EA005217B1 - Липополисахарид бактерий e. coli штамма dsm 6601 и способ его получения - Google Patents

Липополисахарид бактерий e. coli штамма dsm 6601 и способ его получения Download PDF

Info

Publication number
EA005217B1
EA005217B1 EA200200997A EA200200997A EA005217B1 EA 005217 B1 EA005217 B1 EA 005217B1 EA 200200997 A EA200200997 A EA 200200997A EA 200200997 A EA200200997 A EA 200200997A EA 005217 B1 EA005217 B1 EA 005217B1
Authority
EA
Eurasian Patent Office
Prior art keywords
oligosaccharide
nucleus
strain
lipoid
coli strain
Prior art date
Application number
EA200200997A
Other languages
English (en)
Other versions
EA200200997A1 (ru
Inventor
Ханс Пропперт
Юрген Малинка
Юрген Шульце
Ульрих Зонненборн
Ульрих Зарингер
Артур Ульмер
Эрнст Теодор Ритшель
Original Assignee
Фарма-Централе Гмбх
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Фарма-Централе Гмбх filed Critical Фарма-Централе Гмбх
Publication of EA200200997A1 publication Critical patent/EA200200997A1/ru
Publication of EA005217B1 publication Critical patent/EA005217B1/ru

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12PFERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P19/00Preparation of compounds containing saccharide radicals
    • C12P19/04Polysaccharides, i.e. compounds containing more than five saccharide radicals attached to each other by glycosidic bonds
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P37/00Drugs for immunological or allergic disorders
    • A61P37/02Immunomodulators
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C08ORGANIC MACROMOLECULAR COMPOUNDS; THEIR PREPARATION OR CHEMICAL WORKING-UP; COMPOSITIONS BASED THEREON
    • C08BPOLYSACCHARIDES; DERIVATIVES THEREOF
    • C08B37/00Preparation of polysaccharides not provided for in groups C08B1/00 - C08B35/00; Derivatives thereof
    • YGENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02ATECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
    • Y02A50/00TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE in human health protection, e.g. against extreme weather
    • Y02A50/30Against vector-borne diseases, e.g. mosquito-borne, fly-borne, tick-borne or waterborne diseases whose impact is exacerbated by climate change

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Materials Engineering (AREA)
  • Polymers & Plastics (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Polysaccharides And Polysaccharide Derivatives (AREA)
  • Saccharide Compounds (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)

Abstract

Изобретение касается липополисахарида (LPS) из Е. coli DSM 6601. Этот LPS отличается от известных LPS из Е. coli, в частности, фосфорилированным остатком сахара ядра и степенью полимеризации О-цепи. Липоид А соответствует структурно и биологически обычному для E.coli типу. Описанный LPS подходит не только для идентификации несущих его коли-штаммов, но и придает им также пониженную патогенность при сохранении своего иммуномодулирующего влияния.

