CZ357397A3 - Antigeny Helicobacter pylori a vakcinační kompozice - Google Patents
Antigeny Helicobacter pylori a vakcinační kompozice Download PDFInfo
- Publication number
- CZ357397A3 CZ357397A3 CZ973573A CZ357397A CZ357397A3 CZ 357397 A3 CZ357397 A3 CZ 357397A3 CZ 973573 A CZ973573 A CZ 973573A CZ 357397 A CZ357397 A CZ 357397A CZ 357397 A3 CZ357397 A3 CZ 357397A3
- Authority
- CZ
- Czechia
- Prior art keywords
- polypeptide
- helicobacter pylori
- lys
- leu
- vector
- Prior art date
Links
- 239000000203 mixture Substances 0.000 title claims abstract description 32
- 239000000427 antigen Substances 0.000 title claims abstract description 18
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 title claims abstract description 18
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 title claims abstract description 18
- 238000002255 vaccination Methods 0.000 title description 3
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims abstract description 113
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims abstract description 103
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 claims abstract description 100
- 241000590002 Helicobacter pylori Species 0.000 claims abstract description 62
- 229940037467 helicobacter pylori Drugs 0.000 claims abstract description 60
- 239000013598 vector Substances 0.000 claims abstract description 39
- 229960005486 vaccine Drugs 0.000 claims abstract description 29
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims abstract description 28
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims abstract description 26
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims abstract description 26
- 230000028993 immune response Effects 0.000 claims abstract description 19
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 claims abstract description 16
- 230000001681 protective effect Effects 0.000 claims abstract description 16
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims abstract description 15
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 claims abstract description 9
- 206010019375 Helicobacter infections Diseases 0.000 claims description 25
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 25
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims description 20
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 claims description 19
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 claims description 12
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 claims description 12
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims description 11
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims description 11
- 230000036039 immunity Effects 0.000 claims description 7
- 238000009007 Diagnostic Kit Methods 0.000 claims description 6
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 claims description 5
- 210000001124 body fluid Anatomy 0.000 claims description 5
- 239000010839 body fluid Substances 0.000 claims description 5
- 230000002163 immunogen Effects 0.000 claims description 5
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 claims description 4
- 244000005700 microbiome Species 0.000 claims description 4
- 239000007787 solid Substances 0.000 claims description 4
- 239000013600 plasmid vector Substances 0.000 claims description 3
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 claims description 2
- 238000012258 culturing Methods 0.000 claims description 2
- 239000003085 diluting agent Substances 0.000 claims description 2
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 claims description 2
- 230000002265 prevention Effects 0.000 claims description 2
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 claims description 2
- 238000011282 treatment Methods 0.000 claims description 2
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims 1
- 230000003449 preventive effect Effects 0.000 claims 1
- 229940021747 therapeutic vaccine Drugs 0.000 claims 1
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 abstract description 6
- 230000000069 prophylactic effect Effects 0.000 abstract description 3
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 34
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 33
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 22
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 22
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 21
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 21
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 20
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 19
- 101710106459 29 kDa protein Proteins 0.000 description 14
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 14
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 14
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 12
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 11
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 10
- QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;hydron;chloride Chemical compound Cl.OCC(N)(CO)CO QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N Methanol Chemical compound OC OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 9
- 230000003053 immunization Effects 0.000 description 9
- 238000002649 immunization Methods 0.000 description 9
- 239000012071 phase Substances 0.000 description 9
- 102000004895 Lipoproteins Human genes 0.000 description 8
- 108090001030 Lipoproteins Proteins 0.000 description 8
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 8
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 8
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 108010076504 Protein Sorting Signals Proteins 0.000 description 7
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 7
- 210000004379 membrane Anatomy 0.000 description 7
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 7
- 210000002784 stomach Anatomy 0.000 description 7
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N Acetic acid Chemical compound CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 6
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 6
- 108010046334 Urease Proteins 0.000 description 6
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 6
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 6
- 238000011081 inoculation Methods 0.000 description 6
- BPHPUYQFMNQIOC-NXRLNHOXSA-N isopropyl beta-D-thiogalactopyranoside Chemical compound CC(C)S[C@@H]1O[C@H](CO)[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O BPHPUYQFMNQIOC-NXRLNHOXSA-N 0.000 description 6
- 108010034529 leucyl-lysine Proteins 0.000 description 6
- 210000004877 mucosa Anatomy 0.000 description 6
- 239000002953 phosphate buffered saline Substances 0.000 description 6
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 6
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 6
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 6
- 230000009885 systemic effect Effects 0.000 description 6
- 241001590124 Helicobacter pylori 17874 Species 0.000 description 5
- 108010052285 Membrane Proteins Proteins 0.000 description 5
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 5
- 238000012408 PCR amplification Methods 0.000 description 5
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 5
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 108010092854 aspartyllysine Proteins 0.000 description 5
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 5
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 5
- 230000002496 gastric effect Effects 0.000 description 5
- 210000001156 gastric mucosa Anatomy 0.000 description 5
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 5
- 238000002415 sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 5
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 5
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 5
- RAAWHFXHAACDFT-FXQIFTODSA-N Ala-Met-Asn Chemical compound CSCC[C@H](NC(=O)[C@H](C)N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O RAAWHFXHAACDFT-FXQIFTODSA-N 0.000 description 4
- KXEGPPNPXOKKHK-ZLUOBGJFSA-N Asn-Asp-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O KXEGPPNPXOKKHK-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 4
- KNMRXHIAVXHCLW-ZLUOBGJFSA-N Asp-Asn-Ser Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)N)C(=O)O KNMRXHIAVXHCLW-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 4
- MGSVBZIBCCKGCY-ZLUOBGJFSA-N Asp-Ser-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O MGSVBZIBCCKGCY-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 4
- 241000589562 Brucella Species 0.000 description 4
- CURLTUGMZLYLDI-UHFFFAOYSA-N Carbon dioxide Chemical compound O=C=O CURLTUGMZLYLDI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N Chloroform Chemical compound ClC(Cl)Cl HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- BBBXWRGITSUJPB-YUMQZZPRSA-N Glu-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O BBBXWRGITSUJPB-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 4
- 241000589989 Helicobacter Species 0.000 description 4
- SWWCDAGDQHTKIE-RHYQMDGZSA-N Lys-Arg-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O SWWCDAGDQHTKIE-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 4
- HKCCVDWHHTVVPN-CIUDSAMLSA-N Lys-Asp-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O HKCCVDWHHTVVPN-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 4
- CANPXOLVTMKURR-WEDXCCLWSA-N Lys-Gly-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CCCCN CANPXOLVTMKURR-WEDXCCLWSA-N 0.000 description 4
- HVAUKHLDSDDROB-KKUMJFAQSA-N Lys-Lys-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O HVAUKHLDSDDROB-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 4
- ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N Phenol Chemical compound OC1=CC=CC=C1 ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 239000012614 Q-Sepharose Substances 0.000 description 4
- BSNZTJXVDOINSR-JXUBOQSCSA-N Thr-Ala-Leu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O BSNZTJXVDOINSR-JXUBOQSCSA-N 0.000 description 4
- GQVZBMROTPEPIF-SRVKXCTJSA-N Tyr-Ser-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O GQVZBMROTPEPIF-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 4
- 102100023870 YLP motif-containing protein 1 Human genes 0.000 description 4
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 description 4
- 108010040443 aspartyl-aspartic acid Proteins 0.000 description 4
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 4
- 239000003599 detergent Substances 0.000 description 4
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 4
- IPCSVZSSVZVIGE-UHFFFAOYSA-N hexadecanoic acid Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCC(O)=O IPCSVZSSVZVIGE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 238000000760 immunoelectrophoresis Methods 0.000 description 4
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 4
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 description 4
- 108010057952 lysyl-phenylalanyl-lysine Proteins 0.000 description 4
- 108010054155 lysyllysine Proteins 0.000 description 4
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 4
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 4
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 4
- SUBDBMMJDZJVOS-UHFFFAOYSA-N 5-methoxy-2-{[(4-methoxy-3,5-dimethylpyridin-2-yl)methyl]sulfinyl}-1H-benzimidazole Chemical compound N=1C2=CC(OC)=CC=C2NC=1S(=O)CC1=NC=C(C)C(OC)=C1C SUBDBMMJDZJVOS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- QHASENCZLDHBGX-ONGXEEELSA-N Ala-Gly-Phe Chemical compound C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 QHASENCZLDHBGX-ONGXEEELSA-N 0.000 description 3
- AWZKCUCQJNTBAD-SRVKXCTJSA-N Ala-Leu-Lys Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN AWZKCUCQJNTBAD-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 3
- CTWCFPWFIGRAEP-CIUDSAMLSA-N Asp-Lys-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O CTWCFPWFIGRAEP-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 3
- 102000009016 Cholera Toxin Human genes 0.000 description 3
- 108010049048 Cholera Toxin Proteins 0.000 description 3
- LGYCLOCORAEQSZ-PEFMBERDSA-N Glu-Ile-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O LGYCLOCORAEQSZ-PEFMBERDSA-N 0.000 description 3
- STVHDEHTKFXBJQ-LAEOZQHASA-N Gly-Glu-Ile Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O STVHDEHTKFXBJQ-LAEOZQHASA-N 0.000 description 3
- RIYIFUFFFBIOEU-KBPBESRZSA-N Gly-Tyr-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CC1=CC=C(O)C=C1 RIYIFUFFFBIOEU-KBPBESRZSA-N 0.000 description 3
- JWBXCSQZLLIOCI-GUBZILKMSA-N Ile-Leu Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(C)C JWBXCSQZLLIOCI-GUBZILKMSA-N 0.000 description 3
- TWVKGYNQQAUNRN-ACZMJKKPSA-N Ile-Ser Chemical compound CC[C@H](C)[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H](CO)C([O-])=O TWVKGYNQQAUNRN-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 3
- WXHFZJFZWNCDNB-KKUMJFAQSA-N Leu-Asn-Tyr Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 WXHFZJFZWNCDNB-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 3
- ILJREDZFPHTUIE-GUBZILKMSA-N Leu-Asp-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O ILJREDZFPHTUIE-GUBZILKMSA-N 0.000 description 3
- YOKVEHGYYQEQOP-QWRGUYRKSA-N Leu-Leu-Gly Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(O)=O YOKVEHGYYQEQOP-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 3
- FACUGMGEFUEBTI-SRVKXCTJSA-N Lys-Asn-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN FACUGMGEFUEBTI-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 3
- ZXFRGTAIIZHNHG-AJNGGQMLSA-N Lys-Ile-Leu Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)N ZXFRGTAIIZHNHG-AJNGGQMLSA-N 0.000 description 3
- NVGBPTNZLWRQSY-UWVGGRQHSA-N Lys-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN NVGBPTNZLWRQSY-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 3
- UQRZFMQQXXJTTF-AVGNSLFASA-N Lys-Lys-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O UQRZFMQQXXJTTF-AVGNSLFASA-N 0.000 description 3
- 108010002311 N-glycylglutamic acid Proteins 0.000 description 3
- 108700026244 Open Reading Frames Proteins 0.000 description 3
- 229960000723 ampicillin Drugs 0.000 description 3
- AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N ampicillin Chemical compound C1([C@@H](N)C(=O)N[C@H]2[C@H]3SC([C@@H](N3C2=O)C(O)=O)(C)C)=CC=CC=C1 AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N 0.000 description 3
- 239000012298 atmosphere Substances 0.000 description 3
- 239000006161 blood agar Substances 0.000 description 3
- 239000000969 carrier Substances 0.000 description 3
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 3
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 3
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 3
- VPZXBVLAVMBEQI-UHFFFAOYSA-N glycyl-DL-alpha-alanine Natural products OC(=O)C(C)NC(=O)CN VPZXBVLAVMBEQI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108010037896 heparin-binding hemagglutinin Proteins 0.000 description 3
- 101150044361 hpaA gene Proteins 0.000 description 3
- 238000000386 microscopy Methods 0.000 description 3
- 235000015097 nutrients Nutrition 0.000 description 3
- 229960000381 omeprazole Drugs 0.000 description 3
- 230000004044 response Effects 0.000 description 3
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 3
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 3
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 3
- GPRLSGONYQIRFK-MNYXATJNSA-N triton Chemical compound [3H+] GPRLSGONYQIRFK-MNYXATJNSA-N 0.000 description 3
- 239000000304 virulence factor Substances 0.000 description 3
- 230000007923 virulence factor Effects 0.000 description 3
- NHBKXEKEPDILRR-UHFFFAOYSA-N 2,3-bis(butanoylsulfanyl)propyl butanoate Chemical compound CCCC(=O)OCC(SC(=O)CCC)CSC(=O)CCC NHBKXEKEPDILRR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 description 2
- OMNVYXHOSHNURL-WPRPVWTQSA-N Ala-Phe Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 OMNVYXHOSHNURL-WPRPVWTQSA-N 0.000 description 2
- IPWKGIFRRBGCJO-IMJSIDKUSA-N Ala-Ser Chemical compound C[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H](CO)C([O-])=O IPWKGIFRRBGCJO-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 2
- NKLRWRRVYGQNIH-GHCJXIJMSA-N Asn-Ile-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O NKLRWRRVYGQNIH-GHCJXIJMSA-N 0.000 description 2
- JWKDQOORUCYUIW-ZPFDUUQYSA-N Asn-Lys-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O JWKDQOORUCYUIW-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 2
- WXVGISRWSYGEDK-KKUMJFAQSA-N Asn-Lys-Phe Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N WXVGISRWSYGEDK-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 2
- FQHBAQLBIXLWAG-DCAQKATOSA-N Asp-Lys-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N FQHBAQLBIXLWAG-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- RPUYTJJZXQBWDT-SRVKXCTJSA-N Asp-Phe-Ser Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N RPUYTJJZXQBWDT-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- 241000020089 Atacta Species 0.000 description 2
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N Atomic nitrogen Chemical compound N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 2
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 2
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 2
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 2
- RJONUNZIMUXUOI-GUBZILKMSA-N Glu-Asn-Lys Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N RJONUNZIMUXUOI-GUBZILKMSA-N 0.000 description 2
- IVGJYOOGJLFKQE-AVGNSLFASA-N Glu-Leu-Lys Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N IVGJYOOGJLFKQE-AVGNSLFASA-N 0.000 description 2
- MFNUFCFRAZPJFW-JYJNAYRXSA-N Glu-Lys-Phe Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 MFNUFCFRAZPJFW-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 2
- WXONSNSSBYQGNN-AVGNSLFASA-N Glu-Ser-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O WXONSNSSBYQGNN-AVGNSLFASA-N 0.000 description 2
- QCTLGOYODITHPQ-WHFBIAKZSA-N Gly-Cys-Ser Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O QCTLGOYODITHPQ-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 2
- YTSVAIMKVLZUDU-YUMQZZPRSA-N Gly-Leu-Asp Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O YTSVAIMKVLZUDU-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- UHPAZODVFFYEEL-QWRGUYRKSA-N Gly-Leu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)CN UHPAZODVFFYEEL-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 2
- CLNSYANKYVMZNM-UWVGGRQHSA-N Gly-Lys-Arg Chemical compound NCCCC[C@H](NC(=O)CN)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N CLNSYANKYVMZNM-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 2
- XBGGUPMXALFZOT-VIFPVBQESA-N Gly-Tyr Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 XBGGUPMXALFZOT-VIFPVBQESA-N 0.000 description 2
- PNUFMLXHOLFRLD-KBPBESRZSA-N Gly-Tyr-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CC1=CC=C(O)C=C1 PNUFMLXHOLFRLD-KBPBESRZSA-N 0.000 description 2
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 description 2
- IDXZDKMBEXLFMB-HGNGGELXSA-N His-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CNC=N1 IDXZDKMBEXLFMB-HGNGGELXSA-N 0.000 description 2
- ZFDKSLBEWYCOCS-BZSNNMDCSA-N His-Phe-Lys Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC=1NC=NC=1)C1=CC=CC=C1 ZFDKSLBEWYCOCS-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 2
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 2
- MHAJPDPJQMAIIY-UHFFFAOYSA-N Hydrogen peroxide Chemical compound OO MHAJPDPJQMAIIY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- PNDMHTTXXPUQJH-RWRJDSDZSA-N Ile-Glu-Thr Chemical compound N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)O PNDMHTTXXPUQJH-RWRJDSDZSA-N 0.000 description 2
