ES2214744T3 - Regulacion de tejido epitelial por medio de polipeptidos tipo hedgehog (erizo) y formulaciones y usos relacionados con la misma. - Google Patents
Regulacion de tejido epitelial por medio de polipeptidos tipo hedgehog (erizo) y formulaciones y usos relacionados con la misma.Info
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Abstract
Método in vitro que es para modular el estado de crecimiento de una célula epitelial y comprende el paso de poner la célula epitelial ectópicamente en contacto con una cantidad de un polipéptido que comprende una parte extracelular bioactiva de una proteína hedgehog (erizo) que es efectiva para alterar la velocidad de proliferación de la célula epitelial.
Description
Regulación de tejido epitelial por medio de
polipéptidos tipo Hedgehog (erizo) y formulaciones y usos
relacionados con la misma.
La formación de patrón es la actividad en virtud
de la cual las células embrionarias forman disposiciones espaciales
ordenadas de tejidos diferenciados. La complejidad física de los
organismos superiores surge durante la embriogénesis a través de la
interacción del linaje celular por vía intrínseca y de la
señalización celular por vía extrínseca. Las interacciones
inductivas son esenciales para la patronización embrionaria en el
desarrollo de los vertebrados desde el más temprano establecimiento
del plan del cuerpo hasta la patronización de los sistemas
orgánicos, hasta la generación de los diversos tipos de células
durante la diferenciación tisular (Davidson, E., (1990)
Development 108: 365-389; Gurdon, J. B.,
(1992) Cell 68: 185-199; Jessell, T. M. et
al., (1992) Cell 68: 257-270). Son
variados los efectos de las interacciones celulares en el
desarrollo. Típicamente, las células respondedoras son desviadas de
una ruta de diferenciación celular a otra por células inductoras
que difieren tanto del estado de no inducción como del estado de
inducción de las células respondedoras (inducciones). A veces las
células inducen a las células vecinas a las mismas a diferenciarse
como ellas mismas (inducción homoiogénetica); y en otros casos una
célula inhibe a las que son sus vecinas para que no se diferencien
como ella. Las interacciones celulares en las etapas tempranas del
desarrollo pueden ser secuenciales, de forma tal que una inducción
inicial entre dos tipos de células conduce a una progresiva
amplificación de diversidad. Además, las interacciones inductivas
tienen lugar no solamente en los embriones, sino también en células
adultas, y pueden actuar estableciendo y manteniendo patrones
morfogenéticos, así como induciendo diferenciación (J.B. Gurdon
(1992) Cell 68:185-199).
Miembros de la familia Hedgehog (Erizo) de
moléculas señalizadoras median muchos importantes procesos de
patronización a corto y a largo plazo durante el desarrollo de los
invertebrados y los vertebrados. En la mosca, un solo gen
hedgehog (erizo) regula la patronización de los discos
imaginales y segmentales. En contraste con ello, en los vertebrados
una familia de genes erizo interviene en el control de la
asimetría de izquierda-derecha, de la polaridad en
el sistema nervioso central, de los somitas y de los esbozos de los
miembros, de la organogénesis, de la condrogénesis y de la
espermatogénesis.
El primer gen erizo (hedgehog) fue
identificado mediante una selección genética en la mosca de la
fruta Drosophila melanogaster
(Nüsslein-Volhard, C. y Wieschaus, E. (1980)
Nature 287, 795-801). Esta selección
identificó una serie de mutaciones que afectaban al desarrollo
embrionario y larval. En 1992 y 1993 fue descrita la naturaleza
molecular del gen hedgehog (hh) de Drosophila (C.F., Lee
et al. (1992) Cell 71, 33-50), y
desde entonces han sido aislados a partir de varias especies de
vertebrados varios homólogos de hedgehog. Mientras que ha
sido encontrado tan sólo un gen hedgehog (erizo) en la
Drosophila y en otros invertebrados, en los vertebrados están
presentes múltiples genes Hedgehog (Erizo).
Las diversas proteínas Hedgehog (Erizo) constan
de un péptido señal, una región N-terminal altamente
conservada, y un dominio C-terminal más divergente.
Además de la separación de la secuencia señal en la vía secretoria
(Lee, J.J. et al. (1992) Cell
71:33-50; Tabata, T. et al. (1992) Genes
Dev. 2635-2645; Chang, D.E. et al.
(1994) Development 120:3339-3353), las
proteínas precursoras de Hedgehog (Erizo) experimentan una
segmentación autoproteolítica interna que depende de secuencias
conservadas en la parte C-terminal (Lee et
al. (1994) Science 266:1528-1537; Porter
et al. (1995) Nature 374:363-366).
Esta autofragmentación conduce a un péptido
N-terminal de 19 kD y a un péptido
C-terminal de 26-28 kD (Lee et
al. (1992) supra; Tabata et al. (1992)
supra; Chang et al. (1994) supra; Lee et
al. (1994) supra; Bumcrot, D.A., et al. (1995)
Mol. Cell. Biol. 15:2294-2303; Porter et
al. (1995) supra; Ekker, S.C. et al. (1995)
Curr. Biol. 5:944-955; Lai, C.J. et
al. (1995) Development 121:2349-2360). El
péptido N-terminal se mantiene estrechamente
asociado a la superficie de las células en las cuales fue
sintetizado, mientras que el péptido C-terminal es
libremente difusible tanto in vitro como in vivo (Lee
et al. (1994) supra; Bumcrot, et al. (1995)
supra; Mart', E. et al. (1995) Development
121:2537-2547; Roelink, H. et al. (1995)
Cell 81:445-455). Es interesante el hecho de
que la retención en la superficie celular del péptido
N-terminal es dependiente de la autofragmentación,
al ser una forma truncada de HH codificado por un RNA que termina
precisamente en la posición normal de fragmentación interna
difusible in vitro (Porter et al. (1995)
supra) e in vivo (Porter, J.A. et al. (1996)
Cell 86, 21-34). Estudios bioquímicos han
demostrado que la fragmentación autoproteolítica de la proteína
precursora de HH tiene lugar a través de un intermedio tioéster
interno que a continuación es escindido en una sustitución
nucleofílica. Es probable que el nucleófilo sea una pequeña molécula
lipofílica que queda enlazada mediante enlace covalente al extremo
C-terminal del N-péptido (Porter
et al. (1996) supra), atándolo a la superficie de la
célula. Las implicaciones biológicas son profundas. Como resultado
de la atadura, es generada en la superficie de las células
productoras de Hedgehog una alta concentración local de péptido
Hedgehog (Erizo) N-terminal. Es este péptido
N-terminal el que es tanto necesario como suficiente
para las actividades de señalización de Hedgehog a corto y a largo
plazo en la Drosophila y en los vertebrados (Porter et
al. (1995) supra; Ekker et al. (1995)
supra; Lai et al. (1995) supra; Roelink, H.
et al. (1995) Cell 81:445-455; Porter
et al. (1996) supra; Fietz, M.J. et al. (1995)
Curr. Biol. 5:643-651; Fan, C.-M. et
al. (1995) Cell 81:457-465; Mart', E.,
et al. (1995) Nature 375:322-325;
Lopez-Martinez et al. (1995) Curr.
Biol 5:791-795; Ekker, S.C. et al.
(1995) Development 121:2337-2347; Forbes,
A.J. et al. (1996) Development
122:1125-1135).
El HH (Hedgehog) ha estado implicado en procesos
de patronización a corto y a largo plazo en varios sitios durante el
desarrollo de la Drosophila. En el establecimiento de la
polaridad de segmentos en embriones iniciales, el mismo tiene
efectos a corto plazo que parecen estar mediados directamente,
mientras que en la patronización de los discos imaginales, induce
efectos a largo plazo por vía de la inducción de señales
secundarias.
En vertebrados, han sido clonados recientemente
en los últimos años varios genes hedgehog (erizo) (véase la
Tabla 1). De estos genes, el Shh es el que ha recibido la
mayor parte de la atención experimental, dado que el mismo es
expresado en distintos centros organizadores que son las fuentes de
señales que patronizan los tejidos contiguos. La evidencia reciente
indica que el Shh interviene en estas interacciones.
La interacción de una proteína hedgehog (erizo)
con uno de sus receptores afines, patched, pone en
movimiento una cascada que supone la activación e inhibición de
efectores del lado de cola, cuya última consecuencia es, en algunos
casos, un cambio detectable en la transcripción o traducción de un
gen. Los objetivos transcripcionales de la señalización
hedgehog son el propio gen patched (Hidalgo e Ingham,
1990 Development 110, 291-301; Marigo et
al., 1996) y los homólogos de vertebrados del gen cubitus
interruptus (Ci) de drosophila, los genes GLI (Hui
et al. (1994) Dev Biol 162:402-413).
Se ha demostrado que la expresión del gen patched es inducida
en células del esbozo de los miembros y de la placa neural que
responden al Shh. (Marigo et al. (1996)
Development 122:1225-1233). Los genes
GLI codifican putativos factores de transcripción que tienen
dominios dedo de cinc de fijación a DNA (Orenic et al. (1990)
Genes & Dev 4:1053-1067; Kinzler et
al. (1990) Mol Cell Biol 10:634-642). Se
ha descrito que la transcripción del gen GLI es regulada en el
sentido de un incremento en respuesta a hedgehog en esbozos
de los miembros, mientras que la transcripción del gen GLI3
es regulada en el sentido de un decremento en respuesta a la
inducción de hedgehog (Marigo et al. (1996)
Development 122:1225-1233). Además, se ha
demostrado que elevados niveles de Ci son suficientes para activar
el gen patched (ptc) y otros genes objetivo hedgehog,
incluso en ausencia de actividad de hedgehog.
Chemical Abstracts XP-002098623
describe el uso de dibutiril-cAMP para el
tratamiento de trastornos cutáneos tales como heridas, quemaduras y
congelamientos por exposición al frío en forma de un ungüento;
Chemical Abstracts XP-002098624
describe un tónico capilar que comprende
dibutiril-cAMP para promover el crecimiento del
cabello;
Chemical Abstracts XP-002098625
describe una loción que comprende 5-isoquinolina
sulfonamidas inhibidoras de proteína quinasa como estimulador del
crecimiento del cabello;
la EP-A-0 249 873
informa sobre el tratamiento de úlceras cutáneas mediante
soluciones/ungüentos que comprenden (análogos de) cAMP tales como
dibutiril-cAMP;
la WO 96/09806 describe la reducción del
crecimiento capilar mediante composiciones tópicas que comprenden
inhibidores de PKC (proteína quinasa C) tales como
1-(5-isoquinolinilsulfonil)2-metilpiperazina;
la WO 95/18856 describe composiciones
farmacéuticas que comprenden proteína hedgehog (erizo) para
administración tópica.
Un aspecto de la presente invención se refiere a
un método in vitro que es para modular el estado de
crecimiento de una célula epitelial y comprende el paso de poner a
una célula epitelial ectópicamente en contacto con una cantidad de
un polipéptido que comprende una parte extracelular bioactiva de
una proteína hedgehog (erizo) que es efectiva para alterar la
velocidad de proliferación de la célula epitelial.
Una realización de la presente solicitud se
refiere a un método para modular el estado de crecimiento de una
célula epitelial a base de poner a la célula epitelial
ectópicamente en contacto in vitro con un agente terapéutico
hedgehog en una cantidad que es efectiva para alterar la velocidad
de proliferación de la célula epitelial (es decir para promoverla o
inhibirla), p. ej. con respecto a la ausencia de administración del
polipéptido hedgehog. El método que es objeto de la presente puede
ser usado, por ejemplo, para modular el estado de crecimiento de un
tejido epitelial, tal como para inducir la formación de piel o de
otro tejido cutáneo, o para inducir el crecimiento del pelo.
El método que es objeto de la presente es
ejecutado usando un polipéptido que incluye una parte hedgehog
(erizo) que comprende al menos una parte extracelular bioactiva
de una proteína hedgehog (erizo), incluyendo p. ej. la parte
hedgehog al menos 50, 100 ó 150 residuos de aminoácidos
(contiguos) de una mitad N-terminal de una proteína
hedgehog (erizo). En realizaciones preferidas, la parte
hedgehog incluye al menos una parte de la proteína
hedgehog (erizo) que corresponde a un fragmento de 19 kd del
dominio extracelular de una proteína hedgehog (erizo).
En determinadas realizaciones preferidas, la
parte hedgehog (erizo) tiene una secuencia de aminoácidos
que es al menos en un 60, 75, 85 ó 95 por ciento idéntica a una
proteína hedgehog (erizo) de cualesquiera de las ID SEC Núms.
10-18 ó 20, si bien se contemplan también como
útiles en el presente método secuencias idénticas a esas secuencias
registradas en la enumeración de secuencias. La parte hedgehog
(erizo) puede ser codificada por un ácido nucleico que se
hibride bajo condiciones rigurosas con una secuencia de ácidos
nucleicos de cualesquiera de las ID SEC Núms. 1-9 ó
19, y p. ej. la parte hedgehog (erizo) puede ser codificada
por un gen hedgehog (erizo) de vertebrado, y en especial por
un gen hedgehog (erizo) humano.
En ciertas realizaciones, el polipéptido hedgehog
es modificado con una o varias mitades de esterol, como p. ej. de
colesterol o de un derivado del mismo.
En ciertas realizaciones, el polipéptido hedgehog
es modificado con una o varias mitades de ácido graso, tal como una
mitad de ácido graso seleccionada de entre los miembros del grupo
que consta de miristoilo, palmitoilo, estearoilo y araquidoilo.
En ciertas realizaciones, el polipéptido hedgehog
es modificado con uno o varios hidrocarburos aromáticos tales como
benceno, perileno, fenantreno, antraceno, naftaleno, pireno,
criseno o naftaceno.
En ciertas realizaciones, el polipéptido hedgehog
es modificado una o varias veces con un alquilo o cicloalquilo de
C_{7}-C_{30}.
En otras realizaciones, el método que es objeto
de la presente puede ser ejecutado mediante el uso de un constructo
de activación génica, estando el constructo de activación génica
diseñado para recombinarse con un gen hedgehog genómico del
paciente para proporcionar una secuencia reguladora transcripcional
heteróloga ligada operativamente a una secuencia codificante del
gen hedgehog.
En otras realizaciones adicionales, el método que
es objeto de la presente puede ser puesto en práctica mediante el
uso de un constructo de terapia génica que codifique unpolipéptido
hedgehog. Por ejemplo, el constructo de terapia génica puede
preverse en una composición seleccionada de entre los miembros de un
grupo que conste de una partícula viral recombinante, un liposoma y
un agente de fijación de ácido nucleico policatiónico.
La invención puede ser usada para tratar, p. ej.,
un trastorno epitelial, tal como en el control de un proceso de
curación de heridas, para parte de tratamientos tales como el
tratamiento de quemaduras, la regeneración cutánea, los injertos
cutáneos, el tratamiento de llagas por decúbito, el tratamiento de
úlceras dérmicas, la reducción de cicatrices
post-cirugía y el tratamiento de la colitis
ulcerosa. En el control del crecimiento del pelo, la invención
puede ser usada para parte de un tratamiento de la alopecia.
Otro aspecto adicional de la presente invención
se refiere a preparaciones de un agente terapéutico hedgehog
formuladas para aplicación tópica a tejido epitelial, como p. ej. a
la piel, incluyendo tales formulaciones un polipéptido que comprende
una secuencia de polipéptido hedgehog que incluye un fragmento
bioactivo de una proteína hedgehog (erizo), siendo dicho
polipéptido formulado para aplicación tópica a tejido
epitelial.
Las Figuras 1A, B y C ilustran la inducción del
crecimiento del pelo en ratones tratados con varias formulaciones
de agente terapéutico hedgehog.
La epidermis de la piel normal es un complejo
tejido epitelial que contiene queratinocitos que proliferan, se
diferencian y se descaman, estando dicho tejido epitelial
estratificado de forma tal que los cambios morfológicos y
funcionales que se producen en los queratinocitos tienen lugar en
progresión ordenada. La epidermis normal se mantiene en un estado
de régimen dinámico, al compensar continuamente la proliferación de
queratinocitos la pérdida de las células que se desprenden de la
superficie de la piel. Dentro de la epidermis, la proliferación
tiene lugar en la capa basal de queratinocitos que están unidos a
la membrana basal subyacente, y las células experimentan la
diferenciación terminal al migrar a través de las capas
suprabasales, desprendiéndose finalmente de la superficie del
tejido en forma de escamas muertas cornificadas. Han sido definidas
mediante análisis de cinética celular tres subpoblaciones de
queratinocitos basales, que son las de las células troncales, las
células amplificadoras del tránsito y las células comprometidas.
Las células troncales conservan una gran capacidad de
autorenovación a lo largo de su vida adulta, y son en última
instancia las responsables del mantenimiento y la reparación de la
epidermis. Las descendientes de las células troncales pueden ser
ellas mismas células troncales o bien células conocidas como células
amplificadoras del tránsito. Las células amplificadoras del
tránsito se dividen un pequeño número de veces, pero tienen una
alta probabilidad de producir hijas que se retiran irreversiblemente
del ciclo celular y quedan comprometidas a diferenciarse
terminalmente.
La presente solicitud está relacionada con el
descubrimiento de que preparaciones de polipéptidos hedgehog pueden
ser usadas para controlar la formación y/o el mantenimiento de
tejido epitelial. Como se describe en los ejemplos que se adjuntan,
las proteínas erizo están implicadas en la proliferación de
células troncales epiteliales y pueden aportar señales iniciales
que regulan la diferenciación de las células troncales para su
conversión en tejidos epiteliales. En general, una célula epitelial
es puesta en contacto con una cantidad de un agente terapéutico
hedgehog (definido infra) que produce por parte de la célula
una respuesta atóxica de (I) inducción de formación de tejido
epitelial o (II) inhibición de la formación de tejido epitelial, en
dependencia de si el agente terapéutico hedgehog es un suficiente
agonista para hedgehog o un suficiente antagonista para hedgehog.
La invención es adecuada para células epiteliales que pueden estar
dispersadas en cultivo o pueden ser parte de un tejido u órgano
intacto. Además, la invención puede ser usada para células que
estén en cultivo (in vitro), o para células que estén en un
animal intacto (in vivo).
En un aspecto, la presente invención aporta
preparaciones farmacéuticas para controlar la proliferación de
tejido de origen epitelial utilizando como ingrediente activo un
polipéptido hedgehog o un mimético del mismo. La invención se
refiere también al control de la proliferación de tejido de origen
epitelial por medio de las preparaciones farmacéuticas de la
invención.
Las formulaciones que contienen agente
terapéutico hedgehog según la presente invención pueden ser
usadas como parte de regímenes en el tratamiento de trastornos o en
la reparación quirúrgica o cosmética de tejidos epiteliales tales
como piel y órganos cutáneos, tejido corneal, lenticular y ocular
de otro tipo, membranas mucosas y epitelio periodontal. Los métodos
y composiciones que aquí se describen permiten el tratamiento o la
prevención de los de una variedad de tejidos epiteliales y mucosos
dañados. Por ejemplo, el presente método puede ser usado para
controlar procesos de curación de heridas, como puede ser por
ejemplo deseable en conexión con toda cirugía que afecte a tejido
epitelial, tal como es el caso de las cirugías dermatológicas o
periodontales. Los ejemplos de reparación quirúrgica para los cuales
la terapia con agente terapéutico hedgehog es un tratamiento
candidato incluyen la regeneración cutánea y de graves quemaduras,
los injertos cutáneos, las llagas por decúbito, las úlceras
dérmicas, las fisuras, la reducción de cicatrices
post-cirugía y la colitis ulcerosa.
En otro aspecto de la presente invención, las
preparaciones que contienen agente terapéutico hedgehog
pueden ser usadas para llevar a efecto el crecimiento del cabello,
como es por ejemplo el caso del tratamiento de la alopecia, con el
cual es potenciado el crecimiento del cabello, o por ejemplo en la
remoción cosmética de pelo (depilación), con la cual es inhibido el
crecimiento del pelo.
En determinadas realizaciones, las composiciones
que son objeto de la presente pueden ser usadas para inhibir el
crecimiento de tejido de origen epitelial, en lugar de para
promoverlo. Por ejemplo, determinadas composiciones de las aquí
descritas pueden ser aplicadas al tratamiento o a la prevención de
las de una variedad de afecciones hiperplásicas o neoplásicas. El
método puede encontrar aplicación para el tratamiento o la
profilaxis de, p. ej., la psoriasis, la queratosis, el acné, las
lesiones comedogénicas, la foliculitis y la seudofoliculitis, el
queratoacantoma, las callosidades, la enfermedad de Darier, la
ictiosis, el liquen plano, el molusco contagioso, el melasma, la
enfermedad de Fordyce y los queloides o cicatrices hipertróficas.
Determinadas formulaciones de las de la presente invención pueden
ser también usadas como parte de regímenes de tratamiento en
enfermedades autoinmunes para afectar la curación de las
manifestaciones proliferativas del trastorno, o sea por ejemplo
como parte de un tratamiento para úlceras aftosas, para pénfigo tal
como pénfigo vulgar, pénfigo foliáceo, pénfigo vegetante o pénfigo
eritematoso, para la epidermólisis, para lesiones del tipo lupus o
para lesiones descamativas.
Los tratamientos con agente terapéutico
hedgehog que son objeto de la presente son eficaces en
sujetos tanto humanos como animales que sufran de estas afecciones.
Los sujetos animales a los cuales es aplicable la invención
comprenden tanto animales domésticos como ganado, criados ya sea
como animales de compañía o bien con finalidades comerciales. Son
ejemplos los perros, los gatos, el ganado bovino, los caballos, el
ganado ovino, los cerdos y las cabras.
Otro aspecto adicional de la presente invención
está relacionado con la estimulación del crecimiento y la
regulación de la diferenciación de tejido epitelial en cultivo
tisular.
Sin que ésta tenga por qué ser la única teoría
válida, la inducción de la proliferación de células troncales por
parte de las proteínas erizo puede ser debida al menos en parte a
la capacidad de estas proteínas para antagonizar (directa o
indirectamente) la regulación mediada por patched de la
expresión génica y otros efectos fisiológicos mediados por esa
proteína. Se entiende que el producto del gen patched, que es
una proteína de la superficie de la célula, señaliza por una vía
que ocasiona la represión transcripcional de miembros de las
familias Wnt y Dpp/BMP de morfogenes, que son proteínas que imparten
información posicional. En el desarrollo del sistema nervioso
central y la patronización de los miembros en los vertebrados, la
introducción de hedgehog disipa (desreprime) esta inhibición
conferida por patched, permitiendo la expresión de
determinados programas génicos.
Se ha descrito recientemente que mutaciones en la
versión humana del gen patched, que es un gen que fue
primeramente identificado en una vía de desarrollo de la mosca de
la fruta, ocasionan un cáncer de piel hereditario y pueden
contribuir a la aparición de cánceres de piel esporádicos. Véanse,
por ejemplo, Hahn et al. (1996) Cell
86:841-851, y Johnson et al. (1996)
Science 272:1668-1671. La demostración de que
el carcinoma nevoide de células basales (NBCC) resulta de
mutaciones en el gen patched humano aportó un ejemplo de los
papeles que patched desempeña en el desarrollo
post-embrionario. Estas observaciones han hecho que
en la técnica se entienda que una actividad de patched es la
de un gen supresor de tumores que puede actuar a base de inhibir las
señales proliferativas de hedgehog. Nuestras observaciones
que se exponen más adelante revelan nuevos papeles potenciales para
la vía hedgehog/patched en el mantenimiento de la
proliferación y diferenciación de las células epiteliales. En
consecuencia, la presente invención contempla el uso de otros
agentes que son capaces de imitar el efecto de la proteína
hedgehog (erizo) en la señalización de patched, p.
ej., como puede identificarse a partir de los análisis de selección
de drogas que se describen más adelante.
Para mayor comodidad se recogen aquí determinadas
expresiones que son empleadas en la descripción, en los ejemplos y
en las reivindicaciones adjuntas.
La expresión "agente terapéutico hedgehog"
se refiere a varias formas de polipéptidos hedgehog, así como
peptidomiméticos, que pueden modular el estado de
proliferación/diferenciación de células epiteliales a base de, como
quedará claro a la luz del contexto de los ejemplos individuales,
imitar o potenciar (actuar como un agonista para) o inhibir (actuar
como un antagonista para) los efectos de una proteína hedgehog
(erizo) que se da de manera natural. Un agente terapéutico
hedgehog que imita o potencia la actividad de una proteína
hedgehog (erizo) de tipo salvaje es un "agonista para
hedgehog". A la inversa, un agente terapéutico hedgehog
que inhibe la actividad de una proteína hedgehog (erizo) de tipo
salvaje es un "antagonista para hedgehog".
En particular, la expresión "polipéptido
hedgehog" engloba preparaciones de proteínas erizo y
fragmentos peptidílicos de las mismas, en formas tanto agonistas
como antagonistas como quedará claro a la luz del contexto
específico.
En el sentido en el que se la utiliza en la
presente, la expresión "fragmento bioactivo de una proteína
erizo" se refiere a un fragmento de un polipéptido
hedgehog de plena longitud, actuando el fragmento
específicamente como agonista o antagonista para los eventos
inductivos mediados por proteínas erizo de tipo salvaje. El
fragmento bioactivo hedgehog es preferiblemente una parte
extracelular soluble de una proteína erizo, haciendo la
solubilidad referencia a soluciones fisiológicamente compatibles.
Están descritos ejemplos de fragmentos bioactivos en las
publicaciones al amparo del PCT (PCT = Tratado de Cooperación en
Materia de Patentes) WO 95/18856 y WO 96/17924.
El vocablo "patched" o "ptc" se refiere
a una familia de proteínas transmembrana afines que han estado
implicadas en la transducción de señales inducida a base de poner a
una célula en contacto con una proteína erizo. Por ejemplo,
la familia ptc de los mamíferos incluye ptc1 y ptc2. Además de las
referencias que se exponen más adelante, véanse también Takabatake
et al. (1997) FEBS Lett 410:485 y GenBank AB000847
para ejemplos de ptc2. A no ser que resulte de otro modo evidente
por el contexto, se entenderá que las realizaciones descritas en el
contexto de ptc1 (o de sólo ptc) se refieren también a
realizaciones equivalentes que implican a otros homólogos de ptc
como
ptc2.
ptc2.
La expresión "agente terapéutico ptc" se
refiere a agentes que (I) imitan el efecto de proteínas
erizo en la señalización de patched, p. ej., las
cuales actúan como antagonistas para la actividad inhibitoria del
ciclo celular de patched, o bien (II) activan o potencian la
señalización de patched. En otras realizaciones, el agente
terapéutico ptc puede ser un antagonista para hedgehog. El
agente terapéutico ptc puede ser, p. ej., un péptido, un ácido
nucleico, un carbohidrato, una pequeña molécula orgánica o un
extracto de producto natural (o fracción del mismo).
Una forma "proliferativa" de un agente
terapéutico hedgehog o ptc es una forma que induce la proliferación
de células epiteliales, y en particular de células troncales
epiteliales. A la inversa, una forma "antiproliferativa" de un
agente terapéutico hedgehog o ptc es una forma que inhibe la
proliferación de células epiteliales, preferiblemente de una manera
atóxica, p. ej. a base de promover o mantener un fenotipo
diferenciado o de promover de otro modo la quiescencia.
A título de ejemplo, aunque sin pretender que
ésta constituya la única teoría válida, el polipéptido hedgehog
proliferativo será generalmente una forma de la proteína que
desreprime la detención del ciclo celular mediada por patched,
imitando p. ej. el polipéptido el efecto de una proteína erizo
natural en las células epiteliales. Un agente terapéutico ptc
proliferativo incluye otros agentes que deprimen la detención del
ciclo celular mediada por patched, y puede actuar extracelular o
intracelularmente.
Un agente terapéutico ptc antiproliferativo
ilustrativo puede potenciar la detención del ciclo celular mediada
por patched. Tales agentes pueden ser pequeñas moléculas que
inhiban, p. ej., la fijación de hedgehog a patched, así como agentes
que estimulen y/o potencien una vía de transducción de señales de
la proteína patched.
Los vocablos "epitelios", "epitelial" y
"epitelio" se refieren a la cubierta celular de superficies
corporales internas y externas (cutáneas, mucosas y serosas),
incluyendo las glándulas y otras estructuras derivadas de las
mismas, como p. ej. las corneales, esofágicas y epidérmicas, y las
células epiteliales de los folículos pilosos. Otros ejemplos de
tejido epitelial incluyen el epitelio olfatorio, que es el epitelio
pseudoestratificado que reviste la región olfatoria de la cavidad
nasal y contiene los receptores del sentido del olfato; el epitelio
glandular, que se refiere a epitelio que se compone de células
secretoras; y el epitelio escamoso, que se refiere a epitelio que se
compone de células tipo placa aplanadas. El vocablo "epitelio"
puede también referirse a epitelio transicional, que es el que se
encuentra característicamente revistiendo órganos huecos que están
sometidos a grandes cambios mecánicos debido a contracción y
distensión, como es p. ej. el tejido que representa una transición
entre epitelio escamoso estratificado y columnar.
El vocablo "epitelización" se refiere a la
curación mediante el crecimiento de tejido epitelial sobre una
superficie desnudada.
El vocablo "piel" se refiere a la cubierta
protectora exterior del cuerpo, que consta del corium y de
la epidermis, y se entiende que incluye las glándulas sudoríparas y
sebáceas, así como las estructuras de los folículos pilosos. En toda
la presente solicitud puede usarse el adjetivo "cutáneo", y se
entenderá que el mismo se refiere en general a atributos de la
piel, según resulte apropiado para el contexto en el cual sean
usados dichos adjetivos.
El vocablo "epidermis" se refiere a la capa
más exterior y no vascular de la piel, derivada del ectodermo
embrionario y cuyo espesor varía entre 0,07 y 1,4 mm. En las
superficies palmares y plantares, la epidermis comprende, de dentro
a fuera, cinco capas que son las siguientes: la capa basal, que se
compone de células columnares que están dispuestas
perpendicularmente; la capa espinosa o de células espinosas, que se
compone de células poliédricas aplanadas con cortos procesos o
espinas; la capa granular, que se compone de células granulares
aplanadas; la capa clara, que se compone de varias capas de células
claras transparentes en las cuales los núcleos son indistintos o
están ausentes; y la capa córnea, que se compone de células no
nucleadas cornificadas aplanadas. En la epidermis de la superficie
general del cuerpo, la capa clara está habitualmente ausente.
El vocablo "corium" o "dermis"
se refiere a la capa de la piel que es profunda con respecto a la
epidermis, consta de un denso lecho de tejido conectivo vascular y
contiene los nervios y los órganos sensitivos terminales. Las raíces
del pelo y las glándulas sebáceas y sudoríparas son estructuras de
la epidermis que están profundamente embebidas en la dermis.
