DE19502053A1 - Verfahren und DNA-Moleküle zur Steigerung der Photosyntheserate in Pflanzen, sowie Pflanzenzellen und Pflanzen mit gesteigerter Photosyntheserate - Google Patents
Verfahren und DNA-Moleküle zur Steigerung der Photosyntheserate in Pflanzen, sowie Pflanzenzellen und Pflanzen mit gesteigerter PhotosyntheserateInfo
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Description
Die vorliegende Erfindung betrifft ein Verfahren und DNA-Moleküle zur
Steigerung der Photosyntheserate in Pflanzen sowie zur Steigerung des Ertrags von
Pflanzen. Die Steigerung der Photosyntheserate bzw. des Ertrags wird erreicht durch
die Expression einer deregulierten oder unregulierten Fruktose-1,6-Bisphosphatase
im Cytosol transgener Pflanzen. Die Erfindung betrifft ebenfalls die über das
Verfahren erhältlichen Pflanzenzellen und Pflanzen, sowie die Verwendung von
DNA-Sequenzen, die Proteine mit der enzymatischen Aktivität einer Fruktose-1,6-Bis
phosphatase kodieren, zur Herstellung von Pflanzen, die eine gesteigerte
Photosyntheserate aufweisen. Ferner betrifft die Erfindung rekombinante DNA-Mo
leküle, die in Pflanzenzellen und Pflanzen zur Steigerung der Photosyntheserate
führen.
Bedingt durch den kontinuierlich steigenden Nahrungsmittelbedarf, der aus der
ständig wachsenden Weltbevölkerung resultiert, ist eine der Aufgaben der
biotechnologischen Forschung, sich um eine Steigerung des Ertrages von
Nutzpflanzen zu bemühen. Eine Möglichkeit dies zu erreichen besteht in der
gezielten gentechnischen Veränderung des Metabolismus von Pflanzen. Ziele sind
dabei beispielsweise die primären Prozesse der Photosynthese, die zur CO₂-
Fixierung führen, die Transportprozesse, die an der Verteilung der Photoassimilate
innerhalb der Pflanze beteiligt sind, als auch Stoffwechselwege, die zur Synthese
von Speicherstoffen, z. B. von Stärke, Proteinen oder Fetten, führen.
Beschrieben wurde beispielsweise die Expression einer prokaryontischen
Asparaginsynthetase in pflanzlichen Zellen, wodurch es bei den transgenen
Pflanzen unter anderem zu einer Steigerung der Biomasseproduktion kommt (EP 0
511 979).
Ebenfalls vorgeschlagen wurde die Expression einer prokaryontischen
Polyphosphatkinase im Cytosol transgener Pflanzen, was in Kartoffelpflanzen zu
einer Ertragsteigerung in bezug auf das Knollengewicht von bis zu 30% führt.
Weiterhin wird in der EP 0 442 592 die Expression einer apoplastischen Invertase in
Kartoffelpflanzen beschrieben, die zur Veränderung des Ertrages derartig
veränderter transgener Pflanzen führt.
Weitere Versuche konzentrierten sich auf die Modifikation der Aktivitäten von
Enzymen, die an der Synthese von Saccharose, dem wichtigsten Transportmetabolit
in den meisten Pflanzenarten, beteiligt sind. In Pflanzen wird das im Verlauf der
Photosynthese fixierte CO₂ in Form von Triosephosphaten (Glycerinaldehyd-3-Phos
phat und Dihydroxyacetonphosphat) aus den Plastiden ins Cytosol
transportiert. Im Cytosol wird durch Kondensation von Glycerinaldehyd-3-Phos
phat und Dihydroxyacetonphosphat durch das Enzym Aldolase ein Molekül
Fruktose-1,6-Bisphosphat gebildet. Dieses wird in ein Molekül Fruktose-6-Phosphat
umgewandelt, das wiederum Substrat ist für die Synthese von Saccharosephosphat
durch das Enzym Saccharosephosphat-Synthase nach der Gleichung
Fruktose-6-Phosphat + UDP-Glukose → Saccharose-Phosphat + UDP.
Die Umwandlung von Fruktose-1,6-Bisphosphat in Fruktose-6-Phosphat wird von
dem Enzym Fruktose-1,6-Bisphosphatase (im folgenden: FBPase; EC 3.1.3.11)
katalysiert, das durch verschiedene Substanzen reguliert wird. So sind
beispielsweise Fruktose-2,6-Bisphosphat und AMP starke Inhibitoren dieses
Enzyms, wobei AMP allosterisch inhibiert, wohingegen Fruktose-2,6-Bisphosphat
an das aktive Zentrum des Enzyms bindet (Ke et al., 1989, Proc. Natl. Acad. Sci. USA
86 : 1475-1479; Liu et al., 1989, Biochem. Biophys. Res. Comm. 161 : 689-695. In
pflanzlichen Zellen gibt es sowohl eine cytoplasmatische als auch eine kernkodierte
chloroplastische FBPase. Die Rückreaktion (Umwandlung von Fruktose-6-Phosphat
in Fruktose-1,6-Bisphosphat) wird durch das Enzym Phospho-Fruktokinase (PFK)
unter Verwendung von ATP katalysiert. Dieses Enzym wird durch Fruktose-6-Phos
phat, Pi, und Fruktose-2,6-Bisphosphat aktiviert und von Glycerinaldehyd-3-Phos
phat und Dihydroxyacetonphosphat gehemmt. Neben diesen Enzymen kommt
in pflanzlichen Zellen ein weiteres Enzym vor, die Pyrophosphat:Fruktose-6-
Phosphat-1-Phosphotransferase (PFP), die beide Reaktionen katalysiert, nach
folgender Gleichung:
Fruktose-1,6-Bisphosphat + Pi ⇄ Fruktose-6-Phosphat + PPi
Es wurden bisher bereits verschiedene Versuche unternommen, diesen Schritt in
der Synthese der Saccharose derart zu manipulieren, daß es zu einer Erhöhung der
CO₂-Fixierung und folglich zu einer gesteigerten Biomasseproduktion kommt.
Beispielsweise wurde versucht, durch Überexpression einer pflanzlichen FBPase im
Cytosol die Bildung von Fruktose-1,6-Bisphosphat zu steigern (Juan et al., 1994,
Supplement to Plant Physiol., Vol. 105 : 118). Dies führte jedoch zu keiner meßbaren
Steigerung der Saccharosesynthese. Auch die anti-sense-Inhibition der PFP resultierte
in keiner nachweisbaren Steigerung der Saccharosesynthese in pflanzlichen Zellen
(Hajirezaei et al., 1994, Planta 192 : 16-30). Ferner wurde versucht, durch Veränderung
der Konzentration des allosterischen Inhibitors Fruktose-2,6-Bisphosphat Einfluß
auf die durch FBPase katalysierte Reaktion zu nehmen (Kruger und Scott, 1994,
Biochemical Society Transactions, Transgenic Plants and Plant Biochemistry 22 : 904-909).
Hierbei wurde jedoch gefunden, daß eine Erhöhung der Konzentration der
Fruktose-2,6-Bisphosphat-Konzentration keinen Effekt auf die Photosyntheserate
und nur einen geringen Effekt auf die Synthese von Stärke bzw. Saccharose hat.
Aufgabe der vorliegenden Erfindung ist es deshalb, allgemein bei Pflanzen
anwendbare gentechnische Verfahren zur Steigerung der Photosyntheserate und
folglich der Biomasseproduktion bzw. des Ertrages, sowie rekombinante DNA-Mo
leküle für diesen Zweck zur Verfügung zu stellen.
Es wurde nun überraschend gefunden, daß durch die Expression von DNA-Se
quenzen, die für Proteine mit der enzymatischen Aktivität einer Fruktose-1,6-Bis
phosphatase kodieren, im Cytosol pflanzlicher Zellen eine drastische Erhöhung
der Photosyntheserate in derart veränderten Pflanzen im Vergleich zu
Wildtyppflanzen erreicht werden kann. Es handelt sich dabei vorzugsweise um
DNA-Sequenzen, die für FBPasen kodieren, die im Vergleich zu normalerweise in
pflanzlichen Zellen vorkommenden FBPasen dereguliert oder unreguliert sind.
Dereguliert bedeutet dabei, daß diese Enzyme nicht in der gleichen Weise reguliert
werden, wie die in pflanzlichen Zellen normalerweise exprimierten FBPase-En
zyme. Insbesondere unterliegen diese Enzyme anderen
Regulationsmechanismen, d. h. sie werden nicht in demselben Ausmaß durch die
Inhibitoren inhibiert bzw. durch die Aktivatoren aktiviert, die normalerweise
pflanzliche FBPasen inhibieren bzw. aktivieren. Sie werden z. B. nicht im gleichen
Ausmaß wie normalerweise in Pflanzen vorkommende FBPasen von Fruktose-2,6-Bis
phosphat oder von AMP inhibiert.
