DE4325471A1 - Ventilmatrix zur gleichzeitigen Synthese von DNA- oder Peptid-Sequenzen - Google Patents
Ventilmatrix zur gleichzeitigen Synthese von DNA- oder Peptid-SequenzenInfo
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Description
Die Erfindung betrifft allgemein Ventile, die zur
Steuerung des Flusses von flüssigen oder gasförmigen Ma
terialien verwendet werden, und insbesondere Ventile,
die bei der Peptidsynthese verwendet werden.
In dieser Abhandlung wird die Verwendung der Erfindung
bezüglich der Festphasen-Peptidsynthese als ein Bei
spiel verwendet. Die Fachleute erkennen ohne weiteres
verschiedene andere Anwendungen, bei denen sich derar
tige Ventile als kommerziell vorteilhaft erweisen, ein
schließlich, aber nicht ausschließlich DNA-Synthese und
Eiweiß-Sequenzieren.
Die Festphasenmethode der Peptidsynthese wurde zuerst
1964 von Professor R. B. Merrifield eingeführt. Diese
Methode reduzierte drastisch die zur chemischen Synthe
tisierung von Peptiden erforderliche Zeit durch wesent
liche Vereinfachung der bei einer chemischen Synthese
erforderlichen Isolierungs- und Reinigungsschritte.
Diese Vereinfachung wurde durch Anfügen des Carboxyl-
Endes der C-Endaminosäure an einen unlöslichen Harz
träger (gewöhnlich vernetztes Polystyrol) erreicht. Al
le chemischen Isolierungs- und Reinigungsschritte wur
den dann auf diesem unlöslichen System betrieben. Die
Methode wurde auf die Synthese einer sehr großen Anzahl
von Peptiden sowohl im Labor- als auch im kommerziellen
Maßstab angewandt.
Professor Merrifield erhielt 1985 einen Nobelpreis in
Chemie für seine Beiträge zur Wissenschaft. Hunderte von
wissenschaftlichen Abhandlungen wurden veröffentlicht,
die Variationen von Merrifield′s grundsätzlichem chemi
schen Verfahren beschreiben. Mehrere Apparate oder Ge
räte wurden sowohl durch akademische als auch kommer
zielle Laboratorien entworfen und gebaut, um die Fest
phasenmethode zu automatisieren. Die Methode wurde auch
auf die Synthese von Desoxyribonuclein (DNA), Ribo
nuclein (RNA) und Polysaccharide angewandt.
Bei einer typischen Festphasensynthese eines Peptides
gibt es eine kovalente Bindung zwischen dem Carboxyl-
Ende einer alpha-abgeschirmten oder -geschützten Ami
nosäure und einem unlöslichen Harz-Träger, der typi
scherweise vernetztes Polystyrol mit 1 bis 2 Prozent
Divinylbenzol mit einer Kügelchen- oder Korngröße von
200-400 mesh ist.
Die nächste Aminosäure in der Peptidkette wird durch
eine Reihe von chemischen Reaktionen hinzugefügt, die
mit der Aufhebung der Abschirmung der Alpha-Amino-Grup
pe, Waschen zur Reinigung und der Kopplung einer neuen
geschützten oder abgeschirmten Aminosäure beginnen, ge
folgt von weiterem Waschen zur Reinigung.
Dieser Vorgang wird für jede Aminosäure in der Peptid
kette wiederholt. Chemische Reaktions- und Wasch
schritte können automatisiert werden und etliche kom
merzielle Geräte oder Apparate sind nun zum Ausführen
dieser Aufgaben verfügbar.
Wenn einmal die Peptidkette aufgebaut ist, muß sie vom
Polymerträger entfernt werden, wobei die die Seitenket
ten abschirmenden oder schützenden Gruppen entfernt,
isoliert und gereinigt werden.
Als ein guter Überblick über den Stand der Technik bei
Peptidsynthese ist das US-Patent Nr. 4,668,476 mit dem
Titel "Automated Peptide Synthesis Apparatus" anzuse
hen, das für Bridgham et al. am 26. Mai 1987 erteilt
wurde und hierin durch Bezugnahme beinhaltet ist.
Die automatisierte Herstellung der Peptidsynthese ver
wendet zwei Ansätze: (i) die Verwendung von Roboterar
men, um die ausgewählte Aminosäure oder das Reagenz in
ein Reaktionsgefäß zu befördern und dort physisch zu
deponieren oder abzulegen, oder (ii) wahlweises Leiten
eines Flusses von Aminosäure oder Reagenzien in das Re
aktionsgefäß.
Roboterarme haben bei dem Vorgang eine sehr weitgehende
Automatisierung geschaffen. Ein Gelenkarm, der einmal
programmiert wurde, um das spezielle Peptid zu erzeu
gen, wählt die geeigneten Fläschchen des Materials aus
und deponiert das Material im Reaktionsgefäß. Durch ei
ne Reihe von Deponierungen und Wartezeiten wird das ge
wünschte Peptid hergestellt.
Obgleich die Roboter-Methode einige verschiedene Vor
teile bietet, ist die mechanische Bewegung der Ami
nosäuren empfindlich für Verschütten. Ein anderer Nach
teil ist die Zeit, die erforderlich ist, um den Behäl
ter physisch zu bewegen und ihn dann zu ersetzen. Noch
ein weiterer Nachteil ist die Tatsache, daß die Robo
termechanismen nahezu per Definition typischerweise nur
einen Einzelvorgang ermöglichen, das heißt, daß nur ei
ne Synthese oder Synthetisierung zur gleichen Zeit mög
lich ist.
Weitere Nachteile des Robotersystems bestehen darin,
daß es ein "offenes System" ist, das Gefahren für Ar
beiter schafft und für Schmutz aus der Luft anfällig
ist. Noch weiter sind Robotersysteme volumenmäßig be
grenzt und haben eine sequenzielle Natur (ein Vorgang
zur gleichen Zeit).
Wegen dieser Beschränkungen des Raboterverfahrens ver
wenden die meisten Anwendungen nicht den gelenkigen Arm
für die Synthese von Peptiden.
Die überwiegende Mehrheit von Anwendungen verwendet ei
ne Arbeitsweise mit Ventilen, um die Aminosäuren und
Reagenzmaterialien an die Reaktionskammer abzugeben.
Bei diesen Vorrichtungen ist eine Versorgungseinrich
tung von ausgewählten Aminosäuren und Reagenzmateriali
en angeordnet, um durch Ventile das Reaktionsgefäß zu
versorgen. Auf diese Weise werden durch die wahlweise
Aktivierung von einzelnen Ventilen die Aminosäure oder
Reagenzien zum Reaktionsgefäß übertragen, um das Peptid
zu bilden.
Die Verwendung von Ventilen beseitigt das Erfordernis,
die Behälter physisch zu bewegen, und arbeitet dadurch
viel schneller und ohne die Möglichkeit, etwas zu ver
schütten, wie beim Roboterverfahren.
Zu diesem Zweck wurde eine große Anzahl von Patenten
erlangt, die die Ventile selbst und ihre Steuerung be
treffen. Beispiele dieser Patente umfassen: US-Patent
Nr. 4 597 412 mit dem Titel "Valve for Sequential Che
mical Operations", erteilt am 1. Juli 1986 für Stark,
US-Patent Nr. 4 595 565 mit dem Titel "Equipment for
Mixing Liquid Reactants", erteilt am 17. Juni 1986 für
Tenhagen, US-Patent Nr. 4 281 683 mit dem Titel
"Modular Multiple-Fluid Component Selection and Deli
very System", erteilt am 4. August 1981 für Hethering
ton et al., US-Patent Nr. 3 784 169 mit dem Titel
"Method of and Apparatus for the Controlled Mixing of
Two Reactive Components", erteilt am 8. Januar 1974 für
Bockmann et al., US-Patent Nr. 4 848 387 mit dem Titel
"Method and Apparatus for Segregated Introduction of
Two Liquids into a Chemical Reaktor Vessel at a Common
Entry Point", erteilt am 18. Juli 1989 für Hon, und US-
Patent Nr. 4 008 736 mit dem Titel "Valve Arrangement
for Distributing Fluids", erteilt am 22. Februar 1977
für Wittman-Liebold et al.
Zusätzlich haben viele verschieden Firmen ihre eigenen
speziellen Entwürfe erprobt, um eine Gruppierung von
Ventilen zu erzeugen. Ein derartiges Beispiel ist das
von Protein Technologies Inc. verwendete Ventil für ih
ren P53 Peptidsynthesizer oder -synthetisierer.
Bei allen diesen Fällen sind die Ventilanordnungen von
einer derartigen Kompliziertheit, daß nur eine einzige
Gruppe von Ventilen möglich ist, von denen alle ein
einziges Reaktionsgefäß beschicken. Diese Beschränkung
wird ihnen durch ihre eigenen komplexen Rohrleitungsan
forderungen auferlegt.
Ferner haben diese Vorrichtungen einige wesentliche
Nachteile sowohl bei der Betriebszeit als auch der Qua
litätskontrolle. Wenn einmal eine bestimmte Flüssigkeit
durch ein Ventil hindurch und in die Leitung zum Reak
tionsgefäß geströmt ist, wird ein Rückstand zurückge
lassen. Wenn nicht gründlich gereinigt wird, wird die
ser Rückstand von der vorhergehenden Flüssigkeit späte
re Flüssigkeiten beeinflussen und so eine negative Wir
kung auf die Qualität des hergestellten Peptids haben.
