ES2253881T3 - Inhibidores de quinasa dependiente de ciclinas. - Google Patents

Inhibidores de quinasa dependiente de ciclinas.

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ES2253881T3 ES99913426T ES99913426T ES2253881T3 ES 2253881 T3 ES2253881 T3 ES 2253881T3 ES 99913426 T ES99913426 T ES 99913426T ES 99913426 T ES99913426 T ES 99913426T ES 2253881 T3 ES2253881 T3 ES 2253881T3
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Francis Thomas Boyle
Philip John Jewsbury
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Abstract

Uso de un compuesto de pirimidina que tiene la **fórmula** o una de sus sales y/o forma de profármaco farmacéuticamente aceptables, para fabricar un medicamento para el tratamiento de tumores u otros trastornos de proliferación celular susceptibles a la inhibición de una o más enzimas CDK en mamíferos, en el que dicho compuesto de pirimidina proporciona un agente antitumoral o un inhibidor de la proliferación celular, activo, independiente y eficaz.

Description

Inhibidores de quinasa dependiente de ciclinas.
Campo de la invención
La presente invención se refiere a ciertos compuestos, en especial a derivados de pirimidina, que muestran actividad en sistemas biológicos como inhibidores de quinasa dependiente de ciclinas (CDK) y que, por consiguiente, tienen interés como agentes terapéuticos potencialmente útiles que pueden ser incorporados en composiciones o formulaciones farmacéuticas que se emplean para regular o inhibir el crecimiento o proliferación celular en mamíferos, por ejemplo en relación con tratamiento antitumoral o tratamiento del cáncer.
Fundamento
Las quinasas dependientes de ciclinas (CDK's) constituyen una familia de enzimas que forman complejos con otras proteínas de activación conocidas como ciclinas, proporcionando factores reguladores fundamentales implicados en la regulación del crecimiento y la división de células animales. Más particularmente, la progresión de células animales a través del ciclo de división celular (fases G1, S, G2 y M) está regulado por la formación, activación e inactivación subsiguientes, sucesivas, de una serie de complejos de dímeros de CDK/ciclina que regulan los puntos de control del ciclo celular último de paso, y las transiciones entre fases sucesivas del ciclo celular, con la actuación de las CDK's como subunidades catalíticas de los complejos.
Existen, en efecto, varias proteínas de ciclina diferentes que, a semejanza de CDK's diferentes, forman una familia de proteínas de activación de CDK vagamente relacionadas; complejos de CDK/ciclina diferentes actúan en etapas diferentes del ciclo celular con aumento y disminución sucesivos de la expresión de ciclina durante el ciclo celular y degradación de ciclina durante la fase M siendo, habitualmente, un factor importante en la determinación ordenada de la progresión del ciclo celular. Por consiguiente, se opina que la progresión a través de la fase G1 a la fase S en células de mamífero está regulada principalmente por las quinasas dependientes de ciclinas, CDK2, CDK3 y CDK4 (y posiblemente también CDK6 en algunas células) en asociación con al menos las ciclinas D y E, los complejos de CDK2 y CDK4 (y posiblemente CDK6) con ciclinas del tipo D en particular, que desempeñan un papel importante en la regulación de la progresión a través del punto de restricción de G1 mientras que los complejos de CDK2/ciclina E son esenciales para ocasionar la transición desde la fase G1 a la fase S. Una vez se entra en la fase S se piensa que la progresión posterior y la entrada en G2 requiere, entonces, complejos activados de CDK2 con otra ciclina que se denomina ciclina A, es decir, complejos de CDK2/ciclina A. Finalmente, para la transición desde la fase G2 a la fase M y la iniciación de la mitosis, se requieren complejos activados de la quinasa dependiente de ciclina denominada CDK1 (que se conoce también como Cdc2) con una ciclina denominada ciclina B (y también complejos de CDK1 con ciclina A).
En general, la regulación del ciclo celular y la actividad de las CDK's implica una serie de reacciones estimuladoras e inhibidoras de la fosforilación y desfosforilación, y para ejercer sus funciones reguladoras los complejos de CDK/ciclina cuando activados usan el ATP como sustrato para fosforilar una diversidad de otras proteínas celulares sustrato, habitualmente sobre grupos de serina y treonina de las mismas. La regulación del ciclo celular puede implicar, asimismo, inhibidores de complejos de CDK/ciclina que bloqueen la función catalítica de estas enzimas conduciendo de este modo a la detención del ciclo celular. Ciertos inhibidores naturales, tales como por ejemplo las proteínas inhibitorias conocidas como p16 y p21, pueden bloquear la progresión del ciclo celular por unión selectiva con complejos de CDK/ciclina inactivando esta última.
El control por inhibidores de la función de CDK puede proporcionar, por tanto, un mecanismo adicional para regular la progresión del ciclo celular, y este hecho ha llevado a propuestas para usar inhibidores de CDK como agentes terapéuticos antiproliferativos, en terapia antitumoral, por ejemplo, para incidir en células que proliferan de modo anormal, y ocasionando la parada de la progresión del ciclo celular. Esto ha parecido ser especialmente apropiado desde que se conoce que trastornos graves o irregularidades importantes de la progresión del ciclo celular tienen lugar frecuentemente en células tumorales humanas, acompañados con frecuencia de sobreexpresión de CDK's y otras proteínas asociados con ello. Asimismo, en comparación con los fármacos antitumorales citotóxicos conocidos, el uso de inhibidores de la proliferación celular que actúan a través de CDK's podría tener la ventaja de evitar la interacción directa con el DNA, proporcionando con ello un riesgo reducido de desarrollo de un tumor secundario.
Las aplicaciones terapéuticas potenciales y otros posibles usos han llevado, por consiguiente, a la búsqueda de otros inhibidores químicos de las CDK's, en especial inhibidores selectivos que pueden ser adecuados para uso farmacéutico. La actividad inhibitoria y la selectividad de complejos de CDK/ciclina seleccionados, se analizan, en general, midiendo la actividad de quinasa para fosforilar la proteína histona H1 (uno de los constituyentes proteínicos principales de la cromatina, que proporciona generalmente un buen sustituto de las CDK) en presencia del inhibidor sospechoso en ensayo. Diversos compuestos que poseen propiedades inhibitorias de CDK potencialmente útiles que han sido identificados de este modo, han sido descritos en un artículo de revisión cuyo contenido se incorpora en esta memoria como referencia, titulado "Chemical inhibitors of cyclin-dependent kinases" por Laurent Meijer, piblicado en Cell Biology (Vol. 6), octubre 1996. Entre los compuestos a los que se hace referencia en el artículo citado, existe un potente derivado de adenina que inhibe la CDK1 y la CDK2, la 2-(2-hidroxietilamino)-6-bencilamino-9-metil-purina, denomiado "olomoucina", y también un análogo estrechamente relacionado que incorpora modificaciones en las posiciones 2, 6 y 9, la 6-(bencilamino)-2(R)-[{1-(hidroximetil)propil}amino]-9-isopropilpurina. Este último compuesto se denomina "roscovitina" y es incluso más potente que la olomoucina como inhibidor de CDK. Las potentes pero selectivas propiedades inhibitorias de CDK de la olomoucina han sido descritas primeramente en una publicación de J. Vesely et al.., titulada "Inhibition of cyclin-dependent kinases by purine analogues", Eur. J. Biochem. 224, 771-786 (1994), y posteriores estudios sobre propiedades inhibitorias de CDK de una gama de compuestos de purina en forma de derivados de adenina, que incluyen la olomoucina y la roscovitina, están indicados y discutidos en una publicación de L. Havlicek et al.. titulado "Cytokinin-Derived Cyclin-Dependent Kinase Inhibitors: Synthesis and cdc2 Inhibitory Activity of Olomoucine and Related Compounds" J. Med. Chem. (1997) 40, 408-412. De nuevo, el contenido de estas publicaciones ha de considerarse como incorporado en esta memoria como referencia.
Se ha indicado que la actividad inhibitoria tanto de la olomoucina como de la roscovitina resulta de la actuación de estos compuestos como inhibidores competitivos para la unión del ATP. Puede apreciarse que se ha indicado que la olomoucina al menos, tiene una carencia total de actividad inhibitoria en relación con muchas quinasas comunes distintas de las CDK's. La selectividad se manifiesta, además, por el hecho de que ambos compuestos, la olomoucina y la roscovitina, inhiben la actividad de CDK1, CDK2 y CDK5, pero no se ha encontrado que ninguna de las dos sea activa frente a CDK4 ó CDK6.
La olomoucina, en particular, ha sido considerada como que proporciona un compuesto importante para ayudar a identificar y diseñar otros inhibidores de CDK a base de purinas, y basándose en estudios de estructura/actividad se ha sugerido en la publicación citada de Vesely et al.., que la sustitución de N9 por un resto hidrófobo tal como metilo, 2-hidroxietilo o isopropilo, era importante, por ejemplo, para proporcionar una interacción hidrófoba directa con la CDK, y que aparecía como esencial una cadena lateral en C2. De modo semejante, en la publicación de Havlicek et al.., aparte de observar que para que los compuestos de purina tengan actividad inhibitoria, las posiciones 1 y 7. y posiblemente la posición 3, del anillo de purina deben permanecer libres para permitir la unión de hidrógeno, estableciéndose también que aparece también que es esencial una cadena lateral polar en la posición 2 y que la sustitución de N9 por un resto hidrófobo es, asimismo probablemente, importante para obtener una unión positiva. Las posiciones 2, 6 y 9 en el anillo de purina han sido identificadas como que son las posiciones que regulan la unión con CDK1.
En el artículo de revisión de Meijer, se ha citado también que, como resultado de la cristalización de complejos inhibidores de CDK, y en particular estudios de cristalización conjunta con CDK2, se ha descubierto que los inhibidores tales como la olomoucina y la roscovitina se localizan en el espacio de unión del ATP, que está localizado en la fisura existente entre los lóbulos pequeño y grande de la molécula de proteína de CDK, y que la especificidad era proporcionada, probablemente, por porciones de las moléculas inhibidoras que interaccionan con las quinasas fuera de los sitios de unión del ATP.
Sumario de la invención
La presente invención ha sido desarrollada pariendo de observaciones realizadas en el transcurso del ensayo de diversos derivados de guanina, para determinar su actividad como inhibidores de la proteína de reparación de DNA, O^{6}-metilguanina DNA-metiltransferasa (MGMT) cuando se encontró inesperadamente que aunque el compuesto O^{6}-ciclohexilmetilguanina tenía muy poca actividad como inhibidor de MGMT, era, no obstante, citotóxico y mostraba muy alta actividad inihibitoria, comparable a la de la olomoucina, contra complejos de CDK1(cdc2)/ciclina B. Esto era particularmente sorprendente frente al fundamento anteriormente discutido en relación con la olomoucina, dado que este compuesto de guanina no posee sustituyentes ni en la posición 2-NH_{2} ni en la posición 9 del anillo de purina, y que el reemplazo del 6-NH por 6-O hacía al compuesto menos parecido al ATP con el que se piensa que la olomoucina al menos, compite por los sitios de unión.
