DD246318A5 - New genetic sequences generated by the coded type I interferon peptides and these organisms producing them - Google Patents
New genetic sequences generated by the coded type I interferon peptides and these organisms producing them Download PDFInfo
- Publication number
- DD246318A5 DD246318A5 DD27937585A DD27937585A DD246318A5 DD 246318 A5 DD246318 A5 DD 246318A5 DD 27937585 A DD27937585 A DD 27937585A DD 27937585 A DD27937585 A DD 27937585A DD 246318 A5 DD246318 A5 DD 246318A5
- Authority
- DD
- German Democratic Republic
- Prior art keywords
- leu
- ser
- ctg
- arg
- gin
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/52—Cytokines; Lymphokines; Interferons
- C07K14/555—Interferons [IFN]
- C07K14/56—IFN-alpha
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
- A61P31/12—Antivirals
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P35/00—Antineoplastic agents
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/52—Cytokines; Lymphokines; Interferons
- C07K14/555—Interferons [IFN]
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Zoology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Public Health (AREA)
- Toxicology (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Virology (AREA)
- Communicable Diseases (AREA)
- Oncology (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Electrotherapy Devices (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
Description
Berlin, 3·'3· 1986 ~Λ~ AP C 12 Ν/279.375-4Berlin, 3 · '3 · 1986 ~ Λ ~ AP C 12 Ν / 279.375-4
· . 65 649 11 ·. 65 649 11
Verfahren zur Herstellung neuer menschlicher Interferon-Peptide ; ___Process for the preparation of novel human interferon peptides ; ___
Gegenstand der vorliegenden Erfindung ist ein Verfahren zur Herstellung neuer Interferon-Peptide vom Typ I sowie rekombinante DNA-Verfahren zur Herstellung dieser Peptide und Produkte, die bei.diesen Verfahren benötigt werden, beispielsweise Gensequenzen, rekombinante DUA-Moleküle, Expressionsvehikel und Organismen.The present invention relates to a process for the preparation of novel type I interferon peptides and to recombinant DNA processes for the production of these peptides and products which are required in these processes, for example gene sequences, recombinant DUA molecules, expression vehicles and organisms.
Die erfindungsgemäß hergestellten Interferon-Peptide werden angewandt als Arzneimittel, beispielsweise für eine Antitumorbehandlung oder für eine antivivale Behandlung.The interferon peptides prepared according to the invention are used as medicaments, for example for an anti-tumor treatment or for an anti-viral treatment.
Interferon ist ein Begriff, der geprägt wurde, um eine Auswahl von Proteinen zu beschreiben, die endogen.zu menschlichen Zellen sind und dadurch-gekennzeichnet sind, daß sie teilweise überlappende und teilweise divergierende biologische Aktivitäten aufweisen. Diese Proteine modifizieren die körpereigene Immunantwort und man nimmt an, daß sie zu einem wirksamen Schutz gegen Viruserkrankungen beitragen. Die Interferone wurden beispielsweise in drei Klassen eingeteilt, nämlich in o6-, ß - und "p-Interferon.Interferon is a term coined to describe a selection of proteins that are endogenous to human cells and characterized by having partially overlapping and partially divergent biological activities. These proteins modify the body's immune response and are believed to contribute to effective protection against viral diseases. The interferons have been classified for example in three classes, namely O6, ß - and "p-interferon.
Von ß> - und /""-Interferon ist in menschlichem Organismus nur jeweils ein Subtyp bekannt (z.B. S. Ohno et al., Proc. Hatl.Of ß> - and / "" - interferon only one subtype is known in human organism (eg S. Ohno et al., Proc. Hatl.
• η Λ Γ• η Λ Γ
246 31 246 31
Acad. Sei. 7_§, 5305-5309 (1981); Gray et al., Nature 295, 503-508 (1982); Taya et al., EMBO Journal 1/8, 953-958 (1982)). Demgegenüber werden voma-Interferon verschiedene Subtypen beschrieben (z.B. Phil. Trans. R. Soc. Lond. 299, 7-28 (1982)). Die reifen a-.Interferone unterscheiden sich hierbei untereinander - durch maximal' 23 % Divergenz und sind ca. 166 Aminosäuren lang. Bemerkenswert ist ferner ein Bericht über ein α-Interferon, das ein überraschend hohes Molekulargewicht (26 000; bestimmt durch SDS Polyacrylamid/-Gelelektophorese) aufweist (Goren, P. et al. Virology 130, .273-280 (1983)). Dieses Interferon wird IFN-a 26K genannt. Von ihm wurde festgestellt, daß es die bisher höchste spezifische antivirale und antizelluläre Aktivität aufweist.Acad. Be. 7_§, 5305-5309 (1981); Gray et al., Nature 295 , 503-508 (1982); Taya et al., EMBO Journal 1/8 , 953-958 (1982)). In contrast, various subtypes of voma-interferon are described (eg, Phil. Trans. R. Soc., Lond., 299 , 7-28 (1982)). The mature a-interferons differ from each other here - by a maximum of '23% divergence and are about 166 amino acids long. Also noteworthy is a report on an α-interferon which has a surprisingly high molecular weight (26,000 as determined by SDS polyacrylamide / gel electrophoresis) (Goren, P. et al., Virology 130 , 273-280 (1983)). This interferon is called IFN-a 26K. He was found to have the highest specific antiviral and anticellular activity to date.
Die bekannten Interferone scheinen bei verschiedenen Krankheiteh wirksam zu sein, zeigen aber eine geringe oder überhaupt keine Wirkung bei vielen anderen Krankheiten (z.B. Powledge, Bio/Technology, March 1984, 215-228 "Interferon On Trial"). Interferone-weisen zudem Nebenwirkungen auf. Beispielsweise wurde bei Prüfungen der Anticancer-Wirkung von rekombinantem α-Interferon festgestellt, daß Dosen von etwa 50' Millionen Einheiten, die nach den Ergebnissen der Phase I Prüfungen für sicher galten, akute Verwirrungszustände, bis zur Arbeitsunfähigkeit führende Gelenkschmerzen, sehr starke Ermüdung, Appetitlosigkeit, Verlust der Orientierungsmöglichkeit, epileptische Anfälle und Lebertoxizität hervorriefen. 1982 verbot die französische Regierung Prüfungen mit IFN-a, nachdem Krebspatienten, die damit behandelt worden waren, tödliche Herzanfälle erlitten. Über mindestens zwei cardiale Todesfälle wurde auch bei kürzlich durchgeführten Prüfungen in Amerika, berichtet. Es ist zunehmend deutlich geworden, daß zumindest ein Teil der Nebenwirkungen, wie Fieber und Unpäßlichkeit, in unmittelbarem Zusammenhang mit dem Interferonmolekül selbst steht und nicht auf Verunreinigungen zurückzuführen sind.The known interferons appear to be active in a variety of diseases, but have little or no effect on many other diseases (e.g., Powledge, Bio / Technology, March 1984, 215-228 "Interferon On Trial"). Interferons also have side effects. For example, in tests of the recombinant α-interferon anticancer effect, it has been found that doses of about 50,000,000 units considered safe by the Phase I results are acute states of confusion, inability to perform joint pain, severe fatigue, loss of appetite , Loss of orientation, epileptic seizures and liver toxicity. In 1982, the French government banned IFN-a testing after cancer patients treated with it suffered fatal heart attacks. At least two cardiac deaths have also been reported in recent trials in America. It has become increasingly clear that at least some of the side effects, such as fever and ailments, are directly related to the interferon molecule itself and are not due to impurities.
246 31 246 31
Aufgrund der großen Hoffnungen, die durch Interferon geweckt worden waren, und angeregt durch den Wunsch, neue Interferonähnliche Moleküle mit verminderten Nebenwirkungen zu finden, ist es wünschenswert, neue derartige Verbindungen zur Verfügung zu haben·Due to the high hopes aroused by interferon and stimulated by the desire to find new interferon-like molecules with reduced side effects, it is desirable to have new such compounds available.
Ziel der Erfindung ist die Bereitstellung neuer Interferone, die insbesondere für die Antitumorbehandlung oder antivirale Behandlung geeignet sind und die die Nachteile bekannter Interferone nicht aufweisen.The aim of the invention is the provision of new interferons, which are particularly suitable for anti-tumor treatment or antiviral treatment and which do not have the disadvantages of known interferons.
Der Erfindung liegt die Aufgabe zugrunde, neue Interferone mit den gewünschten Eigenschaften und Verfahren zu ihrer Herstellung aufzufinden. ;The invention has for its object to find new interferons with the desired properties and processes for their preparation. ;
Erfindungsgemäß werden neue menschliche Interferon-Peptide vom Typ I hergestellt, die von einem DNA-Molekül codiert werden, wobei die codierende Sequenz unter stringenten Bedingungen, die es erlauben, eine Homologie, die größer als 85 % beträgt, zu erkennen, mit den Inserts in der Pst-1 Schnittstelle a) des Plasmids E76E9 in E. coli HB 101, hinterlegt bei der DSM unter der Nummer DSM 3003 oder b) des Plasmids P9A2 in E. coli HB 101, hinterlegt bei der DSM unter der Nummer DSM 3004 oder mit degenerierten Variationen dieser Inserts hybridisiert,According to the invention, novel type I human interferon peptides encoded by a DNA molecule are prepared, the coding sequence being recognized under stringent conditions allowing homology greater than 85 % with the inserts in the Pst-1 cleavage a) of the plasmid E76E9 in E. coli HB 101, deposited with the DSM under the number DSM 3003 or b) of the plasmid P9A2 in E. coli HB 101, deposited with the DSM under the number DSM 3004 or with degenerate variations of this insert hybridized,
Sie werden in der Weise hergestellt, daß ein geeigneter Wirtsorganismus mit genetischen Informationen, codierend für die Interferon-Peptide gemäß den obigen Angaben, transformiert wird, diese Information exprimiert wird, um das entsprechende Interferon in dem Wirtsorganismus zu produzieren und dasThey are prepared by transforming a suitable host organism with genetic information encoding the interferon peptides as described above, expressing this information to produce the corresponding interferon in the host organism and
246 31 246 31
so erhaltene Interferon-Pep.tid aus diesem Wirtsorganismus isoliert wird.thus obtained interferon-Pep.tid is isolated from this host organism.
Erfindungsgemäß werden bestimmte neue Interferone vom Typ I zur Verfügung gestellt, welche ein Leader-Peptid enthalten können, und ihre N-glykosylierten Derivate (hier als omega-Interferon oder IFN-omega bezeichnet), die 168 bis 174» vorzugsweise 172 Aminosäuren enthalten,' und die eine Divergenz von 30 bis 50 %, vorzugsweise von 40 bis 48 %, gegenüber den bisher bekannten Subtypen des o6>-Interferons und eine Divergenz von ungefähr 70 % gegenüber ß-Interferon aufweisen und einerseits ähnliche Wirkungen wie oC-Interferone zeigen, andererseits viele therapeutische Nachteile dieser bekannten Substanzen nicht besitzen·According to the invention, certain novel type I interferons are provided which may contain a leader peptide and their N-glycosylated derivatives (referred to herein as omega-interferon or IFN-omega) containing 168 to 174 "preferably 172 amino acids" and which have a divergence of from 30 to 50%, preferably from 40 to 48%, over the hitherto known subtypes of the o6> interferon and a divergence of approximately 70 % with respect to β-interferon and, on the one hand, show similar effects as α-interferons, on the other hand do not possess many therapeutic disadvantages of these known substances
Die erfindungsgemäß hergestellten Verbindungen sind neue Interferone in vollständig reiner Form, ihre nicht glykosylierten und glykosylierten Formen, die hierfür codierenden Gensequenzen ebenso wie rekombinante Moleküle, die diese Sequenzen enthalten. Gegenstand der Erfindung sind weiterhin Expressions-Vehikel wie Plasmide j die besagte Gensequenzen enthalten, ebenso verschiedene Wirtsorganismen wie Mikroorganismen oder Gewebskultüren, die die Herstellung des neuen Interferons durch Fermentation oder Gewebskulturenmethode ermöglichen.The compounds prepared according to the invention are novel interferons in completely pure form, their non-glycosylated and glycosylated forms, the gene sequences coding for them as well as recombinant molecules containing these sequences. The invention furthermore relates to expression vehicles such as plasmids containing said gene sequences, as well as various host organisms, such as microorganisms or tissue culture, which allow the production of the new interferon by fermentation or tissue culture method.
Ein bevorzugter Gegenstand der Erfindung sind omega-Interferone ebenso wie die entsprechenden Gensequenzen der nachstehenden Formel:A preferred subject of the invention are omega-interferons as well as the corresponding gene sequences of the following formula:
_ 5 - ' 2 4 6 31_ 5 - '2 4 6 31
In Position 111 kann die Sequenz GGG (co-dierend für GIy) durch GAG (codierend für GIu) ersetzt werden. Die bevorzugten Moleküle beinhalten ebenfalls Derivate, die an der Aminosäureposition 78 N-glykosyliert sind.In position 111, the sequence GGG (coding for GIy) can be replaced by GAG (coding for GIu). The preferred molecules also include derivatives that are N-glycosylated at amino acid position 78.
Beispielsweise können die beiden vorstehend erwähnten omega-Interferone das Leader-Peptid der FormelFor example, the two omega interferons mentioned above may be the leader peptide of the formula
' Met AIa Leu Leu Phe Pro Leu Leu Ala AIa Leu VaI Met Thr Ser Tyr Ser Pro VaI GIy Ser.Leu GIy enthaltenMeta Leu Leu Phe Pro Leu Leu Ala Ala Leu VaI Met Thr Ser Tyr Ser Pro VaI GIy Ser.Leu GIy included
Legende zu den Zeichnungen: Legend to the drawings:
Abbildung 1: Restriktionskarte des Klons E76E9^ - Abbildung 2: Restriktionskarte des Klons P9A2 Abbildung 3: DNA-Sequenz des Klons P9A2 Abbildung 4: DNA-Sequenz des Klons'E76E9Figure 1: Restriction map of clone E76E9 ^ - Figure 2: Restriction map of clone P9A2 Figure 3: DNA sequence of clone P9A2 Figure 4: DNA sequence of clone E76E9
Abbildung 5: Genomische Southern Blot Analyse unter Verwendung der DNA des Klons P9A2 als ProbeFigure 5: Genomic Southern blot analysis using the DNA of clone P9A2 as a sample
Abbildung 6: Konstruktion des Expressionsklons pRHW12Figure 6: Construction of the expression clone pRHW12
Abbildung 7: Aminosäure- und Nukleotiddifferenzen zwischen Typ I-InterferonenFigure 7: Amino acid and nucleotide differences between type I interferons
Abbildung 8a: Auflistung singulärer Nukleotidpositionen des IFN-aA GensFigure 8a: List of unique nucleotide positions of the IFN-aA gene
Abbildung 8b: Auflistung singulärer Nukleotidpositionen des IFN-omegal GensFigure 8b: List of unique nucleotide positions of the IFN-omegal gene
Abbildung 8c: Auflistung singulärer Nukleotidpositionen desFigure 8c: List of singular nucleotide positions of the
IFN-ctD GensIFN-ctD gene
Abbildung 9: Schematische Darstellung der Synthese Interferon-Subtyp spezifischer Proben .Figure 9: Schematic representation of the synthesis of interferon subtype-specific samples.
Abbildung 10: Nachweis Interferon-Subtyp spezifischer mRNA's Abbildung 11": DNA-Sequenz des IFN-omegal Gens Abbildung 12: DNA-Sequenz des IFN-pseudo-omega2 Gens Abbildung 13: DNA-Sequenz des IFN-pseudo-omega3 Gens Abbildung 14: DNA-Sequenz des IFN-pseudo-omega4 Gens Abbildung 15: Korrigierte Auflistung der IFN-omega GenFigure 10: Detection of interferon subtype specific mRNAs Figure 11 ": DNA sequence of the IFN-omegal gene Figure 12: DNA sequence of the IFN-pseudo-omega2 gene Figure 13: DNA sequence of the IFN-pseudo-omega3 gene Figure 14: DNA sequence of the IFN pseudo-omega4 gene Figure 15: Corrected listing of the IFN-omega gene
Sequenzensequences
Abbildung 16: Homologien der Signalsequenzen Abbildung 17: Homologien der "reifen" Proteinsequenzen Abbildung 18:- Homologien der 4 DNA-Sequenzen zueinanderFigure 16: Homologies of the signal sequences Figure 17: Homologies of the "mature" protein sequences Figure 18: - Homologies of the 4 DNA sequences to each other
15' Erfindungsgemäß erhält man die neuen omega-Interferone und die hierfür codierenden DNA-Sequenzen wie folgt:According to the invention, the novel omega interferons and the DNA sequences coding therefor are obtained as follows:
Eine humane B-Lymphom-Zellinie, ζ.Β.. Namalwa-Zellen (siehe G. Klein et al., Int. J. Cancer Γ0, 44 (1972)), kann durch Behandlung mit einem Virus, z.B. Sendai Virus, zur gleichzeitigen Produktion von α- und ß-Interferon angeregt werden.A human B lymphoma cell line, ζ.Β .. Namalwa cells (see G. Klein et al., Int. J. Cancer Γ0, 44 (1972)) can be obtained by treatment with a virus, e.g. Sendai virus, stimulated for the simultaneous production of α- and ß-interferon.
Wird hierbei die aus stimulierten Namalwa-Zellen gebildete mRNA isoliert, so kann diese als Template" zur cDNA-Synthese dienen. Um die Ausbeute an Interferon-spezifischen Sequenzen beim Kloniervorgang zu erhöhen, wird die mRNA-PräparationIn this case, if the mRNA formed from stimulated Namalwa cells is isolated, it can serve as a template for the cDNA synthesis.To increase the yield of interferon-specific sequences in the cloning process, the mRNA preparation becomes
über einen Zuckerdichtegradienten entsprechend der verschiedenen Länge der individuellen mRNA-Moleküle aufgetrennt. Vorteilhafterweise wird die mRNA in dem Bereich um 12S (ungefähr 800 bis 1000 Basen Länge der mRNA) gesammelt. In diesem Bereich sedimentiert die für α- und ß-Interferone spezifische mRNA. Die mRNA aus diesem Gradientenbereich wird durch Präzipitation und Auflösen in Wasser konzentriert. separated by a sugar density gradient corresponding to the different length of the individual mRNA molecules. Advantageously, the mRNA is collected in the region around 12S (about 800 to 1000 bases in length of the mRNA). In this area, the mRNA specific for α- and β-interferons sediments. The mRNA from this gradient region is concentrated by precipitation and dissolution in water.
Die Erstellung einer cDNA Bibliothek "folgt" im wesentlichen literaturbekannten Methoden " (siehe z.B. E. Dworkin-Rastl,The preparation of a cDNA library follows "essentially methods known from the literature" (see, for example, E. Dworkin-Rastl,
\0 M.B. Dworkin und P. Swetly, Journal of Interferon Research 2/4, 575-585 (1982)). Die mRNA wird durch Zusatz von oligo-dT geprimt.' Anschließend wird durch Zusatz der vier Desoxynukleosidtriphosphate (dATP, dGTP, dCTP, dTTP) und dem Enzym Reverse Transkriptase in einer entsprechend gepufferten Lösung die cDNA 1 Stunde bei 450C synthetisiert. . Durch Chlöroformextraktion und Chromatographie über eine .Gelsäule, z.B. über Sephadex G50, wird das cDNA/mRNA-Hybrid gereinigt. Die RNA wird durch Alkalibehandlung (0,3 Mol NaOH bei 5O0C, 1 Stunde) hydrolysiert, und die cDNA nach Neutralisieren mit saurer Natriumaze-tatlösung mit Äthanol präzipi-.tiert. Nach Zusatz der vier Desoxynukleosidtriphosphate und E.coli DNA-Polymerase I in entsprechender Lösung wird die Doppelstrangsynthese ausgeführt, wobei die cDNA zugleich als Template und als Primer durch Haarnadelstrukturbildung an ihrem 3'-Ende fungiert (6 Stunden bei 150C) (siehe A. Eftratiadis et al., Cell 7_, 27*9 (1976)). Nach Phenolextraktion, Sephadex G50 Chromatographie und Äthanolpräzipitation wird die DNA in geeigneter Lösung einer Behandlung mit der Einzelstrangspezifischen Endonuklease Sl unterzogen. Dabei werden die Haarnadelstruktur, sowie nicht in Doppelstrang umgesetzte cDNA abgebaut. Nach Chloroformextraktion und Präzipitation mit Äthanol wird die Doppelstrang-DNA (dsDNA) auf einem Zuckerdichtegradienten der Größe nach aufgetrennt. Für die folgenden Schritte des Klonierens wird bevorzugt nur dsDNA der Größe 600 bp und mehr verwendet, um die Wahr-\ 0 MB Dworkin and P. Swetly, Journal of Interferon Research 2/4, 575-585 (1982)). The mRNA is primed by the addition of oligo-dT. Subsequently, the cDNA is synthesized for 1 hour at 45 ° C. by addition of the four deoxynucleoside triphosphates (dATP, dGTP, dCTP, dTTP) and the enzyme reverse transcriptase in a suitably buffered solution. , By Chlöroformextraktion and chromatography on a .Gelsäule, for example via Sephadex G50, the cDNA / mRNA hybrid is purified. The RNA is by alkali treatment (0.3 mol NaOH at 5O 0 C, 1 hour) hydrolyses, and the cDNA, after neutralization with acid Natriumaze-acetate solution präzipi-.tiert with ethanol. After addition of the four deoxynucleoside triphosphates and E. coli DNA polymerase I in a corresponding solution, the double-strand synthesis is carried out, the cDNA also acts as a template and as a primer by hairpin formation at its 3 'end (6 hours at 15 0 C) (see A Eftratiadis et al., Cell 7: 27 * 9 (1976)). After phenol extraction, Sephadex G50 chromatography and ethanol precipitation, the DNA is subjected to treatment with the single strand-specific endonuclease S1 in a suitable solution. The hairpin structure as well as non-double stranded cDNA are degraded. After chloroform extraction and precipitation with ethanol, the double-stranded DNA (dsDNA) is separated by size on a sugar density gradient. For the following steps of cloning, it is preferred to use only dsDNA of size 600 bp and above to monitor the truth.
scheinlichkeit zu steigern, daß nur Klone erhalten werden, welche die komplette codierende Sequenz für die neuen interferone enthalten. dsDNA von mehr als 600 bp Länge wird aus dem Gradienten durch Präzipitation mit Äthanol und Auflösen 5 in Wasser konzentriert. To increase the probability that only clones are obtained which contain the complete coding sequence for the new interferons. dsDNA greater than 600 bp in length is concentrated from the gradient by precipitation with ethanol and dissolution in water.
Um die entstandenen dsDNA-Moleküle zu vermehren, müssen diese zunächst in einem entsprechenden Vektor und anschließend in das Bakterium E.coli eingebracht .werden. Der verwendete Vektor ist vorzugsweise das Plasmid pBR322 (F. Bolivar et al., Gene 2_, 95 (1977)). Dieses Plasmid besteht im wesentlichen aus einem Replikon und zwei Selektionsmarkern. Diese verleihen dem Wirt Resistenz gegen die Antibiotika Ampicillin, und Tetracyclin (Apr, Tcr)..Das Gen für die ß-Lactamase (Apr) enthält die Erkennungssequenz für die Restriktionsendonuklease Pstl.. pBR322 kann mit Pstl geschnitten werden. Die überhängenden 3'-Enden werden mit dem Enzym terminale Desoxynukleotid-Transferase (TdT) unter Vorlage von dGTP in entsprechend gepufferter Lösung verlängert. Gleichzeitig wird die dsDNA ebenfalls mit dem Enzym TdT unter Verwendung von dCTP an den 3 ' -Enden verlängert. Die Homopolymerenden von Plasmid und dsDNA sind komplementär und hybridisieren, wenn Plasmid DNA' und dsDNA im entsprechenden Konzentrationsverhältnis und unter geeigneten Salz-, Pufferund Temperaturbedingungen gemischt werden (T. Nelson et al., Methods in Enzymology 68_, 41-50 (1980)).In order to propagate the resulting dsDNA molecules, they must first be introduced into an appropriate vector and subsequently into the bacterium E. coli. The vector used is preferably the plasmid pBR322 (F. Bolivar et al., Gene 2: 95 (1977)). This plasmid consists essentially of a replicon and two selection markers. These confer resistance to the host on the antibiotics ampicillin, and tetracycline (Ap r , Tc r ). The gene for the β-lactamase (Ap r ) contains the recognition sequence for the restriction endonuclease PstI. PBR322 can be cut with PstI. The overhanging 3'-ends are extended with the enzyme terminal deoxynucleotide transferase (TdT) with presentation of dGTP in appropriately buffered solution. At the same time, the dsDNA is also extended with the enzyme TdT using dCTP at the 3 'ends. The homopolymer ends of plasmid and dsDNA are complementary and hybridize when plasmid DNA 'and dsDNA are mixed in the appropriate concentration ratio and under appropriate conditions of salt, buffer and temperature (Telson et al., Methods in Enzymology 68_, 41-50 (1980)). ,
E. coli vom Stamm HB 101 (Genotyp F-, hsdS20 (r-B, m-B) recA13, ara-14, proA2, lacYl, galK2, rpsL20 (Smr), xyl-5, mtl-1, supE44, lambda-) wird zur Aufnahme der rekombinanten Vektor-dsDNA-Moleküle durch Waschen mit einer CaCl2-Lösung vorbereitet. Kompetente E.coli HB 101 werden mit der DNA gemischt, und nach Inkubation bei O0C wird die so erhaltene Plasmid-DNA durch Hitzeschock bei 420C für 2 Minuten transformiert (M. Dagert et al., Gene 6_, 23-28 (1979)). An-E. coli from strain HB101 (genotype F-, hsdS20 (rB, mB) recA13, ara-14, proA2, lacY1, galK2, rpsL20 (Smr), xyl-5, mtl-1, supE44, lambda) becomes Reception of the recombinant vector dsDNA molecules prepared by washing with a CaCl 2 solution. Competent E. coli HB 101 are mixed with the DNA, and after incubation at 0 ° C, the thus obtained plasmid DNA by heat shock at 42 0 C for 2 minutes transformed (M. Dagert et al., Gene 6_, 23-28 (1979)). On-
246 311 246 311
schließend werden die transformierten Bakterien auf Tetracycl.in-hal-tigen Agarplatten (10 μg pro ml) plattiert. Auf diesem Agar können nur E.coli HB 101 wachsen, die ein Vektor- oder rekombinantes Vektormolekül aufgenommen haben (Tcr). Rekombinante Vektor-dsDNA Moleküle vermitteln dem Wirt den Genotyp ApsTcr, da durch das Einbringen der dsDNA in das ß-Lactamasegen die Information für die ß-Lactamase zerstört worden ist. Die Klone werden auf Agarplatten übertragen, di-e 50 ]\.q/ml Ampicillin enthalten. Nur etwa 3 % ' wuchsen an, was bedeutet, daß 97 % der Klone die Insertion eines dsDNA Moleküls enthielten. Ausgehend von 0,5 μg dsDNA wurden mehr als 30000 Klone erhalten. 28600 Klone davon wurden individuell in die Näpfe von Mikrotiterplatten übertragen, die Nährmedium, 10 μg/ml Tetracyclin und Glyzerin enthielten. Nachdem die Klone darin angewachsen waren, werden die Platten zur Aufbewahrung bei -700C gehalten (cDNA-Bibliothek).Finally, the transformed bacteria are plated on tetracycline-containing agar plates (10 μg per ml). Only E. coli HB 101 can grow on this agar and have taken up a vector or recombinant vector molecule (Tc r ). Recombinant vector dsDNA molecules give the host the genotype Ap s Tc r , since the introduction of the dsDNA into the β-lactamase gene has destroyed the information for the β-lactamase. Clones are transferred to agar plates containing 50 μl of ampicillin. Only about 3% grew, which means that 97% of the clones contained the insertion of a dsDNA molecule. Starting with 0.5 μg dsDNA, more than 30,000 clones were obtained. 28,600 clones were individually transferred to the wells of microtiter plates containing nutrient medium, 10 μg / ml tetracycline and glycerol. Once the clones had grown therein, the plates are kept for storage at -70 0 C (cDNA library).
Zum Durchsuchen der cDNA-Bibliothek auf neue Interferon-Gene enthaltende Klone werden die Klone nach dem Auftauen auf Nitrozellulosefilter übertragen. Diese Filter .liegen auf Tetracyclin-haltigem Nährägar. Nach dem Anwachsen der Bakterienkolonien wird die DNA der Bakterien auf dem Filter fixiert.To screen the cDNA library for clones containing new interferon genes, the clones are transferred to nitrocellulose filters after thawing. These filters lie on tetracycline-containing nutrient agar. After the bacterial colonies have grown, the DNA of the bacteria is fixed on the filter.
Als Probe dient vorteilhafterweise das Insert des Klons pER33 (E. Rastl et al., Gene 2J1, 237-248 (1983) - siehe auch EP-A-0.115.613) , das das Gen für. 'IFN-a2-Arg enthält. Durch Nicktranslation wird dieses Stück DNA radioaktiv markiert,The insert of the clone pER33 (E. Rastl et al., Gene 2J 1 , 237-248 (1983) - see also EP-A-0.115.613), which is the gene for. Contains IFN-a2-Arg. By nick translation, this piece of DNA is radiolabeled,
32 wobei DNA-Polymerase I, dATP, dGTP, dTTP und α- P-dCTP verwendet wird. Die Nitrozellulosefilter werden unter geeigneten, nicht stringenten Hybridisierbedingungen ohne Zugabe der radioaktiven Probe zunächst vorbehandelt und danach ca. 16 Stunden unter. Zusatz der radioaktiven Probe hybridisiert. Danach werden die Filter ebenfalls unter nicht stringenten32 using DNA polymerase I, dATP, dGTP, dTTP and α-P-dCTP. The nitrocellulose filters are first pretreated under suitable, non-stringent hybridization conditions without addition of the radioactive sample and then submerged for about 16 hours. Addition of the radioactive sample hybridized. Thereafter, the filters are also under non-stringent
- ίο -- ίο -
Bedingungen gewaschen. Durch die niedrige Stringenz der Hybridisierung und Waschung werden nicht nur Interferona2-Arg-haltige Klone erfaßt, sondern auch andere Interferon-haltige Klone, deren Sequenzen beträchtlich von der der bisher bekannten Interferon-α abweichen können. Nach dem Trocknen werden die Filter auf einen Röntgenfilm exponiert. Eine Schwärzung, die deutlich über dem Niveau des Hintergrundes liegt, zeigt das Vorhandensein eines Klons mit Interferon-spezifischen Sequenzen an.Conditions washed. Due to the low stringency of the hybridization and washing not only interferon-2-Arg-containing clones are detected, but also other interferon-containing clones whose sequences can differ considerably from those of the previously known interferon-α. After drying, the filters are exposed to X-ray film. Blackening significantly above background levels indicates the presence of a clone with interferon-specific sequences.
.'0 Da die Radioaktivitätssignale unterschiedlicher Güte sind, werden die positiven Klone bzw. die positiv-verdächtig reagierenden Klone im Kleinmaßstab angezüchtet. Die Plasmid- · DNA-Moleküle werden isoliert, mit der Restriktionsendonuklease Pstl verdaut und auf einem Agarosegel elekrophoretisch der Größe nach aufgetrennt (Birnboim et al., Nucl..'0 Since the radioactivity signals of different quality, the positive clones or the positive-suspicious clones are grown on a small scale. The plasmid DNA molecules are isolated, digested with the restriction endonuclease PstI and electrophoretically size fractionated on an agarose gel (Birnboim et al., Nucl.
Acid. Res. 1_, 1513 (1979)). Die DNA im Agarosegel wird nach der Methode von Southern (E.M. Southern, J. Mol. Biol. -98 , 503-517 (1975))' auf ein Nitrbzellulosefilter übertragen. Die DNA dieses Filters wird mit der radioaktiven, iFN-Gen-haltigen, denaturierten Probe hybridisiert. Als positive Kontrolle dient das Plasmid 1F7 (hinterlegt bei der DSM unter der DSM-Nummer 2362) , das das Gen für Interferon-a2-Arg enthält. Das Autoradiogramm macht deutlich, daß der Klon E76E9 und der Klon P9A2 eine Sequenz enthalten, welche unter nicht stringenten Bedingungen mit dem Gen.des Interferonsa2-Arg hybridisiert. Um die dsDNA Inserts der Klone E76E9 und P9A2 näher zu charakterisieren, werden die Plasmide dieser Klone in größerem Maßstab hergestellt. Die DNA wird mit verschiedenen Restriktionsendonukleasen verdaut, so z.B.Acid. Res. 1, 1513 (1979)). The DNA in the agarose gel is transferred to a nitrated cellulose filter according to the method of Southern (EM Southern, J. Mol. Biol. -98 , 503-517 (1975)). The DNA of this filter is hybridized with the radioactive, iFN-gene-containing, denatured sample. The positive control is plasmid 1F7 (deposited with the DSM under DSM number 2362) which contains the gene for interferon-a2-Arg. The autoradiogram shows that clone E76E9 and clone P9A2 contain a sequence which hybridizes under non-stringent conditions to the gene of interferon-2-Arg. To further characterize the dsDNA inserts of clones E76E9 and P9A2, the plasmids of these clones are made on a larger scale. The DNA is digested with various restriction endonucleases, such as
mit AIuI, Sau3A, BgIII, Hinfl, Pstl und Haelll. Die entstehenden Fragmente werden in einem Agarosegel aufgetrennt. Durch Vergleich mit entsprechenden Größenmarkern, so z.B. den Fragmenten, die durch Verdauung von pBR322 mit der Restriktionsendonuklease Hinfl bzw. Haelll entstehen, werdenwith AIuI, Sau3A, BgIII, Hinfl, Pstl and Haelll. The resulting fragments are separated in an agarose gel. By comparison with corresponding size markers, e.g. the fragments resulting from digestion of pBR322 with the restriction endonuclease Hinfl or Haelll, respectively
• 24 6 3f a• 24 6 3f a
- li -- li -
die Größen der Fragmente bestimmt. Durch Kartieren nach Smith und Birnstiel (H.O. Smith et al. Nucl. Acid. Res. 3_, 2387-2398 (1967)) wird die Reihenfolge dieser Fragmente bestimmt. Aus den so ermittelten Restriktionsenzymkarten (Abbildung 1 und 2) läßt sich überraschenderweise ableiten, daß e's sich bei den Inserts der Klone E76E9 und P9A2 um bisher unbekannte Interferongene, nämlich um jene der omega-Interferone, handelt.the sizes of the fragments are determined. By mapping according to Smith and Birnstiel (H.O. Smith et al., Nucl. Acid. Res., 3: 2387-2398 (1967)), the order of these fragments is determined. Surprisingly, it can be deduced from the restriction enzyme maps determined in this way (FIGS. 1 and 2) that the inserts of the clones E76E9 and P9A2 are hitherto unknown interferon genes, namely those of the omega interferons.
