ES2267308T3 - Produccion de acido ascorbico usando levadura. - Google Patents

Produccion de acido ascorbico usando levadura. Download PDF

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Abstract

Un método para la producción de ácido ascórbico o de un estereoisómero de ácido ascórbico en una levadura, que comprende las etapas de: a) obtener una levadura capaz de utilizar ácido 2-ceto-L-gulónico (KLG) como única fuente de carbono para producir ácido ascórbico o un estereoisómero de ácido ascórbico; y b) cultivar la levadura en presencia de una fuente de carbono en condiciones adecuadas para la producción de ácido ascórbico o de un estereoisómero de ácido ascórbico, en el que la levadura es natural o es una levadura según la reivindicación 20.

Description

Producción de ácido ascórbico usando levadura.
Campo de la invención
La presente invención se refiere al campo de la biología molecular y al uso de levaduras para la producción de ácido ascórbico y de estereoisómeros de ácido ascórbico.
Antecedentes de la invención
El ácido L-ascórbico (vitamina C, AAS) tiene uso en las industrias farmacéutica y alimentaria como vitamina y antioxidante. La síntesis de AAS ha recibido una atención considerable durante muchos años debido a su volumen de mercado relativamente grande y a su elevado valor como producto químico especializado. El método Reichstein-Grussner, una ruta química desde glucosa a AAS, se describió por primera vez en 1934 (Helv. Chim. Acta 17: 311-328). Lazarus et al. (1989, "Vitamin C: Bioconversion via a Recombinant DNA Approach", Genetics and Molecular Biology of Industrial Microorqanisms, American Society for Microbiology, Washington D.C., editado por C.L. Hershberger) describió un método de bioconversión para la producción de un intermedio de AAS, ácido 2-ceto-L-gulónico (2-KLG, KLG), que se puede convertir químicamente en AAS. Saito et al. (1997, Applied and Environmental Microbiology, 63: 454-460) informa de la construcción de un sistema de expresión para la producción de 2-KLG a partir de D-sorbitol. Chemical Abstracts, vol. 84, nº 5, 2 de feb. de 1976, sumario nº: 29189, documento WO 87/00863 y documento US 5.032.514 tratan la producción de AAS en bacterias.
Se ha informado de la presencia de AAS en levaduras (Heick et al., Can. J. Microbiol., 1972, 18, 597-600) y se ha descrito la conversión de sustratos de ácido L-galactónico a AAS en la levadura Candida (patentes de Estados Unidos 4.595.659, expedida el 17/6/86, y 4.916.068, expedida el 10/4/90). Haller et al., (1990) Dechema Biotechnology Conferences, DE, Weinheim, vol. 4, 1 de enero de 1990, páginas 233-236, y Morimitsu et al. (1978) Archives of Biochemistry and Biophysics, vol. 191, nº 2, páginas 479-489, también tratan la producción de AAS en levaduras. Costamagna et al. (Can. J. Microbiol., 1986, 32, 756-758) describe los resultados de un estudio sobre la utilización de AAS por algunas levaduras. Este informe describe que las especies de Cryptococcus y Candida fueron capaces de crecer con AAS, así como con ácido isoascórbico.
A pesar de los avances científicos hechos en la producción de AAS y de sus intermedios biocatalíticos, permanece la necesidad de métodos para la producción de ácido ascórbico para satisfacer la demanda mundial. El descubrimiento de un método que utiliza una fuente de carbono renovable para producir ácido ascórbico sería particularmente ventajoso.
Resumen de la invención
La presente invención se refiere a la producción de ácido ascórbico o de estereoisómeros de ácido ascórbico en levaduras. La presente invención se basa en parte en el descubrimiento inesperado de que múltiples miembros de las levaduras que son capaces de crecer con ácido ascórbico o con ácido isoascórbico como única fuente de carbono son capaces de utilizar KLG como única fuente de carbono para producir ácido ascórbico. Por lo tanto, la presente invención proporciona métodos para la producción de ácido ascórbico o de un estereoisómero de ácido ascórbico a partir de levaduras.
Breve descripción de los dibujos
La Figura 1 ilustra el crecimiento de Candida blankii, Candida shehatae y Cryptococcus dimennae con 2KLG como única fuente de carbono en base de nitrógeno para levaduras.
La Figura 2 ilustra el crecimiento de Candida blankii, Candida shehatae, Cryptococcus dimennae y Cryptococcus luteolus con sal sódica de idonato en base de nitrógeno para levaduras.
La Figura 3 ilustra la determinación del contenido de AAS en el sobrenadante de Candida blankii y Cryptococcus dimennae a partir de una mezcla de reacción con células completas mediante el uso del ensayo de ascorbato oxida-
sa.
Descripción detallada Definiciones
Como se usa aquí, la expresión "ácido ascórbico" es el nombre reconocido por la Comisión de Nomenclatura Bioquímica de la IUPAC-IUB para la vitamina C. Otros nombres son ácido L-ascórbico, ácido L-xiloascórbico y \gamma-lactona del ácido L-treo-hex-2-enoico. La vitamina pura es C_{6}H_{8}O_{6} y tiene un peso molecular de 176,13. Son posibles cuatro estereoisómeros de ácido ascórbico: ácido L-ascórbico, ácido D-araboascórbico (ácido eritórbico), que muestra actividad de vitamina C, ácido L-araboascórbico y ácido D-xiloascórbico. Los intermedios de ácido ascórbico o "intermedios de ruta" son aquellos productos bioquímicos capaces de convertirse en AAS por medios enzimáticos o químicos e incluyen, pero no se limitan a, ácido glucónico, ácido 2-ceto-D-glucónico, ácido 2,5-diceto-D-glucónico, ácido 2-ceto-L-gulónico, ácido idónico, ácido glucónico, sorbitol, sorbosa, sorbosona, y sorbosa diaceto-
na.
La frase "capaz de utilizar KLG para producir ácido ascórbico o un estereoisómero de ácido ascórbico", cuando se refiere a una levadura, significa una levadura que es capaz de producir ácido ascórbico a partir de KLG por cualquier medio, que incluye la conversión biocatalítica.