Unter unregulierten FBPase-Enzymen werden im Rahmen dieser Erfindung
FBPase-Enzyme verstanden, die nicht durch AMP, ATP oder Fruktose-2,6-Bis
phosphat reguliert werden.
Eine gesteigerte Photosyntheserate bedeutet, daß die Pflanzen, die mit einer DNA-Se
quenz transformiert wurden, die zur Synthese einer deregulierten oder
unregulierten FBPase im Cytosol der Zellen führt, im Vergleich zu nicht
transformierten Pflanzen eine erhöhte Photosyntheserate aufweisen, vorzugsweise
eine Photosyntheserate, die um mindestens 10% erhöht ist, insbesondere eine, die
um mindestens 20% erhöht ist, und besonders bevorzugt eine, die um 30-40%
erhöht ist.
Gegenstand der vorliegenden Erfindung sind daher Verfahren zur Steigerung der
Photosyntheserate und des Ertrages in Pflanzen, dadurch gekennzeichnet, daß in
pflanzliche Zellen eine DNA-Sequenz, die für eine deregulierte oder unregulierte
FBPase kodiert, eingeführt wird, die derart mit Steuerelementen für die
Transkription verknüpft ist, daß es im Cytosol transformierter Zellen zur Synthese
einer aktiven, deregulierten oder unregulierten FBPase kommt.
Ein derartiges Verfahren besteht vorzugsweise aus den folgenden Schritten:
- a) Herstellen eines rekombinanten, doppelsträngigen DNA-Moleküls, das folgende
DNA-Sequenzen umfaßt:
- i) einen in pflanzlichen Zellen funktionalen Promotor, der die Transkription einer nachfolgenden DNA-Sequenz gewährleistet,
- ii) eine DNA-Sequenz, die für ein Protein mit der enzymatischen Aktivität einer Fruktose-1,6-Bisphosphatase kodiert und in sense-Orientierung mit dem Promotor verknüpft ist,
- iii) gegebenenfalls eine 3′-nichttranslatierte Region, die die Termination der Transkription und die Polyadenylierung des Transkriptes gewährleistet,
- b) Transfer des gemäß Schritt a) hergestellten DNA-Moleküls in pflanzliche Zellen, und
- c) Regeneration ganzer Pflanzen aus den transformierten Pflanzenzellen,
wobei es sich bei dem Protein mit der enzymatischen Aktivität einer Fruktose-1,6-Bis
phosphatase um ein dereguliertes oder unreguliertes Enzym handelt.
Das gemäß Verfahrensschritt konstruierte DNA-Molekül stellt eine
Expressionskassette dar, die, wenn sie in pflanzliche Zellen eingeführt wird, zur
Transkription eines RNA-Moleküls führt, das für ein funktionales dereguliertes
oder unreguliertes FBPase-Enzym kodiert.
Für den in dem erfindungsgemäßen Verfahren unter i) genannten Promotor
kommt im Prinzip jeder in Pflanzen funktionale Promotor in Betracht. Die
Expression der besagten DNA-Sequenzen kann generell in jedem Gewebe einer
transformierten Pflanze und zu jedem Zeitpunkt stattfinden, bevorzugt findet sie in
photosynthetisch aktiven Geweben statt. Geeignet ist beispielsweise der 35S-Pro
motor des Cauliflower-Mosaik-Virus (Odell et al., 1985, Nature 313 : 810-812), der
eine konstitutive Expression in allen Geweben einer Pflanze gewährleistet. Es
können jedoch auch Promotoren verwendet werden, die nur in einem bestimmten
Gewebe der Pflanze zu einer Expression nachgeschalteter Sequenzen führen,
vorzugsweise in photosynthetisch aktivem Gewebe (siehe z. B. Stockhaus et al.,
1989, EMBO J. 8 : 2245-2251) oder nur zu einem durch äußere Einflüsse
determinierten Zeitpunkt (siehe beispielsweise WO/9307279).
Neben dem Promotor kann das gemäß Verfahrensschritt a) konstruierte DNA-Mo
lekül auch DNA-Sequenzen enthalten, die eine weitere Steigerung der
Transkription gewährleisten, beispielsweise sogenannte Enhancer-Elemente, oder
DNA-Sequenzen, die im transkribierten Bereich liegen und die eine effizientere
Translation der synthetisierten RNA in das entsprechende Protein gewährleisten.
Derartige 5′-nichttranslatierte Regionen können von viralen Genen oder
geeigneten eukaryontischen Genen gewonnen werden oder synthetisch hergestellt
werden. Sie können homolog oder heterolog in bezug auf den verwendeten
Promotor sein.
3′-nichttranslatierte DNA-Sequenzen von Genen, die die Termination der
Transkription und die Polyadenylierung des entstehenden Transkriptes
gewährleisten sind bekannt und beschrieben. Sie sind beliebig gegeneinander
austauschbar. Beispiele für derartige Terminationssequenzen sind die 3′-
nichttranslatierten Regionen, die das Polyadenylierungssignal des Nopalin-Syn
thase-Gens (NOS-Gen) aus Agrobakterien umfassen, oder die 3′-
nichttranslatierten Regionen der Gene der Speicherproteine aus Sojabohne, sowie
die der Gene der kleinen Untereinheit der Ribulose-1,5-Bisphosphat-Carboxylase
(ssRUBISCO).
Bei den unter Verfahrensschritt a)ii) genannten DNA-Sequenzen, die für ein
Protein mit der enzymatischen Aktivität einer FBPase kodieren, kann es sich
sowohl um prokaryontische, insbesondere bakterielle, als auch um eukaryontische
DNA-Sequenzen, d. h. um DNA-Sequenzen aus Pflanzen, Algen, Pilzen oder
tierischen Organismen, handeln. Es handelt sich vorzugsweise um DNA-Se
quenzen, die für Enzyme kodieren, die im Vergleich zu in Wildtyppflanzen
vorkommenden FBPase-Enzymen einer veränderten, vorzugsweise einer
verringerten Regulation durch Inhibitoren, insbesondere einer verringerten
allosterischen Regulation, unterliegen. Bei den durch die Sequenzen kodierten
Enzymen kann es sich sowohl um bekannte, in der Natur vorkommende Enzyme
handeln, die eine abweichende Regulation durch verschiedene Substanzen
aufweisen, als auch um Enzyme, die durch Mutagenese aus bekannten Enzymen
aus Bakterien, Algen, Pilzen, Tieren oder Pflanzen hergestellt wurden.
Eine bevorzugte Ausführungsform der vorliegenden Erfindung sieht die
Verwendung bakterieller DNA-Sequenzen vor, die für Proteine mit der
enzymatischen Aktivität einer FBPase kodieren. Bakterielle FBPasen weisen den
Vorteil auf, daß sie im Vergleich zu pflanzlichen FBPasen nicht durch Fruktose-2,6-Bis
phosphat reguliert werden. Ferner werden viele der bakteriellen FBPasen im
Gegensatz zu den pflanzlichen und tierischen FBPasen in ihrer enzymatischen
Aktivität nicht durch AMP reguliert. DNA-Sequenzen, die für derartige FBPasen
kodieren, werden bevorzugt verwendet.
Eine bevorzugte Ausführungsform des erfindungsgemäßen Verfahrens sieht die
Verwendung von DNA-Sequenzen aus Alcaligenes eutrophus vor, die für die
Fruktose-1,6-Bisphosphatase kodieren. Geeignet sind beispielsweise Sequenzen, die
die unter Seq ID No. 1 dargestellte DNA-Sequenz oder eine im wesentlichen
identische Nukleotidsequenz aufweisen. Das FBPase-Enzym aus Alcaligenes
eutrophus, das die unter Seq ID No. 1 angegebenen Aminosäuresequenz besitzt, weist
im Gegensatz zu pflanzlichen und tierischen FBPase-Enzymen keine Inhibition
durch AMP auf (Abdelal und Schlegel, 1974, J. Bacteriol. 120 : 304-310). Bei der unter
Seq ID No. 1 dargestellten DNA-Sequenz handelt es sich um eine chromosomale
DNA-Sequenz. Daneben existiert in Alcaligenes eutrophus eine durch ein Plasmid
kodierte FBPase. Diese weist in ihrer Aminosäuresequenz das Motiv GQCMAGKS
auf, das bei der chromosomal kodierten FBPase fehlt (J. Koßmann; Diplomarbeit,
1988, Georg-August-Universität, Göttingen, Deutschland). Diese Sequenz ist für die
Phosphoribulokinase und viele andere Enzyme als ATP-Bindungsstelle identifiziert
oder diskutiert worden. Die ermittelte Konsensussequenz (GXXXXGKT/S) ist in der
oben genannten Sequenz vollständig enthalten. Es ist möglich, daß diese Sequenz
für die Bindung von ATP und somit für eine Inhibierung der Enzymaktivität durch
ATP, wie sie bei verschiedenen bakteriellen FBPasen beobachtet wird,
verantwortlich ist.
