ES2240980T3 - Adenovirus mejorado y metodos de utilizacion del mismo. - Google Patents
Adenovirus mejorado y metodos de utilizacion del mismo.Info
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Abstract
SE PROPORCIONAN UN ADENOVIRUS RECOMBINANTE Y UN METODO PARA PRODUCIR EL VIRUS QUE UTILIZAN UN VECTOR DE ENLACE RECOMBINANTE QUE COMPRENDE SECUENCIA DE ADN DE ADENOVIRUS PARA LOS CISELEMENTOS 5'' Y 3'' NECESARIOS PARA REPLICACION Y ENCAPSIDACION DE VIRION EN LA AUSENCIA DE SECUENCIA QUE CODIFIQUE GENES VIRALES Y UN MINIGEN SELECCIONADO ENLAZADO AL MISMO, Y UN ADENOVIRUS AUXILIAR QUE COMPRENDE SUFICIENTES SECUENCIAS DE GEN DE ADENOVIRUS NECESARIAS PARA UNA INFECCION VIRAL PRODUCTIVA. PREFERIBLEMENTE EL GEN AUXILIAR ES DEBILITADO MEDIANTE MODIFICACIONES A SUS SECUENCIAS DE EMPAQUETAMIENTO 5'', LO CUAL FACILITA LA PURIFICACION DE LA PARTICULA VIRAL DEL VIRUS AUXILIAR.
Description
Adenovirus mejorado y métodos de utilización del
mismo.
Esta invención fue apoyada por el National
Institute of Health Grant No. P30 DK 47757. El Gobierno de los
Estados Unidos tiene derechos sobre esta invención.
La presente invención se relaciona con el campo
de los vectores útiles en terapia génica somática y la producción
de los mismos.
La terapia génica humana es una aproximación al
tratamiento de enfermedades humanas que se basa en la modificación
de la expresión de un gen en las células del paciente. Se ha hecho
evidente durante la última década que la única barrera más
sobresaliente para el éxito de la terapia génica como una estrategia
para el tratamiento de enfermedades heredadas tales como el cáncer
y otras disfunciones genéticas, es el desarrollo de vehículos
útiles para la transferencia de genes. Los virus eucariotas han
sido empleados como vehículos para terapia génica somática. Entre
los vectores virales que han sido citados frecuentemente en la
investigación en terapia génica se encuentran los adenovirus.
Los adenovirus son virus eucariota de ADN que
pueden modificarse para liberar en forma eficiente un transgén
terapéutico o indicador a una variedad de tipos de células. Los
adenovirus recombinantes de los tipos 2 y 5 (Ad2 y Ad5,
respectivamente), que causan enfermedad respiratoria en humanos,
actualmente están siendo desarrollados para terapia génica. Tanto
Ad2 como Ad5 pertenecen a una subclase de adenovirus que no está
asociada con malignidad en humanos. Los adenovirus recombinantes son
capaces de proveer niveles extremadamente altos de suministro de
transgenes, virtualmente para todos los tipos de células, haciendo
caso omiso del estado mitótico. Se pueden generar títulos altos
(10^{13} unidades formadoras de placa/ml) de virus recombinante en
células 293 (el equivalente del adenovirus a las líneas celulares
de empaquetamiento de retrovirus) y ser críoalmacenados por largos
períodos de tiempo sin pérdidas apreciables. Se ha demostrado la
eficacia de este sistema para liberar un transgén terapéutico in
vivo que complemente un desequilibrio genético en modelos
animales con diversas enfermedades [Y. Watanabe.
Artherosclerosis, 36: 261-268 (1986);
K. Tanzawa y colaboradores, FEBS Letters, 118(1):
81-84 (1980); J.L. Golasten y colaboradores, New
Engl. J. Med., 309(11983): 288-296
(1983); S. Ishibashi y colaboradores, J. Clin. Invest.,
92: 883-893 (1993); y S. Ishibashi y
colaboradores, J. Clin. Invest., 93:
1885-1893 (1994)]. En realidad, se ha aprobado el
uso de un adenovirus defectuoso de replicación recombinante que
codifica un cADN para el regulador transmembrana de fibrosis cística
(CFTR) para ser usado en al menos dos ensayos clínicos de CF en
humanos [ver, por ejemplo, J. Wilson, Nature, 365:
691-692 (21 de octubre, 1993)]. Un soporte
adicional de la seguridad de los adenovirus recombinantes para
terapia génica es la gran experiencia con las vacunas de adenovirus
vivo en poblaciones humanas.
Los adenovirus humanos constan de un genoma
bicatenario de ADN aproximadamente de 36 kb, que está dividido en
100 unidades cartográficas (m.u.), cada una de las cuales tiene
una longitud de 360 bp. El ADN contiene repeticiones terminales
invertidas cortas (ITR) en cada extremo del genoma que se requieren
para la replicación del ADN viral. Los productos génicos se
organizan en regiones tempranas (E1 hasta E4) y regiones tardías
(L1 hasta L5), con base en la expresión ante y después de la
iniciación de la síntesis del ADN viral [ver, por ejemplo, Horwitz,
Virology, 2da edición, ed. B. N. Fields, Raven Press, Ltd.
New York (1990)].
La primera generación recombinante de adenovirus
de replicación deficiente que se desarrolló para terapia génica,
contiene supresiones de toda la región E1a y parte de la E1b. Este
virus de replicación defectuosa crece sobre un complemento de línea
celular de riñón embrionario humano de adenovirus transformado que
contiene un gen de adenovirus funcional E1a que provee una proteína
de desempeño E1a, la célula 293 [ATCC CRL 1573]. Los virus
suprimidos E1 son capaces de replicarse y de producir virus
infecciosos en las células 293, que proveen productos del gen en las
regiones E1a y E1b in trans. El virus resultante es capaz de
infectar muchos tipos de células y puede expresar al gen
introducido (dado que porta su propio promotor), pero no puede
replicarse en una célula que no porte al ADN de la región E1, a
menos que la célula sea infectada en un sin número muy alto de
infecciones.
Sin embargo, los estudios in vivo
revelaron que la expresión trasgénica en estos vectores suprimidos
E1 fue transciente y estaba invariablemente asociada con el
desarrollo de inflamación severa en el sitio del vector objetivo [S.
Ishibashi y colaboradores, J. Clin. Invest., 93:
1885-1893 (1994); J. M. Wilson y colaboradores,
Proc. Nati. Acad. Sci. USA, 85:
4421-4424 (1988); J. M. Wilson y colabordores,
Clin. Bio., 3: 21-26 (1991); M.
Grossman y colaboradores, Som. Cell. And Mol. Gen.,
17: 601-607 (1991)]. Una explicación que ha
sido propuesta para explicar este hallazgo es que los adenovirus
recombinantes de primera generación, a pesar de la supresión de los
genes E1, expresan bajos niveles de otras proteínas virales. Esto
puede deberse a la expresión basal de los promotores virales no
estimulados o a la transactivación por factores celulares. La
expresión de proteínas virales conduce a respuestas celulares
inmunes de las células modificadas genéticamente, resultando en su
destrucción y en el reemplazo con células con contenido no
transgénico.
Subsiste aún la necesidad en el estado de la
técnica por el desarrollo de vectores adicionales de adenovirus
construidos para terapia génica.
En un aspecto, la invención provee los
componentes de un nuevo sistema de producción de adenovirus
recombinante. Un componente es un plásmido trasbordador.
pAd\Delta, que comprende los elementos cis del adenovirus,
necesarios para la replicación y encapsulación del virión y que se
suprimen de todos los genes virales. Este vector porta un transgén
seleccionado bajo el control de un promotor seleccionado y de otros
componentes reguladores del plásmido/vector convencional. El otro
componente es un adenovirus auxiliar que, ya sea solo o con una
línea celular de empaque, suministra suficientes secuencias de
genes necesarias para una infección viral productiva. En una
modalidad preferida, el virus auxiliar ha sido alterado para
contener modificaciones de las secuencias del gen nativo, que
dirigen el empacado eficiente, con el fin de imposibilitar
sustancialmente, o de "inutilizar" la función de
empaquetamiento del virus auxiliar, o su habilidad para
replicar.
En otro aspecto, la presente invención provee un
adenovirus recombinante único, un virus Ad\Delta, producido por
medio del uso de los anteriores componentes. Este virus
recombinante comprende una cápside adenovírica, los elementos cis de
adenovirus, necesarios para la replicación y la encapsulación del
virión, pero se suprime de todos los genes virales (esto es, de
todas las estructuras virales de lectura abierta). Esta partícula
de virus porta un transgén seleccionado bajo el control de un
promotor seleccionado, y otros componentes reguladores del vector
convencional. Este virus recombinante Ad\Delta se caracteriza por
un suministro del transgén de título alto a una célula huésped y la
capacidad para integrar en forma estable al transgén dentro del
cromosoma de la célula huésped. En una modalidad, el virus porta
como su transgén a un gen indicador. Otra modalidad del virus
recombinante contiene un transgén terapéutico.
En otro aspecto, la invención provee un método
para producir el virus recombinante Ad\Delta anteriormente
descrito por cotransfección de una línea celular (ya sea una línea
celular de empaque o una línea celular no empacadora) con un vector
o un plásmido trasbordador y un adenovirus auxiliar como se
describió antes, en donde la célula trasfectada genera el virus
Ad\Delta. El virus Ad\Delta es posteriormente aislado y
purificado a partir de allí.
En aún otro aspecto adicional, la invención
provee un método para el suministro de un gen seleccionado a una
célula huésped para expresarse en esa célula por medio de la
administración, a un paciente, de una cantidad efectiva de un virus
recombinante Ad\Delta que contiene un transgén terapéutico, para
tratar o corregir un desorden o enfermedad asociados
genéticamente.
Otros aspectos y ventajas de la presente
invención se describen además en la siguiente descripción detallada
de las modalidades preferidas de la misma.
La Figura 1A es una representación esquemática de
la organización de los elementos funcionales principales que
definen a la terminal 5' de Ad5 incluida una repetición terminal
invertida (ITR) y un dominio de empaque/reforzador. También se
muestran la caja TATA del promotor E1 (caja negra) y el sitio
(flecha) de arranque transcripcional E1A.
La Figura 1B es un esquema expandido de la región
de empaque/reforzadora de la Figura 1A, indicando los cinco
dominios de empaque (PAC) (repeticiones A), I hasta V. Las flechas
indican la ubicación de los iniciadores PCR referenciados en las
Figuras 9A y 9B más abajo.
La Figura 2A es un esquema del vector
trasbordador pAdA.CMVLacZ que contiene una 5' ITR de Ad5, seguido
por un promotor/reforzador CMV, un gen LacZ, una 3' ITR de Ad5,
una secuencia sobrante de plásmido de la columna vertebral del
plásmido pSP72. Las enzimas de restricción endonucleasa se
representan por designaciones convencionales en las construcciones
del plásmido.
La Figura 2B es un esquema del vector
trasbordador digerido con EcoRI para liberar al genoma modificado
Ad\Delta de la columna vertebral del plásmido pSP72.
La Figura 2C es una descripción esquemática de la
función del sistema del vector. En presencia de un virus auxiliar
EI suprimido Ad.CbhpAP que codifica a un minigén indicador para la
fosfatasa alcalina de placenta humana (hpAP), el genoma
Ad\Delta.CMVLacZ se empaca dentro de las cápsides preformadas del
virión, en forma distinguible de los viriones auxiliares por la
presencia del gen LacZ.
Las Figuras 3A a 3F [SEQ. ID. No. 1] reportan la
cadena superior de ADN del plásmido bicatenario pAd\Delta.
CMVLacZ. La secuencia complementaria puede ser fácilmente obtenida por una persona entrenada en la técnica. La secuencia incluye los siguientes componentes: 3' Ad ITR (nucleótidos 607-28 de la SEQ. ID. No. 1); el 5' Ad ITR (nucleótidos 5496-5144 de la SEQ. ID. No. 1); promotor/reforzador CMV (nucleótidos 5117-4524 de la SEQ. ID. No. 1); secuencia SD/SA (nucleótidos 4507-4376 de la SEQ. ID. No. 1); gen LacZ (nucleótidos 4320-845 de la SEQ. ID No. 1); y una secuencia poli A (nucleótidos 837-639 de la SEQ. ID. No. 1).
CMVLacZ. La secuencia complementaria puede ser fácilmente obtenida por una persona entrenada en la técnica. La secuencia incluye los siguientes componentes: 3' Ad ITR (nucleótidos 607-28 de la SEQ. ID. No. 1); el 5' Ad ITR (nucleótidos 5496-5144 de la SEQ. ID. No. 1); promotor/reforzador CMV (nucleótidos 5117-4524 de la SEQ. ID. No. 1); secuencia SD/SA (nucleótidos 4507-4376 de la SEQ. ID. No. 1); gen LacZ (nucleótidos 4320-845 de la SEQ. ID No. 1); y una secuencia poli A (nucleótidos 837-639 de la SEQ. ID. No. 1).
La Figura 4A es un esquema del vector
trasbordador pAd\Deltac.CMVLacZ que contiene un Ad5' ITR y 3'ITR
posicionados cabeza con cola, con un minigén
LacZ-promotor/reforzador CMV inmediatamente después
del 5' ITR, seguido por una columna vertebral del plásmido pSP72
(Promega). Las enzimas de restricción endonucleasa se representan
por designaciones convencionales en las construcciones del
plásmido.
La Figura 4B es una descripción esquemática de la
función del sistema del vector de la Figura 4A. En presencia del
virus auxiliar Ad.CbhpAP, la secuencia del vector circular
trasbordador pAd\Deltac.CMVLacZ se empaca dentro las cabezas de
los viriones, en forma distinguible de los viriones auxiliares por
medio de la presencia del gen LacZ.
Las Figuras 5A a 5F (SEQ. ID. No. 2) reportan la
cadena superior de ADN del vector bicatenario pAd\Deltac.CMVLacZ.
La secuencia complementaria puede ser obtenida fácilmente por una
persona entrenada en la técnica. La secuencia incluye los
siguientes componentes: 5' Ad ITR (nucleótidos
600-958 de la SEQ. ID. No. 2); promotor/reforzador
CMV (nucleótidos 969-1563 de la SEQ. ID. No. 2);
secuencia SD/SA (nucleótidos 1579-1711); gen LacZ
(nucleótidos 1762-5236 de la SEQ. ID. No. 2);
secuencia poli A (nucleótidos 5245-5443 de la SEQ.
ID. No. 2); y 3' Ad ITR (nucleótidos 16-596 de la
SEQ. ID. No. 2).
La Figura 6 es un esquema del vector trasbordador
pAd\Delta.CBCFTR que contiene 5' ITR de Ad5, seguido por un
reforzador quimérico CMV/reforzador promotor de actina \beta, un
gen CFTR, una secuencia poli A, un 3' ITR de Ad5 y una secuencia
sobrante de plásmido de la columna vertebral del plásmido pSL1180
(Pharmacia). Las enzimas de restricción endonucleasa se
representan por designaciones convencionales en las construcciones
del plásmido.
Las Figuras 7A hasta 7H [SEQ. ID. No. 3] reportan
la cadena superior de ADN del plásmido bicatenario
pAd\Delta.
