ES2319346T3 - Plantas transgenicas tolerantes a los herbicidas en las cuales el herbicida inhibe la biosintesis de la porfirina. - Google Patents

Plantas transgenicas tolerantes a los herbicidas en las cuales el herbicida inhibe la biosintesis de la porfirina. Download PDF

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Abstract

LA INVENCION SE REFIERE A PLANTAS RESISTENTES A COMPUESTOS PARA EL CONTROL DE LAS MALAS HIERBAS, LAS CUALES SE PRODUCEN MEDIANTE LA INTRODUCCION DE UN GEN QUE CODIFICA PARA UNA PROTEINAS QUE TIENE LAS SIGUIENTES CARACTERISTICAS (A) A (C): (A) TIENE UNA AFINIDAD ESPECIFICA PARA UNA SUSTANCIA RELACIONADA CON LA ACTIVIDAD DE CONTROL DE LAS MALAS HIERBAS DE UN COMPUESTO DE CONTROL DE LAS MISMAS; (B) PRACTICAMENTE NO TIENE CAPACIDAD DE MODIFICACION DE UNA SUSTANCIA PARA LA CUAL DICHA PROTEINA TIENE UNA ACTIVIDAD ESPECIFICA; Y (C) ESTA PRACTICAMENTE EXENTA DE REGIONES ESTRUCTURALES DE LAS REGIONES VARIABLES DE UNA INMUNOGLOBULINA, EN UNA CELULA VEGETAL; Y LA EXPRESION DE DICHO GEN.

Description

Plantas transgénicas tolerantes a los herbicidas en las cuales el herbicida inhibe la biosíntesis de la porfirina.
Antecedentes de la invención Campo de la invención
La presente invención se refiere a un método para proporcionar a las plantas resistencia a compuestos para el control de malas hierbas.
Descripción de la técnica relacionada
El control de las malas hierbas es un trabajo muy importante para mejorar los rendimientos y la calidad de las plantas cultivadas. Para este fin, se utilizan principalmente compuestos para el control de las malas hierbas tales como los herbicidas. Sin embargo, para utilizar compuestos para el control de las malas hierbas, no siempre es fácil distinguir las plantas cultivadas de las malas hierbas de especies aliadas para controlar selectivamente sólo las malas hierbas. En ese caso, se ha intentado la producción de plantas que tienen resistencia a los compuestos para el control de las malas hierbas (en adelante referida como resistencia al compuesto de control de las malas hierbas) y se han puesto en uso práctico algunas plantas resistentes.
Recientemente, se han utilizado técnicas de ingeniería genética para producir plantas que tienen resistencia a compuestos para el control de las malas hierbas. En cuanto a semejante técnica, por ejemplo, Hinchee, M.A.W. et al. describen un método para producir una planta que tiene resistencia a un herbicida, glifosato, donde el gen 5-enolpiruvilshikimato-3-fosfato sintasa (EPSPS) que es una enzima diana del glifosato es sometido a mutagénesis de manera que se reduce la afinidad por el glifosato, y el gen es introducido en una planta [Hinchee, M.A.W. et al., BIO/TECHNOLOGY, 6: pág. 915 (1988)].
Objetos de la invención
Las variedades de métodos conocidos para proporcionar resistencia a compuestos para el control de las malas hierbas a las plantas no son necesariamente suficientes y se ha deseado desarrollar diversas clases adicionales de métodos para proporcionar resistencia a compuestos para el control de las malas hierbas a plantas.
El objeto principal de la presente invención es proporcionar una nueva clase de método para proporcionar resistencia a compuestos para el control de las malas hierbas a plantas.
Este objeto así como otros objetos y ventajas de la presente invención se harán evidentes para los expertos en la técnica a partir de la siguiente descripción con referencia a los dibujos adjuntos.
Breve descripción de los dibujos
La Fig. 1 es un mapa de restricción del plásmido pETBCH. bchH es un gen de la subunidad de unión a la protoporfirina IX de la magnesio quelatasa de una bacteria fotosintética Rhodobacter sphaeroides. T7 pro representa la secuencia promotora del fago T7, y T7 ter representa la secuencia terminadora del fago T7. Amp^{r} es el gen de resistencia a ampicilina, lacI^{q} es un gen de la proteína represora de un operón lactosa, y ori es el origen de replicación.
La Fig. 2 es el mapa de restricción del plásmido pACYCSP. PPO es el gen de la protoporfirinógeno oxidasa IX de soja y lac pro representa la secuencia promotora de un operón lactosa. Cm^{r} es un gen resistente a cloranfenicol y ori es el origen de replicación.
La Fig. 3 es el mapa de restricción del plásmido pTVBCH. bchH es el gen de la subunidad de unión a la protoporfirina IX de la magnesio quelatasa de la bacteria fotosintética Rhodobacter sphaeroides. lac pro representa la secuencia promotora de un operón lactosa. Amp^{r} es un gen resistente a ampicilina y ori es el origen de replicación.
La Fig. 4 es el mapa de restricción del plásmido pBIBCH. bchH es el gen de la subunidad de unión a la protoporfirina IX de la magnesio quelatasa de la bacteria fotosintética Rhodobacter sphaeroides. NP es la secuencia promotora de un gen de la nopalina sintasa, NT es la secuencia terminadora del gen de la nopalina sintasa, y 35S es el promotor de 35S del virus del mosaico de la coliflor. NPTII representa un gen resistente a la kanamicina, y RB y LB representan las secuencias limítrofes derecha e izquierda del ADN-T respectivamente.
La Fig. 5 es el mapa de restricción del plásmido pNO. NP es la secuencia promotora de un gen de la nopalina sintasa, NT es la secuencia terminadora del gen de la nopalina sintasa, y 35S es el promotor 35S del virus del mosaico de la coliflor. NPTII representa un gen de resistencia a la kanamicina, y RB y LB representan las secuencias limítrofes derecha e izquierda del ADN-T, respectivamente.
La Fig. 6 es el mapa de restricción del plásmido pTCHLH. TCHLH es el gen de la subunidad de unión a protoporfirina IX de la magnesio quelatasa de tabaco cuya señal de tránsito a cloroplastos ha sido suprimida. lac pro representa la secuencia promotora de un operón lactosa. Am^{r} es un gen de resistencia a ampicilina, Km^{r} es un gen de resistencia a kanamicina y ori es el origen de replicación.
La Fig. 7 es el mapa de restricción del plásmido pBITCHLH. TCHLH es la subunidad de unión a la protoporfirina IX de la magnesio quelatasa de tabaco cuya señal de tránsito a cloroplastos ha sido suprimida. NP es la secuencia promotora de la nopalina sintasa, NT es la secuencia terminadora de la nopalina sintasa y 35S es el promotor de 35S del virus del mosaico de la coliflor. NPTII representa un gen de resistencia a la kanamicina, y RB y LB representan las secuencias limítrofes derecha e izquierda del ADN-T, respectivamente.
La Fig. 8 es el mapa de restricción del plásmido pTVGMP. GMP es el gen de la protoporfirinógeno IX oxidasa de soja cuya señal de tránsito a cloroplastos y cuya secuencia de unión a FAD han sido suprimidas. lac pro representa la secuencia promotora de un operón lactosa. Amp^{r} representa un gen de resistencia a ampicilina y ori es el origen de replicación.
La Fig. 9 es el mapa de restricción del plásmido pBIGMP. GMP es el gen de la protoporfirinógeno oxidasa de soja cuya señal de tránsito a cloroplastos y cuya secuencia FAD han sido suprimidas. NP es la secuencia promotora de una nopalina sintasa y NT es la secuencia terminadora de una nopalina sintasa, y 35S es el promotor de 35S del virus del mosaico de la coliflor. NPTII es un gen de resistencia a la kanamicina, y RB y LB las secuencias limítrofes derecha e izquierda del ADN-T, respectivamente.
La Fig. 10 es el mapa de restricción del plásmido pTVCRP. CRP es el gen de la protoporfirinógeno oxidasa de Chlamydomonas reinhardtii cuya señal de tránsito a cloroplastos y cuya secuencia FAD han sido suprimidas. lac pro representa la secuencia promotora de un operón lactosa. Amp^{r} es un gen de resistencia a ampicilina y ori es el origen de replicación.
La Fig. 11 es el mapa de restricción del plásmido, pBICRP. CRP es el gen de la protoporfirinógeno oxidasa de Chlamydomonas reinhardtii cuya señal de tránsito a cloroplastos y cuya secuencia de unión a FAD han sido suprimidas. NP es la secuencia promotora de una nopalina sintasa y NT es la secuencia terminadora de una nopalina sintasa, y 35S es el promotor de 35S del virus del mosaico de la coliflor. NPTII es un gen de resistencia a la kanamicina, y RB y LB son las secuencias limítrofes derecha e izquierda del ADN-T, respectivamente.
La Fig. 12 es el mapa de restricción del plásmido pTVHVF1. HVF el gen de la ferroquelatasa de la cebada cuya secuencia señal ha sido suprimida. lac pro representa la secuencia promotora de un operón lactosa. Amp^{r} representa un gen de resistencia a ampicilina y ori es el origen de replicación.
La Fig. 13 es el mapa de restricción del plásmido pBIHVF. HVF es el gen de la ferroquelatasa de la cebada cuya secuencia señal ha sido suprimida. NP es la secuencia promotora de una nopalina sintasa y NT es la secuencia terminadora de una nopalina sintasa, y 35S es el promotor de 35S del virus del mosaico de la coliflor. NPTII es un gen de resistencia a la kanamicina, y RB y LB son las secuencias limítrofes derecha e izquierda del ADN-T, respectivamente.
La Fig. 14 es el mapa de restricción del plásmido pTVCSF. CSF es el gen de la ferroquelatasa de pepino cuya secuencia señal ha sido suprimida. lac pro representa la secuencia promotora de un operón lactosa. Amp^{r} es un gen de resistencia a ampicilina, y ori es el origen de replicación.
La Fig. 15 es el mapa de restricción del plásmido pBICSF. CSF es el gen de la ferroquelatasa de pepino cuya secuencia señal ha sido suprimida. NP es la secuencia promotora de una nopalina sintasa y NT es la secuencia terminadora de una nopalina sintasa, y 35S es el promotor de 35S del virus del mosaico de la coliflor. NPTII es un gen de resistencia a la kanamicina, y RB y LB son las secuencias limítrofes derecha e izquierda del ADN-T, respectivamente.
La Fig. 16 es el mapa de restricción del plásmido pHEMF. HEMF es el gen de la coproporfirinógeno III oxidasa (hemF) de Escherichia coli. lac pro es la secuencia promotora de un operón lactosa. Amp^{r} es un gen de resistencia a ampicilina, y ori es el origen de replicación.
La Fig. 17 es el mapa de restricción del plásmido pBIHEMF. HEMF es el gen de la coproporfirinógeno III oxidasa (hemF) de Escherichia coli. NP es la secuencia promotora de una nopalina sintasa y NT es la secuencia terminadora de una nopalina sintasa, y 35S es el promotor de 35S del virus del mosaico de la coliflor. NPTII es un gen de resistencia a la kanamicina, y RB y LB son las secuencias limítrofes derecha e izquierda del ADN-T, respectivamente.
La Fig. 18 es el mapa de restricción del plásmido pBIHASYS8. HASYS8 es un gen que codifica la proteína MG(HASYS)_{8}. NP es la secuencia promotora de una nopalina sintasa y NT es la secuencia terminadora de una nopalina sintasa, y 35S es el promotor de 35S del virus del mosaico de la coliflor. NPTII es un gen de resistencia a la kanamicina, y RB y LB son las secuencias limítrofes derecha e izquierda del ADN-T, respectivamente.
La Fig. 19 es el mapa de restricción del plásmido pBIRASSL8. RASSL8 es la proteína MG(RASSL)_{8}. NP es la secuencia promotora de una nopalina sintasa y NT es la secuencia terminadora de una nopalina sintasa, y 35S es el promotor de 35S del virus del mosaico de la coliflor. NPTII es un gen de resistencia a la kanamicina, y RB y LB son las secuencias limítrofes derecha e izquierda del ADN-T, respectivamente.
Compendio de la invención
En estas circunstancias, los autores de la presente invención han estudiado intensamente con el fin de desarrollar una nueva clase de métodos para proporcionar resistencia a los compuestos para el control de las malas hierbas a las plantas. Como resultado, han descubierto que se puede proporcionar resistencia a los compuestos para el control de las malas hierbas a las plantas permitiendo que las plantas produzcan cierta proteína en las células de la planta. De este modo, se ha completado la presente invención.
Esto es, la presente invención proporciona los siguientes apartados:
1.
Un método para elaborar plantas resistentes a compuestos para el control de las malas hierbas que comprende las etapas de
(a)
introducir en una célula vegetal un gen que codifica una proteína seleccionada del grupo que consiste en:
\quad
magnesio quelatasa de tipo activo o inactivo que tiene afinidad por la protoporfirina IX;
\quad
ferroquelatasa de tipo activo o inactivo que tiene afinidad por la protoporfirina IX;
\quad
cobalto quelatasa de tipo activo o inactivo que tiene afinidad por la protoporfirina IX,
\quad
un péptido que tiene afinidad por la protoporfirina IX, compuesto por 6 a 100 aminoácidos, estando dicho péptido sustancialmente libre de regiones marco de regiones variables de una inmunoglobulina;
\quad
protoporfirinógeno IX oxidasa de tipo inactivo que tiene afinidad por el protoporfirinógeno IX; y coproporfirinógeno III oxidasa de tipo activo o inactivo que tiene afinidad por el protoporfirinógeno IX,
\quad
no teniendo sustancialmente dicha proteína capacidad de modificar el protoporfirinógeno IX; y
(b)
expresar el gen.
2.
El método de acuerdo con el apartado 1, donde el compuesto para el control de las malas hierbas está inhibiendo la biosíntesis de porfirina de una planta.
3.
El método de acuerdo con el apartado 1 o 2, donde el compuesto para el control de las malas hierbas es un compuesto herbicida de tipo inhibidor de la proto-porfirinógeno IX oxidasa.
4.
El método de acuerdo con uno cualquiera de los apartados 1 a 3, donde la proteína es una magnesio quelatasa o una variante de dicha proteína que tiene una afinidad específica por la protoporfirina IX.
5.
El método de acuerdo con uno cualquiera de los apartados 1 a 3, donde la proteína es la proteína de la subunidad de unión a protoporfirina IX de la magnesio quelatasa, o una variante de dicha proteína que tiene afinidad específica por la protoporfirina IX.
6.
El método de acuerdo con uno cualquiera de los apartados 1 a 5, donde la magnesio quelatasa deriva de un microorganismo fotosintético o una planta.
7.
El método de acuerdo con uno cualquiera de los apartados 1 a 6, donde la magnesio quelatasa deriva de tabaco.
8.
El método de acuerdo con uno cualquiera de los apartados 1 a 3, donde la proteína es una protoporfirinógeno IX oxidasa variante que no tiene capacidad para oxidar el protoporfirinógeno IX y que tiene afinidad específica por el protoporfirinógeno IX.
9.
El método de acuerdo con uno cualquiera de los apartados 1 a 3, donde la proteína es protoporfirinógeno IX oxidasa variante que no tiene capacidad para oxidar el protoporfirinógeno IX y que tiene una afinidad específica por el compuesto herbicida de tipo inhibidor de la protoporfirinógeno IX oxidasa.
10.
El método de acuerdo con uno cualquiera de los apartados 1 a 3, 8 o 9, donde la protoporfirinógeno IX oxidasa deriva de una planta.
11.
El método de acuerdo con uno cualquiera de los apartados 1 a 3 u 8 a 10, donde la protoporfirinógeno IX oxidasa deriva de soja.
\newpage
12.
El método de acuerdo con uno cualquiera de los apartados 1 a 3, 8 o 9, donde la protoporfirinógeno IX oxidasa deriva de algas.
13.
El método de acuerdo con uno cualquiera de los apartados 1 a 3, 8, 9 o 12, donde la protoporfirinógeno IX oxidasa deriva de Chlamydomonas.
14.
El método de acuerdo con uno cualquiera de los apartados 1 a 3, donde la proteína es ferroquelatasa o una variante de dicha proteína que tiene una afinidad específica por la protoporfirina IX.
15.
El método de acuerdo con uno cualquiera de los apartados 1 a 3 o 14, donde la ferroquelatasa deriva de una planta.
16.
El método de acuerdo con uno cualquiera de los apartados 1 a 3, 14 o 15, donde la ferroquelatasa deriva de cebada o pepino.
17.
El método de acuerdo con uno cualquiera de los apartados 1 a 3, donde el péptido comprende la secuencia de aminoácidos del SEQ ID NO: 53, SEQ ID NO: 54, SEQ ID NO: 55, SEQ ID NO: 56, SEQ ID NO: 57, SEQ ID NO: 58, SEQ ID NO: 59, o SEQ ID NO: 60.
18.
El método de acuerdo con uno cualquiera de los apartados 1 a 3, o 17, donde el péptido comprende la repetición de la secuencia de aminoácidos del SEQ ID NO: 53, 55, 57 o 59 cuatro veces u ocho veces.
19.
El método de acuerdo con uno cualquiera de los apartados 1 a 3, donde la proteína es coproporfirinógeno III oxidasa o una variante de dicha proteína que tiene afinidad específica por el protoporfirinógeno IX.
20.
El método de acuerdo con uno cualquiera de los apartados 1 a 3 o 19, donde la coproporfirinógeno III oxidasa deriva de un microorganismo.
21.
El método de acuerdo con uno cualquiera de los apartados 1 a 3, 19 o 20, donde la coproporfirinógeno III oxidasa deriva de Escherichia coli.
22.
El método de acuerdo con uno cualquiera de los apartados 1 a 21, donde el gen es introducido en la célula vegetal de forma que está ligado operablemente a un promotor y un terminador ambos los cuales son funcionales en la célula vegetal.
23.
El método del apartado 1, donde el compuesto para el control de las malas hierbas está inhibiendo la trasferencia de electrones en la fotosíntesis, la biosíntesis de carotenoides, la biosíntesis de aminoácidos, la biosíntesis de lípidos o la biosíntesis de pared celular, influyendo en la biosíntesis de proteínas, la biosíntesis de ácidos nucleicos o la división celular o tiene una actividad antagónica de la auxina.
24.
El método del apartado 23, donde el compuesto para el control de las malas hierbas que inhibe la transferencia de electrones en la fotosíntesis es un compuesto que inhibe la transferencia de electrones del sistema fotoquímico I o II o que inhibe la 4-hidroxifenil-piruvato dioxigenasa (4-HPPD); el que inhibe la biosíntesis de carotenoides es un compuesto que inhibe la fitoeno-desaturasa (PDS); el que inhibe la biosíntesis de aminoácidos es un compuesto que inhibe EPSPS, acetolactato sintasa (ALS), glutamina sintetasa (GS) o dihidropteroato sintasa (DHP); el que inhibe la biosíntesis de lípidos es un compuesto que inhibe la acetil CoA carboxilasa (ACC); el que inhibe la biosíntesis de la pared celular es un compuesto que inhibe la biosíntesis de celulosa; el que influye en la biosíntesis de proteínas, la biosíntesis de ácidos nucleicos o la división de la pared celular es un compuesto que inhibe la formación de microtúbulos; o el que tiene actividad antagónica de auxina es un compuesto que potencia la elongación y diferenciación celular.
25.
El método del apartado 24, donde el compuesto que inhibe la transferencia de electrones en el sistema fotosintético I es paracuat o dicuat; el que inhibe la transferencia de electrones en el sistema fotoquímico II es un compuesto de triazina, un compuesto de urea o un compuesto de nitrilo; el que inhibe 4-HPPD es un isoxazol, pirazol o tricetona; el que inhibe la PDS es norflurazon, flurocloridon, fluridona, flurtamona o diflufenican; el que inhibe la EPSPS es glifosato; el que inhibe la ALS es una sulfonilurea, una imidazolinona, un pirimidiniltiobenzoato o una triazolopirimidina; el que inhibe la GS es bialafos o glufosinato; el que inhibe la DHP es asulam; el que inhibe la ACC es una ciclohexanediona o un ariloxifenoxipropionato; o el que inhibe celulosa es diclobenilo.
26.
El método de acuerdo con uno cualquiera de los apartados 1 a 22, donde el compuesto para el control de las malas hierbas es un compuesto herbicida de tipo inhibidor de protoporfirinógeno IX oxidasa seleccionado entre los compuestos de los apartados (1) a (3) de más abajo:
(1)
clormetoxinil, bifenox, clornitrofen, acifluorfeno y su éster etílico, acifluorfen-sodio, oxifluorfen, oxadiazon, 2-[4-cloro-2-fluoro-5-(prop-2-iniloxi)fenil]-2,3,4,5,6,7-hexahidro-1H-isoindol-1,3-diona, clorftalim, TNPP-etilo, o N3-(1-feniletil)-2,6-dimetil-5-propionilnicotinamida;
(2)
un compuesto representado por la fórmula general: J-G (I), donde G es un grupo representado por una cualquiera de las siguientes fórmulas generales G-1 a G-9 y J es un grupo representado por una cualquiera de las siguientes fórmulas generales J-1 a J-30:
1
2
3
4
\vskip1.000000\baselineskip
\quad
donde las líneas discontinuas de las fórmulas J-5, J-6, J-12 y J-24 representan que el anillo de la izquierda contiene solamente enlaces sencillos, o un enlace en el anillo es un doble enlace entre átomos de carbono;
X es un átomo de oxígeno o un átomo azufre;
Y es un átomo de oxígeno o un átomo de azufre;
R^{1} es un átomo de hidrógeno o un átomo de halógeno;
R^{2} es un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{8}, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{8}, un átomo de halógeno, un grupo OH, un grupo OR^{27}, un grupo SH, un grupo S(O)_{p}R^{27}, un grupo OR^{27}, un grupo CO_{2}R^{27}, un grupo C(O)SR^{27}, un grupo C(O)NR^{29}R^{30}, un grupo CHO, un grupo CR^{27}=NOR^{36}, un grupo CH=CR^{37}CO_{2}R^{27}, un grupo CH_{2}CHR^{37} CO_{2}R^{27}, un grupo CO_{2}N=CR^{31}R^{32}, un grupo nitro, un grupo ciano, un grupo NHSO_{2}R^{33}, un grupo NHSO_{2}NHR^{33}, un grupo NR^{27}R^{38}, un grupo NH_{2} o un grupo fenilo opcionalmente sustituido con uno o más grupos alquilo C_{1}-C_{4} iguales o diferentes;
p es 0, 1 o 2;
R^{3} es un grupo alquilo C_{1}-C_{2}, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{2}, un grupo OCH_{3}, un grupo SCH_{3}, un grupo OCHF_{2}, un átomo de halógeno, un grupo ciano o un grupo nitro;
R^{4} es un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{3}, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{3} o un átomo de halógeno;
R^{5} es un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{3}, un átomo de halógeno, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{3}, grupo ciclopropilo, un grupo vinilo, un grupo alquinilo C_{2}, un grupo ciano, un grupo C(O)R^{38}, un grupo CO_{2}R^{38}, un grupo C(O)NR^{38}R^{39}, un grupo CR^{34}R^{35}CN, un grupo CR^{34}R^{35}C(O)R^{38}, un grupo CR^{30}R^{35}CO_{2}R^{38}, un grupo CR^{34}R^{35}C(O)NR^{38}R^{39}, un grupo CHR^{34}OH, un grupo CHR^{34}OC(O)R^{38} o un grupo OCHR^{34}OC(O)NR^{38}R^{39}, o, cuando G es G-2 o G-6, R^{4} y R^{5} pueden formar un grupo C=O junto con el átomo de carbono al que están anclados;
R^{6} es un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{6}, un grupo alcoxialquilo C_{2}-C_{6}, un grupo alquenilo C_{3}-C_{6} o un grupo alquinilo C_{3}-C_{6};
X^{1} es un enlace sencillo, un átomo de oxígeno, un átomo de azufre, un grupo NH, un grupo N(alquilo C_{1}-C_{3}), un grupo N(haloalquilo C_{1}-C_{3}) o un grupo N(alilo);
R^{7} es un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{6}, un átomo de halógeno, un grupo S(O)_{2}(alquilo C_{1}-C_{6}) o un grupo C(=O)R^{40};
R^{8} es un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{8}, un grupo cicloalquilo C_{3}-C_{8}, un grupo alquenilo C_{3}-C_{8}, un grupo alquinilo C_{3}-C_{8}, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{8}, un grupo alcoxialquilo C_{2}-C_{8}, un grupo alcoxialcoxialquilo C_{3}-C_{8}, un grupo alcoxialquinilo C_{3}-C_{8}, un grupo haloalquenilo C_{3}-C_{8}, un grupo alquilsulfonilo C_{1}-C_{8}, un grupo haloalquilsulfonilo C_{1}-C_{8}, un grupo alcoxicarbonilalquilo C_{3}-C_{8}, un grupo S(O)_{2}NH(alquilo C_{1}-C_{8}), un grupo C(O)R^{41} o un grupo bencilo cuyo anillo de fenilo puede estar sustituido con R^{42};
n y m son independientemente 0, 1, 2 o 3 y m + n es 2 o 3;
Z es un grupo CR^{9}R^{10}, un átomo de oxígeno, un átomo de azufre, un grupo S(O), un grupo S(O)2 o un grupo N(alquilo C_{1}-C_{4});
cada R^{9} es independientemente un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{3}, un átomo de halógeno, un grupo hidroxilo, un grupo alcoxi C_{1}-C_{6}, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{6}, un grupo haloalcoxi C_{1}-C_{6}, un grupo alquilcarboniloxi C_{2}-C_{6} o un grupo haloalquilcarboniloxi C_{2}-C_{6};
cada R^{10} es independientemente un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{3}, y un grupo hidroxilo o un átomo de halógeno;
R^{11} y R^{12} son independientemente un átomo de hidrógeno, un átomo de halógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, un grupo alquenilo C_{3}-C_{6} o un grupo haloalquilo C_{1}-C_{6};
R^{13} es un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{6}, un grupo alquenilo C_{3}-C_{6}, un grupo haloalquenilo C_{3}-C_{6}, un grupo alquinilo C_{3}-C_{6}, un grupo haloalquinilo C_{3}-C_{6}, un grupo HC(=O), un grupo (alquilo C_{1}-C_{4})C(=O) o un grupo NH_{2};
R^{14} es un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, un grupo alquil(C_{1}-C_{6})tio, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{6} o un grupo N(CH_{3})_{2};
W es un átomo de nitrógeno o CR^{15};
R^{15} es un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, un átomo de halógeno, o un grupo fenilo opcionalmente sustituido con un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, uno o dos átomos de halógeno, un grupo alcoxi C_{1}-C_{6} o un grupo CF3;
cada Q es independientemente un átomo de oxígeno o un átomo de azufre;
Q^{1} es un átomo de oxígeno o un átomo de azufre;
Z^{1} es un grupo CR^{16}R^{17}, un átomo de oxígeno, un átomo de azufre, un grupo S(O), un grupo S(O)2 o un grupo N(alquilo C_{1}-C_{4});
cada R^{16} es independientemente un átomo de hidrógeno, un átomo de halógeno, un grupo hidroxilo, un grupo alcoxi C_{1}-C_{6}, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{6}, un grupo haloalcoxi C_{1}-C_{6}, un grupo alquilcarboniloxi C_{2}-C_{6} o un grupo haloalquilcarboniloxi C_{2}-C_{6};
cada R^{17} es independientemente un átomo de hidrógeno, un grupo hidroxilo o un átomo de halógeno;
R^{18} es un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, un átomo de halógeno o un grupo haloalquilo C_{1}-C_{6};
R^{19} y R^{20} son independientemente un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, o un grupo haloalquilo C_{1}-C_{6};
Z^{2} es un átomo de oxígeno, un átomo de azufre, un grupo NR^{9} o un grupo CR^{9}R^{10};
R^{21} y R^{22} son independientemente un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{6}, un grupo alquenilo C_{3}-C_{6}, un grupo haloalquenilo C_{3}-C_{6}, un grupo alquinilo C_{3}-C_{6} o un grupo haloalquinilo C_{3}-C_{6};
R^{23} es un átomo de hidrógeno, un átomo de halógeno o un grupo ciano;
R^{24} es un grupo alquil(C_{1}-C_{6})sulfonilo, un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{6}, un grupo alquenilo C_{3}-C_{6}, un grupo alquinilo C_{3}-C_{6}, un grupo alcoxi C_{1}-C_{6}, un grupo haloalcoxi C_{1}-C_{6} o un átomo de halógeno;
R^{25} es un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{6}, un grupo alquenilo C_{3}-C_{6} o un grupo alquinilo C_{3}-C_{6};
R^{26} es un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{6} o un grupo fenilo opcionalmente sustituido con C_{1}-C_{6} alquilo, uno o dos átomos de halógeno, uno o dos grupos nitro, un grupo alcoxi C_{1}-C_{6} o un grupo CF3;
W^{1} es un átomo de nitrógeno o un grupo CH;
T es un grupo representado por una cualquiera de las siguientes fórmulas generales T-1, T-2 y T-3;
5
(donde E^{1}, E^{2}, E^{3}, E^{4}, E^{5}, E^{6}, E^{7}, E^{8}, E^{9}, E^{10}, E^{11} y E^{12} son independientemente un átomo de hidrógeno o un grupo alquilo C_{1}-C_{3});
R^{27} es un grupo alquilo C_{1}-C_{8}, un grupo cicloalquilo C_{3}-C_{8}, un grupo alquenilo C_{3}-C_{8}, un grupo alquinilo C_{3}-C_{8}, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{8}, un grupo alcoxialquilo C_{2}-C_{8}, un grupo alquiltioalquilo C_{2}-C_{8}, un grupo alquilsulfinil-alquilo C_{2}-C_{8}, un grupo alquilsulfonilalquilo C_{2}-C_{8}, un grupo alquilsulfonilo C_{1}-C_{8}, un grupo fenilsulfonilo cuyo anillo de fenilo puede estar sustituido con al menos un sustituyente seleccionado del grupo que consiste en un átomo de halógeno y un grupo alquilo C_{1}-C_{4}, un grupo alcoxialcoxialquilo C_{4}-C_{8}, un grupo cicloalquilalquilo C_{4}-C_{8}, un grupo cicloalcoxialquilo C_{6}-C_{8}, un grupo alqueniloxialquilo C_{4}-C_{8}, un grupo alquiniloxialquilo C_{4}-C_{8}, un grupo haloalcoxialquilo C_{3}-C_{8}, un grupo haloalqueniloxialquilo C_{3}-C_{8}, un grupo haloalquiniloxialquilo C_{3}-C_{8}, un grupo cicloalquiltioalquilo C_{6}-C_{8}, un grupo alqueniltioalquilo C_{4}-C_{8}, un grupo alquiniltioalquilo C_{4}-C_{8}, un grupo alquilo C_{1}-C_{4} cuyo anillo está sustituido con al menos un sustituyente seleccionado del grupo que consiste en un átomo de halógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{3} y un grupo haloalquilo C_{1}-C_{3}, un grupo benciloxi cuyo anillo está sustituido con al menos un sustituyente seleccionado del grupo que consiste en un átomo de halógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{3} y un grupo haloalquilo C_{1}-C_{3}, un grupo trialquilsililalquilo C_{4}-C_{8}, un grupo cianoalquilo C_{3}-C_{8}, un grupo halocicloalquilo C_{3}-C_{8}, un grupo haloalquenilo C_{3}-C_{8}, un grupo alcoxialquenilo C_{5}-C_{8}, un grupo haloalcoxialquenilo C_{5}-C_{8}, un grupo alquiltioalquenilo C_{5}-C_{8}, un grupo alcoxialquinilo C_{3}-C_{8}, un grupo alcoxialquinilo C_{5}-C_{8}, un grupo haloalcoxialquinilo C_{5}-C_{8}, un grupo alquiltioalquinilo C_{5}-C_{8}, un grupo alquilcarbonilo C_{2}-C_{8}, un grupo bencilo cuyo anillo está sustituido con al menos un sustituyente seleccionado del grupo que consiste en un átomo de halógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{3} y un grupo haloalquilo C_{1}-C_{3}, un grupo CHR^{34}COR^{28}, un grupo CHR^{34}COOR^{28}, un grupo CHR^{34}P(O)(OR^{28})_{2}, CHR^{34}P(S)(OR^{28})_{2}, un grupo CHR^{34}C(O)NR^{29}R^{30} o un grupo CHR^{34}C(O)NH_{2};
R^{28} es un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, un grupo alquenilo C_{2}-C_{6}, un grupo alquinilo C_{3}-C_{6} o un grupo tetrahidrofuranilo;
R^{29} y R^{31} son independientemente un átomo de hidrógeno o un grupo alquilo C_{1}-C_{4};
R^{30} y R^{32} son independientemente un grupo alquilo C_{1}-C_{4} o un grupo fenilo cuyo anillo puede estar sustituido con al menos un sustituyente seleccionado del grupo que consiste en un átomo de halógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{3} y un grupo haloalquilo C_{1}-C_{3}; o,
