ES2201054T3 - Modificacion de aceites vegetales usando desaturasa. - Google Patents

Modificacion de aceites vegetales usando desaturasa.

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ES2201054T3 ES93301895T ES93301895T ES2201054T3 ES 2201054 T3 ES2201054 T3 ES 2201054T3 ES 93301895 T ES93301895 T ES 93301895T ES 93301895 T ES93301895 T ES 93301895T ES 2201054 T3 ES2201054 T3 ES 2201054T3
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Abstract

SE PRESENTAN SEMILLAS DE PLANTAS QUE TIENEN EN LAS MISMAS UN GEN DE DESATURASA DELTA-9 DE LEVADURA, PREFERIBLEMENTE EN ASOCIACION CON UN PROMOTOR ADECUADO Y UNA SECUENCIA DE FINALIZACION. TAMBIEN SE PRESENTA UN METODO PARA MODIFICAR EL CONTENIDO DE ACIDOS GRASOS DEL ACEITE DE SEMILLAS, MEDIANTE LA TRANSFORMACION DE SEMILLAS CON LA DESATURASA DELTA-9 DE LEVADURA.

Description

Modificación de aceites vegetales usando desaturasa.
Campo de la invención
La presente invención se refiere a una semilla de planta de un cultivo de semillas oleaginosas que contiene el gen delta-9 desaturasa de levadura, y a un método para modificar el contenido de ácido graso del aceite de semilla usando el gen desaturasa.
Más específicamente, la presente invención está dirigida a una semilla de planta, tal como una semilla de Brassica, que contiene el gen delta-9 desaturasa de levadura bajo el control de un promotor específico de semillas que provoca la expresión del gen en la semilla y, como corolario, a un método para aumentar el contenido de ácido palmitoleico del aceite de semilla usando el gen desaturasa.
Descripción de los antecedentes y de la información relevante
Los aceites vegetales se usan no sólo en la industria alimentaria, sino así mismo de forma creciente en la industria química, y comienzan a encontrar su camino en aplicaciones industriales como alternativas a fluidos lubricantes más convencionales. La utilización de los aceites depende principalmente de sus composiciones. Los triglicéridos comprenden la mayor parte del aceite vegetal (alrededor del 95%), pero también están presentes un gran número de otros lípidos importantes, tales como fosfolípidos, ácidos grasos libres, ceras, y esteroles. También puede haber una variedad de otros componentes, tales como antioxidantes, que, aunque aparecen en cantidades relativamente minoritarias, no obstante pueden tener un impacto significativo en las características y, por tanto, utilidad de los aceites.
Las características de triglicéridos dependen en gran medida de sus ácidos grasos constituyentes. Debido a que los ácidos grasos que aparecen de forma natural en cepas agronómicamente aceptables de cultivos de oleaginosas frecuentemente hacen al aceite resultante inadecuado para un uso de otro modo atractivo, es extremadamente deseable tener la capacidad para cambiar la composición del aceite para cumplir parámetros específicos.
La modificación de los aceites vegetales puede efectuarse químicamente. Este enfoque se ha usado para obtener un aceite para ensaladas/para cocinar que contiene ácidos grasos saturados en una cantidad menor que alrededor del 3% (patente U.S. número 4.948.811); el aceite se puede formar mediante reacción química, o mediante separación física de los lípidos saturados. Se hace referencia general al uso de la "ingeniería genética" para lograr un aceite de las características deseadas (véase la columna 3, línea 58 y siguientes). Sin embargo, no hay una descripción detallada de cómo se podría modificar cualquier planta oleaginosa particular para proporcionar un aceite vegetal de las características deseadas.
Típicamente, la composición de ácidos grasos de los aceites vegetales se ha modificado por el contrario a través de técnicas de reproducción tradicionales. Estas técnicas utilizan el plasma germinal existente como una fuente de mutaciones de origen natural que afectan a la composición de los ácidos grasos. Tales mutaciones están reveladas y se seleccionan mediante el uso de la selección apropiada, en conjunción con la reproducción subsiguiente. Por ejemplo, tal enfoque se ha usado para disminuir la cantidad de erucato de ácido graso de cadena larga en aceite de semilla de colza (Stefansson, B.R. (1983) en High and Low Erucic Acid Rapeseed Oils, Kramer JKG et al., eds; Academic Press, NY; p. 144-161), y para aumentar la cantidad del ácido graso monoinsaturado oleato en aceite de maíz (Solicitud de Patente de Estados Unidos, Número de Serie 07/554.526).
Recientemente, se han hecho intentos para aumentar el conjunto de mutaciones disponibles a partir de las cuales seleccionar las características deseadas mediante el uso de mutágenos. Sin embargo, los mutágenos generalmente actúan por inactivación o modificación de genes ya presentes, dando como resultado la pérdida o disminución de una función particular. La introducción de una nueva característica a través de mutagénesis a menudo depende de este modo de la pérdida de algún rasgo ya presente. Además, el logro de metas deseadas con mutágenos generalmente es incierto. Usando este enfoque sólo se han logrado unos pocos tipos de composiciones de ácidos grasos modificadas en aceites vegetales. Un ejemplo de tal mutación "creada" que afecta a la composición de ácidos grasos es la disminución de ácidos grasos poliinsaturados, en particular de linoleato y linolenato, en aceite de semilla de colza, con un aumento concomitante en el ácido graso monoinsaturado oleato (Auld, M., et al., (1992) Crop Sci. en prensa). Otro ejemplo es la disminución de ácidos grasos saturados en aceite de semilla de colza (Solicitud de patente Internacional PCT Número de Publicación WO 91/15578). Sin embargo, la bioquímica de la síntesis del aceite de semillas es compleja, y no se comprende bien; puede haber varios mecanismos que contribuyan a los cambios en las composiciones de ácidos grasos observados en el aceite de semilla de colza (Número de Publicación de Solicitud de Patente Internacional PCT WO 91/15578). El uso de la mutagénesis para efectuar tales cambios es esencialmente aleatorio, y no específico.
La posibilidad de modificar la composición de ácidos grasos mediante el uso de ingeniería genética permitiría, en teoría, la introducción precisa y controlada de genes específicos deseables, así como la inactivación de genes específicos indeseables o de productos génicos. De este modo, se podrían introducir en las plantas nuevos rasgos completamente independientes de los genes ya presentes, o se podrían inactivar o modificar genes preseleccionados. Sin embargo, un atributo para hacer uso efectivo de la ingeniería genética para modificar las composiciones de ácidos grasos es un modelo razonablemente exacto de los mecanismos en juego en la célula de la planta que regulan la síntesis y procesamiento de ácidos grasos.
Se postula que, en oleaginosas, la síntesis de ácidos grasos ocurre en el plástido, y que los ácidos grasos recientemente sintetizados se exportan del plástido al citoplasma. Aquí son utilizados en la construcción de triglicéridos, que ocurre en las membranas endorreticulares.
El producto principal de la síntesis de ácidos grasos es palmitato (16:0), que parece que se alarga eficientemente a estearato (18:0). Mientras que están aún en el plástido, los ácidos grasos saturados se pueden entonces desaturar, mediante una enzima conocida como delta-9 desaturasa, para producir uno o más dobles enlaces carbono-carbono. Específicamente, el estearato se puede desaturar rápidamente mediante una enzima delta-9 desaturasa plastídica para producir oleato (18:1). De hecho, el palmitato también se puede desaturar a palmitoleato (16:1) mediante la delta-9 desaturasa plastídica, pero este ácido graso aparece sólo en cantidades en trazas (0-0,2%) en la mayoría de los aceites vegetales.
De este modo, los productos principales de la síntesis de ácidos grasos en el plástido son palmitato, estearato y oleato. En la mayoría de los aceites, el oleato es el principal ácido graso sintetizado, puesto que los ácidos grasos saturados están presentes en proporciones mucho menores.
La desaturación subsiguiente de ácidos grasos de la planta fuera del plástido en el citoplasma parece estar limitada a oleato, que se puede desaturar a linoleato (18:2) y linolenato (18:3). Además, dependiendo de la planta, el oleato se puede modificar adicionalmente por alargamiento (hasta 20:1, 22:1, y/o 24:1), o por adición de grupos funcionales. Estos ácidos grasos, junto con los ácidos grasos saturados palmitato y estearato, se pueden entonces ensamblar en triglicéridos.
La enzima delta-9 desaturasa de las plantas es soluble. Está localizada en el estroma del plástido, y usa ácidos grasos recientemente sintetizados esterificados a ACP, predominantemente estearil-ACP, como sustratos. Esto contrasta con la enzima delta-9 desaturasa de levadura, que está localizada en la membrana reticular endoplásmica, usa ácidos grasos esterificados a Co-A como sustratos, y desatura a ambos ácidos grasos saturados, palmitato y estearato.
