ES2243990T3 - Composicion de interferon hibrido y procedimiento de uso. - Google Patents
Composicion de interferon hibrido y procedimiento de uso.Info
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Abstract
LA PRESENTE INVENCION DESCRIBE POLIPEPTIDOS HIBRIDOS DE FUSION DEL INTERFERON, FORMADOS POR UN PRIMER SEGMENTO QUE CONTIENE LA SECUENCIA DE AMINOACIDOS N - TERMINAL DE UN POLIPEPTIDO INTERFERON - TAU, Y UN SEGUNDO SEGMENTO QUE CONTIENE LA SECUENCIA DE AMINOACIDOS C - TERMINAL DE UN POLIPEPTIDO TIPO I DE INTERFERON NO - TAU. LOS DOS SEGMENTOS SE UNEN EN LA REGION DE UN POLIPEPTIDO DE INTERFERON MADURO ENTRE LOS RESIDUOS 8 Y 37 APROXIMADAMENTE. TAMBIEN SE DESCRIBEN SECUENCIAS DE ACIDO NUCLEICO QUE CODIFICAN DICHOS POLIPEPTIDOS DE FUSION DEL INTERFERON, VECTORES DE EXPRESION QUE CONTIENEN TALES SECUENCIAS Y APLICACIONES TERAPEUTICAS DE LOS POLIPEPTIDOS DE FUSION DEL INTERFERON. LAS APLICACIONES TERAPEUTICAS INCLUYEN APLICACIONES DE PROLIFERACION ANTIVIRAL Y ANTICELULAR. UNA VENTAJA DE LOS POLIPEPTIDOS DE FUSION DEL INTERFERON DE LA PRESENTE INVENCION ES QUE CARECEN DE EFECTOS SECUNDARIOS CITOTOXICOS CUANDO SE UTILIZAN PARA TRATAR CELULAS.
Description
Composiciones de interferón híbrido y
procedimientos de uso.
La presente invención se refiere a un polipéptido
de fusión de interferón híbrido constituido por una región o
regiones derivadas a partir de interferón-\tau y
una región o regiones derivadas a partir de otro interferón.
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Las membranas de embrión o trofectodermo de
diversos mamíferos producen señales bioquímicas que permiten el
establecimiento y mantenimiento de la gestación (Bazer, y col.,
1983). Una de estas proteínas, la proteína de trofoblasto ovina
(oTP-1), se identificó como una proteína de bajo
peso molecular secretada por embriones de oveja entre los días 10 y
12 de gestación (Wilson, y col., 1979; Bazer, y col., 1986). Se
demostró que la proteína oTP-1 inhibía la secreción
uterina de prostaglandina F_{2}-alfa que hace que
el cuerpo lúteo en el ovario sufra la desaparición fisiológica y
endocrinológica en ovejas sin preñar (Bazer, y col., 1986). Por
consiguiente, oTP-1 tiene actividad biológica
antiluteolítica. Se asumió que la principal función de
oTP-1 estaba asociada con el establecimiento de la
gestación.
Se encontró posteriormente que
oTP-1 (i) muestra una homología limitada
(50-70%) con los interferones alfa (IFN\alpha) de
diversas especies (Imakawa, y col., 1987), y (ii) se une a un
receptor de interferón de tipo I (Stewart, y col., 1987). A pesar de
algunas semejanzas con el IFN\alpha, oTP-1 tiene
varias características que la distinguen del IFN\alpha incluyendo
las siguientes: la función de oTP-1 en la bioquímica
de la reproducción (no se sabe que otros interferones tengan ninguna
función en la regulación bioquímica del ciclo reproductivo), la
fuente celular de oTP-1, células de trofoblasto (el
IFN\alpha deriva de linfocitos), el tamaño de
oTP-1, 172 aminoácidos (típicamente el IFN\alpha
tiene aproximadamente 165-166 aminoácidos) y
oTP-1 es débilmente inducible por virus (IFN\alpha
es altamente inducible por virus). La Sociedad Internacional de
Interferón reconoce a oTP-1 como perteneciente a una
nueva clase completamente nueva de interferones que se ha denominado
interferón tau (IFN\tau). La letra griega \tau significa
trofoblasto.
Los interferones se han clasificado dentro de dos
grupos distintos: interferones de tipo I, que incluye IFN\alpha,
IFN\beta e IFN\omega (también conocido como IFN\alphaII); e
interferones de tipo II, representado por IFN\gamma (revisado por
DeMaeyer, y col., 1988). En humanos se estima que hay al menos 17
genes no alélicos de IFN\alpha, al menos aproximadamente 2 ó 3
genes no alélicos de IFN\beta y un único gen de IFN\gamma.
Se ha demostrado que los IFN\alpha inhiben la
proliferación de diversos tipos celulares. Los IFN\alpha son
especialmente útiles contra tumores malignos hematológicos tal como
leucemia por tricoleucitos (Quesada, y col., 1984). Se ha demostrado
además que estas proteínas tienen también actividad contra mieloma
múltiple, leucemia linfocítica crónica, linfoma de bajo grado,
sarcoma de Kaposi, leucemia mielógena crónica, carcinoma de células
renales, tumores de vejiga urinaria y cánceres de ovario (Bonnem, y
col., 1984; Oldham, 1985). Se ha investigado también la función de
los interferones y receptores de interferón en la patogénesis de
ciertas enfermedades autoinmunes e inflamatorias (Benoit, y col.,
1993).
Los IFN\alpha son también útiles contra
diversos tipos de infecciones víricas (Finter, y col., 1991). Los
interferones alfa han mostrado actividad contra la infección por
papilomavirus humano e infecciones por hepatitis B y hepatitis C
(Finter, y col., 1991; Kashima, y col., 1988; Dusheiko, y col.,
1986; Davis, y col., 1989).
De modo significativo, sin embargo, la utilidad
de los IFN\alpha se ha visto limitada por su toxicidad: el uso de
interferones en el tratamiento del cáncer y enfermedades víricas ha
tenido como resultado serios efectos secundarios, tales como fiebre,
escalofríos, anorexia, pérdida de peso y fatiga (Pontzer, y col.,
1991; Oldham, 1985). Estos efectos secundarios a menudo requieren
(i) reducir la dosificación de interferón a niveles que están en el
límite de eficacia del tratamiento, o (ii) la retirada al paciente
del tratamiento. Esta toxicidad ha reducido la utilidad de estas
potentes proteínas antivíricas y antiproliferativas en el
tratamiento de enfermedades debilitantes humanas y animales.
En un aspecto, la invención incluye una molécula
de ácido nucleico quimérica que codifica un polipéptido de fusión de
interferón híbrido. La molécula está formada por un segmento
terminal 5' que codifica la secuencia de aminoácidos
N-terminal de un polipéptido de interferón tau y un
segmento terminal 3' que codifica la secuencia de aminoácidos
C-terminal de un polipéptido de interferón de tipo I
no tau. Los dos segmentos se ayustan en una región que corresponde
con la porción en el resto 28 de un polipéptido de interferón
maduro. Ejemplos de polipéptidos de interferones de tipo I no tau
incluyen interferón alfa e interferón beta. En una realización, el
segmento terminal 5' además incluye una secuencia líder.
El segmento terminal 3' puede codificar, en
diversas realizaciones, una secuencia de aminoácidos derivada de un
interferón alfa 1, alfa 2, beta u omega. El segmento terminal 3'
también puede codificar una secuencia consenso de cualquiera de los
anteriores o una secuencia internamente consistente. Las
realizaciones preferidas son aquellas donde la secuencia deriva de
una fuente humana, tal como un IFN\alpha humano o un IFN\beta
humano.
En otras realizaciones generales, el polipéptido
de interferón tau puede ser un polipéptido de interferón tau de
humano o rumiante (por ejemplo, ovino), y el polipéptido de
interferón de tipo I no tau puede así mismo ser un polipéptido de
interferón de tipo I humano o no humano. En una realización
preferida, el polipéptido de interferón tau es un polipéptido de
interferón tau ovino, y el polipéptido de interferón de tipo I no
tau es un polipéptido de tipo I humano.
Un ejemplo de molécula quimérica de ácido
nucleico de la presente invención es la ID. SEC. Nº: 54, con un
segmento terminal 5' que codifica los aminoácidos
1-28 del IFNtau humano (de ID. SEC. Nº: 3) y un
segmento terminal 3' que codifica los aminoácidos
29-166 del IFN\alpha humano (clon pIFN105; Genbank
HUMIFNN Nº Acc. M28585).
Cualquiera de las moléculas quiméricas de ácido
nucleico descritas anteriormente puede además incluir una secuencia
líder.
En un aspecto relacionado, la invención incluye
un polipéptido de fusión de interferón híbrido formado por un primer
segmento que contiene la secuencia de aminoácidos
N-terminal de un polipéptido de interferón tau y un
segundo segmento que contiene la secuencia de aminoácidos
C-terminal de un polipéptido de interferón de tipo I
no tau. Los dos segmentos se unen en la región del resto 28 de un
polipéptido de interferón maduro. Las realizaciones específicas son
como se ha descrito anteriormente para las moléculas de ácido
quiméricas. Interferón-\alpha e
interferón-\beta son ejemplos de estos
interferones de tipo I no tau. Estas fusiones de híbrido pueden
usarse para reducir la toxicidad de los interferones de tipo I no
tau cuando los interferones se usan en formulaciones farmacéuticas o
en aplicaciones terapéuticas.
El primer segmento puede tener, en diversas
realizaciones, una secuencia de aminoácidos contenida en una
secuencia seleccionada entre el grupo formado por ID. SEC. Nº: 5,
ID. SEC. Nº: 15, ID. SEC. Nº: 45, ID. SEC. Nº: 46, ID. SEC. Nº: 47,
ID. SEC. Nº: 48, ID. SEC. Nº: 49, ID. SEC. Nº: 50, ID. SEC. Nº: 51,
ID. SEC. Nº: 52 y ID. SEC. Nº: 53. Realizaciones preferidas son
aquellas donde la secuencia corresponde a un interferón tau humano,
tal como la ID. SEC. Nº: 15 o ID. SEC. Nº: 35.
En otro aspecto, la presente invención incluye un
vector de expresión que tiene un ácido nucleico que contiene un
marco de lectura abierto (ORF) que codifica un polipéptido de fusión
de interferón híbrido, que incluye las secuencias de ácido nucleico
y polipéptido descritas anteriormente. El vector además incluye
secuencias reguladoras eficaces para expresar el marco de lectura
abierto en una célula hospedadora: tales secuencias pueden ser
endógenas (tales como las secuencias líder de IFN de origen natural)
o heterólogas (tales como una señal secretora reconocida por
levaduras, células de mamífero, células de insecto, cultivos
tisulares o sistemas de expresión bacteriana). En el vector de
expresión, las secuencias reguladoras pueden también incluir en 5'
de dicha secuencia de ácido nucleico, una región promotora y un
codon de inicio ATG en marco con el polipéptido de fusión de
interferón híbrido que codifica la secuencia (molécula de ácido
nucleico quimérica) y en 3' de dicha secuencia codificadora, una
señal de terminación de la traducción seguida de una señal de
terminación de la transcripción. Adicionalmente, la invención
incluye un procedimiento para producir de forma recombinante un
polipéptido de fusión de interferón híbrido usando los vectores de
expresión de la presente invención. Los vectores de expresión se
introducen en células hospedadoras adecuadas. Entonces, las células
hospedadoras se cultivan en condiciones que dan lugar a la expresión
de la secuencia ORF.
En una realización adicional, la invención
incluye un procedimiento para producir de forma recombinante un
polipéptido de fusión de interferón híbrido. En el procedimiento, el
vector de expresión, que contiene secuencias que codifican el marco
de lectura abierto (ORF) de un polipéptido de fusión de interferón
híbrido, se introduce en células hospedadoras adecuadas, donde el
vector se diseña para expresar el ORF en las células hospedadoras.
Las células hospedadoras transformadas son entonces cultivadas en
condiciones que tienen como resultado la expresión de la secuencia
de ORF. Numerosos vectores y sus correspondientes hospedadores son
útiles en la práctica de este procedimiento de la invención,
incluyendo, el vector de fago lambda gt11 y células de E.
coli. Otras células hospedadoras incluyen, levaduras, células de
mamífero, células de insecto, cultivos tisulares, cultivo de células
vegetales, plantas transgénicas o sistemas de expresión
bacterianos.
La invención además incluye una composición
farmacéutica para inhibir el crecimiento de células tumorales por
medio del cual las células tumorales se ponen en contacto con un
polipéptido de fusión de interferón híbrido a una concentración
eficaz para inhibir el crecimiento de las células tumorales. El
polipéptido de fusión de interferón híbrido puede ser parte de
cualquier formulación farmacológica aceptable. Las células tumorales
cuyo crecimiento se puede inhibir por un polipéptido de fusión de
interferón híbrido incluyen, aunque sin limitación, células de
carcinoma, células de cáncer hematopoyético, células de leucemia,
células de linfoma y células de melanoma. En una realización, las
células tumorales son células tumorales sensibles a esteroides, por
ejemplo, células de tumor mamario.
Aún en otro aspecto de la presente invención, los
polipéptidos de fusión de interferón híbrido se usan para inhibir la
replicación vírica por medio del cual las células infectadas con un
virus se ponen en contacto con el polipéptido de fusión de
interferón híbrido a una concentración eficaz para inhibir la
replicación vírica en dichas células. El polipéptido de fusión de
interferón híbrido puede ser parte de cualquier formulación
farmacológica aceptable. La replicación tanto de virus de ARN como
de ADN puede inhibirse por polipéptidos de fusión de interferón
híbrido. Ejemplos de virus de ARN incluyen, virus de leucemia
felina, virus de la neumonía progresiva ovina, lentivirus ovino,
virus de la anemia infecciosa equina, virus de la inmunodeficiencia
bovina, virus visna-maedi, virus de la artritis
encefalitis caprina, virus de la inmunodeficiencia humana (VIH) o
virus de la hepatitis C (VHC). Un ejemplo de virus de ADN es el
virus de la hepatitis B (VHB).
Aún en otro aspecto, la presente invención
incluye una composición farmacéutica para tratar una enfermedad
autoinmune en un sujeto que necesita de este tratamiento. En una
realización, la enfermedad autoinmune es la esclerosis múltiple. La
composición farmacéutica a administrar al sujeto contiene, una
cantidad farmacéuticamente eficaz de un polipéptido de fusión de
interferón híbrido. El interferón híbrido (IFNhib) puede
administrarse, por ejemplo, por vía oral o por vía intravenosa o por
inyección intramuscular. El IFNhib administrado por vía oral es
preferiblemente ingerido por el sujeto.
Otras realizaciones de la invención incluyen un
procedimiento para el tratamiento del lupus eritematoso, diabetes
tipo I y artritis reumatoide en un sujeto que necesita de este
tratamiento. El procedimiento incluye administrar, al sujeto, una
cantidad farmacéuticamente eficaz de un polipéptido de fusión de
interferón híbrido de la presente invención.
Estos y otros objetivos y características de la
invención se apreciarán más completamente cuando se lea la siguiente
descripción detallada de la invención junto con los dibujos que la
acompañan.
Las Figuras 1A, 1B, 1C, 1D y 1E presentan la
secuencia codificadora de ácido nucleico de un gen sintético de
OvIFN\tau diseñado para incluir 19 únicos sitios para enzimas de
restricción colocados uniformemente a través de la secuencia
codificadora.
La Figura 2 muestra la estrategia de clonación
usada para fabricar un gen sintético que codifica OvIFN\tau.
La Figura 3 muestra una comparación de la
secuencia proteica predicha de un gen de
interferón-\tau humano y un gen de
interferón-\tau ovino. Los aminoácidos divergentes
se indican mediante la presentación del aminoácido alternativo en la
línea bajo las secuencias de ácido nucleico.
La Figura 4 presenta los datos que demuestran que
tanto OvIFN\tau como IFN\alpha eran capaces de reducir
drásticamente el crecimiento de células HL-60.
La Figura 5 presenta los datos que demuestran que
rHuIFN\alpha es citotóxico y OvIFN\tau no lo es. En la figura,
se presentan los resultados de uno de tres experimentos repetidos
como la media del % de viabilidad \pm DE.
La Figura 6 presenta las secuencias de
polipéptidos derivada de la secuencia de IFN\tau.
La Figura 7 presenta la secuencia de ácido
nucleico y de aminoácidos completa de una secuencia de
OvIFN\tau.
La Figura 8 presenta los datos que apoyan la
falta de citotoxicidad, relativo a IFN\alpha, cuando IFN\tau se
usa para tratar células mononucleares de sangre periférica.
La Figura 9 muestra los resultados del
tratamiento de una línea de linfoma de linfocitos T cutáneas humano,
HUT 78, con IFN\tau.
La Figura 10 muestra los resultados del
tratamiento de una línea de linfoma de linfocitos T humana, H9, con
IFN\tau.
La Figura 11A presenta los datos de la inhibición
de péptido, relativo a la replicación del VIF (virus de la
inmunodeficiencia felina), de polipéptidos derivados de OvIFN\tau
con OvIFN\tau completo. La Figura 11B presenta los datos para la
inhibición de péptido, relativo a la replicación de VIH (virus de la
inmunodeficiencia humana), de polipéptidos derivados de OvIFN\tau
con OvIFN\tau completo.
La Figura 12 presenta los datos que demuestran la
inhibición de la actividad antivírica de IFN\tau por péptidos
derivados de IFN\tau.
La Figura 13 presenta los datos que demuestran la
inhibición por péptidos derivados de IFN\tau de la actividad
antivírica de OvIFN\tau.
La Figura 14 presenta los datos que demuestran la
inhibición por péptidos derivados de IFN\tau de la actividad
antivírica de IFN\alpha bovino.
La Figura 15 presenta los datos que demuestran la
inhibición por péptidos derivados de IFN\tau de la actividad
antivírica de IFN\alpha humano.
La Figura 16 presenta los datos que evalúan la
falta de inhibición de péptidos derivados de IFN\tau de la
actividad antivírica de IFN\gamma bovino.
La Figura 17 presenta los datos que demuestran la
inhibición por antisueros antipéptidos derivados de IFN\tau de la
actividad antivírica de IFN\tau.
La Figura 18 presenta los datos que demuestran la
inhibición por antisueros antipéptidos derivados de IFN\tau de la
unión de IFN\tau marcado radioactivamente a células.
Las Figuras 19A y 19B presentan un alineamiento
de secuencias de ácido nucleico que codifican polipéptidos de
IFN\tau.
Las Figuras 20A y 20B presentan un alineamiento
de secuencias de aminoácidos de polipéptidos de IFN\tau.
La Figura 21 presenta los datos que comparan la
citotoxicidad de IFN\tau con IFN\beta.
Las Figuras 22A y 22B muestran los perfiles de
citotoxicidad de IFN\alphaA (Figura 22A) e IFN\tau (Figura 22B)
en células MDBK.
Las Figuras 23A y 23B muestran el efecto de
IFN\tau sobre la citotoxicidad de IFN\alphaA en células
MDBK.
Las Figuras 24A y 24B muestran la unión de
^{125}I-IFN\tau (Figura 24A) y
^{125}I-IFN\alphaA (Figura 24B) a células MDBK,
así como las gráficas de Scatchard de los datos de unión.
Las Figuras 25A y 25B muestran la unión
competitiva de IFN\tau (Figura 25A) e IFN\alphaA (Figura 25B) a
células MDBK.
La Figura 26 muestra la inhibición de la unión de
IFN\tau e IFN\alphaA a células MDBK por antisueros contra el
extremo N-terminal (barras rellenas) y
C-terminal (barras rayadas) del IFN\tau con
respecto a controles preinmunotratados (barras abiertas).
Las Figuras 27A y 27B muestran las curvas dosis-
respuesta/ocupación para IFN\tau (Figura 27A) e IFN\alphaA
(Figura 27B) en células MDBK de porcentaje de actividad antivírica
máxima (\circ), citotoxicidad (\Box) y unión
(\diamondsuit).
La Figura 28 muestra un esquema de un polipéptido
de fusión de interferón híbrido.
La ID. SEC. Nº: 1 es la secuencia de nucleótidos
de un gen sintético que codifica el
interferón-\tau ovino (OvIFN\tau). También se
muestra la secuencia de aminoácidos codificada.
La ID. SEC. Nº: 2 es una secuencia de aminoácidos
de una proteína OvIFN\tau madura.
La ID. SEC. Nº: 3 es una secuencia de nucleótidos
sintética que codifica una proteína de IFN-\tau
humana (HuIFN\tau) humano.
La ID. SEC. Nº: 4 es una secuencia de aminoácidos
para una proteína de HuIFN\tau1 madura.
La ID. SEC. Nº: 5 es la secuencia de aminoácidos
del fragmento 1-37 de la ID. SEC. Nº: 2.
La ID. SEC. Nº: 6 es la secuencia de aminoácidos
del fragmento 34-64 de la ID. SEC. Nº: 2.
La ID. SEC. Nº: 7 es la secuencia de aminoácidos
del fragmento 62-92 de la ID. SEC. Nº: 2.
La ID. SEC. Nº: 8 es la secuencia de aminoácidos
del fragmento 90-122 de la ID. SEC. Nº: 2.
La ID. SEC. Nº: 9 es la secuencia de aminoácidos
del fragmento 119-150 de la ID. SEC. Nº: 2.
La ID. SEC. Nº: 10 es la secuencia de aminoácidos
del fragmento 139-172 de la ID. SEC. Nº: 2.
La ID. SEC. Nº: 11 es la secuencia de nucleótidos
de un gen de HuIFNt1 natural con una secuencia líder.
La ID. SEC. Nº: 12 es la secuencia codificada
predicha de aminoácidos de la ID. SEC. Nº: 11.
La ID. SEC. Nº: 13 es un oligonucleótido
sintético 25-mérico según la invención en
cuestión.
La ID. SEC. Nº: 14 es un oligonucleótido
sintético 25-mérico según la invención en
cuestión.
La ID. SEC. Nº: 15 es la secuencia de aminoácidos
del fragmento 1-37 de la ID. SEC. Nº: 4.
La ID. SEC. Nº: 16 es la secuencia de aminoácidos
del fragmento 34-64 de la ID. SEC. Nº: 4.
La ID. SEC. Nº: 17 es la secuencia de aminoácidos
del fragmento 62-92 de la ID. SEC. Nº: 4.
La ID. SEC. Nº: 18 es la secuencia de aminoácidos
del fragmento 90-122 de la ID. SEC. Nº: 4.
La ID. SEC. Nº: 19 es la secuencia de aminoácidos
del fragmento 119-150 de la ID. SEC. Nº: 4.
La ID. SEC. Nº: 20 es la secuencia de aminoácidos
del fragmento 139-172 de la ID. SEC. Nº: 4.
La ID. SEC. Nº: 21 es la secuencia de nucleótidos
del ADNc de HuIFN\tau6.
La ID. SEC. Nº: 22 es la secuencia de aminoácidos
predicha codificada por la secuencia representada como ID. SEC. Nº:
21.
La ID. SEC. Nº: 23 es la secuencia de nucleótidos
del ADNc de HuIFN\tau7.
La ID. SEC. Nº: 24 es la secuencia de aminoácidos
predicha codificada por la secuencia representada como ID. SEC. Nº:
23.
La ID. SEC. Nº: 25 es la secuencia de nucleótidos
del ADNc de HuIFN\tau4.
La ID. SEC. Nº: 26 es la secuencia de aminoácidos
predicha codificada por la secuencia representada como ID. SEC. Nº:
25.
La ID. SEC. Nº: 27 es la secuencia de nucleótidos
del ADNc de HuIFN\tau5.
La ID. SEC. Nº: 28 es la secuencia de aminoácidos
predicha codificada por la secuencia representada como ID. SEC. Nº:
27.
La ID. SEC. Nº: 29 es la secuencia de nucleótidos
del ADNc de HuIFN\tau2.
La ID. SEC. Nº: 30 es la secuencia de aminoácidos
predicha codificada por la secuencia representada como ID. SEC. Nº:
29.
La ID. SEC. Nº: 31 es la secuencia de
nucleótidos, incluyendo la secuencia líder, del clon HuIFN\tau3 de
ADN genómico, un gen HuIFN\tau natural.
La ID. SEC. Nº: 32 es la secuencia de aminoácidos
predicha (incluyendo la secuencia líder) codificada por la secuencia
representada como ID. SEC. Nº: 31.
La ID. SEC. Nº: 33 es la secuencia de
nucleótidos, excluyendo la secuencia líder, del clon HuIFN\tau3 de
ADN genómico, un gen de HuIFN\tau natural.
La ID. SEC. Nº: 34 es la secuencia de aminoácidos
predicha de una proteína de IFN\tau humano madura codificada por
HuIFN\tau3, codificada por la secuencia representada como ID. SEC.
Nº: 33.
La ID. SEC. Nº: 35 es la secuencia de aminoácidos
del fragmento 1-37 de la ID. SEC. Nº: 33.
La ID. SEC. Nº: 36 es la secuencia de aminoácidos
del fragmento 34-64 de la ID. SEC. Nº: 33.
La ID. SEC. Nº: 37 es la secuencia de aminoácidos
del fragmento 62-92 de la ID. SEC. Nº: 33.
La ID. SEC. Nº: 38 es la secuencia de aminoácidos
del fragmento 90-122 de la ID. SEC. Nº: 33.
La ID. SEC. Nº: 39 es la secuencia de aminoácidos
del fragmento 119-150 de la ID. SEC. Nº: 33.
La ID. SEC. Nº: 40 es la secuencia de aminoácidos
del fragmento 139-172 de la ID. SEC. Nº: 33.
La ID. SEC. Nº: 41 es la secuencia de aminoácidos
del fragmento 1-23 de la ID. SEC. Nº: 32.
La ID. SEC. Nº: 42 es la secuencia de aminoácidos
del fragmento 1-23 de la ID. SEC. Nº: 11.
La ID. SEC. Nº: 43 es la secuencia de
nucleótidos, excluyendo la secuencia líder, del clon HuIFN\tau1 de
ADN.
La ID. SEC. Nº: 44 es la secuencia de aminoácidos
predicha de una proteína de IFN\tau humano madura codificada por
HuIFN\tau1, codificada por la secuencia representada como ID. SEC.
Nº: 43.
La ID. SEC. Nº: 45 es la secuencia de aminoácidos
predicha del fragmento 1-37 (secuencia madura) a
partir de la secuencia A40068 (Bin 12, Nº de acceso gi 108955), que
codifica la TP-1 bovina (clon bTP509).
La ID. SEC. Nº: 46 es la secuencia de aminoácidos
predicha del fragmento 1-37 (secuencia madura) a
partir de la secuencia BovTPH1Bcds1 (Bin 13, Nº de acceso gi
163767), que codifica la TP-1 bovina.
La ID. SEC. Nº: 47 es la secuencia de aminoácidos
predicha del fragmento 1-37 (secuencia madura) a
partir de la secuencia BovTPH1Ccds1 (Bin 14, Nº de acceso gi
163769), que codifica la TP-1 bovina.
La ID. SEC. Nº: 48 es la secuencia de aminoácidos
predicha del fragmento 1-37 (secuencia madura) a
partir de la secuencia A39505 (Bin 15, Nº de acceso gi 163769), que
codifica la TP-1 bovina (clon bTP4).
La ID. SEC. Nº: 49 es la secuencia de aminoácidos
predicha del fragmento 1-37 (secuencia madura) a
partir de la secuencia OATPIP5cds1 (Bin 16, Nº de acceso gi 1412),
que codifica la TPp5 ovina.
La ID. SEC. Nº: 50 es la secuencia de aminoácidos
predicha del fragmento 1-37 (secuencia madura) a
partir de la secuencia OATPIP3cds1 (Bin 17, Nº de acceso gi 1410),
que codifica la TPp3 ovina.
La ID. SEC. Nº: 51 es la secuencia de aminoácidos
predicha del fragmento 1-37 (secuencia madura) a
partir de la secuencia SHP010TPcds1 (Bin 18, Nº de acceso gi
165821), que codifica la TP-1 ovina.
La ID. SEC. Nº: 52 es la secuencia de aminoácidos
predicha del fragmento 1-37 (secuencia madura) a
partir de la secuencia SHP02TPcds1 (Bin 19, Nº de acceso gi 165823),
que codifica la TP-1 ovina.
La ID. SEC. Nº: 53 es la secuencia de aminoácidos
predicha del fragmento 1-37 (secuencia madura) a
partir de la secuencia GOTCTPIcds1 (Bin 21, Nº de acceso gi 164117),
que codifica la IFN tau de Capra hircus.
La ID. SEC. Nº: 54 es la secuencia de nucleótidos
de la molécula de ácido nucleico quimérica derivada del ADN humano,
con un segmento terminal 5' que codifica los aminoácidos
1-28 del IFNtau humano (a partir de la ID. SEC. Nº:
3) y un segmento terminal 3' que codifica los aminoácidos
29-166 del IFN\alpha humano (clon pIFN105; Genbank
HUMIFNN Nº Acc. M28585).
ID. SEC. Nº: 55 es la secuencia de aminoácidos
predicha de la ID. SEC. Nº: 54.
Interferón-\tau
(IFN\tau) se refiera a una cualquiera de las familias de proteínas
de interferón que tiene una homología de aminoácido mayor del 70%, o
preferiblemente mayor de aproximadamente el 80% o más
preferiblemente mayor de aproximadamente el 90% de la secuencia
presentada como (a) ID. SEC. Nº: 2 o (b) ID. SEC. Nº: 34. La
homología de aminoácidos puede determinarse usando, por ejemplo, el
programa LALING con los parámetros por defecto. Este programa se
encuentra en el paquete de programas FASTA versión 1.7 de
comparación de secuencias (Pearson y Lipman 1988; Pearson 1990;
programa disponible en William R. Pearson, Department of Biological
Chemistry, Box 440, Jordan Hall, Charlottesville, VA). Típicamente,
el IFN\tau tiene al menos una característica del siguiente grupo
de características: (a) se expresa durante las etapas
embrionarias/fetales por el trofectodermo/placenta, (b) propiedades
antiluteolíticas, (c) propiedades antivíricas y (d) propiedades
antiproliferación celular. El IFN\tau puede obtenerse de varias
fuentes incluyendo vacas, ovejas, buey y humanos.
Un polipéptido de
interferón-\tau es un polipéptidos que tiene
entre aproximadamente 15 y 172 aminoácidos derivado a partir de una
secuencia que codifica los aminoácidos del
interferón-\tau, donde dichos 15 a 172 aminoácidos
son contiguos en el interferón-\tau nativo. Estas
regiones de 15-172 aminoácidos pueden también
ensamblarse en polipéptidos donde dos o más de estas regiones de
interferón-\tau que están normalmente discontinuas
en la proteína nativa se unen.