Bekannt sind neben der genannten DNA-Sequenz aus Alcaligenes eutrophus auch
weitere bakterielle DNA-Sequenzen, die für Proteine mit der enzymatischen
Aktivität einer FBPase kodieren und die aufgrund ihrer Eigenschaften in dem
erfindungsgemäßen Verfahren verwendet werden können.
So ist beispielsweise das für FBPase kodierende cfxF-Gen aus Xanthobacter flavus H4-14
(Meÿer et al., 1990, J. Gen. Microbiol. 136 : 2225-2230; Meÿer et al., 1991, Mol. Gen.
Genet. 225 : 320-330) sowie das fbp-Gen aus Rhodobacter spaeroides kloniert worden
(Gibson et al., 1990, Biochemistry 29 : 8085-8093; GenEMBL-Datenbank;
Zugriffsnummer J02922). Das fbp-Gen aus Rhodobacter spaeroides ist insbesondere
geeignet, da das FBPase-Enzym, das durch dieses Gen kodiert wird, nicht durch AMP
inhibiert wird.
Ferner ist die DNA-Sequenz des FBPase-kodierenden fbp-Gens aus Escherichia coli
bekannt (Sedivy et al., 1984, J. Bacteriol. 158 : 1048-1053; Hamilton et al., 1988, Nucl.
Acids Res. 16 : 8707; Raines et al., 1988, Nucl. Acids Res. 16 : 7931-7942), sowie eine
mutierte FBPase, die insensitiv gegenüber AMP ist (Sedivy et al., 1986, Proc. Natl.
Acad. Sci. USA 83 : 1656-1659).
Ferner ist eine DNA-Sequenz aus Nitrobacter vulgaris bekannt, die für FBPase kodiert
(GenEMBL-Datenbank; Zugriffsnummer L22884).
Gene, die für FBPase kodieren sind ebenfalls aus Saccharomyces cerevisiae und
Schizosaccharomyces pombe isoliert worden (Rogers et al., 1988, J. Biol. Chem.
263 : 6051-6057; GenEMBL-Datenbank; Zugriffsnummer J03207 und J03213).
Bei Säugern ist beispielsweise eine cDNA-Sequenz bekannt, die für die FBPase aus
Rattenleber kodiert (El-Maghrabi et al., 1988, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85 : 8430-8434),
sowie cDNA-Sequenzen, die für FBPase aus Schweineleber und Schweineniere
kodieren (Marcus et al., 1982, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 79 : 7161-7165; Williams et al.,
1992, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89 : 3080-3082; Burton et al., 1993, Biochem. Biophys.
Res. Commun. 192 : 511-517; GenEMBL-Datenbank; Zugriffsnummer M86347).
Bekannt ist ferner eine cDNA-Sequenz, die für FBPase aus Mensch kodiert
(El-Maghrabi, 1993, J. Biol. Chem. 268 : 9466-9472; GenEMBL-Datenbank;
Zugriffsnummer M19922 und L10320).
Pflanzliche DNA-Sequenzen, die für FBPasen kodieren, sind ebenfalls bekannt. So
beschreiben Hur et al. (1992, Plant Mol. Biol. 18 : 799-802) eine cDNA, die für die
cytosolische FBPase aus Spinat kodiert. Dieses Enzym wurde auch auf
biochemischer Ebene ausgiebig untersucht (Zimmermann et al., 1978, J. Biol. Chem.
253 : 5952-5956; Ladror et al., 1990, Eur. J. Biochem. 189 : 89-94). Raines et al. (1988, Nucl.
Acids. Res. 16 : 7931-7942) beschreiben eine cDNA-Sequenz, die für die
chloroplastidäre FBPase aus Weizen kodiert. Eine genomische DNA-Sequenz, die
für dieses Enzym kodiert, wird ebenfalls beschrieben (Lloyd et al., 1991, Mol. Gen.
Gen. 225 : 209-216). Ferner sind cDNA-Sequenzen, die für FBPasen kodieren, aus
Arabidopsis thaliana (GenEMBL-Datenbank; Zugriffsnummer X58148), Beta vulgaris
(Zuckerrübe; GenEMBL-Datenbank; Zugriffsnummer M80597), Brassica napus
(GenEMBL-Datenbank; Zugriffsnummer L15303), Pisum sativum (GenEMBL-Da
tenbank; Zugriffsnummer X68826), Spinacia oleracea (GenEMBL-Datenbank;
Zugriffsnummer X61690) und Solanum tuberosum (GenEMBL-Datenbank;
Zugriffsnummer X76946) bekannt.
Neben DNA-Sequenzen, die für FBPase-Enzyme kodieren, sind aus einer großen
Anzahl von Organismen auch die FBPase-Enzyme gereinigt, biochemisch
charakterisiert und zum Teil sequenziert worden, z. B. die cytosolische und die
chloroplastidäre FBPase aus Spinat (Zimmermann et al., 1978, J. Biol. Chem.
253 : 5952-5956; Ladror et al., 1990, Eur. J. Biochem. 189 : 89-94; Zimmermann et al.,
1976, Eur. J. Biochem. 70 : 361-367; Soulie et al., 1991, Eur. J. Biochem. 195 : 671-678;
Marcus und Harrsch, 1990, Arch. Biochem. Biophys. 279 : 151-157; Marcus et al., 1987,
Biochemistry 26 : 7029-7035; Schimkat et al., 1990, 181 : 97-103), die FBPase aus Mais
(Nishizawa und Buchanan, 1981, J. Biol. Chem. 256 : 6119-6126), die chloroplastidäre
FBPase aus Weizen (Leegood und Walker, 1982, Planta 156 : 449-456), die FBPase aus
Synechococcus leopoliensis (Gerbling et al., 1986, Plant Physiol. 716-720), aus
Polysphondylium pallidum (Rosen, Arch. Biochem. Biophys. 114 : 31-37), aus
Kaninchenleber (Pontremoli et al., 1966, Arch. Biochem. Biophys. 114 : 24-30), aus
Schwein (Marcus et al., 1982, Proc. Natl. Acad. Sci. 79 : 7161-7165), aus
Rhodopseudomonas palustris (Springgate und Stachow, 1972, Arch. Biochem. Biophys.
152 : 1-12; Springgate und Stachow, 1972, Arch. Biochem. Biophys. 152 : 13-20), aus E.
coli (Fraenkel et al., 1966, Arch. Biochem. Biophys. 114 : 4-12), sowie zwei Isoformen
aus Nocardia opaca 1b (Amachi und Bowien, 1979, J. Gen. Microbiol. 113 : 347-356).
Ferner wurden für die FBPasen aus Schwein die Kristallstrukturen der Komplexe
des Enzyms mit Fruktose-6-Phosphat, AMP, Fruktose-2,6-Bisphosphat und
Magnesium bestimmt (Seaton et al., 1984, J. Biol. Chem. 259 : 8915-8916; Ke et al., 1990,
Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87 : 5243-5247; Ke et al., 1989, J. Mol. Biol. 212 : 513-539; Ke et
al., 1991, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 88 : 2989-2993; Ke et al., 1991, Biochemistry
30 : 4412-4420). Hierdurch konnten die Bindungsstellen für Fruktose-6-Phosphat und
AMP identifiziert werden, sowie die Aminosäurereste, die mit diesen Substanzen
interagieren. Ferner wurde für die FBPase aus Schwein beschrieben, daß das
Entfernen Nukleotide, die für die Aminosäurereste 1-25 kodieren, zur Synthese
einer FBPase führt, die durch AMP nicht inhibiert wird, aber ihre katalytischen
Eigenschaften beibehält (Chatterjee et al., 1985, J. Biol. Chem. 260 : 13553-13559).
Sequenzvergleiche auf der Ebene der Nukleotidsequenzen der FBPase-Gene, sowie
auf der Ebene der Aminosäuresequenz der FBPase-Enzyme wurden ebenfalls bereits
in umfangreichem Maße durchgeführt (Marcus et al., 1986, Biochem. Biophys. Res.