Se entiende en la técnica que los derivados ácidos de los sacáridos pueden existir en una diversidad de estados de ionización que dependen del medio circundante, si están en disolución, o, si están en forma sólida, fuera de la disolución a partir de la que se preparan. El uso de una expresión tal como, por ejemplo, ácido idónico para designar tales moléculas pretende incluir todos los estados de ionización de la molécula orgánica a la que se refiere. Así, por ejemplo, "ácido idónico", su forma cíclica "idonolactona", e "idonato" se refieren al mismo resto orgánico, y no pretenden especificar estados de ionización o formas químicas particulares.
Como se usa aquí, el término "recombinante" se refiere a una levadura que contiene ácido nucleico que no se da de forma natural en el organismo y/o a una levadura que tiene copias adicionales de ácido nucleico endógeno introducidas de forma recombinante. El término "heterólogo", como se usa aquí, se refiere a secuencias de ácido nucleico o de aminoácidos que no se dan de forma natural en la levadura. Como se usa aquí, el término "endógeno" se refiere a un ácido nucleico que se da de forma natural en la levadura. Un hospedador recombinante puede tener también mutaciones y/o deleciones en el ácido nucleico natural, de forma que no se produce la proteína codificada por el ácido nucleico.
Como se usa aquí, "ácido nucleico" se refiere a una secuencia de nucleótidos o polinucleótidos, y a sus fragmentos o porciones, y a ADN o ARN de origen genómico o sintético que puede ser bicatenario o monocatenario, y que representa la cadena codificante o la complementaria. Como se usa aquí, "aminoácido" se refiere a secuencias peptídicas o proteicas, o a sus porciones.
La frase "enzima oxidativa", como se usa aquí, se refiere a una enzima o sistema enzimático que puede catalizar la conversión de un sustrato con un estado de oxidación dado a un producto con un estado de oxidación superior que el sustrato. La frase "enzima reductora" se refiere a una enzima o sistema enzimático que puede catalizar la conversión de un sustrato con un estado de oxidación dado a un producto con un estado de oxidación inferior que el sustrato. Las enzimas oxidativas asociadas a la biocatálisis de un carbohidrato de 6 carbonos hacia intermedios de la ruta de AAS incluyen, entre otras, D-glucosa deshidrogenasa, D-gluconato deshidrogenasa y 2-ceto-D-gluconato deshidrogenasa, así como actividad de L-sorbitol deshidrogenasa, L-sorbosa deshidrogenasa y actividad de L-sorbosona deshidrogenasa. Las enzimas reductoras asociadas con la biocatálisis de intermedios de la ruta de AAS hacia productos finales deseados incluyen, entre otras, 2,5-diceto-D-gluconato reductasa (DKGR), 2-ceto reductasa (2-KR) y 5-ceto reductasa (5-KR). Tales enzimas incluyen aquellas producidas de forma natural por la levadura hospedadora o aquellas introducidas por medios recombinantes.
Como se usa aquí, la expresión "ácido de carbohidrato de 6 carbonos" excluye específicamente los sustratos de ácido L-galactónico e incluye, pero no se limita a, ácido 2-ceto-L-gulónico, ácido idónico, ácido glucónico, 6-fosfogluconato, ácido 2-ceto-D-glucónico, ácido 5-ceto-D-glucónico, 2-cetogluconatofosfato, ácido 2,5-diceto-L-gulónico, ácido 2,3-L-dicetogulónico, ácido deshidroascórbico, ácido eritroascórbico y ácido D-manónico.
Como se usa aquí, la expresión "carbohidrato de 6 carbonos" incluye, pero no se limita a, glucosa, gulosa, sorbosa, fructosa, idosa, galactosa y manosa, todos en forma D o L.
Los términos "aislado" o "purificado", como se usan aquí, se refieren a un ácido nucleico o proteína o péptido que se extrae de al menos un componente con el que está asociado de forma natural. En la presente invención, un ácido nucleico aislado puede incluir un vector que comprende el ácido nucleico. Purificado, como se usa aquí para describir una fuente de carbono derivada de un proceso fermentativo, se refiere a extraer esa fuente de carbono de al menos un componente con el que está asociada de forma natural en el medio de fermentación.
Descripción detallada Producción de AAS en levadura
La presente invención se refiere a la producción de AAS o de estereoisómeros de AAS, p.ej. ácido eritórbico, en levaduras que son capaces de utilizar KLG como única fuente de carbono para producir AAS. La presente invención excluye específicamente un método para producir AAS en levaduras que producen AAS por medio de la ruta de la L-galactonolactona oxidasa. Las levaduras se describen en N.J.W. Kreger-van Rij, en "The Yeasts", vol. 1 de Biology of Yeasts, cap. 2, Eds. A.H. Rose & J.S. Harrison, 1987, Academic Press, Londres. Las levaduras que pertenecen a los géneros de levaduras imperfectas se caracterizan en general por no formar ascosporas y basidiosporas. AAS es sensible al oxígeno, y por lo tanto, se prefiere que la levadura sea capaz de crecer de forma anaerobia para reducir la oxidación del AAS producido. La presente invención también abarca métodos para producir AAS mediante el uso de levaduras que se cultivan en condiciones aerobias, con tal de que haya presentes en el medio de AAS agentes reductores tales como ditiotreitol, glutatión, quelantes de metales tales como EDTA, estabilizantes tales como ácido metafosfórico, aminoácidos, glicoles, carbohidratos, ácido oxálico, ácido tricloroacético, 8-hidroxiquinolina (D. W. Bradley, G. Emery y J.E. Maynard, Clin. Chim. Acta 4, 47-52 (1973).
