DE19634828A1 - Vorrichtung und Verfahren zur Zentrifugal-Adsorptionsprobenpräparation - Google Patents
Vorrichtung und Verfahren zur Zentrifugal-AdsorptionsprobenpräparationInfo
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Description
Die Erfindung betrifft Zentrifugalverfahren und -vorrichtungen
zum Konzentrieren von Biomolekülen aus Lösungen und zum
Gewinnen einer maximalen Menge konzentrierten Rückstands,
adsorbierende Membranen (im folgenden Adsorptivmembranen), die
zum Konzentrieren von Biomolekülen aus Lösungen wirksam sind,
und ein Verfahren zum Einschließen (dichtes Einsetzen) der
artiger Membranen in derartigen Vorrichtungen.
In der Biochemietechnik ist eine Vielzahl analytischer Ver
fahren entwickelt worden, bei denen es erforderlich ist,
Lösungsmittel aus Peptidlösungen zu entfernen, um eine kon
zentriertere Peptidprobe zu haben, die wirksam analysiert
werden kann, oder um Ionen geringen Molekulargewichts oder
andere gelöste Substanzen zu entfernen oder auszutauschen. Es
wurden auch viele weitere analytische Verfahren, die nicht nur
Peptide, sondern allgemein Biomolekülarten (z. B. Oligonukleo
tide) einschließen, entwickelt, bei denen es notwendig ist,
eine biomolekulare Komponente in einer flüssigen Probe zu
konzentrieren und/oder zu "entsalzen", da es gewöhnlich in der
Biochemie und medizinischen Chemie notwendig ist, daß reine
analytische Substanzen keine Salze, Detergentien und andere
niedrigmolekulare Verunreinigungen aufweisen. Die Gegen
wart dieser Substanzen kann dahingehend schädlich sein, daß
sie häufig folgende chemische Analysen oder biochemische
Assay′s stören.
Das Patent US 4,755,301 beschreibt ein Zentrifugalverfahren
und eine -vorrichtung zum Konzentrieren von Biomolekülen ohne
eine Filterung bis zur Trockenheit. Eine semipermeable Ultra
filtrations-Membran trennt eine Probenreservoir von einer
Filtratschale, und Filtratleitungen unterhalb der Membran sind
von der Kante der Membran genügend einwärts versetzt, so daß
wenn die Vorrichtung in einem Festwinkelzentrifugenrotor
verwendet wird, die Filtration anhält, wenn der Rückstands-
Meniskus die radiale Zentrifugalhöhe der äußersten Kante der
äußersten Filtratleitung erreicht.
Solche Ultrafiltrationsgeräte werden gewöhnlich für die
"Reinigung" und/oder Probenzubereitung von Biomolekülen und
anderen Makromolekülen verwendet. Damit ein derartiges Ver
fahren erfolgreich ist, muß eine Membran ausgewählt werden,
die die interessierenden Moleküle zurückhält, jedoch die
kleineren Verunreinigungen hindurchläßt. Obwohl diese
Gestaltung für analytische Substanzen relativ einfach ist, die
ein Molekulargewicht größer als ungefähr 10 000 aufweisen,
wird sie für Substanzen zunehmend problematisch, die ein
Molekulargewicht kleiner als ungefähr 5 000 aufweisen. Der
Grund liegt in der Tatsache, daß die Membranporosität, die zum
Zurückhalten der analytischen Substanz mit einem Molekular
gewicht von ungefähr 10 000 so gering ist, daß die Wasser
permeabilität (Flußrate) niedrig wird und die Verarbeitungs
zeiten zu lang werden. Zum Beispiel beträgt eine typische
Schleuder-"Drehzeit" für eine Vorrichtung unter Verwendung
einer Membran, die für analytische Substanzen geeignet ist,
welche ein Molekulargewicht von 30 000 oder mehr aufweisen,
ungefähr 1 Stunde, während bis zu 6 Stunden für analytische
Substanzen mit einem Molekulargewicht von ungefähr 1 000
erforderlich sein können. Außerdem verursacht eine derartige
Langzeitaussetzung zu einer hohen g-Kraft häufig Gerätefehler.
Es ist daher eine Aufgabe der vorliegenden Erfindung, eine
adsorbierende Zentrifugal-Probenpräparationsvorrichtung (im
folgenden: Zentrifugal-Adsorptivprobenpräparationsvorrichtung)
bereitzustellen, die Biomoleküle aus einer Lösung konzen
trieren und/oder entsalzen kann.
Es ist eine weitere Aufgabe der vorliegenden Erfindung, ein
zentrifugales Gewinnungsverfahren für die Gewinnung einer
maximalen Menge konzentrierter makromolekularer Rückstände aus
einer Zentrifugalkonzentratorvorrichtung bereitzustellen.
Es ist eine weitere Aufgabe der vorliegenden Erfindung, einen
wiederverwendbaren zentrifugalen Mikrokonzentrator bereit
zustellen.
Es ist eine weitere Aufgabe der vorliegenden Erfindung, einen
zentrifugalen Mikrovolumenkonzentrator bereitzustellen, der
kostengünstig herstellbar ist.
Es ist eine weitere Aufgabe der vorliegenden Erfindung,
Probenpräparationsvorrichtungen bereitzustellen, in denen
Adsorptivmembranen einfach eingeschlossen werden.
Es ist eine weitere Aufgabe der vorliegenden Erfindung, eine
Adsorptivmembran bereit zustellen, mit der ein herkömmliches
Zentrifugalprobenpräparationsgerät nachrüstbar ist.
Die Probleme des Standes der Technik können durch die vor
liegende Erfindung überwunden werden, die eine Adsorptiv
probenpräparationsvorrichtung und ein -verfahren bereitstellt,
die zum Konzentrieren, Entsalzen und/oder Reinigen von analy
tischen Substanzen in kurzen Zeitbereichen wirksam sind. Zu
diesem Zweck wird eine Adsorptivmembran verwendet, um analy
tische Substanzen (Analyte) zu binden, wobei die analytischen
Substanzen dann mit einem geeigneten Desorptionsmittel
abgelöst werden können.