- POJPZSMTTMLSTG-SRVKXCTJSA-N Leu-Asn-Lys Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N POJPZSMTTMLSTG-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- PVMPDMIKUVNOBD-CIUDSAMLSA-N Leu-Asp-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O PVMPDMIKUVNOBD-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- NFNVDJGXRFEYTK-YUMQZZPRSA-N Leu-Glu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O NFNVDJGXRFEYTK-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- DSFYPIUSAMSERP-IHRRRGAJSA-N Leu-Leu-Arg Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N DSFYPIUSAMSERP-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 2
- OVZLLFONXILPDZ-VOAKCMCISA-N Leu-Lys-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O OVZLLFONXILPDZ-VOAKCMCISA-N 0.000 description 2
- PTRKPHUGYULXPU-KKUMJFAQSA-N Leu-Phe-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O PTRKPHUGYULXPU-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 2
- DCRWPTBMWMGADO-AVGNSLFASA-N Lys-Glu-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O DCRWPTBMWMGADO-AVGNSLFASA-N 0.000 description 2
- ODUQLUADRKMHOZ-JYJNAYRXSA-N Lys-Glu-Tyr Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)N)O ODUQLUADRKMHOZ-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 2
- AHFOKDZWPPGJAZ-SRVKXCTJSA-N Lys-Lys-Cys Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)N AHFOKDZWPPGJAZ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- YDDDRTIPNTWGIG-SRVKXCTJSA-N Lys-Lys-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YDDDRTIPNTWGIG-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- ZCWWVXAXWUAEPZ-SRVKXCTJSA-N Lys-Met-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O ZCWWVXAXWUAEPZ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- CSNNHWWHGAXBCP-UHFFFAOYSA-L Magnesium sulfate Chemical compound [Mg+2].[O-][S+2]([O-])([O-])[O-] CSNNHWWHGAXBCP-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- OSOLWRWQADPDIQ-DCAQKATOSA-N Met-Asp-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O OSOLWRWQADPDIQ-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- LXCSZPUQKMTXNW-BQBZGAKWSA-N Met-Ser-Gly Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(O)=O LXCSZPUQKMTXNW-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 2
- 101710159910 Movement protein Proteins 0.000 description 2
- 206010065764 Mucosal infection Diseases 0.000 description 2
- 108091061960 Naked DNA Proteins 0.000 description 2
- 239000000020 Nitrocellulose Substances 0.000 description 2
- 239000002033 PVDF binder Substances 0.000 description 2
- 235000021314 Palmitic acid Nutrition 0.000 description 2
- WSXKXSBOJXEZDV-DLOVCJGASA-N Phe-Ala-Asn Chemical compound NC(=O)C[C@@H](C([O-])=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H]([NH3+])CC1=CC=CC=C1 WSXKXSBOJXEZDV-DLOVCJGASA-N 0.000 description 2
- LRBSWBVUCLLRLU-BZSNNMDCSA-N Phe-Leu-Lys Chemical compound CC(C)C[C@H](NC(=O)[C@@H](N)Cc1ccccc1)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O LRBSWBVUCLLRLU-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 2
- IAOZOFPONWDXNT-IXOXFDKPSA-N Phe-Ser-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O IAOZOFPONWDXNT-IXOXFDKPSA-N 0.000 description 2
- LAFKUZYWNCHOHT-WHFBIAKZSA-N Ser-Glu Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O LAFKUZYWNCHOHT-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 2
- MIJWOJAXARLEHA-WDSKDSINSA-N Ser-Gly-Glu Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O MIJWOJAXARLEHA-WDSKDSINSA-N 0.000 description 2
- CAOYHZOWXFFAIR-CIUDSAMLSA-N Ser-His-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O CAOYHZOWXFFAIR-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- NLOAIFSWUUFQFR-CIUDSAMLSA-N Ser-Leu-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O NLOAIFSWUUFQFR-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- FBLNYDYPCLFTSP-IXOXFDKPSA-N Ser-Phe-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O FBLNYDYPCLFTSP-IXOXFDKPSA-N 0.000 description 2
- NVNPWELENFJOHH-CIUDSAMLSA-N Ser-Ser-His Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CO)N NVNPWELENFJOHH-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- LDEBVRIURYMKQS-WISUUJSJSA-N Ser-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO LDEBVRIURYMKQS-WISUUJSJSA-N 0.000 description 2
- UYLKOSODXYSWMQ-XGEHTFHBSA-N Ser-Thr-Met Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N)O UYLKOSODXYSWMQ-XGEHTFHBSA-N 0.000 description 2
- 108091081024 Start codon Proteins 0.000 description 2
- QQWNRERCGGZOKG-WEDXCCLWSA-N Thr-Gly-Leu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O QQWNRERCGGZOKG-WEDXCCLWSA-N 0.000 description 2
- KRGDDWVBBDLPSJ-CUJWVEQBSA-N Thr-His-Ser Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O KRGDDWVBBDLPSJ-CUJWVEQBSA-N 0.000 description 2
- ADPHPKGWVDHWML-PPCPHDFISA-N Thr-Ile-Leu Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)N ADPHPKGWVDHWML-PPCPHDFISA-N 0.000 description 2
- 239000007983 Tris buffer Substances 0.000 description 2
- 229920004890 Triton X-100 Polymers 0.000 description 2
- 208000025865 Ulcer Diseases 0.000 description 2
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 2
- 108010011559 alanylphenylalanine Proteins 0.000 description 2
- 230000005875 antibody response Effects 0.000 description 2
- 230000000890 antigenic effect Effects 0.000 description 2
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 2
- QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N atomic oxygen Chemical compound [O] QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000001569 carbon dioxide Substances 0.000 description 2
- 229910002092 carbon dioxide Inorganic materials 0.000 description 2
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 2
- 239000013611 chromosomal DNA Substances 0.000 description 2
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 2
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 2
- 208000000718 duodenal ulcer Diseases 0.000 description 2
- 239000002158 endotoxin Substances 0.000 description 2
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 description 2
- 210000000981 epithelium Anatomy 0.000 description 2
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 2
- XBGGUPMXALFZOT-UHFFFAOYSA-N glycyl-L-tyrosine hemihydrate Natural products NCC(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 XBGGUPMXALFZOT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010026364 glycyl-glycyl-leucine Proteins 0.000 description 2
- 108010059898 glycyl-tyrosyl-lysine Proteins 0.000 description 2
- 108010087823 glycyltyrosine Proteins 0.000 description 2
- 239000011544 gradient gel Substances 0.000 description 2
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 2
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 2
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 2
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 2
- 229930027917 kanamycin Natural products 0.000 description 2
- 229960000318 kanamycin Drugs 0.000 description 2
- SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N kanamycin Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CN)O[C@@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](N)[C@H](O)[C@@H](CO)O2)O)[C@H](N)C[C@@H]1N SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N 0.000 description 2
- 229930182823 kanamycin A Natural products 0.000 description 2
- 108010087810 leucyl-seryl-glutamyl-leucine Proteins 0.000 description 2
- 108010003700 lysyl aspartic acid Proteins 0.000 description 2
- 108010056582 methionylglutamic acid Proteins 0.000 description 2
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 2
- WQEPLUUGTLDZJY-UHFFFAOYSA-N n-Pentadecanoic acid Natural products CCCCCCCCCCCCCCC(O)=O WQEPLUUGTLDZJY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229920001220 nitrocellulos Polymers 0.000 description 2
- 239000001301 oxygen Substances 0.000 description 2
- 229910052760 oxygen Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000008188 pellet Substances 0.000 description 2
- 230000002688 persistence Effects 0.000 description 2
- 108010024607 phenylalanylalanine Proteins 0.000 description 2
- 229920002401 polyacrylamide Polymers 0.000 description 2
- 229920002981 polyvinylidene fluoride Polymers 0.000 description 2
- 230000003389 potentiating effect Effects 0.000 description 2
- 230000028327 secretion Effects 0.000 description 2
- 241000894007 species Species 0.000 description 2
- 238000003756 stirring Methods 0.000 description 2
- 238000003860 storage Methods 0.000 description 2
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 2
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 2
- 108010061238 threonyl-glycine Proteins 0.000 description 2
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 2
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 2
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 2
- LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N tris Chemical compound OCC(N)(CO)CO LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010087967 type I signal peptidase Proteins 0.000 description 2
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 2
- QRXMUCSWCMTJGU-UHFFFAOYSA-L (5-bromo-4-chloro-1h-indol-3-yl) phosphate Chemical compound C1=C(Br)C(Cl)=C2C(OP([O-])(=O)[O-])=CNC2=C1 QRXMUCSWCMTJGU-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- OWEGMIWEEQEYGQ-UHFFFAOYSA-N 100676-05-9 Natural products OC1C(O)C(O)C(CO)OC1OCC1C(O)C(O)C(O)C(OC2C(OC(O)C(O)C2O)CO)O1 OWEGMIWEEQEYGQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LFBQCYXZWFTTCM-UHFFFAOYSA-N 2,5-dihydro-1h-tetrazole;nitric acid Chemical compound O[N+]([O-])=O.C1NNN=N1 LFBQCYXZWFTTCM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101710112984 20 kDa protein Proteins 0.000 description 1
- LVSPDZAGCBEQAV-UHFFFAOYSA-N 4-chloronaphthalen-1-ol Chemical compound C1=CC=C2C(O)=CC=C(Cl)C2=C1 LVSPDZAGCBEQAV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OPIFSICVWOWJMJ-AEOCFKNESA-N 5-bromo-4-chloro-3-indolyl beta-D-galactoside Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1OC1=CNC2=CC=C(Br)C(Cl)=C12 OPIFSICVWOWJMJ-AEOCFKNESA-N 0.000 description 1
- QRXMUCSWCMTJGU-UHFFFAOYSA-N 5-bromo-4-chloro-3-indolyl phosphate Chemical compound C1=C(Br)C(Cl)=C2C(OP(O)(=O)O)=CNC2=C1 QRXMUCSWCMTJGU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LBJYAILUMSUTAM-ZLUOBGJFSA-N Ala-Asn-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O LBJYAILUMSUTAM-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- STACJSVFHSEZJV-GHCJXIJMSA-N Ala-Asn-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O STACJSVFHSEZJV-GHCJXIJMSA-N 0.000 description 1
- MFMDKJIPHSWSBM-GUBZILKMSA-N Ala-Lys-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O MFMDKJIPHSWSBM-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- MSWSRLGNLKHDEI-ACZMJKKPSA-N Ala-Ser-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O MSWSRLGNLKHDEI-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- MMLHRUJLOUSRJX-CIUDSAMLSA-N Ala-Ser-Lys Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN MMLHRUJLOUSRJX-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- ARHJJAAWNWOACN-FXQIFTODSA-N Ala-Ser-Val Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O ARHJJAAWNWOACN-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- PHQXWZGXKAFWAZ-ZLIFDBKOSA-N Ala-Trp-Lys Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@@H](N)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O)=CNC2=C1 PHQXWZGXKAFWAZ-ZLIFDBKOSA-N 0.000 description 1
- 102000002260 Alkaline Phosphatase Human genes 0.000 description 1
- 108020004774 Alkaline Phosphatase Proteins 0.000 description 1
- DFCIPNHFKOQAME-FXQIFTODSA-N Arg-Ala-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O DFCIPNHFKOQAME-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- AYZAWXAPBAYCHO-CIUDSAMLSA-N Asn-Asn-His Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N AYZAWXAPBAYCHO-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- LVHMEJJWEXBMKK-GMOBBJLQSA-N Asn-Ile-Met Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N LVHMEJJWEXBMKK-GMOBBJLQSA-N 0.000 description 1
- HDHZCEDPLTVHFZ-GUBZILKMSA-N Asn-Leu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O HDHZCEDPLTVHFZ-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- FRYULLIZUDQONW-IMJSIDKUSA-N Asp-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O FRYULLIZUDQONW-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- UMHUHHJMEXNSIV-CIUDSAMLSA-N Asp-Leu-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O UMHUHHJMEXNSIV-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- GYWQGGUCMDCUJE-DLOVCJGASA-N Asp-Phe-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O GYWQGGUCMDCUJE-DLOVCJGASA-N 0.000 description 1
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 1
- 238000009631 Broth culture Methods 0.000 description 1
- 101100042788 Caenorhabditis elegans him-1 gene Proteins 0.000 description 1
- 102100035882 Catalase Human genes 0.000 description 1
- 108010053835 Catalase Proteins 0.000 description 1
- 229920000298 Cellophane Polymers 0.000 description 1
- 108091035707 Consensus sequence Proteins 0.000 description 1
- 229920000858 Cyclodextrin Polymers 0.000 description 1
- 238000012270 DNA recombination Methods 0.000 description 1
- 238000011238 DNA vaccination Methods 0.000 description 1
- 108090000204 Dipeptidase 1 Proteins 0.000 description 1
- 241001198387 Escherichia coli BL21(DE3) Species 0.000 description 1
- 208000007882 Gastritis Diseases 0.000 description 1
- 108700007698 Genetic Terminator Regions Proteins 0.000 description 1
- LSPKYLAFTPBWIL-BYPYZUCNSA-N Glu-Gly Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O LSPKYLAFTPBWIL-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- PJBVXVBTTFZPHJ-GUBZILKMSA-N Glu-Leu-Asp Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N PJBVXVBTTFZPHJ-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- JVYNYWXHZWVJEF-NUMRIWBASA-N Glu-Thr-Asn Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N)O JVYNYWXHZWVJEF-NUMRIWBASA-N 0.000 description 1
- RXJFSLQVMGYQEL-IHRRRGAJSA-N Glu-Tyr-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 RXJFSLQVMGYQEL-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- KIEICAOUSNYOLM-NRPADANISA-N Glu-Val-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O KIEICAOUSNYOLM-NRPADANISA-N 0.000 description 1
- IEFJWDNGDZAYNZ-BYPYZUCNSA-N Gly-Glu Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O IEFJWDNGDZAYNZ-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- XPJBQTCXPJNIFE-ZETCQYMHSA-N Gly-Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)CN XPJBQTCXPJNIFE-ZETCQYMHSA-N 0.000 description 1
- 241001473951 Helicobacter pylori NCTC 11638 Species 0.000 description 1
- MLZVJIREOKTDAR-SIGLWIIPSA-N His-Ile-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O MLZVJIREOKTDAR-SIGLWIIPSA-N 0.000 description 1
- RWIKBYVJQAJYDP-BJDJZHNGSA-N Ile-Ala-Lys Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN RWIKBYVJQAJYDP-BJDJZHNGSA-N 0.000 description 1
- NZGTYCMLUGYMCV-XUXIUFHCSA-N Ile-Lys-Arg Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)O)N NZGTYCMLUGYMCV-XUXIUFHCSA-N 0.000 description 1
- AKOYRLRUFBZOSP-BJDJZHNGSA-N Ile-Lys-Ser Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)N AKOYRLRUFBZOSP-BJDJZHNGSA-N 0.000 description 1
- HQEPKOFULQTSFV-JURCDPSOSA-N Ile-Phe-Ala Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)O)N HQEPKOFULQTSFV-JURCDPSOSA-N 0.000 description 1
- 206010061218 Inflammation Diseases 0.000 description 1
- 241000235058 Komagataella pastoris Species 0.000 description 1
- FADYJNXDPBKVCA-UHFFFAOYSA-N L-Phenylalanyl-L-lysin Natural products NCCCCC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 FADYJNXDPBKVCA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SENJXOPIZNYLHU-UHFFFAOYSA-N L-leucyl-L-arginine Natural products CC(C)CC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CCCN=C(N)N SENJXOPIZNYLHU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SENJXOPIZNYLHU-IUCAKERBSA-N Leu-Arg Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N SENJXOPIZNYLHU-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- LESXFEZIFXFIQR-LURJTMIESA-N Leu-Gly Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O LESXFEZIFXFIQR-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- BGZCJDGBBUUBHA-KKUMJFAQSA-N Leu-Lys-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O BGZCJDGBBUUBHA-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- 241000239218 Limulus Species 0.000 description 1
- WXJKFRMKJORORD-DCAQKATOSA-N Lys-Arg-Ala Chemical compound NC(=N)NCCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN WXJKFRMKJORORD-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- ALSRJRIWBNENFY-DCAQKATOSA-N Lys-Arg-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O ALSRJRIWBNENFY-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- QBGPXOGXCVKULO-BQBZGAKWSA-N Lys-Cys Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O QBGPXOGXCVKULO-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- HKXSZKJMDBHOTG-CIUDSAMLSA-N Lys-Ser-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN HKXSZKJMDBHOTG-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-PICCSMPSSA-N Maltose Natural products O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)OC(O)[C@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-PICCSMPSSA-N 0.000 description 1
- 102000018697 Membrane Proteins Human genes 0.000 description 1
- DLAFCQWUMFMZSN-GUBZILKMSA-N Met-Arg-Ala Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O)CCCN=C(N)N DLAFCQWUMFMZSN-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- 108090000143 Mouse Proteins Proteins 0.000 description 1
- WUGMRIBZSVSJNP-UHFFFAOYSA-N N-L-alanyl-L-tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(NC(=O)C(N)C)C(O)=O)=CNC2=C1 WUGMRIBZSVSJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101710171321 Neuraminyllactose-binding hemagglutinin Proteins 0.000 description 1
- 108091005804 Peptidases Proteins 0.000 description 1
- 102000035195 Peptidases Human genes 0.000 description 1
- MIDZLCFIAINOQN-WPRPVWTQSA-N Phe-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 MIDZLCFIAINOQN-WPRPVWTQSA-N 0.000 description 1
- WEMYTDDMDBLPMI-DKIMLUQUSA-N Phe-Ile-Lys Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=CC=C1)N WEMYTDDMDBLPMI-DKIMLUQUSA-N 0.000 description 1
- GLJZDMZJHFXJQG-BZSNNMDCSA-N Phe-Ser-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O GLJZDMZJHFXJQG-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- OLZVAVSJEUAOHI-UNQGMJICSA-N Phe-Thr-Met Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=CC=C1)N)O OLZVAVSJEUAOHI-UNQGMJICSA-N 0.000 description 1
- 241000220324 Pyrus Species 0.000 description 1
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 description 1
- 102000006382 Ribonucleases Human genes 0.000 description 1
- 108010083644 Ribonucleases Proteins 0.000 description 1
- 238000012300 Sequence Analysis Methods 0.000 description 1
- YMTLKLXDFCSCNX-BYPYZUCNSA-N Ser-Gly-Gly Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)NCC(O)=O YMTLKLXDFCSCNX-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- 229930006000 Sucrose Natural products 0.000 description 1
- CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N Sucrose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N 0.000 description 1
- QGXCWPNQVCYJEL-NUMRIWBASA-N Thr-Asn-Glu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O QGXCWPNQVCYJEL-NUMRIWBASA-N 0.000 description 1
- LUMXICQAOKVQOB-YWIQKCBGSA-N Thr-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)[C@@H](C)O LUMXICQAOKVQOB-YWIQKCBGSA-N 0.000 description 1
- VGNLMPBYWWNQFS-ZEILLAHLSA-N Thr-Thr-His Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)N)O VGNLMPBYWWNQFS-ZEILLAHLSA-N 0.000 description 1