Las levaduras que se pueden usar en la presente invención incluyen, pero no se limitan a, las descritas aquí, y se ejemplifican mediante las denominaciones de depósito del listado: Candida blankii CBS1898, ATCC 18735; C. curvata CBS570; C. humicola; C. incommunis ATCC 22971; C. salmanticensis ATCC 16042; C. sp. ATCC 28528, ATCC 20473; Cryptococcus albidus CBS4192; Cr. dimennae CBS5770; Cr. heveanensis CBS140; Cr. kuetzingii UCD68-196; Cr. Luteolus CBS953; Cr. skinneri UCD60-82 CBS5029; Cr. terreus CBS1895, CBS6293 CCY17-8-5; Cr. uiguttulatus CBS1730; Cr. laurentii CCY 17-3-2, CCY17-3-6, ATCC 32044; Cr. neoformans ATCC 32045; Cr. podzolicus CCY17-20-1; Trichosporon cutaneum UCD54-169 CCY30-5-4; T. beigelii NRRLY-1490; T. pullulans ATCC 10677; Aureobasidium pullulans DBV A9, A10, A62, A77 A84; Hansenula capsulata DBV 3164, ATCC 24204; Lipomyces starkeyi UCD 51-55, CBS1809; L. lipofer NRRL Y-1351, Phaffia rhodozyma ATCC 24201, Rhodotorula mucilaginosa NRC 211003; Saccharomyces uvarum ATCC 9373, ATCC 9080; Saccharomycopsis fibuligera ATCC 2082; Schwanniomyces occidentalis NRC2782, NRC2783; y Torulopsis ernobii ATCC 20000. En una realización preferida, la levadura es un miembro del grupo de levaduras imperfectas. Una familia preferida de las levaduras imperfectas para uso en los métodos para producir AAS es la familia Cryptococcaceae. Los géneros preferidos de Cryptococcaceae se seleccionan del grupo que consiste en Candida y Cryptococcus.
Como se demuestra en los ejemplos, Candida blankii y Cryptococcus dimennae fueron capaces de producir AAS por encima de las concentraciones de fondo cuando se cultivaron con KLG como única fuente de carbono, mientras Candida shehatae, aunque fue capaz de crecer con KLG como única fuente de carbono, fue incapaz de producir AAS. Los ejemplos ilustrativos describen el uso de Candida shehatae, número de acceso ATCC 34887, Candida blankii, número de acceso ATCC 18735, Cryptococcus dimennae, número de acceso ATCC 22024 y Cryptococcus luteolus, número de acceso ATCC 32044. La presente invención abarca mutantes, derivados y descendientes de especies conocidas de levaduras, y en particular, mutantes y derivados de especies conocidas que pertenecen al género Cryptococcaceae, p.ej. las que pertenecen a Candida y Cryptococcus, con tal de que el mutante, derivado o descendiente sea capaz de utilizar KLG como única fuente de carbono para producir AAS.
La presente invención abarca métodos para producir AAS o estereoisómeros de AAS en levadura, en los que la levadura es natural, es decir, no está modificada mediante ingeniería genética, y también en los que la levadura es recombinante y comprende ácido nucleico heterólogo que codifica enzimas oxidativas y/o reductoras que están asociadas con la conversión de una fuente de carbono a KLG en la levadura. En la presente invención, la fuente de carbono, tal como un ácido de carbohidrato de 6 carbonos, puede ser un producto de un proceso fermentativo distinto que se añade al cultivo de levadura, tal como KLG producido mediante el método descrito por Lazarus et al. (J. Bact. 1991, 173, 6651-61) o mediante el método descrito en Saito et al. (1997, Applied and Environmental Microbiology, 63: 454-460). La fuente de carbono derivada de un proceso fermentativo distinto se puede purificar antes del uso en un método para producir AAS o estereoisómeros de AAS, o se puede usar directamente del proceso de fermentación. La fuente de carbono puede derivar también de medios químicos.
En otra realización de la presente invención, la levadura se modifica mediante ingeniería genética para que comprenda una o ambas de una enzima oxidativa heteróloga o una enzima reductora heteróloga, asociadas con la conversión de una fuente de carbono a KLG en la levadura, por lo que se proporciona un organismo único que es capaz de convertir una fuente de carbono, tal como glucosa u otro carbohidrato de 6 carbonos, en ácido ascórbico por medio de KLG como intermedio. El hospedador de levadura recombinante puede comprender múltiples enzimas oxidativas heterólogas y/o múltiples enzimas reductoras heterólogas para producir ácido ascórbico a partir de un carbohidrato de 6 carbonos o de un ácido de carbohidrato de 6 carbonos.
En una realización preferida, la fuente de carbono es glucosa y la levadura recombinante comprende un ácido nucleico heterólogo que codifica al menos uno de (a) una glucosa deshidrogenasa (GDH); (b) una ácido glucónico deshidrogenasa (GADH); (c) una ácido 2-ceto-D-glucónico deshidrogenasa (2-KDGDH); y (d) una ácido 2,5-diceto-D-glucónico reductasa (2,5-DGKR), con tal de que si la levadura comprende un ácido nucleico heterólogo para menos de (a) - (d), entonces la levadura comprende un ácido nucleico endógeno, de forma que la levadura comprende ácido nucleico para (a) - (d), y es capaz de convertir glucosa en AAS por el intermedio KLG. Como entenderá fácilmente el técnico experto, las reacciones de oxidación y reducción implicadas en la conversión de un sustrato de carbono a AAS pueden necesitar que se añadan cofactores a los cultivos de levadura. Por ejemplo, 2,5-DGKR descrito en la patente de Estados Unidos número 5032514, expedida el 16 de julio de 1991, necesita NADPH. Otros ejemplos de cofactores necesarios en reacciones enzimáticas incluyen, pero no se limitan a, ATP, NAD+, NADP+, NADH, NADPH y coenzima A. La levadura también puede tener deleciones o mutaciones de enzimas oxidativas y/o reductoras endógenas que interfieren con la ruta deseada de flujo de carbono.
En otra realización de la presente invención, la fuente de carbono es sorbitol y la levadura recombinante comprende un ácido nucleico heterólogo que codifica al menos uno de (a) D-sorbitol deshidrogenasa (SLDH); (b) L-sorbosa deshidrogenasa; y (c) L-sorbosona deshidrogenasa, con tal de que si la levadura comprende ácido nucleico heterólogo para menos de (a) - (c), entonces la levadura comprende ácido nucleico endógeno de forma que la levadura comprende ácido nucleico para (a) - (c), y es capaz de convertir sorbitol a AAS por medio del intermedio 2KLG.
Las fuentes de ácidos nucleicos que codifican enzimas oxidativas o reductoras incluyen las siguientes:
Enzima Cita
glucosa deshidrogenasa Smith et al. 1989, Biochem. J. 261:973;
Neijssel et al. 1989, Antonie Van
Leauvenhoek 56(1):51-61
ácido glucónico deshidrogenasa Matsushita et al. 1979, J. Biochem.
85:1173; Kulbe et al. 1987, Ann. N.Y.