Auf Grund dieser Tatsache ist die physische Struktur
des Ventils und der "Rohrleitungen", Röhren oder Lei
tungen oder Kanäle, die alles verbinden, von ausgepräg
ter Wichtigkeit. Wenn sie ungeeignet hergestellt sind,
werden Totvolumina erzeugt, die die Rückstände vom Rei
nigen abschirmen.
Da sich die Industrie weiter entwickelt hat, nahm die
Notwendigkeit für eine schnellere, genauere und höher
qualitative Synthese zu. Diese vorstehenden Vorrichtun
gen haben dieses Erfordernis nicht erfüllt.
Es ist die Aufgabe der Erfindung die Voraussetzungen
für eine schnellere, genauere und qualitativ höhere
Synthese zu schaffen.
Diese Aufgabe wird erfindungsgemäß mit den Merkmalen
jedes einzelnen der Ansprüche 1, 11, 20, 30, 36, 50 und
54 gelöst.
Insbesondere betrifft die Erfindung einen Peptidsynthe
tisierer oder -synthesizer, der eine Ventilmatrix um
faßt, die durch Verwendung eines Verbundes oder einer
Sandwichbauart aus drei Schichten mit einer biegsamen
oder nachgiebigen Membrane zwischen jeder der Schichten
gebildet wird. Zufuhrkanäle und Abgabekanäle werden
durch Ätzen, Fräsen oder andere derartige Mittel in der
mittleren Schicht geschaffen. Jeder Zufuhrkanal steht
mit allen Abgabekanälen über eine Ventilstelle in Ver
bindung, die durch die nachgiebige Membrane geöffnet
oder geschlossen wird. Die Bewegung der nachgiebigen
Membrane wird durch Sog oder Druck bewirkt, wie er
durch Löcher in der überlagernden Schicht übertragen
wird. Auf diese Weise werden ausgewählte Zufuhr- und
Abgabekanäle einfach durch Anwendung eines geeigneten
Soges auf die Membrane verbunden.
Gemäß der bevorzugten Ausführung der Erfindung wird ei
ne Apparatur zum gleichzeitigen automatischen Aufbauen
von Peptiden geschaffen. Die Apparatur enthält einen
frei stehenden Computer, der zum Eingeben der Ami
nosäure-Sequenz in jeder Peptidkette und der chemischen
Mittel verwendet wird, die zum Aufbauen oder Konstruie
ren dieser Sequenz verwendet werden. Idealerweise hat
die Apparatur Eingabe- oder Zufuhrflaschen für 20 ver
schiedene alpha-amino-geschützte oder -abgeschirmte
Aminosäuren, zwei Lösungsmittel und vier Reagenzien.
Vorzugsweise sind die Gefäße für alpha-amino-geschützte
oder -abgeschirmte Aminosäuren an der Vorderseite der
Apparatur, um leicht gefüllt werden zu können. Die Lö
sungsmittel und Reagenzien sind in einem Gehäuse direkt
unterhalb des Aminosäure- und Reaktionssystems enthal
ten. Bei der bevorzugten Ausführung sind zwölf Reakti
onsgefäße über die vordere Oberseite des Geräts ver
teilt angeordnet. Diese Reaktionsgefäße werden durch
ein besonders aufgebautes federbelastetes Kugel-Sitz-
System an ihrem Ort gehalten.
Es ist wesentlich, daß das Protokoll oder der Ablauf
für jede Peptidsynthese genau durchgeführt wird. Die
Apparatur enthält deshalb ein Fluidsensorsystem, das
jedes Reaktionsgefäß überwacht, um die Integrität oder
Vollständigkeit der Synthese sicherzustellen. Jeder
durch das System detektierte Fluidfehler führt zum
Stillegen dieser einzelnen Synthese, bis ein Bediener
eingriff erfolgt, um das Problem abzustellen.
Sowohl die Rate oder das Ausmaß als auch die Vollstän
digkeit von chemischen Reaktionen bei der Peptidsynthe
se sind von der Struktur der geschützten oder abge
schirmten, anzukoppelnden Aminosäure und der Struktur
der wachsenden Peptidkette abhängig. Es gibt 20 natür
lich vorkommende Aminosäuren, die die meiste Zeit bei
Peptidsynthese verwendet werden. Dies begrenzt die An
zahl von Variablen für diesen Teil der Synthese. Es
gibt jedoch eine praktisch unendliche Anzahl von Mög
lichkeiten für den Aufbau von wachsenden Peptidketten.
Unter normalen Bedingungen setzen sich die beiden che
mischen Reaktionen (Koppeln und Entschirmen oder Aufhe
ben der Abschirmung) unter Standardbedingungen fort.
Jedoch gibt es einige chemische Reaktionen, die langsa
mer und weniger wirkungsvoll sind. Diese automatisierte
Apparatur schafft für jene eine Kompensation, indem sie
wirksamere Bedingungen zuläßt (d. h. längere Reakti
onszeiten, multiple identische Reaktionen oder erhöhte
Reagenzkonzentrationen, um diese Reaktionen zum Ab
schluß voranzutreiben).
Diese Apparatur, die grundsätzlich wie zwölf unabhän
gige Peptidsynthetisierer oder -synthesizer funktio
niert, ist durch die Benutzung eines einzigen Ventilma
trix-Blocks vereinfacht, der unten beschrieben wird.
Dieser Ventilmatrix-Block eliminiert die meisten kom
plexen Installationen, die andernfalls zum Aufbau einer
Apparatur dieser Art erforderlich wären.
Dieser Ventilmatrix-Block erlaubt das unabhängige Fül
len einer Mehrzahl von Aufnahmegefäßen aus einer Mehr
zahl von Versorgungsbehältern in einer wirklich simul
tanen oder gleichzeitigen Weise. Der Ventilblock elimi
niert ferner überzählige Rohrleitungen oder -netze und
Verbinder auf Grund der Flüssigkeitsleitungen, die im
Ventilblock selbst eingearbeitet sind, und der an der
Oberfläche montierten Magnetvorsteuer- oder -schaltven
tile.
Der Ventilblock ist tatsächlich eine Ventilmatrix. Zum
Beispiel, wenn es N Zufuhrleitungen gibt, die M Reakti
onsgefäße speisen, ist der Ventilblock N × M, wobei es
jeder der N Zufuhrleitungen möglich ist, in jedes der M
Reaktionsgefäße zuzuführen.
Durch Computersteuerung wird die Versorgung oder Zufuhr
Si zum Reaktionsgefäß Rj für eine ausgewählte Zeit
freigegeben, um die richtige Reaktion zu erzeugen, wäh
rend gleichzeitig eine andere Zufuhr Sk zum Reaktions
gefäß R1 freigegeben wird.
Die wirklich unabhängige Art des Systems erlaubt es,
daß das Ausmaß (Menge an für eine bestimmte Reaktion
herzustellendem Peptid) von Reaktionsgefäß zu Reakti
onsgefäß variiert wird. Diese Eigenschaft verringert
die Menge an erforderlichen Reagenzien dadurch, daß der
Bediener nicht gezwungen wird, mehr Material zu erzeu
gen, als für die folgenden biologischen Experimente nö
tig sein kann.
Der Ventilmatrix-Block ist vollkommen eingeschlossen
und ermöglicht daher nicht, daß gefährliche Lösungsmit
teldämpfe in die Atmosphäre entkommen, wie es bei kom
merziellen Robotersystemen der Fall ist. Alle Reaktio
nen werden in inerter Stickstoff- oder Argonatmosphäre
durchgeführt.
Da diese Apparatur wirklich simultan funktioniert, ist
sie merklich schneller als Robotersysteme, bei denen
jede Synthese tatsächlich einzeln und schrittweise
durchgeführt wird.
Nachdem alle Aminosäuren auf dem Polymerträger zusam
mengefügt wurden, ist die Peptidsynthese abgeschlossen.
Durch Computersteuerung entfernt diese Apparatur das
Peptid von dem Festphasenträger und jeder Seitenketten-
Schutzgruppe. Das gespaltene und völlig unabgeschirmte
Peptid ist in Lösung und wird automatisch von einem Re
aktionsgefäß zu einem getrennten Sammelrohr überführt.
Das Rohr wird aus der Apparatur entfernt und das Peptid
wird von der Lösung isoliert und gereinigt.
Bevorzugte Weiterbildungen der Erfindung sind in den
Unteransprüchen zu den einzelnen unabhängigen Ansprü
chen angegeben.
Die Erfindung wird anschließend beispielhaft anhand be
vorzugter Ausführungsformen unter Bezugnahme auf die
Zeichnung näher erläutert, in der:
Fig. 1 eine perspektivische Ansicht einer
Ausführungsform des Ventilblocks der
vorliegenden Erfindung ist.
Fig. 2 eine Querschnittsansicht des zuerst
in Fig. 1 bezeichneten Ventilblocks
ist und die Verbund- oder Sandwich
bauweise veranschaulicht.
Fig. 3 eine vergrößerte Querschnittsansicht
des Ventilblocks von Fig. 1 ist und
eine offene und eine geschlossene
Ventilanordnung veranschaulicht.
Fig. 4 eine Frontansicht der bevorzugten
Ausführungsform der Erfindung ist und
die Zufuhrflaschen und Reaktionsge
fäße veranschaulicht.
