ES2330919T3 - Modulacion en la produccion de polisacaridos capsulares de pneumococos. - Google Patents

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Abstract

Procedimiento para producir un polisacárido capsular a partir de un neumococo, comprendiendo dicho procedimiento obtener una variante opaca del neumococo y mantener dicha variante opaca del neumococo en un medio de cultivo en contacto con un gas que tiene una concentración de oxígeno menor de aproximadamente el 16%, comprendiendo opcionalmente dicho procedimiento aislar el polisacárido capsular producido.

Description

Modulación en la producción de polisacáridos capsulares de neumococos.
Antecedentes de la invención
La invención se refiere ampliamente a la producción de material polisacárido capsular de organismos estreptocócicos y a la producción de vacunas usando dicho material.
El Streptococcus pneumoniae, a veces denominado neumococo, generalmente es un organismo comensal que coloniza la superficie de la mucosa de la nasofaringe humana. Cuando factores del hospedador permiten el acceso del organismo al tracto respiratorio inferior, sigue una respuesta inflamatoria enérgica, que conduce a una consolidación densa como espacios aéreos alveolares rellenos de exudado. Esta afección se denomina comúnmente neumonía (Tuomanen et al., 1995). La manifestación más grave de la infección neumocócica es bacteriemia, que puede complicarse con septicemia, meningitis o ambas. Habitualmente, la bacteriemia en adultos es una complicación de la neumonía (Ra2 et al., 1997).
La capacidad de los neumococos para resistir el mecanismo principal de eliminación del organismo del torrente sanguíneo (es decir, opsonofagocitosis) requiere la expresión del factor de virulencia principal del organismo, que es una cápsula polisacárida (Avery et al., 1931; Watson et al., 1990). Los neumococos son capaces de sintetizar no menos de 90 polisacáridos capsulares estructuralmente únicos (CPS).
El CPS neumocócico presenta propiedades antifagocitarias e inhibe la adherencia a células hospedadoras, una etapa crítica en el estado de portador (es decir, la propagación del organismo de un individuo infectado pero no necesariamente sintomático a otro) y posiblemente aspectos posteriores en la patogénesis de la enfermedad (Ring et al., 1998). Descubrimientos similares en otras especies encapsuladas (por ejemplo, Haemophilus influenzae, Neisseria meningitidis, Streptococcus pyogenes y Streptococcus agalactiae) han conducido al entendimiento de cómo las cantidades de CPS deben variar temporalmente para permitir tanto interacciones adhesivas con células hospedadoras como resistencia a inmunidad humoral (Hammerschmidt et al., 1996; Levin et al., 1998; Schrager et al., 1996; Sellin et al., 1995; St. Geme III et al., 1991).
Incluso en una sola cepa, la cantidad de CPS expresado por S. pneumoniae varía. No se ha comprendido bien anteriormente el mecanismo o mecanismos reguladores que modulan la expresión de CPS. La mayoría de los aislados neumocócicos experimentan una variación fenotípica entre al menos dos formas, que pueden distinguirse por la opacidad de la colonia (Weiser, 1998; Weiser et al., 1994). Las formas de colonia opacas (O) difieren de las variantes transparentes (T) de la misma cepa en la cantidad de CPS que se sintetiza, generando generalmente las colonias de forma O una mayor cantidad de CPS (Kim et al., 1998).
Diferencias relativamente minoritarias en la cantidad de CPS generadas por una variante neumocócica pueden tener un impacto muy importante sobre la virulencia (MacLeod et al., 1950). Las cantidades de 1,2 a 5,6 veces superiores de CPS producidas por colonias de forma O, en comparación con colonias de forma T, se correlaciona con una resistencia aumentada de células neumocócicas a la opsonofagocitosis usando suero inmune (Kim et al., 1999). En un modelo murino de infección sistémica, sólo la variante O de varias cepas neumocócicas causaba septicemia (Kim et al., 1998). Por el contrario, la forma T expresa mayores cantidades del otro polisacárido de superficie celular, ácido teicoico. El ácido teicoico de pared celular neumocócico está unido covalentemente a CPS y contiene un constituyente similar al hospedador poco habitual, la fosforilcolina. Este polisacárido contribuye a la adherencia de células neumocócicas a células epiteliales a través del receptor para el factor activador de plaquetas (Cundell et al., 1995; Cundell et al., 1995; Kim et al., 1998). La forma T también presenta una distribución alterada de proteínas de unión a colina de superficie celular, incluyendo CbpA, que actúa promoviendo la adherencia y la colonización (Rosenow et al., 1997). Durante el estado de portador en un modelo de rata lactante, existe selección para variantes neumocócicas que presentan el fenotipo T más que el O (Weiser et al., 1994). Estas observaciones sugieren que los neumococos varían entre una forma (es decir, la forma T) que presenta mayor adherencia y estado de portador y una forma no adherente (es decir, la forma O), que está mejor adaptada a la supervivencia en una infección invasiva.
La identificación del CPS expresado por una forma neumocócica constituye la base del serotipado, un procedimiento de diagnóstico usado para diferenciar variantes de S. pneumoniae. Debido a que variantes diferentes pueden presentar diferentes propiedades fisiológicas (por ejemplo, susceptibilidad a agentes antimicrobianos o velocidad característica de aparición o progresión de la neumonía), la capacidad para diferenciar variantes neumocócicas es médicamente ventajosa. Además, debido a que la capacidad del sistema inmune humano (o de otro vertebrado) para reconocer y atacar variantes neumocócicas depende de su capacidad para reconocer específicamente el CPS de cada variante, la capacidad para obtener CPS específico de variante neumocócica afecta significativamente al desarrollo de métodos terapéuticos y preventivos y composiciones para aliviar trastornos asociados con infección neumocócica. Por ejemplo, las vacunas neumocócicas conocidas comprenden CPS obtenido de numerosas variantes neumocócicas.
Continúa existiendo una necesidad significativa de composiciones y métodos de diagnóstico, pronóstico, terapéuticos y preventivos útiles con trastornos asociados con una infección neumocócica. Muchas de estas composiciones y métodos comprenden, emplean o dependen para su desarrollo de CPS neumocócico aislado. Los procedimientos previamente conocidos para aislar CPS de neumococos se caracterizan generalmente por un bajo rendimiento. La presente invención incluye un procedimiento de mejora de la producción de CPS que puede obtenerse a partir de una variante neumocócica y aumenta la producción y el uso de composiciones y métodos de diagnóstico, pronóstico, terapéuticos y preventivos relacionados con infecciones neumocócicas.
Breve resumen de la invención
La invención se refiere a una mejora en un procedimiento para producir polisacárido capsular a partir de un neumococo que comprende obtener una variante opaca del neumococo y mantener al neumococo en un medio cultivo en contacto con un gas que tenga una concentración subatmosférica de oxígeno no superior a aproximadamente el 16%, o no superior a aproximadamente el 0,1%. El neumococo puede ser un organismo del género Streptococcus, tal como un organismo de la especie Streptococcus pneumoniae (por ejemplo, una de las variantes 6A, 6B, 18C y 9V de S. pneumoniae). En otro aspecto, más que la mejora comprende mantener un gas que tenga tanto una concentración superatmosférica de dióxido de carbono (de al menos aproximadamente el 5%) como una concentración subatmosférica de oxígeno (menor de aproximadamente el 16%) en contacto con el medio cultivo.
La invención se refiere además a un procedimiento para preparar una preparación inmunógena para su administración a un animal en riesgo de desarrollar una infección neumocócica. Este procedimiento comprende obtener una variante opaca del neumococo y mantener las células neumocócicas en un medio de cultivo que tenga un contenido de oxígeno inferior al del mismo medio equilibrado a la misma temperatura con aire normal, y aislar el polisacárido capsular producido por las células a partir de las células. El polisacárido aislado constituye la preparación inmunógena.