Acad Sci 506:552
ácido 2-ceto-D-glucónico deshidrogenasa Stroshane, 1977, Biotechnol. BioEng
19(4) 459
2-ceto gluconato reductasa J. Gen. Microbiol. 1991, 137:1479
ácido 2,5-diceto-D-glucónico reductasa Nºs: Patente de Estados Unidos
5.583.025; 5.795.761; 5.376.544;
5.008.193; 4.757.012; 4.758.514; 5.004.690;
5.032.514
L-sorbosa deshidrogenasa; Saito et al. Applied and Environmental
L-sorbosona deshidrogenasa; Microbiology, 1997, 63: 454
y L-sorbitol deshidrogenasa
\vskip1.000000\baselineskip
Construcción de levaduras recombinantes
La levadura recombinante que contiene el/los ácidos(s) nucleico(s) necesario(s) para producir AAS a partir de una fuente de carbono se puede construir mediante el uso de métodos conocidos en la técnica. Se describen métodos de biología molecular en Sambrook et al., Molecular Biology Cloning: A Laboratory Manual, segunda edición (1989), Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY (1989). Los genes que codifican enzimas oxidativas y enzimas reductoras asociadas con la producción de AAS se pueden aislar a partir de hospedadores nativos como se describe más adelante o se pueden producir por medios químicos. Por ejemplo, si se conoce la secuencia del gen, se pueden crear bibliotecas genómicas adecuadas mediante digestión con endonucleasa de restricción y se pueden cribar con sondas complementarias para la secuencia génica deseada. Una vez que se aísla la secuencia se puede amplificar el ADN mediante el uso de métodos estándar de amplificación dirigida por cebadores, tales como la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) (documento de EE.UU. 4.683.202) para obtener cantidades de ácido nucleico adecuadas para la transformación mediante el uso de vectores apropiados. Los expertos en la técnica conocen una diversidad de vectores y casetes de transformación y expresión adecuados para la clonación, transformación y expresión en levaduras de ácido nucleico que codifica enzimas oxidativas y reductoras asociadas con la producción de AAS. Los expertos en la técnica conocen protocolos para obtener y usar tales vectores (Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, volúmenes 1, 2, 3 (Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, NY, (1989)).
Típicamente, el vector o casete contiene secuencias que dirigen la transcripción y traducción del ácido nucleico, un marcador seleccionable, y secuencias que permiten la replicación autónoma o la integración cromosómica. Los vectores adecuados comprenden una región en 5' del gen que alberga controles de la iniciación de la transcripción, y una región en 3' del fragmento de ADN que controla la terminación de la transcripción. Estas regiones de control se pueden derivar de genes homólogos o heterólogos para la levadura, con tal de que la región de control seleccionada sea capaz de funcionar en la levadura.
Los expertos en la técnica conocen las regiones de control de la iniciación o promotores, que son útiles para manejar la expresión de las enzimas oxidativas o reductoras en la levadura. Virtualmente cualquier promotor capaz de controlar estos genes es adecuado para la presente invención, lo que incluye, pero no se limita a, CYC1, HIS3, GAL1, GAL10, ADH1, PGK, PH05, GAPDH, ADC1, TRP1, URA3, LEU2, ENO, TPI. El ácido nucleico que codifica las enzimas oxidativas o reductoras está unido de forma operable por medio de códones de iniciación a regiones de control de la expresión seleccionadas para una expresión eficaz de las enzimas oxidativas o reductoras.
Una vez que se construyen casetes adecuados, se usan para transformar levaduras, y las levaduras se criban en función de la capacidad de producir AAS a partir de una fuente de carbono apropiada. Por ejemplo, en una realización, la levadura se transforma con ácido nucleico que codifica una o ambas actividades de deshidrogenasa y de reductasa, y las levaduras transformadas se criban en función de su capacidad para producir AAS a partir de un carbohidrato de seis carbonos, tal como glucosa, o de un ácido de carbohidrato de seis carbonos, tal como KLG.
Detección de AAS
Los métodos para la detección de AAS y de estereoisómeros de AAS incluyen el uso de titulación redox con 2,6-dicloroindofenol (Burton et al., 1979, J. Assoc. Pub. Analysts 17:105); cromatografía líquida de elevado rendimiento (HPLC) que usa intercambio de aniones (J. Chrom. 1980, 196:163); y procedimientos electro-redox (Pachia, 1976, Anal. Chem. 48:364). También se pueden emplear procedimientos enzimáticos que implican el uso de ácido ascórbico oxidasa.
En la presente invención, la detección de AAS se llevó a cabo mediante HPLC, ensayo colorimétrico de ascorbato oxidasa como se usa aquí y espectrofotometría CG-masas. El experto será consciente de los controles a aplicar al utilizar estos métodos de detección. Debido a que existe un equilibrio químico entre KLG y AAS (es decir, KLG contiene concentraciones de fondo de AAS), para el uso de detección UV en HPLC de ácido ascórbico, se registró y se usó como control el perfil de elución del sustrato KLG. Para el ensayo de ascorbato oxidasa, se utiliza un control de blanco sin muestra y enzima. Para el análisis de CGMS, se analizaron como control el agente de derivatización y el sustrato KLG.
También es deseable tener un método de cribado para la detección de levaduras que son capaces de producir AAS a partir de una fuente de carbono. Un método para cribar levaduras capaces de producir AAS comprende las etapas de obtener levaduras capaces de crecer con ácido ascórbico o estereoisómero de ácido ascórbico, cultivar dicha levadura en presencia de KLG en condiciones adecuadas para la producción de ácido ascórbico o de un estereoisómero de ácido ascórbico; y analizar en dicho cultivo de levadura la producción de ácido ascórbico o de un estereoisómero de ácido ascórbico.