Fig. 5 eine Seitenansicht der bevorzugten
Ausführungsform in Blockform ist und
die Anordnungen der verschiedenen Be
standteile des bevorzugten Peptid
synthetisierers oder -synthesizers
veranschaulicht.
Fig. 6 eine vergrößerte Seitenansicht des
Reaktionsgefäßes ist, das bei der
Ausführungsform von Fig. 5 verwendet
wird.
Fig. 7 ein Blockschaltbild ist, das die Com
puter/Bediener-Schnittstelle veran
schaulicht, die mit dem bevorzugten
Peptidsynthetisierer oder -synthesi
zer verbunden ist.
Fig. 8 ein Arbeitsablaufplan des bevorzugten
Betriebs des Computers ist, der zum
Steuern des Peptidsynthetisierers
oder -synthesizers verwendet wird.
Fig. 9 ein Arbeitsablaufplan des bevorzugten
Betriebs des Peptidsynthetisierers
oder -synthesizers ist.
Fig. 10 eine graphische Darstellung der be
vorzugten Datenzeichenfolge ist, die
vom Computer verwendet wird, um den
Peptidsynthesebetrieb zu steuern.
Fig. 11 eine graphische Darstellung der be
vorzugten Befehlszeichenfolge ist,
die vom Computer zum Leiten des Be
triebs und zum Abrufen von angefor
derten Zustandsinformationen des Pep
tidsynthetisierers oder -synthesizers
verwendet wird.
Durch die Festphasenmethode zusammen mit ihrer Automa
tisierung sind Peptide ohne weiteres für Forscher ver
fügbar. Jedoch ist der Bedarf an kleinen Mengen (1 bis
100 Milligramm) für viele Forschungsgruppen weit größer
als mit aktuell verfügbarer Ausrüstung herstellbar ist,
die grundsätzlich nur einen Syntheseschritt nach dem
anderen ausführt.
Frühere Maschinen haben ihren Durchsatz durch Verwen
dung sequentieller Synthesen, um die Maschinenausfall
zeit außerhalb der Arbeitszeit zu eliminieren, oder
durch die Verwendung von Robotersystemen erhöht, die
eine große Anzahl von Synthesen in einer sequentiellen
Weise bedienen. Diese Systeme sind alle sehr langsam
und bieten minimale Flexibilität bei dem Ausmaß oder
dem Umfang, bei der chemischen Zusammensetzung und bei
den Reaktionsbedingungen.
Da die Forschungsgeschwindigkeit in der Biotechnologie
zunimmt, hat sich die Anzahl der benötigten syntheti
schen Peptide wesentlich erhöht. Die derzeitigen auto
matisierten Synthesizer oder Synthetisierer sind nicht
in der Lage, mit der Nachfrage Schritt zu halten.
Fig. 1 ist eine perspektivische Ansicht einer Ausfüh
rungsform des Ventilblocks der vorliegenden Erfindung.
Der Ventilblock 10 ist eine allgemein flache Anordnung
mit einer Vielzahl von Saugverbindern, wie 11A, 11B und
11D, die in einer Matrixbeziehung angeordnet sind. Bei
dieser Ausführungsform besteht der Ventilblock 10 aus
einer 6 × 9-Gruppierung von Ventilen. Das heißt, daß der
Ventilblock 10 in der Lage ist, sechs verschiedene
Flüssigkeiten wahlweise zu neun verschieden Reaktions
gefäßen zu übertragen.
Zufuhrlöcher 13A, 13B, 13C, usw. nehmen Rohrleitung
auf, die mit den Reaktionsgefäßen in Verbindung stehen.
Die Fachleute erkennen ohne weiteres verschiedenartige
Mechanismen, die geeignet sind, eine ineinandergreifen
de Anordnung zwischen den Löchern, wie 13A, und den
Rohrleitungen (nicht gezeigt) herzustellen, die zu den
Reaktionsgefäßen gehen.
Zufuhrlöcher, wie 12A und 12B, nehmen auch Rohrleitung
von den Zufuhrbehältern von Aminosäuren, Kopplungsmit
teln und Deblockierungsmaterialien (Materialien, die
die Schutzgruppen entfernen) auf.
Bei dieser Anwendung sei angenommen, daß eine Ami
nosäure X einem Zufuhrloch 12A und eine Aminosäure Y zu
12B zugeführt wird. Durch Aktivierung eines Soges oder
Saugens durch 11A wird die Aminosäure X zum Reaktions
gefäß übertragen, das mit 13A verbunden ist. In glei
cher Weise gestattet ein an 11B erzeugter Sog, daß die
Aminosäure X zum Reaktionsgefäß übertragen wird, das
mit 13B verbunden ist, und der Sog an 11D ermöglicht
der Aminosäure Y zum Reaktionsgefäß übertragen zu wer
den, das mit 13C verbunden ist.
Zu beachten ist der wichtige Gesichtspunkt der vorlie
genden Erfindung, daß alle drei Ventile 11A, 11B und
11D gleichzeitig offen sind, so daß die Zuführmengen
der Aminosäuren oder anderen gewünschten Materialien,
durch die Verwendung der Ventilmatrix zur genau glei
chen Zeit abgegeben werden können.
Bei der vorliegenden Ausführungsform ist es möglich,
daß neun verschiedene Ventile geöffnet sind, so daß je
des der neun Reaktionsgefäße gleichzeitig oder simultan
Materialien erhält.
Fig. 2 ist eine Querschnittsansicht des zuerst in Fig. 1
bezeichneten Ventilblocks und veranschaulicht die
Verbund- oder Schichtbauweise.
Der Ventilblock besteht aus einem Verbund von mehreren
Schichten. Die untere Schicht 24 ist ein im wesentli
chen flaches Materialstück, das darüberliegend eine
Schutzschicht 25B aufweist. Die Schutzschicht 25B wird
bei dieser Ausführungsform verwendet, um die Schicht 24
davor zu schützen, mit den Aminosäuren und anderen der
art ätzenden Materialien zu reagieren, die durch die
Ventile und Kanäle übertragen werden können.
Die Schicht 23 besteht aus einem Material, das gegen
Reaktionen mit den Aminosäuren und ähnlichem beständig
ist. Bei der bevorzugten Ausführungsform besteht die
Schicht 23 aus Polyphenylensulfid. In der Schicht 23
sind Kanäle und Löcher geschaffen, um die Flüssigkeiten
von den Zufuhrbehältern zu den Reaktionsgefäßen zu be
fördern.
Die Schutzschicht 25A schirmt die Schicht 22 von den
Aminosäuren ab. Die Schicht 22 wird verwendet, um die
Ventilstellen zu erzeugen, die mit der Pumpe (nicht ge
zeigt) über Sogverbinder, wie 21A, 21B und 21C, in Ver
bindung stehen.
Durch Sichern dieses Verbundes unter Verwendung von
Schrauben oder anderen derartigen Verbindungsmitteln
bildet die Anordnung einen starren Körper, der für eine
Vielzahl von Anwendungen geeignet ist.
Fig. 3 ist eine vergrößerte Querschnittsansicht des
Ventilblocks von Fig. 1 und veranschaulicht eine offe
ne und eine geschlossene Ventilanordnung.
Wie vorher angegeben wurde, ist der Ventilblock aus ei
nem Verbund aus Schicht 22, Schutzschicht 25A, Schicht
23, Schutzschicht 25B und Schicht 24 aufgebaut. Inner
halb der Schicht 23 sind Kanäle für die Übertragung
oder Leitung von Flüssigkeiten und Gasen geschaffen.
Die Kanäle 31A und 31B erstrecken sich senkrecht zur
Zeichenebene und werden verwendet, um Aminosäuren und
andere Materialien von den Behältern zuzuführen. Diese
Kanäle werden entweder durch eine Schleifbehandlung,
Fräsen, Ätzen oder eine ähnliche den Fachleuten bekann
te Weise erzeugt.
Die Kanäle 31A und 31B stehen mit den Ventilen jeweils
über Löcher 35A und 35B in Verbindung. Die Ventilstel
len 32A und 32B sind so aufgebaut, daß sie ihr ange
schlossenes Zufuhrloch (35A beziehungsweise 35B) und
den Abgabekanal 36 überlagern.
Bei dieser Ausführungsform ist der Abgabekanal 36 auf
der gegenüberliegenden Seite der Schicht 23 geschaffen
und im wesentlichen senkrecht zu den Zufuhrkanälen 31A
und 31B. Diese Anordnung erlaubt einen leichten Zugang
zwischen Zufuhr- und Abgabekanälen über die Ventile und
erzeugt eine Ventilmatrix.
Ein geschlossenes Ventil ist an der Ventilstelle 32A
dargestellt. Ein Druck 30A wird über den Sog- oder
Saugverbinder 21A und das Loch 33A geliefert und drückt
die Schutzschicht 25A über dem Zufuhrloch 35A fest ge
gen die Schicht 23. Flüssigkeiten oder Gase vom Zufuhr
kanal 31A können nicht hindurchgehen und infolgedessen
ist die Ventilstelle 32A geschlossen.
Die Ventilstelle 32B ist offen. Sog 30B wird von einer
nicht gezeigten Pumpe über den Sogverbinder 21B und das
Loch 33B geliefert. Dies zieht einen Teil der Schutz
schicht 25A nach oben in die Aushöhlung der Ventil
stelle 32B, wodurch es Flüssigkeiten oder Gasen ermög
licht wird, vom Zufuhrkanal 31B nach oben durch das Zu
fuhrloch 35B und in den Kanal 36 zu fließen, wie durch
den Pfeil 34 veranschaulicht ist.