Posteriormente han sido identificados otros derivados de guanina, más estrechamente relacionados con la O^{6}-ciclohexilmetilguanina que con compuestos tales como la olomoucina y la roscovitina, que manifiestan importante actividad inhibitoria de CDK, y estudios cristalográficos llevados a cabo han revelado que complejos de CDK2 (homólogos con CDK1, al menos en lo que respecta al sitio de unión catalítico) con derivados de guanina tales como la O^{6}-ciclohexilmetilguanina y la O^{6}-ciclohex-1-enilmetilguanina, se unen de un modo diferente al de los complejos de CDK2 con la olomoucina.
Esto se ilustra en los dibujos que se acompañan en los que:
La Figura 1 es un diagrama que indica el modo en que la olomoucina se une a la CDK2;
la Figura 2 es un diagrama similar que indica el modo encontrado en que el compuesto O^{6}-ciclohexilmetilguanina se une a la CDK2;
la Figura 3 es un diagrama que representa una estructura cristalina que muestra el modo encontrado en que la forma enantiómera R del compuesto O^{6}-(2,2-dimetil-1,3-dioxolano-4-metoxi)guanina se une a la CDK2.
Si bien con la olomoucina es la cadena lateral polar sobre N2 del anillo de purina la que se asienta dentro del espacio de unión de la ribosa del ATP de la proteína de CDK2, y el sustituyente metilo en N9 ocupa un espacio hidrófobo de especificidad, estando implicados N7 y 6-NH en la unión de hidrógeno a la proteína, en el modo de unión ilustrado en la Figura 2 es el anillo de cicloalquilo del sustituyente en la posición 6 el que se asienta en el espacio de unión de la ribosa del ATP mientras que se forman enlaces de puente de hidrógeno con N9, N3 y 2-NH. En otras palabras, la orientación en comparación con la unión de olomoucina, está completamente invertida. Se obtiene una situación similar con el modo de unión ilustrado en la Figura 3 en que está indicada también la intervención de algunas moléculas de agua.
Por consiguiente queda aclarado que las conclusiones alcanzadas con respecto a las relaciones de estructura/activi-
dad en la serie de adenina de compuestos ejemplificados por olomoucina y roscovitina son, verosímilmente, no más que ser válidas para todos los derivados de purina, en especial derivados de guanina, y como se ha descrito en nuestra Solicitud de Patente Internacional en tramitación junto con la presente, No. PCT/GB98/02025, se ha identificado una serie de otros compuestos de purina que poseen actividad inhibitoria con respecto a algunas CDK's por lo menos y que se opina que se unen del modo indicado en la Figura 2 (o la Figura 3) en vez del modo indicado en la Figura 1.
Se ha encontrado ahora que existen también varios compuestos heterocíclicos nitrogenados monocíclicos, en especial compuestos de pirimidina, que cuando se proveen de sustituyentes adecuados pueden actuar igual o imitar a los compuestos de purina antes citados y que ponen de manifiesto actividad de inhibición con respecto a por lo menos algunas proteínas de CDK. A semejanza de los compuestos de purina, en lo referente a la actividad de inhibición de CDK, estos compuestos de pirimidina se fijan en la posición 4, por medio de una cadena lateral, a un anillo carbocíclico o heterocíclico de 4- a 8- miembros, opcionalmente sustituido, que, se opina, puede asentarse en el espacio de unión de la ribosa del ATP de la proteína de la CDK. Asimismo, habrá, habitualmente, un grupo amino o un grupo amino parcialmente sustituido en la posición 6, que puede interaccionar con el espacio hidrófobo de especificidad de la proteína de CDK de un modo análogo al indicado en la Figura 2 o en la Figura 3, para la unión de una purina de inhibición de la CDK. Preferiblemente, habrá también un grupo amino o un grupo amino sustituido en la posición 2.
Más particularmente, en un aspecto la presente invención proporciona composiciones farmacéuticas para el tratamiento de trastornos de la proliferación celular en mamíferos, por ejemplo tumores, cuyas composiciones contienen como ingrediente activo un compuesto de pirimidina que inhibe las CDK y que posee la fórmula estructural I que se indica a continuación:
\vskip1.000000\baselineskip
1
\vskip1.000000\baselineskip
en cuya fórmula, en realizaciones preferidas,
X
es O, S o CHR_{x}
\quad
siendo R_{x} H o alquilo de C_{1-4};
D
es H o NZ_{1}Z_{2}
\quad
en cuya fórmula Z_{1} y Z_{2} son, cada uno independientemente, H, alquilo de C_{1-4}, hidroxialquilo de C_{1-4}, arilo opcionalmente sustituido o aralquilo opcionalmente sustituido;
A
está seleccionado entre H, alquilo de C_{1-4}, alcoxi de C_{1-4}, hidroxi, CH_{2}(CH_{2})_{n} OH (n=1-4), y NR_{a1}R_{a2}, siendo R_{a1} y R_{a2}, cada uno independientemente, H o alquilo de C_{1-4};
Y
es o incluye un anillo carbocíclico o heterocíclico de 4 a 8 miembros, opcionalmente sustituido;
D'
es H o NZ_{3}Z_{4}
\quad
en cuya fórmula Z_{3} y Z_{4} son, cada uno independientemente, H, alquilo de C_{1-4}, hidroxialquilo de C_{1-4}, arilo opcionalmente sustituido o aralquilo opcionalmente sustituido;
E
se selecciona entre H, NO, NO_{2}, N=N-Ar, donde Ar es un grupo arilo opcionalmente sustituido o aralquilo opcionalmente sustituido, NR_{e1}R_{e2} o NR_{e1}NR_{e2}R_{e3} (siendo R_{e1}, R_{e2} y R_{e3}, cada uno independientemente, H, alquilo de C_{1-4}, hidroxialquilo de C_{1-4}, un grupo arilo opcionalmente sustituido o aralquilo opcionalmente sustituido, C(R_{e})=U (siendo R_{e} hidrógeno, alquilo de C_{1-4} o alquilo sustituido, por ejemplo hidroxialquilo, o un grupo arilo o aralquilo sin sustituir o sustituido, por ejemplo bencilo, y estando U seleccionado entre O, NR_{e}', NOR_{e}' y N-NR_{e}'R_{e}'' (en cuyas fórmulas R_{e}' y R_{e}'' son, cada uno independientemente, H, alquilo de C_{1-4} o CONH_{2}) o T, CH_{2}T, CHT_{2} y CT_{3}, en donde T es un haluro I, Br, Cl ó F.
Algunos de los compuestos comprendidos dentro del alcance de la definición anterior son ya conocidos per se, pero no han sido conocidos con anterioridad en la capacidad de inhibidores de CDK. Se opina que algunos de estos compuestos son entidades químicas nuevas. Además, en algunos casos se ha encontrado que la actividad inhibitoria de CDK tiene selectividad hacia CDK's diferentes lo que es notablemente diferente de la de la olomoucina. Así pues, la presente invención ha identificado, en efecto, una clase adicional de inhibidores de CDK y ha agrandado considerablemente la gama de compuestos de que se dispone para usar como inhibidores de CDK.
En tanto en cuanto sea capaz de ajustarse o de asentarse en el espacio de unión de la ribosa del ATP de una proteína de CDK y permita una unión del modo general representando en la Figura 2 en vez de en la Figura 1, existe una serie amplia de sustituyentes que verosímilmente son adecuados para Y. En algunos casos puede ser útil que Y comprenda una estructura cíclica que incluya sustituyentes hidroxilados polares o semejantes.
En la mayor parte de la realizaciones Y será un anillo de cicloalcano o de cicloalqueno, preferiblemente un anillo pentagonal o hexagonal que tiene hasta dos dobles enlaces. Sin embargo, uno o dos átomos de carbono del anillo pueden estar reemplazados por heteroátomos o heterogrupos, en particular O, S, NR’ (siendo R' H o alquilo de C_{1-4}) o, en un anillo de cicloalqueno, -N=. Cuando el anillo está sustituido el sustituyente o cada uno de los sustituyentes (en cualquier posición) será seleccionado, preferiblemente, entre H, alquilo de C_{1-4}, OH, alcoxi de C_{1-4}, halógeno, CF_{3}, CN, N_{3} y NR_{Y1}R_{Y2}, en cuya fórmula R_{Y1} y R_{Y2} son, cada uno independientemente, H o alquilo de C_{1-4}. Además, en el caso en que haya dos sustituyentes sobre átomos adyacentes del anillo,
Por ejemplo,
---
\delm{C}{\delm{\para}{P}}
H ---
\delm{C}{\delm{\para}{Q}}
H ---
estos sustituyentes P y Q pueden unirse formando una estructura cíclica fusionada adicional, por ejemplo un anillo carbocíclico o heterocíclico de 4, 5 ó 6 miembros. Esta estructura cíclica adicional puede incluir, por ejemplo, hasta dos heteroátomos o heterogrupos tales como O, S o NH, y también puede estar sustituida con uno o más sustituyentes, por ejemplo, un grupo o grupos alquilo de C_{1-4} o un grupo fenilo o fenilo sustituido. En algunas realizaciones, Y puede ser también adamantilo.
Ejemplos de estructuras cíclicas representadas por Y incluyen
\vskip1.000000\baselineskip
2
en las que V y W se seleccionan, cada uno independientemente, entre
O, S, NR' (R' es H o alquilo de C_{1-4})
y CH_{2} (o =CH-); y
R_{1} y R_{2} son, cada uno, H o alquilo de C_{1-4}.
Como se ha indicado anteriormente, estas estructuras cíclicas pueden llevar, opcionalmente, sustituyentes que pueden ser iguales o diferentes y que pueden seleccionarse inter alia entre H, alquilo de C_{1-4}, alcoxi de C_{1-4}, -OH, NR_{Y1}R_{Y2} (en cuya fórmula R_{Y1} y R_{Y2} son, cada uno independientemente, H o alquilo de C_{1-4}), CF_{3}, halógeno, N_{3}, CN, arilo opcionalmente sustituido (por ejemplo, fenilo), y aralquilo opcionalmente sustituido (por ejemplo, bencilo). Asimismo, como ya se ha indicado, puede ser útil en algunos casos que la estructura cíclica incluya una pluralidad de sustituyentes polares tales como hidroxilo, por ejemplo.
En general, las composiciones farmacéuticas de esta invención, contienen una cantidad no tóxica, eficaz, de inhibición de CDK, del compuesto de pirimidina activo, y pueden formularse según cualquiera de los métodos bien conocidos en la técnica de farmacia, para su administración de un modo conveniente. Los compuestos pueden presentarse, por ejemplo, en forma de dosificación unitaria, mezclados con al menos otro ingrediente que proporciona un aditivo, vehículo, diluyente o excipiente compatible, farmacéuticamente aceptable.