Das erfindungsgemäße Adsorptivzentrifugalfiltrationssystem
umfaßt:
- (a) eine Adsorptivprobenpräparationsvorrichtung, die umfaßt:
- (1) ein Probenreservoir;
- (2) eine Basis, die unterhalb des Probenreservoirs angeordnet ist;
- (3) Adsorptivfiltermittel, die das Probenreservoir von der Basis trennen, welche Adsorptivfiltermittel eine Adsorptiv membran umfassen;
- (4) einen Träger für das Adsorptivfiltermittel;
- (5) eine oder mehrere Filtratleitungen, um den Durchtritt von Filtrat vom Filtermittel in die Basis zu ermöglichen;
- (6) Mittel zur Bereitstellung eines flüssigkeitsdichten Ver schlusses zwischen dem Rand des Probenreservoirs, der Membran und dem Membranträger;
- (7) Mittel zur Anbringung des Filtermittels an der Basis;
- (8) Mittel zur Anbringung des Probenreservoirs an dem Filter mittel; und
- (b) ein Festwinkel- oder Schwingzellen-Zentrifugenrotor, um die Adsorptivprobenpräparationsvorrichtung aufzunehmen.
Gemäß einer bevorzugten Ausführungsform ist das Adsorptiv
filtermittel eine teilchenbeladene, semipermeable (halbdurch
lässige) Membran, bei der mindestens eine ihrer Hauptober
flächen, vorzugsweise beide ihrer Hauptoberflächen, mit einem
dünnen Gewebe bedeckt ist und die in der Lage ist, analytische
Substanzen mit einem Molekulargewicht unterhalb von ungefähr
10 000, allgemein unterhalb von 5 000, zu binden, die
typischerweise schwierig und langsam auf einer Ultrafil
trationsmembran mit einem Abbruch (cut-off) bei 1 000 und/oder
3 000 Molekulargewichten zu entsalzen sind.
Bei dem erfindungsgemäßen Verfahren zum Konzentrieren von
Biomolekülen oder zum Entsalzen oder Reinigen aus einer Lösung
wird das Probenreservoir der oben beschriebenen Adsorptiv
probenpräparationsvorrichtung mit einer Lösung einer analy
tischen Substanz gefüllt, in einem Festwinkel- oder Schwing
zellen-Zentrifugenrotor plaziert, die Lösung wird durch die
Membran getrieben, die Membran wird gewaschen und die analy
tische Substanz, die als ein Ergebnis der Adsorption an der
Membran erhalten wurde, wird durch Herauslösen mit einem
geeigneten Desorptionsmittel gewonnen.
Ausführungsformen der Erfindung werden im folgenden unter
Bezug auf die Zeichnungen beschrieben. Es zeigen:
Fig. 1 eine Explosionsdarstellung einer Ausführungsform der
erfindungsgemäßen Zentrifugal-Adsorptivprobenprä
parationsvorrichtung;
Fig. 2 eine Querschnittsansicht eines Bereiches des Gerätes
gemäß Fig. 1;
Fig. 3 eine Detailansicht eines Bereiches des Geräts gemäß
Fig. 2;
Fig. 4 eine Explosionsdarstellung einer alternativen Aus
führungsform der erfindungsgemäßen Zentrifugal-
Adsorptivprobenpräparationsvorrichtung;
Fig. 5 eine Querschnittsansicht eines Bereiches der Vor
richtung gemäß Fig. 4;
Fig. 6 eine Kurvendarstellung der Adsorptionskapazität von
verschiedenen Membranen;
Fig. 7 eine Kurvendarstellung der Adsorptionskapazität von
verschiedenen Ausführungsformen von Adsorptions
vorrichtung;
Fig. 8a ein Chromatogramm einer Kontroll-Peptidprobe gemäß
Beispiel 2;
Fig. 8b ein Chromatogramm einer Peptidprobe gemäß Beispiel 2;
Fig. 9a ein Chromatogramm einer Kontroll-Peptidprobe gemäß
Beispiel 3;
Fig. 9b ein Chromatogramm einer desorbierten Peptidprobe
gemäß Beispiel 3;
Fig. 10a ein Chromatogramm einer Kontroll-Oligonukleotidprobe
gemäß Beispiel 4;
Fig. 10b ein Chromatogramm einer desorbierten Oligonukleotid
probe gemäß Beispiel 4;
Fig. 11 eine Scanning-Elektronenmikroskopansicht einer
Adsorptivmembran, die für die vorliegende Erfindung
geeignet ist;
Fig. 12 eine Scanning-Elektronenmikroskopansicht einer
weiteren Adsorptivmembran, die zum Gebrauch mit der
vorliegenden Erfindung geeignet ist;
Fig. 13 eine Explosionsansicht einer alternativen Ausfüh
rungsform des erfindungsgemäßen zentrifugalen
Adsorptivprobenpräparationsgeräts; und
Fig. 14 eine Querschnittsansicht der Vorrichtung gemäß
Fig. 13.
Fachleute werden erkennen, daß viele verschiedene Adsorptiv
membranen in Abhängigkeit von der gewünschten Aufgabe erfin
dungsgemäß verwendet werden können. Die ideale Membran besitzt
schnelle Adsorptionskinetiken, erfordert kein Chaotropie-
Mittel (englisch: chaotropic agent), besitzt eine für die
Anwendung geeignete Kapazität und Selektivität und erlaubt das
Heraus lösen gebundener analytischer Substanz mit einem ver
dampfbaren oder gefriertrockenbaren (englisch: lyophylizable)
Desorptionsmittel. Geeignete Adsorptivmembranen sind polymer
gebundene, teilchenbeladene Adsorptivmembranen wie solche, die
in chromatographischen Kugeln (die funktionalisiert sein
können) enthalten sind, die mit einem Bindemittel wie z. B.
