium (7) Actinobacillus pleuropneumoniae (8), Helicobacter pylori (9) Chlamydia pneumonia (10), y Chlamydia trachomatis (11).
Otra bacteria que contiene LAP es la bacteria Haemophilus influenzae (H. influenzae). La bacteria H. influenzae se divide en dos grupos. Las cepas que poseen una cápsula conocida se tipifican en función de la reacción serológica de la cápsula con el antisuero de referencia. Se han identificado los tipos a-f. Las cepas que no reaccionan con ninguno de los antisueros de referencia se conocen como no tipificables.
H. influenzae de typo b (Hib) es la causa mas frecuente de la meningitis neonatal y otras infecciones invasoras en los estados Unidos (12). La mayor incidencia de meningitis infantil se produce entre uno y cinco años de edad. El sesenta por ciento de los casos de meningitis causadas por Hib aparecen en niños menores de dos años de edad (12).
H. influenzae no tipificable (NTHi) es un organismo gram-negativo que causa varias enfermedades, incluyendo neumonía, bacteriemia, meningitis, sepsis posparto y traqueo bronquitis febril aguda en adultos (13). Se ha indicado que NTHi causa entre el 20 y el 40 por ciento de todos los casos de otitis media observada en niños pequeños (14, 15, 16). Los niños pueden experimentar infecciones múltiples del mismo organismo puesto que la infección no confiere una inmunidad muy duradera. La terapia actual para las apariciones crónicas o repetitivas de la otitis media incluye la administración de antibióticos y la inserción de tubos para drenar el oído interno. Las cepas de NTHi también se han implicado como una causa primaria de sinusitis (17). Adicionalmente, NTHi causa sepsis neonatal.
Las actuales composiciones antigénicas basadas en cápsulas son ineficaces contra NTHi. Se ha observado que la superficie de estas bacterias es antigénicamente muy variable, siendo particularmente diversas las proteínas, P1 y P2, (18,19) de la membrana principal externa. En seres humanos, la presencia de anticuerpos séricos bactericidas se ha descrito para correlacionarla con protección de otitis media causada por cepas NTHi sensibles (20).
Los candidatos para incluir en las composiciones antigénicas contra NTHi deben conservarse altamente al nivel de aminoácido, tener la superficie expuesta (en particular, proteínas externas de membrana), producir anticuerpos bactericidas y estar presentes en todos los aislados. Investigaciones previas han demostrado que la proteína P6 (también conocida como PBOMP-1 e HiPAL) (21) de NTHi cumple todos estos criterios. Se ha demostrado que las proteínas nativas purificadas provocan anticuerpos bactericidas (22, 23, 24, 25) y se conservan antigénicamente (22, 23, 26, 27).
La evaluación de la secuencia genética del gen P6 ha demostrado que este está muy conservado entre los aislados de NTHi óticos y por tanto la secuencia de la proteína también está muy conservada. La P6 nativa es una lipoproteína, más específicamente una LAP, que se modifica en la cisteína amino-terminal con lípidos. Esta proteína está presente en H. influenzae en cantidades relativamente pequeñas (menos del 1% del total de las proteínas de la membrana externa), haciendo muy difícil la purificación de cantidades útiles a partir del organismo nativo. Por tanto, se necesita una versión de P6 recombinante para el desarrollo adicional como un componente en las composiciones antigénicas.
Varios laboratorios no podían expresar la rP6 lipidada en grandes cantidades en E. coli (28.29). Como resultado, construcciones recombinantes iniciales que expresan P6 en E. coli podían expresar solamente una versión no lipidada de la proteína. Estos grupos indicaron que, aunque la proteína P6 lipidada purificada de H. influenzae era más inmunogénica que la rP6 no lipidada purificada de E. coli, era difícil modificar genéticamente un vector de ADN que expresase la P6 lipidada (28.29); es decir, no mejor que los bajos niveles de la P6 nativa expresada por H. influenzae.
Los intentos previos para expresar la rP6 lipidada se basaron en promotores que no estaban bajo estrecha regulación transcripcional, tal como trc, taq, laca y P_{L}-C1857. El documento WO 90/02557A desvela un plásmido que contiene el promotor lac unido operativamente a una secuencia aislada de ADN que codifica la proteína PBOMP01. Se planteó la teoría de que esta transcripción algo filtrante conduce a efectos sutiles sobre E. coli lo que contribuye a niveles bajos de expresión de la proteína lipidada. La evidencia experimental indica que la capacidad de la peptidasa II de señal para añadir lípidos al extremo N de la proteína no era responsable del bajo rendimiento de la P6 procesada (datos no demostrados).
Aunque la proteína P6 de H. influenzae han sido un candidato primario para la inclusión en las composiciones antigénicas contra la enfermedad de Haemophilus (20, 23, 24, 25, 30, 31), las cantidades relativamente pequeñas disponibles de H. influenzae han hecho esencial la expresión recombinante de esta proteína. Los esfuerzos previos para expresar la proteína P6 lipidada en cantidades significativas han fracasado (28, 29). Por tanto, los investigadores se han centrado en la expresión y purificación de formas múltiples de la P6 no lipidada.
La respuesta del anticuerpo engendrada por la rP6 no lipidada era biológicamente funcional, capaz de proteger a ratas recién nacidas de la meningitis (28) y de provocar anticuerpos bactericidas (28, 29), pero de una magnitud más baja que los provocados por la P6 nativa no lipidada (28).
Por lo tanto, hay una necesidad de construir sistemas de vectores de expresión célula-huésped que expresen LAP lipidadas de bacterias gram-negativas. En particular, hay una necesidad de construir sistemas de vectores de expresión célula-huésped que expresen la rP6 lipidada, que se puedan después incluir en composiciones antigénicas contra H. influenzae.
Resumen de la invención
Por tanto, es un objeto de la invención desarrollar construcciones genéticas capaces de expresar las LAP de bacterias gram-negativas en células huéspedes bacterianas.
Es un objeto particular de esta invención desarrollar construcciones genéticas capaces de expresarse en E. coli.
Otro objeto adicional de esta invención es incluir esta rP6 lipidada en composiciones antigénicas para administrar a un mamífero para evitar la enfermedad causada por H. influenzae.
Estos y otros objetos de la invención como se describe a continuación se consiguen por clonación y expresión en células bacterianas de las formas lipidadas de las PAL mediante el uso de promotores estrechamente regulados en los vectores de expresión. Por consiguiente, la presente invención proporciona un plásmido como se define en las reivindicaciones.
La invención se ejemplifica por la clonación y expresión en células bacterianas de la forma lipidada de la proteína P6 recombinante de H. influenzae mediante el uso de dichos promotores en el vector de la expresión.
Específicamente, para la expresión de la P6 recombinante lipidada, se construyen plásmidos que contienen un promotor de arabinosa inducible o un promotor T7, en el que el promotor está unido operativamente a una secuencia aislada y purificada de ADN que comprende una secuencia de ADN que codifica la proteína P6, y en el que la secuencia de ADN, bajo control de dicho promotor, se expresa en la forma del lipidada.
A su vez, una célula huésped bacteriana se transforma, se transduce o se transfecta con dicho plásmido y después se cultiva en condiciones que permitan la expresión de la rP6 lipidada por la célula huésped.