Comm. 135 : 374-381). Dabei stellte sich heraus, daß bestimmte Domänen der FBPase
selbst zwischen entfernt verwandten Organismen relativ stark konserviert sind
(Gibson et al., 1990, Biochemistry 29 : 8085-8093; Marcus et al., 1988, Proc. Natl. Acad.
Sci. USA 85 : 5379-5383; Rogers et al., 1988, J. Biol. Chem. 263 : 6051-6057). So konnte
z. B. gezeigt werden, daß die Aminosäurereste, die in FBPase aus Schwein, das
katalytische Zentrum bilden, in der FBPase aus Xanthobacter flavus stark konserviert
sind (Meÿer et al., 1990, J. Gen. Microbiol. 136 : 2225-2230).
Auch die Sequenzvergleiche der Aminosäuresequenz der FBPase aus Rhodobacter
sphaeroides mit den bis dahin bekannten Sequenzen anderer FBPase-Enzyme geben
Hinweise auf konservierte Regionen, sowie auf Aminosäurereste, die an der
Katalyse bzw. an der Regulation der Enzymaktivität beteiligt sind (Gibson et al.,
1990, Biochemistry 29 : 8085-8093).
Die Regulation der FBPase-Enzyme wurde ebenfalls intensiv untersucht und ist
ausführlich beschrieben (Tejwani, 1983, Advances in Enzymology, Vol. 54 : 121-194).
Insgesamt geben die bisher bekannten Daten über DNA-Sequenzen, die FBPase-En
zyme kodieren, über Aminosäuresequenzen von FBPase-Enzymen, über
Kristallstrukturen, sowie über die Regulation und über kinetische und
biochemische Eigenschaften der bisher bekannten FBPasen ein derart detailliertes
Bild, daß es aufgrund dieser Informationen möglich ist, gezielt Mutationen in
verfügbare DNA-Sequenzen einzuführen, die zu einer veränderten Regulation der
Enzymaktivität des synthetisierten Proteins führen. Wie oben bereits erwähnt, ist es
beispielsweise möglich, die Inhibition durch AMP bei der FBPase aus Schwein
dadurch aufzuheben, daß man die 25 N-teminalen Aminosäuren des Enzyms
entfernt. Die katalytische Aktivität des Enzyms wird dadurch nicht beeinflußt.
Aufgrund der starken Konservierung der FBPase-Gene sollte es daher möglich sein,
auch bei anderen FBPase-Enzymen eine Insensitivität gegenüber AMP dadurch
hervorrufen zu können, daß ein ausreichend langer Bereich am N-Terminus des
Enzyms deletiert wird.
Bekannt ist ferner im Falle der chromosomal bzw. plasmidär kodierten FBPasen aus
Alcaligenes eutrophus, daß das plasmidär kodierte Enzym, eine charakteristische ATP-Bin
dungsstelle aufweist, die dem chromosomal kodiertem Enzym fehlt (siehe
oben). Es ist daher möglich, bakterielle DNA-Sequenzen, die für FBPasen kodieren
und die durch ATP inhibiert werden, daraufhin zu untersuchen, ob sie eine
vergleichbare ATP-Bindungsstelle aufweisen, und durch gängige
molekularbiologische Techniken diese ATP-Bindungsstelle zu inaktivieren oder zu
entfernen, um ein Enzym produzieren zu können, daß durch ATP nicht inhibierbar
ist.
Ähnliches gilt für die Veränderung der Sensitivität gegenüber dem Inhibitor
Fruktose-2,6-Bisphosphat. Die durch Röntgenstruktur-Analyse gewonnenen Daten
von Kristallen der FBPase aus Schwein, sowie die Analyse verschiedener Mutanten
ermöglichen inzwischen die Charakterisierung der Bindungsstelle für Fruktose-2,6-
Bisphosphat im aktiven Zentrum der FBPase. Im Fall der FBPase aus Schwein
wurden beispielsweise Aminosäurereste, von denen aufgrund der strukturellen
Daten angenommen wird, daß sie von Bedeutung sind für die Funktion des
Enzyms, durch punktspezifische Mutagenese modifiziert (Giroux et al., 1994, J. Biol.
Chem. 269 : 31404-31409 und Referenzen darin). So konnte gezeigt werden, daß die
Aminosäure Arginin 243 der FBPase aus Schweinenieren beteiligt ist an der
Substratbindung, sowie an der Inhibition durch Fruktose-2,6-Bisphosphat. Durch
Austausch dieser Aminosäure gegen einen Alaninrest konnte ein funktionales
FBPase-Enzym hergestellt werden, dessen Affinität für Fruktose-2,6-Bisphosphat im
Vergleich zum Wildtypenzym um den Faktor 1000 verringert ist, wohingegen die
Affinität zu dem Substrat Fruktose-1,6-Bisphosphat nur um den Faktor 10
verringert ist (Giroux et al., 1994, J. Biol. Chem. 269 : 31404-31409). Ferner konnte für
FBPase aus Rattenleber gezeigt werden, daß das Entfernen eines Lysinrestes im
aktiven Zentrum, der ebenfalls für die Bindung von Fruktose-1,6-Bisphosphat und
Fruktose-2,6-Bisphosphat, von Bedeutung ist, in einem Enzym resultiert, daß eine
um den Faktor 1000 verringerte Affinität zu dem Inhibitor Fruktose-2,6-Bis
phosphat besitzt (El-Maghrabi et al., 1992, J. Biol. Chem. 267 : 6526-6530).
Die Mutagenisierung der relevanten Aminosäurereste sollte daher auch in diesem
Fall die Erzeugung von Mutanten ermöglichen, die in ihrer Regulation durch
Fruktose-2,6-Bisphosphat gegenüber Wildtypproteinen verändert sind. Aufgrund
der starken Konservierung der Aminosäuresequenz der FBPase-Enzyme,
insbesondere im Bereich des aktiven Zentrums, sollte es ferner möglich sein,
Ergebnisse, die an Mutanten des Enzyms eines Organismus erhalten wurden, auf
Enzyme, die aus anderen Organismen stammen, zu übertragen.
Eine weitere Möglichkeit zur Identifizierung von Aminosäureresten, die für die
Katalyse sowie für die Inhibition durch Fruktose-2,6-Bisphosphat bedeutsam sind,
besteht in der computergestützten Simulation der Molekülstruktur.
Aminosäurereste, die auf diese Weise als relevant identifiziert werden, können
anschließend gezielt durch punktspezifische Mutagenese verändert und Mutanten
auf ihre Eigenschaften hin untersucht werden.
Für eine besonders effiziente Steigerung der Photosyntheserate bzw. der Synthese
von Fruktose-6-Phosphat aus Fruktose-1,6-Bisphosphat werden FBPase-Enzyme
verwendet, die nur noch einer reduzierten Regulation durch die Inhibitoren der
pflanzlichen FBPase-Enzyme unterliegen (deregulierte FBPase-Enzyme),
vorzugsweise Enzyme, die überhaupt keiner Regulation mehr unterliegen
(unregulierte FBPase-Enzyme), wobei jedoch jeweils die katalytische Aktivität
weitgehend erhalten bleibt. Die kodierenden Regionen von FBPase-Genen aus
Bakterien, Pilzen, Tieren oder Pflanzen können in E. coli oder einem anderen
geeigneten Wirt nach dem Fachmann bekannten Methoden mutagenisiert werden
und anschließend hinsichtlich einer erhöhten FBPase-Aktivität analysiert werden.
Die Einführung von Mutationen kann dabei zum einen gerichtet erfolgen (z. B.
durch "site-directed mutagenesis") unter der Verwendung spezifischer
Oligonukleotide, oder ungerichtet. Im Fall der ungerichteten Mutagenese gibt es
beispielsweise die Möglichkeit der Amplifikation der betreffenden DNA-Sequenzen
mittels der Polymerasekettenreaktion in Gegenwart von Mn2+-Ionen anstatt Mg2+-Ionen,
bei der eine erhöhte Fehlerrate auftritt, oder die Vermehrung der
betreffenden DNA-Moleküle in dem E. coli-Stamm XL1-Red, der eine hohe
Fehlerrate bei der Replikation der in die Bakterien eingebrachten Plasmid-DNA
aufweist.
Die mutagenisierten DNA-Sequenzen, die für FBPase-Enzyme kodieren, werden
anschließend zur Analyse der FBPase-Aktivität in einen geeigneten Wirt
eingebracht, vorzugsweise in einen E. coli-Stamm der FBPase-defizient ist. Ein
derartiger Stamm ist beispielsweise der E. coli-Stamm DF657 (Sedivy et al., 1984, J.