Una secuencia o fragmento polipeptídico
"deriva de" otra secuencia o fragmento de
polinucleótidos cuando contiene la misma secuencia de nucleótidos
que la que está presente en la secuencia o fragmento de la cual
deriva. Por ejemplo, un plásmido bacteriano contiene un inserto
"derivado de" un gen humano seleccionado si la secuencia de
polinucleótidos del inserto es la misma que la secuencia de
polinucleótidos del gen humano seleccionado.
De modo similar, una secuencia o fragmento
polipeptídico "deriva de" otra secuencia o fragmento
polipeptídico cuando contiene la misma secuencia de aminoácidos que
la que está presente en la secuencia o fragmento de la cual
deriva.
El porcentaje (%) de identidad, con respecto a
dos secuencias de aminoácidos, se refiere al % de restos que son
idénticos en las dos secuencias cuando las secuencias están
alineadas de forma óptima y no se da ninguna falta debida a
"huecos". En otras palabras, si se necesita insertar un hueco
en una primera secuencia para alinearla óptimamente con una segunda
secuencia, el % de identidad se calcula usando sólo los restos que
están apareados con un resto de aminoácido correspondiente (es
decir, los cálculos no consideran restos de la segunda secuencia que
están en el "hueco" de la primera secuencia). El alineamiento
óptimo se define como el alineamiento que da el valor del % de
identidad más alto. Tales alineamientos se pueden realizar usando el
programa "GENEWORKS". Alternativamente, los alineamientos se
pueden realizar usando el programa de alineamiento local LALING con
un ktup de 1, los parámetros por defecto y el PAM por defecto.
Tratar una enfermedad se refiere a
administrar una sustancia terapéutica eficaz para reducir los
síntomas de la enfermedad y/o atenuar la gravedad de la
enfermedad.
El interferón-\tau ovino
(OvIFN\tau) es una proteína secretora embrionaria importante
producida por el trofectodermo embrionario durante el periodo
crítico de reconocimiento materno en la oveja. Un OvIFN\tau maduro
aislado es de 172 aminoácidos de longitud (ID. SEC. Nº: 2). La
secuencia codificadora de ADNc contiene 23 aminoácidos adicionales
en el extremo amino-terminal de la proteína madura
(Imakawa, y col., 1987). La secuencia codificadora de este aislado
de OvIFN\tau se presenta como la Figura 7.
Con respecto a otros interferones, oIFN\tau
comparte aproximadamente del 45 al 68% de homología de aminoácidos
con el interferón-\alpha y la mayor similitud de
secuencia con el
interferon-\omegas(IFN\omegas) de
aproximadamente el 68%.
Para el aislamiento de la proteína OvIFN\tau,
se cogieron embriones de ovejas preñadas y se cultivaron in
vitro en Medio Esencial Mínimo modificado como se describe
previamente (Godkin, y col., 1982). Los embriones se cogieron a
distintos días de gestación, describiéndose el primer día de
apareamiento como día 0. Se purificó OvIFN\tau a partir del medio
de cultivo de los embriones, esencialmente como describen Vallet, y
col., 1987 y Godkin, y col., 1982.
La homogeneidad de OvIFN\tau se evaluó por
electroforesis en gel de poliacrilamida con dodecil sulfato sódico
(SDS-PAGE; Maniatis y col.; 1982; Ausubel y col.,
1988). La determinación de la concentración de proteínas en las
muestras de OvIFN\tau purificado se realizó usando el ensayo del
ácido bicinconínico (BCA) (Pierce Chemical Co., Rockford, IL; Smith,
P.K. y col., 1985).
Una proteína homóloga a OvIFN\tau se aisló a
partir de vacas (BoIFN\tau; Helmer, y col., 1987; Imakawa, y col.,
(1989). OvIFN\tau y BoIFN\tau (i) tienen funciones similares en
el reconocimiento materno del embarazo y (ii) comparten un alto
grado de homología de secuencia de aminoácidos y nucleótidos entre
las proteínas maduras. La homología de secuencia de ácidos nucleicos
entre OvIFN\tau y BoIFN\tau es del 76,3% para la región 5' no
codificadora, 89,7% para la región codificadora y 91,9% para la
región 3' no codificadora. La homología de la secuencia de
aminoácidos es del 80,4%.
El ejemplo 1 describe las funciones reproductoras
de OvIFN\tau. OvIFN\tau y el
interferón-\alpha2 humano recombinante
(rHuIFN\alpha) se infundieron en el lumen uterino de ovejas a
distintas concentraciones. La vida útil del cuerpo lúteo se evaluó
por el examen de los intervalos interestro, el mantenimiento de la
secreción de progesterona y la inhibición de la secreción de
prostaglandina (Davis, y col., 1992). La comparación de los datos
resultantes de estos exámenes demostró una prolongación considerable
de los intervalos interestro cuando se administraba OvIFN\tau a
100 \mug/día y ningún efecto significativo cuando se administró
rHuIFN\alpha. Estos datos apoyan la conclusión de que OvIFN\tau
influye significativamente en los sucesos bioquímicos del ciclo
estral.
También se examinaron las propiedades antivíricas
del interferón-\tau en diversas etapas del ciclo
reproductor (Ejemplo 2). Se establecieron cultivos embrionarios
usando embriones obtenidos a partir de ovejas en los días 12 a 16
del ciclo estral. Se evaluó la actividad antivírica del sobrenadante
de cada cultivo embrionario. Los sobrenadantes de los cultivos
incrementaron la actividad antivírica asociada con el desarrollo
avanzado del embrión hasta el día 16 tras el estro.
El OvIFN\tau recombinante se produjo usando
linfocitos Bacterianas y de levadura. Se usó la secuencia
codificadora de aminoácidos de OvIFN\tau para generar una
secuencia codificadora de ADN correspondiente con el uso de codones
optimizados para la expresión en E. coli (Ejemplo 3). La
secuencia codificadora de ADN se construyó de forma sintética
mediante la adición secuencial de oligonucleótidos. Los
oligonucleótidos clonados se fusionaron en un único polinucleótido
usando las digestiones de restricción y ligamientos esquematizados
en la Figura 2. La secuencia codificadora de polinucleótidos tenía
la secuencia presentada como ID. SEC. Nº: 1.
Para la expresión de polipéptidos de interferón
recombinante, tales como OvIFN\tau sintético o los polipéptidos de
fusión de interferón híbrido de la presente invención, la secuencia
codificadora quimérica puede situarse en varios vectores de
expresión bacterianos: por ejemplo, lambda gt1 (Promega, Madison
WI); pGEX (Smith, D.B. y col., 1988); pGEMEX (Promega) y pBS
(Stratagene, La Jolla CA). También pueden usarse otros vectores de
expresión bacterianos que contienen promotores adecuados, tales como
el promotor de la ARN polimerasa de T7 o el promotor tac. La
clonación del polinucleótido sintético de OvIFN\tau en un vector
de expresión pIN III omp-A modificado se describe en
el Ejemplo 3. La producción de la proteína OvIFN\tau se inducía
por la adición de IPTG. El IFN\tau recombinante soluble se liberó
de las células por sonicación o fraccionamiento osmótico.
La proteína puede purificarse adicionalmente por
procedimientos convencionales, incluyendo fraccionamiento por tamaño
(cromatografía en columna o electroforesis en gel preparativo) o
cromatografía de afinidad usando, por ejemplo, anticuerpos
anti-interferón (soporte sólido disponible en
Pharmacia, Piscataway NJ). Las preparaciones de proteínas también
pueden concentrarse mediante, por ejemplo, filtración (Amicon,
Danvers, Mass.).
El gen OvIFN\tau sintético también se clonó en
el vector de clonación de levaduras pBS24Ub (Ejemplo 4; Sabin, y
col., 1989; Ecker, y col., 1989). Los conectores sintéticos se
construyeron para permitir la fusión en marco de las secuencias
codificadoras de OvIFN\tau con las secuencias codificadoras de la
ubiquitina en el vector. La unión resultante permitía la escisión
in vivo de las secuencias de ubiquitina a partir de las
secuencias de OvIFN\tau.
El plásmido recombinante
pBS24Ub-INF\tau se transformó en la levadura S.
cerevisiae. Las células de levadura transformadas se cultivaron,
se lisaron y la proteína recombinante INF\tau
(r-INF\tau) se aisló a partir de los lisados
celulares.
La cantidad de r-INF\tau se
cuantificó por radioinmunoanálisis. Se realizó la microsecuenciación
de la r-INF\tau purificada. Los resultados
demostraron identidad con la OvIFN\tau nativa a lo largo de los
primeros 15 aminoácidos. Los resultados también confirmaron que la
proteína de fusión ubiquitina/INF\tau se había procesado
correctamente in vivo.
El INF\tau recombinante obtenido por este
procedimiento mostraba actividad antivírica similar a la actividad
antivírica del IFN\tau purificado a partir de los medios de
cultivo condicionados con el embrión.
Pueden usarse otros vectores de levaduras en la
práctica de la presente invención. Estos incluyen vectores
plasmídicos de 2 micrómetros (Ludwig, y col.; 1993), plásmidos de
integración de levaduras (YIps, por ejemplo, Shaw, y col., 1988),
vectores YEP (Sehn, y col., 1986), plásmidos centroméricos de
levaduras (YCps; por ejemplo, Ernst, 1986) y similares.
Preferiblemente, los vectores incluyen un casete de expresión que
contiene un promotor de levadura eficaz, tal como el promotor
MF\alpha1 (Ernst, 1986; Bayne, y col., 1988). El promotor
de GADPH
(gliceraldehído-3-fosfato-deshidrogenasa;
Wu, y col., 1991), el promotor inducible por galactosa GAL10
(Ludwing, y col., 1993; Feher, y col. 1989; Shen, y col., 1986) o el
promotor de la alcohol oxidasa regulada por metanol (AOX). El
promotor AOX es particularmente útil en células hospedadoras de
Pichia pastoris (por ejemplo, el promotor AOX se usa en
vectores pHIL y pPIC incluido en el kit de expresión de
Pichia, disponible en Invitrogen, San Diego, CA).
El casete de expresión puede incluir elementos
adicionales para facilitar la expresión y purificación de la
proteína recombinante y/o facilitar la inserción del casete en un
vector o en un cromosoma de levadura. Por ejemplo, el casete puede
incluir una secuencia señal para la secreción directa de la
proteína. Un ejemplo de secuencia señal adecuada para su uso en
diversos vectores de expresión de levaduras es la secuencia señal de
pre-pro MF\alpha1 (Bayne, y col., 1988; Ludwig, y
col., 1993; Shaw, y col., 1988). También pueden usarse otras
secuencias señal. Por ejemplo, la secuencia señal PhoI (Elliot, y
col., 1986); es particularmente eficaz en células hospedadoras de
Pichia pastoris y Schizosaccharomyces pombe.
Los ejemplos de casetes de expresión incluyen (i)
un casete que contiene (5' a 3') el promotor AOX, la secuencia señal
PhoI y una secuencia de ADN que codifica OvIFN\tau, para la
expresión en células hospedadoras de P. pastoris y (ii) un
casete que contiene (5' a 3') el promotor MF\alpha1, la secuencia
señal de pre-pro MF\alpha1 y una secuencia de ADN
que codifica una composición de interferón de la presente invención,
para la expresión en células hospedadoras de S.
cerevisiae.
Vectores de levaduras adicionales adecuados para
su uso con la presente invención incluyen, aunque sin limitación,
otros vectores con expresión regulable (Hitzeman, y col., 1988;
Rutter, y col., 1988; Oeda, y col., 1988). El hospedador de levadura
para la transformación es típicamente Saccharomyces
cerevisiae, sin embargo, como se ha ilustrado anteriormente,
puede así mismo usarse otras levaduras adecuadas para la
transformación (por ejemplo, Schizosaccharomyces pombe,
Pichia pastoris y similares).
El ADN que codifica el polipéptido de interferón
puede clonarse en cualquiera de los numerosos vectores disponibles
en el mercado para general la expresión del polipéptido en el
sistema hospedador apropiado. Estos sistemas incluyen los sistemas
de expresión de bacterias y levaduras descritos anteriormente así
como los siguientes: expresión en baculovirus (Reilly, y col., 1992;
Beames y col., 1991; Clontech, Palo Alto CA); expresión en células
vegetales, expresión en plantas transgénicas (por ejemplo, S.B.
Gelvin y R.A. Schilperot, Plant Molecular Biology, 1988) y
expresión en células de mamíferos (Clontech, Palo Alto CA;
Gibco-BRL, Gaithersburg MD). Estos polipéptidos
recombinantes pueden expresarse como proteínas de fusión o como
proteínas nativas. Pueden incluirse varios elementos en los vectores
de expresión, tales como secuencias líderes que promueven la
secreción de las secuencias expresadas en el medio de cultivo. Los
polipéptidos producidos de forma recombinante típicamente se aíslan
a partir de células lisadas o medios de cultivo. La purificación
puede realizarse por procedimientos conocidos en la técnica
incluyendo fraccionamiento salino, cromatografía de intercambio
iónico y cromatografía de afinidad. La cromatografía de
inmunoafinidad puede emplearse, como se ha descrito anteriormente,
usando anticuerpos generados en función de los polipéptidos de
IFN.
El ADN genómico humano se seleccionó a partir de
secuencias homólogas para interferón-\tau (Ejemplo
5). Se identificaron varias secuencias que hibridaban con la sonda
de ADNc de OvIFN\tau. Después se aislaron varios clones que
contenían secuencias parciales de interferón-\tau
humano (Ejemplo 6). Se sintetizaron dos oligonucleótidos sintéticos
25-méricos, correspondientes a secuencias del ADNc
de OvIFN\tau (Imakawa, y col., 1987; Whaley, y col., 1994). Estos
cebadores se emplearon en reacciones de amplificación usando
derivados de ADN a partir de las dos genotecas de ADNc siguientes:
placenta humana y células del citotrofoblasto humano aisladas de
placenta a término. Los fragmentos de ADN amplificados resultantes
se separaron por electroforesis y se aisló una banda que contenía
productos de amplificación de INFr humano. Los productos de
amplificación se subclonaron y los productos de amplificación
insertados se secuenciaron usando el procedimiento didesoxi de
terminación de cadena.
La comparación de las secuencias de cinco de
estos clones reveló un alto grado de homología de secuencia entre
los aislados, pero las secuencias no eran idénticas. Este resultado
sugiere la existencia de múltiples variantes de genes de
interferón-\tau humano. El análisis de las
secuencias de nucleótidos y de proteína sugiere que los genes de
interferón-\tau humano se pueden clasificar en
función de la homología de secuencia en al menos tres grupos. Los
tres grupos se presentan a continuación.
El Ejemplo 7 describe el aislamiento de varios
genes de IFN\tau humano de longitud completa. Se aisló el ADN de
alto peso molecular a partir de células mononucleares de sangre
periférica human (PBMC) y se fraccionó por tamaño. Se analizaron las
fracciones para la presencia de secuencias de IFN\tau usando la
reacción en cadena de la polimerasa: las moléculas de ADN de las
fracciones que resultaron positivas en la amplificación se
utilizaron para generar una genoteca subgenómica en
\lambdagt11.
La genoteca subgenómica se puso en placas y se
hibridó con una sonda de ADNc de OvIFN\tau (Ejemplo 7A). Se
identificaron aproximadamente 20 clones que hibridaban con la sonda.
Se pasaron las placas correspondientes a los clones positivos, se
aisló el ADN y se analizó mediante reacciones de amplificación
usando cebadores de OvIFN\tau. De estas veinte placas, seis placas
generaron señales de PCR positivas. Se purificaron los fagos de
estos seis clones y se secuenciaron los insertos. Uno de los
insertos de uno de estos seis clones se utilizó como sonda de
hibridación en la siguiente selección.
El fago recombinante de la genoteca subgenómica
\lambdagt11 se seleccionó usando la sonda de hibridación como se
describe (Ejemplo 7B). Se aislaron cinco clones que dieron señales
de hibridación positivas y se secuenciaron los insertos. Las
secuencias de tres de los clones se solaparon y la secuencia de
ácido nucleico consenso resultante (HuIFN\tau1) se presenta como
la ID. SEC. Nº: 11 con la secuencia codificadora de la proteína
predicha presentada como la ID. SEC. Nº: 12. La secuencia
codificadora de la proteína madura predicha se presenta como la ID.
SEC. Nº: 4. Las secuencias de los otros dos clones se presentan como
la ID. SEC. Nº: 29 (HuIFN\tau2) y ID. SEC. Nº: 31 (HuIFN\tau3).
La secuencia de aminoácidos madura predicha de HuIFN\tau2 se
presenta como la ID. SEC. Nº: 30. La secuencia de aminoácidos
predicha del HuIFN\tau3 se presenta como la ID. SEC. Nº: 32 y la
secuencia de aminoácidos madura como la ID. SEC. Nº: 34.
La comparación de las secuencias de proteína
predichas (Figura 3) de uno de los genes de
interferón-\tau humano (ID. SEC. Nº: 4) y del gen
del interferón-\tau ovino demuestra los niveles de
homología y divergencia de secuencia al nivel de aminoácidos.
En las Figuras 19A y 19B se muestra un
alineamiento de secuencias de ácido nucleico de las siete secuencias
de ácido nucleico del interferón-\tau humano,
descrito en este documento (Ejemplos 6 y 7), con el
interferón-\tau ovino. Las secuencias de
OvIFN\tau (oIFN\tau), HuIFN\tau1, HuIFN\tau2 y HuIFN\tau3
comienzan en la esquina superior izquierda de la Figura 19A con el
codon de iniciación ATG y continúan en la segunda página de la
figura. Las secuencias de HuIFN\tau4, HuIFN\tau5, HuIFN\tau6 y
HuIFN\tau7 comienzan aproximadamente en la mitad inferior de la
Figura 19A con el codon CAG en el aminoácido en posición 40 (a la
derecha de los signos de admiración) y continúan en la segunda
página de la figura. Los extremos 5' y 3' de cada uno de los clones
para HuIFN\tau4, HuIFN\tau5, HuIFN\tau6 y HuIFN\tau7 se
representan mediante signos de admiración.
La secuencia codificadora completa de OvIFN\tau
se presenta en la línea superior de cada grupo alineado. En las
otras secuencias los nucleótidos sólo se indican en las posiciones
donde difieren de los de OvIFN\tau. Las letras minúsculas
representan cambios de nucleótidos que no tienen como resultado un
cambio de aminoácido, mientras que las letras mayúsculas representan
aquellos cambios que tienen como resultado la sustitución de un
aminoácido.
En las Figuras 20A y 20B se presenta un
alineamiento de las siete secuencias de aminoácidos
correspondientes, construido esencialmente de la misma manera que la
descrita anteriormente. Como anteriormente, la secuencia completa de
aminoácidos de OvIFN\tau se presenta en la línea superior, y los
aminoácidos de las otras secuencias se indican sólo en las
posiciones donde difieren de la secuencia ovina.
Un examen de los alineamientos revela que las
siete secuencias se pueden agrupar en al menos tres grupos. El grupo
I contiene HuIFN\tau1 y HuIFN\tau2, el grupo II contiene
HuIFN\tau3, HuIFN\tau4 y HuIFN\tau5 y el grupo III contiene
HuIFN\tau6 y HuIFN\tau7. Estos grupos pueden representar
familias de genes de interferón-\tau que tienen
distintas funciones celulares.
Estos agrupamientos se establecieron en función
de los siguientes criterios. En proteínas maduras, los HuIFN\tau
del grupo I tienen una asparragina (ASN) en el aminoácido en
posición número 95 (números en referencia a las Figuras 20A y 20B),
una metionina (MET) en el aminoácido en posición número 104 y una
leucina (LEU) en el aminoácido en posición número 120; los
HuIFN\tau del grupo II tienen un ácido aspártico (ASP) en el
aminoácido en posición número 95, una treonina (THR) en el
aminoácido en posición número 104 y una metionina (MET) en el
aminoácido en posición número 120; y los HuIFN\tau del grupo III
tienen una arginina (ARG) en el aminoácido en posición número 72,
una valina (VAL) en el aminoácido en posición número 120 y una
serina (SER) en el aminoácido en posición número 122.
Las secuencias de ácido nucleico y de
polipéptidos de IFN\tau humano presentadas como ID. SEC. Nº: 3,
ID. SEC. Nº: 4, ID. SEC. Nº: 11, ID. SEC. Nº: 12, ID. SEC. Nº: 21,
ID. SEC. Nº: 22, ID. SEC. Nº: 23, ID. SEC. Nº: 24, ID. SEC. Nº: 25,
ID. SEC. Nº: 26, ID. SEC. Nº: 27, ID. SEC. Nº: 28, ID. SEC. Nº: 29,
ID. SEC. Nº: 30, ID. SEC. Nº: 31, ID. SEC. Nº: 32, ID. SEC. Nº: 33 y
ID. SEC. Nº: 34 se pueden usar como fuente para cebadores y sondas
específicos para detectar aislados de secuencias que codifican
IFN\tau humano adicionales y/o pseudogenes. Además, como se ha
descrito anteriormente, puede haber más de una isoforma de la
proteína IFN\tau y más de una secuencia codificadora por especie.
Las sondas de ácido nucleico específicas usadas en la práctica de la
presente invención y los anticuerpos reactivos con los polipéptidos
de IFN\tau pueden ser útiles para aislar variantes sin identificar
de interferón-\tau en mamíferos, según los
procedimientos de la invención descritos en este documento.
Se analizaron genotecas de ADNc de placenta
humana y una genoteca de ADNc ovino mediante hibridación con la
sonda de ADNc de OvIFN\tau (Ejemplo 8). Este análisis de
hibridación de ADN sugirió que las señales de IFN\tau de genotecas
de ADNc humano eran aproximadamente 1/100 de la señal obtenida
usando una genoteca de ADNc ovino. Los ADNc de OvIFN\tau
constituyen aproximadamente el 0,4% de la genoteca de ADNc ovino. En
consecuencia, la abundancia de ADNc humanos que responden a la sonda
de OvIFN\tau parece ser baja, al menos en la placenta a término de
la que se generaron las genotecas de ADNc.
Se analizó también la presencia de ARNm de
HuIFN\tau en placenta a término y en amniocitos humanos. Los
resultados sugieren la presencia de ARNm de HuIFN\tau en el anexo
fetoplacentario. Los amniocitos también expresaban el mensajero
correspondiente a los cebadores de OvIFN\tau y a la sonda humana,
sugiriendo que la expresión del ARNm de IFN\tau no se limita a la
placenta a término.
Además, se aplicó un análisis de
RT-PCR al ARN celular total aislado a partir de
linfocitos adultos humanos para la presencia de HuIFN\tau: los
resultados sugieren que existe ARNm de IFN\tau en linfocitos.
Se examinó también la expresión de
interferón-\tau en tejido humano usando
hibridación in situ (Ejemplo 9). Se examinaron las secciones
de cuatro placentas humanas a término diferentes y del primer
trimestre. Para este análisis se empleó una sonda de ADNc derivada
de la secuencia de OvIFN\tau (Ejemplo 9B). La hibridación in
situ se realizó usando una sonda de ARN antisentido. En tres
experimentos independientes, se observó hibridación específica en
todos los tejidos placentarios a término y del primer trimestre.
Las vellosidades placentarias del primer
trimestre (compuestas de una capa externa de sincitiotrofoblasto,
una capa subyacente de citotrofoblasto y una región estromal central
con varios tipos de células mesenquimales) presentaban los niveles
de transcrito de IFN\tau más altos en las células de
citotrofoblasto. Tanto en las células del sincitiotrofoblasto como
estromales había niveles menos intensos, pero detectables. En las
vellosidades placentarias de tejido a término se demostró un patrón
similar de expresión del transcrito, pero el nivel de detección de
la señal era bajo. Los trofoblastos extravellosos del primer
trimestre presentaron la cantidad más elevada de mensajero y de
positivos teñidos cuando estaban presentes en los espacios
sanguíneos maternos en la decidua.
Howatson, y col., (1988) observaron la producción
de IFN\alpha en el sincitiotrofoblasto de las vellosidades
coriónicas tanto en tejidos del primer trimestre como a término.
Paulesu, y col. (1991) también observaron IFN\alpha en trofoblasto
extravelloso, así como en sincitiotrofoblastos, notando una
reactividad más intensa y abundante en el tejido placentario del
primer trimestre cuando se comparaban con aquellos tomados a
término. Estos investigadores emplearon anticuerpos obtenidos contra
subtipos de IFN\alpha humano y ninguno observó IFN\tau en el
citotrofoblasto
velloso.
velloso.
Los presentes resultados demuestran que el gen de
IFN\tau humano se expresa de forma elevada en tejido placentario
temprano por trofoblastos extravellosos migratorios, pero también se
expresa en sincitiotrofoblastos vellosos, citotrofoblastos y
diversas células estromales. Estos resultados demuestran la
detección de transcritos de IFN\tau en tejidos gestacionales y la
expresión de IFN\tau en los citotrofoblastos vellosos, así como en
el trofoblasto extravelloso de placenta del primer trimestre.
La actividad antivírica de OvIFN\tau se ha
evaluado frente a varios virus, incluyendo tanto virus de ARN como
de ADN. La actividad específica relativa de OvIFN\tau, purificado
hasta la homogeneidad, se evaluó en ensayos antivíricos (Ejemplo
10). OvIFN\tau tiene una actividad antivírica específica más alta
que rBoIFN\alpha o rBoIFN\gamma (Ejemplo 10, Tabla 3).
Una ventaja de la presente invención es que
OvIFN\tau tiene una actividad antivírica potente con efectos
citotóxicos limitados. Se ensayaron los efectos antirretrovíricos y
citotóxicos de OvIFN\tau altamente purificado en linfocitos de
sangre periférica expuestos a los retrovirus del SIDA felino y del
SIDA humano (Bazer, y col., 1989). El lentivirus del SIDA felino
produce un síndrome crónico similar al SIDA en gatos y es un modelo
para el SIDA de humanos (Pederson, y col., 1987). La replicación de
ambos virus en los linfocitos de sangre periférica (PBL) se siguió
por la actividad de la transcriptasa inversa (RT) en los
sobrenadantes de los cultivos a lo largo del tiempo.
Para determinar la actividad antivírica de
IFN\tau contra VIF y VIH, se ensayó la actividad RT de la ADN
polimerasa dependiente de ARN en cultivos de PBL de felino y humanos
infectados con VIF y VIH tratados con OvIFN\tau (Ejemplo 11). La
replicación de VIF se redujo en aproximadamente un tercio de los
valores de control cuando las células se cultivaron en presencia de
OvIFN\tau. La adición de OvIFN\tau produce un rápido descenso
dependiente de dosis de la actividad de transcriptasa inversa (RT)
(Ejemplo 11, Tabla 4). Mientras que concentraciones tan bajas como
0,62 ng/ml de IFN\tau inhibían la replicación vírica,
concentraciones mucho mayores (40 ng/ml) que tenían efectos mayores
en la actividad RT, no tenían efectos tóxicos en las células. Los
resultados sugieren que la replicación del virus de la
inmunodeficiencia felina se reducía significativamente en
comparación con los valores de control cuando las células se
cultivaban en presencia de OvIFN\tau.
Parece que el IFN\tau no ejerce efectos
citotóxicos en células que alojan los retrovirus. Esto era cierto
incluso cuando el IFN\tau estaba presente a 40 ng por ml en el
medio de cultivo. Esta concentración de IFN\tau es equivalente a
aproximadamente 8.000 unidades antivíricas de interferón alfa,
cuando se ensaya la capacidad de OvIFN\tau y HuIFN\alpha para
proteger las células Mandin-Darby de riñón bovino de
la lisis por el virus de la estomatitis vesicular (ensayo de lisis
como describen Pontzar, y col., 1988).
También se ensayó la actividad de IFN\tau
contra la replicación de VIH en células humanas. Los linfocitos
periféricos humanos, que se habían infectado con VIH se trataron con
diversas concentraciones de IFN\tau (Ejemplo 12). La replicación
de VIH en linfocitos de sangre periférica se controló por la
actividad transcriptasa inversa en los sobrenadantes de los cultivos
a lo largo del tiempo. Un intervalo de concentraciones de IFN\tau
producen efectos anti-HIV significativos (Ejemplo
12, Tabla 5). Una concentración de sólo 10 ng/ml tiene como
resultado una reducción de más del 50% de la actividad RT después de
sólo seis días. Una concentración de 500 ng/ml tenía como resultado
una reducción del 90% de la actividad RT en 10 días. Adicionalmente,
no hubo evidencia de ningún efecto citotóxico atribuible a la
administración de IFN\tau (Ejemplo 12, Tabla 5).
Además, los efectos antivíricos de IFN\tau
contra VIH se evaluaron tratando células PBMC humanas con diversas
cantidades de IFN\tau recombinante o IFN\alpha recombinante
humano durante la infección con VIH (Ejemplo 19). Los datos de estos
experimentos (Ejemplo 19, Tabla 11) apoyan la conclusión de que, a
concentraciones similares, IFN\alpha e IFN\tau son eficaces para
reducir la replicación de VIH en linfocitos humanos. Sin embargo, el
tratamiento de células con IFN\alpha daba lugar a citotoxicidad,
mientras que no se ha observado esta citotoxicidad con el
tratamiento usando IFN\tau, incluso cuando se usó IFN\tau a
concentraciones mucho más altas. No se observó citotoxicidad usando
INF\tau, incluso cuando se usó IFN\tau a dosificaciones de 200
veces las del interferón-alfa II.
Las propias transcriptasas inversas de VIF y VIH
no se veían afectadas por IFN\tau en ausencia de PBL. Por tanto,
la actividad antivírica no es debida a un efecto directo en la RT
vírica.
El interferón-\tau también ha
mostrado inhibición de la replicación del ADN del virus de la
hepatitis B en hepatocitos (Ejemplo 19). Se usó una línea celular
humana derivada de células de hígado transfectadas con el virus de
la hepatitis B (VHB) para ensayar los efectos antivíricos de
IFN\tau. Las células se trataron tanto con IFN\alpha como con
IFN\tau sobe un intervalo de concentraciones. Tanto IFN\alpha
como IFN\tau reducían la producción de ADN en aproximadamente dos
veces en comparación con el control sin interferón.
Para demostrar que el efecto de los interferones
era específico del virus infeccioso y no el resultado de un efecto
sobre el metabolismo general de la célula, se examinaron los efectos
de IFN\alpha e IFN\tau en la producción de ARNm hepatoespecífico
en los hepatocitos (Ejemplo 19). Dos proteínas específicas de
hepatocitos, Apo E y Apo A1, se detectaron median análisis por
hibridación. No se observó reducción aparente de la producción de
ARNm para cualquier ARNm hepatoespecífico a concentraciones de hasta
40.000 unidades/ml de IFN\alpha o IFN\tau. Adicionalmente, no se
vieron evidencias de hepatotoxicidad con IFN\tau en este
ensayo.