CBCFTR. La secuencia complementaria puede ser obtenida fácilmente por una persona entrenada en la técnica. La secuencia incluye los siguientes componentes: 5' Ad ITR (nucleótidos 9611-9254 de la SEQ. ID. No. 3); el promotor quimérico reforzador CMV/actina \beta (nucleótidos 9241-8684 de la SEQ. ID. No. 3); el gen CFTR (nucleótidos 8622-4065 de la SEQ. ID. No. 3); secuencia poli A (nucleótidos 3887-3684 de la SEQ. ID. No. 3); y 3' Ad ITR (nucleótidos 3652-3073 de la SEQ. ID. No.3). La columna vertebral del plásmido restante se obtiene de pSL1180 (Pharmacia).
CBCFTR. La secuencia complementaria puede ser obtenida fácilmente por una persona entrenada en la técnica. La secuencia incluye los siguientes componentes: 5' Ad ITR (nucleótidos 9611-9254 de la SEQ. ID. No. 3); el promotor quimérico reforzador CMV/actina \beta (nucleótidos 9241-8684 de la SEQ. ID. No. 3); el gen CFTR (nucleótidos 8622-4065 de la SEQ. ID. No. 3); secuencia poli A (nucleótidos 3887-3684 de la SEQ. ID. No. 3); y 3' Ad ITR (nucleótidos 3652-3073 de la SEQ. ID. No.3). La columna vertebral del plásmido restante se obtiene de pSL1180 (Pharmacia).
La Figura 8A ilustra la generación de la
secuencia terminal 5' del adenovirus que contenía los dominios PAC
I y II por PCR. Ver, las flechas indicando las sondas PCR derecha e
izquierda (PAC II) en la Figura 1B.
La Figura 8B ilustra la generación de la
secuencia terminal 5' que contenía los dominios PAC I, II, III y IV
por PCR. Ver, las flechas indicando las sondas PCR derecha e
izquierda (PAC IV) en la Figura 1B.
La Figura 8C describe los productos subclonados
de amplificación dentro del sitio de clonación múltiple de pAd.Link
1 (núcleo del vector IHGT) que generan pAd.PACII (dominios I y II) y
pAd.PACIV (dominios I, II, III, y IV) que resultan en los virus
auxiliares inutilizados Ad.PACII y Ad.PACIV con señales (PAC)
modificadas de empaquetamiento.
La Figura 9A es una representación esquemática de
la subclonación de un minigén indicador de fosfatasa alcalina de
placenta humana que contiene al promotor/reforzador CMV cercano
inmediato (CMV), cADN fosfatasa alcalina de placenta humana (hpAP),
y señal de poliadenilación (pA) SV40 dentro de pAd.PACII que resulta
en un vector del virus auxiliar inutilizado pAdA.PACII.CMVhpAP.
Las enzimas de restricción endonucleasa se representan por
designaciones convencionales en las construcciones del plásmido.
La Figura 9B es una representación esquemática de
la subclonación del mismo minigén de la Figura 9A dentro de
pAd.PACIV que resulta en un vector del virus auxiliar inutilizado
pAdA.PACIV.CMV.hpAP.
La Figura 10 es un diagrama de flujo que resume
la síntesis de un adenovirus con base en el conjugado policatión del
virus auxiliar y su combinación con un vector trasbordador
pAd\Delta que resulta en un nuevo complejo de partícula viral. La
banda purificada de CsCl del adenovirus auxiliar reaccionó con el
entrecruzador heterobifuncional sulfo-SMCC y la
fibra de proteína de la cápside se marcó con la fracción maleimida
nucleofílica. Los sulfhidrilos libres se introdujeron en
poli-L-lisina usando clorhidrato de
2-iminotiolano y se mezclaron con el adenovirus
marcado, resultando en el conjugado Ad-pLys del
virus auxiliar. Se genera una única partícula con base en el
adenovirus por purificación del conjugado Ad-pLys
sobre un gradiente de CsCl para remover la
poli-L-lisina no incorporada,
seguido por una diálisis extensiva, la adición de los ADN del
plásmido trasbordador a Ad-pLys y permitiendo al
complejo formado por el plásmido trasbordador envuelto alrededor de
Ad-pLys, que se desarrolle.
La Figura 11 es un diagrama esquemático de
pCCL-DMD, que se describe en detalle en el Ejemplo 9
más abajo.
Las Figuras 12A - 12P proveen la secuencia
continua de ADN de pAd\Delta.CMVmDys [SEQ. ID. No. 10].
La presente invención provee un único adenovirus
recombinante capaz de liberar transgenes a células blanco, así como
los componentes para la producción del único virus y los métodos
para el uso del virus para tratar una variedad de desórdenes
genéticos.
El virus Ad\Delta de esta invención es una
partícula viral que contiene solamente los elementos cis del
adenovirus, necesarios para la replicación y la encapsidación del
virión (esto es, ITRs y secuencias de empacado), de lo contrario
suprimidos de todos los genes adenovirus (esto es, todas las
estructuras virales de lectura abierta). Este virus porta un
transgén seleccionado bajo el control de un promotor seleccionado y
de otros componentes reguladores convencionales, tales como una
señal poli A. El virus Ad\Delta se caracteriza por la
persistencia mejorada del ADN del vector en las células huésped,
antigenicidad/inmunogenicidad reducidas, y en consecuencia, un
rendimiento mejorado como vehículo de suministro. Una ventaja
adicional de esta invención es que el virus Ad\Delta permite el
empaquetamiento de transgenes muy grandes, tal como un cADN de
distrofina de longitud completa para el tratamiento del agotamiento
progresivo del tejido muscular característico de la Distrofia
Muscular de Duchenne (DMD).
Este virus recombinante nuevo se produce por el
uso de un sistema de producción de un vector basado en el
adenovirus, que contiene dos componentes: 1) un vector trasbordador
que comprende los elementos cis del adenovirus necesarios para la
replicación y la encapsidación del virión y que se suprime de todos
los genes virales, dicho vector porta un minigén indicador o
terapéutico y 2) un adenovirus auxiliar el cual, solo o con una
línea celular de empaquetamiento, es capaz de proveer todos los
productos del gen viral necesarios para una infección viral
productiva cuando se co-transfecta con el vector
trasbordador. Preferiblemente, el virus auxiliar se modifica de
forma que no se empaca a sí mismo en forma eficiente. En esta
composición, es usado deseablemente en combinación con una línea
celular de empaquetamiento que expresa en forma estable los genes
del adenovirus. Los métodos para producir este vector viral a
partir de estos componentes incluyen tanto un medio nuevo de
empaquetamiento de un vector adenoviral como del vector que
contiene un transgén dentro de un virus, y un método novedoso para
la separación subsiguiente del virus auxiliar a partir del virus
recombinante recientemente formado.
El vector trasbordador, referido como
pAd\Delta, se compone de secuencias de adenovirus y de secuencias
transgénicas, incluidas las secuencias de control reguladoras del
vector.
Las secuencias de ácido nucleico del adenovirus
del vector trasbordador proporcionan las secuencias mínimas de
adenovirus que permiten a una partícula viral ser producida con la
ayuda de un virus auxiliar. Esas secuencias ayudan al suministro de
un genoma de transgén recombinante hacia una célula blanco por medio
del virus recombinante resultante.
Las secuencias de ADN de una cantidad de tipos de
adenovirus se encuentran disponibles en el Banco de Genes, incluido
el tipo Ad5 [Número de Acceso en el Banco de Genes No. M73260]. Las
secuencias de adenovirus pueden obtenerse a partir de cualquier
serotipo de adenovirus conocido, tal como los serotipos 2, 3, 4, 7,
12 y 40, que incluyen además a cualquiera de los 41 tipos humanos
ya identificados [ver, por ejemplo, a Horwitz, citado arriba].
Adenovirus similares que se conoce que infectan a otros animales,
pueden emplearse también en las construcciones del vector de esta
invención. La selección del tipo de adenovirus no se anticipa para
limitar la siguiente invención. Una variedad de cepas de adenovirus
se encuentran disponibles en la American Type Culture Collection,
en Rockville, Maryland, o por solicitud a varias fuentes
comerciales o institucionales. En la siguiente modalidad como
ejemplo, se usa un adenovirus tipo 5 (Ad5) por conveniencia.
Si embargo, es deseable obtener una variedad de
vectores trasbordador pAd\Delta con base en diferentes serotipos
de adenovirus humano. Se anticipa que una biblioteca de tales
plásmidos y los vectores virales Ad\Delta resultantes serían
útiles en un régimen terapéutico pare evadir la inmunidad celular
y posiblemente la humoral, y prolongar la duración de la expresión
del transgén, así como mejorar el éxito de tratamientos
terapéuticos repetidos. Adicionalmente, el uso de varios serotipos
se cree que produce virus recombinantes con diferentes
especificidades de tejido objetivo. La ausencia de genes
adenovirales en el vector viral Ad\Delta se anticipa que reduce o
elimina la respuesta adversa CTL que normalmente causa destrucción
de los adenovirus recombinantes suprimidos únicamente del gen
E1.
Específicamente, las secuencias de ácido nucleico
del adenovirus empleadas en el vector trasbordador pAd\Delta de
esta invención son secuencias genómicas de adenovirus a partir de
las cuales todos los genes virales se suprimen. Más
específicamente, las secuencias de adenovirus empleadas son las
secuencias cis-activas 5' y 3' de repetición
terminal invertida (ITR) de un adenovirus (que funcionan como
orígenes de la reproducción) y el dominio de
empaquetamiento/reforzador 5' nativo, que contiene las secuencias
necesarias para el empaquetamiento de los genomas lineares Ad y de
los elementos reforzadores para el promotor E1. Estas secuencias son
las secuencias necesarias para la replicación y encapsidación del
virión. Ver, por ejemplo, P. Hearing y colaboradores, J.
Virol., 61 (8): 2555-2558 (1987); M.
Grable y P. Hearing, J. Virol., 64(5):
2047-2056 (1990); y M. Grable y P. Hearing, J.
Virol., 66(2): 723-731 (1992).
De acuerdo con esta invención, la secuencia
completa 5'del adenovirus que contiene la ITR 5' y la región de
empaquetamiento/reforzadora pueden ser empleadas como la secuencia
5' del adenovirus en el vector trasbordador pAd\Delta. Esta
secuencia (5') terminal izquierda del genoma Ad5 útil en esta
invención abarca desde bp 1 hasta alrededor de 360 del genoma
convencional del adenovirus, también mencionado como unidades
cartográficas 0-1 del genoma viral. Esta secuencia
se proporciona aquí como los nucleótidos 5496-5144
de la SEQ. ID. No 1, los nucleótidos 600-958 de la
SEQ. ID. No. 2; y los nucleótidos 9611-9254 de la
SEQ. ID. No. 3, y tiene desde alrededor de 353 hasta alrededor de
360 nucleótidos de longitud. Esta secuencia incluye la ITR 5' (bp
1-103 del genoma del adenovirus), y al dominio de
empaquetamiento/reforzador (bp 194-358 del genoma
del adenovirus). Ver, Figuras 1A, 3, 5 y 7.
Preferiblemente, esta región 5' del adenovirus
nativo se emplea en el vector trasbordador en forma no modificada.
Sin embargo, algunas modificaciones que incluyen supresiones,
sustituciones y adiciones a esta secuencia que no efectúan en
forma adversa su función biológica, pueden ser aceptables. Ver, por
ejemplo, WO 93/24641, publicada el 9 de diciembre de 1993. La
capacidad para modificar estas secuencias ITR está dentro de las
posibilidades de una persona entrenada en la técnica. Ver, por
ejemplo, textos tales como el de Sambrook y colaboradores,
"Molecular Cloning. A Laboratory Manual.", 2da edición, Cold
Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, New York (1989).
Las secuencias 3' del adenovirus del vector
trasbordador incluyen la secuencia ITR (3') del terminal derecho
del genoma adenoviral que abarca alrededor de bp 35.353 al extremo
del genoma del adenovirus, o 98,4-100 unidades
cartográficas. Esta secuencia se provee aquí como los nucleótidos
607-28 de la SEQ. ID. No. 1, los nucleótidos
16-596 de la SEQ. ID No. 2; y los nucleótidos
3652-3073 de la SEQ. ID. No. 3, y generalmente es
de alrededor de 580 nucleótidos de longitud. Esta secuencia
completa se la emplea deseablemente como la secuencia 3' de un
vector trasbordador pAd\Delta. Preferiblemente, se emplea la
región 3' del adenovirus nativo en el vector trasbordador, en forma
no modificada. Sin embargo, pueden ser aceptables algunas
modificaciones a esta secuencia que no efectúan en forma adversa su
función biológica.
Un ejemplo de un vector trasbordador pAd\Delta
de esta invención, descrito más abajo y en la Figura 2A, contiene
solamente aquellas secuencias del adenovirus requeridas para el
empaquetamiento del ADN genómico adenoviral dentro de la cabeza
cápside preformada. El vector pAd\Delta contiene secuencias Ad5
que codifican las secuencias terminales 5' y 3' (identificadas en
la descripción de la Figura 3), así como las secuencias
transgénicas descritas más abajo.
A partir de la información precedente, se espera
que alguien entrenado en la técnica pueda emplear otras secuencias
equivalentes de adenovirus para ser usadas en los vectores
Ad\Delta de esta invención. Estas secuencias pueden incluir otras
cepas de adenovirus, o las secuencias cis-activas
anteriormente mencionadas, con modificaciones menores.
La secuencia transgénica del vector y del virus
recombinante es una secuencia de ácido nucleico o una transcripción
inversa de la misma, heteróloga de la secuencia del adenovirus, que
codifica a un polipéptido o proteína de interés. El transgén está
operativamente enlazado a los componentes reguladores en una forma
que permite la trascripción del transgén.
La composición de la secuencia transgénica
dependerá del uso que se le dará al virus resultante. Por ejemplo,
un tipo de secuencia transgénica incluye una secuencia indicadora,
que por expresión produce una señal detectable. Tales secuencias
indicadoras incluyen sin limitación un cADN (LacZ)
beta-galactosidasa de E. coli, un gen de
fosfatasa alcalina de placenta humana y un gen de proteína
fluorescente verde. Estas secuencias, cuando están asociadas con
elementos reguladores que dirigen su expresión, proveen señales
detectables por medios convencionales, por ejemplo, absorbancia de
longitud de onda ultravioleta, cambio de color visible, etc.
Otro tipo de secuencia transgénica incluye un gen
terapéutico que expresa un producto deseado del gen en una célula
huésped. Estas secuencias de ácido nucleico terapéutico típicamente
codifican productos para administración y expresión en un paciente
in vivo o ex vivo para reemplazar o corregir un
defecto genético heredado o no heredado o tratar un desorden o
enfermedad epigenética. Tales genes terapéuticos que son
deseables para la realización de terapia génica incluyen, sin
limitación, un gen regulador normal transmembrana de la fibrosis
cística (CFTR) (ver Figura 7), un gen de lipoproteína de baja
densidad (LDL) [T. Yamamoto y colaboradores, Cell,
39: 27-28 (noviembre, 1984)], una secuencia
cADN DMD [secuencias parciales disponibles del Banco de Genes,
Accesos Nos. M36673, M36671, [A. P. Mónaco y colaboradores,
Nature, 323: 646-650 (1986)] y L06900,
[Roberts y colaboradores, Hum. Mutat., 2:
293-299 (1993)]] (Banco de Genes), y un número de
genes que pueden ser seleccionados fácilmente por alguien
entrenado en la técnica. La selección del transgén no se considera
como una limitación de esta invención, y como tal selección se
encuentra dentro del conocimiento de aquel entrenado en la
técnica.
