ES2211882T3 - Sistema de cesion de polinucleotido, automontable que comprende policationes de dendrimeros. - Google Patents

Sistema de cesion de polinucleotido, automontable que comprende policationes de dendrimeros.

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ES2211882T3 ES94922555T ES94922555T ES2211882T3 ES 2211882 T3 ES2211882 T3 ES 2211882T3 ES 94922555 T ES94922555 T ES 94922555T ES 94922555 T ES94922555 T ES 94922555T ES 2211882 T3 ES2211882 T3 ES 2211882T3
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Abstract

UN SISTEMA DE SUMINISTRO DE POLINUCLEOTIDOS DE AUTOACOPLAMIENTO QUE CONTIENE UN POLICATION DE UN DENDRIMERO QUE AYUDA AL SUMINISTRO DEL POLINUCLEOTIDO A UNA DIRECCION DESEADA, Y OPCIONALMENTE OTROS AGENTES TALES COMO AGENTES DE ENMASCARAMIENTO DEL ADN, AGENTES DE RECONOCIMIENTO DE CELULAS, AGENTES DE NEUTRALIZACION DE CARGAS, AGENTES DE PERMEABILIZACION DE MEMBRANAS, Y AGENTES DE LOCALIZACION SUBCELULAR.

Description

Sistema de cesión de polinucleótido, automontable que comprende policationes de dendrímeros.
Fundamento de la invención Campo de la invención
Esta invención se refiere al campo de sistemas de cesión de oligonucleótidos y terapia génica. En particular, esta invención se dirige a un sistema de cesión de polinucleótido automontable que comprende un polinucleótido y un policatión de dendrímero, y opcionalmente otros agentes, que facilita la cesión del polinucleótido a unas posición subcelular deseada. El polinucleótido y los otros agentes están asociados en general con el polinucleótido mediante interacciones no covalentes. Los agentes adecuados para su uso aquí incluyen componentes de enmascaramiento de ADN, agentes de reconocimiento de células, agentes neutralizantes de carga, agentes de permeabilización de membrana y agentes de localización subcelular, entre otros.
Agradecimiento de ayuda gubernamental
El gobierno tiene derechos en esta invención de acuerdo con Grant Nº GM-30163 otorgado por los National Institutes of Health.
Descripción del fundamento
Los biólogos moleculares han identificado los defectos cromosómicos en un gran número de enfermedades hereditarias humanas, elevando las probabilidades de curas usando terapia génica. Esta rama emergente de la medicina pretende corregir defectos genéticos transfiriendo genes clonados y activos funcionalmente a las células afectadas. La fibrosis cística (CF) es una enfermedad genética recesiva fatal caracterizada por anormalidades en el transporte de cloruro. Se ha recorrido el lugar de la enfermedad hasta mutaciones en el gen que codifica el regulador de conductancia transmembrana de la fibrosis cística (CFTR). La corrección del defecto genético subyacente por complementación o sustitución del CFTR defectuoso es la cura esencial para la CF.
La terapia génica o la cesión in vivo y expresión de genes es una ciencia de rápido desarrollo que puede usarse para sustituir genes defectuosos. Se conocen en la técnica varios sistemas y polímeros adecuados para la cesión de polinucleótidos. Entre ellos, se han usado vectores víricos tales como vectores adenovíricos para transferir CFTR al pulmón de la rata del algodón in vivo. Aunque se ha informado de altos niveles de transfección in vivo con los vectores adenovíricos, los sistemas de cesión no víricos tienen un cierto número de ventajas para la cesión de polinucleótidos.
Durante la década pasada, se ha desarrollado un cierto número de métodos para introducir genes funcionales en células de mamífero in vitro. Estas técnicas son aplicables a terapia génica, siempre que las células objetivo puedan separarse del cuerpo, transfectarse y multiplicarse las células transfectadas y devolverse después al paciente. Esto no es posible, sin embargo, para pacientes con CF.
Actualmente, las mejores eficacias de transfección in vivo se obtienen con retrovirus. Sin embargo, la eficacia de la transfección es variable y los sistemas de cesión de genes basados en virus tienen el riesgo de causar infección vírica o cáncer. Claramente, aunque no se han observado complicaciones agudas procedentes del uso de vectores retrovíricos en seres humanos, la posibilidad de complicaciones a largo plazo obligan a una vigilancia del paciente cuidadosa.
Los riesgos potenciales de usar vectores basados en virus y las ventajas conceptuales de usar en su lugar construcciones de ADN plásmido para terapia génica han conducido al desarrollo de diversos métodos físicos y químicos para facilitar la transferencia génica en ausencia de vectores víricos. Los sistemas estudiados más intensamente implican el tratamiento de células con fosfato cálcico o un facilitador catiónico. Otros métodos implican la inyección del ADN durante el pinchado físico de la membrana o la absorción pasiva del ADN durante la permeabilización o abrasión de la membrana celular. Cada uno de estos métodos es intrínsicamente agresivo y no se prefiere para uso in vivo.
El uso de un sistema de cesión de genes directo que no implique el uso de vehículos víricos puede evitar los riesgos planteados por los sistemas víricos. Un vehículo no vírico adecuado para cesión de genes debe ser capaz de superar muchas barreras. Debe subsistir en la circulación y ser capaz de alcanzar el objetivo de la célula de elección, introducir ADN en el citoplasma de la célula y transportar el ADN al núcleo.
Actualmente, los virus son los vectores más eficaces para transferencia de genes, pero los riesgos potenciales asociados con su uso han catalizado una investigación sobre sistemas de cesión de ADN sintéticos. Un primer trabajo mostró que policationes tales como polilisina y DEAE-dextrano promueven la absorción de proteínas y polinucleótidos de cadena sencilla y de doble cadena en células de animales, y, desde entonces, se han ensayado extensamente vectores basados en polilisina para transferencia de genes. Sin embargo, estos policationes son relativamente citotóxicos y no son por sí mismos muy eficaces, lo que limita su utilidad para transfectar células en cultivo.
A pesar de estos inconvenientes, las polilisinas tienen un cierto número de ventajas tales como ayudar a
1)
montar ADN en una estructura compacta,
2)
desestabilizar membranas celulares, y
3)
proporcionar una palanca para la incorporación de otros efectores al ácido nucleico.
La neutralización y condensación de ADN por polilisinas en estructuras de tipo toroide pequeñas (aprox. 100 nm) promueve la endocitosis del ácido nucleico en células in vitro. El proceso endocítico puede estimularse adicionalmente por la incorporación covalente al policatión de ligandos específicos como transferrina, asialoorosomucoide o insulina. Cuando los procedimientos de transfección del policatión se basan en endocitosis mediada por el receptor o en fase fluida, una gran fracción del ADN endocitosado resulta atrapado en vesículas intracelulares y se degrada finalmente en los lisosomas. La degradación lisosómica puede evitarse parcialmente por adición de agentes lisosomotróficos tales como cloroquina durante la transfección, o por incorporación a la polilisina de agentes que rompan endosoma, tales como virus inactivados o péptidos fusogénicos víricos. La capacidad de complejos de polilisina-ADN para transfectar células depende fuertemente de la presencia de estos efectores.
Una forma de proteger el polinucleótido en la circulación, de manera que subsista lo suficiente para llegar al destino celular deseado es el "enmascaramiento" o protección del polinucleótido.
Se han usado en parte como protección en transferencia de genes micropartículas, tales como espectros de eritrocitos, envolturas víricas reconstituidas y liposomas. Un sistema liposómica de éxito utiliza el lípido catiónico cloruro de N-[1-(2,3-dioleiloxi)propil]-N,N,N-trimetilamonio (DOTMA), mezclado con fosfatidiletanolamina (PE) para formar el reactivo Lipofectin®. Lipofectin® es un liposoma catiónico que puede mezclarse con el ADN, y añadirse la mezcla a una célula sin necesidad de encapsulación del ADN dentro del liposoma con reactivos catiónicos. Se ha usado Lipofectin® para transfectar genes informadores en células epiteliales de pulmón humano en cultivo, para introducir el gen de cloranfenicol acetiltransferasa (CAT) en células de ratas por vía intratraqueal, y para introducir el gen de CAT en células de ratones por vías intratraqueal e intravenosa. En el caso del gen de CAT, aproximadamente el 50% de las células de ratas epiteliales de las vías respiratorias expresaron transitoriamente el gen informador de \beta-galactosidasa, aunque no se cuantificó el nivel de expresión. Cuando el gen de CAT se incorporó a un activador sensible a esteroides y se transfectó en pulmón de rata, se mostró que su expresión era regulada positivamente por dexametasona. No obstante, la citotoxicidad es un problema definido cuando se usan altas concentraciones de Lipofectin®.
Se han usado sustitutos de DOTMA que incluyen lipopoliamina, polilisinas lipófilas y un colesterol catiónico, para mediar en la transferencia de genes en cultivo. Aunque algunos de éstos muestran una mejora de aproximadamente tres veces sobre las proporciones de transfección observadas con Lipofectin®, su toxicidad sigue siendo un problema. No se ha explorado a fondo el mecanismo responsable de la transfección usando lípidos catiónicos. El método pasado ha sido sintetizar diferentes lípidos catiónicos y probarlos en ensayos de transfección, en lugar de estudiar sintemáticamente cómo los sistemas de cesión introducen ADN en una célula. El hallazgo de que liposomas de DOTMA/PE pueden experimentar fusión de bicapa con liposomas aniónicos sugiere que DOTMA puede facilitar la entrada directa del ADN a través de la membrana del plasma. Por otra parte, para transfección de alta eficacia, los sistemas de lípidos catiónicos requieren PE, posiblemente porque PE puede formar compuestos intermedios de lípidos intramembrana que facilitan la fusión de membrana.
Una transferencia de genes eficaz requiere también fijar el objetivo del ADN a la célula de elección. Se han descrito recientemente para transferencia génica diversos procedimientos basados en endocitosis mediada por el receptor. Se unió un conjugado de ligando específico para la célula-poililisina a ácidos nucleicos a través de interacciones de carga, y el complejo resultante se absorbió eficazmente por las células objetivo, tal como en el caso del linaje celular de hepatoma humano HepG2 y hepatocitos de rata in vivo usando este sistema de cesión con asialoorosomucoide como ligando. Se ha informado de la expresión estable de una actividad enzimática en células HepG2 tras la fijación de objetivo dirigida por insulina así como la cesión mediada por transferrina-policatión de un plásmido en el linaje celular leucémico humano K-562 y la expresión subsiguiente del gen de luciferasa codificado. Sin embargo, los sistemas de cesión descritos requieren el enlace de las proteínas de fijación de objetivo de alto peso molecular a ADN a través de un enlazador de polilisina. Estos conjugados grandes de ligando-policatión son de tamaño y composición heterogéneos, químicamente mal definidos y difíciles de preparar de manera reproducible. Además, en muchos de los sistemas mediados por receptores, se requieren cloroquina u otros rompedores del tránsito intracelular para conseguir altos niveles de transfección. En un estudio, se usó un adenovirus para aumentar la cesión de genes de un sistema mediado por receptor.
Así, pueden cederse genes al interior de células de mamífero por endocitosis mediada por receptores, escapando de la degradación una fracción del ADN exógeno, entrando en el núcleo y expresándose. No obstante, el nivel de expresión es bajo, debido probablemente a la entrada limitada del ADN extraño en el citoplasma.
La cesión directa de genes también es facilitada por neutralización de la gran carga negativa en el polinucleótido, y la capacidad (a menudo concomitante) para permeabilizar la membrana de la célula fijada como objetivo. El uso de policationes para neutralizar la carga del polinucleótido facilita la permeabilización de la membrana y la translocalización del polinucleótido. Se han usado con este fin lípidos catiónicos. También se conocen ciertos lípidos catiónicos denominados lipopoliaminas y lipointercaladores.
Una vez que el polinucleótido ha entrado en la célula fijada como objetivo, la cesión directa de genes puede facilitarse dirigiendo los genes a la posición subcelular apropiada. Un objetivo obvio para la cesión de desoxirribonucleótidos es el núcleo. Son ligandos conocidos para facilitar en este proceso péptidos o proteínas de localización nuclear que contienen secuencias de localización nuclear.
Se demostró que la eficacia de transfección obtenida con envolturas víricas reconstituidas aumentaba cuando el gen extraño se co-cede a las células objetivo con proteínas nucleares. Se mostró que ADN mezclado con proteínas nucleares presentaba un aumento modesto de transfección sobre ADN mezclado con albúmina usada como testigo. Así, el ADN parece incorporarse al núcleo más fácilmente cuando proteínas que contienen la secuencia de localización nuclear (NLS) pro-lys-lys-lys-arg-lys-val (SEC. ID NO:1) están asociadas con el plásmido porque la presencia de la NLS en una proteína la señala para transporte a través del poro nuclear. Se han incorporado las secuencias de localización nuclear de 14 aminoácidos a una variedad de macromoléculas e incluso a partículas de oro (diámetro 150 \ring{A}) y, cuando se introdujeron en el citoplasma, se incorporaron rápidamente al núcleo. La entrada nuclear parece ser la etapa limitante de intensidad para una transfección estable con éxito. Esto es respaldado por el hallazgo de que cuando se microinyecta ADN plásmido en el citoplasma, es incapaz de lograr la transfección de la célula. No tuvo lugar transfección en 1.000 inyecciones citoplásmicas, mientras que la microinyección de plásmidos directamente en el núcleo produjo transfección en más del 50% de las células microinyectadas.
Se mostró también aumentar la eficacia de transfección cuando se condensa el ADN usando diversas proteínas catiónicas. Aunque no es fácilmente evidente la razón por la que la condensación de ADN aumenta la transfección, puede ser debido a un aumento en la absorción celular de ADN o a una disminución en la susceptibilidad del ADN a nucleasas, que puede producir cantidades más altas de ADN intacto en la célula.
La cesión directa de genes asociados con una de las clases de agentes comentadas antes es facilitada adicionalmente por la capacidad de esos agentes para permanecer asociados con el ADN. Son ejemplos de esto la asociación de un ligando receptor con un polinucleótido por incorporación covalente del ligando a la polilisina policatión, y opcionalmente incorporando covalentemente el ligando a un intercalador de ADN, por ejemplo, homodímero de etidio (dihidrocloruro de dicloruro de 5,5'-diazadecametilenbis-(3,8-diamino-6-fenilfenantridio)) y la asociación de marcas de fotoafinidad a ADN por incorporación covalente a 9-aminoacridina y ciertas bis-acridinas.
Los dendrímeros son polímeros tridimensionales voluminosos construidos por secuencias de reacción reiterativas alrededor de una molécula de núcleo que pueden prepararse en pesos moleculares y tamaños variados (Tomalia, D.A. et al., "Starburst Cascade Polymers: Molecular-Level Control of Size, Shape, Surface Chemistry, Topology, and Flexibility from Atoms to Macroscopic Matter", Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 29:138 (1990)).
Sin embargo, en la búsqueda para alcanzar mejores resultados en el campo de la terapia génica, hay necesidad aún de sistemas de cesión de polinucleótidos mejorados de alta eficacia de transfección sin los inconvenientes de sistemas anteriores.
El documento WO 93/19768 se refiere a un sistema de cesión de polinucleótido automontable que comprende componentes que facilitan la cesión del polinucleótido a las direcciones deseadas que están asociadas mediante interacciones no covalentes con el polinucleótido. Los componentes de este sistema incluyen ADN, componentes de enmascaramiento, componentes de reconocimiento de células, componentes de neutralización de carga y de permeabilización de membrana y componentes de localización subcelular.
Sumario de la invención
Esta invención se refiere a un sistema de cesión de polinucleótido automontable que utiliza un policatión de dendrímero que tiene grupos catiónicos terminales, acoplado no covalentemente a un polinucleótido a ceder, en el que la proporción de grupos catiónicos terminales del policatión de dendrímero al contenido de nucleótidos del polinucleótido es de 1:1 a 223,3:1, pero excluyendo composiciones obtenibles diluyendo 12 \mug de plásmido PCLuc4 en 660 \mul de HBS (Hepes 20 mM, NaCl 150 mM, pH 7,4) para formar una solución de ADN y disolviendo 1 nmol de micropartículas de dendrímero Starburst de macromolécula de policatión ramificada hidrófila de quinta generación en 340 \mul de HBS y añadiendo esto gota a gota a la solución de ADN. Opcionalmente, puede contener uno o más, preferiblemente dos o más de los siguientes agentes.
1)
Agentes de enmascaramiento de ADN.
2)
Agentes de reconocimiento de células.
3)
Agentes de neutralización de carga y de permeabilización de membrana.
4)
Agentes de localización subcelular.
El policatión de dendrímero es capaz por sí mismo de ceder el polinucleótido con alta eficacia de transfección. Cada componente opcional de este sistema es capaz de realizar su función indicada y también es capaz de montarse o desmontarse con el polinucleótido según se requiera. Por ejemplo, un cierto componente puede tener que disociarse él mismo del polinucleótido con el fin de realizar su función deseada.
Esta invención proporciona una composición para ceder un polinucleótido a un componente subcelular de una célula eucariota que comprende un polinucleótido y un policatión de dendrímero que tiene grupos catiónicos terminales acoplados no covalentemente al polinucleótido, en el que la proporción de grupo catiónico terminal del policatión de dendrímero al contenido de nucleótidos del polinucleótido es de 1:1 a 223,3:1.
En una realización de la presente composición, el polinucleótido comprende un vector híbrido que tiene un gen estructural acoplado operativamente a él.
La composición de la invención puede ponerse en contacto con una célula eucariota objetivo en condiciones eficaces para conseguir una transfección altamente eficaz.