También se evaluaron los efectos del interferón
tau ovino recombinante (roIFN\tau) en la replicación de lentivirus
ovino (OvLV). Se ensayaron los efectos in vitro infectando
células de membrana sinovial de cabra con diluciones seriadas de
OvLV. Las células infectadas se trataron diariamente con roIFN\tau
(0-2.500 unidades antivíricas/ml [UAV/ml]) durante 6
a 12 días, y se evaluaron la replicación vírica y el efecto
citopático (ECP; por ejemplo, como en el Ejemplo 2).
Los procedimientos de evaluación incluían curvas
de crecimiento vírico, ensayo de proliferación celular (por ejemplo,
como en los Ejemplos 13, 14 y 15), ensayo de formación de sincitios
(por ejemplo, como en Nagy, y col., 1983; Dalgleish, y col., 1984) y
cuantificación de ADN provírico por PCR y ensayo de transcriptasa
inversa (Mullis, 1987; Mullis y col., 1987). Se observó una
reducción (p < 0,001) del título de OvLV y CPE
(80-99%) en los cultivos tratados con
roIFN\tau.
Los efectos in vivo de roIFN\tau se
ensayaron mediante la inoculación de veinticuatro corderos recién
nacidos con 5 x 10^{6} DICT_{50} de OvLV cepa 85/34. Once de
éstos corderos se trataron con 10^{5}-10^{6}
UAV/kg de roIFN\tau una vez al día durante 30 días tras la
inoculación (PI) y dos veces por semana después de esto. Se usaron
trece corderos como controles. Los títulos de virus en la sangre,
según se determinó por un procedimiento de dilución a punto final,
alcanzó el máximo a las 4-6 semanas PI en ambos
grupos. Los títulos de OvLV en corderos tratados con roIFN\tau se
redujeron con respecto a los animales de control. La mayor
reducción, un descenso del 90% en el título de OvLV en animales
tratados con respecto a los animales de control (p<0,01), se
obtuvo a las 4 semanas PI.
Los estudios de OvLV descritos anteriormente
indican que OvIFN\tau recombinante puede reducir
significativamente la replicación de OvLV, y sugieren que el
IFN\tau puede usarse para el control de enfermedades clínicas
causadas por infecciones con lentivirus. Tomados en conjunto con los
otros datos antivíricos, estos resultados sugieren que el IFN\tau
en un agente antivírico eficaz contra una amplia variedad de virus,
incluyendo tanto virus de ARN como de ADN.
Las composiciones de interferón de la presente
invención pueden ser útiles en aplicaciones veterinarias incluyendo,
aunque sin limitación, el tratamiento de las siguientes enfermedades
víricas: virus de la leucemia felina, virus de la neumonía
progresiva ovina, lentivirus ovino, virus de la anemia infecciona
equina, virus de la inmunodeficiencia bovina, virus
visna-maedi y artritis encefalitis caprina.
Las composiciones de interferón derivado de
humano pueden usarse para el tratamiento de, por ejemplo, las
siguientes enfermedades víricas: virus de la inmunodeficiencia
humana (VIH), virus de la hepatitis C (VHC) y virus de la hepatitis
B (VHB).
Se han examinado los efectos del IFN\tau sobre
el crecimiento celular. En un análisis se examinó la actividad
anticrecimiento celular usando un ensayo de inhibición de colonias
(Ejemplo 13). Las células de amnios humano (WISH) o MDBK se pusieron
en placas a baja densidad celular para formar colonias originadas a
partir de células únicas. Las diluciones de interferón se añadieron
en pocillos por triplicado y las placas de incubaron para permitir
la formación de colonias. El IFN\tau inhibía tanto el tamaño como
el número de colonias en estos ensayos. El IFN\tau fue más eficaz
para inhibir la proliferación celular de la línea celular humana
(WISH) que el IFN\alpha humano. La actividad proliferativa del
IFN\tau era dependiente de dosis. Las altas concentraciones de
IFN\tau detenían la proliferación, mientras que la viabilidad
celular no se veía alterada.
En función de los análisis del ciclo celular,
usando citometría de flujo, parece que el IFN\tau inhibe la
progresión de las células a través de la fase S. Estos resultados
demuestran los efectos antiproliferativos del IFN\tau y acentúa su
baja citotoxicidad.
Los efectos antiproliferativos del IFN\tau
también se estudiaron en líneas celulares de rata y bovinas (Ejemplo
14). La tasa de incorporación de ^{3}H-timidina se
usó para evaluar la tasa de proliferación celular. Los datos
obtenidos demuestran que el IFN\tau reduce drásticamente la tasa
de proliferación celular (Ejemplo 14, Tabla 7) para cada línea
celular ensayada.
La actividad antiproliferativa y la falta de
toxicidad del IFN\tau se examinaron además usando una serie de
líneas celulares tumorales humanas (Ejemplo 15). Se seleccionaron
diversas líneas celulares tumorales humanas a partir de líneas
convencionales usadas en los procedimientos de selección del NIH
para agentes antineoplásicos (Pontzer, y col., 1991). Se examinó al
menos una línea celular de cada categoría neoplásica principal.
Las siguientes líneas celulares se obtuvieron de
la American Type Culture Collection (12301 Parklawn Dr., Rockville
MD 20852):
NCI-H460 | carcinoma de pulmón de células grandes humano; |
DLD-1 | adenocarcinoma de colon humano; |
SK-MEL-28 | melanoma maligno humano; |
ACHN | adenocarcinoma renal humano; |
HL-60 | leucemia promielocítica humana; |
H9 | linfoma de linfocitos T humano; |
HUT 78 | linfoma cutáneo de linfocitos T humano; y |
MCF7 | adenocarcinoma de mama humano |
Como anteriormente, la actividad
antiproliferativa se evaluó midiendo la tasa de incorporación de
^{3}H-timidina en las células que se habían
tratado con IFN\tau. Se valoraron las diferencias significativas
entre los tratamientos mediante un análisis de varianza seguido de
la prueba F de Scheffe. El análisis de ciclo celular se realizó
mediante citometría de flujo.
El examen de la inhibición por IFN\tau de la
proliferación de MCF7 (adenocarcinoma de mama) demostró que el
IFN\tau reducía la proliferación de MCF7 de una manera dependiente
de la dosis. Se observó una reducción del 50% en la
^{3}H-timidina con 10.000 unidades/ml de IFN\tau
(Ejemplo 15, Tabla 8). Previamente se había encontrado que esta
línea celular no respondía al tratamiento con antiestrógenos.
Se realizó una comparación de los efectos
antiproliferativos de IFN\tau e IFN\alpha usando células
HL-60 (leucemia promielocítica humana). Los
resultados con la leucemia promielocítica (HL-60)
son los típicos de aquellos obtenidos comparando IFN\tau con
IFN\alpha humano (Ejemplo 15). Concentraciones tan bajas como 100
unidades/ml de ambos IFN producían una reducción significativa (>
60%) del crecimiento. Cantidades mayores de IFN disminuían más la
proliferación de células tumorales (Figura 4). Dosis altas de
HuIFN\alpha, pero no de OvIFN\tau, eran citotóxicas (Figura 5).
La viabilidad celular se reducía aproximadamente el 80% por el
IFN\alpha. Por el contrario, cerca del 100% de las linfocitos
Tratadas con IFN\tau se mantenían viables cuando se aplicaba
IFN\tau a 10.000 unidades/ml. De este modo, mientras que ambos
interferones inhibían la proliferación, sólo IFN\tau no era
citotóxico. Esta falta de toxicidad proporciona una ventaja al
IFN\tau para su uso en terapias in vivo.
El linfoma cutáneo de linfocitos T humano, HUT
78, responde de forma similar a HL-60 cuando se
trata con IFN\tau (Ejemplo 15, Figura 9) Tanto OvIFN\tau como
rHuIFN\alpha reducen el crecimiento celular de HUT 78, pero
IFN\alpha demostró efectos adversos sobre la viabilidad
celular.
El linfoma de linfocitos T H9 era menos sensible
a los efectos antiproliferativos del IFN\alpha que las líneas
celulares tumorales descritas anteriormente. Mientras que el
IFN\alpha no era tóxico para las células H9, no era capaz de
inhibir significativamente la división celular a ninguna de las
concentraciones analizadas (Ejemplo 15, Figura 10). Por el
contrario, se observó que el IFN\tau reducía el crecimiento de H9
aproximadamente el 60%. De este modo, sólo OvIFN\tau es un
inhibidor eficaz del crecimiento de este linfoma de linfocitos
T.
En tres líneas celulares tumorales adicionales
(NCI-H460, DLD-1 y
SK-MEL-28) IFN\tau e IFN\alpha
eran agentes antitumorales igualmente eficaces. En el melanoma,
SK-MEL-28, se logró una inhibición
de la proliferación por IFN\alpha con una caída del 13% en la
viabilidad, mientras que IFN\tau no era citotóxico. En la mayoría
de los tumores examinados, IFN\tau es igual o preferible a
IFN\alpha como agente antineoplásico contra tumores humanos.
El IFN\tau muestra una actividad
antiproliferativa contra células tumorales humanas sin toxicidad y
es tan potente o más que el IFN\alpha humano. Los ensayos clínicos
de los IFN\alpha2 han mostrado a estos como agentes antitumorales
eficaces (Dianzani, 1992; Krown, 1987). Una ventaja del IFN\tau
como terapéutico es la eliminación de los efectos tóxicos que se ven
con altas dosis de los IFN\alpha.
Una aplicación adicional del IFN\tau es contra
tumores como el sarcoma de Kaposi (asociado con la infección por
VIH) donde los efectos antineoplásicos del IFN\tau están
acompañados de la capacidad del IFN\tau para inhibir el
crecimiento retrovírico.
Se examinó en un sistema de ratón la eficacia
in vivo del tratamiento con
interferón-\tau (Ejemplo 16).
B16-F10 es un tumor singénico trasplantable en
ratones seleccionado por su alta incidencia de metástasis pulmonar
(Poste, y col., 1981). El tratamiento con interferón se inició 3
días después de la introducción de las células tumorales. La
administración in vivo de IFN\tau reducía de modo
espectacular los tumores pulmonares de B16-F10. Así,
IFN\tau parece ser un agente antineoplásico eficaz in vivo,
así como in vitro.
Estos resultados sugieren que las composiciones
de interferón de la presente invención pueden usarse en
procedimientos para inhibir o reducir el crecimiento de células
tumorales, incluyendo, aunque sin limitación, los siguientes tipos
de células tumorales: células de carcinoma humano, células de cáncer
hematopoyético, células de leucemia humana, células de linfoma
humano, células de melanoma humano y células de tumores sensibles a
esteroides (por ejemplo, células de tumor de mama).
Las composiciones y procedimientos de la presente
invención pueden usarse para tratar terapéuticamente y, por
consiguiente, aliviar diversos trastornos relacionados con el
sistema inmunitario, caracterizados por una función hiper o
hipoactiva del sistema inmunitario. Estos trastornos incluyen
trastornos de hiperalergenicidad y autoinmunes, tales como
esclerosis múltiple, diabetes mellitus tipo I (dependiente de
insulina), lupus eritematoso, esclerosis lateral amiotrófica,
enfermedad de Crohn, artritis reumatoide, estomatitis, asma,
alergias, psoriasis y similares.
Experimentos realizados en apoyo de la presente
invención demuestran que la administración oral de composiciones de
polipéptidos de IFN\tau son comparables en eficacia a las
composiciones de IFN\tau inyectadas con respecto al tratamiento de
enfermedades o estados de enfermedades que se benefician del
tratamiento con IFN\tau, tales como enfermedades autoinmunes (por
ejemplo, esclerosis múltiple).
No sólo el IFN\tau administrado por vía oral
era eficaz en el tratamiento de una enfermedad que se beneficia del
tratamiento con IFN\tau (EAE), sino que la vía oral de
administración tuvo como resultado inesperadas ventajas con respecto
al tratamiento con composiciones de IFN\tau inyectadas. Por
ejemplo, el IFN\tau administrado por vía oral tuvo como resultado
unos niveles significativamente más bajos de anticuerpos
anti-IFN\tau en el suero de los individuos
tratados. Esto es beneficioso porque es menos probable que el
IFN\tau administrado por vía oral se vuelva ineficaz por una
respuesta inmune del hospedador (es decir, la desensibilización al
tratamiento y/o el nivel de dosis disminuye significativamente) y es
menos probable que el individuo que recibe el tratamiento sufra
efectos secundarios adversos como resultado de esta respuesta
inmune.
Una ventaja del IFN\tau sobre otros
interferones, tal como IFN\alpha, es que el tratamiento de un
sujeto con dosis terapéuticas de IFN\tau no parece estar asociado
con citotoxicidad. En particular, el IFN-\tau no
parece ser tóxico a concentraciones a las que el
IFN-\tau induce toxicidad. Esto se demuestra
mediante experimentos en los que células L929 se trataron con varias
concentraciones de oIFN\tau o MuIFN-\tau (Lee
Biomolecular, San Diego, CA), oscilando desde 6000 U/ml a 200.000
U/ml (Ejemplo 19E).
Se añadió oIFN\tau,
MuIFN-\beta o medio (control) a tiempo cero y se
incubaron las células durante 72 horas. Los resultados de los
experimentos se presentan en la Figura 21. El porcentaje de células
vivas (con respecto al control) se indica a lo largo del eje y
(\pm error típico). El 100% de viabilidad es igual a la viabilidad
de las células L929 tratadas con medio solo. Los resultados indican
que esencialmente oIFN\tau no es tóxico a concentraciones de hasta
100.000 U/ml, y es significativamente menos tóxico que
MuIFN-\beta sobre el intervalo terapéutico
completo de los compuestos.
Se ha demostrado previamente que el tratamiento
in vivo con ambos INF de tipo I, IFN\beta e IFN\alpha, en
humanos y animales causa toxicidad que se manifiesta como varios
efectos secundarios incluyendo fiebre, letargia, taquicardia,
pérdida de peso y leucopenia (Degre, 1974; Fent y Zbinden, 1987). Se
examinó el efecto del tratamiento in vivo con IFN\tau,
IFN\beta, e IFN\alpha (10^{5} U/inyección) sobre la fórmula
leucocitaria (WBC) total, el recuento de linfocitos totales y las
medidas de peso en ratones NZW (Tabla 13) como se describe en el
Ejemplo 19F. No se observaron diferencias significativas entre los
ratones tratados con IFN\tau y los no tratados para WBC, recuento
de linfocitos o cambios de peso.
En comparación, los ratones tratados con
IFN\beta mostraban una caída del 31,7% en el recuento de
linfocitos 12 horas después de la inyección. Además, la caída del
recuento de linfocitos continuó 24 horas después de la inyección de
IFN\beta. Los ratones tratados con IFN\alpha mostraron una caída
del 55,8% de linfocitos y pérdida de peso significativa 12 horas
después de la inyección. Experimentos adicionales realizados como
apoyo de la presente invención demostraban que el IFN\tau no
suprimía la médula ósea a altas dosis. De este modo, parece que el
IFN\tau no tiene toxicidad in vivo a diferencia de
IFN\alpha e IFN\beta como se evidenció por los estudios en
sangre periférica y medidas de peso. Como se describe a
continuación, los experimentos realizados como apoyo de la presente
invención indican que la toxicidad reducida del IFN\tau con
respecto al IFN\beta e IFN\alpha, como se ha resumido
anteriormente, puede ser debida a secuencias presentes en los 37
aminoácidos del extremo N-terminal de IFN\tau, y a
que la sustitución de estas secuencias por las secuencias
correspondientes en los interferones de tipo I no tau, tales como
los IFN\beta y/o los IFN\alpha, puede conferir esta
citotoxicidad reducida en los polipéptidos de fusión de interferón
híbrido resultante.
La diversidad de actividades de IFN\tau, su
potencia y falta de citotoxicidad, según se muestra en la presente
memoria descriptiva, sugieren la importancia del análisis de
estructura/función para este nuevo interferón. La base estructural
para la función de OvIFN\tau se ha examinado usando seis péptidos
sintéticos solapados correspondientes a la secuencia completa de
OvIFN\tau (Figura 6). Los polipéptidos correspondientes derivados
de la secuencia del IFN\tau ovino se presentan como ID. SEC. Nº: 5
a ID. SEC. Nº: 10. Se ha demostrado que tres péptidos que
representan los aminoácidos 1-37,
62-92 y 139-172 inhiben la actividad
antivírica de IFN\tau (Ejemplo 17). Los péptidos eran competidores
eficaces a concentraciones de 300 \muM y superiores.
El polipéptido sintético que representa la región
C-terminal de ovIFN\tau,
OvIFN\tau(139-172), y el péptido interno
OvIFN\tau(62-92), inhibían la actividad
antivírica de IFN\tau y rBoIFN\alpha_{\pi } en el mismo grado,
mientras que el péptido N-terminal
OvIFN\tau(1-37) era más eficaz inhibiendo
la actividad antivírica de OvIFN\tau. Los datos de dosis frente a
respuesta indicaron que IFN\tau(62-92) e
IFN\tau(139-172) inhibían la actividad
antivírica de IFN\tau en el mismo grado. Los mismos péptidos que
bloqueaban la actividad antivírica de IFN\tau también bloqueaban
la actividad antivírica del IFN\alpha recombinante bovino
(rBoIFN\alpha); el IFN\gamma recombinante bovino no estaba
afectado por los péptidos. Estos dos péptidos de IFN\tau pueden
representar regiones de unión a receptor comunes para IFN\tau y
varios IFN\alpha.
Los dos péptidos sintéticos
OvIFN\tau(1-37) y
OvIFN\tau(139-172) también bloqueaban la
actividad anti-VIF y anti-VIH de
OvIFN\tau (Ejemplo 17; Figuras 11A y 11B). Mientras que ambos
péptidos bloqueaban la actividad RT de VIF, sólo el péptido
C-terminal,
OvIFN\tau(139-172), parecía ser un
inhibidor eficaz de la actividad del virus de la estomatitis
vesicular en la línea celular felina, Fc9.
Los antisueros policlonales
anti-péptido contra los péptidos de IFN\tau
rindieron resultados similares a los estudios de inhibición de
polipéptidos, descritos anteriormente. Anticuerpos dirigidos contra
las mismas tres regiones (OvIFN\tau(1-37),
IFN\tau(62-92) e
IFN\tau(139-172)) bloqueaban la función de
OvIFN\tau, confirmando la importancia de estos tres dominios en la
actividad antivírica (Ejemplo 17). Estos péptidos, aunque
aparentemente se unen al receptor de interferón, por sí mismos no
desencadenan en las células efectos semejantes a los del
interferón.
La actividad antiproliferativa del IFN\tau
(Ejemplo 17, Tabla 11) implicaba una región adicional de la
molécula, puesto que IFN\tau(119-150) era
el inhibidor más eficaz de la reducción de proliferación celular
inducida por OvIFN\tau. Este resultado sugiere que la región de la
molécula responsable ante todo de la inhibición de la proliferación
celular es la región IFN\tau(119-150). Esta
región de la molécula de IFN\tau puede ser útil sola o fusionada
con otras proteínas (tales como albúmina sérica, un anticuerpo o un
polipéptido de interferón alfa) como agente antineoplásico. Una
proteína conjugada entre un péptido N-terminal
derivado del interferón-\alpha humano y la
albúmina sérica se demostró que tenía actividad antiproliferación
celular (Ruegg, y col., 1990).
Finalmente, la unión de
^{125}I-OvIFN\tau a su receptor en las células
MDBK se pudo bloquear mediante antisueros frente a 4 de los 6
péptidos; los 4 polipéptidos representan los aminoácidos
1-37, 62-92, 119-150
y 139-172 de OvIFN\tau. Esto refleja los múltiples
dominios de unión, así como el significado funcional de estas
regiones. Puesto que diferentes regiones de IFN\tau están
implicadas en el desencadenamiento de diferentes funciones, la
modificación de los aminoácidos seleccionados podría resultar
potencialmente en interferones semejantes al IFN\tau con actividad
biológica selectiva.
Se han propuesto fragmentos polipeptídicos de
proteínas de IFN\tau humano, que tienen propiedades similares a
los polipéptidos de OvIFN\tau ya descritos, basados en los datos
presentados anteriormente para los fragmentos polipeptídicos de
OvIFN\tau combinados con la información de la secuencia de
HuIFN\tau descrita en este documento. Estos polipéptidos derivados
de la secuencia humana incluyen, aunque sin limitación, los
siguientes: ID. SEC. Nº: 15 a ID. SEC. Nº: 20 y ID. SEC. Nº: 35 a
ID. SEC. Nº: 40.
Consecuentemente con los estudios de péptidos
antagonistas descritos anteriormente y en el Ejemplo 17, los
experimentos descritos en el Ejemplo 18 muestran que altas
concentraciones (hasta un exceso de 10 veces) de OvIFN\tau no son
capaces de competir por el receptor y bloquear los efectos tóxicos
del IFN\alphaA en células MDBK. Una comparación de las propiedades
relativas antivíricas citotóxicas de unión a receptor y de
competición por el receptor de OvIFN\tau y de IFN\alphaA humano
proporciona entendimiento en cuanto a interacciones de ligando y
receptor. El IFN\tau y el IFN\alphaA poseen actividades
antivíricas específicas similares, como se ha demostrado previamente
(Pontzer, y col., 1988). Sin embargo, como se muestra en el Ejemplo
18, el IFN\alphaA tiene una K_{d} para el receptor
aproximadamente 10 veces más baja que la que tiene el IFN\tau y,
por tanto, una afinidad de unión al receptor más alta. Además, el
IFN\alphaA es varias veces más eficaz que el IFN\tau en los
ensayos de competición de unión usando
^{125}I-IFN\tau o
^{125}I-IFN\alphaA (Figuras 24A, 24B). Puesto
que el número de sitios de unión por célula para el IFN\tau y el
IFN\alphaA es muy similar, y el IFN\tau compite con el
IFN\alphaA por la unión, parece que IFN\alphaA e IFN\tau
reconocen el mismo complejo receptor.
Una comparación de las curvas de dosis frente a
respuesta/ocupación para las citotoxicidades y actividades
antivíricas (Figuras 27A y 27B) muestra que la citotoxicidad está
asociada con la ocupación máxima del receptor y, por tanto, con las
afinidades de unión; el IFN\alphaA tiene una mayor afinidad de
unión y, de este modo, posee una toxicidad sustancialmente mayor.
Por otro lado, la actividad antivírica es máxima a concentraciones
que tienen como resultado sólo una fracción pequeña de ocupación de
receptores y no se representa por datos de unión en equilibrio.
Experimentos realizados como apoyo de la presente
invención han demostrado también que el IFN\tau ovino, como el
IFN\alphaA, puede inducir una fosforilación muy rápida de la
quinasa TyK2 asociada al receptor de tipo I y de los factores de
transcripción Stat1\alpha y Stat2. Dadas las escalas de tiempo de
la estimulación por IFN\tau e IFN\alphaA, parece que sólo una
pequeña fracción de los receptores necesita ser ocupada para inducir
la fosforilación de TyK2, Star1\alpha y Stat2. Considerados en
conjunto, estos datos sugieren que la fosforilación de estas
proteínas de la transducción de señales puede no ser suficiente para
inducir la toxicidad celular asociada con "otros" IFN de tipo I
(es decir, IFN de tipo I aparte del IFN-tau).
La afinidad de unión más alta del IFN\alphaA
por el receptor y las propiedades de competición diferencial del
IFN\tau e IFN\alphaA también sugieren que los dos IFN reconocen
el receptor de forma diferente. Experimentos realizados como apoyo
de la presente invención usando antagonistas de péptidos sintéticos,
incluyendo los experimentos descritos en el Ejemplo 17, demostraron
que el péptido C-terminal
IFN\tau(139-172) (ID. SEC. Nº: 10) era
competitivo contra las actividades tanto de IFN\alphaA como
IFN\tau, mientras que el péptido N-terminal
IFN\tau(1-37) (ID. SEC. Nº: 5) era eficaz a
una concentración de 5 a 10 veces superior sólo contra la actividad
de IFN\tau. Los experimentos usando antisueros conseguidos contra
el IFN\tau-(139-172) e
IFN\tau-(1-37) han demostrado que el antisuero
contra el IFN\tau-(1-37) bloquea sólo la unión de
IFN\tau, mientras que el antisuero contra el
IFN\tau-(139-172) bloquea la unión tanto de
IFN\alpha como de IFN\tau. Estos datos sugieren que las
porciones N-terminales del IFN\tau e IFN\alphaA
representan determinantes significativos de la unión de alta
afinidad y que las diferencias en la unión en equilibrio de alta
afinidad entre IFN\alphaA e IFN\tau son debidas a diferencias en
interacciones con el receptor en los extremos N de esas moléculas.
En consecuencia, los extremos N de estas moléculas también parecen
ser determinantes significativos de los efectos citotóxicos de los
IFN.
Los datos anteriores considerados en conjunto
sugieren que las regiones C-terminales de los
interferones de tipo I se unen a un sitio común en el receptor de
interferón de tipo I (es decir, en un sitio que afecta las
propiedades de activación del receptor tanto del IFN\alpha como
del IFN\tau), mientras que la región N-terminal
puede estar implicada en el desencadenamiento de funciones únicas
(es decir, se une a un sitio que afecta sólo a las propiedades de
activación del receptor del IFN\tau). En particular, los datos
sugieren que la región N-terminal es responsable de
la disminución de citotoxicidad del IFN\tau con respecto a otros
IFN de tipo I, por ejemplo, el IFN\alpha.
La presente invención emplea observaciones
respecto a la citotoxicidad disminuida conferida por la región
N-terminal del IFN\tau como apoyo de las
construcciones de ADN quimérico usadas para producir proteínas de
fusión de interferón híbrido que tienen una porción
N-terminal derivada del IFN\tau y una porción
C-terminal derivada de un polipéptido de interferón
de tipo I no tau cuya eficacia como terapéutico está reducida por su
citotoxicidad relativamente alta. Ejemplos de tales polipéptidos de
interferón de tipo I no tau incluyen IFN\beta y varias isoformas
de IFN\alpha.
Con referencia a la Figura 28, tal proteína o
polipéptido de fusión de interferón híbrido 40, codificado por una
molécula quimérica de ácido nucleico, tiene un extremo
N-terminal 42 y un extremo
C-terminal 44. La proteína de fusión se construye
con un primer segmento (N-terminal) 46 y un segundo
segmento (C-terminal) 48. El segmento
N-terminal contiene la secuencia de aminoácidos
N-terminal de un polipéptido de interferón tau
codificado por un extremo 5' de la molécula quimérica de ácido
nucleico. El segmento C-terminal contiene la
secuencia de aminoácidos C-terminal de un
polipéptido de interferón de tipo I no tau y la secuencia de
aminoácidos de un polipéptido de interferón tau codificado por un
segmento del extremo 3' de la molécula quimérica de ácido nucleico.
Los dos segmentos se unen o ayustan en el punto de unión 50 que es
una región (región de unión) que corresponde a la porción de un
polipéptido de interferón maduro en el resto del aminoácido 28.
Nótese que el polipéptido de IFN\tau maduro comienza típicamente
con una cisteína en el aminoácido 24 de la secuencia completa (que
incluye la secuencia líder y comienza con una metionina).
La región de unión está contenida en el péptido
N-terminal de 37 aminoácidos (ID. SEC. Nº: 5)
empleado en los experimentos detallados anteriormente. Un
alineamiento de las secuencias de aminoácidos maduras de varios
clones de IFN\tau, IFN\alpha e IFN\beta entre los aminoácidos
1 a 37 reveló que el mayor grado de divergencia entre las secuencias
tiene lugar cerca del extremo N-terminal. En
particular, el mayor grado de divergencia entre secuencias tiene
lugar entre los aminoácidos 1 y 16, con un grado intermedio de
divergencia entre los aminoácidos 17 a 28. La región entre los
aminoácidos 29 y 37 está relativamente bien conservada entre los
diferentes interferones de tipo I, y se piensa que está implicada en
las interacciones de unión con el receptor del interferón de tipo I
(Fish, 1992).
La unión óptima (es decir, el resto de aminoácido
en posición secuencia arriba del cual (hacia el extremo
N-terminal ó 5') la secuencia corresponde al
interferón tau, y secuencia abajo del cual (hacia el extremo
C-terminal ó 3') corresponde a otro interferón, por
ejemplo, IFN\alpha o IFN\beta) se puede identificar, por
ejemplo, mediante los procedimientos descritos en este documento,
usando péptidos o secuencias de ADN que codifican péptidos que
corresponden a regiones más largas o más cortas en el
IFN\tau(1-37), en combinación con los
ensayos funcionales descritos en este documento (tales como ensayos
antivíricos, antiproliferativos y de citotoxicidad). Se contempla
que, por ejemplo, un interferón híbrido o quimérico de la presente
invención que contiene los aminoácidos 1-28 del
interferón tau y el resto de aminoácidos de un interferón de tipo I
no tau posee la baja toxicidad asociada con el interferón tau junto
con la actividad biológica asociada normalmente atribuida a tal
interferón de tipo I. Por ejemplo, un híbrido de
IFN\tau/IFN\alpha puede, por ejemplo, reducir la toxicidad del
IFN\alpha, pero no interferir con las propiedades antivíricas del
IFN\alpha.
Como se ha expuesto anteriormente, el polipéptido
de fusión de interferón de la presente invención tiene una secuencia
de aminoácidos donde los primeros 28 aminoácidos de la proteína
madura de interferón tiene una secuencia de una molécula de
IFN\tau y los aminoácidos restantes tienen una secuencia de un
polipéptido de interferón de tipo I no tau. Ejemplos de secuencias a
partir de las cuales se pueden seleccionar los primeros 28
aminoácidos de la proteína de fusión de interferón incluyen las
secuencias presentadas en este documento como ID. SEC. Nº: 5, ID.
SEC. Nº: 15, ID. SEC. Nº: 35, ID. SEC. Nº: 45, ID. SEC. Nº: 46, ID.
SEC. Nº: 47, ID. SEC. Nº: 48, ID. SEC. Nº: 49, ID. SEC. Nº: 50, ID.
SEC. Nº: 51, ID. SEC. Nº: 52 y ID. SEC. Nº: 53.
La secuencia restante (es decir, la secuencia de
aminoácidos del "segundo" segmento C-terminal
que está codificada por el segmento del extremo 3' de la molécula
quimérica de ácido nucleico) se puede seleccionar entre cualquier
polipéptido de interferón de tipo I no tau adecuado, tales como
interferón alfa (por ejemplo, alfa-1 o
alfa-2), interferón beta, interferón omega, un
interferón híbrido o un interferón consenso. Las secuencias para los
interferones de tipo I no tau son conocidas en la técnica. Por
ejemplo, Gunther, y col., 1990; Leibowitz, y col., 1990; Goeddel,
1983, 1984, 1987, y Creasey, y col., 1986, 1988, proporcionan
ejemplos de secuencias de interferones híbridos. Stabinsky, 1990,
proporciona ejemplos de secuencias de interferones consenso.