El gen delta-9 desaturasa de levadura se ha aislado de Saccharomyces cerevisiae, se ha clonado, y se ha secuenciado (Stukey, J.E. et al., J. Biol. Chem. 264:16537-16544 (1989); Stukey, J.E. et al., J. Biol. Chem. 265:20144-20149 (1990)). Este gen también se ha usado para transformar la misma cepa de levadura en condiciones en las que está aparentemente sobreexpresado, dando como resultado un aumento de la acumulación de lípido almacenado en las células de levadura transformadas, según se determina por microscopía de fluorescencia usando Rojo Nilo como tinte para triglicéridos (Patente U.S. Número 5.057.419). La composición de ácidos grasos no se caracterizó. Esta referencia contiene una discusión general de cómo usar información procedente del gen delta-9 desaturasa de levadura aislado, para aislar primeramente otros genes desaturasa a partir de levadura, o de otros organismos, y entonces reintroducir estos genes en una levadura o planta en condiciones que, se especula, conducirían a una alta expresión, a fin de modificar el aceite producido y su composición de ácidos grasos (véase Ejemplo 2, en la columna 9, líneas 24 y siguientes). Sin embargo, esta discusión es tanto general como hipotética. No se proporcionan ejemplos reales, y la única técnica ofrecida para lograr esta meta es una enumeración de la metodología clásica de ADN recombinante sin ninguna guía en cuanto a la puesta en práctica específica (véase columna 10, líneas 25 y siguientes).
Subsiguientemente, se informó que el gen delta-9 desaturasa de levadura se había introducido de hecho en tejido de hoja de tabaco (Polashcok, J. et al., FASEB J.5:A1157 (1991). Aparentemente, el gen se expresó en este tejido, según se evidencia por un aumento dado a conocer de unas diez veces en ácido palmitoleico y una disminución correspondiente en ácidos palmítico y esteárico.
Recientemente se ha establecido el valor saludable de niveles elevados de ácidos monoinsaturados, particularmente oleico, como el principal constituyente dietético de grasas. Se piensa que tales dietas reducen la incidencia de arteriosclerosis que resulta de dietas ricas en ácidos grasos saturados. En consecuencia, existe una necesidad de un aceite vegetal comestible que tenga un elevado contenido de monoinsaturados. Se ha usado la mutagénesis de semillas para producir un aceite de semilla de colza con no más de 4% de contenido de ácido graso saturado (Solicitud de Patente Internacional PCT, Número de Publicación WO 91/15578); el valor más bajo dado a conocer fue un valor de semilla única de 2,8% de contenido de ácido graso saturado. Sin embargo, este aceite vegetal pobre en ácidos grasos saturados está limitado al aceite de semilla de colza.
La expresión del gen delta-9 desaturasa de levadura en cualquier tejido de semillas de plantas podría dar como resultado una disminución en los ácidos grasos saturados, con un aumento en ácidos grasos monoinsaturados en el aceite de la semilla. En este caso, se propone que la enzima desature aquellos ácidos grasos saturados que son exportados desde el plástido y, de este modo, ya no son un sustrato para la desaturación de ácidos grasos. De este modo, la transformación de plantas con un gen delta-9 desaturasa de levadura en condiciones en las que el gen se expresa en el tejido de la semilla conduce a un aceite de semilla con ácido graso saturado reducido.
Además, la expresión del gen desaturasa de levadura en plantas con composiciones inusuales de ácidos grasos podría dar como resultado el aumento o aparición de ácidos grasos inusuales en el aceite vegetal. Por ejemplo, la expresión del gen delta-9 desaturasa de levadura en tejido de semillas en el que el aceite contiene niveles elevados de palmitato podría dar como resultado un aumento en el nivel de palmitoleato. En aquellos tejidos en los que ocurre el alargamiento del ácido graso (tal como una semilla de colza rica en erucato), se podrían acumular ácidos grasos de cadena más larga con dobles enlaces inusuales. Tales ácidos grasos incluyen cis-vaccénico (18:1 cis 11), 20:1 cis 13, 22:1 cis 15, y 24:1 cis 17. Estos ácidos grasos son de interés industrial. Por ejemplo, la ruptura mediante ozonolisis oxidativa de 18:1 cis 11 da como resultado el ácido graso C7 monobásico y el ácido graso C10 dibásico. Tanto el ácido graso dibásico como el monobásico son un material de partida industrial y ácidos grasos de utilidad. Se pueden usar como sustitutos, o en situaciones en las que se desea una funcionalidad específica.
Sumario de la invención
En consecuencia, se proporciona una semilla de planta de cultivo de semillas oleaginosas que comprende un gen delta-9 desaturasa de levadura, y medios para expresar dicho gen delta-9 desaturasa de levadura en dicha semilla de planta, en la que dichos medios para expresar comprenden un promotor específico de semillas efectivo para provocar la expresión de dicho gen delta-9 desaturasa de levadura en dicha semilla de planta, y en la que la expresión de dicho gen delta-9 desaturasa de levadura da como resultado un aumento en el contenido, en tanto por ciento, de ácido palmitoleico en el aceite de semilla de dicha semilla de planta. El promotor puede ser, por ejemplo, un promotor de faseolina o un promotor de faseolina truncado. Preferiblemente, el promotor es un promotor de faseolina truncado.
La semilla de planta también puede contener una secuencia de terminación para el gen delta-9 desaturasa de levadura, tal como una secuencia de terminación de delta-9 desaturasa de levadura, una secuencia de terminación 3' de faseolina, una secuencia de terminación 3' de ORF 25.
La semilla de planta puede ser un miembro de un género de monocotiledóneas, prefiriéndose el Sorgo. Como alternativa, la semilla de planta puede pertenecer al género de dicotiledóneas, tales como Brassica, Helianthus, Carthamus, Sesamum, Glicine, Arachis, Gossypium, Lesquerella y Vernonia, en cuyo caso se prefiere Brassica, y particularmente Brassica rapa y Brassica napa.
En una realización adicional, la presente invención está dirigida a un método para modificar el contenido de ácidos grasos del aceite de semilla de una semilla de planta de cultivo de oleaginosas, comprendiendo dicho método la etapa de transformar la semilla de planta de cultivo de semillas oleaginosas para expresar un gen delta-9 desaturasa de levadura, en el que dicha modificación comprende aumentar el contenido, en tanto por ciento, de ácido palmitoleico en el aceite de semilla de dicha semilla de planta, y en el que dicha etapa de transformación comprende añadir, al ADN nativo de dicha semilla de planta, ADN exógeno, comprendiendo dicho ADN exógeno un gen delta-9 desaturasa de levadura y un promotor específico de semillas.
Como alternativa, el contenido de ácidos grasos se puede modificar adicionalmente reduciendo el contenido, en tanto por ciento, de ácido esteárico en el aceite de semilla.
En este método, la semilla de planta a modificar se puede seleccionar de los mismos géneros de monocotiledóneas y dicotiledóneas y especies enumeradas anteriormente.
La transformación generalmente se logra añadiendo, al ADN nativo de la semilla de planta, ADN exógeno en forma de gen delta-9 desaturasa de levadura y un promotor específico de semillas para el gen delta-9 desaturasa de levadura. Las técnicas adecuadas de transformación incluyen la mediación de la transformación usando Agrobacterium, electroporación, polietilenglicol (PEG), fibra de carburo de silicio, pistola de partículas, e inyección directa.
En una realización particular, la transformación contempla construir un vector que contiene el gen delta-9 desaturasa de levadura y el promotor específico de semillas, colocar el vector en una cepa seleccionada de Agrobacterium, y tratar las células seleccionadas de la planta con el Agrobacterium en condiciones suficientes para dar como resultado la transferencia de al menos algunos de los vectores desde el Agrobacterium a las células de la planta, con lo que se expresa el gen delta-9 desaturasa de levadura en las células de la planta.
En una realización final, la presente invención está dirigida a una planta oleaginosa obtenible a partir de la semilla de planta como se define por cualquiera de las reivindicaciones 1 a 12, en la que las semillas de dicha planta comprenden un gen delta-9 desaturasa de levadura y medios para expresar dicho gen delta-9 desaturasa de levadura en dicha semilla de planta, en la que dichos medios para expresar comprende un promotor específico de semillas efectivo para provocar la expresión de dicho gen delta-9 desaturasa de levadura en dicha semilla de planta, y en la que la expresión de dicho gen delta-9 desaturasa de levadura da como resultado un aumento en el contenido, en tanto por ciento, de ácido palmitoleico en el aceite de semilla de dicha planta.
Breve descripción de los dibujos
La Figura 1 muestra la secuencia de ADN y el mapa de restricción parcial del gen delta-9 desaturasa de levadura. Se muestra la cadena codificante de ADN junto con la secuencia deducida de aminoácidos del gen desaturasa. Estas secuencias también están representadas en ID SEQ n^{os} 1 y 2 anexas a este documento.
La Figura 2 representa un esquema de plásmido pH602 y cuatro casetes de expresión de plantas con el gen delta-9 desaturasa de levadura que se clonaron en el sitio único BgIII del plásmido.
Descripción detallada de las realizaciones preferidas
Brevemente, por medio de la presente invención se proporciona una semilla de planta de cultivo de semillas oleaginosas que contiene y que expresa un gen delta-9 desaturasa de levadura. Además, se proporciona un método para obtener aceite vegetal que tiene un perfil de ácido palmitoleico elevado transformando una planta con un gen delta-9 desaturasa de levadura en condiciones en las que el gen delta-9 de levadura se expresa en la semilla.