Bacteriol. 158 : 1048-1053). Zur Identifizierung von Klonen, die ein funktionales
FBPase-Enzym exprimieren, werden die transformierten Zellen auf
Minimalmedium ausplattiert, das als Kohlenstoffquelle beispielsweise Glycerin und
Succinat (jeweils in der Konzentration von 0,4%) enthält. Zellen, die keine
funktionale FBPase exprimieren können auf einem derartigen Medium nicht
wachsen. Einen ersten Anhaltspunkt für die Aktivität der exprimierten FBPase
können die Wachstumsraten transformierter, lebensfähiger Klone geben.
Um Mutationen im Promotorbereich auszuschließen, die in einer erhöhten FBPase-Ak
tivität resultieren, müssen die mutierten kodierenden DNA-Sequenzen, die ein
Wachstum auf Minimalmedium ermöglichen, in nicht mutagenisierte Vektoren
umkloniert werden und erneut auf eine FBPase-Aktiviät hin untersucht werden
(wiederum durch Komplementation eines FBPase-defizienten E. coli-Stammes).
Mutanten, die auch in der zweiten Screening-Runde eine Komplementation eines
FBPase-defizienten E. coli-Stammes bewirken, werden hinsichtlich der FBPase-Ak
tivität in Gegenwart der verschiedenen Inhibitoren und Aktivatoren verwendet.
Hierzu werden die betreffenden Zellen aufgeschlossen, und die FBPase-Aktivität
wird in vitro mittels eines Enzym-Tests nachgewiesen. Bei einem derartigen Test
wird der Puffer, in dem der Test durchgeführt wird im Hinblick auf die
Eigenschaften der FBPase, die mutagenisiert wurde, derart gewählt, daß pH-Op
timum und Salzkonzentrationen im optimalen Bereich liegen. Der Puffer muß
ferner das Substrat Fruktose-1,6-Bisphosphat (ca. 1 mM) und MgCl₂ (ca. 5 mM)
enthalten. Werden pflanzliche oder tierische FBPasen exprimiert, sollte ein SH-Schutz
gruppenreagenz wie DTT oder β-Mercaptoethanol im Puffer vorhanden sein.
Die Messung der Enzymaktivität beruht darauf, daß dem Ansatz zwei weitere
Enzyme, Phosphoglukose-Isomerase und Glukose-6-Phosphat-Dehydrogenase aus
Hefe, die das Produkt der FBPase-Reaktion, die Fruktose-6-Phosphat weiter
umsetzen, sowie NADP zugesetzt werden. Die Phosphoglukose-Isomerase
überführt die Fruktose-6-Phosphat in Glukose-6-Phosphat, die wiederum von der
Glukose-6-Phosphat-Dehydrogenase unter Bildung von NADPH in
6-Phosphoglucono-8-Lacton umgesetzt wird. Die Zunahme an NADPH läßt sich
photometrisch durch Messung der Absorption bei 334 nm nachweisen. Anhand
dieser Zunahme ist damit auch die Bestimmung der FBPase-Aktivität möglich.
Durch Zusatz der verschiedenen Inhibitoren (AMP, ATP, Fruktose-2,6-Bisphosphat)
läßt sich mittels des beschriebenen Enzym-Tests der Einfluß der Inhibitoren auf die
Enzymaktivität der mutierten FBPasen bestimmen.
Durch Vergleiche mit der Aktivität des unmutierten Enzyms können geeignete
Mutanten ausgewählt werden. DNA-Sequenzen, die für deregulierte oder
unregulierte mutierte Proteine kodieren, können anschließend mit Hilfe bekannter
Methoden in Pflanzen eingebracht und zur Expression gebracht werden.
Die Erzeugung von Mutationen in FBPase-Genen sowie die Selektion geeigneter
Mutanten in einem FBPase-defizienten E. coli-Stamm kann ebenfalls durchgeführt
werden wie in Sedivy et al. (1986, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 83 : 1656-1659)
beschrieben. Durch dieses Verfahren gelang bereits die Isolierung einer AMP-in
sensitiven FBPase.
Der Transfer des gemäß Verfahrensschritt a) hergestellten DNA-Moleküls erfolgt
vorzugsweise unter Verwendung von geeigneten Plasmiden, insbesondere von
Plasmiden, die eine stabile Integration des DNA-Moleküls in das Genom
transformierter Pflanzenzellen gewährleisten, beispielsweise binären Plasmiden.
Geeignete Pflanzentransformationsvektoren umfassen z. B. Vektoren, die von dem
Ti-Plasmid von Agrobacterium tumefaciens abgeleitet wurden, sowie diejenigen, die
von Herrera-Estrella et al. (1983, Nature 303 : 209), Bevan (1984, Nucl. Acids Res.
12 : 8711-8721), Klee et al. (1985, Bio/Technology 3 : 637-642) und in der EP-Anmeldung
120 516 (Schilperoort et al.) beschrieben wurden.
Zur Transformation gemäß Verfahrensschritt b) mit dem gemäß Verfahrensschritt
a) konstruierten DNA-Molekül kommen grundsätzlich Zellen aller Pflanzenspezies
in Frage. Von Interesse sind sowohl monokotyle als auch dikotyle Pflanzen. Für
verschiedene monokotyle und dikotyle Pflanzenspezies sind bereits
Transformationstechniken beschrieben worden. Bevorzugt werden in dem
Verfahren Zellen landwirtschaftlicher Nutzpflanzen verwendet, insbesondere von
Getreidearten (z. B. Roggen, Hafer, Gerste, Weizen), Kartoffel, Mais, Reis, Raps,
Erbse, Zuckerrübe Sojabohne, Tabak, Baumwolle, Tomate etc., oder Zellen von
Zierpflanzen.
Gegenstand der Erfindung sind ebenfalls die über das Verfahren erhältlichen
transgenen Pflanzenzellen und transgenen Pflanzen, die aufgrund der Expression
einer deregulierten oder unregulierten FBPase im Cytosol der Zellen, eine
Steigerung der Photosyntheserate und folglich eine erhöhte Biomasseproduktion
aufweisen.
Die besagten transgenen Pflanzenzellen bzw. transgenen Pflanzen sind dadurch
gekennzeichnet, daß sie ein rekombinantes DNA-Molekül, vorzugsweise stabil in
das Genom integriert, enthalten, das ein gemäß Verfahrensschritt a) konstruiertes
DNA-Molekül umfaßt, bei dem eine DNA-Sequenz, die für ein Protein mit der
enzymatischen Aktivität einer FBPase kodiert, in sense-Orientierung an einen
Promotor geknüpft ist, wobei es sich bei der FBPase um ein dereguliertes oder
unreguliertes Enzym handelt. Gegenstand der Erfindung sind daher auch
Pflanzenzellen und Pflanzen, die ein rekombinantes DNA-Molekül enthalten, das
aus folgenden Sequenzen aufgebaut ist:
- a) einen in pflanzlichen Zellen funktionalen Promotor, der die Transkription einer nachfolgenden DNA-Sequenz gewährleistet,
- b) eine DNA-Sequenz, die für ein Protein mit der enzymatischen Aktivität einer Fruktose-1,6-Bisphosphatase kodiert und in sense-Orientierung mit dem Promotor verknüpft ist,
- c) gegebenenfalls eine 3′-nichttranslatierte Region, die die Termination der Transkription und die Polyadenylierung des Transkriptes gewährleistet,
wobei es sich bei dem Protein mit der enzymatischen Aktivität einer Fruktose-1,6-Bis
phosphatase um ein dereguliertes oder unreguliertes Enzym handelt.
Bei den Pflanzen handelt es sich vorzugsweise um Nutzpflanzen, insbesondere um
die oben erwähnten Nutzpflanzen.
Einen weiteren Gegenstand der Erfindung stellen rekombinante DNA-Moleküle
dar, die folgende DNA-Sequenzen umfassen:
- a) einen in pflanzlichen Zellen funktionalen Promotor, der die Transkription einer nachfolgenden DNA-Sequenz gewährleistet,
- b) eine DNA-Sequenz, die für ein Protein mit der enzymatischen Aktivität einer Fruktose-1,6-Bisphosphatase kodiert und in sense-Orientierung mit dem Promotor verknüpft ist,
- c) gegebenenfalls eine 3′-nichttranslatierte Region, die die Termination der Transkription und die Polyadenylierung des Transkriptes gewährleistet,
wobei es sich bei dem Protein mit der enzymatischen Aktivität einer Fruktose-1,6-Bis
phosphatase um ein dereguliertes oder unreguliertes Enzym handelt.