En otro aspecto, la invención abarca también la administración de la presente composición a un organismo para ceder a células objetivo específicamente un polinucleótido tal como un gen estructural en condiciones de transfección altamente eficaces e inducir la expresión en las células del producto génico.
Una apreciación más completa de la invención y muchas de las ventajas concomitantes de la misma se percibirán fácilmente cuando se entiendan mejor con referencia a las siguientes figuras.
Descripción breve de los dibujos
La Figura 1 muestra el efecto de pLys115, SD68, SD54 y GALA-SD54 en la movilidad electroforética de ADN plásmido. Se prepararon complejos de policatión-pCMV-\beta-Gal con cada uno de los anteriores y se pasaron como sigue en el gel. Pista 1: pCMV-\betaGal solo: pista 2: 2 \mug de pLys115; pista 3: 4 \mug de pLys115; pista 4: \mug de SD68; pista 5: 6 \mug de SD68; pista 6: 4 \mug de SD54 proporcionado por el conjugado GALA-SD54; pista 7: 160 \mug de SD54 proporcionado por el conjugado GALA-SD54; y pista 8: 4 \mug de SD54 proporcionado por una mezcla equimolar de SD54 y GALA-SD54.
La Figura 2 muestra el efecto de diámetro y cantidad de dendrímero para mediar la transfección en células CV-1 (datos obtenidos de la Tabla 2).
La Figura 3 muestra la dosis-respuesta de actividad de luciferasa en función de la cantidad de plásmido pCLuc4 usado para la transfección.
La Figura 4 muestra la transfección mediada por polímero en cascada PAMAM de células de mamífero. Figura 4A: las células se transfectaron en duplicados con 6 \mug de plásmido acomplejado a SD68. Se comparó la eficacia de transfección del complejo optimizado (25 \mug de SD68/6 \mug de plásmido; \otimes) con la obtenida con complejos formados con 4 \mug de SD68/6 \mug de plásmido ([aminas terminales] = [nucleótidos]; \Box). La actividad de luciferasa en las células transfectadas con pCLuc4 se midió 48 h post-transfección como se describe en la Tabla 2 o 24 h post-transfección en el caso de hepatocitos primarios. Cada valor es la media \pm intervalo de determinaciones duplicadas. Se estimó el porcentaje de células transfectadas en las condiciones optimizadas con el plásmido pCMV-\betaGal. Se detectaron las células transfectadas por coloración histoquímica usando X-Gal, 24 h post-transfección (Lim, K. Y Chae, C-B, "A Simple Assay for DNA Transfection by Incubation of the Cells in Culture Dishes with Substrate for \beta-Glactosydase", Biotech. 7:576 (1989)). Se muestran los resultados como porcentajes en el histograma. Figura 4B: Se transfectaron las células como antes con 6 \mug de pCLuc4 acomplejado a 4 \mug de dendrímero proporcionado por SD54 no modificado (\Box) o por una mezcla equimolar de SD54 no modificado y GALA-SD54 (
\sqt
).
La Figura 5 muestra una comparación de la toxicidad de pLys115 y SD68 en células CV-1. Se trataron durante 5 h células CV-1 en una placa de 96 pocillos en DME H-21 exento de suero con cantidades crecientes de policatión (pLys115 \bullet, o SD68 \circ) acomplejado (- - -) o no (-) a ADN plásmido y cultivaron durante un período de 48 h más en DME H-21 que contenía 10% de FCS. Después de este período, se estimó la toxicidad de los tratamientos por el ensayo de reducción de colorante MTT. Se cuantificó formazano después de lisis de las células por su absorbancia a 570 nm. La observancia de fondo se obtuvo pasando el ensayo en células tratadas con hidrocloruro de guanidinio 6 M. % de reducción en la viabilidad de células = {1-[OD_{570}(células tratadas-fondo]/[ OD_{570}(células no tratadas-fondo]} x 100. Cada valor es la media \pm DT de determinaciones triplicadas.
La Figura 6 muestra un gráfico que indica el desplazamiento competitivo de bromuro de etidio de ADN de timo de becerro por los derivados de bis-acridina del Ejemplo 20. (\bullet): trihidrocloruro de espermidina-bis-acridina, Kd = 4,3 x 10^{-8} M; (\circ): WTcisMPB-bA, Kd = 2,1 x 10^{-7} M; (\Box): cTcysMPB-bA, Kd = 7,9 x 10^{-7} M; (\Delta): MPB-bA, Kd = 1,0 x 10^{-6} M.
La Figura 7 muestra el efecto dependiente de la dosis del policatión de dendrímero SD68 sobre la cesión de oligonucleótidos al núcleo de la célula.
La Figura 8 muestra la dependencia del tiempo con la que el policatión de dendrímero SD68 facilita la acumulación de oligonucleótidos en el núcleo de una célula (sustitución de tampón de 25% de glucosa).
La Figura 9 muestra el efecto de la generación del policatión de dendrímero en la absorción nuclear de oligonucleótidos de 16 meros marcado con Fitc.
La Figura 10 muestra la fluorescencia nuclear observada en función de la dilución de la composición de cesión con soluciones de carbohidrato.
La Figura 11 muestra el efecto sobre la transfección de la incorporación de un ligando de fijación de objetivo y un desestabilizador de membrana al ADN mediante bis-acridina.
La Figura 12 muestra el efecto sobre la transfección de la incorporación de un ligando de fijación de objetivo y un desestabilizador de membrana al policatión de dendrímero.
Otros objetos, ventajas y aspectos de la presente invención se evidenciarán para los expertos en la técnica a partir de la siguiente discusión.
Descripción de las realizaciones preferidas Glosario
"Polinucleótido" según se usa aquí incluye secuencias de ARN o ADN de más de un nucleótido en forma de cadena sencilla, doble o múltiple. El polinucleótido abarca polidesoxirribonucleótidos que contienen 2'-desoxi-D-ribosa o formas modificadas del mismo, es decir, ADN, polirribonucleótidos que contienen D-ribosa o formas modificadas del mismo, ARN, y cualquier otro tipo de polinucleótido que sea un N-glicósido o C-glicósido de una base de purina o pirimidina, o una base de purina o pirimidina modificada o un nucleótido básico. El polinucleótido puede codificar regiones activadoras, regiones operadoras, regiones estructurales, regiones de terminación, combinaciones de ellas o cualquier otro material relevante genéticamente.
Enlaces "sustitutos" se definen aquí como enlaces alternativos convencionales tales como fósforotioato o fósforoamidato, que se sintetizan como se describe en la bibliografía disponible generalmente. No todos los enlaces en un polinucleótido necesitan ser idénticos. Los polinucleótidos de la invención pueden contener uno o más enlaces "sustitutos" como se entiende generalmente en la técnica. Algunos de estos enlaces sustitutos son no polares y contribuyen a la capacidad deseada del polinucleótido para difundirse a través de una membrana. Otros enlaces sustitutos contribuyen a la biodegradabilidad aumentada o disminuida del polinucleótido. La biodegradabilidad es afectada, por ejemplo, por una sensibilidad a nucleasa aumentada o disminuida.
"Purinas análogas" y "pirimidinas análogas" son las conocidas generalmente en la técnica, muchas de las cuales se usan como agentes quimioterapéuticos, que contienen modificaciones en el resto azúcar del polinucleótido. Son ejemplos de purinas y pirimidinas análogas aquellas en las que uno o más de los grupos hidroxilo están sustituidos con grupos halógeno o alifáticos, o están funcionalizadas como éteres, aminas y similares, o en las que la ribosa o desoxirribosa está sustituida con otras estructuras equivalentes funcionalmente. Las modificaciones en el resto de base incluyen purinas o pirimidinas alquiladas, purinas o pirimidinas aciladas u otros heterociclos. En particular, la cadena principal de azúcar-fosfato del polinucleótido puede sustituirse con una cadena principal no carbohidrato tal como un péptido u otro tipo de cadena principal de polímero (Nielsen, P.E. et al., Science 254: 1497 (1991)).
El peso molecular calculado para un dendrímero ideal que no contenga productos de reacción incompletos o productos de reacción secundarios es el peso molecular. Sin embargo, en el transcurso de una síntesis se presentan usualmente algunos productos incompletos o productos secundarios. "Peso molecular medio" según se usa aquí se refiere a un peso molecular hipotético de un dendrímero ideal pero debe señalarse que, en la práctica, pueden tener lugar desviaciones de este peso molecular medio, y están presentes en alguna proporción moléculas de diversos pesos moleculares menores y mayores que este valor. "Radio hidrodinámico" según se usa aquí se refiere al radio aparente de un dendrímero simple en soluciones acuosas. Puede estimarse por los expertos en la técnica usando cromatografía de permeación de gel o fotodispersión laser.
"Componente funcional" según se usa aquí incluye componentes de enmascaramiento de ADN, componentes de reconocimiento de células, componentes de neutralización de carga y permeabilización de membrana, y componentes de localización subcelular.
"Componente de enmascaramiento de ADN" según se usa aquí se refiere a una molécula capaz de enmascarar todo o parte de un polinucleótido para aumentar su vida media circulatoria inhibiendo el ataque por reactivos degradantes tales como nucleasas presentes en la circulación y/o que interfieren con la absorción por el sistema retículoendotelial.
"Componente permeabilizante de membrana" según se usa aquí se refiere a cualquier componente que facilita el paso de un polinucleótido a través de una membrana. Así, este término abarca en parte componentes neutralizantes de carga, habitualmente policationes, que neutralizan la gran carga negativa en polinucleótidos, y permiten al polinucleótido atravesar el interior hidrófobo de una membrana. Muchos componentes neutralizantes de carga pueden actuar como permeabilizadores de membrana. La permeabilización de membrana puede proceder también de moléculas anfipáticas. Un permeabilizador de membrana es una molécula que puede ayudar a una molécula normalmente impermeable a atravesar membranas celulares y conseguir la entrada al citoplasma de la célula. Un permeabilizador de membrana puede ser un péptido, una sal biliar, un glicolípido, un fosfolípido o una molécula de detergente. Los permeabilizadores de membrana tienen a menudo propiedades anfipáticas tales que una porción es hidrófoba y otra es hidrófila, permitiéndoles interactuar con la membrana.
"Péptido fusogénico" según se usa aquí se refiere a un péptido que, cuando se añade a dos membranas bicapa separadas, puede realizar su fusión en una membrana simple.
"Liposoma" según se usa aquí se refiere a pequeñas vesículas compuestas de líquidos anfipáticos dispuestos en bicapas esféricas. Los liposomas se clasifican habitualmente como pequeñas vesículas unilaminares (SUV), grandes vesículas unilaminares (LUV) o vesículas multilaminares (MLV). Las SUVs y LUVs tienen, por definición, sólo una bicapa, mientras que las MLVs contienen muchas bicapas concéntricas. Los liposomas pueden usarse para encapsular diversos materiales, atrapando moléculas hidrófilas en el interior acuoso o entre bicapas, o atrapando moléculas hidrófobas dentro de la bicapa. Los liposomas presentan una amplia variedad de características, dependiendo de su tamaño, composición y carga. Por ejemplo, los liposomas que tienen un pequeño porcentaje de lípidos insaturados tienden a ser ligeramente más permeables, mientras que los liposomas que incorporan colesterol u otros esteroles tienden a ser más rígidos y menos permeables. Los liposomas pueden ser de carga positiva, negativa o neutra, dependiendo del grupo hidrófilo. Por ejemplo, los lípidos basados en colina imparten una carga total neutra, los lípidos basados en fosfato y sulfato aportan una carga negativa, los lípidos basados en glicerol están cargados negativamente generalmente y los esteroles son generalmente neutros en solución pero tienen grupos cargados.
"Componente de reconocimiento de célula" según se usa aquí se refiere a una molécula capaz de reconocer un componente en la superficie de una célula fijada como objetivo. Los componentes de reconocimiento de célula incluyen anticuerpos para antígenos de la superficie celular, ligandos para receptores de la superficie celular incluyendo los implicados en endocitosis mediada por receptor, hormonas de péptidos y similares.
"Resto que se asocia a ADN" se refiere a una molécula o porciones de la misma que interactúan de manera no covalente con ácidos nucleicos. Los restos que se asocian a ADN incluyen aglomerantes de ranura principal y pequeña, intercaladores de ADN y policatión, entre otros. Los aglomerantes de ranura principal y pequeña son moléculas de las que se piensa que interactúan con ADN asociando con la ranura principal o pequeña de ADN de doble cadena. Los intercaladores de ADN son moléculas planas o porciones planas de moléculas que se piensa que se intercalan en ADN insertándose ellas mismas entre, y paralelas a, pares de bases de mucleótidos. Se piensa que los policationes se asocian con las cargas negativas en la cadena principal de ADN. Además, cuando un ADN o ARN de cadena sencilla se usa como cadena terapéutica, la "cadena enlazadora" complementaria como se describe aquí puede actuar funcionalmente como un "resto que se asocia a ADN".
Los restos que se asocian a ADN pueden enlazarse covalentemente a través de un "grupo reactivo" a un componente funcional de esta invención. Estos grupos reactivos se hacen reaccionar fácilmente con un nucleófilo en el componente funcional. Tales grupos reactivos (con sus nucleófilos reactivos correspondientes) incluyen, aunque sin limitarse a ellos, N-hidroxisuccinimida (por ejemplo, amina), maleimida y maleimidofenilo (por ejemplo, sulfhidrilo), disulfuro de piridilo (por ejemplo, sulfhidrilo), hidrazida (por ejemplo, carbohidrato) y fenilglioxal (por ejemplo, arginina).
"Componente de localización subcelular" según se usa aquí se refiere a una molécula capaz de reconocer un componente subcelular en una célula fijada como objetivo. Los componentes subcelulares reconocidos incluyen el núcleo, ribosomas, mitocondrias y cloroplastos. Componentes de localización subcelular particulares incluyen los "componentes de localización nuclear" que ayudan a llevar moléculas al núcleo y se sabe que incluyen los péptidos de localización nuclear y secuencias de aminoácidos.
"Policatión de dendrímero" según se usa aquí se refiere a un compuesto oligómero y/o polímero altamente ordenado, tridimensional, formado por secuencias de reacción reiterativas partiendo de una molécula más pequeña o iniciador diseñado tal como amoníaco o pentaeritritol, entre otros, que tienen una superficie cargada positivamente como se describe, por ejemplo, por Tomalia et al. (1990), supra.
La composición
La composición de esta invención es un sistema de casión de polinucleótido automontable que comprende
un polinucleótido; y
un policatión de dendrímero acoplado operativamente al polinucleótido, como se define en la reivindicación 1ª.
El polinucleótido
El polinucleótido puede ser un ADN o ARN de cadena sencilla, o un ADN de cadena doble o híbrido de ADN-ARN. También se consideran dentro del alcance de esta invención polinucleótidos de triple o cuádruple cadena con valor terapéutico. Los ejemplos de ADN de doble cadena incluyen genes estructurales, genes que incluyen regiones de control de operador y de terminación, y sistemas de autorreplicación tales como ADN plásmido, entre otros.
Los polinucleótidos de cadena sencilla o "cadenas terapéuticas" incluyen polinucleótidos antisentido (ADN y ARN), ribozimas y oligonucleótidos de formación de triple. Con el fin de tener actividad prolongada, la cadena terapéutica tiene preferiblemente algunos o todos sus enlaces nucleótidos estabilizados como enlaces no fosfodiéster. Tales enlaces incluyen, por ejemplo, enlaces fósforotioato, fósforoditioato, fóaforoselenato u O-alquilfosforotriéster en los que el grupo alquilo es metilo o etilo, entre otros.
Para estos polinucleótidos de cadena sencilla, puede ser preferible preparar la complementaria o "cadena enlazadora" a la cadena terapéutica como parte de la composición administrada. La cadena enlazadora se sintetiza habitualmente con un enlace fosfodiéster de manera que se degrade después de entrar en la célula. La "cadena enlazadora" puede ser una cadena separada, o puede estar incorporada covalentemente a o ser una mera extensión de la cadena terapéutica, de modo que la cadena terapéutica se vuelve atrás esencialmente y se hibrida a sí misma.
La cadena enlazadora puede tener también funcionalidades en el extremo 3' o 5' o en el carbohidrato o cadena principal que sirven como componentes funcionales para aumentar la actividad de la cadena terapéutica. Por ejemplo, la cadena enlazadora fosfodiéster puede contener un ligando de fijación de objetivo tal como un derivado folato que permite el reconocimiento y la internalización en las células objetivo. Si la enlazadora está incorporada a su cadena terapéutica complementaria que está compuesta de enlaces resistentes a la degradación, se internalizaría el dúplex. Una vez dentro de la célula, se degradará la enlazadora, liberando por ello la cadena terapéutica. De esta manera, la cadena terapéutica no tendrá funcionalidades adicionales incorporadas y no se verá impedida su función por restos no esenciales. Esta estrategia puede aplicarse a cualquier polinucleótido antisentido, ribozima o de formación de triple y se usa para ceder polinucleótidos antivíricos, antibacterianos, antineoplásticos, antiinflamatorios, antiproliferativos, anti-bloqueo de receptor o anti-transporte, y similares.
Puede sintetizarse una cadena enlazadora separada para tener la secuencia complementaria directa de la cadena terapéutica e hibridarla con ella de manera una en una. Alternativamente, la cadena enlazadora puede construirse de manera que la región 5' de la cadena enlazadora se hibride con la región 5' de la cadena terapéutica, y la región 3' de la cadena enlazadora se hibride con la región 3' de la cadena terapéutica para formar un concatenado de la siguiente estructura.
5' ------ ------ ------
3' ------ ------ ------
Este concatenado tiene la ventaja de que se aumenta el peso molecular aparente de los ácidos nucleicos terapéuticos y pueden ajustarse sus propiedades farmacocinéticas y la relación ligando de fijación de objetivo:oligonucleótido terapéutico para conseguir el efecto terapéutico óptimo.