R^{29} y R^{30} pueden formar juntos -(CH_{2})_{5}-, -(CH_{2})_{4}- o -CH_{2}CH_{2}OCH_{2}CH_{2}-, o el anillo formado de este modo puede estar sustituido con al menos un sustituyente seleccionado del grupo que consiste en un grupo alquilo C_{1}-C_{3}, un grupo fenilo y un grupo bencilo; o,
R^{31} y R^{32} pueden formar un grupo cicloalquilo C_{3}-C_{8} junto con el átomo de carbono al que están anclados;
R^{33} es un grupo alquilo C_{1}-C_{4}, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{4} o un grupo alquenilo C_{3}-C_{6};
R^{34} y R^{35} son independientemente un átomo de hidrógeno o un grupo alquilo C_{1}-C_{4};
R^{36} es un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, un grupo alquenilo C_{3}-C_{6} o un grupo alquinilo C_{3}-C_{6};
R^{37} es un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{4} o un átomo de halógeno;
R^{38} es un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, un grupo cicloalquilo C_{3}-C_{6}, un grupo alquenilo C_{3}-C_{6}, un grupo alquinilo C_{3}-C_{6}, un grupo alcoxialquilo C_{2}-C_{6}, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{6}, un grupo fenilo cuyo anillo puede estar sustituido con al menos un sustituyente seleccionado del grupo que consiste en un átomo de halógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{4} y un grupo alcoxi C_{1}-C_{4}, un grupo -CH_{2}CO_{2}(alquilo C_{1}-C_{4}) o un grupo -CH(CH_{3})CO_{2-}(alquilo C_{1}-C_{4});
R^{39} es un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{2} o un grupo C(O)O(alquilo C_{1}-C_{4});
R^{40} es un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, un grupo alcoxi C_{1}-C_{6} o un grupo NH(alquilo C_{1}-C_{6});
R^{41} es un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{6}, un grupo alcoxi C_{1}-C_{6}, un grupo NH(alquilo C_{1}-C_{6}), un grupo fenilo cuyo anillo puede estar sustituido con un sustituyente seleccionado del grupo que consiste en un grupo R^{42}, un grupo bencilo y un grupo dialquilamino C_{2}-C_{8}; y
R^{42} es un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, uno o dos átomos de halógeno, un grupo alcoxi C_{1}-C_{6} o un grupo CF3;
(3)
un compuesto de fórmula (II):
\vskip1.000000\baselineskip
6
\vskip1.000000\baselineskip
\quad
o nipilacrofeno,
donde R^{43} es un grupo alquilo C_{1}-C_{4};
R^{44} es un grupo alquilo C_{1}-C_{4}, un grupo alquil(C_{1}-C_{4})tio, un grupo alcoxi C_{1}-C_{4}, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{4}, un grupo haloalquil(C_{1}-C_{4})tio o un grupo haloalcoxi C_{1}-C_{4};
R^{43} y R^{44} pueden formar juntos -(CH_{2})_{3}- o -(CH_{2})_{4}-;
R^{45} es un átomo de hidrógeno o un átomo de halógeno;
R^{46} es un átomo de hidrógeno o un grupo alquilo C_{1}-C_{4};
R^{47} es un átomo de hidrógeno, un grupo nitro, un grupo ciano, un grupo -COOR^{49}, un grupo -C(=X)NR^{50}R^{51} o un grupo -C(=X^{2})R^{52};
R^{48} es un átomo de hidrógeno, un átomo de halógeno, un grupo ciano, un grupo alquilo C_{1}-C_{4} opcionalmente sustituido con al menos un sustituyente seleccionado del grupo que consiste en un átomo de halógeno y un grupo hidroxilo, un grupo alcoxi C_{1}-C_{4}, un grupo fenilo opcionalmente sustituido con al menos un sustituyente seleccionado del grupo que consiste en un átomo de halógeno, un grupo nitro, un grupo ciano, un grupo alquilo C_{1}-C_{4}, un grupo alcoxi C_{1}-C_{4} y un grupo haloalquilo C_{1}-C_{4}, un grupo pirrolilo, un grupo alquilo C_{2}-C_{8}, un grupo alquenilo C_{3}-C_{8}, un grupo alquinilo C_{3}-C_{8}, un grupo alcoxi C_{3}-C_{8}, un grupo seleccionado del grupo que consiste en un grupo alquilo C_{2}-C_{8}, un grupo alquenilo C_{3}-C_{8}, un grupo alquinilo C_{3}-C_{8} y un grupo alcoxi C_{3}-C_{8} en el que al menos se inserta un átomo de oxígeno, o uno cualquiera de los grupos representados por las siguientes fórmulas:
7
donde R^{49}, R^{50} y R^{52} son, iguales o diferentes, un átomo de hidrógeno o un grupo alquilo C_{1}-C_{4};
R^{50} y R^{51} pueden formar un anillo de 5 o 6 miembros alicíclico saturado junto con un átomo de nitrógeno al que están anclados;
R^{52} es un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{4} o un grupo alquilo C_{1}-C_{4} sustituido con al menos un átomo de halógeno;
R^{53} es un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{4} opcionalmente sustituido con al menos un átomo de halógeno, un grupo alquenilo C_{2}-C_{6} opcionalmente sustituido con al menos un átomo de halógeno, un grupo alquinilo C_{3}-C_{6} opcionalmente sustituido con al menos un átomo de halógeno, un grupo fenilo opcionalmente sustituido con al menos un átomo de halógeno, un grupo cicloalquilo C_{3}-C_{8}, un grupo cianometilo, o un grupo R^{63}CO-;
R^{54} es un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{6} opcionalmente sustituido con al menos un átomo de halógeno, un grupo alquenilo C_{2}-C_{6} opcionalmente sustituido con al menos un átomo de halógeno, un grupo alquinilo C_{3}-C_{6} opcionalmente sustituido con al menos un átomo de halógeno, un grupo fenilo opcionalmente sustituido con átomo de halógeno, un grupo cicloalquilo C_{3}-C_{8}, un grupo cianometilo, un grupo alcoxi(C_{1}-C_{4})alquilo C_{1}-C_{6}, un grupo dialquil(C_{1}-C_{4})aminoalquilo C_{1}-C_{4}, un grupo tetrahidrofurfurilo, un grupo alquinil(C_{3}-C_{6})alquilo C_{1}-C_{4}, bencilo cuyo anillo puede estar sustituido con un sustituyente seleccionado del grupo que consiste en un átomo de halógeno, un grupo nitro, un grupo ciano, un grupo alquilo C_{1}-C_{4}, un grupo alcoxi C_{1}-C_{4} y un grupo haloalquilo C_{1}-C_{4}, un grupo -C(=X^{2})R^{63}, un grupo -(CH_{2})_{a}-(O)_{d}-R^{70}, un grupo -(CH_{2})_{a}-O-(CH_{2})_{b}-R^{70}, un grupo -(CH_{2})_{a}-X^{2}-R^{76};
R^{53} y R^{54} junto con un átomo de nitrógeno al que están anclados pueden formar un anillo de 3, 5 o 6 miembros alicíclico saturado o un anillo de 5 o 6 miembros aromático en el que un átomo de carbono puede ser opcionalmente remplazado por un átomo de oxígeno;
R^{55} es un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{4}, un grupo alquenilo C_{2}-C_{6} o un grupo alquinilo C_{3}-C_{6}, o R^{55} y R^{56} pueden formar juntos -(CH_{2})_{e}-;
R^{56} y R^{57} son independientemente un grupo alquilo C_{1}-C_{4} opcionalmente sustituido con al menos un átomo de halógeno, un grupo alquenilo C_{2}-C_{6} opcionalmente sustituido con al menos un átomo de halógeno, alquinilo C_{3}-C_{6} opcionalmente sustituido con al menos un átomo de halógeno o un grupo fenilo opcionalmente sustituido con al menos un átomo de halógeno, un átomo de hidrógeno, un grupo cicloalquilo C_{3}-C_{6}, un grupo -XR^{60} o un grupo -NR^{61}R^{62};
R^{58} es un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, un grupo alquenilo C_{2}-C_{6}, un grupo alquinilo C_{3}-C_{6}, un grupo alquilcarbonilo C_{1}-C_{4}, un grupo cianoalquilo C_{1}-C_{3}, un grupo alcoxicarbonil(C_{1}-C_{4})alquilo C_{1}-C_{4}, un grupo dialcoxicarbonil(C_{1}-C_{4})alquilo C_{1}-C_{4}, un grupo bencilo, un grupo alcoxil(C_{1}-C_{4})alquinilo C_{1}-C_{4}, un grupo -(CH_{2})_{a}-R^{75}, un grupo -(CH_{2})_{a}-X^{2}-R^{72}, un grupo -(CH_{2})_{a}-X^{2}-(CH_{2})_{b}-R^{72} o un grupo -(CH_{2})_{a}-X^{2}-(CH_{2})_{b}-X^{2}-(CH_{2})_{c}-R^{72};
R^{59} es un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{4}, un grupo alquenilo C_{2}-C_{6}, un grupo alquinilo C_{3}-C_{6}, un grupo cianoalquilo C_{1}-C_{3}, un grupo alquil(C_{1}-C_{4})carbonilalquilo C_{1}-C_{3} o un grupo fenilo;
R^{60} es un grupo alquilo C_{1}-C_{4} opcionalmente sustituido con al menos un átomo de halógeno;
R^{61} y R^{62} son, iguales o diferentes, un átomo de hidrógeno o un grupo alquilo C_{1}-C_{4};
R^{63} es un grupo alquilo C_{1}-C_{4} opcionalmente sustituido con al menos un átomo de halógeno, un grupo alcoxi(C_{1}-C_{4})alquilo C_{1}-C_{4}, un grupo alquil(C_{1}-C_{4})tioalquilo C_{1}-C_{4}, un grupo cicloalquilo C_{3}-C_{6}, un grupo fenilo cuyo anillo puede estar sustituido con un sustituyente seleccionado del grupo que consiste en un átomo de halógeno, un grupo nitro, un grupo ciano, un grupo alquilo C_{1}-C_{4}, un grupo alcoxi C_{1}-C_{4} y un grupo haloalquilo C_{1}-C_{4}, un grupo -NR^{73}R^{74} o un grupo -(CH_{2})_{a}-(O)_{d}-R^{75};
R^{64} es un grupo alcoxicarbonilo C_{1}-C_{4} o un grupo carboxilo;
R^{65} es un grupo clorometilo, un grupo cianometilo, un grupo cicloalquilo C_{3}-C_{6} en el que al menos un átomo de oxígeno puede ser insertado, o un grupo alcoxicarbonil(C_{1}-C_{4})-alquilo C_{1}-C_{4};
R^{66} es un grupo hidroxilo o un grupo -NR^{67}R^{68};
A es un grupo -NR^{67}R^{68} o un grupo -S(O)_{f}-R^{69};
R^{67} y R^{68} son, iguales o diferentes, un átomo de hidrógeno o un grupo alquilo C_{1}-C_{4};
R^{69} es un grupo alquilo C_{1}-C_{4} o un grupo haloalquilo C_{1}-C_{4};
R^{70} es un átomo de hidrógeno, un grupo hidroxilo, un átomo de halógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{4} opcionalmente sustituido con al menos un grupo alcoxi C_{1}-C_{4}, un grupo cicloalquilo C_{3}-C_{6} en el que al menos un átomo de oxígeno puede ser insertado, un grupo cicloalquilo C_{3}-C_{6} opcionalmente sustituido con uno o dos grupos metilo, un grupo furilo, un grupo tienilo o un grupo -C(=O)R^{71};
R^{71} y R^{72} son, iguales o diferentes, un grupo alquilo C_{1}-C_{4} o un grupo alcoxi C_{1}-C_{4};
R^{73} y R^{74} son, iguales o diferentes, un grupo alquilo C_{1}-C_{4} o un grupo fenilo;
R^{75} es cicloalquilo C_{3}-C_{6} en el que al menos un átomo de oxígeno puede ser insertado, un grupo cicloalquilo C_{3}-C_{6} opcionalmente sustituido con uno o dos grupos metilo, un grupo furilo, un grupo tienilo o un grupo -C(=O)R^{71};
R^{76} es un grupo alquilo C_{1}-C_{4};
a, b y c son independientemente 1, 2 o 3;
d es 0 o 1;
e es 2 o 3;
f es 1 o 2; y
X^{2} es un átomo de oxígeno o un átomo de azufre.
27.
Una célula de una planta transgénica obtenible mediante el método de uno cualquiera de los apartados 1 a 26.
28.
Una planta transgénica o un tejido de una planta que comprende la célula de la planta del apartado 27.
29.
La planta transgénica del apartado 28, que es resistente a al menos un compuesto definido en el apartado 25 o 26.
30.
Partes cosechables o material de propagación de una planta del apartado 28 o 29 que comprende la célula de la planta del apartado 27.
31.
El uso de un gen definido en uno cualquiera de los apartados 1 a 22 para producir una planta resistente a al menos uno de los compuestos definidos en el apartado 25 o 26, la célula de la planta del apartado 27 o la planta del apartado 28 o 29.
32.
Un método para proteger una planta que comprende aplicar el compuesto para el control de las malas hierbas a una zona de crecimiento de la planta del apartado 28 o 29.
33.
Un método para seleccionar una planta que comprende aplicar un compuesto para el control de las malas hierbas al cual es resistente la planta del apartado 28 o 29 a una zona de crecimiento de la planta del apartado 28 o 29 y otras plantas, y seleccionar cualquier planta basándose en la diferencia de crecimiento entre las plantas.
34.
Un método para seleccionar una célula de una planta que comprende aplicar un compuesto para el control de las malas hierbas al cual es resistente la célula de la planta del apartado 27 en una zona de crecimiento de la célula de la planta del apartado 27 y otras células de plantas, y seleccionar cualquier célula de la planta basándose en la diferencia de crecimiento entre las células de las plantas.
Descripción detallada de la invención
En el método de la presente invención, las sustancias que están relacionadas con las actividades de control de las malas hierbas de los compuestos para el control de las malas hierbas (en adelante referidas como sustancias para el control de las malas hierbas) son aquellas que constituyen una parte de los sistemas de reacción metabólicos en organismos que son responsables de las actividades de control de las malas hierbas tras la aplicación de los compuestos a las plantas. Los ejemplos de las mismas incluyen los propios compuestos para el control de las malas hierbas, las sustancias endógenas de las plantas, y similares. Específicamente, en cuanto a tales sustancias endógenas en las plantas, por ejemplo, existen sustratos de enzimas diana sobre los cuales actúan los compuestos para el control de las malas hierbas, o precursores o metabolitos de los sustratos que ocasionan la disfunción celular tras la acumulación en las células de la planta; sustancias producidas por las sustancias anteriores en las células de la planta que ocasionan una disfunción celular; y similares. Más específicamente, se ha sabido que, cuando un compuesto que tiene actividad herbicida (en adelante referido como compuesto herbicida) que inhibe la actividad de la protoporfirinógeno IX oxidasa (EC 1.3.3.4, en adelante referido como PPO) se aplica a una planta, el protoporfirinógeno IX que es el sustrato de la PPO se acumula en las células de la planta y es metabolizado para formar la protoporfirina X, seguido de la formación de oxígeno activo en presencia tanto de protoporfirina X como de luz en las células, lo que daña las funciones celulares [Junshi MIYAMOTO ed., Atarashii Noyaku no Kagaku (Chemistry of New Agrochemicals), Capítulo 3, Sección 3.3, pág. 106 (1993), Hirokawa Shoten, Tokyo]. De este modo, el protoporfirinógeno IX, la protoporfirina IX y el oxígeno activo de estos sistemas, y similares pueden ser ejemplificados como estas sustancias.
En el método de la presente invención, los compuestos para el control de las malas hierbas incluyen compuestos que tienen actividades herbicidas, actividades reguladoras del crecimiento de las plantas, y similares.
Los ejemplos de los compuestos herbicidas incluyen compuestos que inhiben la biosíntesis de porfirina, compuestos que inhiben la transferencia de electrones en la fotosíntesis, compuestos que inhiben la biosíntesis de carotenoides, compuestos que inhiben la biosíntesis de aminoácidos, compuestos que inhiben la biosíntesis de lípidos, compuestos que inhiben la biosíntesis de la pared celular, compuestos que influyen en la biosíntesis de proteínas, biosíntesis de ácido nucleico y división celular, compuestos que tienen actividad antagónica de auxinas, y similares. Más específicamente, en cuanto a los compuestos que inhiben la biosíntesis de porfirina, por ejemplo, existen compuestos que inhiben la actividad de PPO (compuesto herbicida de tipo inhibidor de PPO), y similar. En cuanto a los compuestos que inhiben la transferencia de electrones en la fotosíntesis, por ejemplo, existen compuestos que inhiben la transferencia de electrones del sistema fotoquímico I o II, compuestos que inhiben la 4-hidroxifenilpiruvato dioxigenasa (EC 1.13.11.27; en adelante referida como 4-HPPD) que influyen en la biosíntesis de plastoquinona que transfiere electrones, y similares. En cuanto a los compuestos que inhiben la biosíntesis de carotenoides, por ejemplo, existen compuestos que inhiben la fitoeno desaturasa (en adelante referida como PDS), y similares. En cuanto a los compuestos que inhiben la biosíntesis de aminoácidos, por ejemplo, existen compuestos que inhiben la EPSPS, la acetolactato sintasa (EC 4.1.3.18; en delante referida como ALS), la glutamina sintetasa (EC 6.3.1.2; en adelante referida como GS), la dihidropteroato sintasa (EC 2.5.1.15; en adelante referida como DHP), y similares. En cuanto a los compuestos que inhiben la biosíntesis de lípidos, por ejemplo, existen compuestos que inhiben la acetil CoA carboxilasa (EC 6.4.1.2; en adelante referida como ACC), y similares. En cuanto a los compuestos que inhiben la biosíntesis de la pared celular, por ejemplo, existen compuestos que inhiben la biosíntesis de celulosa, y similares. En cuanto a los compuestos que influyen en la biosíntesis de proteínas, la biosíntesis de ácidos nucleicos o la división celular, por ejemplo, existen compuestos que inhiben la formación de microtúbulos, y similares.
Los ejemplos de los compuestos que tienen actividades reguladoras del crecimiento de las plantas incluyen compuestos que tienen actividades antagónicas de las hormonas vegetales que potencian la elongación y diferenciación celular, y similares. Específicamente, por ejemplo, existen 2,4-D, ácido fenoxialcanocarboxílico, derivados de ácido benzoico, derivados de ácido picolínico, y similares.
En cuanto a los compuestos herbicidas de tipo inhibidor de PPO descritos anteriormente, por ejemplo, existen los compuestos descritos por Duke, S.O., Rebeiz, C.A., ACS Symposium Series 559, Porphyric Pesticides, Chemistry, Toxicology, and Pharmaceutical Applications, American Chemical Society, Washington DC (1994), y similares. Específicamente, los ejemplos de los mismos incluyen los siguientes compuestos:
(1)
clormetoxinil, bifenox, clornitrofeno (CNP), acifluorfeno (ácido 5-[2-cloro-4-(trifluorometil)-fenoxi]-2-nitrobenzoico) y su éster etílico, acifluorfen-sodio, oxifluorfeno (2-cloro-1-(3-etoxi-4-nitrofenoxi)-4-trifluorobenzeno), oxadiazon (3-[2,4-dicloro-5-(1-metiletoxi)fenil]-5-(1,1-dimetiletil)-1,3,4-oxidiazol-2-(3H)- ona), 2-[4-cloro-2-fluoro-5-(prop-2-iniloxi)fenil]-2,3,4,5,6,7-hexahidro-1H-isoindol-1,3-diona, clorfalim, (N-(4-clorofenil)-3,4,5,6-tetrahidroftalimida), TNPP-etilo (2-[1-(2,3,4-triclorofenil)-4-nitropirazolil-5-oxi]propionato de etilo), o N3-(1-feniletil)-2,6-dimetil-5-propionilnicotinamida;
(2)
un compuesto representado por la fórmula general: J-G (I), donde G es un grupo representado por una cualquiera de las siguientes fórmulas generales G-1 a G-9 y J es un grupo representado por una cualquiera de las siguientes fórmula generales J-1 a J-30:
8
800
9
10
\quad
donde las líneas discontinuas de las fórmulas J-5, J-6, J-12 y J-24 representan que el anillo de la izquierda contiene solamente enlaces sencillos, o que el enlace del anillo es un doble enlace entre átomos de carbono;
X es un átomo de oxígeno o un átomo de azufre;
Y es un átomo de oxígeno o un átomo de azufre;
R^{1} es un átomo de hidrógeno o un átomo de halógeno;
R^{2} es un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{8}, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{8}, un átomo de halógeno, un grupo OH, un grupo OR^{27}, un grupo SH, un grupo S(O)_{p}R^{27}, un grupo COR^{27}, un grupo CO_{2}R^{27}, un grupo C(O)SR^{27}, un grupo C(O)NR^{29}R^{30}, un grupo CHO,un grupo CR^{27}=NOR^{36}, un grupo CH=CR^{37}CO_{2}R^{27}, un grupo CH_{2}CHR^{37}CO_{2}R^{27}, un grupo CO_{2}N=CR^{31}R^{32}, un grupo nitro, un grupo ciano, un grupo NHSO_{2}R^{33}, un grupo NHSO_{2}NHR^{33}, un grupo NR^{27}R^{38}, un grupo NH_{2} o un grupo fenilo opcionalmente sustituido con uno o más grupos alquilo C_{1}-C_{4} iguales o diferentes;
p es 0, 1 o 2;
R^{3} es un grupo alquilo C_{1}-C_{2}, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{2}, un grupo OCH3, un grupo SCH_{3}, un grupo OCHF_{2}, un átomo de halógeno, un grupo ciano o un grupo nitro;
R^{4} es un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{3}, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{3} o un átomo de halógeno;
R^{5} es un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{3}, un átomo de halógeno, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{3}, grupo ciclopropilo, un grupo vinilo, un grupo alquinilo C_{2}, un grupo ciano, un grupo C(O)R^{38}, un grupo CO_{2}R^{38}, un grupo C(O)NR^{38}R^{39}, un grupo CR^{34}R^{35}CN, un grupo CR^{34}R^{35}C(O)R^{38}, un grupo CR^{34}R^{35}CO_{2}R^{38}, un grupo CR^{34}R^{35}C(O)NR^{38}R^{39}, un grupo CHR^{34}OH, un grupo CHR^{34}OC(O)R^{38} o un grupo OCHR^{34}OC(O)NR^{38}R^{39}, o, cuando G es G-2 o G-6, R^{4} y R^{5} pueden formar un grupo C=O junto con el átomo de carbono al que están anclados;
R^{6} es un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{6}, un grupo alcoxialquilo C_{2}-C_{6}, un grupo alquenilo C_{3}-C_{6} o un grupo alquinilo C_{3}-C_{6};
X^{1} es un enlace sencillo, un átomo de oxígeno, un átomo de azufre, un grupo NH, un grupo N(alquilo C_{1}-C_{3}), un grupo N(haloalquilo C_{1}-C_{3}) o un grupo N(alilo);
R^{7} es un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{6}, un átomo de halógeno, un grupo S(O)_{2}(alquilo C_{1}-C_{6}) o un grupo C(=O)R^{40};
R^{8} es un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{8}, un grupo cicloalquilo C_{3}-C_{8}, un grupo alquenilo C_{3}-C_{8}, un grupo alquinilo C_{3}-C_{8}, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{8}, un grupo alcoxialquilo C_{2}-C_{8}, un grupo alcoxialcoxialquilo C_{3}-C_{8}, un grupo alcoxialquinilo C_{3}-C_{8}, un grupo haloalquenilo C_{3}-C_{8}, un grupo alquilsulfonilo C_{1}-C_{8}, un grupo haloalquilsulfonilo C_{1}-C_{8}, un grupo alcoxicarbonilalquilo C_{3}-C_{8}, un grupo S(O)_{2}NH(alquilo C_{1}-C_{8}), un grupo C(O)R^{41} o un grupo bencilo cuyo anillo de fenilo puede estar sustituido con R^{42};
n y m son independientemente 0, 1, 2 o 3 y m + n es 2 o 3;
Z es un grupo CR^{9}R^{10}, un átomo de oxígeno, un átomo de azufre, un grupo S(O), un grupo S(O)2 o un grupo N(alquilo C_{1}-C_{4});
cada R^{9} es independientemente un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{3}, un átomo de halógeno, un grupo hidroxilo, un grupo alcoxi C_{1}-C_{6}, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{6}, un grupo haloalcoxi C_{1}-C_{6}, un grupo alquilcarboniloxi C_{2}-C_{6} o un grupo haloalquilcarboniloxi C_{2}-C_{6};
cada R^{10} es independientemente un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{3}, un grupo hidroxilo o un átomo de halógeno;
R^{11} y R^{12} son independientemente un átomo de hidrógeno, un átomo de halógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, un grupo alquenilo C_{3}-C_{6} o un grupo haloalquilo C_{1}-C_{6};
R^{13} es un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{6}, un grupo alquenilo C_{3}-C_{6}, un grupo haloalquenilo C_{1}-C_{6}, un grupo alquinilo C_{1}-C_{6}, un grupo haloalquinilo C_{3}-C_{6}, un grupo HC(=O), un grupo (alquilo C_{1}-C_{4})C(=O) o un grupo NH_{2};
R^{14} es un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, un grupo alquil(C_{1}-C_{6})tio, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{6} o un grupo N(CH_{3})_{2}:
W es un átomo de nitrógeno o CR^{15};
R^{15} es un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, un átomo de halógeno, o un grupo fenilo opcionalmente sustituido con un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, uno o dos átomos de halógeno, un grupo alcoxi C_{1}-C_{6} o un grupo CF3;
cada Q es independientemente un átomo de oxígeno o un átomo de azufre;
Q^{1} es un átomo de oxígeno o un átomo de azufre;
Z^{1} es un grupo CR^{16}R^{17}, un átomo de oxígeno, un átomo de azufre, un grupo S(O), un grupo S(O)_{2} o un grupo N(alquilo C_{1}-C_{4});
cada R^{16} es independientemente un átomo de hidrógeno, un átomo de halógeno, un grupo hidroxilo, un grupo alcoxi C_{1}-C_{6}, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{6}, un grupo haloalcoxi C_{1}-C_{6}, un grupo alquilcarboniloxi C_{2}-C_{6} o un grupo haloalquilcarboniloxi C_{2}-C_{6};
cada R^{17} es independientemente un átomo de hidrógeno, un grupo hidroxilo o un átomo de halógeno;
R^{18} es un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, un átomo de halógeno o un grupo haloalquilo C_{1}-C_{6};
R^{19} y R^{20} son independientemente un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, o un grupo haloalquilo C_{1}-C_{6};
Z^{2} es un átomo de oxígeno, un átomo de azufre, un grupo NR9 o un grupo CR^{9}R^{10};
R^{21} y R^{22} son independientemente un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{6}, un grupo alquenilo C_{3}-C_{6}, un grupo haloalquenilo C_{3}-C_{6}, un grupo alquinilo C_{3}-C_{6} o un grupo haloalquinilo C_{3}-C_{6};
R^{23} es un átomo de hidrógeno, un átomo de halógeno o un grupo ciano;
R^{24} es un grupo alquil(C_{1}-C_{6})sulfonilo, un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{6}, un grupo alquenilo C_{3}-C_{6}, un grupo alquinilo C_{3}-C_{6}, un grupo alcoxi C_{1}-C_{6}, un grupo haloalcoxi C_{1}-C_{6} o un átomo de halógeno;
R^{25} es un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{6}, un grupo alquenilo C_{3}-C_{6} o un grupo alquinilo C_{3}-C_{6};
R^{26} es un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{6} o un grupo fenilo opcionalmente sustituido con C_{1}-C_{6} alquilo, uno o dos átomos de halógeno, uno o grupos nitro, un grupo alcoxi C_{1}-C_{6} o un grupo CF_{3};
W^{1} es un átomo de nitrógeno o un grupo CH;
T es un grupo representado por una cualquiera de las siguientes fórmulas generales T-1, T-2 y T-3;
11
(donde E^{1}, E^{2}, E^{3}, E^{4}, E^{5}, E^{6}, E^{7}, E^{8}, E^{9}, E^{10}, E^{11} y E^{12} son independientemente un átomo de hidrógeno o un grupo alquilo C_{1}-C_{3});
R^{21} es un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, un grupo cicloalquilo C_{3}-C_{6}, un grupo alquenilo C_{3}-C_{8}, un grupo alquinilo C_{3}-C_{8}, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{8}, un grupo alcoxialquilo C_{2}-C_{8}, un grupo alquiltioalquilo C_{2}-C_{8}, un grupo alquilsulfinilalquilo C_{2}-C_{8}, un grupo alquilsulfonilalquilo C_{2}-C_{8}, un grupo alquil-sulfonilo C_{1}-C_{8}, un grupo fenilsulfonilo cuyo anillo de fenilo puede estar sustituido con al menos un sustituyente seleccionado del grupo que consiste en un átomo de halógeno y un grupo alquilo C_{1}-C_{4}, un grupo alcoxialcoxialquilo C_{4}-C_{8}, un grupo cicloalquilalquilo C_{4}-C_{8}, un grupo cicloalcoxialquilo C_{6}-C_{8}, un grupo alqueniloxialquilo C_{4}-C_{8}, un grupo alquiniloxialquilo C_{4}-C_{8}, un grupo haloalcoxialquilo C_{3}-C_{8}, un grupo haloalqueniloxialquilo C_{4}-C_{9}, un grupo haloalquiniloxialquilo C_{3}-C_{8}, un grupo cicloalquiltioalquilo C_{6}-C_{8}, un grupo alqueniltioalquilo C_{4}-C_{8}, un grupo alquiniltioalquilo C_{4}-C_{8}, un grupo alquilo C_{1}-C_{4} cuyo anillo está sustituido con al menos un sustituyente seleccionado del grupo que consiste en un átomo de halógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{3} y un grupo haloalquilo C_{1}-C_{3}, un grupo benciloxi cuyo anillo está sustituido con al menos un sustituyente seleccionado del grupo que consiste en un átomo de halógeno, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{3} y un grupo haloalquilo C_{1}-C_{3}, un grupo trialquilsililalquilo C_{1}-C_{8}, un grupo cianoalquilo C_{3}-C_{8}, un grupo halocicloalquilo C_{3}-C_{8}, un grupo haloalquenilo C_{3}-C_{8}, un grupo alcoxialquenilo C_{5}-C_{8}, un grupo haloalcoxialquenilo C_{5}-C_{8}, un grupo alquiltioalquenilo C_{5}-C_{8}, un grupo alcoxialquinilo C_{3}-C_{8}, un grupo alcoxialquinilo C_{5}-C_{8}, un grupo haloalcoxialquinilo C_{5}-C_{8}, un grupo alquiltioalquinilo C_{5}-C_{8}, un grupo alquilcarbonilo C_{2}-C_{3}, un grupo bencilo cuyo anillo está sustituido con al menos un sustituyente seleccionado del grupo que consiste en un átomo de halógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{3} y un grupo haloalquilo C_{1}-C_{3}, un grupo CHR^{34}COR^{28}, un grupo CHR^{34}COOR^{28}, un grupo CHR^{34}P(O)(OR^{28})_{2}, un grupo CHR^{34}P(S)(OR^{28})_{2}, un grupo CHR^{34}C(O)NR^{29}R^{30} o un grupo CHR^{34}C(O)NH_{2};
R^{28} es un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, un grupo alquenilo C_{2}-C_{6}, un grupo alquinilo C_{3}-C_{6} o un grupo tetrahidrofuranilo;
R^{29} y R^{31} son independientemente un átomo de hidrógeno o un grupo alquilo C_{1}-C_{4};
R^{30} y R^{32} son independientemente un grupo alquilo C_{1}-C_{4} o un grupo fenilo cuyo anillo puede estar sustituido con al menos un sustituyente seleccionado del grupo que consiste en un átomo de halógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{3} y un grupo haloalquilo C_{1}-C_{3}; o,
R^{29} y R^{30} pueden formar juntos -(CH_{2})_{5}-, -(CH_{2})_{4}- o -CH_{2}CH_{2}OCH_{2}CH_{2}-, o el anillo formado de este modo puede estar sustituido con al menos un sustituyente seleccionado del grupo que consiste en grupo alquilo C_{1}-C_{3}, un grupo fenilo y un grupo bencilo; o,
R^{31} y R^{32} pueden formar un grupo cicloalquilo C_{3}-C_{8} junto con el átomo de carbono al que están anclados;
R^{33} es un grupo alquilo C_{1}-C_{4}, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{4} o un grupo alquenilo C_{3}-C_{6};
R^{34} y R^{35} son independientemente un átomo de hidrógeno o un grupo alquilo C_{1}-C_{4};
R^{36} es un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, un grupo alquenilo C_{3}-C_{6} o un grupo alquinilo C_{3}-C_{6};
R^{37} es un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{4} o un átomo de halógeno;
R^{38} es un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, un grupo cicloalquilo C_{3}-C_{6}, un grupo alquenilo C_{3}-C_{6}, un grupo alquinilo C_{3}-C_{6}, un grupo alcoxialquilo C_{2}-C_{6}, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{6}, un grupo fenilo cuyo anillo puede estar sustituido con al menos un sustituyente seleccionado del grupo que consiste en un átomo de halógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{4} y un grupo alcoxi C_{1}-C_{4}, un grupo -CH_{2}CO_{2}(alquilo C_{1}-C_{4}) o un grupo -CH(CH_{3})CO_{2}(alquilo C_{1}-C_{4});
R^{39} es un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{2} o un grupo C(O)O(alquilo C_{1}-C_{4});
R^{40} es un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, un grupo alcoxi C_{1}-C_{6} o un grupo NH(alquilo C_{1}-C_{6});
R^{41} es un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{6}, un grupo alcoxi C_{1}-C_{6}, un grupo NH(alquilo C_{1}-C_{6}), un grupo fenilo cuyo anillo puede estar sustituido con un sustituyente seleccionado del grupo que consiste en un grupo R^{42}, un grupo bencilo y un grupo un grupo dialquilamino C_{2}-C_{8}; y
