CZ68597A3 - Modified human c3 proteins - Google Patents
Modified human c3 proteins Download PDFInfo
- Publication number
- CZ68597A3 CZ68597A3 CZ97685A CZ68597A CZ68597A3 CZ 68597 A3 CZ68597 A3 CZ 68597A3 CZ 97685 A CZ97685 A CZ 97685A CZ 68597 A CZ68597 A CZ 68597A CZ 68597 A3 CZ68597 A3 CZ 68597A3
- Authority
- CZ
- Czechia
- Prior art keywords
- protein
- factor
- convertase
- cleavage
- arg
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/48—Hydrolases (3) acting on peptide bonds (3.4)
- C12N9/50—Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25)
- C12N9/64—Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25) derived from animal tissue
- C12N9/6421—Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25) derived from animal tissue from mammals
- C12N9/6424—Serine endopeptidases (3.4.21)
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K47/00—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
- A61K47/50—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates
- A61K47/51—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent
- A61K47/68—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. an Fc-fragment
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K47/00—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
- A61K47/50—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates
- A61K47/51—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent
- A61K47/68—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. an Fc-fragment
- A61K47/6801—Drug-antibody or immunoglobulin conjugates defined by the pharmacologically or therapeutically active agent
- A61K47/6803—Drugs conjugated to an antibody or immunoglobulin, e.g. cisplatin-antibody conjugates
- A61K47/6811—Drugs conjugated to an antibody or immunoglobulin, e.g. cisplatin-antibody conjugates the drug being a protein or peptide, e.g. transferrin or bleomycin
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P37/00—Drugs for immunological or allergic disorders
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/46—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
- C07K14/47—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
- C07K14/4701—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals not used
- C07K14/472—Complement proteins, e.g. anaphylatoxin, C3a, C5a
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K48/00—Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Public Health (AREA)
- Immunology (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Biophysics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
Description
Vynález se týká proteinu nativní komplementové dráhy, který je modifikovaný tak, že je schopen vytváření stabilní C3 konvertasy, DNA sekvence, kódující tento protein, jeho použití v terii, konjugátu, kde specifickou vazebnou kupinou je specifický vazebný protein, farmaceutické formulace, obsahující takový protein a způsobu redukce proteinů komplementové dráhy podáním takového proteinu savci.
Dosavadní stav techniky
Existuje několik vzácně se přirozeně vyskytujících podmínek, kdy normální regulace tekutinové fáze nemůže proběhnout a spontánní C3 konverze nakonec vede v generál izovanou depleci C3 z cirkulace: - (i) genetická deficience faktoru H nebo I (13), (ii) přítomnost protilátek (nefritických faktorů), které se váží na C3bBb a brání disociaci (4), a (iii) kontakt s proteinem kobřího jedu nazývaného faktor kobřího jedu (CVF), který se kombinuje s faktorem B a formuje C3 konvertasa enzym, který neobsahuje C3b a není ovlivněn faktory Hal (14). Toto ilustruje normální fyziologický význam down regulace komplementu za absence specifické aktivace.
Existují také okolnosti, kdy se specifická aktivace vyskytuje, ale je nežádoucí, zejmena je-li namířena proti tkáním hostitele (t.j. u poškození tkáně ischemií nebo chirurgií) nebo proti cizorodému materiálu úmyslně podanému za terapeutickým účelem (jako je xenograft, arteficiální orgán nebo dialyzační membrána). Aktivace komplementu vede k nežádoucímu ataku a dalšímu poškození, takže v těchto případech bude vhodné blokovat nebo inhibovat aktivaci a odpověď.
Existující přístupy k prevenci komplementem zprostředkovaného poškození jsou zaměřeny na užití down regulačních proteinů (CR1, MCP, DAF a faktorů H a I) k inhihici aktivace komplementu. Inhibitory komplementu jako faktor I, faktor H a solubilní deriváty membránových vazebných proteinů CR1, DAF, MCP suprivují kapalná-fáze amplifikační smyčky alternativní dráhy. Proto se zkoušelo užiti těchto molekul, zejmena CR1 (který se zdá být nejúčinnější) k redukci komplementem zprostředkovaného poškození na modelech fyziologických situací (10,18).
Faktor H je endogenně přítomen v krevní plasmě ve vysoké koncentraci (typicky 0,3 až 0,5 mg/ml), takže ačkoliv vysoké hladiny inhibitorů mírní reakci v kapalné fázi, jejich účinek je slabý, ačkoliv velké množství purifikovaných proteinů může být podáno in vivo (t.j. pravděpodobně až 5 mg/kg tělesné hmotnosti solubilního CR1). Navíc, alternativní dráha je aktivována povrchy, kde je efektu faktoru H již zabráněno. Zatímco toto ne nezbytně konkomitantně redukuje aktivity jiných inhibitorů, stejné faktory napovídají, že nejsou pravděpodobně kompletně nebo univerzálně efektivní.
Faktor kobřího jedu (CVF) způsobuje generování stabilní C3 konvertasy, která může být použita experimentálně k depleci komplementu u zvířat in vivo, a v jiných vzorcích (t.j. lidské krevní plasmě) in vitro. CVF je potentní (t.j. 40 pg/kg může zrušit aktivitu komplementu u myši (16)). Nicméně, jsou zde nevýhody, které mohou znemožnit jeho terapeutické užití u lidí.
Nejprve je získán z kobřího jedu (obtížný zdroj k získání a nebezpečný) a musí pak být pečlivě purifikován od neurotoxinů jedu. Je také samozřejmě obtížné získání zásob. Tento problém nemůže být snadno překonán klonováním a expresí genu ex vivo, jelikož existují posttranslační modifikace, které probíhají u hada (specifické proteolytické zpracování), které může být obtížné (nebo nemožné) reprodukovat in vitro. Navíc, enzymy a podmínky trávení vyžadované pro toto zpracování jsou dosud neznámé. Za druhé, protein je cizorodého původu (pro lidi) a proto je imunogenní. Toto vylučuje jeho opakované terapeutické užití, jak může být žádoucí pro dekomplementaci pacienta po mnoho týdnů (t.j. pro dovolení přežití xenograftu).
Ačkoliv má CVF některé strukturální a funkční homologie s lidským C3 (17), má také velkou odlišnost v některých ohledech (t.j. struktuře řetězce místě biosyntézy, insenzitivitě na regulátory komplementu, formování stabilní C3 konvertasy). Není derivován od kobřího C3 ekvivalentu, který je znám, byl klonován a sekvencován, a který se ve většině struktury a funkce podobá lidskému C3 více než CVF (8).
CVF je specifický produkt jedu zvířete velké evoluční odlišnosti od homo sapiens. Není proto možné užít genetické manipulace k modifikaci tohoto proteinu na produkt, který může být neimunogenicky použit u lidí.
Nyní byla vyvinuta alternativní strategie, spočívající v překlenutí fyziologické regulace a, místo inhibice aktivace komplementu, způsobuje super aktivaci systému. Má dvě aplikace. První, může být použita in vivo k aktivaci komplementu dokud není jedna nebo více komponent vyčerpána, což vede ke ztrátě schopnosti produkovat lokální odpověd na jakoukoliv další zátěž (jako je xenograft). Za druhé, neregulovaná superaktivace může být úmyslně lokalizována na jednotlivý cíl (t.j. virus nebo virem infikovanou buňku) ke zvýšení senzitivity tohoto cíle na komplementem zprostředkované destruktivní odpovědi.
Termín regulátory komplementové aktivace jak je zde použit, zahrnuje všechny proteiny, které inhibují amplifikaci C3 konverze, není omezen na ty proteiny, jejichž geny jsou umístěny v RCA genetické lokusu. Nemůže nicméně zahrnovat up-regulátory jako je properdin. C3 konverze je definována jako proteolytická konverze C3 na C3b a C3a, není-li jinak uvedeno, a C3 konvertasa (nebo jednoduše konvertasa) je definována jako enzym (typicky komplex dvou nebo více proteinových komponent, například C3bBb, C3iBb, CVFBb nebo C4b2a), který katalyzuje tuto reakci.
Podstata vynálezu
Tak, v prvním aspektu vynález poskytuje nativní protein komplementové dráhy tak, že tento protein je schopný vytvářet stabilní C3 konvertasu.
Nativním je míněno přirozeně se vyskytující, tzn. že ho lze získat v přírodě. Tak definice zahrnuje jakýkoliv přirozeně se vyskytující protein komplementové dráhy modifikovaný jak je definováno výše. Není úmyslem se omezovat na druhově specifické proteiny. Jinými slovy, modifikovaný .lidský protein může být například použit jako stabilní C3 konvertasa v jiných druzích savců. Typicky, budou použity modifikované proteiny komplementové dráhy ze stejného druhu.
Modifikace C3 DNA kódující sekvence, například užitím místně řízené mutagenese, může produkovat variantu C3, která je resistentní na komplement regulační proteiny, zatímco si udržuje pozitivní funkční vlastnosti (štěpení na C3b C3 konvertasou) a vlastnosti strukturální integrity (správná struktura řetězce, a přítomnost thiolesterové vazby). Zde popsaný vynález se týká geneticky modifikovaných forem nativních komplementových proteinů, například lidského C3, jehož C3b fragment získává vlastnosti rezistence na fyziologickou regulaci komplementu. Díky této rezistenci mohou tyto molekuly generovat stabilizované formy, korespondující C3 konvertasy, která produkuje amplifikovanou konverzi C3 na C3b, a později degradační produkty, ve fyziologickém prostředí (t.j. in vivo).
V preferovaném provedení poskytuje vynález modifikovaný C3 protein, který je rezistentní na štěpení faktorem I.
Tohoto může být dosaženo modifikací zbytků proteinu v proteolytických místech.
Zejména preferované provedení vynálezu se týká modifikovaného lidského C3 proteinu, kde protein je modifikován nahrazením bud Arg-1303, nebo Arg-1320 nebo obou jinou aminokyselinou. Jinou aminokyselinou může být tyrosin, cystin, tryptofan, glutamin, kyselina glutamová nebo glycin. Arg-1303 je preferovaně nahrazen glutamovou kyselinou nebo glycinem (méně výhodně glutaminem). Arg-1320 je preferovaně nahrazen glutaminem.
Jiné strategie pro produkci vhodných modifikovaných proteinů vynálezu zahrnují:
(i) Redukovanou citlivost na ínhibiční účinek faktoru H a příbuzných proteinů (tj. MCP, DAF, CR1). Například, lidské C3 zbytcích 767-776 a 1209-1271 byly implikovány ve vazbě faktoru H (20,24), a nahrazení jednoho nebo více těchto zbytků nebo jiných zbytků také asociované s akcí těchto proteinů by mohlo redukovat vazbu jednoho nebo více z těchto regulačních proteinů.
(i i) Redukovaná rychlost disociace C3bBb. Mohou být zavedeny mutace, které mohou posílit interakce mezi C3b a Bb. Toto může vést jak k redukci ve spontánní dekompozici enzymu, tak omezení efektivity faktoru H (a příbuzných regulátorů) ve vyjmutí Bb z C3b.
Tyto mutace jsou žádoucí k redukci stupně jak spontánní, tak faktorem H mediované dekompozice C3bBb. I za absence faktoru H má tekutá fáze C3bBb komplexu poločas pouze okolo 10 min při 37 °C za přítomnosti properdinu (6).
(iii) Lidské C3 residua 752-761 jsou implikovány ve vazbě faktoru B. Toto je vysoce konzervovaný region C3, a těsně příbuzná sekvence je nacházena v C4. Jak C4 váže faktor
B homolog C2, spolu s jeho vysokou konzervací v C3, silná similarita tohoto regionu mezi C3 a C4 dále podporuje jeho roli v C3 jako faktor B vazebné místo. Tak mohou mít změny v tomto regionu efekt na B afinitu a na stabilitu C3bBb.
(iv) Rezistence na jiné regulátory aktivace komplementu jako je CR1, DAF, a MCP mohou být také žádoucí. Způsob akce těchto regulátorů je podobný jako u faktoru -H, takže další mutagenese není nezbytně nutná. Podobně, některé patogenní organismy exprivují jejich vlastní inhibitory aktivace komplementu, které jsou často strukturálně a funkčně homologní faktoru H (t.j. Vaccinia virus sekretorní peptid) . Tyto molekuly chrání útočníka proti imunitní odpovědi, a mohlo by být výhodné, aby bylo možno je atakovat cílenými C3 konvertasa enzymy resistentními na tuto obranu.
(v) Mutace, které zvyšují stabilizaci C3 konvertasy properdinem. Aktivitou properdinu je stabilizovat C3bBb komplex, zpomalovat spontánní a na faktoru H závislou disociaci. Tato stabilizace je neúčinná v kapalné fázi, ale zdá se být významnější v amplifikačním procesu jednou nastartovaném vhodným aktivačním povrchem (5). Zvýšení jeho aktivity (zvýšením jeho afinity) může narušit rovnováhu v kapalné fázi, a tak započít spontánní C3 konverzi. Toto může být zejmena užitečné v kombinaci s jinými modifikacemi výše popsanými.
(vi) Mutace, které zabraňují C3bBb vykazovat C5 konvertasovou aktivitu. Při užití k depleci aktivního C3 z cirkulace může být nežádoucím vedlejším účinkem generace velkého množství anafylaktických peptidů. Nejpotentnějším z nich je C5a, který je štěpen z C5 některými C3 konvertasa enzymy. Tato reakce je prqavděpodobně závislá na na afinitě konvertasy k jiné molekule C3b (11), a tak může být subjektem pro supresi mutacemi C3, které odstraní tuto interakci.
(vii) Zlepšená aktivita C3 konvertasy. Aktivní místa C3bBb C3 konvertasa enzymu jsou umístěna v Bb části. C3b komponenta má předpokládané za funkci vytvoření aktivní konformace na Bb a/nebo vazbu a konformaci substrátu, který má být zpracován Bb. Toto není známé, ale v obou případech-zde může být možnost pro zvýšení aktivity konvertasy prostřednictvím mutací v C3.
