CN1705753A - 非小细胞肺癌的诊断方法 - Google Patents

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中村佑辅
醍醐弥太郎
中鹤修一
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Abstract

本发明公开了使用差异表达基因检测非小细胞 肺癌的方法。还提供了新的人基因,该基因在非小细胞肺癌中 的表达与非癌组织中的相比升高。另外还公开了鉴定可用于治 疗和预防非小细胞肺癌的化合物的方法。

Description

非小细胞肺癌的诊断方法
本申请涉及2002年9月30日提交的USSN60/414,673、2003年2月28日提交的USSN60/451,374和2003年4月28日提交的USSN60/466,在此引入作为参考。
发明领域
本发明涉及生物学领域,更具体地涉及癌症研究领域。具体而言,本发明涉及非小细胞肺癌的诊断方法,以及在这类癌性细胞中的表达升高或降低了的基因。
背景技术
肺癌是人类最常见的致命性肿瘤之一。现已报道了许多与肺癌发生和发展有关的遗传变化。尽管遗传变化可以帮助预后并预测转移的风险或对一些治疗的应答,但是关于单个或有限数量的分子标记的信息通常不能为非小细胞肺癌(NSCLC)的临床诊断提供令人满意的结果(Clin Cancer Res 6:4055-63(2000);Nikilnski et al.,Lung Cancer.34 Suppl 2:S53-8(2001);Watine,Bmj 320:379-80(2000))。非小细胞肺癌(NSCLC)是目前最常见的类型,占全部肺肿瘤的近80%(Society,A.C.Cancer Facts and Figures 2001,2001.)。尽管多种-模式(multi-modality)治疗中进来的进展,但是总的10-年存活率仍保持在10%的低水平,这主要是因为大多数NSCLC直到晚期才能诊断出来(Fry,W.A.,Phillips,J.L.,and Menck,H.R.Ten-year survey oflung cancer treatment and survival in hospitals in the United States:a nationalcancer data base report,Cancer.86:1867-76.,1999.)。尽管基于铂的化疗方案被认为是NSCLC治疗的参照标准,但是那些药物仅能将晚期NSCLC患者的存活时间延长大约6周(Chemotherapy in non-small cell lung cancer:ameta-analysis using updated data on individual patients from 52 randomisedclinical trials.Non-small Cell Lung Cancer Collaborative Group,Bmj.311:899-909.,1995.)。现正研究这种疾病的多种靶向治疗方法,其中包括酪氨酸激酶抑制剂,但是迄今为止仅在有限数量的患者中获得了满意的效果,而一些接受者甚至出现了严重的不良反应(Kris M,N.R.,Herbst RS A phaseII trial of ZD1839(′Iressa′)in advanced non-small cell lung cancer(NSCLC)patients who had failed platinum-and docetaxel-based regimens(IDEAL 2).,Proc Am Soc Clin Oncol.21:292a(A1166),2002)。
cDNA微阵列技术已经能够从正常和恶性细胞中获取全面的基因表达图谱,并将恶性细胞中的基因表达与相应的正常细胞中的基因表达进行比较(Okabe et al.,Cancer Res 61:2129-37(2001);Kitahara et al.,Cancer Res61:3544-9(2001);Lin et al.,Oncogene 21:4120-8(2002);Hasegawa et al.,CancerRes 62:7012-7(2002))。这种方法能够揭示癌细胞的复杂特性,并有助于理解致癌作用的机理。鉴定出肿瘤中那些去调节的基因可以更加精确和准确地诊断个体的癌症,从而开发出新的治疗靶标(Bienz and Clevers,Cell103:311-20(2000))。为了从基因组角度揭示肿瘤的发生机理,并且发现诊断用的靶标分子以及开发出新的治疗药物,本发明人用23040个基因组成的cDNA微阵列对肿瘤细胞的表达图谱进行了分析(Okabe et al.,CancerRes 61:2129-37(2001);Kitahara et al.,Cancer Res 61:3544-9(2001);Lin et al.,Oncogene 21:4120-8(2002);Hasegawa et al.,Cancer Res 62:7012-7(2002))。
为揭示致癌机理而设计的实验已经促进了抗-肿瘤剂的分子靶标的鉴定。例如,最初为抑制与Ras相关的生长-信号途径而设计的法呢基转移酶(famexyltransferase)(FTI)抑制剂已经能有效治疗动物模型中的Ras-依赖性肿瘤,其中Ras的活化依赖于翻译后法呢基化(He et al.,Cell 99:335-45(1999))。已使用抗-肿瘤药物与抗-HER2单克隆抗体trastuzumab的组合对人进行临床实验,以拮抗对抗原癌基因受体HER2/neu;并且改善了乳腺癌患者的临床反应和总存活率(Lin et al.,Cancer Res 61:6345-9(2001))。一种能够选择性抑制bcr-abl融合蛋白的酪氨酸激酶抑制剂STI-571已经被开发用于治疗慢性骨髓性白血病(chronic myelogenous leukemia),其中bcr-abl酪氨酸激酶的组成性活化在白细胞转化中发挥着重要的作用。这些种类的药剂被设计用于抑制具体基因产物的致癌活性(Fujita et al.,Cancer Res61:7722-6(2001))。因此,癌性细胞中通常上调的基因产物可以用作开发新型抗癌药物的潜在靶标。
已证明CD8+细胞毒T淋巴细胞(CTL)识别来自MHCI类分子呈递的肿瘤相关抗原(TAA)的表位肽,并溶解肿瘤细胞。自从发现MAGE家族作为TAA的第一个实例,用免疫学方法已发现了许多其它的TAA(Boon,Int JCancer 54:177-80(1993);Boon and van der Bruggen,J Exp Med 183:725-9(1996);van der Bruggen等,Science 254:1643-7(1991);Brichard等,J ExpMed 178:489-95(1993);Kawakami等,J Exp Med 180:347-52(1994))。一些已经发现的TAA目前正处于作为免疫治疗靶点的临床开发阶段。迄今为止已经发现的TAA包括MAGE(van der Bruggen等,Science 254:1643-7(1991)),gp100(Kawakami等,J Exp Med 180:347-52(1994)),SART(Shichijo等,J Exp Med 187:277-88(1998))和NY-ESO-1(Chen等,Proc Natl Acad SciUSA94:1914-8(1997))。另一方面,已证实的在肿瘤细胞中尤其过表达的基因产物可作为诱导细胞免疫反应的靶点而被识别。这种基因产物包括p53(Umano等,Brit J Cancer 84:1052-7(2001)),HER2/neu(Tanaka等,Brit JCancer 84:94-9(2001)),CEA(Nukaya等,Int J Cancer 80:92-7(1999))等等。
尽管在关于TAA的基础和临床研究中取得了重要的进展(Rosenbeg等,Nature Med 4:321-7(1998);Mukherji等,Proc Natl Acad Sci USA 92:8078-82(1995);Hu等,Cancer Res 56:2479-83(1996)),只有有限数量的候选TAA能治疗腺癌,包括结肠直肠癌。在癌细胞中大量的表达,同时其表达限制在癌细胞内的TAA是有希望的免疫治疗靶点的候选物(candidate)。此外,对诱导有效且特异性抗肿瘤免疫反应的新型TAA的鉴定被预期能够促进肽接种策略在多种类型癌中的临床使用(Boon and can der Bruggen,J Exp Med 183:725-9(1996);van der Bruggen等,Science 254:1643-7(1991);Brichard等,JExp Med 178:489-95(1993);Kawakami等,J Exp Med 180:347-52(1994);Shichijo等,J Exp Med 187:277-88(1998);Chen等,Proc Natl Acad Sci USA94:1914-8(1997);Harris,J Natl Cancer Inst 88:1442-5(1996);Butterfield等,Cancer Res 59:3134-42(1999);Vissers等,Cancer Res 59:5554-9(1999);vander Burg等,J Immunol 156:3308-14(1996);Tanaka等,Cancer Res 57:4465-8(1997);Fujie等,Int J Cancer 80:169-72(1999);Kikuchi等,Int J Cancer 81:459-66(1999);Oiso等,Int J Cancer 81:387-94(1999))。
已有报道重复指出,来自具体健康供体的肽刺激的外周血单核细胞(PBMC)对该肽产生响应而产生显著水平的IFN-γ,但在铬-51释放实验中几乎不以HLA-A24或-A0201限制性图谱发挥针对肿瘤细胞的细胞毒作用(Kawano等,Cance Res 60:3550-8(2000);Nishizaka等,Cancer Res 60:4830-7(2000);Tamura等,Jpn J Cancer Res 92:762-7(2001))。但是,HLA-A24和HLA-A0201均为一种在日本人以及高加索人中常见的HLA等位基因(Date等,Tissue Antigens 47:93-101(1996);Kondo等,J Immunol 155:4307-12(1995);Kubo等,J Immunol 152:3913-24(1994);Imanishi等,Proceeding of the eleventh International Hictocompatibility Workshop andConference Oxford University Press,Oxford,1065(1992);Williams等,TissueAntigen 49:129(1997))。因此,由这些HLA所呈递的癌抗原肽特别适用于治疗日本人和高加索人中的癌症。此外,已知在体外诱导低亲和力CTL通常是使用高浓度肽的结果,所述高浓度肽的使用在抗原呈递细胞(APC)上生成高水平特异性肽/MHC复合物,所述复合物将有效激活这些CTL(Alexander-Miller等,Proc Natl Acad Sci USA93:4102-7(1996))。
发明概述
本发明基于与非小细胞肺癌有关的基因表达模式的发现,所述肺癌例如鳞状细胞癌、腺癌(即,腺泡(acinar)、乳头状(papillary)和支气管肺泡(bronchoalveolar))、大细胞癌(即,巨细胞和透明细胞)、腺鳞癌和未分化癌。
那些在非小细胞肺癌中差异性表达的基因在本申请中统称为“非小细胞肺癌-相关基因”、“NSC核酸”或“NSC多核苷酸”,这些基因编码的多肽称为“NSC多肽”或“NSC蛋白”。本申请中,在非小细胞肺癌中的差异性表达表明基因在非小细胞肺癌细胞中的表达水平不同于在正常细胞中的表达水平。正常细胞获自肺组织。
本发明提供了一种诊断或确定受试者中患非小细胞肺癌的倾向性的方法,该方法通过测定患者来源的生物样品中非小细胞肺癌-相关基因的表达水平进行。非小细胞肺癌-相关基因包括,例如非小细胞肺癌-相关基因包括,例如,NSC 1-1448(参见表1-3)。与该基因的正常对照水平相比,该基因表达水平的变化例如升高或降低,表明该受试者患有或易患非小细胞肺癌。
“正常对照水平”是指从正常健康个体或已知不患有非小细胞肺癌的个体的群体中检测到的基因表达水平。对照水平是源自单个参照群体的单一表达模式或者多种表达模式。与“正常对照水平”不同,“对照水平”是从患病状态背景(即,癌的或非癌)已知的个体或个体群体中检测到的基因表达水平。因此,对照水平可基于正常健康个体、已知不患非小细胞肺癌的个体的群体、非小细胞肺癌患者或者所述患者群体中基因的表达水平来测定。与非小细胞肺癌患者或患者群中基因表达水平相应的对照水平称为“非-小细胞肺癌对照水平”。此外,所述对照水平可以是此前测试的细胞的表达模式的数据库。
在受试生物样品中检测到的NSC807-1448中的任意一个或一组(panel)基因的表达水平与正常对照水平相比升高表明:该受试者(从所述受试者获得了所述样品)患有或易患非小细胞肺癌。相反,在受试生物样品中检测到NSC 1-806中的任意一个或一组基因的表达水平与正常对照水平相比降低则表明:该受试者患有或易患非小细胞肺癌。可选,可以将生物样品中任意一个或一组非小细胞肺癌-相关基因的表达水平与同一个或同一组基因的非小细胞肺癌对照水平进行比较。
与对照水平相比基因表达升高或降低了10%,25%,50%或更多。或者,基因表达与对照水平相比增加或减少了1、2、5或更多倍。可以通过检测非小细胞肺癌-相关基因探针与源自患者的生物样品的基因转录物之间的杂交(例如在芯片或阵列上)情况来测定所述表达。所述源自患者的生物样品可以是源自受试者的,例如已知或疑似患有非小细胞肺癌的患者的任何样品。例如,所述生物样品可以是含有痰、血液、血清、血浆或肺细胞的组织。
本发明还提供了一种非小细胞肺癌的参照表达图谱,其中含有NSC1-1448中两个或多个的基因表达水平模式图。
本发明进一步还提供了用于鉴定可抑制或提高非小细胞肺癌相关基因(例如,NSC 1-1448)的表达或活性的化合物的方法,该方法通过使表达非小细胞肺癌相关基因的受试细胞与受试化合物接触,并测定该非小细胞肺癌相关基因的表达水平或活性来进行。所述受试细胞可以是肺细胞例如肺上皮细胞。表达水平与该基因的正常对照水平相比降低则表明该受试化合物是所述非小细胞肺癌相关基因的表达或功能的抑制剂。因此,如果一种化合物使非小细胞肺癌-相关基因NSC 807-1448的表达水平与正常对照水平相比受到抑制,那么该化合物就有望能减轻非小细胞肺癌的症状。反之,与该基因的正常对照水平相比表达水平或活性升高则表明:所述受试化合物是所述非小细胞肺癌-相关基因的表达或功能的增强物。预期可提高非小细胞肺癌-相关基因NSC 1-806表达水平的化合物能够减轻非小细胞肺癌的症状。
另外,本发明还提供了一种筛选用于治疗或预防非小细胞肺癌的方法。该方法包括:使NSC多肽与受试化合物接触,然后筛选出能与所述NSC多肽结合或能改变所述NSC多肽生物活性的受试化合物。另外,本发明还提供了一种筛选用于治疗或预防非小细胞肺癌的化合物的方法,该方法包括下述步骤:使受试化合物与一种表达NSC蛋白或导入了一种载体的细胞接触,该载体含有位于报道基因上游的NSC基因的转录调控区,然后筛选出能改变NSC蛋白或所述报道基因所编码蛋白表达水平的受试化合物。根据这些方法,当使用NSC 807-1448编码的多肽或者表达由NSC 807-1448或NSC 807-1448转录调控区编码的蛋白的细胞时,预期使得所述生物活性或表达水平与正常对照水平相比受抑制的受试化合物可以减轻非小细胞肺癌的症状。可选,当使用NSC 1-806编码的多肽或者表达NSC 1-806或NSC 1-806的转录调控区所编码蛋白的细胞时,预期升高所述表达水平的受试化合物可以减轻非小细胞肺癌的症状。