Además de los elementos principales identificados
antes para el vector trasbordador pAd\Delta, esto es, las
secuencias del adenovirus y del transgén, el vector también
incluye elementos reguladores convencionales necesarios para
conducir la expresión del transgén en una célula transfectada con el
vector pAd\Delta. Por lo tanto, el vector contiene un promotor
seleccionado que se enlaza al transgén y se localiza, con el
transgén, entre las secuencias del adenovirus del vector.
La selección del promotor es una materia
rutinaria y no es una limitación por sí misma del vector
pAd\Delta. Los promotores útiles pueden ser promotores
constitutivos o promotores regulados (inducibles), que permitirán el
control de la cantidad de transgén a ser expresado. Por ejemplo, un
promotor deseable es aquel del citomegalovirus cercanamente
inmediato al promotor/reforzador [ver, por ejemplo, Boshart y
colaboradores, Cell, 41: 521-530
(1985)]. Este promotor se encuentra en los nucleótidos
5117-4524 de las SEQ. ID. No. 1, y los nucleótidos
969-1563 de la SEQ. ID. No. 2. Otro promotor es el
promotor CMV reforzador/\beta-actina de pollo
(nucleótidos 9241-8684 de la SEQ. ID. No. 3). Otro
promotor deseable incluye, sin limitación, al virus del sarcoma de
Rous, promotor/reforzador de LTR. Aún otras secuencias
promotor/reforzadoras pueden ser seleccionadas por alguien entrenado
en la técnica.
Los vectores trasbordadores también contendrán en
forma deseable, secuencias de ácido nucleico heterólogas a las
secuencias del adenovirus incluidas las secuencias que proveen las
señales requeridas para una poliadenilación eficiente del
transcrito y de los intrones con el donante de empalme funcional y
los sitios aceptores (SD/SA). Una secuencia poli A común que se
emplea en los vectores de los ejemplos de esta invención es
aquella derivada del papovavirus SV-40 [ver, por
ejemplo, los nucleótidos 837-639 de la SEQ. ID.
No. 1; 5245-5443 de la SEQ. ID. No. 2; y
3887-3684 de la SEQ. ID. No. 3]. La secuencia poli
A generalmente se inserta en el vector después de las secuencias
transgénicas y antes de las secuencias del adenovirus 3'. Una
secuencia común de intrón también se deriva de
SV-40, y se hace referencia a ella como a la
secuencia T del intrón SV-40 [ver, por ejemplo, los
nucleótidos 4507-4376 de la SEQ. ID. No. 1, y
1579-1711 de la SEQ. ID. No.2]. Un vector
trasbordador pAd\Delta de la presente invención puede también
contener tal intrón, deseablemente localizado entre la secuencia del
promotor/reforzador y el transgén. La selección de estos y otros
elementos comunes del vector es convencional y muchas de tales
secuencias están disponibles [ver, por ejemplo, Sambrook y
colaboradores, y las referencias citadas allí]. Ejemplos de tales
secuencias reguladoras para los anteriores se proporcionan en las
secuencias del plásmido de las Figuras 3, 5 y 7.
La combinación del transgén, del
promotor/reforzador, y de los otros elementos del vector
regulador, se la menciona aquí como un "minigén" para fácil
referencia. El minigén está preferiblemente flanqueado por las
secuencias cis-activas 5' y 3' del adenovirus
descrito antes. Tal minigén puede tener un tamaño en el rango de
varios cientos de pares de bases hasta alrededor de 30 kb debido a
la ausencia de las secuencias temprana y tardía del gen del
adenovirus en el vector. Por lo tanto, este sistema del vector
Ad\Delta permite bastante libertad en la selección de los
diferentes componentes del minigén, particularmente del transgén
seleccionado, con relación al tamaño. Provistos con las enseñanzas
de esta invención, el diseño de un minigén tal puede hacerse por
concurrencia de las técnicas convencionales.
Debido a la limitada cantidad de secuencia de
adenovirus presente en el vector trasbordador Ad\Delta, un
adenovirus auxiliar de esta invención debe, solo o en convenio con
una línea celular de empaquetamiento, proveer suficientes secuencias
del gen del adenovirus, necesarias para una infección viral
productiva. Los virus auxiliares útiles en esta invención contienen
así, secuencias seleccionadas del gen del adenovirus, y
opcionalmente un segundo minigén indicador.
Normalmente, la producción de un adenovirus
recombinante que utiliza un adenovirus auxiliar que contiene un
complemento completo de genes adenovirales, resulta en virus
recombinantes contaminados por exceso de producción del virus
auxiliar. Por lo tanto, se requiere la purificación extensiva del
vector viral del virus auxiliar contaminante. Sin embargo, la
presente invención provee una forma para facilitar la purificación
y reducir la contaminación mutilando al virus auxiliar.
Una modalidad preferida de un virus auxiliar de
esta invención contiene por lo tanto tres componentes (A)
modificaciones o supresiones de las secuencias del gen adenoviral
nativo que dirigen el empaquetamiento eficiente, a fin de
inhabilitar en forma sustancial o "inutilizar" la función de
empacado del virus auxiliar o su capacidad para replicarse, (B)
genes seleccionados de adenovirus y (C) un minigén indicador
opcional. Esos virus auxiliares "inutilizados" pueden formarse
también dentro de los conjugados policatión como se describe más
abajo.
Las secuencias del adenovirus que forman el virus
auxiliar pueden obtenerse de las fuentes identificadas arriba en la
discusión del vector trasbordador. El uso de diferentes serotipos
Ad como virus auxiliares permite la producción de virus
recombinantes que contienen las secuencias del vector trasbordador
\DeltaAd (serotipo 5) en una cápside formada por el otro serotipo
de adenovirus. Esos virus recombinantes son deseables en el
reconocimiento de diferentes tejidos, o evadiendo una respuesta
inmune a las secuencias \DeltaAd que tienen una cápside serotipo
5. El uso de esos virus auxiliares diferentes serotipo Ad puede
también demostrar ventajas en la producción de virus recombinante,
estable y mejor empacado.
Un virus auxiliar deseable, usado en la
producción del vector adenovirus de esta invención se modifica (o
se inutiliza) en su dominio de empaquetamiento/reforzador ITR 5',
identificado arriba. Como se estableció antes, la región de
empaquetamiento/reforzadora contiene las secuencias necesarias para
el empaquetamiento de los genomas lineares de adenovirus
(secuencias "PAC"). Más específicamente, esta secuencia
contiene al menos siete distintos dominios aún funcionalmente
redundantes que se requieren para la encapsidación eficiente del ADN
viral replicado.
Dentro de un intervalo de la secuencia de
nucleótidos de bp 194-358 del genoma Ad5, cinco de
estas así llamadas repeticiones A o secuencias PAC están
localizadas (ver Figura 1B). PAC I se localiza en bp
241-248 del genoma del adenovirus (sobre la hebra
complementaria a los nucleótidos 5259-5246 de la
SEQ. ID. No. 1). PAC II se localiza en bp 262-269
del genoma del adenovirus (sobre la hebra complementaria a los
nucleótidos 5238-5225 de la SEQ. ID. No. 1). PAC III
se localiza en bp 304-311 del genoma del adenovirus
(sobre la hebra complementaria a los nucleótidos
5196-5183 de la SEQ. ID. No. 1). PAC IV se localiza
en bp 314-321 del adenovirus (sobre la hebra
complementaria a los nucleótidos 5186-5172 de la
SEQ. ID. No. 1). PAC V se localiza en bp 339-346
del adenovirus (sobre la hebra complementaria a los nucleótidos
5171-5147 de la SEQ. ID. No. 1).
Las secuencias correspondientes pueden obtenerse
de las SEQ. ID. No. 2 y 3. PAC I se localiza en los nucleótidos
837-851 de la SEQ. ID. No. 2; y sobre la hebra
complementaria a los nucleótidos 9374-9360 de la
SEQ. ID. No. 3. PAC II se localiza en los nucleótidos
859-863 de la SEQ. ID. No. 2; y sobre la hebra
complementaria a los nucleótidos 9353-9340 de la
SEQ. ID. No. 3. PAC III se localiza en los nucleótidos
901-916 de la SEQ. ID. No. 2; y sobre la hebra
complementaria a los nucleótidos 9311-9298 de la
SEQ. ID. No. 3. PAC IV se localiza en los nucleótidos
911-924 de la SEQ. ID. No. 2; y sobre la hebra
complementaria a los nucleótidos 9301-9288 de la
SEQ. ID. No. 3. PAC V se localiza en los nucleótidos
936-949 de la SEQ. ID. No. 2; y sobre la hebra
complementaria a los nucleótidos 9276-9263 de la
SEQ. ID. No. 3.
La Tabla 1 abajo en lista esas cinco secuencias
nativas Ad5 y una secuencia PAC de consenso basada en las
similitudes entre un intervalo de ocho ácidos nucleicos dentro de
las cinco secuencias. La secuencia de consenso contiene dos
posiciones en las cuales el ácido nucleico puede ser A o T (A/T).
Las designaciones convencionales de una sola letra se usan para
los ácidos nucleicos, como se conoce en el estado de la
técnica.
De acuerdo con esta invención, las mutaciones o
supresiones pueden hacerse a una o más de estas secuencias PAC para
generar los deseables virus auxiliares inutilizados. Un análisis de
la supresión del dominio de empaquetamiento reveló una posible
correlación entre la eficiencia de la encapsidación y el número de
empaquetamiento de las repeticiones de A que estaban presentes en el
extremo 5' del genoma. Las modificaciones de este dominio pueden
incluir las secuencias 5' del adenovirus que contiene menos que
todas las cinco de las secuencias PAC de la Tabla 1. Por ejemplo,
solamente dos secuencias PAC pueden estar presentes en el virus
inutilizado, por ejemplo, PAC I y PAC II, PAC III y PAC IV, y así
sucesivamente. Las supresiones de las secuencias PAC seleccionadas
pueden involucrar la supresión de secuencias contiguas y no
contiguas. Por ejemplo, PAC II y PAC IV pueden ser suprimidas,
saliendo PAC I, III y IV en la secuencia 5'. Aún una modificación
alternativa puede ser el reemplazo de una o más de las secuencias
nativas PAC con una o más repeticiones de la secuencia consenso de
la Tabla 1. Alternativamente, esta región del adenovirus puede
modificarse por la inserción deliberada de mutaciones que rompen
una o más de las secuencias nativas PAC. Alguien entrenado en la
técnica puede manipular además las secuencias PAC para lograr en
forma similar el efecto de reducir la eficiencia de empaquetamiento
del virus auxiliar hasta un nivel deseado.
Los virus auxiliares de los ejemplos que
involucran la manipulación de las secuencias PAC descritas antes
se describen en el Ejemplo 7 más abajo. En resumen, como se
describe en ese ejemplo, un virus auxiliar contiene en el lugar de
la región 5' ITR nativa (bp 1-360 del genoma del
adenovirus), una secuencia 5' de adenovirus que se extiende entre
bp 1-269 del genoma del adenovirus, que contiene
solamente las secuencias 5' ITR y PAC I y PAC II, y suprime la
región bp 270-360 del adenovirus.
Otra secuencia PAC modificada del virus auxiliar
contiene solamente la secuencia 5' Ad5 de la ITR y PAC I hasta PAC
IV (bp 1-321 de Ad), suprimiendo PAC V y otras
secuencias en la región bp 322-360 de Ad.
Estos virus auxiliares modificados se
caracterizan por una eficiencia reducida de la encapsidación del
virus auxiliar. Estos virus auxiliares con las modificaciones
específicas de las secuencias relacionadas con la eficiencia del
empaquetamiento, proveen una eficiencia de empaquetamiento lo
suficientemente alta para generar la producción de muchos de los
virus auxiliares, pero aún lo suficientemente baja para que
permitan lograr rendimientos altos de las partículas virales de
transducción Ad\Delta de acuerdo con esta invención.
Los virus auxiliares útiles en esta invención,
sea que contengan o no las modificaciones "inutilizadoras"
descritas antes, contienen secuencias seleccionadas del gen de
adenovirus que dependen de la línea celular que se transfecta por el
virus auxiliar y por el vector trasbordador. Un virus auxiliar
preferido contiene una variedad de genes adenovirus además de las
secuencias descritas antes.
Como ejemplo, si la línea celular empleada para
producir al virus recombinante no es una línea celular de
empaquetamiento, el virus auxiliar puede ser un virus Ad del tipo
silvestre. Por lo tanto, el virus auxiliar suministra los genes
tempranos necesarios E1, E2, E4 del adenovirus, y todos los
restantes genes tardíos, intermedios, estructurales y no
estructurales del genoma del adenovirus. Este virus auxiliar puede
ser un virus auxiliar inutilizado por la incorporación de
modificaciones en su dominio de empaquetamiento/reforzador 5'
nativo.
Un virus auxiliar deseable es una replicación
defectuosa y carece de toda o de una porción del gen temprano E1a,
inmediatamente temprano adenoviral (que abarca desde mu 1,3 hasta
4,5) y el gen temprano E1b retrasado (que abarca desde mu 4,6 hasta
11,2) a fin de eliminar sus funciones biológicas normales. Tales
virus de replicación deficiente pueden tener también modificaciones
mutilantes en el dominio de empaquetamiento/reforzador. Debido a la
dificultad que rodea a la remoción absoluta del adenovirus de las
preparaciones de Ad\Delta que han sido enriquecidas por
centrifugación en gradiente de densidad por flotación con CsCl, el
uso de un auxiliar de adenovirus de replicación deficiente previene
la introducción de adenovirus infeccioso para el estudio de
animales in vivo. Este virus auxiliar se emplea con una línea
celular de empaquetamiento que suministra las proteínas E1
deficientes, tal como la línea celular 293.
Adicionalmente, todo o una porción del gen
temprano E3 postergado del adenovirus (que abarca desde mu 76,6
hasta 86,2) puede eliminarse de la secuencia del adenovirus que
forma parte de los virus auxiliares útiles en esta invención, sin
afectar en forma adversa la función del virus auxiliar debido a que
este producto del gen no es necesario para la formación de un virus
en funcionamiento.
En presencia de otras líneas celulares de
empaquetamiento que sean capaces de proveer las proteínas
adenovirales además del E1, el virus auxiliar puede por lo tanto
ser suprimido de los genes que codifican esas proteínas
adenovirales.
Tales virus auxiliares adicionalmente suprimidos
también contienen en forma deseable, modificaciones mutilantes como
se describió antes.