Ejemplos de secuencias de interferón alfa se presentan en Capon,
1983, Dworkin-Rastl, 1989, Sato, 1988 y Sloma, 1988.
Secuencias de interferón alfa y beta adicionales se proporcionan en
Fish, 1992. También se pueden obtener secuencias adecuadas del
GenBank u otros depositarios públicos de secuencias.
La determinación de la posición del resto de
aminoácido del interferón de tipo I no tau con el cual comienza el
segmento del extremo 3' o C-terminal se lleva a cabo
mediante el alineamiento óptimo de las secuencias parentales y
diseñando una unión de modo que la secuencia de la molécula
quimérica de interferón resultante esté alineada perfectamente con
(i) la secuencia de interferón tau parental en el segmento del
extremo 5' o N-terminal y (ii) la secuencia de
interferón de tipo I no tau parental en el segmento del extremo 3' o
C-terminal. Las secuencias parentales, por supuesto,
son las secuencias de interferón a partir de las cuales derivan el
segmento del extremo 5' o N-terminal y el segmento
del extremo 3' o C-terminal.
La posición del resto en el interferón de tipo I
no tau con el cual comienza el segmento del extremo 3' o
C-terminal es típicamente el número siguiente al
último resto de aminoácido del segmento del extremo 5' o
N-terminal de IFN-tau.
Las realizaciones preferidas de la presente
invención son proteínas de fusión donde las secuencias tanto del
segmento N-terminal como del
C-terminal derivan de secuencias de interferón
humano. Por ejemplo, construcciones donde los primeros 28
aminoácidos corresponden a los primeros 28 aminoácidos de la ID.
SEC. Nº: 15 o ID. SEC. Nº: 35 y la secuencia restante corresponde a
la de un interferón alfa o beta humano. Las secuencias de interferón
tau humano se presentan, por ejemplo, en Bazer, y col., 1994. Las
secuencias de interferón alfa y beta se pueden obtener del
GenBank.
Se apreciará que aunque las proteínas de fusión
de interferón descritas son proteínas "maduras", esto es,
comienzan con el resto 24 de la secuencia de interferón completa, la
invención también incluye proteínas de fusión y moléculas quiméricas
de ácido nucleico que codifican proteínas de fusión que contienen la
secuencia líder, es decir, que comienzan con la metionina de
iniciación. La secuencia líder en estas proteínas de fusión de
interferón puede derivar a partir de interferón de tipo I tau o no
tau.
Además, se entenderá que las secuencias tanto del
primero como del segundo fragmento pueden ser secuencias
"consenso". En otras palabras, la secuencia del segmento 5',
podría no corresponder a un IFN\tau "natural", sino a una
secuencia consenso obtenida mediante la comparación de secuencias
alineadas de varios IFN\tau diferentes. De forma similar, la
secuencia del segmento 3' podría no corresponder a un IFN de tipo I
no tau "natural", sino a una secuencia consenso obtenida
mediante la comparación de secuencias alineadas de varios IFN de
tipo I no tau.
Alternativamente, la secuencia de cualquier
fragmento puede corresponder a una secuencia "internamente
consistente", es decir, a una secuencia donde cada posición en la
secuencia contiene un resto que se encuentra en al menos una
isoforma de origen natural de un IFN\tau (para el segmento
N-terminal) o un IFN de tipo I no tau (para el
segmento C-terminal) en esa posición, pero donde la
secuencia final no corresponde a ninguna isoforma de origen natural
ni a ninguna secuencia consenso. Por ejemplo, si dos isoformas, cada
una de 3 aminoácidos de longitud, tienen las secuencias "C R S"
y "C K G", una secuencia internamente consistente es "C R
G".
Además, se apreciará que la presente invención
también incluye más quimeras complejas, por ejemplo, quimeras que
contienen más de una región discreta derivada del IFN\tau y/o más
de una región de otro interferón adecuado. Estas quimeras pueden
originarse, por ejemplo, en casos donde el interferón de tipo I no
tau que comprende el segundo segmento (C-terminal)
es en sí mismo un interferón híbrido formado de, por ejemplo, un
interferón alfa y un interferón beta (Creasey, y col., 1986, 1988),
un interferón alfa1 y un interferón alfa2 (Leibowitz, y col., 1990)
o un interferón alfa y un interferón omega (Gunther, y col.,
1990).
Como se ha indicado anteriormente, una
considerable ventaja contemplada para las composiciones de proteínas
de fusión de interferón híbrido de la presente invención es la
reducida toxicidad de las composiciones con respecto a los
interferones de tipo I no tau nativos que, por ejemplo, se han
aprobado como terapéuticos. Las composiciones de híbridos pueden
tener la misma actividad biológica que los interferones de tipo I no
tau aprobados con la citotoxicidad disminuida del IFNtau.
Las moléculas de ácido nucleico quiméricas pueden
producirse sintéticamente o con protocolos y manipulaciones
moleculares convencionales (Ausubel, y col., 1988; Sambrook, y col.,
1989) como se ilustra en este documento. Las secuencias de ADN que
codifican los polipéptidos parentales (los dos polipéptidos a partir
de cuyas secuencias derivan los dos segmentos que forman la proteína
híbrida) se clonan adyacentes el uno del otro en un vector de
expresión usando procedimientos de recombinación convencionales (por
ejemplo, mediante el diseño de sitios de restricción que no alteren
la secuencia de aminoácidos traducida dentro de las secuencias de
ADN, la digestión de los plásmidos y la clonación de fragmentos
apropiados en el vector de expresión seleccionado). Ejemplos de
vectores de expresión adecuados se han descrito anteriormente.
Los polipéptidos de fusión de interferón híbrido
recombinante se producen entonces a partir de tales vectores de
expresión como se ha descrito anteriormente, se purifican y se
emplean para el tratamiento de enfermedades y/o dolencias que se
benefician del tratamiento con interferón.
Los datos de las secciones anteriores demuestran
la identificación de péptidos sintéticos que tienen cuatro sitios
discontinuos en la proteína de OvIFN\tau que están implicados en
la interacción con el receptor y en la actividad biológica. Para
explicar la relación estructural de estas regiones, se abordó el
modelado de la estructura tridimensional del IFN\tau. Un modelo
tridimensional podría ser útil para la interpretación de datos
existentes y el diseño de futuros estudios de
estructura/función.
Combinando los datos de dicroismo circular (DC)
del OvIFN\tau recombinante de longitud completa y del IFN\beta
(una proteína de estructura tridimensional conocida (Senda, y col.,
1992)), se construyó un modelo de OvIFN\tau. La característica más
llamativa de este modelo es que IFN\tau está dentro de una clase
de proteínas con un motivo de cuatro hélices empaquetadas. Los
espectros de DC del IFN\tau se tomaron en un espectropolarímetro
AVIV 60 S. Se emplearon dos procedimientos diferentes para las
estimaciones de la estructura secundaria, el algoritmo de Perczel, y
col., (1991) y la selección variable de W.C. Johnson, Jr.
(1992).
Las estimaciones de la estructura secundaria de
los espectros indican el 70-75% de alfa hélice
(caracterizada por mínimos a 222 y 208 nm y máximo a 190 nm). El
algoritmo de selección variable estima que el resto de la molécula
es el 20% beta laminar y 10% de giro. El método de Chang estima que
el resto es el 30% de espiral al azar. El alineamiento de las
secuencias de IFN\tau e IFN\beta reveló homología entre las dos
moléculas, específicamente entre las regiones de estructura
helicoidal conocida en IFN\beta. El análisis de la secuencia de
IFN\tau también demostró que las regiones helicoidales propuestas
poseen una periodicidad apolar indicativa de un motivo de cuatro
hélices empaquetadas.
La etapa final de modelado fue aplicar los
coordinados cristalográficos por rayos x de IFN\beta del esqueleto
de carbono de IFN\beta a la secuencia del IFN\tau. Los dominios
funcionalmente activos del IFN\tau, identificados anteriormente,
se localizaban en un lado de la molécula y se encontró que estaban
en estrecha proximidad espacial. Esto es consistente con los
múltiples sitios de unión en IFN\tau que interaccionan
simultáneamente con el receptor de IFN de tipo I.
Los datos de modelado tridimensional combinados
con los datos de función descritos anteriormente, proporcionan la
información necesaria para introducir variaciones de secuencia en
regiones específicas del IFN\tau para potenciar funciones
seleccionadas (por ejemplo, antivírica o antiproliferación celular)
o para sustituir una región o regiones de función seleccionada en
otra molécula de interferón (por ejemplo, antivírica, antineoplásica
o citotoxicidad reducida).
La construcción de un gen sintético para
OvIFN\tau se describe en el Ejemplo 3. Brevemente, una secuencia
de aminoácidos de OvIFN\tau se retrotranscribió a partir de un
ADNc de OvIFN\tau (Imakawa, y col., 1987) usando un uso de codones
óptimos para E. coli. La secuencia se editó para incluir 20
únicos sitios de restricción espaciados a lo largo de la longitud de
la construcción. Esta secuencia del gen sintético de 540 pares de
bases se dividió en 11 fragmentos de oligonucleótidos. Se
sintetizaron y clonaron los fragmentos individuales, de cadena
sencilla o doble, en pTZ 19R, pTZ 18R o pBluescript, se amplificaron
y se fusionaron. La construcción de OvIFN\tau sintético se clonó
entonces en un vector de expresión
pIN-III-ompA modificado para la
expresión en bacterias y también se clonó en un plásmido de
expresión de levadura. Un gen sintético de IFNr humano construido de
forma similar (ID. SEC. Nº: 3) se ha diseñado, construido y
expresado en células de levadura.
La expresión del gen sintético de OvIFN\tau en
levaduras (Ejemplo 4) permitió la sobreproducción de IFN\tau
recombinante en S. cerevisiae: se pueden purificar grandes
cantidades (5-20 mg/l) de IFN\tau recombinante a
partir de extracto soluble de levadura usando de forma secuencial
cromatografía de intercambio iónico y de exclusión molecular. El
IFN\tau recombinante purificado de esta forma muestran una potente
actividad antivírica (2 a 3 x 10^{8} unidades/mg) similar al
OvIFN\tau nativo.
La construcción del gen sintético facilita la
introducción de mutaciones para una posible potenciación de las
actividades antitumoral (antiproliferativa celular) y antivírica.
Además las regiones dispares de la molécula, responsables de las
diferentes funciones se pueden modificar independientemente para
generar una molécula con una función deseada. Por ejemplo, se han
construido dos mutantes de deleción,
OvIFN\tau(1-162) y
OvIFN\tau(1-166) para examinar la fusión de
las secuencias carboxi terminales en moléculas de IFN\tau.
Se han construido moléculas de IFN\tau mutantes
adicionales para identificar restos críticos para la actividad
antiproliferativa. Por ejemplo, un resto en particular, TYR 123 se
ha implicado en la actividad antiproliferativa celular del
IFN\alpha (MacInnes, y col., 1989). El equivalente de la TYR 123
en el IFN\tau está contenido en el péptido
OvIFN\tau(119-150): este polipéptido inhibe
la actividad antiproliferativa de OvIFN\tau y de IFN\alpha
humano. Se han generado mutaciones que convierten la TYR 123 en
sustituciones conservativas (TRP) y no conservativas (ASP), así como
secuencias mutantes con la deleción de este resto. El codon para la
TYR 123 se localiza en un sitio SspI; se ha usado la
eliminación de este sitio para la selección. La actividad
antiproliferativa de estos IFN\tau mutantes se evaluaron como se
describe en este documento.
Se pueden generar péptidos sintéticos que
corresponden a los polipéptidos de IFN\tau de la presente
invención. Los péptidos sintéticos pueden sintetizarse
comercialmente o prepararse utilizando procedimientos y aparatos
convencionales en la técnica (Applied Biosystems, Foster City
CA).
Alternativamente, las secuencias de
oligonucleótidos que codifican péptidos pueden sintetizarse bien
directamente por procedimientos convencionales de síntesis de
oligonucleótidos, o bien, en el caso de grandes secuencias
codificadoras, sintetizarse mediante una serie de etapas de
clonación que implican un ordenamiento en tándem de múltiples
fragmentos de oligonucleótidos en la secuencia codificadora (Crea,
1989; Yoshio, y col., 1989; Eaton, y col., 1988). Las secuencias
codificadoras de oligonucleótidos se pueden expresar por
procedimientos convencionales de recombinación (Maniads, y col.,
1982; Ausubel, y col., 1988).
Las actividades biológicas de los polipéptidos de
interferón-\tau descritos anteriormente pueden
explotarse usando los polipéptidos de
interferón-\tau solos o conjugados o fusionados
con otras proteínas como se ha descrito anteriormente y más
adelante.
También se describe
interferón-\tau unido covalentemente a un segundo
polipéptido para formar una proteína de fusión o híbrida. Las
secuencias de interferón-\tau para construir estas
proteínas de fusión puede ser interferón-\tau
producido de forma recombinante o una porción bioactiva de él, como
se ha descrito anteriormente.
Por ejemplo, donde se usa el
interferón-\tau para inhibir la expresión vírica,
pueden fusionarse de forma ventajosa polipéptidos derivados de
IFN\tau que demuestren actividad antivírica con un polipéptido de
interferón alfa. En una realización, descrita anteriormente con
referencia a polipéptidos de fusión de interferón híbrido, los
polipéptidos de IFN\tau proporcionan un procedimiento de reducción
de la toxicidad de otras moléculas de interferón (por ejemplo,
IFN\beta o IFN\alpha) reemplazando la región asociada con la
toxicidad de tales interferones por las correspondientes regiones
del interferón-\tau que tienen más baja toxicidad.
También se describen proteínas de fusión que contienen regiones de
interferón-\tau que tienen propiedades de
antiproliferación celular. Estas regiones pueden obtenerse a partir,
por ejemplo, de secuencias de interferón-\tau
humano, descritas en este documento.
Las proteínas fusionadas pueden formarse mediante
conjugación química o mediante técnicas de recombinación. En el
primer procedimiento, el interferón y el segundo polipéptido
seleccionado se modifican mediante agentes de acoplamiento
convencionales para la unión covalente. En un ejemplo de
procedimiento para acoplar albúmina de suero soluble a un
polipéptido de interferón, se deriva la albúmina de suero con
tioacetato de
N-succinimidil-S-acetilo
(Duncan, y col., 1983), rindiendo albúmina de suero tiolada. El
polipéptido de albúmina de suero activado se hace reaccionar
entonces con interferón derivado con
3-(2-piridilditio)propionato de
N-succinimidilo (Cumber, y col., 1985) para producir
la proteína fusionada unida a través de un puente disulfuro.
Como procedimiento alternativo, el interferón
recombinante puede prepararse con un resto de cisteína para permitir
el acoplamiento disulfuro del interferón a un ligando activado,
simplificando de este modo la reacción de acoplamiento. Un vector de
expresión de interferón-\tau, usado para la
producción de interferón-\tau recombinante, puede
modificarse para la inserción de un codon de cisteína interno o
terminal según procedimientos convencionales de mutagénesis dirigida
a sitio (Ausubel, y col., 1988).
En un procedimiento, una proteína fusionada se
prepara de forma recombinante usando un vector de expresión en el
que la secuencia codificadora de un segundo polipéptido seleccionado
se une a la secuencia codificadora del
interferón-\tau. Por ejemplo, las secuencias que
codifican la albúmina sérica humana se pueden fusionar en marco con
la secuencia codificadora de un polipéptido de
interferón-\tau, tales como, ID. SEC. Nº: 9, ID.
SEC. Nº: 19 o ID. SEC. Nº: 39. La proteína fusionada se expresa
entonces usando una célula hospedadora adecuada. La proteína de
fusión puede purificarse mediante procedimientos de cromatografía de
exclusión molecular e intercambio iónico, con la purificación
adicional mediante la separación electroforética en gel de
poliacrilamida y/o cromatografía HPLC, si es necesario.
Se apreciará de lo anterior cómo pueden
prepararse proteínas de fusión que contengan
interferón-\tau. Una variación sobre la fusión
anterior es intercambiar posiciones del
interferón-\tau y de la segunda molécula de
proteína seleccionada en la proteína de fusión (por ejemplo,
fusiones del extremo carboxi terminal frente al extremo amino
terminal). Además, posiciones internas de un polipéptido de
interferón-\tau nativo (por ejemplo, regiones de
aminoácidos de entre 15 y 172 aminoácidos) se pueden ensamblar en
polipéptidos donde dos o más de tales porciones de
interferón-\tau, que normalmente están
discontinuas en la proteína nativa, están contiguas.
Las proteínas de fusión que contienen los
antígenos de polipéptidos de la presente invención fusionados con la
proteína glutatión-S-transferasa
(Sj26) pueden expresarse usando el sistema vector
pGEX-GLI en células E. coli JM101. La
proteína Sj26 fusionada puede aislarse fácilmente mediante una
cromatografía de afinidad con el sustrato glutatión (Smith, D.B., y
col., 1988). La expresión y purificación parcial de las proteínas de
IFN se describe en el Ejemplo 21 y se puede aplicar a cualquiera de
los polipéptidos solubles inducidos codificados por secuencias
descritas en la presente invención.
Las proteínas de fusión GST (Sj26) insolubles
pueden purificarse mediante electroforesis preparativa en gel.
También se incluye en la invención un vector de
expresión, tales como los vectores lambda gt11 de pGEX descritos
anteriormente, que contienen las secuencias codificadoras de
IFN\tau y los elementos de control de la expresión que permiten la
expresión de las regiones codificadoras en un hospedador adecuado.
Los elementos de control generalmente incluyen un promotor, un codon
de iniciación de la traducción y secuencias de terminación de la
transcripción y traducción, y un sitio de inserción para introducir
el inserto en el vector.
El ADN que codifica el polipéptido deseado se
puede clonar en muchos vectores (discutido anteriormente) para
generar la expresión del polipéptido en el sistema hospedador
apropiado. Estos polipéptidos recombinantes se pueden expresar como
proteínas de fusión. Pueden diseñarse vectores de expresión con
varios elementos, tales como secuencias líderes que promueven la
secreción de las secuencias expresadas en el medio de cultivo. Los
IFN producidos de forma recombinante, y los polipéptidos derivados
de ellos, se aíslan típicamente a partir de las células lisadas o de
los medios de cultivo. La purificación puede realizarse mediante
procedimientos conocidos en la técnica incluyendo el fraccionamiento
salino, cromatografía de intercambio iónico y cromatografía de
afinidad. Puede emplearse cromatografía de inmunoafinidad usando
anticuerpos generados contra antígeno seleccionados de IFN\tau o
interferón hibrido.
Los interferones de tipo I muestran potentes
propiedades antivíricas. La actividad antivírica del IFN\tau tiene
amplias aplicaciones terapéuticas sin los efectos tóxicos que se
asocian generalmente con los IFN\alpha. Aunque la presencia de
IFN\tau en el medio de cultivo inhibía la actividad transcriptasa
inversa del virus de la inmunodeficiencia felina (Ejemplo 11), esto
no se debe a un efecto directo del IFN\tau sobre la transcriptasa
inversa. Antes bien, parece que el IFN\tau induce en la célula
hospedadora la producción de un factor o factores que inhiben la
transcriptasa inversa del virus.
Se ha encontrado que el IFN\tau ejerce su
actividad antivírica sin efectos adversos sobre las células: no se
han observado evidencias de efectos citotóxicos atribuibles a la
administración de IFN\tau. Es la falta de citotoxicidad del
IFN\tau lo que le hace extremadamente valioso como agente
terapéutico in vivo. Esta falta de citotoxicidad diferencia
al IFN\tau de la mayoría de los otros agentes antivíricos
conocidos y de todos los demás interferones conocidos.
Se pueden usar formulaciones que comprenden
compuestos de fusión de interferón híbrido de la presente invención
que contienen IFN\tau para inhibir la replicación vírica.
Los polipéptidos de fusión de interferón híbrido
de la presente invención pueden emplearse en procedimientos que
afectan a la relación inmune entre el feto y la madre, por ejemplo,
para prevenir la transmisión de virus maternos (por ejemplo, VIH) al
feto en desarrollo. Las composiciones de interferón humano son
particularmente útiles para el tratamiento de humanos, ya que son
menos probables las respuestas antigénicas potenciales usando una
proteína homóloga.
Los interferones de tipo I muestran una potente
actividad antiproliferación celular. Interferones híbridos tales
como los que se describen en este documento pueden usarse también
para inhibir el crecimiento celular sin los efectos secundarios
negativos asociados con otros interferones que se conocen
actualmente. Pueden usarse formulaciones que comprenden los
compuestos de interferón híbrido de la invención en cuestión para
inhibir, prevenir o ralentizar el crecimiento tumoral.
El desarrollo de ciertos tumores está mediado por
estrógenos. Experimentos realizados como apoyo a la presente
invención indican que el IFN\tau puede suprimir numerosos
receptores de estrógenos. Por tanto, pueden usarse composiciones que
contienen IFN\tau en el tratamiento o prevención de tumores
dependientes de estrógenos.
Las enfermedades que se pueden tratar usando
procedimientos de la presente invención incluyen enfermedades
autoinmunes, inflamatorias, proliferativas e hiperproliferativas,
así como manifestaciones cutáneas de enfermedades mediadas
inmunológicamente. En particular, los procedimientos de la presente
invención son ventajosos para tratar dolencias relacionadas con la
hipersensibilidad del sistema inmunitario. Hay cuatro tipos de
hipersensibilidad del sistema inmunitario (Clayman). El tipo I, o
hipersensibilidad inmediata/anafiláctica, se debe a la
desgranulación de mastocitos en respuesta a un alergeno (por
ejemplo, polen), e incluye asma, rinitis alérgica (fiebre del heno),
urticaria (ronchas), choque anafiláctico y otras enfermedades de
naturaleza alérgica. El tipo II, o hipersensibilidad autoinmune, se
debe a anticuerpos que se dirigen contra "antígenos" detectados
en las células del propio cuerpo. La hipersensibilidad de tipo III
se debe a la formación de complejos inmunes antígeno/anticuerpo que
se depositan en diversos tejidos y activan respuestas inmunes
adicionales, y es responsable de dolencias tales como la enfermedad
del suero, alveolitis alérgica y los grandes hinchazones que a veces
se forman después de las vacunaciones de refuerzo. La
hipersensibilidad de tipo IV se debe a la liberación de linfoquinas
de linfocitos T sensibilizados, lo que da lugar a una reacción
inflamatoria. Los ejemplos incluyen dermatitis de contacto, la
erupción del sarampión y reacciones "alérgicas" a ciertos
medicamentos.
Los mecanismos por los cuales ciertas dolencias
pueden dar lugar a hipersensibilidad en algunos individuos
generalmente no se entienden bien, pero pueden implicar tanto
factores genéticos como extrínsecos. Por ejemplo, bacterias, virus o
medicamentos pueden tener una función importante en el
desencadenamiento de una respuesta inmune en un individuo que ya
tiene una predisposición genética al trastorno autoinmune. Se ha
sugerido que la incidencia de algunos tipos de hipersensibilidad
puede estar correlacionada con otros. Por ejemplo, se ha propuesto
que individuos con ciertas alergias comunes son más susceptibles a
trastornos autoinmunes.
Los trastornos autoinmunes se pueden agrupar
aproximadamente en aquellos restringidos principalmente a órganos o
tejidos específicos y aquellos que afectan al cuerpo entero.
Ejemplos de trastornos específicos de órgano (con el órgano
afectado) incluyen esclerosis múltiple (procesos de mielinización
del nervio), diabetes mellitus de tipo I (páncreas), tiroiditis de
Hashimoto (glándula del tiroides), anemia perniciosa (estómago),
enfermedad de Addison (glándulas adrenales), miastenia grave
(receptores de acetilcolina en las uniones neuromusculares),
artritis reumatoide (revestimiento de la articulación), uveítis
(ojo), psoriasis (piel), síndrome de Guillain-Barré
(células nerviosas) y enfermedad de Grave (tiroides). Las
enfermedades autoinmunes sistémicas incluyen lupus eritematoso
sistémico y dermatomiositis.
Otros ejemplos de trastornos de hipersensibilidad
incluyen asma, eccema, dermatitis atópica, dermatitis de contacto,
otras dermatitis eccematosas, dermatitis seborreica, rinitis, liquen
plano, pénfigo, penfigoide ampollar, epidermólisis ampollar,
urticaria, angiodermas, vasculitis, eritemas, eosinofilias cutáneas,
alopecia areata, ateroesclerosis, cirrosis biliar primaria y
síndrome nefrótico. Las enfermedades relacionadas incluyen
inflamaciones intestinales, tales como enfermedad celiaca,
proctitis, gastroenteritis eosinofílica, mastocitosis, enfermedad
inflamatoria intestinal, enfermedad de Crohn y colitis ulcerativa,
así como alergias relacionadas con los alimentos.
Enfermedades autoinmunes particularmente
sensibles al tratamiento usando los procedimientos de la presente
invención incluyen esclerosis múltiple, diabetes mellitus de tipo I
(dependiente de insulina), lupus eritematoso, esclerosis lateral
amiotrófica, enfermedad de Crohn, artritis reumatoide, estomatitis,
asma, uveítis, alergias y psoriasis.
Pueden usarse medicamentos que contienen IFNhib
para tratar terapéuticamente y, por tanto, aliviar los síntomas de
trastornos autoinmunes tales como aquellos descritos
anteriormente.
Los polipéptidos de fusión de interferón híbrido
de la presente invención pueden formularse según procedimientos
conocidos para preparar composiciones farmacéuticamente útiles. Se
han descrito previamente formulaciones que comprenden compuestos de
interferones o semejantes a interferones (por ejemplo, Martin,
1976). En general, las composiciones de la invención en cuestión se
formularán de modo que una cantidad eficaz del interferón híbrido se
combina con un vehículo adecuado para facilitar la administración
eficaz de la composición.
Las composiciones usadas en estas terapias pueden
estar también en una diversidad de formas. Estas incluyen, por
ejemplo, formas de dosificación sólidas, semisólidas y líquidas,
tales como comprimidos, píldoras, polvos, soluciones o suspensiones
líquidas, liposomas, supositorios, soluciones inyectables y
soluciones infundibles. La forma preferida depende del modo de
administración deseado y de la aplicación terapéutica. Las
composiciones también incluyen preferiblemente vehículos y
adyuvantes farmacéuticamente aceptables convencionales que son
conocidos por aquellos expertos en la materia. Preferiblemente, las
composiciones de la invención están en forma de una única dosis y se
administrará generalmente al paciente una o más veces al día.
Los polipéptidos de fusión de interferón híbrido
pueden administrarse a un paciente en cualquier forma de
dosificación farmacéuticamente aceptable, incluyendo bebible,
inhalación, pulverizador intranasal, inyección intraperitoneal,
intravenosa, intramuscular, intralesional o subcutánea. Pueden
usarse específicamente composiciones y procedimientos usados para
otros compuestos de interferón para la administración de estos
compuestos.
Una ventaja principal de estos compuestos de la
invención en cuestión, sin embargo, es la extremadamente baja
citotoxicidad de las proteínas de IFN\tau. Debido a esta baja
citotoxicidad, es posible administrar las composiciones de
interferón híbrido a concentraciones que son mayores que las que
generalmente se pueden utilizar para otros compuestos de interferón
(por ejemplo, IFN\alpha). De este modo, se contempla que las
composiciones de interferón híbrido de la presente invención pueden
administrarse a tasas de aproximadamente 5 x 10^{4} a 20 x
10^{6} unidades/día a aproximadamente 500 x 10^{6} unidades/día
o más. En una realización preferida, la dosificación es de
aproximadamente 20 x 10^{6} unidades/día. Se prefieren altas dosis
para la administración sistémica. Debe entenderse, por supuesto, que
las composiciones y procedimientos de esta invención pueden usarse
en combinación con otras terapias.
Una vez se ha producido la mejora de la dolencia
del paciente, si es necesario se administra una dosis de
mantenimiento. Posteriormente, la dosificación o la frecuencia de
administración, o ambas, pueden reducirse, en función de los
síntomas, a un nivel al cual se mantiene la dolencia mejorada.
Cuando los síntomas se han aliviado al nivel deseado, el tratamiento
debe cesar. Los pacientes pueden, sin embargo, necesitar tratamiento
intermitente a largo plazo en función de cualquier recurrencia de
los síntomas de la enfermedad.
Las composiciones de la invención en cuestión
pueden administrarse mediante procedimientos convencionales para
tratar una diversidad de cánceres y enfermedades víricas incluyendo
aquellas para las cuales otros interferones han demostrado
previamente actividad. Véase, por ejemplo, Finter, y col., 1991;
Dianzani, 1992; Francis, y col., 1992 y las Patentes de EE. UU. Nº
4.885.166 y 4.975.276. Sin embargo, como se ha planteado
anteriormente, las composiciones de la invención en cuestión tienen
características y ventajas únicas, incluyendo la capacidad para
tratar estas dolencias sin toxicidad.
Los trastornos de la piel pueden tratarse de
forma intralesional usando interferones híbridos de la presente
invención, en el que la formulación y dosis dependerá del
procedimiento de administración y del tamaño y gravedad de la lesión
que se va a tratar. Los procedimientos preferidos incluyen
inyecciones intradérmicas y subcutáneas. Pueden ser posibles
múltiples inyecciones en lesiones grandes, y pueden tratarse a la
vez varias lesiones en la piel de un único paciente. El programa
para la administración puede determinarse por una persona experta en
la materia. Las formulaciones diseñadas para liberación mantenida
puede reducir la frecuencia de administración.
El tratamiento sistémico es esencialmente
equivalente para todas las aplicaciones. Son posibles dosis
intravenosas, subcutáneas y/o intramusculares múltiples, y en el
caso de procedimientos con implantes para tratamiento, son
particularmente útiles las formulaciones diseñadas para liberación
mantenida. Los pacientes pueden tratarse usando portales, depósitos
o bombas subcutáneas implantables.
El tratamiento regional con los polipéptidos de
fusión de interferones híbridos de la presente invención es útil
para el tratamiento de cánceres en órganos específicos. El
tratamiento puede llevarse a cabo mediante infusión intraarterial.
Puede implantarse quirúrgica o angiográficamente un catéter para
dirigir el tratamiento al órgano afectado. Se puede usar un portal
subcutáneo conectado al catéter para el tratamiento crónico, o se
puede emplear también una bomba recargable implantable.
Los siguientes ejemplos ilustran, aunque de
ninguna forma pretenden limitar la presente invención.
Las endonucleasas de restricción, ADN ligasa de
T4, polinucleótido quinasa de T4, ADN polimerasa Taq y
fosfatasa intestinal de ternera se adquirieron de New England
Biolabs (Beverly, MA) o Promega Biotech (Madison, WI): estos
reactivos se usaron de acuerdo a las instrucciones del fabricante.
Para las reacciones de secuenciación, se usó un kit de secuenciación
"SEQUENASE DNA II" (United States Biochemical Corporation,
Cleveland, OH). Los reactivos de inmunotransferencia y otros eran de
Sigma Chemical Co. (St. Louis, MO) o Fisher Scientific (Needham,
MA). Los filtros de nitrocelulosa se obtienen de Schleicher y
Schuell (Keene, NH).