Description

Изобретение касается новых липополисахаридов из Е.сой.
Под эндотоксинами понимают бактериальные структурные компоненты, которые, в отличие от экзотоксинов, не выделяются живыми бактериями, но главным образом освобождаются после аутолиза. В случае так называемых классических эндотоксинов речь идет о термостабильных липополисахаридах (далее ЬР8) из наружных клеточных мембран грамотрицательных бактерий. ЬР8 состоят из так называемого липоида А, олигосахарида ядра, а также специфической О-цепи, причем липоид А отвечает за токсичное действие ЬР8.
Эндотоксины стимулируют в макроорганизме продукцию медиаторов иммунной ситемы, например интерлейкина 1, (1Ь-1) и фактора некроза опухоли (ΤΝΕα).
В отношении состава эндотоксинов бактерий кишечной группы и, в частности, Е.соН. уже проведен ряд исследований, причем было установлено, что 8/В-мутанты, как правило, содержат только повторения, то есть повторяющееся звено О-цепи (ср. фиг. 1). Исходят из того, что в этих случаях ген, который кодирует фермент полимеризации О-цепи, является дефектным и поэтому будет передавать только повторяющееся звено на олигосахарид ядра. ЬР8структуры подобного типа, но отличной структуры часто находятся также в патогенных для человека микроорганизмах, например №188епа, У|Ьпо, Сарту1оЬас1ет, НейсоЬас1ег и т.д. Эти микроорганизмы имеют ЬР8, которые дают им возможность лишать хозяина иммунной защиты путем особой молекулярной мимикрии и т.п., благодаря наличию сиалиновых кислот и содержащих сиалиновые кислоты олигосахаридов, подобных гликопротеинам и гликолипидам млекопитающих. Для Е.сой Ό8Μ 6601 был установлен О6-Серотип. Эта структура исследована и опубликована Р.ЕЛапккоп е! а1., СатЬойубт. Век. 131 (1984) 277-283. Структура соответствует формуле, представленной на фиг.
2.
Различные исследовательские группы изучали липоид А колибактерий. При этом было установлено, что структура липоида А, как правило, существует в гексаацильной форме и совпадает для всех серотипов из Е.сой (фиг. 3). Структура гексаацильной связи была опубликована в 1984 г. Τΐι. В1е!ксйе1 е! а1., 81гпс1пге аиб сопПгтайоп оГ !йе йр1б А сотропеп! оГ йроро1укассйайбек; НапбЬоок оГ Епбо!охшк (Ргос!ог, В., еб.), Уо1.1, СйетГйу оГ Епбо!охш (Е. Τ11. В1е!ксйе1, еб.), Е1кеу1ег, Атк!егбат (1984), рр. 187-220 и соответствует изображению на фиг. 3.
Специфическая О-цепь и липоид А связаны друг с другом через олигосахарид ядра. До настоящего времени известны пять различных олигосахаридов ядра у Е.сой. Здесь также производится ссылка на О.Но1к! е! а1., Сйетюа1 к!гис!ше оГ !йе соге геДоп оГ йроро1укассйапбе, в: Вас!епа1 Епбо!ох1с Ь1роро1укассйапбек, Уо1.1, Моткоп Ό.8. апб Вуап, ЬЬ (ебк.), Воса Ва!оп, РЬ, И8А (1992) рр. 135-170 (ср. фиг. 4).
При исследованиях ЬР8 из штамма Ό8Μ 6601 Е.сой было обнаружено, что липоид А в структуре гексаацильной формы также соответствует липоиду А, описанному для Е. сой.
Исследования в отношении высвобождения 1Ь-1 и ΤΝΕα в моноцитах человека подтверждают, что липоид А обладает такой же активностью и поэтому соответствует с высокой вероятностью известной структуре липоида А Е.сой (ср. фиг. 5, 6). Это предположение подтверждалось химическими анализами.
В структуре специфического О-антигена Ό8Μ 6601 Е. сой поражает тот факт, что очевидно в цепи регулярно существует только единственное „повторяющееся звено (ср. фиг. 1). Отсюда можно заключить, что речь идет о 8/В-мутанте у штамма Ό8Μ 6601, что является чрезвычайно необычным для человеческого изолята. Однако, как показывают серологические анализы, структура этого повторяющегося звена соответствует основному образцу О-цепи Е.сой О6.
Область ядра у штамма Ό8Μ 6601 соответствует известной В1-структуре. Структурные особенности состоят в том, что аналитически было установлено 8 фосфатных остатков на молекулу ЬР8, причем, как правило, на липоид А выпадают только 2 фосфатных остатка. В дальнейшем было обнаружено нестехиометрическое содержание пирофосфоэтаноламина.
Таким образом, обобщение позволяет установить, что ЬР8 штамма Ό8Μ 6601 значительно отличается от до сих пор известного ЬР8 из Е.сой, в частности, в фосфорилированной сахаридной части ядра и по степени полимеризации О-цепи. Липоид А структурно и биологически соответствует обычному для Е.сой типу, что подчеркивает роль этого вещества в биологической активности. Описанный ЬР8 предназначен не только для идентификации несущего его колиштамма, но и придает ему также пониженную патогенность при сохранении иммуномодулирующего действия. Тот факт, что О-цепь имеет β-гликозидную связь вместо αгликозидной, впервые стало возможным однозначно увидеть на примере 8/В-мутанта Ό8Μ 6601 для Е.сой.