El policatión de dendrímero
El policatión de dendrímero es un compuesto oligómero y/o polímero altamente ordenado, tridimensional, formado sobre una molécula de núcleo o iniciador diseñado por secuencias de reacción reiterativas que añaden los oligómeros y/o polímeros y que proporcionan una superficie exterior que está cargada positivamente. Estos dendrímeros pueden prepararse como se describe en el documento PCT/US83/02052 de la Dow Chemical Company, y en las Patentes de los EE.UU. Nº 4.507.466, 4.558.120, 4.568.737, 4.587.329, 4.631.337, 4.694.064, 4.713.975, 4.737.550, 4.871.779 y 4.857.599 de Tomalia, D.A. et al., o como se describe en la descripción de ejemplo proporcionada después. Típicamente, los policationes de dendrímero comprenden una molécula de núcleo sobre la que se añaden polímeros. Los polímeros pueden ser oligómeros o polímeros que comprenden grupos terminales capaces de adquirir una carga positiva. Las moléculas de núcleo adecuadas conprenden al menos dos residuos reactivos que pueden utilizarse para la unión de la molécula de núcleo a los oligómeros y/o polímeros. Son ejemplos de los residuos reactivos hidroxilo, éter, amino, imino, amido, imido, amonio, haluro, carboxilo, carboxihaluro y sulfhidrilo, entre otros. Las moléculas de núcleo preferidas son amoníaco, tris-(2-aminoetil)amina, lisina, ornitina, pentaeritritol y etilendiamina, entre otras. También son adecuadas combinaciones de estos residuos como lo son otros residuos reactivos.
Los oligómeros y polímeros adecuados para la preparación de los policationes de dendrímero de la invención son oligómeros y/o polímeros aceptables farmacéuticamente que son bien aceptados en el cuerpo. Son ejemplos de éstos poliamidoaminas derivadas de la reacción de un éster de alquilo de un ácido carboxílico \alpha,\beta-insaturado etilénicamente o una amida \alpha,\beta-insaturada etilénicamente y una alquilenpoliamina o una polialquilenpoliamina, entre otros. Se prefieren acrilato de metilo y etilendiamina. El polímero está preferiblemente unido covalentemente a la molécula de núcleo.
Los grupos terminales que pueden incorporarse a los oligómeros y/o polímeros deben ser capaces de adquirir una carga positiva. Son ejemplos de éstos azoles y aminas alifáticas y aromáticas primarias, secundarias, terciarias y cuaternarias, que pueden estar sustituidos con S u O, guanidinio y combinaciones de ellos. Los grupos catiónicos terminales se incorporan preferiblemente de manera covalente a los oligómeros y/o polímeros. Los grupos catiónicos terminales preferidos son aminas y guanidinio. Sin embargo, pueden utilizarse también otros. Los grupos catiónicos terminales pueden estar presentes en una proporción de aproximadamente 10 a 100% de todos los grupos terminales del oligómero y/o polímero, y más preferiblemente alrededor del 50 al 100%. El policatión de dendrímero puede comprender también de 0 a aproximadamente 90% de residuos reactivos terminales distintos de los grupos catiónicos. Son residuos reactivos terminales adecuados distintos de los grupos catiónicos terminales hidroxilo, ciano, carboxilo, sulfhidrilo, amida y tioéter, entre otros, y combinaciones de ellos. No obstante, también pueden utilizarse otros.
El policatión de dendrímero está asociado no covalentemente con el polinucleótido. Esto permite una desasociación o desmontaje fácil de la composición una vez que se cede a la célula. Los policationes de dendrímero típicos adecuados para su uso aquí tienen un peso molecular medio de aproximadamente 2.000 a 1.000.000, y más preferiblemente un peso molecular medio de aproximadamente 5.000 a 500.000. No obstante, también son adecuados otros pesos de molécula. Los policationes de dendrímero preferidos tienen un radio hidrodinámico de aproximadamente 11 a 60 \ring{A}, y más preferiblemente de aproximadamente 15 a 55 \ring{A}. No obstante, también son adecuados otros tamaños.
Se obtienen buenos resultados con la presente composición cuando la proporción de grupos catiónicos terminales del policatión de dendrímero al polinucleótido es de aproximadamente 1:1 a 25:1, y más preferiblemente de aproximadamente 1:1 a 10:1. No obstante, también pueden utilizarse otras proporciones.
La composición puede comprender además un agente seleccionado del grupo constituido por
1)
componentes de enmascaramiento de ADN;
2)
componentes de reconocimiento de células;
3)
componentes de neutralización de carga y de permeabilización de membrana; y
4)
componentes de localización subcelular.
Cada elemento en este sistema, incluyendo el policatión de dendrímero, es preferiblemente capaz de realizar su función indicada y capaz también de montarse o desmontarse con el polinucleótido según se requiera. La composición puede comprender además uno o más de los agentes anteriores, y más preferiblemente dos o más de los agentes. Una realización del sistema se muestra en el siguiente Esquema 1.
Esquema 1
1
En esta realización del sistema de cesión de polinucleótido de la invención, NLS es unas secuencia de localización nuclear, MD es un componente de permeabilización de membrana y Ligando es un componente de reconocimiento de célula.
Cuando la composición de la invención comprende también un agente de permeabilización de membrana, la proporción de este agente a grupos catiónicos terminales del policatión de dendrímero es preferiblemente de alrededor de 1:100 a 1:4, y más preferiblemente de 1:50 a 1:8 aproximadamente. No obstante, también son adecuadas otras proporciones. El agente de permeabilización de membrana puede acoplarse al policatión de dendrímero mediante fuerzas covalentes o electrostáticas. La composición de la invención puede contener adicionalmente un fosfolípido que puede estar en forma de un liposoma, un policatión tal como una poliamina y similares.
Cuando el agente de localización subcelular es un agente de localización nuclear, puede contener también un resto que se asocia a ADN tal como un enlazador polinucleótido de cadena sencilla, un policatión de dendrímero o un aglomerante de ranura principal o pequeña, que está acoplado operativamente al agente de localización nuclear, en cuyo caso la incorporación a ADN es preferiblemente no covalente. El resto que se asocia a ADN puede ser un agente intercalador tal como se conocen en la técnica. Se describen después ejemplos de éstos. El agente intercalador puede estar acoplado a uno o más ligandos dirigidos como objetivo a un receptor situado en la superficie de la célula eucariota. En este caso, el ligando y el policatión de dendrímero forman un agente de reconocimiento de célula capaz de reconocer la célula eucariota, y el ligando de fijación de objetivo también está acoplado al policatión de dendrímero. El agente intercalador está acoplado no covalentemente al polinucleótido, y el ligando está preferiblemente acoplado covalentemente al agente intercalador. También puede estar presente un agente de permeabilización de membrana que esté acoplado operativamente al agente intercalador o al ligando. Adicionalmente, la composición puede comprender también un polipéptido fusogénico que esté acoplado operativamente al policatión de dendrímero. Este acoplamiento puede ser covalente o no covalente. La composición puede contener también un resto que se asocia a ADN tal como los descritos después.
Cuando está presente en la composición un ligando con objetivo fijado a un receptor situado en la superficie de la célula eucariota, la proporción de ligando con objetivo fijado a la célula a grupos catiónicos terminales del policatión de dendrímero es preferiblemente de alrededor de 1:100 a 1:10, y más preferiblemente de 1:80 a 1:25 aproximadamente. No obstante, también son adecuadas otras proporciones. Los ejemplos de ligandos con objetivo fijado a la célula preferidos son vitaminas, carbohidratos y polipéptidos. No obstante, otros también son adecuados. El polipéptido puede comprender anticuerpos o fragmentos de ellos que tengan una especificidad predeterminada.
Cuando un polipéptido fusogénico está acoplado al policatión de dendrímero, la proporción de polipéptido fusogénico a grupos catiónicos terminales del policatión de dendrímero es preferiblemente de alrededor de 1:100 a 1:4, y más preferiblemente de 1:80 a 1:10. No obstante, también son adecuadas otras proporciones.
La composición puede contener también un agente de enmascaramiento de ADN que sea capaz de aumentar la vida media circulatoria del polinucleótido. El agente de enmascaramiento de ADN está acoplado operativamente al policatión de dendrímero por fuerzas covalentes o no covalentes. No obstante, el agente de enmascaramiento de ADN está preferiblemente acoplado no covalentemente al polinucleótido. Cuando el agente de enmascaramiento de ADN está presente en la composición, la proporción del agente de enmascaramiento de ADN a los grupos catiónicos terminales del policatión de dendrímero es preferiblemente de alrededor de 1:33 a 1:3, y más preferiblemente de 1:25 a 1:8 aproximadamente. No obstante, también son adecuadas otras proporciones.
Se describen después otras formas particulares de todos estos agentes que pueden añadirse a la composición.
Los componentes funcionales (1) Agentes de enmascaramiento de ADN
El elemento de enmascaramiento de ADN de este sistema es una molécula capaz de enmascarar la totalidad o parte del polinucleótido, aumentando por ello su vida media circulatoria inhibiendo el ataque por reactivos degradantes presentes en la circulación o bloqueando la absorción por el sistema retículoendotelial.
En esta invención, puede enlazarse covalentemente polietilenglicol (PEG) con un resto que se asocia a ADN por métodos convencionales como se describe después, y usarse como componente de enmascaramiento de ADN. El PEG puede tener un peso molecular de aproximadamente 700 a 20.000 Daltons, preferiblemente de 1.800 a 6.000 Daltons aproximadamente, y está presente preferiblemente en una relación (moléculas de PEG:pb de ADN) de aproximadamente 1:4 a 1:100, y más preferiblemente de alrededor de 1:20.
Alternativamente, el ADN puede enmascararse por asociación con lípidos. En una realización, el ADN está encerrado en liposomas estándares como se ha descrito, por ejemplo, en la Patente de los EE.UU. Nº 4.394.448 de Szoka et al. En otra realización, el ADN se incuba con un lípido catiónico sintético similar a los descritos en la Patente de los EE.UU. Nº 4.897.355 de Epstein et al. Estos lípidos catiónicos tienen la fórmula química
2
en la que
n es un número entero de 1 a 8;
R^{1} y R^{2} son iguales o diferentes y son alquilo(C_{6}-C_{24}) o alquenilo;
R^{3} es hidrógeno o alquilo(C_{1}-C_{10}) o alquil(C_{1}-C_{10})amina; y
R^{4} es un alquilo(C_{1}-C_{30}) lineal o ramificado cargado positivamente o alquil(C_{1}-C_{30})amina, en el que uno o más de los átomos de carbono puede estar sustituido con NR', en el que R' es hidrógeno o alquilo(C_{1}-C_{10}) o alqui(C_{1}-C_{10})lamina.
Los grupos preferidos que pueden funcionar como resto -N-R' son tris(aminoetil)amina (NH_{2}CH_{2}CH_{2})_{3}N, agmatina (descarboxiarginina) H_{2}N(CH_{2})_{4}C(=NH)NH_{2}, 3-aminoetil-1,3-propanodiamina H_{2}N(CH_{2})_{3}NH(CH_{2})_{2}NH_{2}, 3-dimetilaminopropilamina (CH_{3})_{2}NH(CH_{2})_{3}NH_{2}, iminobis(N,N')dimetilpropilamina NH((CH_{2})_{3}N(CH_{3})_{2})_{2}, iminobis(3-aminopropil)-1,3-propanodiamina, 1,4-bis(3-aminopropil)piperazina, bis(propilamina) (NH_{2}(CH_{2})_{3})_{2}NH, espermidina y espermina, entre otros. Estos grupos están incorporados preferiblemente a la molécula de lípido a través de uno de sus átomos de nitrógeno.
En una realización preferida específicamente, el lípido catiónico sintético es un lípido de cola catiónico sintético que tiene la fórmula química
3
en la que
n es un número entero de 6 a 24;
Y se selecciona del grupo constituido por hidrógeno, etanolamina, colina, glicerol, serina, monometoxipolietilenglicol, ácido siálico e inositol;
R^{1} es alquilo(C_{6}-C_{24}) o alquenilo(C_{6}-C_{24});
R^{3} es hidrógeno o alquilo(C_{1}-C_{10}) o alquil(C_{1}-C_{10})amina; y
R^{4} es un alquilo(C_{1}-C_{30}) lineal o ramificado cargado positivamente o alquil(C_{1}-C_{30})amina, en el que uno o más de los átomos de carbono puede estar sustituido con NR', en el que R' es hidrógeno o alquilo(C_{1}-C_{10}) o alquil(C_{1}-C_{10})amina.
Los grupos preferidos que pueden funcionar como resto -N-R' son tris(aminoetil)amina (NH_{2}CH_{2}CH_{2})_{3}N, agmatina (descarboxiarginina) H_{2}N(CH_{2})_{4}C(=NH)NH_{2}, 3-aminoetil-1,3-propanodiamina H_{2}N(CH_{2})_{3}NH(CH_{2})_{2}NH_{2}, 3-dimetilaminopropilamina (CH_{3})_{2}NH(CH_{2})_{3}NH_{2}, iminobis(N,N')dimetilpropilamina NH((CH_{2})_{3}N(CH_{3})_{2})_{2}, iminobis(3-aminopropil)-1,3-propanodiamina, 1,4-bis(3-aminopropil)piperazina, bis(propilamina) (NH_{2}(CH_{2})_{3})_{2}NH, espermidina y espermina, entre otros. Estos grupos están incorporados preferiblemente a la molécula de lípido a través de uno de sus átomos de nitrógeno.
Los lípidos catiónicos sintéticos descritos antes enmascaran eficazmente al ADN cuando se asocian con él. Sin intentar limitar la invención en modo alguno, se cree que los lípidos pueden formar una estructura monocapa que encapsula de alguna manera al ADN.
(2) Componentes de reconocimiento de célula
El elemento de reconocimiento de célula de este sistema es una molécula capaz de reconocer un componente en la superficie de una célula fijada como objetivo que está enlazado covalentemente con un resto que se asocia a ADN por métodos convencionales como se describe después. Los componentes de reconocimiento de célula incluyen anticuerpos para antígenos de la superficie celular, ligandos para receptores de la superficie celular incluyendo los implicados en endocitosis mediada por receptor, hormonas péptidas, etc. Los ligandos específicos considerados por esta invención incluyen ligandos carbohidratos tales como galactosa, manosa, 5-fosfato de manosilo, fucosa, grupos siálicos, N-acetilglucosamina o combinaciones de estos grupos como carbohidratos complejos tales como los encontrados en glicolípidos de los grupos sanguíneos o en diversas proteínas segregadas. Otros ligandos incluyen folato, biotina, diversos péptidos que pueden interactuar con receptores de la superficie celular o intracelulares tales como el péptido quimioatrayente N-formil-met-leu-phe (SEC ID NO:2), péptidos que contienen la secuencia arg-asp-glicina o péptidos de cys-ser-gly-arg-glu-asp-val-trp (SEC ID NO:3), péptidos que contienen un residuo de cistina o que interactúan con proteína de la superficie celular tal como el virus de la inmunodeficiencia humana GP-120, y péptidos que interactúan con CD-4. Otros ligandos incluyen anticuerpos o fragmentos de anticuerpos tales como los descritos por Hertler y Frankel (Hertler, A. y Frankel, A., J. Clin. Oncol. 7: 1932 (1989)). La especificidad de los anticuerpos puede dirigirse contra una variedad de epítopes que pueden expresarse en superficies celulares incluyendo macromoléculas de histocompatibilidad, antígenos autoinmunes, proteínas víricas, parásitas o bacterianas. Otros ligandos proteínas incluyen hormonas tales como la hormona del crecimiento e insulina o factores de crecimiento de proteínas tales como GM-CSF, G-CSF, eritropoyetina, factor de crecimiento epidérmico, factor de crecimiento de fibroblastos básico y ácido y similares. Otros ligandos proteínas incluyen diversas citoquinas que funcionan a través de receptores de la superficie celular tales como interleuquina-2, interleuquina-1, factor de necrosis de tumores y fragmentos de péptidos adecuados de tales macromoléculas.
(3) Componentes permeabilizadores de la membrana
El elemento permeabilizador de la membrana de este sistema es una molécula que facilita el paso de un polinucleótido a través de una membrana. Los liposomas y lípidos catiónicos sintéticos descritos antes como componentes de enmascaramiento de ADN también pueden funcionar también como componentes de permeabilización de la membrana.
Los componentes permeabilizadores de la membrana de esta invención incluyen también policationes que neutralizan la gran carga negativa en polinucleótidos. Los policationes de esta invención incluyen polilisina, poliarginina, poli(lisina-arginina) y polipéptidos similares, y los dendrímeros de poliaminas y policatiónicos tales como los descritos antes y utilizados en los ejemplos, y descritos por Tomalia et al. (Tomalia, D.A. et al., (1990), supra). Estos dendrímeros son una realización particularmente preferida de esta invención, porque, por sí mismos, en asociación con el polinucleótido, pueden mejorar sustancialmente la eficacia de transfección de nucleótido como se ha descrito antes.
Estos polímeros en cascada policatiónicos no lineales combinan las propiedades de unión a ADN y cesión de la polilisina y los efectos lisomotrópicos de las bases débiles. Los polímeros en cascada de poliamidoamina (PAMAM), una clase bien definida de polímeros dendríticos sintetizados a partir de acrilato de metilo y etilendiamina como se describe por Tomalia et al., supra, han mostrado en la descripción de ejemplo ser bien tolerados por células y, cuando se acomplejan a plásmidos que codifican genes informadores, mediar en una transfección altamente eficaz de una amplia variedad de células en cultivo.