Die für ein Protein mit der enzymatischen Aktivität einer FBPase kodierende DNA-Se
quenz kann sowohl aus prokaryontischen als auch aus eukaryontischen
Organismen stammen, insbesondere aus Bakterien, Pflanzen, Algen, Pilzen oder
tierischen Organismen.
Vorzugsweise handelt es sich bei der DNA-Sequenz, die für ein Protein mit der
enzymatischen Aktivität eine FBPase kodiert, um eine Sequenz aus Alcaligenes
eutrophus, insbesondere um eine Sequenz mit der unter Seq ID No. 1 angegebenen
Nukleotidabfolge, oder um eine DNA-Sequenz, die eine im wesentlichen damit
identische Nukleotidabfolge aufweist und die enzymatische Aktivität einer FBPase
besitzt.
Auch die in Pflanzenzellen und Pflanzen enthaltenen DNA-Sequenzen, die für ein
Protein mit der enzymatischen Aktivität einer FBPase kodieren, können aus den
entsprechenden Organismen stammen.
Eine bevorzugte Ausführungsform der erfindungsgemäßen DNA-Moleküle besteht
in einem DNA-Molekül, das folgende DNA-Sequenzen umfaßt:
- a) einen 35S-Promotor
- b) eine DNA-Sequenz mit der unter Seq ID No. 1 angegebenen Nukleotidabfolge, die in sense-Orientierung an den Promotor geknüpft ist, und
- c) die Terminationssequenz des Nopalinsynthase-Gens aus Agrobacterium tumefaciens.
Ein derartiges DNA-Molekül wird in Form des Plasmids p35S-FBPase-Ae
bereitgestellt.
Bei den erfindungsgemäßen DNA-Molekülen handelt es sich vorzugsweise um
isolierte und gereinigte DNA-Moleküle, die im wesentlichen frei von
Kontaminationen sind.
Gegenstand der vorliegenden Erfindung ist ferner die Verwendung von DNA-Se
quenzen, die für deregulierte oder unregulierte FBPase-Enzyme kodieren, zur
Transformation pflanzlicher Zellen sowie zur Herstellung von Pflanzen, die im
Vergleich zu Wildtyppflanzen eine gesteigerte Photosyntheserate oder eine
gesteigerte Biomasseproduktion aufweisen.
Fig. 1 zeigt das Plasmid p35S-FBPase-Ae
Dabei bedeuten:
A= Fragment A: CaMV 35S-Promotor, nt 6909-7437 (Franck et al. (1980) Cell 21 : 285-294)
B = Fragment B: DNA-Sequenz aus Alcaligenes eutrophus kodierend die chromosomal kodierte Fruktose-1,6-Bisphosphatase; 1136 bp-Fragment mit der unter Seq ID No. 1 dargestellten DNA-Se quenz Orientierung zum Promotor: sense
C = Fragment C: nt 11748-11939 der T-DNA des Ti-Plasmids pTiACH5 (Gielen et al. (1984) EMBO J. 3 : 835-846)
In den Beispielen werden die folgenden Standardverfahren und Spezialtechniken verwendet:
Dabei bedeuten:
A= Fragment A: CaMV 35S-Promotor, nt 6909-7437 (Franck et al. (1980) Cell 21 : 285-294)
B = Fragment B: DNA-Sequenz aus Alcaligenes eutrophus kodierend die chromosomal kodierte Fruktose-1,6-Bisphosphatase; 1136 bp-Fragment mit der unter Seq ID No. 1 dargestellten DNA-Se quenz Orientierung zum Promotor: sense
C = Fragment C: nt 11748-11939 der T-DNA des Ti-Plasmids pTiACH5 (Gielen et al. (1984) EMBO J. 3 : 835-846)
In den Beispielen werden die folgenden Standardverfahren und Spezialtechniken verwendet:
Zur Klonierung in E. coli wurde der Vektor pUC18 verwendet.
Für die Pflanzentransformation wurden die Genkonstruktionen in den
binären Vektor pBinAR (Höfgen und Willmitzer (1990) Plant Sci. 66 : 221-230)
kloniert.
Für die pUC-Vektoren und für die pBinAR-Konstrukte wurde der E. coli-Stamm
DH5α (Bethesda Research Laboratories, Gaithersburgh, USA)
verwendet.
Die Transformation der Plasmide in die Tabakpflanzen wurde mit Hilfe des
Agrobacterium tumefaciens-Stammes C58C1 pGV2260 durchgeführt (Deblaere et
al., 1985, Nucl. Acids Res. 13 : 4777 : 4788).
Der Transfer der DNA erfolgte durch direkte Transformation nach der
Methode von Höfgen & Willmitzer (1988, Nucleic Acids Res. 16 : 9877). Die
Plasmid-DNA transformierter Agrobakterien wurde nach der Methode von
Birnboim & Doly (1979, Nucleic Acids Res. 7 : 1513-1523) isoliert und nach
geeigneter Restriktionsspaltung gelelektrophoretisch analysiert.
Zehn kleine mit dem Skalpell verwundete Blätter einer Kartoffel-Sterilkultur
(Solanum tuberosum L.cv. Desiree) wurden in 10 ml MS-Medium (Murashige &
Skoog (1962) Physiol. Plant. 15 : 473) mit 2% Saccharose gelegt, welches 50 ml einer
unter Selektion gewachsenen Agrobacterium tumefaciens-Übernachtkultur enthielt.
Nach 3-5 minütigem, leichtem Schütteln erfolgte eine weitere Inkubation für 2 Tage
im Dunkeln. Daraufhin wurden die Blätter zur Kallusinduktion auf MS-Medium
mit 1,6% Glukose, 5 mg/l Naphthylessigsäure, 0,2 mg/l Benzylaminopurin, 250
mg/l Claforan, 50 mg/l Kanamycin, und 0,80.% Bacto Agar gelegt. Nach einwöchiger
Inkubation bei 25°C und 3000 Lux wurden die Blätter zur Sproßinduktion auf MS-Me
dium mit 1,6% Glukose, 1,4 mg/l Zeatinribose, 20 mg/l Naphthylessigsäure, 20
mg/l Giberellinsäure, 250 mg/l Claforan, 50 mg/l Kanamycin, und 0.80.% Bacto
Agar gelegt.
Die radiokative Markierung von DNA-Fragmenten wurde mit Hilfe eines DNA-Ran
dom Primer Labelling Kits der Firma Boehringer (Deutschland) nach den
Angaben des Herstellers durchgeführt.
RNA wurde nach Standardprotokollen aus Blattgewebe von Pflanzen isoliert. 50 µg
der RNA wurden auf einem Agarosegel aufgetrennt (1,5% Agarose, 1 × MEN-Puffer,
16,6% Formaldehyd). Das Gel wurde nach dem Gellauf kurz in Wasser gewaschen.
Die RNA wurde mit 20 × SSC mittels Kapillarblot auf eine Nylonmembran vom
Typ Hybond N (Amersham UK) transferiert. Die Membran wurde anschließend bei
80°C unter Vakuum für zwei Stunden gebacken.
Die Membran wurde in NSEB-Puffer für 2 h bei 68°C prähybridisiert und
anschließend in NSEB-Puffer über Nacht bei 68°C in Gegenwart der radioaktiv
markierten Probe hybridisiert.
Kartoffelpflanzen wurden im Gewächshaus unter folgenden Bedingungen gehalten:
Lichtperiode: 16 h bei 25000 Lux und 22°C
Dunkelperiode: 8 h bei 15°C
Luftfeuchte: 60%
Dunkelperiode: 8 h bei 15°C
Luftfeuchte: 60%
20 × SSC:
175.3 g NaCl
88.2 g Natrium-Citrat
ad 1000 ml mit ddH₂O
pH 7,0 mit 10 N NaOH
88.2 g Natrium-Citrat
ad 1000 ml mit ddH₂O
pH 7,0 mit 10 N NaOH
10 × MEN:
200 mM MOPS
50 mM Natriumacetat
10 mM EDTA
pH 7,0
50 mM Natriumacetat
10 mM EDTA
pH 7,0
NSEB-Puffer:
0,25 M Natriumphosphatpuffer pH 7,2
7% SDS
1 mM EDTA
1% BSA (w/v)
7% SDS
1 mM EDTA
1% BSA (w/v)
Die nachfolgenden Beispiele erläutern den Gegenstand der Erfindung ohne ihn
einzuschränken, wobei die Verwendung einer DNA-Sequenz aus Alcaligenes
eutrophus, die für eine deregulierte Fruktose-1,6-Bisphosphatase kodiert, zur
Transformation von Kartoffelpflanzen mit dem Ziel der Expression dieses Enzyms
im Cytosol transformierter Pflanzenzellen beschrieben wird, was in den
transformierten Pflanzen zu einer Erhöhung der Photosyntheserate führt. Analog
zu dem dargestellten Beispielen können auch andere Pflanzenspezies insbesondere
landwirtschaftliche Nutzpflanzen wie z. B. Raps, Zuckerrübe, Getreidearten, Mais,
Baumwolle, Tomate, Melone, etc. verändert werden. Ferner können neben der
beschriebenen DNA-Sequenz aus Alcaligenes eutrophus auch andere DNA-
Sequenzen, die für eine deregulierte oder unregulierte FBPase kodieren verwendet
werden.