- 239000007984 Tris EDTA buffer Substances 0.000 description 1
- 239000013504 Triton X-100 Substances 0.000 description 1
- 229920004929 Triton X-114 Polymers 0.000 description 1
- 101710090398 Viral interleukin-10 homolog Proteins 0.000 description 1
- 210000001015 abdomen Anatomy 0.000 description 1
- QPMSXSBEVQLBIL-CZRHPSIPSA-N ac1mix0p Chemical compound C1=CC=C2N(C[C@H](C)CN(C)C)C3=CC(OC)=CC=C3SC2=C1.O([C@H]1[C@]2(OC)C=CC34C[C@@H]2[C@](C)(O)CCC)C2=C5[C@]41CCN(C)[C@@H]3CC5=CC=C2O QPMSXSBEVQLBIL-CZRHPSIPSA-N 0.000 description 1
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 1
- 230000009858 acid secretion Effects 0.000 description 1
- 230000002378 acidificating effect Effects 0.000 description 1
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 1
- 239000008346 aqueous phase Substances 0.000 description 1
- 244000052616 bacterial pathogen Species 0.000 description 1
- 108010058966 bacteriophage T7 induced DNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 description 1
- 230000000903 blocking effect Effects 0.000 description 1
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 1
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 1
- 230000001488 breeding effect Effects 0.000 description 1
- UDSAIICHUKSCKT-UHFFFAOYSA-N bromophenol blue Chemical compound C1=C(Br)C(O)=C(Br)C=C1C1(C=2C=C(Br)C(O)=C(Br)C=2)C2=CC=CC=C2S(=O)(=O)O1 UDSAIICHUKSCKT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 1
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 1
- 210000000170 cell membrane Anatomy 0.000 description 1
- 239000006285 cell suspension Substances 0.000 description 1
- 230000008859 change Effects 0.000 description 1
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 1
- 229960005091 chloramphenicol Drugs 0.000 description 1
- WIIZWVCIJKGZOK-RKDXNWHRSA-N chloramphenicol Chemical compound ClC(Cl)C(=O)N[C@H](CO)[C@H](O)C1=CC=C([N+]([O-])=O)C=C1 WIIZWVCIJKGZOK-RKDXNWHRSA-N 0.000 description 1
- 208000023652 chronic gastritis Diseases 0.000 description 1
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 1
- 239000000356 contaminant Substances 0.000 description 1
- NKLPQNGYXWVELD-UHFFFAOYSA-M coomassie brilliant blue Chemical compound [Na+].C1=CC(OCC)=CC=C1NC1=CC=C(C(=C2C=CC(C=C2)=[N+](CC)CC=2C=C(C=CC=2)S([O-])(=O)=O)C=2C=CC(=CC=2)N(CC)CC=2C=C(C=CC=2)S([O-])(=O)=O)C=C1 NKLPQNGYXWVELD-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 210000004748 cultured cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000005520 cutting process Methods 0.000 description 1
- 125000000151 cysteine group Chemical group N[C@@H](CS)C(=O)* 0.000 description 1
- 238000000354 decomposition reaction Methods 0.000 description 1
- 230000007850 degeneration Effects 0.000 description 1
- 230000003412 degenerative effect Effects 0.000 description 1
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 1
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 1
- 238000002405 diagnostic procedure Methods 0.000 description 1
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 1
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 1
- LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I dipotassium trisodium dihydrogen phosphate hydrogen phosphate dichloride Chemical compound P(=O)(O)(O)[O-].[K+].P(=O)(O)([O-])[O-].[Na+].[Na+].[Cl-].[K+].[Cl-].[Na+] LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I 0.000 description 1
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 1
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 1
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 1
- 238000004520 electroporation Methods 0.000 description 1
- 239000003480 eluent Substances 0.000 description 1
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 1
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 1
- 210000003527 eukaryotic cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 1
- 239000012894 fetal calf serum Substances 0.000 description 1
- 235000013305 food Nutrition 0.000 description 1
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 1
- 238000001502 gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 238000001476 gene delivery Methods 0.000 description 1
- 235000011187 glycerol Nutrition 0.000 description 1
- 108010050848 glycylleucine Proteins 0.000 description 1
- PCHJSUWPFVWCPO-UHFFFAOYSA-N gold Chemical compound [Au] PCHJSUWPFVWCPO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000010931 gold Substances 0.000 description 1
- 229910052737 gold Inorganic materials 0.000 description 1
- IPCSVZSSVZVIGE-UHFFFAOYSA-M hexadecanoate Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCC([O-])=O IPCSVZSSVZVIGE-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 108010092114 histidylphenylalanine Proteins 0.000 description 1
- 108010018006 histidylserine Proteins 0.000 description 1
- 238000000265 homogenisation Methods 0.000 description 1
- 244000052637 human pathogen Species 0.000 description 1
- 238000007654 immersion Methods 0.000 description 1
- 230000001900 immune effect Effects 0.000 description 1
- 230000008076 immune mechanism Effects 0.000 description 1
- 238000003018 immunoassay Methods 0.000 description 1
- 230000005847 immunogenicity Effects 0.000 description 1
- 230000016784 immunoglobulin production Effects 0.000 description 1
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 1
- 230000004054 inflammatory process Effects 0.000 description 1
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 description 1
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 1
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 1
- 230000000968 intestinal effect Effects 0.000 description 1
- 150000002500 ions Chemical class 0.000 description 1
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 1
- 210000002429 large intestine Anatomy 0.000 description 1
- 108010000761 leucylarginine Proteins 0.000 description 1
- 230000007774 longterm Effects 0.000 description 1
- 239000006166 lysate Substances 0.000 description 1
- 108010009298 lysylglutamic acid Proteins 0.000 description 1
- 229910052943 magnesium sulfate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000019341 magnesium sulphate Nutrition 0.000 description 1
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000013507 mapping Methods 0.000 description 1
- 239000000463 material Substances 0.000 description 1
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 1
- 239000004005 microsphere Substances 0.000 description 1
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 1
- 239000013642 negative control Substances 0.000 description 1
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 1
- 229940126578 oral vaccine Drugs 0.000 description 1
- 238000007911 parenteral administration Methods 0.000 description 1
- 244000052769 pathogen Species 0.000 description 1
- 230000008506 pathogenesis Effects 0.000 description 1
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 description 1
- 235000021017 pears Nutrition 0.000 description 1
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 description 1
- 239000013641 positive control Substances 0.000 description 1
- 239000000843 powder Substances 0.000 description 1
- 239000002244 precipitate Substances 0.000 description 1
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 1
- 239000000047 product Substances 0.000 description 1
- 230000000750 progressive effect Effects 0.000 description 1
- 210000001236 prokaryotic cell Anatomy 0.000 description 1
- 229940021993 prophylactic vaccine Drugs 0.000 description 1
- 229940024999 proteolytic enzymes for treatment of wounds and ulcers Drugs 0.000 description 1
- 229940126409 proton pump inhibitor Drugs 0.000 description 1
- 239000000612 proton pump inhibitor Substances 0.000 description 1
- 239000002510 pyrogen Substances 0.000 description 1
- 238000000163 radioactive labelling Methods 0.000 description 1
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 1
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 1
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 1
- HFHDHCJBZVLPGP-UHFFFAOYSA-N schardinger α-dextrin Chemical compound O1C(C(C2O)O)C(CO)OC2OC(C(C2O)O)C(CO)OC2OC(C(C2O)O)C(CO)OC2OC(C(O)C2O)C(CO)OC2OC(C(C2O)O)C(CO)OC2OC2C(O)C(O)C1OC2CO HFHDHCJBZVLPGP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 1
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 1
- 239000002002 slurry Substances 0.000 description 1
- 210000000813 small intestine Anatomy 0.000 description 1
- 239000002689 soil Substances 0.000 description 1
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 1
- 238000000527 sonication Methods 0.000 description 1
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 1
- 239000005720 sucrose Substances 0.000 description 1
- 230000002459 sustained effect Effects 0.000 description 1
- 230000008685 targeting Effects 0.000 description 1
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 1
- 231100000397 ulcer Toxicity 0.000 description 1
- 241001515965 unidentified phage Species 0.000 description 1
- 239000003981 vehicle Substances 0.000 description 1
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 1
- 210000005253 yeast cell Anatomy 0.000 description 1
- DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N β‐Mercaptoethanol Chemical compound OCCS DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/195—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria
- C07K14/205—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria from Campylobacter (G)
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
- A61P31/12—Antivirals
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Public Health (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Oncology (AREA)
- Communicable Diseases (AREA)
- Virology (AREA)
- Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
Description
Antigeny Helicobacter pylori a vakcinační kompozice
Oblast techniky
Vynález řeší rekombinantní polypeptidy, které sestávají z antigenů Helicobacter pylori, které jsou exprimovány na povrchu délivé (bacilární) formy i na povrchu kulovité (coccoidní) formy Helicobacter pylori a umožňují nasměrování systémických i lokálních (mukosální) protilátek. Vynález dále řeší molekuly nukleových kyselin. Tyto rekombinantní polypeptidy jsou užitečné pro diagnózu Helicobacter pylori infekcí a pro výrobu vakcinačních kompozic, které mohou vyvolat ochrannou imunitní odezvu proti uvedených infekcím, přičemž tyto kompozice jsou dobré jak pro terapeutické, tak pro preventivní použiti.
Dosavadní stav techniky
Gramnegativní bakterie Helicobacter pylori je důležitým lidským pathogenem, který vyvolává určité gastroduodenální nemoci. Kolonizace žaludečního epitelu touto bakterií vede k aktivnímu zánětu a progresivní chronické gastritidě, která výrazně zvyšuje riziko, že se vyvine vředová choroba.
Za účelem kolonizace žaludeční sliznice používá Helicobacter pylori řadu virulentních faktorů. Mezi tyto faktory patří několik adhesinů, s kterými se bakterium spojuje se sliznici a/nebo se váže k buňkám, ureázám, které pomáhají neutralizovat kyselé prostředí a proteolytickým enzymům, které sliznici ztekucují. Přes silně viditelnou imunitní odezvu na Helicobacter pylori, doprovázenou produkcí lokálních (mukosálních) i systémických protilátek, patogen persistuje v žaludeční sliznici po dobu celého života hostitele velmi často. Proč tomu tak je, lze snad vysvětlit • * · ·« • · · · · ···· ·· · · ♦ ♦ * — 9 — · · v·· · · · · · ♦··· · ** ·«·«·« · · · • 9 «9 ·* ···» ·· * · spontánně indukovanou imunitní odezvou, která je neadekvátní nebo je zaměřena na špatné epitopy antigenů.
Aby se lépe porozumělo patogenézi a imunologii Helicobacter pylori infekcí, je velmi důležité definovat antigenní strukturu této bakterie. Zejména je třeba pro charakterizaci povrchově exponovaných (adhesinům podobných) a vylučovaných proteinů, které jak se ukazuje, představují hlavni virulentní faktory v mnoha bakteriálních patogenech a které mohou být užitečné pro diagnózu Helicobacter pylori a při výrobě vakcinačních prostředků.
Klonování genu hpaA, který kóduje 20 kDa receptor nesoucí podjednotku N-acetylneuraminyllaktozu nesoucí vláknitý hemaglutinyn. (NLBH Helicobacter pylori), bylo objeveno Evansem et al. 1993. J.Bacteriol. 175, 674-683.
Monoklonální protilátky (MAb) proti membránovým preparátům Helicobacter pylori byly objeveny Bólingem et al. (1995 J. Clin. Microbiol 33,381-384), jeden z těchto MAbů, označovaný jako HP30-l:l:6, reagoval s 30 kDa proteinem, který se ukázal být vystaven na povrchu intaktní bakterie a má vlastnosti podobné adhesinu.
Jestliže jsou buňky Helicobacter pyloripodrobeny stresu nebo fyzikálnímu ataku, přemění se z bacilární podoby do coccoidní. V této formě buňky Helicobacter pylori mohou býti nebo měla přeneseny mezi jedinci v přímým kontaktem, sloužit imunitní bacilární i coccoidní, pylori. Přestože systémická omezenou roli této formě, např. vodní cestou
Jako účinná vakcinační kompozice by formám, tedy Helicobacter odezva proti obojím ve které se vyskytuje imunita patrné infekcím sliznice, hraje pouze při ochraně proti infekcím sliznice, je také důležité, že vakcinační kompozice podpoří imunitní mechanizmy lokálně v žaludku.
Úkol vynálezu
Tento vynález si klade za úkol nalézt antigenni peptidy Helicobacter pylori, které mohou být užitečné např. pro vyvolání ochranné imunitní odezvy proti infekci Helicobacter pylori a pro diagnózu této infekce. Tohoto cíle se dosáhlo rekombinantním klonováním genu Helicobacter pylori, který kóduje protein, umístěný na povrchu této bakterie. Sekvence nukleové kyseliny tohoto genu je podobná sekvenci hpaA genu, jak v Journal of Bacteriology, bylo publikováno složení ji publikoval Evans et al. 1993 175, str.674-683. Nicméně zatímco hpaA genu, kódujícího protein o délce 20 kDa, překvapivě bylo zjištěno, že molekula DNA podle vynálezu kóduje polypeptid o molekulové hmotnosti 29 kDa.
Polypeptid o hmotnosti 29 kDa se ukázal být anitenním proteinem, který je exprimován ve všech kmenech Helicobacter pylori, včetně coccoidních forem této bakterie, a který je schopen vyvolat mukosální i systemickou imunitní odpověd u hostitele, jehož produkce protilátek se měří. Polypeptid 29 kDa je exprimován všemi testovanými kmeny Helicobacter pylori a protilátky, vytvořené proti tomuto proteinu nereagují křížově s obecnou lidskou endogenní bakterií jiných druhů nebo s vybranými lidskými tkáněmi včetně žaludeční sliznice. Toto je důležité, neboť dobře konzervovaný adhesin s imunogenními vlastnostmi, uvedený polypeptid 29 kDa, je užitečný jak pro detekci Helicobacter pylori infekci, tak pro výrobu vakcinačních kompozic, které, pokud jsou podány ve vhodné faramceutické kompozici vyvolávají ochrannou nebo terapeutickou imunitní odezvu proti zrnípněným infekcím.
Experimentální výsledky, které jsou uvedeny dále, proto udávají, že protein 29 kDa Helicobacter pylori je důležitý pro kolonizaci a/nebo přetrvávání infekce Helicobacter pylori, neboť vazba monoklonální protilátky k proteinu 29 kDa způsobuje úplnou inhibici kolonizace Helicobacter pylori u myší. Dále Protein 29 kDa Helicobacter pylori, pokud je užíván jako orální imunogen, působí jako stimulátor imunitní odezvy, což vede k zřetelné redukci kolonizace Helicobacter pylori u myší, které byly nakaženy Helicobacter pylori 1 měsíc před imunizací.
Stručný popis přiložených vyobrazení
Obr. 1: obsahující 1,7 polypeptid 29
Mapa restrikčního enzymu plazmidu pAEl, kb fragment Helicobacter pylori, kódující kDa. Srafovaný obdélník určuje pozici strukturálního genu. Umístění promotorových sekvencí T3 a T7 jsou znázorněny nad černými obdélníky indikujícími vektor.
Obr. 2: Plazmidové mapy pS861, pS862 a pS863, naplněné oblasti: lac operonový promotor (Plac) nebo bakterifág T7RNA, polymerázový promotor (T7 promotor), šedá plocha: PCR generované 5'- zakončení nebo 3'- zakončení genu 29 kDa. Terminátor T7 transkripční terminátor. Původ: pBA 322 plazmidová replikace.
Obr. 3: Vliv monoklonálních protilátek na kolonizaci Helicobacter pylori u BALB/c myši.
Obr. 4: Terapeutické orální imunizace Helicobacter pylori nakažené myši.
Podstata vynálezu
V celém tomto popisu a zejména v následujících příkladech, znamenají výrazy standardní protokoly a standardní procedury, pokud jsou používány v kontextu s technikami molekulárního klonování, protokoly a postupy, které lze naleznout v běžné laboratorní příručce jako je
Sambrook, J., Fritsch, E.F. and Maniatis, T. (1989) Molecular
Cloning: A laboratory manual, 2nd Ed., Cold Spring Harbos
Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY.
v prvním aspektu tohoto vynálezu se řeší rekombinantní polypeptid, který má aminokyselinou sekvenci úplně nebo podstatně shodnou s antigenem, vystaveným na povrchu Helicobacter pylori s přibližnou molekulovou hmotností 29 kDa.
Uvedený antigen vystavený na povrchu podle vynálezu má následující důležité vlastnosti:
. Je to adhesin, který je důležitý pro kolonizaci žaludeční sliznice.
. Je exprimován na povrchu jak dělivé (bacilární) formy, tak odolné (coccoidní) formy Helicobacter pylori.
. Je to silný antigen, poskytující terč jak systémickým tak lokálním (mukosálnim) produkovaným protilátkám, . Je konzervován ve všech testovaných kmenech Helicobacter pylori
Protilátky proti polypeptidu 29 kDa nereagují křížové s mnoha různými nehelicobakteriálními bakteriemi nebo s vybranými lidskými tkáněmi včetně žaludeční sliznice.
Polypeptid 29 kDa je lipidován a tak postranslačně modifikován. Tento znak polypeptidu může mít význam pro jeho imunogenicitu a jeho vlastní expozici na povrchu Helicobacter pylori. Je známo v oboru, že tukové modifikace mohou být podstatné pro imunologické vlastnosti bakteriálních lipoproteinú (viz Weis J. J. et al. (1994) Infection and Immunity, vol 62, 4632-4636).
. Je to putativní faktor virulence, přičemž termín faktor virulence znamená specifickou schopnost molekuly v kontaktu s Helicobacter pylori na povrchu epitelu žaludeční sliznice • · • · * ·
a/nebo v stabilní a udržované infekci Helicobacter pylori.
Ve výhodném provedení má zmíněný polypeptid sekvenci aminokyselin v pozicích 1-260 nebo 28-260 podle přiloženého přehledu SEQ ID NO 2 nebo SEQ ID NO 4. Jak je dále popsáno v experimentální části, předpokládá se, že pozice 1-260 v SEQ ID NO 2 a SEQ ID NO 4 představují samostatný protein, zatímco pozice 1-27 představuje signální sekvenci a pozice 28-260 představuje zralý polypeptid. Jediným rozdílem mezi SE ID NO 2 a SEQ ID NO 4 je to, že SEQ ID NO 2 má zbytek SER v pozici 222, zatímco SEQ ID NO 4 má v téže pozici zbytek ARG.
Nicméně polypeptid podle vynálezu není přísně omezen na polypeptid s aminokyselinovou sekvencí identickou se zhora zmíněnými pozicemi SEQ ID NO 2 nebo SEQ ID NO 4, uvedenými v přehledu sekvencí. Vynález také zahrnuje polypeptidy, nesoucí různé modifikace, jako substituce, malé výpadky, vložené zbytky nebo převrácené části řetězců, přičemž všechny takto odvozené polypeptidy mají v podstatě vlastnosti 29 kDa polypeptidu podle vynálezu. Tyto vlastnosti, včetně schopnosti vyvolat mukosální i systémickou imunitní odezvu proti Helicobacter pylori u savčího hostitele, schopnost působit jako adhesin a přítomnost polypeptidu v bacilární i coccoidní formě Helicobacter pylori.
V rámci vynálezu jsou následně i polypeptidy, jejichž sekvence aminokyselin je alespoň z 90 % homologní, výhodně alespoň 95 % homologní, se sekvencí aminokyselin, jak je uváděna na pozicích 1-260 nebo na pozicích 28-260 v SEQ ID NO 2 aSEQ ID NO 4, v přehledu sekvencí. Tyto polypeptidy mají pochopitelně biologické účinky v podstatě stejné, jako polypeptid 29 kDa podle vynálezu.