R^{42} es un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, uno o dos átomos de halógeno, un grupo alcoxi C_{1}-C_{6} o un grupo CF_{3};
(3)
un compuesto de fórmula (II):
12
\quad
o nipilacrofeno,
donde R^{43} es un grupo alquilo C_{1}-C_{4};
R^{14} es un grupo alquilo C_{1}-C_{4}, un grupo alquil(C_{1}-C_{4})tio , un grupo alcoxi C_{1}-C_{4}, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{4}, un grupo haloalquil(C_{1}-C_{4})tio o un grupo haloalcoxi C_{1}-C_{4};
R^{43} y R^{44} pueden formar juntos -(CH_{2})]- o -(CH_{2})_{4}-;
R^{45} es un átomo de hidrógeno o un átomo de halógeno;
R^{46} es un átomo de hidrógeno o un grupo alquilo C_{1}-C_{4};
R^{47} es un átomo de hidrógeno, un grupo nitro, un grupo ciano, un grupo -COOR^{49}, un grupo -C(=X)NR^{50}R^{51} o un grupo -C(=X^{2})R^{52};
R^{48} es un átomo de hidrógeno, un átomo de halógeno, un grupo ciano, un grupo alquilo C_{1}-C_{4} opcionalmente sustituido con al menos un sustituyente seleccionado del grupo que consiste en un átomo de halógeno y un grupo hidroxilo, un grupo alcoxi C_{1}-C_{4}, un grupo fenilo opcionalmente sustituido con al menos un sustituyente seleccionado del grupo que consiste en un átomo de halógeno, un grupo nitro, un grupo ciano, un grupo alquilo C_{1}-C_{4}, un grupo alcoxi C_{1}-C_{4} y un grupo haloalquilo C_{1}-c4, un grupo pirrolilo, un grupo alquilo C_{2}-C_{8}, un grupo alquenilo C_{3}-C_{8}, un grupo alquinilo C_{3}-C_{8}, un grupo alcoxi C_{3}-C_{8}, un grupo seleccionado del grupo que consiste en un grupo alquilo C_{2}-C_{8}, un grupo alquenilo C_{3}-C_{8}, un grupo alquinilo C_{3}-C_{8} y un grupo alcoxi C_{3}-C_{8} en el que al menos un átomo de oxígeno es insertado, o uno cualquiera de los grupos representados por las siguientes fórmulas:
13
14
donde R^{49}, R^{50} y R^{52} son, iguales o diferentes, un átomo de hidrógeno o un grupo alquilo C_{1}-C_{4};
\global\parskip0.900000\baselineskip
R^{50} y R^{51} pueden formar un anillo de 5 o 6 miembros alicíclico saturado junto con un átomo de nitrógeno al que están anclados;
R^{52} es un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{4} o un grupo alquilo C_{1}-C_{4} sustituido con al menos un átomo de halógeno;
R^{53} es un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{4} opcionalmente sustituido con al menos un átomo de halógeno, un grupo alquenilo C_{2}-C_{6} opcionalmente sustituido con al menos un átomo de halógeno, un grupo alquinilo C_{3}-C_{6} opcionalmente sustituido con al menos un átomo de halógeno, un grupo fenilo opcionalmente sustituido con al menos un átomo de halógeno, un grupo cicloalquilo C_{3}-C_{8}, un grupo cianometilo, o un grupo R^{63}CO-;
R^{54} es un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{6} opcionalmente sustituido con al menos un átomo de halógeno, un grupo alquenilo C_{2}-C_{6} opcionalmente sustituido con al menos un átomo de halógeno, un grupo alquinilo C_{3}-C_{6} opcionalmente sustituido con al menos un átomo de halógeno, un grupo fenilo opcionalmente sustituido con átomo de halógeno, un grupo cicloalquilo C_{3}-C_{8}, un grupo cianometilo, un grupo alcoxi(C_{1}-C_{4})alquilo C_{1}-C_{5}, un grupo dialquilamino(C_{1}-C_{4})alquilo C_{1}-C_{4}, un grupo tetrahidrofurfurilo, un grupo alquinil(C_{3}-C_{6})-oxi alquilo C_{1}-C_{4}, bencilo cuyo anillo puede estar sustituido un sustituyente seleccionado del grupo que consiste en un átomo de halógeno, un grupo nitro, un grupo ciano, un grupo alquilo C_{1}-C_{4}, un grupo alcoxi C_{1}-C_{4} y un grupo haloalquilo C_{1}-C_{4}, un grupo -C(=X^{2})R^{63}, un grupo -(CH_{2})_{a}-(O)_{d}-R^{70}, un grupo -(CH_{2})_{a}-O-(CH_{2})_{b}-R^{70}, un grupo -(CH_{2})_{a}-X^{2}-R^{76};
R^{53} y R^{54} junto con un átomo de nitrógeno al que están anclados pueden formar un anillo de 3, 5 o 6 miembros alicíclico saturado o un anillo de 5 o 6 miembros aromático en el que un átomo de carbono puede ser opcionalmente remplazado por un átomo de oxígeno;
R^{55} es un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{4}, un grupo alquenilo C_{1}-C_{6} o un grupo alquinilo C_{1}-C_{6}, o R^{55} y R^{56} pueden formar juntos -(CH_{2})_{e}-;
R^{56} y R^{57} son independientemente un grupo alquilo C_{1}-C_{4} opcionalmente sustituido con al menos un átomo de halógeno, un grupo alquenilo C_{2}-C_{6} opcionalmente sustituido con al menos un átomo de halógeno, alquinilo C_{3}-C_{6} opcionalmente sustituido con al menos un átomo de halógeno o un grupo fenilo opcionalmente sustituido con al menos un átomo de halógeno, un átomo de hidrógeno, un grupo cicloalquilo C_{3}-C_{6}, un grupo -XR^{60} o un grupo -NR^{61}R^{62};
R^{58} es un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, un grupo alquenilo C_{2}-C_{6}, un grupo alquinilo C_{3}-C_{6}, un grupo alquilcarbonilo C_{1}-C_{4}, un grupo cianoalquilo C_{1}-C_{3}, un grupo alcoxicarbonil(C_{1}-C_{4})alquilo C_{1}-C_{4}, un grupo dialcoxicarbonil(C_{1}-C_{4})alquilo C_{1}-C_{4}, un grupo bencilo, un grupo alcoxil(C_{1}-C_{4})alquinilo C_{1}-C_{4}, un grupo -(CH_{2})_{a}-R^{75}, un grupo -(CH_{2})_{a}-X^{2}-R^{72}, un grupo -(CH_{2})_{a}-X^{2}-(CH_{2})_{b}-R^{72} o un grupo -(CH_{2})_{a}-X^{2}-(CH_{2})_{b}-X^{2}-(CH_{2})_{c}-R^{72};
R^{59} es un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{4}, un grupo alquenilo C_{2}-C_{6}, un grupo alquinilo C_{3}-C_{6}, un grupo cianoalquilo C_{1}-C_{3}, un grupo alquil(C_{1}-C_{4})carbonilalquilo C_{1}-C_{3} o un grupo fenilo;
R^{60} es un grupo alquilo C_{1}-C_{4} opcionalmente sustituido con al menos un átomo de halógeno;
R^{61} y R^{62} son, iguales o diferentes, un átomo de hidrógeno o un grupo alquilo C_{1}-C_{4};
R^{63} es un grupo alquilo C_{1}-C_{4} opcionalmente sustituido con al menos un átomo de halógeno, un grupo alcoxi(C_{1}-C_{4})alquilo C_{1}-C_{4}, un grupo alquil(C_{1}-C_{4})tioalquilo C_{1}-C_{4}, un grupo cicloalquilo C_{3}-C_{6}, un grupo fenilo cuyo anillo puede estar sustituido con un sustituyente seleccionado del grupo que consiste en un átomo de halógeno, un grupo nitro, un grupo ciano un grupo alquilo C_{1}-C_{4}, un grupo alcoxi C_{1}-C_{4} y un grupo haloalquilo C_{1}-C_{4}, un grupo -NR^{73}R^{74} o un grupo -(CH_{2})_{a}-(O)_{d}-R^{75};
R^{64} es un grupo alcoxicarbonilo C_{1}-C_{4} o un grupo carboxilo;
R^{65} es un grupo clorometilo, un grupo cianometilo, un grupo cicloalquilo C_{3}-C_{6} en el que al menos un átomo de oxígeno puede ser insertado, o un grupo alcoxicarbonil(C_{1}-C_{4})alquilo C_{1}-C_{4};
R^{66} es un grupo hidroxilo o un grupo -NR^{67}R^{68};
A es un grupo -NR^{67}R^{68} o un grupo -S(O)_{f}-R^{69};
R^{67} y R^{69} son, iguales o diferentes, un átomo de hidrógeno o un grupo alquilo C_{1}-C_{4};
R^{69} es un grupo alquilo C_{1}-C_{4} o un grupo haloalquilo C_{1}-C_{4};
R^{70} es un átomo de hidrógeno, un grupo hidroxilo, un átomo de halógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{4} opcionalmente sustituido con al menos un grupo alcoxi C_{1}-C_{4}, un grupo cicloalquilo C_{3}-C_{6} en el que al menos un átomo de oxígeno puede ser insertado, un grupo cicloalquilo C_{3}-C_{6} opcionalmente sustituido con uno o dos grupos metilo, un grupo furilo, un grupo tienilo o un grupo -C(=O)R^{71};
R^{71} y R^{72} son, iguales o diferentes, un grupo alquilo C_{1}-C_{4} o un grupo alcoxi C_{1}-C_{4};
R^{73} y R^{74} son, iguales o diferentes, un grupo alquilo C_{1}-C_{4} o un grupo fenilo;
R^{75} es cicloalquilo C_{3}-C_{6} en el que al menos un átomo de oxígeno puede ser insertado, un grupo cicloalquilo C_{3}-C_{6} opcionalmente sustituido con uno o dos grupos metilo, un grupo furilo, un grupo tienilo o un grupo -C(=O)R^{71};
R^{76} es un grupo alquilo C_{1}-C_{4};
a, b y c es independientemente 1, 2 o 3;
d es 0 o 1;
e es 2 o 3;
f es 1 o 2; y
X^{2} es un átomo de oxígeno o un átomo de azufre.
Además, en cuanto a otros pirazoles N-sustituidos, existen los 2-aril-4,5,6,7-tetrahidro-indazoles sustituidos en la posición 3 descritos por Lyga et al., Pesticide Sci., 42: pág. 29 (1994), y similares.
Como ejemplos específicos de los compuestos que inhiben la transferencia de electrones en el sistema fotoquímico I, por ejemplo, existen paraquat, diquat, y similares. Como ejemplos específicos de los compuestos que inhiben la transferencia de electrones en el sistema fotoquímico II, por ejemplo, existen compuestos de triazina (p. ej., atrazina, etc.), compuestos de urea (p. ej., diuron, etc.), compuestos de nitrilo (p. ej., bromoxinilo e ioxinilo) y similares. Como ejemplos específicos de los compuestos que inhiben la 4-HPPD, por ejemplo, existen isoxazoles (p. ej., isoxaflutol), pirazoles, tricetonas, y similares. Como ejemplos específicos de los compuestos que inhiben la PDS, por ejemplo, existen norflurazon, flurocloridona, fluridona, flurtamona, diflufenican, y similares. Como ejemplos específicos de los compuestos que inhiben la EPSPS, por ejemplo, existen glifosato, y similares. Como ejemplos específicos de los compuestos que inhiben la ALS, por ejemplo, existen sulfonilureas, imidazolinonas, pirimidiniltiobenzoatos, triazolopirimidinas, y similares. Como ejemplos específicos de los compuestos que inhiben la GS, por ejemplo, existen bialafos, glufosinato, y similares. Como ejemplos específicos de los compuestos que inhiben la DHP, por ejemplo, existen asulam, y similares. Como ejemplos específicos de los compuestos que inhiben ACC, por ejemplo, existen ciclohexanedionas, ariloxifenoxipropionatos, y similares. Como ejemplos específicos de los compuestos que inhiben la celulosa, por ejemplo, existen diclobenilo, y similares.
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En las siguientes estructuras químicas se muestran diversos ejemplos de los compuestos para el control de las malas hierbas útiles en la presente invención:
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Los genes utilizados en el método de la presente invención para elaborar plantas resistentes a los compuestos para el control de las malas hierbas son aquellos que codifican proteínas seleccionadas del grupo que consiste en:
magnesio quelatasa de tipo activo o inactivo que tiene afinidad por la protoporfirina IX,
ferroquelatasa de tipo activo o inactivo que tiene afinidad por la protoporfirina IX, cobalto quelatasa de tipo activo o inactivo que tiene afinidad por la protoporfirina IX,
un péptido que tiene afinidad por la protoporfirina IX, compuesto por 6 a 100 aminoácidos, estando dicho péptido esencialmente libre de regiones marco de regiones variables en una inmunoglobulina,
protoporfirinógeno IX oxidasa de tipo inactivo que tiene afinidad por el protoporfirinógeno IX, y
coproporfirinógeno III oxidasa de tipo inactivo o activo que tiene afinidad por el protoporfirinógeno IX;
no teniendo dichas proteínas esencialmente capacidad para modificar el protoporfirinógeno IX.
En el primer aspecto del método de la presente invención, los genes que se van a utilizar son aquellos que codifican proteínas seleccionadas del grupo, donde las proteínas seleccionadas pueden estar caracterizadas por las siguientes características (a) a (c) (en adelante algunas veces referidas como proteínas objetivo):
(a)
tienen una afinidad específica por las sustancias para el control de las malas hierbas;
(b)
no tienen esencialmente capacidad para codificar sustancias para las cuales dicha proteína tiene una afinidad específica; y
(c)
están esencialmente libres de regiones marco de regiones variables de una inmunoglobulina.
El término "afinidad específica" por sustancias para el control de las malas hierbas de la característica (a) anterior significa que una enzima (la proteína objetivo) y un sustrato (la sustancia para el control de las malas hierbas), o una enzima (la proteína objetivo) y un inhibidor o un regulador de la actividad de la enzima (la sustancia para el control de las malas hierbas) se unen entre sí, enzimáticamente; o que la proteína objetivo y la sustancia para el control de las malas hierbas se unen entre sí basándose en la afinidad y la especificidad, tales como las mostradas en un enlace químico al receptor, por ejemplo, un enlace entre un receptor y un ligando, y similares. Las proteínas objetivo pueden ser proteínas de origen natural; variantes de las mismas obtenidas mediante la introducción de sustituciones, adiciones, deleciones, modificaciones y similares de un aminoácido en proteínas de origen natural: y proteínas sintetizadas artificialmente que tienen secuencias de aminoácidos al azar seleccionadas con la orientación de su afinidad por las sustancias para el control de las malas hierbas, con tal que tengan estructuras que se unan específicamente a las sustancias para el control de las malas hierbas.
El término "que no tiene esencialmente capacidad de modificar" en la característica (b) representa que la reactividad enzimática con sustancias para las cuales dicha proteína tiene una afinidad específica es esencialmente inactiva o no existe (excepto la afinidad específica por las sustancias para el control de las malas hierbas de la característica (a)). Los Ejemplos de esto incluyen un caso en el que la proteína objetivo no tiene ninguna capacidad de convertir una sustancia para la cual dicha proteína tiene una afinidad específica tal como una cierta sustancia para el control de las malas hierbas o una sustancia que tiene una parte esencial de la estructura de los sustratos basándose en una afinidad específica para dicha proteína, y similares a una sustancia que tiene una estructura química diferente, de la de la sustancia para la cual dicha proteína tiene una afinidad específica. La proteína "que no tiene esencialmente capacidad para modificar" puede ser identificada, por ejemplo verificando la no recuperación del crecimiento de un microorganismo cuyo gen que codifica dicha proteína es suprimido y de este modo no puede crecer en condiciones normales en el caso en el que el gen que codifica la proteína mencionada es introducido en el microorganismo en un estado tal que el gen introducido es expresado en el microorganismo.
El término "esencialmente libre de las regiones marco de las regiones variables de una inmunoglobulina" en la característica (c) significa que la proteína objetivo no forma una estereoestructura específica para las regiones variables de una inmunoglobulina. El término "regiones marco de las regiones variables de una inmunoglobulina" representa regiones que quedan después de separar las regiones hipervariables de las regiones variables de la cadena H y la cadena L que son las constitutivas de la molécula de inmunoglobulina. En estas regiones, la conservación de las secuencias de aminoácidos es relativamente elevada y estas regiones, funcionan manteniendo la estereoestructura altamente conservada de las regiones variables. Debido a la formación de la estereoestructura anterior, las regiones hipervariables localizadas separadamente en tres sitios sobre la respectiva cadena H y cadena L son recogidas en la estereoestructura para formar un sitio de unión al antígeno [Alberts, B., et al. ed. (1983), Molecular Biology of the Cell, p 979, Garland Publishing, Inc., New York].
La proteína objetivo que tiene la característica (c) anterior puede ser seleccionada basándose, por ejemplo, en las secuencias de aminoácidos de las proteínas. Como ejemplos específicos de la proteína, existe una proteína que no contiene ninguna secuencia de aminoácidos compuesta por aproximadamente 30 aminoácidos o más y que tiene una homología de aproximadamente 60% o más con las secuencias de aminoácidos conocidas de las regiones marco de las regiones variables de una inmunoglobulina, y similares. Por ejemplo, la presencia o ausencia de las regiones marco anteriores puede ser confirmada mediante PCR utilizando un gen que codifica la proteína como molde y los ADN que tienen secuencias de nucleótidos que codifican las regiones variables derivadas de la cadena H o la cadena L de la inmunoglobulina como cebadores de amplificación, por ejemplo, los cebadores VH1BACK y VH1FOR-2, o VK2BACK y VK4FOR descritos por Clackson, T. et al., Nature 352; p 624 (1991), o los cebadores contenidos en un kit disponible en el mercado para clonar genes de anticuerpos recombinantes, por ejemplo, mezcla de cebadores Heavy o mezcla de cebadores Light de Recombinant Phage Antibody System (Pharmacia Biotech) para analizar la presencia o ausencia de la amplificación de ADN que tiene una longitud dada. Los ejemplos de las proteínas de unión que tienen una afinidad específica por sustancias para el control de las malas hierbas también incluyen péptidos que tienen afinidad por las sustancias para el control de las malas hierbas.
Los ejemplos específicos de las proteínas objetivo que tienen las características (a) a (c) anteriores incluyen proteínas de unión de tipo inactivo que tienen afinidad por la protoporfirina IX [p. ej., magnesio quelatasa de tipo inactivo cuyo sustrato es la protoporfirina IX (sustancias para el control de las malas hierbas de tipo ferroquelatasa inactiva (protohemo ferroliasa; EC 4.9.9.1), cobalto quelatasa de tipo inactivo que cataliza una reacción de quelación de un ión cobalto con un compuesto que tiene un anillo de tetrapirrol como sustrato, péptidos que tienen afinidad por la protoporfirina IX, esto es, proteínas compuestas por 6 a 100 aminoácidos (por ejemplo, el péptido HASYS que tiene una afinidad por la protoporfirina IX, p. ej., una proteína que comprende la secuencia de aminoácidos del SEQ ID NO: 53 y una proteína que tiene la secuencia de aminoácidos del SEQ ID NO: 54; el péptido RASSL que tiene afinidad por la protoporfirina IX, p. ej., una proteína que comprende la secuencia de aminoácidos del SEQ ID NO: 55 y una proteína que tiene la secuencia de aminoácidos del SEQ ID NO: 56; el péptido YAGY que tiene afinidad por los compuestos de porfirina, p. ej., una proteína que comprende la secuencia de aminoácidos del SEQ ID NO: 57 y una proteína que tiene la secuencia de aminoácidos del SEQ ID NO: 58; el péptido YAGF que tiene afinidad por compuestos de porfirina, p. ej., una proteína que comprende la secuencia de aminoácidos del SEQ ID NO: 59 y una proteína que tiene la secuencia de aminoácidos del SEQ ID NO: 60; y similares)], proteínas de unión de tipo inactivo que tienen afinidad por el protoporfirinógeno IX (p. ej., PPO de tipo inactivo, coproporfirinógeno III oxidasa de tipo inactivo), y
similares.
Las proteínas de unión de tipo inactivo anteriores incluyen las variantes de las mismas cuyas actividades se han perdido por sustitución, adición, deleción, modificación y similares de aminoácidos de proteínas activas de origen natural en condiciones naturales o artificiales.
La disfunción celular causada por las sustancias para el control de las malas hierbas puede ser evitada mediante la unión de estas proteínas de unión a las sustancias para el control de las malas hierbas en células vegetales para mostrar la resistencia al compuesto para el control de las malas hierbas deseado.
La magnesio quelatasa de tipo inactivo es la proteína de la subunidad de unión a la protoporfirina IX de la magnesio quelatasa, o su variante que tiene una afinidad de unión específica por la protoporfirina IX, y los ejemplos específicos de la misma incluyen la proteína de la subunidad de la cual se ha suprimido la secuencia señal de tránsito a los orgánulos, y similares.
La ferroquelatasa de tipo inactivo es su variante que no tiene capacidad de modificar la protoporfirina IX y que tiene una afinidad específica por la protoporfirina IX, y los ejemplos específicos de la misma incluyen una variante de ferroquelatasa en la cual se ha modificado una región que se presume que es un sitio de unión al ión Fe de la ferroquelatasa, y similares.
La cobalto quelatasa de tipo inactivo es una proteína de la subunidad de unión al sustrato de la cobalto quelatasa, o su variante que no tiene capacidad de modificación de la protoporfirina IX y que tiene afinidad específica por la protoporfirina IX.
La PPO de tipo inactivo es su variante que no tiene capacidad de oxidar el protoporfirinógeno IX y que tiene afinidad específica por el protoporfirinógeno IX, y los ejemplos específicos de la misma incluyen una variante de PPO en la cual ha sido suprimida una región que se supone que es un sitio de unión a FAD de PPO (una región que tiene la secuencia de aminoácidos GXGXXG donde X es cualquier aminoácido, p. ej., una región que comprende los aminoácidos 63º a 68º desde el extremo N de la PPO localizada en el cloroplasto de la oruga (Arabidopsis thaliana) y que tiene la secuencia de aminoácidos GGGISG), y similares. La coproporfirinógeno III oxidasa de tipo inactivo es su variante que no tiene capacidad de oxidar el protoporfirinógeno IX y que tiene afinidad específica por el protoporfirinógeno IX.
Los genes que codifican las proteínas anteriores se pueden obtener, por ejemplo, como sigue.
En cuanto a los genes que codifican la proteína de de la subunidad de unión a protoporfirina IX de la magnesio quelatasa, por ejemplo, se conocen aquellas derivadas de la bacteria fotosintética, Rhodobacter capsulatus (Acceso Genebank M74001), oruga (Acceso Genebank Z68495), cebada (Acceso Genebank U96216), boca de dragón (Antirrhinum majus) (Acceso Genebank U26916), Synechocystis P.C.C. 6803 (Acceso Genebank U29131) y similares. Para aislar semejante gen conocido (se conoce su secuencia de nucleótidos), se puede llevar a cabo una PCR utilizando ADN genómico o ADNc de un organismo que tiene el gen deseado como molde y cebadores producidos basándose en las secuencias de nucleótidos correspondientes aproximadamente a las de los extremos N y C de la proteína codificada por el gen para amplificar el gen deseado. Adicionalmente, se pueden obtener los genes que codifican la proteína de la subunidad de unión a protoporfirina IX de la magnesio quelatasa a partir de organismos fotosintéticos distintos de los anteriores. Por ejemplo, primero, se construye una colección de ADNc obteniendo ARNm del organismo fotosintético deseado, sintetizando ADNc utilizando el ARNm como molde con una transcriptasa inversa, e integrando el ADNc en un vector de fagos tal como ZAPII, etc. o un vector plasmídico tal como pUC, etc. Para amplificar un fragmento de ADNc que contiene al menos una parte del gen que codifica la proteína de la subunidad de unión a protoporfirina IX de la magnesio quelatasa, se puede llevar a cabo la PCR utilizando la colección de ADNc construida antes como molde y cebadores diseñados y sintetizados basándose en las secuencias de nucleótidos bien conservadas entre los genes conocidos tales como los genes descritos anteriormente. El escrutinio de la colección de ADNc se puede llevar a cabo utilizando el fragmento de ADN, obtenido de este modo como sonda para seleccionar clones positivos. El gen de la proteína de la subunidad de unión a protoporfirina IX de la magnesio quelatasa deseado puede ser confirmado mediante la determinación de la secuencia de la secuencia de nucleótidos del clon seleccionado.
Para obtener el gen que codifica una variante de la proteína de la subunidad de unión a protoporfirina IX de la magnesio quelatasa que tiene una afinidad específica por la protoporfirina IX, por ejemplo, se mutageniza el gen que codifica la proteína de la subunidad mediante introducción de una sustitución, adición, deleción, modificación y similares de nucleótidos, seguido de introducción del gen resultante en la cepa BL21(DE3) de Escherichia coli de acuerdo con el método descrito por Gibson, L.C. D. et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 92; pág. 1941 (1995) y similares para obtener transformantes, y cultivar los transformantes en condiciones tales que se produzca una elevada expresión del gen así producido. El gen deseado que codifica una variante de la proteína de la subunidad que tiene una afinidad específica por la protoporfirina IX se puede obtener seleccionando una cepa cuyas células cultivadas se han vuelto rojas y que tienen una absorción de fluorescencia que muestra acumulación de protoporfirina IX (longitud de onda de excitación 405 nm, longitud de onda de emisión 630 nm).
En cuanto a los genes que codifican la ferroquelatasa, por ejemplo, se conocen aquellos derivados de Escherichia coli (Acceso Genebank D90259), Bacillus subtilis (Acceso Genebank M97208), Bradyrhizobium japonicuim (Acceso Genebank M92427), levadura Saccharomyces cerevisiae (Acceso Genebank J05395), ratón (Acceso Genebank J05697), ser humano (Acceso Genebank D00726), cebada (Acceso Genebank D26105), pepino (Acceso Genebank D26106), y similares. Para aislar semejante gen conocido (se conoce su secuencia de nucleótidos), se lleva a cabo una PCR utilizando ADN genómico o ADNc de un organismo que tiene el gen deseado como molde y cebadores producidos basándose en las secuencias de nucleótidos correspondientes a aproximadamente las de los extremos N y C de la proteína codificada por el gen para amplificar el gen deseado. Adicionalmente, para obtener otros genes que codifican la ferroquelatasa, por ejemplo, primero, se construye una colección de ADNc obteniendo ARNm a partir del organismo deseado, sintetizando ADNc mediante la utilización de ARNm como molde con una transcriptasa inversa, e integrando el ADNc en un vector de fagos tal como ZAPII, etc. o un vector plasmídico tal como pUC, etc. La colección de ADNc puede ser introducida en una cepa de Escherichia coli VS200 mutante carente de ferroquelatasa descrita por Miyamoto, K, et al., Plant Physiol., 105; pág. 769 (1994), sometiéndola después a un ensayo de complementación para seleccionar clones que contienen el gen de la ferroquelatasa derivado del organismo deseado. Adicionalmente, para amplificar un fragmento de ADN, se puede llevar a cabo una PCR utilizando la colección de ADNc construida anteriormente como molde y cebadores preparados basándose en las secuencias de nucleótidos bien conservadas entre genes conocidos tales como los genes descritos anteriormente. El escrutinio de la colección de ADNc se puede llevar a cabo utilizando el fragmento de ADN obtenido de ese modo como sonda para seleccionar los clones positivos. El gen de la Ferroquelatasa deseado se puede confirmar mediante determinación de la secuencia de la secuencia de nucleótidos del clon seleccionado.
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Para obtener el gen que codifica una variante de ferroquelatasa que no tiene capacidad para modificar la protoporfirina IX y que tiene una afinidad específica por la protoporfirina IX (por ejemplo, el gen que codifica una variante de la ferroquelatasa en la cual la región que se presupone que es el sitio de unión a Fe de la ferroquelatasa está modificado), se puede llevar a cabo una PCR preparando un cebador de mutagénesis para la introducción de una mutación en la región basándose en la secuencia de nucleótidos que codifica la secuencia de aminoácidos cerca de la región, y utilizando un kit de mutagénesis dirigida al sitio asequible comercialmente (Mutan-Super Express, Takara Shuzo) para obtener el gen que codifica la variante anterior. Específicamente, se inserta un gen de ferroquelatasa de tipo salvaje en el sitio de clonación del vector plasmídico pKF19K y se lleva a cabo la PCR utilizando el ADN plasmídico resultante como molde, el cebador de mutagénesis descrito anteriormente y un cebador de selección para la restauración de la mutación ámbar localizada en el gen de resistencia a la kanamicina de pKF19K. El gen amplificado por PCR se introduce en Escherichia coli MV1184 (cepa sin supresor) y los transformantes se escrutan de acuerdo con la resistencia a kanamicina para aislar la Escherichia coli que tiene el gen de la ferroquelatasa en el que la secuencia de nucleótidos correspondiente a la secuencia de aminoácidos que constituye la región deseada ha sido modificada. El gen aislado puede ser confirmado como el gen que codifica la proteína deseada analizando la secuencia de nucleótidos del ADN plasmídico de la Escherichia coli.
Los genes que codifican los péptidos que tienen afinidad por la protoporfirina IX, esto es, las proteínas compuestas por 6 a 100 aminoácidos pueden ser obtenidos sintetizando una colección peptídica, por ejemplo, de acuerdo con el método de la química combinatoria descrito por Sugimoto, N., Nakano, S., Chem., Lett., pág. 939 (1997) y similares, seleccionando un péptido que tiene afinidad por la sustancia para el control de las malas hierbas, analizando la secuencia de aminoácidos del péptido así seleccionado con un secuenciador peptídico, diseñando un gen que contiene una secuencia de nucleótidos que codifica la secuencia de aminoácidos, y sintetizando la secuencia de nucleótidos con un sintetizador de ADN o similar.
Adicionalmente, se puede seleccionar un clon de fago que presenta un péptido que tiene afinidad por la sustancia para el control de las malas hierbas de una colección de fagos de acuerdo con el método de presentación en fagos. Específicamente, por ejemplo, se construye una colección de fagos que presentan una proteína que tiene una secuencia de aminoácidos al azar sobre la superficie de partículas del fago M13 insertando una secuencia de nucleótidos que codifica la proteína que tiene la secuencia de aminoácidos al azar aguas arriba de la región que codifica la proteína de la envoltura pIII del gen del fago M13. Por otra parte, la sustancia para el control de las malas hierbas marcada con biotina se une a una placa recubierta con avidina o estreptavidina para preparar un soporte recubierto con la sustancia para el control de las malas hierbas. Se puede aislar un fago que presenta la proteína deseada que tiene afinidad por la sustancia para el control de las malas hierbas escrutando la colección de fagos anterior sobre la placa recubierta con la sustancia para el control de las malas hierbas y se puede obtener el gen de la proteína deseada a partir del fago
aislado.