Polytetrafluorethylen-(PTFE)-Fasern aneinandergeheftet sind,
wie es in den Fig. 10 und 11 gezeigt ist. Im einzelnen
stellt Fig. 10 eine polymergebundene, teilchenbeladene Adsorp
tivmembran dar, die unter dem Namen EMPORE durch das Unter
nehmen "3M" hergestellt und verkauft und im Patent
US 5,147,539 beschrieben wird, dessen Offenbarung hiermit
durch Bezugnahme einbezogen wird. Dies ist eine Membran oder
Scheibe mit starkem Kationenaustausch, die dazu vorgesehen
ist, positiv geladene Polypeptide zu adsorbieren, und daher
ideal zum Entfernen von nicht-proteinartigen, anionischen oder
neutralen Verunreinigungen aus Peptidproben ist. Sie enthält
sphärische Polystyren-Divinylbenzen-(PSDVB)-Kugeln mit einem
Porendurchmesser von 80 Angström und einem Teilchendurchmesser
von 8 Mikrometer, wobei die Kugeln mit einer schwefligen Säure
(-SO₃⁻) funktionalisiert sind, und ist 0,020 +/- 0.002 Inch
(0,051 ± 0,005 cm) dick, besitzt eine Durchflußrate von
15-30 ml/min*cm² mit Wasser bei 10 psi (rd. 0,7 kg/cm²) (Raum
temperatur) und enthält auf das Gewicht bezogen 90% (+/-2)
Teilchen und 10% (+/-2) PTFE. Die Teilchen sind unlösliche,
nicht-quellende sorptive Teilchen, die in einer PTFE-Faser
matrix vernetzt sind. Diese Membran ergibt einen gemischt
kationischen und hydrophoben Oberflächencharakter, der viele
Arten von Biomolekülen adsorbiert, jedoch die meisten Salze,
organischen und nicht-kationischen Detergentien hindurchläßt.
Darüberhinaus können gebundene analytische Substanzen wirksam
mit Säuren, Basen und/oder Salzen in der Gegenwart einer
organischen Substanz desorbiert werden.
Eine weitere geeignete, polymergebundene, teilchenbeladene
Adsorptivmembran ist in Fig. 11 dargestellt. Diese Membran
besteht aus ungefähr 60% sphärischem Silika, das mit einer
schwefeligen Säure funktionalisiert ist, 20% PVDF-Bindemittel
und 20% Träger und wird durch die Amicon Inc. hergestellt.
Gemäß einer bevorzugten Ausführungsform werden das Silika und
das Bindemittel auf beiden Seiten eines Trägers vergossen. Der
Träger kann dasselbe Spinfließ oder Gewebe auf Polyolefinbasis
sein, das unten erwähnt wird. Andere funktionelle Membranen
können sphärische Polystyren-Divinylbenzen-Kugeln (Beads)
enthalten, die in einer PVDF-Matrix zusammengeheftet sind, und
einen Träger enthalten, oder können weitere mikrometergroße,
sphärische Harzteilchen umfassen, die mit anderen funktionellen
Gruppen, einschließlich Anionenaustauscher auf PSDVB- oder
Silika-Basis (quaternäre Amine, z. B. PSDVB(-N(CH₃)₃+),
Umkehrphasenmedien, z. B. C₂, C₄, C₆, C₈ oder C₁₈ auf Silika-
Basis, sowie mit PSDVB gemischte Ionenaustauscher (Kationen
und Anionen) , derivativiziert sein, um eine Vielzahl von
Anwendungen für Peptide, Oligonukleotide und andere Bio
moleküle abzudecken ("Biomoleküle", wie es hier verwendet
wird, enthalten Aminosäuren, Peptide (Molekulargewicht all
gemein niedriger als ungefähr 5 000), kleine Proteine (Mole
kulargewicht allgemein größer als 5 000 und niedriger als
ungefähr 10 000) und Oligonukleotide). Fachleute werden
erkennen, daß auch andere Matrizen mit alternativen Selek
tivitäten (z. B. Anionenaustausch), speziell für Molekül
klassen, die sich von Peptiden unterscheiden, verwendet werden
können. Erfindungsgemäße Vorrichtungen können eine Vielzahl
von funktionellen Membranen enthalten, die Harzmaterialien mit
verschiedenen funktionellen Gruppen aufweisen, um analytische
Substanzen zu fraktionieren, die sich hinsichtlich der Ladung
und Hydrophobität unterscheiden. Alternativ kann eine Vielzahl
von Vorrichtungen in Kombination verwendet werden, die ver
schiedene einzelne funktionelle Membranen enthalten, um ein
ähnliches Ergebnis zu erzielen.
Erfindungsgemäß muß die polymergebundene, teilchenbeladene
Adsorptivmembran in der Probenpräparationsvorrichtung ein
geschlossen sein, um ein Austreten der Probe aus diesem zu
verhindern. Aus Sicht der geringen Größe vieler dieser Vor
richtungen und daher der in diesen enthaltenen Membranen und
aus Sicht der tonartigen Textur einiger dieser Adsorptiv
membranen, ist die Handhabung der Membran und das Einschließen
der Membran in das Gerät äußerst problematisch. Die Membran
wird häufig während der Handhabung oder während des Ein
schließvorgangs deformiert, zerteilt oder zerrissen, was einen
Geräteausfall ergibt. Dementsprechend ist die bevorzugte
Ausführungsform der Erfindung durch die Bereitstellung einer
dünnen, porösen Gewebeschicht über mindestens der Membran
oberfläche, die zum Probenreservoir weist, vorzugsweise sowohl
über diese Oberfläche als auch die Oberfläche, die zur Unter
lage weist, vor dem Einschließen der Membran in das Gerät
gekennzeichnet (diese Oberflächen werden gewöhnlich und auch
im folgenden als die "Hauptoberflächen" der Membran
bezeichnet) . Das poröse Gewebe erfüllt mehrere Funktionen
einschließlich (1) Erhaltung der Membrangestalt und Ver
besserung der Handhabbarkeit, insbesondere während des
Membranschneidens und der Anordnung in der Probenpräparations
vorrichtung, (2) Verhinderung von Membraneinschnitten an der
Dichtverbindung in der Probenpräparationsvorrichtung, (3)
Wirkung als ein Abstandsstück in der Probenpräparationsvor
richtung, und (4) Unterstützung der Durchflußsteuerung durch
Flachhaltung der Membran und Funktion als eine Durchfluß
beschränkung. Die Durchflußbeschränkung vergrößert die
Kontaktzeit der Flüssigkeit mit den Membranmedien und kann bei
einigen Anwendungen nützlich sein.