本发明还提供了一种试剂盒,其中含有两种或多种检测试剂,该试剂能够与一种或多种NSC核酸结合或者能够与NSC核酸的基因产物(例如,mRNA和多肽)结合。本发明还提供了能与一种或多种NSC核酸结合的多核苷酸的阵列。
另外本发明还提供了治疗或预防非小细胞肺癌方法以及该方法所用的组合物。治疗方法包括治疗或预防受试者中非小细胞肺癌的方法,该方法通过向该受试者施用含有能够降低基因NSC 807-1448表达的反义、短干扰RNA(siRNA)或者核酶的组合物,或者含有能与该基因所编码多肽结合并抑制所述多肽功能的抗体或其片段的组合物来进行。
本发明还包括疫苗和接种方法。例如,通过向该受试者施用疫苗从而实施治疗或预防非小细胞肺癌的方法,所述疫苗中含有多核苷酸NSC807-1448编码的多肽或其免疫活性片段。免疫活性片段是一种长度比全长天然蛋白短并且在导入机体时能够诱导免疫应答的多肽。例如,免疫活性片段包括长度至少8个残基的多肽,所述多肽可在体内刺激免疫细胞诸如T细胞或B细胞。免疫细胞刺激的测定可以通过检测细胞增殖、细胞因子(例如,IL-2)加工(elaboration)或抗体生成来进行。
其它的治疗方法包括:向受试者施用一种能够提高基因NSC 1-806表达水平或基因NSC 1-806所编码多肽的活性的化合物。可选,可以通过施用NSC 1-806中的多核苷酸(例如,包含于载体中的多核苷酸)或者该多核苷酸编码的多肽来治疗或预防非小细胞肺癌。另外,本发明提供了用于治疗或预防非小细胞肺癌的方法,其中使用由本发明所述筛选方法选出的化合物。
另一方面,本发明提供了一种基本上纯的多肽,其包含SEQ ID NO:2所示氨基酸序列。可以通过替代、缺失、插入和/或添加至少1、2、3、5、10、25、50、100或200个氨基酸使所述氨基酸序列发生突变,只要具有所述氨基酸序列的多肽仍然保留由SEQ ID NO:2所示氨基酸序列组成的蛋白的一种或多种生物学活性即可。所述突变多肽与包含SEQ ID NO:2所示氨基酸序列的多肽之间具有至少85%,90%,95%或99%的同一性。另外本发明还包括一种由能与SEQ ID NO:1所示核酸序列杂交的多核苷酸编码的多肽。所述多核苷酸在严谨、中度严谨、或低度严谨条件下与SEQ ID NO:1所示核苷酸序列杂交。
本申请中使用的术语“严谨(杂交)条件”是指在这样的条件下探针、引物、寡核苷酸将与靶序列杂交,而不与其它任何序列杂交。严谨条件是序列-依赖性的,因环境的不同而不同。较长序列发生特异性杂交的温度高于较短序列。通常,严谨条件的温度设定为比特定序列在规定的离子强度和pH条件下的热解链温度(Tm)低约5℃。Tm是指这样的温度,(在特定离子强度、pH和核酸浓度下),在该温度达平衡时,与靶序列互补的探针的50%与靶序列杂交。由于所述靶序列通常过量,在Tm达平衡时,50%的探针被占据。通常,严谨条件是这样的条件,其中pH7.0-8.3时,盐浓度小于约1.0M钠离子,通常为约0.01-1.0M钠离子(或其它盐),且温度对于较短的探针、引物或核苷酸(例如,10-50个核苷酸)而言为至少约30℃,对于较长的探针、引物或核苷酸而言为至少约60℃。严谨条件还可以通过加入去稳定剂例如甲酰胺来实现。
本发明进一步还提供了编码本发明所述多肽的分离的多核苷酸。在本申请中,分离的多核苷酸是指这样的多核苷酸,其结构与任何天然存在的多核苷酸或与跨度超过3个独立基因的天然存在基因组多核苷酸的任何片段不完全相同。因此,该术语包括,例如(a)DNA,它具有生物体基因组中天然存在的天然基因组DNA分子的部分序列,其中所述DNA天然存在于所述生物体中;(b)插入载体或插入原核或真核生物基因组DNA中的多核苷酸,该插入方式使获得的分子与任何天然存在的载体或基因组DNA不相同;(c)分离的分子,如cDNA、基因组片段、聚合酶链式反应(PCR)产生的片段或限制性酶切片段;和(d)重组核苷酸序列,其为杂合基因(即编码融合蛋白的基因)的一部分。优选,该分离的核酸分子与SEQ ID NO:1所示核苷酸序列的同一性为至少65%,70%,75%,80%,85%,90%,91%,92%,93%,94%,95%,96%,97%,98%,99%或更高。当分离的多核苷酸比参照序列(例如SEQID NO:1)的长度更长或者相同时,所述比较是以参照序列的全长进行的。当分离的多核苷酸比参照序列(例如SEQ ID NO:1)短,所述比较是以参照序列的相同长度的片段进行的(排除同源性计算所需的任何环(loop))。
另外,本发明还提供了一种载体,其中含有一种或多种本申请所述的核酸,以及一种含有本发明所述载体或核酸的细胞。本发明还涉及用含有上述多核苷酸之一的载体转化了的宿主细胞。
本发明还提供了通过培养包含含有SEQ ID NO:1所示分离多核苷酸的载体的细胞来制备本申请所述多肽的方法。
另一方面,本发明提供了一种能与SEQ ID NO:2所示多肽或其片段特异性结合的抗体。所述抗体可以是单克隆或多克隆抗体。部分地,本发明还提供了与本发明所述多核苷酸互补或反义的多核苷酸(例如反义DNA)、核酶和siRNA(小干扰RNA)。所述多核苷酸构建体可用于检测本发明所述多核苷酸,即诊断非小细胞肺癌,或者用于治疗或预防该疾病。
本发明进一步提供了反义多核苷酸,其具有SEQ ID NO:423,425,427,429,431,433,435,437,439,441,443,445,447,449,451,453,455,457,459,461,463,465,467,469,471,473,475,477,479,481,483,485,487,489,491,493,495,497,499,501,503,505,507,509,511,513,515,517,519,521,523,525,527,529,或531所示的核苷酸序列。已证明具有这些核苷酸序列之一的多核苷酸都能有效抑制NSCLC细胞系的病灶形成(focus formation)。
此外,本发明还提供了具有SEQ ID NO:533,534,535,536,537,538,539,540,541,542,543,544,545,546,547,548,549,550,551或552所示核苷酸序列的siRNA。已证明具有任一上述这些核苷酸序列的siRNA都能有效地抑制NSCLC细胞系的细胞存活力。
本申请该提供了一种使用任一反义多核苷酸或siRNA治疗非小细胞肺癌的药物组合物,以及使用该组合物治疗或者预防非小细胞肺癌的方法。
本发明还提供了用于治疗非小细胞肺癌的药物组合物,其含有一种具有SEQ ID NO:2所示氨基酸序列的多肽、其功能等价物或者编码所述多肽或其功能等价物的多核苷酸。可以将所述组合物中包含的多核苷酸引入载体而在体内表达。
期望本发明药物组合物的作用过程(course)可抑制癌细胞的生长。所述药物组合物可以用于包括人和家养哺乳动物(domesticated mammal)在内的哺乳动物。
另外,本发明提供了通过施用上调的NSC多肽(例如,NSC 807-1448)或其免疫片段或者编码它们的多核苷酸来诱导抗肿瘤免疫的方法。
除另有说明外,本申请中的所有科技术语的都具有与本发明所属领域普通技术人员通常理解相同的含义。尽管与本申请中描述的方法及材料类似或等同的方法及材料都可用于实施或检验本发明,但是下文仍还是对合适的方法和材料进行了描述。本申请中引用的全部出版物、专利申请、专利及其它参考文献其全部内容在此引入作为参考。如有抵触,以本说明书包括定义为准。另外,所述材料、方法以及实施例都只是为了更好地说明,而绝无意进行限制。
应该理解的是上述的发明概述和下面的详述部分都是优选的实施方案,而决不构成对本发明或本发明替代实施方案的限制。
附图简述
图1图示的是印迹的照片,显示了用半定量RT-PCR证实的200个基因在肺癌细胞中的过表达。肺癌细胞通过LCM方法获自肺癌患者。
图2图示了反义S-寡核苷酸在肺癌细胞系中的生长抑制作用,所述反义S-寡核苷酸用于抑制NSC 810,NSC 811,NSC 812,NSC 825,NSC 841,NSC 857,NSC 859,NSC 893,NSC 905,NSC 947,NSC 956,NSC 994,NSC 1075,NSC 1107,NSC1191和NSC 1389。图2图示了MTT实验的结果,显示了NSC 810-AS,NSC 811-AS1,NSC 811-AS2,NSC 811-AS4,NSC812-AS1,NSC 812-AS2,NSC 825-AS1,NSC 825-AS3,NSC 825-AS5,NSC841-AS4,NSC 841-AS5,NSC 857-AS3,NSC 857-AS4,NSC 859-AS2,NSC859-AS3,NSC 859-AS5,NSC 893-AS1,NSC 893-AS2,NSC 905-AS2,NSC905-AS3,NSC 905-AS5,NSC 947-AS1,NSC 947-AS2,NSC 947-AS3,NSC947-AS4,NSC 956-AS1,NSC 956-AS2,NSC 994-AS1,NSC 994-AS3,NSC994-AS4,NSC 994-AS5,NSC 1075-AS5,NSC 1107-AS1,NSC 1107-AS4,NSC 1191-AS2,NSC 1191-AS4,NSC 1191-AS5和NSC 1389-AS对细胞生长的抑制作用。
图3图示了siRNA(NSC 807-sil,NSC 810-sil,NSC 825-sil,NSC825-si2,NSC 841-sil,NSC 841-si2,NSC 903-sil,NSC 903-si2,NSC 956-sil,NSC 956-si2,NSC 994-sil,NSC 1107-sil,NSC 1107-si2,NSC 1107-si3,NSC 1107-si4,NSC 1107-si5,NSC 1191-si2,NSC 1246-si2和NSC 1389-si2)对肺癌细胞系的生长抑制作用。图3A图示了对用表达对照siRNA或靶-siRNA的载体转染的A549细胞进行MTT实验的结果。图3B图示的是对用表达对照-siRNA或靶-siRNA的载体转染的LC319细胞的进行MTT实验的结果。图3C显示的是用siRNA转染的-LC319细胞的时间推移成像(time1apse imaging)分析的显微照片。图3D图示的是流式细胞分析的结果,显示了siRNA转染的细胞的细胞周期图谱。图3E是照片,其显示用两种不同单克隆抗体进行检测的Western印迹的结果,表明LC319细胞中天然蛋白的表达情况以及被siRNA抑制的情况。图3F、G和H显示A549细胞中的细胞色素c氧化酶(CCO)活性及其被COX17 RNAi抑制的情况。图3F是CCO活性测定的示意图。图3G显示的是Western印迹的结果,其利用鼠抗人线粒体单克隆抗体(MAB1273;CHEMICON,Temecula,CA)证实了由COX17 RNAi转染的A549细胞的分级,该细胞的细胞质级分及线粒体级分。图3H显示在转染后2或5天,抑制内源COX17基因导致CCO活性降低。
图4是照片,通过多-组织northern印迹分析对NSC 807,NSC 810,NSC811,NSC 822,NSC 825,NSC 841,NSC 849,NSC 855,NSC 859,NSC 885,NSC 895,NSC 903,NSC 904,NSC 905,NSC 915,NSC 948,NSC 956,NSC 994,NSC 1000,NSC 1066,NSC 1075,NSC 1107,NSC 1113,NSC 1131,NSC 1141,NSC 1164,NSC 1183,NSC 1201,NSC 1240,NSC 1246,NSC1254,NSC 1265,NSC 1277,NSC 1295,NSC 1306,NSC 1343,NSC 1362,NSC 1389,NSC 1399,NSC 1406,NSC 1413,和NSC 1420在不同人组织中的表达进行的分析。
图5A是照片,显示通过免疫细胞化学分析观察到,NSC 849,NSC 855,NSC 895,NSC 915,NSC 948,NSC 1000,NSC 1103,NSC 1164,NSC 1201,NSC 1288,NSC 1295,NSC 1389,NSC 1420和NSC 1441在COS-7细胞的亚细胞定位,其中所述COS-7细胞转染有c-myc-His标记的NSC-基因表达载体,该实验使用抗-His单克隆抗体以及若丹明偶联的第二抗-鼠IgG抗体用于显色。细胞核用DAPI复染。图5B显示照片,其显示对培养基中分泌的c-myc标记的NSC 895,NSC 1164和NSC 1295进行Western印迹分析的结果。
图6显示的是NSC-基因对用加c-myc-His标记的表达载体稳定转染的COS-7细胞生长的影响。图6a显示通过Western印迹检测到的NSC 810,NSC 841和NSC 1389在稳定转染COS-7细胞中的表达。图6b显示的是NSC 810、NSC 841和NSC 1389对COS-7细胞生长的影响。将表达高水平NSC 810(COS7-TTK-1和2)、NSC 841(NIH3T3-URLC2-3和5)和NSC1389(COS-7-NMU-2,3和5)的2或3种独立转化子以及对照(模拟)按一式三份进行培养。通过MTT实验测定细胞存活力。
图7显示了通过自分泌(autocrine)系统测定的NMU对细胞生长的影响。图7A显示的是NMU的自分泌实验结果。每48小时,向单独的COS-7细胞添加NMU的25氨基酸多肽的活性形式(NMU-25)以及BSA(对照)蛋白。添加后7天,用MTT实验计数细胞数目。图7B显示的是抗-NMU抗体对经NMU-25处理过的COS-7细胞的生长抑制作用。图7C显示的是抗-NMU抗体对内源性表达NMU的COS-7细胞的生长抑制作用。
图8显示Westem印迹分析的结果,其证实了TTK蛋白在NSCLC细胞系A549、LC319和NCI-H522中的过表达。
图9显示用抗-NSC 947抗体、抗-NSC1164抗体、抗-NSC 1295抗体和抗-NSC 1389抗体,对包括腺癌、鳞状细胞癌以及正常肺在内的临床样品中的NSC 947、NSC 1164、NSC 1295和NSC 1389进行免疫组织化学染色的结果。
发明详述
本申请中使用的“一”、“一种”及“所述”除另有专门说明外都是指“至少一(种)”。
本发明部分地基于下述发现之上:在取自肺癌患者的原发肺癌组织的肺细胞中,多种基因的表达模式发生变化。通过综合性cDNA微阵列系统鉴定出了基因表达水平的差异。
对23040个基因进行了cDNA微阵列分析,以选出在非小细胞肺癌患者中通常过表达或者被抑制的基因。发现1448个基因呈现本发明所述的差异性表达。其中,642个基因被上调,806个基因被下调。
通过反义S-寡核苷酸和/或siRNA技术对上述微阵列分析鉴定出的基因进行进一步筛选,以鉴定出可作为开发治疗药物或免疫疗法的靶标的侯选基因。反义S-寡核苷酸和siRNA是短的合成DNA/RNA序列,能够与靶基因对应的特异性mRNA链杂交(Jansen and Zangemeister-Wittke,LancetOncol3:672-83(2002);Brummenlkamp et al.,Science296:550-3(2002))。通过与mRNA结合,反义寡核苷酸阻止靶基因翻译成为蛋白,从而阻断所述基因起作用(Jansen and Zangemeister-Wittke,Lancet Oncol 3:672-83(2002))。相反,siRNA是一种序列-特异性的双链RNA,将其导入细胞可以导致不可遗传性后生(epigenetic)的基因功能敲除,从而使对所述靶基因中的无效突变进行表型模拟(phenocopy)(Brummenlkamp et al.,Science296:550-3(2002))。这种利用非小细胞肺癌的整合型基因的表达数据库和上调基因的后生敲除(epigenetic knock-down)的组合方法,为快速鉴定和评估靶分子以进行个性化治疗提供了一种强有力的手段。现已鉴定出了能够调节NSCLC细胞生长、增殖和/或存活的基因。这些基因编码在自分泌、细胞循环/生长和信号转导中发挥作用的蛋白,或者功能未知的产物。