Do vynálezu se také zahrnují peptidky, které mají délku řetězce alespoň 5 aminokyselin, které zahrnují
imunogenní epitop polypeptidu 29 kDa podle vynálezu a zachovávají si schopnost vyvolat imunitní odezvu Helicobacter pylori u savčího hostitele. Jako takovýto epitop (epitopy) lze uvést samotný ve fúzní formě se vyskytující protein, kde epitop je navázán na inertní nebo imunologický aktivní polypeptidový nosič. Identifikace těchto epitopů je založena na přítomnosti protilátek proti různým segmentům polypeptidu 29 kDa, existujícím u hostitele, který vytváří protilátky.
Jedna cesta jak získat informace o struktuře na epitopech polypeptidu 29 kDa, je produkce a charakterizace monoklonálních protilátek, vázaných na polypeptid, následovaná mapováním epitopu, např. analýza PEPSCAN. Monoklonálni protilátky se mohou vyrábět standardní metodou, jak je popsaná v publikaci De St.Groth (1980) in J. Immunol. Methods, vol. 35, 1-21.
V dalším aspektu vynálezu se řeší izolovaná a čištěná molekuly nukleové kyseliny, která má nukleotidovou sekvenci, kódující polypeptid, jak je shora definován. Ve výhodném provedení podle vynálezu je uvedena molekula nukleové kyselinu DNA molekula, která má nukleotidovou sekvenci identickou se SEQ ID NO 2 nebo SEQ ID NO 3 v přehledu sekvencí. Nicméně DNA molekula podle vynálezu nemusí být striktně omezena na sekvenci znázorněnou jako SEQ TO NO 2 nebo SEQ ID NO 3. Vynález také zahrnuje DNA molekuly, v nichž byly provedeny modifikace jako substituce, malé výpadky nebo vložení nebo převrácení, které přesto kódují peptidy, které mají podstatné biochemické vlastnosti shodné jako polypeptid 29 kDa podle vynálezu. Zkušenému pracovníkovi v oboru je jasné, že A a G záměny substituce a T a C záměny substituce, které mají vliv na sekvenci aminokyselin, nejsou u H.pilori neobvyklé. Jediným rozdílem mezi SEQ ID NO 1 a SEQ ID NO 3 je, že SEQ ID NO 1 má zbytek A v pozici 1458, zatímco SEQ ID
NO 3 má zbytek C ve stejné pozici.
Součástí vynálezu jsou také DNA molekuly, jejichž nukleotidové sekvence jsou degenerované, protože obsahuji genetický kod, znázorněný nukleotidovou sekvencí SEQ ID NO 1 nebo SEQ ID NO 3. Přestože existuje 64 možných kodonů, ale pouze 20 aminokyselin, většina aminokyselin je kódována více než jedním kodonem. Tato přírodní degenerace, nebo redundance genetického kódu je v oboru velmi dobře známá. Proto lze odvodit, že sekvence DNA, znázorněné v přehledu sekvencí, je pouhým příkladem v rámci velké, ale definitivní skupiny DNA sekvencí, která bude kodovat polypeptid, popsaný shora.
V návaznosti na to vynález zahrnuje izolovanou molekulu nukleové kyselinu, zvolenou z:
a) molekul nukleové kyselinu zahrnující nukleotidovou sekvenci, která se identická s, nebo podstatně podobná pozicím 796-1572 nebo 874 až 1572 v SEQ ID NO 1 nebo SEQ ID NO 3 v přehledu sekvencí,
b) molekuly nukleové kyselinu, zahrnující nukleotidovou sekvenci schopnou hybridizace na nukleotidovou sekvenci komplementární regionu kódujícímu polypeptid v DNA molekule, jak je definován v a), a který kóduje polypeptid podle vynálezu, nebo funkční ekvivalent, tvořený jeho modifikovanou formou a
c) molekuly nukleové kyselinu, zahrnující sekvenci nukleové kyseliny, která je degenerativní jako důsledek genetického kódu, k nukleotidové sekvenci, jak je definována v a) nebo b), a která kóduje polypeptid podle vynálezu nebo jeho funkční ekvivalent, nebo jeho modifikaci.
Dalším aspektem vynálezu nukleovou kyselinu molekuly podle výhodně plazmidový vektor pAEl je vektor, který zahrnuje vynálezu. Takový vektor je (uložený podle budapešťské dohody o ukládání mikroorganismů pod přístupovým NCIMB 40732) .
Vektor podle vynálezu může také být replikovatelným expresním vektorem, který nese a je schopen zprostředkovat expresi molekuly nukleové kyseliny podle vynálezu. V tomto kontextu je termín replikovatelný míněn v tom významu, že vektor je schopen replikovat v daných typech hostitelských buněk, do kterých je introdukován. Příklady vektoru a virů, jsou bakteriofágy, kosmidy, plasmidy a jiné rekombinantní vektory. Molekuly nukleové kyseliny jsou vloženy do genomů vektoru standardními metodami, známými v oboru. Exprese vektoru podle vynálezu může být s výhodou kterákoli z vektoru pAl 30:1, pAL 30:2, pAL 30:3, pAL 30:4 nebo, ještě výhodněji pAS863.
Součástí vynálezu je také hostitelská buňka nesoucí vektor podle vynálezu. Takovouto hostitelskou buňkou může být prokaryotická buňka, unicelulární eukaryotická buňka nebo buňka odvozená od vícebuněčného oranismu. Hostitelská buňka tak může například být bakteriální buňkou jako je E.coli buňka, buňkou droždí nebo Saccharomices cervisiae nebo Pichia pastoris nebo savčí buňka. Metody, používané k účinnému zavedení vektoru do hostitelské buňky jsou standardními metodami, dobře známými v oboru a pracovníkům obeznámeným s metodami rekombinace DNA. Podle dalšího aspektu vynálezu se řeší způsob výroby polypeptidu, jak je definován shora, přičemž tento způsob zahrnuje kultiaci hostitelské buňky, transformované expresním vektorem, jak je definován shora, za podmínek, kdy uvedený polypeptid je produkován první i následnou generací buněk.
Roztok, používaný pro kultivaci těchto buněk může být jakékoli obvyklé medium vhodné pro tyto účely. Vhodný vektor může být kterýkoli z vektorů zhora popsaných a vhodnou • ·
- 10 hostitelskou kulturou buněk může být jakýkoli typ shora uvedený. Způsoby dosažení konstrukce vektoru a provedení introdukce tohoto vektoru do buněk hostitelských mohou být libovolné způsoby známé pro tyto účely na poli rekombinace DNA. Rekombinantní polypeptid exprimovaný buňkami může být vylučován, tj. dodáván skrz membránu buněk, v závislosti na typu buněk a složení vektoru.
Jestliže je polypeptid produkován intracelulárně rekombinantním hostitelem, tj. není vylučován buňkou, může být vyráběn standardními postupy, zahrnujícími drcení buněk mechanickými prostředky, např. sonizací nebo homogenizací nebo enzymatickými nebo chemickými prostředky s následným čistěním. Za účelem vylučování by měla sekvence DNA, kódující peptid, předcházet sekvenci kódující signální peptid, jejíž přítomnost zajišťuje vylučování polypeptidu buňkami, tak, že alespoň signifikantní část polypeptidu, který má být exprimován, se vylučuje do kultivačního roztoku a získává.
Dalším aspektem vynálezu je polypeptid podle vynálezu pro použití v terapii, pro použití v diagnóze Helicobacter pylori infekce u savců, včetně lidí a pro použití jako léčivé nebo profylaktické vakciny.
Dalším významným kompozice pro vyvolání včetně člověka, proti aspektem vynálezu je vakcinační ochranné imunitní odezvy u savce, bacilární a/nebo coccoidní formě
Helicobacter pylori. Tato vakcinační kompozice obsahuje imunitně účinné množství polypeptidu definovaného shora, včetně alespoň jedné části peptidu 29 kDa obsahujícího imunitní epitop, nebo modifikované formy uvedeného polypeptidu, která si zachovává schopnost vyvolat ochrannou imunitu proti infekci Helicobacter pylori.
Termínem modifikovaná forma se rozumí aniž by však to by jediný význam, mimo jiné formy polypeptidu, které jsou postransačné
- 11 modifikovány, např. lipidovány. Je možno předpokládat, že protein 29 kDa je lipidován, viz příklad 4 dole.
Vakcinační kompozice přijatelný nosič aktivní použití.
jsou známy odborníkům v fosfátem pufrovaná solanka farmaceuticky imunologicky terapeutické a rozpouštědla např.
obsahuje nebo antigeny pro Fyziologicky popřípadě ředidlo, nebo profylaktické přijatelné oboru a patří (PBS) nebo v také další nebo nosiče mezi ně případě orálních vakcin, HCO3 ionty včetně roztoku založených na jejich obsahu nebo entericky povlečené práškové formulace.
Vakcinační kompozice mohou popřípadě zahrnovat nebo být podávány spolu s inhibitory vylučování kyselin, výhodně inhibitory protonové pumpu (PPI), např. omeprazol. Tato vakcina může být formulována do známého systému pro podávání, jako jsou lypozomy, ISCOM, kocheláty, atd. (viz Rabinovich et al. (1994) Science 265, 1401-1404) nebo mohou být připojeny k nebo zahrnuty v polymerních mikrokuličkách degradovatelné nebo nedegradovatelné povahy. Antigeny mohou být asociovány s živými bakteriemi, viry nebo fágy nebo s mrtvými vektory téhož druhu.
Jak bude ukázáno v experimentální části, uvedené dále, vakcinační kompozice podle vynálezu se dá použít pro terpeutické i profylaktické účely. Vakcinační kompozice podle vynálezu se výhodně podává do libovolné sliznice savců, přičemž příkladem může být jícnová, nosní tonsilární, žaludeční, střevní (tenkého i tlustého střeva), rektální a vaginální sliznice. Mukosální vakcíny lze podávat spolu s adjuvanty, určenými pro daný požadovaný účel. Vakcina se může také podat parenterálně, subkutánně, intrakutánně nebo intramuskulárné, popřípadě spolu s vhodným adjuvantem.
Alternativním přístupem pro vytvoření imunitní odezvy
- 12 proti polypeptidů 29 kDa je použití přístupu známého jako vakcinace nukleovou kyselinou nebo naked DNA vaccination. V oboru je známo, že nitrosolová injekce plazmidu DNA kódujícího antigenu, který je předmětem zájmu, může vést k dlouhodobé expresi antigenu a vytvoření imunitní odezvy (viz např. Rabinovich et al., supra) podávání, které jsou možné se nabízí mukosální nebo cestou gene-gun, která několik způsobů pro parentální, dodává nepatrná množství DNA povlečených zlatých nosičů (Fynan et al. (1993 Proč. Nati. Acad. Sci. U.S.A. 90, 11478-11482).
Molekula nukleové kyselinu podle vynálezu může tedy, jak bylo shora uvedeno být exprimována v plazmidu obsahujícím vhodný eukaryotický promotor. Tato naked DNA může být pak injekčně podána intramuskulárné nebo indradermálné cestou gene-gun. Epitopy exprimovaného proteinu se pak exprimují molekulami MHC na povrchu buněk a zajišťují imunitní odezvu. Obdobně lze konkrétné použit molekuly nukleové kyselinu a vektory, jak jsou popsány v předešlých odstavcích, jako vakcíny, což představuje další aspekty tohoto vynálezu. Použití takovýchto molekul nukleových kyselin a vektorů při výrobě prostředků pro léčení, prevenci nebo diagnózu infekcí Helicobacter pylori také představuje další aspekty vynálezu.
Ještě dalším aspektem tohoto vynálezu je použití polypeptidů jak je definován shora, nebo jeho modifikované formy, která má schopnost indukovat ochrannou imunitu proti infekci Helicobacter pylori, při výrobě prostředků pro léčení, prevenci nebo diagnózu infekce Helicobacter pylori. Tyto kompozice zahrnují konkrétně vakcinační kompozice vyvolávající ochrannou imunitní odezvu proti bacilární a/nebo coccoidní formě Helicobacter pylori. Součástí vynálezu je také uvedené použiti při výrobě diagnostických souprav pro diangozu infekcí Helicobacter pylori. Takováto diagnostická souprava je dále popsaná v textu popisu.
·· >» • · ♦· * « ··
- -X · ·· · · — 2 3 · · »» • * · » •· · · •· · • ♦· * • ·· • · · · · · se řeší způsob proti infekcím
Podle dalšího aspektu vynálezu, vyvolání ochranné imunitníé odezvy Helicobacter pyloriu savce včetně člověka, přičemž tento způsob zahrnuje stupen podáváni účinného množství vakcinační kompozice, jak je definovaná shora, tomuto savci nebo člověku. Výraz imunologicky účinné množství je míněn tak, že znamená takové množství, které vyvolá signifikantní ochrannou odezvu proti Helicobacter pylori, která působí proti infekci touto bakterií u nakažených savců nebo prevenci této infekce u ohrožených savců. Obvyklou imunitně účinnou dávkou je asi 1 μg na 100 mg, výhodně asi 10 μg na 10 mg antigenu Helicobacter pylori pro orální podáni, nebo přibližně méně než 100 μg pro parenterální podání.
Dalším aspektem vynálezu je způsob diagnózy in vitro infekcí Helicobacter pylori, zahrnující alespoň jeden stupen, při němž se používá polypeptid, definovaný shora, včetně části polypeptid 29 kDa, kterážto zahrnuje imunitní epitop. Polypeptid může být popřípadě značený a/nebo připojený na pevný podklad. Způsob diagnózy může např. zahrnovat stupně: (a) působení uvedeného polypeptidu, popřípadě vázaného k pevnému podkladu, na tělesnou tekutinu, odebranou savci a (b) detekci protilátek z uvedené tělní tekutiny, vázaných na uvedený polypeptid. Výhodnými způsoby detekce protilátek jsou ELISA (Enzyme linked immunoabsorbent assay) metody, které jsou v oboru dostatečně známé.
Ještě dalším aspektem vynálezu je vyřešení diagnostické soupravy pro detekci infekce Helicobacter pylori u savce, včetně člověka, která zahrnuje komponenty schopné provádět diagnostickou metodu, jak je popsána shora.
* ·
Příklady provedení vynálezu
Příklad 1: Klonování a exprese polypeptidu 29 kDa z
Helicobacter pylori.
1.1. Bakteriální kmeny, vektory a kultivační podmínky.
Helicobacter pyloriCCUG 17874 (=NTCC 11637) byl kultivován na agarových plotnách z koňské krve mikroaerofi lni atmosféře. Kmeny Escherichia coli XLl-Blue MRF a XLORL (Stratagene, La Jolla, California) byly použity jako kmeny hostitelské pro klonovací experimenty a byly kultivovány v půdě Luria-Bertani (LB) nebo NZY doplněné 0,2% maltozou a 10 mM MgSO^, pokud byly používány pro lambda infekci. Lambda expresní vektor ZAP Express a jeho fagemidm derivát pBK-CMV byly získány od firmy Stratagene.
1.2. DNA techniky
Rozmícháním bakterií z ponechány 48 z Helicobacter hodin pylori %
Tris-Cl, pH 8, mg/ml lysozynu Mannheim Scandinavia inkubovaných ploten, kde byly připravena chromozomová DNA přičemž bylo použito 50 mM mM EDTA obsahující 10 byla
17874, sacharoza, 50 ng/ml DNasy-prosté RNasy (Boehringer AB, Bromma, Sweden). Suspenze byla inkubována 10 minut při 37°C. Byl přidán ekvivalentní objem pufru pro rozklad (0,4% Triton X100 v 50 mM Tris-Cl, pH 8 a 6,25 mM EDTA) a suspenze byla inkubována při pokojové teplotě až do znatelného rozkladu bakterií. Suspense byla poté ve třech stupních extrahována pufrovaným fenolem (pH 8,0), fenol/chloroform a chloroform. DNA byla vysrážena z vodné fáze a znovu rozpuštěna v TE pufru (lOmM Tris-Cl, pH 8,0 a 1 mM EDTA).
inkubovány při 37°C dokud OD při 600 nm nedosáhla 0,7. Poté bylo přidáno IPTG na finální koncentraci 1 mM a bakterie byly kultivovány další dvě hodiny. Kultury bez IPTG byly kultivovány podobně. Kultury byly pak odstředěny a resuspendovány v 1/10 objemu. 10 μΐ suspense bylo smíseno s ekvivalentním objemem 2x vzorku pufru, povařeno a analyzováno SDS-PAGE. Kmen XLORL, nakultivovaný stejnou cestou, ale bez kanamycinu, sloužil jako negativní kontrola, pro pozitivní kontrolu byla použita suspense Helicobacter pylori 17874 v PBS (OD při 600 nm = 1,0).
Po imobilizaci proteinových vzorků na nitrocelulozových vrstvách byla provedena reakce s polypeptidem 29 kDa specifickým pro MAb HP30-l:l:6 zředěným 1:10, jak bylo popsáno shora (Bóhlin et al. 1995) a navázané protilátky byly detekovány pomocí anti-mouse IgG značeného s peroxydázou. Filtrační papíry byly vyvíjeny na podkladu peroxidu vodíku a 4-chlornaftolovým chromogenem (Bio Rad Svenska AB).
Dot blot test byl proveden pomocí přes noc získané kultury shora uvedených kmenů. 2 μΐ suspense byly naneseny na nitrocelulozový filtrační papír, sušeny vzduchem a inkubovány s MAb HP30-l:l:6 zředěným 1:10 po dobu jedné hodiny. Poté byly provedeny další stupně, jak jsou obvyklé při této technice.
1.5. Molekulární klonování
Z části vybraná chromozomální DNA z Helicobacter pylori kmene 17874 byla klonována na lambda expresní vektor (ZAP Express™). Po screeningu 24 tisíc plaků na reakci s MAb specifickým pro polypeptid 29 kDa byly detekovány 4 plaky exprimující tento polypeptid. Tyto pozitivní plaky byly čištěny a velikost klonovaných insertů byla zjišťována pomocí • · • · • »····· * · η -τ · 4 · · · · “ 1 f ~ * · 4 ·»···♦
DNA-přípravků s Xbal a Sáli. Velikost vložených části řetězce (insertů) byla mezi 3,7 až 1,78 kb. Po in vivo excisi pBK-CMV fagemidů ze čtyř pozitivních plaků byly konstruovány mapy restrikčních enzymů a porovnány s inserty v lambda vektoru. U fagemidů bylo zjištěno, že obsahují navázané DNA fragmenty stejné velikosti jako byly v lambda vektoru. Většina z těchto restrikčních enzymů, které byly testovány, s výjimkou Smál a Nhel, neobsahovala další klonované fragmenty.