Fermentación y purificación Medios y sustratos de carbono
Las levaduras naturales o las levaduras recombinantes capaces de utilizar KLG para producir AAS se someten a fermentación a gran escala en presencia de una fuente de carbono adecuada, y se recupera AAS. Las fuentes de carbono adecuadas incluyen carbohidratos de seis carbonos o ácidos de carbohidratos de seis carbonos. La fuente de carbono utilizada para cultivar las levaduras descritas aquí estará limitada solamente por las necesidades del organismo hospedador. Por ejemplo, las levaduras naturales se pueden cultivar en presencia de un ácido de carbohidrato de seis carbonos, p.ej. KLG, mientras la levadura recombinante que se ha modificado mediante ingeniería genética para que contenga ácido nucleico que codifica una o ambas de deshidrogenasa y reductasa se puede cultivar en presencia de un carbohidrato de seis carbonos, p.ej. glucosa. Además de una fuente de carbono apropiada, los medios de fermentación deben contener minerales, sales, cofactores, tampones y otros componentes adecuados, conocidos para los expertos en la técnica, adecuados para el crecimiento de los cultivos y la producción de AAS. Los métodos para los medios y las condiciones de cultivo adecuados para cultivar levaduras se describen en Costamagna et al., 1986, Can. J. Microbiology, 32:756-758.
La levadura se puede cultivar en condiciones aerobias o anaerobias. AAS es sensible al oxígeno, y, por lo tanto, el cultivar la levadura que produce AAS de forma anaerobia reducirá la oxidación del AAS producido. De forma alternativa, si las levaduras se cultivan en condiciones aerobias se prefiere que haya presentes en el medio de AAS agentes reductores, p.ej. ditiotreitol, glutatión, agentes quelantes de metales tales como EDTA, estabilizantes tales como ácido metafosfórico, aminoácidos, glicoles, carbohidratos, ácido oxálico, ácido tricloroacético, 8-hidroxiquinolina. La presente invención abarca la fermentación discontinua o continua, y el proceso para producir AAS puede desarrollarse en uno o dos fermentadores. Por ejemplo, si la levadura está modificada mediante ingeniería genética para incluir una ruta a partir de un carbohidrato de seis carbonos, tal como glucosa, por ejemplo, hasta un ácido de carbohidrato de seis carbonos, tal como KLG, la producción de AAS podría desarrollarse en un fermentador usando las levaduras recombinantes como hospedador. Si la levadura es natural y AAS se produce en la levadura a partir de un ácido de carbohidrato de seis carbonos, p.ej. KLG, la producción de AAS puede desarrollarse en dos fermentadores, uno para producir KLG como se describió en la patente de EE.UU. 5032514 o como describió Saito et al., anteriormente mencionado, y otro para producir AAS a partir de KLG en levaduras.
Una fermentación discontinua clásica es un sistema cerrado en el que se ajusta la composición del medio al comienzo de la fermentación y no se somete a alteraciones artificiales durante la fermentación. Así, al comienzo de la fermentación se inocula el medio con el organismo u organismos deseados y se permite que la fermentación ocurra sin añadir nada al sistema. Típicamente, sin embargo, una fermentación discontinua es "discontinua" con respecto a la adición de la fuente de carbono, y a menudo se intenta controlar factores tales como el pH y la concentración de oxígeno. Las composiciones de metabolito y de biomasa del sistema discontinuo cambian constantemente hasta el momento en el que se detiene la fermentación. Dentro de los cultivos discontinuos las células pasan por una fase retardada estática, después por una fase logarítmica de elevado crecimiento y finalmente por una fase estacionaria en la que la velocidad de crecimiento disminuye o se detiene. Si se dejan sin tratar, las células en la fase estacionaria finalmente morirán. Las células de la fase logarítmica son responsables generalmente del volumen de producción de producto final o intermedio.
El sistema de fermentación semicontinuo es una variación del sistema discontinuo estándar, que también es adecuado en la presente invención. En esta variación de un sistema discontinuo típico, el sustrato se añade en incrementos a medida que progresa la fermentación. Los sistemas semicontinuos son útiles cuando la inhibición por catabolitos es apta para inhibir el metabolismo de las células, y cuando es deseable tener cantidades limitadas de sustrato en los medios. La medida de la concentración de sustrato real en los sistemas semicontinuos es difícil, y por lo tanto se estima en base a cambios de factores medibles, tales como el pH, el oxígeno disuelto y la presión parcial de gases de desecho, tales como CO_{2}. Las fermentaciones discontinuas y semicontinuas son habituales y se conocen en la técnica, y se pueden encontrar ejemplos en Brock, anteriormente mencionado.
También se contempla que el método sería adaptable a métodos de fermentación continua. La fermentación continua es un sistema abierto en el que se añade continuamente un medio de fermentación definido a un biorreactor y se extrae una cantidad igual de medio condicionado simultáneamente para procesarlo. La fermentación continua mantiene generalmente los cultivos en una densidad elevada constante, en la que las células están principalmente en la fase logarítmica del crecimiento.
La fermentación continua permite la modulación de un factor o de cualquier número de factores que afecten al crecimiento celular o a la concentración de producto final. Por ejemplo, un método mantendrá un nutriente limitante, tal como la concentración de la fuente de carbono o de nitrógeno, en una proporción fija y permitirá que otros parámetros cambien. En otros sistemas se pueden alterar continuamente varios factores que afectan al crecimiento mientras se mantiene constante la concentración celular, medida por medio de la turbidez. Los sistemas continuos procuran mantener las condiciones de crecimiento en estado estacionario, y así la pérdida de células debida a la retirada del medio se puede equilibrar con la velocidad de crecimiento celular en la fermentación. Los métodos para modular los nutrientes y los factores de crecimiento para los procesos de fermentación continuos, así como los métodos para maximizar la velocidad de la formación de producto, se conocen en la técnica de la microbiología industrial, y se detallan una diversidad de métodos en Brock, anteriormente mencionado.
Los métodos de la presente invención se pueden poner en práctica mediante el uso de procesos discontinuos, semicontinuos o continuos. Tras la fermentación, el AAS producido se puede recuperar del caldo de fermentación mediante una diversidad de métodos, que incluyen resinas de intercambio iónico, resinas de absorción o de retraso de iones, carbón activo, concentración-cristalización, etc.
Se describirán adicionalmente diversos aspectos de la presente invención con respecto a los siguientes ejemplos específicos, que no pretenden limitar el alcance de la presente invención.
Ejemplos
La siguiente descripción de materiales y métodos se aplica a los ejemplos I-III.