El vocablo "uña" se refiere a la placa
cutánea córnea que se encuentra sobre la superficie dorsal del
extremo distal de un dedo de la mano o del pie.
La expresión "glándula epidérmica" se
refiere a una agregación de células asociadas a la epidermis y
especializadas en secretar o excretar materiales no relacionados
con sus necesidades metabólicas ordinarias. Por ejemplo, las
"glándulas sebáceas" son glándulas holocrinas que están en el
corium y secretan una sustancia aceitosa y sebo. La
expresión "glándulas sudoríparas" se refiere a glándulas que
secretan sudor, están situadas en el corium o tejido
subcutáneo y desembocan por medio de un conducto en la superficie
del cuerpo.
El vocablo "pelo" (o "cabello") se
refiere a una estructura filar, y especialmente a la estructura
epidérmica especializada que se compone de queratina y se
desarrolla a partir de una papila que está hundida en el
corium, siendo dicha estructura producida tan sólo por los
mamíferos y característica de ese grupo de animales. El vocablo se
refiere también al agregado de tales pelos (o cabellos). La
expresión "folículo piloso" se refiere a una de las
invaginaciones tubulares de la epidermis que encierran los pelos y
desde las cuales crecen los pelos; y la expresión "células
epiteliales del folículo piloso" se refiere a las células
epiteliales que rodean la papila dérmica en el folículo piloso, como
son p. ej. las células troncales, las células de la vaina radicular
celular interna, las células matriciales y las células de la vaina
radicular celular externa. Tales células pueden ser células
normales no malignas, o células transformadas/inmortalizadas.
La expresión "tejido epitelial nasal" se
refiere al epitelio nasal y olfatorio.
La expresión "heridas por escisión" incluye
desgarramientos, abrasiones, cortes, punciones o laceraciones en la
capa epitelial de la piel, que pueden llegar hasta la capa dérmica
e incluso hasta la grasa subcutánea y más allá de la misma. Las
heridas por escisión pueden ser resultado de procedimientos
quirúrgicos o de una penetración accidental de la piel.
La expresión "heridas por quemadura" se
refiere a los casos en los que grandes áreas superficiales de la
piel se han perdido o han sido retiradas de un individuo debido a
la acción del calor y/o de agentes químicos.
La expresión "úlceras cutáneas dérmicas" se
refiere a lesiones de la piel ocasionadas por una pérdida
superficial de tejido, habitualmente con inflamación. Las úlceras
cutáneas dérmicas que pueden ser tratadas mediante el método de la
presente invención incluyen las úlceras por decúbito, las úlceras
diabéticas, las úlceras por estasis venosa y las úlceras
arteriales. La expresión "heridas por decúbito" se refiere a
úlceras crónicas que son el resultado de una aplicación de presión
a zonas de la piel por espacio de prolongados periodos de tiempo.
Las heridas de este tipo son a menudo llamadas llagas de cama o
llagas por presión. Las úlceras por estasis venosa son el resultado
de un estancamiento de la sangre o de otros fluidos debido a venas
defectuosas. La expresión "úlceras arteriales" se refiere a
piel necrótica en la zona que rodea a arterias en las que es
deficiente el flujo sanguíneo.
La expresión "tejido dental" se refiere a
tejido de la boca que es similar al tejido epitelial, como es por
ejemplo el caso del tejido gingival. El método de la presente
invención es útil para el tratamiento de la enfermedad
periodontal.
La expresión "tejido epitelial interno" se
refiere a tejido que se encuentra dentro del cuerpo y presenta
características similares a las de la capa epidérmica de la piel.
Los ejemplos incluyen el revestimiento del intestino. El método de
la presente invención es útil para promover la curación de
determinadas heridas internas, como son por ejemplo las heridas
resultantes de cirugía.
La expresión "herida en el tejido ocular" se
refiere al grave síndrome del ojo seco, a las úlceras y abrasiones
corneales y a las heridas quirúrgicas oftálmicas.
En toda esta solicitud, la expresión "trastorno
cutáneo proliferativo" se refiere a todo trastorno/enfermedad de
la piel que esté marcado por una proliferación indeseada o
aberrante de tejido cutáneo. Estas afecciones están típicamente
caracterizadas por una proliferación de células epidérmicas o una
diferenciación celular incompleta e incluyen, por ejemplo, la
ictiosis ligada al cromosoma X, la psoriasis, la dermatitis atópica,
la dermatitis alérgica por contacto, la hiperqueratosis
epidermolítica y la dermatitis seborreica. Por ejemplo, la
epidermodisplasia es una forma de desarrollo defectuoso de la
epidermis. Otro ejemplo es la "epidermólisis", que se refiere a
un estado de aflojamiento de la epidermis con formación de
vesículas y ampollas ya sea espontáneamente o bien en el sitio de
trauma.
El vocablo "carcinoma" se refiere a un nuevo
crecimiento maligno que está constituido por células epiteliales y
tiende a infiltrar los tejidos circundantes y a dar lugar a
metástasis. Los ejemplos de carcinomas incluyen los siguientes: el
"carcinoma de células basales", que es un tumor epitelial de
la piel que, si bien raramente produce metástasis, tiene potencial
de invasión y destrucción local; el "carcinoma de células
escamosas", refiriéndose esta expresión a carcinomas que surgen
de epitelio escamoso y tienen células cuboides; el
"carcinosarcoma", que incluye tumores malignos que se componen
de tejidos carcinomatosos y sarcomatosos; el "carcinoma adenoide
quístico", que es un carcinoma que está marcado por cilindros o
bandas de estroma hialino o mucinoso separados o rodeados por nidos
o cordones de pequeñas células epiteliales, siendo éste un carcinoma
que se da en las glándulas mamarias y salivales y en las glándulas
mucosas del tracto respiratorio; el "carcinoma epidermoide",
refiriéndose esta expresión a células cancerosas que tienden a
diferenciarse de la misma manera como las de la epidermis, es decir
que tienden a formar células espinosas y a experimentar
cornificación; el "carcinoma nasofaríngeo", refiriéndose esta
expresión a un tumor maligno que surge en el revestimiento epitelial
del espacio de detrás de la nariz; y el "carcinoma de células
renales", que pertenece al carcinoma del parenquima renal y se
compone de células tubulares que se presentan en varias
disposiciones. Otro crecimiento epitelial carcinomatoso es el
consistente en los "papilomas", refiriéndose este vocablo a
tumores benignos que se derivan de epitelio y tienen como agente
causante un Papillomavirus; y el de los "epidermoidomas",
refiriéndose este vocablo a un tumor cerebral o meníngeo que es
formado por inclusión de elementos ectodérmicos al tener lugar el
cierre del surco neural.
En el sentido en el que se le utiliza en la
presente, el vocablo "psoriasis" se refiere a un trastorno
cutáneo hiperproliferativo que altera los mecanismos reguladores de
la piel. En particular, se forman lesiones que suponen alteraciones
primarias y secundarias de la proliferación epidérmica, respuestas
inflamatorias de la piel, y una expresión de moléculas reguladoras
tales como linfocinas y factores inflamatorios. La piel psoriática
está caracterizada morfológicamente por un incrementado recambio de
células epidérmicas, una epidermis engrosada, una queratinización
anormal, infiltrados celulares inflamatorios en la capa de la
dermis e infiltración de leucocitos polimorfonucleares en la capa
de la epidermis que redunda en un incremento del ciclo de las
células basales. Adicionalmente están presentes células
hiperqueratósicas y paraqueratósicas.
El vocablo "queratosis" se refiere a
trastornos cutáneos proliferativos que están caracterizados por una
hiperplasia de la capa córnea de la epidermis. Los ejemplos de
trastornos queratósicos incluyen la queratosis folicular, la
queratosis palmar y plantar, la queratosis faríngea, la queratosis
pilosa y la queratosis actínica.
En el sentido en el que se les utiliza en la
presente, los vocablos "proliferativas" y "proliferación"
se refieren a células que experimentan mitosis.
En el sentido en el que se la utiliza en la
presente, la expresión "células transformadas" se refiere a
células que se han convertido espontáneamente adoptando un estado
de crecimiento ilimitado, es decir que han adquirido la capacidad de
crecer mediante un número indefinido de divisiones en cultivo. Las
células transformadas pueden ser caracterizadas por vocablos tales
como neoplásicas, anaplásicas y/o hiperplásicas, con respecto a su
pérdida del control del crecimiento.
En el sentido en el que se la utiliza en la
presente, la expresión "células inmortalizadas" se refiere a
células que han sido alteradas mediante medios químicos y/o
recombinantes de forma tal que las células tienen la capacidad de
crecer mediante un número indefinido de divisiones en cultivo.
Los vocablos "paciente" o "sujeto" a
tratar mediante el método que es objeto de la presente pueden
significar un humano o un animal no humano.
La expresión "preparación cosmética" se
refiere a una forma de preparación farmacéutica que está formulada
para administración tópica.
La expresión "cantidad efectiva" de un
agente terapéutico hedgehog, p. ej., con respecto al método de
tratamiento que es objeto de la presente, se refiere a una cantidad
de p. ej. un polipéptido hedgehog en una preparación que, al ser
aplicada como parte de un deseado régimen de dosificación, da lugar
a una variación de la velocidad de proliferación celular y/o del
estado de diferenciación de una célula para así producir una
cantidad de proliferación de células epiteliales acorde con normas
clínicamente aceptables para el trastorno a tratar o la finalidad
cosmética perseguida.
La expresión "estado de crecimiento" de una
célula se refiere a la velocidad de proliferación de la célula y al
estado de diferenciación de la célula.
Los vocablos "homología" e "identidad"
se refieren cada uno a una similitud de secuencia entre dos
secuencias polipeptídicas, siendo la identidad una comparación más
estricta. La homología y la identidad pueden ser cada una
determinadas a base de comparar una posición en cada secuencia, que
puede estar alineada a efectos comparativos. Cuando una posición en
la secuencia comparada está ocupada por el mismo residuo de
aminoácido, puede decirse entonces que los polipéptidos son
idénticos en esa posición; y cuando el sitio equivalente está
ocupado por el mismo aminoácido (p. ej. idéntico) o por un
aminoácido similar (p. ej. similar a cuanto a su naturaleza estérica
y/o electrónica), puede decirse entonces que las moléculas son
homólogas en esa posición. El porcentaje de homología o identidad
entre secuencias es función del número de posiciones coincidentes u
homólogas compartidas por las secuencias. Una secuencia "no
afín" o "no homóloga" comparte menos de un 40 por ciento de
identidad, aunque preferiblemente menos de un 25 por ciento de
identidad, con una secuencia de residuos de aminoácidos de la
presente invención.
Cuando hace referencia a una determinada
secuencia de polipéptido o ácido nucleico, la expresión
"corresponde a" sirve para indicar que la secuencia de interés
es idéntica u homóloga a la secuencia de referencia a la cual se
dice que corresponde.
Las expresiones "proteína recombinante",
"proteína heteróloga" y "proteína exógena" son utilizadas
de manera intercambiable dentro de toda la descripción y hacen
referencia a un polipéptido que es producido mediante técnicas de
DNA recombinante, en las que generalmente el DNA que codifica el
polipéptido es insertado en un adecuado constructo de expresión que
es a su vez usado para transformar una célula huésped para producir
la proteína heteróloga. Esto quiere decir que el polipéptido es
expresado desde un ácido nucleico heterólogo.
Una "proteína quimérica" o "proteína de
fusión" es una fusión de una primera secuencia de aminoácidos que
codifica un polipéptido hedgehog con una segunda secuencia
de aminoácidos que define un dominio que es foráneo y no
considerablemente homólogo con respecto a todo dominio de proteína
hh. Una proteína quimérica puede presentar un dominio
foráneo que se encuentra (si bien en una proteína distinta) en un
organismo que expresa también la primera proteína, o bien puede ser
una fusión "interespecies", "intergénica", etc. de
estructuras proteicas expresadas por distintas clases de
organismos. En general, una proteína de fusión puede ser
representada mediante la fórmula general
(X)_{n}-(hh)_{m}-(Y)_{n}, en la que
hh representa toda o una parte de la proteína erizo,
X e Y representan cada una independientemente una secuencia de
aminoácidos que no se encuentra de manera natural como cadena
polipeptídica contigua a la secuencia hedgehog, m es un
entero de más de 1 o igual a 1, y cada n es independientemente 0 o
un entero de más de 1 o igual a 1 (n y m son preferiblemente de no
más de 5 ó 10).
La invención tiene extensa aplicabilidad al
tratamiento o a la profilaxis de trastornos que afectan a tejido
epitelial, así como en aplicaciones cosméticas. En general, debe
administrarse a un animal una cantidad de un agente terapéutico
hedgehog que sea efectiva para alterar el estado proliferativo de
un tejido epitelial tratado. El modo de administración y los
regímenes de dosificación variarán en dependencia del tejido
epitelial o de los tejidos epiteliales que deba ser tratado o que
deban ser tratados. Por ejemplo, se preferirán las formulaciones
tópicas cuando el tejido tratado sea tejido epidérmico, tal como
tejidos dérmicos o mucosos. Análogamente, como se describe más
detalladamente más adelante, el uso de un determinado agente
terapéutico ptc o hedgehog, o sea p. ej. de un agonista o de un
antagonista, dependerá de si se desea o si se pretende impedir la
proliferación de células del tejido tratado.
Un método que "favorece la curación de una
herida" hace que como resultado del tratamiento la herida se cure
más rápidamente en comparación con la curación de una herida
similar en ausencia del tratamiento. La expresión "favorece la
curación de la herida" puede también significar que el método
ocasiona la proliferación y el crecimiento de, inter alia,
queratinocitos, o bien que la herida se cura con menor formación de
tejido cicatrizal, menor contracción de la herida, menor deposición
de colágeno y un área superficial más en superficie. En ciertos
casos, la expresión "favorecer la curación de una herida"
puede también significar que determinados métodos de curación de
heridas presentan mejorados porcentajes de éxito (como p. ej. los
porcentajes de aceptación de injertos cutáneos) al ser usados en la
presente invención.
Las complicaciones son un riesgo constante con
las heridas que no se han curado por completo y siguen abiertas. A
pesar de que las heridas se curan en su mayoría rápidamente sin
tratamiento, algunos tipos de heridas se resisten a la curación.
Las heridas que abarcan grandes áreas superficiales se mantienen
también abiertas por espacio de prolongados periodos de tiempo. En
una realización de la presente invención, el presente método puede
ser usado para favorecer la curación de heridas que afectan a
tejidos epiteliales, tal como el caso de las heridas resultantes de
cirugía, quemaduras, inflamación o irritación. Algunas de las
formulaciones que contienen agente terapéutico hedgehog (p. ej.
formas proliferativas) de la presente invención pueden ser también
aplicadas profilácticamente, tal como en forma de una preparación
cosmética, para activar procesos de regeneración tisular, p. ej. de
la piel, del pelo y/o de las uñas.
A pesar del considerable progreso de las técnicas
quirúrgicas reconstructivas, la formación de tejido cicatrizal
puede constituir un importante obstáculo para la recuperación de la
función y del aspecto normales de la piel curada. Esto es
particularmente cierto cuando una cicatrización patológica tal como
aquélla en la que se forman queloides o cicatrices hipertróficas en
las manos o en la cara ocasiona una discapacidad funcional o una
deformidad física. En las circunstancias más graves, una formación
de tejido cicatrizal de este tipo puede precipitar sufrimiento
psicosocial y una vida de privaciones económicas. La reparación de
heridas incluye las etapas de hemostasia, inflamación,
proliferación y remodelación. La etapa proliferativa supone la
multiplicación de fibroblastos y células endoteliales y
epiteliales. Mediante el uso de la invención, la velocidad de
proliferación de células epiteliales en la herida y proximalmente a
la misma puede ser controlada a fin de acelerar el cierre de la
herida y/o minimizar la formación de tejido cicatrizal.
Las quemaduras de espesor total y de espesor
parcial son un ejemplo de un tipo de herida que a menudo abarca
grandes áreas superficiales y por consiguiente requiere prolongados
periodos de tiempo para curarse. Como resultado de ello, a menudo
surgen complicaciones que constituyen una amenaza para la vida,
tales como infecciones y pérdidas de fluidos corporales. Además, en
el caso de las quemaduras la curación es a menudo desordenada y
redunda en cicatrización y desfiguración. En algunos casos la
contracción de las heridas debida a una excesiva deposición de
colágeno redunda en una reducida movilidad de los músculos en las
inmediaciones de la herida. Las composiciones de la presente
invención pueden ser usadas para acelerar la velocidad de curación
de quemaduras y para favorecer los procesos de curación, que
redundan entonces en unos resultados cosméticos más deseables y en
una menor contracción y cicatrización de las heridas.
Las quemaduras graves que abarcan grandes áreas
son a menudo tratadas mediante autoinjertos cutáneos tomados de
zonas no dañadas del cuerpo del paciente. La invención puede ser
también usada en conjunción con injertos cutáneos para mejorar las
velocidades de "prendimiento" del injerto a base de acelerar el
crecimiento tanto de la piel injertada como de la piel del paciente
que está junto al injerto.
Las úlceras dérmicas constituyen otro ejemplo
adicional de las heridas que se prestan al tratamiento mediante el
método que es objeto de la presente, p. ej. para ocasionar la
curación de la úlcera y/o para impedir que la úlcera se convierta en
una herida crónica. Por ejemplo, uno de cada siete individuos con
diabetes desarrolla en sus extremidades úlceras dérmicas que son
susceptibles de experimentar infección. Los individuos con úlceras
diabéticas infectadas a menudo requieren hospitalización, servicios
intensivos, antibióticos caros y, en algunos casos, amputación. Las
úlceras dérmicas tales como las resultantes de enfermedad venosa
(úlceras por estasis venosa) o de presión excesiva (úlceras por
decúbito) y las úlceras arteriales se resisten también a la
curación. Los tratamientos del estado de la técnica se limitan en
general a mantener la herida protegida y libre de infección y, en
algunos casos, a restablecer el flujo sanguíneo mediante cirugía
vascular. Según el presente método, la zona afligida de la piel
puede ser tratada mediante una terapia que incluye un agente
terapéutico hedgehog que favorece la epitelización de la
herida, acelerando p. ej. la velocidad de curación de las úlceras
cutáneas.
El presente tratamiento puede ser también
efectivo como parte de un régimen terapéutico para tratar úlceras
orales y paraorales resultantes p. ej. de radiación y/o
quimioterapia. Tales úlceras se desarrollan comúnmente dentro de un
periodo de tiempo de unos días después de la quimioterapia o
radioterapia. Estas úlceras comienzan habitualmente como pequeñas
lesiones dolorosas y de forma irregular que están habitualmente
cubiertas por una delicada membrana necrótica gris y rodeadas por
tejido inflamatorio. En muchos casos, la ausencia de tratamiento
redunda en una proliferación de tejido en torno a la periferia de
la lesión sobre una base inflamatoria. Por ejemplo, el epitelio que
bordea la úlcera manifiesta habitualmente actividad proliferativa,
redundando en una pérdida de continuidad del epitelio superficial.
Debido a su tamaño y a la pérdida de la integridad epitelial, estas
lesiones conducen a posibles infecciones secundarias en el cuerpo.
La ingestión rutinaria de alimento y agua pasa a ser un evento muy
doloroso, y, si las úlceras proliferan en todo el conducto
alimentario, se evidencia habitualmente diarrea con todos sus
factores de complicación. Según la presente invención, un
tratamiento para tales úlceras que incluye la aplicación de un
agente terapéutico hedgehog puede reducir la proliferación y
diferenciación anormal del epitelio afectado, ayudando a reducir la
gravedad de los subsiguientes eventos inflamatorios.
En otro ejemplo de realización, la invención
permite tratar o prevenir enfermedades gastrointestinales. Dicho
brevemente, las de una amplia variedad de enfermedades están
asociadas a la desorganización del epitelio o las vellosidades
gastrointestinales, estando incluidas entre dichas enfermedades la
enteritis (es decir, toxicidad intestinal) y mucositis inducida por
quimioterapia y radioterapia, la enfermedad de la úlcera péptica,
la gastroenteritis y la colitis, los trastornos atróficos de la
vellosidad, y enfermedades similares. Por ejemplo, los agentes
quimioterapéuticos y la radioterapia que son usados en el
trasplante de médula ósea y en la terapia contra el cáncer afectan
las células de proliferación rápida tanto en los tejidos
hematopoyéticos como en el intestino delgado, dando lugar a graves
toxicidades que a menudo obligan a limitar la dosis. Los daños en
la barrera mucosa del intestino delgado redundan en graves
complicaciones de hemorragia y sepsis. La invención puede ser usada
para favorecer la proliferación del epitelio gastrointestinal e
incrementar con ello las dosis toleradas para la radiación y los
agentes de quimioterapia. El eficaz tratamiento de las enfermedades
gastrointestinales puede ser determinado mediante varios criterios,
incluyendo una puntuación de la enteritis y otras pruebas que son
perfectamente conocidas en la técnica.
Las composiciones pueden ser también usadas para
tratar heridas resultantes de enfermedades dermatológicas tales como
lesiones resultantes de trastornos autoinmunes tales como la
psoriasis. La expresión "dermatitis atópica" se refiere a
trauma cutáneo resultante de alergias asociadas a una respuesta
inmune ocasionada por alergenos tales como pólenes, comestibles,
caspa, venenos de insectos y toxinas vegetales.
Con la edad, la epidermis se adelgaza y los
apéndices cutáneos se atrofian. El pelo escasea y las secreciones
sebáceas disminuyen, siendo consecuencia de ello una susceptibilidad
a la sequedad, agrietamiento y fisuración. La dermis disminuye con
la pérdida de fibras elásticas y de colágeno. Además, la
proliferación de queratinocitos (que es indicativa del espesor de
la piel y de la capacidad proliferativa de la piel) disminuye con
la edad. Se cree que un incremento de la proliferación de
queratinocitos contrarresta el envejecimiento de la piel, es decir
la formación de arrugas, dando lugar a un incremento del espesor y
de la elasticidad de la piel y a una reparación de la misma. Según
la presente invención, una forma proliferativa de un agente
terapéutico hedgehog puede ser usada ya sea terapéuticamente
o bien cosméticamente para contrarrestar, al menos por espacio de
un periodo de tiempo, los efectos del envejecimiento en la piel.
La invención puede ser también usada en el
tratamiento de una herida de tejido ocular. En general, un daño
infligido a tejido corneal, ya sea por enfermedad o bien debido a
cirugía o a una lesión, puede afectar a células epiteliales y/o
endoteliales, en dependencia de la naturaleza de la herida. Las
células epiteliales corneales son las células epiteliales no
queratinizadas que revisten la superficie externa de la córnea y
proporcionan una barrera protectora contra el ambiente externo. La
curación de las heridas corneales ha venido preocupando tanto a los
clínicos como a los investigadores. Los oftalmólogos se enfrentan
frecuentemente a distrofias y problemáticas lesiones corneales que
redundan en erosión epitelial persistente y recurrente, que a
menudo conduce a una pérdida endotelial permanente. El uso de
formas proliferativas de los agentes terapéuticos hedgehog que son
objeto de la presente puede servir en estos casos para favorecer la
epitelización del tejido corneal afectado.
En calidad de adicional ilustración, los
trastornos específicos que van típicamente asociados a los daños de
células epiteliales en el ojo y para los cuales el método que es
objeto de la presente puede aportar un tratamiento beneficioso
incluyen los defectos epiteliales corneales persistentes, las
erosiones recurrentes, las úlceras corneales neurotróficas, la
queratoconjuntivitis seca, las úlceras corneales microbianas, las
úlceras corneales virales y trastornos similares. Los procedimientos
quirúrgicos que típicamente ocasionan lesiones en las capas
celulares epiteliales incluyen los procedimientos con láser
efectuados en la superficie ocular, los procedimientos quirúrgicos
refractivos de cualquier tipo tales como la queratotomía radial y
la queratotomía astigmática, los colgajos conjuntivales, los
trasplantes conjuntivales, la epiquetaroplastia y el raspado
corneal. Además, las heridas superficiales tales como rasguños,
erosión superficial, inflamación, etc. pueden ocasionar pérdida de
células epiteliales. Según la presente invención, el epitelio
corneal debe ser puesto en contacto con una cantidad de un agente
terapéutico hedgehog que sea efectiva para ocasionar una
proliferación de las células epiteliales corneales para curar
adecuadamente la herida.
En otras realizaciones, preparaciones
antiproliferativas de agentes terapéuticos hedgehog pueden ser
usadas para inhibir la proliferación de células epiteliales
lenticulares para prevenir las complicaciones
post-operatorias de la extracción de cataratas
extracapsulares. La catarata es una enfermedad ocular intratable, y
se han hecho varios estudios sobre un tratamiento de la catarata.
Sin embargo, en la actualidad el tratamiento de la catarata se
logra mediante operaciones quirúrgicas. La cirugía de las cataratas
ha venido siendo aplicada durante mucho tiempo, y han sido
examinados varios métodos operatorios. La extracción extracapsular
del cristalino ha llegado a ser el método preferido para retirar
las cataratas. Las principales ventajas médicas de esta técnica en
comparación con la extracción intracapsular son las consistentes en
una menor incidencia de edema macular cistoide afáquico y de
desprendimiento de la retina. La extracción extracapsular es
también necesaria para la implantación de lentes intraoculares del
tipo de las de cámara posterior, que son en la actualidad las que
se considera que son preferibles en la mayoría de los casos.
Sin embargo, una desventaja de la extracción
extracapsular de la catarata es la consistente en la alta incidencia
de opacificación de la cápsula lenticular posterior, a la que a
menudo se llama catarata secundaria, que puede producirse en hasta
un 50% de casos dentro de un periodo de tres años después de la
cirugía. La catarata secundaria es ocasionada por una proliferación
de células epiteliales lenticulares de la cápsula ecuatorial y
anterior que quedan después de la extracción extracapsular del
cristalino. Estas células proliferan dando lugar a anillos de
Soemmering, y junto con fibroblastos que también se depositan y se
presentan en la cápsula posterior, ocasionan opacificación de la
cápsula posterior, la cual interfiere en la visión. La prevención de
la catarata secundaria sería preferible al tratamiento. Para
inhibir la formación de la catarata secundaria, el presente método
aporta unos medios para inhibir la proliferación de las células
epiteliales lenticulares restantes. Por ejemplo, puede inducirse a
tales células a que permanezcan quiescentes a base de instilar una
solución que contenga una preparación con agente terapéutico
hedgehog o ptc antiproliferativo al interior de la cámara anterior
del ojo tras la remoción del cristalino. Además, la solución puede
estar osmóticamente equilibrada para lograr una mínima dosificación
efectiva cuando se la instile al interior de la cámara anterior del
ojo, inhibiendo con ello el crecimiento epitelial subcapsular con
cierta especifidad.
La invención puede ser también usada en el
tratamiento de corneopatías marcadas por una proliferación de
células epiteliales corneales, como sucede por ejemplo en el caso
de trastornos epiteliales oculares tales como el decrecimiento
epitelial o los carcinomas de las células escamosas de la
superficie ocular.
Es también muy deseable el mantenimiento de
tejidos y órganos ex vivo. La terapia de sustitución tisular
está perfectamente establecida en el tratamiento de las
enfermedades humanas. Por ejemplo, en los Estados Unidos fueron
llevados a cabo en 1996 más de 40.000 trasplantes de córnea. Las
células epidérmicas humanas pueden ser cultivadas in vitro y
usadas para poblar sitios de quemaduras y úlceras cutáneas crónicas
y otras heridas dérmicas. La invención puede ser usada para
acelerar el crecimiento de tejido epitelial in vitro, así
como para acelerar el injerto del tejido epitelial cultivado en un
huésped animal.
La invención puede ser usada para mejorar la
"velocidad de prendimiento" de un injerto cutáneo. Si la
velocidad con la que prende el injerto es demasiado baja, los
injertos de tejido epidérmico pueden ampollarse y cortarse, con lo
cual disminuirá la probabilidad de que el autoinjerto
"prenda", es decir se adhiera a la herida y forme una membrana
basal con el tejido de granulación subyacente. Las velocidades con
las que prenden los injertos pueden ser incrementadas mediante el
presente método a base de inducir una proliferación de los
queratinocitos. El método para incrementar las velocidades de
prendimiento de los injertos comprende el paso de poner al
autoinjerto cutáneo en contacto con una cantidad efectiva para la
curación de heridas de una composición con contenido de agente
terapéutico hedgehog descrita en el método para favorecer la
curación de heridas y en el método para favorecer el crecimiento y
la proliferación de queratinocitos, como se ha descrito
anteriormente.
Los equivalentes de la piel tienen muchos usos no
tan sólo como sustitutos de la piel humana o animal para los
injertos cutáneos, sino también como piel de ensayo para determinar
los efectos de sustancias farmacéuticas y cosméticos en la piel. Una
dificultad importante en las pruebas farmacológicas, químicas y
cosméticas es la consistente en las dificultades que se tienen para
determinar la eficacia y la seguridad de los productos sobre la
piel. Una ventaja de los equivalentes de piel de la invención es la
que radica en su uso como indicador de los efectos que son
producidos por tales sustancias mediante pruebas in vitro
sobre piel de ensayo.
Así, en una realización la invención puede ser
usada para efectuar injertos cutáneos p. ej. en zonas denudadas y
en heridas y quemaduras granulantes. El uso de agentes terapéuticos
hedgehog proliferativos puede servir para mejorar técnicas de
injerto tales como los autoinjertos de espesor parcial y los
autoinjertos epidérmicos (queratinocitos autogénicos cultivados) y
los aloinjertos epidérmicos (queratinocitos alogénicos cultivados).
En el caso del aloinjerto, la activación de la formación de
equivalentes de piel en cultivo ayuda a procurar/mantener unas
provisiones disponibles de tales injertos (p. ej. en bancos de
tejidos) para que los pacientes puedan ser cubiertos en un solo
procedimiento con un material que permita que se produzca una
curación permanente.
A este respecto, la presente invención se refiere
también a equivalentes de piel vivientes compuestos que comprenden
una capa epidérmica de queratinocitos cultivados que han sido
expandidos mediante tratamiento con un agente terapéutico hedgehog
o con otro agente terapéutico ptc. La invención puede ser usada para
la preparación de equivalentes de piel vivientes compuestos. Una
realización ilustrativa comprende los pasos de obtener una muestra
de piel; tratar la muestra de piel enzimáticamente para separar la
epidermis de la dermis; tratar la epidermis enzimáticamente para
liberar los queratinocitos; cultivar, en presencia de un agente
terapéutico hedgehog, los queratinocitos epidérmicos hasta su
confluencia ya sea en paralelo o bien por separado; tratar la dermis
enzimáticamente para liberar los fibroblastos; cultivar los
fibroblastos hasta la subconfluencia; inocular una membrana porosa
de esponja de colágeno reticulado con los fibroblastos cultivados;
incubar la espuma de colágeno inoculado en su superficie para
permitir el crecimiento de los fibroblastos en toda la esponja de
colágeno; e inocularla entonces con queratinocitos cultivados; e
incubar adicionalmente el complejo equivalente de piel compuesto en
presencia de un agente terapéutico hedgehog para promover el
crecimiento de las células.