(viii) Exprese ve funkční formě. Divoký typ C3 vyžaduje konverzi na C3b před tím, než může být kombinován do nového C3 konvertasa komplexu. Je-li použit in vivo, může požadavek na konverzi na C3b (ebo C3i) odložit akci modifikovaného C3. Bylo proto žádoucí bud podat protein ve formě schopné okamžitého formování konvertasy, nebo podat přeformované konvertasové komplexy. Je proto výhodné vytvářet funkční C3b-podobná činidla ex-vivo. Tohoto může být dosaženo in vitro (t.j. proteolýzou).
(ix) Modifikace nativního proteinu, které slouží k zavedení nových míst štěpení tak jako jsou peptidové regiony požadované pro faktor B vazbu ponechány a ty, které jsou požadovány exklusivně pro faktor H vazbu, mohou být specificky odstraněny. Například mohou být zavedena taková místa, že C3b-podobná forma modifikovaného C3 může být dále štěpena do formy, která stále váže faktor B, ale je méně citlivá na inaktivaci faktorem H a I.
(x) Modifikace v jiných regionech, které mohou ovlivňovat C3b interakce s faktorem B a/nebo faktorem H
Podstata vynálezu
Vynález je založen na obrácení klasického přístupu navozením C3 konverze k depleci C3 a tak vyřazení systému. Další aplikací vynálezu je potenciál k navození C3 konverze v jednotlivém místě, a tak získání komplement dependentních efektorových mechanismů k ovlivnění specifického cíle.
Proto posledním efektem bude zvýšení množství C3 konverze tehdy, je-li modifikovaný protein podán do fyziologického media (t.j. krve), obsahujícího regulátory komplementové aktivace. Tato aktivita pak může být použita bud k depleci nativního C3 media, nebo k lokalizaci C3 konverze do požadovaného místa.
Analog C3, jehož C3h-fragment je rezistentní na účinek faktoru I (t.j. deriváty popsané v příkladu 1) může vázat faktor B, který pak bude štěpen faktorem D a eventuálně disociován v inaktivní formě. Za absence inaktivace faktorem I, bude modifikovaný C3b schopný opakovaně vázat nové molekuly faktoru B a tak spustit jeho inaktivaci. Proto bude jinou potenciální aplikací modifikací popsaných v tomto vynálezu inaktivace alternativní dráhy konsumpcí aktivity faktoru B. Analogický přístup může také být použit k modifikaci C4 ke spuštění konsumce C2, a tak vyřazení klasické dráhy aktivace komplementu.
Vynález zahrnuje jakoukoliv jinou proteasu použitou analogickým způsobem k C3bBb enzymu, která vede ke štěpení C3 na C3b, navzdory přítomnosti regulátorů aktivace komplementu.
Vynález také zahrnuje DNA sekvence, které kódují protein vynálezu stejně jako DNA konstrukty obsahující takové DNA sekvence.
DNA sekvence zahrnují všechny další sekvence nukleových kyselin které, díky degeneraci genetického kódu, také kódují dané aminokyselinové sekvence, nebo které jsou v podstatě homologní k těmto sekvencím. Tyto sekvence jsou tak také zahrnuty v rozsahu vynálezu.
Sekvence nukleových kyselin, které jsou v podstatě homologní jsou také zahrnuty v rozsahu vynálezu. Podstatná homologie může být hodnocena na úrovni nukleových kyselin nebo na úrovni aminokyselin. Na úrovni nukleových kyselin mohou být za sekvence, mající podstatnou homologii považovány ty, které hybridizují se sekvencemi nukleových kyselin vynálezu za přísných podmínek (například, při 35 až 65 °C v solném roztoku asi 0,9M). Na aminokyselinové úrovni může být proteinová sekvence považována za podstatně homologní k jiné proteinové sekvenci, jestliže signifikantní množství přítomných aminokyselin vykazuje homologii. Alespoň 55%, 70%, 80%, 90%,
95% nebo 99%, ve zvyšujícím se stupni, aminokyselin může být homologní.
Jak bylo zmíněno výše, mohou být proteiny vynálezu použity k dosažení lokalizovaných efektů aktivace komplementu. Jednou cestou potvrzení tohoto je konjugace proteinu se skupinou, který se bude vázat na požadovaný cíl. Tak v dalším aspektu vynález poskytuje konjugát zahrnující protein vynálezu navázaný na specifickou vazebnou skupinu, například specifický vazebný protein. Příkladem takového proteinu může být protilátka nebo její antigen vazebný fragment.
Proteiny podle vynálezu jsou zamýšleny pro podání subjektům pro zvýšení žádoucího terapeutického efektu. Proto vynález také poskytuj e:
a) Protein podle vynálezu pro použití v terapii.
b) Užití proteinů nebo konjugátů podle vynálezu ve výrobě léčiv pro užití v depleci hladin proteinů komplementové dráhy, a zejmena pro užití v zabránění rejekce cizorodého materiálu.
c) Farmaceutickou formulaci, zahrnující jeden nebo více proteinů nebo konjugátů vynálezu společně s jedním nebo více farmaceuticky akceptovatelnými nosiči· a/nebo excipienty.
d) Metodu redukce proteinů komplementové dráhy u savců, která zahrnuje podání proteinu podle vynálezu savcům, výhodně ve formě farmaceutické formulace.
Farmaceutické formulace mohou být přítomny v jednotkové dávkové formě, obsahující předem určené množství aktivní složky na dávku. Taková jednotka může obsahovat minimum, například 1 mg aktivní přísady, a preferovaně 2 až 3 mg. Horní hranice, kterou taková jednotková dávka může obsahovat, bude záviset na množství faktorů jako jsou podmínky léčby, způsob podání a věk, hmotnost a stav pacienta stejně jako ekonomické úvahy. Například může jednotková dávková forma obsahovat 10 mg nebo až 100 mg aktivní přísady.
Proteiny podle vynálezu mohou být použity in vivo k vyřazení komplementového systému. Okolnosti, kdy toto může být žádoucí zahrnují následující:
a) Aby se zabránilo komplementem zprostředkované destrukci nebo poškození transplantátu, zejmena xenograftu (materiál transplantovaný od jiných druhů zvířat), a zejména nesouhlasného xenograftu (kde jsou druh dárce a příjemce nesouhlasné). Příjemce by měl být dekomplementován před operaci a udržován v tomto stavu dokud bude transplantát bud přijat, nebo nahrazen více kompatibilním orgánem.
Počáteční léčba bude provedena během několika dní před transplantací. Další dekomplementace může být žádoucí v období rejekční krize. Léčba může být spojena s užitím antihistaminik ke kontrole všeobecné zánětlivé odpovědi (t.j. vasodilatace), pravděpodobně jako odpovědi na generování C3a a/nebo C5a.
Dekomplementace může být také výhodná při použití arteficiálních orgánů nebo tkání (t.j. arteficiální ledvinové dialysační membrány), které aktivují komplementový systém. Jak je popsáno výše, může být protein podán v bud neaktivované formě, funkční C3b-podobné formě nebo jako předformovaná C3 konvertasa (jako C3bBb). Tyto mohou být podány jakoukoliv cestou, kde se aktivní konvertasa setká s cirkulujícím C3 (t.j. intravenosně, subkutánně atd.).
Jinou alternativou bude ex vivo léčba, například transfundováním oběhu přes matrici, nesoucí aktivní konvertasu.
Toto by mělo mít tu výhodu, že dovolí odstranění anafylaktických peptidú (C3a a C5a) a jiných zánětlivých mediátorů nízké molekulární hmotnosti (t.j. histamin a oxid dusný) před tím, než je dekomplementovaná krev (nebo plasma) vrácena pacientovi.
b) K zabránění komplementem zprostředkovaného poškození v důsledku většího chirurgického zákroku. Pacient by měl být dekomplementován, jak je popsáno výše, výhodně před operací (ale je-li to nutné po ní) a udržován v tomto stavu do té doby, než nebezpečí dalšího vnitřního poškození bude zmírněno díky na komplementu závislém imunitním ataku.
c) K minimalizaci komplementem zprostředkovaného poškození v důsledku nechirurgického poranění. V těchto případech musí být dekomplementace provedena po počátečním poškození, ale formulace a metody podání jsou jinak stejné jako ty, které jsou posány výše. Toto může být zejmena užitečné, když zotavení vyžaduje reperfuzi ischemické části cirkulací (t.j. ischemie myokardu, omrzliny, spáleniny atd.).
d) K minimalizaci komplementem zprostředkovaného poškození v důsledku interakce protilátka-antigen.· Komplementem zprostředkovaná obranná odpověď je zejmena nežádoucí u autoimunitních chorob, které mohou zahrnovat glomerulonefritidu, hemolytickou anemii, myastenii gravis a typ II kolagenem indukované artritidy. Vyřazení komplementového systému v průběhu některých epizod choroby může zmírnit příznaky.
e) K vytvoření specifického patogenního cíle více citlivého ke komplementem zprostředkovaným imunitním mechanismům. V tomto přístupu není cílem použít superaktivní C3 konvertasu k produkci generál izované deplece C3, ale místo toho použít použít konvertasu lokálně ke koncentraci C3 konverze do požadovaného cíle. Cílem může být patogenní organismus, jako je bakterie, virus nebo jiný parazit, nebo nadbytečná buňka nebo tkáň hostitele jako je nádorová buňka nebo virem infikovaná buňka. C3 konvertasa může být lokalizovaná na cíl bud lokálním podáním (t.j. přímou injekcí, pokud možno v mediu, které zpomaluje jeho uvolnění do systémové cirkulace), nebo kombinací s cílovou skupinou, t.j. protilátkou. Takto modifikovaný protein může být navázán na specifický imunoglobulin bud chemickým zesítěním proteinů, nebo připojením DNA kódující sekvence a expresí (t.j. v případě IgG může být těžký nebo lehký řetězec připojen k C3 a ko-exprivován s C3, nebo mohou být oba řetězce kombinovány v jednom kompletním fúzním polypeptidu nebo inkorporací specifické kódující sekvence (t.j. pro leucin-zipper- podobné domény) k DNA obou fúzních partnerů (t.j. modifikovaného C3 a specifické protilátky) tak, že exprivované produkty, jsou-li smíchány dohromady, samy asociují za vytváření stabilních konjugátů. Fúzní proteiny mohou pak být podány lokálně nebo do systémové cirkulace.
Liposomy (nesoucí protilátku na povrchu s modifikovaným proteinem bud na povrchu nebo uvnitř liposomu) a/nebo viriony (t.j. zpracované tak, aby exprivovaly proteiny na svém povrchu), mohou být také použity pro ko-dopravu protilátky a modifikovaného proteinu. Tato strategie může být použita přímo, samotná nebo v kombinaci s jinou léčbou, ve kterémkoliv stadiu chorobného procesu. Může být zejmena vhodná pro užití v eliminaci jakýchkoliv nádorových buněk, které zůstaly v cirkulaci po chirurgickém odstranění tumoru. Konjugáty protilátka-modifikovaný protein mohou být také použity ex vivo k eliminaci patogenní tkáně. Například pro usmrcení leukemických buněk z extrahované kostní dřeně a pak pro navrácení zbylých zdravých buněk pacientovi.
Alternativně mohou být eliminovány lymfocyty, které neodpovídají MHC typu příjemce, z kostní dřeně před transplantací. Také modifikovaný protein může být navázán na antigen, a tato kombinace může být použita, bud in vivo nebo ex vivo, k ovlivnění lymfocytú nežádoucí reaktivity (t.j. proti transplantátu nebo vlastní tkáni).
Stejná technologie může být použita k léčbě jiných druhů, použitím jak derivátů lidského modifikovaného proteinu, tak podobných analogů připravených pro ten který druh.
Preferované rysy každého aspektu vynálezu jsou pro každý další aspekt mutatis mutandis.
Vynález bude nyní popsán prostřednictvím následujících příkladů, které nejsou konstruovány jako omezení vynálezu.
Příklady se vztahují k připojeným obrázkům.
Popis obrázků na připojených výkresech
Obr.l: ukazuje předpokládanou proteinovou sekvenci lidského C3, jak je kódovaná v PC3, (užitím standartního jednopísmenného kódu aminokyselin)
Obr.2: ukazuje sekvenci cDNA v PC3, (užitím standartního jednopísmenného kódu pro deoxynukleotidy pro sense řetězec, psaný 5'—3’).
Obr.3:ukazuje vizualizaci modifikovaných proteinů podle vynálezu.
Obr.4: ukazuje efekt různých mutací lidského C3, které nahrazují Arg 1303 nebo Arg 1320, na faktorem I-léčené štěpení v těchto místech.
N.B.
1. (35S) - biosynteticky značené vzorky.
2. Reakce provedené při normálním iontové síle.
3. Imunoprecipitáce s anti-C3.
4. SDS-PAGE za redukčních podmínek.
5. Autoradiografie.
Obr.5: ukazuje zvýšenou rezistenci lidského C3 inkorporujíčího Arg 1303 -> Gin 1303 mutaci k inaktivaci faktory I a H.
Obr.6: ukazuje analýzu štěpení C3 konvertasy mutované v aminokyselinových zbytcích 752-754 a 758-760.
Toto je fotografie Western Blot vyvíjeného ze 7,5% polyakrylamidového SDS-PAGE gelu (redukční podmínky), po e1ektroforetickém transferu do nitrocelulosy, prohování ovčí anti-lidskou C3 protilátkou a vývoji s křenovou peroxidasou spojenou s anti-ovčí imunoglobulinovou protilátkou a metodou Enhanced ChemiLuminiscence (metoda a detekční reagens od Amersham, UK) zachycenou na rentgenovém filmu. Štěpící reakce a detekční procedura byly provedeny jak je popsáno v příkladu 4 s odkazem na výsledky ukázané na Obr.3.
Klíč:
Dráhy 1,5 Dráhy 2,6 Dráhy 3,7 Dráhy 4,8 žádná adice + CVFBb + faktory Η + I + CVFBb + faktory Η + I
Proužky označené šipkami jsou:
A: C3 alfa - řetězec
B: C3 alfař - řetězec
C: C3 beta - řetězec
D: 68 kDa produkt štěpení C3 alfaF- řetězce
E: těžký řetězec IgG
Obr.7: ukazuje analýzu štěpení radioznačeného faktoru B faktorem D, za přítomnosti divokého typu C3 a mutantního C3 (C3i)
Je uvedena fotografie autoradiografu SDS-PAGE gelu. Všechny vzorky obsahují faktor D a 125I-značený faktor B, a byly inkubovány po 3 hodiny při 37 °C.
