CZ20023469A3 - Lipopolysacharidy - Google Patents

Lipopolysacharidy Download PDF

Info

Publication number
CZ20023469A3
CZ20023469A3 CZ20023469A CZ20023469A CZ20023469A3 CZ 20023469 A3 CZ20023469 A3 CZ 20023469A3 CZ 20023469 A CZ20023469 A CZ 20023469A CZ 20023469 A CZ20023469 A CZ 20023469A CZ 20023469 A3 CZ20023469 A3 CZ 20023469A3
Authority
CZ
Czechia
Prior art keywords
lps
coli
lipoid
dsm
chain
Prior art date
Application number
CZ20023469A
Other languages
English (en)
Inventor
Hans Proppert
Jürgen Malinka
Jürgen Schulze
Ulrich Sonnenborn
Ulrich Zähringer
Original Assignee
Pharma-Zentrale Gmbh
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Pharma-Zentrale Gmbh filed Critical Pharma-Zentrale Gmbh
Publication of CZ20023469A3 publication Critical patent/CZ20023469A3/cs

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12PFERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P19/00Preparation of compounds containing saccharide radicals
    • C12P19/04Polysaccharides, i.e. compounds containing more than five saccharide radicals attached to each other by glycosidic bonds
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P37/00Drugs for immunological or allergic disorders
    • A61P37/02Immunomodulators
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C08ORGANIC MACROMOLECULAR COMPOUNDS; THEIR PREPARATION OR CHEMICAL WORKING-UP; COMPOSITIONS BASED THEREON
    • C08BPOLYSACCHARIDES; DERIVATIVES THEREOF
    • C08B37/00Preparation of polysaccharides not provided for in groups C08B1/00 - C08B35/00; Derivatives thereof
    • YGENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02ATECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
    • Y02A50/00TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE in human health protection, e.g. against extreme weather
    • Y02A50/30Against vector-borne diseases, e.g. mosquito-borne, fly-borne, tick-borne or waterborne diseases whose impact is exacerbated by climate change

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Materials Engineering (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Polymers & Plastics (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Polysaccharides And Polysaccharide Derivatives (AREA)
  • Saccharide Compounds (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)