La invención también se refiere a un procedimiento para producir polisacárido neumocócico, comprendiendo dicho procedimiento obtener una variante opaca de un neumococo y mantener dicho neumococo en un medio de cultivo, donde dicho medio de cultivo está sustancialmente desprovisto de oxígeno.
La invención se refiere además a un procedimiento de producción de polisacárido neumocócico. Este procedimiento comprende obtener una variante opaca del neumococo y mantener las células neumocócicas en un medio de cultivo que tenga un contenido de oxígeno inferior al del mismo medio equilibrado a la misma temperatura con un gas que tenga un contenido de oxígeno del 16%, y en el que dicho medio de cultivo tiene un contenido de dióxido carbono que es superior al del mismo medio equilibrado a la misma temperatura con aire normal, por ejemplo, un medio saturado con dióxido de carbono o un medio que comprende una sal de carbonato o bicarbonato.
También se describe en este documento un procedimiento para evaluar si un compuesto de ensayo es útil para aliviar una infección neumocócica en un animal. Este procedimiento comprende comparar:
(a)
el grado de fosforilación de CpsD en células neumocócicas mantenidas en presencia del compuesto de ensayo y
(b)
el grado de fosforilación de CpsD en el mismo tipo de células mantenidas en ausencia del compuesto de ensayo.
Si el grado de fosforilación de CpsD en las células mantenidas en presencia del compuesto de ensayo es menor que el grado de fosforilación de CpsD en las células mantenidas en ausencia del compuesto de ensayo, entonces el compuesto de ensayo es útil para aliviar la infección. El grado de fosforilación de CpsD puede evaluarse, por ejemplo, por evaluación del número de restos de tirosina fosforilados presentes en CpsD o por evaluación de la fracción de CpsD que tiene al menos un resto de tirosina fosforilado.
Breve descripción de los dibujos
La Figura 1, que comprende las Figuras 1Ai-1Avi y 1Bi-1Bvi, es una serie de imágenes que indican el efecto de la concentración de oxígeno y dióxido de carbono ambiental sobre la morfología de las colonias y el tamaño de la cápsula, según se evalúa usando la reacción de Quellung. Se cultivaron variantes opacas (Figuras 1Ai, 1Aii, IAiii, 1Bi, 1Bii y 1Biii) y transparentes (Figuras 1Aiv, 1Av, 1Avi, 1Biv, 1Bv y 1Bvi) de un aislado neumocócico tipo 6A sobre agar nutriente T complementado con catalasa durante 16 horas a 37ºC en condiciones atmosféricas (Figuras 1Ai, 1Aiv, 1Bi y 1Biv), en condiciones atmosféricas que comprenden una concentración de dióxido de carbono aumentada (Figuras 1Aii, 1Av, 1Bii y 1Bv) y en condiciones anaerobias que comprenden una concentración de dióxido de carbono aumentada (Figuras 1Aiii, 1Avi, 1Biii y 1Bvi). Las colonias de las imágenes de las Figuras 1Ai-1Avi se visualizaron usando iluminación oblicua transmitida y se muestran a unos aumentos de 56x. El material capsular de las imágenes de las Figuras 1Bi-1Bvi se visualizó usando la reacción de Quellung y antisueros específicos de tipo y se muestran a unos aumentos de 4000x.
La Figura 2, que comprende las Figuras 2A-2D, es un cuarteto de gráficas de barras que representa los efectos de la concentración de oxígeno y dióxido de carbono ambiental y el fenotipo de opacidad sobre la producción de CPS, en base por proteína unitaria, según se evaluó usando un ELISA de captura. Se cultivaron variantes opacas (Figuras 2Ai, 2Bi, 2Ci y 2Di) y transparentes (Figuras 2Aii, 2Bii, 2Cii y 2Dii) de aislados de los cuatro tipos neumocócicos (variante 6B en las Figuras 2Ai y 2Aii; variante 6A en las Figuras 2Bi y 2Bii; variante 18C en las Figuras 2Ci y 2Cii; variante 9V en las Figuras 2Di y 2Dii) hasta una fase semilogarítmica (barras oscuras) o fase estacionaria (barras punteadas) a las concentraciones de oxígeno y dióxido de carbono indicadas encima de las gráficas. Se determinó la producción de CPS en sedimentos de células sonicados y en sobrenadantes de cultivo (barras sombreadas), y se expresa respecto a la cantidad de proteína celular total. El "*" indica que esta variante no creció en esta condición. Los valores representan la media de dos experimentos separados por duplicado.
La Figura 3, que comprende las Figuras 3A y 3B, es un par de imágenes que representan los efectos de la concentración de oxígeno y dióxido de carbono ambiental y del fenotipo de opacidad sobre la fosforilación de tirosina de CpsD en análisis de Western. Se retiraron lisados de células completas de formas O (carriles 1-4) y T (carriles 5-8) de la variante neumocócica P303 después del cultivo en medio sólido y se ajustaron a una densidad equivalente. La imagen de la Figura 3A representa proteínas en estas muestras que se separaron mediante SDS-PAGE, se transfirieron en una membrana y se inmunotransfirieron con un anticuerpo monoclonal denominado 4G10, que se une específicamente con tirosina fosforilada. La imagen de la Figura 3B representa membranas por duplicado que se inmunotransfirieron usando antisueros generados contra neumococos completos para demostrar una carga equivalente. Las condiciones de cultivo correspondientes a las células lisadas y aplicadas en los carriles eran las siguientes: en los carriles 1 y 5, O_{2} <0,1%/CO_{2} al 10%; en los carriles 2 y 6, O_{2} al 16%/CO_{2} al 3%; en los carriles 3 y 7, O_{2} al 21%/CO_{2} <0,1%; y en los carriles 4 y 8, O_{2} al 19%/CO_{2} al 10%. La flecha en la Figura 3A indica la localización de la banda de CpsD de 25 kD. Los marcadores de tamaño están en kilodaltons.
La Figura 4 es una imagen que representa los efectos de las concentraciones de oxígeno y dióxido de carbono ambientales y del fenotipo de opacidad sobre la transcripción de cpsD, según se evaluaron por análisis de Northern. El ARN total obtenido de formas O (Carriles 1 y 2) o T (Carriles 3 y 4) de la variante neumocócica P303 se separó en un gel de formamida y se sondó usando un fragmento radiomarcado de cpsD obtenido a partir de un neumococo de serotipo 4. Las bacterias de las que se aisló el ARN se cultivaron en O_{2} <0,1%, CO_{2} al 110% (Carriles 1 y 3) o en O_{2} al 21%/CO_{2} <0,1% (Carriles 2 y 4). Los marcadores de tamaño son patrones de ARN en kilodaltons.
Descripción detallada de la invención
La invención se refiere al descubrimiento por el inventor de que la cantidad de polisacárido capsular (CPS) producido por neumococos puede modularse por control del contenido de oxígeno y dióxido de carbono del medio en el que se mantienen. También se ha descubierto por el inventor que la producción de CPS en Streptococcus pneumoniae está modulada por la presencia de proteína CpsD y por la modificación postraduccional de esta proteína. Basándose en estos descubrimientos, la presente invención incluye métodos para modular la producción de CPS por neumococos (por ejemplo, para el uso en la producción de vacunas neumocócicas y otras preparaciones inmunógenas). También se describen métodos para aliviar infecciones neumocócicas y métodos de identificación de agentes útiles para aliviar infecciones neumocócicas.
Definiciones
Como se usan en este documento, cada uno de los siguientes términos tiene el significado asociado con el mismo en esta sección.
Los artículos "un", "uno" y "una" se usa en este documento para referirse a uno o a más de uno (es decir, a al menos uno) de los objetos gramaticales del artículo. A modo de ejemplo, "un elemento" se refiere a un elemento o más de un elemento.