En otra realización de esta invención, la rP6 lipidada se usa como un inmunógeno en composiciones antigénicas contra toda H. influenzae patógena, incluyendo tanto el tipo b como el no tipificable de H. influenzae.
Cuando está purificada, la proteína recombinante es indicada para ser lipidada por varios criterios y, lo que es más importante, es mucho más inmunogénica que la forma P6 no lipidada usada anteriormente.
Se ha demostrado que la modificación lipídica de la cisteína amino-terminal por la peptidasa II de señal hace que estas proteínas sean más inmunogénicas que sus formas no lipidadas (28, 29, 32). Se han evaluado estas formas con respecto a su inmunogenicidad y su relación con la P6 lipidada. Todas han demostrado inmunogenicidad disminuida en comparación con la proteína nativa lipidada.
Esto permite usar dosis mucho mas bajas para inmunizar a seres humanos y por tanto hace que la rP6 lipidada sea una candidata comercialmente más viable para incluir en las composiciones antigénicas. Estos títulos aumentados permiten el uso de dosis más bajas de proteína P6 en seres humanos, lo que proporcionaría ahorrar costes en la producción de dicha proteína.
La proteína rP6 lipidada aislada y purificada se usa para preparar una composición antigénica que produzca una respuesta inmune protectora en un huésped mamífero. La composición antigénica puede comprender adicionalmente uno o más adyuvantes, diluyentes o portadores. Los ejemplos de dichos adyuvantes incluyen hidróxido de aluminio, fosfato de aluminio, Stimulon^{TM} QS-21, MPL^{TM}, IL-12 y la toxina del cólera. La composición antigénica se administra a un huésped mamífero en una cantidad inmunogénicamente eficaz para proteger al huésped contra la enfermedad causada por H. influenzae.
Breve descripción de las figuras
La Figura 1 representa la clonación del gen pal que codifica la proteína P6 con el péptido de señal de la lipoproteína nativa por amplificación PCR del cromosoma de la cepa no tipificable de H. influenzae P860295.
La Figura 2 representa la homogeneidad e identidad de la rP6 lipidada. Geles SDS-PAGE al quince por ciento se cargaron con muestras que contenían aproximadamente 10 \mumg de la rP6 lipidada en el extracto inicial (carril 1) y el grupo de la rp6 lipidada purificada por intercambio aniónico (carril 2). Los carriles etiquetados con S contienen patrones de bajo peso molecular preteñidos de Bio-Rad.
La Figura 2A es el gel teñido con Coomassie. La Figura 2B es la inmunotransferencia de western de un gel similar.
La Figura 3 representa el análisis SDS-PAGE de fracciones de la purificación de la rP6 lipidada. Se realizó la electroforesis de alícuotas de las etapas en el proceso de purificación de la rp6 lipidada en un sistema del gel en gradiente al 4-20%. Carriles: 1, Permeado de diafiltración con tampón de lisis; 2, Permeado de diafiltración con Triton^{TM} X-100; 3, Permeado de diafiltración con tampón Tris^{TM}; 4, Permeado de diafiltración con Zwittergent^{TM} 3-14; 5, Permeado de diafiltración con Zwitter-gent^{TM} 3-14/ NaCl 0,5 M; 6, Permeado de diafiltración con tampón Tris^{TM}; 7, Permeado de diafiltración con sarcosilo; 8, Mark 12 Convencional; 9, Permeado de diafiltración con tampón Tris^{TM}; 10, Permeado de diafiltración con Zwittergent^{TM} 3-12 a temperatura ambiente; 11, Permeado de diafiltración con tampón Tris^{TM}; 12, Permeado de etapa de concentración; 13, Permeado de diafiltración con Zwittergent^{TM} 3-12 a 55ºC; 14, Permeado de diafiltración con tampón Tris^{TM} a 55ºC; 15, Permeado de diafiltración con Zwittergent^{TM} 3-12 a 55ºC.
Descripción detallada de la invención
Para superar la dificultad reconocida para expresar cantidades útiles de las PAL lipidadas, tal como la rP6 lipidada, se ideó una estrategia implicando el uso de promotores estrechamente regulados y cepas huéspedes desprovistas de proteasas citoplasmáticas y periplasmáticas.
Todos los esfuerzos previos no exitosos para expresar la proteína P6 lipidada en cantidades significativas para su uso comercial se basaron en el cambio de la secuencia del promotor y/o en realizar cambios en la secuencia de señal reconocida por la peptidasa de señal II.
Como se describe más adelante, se construyeron plásmidos conteniendo el gen pal que codifica P6 bajo el control del promotor T7 (plásmido pPX4019 - Ejemplo 1) y el promotor inducible de arabinosa (plásmido pPX4020 - Ejemplo 2). En el Ejemplo 3 se describen las cepas bacterianas ejemplares y los medios. Tanto pPX4019 como pPX4020 expresan la proteína P6 lipidada en las cepas de E. coli ensayadas, como se determina por el análisis de transferencia de western, con anticuerpos monoclonales específicos contra P6, clasificando según el tamaño en los geles SDS-PAGE que indicaron una carencia de una secuencia de señal y de una observación visual de los niveles de expresión en los geles teñidos con Coomassie (véase el Ejemplo 4 y las Figuras).
El plásmido pPX4020 produjo niveles aumentados de expresión de la proteína rP6 en las cepas de E. coli BL21 y BLR, con niveles más elevados en la cepa BLR. Por lo tanto, el plásmido pPX4020 se seleccionó para estudios adicionales. El cultivo de grandes cantidades de E. coli expresando la rP6 lipidada se realizó en la cepa huésped BLR. Todos los experimentos posteriores utilizaron este sistema de vector-huésped.
La construcción del plásmido descrita en este documento como una realización preferida (pPX4020) usa el sistema promotor inducible de arabinosa que tiene varias características únicas: Se regula estrechamente y es casi totalmente inactivo si no hay arabinosa y si hay algo de glucosa. Puede modularse ya que muestra niveles de inducción en aumento a medida que se añade arabinosa al medio de cultivo. Estos factores en combinación con la cepa BLR de E. coli, que es altamente deficitaria en proteasa y de recombinación deficiente, permiten la expresión significativa de la proteína P6 lipidada.
La purificación a escala discontinua de la rP6 lipidada implica centrifugación diferencial, extracción diferencial con detergente y cromatografía de intercambio aniónico (véase el Ejemplo 4).
Sin embargo, para hacer que un candidato sea viable para la inclusión en una composición antigénica, la rP6 lipidada expresada debe purificarse por un procedimiento que sea factible a gran escala. La diafiltración es un procedimiento adecuado para purificar a gran escala. El proceso de diafiltración para extraer la rP6 lipidada rP6 es complicado porque la rP6 lipidada se asocia estrechamente a peptidoglicanos.
