ES2257693T3 - Analogos de factor x escindibles por trombina. - Google Patents

Analogos de factor x escindibles por trombina.

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ES2257693T3 ES03762681T ES03762681T ES2257693T3 ES 2257693 T3 ES2257693 T3 ES 2257693T3 ES 03762681 T ES03762681 T ES 03762681T ES 03762681 T ES03762681 T ES 03762681T ES 2257693 T3 ES2257693 T3 ES 2257693T3
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Abstract

Análogo de factor X en el que la secuencia Thr- Arg-Ile del sitio de activación de factor X nativo se reemplaza por una secuencia escindible por trombina, caracterizado porque dicha secuencia escindible por trombina es la secuencia Pro-Arg-Ala.

Description

Análogos de factor X escindibles por trombina.
La presente invención se refiere a derivados de factor X escindibles por trombina y a usos terapéuticos de los mismos.
La coagulación sanguínea es el resultado de una cascada de reacciones enzimáticas cuya etapa final es la generación de trombina, que induce la formación de un coágulo capaz de obstruir la abertura vascular. La mayoría de estas reacciones implican la activación proteolítica de zimógenos inactivos a serinproteasas activas.
Esta cascada de reacciones se divide convencionalmente en dos rutas denominadas: "ruta intrínseca" y "ruta de factor tisular" o "ruta extrínseca".
El proceso de coagulación mediante la ruta intrínseca se inicia mediante la puesta en contacto de la sangre con el tejido subendotelial. Este contacto conduce a la activación del factor XII (FXII) al factor FXIIa, que después cataliza la activación del factor XI (FXI) al factor XIa (FXIa), que activa a su vez el factor (IX) (FIX) al factor IXa. Este último se une a su cofactor, el factor VIIIa (FVIIIa) formando el complejo de tenasa. Este complejo escinde el factor X (FX) con gran eficacia produciendo el factor X activado (FXa).
El proceso de coagulación mediante la ruta extrínseca se inicia mediante el factor tisular (TF), puesto en contacto con la sangre cuando ocurre la formación de una abertura vascular. Este factor tisular se une al factor VII activado (FVIIa) presente en pequeñas cantidades en la sangre. El complejo FVIIa-TF así formado puede activar los factores IX y X.
La ruta intrínseca y la ruta extrínseca convergen así hacia la activación del factor X al factor Xa, que constituye una de las enzimas clave en la coagulación.
El factor Xa se sintetiza por hepatocitos en forma de un precursor aminoacídico de 448 aminoácidos que comprende, desde el extremo N-terminal al extremo C-terminal: un péptido señal, un propéptido, un dominio "Gla", dos dominios "EGF" (por factor de crecimiento epidérmico) de estructura similar a la del factor de crecimiento epidérmico, un péptido de activación y un dominio catalítico de tipo serinproteasa. Las modificaciones postraduccionales del factor X son particularmente complejas: además de la escisión del péptido señal y el propéptido, incluyen la carboxilación de los 11 glutamatos del dominio "Gla" a \gamma-carboxiglutamatos, la escisión del tripéptido Arg_{180}-Lys_{181}-Arg_{182} (la numeración designa el producto de traducción de ADNc de factor X) la separación del segundo dominio EGF del péptido de activación, la \beta-hidroxilación del resto de Asp_{103} del dominio EGF 1 a \beta-hidroxiaspartato y al menos cinco glicosilaciones, incluyendo cuatro en el péptido de activación.
Por lo tanto, el factor X maduro en circulación en el plasma consiste en dos cadenas polipeptídicas ligadas mediante un puente disulfuro (Cys_{172}-Cys_{342}): la cadena "ligera" de 139 aminoácidos está compuesta por el dominio Gla y los dos EGF; la cadena "pesada" de 306 aminoácidos está compuesta por el péptido de activación unido al dominio catalítico.
La activación de factor X a una serinproteasa requiere la escisión proteolítica entre el péptido de activación y el dominio catalítico. El complejo de tenasa, y también el complejo FVIIa-TF, realizan esta escisión entre los restos Arg_{234} e Ile_{235}.
El factor X activado realiza también una escisión autocatalítica que libera lentamente un pequeño fragmento en el extremo C-terminal de su cadena pesada. Los factores Xa \alpha y \beta se distinguen por tanto según si está presente este péptido C-terminal o no. Sin embargo, la actividad catalítica de estas dos formas de factor Xa es idéntica (Jesty, et al., J. Biol. Chem. 250, 4497-4504, 1975); en consecuencia, y a menos que se especifique otra cosa en la explicación de la presente invención, el término "factor Xa" designa igualmente una u otra de estas dos formas.
La unión del factor Xa con su cofactor, el factor Va, forma el complejo de protrombinasa, que activa la protrombina a trombina.
La trombina es también una enzima esencial en la coagulación, y en la hemostasis en general; es una serinproteasa multifuncional. Induce la agregación de plaquetas mediante la escisión de su receptor en su superficie, y convierte el fibrinógeno en circulación en un coágulo de fibrina insoluble. Este coágulo, al reforzar el trombo de plaquetas ya formado, bloquea la abertura vascular y hace posible así detener la hemorragia.
La trombina puede activar también los factores V y VIII, que son respectivamente los cofactores de los complejos de tenasa y protrombinasa, y también el factor XI (FXI), lo que da como resultado la amplificación de las reacciones que conducen a su formación, en las que están implicados estos factores.
La Figura 1 ilustra un diagrama de las reacciones enzimáticas principales de coagulación mediante la ruta extrínseca o mediante la ruta intrínseca, y también el mecanismo de autoamplificación de la formación de trombina (representado por flechas rayadas).
Una deficiencia cualitativa o cuantitativa de uno de los factores implicados en la coagulación conduce a manifestaciones trombóticas o hemorrágicas que son a menudo graves, y que pueden ser una amenaza para la vida. En este contexto, se hará particularmente mención a las hemofilias A y B, que son el resultado respectivamente de una deficiencia de factor VIII o factor IX.
Las hemofilias A y B son coagulopatías de tipo hemorrágico que son graves y bastante comunes: la incidencia de las mismas es de aproximadamente 1 caso por 10.000 nacimientos masculinos para hemofilia A y un caso por 30.000 nacimientos masculinos para hemofilia B.
En términos clínicos, estas dos afecciones patológicas son indistinguibles: en ambos casos, es el complejo de tenasa, resultante de la asociación del factor VIII con el factor IX, el que está afectado. Como resultado, hay una producción insuficiente de factor X activado y, en consecuencia, de trombina.
Esta deficiencia de trombina conduce no sólo a una reducción de la formación de fibrina, sino también a una reducción de la autoamplificación de la producción de trombina.
Los tratamientos para la hemofilia propuestos actualmente son tratamientos de tipo sustitutivo dirigidos a reestablecer la función del complejo de tenasa, o tratamientos basados en el uso de una o más moléculas que posibilitarían eludir el complejo de tenasa (Hedner, Thromb. Haemost., 82, 531-539, 1999).
El tratamiento de sustitución consiste en administrar el factor VIII o IX que es deficiente. Este es el único tratamiento disponible hasta la fecha que posibilita reestablecer correctamente, además de la formación de fibrina, la autoamplificación de la generación de trombina.
La desventaja principal de este tratamiento se encuentra en la antigenicidad potencial de la molécula inyectada, que puede considerarse como extraña por el sistema inmune del receptor. El desarrollo de aloanticuerpos neutralizantes dirigidos contra el factor utilizado es una grave complicación del tratamiento de sustitución, que lo hace gradualmente ineficaz.
Se han propuesto tres enfoques para eludir el complejo de tenasa:
-
inyección de mezclas de factores de coagulación "dependientes de vitamina K", que comprenden en particular protrombina y factores VII, IX y X, estando los factores VII y X parcialmente en forma activada. Sin embargo, este tratamiento induce efectos secundarios infrecuentes pero graves: shock anafiláctico y accidentes trombóticos (infarto de miocardio, coagulación intravascular diseminada) que puede explicarse mediante una acción no localizada en la lesión vascular. Además, este tratamiento reestablece la autoamplificación de la generación de trombina sólo en el caso de hemofílicos de tipo B;
-
inyección masiva de factor VII activado que, en presencia de factor tisular, activa el factor X independientemente del complejo de tenasa. El factor VII activado tiene la ventaja de que su acción está localizada en la abertura vascular donde se forma el complejo con factor tisular. Su eficacia en el tratamiento de la hemofilia podría explicarse también mediante un mecanismo independiente de factor tisular que utiliza los fosfolípidos aniónicos expuestos por las plaquetas activadas (Hoffman et al., Blood Coag. Fibrinolysis, 9 (supl. I), S61-65, 1998). Las principales desventajas de utilizar factor VII activado son su semivida plasmática muy corta (menos de tres horas), que hace necesario administrarlo en grandes cantidades, lo que hace al tratamiento muy caro. Además, el factor VII activado no induce la autoamplificacón de la generación de trombina. La cantidad de trombina generada en un plasma de hemofílico después de la adición de una dosis terapéutica de factor VII activado permanece bastante por debajo de la generada en un plasma normal (Butenas et al., Blood, 99, 923-930, 2002);
-
la administración de factor X, cuya actividad se libera sólo lentamente en el plasma; en este contexto, se han propuesto tres tipos de administración: administración de factor X activado en combinación con vesículas fosfolipídicas (Ni et al., Thromb. Haemost., 67. 264-271, 1992); la administración de factor X que está activado pero inhibido reversiblemente, por ejemplo, mediante acetilación de la serina del sitio activo, y capaz de reactivarse lentamente en el plasma mediante desacilación gradual (Wolf et al., Blood, 86, 4153-4157, 1995; Lin et al., Thromb. Res., 88, 365-372, 1997); la administración de factor X en forma de un zimógeno que puede activarse en el plasma independientemente del complejo de tenasa. Este último enfoque utiliza análogos de factor X en los que el sitio para escisión por el complejo de tenasa está reemplazado por un sitio para escisión por otra proteasa.
Himmelspach et al., (Thromb. Res. 97, 51-67, 2000) describe así análogos de factor X en los que el sitio de activación está reemplazado por un sitio de escisión por furina. Una vez inyectado, este zimógeno puede convertirse lenta y continuamente en el factor Xa.
La solicitud PCT 98/38317 propone la construcción de diversos análogos de factor X en los que el sitio de activación nativo está reemplazado por un sitio para escisión por otra proteasa, elegida de factor XIa, trombina, factor XIIa, calicreína, factor Xa y furina. La solicitud PCT WO 01/10896 propone el reemplazo del sitio nativo para activación por el complejo de tenasa por un sitio para escisión por el factor XIa.
La principal ventaja del uso de análogos de factor X se basa en la semivida plasmática de estos análogos, que es similar a la del factor X (48 horas), y por lo tanto mucho más larga que la del factor X activado (menos de 1 minuto). Las desventajas potenciales de estos análogos son el resultado de la dificultad para controlar sus efectos: la generación de factor X activado ocurre continuamente, sin estar regulado y sin estar localizado en la abertura vascular. Además, estos análogos no posibilitan inducir la amplificación de la generación de trombina.
Por lo tanto, parece ser deseable tener otros análogos de factor X que no exhiban estas desventajas. Con este objetivo, los inventores han buscado derivados de factor X activables por trombina que posibilitarían no sólo eludir las etapas deficientes de la cascada de coagulación, y en particular el complejo de tenasa, sino también reestablecer la autoamplificación de la generación de trombina, según el mecanismo ilustrado en la Figura 2. La forma activada de este derivado de factor X (FXa*) sería capaz de hecho (en combinación con factor V activado) de formar un complejo de protrombinasa funcional, y por lo tanto, de activar la protrombina a trombina. A cambio, la trombina activaría moléculas adicionales de derivado de factor X.
Fisiológicamente, la trombina no activa el factor X. De hecho, la eficacia de la escisión está condicionada por la naturaleza de los aminoácidos que encuadran el sitio de escisión, y en particular por los restos P_{3}-P_{2}-P_{1}-P_{1}'-P_{2}'-P_{3}' del sitio de activación (apareciendo la escisión entre los restos P_{1} y P_{1}'). Ahora, en el caso del factor X, la secuencia Leu-Thr-Arg-Ile-Val-Gly (LTR-IVG, SEC Nº ID 1) del sitio de activación es muy distinta de las secuencias Met-Pro-Arg-Ser-Phe-Arg (MPR-SFR, SEC Nº ID 2) o Val-Pro-Arg-Ser-Phe-Arg (VPR-SFR, SEC Nº ID 3), que son particularmente favorables para escisión por trombina (Marque et al., J. Biol. Chem., 275, 809-816, 2000; Bianchini et al., J. Biol. Chem., 277, 20527-20534, 2002).
Los restos P_{3} a P_{1} que preceden al sitio de escisión no están implicados en la actividad catalítica del factor X después de la activación: son parte del péptido de activación que se libera después de la escisión. Lo mismo no es cierto para los restos P_{1}' a P_{3}', que siguen inmediatamente al sitio de escisión: como en todas las serinproteasas, los restos N-terminales de la cadena catalítica de factor X activado están implicados en la actividad enzimática. El resto P_{1}' en particular desempeña un papel fundamental en el mecanismo catalítico de la enzima.
La sustitución de la secuencia LTR-IVG del sitio de activación del factor X por la secuencia VPR-SFR posibilitaría multiplicar por 10^{5} la relación de escisión de factor X por trombina. Sin embargo, existe el riesgo de que esta sustitución sea perjudicial para la actividad enzimática del factor Xa. De hecho, no es posible predecir cuál sería la actividad enzimática de un análogo de factor X activado en el que la cadena pesada empiece con un resto distinto de isoleucina.
La solicitud PCT WO 98/38317 describe un análogo de factor X en el que la secuencia LTR-IVG del sitio de activación nativo se reemplaza por la secuencia Thr-Arg-Arg-Ser-Val-Gly (TRR-SVG, SEC Nº ID 4) y que se presenta como potencialmente escindible por trombina. Sin embargo, no se dan indicaciones respecto a la escisión eficaz de este zimógeno por trombina, y aún menos respecto a la actividad catalítica del análogo de factor Xa que resultaría de esta escisión.
Los inventores han ensayado diversas sustituciones en las posiciones P_{3}-P_{2}-P_{1}-P_{1}'-P_{2}'-P_{3}' del sitio de activación nativo del factor X para estudiar los efectos de estas sustituciones, en primer lugar, sobre la escisión por trombina y, en segundo lugar, sobre la actividad enzimática del análogo de factor Xa resultante de las mismas.
Por tanto, han observado que la sustitución en las posiciones P_{2}-P_{1}-P_{1}' de la secuencia TR-I por la secuencia PR-A posibilita obtener análogos del factor X que pueden escindirse eficazmente por trombina, y cuya escisión genera un análogo de factor Xa que tiene una actividad catalítica que, aunque reducida, es similar a la de su homólogo no mutado y compatible con una función fisiológica normal; además, esta reducción de la actividad catalítica está compensada por un aumento en la semivida comparado con la del factor Xa nativo. Este aumento de la semivida es el resultado de una mejor resistencia a las serpinas (inhibidores de serinproteasas en el plasma) y, en particular, a la antitrombina.