En otras realizaciones, láminas de piel que
contienen capas tanto epiteliales como mesenquimáticas pueden ser
aisladas en cultivo y expandidas con medio de cultivo suplementado
con una forma proliferativa de un agente terapéutico hedgehog.
Según la presente invención puede usarse toda
muestra de piel que se preste a ser sometida a las técnicas de
cultivo celular. Las muestras de piel pueden ser autogénicas o
alogénicas.
En otro aspecto de la invención, la misma puede
ser usada en conjunción con varios procedimientos periodontales en
los que se desee un control de la proliferación de células
epiteliales en tejido periodontal y en torno al mismo.
En una realización, pueden usarse formas
proliferativas de los agentes terapéuticos hedgehog para activar la
reepitelización en torno a dientes naturales y protésicos, p. ej.
para promover la formación de tejido gingival.
Con respecto al tratamiento de la enfermedad
periodontal, se estima que solamente en los Estados Unidos hay más
de 125 millones de adultos con enfermedad periodontal de distintas
formas. La enfermedad periodontal comienza en forma de lesiones
inflamatorias que se deben a bacterias específicas que se localizan
en la zona en la que la encía se une al diente. Lo primero que
habitualmente se produce es un cambio vascular en el tejido
conectivo subyacente. La inflamación del tejido conectivo estimula
los siguientes cambios en el revestimiento epitelial del sulcus y
en la unión epitelial: incrementada actividad mitótica en la capa
epitelial basal; incrementada producción de queratina con
descamación; descamación celular junto a la superficie del diente,
que tiende a hacer profunda la bolsa; células epiteliales de la
capa basal en el fondo del sulcus y en la zona de unión proliferan
al interior del tejido conectivo y comienza a producirse rotura de
las fibras gingivales, redundando la disolución del tejido
conectivo en la formación de una lesión abierta. La aplicación de
preparaciones con agente terapéutico hedgehog al periodoncio puede
ser usada para inhibir la proliferación de tejido epitelial e
impedir así que prosiga el desarrollo de la periodontoclasia.
En otro aspecto adicional, la invención puede ser
usada para ayudar a controlar la regeneración tisular guiada, tal
como cuando se la usa en conjunción con materiales
biorreabsorbibles. Por ejemplo, puede ser facilitada por el presente
método la incorporación de implantes periodontales tales como
dientes prostéticos. La nueva unión de un diente supone tanto la
formación de fibras de tejido conectivo como la reepitelización de
la bolsa dental. El método/tratamiento que es objeto de la presente
puede ser usado para acelerar la nueva unión tisular a base de
controlar la función mitótica de las células epiteliales basales en
las primeras etapas de curación de la herida.
Otro aspecto adicional de la presente invención
se refiere al uso de preparaciones con agente terapéutico hedgehog
para la preparación de un medicamento para controlar el crecimiento
del pelo. El pelo se compone básicamente de queratina, que es una
proteína resistente e insoluble, radicando su principal fortaleza en
su enlace disulfuro de cistina. Cada pelo individual comprende un
cuerpo cilíndrico y una raíz, y está contenido en un folículo, que
es una depresión tipo matraz en la piel. El fondo del folículo
contiene un saliente del tipo de un dedo al que se llama papila, que
consta de tejido conectivo desde el cual crece el pelo y a través
del cual los vasos sanguíneos suministran nutrición a las células.
El cuerpo es la parte que se extiende hacia el exterior desde la
superficie de la piel, mientras que la raíz ha sido descrita como la
parte enterrada del pelo. La base de la raíz se expande formando el
bulbo piloso, que descansa sobre la papila. Las células a partir de
las cuales el pelo es producido crecen en el bulbo del folículo y
son extrusionadas en forma de fibras a medida que las células
proliferan en el folículo. La expresión "crecimiento del pelo"
se refiere a la formación y al alargamiento de la fibra capilar que
son efectuados por las células que se dividen.
Como es perfectamente conocido en la técnica, el
ciclo del pelo común se divide en las tres fases siguientes:
anágeno, catágeno y telógeno. Durante la fase activa (anágeno), las
células troncales epidérmicas de la papila dérmica se dividen
rápidamente. Las células hijas se desplazan hacia arriba y se
diferencian para formar las capas concéntricas del propio pelo. La
fase de transición, llamada catágeno, está marcada por el cese de
la mitosis de las células troncales en el folículo. La fase de
reposo es conocida como telógeno, y en esta fase el pelo es
retenido en el cuero cabelludo durante varias semanas antes de que
un nuevo pelo emergente que se desarrolla debajo del mismo desaloje
de su folículo al cuerpo que se encuentra en la fase de telógeno. A
la luz de este modelo ha quedado claro que cuanto mayor es el
conjunto de células troncales que se dividen y se diferencian en
células de pelo, tanto más crecimiento del pelo se produce. En
consecuencia, pueden ser ejecutados métodos para incrementar o
reducir el crecimiento del pelo a base de potenciar o inhibir,
respectivamente, la proliferación de estas células troncales.
En una realización, la invención aporta unos
medios para alterar la dinámica del ciclo de crecimiento del pelo
para inducir la proliferación de células del folículo piloso, y en
particular de células troncales del folículo piloso. Las
composiciones que son objeto de la presente pueden ser usadas para
incrementar el tamaño del folículo piloso y la velocidad de
crecimiento del pelo en los animales de sangre caliente, tales como
los humanos, p. ej. a base de promover la proliferación de células
troncales del folículo piloso. Esto se hace a base de administrar a
la piel en la zona en la cual se desea el crecimiento del pelo una
cantidad de agente terapéutico hedgehog suficiente para incrementar
el tamaño del folículo piloso y/o la velocidad de crecimiento del
pelo en el animal. Típicamente, la composición será administrada
tópicamente en forma de crema, y será aplicada diariamente hasta
que se observe crecimiento del pelo y a continuación por espacio de
un periodo de tiempo suficiente para mantener la deseada cantidad
de crecimiento del pelo. Este método puede tener aplicaciones en la
promoción del crecimiento de nuevo cabello o en la estimulación de
la velocidad de crecimiento del cabello, p. ej. a continuación de
tratamiento quimioterapéutico o bien para tratar varias formas de
alopecia, como p. ej. la alopecia de distribución masculina. Por
ejemplo, uno de los varios trastornos bioquímicos celulares y
moleculares que se producen durante la fase de anágeno o la fase de
catágeno en los individuos con alopecia androgénica puede ser
corregido o mejorado mediante tratamiento usando el método que es
objeto de la presente, p. ej. en el funcionamiento o en la
formación de las células troncales, en su proceso de migración o
durante la fase de mitosis de la producción de queratina dentro de
la matriz y papila folicular.
En otras realizaciones, algunos de los agentes
terapéuticos hedgehog (como p. ej. formas antiproliferativas)
pueden ser empleados como una manera de reducir el crecimiento del
pelo humano en oposición a su remoción convencional mediante corte,
afeitado o depilación. Por ejemplo, la invención puede ser usada en
el tratamiento de tricosis caracterizada por un crecimiento
anormalmente rápido o denso del pelo, como es p. ej. el caso de la
hipertricosis. En un ejemplo de realización, pueden usarse
antagonistas para hedgehog para tratar el hirsutismo, que es un
trastorno que está marcado por una vellosidad anormal. El método de
la invención puede también permitir prolongar la duración de la
depilación.
Además, debido al hecho de que un antagonista
para hedgehog será a menudo citostático para las células
epiteliales, en lugar de citotóxico, tales agentes pueden ser
usados para proteger las células del folículo piloso contra los
agentes citotóxicos que requieren el paso a la fase S del ciclo
celular para tener eficacia, como es p. ej. el caso de la muerte
inducida por radiación. El tratamiento puede proporcionar protección
haciendo que las células del folículo piloso devengan quiescentes,
p. ej. a base de inhibir a las células para que no entren en la
fase S, impidiendo con ello que las células foliculares experimenten
catástrofe mitótica o muerte celular programada. Por ejemplo, los
antagonistas para hedgehog pueden ser usados para pacientes
sometidos a quimioterapias o radioterapias, que de ordinario
redundan en una pérdida del cabello. Al inhibir la progresión del
ciclo celular durante tales terapias, el tratamiento que es objeto
de la presente puede proteger a las células del folículo piloso
contra una muerte que podría de otro modo resultar de la activación
de programas de muerte celular. Tras haber concluido la terapia,
puede también retirarse el tratamiento con agente terapéutico
hedgehog, con una concomitante cesación de la inhibición de la
proliferación de las células foliculares.
La invención puede ser también usada en el
tratamiento de foliculitis tales como la foliculitis decalvante, la
foliculitis uleritematosa reticulada o la foliculitis queloidea.
Por ejemplo, una preparación cosmética de un agente terapéutico
hedgehog puede ser aplicada tópicamente en el tratamiento de la
seudofoliculitis, que es un trastorno crónico que se produce en la
mayoría de los casos en la región submandibular del cuello y está
asociado al afeitado, siendo las lesiones características del mismo
pústulas y pápulas eritematosas que contienen pelos enterrados.
En otro aspecto de la invención, formas
antiproliferativas de los agentes terapéuticos hedgehog que
son objeto de la presente pueden ser usadas para inducir la
diferenciación de tejido de origen epitelial. Tales formas de estas
moléculas pueden proporcionar una base para una terapia de
diferenciación para el tratamiento de trastornos hiperplásicos y/o
neoplásicos que afecten a tejido epitelial. Por ejemplo, tales
preparaciones pueden ser usadas para el tratamiento de enfermedades
cutáneas en las cuales hay una proliferación anormal o un
crecimiento anormal de células de la piel.
Por ejemplo, las preparaciones farmacéuticas de
la invención están destinadas al tratamiento de afecciones
epidérmicas hiperplásicas tales como la queratosis, así como al
tratamiento de afecciones epidérmicas neoplásicas tales como las
caracterizadas por una alta velocidad de proliferación para varios
cánceres cutáneos, como es por ejemplo el carcinoma de células
basales o el carcinoma de células escamosas. La invención puede ser
también usada en el tratamiento de enfermedades autoinmunes que
afectan a la piel, y en particular de enfermedades dermatológicas
que suponen una proliferación y/o queratinización mórbida de la
epidermis, como es por ejemplo la ocasionada por psoriasis o
dermatosis atópica.
Muchas enfermedades comunes de la piel, tales
como la psoriasis, el carcinoma de células escamosas, el
queratoacantoma y la queratosis actínica, están caracterizadas por
una proliferación y un crecimiento anormales localizados. Por
ejemplo, en la psoriasis, que está caracterizada por placas rojas
escamosas elevadas sobre la piel, se sabe que los queratinocitos
proliferan mucho más rápidamente de lo normal y se diferencian
menos completamente.
En una realización, las preparaciones de la
presente invención son adecuadas para el tratamiento de dolencias
dermatológicas ligadas a trastornos de queratinización que
ocasionan proliferación anormal de células cutáneas, pudiendo estar
dichos trastornos marcados por componentes inflamatorios o no
inflamatorios. Para ilustrar esto, preparaciones terapéuticas que
promueven la quiescencia o diferenciación pueden ser usadas para
tratar varias formas de psoriasis, ya sean cutáneas, mucosas o
ungulares. Como se ha descrito anteriormente, la psoriasis está
típicamente caracterizada por queratinocitos epidérmicos que
exhiben marcada diferenciación y activación proliferativa por una
vía "regenerativa". El tratamiento con una realización
antiproliferativa del método que es objeto de la presente puede ser
usado para invertir la activación epidérmica patológica y puede
constituir una base para una remisión sostenida de la
enfermedad.
Las de una variedad de otras lesiones
queratósicas son también candidatas al tratamiento con las
preparaciones antiproliferativas que son objeto de la presente. Las
queratosis actínicas, por ejemplo, son tumores premalignos
inflamatorios superficiales que surgen en piel irradiada y que ha
sufrido exposición al sol. Las lesiones son de eritematosas a
marrones con escamación variable. Las terapias actuales incluyen
procedimientos escisionales y criocirugía. Estos tratamientos son
dolorosos, sin embargo, y a menudo producen una cicatrización
cosméticamente inaceptable. En consecuencia, el tratamiento de
queratosis tales como la queratosis actínica puede incluir una
aplicación, preferiblemente tópica, de una composición en
cantidades suficientes para inhibir la hiperproliferación de
células epidérmicas/epidermoides de la lesión.
El acné representa otra dolencia dermatológica
adicional que puede ser tratada con una realización
antiproliferativa del método que es objeto de la presente. El acné
vulgar, por ejemplo, es una enfermedad multifactorial que por lo
común se da en la mayoría de los casos en adolescentes y adultos
jóvenes y está caracterizada por la aparición de lesiones
inflamatorias y no inflamatorias en la cara y en el tronco superior.
El defecto básico que da lugar a la acné vulgar es la
hipercornificación del conducto de una glándula sebácea
hiperactiva. La hipercornificación bloquea la movilidad normal de
los microorganismos cutáneos y foliculares, y al hacerlo estimula
la liberación de lipasas por bacterias Propinobacterium
acnes y Staphylococcus epidermidis y por Pitrosporum
ovale, que es una levadura. El tratamiento con una forma
antiproliferativa de un agente terapéutico hedgehog, y
particularmente con preparaciones tópicas, puede ser útil para
prevenir las características transicionales de los conductos, como
p. ej. la hipercornificación, que conducen a la formación de la
lesión. El tratamiento puede incluir adicionalmente, por ejemplo,
antibióticos, retinoides y antiandrógenos.
La presente invención permite también tratar
varias formas de dermatitis. El vocablo "dermatitis" es un
vocablo descriptivo que se refiere a lesiones mal demarcadas que
son pruríticas, eritematosas, escamosas, vesiculadas, supurantes,
fisuradas o encostradas. Estas lesiones surgen debido a
cualesquiera de las de una amplia variedad de causas. Los tipos más
comunes de dermatitis son la dermatitis atópica, la dermatitis por
contacto y la dermatitis por pañales. Por ejemplo, la dermatitis
seborreica es una dermatitis crónica habitualmente prurítica con
eritema, escamación seca, húmeda o grasienta y partes amarillas
encostradas en varias zonas, especialmente en el cuero cabelludo,
con exfoliación de una cantidad excesiva de escamas secas, y la
dermatitis por estasis es una dermatitis a menudo crónica y
habitualmente eccematosa. La dermatitis actínica es la dermatitis
que sobreviene debido a una exposición a radiación actínica tal como
la del sol, las ondas ultravioleta o la radiación x o gamma. Según
la presente invención, las preparaciones con agente terapéutico
hedgehog que son objeto de la presente pueden ser usadas en el
tratamiento y/o la prevención de determinados síntomas de dermatitis
ocasionada por una indeseada proliferación de células epiteliales.
Tales terapias para estas varias formas de dermatitis pueden
también incluir corticosteroides, agentes antipruriginosos y
antibióticos tópicos y sistémicos.
Están también incluidos en las dolencias que
pueden ser tratadas trastornos específicos de no humanos, tales como
la sarna.
Las composiciones con agente terapéutico
hedgehog del método que es objeto de la presente pueden ser
generadas mediante cualesquiera de las de una variedad de técnicas,
entre las que se incluyen las de purificación de proteínas que se
dan de manera natural, la producción de proteínas producidas por
vía recombinante y la química sintética. Las formas polipeptídicas
de los agentes terapéuticos hedgehog se sacan preferiblemente de
proteínas erizo de vertebrados y tienen p. ej. secuencias que
corresponden a proteínas erizo que se dan de manera natural, o a
fragmentos de las mismas, de organismos vertebrados. Sin embargo,
se comprenderá que el polipéptido hedgehog puede corresponder a una
proteína erizo (o a un fragmento de la misma) que se dé en cualquier
organismo del subreino Metazoa.
Las diversas proteínas hedgehog (erizo)
que se dan de manera natural y de las cuales pueden sacarse los
agentes terapéuticos que son objeto de la presente están
caracterizadas por un péptido señal, una región
N-terminal altamente conservada, y un dominio
C-terminal más divergente. Además de la escisión de
la secuencia señal en la vía secretoria (Lee, J.J. et al.
(1992) Cell 71:33-50; Tabata, T. et
al. (1992) Genes Dev. 2635-2645; Chang,
D.E. et al. (1994) Development
120:3339-3353), las proteínas precursoras de
hedgehog experimentan de manera natural una fragmentación
autoproteolítica interna que depende de secuencias conservadas en
la parte C-terminal (Lee et al. (1994)
Science 266:1528-1537; Porter et al.
(1995) Nature 374:363-36). Esta
autofragmentación conduce a un péptido N-terminal
de 19 kD y a un péptido C-terminal de
26-28 kD (Lee et al. (1992) supra;
Tabata et al. (1992) supra; Chang et al. (1994)
supra; Lee et al. (1994) supra; Bumcrot, D.A.,
et al. (1995) Mol. Cel. Biol.
15:2294-2303; Porter et al. (1995)
supra; Ekker, S.C., et al. (1995) Curr. Biol.
5:994-955; Lai, C.J. et al. (1995)
Development 121:2349-2360). El péptido
N-terminal se mantiene estrechamente asociado a la
superficie de las células en las cuales fue sintetizado, mientras
que el péptido C-terminal es libremente difusible
tanto in vitro como in vivo (Lee et al. (1994)
supra; Bumcrot et al. (1995) supra; Mart', E.
et al. (1995) Development
121:2537-2547; Roelink, H. et al. (1995)
Cell 81:445-455). La retención en la
superficie de la célula del péptido N-terminal es
dependiente de la autofragmentación, al ser difusible in
vitro (Porter et al. (1995) supra) e in
vivo (Porter, J.A. et al. (1996) Cell 86,
21-34) una forma truncada de hedgehog
codificada por un RNA que termina precisamente en la posición normal
de fragmentación interna. Estudios bioquímicos han demostrado que
la fragmentación autoproteolítica de la proteína precursora de
hedgehog tiene lugar pasando por un intermedio tioéster
interno que a continuación es fragmentado en una sustitución
nucleofílica. Se sugiere que el nucleófilo es una pequeña molécula
lipofílica, y más en particular colesterol, que queda fijado
mediante enlace covalente al extremo C-terminal del
N-péptido (Porter et al. (1996)
supra), atándolo a la superficie de la célula.
La familia de los vertebrados de los genes
hedgehog incluye al menos cuatro miembros p. ej. paralogos
del único gen hedgehog de drosophila (ID SEC Nº 19).
Tres de estos miembros, a los que aquí se alude como Desert
hedgehog (Dhh), Sonic hedgehog (Shh) e Indian
hedgehog (Ihh), existen aparentemente en todos los
vertebrados, incluyendo los peces, los pájaros y los mamíferos. Un
cuarto miembro, al que aquí se alude como
tiggie-winkle hedgehog (Thh), parece ser
específico de los peces. Según el listado de secuencias adjunto
(véase también la Tabla 1), un polipéptido Shh de pollo es
codificado por la ID SEC Nº: 1; un polipéptido Dhh de ratón
es codificado por la ID SEC Nº: 2; un polipéptido Ihh de
ratón es codificado por la ID SEC Nº: 3; un polipéptido Shh
de ratón es codificado por la ID SEC Nº: 4; un polipéptido
Shh de pez cebra es codificado por la ID SEC Nº: 5; un
polipéptido Shh humano es codificado por la ID SEC Nº: 6; un
polipéptido Ihh humano es codificado por la ID SEC Nº: 7; un
polipéptido Dhh humano es codificado por la ID SEC Nº: 8; y
un Thh de pez cebra es codificado por la ID SEC Nº: 9.
Nucleótido | Aminoácido | |
Shh de pollo | ID SEC Nº 1 | ID SEC Nº 10 |
Dhh de ratón | ID SEC Nº 2 | ID SEC Nº 11 |
Ihh de ratón | ID SEC Nº 3 | ID SEC Nº 12 |
Shh de ratón | ID SEC Nº 4 | ID SEC Nº 13 |
Shh de pez cebra | ID SEC Nº 5 | ID SEC Nº 14 |
Shh humano | ID SEC Nº 6 | ID SEC Nº 15 |
Ihh humano | ID SEC Nº 7 | ID SEC Nº 16 |
Dhh humano | ID SEC Nº 8 | ID SEC Nº 17 |
Thh de pez cebra | ID SEC Nº 9 | ID SEC Nº 18 |
HH de Drosophila | ID SEC Nº 19 | ID SEC Nº 20 |
Además de la variación de secuencia entre los
varios homólogos de hedgehog, las proteínas hedgehog
están al parecer presentes de manera natural en una serie de
distintas formas entre las que se incluyen una
pro-forma, una forma madura de plena longitud y
varios fragmentos elaborados de las mismas. La
pro-forma incluye un péptido señal
N-terminal para la secreción dirigida del dominio
extracelular, mientras que la forma madura de plena longitud carece
de esta secuencia señal.
Como se ha descrito anteriormente, en algunos
casos tiene lugar un adicional procesamiento de la forma madura para
producir fragmentos biológicamente activos de la proteína. Por
ejemplo, el sonic hedgehog experimenta procesamiento
proteolítico adicional para producir dos péptidos de aproximadamente
19 kDa y 27 kDa, correspondiendo el fragmento de 19 kDa a una parte
N-terminal proteolítica de la proteína madura.
Además de la fragmentación proteolítica, las
proteínas hedgehog de vertebrados pueden ser también
modificadas post-translacionalmente, tal como por
glicosilación y/o adición de mitades lipofílicas tales como ésteres,
ácidos grasos, etc., si bien las formas producidas bacterianamente
(p. ej. no modificadas) de las proteínas siguen manteniendo algunas
de las bioactividades de la proteína nativa. Han sido generados y
están descritos en gran detalle p. ej. en las publicaciones al
amparo del PCT WO 95/18856 y WO 96/17924 fragmentos bioactivos de
polipéptidos hedgehog de la presente invención.
Hay una amplia gama de mitades lipofílicas con
las cuales pueden ser derivatizados polipéptidos hedgehog. En el
contexto de estar unido a un polipéptido hedgehog, la expresión
"grupo lipofílico" se refiere a un grupo que tiene un alto
contenido de hidrocarburo que le da al grupo una alta afinidad para
con fases lípidas. Un grupo lipofílico puede ser, por ejemplo, un
grupo alquilo o cicloalquilo (preferiblemente
n-alquilo) de cadena relativamente larga que tenga
aproximadamente de 7 a 30 carbonos. El grupo alquilo puede terminar
con una "cola" hidroxi o amina primaria. Como adicional
ilustración, las moléculas lipofílicas incluyen mitades aromáticas y
no aromáticas sintéticas y naturales tales como ácidos grasos,
esteroles, ésteres y alcoholes, otras moléculas lípidas,
estructuras tipo jaula tales como adamantano y
buckminsterfullerenos, e hidrocarburos aromáticos tales como
benceno, perileno, fenantreno, antraceno, naftaleno, pireno,
criseno y naftaceno.
En una realización, el polipéptido hedgehog es
modificado con una o varias mitades de esterol, tal como
colesterol. Véase, por ejemplo, la publicación al amparo del PCT WO
96/17924. En ciertas realizaciones, el colesterol es preferiblemente
añadido a la glicina C-terminal cuando el
polipéptido hedgehog corresponde al fragmento proteolítico
N-terminal que se da de manera natural.
En otra realización, el polipéptido hedgehog
puede ser modificado con una mitad de ácido graso tal como una mitad
de miristoilo, palmitoilo, estearoilo o araquidoilo. Véase, p. ej.,
Pepinsky et al. (1998) J Biol. Chem 273: 14037.
Además de los efectos que se ven mediante la
adición de colesterol al C-terminus o mediante la adición de
ácidos grasos al N-terminus de fragmentos extracelulares de
la proteína, al menos algunas de las actividades biológicas de los
productos del gen hedgehog son inesperadamente potenciadas por la
derivatización de la proteína con mitades lipofílicas en otros
sitios en la proteína y/o por mitades que no son colesterol o ácidos
grasos. Determinados aspectos de la invención se refieren al uso de
preparaciones de polipéptidos hedgehog que están modificados en
sitios distintos de los residuos N-terminales o
C-terminales de la forma procesada natural de la
proteína, y/o que están modificados en tales residuos terminales
con mitades lipofílicas distintas de un esterol en el
C-terminus o con ácido graso en el N-terminus.
Son particularmente útiles como moléculas
lipofílicas hidrocarburos alicíclicos, ácidos grasos saturados e
insaturados y otras mitades lípidas y fosfolípidas, ceras,
colesterol, isoprenoides, terpenos e hidrocarburos polialicíclicos
incluyendo adamantano y buckminsterfullerenos, vitaminas,
polietilenglicol u oligoetilenglicol, diésteres de alquilfosfato
(de C1-C18),
-O-CH_{2}-CH(OH)-O-alquilo(de
C12-C18), y en particular conjugados con derivados
de pireno. La mitad lipofílica puede ser un colorante lipofílico
adecuado para ser usado en la invención e incluye, aunque sin
carácter limitativo, difenilhexatrieno, Rojo Nilo,
N-fenil-1-naftilamina,
Prodan, Laurodan, Pireno, Perileno, rodamina, rodamina B,
tetrametilrodamina, Rojo Texas, sulforrodamina,
1,1'-didodecil-3,3,3',3'tetrametilindocarbocianina
perclorato, octadecilrodamina B y los colorantes BODIPY que
suministra la Molecular Probes Inc.
Otros ejemplos de mitades lipofílicas incluyen
grupos radicales carbonilo alifático que incluyen 1- o
2-adamantilacetil,
3-metiladamant-1-ilacetil,
3-metil-3-bromo-1-adamantilacetil,
1-decalinacetil, canforacetil, canfanoacetil,
noradamantilacetil, norbornanoacetil,
biciclo[2.2.2.]-oct-5-enoacetil,
1-metoxibiciclo[2.2.2.]-oct-5-eno-2-carbonil,
cis-5-norborneno-endo-2,3-dicarbonil,
5-norbornen-2-ilacetil,
(1R)-( - )-mirtentanoacetil,
2-norbornanoacetil,
anti-3-oxo-triciclo[2.2.1.0<2,6>
]-heptano-7-carbonil,
decanoil, dodecanoil, dodecenoil, tetradecadienoil, decinoil o
dodecinoil.
El polipéptido hedgehog puede ser ligado a la
mitad hidrofóbica de una serie de maneras entre las que se incluyen
las de utilizar medios de acoplamiento químicos o bien ingeniería
genética.
Hay un gran número de agentes reticuladores
químicos que son conocidos para los expertos en la materia. Para la
presente invención, los agentes reticuladores preferidos son
reticuladores heterobifuncionales que pueden ser usados para ligar
el polipéptido hedgehog y la mitad hidrofóbica por pasos. Los
reticuladores heterobifuncionales proporcionan la posibilidad de
diseñar métodos de acoplamiento más específicos para una
conjugación a proteínas, reduciendo con ello las apariciones de
reacciones laterales indeseadas tales como las que producen
polímeros homoproteicos. Son conocidos en la técnica los de una
amplia variedad de reticuladores heterobifuncionales. Éstos incluyen
los siguientes: succinimidil 4-(N-maleimidometil)
ciclohexano-1-carboxilato (SMCC),
m-maleimidobenzoil-N-hidroxisuccinimida
éster (MBS); N-succinimidil
(4-yodoacetil) aminobenzoato (SIAB), succinimidil
4-(p-maleimidofenil) butirato (SMPB),
1-etil-3(3-dimetilaminopropil)
carbodiimida hidrocloruro (EDC);
4-succinimidiloxicarbonil-
a-metil-a-(2-piridilditio)-tolueno
(SMPT), N-succinimidil
3-(2-piridilditio) propionato (SPDP), succinimidil
6-[3-(2-piridilditio) propionato] hexanoato
(LC-SPDP). Los agentes reticuladores que tienen
mitades de N-hidroxisuccinimida pueden ser obtenidos
como los análogos de N-hidroxisulfosuccinimida, que
tienen en general mayor solubilidad en agua. Además, los agentes
reticuladores que tienen puentes disulfuro dentro de la cadena
ligadora pueden ser en lugar de ello sintetizados en forma de los
derivados alquílicos para reducir la cantidad de fragmentación del
ligador in vivo.
Además de los reticuladores heterobifuncionales,
existe una serie de otros agentes reticuladores que incluyen
reticuladores homobifuncionales y fotorreactivos. El disuccinimidil
suberato (DSS), el bismaleimidohexano (BMH) y el
dimetilpimelimidato\cdot2 HCl (DMP) son ejemplos de útiles agentes
reticuladores homobifuncionales, y el
bis[\beta-(4-azidosalicilamido)etil]disulfuro
(BASED) y el
N-succinimidil-6(4'-azido-2'-nitrofenilamino)hexanoato
(SANPAH) son ejemplos de reticuladores fotorreactivos que son
útiles para ser usados en esta invención. Para un reciente estudio
de técnicas de acoplamiento de proteínas, véase Means et al.
(1990) Bioconjugate Chemistry 1:2-12, que
queda incorporado a la presente por referencia.
Los de una clase particularmente útil de
reticuladores heterobifuncionales incluidos en la enumeración
anterior contienen el grupo reactivo de amina primaria
N-hidroxisuccinimida (NHS) o su análogo soluble en
agua N-hidroxisulfosuccinimida
(sulfo-NHS). Las aminas primarias (grupos lisina
épsilon) a pH's alcalinos están no protonadas y reaccionan por
ataque nucleofílico sobre ésteres de NHS o
sulfo-NHS. Esta reacción redunda en la formación de
un enlace amida y en una liberación de NHS o
sulfo-NHS como subproducto.
Otro grupo reactivo que es útil como parte de un
reticulador heterobifuncional es un grupo reactivo tiol. Los grupos
reactivos tiol comunes incluyen maleimidas, halógenos y disulfuros
de piridilo. Las maleimidas reaccionan específicamente con
sulfhidrilos libres (residuos de cisteína) en minutos, bajo
condiciones que van desde las ligeramente ácidas hasta las neutras
(pH 6,5-7,5). Los halógenos (funciones yodoacetil)
reaccionan con grupos -SH a pH's fisiológicos. Estos grupos
reactivos redundan ambos en la formación de enlaces tioéter
estables.
El tercer componente del reticulador
heterobifuncional es el brazo distanciador o puente. El puente es
la estructura que conecta los dos extremos reactivos. El atributo
más manifiesto del puente es su efecto en el impedimento estérico.
En algunos casos, un puente más largo puede salvar más fácilmente
la distancia necesaria para conectar dos biomoléculas complejas. Por
ejemplo, el SMPB tiene una extensión de 14,5 angstroms.