Bei der der bevorzugten Ausführungsform sind die Ven
tile normalerweise geschlossen (Pneumatikdruck wird ih
nen zugeführt). Wenn ein Ventil geöffnete werden soll,
wird der Druck an diesem Ventil abgeschaltet und an
diesem Ventil ein Sog angelegt.
Obgleich bei der bevorzugten Ausführungsform bei der
Anwendung der Peptidsynthese nur ein Ventil pro Abgabe
kanal offen ist, gibt es einige Situationen oder Gele
genheiten, in denen viele Ventile pro Kanal gleichzei
tig geöffnet sind, um den Betrieb zu beschleunigen.
Zu bemerken ist, daß ein einziger Zufuhrkanal in der
Lage ist, Flüssigkeiten oder Gase zu jeder oder irgend
einer ausgewählten Gruppe von Abgabekanälen zu liefern.
Fig. 4 ist eine Frontansicht der bevorzugten Ausfüh
rungsform der Erfindung und veranschaulicht die Zufuhr
flaschen und Reaktionsgefäße.
Bei dieser Ausführungsform sind sowohl die Reaktionsge
fäße als auch die Zufuhrbehälter an der Vorderseite der
Apparatur zugänglich. Wie gezeigt ist, verwendet diese
Ausführungsform zwölf verschiedene Reaktionsgefäße 41,
R1-R12. Jedes Reaktionsgefäß ist durch Betätigung ei
nes zugehörigen Freigabemechanismus 43 abnehmbar. Bei
spielsweise ist das Reaktionsgefäß R5 durch den Freiga
bemechanismus 44 abnehmbar.
Aminosäuren sind in den Zufuhrbehältern 42, S1-S20.
Obgleich die Vorrichtung mit Sensoren ausgerüstet ist,
um festzustellen, wenn ein Zufuhrbehälter leer ist (wie
später dargestellt wird), bestehen die Zufuhrbehälter
aus klarem Material, wie Glas, um eine schnelle visuel
le Überprüfung ihres Zustandes zu erlauben.
Die Verwendung des vorher dargestellten Ventilblocks
gestattet es, jede der zwanzig Flüssigkeiten von den
Zufuhrbehältern wahlweise zu irgendeinem oder jedem der
zwölf Reaktionsgefäße zu übertragen.
Fig. 5 ist eine Seitenansicht der bevorzugten Ausfüh
rungsform in Blockform und veranschaulicht die Anord
nungen der verschiedenartigen Bestandteile des bevor
zugten Peptidsynthetisierers oder -synthesizers.
Wie vorher erörtert wurde, sind die Zufuhrbehälter 42,
Reaktionsgefäße 41 und Freigabemechanismen 43 alle an
der Vorderseite der Maschine angeordnet, um einen
schnellen Zugriff für die Entfernung und Ersetzung zu
ermöglichen.
Der Sensor 55 wird verwendet, um festzustellen, daß
Flüssigkeit vom Zufuhrbehälter hindurchgeht. Die Flüs
sigkeit wird durch eine Pneumatikbetätigung und die
Rohrleitung 53 zum Ventilblock 51 übertragen. Pneuma
tikeinlaßventile 52 werden verwendet, um diese Pump
aktion zu ermöglichen, und werden ferner dazu verwen
det, den für den Betrieb der Ventile erforderlichen Sog
und Druck in dem Ventilblock 51 bereitzustellen, wie
vorher diskutiert wurde.
Die Flüssigkeiten werden durch das Rohr 54 vom Ventil
block 51 zum Reaktionsgefäß übertragen oder geleitet.
Der Betrieb der gesamten Maschine wird durch den Compu
ter 50 gesteuert.
Auf diese Weise ist der Computer 50 in der Lage, den
Zustand des Zufuhrbehälters 42 über Sensoren, wie den
Sensor 55, zu überwachen. Die Flüssigkeitsvolumina, die
übertragen werden, werden durch den Sensor 56 über
wacht, der mit dem Ventilblock 51 in Verbindung steht.
Beim Betrieb ist das Rohr 54 bis zu der Zeit leer, bis
Flüssigkeit übertragen werden soll. Auf das Öffnen des
geeigneten Ventils im Ventilblock 51 hin wird Flüssig
keit in das Rohr 54 übertragen oder geleitet. Die Länge
des Rohrs 54 zwischen dem Sensor 56 und dem Ventilblock
57 ist hinsichtlich der Länge und des Volumens festge
legt. Infolgedessen, wenn der Sensor 56 die Anwesenheit
einer Flüssigkeit feststellt, begründet dies ein be
kanntes Referenz- oder Vergleichsvolumen, das von der
Steuerung 50 verwendet wird. Zusätzliche Volumina wer
den durch zeitliche Koordinierung der Öffnung des Ven
tils im Ventilblock 57 eingerichtet.
Dank des automatisierten Systems werden bei dieser Aus
führungsform zwölf verschiedene Reaktionen ohne einen
Bedienereingriff noch die physische Bewegung der Zu
fuhrbehälter gleichzeitig ausgeführt.
Fig. 6 ist eine vergrößerte Seitenansicht des Reakti
onsgefäßes, das bei der Ausführungsform von Fig. 5
verwendet wird.
Die Möglichkeit, die Reaktionsgefäße leicht von der
Vorrichtung zu entfernen, ist dadurch ein wichtiger Ge
sichtspunkt, daß es die Abschaltzeit der Maschine zwi
schen den Peptidsynthesen verringert und ferner die
Möglichkeiten des Abfalls oder Verschüttens vermindert.
Das Reaktionsgefäß 41 hat an seinem oberen Ende einen
Kugelventilsitz 61A, der automatisch schließt, wenn der
Druck, der über einen Verbinder 62A auf den Kugelven
tilsitz 61A wirkt, über den Freigabemechanismus 43 ab
geschaltet wird. Das Rohr 54 erstreckt sich durch den
Verbinder 62A, um geeignet mit dem Reaktionsgefäß 41 in
Verbindung zu stehen.
Ähnlich befindet sich am unteren Ende des Reaktionsge
fäßes 41 ein Kugelventilsitz 61B, der über einen Ver
binder 62B mit einem Gasstrom in Verbindung ist, um ei
ne geeignete Bewegung innerhalb des Reaktionsgefäßes zu
ermöglichen.
Auf diese Weise ermöglicht das Lösen des Reaktionsge
fäßes 41 durch den Freigabemechanismus 43, daß das Re
aktionsgefäß schnell und leicht von der Vorrichtung
entfernt wird.
Wenn das Entfernen derart ausgeführt wurde, kann ein
anderes Reaktionsgefäß ohne weiteres eingefügt und das
entfernte Gefäß gelagert oder dem Bediener übergeben
werden, der das darin enthaltene Peptid benötigt.
Fig. 7 ist ein Blockschaltbild, das die Compu
ter/Bediener-Schnittstelle veranschaulicht, die mit dem
bevorzugten Peptidsynthetisierer oder -synthesizer ver
bunden ist.
Bei der bevorzugten Ausführungsform hängt ein externes
Computersystem 71 einschließlich einer Tastatur 70 und
einem Videobildschirm 72 mit dem vorbeschriebenen Pep
tidsynthetisierer oder -synthesizer 40 zusammen und
leitet ihn. Bei dieser Ausführungsform besteht die Pro
grammsteuerung aus zwei Softwareteilen, die zusammenar
beiten.
An der externen Computersystemstufe 71 läuft ständig
ein Multitasking- oder Mehrprozeß-Kern, der Mitteilun
gen oder Meldungen vom Peptidsynthetisierer oder
-synthesizer 40 erhält, Bedienerschnittstellenprozesse
ausführt und Befehle an den Peptidsynthetisierer 40
schickt.
Dieser Multitaskbetriebskern oder -kernel besteht aus
einem Standard eines allgemeinen oder gemeinsamen An
wenderzugriffs (Engl.: "Common User Access standard" =
"CUA standard") (wie die von International Business
Machines entwickelte "CUA"-Schnittstelle), der es dem
Anwender erlaubt, bis zu zwölf Tätigkeiten oder Ope
rationen gleichzeitig an dem Peptidsynthetisierer oder
-synthesizer zu starten/stoppen, während der Anwender
gleichzeitig in der Lage ist, verschiedenartige Bear
beitungsoperationen auf dem externen Computer vorzuneh
men. Diese Bearbeitungsfunktionen sind nützlich zum De
finieren des zum Synthetisieren bestimmten Peptids.
Der Multitaskbetriebskern ist ereignisbetätigt und der
gesamte Vorgang ist durch Meldungs- oder Nachrichten
protokolle mit dem Peptidsynthetisierer oder -synthesi
zer 40 verknüpft.
Der zweite Softwareteil befindet sich im Peptidsynthe
tisierer oder -synthesizer und ist auf einer Grundpla
tinenanordnung eingerichtet. Diese Software verwendet
eine Vielzahl von Unterbrechungen oder Interrupts, um
ihre Aufgaben oder Prozesse, Ereignisse und Kommunika
tion mit dem externen Computer anzuzeigen. Ihr gesamter
Betrieb ist interruptbetätigt und der Peptidsyntheti
sierer handelt als eine "Arbeitsrechner"-Vorrichtung
für den externen Computer 71.
Der externe Computer 71 initiiert die gesamte Kommuni
kation, die einen Interrupt an der Peptidsynthetisie
rerstufe 40 verursacht.