Ein 1136 bp langes DNA-Fragment mit der unter Seq ID No. 1 angegebenen DNA-Se
quenz wurde mit Hilfe der Restriktionsendonukleasen Nsi I und Bal I aus einem
geeigneten Plasmid isoliert. Dieses DNA-Fragment umfaßt die gesamte kodierende
Region für die chromosomal kodierte FBPase aus Alcaligenes eutrophus. Die
überhängenden Enden wurden mit Hilfe der T4-DNA-Polymerase aufgefüllt und
das Fragment wurde in den mit Sma I linearisierten Vektor pBinAR (Höfgen und
Willmitzer (1990) Plant Sci. 66 : 221-230) inseriert. Der Vektor pBinAR ist ein Derivat
des binären Vektors Bin19 (Bevan (1984) Nucleic Acids Res. 12 : 8711-8721;
kommerziell erhältlich bei Clontech Laboratories, Inc., USA).
pBinAR wurde folgendermaßen konstruiert:
Ein 529 bp langes Fragment, das die Nukleotide 6909-7437 des 35S-Promotor des Cauliflowermosaic-Virus umfaßt (Franck et al., 1980, Cell 21 : 285-294), wurde als EcoR I/Kpn I-Fragment aus dem Plasmid pDH51 (Pietrzak et al., Nucl. Acids Res. 14 : 5857-5868) isoliert und zwischen die EcoR I- und die Kpn I-Schnittstellen des Polylinkers von pBin19 ligiert. Dabei entstand das Plasmid pBin19-A.
Ein 529 bp langes Fragment, das die Nukleotide 6909-7437 des 35S-Promotor des Cauliflowermosaic-Virus umfaßt (Franck et al., 1980, Cell 21 : 285-294), wurde als EcoR I/Kpn I-Fragment aus dem Plasmid pDH51 (Pietrzak et al., Nucl. Acids Res. 14 : 5857-5868) isoliert und zwischen die EcoR I- und die Kpn I-Schnittstellen des Polylinkers von pBin19 ligiert. Dabei entstand das Plasmid pBin19-A.
Aus dem Plasmid pAGV40 (Herrera-Estrella et al., Nature 303 : 209-213) wurde mit
Hilfe der Restriktionsendonukleasen Pvu II und Hind III ein 192 bp langes Fragment
isoliert, das das Polyadenylierungssignal des Gens 3 der T-DNA des Ti-Plasmids
pTiACH5 (Gielen et al., EMBO J. 3 : 835-846) umfaßt (Nukleotide 11749-11939). Nach
Addition von Sph I-Linkern an die Pvu I-Schnittstelle wurde das Fragment zwischen
die Sph I- und Hind III-Schnittstellen pBin19-A ligiert. Dabei entstand pBinAR.
Das DNA-Fragment wurde derart in den Vektor inseriert, daß die kodierende
Region in sense-Orientierung zum 35S-Promotor orientiert war.
Das resultierende Plasmid wurde p35S-FBPase-Ae genannt und ist in Fig. 1
dargestellt.
Durch die Insertion des DNA-Fragmentes entsteht eine Expressionskassette, die
folgendermaßen aus den Fragmenten A, B und C aufgebaut ist (Fig. 1):
Das Fragment A (529 bp) enthält den 35S-Promotor des Cauliflower-Mosaik-Virus
(CaMV). Das Fragment umfaßt die Nukleotide 6909 bis 7437 des CaMV (Franck et al.
(1980) Cell 21 : 285-294).
Das Fragment B umfaßt die proteinkodierende Region für die chromosomal
kodierte FBPase aus Alcaligenes eutrophus. Dieses wurde wie oben beschrieben als Nsi
I/BalI-Fragment isoliert und in sense Orientierung an den 35S-Promotor in pBinAR
fusioniert.
Fragment C (192 bp) enthält das Polyadenylierungssignal des Gens 3 der T-DNA des
Ti-Plasmids pTiACH5 (Gielen et al. (1984) EMBO J. 3 : 835-846).
Die Größe des Plasmids p35S-FBPase-Ae beträgt ca. 12 kb.
Der Vektor p35S-FBPase-Ae wurde mittels Agrobacterium tumefaciens vermittelter
Transformation in Kartoffelpflanzenzellen transferiert. Aus den transformierten
Zellen wurden intakte Pflanzen regeneriert.
Die Überprüfung des Erfolges der genetischen Veränderung der Pflanzen erfolgt
durch Analyse der Gesamt-RNA in einer Northern-Blot-Analyse bezüglich der
Synthese einer mRNA, die für die FBPase aus A. eutrophus kodiert. Hierzu wird
Gesamt-RNA aus Blättern transformierter Pflanzen nach Standardmethoden
isoliert, gelelektrophoretisch auf einem Agarosegel aufgetrennt, auf eine
Nylonmembran transferiert und mit einer radioaktiv markierten Probe hybridisiert,
die die unter Seq ID No. 1 dargestellte Sequenz oder einen Teil dieser Sequenz
aufweist. Erfolgreich transformierte Pflanzen weisen in der Northern-Blot-Analyse
eine Bande auf, die das spezifische Transkript des FBPase-Gens aus Alcaligenes
eutrophus darstellt.
Kartoffelpflanzen, die mit dem Plasmid p35S-FBPase-Ae transformiert worden
waren, wurden hinsichtlich der Photosyntheserate im Vergleich zu
nichttransformierten Pflanzen untersucht.
Die Messung der Photosyntheseraten erfolgte dabei mit Blattscheiben in einer
Blattscheiben-Sauerstoffelektrode (LD2; Hansatech; Kinks Lynn, England). Die
Messung wurde wie in von Schaewen et al. (1990, EMBO J. 9 : 3033-3044) beschrieben
durchgeführt bei CO₂-Sättigung und 20°C. Die Lichtintensität betrug 550-600 PAR
(photosynthetic active radiation).
Die Ergebnisse einer derartigen Bestimmung der Photosyntheserate von Pflanzen,
die mit dem Plasmid p35S-FBPase-Ae (UF1-7) transformiert worden waren im
Vergleich zu nicht-transformierten Pflanzen ist in der folgenden Tabelle gezeigt.
Im Fall der Wildtyppflanzen wurden 10 Messungen durchgeführt, im Fall der
transformierten Kartoffelpflanzen UF1-7 wurden 5 Messungen durchgeführt.
Claims (31)
1. Verfahren zur Steigerung der Photosyntheserate und des Ertrages in Pflanzen,
dadurch gekennzeichnet, daß in pflanzliche Zellen eine DNA-Sequenz, die für
eine deregulierte oder unregulierte FBPase kodiert, eingeführt wird, die derart
mit Steuerelementen für die Transkription verknüpft ist, daß es im Cytosol
transformierter Zellen zur Synthese einer aktiven, deregulierten oder
unregulierten FBPase kommt.
2. Verfahren gemäß Anspruch 1, dadurch gekennzeichnet, daß es aus folgenden
Schritten besteht
- a) Herstellen eines rekombinanten, doppelsträngigen DNA-Moleküls, das
folgende DNA-Sequenzen umfaßt:
- i) einen in pflanzlichen Zellen funktionalen Promotor, der die Transkription einer nachfolgenden DNA-Sequenz gewährleistet,
- ii) eine DNA-Sequenz, die für ein Protein mit der enzymatischen Aktivität einer Fruktose-1,6-Bisphosphatase kodiert und in sense-Orientierung mit dem Promotor verknüpft ist,
- iii) gegebenenfalls eine 3′-nichttranslatierte Region, die die Termination der Transkription und die Polyadenylierung des Transkriptes gewährleistet,
- b) Transfer des gemäß Schritt a) hergestellten DNA-Moleküls in pflanzliche Zellen, und
- c) Regeneration ganzer Pflanzen aus den transformierten Pflanzenzellen,
wobei es sich bei dem Protein mit der enzymatischen Aktivität einer
Fruktose-1,6-Bisphosphatase um ein dereguliertes oder unreguliertes Enzym handelt.