El término de aire "normal" se refiere a un gas que tiene aproximadamente el contenido promedio de la atmósfera en una localización seleccionada, sin tener en cuenta la humedad (es decir, en base seca). El contenido promedio de la atmósfera es de aproximadamente N_{2} al 78%, O_{2} al 21%, Ar al 1% y menos del 0,04% de cada uno de CO_{2}, H_{2}, He, Ne, Kr y Xe.
Descripción
Se ha descubierto que la producción de polisacárido capsular (CPS) por neumococos está influenciada por la presencia y la concentración de oxígeno y dióxido de carbono presentes en el entorno de las células. En particular, la producción de CPS aumenta a medida que disminuye el contenido de oxígeno del entorno; la producción de CPS también aumenta a medida que aumenta el contenido de dióxido de carbono del entorno. Aunque estas observaciones se han realizado usando cultivos de Streptococcus pneumoniae, también pueden aplicarse a organismos que presenten propiedades de cápsula y de genes de cápsula similares a neumococos, tales como otras especies de Streptococcus (por ejemplo, Streptococcus agalactiae), a otros organismos encapsulados tales como Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae y Acinetobacter johnsonii y a organismos que presenten similitud fenotípica, similitud genotípica o ambas, con uno o más de éstos. Cuando el organismos es Streptococcus pneumoniae puede ser cualquier variante conocida o que se descubra de aquí en adelante del mismo, incluyendo variantes caracterizadas por la identidad de su CPS, tales como una de las variantes 6A, 6B, 18C y 9V.
Estas observaciones pueden usarse junto con cualquier método conocido de cultivo de neumococos o con cualquier método que se desarrolle de aquí en adelante, para aumentar (o disminuir, si se desea) la producción de CPS por neumococos cultivados por dichos métodos. La invención incluye un procedimiento de aumento de la producción de CPS obtenida por cultivo de un neumococo de acuerdo con un procedimiento conocido. El procedimiento mejorado implica disminuir el contenido de oxígeno del medio en o sobre el que se mantiene el neumococo, respecto al contenido de oxígeno que normalmente se da en el medio durante el cultivo del neumococo. Por ejemplo, es común cultivar neumococos en un medio gelatinoso o semisólido o en un medio líquido, donde el medio se mantiene en contacto con aire normal filtrado (o esterilizado de otro modo).
La producción de CPS por neumococos puede aumentarse por disminución (en base seca) del contenido de oxígeno del gas con el que se mantiene en contacto el medio. El grado en el que se disminuye el contenido de oxígeno no es crítico pero, hablando en general, cuanto mayor sea la disminución del contenido de oxígeno, mayor será la producción aumentada de CPS. El contenido de oxígeno del gas es preferiblemente <16%, o se disminuye hasta el punto en el que el gas es sustancialmente anaerobio (por ejemplo, de modo que contiene O_{2} <0,1%). El modo en el que se disminuye el contenido de oxígeno del gas no es crítico. Los procedimientos convenientes para reducir el contenido de oxígeno del gas por debajo del contenido de oxígeno del aire normal incluyen lavado abundante del recipiente de cultivo (al menos inicialmente, pero como alternativa de forma intermitente, periódica o continua) con un gas que tenga el contenido de oxígeno deseado. Por ejemplo, un recipiente de cultivo puede lavarse abundantemente con una mezcla de gas que comprenda aproximadamente N_{2} al 71%, O_{2} al 19% y CO_{2} al 10% o con una mezcla que comprenda Ar al 95% y CO_{2} al 5%.
La producción de CPS por neumococos también puede aumentarse por aumento del contenido de dióxido de carbono del gas con el que contacta el medio sobre o en el que se mantienen los neumococos. El grado en el que se aumenta el contenido de dióxido de carbono del gas no es crítico pero, hablando en general, cuanto mayor sea el aumento del contenido de dióxido de carbono, mayor será la producción aumentada de CPS. El contenido de dióxido de carbono del gas es preferiblemente de al menos aproximadamente el 5%, o de al menos aproximadamente el 10%, aunque puede ser tan elevado que el medio de cultivo se sature con dióxido de carbono. Como se ha analizado anteriormente, el contenido de dióxido de carbono deseado puede conseguirse lavando abundantemente el recipiente en el que se cultivan los neumococos con un gas que tenga el contenido de dióxido de carbono deseado. Como alternativa, el dióxido de carbono puede suministrarse al medio por incorporación de una sal de carbonato o bicarbonato en el medio o por adición de dicha sal al medio.
Se describen procedimientos de aumento de la producción de CPS por neumococos por aumento del contenido de dióxido de carbono del medio en el que se mantienen los neumococos, por aumento del contenido de dióxido de carbono de un gas que contacta con ese medio, por disminución del contenido de oxígeno de ese medio, por disminución del contenido de oxígeno de un gas que contacta con ese medio o cualquier combinación de éstos. En una realización, el contenido de O_{2}/CO_{2} del medio (o de un gas en contacto con el medio) puede ajustarse para maximizar la producción de células neumocócicas durante una fase y después puede reajustarse para maximizar la producción de CPS durante una segunda fase.
La disminución del contenido de oxígeno del gas que contacta con el medio provoca una disminución en el contenido de oxígeno del medio sobre o en el que se mantienen los neumococos, debido al equilibrado del gas disuelto y no disuelto. El cambio del contenido de dióxido de carbono del gas tiene un efecto similar. La rapidez con la que el gas disuelto en el medio y el gas no disuelto se equilibran depende de varios factores conocidos en la técnica, incluyendo, por ejemplo, el área superficial de la superficie de contacto medio-gas, la viscosidad del medio y el grado de agitación del medio.
Los neumococos pueden mantenerse en un medio (por ejemplo, medio líquido), en el que la superficie de contacto entre el medio y cualquier fase gas, si existe, se minimice. En dichos sistemas de cultivo, la alteración del contenido de la fase gas puede tener un efecto relativamente pequeño sobre el contenido de gas del medio líquido, debido a la difusión limitada de gas desde la fase gas hacia el líquido. En dichos sistemas, el contenido de gas del medio líquido puede estar influenciado por el procedimiento usado para preparar el medio. Por ejemplo, puede prepararse un medio líquido sustancialmente anaerobio por preparación de un medio líquido, esterilización del mismo en un autoclave (cuyo calor empuja sustancialmente todo el oxígeno desde el líquido) y enfriamiento del medio autoclavado en una atmósfera sin oxígeno, tal como en un recipiente cerrado por el que se pasa una corriente continua de gas sin oxígeno. Los ejemplos de gases sin oxígeno adecuados incluyen argón puro, argón mezclado con CO_{2} al 5-10%, nitrógeno puro o alguna combinación de N_{2}, Ar y CO_{2}. Cuando se desee un grado muy alto de anaerobicidad ([O_{2}] <<0,1%), el gas sin oxígeno que pasa sobre el medio a medida que se enfría puede pasar a través de o sobre una bobina o malla de cobre calentada usando procedimientos conocidos en la técnica. Por supuesto, pueden usarse procedimientos similares para la preparación de medios sólidos, gelatinosos y semisólidos que tengan un contenido de gas deseado.
La producción de CPS también puede aumentarse por selección de una variante y forma neumocócica apropiada como el inóculo usado para sembrar el medio para el que se modula el contenido de oxígeno, contenido de dióxido de carbono o ambos. Se entiende que diferentes variantes de neumococos pueden generar CPS estructuralmente diferentes. Los procedimientos descritos en este documento pueden usarse para aumentar la producción de CPS usando cualquier variante neumocócica. Se entiende además que muchos neumococos presentan al menos dos formas fenotípicas. Estas formas pueden incluir una forma opaca (O) y una forma transparente (T), donde la forma opaca se caracteriza generalmente por producción de una mayor cantidad de CPS. Por lo tanto, la producción de CPS puede aumentarse adicionalmente por selección, como inóculo, de una forma de una variante de un neumococo caracterizada por una mayor producción de CPS.