Fig. 8 ist ein Ablaufdiagramm des bevorzugten Betriebs
des Computers, der beim Steuern des Peptidsynthetisie
rers oder -synthesizers 40 verwendet wird.
Wenn einmal das Programm gestartet wurde (bei 80), gibt
der Bediener die Peptiddefinition ein (bei 81A). Diese
Definition nimmt eine Vielzahl von Formen an, ein
schließlich einer Bibliotheksdefinition, wie "Stelle
Peptid mit der I. D. Nr. 367 her", einer chemischen De
finition des Peptids oder einer schrittweisen Defini
tion von dem, was getan werden muß.
Basierend auf der Peptiddefinition richtet der externe
Computer einen Satz Interrupts und Befehle ein (bei
82A), die die Wünsche des Bedieners erfüllen.
Wenn auch noch ein anderes Peptid gewünscht wird (bei
83A), dann geht das Programm in einer Schleife zurück,
um eine weitere Peptiddefinition zu gestatten (bei
81A). Wenn nicht, wird die Uhr- oder der Taktgegeber
und die Überwachung gestartet (bei 82B).
Unter Verwendung der eingestellten Interrupts oder Un
terbrechungen überwacht das Programm, ob ein Interrupt
erreicht wurde (bei 83B). Ein Interrupt kann intern er
zeugt worden sein oder von den programmeigenen, einge
richteten Interrupts erhalten werden, die für eine spe
zielle Peptidsynthese erzeugt wurden.
Der Interrupt wird analysiert, um anzuzeigen, ob es ei
ne Bedienerunterbrechung (83C) ist. Wenn dies der Fall
ist, wählt der Bediener (bei 83D), um entweder zu stop
pen (bei 84) oder ein weiteres Peptid (81A) zu definie
ren. Eine Halt- oder Stoppbetätigung (bei 84) wird ty
pischerweise in einer Notsituation ausgeführt, da die
Arbeit, die in den Reaktionsgefäßen ausgeführt wird,
verloren gehen kann, wenn sie nicht genau überwacht
wird.
Die Wahlmöglichkeit für einen Bediener, ein weiteres
Peptid zu definieren, selbst nachdem das Programm be
gonnen hat, ist wichtig. In dieser Situation wird dem
Bediener ein großer Grad an Freiheiten überlassen, da
nun der Peptidsynthetisierer oder -synthesizer mit ei
nigen Sätzen von Peptiden gestartet werden kann, z. B.
sieben verschiedenen, und dann später, wenn die Notwen
digkeit entsteht, werden noch mehr Peptide hinzugefügt.
Der Peptidsynthetisierer oder -synthesizer ist nicht
"festgelegt", wenn er einmal gestartet wurde, sondern
es ist ein dynamischer Betrieb, bei dem die fortlaufen
den verschiedenartigen Peptidsynthesen verschiedene
Stufen der Fertigstellung haben können.
Auf diese Weise arbeitet das gesamte System wie zwölf
unabhängige Synthesizer, die es dem Anwender erlauben,
willentlich jede Reaktion zu starten und zu stoppen,
ohne die anderen Reaktionen zu stören.
Wenn der Interrupt nicht vom Bediener erzeugt wurde,
wurde der Interrupt durch das Programm bei (82A) er
zeugt und nun müssen die geeignete Aminosäure oder an
dere Tätigkeiten gleichzeitig ein- bzw. ausgeführt wer
den. Unter Verwendung der mit dem Interrupt verbundenen
Informationen, wird eine Überprüfung ausgeführt, um zu
sehen, ob die benötigte Aminosäure (oder eine andere
ähnliche Flüssigkeit) verfügbar ist (bei 83E).
Wenn die Flüssigkeit nicht verfügbar ist, wird diese
bestimmte Peptidsynthese beendet (bei 82E). Die Inter
rupts dieses Peptids werden aufgehoben (bei 82F) und
dem Bediener wird angezeigt oder gemeldet (bei 81B),
daß der benötigte Behälter leer ist. Das Programm fährt
mit dem Überwachen von Interrupts fort (bei 83B).
Zu beachten ist, daß in dieser Situation der Vorgang
für alle anderen Peptidsynthesen im Prozeß weitergeht.
Nur die Synthese, die eine Aminosäure von dem leeren
Behälter erfordert, wird aufgehoben. Der Bediener ist
in der Lage, den Behälter aufzufüllen und die aufgeho
bene Synthese wieder anzufangen.
Wenn davon ausgegangen wird, daß die geeignete Ami
nosäure verfügbar ist (bei 83E), dann veranlaßt der ex
terne Computer den Peptidsynthetisierer oder -synthesi
zer, die richtige Menge zum Reaktionsgefäß zu übergeben
(bei 82C). Wenn einmal die Aminosäure übergeben ist,
wird der Kanal zum Reaktionsgefäß für spätere Operatio
nen von jeglichem Fluid gereinigt (bei 82D). Die Fach
leute erkennen ohne weiteres verschiedenartige Methoden
zum Entleeren oder Reinigen des Kanals. Bei der bevor
zugten Ausführungsform wird Stickstoff in den Kanal ge
geben, um ihn zu entleeren, gefolgt von einem Lösungs
mittel, um ihn zu reinigen.
Nach dem Reinigen kehrt das Programm zurück, um einen
weiteren Interrupt (bei 83B) abzuwarten.
Auf diese Weise erzeugt das Programm einen dynamischen
Rahmen, durch den mehrere Peptide gleichzeitig und un
abhängig erzeugt werden können.
Fig. 9 ist Ablaufdiagramm der bevorzugten Betätigung
des Peptidsynthetisierers oder -synthesizers.
Wenn einmal der Start (90) eingetreten ist, sucht das
Programm nach eingehenden Mitteilungen und geht in ei
ner Schleife zurück (bei 91A), wenn noch keine erhal
ten wurden. Der Peptidsynthetisierer oder -synthesizer
ist eine Nebenvorrichtung zum externen Computer und
überprüft als solche eingehende Mitteilungen oder Mel
dungen, um zu bestimmen, was zu tun ist.
Wenn einmal eine Meldung empfangen wurde, wird die Art
des Befehls (bei 91B) bestimmt. Befehle fallen allge
mein in drei verschiedene Kategorien: Frage, Halt und
Befehl.
Wenn die Meldung eine Frage ist, dann wird die Art der
gesuchten Informations (91C) bestimmt. Fragen nach der
Betriebsart erfordern, daß der Maschinenzustand (94B)
zum externen Computer übertragen wird. Dann geht das
Programm zurück, um weitere eingehende Meldungen 91A zu
erwarten. Wenn die Frage Informationen über die Zufüh
rungen innerhalb des Peptidsynthetisierers sucht, dann
wird die Verfügbarkeit der Aminosäuren (und anderer
Flüssigkeiten) zurück zum externen Computer übertragen
(bei 94A) und das Programm geht zurück, um weitere ein
gehende Meldungen zu erwarten.
Wenn die ankommende Meldung als ein Halt oder Stopp be
stimmt wird (bei 91B), dann wird der Ablauf des Pro
gramms und infolgedessen der Synthesizer gestoppt oder
angehalten (bei 92).
Wenn die ankommende Meldung als ein Befehl bestimmt
wird (bei 91B), wird der Befehl analysiert, um zu be
stimmen, welche Reaktionsgefäße betroffen sind und wel
che Zeit erforderlich ist, um die Aminosäure zu über
tragen (bei 93A). Alle Ventile im Ventilblock sind ge
schlossen (bei 93B). Die geeigneten Ventile sind für
die im Befehl (93C) spezifizierte Zeit geöffnet. Wenn
einmal die richtige Menge von Aminosäure zum Reaktions
gefäß übertragen wurde, kehrt das Programm zurück, um
eingehende Meldungen (91A) zu überwachen.
Auf diese Weise strukturiert das Programm den Peptid
synthetisierer oder -synthesizer, um nur auf die Be
fehle des externen Computers zu reagieren.
Fig. 10 ist eine graphische Darstellung der bevorzug
ten Datenzeichenfolge, die vom Computer zur Steuerung
des Peptidsynthesebetriebs verwendet wird.
Daten, die vom externen Computer zum Peptidsynthetisie
rer oder -synthesizer übertragen werden, sind als eine
Zeichenfolge strukturiert, mit einem Datengruppen- oder
Dateianfang 100 (Engl.: "Start Of File" = SOF), der von
N Vierzehn-Bit-Wörtern, wie 101A, 101B und 101C gefolgt
ist. Die Übertragung wird durch ein Datengruppen- oder
Dateiende 102 (Engl.: "End Of File" = EOF) beendet.
Jedes der Vierzehn-Bit-Wörter 103 ist in eine Reakti
onsgefäß-Identifikationszahl 104A (vier Bits), in eine
Zufuhrmaterialzahl (fünf Bits) 104B und in einen Zeit
wert (fünf Bits) 104C decodiert.
Die Reaktionsgefäßzahl oder -nummer gibt einen von auf
einanderfolgenden Werten an, die von 1 bis N gehen und
die Nummer für die Reaktionsgefäße des einzelnen Pep
tidsynthetisierers oder -synthesizers sind. Infolgedes
sen würde das Reaktionsgefäß für Abschnitt 101A mit
0001 bezeichnet, für 101B ist die Reaktionsgefäßnummer
0010, usw.