En consecuencia, es un objeto de la presente invención un análogo de factor X en el que la secuencia Thr-Arg-Ile del sitio de activación del factor X nativo se reemplaza por una secuencia escindible por trombina, caracterizado porque dicha secuencia escindible por trombina es la secuencia Pro-Arg-Ala.
Es también un objeto de la presente invención cualquier análogo de factor Xa que pueda obtenerse mediante escisión por trombina de un análogo de factor X según la invención.
El término "análogo de factor X" designa aquí tanto la molécula de factor X madura como su precursor intracelular; el término "análogo de factor Xa" designa la molécula en la forma activada \alpha o \beta.
Respecto a las sustituciones en las posiciones P_{3}, P_{2}' y P_{3}' del sitio de activación, tienen menos influencia sobre la eficacia de la escisión por trombina, y sobre la actividad enzimática del análogo de factor Xa obtenido, que las realizadas en las posiciones P_{2}, P_{1} o P_{1}'.
Por tanto, en P_{3}, el resto Leu del factor X nativo puede conservarse o sustituirse por cualquier aminoácido, con la excepción de Pro, Asp y Glu; en P_{2}', el resto de Val del factor X nativo puede conservarse o sustituirse por un aminoácido preferiblemente elegido de Ile, Leu y Phe; en P_{3}', el resto Gly del factor X nativo puede conservarse o sustituirse por un aminoácido preferiblemente elegido de Asn y His.
Opcionalmente, es posible combinar las modificaciones del sitio de activación específicas de los análogos de factor X y análogos de factor Xa según la invención con otras modificaciones referentes a diferentes dominios del factor X o del factor Xa y posibilitar mejorar varias de sus propiedades. Por tanto, es posible, por ejemplo, reemplazar el propéptido del factor X nativo por el de la protrombina, para obtener un mejor rendimiento de proteína madura \gamma-carboxilada, como se describe por Camire et al. (Biochemistry, 39, 14322-14329, 2000). Es también un objeto de la presente invención moléculas de ácido nucleico que codifican análogos de factor X según la invención.
Estas moléculas de ácido nucleico pueden obtenerse mediante procedimientos convencionales bien conocidos por los expertos en la técnica, en particular mediante mutagénesis dirigida a sitio de una molécula de ácido nucleico que codifica el factor X nativo.
La presente invención abarca también los módulos de expresión que comprenden una molécula de ácido nucleico según la invención asociada a elementos adecuados para controlar la transcripción (en particular, promotor y, opcionalmente, terminador) y opcionalmente la traducción, y también los vectores recombinantes en los que se inserta una molécula de ácido nucleico según la invención. Estos vectores recombinantes pueden ser, por ejemplo, vectores de clonación, vectores de expresión o vectores de transferencia génica que pueden utilizarse en terapia génica.
Es también un objeto de la presente invención células huésped procarióticas o eucarióticas transformadas genéticamente con al menos una molécula de ácido nucleico según la invención. Preferiblemente, para la expresión y la producción de análogos de factor X según la invención, se elegirán células eucarióticas, por ejemplo, células de mamífero.
La construcción de vectores según la invención y la transformación de las células huésped pueden llevarse a cabo mediante técnicas de biología molecular convencionales.
La presente invención abarca también animales y, en particular mamíferos transgénicos no humanos, que albergan al menos un transgén que comprende un módulo de expresión según la invención. Estos mamíferos transgénicos pueden utilizarse, por ejemplo, para producir análogos de factor X según la invención de manera similar a la que se ha propuesto ya para la producción de otras proteínas de interés terapéutico (Brink et al., Theriogenology, 53, 139-148, 2000).
Los análogos de factor X según la invención pueden obtenerse, por ejemplo, cultivando genéticamente células transformadas según la invención y recuperando, a partir del cultivo, el análogo expresado por dichas células. Si es necesario, pueden purificarse mediante procedimientos convencionales conocidos por si mismos por los expertos en la técnica, por ejemplo, mediante precipitación fraccionada, en particular precipitación con sulfato de amonio, electroforesis, filtración en gel, cromatografía de afinidad, etc.
Es también un objeto de la presente invención el uso de análogos de factor X o de análogos de factor Xa según la invención, o de las moléculas de ácido nucleico que codifican estos análogos, para obtener productos medicinales procoagulantes.
Los productos medicinales obtenidos a partir de análogos de factor X o análogos de factor Xa según la invención pueden utilizarse en el contexto de la prevención o el tratamiento de coagulopatías de tipo hemorrágico, surgidas en particular por una deficiencia de factor VIII, IX o XI. Éstas pueden ser, en particular, hemofilia A o hemofilia B, que pueden estar complicadas o no por la presencia de inhibidores (aloanticuerpos neutralizantes dirigidos contra factor VIII o IX utilizados convencionalmente para el tratamiento); pueden ser también hemofilias adquiridas resultantes de la aparición de autoanticuerpos asociados a otra afección patológica (enfermedad autoinmune, cáncer, síndrome linfoproliferativo, trastorno idiopático, etc.).
Las moléculas de ácido nucleico según la invención pueden incorporarse ventajosamente a productos medicinales que pueden utilizarse en terapia génica. Los vectores utilizados convencionalmente en terapia génica, tales como vectores virales (por ejemplo, un vector de tipo adenovirus o retrovirus), liposomas, etc., pueden utilizarse para obtener productos medicinales según la invención.
Los análogos de factor Xa según la invención tienen, aparte del complejo de protrombinasa, una actividad catalítica que es mucho más débil que la del factor Xa nativo. Sin embargo, en el complejo de protrombinasa (concretamente en condiciones fisiológicas), la reducción de su actividad comparada con el factor Xa nativo es mucho menor, y son capaces de corregir eficazmente los efectos de un agotamiento de factor VIII o IX. Además, debido a su considerable resistencia a la antitrombina, los análogos de factor Xa según la invención tienen la ventaja de tener una semivida más larga, que compensa su actividad más débil. Aunque es mucho más lenta, sigue habiendo inhibición por antitrombina (que es proporcional a la actividad catalítica), lo que posibilita conservar un mecanismo de autorregulación similar al del factor Xa nativo.
Además, la acción de análogos de factor Xa según la invención permanece localizada en la abertura vascular puesto que, como se muestra en la Figura 2, la cascada enzimática en la que están implicados estos análogos es desencadenada por factor tisular. Finalmente, como se muestra también en la Figura 2, el uso de análogos de factor X según la invención posibilita reestablecer la autoamplificación de la generación de trombina.
El resultado global de esto es un efecto terapéutico que está mejor dirigido y es más fácil de controlar que el de los análogos de factor X o factor Xa de la técnica anterior.
Los análogos de factor X según la invención pueden utilizarse, por ejemplo, a concentraciones plasmáticas del orden de 0,1 a 0,5 \muM, concretamente 5 a 25 mg/l. Estas concentraciones pueden obtenerse administrando dosis que son cercanas a las que se utilizan en el caso de tratamientos con factor VIIa, pero menos frecuentemente.
La presente invención se entenderá más claramente a partir de la descripción adicional siguiente, que designa ejemplos no limitantes de preparación y de caracterización de un análogo de factor X (GDX-AVG) según la
invención.
Ejemplo 1 Construcción de vectores de expresión para análogos de factor X
Se construyeron diversos derivados de factor X humano:
-
un derivado, designado en adelante en la presente memoria como "FX recombinante", que difiere de factor X nativo sólo por la adición, en su extremo terminal, de un péptido de 11 aminoácidos (EQKLISEEDLN, SEC Nº ID 5) que es reconocido por el anticuerpo monoclonal 9E10 (Pharmingen, San José, EE.UU.); esta modificación posibilita facilitar la detección y purificación de la proteína expresada;
-
un derivado, designado en adelante en la presente memoria como "GD-FX", que difiere del derivado "recombinante" en que carece también de un dominio Gla, lo que posibilita aumentar la cantidad de proteína recombinante expresada, y en que comprende en su extremo N-terminal una secuencia de 12 aminoácidos (EDQVDPRLIDGK, SEC Nº ID 6) que constituye un epítope reconocido por el anticuerpo monoclonal HPC-4 (Roche Diagnostics, Meylan, Francia);
-
los derivados, designados en adelante en la presente memoria como GDX-IVG, GDX-IFG, GDX-AVG, GDX-IFR, GDX-SVG, GDX-SFR, que difieren del derivado GD-FX por la modificación de uno o más de los restos en las posiciones P_{3}, P_{2}, P_{1}, P_{1}', P_{2}' o P_{3}' del sitio de activación.
Los restos P_{3} a P_{3}' del sitio de activación de factor X normal aislado de plasma (FX plasmático), y de cada uno de los derivados anteriores, se indican en la Tabla I.
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TABLA I
P_{3} P_{2} P_{1} P_{1}' P_{2}' P_{3}'
FX plasmático (SEC Nº ID 1) Leu Thr Arg Ile Val Gly
FX recombinante (SEC Nº ID 1) Leu Thr Arg Ile Val Gly
GD-FX (SEC Nº ID 1) Leu Thr Arg Ile Val Gly
GDX-IVG (SEC Nº ID 7) Val Pro Arg Ile Val Gly
GDX-IFG (SEC Nº ID 8) Val Pro Arg Ile Phe Gly
GDX-AVG (SEC Nº ID 9) Val Pro Arg Ala Val Gly
GDX-IFR (SEC Nº ID 10) Val Pro Arg Ile Phe Arg
GDX-SVG (SEC Nº ID 11) Val Pro Arg Ser Val Gly
GDX-SFR (SEC Nº ID 12) Val Pro Arg Ser Phe Arg
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Los vectores de expresión utilizados para construir estos derivados se obtienen a partir del vector pNUT-hGH (Palmiter et al., Science, 1983, 222, 809-814, 1983) mediante el reemplazo de la secuencia que codifica hormona de crecimiento humana (hGH) por la secuencia que codifica el derivado de factor X deseado.
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Construcción del vector pNUT-FX
El vector designado como "pNUT-FX" posibilita expresar el derivado "FX recombinante" en células eucarióticas.
El ADNc completo del factor X humano utilizado (1467 pares de bases) se clonó inicialmente por Messier et al. (Gene, 99, 291-294, 1991) en el sitio SalI del plásmido pBluescript KS(-).
Este ADNc se recuperó mediante amplificación por PCR a partir del vector pBluescript que lo contiene. Los cebadores utilizados se representan en la Tabla II siguiente. La temperatura de fusión utilizada (Th') se indica en la columna final de la tabla.
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TABLA II
1
Los cebadores 1 (SEC Nº ID 13) y 2 (SEC Nº ID 14) introducen respectivamente un sitio de restricción BamHI posicionado 5' y un sitio XmaI posicionado 3' en la secuencia que codifica el factor X. Además, el cebador 2 introduce, justo antes del codón de paro de ADNc del factor X, la secuencia que codifica el epítope reconocido por el anticuerpo monoclonal 9E10.
El protocolo de amplificación es el siguiente: la amplificación se lleva a cabo en un volumen de 100 \mul que contiene 2 \mug (7 nM) de plásmido pBluescript, cada uno de los cebadores 1 y 2 2 \muM, cada dNTP 0,2 mM (dATP, dCTP, dGTP, dTTP; Amersham Pharmacia Biotech, Orsay, Francia) y 6 unidades de ADN polimerasa Pfu (Stratagene) en el tampón recomendado por el fabricante. La amplificación se lleva a cabo en un DNA Thermal Cycler (modelo 480, Perkine Elmer, Roissy, Francia) según el programa siguiente: una desnaturalización inicial de 5 minutos a 95ºC, seguida de 30 ciclos, comprendiendo cada uno 45 minutos de desnaturalización a 95ºC, 45 segundos de hibridación a una temperatura de al menos 4ºC por debajo de la temperatura de fusión de los cebadores, y 3,5 minutos de elongación a 72ºC. La amplificación se termina mediante incubación durante 10 minutos a 72ºC.
El producto de amplificación se purifica mediante extracción con fenol/cloroformo y se concentra mediante precipitación con etanol. Después se hacen romos los extremos y se fosforilan mediante incubación durante 30 minutos a 37ºC en presencia de 5 unidades de ADN polimerasa T_{4} (New England Biolabs, Beverly, MA, EE.UU.), 10 unidades de polinucleótido quinasa T_{4} (New England Biolabs) y dNTP 0,3 mM (Amersham Pharmacia Biotech). Se purifica el fragmento de interés utilizando el "QIAquick Gel Extraction Kit" (QIAGEN, Courtaboeuf, Francia) después de separación en un gel de agarosa al 1% estándar, según las instrucciones del fabricante.
En paralelo, se linealizan 40 \mug en 140 \mul (86 nM) de un vector receptor (pBluescript, Stratagene) con 400 unidades de EcoRV durante 90 minutos a 37ºC. Se desfosforilan los extremos del vector pBluescript linealizado mediante incubación durante 60 minutos a 37ºC en presencia de 50 unidades de fosfatasa alcalina intestinal de ternero (New England Biolabs); después se purifica este vector como anteriormente, utilizando el "QIAquick Gel Extraction Kit", después de separación en agarosa al 1% estándar.
Se introduce el inserto en el vector receptor mediante ligamiento, incubando el vector 10 nM con inserto 20 nM en presencia de 400 unidades de ADN ligasa T_{4} (New England Biolabs) durante 24 horas a temperatura ambiente en 10 \mul del tampón recomendado por el fabricante.
El plásmido resultante (pBluescript-FX) se amplifica en la cepa DH5\alpha de E. coli y se purifica según protocolos estándar, descritos por Sambrook et al. ("Molecular Cloning: A Laboratory Manual", Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989).
El inserto del plásmido pBluescript-FX se transfiere al vector pNUT-hGH mediante intercambio de módulos según el siguiente protocolo:
Se digieren 2 \mug (4 nM) de pNUT-hGH con 60 unidades de BamHI durante 2 horas a 37ºC en 100 \mul de mezcla de reacción. Se purifica el vector así linealizado mediante extracción con fenol/cloroformo, seguido de precipitación con etanol. Se recoge después en 10 \mul de Tris 10 mM, pH 8,0, que contiene EDTA 1 mM, y se digiere con 30 unidades de XmaI durante 3 horas a 37ºC.
Se desfosforilan los dos fragmentos derivados de esta segunda digestión mediante incubación durante una hora a 37ºC en presencia de 150 unidades de fosfatasa alcalina.
Se separa el vector pNUT linealizado de su anterior inserto (que contiene la secuencia que codifica hGH) mediante electroforesis en agarosa al 1% estándar, y se purifica utilizando el "QIAquick Gel Extraction Kit".