El gen que codifica una proteína que contiene la repetición de la secuencia de aminoácidos representada por el SEQ ID NO: 53, 55, 57 o 59 cuatro veces u ocho veces puede ser producido, por ejemplo, seleccionando una secuencia de nucleótidos en la que la secuencia de nucleótidos que codifica la secuencia de aminoácidos anterior se repite las veces dadas después del codón de iniciación ATG, sintetizando un oligonucleótido que comprende la secuencia de nucleótidos seleccionada y un oligonucleótido que comprende una secuencia de nucleótidos complementaria a la secuencia de nucleótidos seleccionada por medio de un sintetizador de ADN, y sometiéndolos después a hibridación. Adicionalmente, los genes que codifican la secuencia de aminoácidos representada por el SEQ ID NO: 54, 56, 58 o 60 pueden ser producidos seleccionado una secuencia de nucleótidos que codifica la secuencia de aminoácidos, sintetizando un oligonucleótido que comprende la secuencia de nucleótidos seleccionada y otro oligonucleótido que comprende una secuencia de nucleótidos complementaria a la secuencia de nucleótidos seleccionada por medio de un sintetizador de ADN, y sometiéndolos después a hibridación. Con respecto a esto, para seleccionar la secuencia de nucleótidos que codifica la secuencia de aminoácidos dada, por ejemplo, se prefiere seleccionar codones utilizados frecuentemente en genes derivados de plantas.
En cuanto a los genes de PPO, por ejemplo, se conocen aquellos derivados de Escherichia coli (Acceso Genebank X68660), Bacillus subtilis (Acceso Genebank M97208), Haemophilus influenzae (Acceso Genebank L42023), ratón (Acceso Genebank D45185), ser humano (Acceso Genebank D38537), oruga (Acceso Genebank D83139), tabaco (Acceso Genebank Y13465, Y13466) y similares. Para aislar semejante gen conocido (se conoce su secuencia de nucleótidos), se lleva a cabo la PCR utilizando ADN genómico o ADNc de un organismo que tiene el gen deseado como molde y cebadores producidos basándose en secuencias de nucleótidos correspondientes a aquellas cercanas a los extremos N y C de la proteína codificada por el gen para amplificar el gen deseado. Adicionalmente, para obtener otros genes de PPO, por ejemplo, primero, se construye una colección de ADNc a partir de un organismo que tiene el gen deseado de acuerdo con el método descrito anteriormente. La colección de ADNc puede ser introducida en la cepa mutante de Escherichia coli deficiente en PPO VSR800 descrita por Narita, S., et al., Gene, 182; pág. 169 (1996), sometiéndola después a un ensayo de complementación para seleccionar clones que contienen el gen PPO derivado del organismo deseado. Adicionalmente, para amplificar un fragmento de ADN, se puede llevar a cabo una PCR utilizando la colección de ADNc construida anteriormente como molde y cebadores preparados basándose en las secuencias de nucleótidos bien conservadas entre los genes conocidos tales como los genes descritos anteriormente. El escrutinio de la colección de ADNc se puede llevar a cabo utilizando el fragmento de ADN obtenido de este modo como sonda para seleccionar los clones positivos. El gen PPO deseado puede ser confirmado mediante determinación de la secuencia de la secuencia de nucleótidos del clon seleccionado.
Para obtener el gen que codifica una variante de PPO que no tiene capacidad para oxidar el protoporfirinógeno IX y que tiene una afinidad específica por el protoporfirinógeno IX, por ejemplo, se mutageniza el gen PPO introduciendo una sustitución, adición, deleción, modificación, etc. de nucleótidos y el gen modificado resultante se introduce en la Escherichia coli anterior cuyo crecimiento es inhibido de una forma dependiente de la luz mediante tratamiento con un compuesto herbicida de tipo inhibidor de PPO. Un gen que codifica una proteína que tiene capacidad de unión a protoporfirinógeno IX puede ser seleccionado cultivando la Escherichia coli obtenida de este modo en presencia de hemina, ácido aminolevulínico y un compuesto herbicida de tipo inhibidor de PPO para seleccionar un clon que puede crecer incluso en la luz. Se puede seleccionar un gen que codifica una proteína que no tiene capacidad para oxidar el protoporfirinógeno IX expresando el gen modificado seleccionado de este modo en un anfitrión tal como Escherichia coli, etc. para preparar una proteína codificada por el gen, y midiendo su capacidad para oxidar el protoporfirinógeno IX de acuerdo con el método descrito por Jacobs, N.J. y Jacobs, J.M. (1982) Enzyme, 28, 206-219. y similares. Más específicamente, el gen modificado antes se inserta en un vector de expresión para Escherichia coli y se introduce en el mutante deficiente del gen PPO (locus hemG) de Escherichia coli tal como la cepa BT3 de Escherichia coli descrito por Yamamoto, F., et al., Japanese J. Genet., 63; pág. 237 (1988) y similares. La Escherichia coli se cultiva en un medio de cultivo que contiene hemina y ácido aminolevulínico además del inhibidor del crecimiento celular correspondiente al marcador de selección del vector introducido en la Escherichia coli para obtener transformantes. La proteína codificada por el gen modificado puede ser producida a partir del transformante. Adicionalmente, un gen que no complementa la deficiencia en el gen PPO de su célula anfitriona puede ser obtenido cultivando el transformante en un medio de cultivo esencialmente libre de hemina y ácido aminolevulínico para identificar una cepa que no crece. Este último método también puede ser utilizado para la selección del gen que codifica una proteína que no tiene capacidad para oxidar el protoporfirinógeno IX.
Adicionalmente, para obtener el gen que codifica una variante de PPO en la cual la región que se presume que es un sitio de unión de FAD de PPO (la región que tiene la secuencia de aminoácidos GXGXXG, donde X es cualquier aminoácido) está suprimida, primero, se prepara un cebador de mutagénesis para la introducción de la mutación por deleción de la región basándose en la secuencia de nucleótidos que codifica la secuencia de aminoácidos cerca de la región. Después, se lleva a cabo la PCR utilizando el cebador de mutagénesis y un kit de mutagénesis dirigida al sitio disponible en el mercado (Mutan-Super Express, Takara Shuzo) como se ha descrito anteriormente para obtener el gen que codifica la proteína variante anterior en la cual se ha suprimido la región.
Los genes que codifican las proteínas peptídicas tales como los péptidos HASYS y RASSL que tienen afinidad por la protoporfirina IX, y los péptidos YAGA y YAGF que tienen afinidad por los compuestos de porfirina, y similares pueden ser obtenidos sometiendo los oligonucleótidos sintetizados mediante un sintetizador de ADN a hibridación.
Además, los genes que codifican las proteínas peptídicas desconocidas que tienen afinidades por otras sustancias para el control de las malas hierbas pueden ser producidos mediante los siguientes métodos y similares. Por ejemplo, se pueden construir diversas colecciones peptídicas de acuerdo, por ejemplo, con el método de química combinatoria descrito por Sugimoto, N., Nakano, S., Chem., Lett., p 939 (1997), y similares. Los péptidos se seleccionan a partir de las colecciones peptídicas construidas de este modo con las pautas de las afinidades por las sustancias para el control de las malas hierbas, seguido del análisis de las secuencias de aminoácidos de los péptidos con un secuenciador peptídico. De este modo, se pueden sintetizar los genes que codifican los péptidos por medio de un sintetizador de ADN. Alternativamente, se pueden obtener clones de fagos que presentan péptidos que tienen afinidades por las sustancias para el control de las malas hierbas seleccionando colecciones de fagos de acuerdo con el método de presentación en fagos. Específicamente, por ejemplo, se construye una colección de fagos que presentan una proteína que tiene una secuencia de aminoácidos al azar sobre la superficie de partículas del fago M13 insertando una secuencia de nucleótidos que codifica la proteína que tiene la secuencia de aminoácidos al azar aguas arriba de la región que codifica la proteína de la envoltura pIII del gen del fago M13. Por otra parte, la sustancia para el control de las malas hierbas marcada con biotina se une a una placa recubierta con avidina o estreptavidina para preparar un soporte recubierto con la sustancia para el control de las malas hierbas. Se puede aislar un fago que presenta la proteína deseada que tiene afinidad por la sustancia para el control de las malas hierbas escrutando la colección de fagos anterior sobre la placa recubierta con la sustancia para el control de las malas hierbas y se puede obtener el gen de la proteína deseada a partir del fago aislado.
En cuanto a los genes que codifican por ejemplo la coproporfirinógeno III oxidasa, por ejemplo, se conocen aquellos derivados de Escherichia coli (Acceso Genebank X75413), Salmonella typhimurium (Acceso Genebank L19503), levadura Saccharomyces cerevisiae (Acceso Genebank J03873), ratón (Acceso Genebank D1633), ser humano (Acceso Genebank D16333), soja (Acceso Genebank X71083), cebada (Acceso Genebank X82830), tabaco (Acceso Genebank X82831) y similares. Para aislar semejante gen conocido (se conoce su secuencia de nucleótidos), se lleva a cabo la PCR utilizando ADN genómico o ADNc de un organismo que tiene el gen deseado como molde y cebadores producidos basándose en las secuencias de nucleótidos correspondientes a las cercanas a los extremos N y C de la proteína codificada por el gen para amplificar el gen deseado. Adicionalmente, para obtener los genes de la coproporfirinógeno III oxidasa, por ejemplo, primero, se construye una colección de ADNc de un organismo que tiene el gen deseado preparando ARNm del organismo deseado, sintetizando ADNc utilizando el ARNm como molde con una transcriptasa inversa e integrando este en un vector plasmídico tal como pRS313 descrito por Sikorski, R.S., et al., Genetics, 122; pág. 19 (1989), y similares. La colección ADNc puede ser introducida en cepa mutante HEM13 carente de coproporfirinógeno III oxidasa de levadura descrita por Troup, B., et al., Bacteriol., 176; pág. 673 (1994), sometiéndola después a ensayo de complementación para seleccionar clones que contienen coproporfirinógeno III oxidasa derivada del organismo deseado. Adicionalmente, para amplificar un fragmento de ADN, se puede llevar a cabo una PCR utilizando la colección de ADNc construida anteriormente como molde y cebadores preparados basándose en las secuencias de nucleótidos bien conservadas entre los genes conocidos tales como los genes descritos antes. El escrutinio de la colección de ADNc se puede llevar a cabo utilizando el fragmento de ADN obtenido de este modo como sonda para seleccionar los clones positivos. El gen de la coproporfirinógeno III oxidasa deseado se puede confirmar mediante determinación de la secuencia de la secuencia de nucleótidos del clon seleccionado.
Para obtener el gen que codifica una variante de la coporfirinógeno III oxidasa que no tiene capacidad para oxidar el protoporfirinógeno IX y que tiene una afinidad específica por el protoporfirinógeno IX, por ejemplo, se mutageniza el gen de la coproporfirinógeno III oxidasa introduciendo una sustitución, adición, deleción, modificación, etc. de nucleótidos y el gen resultante se introduce en la Escherichia coli anterior cuyo crecimiento es inhibido de una manera dependiente de la luz mediante tratamiento con un compuesto herbicida de tipo inhibidor de PPO. Se puede seleccionar un gen que codifica una proteína que tiene capacidad de unión a protoporfirinógeno IX cultivando la Escherichia coli obtenida de este modo en presencia de hemina, ácido aminolevulínico y un herbicida de tipo inhibidor de PPO para seleccionar un clon que puede crecer incluso en la luz. Se puede seleccionar un gen que codifica una proteína que no tiene capacidad para oxidar el protoporfirinógeno IX expresando el gen modificado de este modo en un anfitrión tal como Escherichia coli, etc. para preparar una proteína codificada por el gen, y medir su capacidad para oxidar el protoporfirinógeno IX de acuerdo con el método descrito por Jacobs, N.J. y Jacobs, J.M. (1982) Enzyme, 28, 206-219 y similares.
Los genes utilizados en el segundo aspecto del método de la presente invención para elaborar plantas resistentes a los compuestos para el control de las malas hierbas son aquellos que codifican las proteínas seleccionadas del grupo que consiste en:
magnesio quelatasa de tipo activo o inactivo que tiene afinidad por la protoporfirina IX,
ferroquelatasa de tipo activo o inactivo que tiene afinidad por la protoporfirina IX,
un péptido que tiene afinidad por la protoporfirina IX, compuesto por 6 a 100 aminoácidos, estando dichos péptidos esencialmente libres de regiones marco de regiones variables de una inmunoglobulina,
protoporfirinógeno IX oxidasa de tipo inactivo que tiene afinidad por el protoporfirinógeno IX, y
coproporfirinógeno III oxidasa de tipo activo o inactivo que tiene afinidad por el protoporfirinógeno IX;
no teniendo esencialmente dichas proteínas capacidad para modificar el protoporfirinógeno IX;
donde las proteínas seleccionadas también pueden estar caracterizadas por las siguientes características (a) a (c):
(a)
tener una afinidad específica por la protoporfirina IX;
(b)
no tener esencialmente capacidad para modificar el protoporfirinógeno IX; y
(c)
estar sustancialmente libre de regiones marco de regiones variables de inmunoglobulinas.
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El término "afinidad específica" por la protoporfirina IX en la característica (a) es esencialmente lo mismo que en el primer aspecto del método de la presente invención y significa que la proteína y la protoporfirina IX se unen entre sí, enzimáticamente o la proteína y la protoporfirina IX se unen entre sí basándose en la afinidad y especificidad como las mostradas en el enlace químico del receptor tal como el enlace entre un receptor y un ligando y similares. Las proteínas pueden ser proteínas de origen natural; variantes de las mismas en las cuales se introduce una sustitución, adición, deleción, modificación y similares de aminoácidos en proteínas de origen natural; y proteínas sintetizadas artificialmente que tienen secuencias de aminoácidos al azar que se seleccionan con las pautas de una afinidad por la protoporfirina IX con tal que tengan estructuras que se unen específicamente a la protoporfirina IX.
El término "que no tiene esencialmente capacidad para modificar" el protoporfirinógeno IX en la característica (b) significa que la reactividad enzimática con el protoporfirinógeno IX de la proteína es esencialmente inactiva o no existe. Por ejemplo, esto significa que la proteína no tiene capacidad para convertir el protoporfirinógeno IX en una sustancia que tiene una estructura química diferente de la del protoporfirinógeno IX.
El término "esencialmente libre de regiones marco de regiones variables de inmunoglobulinas" significa lo mismo que en el primer aspecto anterior del método de la presente invención y la proteína no forma la estereoestructura específica de las regiones variables de la inmunoglobulina como se ha descrito aquí anteriormente.
Como ejemplos específicos de las proteínas que tienen las características (a) a (c) anteriores, existen proteínas de unión de tipo activo o inactivo que tienen afinidad por la protoporfirina IX [p. ej., magnesio quelatasa de tipo activo o inactivo cuyo sustrato es la protoporfirina IX, ferroquelatasa de tipo activo o inactivo, cobalto quelatasa de tipo activo o inactivo que cataliza una reacción de quelación de un ión cobalto con un compuesto que tiene un anillo de tetrapirrol como sustrato, péptidos, esto es, proteínas compuestas por 4 a 100 aminoácidos, que tienen afinidad por la protoporfirina IX (por ejemplo, proteínas que contienen al menos un péptido seleccionado entre el péptido HASYS que tiene afinidad por la protoporfirina IX, p. ej., una proteína que comprende la secuencia de aminoácidos del SEQ ID NO: 53 y una proteína que tiene la secuencia de aminoácidos del SEQ ID NO: 54; el péptido RASSL que tiene afinidad por la protoporfirina IX, esto es, una proteína que comprende la secuencia de aminoácidos del SEQ ID NO: 55 y una proteína que tiene la secuencia de aminoácidos del SEQ ID NO: 56; el péptido YAGY que tiene afinidad por compuestos de porfirina, p. ej., una proteína que comprende la secuencia de aminoácidos del SEQ ID NO: 57 y una proteína que tiene la secuencia de aminoácidos del SEQ ID NO: 58; el péptido YAGF que tiene afinidad por compuestos de porfirina, esto es, una proteína que comprende la secuencia de aminoácidos del SEQ ID NO: 59 y una proteína que tiene la secuencia de aminoácidos del SEQ ID NO: 60; y similares)], y similares.
Los genes que codifican las proteínas anteriores pueden ser obtenidos, por ejemplo, como sigue.
Las magnesio quelatasas de tipo activo están compuestas por tres proteínas subunitarias heterogéneas, esto es, la proteína de la subunidad unión a protoporfirina IX (proteína de la subunidad H), la proteína de la subunidad I y la proteína de la subunidad D, todas ellas esenciales para la actividad catalítica. Tres proteínas de subunidades independientes están codificadas por genes diferentes. Los genes de la proteína de la subunidad de unión a protoporfirina IX pueden ser obtenidos mediante PCR o escrutinio de la colección de ADNc como se ha descrito aquí anterior-
mente.
En cuanto al gen que codifica la proteína de la subunidad I de una magnesio quelatasa, por ejemplo, se conocen aquellas derivadas de la bacteria fotosintética, Rhodobacter sphaeroides (Acceso Genebank AF017642), Rhodobacter capsulatus (Acceso Genebank Z11165), Arabidopsis (Acceso Genebank D49426), cebada (Acceso Genebank U26545), soja (Acceso Genebank D45857), tabaco (Acceso Genebank AF14053), Synechocystis P.C.C.6803 (Acceso Genebank U35144) y similares. Para aislar semejante gen conocido (se conoce su secuencia de nucleótidos), se puede llevar a cabo la PCR utilizando ADN genómico o ADN de un organismo que tiene el gen deseado como molde y cebadores producidos basándose en las secuencias de nucleótidos correspondientes a aquellas cercanas a los extremos N y C de la proteína codificada por el gen deseado. Adicionalmente, los genes que codifican la proteína de la subunidad I de una magnesio quelatasa pueden ser obtenidos a partir de organismos fotosintéticos distintos de los anteriores. Por ejemplo, se construye primero una colección de ADNc obteniendo ARNm de los organismos fotosintéticos deseados, sintetizando el ADNc utilizando el ARNm como molde con una transcriptasa inversa, e integrando el ADNc en un vector de fago tal como ZAPII, etc. o un vector plasmídico tal como pUC, etc. Para amplificar un fragmento de ADN que contiene al menos una parte del gen que codifica la proteína de la subunidad I de una magnesio quelatasa, se puede llevar a cabo una PCR utilizando la colección de ADNc construida anteriormente como molde y cebadores diseñados y sintetizados basándose en las secuencias de nucleótidos bien conservadas entre los genes conocidos tales como los genes descritos anteriormente. El escrutinio de la colección de ADNc se puede llevar a cabo utilizando el fragmento de ADN obtenido de este modo como sonda para seleccionar clones positivos. El gen deseado de la proteína de la subunidad I de una magnesio quelatasa puede ser confirmado mediante la determinación de la secuencia de nucleótidos del clon seleccionado.
En cuanto al gen que codifica la proteína de la subunidad D de una magnesio quelatasa, por ejemplo, se conocen aquellos derivados de la bacteria fotosintética, Rhodobacter sphaeroides (Acceso Genebank AJ001690), Rhodobacter capsulatus (Acceso Genebank Z11165), guisante (Acceso Genebank AFO14399), tabaco (Acceso Genebank Y10022), Synechocystis P.C.C.6803 (Acceso Genebank X96599) y similares. El aislamiento de semejante gen conocido (su secuencia de nucleótidos es conocida) o de genes distintos de los anteriores se puede llevar a cabo de la misma manera que se ha descrito en el del gen que codifica la proteína de la subunidad I de la magnesio quelatasa.
Los genes utilizados en el tercer aspecto, del método de la presente invención para elaborar plantas resistentes a los compuestos para el control de las malas hierbas son aquellos que codifican proteínas seleccionadas del grupo que consiste en:
magnesio quelatasa de tipo activo o inactivo que tiene afinidad por la protoporfirina IX,
ferroquelatasa de tipo activo o inactivo que tiene afinidad por la protoporfirina IX
un péptido que tiene afinidad por la protoporfirina IX, compuesto por 6 a 100 aminoácidos, estando dichos péptidos esencialmente libres de regiones marco de regiones variables de inmunoglobulina,
Protoporfirinógeno IX oxidasa de tipo inactivo que tiene afinidad por el protoporfirinógeno IX, y
coproporfirinógeno III oxidasa de tipo activo o inactivo que tiene afinidad por el protoporfirinógeno IX;
no teniendo esencialmente dichas proteínas capacidad para modificar el protoporfirinógeno IX;
donde las proteínas seleccionadas también pueden estar caracterizadas por las siguientes características (a) a (c):
(a)
tener una afinidad específica por el protoporfirinógeno IX;
(b)
tener la capacidad de modificar el coproporfirinógeno III; y
(c)
estar esencialmente libre de regiones marco de regiones variables de inmunoglobulinas.
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El término "una afinidad específica" por el protoporfirinógeno IX de la característica (a) es esencialmente el mismo que el del primer o segundo aspecto anteriores del método de la presente invención y significa que la proteína y el protoporfirinógeno IX se unen entre sí, enzimáticamente o la proteína y el protoporfirinógeno IX se unen entre sí basándose en la afinidad y la especificidad mostradas en el enlace receptor-compuesto químico tal como un enlace entre un receptor y un ligando y similares. Las proteínas pueden ser proteínas de origen natural; variantes de las mismas en las cuales se introduce una sustitución, adición, deleción, modificación y similares de aminoácidos en las proteínas de origen natural; y proteínas sintetizadas artificialmente que tienen secuencias de aminoácidos al azar que se seleccionan con las pautas de afinidad por el protoporfirinógeno IX con tal que tengan estructuras que se unen específicamente al protoporfirinógeno IX.
El término "que no tiene la capacidad de modificar" el coproporfirinógeno III de la característica (b) significa que la reactividad enzimática con el coproporfirinógeno III de las proteínas está inactiva. Por ejemplo, esto significa que la proteína tiene la capacidad de convertir el coproporfirinógeno III en una sustancia que tiene una estructura química diferente de la del coproporfirinógeno III.
El término "esencialmente libre de regiones marco de regiones variables de inmunoglobulinas" significa lo mismo que en el primer o segundo aspecto anterior del método de la presente invención y la proteína no forma la estereoestructura específica para las regiones variables de la inmunoglobulina como se ha descrito aquí antes.
Como ejemplos específicos de las proteínas que tienen las características (a) a (c) anteriores, se encuentran las proteínas de unión de tipo activo o inactivo que tienen afinidad por el proporfirinógeno IX, por ejemplo, la coproporfirinógeno III oxidasa de tipo activo cuyo sustrato es el proporfirinógeno IX, y similares.
Como referencia, la actividad de una magnesio quelatasa, una ferroquelatasa o una coproporfirinógeno III oxidasa se mide, por ejemplo, utilizando el siguiente método.
(1) Una magnesio quelatasa
Los genes que codifican tres proteínas de subunidades independientes se utilizan para detectar la actividad magnesio quelatasa de acuerdo con el método de Gibson, L.C.D., et al. (Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 92; pág. 1941 (1995)) y similares.
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(2) Una ferroquelatasa
Se puede detectar una actividad ferroquelatasa, por ejemplo, de acuerdo con el método de Porra, R.J. (Anal. Biochem., 68; pág. 289 (1975)) y similares.
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(3) Una coproporfirinógeno III oxidasa
Se puede detectar una actividad coproporfirinógeno III oxidasa, por ejemplo, de acuerdo con el método de Yoshinaga, T., Sano, S., et al. (J. Biol. Chem., 255; pág. 4722 (1980)) y similares.
En el método (incluyendo el primer y el segundo aspecto anteriores) de la presente invención, para introducir el gen que codifica la proteína mencionada en la presente memoria, se puede introducir un gen que codifica una proteína. Adicionalmente, se pueden introducir genes plurales que codifican proteínas diferentes en una célula vegetal. Semejante introducción de genes en células vegetales se puede llevar a cabo mediante técnicas convencionales de ingeniería genética, por ejemplo, infección con Agrobacterium (JP-B 2-58917 y JP-A 60-70070), electroporación en protoplastos (JP-A 60-251887 y JP-A 5-68575), métodos de pistola génica (JP-A 5-508316 y JP-A 63-258525), y similares. Preferiblemente, el gen que se va a introducir en una célula vegetal es integrado en un vector que tiene un gen marcador de selección tal como un gen que puede proporcionar resistencia al inhibidor del crecimiento celular a la célula vegetal.
Para la expresión del gen en la célula vegetal, se puede introducir el gen en el cromosoma de una célula vegetal mediante recombinación homóloga [Fraley, R.T. et al., pro. Natl. Acad. Sci. USA, 80; pág. 4803 (1983)] para seleccionar la célula vegetal que expresa el gen. Alternativamente, se puede introducir el gen en una célula vegetal de forma que esté ligado operablemente a un promotor y a un terminador ambos los cuales pueden funcionar en la célula vegetal.
El término "ligado operablemente" utilizado en la presente memoria significa que el promotor y el terminador anteriores está unidos en un estado tal que el gen introducido es expresado en la célula vegetal bajo el control del promotor y el terminador.
En cuanto al promotor que puede funcionar en una célula vegetal, por ejemplo, existen promotores constitutivos derivados de ADN T tales como el promotor del gen de la nopalina sintasa, el promotor del gen de la octopina sintasa, etc., promotores derivados de virus vegetales tales como los promotores de 19S y 35S derivados del virus del mosaico de la coliflor, etc., promotores inductivos tales como el promotor del gen de la fenilalanina amoníaco-liasa, el promotor del gen de la chalcona sintasa, el promotor del gen de la proteína relacionada con la patogénesis, etc., y similares. El promotor no está limitado a estos promotores y se pueden utilizar otros promotores vegetales.
En cuanto al terminador que puede funcionar en una célula vegetal, por ejemplo, existen terminadores derivados de ADN T tales como el terminador de la nopalina sintasa, etc., terminadores derivados de virus vegetales tales como terminadores derivados de virus del ajo GV1, GV2, etc., y similares. El terminador no está limitado a estos terminadores y se pueden utilizar otros terminadores vegetales.
En cuanto a las células vegetales en las que se introducen los genes, por ejemplo, existen tejidos vegetales, plantas completas, células cultivadas, semillas y similares. Los ejemplos de las especies de plantas en las cuales se introducen los genes incluyen dicotiledóneas tales como tabaco, algodón, colza, remolacha azucarera, oruga, canola, lino, girasol, patata, alfalfa, lechuga, banana, soja, guisante, legumbres, pinos, chopos, manzano, uva, frutos cítricos, nueces, etc.; y monocotiledóneas tales como maíz, arroz, trigo, cebada, ballico, avena, sorgo, caña de azúcar, césped,
etc.
Las células vegetales transformantes que expresan el gen que codifica la proteína de unión mencionada en la presente memoria se pueden obtener cultivando células en las cuales el gen es transferido a un medio de cultivo de selección correspondiente a un marcador de selección unido al locus del gen, por ejemplo, un medio de cultivo que contiene un inhibidor del crecimiento celular, o similar, y aislando un clon capaz de crecer en el medio de cultivo. Alternativamente, las células vegetales transformantes anteriores pueden ser seleccionadas cultivando células vegetales en las que el gen es introducido en un medio de cultivo que contiene el compuesto para el control de las malas hierbas a las que se proporciona resistencia, y aislando clones capaces de crecer en el medio de cultivo. La planta resistente al compuesto para el control de las malas hierbas deseada se puede obtener a partir de células transformantes obtenidas de este modo regenerando la planta completa de acuerdo con un método de cultivo de células vegetales convencional, por ejemplo, el descrito en Plant Gene Manipulation Manual, Method for Producing Transgenic Plants, UCHIMIYA, Kodansha Scientific (1996). De este modo, se pueden obtener plantas transformadas tales como tejidos vegetales, plantas completas, células cultivadas, semillas y similares.
Por ejemplo, se pueden obtener arroz y oruga que expresan el gen que codifica la proteína anterior de acuerdo con el método descrito en Experimental Protocol of Model Plants, Rice y Mouse-Ear Cress Edition, (Supervisores: Koh SHIMAMOTO y Kiyotaka OKADA, Shujun-sha, 1996), Capítulo 4. Adicionalmente, de acuerdo con el método descrito en la solicitud de patente Japonesa 3-291501, se puede obtener soja que expresa el gen que codifica la proteína de unión introduciendo el gen en embrión adventicio de soja con una pistola de partículas. Del mismo modo, de acuerdo con el método descrito por Fromm, M.E., et al., Bio/Technology, 8; pág. 838 (1990), se puede obtener maíz que expresa el gen que codifica la proteína anterior introduciendo el gen en embrión adventicio con una pistola de partículas. Se puede obtener trigo que expresa el gen que codifica la proteína anterior introduciendo el gen un escutelo inmaduro de trigo cultivado en condiciones estériles con una pistola de partículas de acuerdo con un método convencional descrito por TAKUMI et al., Journal of Breeding Society (1995), 44: Extra Vol. 1, pág. 57. Del mismo modo, de acuerdo con un método convencional descrito por HAGIO, et al., Journal of Breeding Society (1995), 44; Extra Vol. 1, pág. 67, se puede obtener cebada que expresa el gen que codifica la proteína anterior introduciendo el gen en escutelo inmaduro de cebada cultivado en condiciones estériles con una pistola de partículas.
Para la confirmación de la resistencia al compuesto para el control de las malas hierbas de la planta que expresa el gen que codifica la proteína anterior, preferiblemente, la planta se reproduce aplicando el compuesto para el control de las malas hierbas al cual se proporciona resistencia para evaluar el grado de reproducción de la planta. Para una confirmación más cuantitativa, por ejemplo, en el caso de la resistencia a un compuesto que tiene actividad herbicida de tipo inhibidor de PPO, preferiblemente, se sumergen porciones de hojas de la planta en soluciones acuosas que contienen el compuesto que tiene actividad herbicida de tipo inhibidor de PPO a diferentes concentraciones, o las soluciones acuosas que contienen el compuesto que tiene actividad herbicida se pulverizan sobre porciones de hojas de la planta, dejando estar después sobre medio de agar con luz a la temperatura ambiente. Después de varios días, se extrae la clorofila de las hojas de la planta de acuerdo con el método descrito por Mackenney, G., J. Biol. Chem., 140; pág. 315 (1941) para determinar el contenido de clorofila.
Puesto que las plantas resistentes al compuesto para el control de las malas hierbas (p. ej., tejidos de plantas, plantas completas, células cultivadas, semillas, etc.) obtenidas mediante el método de la presente invención (incluyendo los aspectos primero a tercero) muestran resistencia a los compuestos para el control de las malas hierbas, incluso en el caso en el que se aplica un compuesto de control de las malas hierbas a una zona de crecimiento (p. ej., una zona de cultivo, una zona de proliferación, etc.), la planta puede crecer. Por lo tanto, cuando se aplica un compuesto para el control de las malas hierbas a una zona de crecimiento de la planta resistente al compuesto para el control de las malas hierbas deseada, la planta deseada puede ser protegida de las plantas sin resistencia respecto a la planta para el control de las malas hierbas. Por ejemplo, se pueden controlar eficazmente las malas hierbas aplicando un compuesto para el control de las malas hierbas sobre una zona de crecimiento de la planta que tiene resistencia al compuesto para el control de las malas hierbas.
Adicionalmente, aplicando un compuesto para el control de las malas hierbas a una zona de crecimiento de la planta resistente al compuesto para el control de las malas hierbas obtenida mediante el método de la presente invención (incluyendo los aspectos primero a tercero) y otras plantas (p. ej., aquellas que no tienen resistencia o tienen una resistencia débil al compuesto para el control de las malas hierbas), se puede seleccionar una de las plantas basándose en la diferencia en el crecimiento entre las plantas. Por ejemplo, aplicando (añadiendo) un compuesto para el control de las malas hierbas a una zona de cultivo (medio de cultivo) de la planta resistente al compuesto para el control de las malas hierbas obtenida mediante el método de la presente invención y otras células vegetales (p. ej., aquellas que no tienen resistencia o tiene una resistencia débil al compuesto para el control de las malas hierbas), se puede seleccionar una de las células vegetales eficazmente basándose en la diferencia en el crecimiento entre las plantas.
Los siguientes Ejemplos ilustran adicionalmente la presente invención con detalle pero no se debe considerar que limitan el alcance de la misma.
Ejemplo 1 Aislamiento del Gen de la Proteína de la Subunidad de Unión a Protoporfirina IX de la Magnesio Quelatasa
Se preparó ADN genómico de la bacteria fotosintética Rhodobacter sphaeroides ATCC17023 utilizando el kit ISOPLANT para la preparación de ADN genómico (fabricado por Nippon Gene). Después, de acuerdo con la descripción de Gibson, L.C.D. et al., Proc. Natl. Acad. Sci. URSA, 92; pág. 1941 (1995), se llevó a cabo la PCR utilizando aproximadamente 1 \mug de dicho ADN genómico como molde, y 10 pmoles de un oligonucleótido compuesto por la secuencia de nucleótidos representada por el SEQ ID NO: 1 y 10 pmoles de un oligonucleótido compuesto por la secuencia de nucleótidos representada por el SEQ ID NO: 2 como cebadores para amplificar el fragmento de ADN que contenía el gen de la proteína de la subunidad de unión a protoporfirina IX bchH de la magnesio quelatasa. Los oligonucleótidos se prepararon con un sintetizador de ADN (PE Applied Biosystems; sintetizador de ADN/ARN Modelo 394) y se purificaron con un cartucho para la purificación de oligonucleótidos (PE Applied Biosystems; cartucho OPC). La PCR se llevó a cabo manteniendo a 94ºC durante 2 minutos, a 96ºC durante 40 segundos y después a 68ºC durante 7 minutos, repitiendo un ciclo de mantenimiento a 96ºC durante 40 segundos y después a 68ºC durante 7 minutos 28 veces, y manteniendo finalmente a 96ºC durante 40 segundos, a 68ºC durante 7 minutos y después a 72ºC durante 10 minutos.