En una realización aún más preferida, un péptido anfipático tal como GALA puede incorporarse covalentemente al polímero en cascada (Subbarao, N.K. et al., "pH-Dependent Bilayer Destabilization by an Amphipathic Peptide", J. Biol. Chem. 26: 2964 (1987)). Esta composición es también una realización más preferida de esta invención, porque se muestra en la descripción de ejemplo que mejora significativamente la eficacia de transfección de polinucleótido en células primarias y linajes celulares.
Otra clase de policationes son las sales biliares catiónicas que tienen la fórmula química
4
en la que
X e Y son independientemente H u OH;
R^{3} es hidrógeno o alquilo(C_{1}-C_{10}) o alquil(C_{1}-C_{10})amina; y
R^{4} es un alquilo(C_{1}-C_{30}) lineal o ramificado cargado positivamente o alquil(C_{1}-C_{30})amina, en el que uno o más de los átomos de carbono puede estar sustituido con NR', en el que R' es hidrógeno o alquilo(C_{1}-C_{10}) o alquilamina.
Los grupos preferidos que pueden funcionar como resto -N-R' son tris(aminoetil)amina (NH_{2}CH_{2}CH_{2})_{3}N, agmatina (descarboxiarginina) H_{2}N(CH_{2})_{4}C(=NH)NH_{2}, 3-aminoetil-1,3-propanodiamina H_{2}N(CH_{2})_{3}NH(CH_{2})_{2}NH_{2}, 3-dimetilaminopropilamina (CH_{3})_{2}NH(CH_{2})_{3}NH_{2}, iminobis(N,N')dimetilpropilamina NH((CH_{2})_{3}N(CH_{3})_{2})_{2}, iminobis(3-aminopropil)-1,3-propanodiamina, 1,4-bis(3-aminopropil)piperazina, bis(propilamina) (NH_{2}(CH_{2})_{3})_{2}NH, espermidina y espermina, entre otros. Estos grupos están incorporados preferiblemente a la sal biliar a través de uno de sus átomos de nitrógeno.
En una realización diferente, el componente permeabilizador de membrana de la invención es un péptido catiónico anfipático. Los péptidos catiónicos anfipáticos son péptidos cuya configuración nativa es tal que se considera que el péptido tiene una cara catiónica y una cara hidrófoba neutra. En una realización preferida, el péptido es un péptido cíclico. Son ejemplos de los péptidos cíclicos catiónicos anfipáticos de esta invención gramicidina S, y las tirocidinas. El péptido puede contener también algunos o todos los aminoácidos en configuración D, en oposición a la configuración L que tiene lugar naturalmente. La estructura química de la gramicidina S se muestra a continuación.
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En una realización particularmente preferida, el elemento permeabilizador de membrana incluye, además de los péptidos cíclicos catiónicos anfipáticos, (1) un lípido o (2) una poliamina simple, o ambos.
El lípido de la invención es una molécula anfipática que es capaz de formación de liposoma, y es sustancialmente no tóxica cuando se administra en las concentraciones necesarias en forma nativa o como liposomas. Los lípidos adecuados tienen generalmente un extremo polar o hidrófilo y un extremo no polar o hidrófobo. Los lípidos adecuados incluyen sin limitación fosfatidilcolina de huevo (EPC), fosfatidiletanolamina, dipalmitoilfosfatidilcolina (DPPC), colesterol (Chol), colesterilfosforilcolina, 3,6,9-trioxaoctan-1-ol-colesteril-3-ol, dimiristoilfosfatidilcolina (DMPC) y otros derivados de hidroxicolesterol o aminocolesterol (véase, por ejemplo, Patel, K.R. et al., Biochim. Biophys. Acta 814: 256 (1985)). El lípido se añade preferiblemente en forma de liposomas y la poliamina añadida es preferiblemente espermina o espermidina.
Los elementos permeabilizadores de membrana, el péptido cíclico y el fosfolípido y la poliamina opcionales pueden añadirse a la composición simultánea o consecutivamente. Preferiblemente, el péptido cíclico se añade primero, y el fosfolípido o la poliamina después. La relación en moles de pétido cíclico a poliamina añadidos es preferiblemente de alrededor de 1:1 a aproximadamente 1:3. La relación en moles de péptido cíclico a fosfolípido añadidos es preferiblemente de alrededor de 1:1 a aproximadamente 1:20.
(4) Componentes de localización subcelular
El elemento de localización subcelular de este sistema es una molécula capaz de reconocer un componente subcelular en una célula fijada como objetivo, enlazada covalentemente con un resto que se asocia a ADN por métodos convencionales como se describe después. Los componentes subcelulares particulares incluyen el núcleo, ribosomas, mitocondrias y cloroplastos.
En una realización preferida de esta invención, el componente de localización subcelular es un componente de localización nuclear. Los componentes de localización nuclear incluyen péptidos conocidos de secuencias de aminoácidos definidas, y secuencias más largas que contienen estos péptidos. Una secuencia de péptido conocida es el heptapéptido antígeno T grande de SV40 pro-lys-lys-lys-arg-lys-val (SEC ID NO:1). Otros péptidos incluyen el decapéptido de nucleoproteína del virus de la gripe ala-ala-phe-glu-asp-leu-arg-val-leu-ser (SEC ID NO:4), y el segmento de proteína de adenovirus E1a lys-arg-pro-arg-pro (SEC ID NO:5). Otras secuencias pueden percibirse de Dingwall et al. (Dingwall, C. et al., TIBS 16: 478 (1991)).
En otra realización, el componente de localización subcelular es un componente de localización lisosómica. Un componente conocido para fijar como objetivo al lisosoma es un péptido que contiene el segmento lys-phe-glu-arg-gln (SEC ID NO:6).
En otra realización todavía, el componente de localización subcelular es un componente de localización mitocondrial. Un componente conocido para fijar como objetivo mitocondrias es un péptido que contiene la secuencia met-leu-ser-leu-arg-gln-ser-ile-arg-phe-phe-lys-pro-ala-thr-arg (SEC ID NO:7). No obstante, también son adecuados otros componentes o agentes de localización subcelular.
Restos que se asocian a ADN
El resto que se asocia a ADN de este sistema se refiere a una porción de un componente funcional que interactúa de manera no covalente con ácidos nucleicos. El resto está enlazado covalentemente al excedente del componente funcional por medios convencionales o como se describe después. Los restos que se asocian a ADN son preferiblemente aglomerantes de ranura principal y pequeña, intercaladores de ADN o aglomerantes de ADN generales. En el caso de polinucleótidos de cadena sencilla, el resto que se asocia a ADN puede ser incluso la cadena enlazadora como se ha descrito antes. En tal caso, el resto funcional, tal como el componente de reconocimiento de célula o localización subcelular, está enlazado covalentemente a la cadena enlazadora.
En una realización preferida, el resto que se asocia a ADN es un aglomerante de ranura principal o pequeña. Los aglomerantes de ranura principal y pequeña son restos conocidos por asociarse o "meterse dentro de" la ranura principal o pequeña de ADN. Estos aglomerantes incluyen distamicina A y el colorante de Hoechst 33258.
En otra realización, el resto que se asocia a ADN es un aglomerante de ADN no específico tal como un policatión. Los policationes de esta invención incluyen polilisina, poliarginina, poli(lisina-arginina) y polipéptidos similares, y las poliaminas y los dendrímeros policatiónicos.
En otra realización preferida, el resto que se asocia a ADN es un intercalador de ADN. Los intercaladores de ADN son moléculas policíclicas planas tales como bromuro de etidio, acridina, mitoxantrona, oxazolopiridocarbazol, elipticina y N-metil-2,7-diazapirenio, y derivados de ellos. En una realización particular preferida, el intercalador es un dímero consistente en dos moléculas policíclicas planas enlazadas covalentemente. Un resto dímero policíclico plano de esta invención tiene la fórmula química
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en la que
Z es un enlace;
n y m son independientemente un número entero de 1 a 20;
p es un número entero de 0 a 20; y
Ar_{1} y Ar_{2} se seleccionan independientemente del grupo constituido por bromuro de etidio, acridina, mitoxantrona, oxazolopiridocarbazol, elipticina y N-metil-2,7-diazapirenio, y derivados de ellos, entre otros.
Los valores de n y m son importantes porque determinan el espaciamiento de los monómeros de acridina intercalados en el ADN. Los valores más preferidos de n y m son 3 y 4, respectivamente. Se prefieren dímeros de bis-acridina en los que Ar_{1} y Ar_{2} son ambos acridina.
Este resto que se asocia a ADN preferido puede estar incorporado covalentemente a un resto funcional, tal como un resto de reconocimiento de célula, un resto de localización subcelular o un resto permeabilizador de membrana como se ha descrito antes. El valor de p determina la separación del intercalador del resto funcional. Los valores preferidos de p son de 0 a 8.
El resto que se asocia a ADN puede incorporarse covalentemente a copias múltiples de un, o más de un, resto funcional. Por ejemplo, puede incorporarse un dímero de bis-acridina a tres residuos de galactosa que se unen al receptor de asialoglicoproteína de hepatocito.
Un método preferido para incorporar el dímero que se asocia a ADN al resto funcional implica un precursor que tiene la fórmula química
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en la que
n y m son independientemente un número entero de 1 a 20;
p es un número entero de 0 a 20; y
Ar_{1} y Ar_{2} se seleccionan independientemente del grupo constituido por bromuro de etidio, acridina, mitoxantrona, oxazolopiridocarbazol, elipticina y N-metil-2,7-diazapirenio, y derivados de ellos; y
X es un grupo reactivo seleccionado del grupo constituido por N-hidroxisuccinimida, maleimida, maleimidofenilo, disulfuro de piridilo, hidrazida y fenilglioxal.
En una realización preferida, Ar_{1} y Ar_{2} son acridina, p es 3 y X es p-maleimidofenilo. Este resto intercalador se acopla después al resto funcional a través de un grupo sulfhidrilo en el resto funcional, por ejemplo, para obtener un componente bifuncional que tiene la fórmula química
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en la que
Y es un componente funcional;
n y m son independientemente un número entero de 1 a 20;
p es un número entero de 0 a 20;
Ar_{1} y Ar_{2} se seleccionan independientemente del grupo constituido por bromuro de etidio, acridina, mitoxantrona, oxazolopiridocarbazol, elipticina y N-metil-2,7-diazapirenio, y derivados de ellos; y
X es un grupo reactivo seleccionado del grupo constituido por N-hidroxisuccinimida, maleimida, maleimidofenilo, disulfuro de piridilo, hidrazida y fenilglioxal.
También pueden usarse enlazadores biodegradables tales como péptidos que tienen el segmento de aminoácidos -lys-lys- para incorporar el componente funcional al intercalador.
En otra realización todavía de esta invención, el dímero policíclico plano tiene la fórmula química en la que
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en la que
Ar_{1} y Ar_{2} se seleccionan independientemente del grupo constituido por bromuro de etidio, acridina, mitoxantrona, oxazolopiridocarbazol, elipticina y N-metil-2,7-diazapirenio, y derivados de ellos;
cada aa es independientemente un aminoácido;
x y z son números enteros seleccionados independientemente de 1 a 100;
y es un número entero de 0 a 5;
aa_{1} y aa_{2} son residuos de lisina; y
N^{1} y N^{2} son nitrógenos de los grupos \varepsilon-amino de los residuos de lisina aa_{1} y aa_{2}.
La composición de la invención se utiliza convenientemente para introducir un polinucleótido en una célula eucariota poniéndolo en contacto con la célula. La introducción del polincleótido en la célula eucariota puede conseguirse in vitro e in vivo. In vivo, la composición puede administrarse en una cantidad que comprende aproximadamente 0,5 \mug a 20 mg del polinucleótido, y más preferiblemente alrededor de 2,5 \mug a 10 mg del polinucleótido. No obstante, pueden administrarse también otras cantidades. El presente método es adecuado para introducir polinucleótidos en células de plantas o animales, incluyendo células humanas, in vitro e in vivo.
El sistema de cesión de polinucleótido de la invención es útil en un contexto terapéutico. En aplicaciones terapéuticas, la composición de la invención puede formularse para una variedad de modos de administración, incluyendo administración sistémica y tópica o localizada. Pueden encontrarse en general técnicas y formulaciones en Remington's Pharmaceutical Sciences, Mack Publishing Co., Easton, PA, última edición.
La composición de la invención se administra típicamente por vías oral, transdérmica, sistémica o de inhalación.
Para administración sistémica, se prefiere la administración parenteral tal como inyección, incluyendo intramuscular, intravenosa, intraperitoneal y subcutánea. Para tratar trastornos del pulmón, la administración del sistema de cesión de polinucleótido puede hacerse por inhalación o por instalación del sistema directamente en el pulmón.
Para inyección, la composición de la invención puede formularse en forma de una solución líquida, preferiblemente en tampones compatibles fisiológicamente tales como solución de Hank o solución de Ringer, entre otros. Además, la composición puede formularse también en forma sólida y venderse y transportarse en esta forma, y redisolverse o suspenderse inmediatamente antes de usar. También se incluyen dentro de los confines de la invención formas liofilizadas. La forma sólida puede administrarse también directamente mediante un polvo seco en los pulmones, piel, tracto gastrointestinal o músculo.
La administración sistémica de la presente composición también puede hacerse por medios transmucósicos o transdérmicos, o los sistemas pueden administrarse oralmente, o a través de aerosoles intranasales o inhalados. Para administración transmucósica o transdérmica, se usan en la formulación penetrantes apropiados para la barrera a permear. Tales penetrantes son conocidos generalmente en la técnica e incluyen, por ejemplo, para administración transmucósica sales biliares y derivados de ácido fusídico. Además, pueden usarse también detergentes para facilitar la permeación. Pueden usarse también medios físicos tales como impacción a alta velocidad para facilitar la penetración de la capa exterior de la piel para posicionar el complejo en la epidermis. La administración transmucósica puede conseguirse a través de pulverizaciones nasales, por ejemplo, o por medio de supositorios.
Para administración oral, la composición de la invención puede formularse en formas de asdministración oral convencionales tales como cápsulas, pastillas y tónicos.
Para administración tópica, los sistemas de la invención se formulan en ungüentos, bálsamos, geles o cremas, como se conoce generalmente en la técnica. La administración tópica o transdérmica puede realizarse mediante administración por impacción a alta velocidad a la superficie de la piel. No obstante, también son adecuados otros medios de administración transdérmica o tópica.
Habiendo descrito ahora en general esta invención, se entenderá mejor la misma mediante referencia a ciertos ejemplos específicos, que se incluyen aquí sólo con fines de ilustración y no pretenden ser limitativos de la invención o cualquier realización de ella, salvo que así se especifique.
Ejemplos Ejemplo 1
(no reivindicado)
Comparación de transfecciones mediadas por complejo de ADN-dendrímero y complejo de ADN-polilisina
Para encontrar mejores alternativas definidas químicamente a los polímeros poliaminas tales como polilisina, se emplearon las macromoléculas de policatión ramificado hidrófilo también conocidas como micropartículas de dendrímero Starbust® (Tomalia et al., supra) para formar un complejo con ADN o con ADN y el péptido anfipático permeabilizador GALA (Parente, R. et al., Biochemistry 29: 8720 (1990)). El complejo se preparó diluyendo 12 \mug de plásmido pCLuc4 en 660 \mul de HBS (Hepes 20 mM, NaCl 150 mM, pH 7,4) en un tubo de poliestireno. Se disolvió polilisina (Sigma Chemical Co.) o micropartículas de dendrímero Starbust® de la quinta generación (1 nmol) (Polysciences, Inc.) en 340 \mul de HBS y se añadió lentamente (gota a gota) a la solución de ADN. En estas condiciones, las cargas positivas de los grupos amino epsilon de las polilisinas o de las aminas periféricas de los dendrímeros están en un exceso de 1,3 veces sobre las cargas negativas de los plásmidos. Cuando se añadió el péptido GALA, se añadió de tal manera que las cargas negativas en GALA neutralizaban las cargas en exceso en el dendrímero. La mezcla se dejó reposar durante 30 minutos tras la última adición a temperatura ambiente y se añadieron después 500 \mul de la mezcla a células CV-1. El método de transfección se realizó como se ha descrito antes. En este experimento, el mejor método de transfección se logró con el complejo GALA-dendrímero-ADN, seguido por el dendrímero-ADN y después por polilisina-ADN. Los resultados se muestran en la siguiente tabla.
TABLA Transfección mediada por ADN-dendrímero
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Ejemplo 2 Materiales
Se obtuvieron polímeros en cascada PAMAM sintetizados a partir de un núcleo iniciador de amoníaco (generación 2 a 10) de Polysciences, Inc. (Warrington, PA) y se designan como dendrímeros Starbust®. Cuando se necesitaron, se concentraron soluciones de dendrímero usando un sistema Savant SC110 Speed Vac. Se obtienen resultados similares a los indicados aquí cuando el polímero en cascada se sintetizó en el laboratorio de los inventores usando el método de Tomalia et al. (Tomalia et al., supra) pero partiendo de tris(2-aminoetil)amina. Los dendrímeros disponibles comercialmente deben analizarse en una columna de permeación de gel calibrada para asegurarse de que el material se ajusta al diámetro especificado, porque algunos lotes no se ajustan a las especificaciones. Se obtuvo hidrobromuro de poli(L-lisina) con una longitud de cadena media de 115 residuos de lisina (pLys 115) de Sigma. Chemical Co. (St. Louis, MO). 3-(2-Piridil)ditiopropionato de N-succinimidilo (SPDP) se obtuvo de Pierce (Rockford, IL).