Diese Information über die omega-Interferone wird benutzt,This information about the omega interferons is used
"0 um das cDNA-insert mit geeigneten Restriktionsendonukleasen zu verdauen. Die entstehenden Fragmente werden in die dsDNA-Form (replikative Form) des Bakteriophagen M13 mp9 ligiert (J. Messing et al., Gene 19_, 269-276 (1982)) und mit der Sanger'sehen Dideoxymethode sequenziert (F. Sanger et al., Proc. Natl. Acad. Sei. 7_4, 5463-5467 (1977)). Die Einzelstrang-DNA der rekombinanten Ph'agen wird isoliert. Nach dem Binden eines synthetischen Oligomers werden in vier separaten Ansätzen Zweitstrangsynthesen unter Verwendung des großen Fragments der DNA-Polymerase I aus E. coli (Klenow-Fragment) durchgeführt. Zu jeder der vier^Teilreaktionen wird eines der vier Didesoxynukleosidtr!phosphate (ddATP, ddGTP, ddCTP, ddTTP) zugegeben. Das führt zu statistisch verteilten Kettenabbrüchen an jenen Stellen, an denen sich in der Template-DNA die zu dem jeweiligen Didesoxynukleosidtriphosphat komplementäre Base befindet. Außerdem wird zusätzlich radioaktiv markiertes dATP verwendet. Nach Beendigung der Synthesereaktionen werden die Produkte denaturiert, und die Einzelstrang-DNA-Fragmente der Größe nach in einem denaturierenden Polyacrylamidgel getrennt (F. Sanger et al., FEBS Letters 81_, 107-111 (1978)). Danach wird das Gel auf einen Röntgenfilm exponiert. Aus dem Autoradiogramm läßt sich die DNA-Sequenz des rekombinanten M13 Phagen ablesen. Die Sequenzen der Inserts der verschi-edenen rekombinanten Phagen werden mittels geeigneter Computerprogramme verarbeitet (R. Staden, Nucl. Acid. Res. 10, 4731-4751 (1982)).The resulting fragments are ligated into the dsDNA form (replicative form) of the bacteriophage M13 mp9 (J. Messing et al., Gene 19: 269-276 (1982)) and "0" to digest the cDNA insert with appropriate restriction endonucleases Sanger et al., Proc Natl Acad., 7, 5463-5467 (1977)). The single-stranded DNA of the recombinant phage is isolated after binding a synthetic Oligomers are synthesized in two separate sets of second-strand syntheses using the large fragment of DNA polymerase I from E. coli (Klenow fragment), and each of the four partial reactions undergoes one of the four dideoxynucleoside crystals (ddATP, ddGTP, ddCTP, ddTTP). This results in statistically distributed chain terminations at those sites where the template DNA contains the base complementary to the particular dideoxynucleoside triphosphate, and additionally uses radiolabelled dATP the synthesis reactions, the products are denatured and the single-stranded DNA fragments separated in size in a denaturing polyacrylamide gel (F. Sanger et al., FEBS Letters 81, 107-111 (1978)). Thereafter, the gel is exposed to X-ray film. From the autoradiogram, the DNA sequence of the recombinant M13 phage can be read. The sequences of the inserts of the various recombinant phages are processed by means of suitable computer programs (R. Staden, Nucl. Acid. Res. 10, 4731-4751 (1982)).
. 12 . . - 216 3 H, 12 . , - 216 3 H
Abbildung 1 und 2 zeigen die Strategie des Sequenzierens. Abbildung 3 zeigt die DNA-Sequenz des Inserts des Klons P9A2, Abbildung 4 die des Klons E76E9. Der.nicht kodierende . DNA-Strang ist in 5'-> 31 Richtung gezeigt, zusammen mit der daraus «abzuleitenden Aminosäuresequenz.Figures 1 and 2 show the strategy of sequencing. Figure 3 shows the DNA sequence of the insert of clone P9A2, Figure 4 shows that of clone E76E9. The not coding. DNA strand is shown in 5 '-> 3 1 direction, together with the amino acid sequence derived therefrom.
Die isolierte cDNA des Klons E76E9 für omega (GIu)-Interferon ist 858 Basenpaare lang und besitzt eine 31 nicht translatierte Region. Die Region, die für reifes omega (GIu)-Interferon kodiert, reicht von dem Nukleotid 9 bis zum Nukleotid "1P 524. Die isolierte cDNA des Klons P9A2 für omega (GIy)-Interferon ist 877 Basenpaare lang, wobei die für reifes omega-Interferon kodierende Sequenz von dem Nukleotid 8 bis zum. Nukleotid 523 reicht. Die 31 nicht translatierte Region reicht im Fall des P9A2 bis zum poly-A-Abschnitt.The isolated cDNA of clone E76E9 for omega (Glu) interferon is 858 base pairs long and has a 3 1 untranslated region. The region coding for mature omega (GIu) interferon ranges from nucleotide 9 to nucleotide "1 P 524. The isolated cDNA of clone P9A2 for omega (Gly) interferon is 877 base pairs in length, wherein the omega for mature Interferon coding sequence ranges from nucleotide 8 to nucleotide 523. The 3 1 untranslated region extends in the case of P9A2 to the poly A segment.
Die für reifes omega-Interferon kodierenden DNA-Sequenzen sind in den Klonen E76E9 und P9A2 komplett enthalten. Sie beginnen am N-terminalen Ende mit den Aminosäuren Cystein-Asparaginsäure-Leucin. überraschenderweise sind die beiden reifen omega-Interferone 172 Aminosäuren lang, was deutlich von der Länge von den bisher bekannten Interferoneh,. z.B. 166 (bzw. 165) Aminosäuren bei a-Interfero'nen abweicht. Überraschenderweise besitzen die beiden omega-Interferone eine potentielle N-Glykosylierungsstelle an der Aminosäureposition 78 (Asparagin-Methionin-Threonin).The mature omega-interferon-encoding DNA sequences are completely contained in clones E76E9 and P9A2. They begin at the N-terminal end with the amino acids cysteine-aspartic acid-leucine. Surprisingly, the two mature omega interferons are 172 amino acids long, which is significantly shorter than the previously known interferon. e.g. 166 (or 165) amino acids deviate at a-Interfero'nen. Surprisingly, the two omega interferons have a potential N-glycosylation site at amino acid position 78 (asparagine-methionine-threonine).
Ein Vergleich der DNA der Klone E76E9 und P9A2 zeigt einen unterschied. Das für die Aminosäure 111 kodierende Triplett im Klon E76E9 ist GAG und kodiert für Glutaminsäure, während dieses Triplett im Klon E'9Ä2 GGG ist, und für Glycin kodiert. Die beiden omega-Interferbn-Proteine unterscheiden sich daher in einer Aminosäure und werden mit omega (GIu)-Interferon (E76E9) und omega (GIy)-Interferon (P9A2) bezeichnet.A comparison of the DNA of clones E76E9 and P9A2 shows a difference. The triplet in clone E76E9 coding for amino acid 111 is GAG and encodes glutamic acid, while this triplet is in clone E'9Ä2 GGG and encodes glycine. The two omega Interferbn proteins therefore differ in one amino acid and are termed omega (Glu) interferon (E76E9) and omega (Gly) interferon (P9A2).
246-31246-31
Der Vergleich der beiden omega-Interferone mit den bisher bekannten menschlichen α-Interferon Subtypen ergibt folgendes Bild:The comparison of the two omega-interferons with the previously known human α-interferon subtypes gives the following picture:
'Ό +) Interferon alpha A besitzt nur 165 Aminosäuren'Ό +) Interferon alpha A has only 165 amino acids
++) Interferon alpha H besitzt eine potentielle N-Glykosylierungsstelle an Position 75 (D. Goeddel et al., Nature 2^0, 20-26 (1981)).++) Interferon alpha H has a potential N-glycosylation site at position 75 (D. Goeddel et al., Nature 2: 0, 20-26 (1981)).
E. coli HB 101 mit dem Plasmid E76E9 und E. coli 101 mit dem Plasmid P9A2 sind bei der Deutschen Sammlung für Mikroorganismen (DSM Göttigen) unter der Nummer DSM 3003 respektive DSM 3004 am 3. Juli 1984 hinterlegt worden.E. coli HB 101 with the plasmid E76E9 and E. coli 101 with the plasmid P9A2 have been deposited with the German Collection of Microorganisms (DSM Göttigen) under the number DSM 3003 or DSM 3004 on 3 July 1984.
Zum Beleg, daß die neu aufgefundenen Klone eine Interferon-ähnliche-Aktivität produzieren, wird beispielsweise der Klon E76E9 kultiviert und das Lysat des Bakteriums nach dessen Wachstum in einem Plaque-Reduktions-Test überprüft. Das Bakterium produzierte erwartungsgemäß Interferon-ähnliche Aktivität (siehe Beispiel 3).For example, to demonstrate that the newly discovered clones produce an interferon-like activity, clone E76E9 is cultured and the lysate of the bacterium is checked for growth in a plaque reduction assay. The bacterium was expected to produce interferon-like activity (see Example 3).
Ferner wurde zum Beleg, daß es sich bei den beiden neuaufgefundenen Interferonen um Mitglieder einer neuen Interferonfamille handelt, die gesamte DNA aus Namalwa-Zellen isoliert und mit verschiedenen Restrictionsendonucleasen verdaut.Further, to prove that the two newly-found interferons are members of a new interferon family, all DNA from Namalwa cells was isolated and digested with various restriction endonucleases.
- . 246 31-. 246 31
Hierdurch kann die Anzahl der Gene, welche durch die.cDNA1s der Klone P9A2 und E76E9 codiert werden, abgeschätzt werden. Hierzu werden die erhaltenen DNA-Fragmente an Agarosegel nach der Methode von Southern (E.M. Southern et al., J. Mol. 5 Biol. 9J3, 503-517 (1975)) aufgetrennt, auf Nitrocellulose-Filter gebracht und unter, relativ strengen Bedingungen mit radioaktiv markierter spezifischer DNA des Klons P9A2 hybridisiert.This allows the number of genes encoded by die.cDNA 1 s of clones P9A2 and E76E9 to be estimated. For this purpose, the obtained DNA fragments are separated on agarose gel according to the method of Southern (EM Southern et al., J. Mol. 5 Biol. 9J3, 503-517 (1975)), placed on nitrocellulose filter and under relatively severe conditions hybridized with radiolabelled specific DNA of clone P9A2.
Die nach der Hybridisierung mit DNA's aus dem Plasmid P9A2 , 10 und pER33 erhaltenen Ergebnisse werden in Abbildung 5a dargestellt:The results obtained after hybridization with DNAs from plasmid P9A2, 10 and pER33 are shown in Figure 5a:
Hierbei sind die einzelnen Spuren mit Buchstaben gekennzeichnet, die die verschieden verdauten DNA-Proben anzeigen , • (E =EcoRI, H=HindIII, B=BamHI, S=SphI, P=PStI, C=CIaI). Die linke Hälfte des Filters wurde mit der Interferon-a-Gen-Probe ("A") und die rechte Hälfte mit dem cDNA-Insert des Klons P9A2 ("0") hybridisiert. Der Satz der Banden/ die entweder mit der a-Interferon-Gen-Probe oder mit der neuen Interferon-Gen-Probe hybridisieren, ist verschieden. Bei den zwei verschiedenen Proben konnte keine Kreuzhybridisierung festgestellt werden, wenn man die entsprechenden Spuren beurteilt.Here, the individual lanes are labeled with letters indicating the differently digested DNA samples, • (E = EcoRI, H = HindIII, B = BamHI, S = SphI, P = PStI, C = CIaI). The left half of the filter was hybridized with the interferon a gene probe ("A") and the right half hybridized with the cDNA insert of clone P9A2 ("0"). The set of bands / hybridizing to either the α-interferon gene probe or the new interferon gene probe is different. For the two different samples, no cross-hybridization could be detected by judging the corresponding lanes.
In Abbildung 5b ist die cDNA des Klons P9A2 und das für die Hybridisierung benützte Fragment abgebildet. Die Schnittstellen einiger Restrictions-Enzyme sind dargestellt (P=PStI, S=Sau3A, A=AIuI). Die Probe umfaßt nur zwei der möglichen drei Pstl-Fragment'e. Das Hybridisierungsmuster zeigt nur ein hybridisierendes Fragment mit ungefähr 1300 Basenpaaren (bp), welches zu dem homologen Gen gehört. DasFigure 5b shows the cDNA of clone P9A2 and the fragment used for hybridization. The interfaces of some restriction enzymes are shown (P = PStI, S = Sau3A, A = AluI). The sample comprises only two of the possible three PstI fragments. The hybridization pattern shows only one hybridizing fragment of about 1300 base pairs (bp) belonging to the homologous gene. The
50 kleinere 120 bp lange Fragment war vom Gel ausgelaufen. Die dem 5'-Teil des Gens zugehörige B'ande kann nicht entdeckt werden, da die Probe diese Region nicht enthält. Mindestens 6 verschiedene Banden können in dieser Pstl-Spur entdeckt 50 smaller 120 bp fragment had leaked from the gel. The B'ande associated with the 5'-part of the gene can not be detected because the sample does not contain this region. At least 6 different bands can be detected in this Pstl track
werden. Dies bedeutet, daß einige andere Gene, die mit den neuen Sequenzen verwandt sind, in dem menschlichen Genom vorhanden sein müssen. Sollten in diesen Genen eine oder mehrere Pstl-Schnittstellen vorhanden sein, so kann erwartet werden, daß noch mindestens.3 zusätzliche Gene isoliert werden können. . .become. This means that some other genes related to the new sequences must be present in the human genome. If one or more PstI sites are present in these genes, it can be expected that at least 3 additional genes can be isolated. , ,
Diese Gene können vorzugsweise mittels Hybridisierung aus einer menschlichen Gen-Bibliothe-k, die in -,einem- PLa-smid-Vektor, Phagen-Vektor oder Cosmid-Vektor enthalten sind, iso-/1O liert werden (siehe Beispiel 4e) .These genes can preferably by hybridization from a human gene Bibliothe-k in - are included einem- PLA Smid vector, phage vector or cosmid vector, iso- / 1 O lines (see Example 4e).
An dieser Stelle sei erwähnt, daß es sich bei den erfindungsgemäßen omega-Interferonen nicht nur um die zwei reifen Interferone, die im einzelnen beschrieben sind, handelt, sondern ebenfalls um jedwede Modifikation dieser Polypep-. tide, die die IFN-omega-Aktivität unbeeinflußt läßt. Diese Modifikationen beinhalten z.B. Verkürzung des Moleküls am N- oder C-terminalen Ende, Austausch von Aminosäuren durch andere Reste, wodurch die Aktivität nicht wesentlich verändert wird, chemische oder biochemische Bindungen des MoIeküls an andere Moleküle, die inert oder aktiv sind. Bei den letztgenannten Modifikationen kann es sich beispielsweise um Hybridmoleküle aus einem oder mehreren omega-Interferonen und/oder bekannten α- oder ß-Interferonen handeln.It should be noted at this point that the omega interferons according to the invention are not just the two mature interferons which are described in detail, but also any modification of these polypeptides. tide, which leaves the IFN-omega activity unaffected. These modifications include e.g. Truncation of the molecule at the N- or C-terminal end, replacement of amino acids with other residues, whereby the activity is not significantly altered, chemical or biochemical bonds of the molecule to other molecules that are inert or active. The last-mentioned modifications may, for example, be hybrid molecules of one or more omega interferons and / or known α- or β-interferons.
Um die Unterschiede der Aminosäure- und Nukleotidsequenzen der neuen Interferone, insbesondere des omega (GIy) - und des omega (GIy)-Interferons, im Vergleich zu den bereits für die a-Interferone und für das ß-Interferon publizierten Aminosäure- und Nukleotidsequenzen (C. Weissmann et al., Phil. Trans. R. Soc. London 299, 7-28 (1982); A. Ullrich et al., j. Molec. Biol. 156, 467-486 (1982);, T.Taniguchi et al., Proc. Nat. Acad. Sei. 7_7, 4003-4006 (1980); K. Tokodoro et al., EMBO J. 3_' 669-670 (1984)) vergleichen zu können, werden die entsprechenden Sequenzen paarweise angeordnet und die Unterschiede an einzelnen Positionen gezählt.The differences between the amino acid and nucleotide sequences of the new interferons, in particular the omega (GIy) and the omega (GIy) interferon, in comparison to the amino acid and nucleotide sequences already published for the α-interferons and for the β-interferon ( C. Weissmann et al., Phil. Trans Soc R. London 299 , 7-28 (1982), A. Ullrich et al., J. Molec. Biol. 156 , 467-486 (1982); Taniguchi et al., Proc Nat Acad., 7, 7, 4003-4006 (1980); K. Tokodoro et al., EMBO J. 3: 669-670 (1984)), the corresponding sequences become pairwise arranged and counted the differences at individual positions.
Aus den in der Abbildung 7 dargestellten Ergebnissen geht hervor, daß die DNA-Sequenzen der Klone P9A2 und E76E9 verwandt sind mit den Sequenzen der Typ I Interferone (z.B. α- und ß-Interferone). Andererseits wird dargestellt, daß c die Unterschiede der Aminosäuresequenzen zwischen den ein-zelnen a-Interferonen und den neuen Sequenzen größer als 41,6 % und kleiner als 47,0 % sind. Die Unterschiede zwischen den neuen Sequenzen sowie denen der einzelnen a-Interferone und' der des ß-Interferons' liegt in der G'rößen-Ordnung von ungefähr 70 %. Unter Berücksichtigung der Ergeb- : nisse des Beispiels 4, in welchem die Existenz eines ganzen Satzes verwandter Gene belegt wird, und -unter Berücksichtigung der vorgeschlagenen Nomenklatur für die Interferone (J-. Vilceck et al., J. Gen. Virol. 65_, 669-670 (1984)) wird angenommen, daß die cDNA-Inserte der Klone P9A2- und E76E9 für eine neue Klasse der Typ I-Interferon codieren, welche als Interferon-omega bezeichnet werden.From the results shown in Figure 7, it can be seen that the DNA sequences of clones P9A2 and E76E9 are related to the sequences of type I interferons (e.g., α and β interferons). On the other hand, it is shown that c is the difference in amino acid sequences between the single α-interferons and the new sequences greater than 41.6% and less than 47.0%. The differences between the new sequences as well as those of the individual α-interferons and β-interferon are in the order of about 70%. Taking into account the results of Example 4, which demonstrates the existence of a whole set of related genes, and taking into account the proposed nomenclature for the interferons (J-Vilceck et al., J. Gen. Virol. 669-670 (1984)), it is believed that the cDNA inserts of clones P9A2 and E76E9 encode a new class of type I interferon, referred to as interferon-omega.
Desweiteren wird belegt, daß die omega-Interferon-Gen-Expression analog der von einem Interferon-Typl-Gen erfolgt. Hierzu wird die Transkription der einzelnen Mitglieder der Multigenfamilien der α- und omega-Interferone basierend auf der Sl-Mapping-Methode (A.J. Berk et al., Cell 12_, 721 (1977)) untersucht (siehe Beispiel 7) und gezeigt, -daß die Expression omega-1-mRNA virusinduzierbar ist. Da sich die Transkripte einer solchen Genfamilie nur durch einige wenige Basen von ungefähr 1000 unterscheiden, ist die Hybridisierung allein kein genug empfindliches Unterscheidungsmerkmal, um die verschiedenen IFN mRNA's zu unterscheiden.Furthermore, it is demonstrated that the omega-interferon gene expression is analogous to that of an interferon-Typl gene. For this purpose, the transcription of the individual members of the multigene families of α and omega interferons is investigated based on the Sl-mapping method (AJ Berk et al., Cell 12, 721 (1977)) (see Example 7) and shown - the expression omega-1 mRNA is virus-inducible. Since the transcripts of such a gene family differ only by a few bases of about 1000, hybridization alone is not a sufficiently sensitive distinguishing feature to distinguish the different IFN mRNAs.
Hierzu werden die mRNA-Sequenzen von 9 a-Interferonen, von lnterferon-omega-1 und von ß-Interferon dargestellt. Mit Großbuchstaben sind hierbei diejenigen Basen gekennzeichnet, welche für die oberste Sequenz spezifisch sind. Solche -spezifischen Stellen können leicht durch ein triviales Computer-Programm gefunden werden. Eine Hybridisierungsprobe,For this purpose, the mRNA sequences of 9 a-interferons, interferon-omega-1 and ß-interferon are shown. Uppercase letters indicate those bases which are specific to the uppermost sequence. Such specifics can be easily found through a trivial computer program. A hybridization sample,
• ' 246 3 ί 8• '246 3 ί 8
welche von einer spezifischen Stelle ausgeht, kann nur mit der mRNA eines bestimmten Subtyps perfekt hybridisieren. Alle übrigen mRNA's können nicht an der spezifischen Stelle des Subtyps hybridisieren. Wenn die Hybridisierungsprobe an ihrem spezifischen 5'-Ende radioaktiv markiert ist, sind nur jene radioaktiven Markierungen gegen Verdauungen mit einer Einzelstrang-spezifischen Nuclease (vorzugsweise Sl-Nuclease) geschützt, welche mit der'Interferon-Subtyp-mRNA, für welche die Probe konstruiert worden -wac, hybridisiert haben..which emanates from a specific site, can only hybridize perfectly with the mRNA of a particular subtype. All other mRNAs can not hybridize at the specific site of the subtype. When the hybridization probe is radiolabeled at its specific 5 'end, only those radiolabels are protected against digestions with a single-stranded specific nuclease (preferably SI nuclease) which interacts with the interferon subtype mRNA for which the probe constructs have -wac, hybridized ..
'0 Dieses Prinzip ist nicht auf Interferon beschränkt, dieses kann vielmehr auf jede Gruppe bekannter Sequenzen, die die in Abbildung 8 beschriebenen spezifischen Stellen aufweisen, angewendet werden.'This principle is not limited to interferon but may be applied to any group of known sequences that have the specific sites described in Figure 8. '
Die oben erwähnten spezifischen Stellen der Subtypen sind in '-''den meisten Fällen keine Restriction-Stellen, so daß das Schneiden der cDNA1s mit Restrictions-Endonucleasen nicht dazu geeignet ist, Subtyp-spezifische Hybridisierungsproben herzustellen. Die in diesem Beispiel benutzten Proben sind daher durch Erweiterung eines am 5'-Ende radioaktiv markierten Oligönucleotids, welches complementär zu der mRNA von Interferon-omegal oberhalb der spezifischen Stelle ist, hergestellt worden.The specific locations of the above-mentioned subtypes are '-''most cases, no restriction sites, so that the cutting of the cDNA 1 s is not suitable with Restrictions endonucleases to produce subtype-specific hybridization probes. The samples used in this example were therefore prepared by extension of a 5'-end radiolabeled oligonucleotide complementary to the mRNA of interferon-omegal above the specific site.
Aus Abbildung 10 geht hervor, daß erwartungsgemäß omega-1-mRNA in Namalwa- und NC37-Zellen induzierbar ist.Figure 10 shows that omega-1 mRNA is expected to be inducible in Namalwa and NC37 cells.
Gegenstand der Erfindung sind daher nicht nur Gen-Sequenzen, die spezifisch für die angegebenen omega-Interferone codieren, sondern'ebenfalls Modifikationen, die leicht und rou-· tinemäßig durch Mutation, Abbau, Transposition oder Addition erhalten werden können. Jede Sequenz, die für die beschriebenen humanen omega-Interferone codiert (d.h. die das biologische Aktivitätsspektrum aufweist, das hier beschrieben ist) und im Vergleich mit den gezeigten degeneriert ist, istThe invention therefore not only gene sequences which code specifically for the specified omega-interferons, but also modifications which can be easily and routinely obtained by mutation, degradation, transposition or addition. Any sequence coding for the described human omega interferons (i.e., having the biological activity spectrum described herein) and degenerate in comparison to those shown is
ebenfalls eingeschlossen; Fachleute auf diesem Gebiet in der Lage, DNA-Sequenzen der codierenden Regionen zu degenerieren. Ebenso ist jede Sequenz, die für ein Polypeptid mit dem Aktivitätsspektrum des IFN-omega codiert, und die mit den gezeigten Sequenzen (oder Teilen davon) unter stringenten Bedingungen hybridisiert (beispielsweise Bedingungen, die für mehr als 85 %, bevorzugt mehr als 90 % Homologie selektieren), beinhaltet.also included; Those skilled in the art will be able to degenerate DNA sequences of the coding regions. Similarly, any sequence encoding a polypeptide having the spectrum of activity of the IFN-omega and which hybridizes to the sequences (or portions thereof) shown under stringent conditions (for example, conditions greater than 85%, preferably greater than 90%, homology select).
Die Hybridisierungen werden in 6 χ SSC/5 χ Denhardt's Lö-.10 sung/0,1 % SDS bei 650C durchgeführt. Der Grad der Stringenz wird inr Waschschritt festgelegt. So sind für eine Selektionierung auf DNA-Sequenzen mit ca. 85 % oder mehr Homologie die Bedingungen 0,2 χ SSC/0,01 %, SDS/65°C und für eine Selektionierung auf DNA-Sequenzen mit ca. 90 % oder mehr Homologie die Bedingungen 0,1 χ SSC/0,01 % SDS/65°C geeignet.The hybridizations are carried out in 6 χ SSC / 5 χ Denhardt's Lö. 10 sung / 0.1% SDS at 65 0 C. The degree of stringency is set in the washing step. Thus, for a selection on DNA sequences with about 85% or more homology, the conditions are 0.2 χ SSC / 0.01%, SDS / 65 ° C and for selection on DNA sequences with about 90% or more Homology the conditions 0.1 χ SSC / 0.01% SDS / 65 ° C suitable.
Beim Durchsuchen einer Cosmid-Bibliothek unter diesen Bedingungen (0.2 χ SSC) erhält man einige mit einer IFN-omegal Probe hybridisierende Cosmide. Die Sequenzanalyse von daraus isolierten Restriktionsenzymfragmenten ergibt das authentische 'IFN-omegal Gen (siehe Abbildung 11), sowie drei weitere, dazu verwandte Gene, die als IFN-pseudo-omega2, IFN-pseudo-omega3 und IFN-pseudo-omega4 (siehe Abbildungen 12-14) bezeichnet wurden. Diese sind ein weiterer· Gegenstand der vorliegenden Erfindung sowie die durch sie codierten Peptide. Dieser Gegenstand wird in den Ansprüchen 43 bis gekennzeichnet.Examination of a cosmid library under these conditions (0.2 χ SSC) yields some cosmids hybridizing with an IFN-omegal probe. Sequence analysis of restriction enzyme fragments isolated therefrom yields the authentic 'IFN-omegal gene (see Figure 11), as well as three other related genes known as IFN-pseudo-omega2, IFN-pseudo-omega3, and IFN-pseudo-omega4 (see Figures 12-14). These are a further object of the present invention and the peptides encoded by them. This article is characterized in claims 43 to.
Die DNA-Vergleiche ergeben eine rund 85%ige Homologie der Pseudogene zum IFN-omegal-Gen (Interferon-omega-eins-Gen).The DNA comparisons reveal an approximately 85% homology of the pseudogenes to the IFN-omegal gene (interferon omega one gene).
Desweit.eren zeigt das IFN-omegal Gen, daß bei der Transkription die mRNA die information für ein funktionelles Interferonprotein beinhaltet, d.h., es wird ein 23 Aminosäure langes Signalpeptid der FormelFurthermore, the IFN-omegal gene shows that upon transcription, the mRNA contains the information for a functional interferon protein, i.e., it becomes a 23 amino acid long signal peptide of the formula
Met Ala Leu Leu Phe Pro Leu Leu Ala AIa Leu VaI Met Thr Ser Tyr Ser Pro VaI GIy Ser Leu. GIyMet Ala Leu Leu Phe Pro Leu Leu Ala AIa Leu VaI Met Thr Ser Tyr Ser Pro VaI GIy Ser Leu. Gly
codiert, das vom reifen 172 Aminosäuren langen IFN-omegal gefolgt wird.encoded by the mature 172 amino acid IFN-omegal followed.
.5 Interferon-omega-Gene können unter Bedingungen in jeden Organismus eingebracht-werden, die zu ;hohen Ausbeuten führen." Geeignete Wirte und Vektoren sind dem Fachmann bestens bekannt; als Beispiel sei auf die EP-A-O.093.619 hingewiesen..5 Interferon omega genes can be introduced into any organism under conditions which result in "high yields." Suitable hosts and vectors are well known to those skilled in the art, for example EP-A-0 093 619.
Insbesondere sind Prokaryoten für die 'Expression bevorzugt. Beispielsweise ist E. coli K 12, Stamm 294 (ATCC No. 31 446) geeignet. Andere Stämme, die geeignet sind, beinhalten Έ. coli X1776 (ATCC Nr. 31.537). Ebenso wie die vorerwähnten Stämme können auch E. coli W 3110 (F**, Lambda', Prototröph, ATCC Nr. 27325), Bazillen wie Bacillus sübtilis, und andere Enterobacteriaceae, wie Salmonella typhimurium oder Serratia marcensens und verschiedene Pseudomonaden verwendet werden.In particular, prokaryotes are preferred for 'expression. For example, E. coli K 12, strain 294 (ATCC No. 31,446) is suitable. Other strains that are suitable include Έ. coli X1776 (ATCC No. 31,537). Like the aforementioned strains, E. coli W 3110 (F **, Lambda ', Prototröph, ATCC No. 27325), bacilli such as Bacillus sübtilis, and other Enterobacteriaceae such as Salmonella typhimurium or Serratia marcensens and various pseudomonads can also be used.
Im allgemeinen können Plasmid-Vektoren, die Replikon und „ Kontrollsequenzen, die aus Spezies stammen, die kompatibel mit den Wirtszellen sind, enthalten, in Verbindung mit diesen Wirten verwendet werden. Der Vekto'r trägt üblicherweise neben einer Replikationsstelle Erkennungssequenzen, die es ermöglichen, die transformierten Zellen phenotypisch zu .selektieren. Zum Beispiel wird E. coli üblicherweise mit pBR322 transformiert, ein Plasmid, das aus E. coli Spezies stammt (Bolivar, et al., Gene 2_, .95 (1977)). pBR322 enthält Gene für Ampicillin- und Tetracyclin-Resistenz und liefert damit einfache Mittel, transformierte Zellen zu identifizieren. Das pBR322-Plasmid oder auch andere Plasmide müssen außerdem von sich aus Promotoren enthalten oder müssen dahingehend so modifiziert sein, daß sie Promotoren enthalten,In general, plasmid vectors containing replicons and "control sequences derived from species compatible with the host cells can be used in conjunction with these hosts. The vector usually carries recognition sequences next to a replication site, which make it possible to phenotypically select the transformed cells. For example, E. coli is usually transformed with pBR322, a plasmid derived from E. coli species (Bolivar, et al., Gene 2: 95 (1977)). pBR322 contains genes for ampicillin and tetracycline resistance, providing simple means to identify transformed cells. In addition, the pBR322 plasmid or other plasmids must themselves contain promoters or must be modified to contain promoters,
· 2U 3)8 · 2U 3) 8
die vom mikrobiellen Organismus zur Expression ihrer eigenen Proteine verwendet werden können. Die Promotoren, die am häufigsten bei der Herstellung rekombinanter DNA verwendet werden, beinhalten die Beta-Lactamase (Penicillinase) und Lactose-Promotor-Systeme (Chang et al., Nature 275, 615 (1978); Itakura et al., Science 198,. JLO56L (1977); Goeddel et al., Nature 281, 544 (1979)) und Tryptophan(trp) Promotor-Systeme (Goeddel et al., Nucleic Acids- Res. 8, 4057 (1980); EP-A-O. 036. 776) . Während die^erwähnten ...die_ gebräuchlichsten Promotoren sind, sind darüber hinaus auch andere mikrobielle Promotoren entwickelt und benutzt worden. Die Gen-Sequenz für IFN-omega kann beispielsweise unter der Kontrolle des Leftward-Promotors des Bakteriophagen Lambda (P-) eingesetzt werden. Dieser Promotor ist einer der als besonders stark bekannten Promotoren, der steuerbar ist. Die Steuerung wird möglich durch den Lambda-Repressor, von dem benachbarte Restriktionsschnittstellen bekannt sind.which can be used by the microbial organism to express their own proteins. The promoters most commonly used in the production of recombinant DNA include the beta-lactamase (penicillinase) and lactose promoter systems (Chang et al., Nature 275 , 615 (1978); Itakura et al., Science 198); JLO56L (1977); Goeddel et al., Nature 281 , 544 (1979)) and tryptophan (trp) promoter systems (Goeddel et al., Nucleic Acids Res. 8, 4057 (1980); EP-A-036 776). While these are the most commonly used promoters, other microbial promoters have also been developed and used. For example, the gene sequence for IFN-omega can be used under the control of the Leftward promoter of bacteriophage lambda (P-). This promoter is one of the promoters known to be particularly strong, which is controllable. Control is possible through the lambda repressor of which adjacent restriction sites are known.