В случае липополисахарида (ЬР8) из Е. сой Ό8Μ 6601 речь идет о новой гладкошероховатой (8/В)-структуре, которая, с одной стороны, состоит из до сих пор известных частей структур (О-специфическая цепь, олигосахарид ядра и липоид А), с другой стороны, впервые и полностью структурно охарактеризована в представленной здесь комплексной форме (ср. фиг. 7). О-специфическая цепь, состоящая только из единственного повторения (по вторяющееся звено) серотипа О6, имеет βгликозидную связь с олигосахаридом ядра и, таким образом, иначе связана в пределах О-цепи (α-гликозидно). Олигосахарид ядра включает К1-структуру, химическое состояние которой подтверждается серологическими исследованиями с К1-специфическими антителами. Компонент липоида А обладает характерной определенной для липоида А Е. сой химической конституцией.
ЬР8 из штамма Ό8Μ 6601 Е.соН обладает удивительной гомогенностью. Гетерогенность может быть установлена только в отношении заместителей фосфатов (РР и Р-Е1и νδ. Р и Р), что впервые описывается в этой форме. Посредством комплексных ΝΜΚ-анализов можно четко определить Р-Е1и-заместитель в олигосахариде ядра К1-олигосахарида ядра в позиции 2 второй гептозы (Нер).
Окончательная структура ЬР8 штамма Ό8Μ 6601 представлена на фиг. 7.
В дальнейшем изобретение более подробно поясняется с помощью примеров:
Пример 1. Получение ЬР8
ЬР8 получали из промытой и высушенной бактериальной массы после модифицированной экстракции фенол/вода; как указано О.Аез1рйа1 е! а1., Вас(ег1а1 ЫророРъассйапбех. Ехбасйои \νίΐ1ι Рйепо1-Аа!ет аиб Еибйет Аррйсабопз о£ 1йе Ртосебите, Ме111. СагЬойубг. Сйет., Уо1. V (1965) рр.83-91.
г лиофилизированных бактерий, которые перед этим дважды промывали дистиллированной водой, экстрагировали по Аез1рйа1 и 1апи в соответствии с модифицированной инструкцией. Модификация состояла в дополнительной ферментативной обработке (ДНКазой, РНКазой, протеиназой К) водного экстракта, которая служит для удаления случайных чужеродных белков и ДНК/РНК-составных частей. Далее к водной фазе (около 1,2 л) при комнатной температуре примешивали 20 мг ДНКазы (рибонуклеаза А, бычья поджелудочная железа, 81дта) и 20 мг ДНКазы (ДНКаза I, бычья поджелудочная железа, степень II, 8фта), смесь перемешивали при комнатной температуре в течение 30 ч. Далее добавляли 20 мг протеиназы К (Ттйпасйшт а1Ьит, Воейппдег, Мапп11еш1), затем перемешивали 12 ч. Полученную суспензию трижды подвергали диализизу через 15 л дистиллированной воды при 4°С в течение 24 ч и затем лиофилизировали. Ферментсодержащий экстракт промывали в дистиллированной воде до тех пор, пока не была достигнута окончательная концентрация около 50 мг/мл. Суспензию три раза центрифугировали с ультразвуком в холоде (155.000 х г, 4°С, 4 ч). Осадок (ЬР8) помещали в 150 мл дистиллированной воды и еще один раз подвергали диализу через воду в течение трёх дней и после этого лиофилизировали (выход ЬР8: 1,45 г, 3.1% м/м).
Пример 2. Анализ ЬР8 из штамма Ό8Μ 6601 Е.соН.
Гексозамин (НехХ) (обозначаемый здесь как глюкозамин + галактозамин, О1сХ+ОаЬХ) определяли по модифицированному тесту Моргана-Эльсона (8!готшдег, ЕЬ, Рагк,
ЕТ.Тйотрзоп. К.Е. 1. Вю1. Сйет. 234, 3263-3268 (в 1959)), и кроме того также посредством НРЬ8 (Р1СО-ТАС, АаГетз). В противоположность тесту Моргана-Эльсона при этом методе анализа можно не только определить количественно и по-отдельности ΟΚΝ и ОаШ, но также можно параллельно установить еще и наличие С1сХ фосфата, 2-этаноламина (Е!п) и 2-этаноламинфосфата (Е!п-Р), которые часто встречаются в ЬР8. Газожидкостную хроматографию (ОС) проводили на νηπηη 3700 ОС или Не\\1е11 Раскагб (НР 5890 серия II) газовом хроматографе на капиллярной колонке (заполненной диоксидом кремния 8РВ-5®, 30 м, 8ире1со). Комбинированную газожидкостную хроматографию/массспектрометрию (СС-Μδ) проводили в массспектрометре (НР модель 5989), который оснащен НР-1 капиллярной колонкой (30 м, Не\\1еО Раскагб). ОС- и соответственно СС-Μδ анализы применяли для определения нейтрального сахара (О1с, Оа1, Нер, Μаη) в качестве их алдитолацетатов (8а^атбекет, 1.8., 81опеткет, ЕНДеапез,
А. Апа1. Сйет. 37, 1602-1604 (в 1967)), а также для качественного и количественного определения жирных кислот в качестве производных сложных эфиров жирных кислот и метилового эфира после сильного метанолиза (2М НО^еОН, 120°С, 16 ч) (Аойеп^еЬет, Н.-А. апб К1е!зсйе1, Е.Тй., Апа1уз1з о£ 11роро1узассйапбе (йр1б А) £айу ас1бз, 1. Μ^с^оЬ^о1. Μеίй. 11, (1990) 195-211) и экстракции с хлороформом. Оба ОС-метода анализа начинали при 150°С (изотерма для 3 мин) и посредством линейного температурного градиента повышали от 5°С/мин до 320°С. Фосфат определяли по Ьо^ту е! а1. (Ьо^ту, О.Н., КоЬетб, Ν.Κ., Ьешег, Κ.Υ., Аи, Μ.ΚΕ. Еатг, А.Ь, 1. Вю1. Сйет. 207, 1-17 (1954)) и 2-кето-3-дезокси-О-маннооктулозоновую кислоту (Кбо) посредством теста тиобарбитуровой кислоты (Аа^аνбека^, МС. & 8аз1ате,