Ha de comprenderse que cuando se hace referencia en esta memoria descriptiva a compuestos de fórmula I, tal referencia debe ser interpretada como que se extiende también a sus sales farmacéuticamente aceptables y a otros bioprecursores (formas pro-fármaco) farmacéuticamente aceptables, cuando sea importante. El término "pro-fármaco" se usa en la presente memoria descriptiva para denotar formas modificadas o derivados modificados de un compuesto farmacológicamente activo que se biodegrada in vivo y se convierte en dicho compuesto activo después de su administración, en especial su administración oral o intravenosa, durante el curso de tratamiento terapéutico de un mamífero. Tales pro-fármacos son escogidos comúnmente debido a su solubilidad aumentada en medios acuosos, lo que ayuda a superar problemas de formulación, y también, en algunos casos, para proporcionar una cesión del agente activo relativamente lenta o regulada.
Ha de entenderse que cuando algunos de estos compuestos a los que se ha hecho referencia puede existir en más de una forma enantiómera y/o diastereoisómera, la totalidad de tales formas, sus mezclas y su preparación y usos se encuentran dentro del alcance de la invención. Ha de notarse, sin embargo, que es probable que sean importantes consideraciones estereoquímicas y que puede haber una considerable selectividad tal que enatiómeros o diastereoisómeros diferentes tengan actividad inhibitoria significativamente diferente.
La invención incluye también, como es lógico, el uso de los compuestos que inhiben las CDK a que se ha aludido, para la fabricación de medicamentos o de composiciones farmacéuticas a que se ha hecho referencia antes. La invención incluye, además, algunos compuestos de pirimidina que son nuevas entidades químicas, útiles como intermedios en la síntesis de dichos compuestos que inhiben las CDK.
Así pues, un segundo aspecto de la presente invención proporciona un compuesto de pirimidina que tiene la fórmula estructural general I
3
o una de sus sales y/o forma de profármaco, farmacéuticamente aceptables, para usar como agente terapéutico activo para preparar una composición farmacéutica para inhibir la proliferación de células tumorales,
caracterizado porque en la fórmula estructural I
X
es O, S o CHR_{x}
\quad
siendo R_{x} H o alquilo de C_{1-4};
D
es H o NZ_{1}Z_{2} en cuya fórmula Z_{1} y Z_{2} son, cada uno independientemente, H, alquilo de C_{1-4}, hidroxialquilo de C_{1-4}, arilo opcionalmente sustituido o aralquilo opcionalmente sustituido;
A
se selecciona entre H, alquilo de C_{1-4}, alcoxi de C_{1-4}, hidroxi, CH_{2}(CH_{2})_{n}OH (n=1-4), y NR_{a1}R_{a2}, en cuya fórmula R_{a1} y R_{a2} son, cada uno independientemente, H o alquilo de C_{1-4};
Y
es un anillo de cicloalcano o cicloalqueno, pentagonal o hexagonal opcionalmente sustituido, que tiene uno o dos dobles enlaces;
D'
es H o NZ_{3}Z_{4}
\quad
en cuya fórmula Z_{3} y Z_{4} son, cada uno independientemente, H, alquilo de C_{1-4}, hidroxialquilo de C_{1-4}, arilo opcionalmente sustituido o aralquilo opcionalmente sustituido;
E
se selecciona entre H, NO, NO_{2}, N=N-Ar, siendo Ar un grupo arilo opcionalmente sustituido o aralquilo opcionalmente sustituido, NR_{e1}R_{e2} ó NR_{e1}NR_{e2}R_{e}3 (siendo R_{e1}, R_{e2} y R_{e3}, cada uno independientemente, H, alquilo de C_{1-4}, hidroxialquilo de C_{1-4}, un grupo arilo opcionalmente sustituido o un grupo aralquilo opcionalmente sustituido, C(R_{e})=U (siendo R_{e} hidrógeno, alquilo de C_{1-4} o alquilo sustituido, por ejemplo hidroxialquilo, o un grupo arilo o aralquilo sin sustituir o sustituido, por ejemplo bencilo, y estando seleccionado U entre O, NR_{e}', NOR_{e}' y N-NR_{e}'R_{e}'', (en cuyas fórmulas R_{e}' y R_{e}'' son, cada uno independientemente, H, alquilo de C_{1-4} ó CONH_{2}), T, CH_{2}T, CHT_{2} y CT_{3}, siendo T un haluro I, Br, Cl o F.
Preferiblemente, en compuestos según la fórmula estructural I que se usa para llevar a cabo la invención, D es un grupo amino sin sustituir -NH_{2} y X es oxígeno.
El sustituyente Y de los compuestos de la presente invención puede estar sustituido con al menos un sustituyente seleccionado entre H, alcoxi de C_{1-4}, halógeno, CF_{3}, CN, N_{3} y NR_{y1}R_{y2} en cuya fórmula R_{y1} y R_{y2} son, cada uno independientemente, H o alquilo de C_{1-4}.
Cuando el grupo Y de los compuestos de la presente invención comprende dos sustituyentes sobre átomos adyacentes, los sustituyentes pueden unirse formando así una estructura cíclica fusionada, adicional, carbocíclica o heterocíclica.
Aun cuando varios de los compuestos inhibidores de CDK son ya conocidos per se, sin embargo, como se ha apuntado anteriormente, algunos de los compuestos son nuevos y constituyen nuevas entidades químicas.. Esos compuestos per se, están abarcados por el segundo aspecto de la invención.
Ejemplos de compuestos que son en la actualidad especialmente preferidos para usar para llevar a cabo la invención, o bien directamente o como compuestos intermedios, y que incluyen los inhibidores de CDK más potentes que han sido identificados, al menos cuando fueron ensayados in vitro contra la CDK1 y/o la CDK2, incluyen los siguientes:
2,6-Diamino-4-ciclohexilmetoxi-5-nitrosopirimidina,
2,6-Diamino-5-(4'-clorofenil)azo-4-ciclohexilmetoxipirimidina.
2,6-Diamino-4-benciloxipirimidina.
2,6-Diamino-4-benciloxi-5-nitrosopirimidina.
2,5,6-Triamino-4-benciloxipirimidina.
2,6-Diamino-4-ciclohex-3-enilmetoxipirimidina.
2,6-Diamino-4-ciclohex-3-enilmetiloxi-5-nitrosopirimidina.
2-Amino-4.ciclohexilmetiloxi-6-metilaminopirimidina.
2-Amino-6-bencilamino-4-ciclohexilmetiloxipirimidina.
y
2,6-diamino-4-ciclohexil-metiloxipirimidina-5-carbaldehído.
Actividad biológica
Se encuentran disponibles análisis para ensayar la actividad inhibitoria de los compuestos de interés frente a una serie de complejos de CDK/ciclina, que incluyen CDK1/ciclina A, CDK1/ciclina B, CDK1/ciclina F, CDK2/ciclina A, CDK2/ciclina E, CDK4/ciclina D, CDK5/35 y CDK6/ciclina D3, y es interés particular hacer notar la selectividad de algunos de los compuestos frente a diferentes CDK's.
Los resultados de ensayos realizados que ponen de manifiesto valores de la actividad inhibitoria de CDK medidos para algunos de los compuestos que han sido preparados, se muestran en la Tabla 1 que figura al final de la presente descripción. Cuando los compuestos existían en formas enantiomorfas diferentes los ensayos han sido llevados a cabo, generalmente, sobre mezclas racémicas. Aparte de los compuestos de referencia, los compuestos enumerados van acompañados de una referencia NU o un número de código de identificación. La Tabla 1 incluye los compuestos que en la actualidad son los más preferidos de aquellos que han sido preparados, aún cuando todavía no todos han sido ensayados completamente.
En general, los estudios realizados apoyan totalmente la opinión de que las características inhibitorias de CDK de los compuestos ensayados, reflejan la capacidad de estos compuestos para actuar como fármacos antitumorales eficaces.
Los ensayos de inhibición han sido llevados a cabo empleando métodos que se basan en los descritos en la publicación de J. Vesely et al., a que se ha hecho referencia anteriormente en esta memoria, y en la publicación de L. Azzi et al (1992) Eur. J. Biochem. 203, 353-360. A modo de ejemplo, sin embargo, se resume a continuación un protocolo típico.
Ejemplo de ensayo de CDK Reactivos
El Tampón C (que contiene b-glicerofosfato 60 mM, fosfato de nitrofenilo 30 mM, MOPS 25 mM, pH 7,0, EGTA 5 mM, MgCl_{2} 15 mM, MgCl_{2} 1 mM y ortovanadato sódico 0,1 mM) se prepara como sigue:
FW g/100 ml Conc. final
b-glicerofosfato (RT) 216 1,3 60 mM
MOPS (RT) 209,3 0,52 25 mM
EGTA (RT) 380,4 0,19 5 mM
MgCl_{2} (RT) 203,4 0,305 15 mM
FW: Peso fórmula, RT: Temperatura ambiente
Primeramente se disuelven los ingredientes anteriores en aproximadamente 80 ml de agua destilada y se lleva el pH a 7,0
Luego se añade 1 ml de ortovanadato de sodio 10 mM
(1,84 mg/ml - FW = 183,9 RT)
Conc. final = 0,1 mM
Se enfría a 4ºC
Luego se añaden
Fosfato de 4-nitrofenilo (-20ºC) 279,2 1,112 30 mM
DTT (4ºC) 154,2 0,0154 1 mM
(Alternativamente, se prepara DTT 100 mM (15,4 mg/ml) y se almacena en partes alícuotas de 1,2 ml en congelador, se descongela y se añade 1 ml al tampón anterior).
Se completa hasta 100 ml y se guarda en porciones alícuotas de 5 ml, en congelador
p34 cdc2(CDK1)/ciclinaB purificada por afinidad, procedente de estrella de mar fase M (Marthasterias glacialis) en glicerina al 20%, se mantiene a -80ºC en congelador de arcón
Olomoucina 100 mM (Nº de Cat. LC-0-3590-M025 Alexis Co. Bingham Nottingham. WF=298,35 29,835 mg/l = 100 mM, alícuotas de 25 ml se almacenan en congelador.
Ácido fosfórico al 1% (58,8 ml de ácido fosfórico de 85% + 4,942 litros de agua)
Prepárese lo siguiente el día del ensayo:
Histona H1 (tipo III-S (Sigma) 4ºC) 5 mg/ml en tampón C.
[^{32}P]ATP 75 mM: Prepárese usando (múltiplos de ello) las proporciones siguientes:
2 ml [^{32}P]ATP (3000Ci/mMol PB168 Amershamn almacenado en congelador de radiactivos) + 7,5 ml de ATP 1 mM frío (-20ºC)
(0,551 mg/ml - alícuotas de 200 ml almacenadas en congelador) + 90,5 ml de tampón C.
Conc. = 12,5 mM en el ensayo final.
Procedimiento de ensayo
El DMSO no puede exceder del 1% en la mezcla de ensayo. Los inhibidores se añaden en 1/10 del volumen final del ensayo y potencia final 10x. Las soluciones de reserva de DMSO deben diluirse, por tanto, hasta 10x la concentración final deseada de \leq DMSO 10%, tampón C \geq 90%. Intervalos de concentración sugeridos = 0, 1, 10, 100 mM; por tanto las soluciones de reserva de DMSO de 0, 100, 1.000 y 10.000 mM se diluyen 1/10 con tampón C antes de añadir al ensayo.