El CPS producido usando uno o más de los procedimientos descritos en este documento puede usarse (en solitario o en combinación con otras especies de CPS neumocócico) para preparar vacunas neumocócicas y otras preparaciones inmunógenas usando procedimientos conocidos en la técnica. Dichos procedimientos implican generalmente separar el CPS de las células neumocócicas, opcionalmente destruir las células neumocócicas restantes y combinar el CPS con un vehículo farmacéuticamente aceptable (y, opcionalmente, un adyuvante inmunológico). Dichas preparaciones pueden administrarse a un animal con el fin de aumentar la respuesta inmune del animal a una infección por un neumococo.
Debido a que se piensa que el CPS neumocócico permite que los neumococos eludan las defensas inmunes en animales (por ejemplo, seres humanos), pueden usarse procedimientos para inhibir la producción de CPS para aliviar infecciones neumocócicas en animales. Las infecciones neumocócicas (y complicaciones que surgen a partir de las mismas) que pueden aliviarse de este modo incluyen neumonía (particularmente neumonía neumocócica), bacteriemia, septicemia, meningitis, endocarditis bacteriana, faringitis exudativa estreptocócica, celulitis y abscesos viscerales.
Se ha descubierto que el aumento del contenido de oxígeno en el entorno disminuye la producción de CPS neumocócico, aumentando de este modo la susceptibilidad de los neumococos al sistema inmune. De forma similar, se ha descubierto que disminuir el contenido de dióxido de carbono en el entorno disminuye la producción de CPS neumocócico.
Las infecciones neumocócicas y sus efectos secundarios y complicaciones pueden aliviarse manteniendo a un animal aquejado de dicha infección en contacto con un gas que tenga una concentración superatmosférica de oxígeno. Como alternativa, puede aumentarse la tensión de oxígeno en el sitio de la infección (por ejemplo, suministrando oxígeno puro o aire esterilizado directamente a un sitio de infección {por ejemplo, un absceso visceral que implique un neumococo} localizado en el interior de un cuerpo animal), respecto a la tensión de oxígeno normal en el sitio. Por ejemplo, cuando el sitio corporal son los pulmones (por ejemplo, como con una neumonía neumocócica), la tensión normal de oxígeno normal es la del aire normal. La neumonía neumocócica puede aliviarse suministrando una concentración supraatmosférica de oxígeno a los pulmones de los pacientes usando, por ejemplo, un respirador o una máscara de oxígeno convencional.
Las infecciones neumocócicas y sus efectos y complicaciones secundarias también pueden aliviarse disminuyendo la tensión de dióxido de carbono en el sitio de infección en un animal por debajo de la tensión de dióxido de carbono que se da normalmente en dichos sitios de infección y, preferiblemente, por debajo de la tensión de dióxido de carbono que se da normalmente en ese sitio corporal, incluso en ausencia de infección neumocócica. La disminución de la tensión de dióxido de carbono en un sitio corporal interno distinto de los pulmones puede implicar suministrar un flujo de gas estéril a través de, sobre o más allá del sitio corporal. Cuando el sitio de infección son los pulmones, la tensión de dióxido de carbono puede reducirse aumentando la frecuencia de respiración, por acción voluntaria del paciente o de forma artificial (por ejemplo, usando un ventilador o fármacos que aceleren la respiración).
Como se describe con mayor detalle en el ejemplo, una producción de CPS aumentada en neumococos se correlaciona con una expresión reducida del gen cpsD y con un bajo grado de fosforilación de la proteína CpsD. La producción de CPS puede aumentarse por lo tanto por agentes que aumenten la expresión de cpsD, que aumenten el grado de fosforilación de CpsD o ambos. A la inversa, la producción de CPS puede inhibirse por agentes que inhiban o reduzcan la expresión de cpsD, que inhiban la fosforilación de CpsD, que aumenten la desfosforilación de CpsD fosforilada o alguna combinación de éstos. Como se ha analizado anteriormente, la disminución de la producción de CPS en neumococos implicados en una infección en un animal puede hacer a esos neumococos más susceptibles al ataque por el sistema inmune del animal.
También se describen en este documento procedimientos para evaluar si un compuesto de ensayo es un inhibidor de la producción de CPS neumocócico y procedimientos de evaluación de si un compuesto de ensayo es un potenciador de la producción de CPS neumocócico. En cada uno estos procedimientos, las células neumocócicas se mantienen en presencia del compuesto de ensayo y, por separado pero preferiblemente de forma idéntica, en ausencia del compuesto ensayo. Puede evaluarse un efecto directo del compuesto de ensayo sobre la producción de CPS por evaluación de la cantidad de CPS producido por las células en presencia y ausencia del compuesto de ensayo. Como alternativa, el nivel de expresión de cpsD (evaluado por medición de la producción del ARN correspondiente o de la proteína correspondiente) o el grado de fosforilación de CpsD (evaluado por medición del número de restos de tirosina fosforilados presentes en CpsD o la fracción de CpsD que tiene al menos un resto de tirosina fosforilado) se evalúa y se correlaciona con la inhibición o aumento de la producción de CPS, como se ha analizado anteriormente.
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Ejemplo
La invención se describe ahora con referencia al siguiente Ejemplo. Este Ejemplo se proporciona con fines ilustrativos solamente y la invención no se limita a este Ejemplo, sino que incluye todas las variaciones que sean evidentes como resultado de los contenidos proporcionados en este documento.
La dependencia de oxígeno de la expresión de polisacárido capsular por Streptococcus pneumoniae está asociada con la modificación postraduccional de CpsD
Los experimentos que se presentan en este Ejemplo demuestran que las diferencias en el fenotipo de opacidad entre neumococos (es decir, forma O frente a forma T) están afectadas por las concentraciones ambientales de oxígeno y que condiciones de cultivo anaerobias tales como las que pueden darse en la neumonía influyen en la capacidad de neumococos de forma O para aumentar la expresión de CPS y evadir la eliminación inmune.
Se describen a continuación los materiales y procedimientos usados en los experimentos que se presentan en este Ejemplo.
Cepa bacteriana y condiciones de cultivo
Las cepas de S. pneumoniae usadas en este estudio se describen en la Tabla I e incluyen las variantes O y T descritas anteriormente de los aislados clínicos P303 (tipo 6A), P324 (tipo 6B), P68 (tipo 18C) y P10 (tipo 9V), como se describen (Kim et al., 1998; Weiser et al., 1994). Las bacterias se cultivaron en recipientes no cerrados herméticamente en un medio semisintético (medio C+Y, pH 8,0) o tríptico de soja sin agitación a 37ºC, como se describe (Tomasz, 1964). Los cultivos de caldo se sembraron en placas de agar tríptico de soja (TSA) convencionales que contenían agar al 1% (p/v), sobre las que se extendieron 5000 unidades de catalasa (obtenida en Worthington Biochemical, Freehold, NJ). Se incubaron los medios inoculados a 37ºC en una jarra de anaerobiosis por extinción de llama a menos que se especifique otra cosa. Se determinó la morfología de las colonias en este medio TSA con aumentos e iluminación oblicua transmitida, como se describe (Weiser et al., 1994).
TABLA I
1
Se controló la concentración de dióxido de carbono ambiental en condiciones aerobias usando un incubador de CO_{2}. Se obtuvieron condiciones de cultivo anaerobias usando el sistema BBL GasPak^{TM} de acuerdo con las instrucciones del fabricante (Becton Dickinson, Cockeysville, MD). En algunos experimentos se empleó el componente de bicarbonato de sodio del sistema para generar una atmósfera de dióxido de carbono al 10% y en otros experimentos no. Después de recoger las bacterias, se midió el pH del medio cultivo para confirmar que no se veía afectado por estas condiciones de cultivo diferentes.