Description

Lipopolysacharidy
Oblast techniky
Vynález se týká nových lipopolysacharidů z E.coli (LPS). Tyto LPS se liší od dosud známých LPS z E.coli zvláště ve fosforylované cukerné části jádra ve stupni polymerizace O-řetězce. Lipoid A odpovídá strukturálně a biologicky obvyklému typu E.coli. Popsaný LPS není jen vhodný pro identifikaci kmenu coli, který jej nese, nýbrž mu také propůjčuje sníženou patogenitu při zachování jeho imunomudulačního účinku.
Dosavadní stav techniky
Endotoxiny se rozumí bakteriální strukturní složky, které se oproti exotoxinům nevylučují živými baktriemi, nýbrž se především uvolňují po autolýze (rozpouštění buněčné struktury). U takzvaných klasických endotoxinů se jedná o lipopolysacharidy stálé za horka, dále nazývané jako LPS, z vnějších buněčných membrán Gram-negativních bakterií. LPS sestávají z takzvaného lipoidu A, oligosacharidu jádra a specifického O-řetězce, přičemž lipoid A odpovídá za toxický účinek LPS.
Endotoxiny stimulují v makroorganizmu produkci mediátorů imunosystému, jako je interleukin 1, zkráceně IL-1, a faktor tumorové nekrózy, zkráceně TNFa.
O složení endotoxinů enterobakterií a zvláště E-coli byla již provedena celá řada výzkumů, přičemž se zjistilo, že mutanty S/R zpravidla obsahují pouze jednu • ·
-2opakovací jednotku, tedy „repeating unit“ svého O-řetězce (srov. obr.1). Vychází se z toho, že v těchto případech gen, který kóduje pro polymerizační enzym Ořetězce, je defektní a proto se na oligosacharid jádra přenáší pouze jedna „repeating unit“. Struktury LPS podobného typu, ale jiné struktury, se také často nacházejí v lidských patogenních zárodcích, jako je neisseria, vibrio, campylobacter, helicobacter atd. Tyto zárodky disponují LPS, který mu umožňuje, aby se imunitní obrana hostitele pomocí zvláštního molekulárního mimikri kromě jiného zbavila přítomnosti kyseliny sialinové a oligosacharidů s obsahem sialinové kyseliny, které se podobají glykoproteinům a glykolipidům savců. Pro E.coli DSM 6601 byl zhotoven 06-serotyp. Tato struktura byla zkoumána a publikována P.E.Janson et al., Carbohydr.Res. 131 (1984) 277-283. Struktura odpovídá vzorci uvedenému na obr. 2.
Také lipoid A bakterií coli byl zkoumán různými výzkumnými týmy, přičemž se ukázalo, že struktura lipoidu A zpravidla existuje v hexaacylové formě a shoduje se pro všechny serotypy E.coli (obr.3). Struktura hexaacylové sloučeniny byla zveřejněna v roce 1984 Th.Rietschel et al., Structure and conformation of the lipid A component of lipopolysacharides; Handbook of Endotoxins (Proctor, R., ed.), Vol.1, Chemistry of Endotoxin (E.Th.Rietschel, ed.), Elsevier, Amsterdam (1984), stránky 187-200 a odpovídá zobrazení na obr. 3.
Specifický O-řetězec a lipoid A jsou společně vázány oligosacharidem jádra. Doposud je u E-coli známo 5 různých oligosachridů jádra; vynález se odkazuje na O. Holst et al., Chemical structure of the core region of lipopolysaccharide, v: Bacterial Endotoxic Lipopolysaccharides, Vol. 1, Morrison D.C. a Ryan, J.L. (ed.), Boča Raton, FL, USA (1992) stránky 135-170 (srov. obr. 4).
Podstata vynálezu
Při výzkumech LPS E.coli kmene DSM 6601 se ukázalo, že lipoid A ve svém složení odpovídá hexaacylové formě lipoidu A popsaného také pro E.coli.
Výzkumy ohledně uvolňování IL-1 a TNFa v lidských monocytech potvrzují, že lipoid A má stejnou aktivitu, a proto s velkou pravděpodobností odpovídá známé struktuře lipoidu A E.coli (srov. obr.5, obr.6). Tato doměnka byla potvrzena chemickými analýzami.