本申请中鉴定的差异性表达的基因可用于诊断,以及开发用于抑制非小细胞肺癌的基因靶向型疗法。
在非小细胞肺癌患者中的表达水平受到调节(即,升高或降低)的基因概括于表1-3,本申请中统称为“非-小细胞肺癌-相关基因(non-small cell lungcancer-associated genes)”、“NSC基因“、“NSC核酸”或“NSC多核苷酸”,这些基因编码的多肽称为“NSC多肽”或“NSC蛋白”。除另有说明外,“NSC”是指本申请公开的任一序列(例如,NSC1-1448)。这些基因此前已经描述过,一并给出其数据库登录号。
  NSC编号 LMMID Acc 代号 名称
  1  A2125   M31452  C4BPA   补体成分4-结合蛋白,α(complement component
  4-binding protein,alpha)
2 A0386 K02215 SERPINA8   丝氨酸(或半胱氨酸)蛋白酶抑制因子,进化支(clade)A(α抗蛋白酶,抗胰蛋白酶),成员8(serine(orcysteine)proteinase inhibitor,clade A (alphaantiproteinase,antitrypsin),member8)
  3   B3893   AA573809   ITLN   Intelectin
  4   A0038N   W73825   TCF21   转录因子21(transcription factor21)
5 C8088 D87465 KIAA0275   KIAA0275基因产物(KIAA0275gene product)
6 D1273 AJ001015 RAMP2   受体(降钙素)活性调节蛋白2(receptor(calcitonin)activity modifying protein2)
7 C7138 X64559 TNA   tetranectin(血纤蛋白溶酶原-结合蛋白)(tetranectin(plasminogen-binding protein))
8 C7919 X79981 CDH5   钙粘素5,2型,VE-钙粘素(血管上皮)(cadherin5,type2,VE-cadherin(vascular epithelium))
9 A2202 AJ001016 RAMP3   受体(降钙素)活性调节蛋白3(receptor(calcitonin)activity modifying protein3)
  10   A0960   U60115   FHL1   四个半LIM结构域1(four and a half LIM domains 1)
11 A0760 L05568 SLC6A4   溶质载体蛋白家族6(神经递质转运物,五羟色胺),成员4(solute carrier family6(neurotransmittertransporter,serotonin),member4)
  12   A2415   M15856   LPL   脂蛋白脂酶(lipoprotein lipase)
13 A8600 AI200539   人(Homo sapiens)cDNA:FLJ22690 fis,克隆HSI11134(Homo sapiens cDNA:FLJ22690 fis,cloneHSI11134)
14 A4375N AB008109 RGS5   G蛋白信号调节物5(regulator of G protein signaling5)
  15   A0919N   X55635   MRC1   甘露糖受体,C(mannose receptor C)1型
16 A6696 AA491502 C1QR   补体成分Clq受体(complement component Clqreceptor)
  17   B1090N   AA156022   FLJ20798   不确定蛋白(hypothetical protein)
18 C0893 AA122287 GARP   糖蛋白A重复为主(glycoprotein A repetitionspredominant)
  19   C1603   U01317   HBB   血红蛋白(hemoglobin),β
  20   C0724   AA573140   ESTs
  21   C8046   X54380   PZP   妊娠区带蛋白(pregnancy-zone protein)
22 C6234 AI247176   DKFZP586L2024 DKFZP586L2024蛋白
  23   B5155   W84893   AGTRL1   血管紧张素受体-样1(angiotensin receptor-like 1)
24 A6358 AA533191   ESTs,略微近似于ALU7_人ALU亚家族SQ序列污染警告条目(HUMAN ALU SUBFAMILY SQSEQUENCE  CONTAMINATION  WARNINGENTRY)[人(H.sapiens)]
  25   B3794N   N94777   ESTs
  26   B9790   AA054482   LOC51267   C-型凝集素-样受体(C-type lectin-like receptor)
  27   C8228   L36033   SDF1   基质细胞衍生的因子(stromal cell-derived factor)1
  28   E0733   AI459767   SPARCL1   SPARC-样1(mast9,hevin)
  29   C2324   AA036631   ESTs
30 A2508 X03350 ADH2   乙醇脱氢酶2(I类),β多肽(alcohol dehydrogenase 2(class I),beta polypeptide)
  31   B7122   AA480009   人cDNA FLJ13569fis,克隆PLACE1008369
  32   A7775   AA922655   FGL2   纤维蛋白原-样2
33 A0702N AA449301 FLT1   fms-相关的酪氨酸激酶1(血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor)/血管通透因子受体(vascular permeability factor receptor))
34 A4630 U89281 RODH   氧化性3α羟基类固醇脱氢酶(oxidative 3 alphahydroxysteroid dehydrogenase);视黄醇脱氢酶(retinoldehydrogenase);3-羟基类固醇表异构酶(3-hydroxysteroid epimerase)
35 A1739 J02761 SFTPB   表面活性剂(surfactant),肺-相关蛋白(pulmonary-associated protein)B
  36   A6712   W76197   DLC1   在肝癌中缺失1(Deleted in liver cancer 1)
  37   A4829N   D63412   AQP4   水孔蛋白(aquaporin)4
  38   B5205N   AI096938   KIAA0758   KIAA0758蛋白
39 D4204 AA868130   ESTs,中度近似于C4BP_人C4B结合蛋白α链前体(HUMAN C4B-BINDING PROTEIN ALPHACHAIN PRECURSOR)[H.sapiens(人)]
  40   C1604   AA044381   HSD11B1   羟基类固醇(hydroxylsteroid)(11-β)脱氢酶1
41 A2460 AF000959 CLDN5   封闭蛋白(claudin)5(velocardiofacial综合症中缺失的跨膜蛋白)
  42   A3360   S77410   AGTR1   血管紧张素受体1
  43   A1423   L38486   MFAP4   微纤丝(microfillar)-相关蛋白4
  44   B9634   AI094298   ESTs
  45   B8029   AI090219   ESTs
  46   D8515   U21128   LUM   基膜聚糖(lumican)
47 A2195 AF022813 TM4SF7   跨膜4超家族成员7(transmembrane 4superfamilymember 7)
  48   B8384   AA147582   ESTs
  49   B8411   AA122240   人cDNA FLJ13612fis,克隆PLACE
  50   B9603   AI347579   ESTs
  51   A6717   AA487952   SYNEB   突触核表达的基因(synaptic nuclei expressed gene)1b
  52   D0946   AA780308   KSP37   ksp37蛋白
  53   C6387   AI022180   ESTs
  54   A2542   J02874   FABP4   脂肪酸结合蛋白4,脂肪细胞
  55   A3412   M10321   VWF   von Willebrand因子
  56   A4043   AA777648   PMP22   外周髓磷脂蛋白(peripheraI myelin protein)22
  57   A1818N   AA600048   CALD1   钙调蛋白结合(caldesmon)1
  58   A2633N   D13628   ANGPT1   血管生成素(angiopoietin)1
  59   C4884   AA150200   ESTs,略微近似于tuftelin[小家鼠(M.musculus)]
  60   B7922   AI004344   人cDNA:FLJ21042fis,克隆CAE11204
  61   D3758   AI193122   ESTs
  62   A3037   D12763   IL1RL1   白细胞介素1受体-样1
  63   D9082   AI123738   ESTs
  64   A2403   S53911   CD34   CD34抗原
  65   C7654   AA142989   ESTs
66 A1610 X58295 GPX3   谷胱甘肽过氧化物酶(glutathione peroxidase)3(血浆)
67 A6545 M98479 TGM2   谷氨酰胺转移酶(transglutaminase)2(C多肽,蛋白-谷氨酰胺-γ-谷氨酰转移酶)
  68   A8531   AA634913   FBLN5   细胞微丝(fibulin)5
  69   A7230   X03963   COL4A1   胶原,IV型,α1
70 B4240 AI218211 FXYD6   含FXYD结构域的离子转运调节因子(FXYDdomain-containing ion transport regulator)6
  71   B3933   AA487977   ETL   ETL蛋白
  72   D8933   AI239735   ESTs
73 E1622 AI985921 CAV1   陷窝蛋白(caveolin)1,细胞膜穴样内陷蛋白(caveolaeprotein),22kD
74 B9616 AI208877 NYD-SP21   睾丸发育-相关(Testes development-related)NYD-SP21
  75   B7170N   AA604083   PCDH18   原钙粘素(protocadherin)18
  76   A6237   L05485   SFTPD   表面活性剂,肺-相关蛋白BD
77 A6665 AI279606 LOC55885   神经元特异性转录因子(neuronal specifictranscripti on factor)DAT1
78 B4320 AA029815 C5ORF4   染色体5开放阅读框(chonromosome 5open readingframe)4
  79   B4291   T04932   人cDNA:FLJ21545 fis,克隆COL06195
80 B3695 AI090213   人(Homo sapiens)mRNA;cDNA DKFZp586E2023(来自克隆DKFZp586E2023)
  81   C9642   AA493650   人cDNA:FLJ23494fis,克隆LNG01885
  82   C0250   U20391   FOLR1   叶酸受体(folate receptor)1(成人)
  83   A0701   U05291   FMOD   纤调蛋白(fibromodulin)
84 A7247N AA873533   人mRNA;cDNA DKFZp586N0121(来自克隆DKFZp586N0121)
  85   C1412   AA446539   ESTs
86 A2418 M96789 GJA4   缝管隙连接蛋白(gap junction proten),α4,37kD(连接蛋白(connexin)37)
  87   D3727   AA843148   ESTs
  88   B5421   AA648414   ESTs
89 C8253 AA599019 MEOX2   间充质同源框(mesenchyme hemeo box)2(生长停滞-特异性同源框)
90 A0878 L13288 VIPR1   血管活性肠肽受体(vasoactive intestinal peptidereceptor)1
  91   B5175N   AI350168   KIAA0833   KIAA0833蛋白
  92   D5870   AA972840   ESTs
  93   B8423   R65585   ESTs
  94   B8392   AA971017   人cDNA FLJ12028 fis,克隆HEMBB1001850
  95   A6099   W60630   FLJ21935   不确定蛋白FLJ21935
96 B4694 AA436726   DKFZP564D0764 DKFZP564D0764蛋白
  97   B8366   AI342255   人cDNA FLJ20767 fis,克隆COL06986
98 C8048 X58840 TCF2   转录因子2,肝的;LF-B3;肝细胞核因子变体(variant hepatic nuclear factor)
  99   C7458   AI272261   MBP   髓磷脂碱性蛋白(myelin basic protein)
100 C1959 AA192426 KIAA0717   ESTs,略微近似于PEBP小鼠磷脂酰乙醇胺-结合蛋白(MOUSEPHOSPHATIDYLETHANOLAMINE-BINDINGPROTEIN)[小家鼠]
101 A3519 D82348 ATIC   5-氨基咪唑(aminoimidazole)-4-氨甲酰核糖核苷酸甲酰基转移酶(carboxamide  ribonucleotideformyltransferase)/IMP环水解酶(cyclohydrolase)
  102   A2049   X67292   IGHM   免疫球蛋白重链恒定μ(immunoglobulin heavy
 constant mu)
103 A0694 M91211 AGER  高级糖基化作用终产物-特异性受体(advancedglycosylation end product-specific receptor)
104 A4491 L15388 GPRK5  G蛋白-偶联的受体激酶(G protein-coupled receptorkinase)5
105 A7286 AI301935 CFFM4  高亲合力免疫球蛋白ε受体β亚基(high affinityimmunoglobulin epsilon receptorbeta subunit)