1..1)., 1. Вю1. Сйет. 234, 1945-1950 (1959)).
Получение и очистка свободного липоида А и олигосахарида ядра
ЬР8 (258,8 мг) суспендировали в 25 мл 0,1 М №ОАс/НОАс (рН 4.4) и подвергали мягкому кислотному гидролизу при 100°С в течение 1 ч. Затем экстрагировали три раза липофильную часть (липоид А) из гидролизата с 25 мл хлороформа (выход 23,2 мг). Далее липоид А из органической фазы очищали с помощью препаративной слоевой хроматографии (Р8С) (2 мм Р8С силикагеля 60 пластин, ЕМетск, Оаатз1аб!), хроматографировали с хлороформом-метанолом-водой 100:75:15 (объем/объем/объем) и вы деляли погружением в дистилированную воду. Таким образом получали 6 фракций, из которых основная фракция (К|=0.4) представляла собой очищенный дифосфорилированный гексаациллипоид А (ОРНБА-Ес66О|). Очищенный ИРНЬАЕс6601 (выход 2,06 мг) растворяли в хлороформметаноле 8:2 (объем/объем) и обрабатывали перед ΜΆΤΌΙ-ΤΘΕ-Μ8 с ионообменником (АтЬег1йе ΙΚΆ 120, Н+-форма). Аликвоту (250 г) очищенного ПРНЬА-Ес6601 использовали для биологических экспериментов.
Водную фазу экстракции хлороформа лиофилизировали (выход: 272 мг) и далее очищали олигосахарид с помощью ΤδΚ-колонки [3,5 х 90 см, Τ8Κ Н^-40(8), Е.Мегск] в пиридине - уксусной кислоте - воде 8:20:2000 (объем/объем/объем). Отдельные фракции олигосахаридов (пул А, В, С и И) анализировали с помощью ОС-М8 и ΝΜΒ-спектроскопии. Далее очищали основные фракции (пул А, #28-41; 49,05 мг), которые содержали как составные части сахара О-цепи (Мап, ОаШас), так и такие же части олигосахарида ядра (Нер, Кбо). Другие фракции содержали моносахариды, не исследованные ближе артефакты Ибо (ангидро- и лактон) и, наконец, соль. В основной фракции Τ8Κразделения все составные части олигосахарида ядра (Ибо, Оа1, Нер) и О-цепи (Мап, ОаШАс) были обнаружены не только при ОС-М8анализе, но и при NΜΒ-анализе. Поэтому обработку продолжали далее.
Кроме того, в первую очередь проверяли, подходит ли для очистки олигосахарида до гомогенности аналитическая анионно-обменная хроматография при высоком давлении НРАЕС (й1дй ргеккиге ашоп ехсйапде сйгота!одгарйу). Для этого применяли специфическую НРЬСметодику для анализа комплексных структур сахара (ΌΙΟΝΕΧ-система) с аналитической СагЬоРас РА1 колонкой; (4,6 мм х 250 мм) и линейными градиентами соли (5 мин при 0, затем при 50 мин на 0,52 №ОАс) при скорости тока 1 мл/мин. Элюат определяли с помощью пульсамперометрического детектора (РАО) на восстановительном эквиваленте (молекула сахара). Таким образом получали четыре олигосахаридные фракции, которые далее очищали с помощью семипрепаративной НРАЕС аналогичным способом.
Семипрепаративную НРАЕС осуществляли с помощью СагЬоРас РА1 колонки [(9 мм х 250 мм) Эюпех система] с такими же градиентами соли, как при аналитической НРАЕС (5 мин при 0, затем 50 мин на 0,5М №1ОАс) и скорости тока 4 мл/мин. Нанесение олигосахарида (42 мг; пул А из ΤδΚ-колонки) при семипрепаративной НРАЕС осуществляли в двух аналогичных НРАЕС-направлениях. Элюат собирали в фракции каждую минуту, и их по отдельности исследовали с помощью аналитической НРАЕС. Таким образом, с помощью семипрепаративной НРАЕС получали две основных фракции (фрак ция I, время удержания 1К ~ 12 мин и фракция II, 1К ~ 15 мин). Обе НРАЕС-фракции должны были обессоливать перед МАТП1-ТОЕ-М8 и NΜΒанализом с помощью Ο-10-колонки (2,5 х 120 см) (выход: фракция I 4,68 мг; фракция II 4,39 мг).
Усиленная матрицей лазерная десорбция/ионизация времяпролетной (МАЬПЕТОЕ) масс-спектрометрии
Усиленную матрицей лазерную десорбцию/ионизацию времяпролетной (МАЬПЕТОЕ) масс-спектрометрии проводили в Вгикег-Ке11ехп времяпролетном спектрометре (Вгикег-Егапхеп Апа1убк, Вгетеп), а также в линейной конфигурации и в отрицательном режиме при ускоряющем напряжении 20 кВ и запаздывающей экстракции ионов. Пробы вначале растворяли в хлороформе (липоид А) или дистиллированной воде (олигосахаридные фракции) в концентрации 10 мкг/мкл, и 2 мкл их аликвоты растворяли в 2 мкл раствора матрицы, состоящего из 0,5 м 2,4,6-тригидроксиацетофенона (А1бпсй. 81ешйепп) в метаноле. Аликвоты (0,5 мкл) этой смеси наносили на металлический держатель и высушивали феном.
NΜΚ.-спектроскопия