GALAcystrp-glu-ala-ala-leu-ala-glu-ala-leu-ala-glu-ala-leu-ala-glu-his-leu-ala- glu-ala-leu-ala-glu-ala-leu-glu-
ala-cys-ala-ala (SEC ID NO:8), un análogo que contiene cisteína del péptido anfipático GALA, se sintetizó en el UCSF Bioresources Center, se purificó y se analizó esencialmente como se ha descrito previamente para GALA (Subbarao et al., supra).
Ejemplo 3 Abreviaturas
DME: medio de Eagle modificado por Dulbecco.
EDTA: ácido etilendiaminatetraacético.
HBS: solución salinada tamponada con Hepes (Hepes 10 mM; NaCl 150 mM; pH 7,3).
HEPES: N-(2-hidroxietil)piperazina-N'-(ácido 2-etanosulfónico).
MEM: medio de Eagle esencial mínimo.
MTT: bromuro de 3-(4,5-dimetiltiazol-2-il)-2,5-difeniltetrazolio.
TRIS: tris(hidroximetil)aminometano.
PAMAM SD54 y SD68: dendrímero poliamidoamina Starbust® de 54 \ring{A} y 68 \ring{A} de diámetro.
PLys115: poli(L-lisina), longitud media de cadena 115 monómeros.
Ejemplo 4 Modificación de SD54 con GALAcys (SEC ID NO:8)
El dendrímero PAMAM de la 5ª generación (54 \ring{A} de diámetro, SD54) se modificó según el siguiente Esquema 2.
Esquema 2
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Ejemplo 5 Funcionalización de SD54 con SPDP
El dendrímero (66 \mumoles de aminas terminales, 15 mg) en 0,5 ml de agua se diluyó con 0,75 ml de tampón fosfato 0,1 M (pH 8,0) y se añadieron gota a gota 0,75 ml de una solución 15 mM de SPDP en etanol. La mezcla de reacción se agitó durante 1 h bajo argón y se fraccionó en una columna Biogel P2 (2,8 x 20 cm) eluida con tampón fosfato 0,1 M (pH 7,4). Las fracciones que contenían dendrímeros modificados con 3-(2-piridiltio)propionato (PDP-SD54 con una media de 16 grupos ditiopiridina por partícula) se agruparon entre sí y se concentraron hasta un volumen final de 3 ml.
Ejemplo 6 Reacción de PDP-SD54 con GALAcys (SEC ID NO:8)
Un mililitro de una solución 10 mM de GALAcys (SEC ID NO:8) en un tampón fosfato 0,1 M (pH 7,2) se añadió gota a gota a 1 ml de la solución concentrada de PDP-SD54. La mezcla se agitó durante la noche bajo argón y el conjugado de GALA se purificó fraccionando la mezcla de reacción en una columna Sephadex® G75-120 (2 x 90 cm) calibrada (juego de calibración Sigma MW-GF-70 que contiene aprotinina (66.000) y azul dextrano (2.000.000)), y se eluyó la columna con tampón fosfato 0,1 M (pH 7,4). Las fracciones que contenían el conjugado, que eluyeron con un peso molecular aparente de aproximadamente 50.000, se agruparon, concentraron y dializaron frente a HBS (Hepes 10 mM, NaCl 150 mM, pH 7,3). El material dializado se diluyó con HBS hasta 1 mg de dendrímero/ml y se sometió a filtración estéril a través de una membrana Millipore de 0,45 \mum.
Ejemplo 7 Vectores de expresión
Los plásmidos pCLuc4 que codifican luciferasa de luciérnaga y pCMV-\betaGal que codifica \beta-galactosidasa fueron obsequios generosos del Dr. Cotten, M. (Institute of Molecular Pathology, Viena, Austria) y el Dr. Mc Gregor, G. (Howard Hughes Medical Institute, Houston, TX) respectivamente (De Wet, J.R. et al., "Firefly Luciferase Gene: Structure and Expression in Mammalian Cells", Mol. Cell Biol. 7:725 (1987); Mc Gregor, G.R. y Caskey, C.T., "Construction of Plasmids that Express E. Coli \beta-galactosidase in Mammalian Cell Lines", Biotech. 7:1116 (1989)). Los plásmidos se desarrollaron en Escherichia coli, se extrajeron por la técnica de lisis alcalina y se purificaron por centrifugación en gradientes de CsCl de equilibrio. La pureza de los plásmidos se comprobó por electroforesis en un gel de agarosa al 0,8% y se determinó la concentración de ADN a partir de la absorbancia a 260 nm.
Ejemplo 8 Preparación de complejo
Se hizo un complejo típico diluyendo 6 \mug de ADN plásmido en 330 \mul de HBS en un tubo de poliestireno. El policatión y/o su derivado GALA-funcionalizado (2-160 \mug) se diluyeron en 170 \mul de HBS y se añadieron gota a gota al ADN. Cuando se completó la adición, la solución se mezcló suavemente. Se mostró la formación del complejo policatión-ADN por un ensayo de retardo de gel; se sometieron a electroforesis muestras (30 \mul) a través de un gel de agarosa al 0,8% usando un sistema de tampón Tris-acetato-EDTA (pH 8,0) y se visualizó ADN usando coloración con bromuro de etidio.
Ejemplo 9 Células y método de transfección
Los linajes celulares adherentes CV-1 (fibroblasto de mono), HeLa (carcinoma humano) y HepG2 (hepatoma humano) se proporcionaron por la instalación de cultivos de células UCSF. Las células se pusieron en placa con una densidad de aproximadamente 5 x 10^{5} células por placa de cultivos de 60 mm (Falcon) en 3 ml de DME-H21 que contenía 10% de FCS y antibióticos (penicilina 100 unidades/ml y estreptomicina 100 \mug/ml). Se desarrollaron las células hasta semiconfluencia a 37ºC en una atmósfera humidificada que contenía 5% de CO_{2}. En un experimento típico, se transfectaron las células en 1,5 ml de medio sin suero por adición de 0,5 ml de HBS que contenía 6 \mug de plásmido acomplejado con la cantidad indicada de policatión. El medio se separó 5 h más tarde y se sustituyó por medio reciente que contenía 10% de FCS. Las células se cultivaron durante períodos de 24 o 48 h adicionales, y se ensayó en ellas la expresión de gen informador.
Los linajes celulares en suspensión K-562 (eritroleucemia humana), EL-4 (linfoma de ratón) y Jurkat (células T humanas) se obtuvieron de la instalación de cultivos de células UCSF y se desarrollaron en RPMI 1640 que contenía 10% de FCS y antibióticos. Para el experimento de transfección, se introdujeron 1,2 x 10^{6} células en 1,5 ml de RPMI 1640 que contenía 7,5% de FCS en cada pocillo de una placa de 6 pocillos o se hicieron girar en tubos de polipropileno y se transfectaron con 6 \mug de ADN como se ha descrito antes. Se transfirieron las células 5 h más tarde a medio reciente que contenía 10% de FCS. Esto se consiguió después de centrifugar la placa o los tubos (1.200 rpm durante 5 min) y separando el 90% del medio de transfección y sustituyéndolo por medio precalentado reciente. Las células se cultivaron durante períodos de 24 ó 48 h adicionales, y se ensayó en ellas la expresión de gen informador.
Se obtuvieron hepatocitos de rata recién aislados del Dr. Bissel, M. (Liver Center, UCSF) y se pusieron en placa con una densidad de 2 x 10^{6} células por placa de cultivo de 60 mm en 3 ml de un medio de hepatocitos compuesto por 75% de MEM y 25% de medio de Waymouth que contenía 10% de FCS, insulina (10 \mug/ml), transferrina (10 \mug/ml), dexametasona (1 \muM) y antibióticos (penicilina: 100 unidades/ml; estreptomicina: 100 \mug/ml y gentamicina: 25 \mug/ml). Se desarrollaron las células a 37ºC en una atmósfera humidificada que contenía 5% de CO_{2}, y se transfectaron 5 a 6 h más tarde como se ha descrito antes con 6 \mug de plásmido en 2 ml de medio de hepatocitos que contenía 2% de FCS. Tras un período de incubación durante la noche, se retiró el medio de transfección y se sustituyó por 3 ml de medio de hepatocitos reciente que contenía 2% de FCS. Las células se cultivaron adicionalmente durante 24 h y se ensayó en ellas la expresión de gen informador.
La expresión del gen de \beta-galactosidasa se detectó 24 h después de la transfección por coloración histoquímica de las células usando X-Gal (Lim, K. Y Chase, C.-B., supra). La expresión del gen informador de luciferasa se cuantificó 48 h después de la transfección en lisados de células midiendo la emisión de luz con un bioluminómetro (Analytical bioluminiscence, San Diego, CA) en presencia de luciferina y ATP (Brasier, A.R. et al., "Optimized use of the Firefly Luciferase Assay as a Reporter Gene in Mammalian Cell Lines", Biotech. 7:1116 (1989)).
Ejemplo 10 Ensayo de toxicidad
Los efectos de los polímeros en cascada sobre el crecimiento de células se valoraron midiendo el contenido de proteína total después de la transfección así como usando un ensayo de reducción de colorante colorimétrico (Mosmann, T.R., "Rapid Colorimetric Assay for cellular Growth and Survival: Application to Proliferation and Cytotoxycity Assays", J. Immunol. Methods 65:55 (1983)). Se comparó el efecto del dendrímero de 6ª generación (68 \ring{A} de diámetro, SD68) con el efecto de polilisina (pLys115). Los policationes se añadieron a las células con o sin ADN plásmido en una relación de 10 aminas terminales del policatión por nucleótido. Se pusieron las células en placa con una densidad de aproximadamente 5 x 10^{4} células por pocillo en 300 \mul de DME H-21 en bandejas de 96 pocillos. Después de un cultivo durante la noche a 37ºC en una atmósfera humidificada del 5% de CO_{2}, se icubaron las células en triplicados con 200 \mul de medio exento de suero que contenía de 0 a 60 \mug de pLys 115 o SD68. Después de 5 h, se sustituyó el medio por 200 \mul de DME H-21 reciente que contenía 10% de FCS y se cultivaron las células durante 48 h más. Después, se añadieron por pocillo 10 \mul de bromuro de 3-(4,5-dimetiltiazol-2-il)-2,5-difeniltetrazolio (MTT, 5 mg/ml) y se dejó reaccionar durante 2 h a 37ºC. Se añadió solución solubilizante (HCl 0,4 N en isopropanol, 200 \mul) y se incubó la placa durante 30 min a temperatura ambiente. Se midió la absorbancia a 570 nm usando un lector de placas automático ELISA (MR 700, Dynatech Laboratories, Inc.) y se corrigió por la absorbancia de fondo obtenida en células tratadas con hidrocloruro de guanidio 6 M (100% muerte). Los resultados se expresaron como % de reducción en la viabilidad de células = {{1-[OD_{570}(células tratadas)-fondo]/[OD_{570} (células no tratadas)-fondo]} x 100.
Ejemplo 11 Síntesis y caracterización de polímeros en cascada modificados
Se usó el dendrímero para incorporar grupos funcionales a polinucleótidos tales como ADN para crear vehículos de cesión de genes. El dendrímero PAMAM de 5ª generación se enlazó a GALAcys (SEC ID NO:8), un análogo que contiene cisteína del péptido anfipático GALA, usando química de acoplamiento SPDP estándar (Carlsson, J. et al., "Protein Thiolation and Reversible Protein-Protein Conjugation. N-Succinimidyl 3-(2-pyridylthio)Propionate, a New Heterobi-functional Reagent", Biochem. J. 173:723 (1978)) como se muestra en la siguiente Tabla 1.
TABLA 1 Síntesis, características físicas y funcionalización de polímeros en cascada PAMAM
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Modificado de la referencia de Tomalia et al.
El dendrímero se funcionalizó sucesivamente con el reactivo heterobifuncional SPDP y se hizo reaccionar con un exceso de GALAcys (SEC ID NO:8). El conjugado resultante se eluyó de una columna Sephadex® G75-120 calibrada con un peso molecular aparente de aproximadamente 50.000 Daltons. Esto sugiere la presencia de aproximadamente 10 residuos de GALA por dendrímero. Se cuantificó una media de 13 residuos de GALA por dendrímero usando un coeficiente de extinción molar para triptófano de \varepsilon_{280 nm} = 5570 M^{-1} cm^{-1} (pH 7,5). Puesto que GALA contiene 8 cargas negativas por péptido, muchas de las aminas no modificadas en los conjugados se neutralizan probablemente a pH 7,4. Esto está justificado por la unión débil del conjugado GALA-dendrímero a ADN (véase después).
Ejemplo 12 Unión de polímeros en cascada a ADN
Se incubaron muestras (30 \mul) de complejos de policatión-pCMV-\betaGal durante 20 minutos y se sometieron a electroforesis a través de un gel de agarosa al 0,8% usando un sistema de tampón de Tris-acetato-EDTA (pH 8,0). Los complejos se formaron mezclando 6 \mug de plásmido pCMV-\betaGal diluido en 330 \mul de HBS con los siguientes agentes en 170 \mul de HBS.
pista 1: pCMV-\betaGal solo;
pista 2: 2 \mug de pLys115;
pista 3: 4 \mug de pLys115;
pista 4: 4 \mug de SD68;
pista 5: 6 \mug de SD68;
pista 6: 4 \mug de SD54 proporcionado por el conjugado GALA-SD54;
pista 7: 160 \mug de SD54 proporcionado por el conjugado GALA-SD54;
pista 8: 4 \mug de SD54 proporcionado por una mezcla equimolar de SD54 y GALA- SD54.
Tras completarse la electroforesis, se coloreó el gel con bromuro de etidio para visualizar ADN.
Los dendrímeros PAMAM se unen a ADN como se demuestra por la retención del complejo en el punto de aplicación en un gel de electroforesis de agarosa como se muestra en la Figura 1. La polilisina (pistas 2 y 3) y el polímero en cascada (pistas 4 y 5) son capaces de retardar e inmovilizar el ADN en el gel. El retardo del gel es un resultado de efectos electrostáticos y estéricos y sugiere la formación de un complejo de carga entre los dendrímeros cargados positivamente y el ADN aniónico. Puesto que las aminas terminales del dendrímero tienen menor pK_{a} que \varepsilonNH_{2} de lisina (véase discusión), el dendrímero era ligeramente menos eficaz para inducir retardo de gel que la polilisina como se muestra en la Figura 1. Con polilisina, se observó la retención total del plásmido en una relación de \varepsilonNH_{2} a nucleótido de 1:1 (pista 3), mientras que con el dendrímero, la retención total tuvo lugar con una relación de NH_{2} terminal a nucleótido de aproximadamente 1,5:1 (pista 5). La relación exacta de retención total varió por un factor de dilución entre experimentos. El conjugado GALA-dendrímero no inmovilizó el ADN y afectó sólo ligeramente a la migración del plásmido incluso cuando se usó en gran exceso sobre el ADN (pistas 6 y 7). Una combinación de conjugado GALA-dendrímero y dendrímero sin modificar (relación 1:1, como se usó en los ensayos de transfección) retuvo parcialmente al plásmido (pista 8).
Ejemplo 13 Optimización del complejo para transfección
Se transfectaron por duplicado células CV-1 (500.000 células por placa de 60 mm) con cantidades crecientes de pCLuc4 (0,1 a 6 \mug) acomplejado a SD68. En la Figura 3, los complejos se formaron añadiendo el dendrímero disuelto en 170 \mul de HBS al ADN en 330 \mul de HBS; (\Box), se formaron primero complejos añadiendo 25 \mug de SD68 en 6 \mug de pCLuc4 y se diluyeron después en HBS hasta la cantidad indicada de ADN; (\circ), el plásmido se diluyó primero en HBS y se añadieron 25 \mug de SD68; (\Delta), se añadió un plásmido que no contenía luciferasa al plásmido pCLuc4 diluido para mantener la cantidad total de ADN constante en 6 \mug/330 \mul y se añadieron después 25 \mug de SD68. La expresión de luciferasa se midió 48 h después de la transfección como se describe en la siguiente Tabla 2. Cada valor es la media \pm intervalo de determinaciones duplicadas.
Un hallazgo inesperado de este trabajo es que los polímeros en cascada PAMAM pueden por sí mismos transfectar ADN (por ejemplo, plásmidos que codifican genes informadores) en células en cultivo. Los resultados se muestran en la siguiente Tabla 2 y en las Figuras 2 a 4.
TABLA 2 Influencia de la cantidad y tamaño de polímero en cascada PAMAM acomplejado a plásmido pCLuc4 en la expresión de gen informador de luciferasa en células CV-1
13
\dotable{\tabskip\tabcolsep#\hfil\tabskip0ptplus1fil\dddarstrut\cr}{
 \begin{minipage}{145mm}a: Recuperación de proteína celular en
comparación con células no tratadas (sin  indicación = 100% de
recuperación).\end{minipage} \cr  \begin{minipage}{145mm}Se
muestra actividad de luciferasa en las células transfectadas
(unidades de luz  por mg de proteína celular) como media  \pm 
intervalo de duplicados.\end{minipage} \cr
 \begin{minipage}{145mm}Cuando la transfección fue tóxica, la
recuperación porcentual de proteína  celular en células
transfectadas en comparación con células no transfectadas se  indica
entre
corchetes.\end{minipage} \cr}
La actividad de transfección fue particularmente alta cuando se usó un exceso de aminas terminales a nucleótido. Para definir los parámetros que controlan la cesión de genes y la expresión por los dendrímeros, se transfectaron células CV-1 con complejos de pCLuc4-dendrímero y se midió la expresión de luciferasa en función del diámetro y la cantidad de dendrímero en el complejo (véase anterior Tabla 2). La transfección fue sensible a ambos factores. Una alta expresión de luciferasa requirió un exceso de policatión. Con una baja entrada de dendrímero ([aminas primarias de dendrímero]=[nucleótidos]) sólo se transfectaron escasamente las células por los complejos.