  106   B4137   AA148493  人cDNA:FLJ22300 fis,克隆HRC04759
  107   B5721N   AI075111  人cDNA FLJ14054 fis,克隆HEMBB 1000240
  108   D5083   AA649967  ESTs
  109   B6555N   AA904865   KIAA1912  ESTs
  110   A5690   AA927075   KIAA1029  突触后蛋白(synaptopodin)
111 A6436 AB014609 KIAA0709  内吞受体(endocytic receptor)(巨噬细胞甘露糖受体家族(macrophage mannose receptor family)
  112   B6700   AI215600   KIAA1300  KIAA1300蛋白
113 B0081N D59339 KIAA1529  人mRNA;cDNA DKFZp434I2420(来自克隆DKFZp434I2420)
  114   C7592   AA936619   DOK2  船坞蛋白(docking protein)2,56kD
  115   C1703   W84753  人cDNA FLJ13510 fis,克隆PLACE1005146
  116   D1811   AA594318   LOC51304  DHHC1蛋白
  117   A2740   D85777   CDO1  半胱氨酸双加氧酶(cystein dioxygenase),I型
117118 A1779N AF025534 LILRB5  白细胞免疫球蛋白-样受体,亚家族B(带有TM和ITIM结构域),成员5(leukocyte immunoglobulin-likereceptor,subfamily B(with TM and ITIM domains),member5)
  119   C7721   AI333309  ESTs
  120   A7094   U33749   TITF1  甲状腺转录因子1(thyroid transcription factor 1)
  121   B1352   M18786   AMY1A  淀粉酶(amylase),α1A;唾液(salivary)
  122   A1871N   AA778308   RNAE1  核糖核酸酶,RNAe A家族,1(胰腺))
  123   A4798N   Y15724   ATP2A3  腺苷三磷酸酶,Ca++转运,遍在(ubiquitous)
  124   B5442   AA633352   人cDNA:FLJ23067 fis,克隆LNG04993
  125   B7814   AA455087   ESTs
  126   A1617   X69490   TTN   titin
127 A3536 J03040 SPARC   分泌的蛋白(secreted),酸性的(acidic),富含半胱氨酸(cysteine-rich)(骨连接蛋白(osteonectin))
  128   A1150   M37033   CD53   CD53抗原
129 B2148 M61900 PTGDS   前列腺素D合成酶基因(prostaglandin D syntheasegene)
  130   A8156   AI148659   ESTs
131 C1520 D79303 COL14A1   胶原,XIV型,α1(粗纤维调节素)(collagen,typeXIV,alpha 1(undulin))
132 C9503 AA621124   ESTs,略微近似于ALU2_人ALU亚家族SQ序列污染警告条目[人]
  133   D3086   AA806358   ESTs
  134   B4661   AA425371   PTPRD   蛋白酪氨酸磷酸酶,受体型,D
  135   A0593   X76939   LAMA4   层粘连蛋白(laminin),α4
136 A0184 M59832 LAMA2   层粘连蛋白,α2(分区蛋白,先天性肌肉萎缩)(laminin,alpha 2(merosin,congenital musculardystrophy))
  137   B0565   AI090498   PCDH12   原钙粘素(protocadherin)12(protocadherin 12)
  138   B7930   N21096   ESTs
  139   B4396   W58589   ESTs
  140   C0505   AA926639   FLJ11110   不确定蛋白FLJ11110
141 C0219 AA235013 AKAP2   一种激酶(PRKA)锚定蛋白(A kinase(PRKA)anchorprotein)2
142 A1450 M33906   HLA-DQA1   主要组织相容性复合体,II类,DQα1(majorhistocompatibilitycomplex,class II,DQ alpha 1)
143 B1689 AA664472   人mRNA全长插入cDNA克隆EUROIMAGE1913076(Homo sapiens mRNA full length insertcDNA clone EUROIMAGE 1913076)
  144   C9556   N30188   ESTs
  145   C7651   AA142875   ESTs
146 D9990 Z25109 ZP3A   透明带糖蛋白(zona pellucida glycoprotein)3a(精子受体)
  147   A1365   D10653   TM4SF2   跨膜4超家族成员2
148 A1147 M14354 F13A1   凝血因子XIII,A1多肽(coagulation factor XIII,A1polypeptide)
  149   A9462   AA055019   ESTs
150 A6567 C05229 PDK4   丙酮酸脱氢酶激酶(pyruvate dehydrogenase kinase),同工酶4
  151   A0774N   M27717   CPA3   羧肽酶(carboxypeptidase)A3(肥大细胞(mast cell))
  152   B6631   AA968840   人HSPC285mRNA,部分cds
153 A9546N AI076929   ESTs,略微近似于大鼠酶原粒膜蛋白同源物(Homolog of rat Zymogen granule memebraneprotein)[人]
  154   C5014   AI185804   FN1   纤粘连蛋白(fibronectin)1
155 D4936 AI084457 NPR3   利尿钠肽受体(natriuretic peptide receptor)C/鸟苷酸环化酶(guanylate cyclase)C(心房纳尿肽受体(atrionatriuretic peptide receptor)C)
156 D1758 AA368303 TIMP3   金属硫蛋白3的组织抑制因子(sorsby fundusdystrophy,pseudoinflammatory)
  157   B3918   AF055460   STC2   斯钙素(stanniocalcin)2
  158   B9722   AA029906   ESTs
  159   B7441   AA994299   人cDNA:FLJ20898fis,克隆ADKA03584
160 A4014 D28769 PBX2   前-B细胞白血病转录因子(pre-B-cell leukemiatranscription factor)2
  161   B9242   R59292   MS4A8B   跨膜4-结构域,亚家族A,成员8B
  162   A4872   U19568   SSCA1   鳞状细胞癌抗原(squamous cell carcinoma antigen)
163 A0100 J04513 FGF2   成纤维细胞生长因子(fibroblast growth factor)2(碱性)
  164   B4665N   AA045171 ESTs
165 B9172 AI221059   DKFZP566K1924 DKFZP566K1924蛋白
  166   B9957   H39098   KIAA0843 KIAA0843蛋白
  167   A5176   U37791   MMP19 基质金属硫蛋白(matrix metalloproteinase)19
  168   D5160   AI336306 ESTs
  169   A0898   Z22641   CHN1 chimerin(chimaerin)1
  170   A5370   R37540 ESTs
  171   A9317   AA429693 ESTs
172 B6831 X72012 ENG endoglin(Osler-Rendu-Weber 综合症1)(endoglin(Osler-Rendu-Weber syndrome 1))
  173   B3699   AA864739 人cDNA:FLJ21841 fis,克隆HEP01831
  174   B7996N   W73609 ESTs
  175   D1274   AI147089 ESTs
176 C4665 AF009314 人克隆tua8 Cri-du-chat区mRNA(Homo sapiensclone TUA8 Cri-du-chat region mRNA)
177 A4026 D50312 KCNJ8 钾内向整流通道,亚家族J,成员8(potassiuminwardly-rectifying channel,subfamily J,member8)
  178   A0764   L10320   FBP1 果糖,6-二磷酸酶1(fructose,6-bisphosphatase 1)
  179   A2188   J02770   IF I因子(补体)(I factor(complement))
  180   A2510   X04481   C2 补体成分(complement component)2
181 A6248 M15178   HLA-DRB1 主要组织相容性复合体,II类,DRβ1
  182   A1761   K01171   HLA-DRA 主要组织相容性复合体,II类,DRα
183 A7689 X00457 SB类II组织相容性抗原α-链的人mRNA(HumanmRNA for SB IIclass histocompatibility antigen alpha-chain)
  184   A8152   AA485172   HLA-DNA 主要组织相容性复合体,JI类,DNα
185 B7304N AA777308 人cDNA FLJ13942fis,克隆Y79AA1000962,略微近似于MYOSIN HEAVY CHAIN,NON-MUSCLE
  186   D0766   AA424762  ESTs
  187   C4971   U20971   NNMT  烟酰胺(nitocinamide)N-甲基转移酶
  188   B4321   AA256196   RBM8B  RNA结合基序蛋白(binding motif protein)8b
  189   B3746   AA976403  人胰腺肿瘤-相关蛋白(fksg12)mRNA,完整cds
  190   A9373   M34570   COL6A2  胶原蛋白,VI型,α2
191 A1810N X72755 MIG  γ干扰素诱导的单核因子(monokine induced bygamma interferon)
  192   C0371   AA411749  ESTs
  193   A3733   X04665   THBS1  血小板反应蛋白(thrombospondin)1
  194   C1466   H03229   GAB1  GRB2-相关结合蛋白1
  195   A2066   M28443   AMY2A  淀粉酶,α2A;胰腺的
  196   C6547   AA774546   NXF3  核RNA输出因子3
  197   A0401   X00637   HP  触珠蛋白(haptoglobin)
198 B9211 AI075316 FLJ14033  类似于低氧的诱导因子(hypoxia inducible factor)3的不确定蛋白FLJ14033,α亚单位
199 A7978 J04813 CYP3A5  细胞色素p450,亚家族IIIA(niphedipine氧化酶),多肽5(cytochrome P450,subfamily IIIA(niphedipineoxidase),polypeptide 5)
  200   B6827N   AA127856   MPDZ  多PDZ结构域蛋白(multiple PDZ domain protein)
201 C4268 AA885514  ESTs,略微近似于CAYP HUMANCALCYPHOSINE[人]
202 A2487 D10923 HM74  推定的趋化因子受体(putative chemokine receptor);GTP-结合蛋白
203 C7059 AA455044  ESTs,略微近似于AF2571821G-蛋白-偶联的受体48[人]
  204   A3250   M14144   VIM  波形蛋白(vimentin)
205 A5556 AA310364 TIMP2  金属硫蛋白2的组织抑制因子(tissue inhibitor ofmetalloproteinase)
206 A6458 H71292 SLC21A9  溶质载体家族21(有机阴离子转运物(organic aniontransporter)),成员9
  206207 B3759 AJ366242 ESTs
208 B9826 AA621350 SLIT2   slit蛋白(果蝇)同源物2(slit(Drosophila)homolog2)
209 E0336 AI097529 EPAS1   内皮PAS结构域蛋白1(endothelial PAS domainprotein 1)
  210   A6143   AF035315   人克隆23664和23905的mRNA序列
  211   B7171   H75419   十二指肠细胞色素(Duodenal cytochrome)b
  212   C7813   AI201273   ESTs
  213   C9730   AA030027   ESTs
  214   D8827   AA484891   ESTs
215 A1572 U76421 ADARB1   腺苷脱氨酶,RNA-特异性,B1(大鼠RED1同源物同源物)(adenosine deaminase,RNA-specific,B1(homolog of rat RED 1))
  216   A1516   U24488  TNXA   肌腱蛋白(tenascin)XA
217 B4852N X02530 SCYB10   小的可诱导型细胞因子亚家族(small induciblecytokine subfamily)B(Cys-X-Cys),成员10
  218   A0791   L13923  FBN1   原纤蛋白1(Marfan综合症)
219 B8265 AA156792 HEYL   毛发(hairy)/与YRPW基序相关的断裂增强子-样(enhancer-of-split related with YRPW motif-like)
  220   A1064   M33492  TPSB1   类胰蛋白酶(tryptase)β1