En paralelo, se digieren 130 \mul (1,3 \muM) de pBluescript-FX con 20 unidades de BamHI durante 1 hora a 37ºC en 30 \mul de meczla de reacción. Se purifica el vector linealizado mediante extracción con fenol/cloroformo, seguido de precipitación con etanol. Se suspende después en 10 \mul de Tris 10 mM, pH 8,0, que contiene EDTA 1 mM, y se digiere con 30 unidades de XmaI durante 3 horas a 37ºC.
Se separa el inserto FX de su anterior vector mediante electroforesis en agarosa al 1% estándar, y se purifica utilizando el "QIAquick Gel Extraction Kit".
Se obtiene el vector pNUT-FX mediante ligamiento del inserto FX en el vector pNUT en presencia de ADN ligasa T_{4}, como se describe anteriormente.
Construcción del vector pNUT-GDX
La presencia de un dominio "Gla" limita considerablemente la síntesis de una proteína recombinante en una célula eucariótica. Su retirada posibilita multiplicar por cinco la cantidad de proteína recombinante expresada.
Además, el dominio "Gla" del factor X es necesario para su actividad biológica, pero no es esencial para la actividad proteolítica con respecto a sustratos que interaccionan sólo con el surco catalítico. La preparación de derivados que carecen de dominio "Gla" posibilita por lo tanto determinar rápidamente el efecto de modificaciones de los restos yuxtapuestos al sitio de activación sobre la actividad serinproteasa.
El vector pNUT-ETW (Le Bonniec et al., J. Biol. Chem., 267, 6970-6976, 1992) expresa un derivado de protrombina humana que carece de su dominio "Gla" y está fusionado, en N-terminal, con el péptido señal de factor V bovino y con una secuencia de 12 aminoácidos (EDQVDPRLIDGK) que constituye un epítope reconocido por el anticuerpo monoclonal HPC-4.
Para construir el vector pNUT-GDX, el conjunto de "péptido señal y dominio ``Gla'' del vector pNUT-FX" se sustituyó por el conjunto "péptido señal, propéptido y epítope HPC-4 del vector pNUT-ETW".
Los cebadores utilizados para amplificar los fragmentos de los vectores pNUT-FX y pNUT-ETW se representan en la Tabla III siguiente. La amplificación por PCR se lleva a cabo como se describe anteriormente para el vector pNUT-FX.
TABLA III
2
La amplificación del fragmento derivado de pNUT-ETW (que incluye los sitios BamHI y XmaI de pNUT, la secuencia que codifica el péptido señal del factor V y la que codifica el epítope reconocido por el anticuerpo HPC-4) se lleva a cabo con los cebadores 3 (SEC Nº ID 15) y 5 (SEC Nº ID 17); la amplificación del fragmento derivado de pNUT-FX (que incluye la secuencia que codifica los dos dominios EGF, el péptido de activación y el dominio serinproteasa del factor X, y también el epítope reconocido por el anticuerpo 9E10) se lleva a cabo con los cebadores 6 (SEC Nº ID 18) y 4 (SEC Nº ID 16). Los cebadores 5 y 6 son parcialmente complementarios (el cebador 6 introduce, posicionado 5' del primer EGF, una porción de la secuencia que codifica el epítope reconocido por el anticuerpo HPC-4), lo que posibilita unir los fragmentos derivados de las dos PCR mediante PCR "Mega-primer" (Ho et al., Gene, 15, 51-59, 1989) en presencia de los cebadores 3 y 4. El producto de esta PCR se digiere con 40 unidades de XmaI (en un volumen de 400 \mul) y se purifica el fragmento de restricción (con un sitio XmaI en cada extremo) utilizando el QIAquick Gel Extraction Kit después de separación en un gel de agarosa al 1%.
Además, se digieren 6 \mug en 140 \mul (12 nM) de vector pNUT-hGH con 20 unidades de Xmal durante 2 horas a 37ºC. El vector así linealizado se separa de su antiguo inserto (secuencia que codifica hGH) mediante electroforesis en agarosa al 1% estándar, y se purifica utilizando el QIAquick Gel Extraction Kit. El vector sin inserto (0,1 \mug en 10 \mul, concretamente 2,7 nM) se recirculariza mediante ligamiento en presencia de 400 unidades de ADN ligasa T_{4} durante 16 horas a temperatura ambiente.
Se amplifica el vector pNUT recircularizado en la cepa DH5\alpha de E. coli y se purifica.
Se linealizan 40 \mug en 100 \mul (concretamente 110 nM) del vector pNUT sin inserto con 10 unidades de XmaI durante 3 horas a 37ºC, y se desfosforilan sus extremos mediante incubación durante 1 hora a 37ºC en presencia de 150 unidades de fosfatasa alcalina. El vector pNUT así preparado se aísla utilizando el QIAquick Gel Extraction Kit, después de separación en un gel de agarosa al 1%.
El vector pNUT-GDX se obtiene mediante ligamiento del fragmento derivado de PCR "Mega-primer" en el vector pNUT en presencia de ADN ligasa T_{4}, como se describe anteriormente, y selección basándose en los perfiles de restricción de BamHI, XmaI, PstI o EcoRI de los constructos que contienen el inserto en la orientación correcta.
Mutagénesis dirigida a sitio del vector pNUT-GDX
En el factor X nativo (y también en el derivado GDX-FX), la secuencia de los restos P_{3}-P_{2}-P_{1}-P_{1}'-P_{2}'-P_{3}' que encuadran el sitio de escisión (teniendo lugar la escisión entre P_{1} y P_{1}') es LTR-IVG.
Los seis análogos de factor X preparados: GDX-IVG, GDX-IFG, GDX-AVG, GDX-IFR, GDX-SVG, GDX-SFR tienen respectivamente la secuencia P_{3}-P_{2}-P_{1}-P_{1}'-P_{2}'-P_{3}': VPR-IVG, VPR-IFG, VPR-IFR, VPR-AVG, VPR-SVG y VPR-SFR.
Los vectores que expresan estos análogos de factor X se prepararon mediante mutagénesis del vector pNUT-GDX mediante un procedimiento derivado del de Jones et al., (Nature, 344, 793-794, 1990).
Las secuencias de los cebadores utilizados para la mutagénesis del vector pNUT-GDX se indican en la Tabla IV (SEC Nº ID 19 a SEC Nº ID 30).
El cebador "con sentido" (s) hibrida en la cadena de no codificación, y el cebador "sin sentido" (a) hibrida en la cadena de codificación.
TABLA IV
3
La mutagénesis se lleva a cabo mediante PCR en un volumen de 50 \mul que contiene 50 ng (0,2 nM) de pNUT-GDX como matriz, 125 ng (70 nM) de cada cebador (con sentido y sin sentido, véase la Tabla 4), una mezcla equimolar (0,5 mM) de cada dNTP y 2,5 unidades de Pfu polimerasa en el tampón recomendado por el fabricante, utilizando un DNA Thermal Cycler 480 (Perkin Elmer). La PCR comprende una etapa inicial de desnaturalización a 95ºC durante 5 minutos, seguida de 16 ciclos idénticos que están constituidos cada uno por 45 segundos de desnaturalización a 95ºC, 60 segundos de hibridación a 55ºC y 26 minutos de elongación a 68ºC. Al final de estos 16 ciclos, el vector que ha servido como matriz se degrada a 37ºC durante 60 minutos con 10 unidades de DpnI.
Las bacterias DH5\alpha, convertidas en competentes mediante lavado a 4ºC con CaCl_{2} 100 mM, se transforman con 5 a 10 \mul del producto de PCR digerido con DpnI; se seleccionan las colonias que han incorporado un plásmido viable y se verifican la orientación y la secuencia del inserto.
Ejemplo 2 Producción de derivados de factor X en células eucarióticas Transfección de células BHK-21
Se expresaron las proteínas recombinantes en células de riñón de hámster recién nacido (BHK-21) proporcionadas por la European Collection of Cell Cultures (Sofia-Antipolis, Francia).
Se cultivan las células BHK-21 en placas Petri (80 mm de diámetro) en un incubador a 37ºC en atmósfera de CO_{2} al 5% en medio DMEM completo (medio Eagle modificado por Dulbecco) (GIBCO BRL) suplementado con 10% de suero fetal de ternero (GIBCO BRL), L-glutamina 2 mM (GIBCO BRL), 100 unidades/ml de penicilina (GIBCO BRL) y estreptomicina 100 \mug/ml (GIBCO BRL). Cuando alcanzan aproximadamente 80% de confluencia, se aclaran las células dos veces con tampón PBS (solución salina tamponada con fosfato, GIBCO BRL) y después se incuban a 37ºC durante 1 hora en 4 ml de OPTI-MEM (GIBCO BRL).
Se lleva a cabo la transfección añadiendo el vector de expresión 40 nM para el derivado de factor X deseado (40 \mug en un volumen de 220 \mul ajustado con agua destilada) a 250 \mul de una solución a un pH de exactamente 7,05, que está constituido por Hepes 50 mM, Na_{2}HPO_{4} 1,5 mM, NaCl 280 mM, KCl 10 mM y dextrosa 12 mM. La coprecipitación del ADN se obtiene añadiendo gota a gota 31 \mul de CaCl_{2} 2,5 M y con agitación constante. Después de incubación durante 30 minutos a temperatura ambiente, se añade el precipitado al medio que cubre las células y se deja sedimentar durante 3 horas a 37ºC. Se lavan las células con PBS (para retirar la mayoría del precipitado) y se devuelven al cultivo en medio DMEM completo durante 24 horas a 37ºC.
Se separan las células de la placa Petri con 2 ml de una solución de EDTA 54 mM, pH 8,0, que contiene tripsina 0,5 mg/mol, se resuspenden en el medio de selección (DMEM completo que contiene metotrexato 50 mg/l (TEVA, Courbevoie, Francia)) y se vuelven a sembrar en dos nuevas placas Petri. Se renueva el medio de cultivo cada dos días durante 2 a 3 semanas, hasta que se obtienen colonias. Se aíslan estas colonias y se transfieren a los pocillos (2 cm^{2}) de una placa de cultivo de 24 pocillos, donde se multiplican hasta confluencia en el medio de selección.
Identificación de los clones productores de un derivado de factor X
La detección de los clones que expresan establemente un derivado de factor X se lleva a cabo mediante inmunotransferencia.
Se añade una alícuota (30 \mul) de sobrenadante de cultivo de células BHK-21, que ha permanecido en contacto con las células transfectadas durante al menos 48 horas, a 10 \mul de Tris-HCl 100 mM, pH 6,8, que contiene 40% (v/v) de glicerol, 8% (p/v) de SDS, 0,04% (p/v) de azul de bromofenol y 20% (v/v) de \beta-mercaptoetanol. Se desnaturalizan las proteínas en la muestra a 95ºC durante 5 minutos y se separan en un gel de poliacrilamida al 12% (reticulación 29/1) en tampón Tris 25 mM, pH 7,5, que contiene glicina 0,1 M y 0,1% (p/v) de SDS.
La electroforesis es seguida por transferencia a membrana de nitrocelulosa (Trans-Blot, Bio-Rad, Ivry Sur Seine, Francia) en tampón Tris-HCl 25 mM, glicina 0,1 M, pH 7,5, que contiene 20% de metanol. La membrana se satura mediante incubación durante 1 hora a temperatura ambiente en una solución de 5% (p/v) de leche desnatada en tampón Tris 50 mM, pH 7,5, que contiene NaCl 150 mM, 0,1% de Tween 20 (TTBS), y después se lava 3 veces durante 10 minutos en el mismo tampón. Se incuba después la membrana durante 1 a 12 horas en presencia del anticuerpo monoclonal 9E10 50 ng/ml en TTBS. Después de tres lavados (como anteriormente), se incuba la membrana durante una hora a temperatura ambiente en presencia de un anticuerpo policlonal de cabra IgG anti-ratón marcado con fosfatasa alcalina (Bio-Rad) diluido a 1/3.000 en TTBS. Se revela la presencia de proteína recombinante mediante incubación de la membrana en presencia de un sustrato cromogénico (mezcla en cantidades iguales de fosfato de 5-bromo-4-cloro-3-indolilo, sal de p-toluidino (BCIPT) y cloruro de nitrotetrazolio (NTC), diluida en tampón Tris 0,1 M, pH 9,5, que contiene MgCl_{2} 0,5 M).
Cultivo y producción celular
Se amplifican los clones que expresan el derivado de factor X deseado más fuertemente y se conservan congelando en nitrógeno líquido (aproximadamente 10^{6} células en 1 ml de suero fetal de ternero a las que se ha añadido 10% (v/v) de DMSO).
La producción de derivados de factor X se lleva a cabo en medio de selección que contiene cinc 50 \muM (para inducción del promotor de metalotioneína) y, para los clones que expresan el derivado recombinante de FX que poseen un dominio Gla, vitamina K_{1} 5 mg/ml (Roche, Neuilly sur Seine, Francia) para permitir la \gamma-carboxilación postraduccional. Se multiplican las células mediante pasadas sucesivas en matraces de 150 cm^{2} que se utilizan para inocular botellas de 850 cm^{2}. Se recogen los sobrenadantes de cultivo cada 2 a 6 días (dependiendo de la densidad celular), se clarifican mediante centrifugación durante 10 minutos a 5.000 g y se conservan a -20ºC, después de la adición de EDTA 5 mM y benzamidina 10 mM.
Ejemplo 3 Purificación de los derivados de factor X
Se llevó a cabo la purificación de los derivados en dos o tres etapas, dependiendo del derivado referido.
La primera etapa es común a todas las purificaciones: implica una adsorción sobre resina de intercambio aniónico para concentrar las proteínas contenidas en el sobrenadante de cultivo.
Se diluyen los sobrenadantes de cultivo a 1/3 en Tris 50 mM, pH 7,5, que contiene benzamidina 10 mM y EDTA 5 mM. Típicamente, se diluyen 2 litros de sobrenadante en 4 litros de tampón, se añaden 4,5 g de QAE-Sephadex A50 (Amersham Pharmacia Biotech) y se agita lentamente la mezcla durante 30 minutos a temperatura ambiente (utilizando un agitador de palas rotatorio). Se permiten sedimentar las perlas de Sephadex durante una hora y se desecha el sobrenadante.
Se transfiere la resina cargada a una columna, y se eluyen las proteínas adsorbidas con tampón Tris 50 mM, pH 7,5, que contiene NaCl 0,5 M.
La segunda etapa es una cromatografía de afinidad que posibilita separar el derivado de factor X de las demás proteínas contenidas en el eluato de QAE-Sephadex.
El derivado de FX recombinante se purifica mediante cromatografía de afinidad sobre un gel Affi-Prep HZ (Bio-Rad) injertado con 3 mg del anticuerpo monoclonal 9E10 por ml de gel. Después de cargar la columna con el eluato de QAE-Sephadex y lavar con tampón Tris 50 mM, pH 7,5, que contiene NaCl 0,5 M, se eluye el derivado de FX recombinante con tampón HCl-glicina 0,1 M, pH 2,7. Se ajusta el pH del eluato a 7,5 añadiendo 30 \mul/mol de Tris 2 M, y se reequilibra la columna en tampón de lavado.