También es deseable para el virus auxiliar que
contenga un minigén indicador, en el cual el gen indicador es
deseablemente diferente del transgén indicador contenido en el
vector trasbordador. Se conocen varios de tales genes informadores,
como se mencionó antes. La presencia de un gen indicador sobre el
virus auxiliar que es diferente del gen informador sobre el
pAd\Delta, permite hacer un seguimiento independiente tanto al
virus recombinante Ad\Delta como al virus auxiliar. Por ejemplo,
la expresión de la fosfatasa alcalina recombinante permite el
seguimiento de las cantidades residuales del adenovirus
contaminante, en forma independiente del LacZ recombinante expresado
por un vector trasbordador pAd\Delta o un virus Ad\Delta.
Aún otro método para reducir la contaminación del
virus auxiliar implica la formación de conjugados policatión de
virus auxiliar, que pueden asociarse con un plásmido que contiene
otros genes adenovirales, que no están presentes en el virus
auxiliar. Los virus auxiliares descritos arriba pueden modificarse
además por la concurrencia de la tecnología del conjugado
polilisina-adenovirus. Ver, por ejemplo, Wu y
colaboradores, J. Biol. Chem., 264:
16985-16987 (1989); y K. J. Fisher y J. M. Wilson,
Biochem. J., 299: 49 (1 de abril de 1994), incorporada
aquí como referencia.
Usando esta tecnología, un virus auxiliar que
contiene preferiblemente los genes adenovirales tardíos, se
modifica por la adición de una secuencia policatión distribuir
alrededor de la cápside del virus auxiliar. Preferiblemente, el
policatión es polilisina, que se pega alrededor del vector cargado
negativamente para formar una carga externa positiva. Se designa
entonces a un plásmido para expresar a aquellos genes adenovirales
que no están presentes en el virus auxiliar, por ejemplo, los genes
E1, E2 y/o E4. El plásmido asociado al conjugado del virus auxiliar
a través de las cargas sobre la secuencia de polilisina. Esta
modificación deseablemente también se la hace al virus auxiliar
inutilizado de esta invención. Este conjugado (también llamado
partícula de trans-infección) permite que los genes
adicionales de adenovirus sean removidos del virus auxiliar y que
estén presentes sobre un plásmido que no llega a incorporarse
dentro del virus durante la producción del vector viral
recombinante. Por lo tanto, se disminuye considerablemente el
impacto de la contaminación.
El material a partir del cual se derivan las
secuencias usadas en el vector trasbordador pAd\Delta y los virus
auxiliares, así como los diferentes componentes del vector y las
secuencias empleadas en la construcción de los vectores
trasbordadores, virus auxiliares, y los virus Ad\Delta de esta
invención, se obtienen de fuentes comerciales o académicas con base
en los materiales previamente descritos y publicados. Estos
materiales pueden obtenerse también a partir de un paciente
individual, o ser generados y seleccionados usando técnicas
estándar de clonación molecular recombinante, conocidas y
practicadas por aquellos entrenados en la técnica. Cualquier
modificación de las secuencias existentes de ácido nucleico que
forman los vectores y los virus, incluidas las supresiones de
secuencias, las inserciones, y otras mutaciones, también se
generan usando técnicas estándar.
El montaje de las secuencias seleccionadas de ADN
de los adenovirus, y de los genes indicadores o de los genes
terapéuticos y de otros elementos del vector dentro del vector
trasbordador pAd\Delta usando técnicas convencionales, se describe
en el Ejemplo 1 abajo. Tales técnicas incluyen técnicas de
clonación convencionales de cADN tales como aquellas descritas en
textos [Sambrook y colaboradores, citado antes], usan el traslapo
de las secuencias de oligonucleótidos de los genomas de adenovirus,
la reacción en cadena de la polimerasa, y cualquier método adecuado
que provea la secuencia nucleótida deseada. Las técnicas empleadas
de transfección estándar y de co-transfección, por
ejemplo, las técnicas de transfección con CaPO_{4} usando la
línea celular HEK 293. Otros métodos convencionales empleados en
esta invención incluyen recombinación homóloga de los genomas
virales, siembra de los virus en superficie de agar, métodos para
medir la generación de señal, y similares. El montaje de cualquier
vector AdA deseado o virus auxiliar de esta invención, está dentro
de las destrezas de la técnica, que se basan en las enseñanzas de
esta invención.
Como se describe abajo en detalle en el Ejemplo
1, y haciendo uso de la Figura 2A y de la secuencia de ADN del
plásmido reportado en la Figura 3, se genera un único vector
trasbordador pAd\Delta de esta invención, pAd\Delta.CMVLacZ.
pAd\Delta.CMVLacZ contiene secuencias Ad5 que codifican al
terminal 5' seguido por un promotor/reforzador CM, una secuencia
donora de empalme/aceptora de empalme, un gen bacterial
beta-galactosidasa (LacZ), una secuencia
SV-40 poli A (pA), un 3' ITR de Ad5 y una secuencia
del plásmido remanente de la columna vertebral del plásmido pSP72
(Promega).
Para generar el genoma Ad\Delta que se
incorpora en el vector, el plásmido pAd\Delta.CMVLacZ debe
digerirse con EcoRI para liberar el genoma Ad\Delta.CMVLacZ,
liberando el adenovirus ITRs y haciéndolos objetivos disponibles
para replicación. Por lo tanto, la producción del vector es
"dependiente de restricción", esto es, requiere el rescate de
la endonucleasa de restricción de la plantilla de replicación. Ver,
Figura 2B.
Se diseñó un segundo tipo de plásmido pAd\Delta
que ubica la secuencia terminal 3' Ad en una disposición cabeza con
cola con relación a la secuencia terminal 5'. Como se describió en
el Ejemplo 1 y en las Figuras 4A, y haciendo uso de la secuencia
de ADN del plásmido reportado en la Figura 5, se genera una segunda
secuencia única del vector Ad\Delta de esta invención,
Ad\Deltac.CMVLacZ, a partir del plásmido trasbordador
pAd\Deltac.CMVLacZ, que contiene una secuencia Ad5 5' ITR y una
secuencia 3' ITR posicionada cabeza con cola, seguido por un
reforzador/promotor CMV, una secuencia SD/SA, un gen LacZ y una
secuencia pA en una columna vertebral del plásmido pSP72 (Promega).
Como se describió en el Ejemplo 1B, este plásmido "independiente
de restricción" permite que el genoma Ad\Delta sea replicado y
rescatado de la columna vertebral del plásmido sin incluir un
tratamiento con endonucleasa (ver, Figura 4B).
Como se describió en detalle en el Ejemplo 2, un
E1 como ejemplo convencional suprimido el virus auxiliar adenovirus,
es el virus Ad.CbhpAP, que contiene una secuencia 5' de adenovirus
de mu 0-1, un minigén indicador que contiene
fosfatasa alcalina de placenta humana (hpAP) bajo el control
transcripcional del promotor B-actina de pollo,
seguido por una secuencia poli A de SV40, seguido por secuencias de
adenovirus desde 9,2 hasta 78,4 y desde 86 hasta 100. Este auxiliar
que contenía supresiones desde mu 1,0 hasta 9,2 y 78,4 hasta 86,
que elimina sustancialmente la región E1 y la región E3 del virus.
Este virus puede ser deseablemente inutilizado de acuerdo con esta
invención por modificaciones a su dominio reforzador de
empaquetamiento.
Los virus auxiliares inutilizados de los ejemplos
de esta invención se describe utilizando las técnicas descritas en
el Ejemplo 7 y contienen las secuencias modificadas PAC 5', esto
es, genoma de adenovirus bp 1-269; mu
0-0,75 o genoma de adenovirus bp
1-321; mu 0-0,89. En resumen, las
secuencias 5' se modifican por PCR y se clonan por técnicas
convencionales dentro de un plásmido basado en un adenovirus
convencional. Se incorpora un minigén hpAP dentro del plásmido, que
luego se altera por recombinación homóloga con un adenovirus dl7001
suprimido de E3 para resultar en los vectores modificados de forma
que el minigén indicador es seguido sobre su extremo 3' con las
secuencias de adenovirus mu 9,6 hasta 78,3 y 87 hasta 100.
La generación de un virus auxiliar de conjugado
de poli-L-lisina se demostró
esencialmente como se describe en detalle en el Ejemplo 5 más abajo
y en la Figura 10 por acoplamiento de
poli-L-lisina a la cápside del
virión Ad.CbhpAP. Alternativamente, puede emplearse el mismo
procedimiento con la secuencia PAC de los virus auxiliares
modificados de esta invención.
Como se estableció antes, un vector trasbordador
pAd\Delta en presencia de un virus auxiliar y/o de una línea
celular de empaquetamiento, permite a las secuencias transgénicas
de adenovirus en el vector trasbordador, ser replicadas y empacadas
dentro de las cápsides del virión, dando como resultado el virus
recombinante Ad\Delta. El método actual para producir tales virus
Ad\Delta es el basado en la transfección, y se describe en
detalle en el Ejemplo 3. En resumen, se usa el virus auxiliar para
infectar células, tales como la línea celular humana de
empaquetamiento HEK 293, que luego es transfectada con un vector
trasbordador pAd\Delta que contiene un transgén seleccionado por
métodos convencionales. Alrededor de 30 horas o más después de la
transfección, las células se cosechan, y se prepara un extracto.
El genoma viral Ad\Delta se empaca dentro de los viriones que
sedimentan a una densidad más baja que el virus auxiliar en los
gradientes de cesio. Por lo tanto, el virus recombinante Ad\Delta
que contiene un transgén seleccionado, se separa del grueso del
virus auxiliar por medio de purificación a través de
ultracentrifugación por densidad de flotación en gradiente de
CsCl.
El rendimiento de virus de transducción
Ad\Delta depende grandemente del número de células que se
transfectan con el plásmido trasbordador pAd\Delta, haciendo
deseable usar un protocolo de transfección de alta eficiencia. Un
método tal involucra el uso de un adenovirus auxiliar
poli-L-lisinilado como se describió
antes. Un plásmido trasbordador pAd\Delta que contiene al
transgén deseado bajo el control de un promotor adecuado, como se
describe arriba, se compleja luego directamente con la cápside del
virus auxiliar cargada positivamente, lo que resulta en la
formación de una partícula única de transfección que contiene al
vector trasbordador pAdA y las funciones auxiliares del virus
auxiliar.
El principio fundamental es que el adenovirus
auxiliar recubierto con el ADN del plásmido pAd\Delta,
co-transportará al ácido nucleico unido a través de
la membrana celular y dentro del citoplasma, de acuerdo a su
mecanismo normal de entrada a la célula. Por lo tanto, la
poli-L-lisina del adenovirus
auxiliar modificado asume múltiples papeles en el contexto de un
complejo basado en el Ad\Delta. Primero, la fundación estructural
sobre la cual el ADN del plásmido puede unirse incrementando la
concentración efectiva. Segundo, la endocitosis del virus mediada
por el receptor, proporciona el vehículo para la incorporación del
ADN del plásmido a la célula. Tercero, La actividad endosomalítica
asociada con la infección adenoviral facilita el suministro del
plásmido internalizado dentro del citoplasma. Y el adenovirus
contribuye a las funciones auxiliares trans sobre las cuales el
adenovirus recombinante Ad\Delta depende de la replicación y el
empaquetamiento de partículas virales de transducción. El
procedimiento de transfección basado en Ad que utiliza un vector
trasbordador pAd\Delta y un conjugado auxiliar de policatión se
detalla en el Ejemplo 6. Adicionalmente, como se describió
previamente, el conjugado del plásmido virus auxiliar puede ser
otra forma de virus auxiliar liberado de los genes del adenovirus
omitidos no presentes en el vector pAd\Delta. Tal estructura
permite que el resto de los genes requeridos del adenovirus se
dividan entre el plásmido y el virus auxiliar, reduciendo así la
eficiencia en la auto replicación del virus auxiliar.
Un método preferido actualmente para producir el
virus recombinante Ad\Delta de esta invención, implica llevar a
cabo la transfección descrita anteriormente con el virus auxiliar
inutilizado, o el conjugado del virus auxiliar inutilizado, como se
describió antes. Un virus auxiliar "inutilizado" de esta
invención, es incapaz de empacarse a sí mismo en forma eficiente,
y por lo tanto permite la separación fácil del virus auxiliar del
vector Ad\Delta recientemente empacado de esta invención, por
medio del uso de ultracentrifugación por densidad de flotación en
gradiente de CsCl, como se describe más abajo en los ejemplos.
Una vez que el virus Ad\Delta de esta invención
se produce por cooperación del vector trasbordador y del virus
auxiliar, el virus Ad\Delta puede ser destinada a, y adoptada
para, una célula blanco seleccionada. La selección de una célula
blanco también depende del uso del virus recombinante, esto es de
si el transgén va a ser replicado o no in vitro o ex
vivo para la producción en un tipo de célula deseado para el
nuevo suministro dentro de un paciente, o in vivo para el
suministro a un tipo de célula o tejido particulares. Las células
diana pueden ser cualquier célula de mamífero (preferiblemente una
célula humana). Por ejemplo, para uso in vivo, el virus
recombinante puede dirigirse a cualquier tipo de célula normalmente
infectada por adenovirus, dependiendo de la vía de administración,
esto es, puede dirigirse, sin limitaciones a neuronas, hepatocitos,
células epiteliales y similares. Las secuencias de adenovirus
auxiliares suministran las secuencias necesarias para permitir la
entrada del virus por el Ad\Delta.
Una vez que el virus recombinante es adoptado por
una célula el transgén flanqueado del adenovirus se rescata de la
columna vertebral del adenovirus por medio de la maquinaria de la
célula infectada como con otros adenovirus recombinantes. Una vez
desacoplado (rescatado) del genoma del virus Ad\Delta, el minigén
recombinante busca un sitio de integración en la cromatina huésped y
llega a integrarse allí dentro, ya sea en forma transciente o
estable, proveyendo la expresión del transgén acompañante en la
célula huésped.
Los nuevos virus recombinantes y conjugados
virales de esta invención, proveen eficientes vehículos de
transferencia de genes para terapia génica somática. Estos virus se
preparan para contener un gen terapéutico en lugar del transgén
indicador LacZ ilustrado en los virus y vectores de los ejemplos.
Por medio del uso de los virus Ad\Delta que contienen transgenes
terapéuticos, estos transgenes pueden ser liberados en un paciente
in vivo o ex vivo para permitir la integración del gen
deseado dentro de una célula blanco. Por lo tanto, estos virus
pueden emplearse para corregir deficiencias genéticas o defectos.
Un ejemplo de la generación de un vehículo para la transferencia del
gen Ad\Delta para el tratamiento de la fibrosis cística, se
describe en el Ejemplo 4 más abajo. Alguien entrenado en la técnica
puede generar cualquier cantidad de otros vehículos para la
transferencia de genes, incluido un transgén seleccionado para el
tratamiento de otros desórdenes.
Los virus recombinantes de la presente invención
pueden administrarse a un paciente, preferiblemente suspendidos en
una solución biológicamente compatible o en un vehículo de
suministro farmacéuticamente aceptable. Un vehículo aceptable
incluye solución salina estéril. Otras soluciones isotónicas
estériles acuosas y no acuosas para inyección, y suspensiones
estériles acuosas y no acuosas conocidas por ser portadores
farmacéuticamente aceptable, y bien conocidas por aquellos
entrenados en la técnica, pueden ser empleadas para este
propósito.