Wenn mit einem bestimmten Reaktionsgefäß keine Tätig
keit ausgeführt werden muß, zeigt der Zufuhrmaterialab
schnitt 00000 an. Andernfalls bezeichnet die Zufuhrma
terialzahl die Quelle des Stoffes (d. h. Aminosäure für
Behälter sieben - "00111"), der in das bestimmte Reak
tionsgefäß zu übertragen ist.
Die Zeit der Ventilöffnung ist in Zehntelsekunden ange
geben. Diese Bedingung variiert mit den Kanalabmessun
gen im Ventilblock und dem Druck, der zum Übertragen
der Flüssigkeit verwendet wird. Die Zeit wird verwen
det, um einzustellen, wieviel Flüssigkeit übertragen
wird.
Fig. 11 ist eine graphische Darstellung der bevorzug
ten Befehlszeichenfolge, die vom Computer zum Leiten
des Betriebs und zum Abrufen von angeforderten Zu
standsinformationen des Peptidsynthetisierers oder
-synthesizers verwendet wird.
Informationsnachfragen werden durch eine Zeichenfolge
übertragen, die einen Datengruppen- oder Dateianfang
110 haben (Engl.: "Start Of File" = SOF), der von einem
Vierzehn-Bit-Befehl 111 und dann einem Datengruppen-
oder Dateiende 112 (Engl.: "End Of File" = EOF) gefolgt
wird. Der Vierzehn-Bit-Befehl 113 setzt sich zusammen
aus einem Vier-Bit-Identifizierungszeichen, das 0000
ist. Diese Struktur wird verwendet, um diese Art der
Mitteilung von der in Fig. 10 dargestellten zu unter
scheiden.
Der Wert des Zwei-Bit-Identifizierungszeichens 114B
wird verwendet, um anzuzeigen, wenn ein Maschinenzu
stand, Zufuhrzustand, Betriebsbefehl oder eine Notfall
abschaltung übertragen wird.
Das Befehlsidentifizierungszeichen 114C ist ein Acht-
Bit-Befehl, der angibt, welcher Befehl auszuführen ist.
Der Bereich der Befehle variiert stark von einer Aus
führungsform zu einer anderen und die Befehle werden
entsprechend eingestellt.
Zusammenfassend wird dazu eine Matrix aus Ventilen
durch Verwendung eines Verbundes aus drei Schichten 22,
23, 24 mit einer zwischen zwei der Schichten zwischen
gelegten nachgiebigen Membrane 25A gebildet. Zufuhrka
näle 25B und Abgabekanäle 35A, 35B werden durch Ätzen,
Fräsen oder andere derartige Mittel auf der mittleren
Schicht 23 geschaffen. Jeder Zufuhrkanal steht mit al
len Abgabekanälen über eine Ventilstelle 32A in Verbin
dung, die über Pneumatikdruck 30A, 30B auf die nachgie
bige Membrane geöffnet oder geschlossen wird. Die Bewe
gung der nachgiebigen Membrane wird durch Sog oder
Druck bewirkt, wie er durch Löcher in der überlagernden
Schicht übertragen wird. Auf diese Weise werden ausge
wählte Zufuhr- und Abgabeleitungen durch geeigneten Sog
verbunden, der auf die Membrane angesetzt wird. Der
sich daraus ergebende Peptidsynthesizer oder DNA-
Synthesizer liefert Aminosäuren 42 zu zwei oder mehr
Reaktionsgefäßen 41 gleichzeitig. Der Computer 71 im
Synthesizer öffnet wenigstens zwei Ventile, um es Ami
nosäuren zu ermöglichen, gleichzeitig zu wenigstens
zwei verschieden Reaktionsgefäßen zu fließen. Die abge
gebenen Aminosäuren bilden eine Teilmenge der verfügba
ren, in den einzelnen Behältern gespeicherten Aminosäu
ren. Die Anzahl der Elemente in der Abgabeteilmenge ist
so klein wie eine einzelne Aminosäure, oder so groß wie
die Gesamtanzahl der verfügbaren Behälter. Auf diese
Weise arbeitet jedes Reaktionsgefäß unabhängig und
gleichzeitig in einem einzigen Peptidsynthesizer.
Es ist durch das Voranstehende deutlich, daß die vor
liegende Erfindung einen stark verbesserten Peptid
synthetisierer oder -synthesizer mit der Fähigkeit
schafft, gleichzeitig Peptide zu synthetisieren oder
aufzubauen.
Claims (62)
1. Ventilsystem umfassend:
- a) Pneumatikeinrichtungen zum Bereitstellen einer Saugkraft und einer Druckkraft,
- b) einen Ventilblock mit
- 1) einer ersten Schicht mit einer im wesentlichen ebenen ersten Oberfläche,
- 2) einer zweiten Schicht mit wenigstens zwei Zu fuhrkanälen und wenigstens zwei Abgabekanälen, wobei die zweite Schicht ferner wenigstens vier Ventilstellen hat, um fließendes Material von jedem der Zufuhrkanäle zu jedem der Abga bekanäle zu übertragen, und wobei die zweite Schicht über der ersten Oberfläche der ersten Schicht angeordnet ist,
- 3) einer dritten Schicht mit Ventillöchern und Hohlräumen, die über jeder der wenigstens vier Ventilstellen der zweiten Schicht angeordnet sind, und
- 4 einer nachgiebigen Schicht, die zwischen die zweite Schicht und die dritte Schicht zwi schengelegt ist, wobei die nachgiebige Schicht flexibel auf Sog anspricht, wodurch ein Teil der nachgiebigen Schicht in einen angeschlos sen Hohlraum gezogen und ein Fluß von einem der Zufuhrkanäle zu dem Abgabekanal durch die Ventilstelle zugelassen wird, und wobei die nachgiebige Schicht ferner auf Druck an spricht, um den Teil der nachgiebigen Schicht gegen die Ventilstelle der zweiten Schicht zu pressen, so daß ein Fluß von dem Zufuhrkanal zu dem Abgabekanal verhindert wird, und
- c) Steuereinrichtungen, um Sog und Druck von den Pneumatikeinrichtungen zu den ausgewählten Ventil stellen zu übertragen.
2. Ventilsystem nach Anspruch 1, dadurch gekennzeichnet,
daß die Steuereinrichtungen jede Ventilstelle, die
keinen Sog von den Pneumatikeinrichtungen erhält, mit
Druck versorgen.
3. Ventilsystem nach Anspruch 2, dadurch gekennzeichnet,
daß es ferner umfaßt:
- a) Einrichtungen zum wahlweisen Versorgen einer aus gewählten Gruppe von Ventillöchern der dritten Schicht mit Pneumatikdruck, und
- b) Einrichtungen zum wahlweisen Versorgen einer aus gewählten Gruppe von Ventillöchern der dritten Schicht mit Pneumatiksog.
4. Ventilsystem nach Anspruch 3, dadurch gekennzeichnet,
daß es ferner eine erste Schutzschicht, die zwischen
der ersten Schicht und der zweiten Schicht angeordnet
ist, und eine zweite Schutzschicht umfaßt, die zwi
schen der nachgiebigen Schicht und der zweiten Schicht
angeordnet ist.
5. Ventilsystem nach Anspruch 4, dadurch gekennzeichnet,
daß die zweite Schicht aus einem chemisch reaktionsbe
ständigen Material besteht.
6. Ventilsystem nach Anspruch 5, dadurch gekennzeichnet,
daß die Abgabekanäle und die Ventilstellen auf einer
den Zufuhrkanälen gegenüberliegenden Seite angeordnet
sind.
7. Ventilsystem nach Anspruch 6, dadurch gekennzeichnet,
daß es ferner Einrichtungen zum Spülen der Abgabeka
näle enthält.
8. Ventilsystem nach Anspruch 7, dadurch gekennzeichnet,
daß die Einrichtungen zum Spülen Einrichtungen zum
Leiten von gasförmigem Stickstoff in die Abgabekanäle
enthalten.
9. Ventilsystem nach Anspruch 8, dadurch gekennzeichnet,
daß es ferner enthält:
- a) Einrichtungen zum Einleiten eines flüssigen Reini gungsmittels an einem Ende jedes Abgabekanals, und
- b) einen Abfallbehälter, der wahlweise mit einem ge genüberliegenden zweiten Ende jedes Abgabekanals in Verbindung steht.
10. Ventilsystem nach Anspruch 6, dadurch gekennzeichnet,
daß der Hohlraum der dritten Schicht einen Teil der
Abgabekanäle überlagert.
11. Ventilmatrix mit:
- a) einer ersten Schicht mit einer im wesentlichen ebenen ersten Oberfläche,
- b) einer zweiten Schicht mit wenigstens zwei Zufuhr kanälen und wenigstens zwei Abgabekanälen, wobei die zweite Schicht ferner wenigstens vier Ventil stellen hat, um fließendes Material von jedem der Zufuhrkanäle zu jedem der Abgabekanäle zu übertra gen, und wobei die zweite Schicht über der ersten Oberfläche der ersten Schicht angeordnet ist,
- c) einer dritten Schicht mit Ventillöchern und Hohl räumen, die über jeder der wenigstens vier Ventil stellen der zweiten Schicht angeordnet sind, und
- d) einer nachgiebigen Schicht, die zwischen die zwei te Schicht und die dritte Schicht zwischengelegt ist, wobei die nachgiebige Schicht flexibel auf Sog anspricht, wodurch ein Teil der nachgiebigen Schicht in einen angeschlossen Hohlraum gezogen und ein Fluß von einem der Zufuhrkanäle zu dem Ab gabekanal durch die Ventilstelle zugelassen wird, und wobei die nachgiebige Schicht ferner auf Druck anspricht, um den Teil der nachgiebigen Schicht gegen die Ventilstelle der zweiten Schicht zu pressen, so daß ein Fluß von dem Zufuhrkanal zu dem Abgabekanal verhindert wird.