Los conectores y cebadores de oligonucleótidos
sintéticos se preparan usando sintetizadores de oligonucleótidos
automatizados disponibles en el mercado (por ejemplo, un
sintetizador de ADN ABI modelo 380B-02 (Applied
Biosystems, Foster City, CA)). De forma alternativa, pueden
adquirirse oligonucleótidos sintéticos diseñados de encargo, por
ejemplo, de Synthetic Genetics (San Diego, CA). El kit de síntesis
de ADNc y los kit de marcaje de cebadores aleatorios se obtienen de
Boehringer-Mannheim Biochemical (BMB, Indianapolis,
IN).
Las secuencias de oligonucleótidos que codifican
los polipéptidos pueden sintetizarse directamente mediante
procedimientos convencionales de síntesis de oligonucleótidos o, en
el caso de secuencias codificadoras grandes, sintetizarse mediante
una serie de etapas de clonación que implican un ordenamiento en
tándem de fragmentos múltiples de oligonucleótidos correspondientes
con la secuencia codificadora (Crea, 1989; Yoshio, y col., 1989;
Eaton, y col., 1988). Las secuencias codificadoras de
oligonucleótidos pueden expresarse mediante procedimientos de
recombinación convencionales (Maniatis, y col., 1982; Ausubel, y
col., 1988). De forma alternativa, los péptidos pueden sintetizarse
directamente mediante técnicas in vitro convencionales
(Applied Biosystems, Foster City,
CA).
CA).
El IFN\alpha humano recombinante
(rHuIFN\alpha) y rBoIFN\gamma se obtuvieron de Genentech Inc.
(South San Francisco, CA). La preparación de referencia del
IFN\alpha humano recombinante (rHuIFN\alpha) se obtuvo de los
Institutos Nacionales de la Salud: el rHuIFN\alpha está disponible
en el mercado en Lee Biomolecular (San Diego, CA). El IFN\alphaA
humano recombinante purificado (2 x 10^{8} unidades/mg) se obtuvo
de Biosource International (Camarillo, CA). A menos que se indique
lo contrario, la concentración de proteína se determinó con un kit
de ensayo de ácido bicinconínico (Pierce, Rockford, IL) de acuerdo a
las instrucciones del fabricante.
Las manipulaciones comunes implicadas en la
obtención de anticuerpos policlonales y monoclonales, incluyendo la
purificación de anticuerpos a partir de los sueros, se realizan
mediante procedimientos convencionales (Harlow, y col., 1988).
Pierce (Rockford, IL) es fuente de muchos reactivos de
anticuerpos.
Los anticuerpos antipéptido de conejo purificados
por afinidad específicos de Tyk2, Stat1\alpha y Stat2 se
adquirieron de Santa Cruz Biotechnology (Santa Cruz, CA). El
anticuerpo monoclonal antifosfotirosina (4G10) se obtuvo de Upstate
Biotechnology (Lake Placid, NY). Las transferencias por Western se
desarrollaron con un kit de detección de quimioluminiscencia
potenciada (ECL) (Amersham Corp., Arlington Heights, IL).
La línea celular de riñón bovino MDBK y la línea
celular de linfoma de Burkitt humano Daudi se obtuvieron de la
American Type Culture Collection (ATCC; Rockville, MD). Las células
Daudi se crecieron en medio RPMI 1640 complementado con suero bovino
fetal al 20% y antibióticos (Gibco/BRL, Gaithersburg, MD). Las
células MDBK se crecieron en medio mínimo esencial de Eagle (EMEM)
complementado con suero de caballo al 10% y antibióticos
(Gibco/BRL).
Todos los medios de cultivo tisular, sueros y los
IFN usados en este estudio eran negativos para la endotoxina, como
se determinó mediante el ensayo con lisado de amebocito de Limulus
(Associates of Cape Cod, Woods Hole, MA) a un nivel de sensibilidad
de 0,07 ng/ml.
Se cubrieron placas de 96 pocillos de
poliestireno Immulon II (PGC) con 5 \mug/ml (100 \mul por
pocillo) de antígeno en tampón carbonato/bicarbonato 0,1 M, pH 9,5.
Las placas se sellaron con parafilm y se conservaron a 4ºC durante
una noche.
Las placas se aspiraron y se bloquearon con 300
\mul de NGS al 10% y se incubaron a 37ºC durante 1 h.
Las placas se lavaron 5 veces con PBS con
"TWEEN-20" al 0,5%.
Los antisueros se diluyeron en PBS 0,1 M, pH 7,2.
Se añadieron la dilución o diluciones deseadas de los antisueros
(0,1 ml) a cada pocillo y se incubó la placa 1 hora a 37ºC. Entonces
se lavaron las placas 5 veces con PBS con
"TWEEN-20" al 0,5%.
El antisuero antihumano de cabra conjugado con
peroxidasa de rábano (HRP) (Cappel) se diluyó 1/5.000 en PBS. Se
añadieron 0,1 ml de esta solución a cada pocillo. Se incubaron las
placas 30 min a 37ºC, luego se lavaron 5 veces con PBS.
El ABTS (sustrato) de Sigma se preparó justo
antes de añadirlo a la placa.
El reactivo contiene 50 ml de ácido cítrico 0,05
M, pH 4,2, 0,078 ml de solución de peróxido de hidrógeno al 30% y 15
mg de ABTS. Se añadieron 0,1 ml del sustrato a cada pocillo y se
incubó entonces durante 30 min a temperatura ambiente. La reacción
se detuvo con la adición de 0,05 ml de SDS al 5% (p/v). La
absorbancia relativa se determina a 410 nm.
Se examinó el efecto del
interferón-\tau en la vida del cuerpo lúteo.
Se infundió IFN\tau en el lumen uterino de
ovejas a las concentraciones dadas en la Tabla 1. Se infundió
IFN\alpha humano recombinante (rHuIFN\alpha) a concentraciones
similares. Además, también se usaron animales de control que
recibieron proteínas de control. Se valoró la vida del cuerpo lúteo
mediante el examen de los intervalos interestro, el mantenimiento de
la secreción de progesterona y la inhibición de la secreción de
prostaglandina (Davis, y col., 1992).
Interferón | Tratamiento | Intervalo interestro (días) (Medias) |
Control | - | 17,3 |
100 \mug/día | 16,0 | |
rHuIFN\alpha | 200 \mug/día | 16,0 |
2000 \mug/día | 19,0 | |
OvIFN\tau | 100 \mug/día | 27,2 |
La comparación de los intervalos interestro de
los animales de control y de los animales que recibieron OvIFN\tau
demostró una prolongación considerable del intervalo cuando el
IFN\tau se administraba a 100 \mug/día. Por otro lado, la
comparación de los intervalos interestro de los animales de control
y de los animales que recibieron IFN\alpha humano recombinante
demostró que rHuIFN\alpha no tenía efecto significativo.
Estos resultados demuestran que el
interferón-\tau tiene la capacidad de influir
significativamente los sucesos bioquímicos del ciclo
reproductor.
Se establecieron cultivos embrionarios usando
embriones obtenidos de ovejas en los días 12 a 16 del ciclo estro.
Se valoró la actividad antivírica del sobrenadante de cada cultivo
embrionario usando un ensayo del efecto citopático (Familetti, y
col., 1981). Brevemente, diluciones de IFN\tau u otros IFN se
incubaron con células de riñón bovino Madin-Darby
(MDBK) de 16-18 horas a 37ºC. Tras la incubación, se
determinó la replicación vírica en un ensayo de efecto citopático
usando el virus de la estomatitis vesicular (VEV) como virus de
estimulación (Armstrong, 1981).
Una unidad antivírica provoca una reducción del
50% en la destrucción de la monocapa, con respecto a las células
MDBK sin tratar infectadas con VEV (placas de control). Las
actividades específicas se evaluaron adicionalmente usando
fibroblastos ovinos normales (Shnf) en un ensayo de inhibición de
placa (Langford, y col., 1981). Se examinaron un mínimo de tres
muestras para cada punto de tiempo y cada muestra se ensayó por
triplicado. Los resultados presentados en la Tabla 2 se expresan
como la media de unidades/ml.
Día | Muestras | Unidades/ml | |
10 | 9 | <3 | |
12 | 5 | 34 | |
Cultivos embrionarios | 13 | 6 | 4,5 x 10^{3} |
14 | 3 | 7,7 x 10^{3} | |
16 | 12 | 2,0 x 10^{6} |
Día | Muestras | Unidades/ml | |
60 | 3 | 1,4 x 10^{3} | |
Líquido alantoico | 100 | 4 | 11 |
140 | 3 | <3 | |
Líquido amniótico | 60 | 3 | 22 |
100 | 4 | <3 |
Los sobrenadantes de los cultivos tenían la
actividad antivírica aumentada asociado con el desarrollo avanzado
de los embriones (Tabla 2).
Se usó la secuencia codificadora de aminoácidos
para OvIFN\tau (Imakawa, y col., 1987) para generar una secuencia
codificadora de ADN correspondiente con el uso de codones optimizado
para la expresión en E. coli. Se añadieron las secuencias
conectoras a los extremos 5' y 3' para facilitar la clonación en
vectores de expresión bacterianos. La secuencia de nucleótidos se
diseñó para incluir 19 sitios de enzimas de restricción únicos
espaciados uniformemente a lo largo de la secuencia codificadora
(Figuras 1A y 1B).
La secuencia de nucleótidos se dividió en once
fragmentos de oligonucleótidos que oscilaban en tamaño de 33 a 75
bases. Cada uno de los once oligonucleótidos se sintetizaron en un
sintetizador de ADN 380-B 2-columna
(Applied Biosystems) y se clonaron como cadena sencilla o cadena
doble en uno de los siguientes vectores: vectores de clonación
"pBLUESCRIPT^{+}(KS)" (Stratagene, La Jolla, CA),
pTZ18R (Pharmacia, Piscataway, NJ) o pTZ19R (Pharmacia, Piscataway,
NJ).
Los vectores se transformaron en la cepa
"XL1-BLUE" de E. coli K. (recA1, endA1
gyrA96 thi hsdR17 (r_{k}^{-}, m_{k}+) supE44 rela1
\lambda-(lac), {F', proAB, lac^{q}Z\DeltaM15,
Tn10(tet^{R})}) que está disponible en el mercado en
Stratagene (La Jolla, CA). Las linfocitos Transfectadas se crecieron
en medio L complementado con ampicilina (50 \mug/ml). La clonación
y fusión de oligonucleótidos se realizó usando técnicas
convencionales de recombinación de ADN.
Los vectores de clonación se cortaron con las
enzimas de restricción apropiadas para insertar los oligonucleótidos
sintéticos. Los vectores se trataron con fosfatasa alcalina de
intestino de ternera (CIP) para eliminar los grupos fosfato
terminales. Los oligonucleótidos se fosforilaron y clonaron, como
moléculas monocatenarias o bicatenarias, en el vector apropiado
usando la ADN ligasa de T4. Cuando se introdujeron cadenas sencillas
en los vectores de clonación, la segunda cadena se completó por el
hospedador bacteriano seguido de la transfección.
Para la clonación de cadena doble, primero se
hibridaron los oligonucleótidos con su cadena complementaria
sintética y luego se ligó en el vector de clonación. Se
transformaron entonces las cepas SB221 o NM522 de E. coli K12
con la ligación. La cepa GM119 de E. coli se uso para la
clonación cuando estaban implicados los sitios de restricción
StuI y ClaI sensibles a la metilación. Los análisis de
restricción se realizaron en el ADN aislado en cada etapa del
procedimiento de clonación.
Los oligonucleótidos clonados se fusionaron en un
único polipéptido usando las digestiones de restricción y las
ligaciones esquematizadas en la Figura 2. Los fragmentos de ADN que
contenían los oligonucleótidos se aislaron típicamente tras el
fraccionamiento electroforético por tamaño en geles de agarosa de
bajo punto de fusión (Maniatis, y col., 1982; Sambrook, y col.,
1989; Ausubel, y col., 1988). La secuencia codificadora
polinucleotídica de IFN\tau resultante abarca la posición 16 a la
531: una secuencia codificadora de 172 aminoácidos.
La secuencia de nucleótidos del polipéptido final
se confirmó mediante secuenciación del ADN usando el procedimiento
didesoxi de terminación de cadena.
El fragmento StuI/SstI de longitud
completa (540 pb; Figura 2) se clonó en un vector de expresión pIN
III omp-A modificado y se transformó en una cepa
competente SB221 de E. coli. Para la expresión de la proteína
de IFN\tau, las células portadoras del vector de expresión se
crecieron en medio L con ampicilina hasta una DO (550 nm) de
0,1-1, inducida con IPTG durante 3 horas y recogida
mediante centrifugación. El IFN\tau recombinante soluble se liberó
de las células mediante sonicación o fraccionamiento osmótico.
El gen de IFN\tau sintético, sintetizado en el
Ejemplo 3, se flanqueó en el extremo 5' con un sitio de restricción
StuI y en el extremo 3' con un sitio de restricción
SacI.
Se usaron dos cebadores de oligonucleótidos (ID.
SEC. Nº: 13 y ID. SEC. Nº: 14) para unir los conectores al gen de
IFN\tau sintético usando la reacción en cadena de la polimerasa.
El conector en el extremo 5' permitió la colocación del gen de
IFN\tau sintético en lectura correcta con la secuencia
codificadora de la ubiquitina presente en el vector de clonación de
levadura pBS24Ub (Chiron Corp., Emeryville, CA). El conector también
construyó una región de unión ubiquitina-IFN\tau
que permitió la escisión in vivo de las secuencias de
ubiquitina de las secuencias de IFN\tau. El oligonucleótido 5'
también codificaba un sitio de escisión de endonucleasa de
restricción SacII. El oligonucleótido 3' contenía un sitio de
escisión StuI.
El vector portador del gen de IFN\tau sintético
(Ejemplo 3) se aisló de la cepa "XLI-BLUE" de
E. coli por el procedimiento de lisis alcalina. El vector
aislado se diluyó 500 veces en Tris 10 mM, pH 8.0/EDTA 1 mM/NaCl 10
mM. La reacción de PCR se realizó en un volumen de 100 \mul usando
la ADN polimerasa Taq y los cebadores ID. SEC. Nº: 13/ID.
SEC. Nº: 14. Los fragmentos amplificados se digirieron con
StuI y SacII. Estos fragmentos digeridos se ligaron en
los sitios SacII y SmaI de
"pBLUESCRIPT+(KS)".
El plásmido resultante se denominó
pBSY-IFN\tau La secuencia de ADN se verificó
usando ADN de doble cadena como molde.
El plásmido pHSY-IFN\tau se
digirió con SacII y EcoRV y se aislaron los fragmentos
que contenían el gen de IFNr sintético. El vector de expresión de
levadura pBS24Ub (Sabin, y col., 1989; Ecker, y col., 1989) se
digirió con SalI. Se generaron extremos romos usando la ADN
polimerasa de T4. El vector de ADN se extrajo con fenol y se
precipitó con etanol (Sambrook, y col., 1989). El plásmido
linealizado recuperado se digirió con SacII, se purificó
mediante electroforesis en gel de agarosa, y se ligó al fragmento
SacII-EcoRV aislado de pBSY-IFN\tau.
El plásmido recombinante resultante se denominó
pBS24Ub-IFN\tau.
El plásmido recombinante
pHS24Ub-IFN\tau se transformó en E. coli.
Los clones recombinantes que contenían el inserto IFN\tau se
aislaron e identificaron mediante el análisis con enzimas de
restricción. El ADN de plásmido de los clones que contenían la
secuencia codificadora de IFN\tau se utilizó para la
transformación de S. cerevisiae (Rothstein, 1986). Las
mezclas de transformación se pusieron en placas sobre medio sin
uracilo y se incubaron durante 3-5 días a 30ºC.
Entonces se picaron las colonias y se mantuvieron en medio sin
uracilo ni leucina (Rothstein, 1986).
Para la expresión a pequeña escala, se picó una
única colonia de S. cerevisiae AB116 que contenía
pBS24Ub-IFN\tau de una placa sin leucina ni
uracilo y se creció a 30ºC en medio YEP (extracto de levadura al 1%,
peptona al 2%) que contenía glucosa al 1% para la inducción de
condiciones o glucosa al 8% para no inducir condiciones. Se
recuperaron los lisados celulares y se sometieron a
SDS-PAGE en acrilamida al 15%, bisacrilamida al 0,4%
(Sambrook, y col., 1989). Las proteínas fraccionadas se visualizaron
mediante la tinción con azul de Coomassie.
El IFN\tau recombinante se visualizó
específicamente mediante inmunotransferencia con un anticuerpo
monoclonal o antisuero policlonal contra IFN\tau ovino tras la
electrotransferencia del extracto celular fraccionado a papel
"NYTRAN" (Rothstein, 1986).
Para la expresión a gran escala, se creció
pBS24Ub-IFN\tau durante 24 horas a 30ºC en medio
sin uracilo ni leucina 5x que contenía glucosa al 8%. Este cultivo
se diluyó entonces 20 veces en medio YEP que contenía glucosa al 1%
y se incubó durante otras 24-36 horas más.
Las células se recogieron por centrifugación, se
lavaron en Tris 50 mM, pH 7,6/EDTA 1mM y se resuspendieron en tampón
de lavado que contenía PMSF 1mM. Las células se lisaron usando un
aparato Bead-beater (Biospec Products, Bartlesville,
OK). El lisado se centrifugó a 43.000 x g durante 20 minutos. Se
recuperó la fracción sobrenadante y se sometió al protocolo de
purificación descrito a continuación.
El sobrenadante se cargó en una columna de DEAE
de 1 x 10 cm y se lavó con Tris 10 mM, pH 8,0. Las proteínas
retenidas se eluyeron con 300 ml de un gradiente de NaCl de 0 a 0,5
M en Tris 10 mM, pH 8,0. Se recogieron fracciones de tres
mililitros. Muestras de 10 \mul de las fracciones
17-26 que contenían el recombinante (roIFN\tau) se
separaron electroforéticamente en geles de
SDS-poliacrilamida al 15%. Los geles se tiñeron con
azul de Coomassie.
Las fracciones 18, 19 y 20 contenían la mayor
cantidad de roIFN\tau. Estas fracciones se cargaron
individualmente en una columna de Sephadex S-200 de
1,5 x 90 cm y las proteínas se resolvieron en dos picos. Alícuotas
de cada pico de proteína (25 \mul) se separaron
electroforéticamente en geles de SDS-poliacrilamida
al 15% y las proteínas se visualizaron con tinción Coomassie.
Se combinaron las fracciones que contenían
roIFN\tau purificado y se cuantificó la cantidad de roIFN\tau
por radioinmunoanálisis (Vallet, y col., 1988). La concentración
total de proteína se determinó usando el ensayo de proteínas de
Lowry (Lowry, y col., 1951).
La microsecuenciación del roIFN\tau purificado
demostró identidad con el IFN\tau nativo en los primeros 15
aminoácidos, confirmando que la proteína de fusión
ubiquitina/roIFN\tau se había procesado correctamente in
vivo.
El roIFN\tau purificado mostraba de 2 a 3 x
10^{8} unidades de actividad antivírica por miligramo de proteína
(n = 3 placas replicadas) que es similar a la actividad
antivírica del IFN\tau purificado de medio de cultivo condicionado
con embriones (2 x 10^{8} U/mg).
Se recogieron muestras de sangre venosa humana de
donantes sanos en tubos heparinizados y se aislaron los linfocitos
de sangre periférica mediante centrifugación en gradiente de
densidad usando un gradiente de Ficoll-Isopaque
(1,077 g/ml) (Sigma Chemical Co.). El ADN de alto peso molecular
(APM) se aisló de estas células (Sambrook, y col., 1989).
Se digirieron dos muestras de 10 \mug de ADN
APM con las endonucleasas de restricción HindIII o
PstI (Promega) durante 2 horas a 37ºC, y los fragmentos de
ADN se separaron electroforéticamente en un gel de agarosa al 0,8%
(Bio-Rad, Richmond, CA) a 75 voltios durante 8
horas. Los fragmentos de ADN se transfirieron a una membrana de
nailon (IBI-International Biotechnologies, Inc., New
Haven, CT). Las membranas se calentaron a 80ºC durante 2 horas y se
incubaron a 42ºC durante 4 horas en la siguiente solución de
prehibridación: SSC 5x (SSC 1x es NaCl 0,15 M y citrato sódico 0,15
M), formamida al 50% v/v, SDS al 0,6% (p/v), leche desnatada en
polvo al 0,5% (p/v), Tris-HCl 20 mM (pH 7,5), EDTA 4
mM y 0,5 mg/ml de ADN de cadena sencilla de esperma de salmón
(Promega).
Después se incubaron los filtros en una solución
de hibridación (SSC 5x, formamida al 20% v/v, SDS al 0,6% (p/v),
leche desnatada en polvo al 0,5% (p/v), Tris-HCl 20
mM (pH 7,5), EDTA 4 mM y ADNc de OvIFN\tau marcado con ^{32}P 2
x 10^{8} cpm/ml (Imawaka, y col., 1987) durante 18 horas a 42ºC.
Los filtros se lavaron a 42ºC durante 15 min con SSC 2x y SDS al
0,1% (p/v) y se expusieron a una película de rayos x (XAR, Eastman
Kodak, Rochester, NY) a -80ºC durante 48 horas en presencia de una
pantalla intensificadora.
La autorradiografía detectó una señal de
hibridación a aproximadamente 3,4 kb en el ADN digerido con
PstI y un fragmento ligeramente más pequeño (aproximadamente
3,0 kb) en el ADN digerido con HindIII. Estos resultados
indican la presencia de secuencias de ADN humano complementarias a
la sonda de ADNc de OvIFN\tau.
Se sintetizaron dos oligonucleótidos sintéticos
(cada uno de 25-meros) que correspondían a los
nucleótidos en la secuencia de ADN de 231 a 255 (contenidos en la
ID. SEC. Nº: 13) y 566 a 590 (contenidos en la ID. SEC. Nº: 14) del
ADNc de OvIFN\tau (numeración con respecto al sitio cap, Imawaka,
y col., 1987). Estos cebadores contenían, respectivamente, sitios de
escisión para las endonucleasas de restricción PstI y
EcoRI. La ID. SEC. Nº: 13 se modificó para contener un sitio
EcoRI que comienza en la posición 569.
El ADN se aisló de aproximadamente 1 x 10^{5}
unidades formadoras de placa (ufp) de las siguientes dos genotecas
de ADNc: placenta a término humana (Clontech, Inc., Palo Alto, CA) y
citotrofoblasto a término humano (Dr. J.F. Strauss, Universidad de
Pensilvania, Filadelfia, PA). El ADN se empleó en amplificaciones de
la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) (Mullis, 1987; Mullis,
y col., 1987; Perkin Elmer Cetus Corp. Norwalk, CT). Las reacciones
de amplificación se llevaron a cabo durante 30 ciclos (45ºC, 1 min;
72ºC, 2 min; 94ºC, 1 min) (termociclador y reactivos, Perkin Elmer
Cetus) usando los cebadores ID. SEC. Nº: 13/ID. SEC. Nº: 14.
Los productos de amplificación se separaron
electroforéticamente (100 voltios en gel de agarosa al 1,5%
(Bio-Rad)) y se transfirió a una membrana de nailon
(IBI). La membrana se calentó a 80ºC durante 2 horas y se
prehibridaron e hibridaron con ADNc de OvIFN\tau marcado con
^{32}P como se ha descrito anteriormente. Las membranas se lavaron
en SSC 5x/SDS 0,1% (p/v) durante 5 minutos a 42ºC y en SSC 2x/SDS
0,1% (p/v) durante 2 minutos a 42ºC. Se expuso entonces a -80ºC a
una película de rayos x "XAR" (Eastman Kodak) durante 24 horas
en presencia de una pantalla intensificadora. Se detectó el producto
de amplificación que hibridó con la sonda de ADN marcada.
\newpage
La PCR se realizó de nuevo como se hizo
anteriormente. Los productos de la amplificación se digirieron con
las endonucleasas de restricción EcoRI y PstI
(Promega) durante 90 minutos a 37ºC. Los fragmentos de ADN
resultantes se separaron electroforéticamente como se ha descrito
anteriormente y las bandas que contenían el producto de
amplificación de IFN\tau se escindieron del gel. Los fragmentos de
ADN se recuperaron por electroelución, se subclonaron en el plásmido
pUC 19 desfosforilado digerido con EcoRI/PstI y se
transformó en la cepa JM101 de E. coli (Promega) por el
procedimiento de cloruro de calcio (Sambrook, y col., 1989). Se
aislaron los plásmidos y el producto de amplificación insertado se
secuenció usando el procedimiento didesoxi de terminación (Sanger, y
col., 1977; reacciones "SEQUENASE", United States Biochemical,
Cleveland, OH). Se determinaron las secuencias de nucleótidos y se
realizó la comparación de éstas, así como de las secuencias de
aminoácidos deducidas para otras secuencias de IFN usando "DNA
STAR SOFTWARE" (Madison, WI).
La comparación de las secuencias de estos clones
reveló los siguiente cuatro clones diferentes: de la genoteca de
placenta humana, HuIFN\tau6 (299 pb), HuIFN\tau7 (288 pb) y
HuIFN\tau4 (307 pb), que mostraban el 95% de identidad en sus
secuencias nucleotídicas; de la genoteca de citotrofoblasto, el clon
CTB 35 (HuIFN\tau5; 294 pares de bases), que comparte 95% y 98% de
identidad con HuIFN\tau6 y HuIFN\tau4, respectivamente.
Se digirieron 10 mg de ADN APM de PBMC con la
endonucleasa de restricción EcoRI y se sometió a análisis
electroforético en un gel de agarosa al 0,8%. Se escindieron del gel
una serie de muestras que contenían fragmentos de ADN con intervalos
de tamaño de 1,5 a 10 kb (por ejemplo, 1,5 a 2,5 kb, 2,5 kb a 3 kb).
Se electroeluyeron y purificaron los ADN. Cada muestra de ADN se
amplificó como se ha descrito anteriormente usando los cebadores de
OvIFN\tau. Las moléculas de ADN y cualquier muestra que rindiera
una señal de PCR positiva se clonaron en \lambdagt11 (la genoteca
subgenómica de \lambdagt11).
Entonces, el fago \lambdagt11 se dispuso en
placas para la formación de placas y se realizó una hibridación por
transferencia de placas usando la sonda de ADNc de OvIFN\tau
marcada con ^{32}P. Se identificaron aproximadamente 20 clones que
hibridaron con la sonda.
Las placas que hibridaron con la sonda se
analizaron adicionalmente por PCR usando los cebadores de
OvIFN\tau descritos anteriormente. Se purificaron seis placas que
generaron señales de PCR positivas. El ADN de fago de estos clones
se aisló y digirió con la endonucleasa de restricción EcoRI.
Los insertos de ADN se subclonaron en vectores pUC19 y se determinó
su secuencia nucleotídica mediante secuenciación didesoxi de
nucleótidos.
El fago recombinante de la genoteca subgenómica
de \lambdagt11 se propagó en E. coli Y1080 y se dispuso en
placas a una densidad de E. coli Y1090 de aproximadamente
20.000 placas/placa de 150 mm. Las placas se cubrieron con filtros
de nitrocelulosa duplicados, los cuales se hibridaron con la sonda
marcada con ^{32}P de uno de los seis clones de ADNc de IFN\tau
humano aislados anteriormente.
Los clones que dieron señales de hibridación
positivas se seleccionaron y purificaron adicionalmente. Los ADN de
fago de clones positivos en la hibridación se aislaron, se
digirieron con EcoRI, se subclonaron en el vector pUC19 y se
secuenciaron. Se analizó, entonces, la información de la
secuencia.
Tres clones dieron información de solapamiento de
secuencia para más de 800 bases con respecto al sitio cap del ARNm
(los clones se secuenciaron en ambas orientaciones). La información
de secuencia de ácido nucleico combinada se presenta como ID. SEC.
Nº: 11 y la secuencia codificadora de la proteína predicha se
presenta como ID. SEC. Nº: 12. La comparación de la secuencia de la
proteína madura predicha (ID. SEC. Nº: 12) de este gen con la
secuencia de la proteína predicha de OvIFN\tau se muestra en la
Figura 3.
Dos clones adicionales que dieron señales de
hibridación positivas (HuIFN\tau2 y HuIFN\tau3) también se
seleccionaron, se purificaron y los ADN de fago se subclonaron y
secuenciaron como anteriormente. Las secuencias de estos dos clones
se presentan en las Figuras 19A y 19B. Como se puede apreciar en las
Figuras 19A y 19B, la secuencia de nucleótidos de ambos clones
(HuIFN\tau2 y HuIFN\tau3) es homóloga a la de HuIFN\tau1 y
OvIFN\tau.
HuIFN\tau2 (ID. SEC. Nº: 29) puede ser un
pseudogen y parece que contiene un codon de terminación en posición
115-117. La secuencia, ID. SEC. Nº: 29, se presenta
sin la secuencia líder. La secuencia líder se muestra en la Figura
20A. Como puede verse de la secuencia de HuIFN\tau2 presentada en
la Figura 20A, los primeros aminoácidos presentes en el HuIFN\tau1
maduro (un resto CYS) no está presente en la secuencia de
HuIFN\tau2. Por consiguiente, la secuencia de aminoácidos predicha
presentada como ID. SEC. Nº: 29 corresponde a una proteína de
IFN\tau madura con la excepción del primer resto CYS y el
codon de terminación interno.
El codon de terminación interno en la secuencia
codificadora de ácido nucleico se puede modificar mediante
procedimientos convencionales para reemplazar el codon de
terminación por un codon de aminoácido, por ejemplo, que codifique
GLN. El aminoácido GLN está presente en esta posición
en los otros aislados de IFN\tau humanos (HuIFN\tau). Las
manipulaciones de recombinación convencionales también permiten la
introducción de un resto de CYS inicial si se desea.
HuIFN\tau3 (ID. SEC. Nº: 31) parece codificar
una proteína de IFN\tau humana. La secuencia de aminoácidos
traducida de la proteína completa, incluyendo la secuencia líder, se
presenta como ID. SEC. Nº: 32. La secuencia de aminoácidos traducida
de la proteína madura se presenta como ID. SEC. Nº: 34.
Se analizaron mediante hibridación con la sonda
de ADNc de OvIFN\tau, descrita anteriormente, las genotecas de
ADNc de placenta humana y la genoteca de ADNc ovino, construida a
partir de embriones de 15-16 días. Los ADNc se
fraccionaron por tamaño en geles de agarosa y se transfirieron a
filtros (Maniatis, y col., 1982; Sambrook, y col, 1989). El análisis
por transferencia en Southern con la sonda de OvIFN\tau mostró que
las señales autorradiográficas de las genotecas de ADNc humano eran
aproximadamente 1/100 de la señal obtenida usando la genoteca de
ADNc de OvIFN\tau.