Vzorky v číslovaných drahách také zahrnují :
1. Pufr samotný
2. 1/125 C3 divokého typu
3. 1/25 C3 divokého typu
4. 1/5 C3 divokého typu
5. 1/25 mutantního C3 (zbytky 1427 Gin, 1431 Asp a 1433 Gin)
6. 1/5 mutantního C3
7. neředěný mutantní C3
Proužky označené šipkou jsou :
A. Neštěpený 125I-značený faktor B (93 kDa).
B. 60 kDa produkt štěpení (Bb)
C. 33 kDa produkt štěpení (Ba)
Obr. 8: ukazuje SDS-PAGE studii, ilustrující vytváření konjugátů mezi C3i a IgG.
Toto je Coomassie barvení 4% akrylamidového SDS-PAGE gelového průběhu za neredukujících podmínek. Počítané dráhy obsahují vzorky:
1. PDP-IgG
2. C3i
3. PDP-IgG + C3i reakční směs
Šipkou jsou označeny:
A. Pravděpodobný C3i-IgG konjugát (350 kDa)
B. C3i (200 kDa)
C. IgG (150 kDa)
Obr. 9: demonstruje, že konjugát zaměřuje C3 konvertasovou aktivitu proti ovčím erytrocytům. (Tento graf ukazuje % lýze ovčích erytrocytů po potažení roztokem bud C3i-IgG konjugátu, nebo PDP-IgG nebo C3i následovaným promytím, generací C3 konvertasy properdinem a faktory B a D, a závěrečným vývojem lýze NGPS v CFD/EDTA, jak je popsáno v metodách. Pouze konjugát produkuje lýzi a tato lýze je závislá na dávce.
Následující standardní metody a definice jsou aplikovatelné na všechny příklady.
Všechny zmiňované komponenty komplementu jsou lidského původu, pokud není jinak specifikováno, a je použito standardní terminologie pro všechny proteiny a jejich odvozené fragmenty (t.j. jak je obsaženo v odkazu (15)). Navíc termín C3i označuje jakoukoliv molekulární formu C3 bez intaktní thiolesterové vazby, ale zachovávající C3a polypeptid na alfa řetězci .
Lidská C3 cDNA a kódující sekvence jsou značeny jak ukazuje Obr.2, užitím značení užívaného v EMBL nukleotidové databáze (odvozené od odkazu (2)). Ukázaná sekvence je sekvencí našeho konstruktu (r PC3r ) , který postrádá prvních 11 nukleotidů z 5' netranslaťovaného regionu popsaného v odkazu (2), a proto je první báze značena 12. Putativní iniciační kodon jsou nukleotidy 61-63, kodon pro aminoterminální serinový zbytek beta řetězce jsou nukleotidy 127-129, a kodon pro aminoterminální serinový zbytek alfa řetězce jsou nukleotidy 2074-2076.
Proteinová sekvence je značena v souladu s prekurzorovou sekvencí jak je ukázáno na Obrázku 1, která je předpokládané translací DNA sekvence dodatku 1 (u aminokyselin 1-22 se očekává, že zahrnují signální sekvenci, která je odstraněna během biosyntesy, a u aminokyselin 668-671 se očekává, že jsou odstraněny, je-li prekurzor štěpen na alfa a beta řetězce).
Následující zkratky mají následující význam: CVF - faktor kobřího jedu, ELISA - enzymová vazebná imunoadsorbentní zkouška, E.coli - Escherichia coli, kb - kilobáze, HSV-1 - Herpes simplex virus typu 1, PBS - fosfátový pufrovací salinický roztok. COS-1 je buněčná linie odvozená od buněk opičích ledvin. Následující jsou restrikční endonukleasy: AflII, Dral, DralII, EcoRI, EcoPV, HindlII, Nael, Nhel, Xbal.
Standardní metody
Metody pro standardní biologické procedury jako je izolace plasmidů, gelová e1ektroforesa na agarose a DNA ligace mohou být nalezeny v odkazech (21). Dvouřetězcová DNA byla sekvenována užitím r Sequenase version 2.0( kitu poskytnutým 'United States Biochemi cal sr . C3 exprese byla měřena ELISA plastických plátů předem potažených afinitně purifikovanou polyklonální ovčí anti- lidský C3 protilátkou, na které byly přidány vzorky supernatantu kultury. Vazba C3 byla detekována monoklonální krysí protilátkou k C3 konjugovanému s alkalickou fosfatasou, a chromogenímu substrátu, p-nitrofenol fosfátu. Zkoušky byly kalibrovány s purifikovaným C3 lidské plasmy.
Metody pro purifikaci proteinů komplementu a CVF, a pro přípravu afinitně purifikovaných anti-C3 protilátek užívaných v analýze mohou být nalezeny v odkaze (28). Ekvivalentní činidla mohou být také získána od Sigma Chemical Company LTD.
C3 cDNA kódující sekvence
Naše C3 cDNA kódující sekvence byly konstruovány ze dvou segmentů izolovaných z náhodně primed lidské jaterní cDNA knihovny nesené ve vektoru pGEM4 (Promega). Pět o 1 igodeoxynukleotidů, korespondujících známým segmentům v lidské C3 kódující sekvenci, bylo radioznačeno T4 polynukleotid kinasou a (gama-32P)ATP a užito ke zkoušení filtrových transferů knihovny z agarosových plátů. Byly izolovány dva klony obsahující inzerty přibližně 4 kb. Digesce restrikční endonukleasou, hybridizace na specifické o 1 igodeoxynukleotidové proby a částečná sekvenční analýza ukázaly, že jedna z nich (rA13F) zahrnuje 5'- konec 5,1 kb sekvence, zatímco druhá (F B44I ) dosahuje k 3'- konci.
Tyto inserty se proto přesahují přibližně o 3 kb, včetně jedinečného EcoRI místa pro restrikční enzym. Nekompletní 5' sekce A13 byla rozrušena EcoRI a Nhel, a nahrazena kompletním segmentem izolovaným z B44 digescí EcoRI a Xbal. Obě části byly purifikovány gelovou e1ektroforesou na agarose s nízkou teplotou tání před společnou ligací T4 DNA ligasou za vytvoření vektoru (fPGC3r) obsahujícího 5,1 kb DNA, kódující celý C3 prekurzorový protein.
Linker sekvence 5' k C3 kódujícímu regionu obsahovaly dva ATG, které jsou potenciálními falešnými startovacími místy translace. Tyto byly proto odstraněny gapped - plasmid mutagenesí, jak je popsáno v metodě příkladu 1, užitím oligodeoxynukleotidu PL-ATC-3 (tagggagacc ggaagcttgc cctctccctc tgtccctctg t), který deletoval přibližně 50 párů bází 1inker/adaptor DNA, bez alterace C3 kódující sekvence. Tento mutovaný vektor, 7,7 kb obsahující 5,1 kb C3 cDNA sekvence plus 2,6 kb sekvence z PGEM4 vektoru (Promega) je označen jako PC3.
C3 kódující region PGC3 plasmidu byl kompletně sekvenován a vykazoval pouze čtyři odlišnosti od dříve publikované lidské C3 (S alela) cDNA sekvence (2).
(i) Změny C2481 ->G, a C2850 ->T nealterují kódování, (ii) T1001 ->C kóduje dříve popsanou HAV 4-1- (leucin 314 ->prolin) polymorfní formu (20), a (iii) G2716->A kóduje valin 886-> isoleucin, která nebyla dříve popsána v lidském C3, ačkoliv Ile je nacházen v této poloze u myšího a krysího C3.
Naše sekvence zahrnuje start a stop kodony, s kompletní signální sekvencí a měla by proto kodovat funkční C3.
Hladiny exprivovaného divokého typu C3 vyšší než 1,7 pg/ml supernatantu kultury COS-1 buněk (transfektovaných užitím 1ipofectaminu a pcDNA3 (Invitrogen) expresního vektoru) byly dfetekovány ELISA. Žádný detekovatelný C3 nebyl produkován buňkami transfektovanými samotným pcDNA3 vektorem. Navíc, analýza expresního produktu štěpícími reakcemi následovanými imunoprecipitací, SDS-PAGE a imunoblottingem demonstrovala, že (i) primární translační produkt byl správně zpracován do zralé dvouřetězcové formy, (ii) tento produkt byl, jako nativní C3, štěpitelný na C3b
C3 konvertasou (CVFBb), a (iii) exprivovaný protein nebyl, jako nativní C3, štěpitelný faktorem H plus I, ale stal se štěpitelným po konverzi na C3b enzymem C3 konvertasou. Toto potvrzuje, že náš počáteční plasmid může být translatován do funkčního C3.
Pro alternativní popis konstrukce a exprese C3 kódující sekvence viz odkaz (25).
Příklady provedení vynálezu
PŘÍKLAD 1: Produkce C3, který má argininové zbytky v obou štěpících místech faktoru I (aminokyselinová poloha 1303 a 1320) konvertována na glutaminové zbytky z důvodu zabránění štěpení C3b fragmentu faktorem I.
a) Mutagenese
Užité mutagenní oligodeoxynukleotidy byly QRI1 (caactgcccagccaaagctccaagatcacc), QRI2 (gccagcctcctgcaatcagaagagaccaag), a AFL4149 (taataaattcgaccttaaggtcaccataaaac), stejně jako korespondující antisense oligodeoxynukleotidy QRIln (ggtgatcttggagctttggctgggcagttg), QRI2n (cttggtctcttctgattgcaggaggctggc) a AFL4149n (gttttatggtgaccttaaggtcgatttatta).
QRI1 a QRI2 specificky nahrazují arginin glutaminem ve štěpících místech pro faktor I v aminokyselinovém zbytku 1303 v C3 prekurzorové sekvenci (změnou G3968C3969 na AA v cDNA sekvenci) a QRI2 a QRI2n uskutečňují stejnou substituci ve štěpícím místě pro faktor v aminokyselinovém zbytku 1320 (změnou nukleotidu G4019 na A).
AFL4149 a AFL4149n zavádí štěpící místo pro restrikční endonukleasu AflII v poloze 4149 do cDNA sekvence (změnou C4149 na T) bez alterace kódované aminokyselinové sekvence. Tyto dva primery byly použity jako markéry, které dovolují identifikaci úspěšné mutagenese na podkladě štěpení DNA produktu AflII.
Mutagenese byla uskutečněna gapped plasmid metodou. Dávka PGC3 (ΓUPGC3r), obohacená uridinem v místě thymidinu, byla připravena růstem v E.coli kmenu CJ236 za přítomnosti 0,25 pg/ml uridinu. Tento plasmid byl tráven Smál a 7,2 kb produkt C US1F ) byl purifikován na agarosovém gelu pro odstranění 0,5 kb fragmentu z C3 sekvence (zbytky 1463-1947). Jiná komponenta gapped plasmidu (' DN2r ) byla připravena trávením PGC3 DralII plus Nael a purifikací 5,1 kb části dvakrát na agarosové gelové elektroforese. 200 ng DN2 bylo smíseno s přibližně 500 ng US1 v 50 μΐ H2O, zahřáto na 100 °C a pomalu ochlazeno pod 50 °C před přidáním 20 μΐ až 25 μΐ 2XT7 pufru (lOOmM Tris/HCl/pH 7,4/ mM MgClž, 100 mM NaCI, 2mM dithiotrei tolu a lmM ATP, dATP, dCTP, dTTP, a dGTP) plus 10 nmol každého 5'- fosforylovaného mutagenního primeru (jedna reakce použila QRI1, QRI2 plus AFL4149, jiná reakce užila QRIln, QRI2n plus AFL4149n). Směs byla znovu zahřáta na 70 °C po 5 min a pomalu ochlazena (v průběhu 30 až 60 min) na 20 °C. Při 0 °C bylo přidáno 10 jednotek T7 DNA polymerasy plus 80 jednotek T4 DNA ligasy. Směs (celkový objem 50 μΐ) byla inkubována nejprve při 0 °C po 5 min, pak při pokojové teplotě po 5 min a nakonec při 37 °C po 3 h. 1 μΐ každé směsi byl použit pro transformaci 100 μΐ superkompetentní XL1 E.coli (Stratagene) podle instrukcí výrobce .
Ampicilin resistentní kolonie byly vyšetřovány na AflII štěpení a úspěšné mutanty byly kultivovány v 100 ml kultury, ze které byly izolovány a sekvenovány plasmidy (užitím sekvenčního primeru C3pa-3876, cttcatggtgttccaagcct, odpovídající nukleotidům 3876-3895 C3 cDNA) pro charakterizaci mutací ve štěpících místech pro faktor I.
Pro alternativní protokol pro gapped plasmid mutagenesi viz odkazy (26,27).
b) Transfer mutantní DNA do eukaryotního expresního vektoru.
C3 kódující fragment z mutantních plasmidů byl excidován dvojitou digescí HindlII a Nael. Dral byl také použit pro inkapacitaci reziduálního plasmidů. C3 kódující sekvence byla purifikována na agarosovém gelu a ligována do pcDNA3 vektoru (Invitrogen), který byl linearizován HindlII a EcoRV enzymy a defosforylován telecí střevní fosfory1asou. Ligační směs byla užita k transformaci superkompetentní XL1 E.coli, která byla pak umístěna na kultivační pláty obsahující ampicilin.
Náhodný výběr (tři nebo čtyři) ampicilin resistentních kolonií byl kultivován ve 2-3 ml kulturách za malé škály izolace plasmidové DNA. Plasmidy obsahující správný inzert byly identifikovány digescí plasmidové DNA restrikčními endonukleasami EcoRI, HindlII, a AflII. Korespondující kolonie byly kultivovány ve 100 ml kultury a plasmidy byly purifikovány standardní procedurou. Mutanty byly původně konstruovány z PGC3 a tak zachovávaly dva ATG 5' ke kódujícímu regionu. Tento region (plus 5' 3kb C3 kódující sekvence) byl proto excidován HindlII plus EcoRI a nahrazen ligací stejného segmentu vyříznutého z PC3. Tyto rekonstruované vektory byly připraveny standardními procedurami a užity pro transfekci COS buněk.
c) Exprese divokého typu C3 a mutantního C3.