La preparación de conjugados de
proteína-proteína usando reactivos
heterobifuncionales es un proceso de dos pasos que supone la
reacción de amina y la reacción de sulfhidrilo. Para el primer
paso, que es el de la reacción de amina, la proteína elegida deberá
contener una amina primaria. Esto puede ser aminas épsilon de
lisina o una amina alfa primaria que se encuentra en el
N-terminus de la mayoría de proteínas. La proteína no deberá
contener grupos sulfhidrilo libres. En los casos en los que ambas
proteínas a conjugar contienen grupos sulfhidrilo libres, una
proteína puede ser modificada para que queden bloqueados todos los
sulfhidrilos usando, por ejemplo, N-etilmaleimida
(véase Partis et al. (1983) J. Pro. Chem. 2:263, que queda
incorporado a la presente por referencia). Puede usarse Reactivo de
Ellman para calcular la cantidad de sulfhidrilos en una determinada
proteína (véanse, por ejemplo, Ellman et al. (1958) Arch.
Biochem. Biophys. 74:443, y Riddles et al. (1979) Anal.
Biochem. 94:75, que quedan incorporados a la presente por
referencia).
El tampón de reacción deberá estar exento de
aminas y sulfhidrilos foráneos. El pH del tampón de reacción deberá
ser de 7,0-7,5. Esta gama de valores pH impide que
los grupos maleimida reaccionen con aminas, preservando el grupo
maleimida para la segunda reacción con sulfhidrilos.
Los reticuladores con contenido de éster de NHS
tienen una limitada solubilidad en agua. Dichos reticuladores
deberán ser disueltos en una cantidad mínima de disolvente orgánico
(DMF o DMSO) (DMF = dimetilformamida; DMSO =
dimetil-sulfóxido) antes de introducir el
reticulador en la mezcla de reacción. El reticulador forma con el
disolvente una emulsión que permitirá que se produzca la
reacción.
Los análogos de éster de
sulfo-NHS son más solubles en agua, y pueden ser
añadidos directamente al tampón de reacción. Deberán evitarse los
tampones de alta fuerza iónica, puesto que los mismos tienen
tendencia a "salificar" los ésteres de
sulfo-NHS. Para evitar la pérdida de reactividad
debido a la hidrólisis, el reticulador es añadido a la mezcla de
reacción inmediatamente después de disolver la solución de
proteína.
Las reacciones pueden ser más eficientes en
soluciones concentradas de proteína. Cuanto más alcalino es el pH de
la mezcla de reacción, tanto mayor es la velocidad de reacción. La
velocidad de hidrólisis de los ésteres de NHS y de
sulfo-NHS aumentará también al aumentar el pH. Las
temperaturas más altas incrementarán las velocidades de reacción
tanto para la hidrólisis como para la acilación.
Una vez concluida la reacción, la primera
proteína está ahora activada, con una mitad reactiva sulfhidrilo. La
proteína activada puede ser aislada de la mezcla de reacción
mediante simple filtración en gel o diálisis. Para llevar a cabo el
segundo paso de la reticulación, que es la reacción de sulfhidrilo,
el grupo lipofílico elegido para la reacción con maleimidas,
halógenos activados o disulfuros de piridilo debe contener un
sulfhidrilo libre. Como alternativa, una amina primaria puede ser
modificada para añadir un sulfhidrilo.
En todos los casos, el tampón deberá ser
desgasificado para impedir la oxidación de los grupos sulfhidrilo.
Puede añadirse EDTA (EDTA = ácido etildiaminotetracético) para
quelar todos aquellos metales oxidantes que puedan estar presentes
en el tampón. Los tampones deberán estar exentos de cualesquiera
compuestos con contenido de sulfhidrilo.
Las maleimidas reaccionan específicamente con
grupos -SH a pH's situados dentro de la gama de los que van desde
los ligeramente ácidos hasta los neutros (6,5-7,5).
Un pH neutro es suficiente para las reacciones en las que
intervienen halógenos y disulfuros de piridilo. Bajo estas
condiciones, las maleimidas reaccionan generalmente con grupos -SH
en cuestión de minutos. Son necesarios tiempos de reacción más
largos para halógenos y disulfuros de piridilo.
La primera proteína
sulfhidril-reactiva preparada en el paso de reacción
de amina es mezclada con el grupo lipofílico con contenido de
sulfhidrilo bajo las adecuadas condiciones de tampón. Los
conjugados pueden ser aislados de la mezcla de reacción mediante
métodos tales como el de la filtración en gel o la diálisis.
Los ejemplos de mitades lipofílicas activadas
para la conjugación incluyen los siguientes:
N-(1-pireno)maleimida;
2,5-dimetoxistilbeno-4'-maleimida,
eosin-5-maleimida;
fluorescein-5-maleimida;
N-(4-(6-dimetilamino-2-benzofuranil)fenil)maleimida;
benzofenona-4-maleimida;
4-dimetilaminofenilazofenil-4'-maleimida
(DABMI),
tetrametilrodamina-5-maleimida,
tetrametilrodamina-6-maleimida,
maleimida C2 Rojo Rodamina^{MF} (MF = marca de fábrica),
N-(5-aminopentil)maleimida, sal de ácido
trifluoroacético, N-(2-aminoetil)maleimida,
sal de ácido trifluoroacético, maleimida 488 Verde Oregon^{MF},
N-(2-((2-(((4-azido-2,3,5,6-tetrafluoro)benzoil)amino)etil)ditio)etil)maleimida
(TFPAM-SS1),
2-(1-(3-dimetilaminopropil)-indol-3-il)-3-(indol-3-il)maleimida
(bisindolilmaleimida; GF 109203X), BODIPY® FL
N-(2-aminoetil)maleimida,
N-(7-dimetilamino-4-metilcumarin-3-il)maleimida
(DACM), Alexa^{MF} 488 maleimida C5, Alexa^{MF} 594 maleimida
C5, sal sódica N-(1-pireno)maleimida,
2,5-dimetoxistilbeno-4'-maleimida,
eosin-5-maleimida,
fluorescein-5-maleimida,
N-(4-6-dimetilamino-2-benzofuranil)fenil)maleimida,
benzofenona-4-maleimida,
4-dimetilaminofenilazofenil-4'-maleimida,
1-(2-maleimidiletil)-4-(5-(4-metoxifenil)oxazol-2-il)piridinio
metanosulfonato,
tetrametilrodamina-5-maleimida,
tetrametilrodamina-6-maleimida, Rojo
Rodamina^{MF} maleimida
C2, N-(5-aminopentil)maleimida, N-(2-aminoetil)maleimida, N-(2-((2-(((4-azido-2,3,5,6-tetrafluoro)benzoil)amino)etil)ditio)etil)maleimida, 2-(1-(3-dimetilaminopropil)-indoil-3-il)-3-(indol-3-il)maleimida, N-(7-dimetilamino-4-metilcumarin-3-il)maleimida (DACM), 11H-benzo[a]fluoreno y benzo[a]pireno.
C2, N-(5-aminopentil)maleimida, N-(2-aminoetil)maleimida, N-(2-((2-(((4-azido-2,3,5,6-tetrafluoro)benzoil)amino)etil)ditio)etil)maleimida, 2-(1-(3-dimetilaminopropil)-indoil-3-il)-3-(indol-3-il)maleimida, N-(7-dimetilamino-4-metilcumarin-3-il)maleimida (DACM), 11H-benzo[a]fluoreno y benzo[a]pireno.
En una realización, el polipéptido hedgehog puede
ser derivatizado usando pirenomaleimida, que puede ser adquirida a
la Molecular Probes (de Eugene, Oreg.), como p. ej.,
N-(1-pireno)maleimida o yodoacetato de
1-pirenometilo (éster de PMIA).
Para aquellas realizaciones en las que la mitad
hidrofóbica es un polipéptido, el polipéptido hedgehog modificado
de esta invención puede ser construido como una proteína de fusión
que contiene el polipéptido hedgehog y la mitad hidrofóbica como
una cadena polipeptídica contigua.
En ciertas realizaciones, la mitad lipofílica es
un polipéptido anfipático tal como magainina, cecropina, atacina,
melitina, gramicidina S, alfa-toxina de Staph.
aureus, alameticina o un polipéptido anfipático sintético.
Proteínas de la envoltura fusogénica de partículas virales pueden
ser también una conveniente fuente de secuencias anfipáticas para
las presentes proteínas erizo.
Además, puede usarse mutagénesis para crear
polipéptidos hh modificados, p. ej. con finalidades tales
como las de mejorar la eficacia terapéutica o profiláctica o la
estabilidad (como p. ej. la duración de conservación ex vivo
y la resistencia a la degradación proteolítica in vivo).
Tales péptidos modificados pueden ser producidos, por ejemplo,
mediante sustitución, eliminación o adición de aminoácidos. Los
polipéptidos hedgehog modificados pueden también incluir
aquéllos que presentan procesamiento
post-translacional alterado con respecto a una
proteína erizo que se da de manera natural, como es p. ej.
una glicosilación, colesterolización o prenilación alterada y
similares.
En una realización, el agente terapéutico
hedgehog es un polipéptido que es susceptible de ser codificado por
una secuencia de nucleótidos que se hibrida bajo condiciones
rigurosas con una secuencia codificante hedgehog (erizo)
representada en una o varias de las ID SEC Núms.:
1-7. Son conocidas para los expertos en la materia
o pueden encontrarse en Current Protocols in Molecular
Biology, John Wiley & Sons, N.Y. (1989),
6.3.1-6.3.6. las apropiadas condiciones rigurosas
que promueven la hibridación de DNA, como son por ejemplo las de
6,0 x cloruro sódico/citrato sódico (SSC) a aproximadamente 45ºC,
seguido por un lavado con 2,0 x SSC a 50ºC. Por ejemplo, la
concentración de sal en el paso de lavado puede ser seleccionada
para que corresponda a unas condiciones que van desde las poco
rigurosas con aproximadamente 2,0 x SSC a 50ºC hasta las muy
rigurosas con aproximadamente 0,2 x SSC a 50ºC. Además, la
temperatura en el paso de lavado puede ser incrementada para ir
desde las condiciones poco rigurosas a temperatura ambiente de
aproximadamente 22ºC hasta las condiciones muy rigurosas a
aproximadamente 65ºC.
Como se ha descrito en la literatura, utilizando
técnicas que son perfectamente conocidas en el ramo pueden obtenerse
de muestras de RNAm o de DNA genómico genes para otras proteínas
erizo, p. ej. de otros animales. Por ejemplo, cDNA que codifique
una proteína erizo puede ser obtenido a base de aislar RNAm
total de una célula, como p. ej. una célula de mamífero, como p.
ej. una célula humana, incluyendo células embrionarias. cDNAs de
doble hebra pueden ser entonces preparados a partir del RNAm total,
y pueden ser a continuación insertados en un adecuado vector
plásmido o bacteriófago utilizando cualesquiera de las de una serie
de técnicas conocidas. El gen que codifica una proteína
erizo puede ser también clonado utilizando técnicas de
reacción en cadena de la polimerasa acreditadas.
Los ácidos nucleicos preferidos codifican un
polipéptido hedgehog que comprende una secuencia de
aminoácidos que es homóloga en un 60% o idéntica, más
preferiblemente homóloga en un 70% o idéntica, y con la máxima
preferencia homóloga en un 80% o idéntica, con respecto a una
secuencia de aminoácidos seleccionada de entre los miembros del
grupo que consta de las ID SEC Núms.: 8-14. Quedan
también dentro del alcance de la invención los ácidos nucleicos
que codifican polipéptidos que guardan una relación de homología en
aproximadamente un 90%, con más preferencia en al menos
aproximadamente un 95%, y con la máxima preferencia en al menos
aproximadamente un 98-99%, o una relación de
identidad con respecto a una secuencia de aminoácidos representada
en una de las ID SEC Núms.: 8-14.
Además de las proteínas erizo nativas, los
polipéptidos hedgehog que son preferidos en la presente
invención son al menos homólogos en un 60% o idénticos, más
preferiblemente homólogos en un 70% o idénticos, y con la máxima
preferencia homólogos en un 80% o idénticos, con respecto a una
secuencia de aminoácidos representada por cualquiera de las ID SEC
Núms.: 8-14. Quedan también dentro del alcance de la
invención los polipéptidos que guardan una relación de homología en
al menos un 90%, más preferiblemente en al menos un 95%, y con la
máxima preferencia en al menos aproximadamente un
98-99%, o una relación de identidad, con respecto a
una secuencia seleccionada de entre los miembros del grupo que
consta de las ID SEC Núms.: 8-14. El único
requisito previo es el de que el polipéptido hedgehog sea
capaz de modelar el crecimiento de células epiteliales.
La expresión "proteína recombinante" se
refiere a un polipéptido de la presente invención que es producido
mediante técnicas de DNA recombinante, en las que en general DNA
que codifica un polipéptido hedgehog es insertado en un
adecuado vector de expresión que es a su vez usado para transformar
una célula huésped para producir la proteína heteróloga. Además, la
frase "sacado de", con respecto a un gen erizo
recombinante, incluye dentro del significado de "proteína
recombinante" las proteínas que tienen una secuencia de
aminoácidos de una proteína erizo nativa o una secuencia de
aminoácidos que es similar a la misma y es generada mediante
mutaciones incluyendo sustituciones y eliminaciones (incluyendo el
truncamiento) de una forma natural de la proteína.
El método de la presente invención puede ser
también ejecutado usando formas variantes de los polipéptidos
hedgehog que se dan de manera natural, como son p. ej. las
variantes mutacionales.
Como es sabido en la técnica, los polipéptidos
hedgehog pueden ser producidos mediante técnicas biológicas estándar
o mediante síntesis química. Por ejemplo, una célula huésped
transfectada con un vector de ácido nucleico que dirija la expresión
de una secuencia de nucleótidos que codifique los polipéptidos que
son objeto de la presente puede ser cultivada bajo condiciones
apropiadas para permitir que tenga lugar la expresión del péptido.
El polipéptido hedgehog puede ser secretado y aislado de una
mezcla de células y medio que contenga el polipéptido
hedgehog recombinante. Como alternativa, el péptido puede
ser retenido citoplásmicamente retirando la secuencia del péptido
señal del gen erizo recombinante, y las células pueden ser
recolectadas y lisadas y la proteína puede ser aislada. Un cultivo
celular incluye células huésped, medio y otros subproductos. Son
perfectamente conocidos en la técnica medios adecuados para el
cultivo celular. El polipéptido hedgehog recombinante puede
ser aislado del medio de cultivo celular, de las células huésped o
de ambos utilizando técnicas conocidas en el ramo para purificar
proteínas, entre las que se incluyen la cromatografía de
intercambio iónico, la cromatografía de filtración sobre gel, la
ultrafiltración, la electroforesis y la purificación por
inmunoafinidad con anticuerpos específicos para tal péptido. En una
realización preferida, el polipéptido hedgehog recombinante
es una proteína de fusión que contiene un dominio que facilita su
purificación, tal como es el caso de una proteína de fusión
erizo/GST. La célula huésped puede ser cualquier célula
procariótica o eucariótica.
Los genes erizo recombinantes pueden ser
producidos a base de ligar ácido nucleico que codifique una
proteína erizo o una parte de la misma en un vector que sea
adecuado para expresión en células procarióticas o en células
eucarióticas o en ambas. Los vectores de expresión para la
producción de formas recombinantes de los presentes polipéptidos
hedgehog incluyen plásmidos y otros vectores. Por ejemplo,
los vectores adecuados para la expresión de un polipéptido
hedgehog incluyen plásmidos de los tipos siguientes:
plásmidos sacados de pBR322, plásmidos sacados de pEMBL, plásmidos
sacados de pEX, plásmidos sacados de pBTac y plásmidos sacados de
pUC para expresión en células procarióticas tales como E.
coli.
Existe una serie de vectores para la expresión de
proteínas recombinantes en levadura. Por ejemplo, YEP24, YIP5,
YEP51, YEP52, pYES2 e YRP17 son vehículos de clonación y expresión
que son útiles en la introducción de constructos genéticos en S.
cerevisiae (véase, por ejemplo, Broach et al. (1983) en
Experimental Manipulation of Gene Expression, ed. M. Inouye
Academic Press, p. 83, que queda incorporado a la presente por
referencia). Estos vectores pueden replicarse en E. coli
debido a la presencia del pBR322 ori, y en S. cerevisiae
debido al determinante de replicación del plásmido de 2 micras de
la levadura. Además pueden usarse marcadores de la resistencia a las
drogas tales como ampicilina. En una realización ilustrativa, un
polipéptido hedgehog es producido por vía recombinante
utilizando un vector de expresión generado a base de subclonar la
secuencia codificante de uno de los genes erizo representados
en las ID SEC Núms.:1-7.
Los vectores de expresión de mamíferos preferidos
contienen tanto secuencias procarióticas, para facilitar la
propagación del vector en las bacterias, como una o varias unidades
de transcripción eucariótica que son expresadas en células
eucarióticas. Los vectores sacados de pcDNAI/amp, pcDNAI/neo,
pRc/CMV, pSV2gpt, pSV2neo, pSV2-dhfr, pTk2,
pRSVneo, pMSG, pSVT7, pko-neo y pHyg son ejemplos de
vectores de expresión de mamíferos que son adecuados para la
transfección de células eucarióticas. Algunos de estos vectores son
modificados con secuencias de plásmidos bacterianos, tales como
pBR322, para facilitar la replicación y la selección por resistencia
a las drogas en las células tanto procarióticas como eucarióticas.
Como alternativa, pueden usarse para la expresión transitoria de
proteínas en células eucarióticas derivados de virus tales como el
papillomavirus bovino (BPV-1) o el virus de
Epstein-Barr (pHEBo, sacado de pREP y p205). Los
diversos métodos que son empleados en la preparación de plásmidos y
en la transformación de organismos huésped son perfectamente
conocidos en la técnica. Para otros adecuados sistemas de expresión
para células tanto procarióticas como eucarióticas, así como para
procedimientos recombinantes generales, véase Molecular Cloning
A Laboratory Manual, 2ª Ed., publicado por Sambrook, Fritsch and
Maniatis (Cold Spring Harbor Laboratory Press: 1989), Capítulos 16
y 17.
En algunos casos, puede ser deseable expresar el
polipéptido hedgehog recombinante mediante el uso de un
sistema de expresión con baculovirus. Los ejemplos de tales
sistemas de expresión con baculovirus incluyen vectores sacados de
pVL (tales como pVL1392, pVL1393 y pVL941), vectores sacados de
pAcUW (tales como pAcUWI), y vectores sacados de pBlueBac (tales
como el pBlueBac III que contiene \beta-gal).
Cuando es deseable expresar solamente una parte
de una proteína erizo, tal como una forma que carezca de una
parte del N-terminus, es decir un mutante de truncamiento
que carezca del péptido señal, puede ser necesario añadir un codón
de inicio (ATG) al fragmento oligonucleotídico que contiene la
deseada secuencia a expresar. Es perfectamente sabido en la técnica
que una metionina en la posición N-terminal puede
ser escindida enzimáticamente mediante el uso de la enzima metionina
aminopeptidasa (MAP). La MAP ha sido clonada a partir de E.
coli (Ben-Bassat et al. (1987) J.
Bacteriol. 169:751-757) y de Salmonella
typhimurium, y su actividad in vitro ha sido demostrada
sobre proteínas recombinantes (Miller et al. (1987) PNAS
84: 2718-1722). Por consiguiente, si se desea,
la remoción de una metionina N-terminal puede
lograrse ya sea in vivo a base de expresar polipéptidos
sacados de hedgehog en un huésped que produzca MAP (como p.
ej. E. coli o CM89 o S. cerevisiae) o bien in
vitro mediante el uso de MAP purificada (como p. ej. en el
procedimiento de Miller et al., supra).
Como alternativa, las secuencias codificantes
para el polipéptido pueden ser incorporadas como parte de un gen de
fusión que incluya una secuencia de nucleótidos que codifique un
polipéptido distinto. Es un hecho ampliamente reconocido que las
proteínas de fusión pueden también facilitar la expresión de
proteínas, y pueden ser en consecuencia usadas en la expresión de
los polipéptidos hedgehog de la presente invención. Por
ejemplo, pueden ser generados polipéptidos hedgehog como
proteínas de
glutatión-S-transferasa (de fusión
de GST). Tales proteínas de fusión de GST pueden permitir una fácil
purificación del polipéptido hedgehog, tal como por ejemplo
mediante el uso de matrices derivatizadas de glutatión (véase, por
ejemplo, Current Protocols in Molecular Biology, eds.
Ausubel et al. (N.Y.: John Wiley & Sons, 1991)). En otra
realización, un gen de fusión que codifique para una secuencia guía
de purificación, tal como una secuencia de sitio de corte para
poli-(His)/enterocinasa, puede ser usado para sustituir la secuencia
señal que se da de manera natural en el N-terminus de la
proteína erizo (p. ej. de la pro-forma, a
fin de permitir la purificación de la proteína
poli(His)-erizo mediante cromatografía de afinidad
usando una resina metálica de Ni^{2+}). La secuencia guía de
purificación puede ser entonces retirada a continuación mediante
tratamiento con enterocinasa (véase, p. ej., Hochuli et al.
(1987) J. Chromatography 411:177; y Janknecht et al.
PNAS 88:8972).
Son conocidas para los expertos en la materia las
técnicas para hacer genes de fusión. En esencia, la unión de varios
fragmentos de DNA que codifican distintas secuencias polipeptídicas
es llevada a cabo según técnicas convencionales, empleando termini
de extremo romo o de extremo escalonado para ligación, digestión por
enzimas de restricción para lograr apropiados termini, relleno de
extremos cohesivos según sea adecuado, tratamiento con fosfatasa
alcalina para evitar la unión indeseable, y ligación enzimática. En
otra realización, el gen de fusión puede ser sintetizado mediante
técnicas convencionales, incluyendo la de los sintetizadores de DNA
automatizados. Como alternativa, puede efectuarse amplificación de
fragmentos génicos por reacción en cadena de la polimerasa usando
cebadores de anclaje que dan lugar a salientes complementarios
entre dos fragmentos génicos consecutivos que pueden ser a
continuación hibridados para generar una secuencia de gen quimérico
(véase, por ejemplo, Current Protocols in Molecular Biology,
eds. Ausubel et al. John Wiley & Sons, 1992).
Los polipéptidos hedgehog pueden ser
también modificados químicamente para crear derivados de
hedgehog a base de formar conjugados covalentes o agregados
con otras mitades quiméricas tales como grupos glicosilo,
colesterol, isoprenoides, lípidos, fosfatos, grupos acetilo y
similares. Pueden prepararse derivados covalentes de proteínas
erizo a base de ligar las mitades químicas a grupos
funcionales en cadenas laterales de aminoácidos de la proteína en
el N-terminus o en el C-terminus del polipéptido.
Por ejemplo, pueden ser generadas proteínas
erizo que incluyan una mitad que no sea la secuencia que va
naturalmente asociada a la proteína y se fije a un componente de la
matriz extracelular y favorezca la localización del análogo en las
superficies de las células. Por ejemplo, secuencias sacadas de la
"pequeña duplicación en tándem tipo III" de fibronectina, tal
como una secuencia tetrapeptídica
R-G-D-S
(Pierschbacher et al. (1984) Nature
309:30-3; y Kornblihtt et al. (1985)
EMBO 4:1755-9), pueden ser añadidas al
polipéptido hedgehog para sustentar la unión de la molécula
quimérica a una célula a través de componentes de la matriz
extracelular de fijación (Ruoslahti et al. (1987)
Science 238:491-497; Pierschbacheret et
al. (1987) J. Biol. Chem. 262:I7294-8.;
Hynes (1987) Cell 48:549-54; y Hynes (1992)
Cell 69:11-25).
En una realización preferida, el polipéptido
hedgehog está aislado o está de otro modo prácticamente
exento de otras proteínas celulares, y especialmente de otras
proteínas extracelulares o asociadas a la superficie de las células
y que puedan estar normalmente asociadas al polipéptido
hedgehog, a no ser que el mismo esté previsto en forma de
proteína de fusión con el polipéptido hedgehog. Las
expresiones "prácticamente exento de otras proteínas celulares o
extracelulares" (también aquí llamadas "proteínas
contaminantes") o "preparaciones prácticamente puras" o
"preparaciones purificadas" están definidas como expresiones
que engloban preparaciones de polipéptidos hedgehog que
tienen menos de un 20% (en peso en seco) de proteína contaminante,
y tienen preferiblemente menos de un 5% de proteína contaminante.
El vocablo "purificado(a)" significa que la molécula
indicada está presente prácticamente en ausencia de otras
macromoléculas biológicas tales como otras proteínas. En el sentido
el que se le utiliza en la presente, el vocablo
"purificado(a)" significa preferiblemente al menos un
80% en peso en seco, más preferiblemente una gama de porcentajes de
un 95-99% en peso, y con la máxima preferencia al
menos un 99,8% en peso, de macromoléculas biológicas del mismo tipo
que están presentes (si bien pueden estar presentes agua, tampones
y otras pequeñas moléculas, y especialmente moléculas que tengan un
peso molecular de menos de 5000). En sentido en el que se le utiliza
en la presente, el vocablo "puro(a)" tiene
preferiblemente los mismos límites numéricos como los del vocablo
"purificado(a)" que acaba de ser aclarado.
Como se ha descrito anteriormente para los
polipéptidos recombinantes, los polipéptidos hedgehog
aislados pueden incluir la totalidad o una parte de las secuencias
de aminoácidos que están representadas en cualesquiera de las ID SEC
Núms.: 10-18 ó 20, o una secuencia homóloga a las
mismas. Los fragmentos preferidos de las presentes proteínas
erizo corresponden a los fragmentos proteolíticos
N-terminales y C-terminales de la
proteína madura. Están descritos en gran detalle en las
publicaciones al amparo del PCT WO 95/18856 y WO 96/17924
fragmentos bioactivos de polipéptidos hedgehog.
Con respecto a los fragmentos bioactivos de
polipéptido hedgehog, los agentes terapéuticos
hedgehog preferidos incluyen al menos 50 residuos de
aminoácidos (contiguos) de un polipéptido hedgehog, más
preferiblemente al menos 100 residuos (contiguos), y aún más
preferiblemente al menos 150 residuos (contiguos).
Otro polipéptido hedgehog preferido que
puede ser incluido en el agente terapéutico hedgehog es un
fragmento N-terminal de la proteína madura que tiene
un peso molecular de aproximadamente 19 kDa.
Las proteínas erizo humanas preferidas
incluyen fragmentos N-terminales que corresponden
aproximadamente a los residuos 24-197 de la ID SEC
Nº 15, 28-202 de la ID SEC Nº 16, y
23-198 de la ID SEC Nº 17. La expresión
"corresponden aproximadamente" significa que la secuencia de
interés es a lo sumo distinta en 20 residuos de aminoácidos en
cuanto a la longitud con respecto a la secuencia de referencia,
siendo sin embargo más preferiblemente distinta en cuanto a la
longitud a lo sumo en 5, 10 ó 15 aminoácidos.
Como se ha descrito anteriormente para los
polipéptidos recombinantes, los polipéptidos hedgehog
aislados pueden incluir la totalidad o una parte de las secuencias
de aminoácidos que están representadas en la ID SEC Nº: 8, en la ID
SEC Nº: 9, en la ID SEC Nº: 10, en la ID SEC Nº: 11, en la ID SEC
Nº: 12, en la ID SEC Nº: 13 o en la ID SEC Nº: 14, o de una
secuencia homóloga a las mismas. Los fragmentos preferidos de las
proteínas erizo que son objeto de la presente corresponden a
los fragmentos proteolíticos N-terminales y
C-terminales de la proteína madura. Están descritos
en gran detalle en las publicaciones al amparo del PCT WO 95/18856 y
WO 96/17924 fragmentos bioactivos de polipéptidos hedgehog.
Otros adicionales polipéptidos hedgehog
incluyen una secuencia de aminoácidos representada por la fórmula
A-B en la que: (I) A representa la totalidad o la
parte de la secuencia de aminoácidos designada por los residuos
1-168 de la ID SEC Nº: 21; y B representa al menos
un residuo de aminoácido de la secuencia de aminoácidos designada
por los residuos 169-221 de la ID SEC Nº: 21; (II) A
representa la totalidad o la parte de la secuencia de aminoácidos
designada por los residuos 24-193 de la ID SEC Nº:
15; y B representa al menos un residuo de aminoácido de la secuencia
de aminoácidos designada por los residuos 194-250
de la ID SEC Nº: 15; (III) A representa la totalidad o la parte de
la secuencia de aminoácidos designada por los residuos
25-193 de la ID SEC Nº: 13; y B representa al menos
un residuo de aminoácidos de la secuencia de aminoácidos designada
por los residuos 194-250 de la ID SEC Nº: 13; (IV) A
representa la totalidad o la parte de la secuencia de aminoácidos
designada por los residuos 23-193 de la ID SEC Nº:
11; y B representa al menos un residuo de aminoácido de la secuencia
de aminoácidos designada por los residuos 194-250 de
la ID SEC Nº: 11; (V) A representa la totalidad o la parte de la
secuencia de aminoácidos designada por los residuos
28-197 de la ID SEC Nº: 12; y B representa al menos
un residuo de aminoácido de la secuencia de aminoácidos designada
por los residuos 198-250 de la ID SEC Nº: 12; (VI) A
representa la totalidad o la parte de la secuencia de aminoácidos
designada por los residuos 29-197 de la ID SEC Nº:
16; y B representa al menos un residuo de aminoácido de la
secuencia de aminoácidos designada por los residuos
198-250 de la ID SEC Nº: 16; o (VII) A representa la
totalidad o la parte de la secuencia de aminoácidos designada por
los residuos 23-193 de la ID SEC Nº: 17; y B
representa al menos un residuo de aminoácido de la secuencia de
aminoácidos designada por los residuos 194-250 de la
ID SEC Nº: 17. En determinadas realizaciones preferidas, A y B
representan juntamente una secuencia designada como secuencia
polipeptídica conjunta, A representa al menos 25, 50, 75, 100, 125
o 150 aminoácidos (contiguos) de la secuencia designada, y B
representa 5, 10 o 20 residuos de aminoácidos (contiguos) de la
secuencia de aminoácidos designada por la correspondiente anotación
en el listado de secuencias, y A y B representan juntas
preferiblemente una secuencia contigua correspondiente a la
anotación en el listado de secuencias. Se contemplan también
similares fragmentos de otros hedgehog, como p. ej.
fragmentos que correspondan a los fragmentos preferidos de las
anotaciones del listado de secuencias que han sido enumeradas
anteriormente. En realizaciones preferidas, el polipéptido
hedgehog incluye una glicina C-terminal (u
otro residuo apropiado) que está derivatizada con un
colesterol.