Los virus recombinantes de esta invención pueden
administrarse en cantidades suficientes para transfectar las
células deseadas y proveer niveles suficientes de integración y de
expresión del transgén seleccionado y permitir un beneficio
terapéutico sin efectos adversos indebidos o con efectos
fisiológicos médicamente aceptables que pueden ser determinados por
aquellos entrenados en las artes médicas. Las vías de
administración parenteral convencionales y farmacéuticamente
aceptables incluyen el suministro directo al órgano objetivo,
tejido o sitio de administración intranasal, intravenoso,
intramuscular, subcutáneo, intradérmico y oral. Las vías de
administración pueden combinarse, si se desea.
Las dosis del virus recombinante dependerán
primeramente de factores tales como la condición que está siendo
tratada, el gen seleccionado, la edad, el peso y la salud del
paciente, pudiendo variar así entre diferentes pacientes. Una dosis
terapéuticamente efectiva para humanos de los virus de la presente
invención, se cree que está en el rango de alrededor de 20 hasta
alrededor de 50 ml de solución salina que contiene concentraciones
desde alrededor de 1 x 10^{7} hasta 1 x 10^{10} pfu/ml del
virus de la presente invención. Una dosis preferida para humanos
está alrededor de 20 ml de solución salina de las anteriores
concentraciones. La dosis se ajustará para balancear el beneficio
terapéutico contra cualquier efecto secundario. Puede hacerse
seguimiento a los niveles de expresión del gen escogido para
determinar la selección, ajuste o frecuencia de la administración
de la dosis. Los siguientes ejemplos ilustran la construcción de
los vectores trasbordadores Ad\Delta, de los virus auxiliares y
de los virus recombinantes Ad\Delta de la presente invención, y
el uso de los mismos en terapia génica. Estos ejemplos son
solamente ilustrativos, y no limitan el alcance de la presente
invención.
Se modificó una secuencia Ad5 de adenovirus
humano para contener una supresión en la región E1a [1 a 9.2
unidades cartográficas], que seguía inmediatamente a la región Ad
5' (bp 1-360) (ilustrada en las Figuras 1A). Por lo
tanto, el plásmido contiene la secuencia 5' ITR (bp
1-103), las secuencias nativas de
empaquetamiento/del reforzador y la caja TATA para la región E1a
(bp 104-360). Se introdujo un minigén que contiene
al reforzador/promotor inmediato temprano del CMV, una secuencia
SD/SA, un gen citoplasmático lacZ, y un poli A SV40 (pA), en el
sitio de la supresión E1a. Esta construcción fue modificada además
de forma tal que el minigén es seguido por las secuencias 3' ITR
(bp 35.353 hasta el final). Las secuencias de ADN para estos
componentes se proporcionan en la Figura 3 y en la SEQ. ID No. 1
(ver también la breve descripción de esta figura).
Esta construcción fue clonada entonces por
técnicas convencionales dentro de la columna vertebral de un vector
pSP72 (Promega) para hacer al vector trasbordador circular
pAd\DeltaCMVLacZ. Ver el esquema de la Figura 2A. Esta
construcción fue modificada genéticamente con los sitios EcoRI
flanqueando las secuencias 5' y 3' Ad5 ITR. pAd\Delta.CMVLacZ fue
sometida entonces a digestión enzimática con EcoRI, liberando un
fragmento linear del vector abarcando el extremo terminal de la
secuencia Ad 5' ITR a través del extremo terminal de la secuencia
3' ITR de la columna vertebral del plásmido. Ver Figura 2B.
El vector trasbordador pAd\Deltac.CMVLacZ
(Figuras 4ª y 5) se construyó usando una columna vertebral de pSP72
(Promega) de tal manera que los Ad5 5' ITR y 3' ITR estuvieran
posicionados cabeza con cola. La organización de los Ad5 ITR se
basó en los reportes que sugieren que los genomas Ad circulares que
tienen los extremos terminales fusionados juntos cabeza con cola
son infecciosos hasta niveles comparables con los genomas Ad
lineares. Un minigén que codifica al reforzador CMV, una secuencia
SD/SA, el gen LacZ, y la secuencia poli A se insertaron
inmediatamente enseguida de 5' ITR. La secuencia de ADN del
plásmido resultante y las secuencias para los componentes
individuales se reportan en la Figura 5 y la SEQ. ID. No. 2 (ver
también, la breve descripción de la Figura 5). Este plásmido no
requiere digestión enzimática previa a su uso para producir la
partícula viral (ver el Ejemplo 3). Este vector fue diseñado para
permitir la producción independiente de restricción de los vectores
Ad\Delta LacZ.
El virus auxiliar Ad.CbhpAP [K. Kozarsky y
colaboradores, Som. Cell Mol. Genet, 19(5):
449-458 (1993)] es una replicación deficiente de
adenovirus que contiene un minigén de fosfatasa alcalina. Su
construcción involucró técnicas de clonación convencional y
recombinación homóloga. El sustrato ADN del adenovirus se extrajo a
partir de los viriones d17001 purificados de CsCl, una variante Ad5
(serotipo del subgrupo C) que porta una supresión de 3 kb entre mu
78,4 hasta 86 en la región E3 no esencial (proporcionada por el
Dr. William Wold, Washington University St. Louis, Missouri). El
ADN viral se preparó por cotransfección por medio de digestión con
CLAI (bp posición 917 del adenovirus genómico) que remueve el brazo
izquierdo del genoma que abarca a las unidades cartográficas del
adenovirus 0-2,5. Ver el diagrama inferior de la
Figura 1B.
Se diseñó un vector de clonación parental,
pAd.BgIII. Éste contiene dos segmentos del genoma Ad5 de tipo
silvestre (esto es, unidades cartográficas 0-1 y
9-16,1) separados por un único sitio de clonación
BgIII por inserción de las secuencias heterólogas. Las secuencias
Ad5 pérdidas entre los dos dominios (bp 361-3327 del
genoma del adenovirus) resultan en la supresión de E1a y la mayoría
de E1b después de la recombinación con el ADN viral.
Se diseñó un minigén recombinante hpAp y se
insertó dentro del sitio BgIII de pAd.BgIII para generar el
plásmido complementario, pAdCBhpAP. La disposición lineal de este
minigén incluye:
- (a)
- al promotor de \beta-actina citoplasmática de pollo [nucleótidos +1 hasta + 275 como se describe en T.A. Kost y colaboradores, Nucl. Acids Res., 11 (23): 8287 (1983); nucleótidos 9241-8684 de la Figura 7];
- (b)
- un intrón SV40 (por ejemplo, nucleótidos 1579-1711 de la SEQ. ID No. 2),
- (c)
- la secuencia para la fosfatasa alcalina placentaria humana (disponible en el Banco de Genes) y
- (d)
- una señal de poliadenilación SV40 (un fragmento de restricción Bam HI-BclI 237 que contiene señales de escisión/poli A tanto de las unidades de trascripción temprana como tardía; por ejemplo, los nucleótidos 837-639 de la SEQ. ID. No. 1).
El plásmido complementario resultante, pAdCBhpAP,
contenía una copia única del minigén recombinante hpAP flanqueado
por las coordenadas 0-1 del adenovirus por un lado,
y 9,2-16,1 por el otro.
El ADN del plásmido fue linearizado usando un
sitio único NheI enseguida 5' a la unidad cartográfica cero (0)
del adenovirus y el sustrato del adenovirus anteriormente
identificado, y los ADN del plásmido complementario fueron
transfectados a células 293 [ATCC CRL 1573] usando un
procedimiento estándar de transfección de fosfato de calcio [ver,
por ejemplo, Sambrook y colaboradores, citado antes]. El resultado
final de la recombinación homóloga que involucra secuencias que
cartografían al adenovirus, unidades cartográficas
9-16.1 es un virus auxiliar Ad.CbhpAP híbrido que
contiene unidades cartográficas del adenovirus 0-1,
y en lugar de las regiones de codificación E1a y E1b del sustrato
de adenovirus d17001, está el minigén hpAP del plásmido, seguido
por las secuencias AD 9 a 100, con una supresión en las regiones E3
(78,4-86 mu).
Los virus recombinantes Ad\Delta de esta
invención se generan por cotransfección de un vector trasbordador
con el virus auxiliar en una línea celular seleccionada de
empaquetamiento o no empaquetamiento.
Como se describe más abajo en detalle, el
fragmento linear proveído en el Ejemplo 1A, o el genoma circular
Ad\Delta portando al LacZ del Ejemplo 1B, es empacado dentro
del virus auxiliar Ad.CbhpAP (Ejemplo 2) usando técnicas
convencionales, que proporcionan una cabeza de cápside vacía, como
se ilustra en la Figura 2C. Aquellas partículas de virus que han
sido exitosamente adoptadas por el genoma trasbordador pAd dentro
de la cabeza del cápside, puede distinguirse de aquellas que
contienen al gen hpAP en virtud de la expresión diferencial de LacZ
y hpAP.
Más detalladamente, las células 293 (4 x 10^{7}
pfu células 293/150 mm de plato) fueron sembradas e infectadas con
el virus auxiliar Ad.CbhpAP (producidas como se describió en el
Ejemplo 2) en un MOI de 5 en 20 ml DMEM/suero fetal bovino al 2%
(FBS).Este marcador auxiliar especifico es crítico para hacer
seguimiento al nivel de contaminación del virus auxiliar en
preparaciones Ad\Delta antes y después de la purificación. El
virus auxiliar proporciona en trans, las funciones auxiliares
necesarias para la síntesis y empaquetamiento del genoma
Ad\DeltaCMVLacZ.
Dos horas después de la infección, usando ya sea
el vector trasbordador dependiente de restricción, o el vector
trasbordador independiente de restricción, se añadió a las células
el plásmido pAd\Delta.CMVLacZ (digerido con EcoRI) o ADN
pAd\Deltac.CMVLacZ, cada uno portando un minigén LacZ, por medio
de un precipitado de fosfato de calcio (2,5 ml de un coctel de
transfección de fosfato de calcio que contiene 50 \mug del ADN
del plásmido).
Treinta a cuarenta horas después de la
transfección las células fueron cosechadas suspendidas en
Tris-Cl 10 mM (pH 8,0) (0,5 ml/placa de 150 mm) y
congeladas a -80ºC. Las suspensiones de células congeladas fueron
sometidas a tres rondas de ciclos de congelación
(etanol-hielo seco) -descongelación (37ºC) para
liberar las cápsides del virión. Los restos de las células se
removieron por centrifugación (5.000 x g durante 10 minutos) y el
sobrenadante clarificado fue aplicado a un gradiente de CsCl para
separar el virus recombinante del virus auxiliar como sigue.
Los sobrenadantes (10 ml) aplicados al gradiente
discontinuo de CsCl (compuesto de volúmenes iguales de CsCl de 1,2
g/ml, 1,36 g/ml, y 1,45 g/ml de Tris-Cl 10 mM (pH
8,0)) fueron centrifugados durante ocho horas a 72.128 x g, dando
como resultado la separación del virus auxiliar infeccioso de los
viriones formados en forma incompleta. Las fracciones fueron
recogidas de la zona de interfase entre el auxiliar y los
componentes de la superficie y analizados por hibridación de
transferencia Southern, o por la presencia de partículas de
transducción LacZ. Para el análisis funcional fueron añadidas
alícuotas (2,0 ml de cada muestra) de las mismas fracciones a mono
capas de células 293 (en pozos de 35 mm) y se determinó la
expresión de \beta-galactosidasa recombinante 24
horas después. Más específicamente, las monocapas fueron cosechadas,
suspendidas en 0,3 ml de solución amortiguadora de
Tris-Cl 10 mM (pH 8,0), y un extracto preparado
por tres rondas de ciclos de
congelación-descongelación. Los residuos celulares
fueron removidos por centrifugación y el sobrenadante fue analizado
para la actividad (LacZ) de \beta-galactosidasa
de acuerdo al procedimiento descrito en J. Price y colaboradores,
Proc. Natl. Acad. Sci., USA, 84:
156-160 (1987). La actividad especifica
(miliunidades de \beta-galactosidasa/mg de
proteína o enzimas indicadoras) fue medida a partir de las células
indicadoras. Para los virus recombinantes, la actividad específica
fue 116.
Las fracciones con actividad de
\beta-galactosidasa de gradiente discontinuo
fueron sedimentadas a través de un gradiente de cesio en equilibrio
para enriquecer además la preparación para el virus Ad\Delta. Se
generó un gradiente linear en el área del virus recombinante
abarcando densidades desde 1,29 hasta 1,34 gm/ml. Un pico agudo del
virus recombinante, detectado con la apariencia de actividad
\beta-gal en células 293 infectadas, eluyó entre
1,31 y 1,33 gm/dl. Este pico de virus recombinante fue localizado
entre dos picos de absorción principales A_{260} nm y, en un área
del gradiente donde el virus auxiliar fue disminuyendo
precipitadamente. El equilibrio del gradiente de sedimentación logró
otra purificación 102 a 103 veces del virus recombinante a partir
del virus auxiliar. El rendimiento de virus recombinante
Ad\Delta.CMVLacZ recuperado de una preparación de 50 placas
después de 2 sedimentaciones, se encontró en el rango de 107 a 108
partículas transductoras.
El análisis de los lisados de células
transfectadas con el vector recombinante e infectadas con auxiliar
reveló viriones capaces de transducir al minigén recombinante
contenido dentro del vector. Sometiendo las alícuotas de las
fracciones al análisis Southern usando sondas específicas del virus
recombinante o del virus auxiliar, reveló el empaquetamiento de
múltiples formas moleculares de secuencias derivadas del vector.
La forma predominante del genoma viral suprimido era del tamaño
(\sim5,5 kb) del correspondiente monómero de ADN bicatenario
(Ad\Delta.CMVLacZ) con especies discretas menos abundantes pero
de peso molecular mayor (\sim10 kb y \sim15 kb) presentes
también. La longitud completa del virus auxiliar es 35 kb. De forma
muy importante, el pico de actividad de transducción del vector
corresponde con la forma del peso molecular más alto del virus
suprimido. Estos resultados confirman la hipótesis de que los ITR y
las secuencias de empaquetamiento contiguas son los únicos elementos
necesarios para incorporación dentro de los viriones. Un
reordenamiento aparentemente ordenado o preferido del genoma del
monómero Ad recombinante conduce a una molécula biológicamente más
activa. El hecho de que especies moleculares mayores del genoma
suprimido son 2x y 3x veces mayores que el genoma monómero del virus
suprimido, sugiere que el reordenamiento puede involucrar
duplicación secuencial del genoma original.
Estos mismos procedimientos pueden adaptarse para
la producción de un virus recombinante Ad\Delta, usando un virus
auxiliar inutilizado, o un conjugado del virus auxiliar como se
describió anteriormente.
Para analizar la versatilidad del sistema del
virus recombinante Ad\Delta, el minigén indicador LacZ obtenido a
partir de pAd\Delta.CMVLacZ fue el casete reemplazado con un
minigén terapéutico que codifica a CFTR.