Mutantní a divoký typ C3 byly transientně exprivovány plasmidy transfektovanými do COS-1 buněk užitím 1ipofectaminu (GIBCO) podle instrukcí výrobce. Typicky bylo transfektováno 1 až 1,5 x 105 buněk na jamku standardního 6 jamkového kultivačního plátu 2-4 pg plasmidu za použití 9 pl
1ipofectaminového činidla. Supernatanty byly hodnoceny na C3 sekreci, a typicky bylo získáno 0,3 až 1,7 pg na ml 3-6 dní po trans f ekc i.
Výs1edky
a) Generace mutantů
Následující mutanty, pojmenované podle mutagenních oligonukleotidových sekvencí, které byly inkorporovány, byly dosud izolovány:(i) 3 mutanty s jak QRI1, tak QRI2 mutací plus AFL4149: C3M-26, C3M-58, a C3M-61, (ii) 1 mutant s jak QRI1, tak QRI2 mutací, ale bez AFL4149: C3M-8 (iii) 1 mutant s QRI2 a AFL4149, ale bez QRI1: C3M-51 (užitý v příkladu 1.
b) Potvrzení, že funkční efekty byly způsobeny mutacemi specificky zavedenými do faktor I štěpících míst.
Sekvenování potvrdilo nepřítomnost jiných alterací v 178-350 bázích okolo mutovaného regionu každého mutantu. Sekvence jednoho mutantu produkovaného tímto postupem, C3M-51 (viz příklad 3), byla analyzována pro celý gap (báze 2463-5067) užitý v mutagenesi, a žádné jiné odchylky od divokého typu sekvence nebyly nalezeny.
Navíc, reprezentativní sekvenování celkem 2922 bází ze všech mutantů neodhalilo žádnou jednobodovou mutaci, která by mohla být způsobena polymerasou zprostředkovanými chybami.
Exprivované mutanty všechny vykazovaly dvouřetězcovou strukturu a štěpení C3 konvertasou charakteristické pro nativní C3. Souhrnně, užité mutanty pravděpodobně neobsahují žádné nežádoucí změny, ačkoliv nebyly kompletně resekvenovány.
PŘÍKLAD 2: Produkce C3, který má argininový zbytek v jednom štěpícím místě faktoru I (aminokyselinová poloha 1303) konvertovaný na glutaminový zbytek
Byl sledován postup Příkladu 1 s tou výjimkou, že v mutagenesi byly použity pouze mutagenní oligonukleotidy AFL4149 plus QRI1 nebo AFL4149n plus QPIln (t.j. bez QRI2 nebo QPI2n).
Výs1edky
a) Získané mutanty:
Byly získány 2 mutanty s QPI1 a AFL4149, ale bez QRI2:-C3M-I23,27. Mutant C3M-I23 byl exprivován jak je popsáno v příkladu 1.
Tento protein byl štěpitelný CVFBb. C3-b podobný produkt byl relativně (ve srovnání s divokým typem) rezistentní na štěpení faktory I a H v pozici 1303, ale stále mohl být štěpen v poloze 1320. Tento C3b derivát je proto částečně rezistentní na faktor
I.
PŘÍKLAD 3: Produkce C3, který má argininový zbytek v jednom štěpícím místě faktoru I (aminokyselinová poloha 1320) konvertovaný na glutaminový zbytek
Byl sledován postup Příkladu 1 s tou výjimkou, že v mutagenezi byly použity pouze mutagenní oligonukleotidy AFL4149 plus QRI2 nebo AFL4149n plus QRI2n (t.j. bez QRI1 nebo QRIln).
Navíc, metoda použitá v příkladu 1 také produkovala jeden mutant s QRI2 a AFL4149, ale bez QRI1.
Výs1edky
a) Získané mutanty:
Byly izolovány 3 mutanty s QRI2 a AFL4149, ale bez QRI1:-C3M-51, C3M-Q2, C3M-Q13. Mutant C3M-51 byl exprivován jak je popsáno v příkladu 1. Tento protein byl štěpitelný CVFBb. C3-b podobná produkt nebyl snadno štěpen faktory I a H v poloze 1320, ale stále mohl být štěpen v poloze 1303. Tento C3b derivát je proto částečně rezistentní na faktor I.
PŘÍKLAD 4; Analýza funkčních efektů mutací
Supernatanty (100-400 μΐ) z transfektovaných COS buněk byly inkubovány při 37 °C po 2 h s:
COS buňky byly transfektovány pcDNA3 nesoucími inserty:1) nemutované C3 sekvence
2) | mutantní | C3M-I23 | (kóduj ící | Arg1303 | ->Gln) |
3) | mutantní | C3M-26 | (kóduj ící | Argl303 | ->Gln, Argi320 ->Gln) a |
4) | mutantní | C3M-51 | (kóduj ící | Argi 3 2 0 | ->Gln) |
200 μΐ supernatantů kultur, odebraných 3 dny po transfekci, bylo předošetřeno 2mM fenylmethanesulfonyl fluoridem (0 °C, 15 min) a pak inkubováno při 37 °C po 2 hodiny s následujícími:
A) žádná příměs
B) přeformovaná C3 konvertasa, CVFBb (10 μΐ z 200 μΐ obsahujících 6,6 pg CVF, 100 pg faktoru Ba 1,4 pg faktoru D ve fosfátovém pufrovacím salinickém roztoku (PBS) obsahujícím 10 mM MgCl2, preinkubovaném při 37 °C, 15 min),
C) faktory H (5 pg) a I (1 pg), a
D) CVFBb plus faktory Hal.
Tyto byly poté imunoprecipitovány přidáním 0,6 pg afinitně purifikovaného ovčího anti-1idského C3· imunoglobulinu při pokojové teplotě a po 1 hodině přidáním 20 pl 5% suspense promytých formalinem fixovaných buněk Streptococcus sp. skup. C (protein G) (Sigma). Po 45 min při pokojové teplotě byly částice jednou promyty v PBS, 5 mM NaN3, a jednou v 20 mM Tris/HCl, 137 mM NaCl, 0.1% (obj./obj.) Tween 20, pH 7.6, před eluací v 1% SDS/2% 2-merkaptoetanolu (90-100 °C, 5 min). Tyto eluáty byly separovány SDS-PAGE, elektroblotovány do nitrocelulosy a C3 proužek byl detekován probováním s afinitně purifikovaným ovčím anti-lidským imunoglobulinem následovaným křenová peroxidasa konjugovaným oslím anti-ovčím imunoglobulinem (Sigma) a detekcí užitím Enhanced
Chemiluminiscence substráty poskytnutými Amersham. Je ukázána fotografie 2 minutové expozice na rentgenový film. Viditelné C3-odvozené proužky jsou indikovány značenou šipkou, a jednotlivé vzorky (1-4, A-D) jsou ty, které byly právě popsány. (Prominentní proužek okolo 50 kDa (mezi 46-68 kDa proužky) přítomný ve všech vzorcích je těžký řetězec IgG užitý v imunoprecipitaci a detegovaný křenová peroxidasa
- konjugovaný oslí anti-ovčí imunoglobulin).
Výs1edky (viz Obrázek 3)
1. Všechny neošetřené vzorky (1-A, 2-A, 3-A, 4-A) obsahovaly proužky korektní migrace pro alfa a beta řetězce C3, indikujíc tak, že všechny mutanty jsou exprivovány, a posttranslačně zpracovány správně. Přítomnost 43 nebo 46 kDa proužků v těchto vzorcích indikuje přítomnost některé faktoru H + faktoru I-podobné aktivity v kultivačním mediu. Spontánní hydrolýza C3 během 3 denní biosyntetické periody produkuje C3i, který je štěpen touto aktivitou. V nemutovaném C3 toto generuje proužky 43 kDa a 75 kDa (75 kDa není viditelný, jelikož (i) je zakryt 75 kDa beta řetězcem, a (ii) protilátka použitá k vývoji Western blot má velmi malou aktivitu k této části C3 alfa řetězce:- jeho přítomnost byla následovně potvrzena reprobováním krysí monoklonální protilátkou, Clone-3, která je specifická pro tento region). Přidání faktorů Hal bez CVFBb (1-C, 2-C, 3-C, 4-C), neštěpilo zbývající C3 indikujíc tak, že tento reprezentuje aktivní C3 (thiolester intaktní).
2. Nemutovaný C3 (1) je štěpen CVFBb a C3b produkt je dále štěpen endogenními enzymy v 1-B nebo přidanými faktory H a I v 1-D. 43 k a proužek indikuje štěpení v Arg 1320, a θβ kDa proužek (viditelný při delší expozici) indikuje štěpení v Arg1303,
3. Mutantní C3M-I23 (Arg1303->Gln) byl štěpitelný CVFBb a produkt byl relativně rezistentní na endogenní aktivitu faktorů
H a I-podobná (2-B), s persi stujícím malým množstvím alfa řetězce (C3b), ale stále štěpitelný, pokud byl extra přidán faktor H a
I. 43 kDa produkt indikuje štěpení v Arg1320, (slabý prožek 71 kDa representující jiný fragment alfa řetězce může být viditelný při delší expozici), ale nebyl přítomen žádný 68 kDa proužek, ukazujíc tak, že mutant je rezistentní na štěpení v mutovaném Gin1303.
4. Mutant C3M-26 (Arg1303->Gln, Arg132°->Gln) byl štěpitelný CVFBb a C3b-podobná produkt (alfať) byl rezistentní na endogenní aktivitu faktoru Hal (3-B). Byl také velmi rezistentní na adiční faktory Hal (3-D) ve srovnání s nemutovaným C3 (1) a jinými mutanty (2 a 4). Bylo zde malé množství produktu o 46 kDa, což indikuje nějaké štěpení v mutovaném Gin1303 (doprovázející 68 kDa fragment byl také viditelný při delší expozici). Byl zde málo nebo vůbec nedetegovatelný 43 kDa, který by korespondoval s jakýmkoliv štěpením v Gin1320. Proto je Arg->Gln mutace v poloze 1303 méně efektivní než ta v poloze 1320 v zabránění štěpení faktorem I. (Toto malé reziduální štěpení se také může vyskytovat u mutantu C3M-I23 (Arg1303->Gln), ale 46 kDa intermediát je pravděpodobně rychle zpracován na 43 kDa dalším štěpením v nemutovaném Arg1320).
5. Mutant C3M-51 (Argi32°->Gln) byl štěpitelný CVFBb a produkt byl štěpený endogenní aktivitou faktoru Hal (4-B), a adičními faktory Hal (4-D). 46 kDa produkt (a slabý 68 kDa proužek) indikují štěpení v Arg1303. Nicméně, absence 43 kDa proužku indikuje, že není štěpen v mutovaném Gin1320.
PŘIKLAD 5 Srovnání různých aminokyselinových substitucí v poloze 1303
1. Úvod
Předchozí příklady popisují mutace arg 1303 a arg 1320 na glutaminové zbytky. Obě mutace udělují rezistenci na štěpení faktorem I v těchto polohách. Nicméně, je zde malý, ale detegovatelný stupeň štěpení v gin 1303. Proto bylo provedeno množství jiných aminokyselinových substitucí v této poloze a testováno. Stepení se vyskytuje, s klesající účiností, je-li zbytek 1303: Arg > Tyr > (Cys nebo Trp) > Gin > (Glu nebo Gly). Tyto výsledky jsou neočekávané, jelikož (i) všechny známá přirozeně se vyskytující lidská faktorem I zprostředkovaná štěpení mají C-konec k argininovému zbytku, a tak bylo vydedukováno, že enzym má požadavek pro arginin, a (ii) jestliže bude štěpen v jiném zbytku lze předpokládat, že by mělo být elektrostaticky podobné argininu, t.j. bázick zbytek (Lys nebo His), (t.j. trypsin selektivně štěpí C-konec k arg, lys nebo his), a tak nemůžeme předpokládat štěpení tyrosinové substituce.
Proto je substituce arg 1303 glycinem nebo kyselinou glutamovou preferována za účelem vytvoření derivátu C3 rezistentního na inaktivaci faktorem I.
2. Metody
2.1 Mutagenese: degenerování použitých mutageních primerů bylo: caactgcccagc(gt)(ag)(cg)agctccaagatcacc (písmena v závorkách indikují směs bází v těchto pozicích). Mutanty byly konstruovány bud gapped plasmid metodou (jak byla popsána v dřívějších příkladech), nebo megaprimerovou metodou (V.Picard et al., Nuc Acid Res 22:2587-91, (1994)), ve které upstream primer byl caccaggaactgaatctagatgtgtccctc a downstream primer byl gttttatggtgaccttaaggtcgaatttatta. Všechny mutace byly provedeny na templátech, ve kterých C3- kódující DNA byla už mutovaná tak, že aminokyselinovým zbytkem 1320 byl glutamin, a restrikční místo pro AfIII bylo zavedeno do polohy 4149 (jak je popsáno v dřívějších příkladech) a toto bylo potvrzeno sekvencováním.
2.2 Exprese: mutanty byly exprivovány v COS buňkách užitím pcDNA3 vektoru jak je popsáno v dřívějších příkladech, biosynteticky značeny (35S) methioninem v seru prostém mediu.
2.3 Zkouška: supernatanty byly ošetřeny CVFBb (vytvořeného reakcí CVF s faktory B a D v hořčík obsahujícím pufru) a faktory Hal následovanými imunoprecipitaci s anti-C3 a separací SDS-polyakrylamidovou gelovou elektroforesou provedenou za redukčních podmínek (jak je popsáno v dřívějších příkladech). Gel byl fixován, ošetřen Amersham Amplify činidly, sušen a exponován na autoradiografickém filmu za získání výsledků uvedených na obrázku.
3.Výs1edky
Faktorem I zprostředkované štěpení v poloze 1303 (místo 1), bez štěpení v 1320 (místo 2) (kde toto bylo mutováno na glutamin) produkovalo proužky 46 a 68 kDa. Může být pozorováno že se štěpení vyskytuje v pořadí: arg(R) > tyr(Y) > cys(C) > a trp(W) > gln(Q) > gly(G) a glu(E). Divoký typ (arginin v obou pozicích) je štěpen v obou polohách za produkce fragmentů 43 (příliš malý na to, aby byl viditelný na tomto gelu) a 68 kDa.