Одномерный (1Ό) 1Н и 31РЖМК- и двухмерный (2Ό) NΜΒ-спектры получали на Вгикег Ауапсе ΌΚΧ-600 спектрометре (Вгикег, Кйеш81ебеп) и 13С NΜΒ-спектры на Вгикег АМХ-360спектрометре при 300 К в 2Н2О. Перед каждым измерением пробы дважды лиофилизировали с дейтеризированной водой (2Н2О). В качестве внешнего контрольного сигнала использовали ацетон (8Н 2,225 частей на миллион, 8С 31,45 частей на миллион) или 85% Н3РО4 (δρ 0 частей на миллион). Для получения NΜК-данных использовали стандартное программное обеспечение Вгикег (X\VINNΜК. 1.3). Продолжительность перемешивания для ТОС8У (1о(а1 согге1а1еб кресйоксору - общей коррелированной спектроскопии) и соответственно ΝΟΕ8Υ (Νυс1еаг Оуегйаикег епйапсетеШ кресйоксору ядерной супер-увеличенной спектроскопии) составляла 100 и соответственно 500 мс.
Серологические анализы
Серологические анализы проводили как вестерн-блоттинг анализы, которые разрабатывали с тремя различными антителами.
1. Поликлональную анти-О6-антисыворотку (кролик) получали от штамма Э8М 6601 Е. сой (серотип О6:К5:Н1) в Институте гигиены в Гамбурге (профессор Бокемюль).
2. Поликлональную анти-Е.сой К1антисыворотку (кролик, внутреннее обозначение: Κ299/658) получали иммунизацией с мутантами шероховатой формы, один из которых имел КГ-ядро (анти-КГ).
3. Использовали моноклональное антитело (^N1-222-5, внутреннее обозначение Е 167), которое широко перекрестно реагирует против всех олигосахаридов ядра Е. сой с минимальной структурой (>Кб).
Таблица. Анализ компонентов, экстрагированных из Е. со11 ЬР8 из штамма ΌδΜ 6601
Компонент
Углеводы б1с1Мь
Са1Ы Нех№ КРо Мал 6а1 61с ЦО-Нер Полярные группы Р
ЕМ-Р головные
Количество компонента нмоль/мг (моль/1_Р8)а 1. Анализ
283 (1.8)
139 (0.9)
591 (3.8)
248 (1.6)
321 (2.1)
474 (3.0) 1069 (6.9)
566 (3.6)
2. Анализ п.Ь.
п.Ь.
589 (2.9)
242 (1.2)
383 (1.9)
557 (2.8)
1291 (6.4)
442 (2.2)
Жирные кислоты
12:0
14:0 14:0(3-ОН) 16:0
1188 (7.6) (0.5)
1146 (5.7) П.Ь.
130 (0.8)
156 (1.0)
460 (3.0) следы
162 (0.8)
201 (1.0)
504 (2.5) следы
Молярное соотношение отдельных компонентов (в скобках) было стандартным благодаря наличию СаШАс и С1сИАс в О-цепи, при значении миристиновой кислоты (14:0) (1.0 моль 14:0/моль ЬР8).
Ь С1сИ определено с помощью анализатора аминокислоты. Значение получено из суммы С1с\ и СИс\-6Р.
с ΝοχΝ определено по Могдап-Екоп
п.Ь. не определено.
Полученные согласно описанному способу ЬР8-препараты подвергали электрофорезу на полиакриаламидном геле (РАСЕ) вместе со сравниваемыми ЬР8 (ср. фиг. 1). Для получения δΌδ-РАСЕ-анализа ЬР8 обрабатывали 16% полиакриламидным гелем (И.К., Баеттб, С1еауаде ой 51гис1ига1 рго!еш8 биппд аккетЫу ой йеаб ой ЬаЛейорйаде Т4, №1Шге. 227, 680-685 (1970)). ЬР8-полосы окрашивали с помощью чувствительного щелочного метода серебрения ( С.М. Т§а1 апб Ргаксй, С.Е., А 5еп51йуе кйуег йаш йог бе!есйпд 11роро1у8ассйапбе8 ш ро1уасгу1ат1бе де18, Апа1. Вюсйет., 119, 1982, 115-119).
Результат исследований представлен на фиг. 1.
Пример 3. Биологическая активность
а) 1Ь-1-активность
1Ь-1-активность определяли с помощью анализа ΜNС-пролиферации в надосадочной жидкости культуры. Моноциты человека (ΜΝ0) изолировали из периферической крови добровольных доноров (8 х 105 МЫС/200 мл) и их переводили на стекло и одновременно перемещали с тестовым веществом. Для тестирования биологической активности ш уйго клетки вначале стимулировали с ЬР8 (10 нг/мл). После периода инкубации продолжительностью 8 ч исследовали 150 мл надосадочной жидкости культуры на высвобождение цитокинов. ТС-1благодаря ЙБ-1. Сравнением кривой действия дозы надосадочной жидкости культуры с кривой стандарта в пробит-анализе определяли биологическую активность в надосадочной жидкости культуры. ЬР8 из известных эндотоксически активных штаммов бактерий (8а1топе11а йгебепаи) служит как ссылка (положительный контроль) и поэтому представлен на фиг. 5.
Ь) ΤΝΕα-активность
ΤΝΕα-активность в надосадочной жидкости культуры определяли анализом цитотоксичности с помощью ΤΝΕ-чувствительной клеточной линии Ь929. Сравнение кривой действия дозы надосадочной жидкости культуры с кривой стандарта в пробит-анализе позволяет определить ΤΝΕ-активность. Также здесь в качестве положительного контроля служит известный эндотоксически активный ЬР8 из 8а1топе11а йгебепаи. Результаты представлены графически на фиг. 6.
Результаты показывают, что в отношении ЙБ-1- и ΤΝΕα-выделения нет никаких значительных различий между ЬР8 из 8а1топе11а йлебепаи, который служит в качестве стандарта и положительного контроля, и ЬР8, обнаруженном в штамме ΌδΜ 6601 (фиг. 5 и 6 изображения внизу). Это подтверждается также тем, что липоид А штамма ΌδΜ 6601 имеет почти одинаковую активность по покрытию как и высоко очищенный липоидом А из Е. сой (фиг. 5 и 6, изображения сверху).