Partes peptidílicas aisladas de proteínas
erizo pueden ser obtenidas seleccionando péptidos producidos
por vía recombinante a partir del correspondiente fragmento del
ácido nucleico que codifica tales péptidos. Además, los fragmentos
pueden ser sintetizados químicamente utilizando técnicas que son
conocidas en el ramo, tales como la química del
f-Moc (f-Moc = fluorenil
metoxicarbonil) o del t-Boc (t-Boc =
terbutil oxicarbonil) en fase sólida de Merrifield. Por ejemplo, un
polipéptido hedgehog de la presente invención puede ser
dividido arbitrariamente en fragmentos de longitud deseada sin
superposición de los fragmentos, o puede ser preferiblemente
dividido en fragmentos superpuestos de una longitud deseada. Los
fragmentos pueden ser producidos (por vía recombinante o mediante
síntesis química) y probados para identificar los fragmentos
peptidílicos que puedan funcionar como agonistas o antagonistas de
una proteína erizo (p. ej. "auténtica") de tipo
salvaje. Por ejemplo, Román et al. (1994) Eur J
Biochem 222:65-73 describen el uso de análisis
de fijación competitiva usando cortos péptidos sintéticos
superpuestos de proteínas de mayor tamaño para identificar dominios
de fijación.
Los polipéptidos hedgehog recombinantes de
la presente invención incluyen también homólogos de las proteínas
erizo auténticas, tales como versiones de aquellas proteínas
que son resistentes a la fragmentación proteolítica, debido por
ejemplo a mutaciones que alteran secuencias de fragmentación
potencial o inactivan una actividad enzimática asociada a la
proteína. Los homólogos de hedgehog de la presente invención
incluyen también proteínas que han sido modificadas
post-translacionalmente de una manera distinta de
la proteína auténtica. Los ejemplos de derivados de proteínas
erizo incluyen polipéptidos que carecen de sitios de
N-glicosilación (p. ej. para producir una proteína
no glicosilada), que carecen de sitios para colesterolización, y/o
que carecen de secuencias N-terminales y/o
C-terminales.
La modificación de la estructura de los
polipéptidos hedgehog que son objeto de la presente puede
también perseguir finalidades tales como las de aumentar la
eficacia terapéutica o profiláctica o la estabilidad (como p. ej. la
duración de conservación ex vivo y la resistencia a la
degradación proteolítica in vivo). Cuando están diseñados
para conservar al menos una actividad de la forma natural de la
proteína, tales polipéptidos modificados son considerados
equivalentes funcionales de los polipéptidos hedgehog que se
describen más detalladamente en la presente. Tales péptidos
modificados pueden ser producidos, por ejemplo, mediante
sustitución, eliminación o adición de aminoácidos.
Es perfectamente sabido en la técnica que puede
ser razonablemente de esperar que determinadas sustituciones
aisladas de aminoácidos, como es p. ej. la sustitución de un
residuo de aminoácido por otro aminoácido afín (es decir las
mutaciones isoestéricas y/o isoeléctricas), puedan ser efectuadas
sin que se produzcan efectos importantes en la actividad biológica
de la molécula resultante. Son sustituciones conservadoras aquéllas
que tienen lugar dentro de una familia de aminoácidos que son afines
en sus cadenas laterales. Los aminoácidos que son codificados
genéticamente pueden ser divididos en cuatro familias: (1) los
ácidos = aspartato, glutamato; (2) los básicos = lisina, arginina,
histidina; (3) los apolares = alanina, valina, leucina, isoleucina,
prolina, fenilalanina, metionina, triptófano; y (4) los polares sin
carga = glicina, asparagina, glutamina, cisteína, serina, treonina,
tirosina. La fenilalanina, el triptófano y la tirosina son a veces
clasificados juntamente como aminoácidos aromáticos. De manera
similar, los del repertorio de aminoácidos pueden ser agrupados como
(1) ácidos = aspartato, glutamato; (2) básicos = lisina, arginina,
histidina; (3) alifáticos = glicina, alanina, valina, leucina,
isoleucina, serina y treonina, siendo la serina y la treonina
opcionalmente agrupadas por separado como
hidroxil-alifáticos; (4) aromáticos = fenilalanina,
tirosina, triptófano; (5) amida = asparagina, glutamina; y (6) con
contenido de azufre = cisteína y metionina. (Véase, por ejemplo,
Biochemistry, 2ª ed., Ed. de L. Stryer, WH Freeman and Co.:
1981). La cuestión de si un cambio de la secuencia de aminoácidos
de un péptido redunda en un homólogo funcional de hedgehog
(p. ej. funcional en el sentido de que actúe imitando o
antagonizando la forma de tipo salvaje) puede ser fácilmente
determinada a base de valorar la capacidad del péptido variante
para producir una respuesta en células de manera similar a como lo
hace la proteína de tipo salvaje, o para inhibir competitivamente
tal respuesta. Los polipéptidos en los cuales ha tenido lugar más
de una sustitución pueden ser probados fácilmente de la misma
manera.
Se contempla específicamente que los métodos de
la presente invención pueden ser ejecutados usando homólogos de
proteínas erizo que se dan de manera natural. En una realización,
la invención contempla el uso de polipéptidos hedgehog generados
por mutagénesis combinatoria. Tales métodos, como los que son
conocidos en la técnica, son convenientes para generar mutantes
obtenidos tanto por mutación puntiforme como por mutación por
truncamiento, y pueden ser específicamente útiles para identificar
potenciales secuencias variantes (p. ej. homólogos) que sean
funcionales en cuanto a la fijación a un receptor para proteínas
erizo. La finalidad de someter a selección a tales
bibliotecas combinatorias es la de generar, por ejemplo, nuevos
homólogos de hedgehog que puedan actuar como agonistas o
antagonistas. A título ilustrativo, mediante el presente método
pueden diseñarse homólogos de hedgehog para lograr una más
eficiente fijación a un receptor afín, tal como patched,
conservando sin embargo al menos una parte de una actividad
asociada a hedgehog. Así, pueden ser generados homólogos
obtenidos por la vía combinatoria para que tengan una potencia
incrementada con respecto a una forma natural de la proteína.
Análogamente, mediante el presente enfoque combinatorio pueden ser
generados homólogos de hedgehog para que actúen como
antagonistas siendo capaces de imitar, por ejemplo, la fijación a
otros componentes de la matriz extracelular (tales como receptores)
pero sin inducir respuesta biológica alguna, inhibiendo con ello la
acción de los auténticos hedgehog o agonistas para
hedgehog. Además, la manipulación de determinados dominios
de hedgehog por el presente método puede proporcionar
dominios más adecuados para su uso en proteínas de fusión, tales
como uno que incorpore partes de otras proteínas que estén sacadas
de la matriz extracelular y/o fijen componentes de la matriz
extracelular.
Para ilustrar adicionalmente el estado de la
técnica de la mutagénesis combinatoria, se señala que el artículo
de revista de Gallop et al. (1994) J Med Chem 37:1233
describe el estado general de la técnica de las bibliotecas
combinatorias desde los comienzos de la década de los noventa. En
particular, Gallop et al. dicen en la página 1239 "el
someter a selección las bibliotecas de análogos ayuda a determinar
el tamaño mínimo de la secuencia activa y a identificar los
residuos que son decisivos para la fijación y no toleran la
sustitución". Además, la publicación de Ladner et al. al
amparo del PCT WO90/02809, la Patente U.S. 5.223.408 de Goeddel
et al. y la publicación al amparo del PCT WO92/15679 de
Markland et al. ilustran técnicas específicas que un experto
en la materia podría utilizar para generar bibliotecas de variantes
de hedgehog que pueden ser sometidas rápidamente a selección
para identificar las variantes/los fragmentos que conservaron una
determinada actividad de los polipéptidos hedgehog. Estas
técnicas constituyen ejemplos del estado de la técnica y demuestran
que pueden ser generadas y analizadas grandes bibliotecas de
variantes/truncantes afines para aislar variantes específicas sin
una innecesaria experimentación. Gustin et al. (1993)
Virology 193:653 y Bass et al. (1990) Proteins:
Structure, Function and Genetics 8:309-314
describen también otros ejemplos de técnicas que se utilizan en el
ramo y pueden ser adaptadas como medios para generar variantes
mutagénicas de polipéptidos hedgehog.
Ciertamente, está claro a la luz de la técnica de
la mutagénicas combinatoria que puede ser llevada a cabo a gran
escala mutagénesis de proteínas erizo sin ideas preconcebidas de
tipo alguno acerca de qué residuos fuesen decisivos para la función
biológica, y pueden ser generadas amplias gamas de variantes que
tengan una actividad biológica equivalente. Ciertamente, las
técnicas combinatorias tienen la capacidad de someter a selección
billones de distintas variantes mediante análisis de alto
rendimiento que elimina toda necesidad de una comprensión o un
conocimiento a priori de los residuos decisivos.
A título ilustrativo, las secuencias de
aminoácidos para una población de homólogos de hedgehog o de
otras proteínas afines son alineadas, preferiblemente para promover
la máxima homología posible. Tal población de variantes puede
incluir, por ejemplo, homólogos de hedgehog de una o varias
especies. Los aminoácidos que aparecen en cada posición de las
secuencias alineadas son seleccionados para crear un conjunto
degenerado de secuencias combinatorias. En una realización
preferida, la biblioteca diversificada de variantes de
hedgehog es generada mediante mutagénesis combinatoria a
nivel del ácido nucleico, y es codificada por una biblioteca de
genes diversificados. Por ejemplo, los de una mezcla de
oligonucleótidos sintéticos pueden ser ligados enzimáticamente para
ser transformados en secuencias génicas de forma tal que las del
conjunto degenerado de potenciales secuencias hedgehog sean
susceptibles de ser expresadas como polipéptidos individuales, o
bien como alternativa como un conjunto de mayores proteínas de
fusión (p. ej. para la presentación de fagos) que contengan en las
mismas el conjunto de secuencias hedgehog.
Como se ilustra en la publicación al amparo del
PCT WO 95/18856, para analizar las secuencias de una población de
variantes las secuencias de aminoácidos de interés pueden ser
alineadas con respecto a la homología secuencial. La presencia o
ausencia de aminoácidos en una secuencia alineada de una variante
determinada es relativa a una longitud de consenso elegida de una
secuencia de referencia que puede ser real o artificial.
En una realización ilustrativa, la alineación de
los exones 1 y 2 y una parte de las secuencias codificadas por el
exón 3 (como p. ej. los aproximadamente 221 residuos
N-terminales de la proteína madura) de cada uno de
los clones de Shh produce un conjunto degenerado de
polipéptidos Shh que están representados por la fórmula
general:
donde cada una de las posiciones degeneradas
''X'' puede ser un aminoácido que se dé en esa posición en uno de
los clones de Shh de humano, de ratón, de pollo o de pez
cebra, o bien, para expandir la biblioteca, cada X puede ser también
seleccionado de entre residuos de aminoácidos que serían
sustituciones conservadoras para los aminoácidos que aparecen de
manera natural en cada una de estas posiciones. Por ejemplo,
Xaa(1) representa Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Phe, Tyr o Trp;
Xaa(2) representa Arg, His o Lys; Xaa(3) representa
Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Ser o Thr; Xaa(4) representa Gly,
Ala, Val, Leu, Ile, Ser o Thr; Xaa(5) representa Lys, Arg,
His, Asn o Gln; Xaa(6) representa Lys, Arg o His;
Xaa(7) representa Ser, Thr, Tyr, Trp o Phe; Xaa(8)
representa Lys, Arg o His; Xaa(9) representa Met, Cys, Ser o
Thr; Xaa(10) representa Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Ser o Thr;
Xaa(11) representa Leu, Val, Met, Thr o Ser; Xaa(12)
representa His, Phe, Tyr, Ser, Thr, Met o Cys; Xaa(13)
representa Gln, Asn, Glu o Asp; Xaa(14) representa His, Phe,
Tyr, Thr, Gln, Asn, Glu o Asp; Xaa(15) representa Gln, Asn,
Glu, Asp, Thr, Ser, Met o Cys; Xaa(16) representa Ala, Gly,
Cys, Leu, Val o Met; Xaa(17) representa Arg, Lys, Met, Ile,
Asn, Asp, Glu, Gln, Ser, Thr o Cys; Xaa(18) representa Arg,
Lys, Met o Ile; Xaa(19) representa Ala, Gly, Cys, Asp, Glu,
Gln, Asn, Ser, Thr o Met; Xaa(20) representa Ala, Gly, Cys,
Asp, Asn, Glu o Gln; Xaa(21) representa Arg, Lys, Met, Ile,
Asn, Asp, Glu o Gln; Xaa(22) representa Leu, Val, Met o Ile;
Xaa(23) representa Phe, Tyr, Thr, His o Trp; Xaa(24)
representa Ile, Val, Leu o Met; Xaa(25) representa Met, Cys,
Ile, Leu, Val, Thr o Ser; Xaa(26) representa Leu, Val, Met,
Thr o Ser. En una biblioteca aún más expansiva, cada X puede ser
seleccionado de entre cualesquiera
aminoácidos.
De manera similar, la alineación de cada uno de
los clones de hedgehog de humano, de ratón, de pollo y de
pez cebra puede proporcionar una secuencia polipeptídica degenerada
representada por la fórmula general:
donde, al igual como en el caso anterior, cada
una de las posiciones degeneradas ''X'' puede ser un aminoácido que
se dé en una posición correspondiente en uno de los clones de tipo
salvaje, y puede también incluir residuos de aminoácidos que fuesen
sustituciones conservadoras, o bien cada X puede ser cualquier
residuo de aminoácido. En un ejemplo de realización, Xaa(1)
representa Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe o Tyr; Xaa(2)
representa Gly, Ala, Val, Leu o Ile; Xaa(3) representa Gly,
Ala, Val, Leu, Ile, Lys, His o Arg; Xaa(4) representa Lys,
Arg o His; Xaa(5) representa Phe, Trp, Tyr o una laguna de
aminoácido; Xaa(6) representa Gly, Ala, Val, Leu, Ile o una
laguna de aminoácido; Xaa(7) representa Asn, Gln, His, Arg o
Lys; Xaa(8) representa Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Ser o Thr;
Xaa(9) representa Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Ser o Thr;
Xaa(10) representa Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Ser o Thr;
Xaa(11) representa Ser, Thr, Gln o Asn; Xaa(12)
representa Met, Cys, Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Ser o Thr;
Xaa(13) representa Gly, Ala, Val, Leu, Ile o Pro;
Xaa(14) representa Arg, His o Lys; Xaa(15) representa
Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Arg, His o Lys; Xaa(16)
representa Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Phe o Tyr; Xaa(17)
representa Arg, His o Lys; Xaa(18) representa Gly, Ala, Val,
Leu, Ile, Ser o Thr; Xaa(19) representa Thr o Ser;
Xaa(20) representa Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Asn o Gln;
Xaa(21) representa Arg, His o Lys; Xaa(22) representa
Asp o Glu; Xaa(23) representa Ser o Thr; Xaa(24)
representa Glu, Asp, Gln o Asn; Xaa(25) representa Glu o
Asp; Xaa(26) representa Arg, His o Lys; Xaa(27)
representa Gly, Ala, Val, Leu o Ile; Xaa(28) representa Gly,
Ala, Val, Leu, Ile, Thr o Ser; Xaa(29) representa Met, Cys,
Gln, Asn, Arg, Lys o His; Xaa(30) representa Arg, His o Lys;
Xaa(31) representa Trp, Phe, Tyr, Arg, His o Lys;
Xaa(32) representa Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Ser, Thr, Tyr o
Phe; Xaa(33) representa Gln, Asn, Asp o Glu; Xaa(34)
representa Asp o Glu; Xaa(35) representa Gly, Ala, Val, Leu
o Ile; Xaa(36) representa Arg, His o Lys; Xaa(37)
representa Asn, Gln, Thr o Ser; Xaa(38) representa Gly, Ala,
Val, Leu, Ile, Ser, Thr, Met o Cys; Xaa(39) representa Gly,
Ala, Val, Leu, Ile, Thr o Ser; Xaa(40) representa Arg, His o
Lys; Xaa(41) representa Asn, Gln, Gly, Ala, Val, Leu o Ile;
Xaa(42) representa Gly, Ala, Val, Leu o Ile; Xaa(43)
representa Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Ser, Thr o Cys; Xaa(44)
representa Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Thr o Ser; y Xaa(45)
representa Asp o
Glu.
Hay muchas maneras de poder generar la biblioteca
de potenciales homólogos de hedgehog a partir de una
secuencia oligonucleotídica degenerada. La síntesis química de una
secuencia génica degenerada puede ser llevada a cabo en un
sintetizador de DNA automático, y los genes sintéticos pueden ser
entonces ligados en un adecuado vector de expresión. La finalidad
de un conjunto degenerado de genes es la de prever en una mezcla
todas las secuencias que codifican el deseado conjunto de
potenciales secuencias hedgehog. La síntesis de
oligonucleótidos degenerados es perfectamente conocida en la técnica
(véanse, por ejemplo, Narang, SA (1983) Tetrahedron 39:3;
Itakura et al. (1981) Recombinant DNA, Proc 3rd Cleveland
Sympos. Macromolecules, ed. AG Walton, Amsterdam: Elsevier
pp273-289; Itakura et al. (1984) Annu.
Rev. Biochem. 53:323; Itakura et al. (1984)
Science 198:1056; Ike et al. (1983) Nucleic Acid
Res. 11:477). Tales técnicas han sido empleadas en la evolución
dirigida de otras proteínas (véanse, por ejemplo, Scott et
al. (1990) Science 249:386-390; Roberts
et al. (1992) PNAS 89:2429-2433;
Devlin et al. (1990) Science 249:
404-406; Cwirla et al. (1990) PNAS 87:
6378-6382; así como las Patentes U.S. Núms.
5.223.409, 5.198.346 y 5.096.815).
Son conocidas en la técnica las de una amplia
gama de técnicas para someter a selección productos génicos de
bibliotecas combinatorias hechas mediante mutaciones puntiformes, y
para someter a selección a bibliotecas de cDNA para la localización
de productos génicos que presenten una determinada propiedad. Tales
técnicas serán en general adaptables para someter a una rápida
selección las bibliotecas de genes generadas mediante la mutagénesis
combinatoria de homólogos de hedgehog. Las técnicas que son
en la mayoría de los casos utilizadas para someter a selección a
grandes bibliotecas de genes comprenden típicamente los pasos de
clonar la biblioteca de genes en vectores de expresión
reproducibles, transformar células adecuadas con la resultante
biblioteca de vectores, y expresar los genes combinatorios bajo
condiciones en las cuales la detección de una actividad deseada
facilite un aislamiento relativamente fácil del vector que
codifique el gen cuyo producto fue detectado. Cada uno de los
análisis ilustrativos que se describen más adelante se presta a
efectuar un análisis con alto rendimiento según sea necesario para
someter a selección a grandes números de secuencias hedgehog
degeneradas creadas mediante técnicas de mutagénesis
combinatoria.
En una realización, la biblioteca combinatoria es
diseñada para ser secretada (p. ej. los polipéptidos de la
biblioteca incluyen todos ellos una secuencia señal pero no
dominios transmembrana o citoplásmicos), y es usada para transfectar
una célula eucariótica que puede ser cocultivada con células
troncales epiteliales. Una proteína erizo funcional
secretada por las células que expresan la biblioteca combinatoria se
difundirá a las células epiteliales contiguas e inducirá una
determinada respuesta biológica tal como la proliferación. El patrón
de detección de proliferación se asemejará a una función de
gradiente y permitirá el aislamiento (generalmente después de
varios ciclos de selección repetitivos) de las células que produzcan
homólogos de hedgehog que sean activos como agentes
proliferativos con respecto a células epiteliales. Análogamente,
los antagonistas para hedgehog pueden ser seleccionados de
manera similar por medio de la capacidad de la célula para producir
un antagonista funcional para proteger a las células contiguas (p.
ej. para inhibir la proliferación) contra el efecto de
hedgehog de tipo salvaje añadido a los medios de cultivo.
A título ilustrativo, células epiteliales diana
son cultivadas en placas de cultivo de microtitulación de 24
cavidades. Otras células eucarióticas son transfectadas con la
biblioteca combinatoria de genes hedgehog (erizo) y son
cultivadas en insertos de cultivo celular (p. ej. de la
Collaborative Biomedical Products, Nº de Catálogo 40446) que son
capaces de encajar en las cavidades de la placa de cultivo de
microtitulación. Los insertos de cultivo celular son colocados en
las cavidades de forma tal que los homólogos de hedgehog
recombinantes secretados por las células en el inserto puedan
difundirse en el fondo poroso del inserto y establecer contacto con
las células diana en las cavidades de la placa de cultivo de
microtitulación. Tras haber transcurrido un periodo de tiempo
suficiente para que las formas funcionales de una proteína
erizo produzcan una respuesta mensurable en las células
diana, tal como la proliferación, los insertos son retirados y se
determina el efecto de las proteínas erizo variantes en las
células diana. Las células de los insertos correspondientes a las
cavidades que han dado positivo para la actividad pueden ser
divididas y cultivadas de nuevo sobre varios insertos, siendo
repetido el proceso hasta haber sido identificados los clones
activos.
En otro adicional análisis de selección, los
productos del gen hedgehog (erizo) candidato son presentados
en la superficie de una célula o partícula viral, y la capacidad de
específicas células o partículas virales para asociarse a una mitad
de fijación a hedgehog (tal como la proteína patched
u otro receptor para hedgehog) por medio de este producto
génico es detectada en un "análisis de reconocimiento y
selección". Tales pasos de reconocimiento y selección pueden ser
llevados a cabo sobre células cultivadas a partir de embriones. Por
ejemplo, la biblioteca de genes puede ser clonada para su
conversión en el gen de una proteína de membrana de superficie de
una célula bacteriana, y la proteína de fusión resultante puede ser
detectada mediante reconocimiento y selección (Ladner et
al., WO 88/06630; Fuchs et al. (1991)
Bio/Technology 9:1370-1371; y Goward et
al. (1992) TIBS 18:136-140). De manera
similar, moléculas marcadas por fluorescencia que fijen
hedgehog pueden ser usadas para puntuar con respecto a
homólogos de hedgehog potencialmente funcionales. Las
células pueden ser inspeccionadas y separadas visualmente bajo un
microscopio de fluorescencia, o bien, cuando lo permita la
morfología de la célula, pueden ser separadas mediante un
clasificador de células activado por fluorescencia.
En una realización alternativa, la biblioteca de
genes es expresada como proteína de fusión sobre la superficie de
una partícula viral. Por ejemplo, en el sistema de fago
filamentoso, secuencias peptídicas foráneas pueden ser expresadas
sobre la superficie de fago infeccioso, con lo que se logran dos
importantes ventajas. Primeramente, puesto que estos fagos pueden
ser aplicados a matrices de afinidad a concentraciones muy altas,
puede ser sometido a selección cada vez un gran número de fagos. En
segundo lugar, puesto que cada fago infeccioso presenta el producto
del gen combinatorio en su superficie, si un determinado fago es
recuperado a partir de una matriz de afinidad con baja producción,
el fago puede ser amplificado mediante otro ciclo de infección. Los
del grupo de fagos filamentosos casi idénticos de E. coli
M13, fd y f1 son los más frecuentemente usados en las bibliotecas de
presentación de fagos, puesto que cualquiera de las proteínas de
envoltura gIII o gVIII del fago puede ser usada para generar
proteínas de fusión sin desorganizar el empaquetamiento final de la
partícula viral (Ladner et al., publicación al amparo del
PCT WO 90/02909; Garrard et al., publicación al amparo del
PCT WO 92/09690; Marks et al. (1992) J. Biol. Chem.
267:16007-16010; Griffihs et al. (1993) EMBO
J 12:725-734; Clackson et al. (1991) Nature
352:624-628; y Barbas et al. (1992) PNAS
89:4457-4461).
En una realización ilustrativa, el sistema de
anticuerpos para fagos recombinantes (RPAS, número de Catálogo de
Pharamacia 27-9400-01) puede ser
modificado fácilmente para ser usado para expresar y someter a
selección bibliotecas combinatorias de hedgehog. Por
ejemplo, el fagémido pCANTAB 5 del conjunto de materiales y
utensilios RPAS contiene el gen que codifica la proteína de
envoltura fago gIII. La biblioteca de genes combinatorios
hedgehog (erizo) puede ser clonada en el fagémido adyacente a
la secuencia señal gIII de forma tal que será expresada como una
proteína de fusión gIII. Tras ligación, el fagémido es usado para
transformar células TG1 de E. coli competentes. Las células
transformadas son a continuación infectadas con fago colaborador
M13KO7 para rescatar el fagémido y su inserto génico hedgehog
(erizo) candidato. Los fagos recombinantes resultantes contienen
DNA de fagémido que codifica un específico hedgehog
candidato, y exhiben una o varias copias de la correspondiente
proteína de envoltura de fusión. Las proteínas hedgehog
(erizo) candidatas que son exhibidas en fagos y son capaces de
fijar un receptor para hedgehog son seleccionadas o
enriquecidas por reconocimiento y selección. Por ejemplo, la
biblioteca de fagos puede ser aplicada a células que expresen la
proteína patched, y los fagos no fijados pueden ser retirados
por lavado de las células. El fago fijado es entonces aislado, y si
los fagos recombinantes expresan al menos una copia de la proteína
de envoltura gIII de tipo salvaje, los mismos conservarán su
capacidad de infectar E. coli. Así, mediante sucesivos
ciclos de reinfección de E. coli y reconocimiento y selección
se logrará un considerable enriquecimiento en homólogos de
hedgehog, que pueden ser entonces sometidos a selección con
respecto a adicionales actividades biológicas a fin de diferenciar
los agonistas y los antagonistas.
La mutagénesis combinatoria tiene el potencial de
generar bibliotecas muy grandes de proteínas mutantes, p. ej. del
orden de 10^{26} moléculas. Las bibliotecas combinatorias de
estas proporciones pueden representar un desafío técnico de cara a
la selección incluso con análisis de selección de alto rendimiento
tales como el de la presentación en fagos. Para superar este
problema, recientemente ha sido desarrollada una nueva técnica, que
es la de la mutagénesis recursiva de conjunto (REM), que permite
evitar la muy alta proporción de proteínas no funcionales en una
biblioteca aleatoria y aumenta simplemente la frecuencia de
proteínas funcionales, reduciendo así la complejidad necesaria para
lograr un útil muestreo de espacio secuencial. La REM es un
algoritmo que aumenta la frecuencia de mutantes funcionales en una
biblioteca cuando se emplea un adecuado método de selección (Arkin
and Yourvan, 1992, PNAS USA 89:7811-7815;
Yourvan et al., 1992, Parallel Problem Solving from
Nature, 2, en Maenner and Manderick, eds., Elsevier Publishing
Co., Amsterdam, pp. 401-410; Delgrave et
al., 1993, Protein Engineering
6(3):327-331).
La invención permite también la reducción de la
proteína erizo para generar miméticos, como p. ej. agentes
peptídicos o no peptídicos que son capaces de desorganizar la
fijación de un polipéptido hedgehog de la presente invención
a un receptor para hedgehog. Así, técnicas mutagénicas tales
como las anteriormente descritas son también útiles para mapear los
determinantes de las proteínas hedgehog (erizo) que
participan en las interacciones de
proteína-proteína que intervienen en, por ejemplo,
la fijación del presente polipéptido hedgehog a otros
componentes de la matriz extracelular. A título ilustrativo, los
residuos decisivos de un polipéptido hedgehog objeto de la
presente que intervienen en el reconocimiento molecular de un
receptor para hedgehog tal como patched pueden ser
determinados y usados para generar peptidomiméticos sacados de
hedgehog que inhiban competitivamente la fijación de la
proteína hedgehog (erizo) auténtica con esa mitad.
Empleando, por ejemplo, mutagénesis de barrido para mapear los
residuos de aminoácidos de cada una de las proteínas erizo de
interés que intervienen en la fijación de otras proteínas
extracelulares, pueden ser generados compuestos peptidomiméticos que
imiten aquellos residuos de la proteína erizo que facilitan
la interacción. Tales miméticos pueden ser entonces usados para
interferir en el funcionamiento normal de una proteína erizo.
Por ejemplo, pueden ser generados análogos peptídicos no
hidrolizables de tales residuos usando benzodiazepina (véase, p.
ej., Freidinger et al. en Peptides: Chemistry and
Biology, G.R. Marshall ed., ESCOM Publisher: Leiden, Países
Bajos, 1988), azepina (véase, p. ej. Huffman et al. en
Peptides: Chemistry and Biology, G.R. Marshall ed., ESCOM
Publisher: Leiden, Países Bajos, 1988), anillos de
gamma-lactama sustituidos (Garvey et al. en
Peptides: Chemistry and Biology, G.R. Marshall ed., ESCOM
Publisher, Leiden, Países Bajos, 1988), seudopéptidos de
ceto-metileno (Ewenson et al. (1986) J
Med Chem 29:295; y Ewenson et al. en Peptides:
Structure and Function (Proceedings of the 9^{th} American
Peptide Symposium) Pierce Chemical Co. Rockland, IL, 1985), núcleos
de dipéptidos de vuelta \beta (Nagai et al. (1985)
Tetrahedron Lett 26:647; y Sato et al. (1986) J
Chem Soc Perkin Trans 1:1231), y
\beta-aminoalcoholes (Gordon et al. (1985)
Biochem Biophys Res Commun 126:419; y Dann et al.
(1986) Biochem Biophys Res Commun 134:71).
Pueden producirse formas de las proteínas erizo
producidas por vía recombinante usando, p. ej., vectores de
expresión que contengan un ácido nucleico que codifique un
polipéptido hedgehog y esté ligado operativamente a al menos
una secuencia reguladora transcripcional. La expresión "ligado
operativamente" significa que la secuencia nucleotídica está
ligada a una secuencia reguladora de una manera que permite la
expresión de la secuencia nucleotídica. Las secuencias reguladoras
están reconocidas en la técnica y son seleccionadas para dirigir la
expresión de un polipéptido hedgehog. En consecuencia, la
expresión "secuencia reguladora transcripcional" incluye
promotores, potenciadores y otros elementos de control de la
expresión. Tales secuencias reguladoras están descritas en Goeddel;
Gene Expression Technology: Methods in Enzymology 185,
Academic Press, San Diego, CA (1990). Por ejemplo, cualesquiera de
las de una amplia variedad de secuencias de expresión, es decir
secuencias que controlan la expresión de una secuencia de DNA al
estar ligadas operativamente a la misma, pueden ser usadas en estos
vectores para expresar las secuencias de DNA que codifican
polipéptido hedgehog. Tales útiles secuencias de control de
expresión incluyen, por ejemplo, una secuencia terminal repetida
larga viral tal como la secuencia terminal repetida larga del virus
de la leucemia murina de Moloney, los promotores iniciales y
finales de SV40, el promotor inicial inmediato de adenovirus o
citomegalovirus, el sistema LAC, el sistema TRP, el sistema TAC o
TRC, el promotor T7 cuya expresión es dirigida por T7 RNA
polimerasa, las principales regiones operadora y promotora del fago
\lambda, las regiones de control para proteína de envoltura fd, el
promotor para 3-fosfoglicerato cinasa u otras
enzimas glicolíticas, los promotores de ácido fosfatasa, como p. ej.