221 A1708 X85337 MYLK   肌球蛋白(myosin),轻多肽激酶(light polypeptidekinase)
222 A4453 AF027299 EPB41L2   红细胞膜蛋白带4.1-样2(erythrocyte membraneprotein band 4.1-like2)
223 B8354 AA279159 WASPIP   与Wiskott-Aldrich  syndrome  protein  interactingprotein  综合症蛋白相互作用的蛋白(Wiskott-Aldrich syndrome protein interacting protein)
224 C9565 AA252389 LHFP   脂肪瘤HMGIC融合伴侣(lipoma HMGIC fusionpartner)
225 A3560 L06797 CXCR4  趋化因子(C-X-C基序),受体4(融合素)(chemokine(C-X-C motif),receptor 4(fusin))
226 A2135 U29091   SELENBP1 硒结合蛋白1(selenium binding protein 1)
  227   A0578   X68277   DUSP1  双重特异性磷酸酶1(dual specificity phosphatase 1)
  228   A0884   U15085   HLA-DMB  主要组织相容性复合体,II类,DMβ
  229   B1475   AA918725   ARRB1  抑制蛋白(arrestin),β1
  230   B4085   T34883   AQP1  水孔蛋白1(成通道整合蛋白,28kD)
  231   C4095   K01505  DC II类组织相容性抗原α-链
  232   B8722   AB007923   KIAA0477  KIAA0477基因产物
  233   B9564   H85019   KPNB1  核转运蛋白(Karyopherin)(输入蛋白(importin))β1
  234   A1816N   M31158   PRKAR2B  蛋白激酶,cAMP-依赖的,调节的,II型,β
  1 235   B8257   AA426140  人cDNA FLJ11022 fis,克隆PLACE1003771
236 A9393N W67577 CD74  CD74抗原(主要组织相容性复合体的恒定多肽,II类抗原-相关的)
  237   C6900   AA707766  ESTs
  238   B9368   AI342469  ESTs
  239   B3966   AI038938  ESTs
240 B1004 N87886 MMp2  基质金属硫蛋白2(明胶酶(gelatinase)A,72kD明胶酶,72kD IV型胶原酶)
241 A1807N L76465 HPGD  羟前列腺素脱氢酶15-(NAD)(hydroxyprostaglandindehydrogenase 15-(NAD))
242 C3775 AW243357  人克隆24775mRNA序列(Homo sapiens clone 24775mRNA sequence)
243 A1951 L08895 MEF2C  MADS盒转录增强子因子2,多肽C(肌细胞增强因子2C(MADS box transcription enhancer factor 2,polypeptide C(myocyte enhancer factor 2C))
244 A7679 U38894 ROR1  受体酪氨酸激酶-样孤儿受体1(receptor tyrosinekinase-like orphan receptor1)
  245   B9803   C02532   COL21A1  胶原蛋白,XXI型,α1(Collagen,type XXI,alpha 1)
246 D1219 AA453640   ESTs,略微近似于KCC1_人钙/钙调节蛋白-依赖的蛋白酶I型[人](ESTs,Weakly similar toKCC1_HUMANCALCIUM/CALMODULIN-DEPENDENTPROTEIN KINASE TYPE I[H.sapiens])
  247   A3061   M83202   LTF   乳转铁蛋白(lactotransferrin)
248 A0875 L13740 NR4A1   核受体亚家族A,成员1(nuclear receptor subfamily4,group A,member 1)
  249   A4794   AF064492   LDB2   LIM结构域结合2(LIM dom ain binding 2)
  250   A7232N   AA669034   人cDNA:FLJ23125fis,克隆LNG08217
251 C3653 AL133415 DNMT2   DNA(胞嘧啶-5-)-甲基转移酶2(DNA(cytosine-5-)-methyltransferase 2)
  252   C8039   Z22970   CD163   CD163抗原
  253   C8158   K03431   HPR   触珠蛋白-相关蛋白(haptoglobin-related protein)
254 B9924 W52782 LOC58514   HUEL (C4orfl)-相互作用蛋白(HUEL(C4orfl)-interacting protein)
255 A1406 L07555 CD69   CD69抗原(p60,早期T细胞活化抗原)(CD69antigen(p60,early T-cellactivation antigen))
256 A3488 U39050 DAB2   无功能(果蝇)同源物2(有丝分裂原-响应磷蛋白)(disabled (Drosophila)homolog 2(mitogen-responsive phosphoprotein))
  257   A1011   M75106   CPB2   羧肽酶B2(血浆)(carboxypeptidase B2(plasma))
258 A2427 U69546 CUGBP2   CUG三联体重复,RNA-结合蛋白2(CUG tripletrepeat,RNA-binding protein 2)
259 B0337 R37044 MAPRE2   微管-相关蛋白,RP/EB  家族,成员2(microtubule-associated protein,RP/EB family,member 2)
260 A7942 AA578712 ESTs
261 C0629 H16793 C8ORF4   染色体8开放阅读框4(chromosome 8 open readingframe 4)
262 C7057 H22566 DACH   Dachshund同源物(果蝇)(Dachshund homolog(Drosophila))
263 D5981 AA974905 FSCN3   成束蛋白(海胆)同源物3(肌动蛋白-成束蛋白,睾丸)(fascin(Strongylocentrotus purpuratus)homolog 3(actin-bundling protein,testicular))
264 C5002 AC002076 GNG11   鸟苷酸结合蛋白11(guanine nucleotide bindingprotein 11)
  265   A8488  N75156   人cDNA FLJ11570 fis,克隆HEMBA1003309
  266   B9013  AA904456   ESTs
267 B9925 AA993564   人mRNA;cDNA DKFZp564E153(来自克隆DKFZp564E153)
  268   C4743  AA699559   NYD-SP15   蛋白激酶NYD-SP15(Protein kinase NYD-SP15)
  269   A3015  J04080   C1S   补体成分1,S亚成分
270 B6414N AA429149 C11ORF9   染色体11开放阅读框9(chromosome 11openreading frame 9)
271 E0523 AA478501 AHNAK   AHNAK核蛋白(桥粒联结蛋白)(AHNAKnucleoprotein(desmoyokin))
  272   A1414  L25286   COL15A1   胶原蛋白,XV型α1
273 C3724 NP_055269 PA26   p53调控的PA26核蛋白(p53regulated PA26 nuclearprotein)
  274   B0267  R78436   GATA2   GATA-结合蛋白2(GATA-binding protein 2)
275 A3189 M16801 NR3C2   核受体亚家族3,C群,成员2(nuclear receptorsubfamily 3,group C,member 2)
  276   B8656  AA398561   FLJ20371   不确定蛋白FLJ20371
277 C8205 AI276150 TUCAN   含有肿瘤上调CARD的caspase 9的拮抗剂(Tumorup-regulated CARD-containing antagonist of caspasenine)
  278   A9285  AI027810   KIAA1102   KIAA1102蛋白
  279   C8636  AA478752   DKK3   Dickkopf同源物3(爪蟾(Xenopus laevis))
  280   A3178  M29696   IL7R   白细胞介素7受体
  281   C4735   AA258282   KIAA1474   KIAA1474蛋白
282 A1137 L20688 ARHGDIB   Rho GDP解离抑制物(GDI)β(Rho GDP dissociationinhibitor(GDI)beta)
283 A4414 X97187 ABCA3 ATP-结合框,亚家族A(ABC1),成员3(ATP-bindingcassette,sub-family A(ABC1),member 3)
284 A2404 M15395 ITGB2   整联蛋白,β2(抗原CD18(p95),淋巴细胞功能-相关抗原1;巨噬细胞抗原1(mac)β亚单位)(integrin,beta  2(antigen CD18(p95),lymphocytefunction-associated antigen  1;macrophage antigen 1(mac)beta subunit))
285 A8898 AI022075 FLJ13732   与张力蛋白类似的不确定蛋白FLJ13732(hypothetical protein FLJ13732similar totensin)
286 B3924 AI079876 HSPB7   热休克27kD蛋白家族,成员7(心血管的)(heatshock 27kD protein family,member 7(cardiovascular))
  287   B5776N   U51712   ESTs
288 B9533 W44970 SCA7   脊髓小脑共济失调7(伴有视网膜变性的橄榄核桥脑小脑萎缩)(spinocerebellar ataxia 7(olivopontocerebellar atrophy with retinaldegeneration))
289 B0830N AA452493 ID4   DNA结合蛋白4的抑制因子,显性阴性的螺旋-环-螺旋蛋白(inhibitor of DNA binding 4,dominantnegative helix-loop-helix protein)
290 A9067N AI268375 DDB1   损害-特异性DNA结合蛋白1(127kD)(damage-specific DNA binding protein 1(127kD))
291 C6721 AA761358 753P9   染色体X开放阅读框9(Chromosome X open readingframe 9)
  292   B4440   AA418784   LOC64116   由BCG-CWS上调(up-regulated by BCG-CWS)
  293   A2644   X04299   ADH3   乙醇脱氢酶3(I类),γ多肽
  294   A2972   X72475   IGKC   免疫球蛋白κ恒定(immunoglobulin kappa constant)
  295   A1023   X05610   COL4A2   胶原蛋白,IV型,α2
296 C6386 W05570 DKFZP586B0621 DKFZP586B0621蛋白
297 D8491 X97324 ADFP 脂肪组织分化-相关蛋白(adiposedifferentiation-related protein)
298 A1275 AF020543 PPT2 棕榈酰-蛋白硫酯酶2(palmitoyl-protein thioesterase2)
299 A6750 U09608 NKG7   天然杀伤细胞组7序列(natural killer cell group 7sequence)
  300   A3822   AB001928   CTSL2   组织蛋白酶12(cathepsin L2)
301 C8282 R84710 ASAHL   N-酰基鞘氨醇氨基水解酶(酸性神经酰胺酶)-样(N-acylsphingosine amidohydrolase (acidceramidase)-like)
302 B9777 AA903451 SRCL   胶凝素亚家族成员12(Collectin sub-family member12)
303 A0090 D50683 TGFBR2   转化生长因子,β受体II(70-80kD)(transforminggrowth factor,beta receptor II(70-80kD))
  304   B9201   AI083491   WIF   Wnt抑制因子(Wnt inhibitory factor)
305 B1531 AA775224 NPR1   利尿钠肽受体C/鸟苷酸环化酶A(心房纳尿肽受体A))(natriuretic peptide receptor A/guanylate cyclase A(atrionatriuretic peptide receptor A))
  306   A7760N   M62324   MRF   调节子的识别因子I(modulator recognition factor I)
307 B9970 H00903 KIAA0640   人mRNA;cDNA DKFZp586E0724(来自克隆DKFZp586E0724)(Homo sapiens mRNA;cDNADKFZp586E0724(from clone DKFZp586E0724))
  308   A4238   AI089249   HK3   己糖激酶3(白细胞)(hexokinase 3(white cell))
309 C3772 AW237266 ASAH   N-酰基鞘氨醇氨基水解酶(酸性神经酰胺酶)(N-acylsphingosine amidohydrolase(acid ceramidase))
310 A4709 U62015 CYR61   富含半胱氨酸,血管生成诱导物,61(cysteine-rich,angiogenic inducer,61)
311 B4288 AI078144   HNOEL-iso HNOEL-iso蛋白(HNOEL-iso proteib)
312 A6266 AA830322 LMO2   LIM domain only 2(rhombotin-样1)(LIM domainonly 2(rhombotin-like 1))