Preparación
Etiquétese un conjunto de microtubos de 0,2 ml para el ensayo (por ejemplo, A_{0}, A_{1}, A_{10}, A_{100} en una gradilla adecuada y otro conjunto de eppendorfs para dilución del fármaco.
Márquense filtros de fosfocelulosa a lápiz (por ejemplo, A_{0}, A_{1}, A_{10}, A_{100}) y dóblense longitudinalmente para hacer un "tejado en pendiente"
Prepárese un baño de agua a 30º conteniendo una segunda gradilla para microtubos.
Colóquese sobre un agitador magnético un vaso de precipitados que contenga una inserción de malla de alambre y una pequeña barra magnética por debajo de la inserción de malla, junto con 400 ml de ácido fosfórico al 1%.
\vskip1.000000\baselineskip
Mezcla de reacción
Todos los reactivos (excepto los stocks de DMSO) deben mantenerse sobre hielo hasta que se inicien los ensayos.
Colóquese la gradilla de tubos del ensayo sobre hielo
Póngase en cada tubo.
16 ml de tampón C
11 ml de cdc2/ciclinaB quinasa
5 ml de histona H1
3 ml de inhibidor
\vskip1.000000\baselineskip
Iníciese la reacción en cada tubo a intervalos de 30 segundos mediante la adición de
5 ml de [^{32}P]ATP agitando con formación de vórtice y colocando la gradilla en el baño de agua a 30ºC
Termínese la reacción al cabo de 10 min a intervalos de 30 segundos en los tubos, en el mismo orden, separando
25 ml de mezcla de reacción y depositando en forma de mancha sobre filtros apropiadamente marcados, dejando secar durante 20 - 30 segundos y transfiriendo a ácido sulfúrico al 1% en agitación.
Incubación de blanco: se lleva a cabo como anteriormente pero sin histona (en su lugar se añaden 5 ml de tampón C). El blanco de lavado es 5 ml de ATP añadidos directamente al filtro.
Lávense los filtros 5-6 veces, 5 minutos cada uno y séquense los filtros sobre toallas de papel.
Sométanse a recuento en viales mini de centelleo con 5 ml de centelleante.
3 x estándar de 5 ml de ATP sometidos a recuento también (375 pmoles de ATP).
Nota. El ensayo puede ser simplificado preparando un stock de mezcla de reacción como sigue:
(1 parte de cdc2/ciclina B, 16 partes de tampón C, 5 partes de histona H1) x Número de tubos de ensayo +1 y añádanse 22 ml a cada tubo de ensayo conteniendo 3 ml de tampón C \pm inhibidor. Sin embargo, es necesario todavía preparar un blanco del ensayo (es decir, sin histona) por separado.
Descripción de ejemplos ilustrativos
Los ejemplos que siguen y la descripción de etapas de las vías de síntesis de preparación de diversos compuestos de interés, ejemplares, sirven, además, para ilustrar la presente invención, pero en modo alguno deben interpretarse como limitaciones de la misma. De nuevo, en muchos casos, los compuestos descritos van acompañados de una referencia NU o de un número de código de identificación.
2,6-Diamino-4-ciclohexilmetoxipirimidina (NU6034) (para usar como un compuesto intermedio)
Ciclohexilmetanol (30 ml) y sodio (0,76 g, 32 mmol) se calentaron juntos bajo N_{2}, a 150ºC, durante 1,5 h. Se añadió 4-cloro-2,6-diaminopirimidina (4,32 g, 30 mmol) y la mezcla de reacción se calentó a reflujo durante 2 h a 180ºC bajo N_{2}. Se separó el disolvente en vacío en la bomba de aceite usando un aparato de destilación de recorrido corto. El residuo resultante se purificó mediante cromatografía en columna, usando metanol al 10% en diclorometano como eluyente. El producto final se purificó adicionalmente por recristalización en metanol (4,69 g, 70%), p.f. 142ºC; (Encontrado: C, 59,35; H, 8,21; N, 25,17%. Calculado para C_{11}H_{18}N_{4}O: C, 59,45; H, 8,11; N, 25,23%) \delta_{H} (200 MHz, d_{6}-DMSO) 1,03-1,37 (5H, m, C_{6}H_{11}), 1,79-1,84 (6H, m, C_{6}H_{11}), 4,00 (2H, d, OCH_{2}. J = 6,3 Hz), 5,13 (1H, s, C(5)H), 5,96 (2H, s ancho, NH_{2}), 6,10 (2H, s ancho, NH_{2}); m/z (+EI) 222 (M^{+}, 29%) 139 (M^{+}-C_{6}H_{11}, 42), 126 (MH^{+}-C_{7}H_{13}, 100), 110 (MH^{+}-C_{7}H_{13}O, 28), 98 (82).
2,6-Diamino-4-ciclohexilmetoxi-5-nitrosopirimidina (NU 6027)
2,6-Diamino-4-ciclohexilmetoxipirimidina (0,28 g, 1,26 mmol) se disolvió en solución de ácido acético glacial caliente (30%, 10 ml). La solución se calentó a 80ºC y se añadió gota a gota, en el transcurso de 1 hora, solución de nitrito sódico (0,12 g, 1,72 mmol, en 5 ml de H_{2}O), hasta que se observó exceso del oxidante, indicado mediante papel de almidón-yoduro. La mezcla de reacción se dejó enfriar a temperatura ambiente y los cristales de color violeta se recogieron por filtración y se lavaron bien con agua. El compuesto del epígrafe se purificó por recristalización en etanol (0,26 g, 83%), p.f. 254ºC; (Encontrado: C, 52,73; H, 6,59; N, 27,56%. Calculado para C_{11}H_{17}N_{5}O_{2}: C, 52,59; H, 6,77; N, 27,89%); \delta_{H} (200 MHz, d_{6}-DMSO) 1,09-1,38 (5H, m, C_{6}H_{11}), 1,73-2,00 (6H, m, C_{6}H_{11}), 4,39 (2H, d, OCH_{2}, J = 6,3 Hz), 7,85 (2H, s ancho, NH_{2}), 8,08 (1H, s ancho, NH), 10,19 (1H, s ancho, NH); m/z (+EI) 251 (M^{+}, 25%), 155 (M^{+}-C_{7}H_{13}, 100), 138 (M^{+}-C_{7}H_{13}O, 72), 81 (9).
2,5,6-Triamino-4-ciclohexilmetiloxipirimidina (NU 6035)
A una suspensión agitada de 2,6-diamino-5-nitroso-4-ciclohexilmetoxipirimidina (0,10 g, 0,4 mmol) en agua (5 ml), a 50ºC, se añadió ditionito sódico (0,16 g, 0,92 mmol), en porciones, durante un período de 5 horas. La mezcla de reacción se dejó enfriar a temperatura ambiente y se agitó a temperatura ambiente durante la noche. Se ajusto el pH de la solución a 7 con solución acuosa de amoniaco (2 ml), y el precipitado fino de color amarillo que resultó se recogió por filtración y se lavó con agua. El producto se purificó por recristalización en agua (0,06 g, 60%), p.f. 154ºC; (Encontrado: C, 55,50; H, 7,95; N, 29,34%: Calculado para C_{11}H_{19}N_{5}O : C, 55,69; H, 8,02; N, 29,53%); \delta_{H} (200 MHz, d_{6}-DMSO) 1,02-1,39 (5H, m, C_{6}H_{11}), 1,71-1,89 (6H, m, C_{5}H_{11}), 3,22 (2H, s ancho, NH_{2}), 4,03 (2H, d, OCH_{2}, J = 6,53 Hz), 5,32 (2H, s ancho, NH_{2}), 5,71 (2H, s ancho, NH_{2}); m/z (+EI) 237 (M^{+}, 84%), 155 (M^{+}-C_{7}H_{13}, 100), 124 (MH^{+}-C_{7}H_{13}O, 15).
Tetrafluoroborato de 4-clorobencenodiazonio (para emplear como compuesto intermedio)
4-Cloroanilina (1,0 g, 7,87 mmol) se suspendió en HCl 6 M (4 ml) y la mezcla de reacción agitada se enfrió a 0ºC. Se añadió gota a gota en el transcurso de 5 minutos una solución de nitrito sódico (0,54 g, 7,87 mmol) en agua (1 ml), y la mezcla se agitó a 0ºC durante otros 20 minutos. Se añadió en una sola porción ácido fluorobórico (40%, 1,14 ml, 18,11 mmol) enfriado con hielo, y la mezcla se dejó calentar a temperatura ambiente durante 12 horas. Después de enfriar en un baño de hielo, el precipitado resultante se recogió por filtración y se lavó sucesivamente con agua, metanol y éter dietílico. El compuesto se purificó por precipitación desde acetona fría; \delta_{H} (200 MHz, d_{6}-DMSO) 8,24 (2H, dd, 8,810 (2H, dd).
2,6-Diamino-5-(4'-clorofenil)azo-4-ciclohexilmetoxipirimidina (NU6037)
A una solución agitada de tetrafluoroborato de 4-clorobencenodiazonio (0,09 g, 0,68 mmol) en el seno de DMF anhidra (5 ml), bajo N_{2}, a 0ºC, se añadió 2,6-diamino-4-ciclohexilmetoxipirimidina (0,15 g, 0,68 mmol), y la mezcla de reacción agitada se dejó calentar a temperatura ambiente durante 72 horas. Se separó el disolvente a presión reducida y el residuo se trituró con agua y se filtró. Se obtuvo el producto deseado después de recristalización en metanol (0,094 g, 39%); \delta_{H} (200 MHz, d_{6}-DMSO) 1,14-1,47 (5H, m, C_{6}H_{11}), 1,81-1,95 (6H, m, C_{6}H_{11}), 4,31 (2H, d, OCH_{2}, J = 6,04 Hz), 7,36 (2H, s ancho, NH_{2}), 7,62 (2H, d, Ar C(3) H y Ar (C)5, J = 8,7 Hz), 7,85 (2H, d, Ar C(2)H y Ar C (6)H J = 8,72 Hz), 8,04 (1H, s ancho, NH).
2,6-Diamino-4-benciloxipirimidina (NU6038)
Se añadió sodio (0,41 g, 17,8 mmol) a alcohol bencílico (15 ml) bajo atmósfera de nitrógeno y la mezcla se calentó a 150ºC durante 1,5 horas. Se añadió 2,6-diamino-4-cloropirimidina (2,16 g, 14,94 mmol) y la mezcla de reacción se agitó a 180ºC durante otras 2 horas. Los compuestos volátiles se separaron en vacío y el residuo resultante se sometió a cromatografía sobre sílice con diclorometano:metanol (9:1) como eluyente, obteniendo el producto del epígrafe en forma de un sólido blanco (1,98 g, 62%); \nu_{max}/cm^{-1} 3347 (NH), 1498 (C_{6}H_{5}), 1608 (C_{6}H_{5}); \delta_{H} (200 MHz, d_{6}-DMSO) 5,20 (1H, s, C(5)H), 5,32 (2H, s, OCH_{2}), 6,05 (2H, s ancho, NH_{2}), 6,17 (2H, s ancho, NH_{2}), 7,41-7,48 (5H, m, C_{6}H_{5}); m/z (+EI) 216 (M^{+}, 100%), 139 (M^{+}-C_{6}H_{5}, 33), 91 (94).