Restrikční mapa nejmenšího klonovaného fragmentu 1,7 (pAEI), která byla dále analyzována, je zobrazena na obr. 1. Jeden z klonovaných insertů byl v opačném směru analogický vektorovému promotoru. Při analýze extraktů celých buněk E.coli, kmenů obsahujících tyto plazmidy, pomocí imunoforézy s MAb HP30-l:l:6, bylo zjištěno, že exprimují polypeptid o stejné molekulové hmotnosti jako Helicobacter pylori 17874. V expresi polypeptidu 29 kDa nebyla zaznamenána žádná diference, při srovnáni s vektorovým promotorem indukovaným IPTG. To ukazuje, že gen byl transkribován z jeho vlastního promotoru. Celkem byly konstruovány, jak je znázorněno na obr. 1, tři subklony, obsahující DNA fragmenty, a ty byly také testovány pijákovým testem (Bólin et al. 1995) a srovnávány s Helicobacter pylori, přičemž bylo zjištěno, že jsou mírně pozitivní, což ukazuje, že na povrchu musí být vystaven alespoň částečně exprimovaný polypeptid.
1.6. Analýza DNA sekvence
Oba řetězce insertu 1,7 kb pAEI a subklony byly sekvencovány s použitím T3 a T7-specifických primérů a, pokud to bylo nutné, doplněny specifickými priméry pro pokrytí regionů sekvence, které nejsou přístupné se standardními priméry. Počítačová analýza ukázala, že sekvence (SEQ ID NO 1) obsahující otevřený čtecí rámec (open reading frame - ORF) 780 bp na jednom řetězci, určující restrikčnímu enzymu místa •
- 18 používaná pro subklonování (obr. 1). Putativní rybosomová vazebná místa bylo možno identifikovat (pozice 782-785 v SEQ ID NO 1). ORF kóduje 260 aminokyselin polypeptidu o molekulové hmotnosti 29 126 Da (SEQ ID NO 2).
Minokyselinová sekvence obsahuje, jak abylo zjištěno, možnou signální sekvenci 27 aminokyselin. Tato sekvence Leu-Val-Gly-Cys (pozice 25-28 v SEQ ID NO 2 a 4) je jedna z dohodnutých sekvencí (Leu-X-Y-Cys) označovaných jako rozpoznávací místo pro enzym signální peptidázy 2. Signální peptidáza 2 štěpí signální sekvence před cysteinovým zbytkem v prolipoproteinech. Charakteristiky signální sekvence tedy naznačují, že protein 29 kDa je lipoprotein, a že zralý protein obsahuje aminokyseliny 28-260.
1.7. Exprese rekombinantního polypeptidu 29 kDa v E.coli
Rekombinantni polypeptid 29 kDa byl vyráběn ve vysoké koncentraci v E.coli N4830-1 konstruovaném expresním vektorem pAL30, který obsahuje celý gen polypeptidu 29 kDa (pozice 771-1667 v SEQ ID NO 1 a 3). Vektor používaný pro konstrukci byl pML-LCTB lambda 7 (získaný od Michael Lebens, University of Toghenburg, Sweden), který obsahuje silný lambda PL promotor. Tento vektor také obsahuje β laktamázový gen poskytující resistenci vůči ampicilinu. Gen LCTB (kódující toxin choler! a jeho signální pcptid), který je vložen mezi lambda PL promotor a terminátorový region ve vektoru, byl odseknut z vektoru štěpením pomocí restrikčnich enzymů Smál a HindlII.
Strukturní gen kódující polypeptid 29 kDa, zahrnující jeho signální sekvenci, byl amplifikován pomocí polymerázové řetězcové reakce (Polymerase Chain Reaction - PCR). Použitými priméry byly HP30N (GGC GTRA GAA ATG GAA GCG C, odpovídající pozicím 522 až 540 v SEQ ID NO 1 a 3), které váží horní větev
- 15 Restrikční enzymy byly získány od firmy Boehringer Mannheim Scandinavia AB a použity v souladu s instrukcemi výrobce. Plazmidy a lambda DNA byly čištěny pomocí Wizard kitú (Promega, Madison, Wisconsin). Sekvencování bylo prováděno pomocí Sekvenázy 2.0 kitu (Amersham Sweden AB, Solná, Sweden). Oligonukleotidy byly získány od Innovagen, Lund, Sweden. PCR byla vytvořena pomocí Taq DNA plymerázy (Boehringer-Mannheim Scandinavia AB).
1.3. Konstrukce genomové knihovny Helicobacter pylori
Chromozomové fragmenty DNA o velikosti v rozsahu 2-12 kb byly čištěny z částečně předčištěné Sau3A Helicobacter pylori 17874 DNA klonovaný do BamHI s použitím ZAP Express·111 vektoru, jak je popsáno v návodu firmy Stratagene. Následovalo zpracování in vitro, knihovna byla titrována infektováním kmenem XL-1 Blue MRF a nanesena na indikační plotny obsahující izopropyl-p-D-thiogalaktopyranosidu IPTG a 5-brom-4-chlor-3-indolyl-3~D-galaktopyranosidu (X-Gal.)Titr knihovny byl 1,2 x 106 PFU/ml s 85 % rekombinantů.
Plaky exprimující plypeptid 29 kDa byly detekovány imunologickým testem s použitím MAb HP30-l:l:6 (Bólin et al. (1995) J. Cllin. Microbiol. 33,381-384) pomocí známých metod. Pozitivní plaky byly izolovány a opět nanášeny a testovány s MAb, což bylo opakováno až do získání čistých plaků. Konverze na fagemidovou formu ZAP expresních klonů byla provedena pomoci ExAssist protokolu (Stratagene).
1.4. Imunoforézní a dot-blot test
Kultura E.coli XLORL, ponechaná přes noc, obsahující plazmidy s klonovanými vloženými částmi z Helicobacter pylori 17874 je znázorněna na obr. 1, přičemž se jedná o zředění 1:100 až 5 ml LB roztoku s 50 mg/ml kanamycinu. Kultury byly • * « « * · · · ·
271 bp ATG startovního kodonu a HP30C (CCC AAG ATT CAT CAG CCC ΤΤΆ AAT ACA CG) která rozpoznává DNA fragment dolní větve 855 bp startovního kodonu (odpovídající pozicím 1648 až 1667 v SEQ ID NO 1 a 3). HP30C primér obsahující HindlII štěpící místo pro PCR reakci, byl přidán k sekvenci polypeptidového genu polypeptidu 29 kDa. Výsledný PCR produkt byl 1,1 kb. Tento DNA fragment byl štěpen pomocí SspI a HindlII, což poskytlo fragment 0,9 kb, který byl ligatován na vektorový fragment (2,7 kb). Vektorová konstrukce, nyní nazvaná pAL30 (3,6 kb) byla vnesena do E.coli N4830-1 elektroporací. Nalezeny byly čtyři pozitivní klony (pAL30: 1, 2, 3, 4).
Pro vyvolání exprese rekombinantního polypeptidu N4830-1 buněk obsahujících pAL30:l-4 byly kultivovány tyto buňky přes noc při 30°C (lambda cl represor inhiboval při této teplotě transkripci) v lx LB s ampicilinem (100 μ-g na ml). Malá část této kultury byla inokulována v 5 ml lx LB s ampicilinem a buňky byly namnoženy při 30°C, dokud nebyla O.D. při 600nm asi 0,7. Teplota byla přitom zvýšena na 412°C, čímž se aktivoval represor, a kultura byla inkubována po další dvě hodiny.
Vzorky odebrané před a po indukci, byly analyzovány na 14 % SDS-page a imunoforézou s pomocí monoklonální protilátky HP30-l:l:6, která je specifická pro polypeptid 29 kDa. Všechny tři indukované klony, použité při imunoforézc (pAL30:l, 3 a 4), exprimovaly po indukci velká množství rekombinantního peptidu. Suspense z neindukovaných buněk obsahovala pouze malé množství polypeptidu 29 kDa.
Klon pAL30:l byl vybrán pro další analýzu. Za účelem ověření, že klon skutečně obsahuje gen kódující 29 kDa, byly konce fragmentů, vložených do vektoru, sekvencovány. Bylo ověřeno, že vložené sekvence v expresním vektoru odpovídají očekávané sekvenci klonovaného PCL fragmentu.
• ·
- 20 Přiklad 2: Kinetika a exprese polypeptidu 29 kDa při různých kultivačních podmínkách.
Byly používány dva kmeny Helicobacter pylori, zejména CCUG 17874 (laboratorní kmen) a Hel73 (nyní izolovaný z pacienta trpícího duodenálním vředem). Kultivace byla prováděna na krevních agarových plotnách, a na kultivační půdě Brucella Broth doplněné cyklodextrinem. Všechny kultury byly inkubovány v mikroaerofilní atmosféře sestávající z 5 % kyslíku, 10 % oxidu uhličitého a 85 % dusíku. Bakterie byly sklizeny po dvou, čtyřech a sedmi dnech, promývány jednou v ΡΒΞ a ponechány při -20 °C pro následující analýzu. Exprese povrchu peptidu 29 kDa byla pak analyzována inhibicí ELISA s použitím specifických monoklonálních protilátek, jak jsou používány v předchozím provedení pro detekci povrchových antigenů E.coli (Lopez-Vidal, Y a Svennrholm, A-M., J.Clin. Microbiol. 28, 1906) s použitím polypeptidu. Tyto protilátky byly také používány v imunoelektronové mikroskopii.
Po sedmidenní kultivaci kmene CCUG 17874, na krevních agarových plotnách a v Brucella Broth, se přibližně 70 % bakterií převedlo ze spirální formy na coccoidní formu. Tato konverze se projevovala vždy po třech dnech v Hel73. Inhibice - ELISA ukazuje plně konstantní koncentraci polypeptidu 29 kDa ve vzorcích z obou destiček a objemové kultury, v průběhu sedmi dnů. Přítomnost polypeptidu byla potvrzena imunoelektronovou mikroskopií. Polypeptid 29 kDa, jak bylo zjištěno, dobře chrání před coccoidní formou Helicobacter pylori. Bylo také zjištěno, že polypeptid 29 kDa je účinnější v Hel73 než v CCUG 17874.
Příklad 3: Odezva protilátek proti polypeptidu 29 kDa.
- 21 Protilátkové odezvy na polypeptid 29 kDa byly stanoveny v séru pacientů s dvanácterníkovými vředy (n=19) v asymptotických Helicobacter pylori nosičích (n=18) a v nenakažených
Koncentrace kontrolách srovnatelného věku (n=20). 29 kDa byla od tří skupin Hlavní podíl s kontrolními zdravými a žaludečních vzorcích signifikantně vyšší protilátek žaludčních testována v jedinců, způsobem podle nakažených jedinců měl osobami, v séru proti polypeptidu vzorcích a v séru různých ELISA metod, ve srovnání hladiny specifických protilátek proti polypeptidu 29 kDa. titry protilátek v asymptotických vzorcích byly srovnatelné s titry symptomatických pacientů.
Příklad 4: Značení polypeptidu 3H palmitátem
Protože aminokyselinová sekvence polypeptidu 29 kDa obsahuje možný signální peptid typický pro lypoproteiny, bylo pokusně provedeno značení proteinu radioaktivní kyselinou palmitovou: kmen E.coli N4830-1, bud bez pAL 30:1, byl kultivován při 30°C v LB-živném roztoku doplněném 50 μg karbencilinu / ml buněčné hustoty 108 bakterií/ml, 3H palmitová kyselina (5 mCi/ml, DuPont NEN, Boston, MA) byla přidána na finální koncentraci 50μ<:ί/ιη1, teplota byla zvýšena na +42°C a kultury byly inkubovány po dalších 12 hodin. Buňky byly koncentrovány odstředěním a rozloženy v SDS-PAGE pufru. Po elektroforéze byl gel podroben flougrafii imerzním gelem v Amplify™ (Amersham International, UK) po dobu 30 minut, sušen mezi celofánovými foliemi a pomocí gelu byl exponován film, citlivý na paprsky X při -70°C po dobu 36 hodin.
Výsledky ukazují, že polypeptid 29 kDa je lipidován a tak post-translačné modifikován.
Přiklad 5: Triton X-lll, podílející se na expresi rekombinantního polypeptidu 29 kDa bakteriemi E.coli.
- 22 Buňky E.coli, nesoucí pAL30:l, byly kultivovány při
30°C v LB-roztoku doplněném hustotě 108 bakterii/ml, kultury byly inkubovány koncentrovány odstředěním μg carbencilinu/ml při buněčné teplota byla zvýšena na 4 2°C a další tři hodiny. Buňky byly (11 300 x g, 10 minut, + 4°C a resuspendovány v 25 ml PBS na 1 gram buněčné sraženiny.
Suspenze byla zmrazená a pak rozehřátá na pokojovou teplotum, načež bylo přidáno 25 μΐ DNAzy (10 μg na μΐ). Vzorek byl jemně protřepán převracením při pokojové teplotě po dobu 30 minut a ochlazen na 8-12°C načež byl přidán Triton X114 na finální koncentraci 0,3 %. Po inkubaci doprovázené jemným převracením, která trvala 36 hodiny a byla prováděna při 4°C, byl nerozpustný podíl shromážděn pomocí odstředění (18 900 x g, 10 minut, 25°C.
Jednotlivé fáze byly analyzovány SDS-page a byla ověřena identita polypeptidu 29 kDa metodou Western blotting pomocí MAb HP30-l:l:6. Výsledky ukazují, že polypeptid 29 kDa se objevoval v detergentní fázi, což potvrdilo, že jde o lypoprotein. Je známo, že integrální membránové proteiny jsou normálně získatelné z detergentní fáze (Bordier, C (1981) J. Biol. Chem., vol 256, 1604-1607).
Tento experiment také potvrdil, že plazmid, vložený do E.coli může exprimovat a produkovat protein 29 kDa. To je důležité pro budoucí býrobu vakciny ve větším měřítku, protože Helicobacter pylori se nemnoží příliš dobře ani rychle.
Příklad 6: Konstrukce expresního vektoru pS863 pro produkci velkých množství proteinu 29 kDa Helicobacter pylori.
6.1. Příprava pS860
- 23 Pro vytvoření obvyklách restrikčních míst pro 5' zakončení genu 29 kDa byly szntetizovány dva szntetické oligonukleotidy pro PCR amplifikaci. Plazmid pS852 (identický v plazmidu pAL30:l, popsanému v příkladě 1.7) byl pro PCR amplifikaci použit jako matrice. Sekvence těchto dvou oligonukleotidú jsou uvedeny dále:
EcoRI Ndel
5' -CGGAATTCCATATGAGAGCAAATAATCATTTTAAAG-3'
BamHI Xmal Nhel
5' -GCGGATCCCCCGGGGCTAGCTGGATGGTAATTCAATTTC-3‘
Poté byla provedena PCR amplifikace a 165 bp amplifikovaný fragment byli ligován do TA vektoru (Mead, D.A. et al.(1991) Bio/Technology 9,657-663). Zkonstruovaný plazmid byl označen pS860 (obr. 2). Sekvence konstrukce byla potvrzena dideoxy sekvencováním (Sanger et al. (1977) Proč.Nati.Acad.Sci. USA 74, 5463-5467).
6.2. Příprava pS861
Za účelem změny restrikčních míst na 3' zakončení genu 29 kDa byly syntetizovány dva syntetické oligonukleotidy pro PCR amplifikaci. Jako matrice byl pro PCR amplifikaci použit plazmid pS852 (pAL30:l). Sekvence dvou oligonukleotidú jsou uvedeny dále:
EcoRI Xmal
5' -CGGAATTCCCCGGGTTATTATTCTCCACCGG-3'
Pstl BamHI
5' -CGCTGCAGGGATCCTTATTATCGGTTTCTTTTGCCTTTTAA-3'
Byla provedena amplifikace a amplifikované fragmenty byly
- 24 voleny z Xmal a BamHI generujících 357 bp fragmentů. Tento fragment byl klonován do pUC19, zkonstruovaný plazmid byl označen pS861 a jeho složení je uvedeno na obr. 2. Sekvence zkonstruovaného plazmidu byla potvrzena dideoxy sekvencováním (Sanger et al. (1977) Proč.Nati.Acad.Sci. USA 74, 5463-5467).
6.3. Příprava plazmidu pS862
Gelovou elektroforézou byla izolována cDNA kódující střední část genu 29 kDa jako fragment 280 bp Nhel/Xmal plazmidu pS852 (pAL30:l). Tento fragmgent byl ligován s fragmentem 357 bp Xmal/BamHI ze pS861 a fragmentem 4061 bp Nhel/BamHI ze pS861. Vytvořený plazmid byl označen pS862 (obr.2).
6.4. Příprava plazmidu pS863
Poté byl izolován 795 bp Ndel a BamHI restrikční fragment z pS862 a ligován do 4 kb NdcI/BamHI fragmentu z T7 vektoru pS637 (pET-3a) (Studier, F.W. et al. (1990) Methods Enzymol. 185, 60-89). Výsledný expresní vektor bvyl označen jako pS863 (obr. 2).
Příklad 7: Přečištění rekombinančního lipoproteinu 29 kDa Helicobacter pylori
7.1. Hostitelské kmeny a bakteriální kultury
Expresní vektor pS863 byl transformován do následujících hostitelských kmenů E.coli: BL21 (DE3), BL21(DE3JpLysS, a BL21(DE3)pLysE. Postupy k vyvolání exprese byly prováděny v podstatě tak, jak jsou popsány studierem et al. (Methods Enzymol. 185,60-89, 1990). Bakterie byly kultivovány v LB roztoku (Ausubel, F.M. et al. (eds.) Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley and Sons, New • · *
carbencilinu. Dále, pokud
BL21(DE3)pLysE, byl živný
Zork, 1992) obsahujícím 50 pG/ml byly použity BL21(DE3JpLysS and roztok doplněn 30 pg/ml chloramphenicolu. Pro indukci T7 expredsního systému, byly kultury pěstovány až do hustoty zhruba OD600 = 0,5 a pak doplněny 0,4 mM IPTG pro indukci. Buňky byly zklízeny asi 180 minut po indukci. Hostitelský kmen, který poskytl vysoké hladiny exprese byl BL21(DE3)pLysS.