En el intervalo de concentración ensayado, los dendrímeros de diámetro grande (\diameter = 40 nm) mediaron mejores eficacias de transfección que los más pequeños. La expresión de luciferasa aumentó 2 ó 3 órdenes de magnitud cuando se incrementó el diámetro del dendrímero formador de complejo de 40 \ring{A} (generación 4) a 54 \ring{A} (generación 5). Esto puede apreciarse mejor examinando los datos en un gráfico tridimensional (véase Figura 2). Se obtuvieron niveles máximos de transfección (= 10^{10} LU/mg de proteína celular) con el dendrímero de la 6ª generación (SD68, diámetro 68 \ring{A}) con una relación de 6 aminas primarias por nucleótido. Con estas condiciones, la expresión de luciferasa en células CV-1 fue aproximadamente 1.000 veces mayor que la obtenida con una cantidad equivalente de polilisina 115 (véase anterior Tabla 2) y 100 veces mayor que la obtenida con el lípido catiónico DOTMA (Legendre, J.Y. y Szoka, F.C., "Delivery of Plasmid DNA into Mammalian Cell Lines using pH-Sensitive Liposomes: Comparison with Cationic Liposomes", Pharm. Res. 9:1235 (1992)).
Las condiciones optimizadas se ensayaron en 10 experimentos separados en células CV-1, y se obtuvieron actividades de luciferasa entre 2 x 10^{9} y 3 x 10^{10} LU/mg de proteínas celulares. Cuando se transfectan células CV-1 con dendrímero en medio que contiene 10% de FCS, disminuyó la expresión de luciferasa en aproximadamente dos veces, mientras que la expresión disminuyó 50 veces en el caso de DOTMA (Legendre et al., supra).
Se construyó una respuesta a la dosis de la actividad de luciferasa frente a entrada de ADN con una relación constante de aminas terminales/nucleótido de 6:1 usando el dendrímero de diámetro 68 \ring{A} (SD68), y se muestra en la Figura 3. Cuando se formó primero el complejo y se diluyó después hasta la cantidad indicada de plásmido pCLuc4, se observó una disminución lineal de la expresión de luciferasa (véase Figura 3). Si se usó plásmido que no contiene luciferasa para diluir el plásmido de luciferasa y el dendrímero añadido, también disminuyó la actividad de transfección de manera lineal. Cuando se diluyó primero el plásmido y se añadió una cantidad constante de dendrímero, la relación dendrímero/plásmido aumenta en este caso con la dilución del plásmido pCLuc4 y disminuyó la actividad de transfección en mayor medida (véase Figura 3).
Ejemplo 14 Transfección de células de mamífero con complejos de SD68-ADN con bajas relaciones de aminas terminales/ nucleótido
Cada tipo de célula examinado en este estudio podría transfectarse con dendrímero PAMAM-plásmido en condiciones de aminas terminales en exceso sobre nucleótidos, incluyendo células adherentes y en suspensión así como cultivos primarios y linajes establecidos (Figura 4A). Se estudió también la eficacia de transfección del complejo optimizado usando el plásmido pCMV-\betaGal. Se detectó la actividad de \beta-galactosidasa por una coloración histoquímica 24 h después de la transfección y se enumeraron las células transfectadas. Estos datos se indican como el porcentaje al final de la barra en el gráfico (véase Figura 4A). Los diferentes tipos de células estudiados diferían en su capacidad para experimentar transfección (hasta el 80% de transfección en CV-1, menos del 1% de transfección en EL-4 y Jurkat). Esta variabilidad es una propiedad general compartida por todos los sistemas de cesión de genes; no se entiende todavía la razón para tal transfección variable entre diferentes tipos de células.
Con la entrada de dendrímero más baja, la eficacia de transfección de los complejos de dendrímero-ADN se redujo drásticamente (véase Figuras 4A y 4B). Una actividad de transfección reducida con relaciones aminas terminales/nucleótido más bajas es similar a los resultados observados con polilisinas. Así, se examinó la posibilidad de que tratamientos que pueden aumentar la transfección mediada por policationes lineales puedan aumentar la transfección mediada por dendrímero. La transfección fue esencialmente insensible a cloroquina (datos no mostrados), pero aumentó significativamente cuando se incorporó al dendrímero péptido fusogénico GALA (véase Figura 4B).
Ejemplo 15 Aumento de la transfección por incorporación covalente del péptido anfipático GALAcys (SEC ID NO:8) al polímero en cascada
Se han explotado los efectos rompedores de endosoma de partículas víricas inactivadas y de péptidos fusogénicos víricos para iniciar o aumentar la transferencia de genes mediada por polilisina (Wagner, E. et al., "Coupling of Adenovirus to Transferrin-polylysine/DNA Complexes Greatly Enhances Receptor-Mediated Gene Delivery and expression of Transfected Genes", PNAS (EE.UU.) 89:6099 (1992); Wagner, E. et al., "Influenza Virus Hemagglutinin HA-2N-terminal Fusogenic Peptides Augment Gene Transfer by Transferrin-polylysine/DNA Complexes: Toward a Synthetic Virus-Like Gene-Transfer Vehicle", PNAS (EE.UU.) 89:7934 (1992)). Se diseñó el péptido GALA de 30 aminoácidos para desestabilizar bicapas de lípidos de manera sensible al pH hasta propiedades miméticas de proteínas fusogénicas víricas (Subbarao, N.K. et al., supra). Se incorporó aquí GALA al dendrímero para ensayar si aumentaría la transfección como lo hacen las partículas víricas o los péptidos fusogénicos víricos. Con una relación aminas terminales:nucleótido baja, la eficacia de transfección de los complejos de dendrímero-ADN fue baja. Sin embargo, la transfección mejoró significativamente cuando se sustituyó el 50% del dendrímero en el complejo por su GALA-conjugado (véase Figura 4B). En estas condiciones, el conjugado puede funcionar con una baja relación dendrímero/plásmido (aproximadamente 50:1 en estos experimentos). En el caso de algunos tipos de células, tales como K562, el GALA-conjugado era tan eficaz como cuando se empleó un exceso de dendrímero para transfección (véanse Figuras 4A y 4B). Estos resultados indican que GALA aumenta la transfección, probablemente catalizando la infiltración del endosoma. Con una entrada de dendrímero en la que la transfección fue máxima, no se aumentó adicionalmente la expresión por GALA. Esto puede ser debido a que los dendrímeros presentan efectos lisosomotróficos.
Ejemplo 16 Comparación de citotoxicidad de polímero en cascada PAMAM y pLys115
Un índice de la toxicidad del procedimiento de transfección es la cantidad de proteína celular obtenida de los cultivos tras la transfección. Los tratamientos que produjeron una disminución del rendimiento de proteína celular cuando se comparó con células no tratadas, se indican entre corchetes en la anterior Tabla 2. En general, la citotoxicidad inducida por dendrímero-ADN parecía estar controlada por los tres siguientes parámetros principales.
1)
El diámetro del dendrímero.
2)
La cantidad añadida.
3)
Si estaba presente o no ADN.
El último factor puede apreciarse mejor comparando la toxicidad del dendrímero SD68 con la de polilisina 115 en células CV-1 en presencia y ausencia de ADN plásmido (véase Figura 12). La citotoxicidad total de SD68 era baja comparada con la de pLys115. En ausencia de ADN, la LD_{50} de pLys 115 en células CV-1 era 25 \mug/ml mientras que la LD_{50} de SD68 era mayor de 300 \mug/ml. En presencia de ADN plásmido (relación de aminas primarias de policatión:nucleótido 10:1), la citotoxicidad de pLys115 no fue afectada, mientras que la de SD68 aumentó (LD_{50} de SD68-ADN = 100 \mug/ml) pero era aún significativamente más baja que la de pLys115.
Cuando se utilizaron condiciones de transfección optimizadas, la concentración de SD68 fue 12,5 \mug/ml, un nivel de dendrímero que indujo una disminución de aproximadamente el 35% en la reducción de colorante (véase Figura 5), así como en la recuperación de proteína celular (véase anterior Tabla 2). Según la proteína celular recuperada al final del ensayo, la transfección con complejos de SD68-ADN era razonablemente bien tolerada por todos los diferentes tipos de células ensayados (recuperación de proteína = 60%).
Ejemplo 17 Discusión de resultados
Los polímeros policatiónicos tales como polilisinas se han usado extensamente para transferencia de genes a células de animales (Felgner, P.L., Adv. Drug Delivery Rev. 5:163 (1990)). Los vectores basados en polilisina tienen una alta capacidad de cesión, pero una transfección eficaz de las células objetivo sólo tiene lugar en presencia de agentes rompedores de endosoma o lisosomotróficos (Cotten, M. et al., "Transferrin-Polycation-Mediated Introduction of DNA into Human Leukemic Cells: Stimulation by Agents that Affect the Survival od Transfected DNA or Modulate Transferrin Receptor Levels", PNAS (EE.UU.) 87:4033 (1990); Cotten, M. et al., "High Efficiency Receptor- Mediated Delivery of Small and Large (48kb) Gene Constructs Using the Endosome Disruption Activity of Defective or Chemically-Inactivated Adenovirus Particles", PNAS (EE-UU.) 86:6094 (1992)). Los polímeros policatiónicos de los Ejemplos 1 a 16 presentan la capacidad de cesión combinada de las polilisinas y la capacidad de transfección de un virus.
Los polímeros en cascada PAMAM usados aquí se derivan de un núcleo de amoníaco y unidades -CH_{2}CH_{2}CONH
CH_{2}CH_{2}N resultantes de adiciones sucesivas de acrilato de metilo y etilendiamina como se muestra en la anterior Tabla 2. La propagación de crecimiento por etapas controlado de esta estructura produce generaciones de polímeros crecientemente mayores con superficies precisas dimensionalmente y con un número definido de grupos superficiales (Tomalia, D.A. et al., supra). El diámetro de los dendrímeros de generación más alta es similar al diámetro del núcleo histona de cromatina (aproximadamente 70 \ring{A}) y puede actuar como un estrado para condensar el ADN (Richmond, T.J. et al., "Structure of the Nucleosome Core Particle at a 7 \ring{A} Resolution", Nature 311:532 (1984)). Así, los dendrímeros PAMAM difieren de las polilisinas en su bien caracterizada fórmula y estructura, su ramificación y la baja pK_{a} de sus aminas terminales (pK_{a} = 6,9) y aminas internas (pK_{a} = 3,9) (Tomalia, D.A. et al., supra).
La internalización de célula eficaz de ADN cuando se asocia con policationes puede ser debida a una asociación tipo cremallera de las cargas positivas en exceso del complejo de policatión-ADN con grupos de la superficie celular cargados negativamente. La interacción puede producir endocitosis adsortiva y desestabilización de membrana, tal como se ha propuesto por Behr para complejos de liposomas catiónicos-ADN (Behr, J.P., "Synthetic Gene-Transfer Vectors", Acc. Chem. Res. 26:274 (1993)). Realmente, las capacidades de unión a ADN de polilisina y el dendrímero, estudiadas por retardo de gel, son algo similares (véase Figura 1). Para aumentar la desestabilización de membrana tras endocitosis, se incorporó al dendrímero el péptido GALA desestabilizador de membrana.
Cuando se ensaya la cesión de plásmido y la transfección, los dendrímeros PAMAM no modificados presentaron características excelentes. Se vió que la eficacia de transfección dependía del tamaño y cantidad del dendrímero en el complejo de ADN-dendrímero. Más notablemente, se observó un aumento drástico de transfección cuando se incrementó el diámetro del dendrímero de 40 \ring{A} (generación 4) a 54 \ring{A} (generación 5). La razón para este efecto de umbral no está todavía clara pero puede estar relacionada con el diámetro y la estructura del polímero. Aunque los dendrímeros PAMAM de generación 3 parecen una estrella de mar, en la generación 5 tienen una forma esferoidal de aproximadamente 54 \ring{A} de diámetro (Tomalia, D.A. et al., supra). Esta forma esférica podría servir como núcleo altamente estructurado para estrechar favorablemente al ADN, tal como tiene lugar en la cromatina (Richmond, T.J. et al., supra). Alternativamente, la forma esférica puede ser más eficaz para desestabilizar membranas que los dendrímeros de generación más baja o los policationes lineales.
Los polímeros en cascada PAMAM difieren también de las polilisinas en la pK_{a} de sus grupos amino primarios e interiores (pK_{a} = 6,9, 3,9). Esta propiedad puede ser también importante para la transfección. A pH fisiológico, los dendrímeros PAMAM están sólo parcialmente protonados y deben presentar efectos lisosomotróficos similares a las bases débiles (Stenseth, K y Thyberg, J., "Monensin and Chloroquine Inhibit Transfer to lysosomes of Endocytosed Macromolecules in cultured Mouse Peritoneal Macrophages", Eur. J. Cell. Biol. 49:326 (1989)). Además, los grupos amino terciario interiores, que constituyen la ramificación del dendrímero, tienen una pK_{a} de 3,9 y podrían contribuir también al efecto lisosomotrófico. Así, el dendrímero sería capaz de tamponar la acidificación endosómica después de la absorción celular del complejo. Las propiedades lisosomotróficas putativas de los dendrímeros PAMAM puede explicar por qué se requiere un exceso de dendrímeros para una alta transfección mientras que un exceso de polilisinas no aumenta la transfección (véase anterior Tabla 2). Los grupos amino de la cadena secundaria (pK_{a} = 9 a 10) de la polilisina están fuertemente cargados a pH neutro y no pueden tamponar la acidificación del endosoma. Esto es apoyado por la observación de que la eficacia de transfección del complejo de dendrímero-ADN no se aumenta por cloroquina (datos no mostrados). La eficacia de transfección de los complejos de polilisina-ADN, por otra parte, se mejora drásticamente en presencia de cloroquina (Cotten, M. et al. (1990), supra).
El complejo compuesto por ADN plásmido y SD68 en una relación de 6 aminas terminales de SD68 por nucleótido presentó la mejor actividad de transfección. En estas condiciones óptimas, hay aproximadamente 320 partículas de SD68 por plásmido pCLuc4, aunque todas las partículas de dendrímero pueden no estar implicadas en complejos con ADN. Como se ha sugerido antes, el dendrímero en exceso puede actuar como un agente lisosomotrófico. Por encima de esta relación óptima, el sistema se hace menos eficaz. El aumento de la cantidad de SD68 puede disminuir la eficacia de transfección debido a la toxicidad asociada con el complejo. Alternativamente, un aumento en la cantidad de complejo de dendrímero no acomplejado puede competir con el ADN-dendrímero por los lugares de unión putativos en la superficie celular. Esto disminuiría el nivel de ADN asociado a célula y de esta manera disminuir la eficacia de transfección.
Un aumento del diámetro del dendrímero, aún manteniendo la relación 6:1, no aumentó la toxicidad, pero disminuyó la eficacia de transfección. Cuando se observaron bajo el microscopio óptico células expuestas a complejos de dendrímero-ADN formados de dendrímero mayor que el de la 6ª generación, presentaban grandes vacuolas intracitoplásmicas. Estas vacuolas de tamaño no se observan en células tratadas con complejos formados de dendrímeros de la 6ª o generaciones inferiores. No está claro si las vacuolas están relacionadas con las proporciones de transfección reducida observadas.
Se examinó adicionalmente la toxicidad usando el ensayo de reducción de colorante MTT. El dendrímero SD68 es muy bien tolerado por las células, mucho mejor que cantidades equivalentes de pLys115. La marcada diferencia de toxicidad entre pLys115 y SD68 puede ser debida a una diferencia del estado de ionización de las partículas. A pH fisiológico, la polilisina soporta más cargas positivas que los dendrímeros, y debe tener una interacción más fuerte con las membranas celulares. La toxicidad del dendrímero aumentó significativamente en presencia de ADN plásmido pero permaneció inferior que la de los complejos correspondientes de polilisina-ADN.
El péptido GALA, un desestabilizador de membrana, era capaz de aumentar significativamente la actividad de transfección del complejo cuando estaba incorporado covalentemente al dendrímero (véase Figura 4B). GALA es un desestabilizador de membrana soluble en agua y su interacción dependiente del pH con membranas ha sido bien estudiada (Subbarao, N.K. et al., supra); Parente, R.A. et al., "Association of a pH-Sensitive Peptide with Membrane Vesicles: Role of Amino Acid Sequence", Biochem. 29:8713 (1990) y referencias en él). Se ha incorporado por otros péptidos con el motivo GALA a anticuerpos para aumentar su retención e internalización de células de tumores (Anderson, D.C. et al., "Enhanced in Vitro Tumor Cell Retention and Internalization of Antibody Derivatized with Synthetic Peptides", Bioconjugate Chem. 4:10 (1993)). El hecho de que los conjugados de dendrímero-GALA mezclados con dendrímeros no modificados en una relación 1:1 aumente la transfección muestra que los dendrímeros son excelentes constituyentes de sistemas de transfección altamente eficaces.
Los procedimientos de transfección basados en dendrímeros Starbust® PAMAM constituyen métodos simples y eficaces para transferencia de genes a células de animales. Los resultados superiores obtenidos en una amplia variedad de células (véase Figura 4) muestran que los dendrímeros PAMAM, por sí mismos, están bien adaptados para la cesión directa de genes a animales.
Ejemplo 18 Síntesis de MPB-ba
Se sintetizó una molécula bifuncional consistente en una maleimida reactiva con sulfhidrilo incorporada a una bis-acridina-espermidina (N-4-[p-(maleimidofenil)butiril]-N_{1},N_{8}-(bis-9-acridinil)espermidina (MPB-bA). Los péptidos que contienen sulfhidrilo se incorporaron al intercalador mediante un enlace tioéter y el péptido-intercalador resultante se asoció con ds ADN por bis-intercalación de las acridinas. La incorporación de una secuencia de péptido de localización nuclear a ADN usando este reactivo aumenta la transfección en células cultivadas.