Die Erfinder haben festgestellt, daß Adsorptivmembranen, bei
denen eine oder sogar beide ihrer Hauptoberflächen mit Gewebe
bedeckt sind, überraschenderweise in verschiedenen Arten her
kömmlicher Zentrifugal-Probenpräparationsvorrichtungen wirksam
eingeschlossen werden können, ohne irgendeine Modifikation des
Gerätes zu erfordern.
Die verwendeten Gewebe dürfen nicht den Durchfluß schädlich
beeinflussen und sollten in Bezug auf die Komponenten der
Probe, die gereinigt oder konzentriert wird, inert sein.
Geeignete dünne Gewebe sind solche, die aus Spinfließ-Poly
ester zusammengesetzt sind, wobei jedoch auch Gewebe auf Poly
olefinbasis wie Polypropylen und/oder Polyethylen verwendet
werden können. Die Dicke des Gewebes beträgt in Abhängigkeit
von der Art der Probenpräparationsvorrichtung vorzugsweise
ungefähr 0,0005 bis ungefähr 0.005 Inch (rd. 0,0013 bis
0,013 cm). Falls das Gewebe zu dünn ist, wird es nicht stark
genug sein, die Membranmaße zu halten. Falls die Membran zu
dick ist, kann diese die Zusammensetzung der Probenprä
parationsvorrichtung behindern, so wie dort, wo eine "Schnapp
verschluß"-Schließanordnung (englisch: "snap fit") in einer
Ausführungsform verwendet wird, wie sie in den Fig. 1 und 2
dargestellt ist. Ein bevorzugtes dünnes Gewebe zum Gebrauch in
der Schnappverschluß-Vorrichtung, die in Fig. 1 gezeigt ist,
ist HOLYTEX-Gewebe, das von der Ahlstrom Filtration Inc.
verfügbar ist und aus Polyester zusammengesetzt ist, das eine
Dicke von 0,0015 +/-0.0003 Inch (rd. 0,004 + 0,0008 cm), ein
Gewicht von 0,4-05 oz/yd³ (rd. 13,6 bis 17,0 g/m²), eine
Luftdurchlässigkeit von 450-675 cfm/ft² (rd. 19,7 bis 29,6
l/s/m²), eine Zugfestigkeit von 2-6 lbs/inch (rd. 357 bis
1072 g/cm), MD, und 1,5-3,5 lbs/inch (rd. 268 bis 625 g/cm),
CD, und eine Dehnung von 17-33%, MD, und 31-58%, CD, aufweist.
Dickere Gewebe können bei Geräten verwendet werden, die unter
Verwendung eine O-Ringes verschlossen werden, wie das in Fig.
4 gezeigte Gerät. Ein weiteres geeignetes Gewebe ist VILEDON
(registrierte Marke) FO2432, das aus nicht gewebtem Poly
propylen und/oder Polyethylen mit einem Gewicht von 30 g/m²
zusammengesetzt ist und eine Zugfestigkeit in Bearbeitungs
richtung oberhalb von 50 N/5 cm und in der Querrichtung ober
halb 70 N/5 cm und eine Luftdurchlässigkeit bei 0,5 mBar von
700 dm³/s·m² aufweist.
Das Gewebe kann durch jedes geeignete Mittel der Membran
zugeführt werden. Die Erfinder haben herausgefunden, daß das
Gewebe dazu neigt, an der Membran von selbst anzuhaften, wobei
kein Klebemittel notwendig ist. Das bevorzugte Verfahren der
Zuführung des Gewebes auf die Membran erfolgt mit einem
Stempel, der geeignet entsprechend der Gestalt der Membran
geformt ist, die gewöhnlich kreisförmig ist. Auf einer Poly
propylen-Schnittfläche wird Wachspapier angeordnet. Das
Gewebe, das gewöhnlich als Wickelmaterial kommerziell verfüg
bar ist, wird auf dem Wachspapier, gefolgt von einem Stück der
Membran (verfügbar in 1′ * 1′-Stücken, oder 30,5 cm * 30,5 cm-
Stücken) angeordnet. Ein zusätzliches Stück Gewebe kann dann
über die Membran gelegt werden, wenn es gewünscht ist, beide
Hauptoberflächen der Membran zu überdecken. Der Stempel wird
dann herabgedrückt, wobei die Komponenten gleichzeitig über
schichtet und in einer geeigneten Gestalt geschnitten werden.
In Fig. 1 ist allgemein mit dem Bezugszeichen 1 eine Proben
präparationsvorrichtung gemäß einer Ausführungsform der
Erfindung gezeigt. Die Vorrichtung 1, die allgemein zur Ultra
filtration von Probenvolumina von ungefähr 0,5 ml geeignet
ist, umfaßt ein Probenreservoir 2, eine Basis 3 und ein Glas
fläschchen 4 mit einem Flaschendeckel 5. Eine polymer
gebundene, teilchenbeladene Adsorptivmembran 6 ist zwischen
dem Reservoir 2 und der Basis 3 angeordnet und mit einem
dünnen Gewebe 7 und 7a auf Polyesterbasis auf jeder Haupt
oberfläche bedeckt.
Die Fig. 2 und 3 stellen den Schnappverschluß-Verriege
lungsmechanismus der Vorrichtung dar, der die Flüssigkeits
dichtung bereitstellt. Für diesen Zweck besitzt das Reservoir
2 eine erste ringförmige Rille 9, die einen Winkel von
ungefähr 45° aufweist und eine entsprechend gewinkelte ring
förmige obere Oberfläche 8 der Basis 3 aufnimmt. Eine zweite
ringförmige Rille 10 des Reservoirs 2 enthält einen ersten
ringförmigen gewinkelten Bereich 10a und einen zweiten ring
förmigen vertikalen Bereich 10b und endet in einer ring
förmigen gewinkelten Aufnahme 10c. Diese zweite ringförmige
Rille 10 nimmt einen entsprechenden ringförmigen Vorsprung 11
der Basis 3 auf. Wenn das Reservoir 2 in die Basis 3 ein
geschnappt ist (oder umgekehrt), so verriegelt die Aufnahme
10c im Reservoir 2 die Basis 3 dadurch in Position, indem der
ringförmige Vorsprung 11 der Basis 3 gehindert wird, sich
vertikal abwärts zu bewegen. Die Länge "a" des Bereichs des
Reservoirs 2 ist derart gewählt, daß, wenn das Reservoir 2
zusammengesetzt und in der Basis 3 verriegelt wird, die ring
förmige Unterlage 12 des Reservoirs 3 dicht gegen das dünne
Gewebe der Adsorptivmembran anliegt, wie es gezeigt ist. Eine
oder mehrere Durchtrittskanäle oder Leitungen sind unterhalb
der Membran 6 als Ergebnis von Rillen in der Basis gebildet,
um den Durchtritt in die Basis 3 (und schließlich in das
Glasfläschchen 5) von nicht auf der Membran 6 adsorbierter
Probe zu ermöglichen.