7.2. Přečištění lypoproteinu 29 kDa Helicobacter pylori
Kultury E.coli BL21(DE3)/pLysS, transformované plazmidem pS863 byly kultivovány, jak je popsáno shora, a nakultivované buňky byly shromážděny odstředěním a resuspendovánu ve studeném pufru (50 mM Tris-HCl, 2 mM EDTA lOmM Naci, pH 8,0). Na každý gram buněk, (hmotnost za vlhka) bylo přidáno 35 ml pufru.
7.2.1. Extrakce tritonem X114
Pro extrakci lipoproteinu byl přidán Triton 114 (TX114) na finální koncentraci 1,5 % (obj/obj) a suspense byla míchána jednu hodinu při 0°C. Podíl, nerozpustný v tritonu, byl oddělen odstředěním při 18 900 x g po dobu 10 minut. V některých případech byly pelety extrahovány jednou, ale polovičním objemem pufru s obsahem TX114. Po druhé extrakci TX114 byly pelety dekantovány.
Fáze s obsahem supernatantu z extrakce pomocí TX114 byla inkubována 15 minu při 30°C za občasného míchání. Rozmíchaný roztok byl odstředěn při 31 300 x g 30 minut při 30°C. Nižší detergentní fáze byla schromážděna a zředěna na obsah TX114 1 % studeným pufrem (50 mM Tris-HCl, 2mM EDTA 10 mM Naci, pH 8,0).
7.2.2. Q-sepharosa, pH 8,0
Zředěná fáze TX114 byla nanesena na Q-sepharosovou kolonu (Pharmacia) (20 ml/3g buněčné ssedliny) stabilizovanou pufrem (50 mM Tris-HCl, 2 mM EDTA 10 mM NaCl, 0,1 % TritonX-100, pH 8,0). Lipoprotein 29 kDa byl pak koncentrován jako nenavázaná frakce. Tato frakce byla zpracována inkubací s případným mícháním, dokud byl roztok zakalen. Uvedené dvě fáze byly odděleny odstředěním při 31 300 x g po dobu 30 minut při 30°c. Musí detergentní fáze pak byla shromážděna a zředěna studeným pufrem (10 mM Tris-HCl, 2mM EDTA, pH8,6) na 1% TX114.
7.2.3. Q-sepharosa, pH 8,6
Zředěná fáze TX114 byla nanesena na 100 ml Q-sepharosovou kolonu (Pharmacia) stabilizovanou pufrem (10 mM Tris-HCl, 2 mM EDTA, pH 8,6). Nenavázaná frakce obsahovala TX-114. kolona byla promyta pufrem A (10 mM Tris-HCl, 2 mM EDTA, 0,1 % TritonX-100, pH 8,6). Lipoprotein 29 kDa byl pak koncentrován gradientovou chromatografií s gradientem soli pomocí pufru B (10 mM Tris-HCl, 2mM EDTA, 0,1 Triton X-100, pH 8,6). Gradient elučních činidel byl použit následují: 0 - 50 % B, 40 ml; 50 - 100 B 100 ml. Lipoprotein 29 kDa byl eluován mezi 60 až 70 % B.
7.2.4. SDS-PAGE a elektroforéza proteinu
Vzorky proteinu z různých stupňů čistění byly solubilizovány ve vzorku pufru (50 mM Tris HC1, pH 6,8, 8% glycerin, 1,6 % SDS, 4% β-merkaptoetanol, 0,02% bromfenolová modř) a separována na Novexu s gradientem na Novexem upravených gradinetových gelech (4-20 % polyakrylamidu nebo BioRad gradientových gelech 10-20 % polyakrylamidu).
• » • ·
- 27 Elektroforézné používaný pufr obsahoval 25 mM Tris, 192 mM glycinu, 0,5 % SDS, pH 8,3. Gely byly napouštěny 1% Coomasova brilantní modř R-250 v 40% methanolu, 10% kyselině octové a vymývány 10% methanolem,10% kyselinou octovou.
Gely, používané pro polosuchý elektrobloting nebyly napouštěny, ale namáčeny v pufru transfer (48 mM Tris, 38 mM glycinu, 0.075 % SDS, 20 % MeOH), načež bylyproteiny přeneseny na PVDF membrány (Immobilon™, Millipore, USA), zařízení pro polosuchý poloblotting (BioRad). Imunodetekce byla dosažena prvním blokováním PVDF membrány po dobu jedné hodiny v 2% BSA v TBS (50 mM Tris-HCl, 2,5 M NaCI,, pH8,2) a poté byla membrána inkubována jednu hodinu se specifickou monoklonální protilátkou (IgGl) proti lypoproteinu 29 kDa, zředěné 1:10, 1% BSA v TBS. Po stupni promývání membrány TBS, byla tato membrána inkubována po dobu 1 hodiny s antimouse IgG protilátkou, konjugovanou s alkalickou fosfatázou (Dakopatts, Denmark). Po dalším promytí byla membrána vyvíjena vhodnými substráty (5-brom-4-chlor-3-indolylfosfát (BCIP) a nitrátové tetrazolinové modři (NBT) (Sigma)).
7.2.5. Koncentrace proteinu a pyrogenicita
Celková koncentrace proteinu byla stanovena BCA (Pears Chemical Company USA).
Obsah endotoxinu byl testován testem pomocí lyzátu chromogenního amebocytu Limulus (LAL) test (LAL COAMATIC™ Endotoxin, Endosafe lne. USA).
SDS gely byly za účelem detekce relativního množství proteinových konaminantú ve finálních preparátech skenovány zařízením BioRad Imager GS-. Preparáty obsahovaly do 10 % proteinových kontaminantů.
- 28 Příklad 8: Analýza proteinu Helicobacter pylori 29 kDa pro použití jako vakcíny
8.1. Materiály a metody
8.1.1. Zvířata
Samice SPF BALB/c myší byly získány z Bomholt Breeding centre (Denmark). Tyto myši byly ponechány v běžných makrolonobvých klecích s plným přístupem k vodě a k potravě. Zvířata byla získána ve stáři 4-6 týdnů.
8.1.2. Infekce
Po alespoň jednom týdnu aklimatizace byla zvířata nakažena mikroorganismem Helicobacter pylori typu 2 (původní kmen 244, izolovaný od pacienta, trpícího vředem. U tohoto kmene byla předtím zjištěna dobrá schopnost kolonizovat myší žaludek. Bakterie byly ponechány k namnožení přes noc v živném roztoku Brucella, doplněném 10 % fetálního telecího séra při 37°C v mikroaerofilní atmosféře (10 % oxidu uhličitého, 5 % kyslíku). Zvířatům byl podán orálně omeprazol v dávce 400 mmol/kg a poté byla orálně inokulována přibližně o
10° cfu/zviře mikroorganismem Helicobacter pylori. Infekce byla ověřena u kontrolních zvířat 2-3 týdny po inokulaci.
8.1.3. Imunizace
Zvířata byla imunizována 4x v průběhu 34denní periody (dny, kdy byla prováděna imunizace: 1, 15, 25 a 35).
Přečištěný antigen byl podán v dávce 100 pg/myš a membránové proteiny (MP) v dávce 0,5 mg/dávka. Membránové proteiny byly připraveny sonizací bakterií v PBS. Kal byl odstraněn odstředěním směsi při 4°C, 2000 otáček za minutu po dobu 5 minut. Supernatant byl přenesen do nové trubice a odstředěn při 4°C, 15 000 ot/min. po dobu 2ú minut. Sraženina byla oddělena a uchovávána při -70°C do použití.
Zvířatům byl také při každé imunizaci podáván jako adjuvant chloratoxin (CT) v množství 10 ^g/myš. Omeprazol (400 μιηοΐ/kg) byl podáván zvířatům orálně 3-5 hodin před imunizací za účelem ochrany antigenů před rozkladem v kyselém prostředí. Po 4 týdnech po poslední imunizaci byla zvířata usmrcena a provedena analýza.
8.1.4. Pasivní ochrana
Analýza účinku monoklonálních protilátek (MAb) na schopnost Helicobacter pylori kolonizovat myší žaludek, byla prováděna tak že tyto protilátky, s různou specifitou, byly sraíseny s bakteriemi Helicobacter pylori 10 minut před inokulací, jak je popsáno shora. MAb působily proti proteinu 29 kDa (HP30-1:1:6), proti ureáze (URe 8:1) a proti tepelně stálému proteinu E.coli (ST 1:3). MAb byly titrovány v ELISA roztoku, přičemž se zajistila srovnatelná dávka protilátek v každém experimentu. Počet bakterií na myš, použitý pro inakulaci, byl 107. Analýza byla prováděna 2 týdny po inokulací.
8.1.5. Analýza infekce
Myši byly usmrceny CO2 cervikální dislokací. Abdomen byl otevřen a byl vyjmut žaludek. Po rozříznutí žaludku na obvodu více vyklenuté části byl žaludek promyt slaným roztokem. Sliznice z povrchu a z tělesa žaludku o ploše 25 mm2 byla odděleně oškrábána pomocí chirurgického skalpelu.
Oškrábaná (Brucella) sliznice byla rozmíchána v živném roztoku a nanesena na krevní Skirowovy plotny. Ty byly inkubovány v mikroaerofilnich podmínkách po dobu 3-5 dnů a byl spočítán počet kolonií. Identita Helicobacter pylori ·· * · v ♦ ·» • · ·· • ·ι· ·* «· • · · · byla potvrzena ureázovým a katalázovým testem a přímou mikroskopií nebo Gram testem.
8.2. Výsledky
8.2.1. Pasivní ochrana
V testu byly použity, tři skupiny po deseti zvířatech,, přičemž v každé skupině byla podána směs Helicobacter pylori kmen 244 a MAb, a jedné skupině byl podán pouze Helicobacter pylori. Směs MAb a bakterií byla ponechána 10 minut k vzájemnému působení, před inokulací myši. Z použitých MAb neměla žádná protilátka jasný vliv na bakterie invitro. Dva týdny po inokulací byly myši usmrceny a byl testován rozsah infekce u jednotlivých skupin (obr. 3). Všechny myši v kontrolní skupině i v skupině inokulované spolu s ST MAb byly nakaženy. Ve skupině, u které byla aplikována ureáza MAb, byly také všechny myši nakaženy, ale rozsah infekce byl signifikantně nižší ve srovnání s kontrolou. Ve skupině inokulované MAb proti proteinu 29 kDa nebyla nakažena ani jedna myš,
8.2.2. Terapeutická imunizace
Zvířata byla při tomto testu nakažena mikroorganismem
Helicobacter pylori kmen 244 jeden měsíc před
byly potom ve skupinách po deseti imunizovány bud choleratoxinem (CT) nebo CT spolu s membránovými proteiny, ureázou nebo proteinem 29 kDa. Kontrolní skupina zvířat obdržela pouze vehikulum (PBS). Měsíc po poslední imunizaci byla zvířata usmrcena a bylo stanoveno CFU (obr. 4). Všechna kontrolní zvířata, stejně jako zvířata imunizovaná pouze CT, byla nakažena. Zvířataúčinné imunizovaná ureázou a CT, nebo proteinem 29 kDa a CT, měla signifikantně sníženou hodnotu
CFU ve srovnání s kontrolou. Pouze jedno zvíře ve skupině • · · • · ·· imunizované ureázou bylo plně uchráněno před infekcí.
8.3. Závěry
Shora uvedené výsledky ukazují, že protein 29 kDA Helicobacter pylori je důležitý pro kolonizaci a/nebo přetrvávání infekce, neboť vazba MAb na tuto strukturu vede k úplné inhibici kolonizace.
Dále, protein 29 kDa Helicobacter pylori, pokud je používán jako orální imunogen za spolupůsobení choleratoxinu jako orálního adjuvantu, působí jako stimulátor imunitní odezvy, vedoucí k signifikantnímu snížení stupně kolonizace Helicobacter pylori u použitého pokusného zvířete.
Celkové lze říci, že tyto výsledky velmi dobře dokládají použitelnost proteinu 29 kDa Helicobacter pylori při orální vakcinaci u lidí, pomoci které se dá léčit a nebo chránit před infekcemi Helicobacter pylori.
Uložení mikroorganismů
Plazmid pAEl byl uložen podle Budapešťské dohody v národní sbírce NCIMB, Aberdeen, Skotsko, UK a to pod číslem NCIMB 40732. Datum uložení bylo 16. května 1995.
• · · ·
PŘEHLED SEKVENCÍ (1) OBECNÁ INFORMACE (i) Přihlašovatel
(A) Jméno: ASTRA AB | |
(B) | Ulice: Vástra Málarehamnen 9 |
(C) | Město: Sodertálje |
(E) | Země: Sweden |
(F) | Směrovací čísla (ZIP): S-151 85 |
(G) | Telefon: +46 8 553 260 00 |
(H) | Fax: +46 8 553 288 20 |
(I) | telex: 19237 astra s |
(ii) Název vynálezu: Bacterial Antigens and Vaccine
Compositions (iii) Počet sekvencí: 4 (iv) Forma čitelná počítačem:
(A) Nosič: Flopy disk (B) Počítač: IBM PC compatible (C) Operační systém: PC-DOS/MS-DOS (D) Software: Patentln Release +1,0, Verze +1.30 (EPO) (2) Informace pro SEQ ID NO: 1:
(i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 1670 základních páru (B) Typ: nukleová kyselina (C) Druh řetězce: dvojitý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA « · · • · · (ix) Znak:
(A) Jméno/klíč: CDS (B) Umístění: 793..1575 (ix) Znak:
(A) Jméno/klíč: mat-peptid (B) Umístění: 793..1572 (ix) Popis sekvence: SEQ ID NO: 1:
GATCCTATCG CGCCAAAGGT GGTATTAGGA ATAAGAGCTT GATTATTAAT CTCCCTGGTA | 60 |
AGTCCAAAAA GTATTAGAGA ATGCTTAGAG GCGGTTTTTC CAGCGATTCC TTATTGCGTG | 120 |
GATTTGATTT TAGGGAATTA CATGCAAGTG AATGAAAAAA ACATTCAAGC GTTTGCCCCC | 180 |
AAACAATAAG GTAAAAAATG CCACTCACTC ATTTGAATGA AGAAAATCAA CCTAAAATGG | 240 |
TGGATATAGG GGATAAAGAA ACCACTGAAA GAATCGCTCT AGCAAGCGGT CGTATCAGCA | 300 |
TGAATAAAGA GGCTTATGAC GCTATTATCA ATCATGGCGT CAAAAAGGGT CCGGTATTAC | 360 |
AAACTGCTAT TATTGCTGGG ATTATGGGGG CTAAAAAGAC AAGCGAACTC ATTCCCATGT | 420 |
GCCATCCAAT CATGCTCAAT GGGGTGGATA TTGATATTTT AGAAGAAAAA GAGACTTGTA | 480 |
GTTTTAAACT CTATGCGAGA GTCAAAACTC AAGCTAAAAC GGGCGTAGAA ATGGAAGCGC | 540 |
TAATGAGTGT GAGCGTAGGG CTTTTAACCA TTTATGACAT GGTGAAAGCC ATTGATAAGA | 600 |
GCATGACAAT TAGCGGTGTG ATGCTGGAAT ATAAAAGTGG AGGCAAAAGT GGGGATTATA | 660 |
ACGCTAAAAA ATAGAAAAAG ACTGATAATC TAAAGATATT AGGGTAAAAT AACATTTTGA | 720 |
CAACAAAAGC GTGTTGGTTG CTTCGGATTT GTTGTTATAG AAGTCTAAAA TATTACAATC | 780 |
AAGGATAGAA CG ATG AGA GCA AAT AAT CAT TTT AAA GAT TTT GCA TGG Met Arg Ala Asn Asn His Phe Lys Asp Phe Ala Trp 15 10 | 828 |
AAA AAA TGC CTT TTA GGC GCG AGC GTG GTG GCT TTA TTA GTG GGA TGC | 876 |
Lys Lys Cys Leu Leu Gly Ala Ser Val Val Ala Leu Leu Val Gly Cys 15 20 25 | |
AGC CCG CAT ATT ATT GAA ACC AAT GAA GTC GCT TTG AAA TTG AAT TAC | 924 |
Ser Pro His lle lle Glu Thr Asn Glu Val Ala Leu Lys Leu Asn Tyr 30 35 40 |
CAT CCA GCT AGC | GAG Glu | AAA GTT CAA GCG TTA GAT GAA AAG ATT TTG | CTT Leu 60 | 972 | ||||||||||||
His 45 | Pro | Ala | Ser | Lys 50 | Val | Gin Ala | Leu | Asp 55 | Glu | Lys | lle | Leu | ||||
TTA | AGG | CCA | GCT | TTC | CAA | TAT | AGC | GAT | AAT | ATC | GCT | AAA | GAG | TAT | GAA | 1020 |
Leu | Arg | Pro | Ala | Phe | Gin | Tyr | Ser | Asp | Asn | lle | Ala | Lys | Glu | Tyr | Glu | |
65 | 70 | 75 | ||||||||||||||
AAC | AAA | TTC | AAG | AAT | CAA | ACC | GCG | CTC | AAG | GTT | GAA | CAG | ATT | TTG | CAA | 1068 |
Asn | Lys | Phe | Lys | Asn | Gin | Thr | Ala | Leu | Lys | Val | Glu | Gin | lle | Leu | Gin | |
80 | 85 | 90 | ||||||||||||||
AAT | CAA | GGC | TAT | AAG | GTT | ATT | AGC | GTA | GAT | AGC | AGC | GAT | AAA | GAC | GAT | 1116 |
Asn | Gin | Gly | Tyr | Lys | Val | lle | Ser | Val | Asp | Ser | Ser | Asp | Lys | Asp | Asp | |
95 | 100 | 105 | ||||||||||||||
TTT | TCT | TTT | GCA | CAA | AAA | AAA | GAA | GGG | TAT | TTG | GCG | GTT | GCT | ATG | AAT | 1164 |
Phe | Ser | Phe | Ala | Gin | Lys | Lys | Glu | Gly | Tyr | Leu | Ala | Val | Ala | Met | Asn | |
110 | 115 | 120 | ||||||||||||||
GGC | GAA | ATT | GTT | TTA | CGC | CCC | GAT | CCT | AAA | AGG | ACC | ATA | CAG | AAA | AAA | 1212 |
Gly | Glu | lle | Val | Leu | Arg | Pro | Asp | Pro | Lys | Arg | Thr | lle | Gin | Lys | Lys | |
125 | 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
TCA | GAA | CCC | GGG | TTA | TTA | TTC | TCC | ACC | GGT | TTG | GAC | AAA | ATG | GAA | GGG | 1260 |