El minigén contenía cADN CFTR humano [Riordan y
colaboradores, Science, 245: 1066-1073
(1989); nucleótidos 8622-4065 de la SEQ. ID. No. 3]
bajo el control transcripcional de un elemento promotor quimérico
CMV reforzador/\beta-actina de pollo (nucleótidos
+1 hasta +275 como se describió en T.A. Kost y colaboradores,
Nucl. Acids Res., 11(23):8287 (1983); nucleótidos
9241-8684 de la SEQ.ID. No. 3, Figura 7); y seguido
por una secuencia poli A SV-40 (nucleótidos
3887-3684 de la SEQ. ID. No. 3, Figura 7).
El minigén CFTR fue insertado dentro del sitio de
supresión E1 de un virus Ad5 (llamado pAd.E1\Delta) que contiene
una supresión en E1a de mu 1-9,2 y una supresión en
E3 de mu 78,4-86.
El vector trasbordador resultante llamado
pAd\Delta.CBCFTR (ver las Figuras 6 y las secuencia de ADN de la
Figura 7 [SEQ. ID. No. 3]) usó los mismos Ad ITR de
pAd\Delta.CMVLacZ, pero las secuencias Ad5 terminadas con los
sitios Nhel en vez de EcoRI. Por lo tanto, la liberación del
minigén del plásmido fue consumada por digestión con Nhel.
Se empleó el sistema de producción del vector
descrito en el Ejemplo 3, usando el virus auxiliar Ad.CBhpAP
(Ejemplo 2). Las monocapas de células 293 que crecieron hasta una
confluencia del 80-90% en placas de cultivo de 150
mm, fueron infectadas con el virus auxiliar en un MOI de 5. Las
infecciones se hicieron en DMEM suplementado con FBS al 2% en
placas de 150 mm con 20 ml de medio. Dos horas después de la
infección, se añadieron 50 \mug de ADN de plásmido en 2,5 ml de un
cóctel de transfección a cada placa y distribuidos igualmente.
El suministro del plásmido pAd\Delta.CBCFTR las
células 293 fue mediado por la formación de un precipitado de
fosfato de calcio, y el virus Ad\Delta.CBCFTR resuelto del virus
auxiliar Ad.CBhpAP por ultracentrifugación a través de densidad de
flotación en gradiente de CsCl como sigue:
- Las células fueron dejadas en esta condición durante 10-14 horas, después de las cuales el medio de infección/transfección fue reemplazado con 20 ml de DMEM/FBS al 2% fresco. Aproximadamente 30 horas después de la transfección, las células fueron cosechadas, suspendidas en solución amortiguadora Tris-Cl 10 mM (pH 8,0) (0,5 ml/placa 150 mm), y almacenadas a -80ºC.
Las suspensiones de células congeladas fueron
lisadas en tres rondas secuenciales de
congelación(etanol-hielo
seco)-descongelación (37ºC). Los restos de las
células se removieron por centrifugación (5.000 x g durante 10
minutos) y 10 ml de extracto clarificado quedaron sobre una capa
del gradiente con CsCl compuestos de tres hileras de 9,0 ml con
densidades de 1,45 g/ml, 1,36 g/ml y 1,20 g/ml de CsCl en
solución amortiguadora Tris-Cl 10 mM (pH 8,0). La
centrifugación se realizó a 20,000 rpm en un rotor Beckman
SW-28 durante 8 horas a 4ºC. Las fracciones (1,0 ml)
se recolectaron del fondo del tubo de la centrífuga y se analizaron
los vectores de transducción r\DeltaAd. Las fracciones de los
picos se combinaron y se asociaron hasta el equilibrio. Las
fracciones que contenían viriones de transducción fueron dializadas
contra HEPES 20 mM (pH 7,8)/NaCl 150 mM (HBS) y se almacenaron
congeladas a -80ºC en presencia de glicerol al 10% o como un patrón
liquido a -20ºC (HBS + glicerol al 40%).
A las fracciones que se recolectaron después de
ultracentrifugación se les analizó su expresión transgénica y el
ADN del vector. Para los vectores lacZ\DeltarAd, se añadieron
alícuotas de 2 \mul a monocapas de células 293 sembradas en pozos
de cultivo de 35 mm. Veinticuatro horas después las células fueron
cosechadas, suspendidas en 0,3 ml de solución amortiguadora
Tris-Cl 10 mM (pH 8,0), y lisadas en tres rondas de
congelación-descongelación. Los restos de las
células se removieron por centrifugación (15.000 x g durante 10
minutos) y analizada su proteína total [Bradford, (1976)] y la
actividad de \beta-galactosidasa [Sambrook y
colaboradores, (1989)] usando ONPG (o-Nitrofenil
\beta-D-galactopiranosido) como
sustrato.
La expresión de la proteína CFTR del vector
Ad\Delta.CBCFTR se determinó por localización con
inmunofluorescencia. Las alícuotas de Ad\Delta.CBCFTR,
enriquecidas por 2 rondas de ultracentrifugación e intercambiadas a
solución amortiguadora de almacenamiento HBS, fueron añadidas a
cultivos primarios d células epiteliales de las vías respiratorias
obtenidas de los pulmones de receptores de trasplantes CF.
Veinticuatro horas después de la adición del vector, las células
fueron cosechadas y fijadas a portaobjetos de vidrio usando fuerza
centrífuga (Cytospin 3, Shandon Scientific Limited). Las células
fueron fijadas con paraformaldehído al 3% preparado en forma fresca
en PBS (KH_{2}PO_{4} 1,4 mM, Na_{2}HPO_{4} 4,3 mM, KCl 2,7
mM, y NaCl 137 mM) durante 15 minutos a temperatura ambiente (RT),
lavadas dos veces en PBS, y permeabilizadas con
NP-40 al 0,05% durante 10 minutos a RT. El
procedimiento de inmunofluorescencia comenzó con una etapa de
bloqueo en suero de cabra al 10% (PBS/GS) durante 1 hora a RT,
seguido por enlazamiento al anticuerpo monoclonal primario CFTR
(dominio específico R) antihumano de ratón (Genzyme) diluida 1:500
en PBS/GS durante 2 horas a RT. Las células fueron lavadas
extensivamente en PBS/GS e incubadas durante 1 hora a RT con
anticuerpo conjugado con FITC IgG (H+L) antirratón de asno (Jackson
ImmunoResearch Laboratories) diluido 1:100 en PBS/GS.
Para el análisis Southern del ADN del vector, se
tomaron alícuotas de 5 \mul directamente de las fracciones CsCl e
incubadas con 20 \mul de solución amortiguadora para digestión
del cápside (Tris-Cl 50 mM, pH 8,0; EDTA 1,0 mM, pH
8,0; SDS al 0,5%, y Proteinasa K 1,0 mg/ml) a 50ºC durante 1 hora. A
las reacciones se les permitió enfriarse hasta RT, se les añadió
una carga de colorante, y se hizo una electroforesis a través de
gel de agarosa al 1,2%. Los ADN que se resolvieron se procesaron por
electroforesis sobre una membrana de nylon
(Hybond-N) y se hibridaron con un fragmento de
restricción marcado como 32-P. Las manchas se
analizaron por autoradiografia o se escaneó sobre un Phosphorimager
445 SI (Molecular Dynamics).
Los resultados que se obtuvieron del análisis de
transferencia Southern de las fracciones del gradiente revelaron
una banda viral clara que migró más rápidamente que el ADN del
Ad.CBhpAP auxiliar. Los títulos virales más altos se cartografiaron
hasta las fracciones 3 y 4. La cuantificación de las bandas en la
fracción 4 indicó que el título de Ad.CBhpAP era aproximadamente
1,5 veces mayor que el de Ad\Delta.CBCFTR. Sin embargo, si la
diferencia en tamaño entre los 2 virus se pondera (Ad.CBhpAP=35 kb;
Ad\Delta.CBCFTR=6,2 kb), el título viral (donde 1 partícula=1
molécula de ADN) de Ad\DeltaCB.CFTR es al menos 4 veces más
grande que el título viral de Ad.CBhpAP.
Mientras que el análisis de transferencia
Southern de las fracciones del gradiente fueron útiles para mostrar
la producción de las partículas virales Ad\Delta, también
demostró la utilidad de la ultracentrifugación para la purificación
de los virus Ad\Delta. Considerando lo reciente de éstas, tanto
los virus de transducción LacZ como CFTR ubicados en bandas en el
CsCl con una densidad intermedia entre los viriones auxiliares de
adenovirus infeccioso (1,34 g/ml)y las cápsides
incompletamente formadas (1,31 g/ml). La menor densidad relativa
del virus auxiliar probablemente es debida al genoma más pequeño
transportado por los virus Ad\Delta. Esto sugiere además cambios
en el tamaño del virus que influyen en la densidad y en la
purificación de los virus Ad\Delta. Con todo, la capacidad para
separa los virus Ad\Delta de los virus auxiliares es una
observación importante y sugiere que puede lograrse un
purificación adicional por rondas sucesivas de bandeado a través
del CsCl.
Este virus recombinante es útil en terapia génica
solo, o preferiblemente, en la forma de un conjugado preparado como
se describe aquí.
El tratamiento de la fibrosis cística, utilizando
el virus recombinante proporcionado antes, es particularmente
adecuado para terapia génica in vivo dirigida al pulmón. Las
células epiteliales de las vías aéreas son los objetivos más
deseables para transferencia génica, debido a que las
complicaciones pulmonares del CF son usualmente su limitación más
mórbidas y de vida.
El virus recombinante Ad\DeltaCB.CFTR fue
fraccionado sobre los gradientes secuenciales en CsCl, y las
fracciones que contienen las secuencias CFTR, y que migran entre el
adenovirus y las fracciones de los componentes superiores descritas
antes, fueron usadas par infectar cultivos primarios de células
epiteliales humanas de las vías aéreas derivadas de los pulmones
de un paciente CF. Los cultivos fueron posteriormente analizados
por la expresión de la proteína CFTR, por medio de
inmunocitoquímica. La detección por inmunofluorescencia con
anticuerpo CFTR (dominio específico R) antihumano de ratón, se
realizó 24 horas después de la adición del virus recombinante. El
análisis de células CF infectadas en forma simulada falló en revelar
un enlazamiento significativo con el anticuerpo CFTR de dominio
específico R. Los cultivos primarios de epitelio de las vías
aéreas expuestos al virus recombinante, demostraron altos niveles
de proteína CFTR en 10-20% de las células.
Por lo tanto, el virus recombinante de la
invención que contiene al gen CFTR, puede ser suministrado
directamente dentro de las vías aéreas, por ejemplo, por formulación
del virus anterior dentro de una preparación que puede ser inhalada.
Por ejemplo, el virus recombinante o el conjugado de la invención
que contienen al gen CFTR, se suspenden en cloruro de sodio 0,25
molar. El virus o el conjugado son adoptados por las células de las
vías respiratorias y el gen se expresa.
Alternativamente, el virus o los conjugados de la
invención pueden suministrase por otros medios adecuados, incluida
una inyección dirigida al sitio, del virus de apoyo del gen CFTR.
En el caso del suministro del gen CFTR, las soluciones preferidas
para la instilación bronquial son las soluciones salinas estériles
que se encuentran dentro del rango de alrededor de 1 x 10^{7}
hasta 1 x 10^{10} pfu/ml, más particularmente, en el rango de
alrededor de 1 x 10^{8} hasta 1 x 10^{9} pfu/ml del virus de la
presente invención.
Otros métodos adecuados para el tratamiento de la
fibrosis cística por medio del uso de virus recombinantes para
terapia génica de esta invención, pueden obtenerse a partir de la
presentación en el estado de la técnica de otros tipos de vectores
para terapia génica por CF. Ver, por ejemplo, la patente US No.
5.240.846, incorporada aquí para referencia.
Otra versión del virus auxiliar de esta invención
es un conjugado de polilisina que permite al plásmido trasbordador
pAd\Delta acomplejarse directamente con la cápside del virus
auxiliar. Este conjugado permite un suministro eficiente del vector
trasbordador pAd\Delta del plásmido trasbordador en tándem con el
virus auxiliar, eliminando así la necesidad de una etapa de
transfección separada. Ver, la Figura 10 para una reseña
diagramática de esta construcción. Alternativamente, tal conjugado
con un plásmido que suministra algunos genes Ad y el auxiliar que
suministra los genes necesarios restantes para la producción del
vector viral Ad\Delta provee una nueva forma para reducir la
contaminación del virus auxiliar, como se discutió antes.
Los patrones purificados de expansión a gran
escala de Ad.CBhpAP fueron modificados por acoplamiento de
poli-L-lisina con la cápside del
virión, esencialmente como lo describieron K. J. Fisher y J. M.
Wilson, Biochem. J., 299: 49-58
(1994), resultando en un conjugado de Ad.CBhpAP-(Lys)_{n}.
El procedimiento involucra tres etapas.
Primero, el virus auxiliar Ad.CBhpAP purificado
de la banda de CsCl, reaccionó con el entrecruzador
heterobifuncional sulfo-SMCC
[sulfo-(N-succinimidil-4-(N-maleimidometil)
ciclohexano-1-carboxilato] (Pierce).
La reacción de conjugación, que contenía 0,5 mg (375 nmol) de
sulfo-SMCC y 6 x 10^{12} A_{260} de partículas
de virus auxiliar en 3,0 ml de HBS, se incubó a 30ºC durante 45
minutos con agitación suave constante. Esta etapa involucró la
formación de un enlace de péptido entre el éster activo
N-hidroxisuccinimida (NHS) de
sulfo-SMCC y una amina libre (por ejemplo, lisina)
aportada por una secuencia de proteína de adenovirus (proteína de
cápside) en el vector, produciendo una partícula viral activada de
maleimida. El adenovirus activado que se muestra en la Figura 10,
tiene la fibra de la proteína de la cápside marcada con la fracción
nucleofílica de maleimida. En la práctica, otros polipéptidos de la
cápside incluyendo también al hexon y a la base pentón como
objetivos.
EL entrecruzador no incorporado que no reaccionó
se removió por filtración a través de gel sobre una columna
Bio-Gel P-6DG de 1 cm x 15 cm
(BioRad Laboratories) equilibrada con solución amortiguadora
Tris/HCl 50 mM, pH 7,0, y NaCl 150 mM. Las fracciones del pico
A_{260} que contenían virus auxiliar activado con maleimina se
combinaron y se colocaron sobre hielo.
Segundo, la
poli-L-lisina de una masa molecular
de 58 kDa con 10 mg/ml en solución amortiguadora de trietanolamina
50 mM (pH 8,0), NaCl 150 mM y EDTA 1 mM se tioló con
2-iminotiolano/HCl (Reactivo de Traut; Pierce) en
una relación molar de 2 moles-SH/mol de polilisina
bajo atmósfera de N_{2}; el tioimidato cíclico reacciona con las
aminas primarias de poli(L-lisina) dando como
resultado un policatión tiolado. Después de 45 minutos de
incubación a temperatura ambiente la reacción se aplicó a una
columna Bio-Gel P6DG de 1 cm x 15 cm equilibrada con
solución amortiguadora Tris/HCl 50 mM (pH 7,0), NaCl 150 mM y EDTA
2 mM para remover el Reactivo de Traut no incorporado.