313 A7233 AA742701 LCP1   淋巴细胞胞质蛋白1(L-plastin)(lymphocytecytosolic protein 1(L-plastin))
314 B8141 AA431105   人cDNA:FLJ21310 fis,克隆COL02160(Homosapiens cDNA:FLJ21310 fis,clone COL02160)
  315   A3200N   AA419374   COL5A1   胶原蛋白,V型,α1(collagen,type V,alpha 1)
  316   C0922   AA136856   ESTs
  317   C0787   AA448082   ESTs
318 A4660 M20681 SLC2A3   溶质载体家族2(易化的葡萄糖转运蛋白),成员3(solute carrier family 2(facilitated glucosetransporter),member 3)
  319   A5487   AA256347   KIAA1075   KIAA1075蛋白
  320   A0597   X79683   LAMB2   层粘连蛋白,β2(层粘连蛋白S)
321 A3790 X76104 DAPK1   死亡-相关蛋白激酶1(death-associated protein kinase1)
322 A1496 U03688 CYP1B1   细胞色素p450,亚家族I(二噁英可诱导的),多肽1(青光眼3,新生儿)(cytochrome P450,subfamily I(dioxin-inducible),polypeptide 1(glaucoma 3,primaryinfantile))
323 C9716 C17007   ESTs,高度近似于C1QC_人补体C1Q子复合体,C链前体[人](ESTs,Highly similar toC1QC_HUMAN COMPLEMENT C1QSUBCOMPONENT,C CHAIN PRECURSO[H.sapiens])
  324   D8527   J03037   CA2   碳酸酐酶II(carbonic anhydrase II)
325 B2696 AA847136 CSF2RB   集落刺激因子2受体,β,低-亲合力(粒性白细胞-巨噬细胞)(Colony stimulating factor 2receptor,beta,low-affinity(granulocyte-macrophage))
326 D8609 AI052435  ESTs,略微近似于二乙基溴乙酰胺-停止蛋白[小家鼠](ESTs,Weakly similar to neuronal-Stopprotein[M.musculus])
  327   E0896   AI141649   NID  巢蛋白(enactin)(nidogen(enactin))
  328   D7108   AI005420  ESTs
329 A0055N AF058925 JAK2  Janus激酶2(一种蛋白酪氨酸激酶)(Janus kinase 2(a protein tyrosine kinase))
330 A3613 U20157 PLA2G7  磷脂酶A2,VII群(血小板活化因子乙酰水解酶,血浆)(phospholipase A2,group VII(platelet-activatingfactor acetylhydrolase,plasma))
  331   A1879   AF016004   GPM6B  糖蛋白M6B
332 A0711 AF068836 PSCDBP  普列克底物蛋白同源物,Sec7及卷曲/螺旋型结构域,结合蛋白(pleckstrin homology,Sec7andcoiled/coil domains,binding protein)
333 B9198 AA609519 MSRA  甲硫氨酸亚砜还原酶A(methionine sulfoxidereductase A)
  334   A9346N   AA317645   PP2135  PP2135蛋白
  335   B7497   AA687507  ESTs
336 B5284 AA452079  来自染色体X上的克隆RP11-524D16的人DNA序列;含有ESTs、STSs和GSSs;含有一种含sushi-重复单元蛋白的SRPX基因的3′端部分和一种对应于两个蛋白同种型的新基因,这两个蛋白同种型类似于小鼠granuphilin a和b(Human DNA sequencefrom clone RP11-524D16 on chromosome X.ContainsESTs,STSs and GSSs.Contains the 3′part of theSRPX gene for a sushi-repeat containing protein and anovel gene for two protein isoforms similar to mousegranuphilin a und b)
  337   A2471   J03578   ANXA6  膜联蛋白A6(annexin A6)
338 C4068 AF005668 PFC  备解素P因子,补体(properdin P factor,complement)
  339   A0968   M74718   TCF4   转录因子4
  340   B8090   AA152211   KIAA1538   KIAA1538蛋白
341 A2257N AA625532 DDR2   discoidin结构域受体家族,成员2(discoidin domainreceptor family,member 2)
342 A1780N AA449181 ENPP2   外核苷酸焦磷酸酶/磷酸二酯酶2(自趋化素)(ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2(autotaxin))
  343   A1859N   AA418167   GATA3   GATA-结合蛋白3(GATA-binding protein 3)
  344   C3778   BF060779   MSTP032   MSTP032蛋白
345 A0654 M15800 MAL   mal,T细胞分化蛋白(mal,T-cell differentiationprotein)
  346   B4400   AI299106   KIAA1500   KIAA1500蛋白
  347   B5172N   AI288487   CLIC2   氯化物胞内通道2(chloride intracellular channel 2)
  348   A0745   L19871   ATF3   活化转录因子3(activating transcription factor 3)
349 A7672 U20982 IGFBP4   胰岛素-样生长因子-结合蛋白4(insulin-like growthfactor-binding protein 4)
350 B1056N AA757029 DF   补体的D成分(脂肪酶)(D component of complement(adipsin))
351 A1397N M60484 PPP2CB   蛋白磷酸酶2(此前为2A),催化亚单位,β同种型(protein  phosphatase  2(formerly  2A),catalyticsubunit,beta isoform)
  352   C8146   X53331   MGP   基质Gla蛋白(matrix Gla protein)
353 A0582 X69819 ICAM3   细胞间粘附分子3(intercellular adhesion molecule3)
354 A2074 K01396   SERPINA1   丝氨酸(或半胱氨酸)蛋白酶抑制因子,进化枝A(α抗蛋白酶,α抗胰蛋白酶),成员1
355 A1092 M57230 IL6ST   白细胞介素6信号转导蛋白(gp130,制瘤素M受体)(interleukin 6signal transducer(gp130,oncostatin Mreceptor))
  356   A4819   D17408   CNN1   calponin 1,碱性,平滑肌(calponin 1,basic,smooth
  muscle)
357 A6251 M25460 IFNB1   干扰素,β1,成纤维细胞(interferon,beta 1,fibroblast)
  358   C4126   U55766   HRB2   HIV rev结合蛋白2(HIV rev binding protein 2)
359 B8113 AA263000 RNAE6   核糖核酸酶,RNAe家族A,k6(ribonuclease,RNAeA family,k6)
  360   B0297   AA775440   KIAA0909   KIAA0909蛋白
361 B7624 AA434557 LNK 淋巴细胞衔接子蛋白(lymphocyte adaptor protein)
  362   B9647   AA688025   ESTs
363 B4246 AA479071   人克隆24877mRNA序列(Homo sapiens clone 24877mRNA sequence)
  364   B5399   N36581   D2S448   黑色素瘤相关基因(Melanoma associated gene)
365 B7723 AI140597 LIFR 白血病抑制因子受体(leukemia inhibitory factorreceptor)
366 A6595N AA775497 KIAA1095   人mRNA;cDNA DKFZp564J0923(来自克隆DKFZp564J0923)(Homo sapiens mRNA;cDNADKFZp564J0923(from clone DKFZp564J0923))
367 B7465 AI197941   人 mRNA;cDNA DKFZp761K2024(来自克隆DKFZp761K2024)(Homo sapiens mRNA;cDNADKFZp761K2024(from clone DKFZp761K2024))
  368   C8947   AA805687   ESTs
  369   C8186   AA059489   RGC32   RGC32蛋白
  370   C1622   AA807551   ESTs
  371   C1422   AA095034   GK001   GK001蛋白
372 C4105 AA494120 ENPP4   ectonucleotide焦磷酸酶/磷酸二酯酶4(推定的功能)(ectorucleotidepyrophosphatase/phosphodiesterase 4(putativefunction))
373 C9836 AA157832 KIAA4844   人cDNA:FLJ22841fis,克隆KAIA4844(Homosapiens cDNA:FLJ22841fis,clone KAIA4844)
 374   D9444   AI367157   ESTs
 375   D9939   AI079987   ESTs
376 A4385N X59770 IL1R2   白细胞介素1受体,II型(interleukin 1 receptor,typeII)
377 B7869N R42449 FLJ10357   不确定蛋白FLJ10357(hypothetical proteinFLJ10357)
 378   B9611   AA427796   KIAA1754   ESTs
379 B5396 AA446322 FLJ11240   不确定蛋白FLJ11240(hypothetical proteinFLJ11240)
380 D0735 AA740582 ARL5   ADP-核糖基化因子-样5(ADP-ribosylationfactor-like 5)
381 A1032 M87790 IGL@ 免疫球蛋白λ基因座(immunoglobulin lambdalocus)
 382   A2530   J02611   APOD   脱脂蛋白D(apolipoprotein D)
383 A4655N L77864 APBB1   淀粉样蛋白β(A4)前体蛋白结合型,家族杆菌,成员1(fe65)(amyloid  beta  (A4)precursorprotein-binding,family B,member 1(Fe65))
384 C0475 U57961   13CDNA7 推定的基因产物(putative gene product)
385 A9282 AA889218 OGN   osteoglycin(骨诱导因子,mimecan)(osteoglycin(osteoinductive factor,mimecan))
 386   B1451N   AI057161   ESTs
387 C7773 AI300074   ESTs,略微近似于S43506不确定蛋白-大鼠[大家鼠](ESTs,Weakly similar to S43506hypotheticalprotein-rat[R.norvegicus])
 388   B3063   T91708   MD   MD,RP105-相关(MD,RP105-associated)
389 A3903 AF026692 SFRP4   分泌的卷曲-相关蛋白4(secreted frizzled-relatedprotein 4)
390 B8377 N50822 ESTs
391 A5720 AI218225 SPON1   spondin 1,(f-spondin)细胞外基质蛋白(spondin 1,(f-spondin)extracellular matrix protein)
392 B7274 AA777360 KIAA1002 ESTs
  393   A0765   M77477   ALDH3   醛脱氢酶3(aldehyde dehydrogenase 3)
  394   A3563   L10333   RTN1   reticulon 1
395 B6062 AA773223 SLC16A3   溶质载体家族16(一元羧酸转运物),成员3(solutecarrier family 16(monocarboxylic acid transporters),member 3)
  396   C8044   AA987624   EGR3   早期生长反应3(early growth response 3)
397 B8707 AA173755 ROBO1   roundabout(轴突引导受体,果蝇)同源物1(roundabout(axon guidance receptor,Drosophila)homolog 1)
398 C7370 AA961425 EOMES   同源物3(爪蟾)(Eomesodermin homolog(Xenopusaevis))
  399   D4501   AA521117   ESTs
400 A1750 D31716 BTEB1   碱性转录元件结合蛋白1(basic transcription elementbinding protein 1)
401 A1522 U28369 SEMA3B   sema结构域,免疫球蛋白结构域(免疫球蛋白),短的基础结构域,分泌型,(semaphorin)3B(semadomain,immunoglobulin domain (Ig),short basicdomain,secreted,(semaphorin)3B)