En forma de resumen, el gen delta-9 desaturasa de levadura se puede aislar mediante las siguientes etapas. El gen se clona primeramente mediante complementación in vivo de una cepa mutante ole1 de levadura a OLE+ mediante transformación con un banco genómico de levaduras obtenido a partir de ADN de levadura natural. Las secuencias de complementación transportadas por el plásmido se pueden caracterizar mediante la obtención del mapa de restricción, se pueden verificar mediante medios genéticos, y se pueden secuenciar.
La secuencia codificante del gen se coloca bajo el control de secuencias reguladoras que funcionan en una semilla de planta, y entonces se mueve a vectores de transformación de la planta. Estos constructos, con un marcador seleccionable adecuado para seleccionar transformantes positivos, se usan entonces para transformar el tejido de la planta. Los callos resultantes se regeneran en plantas; se seleccionan muestras de tejidos de estas plantas mediante al menos un ensayo molecular o biológico para determinar qué individuos contienen realmente un gen delta-9 desaturasa de levadura.
Aquellos transformantes que contienen el delta-9 desaturasa de levadura se hacen crecer hasta madurez, y se dejan que hagan semillas. La expresión del gen delta-9 desaturasa de levadura en la semilla se determina por análisis de ARNm, tal como con un ensayo de PCR, y/o mediante análisis de proteínas, tal como mediante un ensayo Western. Además, se determina la composición de ácidos grasos de las semillas maduras para identificar cualquier composición nueva de ácidos grasos producida en respuesta a la presencia del delta-9 desaturasa de levadura en las semillas. Aquellas semillas que muestren una composición alterada de ácidos grasos se hacen germinar, y se caracteriza la estabilidad y la genética del rasgo o rasgos observados mediante los cruces genéticos apropiados.
Cada uno de los aspectos de la invención se discutirá ahora con más detalle.
La mayoría de las manipulaciones genéticas de ADN y de la levadura descritas más abajo son protocolos estándares bien establecidos, y se pueden encontrar en varios manuales de protocolo (Sherman, F et al (1986) Laboratory Course Manual For Methods in Yeast Genetics, Cold Spring Harbor Laboratory Press, NY; Sambrook, J et al (1989) Molecular Cloning, A laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, NY; y Methods in Enzym 152: Guide to Molecular Cloning Techniques, Berger, SL y Kimmel, AR, eds (1987)). El ADN se puede secuenciar mediante varios métodos, incluyendo, por ejemplo, el método de Sanger, usando el protocolo para moldes de doble cadena según las instrucciones del fabricante (U.S. Biochem. Corp., Cleveland, OH).
Se puede aislar un gen delta-9 desaturasa a partir de levadura mediante las siguientes etapas. Se crea una cepa de levadura que es adecuada para la transformación y complementación. Tal cepa debe ser deficiente en actividad delta-9 desaturasa y, de este modo, requiere ácidos grasos insaturados exógenos para su crecimiento. Además, la cepa puede tener una segunda característica o marcador para permitir la selección de células transformadas. Entonces se usa un banco genómico de ADN natural de levadura para transformar la cepa de levadura deficiente en actividad delta-9 desaturasa. Se presupone que aquellas cepas en las que se observó la restauración de la función delta-9 desaturasa (es decir, que exhibieron un fenotipo natural y ya no requirieron más ácidos grasos exógenos para el crecimiento) contienen el gen delta-9 desaturasa de levadura. Entonces se aíslan los insertos de plásmidos recombinantes que contienen putativamente el gen delta-9 desaturasa. Se prepara un mapa de restricción del inserto, y se puede comparar con un mapa publicado (Stukey, JE (1989) J. Biol. Chem. 264: 16537-16544). Finalmente, se verifica la identidad del gen mediante análisis genético estándar.
El ADN del inserto se subclona y secuencia entonces para localizar y caracterizar la región codificante del gen delta-9 desaturasa de levadura. La región codificante se mueve a casetes de expresión de la planta tras seleccionar la secuencia o secuencias reguladoras apropiadas para la expresión deseada. Las secuencias reguladoras incluyen tanto secuencias promotoras como de terminación.
Los posibles promotores específicos de semillas incluyen aquellos procedentes de genes de biosíntesis de ácidos grasos/lípidos de plantas (ACP, aciltransferasas, desaturasas, genes proteínicos de transferencia de lípidos) o procedentes de genes de proteína de almacenamiento (genes de zeína, napina, cruciferina, conglicinina, lectina), pudiéndose usar sus secuencias correspondientes de terminación/poliA+ para la expresión objetivo. Es claro para el experto en la técnica que un promotor se puede usar tanto en forma original como truncada, y se puede emparejar con su propia secuencia de terminación/poliA+ o una secuencia heteróloga de terminación/poliA+.
Además, el producto génico delta-9 desaturasa de levadura se puede localizar en un orgánulo específico en la semilla de planta ligando el ADN que codifica secuencias líder de péptidos al gen desaturasa. Tales secuencias líder se obtienen a partir de varios genes, bien de plantas o de otras fuentes. Estos genes codifican proteínas sintetizadas citoplásmicamente dirigidas a, por ejemplo, mitocondrias (la subunidad beta de F1-ATPasa a partir de levadura o tabaco, citocromo c1 a partir de levadura), cloroplastos (subunidad Va de citocromo-oxidasa a partir de levadura, subunidad pequeña de rubisco a partir de guisante), lumen del retículo endoplásmico (disulfuroisomerasa de proteína), vacuolas (carboxipeptidasa Y y proteinasa A a partir de levadura, fitohemaglutinina a partir de guisante francés), peroxisomas (D-aminoácido-oxidasa, uricasa) y lisosomas (hidrolasas). Estos constructos se pueden usar con cualquiera de los promotores sugeridos mencionados anteriormente.
También se escoge un marcador seleccionable para la selección óptima de la transformación. Tales marcadores son típicamente genes que codifican la resistencia a diversos productos químicos tóxicos, tales como antibióticos y herbicidas; la resistencia habitualmente es conferida por enzimas que convierten típicamente al producto químico en no tóxico. Tales productos químicos tóxicos incluyen, por ejemplo, higromicina, canamicina, metotrexato, y fosfinotricina. Enzimas que confieren resistencia a estos productos químicos son higromicinfosfotransferasa, neomicinfosfotransferasa, dihidrofoliato-reductasa, y fosfintricinacetiltransferasa. Los genes que codifican la resistencia son bien conocidos por los expertos normales en la técnica de la transformación de plantas. Las plantas transformadas con tales genes son capaces de crecer en presencia del compuesto tóxico, mientras que no así las plantas no transformadas. Por lo tanto, tales genes sirven tanto como un medio para seleccionar plantas transformadas así como marcadores para la transformación, indicando que ha transcurrido la transformación.
Finalmente, el casete de expresión de la planta que contiene el gen delta-9 desaturasa de levadura se mueve en el vector que también contiene el marcador seleccionable para uso en la transformación de la planta. El marcador seleccionable está típicamente bajo el control de un promotor constitutivo como se describe anteriormente. El vector se construye de tal forma que tanto el gen delta-desaturasa de la levadura como el gen marcador se transfieren juntos en el genoma de la planta.
El tejido de la planta para uso en la transformación se puede obtener a partir de cualquier planta oleaginosa adecuada. Tales plantas se pueden encontrar en los géneros Brassica, Helianthus, Carthamus, Sesamum, Glycine, Arachis, Gossypium, Ricinus, Linum, Cuphea, Euphorbia, Limnanthes, Crambe, Lesquerella, Vernonia, Simmondsia, Olea, Papaver, Elaeis y Cocos. El tejido vegetal apropiado incluye pero no se limita a hojas, hipocotilos, cotiledones, bulbos, callos, células simples, y protoplastos.
Las técnicas de transformación son bien conocidas por los expertos en la técnica de la transformación de plantas, e incluyen la transformación mediada por Agrobacterias, electroporación, polietilenglicol (PEG), fibras de carburo de silicio, inyección directa y una pistola de partículas. Estos métodos son diversos medios para introducir ADN foráneo en las células de la planta. Una vez en la célula, una porción del ADN que lleva tanto el gen delta-9 desaturasa de levadura como el marcador seleccionable se incorpora en el genoma de la planta vía las funciones de transferencia incluidas en el ADN.
El tejido calloso transformado se selecciona por crecimiento sobre medio de selección (por ejemplo, un medio que contiene un producto químico tóxico y para el cual la planta transformada contiene un gen de resistencia, en virtud de su transformación). Las plantas transformadas se regeneran y seleccionan para determinar la presencia del gen delta-9 desaturasa de levadura. Esto implica analizar el tejido mediante al menos un ensayo molecular o biológico para determinar que, si lo hay, los transformantes contienen secuencias de ARNm o ADN específicas de delta-9 desaturasa de levadura. Estos ensayos incluyen ensayos del tejido para la expresión de la enzima del gen de resistencia, y ensayos del tejido para determinar la presencia del ADN delta-9 desaturasa de levadura mediante, por ejemplo un ensayo Southern o un ensayo de PCR.