12. Ventilmatrix nach Anspruch 11, dadurch gekennzeichnet,
daß sie ferner umfaßt:
- a) Einrichtungen zum wahlweisen Versorgen einer aus gewählten Gruppe von Ventillöchern der dritten Schicht mit Pneumatikdruck, und
- b) Einrichtungen zum wahlweisen Versorgen einer aus gewählten Gruppe von Ventillöchern der dritten Schicht mit Pneumatiksog.
13. Ventilmatrix nach Anspruch 12, dadurch gekennzeichnet,
daß sie ferner eine erste Schutzschicht, die zwischen
der ersten Schicht und der zweiten Schicht angeordnet
ist, und eine zweite Schutzschicht umfaßt, die zwi
schen der nachgiebigen Schicht und der zweiten Schicht
angeordnet ist.
14. Ventilmatrix nach Anspruch 13, dadurch gekennzeichnet,
daß die zweite Schicht aus einem chemisch reaktionsbe
ständigen Material besteht.
15. Ventilmatrix nach Anspruch 14, dadurch gekennzeichnet,
daß die Abgabekanäle und die Ventilstellen auf einer
den Zufuhrkanälen gegenüberliegenden Seite angeordnet
sind.
16. Ventilmatrix nach Anspruch 15, dadurch gekennzeichnet,
daß sie ferner Einrichtungen zum Freispülen der Abga
bekanäle von ausgewähltem Flußmaterial enthält.
17. Ventilmatrix nach Anspruch 16, dadurch gekennzeichnet,
daß die Einrichtungen zum Spülen Einrichtungen zum
Leiten von gasförmigem Stickstoff in die Abgabekanäle
enthalten.
18. Ventilmatrix nach Anspruch 17, dadurch gekennzeichnet,
daß sie ferner enthält:
- a) Einrichtungen zum Einleiten eines flüssigen Reini gungsmittels an einem Ende jedes Abgabekanals, und
- b) einen Abfallbehälter, der wahlweise mit einem ge genüberliegenden zweiten Ende jedes Abgabekanals in Verbindung steht.
19. Ventilmatrix nach Anspruch 15, dadurch gekennzeichnet,
daß der Hohlraum der dritten Schicht einen Teil der
Abgabekanäle überlagert.
20. Peptidsynthesesystem mit:
- a) Pneumatikeinrichtungen zum Bereitstellen einer Saugkraft und einer Druckkraft,
- b) einem Ventilblock mit
- 1) einer ersten Schicht mit einer im wesentlichen ebenen ersten Oberfläche,
- 2) einer zweiten Schicht mit wenigstens zwei Zu fuhrkanälen und wenigstens zwei Abgabekanälen, wobei die zweite Schicht ferner wenigstens vier Ventilstellen hat, um fließendes Material von jedem der Zufuhrkanäle zu jedem der Abga bekanäle zu übertragen, und wobei die zweite Schicht über der ersten Oberfläche der ersten Schicht angeordnet ist,
- 3) einer dritten Schicht mit Ventillöchern und Hohlräumen, die über jeder der wenigstens vier Ventilstellen der zweiten Schicht angeordnet sind, und
- 4) einer nachgiebigen Schicht, die zwischen die zweite Schicht und die dritte Schicht zwi schengelegt ist, wobei die nachgiebige Schicht flexibel auf Sog anspricht, wodurch ein Teil der nachgiebigen Schicht in einen angeschlos sen Hohlraum gezogen und ein Fluß von einem der Zufuhrkanäle zu dem Abgabekanal durch die Ventilstelle zugelassen wird, und wobei die nachgiebige Schicht ferner auf Druck an spricht, um den Teil der nachgiebigen Schicht gegen die Ventilstelle der zweiten Schicht zu pressen, so daß ein Fluß von dem Zufuhrkanal zu dem Abgabekanal verhindert wird,
- c) wenigstens zwei Reaktionsgefäßen, von denen jedes in Verbindung mit einem der Abgabekanäle steht,
- d) wenigstens zwei Aminosäurebehältern, von denen je der in Verbindung mit einem der Zufuhrkanäle steht, und
- e) Steuereinrichtungen, um Sog und Druck von den Pneumatikeinrichtungen zu den ausgewählten Ventil stellen zu übertragen.
21. Peptidsynthesesystem nach Anspruch 20, dadurch gekenn
zeichnet, daß die Steuereinrichtungen jede Ventil
stelle, die keinen Sog von den Pneumatikeinrichtungen
erhält, mit Druck versorgen.
22. Peptidsynthesesystem nach Anspruch 21, dadurch gekenn
zeichnet, daß es ferner umfaßt:
- a) Einrichtungen zum wahlweisen Versorgen einer aus gewählten Gruppe von Ventillöchern der dritten Schicht mit Pneumatikdruck, und
- b) Einrichtungen zum wahlweisen Versorgen einer aus gewählten Gruppe von Ventillöchern der dritten Schicht mit Pneumatiksog.
23. Peptidsynthesesystem nach Anspruch 22, dadurch gekenn
zeichnet, daß es ferner eine erste Schutzschicht, die
zwischen der ersten Schicht und der zweiten Schicht
angeordnet ist, und eine zweite Schutzschicht umfaßt,
die zwischen der nachgiebigen Schicht und der zweiten
Schicht angeordnet ist.
24. Peptidsynthesesystem nach Anspruch 23, dadurch gekenn
zeichnet, daß die zweite Schicht aus einem chemisch
reaktionsbeständigen Material besteht.
25. Peptidsynthesesystem nach Anspruch 24, dadurch gekenn
zeichnet, daß die Abgabekanäle und die Ventilstellen
auf einer den Zufuhrkanälen gegenüberliegenden Seite
angeordnet sind.
26. Peptidsynthesesystem nach Anspruch 25, dadurch gekenn
zeichnet, daß es ferner Einrichtungen zum Freispülen
der Abgabekanäle von ausgewähltem Flußmaterial ent
hält.
27. Peptidsynthesesystem nach Anspruch 26, dadurch gekenn
zeichnet, daß die Einrichtungen zum Spülen Einrichtun
gen zum Leiten von gasförmigem Stickstoff in die Abga
bekanäle enthalten.
28. Peptidsynthesesystem nach Anspruch 27, dadurch gekenn
zeichnet, daß es ferner enthält:
- a) Einrichtungen zum Einleiten eines flüssigen Reini gungsmittels an einem Ende jedes Abgabekanals, und
- b) einen Abfallbehälter, der wahlweise mit einem ge genüberliegenden zweiten Ende jedes Abgabekanals in Verbindung steht.
29. Peptidsynthesesystem nach Anspruch 25, dadurch gekenn
zeichnet, daß der Hohlraum der dritten Schicht einen
Teil der Abgabekanäle überlagert.
30. Peptidsynthetisierer mit:
- a) wenigstens zwei Behältern, die verschiedene Ami nosäuren enthalten,
- b) wenigstens zwei Reaktionsgefäßen,
- c) einer Ventilmatrix mit einer Vielzahl von Venti len, wobei die Ventilmatrix in Flüssigkeitsverbin dung mit den wenigstens zwei Behältern und den we nigstens zwei Reaktionsgefäßen steht, und wobei es die Ventilmatrix zuläßt, daß von jedem der wenig stens zwei Behälter Aminosäure zu jedem der wenig stens zwei Reaktionsgefäße übertragen wird, und
- d) Steuereinrichtungen zum wahlweisen und gleichzei tigen Öffnen von wenigstens zwei Ventilen in der Ventilmatrix, um dadurch zuzulassen, daß Aminosäu re gleichzeitig zu wenigstens zwei der Reaktions gefäße fließt.
31. Peptidsynthetisierer nach Anspruch 30, dadurch ge
kennzeichnet, daß die Steuereinrichtungen ferner
Einrichtungen zum wahlweisen Schließen eines ge
öffneten Ventils enthalten.
32. Peptidsynthetisierer nach Anspruch 31, dadurch gekenn
zeichnet, daß er wenigstens zwei Sensoreinrichtungen
enthält, von denen jede an einen der wenigstens zwei
Behälter angeschlossen ist, wobei die Sensoreinrich
tungen feststellen, wenn ein Behälter leer ist, und
Zustandsdaten, die auf den leeren oder vollen Zustand
des Behälters hinweisen, zu den Steuereinrichtungen
übertragen.
33. Peptidsynthetisierer nach Anspruch 32, dadurch gekenn
zeichnet, daß er ferner eine Bedienerschnittstelle
enthält und daß die Steuereinrichtungen Einrichtungen
zum Mitteilen von Betriebsdaten an einen Bediener über
die Bedienerschnittstelle enthalten.
34. Peptidsynthetisierer nach Anspruch 33, dadurch gekenn
zeichnet, daß die Steuereinrichtungen ferner Einrich
tungen enthalten zum:
- a) Schließen aller an einen der Behälter angeschlos senen Ventile in der Ventilmatrix, wenn die Zu standsdaten von den an den Behälter angeschlosse nen Sensoreinrichtungen auf einen leeren Zustand des Behälters hinweisen, und
- b) Mitteilen des Zustandes des Behälters über die Be dienerschnittstelle.