Struktura specifického O-antigenu E.coli DSM 6601 překvapuje skutečností, že se v řetězci zřejmě pravidelně opakuje pouze jediná „repeating unit“ (srov. obr. 1_), z čehož lze usoudit, že se u kmene DSM 6601 jedná o mutant S/R, což je pro lidský izolát nanejvýš neobvyklé. Struktura této „repeating unit“ ale odpovídá, jak ukazuje serologická analýza, základnímu vzoru O-řetězce E-coli 06.
Oblast jádra u kmene DSM 6601 odpovídá známé struktuře R1. Strukturální zvláštnosti spočívají ovšem v tom, že bylo analyticky zjištěno 8 fosfátových zbytků na molekulu LPS, přičemž na lipoid A zpravidla připadají 2 fosfátové zbytky. Dále byl nalezen nestechiometrický obsah pyrofosfoethanolaminu.
Souhrnně se proto zjistilo, že se LPS kmene DSM 6601 výrazně liší od dosud známého LPS z E.coli, zvláště ve fosforylovanén cukerném zbytku jádra a ve stupni polymerizace O-řetězce. Lipoid A odpovídá strukturálně a biologicky obvyklému typu E.coli, což podtrhuje roli této látky při biologické účinnosti. Popsaný LPS je vhodný nejen pro identifikaci kmene coli, který nese, nýbrž mu také propůjčuje sníženou patogenitu při zachování jeho imunomodulačního ··· · 9 ··· ···· ·· ··. .... ···· účiku. Skutečnost, že O-řetězec je vázán β- místo α-glykozidickou vazbou, se mohla nejprve výrazně projevit na příkladu S/R-mutantů DSM 6601 E.coli.
U lipopolysacharidu (LPS) E.coli DSM 6601 se jedná o novou smooth-rough (S/R)-strukturu, která se na jedné straně skládá z dosud známé dílčí struktury (specifický O-řetězec, oligosacharid jádra a lipoid A), na druhé straně byla plně charakterizována v předkládané komplexní formě (srov. Obr.7). Specifický Ořetězec, sestávající jen z jediné opakující se jednotky („repeating unit“) serotypu 06, je β-glykozidicky vázán na oligosacharid jádra a tím je připojen jinak, než Ořetězec (α-glykozidicky). Oligosacharid jádra má strukturu R1, chemický nález, který se potvrdí serologickými vyšetřeními R1-specifickými protilátkami. Složky lipoidu A mají pro lipoid A E.coli určitou charakteristickou chemickou strukturu.
LPS E.coli kmene DSM 6601 má překvapující homogenitu. Lze zjistit pouze heterogenitu s ohledem na fosfátové substituenty (PP a P-Etn vs. P a P), která se především popisuje v této formě. Pomocí komplexních analýz NMR se mohl substituent P-Etn v oligosacharidu jadra jednoznačně stanovit oligosacharidu jádra R1 v poloze 2 druhé heptozy (Hep).
Komplexní struktura LPS kmene DSM 6601 je zobrazena na obr.7.
Následně se vynález blíže objasní pomocí příkladů.
·· • ···
-5Příklady provedení vynálezu
Příklad 1
Výroba LPS
LPS byl získán z promyté a vysušené bakteriální hmoty po modifikované extrakci směsí fenol/voda; potud se vynález odkazuje na O. Westphal et al., Bactrial Lipopolysaccharides, Extraction with Phenol-Water and Futher Applications of the Proceduře, Meth. Cabohydr. Chem., Vol.V (1965) str. 83-91.
g suchých vymrazených bakterií, které byly nejdříve dvakrát promyty destilovanou vodou, byly podle Westphala a Janna extrahovány podle odpovídajícího modifikovaného předpisu. Modifikace spočívala v následné úpravě enzymu (DNAza, RNAza, Proteináza K) vodného extraktu, která slouží k tomu, aby se odstranily eventuální cizí proteiny a složky DNA/RNA. Proto se vodná fáze (ca. 1,2 I) při pokojové teplotě smíchá s 20 mg RNAzy (ribonuklaza A, bovine pancreas, Sigma) a 20 mg DNAzy (DNAza I, bovine pancreas, grade II, Sigma) a směs se při pokojové teplotě míchá 30 hodin. Následně se přidá 20 mg proteinázy K (tritirachium album, Boehringer Mannheim) a míchá dalších 12 hodin. Suspenze se potom 24 hodin při teplotě 4 °C třikrát dialyzuje 15 I destilované vody a následně suší vymrazením. Extrakt upraveného enzymu se opět pohltí v destilované vodě, takže se dosáhne konečné koncentrace 50 mg/ml. Tato suspenze se třikrát v chladu ultracentriguguje (155.000xg, 4 °C, 4 h). Sediment (LPS) se pohltí ve 150 ml destilované vody a ještě hednou tři dny dialyzuje vodou a následně lyofilizuje (výtěžek LPS: 1,45 g, 3,1 % hmotn/hmotn).