Aquellas plantas que son positivas para el gen delta-9 desaturasa de levadura se hacen crecer hasta madurez, se polinizan, y se dejan que den semillas. Las semillas obtenidas a partir de plantas transformadas se analizan para determinar la expresión del gen delta- 9 desaturasa de levadura tanto buscando la proteína codificada por el gen, como por ejemplo vía un análisis Western, como para determinar el fenotipo de la composición grasa alterada como resultado de la actividad de la desaturasa.
Un análisis Western determina la presencia de una proteína codificada y expresada por el gen delta-9 desaturasa de levadura, y se utiliza para detectar la expresión del gen en el tejido de la semilla de la planta. El ensayo requiere el uso de anticuerpos a la delta- 9 desaturasa de levadura para detectar la presencia de la proteína. Los anticuerpos específicos para la proteína delta-9 desaturasa de levadura, que no ha sido purificada previamente, se preparan según lo siguiente. La secuencia codificante para la enzima delta-9 desaturasa de levadura se clona en un vector de expresión (por ejemplo, pMAL-p, pMAL-cRI, de New England Biolabs). La proteína resultante se aísla y se purifica según las instrucciones de los fabricantes. Entonces se generan los anticuerpos para la enzima delta-9 desaturasa mediante técnicas convencionales. La especificidad de los anticuerpos a la enzima delta-9 desaturasa se determina mediante ensayos ELISA.
La composición de ácidos grasos de semillas tanto enteras como en mitades, obtenidas a partir de plantas de control o bien transgénicas, se determina extrayendo el aceite, preparando ésteres metílicos de los ácidos grasos, y luego separando y cuantificando los ésteres metílicos de los ácidos grasos mediante procedimientos convencionales. Las nuevas características de los ácidos grasos se determinan comparando la composición grasa de las semillas transgénicas con la de la planta progenitora.
La estabilidad y herencia genética de los nuevos rasgos de los ácidos grasos se determinan mediante cruces genéticos clásicos. El rasgo o rasgos conferidos por el gen delta-9 desaturasa de levadura se puede transferir en otros cultivos agronómicamente aceptables mediante tecnología de reproducción estándar.
Ejemplo 1 Clonado, Aislamiento y Secuenciación del Gen a. Clonado y Aislamiento del Gen
El gen delta-9 desaturasa se clonó en levadura mediante complementación usando un vector de 2 micrómetros y buscando la cosegregación de marcadores. Se preparó un banco genómico de ADN de levadura de tipo natural a partir de la cepa X2180-1A de Saccharomyces cerevisiae (the Yeast Genetic Stock Center, Berkeley, CA) en el plásmido autónomo de levadura YEp13. Este plásmido se transforma a una elevada eficiencia y se replica independientemente de los cromosomas a un número elevado de copias. El YEp13 contiene un gen LEU2 de tipo natural para la selección de transformantes, y es mitóticamente inestable cuando se hace crecer en condiciones no selectivas. Con la transformación en E. coli, el banco dio 1,7 x 10^{4} transformantes independientes, muy por encima de la cifra de 9,5 x 10^{3} calculada como necesaria para dar como resultado una probabilidad del 99% de que una copia del gen delta-9 desaturasa de levadura estuviera contenida en el banco.
Se construyó una cepa de levadura adecuada para transformación apareando dos cepas de levaduras haploides y analizando las esporas haploides resultantes. Se encontró que una cepa contenía ambas mutaciones (ole1/leu2) necesarias para la complementación. Se realizó una transformación de la levadura, y se seleccionaron los transformantes tanto para el marcador LEU2 contenido en el plásmido como para la actividad de desaturasa natural por crecimiento en un medio que carece de oleato. De esta manera, se obtuvieron 450 transformantes que eran de tipo fenotípicamente naturales tanto para LEU2 como para la actividad de desaturasa. Estos transformantes se hicieron crecer a continuación en condiciones no selectivas, induciendo de ese modo la inestabilidad mitótica, y luego se detectaron sistemáticamente en busca de la co-pérdida del marcador del plásmido LEU2 y la actividad de desaturasa. La co-pérdida de marcadores indicó que la actividad de desaturasa estaba portada por plásmido y no era un revertiente cromosómico natural.
De este modo, se identificaron varios insertos portados por plásmidos que restauraron la función natural cuando se encuentran en células de levaduras mutantes. Se encontró un fragmento Hind III de 5,7 kb que era común para la mayoría de los insertos, y el análisis del mapa de restricción del inserto indicó una extensa homología a la del mapa de restricción publicado (Stukey, JE et al (1989) J. Biol. Chem. 264: 16537-16544). La principal diferencia entre los dos mapas es que el inserto publicado es un fragmento Hind III de 4,8 kb, comparado con el fragmento Hind III de 5,7 kb aislado aquí. Sin embargo, se ha demostrado que la región es polimórfica en diversas cepas de levaduras, incluyendo la cepa progenitora de la cepa a partir de la que se obtuvo el banco genómico (Stukey, JE et al, más arriba). Adicionalmente, el mapa de restricción se conserva sumamente en la región codificante de delta-9 desaturasa de levadura putativa en el inserto; la diferencia en el tamaño es debida a las secuencias en dirección 3' fuera de la región codificante.
Se realizó un intento para identificar, mediante análisis Southern, secuencias de ADN de plantas que mostraron homología con el gen de desaturasa de levadura. Se digirió ADN genómico procedente de Brassica napus, Brassica rapa, Arabidopsis thaliana, haba de soja, y maíz, con cada una de las tres enzimas de restricción, y se transfirió a una membrana. La membrana se examinó entonces con dos insertos subclonados marcados con cebadores al azar, que contenían sólo secuencias de marco de lectura abierta procedente del gen delta-9 desaturasa de levadura. Tras la hibridación, el filtro de lavó secuencialmente en condiciones cada vez más rigurosas, a fin de determinar si la relación de señal a ruido de cualquier homología se pudiera reducir suficientemente para hacer factible la detección sistemática de un banco genómico usando la misma sonda. Usando las condiciones de lavado menos rigurosas, se pudieron observar bandas tenues para todos los genomas, pero se observó, no inesperadamente, un fuerte fondo. En las condiciones de lavado más rigurosas (es decir, "normales"), el fondo se redujo notablemente; sin embargo, en estas condiciones, sólo el ADN del maíz y del haba de soja mostraron bandas obvias que seguían siendo tenues, especialmente cuando se comparan con aquellas en el ADN de la levadura.
Estos datos indican que el gen delta-9 desaturasa de levadura tiene poca homología con su gen correspondiente en Brassica, al menos al nivel del ADN. Debido a que la delta-9 desaturasa de levadura tiene tanto una localización diferente (microsómica frente a cloroplástica) como una especificidad por el sustrato (tioésteres de acil-CoA grasos frente a tioésteres de acil-ACP grasos) que la que tiene la enzima de la planta, no es inesperado que las dos enzimas, a pesar de su función similar, muestren poca homología ya sea al nivel de ADN como al nivel proteínico.
Estudios de ruptura de genes corroboraron los resultados de complementación que indicaron que el gen clonado era de hecho el gen delta-9 desaturasa de levadura. Se obtuvo un constructo que insertó un gen LEU2 funcional en la región codificante del gen de delta-9 desaturasa de levadura putativo, rompiendo de ese modo el gen clonado. Usando técnicas genéticas de levadura estándares, se sustituyó la copia cromosómica del gen clonado con la versión rota con LEU2, y las células resultantes se analizaron entonces para determinar su capacidad para crecer sin ácido oleico suplementario. En este análisis, si el gen clonado no fue el delta-9 desaturasa de levadura, entonces esta ruptura no debería afectar a la biosíntesis de ácidos grasos. Si el gen clonado fue el delta-9 desaturasa de levadura, entonces esta ruptura debía dar como resultado células que no pueden fabricar ácido oleico y por lo tanto requieren una fuente suplementaria. De hecho, las células de levadura, verificadas mediante análisis Southern que contienen el gen roto, no pueden crecer sin ácido oleico suplementario.
b. Secuenciación génica
Se produjeron fragmentos de restricción del gen delta-9 desaturasa de levadura mediante digestiones con varias enzimas diferentes que se subclonaron en el vector pUC18. Estos fragmentos se secuenciaron usando moldes de doble cadena con Sequenase (USB) según las instrucciones del fabricante. Los resultados se presentan en la figura 1.
El análisis de la secuencia de ADN del inserto clonado identificó una ventana de lectura abierta de 1530 pb con una secuencia TATAA, la secuencia promotora preferida en levadura, localizada a -30 desde la primera ATG de la proteína predicha que se usa generalmente como el codón de iniciación de un péptido en levadura. El análisis Northern demostró que las secuencias de ADN de la ventana de lectura abierta se hibridaron a un ARNm poliadenilado de aproximadamente 2,0 kb. El tamaño del transcripto observado es un buen ajuste para una secuencia codificante de 1530 pb, permitiendo un espacio adecuado para una cola 3' poliA+, y sugiere que el transcripto, al igual que la mayoría de los ARNm de levaduras, no contiene intrones.