3. Verfahren gemäß Anspruch 2, dadurch gekennzeichnet, daß es sich bei der DNA-Se
quenz, die für ein Protein mit der enzymatischen Aktivität einer Fruktose-1,6-Bis
phosphatase kodiert, um eine prokaryontische DNA-Sequenz handelt.
4. Verfahren gemäß Anspruch 3, dadurch gekennzeichnet, daß es sich bei der DNA-Se
quenz, die für ein Protein mit der enzymatischen Aktivität einer Fruktose-1,6-Bis
phosphatase kodiert, um eine DNA-Sequenz aus dem Mikroorganismus
Alcaligenes eutrophus handelt.
5. Verfahren gemäß Anspruch 4, dadurch gekennzeichnet, daß es sich bei der DNA-Se
quenz, die für ein Protein mit der enzymatischen Aktivität einer Fruktose-1,6-Bis
phosphatase kodiert, um eine DNA-Sequenz mit der unter Seq ID No. 1
angegebenen Nukleotidabfolge oder einer im wesentlichen identischen
Nukleotidabfolge handelt.
6. Verfahren gemäß Anspruch 2, dadurch gekennzeichnet, daß es sich bei der DNA-Se
quenz, die für ein Protein mit der enzymatischen Aktivität einer Fruktose-1,6-Bis
phosphatase kodiert, um eine DNA-Sequenz aus Pflanzen oder Algen
handelt.
7. Verfahren gemäß Anspruch 2, dadurch gekennzeichnet, daß es sich bei der DNA-Se
quenz, die für ein Protein mit der enzymatischen Aktivität einer Fruktose-1,6-Bis
phosphatase kodiert, um eine DNA-Sequenz aus Pilzen handelt.
8. Verfahren gemäß Anspruch 2, dadurch gekennzeichnet, daß es sich bei der DNA-Se
quenz, die für ein Protein mit der enzymatischen Aktivität einer Fruktose-1,6-Bis
phosphatase kodiert, um eine DNA-Sequenz aus einem tierischen
Organismus handelt.
9. Rekombinante DNA-Moleküle, die folgende DNA-Sequenzen umfassen:
- a) einen in pflanzlichen Zellen funktionalen Promotor, der die Transkription einer nachfolgenden DNA-Sequenz gewährleistet,
- b) eine DNA-Sequenz, die für ein Protein mit der enzymatischen Aktivität einer Fruktose-1,6-Bisphosphatase kodiert und in sense-Orientierung mit dem Promotor verknüpft ist,
- c) gegebenenfalls eine 3′-nichttranslatierte Region, die die Termination der Transkription und die Polyadenylierung des Transkriptes gewährleistet,
wobei es sich bei dem Protein mit der enzymatischen Aktivität einer
Fruktose-1,6-Bisphosphatase um ein dereguliertes oder unreguliertes Enzym handelt.
10. DNA-Moleküle gemäß Anspruch 9, dadurch gekennzeichnet, daß es sich bei der
DNA-Sequenz, die für ein Protein mit der enzymatischen Aktivität einer
Fruktose-1,6-Bisphosphatase kodiert, um eine prokaryontische DNA-Sequenz
handelt.
11. DNA-Moleküle gemäß Anspruch 10, dadurch gekennzeichnet, daß es sich bei der
DNA-Sequenz, die für ein Protein mit der enzymatischen Aktivität einer
Fruktose-1,6-Bisphosphatase kodiert, um eine DNA-Sequenz aus dem
Mikroorganismus Alcaligenes eutrophus handelt.
12. DNA-Moleküle gemäß Anspruch 11, dadurch gekennzeichnet, daß es sich bei der
DNA-Sequenz, die für ein Protein mit der enzymatischen Aktivität einer
Fruktose-1,6-Bisphosphatase kodiert, um eine DNA-Sequenz mit der unter Seq
ID No. 1 angegebenen Nukleotidabfolge oder einer im wesentlichen identischen
Nukleotidabfolge handelt.
13. DNA-Moleküle gemäß Anspruch 9, dadurch gekennzeichnet, daß es sich bei der
DNA-Sequenz, die für ein Protein mit der enzymatischen Aktivität einer
Fruktose-1,6-Bisphosphatase kodiert, um eine DNA-Sequenz aus Pflanzen oder
Algen handelt.
14. DNA-Moleküle gemäß Anspruch 9, dadurch gekennzeichnet, daß es sich bei der
DNA-Sequenz, die für ein Protein mit der enzymatischen Aktivität einer
Fruktose-1,6-Bisphosphatase kodiert, um eine DNA-Sequenz aus Pilzen handelt.
15. DNA-Moleküle gemäß Anspruch 9, dadurch gekennzeichnet, daß es sich bei der
DNA-Sequenz, die für ein Protein mit der enzymatischen Aktivität einer
Fruktose-1,6-Bisphosphatase kodiert, um eine DNA-Sequenz aus einem
tierischen Organismus handelt.
16. Pflanzenzellen, die ein rekombinantes DNA-Molekül enthalten, das aus
folgenden Sequenzen aufgebaut ist:
- a) einen in pflanzlichen Zellen funktionalen Promotor, der die Transkription einer nachfolgenden DNA-Sequenz gewährleistet,
- b) eine DNA-Sequenz, die für ein Protein mit der enzymatischen Aktivität einer Fruktose-1,6-Bisphosphatase kodiert und in sense-Orientierung mit dem Promotor verknüpft ist,
- c) gegebenenfalls eine 3′-nichttranslatierte Region, die die Termination der Transkription und die Polyadenylierung des Transkriptes gewährleistet,
wobei es sich bei dem Protein mit der enzymatischen Aktivität einer
Fruktose-1,6-Bisphosphatase um ein dereguliertes oder unreguliertes Enzym handelt.
17. Pflanzenzellen gemäß Anspruch 16, in denen die DNA-Sequenz, die für ein
Protein mit der enzymatischen Aktivität einer Fruktose-1,6-Bisphosphatase
kodiert, aus einem prokaryontischen Organismus stammt.
18. Pflanzenzellen gemäß Anspruch 17, in denen die DNA-Sequenz, die für ein
Protein mit der enzymatischen Aktivität einer Fruktose-1,6-Bisphosphatase
kodiert, aus dem Mikroorganismus Alcaligenes eutrophus stammt.
19. Pflanzenzellen gemäß Anspruch 18, in denen die DNA-Sequenz, die für ein
Protein mit der enzymatischen Aktivität einer Fruktose-1,6-Bisphosphatase
kodiert, die unter Seq ID No. 1 angegebenen Nukleotidabfolge oder eine im
wesentlichen identische Nukleotidabfolge aufweist.
20. Pflanzenzellen gemäß Anspruch 16, in denen die DNA-Sequenz, die für ein
Protein mit der enzymatischen Aktivität einer Fruktose-1,6-Bisphosphatase
kodiert, aus Pflanzen oder Algen stammt.
21. Pflanzenzellen gemäß Anspruch 16, in denen die DNA-Sequenz, die für ein
Protein mit der enzymatischen Aktivität einer Fruktose-1,6-Bisphosphatase
kodiert, aus Pilzen stammt.
22. Pflanzenzellen gemäß Anspruch 16, in denen die DNA-Sequenz, die für ein
Protein mit der enzymatischen Aktivität einer Fruktose-1,6-Bisphosphatase
kodiert, aus einem tierischen Organismus stammt.
23. Pflanzen bestehend aus Pflanzenzellen gemäß den Ansprüchen 16-22.
24. Pflanzen gemäß Anspruch 23, dadurch gekennzeichnet, daß es sich um
Nutzpflanzen handelt.
25. Pflanzen gemäß Anspruch 24, dadurch gekennzeichnet, daß es sich um eine
Pflanze aus der Gruppe Tomate, Kartoffel, Zuckerrübe, Mais, Reis, Gerste,
Roggen, Hafer, Weizen, Erbse, Tabak, Baumwolle, Raps, Sojabohne und handelt.
26. Pflanzen gemäß Anspruch 23, dadurch gekennzeichnet, daß es sich um
Zierpflanzen handelt.
27. Verwendung von DNA-Sequenzen, die für deregulierte oder unregulierte
FBPase-Enzyme kodieren, zur Transformation pflanzlicher Zellen.
28. Verwendung von DNA-Sequenzen, die für deregulierte oder unregulierte
FBPase-Enzyme kodieren, zur Herstellung von Pflanzen, die im Vergleich zu
Wildtyppflanzen eine gesteigerte Photosyntheserate oder eine gesteigerte
Biomasseproduktion aufweisen.
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