Ein temperaturempfindliches Allel dieses Repressof-Gens kann in einem Vektor, der eine vollständige IFN-omega-Sequenz enthält, eingefügt werden. Wird die Temperatur auf 420C erhöht, wird der Repressor inaktiviert und der Promotor bis zu seiner maximalen Konzentration exprimiert. Die Summe der mRNA, die unter diesen Bedingungen produziert wird, sollte ausreichend sein, um eine Zelle zu erhalten, die unter ihren neuen synthetischen Ribonukleinsäuren ungefähr 10 % enthält, die von dem P,-Promotor stammt. Auf diese Weise ist es möglich, eine Clon-Bank zu etablieren, in der eine funktioneile IFN-omega-Sequenz in Nachbarschaft zu einer Ribosom-Bindungsstelle plaziert wird in variierenden Abständen zu dem Lambda-PL-Promotor. Diese Klone können dann überprüft und der mit der höchsten Ausbeute selektiert werden.A temperature-sensitive allele of this repressor gene can be inserted into a vector containing a complete IFN-omega sequence. When the temperature is raised to 42 ° C., the repressor is inactivated and the promoter is expressed to its maximum concentration. The sum of the mRNA produced under these conditions should be sufficient to obtain a cell containing about 10% of its new synthetic ribonucleic acid derived from the P, promoter. In this way, it is possible to establish a clone bank in which a functional IFN-omega sequence is placed adjacent to a ribosome binding site at varying distances to the lambda P L promoter. These clones can then be checked and selected with the highest yield.
Die Expression und Translation einer IFN-omega-Sequenz kann auch unter Kontrolle anderer Regulationssysteme, die als "homolog" zu dem Organismus in seiner untransformierten Form gelten können, ablaufen. So enthält z.B. chromosdmale DNAThe expression and translation of an IFN-omega sequence may also proceed under the control of other regulatory systems which may be considered to be "homologous" to the organism in its untransformed form. Thus, e.g. chromosomal DNA
von einem Lactose-abhängigen E. coli ein Lactose oder Lac-Operon, der durch Ausschüttung des Enzyms Beta-Galactosidase den Lactose-Abbau ermöglicht.from a lactose-dependent E. coli, a lactose or lac operon, which enables the lactose degradation by release of the enzyme beta-galactosidase.
Die Lac-Kontrollelemente können aus dem Bacteriophagen Lambda-plac5, der infektös für E. coli ist, erhalten werden. Das Lac-Operon des Phagen kann durch Transduktion aus derselben Bakterien-Spezies stammen. Regulationssysteme, die bei dem erfindungsgemäßen Verfahren Verwendung finden. können, können aus plasmidischer DNA stammen, die dem Organismus eigen ist. Das Lac-Promotor-Operator-System kann durch IPTG induziert werden.The Lac controls can be obtained from bacteriophage lambda plac5, which is infectious for E. coli. The lac operon of the phage can be derived by transduction from the same bacterial species. Regulation systems that find use in the inventive method. can be derived from plasmid DNA inherent in the organism. The lac promoter-operator system can be induced by IPTG.
Andere Promotor-Operator-Systeme oder Teile hiervon können genausogut verwendet werden: beispielsweise Arabinose-Operator, Colicine Ei-Operator, Galactose-Operator, alkalischer Phosphatase-Operator, trp-Operator, Xylose-A-Operator, tac-Promotor u.a..Other promoter-operator systems or parts thereof may be used as well: for example, arabinose operator, colicine egg operator, galactose operator, alkaline phosphatase operator, trp operator, xylose A operator, tac promoter, and the like.
Zusätzlich zu Prokaryoten können auch eukaryotische Mikroorganismen, wie Hefekulturen verwendet werden Saccharomyces cerevisiae ist die am meisten verwendete unter den eukaryotischen Mikroorganismen, obwohl eine Anzahl anderer Spezies allgemein erhältlich ist. Zur Expression in Saccharomyces wird beispielsweise das Plasmid YRp7 (Stinchcomb et al. Natur 2J32_, 39 (1979); Kingsman et al., Gene 7_, 141 (1979); Tschumper et al., Gene 10_, 157 (1980)) und das Plasmid YEp 13 (Bwach et al., Gene 8_, 121-133 (19.79)) üblicherweise verwendet. Das Plasmid YRp7 enthält das TRPl-Gen, das eine Selektionierungsmarkierung für eine Hefemutante, die unfähig ist, in trypthophanhaltigem Medium zu wachsen, bereitstellt; beispielsweise ATCC Nr. 44076.In addition to prokaryotes, eukaryotic microorganisms such as yeast cultures may also be used. Saccharomyces cerevisiae is the most widely used among eukaryotic microorganisms, although a number of other species are commonly available. For expression in Saccharomyces , for example, the plasmid YRp7 (Stinchcomb et al., Nature 2J32, 39 (1979), Kingsman et al., Gene 7, 141 (1979), Chumper et al., Gene 10, 157 (1980)), and the Plasmid YEp13 (Bwach et al., Gene 8_, 121-133 (19.79)) is commonly used. The plasmid YRp7 contains the TRPl gene, which provides a selection marker for a yeast mutant unable to grow in tryptophan-containing medium; for example, ATCC No. 44076.
Das Vorhandensein des TRPl Schadens als Charakteristikum des Hefe-Wirts Genoms stellt dann ein wirksames Hilfsmittel dar, um die- Transformation nachzuweisen, indem ohne TryptophanThe presence of TRPl damage as a characteristic of the yeast host genome then provides an effective means of detecting the transformation by using no tryptophan
kultiviert wird. Ganz ähnlich verhält es sich bei dem Plasmid YEpl3, das das Hefe-Gen LEU 2, das zur Ergänzung einer LEU-2-minus-Mutante verwendet werden kann, enthält. Geeignete Promotor-Sequenzen für Hefe Vektoren beinhalten die 5'-flankierende Region der Gene des ADH I (Ammerer G., Methods of Enzymology 101, 192-201 (1983)), 3-Phosphoglycerate-Kinase (Hitzeman et al., J. Biol. Chem. 255, 2073 (1980)) oder andere glykolytische Enzyme (Kawaski und Fraenkel, BBRC 108, 1107-1112 (1982)) wie-Eno-lase, Glyce-r— aldehyd-3-phosphat, Dehydrogenase, Hexokinase, Pyruvat, Decarboxylase, Phosphofructokinase, Glucose-6-Phosphat-Isomerase, Phosphoglucose-Isomerase und -Glucokinase. Bei der Konzentration geeigneter Expres- sions Plasmide können die mit diesen Genen assoziierten Terminationssequenzen ebenfalls in den Expressions-Vektor am 3'-Ende der zu· exprimierenden Sequenz eingesetzt werden, um Polyadenylierung und Termination der mRNA vorzusehen.is cultivated. Similarly, the plasmid YEpl3 contains the yeast LEU 2 gene, which can be used to complement a LEU 2 minus mutant. Suitable promoter sequences for yeast vectors include the 5 'flanking region of the genes of ADH I (Ammerer G., Methods of Enzymology 101 , 192-201 (1983)), 3-phosphoglycerate kinase (Hitzeman et al., J. Biol. Biol. Chem. 255 , 2073 (1980)) or other glycolytic enzymes (Kawaski and Fraenkel, BBRC 108 , 1107-1112 (1982)) such as enolase, glyceraldehyde-3-phosphate, dehydrogenase, hexokinase, Pyruvate, decarboxylase, phosphofructokinase, glucose-6-phosphate isomerase, phosphoglucose isomerase and glucokinase. When concentrating suitable expression plasmids, the termination sequences associated with these genes can also be used in the expression vector at the 3 'end of the sequence to be expressed in order to provide polyadenylation and termination of the mRNA.
Andere Promotoren, die zudem noch den Vorteil der durch Wachstumsbedingungen kontrollierten Transkription besitzen, sind die Promotor-Regionen der Gene für Alkohol-Dehydrogenase-2,Isocytochrom C, Saure-Phosphatase abbauende Enzyme, die mit dem Stickstoff-Metabolismus gekoppelt sind, die oben • erwähnte Glyceraldehyd-S-Phosphat-Dehydrogenase und Enzyme, die für die Verarbeitung von Maltose und Galaktose verantwortlich sind. Promotoren, die durch den Hefe Mating Typ Locus reguliert werden, beispielsweise Promotoren der Gene BARI, MFaI, STE2, STE3, STE5 können bei temperaturregulierten Systemen durch die Verwendung von temperaturabhängigen siv Mutationen eingesetzt werden. (Rhine PH.D. in Thesis, University of Oregon, Eugene, Oregon (1979), Herskowitz and Oshima, The Molecular Biology of the Yeast Saccharomyces, part I, 181-209 (1981), Cold Spring Harbor Laboratory). Diese Mutationen beeinflussen* die Expression der ruhenden Mating Typ Kassetten von Hefen und dadurch indirekt die Mating Typ abhängigen Promotoren. Generell ist jedoch jeder Plasmid Vektor, der einen Hefe-kompatiblen Promotor, originäre Replikations- und Terminationssequenzen enthält, geeignet.Other promoters that also have the advantage of growth-controlled transcription are the promoter regions of the genes for alcohol dehydrogenase-2, isocytochrome C, acid phosphatase-degrading enzymes coupled with the nitrogen metabolism discussed above. mentioned glyceraldehyde S-phosphate dehydrogenase and enzymes responsible for the processing of maltose and galactose. Promoters that are regulated by the yeast mating type locus, for example promoters of the BARI, MFaI , STE2 , STE3 , STE5 genes, can be used in temperature-regulated systems through the use of temperature dependent siv mutations. (Rhine PH.D., Thesis, University of Oregon, Eugene, Oregon (1979), Herskowitz and Oshima, The Molecular Biology of Yeast Saccharomyces , part I, 181-209 (1981), Cold Spring Harbor Laboratory). These mutations affect * the expression of quiescent mating type cassettes of yeasts and thereby indirectly the mating type dependent promoters. In general, however, any plasmid vector containing a yeast-compatible promoter, original replication and termination sequences is suitable.
Zusätzlich zu Mikroorganismen sind Kulturen multizellulärer Organismen ebenfalls geeignete Wirtsorganismen. Im Prinzip ist jede dieser Kulturen einsetzbar, ob von Wirbeltier- oder wirbellosen Tierkulturen. Größtes Interesse besteht jedoch an Wirbel-tier-Zellen, so daß die' Vermehrung von Wirbeltierzellen in Kultur (Gewebe-Kultur) in den letzten Jahren zu einer routinemäßigen Methode wurde (Tissue, Culture, Academic Press, Kruse and Patterson, Editors (1973)). Beispiele solcher nützlichen Wirtszellinien sind VERO- und HeLa-ZeI-len, Goldhamster-Eierstock (CHO)-Zellen und W138, BHK, COS-7 und MDCK-Zellinien. Expressionsvektoren für diese Zellen enthalten üblicherweise (wenn nötig) eine Replikationsstelle, einen Promotor, der vor dem zu exprimierenden Gen lokalisiert ist, gemeinsam mit jeder notwendigen Ribosomenbindungsstelle,' RNA-Splicing-Stelle, Polyadenylierungsstelle und'transkriptioneile Terminations-Sequenzen.In addition to microorganisms, cultures of multicellular organisms are also suitable host organisms. In principle, each of these cultures can be used, whether from vertebrate or invertebrate animal cultures. However, there has been a great deal of interest in vertebrate animal cells, so that the proliferation of vertebrate cells in culture (tissue culture) has become a routine method in recent years (Tissue, Culture, Academic Press, Kruse and Patterson, Editors (1973). ). Examples of such useful host cell lines are VERO and HeLa cells, Golden hamster ovary (CHO) cells and W138, BHK, COS-7 and MDCK cell lines. Expression vectors for these cells usually contain (if necessary) a replication site, a promoter located in front of the gene to be expressed, along with any necessary ribosome binding site, RNA splicing site, polyadenylation site, and transcriptional termination sequences.
Bei der Verwendung in Säugetierzellen werden die Kontroll- . funktionen auf den Expressions-Vektoren oftmals aus viralem Material vorgesehen. Beispielsweise stammen die üblicherweise verwendeten Promotoren aus Polyoma Adenovirus 2, und besonders häufig aus Simian Virus 40 (SV 40). Die frühen und spaten Endpromotoren des SV 40 sind besonders nützlich, da beide leicht aus dem Virus als Fragment zu erhalten sind, das auch noch die virale Replikationsstelle des SV 40 enthält. (Fiers et al., Nature 273, 113 (1978)). Auch können kleinere oder größere Fragmente des SV 40 verwendet werden, vorausgesetzt, sie enthalten die annähernd 250 bp lange Sequenz, die von der Hindlll Schnittstelle bis zur BgI 1 Schnittstelle in der viralen Replikationsstelle reicht.When used in mammalian cells, the control. functions on the expression vectors often made of viral material. For example, the promoters commonly used are derived from Polyoma Adenovirus 2, and more commonly from Simian Virus 40 (SV 40). The early and late end promoters of the SV 40 are particularly useful because both are easily obtained from the virus as a fragment that also contains the SV 40 viral replication site. (Fiers et al., Nature 273 , 113 (1978)). Also, smaller or larger fragments of the SV 40 can be used, provided they contain the approximately 250 bp sequence that extends from the HindIII site to the BglI site in the viral replication site.
Außerdem ist es ebenfalls möglich und oft empfehlenswert, Promotor- oder Kontroll-Sequenzen zu verwenden, die normalerweise mit den gewünschten Gensequenzen verknüpft sind, vorausgesetzt, diese Kontroll-Sequenzen sind kompatibel zu den Wirtszellsystemen.In addition, it is also possible and often advisable to use promoter or control sequences normally linked to the desired gene sequences, provided these control sequences are compatible with the host cell systems.
24 6 3124 6 31
Eine Replikationsstelle kann entweder durch entsprechende Vektorkonstruktion vorgesehen werden, um eine exogene Stelle einzubauen, beispielsweise aus SV 40 oder anderen viralen Quellen (z.B. Polyoma, Adeno, VSV, PBV, etc.) oder kann durch die chromosomalen- Replikationsmechanismen der Wirtszelle vorgesehen-werden. Wird der Vektor in das Wirtszellenchromosom integriert, reicht die zuletztgenannte Maßnahme meistens aus.A replication site may either be provided by appropriate vector construction to incorporate an exogenous site, such as SV40 or other viral sources (e.g., polyoma, adeno, VSV, PBV, etc.), or may be provided by the host cell's chromosomal replication mechanisms. If the vector is integrated into the host cell chromosome, the latter measure is usually sufficient.
Die Gene können jedoch vorzugsweise in einem Expressions-.10 Plasmid pERlO3 (E. Rastl-Dworkin et al., Gene 21, 237-248However, the genes may preferably be expressed in an expression plasmid pER103 (E. Rastl-Dworkin et al., Gene 21, 237-248
(1983) und EP-A-O.115-613 - hinterlegt bei der DSM unter der Nummer DSM 2773 am 20. Dezember 1983) exprimiert werden, da dieser Vektor alle Regulationselemente enthält, die zu einer hohen Expressionsrate der klonierten Gene führen. Erfindungsgemäß wurde also in dem 'Plasmid pBR322 das plasmideigene kürzere EcoRI/BamHI-Fragment durch die DNA-Sequenz der Formel(1983) and EP-A-O.115-613 - deposited with the DSM under the number DSM 2773 on December 20, 1983), since this vector contains all regulatory elements which lead to a high expression rate of the cloned genes. According to the invention, therefore, in the plasmid pBR322, the shorter plasmid EcoRI / BamHI fragment was replaced by the DNA sequence of the formula
EcoRI Sau3AEcoRI Sau3A
gaattcacgctGATCGCTAAAACATTGTGCAAAAAGAGGGTTGACTTTGCCTTCGCGA gaattc acgct GATC GCTAAAACATTGTGCAAAAGAGGGTTGACTTTGCCTTCGCGA
imRNÄ-Start MetimRNÄ-Start Met
->0 accagttaactagtacacaagttcacggcaacggtaaggaggtttaagcttaaag atg-> 0 accagttaactagtacacaagttcacggcaacggt aaggagg ttta agct taaag atg
RBS _ Hindlll. Cys AspRBS _ HindIII. Cys Asp
TGT GAT C IFN-omega-Gen > TGT GAT C IFN-omega gene >
Sau3ASau3A
ersetzt.replaced.
Um das erfindungsgemäße Ziel zu erreichen, wird gemäß Abbildung 6 beispielsweise wie folgt verfahren:In order to achieve the object according to the invention, as shown in FIG. 6, the procedure is, for example, as follows:
I. Herstellung der'hierfür erforderlichen einzelnen DNA-Fragmente:I. Preparation of Required Individual DNA Fragments:
- .25 -- .25 -
246 31246 31
Fragment aFragment a
Zur Herstellung des Fragments a) wird ein Plasmid, das ein Gen. für IFN-omega enthält, z.B. das Plasmid P9A2, mit der Restrictionsendonuclease Avail verdaut. Nach Chromatographie und Reinigung des erhaltenen cDNA-rlnser.ts wird dieses mit den Restrictionsendonucleasen Ncol und AIuI zweifach weiterverdaut und anschließend mittels Chromatographie und Elektroelution isoliert. Dieses Fragment enthält den größten Teil des entsprechenden omega-Interferon-Gens. So weist beispielsweise das omega (GIy)-Interferon-Gen des Klons P9A2For the preparation of fragment a), a plasmid containing a gene. for IFN-omega, e.g. the plasmid P9A2, digested with the restriction endonuclease Avail. After chromatography and purification of the resulting cDNA rlnser.ts this is digested with the restriction Endonucleasen Ncol and AIuI two times and then isolated by chromatography and electroelution. This fragment contains most of the corresponding omega interferon gene. For example, the omega (GIy) interferon gene of clone P9A2
folgende Struktur auf: . following structure:.
5 10 155 10 15
His GIy Leu Leu Ser Arg Asn Thr LeuHis GIy Leu Leu Ser Arg Asn Thr Leu
CI CAT GGC CTA CTT AGC AGG AAC ACC TTG Nc ο IC I CAT GG C CTA CTT AGC AGG AAC ACC TTG Nc ο I
20 25 3020 25 30
VaI Leu Leu His Gin Met Arg Arg He Ser Pro Phe Leu Cys Leu GTG CTT CTG CAC CAA ATG AGG AGA ATC TCC CCT TTC TTG TGT CTCVaI Leu Leu His Gin Met Arg Arg He Ser Pro Phe Leu Cys Leu GTG CTT CTG CAC CAA ATG AGG AGA ATC TCC CCT TTC TTG TGT CTC
35 40 4535 40 45
Lys Asp Arg Arg Asp Phe Arg Phe Pro Gin GIu Met VaI Lys GIy AAG GAC AGA AGA GAC TTC AGG TTC CCC CAG GAG ATG GTA AAA GGGLys Asp Arg Arg Asp Phe Arg Phe Pro Gin GIu Met VaI Lys GIy AAG GAC AGA AGA GAC TTC AGG TTC CCC CAG GAG ATG GTA AAA GGG
50 55 6050 55 60
Ser GIn Leu GIn Lys Ala His VaI Met Ser VaI Leu His GIu 'Met AGC CAG TTG CAG AAG GCC CAT GTC ATG TCT GTC CTC CAT GAG ATG 16Ser GIn Leu GIn Lys Ala His VaI Met Ser VaI Leu His GIu 'Met AGC CAG TTG CAG AAG GCC CAT GTC ATG TCT GTC CTC CAT GAG ATG 16
65 70 , 7565 70, 75
Leu Gin Gin He Phe Ser Leu Phe His Thr GIu Arg Ser Ser AIa CTG CAG CAG ATC TTC AGC CTC TTC CAC ACA GAG CGC TCC TCT GCTLeu Gin Gin He Phe Ser Leu Phe His Thr GIu Arg Ser Ser AIa CTG CAG CAG ATC TTC AGC CTC TTC CAC ACA GAG CGC TCC TCT GCT
80 85 ". 9080 85 ". 90
AIa'Trp Asn Met Thr Leu Leu Asp Gin Leu His Thr GIy Leu His GCC TGG AAC ATG ACC CTC CTA GAC CAA CTC CAC ACT GGA CTT CATAIa'Trp Asn Met Thr Leu Leu Asp Gin Leu His Thr GIy Leu His GCC TGG AAC ATG ACC CTC CTA GAC CAA CTC CAC ACT GGA CTT CAT
95 . 100 10595. 100 105
Gin Gin Leu Gin His Leu GIu Thr Cys Leu Leu Gin VaI VaI GIy CAG CAA CTG CAA CAC CTG GAG ACC TGC TTG CTG CAG GTA GTG GGAGin Gin Leu Gin His Lei Giu Thr Cys Leu Leu Gin VaI VaI GIy CAG CAA CTG CAA CAC CTG GAG ACC TGC TTG CTG CAG GTA GTG GGA
. 26 -, 26 -
110 115 120110 115 120
GIu GIy GIu Ser Ala GIy Ala lie Ser Ser Pro Ala Leu Thr Leu GAA GGA GAA TCT GCT GGG GCA ATT AGC AGC CCT GCA CTG ACC TTG 343GIu GIy GIu Ser Ala GIy Ala lie Ser Ser Pro Ala Leu Thr Leu GAA GGA GAA TCT GCT GGG GCA ATT AGC AGC CCT GCA CTG ACC TTG 343
125 · 130 135125 · 130 135
Arg Arg Tyr Phe Gin GIy lie Arg VaI Tyr Leu Lys GIu Lys Lys AGG AGG TAC TTC CAG GGA ATC CGT GTC TAC CTG AAA GAG AAG AAA 388Arg Arg Tyr Phe Gin Gly Arg VaI Tyr Leu Lys GIu Lys Lys AGG AGG TAC TTC CAG GGA ATC CGT GTC TAC CTG AAA GAG AAG AAA 388
Ϊ40 145 15014540 145 150
Tyr Ser Asp Cys AIa Trp GIu VaI VaI Arg Met GIu He Met Lys TAC AGC GAC TGT GCC TGG GAA GTT. GTC AGA.ATG GAA ATC ATG AAA 433Tyr Ser Asp Cys AIa Trp GIu VaI VaI Arg Met GIu He Met Lys TAC AGC GAC TGT GCC TGG GAA GTT. GTC AGA.ATG GAA ATC ATG AAA 433
.10 155 160 165.10 155 160 165
Ser Leu Phe Leu Ser Thr Asn Met Gin GIu Arg Leu Arg Ser Lys TCC TTG TTC TTA TCA ACA AAC ATG CAA GAA AGA CTG-AGA AGT AAA 478Ser Leu Phe Leu Ser Thr Asn Met Gin Giu Arg Leu Arg Ser Lys TCC TTG TTC TTA TCA ACA AAC ATG CAA GAA AGA CTG AGA AGT AAA 478
170 Asp Arg Asp Leu GIy Ser Ser170 Asp Arg Asp Leu GIy Ser Ser
GAT AGA GAC CTG GGC TCA TCT TGAAATGATTCTCATTGATTAATTTGCCATA 530GAT AGA GAC CTG GGC TCA TCT TGAAATGATTCTCATTGATTAATTTGCCATA 530
TAACACTTGCACATGTGACTCTGGTCAATTCAAAAGACTCTTATTTCGGCTTTAATCAC 589TAACACTTGCACATGTGACTCTGGTCAATTCAAAGACTCTTATTTCGGCTTTAATCAC 589
AGAATTGACTGAATTAGTTCTGCAAATACTTTGTCGGTATATTAAGCCAGTATATGTTA 648AGAATTGACTGAATTAGTTCTGCAAATACTTTGTCGGTATATTAAGCCAGTATATGTTA 648
AAAAGACTTAGGTTCAGGGGCATCAGTCCCTAAGATGTTATTTATTTTTACTCATTTAT 707AAAAGACTTAGGTTCAGGGGCATCAGTCCCTAAGATGTTATTTATTTTTACTCATTTAT 707
TTATTCTTACATTTTATCATATTTATACTATTTATATTCTTATATAACAAATGTTTGCC 7 66TTATTCTTACATTTTATCATATTTATACTATTTATATTCTTATATAACAAATGTTTGCC 7 66
TTTACATTGTATTAAGATAACAAAACATGTTCAGbt 802TTTACATTGTATTAAGATAACAAAACATGTTC AGbt 802
• Alul• Alul
Fragment b:Fragment b:
Zur Herstellung des Fragments b) wird das Plasmid P9A2 mit der Restrictionsendonuclease Avail verdaut. Nach Chromatographie und. Reinigung des erhaltenen cDNA-Inserts wirdFor the preparation of fragment b), the plasmid P9A2 is digested with the restriction endonuclease Avail. After chromatography and. Purification of the resulting cDNA insert is
dieses mit der Restrictionsendonuclease Sau3A weiterverdaut und das gewünschte 189bp lange- Fragment mittels Chromatogra-. phie und Elektroelution isoliert. Dieses weist folgende Struktur auf:this with the Restrictionsendonuclease Sau3A further digested and the desired 189bp long fragment using Chromatogra-. phie and electroelution isolated. This has the following structure:
246 31246 31
-" 5 10 15- "5 10 15
Asp Leu Pro Gin Asn His GIy Leu Leu Ser Arg Asn Thr Leu j GATCTG CCT CAG AAC CAT GGC CTA CTT AGC AGG AAC ACC TTGAsp Leu Pro Gin Asn His Glu Leu Leu Ser Arg Asn Thr Leu j GATCTG CCT CAG AAC CAT GGC CTA CTT AGC AGG AAC ACC TTG
Sau3ASau3A
Ncolncol
20 25 3020 25 30
VaI Leu Leu His Gin Met Arg Arg He Ser -Pro Phe Leu Cys Leu GTG CTT CTG CAC CAA ATG AGG AGA ATC TCC CCT TTC TTG TGT CTCVaI Leu Leu His Gin Met Arg Arg He He-Pro Phe Leu Cys Leu GTG CTT CTG CAC CAA ATG AGG AGA ATC TCC CCT TTC TTG TGT CTC
35 40 4535 40 45
Lys Asp Arg Arg Asp Phe Arg Phe Pro Gin GIu Met VaI Lys GIy AAG GAC AGA AGA GAC TTC AGG TTC CCC CAG GAG ATG GTA AAA GGGLys Asp Arg Arg Asp Phe Arg Phe Pro Gin GIu Met VaI Lys GIy AAG GAC AGA AGA GAC TTC AGG TTC CCC CAG GAG ATG GTA AAA GGG
50 55 6050 55 60
Ser GIn Leu GIn Lys Ala His VaI Met Ser VaI Leu His GIu Met ACG CAG TTG CAG AAG GGC CAT GTC ATG TCT GTC CTC CAT GAG ATGSer GIn Leu GIn Lys Ala His VaI Met Ser VaI Leu His GIu Met ACG CAG TTG CAG AAG GGC CAT GTC ATG TCT GTC CTC CAT GAG ATG
Leu Gin Gin HeLeu Gin Gin Hey
CTG CAG CAJq ate .CTG CAG CA Jq ate .
Sau3A|Sau3A |
Fragment cFragment c
Zur Herstellung des Fragments'c) wird das Plasmid pER33 (siehe E. Rastl-Dworkin et al., Gene 2J1, 237-248 (1983) und EP-A-O.115.613) mit den Restrictionsenzymen EcoRI und PvuII zweifach verdaut. Das nach Agarosegel-Fraktionierung und Reinigung erhaltene 389bp lange Fragment, welches den Trp-Promotor, die ribosomale Bindungsstelle und das Startcodon enthält, wird anschließend mit Sau3A verdaut. Das gewünschte 108bp lange Fragment erhält man durch Agarosegel-Elektrophorese, Elektroelution und Elutip-Säulerireinigung. Dieses weist folgende Struktur auf:For the preparation of Fragment'c) the plasmid pER33 (see E. Rastl-Dworkin et al., Gene 2J 1 , 237-248 (1983) and EP-AO.115.613) with the restriction enzyme EcoRI and PvuII digested twice. The 389 bp fragment obtained after agarose gel fractionation and purification, which contains the Trp promoter, the ribosomal binding site and the start codon, is then digested with Sau3A. The desired 108bp fragment is obtained by agarose gel electrophoresis, electroelution and Elutip acid purification. This has the following structure:
- 28 - 24 6- 28 - 24 6
EcoRI |Sau3AEcoRI | Sau3A
gaattcacgctJGATCGCTAAAACATTGTGCAAAAAGAGGGTTGACTTTGCCTTCGCGA ' 59 gaattca cgct JGATC GCTAAAACATTGTGCAAAAGAGGGTTGACTTTGCCTTCGCGA '59
JmRNA-Start . ·.· MetJmRNA start. · · · Met
ACCAGTTAACTAGTACACAAGTTCACGGCAACGGTAAGGAGGTTTAAGCTTAAAG ATG .5 RBS HindIIIACCAGTTAACTAGTACACAAGTTCACGGCAACGGT AAGGAGG TTT AAGCTTA AAG ATG .5 RBS HindIII
Cys AspCys Asp
TGT gat c .-.·- -TGT gat c .-. · - -
Sau3ASau3A
. 10 Die Fragmente b und c werden mit T4-Ligase ligiert und- nach, 10 Fragments b and c are ligated and ligated with T4 ligase
Zerstörung des Enzyms mit HindIII geschnitten. Dieses ligierte Fragment weist folgende Struktur auf:Destruction of the enzyme cut with HindIII. This ligated fragment has the following structure:
HindIII Sau3A NcolHindIII Sau3A Ncol
aJAGCTTAAAG ATGTGTGATC TGCCTCAGAA CCATGGCCTA CTTAGCAGGA ' 50a JAGCT TAAAG ATGTGTGATC TGCCTCAGAA CCATGGC CTA CTTAGCAGGA '50
ACACCTTGGT GCTTCTGCAC CAAATGAGGA GAATCTCCCC TTTCTTGTGT 100 CTCAAGGACA GAAGAGACTT CAGGTTCCCC CAGGAGATGG TAAAAGGGAG 150 CCAGTTGCAG AAGGCCCATG TCATGTCTGT CCTCCATGAG ATGCTGCAGC 200ACACCTTGGT GCTTCTGCAC CAAATGAGGA GAATCTCCCC TTTCTTGTGT 100 CTCAAGGACA GAAGAGACTT CAGGTTCCCC CAGGAGATGG TAAAAGGGAG 150 CCAGTTGCAG AAGGCCCATG TCATGTCTGT CCTCCATGAG ATGCTGCAGC 200
AGATCACACA TCTTTAjagct t Sau3A Hindlll!A GATCA CACA TCTTTA chases t Sau3A Hindlll!
Alternativ kann dieses für die Herstellung des PlasmidsAlternatively, this may be for the preparation of the plasmid
pRHWlO notwendige DNA-Fragment auch durch die Verwendung von zwei synthetisch hergestellten Oligonukleotiden erzeugt werden:pRHWlO necessary DNA fragment can also be generated by the use of two synthetically produced oligonucleotides:
- 29 - 24ö 3 1- 29 - 24ö 3 1
Das Oligonukleotid der FormelThe oligonucleotide of the formula
5'-AGCTTAAAGATGTGt-S' . bleibt an seinem 5'-Ende dephosphoryliert.5'-AGCTTAAAGATGTGt-S '. remains dephosphorylated at its 5 'end.
Das Oligonukleotid der Formel 5'-GATCACACATCTTTA-S'The oligonucleotide of the formula 5'-GATCACACATCTTTA-S '
wird mittels der T.-Polynukleotidkinase und ATP am 5'-Ende kinasiert^is kinased by T. polynucleotide kinase and ATP at the 5'-end ^
Beim Hybridisieren beider Oligonukleotide erhält man folgendes kurzes DNA-Fragment:When hybridizing both oligonucleotides, the following short DNA fragment is obtained:
5'-AGCTTAAAGATGTGt 3'5'-AGCTTAAAGATGTGt 3 '
3'- ÄTTTCTACACACTAGp . 5'3'-ATCTACACACTAGp. 5 '
Es entsteht dadurch an einem Ende der für Hindlll typische 5'-Überhang und am anderen Ende der für Sau3A typische 5'-Überhang.This results in one end of the typical Hindlll 5'-overhang and at the other end of the typical Sau3A 5'-overhang.
Das Fragment b) wird unter Verwendung von Kalbsdarmphosphatase dephosphoryliert. Fragment b) und das oben beschriebene Fragment werden zusammengebracht und mittels T.-Ligase miteinander verbunden.Fragment b) is dephosphorylated using calf intestinal phosphatase. Fragment b) and the fragment described above are brought together and ligated together by T. ligase.
Da die Ligase mindestens ein 5'-Phosphat-hältiges Ende benötigt > können nur das synthetische DNA-Stück mit Fragment b) 'oder aber 2 synthetische Fragmente an ihren Sau3A-Enden verknüpft werden. Da sich die beiden resultierenden Fragmente in ihrer Länge unterscheiden, können sie durch selektive Isopropan-olfällung getrennt werden. Das so gereinigte Fragment wird mittels T.-Polynukleotidkinase und ATP phosphoryliert.Since the ligase requires at least one 5'-phosphate-containing end> only the synthetic DNA piece can be linked to fragment b) 'or else 2 synthetic fragments at their Sau3A ends. Since the two resulting fragments differ in length, they can be separated by selective isopropane precipitation. The thus purified fragment is phosphorylated by T. polynucleotide kinase and ATP.