Ser | Glu | Pro | Gly | Leu | Leu | Phe | Ser | Thr | Gly | Leu | Asp | Lys | Met | Glu | Gly | |
145 | 150 | 155 | ||||||||||||||
GTT | TTA | ATC | CCG | GCT | GGG | TTT | ATT | AAG | GTT | ACC | ATA | CTA | GAG | CCT | ATG | 1308 |
Val | Leu | lle | Pro | Ala | Gly | Phe | lle | Lys | Val | Thr | lle | Leu | Glu | Pro | Met | |
160 | 165 | 170 | ||||||||||||||
AGT | GGG | GAA | TCT | TTG | GAT | TCT | TTT | ACG | ATG | GAT | TTG | AGC | GAG | TTG | GAC | 1356 |
Ser | Gly | Glu | Ser | Leu | Asp | Ser | Phe | Thr | Met | Asp | Leu | Ser | Glu | Leu | Asp | |
175 | 180 | 185 | ||||||||||||||
ATT | CAA | GAA | AAA | TTC | TTA | AAA | ACC | ACC | CAT | TCA | AGC | CAT | AGC | GGG | GGG | 1404 |
lle | Gin | Glu | Lys | Phe | Leu | Lys | Thr | Thr | His | Ser | Ser | His | Ser | Gly | Gly | |
190 | 195 | 200 | ||||||||||||||
TTA | GTT | AGC | ACT | ATG | GTT | AAG | GGA | ACG | GAT | AAT | TCT | AAT | GAC | GCG | ATC | 1452 |
Leu | Val | Ser | Thr | Met | Val | Lys | Gly | Thr | Asp | Asn | Ser | Asn | Asp | Ala | lle | |
205 | 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
AAG | AGC | GCT | TTG | AAT | AAG | ATT | TTT | CGA | AAT | ATC | ATG | CAA | GAA | ATA | GAC | 1500 |
Lys | Ser | Ala | Leu | Asn | Lys | lle | Phe | Ala | Asn | lle | Met | Gin | Glu | lle | Asp | |
225 | 230 | 235 | ||||||||||||||
AAA | AAA | CTC | ACT | CAA | AAG | AAT | TTA | GAA | TCT | TAT | CAA | AAA | GAC | GCC | AAA | 1548 |
Lys | Lys | Leu | Thr | Gin | Lys | Asn | Leu | Glu | Ser | Tyr | Gin | Lys | Asp | Ala | Lys | |
240 | 245 | 250 |
If « ·
GAA TTA AAA AGA AAC CGA TAA AAA CAAATAA CGCATAAGAA 1595
Glu Leu Lys Gly Lys Arg Asn Arg
255 260
AAGAACGCTT GAATAAACTG CTTAAAAAGG GTTTTTTAGC GTTCTTTTTG AGCGTGTATT 1655
TAAGGGCTGA TGATC 1670
- 35 (2) Informace pro SEQ ID NO: 2:
(i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 261 amino kyselin (B) Typ: amino kyselina (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: proteinová (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 2:
Met Arg 1 | Ala Asn | Asn 5 | His | Phe | Lys Asp Phe Ala Trp 10 | Lys | Lys | Cys 15 | Leu | ||||||
Leu | Gly | Ala | Ser | Val | Val | Ala | Leu | Leu | Val | Gly | Cys | Ser | Pro | His | Ile |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Ile | Glu | Thr | Asn | Glu | Val | Ala | Leu | Lys | Leu | Asn | Tyr | HiS | Pro | Ala | Ser |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Glu | Lys | Val | Gin | Ala | Leu | Asp | Glu | Lys | Ile | Leu | Leu | Leu | Arg | Pro | Ala |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Phe | Gin | Tyr | Ser | Asp | Asn | Ile | Ala | Lys | Glu | Tyr | Glu | Asn | Lys | Phe | Lys |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Asn | Gin | Thr | Ala | Leu | Lys | Val | Glu | Gin | Ile | Leu | Gin | Asn | Gin | Gly | Tyr |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Lys | Val | Ile | Ser | Val | Asp | Ser | Ser | Asp | Lys | Asp | Asp | Phe | Ser | Phe | Ala |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Gin | Lys | Lys | Glu | Gly | Tyr | Leu | Ala | Val | Ala | Met | Asn | Gly | Glu | Ile | Val |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Leu | Arg | Pro | Asp | Pro | Lys | Arg | Thr | Ile | Gin | Lys | Lys | Ser | Glu | Pro | Gly |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Leu | Leu | Phe | Ser | Thr | Gly | Leu | Asp | Lys | Met | Glu | Gly | Val | Leu | Ile | Pro |
145 | 150 | 155 | 160 |
f * W · 4« «
- 36 - | • v • • | • · · · v · | • • · • · • · ·· | • · • « • · | |||||||||||
* * ♦ · | » | ||||||||||||||
Ala | Gly | Phe | Ile | Lys | Val | Thr | Ile | Leu | Glu | Pro | Met | Ser | Gly | GlU | Ser |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
Leu | Asp | Ser | Phe | Thr | Met | Asp | Leu | Ser | Glu | Leu | Asp | Ile | Gin | Glu | Lys |
180 | 185 | 190 | |||||||||||||
Phe | Leu | Lys | Thr | Thr | HÍS | Ser | Ser | His | Ser | Gly | Gly | Leu | Val | Ser | Thr |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
Met | Val | Lys | Gly | Thr | Asp | Asn | Ser | Asn | Asp | Ala | Ile | Lys | Ser | Ala | Leu |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
Asn | Lys | Ile | Phe | Ala | Asn | Ile | Met | Gin | Glu | Ile | Asp | Lys | Lys | Leu | Thr |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
Gin | Lys | Asn | Leu | Glu | Ser | Tys | Gin | Lys | Asp | Ala | Lys | Glu | Leu | Lys | Gly |
245 | 250 | 255 |
Lys Arg Asn Arg
260 (2) Informace pro SEQ ID NO: 3:
(i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 1670 základních párů (B) Typ: nukleová kyselina (C) Druh řetězce: dvojitý (D) Typologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA (ix) Znak:
(A) Jméno/klíč: CDS (B) Umístění: 793..1575 (ix) Znak:
(A) Jméno/klíč: mat-peptid (B) Umístění: 793..1572 (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 3:
• «
GATCCTATCG CGCCAAAGGT GGTATTAGGA ATAAGAGCTT GATTATTAAT CTCCCTGGTA | 60 |
AGTCCAAAAA GTATTAGAGA ATGCTTAGAG GCGGTTTTTC CAGCGATTCC TTATTGCGTG | 120 |
GATTTGATTT TAGGGAATTA CATGCAAGTG AATGAAAAAA ACATTCAAGC GTTTGCCCCC | 180 |
AAACAATAAG GTAAAAAATG CCACTCACTC ATTTGAATGA AGAAAATCAA CCTAAAATGG | 240 |
TGGATATAGG GGATAAAGAA ACCACTGAAA GAATCGCTCT AGCAAGCGGT CGTATCAGCA | 300 |
TGAATAAAGA GGCTTATGAC GCTATTATCA ATCATGGCGT CAAAAAGGGT CCGGTATTAC | 360 |
AAACTGCTAT TATTGCTGGG ATTATGGGGG CTAAAAAGAC AAGCGAACTC ATTCCCATGT | 420 |
GCCATCCAAT CATGCTCAAT GGGGTGGATA TTGATATTTT AGAAGAAAAA GAGACTTGTA | 480 |
GTTTTAAACT CTATGCGAGA GTCAAAACTC AAGCTAAAAC GGGCGTAGAA ATGGAAGCGC | 540 |
TAATGAGTGT GAGCGTAGGG CTTTTAACCA TTTATGACAT GGTGAAAGCC ATTGATAAGA | 600 |
GCATGACAAT TAGCGGTGTG ATGCTGGAAT ATAAAAGTGG AGGCAAAAGT GGGGATTATA | 660 |
ACGCTAAAAA ATAGAAAAAG ACTGATAATC TAAAGATATT AGGGTAAAAT AACATTTTGA | 720 |
CAACAAAAGC GTGTTGGTTG CTTCGGATTT GTTGTTATAG AAGTCTAAAA TATTACAATC | 780 |
AAGGATAGAA CG ATG AGA GCA AAT AAT CAT TTT AAA GAT TTT GCA TGG Met Arg Ala Asn Asn His Phe Lys Asp Phe Ala Trp | 828 |
10
AAA Lys | AAA TGC | CTT Leu | TTA GGC | GCG Ala | AGC Ser 20 | GTG Val | GTG GCT | TTA Leu | TTA Leu 25 | GTG Val | GGA Gly | TGC Cys | 876 | |||
Lys | Cys 15 | Leu | Gly | Val | Ala | |||||||||||
AGC | CCG | CAT | ATT | ATT | GAA | ACC | AAT | GAA | GTC | GCT | TTG | AAA | TTG | AAT | TAC | 924 |
Ser | Pro | His | Ile | Ile | G1U | Thr | Asn | Glu | Val | Ala | Leu | Lys | Leu | Asn | Tyr | |
30 | 35 | 40 | ||||||||||||||
CAT | CCA | GCT | AGC | GAG | AAA | GTT | CAA | GCb | TTA | GAT | GAA | Λ H HrtVJ | a mm ni i | mmr' 1 1*J | X X | 070 J f 4-1 |
His | Pro | Ala | Ser | Glu | Lys | Val | Gin | Ala | Leu | Asp | Glu | Lys | Ile | Leu | Leu | |
45 | 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
TTA | AGG | CCA | GCT | TTC | CAA | TAT | AGC | GAT | AAT | ATC | GCT | AAA | GAG | TAT | GAA | 1020 |
Leu | Arg | Pro | Ala | Phe | Gin | Tyr | Ser | Asp | Asn | Ile | Ala | Lys | Glu | Tyr | Glu | |
65 | 70 | 75 | ||||||||||||||
AAC | AAA | TTC | AAG | AAT | CAA | ACC | GCG | CTC | AAG | GTT | GAA | CAG | ATT | TTG | CAA | 1068 |
Asn | Lys | Phe | Lys | Asn | Gin | Thr | Ala | Leu | Lys | Val | Glu | Gin | Ile | Leu | Gin | |
80 | 85 | 90 | ||||||||||||||
AAT | CAA | GGC | TAT | AAG | GTT | ATT | AGC | GTA | GAT | AGC | AGC | GAT | AAA | GAC | GAT | 1116 |
Asn | Gin | Gly | Tyr | Lys | Val | Ile | Ser | Val | Asp | Ser | Ser | Asp | Lys | Asp | Asp | |
95 | 100 | 105 |
* · • · · * * ·«·· · • 0 » v · · · ·* ·· tf ♦ · ··♦♦ ···
TTT Phe | TCT Ser 110 | TTT GCA | CAA AAA AAA GAA GGG | TAT Tyr | TTG Leu | GCG Ala 120 | GTT GCT ATG AAT | 1164 | ||||||||
Phe | Ala | Gin | Lys | Lys 115 | Glu | Gly | Val | Ala | Met Asn | |||||||
GGC | GAA | ATT | GTT | TTA | CGC | CCC | GAT | CCT | AAA | AGG | ACC | ATA | CAG | AAA | AAA | 1212 |
Gly | Glu | Ile | Val | Leu | Arg | Pro | Asp | Pro | Lys | Arg | Thr | Ile | Gin | Lys | Lys | |
125 | 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
TCA | GAA | ccc | GGG | TTA | TTA | TTC | TCC | ACC | GGT | TTG | GAC | AAA | ATG | GAA | GGG | 1260 |
Ser | Glu | Pro | Gly | Leu | Leu | Phe | Ser | Thr | Gly | Leu | Asp | Lys | Met | Glu | Gly | |
145 | 150 | 155 | ||||||||||||||
GTT | TTA | ATC | CCG | GCT | GGG | TTT | ATT | AAG | GTT | ACC | ATA | CTA | GAG | CCT | ATG | 1308 |
Val | Leu | Ile | Pro | Ala | cly | Phe | Ile | Lys | Val | Thr | Ile | Leu | Glu | Pro | Met | |
160 | 160 | 170 | ||||||||||||||
AGT | GGG | GAA | TCT | TTG | GAT | TCT | TTT | ACG | ATG | GAT | TTG | AGC | GAG | TTG | GAC | 1356 |
Ser | Gly | Glu | Ser | Leu | Asp | Ser | Phe | Thr | Met | Asp | Leu | Ser | Glu | Leu | Asp | |
175 | 180 | 185 | ||||||||||||||
ATT | CAA | GAA | AAA | TTC | TTA | AAA | ACC | ACC | CAT | TCA | AGC | CAT | AGC | GGG | GGG | 1404 |
Ile | Gin | Glu | Lys | Phe | Leu | Lys | Thr | Thr | His | Ser | Ser | His | Ser | Gly | Gly | |
190 | 195 | 200 | ||||||||||||||
TTA | GTT | AGC | ACT | ATG | GTT | AAG | GGA | ACG | GAT | AAT | TCT | AAT | GAC | GCG | ATC | 1452 |
Leu | Val | Ser | Thr | Met | Val | Lys | Gly | Thr | Asp | Asn | Ser | Asn | Asp | Ala | Ile | |
205 | 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
AAG | AGA | GCT | TTG | AAT | AAG | ATT | TTT | GCA | AAT | ATC | ATG | CAA | GAA | ATA | GAC | 1500 |
Lys | Arg | Ala | Leu | Asn | Lys | Ile | Phe | Ala | Asn | Ile | Met | Gin | Glu | Ile | Asp | |
225 | 230 | 235 | ||||||||||||||
AAA | AAA | CTC | ACT | CAA | AAG | AAT | TTA | GAA | TCT | TAT | CAA | AAA | GAC | GCC | AAA | 1548 |
Lys | Lys | Leu | Thr | Gin | Lys | Asn | Leu | Glu | Ser | Tyr | Gin | Lys | Asp | Ala | Lys | |
240 | 245 | 250 | ||||||||||||||
GAA | TTA | AAA | GGC | AAA | AGA | AAC | CGA | TAA | AAACAAATAA CGCATAAGAA | 1595 | ||||||
Glu | Leu | Lys | Gly | Lys | Arg | Asn | Arg | |||||||||
255 | 260 |
AAGAACGCTT GAATAAACTG CTTAAAAAGG GTTTTTTAGC GTTCTTTTTG AGCGTGTATT 1655
TAAGGGCTGA TGATC1670 (2) Informace pro SEQ ID NO: 4:
(i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 261 amino kyselin (B) Typ: amino kyselina (D) Topologie: lineární
- 39 (ii) Typ molekuly: protein (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 4:
Met 1 | Arg | Ala | Asn | Asn 5 | His | Phe | Lys | Asp Phe 10 | Ala | Trp | Lys | Lys | Cys 15 | Leu | |
Leu | Gly | Ala | Ser | Val | Val | Ala | Leu | Leu | Val | Gly | Cys | Ser | Pro | His | Ile |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Ile | Glu | Thr | Asn | Glu | Val | Ala | Leu | Lys | Leu | Asn | Tyr | His | Pro | Ala | Ser |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Glu | Lys | Val | Gin | Ala | Leu | Asp | Glu | Lys | Ile | Leu | Leu | Leu | Arg | Pro | Ala |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Phe | Gin | Tyr | Ser | Asp | Asn | Ile | Ala | Lys | Glu | Tyr | Glu | Asn | Lys | Phe | Lys |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Asn | Gin | Thr | Ala | Leu | Lys | Val | Glu | Gin | Ile | Leu | Gin | Asn | Gin | Gly | Tyr |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Lys | Val | Ile | Ser | Val | Asp | Ser | Ser | Asp | Lys | Asp | Asp | Phe | Ser | Phe | Ala |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Gin | Lys | Lys | Glu | Gly | Tyr | Leu | Ala | Val | Ala | Met | Asn | Gly | Glu | Ile | Val |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Leu | Arg | Pro | Asp | Pro | Lys | Arg | Thr | Ile | Gin | Lys | Lys | Ser | Glu | Pro | Gly |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Leu | Leu | Phe | Ser | Thr | Gly | Leu | Asp | Lys | Met | Glu | Gly | Val | Leu | Ile | Pro |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
Ala | Gly | Phe | Ile | Lys | Val | Thr | Ile | Leu | Glu | Pro | Met | Ser | Gly | Glu | Ser |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
Leu | Asp | Ser | Phe | mu 1 lid. | 4ri© e | Asp | Leu | r> Λ -wOtU. | /· Ί , , U1U | Leu | Asp | T Ί « 11C | /* Ί kJlll | Ί <. uiu | Lys |
180 | 185 | 190 | |||||||||||||
Phe | Leu | Lys | Thr | Thr | His | Ser | Ser | His | Ser | Gly | Gly | Leu | Val | Ser | Thr |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
Met | Val | Lys | Gly | Thr | Asp | Asn | Ser | Asn | Asp | Ala | Ile | Lys | Arg | Ala | Leu |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
Asn | Lys | Ile | Phe | Ala | Asn | Ile | Met | Gin | Glu | Ile | Asp | Lys | Lys | Leu | Thr |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
Gin | Lys | Asn | Leu | Glu | Ser | Tyr | Gin | Lys | Asp | Ala | Lys | Glu | Leu | Lys | Gly |
245 | 250 | 255 |
• ·
Claims (22)
1. Polypeptid, jehož aminokyselinová sekvence je shodná, nebo v podstatě podobná, na pozicích 1-260 nebo 28-260 se sekvencí SEQ ID NO 2 nebo se sekvencí SEQ ID NO 4 v přehledu sekvencí.
2. Peptid o délce řetězce alespoň 5 aminokyselin zahrnující iiuunogenní epitop polypeptidů podle nároku 1.
3. Izolovaná molekula nukleové kyseliny, která má sekvenci nukleotidů, kódující polypeptid podle nároku 1.
4. Izolovaná molekula nukleové kyseliny, vybraná ze skupiny zahrnující:
(a) molekuly nukleových kyselin obsahující sekvenci nuklotidu, která je identická nebo v podstatě podobná, na pozicích 796-1572 nebo 874-1572, sekvenci SEQ ID NO 1 nebo SEQ ID NO 3, uvedených v přehledu sekvencí, (b) molekuly nukleových kyselin obsahující sekvenci nukleotidů, schopnou hybridizovat na nukleovou sekvenci komplementární k regionu molekuly nukleové kyseliny, kódující polypeptid, jak je definován v (a), a který kóduje polypeptid podle nároku 1, nebo jejich funkčně ekvivalentní modifikované formy a (c) molekuly nukleových kyselin obsahující sekvenci nukleových kyselin, která je degenerována podle genetického kódu na nukleotidovou sekvenci, jak je definována v (a) nebo (b), a která kóduje polypeptid podle nároku 1, nebo jeho funkčně ekvivalentní modifikovanou formu.