4. Obrázek
Výsledky jsou ukázány na Obrázku 4. Zbytky v místě 1 (poloha 1303) a místě 2 (1320) jsou indikovány nad příslušnými dráhami.
PŘÍKLAD 6 Demonstrace zvýšené rezistence na inaktivaci faktory I a H po mutaci arg 1303 na gin.
1. Úvod
Předchozí příklady demonstrují, že konverze bud arg 1303, nebo arg 1320 na glutamin učiní toto místo rezistentní na štěpení faktorem I. Mutace obou míst vytvoří molekulu, která je rezistentní na štěpení v obou místech. Zde dále demonstrujeme, že mutace arg 1303 na gin samotná (bez alterace arg 1320) vede ke srovnatelné resistenci, ve srovnání s divokým typem, na funkční inaktivaci faktory I a H.
2. Metoda
2.1 Exprese: Příprava arg 1303->gln mutace byla popsána v dřívějším příkladu. Tato byla transfektována do CHO (obecná laboratorní buněčná linie odvozená od ovariálních buněk čínského křečka) kalcium-fosfátovou metodou a stabilní transfektanty byly selektovány na podkladě rezistence na G418 (Geneticin dostupný u Sigma). Supernatanty buněčných kultur byly shromážděny a exprivovaný C3 byl částečně purifikován precipitací síranem sodným (10-20% (hmotn./obj.) frakce), a iontovou výměnou chromatografií na Q-sepharose a mono-Q-sepharose (A W Dodds Methods Enzymol 223:46 (1993)).
2.2 Zkouška: Ovčí erytrocyty byly potaženy S016 monoklonální protilátkou (R A Harrison a P J Lachmann, Handbook of
Experimental Immunology 4th Edition kap. 39 (1986)) a 4,4 ml 5% (obj/obj.) suspenze pak bylo inkubováno s přibližně 10 pg C2, 24 pg C4 a 1 pg Cl (purifikované lidské komponenty) po 10 min při 37 °C v CFD (R A Harrison and P J Lachman supra). 0,8 ml této směsi pak bylo inkubováno po 105 min s 0,25 ml obsahujícími semi-purifikovaný mutant nebo divoký typ C3 a EDTA do koncové koncentrace 12,5 mM. Buňky byly pak promývány v CFD a použity v CFD obsahující 0,1% (hmotn./obj.) želatiny (CFD-gel). Radioligand vázaný s (125I) -značenou klon 4 monoklonální anti-C3 protilátkou byl použit pro potvrzení toho, že bylo deponováno stejné množství C3b divokého typu nebo mutantního C3b.
Pro zkoušku bylo rozpuštěno 40 pl 5% suspense buněk v 250 pl CFD-gelu a 50 pl aliquoty byly inkubovány s 50 pl CFD-gelu obsahujícího rozpuštěné faktory I a H v konečné koncentraci 100, 10, 1 a 0 1 pg/ml každého, při 37 °C po 30 min. 0,9 CFD pak bylo přidáno, buňky byly peletovány centrifugací a promyty dvakrát více než 1 ml CFD pokaždé. Buňky pak byly re suspendovány v 100 pl CFD-gelu obsahujícího 100 1 pg/ml faktoru B, 100 pg/ml properdinu, 1 pg/ml faktoru D a 0.3 mM NiCH. Po 10 minutách při 37 °C , 0.9 ml CFD obsahujícího 10 mM EDTA a 2% (obj./obj.) normálního morčecího séra. Po dalších 30 min při 37 °C byly nelyžované buňky peletovány centrifugací, a stupeň lýze byl určen měřením absorbance supernatantu při 412 nm. Absorbanční ekvivalent ke 100% lýze byl určen z aliquoty buněk lyžovaných ve vodě, a proto bylo kalkulováno procento lýzy.
Tato zkouška měří schopnost deponovaného C3b formovat funkční C3bBbP konvertasu. Konverze iC3b brání formování konvertasy a následné lýze v serum/EDTA.
3. Výsledky
Výsledky ukázané na obrázku indikují, že více než desetkrát více faktoru I a faktoru H je požadováno pro dosažení hemolytické aktivity argl303->gln mutantu ve srovnání s divokým typem. Tato mutace je proto výhodná pro vytvoření derivátu C3, jehož produkt C3b je rezistentní na inaktivaci faktory Hal. Efekt může být bud díky vyšší rezistenci na štěpení v poloze 1303 (je-li arg mutován na gin), nebo díky vyšší rezistenci na štěpení v poloze 1320, je-li štěpení nejprve umístěno v poloze 1303.
4. Obrázek
Výsledky jsou ukázány na Obrázku 5. X osa indikuje koncentraci faktorů H a I. Q1 representuje argl303->gln mutaci. % lýze je měřeno jak popisuje metoda.
Diskuse
Základní rysy lidského 03, s ohledem na modifikované varianty zde popsané, jsou:
(i) Molekula má funkční C3b-podobný derivát, ve kterém může být kombinován s funkčním aktivním lidským faktorem B, který pak může být štěpen lidským faktorem D za vytváření enzymu schopného štěpení lidského C3.
(ii) Aminokyselinová sekvence derivátů je více homologní k lidskému 03 než k C3 z jiných druhů, pro které je sekvence nyní známá, nebo jakékoliv jiné nyní známé proteinové sekvenci. Strukturální rysy C3 přítomné v divokém typu, ale ne nezbytně v modifikovaných derivátech, zahrnují následující:35
a) DNA kódující sekvence a sekvence trans laťovaného proteinu pro variantu lidského C3 užitého v příkladech vynálezu zde popsaných jsou dány v Obrázcích 2 a 1, v příslušném pořadí.
Tato proteinová sekvence se liší od publikované sekvence (2) v právě dvou aminokyselinách (detaily jsou dány v příkladech).
Bylo předpokládáno, že více variací je kompatibilních s C3 funkcí, třebaže většina není přítomná v populaci.
b) Primární translační produkt je proteolyticky zpracován do dvou disulfidicky vázaných řetězců, alfa (zbytky 672-1663) a beta (zbytky 23-667), s odstraněním signální sekvence (zbytky 1-22).
c) Zralý protein obsahuje thiolesterovou vazbu mezi zbytky CyslOlO a Gin 1013.
d) C3 konvertasa štěpí C3 za odstranění C3a (zbytky 672-748). Tato reakce je provázena rozbitím thio 1 esterové vazby.
e) Za přítomnosti faktoru H štěpí faktor I C3b mezi zbytky Arg 1303 a Ser 1304, a mezi Argl320 a Serl321.
Modifikace provedené na nativní C3 molekule
Nahrazení Argl303 Gin
Tato modifikace je v jednom místě štěpení C3b faktorem I. Efektem je redukce rychlosti štěpení faktorem I v této poloze. Změna na glutamin byla vybrána kvůli odstranění pozitivního náboje argininu, který je pravděpodobně důležitý pro serin proteasovou aktivitu faktoru I, protože udržuje hydrofilní charakter a podobnou velikost postraního řetězce, což může minimalizovat jakékoliv disrupce v terciální struktuře proteinu. Důkazem podporujícím tento předpoklad je to, že mutace nebrání zpracování do dvouřetězcové struktury, formování thiolesteru nebo štěpení C3 C3 konvertasou. Mutace Argl303 na jinou aminokyselinu může dosáhnout podobného nebo i vyššího efektu, jak je demonstrováno v příkladu 5.
Je také možné redukovat toto štěpení mutováním Serl304 (jiná strana štěpícího místa) nebo jiných zbytků zahrnutých v interakci enzym-substrát.
Nahrazení Argl320 Gin
Tato modifikace je v jiném místě štěpení C3b faktorem I. Efektem je drastická redukce (prakticky zrušení) stupně štěpení faktorem I v této poloze. Změna na glutamin byla provedena za stejných podmínek jako jsou popsány výše, a tato mutace také nebránila zpracování do dvouřetězcové struktury, formování thiolesteru nebo štěpení C3 C3 konvertasou. Opět, mutace jiné aminokyseliny může vést k stejnému efektu, jako například mutace Serl321 nebo jiných zbytků zahrnutých v interakci enzym-substrát.
Při kombinaci dvou mutací, Argl303->Gln a Arg1320->Gln, je předcházeno C3b inaktivaci a proto zachování jeho schopnosti vytvářet část aktivní C3bBb konvertasy. Jiné mutace (včetně kombinací mutací), které ruší obě štěpící reakce, mohou být také použity (například Argl303 Glu nebo Argl303 Gly může být použita v kombinaci s Arg 1320 Gin).
PŘÍKLAD 7 Různé mutace, které redukují interakce C3b/C3i faktorem H
7.1 úvod
Jiné laboratoře produkovaly důkazy založené bud na vlivu syntetických peptidů (Ganu, V.S. and Muller - Eberhard, H.J.,
1985, Complement 2:27, Becherer, J.D. et al., 1992,
Biochemistry 31:1787-1794), nebo limitované mutagenese (Taniguchi - Sidle, A. and Isenman, D.E., 1994, J.Immunol. 153: 5285 - 5302), které naznačují, že zbytky 752 - 761 v primární sekvenci C3 transkriptu (viz Obr. 1) mohou být zahrnuty v interakci s faktorem H. Nicméně, jiní publikovali důkazy, které naznačují, že v interakci s faktorem H jsou zahrnuty pouze zbytky 767-776, zatímco zbytky 752-761 jsou důležité pro interakci s faktorem B (Fishelson, 1991, Mol.Immunol. 28:545-552). Předpokládáme, že více extenzivní mutagenese tohoto regionu může redukovat afinitu pro faktor H a proto být žádoucí pro objektivní vytváření C3 derivátu, který je rezistentní na faktor H. Navíc se domníváme, že významnými zbytky pro mutaci mohou být prominentní kyselá residua (kyselina aspartová a glutamová) a že bude žádoucí změnit je na neutrální zbytky, které s menší pravděpodobností mediují silné interakce. V tomto příkladu jsme změnili zbytky 752-754 z Asp
- Glu - Asp na Gly - Ser - Gly, v kombinaci se změnou zbytků 758
- 760 z Glu - Glu - Asn na Gly - Ser - Gly. Produkt vykazoval redukované štěpící charakteristiky konzistentní s redukcí citlivosti na faktor H. Toto poskytuje důkaz, že C3 může být modifikován k redukci vazby faktoru H, a proto citlivosti na faktory Hal. Tyto modifikace jsou žádoucí pro vytvoření C3 konvertasy, která je stabilní za fyziologických podmínek.
7.2 Metoda
Metody mutagenese, exprese a analýzy byly popsány v dřívějších příkladech. Mutagenní oligonukleotid, který byl syntetizován, měl sekvenci :
agtaacctgggttcggggcatcattgcaggatcgggcatcgtttcc.
7.3 Výsledky
Výsledky štěpících reakcí jsou ukázány na Obr.6. Tyto indikují, že:
1. Adice CVFBb k divokému typu C3 vede k eliminaci alfa řetězce (dráha 2), jelikož C3b, který je formován, je citlivý na nízké koncentrace faktoru I a H v supernatantu kultury. C3i, který byl vytvořen během exprese nebo následné inkubace, byl rozrušen na iC3i stejným způsobem. Přidání exogenních faktorů I a H (dráhy 3 a 4) se zde neliší od drah 1 a 2, protože medium samo obsahuje dostatek aktivity faktoru H a I k efektu kompletního štěpení.
2. Oproti tomu ošetření mutantu C3 CVFBb (dráha 6) nevede k vymizení alfa řetězce. Je zde určité generování alfa, korespondujícího k C3b, ale některé z těchto všech zbývají, indikujíc tak, že perzistence alfa řetězce není jenom výsledkem selhání štěpení CVFBb. Zbývající neštěpený alfa řetězec v dráze 2 může proto reprezentovat C3i, který nebyl štěpen endogenní aktivitou faktorů Hal, ačkoliv je také možné, že některé z nich representují nativní C3 perzistující tehdy, je-li pro mutant požadována parciální rezistence na CVFBb. Přidání vysokých koncentrací exogenních faktorů Hal (dráha 7 a 8) produkuje depleci alfa a alfa' řetězců, což indikuje, že (i) mutant není kompletně rezistentní na tyto faktory a (ii) alfa řetězec neštěpený CVFBb v dráze 2 je predominantně odvozen od C3i (který je štěpitelný faktory H a I, ale ne CVFBb) než od nativního C3 (který je štěpitelný CVFBb, ale ne faktory H a I). Stále ještě není štěpen všechen alfa řetězec, jako ve dráze 8, pravděpodobně z důvodu rezistence na faktory Hal.
Proto mohou mutace zbytků 752-754 a zbytků 758-760 generovat C3 molekulu, která stále ještě může být štěpena C3 konvertasou, ale je parciálně rezistentní na účinek faktorů H a I. Ve světle nově publikovaných dat je toto pravděpodobně z důvodu mutací, které modifikovaly region, který je zahrnut v interakci s faktorem H a proto vedou k redukované afinitě k faktoru H.