II. Herstellung der Expressionsplasmide a) Herstellung des Plasmids pRHWIO: II. Preparation of the expression plasmids a) Preparation of the plasmid pRHWIO:
Man linearisiert das Expressionsplasmid pERlO3 (E. Rastl-Dworkin et al., Gene _21, 237-284 (1983) und EP-A-0.115.613 hinterlegt bei der DSM unter der DSM-Nummer 2773) mit Hindlll und behandelt anschließend mit Kalbsdarmphosphatase. Nach Isolierung und Reinigung der so erhaltenen DNA wird diese dephosphoryliert und anschließend mit ligierten Fragmenten b und c (nach deren Hindlll-Verdauung) ligiert. Anschließend wird E. coli HB 101 mit der erhaltenen Ligierungsmischung transformiert und auf LB-Agar plus 50 μg/ml Ampicillin kultiviert. Das die gewünschte Struktur aufweisende Plasmid erhielt die Bezeichnung pRHW 10 (siehe Abbildung 6), welches nach seiner Replication als Zwischenprodukt zur Herstellung von weiteren Plasmiden diente.The expression plasmid pER103 (E. Rastl-Dworkin et al., Gene 21, 237-284 (1983) and EP-A-0.115.613 deposited with the DSM under DSM number 2773) is linearized with HindIII and then treated with calf intestinal phosphatase , After isolation and purification of the DNA thus obtained, it is dephosphorylated and then ligated with ligated fragments b and c (after their HindIII digestion). Subsequently, E. coli HB 101 is transformed with the resulting ligation mixture and cultured on LB agar plus 50 μg / ml ampicillin. The plasmid containing the desired structure was named pRHW 10 (see FIG. 6), which after its replication served as an intermediate for the preparation of further plasmids.
bj Herstellung des Plasmids pRHWl2:bj Preparation of the plasmid pRHW12:
Zu dem mit BamHI geschnittenem Plasmid pRHWIO gibt man das Klenow-Fragment der DNA-Polymerase I und die 4 Deoxynucleosidtr!phosphate. Das nach Inkubation erhaltene linearisierte, mit stumpfen Enden versehene Plasmid wird gereinigt und anschließend mit Ncol geschnitten. Das größere Fragment, welches mittels Agarosegel-Elektrophorese, Elektroelution und Elutip-Reinigung gewonnen wird, wird mit dem Fragment a Iigiert. Anschließend wird die Ligierungsmischung mit E. coli HB 101 transformiert und auf LB-Agar plus 50 μg/ml Ampicillin kultiviert. Das die gewünschte Struktur aufweisende Plasmid erhielt die Bezeichnung pRHWl2 (siehe Abbildung 6), welches das gewünschte omega (GIy)-Interferon exprimiert.To the cut with BamHI plasmid pRHWIO are added the Klenow fragment of DNA polymerase I and the 4 Deoxynucleosidtr! Phosphates. The obtained after incubation linearized, blunt ends provided w ith plasmid is purified and then cut with NcoI. The larger fragment, which is recovered by agarose gel electrophoresis, electroelution and Elutip purification, is ligated with fragment a. Subsequently, the ligation mixture is transformed with E. coli HB 101 and cultured on LB agar plus 50 μg / ml ampicillin. The desired structure-containing plasmid was named pRHW12 (see Figure 6), which expresses the desired omega (Gly) interferon.
Beispielsweise enthält 1 1 der so erhaltenen Bakterienkultur (optische Dichte: 0,6 beFor example, contains 1 1 of the resulting bacterial culture (optical density: 0.6 be
Einheiten an Interferon. Units of interferon.
(optische Dichte: 0,6 bei 600 nm) 1 χ 10 Internationale(optical density: 0.6 at 600 nm) 1 χ 10 International
24ö 31 824ö 31 8
. c) Herstellung des Plasmids pRHWll:, c) Preparation of the plasmid pRHWII:
Zu dem mit BarnHI geschnittenem Plasmid pRHWlO gibt man das Klenow-Fragment der DNA-Pοlymerase I und,die 4 Desoxynucleosidtriphosphate.· Das nach-Inkubation erhaltene linearisierte, mit geraden Enden versehene Plasmid wird gereinigt und anschließend mit Ncol geschnitten. Das größere Fragment, welches mittels^ Agarosegel-Elektrophorese, Elektro.elution und Elutip-Reinigung gewonnen wird, wird mit dem aus dem Plasmid E79E9 analog gewonnenem Fragment a, in welchem Ie-To the BarnHI-cut plasmid pRHW10 is added the Klenow fragment of DNA polymerase I and the 4 deoxynucleoside triphosphates. The linearized, straight-ended plasmid obtained after incubation is purified and then cut with NcoI. The larger fragment, which is obtained by means of agarose gel electrophoresis, electro-elution and Elutip purification, is incubated with the fragment a obtained analogously from the plasmid E79E9, in which
"10 diglich das für die 111. Aminosäure (GIy) codierende GGG-Codon durch das GAG-Codon (GIu) ersetzt ist, ligiert. Anschließend wird die erhaltene Ligierungsmischung mit E. coli HB 101 transformiert und auf LB-Agar kultiviert. Das die gewünschte Struktur aufweisende Plasmid erhielt die Bezeich-· nung pRHWll (siehe analog Abbildung 6), welches das gewünschte omega (GIu)-Interferon exprimiert.Once the GGG codon coding for the 111th amino acid (GIy) has been replaced by the GAG codon (Glu), the ligation mixture obtained is then transformed with E. coli HB 101 and cultivated on LB agar desired structure having plasmid received the name pRHWll (see Figure 6 analogous), which expresses the desired omega (Glu) interferon.
Transformation der- Zellen mit den Vehikeln kann durch eine Vielzahl an Verfahren erreicht werden. Beispielsweise kann sie. durch Kalzium erfolgen., wobei entweder die Zellen in Magnesium gewaschen und die DNA den in Kalzium suspendierten Zellen zugegeben oder die Zellen einem Kopräzipitat von DNA und Kalziumphosphat ausgesetzt werden. Bei nachfolgender Genexpression werden die Zellen auf Medien übertragen, die für transformierte Zellen selektieren'.Transformation of the cells with the vehicles can be achieved by a variety of methods. For example, she can. calcium, either by washing the cells in magnesium and adding the DNA to the calcium suspended cells or exposing the cells to a coprecipitate of DNA and calcium phosphate. Upon subsequent gene expression, the cells are transferred to media which selects for transformed cells.
Nach erfolgter Transformation des Wirtes, Expression des Gens und Fermentation oder Zellkultivierung unter Bedingungen, bei denen iFN-omega exprimiert wird, kann das Produkt üblicherweise durch bekannte chromatographische Trennmethoden extrahiert werden, um so ein Material zu erhalten, das IFN-omega mit oder ohne Leader und Tailing-Sequenzen enthält. IFN-omega kann mit einer Leader-Sequenz am N-Terminus exprimiert werden (Pre-IFN-omega), die von einigen Wirts-After host transformation, expression of the gene, and fermentation or cell culture under conditions where iFN-omega is expressed, the product can usually be extracted by known chromatographic separation techniques to yield a material containing IFN-omega with or without a leader and includes tailing sequences. IFN-omega can be expressed with a leader sequence at the N-terminus (Pre-IFN-omega), which may be expressed by some host
zellen entfernt werden kann. Wenn nicht, so ist eine Abspaltung des Leader-Polypeptids (wenn vorhanden) erforderlich, um reifes IFN-omega zu erhalten. Alternativ kann der IFN-omega Klon so modifiziert werden, daß das reife Protein im Mikroorganismus direkt statt des Pre-IFN-pmega produziert wird. .Für diesen Fall kann die Precursor-Sequenz des Hefe-Mating-Pheromons MF-alpha-1 verwendet werden, um eine korrekte "Reifung" des fusionierten Proteins und die Ausscheidung der Produkte in das Wachstumsmedium-oder den 10^ periplasmischen Raum zu gewährleisten. Die DNA-Sequenz für funktionelles oder reifes IFN-omega kann mit MF-alpha-1 an der vermuteten Kathepsin-ähnlichen Schnittstelle (nach Lys-Arg) an Position 256 vom Initiationscodon ATG aus (Kurjan, Herskowitz, Cell 3_0_, 933-943 (1982)) verbunden sein,cells can be removed. If not, cleavage of the leader polypeptide (if present) is required to obtain mature IFN-omega. Alternatively, the IFN-omega clone can be modified so that the mature protein is produced in the microorganism directly instead of the pre-IFN-pmega. In this case, the precursor sequence of the yeast mating pheromone MF-alpha-1 can be used to ensure correct "maturation" of the fused protein and excretion of the products into the growth medium or periplasmic space. The DNA sequence for functional or mature IFN-omega can be labeled with MF-alpha-1 at the putative cathepsin-like (Lys-Arg) interface at position 256 from the ATG initiation codon (Kurjan, Herskowitz, Cell 3_0_, 933-943 ( 1982)),
Basierend auf ihrem biologischen Wirkungsspektrum sind die neuen, erfindungsgemäßen Interferone verwendbar für jede Art der Behandlung für die auch die bekannten Interferone eingesetzt werden. Diese beinhalten beispielsweise Herpes, Rhinovirus, opportunistische AIDS-Infektionen, verschiedene Krebsarten und ähnliches. Die neuen Interferone können alleine oder' in Kombination mit anderen bekannten Interferonen oder biologisch aktiven Produkten eingesetzt werden, beispielsweise mit IFN-alpha, IL-2, anderen Immun-Modulatoren und ähnlichen.Based on their biological spectrum of action, the novel interferons according to the invention can be used for any type of treatment for which the known interferons are also used. These include, for example, herpes, rhinovirus, opportunistic AIDS infections, various cancers and the like. The novel interferons may be used alone or in combination with other known interferons or biologically active products, for example IFN-alpha, IL-2, other immunomodulators and the like.
IFN-omega kann parenteral verabreicht werden in Fällen, in denen Antitumor oder antivirale Behandlung erforderlich ist und in Fällen, in denen sich immunosuppressive Eigenschaften zeigen. Dosierung und Dosierungsrate können ähnlich denen sein, die zur Zeit bei klinischen Untersuchungen fur iFN-a-Materialien gelten z.B. ca. (1-10) χ '10 Einheiten täglich und bei Präparaten, die zu mehr als 1 % rein sind, bis zu beispielsweise 5 χ 10 Einheiten täglich.IFN-omega may be administered parenterally in cases where antitumor or antiviral treatment is required and in cases where immunosuppressive properties are demonstrated. Dosage and dosage rates may be similar to those currently in clinical trials for iFN-a materials, e.g. approx. (1-10) χ '10 units daily and for preparations that are more than 1% pure, up to, for example, 5 χ 10 units daily.
246 31246 31
Beispielsweise können für eine zweckmäßige Dosieningsform bei einem im wesentlichen homogenen, bakteriell produzierten IFN-omega, bei parenteraler Verwendung 3 mg IFN-omega in 25 ml 5 %igem menschlichem Serum Albumin gelöst werden· Diese Lösung wird dann durch ein bakteriologisches Filter gegeben und die gefilterte Lösung aseptisch auf 100 Fläschchen verteilt, von dem jedes 6 χ 10 Einheiten reines IFN-omega zur parenteralen Applikation geeignet, enthält. Die Gläschen werden vor Verwendung vorzugsweise in der Kälte (-20 0C) aufbewahrt· Die erfindungsgemäßen Substanzen können in bekannter Weise formuliert werden, um pharmazeutisch verwendbare Mittel zu erhalten, wobei das erfindungsgemäße Polypeptid mit einer pharmazeutischen, akzeptablen Trägersubstanz vermischt wird· Gebräuchliche Trägerstoffe und ihre Formulierung sind bei E.- W. Martin in Remingtom's Pharmaceutical Sciences beschrieben, worauf ausdrücklich Bezug genommen wird. IFN-omega wird mit einer angemessenen Menge des Trägerstoffes vermischt, um geeignete pharmazeutische Mittel zu schaffen, die für eine effektive Anwendung beim Empfänger (Patienten) geeignet sind. Bevorzugt wird eine parenterale Applikation vorgenommen.For example, for a convenient dosage form with a substantially homogeneous, bacterially produced IFN-omega, 3 mg IFN-omega may be dissolved in 25 ml of 5% human serum albumin when used parenterally. This solution is then passed through a bacteriological filter and filtered Dissolve the solution aseptically on 100 vials, each containing 6 χ 10 units of pure IFN-omega suitable for parenteral administration. The vials are preferably stored in the cold (-20 0 C) before use · The substances according to the invention may be formulated in known manner to obtain pharmaceutically acceptable agent, wherein the polypeptide of the invention is mixed with a pharmaceutical acceptable carrier · Common carriers and their formulation is described by E.W. Martin in Remington's Pharmaceutical Sciences, to which reference is expressly made. IFN-omega is mixed with an appropriate amount of the excipient to provide suitable pharmaceutical agents suitable for effective use in the recipient (patient). Preferably, a parenteral administration is carried out.
Die folgenden Beispiele, die die Erfindung nicht eingrenzen sollen, beschreiben die Erfindung im Detail.The following examples, which are not intended to limit the invention, describe the invention in detail.
a) Herstellung der cDNA-Bibliothek a) Preparation of the cDNA library
mRNA aus Sendai-Virus-stimulierten Zellen wird als Ausgangs-. 5 material zur Herstellung einer cDNA-Bibliothek nach literaturbekannten Methoden verwendet- (E. Dworkin-Rastl et al., Journal of Interferon Research VoI 2/4, 575-585 (1982)). DiemRNA from Sendai virus-stimulated cells is used as the source. 5 used to prepare a cDNA library according to methods known from the literature (E. Dworkin-Rastl et al., Journal of Interferon Research VoI 2/4, 575-585 (1982)). The
angefallenen 30.000 Klone werden individuell in die Näpfe von Mikrotiterplatten übertragen. Folgendes Medium wird zum Wachstum und Einfrieren der Kolonien verwendet:accumulated 30,000 clones are transferred individually in the wells of microtiter plates. The following medium is used to grow and freeze the colonies:
adad
Die Mikrotiterplatten mit den individuellen Klonen werden über Nacht bei 37°C inkubiert und danach bei -700C aufbewahrt.The microtiter plates with the individual clones are incubated overnight at 37 ° C and then stored at -70 0 C.
b) Hybridisierungsprobe . ·b) hybridization probe . ·
Als Ausgangsmaterial für die Hybridisierungsprobe dient das rekombinante Plasmid pER33 (E. Dworkin-Rastl et al., Gene 21, 237-248 (1983)). Dieses Plasmid enthält die kodierendeThe starting material for the hybridization probe is the recombinant plasmid pER33 (E. Dworkin-Rastl et al., Gene 21, 237-248 (1983)). This plasmid contains the coding
24 6 31 24 6 31
Region für das reife Interferon IFN-a2arg plus 190 Basen der 3' nichttranslatierten Region. 20 μg p'ER33 werden mit 30 Einheiten Hindlll Restriktionsendonuklease in 200 μΐ Reaktionslösung (10 mM Tris-HCl pH-7,5, 10 mM MgCl2, 1 mM Dithiotreitol (DTT), 50 mM NaCl) 1 Stunde bei 370C inkubiert. Die Reaktion wird durch Zusatz von-1/25 vol 0,5 M Äthylendinitrilotetraessigsäure (EDTA) und Erhitzen auf 7O0C für 10 Minuten beendet. Nach Zusatz von 1/4 vol 5 χ Puffer (80 % Glyzerin, 40 mM Tris-Essigsäure pH=7,8, 50 mM EDTA, o.,O5 % Natriumdo.decylsulfat (SDS), 0,1 % Bromphenolblau) werden die entstandenen Fragmente der Größe nach elektropho-• retisch' in einem 1 % Agarosegel getrennt [Gel- und Laufpuffer" (TBE): 10,8 g/l Trishydroxymethylaminomethan (TrisBase), 5,5 g/l Borsäure, 0,93 g/l EDTA]. Nach Inkubation des Gels in einer 0,5 μg/ml Ethidiumbromidlösung werden die DNA-Banden im UV-Licht sichtbar gemacht, und der Gelbereich, der das IFN-Gen-hältige DNA Stück (ca. 800 bp lang) enthält, ausgeschnitten. Durch Anlegen einer Spannung wird die DNA in 1/10 χ TBE-Puffer elektroeluiert. Die DNA Lösung wird einmal mit Phenol und viermal mit Äther extrahiert und die DNA durch Zusatz von 1/10 vol 3 M Natriumacetat (NaAc) pH-5,8 und 2,5 vol EtOH aus der wäßrigen Lösung bei -200C präzipitiert. Nach dem Abzentrifugieren wird die DNA einmal mit 70 % Äthanol gewaschen und 5 Minuten im Vakuum getrocknet. Die DNA wird in 50 μΐ Wasser aufgenommen (ca. 50μg/μl). Diese DNA wird durch Nicktranslation (modifiziert nach T. Maniatis et al., Molecular Cloning, ed. CSH) radioaktiv markiert. 50 μΐ Inkubationslösung enthalten: 50 mM Tris pH=7,8, 5 mM MgCl2, 10 mM Mercaptoäthanol, 100 ng Insert-DNA von pER33, 16 pg DNasel, 25 μΜοΙ dATP, 25 μΜοΓ dGTP, 25 μΜοΙ dTTP, 20 μα a32P-dCTP (> 3000 Ci/mMol) sowie 3 units DNA-Polymerase I (E.coli). Die Inkubation erfolgte bei 140C für 45 Minuten. Die Reaktion wird durch Zusatz von 1 vol 50 mM EDTA, 2 % SDS, 10 mM Tris pH=7,6 Lösung und Erhitzen auf 7O0C für 10 Minuten beendet. Die DNA wird durch Chromatogra-Region for the mature interferon IFN-a2arg plus 190 bases of the 3 'untranslated region. 20 μg p'ER33 are incubated with 30 units HindIII restriction endonuclease in 200 μΐ reaction solution (10 mM Tris-HCl pH-7.5, 10 mM MgCl 2 , 1 mM dithiothreitol (DTT), 50 mM NaCl) for 1 hour at 37 0 C. , The reaction is terminated by the addition of-1/25 volume of 0.5 M Äthylendinitrilotetraessigsäure (EDTA) and heating to 7O 0 C for 10 minutes. After addition of 1/4 vol 5 χ buffer (80% glycerol, 40 mM Tris-acetic acid pH = 7.8, 50 mM EDTA, o., O5% Natriumdo.decylsulfat (SDS), 0.1% Bromophenol Blue) are the The resulting fragments were size-separated electrophoretically in a 1% agarose gel [gel and running buffer "(TBE): 10.8 g / l tris-hydroxymethylaminomethane (TrisBase), 5.5 g / l boric acid, 0.93 g / l EDTA] After incubation of the gel in a 0.5 μg / ml ethidium bromide solution, the DNA bands are visualized in UV light and the gel area containing the IFN gene-containing DNA piece (about 800 bp in length) By applying a voltage, the DNA is electroeluted in 1/10 χ TBE buffer The DNA solution is extracted once with phenol and four times with ether and the DNA by addition of 1/10 vol 3 M sodium acetate (NaAc) pH- 5.8 and 2.5 vol of EtOH from the aqueous solution at -20 0 C precipitated. After centrifugation, the DNA is washed once with 70% ethanol and dried for 5 minutes in a vacuum. D The DNA is taken up in 50 μΐ of water (approx. 50 ug / ul). This DNA is radiolabeled by nick translation (modified according to T. Maniatis et al., Molecular Cloning, ed. CSH). 50 μΐ incubation solution contains: 50 mM Tris pH = 7.8, 5 mM MgCl 2 , 10 mM mercaptoethanol, 100 ng pER33 insert DNA, 16 pg DNasel, 25 μM dATP, 25 μM dGTP, 25 μM dTTP, 20 μα a 32 P-dCTP (> 3000 Ci / mmol) and 3 units of DNA polymerase I ( E. coli) . The incubation was carried out at 14 0 C for 45 minutes. The reaction is stopped 7.6 solution and heating at 7O 0 C for 10 minutes by addition of 1 vol of 50 mM EDTA, 2% SDS, 10 mM Tris pH =. The DNA is separated by chromatogra-
246 31246 31
' phie über Sephadex G-IOO in TE-puffer (10 mM Tr is pH=8,0, 1 mM EDTA) von nicht eingebauter Radioaktivität getrennt. Die radioaktiv markierte Probe weist eine spezifische Aktivität von ca. 4 χ 10 cpm/]ig auf.phie over Sephadex G-IOO in TE buffer (10 mM Tris pH = 8.0, 1 mM EDTA) of unincorporated radioactivity. The radioactively labeled sample has a specific activity of about 4 × 10 cpm.
5. c) Screening der Klone auf JFN-Gen-haltige Inserts 5.c) Screening of clones for JFN gene-containing inserts
Die in den Mikrotiterplatten eingefrorenen Bakterienkulturen werden aufgetaut (a). Ein Stück Nitrozellulosefilter der entsprechenden Größe (Schleicher und Schüll, BA 85/ 0,45 μΐη Porengröße) wird auf LB-Agar aufgelegt (LB-Agar: 10 g/l Trypton, 5 g/l Yeast Extrakt, 5 g/l NaCl, 15.g/l Bacto Agar, 20 mg/1 Tetracyclin-HCl). Mit einem den Mikrotiterplatten angepaßten Stempel werden die individuellen Klone auf das Nitrozellulosefilter übertragen. Die Bakterien wachsen über Nacht bei 37°C zu etwa.5 mm Durchmesser großen Kolonien. Zum Zerstören der Bakterien und Denaturieren der DNA werden die Nitrozellulosefilter der Reihe nach auf einen Stapel mit folgenden Lösungen getränkte Whatman 3MM Filter gelegt: 1) 8 Minuten auf 0,5 M NaOH, 2) 2 Minuten 1 M Tris pH=7,4, 3) 2 Minuten 1 M Tris pH=7,4 und 4) 4 Minuten 1,5 M NaCl, 0,5 M Tris pH=7,4. Die Filter werden'luftgetrocknet und "dann 2 Stunden bei 800C gehalten. Die Vorbehandlung der Filter erfolgte 4 Stunden bei 650C in der Hybridisierlösung, bestehend aus 6 χ SSC (1 χ SSC entspricht 0,15 M NaCl; 0,015 M Trinatriumcitrat; pH=7,0), 5 χ Denhardt's Lösung (Ix Denhardt's Lösung entspricht 0,02 % PVP (Polyvinylpyrrolidon); 0,02 % Ficoll (MG: 40.000 D); 0,02 % BSM (Bovine Serum Albumine) und 0,1 % SDS (Sodium dodecylsulfate). Ca 1 χ ΙΟ6 cpm pro Filter der in b) hergestellten Probe werden durch Kochen denaturiert und der Hybridisierlösung zugesetzt. Hybridisierung erfolgt 16 Stunden bei 65°C. Das Waschen der Filter erfolgt bei 65°C viermal 1 Stunde mit 3 χ SSC/0,1 % SDS. Die Filter werden luftgetrocknet, mit Saran Wrap bedeckt und auf Kodak X-OmatS Film exponiert.The bacterial cultures frozen in the microtiter plates are thawed (a). A piece of nitrocellulose filter of the appropriate size (Schleicher and Schüll, BA 85 / 0.45 μΐη pore size) is placed on LB agar (LB agar: 10 g / l tryptone, 5 g / l yeast extract, 5 g / l NaCl, 15.g / l Bacto agar, 20 mg / l tetracycline HCl). With a stamp adapted to the microtiter plates, the individual clones are transferred to the nitrocellulose filter. The bacteria grow overnight at 37 ° C to approximately 5 mm diameter colonies. To destroy the bacteria and denature the DNA, place the nitrocellulose filters sequentially in a stack of Whatman 3MM filters soaked in the following solutions: 1) 8 minutes to 0.5 M NaOH, 2) 1 minute Tris pH = 7.4 3) 2 minutes 1 M Tris pH = 7.4 and 4) 4 minutes 1.5 M NaCl, 0.5 M Tris pH = 7.4. . The filters werden'luftgetrocknet and then "held 2 hours at 80 0 C. The pretreatment of the filter was carried out for 4 hours at 65 0 C in the hybridization solution consisting of 6 χ SSC (1 SSC χ corresponds to 0.15 M NaCl, 0.015 M trisodium citrate Denhardt's solution (Ix Denhardt's solution corresponds to 0.02% PVP (polyvinylpyrrolidone), 0.02% Ficoll (MW: 40,000 D), 0.02% BSM (bovine serum albumins) and 0 , 1% SDS (sodium dodecylsulfate) Ca 1 χ ΙΟ 6 cpm per filter of the sample prepared in b) are denatured by boiling and added to the hybridization solution Hybridization is carried out for 16 hours at 65 ° C. The filters are washed at 65 ° C. four times 1 hour with 3 χ SSC / 0.1% SDS The filters are air dried, covered with Saran Wrap and exposed on Kodak X-OmatS film.
" 37 - 246 31" 37 - 246 31
Southern Transfer zur Bestätigung von IFN-Gen-haltigen rekombinanten Plasmiden Southern transfer confirming IFN gene-containing recombinant plasmids
Von den positiv öder positiv verdächtig reagierenden KoIo- nien werden 5 ml Kulturen in L-Broth (10 g/l Trypton, 5 g/l Yeast Extract, 5 g/l NaCl, 20 mg/1 Tetracyclin χ HCl) über Nacht bei 37°C gezüchtet. Die Plasmid-DNA wird modifiziert nach Birnbo.im und DoIy (Nucl. Acid Res. "]_, 1513, (1979)) isoliert. Die Zellen von 1,5 ml Suspension werden abzentri-Of the positive or suspect positive cells, 5 ml cultures in L-Broth (10 g / l tryptone, 5 g / l yeast extract, 5 g / l NaCl, 20 mg / l tetracycline χ HCl) overnight at 37 ° C bred. The plasmid DNA is modified according to Birnbo.im and DoIy (Nucl. Acid Res. "], 1513, (1979) isolated.) The cells of 1.5 ml of suspension are centrifuged off.
'10 fugiert ^Eppendorf Zentrifuge) und bei O0C in 100 μΐ Lyso-. zymlösung bestehend aus 50 mM Glucose, 10 mM EDTA, 25 mM Tris-HCl pH=8,0 und 4 mg/ml Lysozym resuspendiert. Nach 5 Minuten.Inkubation bei Raumtemperatur werden 2 Volumteile eiskalter 0,2 M NaOH, 1 % SDS Lösung zugegeben und weitere 5 Minuten inkubiert. Dann werden 150 μΐ eiskalte Kaliumacetatlösung pH=-4,8 zugesetzt und 5 Minuten inkubiert. Die ausgefallenen Zellbestandteile werden abzentrifugiert. Die DNA-Lösung wird mit 1 Volumteil Phenol/CHCln (1:1) extrahiert und die DNA durch Zugabe von 2 Volumteilen Äthanol ausgefällt. Nach dem Abzentrifuieren wird das Pellet einmal mit 70 % Ethanol gewaschen und 5 Minuten im Vakuum getrocknet. Die DNA wird in 50 μί (TE)-Puffer gelöst. 10 μΐ davon werden in 50 μΐ Reaktionslösung (10 mM Tris-HCl pH=7,5, 10 mM MgCl2, 50 mM NaCl, 1 mM DTT) mit 10 Ein-'10 ffers Eppendorf centrifuge) and at 0 0 C in 100 μΐ Lyso-. zymlösung consisting of 50 mM glucose, 10 mM EDTA, 25 mM Tris-HCl pH = 8.0 and 4 mg / ml lysozyme resuspended. After 5 minutes incubation at room temperature, 2 volumes of ice cold 0.2 M NaOH, 1% SDS solution are added and incubated for a further 5 minutes. Then 150 .mu.l of ice-cold potassium acetate solution pH = -4.8 are added and incubated for 5 minutes. The precipitated cell components are centrifuged off. Extract the DNA solution with 1 volume of phenol / CHCln (1: 1) and precipitate the DNA by adding 2 volumes of ethanol. After centrifuging, the pellet is washed once with 70% ethanol and dried in vacuo for 5 minutes. The DNA is dissolved in 50 μί (TE) buffer. 10 μΐ thereof are dissolved in 50 μΐ reaction solution (10 mM Tris-HCl pH = 7.5, 10 mM MgCl 2 , 50 mM NaCl, 1 mM DTT) with 10 μl
heiten Pstl-Restrlktionsendonuklease 1 Stunde bei 37°C verdaut. Nach Zusatz von 1/25 Volumteilen 0,5 M EDTA sowie 1/4 Volumteilen 5 χ Puffer (siehe Beispiel Ib)) wird 10 Minuten bei 700C erhitzt und die DNA anschließend in einem 1% Agarosegel (TBE-puffer) elektrophoretisch aufgetrennt. Die DNA im Agarosegel wird nach der Methode von Southern (E.M. Southern, J. Mol. Biol. 9£, 503-517 (1975)) auf ein Nitrozellulosefilter übertragen. Die DNA im Gel w.ird durch einstündige Inkubation des Gels mit einer 1,5 M NaCl/0,5 M NaOH Lösung denaturiert. Anschließend wird 1 Stunde mit einer χ M Tris χ HCl pH=8/l,5 M NaCL Lösung neutralisiert. Die DNApstl Restrlktionsendonuklease for 1 hour at 37 ° C digested. After addition of 1/25 volume of 0.5 M EDTA and 1/4 volume of 5 χ buffer (see Example Ib)) is heated for 10 minutes at 70 0 C and then the DNA in a 1% agarose gel (TBE buffer) separated by electrophoresis , The DNA in the agarose gel is transferred to a nitrocellulose filter by the method of Southern (EM Southern, J. Mol. Biol. 9, 503-517 (1975)). The DNA in the gel is denatured by incubation of the gel with a 1.5 M NaCl / 0.5 M NaOH solution for one hour. Then, about 1 hour with a χ χ M Tris HCl pH = 8 / l, NaCl 5 M solution neutralized. The DNA
246 31246 31
wird mit 10 χ SSC (1,5 M NaCl, 0,15 M Natriumeitrat, pH=7,0) auf das Nitrozellulosefilter übertragen. Nach vollendetem Transfer (ca. 16 Stunden) wird das Filter kurz in 6 χ SSC Puffer gespült, dann luftgetrocknet und abschließend 2 Stunden bei 800C gebacken. Das Filter wird 4 Stunden mit einer χ SSC/5 χ Denhardt's Lösung/0,1 % SDS (siehe Beispiel Ic), bei 650C vorbehandelt. Ca. 2 x.10 cpm der Hybridisierungsprobe (siehe Beispiel Ib) werden durch Erhitzen auf 1000C denaturiert und anschließend in die Hybridisierlösung eingebracht. Die Hybridisierdauer beträgt 16 Stunden bei 650C. Anschließend wird das Filter 4x1 Stunde, bei .650C mit einer 3 χ SSC/0,1 % SDS-Lösung gewaschen. Nach dem Lufttrocknen wird das Filter mit Saran Wrap bedeckt und auf Kodak X-OmatS Film exponiert.is transferred to the nitrocellulose filter with 10 χ SSC (1.5 M NaCl, 0.15 M sodium citrate, pH = 7.0). After completion of the transfer (about 16 hours), the filter is rinsed briefly in 6 χ SSC buffer, then air-dried and finally baked at 80 0 C for 2 hours. The filter is pretreated for 4 hours with a χ SSC / 5 χ Denhardt's solution / 0.1% SDS (see Example Ic) at 65 ° C. Approximately 2 x.10 cpm the hybridization probe (see Example Ib) are introduced by heating to 100 0 C, and then denatured in the hybridization solution. The hybridization time is 16 hours at 65 ° C. Subsequently, the filter is washed for 4 × 1 hour at .65 ° C. with a 3 × SSC / 0.1% SDS solution. After air drying, the filter is covered with Saran Wrap and exposed to Kodak X-OmatS film.
Eine 100 ml Kultur des Klons E76E9 wird in L-Broth (10 g/l Trypton, 5 g/l Yeast Extract, 5 g/l NaCl, 5'g/l Glucose, 20 mg Tetracyclin χ HCl pro 1) bei 37°C bis zu der optischen Dichte Ag00= 0,8 angezüchtet. Die Bakterien werden 10 Minuten mit 7000 rpm abzentrifugiert, einmal mit einer 50 mM-Tris χ HCl PH=S7O, 30 mM NaCl Lösung gewaschen und in 1,5 ml Waschlösung resuspendiert. Nach Inkubation mit 1 mg/ml Lysozym bei 00C eine halbe Stunde lang, wird die Bakteriensuspension fünfmal gefroren und getaut. Die Zelltrümmer werden durch Zentrifugation mit 40.000 rpm eine Stunde lang pelletiert. Der Überstand wird sterilfiltriert und auf Inter- · feronaktivität geprüft. Als Test verwendet man den Plaque Reduktionstest mit V3-Zellen und Vesicular Stomatitis Virus (G.R. Adolf et al., Arch. Virol. 22, 169-178 (1982)). Überraschenderweise produziert der Klon.bis zu 9000 IU Interferon pro Liter Ausgangskultur.A 100 ml culture of clone E76E9 is dissolved in L-broth (10 g / l tryptone, 5 g / l yeast extract, 5 g / l NaCl, 5'g / l glucose, 20 mg tetracycline χ HCl per 1) at 37 ° C grown to the optical density Ag 00 = 0.8. The bacteria are centrifuged off for 10 minutes at 7000 rpm, washed once with a 50 mM Tris χ HCl pH = S 7 O, 30 mM NaCl solution and resuspended in 1.5 ml of washing solution. After incubation with 1 mg / ml lysozyme at 0 ° C. for half an hour, the bacterial suspension is frozen and thawed five times. The cell debris are pelleted by centrifugation at 40,000 rpm for one hour. The supernatant is sterile filtered and tested for interferon activity. The test used is the plaque reduction test with V3 cells and vesicular stomatitis virus (GR Adolf et al., Arch. Virol. 22, 169-178 (1982)). Surprisingly, the clone produces up to 9000 IU of interferon per liter of starting culture.