Pho5, los promotores de los factores de apareamiento \alpha de
levadura, el promotor poliédrico del sistema de baculovirus
y otras secuencias de las que se sabe que controlan la expresión de
genes de células procarióticas o eucarióticas u otros virus, y
varias combinaciones de los mismos. Deben entenderse que el diseño
del vector de expresión puede depender de factores tales como la
elección de la célula huésped a transformar y/o el tipo de proteína
que se desee expresar. Además deberán considerarse también el
número de copias del vector, la capacidad de controlar ese número de
copias y la expresión de cualesquiera otras proteínas codificadas
por el vector, tales como marcadores antibióticos.
Además de proporcionar una pronta fuente de
polipéptidos hedgehog para purificación, los constructos génicos de
la presente invención pueden ser también usados como parte de un
protocolo de terapia génica para suministrar ácidos nucleicos que
codifiquen una forma agonista o antagonista de un polipéptido
hedgehog. Así, otro aspecto de la invención se refiere a
vectores de expresión para transfección in vivo de un
polipéptido hedgehog en específicos tipos de células para
ocasionar una expresión ectópica de un polipéptido hedgehog
en un tejido epitelial.
Las formulaciones de tales constructos de
expresión pueden ser administradas en cualquier vehículo
biológicamente efectivo, como p. ej. toda formulación o composición
que sea capaz de suministrar efectivamente el gen recombinante a
células in vivo. Las soluciones que pueden adoptarse a este
respecto incluyen la inserción de la secuencia codificante de
hedgehog en vectores virales entre los que se incluyen retrovirus
recombinantes, adenovirus, virus adeno-asociados y
virus del herpes simplex tipo 1, o plásmidos eucarióticos o
bacterianos recombinantes. Los vectores virales transfectan las
células directamente; pudiendo ser el DNA plasmídico suministrado
con ayuda de, por ejemplo, liposomas catiónicos (lipofectina) o
conjugados de polilisina (p. ej. conjugados de anticuerpos)
derivatizados, gramacidina S, envolturas virales artificiales u
otros vehículos intracelulares de este tipo, así como la inyección
directa del constructo génico o la precipitación con CaPO_{4}
llevada a cabo in vivo. Se comprenderá que debido al hecho
de que la transducción de adecuadas células diana representa el
primer paso decisivo en terapia génica, la elección del específico
sistema de suministro de genes dependerá de factores tales como el
fenotipo de la diana prevista y la ruta de administración, como es
p. ej. la administración local o la administración sistémica.
Además, se reconocerá que los específicos constructos génicos
previstos para transducción in vivo de la expresión de
hedgehog son también útiles para la transducción in
vitro de células, tal como para su uso en los sistemas de
cultivo de tejido ex vivo que se describen más adelante.
Un enfoque preferido para la introducción in
vivo de ácido nucleico en una célula es el consistente en el
uso de un vector viral que contenga ácido nucleico, como p. ej. un
cDNA que codifique la forma específica del polipéptido
hedgehog deseada. La infección de células con un vector
viral tiene la ventaja de que las de una gran proporción de las
células que constituyen la diana u objetivo pueden recibir el ácido
nucleico. Adicionalmente, las moléculas codificadas dentro del
vector viral, p. ej. por un cDNA contenido en el vector viral, son
expresadas eficientemente en las células que han admitido el ácido
nucleico del vector viral.
Se entiende en general que los vectores de
retrovirus y los vectores de virus adeno-asociados
son el sistema de suministro de genes recombinantes a elegir para
la transferencia de genes exógenos in vivo, particularmente a
los humanos. Estos vectores proporcionan un suficiente suministro
de genes a las células, y los ácidos nucleicos transferidos quedan
integrados de manera estable en el DNA cromosómico del huésped. Un
importante requisito previo para el uso de retrovirus es el de
asegurar la seguridad de su uso, particularmente con respecto a la
posibilidad de difusión de virus de tipo salvaje en la población
celular. El desarrollo de líneas celulares especializadas
(denominadas "células empaquetadoras") que producen solamente
retrovirus defectivos para la replicación ha incrementado la
utilidad de los retrovirus para terapia génica, y los retrovirus
defectivos están bien caracterizados para ser usados en
transferencia génica a efectos de terapia génica (para un estudio al
respecto, véase Miller, A.D. (1990) Blood 76:271). Así,
pueden ser construidos retrovirus recombinantes en los cuales parte
de la secuencia codificante retroviral (gag, pol, env) ha
sido sustituida por ácido nucleico que codifica un polipéptido
hedgehog y hace que sea defectiva la replicación del retrovirus. El
retrovirus defectivo para la replicación es entonces empaquetado en
viriones que pueden ser usados para infectar una célula diana
mediante el uso de un virus colaborador por medio de técnicas
estándar. En Current Protocols in Molecular Biology,
Ausubel, F.M. et al. (eds.) Greene Publishing Associates,
(1989), Párrafos 9.10-9.14, y en otros manuales de
laboratorio estándar pueden encontrarse protocolos para producir
retrovirus recombinantes y para infectar células in vitro o
in vivo con tales virus. Los ejemplos de retrovirus adecuados
incluyen los pLJ, pZIP, pWE y pEM, que son perfectamente conocidos
para los expertos en la materia. Los ejemplos de líneas de virus
empaquetadores adecuados para preparar sistemas retrovirales tanto
ecotrópicos como anfotrópicos incluyen los Crip, Cre, 2 y Am. Han
sido usados retrovirus para introducir los de una variedad de genes
en muchos tipos de células distintos, entre los que se incluyen los
de células epiteliales, in vitro y/o in vivo (véase,
por ejemplo, Eglitis, et al. (1985) Science
230:1395-1398; Danos and Mulligan (1988) Proc.
Natl. Acad. Sci. USA 85:6460-6464; Wilson et
al. (1988) Proc. Natl. Acad. Sci. USA
85:3014-3018; Armentano et al. (1990)
Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87:6141-6145;
Huber et al. (1991) Proc. Natl. Acad. Sci. USA
88:8039-8043; Ferry et al. (1991) Proc.
Natl. Acad. Sci. USA 88:8377-8381; Chowdhury
et al. (1991) Science 254:1802-1805;
van Beusechem et al. (1992) Proc. Natl. Acad. Sci.
USA 89:7640-7644; Kay et al. (1992)
Human Gene Therapy 3:641-647; Dai et
al. (1992) Proc. Natl. Acad. Sci. USA
89:10892-10895; Hwu et al. (1993) J.
Immunol. 150:4104-4115; Patente U.S. Nº
4.868.116; Patente U.S. Nº 4.980.286; Solicitud al amparo del PCT
WO 89/07136; Solicitud al amparo del PCT WO 89/02468; Solicitud al
amparo del PCT WO 89/05345; y Solicitud al amparo del PCT WO
92/07573).
Además, se ha demostrado que es posible limitar
el espectro de infección de los retrovirus, y en consecuencia de
los vectores de base retroviral, a base de modificar las proteínas
empaquetadoras virales sobre la superficie de la partícula viral
(véanse, por ejemplo, las publicaciones al amparo del PCT
WO93/25234 y WO94/06920). Por ejemplo, las estrategias para la
modificación del espectro de infección de los vectores retrovirales
incluyen las siguientes: acoplar anticuerpos específicos para
antígenos de la superficie de las células a la proteína env
viral (Roux et al. (1989) PNAS
86:9079-9083; Julan et al. (1992) J. Gen
Virol 73:3251-3255; y Goud et al. (1983)
Virology 163:251-254); o acoplar ligandos de
receptor de la superficie de la célula a las proteínas env
virales (Neda et al. (1991) J Biol Chem
266:14143-14146). El acoplamiento puede ser en forma
de la reticulación química con una proteína u otra variedad (como
p. ej. lactosa para convertir la proteína env en una
asialoglicoproteína), así como a base de generar proteínas de
fusión (como p. ej. proteínas de fusión de anticuerpo de cadena
única/env). Si bien es útil para limitar o dirigir de otra
manera la infección a determinados tipos de tejido, esta técnica
puede ser también usada para convertir un vector ecotrópico en un
vector anfotrópico.
Además, el uso del suministro de genes
retrovirales puede ser adicionalmente favorecido por el uso de
secuencias reguladoras transcripcionales que sean específicas de
tejidos o específicas de células y controlen la expresión del gen
hedgehog (erizo) del vector retroviral.
Otro sistema de suministro de genes virales que
es útil en el presente método utiliza vectores derivados de
adenovirus. El genoma de un adenovirus puede ser manipulado de
forma tal que codifique y exprese un producto génico de interés pero
quede inactivado en cuanto a su capacidad para replicarse en un
ciclo vital viral lítico normal. Véase, por ejemplo, Berkner et
al. (1988) BioTechniques 6:616; Rosenfeld et al.
(1991) Science 252:431-434; y Rosenfeld
et al. (1992) Cell 68:143-155. Son
perfectamente conocidos para los expertos en la materia adecuados
vectores adenovirales derivados de la cepa de adenovirus Ad tipo 5
dl324 u otras cepas de adenovirus (como p. ej. las Ad2, Ad3, Ad7,
etc.). Los adenovirus recombinantes pueden ser ventajosos en
determinadas circunstancias por cuanto que los mismos pueden ser
usados para infectar los de una amplia variedad de tipos de células
entre los que se incluyen células epiteliales (Rosenfeld et
al. (1992) citado supra). Además, la partícula viral es
relativamente estable y se presta a purificación y concentración, y,
como se ha indicado anteriormente, puede ser modificada para
afectar al espectro de infectividad. Adicionalmente, el DNA
adenoviral introducido (y el DNA foráneo contenido en el mismo) no
queda integrado en el genoma de una célula huésped sino que sigue
siendo episomal, evitando con ello los problemas potenciales que
pueden producirse como resultado de una mutagénesis insercional en
las situaciones en las que el DNA introducido queda integrado en el
genoma huésped (como es p. ej. el caso del DNA retroviral). Además,
la capacidad de transporte del genoma adenoviral para el DNA foráneo
es considerable (de hasta 8 kilobases) en comparación con otros
vectores de suministro de genes (Berkner et al. citado
supra; Haj-Ahmand y Graham (1986) J.
Virol. 57:267). En los de la mayoría de los vectores
adenovirales defectivos para la replicación que están actualmente en
uso y son por consiguiente preferidos para la presente invención
están anuladas la totalidad o partes de los genes E1 y E3 virales,
pero se mantiene tanto como un 80% del material genético adenoviral
(véanse, p. ej., Jones et al. (1979) Cell 16:683;
Berkner et al., supra; y Graham et al. in
Methods in Molecular Biology, E.J. Murray, Ed. (Humana,
Clifton, NJ, 1991) vol. 7. pp. 109-127). La
expresión del gen hedgehog (erizo) insertado puede tener
lugar bajo el control del promotor E1A, del promotor tardío
principal (MLP) y de las correspondientes secuencias guía, del
promotor E3, o de secuencias promotoras añadidas exógenamente, por
ejemplo.
Además de los métodos de transferencia viral
tales como los anteriormente ilustrados, pueden ser también
empleados métodos no virales para ocasionar la expresión de un
polipéptido hedgehog en el tejido de un animal. Los métodos
no virales de transferencias de genes se basan en su mayoría en los
mecanismos normales que son utilizados por las células de mamíferos
para la captación y el transporte intracelular de macromoléculas. En
realizaciones preferidas, los sistemas no virales de suministro de
genes de la presente invención se basan en vías endocíticas para la
captación del gen polipeptídico hedgehog (erizo) por parte de
la célula establecida como diana u objetivo. Los ejemplos de
sistemas de suministro de genes de este tipo incluyen sistemas de
origen liposomal, conjugados de polilisina y envolturas virales
artificiales.
En escenarios clínicos, los sistemas de
suministro de genes para el gen hedgehog (erizo) terapéutico
pueden ser introducidos en un paciente por cualesquiera de los de
una serie de métodos que son todos y cada uno de ellos perfectamente
conocidos en la técnica. Por ejemplo, una preparación farmacéutica
del sistema de suministro de genes puede ser introducida
sistémicamente, p. ej. mediante inyección intravenosa, y la
transducción específica de la proteína en las células diana tiene
lugar predominantemente sobre la base de la especificidad de
transfección proporcionada por el vehículo de suministro de genes, o
de la expresión de tipo celular o de tipo tisular debida a las
secuencias reguladoras transcripcionales que controlan la expresión
del gen receptor, o de una combinación de las mismas. En otras
realizaciones, el suministro inicial del gen recombinante es más
limitado, siendo del todo localizada la introducción en el animal.
Por ejemplo, el vehículo de suministro de genes puede ser
introducido mediante catéter (véase la Patente U.S. 5.328.470) o
bien mediante inyección estereotáctica (véase, p. ej. Chen et
al. (1994) PNAS 91: 3054-3057). Un
constructo de expresión de hedgehog puede ser suministrado
en un constructo de terapia génica a células dérmicas por
electroporación, p. ej., utilizando técnicas descritas, por
ejemplo, por Dev et al. ((1994) Cancer Treat Rev
20:105-115).
La preparación farmacéutica del constructo de
terapia génica puede constar esencialmente del sistema de
suministro de genes en un diluyente aceptable, o bien puede
comprender una matriz de liberación lenta en la cual esté embebido
el vehículo de suministro de genes. Como alternativa, cuando todo
el sistema de suministro de genes pueda ser producido de manera
intacta a partir de células recombinantes, como p. ej. vectores
retrovirales, la preparación farmacéutica puede comprender una o
varias células que produzcan el sistema de suministro de genes.
En otra realización adicional, el agente
terapéutico hedgehog puede ser un constructo de "activación
génica" que, por recombinación homóloga con un DNA genómico,
altere las secuencias reguladoras transcripcionales de un gen
endógeno. Por ejemplo, el constructo de activación génica puede
sustituir al promotor endógeno de un gen hedgehog (erizo) por
un promotor heterólogo, como p. ej. uno que ocasione la expresión
constitutiva del gen hedgehog (erizo) o que ocasione la
expresión inducible del gen bajo condiciones distintas del patrón de
expresión normal del gen. Pueden ser análogamente establecidos como
diana otros genes en la vía de señalización de patched.
Están disponibles los de una variedad de distintos formatos para los
constructos de activación génica. Véanse, por ejemplo, las
publicaciones al amparo del PCT WO93/09222, WO95/31560, WO96/29411,
WO95/31560 y WO94/12650 de la Transkaryotic Therapies, Inc.
En realizaciones preferidas, la secuencia de
nucleótidos que es usada en calidad del constructo de activación
génica puede constar de (1) DNA de alguna parte del gen hedgehog
(erizo) endógeno (secuencia exón, secuencia intrón, secuencias
promotoras, etc.) que dirija la recombinación, y (2)
secuencia(s) reguladora(s) transcripcional(es)
heteróloga(s) que debe(n) ser ligada(s)
operativamente a la secuencia codificante para el gen hedgehog
(erizo) genómico tras la recombinación del constructo de
activación génica. Para su uso para generar cultivos de células
productoras de hedgehog, el constructo puede incluir
adicionalmente un gen informador para detectar la presencia del
constructo de alelo nulo en la célula.
El constructo de activación génica es insertado
en una célula y se integra en el DNA genómico de la célula en una
posición adecuada para establecer las secuencias reguladoras
heterólogas en asociación operativa con el gen hedgehog
(erizo) nativo. Tal inserción tiene lugar por recombinación
homóloga, es decir que las regiones de recombinación del constructo
de activación que son homólogas a la secuencia génica
hedgehog endógena se hibridan con el DNA genómico y se
recombinan con las secuencias genómicas de tal manera que el
constructo es incorporado en la correspondiente posición del DNA
genómico.
Las expresiones "región de recombinación" o
"secuencia de destinación" se refieren a un segmento (es
decir, a una parte) de un constructo de activación génica que tiene
una secuencia que es prácticamente idéntica o prácticamente
complementaria a una secuencia génica genómica, p. ej. incluyendo
las secuencias flanqueadoras del lado 5' del gen genómico, y puede
facilitar la recombinación homóloga entre la secuencia genómica y el
constructo transgénico de destinación.
En el sentido en el que se la utiliza en la
presente, la expresión "región de sustitución" se refiere a
una parte de un constructo de activación que queda integrada en una
ubicación cromosómica endógena a continuación de la recombinación
homóloga entre una región de recombinación y una secuencia
genómica.
Las secuencias reguladoras heterólogas que se
prevén p. ej. en la región de sustitución pueden incluir uno o
varios de los de una variedad de elementos entre los que se
incluyen promotores (tales como promotores constitutivos o
inducibles), potenciadores, elementos reguladores negativos,
regiones de control de locus, sitios de fijación para el factor de
transcripción, o combinaciones de los mismos. Los
promotores/potenciadores que pueden ser usados para controlar la
expresión del gen objetivo in vivo incluyen, aunque sin
carácter limitativo, el promotor/potenciador del citomegalovirus
(CMV) (Karasuyama et al., 1989, J. Exp. Med.,
169:13), el promotor de \beta-actina humano
(Gunning et al. (1987) PNAS
84:4831-4835), el promotor inducible por
glucocorticoides que está presente en la secuencia terminal
repetida larga del virus del tumor mamario de ratón (MMTV LTR)
(Klessig et al. (1984) Mol. Cell Biol.
4:1354-1362), las secuencias terminales repetidas
largas del virus de la leucemia murina de Moloney (MuLV LTR (Weiss
et al. (1985) RNA Tumor Viruses, Cold Spring Harbor
Laboratory, Cold Spring Harbor, Nueva York), el promotor región
temprano o tardío SV40 (Bernoist et al. (1981) Nature
290:304-310; Templeton et al. (1984) Mol.
Cell Biol., 4:817; y Sprague et al. (1983) J.
Virol., 45:773), el promotor que está contenido en la secuencia
terminal repetida larga del lado 3' del virus del sarcoma de Rous
(RSV) (Yamamoto et al., 1980, Cell,
22:787-797), el promotor/potenciador de timidina
cinasa del virus del herpes simplex (HSV) (Wagner et al.
(1981) PNAS 82:3567-71), y el promotor LAT
del virus del herpes simplex (Wolfe et al. (1992) Nature
Genetics, 1:379-384).
En un ejemplo de realización, partes de la región
flanqueadora del lado 5' del gen Shh humano son amplificadas usando
cebadores que añaden sitios de restricción, para generar los
siguientes fragmentos
5'-gcgcgcttcgaaGCGAGGCAGCCAGCGAGGGAGAGAGCGAGCGGGCGAGCCGGAGC-GAGGAAatcgatgc
gcgc (cebador 1)
gcgc (cebador 1)
5'-gcgcgcagatctGGGAAAGCGCAAGAGAGAGCGCACACGCACACACCCGCCGCGCG-CACTCGggatccgcg
cgc (cebador 2)
cgc (cebador 2)
Como se ha ilustrado, el cebador 1 incluye una
región no codificante del lado 5' del gen Shh humano y está
flanqueado por sitios de restricción para AsuII y ClaI. El cebador
2 incluye una parte de la región no codificante del lado 5' que está
inmediatamente en el lado 3' con respecto a la que está presente en
el cebador 1. La secuencia del gen hedgehog (erizo) está flanqueada
por sitios de restricción para XhoII y BamHI. Los amplímeros
purificados son cortados con cada una de las enzimas como es
adecuado.
El vector pCDNA1.1 (Invitrogen) incluye un
promotor de CMV. El plásmido es cortado con AsuII, que efectúa la
escisión justo en el lado 3' con respecto a la secuencia promotora
de CMV. El fragmento de AsuII/ClaI del cebador 1 es ligado al sitio
de escisión para AsuII del vector pcDNA. La ligación de ClaI/AsuII
destruye el sitio para AsuII en el extremo del lado 3' de un
cebador 1 correctamente insertado.
El vector es entonces cortado con BamHI, y un
fragmento de XhoII/BamHI del cebador 2 es ligado al sitio de
escisión para BamHI. Como antes, la ligación de BamHI/XhoII
destruye el sitio para BamHI en el extremo del lado 5' de un cebador
2 correctamente insertado.
Las colonias individuales son seleccionadas y
cortadas con AsuII y con BamHI, y es determinado el tamaño del
fragmento de AsuII/BamHI. Las colonias en las cuales las secuencias
tanto del cebador 1 como del cebador 2 están correctamente
insertadas son amplificadas adicionalmente y cortadas con AsuII y
con BamHI para producir el constructo de activación génica
En este constructo, las secuencias flanqueadoras
del cebador 1 y del cebador 2 proporcionan la región de
recombinación que permite la inserción del promotor de CMV delante
de la secuencia codificante para el gen Shh humano. Otros
promotores heterólogos (u otras secuencias reguladoras
transcripcionales) pueden ser insertados en un gen hedgehog
(erizo) genómico por un método similar.
En otras realizaciones adicionales, la región de
sustitución meramente anula un elemento de control transcripcional
negativo del gen nativo, p. ej. para activar la expresión, o
extirpa un elemento de control positivo, p. ej. para inhibir la
expresión del gen objetivo.
Pueden ser generadas composiciones con agente
terapéutico ptc por ejemplo con compuestos que se fijen a patched y
alteren su actividad de transducción de señales, compuestos que
alteren la fijación y/o actividad enzimática de una proteína (p. ej.
intracelular) que intervenga en la vía de señales de patched, y
compuestos que alteren el nivel de expresión de una proteína
hedgehog (erizo), una proteína patched o una proteína que intervenga
en la vía de transducción de señales intracelulares de patched.
La disponibilidad de los polipéptidos
hedgehog purificados y recombinantes facilita la generación
de sistemas de análisis que pueden ser usados para seleccionar
drogas, tales como pequeñas moléculas orgánicas, que sean agonistas
o antagonistas para con la función celular normal de una proteína
hedgehog y/o patched, y en particular para con su papel en
la patogénesis de proliferación y/o diferenciación de células
epiteliales. En una realización, el análisis evalúa la capacidad de
un compuesto para modular la fijación entre un polipéptido
hedgehog y un receptor para hedgehog tal como
patched. En otras realizaciones, el análisis sirve meramente
para puntuar la capacidad de un compuesto de ensayo para alterar la
actividad de transducción de señales de la proteína patched.
De esta manera pueden ser identificados los de una variedad de
agentes terapéuticos hedgehog de actividad tanto
proliferativa como antiproliferativa. Bastará con una variedad de
formatos de análisis que a la luz de la presente descripción será
comprendida por el experto en la materia.
En muchos programas de selección de drogas que
someten a ensayo a bibliotecas de compuestos y extractos naturales,
los análisis de alto rendimiento son deseables a fin de maximizar
el número de compuestos estudiados en un determinado periodo de
tiempo. Los análisis que son llevados a cabo en sistemas exentos de
células, tales como los que pueden obtenerse con proteínas
purificadas o semipurificadas, son a menudo denominados selecciones
"primarias" por cuanto que pueden ser generados para permitir
un rápido desarrollo y una relativamente fácil detección de una
alteración en una diana molecular que es mediada por un compuesto de
ensayo. Además, los efectos de toxicidad celular y/o
biodisponibilidad del compuesto de ensayo pueden ser en general
ignorados en el sistema in vitro, centrándose en lugar de
ello el análisis principalmente en el efecto de la droga en la
diana molecular según puede quedar de manifiesto en una alteración
de la afinidad de fijación con proteínas receptoras.
En consecuencia, en un ejemplo de análisis de
selección para la identificación de agentes terapéuticos
ptc, el compuesto de interés es puesto en contacto con una
mezcla que incluye una proteína receptora de hedgehog (como
p. ej. una célula que exprese el receptor patched) y una
proteína hedgehog (erizo) bajo condiciones en las cuales dicha
proteína receptora es de ordinario capaz de fijar la proteína
hedgehog (erizo). Es entonces añadida a la mezcla una
composición que contiene un compuesto de ensayo. La detección y
cuantificación de complejos de receptor/hedgehog proporciona
unos medios para determinar la eficacia del compuesto de ensayo
para inhibir (o potenciar) la formación de complejos entre la
proteína receptora y el polipéptido hedgehog. La eficacia
del compuesto puede ser valorada a base de generar curvas de
respuesta según dosis a partir de los datos obtenidos usando varias
concentraciones del compuesto de ensayo. Puede ser además llevado a
cabo un análisis de control para disponer de una línea base a
efectos comparativos. En el análisis de control, es añadido a la
proteína receptora polipéptido hedgehog aislado y
purificado, y es cuantificada en ausencia del compuesto de ensayo la
formación de complejo de receptor/hedgehog.
En otros casos, un agente terapéutico ptc es un
agente terapéutico que desorganiza la asociación de patched
a smoothened.
Los agonistas y antagonistas para con el
crecimiento de células epiteliales pueden ser distinguidos, y la
eficacia del compuesto puede ser valorada, mediante la realización
de subsiguientes ensayos con células epiteliales, p. ej. en
cultivo.
El polipéptido utilizado como receptor de
hedgehog puede ser generado a partir de la proteína
patched. En consecuencia, un ejemplo de análisis de selección
incluye la totalidad o una parte adecuada de la proteína
patched que puede ser obtenida del gen patched humano
(GenBank U43148), por ejemplo, u otras fuentes de vertebrados
(véanse los números de Accesión al GenBank U40074 para
patched de pollo y U46155 para patched de ratón), así
como de drosophila (número de Accesión al GenBank M28999) o
de otras fuentes de invertebrados. La proteína patched puede
preverse en el análisis de selección en forma de proteína intacta
(preferiblemente expresada en la superficie de una célula), o bien y
como alternativa en forma de un fragmento de la proteína de plena
longitud que se fija a polipéptidos hedgehog, en forma de uno
o ambos de los considerables dominios extracelulares (p. ej.
correspondientes a los residuos Asn120-Ser438 y/o
Arg770-Trp1027 de la proteína patched humana,
que son también potenciales antagonistas de la transducción de
señales dependiente de hedgehog). Por ejemplo, la proteína
patched puede preverse en forma soluble, como por ejemplo una
preparación de uno de los dominios extracelulares, o una
preparación de ambos dominios extracelulares que estén conectados
en enlace covalente por un ligador no estructurado (véase, por
ejemplo, Huston et al. (1988) PNAS 85:4879; y la Patente
U.S. Nº 5.091.513). En otras realizaciones, la proteína puede
preverse como parte de una preparación liposomal, o puede estar
expresada en la superficie de una célula. La proteína
patched puede ser obtenida de un gen recombinante, siendo p.
ej. expresada ectópicamente en una célula heteróloga. Por ejemplo,
la proteína puede ser expresada sobre oocitos, células de mamífero
(como p. ej. COS, CHO, 3T3 o similares) o células de levadura
mediante técnicas de DNA recombinante estándar. Estas células
recombinantes pueden ser usadas para análisis de fijación al
receptor, transducción de señales o expresión génica. Marigo et
al. (1996) Development 122:1225-1233
ilustran un análisis de fijación de hedgehog humano a
proteína patched de polluelo expresada ectópicamente en
oocitos de Xenopus laevis. El sistema de análisis de Marigo
et al. puede ser adaptado a los presentes análisis de
selección de drogas. Como se ilustra en esa referencia, Shh
se fija a la proteína patched de manera selectiva, saturable
y dependiente de la dosis, demostrando así que patched es un
receptor para Shh.
La formación de complejos entre el polipéptido
hedgehog y un receptor de hedgehog puede ser
detectada mediante las de una variedad de técnicas. Por ejemplo, la
modulación de la formación de complejos puede ser cuantificada
usando, por ejemplo, proteínas marcadas de manera detectable, tal
como radiomarcadas o marcadas por fluorescencia, o polipéptidos
hedgehog marcados enzimáticamente, mediante inmunoanálisis o
mediante detección cromatográfica.
Típicamente, para los análisis sin células será
deseable inmovilizar ya sea el receptor de hedgehog o bien
el polipéptido hedgehog para facilitar la separación de los
complejos de receptor/hedgehog de las formas de una de las
proteínas que no han formado complejos, así como para permitir la
automatización del análisis. En una realización, puede preverse una
proteína de fusión que añada un dominio que permita que la proteína
sea fijada a una matriz. Por ejemplo, proteínas de fusión de
glutationa-S-transferasa/receptor
(GST/receptor) pueden ser adsorbidas sobre perlas de glutationa
sefarosa (Sigma Chemical, St. Louis, MO) o placas de cultivo de
microtitulación derivatizadas con glutationa, que son entonces
combinadas con el polipéptido hedgehog, como p. ej. un
polipéptido hedgehog marcado con ^{35}S, y el compuesto de
ensayo, y son incubadas bajo condiciones conducentes a la formación
de complejos, y p. ej. en condiciones fisiológicas en cuanto a la
sal y al pH, si bien pueden desearse condiciones ligeramente más
rigurosas. A continuación de la incubación, las perlas son lavadas
para retirar todo el polipéptido hedgehog que no se haya
fijado, y la radiomarca fijada a las perlas matriz es determinada
directamente (siendo p. ej. las perlas puestas en escintilante), o
bien en el supernatante tras haber sido disociados los complejos de
receptor/hedgehog. Como alternativa, los complejos pueden
ser disociados de la perla y separados mediante gel de
SDS-PAGE (SDS-PAGE = electroforesis
en gel de poliacrilamida-dodecilsulfato sódico), y
el nivel de polipéptido hedgehog que se encuentra en la
fracción de la perla puede ser cuantificado a partir del gen
utilizando técnicas de electroforesis estándar.
Están también disponibles para ser usadas en el
análisis que es objeto de la presente otras técnicas para
inmovilizar proteínas sobre matrices. Por ejemplo, partes solubles
de la proteína receptora hedgehog pueden ser inmovilizadas
utilizando una conjugación de biotina y estreptavidina. Por
ejemplo, pueden prepararse moléculas receptoras biotiniladas a base
de biotina-NHS
(N-hidroxisuccinimida) utilizando técnicas que son
perfectamente conocidas en el ramo (como p. ej. el conjunto de
materiales y utensilios de biotinilización de la Pierce Chemicals,
Rockford, IL), y dichas moléculas pueden ser inmovilizadas en las
cavidades de placas de cultivo de 96 cavidades recubiertas con
estreptavidina (Pierce Chemical). Como alternativa, anticuerpos que
sean reactivos para con el receptor de hedgehog pero que no
interfieran en la fijación de hedgehog pueden ser
derivatizados en las cavidades de la placa de cultivo, y el
receptor puede ser atrapado en las cavidades por conjugación con los
anticuerpos. Como se ha indicado anteriormente, preparaciones de un
polipéptido hedgehog y un compuesto de ensayo son incubadas
en las cavidades de la placa de cultivo que presentan el receptor, y
puede ser cuantificada la cantidad de complejo de
receptor/hedgehog atrapada en la cavidad. Los ejemplos de
métodos para detectar tales complejos, además de los descritos
anteriormente para los complejos inmovilizados en GST, incluyen la
inmunodetección de complejos usando anticuerpos que sean reactivos
con el polipéptido hedgehog o que sean reactivos con la
proteína receptora y compitan por la fijación con el polipéptido
hedgehog; así como análisis ligados a enzimas que se basen en
la detección de una actividad enzimática asociada al polipéptido
hedgehog. En el caso de éstos últimos, la enzima puede estar
conjugada químicamente o prevista como proteína de fusión con el
polipéptido hedgehog. A título ilustrativo, el polipéptido
hedgehog puede ser reticulado químicamente o fusionado
genéticamente con fosfatasa alcalina, y la cantidad de polipéptido
hedgehog atrapada en el complejo puede ser evaluada con un
sustrato cromogénico de la enzima, como p. ej.
paranitrofenilfosfato. Análogamente, puede preverse una proteína de
fusión que comprenda el polipéptido hedgehog y
glutationa-S-transferasa, y la
formación de complejo puede ser cuantificada a base de detectar la
actividad de GST usando
1-cloro-2,4-dimitrobenceno
(Habig et al. (1974) J Biol Chem 249:7130).