2,6-Diamino-4-benciloxi-5-nitrosopirimidina (NU6039)
2,6-Diamino-4-benciloxipirimidina (0,5 g, 2,3 mmol) se disolvió en ácido acético caliente (30%, 10 ml) y la mezcla de reacción se calentó a 80ºC. Se añadió gota a gota en el transcurso de 1 hora una solución de nitrito sódico (0,22 g, 3,19 mmol) en agua (5 ml), en que fue evidente un exceso de oxidante mediante papel de almidón-yoduro. La mezcla de reacción se dejó enfriar a temperatura ambiente y los cristales de color violeta que se depositaron se recogieron y se lavaron con agua (0,53 g, 98%), p.f. 209ºC (descompone); Encontrado: C, 55,32; H, 5,28; N, 26,47%. Calculado para C_{11}H_{11}N_{5}O_{2} 0,1 H_{2}O: C, 55,98; H, 4,75; N, 29,69%); \nu_{max}/cm^{-1} 3408 (NH), 2952 (CH_{2}), 1610 (C_{6}H_{5}), 1518 (NO); \delta_{H} (200 MHz. d_{6}-DMSO) 5,69 (2H, s, OCH_{2}), 7,44-7,68 (5H, m, C_{6}H_{5}), 8,0 (2H, d, NH_{2}), 8,17 (1H, s, NH) 10,19 (1H, s, NH); m/z (+EI) 245 (M^{+}, 25%), 91 (100), 65 (9).
2,5,6-Triamino-4-benciloxipirimidina (NU6040)
A una suspensión de 2,6-diamino-4-benciloxi-5-nitrosopirimidina (0,3 g, 1,28 mmol) en agua (10 ml), a 50ºC, se añadió ditionito sódico (0,48 g, 2,76 mmol), en porciones, durante el transcurso de 5 horas. La mezcla de reacción se agitó a temperatura ambiente durante la noche, se calentó de nuevo a 50ºC y se añadió una cantidad adicional de ditionito sódico (0,4 g).
Después de agitar durante otras 12 horas, la mezcla de reacción se enfrió a temperatura ambiente y la solución se ajustó a pH 7 con solución acuosa de amoniaco (0,2 ml). El sólido fino de color amarillo resultante que se depositó, se recogió, se lavó con agua y se recristalizó en agua caliente (0,11 g, 35%), p.f. 130-135ºC; \nu_{max}/cm^{-1} 3394 (NH_{2}), 3033 (C_{6}H_{5}); \delta_{H} (200 MHz, d_{6}-DMSO) 5,36 (2H, s OCH_{2}), 5,40 (2H, s, NH_{2}), 5,81 (2H, s, NH_{2}), 7,39-7,56 (5H, m,
C_{6}H_{5}).
2,6-Diamino-4-ciclohex-3-enilmetiloxipirimidina (NU6046)
A una solución agitada de sodio (0,4 g, 17,4 mmol) en alcohol 1,2,3,6-tetrahidrobencílico (20 ml, 0,17 mol), bajo nitrógeno, a 120ºC, se añadió 2,6-diamino-4-cloropirimidina (2 g, 13,84 mmol) y la mezcla de reacción se agitó otras 2 horas a 180ºC. Se separaron en vacío los disolventes y el producto crudo se purificó por cromatografía sobre sílice, empleando diclorometano:metanol (9:1) como eluyente. Por recristalización en acetato de etilo-éter de petróleo se obtuvo el compuesto del epígrafe en forma de un sólido amarillo (1,3 g, 43%), p.f. 89ºC; \delta_{H} (200 MHz, d_{6}-DMSO) 1,26-2,24 (7H, m, C_{6}H_{7}), 4,16 (2H, d, OCH_{2}, J = 6,56 Hz), 5,14 (1H, s, C(5) H), 5,76 (2H, s, C_{2}H_{2}), 5,96 (2H, s ancho, NH_{2}), 6,10 (2H, s ancho, NH_{2}); m/z (+EI) 220 (M^{+}, 27%), 125 (MH^{+}-C_{7}H_{11}, 97), 98 (25).
2,6-Diamino-4-ciclohex-3-enilmetiloxi-5-nitrosopirimidina (NU6045)
Una solución de 2,6-diamino-4-ciclohex-3-enilmetiloxipirimidina (0,5 g, 2,27 mmol) en solución de ácido acético al 30%, se calentó a 80ºC y se añadió gota a gota a lo largo de 1 hora solución de nitrito sódico (0,22 g 3,19 mmol) en 10 ml de H_{2}O) hasta que era evidente exceso de oxidante (papel de almidón-yoduro). La mezcla de reacción se enfrió a temperatura ambiente y los cristales de color violeta resultantes se recogieron, se lavaron a fondo con agua y se secaron (0,52 g, 92%), p.f. 237ºC; \delta_{H} (200 MHz, d_{6}-DMSO) 1,51-2,19 (7H, m, C_{6}H_{7}), 4,51 (2H, d, OCH_{2}, J = 5,66 Hz), 5,82 (2H, s ancho, C_{2}H_{2}), 7,95 (2H, s ancho, NH_{2}), 8,15 (1H, s ancho, NH), 10,21 (1H, s ancho, NH); m/z (+EI) 249 (M^{+}, 22%), 155 (M^{+}-C_{7}H_{11}, 60), 138 (M^{+}-C_{7}H_{11}O, 100), 69 (24).
2-Amino-4-cloro-6-metilaminopirimidina (NU6042) (para utilizar como compuesto intermedio)
Una mezcla de 2-amino-4,6-dicloropirimidina (1 g, 6,1 mmol), metilamina (0,8 ml), carbonato potásico (0,5 g, 3,62 mmol) y etanol anhidro (15 ml), se calentó a reflujo, bajo nitrógeno, durante 18 horas. La mezcla de reacción se enfrió a temperatura ambiente, se filtró y el filtrado se concentró hasta un volumen de aproximadamente 2 ml, en que se obtuvo un sólido de color crema (0,82 g, 85%), p.f. 152-157ºC; \nu_{max}/ cm^{-1} 3442 (NH), 2934 (CH_{3}), 2549 (NH_{2}); \delta_{H} (200 MHz, d_{6}-DMSO), 3,48 (3H, s, CH_{3}), 5,84 (1H, s, C(5)H), 6,53 (2H, s ancho, NH_{2}), 7,28 (1H, s ancho, NH); m/z (+EI) 158 (M^{+}, 100%), 123 (M^{+}-Cl, 9) 94 (18).
2-Amino-4-ciclohexilmetiloxi-6-metilaminopirimidina (NU6041)
Se añadió 2-amino-4-cloro-6-metilaminopirimidina (0,5 g, 2,25 mmol) a una solución agitada de sodio (0,062 g, 2,69 mmol) en el seno de ciclohexilmetanol (10 ml) bajo N_{2}, y la mezcla de reacción se calentó a 180ºC durante 12 horas. Los disolventes se separaron en vacío y el producto crudo se purificó por cromatografía sobre sílice, empleando diclorometano:metanol (9:1) como eluyente, obteniendo el compuesto del epígrafe en forma de un sólido blanco (0,03 g, 6%), p.f. 128-129ºC; \nu_{max}/cm^{-1} 3452 (NH), 2851 (NCH_{3}), 1583 (NH_{2}), 1514 (NH); \delta_{H} (200 MHz, d_{6}-DMSO) 1,04-1,31 (5H, m, C_{6}H_{11}), 2,78 (3H, d, NCH_{3}, J = 4,67 Hz), 4,02 (2H, d, OCH_{2}), 5,10 (1H, s, C(5)H), 6,00 (2H, s ancho, NH_{2}), 6,52 (1H, d ancho, NH, J = 4,22 Hz); m/z (+EI) 236 (M^{+}, 37%), 206 (MH^{+}-NHMe, 31), 153 (M^{+}-C_{6}H_{11}, 45), 140 (MH^{+}-C_{6}H_{11}CH_{2}O, 100).
2-Amino-6-bencilamino-4-cloropirimidina (para utilizar como compuesto intermedio)
Una mezcla de 2-amino-4,6-dicloropirimidina (0,5 g, 3,05 mmol), bencilamina (0,35 ml, 3,2 mmol), carbonato potásico (0,25 g, 1,81 mmol) y etanol (15 ml), se calentó a reflujo durante 16 horas. La mezcla de reacción se enfrió a temperatura ambiente y los disolventes se separaron a presión reducida. El residuo se trituró con acetato de etilo y el producto blanco se recogió por filtración. La concentración del filtrado de acetato de etilo proporcionó también una segunda cosecha de producto. Los sólidos reunidos se secaron obteniendo la pirimidina requerida (0,36 g, 50%), p.f. 136ºC; \delta_{H} (200 MHz, d_{6}-DMSO) 4,55 (2H, s ancho, OCH_{2}), 5,87 (1H, s ancho, C(5)H), 6,54 (2H, s ancho, NH_{2}), 7,35-7,41 (5H, m, C_{6}H_{5}), 7,72 (1H, m, NH); m/z (+EI) 234 (M^{+}, 85%), 106 (100), 91 (C_{6}H_{5}CH_{2}^{+}, 51%).
\newpage
2-Amino-6-bencilamino-4-ciclohexilmetiloxipirimidina
A una solución agitada de sodio (0,025 g, 1,09 mmol) en el seno de ciclohexilmetanol (5 ml, 43 mmol), bajo nitrógeno, a 100ºC, se añadió 2-amino-6-bencilamino-4-cloropirimidina (0,2 g, 0,86 mmol), y la mezcla se agitó a 180ºC durante 2 horas. Después de separar los disolventes, el residuo se redisolvió en metanol, se filtró y el filtrado se evaporó a sequedad. El producto crudo se purificó por cromatografía sobre sílice, empleando éter de petróleo:acetato de etilo (8:2) como eluyente, obteniendo el producto del epígrafe en forma de un sólido de color amarillo (0,13 g, 49%); \delta_{H} (200 MHz, d_{6}-DMSO) 0,96-1,15 (5H, m, C_{6}H_{11}), 1,23-1,34 (6H, m, C_{6}H_{11}), 4,03 (2H, s ancho, OCH_{2}), 4,51 (2H, d, C_{6}H_{5}CH_{2}, J = 5,31 Hz), 5,12 (1H, s, C(5)H), 6,56 (2H, s ancho, NH_{2}), 7,20 (1H, s ancho, NH), 7,28-7,39 (5H, m, C_{6}H_{5}); m/z (+EI) 312 (M^{+}, 100%), 229 (M^{+}-C_{6}H_{11}, 45), 216 (MH^{+}-C_{6}H_{11}CH_{2}, 53), 91 (72).
En general, hay varias rutas de que se dispone para sintetizar derivados de pirimidina según la invención, que poseen actividad de inhibición de CDK o que proporcionan intermedios para preparar tales compuestos que inhiben las CDK. A título de ejemplo algunos de los esquemas de síntesis que pueden usarse, que conducen en algunos casos a nuevas entidades químicas, se ilustran en la descripción que sigue de detalles experimentales de etapas típicas de varios esquemas de síntesis indicados en diagramas esquemáticos presentados al final de esta descripción.