Genomischer Southern Blot zur Bestimmung der Anzahl der Gene, die den neuen Sequenzen zugeordnet sindGenomic Southern blot to determine the number of genes associated with the new sequences
a) Isolierung der DHA aus Namalwa-Zellen a) Isolation of DHA from Namalwa cells
400 ml einer Namalwa-Zellkultur werden bei 1000 rpm in einer JA21-Zentrifuge zentrifugiert, um die Zellen zu pelletieren· Die erhaltenen Pellets werden vorsichtig gewaschen, indem diese in NP40-Puffer resuspendiert (NP40-Puffer: 140 mM HaGl, 1,5 mM IgCl2, 10 mM Tris/Cl pH = 7,4) und erneut bei 1000 rpm pelletiert werden· Die erhaltenen Pellets werden erneut in 20 ml NP40-Puffer suspendiert und zur·Zerstörung der Zellwände mit 1 ml einer 10 %igen UP40-Lösung versetzt. Nach 5-minütigem Stehen in einem Eisbad werden die intakten Zellkerne durch Zentrifugation bei 1000 rpm pelletiert und der Überstand verworfen. Die Zellkerne werden in 10 ml einer Lösung, bestehend aus 50 mM Tris/Cl pH = 8·0, 10 mM EDTA und 200 mM ITaCl, resuspendiert und anschließend mit 1 ml 20 %iger SDS versetzt, um die Proteine zu entfernen. Die entstandene viskose Lösung wird zweimal mit der gleichen Menge Phenol (gesättigt mit 10 mM Tris/Cl pH = 8.0) und zweimal mit Chloroform extrahiert. Die DUA wird durch Zugabe von Ethanol ausgefällt, durch Zentrifugation abgetrennt, anschließend das erhaltene DNA-Pellet einmal mit 70 folgern Äthanol gewaschen, 5 Minuten lang im Vakuum getrocknet und in 6 ml TE-Puffer (TE-Puffer: 10 mM Tris/Cl pH = 8.0, 1 mM EDTA) gelöst. Die Konzentration der DNA beträgt 0,8 mg/ml.400 ml of a Namalwa cell culture are centrifuged at 1000 rpm in a JA21 centrifuge to pellet the cells. The resulting pellets are gently washed by resuspending them in NP40 buffer (NP40 buffer: 140 mM HaGl, 1.5 mM IgCl 2 , 10 mM Tris / Cl pH = 7.4) and pelleted again at 1000 rpm. The resulting pellets are resuspended in 20 ml of NP40 buffer and destroying the cell walls with 1 ml of a 10% UP40 solution added. After standing for 5 minutes in an ice bath, the intact cell nuclei are pelleted by centrifugation at 1000 rpm and the supernatant discarded. The cell nuclei are resuspended in 10 ml of a solution consisting of 50 mM Tris / Cl pH = 8 x 0, 10 mM EDTA and 200 mM ITaCl, followed by addition of 1 ml of 20% SDS to remove the proteins. The resulting viscous solution is extracted twice with the same amount of phenol (saturated with 10 mM Tris / Cl pH = 8.0) and twice with chloroform. The DUA is precipitated by addition of ethanol, separated by centrifugation, then the DNA pellet obtained is washed once with 70 % ethanol, dried in vacuo for 5 minutes and in 6 ml TE buffer (TE buffer: 10 mM Tris / Cl pH = 8.0, 1 mM EDTA). The concentration of the DNA is 0.8 mg / ml.
b) Restriktions-Endonuclease-Verdauung der DNA aus Namalwa-Zellen b) Restriction endonuclease digestion of DNA from Namalwa cells
Die Restriction —Endonuclease-Verdauungen werden jeweils gemäß den nach den vom HerstellerThe Restriction endonuclease digestions are each according to the according to the manufacturer
angegebenen Bedingungen durchgeführt. 1 μg DNA wird mit 2 Einheiten der geeigneten Restriction-Endonuclea.se in einem Volumen von 10 μΐ bei 370C 2 Stunden lang oder länger verdaut. EcoRI, Hindlll, BamHI, Sphl, Pstl und CIaI werden als Restriction-Endonucleasen verwendet. 20 μg DNA werden bei jeder Verdauung eingesetzt. Um die Vollständigkeit der Verdauung zu kontrollieren werden jeweils beim Start der Reaktion 10 μΐ (aliquote Teile) abgetrennt und mit 0,4 μg Lambda Phagen-DNA versetzt. Nach 2-stündiger "Inkubation werden -^q diese aliquoten Teile mittels Agarose-Gel-Elektrophorese kontrolliert und die Vollständigkeit der Verdauung wird mit Hilfe eines Musters der gefärbten Lambda Phagen-DNA-Fragmente beurteilt.specified conditions. 1 μg DNA is digested with 2 units of the appropriate Restriction-Endonuclea.se in a volume of 10 μΐ at 37 0 C for 2 hours or longer. EcoRI, HindIII, BamHI, Sphl, PstI and CIaI are used as restriction endonucleases. 20 μg of DNA are used in every digestion. In order to check the completeness of the digestion, 10 μΐ (aliquots) are separated off each time the reaction is started and 0.4 μg lambda phage DNA is added. After incubation for 2 hours, these aliquots are monitored by agarose gel electrophoresis and the completeness of digestion is assessed by a pattern of the stained lambda phage DNA fragments.
Nach Durchführung dieser Kontrolle werden die Reaktionen durch Zugabe von .EDTA bis zu einer Endkonzentration von 20 mM und 10-minütiges Erhitzen der Lösung auf 7O0C gestoppt. Die DNA wird durch Zugabe von 0.3 M NaAc pH=5.6 und 2.5 Volumteilen Äthanol gefällt. Nach 30-minütiger Inkubation bei -700C wird die DNA in einer Eppendorf-Zentrifuge pelletiert, einmal mit 70%igem Äthanol gewaschen und getrocknet. Die erhaltene DNA wird in 30 μΐ TE-Puffer aufgenommen.After carrying out this control, the reactions are stopped by adding .EDTA to a final concentration of 20 mM and heating the solution to 7O 0 C for 10 minutes. The DNA is precipitated by addition of 0.3 M NaAc pH = 5.6 and 2.5 volumes of ethanol. After incubation for 30 minutes at -70 0 C the DNA is pelleted in an Eppendorf centrifuge, washed once with 70% ethanol and dried. The resulting DNA is taken up in 30 μM TE buffer.
c) Gel Elektrophorese und Southern Transfer c) gel electrophoresis and Southern transfer
Die verdauten DNA-Proben werden entsprechend ihrer Größe in einem 0,8%igem Agarose-Gel in TBE-Puffer (10,8 g/l Tris-Base, 5,5 g/l Borsäure, 0,93 g/l EDTA) fraktioniert. Hierzu werden 15 μΐ der DNA-Probe mit 4 μΐ Beladungs-Puffer (0,02 % SDS, 5 χ TBE-Puffer, 50 mM EDTA, 50 % Glycerin, 0,1 % Bromphenolblau) vermischt, kurz auf 700C erhitzt und in die vorgesehenen Tröge des Gels aufgetragen. Lambda-DNA, welche mit EcoRI und HihdIII geschnitten wurde, wird in einem entsprechenden Trog aufgetragen und dient als Marker für die Größe der DNA. Die Gel-Electrophorese wird 24 Stunden langThe digested DNA samples are sized according to their size in a 0.8% agarose gel in TBE buffer (10.8 g / l Tris base, 5.5 g / l boric acid, 0.93 g / l EDTA). fractionated. For this purpose, 15 μΐ of the DNA sample with 4 μΐ loading buffer (0.02% SDS, 5 χ TBE buffer, 50 mM EDTA, 50% glycerol, 0.1% bromophenol blue), briefly heated to 70 0 C and applied in the provided troughs of the gel. Lambda DNA cut with EcoRI and HihdIII is applied in a suitable well and serves as a marker for the size of the DNA. Gel electrophoresis will last 24 hours
246 3246 3
bei ungefähr 1 V/cm durchgeführt. Anschließend wird die DNA nach der Methode von Southern auf ein Nitrocellulose-Filter (Schleicher und Schuell, BA85) gebracht, hierbei wird als Transfer-Puffer 10 χ SSC (1 χ SSC: 150 jmM Trinatriumcitrat, 15 mM NaCl, pH=7,0) verwendet. Nach dem Trocknen des Filterscarried out at about 1 V / cm. Subsequently, the DNA is brought to the method of Southern on a nitrocellulose filter (Schleicher and Schuell, BA85), in this case, as a transfer buffer 10 χ SSC (1 χ SSC: 150 mM trisodium citrate, 15 mM NaCl, pH = 7.0 ) used. After drying the filter
bei Raumtemperatur wird dieses 2 Stunden lang, auf 800C erhitzt, um die DNA an dieses zu binden.at room temperature, this is heated for 2 hours at 80 0 C to bind the DNA to this.
d) Hybridisierungsprobe d) hybridization probe
20 μg des Plasmids P9A2 werden mit Avail geschnitten, wobei ein ungefähr 1100 bp langes Fragment freigesetzt wird,20 μg of plasmid P9A2 are cut with Avail, releasing an approximately 1100 bp fragment,
. welches das ganze cDNA-Insert enthält. Dieses DNA-S.tück wird erneut mit Sau3A und AIuI geschnitten und das größte DNA-Stück nach Agarose-Gel-Elektrophorese (siehe Abbildung 5b), mittels Elektroelution und Elutip-Säulenchromatographie isoliert. Die so erhaltene DNA (1,5 μg) wird in 15 μΐ Wasser gelöst. ., which contains the whole cDNA insert. This DNA fragment is again cut with Sau3A and AluI and the largest piece of DNA after agarose gel electrophoresis (see Figure 5b), isolated by electroelution and Elutip column chromatography. The DNA thus obtained (1.5 μg) is dissolved in 15 μl of water. ,
20 μg des Plasmids pER33 werden mit Hindill geschnitten, wobei dieses Expressionsplasmid für IFN-a2-Arg (E. Rastl.-Dworkin et al. Gene 2_1, 237-248 (1983)) zweimal- geschnitten wird. Das kleinere DNA-Fragment enthält das Gen für Interferon-a2-Arg und wird auf die gleiche Weise wie bei dem Plasmid P9A2 isoliert.20 μg of the plasmid pER33 are cut with HindIII, whereby this expression plasmid is cut twice for IFN-α2-Arg (E. Rastl.-Dworkin et al., Gene 2_1, 237-248 (1983)). The smaller DNA fragment contains the gene for interferon-a2-Arg and is isolated in the same manner as in the plasmid P9A2.
Beide DNA's werden nach der von P.W.J. Rigby et al. (J. Mol. Both DNAs are prepared according to the method described by P.W.J. Rigby et al. (J. Mol.
Biol. 113, 237-251 (1977)) vorgeschlagenen Methode nicktranslatiert. Die Nick-Translation wird jeweils mit 0,2 μg DNA in einer Lösung von 50 μΐ, bestehend aus 1 χ Nick-Puffer (1 χ Nick-Puffer: 50 mM Tris/Cl pH=7,2, 10 mM MgSO4, 0,1 mM DTT, 50 μg/ml BSA), je 100 μΜοΙ dATP, dGTP und dTTP,Biol. 113 , 237-251 (1977)) nick-translated. The nick translation is carried out in each case with 0.2 μg of DNA in a solution of 50 μΐ, consisting of 1 × Nick buffer (1 × Nick buffer: 50 mM Tris / Cl pH = 7.2, 10 mM MgSO 4 , 0 , 1 mM DTT, 50 μg / ml BSA), 100 μΜοΙ each dATP, dGTP and dTTP,
3232
150 μθί α- P-dCTP (Amersham, 3 000 Ci/itiMol) und 5 Einheiten DNA-Polymerase I (Boehringer-Mannheim, Nick-Translation Qualität) durchgeführt. Nach 2 Stunden bei 140C wird die Reaktion durch Zugabe der gleichen Menge einer EDTA-150 μίί α-P-dCTP (Amersham, 3000 Ci / itiMol) and 5 units of DNA polymerase I (Boehringer-Mannheim, nick translation quality) performed. After 2 hours at 14 0 C, the reaction by adding the same amount of an EDTA
_ 42 -_ 42 -
Lösung (40 mMol) gestoppt und das nicht umgesetzte radioaktive Material mittels GSO-Säulenchromatographie in TE-Puffer abgetrennt. Die verbleibende spezifische Radioaktivität beträgt ungefähr 100 χ 10 cpm/^g DNA.Solution (40 mmol) stopped and the unreacted radioactive material separated by GSO column chromatography in TE buffer. The remaining specific radioactivity is approximately 100 χ 10 cpm / g of DNA.
e) Hybridisierung und Autoradiography e) hybridization and autoradiography
Das Nitrocellulosefilter wird in zwei Hälften geschnitten. Jede Hälfte enthält-einen identischen Satz von Spuren mit Namalwa-DNA, welche mit den Restrictions-Enzymen, die in Beispiel 4a erwähnt sind, behandelt worden sind. Die Filter werden in einer Lösung enthaltend 6 χ SSC, 5 χ-Denhardt's (1 χ Denhardt's: 0,02 % Rinderserum Albumin (BSA), 0,02 % Polyvinylpyrrolidon (PVP), 0/02 % Ficoll 400), 0,5 % SDS, 0,1 mg/ml denaturierte Kalbsthymus-DNA und. 10 mM EDTA 2 Stunden lang bei 65°C vorhybridisiert. Die Hybridisierung wird in einer Lösung enthaltend 6 χ SSC, 5 χ Denhardt's, 10 mM EDTA, 0,5 % SDS und.ungefähr 10 χ 10 cpm nicktranslatierter DNA während 16 Stunden bei 65°C durchgeführt. Die eine Hälfte des Filters wird mit Interferon-a2-Arg-DNA und die andere Hälfte mit Interferon-DNA, die aus dem Plasmid P9A2 isoliert wurde, hybridisiert. Nach der Hybridisierung werden beide Filter bei Raumtemperatur viermal mit einer Lösung bestehend aus 2 χ SSC und 0,1 % SDS und dann zweimal bei 65°C 45 Minuten lang mit einer Lösung bestehend aus 0,2 χ SSC und 0,01 % SDS gewaschen. Anschließend werden die Filter getrocknet und einem Kodak X-Omat S Film exponiert.The nitrocellulose filter is cut in half. Each half contains an identical set of traces of Namalwa DNA treated with the restriction enzymes mentioned in Example 4a. The filters are suspended in a solution containing 6 χ SSC, 5 χ Denhardt's (1 χ Denhardt's: 0.02% bovine serum albumin (BSA), 0.02% polyvinylpyrrolidone (PVP), 0/02% Ficoll 400), 0.5 % SDS, 0.1 mg / ml denatured calf thymus DNA and. 10mM EDTA prehybridized for 2 hours at 65 ° C. The hybridization is carried out in a solution containing 6 χ SSC, 5 χ Denhardt's, 10 mM EDTA, 0.5% SDS and approximately 10 χ 10 cpm nick translated DNA for 16 hours at 65 ° C. One half of the filter is hybridized with interferon-a2-Arg DNA and the other half with interferon DNA isolated from plasmid P9A2. After hybridization, both filters are washed four times at room temperature with a solution consisting of 2 χ SSC and 0.1% SDS and then washed twice at 65 ° C for 45 minutes with a solution consisting of 0.2 χ SSC and 0.01% SDS , The filters are then dried and exposed to a Kodak X-Omat S film.
Herstellung der- Expressionsplasmide pRHW 12 und pRHW 11Preparation of expression plasmids pRHW 12 and pRHW 11
Vorbemerkung:Preamble:
Die Herstellung der Expressionsplasmide wird in Abbildung βThe preparation of the expression plasmids is shown in Figure β
2 4 6 312 4 6 31
dargestellt (nicht maßstabgerecht), ferner werden alle Restrictionsenzymverdauungen nach den Angaben der Enzymhersteller durchgeführt.(not to scale), and all Restrictionsenzymverdauungen are performed according to the instructions of the enzyme manufacturers.
a) Herstellung des Plasmids pRHW 10 a) Preparation of the plasmid pRHW 10
100 μg des Plasmids P9A2 werden mit 100 Einheiten der Restriction-Endonuclease Avail (New Englands Biolabs) verdaut. Nach der Verdauung- wird das- Enzym durch Erhitzen auf 7O0C inaktiviert und die erhaltenen Fragmente" an einem l,4%igen Agarose Gel mit TBE-Puffer (TBE-Puffer: 10,8 g/l Tris-Base,100 μg of the plasmid P9A2 are digested with 100 units of the restriction endonuclease Avail (New England Biolabs). After Digestion- DAS is inactivated enzyme by heating to 7O 0 C and the resulting fragments "of a l, 4% agarose gel with TBE buffer (TBE buffer: 10.8 g / l Tris base,
10; 5,5 g/l Borsäure, 0,93-g/l EDTA) entsprechend ihrer Größe fraktioniert. Die Bande, welche das ganze cDNA-Insert enthält, wird elektroeluiert und an einer Elutip-Säule (Schleicher & Schuell) gereinigt. Von den erhaltenen 20^g werden 6 μg mit der Restriction-Endonuclease Sau3a (20 Einheiten in insgesamt 100 μΐ Lösung) weiter verdaut. Die Fragmente trennt man mittels 2%igen Agarose Gel in TBE-Puffer. Nach Färben mit Ethidium Bromid (EtBr) wird das 189 bp lange DNA-Stück elektroeluiert und wie oben beschrieben gereinigt (=Fragment b in Abbildung 6).10; 5.5 g / L boric acid, 0.93 g / L EDTA) according to their size. The band containing the entire cDNA insert is electroeluted and purified on an Elutip column (Schleicher & Schuell). 6 μg of the 20 μg obtained are further digested with the restriction endonuclease Sau3a (20 units in a total of 100 μl solution). The fragments are separated by means of 2% agarose gel in TBE buffer. After staining with ethidium bromide (EtBr), the 189 bp piece of DNA is electroeluted and purified as described above (= fragment b in Figure 6).
2Q Um das Interferongen mit einem Promotor, einer ribosomalen Bindungsstelle und einem Startcodon zu verknüpfen, wird das entsprechende DNA-Stück aus dem Expressionsplasmid pER 33 (E.Rastl-Dworkin et al., Gene 2JL, 237-248 (1983)) isoliert. Hierzu werden 50 μg pER 33 mit den Restrictionenzymen EcoRI und PvuII zweifach verdaut und die erhaltenen Fragmente entsprechend ihrer Größe an einem l,4%igen Agarose-Gel in TBE-Puffer fraktioniert. Das 389 bp lange DNA-Stück, welches den Trp-Promotor, die ribosomale Bindungsstelie und das Startcodon enthält, wird elektroeluiert und über eine Elutip-Säule gereinigt. Das so erhaltene Fragment wird anschließend mit Sau3A verdaut, und das gewünschte 108 bp lange Fragment erhält man mittels Agarose-Gel-Elektrophorese, Elektro-elution und Elutip-Säulenreinigung in einer Ausbeute von ungefähr 100 ng (= Fragmente c in Abbildung 6).In order to link the interferon gene with a promoter, a ribosomal binding site and a start codon, the corresponding piece of DNA is isolated from the expression plasmid pER 33 (E. Rastl-Dworkin et al., Gene 2JL, 237-248 (1983)). For this purpose, 50 μg of pER 33 are digested twice with the restriction enzymes EcoRI and PvuII and the fragments obtained are fractionated according to their size on a 1.4% agarose gel in TBE buffer. The 389 bp piece of DNA containing the trp promoter, the ribosome binding site and the start codon is electroeluted and purified on an Elutip column. The resulting fragment is then digested with Sau3A and the desired 108 bp fragment is obtained by agarose gel electrophoresis, electro-elution and Elutip column purification in a yield of approximately 100 ng (= fragments c in Figure 6).
AA 246 3-1 AA 246 3-1
20 ng des Fragmentes b werden mit 20 ng des Fragmentes c in einem Volumen von 40 μΐ unter Verwendung von 10 Einheiten. T4-Ligase in einer Lösung, welche 50 mM Tris/ClΛρΗ=7,5, . 10 mM MgCl2, 1 mM DTT und 1 mM ATP enthält, bei-14°C 18 Stunden lang ligiert. Anschließend wird das Enzym durch Erhitzen auf 7O0C zerstört und die erhaltene DNA mit'Hindlll in einem Gesamtvolumen von 50 μΐ geschnitten.20 ng of fragment b are mixed with 20 ng of fragment c in a volume of 40 μΐ using 10 units. T4 ligase in a solution containing 50 mM Tris / Cl Λ ρΗ = 7.5. 10 mM MgCl 2 , 1 mM DTT and 1 mM ATP, ligated at -14 ° C for 18 hours. Subsequently, the enzyme is destroyed by heating to 7O 0 C and cut the DNA obtained with'Hindlll in a total volume of 50 μΐ.
10 μ9 des Expressionsplasmids pER 103 (E. Rastl-Dworkin et al., Gene 2\_< 237-248 (1983)) linearisiert man mit Hindlll in einem Gesamtvolumen von 100 μΐ. Nach 2 Stunden bei 37°C wird 1 Volumen 2 χ Phosphatase Puffer (20 mM Tris/Cl pH='9,2, 0,2 mM EDTA) zusammen mit einer Einheit Kalbsdarmphosphatase (CIP) hinzugegeben. Nach 30 Minuten bei 45°C gibt man eine weitere Einheit CJP zu und inkubiert nochmals 30 Minuten lang. Die so erhaltene DNA wird durch zweimalige Phenolextraktion, einmalige Chloroformextraktion und durch Fällung mittels Zugabe von 0,3 M Natriumacetat (pH=5,5) und 2,5 VoI Äthanol gereinigt. Anschließend wird dephosphoryliert, um beim nächsten Ligierungsschritt die Religierung des Vektors zu verhindern.10 μ9 of the expression plasmid pER 103 (E. Rastl-Dworkin et al., Gene 2 \ _ < 237-248 (1983)) is linearized with HindIII in a total volume of 100 μΐ. After 2 hours at 37 ° C, 1 volume of 2 χ phosphatase buffer (20 mM Tris / Cl pH = '9.2, 0.2 mM EDTA) is added along with one unit of calf intestinal phosphatase (CIP). After 30 minutes at 45 ° C, add another unit of CJP and incubate again for 30 minutes. The resulting DNA is purified by phenol extraction twice, chloroform extraction once, and precipitation by the addition of 0.3 M sodium acetate (pH = 5.5) and 2.5% ethanol. It is then dephosphorylated to prevent religation of the vector in the next ligation step.
100 ng des linearisierten pER 103 und die ligierten Fragmente b und c (nach der Hindlll-Verdauung) werden in· eine Lösung von 100 μΐ, welche Ligase Puffer enthält, eingetragen und bei 140C 18 Stunden lang mit T.-DNA-Ligase ligiert.100 ng of the linearized pER 103 and the ligated fragments b and c (after HindIII digestion), a solution of 100 are in · μΐ which ligase containing buffer was added and at 14 0 C for 18 hours with T. DNA ligase ligated.
200 μΐ kompetente E. coli HB 101 (E. Dworkin et al., Dev. Biol. 1S_, 435-448 (1980)) werden mit 20 μΐ der Ligierungs-Mischung vermischt und 45 Minuten lang auf Eis inkubiert. Danach wird die DNA-Aufnahme durch, einen Hitzeschock von 2 Minuten bei 42°C vollendet. Die Zellsuspension wird weitere 10 Minuten auf Eis inkubiert und schließlich auf LB-Agar (10 g/l Trypton, 5 g/l Hefeextrakt, 5 g/l NaCl, 1,5 % Agar), welcher 50 mg/1 Ampicillin enthält, aufgebracht. Die Plasmide, die in den erhaltenen 24 Kolonien enthalten sind,200 μΐ of competent E. coli HB 101 (E. Dworkin et al., Dev. Biol. 1S, 435-448 (1980)) are mixed with 20 μΐ of the ligation mixture and incubated on ice for 45 minutes. Thereafter, the DNA uptake is completed by a heat shock of 2 minutes at 42 ° C. The cell suspension is incubated on ice for an additional 10 minutes and finally plated on LB agar (10 g / l tryptone, 5 g / l yeast extract, 5 g / l NaCl, 1.5% agar) containing 50 mg / l ampicillin , The plasmids contained in the obtained 24 colonies
werden nach der Methode von'Birnboim und DoIy (siehe Nucl. Acid. Res. 1_, 1513-1523 (1979)) isoliert. Nach der Verdauung mit verschiedenen Restrictionsenzymen weist ein Plasmid die gewünschte Struktur auf. Dieses erhielt die Bezeichnung pRHW 10 (siehe Abbildung 6).are isolated by the method of Birnboim and Doyy (see Nucl. Acid. Res., 1, 1513-1523 (1979)). After digestion with various restriction enzymes, a plasmid has the desired structure. This was named pRHW 10 (see Figure 6).
b) Herstellung des Plasmids pRHW 12 b) Preparation of the plasmid pRHW 12
.Ca. 10 ng des Plasmids pRHW 10 werden jnit BamHI. .geschnitten,. Anschließend wird.das Klenow-Fragment der DNA-Pοlymerase I und die 4 Deoxynucleosid-tr!phosphate zugegeben und 20 Minuten lang bei Raumtemperatur inkubiert. Das erhaltene linearisierte und mit geraden Enden versehene Plasmid wird durch Phenolextraktion und durch Fällung gereinigt und anschließend mit der Restrictions-Endonuclease Ncol in einem Volumen von 100 μΐ geschnitten. Das größere Fragment wird mittels Agarose-Gel-Elektrophorese, Elektroelution und EIutip-Reinigung gewonnen. Das Fragment a) (siehe Abbildung 6 ^ erhält man durch Verdauung von 4 ]ig AvalI-Fragment, welches das P9A2-cDNA-Insert enthält (siehe oben) mit Ncol und AIuI, wobei man ungefähr 2 \xg an Fragment a) erhält..Ca. 10 ng of the plasmid pRHW 10 are mixed with BamHI. .geschnitten ,. Subsequently .The Klenow fragment of DNA Pοlymerase I and the 4 deoxynucleoside phosphates added tr! And incubated for 20 Minu th at room temperature. The obtained linearized and straight-ended plasmid is purified by phenol extraction and precipitation and then cut with the restriction endonuclease Ncol in a volume of 100 μΐ. The larger fragment is recovered by agarose gel electrophoresis, electroelution and EIutip purification. The fragment a) (see Figure 6 ^ is obtained by digesting 4] ig Avali fragment containing the P9A2 cDNA insert (see above) with NcoI and AluI to yield approximately 2 \ xg of fragment a) obtains.
im letzten Ligierungsschritt wird das Fragment a) und das hinzugegebene mit BamHI/NcoI zweifach verdaute pRHW 10 in einem Volumen von 10 μΐ ligiert, wobei je DNA jeweils 10 ng eingesetzt werden. Die- Ligierung einer aufgefüllten BamHI-Schnittstelle an eine durch Alul geschnittene DNA ergibt wieder eine BamHI-Schnittstelle.In the last ligation step, fragment a) and the BamHI / NcoI doubly digested pRHW 10 are ligated in a volume of 10 μΐ, using 10 ng per DNA. The ligation of a filled-in BamHI site to Alul cut DNA again yields a BamHI site.
Die erhaltene Ligierungsmischung wird mit kompetenten E.coli HB 101 wie oben beschrieben transformiert. Von den erhaltenen 40 Kolonien wählt man eine aus, diese erhält die Bezeichnung ρRHW 12 .The resulting ligation mixture is transformed with competent E. coli HB 101 as described above. Of the 40 colonies obtained, one is selected, this receives the name ρRHW 12th
Das Plasmid wird isoliert und das EcoRI/BamHI-Insert nach der Methode von Sanger (F. Sanger et al., Proc. Nat. Acad. Sei 7_4' 5463-5467 (1979)) sequenziert. Dieses weist die erwartete Sequenz auf.The plasmid is isolated and the EcoRI / BamHI insert is sequenced by the method of Sanger (F. Sanger et al., Proc. Nat. Acad., 7, 5463-5467 (1979)). This has the expected sequence.
c) Herstellung des_Plasmids pRHW 11 c) Preparation of the plasmid pRHW 11
Diese erfolgt analog Beispiel 5b. 1 μ9 des Plasmids pRHW 10 wird mit BamHI verdaut. Die klebrigen (sticky) Enden der erhaltenen DNA werden mittels des Klenow-Fragments der DNA-Polymerase I und der 4 Deoxynucleosid-triphosphate stumpf gemacht, anschließend wird die linearisierte DNA mit Ncol geschnitten. Das größere Fragment wird mittels. Agarose-Gel-Elektrophorese, Elektroelution und Elutip-Säulenchromatogr.aphie gewonnen.This takes place analogously to Example 5b. 1 μ9 of the plasmid pRHW 10 is digested with BamHI. The sticky ends of the DNA obtained are made blunt by means of the Klenow fragment of DNA polymerase I and the deoxynucleoside triphosphate, then the linearized DNA is cut with Ncol. The larger fragment is using. Agarose gel electrophoresis, electroelution and Elutip column chromatography.
Das Ncol-Alul-Fragment isoliert man aus dem Klon E76E9 analog Beispiel 5b. Anschließend ligiert man 10 ng des. Vektor-Teils mit 10 ng des cDNA-Teils in einem Volumen von 10 μΐ unter geeigneten Bedingungen und unter Verwendung von 1 Ein-heit T4-Ligase. Nach Transformation der.erhaltenen DNA-Mischung in E. coli HB 101 und Selection der erhaltenen 45 Kolonien auf Ampicillin enthaltenden LB-Platten wird ein Klon ausgewählt, welche die Bezeichnung pRHW 11 erhält. Nach Züchtung des entsprechenden Klons isoliert man die Plasmid-DNA. Deren Struktur wird durch die Anwesenheit von mehreren spezifischen Restriction-Endonuclease-Schnittstellen' (AIuI, EcoRI, Hindlll, Ncol, Pstl) belegt.The Ncol-Alul fragment is isolated from clone E76E9 analogously to Example 5b. Subsequently, 10 ng of the vector portion are ligated with 10 ng of the cDNA portion in a volume of 10 μΐ under suitable conditions and using 1 unit T4 ligase. After transformation of the. Obtained DNA mixture in E. coli HB 101 and selection of the obtained 45 colonies on ampicillin-containing LB plates, a clone is selected, which receives the name pRHW 11. After culturing the corresponding clone, the plasmid DNA is isolated. Their structure is evidenced by the presence of several specific restriction endonuclease cleavage sites (AluI, EcoRI, HindIII, Ncol, PstI).
d) Expression der Interferon-Aktivität durch E. coli HB 101 enthaltend das Plasmid pRHW 12 d) Expression of interferon activity by E. coli HB 101 containing the plasmid pRHW 12
100 ml der Bakterienkultur werden bis zu einer optischen Dichte von 0,6 bei 600 nm in M9 minimal Medium, welches alle Aminosäuren ausgenommen Trypthophan (20 μg/ml pro Aminosäure) , 1 μg/ml Thiamin, 0,2 % Glucose und 20 μg/ml Indol-(3)-acrylsäure (IAA), den Induktor des Tryphtophan-Operons enthält, inkubiert. Anschließend werden die Bakterien durch Zentrifugieren (10 Minuten bei 7000 rpm) pelletiert, einmal mit 50 mM Tris/Cl pH=8, 30 mM NaCl gewaschen und schließlich100 ml of the bacterial culture are minimal medium up to an optical density of 0.6 at 600 nm in M9, all amino acids except tryptophan (20 ug / ml per amino acid), 1 ug / ml thiamine, 0.2% glucose and 20 ug / ml indole (3) -acrylic acid (IAA) containing the inducer of the tryphtophan operon. Subsequently, the bacteria are pelleted by centrifuging (10 minutes at 7000 rpm), washed once with 50 mM Tris / Cl pH = 8, 30 mM NaCl and finally
·- 47 - · - 47 -
in 1,5 ml desselben Puffers suspendiert. Nach 30-minütiger Inkubation mit 1 mg/ml Lysozym auf Eis werden die Bakterien 5 χ gefroren und aufgetaut. Die Zelltrümmer entfernt man durch 1-stündige Zentrifugieren bei 40 000 rpm. Der Überstand wird steril filtriert und auf Interferon-Aktivität im Plaque-Reduction-Assay unter Verwendung, von menschlichen A549 Zellen und Encophalo-myocarditisvirus geprüft. Ergebnis: 1 1 der hergestellten Bakterienkultur enthält 1 χ 10 . Internationale. Einheiten an Interferon. , (A. Billiau, Antiviral Res. 4_, 75-98 (1984·)).suspended in 1.5 ml of the same buffer. After incubation for 30 minutes with 1 mg / ml lysozyme on ice, the bacteria are frozen 5 χ and thawed. The cell debris is removed by centrifugation at 40,000 rpm for 1 h. The supernatant is sterile filtered and assayed for interferon activity in the plaque reduction assay using human A549 cells and encophalo myocarditis virus. Result: 1 liter of the bacterial culture produced contains 1 × 10. International. Units of interferon. , (A. Billiau, Antiviral Res. 4_, 75-98 (1984)).
Zusammenstellung der Unterschiede der Aminosäure- und Nukleotid-Sequenzen von Typl-InterferonenCompilation of differences in amino acid and nucleotide sequences of Typl interferons
a) Vergleich der Aminosäuresequenzen a) Comparison of the amino acid sequences
Der paarweise Vergleich der Aminosäuresequenzen erhält man durch Auflisten des ersten Cystein-Restes des reifen α-Interferons mit dem ersten Cysteinrest der Aminosäuresequenzen, welche durch die cDNA-Inserte der Plasmide P9A2 und E76E9 codiert werden. Beide Sequenzen werden in Abbildung 7 als IFN-omega dargestellt, da bei den ermittelten Werten keine Unterschiede zwischen den spezifischen Sequenzen der · P9A2- oder E76E9-Klone festgestellt werden konnten. Die einzige durchgeführte Korrektur war eine Einfügung einer Lücke bei Position 45 des Interferons-aA, welche als Fehlstelle gezählt wurde. Wenn die Sequenz des omega-Interferons ein Partner ist, wurde der Vergleich unter Berücksichtigung der üblichen 166 Aminosäuren durchgeführt. Dieser Wert wird in Abbildung 7 zusammen mit den zusätzlichen 6 Aminosäuren, die durch die Klone P9A2 und E76E9 codiert werden, dargestellt. Die prozentualen Unterschiede werden durch Dividierung derThe pairwise comparison of the amino acid sequences is obtained by listing the first cysteine residue of the mature α-interferon with the first cysteine residue of the amino acid sequences encoded by the cDNA inserts of plasmids P9A2 and E76E9. Both sequences are shown in Figure 7 a ls IFN-omega, since no differences between the specific sequences of the · P9A2 or E76E9 clones could be found in the values determined. The only correction made was an insertion of a gap at position 45 of interferon-aA, which was counted as a defect. If the sequence of the omega interferon is a partner, the comparison was carried out considering the usual 166 amino acids. This value is shown in Figure 7 together with the additional 6 amino acids encoded by clones P9A2 and E76E9. The percentage differences are calculated by dividing the
ermittelten Unterschiede durch die Zahl 1.66 erhalten. Eine zusätzliche Aminosäure stellt somit die Prozentsatzzahl 0,6 dar. Das ergibt 3,6 % für die 6 zusätzlichen Aminosäuren des IFN-omega, welche bereits in der Prozentsatzzahl enthalten sind.differences obtained by the number 1.66. An additional amino acid thus represents the percentage number 0.6. This gives 3.6% for the 6 additional amino acids of IFN-omega, which are already included in the percentage number.