La presencia de ARNm de HuIFN\tau en placenta a
término y amniocitos humanos (26 semanas, 2 millones de células) se
analizó usando el procedimiento de PCR con transcripción inversa
(RT-PCR) (Clontech Laboratories, Palo Alto, CA).
El ARN celular total (ARNct) aislado de placenta
humana, amniocitos y embriones ovinos se retrotranscribió usando el
cebador de ID. SEC. Nº: 14. El cebador de ID. SEC. Nº: 13 se añadió,
entonces, a la reacción y se llevó a cabo la reacción en cadena de
la polimerasa durante 40 ciclos. Los productos de PCR se
fraccionaron por tamaño en geles de agarosa y se transfirieron a
filtros. El ADN de los filtros se hibridó con ADNc de OvIFN\tau y
HuIFN\tau marcado con ^{32}P. Los resultados de estos análisis
demostraron la presencia de ARNm de IFN\tau humano en el anexo
fetoplacentario. Los amniocitos también expresaban el mensajero
correspondiente a los cebadores y sonda de OvIFN\tau humana.
Además, se aplicó un análisis por
RT-PCR de la presencia de HuIFN\tau al ARNct
aislado de linfocitos adultos humanos. Un análisis densitométrico
reveló que existe ARNm de IFN\tau en linfocitos.
Se examinaron portaobjetos de cortes seriados de
5 \mum de cuatro placentas humanas sanas diferentes a término y
del primer trimestre incluidas en parafina.
A partir del clon de ADNc aislado de la genoteca
amplificada de OvIFN\tau se subclonó un fragmento correspondiente
a las bases Nº 177-736 (la base Nº 1 es el sitio
cap; el marco de lectura abierto del ADNc de OvIFN\tau es la base
Nº 81-665; Figura 7) en el vector de transcripción,
pBS (New England Biolabs). Se aislaron varios clones pBS, se
subclonaron y se secuenciaron sus nucleótidos. A partir de este clon
se escindió un fragmento 3' (bases Nº 425-736)
usando las endonucleasa de restricción NlaIV y EcoRI y
se subclonó en el vector de transcripción pBS. Este vector se
denominó pBS/OvIFN\tau.
Tras la linearización del plásmido
pBS/OvIFN\tau, se sintetizó una sonda de ARNc mediante
transcripción in vitro (Sambrook, y col., 1989) usando la ARN
polimerasa de T_{7} (Stratagene). Se usaron trazas de
^{3}H-CTP (NEN-DuPont, Cambridge,
MA) en la reacción de transcripción. Se incorporó dUTP marcado con
digoxigenina (Boehringer-Mannheim, Indianapolis, IN)
en el ARNc y se estimó el rendimiento por precipitación con TCA y
recuento de centelleo.
La hibridación in situ se realizó usando
la sonda de ARN antisentido, como describen Lawrence, y col. (1985)
con las siguientes modificaciones. Los cortes desparafinados e
hidratados se prehibridaron durante 10 min a temperatura ambiente en
solución salina tamponada con fosfato (PBS) que contenía MgCl_{2}
5 mM. Se desnaturalizaron los ácidos nucleicos de los cortes durante
10 min a 65ºC en formamida al 50%/SSC 2x. Los cortes se incubaron
una noche a 37ºC con una mezcla de hibridación (30 \mul/porta) que
contenía 0,3 \mug/ml de la sonda de ARNc marcada con digoxigenina
y luego se lavaron durante 30 minutos cada uno a 37ºC en formamida
al 50%/SSC 1x. Los lavados finales se realizaron durante 30 min cada
uno a temperatura ambiente en SSC 1x y SSC 0,1x. Los cortes se
bloquearon durante 30 minutos con Triton X-100
(Sigma) al 0,5% y leche desnatada en polvo al 0,5%.
La señal de hibridación se detectó usando
fragmentos Fab antidigoxigenina purificados de oveja conjugados con
fosfatasa alcalina (Boehringer-Mannhein). Después se
eliminó el anticuerpo no unido y se añadió el sustrato nitroazul de
tetrazolio/5-bromo-4-cloro-3-indolil-fosfato
(Promega) y levamisol (Bector Laboratories, Burlingame, CA) para
detectar la señal a través de la generación colorimétrica del
sustrato. Los tejidos se contrastaron con verde de metilo (Sigma),
se deshidrataron y se montaron.
Como control, se pretrataron algunos cortes de
tejido con 100 \mug/ml de ribonucleasa A pancreática (Sigma)
durante 30 minutos a 37ºC. La ribonucleasa se inactivó en los cortes
con 400 unidades de inhibidor de ribonucleasa (Promega). Entonces se
lavaron los cortes dos veces en 250 ml de PBS/MgCl_{2} 5 mM. En
otros experimentos de control, el ARNt (Sigma) se sustituyó por la
sondas de digoxigenina.
Se observó hibridación específica en todos los
tejidos de placenta a término y del primer trimestre en tres
experimentos independientes con diversas concentraciones de sonda de
ARNc de OvIFN\tau y reactivos de bloqueo.
Los compuestos de vellosidades placentarias del
primer trimestre de una capa externa de sincitiotrofoblasto, una
capa subyacente de citotrofoblasto y una región estromal central con
diversos tipos de células mesenquimales, mostraron el nivel de
transcrito de IFN\tau más alto en las células del citotrofoblasto.
Niveles menos intensos, pero detectables, estaban presentes tanto en
las células del sincitiotrofoblasto como del estroma. Un patrón
similar de expresión del transcrito se demostró en las vellosidades
placentarias de tejido a término, pero el nivel de detección de la
señal era bajo. El trofoblasto extravelloso del primer trimestre
mostró la cantidad más alta de mensajero y positivos teñidos cuando
estaba presente en los espacios sanguíneos maternos.
La actividad específica relativa de OvIFN\tau,
purificado hasta la homogeneicidad, se evaluó en ensayos
antivíricos. Los ensayos antivíricos se realizaron esencialmente
como se ha descrito anteriormente en el Ejemplo 2. Las actividades
específicas se expresan en unidades antivíricas/mg de proteína
obtenidas de los ensayos antivíricos usando células de riñón bovino
Madin-Darby (MDBK) o fibroblastos normales de oveja
(Shnf). Todas las muestras se ensayaron simultáneamente para
eliminar la variabilidad entre ensayos. Los resultados, presentados
en la Tabla 3, son las medias de cuatro determinaciones donde la
desviación típica era de menos del 10% de la media.
Actividades específicas | ||
MDBK | Shnf | |
OvIFN\tau | 2 x 10^{8} | 3 x 10^{8} |
rBoIFN\alpha | 6 x 10^{7} | 1 x 10^{7} |
rBoIFN\gamma | 4,5 x 10^{6} | 3 x 10^{6} |
NIH rHuIFN\alpha | 2,2 x 10^{8} | 2,2 x 10^{8} |
rHuIFN\alpha | 2,9 x 10^{8} | 4,3 x 10^{5} |
El IFN\tau tiene una actividad específica más
alta que rBoIFN\alpha o rBoIFN\gamma (Tabla 3). La preparación
convencional del NIH de rHuIFN\alpha tenía una actividad
específica similar, mientras que la preparación comercial de
rHuIFN\alpha mostraba baja actividad antivírica específica. Se
demostró una actividad antivírica específica relativa comparable
usando linfocitos Bovinas u ovinas.
Se probaron los efectos antirretrovíricos y
citotóxicos de OvIFN\tau altamente purificado en linfocitos de
sangre periférica de felinos expuestos al retrovirus de la
inmunodeficiencia felina. Este lentivirus produce un síndrome
similar al SIDA crónico en gatos y es un modelo para el SIDA humano
(Pederson, y col., 1987). La replicación del virus en linfocitos de
sangre periférica se controla por la actividad transcriptasa inversa
en los sobrenadantes de los cultivos a lo largo del tiempo. Los
datos de estos ensayos se presentan en la Tabla 4.
La adición de OvIFN\tau producía un rápido
descenso dependiente de la dosis en la actividad de la transcriptasa
inversa (RT) (Tabla 4). Mientras que las concentraciones inferiores
a 0,62 ng/ml de IFN\tau inhibían la replicación vírica,
concentraciones mucho más altas (40 ng/ml) tenían efectos mayores en
la actividad RT sin efectos tóxicos en las células. Los resultados
sugieren que la replicación del virus de la inmunodeficiencia felina
se redujo significativamente en comparación con valores de control
cuando las células se cultivaron en presencia de OvIFN\tau.
Parecía que IFN\tau no ejercía efecto
citotóxico en las células que hospedaban al retrovirus. Esto era
verdad cuando el IFN\tau estaba presente a 40 ng por ml de medio
de cultivo.
También se ensayó la actividad de IFN\tau
frente a la infección por VIH en células humanas. Se trataron
linfocitos de sangre periférica humana, que se habían infectado por
VIH (Crowe, y col., 1987), con concentraciones diversas de
OvIFN\tau. La replicación de VIH en los linfocitos de sangre
periférica se controló por la actividad transcriptasa inversa en los
sobrenadantes de los cultivos a lo largo del tiempo. La actividad
transcriptasa inversa se midió esencialmente por el procedimiento de
Hoffman, y col., (1985). Los datos de estos ensayos se presentan en
la Tabla 5.
Concentración de | Actividad RT | |||
IFN\tau (ng/ml) | Día 6 cpm/ml % de reducción | Día 10 cpm/ml % de reducción | ||
0 | 4.214 | - - | 25.994 | - - |
10 | 2.046 | 51 | 9.883 | 62 |
50 | 1.794 | 57 | 4.962 | 81 |
100 | 1.770 | 58 | 3.012 | 88 |
500 | 1.686 | 60 | 2.670 | 90 |
1000 | 1.499 | 64 | 2.971 | 89 |
Como se muestra en la Tabla 5, concentraciones de
OvIFN\tau producían efectos antivíricos significativos. Una
concentración de sólo 10 ng/ml daba lugar a una reducción del 50% en
la actividad RT después de sólo seis días. Una concentración de 500
ng/ml daba lugar a una reducción del 90% en la actividad RT en 10
días.
Se evaluó por exclusión de azul de tripán la
viabilidad de los linfocitos humanos de sangre periférica tras el
tratamiento con IFN\tau, para un intervalo de concentraciones de
3-13 días. Los resultados de este análisis de
viabilidad se presentan en la Tabla 6.
Concentración de | Células viables/ml x 10^{5} | ||
IFN\tau (ng/ml) | Día 3 | Día 6 | Día 13 |
0 | 16,0 | 7,5 | 5,3 |
10 | 13,0 | 7,5 | 6,0 |
50 | 13,0 | 11,5 | 9,0 |
100 | 15,0 | 8,5 | 9,5 |
500 | 16,5 | 12,0 | 11,0 |
1000 | 21,9 | 9,5 | 8,5 |
Los datos presentados en la Tabla 6 no muestran
evidencias de los efectos atribuibles a la administración de
IFN\tau.
También se examinaron los efectos de IFN\tau
sobre el crecimiento celular. La actividad
anti-crecimiento celular se examinó usando un ensayo
de inhibición de colonia. Células del amnios humano (WISH) o MDBK se
dispusieron en placas a bajas densidades celulares para formar
colonias originarias de células únicas. Las células se cultivaron a
200 ó 400 células/pocillo en placas de 24 pocillos en HMEM
complementado con suero bovino fetal al 2% (FBS) y aminoácidos
esenciales y no esenciales. Se añadieron diversas diluciones de
interferones a pocillos por triplicado, y las placas se incubaron
durante 8 días para permitir la formación de colonia. Las colonias
se visualizaron tras la tinción con violeta de cristal y se
contaron. El análisis del ciclo celular se realizó con HMEM que
contenía medios "agotados" al 0,5% durante 7 días más. Se
usaron células WISH que no habían sido sincronizadas.
Para el examen de la actividad IFN\tau, las
células se dispusieron otra vez en placas a 2,5 x 10^{5}
células/pocillo en HMEM con FBS al 10% en placas de 6 pocillos. Se
añadieron diversas diluciones de OvIFN\tau solo o en combinación
con péptidos hasta alcanzar un volumen final de 1 ml. Las placas se
incubaron a 37ºC en CO_{2} al 5% durante 12, 15, 18, 24 ó 48
horas. Las células se trataron con tripsina, se recogieron por
centrifugación a baja velocidad y se lavaron. El sedimento celular
se secó con un papel secante y se añadieron a cada tubo 250 \mul
de una solución de tinción nuclear (5 mg de yoduro de propidio, 0,3
ml de NP40 y 0,1 g de citrato sódico en 100 ml de H_{2}O
destilada). Los tubos se incubaron a temperatura ambiente. Después
de 10 min, se añadieron 250 \mul por tubo de ribonucleasa (500
unidades/ml en citrato sódico al 1,12%) y se incubaron otros 20
minutos. Los núcleos se filtraron a través de una malla de 44
\mum, y se analizaron en un FACStar (Becton Dickinson, Mountain
View, CA) usando el programa DNA Start 2.0.
En el ensayo de crecimiento celular usando
formación de colonia tanto de la línea epitelial bovina, MDBK, como
de la línea amniótica humana WISH, OvIFN\tau inhibía tanto el
tamaño de la colonia como el número. El IFN\tau ovino era más
eficaz que el IFN\alpha en la línea celular humana; de este modo,
es muy potente en la actividad en especies cruzadas. Su actividad
era dependiente de dosis, y la inhibición de la proliferación podía
observarse a concentraciones tan bajas como 1 unidad/ml. A
concentraciones tal altas como 50.000 unidades/ml (unidades de
actividad antivírica/ml) se paraba la proliferación, mientras que no
se alteraba la viabilidad celular.
El análisis del ciclo celular por citometría de
flujo con células WISH teñidas con yoduro de propidio revelaba una
proporción aumentada de células en G2/M después de 48 horas de
tratamiento con OvIFN\tau. Por tanto, parece que el IFN\tau
inhibe la progresión de las células a través de la fase S. Los
efectos antiproliferativos de IFN\tau ovino puede observarse tan
pronto como a las 12 horas después del inicio del cultivo y se
mantiene durante 6 días.
Los resultados presentados anteriormente
demuestran tanto el efecto antiproliferativo de IFN\tau como su
baja citotoxicidad.
Los efectos antiproliferativos de OvIFN\tau se
estudiaron en una línea celular de rata y una línea celular bovina.
La tasa de incorporación de ^{3}H-timidina se usó
para evaluar la tasa de proliferación celular.
Las células de riñón de rata (MtBr7.c5) o bovino
(MDBK) se dispusieron en medio DME-F12 sin rojo de
fenol complementado con Controlled Process Serum Replacement 2 (CPSR
2, Sigma) sin esteroides por tratamiento con carbón recubierto de
dextrano al 3% y suero fetal bovino (FBS) sin esteroides por
tratamiento con carbón recubierto de dextrano al 5%. Después de la
unión durante aproximadamente 15-18 horas, las
células se lavaron una vez con medio DME-F12 sin
suero. El medio se sustituyó por medio DME-F12 sin
rojo de fenol con CPSR2 sin esteroides al 3%, FBS sin esteroides al
1% (medio "3/1") o medio 3/1 que contenía OvIFN\tau a
diversas unidades de actividad antivírica como se determinó en el
ensayo de estimulación con el virus de la estomatitis vesicular para
interferones (Ejemplo 2). Se usaron como controles medios que
contenía una dilución similar del tampón (tampón sin diluir = Tris
10 mM, NaCl 330 mM, [TS]), en los que se disolvió OvIFN\tau.
Las células se marcaron con un pulso de
^{3}H-timidina de dos horas a aproximadamente 48
horas post-tratamiento. Se determinaron las cuentas
incorporadas precipitables con ácido tricloroacético (TCA) por
recuento de centelleo. Se incluyeron tres replicados por
tratamiento. Los valores medios para los tratamientos de OvIFN\tau
se compararon con muestran que contenían diluciones comparables de
tampón TS vehículo. Los resultados de estos experimentos se muestran
en la Tabla 7.
Tratamiento | % de reducción de incorporación de ^{3}H-timidina |
Experimento 1: MtBr7.c5 (rata) | |
\hskip0,5cm 3/1 | - |
\hskip0,5cm 10^{3} u de OvIFN\tau /ml | 0 (+12) |
\hskip0,5cm 1:5000 TS | - |
\hskip0,5cm 10^{4} u de OvIFN\tau /ml | 24 |
\hskip0,5cm 1:500 TS | - |
\hskip0,5cm 10^{5} u de OvIFN\tau /ml | 87 |
Tratamiento | % de reducción de incorporación de ^{3}H-timidina |
Experimento 2: MDBK | |
\hskip0,5cm 3/1 | - |
\hskip0,5cm 10^{3} u de OvIFN\tau /ml | 74 |
\hskip0,5cm 1:5000 TS | - |
\hskip0,5cm 10^{4} u de OvIFN\tau /ml | 83 |
\hskip0,5cm 1:500 TS | - |
\hskip0,5cm 10^{5} u de OvIFN\tau /ml | 83 |
Como se puede ver en la Tabla 7, OvIFN\tau
reduce drásticamente la tasa de proliferación celular (en función de
la incorporación de timidina) para cada línea celular ensayada.
La actividad antiproliferativa de OvIFN\tau en
líneas celulares tumorales humanas se evaluó midiendo la proporción
de incorporación de ^{3}H-timidina en células que
han sido tratadas con OvIFN\tau.
Para los experimentos en líneas tumorales que
crecen en suspensión, se dispuso 1 ml de células de
2,5-5 x 10^{5} células/pocillo en placas de 24
pocillos. Los pocillos por triplicado recibieron los medios
apropiados con 100, 1.000 o 10.000 unidades/ml de OvIFN\tau o
concentraciones equivalentes antivíricos de rHuIFN\alpha2A (Lee
Biomolecular). Después de 48 horas de incubación, las células se
contaron y se valoró la viabilidad por exclusión con azul de
tripan.
tripan.
Las líneas tumorales adherentes se dispusieron en
placas a 2,5 x 10^{5} células/pocillo en 1 ml en placas de 6
pocillos. Recibieron tratamientos con interferón como ya se ha
descrito, pero se tripsinizaron antes del recuento.
Se valoraron las diferencias significativas entre
los tratamientos mediante un análisis de varianza seguido de una
prueba F de Scheffe. El análisis del ciclo celular se realizó por
citometría de flujo usando yoduro de propidio.
Células de adenocarcinoma de mama humano MCF7 se
dispusieron en placas a partir de cultivos en crecimiento
logarítmico en medio DME-F12 sin rojo de fenol
complementado con CPSR2 sin esteroides por tratamiento con carbón
recubierto de dextrano al 3% y FBS recubierto de dextrano al 5%.
Tras la unión durante aproximadamente 15-18 horas,
las células se lavaron una vez con medio DME-F12 sin
suero. El medio se sustituyó por medio DME-F12 sin
rojo de fenol complementado con CPSR2 sin esteroides al 3%, FBS sin
esteroides al 1% (medio "3/1") o medio 3/1 que contenía
OvIFN\tau al número de unidades de actividad antivírica indicado
como se determinó en el ensayo de estimulación con el virus de la
estomatitis vesicular para interferones. Se usaron como controles
medios que contenía una dilución similar del tampón (tampón sin
diluir = Tris 10 mM, NaCl 330 mM, [TS]). Las células se marcaron con
un pulso de ^{3}H-timidina de dos horas a
aproximadamente 48 horas post-tratamiento.
Se determinaron las cuentas incorporadas
precipitables con ácido tricloroacético (TCA) por recuento de
centelleo. Se incluyeron tres replicados por tratamiento. Los
valores medios para los tratamientos con OvIFN\tau se compararon
con muestran que contenían diluciones comparables de tampón TS
vehículo. Los resultados de estos análisis se muestran en la Tabla
8.
Tratamiento | % de reducción de incorporación de ^{3}H-timidina |
MCF7 humano | |
\hskip0,5cm 3/1 | - |
\hskip0,5cm 10^{3} u de OvIFN\tau/ml | 35 |
\hskip0,5cm 1:5000 TS | - |
\hskip0,5cm 10^{4} u de OvIFN\tau/ml | 53 |
\hskip0,5cm 1:500 TS | - |
\hskip0,5cm 10^{5} u de OvIFN\tau/ml | 70 |
Como puede verse a partir de los resultados
mostrados en la Tabla 8, OvIFN\tau era capaz de reducir
sustancialmente la proporción de incorporación de
^{3}H-timidina en la línea celular de carcinoma
humano. Esto demuestra la eficacia de OvIFN\tau para inhibir la
proliferación de las células tumorales, en particular, la
proliferación de células tumorales mamarias.
Se llevó a cabo una comparación de los efectos
antiproliferativos de OvIFN\tau y de IFN\alpha usando células
HL-60 (leucemia humana) (Foa, y col., 1982; Todd y
col., 1981) esencialmente como se ha descrito anteriormente para las
células MDBK. Tanto OvIFN\tau como rHuIFN\alpha inhiben la
proliferación de células HL-60. Los resultados de
uno de los tres experimentos replicados se presentan como media del
% de reducción del crecimiento \pm DT en la Figura 4. La Figura 4
muestra que tanto OvIFN\tau como IFN\alpha eran capaces de
reducir radicalmente el crecimiento de células HL.60. La reducción
de crecimiento para cada compuesto excede el 60% para cada
concentración ensayada. A 10.000 unidades/ml, OvIFN\tau causa
aproximadamente una reducción del 80% en el crecimiento mientras que
IFN\alpha causa una reducción del 100% del crecimiento.
Sin embargo, los datos presentados en la Figura 4
revelan que un factor sustancial en la capacidad de IFN\alpha para
reducir el crecimiento era su efecto tóxico en las células. A 10.000
unidades/ml, la toxicidad de IFN\alpha tiene como resultado que
menos del 25% de las células permanecía viable. Por el contrario,
aproximadamente el 100% de las células permanecía viable cuando se
aplicaban 10.000 unidades/ml de OvIFN\tau.
La Figura 5 representa los datos que demuestran
que rHuIFN\tau es citotóxico. En la figura, se representan los
resultados de tres experimentos replicados como media del % de
viabilidad \pm DT.
El linfoma cutáneo de linfocitos T, HUT 78,
respondía de forma similar a HL-60 cuando se
trataban con IFN\tau (Figura 9). Tanto OvIFN\tau como
rHuIFN\alpha reducen el crecimiento de células HUT 78, pero 10.000
unidades/ml de rHuIFN\alpha disminuían el número de células por
debajo de las dispuestas originalmente (5 x 10^{5}). Esto es
indicativo de una reducción en la viabilidad celular de
aproximadamente el 60%.
El análisis del ciclo celular (realizado por
citometría de flujo celular) reveló un aumento de la proporción de
células en la fase G2/M del ciclo celular a las 48 horas del
tratamiento con ambos interferones (Tabla 9). En la Tabla 9 se
representan los resultados de uno de los tres experimentos
replicados como el porcentaje de células en cada fase del ciclo
celular. Se analizaron 10.000 sucesos por muestra.
Este resultado probablemente se debe al progreso
más lento de las células a lo largo del ciclo celular. En la muestra
tratada con 10.000 unidades/ml de rHuIFN\alpha, se presentó un
gran porcentaje de sucesos con dispersión frontal baja y lateral
alta, identificando células muertas. Esto concuerda con los datos de
los experimentos de proliferación, en los que sólo OvIFN\tau
inhibe la proliferación de HUT 78 sin toxicidad.
Tratamiento (unidades/ml) | G0/G1 | S | G2/M |
Medios | 44,43 | 49,95 | 5,61 |
100 OvIFN\tau | 44,35 | 47,45 | 8,20 |
100 rHuIFN\alpha | 40,01 | 57,53 | 2,45 |
1.000 OvIFN\tau | 41,29 | 50,50 | 8,21 |
1.000 rHuIFN\alpha | 41,73 | 44,91 | 13,36 |
10.000 OvIFN\tau | 42,79 | 42,61 | 14,60 |
10.000 rHuIFN\alpha | 18,01 | 71,31 | 10,67 (células muertas) |
La línea celular de linfoma de linfocitos T H9
era ligeramente menos sensible a los efectos antiproliferativos de
los IFN que las líneas celulares tumorales descritas anteriormente.
Los resultados de uno de los tres experimentos replicados se
presentan en la Figura 10 como media del % de reducción de
crecimiento \pm.DT. Mientras que rHuIFN\alpha no era tóxico en
las células H9, falló para inhibir de forma significativa para
inhibir la división celular a cualquier concentración examinada. Por
el contrario, se observó que OvIFN\tau reducía el crecimiento de
H9 en aproximadamente el 60% (Figura 10). De este modo, sólo
OvIFN\tau es un inhibidor del crecimiento eficaz de este linfoma
de linfocitos T.
Los resultados presentados anteriormente
demuestran tanto el efecto antiproliferativo de IFN\tau como su
baja citotoxicidad.
Tres grupos de 4 ratones C57B1/6 por grupo
recibieron por medio de de la vena de la cola 2,5 x 10^{4}
linfocitos B16-F10: B16-F10 es un
tumor singénico de ratón trasplantable seleccionado debido a su alta
incidencia de mestástasis pulmonar (Poste, y col., 1981). El
tratamiento con interferón se inició 3 días antes de la introducción
de las células tumorales. Cada ratón recibió 100 \mul de PBS solo,
PBS que contenía 1 x 10^{5} unidades de OvIFN\tau o PBS que
contenía 1 x 10^{5} unidades de IFN\alpha murino recombinante
(MuIFN\alpha) i.v. al día durante 3 días consecutivos.
Los ratones se sacrificaron a día 21 y se
conservaron los pulmones en formalina tamponada al 10%. Se comparó
la frecuencia de metástasis pulmonares entre los ratones de control
(PBS), ratones tratados con OvIFN\tau y ratones tratados con
MuIFN\alpha. Los resultados de estas administraciones in
vivo demostraban que OvIFN\tau reducía de forma radical los
tumores pulmonares de B16-F10. Estos resultados
apoyan el uso de IFN\tau como un agente antineoplásico eficaz
in vivo.
Se sintetizaron péptidos sintéticos solapados
correspondientes a la secuencia completa de IFN\tau (Figura 6). Se
calcularon los valores medios de hidropaticidad tomando la suma de
los valores de hidropatía de cada aminoácido dividido por el número
total de aminoácidos de cada secuencia. Los valores de hidropatía se
tomaron de Kyte, y col. (1982).
Estos péptidos eran de aproximadamente el mismo
peso molecular pero ligeramente diferentes en la hidrofilicidad
total. A pesar de esta diferencia, todos los péptidos eran
antigénicos como demostraba la producción de antisueros en conejos
con valores mayores de 1:3.000 como se evaluó por ELISA (Harlow, y
col., 1988).
Los péptidos se usaron para inhibir la actividad
antivírica (Ejemplo 2) de OvIFN\tau y rBoIFN\alpha. Los
resultados de este análisis se presentan en la Figura 12: tanto
péptidos del extremo N- como del C- terminal a 1 mM bloqueaban de
forma eficaz la actividad antivírica de OvIFN\tau usando células
MDBK. Un tercer péptido, que representaba los aminoácidos
62-92, también reducía la actividad antivírica del
IFN\tau (70% de inhibición). El péptido de OvIFN\tau
(119-150) mostraba una actividad inhibidora mínima.
Los péptidos de OvIFN\tau (34-64) y
(90-122) no tenía actividad inhibidora aparente.
También se examinó la inhibición peptídica de la
actividad antivírica de OvIFN\tau como sigue. Monocapas de células
de riñón bovino de Madin Darby se incubaron con 40 unidades/ml de
OvIFN\tau en presencia o ausencia de diversas concentraciones de
péptidos de OvIFN\tau (véase la Figura 13). Los resultados de la
Figura 13 se expresan como el porcentaje de la actividad antivírica
del control: esto es, en ausencia de cualquier péptido competidor.
Los datos presentados son las medias de 6 experimentos replicados.
Los datos demuestran que la inhibición por OvIFN\tau
(1-37), (62-92),
(119-150) y (139-172) era
significativamente diferente que la de OvIFN\tau
(34-64) y (90-122) a 10^{-3} M y 3
x 10^{-3} M. OvIFN\tau (139-172) era
significativamente distinto a todos los otros péptidos a 10^{-3}
M. La significancia se valoró por análisis de varianza seguido de la
prueba T de Scheffe a p < 0,05. De este modo, OvIFN\tau
(1-37), (62-92),
(119-150) y (139-172), en particular
(139-172), pueden representar las regiones de unión
al receptor para el IFN\tau.
La capacidad de los péptidos de OvIFN\tau para
inhibir la actividad antivírica del IFN\alpha bovino
(BoIFN\alpha) se examinó como sigue. Las monocapas de células de
riñón bovino de Madin Darby se incubaron con 40 unidades/ml de
IFN\alpha bovino en presencia o ausencia de diversas
concentraciones de péptidos de OvIFN\tau. Los resultados se
presentan en la Figura 14 y se expresan como el porcentaje de la
actividad antivírica del control en ausencia de los péptidos de
OvIFN\tau. Los datos presentados son la media de 4 experimentos
replicados. Los resultados indican que la inhibición por OvIFN\tau
(62-92), (119-150) y
(139-172) eran significativamente diferentes de las
de OvIFN\tau (1-37), (34-64) y
(90-122) a 3 x 10^{-3} M. La significanza se
valoró por análisis de varianza seguido de una prueba F de Scheffe a
p < 0,05. De este modo, OvIFN\tau (62-92),
(119-150) y (139-172), en particular
(139-172), pueden representar regiones comunes de
unión al receptor para IFN\tau.
También se examinó la inhibición peptídica de la
actividad antivírica de IFN\alpha humano por los péptidos de
OvIFN\tau. Monocapas de células de riñón bovino de Madin Derby se
incubaron con 40 unidades/ml de IFN\alpha humano en presencia o
ausencia de diversas concentraciones de péptidos de OvIFN\tau. Los
resultados se expresan como el porcentaje de la actividad antivírica
del control en ausencia de los péptidos de OvIFN\tau. Los datos se
presentan en la Figura 15 y son las medias de 3 experimentos
replicados. OvIFN\tau (139-172) era
significativamente diferente de todos los otros péptidos a 10^{-3}
M. La significanza se valoró por análisis de varianza seguido de una
prueba F de Scheffe a p < 0,05. De este modo, OvIFN\tau
(139-172) pueden representar una región de unión al
receptor común para IFN\tau y diversos IFNa.