La región codificante de 1530 pb del gen clonado, suponiendo que el comienzo de la traducción es la primera ATG en la ventana de lectura tras la caja TATAA, codifica una proteína de 510 aa. Las investigaciones de homología de bancos de datos de proteínas conocidas han demostrado que la secuencia de aminoácidos predicha del gen delta-9 desaturasa de levadura es homólogo tanto para las proteínas estearil-CoA desaturasa de rata como de ratón. De forma interesante, la homología para ambas proteínas de los mamíferos comienza a alrededor de 42aa y termina a 397aa. Aunque la secuencia del gen delta-9 desaturasa de levadura clonado procedente de la cepa X2180-1A de Saccharomyces cerevisiae es muy similar en secuencia a la dada a conocer aislada de la cepa R 254 (originalmente denominada AB320) (Stukey, JE et al (1990) J. Biol. Chem. 265: 20144-20149), hay al menos una diferencia de un aminoácido entre las dos regiones codificantes: la secuencia publicada da a conocer una met en la posición 304 de los aminoácidos, opuesto a una leu en la misma posición observada aquí.
Los datos obtenidos a partir de estudios de complementación génica, estudios de ruptura de genes, y análisis de secuencias, han demostrado que el gen clonado fue el delta-9 desaturasa de levadura.
Ejemplo 2 Construcción del Vector
Se construyeron 4 vectores de expresión, en los que el gen delta-9 desaturasa de levadura se colocó bajo el control de diferentes promotores, y se siguió por diferentes secuencias de terminación/poliadenilación. El vector usado para la transformación de la planta contenía tanto el marcador seleccionable deseado como el casete de expresión del gen delta-9 desaturasa de levadura.
El vector de transformación en el cual se colocaron los casetes de expresión del gen delta-9 desaturasa de levadura es pH602 (véase Figura 2; RED). Este vector es un vector binario de plásmido micro Ti similar al plásmido pH575 descrito previamente (Hoffman, LM et al (1987) EMBO J. 6: 3213-3221), excepto que contiene como marcador seleccionable el gen higromicin-fosfotransferasa (HPT) en lugar de un gen neofosfotransferasa II (NPTII) (Murria, EE et al (1991) Plant Mol. Biol. Reporter 16: 1035-1050). El gen HPT, que confiere resistencia al antibiótico higromicina, está bajo control del promotor constitutivo CaMV 35S.
A fin de obtener la expresión del gen delta-9 desaturasa de levadura, el gen se puso bajo el control de un promotor de faseolina específico de semillas, obtenido de la haba francesa, Phaseolus vulgaris (REF). Debido a que la acumulación de aceite en la semilla ocurre antes que la acumulación de la proteína de almacenamiento en la semilla durante el desarrollo y maduración de la semilla, el promotor de faseolina no es óptimo en términos de regulación temporal. Por lo tanto, el gen se puso bajo el control de un promotor de faseolina modificado diseñado para ser expresado antes que la faseolina nativa (Bustos et al (1991) EMBO J. 10: 1469-1479) así como bajo el control del promotor CaMV 35S constitutivamente expresado.
a. pH.PO
En este vector, el gen desaturasa de levadura se colocó bajo el control de un promotor específico de semillas, el promotor de faseolina de proteína de almacenamiento en la semilla, y fue seguido por las secuencias de terminación de desaturasa de levadura.
El vector pSPPneo contenía un gen de faseolina genómica, y fue la fuente del promotor usado en este constructo. El vector se digirió con EcoR1 y Sca1; el fragmento EcoR1-Sca1 de 1,4 kb resultante, que contenía el promotor de faseolina junto con un sitio de clonación múltiple, se aisló y se clonó en pUC18, dando como resultado el vector denominado scp5'phas.
La siguiente etapa eliminó el sitio de clonación múltiple del promotor de faseolina. El scp5'phas se digirió con EcoR1 y EcoRV, ambos extremos se rellenaron y el vector se volvió a ligar. El vector resultante se denominó scp5'phas-delta, y contenía la región del promotor de faseolina menos el sitio de clonación múltiple.
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Se aisló un fragmento HindIII de 5,8 kb de ADN genómico de levadura que contenía el gen desaturasa de levadura (véase anteriormente), y se clonó en el sitio Hindi de pUC18, dando como resultado el vector denominado pUC26A, Entonces se aisló a partir de pUC26A un fragmento SnaB1-Xho1 de 3,5 kb que contenía toda la secuencia codificante de desaturasa de levadura y la secuencia de terminación, y se clonó en el sitio Sma1-Sal1 de scp5'phas-delta. El vector resultante se denominó pPO.
Finalmente, se aisló de pPO un fragmento Nhe1-HindIII de 4,5 kb, que contenía el promotor de faseolina y las secuencias codificantes y de terminación de desaturasa de levadura; este fragmento se rellenó, se añadieron ligantes BamH1, y el fragmento se clonó en el sitio BglII de pH606. El vector resultante se denominó pH.PO.
b. pH.POP
En este vector, el gen desaturasa de levadura se colocó bajo el control del promotor de faseolina y fue seguido por las secuencias de terminación de faseolina.
Se aisló un fragmento Nhe1-BspH1 de 2,6 kb a partir de pPO (véase anteriormente), que contenía el promotor de faseolina y la secuencia codificante de desaturasa de levadura. El sitio BspH1 se rellenó, se añadieron los ligantes Pst1 y el fragmento se clonó en los sitios Xba1-Pst1 de pUC18. El vector resultante se denominó pPO-2.
Se aisló un fragmento Pst1-Sst1 de 1,5 kb a partir de pSPPneo, que contenía las secuencias terminantes 3' de faseolina. El sitio Sst1 se rellenó, se añadieron los ligantes Pst1, y el fragmento se clonó en el sitio Pst1 de pPO-2. El vector resultante se denominó pPOP.
El pPOP se digirió con BamH1, y el inserto que contenía el promotor de faseolina, el gen desaturasa de levadura, y la secuencia de terminación 3' de faseolina se clonó en el sitio BglII en pH602. El vector resultante se denominó pH.POP.
c. pH.PdeltaBOP
En este vector, el gen desaturasa de levadura se colocó bajo el control de un promotor de faseolina modificado, y fue seguido por las secuencias de terminación de faseolina. El promotor de faseolina se modificó por truncamiento, lo que se ha informado que da como resultado una expresión temprana de los genes regulados por el promotor (Bustos et al (1991) The EMBO J. 10: 1469-1479).
Se aisló un fragmento Bcl1-Pst1 de 2,0 kb a partir de pPO-2 (véase anteriormente), que contenía un promotor de faseolina truncado y la secuencia codificante de desaturasa de levadura. El promotor de faseolina truncado contenía sólo alrededor de un tercio, o 295 pb, de la secuencia del promotor original. Este fragmento se clonó en los sitios BamH1- Pst1 de pUC18. El vector resultante se denominó pPOdeltaB.
Se aisló a partir de POP (véase anteriormente) un fragmento Pst1 de 1,5 kb, que contenía la secuencia de poliadenilación 3' del gen de faseolina. Este fragmento se insertó en el sitio Pst1 de pPOdeltaB, para crear un constructo que contiene un promotor de faseolina truncado, el gen desaturasa de levadura y la secuencia de terminación de faseolina. El vector resultante se denominó pPdeltaBOP.
Se aisló un fragmento BamH1 de 3,2 kb a partir de pPdeltaBOP, que contenía el promotor de faseolina truncado, la secuencia codificante de desaturasa de levadura, y la secuencia de terminación de faseolina. Este fragmento se insertó en el sitio de clonación de BglII de pH606. El vector resultante se denominó pH.PdeltaBOP.
d. pH.SOA.
En este vector, el gen desaturasa de levadura se colocó bajo control de un promotor constitutivo, el promotor 35S, y se siguió por las secuencias de terminación de ORF25.
El vector pIC35/A contiene el promotor CaMV 35S y la secuencia de poliadenilación de ORF25; los dos están separados por un sitio de clonación múltiple. De este modo, la estrategia para construir el vector fue mover el gen desaturasa de levadura de pUC26A a pIC35A entre el promotor y las secuencias de terminación, y entonces moverlo al vector pH602.
Se aisló un fragmento BclI-BspH1 de 1665 pb a partir de pUC26A, que contenía la secuencia codificante de desaturasa de levadura genómica; el sitio BspH1 se rellenó y se añadieron los ligantes BamH1. Este fragmento se clonó entonces en el sitio BamH1 de pIC35A; el vector resultante se denominó pSOA. Se aisló un fragmento Xba1 de 3075 a partir de pSOA, que contenía el promotor 35S, la secuencia codificante del gen desaturasa de levadura y la secuencia de poliadenilación 3' de ORF25; el fragmento se terminó de manera abrupta con ADN polimerasa de T4, y se clonó en el sitio BglII de pH602, que se había terminado de forma abrupta con ADN polimerasa de T4. El vector resultante se denominó pH.SOA.