Die Vergleiche mit dem ß-Interferon wird durch Auflisten der 3. Aminosäure des reifen ß-Interferons mit der ersten Aminosäure des reifen α-Interferons ,oder der ersten Aminosäure,= welche durch die Plasmides P9A2 und E76E9 codiert werden, .10 durchgeführt. Die längste Vergleichsstruktur eines α-Interferons mit ß-Interferon geht somit über 162 Aminosäuren, was 2 zusätzliche Aminosäuren jeweils für das α-Interferon und das ß-Interferon ergibt. Diese werden als Fehlstellen gezählt und werden getrennt in Abbildung 7 dargestellt, sind aber in der Prozentsatzzahl enthalten.., Die Auflistung des ß-Interferons mit den Aminosäuresequenzen der Klone P9A2 oder E76E9 wird in derselben Weise durchgeführt. Dies ergibt aber insgesamt 10 zusätzliche Aminosäuren.Comparisons with the β-interferon are made by listing the 3rd amino acid of the mature β-interferon with the first amino acid of the mature α-interferon, or the first amino acid, = encoded by plasmids P9A2 and E76E9. The longest comparison structure of an alpha interferon with beta interferon thus goes over 162 amino acids, giving 2 additional amino acids each for the alpha interferon and beta interferon. These are counted as defects and are shown separately in Figure 7 but are included in the percentage number. The listing of the β-interferon with the amino acid sequences of clones P9A2 or E76E9 is performed in the same manner. But this gives a total of 10 additional amino acids.
b) Vergleich der Nucleotid-Sequenzen b) Comparison of nucleotide sequences
Die Auflistung der zu vergleichenden Sequenzen erfolgt analog Beispiel 6b. Das erste Nucleotid von der DNA des reifen α-Interferons ist das erste Nucleotid des für Cystein codierenden Tripletts des reifen α-Interferons. Das erste Nucleotid von der DNA der Plasmide P9A2 oder E76E9 ist ebenfalls das erste Nucleotid des Codons für Cystein-1. Das erste Nucleotid von der DNA des ß-Interferons ist das erste Nucleotid des 3. Tripletts. Der Vergleich erfolgt über insgesamt 498 Nucleotide, wenn die einzelnen DNA's der a-Interferone mit der DNA des ß-Interferons verglichen werden, und über 516 Nucleotide, wenn die DNA-Sequenzen der einzelnen a-Interferone oder des ß-Interferons mit den der Plasmide P9A2 und E76E9 verglichen werden. Die absolute Zahl der Fehlstellen wird im linken Teil der Tabelle der Abbildung 7 angegeben und dann in Klammern die entsprechenden Prozentangaben.The list of the sequences to be compared is carried out analogously to Example 6b. The first nucleotide of mature alpha interferon DNA is the first nucleotide of the cysteine-encoding triplet of mature alpha interferon. The first nucleotide of the DNA of plasmids P9A2 or E76E9 is also the first nucleotide of the codon for cysteine-1. The first nucleotide of the DNA of β-interferon is the first nucleotide of the third triplet. The comparison is made over a total of 498 nucleotides, when the individual DNAs of the α-interferons are compared with the DNA of the β-interferon, and over 516 nucleotides, when the DNA sequences of the individual α-interferons or β-interferon with those of the plasmids P9A2 and E76E9 are compared. The absolute number of defects is given in the left part of the table in Figure 7 and then in brackets the corresponding percentages.
a) Synthese einer omega-Ihterferon spezifischen Hybridi-a) Synthesis of an omega-interferon-specific hybridi
10 pMol des Oligonucleotids d(TGCAGGGCTGCTAA) werden mit 12 pMol gamma- 32P-ATP (spezifische Aktivität: > 5000 Ci/mMol) und 10 Einheiten Polynucleotid-Kinase in einem Gesamtvolumen von 10 μΐ (70 mM Tris/Cl pH = 7,6, 10 mM MgCl2, 50 mM DTT) vermischt und eine Stunde bei 37°C10 pmol of the oligonucleotide d (TGCAGGGCTGCTAA) are incubated with 12 pmol of gamma- 32 P-ATP (specific activity:> 5000 Ci / mmole) and 10 units of polynucleotide kinase in a total volume of 10 μl (70 mM Tris / Cl pH = 7, 6, 10mM MgCl 2 , 50mM DTT) and incubated for one hour at 37 ° C
stehen gelassen. Anschließend wird die Umsetzung durch 10-minütiges Erhitzen auf 7O0C gestoppt. Das erhaltene radioaktiv markierte Obligonucleotid wird mit 5 pMol M13pRHW 12 ssDNA (siehe Abbildung 9) in einem Gesamtvolumen von 35 μΐ (100 mM NaCl) durch einstündiges Stehen bei 500C hybridisiert.ditched. Subsequently, the reaction is stopped by heating for 10 minutes at 7O 0 C. The radiolabeled Obligonucleotid obtained is mixed with 5 pmol of ssDNA M13pRHW 12 (see Figure 9) in a total volume of 35 μΐ (100 mM NaCl) hybridized by one hour of standing at 50 0 C.
Nach Kühlen auf Raumtemperatur wird Nick-Translation-Puffer, die 4 Deoxynucleosid-triphosphate und 10 Einheiten Klenow-Polymerase bis zu einem Gesamtvolumen von 50 μΐ (50 mM Tris/Cl pH = 7,2, 10 mM MgCl2, 50 μ9/ΐη1 BSA, 1 mM pro Nucleotid) zugegeben. Die Polymerisation wird durch einstündiges Stehen bei Raumtemperatur durchgeführt, anschließend die Umsetzung durch fünfminütiges Erhitzen auf 700C gestoppt.After cooling to room temperature, nick translation buffer, the 4 deoxynucleoside triphosphates and 10 units of Klenow polymerase are added to a total volume of 50 μΐ (50 mM Tris / Cl pH = 7.2, 10 mM MgCl 2 , 50 μ 9 / ηη 1 BSA, 1mM per nucleotide). The polymerization is carried out by standing at room temperature for one hour, then the reaction is stopped by heating to 70 0 C for five minutes.
Bei der Umsetzung erhält man eine teilweise doppelsträngige zirculäre DNA. Diese wird anschließend in einem Gesamtvolumen von 500 μΐ mit 25 Einheiten Avail geschnitten, wobei der vom Hersteller beschriebene Puffer verwendet wird. Hierbei werden die doppelsträngigen Regionen zu einheitlichen Größen geschnitten. Anschließend wird die Umsetzung durch 5-minütiges Erhitzen auf 700C gestoppt.The reaction gives a partially double-stranded circular DNA. This is then cut in a total volume of 500 μΐ with 25 units of Avail, using the buffer described by the manufacturer. Here, the double-stranded regions are cut to uniform sizes. The reaction is then stopped by heating to 70 ° C. for 5 minutes.
b) Herstellung der RNA aus durch Virus infizierten Zellen b) Preparation of RNA from virus-infected cells
' ' '""" fiii ι Ii o '''"" fiii ι ii o
100 χ 106Zellen (0,5 χ 106/ml) werden mit 100 μΜοΙ Dexamethason 48 bis ·72 Stunden lang behandelt - die Kontrolle enthält kein Dexamethason. Zur Interferon-Induktion werden die Expression-Zellen - in serumfreiem Medium in einer Konzentration von 5 χ 10 /ml suspendiert und mit 2 Einheiten/ml Sendai Virus infiziert. Aliquote Teile der Zellkulturüberstande werden im P 1-aq-ue- Reduction -As say (Beispiel 5b) auf IFN-Aktivität geprüft. Die Zellen werden 6 Stunden nach (3er virus-Infizierung mittels Zentrifugieren (1000 g, 10 Minuten) geerntet, in 50 ml NP40-Puffer (Beispiel 4a) gewaschen, in 9,5 ml eiskaltem NP40-Puffer resuspendiert und durch Zugabe von 0,5 ml 10%iger NP40 5 Minuten lang auf Eis lysiert. Nach Entfernen der Kerne durch Zentrifugieren (1000 χ g, 10 Minuten) wird der überstand mit 50 mM- Tris/Cl, 0,5 % Sarkosin und 5 mM EDTA auf pH=8 eingestellt und bei -200C aufbewahrt. Zur Isolierung der gesamten RNA aus dem Überstand wird einmal mit Phenol, einmal mit Phenol/Chloroform/Isoamylalkohol und einmal.mit Chloroform/Isoamylalkohol extrahiert. Die wäßrige Phase wird auf einen 4 ml 5,7 molaren CsCl-Polster aufgetragen und in einem SW40-Rotor zentrifuiert (35 krpm, 20 Stunden), um den Extrakt von DNA und verbleibenden Proteinen zu befreien. Das erhaltene RNA-Pellet wird in 2 ml TEpH=8,0 resuspendiert und mit Äthanol ausgefällt. Die ausgefällte RNA wird anschließend mit einer Konzentration von 5 mg/ml in Wasser gelöst.100 × 10 6 cells (0.5 × 10 6 / ml) are treated with 100 μl of dexamethasone for 48 to 72 hours - the control contains no dexamethasone. For the purpose of interferon induction, the expression cells are suspended in serum-free medium at a concentration of 5 × 10 / ml and infected with 2 units / ml of Sendai virus. Aliquots of cell culture supernatants are assayed for IFN activity in the P 1-aq-ue-Reduction -As say (Example 5b). The cells were harvested 6 hours after (3 he virus-infection (by centrifugation 1000 g, 10 minutes), washed (50 ml in NP40 buffer Example 4a), resuspended ice cold NP40 buffer to 9.5 ml by addition of 0 5 ml of 10% NP40 is lysed on ice for 5 minutes, after removal of the nuclei by centrifugation (1000 g, 10 minutes), the supernatant with 50 mM Tris / Cl, 0.5% sarcosine and 5 mM EDTA to pH = 8 is set and stored at -20 0 C. for the isolation of total RNA from the supernatant is extracted once with phenol, once with phenol / chloroform / isoamyl alcohol and einmal.mit chloroform / isoamyl alcohol extracted. the aqueous phase is applied to a 4 ml 5, 7 molar CsCl pad and centrifuged in a SW40 rotor (35 krpm, 20 hours) to free the extract of DNA and remaining proteins The resulting RNA pellet is resuspended in 2 ml TEpH = 8.0 and ethanol The precipitated RNA is then added at a concentration of 5 mg / ml dissolved in water.
c) Nachweis der Interferon-omega mRNA c) detection of interferon-omega mRNA
0,2 μΐ der gemäß Beispiel 7t> hergestellten Hybridisierungsprobe werden zusammen mit 20-50 μg der gemäß Beispiel 7c hergestellten RNA durch Zugabe von Äthanol ausgefällt. Im Kontrollexperiment wird anstatt der zellulären RNA transfer RNA (tRNA) oder RNA, welche aus mit dem Plasmid pRHW 12 (Beispiel 5) transformierten E. coli stammt, zugegeben.0.2 μΐ of the hybridization sample prepared according to Example 7t> are precipitated together with 20-50 μg of the RNA prepared according to Example 7c by addition of ethanol. In the control experiment, RNA (tRNA) or RNA derived from E. coli transformed with the plasmid pRHW 12 (Example 5) is added instead of the cellular RNA.
24 6 3124 6 31
Die erhaltenen Pellets werden mit 70%igem Äthanol salzfrei gewaschen, getrocknet und im 25 μΐ 80%igem Formamid (100 mM PIPES pH=6,8, 400 mM NaCl, 10 mM EDTA) gelöst. Anschließend werden die Proben 5 Minuten lang ^auf 1000C erhitzt, um·die Hybridisierungsprobe zu denaturieren, unmittelbar auf 52°C eingestellt und bei dieser Temperatur 24 Stunden lang inkubiert. Nach der Hybridisierung werden die Proben auf Eis "gestellt und 475 μΐ Sl-Reaktionsmischung (4 mM Zn(Ac)2^ 30 mM NaAc, 250 mM NaCl,'5 % Glycerin, 20 μg ss Kalb-Thymus-DNA, 100 Einheiten Sl-Nuclease) zugegeben. Nach einstündiger Verdauung bei 37°C wird die Umsetzung durch Äthanol-Fällung gestoppt.The resulting pellets are washed salt-free with 70% ethanol, dried and dissolved in 25 μM 80% formamide (100 mM PIPES pH = 6.8, 400 mM NaCl, 10 mM EDTA). The samples are then heated for 5 minutes at 100 ^ 0 C to denature the hybridization · sample immediately adjusted to 52 ° C and incubated for 24 hours at this temperature. After hybridization, the samples are placed on ice and 475 μL Sl reaction mixture (4 mM Zn (Ac) 2 → 30 mM NaAc, 250 mM NaCl, 5% glycerol, 20 μg ss calf thymus DNA, 100 units of Sl After 1 hour of digestion at 37 ° C, the reaction is stopped by ethanol precipitation.
Die Pellets werden in 6 μΐ Formamid-Puffer gelöst und im wesentlichen wie Proben von DNA-Sequenzierungs-Reaktionen auf einem·6 % Acrylamidgel, welches 8 M Harnstoff enthält, aufgetrennt (F. Sanger et al., Proc. Nat. Acad. Sei. 74, 5463-5467 (1979)).The pellets are dissolved in 6 μM formamide buffer and separated essentially as samples from DNA sequencing reactions on a 6% acrylamide gel containing 8 M urea (F. Sanger et al., Proc. Nat. Acad 74 , 5463-5467 (1979)).
Zur. Autoradiographie wird das getrocknete Gel einem DuPont Cronex X-ray Film unter Verwendung des Kodak Lanex Regular Intensivators bei -7O0C ausgesetzt.To. Autoradiography, the dried gel is exposed to a DuPont Cronex X-ray film using the Kodak Lanex Regular Intensivators at -7O 0 C.
Die Spuren A bis C stellen die Kontrollen dar.Lanes A to C represent the controls.
Spur A: 20 μg tRNALane A: 20 μg tRNA
Spur B: 10 μg RNA aus pER 33 (E. coli Expression-Stamm für Interferon-a2-Arg)Lane B: 10 μg RNA from pER 33 (E. coli expression strain for interferon-a2-Arg)
Spur C: 1 ng RNA aus pRHW 12 (E. coli-Expression-Lane C: 1 ng RNA from pRHW 12 (E. coli expression
Stamm für Interferon-omega 1)Strain for interferon-omega 1)
Spur D: 50 μg RNA aus unbehandeLten Namalwa ZellenLane D: 50 μg RNA from untreated Namalwa cells
- 52 - 24 6 3 1-β- 52 - 24 6 3 1-β
Spur E: 50 μς RNA aus mit Virus infizierten Namalwa ZellenLane E: 50 μ s RNA from virus infected Namalwa cells
Spur F: 50 μg RNA aus mit Dexamethason vorbehandelten und mit Virus infizierten Namalwa . 5 ZellenLane F: 50 μg RNA from dexamethasone pretreated and virus-infected Namalwa. 5 cells
Spur G: 20 μς RNA aus unbehandelten NC 37 Zellen.Lane G: 20 μ s RNA from untreated NC 37 cells.
Spur H: ' 20 μ9 RNA aus mit Virus infizierten NC 37Lane H: 20 μ9 RNA from virally infected NC 37
Zellen cell
Spur I: 20 μg RNA aus mit. Dexamethason vorbehan-. delten und mit Virus infizierten NC 37-'Lane I: 20 μg RNA from with. Dexamethasone reserved. infected and virus-infected NC 37- '
Zellencell
Spur M: Großenmarkierung (pBR 322 geschnitten mitLane M: large mark (pBR 322 cut with
Hinfl) .Hinfl).
Spuren B und C zeigen, daß das erwartete .Signal nur dann nachgewiesen werden kann, wenn sich eine omegal-spezifische RNA unter den RNA-Molekülen befindet. Ferner wird gezeigt, daß selbst ein großer Überschuß der fälschen RNA kein Hintergrundsignal hervorruft (siehe Spur B). Ferner ergibt auch die als Hybridisierungspartner verwendete tRNA kein Signal (siehe Spur A).Lanes B and C show that the expected signal can only be detected if an omega-specific RNA is under the RNA molecules. Further, it is shown that even a large excess of the counterfeit RNA does not elicit a background signal (see lane B). Furthermore, the tRNA used as hybridization partner also gives no signal (see lane A).
Die Spuren G bis I zeigen die Induktion der omegal-spezifischen RNA in mit Virus infizierten NC 37-Zellen. Die Vorbehandlung mit Dexamethason verstärkt hierbei diesen Effekt.Lanes G to I show the induction of omega-specific RNA in virus-infected NC 37 cells. Pretreatment with dexamethasone enhances this effect.
Die Spuren D bis F zeigen grundsätzlich das gleiche Ergeb-' nis, das mit Namalwa-Zellen erhalten wird. Die Induktion mit omegal-spezifischen RNA ist jedoch nicht so stark wie bei den NC 37-Zellen. Dieses Resultat ist parallel mit den Interferon-Titern, die im jeweiligen Zeilüberstand gemessen wurden.Lanes D to F basically show the same result obtained with Namalwa cells. However, induction with omega-specific RNA is not as strong as with NC37 cells. This result is in parallel with the interferon titers measured in each cell supernatant.
DJDJ £ <r ο -i : j£ <r ο -i: j
Dieses Verhalten der Interferon-omegal-Gen Expression ist also so, wie es von einem Interferon-TypI-Gen zu erwarten war .This behavior of interferon-omegal gene expression is thus as expected from an interferon type I gene.
Isolierung des Gens kodierend für IFN-omegal bzw. dazu verwandter Gene:Isolation of the gene encoding IFN-omegal or related genes:
a) Cosmid Screening a) cosmid screening
Eine humane Cosmidbank (menschliche DNA (männlich) kloniert im Cosmidvektor pcos2 EMBL (A. Ponstka, H.-R. Rockwitz, A.-M. Frischauf, B. Hohn, H. Lehrach Proc. Natl. Acad. Sei. 81, 4129-4133 (1984)) mit einer Komplexität von 2 χ ΙΟ6) wurde nach IFN-omega- bzw. dazu verwandten Genen durchsucht.A human cosmid library (human DNA (male) was cloned in the cosmid vector pcos2 EMBL (A. Ponstka, H.-R. Rockwitz, A.-M. Frischauf, B. Hohn, H. Lehrach Proc. Natl. Acad. Sci. 81, 4129-4133 (1984)) with a complexity of 2 χ ΙΟ 6 ) was searched for IFN-omega or related genes.
E. coli DHl (rv-, mv+, rec.A; gyrA96, sup.E) wurdd alsE. coli DHl (RA, m + v, rec.A; gyrA96, sup.E) as wurdd
Wirt'verwendet. Es wurden zunächst Mg -Zellen (= "plating bacteria") hergestellt. E.coli DHl wächst über Nacht in L-Broth (10'g/l Trypton, 5 g/l Yeast-Extract, 5 g/l NaCl) Supplementiert mit 0,2 % Maltose. Die Bakterien werden abzentrif ugiert und- in einer 10 mM MgSO. Lösung zu einer ODgQQ = 2 aufgenommen. 5 ml dieser Zellsuspension werdenWirt'verwendet. Initially, Mg cells (= "plating bacteria") were produced. E. coli DHI grows overnight in L-Broth (10 g / l tryptone, 5 g / l yeast extract, 5 g / l NaCl) Supplemented with 0.2% maltose. The bacteria are centrifuged and centrifuged in a 10 mM MgSO 4. Solution added to an ODgQQ = 2. 5 ml of this cell suspension
,20 mit 12,5 χ 10 colony forming units verpackter Cosmide 20 Minuten bei 370C inkubiert. Anschließend werden 10 vol LB zugesetzt und die Suspension 1 Stunde zwecks Expression der durch das Cosmid vermittelten Kanamycinresistenz bei 370C gehalten. Dann werden die Bakterien abzentrifugiert, in 5 ml 2.5 LB resuspendiert und in 200 μΐ Aliqots auf Nitrozellulosefilter ausgestrichen (BA85, Schleicher und Schüll, 132 mm Durchmesser), die auf LB-Agar (1,5 % Agar in L-Broth) plus 30 μg/ml Kanamycin aufliegen. Pro Filter wachsen ca. 10.000 bis 20.000 Kolonien an. Die Kolonien werden auf weitere Nitrozellulosefilter replika-plattiert, die bei 4°C aufbewahrt werden., 20 with 12.5 × 10 colony forming units of packaged cosmids for 20 minutes at 37 0 C incubated. Subsequently, 10 vol LB are added and the suspension was maintained for 1 hour for expression of kanamycin resistance conferred by the cosmid at 37 0 C. The bacteria are then removed by centrifugation, resuspended in 5 ml of 2.5 LB and streaked in 200 μL aliquots on nitrocellulose filters (BA85, Schleicher and Schuell, 132 mm diameter), which are incubated on LB agar (1.5% agar in L-broth) plus 30 μg / ml kanamycin. Approx. 10,000 to 20,000 colonies grow per filter. The colonies are replica-plated on additional nitrocellulose filters stored at 4 ° C.
Ein Satz der Kolonien-Filter wird wie in Beispiel Ic) beschrieben prozessiert, d.h. die Bakterien werden denaturiert, und die Einzelstrang-DNA an der Nitrozellulose fixiert. Die Filter werden 4 Stunden bei 650C in einer 50 mM Tris/HCl, PH=SzO, 1 M NaCl, 1 mM EDTA, 0,1 % SDS Lösung vorgewaschen. Anschließend werden die Filter in einer 5 χ Denhardt's (siehe Beispiel Ic), 6 χ SSC, 0,1 % SDS-Lösung 2 Stunden bei 650C inkubiert und mit ca. 50 χ 10 cpm nicktranslatierter, denaturierter IFN-omegal DNA (Hindlll-BamHI Insert des Klons pRHWl2, siehe Abbildung 6) 24 Stunden bei 65°C in derselben Lösung hybridisiert. Nach erfolgter Hybridisierung werden die Filter zunächst 3 χ 10 Minuten bei Raumtemperatur in einer 2 χ SSC, 0,01 % SDS-Lösung und anschließend 3 χ 45 Minuten bei 650C in einer 0,2 χ SSC, 0,01 % SDS-Lösung gewaschen. Die Filter werden getrocknet.und auf Kodak X-Omat S Film unter Verwendung einer Verstärkerfolie bei -7O0C exponiert. Positiv reagierende Kolonien werden auf den Replika-.Filter lokalisiert, abgekratzt und in L-Broth + Kanamycin (30 μg/ml) resuspendiert.. Von dieser Suspension werden einige μΐ auf LB-Agar + 30 μg/ml Kanamycin ausplattiert. Die resultierenden Kolonien werden auf Nitrozellulosefilter replika-plattiert. Diese Filter werden wie oben be-One set of the colony filters is processed as described in Example Ic), ie the bacteria are denatured and the single-stranded DNA is fixed to the nitrocellulose. The filters are pre-washed solution at 65 0 C in a 50 mM Tris / HCl, pH = SzO, 1 M NaCl, 1 mM EDTA, 0.1% SDS for 4 hours. The filters are then incubated in a 5 χ Denhardt's (see Example Ic), 6 χ SSC, 0.1% SDS solution for 2 hours at 65 0 C and with about 50 χ 10 cpm nicktranslated, denatured IFN-omegal DNA (HindIII -BamHI insert of the clone pRHW12, see Figure 6) hybridized for 24 hours at 65 ° C in the same solution. After hybridization, the filters are first placed for 3 χ 10 minutes at room temperature in a 2 χ SSC, 0.01% SDS solution and then 3 χ 45 minutes at 65 0 C in a 0.2 χ SSC, 0.01% SDS Solution washed. The filters are exposed to Kodak X-Omat getrocknet.und on S film using an intensifying screen at -7O 0 C. Positively responding colonies are localized on the replica filter, scraped off and resuspended in L-broth + kanamycin (30 μg / ml). From this suspension, several μΐ are plated on LB agar + 30 μg / ml kanamycin. The resulting colonies are replica-plated on nitrocellulose filters. These filters are as described above.
3232
schrieben mit P-markierter IFN-omegal-DNA hybridisiert.hybridized with P-labeled IFN-omegal DNA.
Von jeweils einer hybridisierenden Kolonie wurde mittels der von Birnboim & DoIy (Nucl. Acids Res. 7_, 1513 (1979)) beschriebenen Methode das Cosmid isoliert. Mit dieser Cosmid DNA Präparation wurde E. coli DHl transformiert und die Transformanten auf LB-Agar + 30 μg/ml Kanamycin selektioniert. Die Transformanten wurden wieder mit 3 P-radioaktiv markierter IFN-omegal DNA auf positiv reagierende Klone geprüft. Jeweils ein Klon ausgehend vom ursprünglichen Isolat wird ausgewählt und dessen Cosmid in größerem Maßstab hergestellt (Clewell, D.B. und Helinski, D.R., Biochemistry 9_, 4428 (1970)). Drei der isolierten Cosmide tragen die Namen cos9, coslO und cosB. .From each hybridizing colony, the cosmid was isolated by the method described by Birnboim & Doyl (Nucl. Acids Res., 7, 1513 (1979)). E. coli DH1 was transformed with this cosmid DNA preparation and the transformants were selected on LB agar + 30 μg / ml kanamycin. The transformants were again tested with 3 P-radiolabelled IFN-omegal DNA for positive-reacting clones. One clone each starting from the original isolate is selected and its cosmid produced on a larger scale (Clewell, DB and Helinski, DR, Biochemistry 9_, 4428 (1970)). Three of the isolated cosmids are named cos9, cos10 and cosB. ,
b) Subklonieren hybridisierender Fragmente in PUC8 b) Subcloning of hybridizing fragments into PUC8
Jeweils 1/Ug der Gosmide cos9, cos10 und cosB wurden mit HindIII unter den vom Hersteller (Hew England Biolabs) empfohlenen Bedingungen geschnitten· Die Fragmente werden auf 1 % Agarosegelen in TBE-Puffer elektrophoretisch aufgetrennt und nach Southern auf Hitrozellulosefilter transferiert (Beispiel 4c)· Beide Filter werden wie in Beispiel 4d) beschrieben mit nicktranslatierter omegal-DUA hybridisiert, gewaschen und exponiert· Etwa 20/Ug von jedem Cosmid werden mit HindIII geschnitten, und die entstehenden Fragmente gelten elektrophoretisch aufgetrennt· Die im Vorversuch mit omegal-DHA hybridisierenden Fragmente werden elektroeluiert und über Elutip-Säulen (Schleicher + Schüll) gereinigt. Diese Fragmente werden mit Hindlll-linearisiertem, dephosphoryliertem pUC8 (Messing, J·, Vieira, J·, Gene T9, 269-276 (1982)) ligiert. E. coli JM101 (supE, thi, (lacproAB), £"Ff, traD3*>, pro AB, Iac q Z 1115_7 wird mit der Ligasereaktionslösung transformiert· Die Bakterien werden auf IiB-Agar, enthaltend 50/Ug/ml Ampicillin, 250/Ug/ml 5-Brom-4-chior-3-indolyl-ß-D-galaktopyranosid (BCIG, Sigma) und 250/Ug/ml Isopropyl-ß-D-thiogalakto-pyranosid (IPTG, Sigma), ausgestrichen· Eine Blaufärbung der entstehenden Kolonien zeigt das Fehlen eines Inserts in püC8 an· Yon einigen weißen Klonen wurden die Pasmid DBA's in kleinem Maßstab isoliert, mit HindIII geschnitten und auf 1 % Agarosegelen aufgetrennt· Die DNA Fragmente wurden auf Efitrozellulose-In each case 1 μg of the cosmids cos9, cos10 and cosB were cut with HindIII under the conditions recommended by the manufacturer (Hew England Biolabs). The fragments were electrophoresed on 1 % agarose gels in TBE buffer and transferred to Southern on a Hitrocellulose filter (Example 4c). Both filters are hybridized with nick-translated omegal-DUA as described in Example 4d), washed and exposed. About 20 μg of each cosmid are cut with HindIII and the resulting fragments are separated electrophoretically. The fragments hybridizing in the preliminary experiment with omegal-DHA are electroeluted and purified over Elutip columns (Schleicher + Schull). These fragments are ligated with HindIII-linearized, dephosphorylated pUC8 (Messing, J, Vieira, J, Gene T9, 269-276 (1982)). E. coli JM101 (supE, thi, (lacproAB), £ "F f, traD3 *>, pro AB, lac Z q 1115_7 is transformed with the Ligasereaktionslösung · The bacteria are on IiB agar containing 50 / ug / ml ampicillin , 250 μg / ml 5-bromo-4-chloro-3-indolyl-β-D-galactopyranoside (BCIG, Sigma) and 250 μg / ml isopropyl-β-D-thiogalactopyranoside (IPTG, Sigma) · A blue colouration of the resulting colonies indicates the lack of an insert in pUC8 · In some white clones, the pasmid DBA's were isolated on a small scale, cut with HindIII and separated on 1 % agarose gels · The DNA fragments were seeded on to Efcrc cellulose
3232
filter übertragen und wie oben mit ^ P-omegal-DHA hybridisiert. Ausgehend von cos9 und cos10 wurde jeweils ein Subklon ausgewählt und mit pRHW22 bzw. pRH57 bezeichnet· Yon cosB wurden zwei mit der omegal-Probe gut hybridisierende DHA Fragmente subkloniert und mit pEH51 bzw· pRH52 bezeichnet.filter and hybridized as above with ^ P-omega-DHA. Starting from cos9 and cos10, a subclone was selected in each case and designated pRHW22 or pRH57 · Yon cosB were subcloned two DHA fragments which hybridized well with the omegal sample and designated pEH51 or pRH52.
- 56 - . 2 46 3 I S- 56 -. 2 46 3 I S
c) Sequenzanalyse c) Sequence analysis
Die in pUC8 insertierte DNA wird durch Schnitte mit HindIII und anschließende Gelelektrophorese vom Vektorteil getrennt. Diese DNA, ca. 10 \ig, wird unter Verwendung von T4 DNA Ligase in 50 μΐ Reaktionslösung ligiert, das Volumen auf 250 μΐ mit Nicktranslationspuffer gebracht (Beispiel 4d) und anschließend unter Eiskühlung mittels Ultraschall zerbrochen (MSE 100 Watt Ultrasonic Disintegrator, max. Abgabe bei 20 kHz, fünfmal 30 Sekunden). Hernach werden die Enden der Bruchstücke durch Zugabe von 1/100 vol je 0,5 mM dATP, dGTP, dCTP und dTTP sowie 10 units Klenowfragment der DNA-Polymerase I zwei Stunden bei 14°C repariert. Die resultierenden, gerade Enden aufweisenden DNA-Fragmente werden ihrer Größe nach auf einem 1 % Agarosegel aufgetrennt. Fragmente der Größen zwischen 500 und 1000 bp wurden isoliert und in den mit Smal geschnittenen, dephosphorylierten Phagenvektor Ml3 mp8 subkloniert. Die Einzelstrang DNA rekombinanter Phagen wird isoliert und nach der von Sanger entwickelten Methode (Sanger, F. et al., Proc. Natl. Acad. Sei 7_4' 5463-5467 (1976)) sequenziert. Das Zusammensetzen der Einzelsequenzen zu der Gesamtsequenz erfolgt mittels Computer (Staden, R., Nucl. Acids Res. IC), 4731-4751 (1982)).The DNA inserted into pUC8 is separated from the vector portion by sections with HindIII and subsequent gel electrophoresis. This DNA, about 10 \ ig, is ligated using T4 DNA ligase in 50 μΐ reaction solution, the volume to 250 μΐ reacted with nick-translation buffer (Example 4d) and then broken under ice cooling by means of ultrasound (MSE 100W ultrasonic disintegrator, max Output at 20 kHz, five times 30 seconds). Thereafter, the ends of the fragments are repaired by addition of 1/100 vol per 0.5 mM dATP, dGTP, dCTP and dTTP and 10 units Klenow fragment of DNA polymerase I for two hours at 14 ° C. The resulting straight ended DNA fragments are size separated on a 1% agarose gel. Fragments of sizes between 500 and 1000 bp were isolated and subcloned into the SmaI-cut, dephosphorylated phage vector M13mp8. The single-stranded recombinant phage DNA is isolated and sequenced according to the method developed by Sanger (Sanger, F. et al., Proc. Natl. Acad., 7, 543-5467 (1976)). The assembly of the individual sequences into the total sequence is carried out by means of a computer (Staden, R., Nucl. Acids Res. IC), 4731-4751 (1982)).
d) Sequenz des Subklons pRH57 (IFN-omegal) d) Sequence of Subclone pRH57 (IFN-omegal)
Die Sequenz ist in Abbildung 11 wiedergegeben. Dieses 1933 bp lange Fragment enthält das Gen für Interferon-omegal. Die für Protein kodierende Region umfaßt die Nukleotide 576 bis 1163. Die Sequenz ist völlig identisch mit der des cDNA Klons P9A2. Der Nukleotidabschnitt 576 bis 674 kodiert für ein 23 Aminosäure langes Signalpeptid. Die TATA-Box liegt in einem für Interferon Typ I Gene charakteristischen Abstand vor dem Startcodon ATG (Positionen 476-482). Das Gen weist einige Signalsequenzeri für die Polyadenylierung bei der Transkription auf (ATTAAA auf Positionen 1497-1502, bzw. 1764-1796; AATAAA auf Positionen 1729-1734 bzw. 1798-1803), deren erste im Klon P9A2 verwendet wurde.The sequence is shown in Figure 11. This 1933 bp fragment contains the gene for interferon-omegal. The protein coding region comprises nucleotides 576 to 1163. The sequence is completely identical to that of the cDNA clone P9A2. Nucleotide section 576 to 674 encodes a 23 amino acid signal peptide. The TATA box is located in a distance characteristic of interferon type I genes before the start codon ATG (positions 476-482). The gene has some transcriptional polyadenylation signal sequencing sera (ATTAAA at positions 1497-1502, and 1764-1796 respectively, AATAAA at positions 1729-1734 and 1798-1803, respectively), the first of which was used in clone P9A2.
e) Sequenz des Subklons pRHW22 (IFN-pseudo-omega2) e) Sequence of Subclone pRHW22 (IFN-pseudo-omega2)
In Abbildung 12 ist die 2132 bp lange Sequenz des mit der omegal-DNA Probe hybridisierenden HindiII Fragments aus dem . Cosmid cos 9 wiedergegeben. Es ergibt sich ein offener Leserahmen von Nukleotid 905 bis zu Nukleotid 1366. Die daraus abzuleitende Aminosäuresequenz ist wiedergegeben. Die ersten 23 Aminosäuren sind denen des Signalpeptids eines typtischen Typ I Interferons ähnlich. Die nachfolgenden 131 Aminosäuren zeigen bis zur Aminosäure 65 Ähnlichkeit zum omegal-Interferon, wobei Tyrosin als erste Aminosäure des reifen Proteins bemerkenswert ist.Figure 12 shows the 2132 bp sequence of the Hindi II fragment hybridizing with the omegal DNA probe. Cosmid cos 9 reproduced. The result is an open reading frame from nucleotide 905 to nucleotide 1366. The amino acid sequence derived therefrom is reproduced. The first 23 amino acids are similar to those of the signal peptide of type I type interferon. The following 131 amino acids show similarity to omegal interferon up to amino acid 65, with tyrosine being the first amino acid of the mature protein.