Die in den Fig. 1 bis 3 gezeigte Vorrichtung zeigt eine
hohe Extraktionseffektivität bei kurzen Drehzeiten. Die
Kapazität für Peptide reicht in Abhängigkeit von der Probe und
vom für die Zentrifugierung verwendeten Rotortyp von ungefähr
150 bis ungefähr 400 µgs/Gerät, wobei Festwinkelrotoren eine
geringere Kapazität ermöglichen als horizontale Rotoren. Für
eine maximale Adsorption sollte die ermittelte Gesamtionen
stärke der Probe nicht 0.1 M in einem 500 µl-Volumen über
steigen. Falls die Ionenstärke unbekannt ist, kann ein Ver
fahren von Verdünnungsserien verwendet werden, um sicher
zustellen, ob konkurrierende Ionen die Adsorption verdichten
(oder verstopfen, engl.: impact). Gelöste Substanzen müssen
einen positiv geladenen Anteil wie ein primäres, sekundäres
oder tertiäres Amin aufweisen, damit die Adsorption statt
findet. Allgemein sollte der Proben-pH-Wert auf einen Wert
unterhalb des pKa- oder pI-Wertes der analytischen Substanz
eingestellt sein. Zum Beispiel können Ammoniumhydroxid oder
alkoholische HCl (1M) verwendet werden, um die Probe abzu
lösen. Fachleute erkennen, daß das spezielle, verwendete
Ablösemittel von der Identität der analytischen Substanz
abhängt und leicht bestimmt werden kann.
Die Fig. 4 und 5 stellen eine zweite Ausführungsform der
Erfindung dar, die allgemein zur Ultrafiltration von Proben
volumen von ungefähr 2,0 ml anwendbar ist. Die Vorrichtung in
Fig. 4 verwendet einen kalt geformten Bördelverschlußmechanis
mus, in dem ein O-Ring über der Membran angeordnet ist, die in
die Basis gelegt worden ist. Das Reservoir wird dann in die
Basis eingeführt und die überstehende Kante der Basis wird
über die Reservoirkante geformt, um diese in Position zu
halten. Somit enthält das Reservoir 2′ eine ringförmige Kante
oder einen Kragen 16, der in einen ringförmigen Flansch 17 der
Basis 3′ einschnappt und durch diesen verriegelt ist. Die
Basis des ringförmigen Kragens 16 steht mit dem O-Ring 13 in
Eingriff, um die Dichtung zu bewirken. Da der O-Ring 13
geringfügig kompressibel ist, ist die Dicke des Gewebes 7a
(und optional 7b) nicht kritisch, die die Adsorptivmembran 6
bedeckt, wobei dickere Gewebe verwendet werden können, ohne
die Dichtfähigkeit der Vorrichtung zu verschlechtern.
Die Fig. 13 und 14 zeigen eine dritte Ausführungsform der
Erfindung, die allgemein zur Ultrafiltration von Probenvolumen
von ungefähr 250 µl verwendet wird. Bei dieser Vorrichtung
bilden die Basis und das Reservoir eine integrale, einzeln
geformte Einheit, wobei somit das Glasröhrchen 4′′ die Funktion
ausführt, die bei den Ausführungsformen der Fig. 1 bis 3
und 4 bis 5 durch die Basis ausgeführt wurden, indem sie
Flüssigkeit aufnimmt, die durch die Membran 6 hindurchtritt),
und eine Druckpassung wird verwendet, um die Membran in dem
Gerät einzuschließen. Im einzelnen enthält eine Basis-/
Reservoir-Einheit 100 (im folgenden: Basis-Reservoir) eine
Vielzahl von Leitungen oder Durchtrittskanälen 15′, die auf
der Bodenoberfläche der Basis 103 unterhalb der Membran 6
gebildet sind, um zu ermöglichen, daß die Probe vom Basis/
Reservoir 100 in ein Glasröhrchen 4 ausgegeben wird. Die
Membran 6 und Gewebeschicht 7 (und/oder Gewebeschicht 7a) sind
mit einem hohlen, zylindrischen Druckpassungsrohr 200 auf der
Basis 103 schichtartig in Position gebracht (die Basis 103 des
Teils Basis-Reservoirs 100 dient daher als eine Membran
halterung) . Der Außendurchmesser des Rohres 200 ist gering
fügig größer als der Innendurchmesser des Basis-Reservoirs
100, so daß, wenn das Rohr 200 in das Basis-Reservoir 100 mit
Druck eingepaßt wird, ein wasserdichter Verschluß gebildet
wird. Das Rohr 200 wird hinabgedrückt, um so die Membran 6
(oder die Gewebeschicht 7 auf der Membran 6) zu berühren, wie
es in Fig. 14 gezeigt ist. Die Wandreibung hält das Rohr 200
in dem Basis-Reservoir 100 in Position. Wenn sich das Rohr 200
in Position befindet, dient das innere Volumen des Rohrs 200
als das Probenreservoir. Das Basis-Reservoir 100 enthält einen
ringförmigen Flansch 101, der einen Außendurchmesser ausweist,
der größer als der Durchmesser der Oberseite des Glasröhrchens
4′′ ist, so daß wenn das Basis-Reservoir 100 in dem Glas
röhrchen 4′′ zur Zentrifugierung positioniert wird, der ring
förmige Flansch 101 verhindert, daß das Basis-Reservoir 100 in
das Glasröhrchen 4′′ fällt, und einen weiteren Zugriff
ermöglicht. Vorzugsweise ist ein Deckel 5, mit dem Glas
röhrchen 4′′ verbunden und in geeigneter Weise gestaltet, um in
die Öffnung 102 in der Oberseite des Basis-Reservoirs 100 zu
passen.