Como se describe en el Ejemplo 5, la solubilización de la rP6 lipidada se consiguió siguiendo la extracción diferencial con detergente como la proteína nativa obtenida de Haemophilus (Hi-P6) (33), pero se usó diafiltración de flujo tangencial en lugar de centrifugación. Todos los detergentes tales como dodecilmaltósido, desoxicolato, Zwittergent^{TM} 3-08, 3-12, y 3-14 se ensayaron y se observó que eran aceptables para extraer la rP6 lipidada rP6 cuando se usaban en el intervalo de 0,2-1%(p/v). La rP6 lipidada también podría solubilizarse en un tampón de borato sódico, pH 9,5 a 65ºC. La flexibilidad de la elección del detergente permite el uso de Zwittergent^{TM} 3-12 para extraer la rP6 lipidada. La elección de Zwittergent^{TM} 3-12 por tanto minimiza el número de componentes necesarios para producir una composición antigénica multi componente. Aunque la Hi P6 nativa se obtiene en forma esencialmente pura después de la solubilization, la proteína recombinante se solubiliza junto con varias proteínas de E. coli. La cantidad relativa de estas proteínas puede variarse y en algunos casos casi eliminarse por la elección del detergente usado en el extracto final. La rP6 lipidada se separa de cualquier resto de proteínas de E. coli por cromatografía de intercambio aniónico (véase el Ejemplo 6).
Este procedimiento de extracción de las LAP combina los procesos de aclarado y extracción en una unidad de operación. El producto se extrae de las células y se separa de los residuos celulares tan sólo con un proceso de diafiltración continuo. Adicionalmente, las LAP se extraen en un estado semi-purificado lo que simplifica las etapas de procesamiento aguas abajo. Por último, este proceso es muy escalable porque el único requisito es que el área superficial de las membranas esté aumentada de manera proporcional con la cantidad de células. Este proceso de extracción evita el uso de la centrifugación, un procedimiento no preferido para usar en la extracción a gran escala. Después de la extracción, la rP6 lipidada se purifica por técnicas convencionales.
El análisis de la rP6 lipidada coincidió con la caracterización de la proteína recombinante como una lipoproteína, según lo esperado. El tamaño molecular según lo determinado por espectrometría de masas MALDI-TOF demuestra que la proteína recombinante purificada es más grande que lo esperado de su secuencia de aminoácidos solamente (véase el ejemplo 7). El tamaño de la proteína, combinado con el análisis de aminoácidos detallado en la tabla 1 (véase el Ejemplo 8), indica que se ha eliminado la secuencia de la señal y la proteína está en la forma madura. La existencia de un extremo amino bloqueado, según lo demostrado por el análisis de aminoácidos amino-terminal (véase el Ejemplo 9), también demuestra que se ha producido la modificación del resto cisteína terminal. Considerados en su conjunto, estos resultados demuestran que la secuencia de señal, que se ha demostrado que reconoce y procesa E. coli dando como resultado la P6 lipidada (23), se ha eliminado y que la P6 recombinante purificada aquí está lipidada en su extremo amino.
Investigadores anteriores han demostrado que después de producirse infecciones por NTHi de origen natural los niveles de anticuerpos contra la P6 tienen una correlación inversa con la incidencia de la enfermedad (34, 35, 36), haciendo de la producción de títulos elevados contra la P6 un objetivo de cualquier programa de inmunización que usa este antígeno. La proteína P6 nativa lipidada está presente en cantidades muy pequeñas (menos del 1% de las proteínas de la membrana externa) (33), lo que hace que la purificación de cantidades comercialmente viables sea más problemática.
Una ventaja crítica de la rP6 modificada-lipidada sobre la rP6 no lipidada expresada anteriormente es la inmunogenicidad potenciada asociada con la modificación lipídica. Dos informes han demostrado que, aunque la rP6 no lipidada es capaz de provocar anticuerpos biológicamente activos, esta es menos inmunogénica que la proteína lipidada (28, 29).
A diferencia, los datos de inmunogenicidad en animales presentados en las Tablas 2-4 más adelante (véanse los Ejemplos 10 y 11) muestran que la modificación lipídica de la P6 recombinante también aumenta la inmunogenicidad de este antígeno en el modelo murino. El aumento de hasta un logaritmo de 2 en los títulos medios geométricos de los anticuerpos (TMG) a las 6 semanas es muy significativo y hace de la forma lipidada de la proteína rP6 un candidato práctico para incluir en las composiciones antigénicas. Los resultados en estos experimentos refuerzan esto ya que la rP6 lipidada no interfiere con la respuesta inmune generada por los otros antígenos ensayados.
Considerados en su conjunto, estos datos apoyan la creencia de que la rP6 lipidada es viable para incluir en composición antigénicas contra H. influenzae. Aunque más adelante se ha ejemplificado con la rP6 lipidada de NTHi, también es adecuada la rP6 lipidada de Hib para incluir en las composiciones antigénicas de esta invención.
Además de los detallados en los ejemplos 1-3 una diversidad de sistemas de vectores de células huéspedes bacterianos son adecuados para usar para expresar la proteína rP6 lipidada usada en las composiciones antigénicas de esta invención.
Estos sistemas de expresión sitúan al gen que codifica la LAP lipidada recombinante bajo el control de un promotor estrechamente regulado. En condiciones especificas, estos promotores operan para regular negativamente la producción del ARNm de LAP recombinante, y por consiguiente mitiga cualquier efecto perjudicial en la célula huésped debido a la producción de la LAP lipidada recombinante (37). Esta regulación estrecha puede eliminarse después en condiciones específicas para permitir la expresión de la LAP lipidada recombinante maximizada en la célula huésped.
Estos promotores regulados estrechamente (que pueden estar junto con otros elementos de control) incluyen, pero sin limitación, el promotor inducible por arabinosa (38), el promotor T7 que puede modificarse para estar bajo control por la función antiterminación nutL/N (39, 40) o por Mu C (41), el promotor P_{L} en combinación con el antiterminador (42), la ARN polimerasa SP6 y los promotores de SP6 (43), el promotor de la colicina (44) el promotor/operador tetA (45) los promotores de rhamnosa y fosfato (46), los elementos reguladores LacR/O, tetR/O y AraCI1-12 (47) y los promotores invertibles (48).
El sistema de vectores es compatible con la célula huésped usada. Las células huéspedes adecuadas incluyen bacterias transformadas, transfectadas o transducidas por técnicas convencionales con ADN de plásmidos, ADN de cósmidos o ADN de bacteriófagos. Los ejemplos de huéspedes bacterianos incluyen E. coli, B. subtilis, Salmonella y Shigella.
Para construir un vector de este tipo, se inserta ADN de lap en un vector plasmídico que contiene un promotor bajo estrecho control transcripcional, y otros elementos de control y se liga a sitios específicos dentro del vector, de manera que cuando el vector plasmídico se inserta en una célula huésped bacteriana, la célula huésped puede expresar el ADN de lap.
El plásmido se introduce en la célula huésped por transformación, transducción o transfección dependiendo del sistema vector célula huésped usado. La célula huésped después se cultiva en condiciones que permiten que la célula huésped exprese la proteína rP6 lipidada. Una célula huésped que contiene un plásmido con el promotor inducible por arabinosa se induce con L-arabinosa, mientras que una célula huésped que contiene un plásmido con el promotor T7 se induce con IPTG.
La LAP lipidada es útil en la preparación de composiciones antigénicas para conferir protección a mamíferos contra enfermedades causadas por las bacterias correspondientes. Por ejemplo, la proteína rP6 lipidada es útil en la preparación de composiciones antigénicas para conferir protección a mamíferos contra enfermedades causadas por H. influenzae.