La cuantificación de los grupos tiol libres fue
acompañada con el reactivo de Ellman
[5,5'-ditio-bis-(2-ácido
nitrobenzóico)] revelando aproximadamente 3-4 moles
de -SH/mol de poli(L-lisina). La reacción de
acoplamiento se inició por la adición de 1 x 10^{12} A_{260}
partículas de virus auxiliar activado por maleimida de
poli(L-lisina) tiolada e incubación de la
mezcla sobre hielo a 4ºC durante 15 horas bajo atmósfera de argón.
Se añadió 2-mercaptoetilamina al completarse la
reacción y se realizó la incubación a temperatura ambiente durante
20 minutos para bloquear los sitios de maleimida que no
reaccionaron.
Los conjugados de
polilisina-virus,
Ad.CPAP-p(Lys)_{n}, se purificaron a
partir de la poli(L-lisina) no conjugada
por ultracentrifugación a través de un gradiente por etapas de CsCl
con una composición inicial de volúmenes iguales de 1,45 g/ml (etapa
del fondo) y 1,2 g/ml (etapa superior) de CsCl en solución
amortiguadora Tris/HCl 10 mM (pH 8,0). La centrifugación se realizó
a 90.000 g durante 2 horas a 5ºC. El producto final se dializó
contra solución amortiguadora Hepes 20 mM (pH 7,8) que contenía
NaCl 150 mM (HBS).
La formación de la partícula
Ad.CBhpAP-pLys/pAd\Delta.CMVLacZ se inicia por la
adición de 20 \mug los ADN del plásmido pAd\Delta.CMVLacZ a 1,2
x 10^{12} A_{260} partículas de Ad.CBhpAP-pLys
en un volumen final de 0,2 ml de DMEM y permitiendo al complejo
desarrollarse a temperatura ambiente entre 10-15
minutos. Esta relación representa típicamente la capacidad de
enlazamiento del ADN del plásmido de un lote estándar de conjugado
de adenovirus-pLys y da los niveles más altos de
expresión transgénica del plásmido.
La partícula resultante de la
trans-infección se transfecta sobre células 293 (4
x 10^{7} células sembradas sobre una placa de 150 mm). Treinta
horas después de la transfección, las partículas se recuperan y se
someten a una técnica de congelación/descongelación para obtener un
extracto. El extracto se purifica sobre un gradiente en etapas de
CsCl con gradientes de 1,20 g/ml, 1,36 g/ml y 1,45 g/ml. Después de
centrifugación a 90.000 x g durante 8 horas, los vectores Ad\Delta
se obtuvieron a partir de una fracción bajo los componentes
superiores que se identificaron por la presencia de LacZ, y el
virus auxiliar se obtuvo a partir de una fracción más pequeña y más
densa, que se identificó por la presencia de hpAP.
Este ejemplo se refiere a las Figuras 9A hasta
9C, 10A y 10B en el diseño de virus auxiliares modificados de esta
invención.
Las secuencias del terminal 5' Ad5 que contenían
dominios PAC I y II (Figura 8A) o dominios PAC I, II, III y IV
(Figura 8B) se generaron por PCR a partir del genoma 5' Ad5 del
tipo silvestre descrito en la Figura 1B usando los clones PCR
indicados por las flechas en la Figura 1B. Las secuencias de los
productos resultantes de la amplificación (Figuras 8A y 8B)
difirieron del genoma Ad5 de tipo silvestre en el número de
repeticiones A transportadas por el extremo izquierdo (5').
Como se describió en la Figura 8C, estos
productos de amplificación fueron subclonados dentro del sitio de
clonación múltiple de pAd.Link.1 (IHGT Centro del Vector).
pAd.Link.1 es un adenovirus basado en el plásmido que contiene al
adenovirus m.u. 9,6 hasta 16,1. La inserción de las regiones PAC
modificadas dentro de pAd.Link.1 generó dos vectores pAd.PACII
(que contienen dominios PAC I y II) y pAd.PACIV (que contienen
dominios PAC I, II, III y IV).
Después de eso, como se describe en las Figuras
10A y 10B, para cada uno de esos plásmidos, un minigén indicador de
fosfatasa alcalina de placenta humana que contiene al
promotor/reforzador CMV temprano inmediato (CMV), cADN de fosfatasa
alcalina de placenta humana (hpAP), y una señal de poliadenilación
SV40 8pA), se subclonaron dentro de cada vector PAC, generando
pAd.PACII.CMVhpAP y pAd.PACIV.CMVhpAP, respectivamente.
Esos plásmidos fueron usados entonces como
sustratos para recombinación homóloga con virus dI7001, descritos
arriba, por cotransfección dentro de células 293. la recombinación
homóloga ocurrida entre las unidades cartográficas
9-16 del adenovirus del plásmido y del virus Ad5
inutilizado. Los resultados de la recombinación homóloga fueron los
virus auxiliares que contenían las secuencias del terminal 5' Ad5
que contenían los dominios PAC I y II o los dominios I, II, III y
IV, seguidos por el minigén, y por las secuencias 3' Ad5
9,6-78,3 y 87-100. Por lo tanto,
esos virus inutilizados se suprimen del gen E1 y del gen E3.
Las características de la formación de la placa
de los virus auxiliares PAC dieron una indicación inmediata de que
las modificaciones PAC disminuyeron la velocidad y el grado de
crecimiento. Específicamente, las placas del virus auxiliar no se
desarrollaron hasta el día 14-21 después de la
transfección, y en la madures permanecieron pequeñas. A partir de
la experiencia previa, una primera generación estándar del virus
auxiliar Ad.CBhpAP con una secuencia terminal izquierda completa
comenzaría a desarrollarse hacia el día 7 y a madurar hacia el día
10.
Las placas virales fueron escogidas y suspendidas
en 0,5 ml de medio DMEM. Se usó una pequeña alícuota del patrón de
virus para infectar a una monocapa fresca de células 293 teñidas
histoquímicamente para medir la actividad de la fosfatasa alcalina
recombinante 24 horas después de la infección. Seis de los ocho
clones Ad.PACIV.CMVhpAP (que codifican las repeticiones A
I-IV) que fueron protegidos de la expresión
transgénica fueron positivos, mientras que los tres clones
Ad.PACII.CMVhpAP que fueron seleccionados marcaron positivo. Los
clones habían sido tomados a través de dos rondas de purificación
de placa y actualmente están siendo expanden para generar un patrón
de trabajo.
Estos virus auxiliares inutilizados fueron útiles
en la producción de las partículas virales Ad\Delta de acuerdo a
los procedimientos descritos en el Ejemplo 3. Ellos se
caracterizan por contener suficiente genes de adenovirus para
permitir el empaquetamiento del genoma del vector trasbordador, pero
sus secuencias PAC inutilizadas reducen su eficiencia para su propia
encapsidación. Por lo tanto, se producen menos virus auxiliares a
favor de más virus recombinantes Ad\Delta. La purificación de las
partículas virales Ad\Delta a partir de los virus auxiliares se
facilita en el gradiente de CsCl, que se basa en el peso de las
partículas virales respectivas. Esta facilidad en la purificación
es una ventaja decisiva de los vectores Ad\Delta de esta
invención en contraste con los vectores adenovirus que tienen
solamente E1 o supresiones más pequeñas. Los vectores Ad\Delta
aún con minigenes de hasta aproximadamente 15 kb son
significativamente diferentes en peso con respecto a los de tipo
silvestre o a otros auxiliares de adenovirus que contienen muchos
genes de adenovirus.
La distrofia muscular de Duchenne (DMD) es una
enfermedad genética común x-enlazada causada por la
ausencia de distrofina, una proteína de 427K codificada por una
trascripción de 14 Kbases. La carencia de esta importante proteína
del sarcolema conduce a un desgaste progresivo del músculo,
debilidad y a la muerte. Una aproximación corriente para el
tratamiento de esta enfermedad letal es transferir una copia
funcional del gen de distrofina dentro de los músculos afectados.
Para el músculo esqueletal, un adenovirus de replicación defectuosa
representa un sistema de suministro eficiente.
De acuerdo con la presente invención, se creo un
plásmido recombinante pAd\Delta.CMVmdys que contiene solamente los
elementos cis de Ad5 (esto es, los ITR y las secuencias de
empaquetamiento contiguas) y puertos del gen de distrofina murina
de longitud completa conducidos por el promotor CMV. Este plásmido
se generó como sigue.
pSL1180 [Pharmacia Biotech] fue cortado con Not
I, insertado por Klenow, y ligado nuevamente por ablación del sitio
Not I en el plásmido. El plásmido resultante es llamado pSL1180NN
y porta un gen de resistencia bacterial ori y Amp.
pAd\Delta.CMVLacZ del Ejemplo 1 fue cortado con
EcoRI, klenowado, y ligado con el ApaI-cut
pSL1180NN para formar pAd\Delta.CMVLacZ (Apal).
El cADN de distrofina de ratón de 14 kb
[secuencias suministradas en C.C. Lee y colaboradores,
Nature, 349:334-336 (1991)] fue
clonado en dos grandes fragmentos usando un vector de clonación
lambda ZAP (Stratagene) y clonado seguidamente dentro del vector
blue-script pSK dando origen al plásmido
pCCL-DMD. Un diagrama esquemático de este vector es
proporcionado en la Figura 11, que ilustra los sitios de
restricción de la enzima.
pAd\Delta.CMVLacZ (Apal) fue cortado con NotI y
el fragmento grande aislado con gel del cADN lacZ.
pC-CL-DMD fue cortado también con
NotI, aislado con gel y seguidamente ligado al fragmento grande NotI
del NotI digerido con pAd\Delta.CMVLacZ (Apal). Las secuencias
del vector resultante, pAd\Delta.CMVmdys, se suministran en las
Figuras 12A- 12P [SEQ. ID.No. 10].
Este plásmido contiene secuencias del extremo
izquierdo del Ad5 que abarcan bp 1-360 (5' ITR), un
minigén de distrofina de ratón bajo el control del promotor CMV, y
una secuencia del extremo derecho de Ad5 que abarca BP35353 del
extremo del genoma (3' ITR). El minigén es seguido por una
secuencia poli A SV-40 similar a aquella descrita
para los plásmidos descritos arriba.
Se emplea el sistema de producción del vector
descrito aquí. Diez placas 293 de 150 mm fueron infectadas con una
confluencia de alrededor de 90% con un virus suprimido de EI
recombinante indicador Ad.CBhpAP en un MOI de 5 durante 60 minutos
a 37ºC. Estas células se transfectaron con pAd\Delta.CMVmDys por
coprecipitación con fosfato de calcio usando 50 \mug de ADN
linearizado/placa durante aproximadamente 12-16
horas a 37ºC. El medio se reemplazó con DMEM + suero bovino fetal al
10%.
Se observa un efecto citopático completo y se
elaboró un lisado de células sometiendo a la pelotilla de células a
un procedimiento de congelación-descongelación por
tres veces. Las células se sometieron a un gradiente de CsCl en tres
hileras de SW41 durante 2 horas y se detectó una migración de banda
entre el adenovirus auxiliar y el virus incompleto. Las fracciones
fueron analizadas sobre una placa de seis pozos conteniendo células
293 infectadas con 5\lambda de fracción durante
16-20 horas en DMEM + FBS al 2%. Las células se
recolectan, se lavan con solución salina amortiguada de fosfato, y
se resuspenden en 2 ml de PBS. 200\lambda de las fracciones de
células en los 2 ml son hilados de células sobre un
portaobjetos.
Las células fueron sometidas a
inmunofluorescencia para distrofina como sigue. Las células fueron
fijadas en MeOH 10N a -20ºC. Las células se expusieron a un
anticuerpo monoclonal específico para el terminal carboxi de
distrofina humana [NCL-DYS2; Novocastra
Laboratories Ltd., Reino Unido]. Las células fueron lavadas
entonces tres veces y expuestas a un anticuerpo secundario, esto es
1:200 IgG de cabra anti-ratón en FITC.
El título/fracción para siete fracciones
reveladas en la coloración por inmunofluorescencia fueron calculados
fue calculado por la siguiente fórmula y reportado en la Tabla 2
más abajo. DFU/campo = (DFU/células 200\lambda) x 10 =
DFU/10^{6} células = (DFU/fracción viral 5\lambda) x 20 =
DFU/fracción 100\lambda.
Fracción | DFU/100\lambda |
1 | - |
2 | - |
3 | 6 x 10^{3} |
4 | 1,8 x 10^{4} |
5 | 9.6 x 10^{3} |
6 | 200 |
7 | 200 |
Un virus capaz de transducir al minigén de
distrofina es detectado como una célula "positiva" (esto es,
fluorescencia verde). Los resultados de la IF ilustran que las
fracciones tratadas con calor no muestran inmunofluorescencia
positiva. Los datos por transferencia Southern sugieren una especie
del mismo tamaño que el ADN ingresado, con contaminación del virus
auxiliar.
El virus recombinante puede ser separado a
continuación de la mayoría del virus auxiliar por sedimentación a
través de gradientes de cesio. Los estudios iniciales demuestran
que se producen los viriones funcionales AdCMV\DeltamDys, pero
están contaminados con el virus auxiliar. La purificación exitosa
produciría viriones Ad\Delta que son incapaces de codificar
proteínas virales, pero capaces de transducir músculo esqueletal de
murina.
El siguiente experimento proporciona un método
para preparar un Ad\Delta recombinante de acuerdo a la invención
utilizando virus auxiliares de serotipos que difieren de aquellos
del pAd\Delta en el protocolo de transfección/infección. No se
esperó que los ITR y las secuencias de empaquetamiento de Ad5
pudieran ser incorporadas dentro de un virión de otro serotipo.
La aproximación básica es transfectar al virus
recombinante Ad\Delta.CMVlacZ (Ad5) dentro de células 293 y
posteriormente infectar a la célula con el virus auxiliar derivado
de una variedad de serotipos Ad (2, 3, 4, 5, 7, 8, 12 y 40). Cuando
CPE se activa, el lisado se cosecha y se pasa por bandas a través
de dos gradientes de cesio.
Más particularmente, el plásmido
pAd\Delta.CMVlacZ con base en Ad5 del Ejemplo 1 se linearizó con
EcoRI. Los plásmidos linearizados fueron entonces transfectados
dentro de diez placas de 150 mm de células 293, usando
coprecipitación con fosfato de calcio. 10-15 horas
después de la transfección, fueron usados los adenovirus tipo
silvestre (de un de los siguientes serotipos: 2, 3, 4, 5, 7, 12, 40)
para infectar células en un MOI de 5. las células fueron entonces
cosechadas a CPE completo y lisadas por medio de tres rondas de
congelación-descongelación. La pelotilla se
resuspende en 4 mL de Tris-HCl. Los residuos de las
células se removieron por centrifugación y la purificación parcial
de Ad5\Delta.CMVlacZ a partir del virus auxiliar se logró con dos
rondas de centrifugación por gradiente de CsCl (columna SW41,
35.000 rpm, 2 horas). Las fracciones se recolectaron del fondo del
tubo (fracción #1) y se analizaron para virus de transducción lacZ
sobre células blanco 293 por coloración histoquímica (a 20h PI). Los
virus auxiliares contaminantes fueron cuantificados por ensayo de
placa.