5. Vektor, který obsahuje molekulu nukleové kyseliny podle nároku 3 nebo 4.
6. Vektor podle nároku 5, který je plazmidovým • · · · ♦ · vektorem pAEl (NCIMB 40732),
7. Vektor podle nároku 5, který je expresním vektorem schopným zprostředkovat expresi DNA molekuly podle nároku 3 nebo 4.
8. Vektor podle nároku 7, který je plazmidovým vektorem pS863 zobrazeným na obr. 2.
9. Hostitelská buňka nesoucí vektor podle kteréhokoli z nároků 5-8.
10. Způsob výroby polypeptidů, který je antigenem 29 kDa, a je vystaven na povrchu mikroorganismu Helicobacter pylori, vyznačující se tím, že zahrnuje kultivaci hostitelské buňky transformované expresním vektorem podle nároku 7 nebo 8 za podmínek, kdy je produkován uvedený polypeptid a izolaci uvedeného polypeptidů.
11. Polypeptid nebo peptid podle nároku 1 použití při léčení.
12. Polypeptid nebo peptid podle nároku 1 použití při diagnóze infekce Helicobacter pylori.
13= Polypeptid nebo peptid podle nároku 1 použití jako vakcina.
nebo 2 pro nebo 2 pro nebo 2 pro
14. Vakcinační prostředek pro vyvolání ochranné imunitní odezvy vůči infekci Helicobacter pylori, vyznačující se tím, že zahrnuje imunologicky účinné množství polypeptidů podle nároku 1, nebo jeho modifikované formy, která si zachovává schopnost vyvolat ochrannou imunitu proti infekci Helicobacter pylori, popřípadě spolu s farmaceuticky přijatelným nosičem nebo ředidlem.
15. Vakcinační prostředek podle nároku 14 pro použití jako terapeutická vakcina u savců včetně člověka, který je nakažen Helicobacter pylori.
16. Vakcinační prostředek podle nároku 14 pro použití jako preventivní vakcina, chránící savce, včetně člověka, . proti infekci Helicobacter pylori.
»
17. Použití polypeptidu podle nároku 1 nebo 2 nebo jeho modifikované formy, která si uchovává schopnost vyvolat ochrannou imunitu proti infekci Helicobacter pylori, při výrobě prostředku pro léčení, prevenci nebo diagnózu infekce Helicobacter pylori.
18. Použití polypeptidu podle nároku 1 nebo 2 nebo jeho modifikované formy, která si udržuje schopnost vyvolat ochrannou imunitu proti infekci Helicobacter pylori při výrobě diagnostické soupravy pro diagnózu infekce Helicobacter pylori.
19. Použití polypeptidu podle nároku 1 nebo 2 nebo jeho modifikované formy, která si udržuje schopnost vyvolat ochrannou imunitu proti infekci Helicobacter pylori při výrobě diagnostické soupravy pro výrobu vakciny pro použití k vyvolání ochranné imunitní odezvy proti Helicobacter pylori.
20. Způsob diagnózy infekce Helicobacter pylori invitro, vyznačující se tím, že zahrnuje alespoň jeden krok, • při kterém se používá polypeptid podle nároku 1 nebo 2, popřípadě značený nebo spojený s pevným nosičem.
21. Způsob podle nároku 20, vyznačující se tím, že zahrnuj e stupně:
(a) působení uvedeného polypeptidu, popřípadě vázaného na pevný nosič, na tělní tekutinu odebranou savci a (b) detekci protilátek z uvedené tělní tekutiny navázáním na uvedený polypeptid.
22. Diagnostická souprava pro detekci infekce Helicobacter pylori u savců, včetně člověka, vyznačující se tím, že zahrnuje komponenty, schopné uskutečnit způsob podle nároku 20 nebo 21.
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
SE9502007A SE9502007D0 (sv) | 1995-06-01 | 1995-06-01 | Novel polypeptides |
SE9601085A SE9601085D0 (sv) | 1996-03-21 | 1996-03-21 | Novel polypeptides |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CZ357397A3 true CZ357397A3 (cs) | 1998-05-13 |
Family
ID=26662316
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CZ973573A CZ357397A3 (cs) | 1995-06-01 | 1996-06-03 | Antigeny Helicobacter pylori a vakcinační kompozice |
Country Status (22)
Country | Link |
---|---|
US (2) | US6025164A (cs) |
EP (1) | EP0828757A1 (cs) |
JP (1) | JP3380559B2 (cs) |
KR (1) | KR19990022131A (cs) |
CN (1) | CN1191544A (cs) |
AR (1) | AR003125A1 (cs) |
BR (1) | BR9608627A (cs) |
CA (1) | CA2222797A1 (cs) |
CZ (1) | CZ357397A3 (cs) |
EE (1) | EE9700306A (cs) |
HU (1) | HUP9901546A3 (cs) |
IL (1) | IL122340A0 (cs) |
IS (1) | IS4615A (cs) |
MY (1) | MY119003A (cs) |
NO (1) | NO975490L (cs) |
NZ (1) | NZ303356A (cs) |
PL (1) | PL323741A1 (cs) |
RU (1) | RU2195463C2 (cs) |
SK (1) | SK155297A3 (cs) |
TR (1) | TR199701471T1 (cs) |
TW (1) | TW570925B (cs) |
WO (1) | WO1996038475A1 (cs) |
Families Citing this family (33)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
FR2682122B1 (fr) * | 1991-10-03 | 1995-06-09 | Pasteur Institut | Nouveaux genes d'helicobacter pylori. leur utilisation pour la preparation de souches recombinantes de h. pylori. |
US5843460A (en) * | 1993-05-19 | 1998-12-01 | Institut Pasteur | Immunogenic compositions against helicobacter infection, polypeptides for use in the compositions, and nucleic acid sequences encoding said polypeptides |
WO1995014093A1 (en) | 1993-05-19 | 1995-05-26 | Institut Pasteur | Immunogenic compositions against helicobacter infection, polypeptides for use in the compositions and nucleic acid sequences encoding said polypeptides |
US6406703B1 (en) | 1993-07-27 | 2002-06-18 | Csl Limited | Treatment of H. pylori associated gastroduodenal disease |
NZ269124A (en) * | 1993-07-27 | 1997-06-24 | Csl Ltd | Vaccine comprising helicobacter antigens and its use in treating such infections |
AUPM612494A0 (en) * | 1994-06-08 | 1994-06-30 | Csl Limited | Treatment or prevention of helicobacter infection |
RU98100081A (ru) * | 1995-06-07 | 2005-11-27 | Астра Актиеболаг (SE) | Нуклеиново-кислотные и аминокислотные последовательности helicobacter pylory для диагностики и терапии |
AU6584298A (en) * | 1997-03-26 | 1998-10-20 | Avant Immunotherapeutics, Inc. | Carbohydrate antigens which immunoreact with polyclonal antisera against (h. pylori) |
KR20010020366A (ko) * | 1997-04-30 | 2001-03-15 | 메리오 오라벡 | 횡경막하 전신 경로용 항-헬리코박터 백신 조성물 및 복합 점막/경구 면역법 |
SE9702241D0 (sv) * | 1997-06-12 | 1997-06-12 | Astra Ab | Vaccine compositions IV |
SE9702242D0 (sv) * | 1997-06-12 | 1997-06-12 | Astra Ab | Vaccine compositions V |
US7393529B2 (en) * | 1998-04-09 | 2008-07-01 | Idexx Laboratories, Inc. | Methods and compositions for inhibiting binding of IgE to a high affinity receptor |
SE9801288D0 (sv) * | 1998-04-14 | 1998-04-14 | Astra Ab | Vaccine delivery system and metod of production |
US6841155B1 (en) * | 1998-04-30 | 2005-01-11 | Chiron S.R.L. | Immunization against and treatment for infection by H. pylori |
WO2000049044A1 (en) * | 1999-02-19 | 2000-08-24 | Astrazeneca Ab | Expression of helicobacter polypeptides in pichia pastoris |
GB9924351D0 (en) | 1999-10-14 | 1999-12-15 | Brennan Frank | Immunomodulation methods and compositions |
ATE345354T1 (de) * | 2000-04-27 | 2006-12-15 | Max Planck Gesellschaft | Methode zur identifizierung von helicobacter antigenen |
GB0010371D0 (en) * | 2000-04-29 | 2000-06-14 | Astrazeneca Ab | Helicobacter pylori antigens |
US20020107368A1 (en) * | 2000-12-07 | 2002-08-08 | Jing-Hui Tian | Helicobacter proteins, gene sequences and uses thereof |
WO2005019249A2 (en) | 2003-08-15 | 2005-03-03 | University Of Florida | Identification of porphyromonas gingivalis virulence polynucleotides for diagnosis, treatment, and monitoring of periodontal diseases |
US7381547B2 (en) * | 2004-04-28 | 2008-06-03 | Tzam Diagnostics, Llc | Methods and compositions to detect bacteria using multiplex PCR |
KR100613924B1 (ko) * | 2004-06-23 | 2006-08-21 | 현대자동차주식회사 | 자동차 연료 시스템 |
US20090269362A1 (en) * | 2005-07-25 | 2009-10-29 | Sant Andrea J | Method for Controlling Immunodominance |
EP2139993A2 (en) * | 2007-04-27 | 2010-01-06 | Dow Global Technologies Inc. | Improved production and in vivo assembly of soluble recombinant icosahedral virus-like particles |
CN101496898B (zh) * | 2009-02-16 | 2011-06-15 | 中国人民解放军军事医学科学院生物工程研究所 | 一种预防和/或治疗幽门螺杆菌感染的疫苗 |
RU2449805C1 (ru) | 2011-01-27 | 2012-05-10 | Общество С Ограниченной Ответственностью "Гармония" | Пептидная фармацевтическая композиция, средство на ее основе для лечения гастродуоденальных заболеваний, вызываемых helicobacter pylori, и способ его использования |
JP6959937B2 (ja) | 2015-12-14 | 2021-11-05 | テクニシェ ユニバーシタット ミュンヘン | ヘリコバクターピロリワクチン |
US10577409B2 (en) * | 2016-05-26 | 2020-03-03 | Sagabio Co., Ltd. | Monoclonal antibody inhibiting immunosuppressive functions of pathogens, antigen-binding fragment thereof, and hybridomas producing such antibody |
CN107456578A (zh) * | 2016-06-03 | 2017-12-12 | 硕英生医股份有限公司 | 一种关闭病原体的免疫抑制功能的方法及其用途 |
EP3272354A1 (en) | 2016-07-20 | 2018-01-24 | Technische Universität München | Agents and methods for the prevention or treatment of h. pylori infections |
CN111467368B (zh) * | 2020-04-13 | 2021-05-28 | 江南大学 | 含庚糖链的寡糖化合物在制备幽门螺旋杆菌疫苗中的应用 |
CN113144182B (zh) * | 2021-04-22 | 2023-03-10 | 成都欧林生物科技股份有限公司 | 一种幽门螺杆菌口服缓释疫苗及其制备与应用 |
CN113896775A (zh) * | 2021-08-25 | 2022-01-07 | 河北医科大学第四医院 | 幽门螺杆菌特异性免疫原性肽段 |
Family Cites Families (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
KR100188323B1 (ko) * | 1989-03-09 | 1999-06-01 | 이곤 이이 버어그 | 비타입성 헤모필루스 인플렌자에 대한 백신 |
US5721349A (en) * | 1992-02-26 | 1998-02-24 | Vanderbilt University | Vacuolating toxin-deficient H. pylori |
MX9301706A (es) * | 1992-04-13 | 1994-05-31 | Oravax Inc | Composicion de vacuna para el tratamiento de la infeccion por helicobacter. |
US5420014A (en) * | 1992-04-30 | 1995-05-30 | Auspharm International Ltd. | Rapid in vitro test for helicobacter pylori using saliva |
-
1996
- 1996-05-22 AR ARP960102670A patent/AR003125A1/es unknown
- 1996-05-30 MY MYPI96002075A patent/MY119003A/en unknown
- 1996-06-03 EP EP96917779A patent/EP0828757A1/en not_active Withdrawn
- 1996-06-03 KR KR1019970708610A patent/KR19990022131A/ko not_active Application Discontinuation
- 1996-06-03 RU RU98100200/13A patent/RU2195463C2/ru not_active IP Right Cessation
- 1996-06-03 US US08/669,560 patent/US6025164A/en not_active Expired - Fee Related
- 1996-06-03 SK SK1552-97A patent/SK155297A3/sk unknown
- 1996-06-03 IL IL12234096A patent/IL122340A0/xx unknown
- 1996-06-03 CA CA002222797A patent/CA2222797A1/en not_active Abandoned
- 1996-06-03 HU HU9901546A patent/HUP9901546A3/hu unknown
- 1996-06-03 PL PL96323741A patent/PL323741A1/xx unknown
- 1996-06-03 EE EE9700306A patent/EE9700306A/xx unknown
- 1996-06-03 BR BR9608627A patent/BR9608627A/pt not_active Application Discontinuation
- 1996-06-03 CN CN96195684A patent/CN1191544A/zh active Pending
- 1996-06-03 WO PCT/SE1996/000727 patent/WO1996038475A1/en not_active Application Discontinuation
- 1996-06-03 CZ CZ973573A patent/CZ357397A3/cs unknown
- 1996-06-03 JP JP53641496A patent/JP3380559B2/ja not_active Expired - Fee Related
- 1996-06-03 TR TR97/01471T patent/TR199701471T1/xx unknown
- 1996-08-20 TW TW085110165A patent/TW570925B/zh active
- 1996-12-05 NZ NZ303356A patent/NZ303356A/en unknown
-
1997
- 1997-11-17 IS IS4615A patent/IS4615A/is unknown
- 1997-11-28 NO NO975490A patent/NO975490L/no not_active Application Discontinuation
-
1999
- 1999-09-15 US US09/396,975 patent/US20020168726A1/en not_active Abandoned
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
IS4615A (is) | 1997-11-17 |
US6025164A (en) | 2000-02-15 |
HUP9901546A2 (hu) | 1999-08-30 |
SK155297A3 (en) | 1998-08-05 |
AR003125A1 (es) | 1998-07-08 |
EP0828757A1 (en) | 1998-03-18 |
US20020168726A1 (en) | 2002-11-14 |
NZ303356A (en) | 1999-05-28 |
KR19990022131A (ko) | 1999-03-25 |
IL122340A0 (en) | 1998-04-05 |
WO1996038475A1 (en) | 1996-12-05 |
JP3380559B2 (ja) | 2003-02-24 |
RU2195463C2 (ru) | 2002-12-27 |
EE9700306A (xx) | 1998-06-15 |
TW570925B (en) | 2004-01-11 |
JPH11507210A (ja) | 1999-06-29 |
AU6020596A (en) | 1996-12-18 |
CA2222797A1 (en) | 1996-12-05 |
MY119003A (en) | 2005-03-31 |
MX9709194A (es) | 1998-07-31 |
HUP9901546A3 (en) | 2003-07-28 |
PL323741A1 (en) | 1998-04-14 |
BR9608627A (pt) | 1999-06-15 |
NO975490D0 (no) | 1997-11-28 |
TR199701471T1 (xx) | 1998-02-21 |
CN1191544A (zh) | 1998-08-26 |
AU703331B2 (en) | 1999-03-25 |
NO975490L (no) | 1998-01-07 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
CZ357397A3 (cs) | Antigeny Helicobacter pylori a vakcinační kompozice | |
US6630582B1 (en) | Treatment and prevention of helicobacter infection | |
Kostrzynska et al. | Molecular characterization of a conserved 20-kilodalton membrane-associated lipoprotein antigen of Helicobacter pylori | |
EA001789B1 (ru) | Выделенные, по существу очищенные, поверхностные антигены белковой природы neisseria meningitidis и neisseria gonorrhoeae, их фрагменты и последовательности днк | |
JP4368944B2 (ja) | 防御用ヘリコバクター抗原 | |
CA2183769A1 (en) | Vacuolating toxin-deficient h. pylori and related methods | |
US20020054883A1 (en) | Recombinant fusobacterium necrophorum leukotoxin vaccine and preparation thereof | |
AU2003227537A2 (en) | Expec-specific proteins, genes encoding them and uses thereof | |
US20020028210A1 (en) | Vaccine composition comprising helicobacter pylori flagellin polypeptide | |
US6100066A (en) | Nucleic acid molecules encoding Haemophilus somnus proteins | |
AU750792B2 (en) | 76 kDa, 32 kDa, and 50 kDa helicobacter polypeptides and corresponding polynucleotide molecules | |
US20040047871A1 (en) | Recombinant fusobacterium necrophorum leukotoxin vaccine and prepaation thereof | |
AU703331C (en) | Helicobacter pylori antigens and vaccine compositions | |
WO1998006853A1 (en) | Treatment and prevention of helicobacter infection | |
SK173099A3 (en) | Vaccine compositions comprising the helicobacter pylori flge polypeptide | |
MXPA97009194A (en) | Antigens of helicobacter pylori and compositions of vac | |
AU3390599A (en) | Helicobacter pylori vaccine compositions | |
WO1997028264A1 (en) | A novel gene encoding an outer membrane protein of helicobacter pylori and a recombinant microorganism expressing the same | |
JPH06189773A (ja) | トレポネーマ・ヒオジセンテリエ ワクチン | |
WO1998056815A1 (en) | VACCINE COMPOSITIONS COMPRISING THE HELICOBACTER PYLORI Pfr POLYPEPTIDE | |
WO2001049722A2 (en) | New actinobacillus pleuropneumoniae outer membrane protein and its uses | |
EP1113074A1 (en) | Actinobacillus pleuropneumoniae outer membrane protein and its use | |
WO1998056412A1 (en) | VACCINE COMPOSITIONS COMPRISING THE HELICOBACTER PYLORI 26kDa POLYPEPTIDE |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
PD00 | Pending as of 2000-06-30 in czech republic |