PŘÍKLAD 8 Místo v C3, které může být mutováno pro modifikaci interakce C3i s faktorem B
8.1 úvod
Předchozí příklady demonstrovaly, že mutace C3 mohou modulovat interakce s faktory Hal. Pro objevení nových míst v C3, která mohou interagovat s faktorem B jsme srovnávali známé sekvence C3 molekuly od různých druhů, stejně jako dostupné sekvence pro C4 a jiné homologní proteiny. Identifikovali jsme region korespondující zbytkům 1427-1433 lidského C3, který může být zahrnut v C3 a C4 specifických funkcích. Tyto mohou zahrnovat interakce s faktorem B (nebo jeho homologem, C2, v případě C4), ale ne nezbytně, protože jiné potenciální funkce zahrnují formování thiolesteru, konverzi na C3h (nebo C4h formu), interakci se substrátem C3 a/nebo C5 v konvertasové aktivitě a interakci s faktorem I a jeho kofaktory. Proto byly selektované zbytky mutována do korespondujících zbytků (podle seřazení sekvence) nacházených v jiných homologních proteinech, v tomto případě lidském C5. Tak byl změněno zbytek 1427 z Arg na Gin, zbytek 1431 z Lys na Asp, a zbytek 1433 z Glu na Gin. Výsledný mutant byl shledán citl.ivým na štěpení C3 konvertasou (CVFBb) a C3b produkt byl štěpitelný faktory Hal. Nicméně, tento mutant nepodporoval konverzi faktoru B na Bh plus Ba, která je závislá na vazbě faktoru B na C3i (nebo C3b). Proto máme důkaz, že tento region má menší interakci s faktorem B. Zatímco je toto nežádoucí pro generování superaktivní C3 konvertasy, poskytuje to indikaci, že jiné modifikace tohoto regionu C3 budou také alterovat interakci s faktorem B, a některé z nich budou pravděpodobně zvyšovat afinitu. Následek takových mutací může také zvyšovat stabilitu a aktivitu biomo1ekulárního konvertasového enzymu C3bBb (nebo C3iBb).
8.2 Metody
Přehled ukázaný v Tabulce 1 dále dokládá, proč se domníváme, že tento region je kandidátem pro mutagenesi. Předpokládáme, že charakter jistých zbytků byl dobře konzervován v C3 a C4, ale mírně se lišil u obou proteinů. Zbytky 1427, 1431 a 1433 byly vybrány, jelikož jejich přirozený náboj může být ukazatelem skupiny zahrnuté v protein - protein interakcích. Byly provedeny změny ke korespondujícím zbytkům v lidském C5, protože vykazovaly velmi odlišné elektrostatické vlastnosti, ale v kontextu některých jiných konzervovaných zbytků, které mohou indikovat podobnou lokální strukturu.
TABULKA 1
Připojení sekvencí C3 a příbuzných molekul k regionu zbytků 1427-1435 lidského C3
Zbytek (člověk)
Protein | Druh | 1427 | 1428 | 1429 1430 1431 1432 1433 | 1434 | 1435 | ||||
C3 | člověk | R | Y | I | s | K | Y | E | L | D |
myš | R | Y | I | s | K | Y | E | M | N | |
krysa | R | Y | I | s | K | Y | E | M | D | |
morče | R | Y | I | s | K | Y | E | L | D | |
králík | R | Y | I | s | K | Y | E | L | N | |
kobra | R | Y | I | s | K | F | E | I | D | |
Xenopus | K | Y | I | s | K | Y | E | V | N | |
pstruh | R | Y | I | E | K | F | E | M | D | |
C4 | člověk | R | Y | v | s | H | F | E | T | E |
myš | R | Y | v | s | H | F | E | T | D | |
Slp | myš | R | Y | v | s | H | F | E | T | D |
C3/C4- | haglish | N | Y | I | v | Q | Y | E | I | R |
podobný | mihule | K | Y | I | s | N | Y | E | I | T |
C5 | člověk | Q | L | F · | T | D | Y | Q | I | K |
myš | Q | L | L | T | D | Y | Q | I | K | |
A2M | člověk | P | T | V | K | M | L | E | R | s |
myš | P | S | v | K | R | L | Q | D | Q | |
krysa | P | T | v | K | M | L | E | R | s | |
PZP | člověk | P | T | v | K | M | L | E | R | s |
Murinoglobulin | myš | P | T | v | K | K | L | E | R | L |
A1M | krysa | P | s | v | K | K | L | Q | D | Q |
A1M | g.křeček | P | T | v | K | K | L | E | R | s |
A1I3 | krysa | P | T | v | K | K | L | E | R | L |
Metody mutagenese, exprese a analýzy C3 štěpících reakcí byly stejné, jako jsou popsány v předcházejících příkladech (Příklady 1-4). Mutagení oligonukleotid byl syntetizován se sekvencí: tggtgttgaccaatacatctccgactatcagctggacaa.
Zkouška pro obrat faktoru B
Exprivovaný produkt byl purifikován z media COS buněk afinitní purifikací na koloně Cloně - 3 - Sepharose jak popisuje Příklad 9. Tato metoda vedla ke značné konverzi thiolester rozrušené formy C3i. Divoký typ C3 byl izolován stejnou procedurou. Diluovaný divoký typ C3 (1/5, 1/25 a 1/125) byl zpracován na SDS-PAGE gelu (redukční podmínky) spolu s mutantním C3, a barvení stříbrem indikovalo, že mutant byl přítomen v koncentraci ekvivalentní k o něco méně než 1/25, ale o něco více než 1/125 ředění divokého typu. Stejná ředění byla použita ve zkoušce na obrat faktoru B. 5 μΐ těchto C3 bylo inkubováno s 25 μΐ CFD-G obsahujícího 5 μg/ml faktoru D a přibližně 1.6 pg/ml 125I-značeného faktoru B (přibližně 1000 2000 dpm/μΐ) po 3 h při 37 °C. Vzorky pak byly analyzovány SDS-PAGE (redukční podmínky) s autioradiografií sušeného gelu. Výsledky jsou ukázány na Obr. 7.
8.3 Výsledky
Jak ukazuje Obr.7, zřetelné štěpení faktoru BV se vyskytuje ještě ve 1/125 ředění divokého typu C3 (C3i). Oproti tomu, žádné signifikantní štěpení nebylo pozorováno v přítomnosti mutantního C3, ani neředěného, který byl v koncentracích vyšších než 1/125 vzorek divokého typu.
U tohoto mutantu se proto jeví, že má porušenou schopnost podporovat štěpení faktoru B, nejpravděpodobněji redukci afinity vazby pro faktor B. Z tohoto důvodu je toto region C3, který může být mutován pro modulaci interakce mezi C3i (nebo C3b) a faktorem B a také snad stabilitu konvertasy (C3iBb nebo C3bBb).
PŘÍKLAD 9 Purifikace exprivovaných C3 mutantních molekul
9.1 úvod
Tento příklad demonstruje, jak mohou být mutantní C3 molekuly izolovány z expresního media, jako je kultivační medium transfektovaných eukaryotických buněk. Jednoduchou afinitní purifikací jsou C3 molekuly získány v čistotě dostatečné pro funkční testy a pro konjugaci s protilátkou metodou popsanou v příkladu 10. Ačkoliv eluce z protilátky je spojena s hydrolýzou značné části vnitřních thiolesterů je C3i produkt stále ještě vhodným prekursorem pro generaci aktivní C3 konvertasy, stejně jako pro produkci C3i-proti látkových konjugátů. Tento přístup je také pravděpodobně využitelný jako část přípravy vyžadované pro in vivo užití.
9.2 Metoda
Afinitní purifikace na Cloně - 3 - Sepharose
Cloně - 3 je krysí monoklonální protilátka, která je specifická pro C3 a jeho deriváty, včetně C3b a C3i (Lachmann, P.J. et al., 1980, J.Immunol. 41:503-515). Jsou dosažitelné jiné monoklonální protilátky proti C3 a v některých případech byly úspěšně použity v izolování C3 z malých množství lidské plasmy (Dodds, A.W., 1993,Methods Enzymol. 223:46-61) a jsou proto také pravděpodobně aplikovatelné pro izolování molekul exprivovaných ex vivo. IgG frakce byla spojena na Sepharosa CL-4B užitím kyanobromid (metodologie může být nalezena v Harrison and Lachmann, 1986, Handbook of Experimental
Immunology, 4. vyd., vyd. Weir, Herzenberg, Blackwell and Herzenberg, Blackwell, Oxford). Supernatanty kultur byly bud přímo vloženy do kolon této pryskyřice (re-cirkulované), nebo nejprve koncentrovány precipitací s 25% (hmotn./obj.) Na2SC>4, a resolubi1izací a dialýzou do PBS, 5 mM NaN3· Kolony pak byly promývány postupně (i) PBS, 5 mM NaN3 a (ii) PBS obsahujícím 1M NaCl. Vazba C3 se eluuje s 50 mM boritanu sodného pufrem, pH 10,5, a je okamžitě neutralizována odebíráním 0,9 ml frakcí do 0,1 ml 1M Tris/HCl pH 7. Materiál je pak dialyzován do PBS, 5mM NaN3.
Příprava C3 nesoucího His - Tag
His - Tag je vlákno histidinových zbytků, které vykazuje afinitu pro kolony nesoucí ionty niklu. Tato metoda byla využita pro izolaci exprivovaných proteinů. Domnívali jsme se, že může být užitečná pro izolaci exprivovaných mutantních C3 molekul a tak jsme užili insertní mutagenese pro vytvoření plasmidu kódujícího C3 s připojenými 6 histidinovými zbytky na karboxy konci (přímo na karboxy konec ke zbytku 1663). Toto umístění pro His - Tag bylo vybráno tak, aby minimalizovalo interferenci se syntézou, skládáním, zpracováním a tvorbou disulfidových vazeb nascentní C3. Zbytek 1661 je cysteinový zbytek, který je zahrnut v disulfidové vazbě na zbytek v sekveci dřívější (pravděpodobně Cys 1537, Dolmer , K. and Sottrup - Jensen, L., 1993, FEBS-Lett 315: 85-90) a proto se zdá být opatrné udělat inzerci za tímto strukturálním rysem. Mutace byly zavedeny použitím gapped plasmid techniky užité v Příkladu 1, užitím syntetizovaného mutageního oligonukleotidu se sekvencí: tgggtgccccaaccatcatcatcatcatcattgaccacaccccc.
Inkorporace korektní sekvence byla potvrzena DNA sekvenováním. Tato DNA sekvence může nyní být transferována do expresního vektoru. Po transfekci eukaryotních buněk by mělo být možné izolovat exprivovaný C3 díky afinitě pro kolonu nesoucí ionty niklu, nebo jakoukoliv jinou matrici se specifickou afinitou pro His - Tag.
9.3 Výsledky
Množství mutantního C3 bylo purifikováno na Cloně - 3 Sepharose, včetně těch, které jsou popsané v Příkladu 1 a 2 a jsou exprivovány v CHO buňkách. Produkty si uchovávají schopnost podporovat štěpení faktoru B faktorem D. Stejná metoda byla použita k izolaci mutantů popsaných v příkladu B2, exprivovaných v COS buňkách. Barvení stříbrem SDS-PAGE gelů indikovalo, že izolované produkty nebyly 100% čisté, ale obvykle se zdály být více než nebo alespoň 50% čisté. Toto vychází z počátečních materiálů obyčejně obsahujících méně než 10 pg/ml C3 v 10% (obj./obj.) fetálním telecím seru plus jiné celulární proteiny. Navíc nebyly C3 degradovány v průběhu izolace a aktivita endogeních faktorů H a I se zdála být odstraněna.
Purifikace pomocí His - Tag vyžaduje mírnější eluční podmínky z kolon nesoucích ionty niklu. Například byla použita EDTA. Aplikace této metody na C3 může proto dovolit izolaci bez porušení vnitřní thiolesterové vazby.
PPíKLAD 10 Konjugace C3i protilátky a užití k cílené aktivitě C3 konvertásy proti jednotlivým buňkám
10.I úvod
Jedním aspektem vynálezu je, že stabilní C3 konvertásy odvozené od mutantních C3 molekul budou zvyšovat konverzi C3, která, je-li lokalizovaná na určité cílové místo, nastartuje na komplementu závislý útok na tento cíl. Upřednostňovaný přístup pro zacílení odpovědi je spojení mutantní C3 molekuly, bud C3i nebo C3b derivátu, s protilátkou specifickou pro žádoucí cíl. V tomto příkladě demonstrujeme pracovní metodologii pro vytváření takových konjugátů, která je aplikovatelná na mutantní C3i nebo C3b molekuly a muže být použita na materiálu afinitně purifikovaném z expresního systému, když byl thiolester C3 porušen při zpracování. Spojením C3i s protilátkou, která se specificky váže na ovčí erytrocyty jsme dále ukázali, že konjugát fixuje C3i na povrch erytrocytu tak, že může být formována konvertasa, C3iBbP, která iniciuje lýzu těchto buněk, když jsou jiné komponenty komplementu poskytnuty ve formě normálního morčecího séra ( v EDTA kvůli zabránění de novo formaci C3 konvertasy). Proto může být konjugovaná protilátka použita k zaměření C3 molekuly pro iniciaci komplement dependentního ataku jednotlivých typů buněk. Tento příklad využívá divoké formy C3i, z lidské plasmy, který formuje C3 konvertasu in vitro. In vivo je divoký typ C3i a C3b porušen faktory Hal. Proto může být v tomto kontextu výhodné použití mutantního C3, konstruovaného podle plánu tohoto patentu tak, aby byl resistentní na faktory Hala proto vytvářel stabilní C3 konvertasu.
10.2 Metoda (i) Generování a purifikace C3i - protilátka konjugátu
Užitou protilátkou byla IgG frakce izolováná od po 1yk1oná1 ní ho králičího anti-ovčí erytrocyt antisera. 1.1 mg bylo inkubováno s 75 nmol SPDP v konjugačním pufru, pH 7,5 (20 mM KH2PO4, 60 mM Na2HPOz,, 0,12 M NaCl) po 2 h při pokojové teplotě. PDP-IgG byl purifikován gelovou filtrací na Superose 6 koloně (Pharmacia) (ve fosfátovém pufru, pH 7,4, obsahujícím 0,5 M NaCl). Redukce vzorku dithiotreitolem byla užita k hodnocení 4 PDP skupin připojených na molekulu IgG. C3i byl připraven ošetřením purifikovaného C3 0,1 M methylaminu, pH 7,2 (2h při 37 °C). Přebytečný methylamin byl odstraněn gelovou filtrací následovanou dialýzou do konjugačního pufru. 18 nmol C3i bylo smíseno s 1,7 nmol PDP-IgG v 1,26 ml konjugačního pufru a inkubováno po 1 den při pokojové teplotě a potom po 1,5 dne při 4 °C. Obrázek 8 ukazuje Coomassie Blue barvený SDS-PAGE gel konjugační reakční směsi, vykazující přítomnost druhu o přibližně 350 kDa, který nebyl přítomen ani v PDP-IgG, ani v C3i. Tento druh byl parciálně purifikován gelovou filtrací na Superose - 6 koloně ve fosfátovém pufru, pH 7,4, obsahujícím 0,5 M NaCl a pak dialyzován do PBS. Tento se eluuje před C3, v objemu, ze kterého může být hodnocena molekulární hmotnost 300 - 400 kDa kalibrací s globulárními standardy molekulární hmotnosti. Koncentrace konjugátu, volné protilátky a nenavázaného C3 byly hodnoceny z Coomassie - barveného SDS-PAGE gelu (neredukující podmínky). Dvoudimensionální SDS-PAGE (první dimense neredukovaná, druhá dimense redukovaná) odhalil vzorky kompatibilní s 1 : 1 konjugátem mezi IgG a C3i.