Los péptidos de OvIFN\tau descritos
anteriormente parecen no tener efecto en la actividad antivírica de
IFN\gamma. La inhibición peptídica de la actividad antivírica del
IFN\gamma bovino se evaluó como sigue. Las monocapas de células de
riñón bovino de Madin Darby se incubaron con 40 unidades/ml de IFN
gamma bovino en presencia o ausencia de diversas concentraciones de
péptidos de OvIFN\tau. Los resultados se expresan como el
porcentaje de la actividad antivírica del control en ausencia de los
péptidos de OvIFN\tau. Los datos se presentan en la Figura 16 y
son las medias de 3 experimentos replicados. No hubo diferencias
significativas entre péptidos según se valoró por análisis de
varianza seguido de una prueba F de Scheffe a p < 0,05.
Los dos péptidos sintéticos
OvIFN\tau(1-37) y
OvIFN\tau(139-172) también bloqueaban la
actividad de OvIFN\tau anti-VIF y
anti-VIH. La actividad transcriptasa inversa (RT)
(Ejemplos 12 y 13) se controló por un periodo de 14 días en células
FET-1 infectadas con VIF (1x10^{6}/ml) y HPBL
infectadas por VIH (1 x 10^{6}/ml). Los cultivos de control no
recibieron OvIFN\tau. OvIFN\tau se usó a 100 ng/ml y los
péptidos se usaron a 200 \muM. Los datos de un experimento
representativo se expresan como cpm/ml de sobrenadante de cultivo y
se presentan para las células infectadas por VIF, Figura 11A, y para
la células infectadas por VIH, Figura 11B. Tanto el extremo
N-terminal como el C-terminal
parecen estar implicados en su actividad antirretrovírica. Aunque
ambos péptidos bloquean la actividad RT del VIF, sólo el péptido del
extremo C-terminal, OvIFN\tau
(139-172), era un inhibidor eficaz de la actividad
del virus de la estomatitis vesicular en las línea celular felina,
Fc9. De este modo, las regiones C-terminal de los
IFN de tipo I pueden unirse al sitio común en el receptor del IFN de
tipo I, mientras que la región N-terminal puede
estar implicada en el desencadenamiento de funciones únicas.
También se determinó la capacidad de los
antisueros antipéptidos para inhibir la actividad antivírica de
OvIFN\tau. La inhibición de la actividad antivírica de OvIFN\tau
por antisueros antipéptidos se evaluó como sigue. Monocapas de
células MDBK se incubaron con 20 unidades/ml de OvIFN\tau en
presencia de una dilución 1:30 de sueros preinmunes o antisueros
para cada péptido de OvIFN\tau descrito anteriormente. Los datos
de los experimentos duplicados se presentan en la Figura 17 como la
media del porcentaje de inhibición de la actividad antivírica de
OvIFN\tau producida por los antisueros antipéptidos en relación
con los sueros preinmunes apropiados \pm error típico. Las
diferencias significativas se valoraron por análisis de varianza
seguido de la prueba F de Scheffe a p < 0,05. En consecuencia con
la inhibición peptídica de las actividades antivíricas, los sueros
que contenían anticuerpos inmunorreactivos con
OvIFN\tau(1-37),
OvIFN\tau(62-92) y
OvIFN\tau(139-172) también fueron los
inhibidores más eficaces de la actividad antivírica de OvIFN\tau,
siendo los más eficaces los anticuerpos dirigidos contra los
péptidos de los extremos N-terminal y
C-terminal.
Los mismos sueros también se usaron para examinar
su efecto en la unión de IFN\tau a su receptor.
El ensayo de unión de IFN\tau se realizó como
sigue. Cinco \mug de IFN\tau se marcaron con yodo radiactivo
durante 2 minutos con 500 \muCi de Na^{125}I (15 mCi/\mug;
Amersham Corporation, Arlington Heights, IL) en 25 \mul de tampón
fosfato potásico 9,5 M, pH 7,4 y 10 \mul de
cloramina-T (5 mg/ml)(Griggs, y col., 1992). La
actividad específica de la proteína marcada con yodo era de 137
\muCi/\mug. Para los ensayos de unión, monocapas de células MDBK
se fijaron con paraformaldehído y se bloquearon con leche desnatada
en polvo al 5%. Las células se incubaron con
^{125}I-IFN\tau en solución salina tamponada con
fosfato con BSA al 1% durante 2 horas a 4ºC en presencia o ausencia
de una dilución 1:30 de los sueros que contienen anticuerpos
obtenidos contra los péptidos de IFN\tau o los sueros preinmunes
apropiados. La unión específica se valoró por incubación con un
exceso molar de 100 veces de IFN\tau sin marcar. La unión
específica del 36% se determinó por competición con IFN\tau sin
marcar 500 nM. Por ejemplo, el total de cuentas unidas fue de 6850
\pm 133, y un exceso molar de 100 veces de OvIFN\tau producía
4398 \pm 158 cuentas por minuto. Tras la incubación, las monocapas
se lavaron tres veces, se solubilizaron con dodecil sulfato sódico
al 1% y se contó la radiactividad. Los datos de tres experimentos
replicados se presentan en la Figura 18 como la media del porcentaje
de reducción de una unión específica de OvIFN\tau producida por
los antisueros antipeptídicos en relación con los sueros preinmunes
apropiados \pm desviación típica. Las diferencias significativas
de valoraron por análisis de la varianza seguido de la prueba de
Scheffe.
Los mismos sueros (que contenían anticuerpos
inmunorreactivos con OvIFN\tau(1-37),
OvIFN\tau(62-92) y
OvIFN\tau(139-172)) eran los inhibidores
más eficaces de la unión de ^{125}I-IFN\tau a su
receptor el células MDBK. La falta de efecto de los sueros
inmunorreactivos con otros péptidos derivados de IFN\tau no estaba
en función del valor contra OvIFN\tau, ya que cada suero tenía
igual o mayor título que sus respectivos péptidos en relación con
los tres sueros inhibidores: se obtuvieron similares resultados
cuando se valoró por ELISA para cada suero la reactividad de los
sueros contra la molécula de OvIFN\tau completa.
Aunque estos péptidos aparentemente se unión al
receptor de interferón, no estimulan por sí mismo efectos similares
al interferón en las células.
Los sitios funcionalmente importantes para la
actividad antiproliferativa de IFN\tau también se examinaron
usando péptidos sintéticos (Tabla 10). La proliferación celular se
evaluó como se ha descrito anteriormente usando células MDBK. Las
células MDBK se cultivaron a 5x10^{5} células/ml en los
experimentos 1 y 2 o a 10x10^{5} células/ml en el experimento 3 y
se trataron con medio sólo, IFN\tau a una concentración de 300
unidades/ml y péptidos a 1 mM durante 48 horas. Los pocillos
duplicados se contaron en cada uno de los experimentos replicados.
Para el análisis estadístico, los datos se normalizaron en función
del medio solo y se valoraron por análisis de varianza seguido de la
prueba de comparación multiplaca de Menor Diferencia Significativa
(p > 0,05).
Cuando se controló la proliferación de las
células MBDK durante un período de dos días, el número de células
aumentaba aproximadamente en 2 veces con una viabilidad mayor del
95%. La adición de 300 unidades/ml de OvIFN\tau eliminaba
completamente la proliferación celular sin un descenso de la
viabilidad celular. El IFN\tau ovino (119-150) era
el inhibidor más eficaz de la actividad antiproliferativa de
IFN\tau.
Los antisueros de
IFN\tau(119-150), que inhiben la unión de
OvIFN\tau al receptor, también invierten el efecto
antiproliferativo de OvIFN\tau. Algunos otros péptidos,
especialmente IFN\tau (139-172), invierten el
efecto antiproliferativo de OvIFN\tau, pero en menor
extensión.
Los ensayos de citotoxicidad se realizaron en
células MDBK cultivada hasta la confluencia en placas de 96
pocillos. Las células del ensayo se trataron con diversas
concentraciones (indicadas en las Figuras) de IFN, por triplicado,
en 100 \mul de EMEM complementado con suero de ternera fetal al 2%
y las células de control se trataron con medio solo. Las secuencias
de ADN codificadoras de ADN de OvIFN\tau se clonaron en el
plásmido pHIL-S1 de Pichia (Invitrogen, San
Diego, CA), el plásmido se cortó con BglII y se usó el
plásmido linealizado para transformar esferoplastos de Pichia
pastoris (cepa GS115; Invitrogen) de acuerdo a las instrucciones
del fabricante). La proteína recombinante de OvIFN\tau se expresó
en células de levadura His^{+} Mut^{-} transformadas y se
purificó del medio de cultivo mediante cromatografía de intercambio
iónico e hidroxiapatita hasta homogeneidad (0,8 x 10^{8}
unidades/mg). El IFN\alphaA humano recombinante purificado (2 x
10^{8} unidades/mg) se obtuvo de Biosource International
(Camarillo, CA).
Las células se incubaron a 37ºC hasta que se
manifestó una muerte celular significativa por examen microscópico.
Entonces las células se tiñeron con violeta de cristal, se lavaron
las placas, se dejaron secar al aire y el colorante se extrajo con
2-metoxietanol (metil cellosolve). La absorbancia
del eluído seco se midió a 570 nm.
Los resultados se muestran en las Figuras 22A y
22B. El IFN\tau era al menos 30 veces menos tóxico para las
células MDBK que el IFN\alpha. La concentración que causaba el 50%
de muerte celular era aproximadamente de 2.500 unidades/ml para el
IFN\alpha, en comparación con aproximadamente 85.000 unidades/ml
para el IFN\tau. Estos resultados confirman además que el
IFN\tau y el IFN\alpha difieren notablemente en sus efectos
citotóxicos.
Se investigó el potencial de concentraciones
subtóxicas de IFN\tau para actuar como antagonista competitivo del
efecto citotóxico del IFN\alpha usando el ensayo de citotoxicidad
descrito inmediatamente antes.
En el primer experimento, mostrado en la Figura
23A, se añadieron a las células IFN\tau (50.000 unidades/ml) y/o
IFN\alphaA (5.000 unidades/ml) y se realizó el ensayo como se
describe inmediatamente antes. Los datos indican que el tratamiento
con IFN\tau a una concentración 10 veces superior (pero no tóxica)
que la del IFN\alphaA, no bloquea la toxicidad de IFN\alphaA
sobre las células MDBK.
En el segundo experimento, mostrado en la Figura
23B, las células se trataron durante 1 h a 37ºC con IFN\tau
(25.000 unidades/ml) antes de la adición del IFN\alphaA (5.000
unidades/ml) sin eliminar el IFN\tau. Los resultados muestran que
la adición de IFN\tau a una concentración 5 veces superior 1 h
antes de la adición de IFN\alphaA a las células no bloquea la
toxicidad de IFN\alphaA.
Considerados en conjunto, estos resultados
muestran que el IFN\tau es un pobre antagonista del efecto
citotóxico de IFN\alphaA. Esta fue una observación sorprendente en
vista de la homología estructural y funcional establecida de estos
dos interferones de tipo I (Jarpe, y col., 1994) y sus actividades
antivíricas específicas similares sobre células MDBK (Pontzer, y
col., 1988). La incapacidad del IFN\tau para bloquear la
citotoxicidad del IFN\alphaA sugiere que estos IFN se unen de
forma diferente al complejo receptor de tipo I, iniciando, quizás,
diferentes sucesos de señalización.
Se marcaron IFN\tau e IFN\alphaA con el
reactivo Bolton-Flunter (derivado de
mono[^{125}I]yodo, \sim2000 Ci/mmol, Amersham; 1
Ci = 37 GBq) como se ha descrito (Langer y Pestka, 1986). La
actividad específica de las proteínas marcadas era
40-70 \muCi/\mug. Los IFN marcados retenían la
actividad antivírica completa en células MDBK que no había variado
durante al menos 4 semanas a 4ºC.
Los ensayos de unión usando células MDBK se
realizaron como se describe para IFN\alpha (Zoon, y col., 1986).
Se incubaron monocapas confluentes de células MDBK en placas de 6
pocillos enfriadas previamente a 4ºC durante 4 h para
^{125}I-IFN\alphaA o toda la noche (\geq 17 h)
para ^{125}I-IFN\tau para permitir la unión
hasta alcanzar el equilibrio. Los datos de saturación de unión se
analizaron con el programa "EBDA" (McPherson, 1985).
Los resultados se muestran en las figuras 24A
(^{125}I-IFN\tau) y 24B
(^{125}I-IFN\alphaA). La unión específica se
calculó por sustracción de la unión inespecífica determinada para
cada concentración en presencia de un exceso de 100 veces del
correspondiente IFN sin marcar. La unión inespecífica era < 20%
para IFN\tau y < 7% para IFN\alphaA. Los valores se
representan como la media \pm DT. En las inserciones de cada
figura se muestran los gráficos de Scatchard de los datos de unión
(U, unido; L, libre).
Los datos muestran que
^{125}I-IFN\tau se une a las células MDBK con
alta especificidad (Figura 24A). El análisis de Scatchard de la
unión (inserción en la Figura 24A) revela una K_{d} aparente de
3,90 x 10^{-10} M. El valor de K_{d} está dentro del intervalo
(10^{-11} a 10^{-9} M) para la unión de los diversos IFN\alpha
a una diversidad de tipos celulares (Rubinstein, y col., 1986;
Aguet, y col., 1983) y es similar al valor de unión del IFN\alphaD
recombinante bovino (3,5 x 10^{-10} M) y del IFN\tau
recombinante bovino (3,7 x 10^{-10} M) a membranas del endometrio
bovino (Li y Roberts, 1994). Sin embargo, el análisis de Scatchard
de la unión de ^{125}I-IFN\alphaA a células MDBK
(Figura 24B) rindió una Kd aparente de 4,45 x 10^{-11} M para
IFN\alphaA, similar a aquella (6,0 x 10^{-11} M) previamente
publicada (Zoon, y col., 1986). La concentración total de receptor
para ^{125}I-IFN\alphaA (4,62 pM) era muy
similar a la de ^{125}I-IFN\tau (4,22 pM) de los
gráficos de Scatchard. Estos resultados indican que el IFN\alphaA
tiene una Kd para los receptores de IFN en las células MDBK casi 10
veces menor que la del IFN\tau. Además, los resultados sugieren
que esta diferencia sustancial en las afinidades de unión es
responsable de la incapacidad del IFN\tau para "competir" por
los receptores y bloquear la toxicidad del IFN\alphaA.
Se llevaron a cabo experimentos de unión
competitiva para confirmar que IFN\tau e IFN\alphaA se unían al
mismo receptor. Se incubaron monocapas confluentes de células MDBK
en placas de 6 pocillos, por triplicado, con las concentraciones
indicadas de IFN\alphaA o IFN\tau sin marcar y
^{125}I-IFN\tau 0,2 nM (Figura 25A) o
^{125}I-IFN\alphaA 0,02 nM (Figura 25B). Los
valores se representan como porcentaje de la unión específica del
control determinado en ausencia de competidor. Un valor del 100%
representa una media de unión media de 1673 \pm 51 cpm (media
\pm DT) para ^{125}I-IFN\tau y de 1255,7 \pm
16,3 cpm (media \pm DT) para
^{125}I-IFN\alphaA. La unión inespecífica se
determinó en presencia de 200 nM de IFN\tau sin marcar para
^{125}I-IFN\tau (11% de unión inespecífica) y 20
nM de IFN\alphaA sin marcar para FNaA (5% de unión inespecífica) y
se sustrajo de la unión total.
El IFN\alphaA era un potente competidor de la
unión de ^{125}I-IFN\tau a células MDBK (Figura
25A). De hecho, el IFN\alphaA era 40 veces más eficaz que el
propio IFN\tau para inhibir la unión de
^{125}I-IFN\tau a un nivel del 50%. Se
obtuvieron resultados similares cuando se usó IFN\alphaD
recombinante humano como competidor. Los estudios de competición
cruzada usando ^{125}I-IFN\alphaA (Figura 25B)
de nuevo mostraban que el IFN\alphaA era > 40 veces más eficaz
que el IFN\tau en desplazar el
^{125}I-IFN\alphaA a un nivel del 50%.
Estos datos indican que el IFN\alphaA tenía
mucha mayor afinidad que el IFN\tau por los receptores de IFN en
las células MDBK, un resultado que concuerda con la K_{d} 10 veces
menor. Además, los resultados de los experimentos de competición
proporcionan una explicación para la incapacidad de que un exceso
(5:1) de IFN\tau bloquee los efectos citotóxicos de IFN\alphaA
en células MDBK. La afinidad más alta por parte del receptor de
IFN\alphaA sugiere un reconocimiento por el receptor diferencial
entre IFN\tau e IFN\alphaA y explica la incapacidad de IFN\tau
para bloquear la toxicidad de IFN\alphaA.
Se ensayó la capacidad de los antisueros de
conejo obtenidos contra péptidos de IFN\tau
IFN\tau(1-37) (N-terminal;
ID. SEC. Nº: 5) e IFN\tau(139-172)
(C-terminal; ID. SEC. Nº: 10) como se describen en
el Ejemplo 17, para bloquear la unión de IFN\alpha e IFN\tau a
células MDBK. Se incubaron monocapas confluentes de células MDBK en
placas de 96 pocillos con 0,3 \muM de IFN\alpha o IFN\tau
biotinilados en solución salina tamponada con fosfato (PBS) que
contenía suero bovino fetal al 5% y una dilución 1:30 del antisuero
apropiado durante 3 h a temperatura ambiente. Tras lavar con
solución salina tamponada con fosfato con suero bovino fetal al 5%,
las placas se revelaron con un conjugado "EXTRAVIDIN"-fosfato
alcalino usando fosfato de p-nitrofenilo como sustrato (Sigma
Chemical Co., St. Louis, MO). IFN\alpha e IFN\tau se
biotinilaron con el kit de biotinilización NHS-LC
(Pierce) de acuerdo a las instrucciones del fabricante. La unión
específica se determinó como se ha descrito anteriormente para los
IFN marcados con ^{125}I.
Los resultados se muestran en la Figura 26. Las
barras rellenas representan la inhibición de la unión de IFN\tau e
IFN\alphaA a células MDBK por antisueros obtenidos contra el
extremo N-terminal, mientras que las barras rayadas
representan la inhibición por antisueros obtenidos contra el extremo
C-terminal. Los datos se representan como la media
de absorbancia \pm DT. Las muestras de control se trataron con
suero preinmune (barras vacías).
Los datos indican que el antisuero contra el
péptido N-terminal
IFN\tau(1-37) (ID. SEC. Nº: 5) bloqueaba
específicamente la unión de IFN\tau, pero no la de IFN\alpha, a
células MDBK. Por el contrario, el antisuero contra el péptido
C-terminal IFN\tau(139-172)
(ID. SEC. Nº: 10) bloqueaba la unión tanto del IFN\tau como del
IFN\alpha. Estos hallazgos concuerdan con la hipótesis de que el
IFN\tau(1-37) contiene un epítopo que es
único para el IFN\tau y que contribuye materialmente tanto a la
unión como a la actividad biológica del IFN\tau en células MDBK.
Además, los datos sugieren que esta interacción diferencial en el
extremo N-terminal del IFN\tau y del IFN\alpha
da cuenta, al menos en parte, de la competición diferencial por el
receptor en las células MDBK.
Las curvas de dosis frente a respuesta/ocupación,
o curvas del efecto de la concentración, para (i) porcentaje de
actividad antivírica máxima, (ii) porcentaje de citotoxicidad máxima
y (iii) porcentaje de unión máxima para IFN\tau e IFN\alphaA en
células MDBK se calcularon usando los datos descritos anteriormente
y se representaron como funciones de concentración en las Figuras
27A (IFN\tau) y 27B (IFN\alphaA). La actividad antivírica se
cuantificó mediante un ensayo de inhibición del efecto citopático
usando el virus de la estomatitis vesicular (Armstrong, 1981) como
se describe en el Ejemplo 2, y se normalizaron usando un valor de 2
x 10^{8} unidades/mg para IFN\alphaA. Los datos de las curvas de
dosis frente a respuesta de citotoxicidad y las curvas de saturación
de unión se representaron como porcentaje de los valores máximos.
Las concentraciones se determinaron a partir de las unidades
antivíricas, usando una actividad específica de 2,0 x 10^{8}
unidades/mg para IFN\alphaA y 0,8 x 10^{8} unidades/mg para
IFN\tau en células MDBK. Los símbolos son como sigue: porcentaje
de la actividad antivírica máxima (\circ), porcentaje de
citotoxicidad máxima (\Box) y porcentaje de unión máxima
(\diamondsuit).
Los resultados demuestran que la citotoxicidad
está asociada a la saturación de unión al receptor, mientras que la
actividad antivírica implica una ocupación fraccionaria de los
receptores. En otras palabras, la toxicidad se correlaciona con la
K_{d}. El IFN\alphaA se une a células MDBK con una afinidad 10
veces mayor que el IFN\tau y es tóxico a concentraciones mucho más
bajas. Las actividades antivíricas específicas de los dos IFN son
similares, 2 x 10^{8} unidades/mg de proteína para IFN\alphaA y
0,8 x 10^{8} unidades/mg para IFN\tau, que concuerda con la
inducción de actividad antivírica máxima sólo con una ocupación
fraccionaria baja de los receptores.
La unión de los IFN a sus receptores se traduce
en la célula por la maquinaria de transducción de señales que
implican un grupo de tirosina quinasas y factores de transcripción
que se activan por fosforilación. De este modo, se realizaron los
experimentos para determinar si las diferencias en la unión del
IFN\alpha y del IFN\tau se manifiestan en cambios en la
activación de la tirosina quinasa TyK2 asociada al receptor de tipo
I y los factores de transcripción Stat1\alpha y Stat2.
Se estimularon células Daudi en medio RPMI 1640
(4-5 x 10^{7} células por ml de muestra) con
IFN\alphaA o IFN\tau a 5000 unidades/ml o se dejaron sin tratar
durante 4 min (Tyk2) o 10 min (Stat1\alpha y Stat2) a 37ºC. Luego
se lisaron las células a 4ºC durante 20 min en 500 \mul de tampón
de lisis enfriado en hielo que contenía Tris HCl 50 mM (pH 7,4),
NaCl 150 mM, EGTA 2mM, EDTA 2 mM, NaF 50 mM, fosfato de
B-glicerilo 20 mM, Na_{3}VO_{4} 2 mM,
p-guanidinobenzoato de p-nitrofenilo 0,05 mM (de una
solución madre en dimetilformamida), leupeptina (10 \mug/ml),
pepstatina (10 \mug/ml), aprotinina (10 \mug/ml), benzamidina (5
\mug/ml), fluoruro de fenilmetanosulfonilo 1 mM, glicerol al 10%
(vol/vol) y "NONIDET P-40" al 1% (vol/vol).
Tras la inmunoprecipitación de los extractos (500
\mul) con 1 \mug de anticuerpos anti-Tyktc2, o
una mezcla de 1 \mug de anticuerpos
anti-Stat1\alpha y 1 \mug de
anti-Stat2 y la inmunotransferencia, las
transferencias se incubaron (transferencia por Western) con
anticuerpo monoclonal antifosfotirosina (anti-PY)
(4G10) y se detectó la fosforilación en la tirosina de Tyk2,
Stat1\alpha y Stat2 con ECL (Amersham). Luego las transferencias
se limpiaron del anti-PY y se reincubó bien con
anticuerpos contra la proteína Tyk2 o con una mezcla de anticuerpos
contra Stat1\alpha y Stat2.
Los resultados demuestran que el IFN\tau era
tan eficaz como el IFN\alpha en la fosforilación de Tyk2. No se
vieron diferencias en los niveles de proteína Tyk2 en células sin
estimular y células estimuladas con los IFN. Además, el IFN\tau y
el IFN\alpha inducían niveles comparables de fosforilación tanto
de Stat1\alpha como de Stat2. De nuevo, no se observaron
diferencias en los niveles de proteína de los inmunoprecipitados de
Stat1\alpha y Stat2 a partir de células estimuladas o no
estimuladas. De este modo, el IFNr es similar al IFN\alpha en la
activación de estas proteínas de transducción de señales asociadas
con los receptores de tipo I, en mantener sus semejanzas
estructurales y funcionales con los
IFN\alpha.
IFN\alpha.
Los efectos antivíricos del IFN\tau contra VIH
se evaluaron tratando células PBMC humanas con diversas cantidades
de IFN\tau recombinante ovino (r-OvIFN\tau) o de
IFN\alpha2a recombinante humano en el momento de la infección con
VIH. El IFN\tau estuvo presente a lo largo de todo el experimento.
El día 7 y el día 14 se determinó la producción de p24 (mediante
ELISA (Wang, y col., 1988, 1989)) y se comparó con un control cero
de medicamento. Los resultados de este análisis se presentan en la
Tabla 11.
Cantidades de medicamento Unidades/ml | % de inhibición | % de inhibición | |
IFN\alpha2a | IFN\tau | Día 7 | Día 14 |
10 | 58%, 48% | 91%, 91% | |
26 | 48%, 45% | 88%, 59% | |
100 | 68%, 74% | 94%, 91% | |
260 | 58%, 51% | 82%, 70% | |
1.000 | 89%, 86% | 97%, 93% | |
2.600 | 65%, 68% | 87%, 79% | |
10.000 | 90%, 86% | 99%, 99% | |
26.000 | 77%, 85% | 77%, 96% | |
260.000 | 85%, 84% | 96%, 86% |
Los datos de estos experimentos apoyan la
conclusión que, a concentraciones relativamente bajas, IFN\alpha2a
e IFN\tau son eficaces reduciendo la replicación del VIH en
linfocitos humanos.
Se dispusieron en placas PBMC humanos a 5 x
10^{5} células/ml. Las células se estimularon a día 0 con 3
\mug/ml de PHA. Las células se trataron con IFN\alpha2a
recombinante humano (a concentraciones de 10, 100, 1.000 y 10.000
unidades/ml) y con IFN\tau (a concentraciones de 2,6, 26, 260,
2.600, 26.000, 260.000 y 2.600.000 unidades/ml) en 200
\mul/pocillo (4 replicados de cada concentración usando placas de
96 pocillos con fondo plano). A los cultivos de control no se les
suministró interferón. Después de 4 días de incubación, las células
recibieron un pulso de 9 horas usando
^{3}H-timidina a 1 \muCi/pocillo. Se recogieron
las células y se determinó la incorporación de timidina marcada en
el ADN (Figura 8).
No se observó citotoxicidad midiendo la captación
de timidina a ninguna concentración de IFN\tau. Sin embargo, el
rHuIFN\alpha2a era tóxico para las células a 1.000
unidades/ml.
En el segundo experimento, los mismos PBMC
humanos se trataron con IFN\tau o con IFN\alpha2a humano a
concentraciones de 100 unidades/ml o 10.000 unidades/ml. Después de
3 días u 8 días de incubación, se contaron las células viables por
citometría de flujo. Los resultados de este análisis se presentan en
la Tabla 12.
Tratamiento (unidades/ml) | Número de células viables x 10.000 | |
Día 3 | Día 8 | |
Sin tratamiento | 735 | 840 |
IFN\tau 100 unidades/ml | 745 | 860 |
IFN\tau 10.000 unidades/ml | 695 | 910 |
IFN\alpha2a 100 unidades/ml | 635 | 750 |
IFN\alpha2a 10.000 unidades/ml | 680 | 495 |
No se observó citotoxicidad en las linfocitos
Tratadas con IFN\tau. Sin embargo, había el 10% de muerte celular
en las linfocitos Tratadas con IFN\alpha2a a día 3 y el 49% a día
8.
La línea celular usada,
HepG2-T14, es una célula humana que deriva de
células de hígado transfectadas con el virus de la hepatitis B
(VHB). La línea celular produce virus VHB de forma semiestable: a lo
largo del tiempo disminuye la producción de ADN intracelular de VHB
de la línea celular y el virus secretado. Para maximizar la
producción de ADN y de virus VHB, las células se pretratan con
deAZA-C (5-azacitidina; Miyoshi, y
col., 1992) para inducir la producción del virus. El tratamiento fue
de 2-3 días y la cantidad de inducción fue
aproximadamente un factor o dos.
Entonces se trataron con IFN\alpha e IFN\tau
a concentraciones de 0, 5.000, 10.000, 20.000 y 40.000 unidades por
ml.
Todas las concentraciones de IFN\alpha o
IFN\tau reducían la producción de ADN aproximadamente un factor o
2 comparado con el control sin medicamento.
Los efectos del IFN\alpha y del IFN\tau en la
producción de ARNm hepatoespecífico se examinaron en la línea
celular de hepatocito HepG2-T14 (descrita
anteriormente). Las células se incubaron con concentraciones de
IFN\alpha o de IFN\tau de 0, 5.000, 10.000, 20.000 y 40.000
unidades/ml. Los ARN mensajeros de las proteínas específicas de
hepatocito Apo E y Apo A1 se detectaron por análisis de hibridación
(Sambrook, y col. 1989; Maniatis, y col., 1982) usando sondas
específicas para estos dos ARNm (Shoulders, y col., 1982; Wallis, y
col., 1983).
No se observó reducción de la producción de ARNm
para la producción de ARNm Apo E o Apo A1 con hasta 40.000 unidades
de IFN\alpha o de IFN\tau. Este resultado sugiere que la
reducción de la replicación del ADN vírico en experimentos previos
no era debida a los efectos de los IFN en las actividades celulares
constitutivas; más que la reducción fuera probablemente debida a la
inhibición específica de la replicación vírica en las células
hospedadores.
La toxicidad del tratamiento con IFN se midió
in vitro usando la línea celular de ratón L929. Las células
de L929 se trataron con 6000 U/ml a 200.000 U/ml de OvIFH\tau o
MuIFN\beta. Los interferones se añadieron a tiempo cero y las
células se incubaron durante 72 horas y se tiñeron con violeta de
cristal. El porcentaje de células vivas se determinó midiendo la
absorbancia a 405 nm.
En la Figura 21 se presentan ejemplos de los
datos. Los valores se representan como porcentaje de viabilidad
\pm error típico en los que el 100 por ciento es igual a la
viabilidad de las células L929 tratadas sólo con medios. A 6000
U/ml, las linfocitos Tratadas con IFN\beta mostraban una
viabilidad del 77,0 \pm 0,6. La viabilidad de las células L929
disminuía cuando aumentaban las concentraciones de IFN\beta de
manera dependiente de la dosis. Por el contrario, las células L929
no mostraron disminución de la viabilidad a ninguna de las
concentraciones de IFN\tau ensayadas. Estos datos indican que, a
diferencia de IFN\beta, IFN\tau carece de toxicidad a altas
concentraciones in vitro.
Tomados conjuntamente, los resultados resumidos
anteriormente demuestran que IFN\tau es esencialmente no tóxico a
concentraciones a las que IFN\beta induce toxicidad tanto in
vitro como in vivo.