Materiales y métodos Condiciones de cultivo
Se cultivaron levaduras en base de nitrógeno para levaduras de Difco (YNB) de 6,7 g/L con un crecimiento inicial en un 2% de glucosa, seguido de transferencia a un 0,5% (p/v) de fuente de carbono única de L-AAS, y después 2-KLG o L-idonato 20,8 mM. Las levaduras se cultivaron en 50 ml de medio YNB a 22ºC y pH 5,5 durante un ciclo de 48 horas a una velocidad de agitación de 250 rpm en un matraz con agitación.
HPLC: La elución mediante HPLC de ascorbato y otros ácidos de ceto-carbohidratos se realizó mediante el uso de una columna analítica Dionex IonPac AS10 con una precolumna. Se empleó elución isocrática usando como eluyente acetato 40 mM de pH 4,86 para obtener una buena separación de los tiempos de retención entre el sustrato KLG y el producto ascorbato (>5 min). Se detectó ascorbato (>100 ppb) mediante el uso de un detector UV entre las longitudes de onda de 245-270 nm, mientras KLG se detectó mediante el uso de un detector de índice de refracción. El sistema de HPLC usado para el estudio es un aparato HP-Alliance, equipado con un paquete informático Millenium usado para el cálculo de la integración del área de los picos. Se generó una curva de calibración para la cuantificación de ascorbato entre 100 ppb - 100 ppm.
CG-MS: La identificación de ascorbato mediante el uso de CG-MS se realizó usando un procedimiento publicado (J. C. Deutsch y J. Fred Kolhouse, Anal. Chem., 1993, 65, 321-326). La CG se realizó en un equipo HP 5890 con el uso de una columna capilar de sílice fundida Supelco SPB-1 de 15 metros por 0,25 mm. La derivatización de ascorbato se realizó mediante el uso de N-metil-N-(tert-butildimetilsilil)trifluoroacetamida y acetonitrilo, siguiendo el método informado en la referencia anteriormente mencionada. El tiempo de retención de ascorbato estándar obtenido en estas condiciones experimentales fue de 8,75 minutos. El patrón de fragmentación de masas característico de m/z 575, 531, 433, 343 se detectó en los espectros obtenidos tanto para la muestra estándar como para la desconocida.
Ensayo de ascorbato oxidasa: El ensayo de ascorbato oxidasa se realizó usando el equipo de determinación de ácido L-ascórbico (nº de cat. 409677) obtenido de Boehringer Mannheim y siguiendo el protocolo proporcionado con el equipo. El equipo contenía enzima ascorbato oxidasa y una detección/cuantificación (578 nm) mediante el uso de un sistema de colorante acoplado de MTT y PMS (Beutler, H.-O. y Beinstingl, G.; 1984, en methods of enzymatic analysis (Bergmeyer, H. U. Ed.) 3ª ed., vol. 7, págs. 376-385, Vertag Chemie, Weinheim, Deerfield, Beach/Florida, Basilea).
Controles y blancos: La disolución de 0,5% de 2-KLG contiene 2 ppm de ascorbato a pH 6,1. Se ensayó una reacción de control solamente con tampón que contenía KLG junto con cada experimento como reacción de control, junto con una mezcla de reacción que contenía levadura durante el transcurso del tiempo del experimento de conversión de KLG a AAS con células completas. En otro control, las células de levadura se destruyeron térmicamente y después se incubaron con KLG para asegurarse de que no se detectaba transformación de KLG a AAS en estas condiciones. El pico de ascorbato detectado mediante análisis de HPLC se confirmó adicionalmente mediante reacción de la muestra con ascorbato oxidasa, y así se comprobó la desaparición del pico en el cromatograma debida a la degradación de ascorbato por la ascorbato oxidasa.
Ejemplo I
Este ejemplo ilustra que la levadura Candida blankii es capaz de utilizar KLG o idonato como única fuente de carbono para el crecimiento. Este ejemplo también demuestra la producción de ácido ascórbico mediante Candida blankii cuando se cultiva en presencia de KLG como única fuente de carbono.
Se cultivó Candida blankii que tenía el número de acceso ATCC 18735 como se describió en la sección de materiales y métodos. La reacción de KLG a AAS con células completas se realizó como se describe más adelante. Se recogieron alrededor de 3 gramos de células húmedas de un cultivo de 48 horas y 500 ml mediante centrifugación a 4ºC y 9000 rpm. Las células se lavaron con tampón fosfato frío 200 mM de pH 6,1 que contenía EDTA 0,5 mM. Las células se resuspendieron después en el mismo tampón que contenía un 0,5% de KLG (10 ml). Se extrajeron tres ml de esta mezcla de reacción y se hirvieron en un microondas durante dos minutos. Ambas mezclas de reacción se colocaron después a 30ºC en un incubador rotatorio para la producción de AAS con células completas. Se extrajeron 1,5 ml de muestra para el tiempo cero, se centrifugaron para eliminar el sedimento celular y se almacenaron a -20ºC. El sobrenadante se filtró a través de un filtro de 0,2 \mum y se sometió a análisis de HPLC seguido de análisis con ascorbato oxidasa y CGMS como se describió anteriormente. Se usó la misma retirada de muestra y el mismo método de trabajo para los tiempos de 2, 4 y 20 horas para la reacción con células vivas, y la muestra de 20 horas para la mezcla de reacción de células destruidas térmicamente (Tabla 1). Las muestras de células destruidas térmicamente no tuvieron concentraciones de fondo de AAS y no produjeron AAS.
Después de la extracción de la muestra de las 20 horas, se disminuyó el pH de la mezcla de reacción en tres unidades de pH hasta pH 3,15 usando tampón citrato-fosfato. Se extrajo una muestra y se analizó a las 21 horas para marcar el tiempo cero para este cambio de estado. La reacción se dejó continuar durante la noche. Después de otro periodo de 24 h, se tomó la muestra final. Se usó una reacción de control de blanco de KLG paralela sin células a ambos valores de pH para observar la producción de fondo de AAS a partir de KLG (véase la Tabla 1, Fig. 3).
Como se puede observar a partir de la Tabla 1 y de la Figura 3, cuando se cultivó C. blankii en el cultivo de células completas usando KLG como único sustrato, se confirmó la presencia de AAS en el medio de reacción. La concentración del AAS presente en la mezcla de reacción superó en 3 veces las concentraciones de fondo. Disminuyendo el pH de la mezcla de reacción a pH 3, se observó otro incremento de 3 veces en las concentraciones de AAS. La disminución del pH tuvo el efecto de estabilizar el AAS, así como de favorecer la termodinámica química hacia la producción de AAS.