(ii) Demonstrace toho že C3i - protilátka konjugát může být použit k zaměření aktivity konvertasy proti jednotlivým buňkám.
μΐ rozpuštěného konjugátu (0 (bez konjugátu), 1/100,
1/50, 1/10) bylo inkubováno se 100 μΐ přibližně 1% (obj./obj.) ovčích erytrocytů (předem promytých v CFD) po 1 h při 37 °C. Paralelní inkubace byly provedeny s ekvivalentním množstvím PDP-IgG (bez C3) a s C3 samotným. Buňky pak byly 4 krát promývány v CFD a resuspendovány do 100 μΐ v CFD-G. 50 μΐ z nich bylo lysováno s 150 μΐ H2O, po které následovalo přidání 800 μΐ CFD obsahujícího 10 mM EDTA a 2% (obj./obj.) NGPS.
Dalšíh 50 μΐ konjugátem potažených buněk bylo inkubováno po 15 min při 37 °C s 50 μΐ CFD-G obsahujícího 190 pg/ml faktoru B, pg/ml faktoru D, 20 pg/ml properdinu a 0.6 mM N1CI2, a potom následovala lýsa 900 μΐ CFD obsahujícího 10 mM EDTA a 2% (obj./obj.) NGPS. Po 30 min při 37 °C byly buňky peletovány centrifugací (2000 x g, asi 3 min) a byla měřena optická absorbance supernatantu při 412 nm. Užitím H2O ošetřených vzorků jako 100% lýzy a čistého pufru postrádajícího buňky, bylo kalkulováno % lýze, jak ukazuje Obr. 9. Konjugát produkoval lýzu dependentní na dávce, zatímco ani PDP-IgG, ani C3i sám negeneroval žádnou lýzu signifikantně vyšší než byla pozorována za absence jakéhokoliv ošetření.
10.3 Souhrn výsledků
Použitá metoda se ukázala být úspěšnou pro spojení C3i s IgG jak je ukázáno:
1. Formováním proužku vhodné velikosti (okolo 350 kDa) pro 1 : 1 C3 :IgG konjugát ukázaný SDS-PAGE na Obr. 8.
2. Dvoudimensionálním SDS-PAGE (první dimense neredukovaná, druhá dimense redukovaná) indikujícím, že tento druh obsahoval jak IgG, tak C3i.
3. Eluční charakteristika tohoto druhu na gelové filtraci je opět konsistentní s molekulou okolo 350 kDa.
4. Konjugát vykazuje hemolytickou aktivitu, která není vykazována ani PDP-IgG, ani C3i (Obr.9).
Hemolytická zkouška (Obr. 9) dále demonstrovala, že:
1. Specifická anti- ovčí erytrocyt protilátka lokalizovala C3i na membránu cílové buňky (ovčího erytrocytu), a tak zabránila jeho odstranění promýváním (oproti volnému C3i).
2. Konjugát udržoval aktivitu C3i ve které byl stále ještě schopen vytvářet C3 konvertasu reakcí s properdinem a faktory B a D.
3. Tato konvertasa může iniciovat komplement - dependentní atak na cíl, v tomto případě aktivací dráhy lýzy (C5-9) k lýze erytrocytů.
Další data z jiných laboratoří ukazují, že faktor kobřího jedu může být připojen na protilátku a že tento konjugát může namířit aktivaci komplementu na jednotlivé typy buněk (Vogel, 1988, Targeted. Diagn. Ther., 1:191-224, Muller, B. and Muller - Puchholtz, W. , 1987, Leuk. Pes, 1 1:461 - 468, Parker, C.J., White, V.F. and Falk, P.J., 1986, Complement 3:223 - 235, Petrella, E.C. et al., 1987, J.Immunol. Methods 104:159-172). Tato data podporují tvrzení, že C3 modifikovaný tak, že je schopný vytvářet stabilní C3 konvertasu, jako faktor kobřího jedu, může být užit k zacílení komplementem zprostředkované odpovědi, jak je zdůrazněno v tomto vynálezu.
PPíKLAD 11 Demonstrace toho, že mutantní molekuly C3 indukují obrat faktoru B v normálním lidském séru.
11.1 úvod
Hlavním účelem zde popsaného vynálezu je konsumpční deplece aktivity komplementu z biologických tekutin. Vynález popisuje metody pro výrobu C3 molekul, které jsou rezistentní na down regulaci faktory H a I. V tomto stavu budou vázat faktor B a generovat aktivní C3 konvertasy. Aktivita těchto konvertas je demonstrována hemolytickou zkouškou využitou v Příkladu 6. Taková konvertasa bude proto konzumovat C3. Jestliže je konvertasa nestabilní, bude disociovat bez velké C3 konverze. Nicméně dovolí vazbu čerstvého faktoru B, a jeho konverzi na Bb a Ba. Tak mutantní C3 započne konsumpci faktoru B, vedoucí nakonec k vyřazení alternativní dráhy, a znemožnění amplifikace stimulace klasickou dráhou. Jestliže je vytvořena stabilní C3 konvertasa, bude obrat faktoru B redukován, ale konsumpce C3 bude zvýšena. Obě situace mohou proto být žádoucí. V tomto příkladu demonstrujeme, že mutantní C3 molekuly, které jsou modifikovány k rezistenci na faktor I, ale bez jakékoliv modifikace k ovlivnění stability konvertasy, započnou akcelerovaný obrat faktoru B v lidském séru. Oproti tomu divoký typ C3 nezpůsobuje žádný signifikantní obrat, pravděpodobně díky tomu, že divoký typ C3i je rychle degradován faktory H a
I.
II. 2 Metoda
Připravené mutanty jsou následující:
Q1R2 | Arg1303 | zaměněn | za | Gin (Příklad 2) | ||
Q1Q2 | Argl303 | zaměněn | za | Gin, plus Arg1320 | zaměněn | za Gin |
(Příklad | 1) | |||||
E1Q2 | Argl303 | zaměněn | za | Glu, plus Argl320 | zaměněn | za Gin |
(Příklad | 5) | |||||
Tyto | mutanty byly všechny | exprivovány v CHO | buňkách | a pak |
purifikovány precipitací s Na2S0«, pak následovala afinitní purifikace na Cloně - 3 - Sepharose, .jak popisuje Příklad B3. Divoký typ C3 (R1R2) byl izolován podobně. Podle SDS-PAGE s barvením stříbrem byla koncentrace 01 mezi 1/5 a 1/25 divokého typu, a koncentrace Q1Q2 byla 1/ divokého typu, a koncentrace E1Q2 byla mezi 1/25 a 1/125 divokého typu. Všechny preparáty pravděpodobně obsahovaly většinu molekul s rozrušeným thiolesterem (C3i).
μΐ těchto C3 preparátů bylo inkubováno s 10 μΐ roztoku 20% (obj./obj.) normálního lidského séra v PBS obsahujícím 1 mM MgCl2 a přibližně 300 ng 125I-značeného faktoru B (přibližně
- 300 00 dpm) po 1 hodinu při 37 °C. 5 pl bylo pak analyzováno SDS-PAGE (redukční podmínky). Sušený gel byl exponován na autoradiografickém filmu pro indikaci pozice proužků korespondující s intaktním faktorem B a jeho produkty štěpení. Tyto pak byly excidovány a pečlivě zkoumány pro určení stupně štěpení. Hodnoty získané v pufru samotném byly odečteny jako pozadí (zahrnujíc nejenom pozadí štěpení, ale také degradační produkty a jiné nečistoty přítomné v přípravě radioligandu) .
11.3 Výs1edky
Výsledné stupně štěpení faktoru B jsou ukázány níže:
1/25 Divoký typ 1,49% 1/5 Divoký typ 2,74% Q1R1 6,19% Q1Q2 7,41% E1Q2 6,42%
Podle toho všechny faktor I rezistentní mutanty produkovaly vyšší úrovně štěpení faktoru B než ekvivalentní množství divokého typu C3 (C3i) . Při vyšších dávkách nebo delší inkubaci může být výsledkem kompletní inkapacitace alternativní dráhy.
Zkratky použité v předešlých příkladech zahrnují:
CFD - komplement fixační rozpouštědlo (definované Harrison and Lachmann, 1986, Handbook of Experimental Immunology, 4th edn., Ed.s Weir, Herzenberg, Blackwell and Herzenberg, Blackwell, Oxford), CFD-G, CFD obsahující 0,1% (hmotn./obj.) želatinu, PBS fosfátový pufrovací salinický roztok, NGPS, normální morčecí sérum, SDS-PAGE SDS-polyakrylamid gelová e1ektroforesa, SPDP N - Succimidyl - 3 - (2
-pyridyldi thi o)propionat.
Odkazy:
1. Bergmann,M. & Fruton.J.S. (1941) Adv. Enzymol., 1:63-98.
2. de Bruijn,M.H. & Fey,G.H. (1985), Proč. Nati. Acad. Sci. U.S.A. 82:708-712
3. Crawford-MH et al. (1988) Circulation. 78:1449-58
4. Daha,M.R. & van Es,L.A. (1982) Immunol. 43:33-38.
5. Farries,TC; Lachmann,PJ & Harrison,RA (1988)
Biochem. J. 252:47-54
6. Farries,TC; Lachmann,PJ St Harrison, RA (1988)
Biochem. J. 253:667-75
7. Fořty,J; Hasan,R; Cary,N; White,DJ & Wallwork,J (1992) Transplant. Proč. 24:488-9
8. Fritzinger,D.C. et al. (1992) J. Immunol.
149:3554-3562
9. Harrison,R.A. í Lachmann, P. J. (1980) Mol. Immunol.
17:9-20.
10. Kalii,K.R., Hsu,P. & Fearon,D.T. (1994) Springer Semin. Immunopathol. 15:417-431.
11. Kinoshita,T; Takata,Y; Κοζοηο,Η; Takeda,J; Hong,KS &. Inoue,K (1988) J. Immunol. 141:3895-901
12. McNearney,TA; Oděli,C; Holers,VM; Spear,PG; Atkinson,JP (1987) J. Exp. Med. .166:1525-35
13. Nicol,P.A.E. & Lachmann,P.J. (1973) Immunol.
24:259-275
14. Pangburn,MK í Muller-Eberhard, HJ (1984) Springer Semin. Immunopathol. 7:163-92
15. Rother,K. & Till.G.O. (eds) (1988) The complement System (Springer-Verlag Berlin Heidelberg, Germany)
16. Van den Berg,C.W., Aerts,P.C. & Van Dijk,H. (1991)
J. Immunol. Methods 136:287-294.
17. Vogel,CW; Smith,CA & Muller-Eberhard,'HJ (1984) J. Immunol. 133:3235-41
18. Weisman,HF et al. (1990) Science 249:146-51.
19. Wu,R. (ed.) (1993) Methods Enzymol. 217: ch.s 12-14 (Academie Press, San Diego, U.S.A.)
20. Fong,K.Y., So,A.K., Koch,C. & Walport,M.J. (1990) J. Exp. Med. 172:1011-7
21. Sambrook,J., Fritsch,E.F. & Maniatis,T. (1989) Molecular Cloning. A Laboratory Manual second edition (Cold Spring Harbor Laboratory Press)
22. Fishelson,Z.(1991) Mol. Immunol. 28:545-52.
23. Taniguchi-Sidle, A & Isenman,D.E. (1993) Mol. Immunol. 30:54.
24. Lambris,J.D.,Avi1 a,D.,Becherer,J.D. &
Muller,Eberhard,H.J. (1988) J. Biol. Chem. 263:12147-50.
25. Taniguchi-Sidle, A. and Isenman, D.E. (1992) J. Biol. Chem. 267:635-643.
26. Hofer, B. and Kuhlein, B. (1993) Methods Enzymol. 217:173-189.
27. Morinaga, Y., Franceschini, T., Inouye, S. and Inouye, M. (1984) Bio-technology 2:636-639 .
28. Harrison, R.A. and Lachmann, P.J. (1986) Handbook of Experimental Immunology (eds Weir, Herzenberg, Blackwell and Herzenberg;Blackwell, Oxford) 4th ed.,
29. Kotwal, G., J., and Moss, B., Nátuře (1988) 335 (6186) :176-8.
Claims (7)
1. Protein nativní komplementové dráhy modifikovaný tak, že tento protein je schopen vytváření stabilní C3 konvertasy.
2. Protein, podle nároku 1, který je modifikovaným lidským proteinem.
3. Protein, podle nároku 1 nebo nároku 2, který je více rezistentní na štěpení faktorem I než nativní protein.
4. Protein, podle kteréhokoliv z nároků 1 až 3, který je modifikovaným C3 proteinem.
5. Protein, podle nároku 5, kde je protein modifikován nahrazením bud Arg-1303, Arg-1320 nebo obou, jinou aminokyselinou.
6. Protein, podle nároku 5, kde Arg-1303 nebo Arg-1320 nebo oba jsou nahrazeny glutaminem, tyrosinem, cystinem, tryptofanem, glutamovou kyselinou nebo glycinem.
je nahrazen glutamovou kyselinou, glycinem nebo glutaminem.
9. Protein, podle kteréhokoliv z předchozích nároků, který má redukovanou citlivost na faktor H a/nebo faktor I vzhledem k nativní lidské C3 konvertase, kde zmíněný protein má jednu nebo více aminokyselinových změn vzhledem k nativní lidské C3 konvertase v regionu korespondujícímu aminozbytkum 752 - 754 a/nebo zbytkům 758 - 780 nativní lidské C3 konvertasy.