35. Peptidsynthetisierer nach Anspruch 31, dadurch gekenn
zeichnet, daß er ferner Einrichtungen zum Feststellen
eines bestimmten Flüssigkeitsvolumens enthält, das
durch die Ventilmatrix hindurchgeht, wobei die Ein
richtungen zum Feststellen mit den Steuereinrichtungen
in Verbindung stehen.
36. Mechanismus für die Synthese von Peptiden mit:
- a) wenigstens zwei Behältern, die verschiedene Ami nosäuren enthalten,
- b) wenigstens zwei Reaktionsgefäßen, und
- c) Einrichtungen zum gleichzeitigen Übertragen von Inhalt aus einem Behälter zu den wenigstens zwei Reaktionsgefäßen.
37. Mechanismus nach Anspruch 36, dadurch gekennzeichnet,
daß die Steuerung ferner Einrichtungen zum wahlweisen
Schließen eines der geöffneten Ventile enthält.
38. Mechanismus nach Anspruch 37, dadurch gekennzeichnet,
daß er wenigstens zwei Sensoreinrichtungen enthält,
von denen jede an einen der wenigstens zwei Behälter
angeschlossen ist, wobei die Sensoreinrichtungen fest
stellen, wenn ein Behälter leer ist, und Zustandsda
ten, die darauf hinweisen, zu den Steuereinrichtungen
übertragen.
39. Mechanismus nach Anspruch 38, dadurch gekennzeichnet,
daß er ferner eine Bedienerschnittstelle enthält und
daß die Steuereinrichtungen Einrichtungen zum Mittei
len von Betriebsdaten an einen Bediener über die Be
dienerschnittstelle enthalten.
40. Mechanismus nach Anspruch 39, dadurch gekennzeichnet,
daß die Steuereinrichtungen ferner Einrichtungen ent
halten zum:
- a) Schließen aller an einen der Behälter angeschlos senen Ventile in der Ventilmatrix, wenn die Zu standsdaten vom an den Behälter angeschlossenen Sensor auf einen leeren Zustand des Behälters hin weisen, und
- b) Mitteilen des Zustandes des Behälters über die Be dienerschnittstelle.
41. Mechanismus nach Anspruch 39, dadurch gekennzeichnet,
daß er ferner Einrichtungen zum Feststellen eines be
stimmten Flüssigkeitsvolumens enthält, das durch die
Ventilmatrix hindurchgeht, wobei die Einrichtungen zum
Feststellen mit den Steuereinrichtungen in Verbindung
stehen.
42. Mechanismus nach Anspruch 41, dadurch gekennzeichnet,
daß er ferner Einrichtungen zum Übertragen eines
Spaltmittels zu ausgewählten der wenigstens zwei Reak
tionsgefäße enthält.
43. Mechanismus nach Anspruch 36, dadurch gekennzeichnet,
daß er ferner eine Ventilmatrix zur wahlweisen Verbin
dung jedes der wenigstens zwei Behälter mit jedem der
wenigstens zwei Reaktionsgefäße enthält.
44. Mechanismus nach Anspruch 43, dadurch gekennzeichnet,
daß er ferner Steuereinrichtungen zum wahlweisen
gleichzeitigen Aktivieren von wenigstens zwei Ventilen
in der Ventilmatrix enthält.
45. Mechanismus nach Anspruch 44, dadurch gekennzeichnet,
daß die Steuerung ferner Einrichtungen zum wahlweisen
Schließen eines geöffneten Ventils enthält.
46. Mechanismus nach Anspruch 45, dadurch gekennzeichnet,
daß er wenigstens zwei Sensoreinrichtungen enthält,
von denen jede an einen der wenigstens zwei Behälter
angeschlossen ist, wobei die Sensoreinrichtungen fest
stellen, wenn ein Behälter leer ist, und Zustandsda
ten, die auf den leeren oder vollen Zustand des Behäl
ters hinweisen, zu den Steuereinrichtungen übertragen.
47. Mechanismus nach Anspruch 46, dadurch gekennzeichnet,
daß er ferner eine Bedienerschnittstelle enthält und
daß die Steuereinrichtungen Einrichtungen zum Mittei
len von Betriebsdaten an einen Bediener über die Be
dienerschnittstelle enthalten.
48. Mechanismus nach Anspruch 47, dadurch gekennzeichnet,
daß die Steuereinrichtungen ferner Einrichtungen ent
halten zum:
- a) Schließen aller an einen der Behälter angeschlossenen Ventile in der Ventilmatrix, wenn die Zustandsdaten vom an den Behälter angeschlossenen Sensor auf einen leeren Zustand des Behälters hinweisen, und
- b) Mitteilen des Zustandes des Behälters über die Bedienerschnittstelle.
49. Mechanismus nach Anspruch 48, dadurch gekennzeichnet,
daß er ferner Einrichtungen zum Feststellen eines be
stimmten Flüssigkeitsvolumens enthält, das durch die
Ventilmatrix hindurchgeht, wobei die Einrichtungen zum
Feststellen mit den Steuereinrichtungen in Verbindung
stehen.
50. Mechanismus für die Peptidsynthese mit:
- a) wenigstens zwei Behältern, die verschiedene Aminosäuren enthalten,
- b) wenigstens zwei Reaktionsgefäßen, und
- c) Einrichtungen zum gleichzeitigen Übertragen von Inhalt aus einem der wenigstens zwei Behälter zu einem ersten Reaktionsgefäß und des Inhalts aus einem zweiten der wenigstens zwei Behälter zu einem zweiten Reaktionsgefäß.
51. Mechanismus nach Anspruch 50, dadurch gekennzeichnet,
daß er ferner eine Ventilmatrix zur wahlweisen Verbin
dung jedes der wenigstens zwei Behälter mit jedem der
wenigstens zwei Reaktionsgefäße enthält.
52. Mechanismus nach Anspruch 51, dadurch gekennzeichnet,
daß er ferner Steuereinrichtungen zum wahlweisen
gleichzeitigen Aktivieren von wenigstens zwei Ventilen
in der Ventilmatrix enthält.
53. Mechanismus nach Anspruch 52, dadurch gekennzeichnet,
daß er ferner Einrichtungen zum Übertragen eines
Spaltmittels zu ausgewählten der wenigstens zwei Reak
tionsgefäße enthält.
54. DNA-Synthetisierer mit:
- a) wenigstens zwei Behältern, die verschiedene Aminosäuren enthalten,
- b) wenigstens zwei Reaktionsgefäßen, und
- c) Einrichtungen zum gleichzeitigen Übertragen von Inhalt aus einem der wenigstens zwei Behälter zu einem ersten Reaktionsgefäß und des Inhalts aus einem zweiten der wenigstens zwei Behälter zu einem zweiten Reaktionsgefäß.
55. DNA-Synthetisierer nach Anspruch 54, dadurch gekenn
zeichnet, daß er ferner eine Ventilmatrix zur wahlwei
sen Verbindung jedes der wenigstens zwei Behälter mit
jedem der wenigstens zwei Reaktionsgefäße enthält.
56. DNA-Synthetisierer nach Anspruch 55, dadurch gekenn
zeichnet, daß er ferner Steuereinrichtungen zum wahl
weisen gleichzeitigen Aktivieren von wenigstens zwei
Ventilen in der Ventilmatrix enthält.
57. DNA-Synthetisierer nach Anspruch 56, dadurch gekenn
zeichnet, daß die Steuerung ferner Einrichtungen zum
wahlweisen Schließen eines der geöffneten Ventile ent
hält.
58. DNA-Synthetisierer nach Anspruch 57, dadurch gekenn
zeichnet, daß er wenigstens zwei Sensoreinrichtungen
enthält, von denen jede an einen der wenigstens zwei
Behälter angeschlossen ist, wobei die Sensoreinrich
tungen feststellen, wenn ein Behälter leer ist, und
Zustandsdaten, die darauf hinweisen, zu den Steuerein
richtungen übertragen.
59. DNA-Synthetisierer nach Anspruch 58, dadurch gekenn
zeichnet, daß er ferner eine Bedienerschnittstelle
enthält und daß die Steuereinrichtungen Einrichtungen
zum Mitteilen von Betriebsdaten an einen Bediener über
die Bedienerschnittstelle enthalten.
60. DNA-Synthetisierer nach Anspruch 59, dadurch gekenn
zeichnet, daß die Steuereinrichtungen ferner Einrich
tungen enthalten zum:
- a) Schließen aller an einen der Behälter angeschlos senen Ventile in der Ventilmatrix, wenn die Zustandsdaten vom an den Behälter angeschlos senen Sensor auf einen leeren Zustand des Behälters hinweisen, und
- b) Mitteilen des Zustandes des Behälters über die Bedienerschnittstelle.
61. DNA-Synthetisierer nach Anspruch 59, dadurch gekenn
zeichnet, daß er ferner Einrichtungen zum Feststellen
eines bestimmten Flüssigkeitsvolumens enthält, das
durch die Ventilmatrix hindurchgeht, wobei die Ein
richtungen zum Feststellen mit den Steuereinrichtungen
in Verbindung stehen.
62. DNA-Synthetisierer nach Anspruch 61, dadurch gekenn
zeichnet, daß er ferner Einrichtungen zum Übertragen
eines Spaltmittels zu ausgewählten der wenigstens zwei
Reaktionsgefäße enthält.
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