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Ejemplo 2 Expresión del Gen de la Proteína de la Subunidad de Unión a Protoporfirina IX de la Magnesio quelatasa en Escherichia coli (en adelante abreviada como E. coli)
De acuerdo con la descripción de Gibson, L.C.D. et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 92; pág. 1941 (1995), se digirió el fragmento de ADN que contenía el gen bchH preparado en el Ejemplo 1 con las enzimas de restricción NdeI y BglII. El fragmento de ADN resultante se insertó entre el sitio de restricción NdeI y el sitio de restricción BamHI del vector de expresión pET11a (fabricado por Stratagene) para obtener el plásmido pETBCH (Fig. 1). Este plásmido pETBCH se introdujo en células competentes de la cepa BL21(DE3) de E. coli (fabricado por Stratagene) de acuerdo con el manual adjunto a las células competentes para obtener la cepa BL21(DE3)/pETBCH de E. coli. La cepa se inoculó en 1,5 ml de medio de cultivo líquido LB (triptona al 1%, extracto de levadura al 0,5%, NaCl al 0,5%) que contenía 100 \mug/ml de ampicilina en un tubo (14 x 10 mm), y el tubo se cubrió con papel de aluminio (referido en adelante como condiciones de oscuridad), se cultivó con sacudimiento a 37ºC a la luz de una lámpara fluorescente (aproximadamente 8000 lux). Cuando la absorbancia a 600 nm del medio de cultivo líquido llegó a 0,6, se añadió isopropil-\beta-D-tiogalactopiranósido (IPTG) al medio de cultivo líquido de manera que la concentración final fuera de 0,4 mM, y el cultivo continuó durante aproximadamente 20 horas más. En ese momento, la Escherichia coli viró a color rojo y se observó absorbancia fluorescente (longitud de onda de excitación 405 nm, longitud de onda de emisión 630 nm) que demostró la acumulación de protoporfirina IX en E. coli. Cuando se cultivó la cepa BL21(DE3)/pETBCH de E. coli de la misma manera excepto que no se añadió IPTG, la E. coli no viró a color rojo y no se detectó la absorbancia fluorescente anterior. En contraste con esto, cuando se cultivó la cepa BL21(DE3)/pETHCH de E. coli de la misma manera (con IPTG) excepto que el tubo no estaba cubierto con papel de aluminio (referido en adelante como condiciones de luz), E. coli creció y viró a color rojo como antes.
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Ejemplo 3 Expresión del Gen PPO Derivado de Soja en el E. coli Carente del Gen hemG
Se sembró soja (Glycine max var. Williams 82) y se cultivó a 25ºC durante 20 días y se recogieron hojas verdes. Las hojas verdes recogidas se congelaron con nitrógeno líquido y las hojas congeladas se trituraron con una mano y un mortero. De las hojas trituradas, se extrajo el ARN utilizando el reactivo para la extracción de ARN ISOGEN (fabricado por Nippon Gene) de acuerdo con el manual adjunto. El extracto líquido con ARN resultante se sometió a precipitación con etanol para recoger el ARN total, después el ARN total se fraccionó utilizando el kit de fraccionamiento de ADN poli (A) BIOMAG mRNA Purification Kit (fabricado por Perceptive Bio System) de acuerdo con el manual adjunto para recoger la fracción de ARN poli(A). Utilizando 1 \mug de esta fracción de ARN poli(A) como molde, se sintetizó ADNc con el reactivo sintético de ADNc contenido en el kit de amplificación de ADNc Marathon (fabricado por Clontech) de acuerdo con el manual adjunto. La PCR se llevó a cabo utilizando el ADNc resultante como molde, y el oligonucleótido compuesto por la secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO: 3 y el oligonucleótido compuesto por la secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO: 4 como cebadores para amplificar el fragmento de ADN que contiene el gen de la protoporfirinógeno IX oxidasa de tipo cloroplasto. Los oligonucleótidos anteriores se prepararon con un sintetizador de ADN (PE Applied Biosystems; sintetizador de ADN/ARN Modelo 394) y se purificaron con un cartucho de purificación de oligonucleótidos (PE Applied Biosystems; cartucho OPC). La PCR se llevó a cabo manteniendo a 94ºC durante 1 minuto y después a 65ºC durante 5 minutos, repitiendo un ciclo de mantenimiento a 94ºC durante 15 segundos y después a 65ºC durante 5 minutos 29 veces. Después de la PCR, el fragmento de ADN amplificado se purificó filtrando la mezcla de reacción con MicroSpin S-400HR (fabricado por Pharmacia Biotech), y el fragmento de ADN se ligó al plásmido pCR2.1 (fabricado por Invitrogen) escindido por la enzima de restricción SalI para obtener el plásmido pSPPO-P. Después, se introdujo el plásmido en células competentes de la cepa INV\alphaF' de E. coli (fabricada por Invitrogen) y se seleccionaron las cepas resistentes a ampicilina. Después, el plásmido contenido en las cepas resistentes a ampicilina seleccionadas se secuenciaron utilizando el kit de Secuenciación Dye Terminator Cycle Sequencing (fabricado por PE Applied Biosystems) y el secuenciador de ADN 3735 (fabricado por PE applied Biosystems). Como resultado, se revelo la secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO: 5, confirmando de ese modo que el plásmido pSPPO-P contenía el gen de la protoporfirinógeno IX oxidasa de tipo cloroplasto de
soja.
Se digirió el plásmido pSPPO-P con la enzima de restricción PshBI, se volvieron romos los extremos del fragmento de ADN resultante utilizando ADN polimerasa de T4 y adicionalmente se digirieron con SphI para aislar el fragmento de ADN que contenía el gen de PPO de tipo cloroplasto de la soja y el promotor lac. Después, se digirió el plásmido pACYC_{1}84 (fabricado por Nippon Gene) con las enzimas de restricción NruI y SphI para separar el fragmento de 410 pb y se insertó el fragmento de ADN anterior en su lugar para obtener el plásmido pACYCSP (Fig. 2). Después, se introdujo el plásmido pACYCSP en la cepa BT3 de E. coli carente del gen PPO (locus del gen hemG) (descrito por Yamamoto, F. et al., Japanese J. Genet., 63; pág. 237 (1988) etc.) de acuerdo con el método descrito por Hanahan, D.J., Mol. Biol., 166; pág. 557 (1983). La E. coli resultante se cultivó en medio YPT (5 g/litro de extracto de levadura, 5 g/litro de triptona, 5 g/litro de peptona, 10 g/litro de NaCl, pH 7,0) que contenía 15 \mug/ml de cloramfenicol y 10 \mug/ml de kanamicina para seleccionar la cepa BT3/pACYCSP de E. coli resistente a cloramfenicol y kanamicina cuya carencia de gen hemG fue complementada por el gen derivado de la soja.
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Ejemplo 4 Ensayo de la Proteína de la Subunidad de Unión a Protoporfirina IX de la Magnesio quelatasa en busca de la Capacidad para proporcionar Resistencia a Compuestos para el Control de las Malas Hierbas
Se inoculó la cepa BT3/pACYCSP de E. coli preparada en el Ejemplo 3 en medio YPT que contenía 10 o 1 ppm de compuesto herbicida de tipo inhibidor de PPO representado por la Estructura 8 anterior, 10 \mug/ml de hemina, 50 \mug/ml de ácido aminolevulínico, 15 \mug/ml de cloramfenicol y 10 \mug/ml de kanamicina, se cultivó en condiciones de oscuridad o en condiciones de luz de la misma manera que en el Ejemplo 2. Como control, se cultivó la cepa BT3/pACYCSP de E. coli en el mismo medio que antes sin los compuestos herbicidas en las mismas condiciones. Luego, a las 18 horas del inicio del cultivo, se midió la absorbancia del medio de cultivo líquido a 600 nm. Tomando la absorbancia del medio sin el compuesto herbicida como 1, se calculó el valor relativo de la absorbancia del medio que contenía el compuesto herbicida. Los resultados se muestran en la Tabla 1.
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TABLA 1
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Se construyó el plásmido pTVBCH (Fig. 3) mediante amplificación del fragmento de ADN que contenía el gen bchH derivado de la bacteria fotosintética Rhodobacter sphaeroides utilizando un oligonucleótido compuesto por la secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO: 1 y el oligonucleótido compuesto por la secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO: 2 de la misma manera que en el Ejemplo 1, digestión del fragmento de ADN resultante con las enzimas de restricción NcoI y BgIII e introducción del fragmento de ADN digerido entre el sitio de restricción NcoI y el sitio de restricción BamHI del plásmido pTV118N (fabricado por Takara Shuzo Co., Ltd.).
Se introdujeron los plásmidos pTVBCH y pTV118N respectivamente en la cepa BT3/pACYCSP de E. coli preparada en el Ejemplo 3 de acuerdo con el método descrito por Hanahan, D.J., Mol. Biol., 166; pág. 557 (1983). La E. coli resultante se cultivó en medio YPT que contenía 100 \mug/ml de ampicilina, 15 \mug/ml de cloramfenicol y 10 \mug/ml de kanamicina para obtener la cepa BT3/pACYCSP+pTVBCH de E. coli que portaba los plásmidos pACYCSP y pTVBCH, y la cepa BT3/pACYCSP+pTV118N de E. coli que portaba los plásmidos pACYCSP y pTV118N.
Estas cepas se inocularon en medio YPT que contenía 10 o 1 ppm del compuesto herbicida de tipo inhibidor de PPO representado por la Estructura 8 anterior, 100 \mug/ml de ampicilina, 15 \mug/ml de cloramfenicol, 10 \mug/ml de kanamicina, 10 \mug/ml de hemina y 50 \mug/ml ácido aminolevulínico, se cultivaron en condiciones de oscuridad o condiciones de luz de la misma manera que en el Ejemplo 2. Después, a las 18 del inicio del cultivo, se midió la absorbancia del medio de cultivo líquido a 600 nm. Tomando la absorbancia del medio sin el compuesto herbicida como 1, se calculó el valor relativo de la absorbancia del medio que contenía el compuesto herbicida. Los resultados se muestran en la Tabla 2.
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TABLA 2
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Adicionalmente, estas cepas se inocularon en medio YPT que contenía compuestos herbicidas de tipo inhibidor de PPO representados por las Estructuras 1, 14, 15, 18-22, 29, 32, 33, 34 y 36, anteriores, respectivamente, 100 \mug/ml de ampicilina, 15 \mug/ml de cloramfenicol, 10 \mug/ml de kanamicina, de 10 \mug/ml hemina y de 50 \mug/ml ácido aminolevulínico, se cultivaron en condiciones de oscuridad o en condiciones de luz similares a las del Ejemplo 2. Después, a las 18 horas del inicio del cultivo, se midió la absorbancia del medio de cultivo líquido a 600 nm. Tomando la absorbancia del medio sin compuesto herbicida como 1, se calculó el valor relativo de la absorbancia del medio que contenía el compuesto herbicida. Los resultados se muestran en la Tabla 3.
TABLA 3
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Ejemplo 5 Introducción del Gen que Codifica la Proteína de la Subunidad de Unión a la Protoporfirina IX de la Magnesio quelatasa en Tabaco
Se construyó un plásmido para introducir el gen bchH en una planta mediante el método de infección con Agrobacterium. Primero, se digirió el vector binario pBI121 (fabricado por Clontech) con la enzima de restricción SacI, y se insertó el conector Kpn I (fabricado por Takara Shuzo Co., Ltd.) para preparar el plásmido pBIK en el que se separó el sitio de reconocimiento SacI de pBI121 y se añadió el sitio de reconocimiento de Kpn I. Por otra parte, de la misma manera que en el Ejemplo 1, se llevó a cabo la PCR utilizando el ADN genómico de la bacteria fotosintética Rhodobacter sphaeroides como molde, y el cebador oligonucleotídico compuesto por la secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO: 7 y el cebador oligonucleotídico compuesto por la secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO: 8 para amplificar el fragmento de ADN que contenía el gen bchH. Después, se digirió el plásmido pBIK anterior con las enzimas de restricción XbaI y KpnI para separar el gen de la \beta-glucuronidasa, y en lugar de ello, se insertó un fragmento de ADN que se obtuvo digiriendo el fragmento de ADN anterior que contenía el gen bchH con las enzimas de restricción XbaI y KpnI para producir el plásmido pBIBCH (Fig. 4) en el que se unía el gen bchH aguas abajo del promotor de 35S. El vector binario pBI121 (fabricado por Clontech) también se digirió con las enzimas de restricción BamHI y SacI para separar el gen de la \beta-glucuronidasa, se volvieron romos los extremos del fragmento de ADN resultante utilizando ADN polimerasa de T4, seguido de auto-ciclación con ADN ligasa de T4 para construir el plásmido pNO (Fig. 5). Se utilizó el plásmido como vector control del plásmido de expresión de bchH pBIBCH.
Se introdujeron el plásmido pBIBCH y pNO en Agrobacterium tumefaciens LBA4404, respectivamente. Las cepas de Agrobacterium que portaban pBIBCH y que portaban pNO se aislaron cultivando los transformantes resultantes en un medio que contenía 300 \mug/ml de estreptomicina, 100 \mug/ml de rifampicina y 25 \mug/ml de kanamicina y seleccionando los transformantes deseados.
Después, de acuerdo con el método descrito en el Manual para la Manipulación Génica de Plantas (de Hirofumi UCHIMIYA, Kodan-sha Scientific, 1992), se introdujo el gen en tabaco. Se cultivó la cepa de Agrobacterium que portaba el plásmido pBIBCH a 28ºC durante la noche en medio LB y luego se sumergieron trozos de hoja de tabaco cultivado en condiciones estériles en el medio de cultivo líquido. Los trozos de hoja se cultivaron a la temperatura ambiente durante 2 días en medio Murashige-Skoog (medio MS, descrito por Murasige T. y Skoog F., Physiol. Plant. (1962) 15, pág. 473) que contenía agar al 0,8%, 0,1 mg/litro de ácido naftalenoacético y 1,0 mg/litro de bencilaminopurina. Después, se lavaron trozos de hoja con agua esterilizada y se cultivaron durante 7 días en medio MS que contenía agar al 0,8%, 0,1 mg/litro de ácido naftalenoacético, 1,0 mg/litro de bencilaminopurina y 500 \mug/ml de cefotaxima. Se transplantaron los trozos de hoja a medio MS que contenía agar al 0,8%, 0,1 mg/litro de ácido naftalenoacético, 1,0 mg/litro de bencilaminopurina, 500 \mug/ml de cefotaxima y 100 \mug/ml de kanamicina (referido en adelante como medio MS selectivo) y se cultivaron sobre medio continuamente durante 4 meses transplantando los trozos de hoja de tabaco sobre medio MS selectivo reciente cada mes. Durante el cultivo, aparecieron brotes diferenciados de tallo y hoja a partir de los trozos de hoja de tabaco; estos brotes se transplantaron a medio MS que contenía agar al 0,8%, 300 \mug/ml de cefotaxima y 50 \mug/ml de kanamicina para inducir raíces para obtener plantas regeneradas. La planta regenerada resultante se transplantó y se cultivó sobre medio MS con agar al 0,8% y 50 \mug/ml de kanamicina para obtener plantas de tabaco en las cuales se introdujo el gen bchH. De un modo similar, se infectaron trozos de hojas de tabaco con una cepa de Agrobacterium que portaba pNO para obtener plantas regeneradas a partir de los trozos de hoja de tabaco y plantas de tabaco (referidas en adelante como tabaco recombinante de control).
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Ejemplo 6 Ensayo de Tabaco que Porta un Gen Introducido que Codifica la Proteína de la Subunidad de Unión a Protoporfirina IX de la Magnesio quelatasa en busca de Resistencia a Compuestos Herbicidas
Se recogieron las hojas de tabaco en las cuales se había introducido el gen bchH y las hojas de tabaco recombinante de control obtenidas en el Ejemplo 5 y cada hoja se dividió en trozos equivalentes derecho e izquierdo a lo largo del nervio principal, respectivamente. A un trozo se le aplicó una solución acuosa que contenía 0,3 ppm de compuesto herbicida de tipo inhibidor de PPO de Estructura 8, mientras, al otro trozo no se le aplicó el compuesto. Estos trozos de hoja se colocaron en medio MS que contenía agar al 0,8% y se dejaron estar a la temperatura ambiente durante 7 días en un lugar con luz. Después, se trituró cada trozo de hoja con una mano y un mortero en 5 ml de solución acuosa de acetona al 80% para extraer la clorofila. El líquido del extracto se diluyó con solución acuosa de acetona al 80% y se midió la absorbancia a 750 nm, 663 nm y 645 nm para calcular el contenido total de clorofila de acuerdo con el método descrito por Macknney G., J. Biol. Chem. (1941) 140, pág. 315. Los resultados obtenidos de 4 clones de tabaco en los que se introdujo el gen bchH (BCH1 a 4) y del tabaco recombinante de control se muestran en la Tabla 4. En la tabla, se representó el nivel de resistencia al compuesto herbicida por medio de porcentajes del contenido total de clorofila de los trozos de hoja tratados con compuesto herbicida con respecto a los de los trozos de hoja no tratados.
TABLA 4
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El clon de tabaco en el que se había introducido el gen bchH y el tabaco recombinante de control también se trataron de la misma manera con la solución que contenía el compuesto herbicida de tipo inhibidor de PPO representado por la Estructura 3, 7, 10, 11, 13, 17, 23, 24, 25, 27, 28, 30 o 35 anterior, y se midió el nivel de resistencia a cada compuesto herbicida. Los resultados se muestran en la Tabla 5. En la tabla, los niveles de resistencia al compuesto herbicida se representaron como porcentajes del contenido de clorofila total de los trozos de hoja tratados con el compuesto herbicida con respecto al de los trozos de hoja no tratados.
TABLA 5
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Ejemplo 7 Aislamiento del Gen que Codifica la Proteína Variante de la Proteína de la Subunidad de Unión a Protoporfirina IX de la Magnesio quelatasa de tabaco
Los ARN totales se prepararon a partir de tejido de hoja de tabaco (Nicotiana tabacum cv. SR1) utilizando el kit RNeasy Plant (fabricado por QIAGEN) de acuerdo con el manual adjunto. El fragmento de ADN que contenía el gen que codifica la proteína de la subunidad de unión a protoporfirina IX de la magnesio quelatasa de tabaco cuya señal de tránsito a cloroplastos ha sido suprimida (referida en adelante como subunidad de la quelatasa de tabaco variante) se obtuvo utilizando el Kit RNA LA PCR (AMV) Ver 1.1 (fabricado por Takara Shuzo Co., Ltd.) de acuerdo con el manual adjunto. Primero, se sintetizó la 1ª hebra de ADN utilizando los ARN totales de tabaco como moldes y el Oligo dT-Adaptor Primer contenido en el kit anterior como cebador con la transcriptasa inversa contenida en el kit anterior. Después, se llevó a cabo la PCR utilizando la 1ª hebra de ADNc como molde y LA Taq polimerasa contenida en el kit anterior para amplificar el fragmento de ADN que contenía el gen que codificaba la proteína de la subunidad de la quelatasa de tabaco variante. En esta PCR, se utilizaron el cebador oligonucleotídico compuesto por la secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO: 9 y el cebador oligonucleotídico compuesto por la secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO: 10. Estos oligonucleótidos se sintetizaron utilizando un sintetizador de ADN (PE Applied Biosystems; Sintetizador de ADN/ARN Modelo 394) y se purificaron con el cartucho de purificación de oligonucleótidos (PE Applied Biosystems; cartucho OPC). La PCR se llevó a cabo manteniendo a 94ºC durante 2 minutos y repitiendo después un ciclo de mantenimiento a 94ºC durante 30 segundos, a 50ºC durante 30 segundos y después a 72ºC durante 7 minutos 30 veces. Después de la PCR, el fragmento de ADN amplificado mediante la PCR se clonó en el plásmido pCR2.1 utilizando el Kit TA Cloning (fabricado por Invitrogen) de acuerdo con el manual adjunto. El plásmido resultante se digirió con la enzima de restricción KpnI y se analizó mediante electroforesis en gel de agarosa. El plásmido a partir del cual se detectó el fragmento de ADN de 8,0 kb tenía el nombre pTCHLH. El plásmido tenía una estructura en la que el gen que codifica la subunidad de la quelatasa de tabaco variante había sido insertado en la dirección expresable bajo el control del promotor lac. El plásmido pTCHLH se digirió con la enzima de restricción KpnI seguido de auto-ligación para obtener el plásmido pTCHLH1 (Fig. 6) en el que el fragmento de ADN compuesto por aproximadamente 60 nucleótidos había sido suprimido del plásmido pTCHLH.
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Ejemplo 8 Ensayo de la Proteína de la Subunidad de la Magnesio quelatasa de tabaco variante en busca de la Capacidad para Proporcionar Resistencia a Compuestos Herbicidas
Se introdujeron el plásmido pTCHLH1 y pCR2.1 preparado en el Ejemplo 7 en la cepa BT3/pACYCSP de E. coli preparada en el Ejemplo 3, respectivamente de acuerdo con el método descrito por Hanahan, D.J., Mol. Biol., 166; pág. 557 (1983). Se obtuvieron la cepa BT3/pACYCSP+pTCHLH1 de E. coli que portaba los plásmidos pACYCSP y pTCHLH1, y la cepa BT3/pACYCSP+pCR2.1 de E. coli que portaba los plásmido pACYCSP y pCR2.1 cultivando las cepas anteriores en medio YPT que contenía 100 \mug/ml de ampicilina, 15 \mug/ml de cloramfenicol y 50 \mug/ml de kanamicina, respectivamente.
Estas cepas de E. coli se inocularon en medio YPT que contenía 10 o 1 ppm del compuesto herbicida de tipo inhibidor de PPO representado por la Estructura 8, 100 \mug/ml de ampicilina, 15 \mug/ml de cloramfenicol, 50 \mug/ml de kanamicina, 10 \mug/ml de hemina y 50 \mug/ml de ácido aminolevulínico, se cultivaron en condiciones de oscuridad o en condiciones de luz de la misma manera que en el Ejemplo 2. Después, a las 18 horas del inicio del cultivo, se midió la absorbancia del medio de cultivo líquido a 600 nm. Tomando la absorbancia del medio sin compuesto herbicida como 1, se calculó el valor relativo de la absorbancia del medio que contenía el compuesto herbicida. Los resultados se muestran en la Tabla 6.
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TABLA 6
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Ejemplo 9 Introducción del Gen que Codifica la Proteína de la Subunidad de la Magnesio quelatasa de Tabaco Variante en Tabaco
Se construyó un plásmido para introducir el gen que codifica una proteína de la subunidad de la magnesio quelatasa de tabaco variante en tabaco mediante el método de infección con Agrobacterium. Primero, se preparó un fragmento de ADN que contenía el gen que codificaba la proteína de la subunidad de la magnesio quelatasa de tabaco variante digiriendo el plásmido pTCHLH1 preparado en el Ejemplo 7 con las enzimas de restricción KpnI y SalI. Por otra parte, se digirió el vector binario pBI121 (fabricado por Clonetech) con la enzima de restricción SmaI y se insertó el conector KpnI (fabricado por Takara Shuzo Co., Ltd.) en esta porción para preparar el plásmido pBI121K en el cual se había separado el sitio de reconocimiento SmaI de pBI121 y se había añadido el sitio de reconocimiento de KpnI. Se digirió el plásmido pBI121K con la enzima de restricción SacI volviendo después romos los extremos del ADN añadiendo nucleótidos al espacio del ADN de doble hebra con ADN polimerasa I. Después, se desfosforiló el ADN con fosfatasa alcalina derivada de intestino de ternera y se cicló insertando el conector de SalI fosforilado (4680P, fabricado por Takara Shuzo Co., Ltd.) para construir el plásmido pBI121KS. Se digirió el vector binario pBI121KS con las enzimas de restricción KpnI y SalI para separar el gen de la \beta-glucuronidasa y se insertó el gen que codificaba la proteína de la subunidad de la magnesio quelatasa de tabaco variante en esta porción para preparar el plásmido pBITCHLH (Fig. 7).
Se introdujo el plásmido pBITCHLH en Agrobacterium tumefaciens LBA4404. Los transformantes resultantes se cultivaron en un medio que contenía 300 \mug/ml de estreptomicina, 100 \mug/ml de rifampicina y 25 \mug/ml de kanamicina, seguido de la selección de los transformantes deseados para aislar una cepa de Agrobacterium que portara
pBITCHLH.
Se infectaron trozos de hoja de tabaco cultivado en condiciones estériles con la cepa de Agrobacterium y, de la misma manera que en el Ejemplo 5, se obtuvo tabaco en el que se había introducido el gen que codificaba la proteína de la subunidad de la magnesio quelatasa de tabaco variante.
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Ejemplo 10 Confirmación de la Resistencia a los Compuestos Herbicidas de Tabaco que Porta el Gen que Codifica la Proteína de la Subunidad de la Magnesio Quelatasa de Tabaco Variante Introducido
Los niveles de resistencia a los compuestos herbicidas se confirman cuantitativamente sometiendo a ensayo el tabaco en el que se ha introducido el gen que codifica la proteína de la subunidad de la magnesio quelatasa de tabaco variante preparado en el Ejemplo 9 de la misma manera que en el Ejemplo 6.
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Ejemplo 11 Aislamiento del Gen que Codifica la Proteína Variante de PPO de Soja que No Tiene Capacidad de Oxidar el Protoporfirinógeno IX y que Tiene Afinidad Específica por el Protoporfirinógeno IX
Se llevó a cabo la PCR utilizando el plásmido pSPPO-P preparado en el Ejemplo 3 como molde y un oligonucleótido compuesto por la secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO: 11 y un oligonucleótido compuesto por la secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO: 12 como cebadores para amplificar el fragmento de ADN que codificaba la PPO de soja cuya señal de tránsito a cloroplastos y secuencia de unión a FAD habían sido suprimidas (referido en adelante como PPO de soja variante). Los oligonucleótidos se prepararon con un sintetizador de ADN (PE Applied Biosystems); sintetizador de ADN/ARN Modelo 394) y se purificaron con un cartucho de purificación de oligonucleótidos (PE Applied Biosystems; Cartucho OPC). La PCR se llevó a cabo repitiendo un ciclo de mantenimiento a 94ºC durante 1 minuto, a 55ºC durante 2 minutos y a 72ºC durante 3 minutos 30 veces. Los fragmentos de ADN amplificados se digirieron con las enzimas de restricción NcoI y SalI, y se introdujeron entre el sitio de restricción NcoI y el sitio de restricción SalI del plásmido pTV118N (fabricado por Takara Shuzo Co., Ltd.) para construir el plásmido pTVGMP (Fig. 8).
El plásmido pTVGMP se introdujo en la cepa BT3 mutante carente del gen PPO de E. coli de acuerdo con el método descrito por Hanahan, D.J., Mol. Biol., 166; pág. 557 (1983). Cuando la E. coli resultante se cultivó en medio YPT que contenía 100 \mug/ml de ampicilina y 10 \mug/ml de kanamicina, no se obtuvo ningún clon con el crecimiento complementado.
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Ejemplo 12 Ensayo del Efecto de Comunicación de Resistencia a Compuestos Herbicidas de la PPO de Soja Variante
Se introdujeron los plásmidos pTVGMP y pTV118N preparados en el Ejemplo 11 en la cepa BT3/pACYCSP de E. coli preparada en el Ejemplo 3 respectivamente de acuerdo con el método descrito por Hanahan, D.J., Mol. Biol., 166; pág. 557 (1983). La cepa BT3/pACYCSP+pTVGMP de E. coli que portaba los plásmidos pACYCSP y pTVGMP, y la cepa BT3/pACYCSP+ pTV118N de E. coli que portaba los plásmidos pACYCSP y pTV118N se obtuvieron cultivando las cepas anteriores en medio YPT que contenía 100 \mug/ml de ampicilina, 15 \mug/ml de cloramfenicol y 10 \mug/ml de kanamicina.
Estas cepas de E. coli se inocularon en medio YPT que contenía 10 o 1 ppm de compuesto herbicida de tipo inhibidor de PPO representado por la Estructura 8, 100 \mug/ml de ampicilina, 15 \mug/ml de cloramfenicol, 10 \mug/ml de kanamicina, 10 \mug/ml de hemina y 50 \mug/ml de ácido aminolevulínico, se cultivaron en condiciones de oscuridad o en condiciones de luz de la misma manera que en el Ejemplo 2. Después, a las 18 horas del inicio del cultivo, se midió la absorbancia del medio de cultivo líquido a 600 nm. Tomando la absorbancia del medio de cultivo sin compuesto herbicida como 1, se calculó el valor relativo de la absorbancia del medio que contenía el compuesto herbicida. Los resultados se muestran en la Tabla 7.
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TABLA 7
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Ejemplo 13 Introducción del Gen que Codifica PPO de Soja Variante en Tabaco
Se construyó un plásmido para introducir el gen que codificaba PPO de soja variante en una planta mediante el método de infección con Agrobacterium. La PCR se llevó a cabo utilizando el plásmido pSPPO-P preparado en el Ejemplo 3 como molde, un cebador oligonucleotídico compuesto por la secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO: 13 y un cebador oligonucleotídico compuesto por la secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO: 14 para amplificar el fragmento de ADN que contenía el gen que codificaba PPO de soja variante. Después, se digirió el plásmido pBI121K preparado en el Ejemplo 9 con las enzimas de restricción KpnI y SacI para separar el gen de la \beta-glucuronidasa, y se insertó el fragmento de ADN que se obtuvo digiriendo el fragmento de ADN que contenía el gen anterior que codificaba PPO de soja variante con las enzimas de restricción KpnI y Sac I en esta porción para preparar el plásmido pBIGMP (Fig. 9) en el cual el gen se unía aguas abajo del promotor de 35S.
El plásmido pBIGMP se introdujo en Agrobacterium tumefaciens LBA4404. Los transformantes resultantes se cultivaron en un medio que contenía 300 \mug/ml de estreptomicina, 100 \mug/ml de rifampicina y 25 \mug/ml de kanamicina, seguido de la selección de los transformantes deseados para aislar la cepa de Agrobacterium que portaba pBIGMP.
Se infectaron trozos de hoja de tabaco cultivado en condiciones estériles con la cepa de Agrobacterium y, de la misma manera que en el Ejemplo 5, se obtuvo tabaco en el que se había introducido el gen que codificaba PPO de soja variante.
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Ejemplo 14 Confirmación de la Resistencia a los Compuestos Herbicidas de Tabaco que Porta un Gen Introducido que Codifica PPO de Soja Variante
El nivel de resistencia a un compuesto herbicida de tipo inhibidor de PPO representado por la Estructura 8 se confirmó cuantitativamente sometiendo a ensayo el tabaco en el que se había introducido el gen que codificaba PPO de soja variante preparado en el Ejemplo 13 de la misma manera que en el Ejemplo 6. Los resultados obtenidos de 4 clones (GMP 1-4) de tabaco en los que se había introducido el gen que codificaba PPO de soja variante y tabaco recombinante de control se muestran en la Tabla 8. En la tabla, el nivel de resistencia al compuesto herbicida se representa mediante el porcentaje del contenido de clorofila total de trozos de hoja tratados con el compuesto herbicida con respecto al de los trozos de hoja no tratados.
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TABLA 8
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Ejemplo 15 Aislamiento del Gen PPO de Chlamydomonas
Se obtuvo la cepa CC407 de Chlamydomonas reinhardtii de Chlamydomonas Genetics Center (dirección: DCMB Group, Department of Botany, Box 91000, Duke University, Durham, NC 27708-1000, USA), se cultivó en 200 \muE/m^{2}/s de luz activa para fotosíntesis durante 5 días en medio de cultivo líquido TAP (E. H. Harris, The Chlamydomonas Sourcebook, Academic Press, San Diego, 1989, p 576-577) que contenía NH_{4}Cl 7 mM, MgSO_{4} 7H_{2}O 0,4 mM, CaCl_{2}\cdot2H_{2}O 0,34 mM, fosfato de potasio 25 mM, Tris 0,5 mM (pH 7,5), 1 ml/litro de elemento mineral Hatner y 1 ml/litro de ácido acético glacial para obtener 200 ml (1,0 x 10^{6} células/ml) de medio de cultivo líquido que contenía células en una fase de crecimiento estacionaria temprana.