La síntesis de MPB-bA se basa en una trifuncionalización de espermidina como se muestra en el siguiente Esquema 3.
Esquema 3
14
N_{1},N_{8}-bis(t-butoxicarbonil)espermidina 1, el material de partida, es un sustrato adecuado para N_{4}-acilación de espermidina (Bergeron, R.J. et al., Synthesis 689-692 (1989)). El compuesto 1 se N_{4}-aciló sucesivamente con 4-[p-(maleimidofenil)butirato] de N-succinimidilo (SMPB) como se describe por Kitogawa y Aikawa, se desprotegió, y se hicieron reaccionar las aminas N_{1},N_{8} regeneradas con 9-fenoxicaridina como se describe por Nielsen et al. para formar una bis-acridina que lleva una maleimida reactiva (MPB-bA) (Kitawa, T. y Aikawa, T., J. Biochem. 79:233 (1976); Nielsen, P.E. et al., Bioconjugate Chem. 2:57 (1991)).
Se precipitó MPB-bA en dietiléter y se purificó por cromatografía de columna en gel de sílice y se eluyó con
n-butanol/ácido acético/agua (5:4:1 v/v).
Rf = 0,28.
LSIMS: m/z = 741,8 (M^{+}H).
Se forma un enlace tioéter estable cuando se hace reaccionar un péptido que contiene sulfhidrilo con el intercalador que lleva maleimida como se muestra en el Esquema 3 anterior; puede incorporarse un grupo sulfhidrilo al N-terminal del péptido con el reactivo 3-(2-piridiltio)propionato de succinimidilo (Carlsson, J. et al., Biochem. 173:723 (1978)). Alternativamente, puede sintetizarse el péptido con un residuo de cisteína en la posición apropiada. La síntesis es sólida y proporciona un rendimiento global de aproximadamente 15%.
Ejemplo 19 Síntesis de péptidos de 13 aminoácidos con cys terminal
Para demostrar que el MPB-bA podía mediar en la incorpooración de péptido a ADN, se sintetizaron dos péptidos de 13 residuos con una cisteína N-terminal. El primero, cys-gly-tyr-gly-pro-lys-lys-lys-arg-lys-val-gly-gly (SEC ID NO: 9) (Wtcys), contenía la secuencia de localización nuclear de antígeno T grande de SV40. El segundo, cys-gly-tyr-gly-pro-lys-asp-lys-val-gly-gly (SEC ID NO: 10) (cTcys), era un péptido testigo que mimetiza la mutación presente en el mutante (cT)-3 de SV40, que es deficitario en el transporte de antígeno T al núcleo. Estos péptidos se sintetizaron como se describe por Landford et al. (Landford, R.E. et al., Cell. 46:576 (1986)).
Ejemplo 20 Incorporación de los péptidos de 13 aminoácidos a MPB-bA
Los péptidos del Ejemplo 19 se hicieron reaccionar con MPB-bA como se muestra en el anterior Esquema 3. Un mg de péptido puro por HPLC disuelto en 360 \mul de un tampón fosfato 0,2 M y EDTA 1 mM, pH 7,2, se hicieron reaccionar con 1 mg de MPB-bA disuelto en 40 \mul de metanol durante 45 min con agitación bajo argón. Se purificaron WTcysMPB-bA y cTcysMPB-bA por filtración de gel en una columna Biogel P2 seguida por HPLC de fase inversa C-18 como se describe para los péptidos libres por Landford et al. (1996), supra, y se liofilizaron.
LSIMS: WTcysMPB-bA.
m/z = 2118,9 (M^{+}H).
m/z = 2140,7 (M^{+}Na).
CTcysMPB-bA.
m/z = 2106,2 (M^{+}H).
m/z = 218,4 (M^{+}Na).
La interacción de los bis-acridinil péptidos resultantes con ADN plásmido, en una relación que permitía la neutralización de la carga, condujo a una inhibición total de la movilidad electroforética del plásmido mientras que cantidades iguales de los péptidos no conjugados sólo retenían parcialmente el ADN (resultados no mostrados).
La intercalación de los bis-acridinil péptidos en ds ADN condujo al desplazamiento de bromuro de etidio de ADN de timo de becerro como se muestra en la Figura 6.
Se computaron las constantes de unión de las diversas bis-acridinas a partir del desplazamiento competitivo de bromuro de etidio, una constante de disociación intrínseca de 6,7 x 10^{-6} M para bromuro de etidio y el algoritmo de Wolfe y Meehan (Reinhardt, C.G. y Krugh, T.R., Biochem. 17:4845 (1978); Wolfe, A.R. y Meehan, T., Mol. Biol. 223:1063 (1992)). Estas constantes de unión se compararon con las de espermidina bis-acridina sola. Como resultado de la pérdida de una de sus cargas positivas, se observó una disminución de afinidad ligera pero significativa cuando el grupo amino N_{4} de la espermidina bis-acridina se aciló como en MPB-bA. Se encontró que los conjugados formados por los péptidos que contienen cisteína y MPB-bA se unen a ADN con constantes de afinidad compatibles con un mecanismo de bis-intercalación. La incorporación de los péptidos cargados positivamente a MPB-bA restauró parcialmente la afinidad como se indica en la Figura 6.
Se mezcló bromuro de etidio (19 \muM) con ADN de timo de becerro (5,7 \muM como equivalentes de nucleótido) en un tampón Tris-HCl 10 nM, NaCl 0,2 M, pH 7,4, y se añadieron cantidades crecientes de un derivado de bis-acridina. Se midió la fluorescencia obtenida por el desplazamiento de bromuro de etidio en las siguientes condiciones.
Excitación = 540 nm; Emisión = 610 nm.
Fo: Fluorescencia de bromuro de etidio libre (19 \muM).
Fmax: Fluorescencia del complejo de etidio-ADN solo (etidio 19 \muM, nucleótido 5,7 \muM).
F: Fluorescencia del complejo de etidio-ADN en presencia del derivado de bis- acridina.
i)
La fluorescencia intrínseca de la acridina tiene lugar a 450 nm y no interfiere en este ensayo.
ii)
La concentración de las soluciones madre de bis-acridina se determinó a partir de la absorbancia a 412 nm usando un patrón de espermidina bis-acridina.
Ejemplo 21 Eficacia de transfeción de WTcysMPB-bA y cTcysMPB-bA
Se determinaron las eficacias de transfección de plásmidos no modificados o plásmidos mezclados con WTcys
MPB-bA o el mutante cTcysMPB-bA. Este ensayo funcional se basa en las siguientes observaciones.
i)
La eficacia de transfección obtenida con envolturas víricas reconstituidas aumenta cuando los genes encapsulados se co-ceden a las células objetivo con proteínas nucleares sintéticas compuestas por BSA enlazado a la secuencia de localización nuclear de antígeno T grande de SV40 (Kaneda, Y. et al., Science 243-375 (1989).
ii)
Las partículas de virión de SV40 microinyectadas en el citoplasma de células cultivadas se transportan a través de complejos de los poros nucleares. La importancia nuclear de las partículas de virión se induce por señales de transporte nuclear específicas contenidas en las proteínas estructurales del virión (Clever, J. et al. PNAS (EE.UU.) 88:7333 (1991)).
Un plásmido que codifica el gen de luciferasa bacteriana, el plásmido pCLuc4, acomplejado a los péptidos de MPB-bA podía encapsularse dentro de liposomas sensibles al pH, sin afectar a la eficacia de encapsulación ni al tamaño de las vesículas en comparación con liposomas que contienen el plásmido solo (Legendre, J.Y. y Szoka, F.C., Pharm. Res. 9:1235 (1992)). En una serie de experimentos, el WTcys MPB-bA aumentaba significativamente (P < 0,025) la eficacia de transfección aproximadamente 3 veces sobre el plásmido acomplejado con el cTcysMPB-bA. Estos datos se muestran en la siguiente Tabla 3.
TABLA 3 Transfección usando liposomas sensibles al pH que contienen plásmidos modificados
15
\begin{minipage}{145mm}a La eficacia de transfección se midió en células CV-1 en cultivo (Legendre y Szoka, supra).\end{minipage}
\begin{minipage}{145mm}Las células CV-1 se transfectaron por triplicado con 4 \mu g de pCLuc4 encapsulado en liposoma, libre o acomplejado a WTcysMPB-bA en una relación de 300 péptidos/plásmido.\end{minipage}
\begin{minipage}{145mm}Las actividades de transfección medias obtenidas con liposomas que contienen complejos de WTcys-pCLuc4 o cTcys-pCLuc4 se dividieron por las de liposomas que contienen pCLuc4.\end{minipage}
\begin{minipage}{145mm}Las relaciones obtenidas de 4 experimentos diferentes se promediaron (aumento de veces en Tabla) y se compararon usando un ensayo de la t de Student [Ho rechazado; p 0,025].\end{minipage}
\begin{minipage}{145mm}No hay diferencias significativas en el diámetro de liposoma o las eficacias de encapsulación de los diversos plásmidos usados en los experimentos de transfección anteriores.\end{minipage}
Este aumento es similar al observado cuando se combinan proteínas nucleares sintéticas con ADN y se ceden con virosomas reconstituidos (Kaneda, Y. et al., supra).
Ejemplo 22 Resultados y discusión
En conclusión, la bis-acridina reactiva con sulfhidrilo proporciona un reactivo excelente para la incorporación no covalente de moléculas que contienen sulfhidrilo a ds ADN. Empleando una combinación de diferentes péptidos efectores que mimetizan los atributos de diversos virus biológicos, se han producido inesperadamente nuevos complejos de cesión de genes sintéticos superiores.
Ejemplo 23 Cesión de oligonucleótidos a células en cultivo por dendrímeros
Se pusieron 1,2 \mug de oligonucleótidos marcados con fluoresceína en 330 \mul de solución salina de tampón Hepes (HBS: Hepes 10 mM, NaCl 150 mM, pH 7,4) en un tubo de poliestireno y se añadieron gota a gota con mezclado muy ligero 170 \mul de HBS que contenía 100 \mug de un dendrímero de poliamidoamina de sexta generación (SD68). Después de 30 minutos a temperatura ambiente, se añadieron 1,5 ml de medio DME H21 exento de suero, y se aplicó la mezcla a células en cultivo. Típicamente, se añadieron 100 \mul del complejo a cada cubreobjetos de 22 mm que contenía células CV-1 80% confluentes puestas en placa 24 h antes. Después de 2 a 4 h, se lavaron los cubreobjetos con DME H21-10% de FCS y se montaron sin fijar en platinas de depresión. Estas platinas pueden acomodar 200 \mul de medio por debajo del cubreobjetos y se cerraron en los bordes con parafina caliente.
Para análisis, se visualizaron los cubreobjetos por microscopía confocal de exploración laser. Se emplearon un sistema confocal BioRad MRC-600 que emplea un laser de cripton-argón (excitación: 488 nm) y un microscopio invertido Nikon. Una regulación típica para análisis utilizado para los ensayos fue como sigue.
Alta regulación de laser
Densidad neutra = 1
Ganancia = 7
Abertura = 10
Auto black conectado
Promedio de Kalman = 3
Objetivo = 63X
Las células se anotaron como positivas en base a la presencia de fluorescencia nuclear inequívoca y la existencia de un borde visual entre el núcleo y el citoplasma. La fracción de núcleos fluorescentes observada se calculó contando el número de núcleos fluorescentes observados y dividiendo por el número total de células en campos sanos aleatorios.
Ejemplo 24 Relación de dendrímero a oligonucleótido para acumulación nuclear de oligonucleótidos
En la Figura 7 se muestra el efecto del policatión de dendrímero SD68 utilizado en el Ejemplo 23 que media en la acumulación nuclear de oligonucleótido de manera dependiente de la dosis. Se prepararon como se ha descrito antes cantidades variables de policatión de dendrímero (3-200 \mug/prep) con una cantidad fija de oligonucleótido (1,2 \mug/prep). Estos se añadieron a las células CV-1 mediante procedimientos estándares y se ensayó la fluorescencia nuclear. Se observó que se requería una relación umbral de policatión de dendrímero a oligonucleótido para acumulación nuclear. Más allá de ésta, se observó coloración nuclear hasta aproximadamente el 25%. La Tabla 4 muestra la carga y las relaciones de oligonucleótido a dendrímero para cada ensayo, y la acumulación nuclear resultante de fluorescencia (nucleótido).
TABLA 4 Condiciones y resultados
16
Ejemplo 25 Dependencia del tiempo de la acumulación nuclear de oligonucleótido mediada por dendrímero
La dependencia del tiempo con la que el policatión de dendrímero SD68 facilitó la acumulación nuclear de los oligonucleótidos se muestra en la Figura 8. Se añadió una preparación estándar de policatión de dendrímero-oligonucleótido a células CV-1 que se lavaron, montaron y visualizaron a los 5, 30, 60, 90, 120 y 180 minutos. Las células se anotaron como positivas o negativas en base a la presencia o ausencia de fluorescencia nuclear como se ha descrito antes. La acumulación nuclear se vio tan pronto como 30 min después del tiempo de contacto y alcanzó casi el 80% en 3 h.
Ejemplo 26 Efecto del tamaño de dendrímero en la capacidad para mediar en la acumulación nuclear
La generación del dendrímero, correspondiente al tamaño, afecta a su capacidad para facilitar la acumulación nuclear de oligonucleótidos. Se prepararon preparaciones estándares de dendrímero-oligonucleótido con tamaños variables de dendrímero (SD22, SD68, SD124). Cada una se aplicó a células CV-1 durante 4 h, y se ensayó la acumulación nuclear de manera usual. El experimento se realizó en DME H21 o un medio optimizado de fuerza iónica reducida. El SD68 podía mediar en casi el 80% de acumulación nuclear, mientras que el SD22 y el SD124 eran algo menos eficaces como mediadores de la acumulación nuclear en condiciones iónicas reducidas. Los resultados de este ensayo se muestran en la Figura 9.
Ejemplo 27 Una fuerza iónica reducida aumenta la acumulación nuclear de oligonucleótido
Los complejos de policatión de dendrímero-oligonucleótido se prepararon como se ha descrito antes. Estos se diluyeron con DME H21 o DME H21 diluido 30% con una solución no iónica equimolar de un sacárido incluyendo glucosa, lactosa, manitol, sorbitol y sacarosa. Los complejos se aplicaron a células CV-1 durante 2 h, y se analizó como se ha descrito antes. Independientemente del tipo de carbohidrato usado, una fuerza iónica reducida aumentó la acumulación nuclear mediada por dendrímero. Las condiciones y resultados del ensayo se muestran en la Figura 10.
Ejemplo 28 Incorporación de ligandos de fijación de objetivo y desestabilizadores de membrana a ADN mediante bis-acridinas y combinación con el dendrímero
El péptido GALA cys se incorporó a la bis-acridina maleimida como se ha descrito en el Ejemplo 21 para preparar un desestablizador de membrana que se asocia a ADN. El aminoácido cisteína se incorporó a las bis-acridina maleimida como se ha descrito en el Ejemplo 21 como testigo. Se diluyeron seis microgramos de plásmido que contenía el gen de luciferasa en 330 \mul de HBS en un tubo de poliestireno. GALA cysMPB-bis-acridina (1 nmol) o cysMPB-bis-acridina y/o dendrímero PAMAM SD68 de 6ª generación (4 \mug) se diluyeron en 170 \mul de HBS y se añadieron gota a gota al ADN. El tubo se mezcló suavemente y, después de 20 min, se ensayo en los complejos resultantes la transfección en hepatocitos recién aislados.
De manera similar, la (galactosa-6)3Lys2-bis-acridina (Haensler, J. y Szoka, F., Bioconjugate Chemistry 4:85 (1993)) se incorporó a ADN y se formó un complejo con el dendrímero SD68.
Además, la GALA cysMPB-bis-acridina y la (galactosa-6)3Lys2-bis-acridina se mezclaron a 0,5 nmoles cada una y se añadieron a ADN junto con el dendrímero. La composición que contenía los tres componentes se añadió después a los hepatocitos como se ha descrito antes. Los resultados se presentan en la Figura 11. Las cantidades de componentes en cada transfección se dan debajo de la actividad de luciferasa. La adición del desestabilizador de membrana GALA cysMPB-bis-acridina o el ligando de fijación de objetivo (galactosa-6)3Lys2bis- acridina al dendrímero aumenta la transfección en aproximadamente dos órdenes de magnitud. La adición de los dos efectores juntos al dendrímero pero en una cantidad reducida también era capaz de aumentar la transfección. Sin embargo, la adición del testigo cysMPB-bA al dendrímero no aumentó la transfección.
Ejemplo 29 Incorporación de ligando de fijación de objetivo y desestabilizador de membrana directamente a dendrímero y mezclado en diversas proporciones para aumentar la transfección
Se incorporó tio-galactosa al dendrímero modificado con SPDP de 40 \ring{A} de diámetro (SD40) como se describe en el Ejemplo 4 y se mezcló con dendrímero SD40 sin modificar y dendrímero GALA cys. Las mezclas de los dendrímeros se usaron para transfectar hepatocitos con el plásmido de luciferasa. Los resultados se dan en la Figura 12. Se observaron los mayores niveles de transfección cuando la relación de dendrímero/gal-dendrímero/GALA-dendrímero fue 24/141/42 en base a peso.