Auf Aminosäureposition 66 folgt die Sequenz einer potentiellen N-Glykosylierungsstelle (Asn-Phe-Ser). Ab dieser Stelle wird die Aminosäuresequenz von der eines Typ 1 Interferons verschieden. Es läßt sich jedoch zeigen, daß durch geeignete Insertionen und daraus resultierendem Verschieben der Proteinleserahmen Ähnlichkeit zum IFN-omegal herstellen läßt (siehe Beispiel 9). Es handelt sich bei dem isolierten Gen daher vom Standpunkt der Typ I "Interferone her gesehen um ein Pseudogen: IFN-pseudo-omega2.Amino acid position 66 is followed by the sequence of a potential N-glycosylation site (Asn-Phe-Ser). From this point the amino acid sequence will be different from that of a type 1 interferon. However, it can be shown that it is possible to produce similarity to the IFN-omegal by suitable insertions and the resulting displacement of the protein reading frame (see Example 9). Therefore, the isolated gene is a pseudogene: IFN-pseudo-omega2, as seen from the point of view of type I interferons.
f) Sequenz des Subklons pRH51 (IFN-pseudo-omega3) f) Sequence of Subclone pRH51 (IFN-pseudo-omega3)
Das eine, aus dem Cosmid B stammende, etwa 3.500 bp lange und mit der omeg'al-Probe hybridisierende Hindlll Fragment wurde teilweise sequenziert (Abbildung 13). Es ergibt sich ein offener Leserahmen von Nukleotidposition 92 bis 394. Die ersten 23 Aminosäuren zeigen die Merkmale eines Signalpeptids. Die daran anschließende Sequenz beginnt mit Tryptophan und zeigt Ähnlichkeit zu IFN-omegal bis Aminosäure 42. Danach wird die abgeleitete Sequenz unterschiedlich zu IFN-omegal und endet nach der Aminosäure 78. Die Sequenz läßt sich durch'lnsertionen so verändern, daß* sie dann große Homologie zu IFN-omegal aufweist (Beispiel 9). Das Gen wird mit IFN-pseudo-omega3 bezeichnet.The one, from the Cosmid B originating, approximately 3,500 bp and with the omeg'al sample hybridizing HindIII fragment was partially sequenced (Figure 13). The result is an open reading frame from nucleotide position 92 to 394. The first 23 amino acids show the characteristics of a signal peptide. The subsequent sequence begins with tryptophan and shows similarity to IFN-omegal to amino acid 42. Thereafter, the deduced sequence becomes different from IFN-omegal and ends after amino acid 78. The sequence can be changed by transpositions so that they are then large Homology to IFN-omegal (Example 9). The gene is called IFN-pseudo-omega3.
- 58 -. -: ! ο ο ί w- 58 -. - :! ο ο w w
g) Sequenz des Inserts von pRH52 (IFN-pseudo-omega4) g) Sequence of the Insert of pRH52 (IFN-pseudo-omega4)
Die 3659 lange, aus dem Cosmid B isolierten und mit omegal-DNA hybridisierenden Sequenz des Hindlll Fragments ist in Abbildung 14 dargestellt. "Ein offener Leserahmen, dessen Translationsprodukt teilweise Homologie zu IFN-omegal zeigt, befindet sich zwischen Nukleotidposition 2951 und 3250. Nach einem 23 Aminosäure langen Signalpeptid beginnt die weitere Aminosäuresequenz mit Phenylalanin. Die Homologie zu IFN-I wird bereits nach der 16. Aminosäure unterbrochen, setzt sich bei der 22. Aminosäure fort und endet mit der 41.The 3659 long, isolated from cosmid B and hybridizing with omegal DNA sequence of the HindIII fragment is shown in Figure 14. "An open reading frame whose translation product partially shows homology to IFN-omegal is located between nucleotide positions 2951 and 3250. After a signal peptide containing 23 amino acids, the further amino acid sequence begins with phenylalanine, the homology to IFN-I being interrupted after the 16th amino acid , continues at the 22nd amino acid and ends with the 41st.
Aminosäure. Eine eventuelle Translation wäre bis zur Aminosäure 77 möglich. Analog zu Beispiel 8f) und 8g) läßt sich auch hier eine gute Homologie zu IFN-omegal durch Einführen von Insertionen herstellen (Beispiel 9). Das hier isolierte Pseudogen wird als IFN-pseudo-omega4 bezeichnet.Amino acid. A possible translation would be possible up to the amino acid 77. Analogous to Example 8f) and 8g), a good homology to IFN-omegal can also be produced here by introduction of insertions (Example 9). The pseudogen isolated here is called IFN pseudo-omega4.
In Abbildung 15 sind die Gene für IFN-omegal bis IFN-pseudo-omega4 untereinander zusammen mit der Aminosäureübersetzung aufgelistet. Zur besseren Übereinstimmung werden Lücken in die einzelnen Gene eingefügt, die durch Punkte dargestellt sind. Es werden keine Basen weggelassen. Die Basennummerierung schließt die Lücken mit ein. Die Aminosäureübersetzung von IFN-omegal wird beibehalten (z.B. auf Posi- tion 352-355: "CAC" kodiert für His). Bei den Pseudogenen erfolgt Übersetzung in eine Aminosäure nur dort, wo sie eindeutig möglich ist. Auf Grund dieser Auflistung ist sofort erkennbar, daß die 4 isolierten Gene untereinander verwandt sind. So ist z.B. die potentielle N-Glykosylierungsstelle (Nukleotidpositionen 301 bis 309) in allen 4 Genen erhalten.In Figure 15, the genes for IFN-omegal to IFN-pseudo-omega4 are listed together with the amino acid translation. To better fit gaps in the individual genes are inserted, which are represented by dots. No bases are left out. The base numbering includes the gaps. The amino acid translation of IFN-omegal is retained (e.g., at position 352-355: "CAC" encodes His). In pseudogenes, translation into an amino acid occurs only where it is clearly possible. Based on this listing, it is immediately apparent that the 4 isolated genes are related to each other. For example, e.g. obtained the potential N-glycosylation site (nucleotide positions 301 to 309) in all 4 genes.
- 59 - I - ' - > J i i- 59 - I - '-> ii
Ebenso findet sich außer bei IFN-pseudo-omega4 an den Nukleotidpositionen 611 bis 614 ein Triplett, daß ein Stopcodon darstellt, und welches bei IFN-omegal ein reifes Protein der Länge von 172 Aminosäuren beendet. Allerdings existieren in dieser Anordnung bei IFN-pseudo-omega2 (Nukleotidpositionen 497 bis 499) und bei IFN-pseudo-omega4 (Nukleotidpositionen 512 bis 514) vorzeitige Stopcodons.Also, except for IFN pseudo-omega4 at nucleotide positions 611 to 614, there is a triplet that is a stop codon and that terminates a mature protein of 172 amino acids in IFN-omegal. However, IFN pseudo omega2 (nucleotide positions 497 to 499) and IFN pseudo omega4 (nucleotide positions 512 to 514) have premature stop codons in this arrangement.
Der Verwandtschaftsgrad zwischen den Genen bzw. den Aminosäuretranslationen läßt sich aus der in Abbildung 15 getroffenen Anordnung berechnen. Abbildung 16 gibt die DNA Homologien zwischen den Mitgliedern der IFN-omega-Familie wieder. Dabei werden beim paarweisen Vergleich jene Positionen nicht mitgezählt, an denen einer der beiden Partner oder beide, eine Lücke aufweisen. Der Vergleich ergibt eine Homologie von rund 85 % zwischen IFN-omegal-DNA und den Sequenzen der Pseudogene. IFN-pseudo-omega2-DNA ist zu den DNA's von IFN-pseudo-omega3 bzw. IFN-pseudo-omega4 zu etwa 82 % homolog. Abbildung 17 zeigt die Ergebniss'e der Vergleiche der Signalsequenzen und Abbildung 18 jene der Vergleiche der "reifen" Proteine. Die letzteren bewegen sich zwischen 72 und 88 %. Diese Homologie ist jedoch wesentlich größer als jene zwischen IFN-omegal und den IFN-a's und IFN-ß (Beispiel 6). ' Der Umstand, daß die einzelner! Mitglieder der IFN-omega-Familie weiter voneinander entfernt sind als die der IFN-a-Familie untereinander, läßt sich dadurch erklären, daß drei der vier isolierten IFN-omega-Gene Pseudogene sind und offen-. bar nicht mehr jenem Selektionsdruck wie funktionelle Gene unterliegen.The degree of relationship between the genes and the amino acid translations can be calculated from the arrangement in Figure 15. Figure 16 shows the DNA homologies between the members of the IFN-omega family. In the pairwise comparison, those positions in which one of the two partners or both have a gap are not counted. The comparison gives a homology of approximately 85% between IFN-omegal DNA and the sequences of the pseudogenes. IFN pseudo omega2 DNA is approximately 82% homologous to the DNAs of IFN pseudo omega3 and IFN pseudo omega4, respectively. Figure 17 shows the results of the comparisons of the signal sequences and Figure 18 shows the comparisons of the "mature" proteins. The latter range between 72 and 88%. However, this homology is significantly greater than that between IFN-omegal and IFN-α's and IFN-β (Example 6). 'The fact that the individual! Members of the IFN-omega family are more distant from each other than those of the IFN-a family, can be explained by the fact that three of the four isolated IFN-omega genes are pseudogenes and open. bar no longer subject to that selection pressure as functional genes.
24 6 3 13 24 6 3 13
Eine Einzelkolonie des Stammes HB101/pRHW12 auf LB-Agar (mit 25 mg/ml Ampicillin) wird in Trypton-Soya-Broth (OH)ID CM129) mit 25 mg/ml Ampicillin überimpft und bei 250 Umdrehungen pro Minute (U/min.) und 37 0C geschüttelt, bis eine optische Dichte (546 mn) von ca· 5 erreicht ist (logarithm!sehe Wachstumsphase). Daraufhin werden 10 Gewichtsprozent steriles Glycerin zugesetzt, die Kultur in 1,5 ml Portionen in sterile Ampullen abgefüllt und bei -70 0C eingefroren.A single colony of strain HB101 / pRHW12 on LB agar (containing 25 mg / ml ampicillin) is inoculated into tryptone soy broth (OH) ID CM129) with 25 mg / ml ampicillin and incubated at 250 revolutions per minute (rpm). and 37 ° C. until an optical density (546 nm) of approximately 5 is reached (logarithmic growth phase). Then 10 weight percent of sterile glycerol is added, the culture filled in 1.5-ml portions in sterile vials and frozen at -70 0 C.
Vorkultur:preculture:
Das Kulturmedium enthält 15 g/l Ha2HPO4 χ 12H2Oj 0,5 g/l NaCl5 1,0 g/l M4Gl; 3,0 g/l KH2PO4; 0,25 g/l MgSO4 χ 7H2O; 0,011 g/l CaGl2; 5 g/l Caseinhydrolysat (Merck 2238); 6,6 g/l Glucose-Monohydrat; 0,1 g/l Ampicillin; 20 mg/1 Cystein und 1 mg/1 Thiamin-hydrochlorid. 4 2 200 ml dieses Mediums in je einem 1000 ml. Erlenmeyerkolben werden mit je 1 ml einer Stammkultur von HB101/pRHW1¥ beimpft und 16 bis 18 Stunden bei 37 0C und 250 Umdrehungen pro Minute geschüttelt·The culture medium contains 15 g / l Ha 2 HPO 4 χ 12H 2 Oj 0.5 g / l NaCl 5 1.0 g / l M 4 Gl; 3.0 g / l KH 2 PO 4 ; 0.25 g / l MgSO 4 .7H 2 O; 0.011 g / l CaGl 2 ; 5 g / l casein hydrolyzate (Merck 2238); 6.6 g / l glucose monohydrate; 0.1 g / l ampicillin; 20 mg / 1 cysteine and 1 mg / 1 thiamine hydrochloride. 4 2 200 ml of this medium in a 1000 ml. Erlenmeyer flask are inoculated with 1 ml of a stock of HB101 / pRHW1 ¥ and shaken for 16 to 18 hours at 37 0 C and 250 revolutions per minute ·
Das Medium für die Fermentation enthält 10 g/l (HH4)2HP04; 4,6 g/l K2HPO4 χ 3H2O; 0,5 g/l HaGl; 0,25 g/l MgSO4 ζ 7H2O; 0,011 g/l CaGl2; 11 g/l Glucose-Honohydrat; 21 g/l Caseinhydrolysat (Merck 2238); 20 mg/1 Cystein, 1 mg/1 Thiaminhydrochlorid und 20 mg/1 3-ß-Indolacrylsäure· 8 Liter steriles Medium in einem Fermenter mit 14 Litern Totalvolumen (Höhe: Radius = 3:1) werden mit 800 ml der ITorkultur inoculiert·The medium for the fermentation contains 10 g / l (HH 4 ) 2 HP0 4 ; 4.6 g / l K 2 HPO 4 χ 3H 2 O; 0.5 g / l HaGl; 0.25 g / l MgSO 4 .7H 2 O; 0.011 g / l CaGl 2 ; 11 g / l glucose-honohydrate; 21 g / l casein hydrolyzate (Merck 2238); 20 mg / l cysteine, 1 mg / l thiamine hydrochloride and 20 mg / l 3-β-indoleacrylic acid · 8 liters of sterile medium in a fermenter with 14 liters total volume (height: radius = 3: 1) are inoculated with 800 ml of the IT culture
Die Fermentation erfolgt bei 28°C, 1000 U/min. (Effigas-Turbine), einer Belüftungsrate von lvvm (Volume/Volume/Minute) und einem Start-pH von 6,9. Während der Fermentation sinkt der pH-Wert ab und wird dann bei 6,0 mit 3N NaOH konstant gehalten. Ist eine optische Dichte (546 nm) von 18 bis 20 erreicht (gewöhnlich nach 8,5 bis 9,5 Stunden Fermentationszeit) , wird unter sonst gleichen Bedingungen auf 200C abgekühlt und anschließend mit 6N H2SO4 (ohne Belüftung) der pH-Wert auf 2,2 eingestellt und 1 Stunde bei 200C und 800 U/min, (ohne Belüftung) gerührt. Die auf diese Weise inaktivierte Biomasse wird daraufhin in einer CEPA-Laboratoriumszentrifuge Typ GLE bei 30 000 U/min, abzentrifugiert und bei -200C eingefroren und aufbewahrt. .The fermentation is carried out at 28 ° C, 1000 U / min. (Effigas turbine), a ventilation rate of lvvm (volume / volume / minute) and a starting pH of 6.9. During the fermentation, the pH decreases and is then kept constant at 6.0 with 3N NaOH. If an optical density (546 nm) of 18 to 20 is reached (usually after 8.5 to 9.5 hours fermentation time) is cooled under otherwise identical conditions to 20 0 C and then with 6N H 2 SO 4 (without aeration) the pH adjusted to 2.2 and stirred for 1 hour at 20 0 C and 800 U / min, (without aeration). The thus inactivated biomass is then in a CEPA laboratory centrifuge type GLE at 30 000 U / min, centrifuged and frozen at -20 0 C and stored. ,
Re'inigung des Interferon-omgega-GlyPurification of interferon-omgega-Gly
a) Teilweise Reinigung . ,_ a) Partial cleaning . _
Alle Stufen werden bei 40C durchgeführt.All stages are carried out at 4 0 C.
140 g. Biomasse (E.coli HBlOl transformiert mit dem Expressionsklon pRHW12) werden in 1150 ml 1 %iger Essigesäure (vorgekühlt auf 4°C) resuspendiert und 30 Minuten gerührt. Die Suspension wird mit 5 M NaOH auf pH = 10,0 gestellt und weitere 2 Stunden gerührt. Nach dem Einstellen mit 5 M HCl auf pH = 7,5 wird weitere 15 Minuten gerührt und dann zentrifugiert (4°C, 1 Stunde 10.000 U/min, J21 Zentrifuge (Beckman), JAlO-Rotor).140 g. Biomass (E. coli HBlOl transformed with the expression clone pRHW12) are resuspended in 1150 ml of 1% acetic acid (pre-cooled to 4 ° C) and stirred for 30 minutes. The suspension is adjusted to pH = 10.0 with 5 M NaOH and stirred for a further 2 hours. After adjustment with 5 M HCl to pH = 7.5, the mixture is stirred for a further 15 minutes and then centrifuged (4 ° C., 10,000 rpm for 1 hour, J21 centrifuge (Beckman), JA10 rotor).
Die klare, überstehende Lösung wird auf eine 150 ml CPG(controlled pore glass)-Säule (CPG 10-350, Mesh Size 120/200) mit 50 ml/h aufgetragen, mit 1000 ml 25 mM Tris/ IM NaCl, pH 7,5 nachgewaschen und mit 25 mM Tris/lM KCNS/50% Äthylenglykol, pH = 7,5 eluiert (50 ml/h).The clear, supernatant solution is applied to a 150 ml controlled pore glass (CPG 10-350, Mesh Size 120/200) column at 50 ml / h, with 1000 ml of 25 mM Tris / IM NaCl, pH 7, 5 and washed with 25 mM Tris / lM KCNS / 50% ethylene glycol, pH = 7.5 (50 ml / h).
3 j 33 j 3
Der Interferonaktivität enthaltende Proteinpeak wurde gesam melt, gegen 0,1 M Na-Phosphat, pH = 6,0 und 10 % Polyäthylenglykol 40.000 über Nacht dialysiert, und das entstandene Präzipitat abzentrifugiert (40C, 1 Stunde, 10.000 ü/min, J21-Zentrifuge, JA20-Rotor) (siehe Tabelle 1).The protein peak containing interferon activity was GESAM melt, dialyzed against 0.1 M Na-phosphate, pH = 6.0 and 10% polyethylene glycol 40,000 overnight and the resultant precipitate collected by centrifugation (4 0 C, 1 hour, 10,000 u / min, J21 Centrifuge, JA20 rotor) (see Table 1).
b) Weitere Reinigung b) Further cleaning
Das dialysierte und konzentrierte CPG-Eluat wird mit Puffer A (0,1 M Na-Phosphat pH = 6,25/25 % 1,2-Propylenglykol) 1:5 verdünnt und über ein "Superloop"-Injektionsgerät (Pharmacia) mit 0,5 ml/min auf die mit Puffer A äquilibrierte MonoS 5/5(Pharmacia, Kationenaustauscher)-Säule aufgetragen. Die Elution erfolgt durch 20 ml eines linearen Gradienten von 0 auf 1 M NaCl in Puffer A ebenfalls bei einer Flußrate von 0,5 ml/min. Der Durchlauf und die 1 ml Fraktionen wurden gesammelt und mittels eines CPE-Reduktionstests auf Interferonaktivität getestet. Die aktiven Fraktionen wurden gesammelt.The dialyzed and concentrated CPG eluate is diluted 1: 5 with buffer A (0.1 M Na phosphate pH = 6.25 / 25% 1,2-propylene glycol) and assayed 0 with a "Superloop" injection device (Pharmacia) , 5 ml / min applied to the MonoS 5/5 (Pharmacia, cation exchanger) equilibrated with buffer A column. Elution is carried out by 20 ml of a linear gradient from 0 to 1 M NaCl in Buffer A also at a flow rate of 0.5 ml / min. The run and the 1 ml fractions were collected and tested for interferon activity by a CPE reduction assay. The active fractions were collected.
+ CPE-Reduktionstest: A549 Zellen, EMC-Virus U: Einheiten bezogen auf Interferon-a2 (siehe Beispiel 2 der EP-A-O.115.613: E. CoIi HBlOl transformiert mit dem Ex- + CPE reduction test: A549 cells, EMC virus U: units based on interferon-a2 (see Example 2 of EP-AO.115.613: E. CoIi HBlOl transformed with the ex
pressionsklon pER 33) als Standard DL: Durchlaufpress clone pER 33) as standard DL: run
A. Antivirale Aktivität auf HumanzellenA. Antiviral activity on human cells
B. Antivirale Aktivität auf AffenzellenB. Antiviral activity on monkey cells
C. Antiproliferative Aktivität auf humanen Burkitt's Lymphom-Zellen (Zellinie Daudi)C. Antiproliferative Activity on Human Burkitt's Lymphoma Cells (Daudi Cell Line)
D. Antiproliferative Aktivität auf humanen Cervixcarcinom-Zellen (Zellinie HeLa)D. Antiproliferative Activity on Human Cervical Carcinoma Cells (Cell Line HeLa)
E. SäurestabilitätE. Acid stability
F. Serologische CharakterisierungF. Serological characterization
Zellinie: . Humane Lungenkarzinom-Zellinie A549Cell line:. Human lung carcinoma cell line A549
(ATCC CCL 185)(ATCC CCL 185)
Virus: Maus Encephalomyocarditis-Virus (EMCV) Testsystem: Hemmung des cytopathischen EffektsVirus: Mouse Encephalomyocarditis virus (EMCV) Test system: Inhibition of the cytopathic effect
(alle Titrationen wurden vierfach durchgeführt)(all titrations were done four times)
Ein partiell gereinigtes Präparat von HuIFN-omegal mit einem Proteingehalt von 9.4 mg/ml wurde in einer geeigneten Verdünnung im genannten Testsystem titriert. Das Präparat zeigte eine antivirale Wirkung mit einer spezifischen Aktivität von 8300 IE/mg bezogen auf den Referenzstandard Go-23-901-527.A partially purified preparation of HuIFN-omegal with a protein content of 9.4 mg / ml was titrated in a suitable dilution in said test system. The preparation showed an antiviral activity with a specific activity of 8300 IU / mg based on the reference standard Go-23-901-527.
Zellinie: GL-V3 Affennierenzellen (Christofinis G.J., J. Med. Microbiol. 3_, 251-258, 1970)Cell line: GL-V3 monkey kidney cells (Christofinis G.J., J. Med. Microbiol. 3_, 251-258, 1970)
Virus: Vesicular Stomatitis Virus (VSV) Testsystem: Plaque-Reduktions-Test (alle Titrationen vierfach) .Virus: Vesicular stomatitis virus (VSV) Test system: Plaque reduction test (all titrations fourfold).
Das in Beispiel 12A beschriebene Präparat zeigte eine spezifische antivirale Aktivität von 580 E/mg im genannten Testsystem.The preparation described in Example 12A showed a specific antiviral activity of 580 U / mg in said test system.
C. Antiproliferative Aktivität auf humanen Burkitt1s Lymphom-Zellen (Zellinie Daudi) C. Antiproliferative Activity on Human Burkitt 1 s Lym phom Cells (Daudi Cell Line)
Die humae Burkitt1s Lymphom-Zellinie Daudl wurde in Gegenwart verschiedener Konzentrationen von HuIFN-omegal gezüchtet. Nach zwei, vier und sechs Tagen Inkubation bei 37°C wurde die Zelldichte bestimmt; unbehandelte Kulturen dienten als Kontrollen, Alle Kulturen wurden dreifach parallel angesetzt. Aus der nachfolgenden Abbildung geht hervor, daß IFN-omega eine ausgeprägte Hemmung der Zellproliferation bei einer Konzentration von 100 antiviralen Einheiten (IE, siehe Beispiel 12A) pro ml zeigt; bei einer Konzentration von 10 ΙΕ/ml war eine partielle, transiente Hemmung zu beobachten (Folgende Symbole werden in der nachfolgenden Abbildung verwendet: O Kontolle,* 1 IE/ml, C 10 IE/ml, "^ 100 IE/ml).The humae Burkitt 1 s lymphoma cell line Daudl was grown in the presence of various concentrations of HuIFN-omegal. After two, four and six days of incubation at 37 ° C, the cell density was determined; Untreated cultures served as controls, all cultures were set up in triplicate. The following figure shows that IFN-omega shows a marked inhibition of cell proliferation at a concentration of 100 antiviral units (IE, see Example 12A) per ml; at a concentration of 10 ΙΕ / ml, a partial, transient inhibition was observed (following symbols are used in the following figure: O control, * 1 IU / ml, C 10 IU / ml, "^ 100 IU / ml).
! Λ .< 'j ! Λ
D. Antiproliferative Aktivität auf humanen Cervixcarcinom-Zellen (Zellinie HeLa)D. Antiproliferative Activity on Human Cervical Carcinoma Cells (Cell Line HeLa)
Die humane Cervixcarcinom-Zellinie HeLa wurde in Gegenwart folgender Proteine bzw. Proteinmischungen gezüchtet:The human cervical carcinoma cell line HeLa was cultured in the presence of the following proteins or protein mixtures:
HuIFN-omegal (siehe Beispiel 12A) 100 IE/ml HuIFN-gamma (siehe Beispiel 12A) 100 IE/ml Humaner Tumor-Ne'Rrose-Faktor (HuIi1N) , >_98 % rein, hergestellt von Genentech Inc., San Franzisco, USA (siehe Pennica D. et al., Nature 312, 724-729; 1984) 100 ng/mlHuIFN-omegal (see Example 12A) 100 IU / ml HuIFN-gamma (see Example 12A) 100 IU / ml Human Tumor Ne'Rrose Factor (HuIi 1 N),> _98% pure, manufactured by Genentech Inc., San Franzisco, USA (see Pennica D. et al., Nature 312 , 724-729, 1984) 100 ng / ml
Alle binären Kombinationen der genannten Proteine Konzentrationen wie obenAll binary combinations of said protein concentrations are as above
Je 2 Kulturen wurden in 3 cm-Kunststoff-Gewebekulturschalen angesetzt (50 000 Zellen/Schale) und sechs Tage bei 37°C inkubiert; anschließend wurde die Zelldichte bestimmt. Behandlung der Zellen mit HuIFN-omegal oder HuINF-gamma hatte nur geringen Einfluß auf das Zellwachstum, während HuIFN-gamma einen deutlichen cytostatischen Effekt zeigte. Kombinationen von IFN-gamma mit IFN-omegal zeigten synergistische cytostatische/cytotoxische Wirkung.Each 2 cultures were seeded in 3 cm plastic tissue culture dishes (50,000 cells / dish) and incubated at 37 ° C for six days; then the cell density was determined. Treatment of cells with HuIFN-omegal or HuINF-gamma had little effect on cell growth, while HuIFN-gamma showed a marked cytostatic effect. Combinations of IFN-gamma with IFN-omegal showed synergistic cytostatic / cytotoxic effects.
Die nachfolgende Abbildung zeigt das Ergebnis des Versuchs:The following figure shows the result of the experiment:
30 50 10030 50 100
ZELLEN/SCHALECELL / SHELL
Folgende Symbole werden in der obigen Abbildung verwendet; C unbehandelte Kontrolle, T HuTNF, O HuIFN-' omegal, G HuIFN-gamma.The following symbols are used in the figure above; C untreated control, T HuTNF, O HuIFN-omegal, G HuIFN-gamma.
- 67 - / 4 6 3 I c - 67 - / 4 6 3 I c
Zur Untersuchung der Säurestabilität von HuIFN-omegal wurde eine Verdünnung des in Beispiel 12A genannten Präparates in Zellkulturmedium (U/min.I 1640 mit 10 % fötalem Kalbsserum) mit Hilfe von HCl auf pH 2 eingestellt, 24 Stunden bei 40C inkubiert und anschließend mit NaOH neutralisiert. Diese Probe wurde im antiviralen Test titriert (siehe Beispiel 12A); sie zeigte 75 % der biologischen Aktivität einer bei neutralem pH inkubierten Kontrolle; IFN-omegal ist somit als säurestabil zu bezeichnen.To examine the acid stability of HuIFN-omegal a diluent mentioned in Example 12A preparation in cell culture medium (U / min.I 1640 with 10% fetal calf serum) was adjusted by means of HCl to pH 2, incubated 24 hours at 4 0 C, and then neutralized with NaOH. This sample was titered in the antiviral assay (see Example 12A); it showed 75% of the biological activity of a control incubated at neutral pH; IFN-omegal is thus to be designated as acid-stable.
Zur Bestimmung der serologischen Eigenschaften von HuIFN-omegal im Vergleich zu HuIFN-a2 wurden Proben (verdünnt auf 100 ΙΕ/ml) mit gleichen Volumina von Lösungen monoklonaler Antikörper oder polyklonaler Antiseren 90 Minuten bei 37°C vorinkubiert; anschließend wurde die antivirale Aktivität der Proben bestimmt. Die nachfolgende Tabelle zeigt, daß HuIFN-omegal nur durch ein Antiserum gegen Leukocyteninterferon in relativ hoher Konzentration neutralisiert werden kann, nicht aber durch Antikörper, die gegen HuIFN-a2 oder HuIFN-beta gerichtet sind. HuIFN-omegal ist somit weder mit HuIFN-a2 noch mit HuIFN-beta serologisch verwandt:To determine the serological properties of HuIFN-omegal compared to HuIFN-a2, samples (diluted to 100 ΙΕ / ml) were pre-incubated with equal volumes of solutions of monoclonal antibodies or polyclonal antisera for 90 minutes at 37 ° C; then the antiviral activity of the samples was determined. The table below shows that HuIFN-omegal can only be neutralized by an antiserum against leukocyte interferon at a relatively high concentration, but not by antibodies directed against HuIFN-a2 or HuIFN-beta. HuIFN-omegal is therefore not serologically related to either HuIFN-a2 or HuIFN-beta:
Antiserum Verdünnung Neutralisierung vonAntiserum dilution neutralization of
monokl. Antikörper ]xg/TRl HuIFN-a2 HuIFN-omegalmonocl. Antibodies ] xg / TRl HuIFN-a2 HuIFN-omegal
EBI-1EBI-1
-11) -1 1)
EBI-3 EBI -3
L3B72) L3B7 2)
Schaf-anti-Leu kocy ten -I FNSheep anti-Leukocyte -I FN
3)3)
Kaninchen-anti-HuIFN-a2Rabbit anti-HuIFN-a2
Schaf-anti-HuIFN-ß4) Sheep anti-HuIFN-ß 4)
1010
100100
10001000
1010
100100
10001000
100100
10001000
1:50 0001:50 000
1: 5 0001: 5,000
1: 5001: 500
1: 501:50
1: 1 000 1: 100 1: 101: 1 000 1: 100 1:10
1:1:
O O OO O O
O OO O
= siehe EP-A-O.119.476= see EP-A-O.119.476
= A.,Berthold et al. in Arzneimittelforschung 35, 364-369 (1985)= A., Berthold et al. in Arzneimittelforschung 35 , 364-369 (1985)
= Research Reference Reagent Catalog No. G-026-502-568 · = Research Reference Reagent Catalog No. G-028-501-568 Research Resources Branch, National Institute of Allergy and Infectious Diseases, Bethesda, Maryland, USA.= Research Reference Reagent Catalog No. G-026-502-568 · = Research Reference Reagent Catalog No. G-028-501-568 Research Resources Branch, National Institute of Allergy and Infectious Diseases, Bethesda, Maryland, USA.
Symbole: - nicht getestet, O keine Neutralisation, + partielle Neutralisation, +++ vollständige NeutralisationSymbols: - not tested, O no neutralization, + partial neutralization, +++ complete neutralization
2 4 62 4 6
Patentanmeldung in der DDR Nr. AP C12N/279.375.4 Case 12/010-FlPatent application in the GDR No. AP C12N / 279.375.4 Case 12/010-Fl
Vorbemerkungen; su Bei spiel 1 o' Preliminary remarks; see example 1 o '
Das Konstruktionsschema für den IFN-omegal Hefeexpressionsvektor (siehe Abbildung) ist nicht maßstabgetreu.The construction scheme for the IFN-omegal yeast expression vector (see picture) is not to scale.
Das Ausgangsplasmid pES103 erhält man durch Einbringen des ca. 1450 bp langen ADHI-Promotor-Fragmentes (BamHI-XhoI) aus dem Plasmid AXaIl (siehe G. Ammerer: Methods Enzymology 101, 192-201 (1983), Academic Press) in pUC 18 (siehe Pharmacia P-L, # 27-4949-01).The starting plasmid pES103 is obtained by introducing the approximately 1450 bp ADHI promoter fragment (BamHI-XhoI) from the plasmid AXalI (see G. Ammerer: Methods Enzymology 101 , 192-201 (1983), Academic Press) in pUC 18 (see Pharmacia PL, # 27-4949-01).