Para los procesos que se basan en la
inmunodetección para cuantificar una de las proteínas atrapadas en
el complejo, pueden usarse anticuerpos contra la proteína tales
como los anticuerpos anti-hedgehog que aquí se describen.
Como alternativa, la proteína que debe ser detectada en el complejo
puede ser "identificada con epítope" en forma de una proteína
de fusión que incluya, además del polipéptido hedgehog o de
la secuencia receptora de hedgehog, un segundo polipéptido
para el cual estén disponibles sin problemas anticuerpos (p. ej. de
fuentes comerciales). Por ejemplo, las proteínas de fusión con GST
anteriormente descritas pueden ser también usadas para la
cuantificación de la fijación utilizando anticuerpos contra la mitad
GST. Otros útiles epítopes identificadores incluyen
myc-epítopes (véase, p. ej. Ellison et al.
(1991) J Biol Chem 266:21150-21157), lo cual
incluye una secuencia de 10 residuos de c-myc, así
como el sistema pFLAG (International Biotechnologies, Inc.) o el
sistema pEZZ-proteína A (Pharamacia, NJ).
Cuando la deseada parte del receptor de
hedgehog (u otra molécula de fijación a hedgehog) no
pueda preverse en forma soluble, pueden usarse vesículas liposomales
para disponer de fuentes manipulables y aislables del receptor. Por
ejemplo, tanto formas auténticas como formas recombinantes de la
proteína patched pueden ser reconstituidas en vesículas de
lípidos artificiales (como p. ej. liposomas de fosfatidilcolina) o
en vesículas sacadas de membranas celulares (véase, por ejemplo,
Bear et al. (1992) Cell 68:809-818;
Newton et al. (1983) Biochemistry
22:6110-6117; y Reber et al. (1987) J Biol
Chem 262:11369-11374).
Además de los análisis sin células tales como los
descritos anteriormente, la fuente de suministro sin problemas de
proteínas hedgehog con que se cuenta en la técnica facilita
también la generación de análisis basados en células para
identificar pequeñas moléculas agonistas/antagonistas y similares.
Análogamente al caso de los análisis basados en células que han
sido descritos anteriormente para la selección de bibliotecas
combinatorias, células que son sensibles a la inducción de
hedgehog, como p. ej. células que expresan patched u
otras células de origen epitelial que sean sensibles a la inducción
de hedgehog, pueden ser puestas en contacto con una proteína
hedgehog y un agente de ensayo de interés, puntuando el
análisis todo lo que va desde la simple fijación a la célula hasta
la modulación de las respuestas inductivas para hedgehog por
parte de la célula diana en presencia y en ausencia del agente de
ensayo. Como en el caso de los análisis sin células, pueden ser
identificados los agentes que produzcan una variación
estadísticamente significante de las actividades de hedgehog
(ya sea la inhibición o bien la potenciación).
En otros casos, el análisis basado en células
permite identificar y seleccionar los agentes que desorganizan la
asociación de proteínas patched y smoothened, p. ej. en la
membrana de la superficie de la célula o en una preparación
liposomal.
Además de para caracterizar las células que
expresan de manera natural la proteína patched, células que
han sido manipuladas genéticamente para expresar ectópicamente
patched pueden ser utilizadas para análisis de selección de
drogas. A título de ejemplo, células que expresen bajos niveles o
que carezcan de expresión de la proteína patched, como p.
ej. oocitos de Xenopus laevis, células COS o células de
levadura, pueden ser modificadas genéticamente utilizando técnicas
estándar para expresar ectópicamente la proteína patched
(véase Marigo et al., supra).
Las células recombinantes resultantes, que
expresan p. ej. un receptor patched funcional, pueden ser
utilizadas en análisis de fijación al receptor para identificar
agonistas o antagonistas de la fijación de hedgehog. Pueden
ser efectuados análisis de fijación usando células intactas.
Además, las células recombinantes de la presente invención pueden
ser manipuladas para que incluyan otros genes heterólogos que
codifiquen proteínas que intervengan en las vías de señales
dependientes de hedgehog. Por ejemplo, los productos génicos
de uno o varios de los miembros del grupo que consta de
smoothened, costal-2 y/o fused pueden
ser coexpresados con patched en la célula reactiva, siendo
los análisis sensibles a la reconstitución funcional de la cascada
de transducción de señales de hedgehog.
Como alternativa, pueden ser utilizadas
preparaciones liposomales usando proteína patched
reconstituida. Proteína patched purificada a partir de
extractos obtenidos con detergente y de orígenes tanto auténtico
como recombinante puede ser reconstituida en vesículas de lípido
artificial (como p. ej. liposomas de fosfatidilcolina) o en
vesículas sacadas de las membranas de células (véase, por ejemplo,
Bear et al. (1992) Cell 68:809-818;
Newton et al. (1983) Biochemistry
22:6110-6117; y Reber et al. (1987) J Biol
Chem 262:11369-11374). La estructura laminar y
el tamaño de los liposomas resultantes pueden ser caracterizados
utilizando microscopia electrónica. La orientación externa de la
proteína patched en las membranas reconstituidas puede ser
demostrada, por ejemplo, mediante microscopia inmunoelectrónica. La
actividad de fijación de la proteína hedgehog de liposomas
que contienen patched y liposomas sin la proteína en
presencia de agentes candidatos puede ser comparada a fin de
identificar los moduladores potenciales de la interacción de
hedgehog-patched.
La proteína hedgehog usada en estos
análisis basados en células puede preverse en forma de fuente
purificada (de origen natural o recombinante) o bien en forma de
células/tejido que expresan la proteína y son cocultivados con las
células diana. Al igual como en el caso de los análisis sin
células, en los que la simple fijación (en lugar de la inducción)
es la actividad de hedgehog que es evaluada en el análisis, la
proteína puede ser marcada mediante cualesquiera de las técnicas
que han sido mencionadas anteriormente, como es p. ej. el caso de
la marcación por fluorescencia, la marcación enzimática o la
marcación radiactiva, o bien puede ser detectada por
inmunoanálisis.
Además de para los estudios de fijación, los
análisis funcionales pueden ser utilizados para identificar
moduladores, es decir agonistas o antagonistas, de las actividades
de hedgehog o patched. A base de detectar las
variaciones de las señales intracelulares, tales como las
alteraciones de los segundos mensajeros o de la expresión génica, en
las células que expresan patched y que han sido puestas en
contacto con un agente de ensayo, pueden ser identificados los
agonistas y antagonistas candidatos para con la señalización de
patched.
Han estado implicados en la transducción de
señales mediada por patched los de una serie de productos
génicos entre los que se incluyen patched, el factor de
transcripción cubitus interruptus (ci), la serina/treonina
cinasa fused (fu) y los productos génicos de
costal-2, smoothened y suppressor of
fused.
La interacción de una proteína hedgehog con
patched pone en movimiento una cascada que supone la
activación e inhibición de efectores del lado de cola y cuya última
consecuencia es, en algunos casos, una variación detectable de la
transcripción o traducción de un gen. Los potenciales objetivos o
dianas transcripcionales de la señalización de patched son el
propio gen patched (Hidalgo y Ingham, 1990
Development 110, 291-301; Marigo et
al., 1996) y los homólogos de vertebrados del gen cubitus
interruptus de drosophila, o sea los genes GLI
(Hui et al. (1994) Dev Biol
162:402-413). Se ha demostrado que la expresión del
gen patched es inducida en células del esbozo de los miembros
y de la placa neural que responden a Shh. (Marigo et
al. (1996) PNAS, en impresión; Marigo et al.
(1996) Development 122:1225-1233). Los genes
GLI codifican putativos factores de transcripción que tienen
dominios dedo de cinc de fijación a DNA (Orenic et al.
(1990) Genes & Dev 4:1053-1067; Kinzler
et al. (1990) Mol Cell Biol
10:634-642). Se ha descrito que la transcripción del
gen GLI es regulada en el sentido de un incremento en
respuesta a hedgehog en los esbozos de los miembros, mientras
que la transcripción del gen GLI3 es regulada en el sentido
de un decremento en respuesta a la inducción de hedgehog
(Marigo et al. (1996) Development
122:1225-1233). Seleccionando las secuencias
reguladoras transcripcionales de tales genes diana, como p. ej. de
los genes patched o GLI, que son responsables de la
regulación en el sentido de un incremento o de un decremento de la
transcripción de estos genes en respuesta a la señalización de
patched, y ligando operativamente tales promotores a un gen
informador, puede obtenerse un análisis basado en la transcripción
que es sensible a la capacidad de un específico compuesto de ensayo
para modificar las vías de señalización de patched. Así, la
expresión del gen informador proporciona una valiosa herramienta de
selección para el desarrollo de compuestos que actúen como
agonistas o como antagonistas para con la inducción por ptc
de la diferenciación/quiescencia.
Los análisis basados en genes informadores según
esta invención miden la fase final de la anteriormente descrita
cascada de eventos, como p. ej. la modulación transcripcional. En
consecuencia, en la puesta en práctica de una realización del
análisis, un constructo de gen informador es insertado en la célula
reactiva a fin de generar una señal de detección que es dependiente
de la señalización de ptc. Para identificar potenciales
elementos reguladores que respondan a la señalización de ptc
que está presente en la secuencia reguladora transcripcional de un
gen diana, utilizando técnicas estándar pueden construirse
deleciones anidadas de clones genómicos del gen diana. Véanse, por
ejemplo, Current Protocols in Molecular Biology, Ausubel,
F.M. et al. (eds.) Greene Publishing Associates, (1989);
Patente U.S. 5.266.488; Sato et al. (1995) J Biol
Chem 270:10314-10322; y Kube et al.
(1995) Cytokine 7:1-7. Un conjunto anidado
de fragmentos de DNA de la región flanqueadora del lado 5' del gen
es situado en el lado de cabeza con respecto a un gen informador
tal como el gen de luciferasa, y es sometido a análisis para
determinar su capacidad para dirigir la expresión del gen informador
en las células que expresan patched. Las células huésped
transfectadas transitoriamente con constructos del gen informador
pueden ser sometidas a análisis para determinar la inducción de la
expresión del gen informador en presencia y en ausencia de
hedgehog para determinar las secuencias reguladoras que son
responsables de la señalización dependiente de patched.
En la puesta en práctica del análisis, un
constructo de gen informador es insertado en la célula reactiva a
fin de generar una señal de detección dependiente de segundos
mensajeros generados por inducción con proteína hedgehog
(erizo). Típicamente, el constructo de gen informador incluirá
un gen informador en ligación operativa con uno o varios elementos
reguladores transcripcionales que responden a la actividad de
hedgehog, proporcionando el nivel de expresión del gen
informador la señal de detección dependiente de hedgehog. La
cantidad de transcripción del gen informador puede ser medida
utilizando cualesquiera de los métodos que consideren adecuados los
expertos en la materia. Por ejemplo, la expresión de RNAm del gen
informador puede ser detectada usando protección frente a la RNasa o
la reacción en cadena de la polimerasa basada en RNA, o bien el
producto proteico del gen informador puede ser identificado
mediante una coloración característica o una actividad intrínseca.
La cantidad de expresión del gen informador es entonces comparada
con la cantidad de expresión en la misma célula en ausencia del
compuesto de ensayo (o hedgehog), o bien puede ser comparada
con la cantidad de transcripción en una célula prácticamente
idéntica que carezca de la proteína receptora objetivo. Toda
diferencia estadísticamente significante o significante de otro modo
en la cantidad de transcripción indica que el compuesto de ensayo
ha alterado de alguna manera la transducción de señales de la
proteína patched, siendo p. ej. el compuesto de ensayo un
potencial agente terapéutico ptc.
Como se describe más detalladamente a
continuación, el producto génico del informador es detectado por
medio de una actividad intrínseca asociada a ese producto. Por
ejemplo, el gen informador puede codificar un producto génico que,
mediante actividad enzimática, dé lugar a una señal de detección
basada en el color, en la fluorescencia o en la luminiscencia. En
otros casos, el gen informador o marcador aporta una ventaja de
crecimiento selectivo, y p. ej. el gen informador puede incrementar
la viabilidad de la célula, eliminar una necesidad nutricional de
la célula y/o proporcionar resistencia a una droga.
Son genes informadores preferidos aquéllos que
son fácilmente detectables. El gen informador puede ser también
incluido en el constructo en forma de un gen de fusión con un gen
que incluya deseadas secuencias reguladoras transcripcionales o
presente otras propiedades deseables. Los ejemplos de genes
informadores incluyen, aunque sin carácter limitativo, CAT
(cloramfenicol acetil transferasa) (Alton y Vapnek (1979), Nature
282: 864-869); luciferasa y otros sistemas de
detección enzimática tales como beta-galactosidasa;
luciferasa de la luciérnaga (deWet et al. (1987), Mol. Cell.
Biol. 7:725-737); luciferasa bacteriana (Engebrecht
y Silverman (1984), PNAS 1: 4154-4158; Baldwin et
al. (1984), Biochemistry 23: 3663-3667);
fosfatasa alcalina (Toh et al. (1989) Eur. J. Biochem. 182:
231-238, Hall et al. (1983) J. Mol. Appl.
Gen. 2: 101) y fosfatasa alcalina secretada placentaria humana
(Cullen y Malim (1992) Methods in Enzymol,
216:362-368).
Los elementos de control transcripcional que
pueden ser incluidos en un constructo de gen informador incluyen,
aunque sin carácter limitativo, promotores, potenciadores y sitios
de fijación de represores y activadores. Los adecuados elementos
reguladores transcripcionales pueden sacarse de las regiones
reguladoras transcripcionales de genes cuya expresión sea inducida
tras la modulación de una vía de transducción de señales de
patched. Las características de los genes preferidos de los
cuales se sacan los elementos de control transcripcional incluyen,
aunque sin carácter limitativo, una baja o indetectable expresión en
las células quiescentes, una rápida inducción al nivel
transcripcional a unos minutos de la estimulación extracelular, una
inducción que es transitoria e independiente de la nueva síntesis de
proteína, que la subsiguiente cesación de la transcripción requiera
una nueva síntesis de proteína, y que los RNAms transcritos a
partir de estos genes tengan una corta vida media. No es necesario
que estén presentes todas estas propiedades.
La generación de segundos mensajeros puede ser
medida directamente en el paso de detección, tal como por ejemplo al
ser cuantificados la movilización del calcio intracelular, el
metabolismo de fosfolípidos o la actividad de adenilato ciclasa,
podrían ser medidos los productos de la hidrólisis de fosfolípidos
IP_{3}, DAG o cAMP. Por ejemplo, recientes estudios han implicado
la proteína cinasa A (PKA) como un posible componente de la
señalización de hedgehog/patched (Hammerschmidt et
al. (1996) Genes & Dev 10:647). Se ha demostrado que
la alta actividad de PKA antagoniza la señalización de
hedgehog en estos sistemas. A pesar de que no está claro si
la PKA actúa directamente en el lado de cola o en paralelo con
respecto a la señalización de hedgehog, es posible que la
señalización de hedgehog se produzca por vía de la
inhibición de la actividad de PKA. Por consiguiente, la detección de
la actividad de PKA proporciona una lectura potencial para los
presentes análisis.
Como ejemplo comparativo, el agente terapéutico
ptc es un inhibidor de PKA. Son conocidos en la técnica los
de una variedad de inhibidores de PKA entre los que se incluyen
compuestos tanto peptidílicos como orgánicos. Por ejemplo, el agente
terapéutico ptc puede ser una
5-isoquinolinasulfonamida tal como la representada
en la fórmula general:
donde:
R_{1} y R_{2} pueden representar cada uno
independientemente hidrógeno, y, según lo permitan la valencia y la
estabilidad, un alquilo inferior, un alquenilo inferior, un
alquinilo inferior, un carbonilo (tal como un carboxilo, un éster,
un formiato o una cetona), un tiocarbonilo (tal como un tioéster,
un tioacetato o un tioformiato), un amino, un acilamino, un amido,
un ciano, un nitro, un azido, un sulfato, un sulfonato, un
sulfonamido, -(CH_{2})_{m}-R_{8},
-(CH_{2})_{m}-OH,
-(CH_{2})_{m}-O-
alquilo inferior, -(CH_{2})_{m}-O-alquenilo inferior_{8}, -(CH_{2})_{n}-O-(CH_{2})_{m}-R_{8}, -(CH_{2})_{m}-SH, -(CH_{2})_{m}-S-alquilo inferior,
-(CH_{2})_{m}-S-alquenilo inferior, -(CH_{2})_{n}-S-(CH_{2})_{m}-R_{8}, o bien
alquilo inferior, -(CH_{2})_{m}-O-alquenilo inferior_{8}, -(CH_{2})_{n}-O-(CH_{2})_{m}-R_{8}, -(CH_{2})_{m}-SH, -(CH_{2})_{m}-S-alquilo inferior,
-(CH_{2})_{m}-S-alquenilo inferior, -(CH_{2})_{n}-S-(CH_{2})_{m}-R_{8}, o bien
R_{1} y R_{2} tomados junto con N forman un
heterociclo (sustituido o insustituido);
R_{3} está ausente o representa una o varias
sustituciones en el anillo de isoquinolina, tales como un alquilo
inferior, un alquenilo inferior, un alquinilo inferior, un
carbonilo (tal como un carboxilo, un éster, un formiato o una
cetona), un tiocarbonilo (tal como un tioéster, un tioacetato o un
tioformiato), un amino, un acilamino, un amido, un ciano, un nitro,
un azido, un sulfato, un sulfonato, un sulfonamido,
-(CH_{2})_{m}-R_{8},
-(CH_{2})_{m}-OH,
-(CH_{2})_{m}-O-alquilo
inferior, -(CH_{2})_{m}
-O-alquenilo inferior, -(CH_{2})_{n}-O-(CH_{2})_{m}-R_{8}, -(CH_{2})_{m}-SH, -(CH_{2})_{m}-S-alquilo inferior, -(CH_{2})_{m}-S-alquenilo inferior, -(CH_{2})_{n}-S-(CH_{2})_{m}-R_{8};
-O-alquenilo inferior, -(CH_{2})_{n}-O-(CH_{2})_{m}-R_{8}, -(CH_{2})_{m}-SH, -(CH_{2})_{m}-S-alquilo inferior, -(CH_{2})_{m}-S-alquenilo inferior, -(CH_{2})_{n}-S-(CH_{2})_{m}-R_{8};
R_{8} representa un arilo, aralquilo,
cicloalquilo, cicloalquenilo o heterociclo sustituido o
insustituido; y
n y m son independientemente para cada caso cero
o un entero de 1 a 6.
En una realización comparativa, el inhibidor de
PKA es
N-[2-((p-bromocinamil)amino)etil]-5-isoquinolinasulfonamida
(H-89; Nº de Catálogo 371963 de Calbiochem), p.
ej., que tiene la fórmula:
En otra realización comparativa, el inhibidor de
PKA es
1-(5-isoquinolinasulfonil)-2-metilpiperazina
(H-7; Nº de Catálogo 371955 de Calbiochem), p. ej.,
que tiene la fórmula:
En otras realizaciones comparativas adicionales,
el inhibidor de PKA es KT5720 (Nº de Catálogo 420315 de
Calbiochem), que tiene la estructura:
Son también útiles como inhibidores de PKA los de
una variedad de análogos de nucleósidos. Por ejemplo, el método que
es objeto de la presente puede ser ejecutado con análogos de
3',5'-fosfato cíclico de adenosina (AMP cíclico) que
inhiban la actividad de cinasa de PKA, como es por ejemplo el caso
del 8-bromo-AMPc o del
dibutiril-AMPc
Los ejemplos de inhibidores peptidílicos de la
actividad de PKA incluyen el Inhibidor Termoestable de PKA
(isoforma \alpha; véase, por ejemplo, el Nº de Catálogo 539488 de
Calbiochem, y Wen et al. (1995) J Biol Chem
270:2041).
Determinados receptores de hedgehog pueden
estimular la actividad de fosfolipasas. Los lípidos de inositol
pueden ser extraídos y analizados utilizando técnicas estándar de
extracción de lípidos. Los derivados solubles en agua de los tres
lípidos de inositol (IP_{1}, IP_{2}, IP_{3}) pueden ser
también cuantificados utilizando técnicas de radiomarcación o
cromatografía de líquidos de alta resolución.
La movilización del calcio intracelular o la
entrada de calcio desde el exterior de la célula puede ser una
respuesta a la estimulación de hedgehog o a la ausencia de la
misma. El flujo de calcio en la célula reactiva puede ser medido
utilizando técnicas estándar. La elección del apropiado indicador
de calcio, ya sea fluorescente, bioluminiscente, metalocrómico o
microelectrodos sensibles al Ca^{++}, depende del tipo de célula y
de la magnitud y la constante de tiempo del evento en estudio
(Borle (1990) Environ Health Perspect
84:45-56). Como ejemplo del método de detección del
Ca^{++}, las células podrían ser cargadas con el colorante
fluorescente sensible al Ca^{++} fura-2 o
indo-1, utilizando métodos estándar, y toda
variación del Ca^{++} podría ser medida utilizando un
fluorómetro.
En determinadas realizaciones del análisis, puede
ser deseable detectar variaciones de la fosforilación celular. A
título de ejemplo, el gen fused (fu) de drosophila,
que codifica una serina/treonina cinasa, ha sido identificado como
potencial objetivo del lado de cola en la señalización de
hedgehog. (Preat et al., 1990 Nature
347,87-89; Therond et al. 1993, Mech.
Dev. 44. 65-80). La capacidad de los compuestos
para modular la activación de serina/treonina cinasa podría ser
sometida a selección utilizando inmunotransferencia de colonias
(Lyons and Nelson (1984) Proc. Natl. Acad. Sci. USA
81:7426-7430) usando anticuerpos contra residuos de
serina o treonina fosforilados. Los reactivos para llevar a cabo
tales análisis están disponibles comercialmente, pudiendo ser por
ejemplo adquiridos a proveedores comerciales anticuerpos
específicos de fosfoserina y fosfotreonina que miden los incrementos
de la fosforilación de esos residuos.
En otro caso adicional, el agente terapéutico
ptc es una molécula antisentido que inhibe la expresión de
una proteína que interviene en una vía de transducción de señales
mediada por patched. A título ilustrativo, inhibiendo la
expresión de una proteína que intervenga en las señales de
patched, tal como es el caso de los genes fused,
costal-2, smoothened y/o Gli, puede alterarse la
capacidad de la(s) vía(s) de señales de patched para
inhibir la proliferación de una célula, pudiendo ser p. ej. dicha
capacidad potenciada o reprimida.
En el sentido en el que se la utiliza en la
presente, la expresión "terapia antisentido" se refiere a la
administración o generación in situ de sondas
oligonucleotídicas o de sus derivados que se hibriden (que p. ej. se
fijen) específicamente bajo condiciones celulares con RNAm celular
y/o DNA genómico codificando una proteína hedgehog (erizo),
patched o una proteína que intervenga en la transducción de señales
mediada por patched. La hibridación deberá inhibir la expresión de
esa proteína, p. ej. a base de inhibir la transcripción y/o
traducción. La fijación puede ser por complementariedad de pares de
bases convencional, o bien, por ejemplo en el caso de la fijación a
DNAs de dos hebras, a través de interacciones específicas en el
surco mayor de la doble hélice. En general, la expresión "terapia
antisentido" se refiere a la gama de técnicas que son empleadas
en general en el ramo, e incluye toda terapia que se base en la
fijación específica a secuencias oligonucleotídicas.
Un constructo antisentido puede ser suministrado,
por ejemplo, en forma de un plásmido de expresión que, al ser
transcrito en la célula, produzca RNA que sea complementario de al
menos una parte singular del RNAm celular objetivo. Como
alternativa, el constructo antisentido es una sonda
oligonucleotídica que es generada ex vivo y que, al ser
introducida en la célula, ocasiona la inhibición de la expresión a
base de hibridarse con las secuencias de RNAm y/o genómica de un
gen objetivo. Tales sondas oligonucleotídicas son preferiblemente
oligonucleótidos modificados que son resistentes a las nucleasas
endógenas, como p. ej. exonucleasas y/o endonucleasas, y son por
consiguiente estables in vivo. Son ejemplos de moléculas de
ácido nucleico que pueden ser usadas como oligonucleótidos
antisentido análogos de fosforamidato, fosfotioato y metilfosfonato
de DNA (véanse también las Patentes U.S. 5.176.996, 5.264.564 y
5.256.775). Adicionalmente, enfoques generales para la construcción
de oligómeros útiles en terapia antisentido han sido estudiados,
por ejemplo, por Van der Krol et al. (1988)
Biotechniques 6:958-976; y Stein et
al. (1988) Cancer Res 48:2659-2668.
Al construir oligonucleótidos antisentido
destinados a ser usados en los métodos de la invención deberán
hacerse varias consideraciones: (1) Los oligos deberán tener un
contenido de GC de un 50% o más; (2) deberán evitarse las secuencias
con tramos de 3 o más G's; y (3) los oligonucleótidos no deberán
tener una longitud de más de 25-26 mers. Cuando se
somete a ensayo a un oligonucleótido antisentido, puede construirse
un control discordante. Los controles pueden ser generados a base
de invertir el orden de la secuencia del correspondiente
oligonucleótido antisentido a fin de conservar la misma proporción
de bases.
El agente terapéutico ptc puede ser un
constructo antisentido para inhibir la expresión de patched,
p. ej. para imitar la inhibición de patched por parte de
hedgehog. Los ejemplos de constructos antisentido incluyen
los siguientes:
5'-GTCCTGGCGCCGCCGCCGCCGTCGCC
5'-TTCCGATGACCGGCCTTTCGCGGTGA
5'-GTGCACGGAAAGGTGCAGGCCACACT
La fuente de los agentes terapéuticos hedgehog a
utilizar en la preparación de formulaciones dependerá de la forma
específica del agente. Pueden ser sintetizadas químicamente y
puestas en una forma pura adecuada para uso farmacéutico/cosmético
pequeñas moléculas orgánicas y fragmentos de peptidilo. Los
productos de extractos naturales pueden ser purificados según
técnicas que son conocidas en el ramo. Por ejemplo, la Patente U.S.
5.286.654 de Cox et al. describe un método para purificar
formas naturales de una proteína secretada y puede ser adaptada
para la purificación de polipéptidos hedgehog. Están también
disponibles fuentes recombinantes de polipéptidos hedgehog. Por
ejemplo, los genes que codifican polipéptidos hedgehog son
conocidos, inter alia, por las publicaciones al amparo del
PCT WO 95/18856 y WO 96/17924.
Los expertos en el tratamiento de tejidos
epiteliales pueden determinar la cantidad efectiva de un agente
terapéutico hedgehog o ptc que debe ser incorporada en la
formulación de una preparación farmacéutica o cosmética.
Las formulaciones con agentes terapéuticos
hedgehog que son usadas en el método de la invención son con la
máxima preferencia aplicadas en forma de composiciones apropiadas.
Pueden citarse como composiciones apropiadas todas las composiciones
que son habitualmente empleadas para administrar drogas sistémica o
tópicamente. El vehículo farmacéuticamente aceptable deberá ser
prácticamente inerte, a fin de que no actúe en el componente activo.
Los vehículos inertes adecuados incluyen el agua, el alcohol
polietilenglicol, el aceite mineral o la vaselina, el
propilenglicol y vehículos similares.
Para preparar las composiciones farmacéuticas de
esta invención, una cantidad efectiva del específico agente
terapéutico hedgehog en calidad del ingrediente activo es combinada
en mezcla íntima con un vehículo farmacéuticamente aceptable,
pudiendo dicho vehículo adoptar las de una amplia variedad de
formas en dependencia de la forma de preparación deseada para la
administración. Estas composiciones farmacéuticas son deseables en
formas de dosificación unitaria adecuadas particularmente para
administración por vía oral, rectal o percutánea o mediante
inyección parenteral. Por ejemplo, al preparar las composiciones en
forma de dosificación oral pueden emplearse cualesquiera de los
habituales medios farmacéuticos tales como, por ejemplo, agua,
glicoles, aceites, alcoholes y medios similares en el caso de las
preparaciones orales líquidas tales como suspensiones, jarabes,
elixires y soluciones; o bien vehículos sólidos tales como
almidones, azúcares, caolín, lubricantes, aglutinantes, agentes
desintegradores y vehículos similares en el caso de los polvos, las
píldoras, las cápsulas y las tabletas. Debido a su facilidad de
administración, las tabletas y las cápsulas representan la forma de
unidad de dosificación oral más ventajosa, en cuyo caso se emplean
obviamente vehículos farmacéuticos sólidos. Para composiciones
parenterales, el vehículo comprenderá habitualmente agua estéril,
al menos en gran parte, si bien pueden incluirse otros ingredientes
por ejemplo para contribuir a la solubilidad. Pueden prepararse por
ejemplo soluciones inyectables en las cuales el vehículo comprende
solución salina, solución de glucosa o una mezcla de solución salina
y solución de glucosa. Pueden también prepararse suspensiones
inyectables, en cuyo caso pueden emplearse apropiados vehículos
líquidos, agentes de suspensión e ingredientes similares. Están
también incluidas las preparaciones en forma sólida que están
destinadas a ser convertidas poco antes del uso en preparaciones en
forma líquida. En las composiciones que son adecuadas para
administración percutánea, el vehículo comprende opcionalmente un
agente mejorador de la penetración y/o un adecuado agente mojante,
combinado opcionalmente con adecuados aditivos de cualquier
naturaleza en pequeñas proporciones, cuyos aditivos no deberán dar
lugar a un importante efecto perjudicial en la piel.
Además de la aplicación tópica directa de las
preparaciones, las mismas pueden ser administradas tópicamente por
otros métodos, estando por ejemplo encapsuladas en una matriz
sensible a la temperatura y/o a la presión o en película o vehículo
sólido que sea soluble en los fluidos corporales y similares para
una subsiguiente liberación, y preferiblemente para una liberación
sostenida, del componente activo.