Příklad 2
Analýza LPS z E.coli kmene DSM 6601
Hexosamin (HexN) (znamená glukosamin + galaktosamin, GIcN+GalN) byl podle modifikovaného testu Morgan-Elson stanoven (Strominger, J.L., Park, J.T Thompson, R.E. J. Biol. Chem. 234, 3263-3268 (1959)), ale alternativně také pomocí HPLC (PICO-TAG, Waters). Oproti testu Morgan-Elson mohou být při tomto analytickém způsobu GlcN a GalN nejen odděleně stanoveny a kvantifikovány, nýbrž lze tímto způsobem paralelně zjistit přítomnost GIcNfosfátu, 2-ethanolaminu (Etn) a 2-ethanolaminofosfát (Etn-P), které se v LPS často nacházejí. Plynová-kapalinová chromatografie (GC) byla provedena na plynovém chromatografu Varian 3700 GC nebo Hewlett Packard (HP 5890 Serie II) na kapilární koloně (fused-silica SPB-5®, 30 m, Supelco). Kombinace plynovákapalinová chromatografie/hmotnostní spektrometrie (GC-MS) probíhala na hmotnostním spektrometru (HP Modell 5989), který byl vybaven kapilární kolonou HP-1 (30 m, Hewlet Packard). Analýzy GC nebo GC-MS byly použity pro stanovení neutrálního cukru (Glc, Gal, Hep, Man) jako jejich alditolacetáty (Sawardeker, J.S., Slonerker, J.H.Jeanes, A. Anal. Chem. 37, 1602-1604)) a také pro stanovení a kvantifikaci masných kyselin jako jejich methylesterových derivátů mastných kyselin po silné methanolýze (2M HCI/MeOH, 120 °C, 16 h) (Wollenweber, H.W. a Rietschel, E,Th., Analysis of lipopolysaccharide (lipid A) fatty acids, J.Microbiol.Meth. 11, (1990) 195-211) a extrakci chloroformem. U obou způsobů analýzy GC se začalo při teplotě 150 °C (izotermicky 3 minuty) a pomocí lineárního teplotního gradientu 5 °C/min. se zvýšilo na teplotu 320 °C. Fosfát byl stanoven podle Lowry et al. (Lowry, O,H., Roberts, N.R., leiner, K.Y., Wu, M.KL. Farr, A.L., J.Biol.Chem. 207, 1-17 (1954)) a 2-keto-3-desoxy-D-mano.,>4
-7oktulozonová kyseliny (Kdo) pomocí zbytku kyseliny thiobarbiturové (Waravdekar, V.C.& Saslaw, L.D., J.Biol.Chem. 234, 1945-1950 (1959)).
Provedení a čištění volného lipoidu A oligosacharidu jádra
LPS (258,8 mg) byl suspendován v 25 ml 0,1 M NaOAc/HOAc (pH 4,4) a při teplotě 100 °C 1 hodinu podroben mírné kyselé hydrolýze. Poto byl lipofilní podíl (lipoid A) třikrát extrahován z hydrolyzátu 25 ml chloroformu (výtěžek 23,2 mg). Lipoid A z organické fáze byl dále čištěn pomocí preparativní vrstvové chromatografie (PSC) (2 mm PSC Kieselgel 60 Platte, E.Merck, Darmstadt), která se chromatografovala směsí chloroform-methanol-voda 100:75:15 (obj/obj/obj) a vyvinula ponořením do destilované vody. Tímto způsobem se získalo 6 frakcí, ze kterých hlavní frakce (Rf s 0,4) představuje vyčištěný difosforylovaný hexaacyl-lipoid A (DPHLA-Ec66oi)· Vyčištěný DPHLA-Ec6601 (výtěžek 2,06 mg) byl rozpuštěn ve směsi chloroform-methanol 8:2 (obj/obj) a před MALDI-TOF-MS upraven iontoměničem (Amberlite IRA 120, forma H+). Část (250 gg) vyčištěného DPHLA-EC6601 byla použita pro biologické experimenty.
Vodná fáze chloroformové extrakce byla sušena vymrazením (výtěžek: 272 mg) a oligosacharid byl dále čištěn pomocí kolony TSK [3,5x89 cm, TSK HW-40(S), E.Merck] ve směsi pyridin-kyselina octová-voda 8:20:2000, (obj/obj/obj). Jednotlivé oligosacharidové frakce (Pool A, B, C a D) byly analyzovány pomocí GC-MS a spektroskopie NMR. Hlavní frakce (Pool A, #28-41; 49,05 mg), která obsahovala jako cukerné složky O-řetězce (Man, GalNac), tak také složky oligosacharidu (Hep, Kdo), byly dále čištěny. Ostatní frakce obsahovaly monosacharidy, blíže nezkoumané artefakty Kdo (anhydro- a laktony) a nakonec sůl. Hlavní frakce dělení TSK ukázala, jak v analýze GC-MS, tak také v analýze