Fachleute werden erkennen, daß die Prinzipien der vorliegenden
Erfindung nicht auf irgendein Teilchenvolumen-Zentrifugalgerät
beschränkt sind. Geeignete Geräte enthalten solche Vorrich
tungen, die von 0,2 ml- bis 15 ml-Geräten reichen.
Durch Minimieren der Membranoberflächen-Fläche für die erfor
derlichen Volumina kann eine optimale Adsorption/Desorption
der analytischen Substanzen in der Probe erzielt werden.
Studien haben gezeigt, daß diese Vorrichtungen die erforder
liche Probendurchtrittsrate erzielen, die für eine quanti
tative Aufnahme analytischer Substanzen langsam genug und zur
Ermöglichung des Lösungsmitteldurchtritts schnell genug ist,
um die erforderliche Analyse durchzuführen. Ergebnisse zeigen,
daß das Lösungsmittel durch die Membran mit rund 35 ml/min
fließen muß. Dem Durchtritt der analytischen Substanz und des
Lösungsmittels durch die Membran mittels Zentrifugierung
folgend sind die interessierenden Spezies auf der Membran
adsorbiert, und sie werden darauffolgend entfernt, indem
vorzugsweise zuerst die Membran gewaschen wird, um un
gebundene, unerwünschte Verunreinigungen wie Detergentien,
Salze usw. zu beseitigen, und dann ein geringes Volumen eines
niedrigpolaren Lösungsmittels verwendet wird, das in der Lage
ist, die adsorbierten Spezies durch die funktionale
Extraktionsmembran zu verschieben und abzulösen. Falls eine
Entfernung von locker gebundenen Verunreinigungen gewünscht
ist, kann ein verdünntes Desorptionsmittel (wie ein
Desorptionsmittel mit einer Konzentration, die ungefähr 1/10
der Konzentration zur vollständigen Desorption beträgt) für
das Waschen verwendet werden. Falls das Ablösevolumen kleiner
als das ursprüngliche Probenvolumen ist, wird eine Nettokon
zentration erzielt.
Im Vergleich mit herkömmlichen Extraktionsgeräten, z. B. vom
Typ mit einer Schüttschicht, zeigt die erfindungsgemäße Vor
richtung als Ergebnis des Harzaustauschers geringer Größe, der
in die Bindemittel-Fasermatrix (z. B. PTFE) eingewirkt ist,
eine verbesserte Leistungsfähigkeit, die eine hohe Extraktions
wirksamkeit und schnelle Durchflußraten erlaubt, ohne die
Erhaltung eines gleichförmigen Flusses einzuschränken, während
die Kontaktplätze für analytische Substanzen maximiert werden.
Eine Auswahl dünner Gewebe verschiedener Dicke wurde bei
Adsorptivmembranen des Typs EmPore-SCX (registrierte Marke)
eingesetzt und in den Probenpräparationsvorrichtungen gemäß
Fig. 1 eingeschlossen. Dann wurde die Fähigkeit der Geräte,
selektiv zu absorbieren, unter Verwendung bekannter Mengen von
Cytochrom c bestimmt. Obwohl Cytochrom c ein Protein mit einem
Molekulargewicht (12 000) ist, das größer ist, als für solche
Geräte bevorzugt wird, wurde dieses als Grenzfall ("worst
case"-Fall) verwendet, da solche großen Moleküle langsamer
diffundieren. Ferner besitzt es eine sichtbare Absorption bei
410 nm, wodurch ein Mittel zur bequemen Quantifizierung
bereitgestellt wird. Das Protein wurde in einer gegebenen
Einheit eingeführt, um die Gerätekapazität zu bestimmen. Diese
Menge wurde durch eine kalorimetrische Probe bestimmt, die die
Menge von ungebundenem oder freiem (F) Cytochrom c gemessen
hat, das in das Filtrat hindurchtrat. Die optimale Leistungs
fähigkeit wurde durch komplexe (oder schwierige, engl.:
challenging) Geräte mit steigenden Mengen von Cytochrom c
bestimmt, um die maximale Polypeptid-Adsorptionskapazität zu
ermitteln. In Fig. 6 sind Ergebnisse gezeigt, die Vorrich
tungen vergleichen, die mit einer unbedeckten Membran ("Kein
Htex"), einer Membran, bei der nur die zum Probenreservoir
weisende Hauptoberfläche mit MOLLYTEX-Polyestergewebe bedeckt
ist ("1 Htex"), und einer Membran vorbereitet wurde, bei der
beide Hauptoberflächen mit HOLLYTEX-Gewebe ("2 Htex") bedeckt
ist. Diese Daten zeigen, daß mehr Cytochrom c bei Vorrich
tungen gebunden (B) ist, wo eine oder beide Hauptoberflächen
der Membran mit Gewebe bedeckt waren. Zusätzlich diente bei
den Proben, bei denen die zum Probenreservoir weisende Ober
fläche der Membran mit Gewebe bedeckt war, das Gewebe dazu, zu
verhindern, daß die Membran während des Zusammensetzens zer
teilt oder während der Hochgeschwindigkeitszentrifugierung
verzogen wird. Bei der Probe, wo beide Hauptoberflächen der
Membran bedeckt waren, diente das Gewebe, das die zur Basis
weisende Oberfläche der Membran bedeckte, dazu, die Bindungs
wirksamkeit zu vergrößern.
Fig. 7 zeigt klar, daß Vorrichtungen, die mit Gewebe auf
beiden Hauptoberflächen der Membran vorbereitet wurden, in der
Lage waren, über 250 µgs Cytochrom c zu binden, was mit
weniger als 170 µgs zu vergleichen ist, wenn nur eine Haupt
oberfläche mit Gewebe bedeckt war.
Cytochrom c wurde mit Trypsin digeriert, um Mehrfachpeptide
freizugeben, die hinsichtlich der Ladung und Größe variieren.
Ungefähr 150 µgs (in 400 µl) des digerierten Materials wurden
dem Gerät gemäß Fig. 1 zugeführt, zentrifugiert und zur
folgenden Quantifizierung durch Umkehrphasen-HPLC desorbiert.