402 A8482 R79064   ESTs,略微近似于推定的III型乙醇脱氢酶[黑腹果蝇](ESTs,Weakly similar to putative type IIIalcohol dehydrogenase[D.melanogaster])
  403   B9053   AA446948   KIAA0941   KIAA0941蛋白(KIAA0941protein)
404 B4643 AI332375 FSTL3   follistatin-样3(分泌糖蛋白)(follistatin-like 3(secreted glycoprotein))
  405   C0825   D61466   ESTs
406 C3648 W79423   人mRNA;cDNA DKFZp586P1622(来自克隆DKFZp586P1622)(Homo sapiens  mRNA;cDNADKFZp586P1622(from clone DKFZp586P1622))
  407   D4020   AA858162   人cDNAFLJ13005fis,克隆NT2RP3000441,略微
  近似于T细胞识别的人鳞状细胞癌抗原(SART-2)的mRNA(Homo sapiens cDNA FLJ13005fis,cloneNT2RP3000441,weakly similar to Homo sapienssquamous cell carcinoma antigen recognized by T cell(SART-2)mRNA)
  408   E1621   AL117515   PLCE2   磷脂酶C,ε2(phospholipase C,epsilon 2)
  409   A5442   AI290876   KLF4   Kruppel-样因子4(肠)(Kruppel-like factor 4(gut))
  410   A9482   AI160184   LOC51673   脑特异性蛋白(bram specific protein)
411 A3867 AF013249 LAIR1   白细胞-相关免疫球蛋白-样受体1(leukocyte-associated Ig-like receptor 1)
412 A1510 U16306 CSPG2   硫酸软骨素蛋白多糖2(多功能蛋白聚糖)(chondroitin sulfate proteoglycan 2(versican))
413 B9132 AA455877   人cDNA FLJ 11177 fis,克隆PLACE1007402(Homosapiens cDNA FLJ11177 fis,clone PLACE1007402)
414 A2291 AF003341 ALDH1   醛脱氢酶1,可溶解的(aldehyde dehydrogenase 1,soluble)
  415   A1010   X83378   CLCN6   氯化物通道6(chloride channel 6)
416 B8379 D25869   DKFZP434I1735 DKFZP434I1735蛋白
  417   B6622   AA369905   ESTs
418 C8388 N92299 FLJ21939   类似于5-氮胞苷诱导基因2的不确定蛋白flj21939(hypothetical protein FLJ21939 similar to5-azacytidine induced gene 2)
419 C4116 AA242923 DXS9928E   染色体X(独特的)9928表达序列上的DNA片段(DNA segment on chromosome X(unique)9928expressed sequence)
420 B8203 D81610 FLJ11109   不确定蛋白FLJ11109(hypothetical  proteinFLJ11109)
421 A1431 L43821 HEF1   成丝作用1的增强子(cas-样停靠;crk-结合底物相关)(enhancer of filamentation 1(cas-like docking;Crk-associated substrate related))
  422   B5949   AA678263   BIN2   桥联整合蛋白2(bridging integrator 2)
423 C7886 AI270402 INHBA   抑制素,βA(活化素A,活化素ABα多肽)(inhibin,beta A(activin A,activin AB alpha polypeptide))
424 A1405 L01042 TMF1   TATA元件调节因子1(TATA element modulatoryfactor 1)
  425   B3940   W45244   C3   补体成分3(complement component 3)
  426   A1387   D86479   AEBP1   AE-结合蛋白1(AE-binding protein 1)
427 A1748 U29089 PRELP   富含脯氨酸精氨酸富含末端亮氨酸重复蛋白(proline arginine-rich end leucine-rich repeat protein)
  428   A3054   U01839   FY   Duffy血型(Duffy blood group)
429 A2039N AA843756 ID2   DNA结合蛋白2的抑制因子,显性性状阴性的螺旋-环-螺旋蛋白(inhibitor of DNA binding 2,dominantnegative helix-loop-helix protei)
430 B6319 AA328385 ICSBPl   干扰素共有序列结合蛋白1(consensus sequencebindingprotein 1)
431 B4364 AI305201 VRL   辣椒素受体-样蛋白1(vanilloid receptor-like protein1)
432 B4638 AI122867   人cDNA FLJ 12666 fis,克隆NT2RM4002256(Homosapiens cDNA FLJ12666 fis,clone NT2RM4002256)
433 D9799 AI074177 C1QA   补体成分1,q亚成分,α多肽(complement component1,q subcomponent,alpha polypeptide)
434 A2523 D21238 GLRX   谷氧还蛋(巯基转移酶)(glutaredoxin(thioltransferase))
  435   A5449   U90654   LMO7   LIM domain only 7(LIM domain only 7)
436 A3409 L77564 STK22B   丝氨酸/苏氨酸激酶22b(精子形成相关)(serine/threonine kinase 22B(spermiogenesisassociated))
437 A0174 M37435 CSF1   集落刺激因子1(巨噬细胞)(colony stimulating factor1(macrophage))
  438   B2439   U04735   STCH   应激70蛋白伴侣,微粒体-相关,60kD(stress 70
  protein chaperone,microsome-associated,60kD)
439 B5470 AA876372   FSTs,略微近似于ALU1_人ALU亚家族J序列污染警告条目[人](ESTs,Weakly similar toALU1_HUMAN ALU SUBFAMILY J SEQUENCECONTAMINATION WARNING ENTRY[H.sapiens])
 440   B4864   X16665   HOXB2   同源框B2(homeo box B2)
441 B5800 AA233243 BM046   非典型的骨髓蛋白BM046(uncharacterized bonemarrow protein BM046)
442 C4170 AB007884 ARHGEF9   Cdc42鸟嘌呤交换因子(GEF)9(Cdc42 guanineexchange factor(GEF)9)
443 A5504N AF052178   人cDNA:FLJ21897fis,克隆HEP03447,高度近似于af052178人克隆24523的mRNA序列(Homosapiens cDNA:FLJ21897fis,clone HEP03447,highlysimilar to AF052178Homo sapiens clone 24523mRNA sequence)
444 B4574 AI042204 FLJ12895   不确定蛋白FLJ12895(hypothetical proteinFLJ12895)
445 B6998 AA401227 SEC31B-1   分泌型的通道成分Sec31B-1(Secretory pathwaycomponent Sec31B-1)
446 B9299 N53090   人mRNA;cDNA DKFZp434I0835(来自克隆DKFZp434I0835)(Homo sapiens mRNA;cDNADKFZp434I0835(from clone DKFZp434I0835))
 447   A3538   J03464   COL1A2   胶原蛋白,I型,α2(collagen,type I,alpha 2)
 448   A8508N   AA977227   NET-6   tetraspan NET-6蛋白(tetraspan NET-6protein)
449 A1887N W76477 JUN   v-jun鸟类肉瘤病毒17致癌基因同源物(v-jun aviansarcoma virus 17 oncogene homolog)
450 B5459 AA666119   ESTs,高度近似于GBP1人干扰素诱导的鸟苷酸-结合型蛋白1[人](ESTs,Highly similar toGBP1_HUMAN INTERFERON-INDUCEDGUANYLATE-BINDING PROTEIN 1[H.sapiens])
  451   B4646   AI245038   GLS   谷氨酰胺酶(glutaminase)
452 C3799 BE873804   人mRNA;cDNA DKFZp564F053(来自克隆DKFZp564F053)(Homo sapiens mRNA;cDNADKFZp564F053(from clone DKFZp564F053))
453 C8119 D87258 PRSS11 蛋白酶,丝氨酸,11(IGF结合)(protease,serine,11(IGF binding))
454 D8494 D16294 ACAA2   乙酰辅酶A酰基转移酶2(线粒体3-噁酰基-辅酶A硫解酶)(acetyl-Coenzyme A acyltransferase 2(mitochondrial 3-oxoacyl-Coenzyme A thiolase))
455 E1456 AB040951 FLJ20004   不确定蛋白FLJ20004(hypothetical proteinFLJ20004)
456 B2119 M33552 LSP1   淋巴细胞-特异性蛋白1(lymphocyte-specific protein1)
457 B0979 AI361053 ESTs
458 A4702 U53445 DOC1   卵巢癌1中表达下调(downregulated in ovarian cancer1)
  459   D0737   AA885279   ESTs
460 A0753 L10918 CCR1   趋化因子(C-C键基序)受体1(chemokine(C-Cmotif)receptor 1)
461 A3977 AF069736 PAF65B   PCAF 相关因子65β(PCAF associated factor 65beta)
462 A2839 M36284 GYPC   血型糖蛋白C(Gerbich血型)(glycophorin C(Gerbichblood group))
  463   A2019N   AA442410   EMP1   上皮膜蛋白1(epithelial membrane protein 1)
464 A3203 M64925 MPP1   膜蛋白,棕榈酰化1(55kD)(membrane protein,palmitoylated 1(55kD))
465 A0539 U23946 RBM5   RNA结合基序蛋白8b 5(RNA binding motif protein5)
  466   A5899   D61837   KIAA1109   KIAA1109蛋白(KIAA1109 protein)
  467   A3119   J04621   SDC2   多配体蛋白聚糖2(硫酸乙酰肝素蛋白聚糖1,细胞
 表面-结合,纤维蛋白聚糖)(syndecan 2(heparansulfate proteoglycan 1,cell surface-associated,fibroglycan))
468 A3745 X16155 NR2F1  核受体亚家族2,C群,成员1(nuclear receptorsubfamily 2,group F,member 1)
469 A7016 U82108 SLC9A3R2  溶质载体家族9(钠/氢交换蛋白),同种型3调节因子2(solute carrier family 9(sodium/hydrogenexchanger),isoform 3 regulatory factor 2)
470 B2609 N42862 KIAA1434  不确定蛋白FLJ11085(hypothetical  proteinFLJ11085)
471 B1966 AA933908 ROCK1  Rho-相关的,含卷曲-螺旋的蛋白激酶1(Rho-associated,coiled-coil containing protein kinase1)
472 A2214N L37080 FMO5  含有核黄素的单加氧酶5(flavin containingmonooxygenase 5)
473 D4128 W37848 ARTS  1型肿瘤坏死因子受体脱落型氨肽酶调节因子(type1 tumor necrosis factor receptor sheddingaminopeptidase regulator)
  474   A7678   U32331   RIG  在神经胶质瘤中受到调控(regulated in glioma)
475 B5489 AI278652 APlS2  衔接子-相关蛋白集合体1,σ2亚单位(adaptor-related protein complex 1,sigma 2subunit)
476 A0563 X58288 PTPRM  蛋白酪氨酸磷酸酶,受体型,M(protein tyrosinephosphatase,receptor type,M)
477 A4641 J02854 MYRL2  肌球蛋白调节的轻链2,平滑肌同种型(myosinregulatory light chain 2,smooth muscle isoform)
478 B6764 AA313118 DUSP10  双重特异性磷酸酶10(dual specificity phosphatase10)
479 A6780 M63262 ALOX5AP  花生四烯酸盐5-脂肪氧合酶-活化蛋白(arachidonate5-lipoxygenase-activating protein)
480 A3161N M92843 ZFP36  与小鼠Zfp-36同源的锌指蛋白(zinc finger proteinhomologous to Zfp-36 in mouse)
 481   B5367   AA151153   DPT   dermatopontin