Como composiciones adecuadas para aplicación
tópica pueden citarse todas las composiciones que son habitualmente
empleadas para administrar tópicamente agentes terapéuticos, como
son p. ej. las cremas, los geles, los apósitos, los champús, las
tinturas, las pastas, los ungüentos, las pomadas, los polvos, las
formulaciones líquidas o semilíquidas y composiciones similares. La
aplicación de dichas composiciones puede hacerse mediante aerosol
p. ej. con un propelente tal como nitrógeno, dióxido de carbono o un
freón, o sin propelente tal como en el caso de un pulverizador de
bomba, o bien en forma de gotas, lociones o un semisólido tal como
una composición espesada que pueda ser aplicada con un tampón. En
determinadas composiciones, serán convenientemente usadas
composiciones semisólidas tales como pomadas, cremas, pastas,
geles, ungüentos y composiciones similares.
Es especialmente ventajoso formular las
composiciones que son objeto de la presente en forma de unidad de
dosificación en aras de la facilidad de administración y de la
uniformidad de dosificación. En el sentido en el que se la utiliza
en la descripción y en las reivindicaciones en la presente, la
expresión "forma de unidad de dosificación" se refiere a
unidades físicamente discretas que son adecuadas como
dosificaciones unitarias, conteniendo cada unidad una cantidad
predeterminada de ingrediente activo calculada para producir el
deseado efecto terapéutico en asociación con el necesario vehículo
farmacéutico. Son ejemplos de tales formas de unidades de
dosificación las tabletas (incluyendo las tabletas estriadas o
recubiertas), las cápsulas, las píldoras, los paquetes de polvos,
las obleas, las soluciones o suspensiones inyectables, las
cucharadas de café, las cucharadas soperas y formas similares, y
múltiplos segregados de las mismas.
Como se ha indicado anteriormente, las
preparaciones farmacéuticas de la presente invención pueden ser
usadas para las muchas aplicaciones que pueden ser consideradas
usos cosméticos. Son especialmente preferidas las composiciones
cosméticas que son conocidas en la técnica, preferiblemente
hipoalérgicas y de pH controlado, y las mismas incluyen aguas de
colonia, emplastos, lociones, leches cutáneas o lociones lechosas.
Además del agente terapéutico hedgehog o ptc, las preparaciones
contienen componentes de los que son habitualmente empleados en
tales preparaciones. Son ejemplos de tales componentes aceites,
grasas, ceras, agentes superficiactivos, humectantes, agentes
espesantes, antioxidantes, estabilizadores de la viscosidad,
agentes quelantes, tampones, preservativos, perfumes, colorantes,
alcanoles inferiores y componentes similares. Si se desea, pueden
incorporarse a las composiciones adicionales ingredientes, como p.
ej. agentes antiinflamatorios, antibacterianos, antifúngicos,
desinfectantes, vitaminas, filtros solares, antibióticos u otros
agentes anti-acné.
Los ejemplos de aceites comprenden grasas y
aceites tales como aceite de oliva y aceites hidrogenados; ceras
tales como cera de abeja y lanolina; hidrocarburos tales como
parafina líquida, ceresina y escualeno; ácidos grasos tales como
ácido esteárico y ácido oleico; alcoholes tales como alcohol
cetílico, alcohol estearílico, alcohol de lanolina y hexadecanol; y
ésteres tales como miristato de isopropilo, palmitato de isopropilo
y estearato de butilo. Como ejemplos de agentes superficiactivos
pueden citarse agentes superficiactivos aniónicos tales como
estearato sódico, cetilsulfato sódico, lauriléterfosfato de
polioxietileno, N-acil glutamato sódico; agentes
superficiactivos catiónicos tales como cloruro
estearildimetilbencilamónico y cloruro esteariltrimetilamónico;
agentes superficiactivos anfóteros tales como soluciones de
hidrocloruro de alquilaminoetilglicina y lecitina; y agentes
superficiactivos no iónicos tales como monoestearato de glicerina,
monoestearato de sorbitán, ésteres de ácidos grasos de sucrosa,
monoestearato de propilenglicol, oleiléter de polioxietileno,
monoestearato de polietilenglicol, monopalmitato de sorbitán
polioxietilénico, monoetanolamida de ácido graso de coco
polioxietilénico, polioxipropilenglicol (como p. ej. los materiales
que se venden con la marca de fábrica "Pluronic"), aceite de
ricino polioxietilénico y lanolina polioxietilénica. Los ejemplos de
humectantes incluyen glicerina, 1,3-butilenglicol y
propilenglicol; los ejemplos de alcoholes inferiores incluyen
etanol e isopropanol; los ejemplos de agentes espesantes incluyen
goma de xantano, hidroxipropilcelulosa, hidroxipropilmetilcelulosa,
polietilenglicol y carboximetilcelulosa sódica; los ejemplos de
antioxidantes comprenden hidroxitolueno butilado, hidroxianisol
butilado, galato de propilo, ácido cítrico y etoxiquina; los
ejemplos de agentes quelantes incluyen edetato disódico y
etanohidroxidifosfato; los ejemplos de tampones comprenden ácido
cítrico, citrato sódico, ácido bórico, bórax y fosfato disódico de
hidrógeno; y son ejemplos de preservativos el parahidroxibenzoato
de metilo, el parahidroxibenzoato de etilo, el ácido
dehidroacético, el ácido salicílico y el ácido benzoico.
Para preparar ungüentos, cremas, aguas de
colonia, leches cutáneas y preparaciones similares, se incorporará
a las composiciones típicamente de un 0,01 a un 10%, en particular
de un 0,1 a un 5%, y más en particular de un 0,2 a un 2,5% del
ingrediente activo, o sea p. ej. del agente terapéutico hedgehog o
ptc. En ungüentos o cremas, el vehículo consta por ejemplo de un 1
a un 20%, y en particular de un 5 a un 15% de un humectante, y de un
0,1 a un 10%, y en particular de un 0,5 a un 5% de un espesante y
agua; o bien dicho vehículo puede constar de un 70 a un 99%, y en
particular de un 20 a un 95% de un agente superficiactivo, y de un
0 a un 20%, y en particular de un 2,5 a un 15% de una grasa; o de un
80 a un 99,9%, y en particular de un 90 a un 99% de un espesante; o
de un 5 a un 15% de un agente superficiactivo, de un
2-15% de un humectante, de un 0 a un 80% de un
aceite, y de cantidades muy pequeñas (< 2%) de preservativo,
agente colorante y/o perfume y agua. En un agua de colonia, el
vehículo consta por ejemplo de un 2 a un 10% de un alcohol
inferior, de un 0,1 a un 10%, o en particular de un 0,5 a un 1% de
un agente superficiactivo, de un 1 a un 20%, y en particular de un 3
a un 7% de un humectante, de un 0 a un 5% de un tampón, agua y
pequeñas cantidades (< 2%) de preservativo, colorante y/o
perfume. En una leche cutánea, el vehículo consta típicamente de un
10-50% de aceite, de un 1 a un 10% de agente
superficiactivo, de un 50-80% de agua y de un 0 a un
3% de preservativo y/o perfume. En las preparaciones anteriormente
mencionadas, todos los porcentajes son en peso.
Son particulares composiciones según la presente
invención aquéllas en las que el agente terapéutico hedgehog es
incorporado a las formulaciones en composiciones que contienen
liposomas. Los liposomas son vesículas artificiales formadas por
moléculas anfifáticas tales como lípidos polares, como por ejemplo
fosfatidilcolinas, etanolaminas y serinas, esfingomielinas,
cardiolipinas, plasmalógenos, ácidos fosfatídicos y cerebiósidos.
Los liposomas se forman cuando se deja que adecuadas moléculas
anfifáticas se hinchen en agua o en soluciones acuosas para formar
cristales líquidos habitualmente de estructura multicapas que consta
de muchas bicapas que están separadas unas de otras por material
acuoso (siendo éstos también los llamados liposomas gruesos). Otro
tipo de liposoma del que se sabe que consta de una sola bicapa que
encapsula material acuoso es el llamado vesícula unilamelar. Si
durante el hinchamiento de los lípidos son incluidos en la fase
acuosa materiales solubles en agua, los mismos quedan atrapados en
la capa acuosa entre las bicapas lipídicas.
Son encapsulados en los espacios acuosos entre
las capas moleculares ingredientes activos solubles en agua tales
como, por ejemplo, varias formas de sal de un polipéptido hedgehog.
El ingrediente activo soluble en lípidos, de agente terapéutico
hedgehog o ptc, tal como un mimético orgánico, es predominantemente
incorporado en las capas lipídicas, si bien grupos polares de
cabeza pueden sobresalir de la capa al interior del espacio acuoso.
La encapsulación de estos compuestos puede lograrse mediante los de
una serie de métodos. El método que es más comúnmente utilizado
supone verter una película delgada de fosfolípido sobre las paredes
de un matraz mediante evaporación de un disolvente orgánico. Cuando
esta película es dispersada en un adecuado medio acuoso, son
formados liposomas multilamelares. Tras una adecuada sonicación,
los liposomas gruesos forman menores vesículas que están
análogamente cerra-
das.
das.
Los ingredientes activos solubles en agua son
habitualmente incorporados a base de dispersar la película vertida
con una solución acuosa del compuesto. El compuesto no encapsulado
es entonces retirado por centrifugación, cromatografía, diálisis u
otros adecuados procedimientos que son conocidos en la técnica. El
ingrediente activo soluble en lípidos es habitualmente incorporado
a base de disolverlo en el disolvente orgánico con el fosfolípido
antes de efectuar el vertido de la película. Si no es sobrepasada la
solubilidad del material en la fase lipídica o si la cantidad que
está presente no sobrepasa la que puede ser fijada al lípido, los
liposomas preparados por el método anteriormente indicado contienen
habitualmente la mayor parte del material fijado en las bicapas
lipídicas, no siendo necesario separar los liposomas del material
no encapsulado.
Un método particularmente conveniente para
preparar formas formuladas como liposomas de agentes terapéuticos
hedgehog y ptc es el método que está descrito en la
EP-A-253.619, que queda incorporada
a la presente por referencia. En este método son preparados
liposomas bicapa individuales que contienen ingredientes activos
encapsulados a base de disolver el componente lipídico en un medio
orgánico, inyectar la solución orgánica del componente lipídico
bajo presión en un componente acuoso mientras se mezclan
simultáneamente los componentes orgánico y acuoso con un
homogeneizador o con medios de mezcla a alta velocidad, a
continuación de lo cual los liposomas se forman espontáneamente.
Los liposomas bicapa individuales que contienen
el agente terapéutico hedgehog o ptc encapsulado pueden ser
empleados directamente, o bien pueden ser empleados en un adecuado
vehículo farmacéuticamente aceptable para administración tópica. La
viscosidad de los liposomas puede ser incrementada mediante la
adición de uno o varios adecuados agentes espesantes tales como,
por ejemplo, goma de xantano, hidroxipropilcelulosa,
hidroxipropilmetilcelulosa y mezcla de los mismos. El componente
acuoso puede constar de agua solamente, o bien puede contener
electrólitos, sistemas tamponados y otros ingredientes, tales como
preservativos, por ejemplo. Los adecuados electrólitos que pueden
ser empleados incluyen sales metálicas tales como sales de metales
alcalinos y sales de metales alcalinotérreos. Las sales metálicas
preferidas son cloruro cálcico, cloruro sódico y cloruro potásico.
La concentración del electrólito puede variar desde la de cero
hasta la de 260 mM, y preferiblemente desde la de 5 mM hasta la de
160 mM. El componente acuoso es puesto en un adecuado recipiente que
puede ser adaptado para efectuar homogeneización a base de generar
gran turbulencia durante la inyección del componente orgánico. La
homogeneización de los dos componentes puede ser llevada a cabo
dentro del recipiente, o bien y como alternativa los componentes
acuoso y orgánico pueden ser inyectados por separado al interior de
los medios de mezcla que estén situados fuera del recipiente. En
este último caso, los liposomas son formados en los medios de mezcla
y son entonces transferidos a otro recipiente para ser
recogidos.
El componente orgánico consta de un adecuado
disolvente atóxico farmacéuticamente aceptable tal como, por
ejemplo, etanol, glicerol, propilenglicol y polietilenglicol, y de
un adecuado fosfolípido que es soluble en el disolvente. Los
fosfolípidos adecuados que pueden ser empleados incluyen la
lecitina, la fosfatidilcolina, la fosfatidilserina, la
fosfatidiletanolamina, el fosfatidilinositol, la
lisofosfatidilcolina y el fosfatidilglicerol, por ejemplo. Pueden
emplearse otros aditivos lipofílicos a fin de modificar
selectivamente las características de los liposomas. Los ejemplos
de tales otros aditivos incluyen la estearilamina, el ácido
fosfatídico, el tocoferol, el colesterol y extractos de
lanolina.
Además pueden ser añadidos al componente orgánico
otros ingredientes que puedan impedir la oxidación de los
fosfolípidos. Los ejemplos de tales otros ingredientes incluyen el
tocoferol, el hidroxianisol butilado, el hidroxitolueno butilado, el
palmitato de ascorbilo y el oleato de ascorbilo. Pueden ser también
añadidos preservativos tales como ácido benzoico,
metilparahidroxibenzoato y propilparahidroxibenzoato.
Aparte de las composiciones anteriormente
descritas, puede hacerse uso de cubiertas, como p. ej. emplastos,
vendajes, apósitos, almohadillas de gasa y cubiertas similares, que
contengan una cantidad adecuada de un agente terapéutico hedgehog o
ptc. En algunos casos puede hacerse uso de emplastos, vendajes,
apósitos, almohadillas de gasa y cubiertas similares que hayan sido
impregnadas con una formulación tópica que contenga la formulación
terapéutica.
Habiendo sido hasta aquí descrita en general la
invención, se comprenderá más fácilmente la misma haciendo
referencia a los ejemplos siguientes, que son incluidos meramente a
efectos de ilustrar determinados aspectos y realizaciones de la
presente invención y no pretenden limitarla en modo alguno.
Fue expresada en el sistema de
baculovirus/células de insecto (Roelink et al. (1995)
Cell 81:445-455) proteína sonic hedgehog
humana (residuos 24-197). El medio acondicionado
fue cargado en agarosa Fast Flo SP equilibrada con fosfato potásico
50 mM, DTT (DTT = ditiotreitol) 0,5 mM, a pH 7,0. La columna fue
lavada con este tampón, y fue entonces eluida con un gradiente
hasta NaCl 10 M. Las fracciones fueron analizadas para determinar la
inducción de actividad de fosfatasa alcalina en células troncales
mesenquimáticas (células C3H10T1/2, véase, p. ej., Wang et
al. (1993) Growth Factors 9:57-71), y
fueron entonces agrupadas sobre la base de esta actividad y también
según pureza sobre geles de SDS (SDS = dodecilsulfato sódico). El
material reunido fue concentrado en una unidad de ultrafiltración
Amicon (membrana PM10), y fue sometido a diafiltración contra Tris
10 mM, pH 7,4, DTT 0,5 mM. La proteína fue estimada por el método
Bradford usando globulina gamma como patrón.
La esponja de colágeno fue lavada extensivamente
en agua MilliQ para retirar todos los agentes superficiactivos y
aditivos del fabricante. La esponja fue entonces lavada en etanol
al 70%, y fue a continuación secada in vacuo.
La proteína fue añadida a pedazos de esponja de
colágeno de 1,0 x 1,5 mm por 8-10 mm (de un peso de
1,5-3,0 mg). En algunos casos fue añadido sulfato de
cinc hasta una concentración final de 0,2 mM antes de ser añadida a
la esponja de colágeno la proteína hedgehog (erizo). Las esponjas
reconstituidas fueron entonces congeladas y liofilizadas.
Las esponjas fueron implantadas subcutáneamente
en la región torácica de ratas de Sprague Dawley (de
4-8 semanas de edad) o en el músculo del muslo de
conejos (de 11-14 semanas de edad). Los animales
fueron mantenidos por espacio de 2-5 semanas antes
de retirar el implante. El implante fue entonces fijado en
formalina al 4% o paraformaldehído al 4%, y fue entonces embebido
en resina JB-4. Las secciones fueron coloreadas con
azul de toluidina (Wang et al. (1988) PNAS
85:9484-9488).
La inducción de nuevos folículos pilosos,
glándulas sebáceas y otras estructuras dérmicas fue identificada
por medio de su morfología distintiva. La cuidadosa colocación
subcutánea o intramuscular de nuestros implantes y la cuidadosa
remoción de estos implantes excluyen la posibilidad de
contaminación por las estructuras dérmicas existentes. Se ve
asimismo en los implantes de duración más corta (2 semanas) la
aparición de folículos pilosos más inmaduros.
Fueron obtenidas secciones de biopsia de un
implante intramuscular sacado de un músculo de conejo a las tres
semanas, y las mismas fueron coloreadas con hematoxilina y eosina.
Fueron examinadas secciones similares de un implante intramuscular
en músculo de conejo a las tres semanas, y las mismas fueron
coloreadas con azul de toluidina. Las secciones de determinadas
muestras revelaban una morfología tisular que indicaba la presencia
de estructuras de tipo folicular y de tipo capilar en formación en
el tejido intramuscular.
Como seguimiento de los experimentos
anteriormente descritos, fueron implantadas bajo la piel afeitada
de ratones esponjas de colágeno cargadas con hedgehog. Como se
indica en las Figuras 1A-C, las preparaciones de
hedgehog fueron capaces de inducir el crecimiento del pelo en los
implantes. Además, la proteína Ihh modificada en el
C-terminus con un sitio de fijación de colágeno de factor
Von Willebrand estaba activa en el crecimiento del pelo, lo cual
indica una actividad inductora localizada de la proteína
implantada.
Todas las referencias y publicaciones que han
sido citadas anteriormente quedan incorporadas a la presente por
referencia.
Usando no más que experimentación rutinaria, los
expertos en la materia reconocerán o serán capaces de descubrir
numerosos equivalentes de los específicos polipéptidos, ácidos
nucleicos, métodos, análisis y reactivos aquí descritos.
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº: 1:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1277 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- ORIENTACIÓN: ambas
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: cDNA
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 1..1275
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº: 1:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº: 2:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1190 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- ORIENTACIÓN: ambas
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: cDNA
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 1..1191
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº: 2:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº: 3:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1281 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- ORIENTACIÓN: ambas
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: cDNA
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 1..1233
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº: 3:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº: 4:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1313 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- ORIENTACIÓN: ambas
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: cDNA
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 1..1314
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº: 4:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº: 5:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1256 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- ORIENTACIÓN: ambas
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: cDNA
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 1..1257
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº: 5:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº: 6:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1425 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- ORIENTACIÓN: única
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: cDNA
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 1..1425
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº: 6:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº: 7:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1622 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- ORIENTACIÓN: única
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: cDNA
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 51..1283
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº: 7:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº: 8:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1191 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- ORIENTACIÓN: única
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: cDNA
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 1..1191
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº: 8
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº: 9
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1251 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- ORIENTACIÓN: única
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: cDNA
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 1..1248
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº: 9:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº: 10:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 425 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº: 10:
\vskip1.000000\baselineskip
\newpage
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº: 11:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 396 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº: 11:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº: 12:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 411 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº: 12:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº: 13:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 437 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\newpage
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº: 13:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº: 14:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 418 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº: 14:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº: 15:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 475 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº: 15:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº: 16:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 411 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº: 16:
\vskip1.000000\baselineskip
\newpage
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº: 17:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 396 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº: 17:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº: 18:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 416 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº: 18:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº: 19:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1416 es de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- ORIENTACIÓN: única
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: cDNA
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 1..1413
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº: 19:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº: 20:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 471 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº: 20:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº: 21:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 471 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.666000\baselineskip
- (v)
- TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº: 21:
\vskip1.000000\baselineskip
2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº: 22:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 167 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.666000\baselineskip
- (v)
- TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº: 22:
\vskip1.000000\baselineskip
Claims (55)
1. Método in vitro que es para modular el
estado de crecimiento de una célula epitelial y comprende el paso
de poner la célula epitelial ectópicamente en contacto con una
cantidad de un polipéptido que comprende una parte extracelular
bioactiva de una proteína hedgehog (erizo) que es efectiva para
alterar la velocidad de proliferación de la célula epitelial.
2. Uso de un polipéptido que comprende una parte
extracelular bioactiva de una proteína hedgehog (erizo) en la
fabricación de un medicamento para inducir la formación de
piel.
3. Uso de un polipéptido que comprende una parte
extracelular bioactiva de una proteína hedgehog (erizo) en la
fabricación de un medicamento para inducir el crecimiento del pelo
en un animal.
4. El método de la reivindicación 1 o el uso de
la reivindicación 2 ó 3, en el que el agente incrementa la
velocidad de proliferación de células epiteliales.
5. El método de la reivindicación 1, en el que la
célula epitelial es una célula epitelial cutánea.
6. El método o uso de la reivindicación 5, en el
que la célula epitelial es un queratinocito dérmico.
7. El método o uso de la reivindicación 5, en el
que la célula epitelial es una célula epitelial mucosa.
8. El método o uso de la reivindicación 5, en el
que la célula epitelial es una célula troncal epitelial.
9. El método o uso de la reivindicación 5, en el
que la célula epitelial es una célula troncal de folículo
piloso.
10. El método de la reivindicación 1, en el que
la célula está en cultivo, y el agente es aportado como aditivo de
cultivo celular.
11. El método de la reivindicación 1, en el que
el tejido epitelial está en cultivo tisular, y el agente es
aportado como aditivo de cultivo tisular.
12. El uso de la reivindicación 2 ó 3, en el que
el medicamento está destinado a aplicación tópica.
13. El método de la reivindicación 1 o el uso de
las reivindicaciones 2 ó 3, en los que el polipéptido incluye al
menos 50 residuos de aminoácidos de una mitad
N-terminal de la proteína hedgehog
(erizo).
14. El método o uso de la reivindicación 13, en
el que el polipéptido incluye al menos 100 aminoácidos de un
dominio extracelular de la proteína hedgehog (erizo).
15. El método o uso de la reivindicación 13, en
el que el polipéptido incluye al menos una parte de la proteína
hedgehog (erizo) que corresponde a un fragmento de 19 kd de un
dominio extracelular de la proteína hedgehog (erizo).
16. El método o uso de la reivindicación 13, en
el que la proteína hedgehog (erizo) es codificada por un gen de un
organismo vertebrado.
17. El método o uso de la reivindicación 13, en
el que el polipéptido incluye una secuencia de polipéptido
hedgehog (erizo) representada en la fórmula general de la ID
SEC Nº 21.
18. El método o uso de la reivindicación 13, en
el que el polipéptido incluye una secuencia de polipéptido
hedgehog (erizo) representada en la fórmula general de la ID
SEC Nº 22.
19. El método o uso de la reivindicación 13, en
el que la proteína hedgehog (erizo) es codificada por un gen
hedgehog (erizo) humano.
20. El método o uso de la reivindicación 13, en
el que la secuencia de polipéptido hedgehog (erizo) es
idéntica en al menos un 60 por ciento a una secuencia de
aminoácidos de una proteína hedgehog (erizo) seleccionada de
entre los miembros del grupo que consta de las siguientes
secuencias identificadas con sus correspondientes números de
identificación: ID SEC Nº: 9, ID SEC Nº: 10, ID SEC Nº: 11, ID SEC
Nº: 12, ID SEC Nº: 13, ID SEC Nº: 14, ID SEC Nº: 15 e ID SEC Nº:
16.
21. El método o uso de la reivindicación 20, en
el que la secuencia de polipéptido hedgehog (erizo) es
idéntica en al menos un 75 por ciento a una secuencia de
aminoácidos de una proteína hedgehog (erizo) seleccionada de
entre los miembros del grupo que consta de las siguientes
secuencias identificadas con sus correspondientes números de
identificación: ID SEC Nº: 9, ID SEC Nº: 10, ID SEC Nº: 11, ID SEC
Nº: 12, ID SEC Nº: 13, ID SEC Nº: 14, ID SEC Nº: 15 e ID SEC Nº:
16.
22. El método o uso de la reivindicación 20, en
el que la secuencia de polipéptido hedgehog (erizo) es
idéntica en al menos un 85 por ciento a una secuencia de
aminoácidos de una proteína hedgehog (erizo) seleccionada de
entre los miembros del grupo que consta de las siguientes
secuencias identificadas con sus correspondientes números de
identificación: ID SEC Nº: 9, ID SEC Nº: 10, ID SEC Nº: 11, ID SEC
Nº: 12, ID SEC Nº: 13, ID SEC Nº: 14, ID SEC Nº: 15 e ID SEC Nº:
16.
23. El método o uso de la reivindicación 20, en
el que la secuencia de polipéptido hedgehog (erizo) es
susceptible de ser codificada por una secuencia de nucleótidos que
se hibrida bajo condiciones rigurosas con una secuencia seleccionada
de entre los miembros del grupo que consta de las siguientes
secuencias identificadas con sus correspondientes números de
identificación: ID SEC Nº: 1, ID SEC Nº: 2, ID SEC Nº: 3, ID SEC Nº:
4, ID SEC Nº: 5, ID SEC Nº: 6, ID SEC Nº: 7 e ID SEC Nº: 8.
24. El método o uso de la reivindicación 13, en
el que la secuencia de polipéptido hedgehog (erizo) es una
secuencia de aminoácidos de una proteína hedgehog (erizo)
seleccionada de entre los miembros del grupo que consta de las
siguientes secuencias identificadas con sus correspondientes
números de identificación: ID SEC Nº: 9, ID SEC Nº: 10, ID SEC Nº:
11, ID SEC Nº: 12, ID SEC Nº: 13, ID SEC Nº: 14, ID SEC Nº: 15 e ID
SEC Nº: 16.
25. El método o uso de la reivindicación 13, en
el que la secuencia de polipéptido hedgehog (erizo) es una
secuencia de aminoácidos de una proteína Sonic hedgehog.
26. El método o uso de la reivindicación 13, en
el que la secuencia de polipéptido hedgehog (erizo) es una
secuencia de aminoácidos de una proteína Indian
hedgehog.
27. El método o uso de la reivindicación 13, en
el que la secuencia de polipéptido hedgehog es una secuencia
de aminoácidos de una proteína Desert hedgehog.
28. El método o uso de la reivindicación 13, en
el que la secuencia de polipéptido hedgehog (erizo) incluye
una secuencia de aminoácidos que corresponde aproximadamente a los
residuos 24-193 de la ID SEC Nº: 15.
29. El método o uso de la reivindicación 13, en
el que el polipéptido es purificado hasta al menos un 80% en peso
en seco.
30. El método de la reivindicación 13, en el que
el polipéptido es un polipéptido producido por vía
recombinante.
31. El método o uso de la reivindicación 13, en
el que el polipéptido es un polipéptido sintetizado
químicamente.
32. El método o uso de la reivindicación 13, en
el que el agente terapéutico hedgehog es un peptidomimético
de una secuencia de polipéptido hedgehog.
33. Uso de un constructo antisentido que inhibe
la expresión de una proteína patched en la fabricación de un
medicamento para inducir la formación de piel o inducir el
crecimiento de pelo en un animal.
34. El uso de la reivindicación 33, en el que el
constructo antisentido es un oligonucleótido que tiene una longitud
de aproximadamente 20-30 nucleótidos y un contenido
de GC de al menos un 50 por ciento.
35. El uso de la reivindicación 34, en el que el
oligonucleótido antisentido es seleccionado de entre los miembros
del grupo que consta de:
5'-GTCCTGGCGCCGCCGCCGCCGTCGCC;
5'-TTCCGATGACCGGCCTTTCGCGGTGA;
y
5'-GTGCACGGAAAGGTGCAGGCCACACT
36. Uso de un polipéptido que comprende una
secuencia de aminoácidos que incluye al menos una parte bioactiva
de la mitad N-terminal de una proteína hedgehog
(erizo) en la fabricación de un medicamento para promover la
proliferación de células epiteliales de piel.
37. El uso de la reivindicación 36, en el que
dicho medicamento está destinado a ser usado como parte de un
tratamiento para regular un proceso de curación de heridas.
38. El uso de la reivindicación 36, en el que el
tratamiento es seleccionado de entre los miembros de un grupo que
consta de tratamiento de quemaduras, regeneración de piel, injertos
de piel, tratamiento de llagas por decúbito, tratamiento de úlceras
dérmicas, reducción de cicatrices post-cirugía y
tratamiento de colitis ulcerosa.
39. El uso de la reivindicación 36, en el que
dicho medicamento está destinado a ser usado como parte de un
tratamiento de la alopecia.
40. Preparación de un polipéptido que comprende
una secuencia de polipéptido hedgehog (erizo) que incluye un
fragmento bioactivo de una proteína hedgehog (erizo), siendo
dicho polipéptido incorporado a una formulación para aplicación
tópica a tejido epitelial.
41. La preparación de la reivindicación 40, en la
que el polipéptido es incorporado a una formulación para aplicación
tópica a la piel.
42. La preparación de la reivindicación 40, en la
que el polipéptido incluye al menos 50 residuos de aminoácidos de
una mitad N-terminal de la proteína hedgehog
(erizo).
43. La preparación de la reivindicación 40, en la
que el polipéptido incluye al menos 100 aminoácidos de un dominio
extracelular de la proteína hedgehog (erizo).
44. La preparación de la reivindicación 40, en la
que el polipéptido incluye al menos una parte de la proteína
hedgehog (erizo) que corresponde a un fragmento de 19 kd de un
dominio extracelular de la proteína hedgehog (erizo).
45. La preparación de la reivindicación 40, en la
que la proteína hedgehog (erizo) es codificada por un gen de un
organismo vertebrado.
46. Uso de un antagonista para hedgehog en
la fabricación de un medicamento para inhibir la proliferación de
una célula epitelial, para la inhibición de la formación de tejido
epitelial, o para inhibir el crecimiento de pelo en un animal.
47. El uso de la reivindicación 46, en el que el
antagonista para hedgehog es un ácido nucleico antisentido
que inhibe la expresión de una proteína hedgehog
(erizo).
48. El uso de la reivindicación 46, en el que el
agente reduce la velocidad de proliferación de células
epiteliales.
49. El uso de la reivindicación 46, en el que la
célula epitelial es una célula epitelial cutánea.
50. El uso de la reivindicación 46, en el que la
célula epitelial es un queratinocito dérmico.
51. El uso de la reivindicación 46, en el que la
célula epitelial es una célula epitelial mucosa.
52. El uso de la reivindicación 46, en el que la
célula epitelial es una célula troncal epitelial.
53. El uso de la reivindicación 46, en el que la
célula epitelial es una célula troncal de folículo piloso.
54. El uso de la reivindicación 46, en el que el
medicamento es para aplicación tópica.
55. El uso de la reivindicación 46, en el que el
medicamento es para el tratamiento del carcinoma de células
basales.
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