Estas composiciones antigénicas comprenden las LAP lipidadas purificadas y aisladas, tales como la proteína rP6 lipidada, en la que en la composición antigénica provoca una respuesta inmune protectora en un huésped de mamífero. Las composiciones antigénicas multivalentes se proporcionan incluyendo otras proteínas, tales como combinando la rP6 lipidada con la proteína UspA2 de Moraxella catarrhalis (que se describe en la Solicitud Internacional PCT Nº WO 98/28333 (49), que se incorpora en este documento por referencia), un agente causante de otitis media bacteriana y diluyentes o portadores inmunológicamente aceptables lipidados recombinantes de una manera convencional para preparar soluciones o suspensiones líquidas inyectables. Dichos diluyentes o portadores incluyen, pero sin limitación, PBS, solución salina fisiológica, soluciones isotónicas tamponadas, liposomas e ISCOMS. El nivel de anticuerpos provocado por las composiciones antigénicas pueden mejorarse usando determinados adyuvantes tales como hidróxido de aluminio, fosfato de aluminio, Stimulon^{TM} QS-21 (Aquila Biopharmaceuticals, Inc., Framingham, MA), MPL^{TM} (monofosforil lipido A 3-O-desacetilado; RIBI ImmunoChem Research, Inc., Hamilton, MT), IL-12 (Genetics Institute, Cambridge, MA), la toxina termolábil de E. coli y la toxina del cólera (tanto en una forma de tipo silvestre como mutante, por ejemplo en la que el ácido glutámico en la posición 29 del aminoácido se sustituye por otro aminoácido, preferiblemente una histidina, de acuerdo con la Solicitud Internacional PCT Nº WO 00/18434) (51).
Las composiciones antigénicas de esta invención se administran por inyección de una manera convencional, tal como inyección subcutánea, intradérmica o intramuscular en seres humanos, así como por administración oral, mucosa, intranasal o vaginal para inducir una respuesta inmune activa para proteger frente a enfermedades causadas por una bacteria gram- negativa tal como H. influenzae. La dosificación a administrarse se determina por medios conocidos por los expertos en la materia. La protección puede conferirse por una dosis única de las composiciones antigénicas o puede necesitarse la administración de varias dosis, además de dosis de refuerzo posteriormente para mantener la protección.
Para entender mejor esta invención, se exponen los siguientes ejemplos a continuación.
Ejemplos
Se utilizan técnicas de biología molecular convencionales de acuerdo con los protocolos descritos en Sambrook y col. (52).
Ejemplo 1 Construcción del Plásmido pPX4019 Conteniendo el Gen lap y el Promotor T7
Como se presenta en la Figura 1, el gen lap que codifica la proteína P6 se clonó con el péptido de señal de la lipoproteína nativa por amplificación PCR del cromosoma de la cepa H. influenzae no tipificable P860295. Usando cebadores mutagénicos que crean un sitio de restricción Ndel abarcando el codón de inicio en el extremo 5' del gen (GGAGAAATCATATGAACAAATTTG) (SEC ID Nº: 1) y un sitio HindIII en la región 3' del codón de terminación (GGATCCTGTTTTTCAAGCTTAGAAATACTAAG) (SEC ID Nº: 2), el fragmento de PCR conteniendo el gen lap se clonó en el vector de expresión pCRII (Invitrogen, Carlsbad, CA) y se exploró mediante análisis de restricción. El plásmido resultante se usó como la fuente para el fragmento NdeI/HindIII conteniendo el gen lap para P6 que se clonó en los sitios NdeI y HindIII del vector de expresión pET27b (Novagen, Madison, WI). El diseño de esta construcción coloca al gen para P6 bajo el control del promotor T7 y se aprovecha de un sitio de unión al ribosoma consenso en el vector. Los clones iniciales se identificaron en un huésped de E. coli no permisivo (DH5\alpha) por análisis de restricción. Se seleccionó un aislado de plásmido único y se conservó como pPX4019. Este plásmido se usó para transformar el control del huésped permisivo del promotor T7 y se aprovecha de un sitio de unión al ribosoma consenso en el vector. Los clones iniciales se identificaron en un huésped de E. coli no permisivo (DH5\alpha) por análisis de restricción. Se seleccionó un aislado de plásmido único y se conservó como pPX4019. Este plásmido se usó para transformar la cepa huésped permisiva BL21 (DE3, pLysS) (Novagen) para estudios de expresión.
Ejemplo 2 Construcción del Plásmido pPX4020 Conteniendo el Gen lap y el Promotor Inducible por Arabinosa
Se construyó un segundo plásmido de expresión de la proteína P6 colocando al gen lap bajo el control del promotor inducible por arabinosa estrechamente regulado (38). Este plásmido se generó subclonando el fragmento Xbal/HindIII del plásmido pPX4019 conteniendo el gen lap y el sitio de unión al ribosoma consenso de pET27b en el plásmido pBAD18-Cm digerido de manera similar (véase la Figura 1). Los clones se exploraron por análisis de restricción seguido de estudios de expresión en candidatos seleccionados. Unos de los aislados pBAD18-Cm que expresa la proteína P6 se denominó pPX4020.
Ejemplo 3 Expresión de la rP6 Lipidada de pPX4019 y pPX4020
Todos los estudios de expresión cualitativa comparando diferentes aislados, construcciones plasmídicas, cepas huéspedes de E. coli y concentración del inductor (IPTG para pPX4019, L-arabinosa (Sigma Chemical Co., St. Louis, MO) para pPX4020) se realizaron de una manera similar para proporcionar un fondo consistente para la comparación. Se cultivaron aislados de colonias simples durante una noche a 37ºC en medio HySoy^{TM}, glucosa al 1% y el antibiótico apropiado para la selección del plásmido (pPX4019, 15 \mug/ml de Kanamicina; y pPX4020, 15 \mug/ml de Cloramfenicol). Estos cultivos se diluyeron hasta una DO_{600} = 0,5 en HySoy^{TM}, glicerol al 1% y antibiótico, se cultivaron a 37ºC hasta una DO_{600} = 2-4 y se indujeron. Se tomaron muestras equivalentes hasta una DO_{600} = 1,0 a intervalos justo antes de la inducción, a las dos horas y a las 18 horas después de la inducción. Estas muestras se centrifugaron y el sedimento celular se resuspendió en un tampón de carga de SDS-PAGE de 150 \mul (ISS, Natick, MA). Se realizaron comparaciones de geles por SDS-PAGE al 15% teñidos con azul de Coomassie con 15 \mul de carga cargada por carril.
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Cepas de Células Huésped de E. coli Usadas para Expresar la rP6 Lipidada del Plásmido pPX4019
DH5\alpha - \phi80dlacZ\DeltaM15 \Delta(lacZYA-argF)U169 deoR recA1endA1 hsdR17 (r_{k}^{-},m^{+}_{k}) phoA supE44\lambda- thi-1 gyrA96 relA1 (Life Technologies, Rockville, MD)
BL21(DE3) - ompT lon hsdS_{B} (r_{B}^{-} m_{B}^{-}) gal dcm (DE3) (Novagen)
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Cepas de Células Huésped de E. coli Usadas para Expresar la rP6 Lipidada del Plásmido pPX4020
DH5\alpha - \phi80dlacZ\DeltaM15 \Delta(lacZYA-argF)U169 deoR recA1endA1 hsdR17 (r_{k}^{-},m^{+}_{k}) phoA supE44\lambda- thi-1 gyrA96 relA1(Life Technologies)
BLR - ompT lon hsdS_{B} (r_{B}^{-} m_{B}^{-}) gal dcm \Delta (srl-recA)306::Tn10(tet^{r}) (Novagen)
BL21 (DE3) - ompT lon hsdSB (r_{B}^{-} m_{B}^{-}) gal dcm (DE3) (Novagen)
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Cultivo de BLR en E. coli (pPX4020) expresando L-rP6
Se cultivaron células de E. coli recombinantes expresando la rP6 lipidada en un fermentador como se describe a continuación. Se preparó el medio de cultivo conteniendo los siguientes materiales y se esterilizó in situ para fermentadores y mediante autoclave para el cultivo en matraz.