Se prepararon ARN totales a partir de estas células utilizando ISOGEN (fabricado por Nippon Gene) de acuerdo con el manual adjunto. Asimismo, se fraccionó ARN poli(A) utilizando el Kit de Purificación de ARNm BioMag (fabricado por Perceptive Bio System) de acuerdo con el manual adjunto. Se sintetizó ADNc a partir del ARN poli(A) utilizando el Kit de Amplificación de ADNc Marathon (fabricado por Clontech) de acuerdo con el manual adjunto y se utilizó el ADNc como molde para la PCR.
En cuanto a los cebadores de la PCR, se prepararon un oligonucleótido compuesto por la secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO: 15 y un oligonucleótido compuesto por la secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO: 16. Los oligonucleótidos se prepararon con un sintetizador de ADN (PE Applied Biosystems; sintetizador de ADN/ARN Modelo 394) y se purificaron con un cartucho de purificación de oligonucleótidos (PE Applied Biosystems; cartucho
OPC).
Se llevó a cabo la PCR preparando un líquido de reacción utilizando el kit para PCR de ADNc Advantage (fabricado por Clontech) de acuerdo con el manual adjunto, y después, tras mantener a 94ºC durante 1 minuto y luego a 65ºC durante 5 minutos, repitiendo un ciclo de mantenimiento a 94ºC durante 15 segundos y a 65ºC durante 5 minutos 29 veces. Después de la PCR, se purificaron los fragmentos de ADN amplificados filtrando el líquido de reacción con MicroSpin S-400HR (fabricado por Pharmacia Biotech), y se clonó el fragmento de ADN en el plásmido pCR2.1 utilizando el Kit de Clonación TA (fabricado por Invitrogen) de acuerdo con el manual adjunto para construir el plásmido pCPPO.
Se determinó la secuencia de nucleótidos del fragmento de ADN contenido en el plásmido pCPPO resultante utilizando el kit de secuenciación Dye Terminator (fabricado por PE applied Biosystems) y el secuenciador de ADN 373S (fabricado por PE applied Biosystems). Como resultado, se reveló la secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO: 17, confirmando de ese modo que el plásmido pCPPO contenía el ADNc de PPO completo de Chlamydomonas reinhardtii.
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Ejemplo 16 Aislamiento del Gen que Codifica la Proteína variante de PPO de Chlamydomonas reinhardtii que no tiene capacidad de Oxidar el Protoporfirinógeno IX y con Afinidad Específica por el Protoporfirinógeno IX
Se llevó a cabo la PCR utilizando el plásmido cCPPO preparado en el Ejemplo 15 como molde, y un oligonucleótido compuesto por la secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO: 19 y un oligonucleótido compuesto por el nucleótido del SEQ ID NO: 20 como cebadores para amplificar el fragmento de ADN que codifica PPO de Chlamydomonas reinhardtii cuya señal de tránsito a cloroplastos y secuencia de unión a FAD habían sido suprimidas (referido en adelante como PPO de Chlamydomonas reinhardtii variante). Los oligonucleótidos se prepararon con un sintetizador de ADN (PE Applied Biosystems; sintetizador de ADN/ARN Modelo 394) y se purificaron con un cartucho de purificación de oligonucleótidos (PE Applied Biosystems; Cartucho OPC). La PCR se llevó a cabo repitiendo un ciclo para mantener a 94ºC durante 1 minuto, a 55ºC durante 2 minutos y después a 72ºC durante 3 minutos 30 veces. El fragmento de PCR amplificado se digirió con las enzimas de restricción BamHI y SacI, y se insertó entre el sitio de restricción BamHI y el sitio de restricción SacI del plásmido pTV119N (fabricado por Takara Shuzo Co., Ltd.) para construir el plásmido pTVCRP (Fig. 10).
Se introdujo el plásmido pTVCRP en la cepa BT3 mutante carente del gen PPO de E. coli de acuerdo con el método descrito por Hanahan, D. J., Mol. Biol., 166; pág. 557 (1983). Cuando se cultivó la E. coli resultante en medio YPT que contenía 100 \mug/ml de ampicilina y 10 \mug/ml de kanamicina, no se obtuvo ningún clon con crecimiento complementado.
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Ejemplo 17 Ensayo de PPO de Chlamydomonas reinhardtti Modificada Variante en busca de la Capacidad para Proporcionar Resistencia a Compuestos Herbicidas
Se introdujeron los plásmidos pTVCRP y pTV118N preparados en el Ejemplo 16 en la cepa BT3/pACYCSP de E. coli preparada en el Ejemplo 3 respectivamente de acuerdo con el método descrito por Hanahan, D. J., Mol. Biol., 166; pág. 557 (1983). Los plásmidos que portaban la cepa BT3/pACYCSP+pTVCRP de E. coli, pACYCSP y pTVCRP, y los plásmidos que portaban la cepa BT3/pACYCSP+pTV118N de E. coli, pACYCSP y pTV118N se obtuvieron cultivando las cepas anteriores en medio YPT que contenía 100 \mug/ml de ampicilina, 15 \mug/ml de cloramfenicol y 10 \mug/ml de kanamicina.
Estas cepas de E. coli se inocularon en medio YPT que contenía 10 o 1 ppm del compuesto herbicida de tipo inhibidor de PPO representado por la Estructura 8, 100 \mug/ml de ampicilina, 15 \mug/ml de cloramfenicol, 10 \mug/ml de kanamicina, 10 \mug/ml de hemina y 50 \mug/ml de ácido aminolevulínico, se cultivaron en condiciones de oscuridad o en condiciones de luz de la misma manera que en el Ejemplo 2. Después, a las 18 horas del inicio del cultivo, se midió la absorbancia del medio de cultivo líquido a 600 nm. Tomando la absorbancia del medio que no contenía compuesto herbicida como 1, se calculó el valor relativo de la absorbancia del medio que contenía el compuesto herbicida. Los resultados se muestran en la Tabla 9.
TABLA 9
32
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Ejemplo 18 Introducción del Gen que Codifica PPO de Chlamydomonas reinhardtii Variante en Tabaco
Se construyó un plásmido para introducir el gen que codificaba la PPO de Chlamydomonas reinhardtii variante en una planta mediante el método de infección con Agrobacterium. El fragmento de ADN que contenía el gen que codificaba la PPO de Chlamydomonas reinhardtii variante se preparó digiriendo el plásmido pTVCRP preparado en el Ejemplo 16 con las enzimas de restricción BamHI y SacI. Se digirió el vector binario pBI121 (fabricado por Clontech) con las enzimas de restricción BamHI y SacI para separar el gen de la \beta-glucuronidasa y el gen anterior que codificaba la PPO de Chlamydomonas reinhardtii variante se insertó en esta porción para preparar el plásmido pBICRP
(fig. 11).
Se introdujo el plásmido pBICRP en Agrobacterium tumefaciens LBA4404. Los transformantes resultantes se cultivaron en un medio que contenía 300 \mug/ml de estreptomicina, 100 \mug/ml de rifampicina y 25 \mug/ml de kanamicina, seguido de la selección de los transformantes deseados para aislar la cepa de Agrobacterium que portaba pBICRP.
Se infectaron trozos de hoja de tabaco cultivado en condiciones estériles con la cepa de Agrobacterium y, de la misma manera que en el Ejemplo 5, se obtuvo tabaco en el que se había introducido el gen que codificaba la PPO de Chlamydomonas reinhardtii variante.
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Ejemplo 19 Confirmación de la Resistencia a Compuestos Herbicidas de Tabaco que Porta el Gen Introducido que Codifica la PPO de Chlamydomonas reinhardtii Variante
Se confirmó cuantitativamente el nivel de resistencia al compuesto herbicida de tipo inhibidor de PPO representado por la Estructura 8 sometiendo a ensayo el tabaco en el que se había introducido el gen que codificaba la PPO de Chlamydomonas reinhardtii variante preparado en el Ejemplo 18 de la misma manera que en el Ejemplo 6. Los resultados obtenidos de 4 clones (CRP 1-4) de tabaco en los que se había introducido el gen que codificaba la PPO de Chlamydomonas reinhardtii variante y el tabaco recombinante de control se muestran en la Tabla 10. En la tabla, los niveles de resistencia al compuesto herbicida se representan por medio de los porcentajes del contenido total de clorofila de los trozos de hoja tratados con el compuesto herbicida con respecto a los trozos de hoja no
tratados.
TABLA 10
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Ejemplo 20 Ensayo de la Proteína Variante de Ferroquelatasa de Cebada que Tiene Afinidad por la Protoporfirina IX Específicamente en Busca de la Capacidad de Comunicar Resistencia a Compuestos Herbicidas
Se preparó un plásmido que portaba el gen de la ferroquelatasa de cebada mediante el método descrito por Miyamoto, K. et al., Plant Physiol. 105; pág. 769 (1994). El plásmido resultante se digirió con las enzimas de restricción NspI y EcoRI para obtener el fragmento de ADN que contenía el gen que codificaba la ferroquelatasa de cebada cuya secuencia señal había sido suprimida (referida en adelante como ferroquelatasa de cebada variante). Este fragmento de ADN se insertó entre el sitio de restricción SphI y el sitio de restricción EcoRI del plásmido pTV119N (fabricado por Takara Shuzo Co., Ltd.) para construir el plásmido pTVHVF1 (Fig. 12).
Los plásmidos pTVHVF1 y pTV118N se introdujeron en las cepas BT3/pACYCSP de E. coli preparadas en el Ejemplo 3 respectivamente de acuerdo con el método descrito por Hanahan, D.J., Mol. Biol., 166; pág. 557 (1983). Se obtuvieron el plásmido que portaba la cepa BT3/pACYCSP+pTVHVF1 de E. coli, pACYCSP y pTVHVF1, y el plásmido que portaba la cepa BT3/pACYCSP+pTV118N de E. coli, pACYCSP y pTV118N cultivando las cepas anteriores en medio YPT que contenía 100 \mug/ml de ampicilina, 15 \mug/ml de cloramfenicol y 10 \mug/ml de
kanamicina.
Estas cepas de E. coli se inocularon en medio YPT que contenía 10 o 1 ppm del compuesto herbicida de tipo inhibidor de PPO representado por la Estructura 8, 100 \mug/ml de ampicilina, 15 \mug/ml de cloramfenicol, 10 \mug/ml de kanamicina, 10 \mug/ml de hemina y 50 \mug/ml de ácido aminolevulínico, se cultivaron en condiciones de oscuridad o en condiciones de luz de la misma manera que en el Ejemplo 2. Después, a las 18 horas del inicio del cultivo, se midió la absorbancia del medio de cultivo líquido a 600 nm. Tomando la absorbancia del medio sin compuesto herbicida como 1, se calculó el valor relativo de la absorbancia del medio que contenía el compuesto herbicida. Los resultados se muestran en la Tabla 11.
TABLA 11
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Ejemplo 21 Introducción del Gen que Codifica la Ferroquelatasa de Cebada Variante en Tabaco
Se construyó un plásmido para introducir el gen que codificaba la ferroquelatasa de cebada en tabaco por medio del método de infección con Agrobacterium. Se digirió el plásmido pTVHVF1 descrito en el Ejemplo 20 con la enzima de restricción Nco I volviendo después romos los extremos del ADN con ADN polimerasa I añadiendo nucleótidos al espacio del ADN de doble hebra. Luego, se desfosforiló el ADN con fosfatasa alcalina derivada de intestino de ternera y se cicló insertando el conector BamHI fosforilado (4610P, fabricado por Takara Shuzo Co., Ltd.) para construir el plásmido. Después, se digirió pTVHVF2 con la enzima de estricción EcoRI volviendo después romos los extremos del ADN con ADN polimerasa I añadiendo nucleótidos al espacio de ADN de doble hebra. Adicionalmente, se desfosforiló el ADN con fosfatasa alcalina derivada de intestino de ternera y se cicló insertando el conector SalI fosforilado (4680P, fabricado por Takara Shuzo Co., Ltd.) para construir el plásmido pTVHVF3. El plásmido pBI121KS preparado en el Ejemplo 9 se digirió con las enzimas de restricción BamHI y SalI para separar el gen de la \beta-glucuronidasa. El fragmento de ADN que contenía el gen que codificaba la ferroquelatasa de cebada variante se preparó digiriendo el pTVHVF3 anterior con las enzimas de restricción BamHI y SalI. El fragmento de ADN resultante se insertó en el plásmido pBI121KS remplazando el gen de la \beta-glucuronidasa para preparar el plásmido pBIHVF (Fig. 13) en el que el gen de la cebada variante se unía aguas abajo del promotor de 35S.
Se introdujo el plásmido pBIHVF en Agrobacterium tumefaciens LBA4404. Los transformantes resultantes se cultivaron en un medio que contenía 300 \mug/ml de estreptomicina, 100 \mug/ml de rifampicina y 25 \mug/ml de kanamicina, seguido de selección de los transformantes deseados para aislar la cepa de Agrobacterium que portaba pBIHVF.
Se infectaron trozos de hoja de tabaco cultivado en condiciones estériles con dicha cepa de Agrobacterium y, de la misma manera que en el Ejemplo 5, se obtuvo tabaco en el que se había introducido el gen que codificaba la ferroquelatasa de cebada variante.
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Ejemplo 22 Confirmación de la Resistencia a Compuestos Herbicidas de Tabaco que Porta un Gen Introducido que Codifica la Ferroquelatasa de Cebada Variante
Se confirmó el nivel de resistencia al compuesto herbicida de tipo inhibidor de PPO representado por la Estructura 8 cuantitativamente sometiendo a ensayo el tabaco en el que se había introducido el gen que codificaba la ferroquelatasa de cebada variante preparada en el Ejemplo 21 de la misma manera que en el Ejemplo 6. Los resultados obtenidos de 4 clones (HVF 1-4) de tabaco con el gen que codifica la ferroquelatasa de cebada variante introducido y tabaco recombinante de control se muestran en la tabla 12. En la tabla, se representan los niveles de resistencia al compuesto herbicida por medio de porcentajes del contenido total de clorofila de los trozos de hoja tratados con compuesto herbicida con respecto a los trozos de las hojas no tratados.
TABLA 12
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Ejemplo 23 Ensayo de la Proteína Variante de Ferroquelatasa de Pepino que Tiene Afinidad Específica por la Protoporfirina IX en busca de la Capacidad para Comunicar Resistencia a Compuestos Herbicidas
Se llevó a cabo la PCR utilizando un clon de ADNc de ferroquelatasa de pepino aislado mediante el método descrito por Miyamoto, K. et al., Plant Physiol., 105; pág. 769 (1994) como molde, un oligonucleótido compuesto por la secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO: 21 y un oligonucleótido compuesto por la secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO: 22 como cebadores para amplificar el fragmento de ADN que codificaba la ferroquelatasa de pepino cuya secuencia señal había sido suprimida (en adelante referida como ferroquelatasa de pepino variante). Los oligonucleótidos se prepararon con un sintetizador de ADN (PE Applied Biosystems; sintetizador de ADN/ARN Modelo 394) y se purificaron con un cartucho de purificación de oligonucleótidos (PE Applied Biosystems; Cartucho OPC). La PCR se llevó a cabo repitiendo un ciclo de mantenimiento a 94ºC durante 1 minuto, a 55ºC durante 2 minutos y después a 72ºC durante 3 minutos 30 veces. Los fragmentos de ADN amplificados fueron digeridos con las enzimas de restricción BamHI y SacI, e insertados entre el sitio de restricción BamHI y el sitio de restricción SacI del plásmido pTV119N (fabricado por Takara Shuzo Co., Ltd.) para construir el plásmido pTVCSF (Fig. 14).
Se introdujeron los plásmidos pTVCSF y pTV118N en la cepa BT3/pACYCSP de E. coli preparada en el Ejemplo 3 respectivamente de acuerdo con el método descrito por Hanahan, D.J., Mol. Biol., 166; pág. 557 (1983). La cepa BT3/pACYCSP+ pTVCSF de E. coli que porta el plásmido pACYCSP y pTVCSF, y la cepa BT3/pACYCSP+
pTV118N de E. coli que porta el plásmido pACYCSP y pTV118N fueron obtenidas cultivando las cepas anteriores en medio YPT que contenía 100 \mug/ml de ampicilina, 15 \mug/ml de cloramfenicol y 10 \mug/ml de kanamicina.
Estas cepas de E. coli fueron inoculadas en medio YPT que contenía 10 o 1 ppm del compuesto herbicida de tipo inhibidor de PPO representado por la Estructura 8, 100 \mug/ml de ampicilina, 15 \mug/ml de cloramfenicol, 10 de \mug/ml kanamicina, 10 \mug/ml de hemina y 50 \mug/ml de ácido aminolevulínico, cultivadas en condiciones de oscuridad o en condiciones de luz de la misma manera que en el Ejemplo 2. Después, a las 18 horas del inicio del cultivo, se midió la absorbancia del medio de cultivo líquido a 600 nm. Tomando la absorbancia del medio sin el compuesto herbicida como 1, se calculó el valor relativo de la absorbancia del medio que contenía el compuesto herbicida. Los resultados se muestran en la Tabla 13.
TABLA 13
36
Ejemplo 24 Introducción del Gen que Codifica la Ferroquelatasa de Pepino Variante en Tabaco
Se construyó un plásmido para introducir el gen que codificaba la ferroquelatasa de pepino modificada en tabaco por medio del método de infección con Agrobacterium. Se digirió el plásmido pBI121 (fabricado por Clontech) con las enzimas de restricción BamHI y SacI para separar el gen de la \beta-glucuronidasa. Se preparó un fragmento de ADN que contenía el gen que codificaba la ferroquelatasa de pepino variante digiriendo el plásmido pTVCSF descrito en el Ejemplo 23 con las enzimas de restricción BamHI y SacI. El fragmento de ADN resultante se introdujo en el plásmido pBI121 remplazando el gen de la \beta-glucuronidasa para preparar el plásmido pBICSF (Fig. 15) en el que el gen de la ferroquelatasa de pepino variante se unía aguas abajo del promotor de 35S.
El plásmido pBICSF se introdujo en Agrobacterium tumefaciens LBA4404. Los transformantes resultantes se cultivaron en un medio que contenía 300 \mug/ml de estreptomicina, 100 \mug/ml de rifampicina y 25 \mug/ml de kanamicina, seguido de selección de los transformantes deseados para aislar la cepa de Agrobacterium que portaba la cepa pBICSF.
Se infectaron trozos de hoja de tabaco cultivado en condiciones estériles con dicha cepa de Agrobacterium para obtener tabaco con el gen que codifica la ferroquelatasa de pepino variante introducido de la misma manera que en el Ejemplo 5.
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Ejemplo 25 Confirmación de la Resistencia a Compuestos Herbicidas de Tabaco que Porta el Gen que Codifica la Ferroquelatasa de Pepino Variante Introducido
Se confirma el nivel de resistencia a los compuestos herbicidas de tipo inhibidor de PPO cuantitativamente sometiendo a ensayo el tabaco con el gen que codifica la ferroquelatasa de pepino variante introducido preparado en el Ejemplo 24 de la misma manera que en el Ejemplo 6.
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Ejemplo 26 Aislamiento del Gen de la Coproporfirinógeno III Oxidasa (hemF) de E. coli
Se preparó ADN genómico a partir de la cepa LE392 de E. coli utilizando el Kit ISOPLANT para la preparación de ADN del genoma (fabricado por Nippon Gene). Se sintetizaron un cebador oligonucleotídico compuesto por la secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO: 23 y un cebador oligonucleotídico compuesto por la secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO: 24 de acuerdo con las secuencias de nucleótidos de sus regiones 5' y 3' del gen hemF de E. coli registradas en GenBank (Acceso X75413). Los oligonucleótidos fueron preparados con un sintetizador de ADN (PE Applied Biosystems; sintetizador de ADN/ARN Modelo 394) y se purificaron con un cartucho para la purificación de oligonucleótidos (PE Applied Biosystems; Cartucho OPC). La PCR se llevó a cabo utilizando aproximadamente 1 \mug de ADN genómico de la cepa LE392 de E. coli como molde y los oligonucleótidos anteriores (10 pmoles de cada uno) como cebadores para amplificar el fragmento de ADN que contenía el gen hemF de E. coli. Se llevó a cabo la PCR repitiendo un ciclo para mantener a 96ºC durante 1 minuto, a 55ºC durante 2 minutos y después a 72ºC durante 3 minutos 30 veces.
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Ejemplo 27 Ensayo de la Proteína hemF de E. coli en busca de su Capacidad para Comunicar Resistencia a Compuestos Herbicidas
Se digirió el fragmento de ADN que contenía el gen hemF amplificado mediante el método descrito en el Ejemplo 26 con las enzimas de restricción FbaI y PstI, y se insertó entre el sitio de restricción BamHI y el sitio de restricción PstI del plásmido asequible comercialmente pUC118N (fabricado por Takara Shuzo Co., Ltd.) para construir el plásmido pHEMF (Fig. 16).
Se introdujeron los plásmidos pHEMF y pTV118N en la cepa BT3/pACYCSP de E. coli preparada en el Ejemplo 3 respectivamente de acuerdo con el método descrito por Hanahan, D. J., Mol. Biol., 166; pág. 557 (1983). Se obtuvieron la cepa BT3/pACYCSP+ pHEMF de E. coli que portaba el plásmido pACYCSP y pHEMF, y la cepa BT3/pACYCSP+pTV118N de E. coli que portaba el plásmido pACYCSP y pTV118N cultivando las cepas anteriores en medio YPT que contenía 100 \mug/ml de ampicilina, 15 \mug/ml de cloramfenicol y 10 \mug/ml de kanamicina.
Estas cepas de E. coli se inocularon en medio YPT que contenía 10 o 1 ppm del compuesto herbicida de tipo inhibidor de PPO representado por la Estructura 8, 100 \mug/ml de ampicilina, 15 \mug/ml de cloramfenicol, 10 \mug/ml de kanamicina, 10 \mug/ml de hemina y 50 \mug/ml de ácido aminolevulínico, se cultivaron en condiciones de oscuridad o en condiciones de luz de la misma manera que en el Ejemplo 2. Después, a las 18 horas del inicio del cultivo, se midió la absorbancia del medio de cultivo líquido a 600 nm. Tomando la absorbancia del medio sin el compuesto herbicida como 1, se calculó el valor relativo de la absorbancia del medio que contenía el compuesto herbicida. Los resultados se muestran en la Tabla 14.
TABLA 14
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Ejemplo 28 Introducción del gen hemF de E. coli en Tabaco
Se construyó un plásmido para introducir el gen hemF de E. coli en una planta mediante el método de infección con Agrobacterium. Primero, para obtener el gen hemF de E. coli, se sintetizaron un cebador oligonucleotídico compuesto por la secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO: 25 y un cebador oligonucleotídico compuesto por la secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO: 26 con un sintetizador de ADN (PE Applied Biosystems; sintetizador de ADN/ARN Modelo 394) y se purificaron con un cartucho para la purificación de oligonucleótidos (PE Applied Biosystems; Cartucho OPC). La PCR se llevó a cabo utilizando los cebadores oligonucleotídicos de la misma manera que en el Ejemplo 26 para amplificar el fragmento de ADN que contenía el gen hemF de E. coli.
El plásmido pBI121 (fabricado por Clontech) fue digerido con las enzimas de restricción BamHI y SacI para separar el gen de la \beta-glucuronidasa. El fragmento de ADN que contenía el gen que codificaba el gen hemF de E. coli se preparó mediante digestión del fragmento de ADN amplificado por PCR anterior con las enzimas de restricción BamHI y SacI. El fragmento de ADN resultante se introdujo en el plásmido pBI121 remplazando el gen de la \beta-glucuronidasa para preparar el plásmido pBIHEMF (Fig. 17) en el que el gen hemF de E. coli se unía aguas abajo del promotor de 35S.
Se introdujo el plásmido pBIHEMF en Agrobacterium tumefaciens LBA4404. Los transformantes resultantes se cultivaron en un medio que contenía 300 \mug/ml de estreptomicina, 100 \mug/ml de rifampicina y 25 \mug/ml de kanamicina, seguido de selección de los transformantes deseados para aislar la cepa de Agrobacterium que portaba pBIHEMF.
Se infectaron trozos de hoja de tabaco cultivado en condiciones estériles con la cepa de Agrobacterium para obtener tabaco con el gen hemF de E. coli introducido de la misma manera que en el Ejemplo 5.
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Ejemplo 29 Confirmación de la Resistencia a Compuestos Herbicidas del Tabaco con el Gen hemF de E. coli Introducido
El nivel de resistencia a los compuestos herbicidas de tipo inhibidor de PPO se confirma cuantitativamente sometiendo a ensayo el tabaco con el gen hemF de E. coli introducido (preparado en el Ejemplo 28) de la misma manera que en el Ejemplo 6.
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Ejemplo 30 Ensayo de Unión del Compuesto de Porfirina-Proteína de Unión a la Protoporfirina IX
Se prepararon una colección de fagos que presentaban una proteína que contenía una secuencia de aminoácidos compuesta por 5 aminoácidos al azar y un clon de fago que presentaba una proteína que contenía una secuencia de aminoácidos HASYS o RASSL (donde H es histidina, A es alanina, S es serina, Y es tirosina, R es arginina y L es leucina) que se puede unir específicamente al compuesto de porfirina 5,10,15,20-tetrakis(N-metilpiridinio-4-il)-21H,23H-porfina (H_{2}TMpyP) de acuerdo con el método descrito por KITANO et al., Nihon Kagakukai (Sociedad Química Japonesa) 74º Encuentro Anual de Primavera Resúmenes Pre-Publicados de Presentación II, pág. 1353, 4G511 (1998).
Primero, se construyó la colección de fagos que presentaban una proteína que contenía una secuencia de aminoácidos compuesta por 5 aminoácidos al azar.
Se sintetizaron los oligonucleótidos mezclados compuestos por la secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO: 27 y los oligonucleótidos mezclados compuestos por la secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO: 28. Los oligonucleótidos mezclados se sintetizaron con un sintetizador de ADN (PE Applied Biosystems; Sintetizador de ADN/ARN Modelo 394) y se purificaron con un cartucho de purificación de oligonucleótidos (PE Applied Biosystems; Cartucho OPC). Los oligonucleótidos mezclados anteriores (50 pmoles cada uno) se fosforilaron en el extremo 5' tratando con ADN quinasa de T4 respectivamente. Se mezclaron y, después de calentar a 70ºC durante 10 minutos, se sometieron a hibridación enfriando lentamente a la temperatura ambiente a una velocidad de 0,5ºC/minuto. Se digirió el plásmido pCANTAB5E (fabricado por Pharmacia Biotech) con las enzimas de restricción SfiI y NotI para separar el ScFv del gen del anticuerpo recombinante. El par anterior de oligonucleótidos fosforilados e hibridados se insertó en la porción del ScFv del gen del anticuerpo recombinante anterior para preparar un plásmido que contenía una secuencia de nucleótidos que codificaba una proteína compuesta por una secuencia de 5 aminoácidos al azar aguas arriba de una proteína que comprendía una secuencia de aminoácidos de la proteína de la envoltura del fago M13. El plásmido se introdujo en la cepa TG-1 de E. coli de acuerdo con el método descrito por Hanahan, D.J., Mol. Biol. 166; pág. 557 (1983) y se cultivó en 2 x medio YT (10 g/litro de extracto de levadura, 15 g/litro de triptona y 5 g/litro de NaCl, pH 7,2) que contenía 100 \mug/ml de ampicilina para obtener una cepa TG-1 de E. coli recombinante. La cepa TG-1 de E. coli recombinante se inoculó en medio 2 x YT que contenía 100 \mug/ml de ampicilina y se cultivó con sacudimiento a 37ºC. Después, al cabo de 1 hora de inicio del cultivo, se inocularon 6 x 10^{10} ufp de fago coadyuvante M13K07 (fabricado por Pharmacia Biotech) en el medio, y el cultivo continuó durante 18 horas más con sacudimiento. Luego, se centrifugó el medio de cultivo líquido a 1.000 x g durante 20 minutos para recoger la colección de fagos que presentaban una proteína que contenía la secuencia de aminoácidos compuesta por 5 aminoácidos al azar.
Para preparar el clon del fago que presentaba una proteína que contenía la secuencia de aminoácidos HASYS (SEQ ID NO: 53), se sintetizaron un oligonucleótido compuesto por la secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO: 29 y un oligonucleótido compuesto por la secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO: 30. Y, para preparar el clon del fago que presentaba una proteína que contenía la secuencia de aminoácidos RASSL (SEQ ID No: 55), se sintetizaron un oligonucleótido compuesto por la secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO: 31 y un oligonucleótido compuesto por la secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO: 32. Estos oligonucleótidos se sintetizaron con un sintetizador de ADN (PE Applied Biosystems; Sintetizador de ADN/ARN Modelo 394) y se purificaron con un cartucho de purificación de oligonucleótidos (PE Applied Biosystems; Cartucho OPC). El clon del fago que presentaba la proteína que contenía la secuencia de aminoácidos HASYS o RASSL se obtuvo por medio de la misma operación que antes para obtener la colección de fagos que presentaban una proteína que contenía la secuencia de aminoácidos compuesta por 5 aminoácidos al azar.
Se aplicó una suspensión de fagos que contenía el clon del fago que presentaba la proteína que contenía la secuencia de aminoácidos HASYS, el clon del fago que presentaba la proteína que contenía la secuencia de aminoácidos RASSL o la colección de fagos que presentaba la proteína que contenía la secuencia de aminoácidos que consistía en 5 aminoácidos al azar (título 10^{5} ufp) respectivamente en un filtro de nitrocelulosa (fabricado por Scleicher y Schuell), y después se bloqueó el filtro de nitrocelulosa sacudiéndolo en tampón PBT (NaCl 137 mM, Na_{2}HPO_{4} 8,10 mM, KCl 2,68 mM, KH_{2}PO_{4} 1,47 mM, Tween 20 al 0,05%, pH 7,2) que contenía seralbúmina bovina al 1%. El filtro de nitrocelulosa se lavó con tampón PBT y se sacudió durante 18 horas en 2 x tampón SSC (NaCl 0,3 M, sal sódica de ácido cítrico 0,03M) que contenía protoporfirina IX 10 \muM.
Adicionalmente, dicho filtro de nitrocelulosa se lavó con 2 x tampón SSC, se secó, y se detectó la fluorescencia derivada de la protoporfirina IX en luz ultravioleta (365 nm).
Las aplicaciones de la colección de fagos no mostraron fluorescencia, mientras las aplicaciones de los clones que presentaban la proteína que contenía la secuencia de aminoácidos HASYS y la que contenía la secuencia de aminoácidos RASSL mostraban una clara fluorescencia.
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Ejemplo 31 Ensayo de la Proteína de Unión a Protoporfirina IX en busca de la Capacidad para Comunicar Resistencia a los Compuestos Herbicidas
Primero, se preparó un plásmido que podía expresar el gen que codificaba la proteína que contenía la secuencia de aminoácidos HASYS (SEQ ID NO: 53), o la secuencia de aminoácidos RASSL (SEQ ID NO: 55). Para preparar el plásmido capaz de expresar el gen que codificaba la proteína compuesta por la secuencia de aminoácidos del SEQ ID NO: 54 (en adelante referida como proteína MGHASYS), se sintetizaron un oligonucleótido compuesto por la secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO:33 y un oligonucleótido compuesto por la secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO: 34. Los oligonucleótidos se sintetizaron con un sintetizador de ADN (PE Applied Biosystems; Sintetizador de ADN/ARN Modelo 394) y se purificaron con un cartucho para la purificación de oligonucleótidos (PE Applied Biosystems; Cartucho OPC). Los oligonucleótidos anteriores (50 pmoles cada uno) se fosforilaron en el extremo 5' mediante tratamiento con ADN quinasa de T4, respectivamente. Se mezclaron, y después, tras calentar durante 10 minutos a 70ºC, se sometieron a hibridación enfriando lentamente a la temperatura ambiente a una velocidad de 0,5ºC/minuto. El plásmido pTV118N se digirió con las enzimas de restricción NcoI y EcoRI para separar el fragmento del gen que consistía en 16 pares de bases. El plásmido pHASYS capaz de expresar el gen que codifica la proteína MGHASYS se preparó insertando los pares de oligonucleótidos fosforilados e hibridados en la posición de los 16 pares de bases anteriores.
Después, para preparar el plásmido capaz de expresar el gen que codifica la proteína que consiste en la secuencia de aminoácidos del SEQ ID NO: 56 (en adelante referida como MGRASSL), se sintetizaron un oligonucleótido compuesto por la secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO: 35 y un oligonucleótido compuesto por la secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO: 36. Los oligonucleótidos se sintetizaron con un sintetizador de ADN (PE Applied Biosystems; Sintetizador de ADN/ARN Modelo 394) y se purificaron con un cartucho para la purificación de oligonucleótidos (PE Applied Biosystems; Cartucho OPC). Se preparó el plásmido pRASSL capaz de expresar el gen que codificaba la proteína MGRASSL mediante el mismo procedimiento que para el plásmido pHASYS.