Ejemplo 3 Transferencia del Vector a Agrobacterium
Los cuatro plásmidos descritos anteriormente, pH.PO, pH.POP, pH.PdeltaBOP, y pH.SOA, se movieron a la cepa Z707s de Agrobacterium por apareamiento triparental con las cepas DH15 y RK2013 de E. coli, esencialmente como se describe (Rogers SG et al (1988) Plant Molecular Biology Manual A2 (Kluwer Academic Publisher, Dordrecht),
p. 1-12).
Ejemplo 4 Transformación de Semilla de Colza
La semilla de colza es uno de los cultivos de semillas oleaginosas más importantes del mundo. Se ha hecho un esfuerzo considerable para mejorar sus cualidades agronómicas mediante técnicas de reproducción selectiva. La Brassica napus y Brassica rapa constituyen la mayoría de la producción de semilla de colza en América del Norte.
La Brassica napus es bastante susceptible al cultivo de tejidos, ofreciendo de este modo un buen sistema para la introducción de genes foráneos. Se han dado a conocer previamente plantas transgénicas de B. napus obtenidas por transformación mediada por agrobacterias (Pua et a (1987) Bio/Technology 5: 815-817; Fry et al (1987) Plant Cell Reports 6: 321-325; Radke et al (1988) Theor, Appl. Genet 75; 685-694; y Moloney et al (1989) Plant Cell Reports 8: 238-242). También se han usado técnicas de microinyección (Neuhaus et al (1987) Theor Appl. Genet. 75: 30-36)) y de electroporación de protoplastos (Guerche et al (1987) Plant Sci. 52: 111-116), para transformar B. napus. La Brassica rapa también se puede transformar, como se ha dado a conocer recientemente por Mehra-Palta et al (1991, Proceedings of the Rapeseed GCIRC Congress, p. 1108-1115).
La planta usada en este ejemplo de transformación de semilla de colza fue la variedad de cultivo Profit de Brassica napus. Las semillas se obtuvieron tanto de plantas normales como de plantas obtenidas a partir de una estirpe de plantas previamente regeneradas. Esta estirpe regenerada de Profit da como resultado plantas cuyo tejido demuestra una frecuencia creciente de transformación, cuando la frecuencia se calcula como el número de plantas transgénicas obtenidas a partir de un número específico de explantes tisulares. Se esterilizó la semillas con hipoclorito sódico al 1,05% (Chlorox al 20%) durante 20 minutos, y se aclararon 3 veces con agua destilada estéril. Estas semillas se hicieron germinar asépticamente en medio basal (BM) en cápsulas de Petri de 20 x 100 mm durante 4-6 días. El BM constaba de macro y micro elementos de Murashige y Skoog (1962), con hierro en FeNa2EDTA 40 mg/l, y los siguientes constituyentes (mg/l): mio-inositol, 100; ácido nicotínico, 0,1; pirodoxina HCl, 0,1; tiamina HCl, 0,02; glicina, 0,4; sacarosa, 30.000; y bactoagar Difco, 8,000. Las plántulas se hicieron crecer a 25ºC con un período de luz de 16 horas. Se cortaron segmentos (2-3 mm) de hipocotilos de plántulas de 4-6 días, y se pretrataron durante 24 horas en BM o en medio B5 de Gamborg (Gamborg et al, 1968) que contiene ácido alfa-naftalenacético (NAA) a 5 mg/l o ácido 2,4-diclorofenoxiacético (2,4-D) a 1 mg/l) (medio formador de callos). Se colocó un papel de filtro estéril sobre el medio antes del tratamiento.
Los segmentos de hipocotilos se trataron con la disolución de Agrobacterium (diluida hasta 10 * 8/ml con medio basal líquido) durante 30 minutos, y luego se colocaron sobre el medio formador de callos durante 2-3 días de cocultivo.
Los tejidos de los hipocotilos se transfirieron al medio formador de callos que contenía carbenicillina (500 mg/l) e higromicina (5-10 mg/l). Los cultivos se mantuvieron a 22 \pm 2ºC, con un período de luz de 16 horas. Después de 7 días, los segmentos de hipocotiledones se transfirieron a un medio BM o B5 de regeneración de retoños, los cuales contienen ambos BAP (1-4 mg/l), zeatina (0-4 mg/l), nitrato de plata (AgNO3, 2,5-10 mg/l), carbenicillina (500 mg/l), e higromicina (5-10 mg/l). Los medios de formadores de callos y de regeneración se solidificaron con agarosa (SeaKem, 0,5%) o Gelrite (0,2%). Los tejidos se transfirieron a un medio de selección reciente cada tres semanas. La formación del callo ocurrió tras 1-3 semanas de cultivo y los retoños se formaron 3-6 semanas después. Estos retoños se transfirieron entonces a un BM que contiene BAP (0,01-0,1 mg/l) y carbenicillina (100 mg/l) para alargamiento y se hicieron arraigar más tarde en BM con ácido indolbutílico (IBA, 0,1 mg/l).
Ejemplo 5 Determinación de la Transformación de la Planta
Cada planta regenerada que sobrevivió en el medio de selección se ensayó para determinar para determinar si de hecho era transgénica, mediante al menos uno de los siguientes ensayos biológicos y moleculares.
a. Ensayo del disco de hoja
La presencia y expresión de un gen se puede determinar mediante un ensayo de la actividad de la proteína que es codificada por el gen. El ensayo del disco de hoja es un ensayo biológico que detecta la actividad del gen marcador seleccionable, HPT (que confiere resistencia frente a higromicina al tejido transformado), midiendo el crecimiento del tejido en presencia de higromicina. Puesto que tanto el gen HPT como el gen desaturasa de levadura se transfieren juntos en una sola pieza de ADN, la presencia del gen HPT indica que también está presente el gen desaturasa de levadura en el tejido ensayado, como se confirma separadamente por análisis de PCR (véase a continuación).
Se cultivaron pequeñas secciones de hojas (2-3 mm cuadrados), obtenidas de retoños que se hicieron crecer en el medio de selección, en BM que contenía BAP (4 mg/l), NAA (0,5 mg/l) e higromicina (10 mg/l), durante 3-4 semanas. Se determinó que aquellas secciones de hojas que permanecían verdes, y producían callos, raíces, o retoños, se originan a partir de plantas transgénicas. El tejido no transformado (o "escapes") se puso marrón y murió.
b. Reacción en cadena de polimerasa: ADN
La presencia de un gen se puede determinar ensayando la presencia de su ADN en una muestra de tejido. Dos de tales métodos de ensayo incluyen un ensayo de reacción en cadena de polimerasa (PCR) y un ensayo Southern.
Se utilizó un ensayo en cadena de polimerasa (PCR) para analizar cantidades muy pequeñas de ADN para determinar la presencia de dos genes, las regiones codificantes de desaturasa de levadura, y el gen HPT (que confiere resistencia frente a higromicina). Sólo se ensayaron por muestra 100 ng de ADN aislado a partir de tejido de hoja de semilla de colza, esencialmente según se ha descrito (en Current Protocols in Molecular Biology (1987), editado por Ausubel, RM et al; Greene Publishing Associates & Wiley-Interscience). Los cebadores que corresonden a las posiciones +543 y +1277 en la secuencia codificante del gen desaturasa de levadura dieron como resultado la síntesis de un fragmento de ADN que apareció como una banda de 751 pb en aquellas plantas que contenían el gen. De manera similar, los cebadores para secciones específicas del gen HPT dieron como resultado la síntesis de un fragmento de ADN en aquellas plantas que contenían el gen HPT.
c. Análisis Southern
Un análisis Southern detecta la presencia de una secuencia específica de ADN en una muestra mediante hibridación de una sonda marcada para esa secuencia en el ADN de la muestra. Para el análisis, se requiere mucho más ADN que el necesario para un ensayo de PCR (véase anteriormente). El número de copias del gen desaturasa de levadura transferido a las plantas de semilla de colza transformadas también se puede determinar a partir del análisis Southern.
Se digirieron con HindIII 10 \mug de ADN por muestra aislada a partir de tejido de semilla de colza, y se sometió a análisis Southern esencialmente como se ha descrito (Current Protocols in Molecular Biology (1987), editado por Ausubel, RM et al; Greene Publishing Associates & Wiley-Interscience). Se marcó un doblete EcoR1 de 402 pb y 422 pb, procedente de la secuencia codificante del gen desaturasa de levadura, mediante el procedimiento de hexámero aleatorio según las instrucciones del fabricante (United States Biochemical), y se usó como una sonda.
Ejemplo 6 Expresión de delta-9 desaturasa de levadura en tejido de semilla
La expresión del delta-9 desaturasa de levadura en tejido de semillas dio como resultado la transcripción del ADN a ARNm; el ARNm se traduce a su vez en la proteína. Finalmente, la proteína activa desatura ácidos grasos saturados. De este modo, la determinación de la expresión del gen delta-9 desaturasa de levadura en tejido de semillas se puede determinar ensayando la presencia de ARNm, de la proteína, o de una composición de ácido graso alterado en el aceite de semilla.
a. Reacción en cadena de polimerasa: ARNm
La expresión del gen desaturasa de levadura se determina al nivel de transcripción detectando la presencia del ARNm de desaturasa. Esto se logra mediante ensayo de PCR y transcripción inversa ligada, modificado a partir de Frohman et al (1988; PNAS (USA) 85: 8998 - 9002), en el que se analizan pequeñas cantidades de tejido en busca de la presencia de transcriptos de ARN a partir del gen desaturasa.
b. Análisis Western
Un análisis Western detecta la presencia de una proteína uniendo la proteína, tras separación mediante electroforesis en gel, a un anticuerpo marcado. De este modo, este método detecta la expresión de un gen al nivel de traducción, o al nivel de la proteína. Es preferible analizar el tejido cuando se espera el nivel de expresión más alto del gen, por ejemplo durante la acumulación de aceite durante el desarrollo de la semilla.