Esquema 1
Este esquema ilustra la síntesis de 2-amino-4-ciclohexilmetoxi-6-di(4-metoxibencil)amino-5-pirimidina carbaldehído (NU6057) y la separación desde éste de o bien uno o ambos grupos bencilamino para dar 2-amino-4-ciclohexilmetoxi-6-(4-metoxibencil)amino-5-pirimidina carbaldehído (NU6056) ó bien 2,6-diamino-4-ciclohexilmetoxi-5-pirimidina carbaldehído (NU6055), respectivamente.
1.1 Preparación de 2-amino-4,6-dicloro-5-pirimidina carbaldehído
Oxicloruro de fósforo (21,6 ml, 0,236 mol) se enfrió en un baño de hielo (\sim5ºC) antes de la adición lenta de N,N-dimetilformamida seca (DMF, 7,0 ml) durante el transcurso de 15 minutos. No se formó precipitado como se ha indicado con anterioridad, y la mezcla de reacción se retiró del baño de hielo. Se añadió 2-amino-4,6-dihidroxipirimidina, de que se dispone en el comercio, (5,6 g, 0,044 mol), en pequeñas porciones, a lo largo de 30 minutos. La suspensión resultantes se calentó a 90ºC durante 1 hora, y luego a 105ºC durante otras 5 horas formándose una solución de color pardo rojizo que se enfrió a 4ºC durante la noche.
La destilación de 3-4 ml de oxicloruro de fósforo en exceso a presión atmosférica produjo una suspensión viscosa que se vertió en agua helada (100 ml). Se formó una sustancia gomosa que se disolvió a medida que la temperatura del agua iba aumentando hasta 20ºC. Se añadió gota a gota hidróxido amónico hasta que la solución alcanzó un pH 7, y se formó un precipitado que se recogió por filtración. El producto se recristalizó en acetato de etilo (5,15 g, 0,027 mol, 61%)
1.2 Preparación de di-(4-metoxibencil)amina
A una solución de 4-metoxibenzaldehído (3,0 g, 22 mmol) en etanol anhidro (40 ml) se añadió 4-metoxibencilamina (3,02 g, 22 mmol). La mezcla se calentó a reflujo y se continuó el calentamiento durante 1,5 horas antes de separar el disolvente a presión reducida. El análisis por TLC indicó que el producto y el aldehído de partida eluían conjuntamente en un R_{f} 0,8 (MeOH al 10%/DCM). No se intentó aislar la imina intermedia; en su lugar el producto se disolvió en metanol (10 ml), a cuya disolución se añadió lentamente hidróxido sódico (0,834 g, 22 mmol) con agitación. Se observó que la mezcla de reacción refluía sin calor adicional, y se agitó durante 1 hora. Por separación del disolvente se obtuvo un aceite de color amarillo pálido, que se purificó después por cromatografía en columna (EtOAc al 100%) obteniendo un aceite incoloro que solidificó por enfriamiento proporcionando
\hbox{un sólido blanco (5,31 g; 20,7 mmol; 94%).}
1.3 Preparación de 2-amino-4-cloro-6-di-(4-metoxibencil)amino-5-pirimidina carbaldehído
2-Amino-4,6-dicloro-5-pirimidina carbaldehído (0,50 g; 2,60 mmol) se agitó en el seno de DCM anhidro (5 ml). Se añadieron trietilamina (0,263 g; 2,60 mmol) y di(4-metoxibencil)amina (0,669 g; 2,60 mmol) y la mezcla de reacción se agitó a temperatura ambiente durante 1,25 horas, La mezcla de reacción se trató por adición de más DCM (50 ml) y extracción con solución saturada de cloruro sódico (3 x 50 ml). La capa orgánica se lavó con agua (50 ml), se secó (MgSO_{4}) y se evaporó, obteniéndose una espuma amarilla (0,957 g; 2,32 mmol; 89,2%).
En la fase siguiente (1.4) el sustituyente cloro en la posición 4 del anillo de pirimidina ha sido reemplazado por un grupo ciclohexilmetoxi. Se describen dos métodos alternativos (Método 1 y Método 2).
1.4 Preparación de 2-amino-4-ciclohexilmetoxi-6-di(4-metoxibencil)amino-5-pirimidina carbaldehído (NU6057)
Método 1
Ciclohexilmetanol (8 ml) se calentó con sodio (0,14 g; 6,06 mmol) a 90ºC durante 1 hora. Se añadió 2-amino-4-cloro-6-di(4-metoxibencil)amino-5-pirimidina carbaldehído (0,50 g; 1,212 mmol) y la mezcla se calentó a la misma temperatura durante 25 minutos. Se separó el exceso de ciclohexilmetanol mediante destilación de recorrido corto, a presión reducida, y el residuo se cargó sobre MgSO_{4}. El producto seco-MgSO_{4} se aplicó a una columna de sílice, eluyendo con EtOAc al 40%/ éter de petróleo (40:60). El producto eluyó junto con algo de ciclohexilmetanol que no había podido ser separado. Esta mezcla se hizo pasar a la siguiente etapa.
Método 2
Hidruro de sodio (3 eq; 0,087 g; 3,6 mmol), sulfóxido de dimetilo seco (3 ml) y ciclohexilmetanol (5,5 eq; 0,691 g; 6,1 mmol) fueron agitados bajo nitrógeno durante 30 minutos hasta que se hubo formado una solución transparente, Se añadió, con agitación, 2-amino-4-cloro-6-di(4-metoxibencil)amino-5-pirimidina carbaldehído (0,50 g; 1,12 mmol). La mezcla de reacción se calentó a 100ºC durante 2 horas antes de separar el disolvente por destilación de recorrido corto, en vacío. El residuo se aplicó a una columna de sílice eluyendo con EtOAc al 30%/éter de petróleo. El producto se aisló en forma de un sólido de color amarillo pálido (0,183 g; 0,37 mmol; 30,6%). p.f. 140-141ºC.
Seguidamente, o bien uno o los dos grupos bencilamino (que actúan como grupos protectores) se separan según se describe a continuación (1.5 y 1.6) formándose NU6056 ó NU6055.
1.5 Preparación de 2-amino-4-ciclohexilmetoxi-6-(4-metoxibencil)amino-5-pirimidina carbaldehído (NU6056)
La mezcla de 2-amino-4-ciclohexilmetoxi-6-di(4-metoxibencil)amino-5-pirimidina carbaldehído y ciclohexilmetanol obtenida anteriormente, se agitó en el seno de ácido trifluoroacético (2 ml) durante 18 horas. Se separó el exceso de ácido trifluoroacético y el residuo se extrajo con acetato de etilo y agua (50 ml de cada uno). Se añadió a la capa acuosa más acetato de etilo y los componentes orgánicos se reunieron, se secaron y se evaporaron. El aceite residual, de color pardo, se aplicó a una columna de sílice, eluyendo con EtOAc al 20%/éter de petróleo (40:60) Se obtuvo un aceite de color amarillo pálido. Por adición y separación de acetonitrilo se obtuvo un sólido que se recristalizó en una mezcla de éter de petróleo/acetato de etilo (0,091 g; 0,34 mmol). p.f. 97ºC.
1.6 Preparación de 2,6-diamino-4-ciclohexilmetoxi-5-pirimidina carbaldehído (NU6055)
La mezcla de 2-amino-4-ciclohexilmetoxi-6-di(4-metoxibencil)amino-5-pirimidina carbaldehído y ciclohexilmetanol obtenida anteriormente, se agitó en el seno de ácido trifluoroacético (2 ml) a 65ºC durante 24 horas. Se usó el mismo procedimiento operatorio que anteriormente, con purificación del producto mediante cromatografía en columna, eluyendo con EtOAc al 40%/éter de petróleo (40:60), obteniendo un
\hbox{sólido de color amarillo pálido. p.f.
159-160ºC.}
Esquema 2
Este esquema ilustra un procedimiento ligeramente diferente empleado para la síntesis de 2-amino-4-ciclohexilmetoxi-6-dibencilamino-5-pirimidina carbaldehido.
2.1 Preparación de 2-amino-4-cloro-6-dibencilamino-5-pirimidina carbaldehido
2-Amino-4,6-dicloro-5-pirimidina carbaldehído (0,15 g; 0,78 mmol) preparado según el Esquema 1, se agitó en el seno de diclorometano anhidro (3 ml) a 0ºC. Se añadieron gota a gota dibencilamina (1 eq; 0,78 mmol; 0,154 g) y trietilamina (1 eq; 0,78 mmol; 0,078 eq). Se dejó que la mezcla de reacción alcanzara la temperatura ambiente y se agitó durante la noche, al cabo de cuyo tiempo se había obtenido una solución transparente.
Se añadió más diclorometano (50 ml) y la solución se lavó con solución saturada de cloruro sódico y agua. La capa orgánica se secó y se evaporó quedando un sólido amarillo (0,253 g; 0,72 mmol; 92,3%). p.f. 138-142ºC.
2.2 Preparación de 2-amino-4-ciclohexilmetoxi-6-dibencilamino-5-pirimidina carbaldehido
Ciclohexilmetanol (10 ml) y sodio (5 eq; 0,163 g) se hicieron reaccionar a 90ºC durante 1 hora. Se añadió 2-amino-4-cloro-6-dibencilamino-5-pirimidina carbaldehido (0,5 g; 1,42 mmol) y se continuó calentando durante 90 minutos. Se separó el alcohol en exceso mediante destilación de recorrido corto, a presión reducida, y el producto se purificó posteriormente mediante cromatografía en columna. Se puso de manifiesto que el producto estaba contaminado con ciclohexilmetanol por visualización del alcohol con pulverización de ácido sulfúrico (2%).
Esquema 3
Este esquema ilustra una vía de síntesis de derivados de pirimidina que poseen grupos aralquilo o aralqueno en la posición 5.
3.1 2-Amino-4-cloro-6-dibencilamino-5-(1-hidroxifenetil)pirimidina
Método basado en el descrito en J. Org. Chem. 1958, 23, 1783-1784
2-Amino-4-cloro-6-dibencilamino-5-pirimidina carbaldehido (0,10 g; 0,28 mmol), preparado según el Esquema 2, se agitó en el seno de THF anhidro (10 ml) a 0ºC. Se añadió gota a gota cloruro de bencilmagnesio (1,0 M; 3 eq; 0,85 mmol; 0,85 ml), obteniendo una coloración amarilla que se disipó rápidamente. La mezcla de reacción se agitó durante 30 minutos antes de añadir solución saturada de cloruro amónico (50 ml) y acetato de etilo (50 ml). La capa acuosa se extrajo posteriormente con acetato de etilo y las capas orgánicas reunidas, se lavaron con agua, se secaron y se evaporaron. El producto se purificó por cromatografía en columna eluyendo con EtOAc al 40%/éter de petróleo (40:60) obteniendo un aceite de color amarillo pálido (0,086 g; 0,19 mmol; 68%).