La columna de afinidad injertada con el anticuerpo 9E10 tiene la desventaja de tener una baja capacidad y de requerir elución en medio desnaturalizante. Es necesaria en este caso una tercera etapa de purificación, mediante cromatografía de intercambio aniónico de alta resolución, para retirar el agente desnaturalizante y concentrar el derivado eluído de la columna.
Se reúnen varios eluatos de la columna de afinidad, por un total de 2 a 10 mg de derivado de FX recombinante, se diluyen a ¼ con tampón Tris 50 mM, pH 7,5, que contiene EDTA 5 mM, y se cargan en una columna Q-Sepharose Fast Flow (0,8 x 10 cm) (Amersham Pharmacia Biotech). Después de lavar con tampón de dilución, se eluye la columna en tampón Tris 50 mM, pH 7,5, que contiene NaCl 0,5 M.
Los derivados de factor X que carecen del dominio Gla, que portan en su extremo N-terminal el epítope reconocido por el anticuerpo HPC-4, se purificaron sobre una columna de afinidad injertada con este anticuerpo. Ya que el anticuerpo HPC-4 es dependiente de calcio, la columna puede eluirse mediante lavado en presencia de un quelante de calcio, que no desnaturaliza la proteína. El derivado de factor X así purificado puede utilizarse directamente.
En este caso, el eluato de QAE-Sephadex se recalcifica anteriormente a 5 mM añadiendo CaCl_{2}. Se lava la columna con tampón Tris 50 mM, pH 7,5, que contiene NaCl 0,5 M y CaCl_{2} 1 mM, y se eluye el factor X con tampón Tris 50 mM, pH 7,5, que contiene NaCl 100 mM y EDTA 5 mM.
En total, se prepararon un mínimo de 10 mg de cada uno de los derivados de factor X.
Independientemente del protocolo utilizado, se controla la pureza de la preparación, después de desnaturalización y reducción de una muestra, mediante electroforesis en gel de poliacrilamida (12%, reticulación 29/1) y tinción con azul de Coomasie.
Todas las preparaciones obtenidas parecen ser puras sobre un gel de SDS-poliacrilamida, pero están presentes sistemáticamente dos formas: una forma bicatenaria principal (80 a 90%) con masas moleculares aparentes compatibles con las esperadas para las cadenas pesada y ligera (50 y 23 kDa para el FX recombinante; 50 y 18 kDa para los derivados que carecen del dominio Gla); una forma monocatenaria minoritaria (10 a 20%, dependiendo de las preparaciones), con una masa molecular de 66 kDa para el FX recombinante y 60 kDa para los derivados que carecen del dominio Gla.
El porcentaje de forma monocatenaria parece depender más del conjunto de sobrenadantes del que deriva la preparación que de la mutación introducida: para una mutación dada, el porcentaje de forma monocatenaria varía de una purificación a otra.
Los derivados purificados se dividen en alícuotas y se almacenan a -80ºC hasta el uso. Se estima la concentración de la alícuota mediante su absorbancia a 280 nm, tomando 1,25 g^{-1}cm^{-1} como el coeficiente de absorción molar (\varepsilon%_{280}).
Ejemplo 4 Activación por trombina de los derivados de factor X
El factor X nativo puede activarse sólo por sus activadores fisiológicos (complejos de tenasa o factor tisular) y por ciertos venenos de serpiente, siendo el más habitualmente utilizado el extracto de veneno de víbora de Russell (RVV-X). El dominio Gla del factor X desempeña un papel muy importante en esta activación: la velocidad de activación del factor X normal que carece del dominio Gla es de promedio aproximadamente cien veces más lenta que la del factor X completo.
El FX recombinante se comporta esencialmente como factor X plasmático, excepto porque una porción (que está \gamma-carboxilada incorrectamente por las células BHK-21) es difícil de activar y es sólo ligeramente activa en el complejo de protrombinasa. Los derivados de factor X que carecen del dominio Gla permanecen escindibles (lentamente) por el activador de veneno de serpiente aislado y (en cierta medida) por los complejos fisiológicos.
Se ensayó la capacidad de los derivados que carecen del dominio Gla de escindirse por la trombina.
Se utilizaron dos procedimientos para evaluar la velocidad de escisión de los derivados de factor X por trombina, dependiendo de si esta escisión genera o no una actividad amidolítica detectable. En el primer caso, se mide la actividad amidolítica generada por el factor activado y, en el segundo caso, se cuantifica la forma escindida mediante electroforesis.
Medición de la actividad amidolítica
Se determinan las constantes de velocidad para la activación de los derivados de factor X por trombina en condiciones de seudo-primer orden, concretamente, la concentración del zimógeno es al menos igual a 0,1 veces la concentración para semisaturación del activador (su K_{m}). En estas condiciones, la constante de velocidad medida es directamente proporcional a la constante de especificidad (k_{cat}/K_{m}) del activador (trombina) por su sustrato (el zimógeno derivado de factor X). Sin conocer el valor de la K_{m}, es posible verificar que la condición de seudo-primer orden se respeta midiendo la velocidad de activación a dos concentraciones de sustrato: la constante de velocidad medida debería ser la misma (permitiendo el error experimental) para las dos concentraciones de zimógeno.
Se incuba cada derivado de factor X (entre 1 y 10 \muM) en presencia de trombina (100 nM) en tampón cinético (Tris 50 mM, pH 7,8 que contiene NaCl 150 mM, 0,2% de PEG 8000 (p/v) y CaCl_{2} 5 mM) a 37ºC. Después de variar los tiempos de incubación, se muestrea una alícuota de 10 \mul, a la que se añaden hirudina (Refludan, Hoechst, Frankfurt, Alemania) 1 \muM (100 unidades por ml) (para detener la reacción neutralizando la trombina). Se estima la cantidad de forma activa generada por la actividad amidolítica del derivado activado. Después de haber añadido N-\alpha-Z-Arg-Gly-Arg-pNA 100 \muM (S2765, Biogenic, Maurin, Francia), se mide la actividad amidolítica registrando la variación de absorbancia a 405 nm en función del tiempo (la velocidad inicial de hidrólisis de S2765) utilizando un lector de microplacas MR5000 (Dynex, Guyancourt, Francia). Antes de la adición de trombina, la velocidad de hidrólisis de S2765 es cero, puesto que el derivado de factor X está enteramente en forma de zimógeno. Al representar la velocidad inicial de hidrólisis de S2765 en función del tiempo de incubación del zimógeno con trombina, se obtiene una curva que posibilita, por regresión no lineal, estimar la constante de velocidad para la activación del zimógeno (k) utilizando la ecuación 1 que representa un aumento exponencial de primer orden:
(ecuación 1)V_{t}= V_{0} + V_{máx} (1-exp^{(-kt)})
en la que V_{t} representa la velocidad de hidrólisis del sustrato cromogénico en el tiempo t, V_{0} la velocidad de hidrólisis del sustrato cromogénico a tiempo cero (normalmente cero) y V_{máx} la velocidad de hidrólisis del sustrato cromogénico a tiempo infinito (cuando todo el zimógeno está activado). Si la condición de seudo-primer orden se respeta, el valor de k es igual a la concentración del activador (trombina) multiplicado por la k_{cat}/K_{m} de la reacción de activación de zimógeno. Por lo tanto, este procedimiento posibilita comparar la capacidad de la trombina de activar los derivados de factor X que generan actividad amidolítica después de la activación. Este procedimiento es aplicable independientemente de la actividad amidolítica generada, siendo la única condición que pueda medirse una actividad catalítica: es de hecho lo mismo que medir el porcentaje de activación en función del tiempo.
Cuantificación por electroforesis
Como alternativa, si no es detectable actividad catalítica, se detecta la capacidad de la trombina de escindir el derivado de factor X en gel de SDS-poliacrilamida. La incubación del zimógeno sustrato con su activador se lleva a cabo en las mismas condiciones de seudo-primer orden que anteriormente. Después de variar los tiempos de incubación, se toma una alícuota de 20 \mul, y se analiza mediante electroforesis en gel de poliacrilamida (12%, reticulación 29/1) después de desnaturalización y reducción de la muestra.
Después de teñir con azul de Coomasie, se examina el gel y se estima la intensidad de cada banda de migración con software de formación de imágenes (Scion-Image, disponible en la dirección http://www.scioncorp.com).
Este procedimiento posibilita evaluar, para cada muestra, el porcentaje de cada forma de derivado de factor X (monocatenaria inactiva, bicatenaria inactiva, activada en forma \alpha, activada en forma \beta). Al representar la intensidad de las bandas correspondientes a las formas activadas en función del tiempo de incubación del zimógeno con trombina, se obtiene una curva que posibilita, mediante regresión no lineal, estimar la constante de velocidad para la activación del zimógeno (k) utilizando la ecuación 1, en la que V_{t}, V_{0} y V_{máx} son, respectivamente, reemplazados por: la intensidad de la banda a tiempo t, a tiempo cero (normalmente cero) y a tiempo infinito (cuando está activado 100% del zimógeno). Si la condición de seudo-primer orden se respeta, el valor de k es igual a la concentración del activador (trombina) multiplicada por el k_{cat}/K_{m} para la reacción de activación de zimógeno. En la práctica, es más fiable evaluar la desaparición del zimógeno con el tiempo. Al representar la intensidad de las bandas correspondientes a las formas de zimógeno en función del tiempo de incubación con trombina, se obtiene una curva que posibilita, mediante regresión no lineal, utilizar la ecuación 2 inferior (representante de una reducción exponencial de primer orden), para estimar la constante de velocidad del zimógeno:
(ecuación 2)d_{t}= d_{0} + d_{min} exp^{(-kt)}
En esta ecuación, d_{t} representa la densidad a tiempo t, d_{0} la densidad a tiempo cero (que está al máximo) y d_{min} la densidad a tiempo infinito (que es cero cuando todo el zimógeno está activado). Si la condición de seudo-primer orden se respeta, el valor de k es igual a la concentración del activador (trombina) multiplicada por el k_{cat}/K_{m} para la reacción de activación de zimógeno. Este procedimiento es aplicable independientemente del factor X considerado, pero es menos exacta que el procedimiento cromogénico.
Se dan los resultados en la Tabla V.
Se da el valor de k_{cat}/K_{m} para la activación de cada derivado de factor X por trombina, así como el error estándar (expresado como porcentaje del valor obtenido).
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TABLA V
Derivado k_{cat}/K_{m} (M^{-1}s^{-1})
GD-FX ND
GDX-IVG <1
GDX-IFG <1
GDX-AVG 1 x 10^{2} (\pm9%)
GDX-IFR ND
GDX-SVG <1
GDX-SFR 4 x 10^{3} (\pm27%)
Como su homólogo en plasma normal, el FX recombinante no es escindible detectablemente por trombina (ND), como con el derivado GD-FX. Por otro lado, el derivado GDX-SFR se escinde muy rápidamente por trombina: el valor de k_{cat}/K_{m} es 4 x 10^{3} M^{-1}s^{-1}; sin embargo, el derivado escindido carece de actividad amidolítica. El derivado GDX-SVG es también escindido por trombina, pero no genera actividad amidolítica detectable tampoco. El valor de k_{cat}/K_{m} para la escisión del derivado GDX-AVG por trombina es 10^{2} M^{-1}s^{-1}, y el derivado activado tiene actividad amidolítica fácilmente detectable. Los otros derivados de factor X (GDX-IVG, GDX-IFG y GDX-IFR) parecen ser escindibles por trombina, pero la reacción es demasiado lenta para que sea posible estimar fiablemente el valor de k_{cat}/K_{m}.
Ejemplo 5 Preparación y caracterización de la forma activada de los derivados de factor X
Para caracterizar más concienzudamente la actividad catalítica (después de escisión) de cada uno de los derivados de factor X, se activaron y purificaron varios miligramos de cada derivado.
Los derivados de factor X que portan en posición P_{3}, P_{2} y P_{1} de su sitio de activación la secuencia LTR (FX recombinante y derivado GD-FX) no son escindibles por trombina. Se activaron pasándolos por una columna HITRAP activada con NHS (5 ml) (Amersham Pharmacia Biotech) injertada, a 5 mg/ml de gel, con activador veneno de víbora de Russell aislado (RVV-X) (Kordia, Leiden, Holanda). Se introducen 4 mg de derivado de factor X en tampón Tris 50 mM, pH 7,5, que contiene NaCl 150 mM, CaCl_{2} 5 mM y 0,2% (p/v) de PEG 8000 en la columna injertada con RW-X. Se cierra la columna por ambos extremos y se mantiene la incubación durante 16 horas a temperatura ambiente. Se eluye el derivado activado con Tris 50 mM, pH 7,5, que contiene NaCl 0,5 M y CaCl_{2} 5 mM. El eluato contiene principalmente la forma activada, pero la activación no es siempre completa. Para enriquecer el eluato en forma activada, se diluye a 1/3 en Tris 50 mM, pH 7,5, que contiene CaCl_{2} 5 mM (para reducir la fuerza iónica), se carga en 1 ml de columna HITRAP heparina-Sepharose (Amersham Pharmacia Biotech) y se eluye con tampón Tris 50 mM, pH 7,5, que contiene NaCl 0,5 M y CaCl_{2} 5 mM.
Los otros derivados de factor X, que pueden activarse (incluso lentamente) por trombina, se activaron todos pasándolos por una columna HITRAP activada con NHS (1 ml) (Amersham Pharmacia Biotech) injertada, a 1 mg/ml de gel, con trombina. Las condiciones de incubación (concentración, tampón, temperatura y duración) son las mismas que para la activación mediante pasada a través de la columna injertada con RVV-X, así como la elución de la columna y la purificación de la forma activada del derivado en heparina-Sepharose.
La secuencia N-terminal de la cadena pesada producida mediante la activación de los diversos derivados de factor X se determinó mediante microsecuenciación. Cada secuencia obtenida corresponde inequívocamente al extremo N-terminal esperado para la cadena pesada de la forma activada del derivado considerado (IVG, IFG, IFR, AVG, SVG o SFR) después de escisión entre los restos P_{1} y P_{1}' del sitio de activación.
Interacción con clorometilcetonapéptidos
Los clorometilcetonapéptidos son inhibidores irreversibles de serinproteasa que forman un complejo equimolecular y covalente con su diana. La velocidad de interacción de un clorometilcetonapéptido con una proteasa depende de la secuencia que precede al grupo clorometilcetona. Estos inhibidores posibilitan de hecho evaluar la integridad del sitio activo de la diana: la constante de velocidad para la reacción (la k_{on}) es de hecho una firma que es específica de cada par inhibidor/proteasa. Uno de los clorometilcetonapéptidos más reactivos con la forma activada del factor X es D-Phe-Phe-Arg-CH_{3}Cl (D-FFR-CK, comercializado por Calbiochem, Meudon, Francia). Cuando la reacción se lleva a cabo en condiciones de seudo-primer orden, la k_{on} puede estimarse incluso si la concentración precisa de la diana no es conocida. Una vez es conocida la k_{on}, es posible predecir las condiciones experimentales que posibilitarán titular exactamente la concentración de sitio activo para la proteasa (véase a continuación). Esta titulación es un requisito previo para una verdadera caracterización funcional.