10. Protein podle nároku 9, kde jednou nebo více aminokyselinovými změnami jsou změny z kyselých aminokyselinových zbytků na neutrální aminokyselinové zbytky.
11. Protein podle nároku 9 nebo nároku 10, kde změny aminokyselinových zbytků jsou změny z Asp - Glu - Asp na Gly Ser - Gly.
12. Protein, podle kteréhokoliv z předchozích nároků, který má aminokyselinové změny vzhledem k nativní C3 konvertase v aminokyselinových zbytcích, korespondujících zbytkům 1427, 1431 a/nebo 1433 nativní lidské C3 konvertasy.
13. DNA sekvence kódující protein, jak je nárokován kterýmkoliv z nároků 1 až 12.
14. DNA konstrukt (t.j. vektor) obsahující DNA sekvenci jak je definována v nároku 13.
15. Protein, jak je definován kterýmkoliv z nároků 1 až 12, pro použití v terapii.
16. Konjugát obsahující protein, jak je definován v kterémkoliv z nároků 1 až 12, navázaný na specifickou vazebnou skupinu.
17. Konjugát podle nároku 16, kde specifickou vazebnou skupinou je specifický vazebný protein.
18 Konjugát podle nároku 17, kde specifickým vazebným proteinem je protilátka nebo její antigen vazebný fragment.
19. Použití proteinu, jak je definován kterýmkoliv z nároků 1 až 12 nebo konjugátu, jak je definován kterýmkoliv z nároků 16 až 18 k výrobě léčiv pro použití v depleci hladin proteinů komplementové dráhy.
20. Použití podle nároku 19, kde je léčivo použito v prevenci rejekce cizorodého materiálu.
21. Použití podle nároku 19, kde je léčivo použito pro lokalizaci a/nebo amplifikaci endogenní konverze proteinů komplementu a depozici ve specifickém místě.
22. Farmaceutická formulace zahrnující jeden nebo více proteinů, jak jsou definovány v kterémkoliv z nároků 1 až 12 nebo konjugátů, jak jsou definovány v kterémkoliv z nároků 16 až 18 dohromady s jedním nebo více farmaceuticky přijatelnými nosiči nebo excipienty.
23. Farmaceutická formulace podle nároku 22, pro použití v depleci hladin proteinů komplementové dráhy.
24. Farmaceutická formulace podle nároku 23, pro použití v prevenci rejekce cizorodého materiálu.
25. Farmaceutická formulace podle nároku 22, pro použití v lokalizaci a/nebo amplifikaci endogenní konverze proteinů komplementu a depozici ve specifickém místě ůsob r ce protXinů kpmpTementQvé djJtfry u sáXců, ^erý zahrnuje podání proteinu definovaného^ nároků 1 až 12s-aycúm.
Zrnko 1 i v z
27. Způsj/ť-pxrdTe^ nároku 25, kde prhťeiivj^e podán ve foxfiťě^Tarmaceutické formulace podle nároku 22.
2/13
1-2
3/13
4/13
2-2
5/13
6/13
2-4
7/13
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
GB9418147A GB9418147D0 (en) | 1994-09-08 | 1994-09-08 | Modified proteins |
GBGB9509102.1A GB9509102D0 (en) | 1995-05-04 | 1995-05-04 | Modified proteins |
PCT/GB1995/002121 WO1996007738A2 (en) | 1994-09-08 | 1995-09-08 | Modified human c3 proteins |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CZ68597A3 true CZ68597A3 (en) | 1997-11-12 |
CZ290596B6 CZ290596B6 (cs) | 2002-08-14 |
Family
ID=26305590
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CZ1997685A CZ290596B6 (cs) | 1994-09-08 | 1995-09-08 | Modifikovaný lidský C3 protein, DNA sekvence kódující tento protein, DNA konstrukt obsahující tuto DNA sekvenci, konjugát obsahující uvedený protein, pouľití uvedeného proteinu a konjugátu a farmaceutický prostředek obsahující uvedený protein nebo konjugát |
Country Status (21)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US5849297A (cs) |
EP (1) | EP0779922B1 (cs) |
JP (1) | JPH10505241A (cs) |
CN (1) | CN1104501C (cs) |
AT (1) | ATE273388T1 (cs) |
AU (1) | AU707004B2 (cs) |
BG (1) | BG63606B1 (cs) |
BR (1) | BR9509172A (cs) |
CA (1) | CA2197888A1 (cs) |
CZ (1) | CZ290596B6 (cs) |
DE (1) | DE69533359T2 (cs) |
ES (1) | ES2224133T3 (cs) |
FI (1) | FI970979A0 (cs) |
HU (1) | HUT77874A (cs) |
NO (1) | NO971059L (cs) |
NZ (2) | NZ292565A (cs) |
PL (1) | PL319040A1 (cs) |
RO (1) | RO117189B1 (cs) |
RU (1) | RU2194713C2 (cs) |
SK (1) | SK29697A3 (cs) |
WO (1) | WO1996007738A2 (cs) |
Families Citing this family (19)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
SK121798A3 (en) | 1996-03-07 | 1999-04-13 | Imutran Ltd | Native protein of a complement line, a fragment or variant of protein, dna sequence coding a protein, dna construct, a conjugate containing protein, pharmaceutical composition and use of protein |
EP0972200A1 (en) * | 1997-03-06 | 2000-01-19 | Bion Diagnostic Sciences, Inc. | Screening and treatment using complement regulator or receptor proteins |
US6221621B1 (en) | 1997-03-06 | 2001-04-24 | Bard Diagnostic Sciences, Inc. | Methods of screening for colorectal cancers in which a complement Factor I or related protein is associated |
WO2001092295A2 (en) * | 2000-05-30 | 2001-12-06 | University Of Toronto | Ligands for cd21 and compositions thereof for modulating immune responses |
US6756476B2 (en) * | 2001-04-30 | 2004-06-29 | Syn X Pharma, Inc. | Biopolymer marker indicative of disease state having a molecular weight of 2021 daltons |
US7294688B2 (en) * | 2001-04-30 | 2007-11-13 | Nanogen Inc. | Biopolymer marker indicative of disease state having a molecular weight of 1348 daltons |
US6998243B2 (en) * | 2001-04-30 | 2006-02-14 | Syn X Pharma, Inc. | Biopolymer marker indicative of disease state having a molecular weight of 1793 daltons |
US7314717B2 (en) * | 2001-04-30 | 2008-01-01 | Nanogen Inc. | Biopolymer marker indicative of disease state having a molecular weight of 1562 daltons |
US7179610B2 (en) * | 2001-11-23 | 2007-02-20 | Nanogen Inc. | Complement C3 precursor biopolymer markers indicative of insulin resistance |
US7097989B2 (en) * | 2001-11-23 | 2006-08-29 | Syn X Pharma, Inc. | Complement C3 precursor biopolymer markers predictive of type II diabetes |
WO2005107785A2 (en) * | 2004-04-30 | 2005-11-17 | University Of Hawaii | Human complement c3 derivates with cobra venom factor-like function |
US10206998B2 (en) | 2005-01-12 | 2019-02-19 | Proteonova, Inc. | Modular targeted therapeutic agents and methods of making same |
WO2006076417A1 (en) * | 2005-01-12 | 2006-07-20 | Proteonova, Inc. | Method for making targeted therapeutic agents |
WO2010056399A1 (en) * | 2008-11-17 | 2010-05-20 | Incode Biopharmaceutics, Inc. | Method and composition for modulating the immune system and various inflammatory conditions comprising complement depletors |
RU2542404C1 (ru) * | 2013-11-06 | 2015-02-20 | Федеральное бюджетное учреждение науки "Московский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н. Габричевского" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека | Способ определения функциональной активности компонента с4 комплемента человека |
RU2542401C1 (ru) * | 2013-11-06 | 2015-02-20 | Федеральное бюджетное учреждение науки "Московский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н. Габричевского" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека | Способ определения функциональной активности компонента с2 комплемента человека |
US11903996B2 (en) * | 2015-10-07 | 2024-02-20 | David C. Fritzinger | Modulators of complement function |
CN113214373B (zh) * | 2020-02-06 | 2022-08-30 | 深圳华大基因股份有限公司 | 新包虫病抗原Murinoglobulin-2蛋白 |
US11918624B2 (en) * | 2020-06-10 | 2024-03-05 | Kelsius Laboratories LLC | Therapeutic composition for use in the treatment of COVID-19 and other cytokine storm associated disorders |
Family Cites Families (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US4661347A (en) * | 1982-11-12 | 1987-04-28 | Scripps Clinic | Cytotoxic compositions |
-
1995
- 1995-09-08 JP JP8509319A patent/JPH10505241A/ja not_active Ceased
- 1995-09-08 ES ES95931276T patent/ES2224133T3/es not_active Expired - Lifetime
- 1995-09-08 CN CN95194984A patent/CN1104501C/zh not_active Expired - Fee Related
- 1995-09-08 WO PCT/GB1995/002121 patent/WO1996007738A2/en active IP Right Grant
- 1995-09-08 PL PL95319040A patent/PL319040A1/xx unknown
- 1995-09-08 AT AT95931276T patent/ATE273388T1/de not_active IP Right Cessation
- 1995-09-08 DE DE69533359T patent/DE69533359T2/de not_active Expired - Fee Related
- 1995-09-08 AU AU34772/95A patent/AU707004B2/en not_active Ceased
- 1995-09-08 CZ CZ1997685A patent/CZ290596B6/cs not_active IP Right Cessation
- 1995-09-08 HU HU9800775A patent/HUT77874A/hu unknown
- 1995-09-08 NZ NZ292565A patent/NZ292565A/xx unknown
- 1995-09-08 SK SK296-97A patent/SK29697A3/sk unknown
- 1995-09-08 BR BR9509172A patent/BR9509172A/pt not_active Application Discontinuation
- 1995-09-08 NZ NZ333949A patent/NZ333949A/en unknown
- 1995-09-08 RU RU97105374/13A patent/RU2194713C2/ru not_active IP Right Cessation
- 1995-09-08 EP EP95931276A patent/EP0779922B1/en not_active Expired - Lifetime
- 1995-09-08 CA CA002197888A patent/CA2197888A1/en not_active Abandoned
- 1995-09-08 RO RO97-00417A patent/RO117189B1/ro unknown
-
1997
- 1997-02-07 US US08/793,126 patent/US5849297A/en not_active Expired - Lifetime
- 1997-03-07 NO NO971059A patent/NO971059L/no unknown
- 1997-03-07 BG BG101295A patent/BG63606B1/bg unknown
- 1997-03-07 FI FI970979A patent/FI970979A0/fi unknown
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
BG63606B1 (bg) | 2002-06-28 |
NO971059D0 (no) | 1997-03-07 |
CZ290596B6 (cs) | 2002-08-14 |
BR9509172A (pt) | 1997-11-25 |
ATE273388T1 (de) | 2004-08-15 |
NZ333949A (en) | 2000-06-23 |
US5849297A (en) | 1998-12-15 |
EP0779922A2 (en) | 1997-06-25 |
ES2224133T3 (es) | 2005-03-01 |
WO1996007738A3 (en) | 1996-03-28 |
SK29697A3 (en) | 1998-01-14 |
PL319040A1 (en) | 1997-07-21 |
FI970979A (fi) | 1997-03-07 |
CN1162335A (zh) | 1997-10-15 |
CN1104501C (zh) | 2003-04-02 |
AU707004B2 (en) | 1999-07-01 |
NO971059L (no) | 1997-05-07 |
FI970979A0 (fi) | 1997-03-07 |
HUT77874A (hu) | 1998-09-28 |
EP0779922B1 (en) | 2004-08-11 |
DE69533359T2 (de) | 2005-07-28 |
DE69533359D1 (de) | 2004-09-16 |
RU2194713C2 (ru) | 2002-12-20 |
AU3477295A (en) | 1996-03-27 |
BG101295A (en) | 1997-12-30 |
MX9701783A (es) | 1997-10-31 |
RO117189B1 (ro) | 2001-11-30 |
WO1996007738A2 (en) | 1996-03-14 |
NZ292565A (en) | 1999-03-29 |
CA2197888A1 (en) | 1996-03-14 |
JPH10505241A (ja) | 1998-05-26 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
CZ68597A3 (en) | Modified human c3 proteins | |
JP4344136B2 (ja) | アポリポタンパク質類似体 | |
CN104507489B (zh) | 用于预防和治疗类风湿性关节炎的组合物 | |
EP0912730B1 (en) | Conjugates of soluble peptidic compounds with membrane-binding agents | |
KR20040026686A (ko) | 종양 및 세포의 제거 또는 파괴를 필요로 하는 다른질환의 치료에 효과적인 펩티드 | |
CN114099636A (zh) | 使用来源于神经丝蛋白的肽治疗需要破坏或移除细胞的病症的方法 | |
US6221657B1 (en) | Modified human C3 DNA sequences and vectors | |
MXPA06012321A (es) | Derivados c3 del complemento humano con funcion similar al factor de veneno de cobra. | |
US6268485B1 (en) | Down-regulation resistant C3 convertase | |
EP2004680B1 (en) | N-terminal vdac variants and uses thereof | |
RU2238322C2 (ru) | Протеин, обладающий способностью к образованию с3-конвертазы, днк, вектор, конъюгат и их использование | |
KR20160013730A (ko) | 세포투과성이 우수한 tat-a20 융합단백질의 제조방법 및 이의 용도 | |
JP2001521385A (ja) | ヒト腫瘍関連膜タンパク質 | |
MXPA97001783A (es) | Proteinas c3 humanas modificadas | |
WO2003080662A1 (en) | Protein kinase c modulators, their aminoacid and nucleotide sequences and uses thereof | |
JP2002502424A (ja) | 亜鉛ringタンパク質 | |
JP2002503103A (ja) | 新規のヒトdp1相同体 | |
PT1335938E (pt) | Construções de apolipoproteínas | |
IL194466A (en) | Variants of the V-N terminal of VDAC and their use |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
PD00 | Pending as of 2000-06-30 in czech republic | ||
MM4A | Patent lapsed due to non-payment of fee |
Effective date: 20030908 |