3.2 Oxidación de 2-amino-4-cloro-6-deibencilamino-5-(1-hidroxietil)pirimidina para formar el correspondiente derivado de fenetileno en la posición 5
Cloruro de oxalilo (1,1 eq; 0,016 g; 0,12 mmol) se añadió a DCM seco (5 ml) en un matraz de 3 bocas provisto de embudo de adición, bajo nitrógeno. El matraz se enfrió en un baño de hielo seco-acetona a -75 -80ºC. Se añadió gota a gota, en el transcurso de 5 minutos, una solución de DMSO (2,2 eq; 0,25 mmol; 0,02 g) en el seno de DCM anhidro y se dejó agitar durante 10 minutos. Se añadió gota a gota, a lo largo de 5 minutos, una solución de 2-amino-4-cloro-6-dibencilamino-5-(1-hidroxietil)pirimidina (0,05 g; 0,11 mmol) en el seno de DCM anhidro y la mezcla de reacción se dejó durante 15 minutos. Se añadió gota a gota,a lo largo de 5 minutos, trietilamina (5 eq; 0,56 mmol; 0,057 g) y se retiró el baño de enfriamiento. A medida que la mezcla de reacción se calentaba a temperatura ambiente, se añadió agua (50 ml) y se separó la capa orgánica. La fase acuosa se lavó con más DCM (50 ml) y las fases orgánicas se reunieron, se secaron y se evaporaron. El producto obtenido se cargó en una columna de sílice, eluyendo con EtOAc al 30%/éter de petróleo (40:60). Esto proporcionó el producto en forma de un aceite de color amarillo (0,020 g; 0,05 mmol; 45%), con recuperación de algo del material de partida (0,01 g).
Para los dos productos anteriores, que son compuestos intermedios, el sustituyente cloro en la posición 4 del anillo de pirimidina pueden ser reemplazado por un grupo ciclohexilmetoxi, mediante los
\hbox{métodos descritos en el
Esquema 1.}
Esquema 4
Este esquema ilustra otros ejemplos de la síntesis de derivados de pirimidina que tienen sustituyentes dibencilamino en la posición 6 y grupos alquilo, alqueno, aralquilo o aralqueno sustituidos con hidroxi o ceto, en la posición 5
4.1 Preparación de 2-amino-4-cloro-6-di-(4-metoxibencil)amino-5-(1-hidroxi-fenetil)pirimidina (R=Ph)
2-Amino-4-cloro-6-di(4-metoxibencil)amino-5-pirimidina carbaldehído (0,20 g; 0,48 mmol), se agitó en el seno de THF amhidro (5 ml) a 0ºC. Se añadió gota a gota cloruro de bencilmagnesio (1,0 M; 3 eq; 1,45 mmol).
La mezcla se agitó durante 30 minutos antes de añadir solución saturada de cloruro amónico (50 ml) y acetato de etilo (50 ml). La capa acuosa se extrajo posteriormente con acetato de etilo y las capas orgánicas se reunieron, se lavaron con agua, se secaron y se evaporaron. El producto se purificó por cromatografía en columna eluyendo con EtOAc al 40%/éter de petróleo (40:60) obteniendo un aceite de color amarillo (0,151 g; 0,30 mmol; 62,4%).
4.2 Preparación de 2-amino-4-cloro-6-di-(4-metoxibencil)amino-5-(1-hidroxietil)pirimidina (R=H)
Se procede como anteriormente con 2-amino-4-cloro-6-di(4-metoxibencil)amino-5-pirimidina carbaldehído (0,20 g; 0,48 mmol) y bromuro de metilmagnesio 3,0 M (3 eq; 0,5 ml). El producto se obtuvo en forma de una sustancia vítrea incolora (0,159 g; 0,37 mmol; 77%).
4.3 Oxidación de 2-amino-4-cloro-6-di-(4-metoxibencil)amino-5-(1-hidroxietil)-pirimidina (R=H) para formar el correspondiente derivado de etenilo en la posición 5
Se añadió cloruro de oxalilo (1,1 eq; 0,039 g; 0,31 mmol) a DCM seco (5 ml) en un matraz de tres bocas provisto de embudo de adición, bajo nitrógeno. El matraz se enfrió en un baño de hielo seco-cloroformo a -60ºC. Se añadió una solución de DMSO (2,2 eq; 0,62 mmol; 0,048 g) en el seno de DCM seco, gota a gota, durante el transcurso de 5 minutos, y se continuó agitando durante 10 minutos. Se añadió gota a gota, durante 5 minutos, una solución de 2-amino-4-cloro-6-di-(4-metoxibencil)amino-5-(1-hidroxietil)pirimidina (0,12 g; 0,28 mmol) en el seno de DCM seco (5 ml) y la mezcla de reacción se dejó estar durante 25 minutos. Se añadió gota a gota a lo largo de 5 minutos trietilamina (5 eq; 1,4 mmol; 0,141 g) y se retiró el baño de enfriamiento. La mezcla de reacción se dejó calentar a temperatura ambiente durante 40 minutos, antes de añadir agua (50 ml) y separar la capa orgánica. La fase acuosa se lavó con más DCM (50 ml) y las capas orgánicas se reunieron, se secaron y se evaporaron. El producto obtenido se cargó en una columna de sílice, eluyendo con EtOAc al 40%/éter de petróleo (40:60). Esto proporcionó un aceite amarillo (0,031 g; 0,08 mmol; 24,5%).
De nuevo, el sustituyente cloro en la posición 4 del anillo de pirimidina puede ser reemplazado por un grupo ciclohexilmetoxi utilizando los métodos descritos en el Esquema 1, obteniendo compuestos de inhibición de CDK según la invención.
Sumario breve
La presente invención debe ser considerada en su totalidad, como comprendiendo todas y cada una de las nuevas características o combinación de características descritas en esta memoria, pero los aspectos principales de la invención comprenden, ampliamente, principal aun cuando no exclusivamente, los siguientes:
(i)
Nuevos compuestos de fórmula (I) como se ha definido en esta memoria;
(ii)
Compuestos de fórmula (I) con sustituyentes tales como los definidos en esta memoria (incluyendo formas de pro-fármacos y sus sales) para tratamiento terapéutico o para usar en medicina y en la fabricación de preparaciones medicinales, útiles, por ejemplo, como inhibidores de CDKs, para el tratamiento del cáncer u otros trastornos de proliferación celular
(iii)
Procedimientos de preparación de nuevos compuestos de fórmula (I) según se define en esta memoria, incluyendo cualesquiera nuevos compuestos intermedios producidos al poner en práctica tales procedimientos;
(iv)
Composiciones o formulaciones farmacéuticas que comprenden un compuesto de fórmula (I) según se define en esta memoria, junto en ellas con un excipiente farmacéuticamente aceptable; y
(v)
Procedimientos de preparación de una formulación farmacéutica, según se define en el apartado (iv) anterior, por ejemplo mediante métodos a que se hace referencia en esta memoria.
Esquema 1
4
Esquema 2
5
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Esquema 3
6
Esquema 4
7
TABLA 1
8
TABLA 1 (continuación)
9

Claims (22)

1. Uso de un compuesto de pirimidina que tiene la fórmula estructural general I
11
o una de sus sales y/o forma de profármaco farmacéuticamente aceptables, para fabricar un medicamento para el tratamiento de tumores u otros trastornos de proliferación celular susceptibles a la inhibición de una o más enzimas CDK en mamíferos, en el que dicho compuesto de pirimidina proporciona un agente antitumoral o un inhibidor de la proliferación celular, activo, independiente, eficaz, y se caracteriza porque en la fórmula estructural I
X
es O, S o CHR_{x}
\quad
en cuya fórmula R_{x} es H o alquilo de C_{1-4};
D
es H o NZ_{1}Z_{2}
\quad
siendo Z_{1} y Z_{2}, cada uno independientemente, H, alquilo de C_{1-4}, hidroxialquilo de C_{1-4}, arilo opcionalmente sustituido o aralquilo opcionalmente sustituido;
A
se selecciona entre H, alquilo de C_{1-4}, alcoxi de C_{1-4}, hidroxi, CH_{2}(CH_{2})_{n} OH (n=1-4), y NR_{a1}R_{a2}, en cuya fórmula R_{a1} y R_{a2} son, cada uno independientemente H o alquilo de C_{1-4};
Y
es un anillo carbocíclico o heterocíclico de 4 a 8 miembros, opcionalmente sustituido;
D'
es H o NZ_{3}Z_{4}
\quad
siendo Z_{3} y Z_{4}, cada uno independientemente, H, alquilo de C_{1-4}, hidroxialquilo de C_{1-4}, arilo opcionalmente sustituido o aralquilo opcionalmente sustituido;
E
se selecciona entre H, NO, NO_{2}, N=N-Ar, en cuya fórmula Ar es un grupo arilo opcionalmente sustituido o aralquilo opcionalmente sustituido, NR_{e1}R_{e2} o NR_{e1}NR_{e2}R_{e3} (siendo R_{e1}, R_{e2} y R_{e3}, cada uno independientemente, H, alquilo de C_{1-4}, hidroxialquilo de C_{1-4}, un grupo arilo opcionalmente sustituido o un grupo aralquilo opcionalmente sustituido, C(R_{e})=U (siendo R_{e} hidrógeno, alquilo de C_{1-4} o alquilo sustituido, o un grupo arilo o aralquilo sin sustituir o sustituido, y estando U seleccionado entre O, NR_{e}', NOR_{e}' y N-NR_{e}'R_{e}'', (en cuya fórmula R_{e}' y R_{e}'' son, cada uno independientemente, H, alquilo de C_{1-4} o CONH_{2}). T, CH_{2}T, CHT_{2} y CT_{3}, en donde T es un haluro, I, Br, Cl ó F.
2. El uso según la reivindicación 1, de un compuesto de pirimidina como se define en ella, en el que Y comprende una estructura cíclica que incluye sustituyentes hidroxilados polares.
3. El uso según la reivindicación 1, de un compuesto de pirimidina como se define en ella, en el que Y es un anillo de cicloalcano o cicloalqueno.
4. El uso según la reivindicación 3, de un compuesto de pirimidina como se define en ella, en el que Y es un anillo de cicloalcano o cicloalqueno de 5 ó 6 miembros, que tiene uno o dos dobles enlaces.
5. El uso según la reivindicación 4, de un compuesto de pirimidina como se define en ella, excepto que uno o dos de los átomos de carbono del anillo de cicloalcano o cicloalqueno han sido reemplazados por heteroátomos o heterogrupos.
6. El uso según la reivindicación 5, de un compuesto de pirimidina como se define en ella, en el que dichos heteroátomos o heterogrupos están seleccionados entre O, S, NR’ (siendo R’ H o alquilo de C_{1-4}) y (en un anillo de cicloalqueno) -N=.
7. El uso según la reivindicación 1, de un compuesto de pirimidina como se define en ella, en el que Y es un anillo carbocíclico o heterocíclico de 4 a 8 miembros, sustituido, en el que el sustituyente o todos los sustituyentes están seleccionados entre H, alquilo de C_{1-4}, OH, alcoxi de C_{1-4}, halógeno, CF_{3}, CN, N_{3} y NR_{y1}R_{y2}, en cuya fórmula R_{y1} y R_{y2} son, cada uno independientemente, H o alquilo de C_{1-4}.