.......i..:..
NMR, všechny složky oligosacharidu jádra (Kdo, Gal, Hep) a O-řetězce (Man, GalNAc) a byly dále zpracována.
Proto bylo nejdříve zkoumáno, zda je analytická vysokotlaká chromatografie s výměnou aniontů („high pressure anion exchange chromatografy, HPAEC“) vhodná pro homogenní čištění oligosacharidů. K tomu byla použita specifická metodika HPLC pro analýzu komplexních cukerných struktur (systém DIONEX) s analytickou kolonou CarboPac PA1; (4,6 mm x 250 mm) a lineárním gradientem soli (5 min při 0, potom 50 min. na 0,5 M NaOAc) při průtoku 1 ml/min. Eluát byl detekován pomocí pulsního amperometrického detektoru (PAD) na snížených ekvivalencích (molekuly cukru). Tímto způsobem se mohly získat čtyři oligosacharidové frakce, které byly dále čištěny analogicky pomocí semipreparativní HPAEC.
Semipreparartivní HPAEC probíhala pomocí kolony CarboPac PA1 [(9 mmx250 mm) systém Dionex] se stejným gradientem soli jako při analytickém HPAEC (5 min. při 0, potom 50 min. na 0,5 M NaOAc) a průtoku 4 ml/min. Nanesení oligosacharidu (42 mg; pool A z kolony TSK) na semipreparativní HPAEC probíhalo ve dvou analogických bězích HPAEC. Eluát byl ve frakcích shromážděn za jednu minutu a ty byly jednotlivě podrobeny analytické HPAEC. Tímto způsobem byly pomocí semipreparativní HPAEC získány dvě hlavní frakce (frakce I, retenční doba tg ~ 12 min. a frakce II, tg ~ 15 min.). Obě frakce HPAEC musely být před MALDI-TOF-MS a analýzou NMR odsoleny pomocí kolony G-10 (2,5x120 cm) (výtěžek:frakce I 4,68 mg; frakce II 4,39 mg).
-9Hmotnostní spektrometrie matrix-assisted laser desorption/ionisation timeof-flight (MALDI-TOF)
Hmotnostní spektrometrie matrix-assisted laser desorption/ionisation time-offlight (MALDI-TOF-MS) byla snímána na neutronovém spektrometru (spočívající v době přeletu) Bruker-Reflex (Bruker- Franzen Analytik, Břemen) výlučně v lineární konfiguraci a v negativním modusu při urychlovacím napětí 20 kV a „delayed ion extraction“. Vzorky byly nejdříve rozpuštěny v chloroformu (lipoid A) nebo destilované vodě (frakce oligosacharidu) na roztok o koncentraci 10 pg/μΙ a jeho část 2 μΙ byla s 2 μΙ matečného roztoku, sestávající z 0,5 M 2,4,6trihydroxyacetofenonu (Aldrich, Steinheim) roztuštěna v methanolu. Části (0,5 μΙ) této směsi byly naneseny na kovový nosič a vysušeny fénem.
Spektroskopie NMR
Jednorozměrná (1D) 1H a 31P-NMR- a dvourozměrná (2D) NMR spektra byla snímána spektrometrem Bruker Avance DRX-600 (Bruker, Rheinstetten) a spektra 13C NMR byla snímána spetrometrem Bruker AMX-360 při 300 K v 2H2O. Před každým měřením byly vzorky dvakrát sušeny vymrazením deuterizovanou vodou 2H2O). Jako externí referenční signál byl použit aceton (3h 2,225 ppm, 3c 31,45 ppm) nebo 85% H3PO4Ρ 0 ppm). Standardní software Bruker (XWINNMR 1.3) byl použit pro snímání dat NMR. Doby míchání pro TOCSY (total correlated spectroscopy) popř. NOESY (nuclear overhauser enhancement spectroscopy) byly 100 popř. 500 ms.
- 10• · · ·
Serologické analýzy
Serologické analýzy byly provedeny jako Western-Blots, které byly vyvinuty třemi různými protilátkymi.
1. Polyklonální anti-O6-antiserum (králičí) bylo vyrobeno z E.coli kmene DSM 6601 (serotyp O6:K5:H1) v hygienickém ústavu Hamburg (Hygieneinstitut) (prof. Bockenmuhl).