Claims (3)

ФОРМУЛА ИЗОБРЕТЕНИЯ
1 ЬР8 препарат 1 (фенол/вода-экстракт ϋΜ 11,82)
1 2 3 4 5 6 7
Фиг. 1. 8Б8-РА0Е ЕзсНспсЫа со11 Б8М 6601
1. Липополисахарид бактерий Е.сой штамма ΌδΜ 6601, содержащий 8 фосфатных остатков и 0,5 моль Р-Е1п в расчете на молекулу, имеющий структуру, представленную на фиг. 7.
2 ЬР8 препарат 2
3 ЬР8 препарат 3
4 свободно
5 Е. со11 О111 ЬР8
6 Рзеиботопаз аегидтоза тип Фишера 2 ЬР8
7 8а1топе11а ттпезоШ К60 ЬР8
Стрелки указывают на ЬР8 полосы олигосахарида ядра и «повторяющееся звено» (К/8-мутант, полоса А) и соответственно на ЬР8 со сложным олигосахаридом ядра (полоса В).
2. Способ получения липополисахарида по п.1, заключающийся в том, что промытую и высушенную бактериальную массу Е.сой штамма ΌδΜ 6601 подвергают экстракции смесью фенол/вода и полученный экстракт обрабатывают РНКазой, ДНКазой и протеиназой К.
3. Применение липополисахарида бактерий Е.сой штамма ΌδΜ 6601 по п.1, в частности полученного в соответствии с п.2, для модулирования иммунной системы человека и животных, изменения биологической активности других микроорганизмов, получения иммуномодулирующих лекарственных средств для человека и животных, а также в качестве маркера или эталонного вещества для микробиологической или медицинской диагностики ш уйго, в качестве иммуностимулятора для вакцинации человека и животных, в качестве основного материала для биотехнологического синтеза и изготовления иммуномодулирующих веществ.
активность определяли с помощью анализа пролиферации фибробластов в надосадочной жидкости культуры. Необходимые для этого фибробласты получали из крайней плоти человека.
Пролиферация этих фибробластов повышалась
16 % разделительный гель
—>3)-й-Мап-( I —>4)-В-Мап-С1—>3}-α·άΐοΝΑε-(1 —>4)-а-<Эа1ЫАс-(1 —>
Г β-СНс
Фиг. 2. Структура О-антигена Е. со11 О6 цитировано из: 1апззоп, Р.Е., ЬтбЪегд, В., Ьоппдгеп, 1., Ог1еда. С, 8уепзоп, 8.В. (1984) СагЪойубг. Кез., 131, 277-283.
Все сахара находятся в Б-пиранозной форме.
В противоположность опубликованной 1апззоп е1 а1. структуре О-цепи Е.со11 06 первое «повторяющееся звено» 8/К-мутанта Е.со11 Б8М 6601 связано ргликозидически и впервые определено в настоящей заявке на патент, вместе с местом замещения на расположенной в стороне глюкозе (01с111) олигосахарида ядра (см. фиг. 4).
Фиг. 3. Структура гексаацильного липоида А Езсйег1сЫа со11 ('/.аНппдег. и., Ьтбпег, В., апб Е. ТЕ. К1е1зсНе1. Мо1еси1аг з1гнс1нге о! 1ίρίά А, 111е епбо1о\1с сеп1ег о! Ъас!епа1 11роро1узассйапбез, Α6ν. СагЪойубг. СЕет. ВюсЕет., 50 (1994)211-276)
Цифры в кружках обозначают число атомов углерода настоящей жирной кислоты. Свободная гидроксигруппа О1сЫ (II) представляет место связывания для Кбо (I) олигосахарида ядра.
рр
II а<^Ч1-^)-а-Оа141_>2>а-<Э1с,-(1_»3>а431с'Ч1->3>1^(-1>НСр1-(1->.3)-Ьх1-Г».Нгр1Ч1^5)-а-К1,-(2^6) _> Σίροίά А Т |* 1 I2
О-КеПе—> 3>₽-О1с“ Ых-О-Нер β.ΚΛ,
Фиг. 4. Структура основного каркаса углевода главной фракции в олигосахариде ядра Е.со11 К1:
цитировано из: V^ηод^абоν, Е.У., νап бег Бг1й, К., Тйотаз-Оа1ез, ЕЕ., МезЬЕот, 8., Вгабе, Н.-, апб О. Но1з1 (1999) Еиг. 1. Вюсйет., 261, 629-639.
Все сахара представлены в Б-пиранозной форме. Ь,Б-Нер, Ь-глицеро-Б-манно-гептоза; Кбо Бманно-окт-2-улозоновая кислота, Р, фосфат.
Замещение О-цепи на расположенной в стороне глюкозе (01с111), вместе с ее аномерией, впервые определено и изображено в настоящей заявке на выдачу патента
Фиг. 5. Зависимость от дозы высвобождения 1Ь1 из моноцитов человека, индуцируемое с помощью: 1. липода А Езсйепсй1а сой (слева вверху) или липоидом А из штамма Б8М 6601 Е.со11 (справа вверху) и 2. ЬР8 из 8.!пебепаи (слева внизу) и Езс11епс1на со11 штамм Б8М 6601 (справа внизу).
Фиг. 6. Зависимость от дозы высвобождения ΤΝΕα из моноцитов человека, индуцируемое с помощью: 1. липоида А Езс11епс1на со11 (слева вверху) или липоида А из штамма Б8М 6601 Е.со11 (справа вверху); и 2.
ЬР8 из 8.!пебепаи (слева внизу) и ЕзсйепсЫа сой штамм Б8М 6601 (справа внизу).
Фиг. 7. Структура сложного липополисахарида (ЬР8) из Е. со11 Б8М 6601.
В олигосахариде ядра фосфатные заместители Ри Е1п в обеих гептозах Нер1 и Нер11 не являются стехиметрическими и поэтому обозначены закрашенными линиями.
Позиция и аномерное связывание КОо1 с липоидом А происходит по аналогии с другими БРЗ-структурами Е. со11, таким же образом, как позиция и аномерное связывание КОо.
EA200200997A 2000-03-20 2001-03-20 Липополисахарид бактерий e. coli штамма dsm 6601 и способ его получения EA005217B1 (ru)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
DE10013539A DE10013539B4 (de) 2000-03-20 2000-03-20 Lipopolysaccharide aus Escherichia coli, Verfahren zu deren Herstellung und deren Verwendungen
PCT/EP2001/003153 WO2001070756A2 (de) 2000-03-20 2001-03-20 Lipopolysaccharide aus escherichia coli