Solución A
1
3
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Solución de Suministro de Pre-inoculación: MCG
4
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Solución EDTA
5
Se realizaron alícuotas de medio estéril conteniendo la Solución A y la solución Mineral en matraces agitadores y se añadieron 20 ml de MCG por litro de medio. Se añadió cloramfenicol a 50 \mul Cg/ml. Los cultivos iniciadores se inocularon con 200-300 \mul de BLR de E. coli (pPX4020) de una reserva congelada. Las células se cultivaron a 30ºC con aireación durante 16 horas. Se inoculó con el medio de cultivo un fermentador de 10 litros conteniendo medio de cultivo, complementado como se ha indicado anteriormente, hasta una de DO_{600} de aproximadamente 0,2.
Los parámetros de control del fermentador se ajustaron de la siguiente manera:
6
Para controlar los parámetros del proceso se usaron las siguientes soluciones y se esterilizaron antes del uso: PPG-2000-200 ml para el control de espuma si es necesario, 1 l de hidróxido de amonio al 40% para el control del pH durante el cultivo, 1 l de glucosa al 50% para suministrar cuando el pH comienza a elevarse debido al empobrecimiento de glucosa - para el cultivo continuado, 500 ml de ácido acético 4 N para el control del pH durante la inducción, solución de arabinosa al 25%, filtrado estéril (250 g/l) + glicerol al 1% - 250 ml (antes de esterilizar en autoclave). Se usó solución arabinosa/glicerol para suministrar después de la adición de glucosa final cuando el pH comienza a elevarse debido al empobrecimiento de glucosa para inducir la producción de proteína. La solución de arabinosa se filtró esterilizada antes de la adición de la reserva de glicerol esterilizada en autoclave. La solución se realizó añadiendo 100 ml de glicerol y 400 ml de solución de arabinosa al 25% para un fermentador de 10 l. La concentración final del fermentador contenía 10 gramos/litro de arabinosa y 10 ml/litro de glicerol.
Después de la inoculación del fermentador, se añadió base (hidróxido de sodio) en función de la necesidad para el control del pH, junto con antiespuma (PPG-200) en función de la necesidad. Se suministró oxígeno puro a 800 rpms. Cuando el pH se elevó por encima de 7,0, se suministraron al cultivo 900 ml de glucosa al 50%. Cuando el pH era superior o igual a 7,1, se añadió una solución adicional de 200 ml de glucosa al 50%. Estas condiciones continuaron hasta alcanzar una DO_{600} de aproximadamente 50.
Después de alcanzar una DO_{600} de aproximadamente 50, cuando el pH se elevó de nuevo por encima de 7,0 de nuevo, se añadió una solución de arabinosa/glicero de 50 ml para inducir la expresión de la rP6 lipidada. En este momento, se usó ácido para controlar adicionalmente el pH. La incubación prosiguió durante tres horas post-inducción y después el cultivo se recogió tras la adición de 10 ml por litro de solución EDTA 500 mM, pH 8. El caldo de cultivo se almacenó a 4ºC hasta la purificación de la rP6 lipidada.
Ejemplo 4 Purificación Analítica a Escala Discontinua de la rP6 Lipidada por Extracción Diferencial de la Membrana con Detergente
Se utilizaron lotes de la rP6 lipidada expresada de pPX4020 en experimentos posteriores y se purificaron por extracción diferencial de la membrana con detergente como se indica a continuación:
1)
aislamiento de la fracción de la membrana de E. coli: sedimentos celulares bacterianos congelados obtenidos del fermentador se congelaron y se suspendieron en HEPES-NaOH 10 mM, pH 7,4, Na_{2} EDTA 1 mM con un volumen de tampón igual a cinco veces el peso del sedimento celular congelado. La suspensión celular se homogeneizó en un microfluidificador Microfluidics (Newton, MA) 110-Y para lisar las células. Las membranas se obtuvieron del lisado celular por centrifugación diferencial (300.000 x g durante 1 una hora). Las membranas se lavaron dos veces con el mismo volumen de tampón usado para la lisis y después se congelaron como un sedimento.
2)
Solubilización de la rP6 lipidada de membranas de E. coli: la P6 lipidada se solubilizó de E. coli usando extracción diferencial con detergente similar a la descrita por Zlotnick y col (33) y Green y col (22). Todas las extracciones se realizaron durante 30 minutos a temperatura ambiente a menos que se indique otra cosa. Todas las centrifugaciones se realizaron usando un rotor Beckman 45 Ti a 42.000 rpm durante 1 hora con la temperatura del rotor controlada a 10ºC a menos que se indique otra cosa. Las membranas de E. coli se suspendieron en HEPES-NaOH 10 mM, pH 7,4, MgCl_{2} 1 mM y se extrajeron dos veces con Tritón^{TM} X-100 (Calbiochem-Novabiochem International, San Diego, CA) hasta una concentración final del 1% (p/v) para eliminar los componentes de la membrana interna. El sedimento de la membrana externa resultante se suspendió en Tris^{TM} 50 mM HCl pH 8,5 Na_{2} EDTA 5 mM, que también se usó para suspender los sedimentos posteriores antes de la solubilización de la rP6 lipidada. Las membranas externas se extrajeron después secuencialmente dos veces con Zwittergent^{TM} 3-14 al 1%; dos veces con Zwittergent^{TM} 3-14 al 1%; y NaCl 0,5 M; dos veces con N-lauril sarcosina al 1%, sal sódica; Zwittergent^{TM} 3-14 al 1%. El sedimento final obtenido después de estas extracciones se extrajo con Zwittergent^{TM} 3-12 al 2%; en Tris^{TM} HCl 10 mM, pH 8, Na_{2} EDTA 1 mM durante con 45 minutos a 55ºC con mezcla intermitente seguido por centrifugación durante al menos una hora. El sobrenadante de esta extracción final contenía la rP6 lipidada.
3)
Purificación de la rP6 lipidada: la rP6 lipidada conteniendo el extracto obtenido como se describe anteriormente se purificó además por cromatografía de intercambio aniónico utilizando una resina de flujo rápido de DEAE (Amersham Pharmacia Biotech, Piscataway, NJ) y el mismo tampón de fuerza iónica baja utilizado para la extracción. La rP6 lipidada solubilizada se absorbió a una columna de flujo rápido de DEAE con un volumen de lecho de aproximadamente 20 ml. La columna se desarrolló con un gradiente NaCl 0-0,2 M durante 40 minutos, seguido de 20 minutos de una elución isocrática con NaCl 0,2 M. La rP6 lipidada se eluyó durante la fase isocrática del desarrollo. La mayor parte de las otras proteínas permanecieron absorbidas a la columna y se desorbieron más tarde con NaCl 1M. De 200 g de células, se purificaron aproximadamente 100 mg.