Die Integrationswerte von abgelösten Maxima wurden dann mit
der äquivalenten Probenmenge verglichen, die direkt der HPLC-
Säule zugeführt wurde (Kontrolle). Um eine optimale Bindung
sicherzustellen, wurde der pH-Wert auf 3 eingestellt. Dem
Probenzusatz folgend wurde das Gerät für 15 Sekunden zentri
fugiert. Als ein Waschschritt wurden 400 µl dH₂O durchzentri
fugiert, um Salze, Detergentien und andere nichtadsorbierte
gelöste Substanzen zu entfernen. Gebundene Komponenten wurden
dann mit zwei 50 µl-Aliquoten eines alkoholischen Lösungs
mittels mit hohem pH-Wert desorbiert. Der Ablösevorgang
erforderte nur ungefähr 1 Minute zur Ausführung. Die freige
gebenen Peptide wurde nachfolgend mit Säure neutralisiert, in
eine Säule injiziert und unter Verwendung eines Acetonitril
gradienten chromatographiert. In den Fig. 8a und 8b sind
Ergebnisse gezeigt, die Peptide, die bei dieser Prozedur
erhalten wurden, in Bezug auf die Kontrollprobe vergleichen.
Die Chromatogramme in den Fig. 8 und 8b sind virtuell
identisch, womit eine wirksame Bindung und Ablösung
demonstriert wird. Die Maximaintegrationsergebnisse zeigten,
daß die Rückgewinnungen von 75% bis 95% reichen.
Die Prozedur gemäß Beispiel 2 wurde unter Verwendung eines
Endo-lys-c-(Enzym)-Auszugs von α-Lactoglobulin wiederholt,
das einen vollständig anderen Peptidsatz als den gemäß
Fig. 2 erzeugt. Die Peptide wurden erneut gebunden, gewaschen,
abgelöst und analysiert. Die Fig. 9a und 9b zeigen die Chroma
togramme, die wiederum virtuell identisch sind, wodurch die
Wirksamkeit der Vorrichtung gezeigt wird, selektiv zu
adsorbieren und zu desorbieren.
Ungefähr 20 Picomol von PCR-Primer-Polythymidinsäure, die aus
6 Oligomeren mit einer von 19 bis 24 reichenden Oligomergröße
wurden für die Vorrichtung gemäß Fig. 1 durch Lösen einer
Probe in einem Puffer (100 mM Ammoniumacetat mit pH 7,0)
zubereitet. Dem Zusatz von 10 µl wasserfreier Essigsäure zu
400 µl der Probe (pH = 3,5) folgend wurden die Primere auf dem
Gerät zentrifugiert, mit 400 µl deionisiertem Wasser
gewaschen, um ungebundene gelöste Substanzen zu entfernen, und
schließlich durch Zusatz von 50 µl von 1N-Ammoniumhydroxid in
50% Methanol unter Verwendung einer 30 s-Hochgeschwindigkeits
zentrifugierung abgelöst. Die Proben wurden schnell mit HCl
neutralisiert und einer C18-Umkehrphasen-Säule in 100 mM-
Triethylaminacetat zugeführt und mit einem flachen Gradienten
von Acetonitril (0,5%/min) chromatographiert. Der Vergleich
des Probenchromatogramms mit dem der abgelösten Substanz zeigt
einen hohen Grad der Rückgewinnung. Diese Daten demonstrieren
klar, daß die Vorrichtung Oligonukleotide bindet und löst.
Daher können solche Moleküle erfindungsgemäß konzentriert und
gereinigt werden.
Claims (23)
1. Zentrifugal-Adsorptivprobenpräparationsvorrichtung,
umfassend:
ein erstes Mittel zur Aufnahme einer Probe;
ein zweites Mittel zum Verteilen der Probe; und
eine polymergebundene, teilchenbeladene, semipermeable Adsorptivmembran, die zum selektiven Adsorbieren von Biomolekülen wirksam ist, welche ein Molekulargewicht unter halb ungefähr 10 000 aufweisen, und zwischen den ersten und zweiten Mitteln eingeschlossen ist.
ein erstes Mittel zur Aufnahme einer Probe;
ein zweites Mittel zum Verteilen der Probe; und
eine polymergebundene, teilchenbeladene, semipermeable Adsorptivmembran, die zum selektiven Adsorbieren von Biomolekülen wirksam ist, welche ein Molekulargewicht unter halb ungefähr 10 000 aufweisen, und zwischen den ersten und zweiten Mitteln eingeschlossen ist.
2. Zentrifugal-Adsorptivprobenpräparationsgerät gemäß
Anspruch 1, worin die semipermeable Adsorptivmembran eine
erste Oberfläche, die zu dem ersten Mittel weist, und eine
zweite Oberfläche besitzt, die zu dem zweiten Mittel weist,
welche semipermeable Adsorptivmembran eine Schicht aus einem
Polyester- oder Polyolefin-Gewebe mindestens auf einer von den
ersten und zweiten Oberflächen aufweist.
3. Zentrifugal-Adsorptivprobenpräparationsgerät gemäß
Anspruch 2, bei dem auf beiden der ersten und zweiten Ober
fläche der semipermeablen Membran eine Schicht aus Poly
ester- oder Polyolefin-Gewebe vorgesehen ist.
4. Zentrifugal-Adsorptivprobenpräparationsgerät gemäß
Anspruch 1 oder 2, bei dem die Adsorptivmembran Polystyren-
Divinylbenzen-Kugel umfaßt.
5. Zentrifugal-Adsorptivprobenpräparationsgerät gemäß
Anspruch 4, bei dem die Polystyren-Divinylbenzen-Kugel mit
einer schwefligen Säure funktionalisiert sind.
6. Schleuder-Adsorptivprobenpräparationsgerät gemäß
Anspruch 1 oder 2, bei dem die Adsorptivmembran Silika, PVDF-
Bindemittel und einen Träger umfaßt.
7. Schleuder-Adsorptivprobenpräparationsgerät gemäß
Anspruch 1, bei dem die Adsorptivmembran biomolekulare
Kationen adsorbiert.