Se preparó un plásmido capaz de expresar el gen que codificaba la proteína que contenía la secuencia de aminoácidos YAGY o YAGF (donde Y es tirosina, A es alanina, G es glicina, F es fenilalanina) (Sugimoto, N., Nakano. S., Chem. Lett. pág. 939, 1997) capaz de unirse al compuesto de porfirina H_{2}TMPyP. Para preparar el plásmido capaz de expresar el gen que codificaba la proteína que consistía en la secuencia de aminoácidos del SEQ ID NO: 58 (en adelante referida como proteína MGYAGY), se sintetizaron un oligonucleótido compuesto por la secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO: 37 y un oligonucleótido compuesto por la secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO: 38. Para preparar el plásmido capaz de expresar el gen que codificaba la proteína compuesta por la secuencia de aminoácidos del SEQ ID NO: 60 (en adelante referida como proteína MGYAGF), también se sintetizaron un oligonucleótido compuesto por la secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO: 39 y un oligonucleótido compuesto por la secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO: 40. Estos oligonucleótidos se sintetizaron con un sintetizador de ADN (PE Applied Biosystems; Sintetizador de ADN/ARN Modelo 394) y se purificaron con un cartucho para la purificación de oligonucleótidos (PE Applied Biosystems; Cartucho OPC). El plásmido pYAGY capaz de expresar el gen que codifica la proteína MGYAGY y el plásmido pYAGF capaz de expresar la proteína MGYAGF se prepararon mediante el mismo procedimiento que para el plásmido pHASYS.
Los plásmidos pHASYS, pRASSL, pYAGY, pYAGF y pTV118N anteriores se introdujeron en la cepa BT3/
pACYCSP de E. coli preparada en el Ejemplo 3 respectivamente de acuerdo con el método descrito por Hanahan, D. J., Mol. Biol., 166; p 557 (1983). La cepa BT3/pACYCSP+pHASYS de E. coli que portaba el plásmido pACYCSP y pHASYS, la cepa BT3/pACYCSP+pRASSL de E. coli que portaba el plásmido pACYCSP y pRASSL; la cepa BT/pACYCSP+pYAGY de E. coli que portaba el plásmido pACYCSP y pYAGY, la cepa BT3/pACYCSP+pYAGF de E. coli que portaba el plásmido pACYCSP y pYAGF y la cepa BT3/pACYCSP+pTV118N de E. coli que portaba el plásmido pACYCSP y pTV118N se obtuvieron cultivando las cepas anteriores en medio YPT que contenía 100 \mug/ml de ampicilina, 15 \mug/ml de cloramfenicol y 10 \mug/ml de kanamicina.
Estas cepas de E. coli se inocularon en medio YPT que contenía 1 ppm del compuesto herbicida de tipo inhibidor de PPO representado por la Estructura 8, 100 \mug/ml de ampicilina, 15 \mug/ml de cloramfenicol, 10 \mug/ml de kanamicina, 10 \mug/ml de hemina y 50 \mug/ml de ácido aminolevulínico, se cultivaron en condiciones de oscuridad o condiciones de luz de la misma manera que en el Ejemplo 2. Después, a las 18 horas del inicio del cultivo, se midió la absorbancia del medio de cultivo líquido a 600 nm. Tomando la absorbancia del medio sin el compuesto herbicida como 1, se calculó el valor relativo de la absorbancia del medio que contenía el compuesto herbicida. Los resultados se muestran en la Tabla 15.
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TABLA 15
38
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Adicionalmente, se preparó un plásmido capaz de expresar un gen que codificaba una proteína que contenía una secuencia de aminoácidos en la que una unidad de las secuencias de aminoácidos se unía repetidamente. Para preparar el plásmido capaz de expresar el gen que codificaba la proteína compuesta por la secuencia de aminoácidos del SEQ ID NO: 61 (en adelante referida como proteína MG(HASYS)_{4}, (HASYS)_{n} referida como secuencia en la cual el péptido HASYS se unía repetidamente entre sí n veces), se sintetizó un oligonucleótido compuesto por la secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO: 41, SEQ ID NO: 42, SEQ ID NO: 43 o SEQ ID NO: 44. Estos oligonucleótidos se sintetizaron con un sintetizador de ADN (PE Applied Biosystems; Sintetizador de ADN/ARN Modelo 394) y se purificaron con un cartucho de purificación de oligonucleótidos (PE Applied Biosystems; Cartucho OPC). Primero, el oligonucleótido compuesto por la secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO. 42 y el oligonucleótido compuesto por la secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO: 43 se fosforilaron respectivamente en el extremo 5' mediante tratamiento con ADN quinasa de T4. Después de eso, el oligonucleótido compuesto por la secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO: 41 y el oligonucleótido compuesto por la secuencia de nucleótidos fosforilada del SEQ ID NO: 42 o el oligonucleótido compuesto por la secuencia de nucleótidos fosforilada del SEQ ID NO: 43 y el oligonucleótido compuesto por la secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO: 44 se mezclaron (300 pmoles cada uno), y después de calentar durante 5 minutos a 70ºC, se hibridaron enfriando lentamente a la temperatura ambiente a una velocidad de 0,5ºC/minuto. Los pares de oligonucleótidos hibridados se mezclaron y se ligaron con ADN ligasa de T4, luego el fragmento de ADN resultante se fosforiló con ADN quinasa de T4 en el extremo 5'. Por otra parte, se digirió el vector pTV118N con las enzimas de restricción NcoI y EcoRI para separar un fragmento de ADN de 16 pares de bases y se insertó el fragmento de ADN fosforilado anterior en esta porción para obtener el plásmido pHASYS4 que expresaba el gen que codificaba la proteína MG(HASYS)_{4}.
Adicionalmente, para preparar el plásmido capaz de expresar el gen que codifica la proteína compuesta por la secuencia de aminoácidos del SEQ ID NO: 62 (en adelante referida como proteína MG(HASYS)_{8}), se sintetizaron un oligonucleótido compuesto por la secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO: 45 y un oligonucleótido compuesto por la secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO: 46. Estos oligonucleótidos se sintetizaron con un sintetizador de ADN (PE Applied Biosystems; Sintetizador de ADN/ARN Modelo 394) y se purificaron con un cartucho para la purificación de oligonucleótidos (PE Applied Biosystems; Cartucho OPC). Primero, se fosforilaron los oligonucleótidos anteriores en el extremo 5' mediante tratamiento con ADN quinasa de T4. Después de eso, se mezclaron un oligonucleótido compuesto por la secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO: 41 y un oligonucleótido compuesto por la secuencia de nucleótidos fosforilada del SEQ ID NO: 42 (300 pmoles cada uno), se mezclaron un oligonucleótido compuesto por la secuencia de nucleótidos fosforilada del SEQ ID NO: 43 y un oligonucleótido compuesto por la secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO: 44 (300 pmoles cada uno), y adicionalmente, se mezclaron un oligonucleótido compuesto por la secuencia de nucleótidos fosforilada del SEQ ID NO: 45 y un oligonucleótido compuesto por la secuencia de nucleótidos fosforilada del SEQ ID NO: 46 (600 pmoles cada uno). Estas tres mezclas se calentaron durante 5 minutos a 70ºC, y se hibridaron lentamente a la temperatura ambiente a una velocidad de 0,5ºC/minuto, respectivamente. Los tres pares de nucleótidos hibridados anteriores se mezclaron, y se ligaron con ADN ligasa de T4, y después el fragmento resultante se fosforiló con ADN quinasa de T4 en el extremo 5'. Se preparó el plásmido pHASYS8 capaz de expresar la proteína MG(HASYS)_{8} de la misma manera que para el plásmido pHASYS4
anterior.
Después, para preparar un plásmido capaz de expresar el gen que codifica la proteína compuesta por la secuencia de aminoácidos del SEQ ID NO: 63 (en adelante referida como proteína MG(RASSL)_{4}, (RASSL)_{n} referida como secuencia en la que el péptido RASSL se unía repetidamente entre sí n veces), se sintetizaron un oligonucleótido compuesto por la secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO: 47, SEQ ID NO: 48, SEQ ID NO: 49 o SEQ ID NO: 50. Asimismo, para preparar un plásmido capaz de expresar el gen que codificaba la proteína compuesta por la secuencia de aminoácidos del SEQ ID NO: 64 (en adelante referida como proteína MG(RASSL)_{8}), se sintetizaron un oligonucleótido compuesto por la secuencia de nucleótidos del SEQ ID NO: 51 y un oligonucleótido compuesto por la secuencia de nucleótidos del SEQ ID No: 52. Estos oligonucleótidos se sintetizaron con un sintetizador de ADN (PE Applied Biosystems; Sintetizador de ADN/ARN Modelo 394) y se purificaron con un cartucho para la purificación de oligonucleótidos (PE Applied Biosystems; Cartucho OPC).
Se preparó un plásmido pRASSL4 capaz de expresar la proteína MG(RASSL)_{4} de la misma manera que para el plásmido pHASYS4 anterior. También se preparó el plásmido pRASSL8 capaz de expresar la proteína MG(RASSL)_{8} de la misma manera que para el plásmido pHASYS8 anterior.
Los plásmidos pHASYS4, pHASYS8, pRASSL4, pRASSL8 y pTV118N anteriores se introdujeron en la cepa BT3/pACYCSP de E. coli. preparada en el Ejemplo 3 respectivamente de acuerdo con el método descrito por Hanahan, D. J., Mol. Biol., 166; pág. 557 (1983). La cepa BT3/pACYCSP+pHASYS4 de E. coli que portaba el plásmido pACYCSP y pHASYS4, la cepa BT3/pACYCSP+pHASYS8 de E. coli que portaba el plásmido pACYCSP y pHASYS8, la cepa BT3/pACYCSP+pRASSL4 de E. coli que portaba el plásmido pACYCSP y pRASSL4, la cepa HT3/pACYCSP+pRASSL8 de E. coli que portaba el plásmido pACYCSP y pRASSL8 y la cepa BT3/pACYCSP+
pTV118N de E. coli que portaba el plásmido pACYCSP y pTV118N se obtuvieron cultivando las cepas anteriores en medio YPT que contenía 100 \mug/ml de ampicilina, 15 \mug/ml de cloramfenicol y 10 \mug/ml de kanamicina.
Estas cepas de E. coli se inocularon en medio YPT que contenía 1 ppm del compuesto herbicida de tipo inhibidor de PPO representado por la Estructura 8, 100 \mug/ml de ampicilina, 15 \mug/ml de cloramfenicol, 10 \mug/ml de kanamicina, 10 \mug/ml de hemina y 50 \mug/ml de ácido aminolevulínico, se cultivaron en condiciones de oscuridad o en condiciones de luz de la misma manera que en el Ejemplo 2. Después, a las 18 horas del inicio del cultivo, se midió la absorbancia del medio de cultivo líquido a 600 nm. Tomando la absorbancia del medio de cultivo sin compuesto herbicida como 1, se calculó el valor relativo de la absorbancia del medio de cultivo que contenía el compuesto herbicida. Los resultados se muestran en la Tabla 16.
TABLA 16
40
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Ejemplo 32 Introducción del Gen que Codifica el Péptido de Unión a Protoporfirina IX en Tabaco
Se construyó un plásmido para introducir el gen que codificaba el péptido de unión a protoporfirina IX en tabaco mediante el método del Agrobacterium. Se digirió el plásmido pHASYS8 preparado en el Ejemplo 31 con la enzima de restricción NcoI volviendo después romos los extremos del ADN con la ADN polimerasa I con adición de nucleótidos al espacio de ADN de doble hebra. Luego, se desfosforiló el ADN con fosfatasa alcalina derivada de intestino de ternera y se cicló insertando el conector BamHI fosforilado (4610P, fabricado por Takara Syuzo Co., Ltd.) para construir el plásmido pHASYS8B. Se digirió el plásmido pBI121 (fabricado por Clonetech) con las enzimas de restricción BamHI y SacI para separar el gen de la \beta-glucuronidasa. Por otra parte, se digirió el plásmido pHASYS8B con las enzimas de restricción BamHI y SacI para preparar el fragmento de ADN que contenía el gen que codificaba la proteína MG(HASYS)_{8}, se insertó el fragmento de ADN resultante en el plásmido pBI121 remplazando el gen de la \beta-glucuronidasa para preparar el plásmido pBIHMYS8 (Fig. 18) en el que el gen que codificaba la proteína de unión a protoporfirina IX MG(HASYS)_{8} se unía aguas abajo del promotor de 35S.
Se construyó un plásmido para introducir el gen que codificaba el péptido de unión a protoporfirina IX MG(RASSL)_{8} en una planta mediante el método de infección con Agrobacterium. Se preparó el plásmido pBIRASSL8 (Fig. 19) en el cual el gen que codificaba la proteína de unión a protoporfirina IX MG(RASSL)_{8} se unía aguas abajo del promotor de 35S a partir de pRASSL8 de acuerdo con el mismo procedimiento que para pBIHASYS8.
Se introdujeron el plásmido pBIHASYS8 y pBIRASSL8 anteriores en Agrobacterium tumefaciens LBA4404 respectivamente. Los transformantes resultantes se cultivaron en un medio que contenía 300 \mug/ml de estreptomicina, 100 \mug/ml de rifampicina y 25 \mug/ml de kanamicina, seguido de la selección de los transformantes deseados para aislar cepas de Agrobacterium que portaban pBIHASYS8 y pBIRASSL8, respectivamente.
Se infectan trozos de hoja de tabaco cultivado en condiciones estériles con dichas cepas de Agrobacterium para obtener tabaco con el gen que codifica la proteína de unión a protoporfirina IX MG(HASYS)_{8} introducido, y tabaco con el gen que codifica la proteína de unión a protoporfirina IX MG(RASSL)_{8} introducido de la misma manera que en el Ejemplo 5.
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Ejemplo 33 Confirmación de la Resistencia a Compuestos Herbicidas de Tabaco que Porta el Gen que Codifica el Péptido de Unión a Protoporfirina IX Introducido
Se confirma cuantitativamente el nivel de resistencia a compuestos herbicidas sometiendo a ensayo el tabaco con el gen que codifica el péptido de unión a protoporfirina IX introducido preparado en el Ejemplo 32 de la misma manera que en el Ejemplo 14.
Como se ha descrito antes, de acuerdo con la presente invención, se pueden producir plantas resistentes a compuestos para el control de las malas hierbas.
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Texto libre de la lista de secuencias
SEQ ID NO: 1
Oligonucleótido diseñado para amplificar el gen bchH
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SEQ ID NO: 2
Oligonucleótido diseñado para amplificar el gen bchH
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SEQ ID NO: 3
Oligonucleótido diseñado para amplificar el gen PPO de soja
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SEQ ID NO: 4
Oligonucleótido diseñado para amplificar el gen PPO de soja
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SEQ ID NO: 7
Oligonucleótido diseñado para amplificar el gen bchH
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SEQ ID NO: 8
Oligonucleótido diseñado para amplificar el gen bchH
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SEQ ID NO: 9
Oligonucleótido diseñado para amplificar un fragmento de ADN que tiene la secuencia parcial del gen ch1H de tabaco
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SEQ ID NO: 10
Oligonucleótido diseñado para amplificar un fragmento de ADN que tiene la secuencia parcial del gen ch1H de tabaco
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SEQ ID NO: 11
Oligonucleótido diseñado para amplificar un fragmento de ADN que tiene la secuencia parcial del gen PPO de soja
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SEQ ID NO: 12
Oligonucleótido diseñado para amplificar un fragmento de ADN que tiene la secuencia parcial del gen PPO de soja
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SEQ ID NO: 13
Oligonucleótido diseñado para amplificar Fragmento de ADN que tiene la secuencia parcial del gen PPO de soja
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SEQ ID NO: 14
Oligonucleótido diseñado para amplificar Fragmento de ADN que tiene la secuencia parcial del gen PPO de soja
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SEQ ID NO: 15
Oligonucleótido diseñado para amplificar el gen PPO de Chlamydomonas
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SEQ ID NO: 16
Oligonucleótido diseñado para amplificar el gen PPO de Chlamydomonas
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SEQ ID NO: 19
Oligonucleótido diseñado para amplificar un fragmento de ADN que tiene la secuencia parcial del gen PPO de Chlamydomonas
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SEQ ID NO: 20
Oligonucleótido diseñado para amplificar un fragmento de ADN que tiene la secuencia parcial del gen PPO de Chlamydomonas
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SEQ ID NO: 21
Oligonucleótido diseñado para amplificar un fragmento de ADN que tiene la secuencia parcial del gen de la ferroquelatasa de pepino
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SEQ ID NO: 22
Oligonucleótido diseñado para amplificar un fragmento de ADN que tiene la secuencia parcial del gen de la ferroquelatasa de pepino
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SEQ ID NO: 23
Oligonucleótido diseñado para amplificar el gen hemF de Escherichia coli
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SEQ ID NO: 24
Oligonucleótido diseñado para amplificar el gen hemF de Escherichia coli
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SEQ ID NO: 25
Oligonucleótido diseñado para amplificar el gen hemF de Escherichia coli
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SEQ ID NO: 26
Oligonucleótido diseñado para amplificar el gen hemF de Escherichia coli
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SEQ ID NO: 27
Oligonucleótidos diseñados para sintetizar genes que codifican péptidos al azar que comprenden 5 aminoácidos
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SEQ ID NO: 28
Oligonucleótidos diseñados para sintetizar genes que codifican péptidos al azar que comprenden 5 aminoácidos
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SEQ ID NO: 29
Oligonucleótido diseñado para sintetizar el gen que codifica el péptido HASYS
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SEQ ID NO: 30
Oligonucleótido diseñado para sintetizar el gen que codifica el péptido HASYS
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SEQ ID NO: 31
Oligonucleótido diseñado para sintetizar el gen que codifica el péptido RASSL
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SEQ ID NO: 32
Oligonucleótido diseñado para sintetizar el gen que codifica el péptido RASSL
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SEQ ID NO: 33
Oligonucleótido diseñado para sintetizar el gen que codifica el péptido MGHASYS
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SEQ ID NO: 34
Oligonucleótido diseñado para sintetizar el gen que codifica el péptido MGHASYS
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SEQ ID NO: 35
Oligonucleótido diseñado para sintetizar el gen que codifica el péptido MGRASSL
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SEQ ID NO: 36
Oligonucleótido diseñado para sintetizar el gen que codifica el péptido MGRASSL
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SEQ ID NO: 37
Oligonucleótido diseñado para sintetizar el gen que codifica el péptido MGYAGY
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SEQ ID NO: 38
Oligonucleótido diseñado para sintetizar el gen que codifica el péptido MGYAGY
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SEQ ID NO: 39
Oligonucleótido diseñado para sintetizar el gen que codifica el péptido MGYAGF
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SEQ ID NO: 40
Oligonucleótido diseñado para sintetizar el gen que codifica el péptido MGYAGF
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SEQ ID NO: 41
Oligonucleótido diseñado para sintetizar el gen que codifica el péptido MG(HASYS)4
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SEQ ID NO: 42
Oligonucleótido diseñado para sintetizar el gen que codifica el péptido MG(HASYS)4
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SEQ ID NO: 43
Oligonucleótido diseñado para sintetizar el gen que codifica el péptido MG(HASYS)4
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SEQ ID NO: 44
Oligonucleótido diseñado para sintetizar el gen que codifica el péptido MG(HASYS)4
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SEQ ID NO: 45
Oligonucleótido diseñado para sintetizar el gen que codifica el péptido MG(HASYS)8
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SEQ ID NO: 46
Oligonucleótido diseñado para sintetizar el gen que codifica el péptido MG(HASYS)8
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SEQ ID NO: 47
Oligonucleótido diseñado para sintetizar el gen que codifica el péptido MG(RASSL)4
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SEQ ID NO: 48
Oligonucleótido diseñado para sintetizar el gen que codifica el péptido MG(RASSL)4
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SEQ ID NO: 49
Oligonucleótido diseñado para sintetizar el gen que codifica el péptido MG(RASSL)4
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SEQ ID NO: 50
Oligonucleótido diseñado para sintetizar el gen que codifica el péptido MG(RASSL)4
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SEQ ID NO: 51
Oligonucleótido diseñado para sintetizar el gen que codifica el péptido MG(RASSL)8
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SEQ ID NO: 52
Oligonucleótido diseñado para sintetizar el gen que codifica el péptido MG(RASSL)8
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SEQ ID NO: 53
Proteína de unión a protoporfirina IX HASYS
\vskip1.000000\baselineskip
SEQ ID NO: 54
Proteína de unión a protoporfirina IX MGHASYS
\vskip1.000000\baselineskip
SEQ ID NO: 55
Proteína de unión a protoporfirina IX RASSL
\vskip1.000000\baselineskip
SEQ ID NO: 56
Proteína de unión a protoporfirina IX MGRASSL
\vskip1.000000\baselineskip
SEQ ID NO: 57
Proteína de unión a H_{2}TMpyP YAGY
\vskip1.000000\baselineskip
SEQ ID NO: 58
Proteína de unión a H_{2}TMpyP MGYAGY
\vskip1.000000\baselineskip
SEQ ID NO: 59
Proteína de unión a H_{2}TMpyP YAGF
\vskip1.000000\baselineskip
SEQ ID NO: 60
Proteína de unión a H_{2}TMpyP MGYAGF
\vskip1.000000\baselineskip
SEQ ID NO: 61
Proteína de unión a protoporfirina IX MG(HASYS)_{4}
\vskip1.000000\baselineskip
SEQ ID NO: 62
Proteína de unión a protoporfirina IX MG(HASYS)_{8}
\vskip1.000000\baselineskip
SEQ ID NO: 63
Proteína de unión a protoporfirina IX MG(RASSL)_{4}
\vskip1.000000\baselineskip
SEQ ID NO: 64
Proteína de unión a protoporfirina IX MG(RASSL)_{8}
\global\parskip0.000000\baselineskip
<110> Hiroki NAKAJIMA et al.; Sumitomo Chemical Company Limited
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<120> Método para comunicar resistencia a compuestos para el control de las malas hierbas a plantas
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<130>
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<150> JP 10/120553
\vskip0.400000\baselineskip
<151> 1998-04-30
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<150> JP 10/281127
\vskip0.400000\baselineskip
<151> 1998-10-02
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<150> JP 10/330981
\vskip0.400000\baselineskip
<151> 1998-11-20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<150> JP 11/054730
\vskip0.400000\baselineskip
<151> 1999-03-02
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<160> 64
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 1
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 39
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Oligonucleótido diseñado para amplificar el gen bchH
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gacatctaga ggagacgacc atatgcacgg tgaagtctc
\hfill
39
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 2
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 31
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Oligonucleótido diseñado para amplificar el gen bchH
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
acggaagctt agatcttcac tcggcggcaa t
\hfill
31
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 3
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 39
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Oligonucleótido diseñado para amplificar el gen PPO de soja
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 3
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
tcgagctcca tggtttccgt cttcaacgag atcctattc
\hfill
39
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 4
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 39
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Oligonucleótido diseñado para amplificar el gen PPO de soja
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 4
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ttgtcgacaa ctgctactat ttgtacactc tatttg
\hfill
36
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1632
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Glycine max var. Williams82
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)... (1632)
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 5
41
42
43
44
45
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 6
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 543
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Glycine max var. Williams82
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 6
46
47
48
49
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 39
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Oligonucleótido diseñado para amplificar el gen bchH
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 7
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gacatctagt ctagacgacc atatgcacgg tgaagtctc
\hfill
39
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 8
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 31
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Oligonucleótido diseñado para amplificar el gen bchH
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 8
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
acggaagctt ggtacctcac tcggcggcaa t
\hfill
31
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 35
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Oligonucleótido diseñado para amplificar el fragmento de ADN que tiene la secuencia parcial del gen ch1H de tabaco
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 9
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ccaatgtaat gctatggtac ctatgttatt cactc
\hfill
35
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 10
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 34
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Oligonucleótido diseñado para amplificar el fragmento de ADN que tiene la secuencia parcial del gen ch1H de tabaco
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 10
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gagatcattc tttttgctgt cgacttatcg atcg
\hfill
34
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 39
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Oligonucleótido diseñado para amplificar el fragmento de ADN que tiene la secuencia parcial del gen PPO de soja
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 11
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ggcggaggcg tcaccatggt ctgcatcgcc caggcc
\hfill
36
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 12
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 36
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Oligonucleótido diseñado para amplificar el fragmento de ADN que tiene la secuencia parcial del gen PPO de soja
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 12
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gcctgcaggt cgacaactgc tactatttgt acactc
\hfill
36
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 13
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 33
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Oligonucleótido diseñado para amplificar el fragmento de ADN que tiene la secuencia parcial del gen PPO de soja
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 13
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
cacaggaaag gtaccatggt ctgcatcgcc cag
\hfill
33
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 14
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 33
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Oligonucleótido diseñado para amplificar el fragmento de ADN que tiene la secuencia parcial del gen PPO de soja
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 14
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
cctgcagctc gagagctcct actatttgta cac
\hfill
33
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 15
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 28
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Oligonucleótido diseñado para amplificar el gen PPO de Chlamydomonas
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 15
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
aatgatgttg acccagactc ctgggacc
\hfill
28
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 16
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 27
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Oligonucleótido diseñado para amplificar el gen PPO de Chlamydomonas
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 16
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
tactacacat cccagcaagc gccaatg
\hfill
27
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 17
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1838
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Chlamydomonas reinhardtii CC_{4}07
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (2)... (1693)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 17
50
51
52
53
54
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 18
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 563
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Chlamydomonas reinhardtii CC_{4}07
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 18
55
56
57
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 19
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 32
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Oligonucleótido diseñado para amplificar el fragmento de ADN que tiene la secuencia parcial del gen PPO de Chlamydomonas
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 19
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ggtcggtgga ggggatccga tgctggtgac cg
\hfill
32
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 32
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Oligonucleótido diseñado para amplificar el fragmento de ADN que tiene la secuencia parcial del gen PPO de Chlamydomonas
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gctactgctg cgagctctta ggccttgact gc
\hfill
32
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 33
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Oligonucleótido diseñado para amplificar el fragmento de ADN que tiene la secuencia parcial del gen ferroquelatasa de pepino
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 21
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gctttagaat cggatcctat ggcagtggat gac
\hfill
33
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 22
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 36
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Oligonucleótido diseñado para amplificar el fragmento de ADN que tiene la secuencia parcial del gen ferroquelatasa de pepino
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 22
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ggtgaacttc tatttgagct ctcaggtaaa tataag
\hfill
36
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 25
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Oligonucleótido diseñado para amplificar el gen hemF de Escherichia coli
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gctgaaggcg tgatcagtta tttcc
\hfill
25
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Oligonucleótido diseñado para amplificar el gen hemF de Escherichia coli
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 24
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
catcagcctg cagtgcgaaa agtg
\hfill
24
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 25
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 26
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Oligonucleótido diseñado para amplificar el gen hemF de Escherichia coli
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 25
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
cgaaaaaggg atccgttatg aaaccc
\hfill
26
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 26
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
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<213> Secuencia Artificial
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<223> Oligonucleótido diseñado para amplificar el gen hemF de Escherichia coli
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<223> Oligonucleótidos diseñados para sintetizar genes que codifican péptidos al azar que comprenden 5 aminoácidos
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<220>
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<223> Oligonucleótidos diseñados para sintetizar genes que codifican péptidos al azar que comprenden 5 aminoácidos
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<223> Oligonucleótido diseñado para sintetizar el gen que codifica el péptido HASYS
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<223> Oligonucleótido diseñado para sintetizar el gen que codifica el péptido HASYS
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<223> Oligonucleótido diseñado para sintetizar el gen que codifica el péptido RASSL
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<223> Oligonucleótido diseñado para sintetizar el gen que codifica el péptido RASSL
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<223> Oligonucleótido diseñado para sintetizar el gen que codifica el péptido MGHASYS
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<223> Oligonucleótido diseñado para sintetizar el gen que codifica el péptido MGHASYS
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<223> Oligonucleótido diseñado para sintetizar el gen que codifica el péptido MGRASSL
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<212> ADN
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
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<223> Oligonucleótido diseñado para sintetizar el gen que codifica el péptido MGRASSL
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<220>
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<223> Oligonucleótidos diseñados para sintetizar el gen que codifica el péptido MGYAGY
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<213> Secuencia Artificial
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<223> Oligonucleótido diseñado para sintetizar el gen que codifica el péptido MGYAGY
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
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<223> Oligonucleótido diseñado para sintetizar el gen que codifica el péptido MGYAGF
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<213> Secuencia Artificial
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<223> Oligonucleótido diseñado para sintetizar el gen que codifica el péptido MGYAGF
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<212> ADN
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
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<223> Oligonucleótido diseñado para sintetizar el gen que codifica el péptido MG(HASYS)4
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<212> ADN
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
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<223> Oligonucleótido diseñado para sintetizar el gen que codifica el péptido MG(HASYS)4
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<213> Secuencia Artificial
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<223> Oligonucleótido diseñado para sintetizar el gen que codifica el péptido MG (HASYS)4
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<213> Secuencia Artificial
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<223> Oligonucleótido diseñado para sintetizar el gen que codifica el péptido MG(HASYS) 4
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<212> ADN
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<213> Secuencia Artificial
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<223> Oligonucleótido diseñado para sintetizar el gen que codifica el péptido MG (HASYS)8
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<213> Secuencia Artificial
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<223> Oligonucleótido diseñado para sintetizar el gen que codifica el péptido MG(HASYS)8
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<223> Oligonucleótido diseñado para sintetizar el gen que codifica el péptido MG(RASSL)4
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<212> ADN
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<213> Secuencia Artificial
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<223> Oligonucleótido diseñado para sintetizar el gen que codifica el péptido MG(RASSL)4
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<212> ADN
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
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<223> Oligonucleótido diseñado para sintetizar el gen que codifica el péptido MG(RASSL)4
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<211> 35
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<212> ADN
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<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
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<223> Oligonucleótido diseñado para sintetizar el gen que codifica el péptido MG(RASSL)4
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<212> ADN
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<213> Secuencia Artificial
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<223> Oligonucleótido diseñado para sintetizar el gen que codifica el péptido MG(RASSL)8
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<211> 30
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<212> ADN
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<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
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<223> Oligonucleótido diseñado para sintetizar el gen que codifica el péptido MG(RASSL)8
\vskip1.000000\baselineskip
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acgcagggaa gatgcgcgca gggaagaagc
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<210> 53
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<211> 5
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<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Proteína de unión a protoporfirina IX HASYS
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 53
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
58
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 54
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Proteína de unión a protoporfirina IX MGHASYS
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 54
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
59
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 55
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Proteína de unión a protoporfirina IX RASSL
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 55
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
60
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 56
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Proteína de unión a protoporfirina IX MGRASSL
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 56
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
61
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 57
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 4
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Proteína de unión a H_{2}TMpyP YAGY.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 57
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
610
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 58
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 6
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Proteína de unión a H_{2}TMpyP MGYAGY
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 58
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
62
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 59
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 4
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Proteína de unión a H_{2}TMpyP YAGF
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 59
\hskip1cm
63
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 60
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 6
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Proteína de unión a H_{2}TMpyP MGYAGF
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 60
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
64
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 61
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 22
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Proteína de unión a protoporfirina IX MG (HASYS)_{4}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 61
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
65
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 62
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 42
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Proteína de unión a protoporfirina IX MG(HASYS)_{8}
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 62
66
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 63
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 22
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Proteína de unión a protoporfirina IX MG(RASSL)_{4}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 63
67
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 64
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 42
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Proteína de unión a protoporfirina IX MG(RASSL)_{8}.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 64
68

Claims (34)

1. Un método para elaborar plantas resistentes a compuestos para el control de las malas hierbas que comprende las etapas de
(a)
introducir en una célula vegetal un gen que codifica una proteína seleccionada del grupo que consiste en:
\quad
magnesio quelatasa de tipo activo o inactivo que tiene afinidad por la protoporfirina IX;
\quad
ferroquelatasa de tipo activo o inactivo que tiene afinidad por la protoporfirina IX; cobalto quelatasa de tipo activo o inactivo que tiene afinidad por la protoporfirina IX,
\quad
un péptido que tiene afinidad por la protoporfirina IX, compuesto por 6 a 100 aminoácidos, estando dicho péptido esencialmente libre de regiones marco de regiones variables de una inmunoglobulina;
\quad
protoporfirinógeno IX oxidasa de tipo inactivo que tiene afinidad por el protoporfirinógeno IX; y
\quad
coproporfirinógeno III oxidasa de tipo activo o inactivo que tiene afinidad por el protoporfirinógeno IX,
\quad
no teniendo esencialmente dichas proteínas capacidad de modificar el protoporfirinógeno IX; y
(b)
expresar el gen.