4)
Caracterización de la rP6 lipidada purificada por SDS-PAGE y transferencia de Western. La homogeneidad de la rP6 purificada se ensayó por SDS-PAGE en el sistema de tampón Laemmli, seguido por densitometría láser del gel teñido. Aproximadamente se analizaron 10 \mug de la rP6 lipidada tanto del extracto bruto como del grupo purificado por intercambio aniónico en un gel SDS-PAGE al 15% (53). El gel se tiñó con azul de Coomassie y se escaneó en un densitómetro láser. La densitometría por láser del gel teñido con Coomassie (Figura 2A, carril 2), reveló un solo pico sencillo de más del 98% de homogeneidad en las fracciones agrupadas del intercambio aniónico, indicando que la rP6 lipidada se había purificado casi homogéneamente. La identidad de la rP6 lipidada de estas muestras se verificó por una reacción de transferencia de western de las mismas muestras usadas para determinar la homogeneidad con anticuerpos monoclonales específicos para la P6 de Haemophilus influenzae, que no reacciona con la proteína afín de E. coli (datos no mostrados). Los resultados del análisis de transferencia de western se muestran en la Figura 2B. La banda de la rP6 lipidada era la única banda reactiva con el anticuerpo monoclonal específico para P6 tanto en el extracto bruto (carril 1) como en las fracciones agrupadas (carril 2). Esto indica que la proteína purificada es de hecho, la P6. No se observaron productos de degradación.
Ejemplo 5 Purificación a Gran Escala de la rP6 Lipidada Usando Extracción Diferencial de la Membrana con Detergente
El caldo de fermentación de las células de E.coli expresando la rP6 lipidada se ajustó con EDTA 10 mM y se diluyó a menos o igual del 10% en peso húmedo de células/volumen antes de la homogenización. Después las células se lisaron con un microfluidizador de alta presión y se diafiltraron a temperatura ambiente con una secuencia de tampones usando un dispositivo de filtración por membrana de flujo cruzado. Se determinó que el área mínima de la membrana para permitir el transporte en masa eficaz de las proteínas solubilizadas a través de la membrana era aproximadamente de 0,002 m^{2}/g peso en húmedo de células Las proteínas solubilizadas de tamaño aproximado menor que el límite de peso molecular de 1000 kD de la membrana pasaron a través con el infiltrado, mientras que las moléculas y las proteínas no solubilizadas mas grandes quedaron retenidas. La secuencia de las etapas de diafiltración era la siguiente:
(1)
El caldo de fermentación lisado se diafiltró con HEPES 10 mM/EDTA 1 mM/pH 8,0 (tampón de lisis) a un volumen igual a tres veces el volumen del concentrado para eliminar los contaminantes intracelulares y extracelulares a través del infiltrado.
(2)
El lisado se diafiltró tres veces con HEPES 10 mM/MgCl_{2} 1 mM/Tritón^{TM} X-100 al 0,02% para solubilizar y eliminar las proteínas de la membrana interna. Los iones Mg^{++} estabilizan la membrana externa, por lo tanto, las proteínas de la membrana externa no se solubilizaron en presencia de Tritón^{TM} X-100.
(3)
El lisado se diafiltró tres veces con Tris^{TM} 50 mM/EDTA 5 mM/Zwittergent^{TM} 3-14 al 0,2% para solubilizar y eliminar las proteínas de la membrana externa (pero no la rP6 lipidada). El EDTA sirve para secuestrar los iones Mg^{++} de la etapa (2) así como para evitar la proteolisis.
(4)
El lisado se diafiltró tres veces con Tris^{TM} 50 mM/EDTA 0,5 mM/Zwittergent^{TM} 3-14 al 0,2% para solubilizar y eliminar las proteínas adicionales. Se añadió NaCl al tampón en esta etapa para interrumpir cualquier interacción iónica entre las proteínas de la membrana y las membranas. Esta etapa se realizó porque la rP6 lipidada es una LAP y la sal sirve para eliminar las proteínas unidas a la membrana (pero no la rP6 lipidada) del complejo proteína de membrana/membrana externa. La diafiltración continuó con tres volúmenes del concentrado de Tris^{TM} 50 mM/EDTA 5 mM para reducir la concentración Zwittergent^{TM} en el concentrado.
(5)
El lisado se diafiltró tres veces con Tris^{TM} 50 mM/EDTA 5 mM/sacorsilo al 0,2% para eliminar las proteínas adicionales unidas a las membranas (pero no la rP6 lipidada) y después se diafiltró tres veces con Tris^{TM} 50 mM/EDTA 5 mM para reducir la concentración de sarcosilo en el concentrado.
(6)
El lisado se diafiltró tres veces con fosfato 10 mM/Zwittergent^{TM} 3-12 al 0,2% para eliminar las proteínas adicionales unidas a las membranas (pero no la rP6 lipidada) y después se diafiltró tres veces con fosfato sódico 10 mM para reducir la concentración de Zwittergent^{TM} 3-12 en el concentrado.
(7)
El lisado se concentró al 20% de su volumen original y después se diafiltró tres veces con fosfato de sodio 10 mM, Zwittergent^{TM} 3-12 al 0,2% a 55ºC para solubilizar la rP6 lipidada, que se recogió a través del infiltrado. La etapa de concentración se realizó antes de la diafiltración para aumentar la concentración de la rP6 lipidada en el infiltrado. La diafiltración continuó con tres volúmenes adicionales de concentrado con fosfato de sodio 10 mM a 55ºC para reducir la concentración de Zwittergent^{TM} 3-12 en el concentrado. Esta etapa de calentamiento se realizó porque (al igual que en la etapa (4) anterior) la rP6 es una LAP y el calentamiento sirve para eliminar la rP6 lipidada del complejo proteína membrana/membrana. Finalmente, la diafiltración concluyó con tres volúmenes de concentrado de fosfato de sodio 10 mM a 55ºC.
Durante las etapas de diafiltración, la presión transmembrana se mantuvo aproximadamente a 0,68 atm (10 psi) y la velocidad de flujo cruzado se mantuvo a aproximadamente 120-180 lmh. Todos los procesos de diafiltración se ejecutaron a temperatura ambiente excepto la etapa final de extracción a 55ºC, que se ejecutó a la temperatura más elevada para solubilizar la rP6 lipidada. El flujo del infiltrado variaba de 30 a 50 lmh, que era lo suficientemente alto para que el proceso de extracción fuera práctico y graduable.
Durante la extracción, se tomaron muestras en diferentes puntos para análisis por SDS-PAGE para evaluar el efecto de diversas etapas de diafiltración en la extracción de proteínas. Las muestras se precipitaron añadiendo alcohol, se centrifugaron y se resolubilizaron al 20% del volumen original en el tampón prep de muestra SDS. Este procedimiento de preparación de muestras concentra la muestra y reduce la concentración de Tritón^{TM} X-100 o la de Zwittergent^{TM} 3-12 de las muestras. El Tritón^{TM} X-100 o el Zwittergent^{TM} 3-12 interfieren con la unión de SDS con respecto a la muestra y reduce la resolución de las bandas en los geles. Se cargaron diez \mul de cada muestra en geles de acrilamida Novex al 10% y los geles se ejecutaron durante 60-90 minutos a 125 Voltios.