2. Polyklonální anti-E-co// R1-antiserum (králičí, interní označení: K299/d58) bylo získáno imunizací drsnou formou mutantu, která obsahuje jádro R1 (anti-R1).
3. Monoklonální protilátka (WN1-222-5, interní označení F 167), byla použita, která reaguje křížově proti všem jádrovým oligosacharidům E.coli již od minimální struktury (>Rd).
··♦·
-11Tabulka
Analýza složek E.coli LPS extrahovaného z kmene DSM 6601
Složka Množství složek nmol/mg (mol/LPS)a
Sacharidy Analýza 1 Analýza 2
GlcNb 283 (1,8) n.b
GalN 139 (0,9) n.b.
HexN0 591 (3,8) 589 (2,9)
Kdo 248 (1,6) 242 (1,2)
Man 321 (2,1) 383 (1,9)
Gal 474 (3,0) 557 (2,8)
Glc 1069 (6,9) 1291 (6,4)
L, D-hep 566 (3,6) 442 (2,2)
Polární skupiny P 1188 (7,6) 1146(5,7)
Ent-P 85 (0,5) n.b.
Mastné kyseliny 12:0 130 (0,8) 162 (0,8)
14:0 156 (1,0) 201 (1,0)
14:0 (3-OH) 460 (3,0) 504 (2,5)
16:0 stopy stopy
Molární poměr jednotlivých složek (v závorkách) byl kvůli přítomnosti GalNAc a GIcNAc v O-řetězci normován na hodnotu kyseliny myristinové (14:0) (1,0 mol 14:0/mol LPS).
GlcN stanoven pomocí katalyzátoru aminokyseliny. Hodnota vznikne ze součtu hodnot GlcN a GlcN-6P.
HexN fotometricky stanovena podle Morgan-Elson
n.b. není stanoveno ·· »·00
- 12Preparáty LPS získané podle popsaného způsobu byly společně se srovnávacím LPS podrobeny polyakryamidové Gelektoroforéze (srov. obr.1). Pro provedení SDS-PAGE analýzy LPS se pracovalo s 16% polyakrylamidovým gelem (U.K., Laemmli, Cleavage of structural proteins during assembly of head of bacteriophage T4, nátuře, 227, 680-685 (1970)). Svazky LPS byly nabarveny citlivým alkalickým způsobem stříbrné barvy. (C.M. Tsai a Frasch, C.F., A sensitive silver stain for detecting lipopolysaccharides in polyacrylamide gels, Anal. Biochem., 119, 1982, 115-119).
Výsledek výzkumu je zobrazen na obrázku 1.
Příklad 3
Biologická aktivita
a) Aktivita 1L-1
Aktivita IL-1 se stanoví pomocí proliferačního testu MNC v přebytku kultury. Lidské monocyty (MNC) se izolují z periferní krve dobrovolného dárce (8x105 MNC/200 ml) a ty se převedou do sklenice a současně se míchají s testovanou látkou. Pro testování biologické aktivity in vitro se buňky nejprve stimulují LPS (10 ng/ml). Po inkubační době 8 hodin se 150 ml přebytku kultury zkoumá na uvolnění cytokinu. Aktivita IL-1 se stanoví pomocí proliferačního testu fibroblastů v přebytku kultury. Požadované fibroblasty byly získány z lidské předkožky. Proliferace těchto fibroblastů se zvýšila pomocí IL-1. Srovnáním křivky účinné dávky přebytku kultury s křivkou standardu v probitanalýze (Probitanalyse) se stanoví biologická aktivita v přebytku kultury. LPS ze známého endotoxicky
Λ·* ·· ····
♦♦ ·· • · · · • · · • · 9 « 9 9 ·· 999«
-13aktivního kmene bakterie (Salmonella friedenau) slouží jako reference (pozitivní kontrola) a je proto uvedena na obrázku 5.
b) Aktivita TNFa
Aktivita TNFa v přebytku kultury se stanoví v testu cytotoxicity s buněčnou linií L929 citlivou na TNF. Srovnání křivky účinné dávky přebytku kultury s křivkou standardu v probitanalýze umožní stanovení aktivity TNF. Také zde slouží známý endotoxicky aktivní LPS ze Salmonella friedenau jako pozitivní kontrola.
Výsledky jsou graficky zobrazeny na obrázku 6.
Výsledky ukazují, že s ohledem na rozdělení IL-1 a TNFa nelze zjistit žádné výrazné rozdíly mezi LPS ze Salmonella firedenau, který slouží jako standard a pozitivní kontrola, a LPS z kmene DSM 6601 (obr. 5 a 6, obrázky dole). To se potvrzuje také tím, že lipoid A kmene DSM 6601 je téměř shodně aktivní s vysoce čistým lipoidem A z E.coli (obr. 5 a 6, obrázky nahoře).
Zastupuje:

Claims (6)

  1. Patentové nároky
    1. Lipopolysacharid (LPS) podle struktury zobrazené na obrázku 7.
  2. 2. LPS podle nároku 1,vyznačuj ící se tím, že obsahuje 8 fosfátových zbytků na molekulu LPS.
  3. 3. LPS podle nároku 1 nebo 2, vyznačující se tím, že obsahuje 0,5 mol P-Etn na molekulu LPS.
  4. 4. Způsob výroby LPS podle nároku 1 až 3, v y z n a č u j í c í se t í m, že promytá a vysušená bakteriální hmota E.coli se známým způsobem podrobí extrakci fenol/voda a takzvaný extrakt se zpracuje s RNAzou/ DNAzou a proteinazou K.
  5. 5. Způsob podle nároku 4, v y z n a č u j i c i se t i m, že se použije E.coli kmen DSM 6601.
  6. 6. Použití lipopolysacharidů z E.coli kmen DSM 6601 podle nároků 1 až 3 pro mikrobiologické, biotechnické, analytické, diagnostické a/nebo lékařské účely.
CZ20023469A 2000-03-20 2001-03-20 Lipopolysacharidy CZ20023469A3 (cs)

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
DE10013539A DE10013539B4 (de) 2000-03-20 2000-03-20 Lipopolysaccharide aus Escherichia coli, Verfahren zu deren Herstellung und deren Verwendungen

Publications (1)

Publication Number Publication Date
CZ20023469A3 true CZ20023469A3 (cs) 2003-04-16

Family

ID=7635468

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CZ20023469A CZ20023469A3 (cs) 2000-03-20 2001-03-20 Lipopolysacharidy

Country Status (28)

Country Link
US (1) US6833451B2 (cs)
EP (1) EP1266023A2 (cs)
JP (1) JP2003528175A (cs)
KR (1) KR20030047878A (cs)
CN (1) CN1436245A (cs)
AP (1) AP2002002622A0 (cs)
AU (2) AU2001273899B2 (cs)
BG (1) BG107115A (cs)
BR (1) BR0109392A (cs)
CA (1) CA2402544A1 (cs)
CZ (1) CZ20023469A3 (cs)
DE (1) DE10013539B4 (cs)
EA (1) EA005217B1 (cs)
EE (1) EE200200537A (cs)
HK (1) HK1053148A1 (cs)
HR (1) HRP20020682A2 (cs)
HU (1) HUP0204540A3 (cs)
IL (1) IL151785A0 (cs)
IS (1) IS6517A (cs)
MX (1) MXPA02009215A (cs)
NO (1) NO20024480L (cs)
NZ (1) NZ520968A (cs)
PL (1) PL368447A1 (cs)
SK (1) SK13492002A3 (cs)
UA (1) UA75068C2 (cs)
WO (1) WO2001070756A2 (cs)
YU (1) YU71202A (cs)
ZA (1) ZA200207408B (cs)

Families Citing this family (12)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20030031684A1 (en) 2001-03-30 2003-02-13 Corixa Corporation Methods for the production of 3-O-deactivated-4'-monophosphoryl lipid a (3D-MLA)
DE10328669B4 (de) * 2003-06-26 2005-12-01 Pharma-Zentrale Gmbh Plasmidfreier Klon des E. coli Stammes DSM 6601
US20050238651A1 (en) * 2003-11-25 2005-10-27 Gurtner Gregory J Treatment of inflammatory bowel disease
WO2005051321A2 (en) * 2003-11-25 2005-06-09 Washington University Treatment of inflammatory bowel disease through induction of indoleamine 2,3-dioxygenase
US8821884B2 (en) * 2004-07-27 2014-09-02 The Regents Of The University Of California Compositions and methods using MD-2 mutants and chimeric proteins
CN100354428C (zh) * 2005-01-13 2007-12-12 丁友玲 隧道式干热灭菌设备测试用内毒素指示剂的制备方法
US10017727B2 (en) 2005-11-28 2018-07-10 Gen-Ichiro Soma Method for fermentation and culture, fermented plant extract, fermented plant extract composition, method for producing lipopolysaccharide and lipopolysaccharide
US9664677B2 (en) 2010-04-19 2017-05-30 Massachusetts Institute Of Technology Polymer-nanostructure composition for selective molecular recognition
US20130066064A1 (en) * 2010-05-20 2013-03-14 Glaxosmithkline Biologicals S.A, Novel process
CN105137073A (zh) * 2015-08-06 2015-12-09 中国兽医药品监察所 牛布鲁氏菌胶体金抗体检测试纸条
PL432842A1 (pl) * 2020-02-10 2021-08-16 Uniwersytet Warszawski LPS do zastosowania w indukowaniu u osobnika tolerancji na alergeny pokarmowe wywołujące alergie pokarmowe zależne od IgE
KR20230074410A (ko) * 2020-03-13 2023-05-30 헤파이스토스-파마 해독된 지질다당류(lps), 천연 무독성 lps, 및 이의 용도