Ejemplo II
Este ejemplo ilustra que Cryptococcus dimennae es capaz de utilizar KLG o idonato como única fuente de carbono para el crecimiento. Este ejemplo también muestra la producción de ácido ascórbico mediante Cryptococcus dimennae cuando se cultiva en presencia de KLG como única fuente de carbono.
Se cultivó Cryptococcus dimennae que tiene el número de acceso de ATCC 22024 como se describió en la sección de materiales y métodos. La reacción de KLG a AAS con células completas se realizó como se describió en el Ejemplo I.
Como se puede observar a partir de la Tabla 1 y de la Figura 3, cuando se hizo crecer el cultivo de células completas de Cryptococcus dimennae mediante el uso de KLG como único sustrato, se confirmó la presencia de AAS en el medio de reacción. La concentración de AAS presente en la mezcla de reacción superó en 2 veces las concentraciones de fondo.
Ejemplo III
Este ejemplo ilustra que Candida shehatae es capaz de usar KLG como única fuente de carbono, pero no es capaz de producir AAS. La reacción de KLG a AAS con células completas se realizó como se describió en el Ejemplo I. Como se puede observar a partir de la Figura 1, Candida shehatae no es capaz de producir AAS a partir de KLG en estas condiciones.
TABLA 1 Resultados de HPLC ABC/área y concentración de AAS en mg/L en las muestras
ABC/área a 266 nm Conc. de ácido ascórbico, mg/L
Muestras Tiempo Tiempo Tiempo Tiempo Tiempo Tiempo
0 h 4 h 20 h 0 h 4 h 20 h
Blanco de tampón 2KLG 259831 280706 264840 1,9 2,1 1,9
Candida blankii 314059 240613 905162 2,3 1,8 6,6
Candida shehatae 204867 205323 270663 1,5 1,5 1,9
Cryptoc. dimennae 224203 223112 522325 1,6 1,6 3,8

Claims (40)

1. Un método para la producción de ácido ascórbico o de un estereoisómero de ácido ascórbico en una levadura, que comprende las etapas de:
a)
obtener una levadura capaz de utilizar ácido 2-ceto-L-gulónico (KLG) como única fuente de carbono para producir ácido ascórbico o un estereoisómero de ácido ascórbico; y
b)
cultivar la levadura en presencia de una fuente de carbono en condiciones adecuadas para la producción de ácido ascórbico o de un estereoisómero de ácido ascórbico,
en el que la levadura es natural o es una levadura según la reivindicación 20.
2. El método de la reivindicación 1, que comprende además la etapa de recuperar dicho ácido ascórbico.
3. El método de la reivindicación 1, en el que dicha fuente de carbono es un ácido de carbohidrato de seis carbonos.
4. El método de la reivindicación 3, en el que dicho ácido de carbohidrato de seis carbonos incluye ácido 2-ceto-L-gulónico, ácido idónico, ácido glucónico, 6-fosfogluconato, ácido 2-ceto-D-glucónico, ácido 5-ceto-D-glucónico, 2-cetogluconato-6-fosfato, ácido 2,5-diceto-L-glucónico, ácido 2,3-L-dicetogulónico, ácido deshidroascórbico, ácido eritroascórbico y ácido D-manónico.
5. El método de la reivindicación 1, en el que dicha fuente de carbono es un carbohidrato de seis carbonos y dicha levadura comprende uno o ambos de a) un ácido nucleico heterólogo que codifica una enzima oxidativa asociada con la producción de ácido ascórbico o de un estereoisómero de ácido ascórbico en dicha levadura, y b) un ácido nucleico heterólogo que codifica una enzima reductora asociada con la producción de ácido ascórbico o de un estereoisómero de ácido ascórbico en dicha levadura.
6. El método de la reivindicación 5, en el que dicho carbohidrato de seis carbonos incluye glucosa, gulosa, idosa, galactosa, manosa, sorbosa y fructosa.
7. El método de la reivindicación 5, en el que dicha enzima oxidativa tiene actividad deshidrogenasa.
8. El método de la reivindicación 7, en el que dicha deshidrogenasa incluye una actividad de glucosa deshidrogenasa, una actividad de ácido glucónico deshidrogenasa, una actividad de ácido 2-ceto-D-glucónico deshidrogenasa, una actividad de galactosa deshidrogenasa, una actividad de L-sorbosa deshidrogenasa, una actividad de D-sorbitol deshidrogenasa, una actividad de L-sorbosona deshidrogenasa, ácido L-idónico oxidasa y ácido L-gulónico oxidasa.
9. El método de la reivindicación 5, en el que dicha enzima reductora tiene una actividad de reductasa.
10. El método de la reivindicación 9, en el que dicha actividad de reductasa incluye actividad de 2,5-diceto-D-gluconato (DKG) reductasa, 2,3-DKG reductasa, 5-ceto reductasa, 2-ceto reductasa y 2-cetogulonato reductasa.
11. El método de la reivindicación 1, en el que dicha fuente de carbono es glucosa y la levadura comprende un ácido nucleico heterólogo que codifica al menos uno de (a) una glucosa deshidrogenasa (GDH); (b) una ácido glucónico deshidrogenasa (GADH); (c) una ácido 2-ceto-D-glucónico deshidrogenasa (2-KDGDH); y (d) una ácido 2,5-diceto-D-glucónico reductasa (2,5 [DKGR]), con tal de que si la levadura comprende ácido nucleico heterólogo para menos de (a) - (d), entonces la levadura comprende ácido nucleico endógeno, de forma que la levadura comprende ácido nucleico para (a) - (d), y es capaz de convertir glucosa en ácido ascórbico (AAS) por el intermedio KLG.
12. El método de la reivindicación 1, en el que la levadura es un miembro del grupo de levaduras imperfectas.
13. El método de la reivindicación 12, en el que la levadura es un miembro de la familia Cryptococcaceae.
14. El método de la reivindicación 13, en el que la levadura incluye Candida y Cryptococcus.
15. El método de la reivindicación 14, en el que la levadura es Candida blankii.
16. El método de la reivindicación 14, en el que la levadura es Cryptococcus dimennae.
17. El método de la reivindicación 1, en el que dicha levadura es Candida blankii o Cryptococcus dimennae, y dicha fuente de carbono comprende glucosa, en el que dicha levadura comprende una actividad de glucosa deshidrogenasa heteróloga y una actividad de 2,5-DKG reductasa.