8. Verfahren zum Einschließen einer Adsorptivmembran in einem
Probenpräparationsvorrichtung, die ein erstes Mittel zur
Aufnahme einer Probe und ein zweites Mittel zum Verteilen der
Probe aufweist, wobei eines der ersten und zweiten Mittel
einen Membranträger umfaßt, umfassend:
Bereitstellung einer Schicht umfassend ein Polyester- oder Polyolefingewebe auf einer Hauptoberfläche der Adsorptiv membran;
Anordnung der Adsorptivmembran auf dem Membranträger; und Verbindung des ersten und zweiten Mittels gemeinsam mit der Membran, die zwischen diesen angeordnet ist.
Bereitstellung einer Schicht umfassend ein Polyester- oder Polyolefingewebe auf einer Hauptoberfläche der Adsorptiv membran;
Anordnung der Adsorptivmembran auf dem Membranträger; und Verbindung des ersten und zweiten Mittels gemeinsam mit der Membran, die zwischen diesen angeordnet ist.
9. Verfahren gemäß Anspruch 8, bei dem die Adsorptivmembran
Polystyren-Divinylbenzen-Kugel umfaßt.
10. Verfahren gemäß Anspruch 8, bei dem die Adsorptivmembran
Silika, PVDF-Bindemittel und einen Träger umfaßt.
11. Verfahren gemäß Anspruch 8, bei dem ferner eine Schicht
umfassend ein Polyester- oder Polyolefin-Gewebe auf einer
zweiten Hauptoberfläche der Adsorptivmembran bereitgestellt
wird.
12. Verfahren gemäß Anspruch 8, bei der das erste Mittel ein
Probenreservoir umfaßt.
13. Polymergebundene, teilchenbeladene Adsorptivmembran,
die zum selektiven Adsorbieren einer analytischen Substanz
wirksam ist, welche Membran eine erste Oberfläche umfaßt, die
dazu vorgesehen ist, der analytischen Substanz ausgesetzt zu
sein, wobei auf der ersten Oberfläche eine Schicht aus Gewebe
auf Polyester- oder Polyolefin-Basis vorgesehen ist.
14. Adsorptivmembran gemäß Anspruch 13, bei der die Membran
ferner eine zweite Oberfläche gegenüber zu der ersten Ober
fläche umfaßt, wobei auf der zweiten Oberfläche eine Schicht
aus Gewebe auf Polyester- oder Polyolefin-Basis vorgesehen
ist.
15. Adsorptivmembran gemäß Anspruch 13 oder 14, ferner
umfassend Polystyren-Divinylbenzen-Kugel.
16. Adsorptivmembran gemäß Anspruch 13 oder 14, ferner
umfassend Silika, PVDF-Bindemittel und einen Träger.
17. Zentrifugalfiltrationsvorrichtung, umfassend:
ein Probenreservoir,
eine Basis, die unterhalb des Probenreservoirs angeordnet ist,
ein Adsorptivfiltermittel, das das Probenreservoir von der Basis trennen, wobei das Adsorptivfiltermittel eine semi permeable, polymergebundene, mit Teilchen beladene Adsorptiv membran umfassen,
einen Träger für das Adsorptivfiltermittel,
eine oder mehrere Filtratleitungen in der Basis, um den Durchtritt von Filtrat von dem Filtermittel in die Basis zu ermöglichen, und
Mittel zur Bereitstellung eines flüssigkeitsdichten Verschlusses zwischen dem Rand des Probenreservoirs, der Membran und dem Membranträger.
ein Probenreservoir,
eine Basis, die unterhalb des Probenreservoirs angeordnet ist,
ein Adsorptivfiltermittel, das das Probenreservoir von der Basis trennen, wobei das Adsorptivfiltermittel eine semi permeable, polymergebundene, mit Teilchen beladene Adsorptiv membran umfassen,
einen Träger für das Adsorptivfiltermittel,
eine oder mehrere Filtratleitungen in der Basis, um den Durchtritt von Filtrat von dem Filtermittel in die Basis zu ermöglichen, und
Mittel zur Bereitstellung eines flüssigkeitsdichten Verschlusses zwischen dem Rand des Probenreservoirs, der Membran und dem Membranträger.
18. Filtrationsvorrichtung gemäß Anspruch 17, bei der das
Adsorptivfiltermittel eine erste Oberfläche aufweist, die zum
Probenreservoir weist, wobei auf der ersten Oberfläche eine
Schicht aus Gewebe auf Polyester- oder Polyolefin-Basis vor
gesehen ist.
19. Filtrationsvorrichtung gemäß Anspruch 18, bei der das
Adsorptivfiltermittel eine zweite Oberfläche gegenüber zu der
ersten Oberfläche aufweist, wobei auf der zweiten Oberfläche
eine Schicht aus Gewebe auf Polyester- oder Polyolefin-Basis
vorgesehen ist.
20. Verfahren zum selektiven Adsorbieren von Biomolekülen, die
ein Molekulargewicht unterhalb von ungefähr 10 000 aufweisen,
aus einer Probe, umfassend:
Kontaktieren der Probe mit einer semipermeablen, polymer gebundenen, teilchenbeladenen Adsorptivmembran, um so die Biomoleküle zu veranlassen, an der Membran adsorbiert zu werden, und
Unterziehen der Membran einer Zentrifugierung, um so die Probe, die nicht durch die Membran adsorbiert wird, zu veran lassen, durch die Membran hindurchzutreten.
Kontaktieren der Probe mit einer semipermeablen, polymer gebundenen, teilchenbeladenen Adsorptivmembran, um so die Biomoleküle zu veranlassen, an der Membran adsorbiert zu werden, und
Unterziehen der Membran einer Zentrifugierung, um so die Probe, die nicht durch die Membran adsorbiert wird, zu veran lassen, durch die Membran hindurchzutreten.
21. Verfahren gemäß Anspruch 20, bei dem ferner die Biomole
küle mit einem Mittel, das zum Ablösen der Biomoleküle wirksam
ist, von der Membran abgelöst werden.
22. Verfahren gemäß Anspruch 21, bei dem das Volumen der Probe
größer als das Volumen des ablösenden Mittels ist, wodurch
eine Konzentration der Biomoleküle resultiert.
23. Verfahren gemäß Anspruch 20, bei dem die Probe, die nicht
adsorbiert wird, Verunreinigungen umfaßt, wodurch eine
Reinigung der Biomoleküle bei Ablösung resultiert.
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