Family Cites Families (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
DE19844191A1 (de) * 1998-09-28 2000-03-30 Pharma Zentrale Gmbh Lipopolysaccharide aus Escherichia coli

Also Published As

Publication number Publication date
KR20030047878A (ko) 2003-06-18
US6833451B2 (en) 2004-12-21
HK1053148A1 (zh) 2003-10-10
ZA200207408B (en) 2003-01-02
UA75068C2 (en) 2006-03-15
NZ520968A (en) 2005-07-29
PL368447A1 (en) 2005-03-21
DE10013539A1 (de) 2001-10-18
WO2001070756A2 (de) 2001-09-27
EA200200997A1 (ru) 2003-04-24
EE200200537A (et) 2004-04-15
HRP20020682A2 (en) 2004-12-31
BR0109392A (pt) 2003-06-03
AU2001273899B2 (en) 2005-10-06
AP2002002622A0 (en) 2002-09-30
DE10013539B4 (de) 2006-07-13
YU71202A (sh) 2006-01-16
CA2402544A1 (en) 2002-09-10
JP2003528175A (ja) 2003-09-24
NO20024480D0 (no) 2002-09-19
IS6517A (is) 2002-08-21
AU7389901A (en) 2001-10-03
EP1266023A2 (de) 2002-12-18
HUP0204540A3 (en) 2003-12-29
CN1436245A (zh) 2003-08-13
NO20024480L (no) 2002-11-20
HUP0204540A2 (hu) 2003-04-28
US20030108573A1 (en) 2003-06-12
BG107115A (bg) 2003-05-30
IL151785A0 (en) 2003-04-10
MXPA02009215A (es) 2004-09-10
WO2001070756A3 (de) 2002-05-02
EA005217B1 (ru) 2004-12-30
SK13492002A3 (sk) 2003-03-04

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Gottschalk The chemistry and biology of sialic acids and related substances
Kulshin et al. Structural characterization of the lipid A component of Pseudomonas aeruginosa wild‐type and rough mutant lipopolysaccharides
Carlson et al. Polyuronic acids produced by Pseudomonas aeruginosa
DORFMAN Polysaccharides of connective tissue
US5952313A (en) LPS antagonists and methods of making and using the same
CZ20023469A3 (cs) Lipopolysacharidy
WO2009149155A1 (en) Microbial-derived chondroitin sulfate
Sandal et al. Identification, structure, and characterization of an exopolysaccharide produced by Histophilus somni during biofilm formation
Haishima et al. Structural investigation on the lipopolysaccharide of Escherichia coli rough mutant F653 representing the R3 core type
Masoud et al. General strategy for structural analysis of the oligosaccharide region of lipooligosaccharides. Structure of the oligosaccharide component of Pseudomonas aeruginosa IATS serotype 06 mutant R5 rough-type lipopolysaccharide
Jin et al. Preactivation-based, iterative one-pot synthesis of anticoagulant pentasaccharide fondaparinux sodium
US6534648B1 (en) Isolated algal lipopolysaccharides and use of same to inhibit endotoxin-initiated sepsis
DRAPER et al. Galactosamine in walls of slow-growing mycobacteria
JP2010529980A (ja) 栄養組成物
Naess et al. Chemical composition and biological activity of lipopolysaccharides prepared from type strains of Campylobacter jejuni and Campolybacter coli
Rybka et al. Determination of endotoxin by the measurement of the acetylated methyl glycoside derivative of Kdo with gas–liquid chromatography-mass spectrometry
Schulte Genetic and sex-related differences in the structure of submandibular glycoconjugates
Song et al. Structure of novel gangliosides, deaminated neuraminic acid (KDN) containing glycosphingolipids, isolated from rainbow trout ovarian fluid
JP4091137B2 (ja) 免疫抑制剤
US6444654B1 (en) Isolated asgal lipopolysaccharides and use of same to inhibit innate immune response
Qu et al. Design, Synthesis and Bioactivity of Core 1 O-glycan and its Derivative on Human Gut Microbiota
Vliegenthart et al. Introduction to sialic acids
DE19844191A1 (de) Lipopolysaccharide aus Escherichia coli
Varbanets et al. Characterization of the Lipopolysaccharide from Rahnella aquatilis 1-95
Kobatake et al. Lipopolysaccharide isolated from Mycobacterium tuberculosis strain Aoyama B