18. El método de la reivindicación 1, en el que dicha levadura es Candida blankii o Cryptococcus dimennae, y dicha fuente de carbono comprende D-sorbitol, L-sorbosa o L-sorbosona, en el que dicha levadura comprende al menos uno de una actividad de L-sorbosa deshidrogenasa, una actividad de D-sorbitol deshidrogenasa, una actividad de L-sorbosona deshidrogenasa y una actividad de galactosa deshidrogenasa.
19. El método de la reivindicación 1, en el que dicho estereoisómero de ácido ascórbico incluye ácido D-ascórbico, ácido D-araboascórbico y ácido L-araboascórbico.
20. Una levadura recombinante capaz de utilizar ácido 2-ceto-D-glucónico (KLG) como única fuente de carbono para producir ácido ascórbico o un estereoisómero de ácido ascórbico, que comprende uno o ambos de a) un ácido nucleico heterólogo que codifica una enzima oxidativa asociada con la conversión de una fuente de carbono a KLG en la levadura, y b) un ácido nucleico heterólogo que codifica una enzima reductora asociada con la conversión de una fuente de carbono a KLG en la levadura.
21. La levadura de la reivindicación 20, en la que dicha enzima oxidativa tiene una actividad deshidrogenasa.
22. La levadura de la reivindicación 21, en la que dicha deshidrogenasa incluye una actividad de glucosa deshidrogenasa, una actividad de ácido glucónico deshidrogenasa, una actividad de ácido 2-ceto-D-glucónico deshidrogenasa, una actividad de galactosa deshidrogenasa, una actividad de L-sorbosa deshidrogenasa, una actividad de D-sorbitol deshidrogenasa, actividad de L-sorbosona deshidrogenasa, ácido L-idónico oxidasa y ácido L-gulónico oxida-
sa.
23. La levadura de la reivindicación 20, en la que dicha enzima reductora tiene una actividad reductasa.
24. La levadura de la reivindicación 23, en la que dicha actividad reductasa incluye actividad de ácido 2,5-diceto-D-glucónico (DKG) reductasa, 2,3-DKG reductasa, 5-ceto reductasa, 2-ceto reductasa y 2-cetogulonato reductasa.
25. La levadura de la reivindicación 20, en la que la levadura es un miembro del grupo de levaduras imperfectas.
26. La levadura de la reivindicación 25, en la que la levadura es un miembro de la familia Cryptococcaceae.
27. La levadura de la reivindicación 26, en la que la levadura incluye Candida y Cryptococcus.
28. La levadura de la reivindicación 27, en la que la levadura es Candida blankii.
29. La levadura de la reivindicación 27, en la que la levadura es Cryptococcus dimennae.
30. La levadura de la reivindicación 20, en la que dicha levadura es Candida blankii o Cryptococcus dimennae, y dicha fuente de carbono comprende glucosa, en la que dicha levadura comprende una actividad de glucosa deshidrogenasa heteróloga y una actividad de 2,5-DKG reductasa.
31. La levadura de la reivindicación 20, en la que dicha levadura es Candida blankii o Cryptococcus dimennae, y dicha fuente de carbono comprende D-sorbitol, L-sorbosa o L-sorbosona, en la que dicha levadura comprende al menos uno de una actividad de L-sorbosa deshidrogenasa, una actividad de D-sorbitol deshidrogenasa, una actividad de L-sorbosona deshidrogenasa y una actividad de galactosa deshidrogenasa.
32. Un método para producir una levadura recombinante capaz de utilizar un carbohidrato de seis carbonos para producir ácido ascórbico (AAS) o un estereoisómero de AAS, que comprende las etapas de:
a)
obtener una levadura capaz de utilizar ácido 2-ceto-L-gulónico (KLG) como única fuente de carbono para producir AAS o un estereoisómero de AAS, y
b)
introducir al menos uno o ambos de a) un ácido nucleico heterólogo que codifica una enzima oxidativa asociada con la conversión de una fuente de carbono a KLG en dicha levadura, y b) un ácido nucleico heterólogo que codifica una enzima reductora asociada con la conversión de una fuente de carbono a KLG en dicha levadura.
33. El método de la reivindicación 32, en el que dicha levadura es un miembro del grupo de levaduras imperfectas.
34. El método de la reivindicación 33, en el que la levadura es un miembro de la familia Cryptococcaceae.
35. El método de la reivindicación 34, en el que la levadura incluye Candida y Cryptococcus.
36. El método de la reivindicación 35, en el que la levadura es Candida blankii.
37. El método de la reivindicación 35, en el que la levadura es Cryptococcus dimennae.
38. El método de la reivindicación 32, en el que dicha levadura es Candida blankii o Cryptococcus dimennae, y dicha fuente de carbono comprende glucosa, en el que dicha levadura comprende una actividad de glucosa deshidrogenasa heteróloga y una actividad de 2,5-dicetogluconato (DKG) reductasa.
39. El método de la reivindicación 32, en el que dicha levadura es Candida blankii o Cryptococcus dimennae, y dicha fuente de carbono comprende D-sorbitol, L-sorbosa o L-sorbosona, en el que dicha levadura comprende al menos uno de una actividad de L-sorbosa deshidrogenasa, una actividad de D-sorbitol deshidrogenasa, una actividad de L-sorbosona deshidrogenasa y una actividad de galactosa deshidrogenasa.
40. Un método para cribar una levadura capaz de producir ácido ascórbico (AAS) a partir de ácido 2-ceto-L-glucónico (KLG), que comprende las etapas de obtener una levadura capaz de crecer con ácido ascórbico o con un estereoisómero de ácido ascórbico, cultivar dicha levadura en presencia de KLG como única fuente de carbono en condiciones adecuadas para la producción de ácido ascórbico o del estereoisómero de ácido ascórbico; y analizar en dicho cultivo de levadura la producción de ácido ascórbico o de un estereoisómero de ácido ascórbico, en el que la levadura es una levadura natural o una levadura según la reivindicación 20.
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