En las Figuras 2 y 3 se muestra un análisis SDS-PAGE típico de las muestras tomadas de las corrientes del infiltrado durante los procesos de extracción de la rP6 lipidada. La rP6 lipidada se ejecuta a 15 kilodaltons (kD) en estos geles. Los geles muestran que algunas proteínas contaminantes se eliminaron durante la diafiltración con tampón de lisis y tampón que contenía diversos detergentes. Había muy pocas pérdidas de rP6 lipidada durante estas etapas de diafiltración. Durante la etapa de diafiltración final con Zwittergent^{TM} 3-12 a 55ºC, la rP6 lipidada se extrajo en un estado parcialmente purificado. Al final de la segunda etapa de diafiltración con Zwittergent^{TM} 3-12 a 55ºC, había muy poca rP6 lipidada en la corriente del infiltrado. Esto sugiere que la mayoría de las rP6 lipidadas solubilizadas se habían recuperado a través del infiltrado. Otros experimentos han demostrado que muy pocas rP6 lipidadas permanecían insolubilizadas en el concentrado después de completar los procesos de diafiltración. La banda de 15 kD del extracto Zwittergent^{TM} 3-12 /55ºC demostró ser la rP6 lipidada por análisis de western (datos no mostrados).
El uso de Zwittergent^{TM} 3-12 en la solubilización de la rP6 lipidada dio como resultado un extracto que contenía varias proteínas además de la rP6 lipidada. Se determinó que la homogeneidad de este extracto era aproximadamente del 78% de la rP6 lipidada (Figura 2, Panel A, carril 1). Aunque éste es un elevado grado de homogeneidad para una solubilización inicial, se deseaba separar, si posible, la rP6 lipidada de estas proteínas de E. coli. Esto se realizó como se describe en el Ejemplo 6.
Ejemplo 6 Purificación Adicional de la rP6 Lipidada Purificada por Cromatografía de Intercambio Aniónico
Se usó cromatografía de intercambio aniónico para purificar adicionalmente la rP6 lipidada descrita en el Ejemplo 5, porque se había usado con éxito para purificar la rP6 no lipidada. La rP6 lipidada se absorbe más estrechamente en la resina DEAE que la rP6, que típicamente se eluye con NaCl 0,1 M. La rP6 lipidada en Zwittergent^{TM} 3-12 al 0,2% requiere NaCl al 0,2 M en el tampón antes de producirse la desorción. Las proteínas de E. coli permanecieron absorbidas a la resina de intercambio aniónico (DEAE) hasta después de que la rP6 lipidada se eluyese.
En la Figura 2 se muestra la homogeneidad e identidad de la rP6 lipidada extraída y purificada con Zwittergent^{TM} 3-12 al 0,2%. Se determinó que la homogeneidad de la rP6 lipidada purificada era superior al 98% (Figura 2, Panel A, carril 2).
Ejemplo 7 Determinación del Peso Molecular por Análisis de Espectro de Masas (MALDI-TOF)
La medición exacta de peso molecular de la rP6 lipidada expresada de pPX4020 con el promotor inducible de arabinosa se realizó por espectrometría de masas por Desorción/Ionización por Láser Asistida por Matriz-Tiempo de vuelo (MALDI-TOF) usando un analizador de masa lineal Finnigan Mat Lasermat^{TM} 2000 (Finnigan Mat, Ltd., San Jose, CA). El Lasermat^{TM} usa la técnica de deserción por láser asistida por matriz (54) para ionizar la muestra y el Tiempo de vuelo para analizar los iones producidos. La muestra se embebió en una matriz de ácido 3,5-dimetoxi-4-hidroxi-cinámico (ácido sinapínico) para potenciar la ionización de la muestra. Un microlitro de la muestra conteniendo 5-10 pmol de la proteína purificada se mezcló con 1 \mul de la matriz (10 mg/ml) disuelto en acetonitrilo acuoso al 70% (v/v) conteniendo ácido trifluoroacético al 0,1% (v/v). Un microlitro de esta muestra y de la mezcla de matriz se cargó en un portamuestras, se dejó secar y se irradió mediante un impulso corto de luz ultravioleta de un láser. Las muestras de la proteína usualmente generan un espectro relativamente simple en este procedimiento, ya que los iones producidos relacionados con la proteína son predominantemente de estados de carga z=+1 [M+H]^{+} y z=+2
[M+2H]^{2+}. Se usó citocromo C de corazón bovino (Sigma Chemical Co., St. Louis, MO) de peso molecular 12.230,9 para el calibrado externa.
Se determinó que el peso molecular de la rP6 lipidada en la muestra usada era de 15.078. Además del ión molecular [M+H]^{+} esperado, se observó también el ión molecular [M+2H]^{2+} de la rP6 lipidada. El peso molecular teórico de la P6 conteniendo un resto de tripalmitoíl cisteína en su extremo N es de 15.024 y el peso molecular predicho de la P6 sin procesar por la peptidasa de señal II es de 16.016,66, mientras que el peso molecular predicho de la P6 no lipidada escindida por la peptidasa de señal II es 14.234,66. Por tanto, estos resultados son coherentes con la expresión de la forma lipidada de la rP6 por E. coli.
Ejemplo 8 Análisis de la Composición de Aminoácidos
Se secó hacia abajo una muestra de la rP6 lipidada para análisis de aminoácidos en tubos de vidrio, seguido de hidrólisis usando 100 \mul de HCl 6 N conteniendo fenol al 5% y 2-mercaptoetanol al 1% al vacío durante 22 horas a 110ºC. Posteriormente las muestras se secaron al vacío, seguido de la resolubilización en el tampón de dilución de muestra Na-S (Beckman Instruments, Inc., Fullerton, CA). La composición de aminoácidos se determinó en un Analizador de Aminoácidos Beckman modelo 6300 (55) usando un gradiente de Na-citrato de tres etapas de acuerdo con las instrucciones del fabricante. Los restos de treonina y serina no se corrigieron para la destrucción. Como el procedimiento usado no determinó los restos de cisteína y triptófano, los resultados se expresaron como moles de restos por mol de rP6 lipidada basándose en el peso molecular teórico de las cisteínas menos la rP6 no lipidada, que es igual a 14.132,4 (la rP6 no lipidada no contiene Trp). Estos resultados se muestran en la Tabla 1 y representan la media de las determinaciones por duplicado. Los resultados son coherentes con la secuencia de señal del gen lap que se ha eliminado por E. coli.
TABLA 1
7
Ejemplo 9 Análisis de Secuencias de Aminoácidos Amino-Terminal
Se realizó un análisis de secuencia de la proteína amino-terminal usando un Secuenciador Proteína/Péptido Applied Biosystems Modelo 477A equipado con un Analizador on-line Modelo 120A PTH (Applied Biosystems, Foster City, CA). Después de la escisión de cada extremo amino sucesivo, el derivado anilinotiazolinona formado se transformó al derivado más estable feniltiohidantoína (PTH) por tratamiento con ácido trifluoroacético al 25% a 64ºC durante 20 minutos. Los derivados de PTH se separaron y se identificaron en el analizador de PTH por HPLC de fase inversa usando una columna Brownlee PTH C-18 (tamaño de partícula 5 \mul, 2,1 mm i.d. x 22 cm 1.; Applied Biosystems) con un sistema de gradiente de dos disolventes modificado desarrollado por el fabricante (56).