Las semillas procedentes de plantas transgénicas se recogen a diversos tiempos tras la polinización. Las muestras proteínicas se preparan de conjuntos de 10 semillas para cada planta homogenizando en tampón de gel de SDS (50 mM Tris-HCl, pH 6,8, 1% de SDS, 2 mN de DTT y 2 mM de EDTA). Los homogenados se aclaran haciéndolos girar en una microcentrífuga durante cinco minutos. Las proteínas en las fracciones sobrenadantes se separan mediante SDS-PAGE al 10% (Laemmli, UK (1970) Nature 227; 680-685), se transfirieron a una membrana de nitrocelulosa (Towbin, H et al. (1979) Proc. Natl. Acd. Sci. USA 76: 4350- 4354) y se hicieron reaccionar secuencialmente primero con antisuero policlonal de conejo elevado a un péptido de desaturasa de levadura, y entonces con IgG conjugada con enzima (bien fosfatasa alcalina o bien peroxidasa de rábano picante) anticonejo. Los anticuerpo conjugados se visualizaron mediante tinción de la actividad según el protocolo o protocolos del fabricante.
c.Análisis de ácidos grasos
La composición de ácidos grasos de la semilla de colza se determinó a continuación para análisis de "media semilla", análisis de "semilla única/completa", o análisis del "conjunto de las semillas" (por ejemplo, el procedimiento de metilación de ácidos grasos es una modificación del dado a conocer por Craig, BM y Murty, NL, 1959, J Amer Oil Chem Soc 36: 549-552).
Para los análisis de "media semilla", se retiró y analizó una porción de tejido de cotiledón procedente del embrión; el resto de la semilla se guardó entonces, y se pudo germinar si se desea.
1. La muestra de tejido de cotiledón se colocó en un vial de 2 ml para toma de muestras automatizada.
2. Se añadió n-heptano (500 \mul), y el aceite se extrajo durante 16 horas por incubación a temperatura ambiente.
3. Se añadió metóxido sódico en metanol (50 \mul de 0,5 M), y los ácidos grasos se transesterificaron durante 60 minutos a temperatura ambiente.
4. Entonces se añadió agua destilada (20 \mul), y el vial se tapó con un tapón superior de bordes fruncidos forrado con TPFE. La muestra estaba de este modo lista para ser procesada a través del cromatógrafo gas-líquido.
Para los análisis de "semilla única" se colocó una sola semilla en un vial de 2 ml para toma de muestras automatizada, y se trituró con una varilla de vidrio.
1. Se añadió n-heptano (1,0 ml), y el aceite se extrajo durante 16 horas por incubación a temperatura ambiente.
2. Se añadió n-heptano (3,0 ml), y el aceite se extrajo durante una hora por incubación a temperatura ambiente.
3. Se añadió metóxido sódico en metanol (50 \mul de 0,5 N), el vial se sometió a un vórtex, y los ácidos grasos se transesterificaron durante 60 minutos a temperatura ambiente.
4. Se añadió agua destilada (20 \mul), el vial se sometió a vórtex y entonces se tapó con un tapón superior de bordes fruncidos forrado con TPFE. La muestra estaba de este modo lista para ser procesada a través del cromatógrafo gas-líquido.
Para los análisis del "conjunto de semillas", se seleccionaron seis semillas maduras que eran de color negro y estaban bien rellenas.
1. Las semillas se colocaron en un tubo de ensayo de vidrio desechable de 16 x 100 mm.
2. Se añadió n-heptano (1,5 ml), y las semillas se molieron con un homogeneizador de tejidos. El aceite se extrajo durante un minuto.
3. Se añadió metóxido sódico en metanol (500 \mul de 0,5 N), el tubo se sometió a un vórtex, y la muestra se incubó durante 5 minutos.
4. Se añadió agua destilada (7,0 ml), y el tubo se sometió a un vórtex.
5. Una porción de la capa orgánica (1,5 ml) se transfirió a un vial de 2,0 ml para toma de muestras automatizada, y el vial se tapó entonces con un tapón superior de bordes fruncidos forrado con TPFE. La muestra estaba de este modo lista para ser procesada a través del cromatógrafo gas-líquido.
Los análisis de GLC se realizaron con un cromatógrafo de gas líquido Hewlett Packard 5890 equipado con un detector de ionización por llama y un integrador ChromStation. Se usó un aparato de toma de muestras automatizada Hewlett Packard 7376 para extraer una porción de 1 \mul de ácidos grasos libres metilados de la fase orgánica superior en el vial, y para inyectarlo en el GLC. La columna usada fue una columna capilar de sílice fundida DB-23 (con un grosor de película de 0,24 micrómetros, y dimensiones de la columna de 0,25 mm de diámetro interno x 30 mm de longitud.
Las condiciones de funcionamiento para el análisis de GLC incluyeron una temperatura del inyector de 250ºC, y una temperatura del detector de 300ºC. El gas portador fue helio que fluye a 1,1 cm^{3}/minuto a través de la columna, y a 30 cm^{3}/minuto a través del detector. Cada experimento cromatográfico comenzó a 180ºC durante 8 minutos; la temperatura se incrementó entonces en 5ºC por minuto hasta 220ºC, y entonces se mantuvo a 220ºC durante 4 minutos. Con este programa, eluyeron todos los principales ésteres metílicos de ácidos grasos esperados para aceites vegetales (es decir, palmitato, estearato, oleato, linoleato y linolenato); además, se separaron entre sí los dos isómeros del éster metílico del ácido graso de 18 carbonos monoinsaturado, oleato y cis-vaccenato. La proporción de cada ácido graso presente se expresó como el porcentaje en peso con relación al contenido de ácido graso total de la semilla.
Ejemplo 7 Plantas transformadas
La variedad Profit de B. napus de semilla de colza es una semilla de colza de primavera de tipo Canola con un alto contenido en oleato en el aceite de semilla. El análisis de cincuenta semillas individuales dio como resultado el siguiente perfil de ácidos grasos:
TABLA 1
a. Perfil de ácidos grasos de B. napus, variedad de cultivo Profit
Ácido graso Media Mínimo Máximo
C16:0 4,05 3,20 7,40
C16:1 0,18 0,00 0,50
C18:0 2,07 1,20 3,80
C18:1D9 63,78 51,90 72,10
C18:1D11 2,72 1,80 5,90
C18:2 16,76 11,50 21,80
C18:3 6,82 3,60 11,20
C20:0 0,73 0,50 1,30
C20:1 1,24 0,90 1,50
C22:0 0,38 0,00 0,80
C24:0 0,24 0,00 0,90
C24:1 0,21 0,00 0,40
b. Perfil de ácidos grasos de B. napus regenerado, variedad de cultivo Profit
Ácido graso Media Mínimo Máximo
C16:0 5,28 4,30 6,90
C16:1 0,26 0,10 0,50
C18:0 1,78 1,20 3,60
C18:1D9 51,51 40,70 63,70
C18:1D11 2,39 1,40 3,70
C18:2 25,35 16,30 35,00
C18:3 9,68 4,80 18,20
C20:0 0,66 0,40 1,30
C20:1 1,08 0,80 1,40
C22:0 0,40 0,20 0,90
C24:0 0,30 0,00 0,70
C24:1 0,29 0,00 0,70
El tejido obtenido a partir de la variedad Profit se transformó con cada uno de los cuatro vectores como se describe anteriormente. Las plantas transformadas enraizadas se transfirieron a tierra cuando los retoños tenían una longitud de 2 cm o más. Las plantas se mantuvieron en una cámara de crecimiento Conviron a 20ºC con 16 horas de luz a 15ºC durante 3-4 semanas; entonces se movieron al invernadero, donde se hicieron crecer hasta madurez. Con la floración, las plantas se autopolinizaron, y se recogieron semillas maduras.
El contenido en ácidos grasos del aceite resultante en las semillas maduras se analiza mediante análisis de la semilla completa, o mediante análisis de media semilla en el que se analiza una porción del cotiledón mientras se guarda el resto de la semilla y se puede plantar.
\newpage
Como alternativa, a fin de detectar la presencia de la proteína delta-9 desaturasa de levadura en la semilla, se recogieron semillas en desarrollo, y se analizó el ARNm mediante un ensayo de PCR o la proteína se analizó mediante un ensayo Western.