8. El uso según la reivindicación 7, de un compuesto de pirimidina como se define en ella, en el que dos de dichos sustituyentes están situados en átomos adyacentes del anillo y se unen formando una estructura cíclica fusionada adicional, carbocíclica o heterocíclica.
9. El uso según la reivindicación 1, de un compuesto de pirimidina como se define en ella, en el que Y comprende una estructura cíclica representada mediante una de las fórmulas estructurales que siguen:
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12
\vskip1.000000\baselineskip
en cuyas fórmulas V y W se seleccionan, cada uno independientemente, entre O, S, NR' (siendo R' H o alquilo de C_{1-4}), y CH_{2} ó =CH-; y
R_{1} y R_{2} son, cada uno, H o alquilo de C_{1-4}.
10. El uso según la reivindicación 1, de un compuesto de pirimidina como se define en ella, en el que D es un grupo amino sin sustituir y X es oxígeno.
11. El uso según la reivindicación 1, de un compuesto de pirimidina como se define en cualquiera de las reivindicaciones anteriores, en el que cada uno de los grupos alquilo presentes, o bien tal cual o bien como un resto de un grupo alcoxi o de otro grupo, contiene 1-6 átomos de carbono.
12. El uso según la reivindicación 1, de un compuesto de pirimidina, que es uno de los siguientes:
2,6-Diamino-4-ciclohexilmetoxi-5-nitrosopirimidina,
2,5,6-Triamino-4-ciclohexilmetiloxipirimidina
2,6-Diamino-5-(4'-clorofenil)azo-4-ciclohexilmetoxipirimidina.
2,6-Diamino-4-benciloxi-5-nitrosopirimidina.
2,6-Diamino-4-ciclohex-3-enilmetiloxipirimidina;
2,6-Diamino-4-ciclohex-3-enilmetiloxi-5-nitrosopirimidina.
2-Amino-4.ciclohexilmetiloxi-6-metilaminopirimidina.
2-Amino-6-bencilamino-4-ciclohexilmetiloxipirimidina.
y
2,6-diamino-4-ciclohexilmetiloxipirimidina-5-carbaldehído.
\newpage
13. Un compuesto de pirimidina que tiene la fórmula estructural general I
13
o una de sus sales y/o forma de profármaco, farmacéuticamente aceptables, para usar como agente terapéutico activo para preparar una composición farmacéutica para inhibir la proliferación de células tumorales, caracterizado porque en la fórmula estructural I
X
es O, S o CHR_{x}
\quad
en cuya fórmula R_{x} es H o alquilo de C_{1-4};
D
es H o NZ_{1}Z_{2}
\quad
siendo Z_{1} y Z_{2}, cada uno independientemente, H, alquilo de C_{1-4}, hidroxialquilo de C_{1-4}, arilo opcionalmente sustituido o aralquilo opcionalmente sustituido;
A
se selecciona entre H, alquilo de C_{1-4}, alcoxi de C_{1-4}, hidroxi, CH_{2}(CH_{2})_{n} OH (n=1-4), y NR_{a1}R_{a2}, en cuya fórmula R_{a1} y R_{a2} son, cada uno independientemente H o alquilo de C_{1-4};
E
se selecciona entre NO, NO_{2}, N=N-Ar, en cuya fórmula Ar es un grupo arilo opcionalmente sustituido o aralquilo opcionalmente sustituido, NR_{e1}R_{e2} o NR_{e1}NR_{e2}R_{e3} (siendo R_{e1}, R_{e2} y R_{e3}, cada uno independientemente, H, alquilo de C_{1-4}, hidroxialquilo de C_{1-4}, un grupo arilo opcionalmente sustituido o un grupo aralquilo opcionalmente sustituido, C(R_{e})=U (siendo R_{e} hidrógeno, alquilo de C_{1-4} o alquilo sustituido, o un grupo arilo o aralquilo sin sustituir o sustituido, y estando U seleccionado entre O, NR_{e}', NOR_{e}' y N-NR_{e}'R_{e}'', (en cuyas fórmulas R_{e}' y R_{e}'' son, cada uno independientemente, H, alquilo de C_{1-4} o CONH_{2}), T, CH_{2}T, CHT_{2} y CT_{3}, siendo T un haluro, I, Br, Cl ó F:
Y
es un anillo de 5 ó 6 miembros, cicloalcano o cicloalqueno, opcionalmente sustituido, que tiene uno o dos dobles enlaces; y
D'
es H o NZ_{3}Z_{4}
\quad
siendo Z_{3} y Z_{4}, cada uno independientemente, H, alquilo de C_{1-4}, hidroxialquilo de C_{1-4}, arilo opcionalmente sustituido o aralquilo opcionalmente sustituido.
14. Un compuesto según la reivindicación 13, para usar como agente terapéutico activo para preparar una composición terapéutica para inhibir la proliferación de células tumorales, en el que el grupo alquilo o todos los grupos alquilo presentes, o bien tal cual o bien como un resto de un grupo alcoxi o de otro grupo, contiene 1-6 átomos de carbono.
15. Un compuesto según la reivindicación 13 ó 14, para usar como agente terapéutico activo para preparar una composición farmacéutica para inhibir la proliferación de células tumorales, en el que Y es un anillo de 5 ó 6 miembros, cicloalcano o cicloalqueno, que tiene uno o dos dobles enlaces sustituido con sustituyentes hidroxilados polares.
16. Un compuesto según la reivindicación 13 ó 14, para usar como agente terapéutico activo para preparar una composición farmacéutica para inhibir la proliferación de células tumorales, en el que Y es un anillo de 5 ó 6 miembros, cicloalcano o cicloalqueno, sustituido, que tiene uno o dos dobles enlaces, en el que el sustituyente o cada uno de los sustituyentes está seleccionado entre H, alquilo de C_{1-4}, OH, alcoxi de C_{1-4}, halógeno, CF_{3}, CN, N_{3} y NR_{y1}R_{y2}, siendo R_{y1} y R_{y2}, cada uno independientemente, H o alquilo de C_{1-4}.
17. Un compuesto según la reivindicación 16, en el que dos de dichos sustituyentes están situados sobre átomos adyacentes del anillo y se unen formando una estructura cíclica fusionada, adicional, carbocíclica o heterocíclica.
18. Un compuesto según la reivindicación 13 ó 14, para usar como agente terapéutico activo para preparar una composición farmacéutica para inhibir la proliferación de células tumorales, en el que D es un grupo amino sin sustituir y X es oxígeno.
19. Un compuesto de pirimidina para usar en una composición farmacéutica para proporcionar un agente terapéutico activo para preparar una composición farmacéutica para inhibir la proliferación de células tumorales, caracterizado porque es uno de los siguientes:
2,6-Diamino-4-ciclohexilmetoxi-5-nitrosopirimidina,
2,5,6-Triamino-4-ciclohexilmetiloxipirimidina
2,6-Diamino-5-(4'-clorofenil)azo-4-ciclohexilmetoxipirimidina.
2,6-Diamino-4-benciloxi-5-nitrosopirimidina.
2,6-Diamino-4-ciclohex-3-enilmetiloxipirimidina;
2,6-Diamino-4-ciclohex-3-enilmetiloxi-5-nitrosopirimidina.
2-Amino-4.ciclohexilmetiloxi-6-metilaminopirimidina.
2-Amino-6-bencilamino-4-ciclohexilmetiloxipirimidina.
y
2,6-diamino-4-ciclohexil-metiloxipirimidina-5-carbaldehído.
20. Una formulación o composición farmacéutica que consiste esencialmente en una cantidad eficaz, que inhibe la proliferación de células tumorales, de un compuesto según una cualquiera de las reivindicaciones 13 a 24, preparada en una forma unitaria de dosificación junto con un excipiente farmacéuticamente aceptable, para administrar a un mamífero necesitado de tratamiento antitumoral.
21. Una composición farmacéutica para el tratamiento de tumores u otros trastornos de proliferación celular de los mamíferos, en la que el ingrediente terapéutico activo de dicha composición comprende una cantidad antitumoral eficaz y que inhibe las CDKs, de un compuesto de pirimidina que tiene la fórmula estructural I que sigue:
14
o una de sales y/o forma de profármaco, farmacéuticamente aceptables, de dicho compuesto de pirimidina, que se caracteriza porque en la fórmula estructural I
X
es O, S o CHR_{x}
\quad
en cuya fórmula R_{x} es H o alquilo de C_{1-4};
D
es H o NZ_{1}Z_{2} siendo Z_{1} y Z_{2}, cada uno independientemente, H, alquilo de C_{1-4}, hidroxialquilo de C_{1-4}, arilo opcionalmente sustituido o aralquilo opcionalmente sustituido;
A
se selecciona entre H, alquilo de C_{1-4}, alcoxi de C_{1-4}, hidroxi, CH_{2}(CH_{2})_{n}OH (n=1-4), y NR_{a1}R_{a2}, en cuya fórmula R_{a1} y R_{a2} son, cada uno independientemente, H o alquilo de C_{1-4};
Y
es o incluye un anillo carbocíclico o heterocíclico de 4 a 8 miembros, opcionalmente sustituido;
D'
es H o NZ_{3}Z_{4}
\quad
en cuya fórmula Z_{3} y Z_{4} son, cada uno independientemente, H, alquilo de C_{1-4}, hidoxialquilo de C_{1-4}, arilo opcionalmente sustituido o aralquilo opcionalmente sustituido;
E
se selecciona entre NO, NO_{2}, N=N-Ar, en cuya fórmula Ar es un grupo arilo opcionalmente sustituido o aralquilo opcionalmente sustituido, NR_{e1}R_{e2} ó NR_{e1}NR_{e2}R_{e3} (siendo R_{e1}, R_{e2} y R_{e3}, cada uno independientemente, H, alquilo de C_{1-4}, hidroxialquilo de C_{1-4}, un grupo arilo opcionalmente sustituido o aralquilo opcionalmente sustituido, C(R_{e})=U (siendo R_{e} hidrógeno, alquilo de C_{1-4} o alquilo sustituido, o un grupo arilo o aralquilo sin sustituir o sustituido, y estando seleccionado U entre O, NR_{e}', NOR_{e}' y N-NR_{e}'R_{e}'', (en cuyas fórmulas R_{e}' y R_{e}'' son, cada uno independientemente, H, alquilo de C_{1-4} ó CONH_{2}), T, CH_{2}T, CHT_{2} y CT_{3}, siendo T un haluro, I, Br, Cl o F, estando mezclado dicho ingrediente activo con al menos otro ingrediente que proporciona un aditivo, vehículo, diluyente o excipiente compatible, farmacéuticamente aceptable.
22. Un método de fabricación de una composición farmacéutica para usar para el tratamiento de tumores u otros trastornos de proliferación celular de los mamíferos, cuyo método comprende mezclar una cantidad eficaz antitumoral y que inhibe las CDKs, de un compuesto de pirimidina según una cualquiera de las reivindicaciones anteriores, o una de sus formas de profármaco, con un aditivo, vehículo, diluyente o excipiente compatible, farmacéuticamente aceptable.
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