2. El método de acuerdo con la reivindicación 1, donde el compuesto para el control de las malas hierbas está inhibiendo la biosíntesis de porfirina de una planta.
3. El método de acuerdo con la reivindicación 1 o 2, donde el compuesto para el control de las malas hierbas es un compuesto herbicida de tipo inhibidor de protoporfirinógeno IX oxidasa.
4. El método de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3, donde la proteína es la magnesio quelatasa o una variante de dicha proteína que tiene afinidad específica por la protoporfirina IX.
5. El método de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3, donde la proteína es una proteína de la subunidad de unión a protoporfirina IX de la magnesio quelatasa, o una variante de dicha proteína que tiene afinidad específica por la protoporfirina IX.
6. El método de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 5, donde la magnesio quelatasa deriva de un microorganismo fotosintético o una planta.
7. El método de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 6, donde la magnesio quelatasa deriva de tabaco.
8. El método de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3, donde la proteína es una variante de la protoporfirinógeno IX oxidasa que no tiene capacidad para oxidar el protoporfirinógeno IX y que tiene una afinidad específica por el protoporfirinógeno IX.
9. El método de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3, donde la proteína es una variante de la protoporfirinógeno IX oxidasa que no tiene capacidad para oxidar el protoporfirinógeno IX y que tiene afinidad específica por un compuesto herbicida de tipo inhibidor de la protoporfirinógeno IX oxidasa.
10. El método de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3, 8 o 9, donde la protoporfirinógeno IX oxidasa deriva de una planta.
11. El método de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3 o 8 a 10, donde la protoporfirinógeno IX oxidasa deriva de soja.
12. El método de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3, 8 o 9, donde la protoporfirinógeno IX oxidasa deriva de algas.
13. El método de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3, 8, 9 o 12, donde la protoporfirinógeno IX oxidasa deriva de Chlamydomonas.
14. El método de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3, donde la proteína es ferroquelatasa o una variante de dicha proteína que tiene afinidad específica por la protoporfirina IX.
15. El método de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3 o 14, donde la ferroquelatasa deriva de una planta.
16. El método de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3, 14 o 15, donde la ferroquelatasa deriva de cebada o de pepino.
17. El método de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3, donde el péptido comprende la secuencia de aminoácidos del SEQ ID NO: 53, SEQ ID NO: 54, SEQ ID NO: 55, SEQ ID NO: 56, SEQ ID NO: 57, SEQ ID NO: 58, SEQ ID NO: 59, o SEQ ID NO: 60.
18. El método de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3, o 17, donde el péptido comprende la repetición de la secuencia de aminoácidos del SEQ ID NO: 53, 55, 57 o 59 cuatro veces u ocho veces.
19. El método de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3, donde la proteína es la coproporfirinógeno III oxidasa o una variante de dicha proteína que tiene afinidad específica por el protoporfirinógeno IX.
20. El método de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3 o 19, donde la coproporfirinógeno III oxidasa deriva de un microorganismo.
21. El método de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3, 19 o 20, donde la coproporfirinógeno III oxidasa deriva de Escherichia coli.
22. El método de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 21, donde el gen es introducido en la célula vegetal de forma que está ligado operablemente a un promotor y un terminador ambos los cuales son funcionales en la célula vegetal.
23. El método de acuerdo con la reivindicación 1, donde el compuesto para el control de las malas hierbas está inhibiendo la transferencia de electrones en la fotosíntesis, la biosíntesis de carotenoides, la biosíntesis de aminoácidos, la biosíntesis de lípidos o la biosíntesis de la pared celular, influyendo en la biosíntesis de proteínas, la biosíntesis de ácido nucleico o la división celular o teniendo una actividad antagonista de auxinas.
24. El método de la reivindicación 23, donde el compuesto para el control de las malas hierbas que inhibe la transferencia de electrones en la fotosíntesis es un compuesto que inhibe la transferencia de electrones del sistema fotoquímico I o II o inhibe la 4-hidroxifenilpiruvato-dioxigenasa (4-HPPD); el que inhibe la biosíntesis de carotenoides es un compuesto que inhibe la fitoeno-desaturasa (PDS); el que inhibe la biosíntesis de aminoácidos es un compuesto que inhibe la EPSPS, la acetolactato sintasa (ALS), la glutamina sintetasa (GS) o la dihidropteroato sintasa (DHP); el que inhibe la biosíntesis de lípidos es un compuesto que inhibe la acetil CoA carboxilasa (ACC); el que inhibe la biosíntesis de la pared celular es un compuesto que inhibe la biosíntesis de celulosa; el que influyen en la biosíntesis de proteínas, la biosíntesis de ácido nucleico o la división celular es un compuesto que inhibe la formación de microtúbulos; o el que tiene la actividad antagónica de auxinas es un compuesto que potencia la elongación y diferenciación celular.
25. El método de la reivindicación 24, donde el compuesto que inhibe la transferencia de electrones en el sistema fotoquímico I es paraquat o diquat; el que inhibe la transferencia de electrones en el sistema fotoquímico II es un compuesto de triazina, un compuesto de urea o un compuesto de nitrilo; el que inhibe la 4-HPPD es un isoxazol, pirazol o tricetona; el que inhibe la PDS es norflurazon, flurocloridon, fluridona, flurtamona o diflufenican; el que inhibe la EPSPS es glifosato; el que inhibe la ALS es una sulfonilurea, imidazolinona, pirimidiniltiobenzoato o triazolopirimidina; el que inhibe GS es bialafos o glufosinato; el que inhibe la DHP es asulam; el que inhibe ACC es una ciclohexanodiona o ariloxifenoxipropionato; o el que inhibe la celulosa es diclobenilo.
26. El método de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 22, donde el compuesto para el control de las malas hierbas es un compuesto herbicida de tipo inhibidor de protoporfirinógeno IX oxidasa seleccionado entre los compuestos (1) a (3) de más abajo:
(1)
clormetoxinil, bifenox, clomitrofeno, acifluorfeno y su éster etílico, acifluorfeno-sodio, oxifluorfeno, oxadiazon, 2-[4-cloro-2-fluoro-5-(prop-2-iniloxi)fenil]-2, 3, 4, 5, 6, 7-hexahidro-1H-isoindol-1,3-diona, clorfalim, TNPP-etilo, o N3-(1-feniletil)-2,6-dimetil-5-propionilnicotinamida;
(2)
un compuesto representado por la fórmula general: J-G (I), donde G es un grupo representado por una cualquiera de las siguientes fórmulas generales G-1 a G-9 y J es un grupo representado por una cualquiera de las siguientes fórmulas generales J-1 a J-30:
69
70
71
72
\quad
donde las líneas discontinuas en las fórmulas J-5, J-6, J-12 y J-24 significan que el anillo de la izquierda contiene solamente enlaces sencillos, o un enlace en el anillo de la derecha es un doble enlace entre los átomos de carbono;
\quad
X es un átomo de oxígeno o un átomo de azufre;
\quad
Y es un átomo de oxígeno o un átomo de azufre;
\quad
R^{1} es un átomo de hidrógeno o un átomo de halógeno;
\quad
R^{2} es un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{8}, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{8}, un átomo de halógeno, un grupo OH, un grupo OR^{27}, un grupo SH, un grupo S(O)_{p}R^{27}, un grupo COR^{27}, un grupo CO_{2}R^{27}, un grupo C(O)SR^{27}, un grupo C(O)NR^{25}R^{30}, un grupo CHO, un grupo CR^{27}=NOR^{36}, un grupo CH=CR^{37}CO_{2}R^{27}, un grupo CH_{2}CHR^{37}CO_{2}R^{27}, un grupo CO_{2}N=CR^{31}R^{32}, un grupo nitro, un grupo ciano, un grupo NHSO_{2}R^{33}, un grupo NHSO_{2}NHR^{33}, un grupo NR^{27}R^{39}, un grupo NH_{2} o un grupo fenilo opcionalmente con uno o más grupos alquilo C_{1}-C_{4} iguales o diferentes;
\quad
p es 0, 1 o 2;
\quad
R^{3} es un grupo alquilo C_{1}-C_{2}, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{2}, un grupo OCH3, un grupo SCH3, un grupo OCHF2, un átomo de halógeno, a grupo ciano o un grupo nitro;
\quad
R^{4} es un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{3}, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{3} o un átomo de halógeno;
\quad
R^{5} es un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{3}, un átomo de halógeno, a grupo haloalquilo C_{1}-C_{3}, grupo ciclopropilo, un grupo vinilo, un grupo alquinilo C_{2}, un grupo ciano, un grupo C(O)R^{38}, CO_{2}R^{38}, un grupo C(O)NR^{38}R^{39}, un grupo CR^{34}R^{35}CN, un grupo CR^{34}R^{35}C(O)R^{38}, un grupo CR^{34}R^{35}CO_{2}R^{38}, un grupo CR^{34}R^{35}C(O)NR^{38}R^{39}, un grupo CHR^{34}OH, un grupo CHR^{34}OC(O)R^{38} o un grupo OCHR^{34}OC(O)NR^{39}R^{39}, o, cuando G es G-2 o G-6, R^{4} y R^{5} pueden formar un grupo C=O junto con el átomo de carbono al que están anclados;
\quad
R^{6} es un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{6}, un grupo alcoxialquilo C_{2}-C_{6}, un grupo alquenilo C_{3}-C_{6} o un grupo alquinilo C_{3}-C_{6};
\quad
X^{1} es un enlace sencillo, un átomo de oxígeno, un átomo de azufre, un grupo NH, un grupo N(alquilo C_{1}-C_{3}), un grupo N(haloalquilo C_{1}-C_{3}) o un grupo N(alilo);
\quad
R^{7} es un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{6}, un átomo de halógeno, un grupo S(O)_{2}(alquilo C_{1}-C_{6}) o un grupo C(=O)R^{40};
\quad
R^{9} es un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{8}, un grupo cicloalquilo C_{3}-C_{8}, un grupo alquenilo C_{3}-C_{8}, un grupo alquinilo C_{3}-C_{8}, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{8}, un grupo alcoxialquilo C_{2}-C_{8}, un grupo alcoxialcoxialquilo C_{3}-C_{8}, un grupo alcoxialquinilo C_{3}-C_{8}, un grupo haloalquenilo C_{3}-C_{8}, un grupo alquilsulfonilo C_{1}-C_{8}, un grupo haloalquilsulfonilo C_{1}-C_{8}, un grupo alcoxicarbonilalquilo C_{3}-C_{8}, un grupo S(O)_{2}NH(alquilo C_{1}-C_{8}), un grupo C(O)R^{41} o un grupo bencilo cuyo anillo de fenilo puede estar sustituido con R^{42};
\quad
n y m son independientemente 0, 1, 2 o 3 y m + n es 2 o 3;
\quad
Z es un grupo CR^{9}R^{10}, un átomo de oxígeno, un átomo de azufre, un grupo S(O), un grupo S(O)2 o un grupo N(alquilo C_{1}-C_{4});
\quad
cada R^{9} es independientemente un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{3}, un átomo de halógeno, un grupo hidroxilo, un grupo alcoxi C_{1}-C_{6}, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{6}, un grupo haloalcoxi C_{1}-C_{6}, un grupo alquilcarboniloxi C_{2}-C_{6} o un grupo haloalquilcarboniloxi C_{2}-C_{6};
\quad
cada R^{10} es independientemente un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{3}, y un grupo hidroxilo o un átomo de halógeno;
\quad
R^{11} y R^{12} son independientemente un átomo de hidrógeno, un átomo de halógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, un grupo alquenilo C_{3}-C_{6} o un grupo haloalquilo C_{1}-C_{6};
\quad
R^{13} es un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{6}, un grupo alquenilo C_{3}-C_{6}, un grupo haloalquenilo C_{3}-C_{6}, un grupo alquinilo C_{3}-C_{6}, un grupo haloalquinilo C_{3}-C_{6}, un grupo HC(=O), un grupo (alquilo C_{1}-C_{4})C(=O) o un grupo NH_{2};
\quad
R^{14} es un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, un grupo alquil(C_{1}-C_{6})tio, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{6} o un grupo N(CH_{3})_{2};
\quad
W es un átomo de nitrógeno o CR^{15};
\quad
R^{15} es un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, un átomo de halógeno, o grupo fenilo opcionalmente sustituido con un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, uno o dos átomos de halógeno, un grupo alcoxi C_{1}-C_{6} o un grupo CF3;
\quad
cada Q es independientemente un átomo de oxígeno o un átomo de azufre;
\quad
Q^{1} es un átomo de oxígeno o un átomo de azufre;
\quad
Z^{1} es un grupo CR^{16}R^{17}, un átomo de oxígeno, un átomo de azufre, un grupo S(O), un grupo S(O)2 o un grupo N(alquilo C_{1}-C_{4});
\quad
cada R^{16} es independientemente un átomo de hidrógeno, un átomo de halógeno, un grupo hidroxilo, un grupo alcoxi C_{1}-C_{6}, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{6}, un grupo haloalcoxi C_{1}-C_{6}, un grupo alquilcarboniloxi C_{2}-C_{6} o un grupo haloalquilcarboniloxi C_{2}-C_{6};
\quad
cada R^{17} es independientemente un átomo de hidrógeno, un grupo hidroxilo o un átomo de halógeno;
\quad
R^{18} es un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, un átomo de halógeno o un grupo haloalquillo C_{1}-C_{5};
\quad
R^{19} y R^{20} son independientemente un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, o un grupo haloalquillo C_{1}-C_{5};
\quad
Z^{2} es un átomo de oxígeno, un átomo de azufre, un grupo NR9 o un grupo CR^{9}R^{10};
\quad
R^{21} y R^{22} son independientemente un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{6}, un grupo alquenilo C_{3}-C_{6}, un grupo haloalquenilo C_{3}-C_{6}, un grupo alquinilo C_{3}-C_{6} o un grupo haloalquinilo C_{3}-C_{6};
\quad
R^{13} es un átomo de hidrógeno, un átomo de halógeno o un grupo ciano;
\quad
R^{24} es un grupo alquil(C_{1}-C_{6})sulfonilo, un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{6}, un grupo alquenilo C_{3}-C_{6}, un grupo alquinilo C_{3}-C_{6}, un grupo alcoxi C_{1}-C_{6}, un grupo haloalcoxi C_{1}-C_{6} o un átomo de halógeno;
\quad
R^{25} es un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{6}, un grupo alquenilo C_{3}-C_{6} o un grupo alquinilo C_{3}-C_{6};
\quad
R^{26} es un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{6} o un grupo fenilo opcionalmente sustituido con un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, uno o dos átomos de halógeno, uno o dos grupos nitro, un grupo alcoxi C_{1}-C_{6} o un grupo CF3;
\quad
W^{1} es un átomo de nitrógeno o un grupo CH;
\quad
T es un grupo representado por una cualquiera de las siguientes fórmulas generales T-1, T-2 y T-3;
73
\quad
(donde E^{1}, E^{2}, E^{3}, E^{4}, E^{5}, E^{6}, E^{7}, E^{8}, E^{9}, E^{10}, E^{11} y E^{12} son independientemente un átomo de hidrógeno o un grupo alquilo C_{1}-C_{3});
\quad
R^{27} es un grupo alquilo C_{1}-C_{8}, un grupo cicloalquilo C_{3}-C_{8}, un grupo alquenilo C_{3}-C_{8}, un grupo alquinilo C_{3}-C_{8}, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{8}, un grupo alcoxialquilo C_{2}-C_{8}, un grupo alquiltioalquilo C_{2}-C_{8}, un grupo alquilsulfinilalquilo C_{2}-C_{8}, un grupo alquilsulfonilalquilo C_{2}-C_{8}, un grupo alquilsulfonilo C_{1}-C_{8}, un grupo fenilsulfonilo cuyo anillo de fenilo puede estar sustituido con al menos un sustituyente seleccionado del grupo que consiste en un átomo de halógeno y un grupo alquilo C_{1}-C_{4}, un grupo alcoxialcoxialquilo C_{4}-C_{9}, un grupo ciclo-alquilalquilo C_{4}-C_{8}, un grupo cicloalcoxialquilo C_{6}-C_{8}, un grupo alqueniloxialquilo C_{4}-C_{9}, un grupo alquiniloxialquilo C_{4}-C_{8}, un grupo haloalcoxialquilo C_{3}-C_{8}, un grupo haloalqueniloxialquilo C_{3}-C_{8}, un grupo haloalquiniloxialquilo C_{3}-C_{8}, un grupo cicloalquiltioalquilo C_{6}-C_{8}, un grupo alquenil-tioalquilo C_{4}-C_{8}, un grupo alquiniltioalquilo C_{4}-C_{8}, un grupo alquilo C_{1}-C_{4} sustituido con un grupo fenoxi cuyo anillo está sustituido con al menos un sustituyente seleccionado del grupo que consiste en un átomo de halógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{3} y grupo haloalquilo C_{1}-C_{3}, un grupo benciloxi cuyo anillo está sustituido con al menos un sustituyente seleccionado del grupo que consiste en un átomo de halógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{3} y, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{3}, un grupo trialquilsililalquilo C_{4}-C_{8}, un grupo cianoalquilo C_{3}-C_{8}, un grupo halocicloalquilo C_{3}-C_{8}, un grupo haloalquenilo C_{3}-C_{8}, un grupo alcoxialquenilo C_{5}-C_{3}, un grupo haloalcoxialquenilo C_{5}-C_{8}, un grupo alquiltioalquenilo C_{5}-C_{8}, un grupo alcoxialquinilo C_{3}-C_{8}, un grupo alcoxialquinilo C_{5}-C_{8}, un grupo haloalcoxialquinilo C_{5}-C_{8}, un grupo alquil(C_{5}-C_{8})tioalquinilo, un grupo alquilcarbonilo C_{2}-C_{8}, un grupo bencilo cuyo anillo está sustituido con al menos un sustituyente seleccionado del grupo que consiste en un átomo de halógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{3} y un grupo haloalquilo C_{1}-C_{3}, un grupo CHR^{34}COR^{23}, un grupo CHR^{34}COOR^{28}, un grupo CHR^{34}P(O)(OR^{28})_{2}, un grupo CHR^{34}P(S)(OR^{28})_{z}, un grupo CHR^{34}C(O)NR^{29}R^{30} o un grupo CHR^{34}C(O)NH_{2};
\quad
R^{28} es un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, un grupo alquenilo C_{2}-C_{6}, un grupo alquinilo C_{3}-C_{6} o un grupo tetrahidrofuranilo;
\quad
R^{29} y R^{31} son independientemente un átomo de hidrógeno o un grupo alquilo C_{1}-C_{4};
\quad
R^{30} y R^{32} son independientemente un grupo alquilo C_{1}-C_{4} o un grupo fenilo cuyo anillo puede estar sustituido con al menos un sustituyente seleccionado del grupo que consiste en un átomo de halógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{3} y un grupo haloalquilo C_{1}-C_{3}; o,
\quad
R^{29} y R^{30} pueden formar juntos -(CH_{2})_{5}-, -(CH_{2})_{4}- o -CH_{2}CH_{2}OCH_{2}CH_{2}-, o el anillo formado de este modo puede estar sustituido con al menos un sustituyente seleccionado del grupo que consiste en un grupo alquilo C_{1}-C_{3}, un grupo fenilo y un grupo bencilo; o,
\quad
R^{31} y R^{32} pueden formar un grupo cicloalquilo C_{3}-C_{8} junto con el átomo de carbono al que están anclados;
\quad
R^{33} es un grupo alquilo C_{1}-C_{4}, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{4} o un grupo alquenilo C_{3}-C_{6};
\quad
R^{34} y R^{35} son independientemente un átomo de hidrógeno o un grupo alquilo C_{1}-C_{4};
\quad
R^{36} es un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{5}, un grupo alquenilo C_{3}-C_{6} o un grupo alquinilo C_{3}-C_{6};
\quad
R^{37} es un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{4} o un átomo de halógeno;
\quad
R^{38} es un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, un grupo cicloalquilo C_{3}-C_{6}, un grupo alquenilo C_{3}-C_{6}, un grupo alquinilo C_{3}-C_{6}, un grupo alcoxialquilo C_{2}-C_{6}, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{6}, a grupo fenilo cuyo anillo puede estar sustituido con al menos un sustituyente seleccionado del grupo que consiste en un átomo de halógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{4} y un grupo alcoxi C_{1}-C_{4}, un grupo -CH_{2}CO_{2}(alquilo C_{1}-C_{4}) o un grupo -CH(CH_{3})CO_{2}-(alquilo C_{1}-C_{4});
\quad
R^{39} es un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{2} o un grupo C(O)O(alquilo C_{1}-C_{4});
\quad
R^{40} es un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, un grupo alcoxi C_{1}-C_{6} o un grupo NH (alquilo C_{1}-C_{6});
\quad
R^{41} es un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{6}, un grupo alcoxi C_{1}-C_{6}, un grupo NH(alquilo C_{1}-C_{6}), un grupo fenilo cuyo anillo puede estar sustituido con un sustituyente seleccionado del grupo que consiste en un grupo R42, un grupo bencilo y un grupo dialquilamino C_{2}-C_{8}; y
\quad
R^{12} es un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, uno o dos átomos de halógeno, un grupo alcoxi C_{1}-C_{6} o un grupo CF_{3};
\newpage
(3)
un compuesto de fórmula (II):
74
\quad
o nipilacrofeno,
donde R^{43} es un grupo alquilo C_{1}-C_{4};
R^{4} es un grupo alquilo C_{1}-C_{4}, un grupo alquil(C_{1}-C_{4})tio , un grupo alcoxi C_{1}-C_{4}, un grupo haloalquilo C_{1}-C_{4}, un grupo haloalquil(C_{1}-C_{4})tio o un grupo haloalcoxi C_{1}-C_{4};
R^{43} y R^{44} pueden formar juntos -(CH_{2})_{3}- o (CH_{2})_{4}-;
R^{45} es un átomo de hidrógeno o un átomo de halógeno;
R^{46} es un átomo de hidrógeno o un grupo alquilo C_{1}-C_{4};
R^{47} es un átomo de hidrógeno, un grupo nitro, un grupo ciano, un grupo -COOR^{49}, un grupo -C(=X)NR^{50}R^{51} o un grupo -C(=X^{2})R^{52};
R^{48} es un átomo de hidrógeno, un átomo de halógeno, un grupo ciano, un grupo alquilo C_{1}-C_{4} opcionalmente sustituido con al menos un sustituyente seleccionado del grupo que consiste en un átomo de halógeno y un grupo hidroxilo, un grupo alcoxi C_{1}-C_{4}, un grupo fenilo opcionalmente sustituido con al menos un sustituyente seleccionado del grupo que consiste en un átomo de halógeno, un grupo nitro, un grupo ciano, un grupo alquilo C_{1}-C_{4}, un grupo alcoxi C_{1}-C_{4} y un grupo haloalquilo C_{1}-c4, un grupo pirrolilo, un grupo alquilo C_{2}-C_{8}, un grupo alquenilo C_{3}-C_{8}, un grupo alquinilo C_{3}-C_{8}, un grupo alcoxi C_{3}-C_{9}, un grupo seleccionado del grupo que consiste en un grupo alquilo C_{2}-C_{8}, un grupo alquenilo C_{3}-C_{8}, un grupo alquinilo C_{3}-C_{8} y un grupo alcoxi C_{3}-C_{8} en el que al menos un átomo de oxígeno es insertado, o uno cualquiera de los grupos representados por las siguientes fórmulas:
75
\vskip1.000000\baselineskip
76
donde R^{49}, R^{50} y R^{52} son, iguales o diferentes, un átomo de hidrógeno o un grupo alquilo C_{1}-C_{4};
R^{50} y R^{51} pueden formar un anillo de 5 o 6 miembros alicíclico saturado junto con un átomo de nitrógeno al que están anclados;
R^{52} es un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{4} o un grupo alquilo C_{1}-C_{4} sustituido con al menos un átomo de halógeno;
R^{53} es un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{4} opcionalmente sustituido con al menos un átomo de halógeno, un grupo alquenilo C_{2}-C_{6} opcionalmente sustituido con al menos un átomo de halógeno, un grupo alquinilo C_{3}-C_{6} opcionalmente sustituido con al menos un átomo de halógeno, a grupo fenilo opcionalmente sustituido con al menos un átomo de halógeno, un grupo cicloalquilo C_{3}-C_{8}, un grupo cianometilo, o un grupo R^{63}CO-;
R^{54} es un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{6} opcionalmente sustituido con al menos un átomo de halógeno, un grupo alquenilo C_{2}-C_{6} opcionalmente sustituido con al menos un átomo de halógeno, un grupo alquinilo C_{3}-C_{6} opcionalmente sustituido con al menos un átomo de halógeno, a grupo fenilo opcionalmente sustituido con un átomo de halógeno, un grupo cicloalquilo C_{3}-C_{8}, un grupo cianometilo, C_{1}-C_{4} alkoxi-un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, di-C_{1}-C_{4} alkylamino-un grupo alquilo C_{1}-C_{4}, un grupo tetrahidrofurfurilo, C_{3}-C_{6} alkiniloxi-un grupo alquilo C_{1}-C_{4}, a bencilo cuyo anillo puede estar sustituido con un sustituyente seleccionado del grupo que consiste en un átomo de halógeno, un grupo nitro, un grupo ciano, un grupo alquilo C_{1}-C_{4}, un grupo alcoxi C_{1}-C_{4} y un grupo haloalquilo C_{1}-C_{4}, un grupo -C(=X^{2})R^{63}, un grupo (CH_{2})_{a}-(O)_{d}-R^{70}, un grupo -(CH_{2})_{a}-O-(CH_{2})_{b}-R^{70}, un grupo -(CH_{2})_{a}-X^{2}-R^{76};
R^{53} y R^{54} junto con un átomo de nitrógeno al que están anclados pueden formar un anillo de 3, 5 o 6 miembros alicíclico saturado o un anillo de 5 o 6 miembros aromático en el que un átomo de carbono puede ser opcionalmente remplazado por un átomo de oxígeno;
R^{35} es un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{4}, un grupo alquenilo C_{2}-C_{6} o un grupo alquinilo C_{3}-C_{6}, o R^{55} y R^{56} pueden formar juntos -(CH_{2})_{e}-;
R^{56} y R^{57} son independientemente un grupo alquilo C_{1}-C_{4} opcionalmente sustituido con al menos un átomo de halógeno, un grupo alquenilo C_{2}-C_{6} opcionalmente sustituido con al menos un átomo de halógeno, un grupo alquinilo C_{3}-C_{6} opcionalmente sustituido con al menos un átomo de halógeno o un grupo fenilo opcionalmente sustituido con al menos un átomo de halógeno, un átomo de hidrógeno, un grupo cicloalquilo C_{3}-C_{6}, un grupo -XR^{60} o un grupo -NR^{61}R^{62};
R^{58} es un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{6}, un grupo alquinilo C_{2}-C_{6}, un grupo alquinilo C_{3}-C_{6}, un grupo alquilcarbonilo C_{1}-C_{4}, un grupo cianoalquilo C_{1}-C_{3}, un grupo alcoxicarbonil(C_{1}-C_{4})alquilo C_{1}-C_{4}, un grupo dialcoxicarbonil(C_{1}-C_{4})alquilo C_{1}-C_{4}, un grupo bencilo, un grupo alcoxil(C_{1}-C_{4})alquinilo C_{1}-C_{4}, un grupo -(CH_{2})_{a}-R^{75}, un grupo -(CH_{2})_{a}-X^{2}-R^{72}, un grupo -(CH_{2})_{a}-X^{2}-(CH_{2})_{b}-R^{72} o un grupo -(CH_{2})_{a}-X^{2}-(CH_{2})_{b}-X^{2}-(CH_{2})_{c}-R^{72};
R^{59} es un átomo de hidrógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{4}, un grupo alquenilo C_{2}-C_{6}, un grupo alquinilo C_{3}-C_{6}, un grupo cianoalquilo C_{1}-C_{3}, un grupo alquil(C_{1}-C_{4})carbonilalquilo C_{1}-C_{3} o un grupo fenilo;
R^{60} es un grupo alquilo C_{1}-C_{4} opcionalmente sustituido con al menos un átomo de halógeno;
R^{61} y R^{62} son, iguales o diferentes, un átomo de hidrógeno o un grupo alquilo C_{1}-C_{4};
R^{53} es un grupo alquilo C_{1}-C_{4} opcionalmente sustituido con al menos un átomo de halógeno, un grupo alcoxi(C_{1}-C_{4})alquilo C_{1}-C_{4}, un grupo alquil(C_{1}-C_{4})tioalquilo C_{1}-C_{4}, un grupo cicloalquilo C_{3}-C_{6}, un grupo fenilo cuyo anillo puede estar sustituido con un sustituyente seleccionado del grupo que consiste en un átomo de halógeno, un grupo nitro, un grupo ciano, un grupo alquilo C_{1}-C_{4}, un grupo alcoxi C_{1}-C_{4} y un grupo haloalquilo C_{1}-C_{4}, un grupo -NR^{73}R^{74} o un grupo -(CH_{2})_{a}-(O)_{d}-R^{75};
R^{64} es un grupo alcoxicarbonilo C_{1}-C_{4} o un grupo carboxilo;
R^{65} es un grupo clorometilo, un grupo cianometilo, un grupo cicloalquilo C_{3}-C_{6} en el que al menos un átomo de oxígeno puede ser insertado, o un grupo alcoxicarbonil(C_{1}-C_{4})alquilo C_{1}-C_{4};
R^{65} es un grupo hidroxilo o un grupo -NR^{67}R^{68};
A es un grupo NR^{67}R^{68} o un grupo -S(O)_{r}-R^{69};
R^{67} y R^{63} son, iguales o diferentes, un átomo de hidrógeno o un grupo alquilo C_{1}-C_{4};
R^{69} es un grupo alquilo C_{1}-C_{4} o un grupo haloalquilo C_{1}-C_{4};
R^{70} es un átomo de hidrógeno, un grupo hidroxilo, un átomo de halógeno, un grupo alquilo C_{1}-C_{4} opcionalmente sustituido con al menos un grupo alcoxi C_{1}-C_{4}, un grupo cicloalquilo C_{3}-C_{6} en el que al menos un átomo de oxígeno puede ser insertado, un grupo cicloalquilo C_{3}-C_{6} opcionalmente sustituido con uno o dos grupos metilo, un grupo furilo, un grupo tienilo o un grupo -C(=O)R^{71};
R^{71} y R^{72} son, iguales o diferentes, un grupo alquilo C_{1}-C_{4} o un grupo alcoxi C_{1}-C_{4};
R^{73} y R^{74} son, iguales o diferentes, un grupo alquilo C_{1}-C_{4} o un grupo fenilo;
R^{75} es un grupo cicloalquilo C_{3}-C_{6} en el que al menos un átomo de oxígeno puede ser insertado, un grupo cicloalquilo C_{3}-C_{6} opcionalmente sustituido con uno o dos grupos metilo, un grupo furilo, un grupo tienilo o un grupo -C(=O)R^{71};
R^{76} es un grupo alquilo C_{1}-C_{4};
a, b y c es independientemente 1, 2 o 3;
d es 0 o 1;
e es 2 o 3;
f es 1 o 2; y
X^{2} es un átomo de oxígeno o un átomo de azufre.
27. Una célula de una planta transgénica obtenible mediante el método de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 26.
28. Una planta transgénica o un tejido vegetal que comprende la célula vegetal de la reivindicación 27.
29. La planta transgénica de la reivindicación 28, que es resistente a al menos un compuesto definido en la reivindicación 25 o 26.
30. Partes cosechables o material de propagación de una planta de la reivindicación 28 o 29 que comprenden la célula vegetal de la reivindicación 27.
31. El uso de un gen definido en una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 22 para producir una planta resistente a al menos uno de los compuestos definidos en la reivindicación 25 o 26, la célula vegetal de la reivindicación 27 o la planta de la reivindicación 28 o 29.
32. Un método para proteger una planta que comprende aplicar el compuesto para el control de las malas hierbas a una zona de crecimiento de la planta de la reivindicación 28 o 29.
33. Un método para seleccionar una planta que comprende aplicar un compuesto para el control de las malas hierbas al cual es resistente la planta de la reivindicación 28 o 29 a una zona de crecimiento de la planta de la reivindicación 28 o 29 y otras plantas, y seleccionar cualquier planta basándose en la diferencia de crecimiento entre las plantas.
34. Un método para seleccionar una célula vegetal que comprende aplicar un compuesto para el control de las malas hierbas al cual es resistente la célula vegetal de la reivindicación 27 a una zona de crecimiento de la célula vegetal de la reivindicación 27 y otras células vegetales, y seleccionar cualquier planta basándose en la diferencia de crecimiento entre las células vegetales.
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