Excepto por el adenovirus tipo 3, la infección
con serotipos Ad 2, 4, 5, 7, 12, y 40 fueron capaces de producir
virus de transducción lacZ. El pico de actividad de
\beta-galactosidasa se detectó entre los dos picos
de absorción mayores A_{260}, donde la mayoría de los virus
auxiliares se pasan por bandas (no se muestran datos). La cantidad
de virus lacZ recuperados de las 10 placas están en el rango entre
10^{4} a 10^{8} partículas de transducción, dependiendo del
serotipo del auxiliar. Como se esperaba Ad2 y Ad5 produjeron el
título más alto de virus de transducción lacZ (Tabla 3). La
contaminación de tipo silvestre fue en general
10^{2}-10^{3} log más alto que el
correspondiente título lacZ, excepto en el caso de Ad40.
La Tabla 3 resume las características de
crecimiento de los adenovirus tipo silvestre como se evaluaron en su
propagación sobre células 293. Esto demostró la posibilidad de
utilizar estos virus auxiliares para infectar la línea celular que
ha sido transfectada con el virus suprimido Ad5.
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La Tabla 4 resume los resultados de las
fracciones purificadas finales. La columna del medio, marcada como
LFU/\mul cuantifica la producción de las unidades que forman
lacZ, que es una medida directa del empaquetamiento y de la
propagación de los virus recombinantes Ad\Delta pseudotipados. El
título pfu/\mul es un estimado del virus contaminante de tipo
silvestre. Se generó un virus Ad\Delta pseudotipado con todas las
cepas adenovirales, excepto para Ad3. El rango de títulos está entre
10^{7}-10^{4}.
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Las Tablas 5A-5D representan un
análisis más detallado de las fracciones de la segunda purificación
para cada uno de los experimentos resumidos en la Tabla 4.
Nuevamente, LFU/\mul es la recuperación de los virus Ad\Delta,
mientras que pfu/\mul representa la recuperación del virus
auxiliar.
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Las alícuotas de las fracciones consecutivas
fueron analizadas por transferencia Southern usando una sonda lacZ.
En el caso de Ad2 y 5, no solamente el monómero linearizado fue
empaquetado sino que se encontraron formas múltiples de virus
recombinantes con tamaños distintos. Esas formas se correlacionaron
bien con los tamaños de los dímeros, trímeros y otros concatámeros
de mayor peso molecular. Los monómeros linearizados fueron más
puntiagudos cerca de la superficie del tubo (la banda defectiva de
adenovirus) que otras formas. Cuando esas formas fueron
correlacionadas con la actividad de lacZ, se encontró una mejor
correlación entre las formas de peso molecular más alto que los
monómeros. Con la pseudotipación de Ad4 y Ad7, los monómeros no
linearizados fueron empaquetados y solamente se encontraron las
formas de peso molecular más alto.
Estos datos demuestran definitivamente la
producción y caracterización del virus \Delta y de los
pseudotipos diferentes. Este ejemplo ilustra una forma muy simple
de generar virus pseudotipo.
La hipercolesterolemia familiar (FH) es un
desorden autosómico dominante causado por anormalidades
(deficiencias) en la función o expresión de los receptores LDL
[M.S. Brown y J. L. Goldstein, Science, 232 (4746):
34-37 (1986); J. L. Goldstein y M. S. Brown,
"Familial hipercolesterolemia" en Metabolic Basis of
Inherited Disease., ed. C. R. Scriver y colaboradores, McGraw
Hill, New York, pgs. 1215-1250 (1989)]. Los
pacientes que heredan un alelo anormal tienen elevaciones moderadas
en el LDL del plasma y sufren de enfermedad prematura de la arteria
coronaria con peligro para la vida (CAD). Los pacientes
homocigóticos tienen hipercolesterolemia aguda y CAD con peligro
para la vida en la niñez. Un vector de la invención que contiene FH
se construye por reemplazo del minigén lacZ en el vector
pAd\Deltac.CMVlacZ con un minigén que contiene al gen receptor de
LDL [T. Yamamoto y colaboradores, Cell,
39:27-38 (1984)] usando técnicas conocidas y
como se describió análogamente para el gen de la distrofina y CFTR
en los ejemplos precedentes. Los vectores de apoyo del gen receptor
de LDL pueden construirse fácilmente de acuerdo con esta invención.
El plásmido resultante se llama
pAd\Deltac.CMV-LDL.
Este plásmido es útil en terapia génica de FH
solo, o preferiblemente, en la forma de un conjugado preparado como
se describe aquí para sustituir un gen normal de LDL por el alelo
anormal responsable del gen.
La terapia génica ex vivo puede realizarse
cosechando y estableciendo un cultivo primario de hepatocitos de un
paciente. Pueden utilizarse técnicas conocidas para aislar y
transducir los hepatocitos con el(los) vector(es)
anterior(es) con el apoyo del(los) gen(es)
receptor(es) de LDL. Por ejemplo, las técnicas de perfusión
de colagenasa desarrolladas para el hígado de conejo, pueden
adaptarse al tejido humano y usarse en transducción. Después de la
transducción, los hepatocitos se remueven de las placas de cultivo
del tejido y se introducen nuevamente dentro del paciente usando
técnicas conocidas, por ejemplo, por medio de un catéter colocado
dentro de la vena mesentérica inferior.
En forma deseable, la aproximación in vivo
a la terapia génica, por ejemplo, dirigida al hígado, implica el
uso de los vectores y de los conjugados de los vectores descritos
arriba. Un tratamiento preferido implica la infusión de un conjugado
LDL del vector de esta invención dentro de la circulación
periférica del paciente. El paciente es evaluado entonces por el
cambio de los lípidos en el suero y en los tejidos del hígado.
El virus o el conjugado pueden usarse para
infectar hepatocitos in vivo por inyección directa dentro de
una vena periférica o la vena porta
(10^{7}-10^{8} pfu/kg) o de un retrógrado
dentro del tracto biliar (misma dosis). Esto efectúa la
transferencia génica dentro de la mayoría de los hepatocitos.
Los tratamientos se repiten en la medida en que
sean necesarios, por ejemplo, en forma semanal. La administración
de una dosis de virus equivalente a un MOI de aproximadamente 20
(esto es, 20 pfu/hepatocito) se anticipa que conduce a un alto
nivel de expresión génica en la mayoría de los hepatocitos.
(1) INFORMACIÓN GENERAL:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SOLICITANTE: Depositarios de la Universidad de Pensilvania
\hskip3.9cmWilson, James M.
\hskip3.9cmFisher, Krishna J.
\hskip3.9cmChen, Shu-Jen
\hskip3.9cmWeitzman, Matthew
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TÍTULO DE LA INVENCIÓN: Adenovirus Mejorado y Métodos de Utilización del Mismo
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- NÚMERO DE SECUENCIAS: 10
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- DIRECCIÓN PARA CORRESPONDENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESTINATARIO: Howson y Howson
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CALLE: Spring House Corporate Cntr, PO Box 457
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CIUDAD: Spring House
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- ESTADO: Pensilvania
\vskip0.500000\baselineskip
- (E)
- PAÍS: Estados Unidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (F)
- CÓDIGO POSTAL: 19477
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- FORMA QUE PUEDE LEERSE EN EL COMPUTADOR:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- TIPO DE MEDIO: Disco flexible
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- COMPUTADOR: IBM PC compatible
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- SISTEMA OPERATIVO: PC-DOS/MS-DOS
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- SOFTWARE: PatentIn Release #1.0, Versión #1.30
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- DATOS DE LA SOLICTUD ACTUAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NÚMERO DE SOLICITUD:
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- FECHA DE PRESENTACIÓN:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CLASIFICACIÓN:
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- DATOS DE LA SOLICITUD DE PRIORIDAD
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NÚMERO DE LA SOLICTUD: US 08/331.381
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- FECHA DE PRESENTACIÓN: 28 de octubre de 1994
\vskip0.800000\baselineskip
- (viii)
- INFORMACIÓN DEL APODERADO/AGENTE:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE: Bak, Mary E.
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- NÚMERO DE REGISTRO: 31.215
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REFERENCIA/MINUTA: GNVPN.008PCT
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- INFORMACIÓN PARA TELECOMUNICACIÓN:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- TELÉFONO: 215-540-9200
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TELEFAX: 215-540-5818
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO: 1:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 7897 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- ENTRELAZAMIENTO: doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: desconocida
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: cADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 1:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO: 2:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 7852 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- ENTRELAZAMIENTO: doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: desconocida
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: cADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 2:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO: 3:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD:9972 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- ENTRELAZAMIENTO: doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: desconocida
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: cADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 3:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO: 4:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 14 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- ENTRELAZAMIENTO: doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: desconocida
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 4:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTAGTAAATTT GGGC
\hfill14
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO: 5:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 14 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- ENTRELAZAMIENTO: doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: desconocida
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 5:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAGTAAGATTT GGCC
\hfill14
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO: 6:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 14 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- ENTRELAZAMIENTO: doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: desconocida
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 6:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAGTGAAATCT GAAT
\hfill14
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO:7:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 14 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- ENTRELAZAMIENTO: doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: desconocida
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 7:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGAATAATTTT GTGT
\hfill14
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO: 8:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 14 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- ENTRELAZAMIENTO: doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: desconocida
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 8:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCGTAATATTT GTCT
\hfill14
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO:9:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 14 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- ENTRELAZAMIENTO: doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: desconocida
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 9:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipWANWTTTG
\hfill8
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO: 10:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 19307 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- ENTRELAZAMIENTO: doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: desconocida
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: cADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 10:
Claims (15)
1. Un método para producir un pseudotipo de
adenovirus que comprende las etapas de:
- (a)
- introducir en una célula huésped seleccionada:
- (i)
- un vector trasbordador recombinante que comprende secuencias de ácido nucleico de adenovirus y un minigén, en donde dichas secuencias de adenovirus son de un primer serotipo y consisten de los elementos cis 5' y 3' del adenovirus, necesarios para la replicación y encapsidación del virión; y en donde dicho minigén comprende un gen seleccionado enlazado operativamente a las secuencias reguladoras que dirigen la expresión de dicho gen seleccionado en una célula blanco, dichos elementos cis del adenovirus flanqueando a dicho minigén, y
- (ii)
- un virus auxiliar que comprende las secuencias génicas de adenovirus necesarias para infección adenoviral y codificación de una cápside adenoviral de un segundo serotipo que difiere del serotipo del adenovirus de (i)
- (b)
- cultivar dicha célula huésped que contiene al vector trasbordador y al virus auxiliar para permitir la formación de pseudotipo de adenovirus que comprende las secuencias de ácido nucleico del adenovirus y un minigén del vector trasbordador (i) en una cápside adenoviral de un segundo serotipo que difiere de dicho primer serotipo.
2. Un método de acuerdo con la reivindicación 1,
en donde el virus auxiliar carece de todo o de una porción
suficiente del adenovirus E1 y/o de los genes E3 para eliminar su
función biológica.
3. Un método de acuerdo con las reivindicaciones
1 ó 2, en donde el primero y el segundo serotipos se seleccionan
independientemente de un serotipo de adenovirus del grupo que
consiste de 2, 4, 5, 7, 12 y 40.
4. Un método de acuerdo con cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 3, que comprende además las etapas de aislar el
pseudotipo de adenovirus de dicha célula huésped o del cultivo
celular que lo contiene.
5. Un método para producir un pseudotipo de
adenovirus que comprende las etapas de:
- (a)
- introducir en una célula huésped seleccionada:
- (i)
- un vector trasbordador recombinante que comprende secuencias de ácido nucleico de adenovirus y un minigén, en donde dichas secuencias de adenovirus son de un primer serotipo y consisten de los elementos cis 5' y 3' del adenovirus, necesarios para la replicación y encapsidación del virión; y en donde dicho minigén comprende un gen seleccionado operativamente enlazado a las secuencias reguladoras que dirigen la expresión de dicho gen seleccionado en una célula blanco, dichos elementos cis del adenovirus flanqueando a dicho minigén, y
- (ii)
- un virus auxiliar que comprende secuencias génicas de adenovirus de un segundo serotipo que difiere del serotipo de las secuencias del adenovirus de (i); y
- (b)
- cultivar dicha célula huésped que contiene al vector trasbordador y al virus auxiliar, en donde el virus auxiliar y la célula huésped contienen los genes del adenovirus que son necesarios para la infección adenoviral y que permiten la formación de un pseudotipo de adenovirus que comprende las secuencias de ácido nucleico del adenovirus y un minigén del vector trasbordador (i) en una cápside adenoviral de un segundo serotipo que difiere de dicho primer serotipo.
6. Un método de acuerdo con la reivindicación 5,
en donde el primero y el segundo serotipos se seleccionan
independientemente de un serotipo de adenovirus del grupo que
consiste de 2, 4, 5, 7, 12 y 40.
7. Un método de acuerdo con la reivindicación 5 o
la 6, que comprende además las etapas de aislar el pseudotipo de
adenovirus de dicha célula huésped o del cultivo celular que lo
contiene.
8. Un pseudotipo de adenovirus que comprende:
- (a)
- secuencias de ácido nucleico de adenovirus y un minigén, en donde dichas secuencias de ácido nucleico de adenovirus comprenden los elementos cis 5' y 3' del adenovirus para replicación y encapsidación del virión; en donde dicho minigén comprende un gen seleccionado operativamente enlazado a las secuencias reguladoras que dirigen la expresión de dicho gen seleccionado en una célula blanco, dichos elementos cis del adenovirus son de un primer serotipo y flanquean a dicho minigén; y
- (b)
- una cápside de un segundo serotipo de adenovirus que difiere de dicho primer serotipo y que encapsida a dichas secuencias de ácido nucleico de adenovirus y al minigén de (a).
9. Un pseudotipo de adenovirus de acuerdo con la
reivindicación 8, en donde el primero y el segundo serotipos se
seleccionan independientemente de un serotipo de adenovirus del
grupo que consiste de 2, 4, 5, 7, 12 y 40.
10. Un pseudotipo de adenovirus de acuerdo con
la reivindicación 8 o la 9, en donde dichos elementos cis 5' del
adenovirus comprenden las repeticiones terminales invertidas (ITRs)
5' del adenovirus nativo, y secuencias de empaquetamiento.
11. Un pseudotipo de adenovirus de acuerdo con
cualquiera de las reivindicaciones 8 a 10, en donde dichos
elementos cis 3' comprenden las repeticiones terminales invertidas
(ITRs) 3' del adenovirus nativo.
12. Un pseudotipo de adenovirus de acuerdo con
cualquiera de las reivindicaciones 8 a 11, en donde dicho gen
seleccionado es un gen indicador seleccionado del grupo que
consiste de los genes que codifican
\beta-galactosidasa, fosfatasa alcalina y
proteína fluorescente verde.
13. Un pseudotipo de adenovirus de acuerdo con
cualquiera de las reivindicaciones 8 a 12, en donde dicho gen
seleccionado es un gen terapéutico seleccionado del grupo que
consiste de un gen CFTR normal, un alelo DMD de Becker y un gen
receptor normal de LDL.
14. Una composición farmacéutica que comprende un
pseudotipo de adenovirus de acuerdo con cualquiera de las
reivindicaciones 8 a 13 y un vehículo farmacéuticamente
aceptable.
15. El uso de un pseudotipo de adenovirus de
acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones 8 a 13 en la
preparación de un medicamento.
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