Se realizó el análisis de muestras clínicas usando procedimientos similares. Se examinaron un total de 502 pacientes aquejados de meningitis, de los que aproximadamente el 20% tenían una meningitis neumocócica demostrada bacteriológicamente. Se recogió una muestra de hisopo nasofaríngeo de pacientes en los que se había realizado un diagnóstico clínico presunto de meningitis neumocócica. Esta muestra se sembró en placas inmediatamente tanto sobre agar sangre de oveja al 5% como sobre agar tríptico de soja que contenía 5000 unidades de catalasa, y las placas se incubaron a 37ºC en una atmósfera de aire que contenía CO_{2} al 5%. También se sembraron muestras de líquido cefalorraquídeo (LCR) sobre placas de tanto de agar sangre como transparentes, como se cultivaron muestras de sangre de pacientes en las que se observaron neumococos después de una incubación convencional en aerobiosis durante hasta 48 horas. Inicialmente, se confirmó que los aislados que presentaban una morfología típica en agar sangre eran neumococos por tinción Gram y reacción de Quellung. Todos los aislados se almacenaron a -80ºC en conservadores bacterianos y se determinó la morfología de las colonias como se describe en este documento. Se examinaron las diferencias estadísticas entre las proporciones de los fenotipos T y O en cultivos nasofaríngeos y de sitio invasivo usando una Prueba Exacta de Fisher.
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Transformación Genética
Se hicieron competentes para transformación natural neumococos encapsulados y no encapsulados como se describe (Weiser et al., 1999). Se transformaron mutaciones en sistemas de transducción de señales de dos componentes (TCSTS) en la cepa P303 por selección de colonias a partir de un medio que comprendía eritromicina (1 microgramo por mililitro). Se exploraron los transformantes encapsulados para determinar una morfología de colonia alterada y la expresión de CPS confirmada mediante la reacción de Quellung usando antisueros específicos de tipo (obtenidos en Statens Seruminstitut, Copenhague, Dinamarca).
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Reacción de Quellung
Se visualizaron cápsulas neumocócicas en bacterias cultivadas hasta una fase semilogarítmica en medio semisintético en diversas condiciones. Para la reacción de Quellung, se mezcló un volumen equivalente de cultivo y una composición que comprendía antisuero tipo 6 y azul de metileno al 1% (p/v) obtenido en el Statens Seruminstitut (Copenhague, Dinamarca) en un portaobjetos de vidrio durante un minuto, como se describe (Neufeld, 1902).
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Cuantificación de CPS
Se cultivaron variantes neumocócicas de forma O y T en el medio semisintético hasta una fase semilogarítmica (A_{620} = 0,3) o durante 16 horas (momento en el que las células estaban en la fase estacionaria). Las células se recogieron por centrifugación a 2000 x g, se lavaron en solución salina tamponada con fosfato (PBS), se sonicaron durante tres intervalos de 10 segundos a 0ºC y se almacenaron a -20ºC. Se usó una técnica de ELISA de captura para determinar las cantidades de CPS presentes en variantes cultivadas en condiciones seleccionadas, como se describe (Kim et al., 1998). Se usó antisuero de conejo específico de tipo (obtenido en Statens Seruminstitut, Copenhague, Dinamarca) a una dilución de 1:5.000 en Na_{2}CO_{3} 0,05 molar (pH 9,6) y se fijó durante una noche a temperatura ambiente a las paredes de pocillos en placas de microtitulación. Entre cada etapa de incubación, la placa se lavó cinco veces con tampón Tris (que comprendía Tris 10 milimolar, NaCl 150 milimolar, Brij^{TM} 35 al 0,05% y azida sódica al 0,02% (p/v). El Brij^{TM} 35 (polioxietilen(23) lauril éter C_{12}H_{25}(OCH_{2}CH_{2})_{23}OH) es un detergente. Se usó CPS purificado obtenido de neumococos tipo 6B, 6A, 18C o 9V a una concentración conocida y se adquirió en la Colección Americana de Cultivos Tipo (Rockville, MD) para su uso como patrón. Se detectó el CPS en muestras de células sonicadas usando anticuerpos monoclonales denominados HASP 4 (que se une específicamente con CPS tipo 6A y 6B), HASP 22 (que se une específicamente con CPS tipo 18C) y HASP 33 (que se une específicamente con CPS tipo 9V) y se usaron a una concentración determinada en experimentos piloto. La unión de anticuerpos monoclonales y CPS se detectó usando antisueros que reaccionan específicamente con IgM de ratón y que están conjugados con fosfatasa alcalina. Este reactivo se usó como se describe (Kim y Weiser, 1998). Se realizó la determinación de proteína celular total con extractos celulares sonicados usando el microkit de ácido bicincónico de acuerdo con las instrucciones del fabricante (Pierce Chemical Co., Rockford, IL). La cantidad de CPS en la fracción de sobrenadante se basaba en la concentración de proteína en la fracción sonicada de células correspondiente (es decir, para normalizar el contenido de CPS en base por proteína unitaria).
Se ha descrito el método de ELISA de captura usado para comparar cantidades de ácido teicoico total en sonicados de células (Kim et al., 1998). Todos los experimentos se realizaron por duplicado y se repitieron al menos tres veces. Los resultados se expresan como valores medios por concentración total de proteína celular.
Análisis de Western
Se cultivaron bacterias en agar tríptico de soja complementado con catalasa como se ha descrito anteriormente. Después del cultivo en condiciones seleccionadas durante 16 horas a 37ºC, las células se retiraron de la superficie usando un hisopo estéril Dacron^{TM}, se resuspendieron en PBS y se lavaron en PBS para ajustar la densidad celular de modo que A_{620} = 0,5. Después de centrifugar, las células sedimentadas se resuspendieron en tampón de carga en gel Laemmli y se calentaron a 100ºC durante 5 minutos. Después, las muestras se separaron mediante SDS-PAGE en geles de poliacrilamida al 12,5% (p/v) y después se transfirieron a membranas de Immobilon-P^{TM} como se describe (Wani et al., 1996).
Se realizó una inmunotransferencia usando un anticuerpo monoclonal denominado 4G10 (Upstate Biotechnology Inc., Waltham, MA) a una dilución 1:2000 en tampón TSBP (Wani et al., 1996) y se detectó la reactividad de muestras inmunotransferidas con este anticuerpo usando antisueros de IgG de ratón conjugados con fosfatasa alcalina como se describe (Kim et al., 1999). Se confirmó la carga de cantidades aproximadamente equivalentes de bacterias por inmunotransferencia de membranas por duplicado usando antisueros descritos anteriormente generados contra neumococos completos (Wani et al., 1996).
Análisis de Northern
Se aisló el ARN total de variantes O y T de células de la cepa P303 cultivadas hasta una fase semilogarítmica en medio semisintético en condiciones atmosféricas y anaerobias y se purificó como se describe (Weyand et al., 2000). Después de la separación de ARN en un gel de formamida, se fotografió el ARN teñido con bromuro de etidio y la imagen se digitalizó para su comparación con marcadores de tamaño de ARN. El ARN se transfirió a una membrana usando el Sistema VacuGene^{TM} XL de acuerdo con las instrucciones del fabricante (Pharmacia LKB Biotechnology, Uppsala, Suecia). La membrana se hibridó previamente en una solución que comprendía NaPO_{4} 0,5 molar a pH 7,2, EDTA 1,5 milimolar y SDS al 7% (p/v) durante 15 minutos a 65ºC. La sonda se preparó a partir de un fragmento interno del gen cps4D y se amplificó por PCR usando cebadores que tienen las siguientes secuencias:
5'-CCGGAATTCG TACAAATATA CAGTTGAGCG GAGATAAAC-3' (SEC ID Nº: 1) y
5'-CGCGGATCCT GTTGCTGTTA CCAAGATGGA CG-3' (SEC ID Nº: 2)
y ADN genómico a partir de una cepa tipo 4. La cepa es la misma cepa usada en secuenciación de genoma completo por el Instituto para Investigación Genómica. El producto de PCR se digirió usando las endonucleasas de restricción BamHI y EcoRI, y después se clonó en un vector que tenía terminadores de la transcripción flanqueando al polienlazador para permitir la clonación de secuencias estreptocócicas. Este vector se construyó a partir de pJDC9 por inserción del casete de resistencia a kanamicina con extremos romos de pUK4K (Pharmacia, Upsalla, Suecia) en un sitio CLAI de extremos romos para permitir la selección de este marcador en E. coli (Chen y Morrison, 1988). Se insertó el fragmento cps4D en un vector digerido con BamHI y EcoRI y se usó para transformar la cepa DH5\alpha de E. coli. Se extrajo el ARN total a partir de variantes O y T neumocócicas de la cepa P303 cultivadas hasta una fase semilogarítmica en medio tríptico de soja en condiciones atmosféricas y anaerobias.