Publications (2)

Publication Number Publication Date
EA200200997A1 EA200200997A1 (ru) 2003-04-24
EA005217B1 true EA005217B1 (ru) 2004-12-30

Family

ID=7635468

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
EA200200997A EA005217B1 (ru) 2000-03-20 2001-03-20 Липополисахарид бактерий e. coli штамма dsm 6601 и способ его получения

Country Status (28)

Country Link
US (1) US6833451B2 (ru)
EP (1) EP1266023A2 (ru)
JP (1) JP2003528175A (ru)
KR (1) KR20030047878A (ru)
CN (1) CN1436245A (ru)
AP (1) AP2002002622A0 (ru)
AU (2) AU2001273899B2 (ru)
BG (1) BG107115A (ru)
BR (1) BR0109392A (ru)
CA (1) CA2402544A1 (ru)
CZ (1) CZ20023469A3 (ru)
DE (1) DE10013539B4 (ru)
EA (1) EA005217B1 (ru)
EE (1) EE200200537A (ru)
HK (1) HK1053148A1 (ru)
HR (1) HRP20020682A2 (ru)
HU (1) HUP0204540A3 (ru)
IL (1) IL151785A0 (ru)
IS (1) IS6517A (ru)
MX (1) MXPA02009215A (ru)
NO (1) NO20024480L (ru)
NZ (1) NZ520968A (ru)
PL (1) PL368447A1 (ru)
SK (1) SK13492002A3 (ru)
UA (1) UA75068C2 (ru)
WO (1) WO2001070756A2 (ru)
YU (1) YU71202A (ru)
ZA (1) ZA200207408B (ru)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US10017727B2 (en) 2005-11-28 2018-07-10 Gen-Ichiro Soma Method for fermentation and culture, fermented plant extract, fermented plant extract composition, method for producing lipopolysaccharide and lipopolysaccharide

Families Citing this family (11)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20030031684A1 (en) * 2001-03-30 2003-02-13 Corixa Corporation Methods for the production of 3-O-deactivated-4'-monophosphoryl lipid a (3D-MLA)
DE10328669B4 (de) * 2003-06-26 2005-12-01 Pharma-Zentrale Gmbh Plasmidfreier Klon des E. coli Stammes DSM 6601
US20050238651A1 (en) * 2003-11-25 2005-10-27 Gurtner Gregory J Treatment of inflammatory bowel disease
US20050191276A1 (en) * 2003-11-25 2005-09-01 Gregory Gurtner Treatment of inflammatory bowel disease through induction of indoleamine 2.3-dioxygenase
WO2006025995A2 (en) * 2004-07-27 2006-03-09 The Regents Of The University Of California Compositions and methods using md-2 mutants and chimeric proteins
CN100354428C (zh) * 2005-01-13 2007-12-12 丁友玲 隧道式干热灭菌设备测试用内毒素指示剂的制备方法
US9664677B2 (en) 2010-04-19 2017-05-30 Massachusetts Institute Of Technology Polymer-nanostructure composition for selective molecular recognition
US20130066064A1 (en) * 2010-05-20 2013-03-14 Glaxosmithkline Biologicals S.A, Novel process
CN105137073A (zh) * 2015-08-06 2015-12-09 中国兽医药品监察所 牛布鲁氏菌胶体金抗体检测试纸条
PL432842A1 (pl) * 2020-02-10 2021-08-16 Uniwersytet Warszawski LPS do zastosowania w indukowaniu u osobnika tolerancji na alergeny pokarmowe wywołujące alergie pokarmowe zależne od IgE
CA3171408A1 (en) * 2020-03-13 2021-09-16 Martine Caroff Detoxified lipopolysaccharides (lps), naturally non-toxic lps, and uses thereof