Cuando la rP6 lipidada (400 pmoles) se sometió al análisis de secuencia de aminoácidos amino-terminal, no se pudieron obtener datos de la secuencia. Esto sugiere que en el grupo amino primario (o un secundario) del aminoácido amino-terminal no estaba disponible para la química de secuenciación, es decir, el resto terminal-amino de la rP6 estaba bloqueado. Para justificar que la incapacidad de generar datos de la secuencia no se debía a ningún mal funcionamiento de los instrumentos, se ejecutó posteriormente un experimento de control en el que una mezcla de 400 pmoles de la rP6 lipidada y 200 pmoles de beta-lactoglobulina se sometió al análisis de la secuencia amino-terminal. Se obtuvo una sola secuencia representando la secuencia amino-terminal de la beta-lactoglobulina, lo que confirmó que el resto amino-terminal de la rP6 lipidada estaba esencialmente bloqueado.
Ejemplo 10 Inmunogenicidad de la rP6 Lipidada Comparada con la rP6 no Lipidada
La relativa inmunogenicidad de la P6 recombinante purificada lipidada y la P6 recombinante no lipidada (28) se comparó en ratones Swiss-Webster. Cada dosis de cinco \mug de de cada proteína se mezcló con AIPO_{4} 100 \mug y 50 \mug de monofosforil lipido A 3-O-desacetilado (MPL^{TM}) (Ribi Immunochemicals, Hamilton, MT) que se usó para inmunizar ratones por vía subcutánea en las semanas 0, 4 y 6. Se tomaron muestras de sangre en las semanas 0, 4, 6 y 8. Otros grupos de ratones se inmunizaron con mezclas de rP6 no lipidada o rP6 lipidada y la proteína UspA2 de Moraxella catarrhalis (49), un agente causante de otitis media bacteriana, y la rP4 recombinante y lipidada (50). A estas mezclas se les añadieron también los adyuvantes IPO_{4} y MPL^{TM} como anteriormente.
El antisuero obtenido de los ratones se analizó por ELISA para detectar anticuerpos contra las proteínas P6, P4 o IspA2. Los títulos ELISA se determinaron (22,28) tanto para el suero del grupo como para animales individuales y después se obtuvo el resultado del título medio geométrico (TMG). Los resultados se muestran en las Tablas 2 y 3.
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TABLA 2
9
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TABLA 3
10
La rP6 lipidada es al menos un logaritmo más inmunogénica que la rP6 no lipidada cuando se administra en solitario con adyuvantes MPL^{TM} y AIPO_{4}. Cuando se combina con rP4 y UspA2, no se observó competición antigénica. De hecho, la respuesta de la rP6 lipidada aumentó a aproximadamente 1,5 logs mayor que la respuesta de la rP6 no lipidada.
El análisis de la respuesta inmune de los antígenos UspA2 y rP4 muestra que la adición de la rP6 lipidada no modifica la respuesta inmune contra estos antígenos en comparación con la adición de la rp6 lipidada. Se observó que ningún antígeno tuvo ningún efecto sobre la respuesta inmune normal cuando la rP4 lipidada y la UspA2 se mezclaron entre sí. Esto demuestra la compatibilidad de estos antígenos.
Ejemplo 11 Actividad Bactericida del Antisuero de Ratón
La actividad biológica del antisuero dirigida contra la rP6 lipidada y las mezclas rP6/rP4 lipidadas se demostró usando un ensayo bactericida in vitro. Este ensayo se realizó como se describe anteriormente (22,28) usando la cepa H. influenzae no tipificable P861454 como la diana. Los resultados se muestran en la Tabla 4.
TABLA 4
11
Los resultados demuestran que la rP6 lipidada provoca anticuerpos biológicamente activos en este ensayo. Aunque los títulos absolutos no son diferentes entre el antisuero lipidado y no lipidado, esto puede deberse a que los antisueros son máximamente bactericidas en este sistema de ensayo, especialmente dado que el suero preinmune demostró un elevado grado de eliminación no específica con la fuente del complemento usada en este ensayo. La mezcla de rP6/rP4 lipidadas también provoca anticuerpos bactericidas a títulos equivalentes a los obtenidos con la mezcla de rP6/rP4 no lipidadas. No era posible distinguir entre la actividad bactericida de los anticuerpos anti-rP4 y los anticuerpos anti-rP6 en este ensayo, pero está claro que la mezcla de los antígenos de Haemophilus provoca antisueros altamente bactericidas contra H. influenzae no tipificable.
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<110> American Cyanamid Company
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<120> PRODUCCIÓN DE LA FORMA LIPIDADA DE LAS LIPOPROTEÍNAS ASOCIADAS A PEPTIDOGLICANO DE BACTERIAS GRAM-NEGATIVAS
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<130> 33484-00PCT
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<140>
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<141>
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<160> 2
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<170> PatentIn Ver. 2.1
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<210> 1
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<211> 24
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<212> ADN -
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<213> Haemophilus influenzae
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<400> 1
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12
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<210> 2
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<213> Haemophilus influenzae
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<400> 2
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13

Claims (13)

1. Un plásmido que contiene un promotor estrechamente regulado, en el que dicho promotor está unido operativamente a una secuencia de ADN aislada y purificada que codifica una lipoproteína asociada a un peptidoglicano (LAP) de bacterias gram-negativas, en el que el promotor es un promotor inducible por arabinosa o un promotor T7.
2. El plásmido de la Reivindicación 1 en el que la LAP es la proteína P6 de Haemophilus influenzae (H. influenzae).
3. El plásmido de la Reivindicación 2 en el que el plásmido se denomina pPX4020 o pPX4019 como se especifica en la Fig. 1.
4. Una célula huésped bacteriana transformada, transducida o transfectada con el plásmido de la Reivindicación 1.
5. Un procedimiento para producir una LAP lipidada recombinante, que comprende transformar, transducir o transfectar una célula huésped bacteriana con el plásmido de la Reivindicación 1 y cultivar la célula huésped en condiciones que permitan la expresión de dicha LAP recombinante en forma lipidada por la célula huésped.
6. El procedimiento de la Reivindicación 5 en el que la LAP es proteína P6 de H. influenzae.
7. El procedimiento de la Reivindicación 5 en el que la LAP se usa en la preparación de composiciones antigénicas para conferir protección a mamíferos contra enfermedades causadas por las bacterias correspondientes
8. El procedimiento de la Reivindicación 7 en el que la enfermedad está causada por H. influenzae.
9. El uso un plásmido de acuerdo con una cualquiera de las Reivindicaciones 1-3 en la fabricación de una composición antigénica que comprende una LAP lipidada recombinante, en la que dicha composición antigénica provoca una respuesta inmune protectora en un huésped mamífero.
10. El uso de la Reivindicación 9 en que la LAP es la proteína P6 de H. influenzae.
11. El uso de la Reivindicación 9 que adicionalmente comprende uno o más de un diluyente o portador.
12. El uso de la Reivindicación 9 que adicionalmente comprende al menos un adyuvante.
13. El uso de la Reivindicación 12, en la que el adyuvante se selecciona del grupo constituido al menos por hidróxido de aluminio, fosfato de aluminio, Stimulon TM QS-21, monofosforil lipido A 3-O-desacetilado, IL-12, toxina termoestable de E.coli, y la toxina del cólera de tipo silvestre o mutante.
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