Se describen a continuación los resultados de los experimentos que se presentan en este Ejemplo.
Selección para variantes fenotípicas en seres humanos
Para ensayar si se produce selección para diferentes fenotipos neumocócicos en el estado de portador y la bacteriemia en seres humanos, se obtuvieron aislados emparejados del mismo serotipo de la nasofaringe y sangre de pacientes que presentaban signos de septicemia. Era necesario obtener aislados emparejados debido a la heterogeneicidad de una cepa a otra en la morfología de las colonias no relacionada con la opacidad. No podían aislarse neumococos de la nasofaringe de pacientes bacteriémicos una vez que se había iniciado el tratamiento con antibióticos. Por lo tanto, los cultivos de nasofaringe y sangre se obtuvieron sustancialmente al mismo tiempo. Esta limitación requería que el estudio se llevase a cabo en una localización geográfica que tuviera una alta incidencia de bacteriemia neumocócica para que pudiera obtenerse un número suficiente de aislados emparejados.
Se obtuvieron aislados de sangre y nasofaringe de 19 pacientes adultos en Blantyre, Malawi, y sólo se consideraron como aislados emparejados si se demostraba posteriormente que los aislados eran del mismo tipo mediante la reacción de Quellung que usa antisueros específicos de tipo. La mayoría de los aislados emparejados eran del tipo 1, el tipo más común en esta localización, como se indica en la Tabla II. La mayoría de los pacientes también dieron positivo para infección por el virus de la inmunodeficiencia humana, que se piensa que explica la alta incidencia de enfermedad neumocócica invasiva entre estos pacientes. De los 19 aislados emparejados, 17 (89%) eran del fenotipo T en la nasofaringe, mientras que 12 (63%) eran del fenotipo O en la sangre. De los diez aislados emparejados en los que no concordada el fenotipo de los neumococos obtenidos de los dos sitios, todos presentaban un fenotipo más tipo T en la nasofaringe (P < 0,001). Esto demuestra que, en general, existe una selección para variantes fenotípicas que da como resultado la presencia en sangre de un fenotipo más tipo O derivado de entre la población predominantemente tipo T en la nasofaringe en una infección bacteriémica natural.
TABLA II
2
Efecto de oxígeno sobre las cantidades de CPS
Se investigaron factores del hospedador y bacterianos que podían promover la selección de variantes O durante la infección y de variantes T durante el estado de portador. Se formuló la hipótesis de que una menor tensión de oxígeno, de la clase que se encontraría en un pulmón consolidado promovería una transición del fenotipo T al O. El cultivo de un aislado clínico tipo 6A, P303, en concentraciones reducidas de oxígeno no tenía efecto sobre el índice de cambio espontáneo de forma T a O. El cultivo en condiciones anaerobias (en presencia de una concentración elevada de dióxido carbono), sin embargo, se asociaba con un cambio a una morfología de colonia de mayor tamaño y más mucoide que era particularmente marcada para la variante O, como se muestra en la Figura 1A.
Debido a que los neumococos que presentan el fenotipo O expresan mayores cantidades de CPS que los que presentan el fenotipo T, se consideraba posible que el mayor tamaño de colonia asociado con la forma O fuera un resultado de una producción aumentada de este material (Kim et al., 1998). En estudios iniciales, la zona refractaria de CPS alrededor de las colonias bacterianas se visualizó usando la reacción de Quellung y antisueros tipo 6, como se muestra en la Figura 1B. Esta zona era de mayor tamaño para la variante O cultivada en condiciones anaerobias en presencia de dióxido de carbono al 10%, en comparación con el cultivo del mismo fenotipo en presencia de oxígeno o cultivo de la variante T en cualquiera de las condiciones ensayadas, incluyendo la ausencia de oxígeno. Por el contrario, cuando se cultivaron las bacterias en condiciones atmosféricas, podía no detectarse una zona de material capsular alrededor de las colonias de neumococos de forma T. Este resultado confirmaba la capacidad de la forma O para sintetizar cantidades aumentadas de CPS e indicaba que una tensión reducida de oxígeno, una mayor tensión de dióxido de carbono o ambas promueven una producción de CPS aumentada.
El efecto de la concentración de oxígeno y dióxido de carbono ambiental se evaluó cuantitativamente usando un ensayo desarrollado para medir cantidades de CPS, como se indica en la Figura 2 (Kim et al., 1998). Las cantidades de CPS por miligramo de proteína celular total, según se evaluaron usando el ELISA de captura descrito en este documento, se correlacionan con el área de superficie de colonia y con valores de volumen capsular calculados basándose en la visualización de zonas usando la reacción de Quellung y con el área de superficie de colonia, como se indica en la Tabla III. Las bacterias de forma O en crecimiento en fase semilogarítmica o fase estacionaria presentaban cantidades aumentadas de CPS asociado con células en comparación con los organismos de forma T. El cultivo de la variante O tipo 6A en condiciones anaerobias en presencia de CO_{2} al 10% causaba un aumento de 7,9 veces en la cantidad de CPS producido, en comparación con la producción de CPS en las mismas células cultivadas en condiciones atmosféricas. En comparación con las variantes T cultivadas en las condiciones anaerobias en presencia de CO_{2} al 10%, la variante O generaba 29 veces el mismo CPS. Se obtuvieron resultados similares usando aislados O y T obtenidos de dos aislados clínicos no relacionados (es decir, usando los tipos 6B y 18C).
TABLA III
3
La producción CPS en sobrenadante de cultivo se evaluó para neumococos tipo 18C después del cultivo hasta una fase estacionaria. La observación de que se producía una mayor cantidad de polisacárido en el sobrenadante de cultivo de la variante de forma O a medida que se disminuía la concentración de oxígeno y que se aumentaba la concentración de dióxido de carbono indica que la producción aumentada de CPS podía atribuirse a una síntesis aumentada de CPS por células en condiciones de oxígeno disminuido/dióxido de carbono aumentado, más que poder atribuirse a una liberación disminuida de CPS a partir de las células en condiciones de oxígeno aumentado/dióxido de carbono disminuido. Se usó un aislado tipo 9V para determinar si la síntesis aumentada de CPS podía atribuirse a oxígeno disminuido o dióxido de carbono aumentado. Bacterias tipo 9V cultivadas hasta una fase estacionaria en presencia de dióxido de carbono al 10% presentaban una producción de CPS 12 veces mayor en ausencia de oxígeno que las mismas células cultivadas en presencia de dióxido de carbono al 10% y en presencia de oxígeno. Esto confirmaba que la tensión de oxígeno, más que la tensión de dióxido de carbono, es el factor ambiental predominante que afecta al grado de producción de CPS.