Los efectos del tratamiento in vivo con
IFN\tau, IFN\beta e IFN\gamma (10^{5} U/inyección) en
linfocitos totales (WBC), el recuento de linfocitos totales y las
medidas de peso en ratones NZW se evaluaron como sigue. Los
interferones (OvIFH\tau, MuIFN\beta y MuIFN\alpha) se
inyectaron por vía intraperitoneal (i.p.) a una concentración de
10^{5} U en un volumen total de 0,2 ml en PBS en grupos de ratones
blancos New Zealand (NZW) (Jackson Laboratories, Bar Harbor, ME). En
cada grupo se incluyeron de tres a cuatro animales. Los recuentos de
linfocitos (WBC) se determinaron antes de la inyección y a
intervalos de tiempo seleccionados a partir de entonces (típicamente
a 12 y 24 horas) usando un hemocitómetro y técnicas convencionales.
Los recuentos diferenciales de WBC se realizaron en frotis de sangre
teñidos con Wright-Giemsa. Antes de la inyección
inicial, los pesos de los animales oscilaban de 20 a 23
gramos.
gramos.
Los resultados se resumen en la Tabla 13, a
continuación.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(Tabla pasa a página
siguiente)
No se observaron diferencias significativas en el
recuento de WBC, recuento de linfocitos o cambios de peso entre los
ratones tratados y no tratados con IFN\tau. Por el contrario, los
ratones tratados con IFN\beta mostraban un decaimiento del 31,7%
en el recuento de linfocitos 12 horas después de la inyección, que
continuaba durante al menos las siguientes 12 horas. Los ratones
tratados con IFN\alpha mostraban un decaimiento del 55,8% en los
linfocitos y una pérdida de peso significativa 12 horas después de
la inyección. Estos datos indican que, al contrario que el
IFN\beta y el IFN\alpha, el IFN\tau carece de toxicidad in
vivo a las concentraciones anteriores como evidencia el recuento
de linfocitos periféricos y las medidas de peso.
Las perlas de Sepharosa 4B conjugadas con
anti-beta galactosidasa se obtuvieron de Promega.
Las perlas se empaquetaron en una columna de 2 ml y se lavaron
sucesivamente con solución salina tamponada con fosfato con azida
sódica al 0,02% y 10 ml de tampón TX (tampón Tris 10 mM, pH 7,4,
aprotinina al 1%).
Una secuencia que codifica el interferón híbrido
se clona en el sitio del policonector de lambda gt11. La secuencia
codificadora quimérica se sitúa en marco con las secuencias de
lambda gt11 que codifican el extremo amino terminal de la
\beta-galactosidasa. Se usan lisógenos infectados
con gt11/IFN para inocular 500 ml de caldo de cultivo NZYDT. El
cultivo se incuba a 32ºC con aireación hasta una D.O. de
aproximadamente 0,2 a 0,4, después se lleva a 43ºC rápidamente en un
baño con agua a 43ºC durante 15 minutos para inducir la síntesis del
péptido gt11, y se incuba a 37ºC durante 1 hora más. Las células se
sedimentan por centrifugación, se suspenden en 10 ml de tampón de
lisis (Tris 10 mM, pH 7,4 que contiene "TRITON
X-100" al 2% y aprotinina al 1% añadida justo
antes del uso).
Las células resuspendidas se congelan en
nitrógeno líquido y luego se descongelan, dando como resultado una
lisis celular sustancialmente completa. El lisado se trata con
desoxirribonucleasa I para digerir el ADN bacteriano y del fago,
como se ponía de manifiesto por una pérdida gradual de viscosidad en
el lisado. El material no solubilizado se retira por
centrifugación.
El material lisado aclarado se carga en una
columna de Sepharosa, se cierran los extremos de la columna y la
columna se coloca en un agitador rotatorio durante 2 h a temperatura
ambiente y 16 horas a 4ºC. Después de que la columna se deposite, se
lava con 10 ml de tampón TX. La proteína de fusión se eluye con
tampón carbonato/bicarbonato 0,1 M, pH 10. Típicamente, se pasan a
través de la columna 14 ml del tampón de elución, y la proteína de
fusión eluye en los primeros 4-6 ml de eluído.
El eluído que contiene la proteína de fusión se
concentra en cartuchos de "CENTRICON-30"
(Amicon, Danvers, Mass.). El concentrado de la proteína final se
resuspende en, por ejemplo, 400 \mul de tampón PBS. La pureza de
la proteína se analiza por SDS-PAGE.
Para los anticuerpos policlonales, la proteína de
fusión purificada se inyecta por vía subcutánea en adyuvante de
Freund en un conejo. Aproximadamente se inyecta 1 mg de la proteína
de fusión los días 0 y 21, y el suero del conejo se recoge
típicamente a las 6 y 8 semanas.
Una molécula quimérica de ácidos nucleicos de
secuencia codificadora de un interferón híbrido se clona en el
vector pGEX (Boyer, y col., 1992; Frangioni, y col., 1993; Guan, y
col., 1991; Hakes, y col., 1992; Smith, D.B., y col., 1988). El
vector pGEX (Smith, D.B., y col., 1988) se modificó por inserción de
una secuencia en marco de trombina escindible con la proteína
glutation-S-transferasa (GST -
secuencia que codifica sj26). Este vector se denomina pGEXthr. La
secuencia codificadora del IFN híbrido (IFNhib) se sitúa en marco
con las secuencias que codifican sj26-trombina
(Guan, y col., 1991; Hakes y col., 1992).
La secuencia codificadora del IFN híbrido se liga
a vector pGEXthr linealizado. La mezcla de ligamiento se transforma
en E. coli y se seleccionan colonias resistentes a
ampicilina. Los plásmidos se aíslan a partir de las colonias
resistentes a ampicilina y se analizan por digestión con enzima de
restricción para identificar los clones que contiene la inserción de
IFN (vector denominado pGEXthr-IFNhib).
La cepa XL-I Azul de E.
coli se transforma con pGEXthr-IFNhib y se crece
a 37ºC durante una noche. El ADN se prepara a partir de colonias
seleccionadas al azar. La presencia de la secuencia codificadora
insertada típicamente se confirma por (i) mapeo de digestión de
restricción, (ii) análisis de hibridación usando sondas IFNhib
marcadas (es decir, análisis por Southern), o (iii) análisis directo
de la secuencia de ADN.
El clon pGEXthr-IFNhib se crece
durante una noche. El cultivo de una noche se diluye 1:10 con medio
LB que contiene ampicilina y se crece durante 1 hora a 37ºC. De
forma alternativa, el cultivo de una noche se diluye 1:100 y se
crece hasta D.O. de 0,5-1,0 antes de la adición de
IPTG
(isopropiltio-\beta-galactosidasa).
Se añade IPTG (GIBCO-BRL, Gaithersburg MD) a una
concentración final de 0,2-0,5 mM para la inducción
de la expresión de proteína y la incubación se continúa típicamente
de 2-5 horas, preferiblemente 3,5 horas.
Las células Bacterianas se recogen por
centrifugación y se resuspenden en un volumen 1/100 del cultivo de
MTPBS (NaCl 150 mM, Na_{2}PO_{4} 16 mM, NaH_{2}PO_{4}). Las
células se lisaron con lisozima, sonicación o con prensa de French,
y los lisados se aclararon de los detritus celulares por
centrifugación.
Se analiza una alícuota del sobrenadante obtenido
de cultivos de células que contienen pGEXthr-IFNhib
inducidos con IPTG y una alícuota del sobrenadante obtenido de
cultivos de vector pGEXthr-IFNhib solo inducidos con
IPTG mediante electroforesis en gel de
SDS-poliacrilamida seguido de transferencia por
Western, como se ha descrito anteriormente.
Si es necesario, los extractos se pueden
concentrar por ultrafiltración usando, por ejemplo, un filtro
"CENTRICON 10".
Alternativamente, las proteínas de fusión se
purifican parcialmente en una columna de afinidad de agarosa
glutatión como describen en detalle Smith, D.B., y col., 1988. En
este procedimiento, se crecen 100 ml de cultivo durante una noche.
Los cultivos se diluyen hasta 1 litro, y las células se crecen otra
hora a 37ºC. La expresión de las proteínas de fusión se induce
usando IPTG. Los cultivos inducidos se crecen a 37ºC durante 3,5
horas. Se recogen las células y se usa un sonicador para lisar las
células. Se sedimentan los restos celulares y el lisado claro se
carga en una columna "SEPHAROSE" glutatión. La columna se lava
con varios volúmenes de columna. Se eluye la proteína de fusión de
la columna de afinidad con glutatión reducido y se dializa. El IFN
puede liberarse de la proteína híbrida combinada mediante el
tratamiento con trombina. Los fragmentos sj26 e IFNhib de la
proteína híbrida combinada se pueden separar después por
fraccionamiento en función del tamaño en columnas o en geles.
Alternativamente, la porción de IFNhib de la
proteína híbrida combinada se libera de la columna mediante el
tratamiento con trombina (Guan, y col., 1991; Hakes, y col.,
1992).
La proteína de fusión Sj26/IFN se inyecta por vía
subcutánea en adyuvante de Freund en un conejo. Se inyecta
aproximadamente 1 mg de la proteína de fusión los días 0 y 21 y
típicamente, el suero del conejo se recoge a las semanas 6 y 8. Un
segundo conejo se inmuniza de forma similar con proteína Sj26
purificada obtenida del lisado bacteriano de control.
Se preparan minilisados de los siguientes
cultivos bacterianos: (1) células KM392 infectadas con pGEXthr y
pGEXthr que contiene el inserto IFNhib; y (2) células infectadas con
lambda gt11 que contiene la inserción IFNhib. Los minilisados y una
fuente comercial de \beta-galactosidasa de origen
comercial se fraccionan mediante SDS-PAGE y se
transfieren las bandas a filtros de nitrocelulosa mediante
transferencia por Western (Sambrook, y col., 1989; Ausubel, y col.,
1988).
Resumiendo los resultados esperados, el suero de
conejos de control (Sj26) es inmunorreactivo con cada uno de los
antígenos de Sj26 y de las proteínas fusionadas Sj26. El suero de
los animales inmunizados con la proteína de fusión Sj26/IFNhib es
reactivo con todas las proteínas de fusión Sj26 y
beta-gal que contenían la secuencia codificadora de
IFNhib, indicando la presencia de una inmunoreacción específica con
el antígeno IFNhib. No se esperaba que ninguno de los sueros fuera
inmunorreactivo con beta-galactosidasa.
El anticuerpo anti-IFNhib
presente en los sueros de los animales inmunizados con Sj26/IFNhib
se purifica mediante cromatografía de afinidad (usando IFNhib
producido de forma recombinante inmobilizado como ligando,
esencialmente como se ha descrito anteriormente en el Ejemplo 12
para el anticuerpo
anti-beta-galactosidasa).
Mientras que la invención se ha descrito con
referencia a procedimientos y realizaciones específicos, será
evidente que se pueden hacer diversas modificaciones y cambios sin
apartarse de la invención.
(1) INFORMACIÓN GENERAL:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SOLICITANTE: UNIVERSIDAD DE FLORIDA
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TÍTULO DE LA INVENCIÓN: Composiciones de interferón híbrido y procedimientos de uso
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- NÚMERO DE SECUENCIAS: 55
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- DIRECCIÓN PARA CORRESPONDENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESTINATARIO: Dehlinger & Associates
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CALLE: 350 Cambridge Ave., Suite 250
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CIUDAD: Palo Alto
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- ESTADO: CA
\vskip0.500000\baselineskip
- (E)
- PAÍS: Estados Unidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (F)
- CÓDIGO POSTAL: 94306
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- FORMA LEGIBLE EN ORDENADOR:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- TIPO DE MEDIO: Disco flexible
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- ORDENADOR: IBM compatible con PC
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- SISTEMA OPERATIVO: PC-DOS/MS-DOS
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- PROGRAMA: PatentIn Release Nº 1.0, Versión Nº 1.25
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- DATOS DE LA SOLICITUD ACTUAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NÚMERO DE SOLICITUD:
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- FECHA DE PRESENTACIÓN: 11 de abril de 1997
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CLASIFICACIÓN:
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- DATOS DE LA SOLICITUD ANTERIOR:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NÚMERO DE SOLICITUD: US 08/631.328
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- FECHA DE PRESENTACIÓN: 12 de abril de 1996
\vskip0.800000\baselineskip
- (viii)
- INFORMACIÓN DEL MANDATARIO/AGENTE:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE: Sholtz, Charles K.
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- NÚMERO DE REGISTRO: 38.615
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REFERENCIA/EXPEDIENTE: 5600-0201.41
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- INFORMACIÓN DE TELECOMUNICACIÓN:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- TELÉFONO: 415-324-0880
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TELEFAX: 415-324-0960
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 1:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 516 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: circular
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Ovis aries
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CEPA: Doméstica
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- ESTADO DE DESARROLLO: Blástula (Blastocisto)
\vskip0.500000\baselineskip
- (F)
- TIPO DE TEJIDO: Trofectodermo
\vskip0.500000\baselineskip
- (G)
- TIPO CELULAR: Células mononucleares de trofectodermo
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: oTP-1a
\vskip0.800000\baselineskip
- (viii)
- POSICIÓN EN EL GENOMA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- UNIDADES: pb
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1..516
\vskip0.800000\baselineskip
- (x)
- INFORMACIÓN SOBRE LA PUBLICACIÓN:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- AUTORES: Ott, Troy L
\vskip0.500000\baselineskip
- Van Heeke, Gino
\vskip0.500000\baselineskip
- Johnson, Howard M
\vskip0.500000\baselineskip
- Bazer, Fuller W
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TÍTULO: Cloning and Expression in Saccharomyces cerevisiae of a Synthetic Gene for the Type I Trophoblast Interferon Ovine Trophoblast Protein-1: Purification and Antiviral Activity
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- REVISTA: J. Interferon Res.
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- VOLUMEN: 11
\vskip0.500000\baselineskip
- (F)
- PÁGINAS: 357-364
\vskip0.500000\baselineskip
- (G)
- FECHA: 1991
\vskip0.500000\baselineskip
- (K)
- RESTOS IMPORTANTES EN LA ID. SEC. Nº: 1: DEL 1 AL 516
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 1:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 2:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 172 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: secuencia de aminoácidos de una proteína OvIFNtau madura
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 2:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 3:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 516 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: secuencia de nucleótidos sintéticos que codifica una proteína de interferón tau humana madura, HuIFNtau1
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 3:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 4:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 172 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: secuencia de aminoácidos para una proteína HuIFNtau madura, RuIFNtau1.
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 4:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 5:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 37 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: secuencia de aminoácidos del fragmento 1-37 de la ID. SEC. Nº: 2
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 5:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Cys Tyr Leu Ser Arg Lys Leu Met Leu Asp Ala
Arg Glu Asn Leu Lys}
\sac{Leu Leu Asp Arg Met Asn Arg Leu Ser Pro His
Ser Cys Leu Gln Asp}
\sac{Arg Lys Asp Phe Gly}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 6:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 31 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: secuencia de aminoácidos del fragmento 34-64 de la ID. SEC. Nº: 2
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 6:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Lys Asp Phe Gly Leu Pro Gln Glu Met Val Glu
Gly Asp Gln Leu Gln}
\sac{Lys Asp Gln Ala Phe Pro Val Leu Tyr Glu Met
Leu Gln Gln Ser}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 7:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 31 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: secuencia de aminoácidos del fragmento 62-92 de la ID. SEC. Nº: 2
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 7:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gln Gln Ser Phe Asn Leu Phe Tyr Thr Glu His
Ser Ser Ala Ala Trp}
\sac{Asp Thr Thr Leu Leu Glu Gln Leu Cys Thr Gly
Leu Gln Gln Gln}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 8:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 33 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: secuencia de aminoácidos del fragmento 90-122 de la ID. SEC. Nº: 2
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 8:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gln Gln Gln Leu Asp His Leu Asp Thr Cys Arg
Gly Gln Val Met Gly}
\sac{Glu Glu Asp Ser Glu Leu Gly Asn Met Asp Pro
Ile Val Thr Val Lys}
\sac{Lys}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 9:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 32 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: secuencia de aminoácidos del fragmento 119-150 de la ID. SEC. Nº: 2
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 9:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Thr Val Lys Lys Tyr Phe Gln Gly Ile Tyr Asp
Tyr Leu Gln Glu Lys}
\sac{Gly Tyr Ser Asp Cys Ala Trp Glu Ile Val Arg
Val Glu Met Met Arg}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 10:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 34 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: secuencia de aminoácidos del fragmento 139-172 de la ID. SEC. Nº: 2
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 10:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Cys Ala Trp Glu Ile Val Arg Val Glu Met Met
Arg Ala Leu Thr Val}
\sac{Ser Thr Thr Leu Gln Lys Arg Leu Thr Lys Met
Gly Gly Asp Leu Asn}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 11:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 588 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: secuencia que codifica el interferón tau humano HuIFNtau con una secuencia líder.
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1..585
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 11:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 12:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 195 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: secuencia de aminoácidos predicha codificada por la ID. SEC. Nº: 11 (HuIFNtau1)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 12:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 13:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 25 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (sintético)
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: oligonucleótido sintético 25-mérico
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 13:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCCTGTCTGCA GGACAGAAAA GACTT
\hfill25
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 14:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 25 bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (sintético)
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: oligonucleótido sintético 25-mérico
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 14:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTCTGAATTCT GACGATTTCC CAGGC
\hfill25
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 15:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 37 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: secuencia de aminoácidos del fragmento 1-37 de la ID. SEC. Nº: 4
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 15:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Cys Asp Leu Ser Gln Asn His Val Leu Val Gly
Arg Lys Asn Leu Arg}
\sac{Leu Leu Asp Glu Mer Arg Arg Leu Ser Pro Arg
Phe Cys Leu Gln Asp}
\sac{Arg Lys Asp Phe Ala}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 16:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 31 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: secuencia de aminoácidos del fragmento 34-64 de la ID. SEC. Nº: 4
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 16:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Lys Asp Phe Ala Leu Pro Gln Glu Met Val Glu
Gly Gly Gln Leu Gln}
\sac{Glu Ala Gln Ala Ile Ser Val Leu His Glu Met
Leu Gln Gln Ser}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 17:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 31 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: secuencia de aminoácidos del fragmento 62-92 de la ID. SEC. Nº: 4
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 17:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gln Gln Ser Phe Asn Leu Phe His Thr Glu His
Ser Ser Ala Ala Trp}
\sac{Asp Thr Thr Leu Leu Glu Gln Leu Arg Thr Gly
Leu His Gln Gln}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 18:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 33 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: secuencia de aminoácidos del fragmento 90-122 de la ID. SEC. Nº: 4
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 18:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{His Gln Gln Leu Asp Asn Leu Asp Ala Cys Leu
Gly Gln Val Met Gly}
\sac{Glu Glu Asp Ser ala Leu Gly Arg Thr Gly Pro
Thr Leu Ala Leu Lys}
\sac{Arg}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 19:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 32 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: secuencia de aminoácidos del fragmento 119-150 de la ID. SEC. Nº: 4
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 19:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Ala Leu Lys Arg Tyr Phe Gln Gly Ile His Val
Tyr Leu Lys Glu Lys}
\sac{Gly Tyr Ser Asp Gys Ala Trp Glu Thr Val Arg
Leu Glu Ile Met Arg}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 20:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 34 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: secuencia de aminoácidos del fragmento 139-172 de la ID. SEC. Nº: 4
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 20:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Cys Ala Trp Glu Thr Val Arg Leu Glu Ile Met
Arg Ser Phe Ser Ser}
\sac{Leu Ile Ser Leu Gln Gln Arg Leu Arg Met Met
Asp Gly Asp Leu Ser}
\sac{Ser Pro}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 21:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 299 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc a ARNm
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: HuIFNtau6
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 2..298
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 21:
\vskip1.000000\baselineskip
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 22:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 99 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: secuencia de aminoácidos predicha codificada por la ID. SEC. Nº: 21 (HuIFNtau6)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 22:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 23:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 288 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc para ARNm
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: HuIFNtau7
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 2..286
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 23:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 24:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 95 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: secuencia de aminoácidos predicha codificada por la ID. SEC. Nº: 23 (HuIFNtau7)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 24:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 25:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 307 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc para ARNm
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: HuIFNtau4
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 2..307
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 25:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 26:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 102 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: secuencia de aminoácidos predicha codificada por la ID. SEC. Nº: 25 (HuIFNtau4)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 26:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 27:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 294 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc para ARNm
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: HuIFNtau5
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 2..292
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 27:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 28:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 97 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: secuencia de aminoácidos predicha codifica por la ID. SEC. Nº: 27 (HuIFNtau5)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 28:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 29:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 516 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: HuIFNtau2
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1..516
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 29:
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: Sitio modificado
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 115-117
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "para permitir la expresión de la proteína codificada, este sitio puede modificarse para codificar un aminoácido, por ejemplo, Gln"
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 30:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 171 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: secuencia de aminoácidos predicha codificada por la ID. SEC. Nº: 29 (HuIFNtau2)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 30:
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: Sitio modificado
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 39
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota= "donde Xaa es un aminoácido seleccionado, por ejemplo, Gln"
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 31:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 588 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: HuIFNtau3
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1..588
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 31:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 32:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 195 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: secuencia de aminoácidos predicha codificada por la ID. SEC. Nº: 31 (HuIFNtau3)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 32:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 33:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 518 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: HuIFNtau3, madura sin secuencia líder
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1..518
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 33:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 34:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 172 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 34:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 35:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 37 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: secuencia de aminoácidos del fragmento 1-37 de la ID. SEC. Nº: 33
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 35:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Cys Asp Leu Ser Gln Asn His Val Leu Val Gly
Ser Gln Asn Leu Arg}
\sac{Leu Leu Gly Gln Mer Arg Arg Leu Ser Leu Arg
Phe Cys Leu Gln Asp}
\sac{Arg Lys Asp Phe Ala}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 36:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 31 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: secuencia de aminoácidos del fragmento 34-64 de la ID. SEC. Nº: 33
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 36:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Lys Asp Phe Ala Phe Pro Gln Glu Met Val Glu
Gly Gly Gln Leu Gln}
\sac{Glu Ala Gln Ala Ile Ser Val Leu His Glu Met
Leu Gln Gln Ser}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 37:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 31 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: secuencia de aminoácidos del fragmento 62-92 de la ID. SEC. Nº: 33
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 37:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gln Gln SEr Phe Asn Leu Phe His Thr Glu His
Ser Ser Ala Ala Trp}
\sac{Asp Thr Thr Leu Leu Glu Gln Leu Arg Thr Gly
Leu His Gln Gln}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 38:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 33 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: secuencia de aminoácidos del fragmento 90-122 de la ID. SEC. Nº: 33
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 38:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{His Gln Gln Leu Asp Asp Leu Asp Ala Cys Leu
Gly Gln Val Thr Gly}
\sac{Glu Glu Asp Ser Ala Leu Gly Arg Thr Gly Pro
Thr Leu Ala Met Lys}
\sac{Arg}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 39:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 32 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: secuencia de aminoácidos del fragmento 119-150 de la ID. SEC. Nº: 33
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 39:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Ala Mer Lys Arg Tys Phe Gln Gly Ile His Val
Tyr Leu Lys Glu Lys}
\sac{Gly Tyr Ser Asp Cys Ala Trp Gly Ile Val Arg
Leu Glu Ile Met Arg}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 40:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 34 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: secuencia de aminoácidos del fragmento 139-172 de la ID. SEC. Nº: 33
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 40:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Cys Ala Trp Glu Ile Val ARG Leu Glu Ile Met
Arg SEr Leu Ser Ser}
\sac{Ser Thr Ser Leu His Lys Arg Leu Arg Met Met
Asp Gly Asp Leu Ser}
\sac{Ser Pro}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 41:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: secuencia de aminoácidos del fragmento 1-23 de la ID. SEC. Nº: 32
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 41:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Met Ala Phe Val Leu Ser Leu Leu Met Ala Leu
Val Leu Val Ser Tyr}
\sac{Gly Pro Gly Glu Ser Leu Arg}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 42:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: secuencia de aminoácidos del fragmento 1-23 de la ID. SEC. Nº: 11
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 42:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Met Ala Phe Val Leu Ser Leu Leu Met Ala Leu
Val Leu Val Ser Tyr}
\sac{Gly Pro Gly Gly Ser Leu Gly}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 43:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 519 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: secuencia codificadora de ADN derivado-genómico de HuIFNtau1, sin sec. líder
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1..519
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 43:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 44:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 172 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 44:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 45:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 37 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: Bin 12, A40068, Nº Acc. gi 108955, TP-1 bovina (clon bTP509) (aa 1-37)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 45:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Cys Tyr Leu Ser Glu Asp His Met Leu Gly Ala
Arg Glu Asn Leu Arg}
\sac{Leu Leu Ala Arg Met Asn Arg Leu Ser Pro His
Pro Cys Leu Gln Asp}
\sac{Arg Lys Asp Phe Gly}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 46:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 37 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: Bin 13, BovTPH1Bcds1, Nº Acc. gi 163767, TP-1 bovina (aa 1-37)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 46:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Cys Tyr Leu Ser Glu His His Ile Leu Gly Pro
Arg Gln Asn Leu Ser}
\sac{Leu Leu Ala Arg Met Asn Arg Leu Ser Pro His
Pro Cys Leu Gln Asp}
\sac{Arg Lys Asp Phe Gly}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 47:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 37 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: Bin 14, BovTPH1Ccds1, Nº Acc. gi 163769, TP-1 bovina (aa 1-37)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 47:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Cys Tyr Leu Ser Glu His His Met Leu Gly Ala
Arg Gln Asn Leu Arg}
\sac{Leu Leu Ala Arg Met Asn Arg Leu Ser Pro His
Pro Cys Leu Gln Asp}
\sac{Arg Lys Asp Phe Gly}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 48:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 37 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: Bin 15, A39505, TP-1 bovina (clon bTP4) (aa 1-37)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 48:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Cys Tyr Leu Ser Glu Asn His Met Leu Gly Ala
Arg Glu Asn Leu Arg}
\sac{Leu Leu Ala Arg Met Asn Arg Leu Ser Pro His
Pro Cys Leu Gln Asp}
\sac{Arg Lys Asp Phe Gly}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 49:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 37 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: Bin 16, OATP1P5cds1, Nº Acc. gi 1412, TPp5 ovina (aa 1-37)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 49:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Cys Tyr Leu Ser Gln Arg Leu Met Leu Asp Ala
Lys Glu Asn Leu Lys}
\sac{Leu Leu Asp Arg Met Asn Arg Leu Ser Pro His
Ser Cys Leu Gln Asp}
\sac{Arg Lys Asp Phe Gly}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 50:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 37 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: Bin 17, OATP1P3cds1, Nº Acc. gi 1410, TPp3 ovina (aa 1-37)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 50:
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Cys Tyr Leu Ser Gln Arg Leu Met Leu Asp Ala
Arg Glu Asn Leu Lys}
\sac{Leu Leu Asp Arg Met Asn Arg Leu Ser Pro His
Ser Cys Leu Gln Asp}
\sac{Arg Lys Asp Phe Gly}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 51:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 37 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: Bin 18, SHP010TPcds1, Nº Acc. gi 165821, TP-1 ovina (aa 1-37)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 51:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Cys Tyr Leu Ser Gln Arg Leu Met Leu Asp Ala
Arg Glu Asn Leu Lys}
\sac{Leu Leu Glu Pro Met Asn Arg Leu Ser Pro His
Ser Cys Leu Gln Asp}
\sac{Arg Lys Asp Phe Gly}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 52:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 37 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: Bin 19, SHP02TPcds1, Nº Acc. gi 165823, TP-1 ovina (aa 1-37)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- ESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 52:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Cys Tyr Leu Ser Gln Arg Leu Met Leu Asp Ala
Arg Glu Asn Leu Arg}
\sac{Leu Leu Asp Arg Met Asn Arg Leu Ser Pro His
Ser Cys Leu Gln Asp}
\sac{Arg Lys Asp Phe Gly}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 53:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 37 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: Bin 21, GOTCTP1cds1, Nº Acc. gi 164117, IFN tau de Capra hircus (aa 1-37)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 53:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Cys Tyr Leu Ser Arg Arg Leu Met Leu Asp Ala
Arg Glu Asn Leu Arg}
\sac{Leu Leu Asp Arg Met Asn Arg Leu Ser Pro His
Ser Cys Gln Gln Asp}
\sac{Arg Lys Asp Phe Gly}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 54:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 498 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: híbrido huIFNtau/huIFNalfa (1-28/29-167)
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1..498
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 54:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID. SEC. Nº: 55:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 166 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 55:
Claims (11)
1. Un polipéptido de fusión de interferón
híbrido, formado por:
una primera secuencia de aminoácidos que se
extiende desde el resto de aminoácido 1 hasta el resto de aminoácido
28 de un polipéptido de interferón tau maduro, y
una segunda secuencia de aminoácidos que se
extiende desde el resto de aminoácido 29 al resto de aminoácido
C-terminal de un polipéptido de interferón de tipo I
no tau.
2. El polipéptido de fusión de interferón híbrido
de la reivindicación 1, en el que el polipéptido de interferón tau
es un polipéptido de interferón de rumiante y el polipéptido de
interferón de tipo I no tau es un polipéptido de interferón de tipo
I no tau humano.
3. El polipéptido de fusión de interferón híbrido
de la reivindicación 1, en el que el polipéptido de interferón de
tipo I no tau es interferón alfa o interferón beta.
4. Un ácido nucleico que incluye una secuencia de
marco de lectura abierto (ORF) que codifica el polipéptido de fusión
de interferón híbrido de la reivindicación 1.
5. Un vector de expresión que incluye
(a) el ácido nucleico de la reivindicación 4,
y
(b) secuencias reguladoras eficaces para expresar
la secuencia del ORF en una célula hospedadora.
6. Un procedimiento para producir de forma
recombinante un polipéptido de fusión de interferón híbrido, que
incluye introducir en una célula hospedadora adecuada, un vector de
expresión recombinante que incluye el ácido nucleico de la
reivindicación 4, donde el vector está diseñado para expresar la
secuencia del ORF en las células hospedadoras, y cultivar las
células hospedadoras en condiciones que dan lugar a la expresión de
la secuencia del ORF.
7. Una composición farmacéutica para inhibir el
crecimiento de células tumorales en un sujeto, que comprende el
polipéptido de fusión de interferón híbrido de la reivindicación 1
en una cantidad eficaz para inhibir el crecimiento de las células
tumorales.
8. Una composición farmacéutica para inhibir la
replicación vírica en células de un sujeto infectado por un virus,
que comprende el polipéptido de fusión de interferón híbrido de la
reivindicación 1 en una cantidad eficaz para inhibir la replicación
vírica en las células.
9. Una composición farmacéutica para tratar una
enfermedad autoinmune en un sujeto que necesita este tratamiento,
que comprende
una cantidad eficaz del polipéptido de fusión de
interferón híbrido de la reivindicación 1.
10. La composición farmacéutica de cualquiera de
las reivindicaciones 7-9 formulada para ser
administrada mediante inyección intraperitoneal, intravenosa,
intramuscular, intralesional o subcutánea.
11. La composición farmacéutica de cualquiera de
las reivindicaciones 7-9 formulada para ser
administrada mediante administración oral.
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