Se incuba una cantidad de la forma activada del derivado de factor X suficiente para obtener una actividad amidolítica fácilmente detectable en un volumen de reacción de 10 \mul, durante un periodo de tiempo dado, en presencia de una concentración fija de D-FFR-CK en tampón cinético a 25ºC. La concentración de los reactivos es de hecho muy variable: de 30 nM a 1,8 \muM de forma activada (según la absorbancia a 280 nm), dependiendo del derivado de factor X, para tener una actividad amidolítica fácilmente detectable (10% de hidrólisis del sustrato cromogénico en 30 minutos). La concentración de D-FFR-CK añadida debería ser mucho mayor que la de su diana, de tal modo que la reacción ocurra en condiciones de seudo-primer orden. Sin embargo, la concentración de D-FFR-CK no debería ser demasiado alta, de otro modo la reacción es demasiado rápida. Típicamente, se utilizan tres concentraciones de D-FFR-CK, que corresponden a 10, 20 y 40 veces la de la diana (estimada por su absorbancia a 280 nm). Se repite el mismo experimento doce veces, variando el tiempo de incubación de un experimento a otro (de 10 segundos para el primero a 5 horas para el último, de tal modo que el tiempo de incubación para un experimento dado sea igual al doble del experimento precedente). Al final de cada incubación, se añaden 190 \mul de S2765 100 \muM en tampón cinético, y se mide la actividad amidolítica residual registrando la variación de absorbancia a 405 nm en función del tiempo (concretamente, la velocidad inicial de hidrólisis de S2765) utilizando un lector de microplacas MR5000. Al representar la velocidad de hidrólisis de S2765 en función del tiempo de incubación del inhibidor con su diana, se obtiene una curva que posibilita, mediante regresión no lineal, utilizar la ecuación 2 para estimar la constante de velocidad para la inactivación de la forma activada del derivado de factor X. Los parámetros d_{t}, d_{0} y d_{min} de la ecuación 2 representan, en este caso, la actividad residual a tiempo t, la actividad inicial (que está al máximo) y la actividad a tiempo infinito (que es normalmente cero). Si la condición de seudo-primer orden se respeta, el valor obtenido para k es igual a la concentración de inhibidor multiplicada por su k_{on} para la enzima.
Los valores de k_{on} de D-FFR-CK para las formas activadas de los derivados de factor X obtenidos se resumen en la Tabla VI, así como el error estándar (expresado como el porcentaje del valor obtenido). La k_{on} para los derivados que carecen de actividad catalítica no puede determinarse mediante el procedimiento utilizado (ND).
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TABLA VI
Derivado k_{on} (M^{-1}s^{-1})
FX plasmático 2304 (\pm1%)
GD-FX 2233 (\pm3%)
GDX-IVG 2250 (\pm4%)
GDX-IFG 104 (\pm4%)
GDX-AVG 2 (\pm10%)
GDX-IFR ND
GDX-SVG ND
GDX-SFR ND
Los valores de k_{on} de la forma activada del derivado de FX recombinante, de la forma activada del derivado GF-FX y de la forma activada del derivado GDX-IVG son todos similares a los obtenidos con la forma activada del factor X plasmático. Este resultado se esperaba: los zimógenos de estos derivados de factor X difieren por la presencia o ausencia de un dominio Gla y también por los restos P_{3} y P_{2} cadena arriba del sitio de activación, pero el dominio catalítico del producto de su activación es idéntico.
El valor de k_{on} para la forma activada del derivado GDX-IFG es 20 veces menor; esto sugiere que el surco catalítico de este derivado de factor X no está conservado estrictamente por la mutación. El valor de la k_{on} para la forma activada del derivado GDX-AVG es 1.000 veces menor. Los derivados de factor X que, después de la escisión, carecen de actividad amidolítica detectable (GDX-IFR, GDX-SVG y GDX-SFR) no pueden analizarse mediante este procedimiento.
Titulación de la forma activada de derivados de factor X
La concentración de sitio activo para la forma activada de derivados del factor X es un valor que es esencial determinar para poder evaluar la actividad catalítica eficaz de cada mutante. La absorbancia a 280 nm misma posibilita calcular la concentración de proteasa purificada, pero no proporciona la proporción de muestra que está en forma activa. Por otro lado, la titulación posibilita estimar la concentración de forma activa, independientemente del porcentaje de forma zimogénica residual o de la actividad intrínseca del mutante comparada con la proteasa normal.
Un procedimiento muy exacto para titular serinproteasas está basado en el uso de un clorometilcetonapéptido, a condición de que la enzima tenga una actividad catalítica mensurable y que pueda predecirse la semivida de la reacción de la sustancia de titulación con su diana. Tres de las formas activadas de derivados de factor X satisfacen estos criterios, y se titularon mediante este procedimiento: midiendo la actividad amidolítica residual después de incubación con concentraciones crecientes de inhibidor. El clorometilcetonapéptido utilizado es D-FFR-CK, cuya k_{on} para cada diana se determinó anteriormente.
Se incuban concentraciones crecientes de D-FFR-CK, de entre 20 nM y 12 \muM, con una cantidad fija (0,5 a 1 \muM) de la forma activa del derivado de factor X para titular en tampón cinético a 25ºC. Se mantiene la incubación hasta que se completa la reacción: concretamente, se cubre un mínimo de 10 semividas (la semivida de la reacción es igual al logaritmo natural de 2 dividido entre el producto de la k_{on} y la concentración del inhibidor). Al final de esta incubación, se añaden 190 \mul de S2765 100 \muM en tampón cinético y se mide la actividad amidolítica residual registrando la variación de absorbancia a 405 nm en función del tiempo (concretamente, la velocidad inicial de hidrólisis de S2765) utilizando un lector de microplacas MR5000. Al representar la velocidad de hidrólisis de S2765 en función de la concentración de D-FFR-CK, se obtiene una línea recta para la que la abscisa en el origen corresponde a la concentración inicial de enzima activa (Le Bonniec et al., Biochemistry, 33, 3959-3966, 1994).
La forma activada del derivado GDX-AVG no podía titularse mediante este procedimiento debido a que el valor de la k_{on} de D-FFR-CK (2 M^{-1}s^{-1}) es demasiado bajo para poder acabar la reacción en una cantidad razonable de tiempo: en presencia de D-FFR-CK 1 \muM, sería necesario mantener la reacción durante 15 días para cubrir aproximadamente 10 semividas, mientras que la estabilidad de D-FFR-CK no supera las 48 horas a pH 7,5. Las formas "activadas" de derivados del factor X que carecen de actividad amidolítica detectable (GDX-IFR, GDX-SVG y GDX-SFR) no podían titularse tampoco utilizando D-FFR-CK. Para estos derivados, se estimó simplemente el porcentaje de forma activa mediante densitometría después de electroforesis en gel de poliacrilamida (12%, reticulación 29/1), después de desnaturalización y reducción de la muestra (como se describe anteriormente para identificar los clones BHK-21 productores de un derivado de factor X). Después de teñir con azul de Coomasie, se examina el gel y se compara la intensidad de las bandas correspondientes a las cadenas pesadas \alpha y \beta activadas con la de las formas no escindidas residuales utilizando el software de análisis Scion-Image. Este procedimiento posibilita evaluar el porcentaje de forma activada de cada alícuota de derivado de factor X. Al comparar este porcentaje de formas activadas con la concentración total estimada mediante la absorbancia a 280 nm, se deduce a partir de ella la concentración eficaz de formas \alpha y \beta activadas.
Este procedimiento es más laborioso que el precedente, pero suficientemente fiable para poder realizar una caracterización funcional de los mutantes referidos.
Actividad amidolítica
La actividad amidolítica de las serinproteasas implica sólo a su surco catalítico y a su sistema de relé de carga. Se mide utilizando sustratos sintéticos constituidos por un pequeño péptido que porta, en C-terminal, un grupo para-nitroanilida; durante la hidrólisis de estos sustratos, se libera para-nitroanilina (pNA), que es fácilmente detectable a 405 nm. Estos péptidos permiten una caracterización muy fina de la maquinaria catalítica de una proteasa: la k_{cat} y la K_{m} para la hidrólisis de uno de estos sustratos constituye aquí de nuevo una firma que es única para cada par enzima/sustrato. Por lo tanto, medir la actividad amidolítica de las formas activadas de los derivados de factor X posibilita detectar si su maquinaria catalítica se alteró o no. Se utilizaron dos sustratos cromogénicos para este análisis: S2765 y bencil-CO-Ile-Glu-(\gamma-OR)-Gly-Arg-pNA (S2222) comercializados por Biogenic.
Los valores de k_{cat} y K_{m} de las formas activadas de los derivados de factor X se determinan en tampón cinético a 25ºC. Se incuban concentraciones variables (de entre 6 y 800 \muM) con una cantidad fija de la forma activada del derivado de factor Xa (10 nM a 0,5 \muM, dependiendo de la forma activada del derivado de factor X, de tal modo que al menos un 10% del sustrato cromogénico se hidroliza en 30 minutos). La variación de absorbancia a 405 nm en función del tiempo se registra utilizando un lector de microplacas MR5000, y la velocidad inicial de hidrólisis se estima mediante regresión lineal (sólo las absorbancias correspondientes como máximo a un 15% de hidrólisis del sustrato se tienen en cuenta para el análisis). Los valores de k_{cat} y K_{m} se estiman mediante regresión no lineal de la variación en la velocidad inicial de hidrólisis en función de la concentración inicial de sustrato, utilizando la ecuación de Michaelis-Menten.
Se dan en la Tabla VII los valores de k_{cat} y K_{m} y de la relación k_{cat}/K_{m} de S2222 y S2765, y también el error estándar (expresado como un porcentaje del valor obtenido) para las formas activadas de derivados de factor X.
Estas constantes no pueden estimarse para los derivados que carecen de actividad amidolítica detectable (ND).
TABLA VII
Bencil-CO-Ile-Glu-(\gamma-OR)-Gly-Arg-pNA (S2222)
Derivado K_{m} (\muM) k_{cat} (s^{-1}) k_{cat}/K_{m} (M^{-1}s^{-1})
FX plasmático 260 (\pm15%) 79 (\pm6%) 3 x 10^{5}
FX recombinante 210 (\pm5%) 59 (\pm2%) 3 x 10^{5}
GD-FX 480 (\pm5%) 68 (\pm2%) 1 x 10^{5}
GDX-IVG 410 (\pm6%) 107 (\pm3%) 3 x 10^{5}
GDX-IFG 1500 (\pm8%) 8 (\pm5%) 5 x 10^{3}
GDX-AVG 1300 (\pm28%) 1 (\pm17%) 5 x 10^{2}
GDX-IFR ND ND ND
GDX-SVG ND ND ND
GDX-SFR ND ND ND
N-\alpha-Z-Arg-Glu-Arg-pNA (S2765)
Derivado K_{m} (\muM) k_{cat} (s^{-1}) k_{cat}/K_{m} (M^{-1}s^{-1})
FX plasmático 90 (\pm24%) 182 (\pm7%) 2 x 10^{6}
FX recombinante 65 (\pm6%) 126 (\pm2%) 2 x 10^{6}
GD-FX 80 (\pm14%) 89 (\pm4%) 1 x 10^{6}
GDX-IVG 75 (\pm14%) 153 (\pm4%) 2 x 10^{6}
GDX-IFG 820 (\pm6%) 61 (\pm3%) 7 x 10^{4}
GDX-AVG 3750 (\pm21%) 19 (\pm18%) 5 x 10^{3}
GDX-IFR ND ND ND
GDX-SVG ND ND ND
GDX-SFR ND ND ND
Los valores de k_{cat} y K_{m} para la forma activada del derivado FX recombinante, aquellos de la forma activada de FX recombinante que carece de dominio Gla y aquellos del derivado GDX-IVG, son similares a los obtenidos para la forma activada de factor X plasmático (difieren como máximo por un factor de dos). Además del epítope C-terminal, el dominio catalítico que se forma durante la activación de estos derivados de factor X es idéntico; por tanto, como para la k_{on} de D-FFR-CK, se esperaba que sus actividades amidolíticas fueran al menos comparables. Es interesante observar que la ausencia del dominio Gla no tiene influencias notables sobre la actividad amidolítica de la forma activada del derivado; esto sugiere que no influye en la estructura del surco catalítico de la forma activada de factor X. En comparación, el valor de k_{cat} de la forma activada del derivado GDX-IFG se reduce (10 veces para S2222 y 3 veces para S2765); el valor de K_{m} se reduce similarmente (5 a 10 veces). Globalmente, la k_{cat}/K_{m} para estos sustratos cromogénicos es de 30 a 50 veces menor que para la forma activada de factor X normal, una reducción que es por lo tanto del mismo orden de magnitud que la observada para la k_{on} de D-FRR-CK (2 veces). La reducción del valor de k_{cat} de la forma activada del derivado GDX-AVG es en mucha mayor proporción (aproximadamente 100 veces para S2222, aproximadamente 10 veces para S2765) que el aumento en la K_{m} (5 veces mayor para S2222, 40 veces mayor para S2765). Globalmente, la k_{cat}/K_{m} para estos sustratos cromogénicos es 400 a 600 veces menor que para la forma activada de factor X normal; estos valores están de acuerdo con la reducción observada para la k_{on} de D-FFR-CK (1000 veces).Estos resultados confirman que las mutaciones portadas por los derivados GDX-IFG y GDX-AVG inducen claramente modificaciones estructurales en el surco catalítico y/o alteran la actividad del sistema de relé de carga.
Actividad en el complejo de protrombinasa
El factor Xa nativo no es una enzima muy activa comparada con tripsina o trombina. Fisiológicamente, es sólo cuando la enzima se une a su cofactor (factor de coagulación Va), en presencia de fosfolípidos y calcio, cuando la reacción de activación de protrombina se vuelve muy rápida (la reacción es miles de veces más rápida en presencia de los cofactores que en su ausencia). Sin embargo, la actividad en el complejo de protrombinasa depende en gran medida de la presencia de un dominio Gla; sin él, la velocidad aumenta como máximo sólo 50 veces. Sin embargo, esta diferencia es más que suficiente para posibilitar detectar si la forma activada de los derivados de factor X interacciona o no con el factor Va, y especialmente si el cofactor posibilita o no que se active eficazmente la protrombina. Por lo tanto, los inventores han comparado la velocidad de activación de la protrombina por cada una de las formas activadas de los derivados de factor X, en presencia así como en ausencia de factor Va, de fosfolípidos y de calcio.