Los cambios en la producción de CPS se correlacionan con cambios en cpsD/CpsD
La siguiente fase del estudio abordaba el mecanismo por el que estaba mediado el efecto del oxígeno sobre la producción de CPS. Se examinó la implicación de un sistema de transducción de señales de dos componentes para percibir y transducir la tensión/presencia de oxígeno. Mutaciones marcadas descritas anteriormente en 11 de los 12 sistemas de transducción de señales de dos componentes que se encuentran en el genoma de un aislado tipo 3 se transformaron en la cepa P303, como se describe (Troup et al., 2000). Se prepararon 10 construcciones que albergaban mutaciones en homólogos de reguladores de respuesta, así como 7 construcciones que albergaban mutaciones en homólogos de histidina quinasa. Para cada uno de los 17 homólogos mutantes ensayados en P303, no había efectos sobre un tamaño de colonia o zona de formación de cápsula aumentada, según se evaluó usando la reacción de Quellung, en experimentos en los que las células se cultivaron en condiciones anaerobias. Este resultado indicaba que es poco probable que el efecto del oxígeno esté mediado por un TCSTS, aunque uno de estos sistemas en los neumococos no podía examinarse debido a que los genes parecen ser esenciales.
A continuación se examinaron los genes de un locus que se sabe que es necesario para la expresión de CPS. Puesto que se observó el efecto del oxígeno sobre las cantidades de CPS en cepas de múltiples tipos, los genes conservados entre diferentes tipos se consideraron los candidatos más probables. Entre los genes en los loci de la cápsula, sólo los primeros cuatro, cpsA-D, son comunes para neumococos de diferentes tipos (Iannelli et al., 1999). Se sabe que los neumococos tipo 3 forman colonias mucoides y tienen cápsulas de gran tamaño, según se evaluó mediante la reacción de Quellung, cuando se cultivan en condiciones atmosféricas, como se indica en la Tabla I (Knecht et al., 1970). A diferencia de todos los demás tipos neumocócicos ensayados, las cepas tipo 3 no muestran un aumento en el tamaño de las colonias o cápsulas cuando se cultivan en condiciones anaerobias, respecto a los tamaños cuando se cultivan en condiciones atmosféricas. Basándose en esta observación, se determinaron diferencias en cpsA-D entre el tipo 3 y loci de otros tipos.
Están presentes homólogos de cpsA, que codifica un supuesto atenuador de la transcripción, y cpsB, que codifica una proteína de función desconocida, en el locus de encapsulación tipo 3 (nº de acceso de Genbank Z47210; Arrecubieta, 1995). El gen que codifica CpsC en neumococos de serotipo 2 está muy conservado en el locus de encapsulación tipo 3, pero el CpsD predicho en neumococos de serotipo 3 está truncado después del aminoácido 69 (de 226). CpsC y CpsD son necesarias para la expresión de la cápsula neumocócica y en conjunto son homólogas a una sola proteína (Wzc) expresada en Escherichia coli que está implicada en la regulación de longitud de cadena y la exportación del polisacárido extracelular denominado ácido colánico (Morona et al., 1999; Stevenson et al., 1996).
En E. coli, Wzc experimenta una autofosforilación reversible en un resto de tirosina (Vincent et al., 1999). Se usó un anticuerpo monoclonal que se denomina 4G10 que se une específicamente con restos de tirosina fosforilados para determinar mediante análisis de Western que estaba presente tirosina fosforilada en el neumococo. Una sola banda de aproximadamente 26 kD, el tamaño predicho de CpsD, estaba presente en lisados de células completas del aislado tipo 6A. También se observó una sola banda del mismo tamaño en lisados de células completas de las cepas tipo 6B, 18C y 9V usadas en este estudio, pero estaba ausente de los neumococos tipo 3 (que tenían una CpsD truncada). Estas observaciones indicaban que CpsD es fosforilable en un resto de tirosina. Se obtuvieron pruebas adicionales de que 4G10 estaba reconociendo CpsD que tenía restos de tirosina fosforilados, por comparación de cepas D39 (un mutante no encapsulado) y R6x (una cepa que tenía una deleción de 7504 pares de bases que abarcan cps2A-H, de la que sólo A-D son comunes a otros tipos; Iannelli et al., 1999). La mutación en neumococos tipo R6x se corrigió en algunos experimentos por transformación de las bacterias usando ADN obtenido de la cepa parental D39 (tipo 2) o de una cepa tipo 3 para dar una cepa encapsulada con cápsula tipo 3 ó 2 en el fondo genético tipo 2 D39.
La falta de reacción de 4G10 con R6x y el transformante R6x tipo 3 y la reacción del anticuerpo con el transformante R6x tipo 2 confirmaba que la expresión de la proteína que se corresponde con esta banda requiere uno de los primeros cuatro genes comunes en el locus de encapsulación y una copia intacta de cpsD. Se determinó que la proteína reactiva con 4G10 probablemente no es CpsA ni B basándose en el tamaño. Sólo hay 15 cambios de aminoácidos conservativos entre CpsC tipo 2 y 3, de los cuales ninguno implica tirosina. La ausencia de banda reactiva con 4G10 en la cepa tipo 3 indicaba que la proteína reactiva con 4G10 no es CpsC. Por lo tanto, se concluía que la proteína CpsD comprende un resto de tirosina fosforilable en el neumococo.
Se examinó el efecto del cultivo en diversas concentraciones de oxígeno y dióxido de carbono sobre la fosforilación de tirosina de CpsD. Lisados de células completas de las forma O y T del aislado neumocócico tipo 6A denominado P303 que se habían cultivado en diversas concentraciones de oxígeno y de dióxido de carbono se ajustaron a una densidad equivalente y se examinaron mediante análisis de Western usando el anticuerpo monoclonal específico de fosfotirosina 4G10. Los resultados de estos experimentos se muestran en la Figura 3. Se detectó una sola banda del tamaño esperado para CpsD en la variante O cultivada en presencia de oxígeno. No había reactividad con el extracto obtenido a partir de un número aproximadamente equivalente de células cultivadas en condiciones anaerobias, según se indica en el carril 1 de la Figura 3. No había un efecto evidente de las diferencias en la tensión de dióxido de carbono de <0,1 al 10%, según indicaban los resultados en los carriles 2-4 de la Figura 3. En todas las condiciones ensayadas (oxígeno de <0,1% al 21% y dióxido de carbono de <0,1% al 10%), la reactividad de los anticuerpos con extractos celulares de la variante T era débil. Se obtuvieron resultados similares usando otras cepas. Por lo tanto, se concluía que la fosforilación de tirosina de CpsD se ve afectada por el fenotipo de opacidad y requiere el cultivo en presencia de oxígeno.
La diferencia en la fosforilación de tirosina puede afectar a la actividad de CpsD y explica la expresión disminuida de CPS en neumococos O en presencia de oxígeno. Ni los neumococos O ni T cultivados en condiciones anaerobias expresan tirosina fosforilada; sin embargo, las dos formas fenotípicas presentan grandes diferencias en el grado de producción de CPS.
Se usó análisis de Northern para determinar si las diferencias entre las variantes O y T se debían a diferencias en el nivel de transcripción de cpsD. Los resultados de estos experimentos se muestran en la Figura 4. Se obtuvo el ARN celular total de formas O y T de la cepa neumocócica P303 cultivada en condiciones atmosféricas o en condiciones anaerobias en presencia de dióxido de carbono al 10%. El ARN se sondó usando un fragmento clonado de cpsD. Se determinaron las diferencias cuantitativas en la actividad transcripcional por evaluación de la hibridación de sonda radiomarcada con cpsD en ARNm y ajuste de estos valores para la cantidad total de ARN presente en la mezcla de ensayo de hibridación. Estos experimentos demostraban que la concentración de oxígeno no tenía un efecto sustancial sobre el nivel de transcripción de cpsD. Sin embargo, cpsD se transcribía a un nivel 3,4 veces mayor en células de forma T, respecto a células de forma O. Por lo tanto, se concluía que la regulación de la transcripción de cpsD determina el fenotipo de opacidad de neumococos.