Das Ausgangsplamid pJDB207 (siehe V.D. B egg's: Gene cloning in yeast, Ed. R. Williamson: Genetic engineering Vol. 2_, 175-203 (1981), Academic Press, London) wurde in E.coli RRl unter der DSM-Nummer 3181 bei Deutsche Sammlung von Mikroorganismen, Grisebachstraße 8, D-3400 Göttingen, von der gleichen Anmelderin am 28. 12. 1984 hinterlegt.The starting plasmid pJDB207 (see VD B eggs: Gene cloning in yeast, Ed. R. Williamson: Genetic engineering Vol. 2_, 175-203 (1981), Academic Press, London) was used in E. coli RR1 under DSM number 3181 in the German Collection of Microorganisms, Grisebachstraße 8, D-3400 Göttingen, deposited by the same applicant on December 28, 1984.
Enzymreaktionen wurden laut Vorschrift der Hersteller durchgeführt, sonstige Techniken sind Standardtechniken und kön-. nen z. B. dem Buch "Molecular cloning - a laboratory manual" von T. Maniatis (Cold Spring Harbor, 1982) entnommen werden.Enzyme reactions were carried out according to the manufacturer's instructions, other techniques are standard techniques and can-. nen z. In the book "Molecular cloning - a laboratory manual" by T. Maniatis (Cold Spring Harbor, 1982).
Bei der Hefetransformation wurden folgende Hefemedien verwendet :In the yeast transformation, the following yeast media were used:
YNB + CAA Medium (1 Liter):YNB + CAA medium (1 liter):
6,7 g YNB ohne Aminosäuren 5 g Casaminosäuren Wasser6.7 g YNB without amino acids 5 g casamino acids water
3897j·3897j ·
YPD Medium (I Liter): 10 g Hefeextrakt 20 g Bacto-Peptone WasserYPD medium (1 liter): 10 g yeast extract 20 g Bacto-Peptone water
χ minus Leu drop out Lösung (100 ml): 0,25 g Tryptophan 0,20 g Arginin 0,10 g Histidin 0,60 g Isoleucin 0,40 g Lysin 0,10 g Methionin 0,60 g Phenylalanin 0,50 g Threonin 0,12 g Adenin 0,24 g Uracil Wasser Sterilfiltrierenχ minus leu drop out solution (100 ml): 0.25 g tryptophan 0.20 g arginine 0.10 g histidine 0.60 g isoleucine 0.40 g lysine 0.10 g methionine 0.60 g phenylalanine 0.50 g Threonine 0.12 g adenine 0.24 g uracil water Sterile filtration
Medium für Hefekultur:Medium for yeast culture:
100 ml autoklaviertes YNB + CAA medium oder YPD Medium 4 ml 50 % Glucose 4 ml 50 χ minus Leu drop out Lösung100 ml autoclaved YNB + CAA medium or YPD medium 4 ml 50% glucose 4 ml 50 χ minus leu drop out solution
Sorbit Platten (600 ml): 109,2 g Sorbit 12 g GlucoseSorbitol plates (600 ml): 109.2 g sorbitol 12 g glucose
4, 02 g YNB 15 g Agar Wasser4, 02 g YNB 15 g agar water
Autoklavieren und auf 450C abkühlen, dann die drop out Lösung zusetzen und ausplattierenAutoclave and cool to 45 ° C., then add the drop-out solution and plate
-71- 246 -71- 246
Topagar (1 Liter):Topagar (1 liter):
g Sorbit 20 g Glucoseg sorbitol 20 g glucose
6, 7 g YNB 25 g Agar Wasser Autoklavieren6, 7 g YNB 25 g agar water autoclave
SED (25 ml):SED (25 ml):
12,5 ml 2 M Sorbit 1,25 ml 0,5 M EDTA 11,25 ml dest. Wasser 192,75 mg DTT (Dithiothreit) Sterilfiltration12.5 ml 2 M sorbitol 1.25 ml 0.5 M EDTA 11.25 ml dist. Water 192.75 mg DTT (Dithiothreitol) Sterile filtration
SCE (25 ml):SCE (25 ml):
12,5 ml 2 M Sorbit 5 ml 0,5 M Na3citrat 0,5 ml 0,5 M EDTA 7 ml steriles, dest. Wasser12.5 ml 2 M sorbitol 5 ml 0.5 M Na 3 citrate 0.5 ml 0.5 M EDTA 7 ml sterile, dist. water
CAS (25 ml):CAS (25 ml):
12,5 ml 2 M Sorbit12.5 ml 2 M sorbitol
2,5 ml 100 mM CaCl2 2.5 ml of 100 mM CaCl 2
0,25 ml 1 M Tris pH 7,0.25 ml of 1 M Tris pH 7,
9,75 ml steriles, dest. Wasser9.75 ml sterile, dist. water
PEG Lösung (20 ml):PEG solution (20 ml):
4 g PEG 4000 (Polyäthylenglykol, SERVA) 2 ml 100 mM CaCl2 4 g PEG 4000 (polyethylene glycol, SERVA) 2 ml 100 mM CaCl 2
0,2 ml 1 M Tris pH 7, 17,8 ml dest. Wasser Sterilfiltrieren0.2 ml 1 M Tris pH 7, 17.8 ml dist. Water sterile filtration
SOG (5 ml) :SOG (5 ml):
2,5 ml 2 M Sorbit2.5 ml 2 M sorbitol
1, 7 ml YPD1.7 ml of YPD
0,3 ml 100 mM CaCl2 12,5 μΐ 50 χ minus Leu drop out Lösung0.3 ml 100 mM CaCl 2 12.5 μΐ 50 χ minus Leu drop out solution
0,5 ml dest. Wasser Sterilfiltrieren0.5 ml of dist. Water sterile filtration
Beispiel ή3 ,' Example ή3 , '
Konstruktion eines Hefeexpressionsvektors für IFN-omegalConstruction of a yeast expression vector for IFN-omegal
a) Herstellung des Hefe-ÄDHI-Promotor Fragmentesa) Preparation of the yeast λDHI promoter fragment
80 μg -des Plasmids pES103 werden in 500 μΐ Lösung mit BamHI und Xhol doppelt verdaut. Das ca. 1400 Basenpaare (bp) lange Promotor Fragment wird über ein 1 % Agarosegel vom Vektor getrennt, aus dem Gel durch Elektroelution isoliert und präzipitiert. Das Fragment wird in 40 μΐ TE-Puffer (10 mM Tris, 1 mM EDTA, pH 8) aufgenommen.80 μg of the plasmid pES103 are digested twice in 500 μl solution with BamHI and Xhol. The approximately 1400 base pair (bp) promoter fragment is separated from the vector via a 1% agarose gel, isolated from the gel by electroelution and precipitated. The fragment is taken up in 40 μM TE buffer (10 mM Tris, 1 mM EDTA, pH 8).
b) Vorbereitung des Vektors pJDB207b) Preparation of the vector pJDB207
10 μg pJDB207 werden in 100 μΐ Lösung mit BamHI geschnitten und dadurch linearisiert. Um ein Religieren in der Folge zu vermeiden, werden die 5'terminalen Phosphatgruppen durch Behandlung mit Kalbsdarm-Phosphatase (Calf intestine phosphotase, CIP) entfernt. Die lineare Form wird auf einem 1 % Agarosegel von eventuell nicht geschnittenem Plasmid getrennt, daraus durch Elektroelution isoliert und präzipitiert. Die Vektor-DNA wird in 20 μΐ TE-Puffer aufgelöst.10 μg pJDB207 are cut in 100 μl solution with BamHI and thereby linearized. In order to avoid subsequent religation, the 5'-terminal phosphate groups are removed by treatment with calf intestinal phosphatase (Calf intestine phosphotase, CIP). The linear form is separated on a 1% agarose gel from any uncut plasmid, isolated therefrom by electroelution and precipitated. The vector DNA is dissolved in 20 μM TE buffer.
- 73 - 2 i 6 :m c- 73 - 2 i 6: m c
c) Expressionsvektor für IFN-omegalc) expression vector for IFN-omegal
50 μg Plasmid pRHW12 (Beispiel 5) werden in 600 μΐ Lösung mit HindIII linearisiert. Durch Zugabe des Klenow-Fragments der DNA-Polymerase I (10 Einheiten) und den vier Desoxynukleosidtriphosphaten (je 25 μΜ) und Inkubation bei Raumtemperatur werden die 5' überhängenden Enden in gerade Enden umgewandelt. Die lineare Form des Plasmids wird durch Agarosegelelektrophorese und anschließender Isolierung gereinigt. Das Fragment wird in 50 μΐ TE-Puffer gelöst.50 μg of plasmid pRHW12 (Example 5) are linearized in 600 μΐ solution with HindIII. By adding the Klenow fragment of DNA polymerase I (10 units) and the four deoxynucleoside triphosphates (25 μΜ each) and incubating at room temperature, the 5 'overhanging ends are converted to straight ends. The linear form of the plasmid is purified by agarose gel electrophoresis followed by isolation. The fragment is dissolved in 50 μΐ TE buffer.
Um mit dem Promotor Fragment kompatible Enden zu erzeugen, müssen Xhol-Linker an die Enden des linearen pRHW12 angebracht werden. 3 μΐ Xhol-Linker (0,06 OD01^ , Pharmacia P-L, #27-7758-01, Formel dCCCTCGAGG]) werden in 20 μΐ mittels 5 Einheiten T4-Polynukleotidkinase und rATP phosphoryliert. Nach Inaktivierung des Enzyms durch 10-minütiges Erhitzen bei 700C werden 5 μΐ dieser Lösung mit 10 μΐ linearem pRHW12 vereint und insgesamt 20 μΐ Reaktionslösung mit T4-DNA Ligase ligiert (16 Stunden bei 140C). Die Ligase wird durch 10-minütige Behandlung bei 700C inaktiviert, und das Reaktionsvolumen mit 1 χ Mediumpuffer (10 mM Tris, pH 7,5, 50 mM NaCl, 10 mM MgCl2) auf 150 μΐ gebracht.To generate ends compatible with the promoter fragment, Xhol linkers must be attached to the ends of the linear pRHW12. 3 μΐ Xhol linkers (0.06 OD 01 ^, Pharmacia PL, # 27-7758-01, formula dCCCTCGAGG)) are phosphorylated in 20 μΐ using 5 units of T4 polynucleotide kinase and rATP. After inactivation of the enzyme by heating for 10 minutes at 70 0 C 5 μΐ of this solution are combined with 10 μΐ linear pRHW12 and a total of 20 μΐ reaction solution with T4-DNA ligase ligated (16 hours at 14 0 C). The ligase is inactivated by 10-minute treatment at 70 0 C, and the reaction volume with 1 χ medium buffer (10 mM Tris, pH 7.5, 50 mM NaCl, 10 mM MgCl 2) brought to 150 μΐ.
Durch Behandlung mit 100 Einheiten Xhol werden die Xhol spezifischen 5' Überhänge freigesetzt. Das mit Xhol-Enden versehene, lineare pRHW12 wird durch Agarosegelelektrophorese gereinigt und aus dem Gel elektroeluiert. Vor dem Präzipitieren werden 5 μΐ Promotorfragment (Punkt a) zugesetzt. Nach dem Präzipitieren werden die DNA Moleküle in 14,5 μΐ TE-Puffer aufgenommen und nach Zusatz des Ligasepuffers und 5 Einheiten T4-DNA-Ligase 16 Stunden bei 14°C ligiert. Nach Hitzeinaktivierung des Enzyms wird das Volumen der Lösung mit 1 χ Mediumpuffer auf 200 μΐ gebracht, und die DNA mit BamHI geschnitten. Die gewünschte DNA wird durch Agarosegelreinigung erhalten und in 20 μΐ TE-Puffer gelöst..By treatment with 100 units of Xhol, the Xhol specific 5 'overhangs are released. The Xhol-terminated, linear pRHW12 is purified by agarose gel electrophoresis and electroeluted from the gel. 5 μΐ promoter fragment (point a) are added before precipitation. After precipitation, the DNA molecules are taken up in 14.5 μΐ TE buffer and ligated for 16 hours at 14 ° C after addition of the ligase buffer and 5 units of T4 DNA ligase. After heat inactivation of the enzyme, the volume of the solution is brought to 200 μΐ with 1 χ medium buffer and the DNA cut with BamHI. The desired DNA is obtained by agarose gel purification and dissolved in 20 μM TE buffer.
d) Ligieren der Fragmented) Ligation of the fragments
Der fertige Expressionsvektor entsteht durch Ligieren von 5 μΐ des BamHI-Fragmentes (Promotor und IFN-omegal-Gen) mit 1 μΐ linearisiertem pJDB207 Vektor (Hefe 2μ Terminator und Hefe 2μ Replikationsursprung, Leu2 Marker, E.coli Replikationsursprung, Ampicillin Resistenzgen) in insgesamt 10 μΐ Lösung in Gegenwart von 1 unit T4-DNA Ligase.The final expression vector is obtained by ligating 5 μΐ of the BamHI fragment (promoter and IFN-omegal gene) with 1 μΐ of linearized pJDB207 vector (yeast 2μ terminator and yeast 2μ origin of replication, Leu2 marker, E. coli origin of replication, ampicillin resistance gene) in total 10 μΐ solution in the presence of 1 unit T4 DNA ligase.
e) Transformatione) transformation
10 μΐ kompetente E.coli HBlOl Zellen werden durch Zusatz von 5 μΐ Ligaselösung transformiert und auf LB-Ager mit 100 μg/ml Ampicillin plattiert.10 μΐ competent E. coli HBlOl cells are transformed by addition of 5 μΐ ligase solution and plated on LB agar with 100 μg / ml ampicillin.
12 der entstandenen Klone wurden willkürlich ausgesucht, und die darin enthaltenen Plasmide im Minimaßstab (1,5 ml Kulturen) isoliert. Nach Schnitt dieser Plasmide mit verschiedenen Restriktionsenzymen und Agarosegelelektrophorese wurde ein Plasmid ausgewählt, das die gewünschte Konstruktion aufweist, und mit ρY-JDB-HuIFN-omegal bezeichnet.Twelve of the resulting clones were picked at random and the plasmids contained therein were isolated on a mini scale (1.5 ml cultures). After cutting these plasmids with various restriction enzymes and agarose gel electrophoresis, a plasmid having the desired construction was selected and designated ρY-JDB-HuIFN-omegal.
f) Hefetransformation · f) Yeast Transformation ·
Als Vorkultur werden 25 ml YPD + minus Leu drop out Lösung mit einer Hefekolonie (Stamm GM3-C2) inokuliert. Die Kultur wird über Nacht bei 300C wachsen gelassen. 100 ml YPD + minus Leu drop out Lösung werden mit 100 μΐ der Vorkultur inokuliert und bei 300C bis zu einer 0D^nn von 1As preculture 25 ml of YPD + minus Leu drop out solution are inoculated with a yeast colony (strain GM3-C2). The culture is grown overnight at 30 ° C. 100 ml YPD + minus Leu drop out solution are inoculated with 100 μΐ of the preculture and at 30 0 C up to a 0D ^ nn of 1
7 600 nm 7 600 nm
wachsen gelassen (ca. 4x10 Zellen/ml). Die Hefezellen werden abzentrifugiert (5 Minuten bei 50Ö0 rpm). Das Pellet wird in 10 ml SED resuspendiert und 10 Minuten bei 300C inkubiert. Die Zellen werden nochmals abzentrifugiert (6 Minuten bei 2500 rpm). Die Zellen werden in 10 ml SCE resuspendiert.grow (about 4x10 cells / ml). The yeast cells are centrifuged off (5 minutes at 50O0 rpm). The pellet is resuspended in 10 ml of SED and incubated at 30 ° C. for 10 minutes. The cells are again centrifuged off (6 minutes at 2500 rpm). The cells are resuspended in 10 ml of SCE.
- 7s-- 7s-
Es werden 100 μΐ Glusulase (B-Glucuronidase, Arylsulfatase, Boehringer-Manhheim) zugesetzt und 30 Minuten bei 300C inkubiert. Dabei entstehen die Sphäroblasten. Die Sphäroblasten werden abzentrifugiert (5 Minuten bei 2000 rpm). Das Pellet wird einmal mit CAS gewaschen und in 500 μΐ GAS resuspendiert.Are added 100 μΐ Glusulase (B-glucuronidase, arylsulfatase, Boehringer-Manhheim) and incubated for 30 minutes at 30 0 C. This creates the spheroplasts. The spheroplasts are centrifuged off (5 minutes at 2000 rpm). The pellet is washed once with CAS and resuspended in 500 μΐ of GAS.
120 μΐ Sphäroblasten werden mit 6 μg Plasmid-DNA (pY-JDB-HuIFN-omegal) versetzt und 15 Minuten bei Raumtemperatur inkubiert. Nach Zusatz von 1 ml PEG-Lösung wird weitere 15 Minuten bei Raumtemperatur inkubiert und anschließend die Zellen abzentrifugiert (5 Minuten bei 2000 rpm). Das Pellet wird in 150 μΐ SOG resuspendiert und 30 Minuten bei 300C inkubiert. Danach werden 5 ml Topagar + 250 μΐ 50 χ minus Leu drop out Lösung zugesetzt, und die Zellen auf Sorbitplatten plattiert. Nach 2 bis 4 Tagen Inkubation bei 3O0C entwickeln sich Kolonien.120 μΐ spheroplasts are mixed with 6 μg of plasmid DNA (pY-JDB-HuIFN-omegal) and incubated for 15 minutes at room temperature. After addition of 1 ml of PEG solution, the mixture is incubated for a further 15 minutes at room temperature and then the cells are centrifuged off (5 minutes at 2000 rpm). The pellet is resuspended in 150 μΐ SOG and incubated for 30 minutes at 30 0 C. Thereafter, 5 ml Topagar + 250 μΐ 50 χ minus Leu drop out solution are added and the cells plated on sorbitol plates. After 2 to 4 days of incubation at 3O 0 C, colonies develop.
g) He'fe-Ze lly sateg) He'e-ze lly sate
25 ml YNB + CAA Medium + 1 ml 50 % Glucose + 1 ml 50 χ minus Leu drop out Lösung werden mit einer transformierten Hefekolonie inokuliert. Die Inkubationsdauer beträgt.zumindest 40 Stunden bei 300C. 13 ml dieser Kultur werden 5 Minuten bei 4500 rpm abzentrifugiert. Das Pellet wird unter Vortexen in 0,5 ml 2 M Guanidinium-Hydrochlorid resuspendiert. Nach Zusatz von 2 ml Glaskugeln (Durchmesser: 0,4 bis 0,5 mm) wird 10 Minuten bei 4°C heftig geschüttelt. Danach wird der Überstand in ein Eppendorfgefäß umgefüllt und bei 00C inkubiert. Die Glaskugeln werden einmal mit 0,5 ml 7 M Guanidinium-Hydrochlorid gewaschen, und die Waschlösung mit dem ersten Überstand vereint. Die Lösung wird 1 Minute in einer Eppendorf-Zentrifuge zentrifugiert. Der Überstand wird im CPE-Reduktionstest auf Interferonaktivität geprüft.25 ml YNB + CAA medium + 1 ml 50% glucose + 1 ml 50 χ minus leu drop out solution are inoculated with a transformed yeast colony. The incubation beträgt.zumindest for 40 hours at 30 0 C. 13 ml of this culture are centrifuged at 4500 rpm for 5 minutes. The pellet is resuspended in 0.5 ml of 2 M guanidinium hydrochloride while vortexing. After adding 2 ml of glass beads (diameter: 0.4 to 0.5 mm), shake vigorously for 10 minutes at 4 ° C. Thereafter, the supernatant is transferred to an Eppendorf vessel and incubated at 0 0 C. The glass beads are washed once with 0.5 ml of 7 M guanidinium hydrochloride, and the washing solution is combined with the first supernatant. The solution is centrifuged for 1 minute in an Eppendorf centrifuge. The supernatant is tested for interferon activity in the CPE reduction assay.
Ausbeute: 1 χ 10 Einheiten IFN-omegal/l HefekulturYield: 1 χ 10 units IFN-omegal / l yeast culture
Claims (7)
vr*rir>r*-\oiAvoPα3 (Νθ · "·" 0ι (βσνθ
vr * rir> r * - \ oiAvoP
(N CN ^ ^* «™S »- · - O #wf» in t * "
(N CN ^ ^ * «™
Asp Arg Asp Leu GIy Ser Ser170
Asp Arg Asp Leu GIy Ser Ser
St
S
At
A
Asp Arg Asp Leu GIy Ser Ser170
Asp Arg Asp Leu GIy Ser Ser
Asp Arg Asp Leu GIy Ser Ser170
Asp Arg Asp Leu GIy Ser Ser
aufweist.GIy Thr
having.
aufweist.Pro GIy Thr
having.
Formel8. The method according to claims 3 and 7, characterized in that the coding for IFN-omegal sequence the
formula
die für IFN-pseudo-omega2 codierende Sequenz die Formel9. The method according to claim 1, characterized in that
the sequence coding for IFN pseudo-omega2 is the formula
die für IFN-pseudo-omega4 codierende Sequenz die Formel'11. The method according to claim 1, characterized in that
the sequence coding for IFN pseudo-omega4 has the formula '
DSM Nr. 3004 ist.15. The method according to claim 14, characterized in that the host E. coli with the DSM no. 3003 or E. coli with the
DSM No. 3004 is.
EcoRl/BamHI-Fragmentes die DNA Sequenz der Formel18. The method according to claim 17, characterized in that the plasmid pBR322 instead of the plasmid itself shorter
EcoRI / BamHI fragment the DNA sequence of the formula
gaattcacgctGATCGCTAAAACATTGTGCAAAAAGAGGGTTGACTTTGCCTTCGCGA 5 9EcoRI Sau3A
gaattc acgct GATCG CTAAAACATTGTGCAAAAGAGGGTTGACTTTGCCTTCGCGA 5 9
Cys AspRBS HindIII
Cys Asp
das IFN-omega-Gen die DNA-Sequenz der Formel19. The method according to claim 18, characterized in that
the IFN-omega gene is the DNA sequence of the formula
aufweist, wobei X das Nucleotid A (pRHW12) oder G (pRHWll) >
where X is the nucleotide A (pRHW12) or G (pRHWll)
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
DE3428370A DE3428370A1 (en) | 1984-08-01 | 1984-08-01 | Interferon, genetic sequences which code therefor, and organisms producing these |
DE19853505060 DE3505060A1 (en) | 1985-02-14 | 1985-02-14 | Type I interferons, genetic sequences which code therefor, and organisms producing these |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
DD246318A5 true DD246318A5 (en) | 1987-06-03 |
Family
ID=25823496
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
DD27937585A DD246318A5 (en) | 1984-08-01 | 1985-07-29 | New genetic sequences generated by the coded type I interferon peptides and these organisms producing them |
Country Status (21)
Country | Link |
---|---|
EP (1) | EP0170204B1 (en) |
JP (2) | JP2566909B2 (en) |
KR (1) | KR0136799B1 (en) |
AT (1) | ATE67786T1 (en) |
AU (1) | AU600653B2 (en) |
BG (1) | BG60445B2 (en) |
CA (1) | CA1340184C (en) |
DD (1) | DD246318A5 (en) |
DE (1) | DE3584198D1 (en) |
DK (1) | DK175194B1 (en) |
ES (2) | ES8609475A1 (en) |
FI (1) | FI90667C (en) |
GR (1) | GR851866B (en) |
HK (1) | HK187896A (en) |
HU (1) | HU205779B (en) |
IE (1) | IE58942B1 (en) |
IL (1) | IL75963A (en) |
MX (1) | MX9203645A (en) |
NO (1) | NO177863C (en) |
NZ (1) | NZ212937A (en) |
PT (1) | PT80901B (en) |
Families Citing this family (19)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5231176A (en) * | 1984-08-27 | 1993-07-27 | Genentech, Inc. | Distinct family DNA encoding of human leukocyte interferons |
DE3607835A1 (en) * | 1986-03-10 | 1987-09-24 | Boehringer Ingelheim Int | HYBRID INTERFERONS, THEIR USE AS MEDICINAL PRODUCTS AND AS INTERMEDIATE PRODUCTS FOR THE PRODUCTION OF ANTIBODIES AND THE USE THEREOF AND METHOD FOR THEIR PRODUCTION |
EP0490233A1 (en) * | 1986-03-10 | 1992-06-17 | BOEHRINGER INGELHEIM INTERNATIONAL GmbH | Monoclonal antibodies against Bgl III-hybrid interferons, their use and process for preparing them |
US4863727A (en) * | 1986-04-09 | 1989-09-05 | Cetus Corporation | Combination therapy using interleukin-2 and tumor necrosis factor |
DE3633323A1 (en) * | 1986-10-01 | 1988-04-07 | Boehringer Ingelheim Int | NEW MONOCLONAL ANTIBODIES AGAINST IFN-OMEGA, METHOD FOR THE PRODUCTION THEREOF AND THEIR USE FOR CLEANING AND DETECTING IFN-OMEGA |
DE3635867A1 (en) * | 1986-10-22 | 1988-05-11 | Boehringer Ingelheim Int | NEW YEAR EXPRESSION VECTORS FOR IFN-OMEGA, METHOD FOR THEIR PRODUCTION AND USE THEREOF |
CA2641217A1 (en) | 1997-11-20 | 1999-06-03 | Vical Incorporated | Treatment of cancer using cytokine-expressing polynucleotides and compositions therefor |
WO2000040273A2 (en) * | 1999-01-08 | 2000-07-13 | Vical Incorporated | Treatment of viral diseases using an interferon omega expressing polynucleotide |
WO2004099231A2 (en) | 2003-04-09 | 2004-11-18 | Neose Technologies, Inc. | Glycopegylation methods and proteins/peptides produced by the methods |
US20050287628A1 (en) | 2002-03-07 | 2005-12-29 | Markus Aebi | System and method for the production of recombinant glycosylated proteins in a prokaryotic host |
CA2818688A1 (en) * | 2002-03-07 | 2003-09-12 | Eidgenossische Technische Hochschule Zurich | System and method for the production of recombinant glycosylated proteins in a prokaryotic host |
WO2004096852A1 (en) * | 2003-04-25 | 2004-11-11 | The Institute Of Microbiology And Epidemiology, Academy Of Military Medical Sciemces, Pla | A RECOMBINANT HUMAN INTERFERON ϖ, THE METHOD FOR EXPRESSING IT AND THE USES OF IT |
AU2006245969B8 (en) | 2005-05-11 | 2011-08-25 | Eth Zurich | Recombinant N-glycosylated proteins from procaryotic cells |
US8895014B2 (en) | 2008-02-20 | 2014-11-25 | Glycovaxyn Ag | Bioconjugates made from recombinant N-glycosylated proteins from procaryotic cells |
AU2010322454B2 (en) | 2009-11-19 | 2016-05-19 | Glaxosmithkline Biologicals S.A. | Biosynthetic system that produces immunogenic polysaccharides in prokaryotic cells |
CN103079591B (en) | 2010-05-06 | 2017-07-28 | 格林考瓦因有限公司 | Capsular gram-positive bacteria bioconjugate vaccine |
WO2013024158A1 (en) | 2011-08-17 | 2013-02-21 | INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) | Combinations of protein kinase inhibitors and interferons or of protein kinase inhibitors and direct acting antivirals for the treatment and the prevention of hcv infection |
WO2013024156A2 (en) | 2011-08-17 | 2013-02-21 | INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) | Combinations of anti-hcv-entry factor antibodies and interferons for the treatment and the prevention of hcv infection |
WO2014033266A1 (en) | 2012-08-31 | 2014-03-06 | INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) | Anti-sr-bi antibodies for the inhibition of hepatitis c virus infection |
Family Cites Families (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CA1217440A (en) * | 1982-08-18 | 1987-02-03 | Michael A. Innis | INTERFERON .alpha. 6L |
AU1946283A (en) * | 1982-08-18 | 1984-03-07 | Cetus Corporation | Interferon-alpha 6l |
DE3247922A1 (en) * | 1982-12-24 | 1984-06-28 | Boehringer Ingelheim International GmbH, 6507 Ingelheim | DNA SEQUENCES, THEIR PRODUCTION, PLASMIDES CONTAINING THESE SEQUENCES AND THE USE THEREOF FOR THE SYNTHESIS OF EUKARYOTIC GENE PRODUCTS IN PROKARYOTS |
ATE47864T1 (en) * | 1984-08-27 | 1989-11-15 | Genentech Inc | MISCELLANEOUS FAMILY OF HUMAN WBC INTERFERONS, COMPOSITIONS CONTAINING THEM, METHODS FOR THEIR PRODUCTION, AND DNA AND TRANSFECTED HOSTS THEREOF. |
-
1985
- 1985-07-24 AT AT85109284T patent/ATE67786T1/en not_active IP Right Cessation
- 1985-07-24 DE DE8585109284T patent/DE3584198D1/en not_active Expired - Lifetime
- 1985-07-24 EP EP85109284A patent/EP0170204B1/en not_active Expired - Lifetime
- 1985-07-29 GR GR851866A patent/GR851866B/el unknown
- 1985-07-29 DD DD27937585A patent/DD246318A5/en not_active IP Right Cessation
- 1985-07-29 AU AU45549/85A patent/AU600653B2/en not_active Expired
- 1985-07-30 DK DK198503463A patent/DK175194B1/en not_active IP Right Cessation
- 1985-07-30 NO NO853012A patent/NO177863C/en not_active IP Right Cessation
- 1985-07-30 ES ES545725A patent/ES8609475A1/en not_active Expired
- 1985-07-30 IL IL75963A patent/IL75963A/en not_active IP Right Cessation
- 1985-07-31 HU HU852942A patent/HU205779B/en unknown
- 1985-07-31 KR KR1019850005511A patent/KR0136799B1/en not_active IP Right Cessation
- 1985-07-31 JP JP60169667A patent/JP2566909B2/en not_active Expired - Lifetime
- 1985-07-31 IE IE190685A patent/IE58942B1/en not_active IP Right Cessation
- 1985-07-31 FI FI852956A patent/FI90667C/en not_active IP Right Cessation
- 1985-07-31 CA CA000487921A patent/CA1340184C/en not_active Expired - Lifetime
- 1985-07-31 NZ NZ212937A patent/NZ212937A/en unknown
- 1985-08-01 PT PT80901A patent/PT80901B/en unknown
-
1986
- 1986-02-26 ES ES552431A patent/ES8708013A1/en not_active Expired
-
1992
- 1992-06-26 MX MX9203645A patent/MX9203645A/en unknown
-
1993
- 1993-08-27 JP JP5212933A patent/JP2567195B2/en not_active Expired - Lifetime
-
1994
- 1994-01-25 BG BG98417A patent/BG60445B2/en unknown
-
1996
- 1996-10-10 HK HK187896A patent/HK187896A/en not_active IP Right Cessation
Also Published As
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
DE3238554C2 (en) | ||
DE3544520C2 (en) | Dog interferons | |
EP0236920B1 (en) | Hybrid interferons, their use as medicaments and as intermediates in the preparation of antibodies, their use and process for their preparation | |
EP0170204B1 (en) | Genetic sequences, type i interferon peptide coded by them, and these organisms producing the same | |
EP0271824B1 (en) | Horse gamma interferon | |
EP0147819B1 (en) | Purification of recombinant interleukin-2 | |
DD159782A5 (en) | METHOD FOR PRODUCING AN IMMUNOLOGICAL OR BIOLOGICAL ACTIVITY OF HUMANLEUCOCYTE INTERFERONIC POLYPEPTIDE | |
DD202085A5 (en) | METHOD FOR PRODUCING HUMAN FIBROBLAST INTERFERON | |
DE3382575T2 (en) | DNA SEQUENCES, RECOMBINANT DNA MOLECULES AND METHOD FOR THE PRODUCTION OF PIG GROWTH HORMONE-LIKE POLYPEPTIDES. | |
DD212748A5 (en) | METHOD FOR THE FORMATION OF DOUBLE-STRAIN, HYBRID HUMAN-LEUKOCYTE INTERFERONE ENCODING DNA | |
GB2079291A (en) | Interferons and process for their preparation | |
DD160280A5 (en) | PROCESS FOR PREPARING AN IMMUNOLOGICAL OR BIOLOGICAL ACTIVITY OF HUMAN FIBROBLAST INTERFERONYPROOF POLYPEPTIDE | |
DE3308030C2 (en) | Animal interferons | |
AU606585B2 (en) | Human granulocyte-macrophage colony stimulating factor-like polypeptides and processes for producing them in high yields in microbial cells | |
CH663032A5 (en) | DOUBLE STRING DNA, REPLICABLE PLASMIDIC EXPRESSION CARRIERS FOR THE MICROBIAL PRODUCTION OF HYBRID HUMAN LEUCOCYTE INTERFERON AND TRANSFORMED MICROORGANISMS. | |
AT393690B (en) | Homogeneous, recombinant immune interferon fragments | |
AT394209B (en) | METHOD FOR PRODUCING NEW MICROORGANISMS FOR PRODUCING HYBRID HUMAN LEUCOCYTE INTERFERON | |
AT392082B (en) | The gene encoding polypeptide Interleukin-2, recombinant, DNA containing this gene, cell recombinant, and method for producing interleukin-2 using the named cells | |
DE3428370A1 (en) | Interferon, genetic sequences which code therefor, and organisms producing these | |
DE3505060A1 (en) | Type I interferons, genetic sequences which code therefor, and organisms producing these | |
AT394208B (en) | Process for the preparation of vectors | |
AT394207B (en) | Process for the preparation of human leukocyte interferons | |
DD251789A5 (en) | Process for the preparation of recombinant equine and canine interferons | |
DD259419A5 (en) | Process for the preparation of new expression plasmids | |
DD264706A5 (en) | Process for the preparation of polypeptides (horse-interforon-gamma) |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
ENJ | Ceased due to non-payment of renewal fee |