El efecto cofactor del factor Va (Kordia) se estudia en un sistema purificado estrictamente controlado: la protrombina en particular se immunopurifica (Le Bonniec et al., J. Biol. Chem., 266, 13796-13803, 1991; Le Bonniec et al., 1992, citado anteriormente) para liberar de cualquier traza de forma activada (de factor X o de trombina). La activación de esta protrombina se detecta mediante la formación de la trombina que resulta a partir de la misma. La reacción se sigue continuamente en virtud de la presencia en el medio de reacción de un sustrato cromogénico, H-D-Phe-Pip-Arg-PNA (S2238, Biogenic), que es mucho más sensible a la trombina que la forma activada de factor X. A tiempo cero, no hay trombina y hay sólo una hidrólisis insignificante de S2238 por la forma activada del derivado de factor X. Durante la reacción, la concentración de trombina aumenta de manera lineal con el tiempo (cuando la reacción para activación de protrombina por la forma activada del derivado de factor X está en estado estacionario). La velocidad de hidrólisis de S2238 es directamente proporcional a la concentración de trombina, pero ésta aumenta con el tiempo. Por lo tanto, la velocidad de escisión no es constante; va cada vez más rápida: la reacción acelera. Es posible mostrar (Kosow, Thromb. Res. Suppl. 4, 219-227, 1974) que la cantidad de pNA liberada por el S2238 hidrolizado (por lo tanto la absorbancia a 405 nm de la mezcla) es proporcional al coeficiente de aceleración de la reacción multiplicado por el tiempo al cuadrado; siendo el coeficiente de aceleración mismo directamente proporcional a la velocidad inicial de formación de trombina. En la práctica, se preincuban 195 \mul de tampón cinético que contiene S2238 100 \muM, protrombina 0,5 \muM y vesículas fosfolipídicas 35 \muM (mezcla de fosfatidilserina y fosfatidilcolina en una proporción de 20%-80% p/p), en presencia o ausencia de factor Va 20 nM a 37ºC en una placa de microtitulación. Se desencadena la reacción añadiendo la forma activada del derivado de factor X 2,5 nM (5 \mul a 50 nM), y se registra la variación de la absorbancia a 405 nm en función del tiempo utilizando un lector de microplacas MR5000. Al representar la absorbancia a 405 nm en función del tiempo de incubación, se obtiene una curva que posibilita, mediante regresión no lineal, estimar c, el coeficiente de aceleración de la reacción, utilizando la ecuación 3:
(ecuación 3)A_{405}: A_{0} + bt + ct^{2}
en la que A_{0} representa la absorbancia inicial de la mezcla a 405 nm (antes de la adición de la enzima) y b la velocidad de hidrólisis de S2238 por la forma activada del derivado de factor X (que es insignificante en la práctica). Si la reacción para activación de protrombina por la forma activada del derivado de factor X está en estado estacionario, y si la concentración residual de S2238 no hidrolizado sigue siendo mucho mayor que su K_{m} por trombina (3,6 \muM), el parámetro c es eficazmente proporcional a la velocidad inicial de activación de la protrombina por la forma activada del derivado de factor X. Para satisfacer estas condiciones, sólo se tienen en cuenta los puntos experimentales correspondientes a menos de 15% de hidrólisis de cada sustrato (protrombina y S2238) para análisis mediante regresión no lineal. Este enfoque no posibilita estimar las constantes catalíticas para la activación de protrombina por la forma activada de los derivados de factor X; sólo posibilita, cuando la reacción se lleva a cabo en condiciones idénticas, comparar la actividad de las dos enzimas (aquí la actividad de cada forma activada de los derivados de factor X se compara con la de la forma activada que carece de dominio Gla que sirve como referencia).
Los resultados obtenidos se resumen en la Tabla VIII.
Se indican los coeficientes de aceleración de la liberación de pNA por la trombina generada por el complejo de protrombinasa (+ factor Va) o por el derivado de factor X activado solo (- factor Va), junto con el error estándar (expresado como un porcentaje del valor obtenido).
TABLA VIII
Derivado + factor Va - factor Va
GD-FX 4,2 x 10^{-4} (\pm2%) 8,8 x 10^{-6} (\pm2%)
GDX-IVG 1,1 x 10^{-4} (\pm1%) 2,8 x 10^{-5} (\pm2%)
GDX-IFG 4,9 x 10^{-6} (\pm1%) 1,0 x 10^{-7} (\pm2%)
GDX-AVG 3,1 x 10^{-5} (\pm1%) 9,6 x 10^{-7} (\pm2%)
GDX-IFR 3,3 x 10^{-6} (\pm1%) ND
GDX-SVG ND ND
GDX-SFR ND ND
En presencia de fosfolípidos y calcio (pero en ausencia de factor Va), la activación de la protrombina es muy lenta y difícil de detectar, incluyendo por la forma activada de factor X que carece del dominio Gla o la de su derivado GDX-IVG; la adición de factor Va aumenta la velocidad de activación de la protrombina 50 veces y 10 veces, respectivamente. En ausencia de factor Va, la activación de la protrombina no es detectable por ninguna de las otras formas activadas de derivados del factor X (GDX-AVG, GDX-IFG, GDX-IFR, GDX-SVG y GDX-SFR). La adición de factor Va posibilita aumentar considerablemente la velocidad de activación de la protrombina por la forma activada del derivado GDX-IVG; ésta es entonces sólo 13 veces menor que la obtenida por la forma activada de su homólogo no mutado (GDX-IVG). Por lo tanto, parece que el factor Va restaura en gran medida la actividad catalítica de la forma activada del derivado GDX-AVG ya que, comparado con su homólogo no mutado, las muestras de surco catalítico (D-FFR-CK, S2765 y S2222) reflejan una eficacia de catálisis que se reduce en al menos 400 veces. Con las otras formas activadas de los derivados de factor X (GDX-IFG, GDX-IFR, GDX-SVG y GDX-SFR), la adición de factor Va está lejos de tener dicho efecto: sigue sin hacer posible detectar ninguna activación de la protrombina (ND).
Inhibición por antitrombina
El inhibidor plasmático más potente de la forma activada de factor X es el inhibidor de la ruta de factor tisular (TFPI); el valor de su k_{on} para la interacción con la forma activada de factor X es mayor de 10^{5} M^{-1}s^{-1}. Sin embargo, la concentración plasmática de TFPI (2,5 nM) significa que este inhibidor desempeña un papel relativamente minoritario en la inhibición de la forma activada de factor X (su diana fisiológica es más bien el factor de coagulación VIIa).
La antitrombina (sola) es un inhibidor relativamente menos potente, ya que el valor de su k_{on} para la interacción con la forma activada de factor X es sólo del orden de 10^{4} M^{-1}s^{-1}. Sin embargo, la concentración plasmática de antitrombina (2,3 \muM) la hace el inhibidor fisiológico principal del factor Xa; a esta concentración, la semivida plasmática de la forma activada de factor X sería sólo de 30 segundos (se ha medido experimentalmente un minuto, véase a continuación). En particular, en presencia de heparina, el valor de la k_{on} de antitrombina para la interacción con la forma activada del factor X supera 10^{6} M^{-1}s^{-1}, concretamente, para una concentración plasmática de antitrombina de 2,3 \muM, la neutralización de la proteasa aparece en unos pocos segundos (la semivida sería entonces de sólo 0,3 segundos). Por lo tanto, era esencial determinar la k_{on} de la interacción de antitrombina con las formas activadas de los derivados de factor X, ya que cualquier aumento de la semivida plasmática prolongaría la acción procoagulante del derivado de factor X, y por lo tanto potenciaría su efecto antihemofílico.
Los inventores determinaron la capacidad de cada forma activada de los derivados de factor X de formar un complejo covalente estable con antitrombina. Estimaron también el valor de la k_{on} de antitrombina (en presencia y ausencia de heparina) para las formas activadas de derivados de factor X que tienen actividad amidolítica detectable (derivado que carece del dominio Gla, y derivados GDX-IVG, GDX-IFG y GDX-AVG).
La demostración de complejos covalentes entre la forma activada de los derivados de factor X (1 \muM) y la antitrombina (2 \muM, purificada a partir de plasma humano según la técnica descrita por McKay (Thromb. Res. 21, 375-382, 1981)) se lleva a cabo en presencia de 2 unidades/ml de heparina (Kordia). La incubación se mantiene durante 1 hora a 25ºC y la mezcla de reacción se analiza mediante electroforesis en gel de poliacrilamida (10%, reticulación 29/1), después de desnaturalización y reducción de la muestra. Después de teñir con azul de Coomasie, la presencia de complejos covalentes entre la forma (inactivada) del derivado de factor X y la antitrombina da como resultado una reducción de la intensidad de la banda correspondiente a la antitrombina (60 kDa), una reducción de la intensidad de la banda correspondiente a la forma activada del derivado de factor X (31 kDa), y la aparición de una nueva banda de mayor peso molecular (aproximadamente 100 kDa) correspondiente al complejo covalente.
Los resultados se dan en la Figura 3.
Carriles 1 y 8: antitrombina sola; carriles 2 y 3: derivado GDX-IVG sin y con antitrombina; carriles 4 y 5: derivado GDX-IFG sin y con antitrombina; carriles 6 y 7: derivado GDX-IFR sin y con antitrombina; carriles 9 y 10: derivado GDX-SVG sin y con antitrombina; carriles 11 y 12: derivado GDX-SFR sin y con antitrombina; carriles 13 y 15: derivado GDX-AVG sin y con antitrombina.
La formación de un complejo da como resultado la aparición de una banda de alto peso molecular (carriles 3, 5, 7, 10 y 14) que está ausente cuando la antitrombina (carriles 1 y 8) o una de las formas activadas de los análogos de factor X (carriles 2, 4, 6, 9, 11, 13) se utilizan solos. Un solo análogo de factor X (GDX-SFR, carril 12) no permite la formación de un complejo covalente detectable.
Todas las formas activadas de los derivados de factor X (excepto el derivado GDX-SFR) son por lo tanto capaces, en presencia de heparina, de formar un complejo covalente estable con antitrombina, incluyendo el derivado GDX-SVG, que sin embargo está desprovisto de actividad catalítica detectable.
El procedimiento seleccionado para estimar la k_{on} de la antitrombina para la forma activada del derivado de factor X depende de la semivida de los reactivos. El procedimiento no es igual dependiendo de si la semivida es mayor de 3 minutos, entre 15 segundos y 3 minutos o menor de 15 segundos. La reacción debe llevarse a cabo (a menos que sea imposible, véase a continuación) en condiciones de seudo-primer orden: concretamente la concentración del inhibidor (antitrombina) debe ser como mínimo 10 veces la de su diana (la forma activada del derivado de factor X). Además, la concentración de la diana debe ser suficiente para poder detectar fácilmente su actividad amidolítica residual (10 nM a 1 \muM, dependiendo de la forma activada del derivado de factor X de tal modo que, idealmente, se hidrolice un 10% del sustrato cromogénico en 30 minutos). Estas dos limitaciones limitan considerablemente la elección de la concentración de los reactivos: la concentración de antitrombina debe ser al menos de 0,1 a 10 \muM (dependiendo de la diana). La semivida de la diana (igual al logaritmo natural de 2 dividido entre el producto de la concentración del inhibidor y su k_{on} para la diana) determina el procedimiento a utilizar. Para semividas mayores de tres minutos, el procedimiento utilizado es el mismo que el descrito para estimar la k_{on} de D-FFR-CK: consiste en determinar la actividad residual contenida en alícuotas tomadas a tiempos variados, de modo que se cubran aproximadamente diez semividas. Para concentraciones de antitrombina entre 0,1 y 10 \muM, este enfoque posibilita estimar sólo valores de k_{on} que son como máximo iguales a 2 x 10^{4} M^{-1}s^{-1}. Cuando la semivida de la reacción es menor de tres minutos, la medida por lotes de la actividad residual (mediante muestreo de alícuotas) se vuelve difícil de poner en práctica. En este caso, aún con concentraciones de antitrombina entre 0,1 y 10 \muM (por lo tanto, valores de k_{on} mayores de 2 x 10^{4} M^{-1}s^{-1}), la reacción es seguida continuamente en virtud de la presencia en el medio de reacción de S2765. La velocidad de hidrólisis de S2765 es directamente proporcional a la concentración residual de la forma activada de factor X. A tiempo cero, la actividad amidolítica está al máximo, ya que no ha aparecido todavía inhibición. Si las condiciones de seudo-primer orden se respetan, la concentración de la forma activada del derivado de factor X se reduce con el tiempo, según un exponencial decreciente de primer orden. La velocidad de escisión no es constante: se retarda hasta convertirse en cero (cuando se ha neutralizado toda la diana). Es posible mostrar (Cha, Biochem. Pharmacol., 24, 2177-2185, 1975; Stone y Hofsteenge, Biochemistry, 25, 4622-4628, 1986) que la cantidad de pNA liberada por la hidrólisis de S2765 (por lo tanto la absorbancia a 405 nm de la mezcla de reacción) aumenta según un aumento exponencial de primer orden que puede analizarse mediante regresión no lineal utilizando la ecuación 4:
(ecuación 4)A_{405} \approx A_{0} + V_{i} (1-exp^{(-Ikt)})/k
en la que A_{0} representa la absorbancia inicial a 405 nm, V_{i} la velocidad de hidrólisis de S2765 en ausencia de antitrombina, I la concentración de antitrombina y k la constante de velocidad de seudo-primer orden para la reacción de inhibición. Durante la reacción, el inhibidor está en competición con el sustrato por la interacción con la enzima; por tanto, el valor de la k_{on} de antitrombina para la forma activada del derivado de factor X está relacionada con k por la ecuación:
(ecuación 5)k_{on}= k (1+s/k_{m})
en la que S representa la concentración inicial de sustrato cromogénico (S2765) y K_{m} su constante de Michaelis por la forma activada del derivado de factor X (determinada durante la caracterización de la actividad amidolítica). Este procedimiento posibilita medir semividas del orden de 15 segundos, concretamente, estimar valores de k_{on} como máximo iguales a 2 x 10^{5} M^{-1}s^{-1} (para concentraciones de antitrombina entre 0,1 y 10 \muM). Para concentraciones de formas activadas de derivados de factor X entre 10 nM y 1 \muM, cuando la semivida de la reacción es menor de 15 segundos, la amplitud de la señal (la absorbancia a 405 nm) es demasiado pequeña para permitir una medida continua fiable de la actividad residual (aumentar la concentración de la enzima requeriría que la antitrombina aumentara para respetar la condición de seudo-primer orden y, por lo tanto, la semivida se reduciría adicionalmente). Por tanto, cuando la k_{on} es mayor de 2 x 10^{5} M^{-1}s^{-1}, la reacción no se lleva a cabo ya en condiciones de seudo-primer orden, sino en condiciones de segundo orden. La condición de seudo-primer orden significa que la concentración de antitrombina permanece (aparentemente) constante a lo largo de la reacción; este es el caso cuando está en gran exceso comparada con la diana. Si la concentración del inhibidor es menos de 10 veces mayor que la de su diana, la reducción de la concentración del inhibidor (mediante la formación de un complejo con su diana) no puede ya ignorarse. Durante la reacción, las concentraciones del inhibidor y de su diana varían ambas con el tiempo, lo que complica en gran medida el análisis. Sin embargo, sigue siendo posible obtener una amplitud de señal suficiente y seguir la cinética de la inhibición en presencia de un sustrato cromogénico en condiciones de segundo orden. Es posible mostrar que, en este caso, la absorbancia a 405 nm de la mezcla de reacción aumenta según una curva que puede analizarse mediante regresión no lineal utilizando la ecuación 6, denominada "inhibición de unión estrecha lenta" (Cha, 1975, citado anteriormente; Biochem. Pharmacol., 25, 2695-2702, 1976; Williams y Morrison, Methods Enzymol. 63, 437-467, 1979):
(ecuación 6)P = V_{s}t + (V_{0}-V_{s}) (1-d)/(dk')ln\{(1-d exp^{(-k't)})/(1/d)
en la que P representa la concentración de pNA liberada en el tiempo t (directamente proporcional a la absorbancia a 405 nm), V_{0} la velocidad de hidrólisis de S2765 en ausencia de inhibidor y V_{s} la velocidad final de hidrólisis de S2765 (cuando la reacción ha terminado). Los parámetros d y k' mismos dependen de dos parámetros (F_{1} y F_{2}) de tal modo que:
d = (F_{1} - F_{2})/(F_{1} + F_{2})
k' = kF_{2};
F_{1} = K_{I}' + I + E;
F_{2} = (F_{1}^{2} - 4EI)^{1/2}.