Sin desear ligarse a teoría particular de funcionamiento alguna, se piensa que CpsD regula la producción de CPS. La correlación entre las diferencias observadas en el grado de fosforilación de tirosina de CpsD y las diferencias en la producción de CPS confirman esta teoría. Se piensa que CpsD funciona como una tirosina quinasa, basándose en parte en su similitud de secuencia de aminoácidos con una enzima autofosforilante de tirosina en E. coli que está implicada en la regulación de la longitud de cadena y la exportación del polisacárido extracelular ácido colánico. La Cps23FD tiene una identidad del 30% y una similitud del 49% sobre 188 de 299 aminoácidos con Wzc. La CpsD de neumococos de serotipo 23f contiene una secuencia aminoácidos carboxilo-terminal poco habitual (YGSYGNYGNY GKNKK; SEC ID Nº: 3) que contiene un motivo repetitivo (YGX)_{4} que incluye restos de tirosina. Esta región carboxilo-terminal presenta una heterogeneicidad de secuencia de aminoácidos considerablemente mayor entre variantes neumocócicas que el resto de CpsD. Se piensa que la variabilidad en la producción de CPS entre cepas neumocócicas puede atribuirse a la variabilidad de esta porción carboxilo-terminal entre las cepas, afectando la variación de secuencia a la capacidad de fosforilación de la proteína. Se han identificado varias otras proteínas quinasas bacterianas y éstas tienen en común un extremo C-terminal con un motivo repetitivo rico en tirosina (Ilan et al, 1999). La incapacidad para generar una cepa neumocócica que albergue una mutación en cpsD al tiempo que mantenga la capacidad de la cepa para producir CPS es una prueba adicional de la importancia de este gen en la producción de CPS y cápsula.
Se propone el siguiente modelo de un mecanismo para regular la producción de CPS en respuesta al fenotipo de opacidad de colonia y a la tensión de oxígeno. El modelo implica la regulación de la transcripción de cpsD y la modificación postraduccional de CpsD.
CpsD es un factor regulador negativo que actúa sobre genes implicados en la biosíntesis de CPS específico de tipo neumocócico. Una transcripción relativamente reducida de cpsD explica las cantidades relativamente elevadas de CPS expresado en neumococos tipo O en condiciones anaerobias. Aparte de la regulación de la transcripción de cpsD, que explica una proporción significativa de la regulación de la expresión de CPS, está implicado un segundo nivel de regulación, en concreto la fosforilación o autofosforilación de un resto o restos de tirosina en CpsD. La fosforilación de CpsD afecta sólo a la variante O y requiere cultivo en condiciones aerobias. La capacidad de detección de CpsD que esté fosforilada en uno o más restos de tirosina sólo en la variante O puede deberse a una actividad fosfatasa aumentada en neumococos T. La fosforilación de tirosina aumenta la actividad reguladora negativa de CpsD, de modo que la CpsD fosforilada disminuye la síntesis de CPS en condiciones aerobias. Como resultado, se genera menos CPS por variantes O en condiciones aerobias que en condiciones de cultivo anaerobias. Una producción de CPS relativamente reducida en neumococos de forma T, incluso en ausencia de una fosforilación de tirosina apreciable de CpsD, puede atribuirse a una expresión aumentada de cpsD en neumococos de forma T.
Lo que se había descrito anteriormente como un crecimiento mejorado en condiciones anaerobias puede ser de hecho un efecto de una síntesis aumentada de CPS que dé como resultado un mayor tamaño de colonia (Modde, 1978).
Están presentes homólogos de CpsD con una similitud aún mayor con Wzc en muchas otras especies de bacterias que expresan polisacáridos de superficie. Los ejemplos de dichas especies incluyen Streptococcus agalactiae, Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae y Acinetobacter johnsonii. Puesto que las cápsulas y su tamaño son determinantes críticos de la virulencia, la capacidad para regular las cantidades de CPS basándose en la modificación transcripcional y postraducción de esta clase de gen/proteína puede ser importante para facilitar la capacidad de bacterias encapsuladas para adaptarse a las diferentes necesidades de colonización e infección.
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Referencias citadas en la descripción Esta lista de referencias citadas por el solicitante únicamente es para comodidad del lector. Dicha lista no forma parte del documento de patente europea. Aunque se ha tenido gran cuidado en la recopilación de las referencias, no se pueden excluir errores u omisiones y la EPO rechaza toda responsabilidad a este respecto. Bibliografía no relativa a patentes citada en la descripción
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Claims (16)

1. Procedimiento para producir un polisacárido capsular a partir de un neumococo, comprendiendo dicho procedimiento obtener una variante opaca del neumococo y mantener dicha variante opaca del neumococo en un medio de cultivo en contacto con un gas que tiene una concentración de oxígeno menor de aproximadamente el 16%, comprendiendo opcionalmente dicho procedimiento aislar el polisacárido capsular producido.
2. Procedimiento de la reivindicación 1, en el que dicho gas tiene una concentración de oxígeno no superior a aproximadamente el 0,1%.
3. Procedimiento de la reivindicación 1, en el que dicho neumococo es un organismo del género Streptococcus.
4. Procedimiento de la reivindicación 3, en el que dicho neumococo es un organismo de la especie Streptococcus pneumoniae.
5. Procedimiento de la reivindicación 4, en el que dicho neumococo es una variante de la especie Streptococcus pneumoniae seleccionada del grupo que consiste en las variantes 6A, 6B, 18C y 9V.
6. Procedimiento de la reivindicación 1, en el que dicho gas tiene una concentración superatmosférica de dióxido de carbono.
7. Procedimiento para producir un polisacárido capsular a partir de un neumococo, comprendiendo dicho procedimiento obtener una variante opaca del neumococo y mantener dicha variante opaca del neumococo en un medio de cultivo en contacto con un gas que tiene una concentración de dióxido de carbono de al menos aproximadamente el 5% y una concentración de oxígeno menor de aproximadamente el 16%, comprendiendo opcionalmente dicho procedimiento aislar el polisacárido capsular producido.
8. Procedimiento de la reivindicación 7, en el que dicho gas tiene una concentración de dióxido de carbono de al menos aproximadamente el 10%.
9. Procedimiento de la reivindicación 7, en el que dicho gas tiene una concentración de oxígeno no superior a aproximadamente el 0,1%.
10. Procedimiento para preparar una preparación inmunógena para su administración a un animal en riesgo de desarrollar una infección neumocócica, comprendiendo el procedimiento las etapas de:
a)
obtener una variante opaca del neumococo;
b)
mantener dicha variante opaca del neumococo en un medio de cultivo que tiene un contenido de oxígeno inferior al del mismo medio equilibrado a la misma temperatura con un gas que tiene una concentración de oxígeno menor del 16%; y
c)
aislar el polisacárido capsular producido por las células a partir de las células; en el que el polisacárido aislado constituye la preparación inmunógena.
11. Procedimiento de la reivindicación 10, en el que dicho gas tiene una concentración de oxígeno no superior a aproximadamente el 0,1%.
12. Procedimiento de la reivindicación 10, en el que dicho gas tiene una concentración superatmosférica de dióxido de carbono.
13. Procedimiento para producir un polisacárido neumocócico, comprendiendo dicho procedimiento obtener una variante opaca de un neumococo y mantener dicho neumococo en un medio de cultivo, donde dicho medio de cultivo está sustancialmente desprovisto de oxígeno.
14. Procedimiento para producir un polisacárido neumocócico, comprendiendo dicho procedimiento obtener una variante opaca de un neumococo y mantener dicho neumococo en un medio de cultivo que tenga un contenido de oxígeno inferior al del mismo medio equilibrado a la misma temperatura con un gas que tenga un contenido de oxígeno del 16%, y en el que dicho medio de cultivo tiene un contenido de dióxido de carbono que es superior al del mismo medio equilibrado a la misma temperatura con aire normal.
15. Procedimiento de la reivindicación 14, en el que dicho medio de cultivo está saturado con dióxido de carbono.
16. Procedimiento de la reivindicación 14, en el que dicho medio de cultivo comprende una sal de carbonato o bicarbonato.
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