El contenido en ácidos grasos de las semillas obtenidas a partir de tejido de semilla de colza transformado con el tercer vector, pH.PdeltaBOP, que entonces se regeneró y se autopolinizó, contenía una disminución significativa en las proporciones de los ácidos grasos saturados palmitato y estearato, con un aumento concomitante en los niveles de palmitoleato y oleato, cuando se compara con las proporciones observadas en la planta "progenitora" no transformada (véase Tabla 1). En este vector, el gen desaturasa de levadura se coloca bajo control de un promotor de faseolina modificado. La modificación, que consiste en eliminar los primeros 2/3 del promotor, da como resultado una expresión más temprana del gen regulado durante el desarrollo de la semilla. La expresión del gen parece que ocurre durante la acumulación de líquidos, de forma que los ácidos grasos insaturados se desaturan durante el ensamblaje con triglicerol. El aceite vegetal resultante, con niveles muy bajos de ácidos grasos saturados, es un sustituto deseable para aceites vegetales actualmente en el mercado.
El contenido en ácidos grasos de las semillas obtenidas a partir de plantas transformadas con cualquiera de los otros tres vectores, que entonces se regeneran y se autopolinizan, contienen proporciones variables de los ácidos grasos saturados palmitato y estearato, las cuales, sin embargo, son todas iguales o menores que las observadas en la planta "progenitora" no transformada (véase Tabla 1). Estos vectores, que contienen elementos reguladores que causan la expresión génica durante el desarrollo de la semilla, dan como resultado niveles variables de la expresión del gen durante la acumulación de los lípidos.
Las semillas que resultan de plantas transformadas, regeneradas y autopolinizadas, se hacen germinar y entonces se autopolinizan con la floración. Las semillas resultantes se analizan para determinar la estabilidad de los rasgos y la herencia génica.
Ejemplo 8 Transferencia de gen delta-9 desaturasa de levadura en otras Brassica
El gen delta-9 desaturasa de levadura se transfiere a otras Brassica mediante uno de los dos métodos. Uno es transformar directamente otra semilla de colza y mostaza de oleaginosa según se describe anteriormente; y el otro es mover el rasgo a otra semilla de colza y mostaza de oleaginosa mediante técnicas de reproducción clásicas. Las plantas adecuadas para la transformación de plantas (véase anteriormente) son Brassica rapa, Brassica napus, y Brassica junceae. Además, se pueden aparear de forma cruzada en un programa de reproducción.
Esto permite la transferencia del delta-9 desaturasa de levadura a la semilla de colza y mostaza de oleaginosas seleccionada en base a sus perfiles iniciales de ácidos grasos o a sus características agronómicas. En la Tabla 2 se resumen algunos ejemplos de semilla de colza y de mostaza de oleaginosa a los que se transfiere el gen delta-9 desaturasa de levadura.
TABLA 2 Variedades de cultivo de Brassica a las que se transfiere el gen delta-9 desaturasa de levadura
Brassica napus
Canola de Primavera Profit, Excel, Legend, Delta, cepas
patentadas con alto contenido en
oleato/bajo contenido en linoleato
HEAR de Primavera Hero
Canola de Invierno Ceres, Tapidor, Samoris, cepas
patentadas con alto contenido en oleato y
alto contenido en oleato/bajo contenido en
linoleato
Brassica rapa
HEAR de Invierno Bridger, LEI
TABLA 2 (continuación)
Canola de Primavera Parkland, Colt, Horizon, Svalof, cepas
patentas con alto contenido en palmitato,
alto contenido en oleato
Brassica junceae
HEAR de Primavera R500
Tipo de oleaginosa de la India con alto RH30, Puva Bold
contenido en erucato
Tipo de oleaginosa canadiense con bajo ZEM 87-1
contenido en erucato
La presente invención se ha expuesto aquí forzosamente con referencia a ciertos métodos y materiales específicos. La enumeración de estos métodos y materiales fue meramente ilustrativa, y de ningún modo constituye ninguna limitación al alcance de la presente invención. Es de esperar que aquellos expertos en la técnica pueden discernir y practicar variaciones o alternativas a las enseñanzas específicas proporcionadas en este documento, sin apartarse del alcance de la presente invención.

Claims (23)

1. Semilla de planta de cultivo de semillas oleaginosas que comprende un gen delta-9 desaturasa de levadura y medios para expresar dicho gen delta-9 desaturasa de levadura en dicha semilla de planta, en la que dichos medios para expresar comprende un promotor específico de semillas efectivo para provocar la expresión de dicho gen delta-9 desaturasa de levadura en dicha semilla de planta, y en la que la expresión de dicho gen delta-9 desaturasa de levadura da como resultado un aumento en el contenido, en tanto por ciento, de ácido palmitoleico en el aceite de semilla de dicha semilla de planta.
2. Semilla de planta según la reivindicación 1, en la que dicho promotor específico de semillas es un promotor de faseolina.
3. Semilla de planta según las reivindicaciones 1 y 2, en la que dicho promotor específico de semillas es un promotor de faseolina truncado.
4. Semilla de planta según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3, que comprende además una secuencia de terminación para dicho gen delta-9 desaturasa de levadura.
5. Semilla de planta según la reivindicación 4, en la que dicha secuencia de terminación se selecciona de una secuencia de terminación de delta-9 desaturasa de levadura, una secuencia de terminación 3' de faseolina, y una secuencia de terminación 3' de ORF 25.
6. Semilla de planta según la reivindicación 5, en la que dicha secuencia de terminación es una secuencia de terminación de ORF.
7. Semilla de planta según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 6, en la que dicha semilla de planta es una semilla de un género de planta monocotiledónea.
8. Semilla de planta según la reivindicación 7, en la que dicho género de planta monocotiledónea es sorgo.
9. Semilla de planta según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 6, en la que dicha semilla de planta es una semilla de un género de planta dicotiledónea.
10. Semilla de planta según la reivindicación 9, en la que dicho género de planta dicotiledónea se selecciona de Brassica, Helianthus, Carthamus, Sesamum, Glicine, Arachis, Gossypium, Lesquerella y Vernonia.
11. Semilla de planta según la reivindicación 10, en la que dicho género de planta dicotiledónea es Brassica.
12. Semilla de planta según la reivindicación 11, en la que dicha semilla de planta es una semilla seleccionada de Brassica rapa y Brassica napus.
13. Método para modificar el contenido en ácidos grasos del aceite de semilla de una semilla de planta de cultivo de semillas oleaginosas, comprendiendo dicho método la etapa de transformar la semilla de planta de cultivo de semillas oleaginosas para expresar un gen delta-9 desaturasa de levadura, en el que dicha modificación comprende aumentar el contenido en tanto por ciento de ácido palmitoleico en el aceite de semilla de dicha semilla de planta, y en el que dicha etapa de transformación comprende añadir, al ADN nativo de dicha semilla de planta, ADN exógeno, comprendiendo dicho ADN exógeno un gen delta-9 desaturasa de levadura y un promotor específico de semillas.
14. Método según la reivindicación 13, en el que dicha etapa de transformación se lleva a cabo usando una mediación de la transformación seleccionada de Agrobacterium, electroporación, polietilenglicol (PEG), fibra de carburo de silicio, pistola de partículas, e inyección directa.
15. Método según las reivindicaciones 13 y 14, que comprende además construir un vector que contiene dicho gen delta-9 desaturasa de levadura y dicho promotor, colocar dicho vector en una cepa seleccionada de Agrobacterium, y tratar células seleccionadas de la planta con dicho Agrobacterium en condiciones suficientes para dar como resultado la transferencia de al menos algunos de dichos vectores desde dicho Agrobacterium a dichas células de la planta, con lo que dicho gen delta-9 desaturasa de levadura se expresa en dichas células de la planta.
16. Método según una cualquiera de las reivindicaciones 13 a 15, en el que dicha modificación comprende además reducir el contenido en tanto por ciento de ácido esteárico en el aceite de semilla de dicha semilla de planta.
17. Método según una cualquiera de las reivindicaciones 13 a 16, en el que dicha semilla de planta es una semilla de un género de planta monocotiledónea.
18. Método según la reivindicación 17, en el que dicho género de planta monocotiledónea es Sorgom.
\newpage
19. Método según una cualquiera de las reivindicaciones 13 a 16, en el que dicha semilla de planta es una semilla de un género de planta dicotiledónea.
20. Método según la reivindicación 19, en el que dicho género de planta dicotiledónea se selecciona de Brassica, Helianthus, Carthamus, Sesamum, Glicine, Arachis, Gossypium, Lesquerella y Vernonia.
21. Método según la reivindicación 20, en el que dicho género de planta dicotiledónea es Brassica.
22. Método según la reivindicación 21, en el que además dicha semilla de planta es una semilla seleccionada de Brassica rapa y Brassica napus.
23. Planta de semillas oleaginosas obtenible a partir de la semilla de planta según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 12, en la que las semillas de dicha planta comprenden un gen delta-9 desaturasa de levadura y medios para expresar dicho gen delta-9 desaturasa de levadura en dicha semilla de planta, en la que dichos medios para expresar comprende un promotor específico de semillas efectivo para provocar la expresión de dicho gen delta-9 desaturasa de levadura en dicha semilla de planta, y en la que la expresión de dicho gen delta-9 desaturasa de levadura da como resultado un aumento en el contenido, en tanto por ciento, de ácido palmitoleico en el aceite de semilla de dicha planta.
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