En estas ecuaciones, I representa la concentración inicial de antitrombina, E la de diana y K_{1}' la constante de inhibición aparente para la interacción. La k_{on} de la antitrombina para la forma activada del derivado de factor X está relacionada con k (que tiene el mismo significado que en la ecuación 4) mediante la relación dada en la ecuación 5.
El procedimiento de muestreo por lotes de alícuotas se utiliza para estimar la k_{on} de la antitrombina para la forma activada del derivado GDX-AVG (en presencia y en ausencia de heparina).
La reacción se lleva a cabo en tampón cinético que contiene albúmina bovina exenta de proteasa 1 mg/ml (Sigma, St. Quentin-Fallavier, Francia) y, cuando sea apropiado, 2 unidades por ml de heparina (Kordia). En un volumen de reacción de 10 \mul, se incuba una cantidad suficiente de la forma activada del derivado GDX-AVG (0,5 \muM en presencia de heparina, 1 \muM en su ausencia) en presencia de un gran exceso de antitrombina (5 \muM en presencia de heparina, 10 \muM en su ausencia) durante una cantidad de tiempo variable a 25ºC. Se repite el mismo experimento doce veces, variando el tiempo de incubación de un experimento a otro (de 10 segundos para el primero a 5 horas para el último, de tal modo que el tiempo de incubación para un experimento dado sea igual al doble del precedente). Al final de cada incubación, se añaden 190 \mul de S2765 (200 \muM en tampón cinético) y se mide la actividad amidolítica residual registrando la variación de absorbancia a 405 nm en función del tiempo (concretamente, la velocidad inicial de hidrólisis de S2765) utilizando un lector de microplacas MR5000. Representando la velocidad de hidrólisis de S2765 en función del tiempo de incubación del inhibidor con su diana, se obtiene una curva que posibilita, mediante regresión no lineal utilizando la ecuación 2, estimar la constante de velocidad para inactivación de la forma activada del derivado de factor X. Los parámetros d_{t}, d_{0} y d_{min} de la ecuación 2 representan respectivamente: la actividad residual a tiempo t, la actividad inicial (que está al máximo) y la actividad a tiempo infinito (que es habitualmente cero). Si la condición de seudo-primer orden se respeta, el valor obtenido para k es igual a la concentración del inhibidor multiplicada por la k_{on} de la reacción para inactivación de la forma activada del derivado de factor X.
El procedimiento mediante registro continuo de la absorbancia a 405 nm en condiciones de seudo-primer orden se utiliza para estimar (en ausencia de heparina) la k_{on} de la antitrombina para la forma activada del derivado de factor X que carece de dominio Gla, y las de las formas activadas de los derivados GDX-IVG y GDX-IFG.
Las cinéticas se estudian a 25ºC, en tampón cinético que contiene albúmina bovina exenta de proteasa 1 mg/ml, y se siguen continuamente en virtud de la presencia en el medio de reacción de S2765 100 \muM. La reacción se lleva a cabo en una microplaca, en un volumen de 200 \mul, si la amplitud de la señal posibilita seguir la cinética con un lector de placa. Si no es éste el caso, la reacción se lleva a cabo en una microcubeta de 600 \mul y la cinética se sigue utilizando un espectrofotómetro (Lambda 14, Perkin-Elmer (Courtaboeuf, Francia)). La reacción se desencadena añadiendo la forma activada del derivado de factor X 10 a 25 nM (idealmente de tal modo que, en ausencia de inhibidor, se hidrolice un 10% del sustrato cromogénico en 60 minutos). Para cada forma activada de derivado de factor X, la reacción se lleva a cabo en presencia de tres concentraciones de antitrombina, iguales a 10, 20 y 40 veces la concentración de la diana. Al representar la absorbancia a 405 nm en función del tiempo, se obtiene una curva que posibilita, mediante regresión no lineal utilizando la ecuación 4 (que representa un crecimiento exponencial de primer orden), estimar la constante de velocidad para la inactivación de la forma activada del derivado de factor X. Si la condición de seudo-primer orden se respeta, la k_{on} de la antitrombina para la forma activada del derivado de factor X está dada por la ecuación 5, que tiene en consideración la competición introducida por el sustrato durante la
cinética.
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En presencia de heparina, si las condiciones de seudo-primer orden se respetan, las semividas de la forma activada del derivado de factor X que carece de dominio Gla, y también las de las formas activadas de los derivados GDX-IVG y GDX-IFG son menores de 15 segundos. Reducir las concentraciones de antitrombina y las de su diana podría posibilitar respetar la condición de seudo-primer orden aumentando al mismo tiempo la semivida, pero se reduciría la amplitud de la señal; entonces, la sensibilidad del espectrofotómetro se vuelve insuficiente para seguir la cinética continua cuando la amplitud es sólo de unas pocas miliunidades de absorbancia. En consecuencia, la cinética de la inhibición por antitrombina, en presencia de heparina, de la forma activada del derivado de factor X que carece de dominio Gla, y también de las formas activadas de los derivados GDX-IVG y GDX-IFG, es seguida en condiciones de segundo orden.
Las cinéticas se estudian a 25ºC en tampón cinético que contiene albúmina bovina exenta de proteasa 1 mg/ml y 2 unidades por ml de heparina; son seguidas continuamente en virtud de la presencia en el medio de reacción de S2765 400 \muM. La reacción se lleva a cabo en una microcubeta en un volumen de 600 \mul, siguiendo la cinética utilizando un espectrofotómetro Lambda 14. La reacción se desencadena mediante la adición de la cantidad mínima de forma activada de derivado de factor X que sea compatible con una señal fiable (1 a 2,5 nM dependiendo del derivado de tal modo que, en ausencia de inhibidor, se hidrolice aproximadamente un 10% del sustrato cromogénico en 60 minutos). Para cada forma activada de derivado de factor X, la reacción se lleva a cabo en presencia de dos concentraciones de antitrombina, iguales a 2 y 3 veces la concentración de la diana. Al representar la absorbancia a 405 nm en función del tiempo, se obtiene una curva que posibilita, mediante regresión no lineal utilizando la ecuación 6, estimar la constante de velocidad de segundo orden para la reacción. La k_{on} de la antitrombina para la forma activada del derivado de factor X está dada por la ecuación 5, que tiene en consideración la competición introducida por el sustrato durante la cinética.
Los resultados obtenidos se resumen en la Tabla IX. Se indican los valores de k_{on} (en M^{-1}s^{-1}) de la antitrombina en presencia de heparina (+heparina) o en su ausencia (-heparina), junto con el error estándar (expresado como un porcentaje del valor obtenido).
TABLA IX
Derivado k_{on} (M^{-1}s^{-1})
- heparina + heparina
GD-FX 1,2 x 10^{4} (\pm4%) 1,3 x 10^{7} (\pm1%)
GDX-IVG 5,8 x 10^{3} (\pm3%) 2,0 x 10^{7} (\pm1%)
GDX-IFG 1,8 x 10^{2} (\pm2%) 7,6 x 10^{5} (\pm1%)
GDX-AVG 10,0 (\pm17%) 3,0 x 10^{2} (\pm6%)
GDX-IFR ND ND
GDX-SVG ND ND
GDX-SFR ND ND
En ausencia de heparina, los valores de k_{on} de la antitrombina para la forma activada del derivado de factor X que carece de dominio Gla y la forma activada del derivado GDX-IVG son similares (difieren como máximo por un factor de dos). En comparación, el valor de la k_{on} de la antitrombina para la forma activada del derivado GDX-IFG es 66 veces menor. En particular, el valor de la k_{on} para la forma activada del derivado GDX-AVG es más de 1.000 veces menor que el de su homólogo no mutado (la inhibición es, de hecho, difícil de detectar). En presencia de heparina, el valor de k_{on} de la antitrombina para los derivados activados de factor X aumenta 1.000 a 4.000 veces mientras que, incluso en presencia de heparina, la k_{on} de la antitrombina para la forma activada del derivado GDX-AVG no supera 3 x 10^{2} M^{-1}s^{-1}. Esta importante observación sugiere que, después de la activación, el derivado GDX-AVG podría permanecer activo durante mucho más tiempo que su homólogo no mutado (su semivida plasmática podría ser de varias horas en ausencia de heparina, 17 minutos en su presencia).
Semivida plasmática de la forma activada de derivados de factor X
La k_{on} de la antitrombina para la forma activada de derivados de factor X sugiere que la semivida plasmática de la forma activada del derivado GDX-AVG podría extenderse considerablemente, lo que reforzaría su potencial antihemofílico. Para verificar esta hipótesis, los inventores determinaron la semivida plasmática de la forma activada de cada uno de los derivados de factor X.
Se estima la semivida plasmática de las formas activadas de derivados de factor X midiendo su actividad residual después de incubación durante una cantidad variable de tiempo en un conjunto de plasmas humanos normales. Para evitar la formación de un coágulo, se vuelve no coagulable el conjunto de plasma añadiendo hirudina 0,8 \muM (80 unidades por ml) antes de recalcificar (añadiendo CaCl_{2} 8 mM). La mezcla de reacción está constituida por 80% (v/v) de plasma y 20% (v/v) de tampón cinético que contiene hirudina, calcio y la forma activada de uno de los derivados de factor X a una concentración suficiente para permitir su detección (concentración final 20 a 300 nM). Después de variar los tiempos de incubación, se retira una alícuota (40 \mul) y se mide la actividad amidolítica residual, después de haber añadido 160 \mul de S2765 (1 mM para la forma activada del derivado GDX-AVG, 100 \muM para las demás formas activadas de derivados de factor X), registrando la variación en la absorbancia a 405 nm en función del tiempo (velocidad de hidrólisis inicial de S2765) utilizando un lector de microplacas MR5000. La constante de velocidad por la reducción de actividad se estima mediante regresión no lineal de la variación de la actividad residual en función del tiempo utilizando la ecuación 2, en la que d_{t}, d_{0} y d_{min} representan la actividad residual a tiempo t, la actividad inicial (que está al máximo) y la actividad a tiempo infinito (que está al mínimo), respectivamente. Aunque la hirudina neutraliza cualquier traza de trombina, la actividad mínima no es cero ni siquiera si se neutraliza toda la forma activada de factor X: el ruido de fondo viene de otras proteasas contenidas en el plasma, capaces de hidrolizar lentamente S2765. Si la condición de seudo-primer orden se respeta, la semivida plasmática es igual a la relación del logaritmo natural de 2 entre k (la constante de velocidad para reducción). La semivida plasmática observada no depende de la concentración de la diana ni de la amplitud de la actividad amidolítica medida, depende sólo de la concentración inicial del inhibidor contenido en el plasma (y, por supuesto, de su reactividad con respecto a la diana): si la antitrombina es realmente el inhibidor plasmático principal implicado, la condición de seudo-primer orden se respeta ya que, durante toda la incubación, permanece en gran exceso (1,8 \muM) comparado con su diana.
Los resultados obtenidos se resumen en la Tabla X. Se dan los valores de semivida (en minutos) de la forma activada de derivados de factor X en presencia de heparina (+heparina) o en su ausencia (-heparina), así como el error estándar (expresado como un porcentaje del valor obtenido). La semivida de las formas activadas de derivados que carecen de actividad amidolítica detectable no se determinó (ND).
TABLA X
Derivado Semivida (minutos)
- heparina + heparina
GD-FX 1,1 (\pm2%) < 0,5
GDX-IVG 1,1 (\pm19%) < 0,5
GDX-IFG 12,5 (\pm5%) < 0,5
GDX-AVG > 60 5,5 (\pm19%)
GDX-IFR ND ND
GDX-SVG ND ND
GDX-SFR ND ND
En ausencia de heparina, la semivida plasmática de la forma activada de factor X que carece de dominio Gla y de la forma activada del derivado GDX-IVG son comparables (un minuto); en presencia de heparina, la semivida plasmática de estas formas activadas es demasiado corta para medirse fiablemente. En ausencia de heparina, la semivida de la forma activada del derivado GDX-AVG está notablemente extendida: es 55 veces más larga que la de la forma activada de factor X que carece de dominio Gla. El aumento de la semivida plasmática en presencia de heparina es también notable, ya que puede medirse fácilmente (5 minutos y 30 segundos), al contrario que su homólogo no mutado. La semivida plasmática de la forma activada del derivado GDX-IFG está también extendida (12 veces comparada con la forma activada del factor X que carece de dominio Gla). La semivida plasmática de las demás formas activadas de derivados de factor X (que carecen de actividad amidolítica) no pueden estimarse mediante el procedimiento utilizado.
Ejemplo 6 Actividad antihemofílica de los derivados de factor X
Se ensayó la actividad procoagulante de las formas activadas de los derivados de factor X en plasmas que simulan hemofilia A o B grave. Estos plasmas se obtienen agotando el factor VIII o IX de un plasma normal y se comportan, in vitro, como plasmas auténticos de hemofílicos. Los análogos de factor X ensayados (GDX-IVG, GDX-IFG, GDX-AVG, GDX-IFR, GDX-SFR, GDX-SVG) carecen todos de dominio Gla. En plasma normal, la acción procoagulante del factor X que carece de dominio Gla es mucho menor que la del factor X normal, porque el dominio Gla contribuye a la actividad del complejo de protrombinasa.