Family Cites Families (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
DE19844191A1 (de) * 1998-09-28 2000-03-30 Pharma Zentrale Gmbh Lipopolysaccharide aus Escherichia coli

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US10017727B2 (en) 2005-11-28 2018-07-10 Gen-Ichiro Soma Method for fermentation and culture, fermented plant extract, fermented plant extract composition, method for producing lipopolysaccharide and lipopolysaccharide

Also Published As

Publication number Publication date
SK13492002A3 (sk) 2003-03-04
EA200200997A1 (ru) 2003-04-24
UA75068C2 (en) 2006-03-15
CZ20023469A3 (cs) 2003-04-16
HK1053148A1 (zh) 2003-10-10
NO20024480L (no) 2002-11-20
US6833451B2 (en) 2004-12-21
HUP0204540A3 (en) 2003-12-29
NZ520968A (en) 2005-07-29
DE10013539A1 (de) 2001-10-18
WO2001070756A2 (de) 2001-09-27
YU71202A (sh) 2006-01-16
HUP0204540A2 (hu) 2003-04-28
AP2002002622A0 (en) 2002-09-30
CA2402544A1 (en) 2002-09-10
MXPA02009215A (es) 2004-09-10
PL368447A1 (en) 2005-03-21
BR0109392A (pt) 2003-06-03
HRP20020682A2 (en) 2004-12-31
IL151785A0 (en) 2003-04-10
US20030108573A1 (en) 2003-06-12
EP1266023A2 (de) 2002-12-18
JP2003528175A (ja) 2003-09-24
IS6517A (is) 2002-08-21
NO20024480D0 (no) 2002-09-19
CN1436245A (zh) 2003-08-13
ZA200207408B (en) 2003-01-02
WO2001070756A3 (de) 2002-05-02
AU7389901A (en) 2001-10-03
EE200200537A (et) 2004-04-15
BG107115A (bg) 2003-05-30
KR20030047878A (ko) 2003-06-18
AU2001273899B2 (en) 2005-10-06
DE10013539B4 (de) 2006-07-13

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CA1181691A (en) Vaccinal complex containing a specific antigen and vaccine containing it
FI110164B (fi) Menetelmä oligosakkaridin valmistamiseksi depolymeroimalla antigeeninen polysakkaridi
Wilson et al. Role of competition for nutrients in suppression of Clostridium difficile by the colonic microflora
Gottschalk The chemistry and biology of sialic acids and related substances
Rietschel et al. Chemical structure and biologic activity of bacterial and synthetic lipid A
US5952313A (en) LPS antagonists and methods of making and using the same
EP0319253A3 (en) Sialic acid glycosides, antigens, immunoadsorbents, and methods for their preparation
EA005217B1 (ru) Липополисахарид бактерий e. coli штамма dsm 6601 и способ его получения
CN101896197B (zh) 来自艰难梭菌的新型多糖免疫原
JP4043533B2 (ja) 低分子量リポポリサッカライド
CA2265696C (en) Method for purifying gbs toxin/cm101
JPH08245702A (ja) 高分子量リポポリサッカライド
Stevens et al. Biological and chemical characterization of endotoxin from Capnocytophaga sputigena
Wang et al. Cell envelope of an iron-oxidizing bacterium: studies of lipopolysaccharide and peptidoglycan
CN107184972B (zh) 一种结核杆菌OS-tb寡糖缀合物及其制备方法与应用
Bock et al. Interaction of viruses, bacteria and bacterial toxins with host cell surface glycolipids. Aspects on receptor identification and dissection of binding epitopes
RU2260053C2 (ru) Способ выделения биологически активной фракции (баф), содержащей s-липополисахариды (s-лпс) из грамотрицательных бактерий, баф для лечения и профилактики заболеваний, вызываемых грамотрицательными бактериями, производящими эндотоксичные s-лпс, фармацевтическая композиция, способы индукции протективного иммунитета и улучшения состояния пациента при состояниях, требующих повышения иммунного статуса
Acosta et al. Chemical nature of the interaction between macrophage fusion factor and macrophage membranes
RU2068270C1 (ru) Антиген менингококков группы в
Diamantstein et al. Effect of N 6‐(Δ2‐isopentenyl)‐adenosine on thymus and spleen in relation to antibody formation in mice
Varbanets et al. Characterization of the lipipolysaccharides of Pseudomonas chlororaphis
Hasløv et al. Immunosuppressive effects induced by the polysaccharide moiety of some bacterial lipopolysaccharides
Overend Maurice Stacey, CBE 8 April 1907—9 October 1994: Elected FRS 1950
Beynon Structural studies of Escherichia coli K26 and K46-50 using chemical and microbiological methods
GB2088399A (en) Lipopolysaccharide Containing Compounds as Immunotherapeutic Agent for Tumors

Legal Events

Date Code Title Description
MM4A Lapse of a eurasian patent due to non-payment of renewal fees within the time limit in the following designated state(s)

Designated state(s): AM AZ KZ KG MD TJ TM

MM4A Lapse of a eurasian patent due to non-payment of renewal fees within the time limit in the following designated state(s)

Designated state(s): BY RU