(1) INFORMACIÓN GENERAL:
\vskip0.666000\baselineskip
(i)
SOLICITANTE: SZOKA; FRANCIS C:
\hskip3.35cm
HENSLER, JEAN
\vskip0.666000\baselineskip
(ii)
TÍTULO DE LA INVENCIÓN: SISTEMA DE CESIÓN DE POLINUCLEOTIDOS AUTOMONTABLE QUE COMPRENDE POLICATIONES DE DENDRIMERO
\vskip0.666000\baselineskip
(iii)
NÚMERO DE SECUENCIAS: 10
\vskip0.666000\baselineskip
(iv)
DIRECCIÓN DE CORRESPONDENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
DESTINATARIO: ROBBINS, BERLINER & CARSON
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
CALLE: 201 Nth FIGUEROA STREET
\vskip0.333000\baselineskip
(C)
CIUDAD: LOS ANGELES
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
ESTADO: CA
\vskip0.333000\baselineskip
(E)
PAÍS: EE:UU:
\vskip0.333000\baselineskip
(F)
ZIP: 90012
\vskip0.666000\baselineskip
(v)
FORMA LEIBLE EN ORDENADOR:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
TIPO DE MEDIO: Floppy disk
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
ORDENADOR: IBM PC compatible
\vskip0.333000\baselineskip
(C)
SISTEMA OPERATIVO: PC-DOS/MS-DOS
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
SOFTWARE: WordPerfect 5.1 / ASCII
\vskip0.666000\baselineskip
(vi)
DATOS DE LA SOLICITUD ACTUAL:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
NÚMERO DE SOLICITUD:
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
FECHA DE PRESENTACION: 14 de Julio de 1994
\vskip0.333000\baselineskip
(C)
CLASIFICACIÓN:
\vskip0.666000\baselineskip
(viii)
INFORMACIÓN DE APODERADO/AGENTE
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
NOMBRE: BERLINER, ROBERT
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
NÚMERO DE REGISTRO: 20.121
\vskip0.333000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REFERENCIA/EXPEDIENTE: 5555-242
\vskip0.666000\baselineskip
(ix)
INFORMACION DE TELECOMUNICACIÓN:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
TELÉFONO: (213) 977-1001
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
TELEFAX: (213) 977-1003
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
TELEX:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO:1
\vskip0.666000\baselineskip
(i)
CARACTERISTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 7 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
TOPOLOGIA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
(x)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO:1:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Pro Lys Lys Lys Arg Lys Val}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO:2
\vskip0.666000\baselineskip
(i)
CARACTERISTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 4 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
T IPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
TOPOLOGIA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
(ix)
CONFIGURACIÓN:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
NOMBRE/GUIA: Lugar modificado
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
POSICIÓN: 1
\vskip0.333000\baselineskip
(C)
OTRA INFORMACION: /nota = "Esta posición es n-formil-".
\vskip0.666000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO:2:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Xaa Met Leu Phe}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO:3
\vskip0.666000\baselineskip
(i)
CARACTERISTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 8 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
TOPOLOGIA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO:3:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Cys Ser Gly Arg Glu Asp Val Trp}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO:4
\vskip0.666000\baselineskip
(ii)
CARACTERISTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(E)
LONGITUD: 10 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
(F)
TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
(G)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
(H)
TOPOLOGIA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 4:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Ala Ala Phe Glu Asp Leu Arg Val Leu Ser}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO:5
\vskip0.666000\baselineskip
(i)
CARACTERISTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 5 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 5:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Lys Arg Pro Arg Pro}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO:6
\vskip0.666000\baselineskip
(i)
CARACTERISTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 5 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
TOPOLOGIA: lineal
\newpage
\vskip0.666000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 6:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Lys Phe Glu Arg Gln}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO: 7:
\vskip0.666000\baselineskip
(i)
CARACTERISTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 16 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
TOPOLOGIA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
(2) DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO:7:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Met Leu Ser Leu Arg Gln Ser Ile Arg Phe Phe Lys Pro Ala Thr Arg}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO: 8:
\vskip0.666000\baselineskip
(i)
CARACTERISTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 30 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
TOPOLOGIA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO:8:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Trp Glu Ala Ala Leu Ala Glu Ala Leu Ala Glu Ala Leu Ala Glu}
\sac{His Leu Ala Glu Ala Leu Ala Glu Ala Leu Glu Ala Cys Ala Ala}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO: 9:
\vskip0.666000\baselineskip
(i)
CARACTERISTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 13 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
TOPOLOGIA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO:9:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Cys Gly Tyr Gly Pro Lys Lys Lys Arg Lys Val Gly Gly}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÍN PARA SEC ID NO: 10:
\vskip0.666000\baselineskip
(i)
CARACTERISTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 13 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
TOPOLOGIA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO:10:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Cys Gly Tyr Gly Pro Lys Asp Lys Arg Lys Val Gly Gly}
\vskip1.000000\baselineskip

Claims (65)

1. Una composición para presentar un polinucleótido a un componente subcelular de una célula eucariota, que comprende
un polinucleótido; y
un policatión de dendrímero que tiene grupos catiónicos terminales acoplados no covalentemente al polinucleótido, en la que la proporción de grupos catiónicos terminales del policatión de dendrímero al contenido de nucleótido del polinucleótido es de 1:1 a 223,3:1 pero excluyendo composiciones obtenibles
diluyendo 12 \mug de plásmido pCLuc4 en 660 \mul de HBS (Hepes 20 mM, NaCl 150 mM, pH 7,4) para formar una solución de ADN; y
disolviendo 1 nmol de micropartículas de dendrímero Starburst de macromolécula de policatión ramificada hidrófila de quinta generación en 340 \mul de HBS y añadiendo esto gota a gota a la solución de ADN.
2. La composición de la reivindicación 1ª, que comprende además un excipiente aceptable farmacéuticamente.
3. La composición de la reivindicación 1ª, en la que el policatión de dendrímero comprende una molécula de núcleo que comprende al menos dos residuos reactivos seleccionados del grupo constituido por hidroxilo, éter, amino, imino, amido, imido, amonio, haluro, carboxilo, carboxihaluro y sulfhidrilo, y combinaciones de ellos.
4. La composición de la reivindicación 3ª, en la que el policatión de dendrímero comprende además un polímero aceptable farmacéuticamente seleccionado del grupo constituido por poliamidoaminas derivadas de la reacción de un éster de alquilo de un ácido carboxílico \alpha,\beta-insaturado etilénicamente o una amida \alpha,\beta-insaturada etilénicamente y una alquilenpoliamina o una polialquilenpoliamina, estando el polímero acoplado operativamente a la molécula de núcleo.
5. La composición de la reivindicación 1ª, en la que el policatión de dendrímero comprende una poliamidoamina.
6. La composición de la reivindicación 1ª, en la que el policatión de dendrímero comprende grupos terminales capaces de adquirir una carga positiva.
7. La composición de la reivindicación 6ª, en la que los grupos catiónicos terminales se seleccionan del grupo constituido por azoles y aminas alifáticas y aromáticas primarias, secundarias, terciarias y cuaternarias, que pueden estar sustituidos con S u O, guanidinio y combinaciones de ellos, estando los grupos catiónicos terminales acoplados operativamente al polímero.
8. La composición de la reivindicación 6ª, en la que los grupos catiónicos terminales comprenden del 10 al 100% de todos los grupos terminales del polímero.
9. La composición de la reivindicación 8ª, en la que el policatión de dendrímero comprende además del 0 al 90% de residuos reactivos terminales de todos los grupos terminales del policatión de dendrímero.
10. La composición de la reivindicación 9ª, en la que los residuos reactivos terminales se seleccionan del grupo constituido por hidroxilo, ciano, carboxilo, sulfhidrilo, maleimida y ditiopiridilo, y combinaciones de ellos.
11. La composición de la reivindicación 1ª, en la que el policatión de dendrímero tiene un peso molecular medio de 2.000 a 1.000.000.
12. La composición de la reivindicación 1ª, en la que el policatión de dendrímero tiene un radio hidrodinámico de 11 a 60 \ring{A}.
13. La composición de la reivindicación 1ª, en la que la proporción de grupos catiónicos terminales del policatión de dendrímero al contenido de nucleótidos es de 1:1 a 25:1.
14. La composición de la reivindicación 1ª, que comprende además un agente permeabilizador de membrana capaz de transportar el polinucleótido a través de las membranas citoplásmica o endosómica de la célula eucariota, estando el agente permeabilizador de membrana acoplado operativamente al policatión de dendrímero.
15. La composición de la reivindicación 14ª, en la que la proporción del agente permeabilizador de membrana a grupos catiónicos terminales del policatión de dendrímero es de 1:100 a 1:4.
16. La composición de la reivindicación 14ª, en la que el agente permeabilzador de membrana comprende un péptido anfipático.
17. La composición de la reivindicación 16ª, en la que el péptido anfipático comprende GALA.
18. La composición de la reivindicación 16ª, en la que el péptido comprende un péptido cíclico.
19. La composición de la reivindicación 16ª, en la que el péptido cíclico se selecciona del grupo constituido por gramicidina S y tirocidinas.
20. La composición de la reivindicación 19ª, en la que el péptido cíclico comprende gramicidina S.
21. La composición de la reivindicación 14ª, que comprende además un fosfolípido.
22. La composición de la reivindicación 21ª, en la que el fosfolípido comprende fosfatidiletanolamina.
23. La composición de la reivindicación 22ª, en la que la fosfatidiletanolamina comprende dioleilfosfatidiletanolamina.
24. La composición de la reivindicación 21ª, en la que el fosfolípido está presente en forma de liposomas.
25. La composición de la reivindicación 14ª, que comprende además un policatión.
26. La composición de la reivindicación 25ª, en la que el policatión comprende una poliamina.
27. La composición de la reivindicación 26ª, en la que la poliamina se selecciona del grupo constituido por polilisina, poliarginina, poliornitina, espermina, espermidina, 3,3'-diaminobispropilamina, iminobis(N,N)-dimetilpropilamina, iminobis(3-aminopropil)-1,3-propanodiamina y dendrímeros catiónicos.
28. La composición de la reivindicación 15ª, en la que el agente permeabilizador de membrana comprende una sal biliar catiónica de fórmula química
17
\vskip1.000000\baselineskip
en la que
X e Y son independientemente H u OH;
R^{3} es H, alquilo(C_{1}-C_{10}) o alquil(C_{1}-C_{10})amina; y
R^{4} es un alquilo(C_{1}-C_{30}) lineal o ramificado cargado positivamente o alquil(C_{1}-C_{30})amina, en el que uno o más de los átomos de carbono puede estar sustituido con NR', en el que R' es H, alquilo(C_{1}-C_{10}) o alquil(C_{1}-C_{10})amina.
29. La composición de la reivindicación 1ª, que comprende además un agente de localización subcelular capaz de ceder el polinucleótido desde el citoplasma de la célula eucariota a un componente subcelular de la célula eucariota, estando el agente de localización subcelular acoplado operativamente al policatión de dendrímero.
30. La composición de la reivindicación 29ª, en la que la proporción del agente de localización subcelular a grupos catiónicos terminales del policatión de dendrímero es de 1:100 a 1:5.
31. La composición de la reivindicación 30ª, en la que el agente de localización subcelular comprende un agente de localización nuclear capaz de ceder el polinucleótido al núcleo de la célula eucariota.
32. La composición de la reivindicación 31ª, en la que el agente de localización nuclear está acoplado operativamente a un resto que se asocia a ADN.
33. La composición de la reivindicación 32ª, en la que el resto que se asocia a ADN comprende un agente intercalador.
34. La composición de la reivindicación 33ª, en la que el agente intercalador tiene la fórmula química
\vskip1.000000\baselineskip
18
\vskip1.000000\baselineskip
en la que
Z comprende un enlace, un grupo reactivo seleccionado del grupo constituido por N-hidroxisuccinimida, maleimida, maleimidofenilo, disulfuro de piridilo, hidrazida y fenilglioxal, o ZY, en el que Y se selecciona de los grupos constituidos por ligandos receptores de la superficie celular, secuencias de localización nuclear y componentes permeabilizadores de membrana;
n y m son independientemente un número entero de 1 a 20;
p es un número entero de 0 a 20; y
Ar_{1} y Ar_{2} se seleccionan independientemente del grupo constituido por bromuro de etidio, acridina, mitoxantrona, oxazolopiridocarbazol, elipticina, N-metil-2,7-diazapirenio y derivados de ellos.
35. La composición de la reivindicación 34ª, en la que Ar_{1} y Ar_{2} comprenden acridina.
36. La composición de la reivindicación 35ª, en la que Z comprende maleimidofenilo o ditiopiridilo.
37. La composición de la reivindicación 34ª, en la que Z comprende el grupo
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38. La composición de la reivindicación 33ª, en la que el agente intercalador está acoplado a al menos un ligando que tiene como objetivo un receptor situado en la superficie de la célula eucariota, en la que el ligando y el policatión de dendrímero están comprendidos en un agente de reconocimiento de célula capaz de reconocer la célula eucariota, estando el ligando con objetivo fijado acoplado operativamente al policatón de dendrímero.
39. La composición de la reivindicación 33ª, que comprende además un agente permeabilizador de membrana acoplado operativamente al agente intercalador o al ligando.
40. La composición de la reivindicación 33ª, en la que el agente intercalador tiene la fórmula química
20
41. La composición de la reivindicación 32ª, en la que el resto que se asocia a ADN comprende un enlazador de polinucleótido de cadena sencilla.
42. La composición de la reivindicación 32ª, en la que el resto que se asocia a ADN comprende un policatión de dendrímero.
43. La composición de la reivindicación 32ª, en la que el resto que se asocia a ADN comprende un aglomerante de ranura principal o pequeña.
44. La composición de la reivindicación 1ª, que comprende además un ligando que tiene como objetivo un receptor situado en la superficie de la célula eucariota, en la que el ligando y el policatión de dendrímero están comprendidos en un agente de reconocimiento de célula capaz de reconocer la célula eucariota, estando el ligando con objetivo fijado acoplado operativamente al policatón de dendrímero.
45. La composición de la reivindicación 44ª, en la que la proporción de ligando con objetivo fijado en la célula a grupos catiónicos terminales del policatión de dendrímero es de 1:100 a 1:10.
46. La composición de la reivindicación 45ª, en la que el ligando con objetivo fijado en la célula se selecciona del grupo constituido por vitaminas, carbohidratos y polipéptidos.
47. La composición de la reivindicación 46ª, en la que el polipéptido comprende un anticuerpo o fragmento del mismo.
48. La composición de la reivindicación 44ª, que comprende además un agente permeabilizador de membrana acoplado operativamente al agente intercalador o al ligando.
49. La composición de la reivindicación 1ª, que comprende además un polipéptido fusogénico, estando el polipéptido fusogénico acoplado operativamente al policatión de dendrímero.
50. La composición de la reivindicación 49ª, en la que la proporción de polipéptido fusogénico a grupos catiónicos terminales del policatión de dendrímero es de 1:100 a 1:4.
51. La composición de la reivindicación 1ª, que comprende además un agente de enmascaramiento de ADN capaz de aumentar la vida media circulatoria del polinucleótido, estando el agente de enmascaramiento de ADN acoplado operativamente al policatión de dendrímero.
52. La composición de la reivindicación 51ª, en la que la proporción de agente de enmascaramiento de ADN a grupos catiónicos terminales del policatión de dendrímero es de 1:33 a 1:3.
53. La composición de la reivindicación 51ª, en la que el agente de enmascaramiento de ADN está acoplado operativamente a un resto que se asocia a ADN.
54. La composición de la reivindicación 51ª, en la que el agente de enmascaramiento de ADN tiene la fórmula química
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en la que
n es un número entero de 6 a 24;
Y se selecciona del grupo constituido por hidroxi, sialilo, etanolamina, colina, glicerol, serina, monometoxipolietilenglicol e inositol;
R^{1} es alquilo(C_{6}-C_{24}) o alquenilo(C_{6}-C_{24});
R^{3} es H, o alquilo(C_{1}-C_{10}) o alquil(C_{1}-C_{10})amina;
R^{4} es un alquilo(C_{1}-C_{30}) lineal o ramificado cargado positivamente o alquilamina, en el que uno o más de los átomos de carbono puede estar sustituido con NR', en el que R' es H, alquilo(C_{1}-C_{10}) o alquil(C_{1}-C_{10})amina.
55. La composición de la reivindicación 51ª, en la que el agente de enmascaramiento comprende polietilenglicol (PEG).
56. La composición de la reivindicación 1ª, en la que el polinucleótido comprende un vector híbrido que comprende un gen estructural acoplado operativamente a él.
57. La composición de la reivindicación 1ª, en forma sólida, líquida o de aerosol.
58. Un método para introducir un polinucleótido en una célula eucariota, que comprende poner en contacto la célula con la composición de la reivindicación 1ª in vitro.
59. El método de la reivindicavión 58ª, en el que la célula eucariota es una célula de mamífero.
60. Un método para introducir un polinucleótido en una célula de planta, que comprende poner en contacto la célula con la composición de la reivindicación 1ª.
61. El uso de la composición de la reivindicación 1ª, en la fabricación de un medicamento para la introducción de un polinucleótido en una célula eucariota presente en un animal vivo, en el que la composición se administra al animal en una cantidad eficaz para alcanzar y entrar en las células del animal.
62. El uso de la reivindicación 61ª, en el que el medicamento es para la introducción de un polinucleótido en una célula eucariota presente en un ser humano vivo.
63. El uso de la reivindicación 61ª, en el que el medicamento comprende aproximadamente 0,5 \mug a 20 mg de polinucleótido.
64. El uso de la reivindicación 61ª, en el que el medicamento está adaptado para administración por vía oral, transdérmica, sistémica o de inhalación.
\newpage
65. El uso de la reivindicación 64ª, en el que el medicamento está adaptado para administración transdérmicamente mediante administración por impacción a alta velocidad a la superficie de la piel.
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