La actividad procoagulante de estos derivados de factor X no puede ser comparable con la del factor X normal. De hecho, cualquier derivado de factor X que carece de dominio Gla es un inhibidor del complejo de protrombinasa; específicamente, compite con la forma activada de factor X plasmático que, teniendo su dominio Gla, es mucho más activo. En otras palabras, en un plasma normal, la adición de cualquier derivado de factor X que carece de dominio Gla retarda la formación de un coágulo en lugar de promoverla.
El hecho de que la actividad procoagulante de los derivados que carecen de dominio Gla sea mucho menor que la del factor X normal no evita, sin embargo, que se hagan comparaciones entre estos derivados. Específicamente, la contribución del dominio Gla a la actividad procoagulante es uniforme independientemente del derivado: es independiente de su actividad catalítica. Un derivado de factor X que, comparado con el derivado normal, reduce el "tiempo de coagulación" (tiempo necesario para que el plasma pierda su fluidez) refleja por lo tanto una mejor actividad procoagulante; un aumento del tiempo de coagulación indica, por otro lado, que el derivado es menos activo que su homólogo normal. Por lo tanto, se comparó la actividad procoagulante de los derivados de factor X (activados o no) con la del homólogo normal que carece de dominio Gla (GD-FX).
Efecto procoagulante de las formas activadas de los derivados de factor X
La adición de la forma activada de un derivado de factor X a plasma de un hemofílico no ensaya la ciclación de la activación de protrombina: refleja sólo la capacidad del derivado activado de funcionar en condiciones cercanas a las encontradas in vivo. En ausencia de factor tisular y de factor VIII o IX, no tiene lugar amplificación de la cascada de coagulación, sólo la forma activada del derivado de factor X posibilita la formación de trombina y, en consecuencia, la formación de un coágulo. El estudio de la actividad en el complejo de protrombinasa (véase el ejemplo 5) muestra que la adición de factor V activado restaura la actividad catalítica de la forma activada del análogo GDX-AVG; es entonces sólo 13 veces menor que la de su homólogo no mutado (GDX-IVG). Este efecto está lejos de ser tan marcado con las demás formas activadas de análogos de factor X (GDX-IFG, GDX-IFR, GDX-SVG y GDX-SFR). El uso de plasma con factor VIII o factor IX agotado posibilita estudiar la posible interferencia con otros factores de coagulación, en particular el efecto de los mecanismos regulatorios (antitrombina, etc.).
El efecto procoagulante de la forma activada de los derivados de factor X se detecta mediante la capacidad de inducir la formación de un coágulo en un plasma con factor VIII o factor IX agotado (Diagnostica Stago, Asnières, Francia). Al añadir factor tisular a uno de estos plasmas, es posible desencadenar la formación de suficiente trombina para inducir la formación de un coágulo, pero el tiempo de coagulación es extremadamente largo y no puede medirse mediante procedimientos convencionales. Por tanto, la reacción se lleva a cabo en una microplaca, y la formación de coágulo es seguida por turbidimetría, registrando la densidad óptica a 405 nm en función del tiempo (independientemente de la longitud de onda, la absorbancia aumenta con la turbidimetría). La formación de coágulo, que es relativamente brusca, está precedida por un periodo de latencia más o menor largo: típicamente la turbidimetría sigue una curva sigmoidea en función del tiempo. El tiempo necesario para alcanzar un 50% de la turbidimetría máxima es representativo del "tiempo de coagulación" de ensayos de coagulación convencionales.
En la práctica, se preincubaron 100 \mul de plasma con factor VIII o factor IX agotado en una microplaca a 25ºC, y se desencadenó la reacción añadiendo 100 \mul de tampón cinético que contenía CaCl_{2} 20 mM y derivado de factor X activado 200 nM. Se registra la variación de la absorbancia a 405 nm en función del tiempo utilizando un lector de microplaca MR5000. Al representar la variación de la absorbancia a 405 nm en función del tiempo, se obtiene una curva que posibilita, mediante regresión no lineal, estimar el tiempo de coagulación (V_{50}) utilizando la ecuación de Boltzmann 7:
(ecuación 7)A_{405} = A_{min} + (A_{max} - A_{min})/(1+e^{((V_{50}-t)/pendiente)})
en la que A_{405} representa la absorbancia a 405 nm a tiempo t, A_{min} la absorbancia inicial a 405 nm y A_{máx} la absorbancia final a 405 nm (después de la formación del coágulo). La pendiente es un parámetro que tiene en cuenta la naturaleza relativamente breve de la fase ascendente en la formación del coágulo (la pendiente aumenta a medida que se reduce el periodo de latencia).
Los resultados obtenidos se resumen en la Tabla XI.
Se indica el tiempo de coagulación (en minutos) de un plasma con factor VIII agotado (-factor VIII) o factor IX agotado (-factor IX) después de la adición de la forma activada de uno de los derivados de factor X, así como el error estándar (expresado como un porcentaje del valor obtenido). Más allá de 50 minutos, el valor de tiempo de coagulación no es ya fiable (<50).
TABLA XI
Derivado Tiempo de coagulación (minutos)
- factor VIII - factor IX
GD-FX 10,5 (\pm1%) 6,5 (\pm3%)
GDX-IVG 12,6 (\pm3%) 6,7 (\pm1%)
GDX-IFG >50 22,9 (\pm1%)
GDX-AVG 10,9 (\pm3%) 7,4 (\pm3%)
GDX-IFR >50 >50
GDX-SVG >50 >50
GDX-SFR >50 >50
La forma activada del derivado GD-FX y la del derivado GDX-IVG tienen un marcado efecto procoagulante.
Además, se confirma el potencial de la forma activada del derivado GDX-AVG: en plasma con factor VIII o factor IX agotado, este derivado acorta el tiempo de coagulación tanto como la forma activada del derivado GD-FX. Lo mismo no es cierto para la forma activada del derivado GDX-IFG: su actividad procoagulante en plasma con factor IX agotado es detectable, pero este derivado sigue siendo incapaz de inducir la formación de un coágulo en menos de 50 minutos en un plasma con factor VIII agotado. Las formas activadas de derivados de factor X que carecen de actividad catalítica detectable (GDX-SFR, GDX-SVG y GDX-IFR) no tienen actividad procoagulante detectable.
Efecto procoagulante del derivado GDX-AVG (no activado)
Sin factor tisular no hay formación de coágulo, tanto si el plasma es de un hemofílico como si no: la cascada de coagulación no se inicia. Un plasma normal coagula, por otro lado, muy rápidamente tras la adición de factor tisular; el de un hemofílico eventualmente también coagula, porque el complejo de coagulación extrínseco (formado entre el factor tisular y el factor VIIa) activa el factor X que, en el complejo de protrombinasa (formado con factor V activado) activa la protrombina a trombina, que eventualmente escinde suficiente fibrinógeno para formar un coágulo. La reacción es mucho más lenta porque no hay amplificación que implique al complejo de tenasa. La presencia de un factor X activable por trombina debería reestablecer una amplificación de la generación de trombina: estarían disponibles dos activadores: el complejo de factor tisular con factor VIIa como anteriormente, pero también la trombina. A medida que aumenta la concentración de trombina, se activan más y más derivados de factor X, lo que genera más trombina y por tanto la amplificación.
Un derivado de factor X que carece de dominio Gla no posibilita realmente ensayar su potencial antihemofílico, ya que su acción procoagulante está limitada en cualquier caso. Sin embargo, es posible verificar si, en presencia de dicho derivado, tiene lugar una amplificación de la formación de trombina después de la adición de factor tisular.
El procedimiento utilizado para detectar el efecto procoagulante de derivados de factor X (no activados) es muy similar al descrito para detectar la actividad de sus formas activadas. La diferencia principal es que la reacción se inicia añadiendo una mezcla de factor tisular y fosfolípidos (además del hecho de que estos derivados no están preactivados). Como para el estudio de las formas activadas, la reacción se lleva a cabo en una microplaca a 25ºC, y la formación de coágulo es seguida por turbidimetría, registrando la densidad óptica a 405 nm en función del tiempo. Es la capacidad de los derivados de factor X de acortar el tiempo de coagulación de un plasma con factor VIII o factor IX agotado lo que se estudia.
En la práctica, el derivado de factor X (0,5 \muM) se añade a 100 \mul de plasma con factor VIII o factor IX agotado, y se desencadena la reacción añadiendo 100 \mul de tampón cinético que contiene CaCl_{2} 20 mM y factor tisular recombinante 2 pM mezclado con fosfolípidos (Innovin, Dade Behring, La Défense, Francia). Se registra la variación en la absorbancia a 405 nm en función del tiempo utilizando un lector de microplaca MR5000, y se estima el tiempo necesario para alcanzar la mitad de la turbidimetría máxima mediante regresión no lineal utilizando la ecuación 7 como se describe anteriormente para estudiar la actividad procoagulante de las formas activadas de los derivados de factor X.
Los resultados obtenidos con el derivado GDX-AVG (zimógeno) se dan en la Figura 4, que compara el efecto procoagulante de este derivado (\circ) (no activado) con el derivado GD-FX (\Box) (no activado) en plasma con factor VIII agotado (4A) o con factor IX agotado (4B). En presencia del derivado GDX-AVG, el tiempo de coagulación es más corto que en presencia del derivado GD-FX (tanto en plasma con factor VIII agotado como plasma con factor IX agotado). La forma zimogénica del derivado GDX-AVG tiene por lo tanto claramente una acción procoagulante, a pesar de la ausencia de dominio Gla y de su actividad catalítica reducida comparado con su homólogo no mutado. El hecho de que el derivado GDX-AVG sea más activo que el derivado GD-FX sugiere que ha tenido lugar realmente una amplificación de la generación de trombina en presencia de GDX-AVG. De hecho, comparado con el derivado GD-FX, el derivado GDX-AVG es 13 veces menos activo en el complejo de protrombinasa, donde es al menos dos veces más activo que en plasma de un hemofílico: existe por lo tanto la producción de una forma al menos 26 veces más activada del derivado GDX-AVG durante la formación de coágulo.
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<110> INSTITUT NATIONAL DE LA SANTÉ ET DE LA RECHERCHE MEDICALE (INSERM)
\hskip1cm
LOUVAIN, Virginie
\hskip1cm
BIANCHINI, Elsa
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MARQUE, Pierre-Emmanuel
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CALMEL-TAREU, Claire
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ALACH, Martine
\hskip1cm
LE BONNIEC, Bernard
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<120> ANÁLOGOS DE FACTOR X ESCINDIBLES POR TROMBINA
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<130> MJPah598/68
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<150> FR 02 08299
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<151> 03-07-2002
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<160> 31
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<170> PatentIn versión 3.1
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<210> 1
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<211> 6
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> Sitio de activación de factor X
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<400> 1
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<212> PRT
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<400> 7
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<220>
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<223> variante de sitio de activación de factor X
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<400> 8
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<220>
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<223> variante de sitio de activación de factor X
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<400> 9
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<223> variante de sitio de activación de factor X
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acgcggatcc gcgatggggc gcccactgca
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30
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<212> ADN
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tcccccgggg gatcagttca ggtcttcctc gctgatcagc ttctgctcct ttaatggaga
\hfill
60
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ggacgtta
\hfill
68
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tatgcgtggg ctggagcaac c
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ttattaggac aaggctggtg gg
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cttgcattcc tggccgccca cgatcctagg cacgttgttg tcgcccct
\hfill
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aggggcgaca acaacgtgcc taggatcttc ggcggccagg aatgcaag
\hfill
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<211> 48
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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<223> cebador de PCR
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cttgcattcc tggccgccga agatcctagg tcgcccct
\hfill
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<212> ADN
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aggggcgaca acaacgtgcc taggatcttc aggggccagg aatgcaag
\hfill
48
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<220>
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\hfill
48
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> cebador de PCR
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<400> 25
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aggggcgaca acaacgtgcc taggagcttc aggggccagg aatgcaag
\hfill
48
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<212> ADN
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\hfill
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<212> ADN
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<400> 28
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cctggccgcc cacgctccta ggcacgttg
\hfill
29
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 29
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<211> 55
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> cebador de PCR
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<400> 29
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\hskip-.1em\dddseqskip
cctgagaggg gcgacaacaa cgtgcctagg gccgtgggcg gccaggaatg caagg
\hfill
55
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<210> 30
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<211> 55
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> cebador de PCR
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<400> 30
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\hskip-.1em\dddseqskip
ccttgcattc ctggccgccc acggccctag gcacgttgtt gtcgcccctc tcagg
\hfill
55
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<210> 31
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<211> 6
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> variantes de sitio de activación de factor X
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<220>
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<221> MISC_FEATURE
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<222> (1)...(1)
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<223> xaa= Ala, Cys, Phe, Gly, His, Ile, Lys, Met, Asn, Gln, Arg, Ser, Thr, Val, Trp o Tyr
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<220>
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<221> MISC_FEATURE
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<222> (5)...(5)
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<223> Xaa= Val, Ile, Leu o Phe
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<220>
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<221> MISC_FEATURE
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<222> (6)...(6)
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<223> xaa= Gly, Asn o His
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<400> 31
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\sa{Xaa Pro Arg Ala Xaa Xaa}
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Claims (10)

1. Análogo de factor X en el que la secuencia Thr-Arg-Ile del sitio de activación de factor X nativo se reemplaza por una secuencia escindible por trombina, caracterizado porque dicha secuencia escindible por trombina es la secuencia Pro-Arg-Ala.
2. Análogo de factor X según la reivindicación 1, caracterizado porque la secuencia Leu-Thr-Arg-Ile-Val-Gly del sitio de activación de factor X nativo se reemplaza por la secuencia P_{3}-Pro-Arg-Ala-P_{2}'-P_{3}' (SEC Nº ID 31), en la que P_{3} representa cualquier aminoácido, con la excepción de Pro, Asp o Glu, P_{2}' representa Val, Ile, Leu o Phe y P_{3}' representa Gly, Asn o His.
3. Análogo de factor X según la reivindicación 2, caracterizado porque la secuencia Leu-Thr-Arg-Ile-Val-Glu del sitio de activación de factor X nativo se reemplaza por la secuencia Val-Pro-Arg-Ala-Val-Gly.
4. Análogo de factor Xa que puede obtenerse mediante escisión de un análogo de factor X, según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3, por trombina.
5. Molécula de ácido nucleico según un análogo de factor X según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3, o que codifica un análogo de factor Xa según la reivindicación 4.
6. Vector recombinante, caracterizado porque comprende una molécula de ácido nucleico según la reivindicación 5.
7. Célula huésped transformada genéticamente con una molécula de ácido nucleico según la reivindicación 5.
8. Uso de un análogo de factor X según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3, o de un análogo de factor Xa según la reivindicación 4 o de una molécula de ácido nucleico según la reivindicación 5, para obtener un producto medicinal procoagulante.
9. Uso según la reivindicación 8, caracterizado porque dicho producto medicinal se pretende para el tratamiento de una coagulopatía resultante de una deficiencia de factor VIII, factor IX o factor XI.
10. Uso según la reivindicación 9, caracterizado porque dicha coagulopatía es hemofilia de tipo A o hemofilia de tipo B.
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