482 A6156 AA587167 ARHE   ras同源物基因家族,成员E(ras homolog genefamily,member E)
 483   A0127   L24158   ITGA9   整联蛋白,α9(integrin,alpha 9)
 484   B1524   AI126293   ESTs
485 A6781 M69199 G0S2   推定的淋巴细胞G0/G1开关基因(putative1ymphocyte G0/G1 switch gene)
486 B8775 AA588212 FLJ10128   带有卷曲螺旋结构域和锚蛋白重复单元的uveal自身抗原(uyeal autoantigen with coiled coil domainsand ankyrin repeats)
487 A0300 U43142 VEGFC   血管内皮生长因子C(vascular endothelial growthfactor C)
488 A6530 AI089584 ADAMTS1   去整联蛋白-样且带有血小板反应蛋白型1基序的金属蛋白酶(reprolysin型)(a disintegrin-like andmetalloprotease(reprolysin type)with thrombospondintype 1motif,1)
489 A0971 D83407 ZAKI4   Down综合症关键区域基因1-样1(Down syndromecritical region gene 1-like 1)
490 D4142 N93781 TAX1BP1   Tax1(人T细胞白血病毒I型)结合蛋白1(Taxl(human T-cell leukemia virus type I)binding protein 1)
491 A1485N S69790 WASF3   WAS蛋白家族,成员3(WAS protein family,member 3)
 492   B8036   R20340   ESTs
 493   C9718   W94051   ESTs
494 E0872 AK025627   人cDNA:FLJ21974 fis,克隆HEP05861(Homosapiens cDNA:FLJ21974 fis,clone HEP05861)
 495   B0243   R76379   LOC51316   不确定蛋白(hypothetical protein)
 496   A1981   U58514   CHI3L2   壳多糖酶3-样2(chitinase 3-like 2)
 497   A2158   Z11793   SEPP1   含硒蛋白P,血浆,1(selenoprotein P,plasma,1)
 498   A0975   M14333   FYN   与SRC、FGR、YES相关的FYN癌基因(FYN
  oncogene related to SRC,FGR,YES)
499 B4849 W74368   人cDNA:FLJ23324 fis,克隆HEP12482,高度近似于HUMMYOHCB人非肌肉肌球蛋白重链-B(MYH10)mRNA(Homo sapiens cDNA:FLJ23324fis,clone HEP 12482,highly similar  toHUMMYOHCB Human nonmuscle myosin heavychain-B(MYH10)mRNA)
500 A7640 AA147751   人cDNA FLJ14146fis,克隆MAMMA1002947(Homo sapiens cDNA FLJ14146fis,clone MAMMA 1002947)
  501  C0830   AA012832   ESTs
502 C6974 AA679312 HIBCH   3-羟异丁酰基-辅酶A水解酶(3-hydroxyisobutyryl-Coenzyme A hydrolase)
  503  E0289   AI224952   ESTs
  504  B4750   AA769424   VNN2   vanin 2
  505  A3334   M90696   CTSS   组织蛋白酶S(cathepsin S)
506 B1676 AJ001563 IGHG3   免疫球蛋白重链γ3恒定区(G3m标记)(immunoglobulin heavy constant gamma 3(G3mmarker))
507 C7731 AI142828   人adlican mRNA,完整cds(Homo sapiens adlicanmRNA,complete cds)
  508  C4700   AA099820   ESTs
509 D0533 AA234500   ARHGEF12   Rho鸟嘌呤交换因子(GEF)12(Rho guanineexchange factor(GEF)12)
  510  A4744   AF020202   UNC13   UNC13(C.elegans)-样(UNC13(C.elegans)-like)
511 A1154 M62401 CYP27A1   细胞色素P450,亚家族XXVIIA(类固醇27-羟化酶,脑腱性黄色瘤),多肽1(cytochrome P450,subfamilyXXVIIA(steroid 27-hydroxylase,cerebrotendinousxanthomatosis),polypeptide 1)
  512  A2292   X16832   CTSH   组织蛋白酶H(cathepsin H)
513 A1825 X76775 HLA-DMA 主要组织相容性复合体,II类,DMα(majorhistocompatibility complex,class II,DM alpha)
514 A3841 AF000984 DBY   DEAD/H(Asp-Glu-Ala-Asp/His)框多肽,Y染色体(DEAD/H(Asp-Glu-Ala-Asp/His)box polypeptide,Ychromosome)
515 A4645 L13852 UBE1L   泛素-激活酶E1-样(ubiquitin-activating enzymeE1-like)
516 A9003 W39638 FLJ10856   不确定蛋白FLJ10856(hypothetical  proteinFLJ10856)
517 A7239 AA523541 GILZ   糖皮质激素-诱导的亮氨基酸拉链结构(glucocorticoid-induced leucine zipper)
  518   A3308N   L23823   ITGB7   整联蛋白β7亚单位(integrin beta 7subunit)
519 B8437 Z20328 DKFZp434C0328 不确定蛋白DKFZp434C0328(hypothetical proteinDKFZp434C0328)
520 B4481 AA857089   DKFZP566G1424   不确定蛋白DKFZp566G1424(hypothetical proteinDKFZp566G1424)
  521   B6014N   H09503   KIAA0740   KIAA0740基因产物(KIAA0740 gene product)
  522   B6825   AI290349   C5   补体成分5(complement component 5)
  523   B9233   AA211909   ESTs
  524   B5381N   D42047   KIAA0089   KIAA0089蛋白(KIAA0089protein)
525 B7003N AF045584 POV1   非小细胞肺癌症过表达基因1(prostate canceroverexpressed gene 1)
526 C8356 AI265858   人克隆23574mRNA序列(Human clone 23574mRNA sequence)
  527   C4596   AI344470   ESTs
  528   C6906   AA346311   RAI3   视黄酸诱导3(retinoic acid induced 3)
529 C8023 M81141   HLA-DQB1   主要组织相容性复合体,II类,DQβ1(majorhistocompatibility complex,class II,DQ beta 1)
530 D2661 AA894447   人BAC克隆GS1-99H8(Human BAC cloneGS1-99H8)
  531   B7659   AB007924   KIAA0455   KIAA0455基因产物(KlAA0455 gene product)
  532   A6593   AI160213   ANGPTL2   血管生成因子-样2(Angiopoietin-like 2)
533 B7526 R40594   人cDNA:FLJ22845 fis,克隆KAIA5195(Homosapiens cDNA:FLJ22845 fis,clone KAIA5195)
534 B7796 N52157   人mRNA;cDNA DKFZp762O1615(来自克隆DKFZp762O1615)(Homo sapiens mRNA;cDNADKFZp762O1615(from clone DKFZp762O1615))
  535   A8525   W67837   AHSG   α-2-HS-糖蛋白(alpha-2-HS-glycoprotein)
  536   E0537   AW276358   DPYSL2   二氢嘧啶酶-样2(dihydropyrimidinase-like 2)
  537   A4254   AI140851   COL6A1   胶原蛋白,VI型,α1(collagen,type VI,alpha 1)
538 A0941 S59049 RGS1   G-蛋白信号1的调节因子(regulator of G-proteinsignalling 1)
539 A2122 AB003476 AKAP12   一种激酶(PRKA)锚定蛋白(gravin)12(A kinase(PRKA)anchor protein(gravin)12)
540 A9501 AA279817 GADD45B   生长抑止和DNA-损害-诱导,β(growth arrest andDNA-damage-inducible,beta)
541 B8782 U97067 CTNNAL1 连环蛋白(钙粘着蛋白-相关蛋白),α-样1(catenm(cadherin-associated protein),alpha-like 1)
542 B9769 AA156269   人mRNA;cDNA DKFZp434E2321(来自克隆DKFZp434E2321);部分cds(Homo sapiens mRNA;cDNA DKFZp434E2321(from cloneDKFZp434E2321);partial cds)
  543   A1567   U70824   BLu   BLu蛋白()BLu protein
544 A2444 AF002672   LOH11CR2A   杂合性损失,11,染色体区域2,基因A(loss ofheterozygosity,11,chromosomal region 2,gene A)
  545   B9317   N35421   ESTs
  546   A5086N   AA402615   SELPLG   选择蛋白P配体(selectin P ligand)
  547   C6059   AA699359   ESTs
  548   A0399   M20496   CTSL   组织蛋白酶L(cathepsin L)
  549   A0325   X03663   CSF1R   集落刺激因子1受体,此前为McDonough猫的肉瘤
  病毒的(v-fms)癌基因同源物(colony stimulatingfactor 1 receptor,formerly McDonough feline sarcomaviral(v-fms)oncogene homolog)
550 A0131 L34155 LAMA3   层粘连蛋白,α3(nicein(150kd),缰蛋白(165kd),BM600(150kd),epilegrin(laminin,alpha 3(nicein(150kD),kalinin(165kD),BM600(150kD),epilegrin))
551 A8879N AA583491 HCA112   肝细胞癌-相关抗原112(hepatocellularcarcinoma-associated antigen 112)
552 E0691 AL021917 BTN2A3   嗜乳脂蛋白,亚家族2,成员A3(butyrophilin,subfamily 2,member A3)
553 A1051 M33195 FCER1G   IgE的Fc片段,高亲合力I,受体;γ多肽(Fc fragmentof IgE,high affinity I,receptor for;gammapolypeptide)
554 A9090 AI306435   DKFZP586A0522 DKFZP586A0522蛋白(DKFZP586A0522protein)
555 A1471N AL021026   来自染色体1q23-25上的PAC 127D3的人DNA序列含有编码含核黄素单加氧酶2及含核黄素单加氧酶3的FMO2和FMO33基因(二甲苯胺单加氧酶(氮-氧化物3,EC1.14.13.8,二甲苯胺氧化酶3,FMO(Homo sapiens DNA sequence from PAC 127D3on chromosome 1q23-25.Contains FMO2 and FMO3genes for Flavin-containing Monooxygenase 2 andFlavin-containing Monooxygenase 3(DimethylanilineMonooxygenase (N-Oxide 3,EC1.14.13.8,Dimethylaniline Oxidase 3,FMO)
556 B2937 AA416820 H2AFZ   H2A组蛋白家族,成员Z(H2A histone family,member Z)
557 A1125 J04127 CYP19   细胞色素p450,XIX亚家族(芳构化的雄激素)(cytochrome P450,subfamily XIX(aromatizationof androgens))
 558   A6380   T28620   FGB   纤维蛋白原,Bβ多肽(fibrinogen,B beta polypeptide)
 559   A4970   AF062075   LPXN   leupaxin
560 C9579 N42267   人cDNA:FLJ22554 fis,克隆HSI01092(Homosapiens cDNA:FLJ22554 fis,clone HSI01092)
561 C7036 U59289 CDH13   钙粘着蛋白13,H-钙粘着蛋白(心)(cadherin 13,H-cadherin(heart))
562 A9308 AA452780   GENX-3414 genethonin 1
563 A2638 U20158 LCP2   淋巴细胞胞质蛋白2(含有SH2结构域的白细胞76kD蛋白)(ymphocyte cytosolic protein 2(SH2domain-containing leukocyte protein of 76kD))
564 C9620 AI092721   人cDNA FLJ11896 fis,克隆HEMBA1007319(Homo sapiens cDNA FLJ11896fis,cloneHEMBA1007319)
565 A5868 AA418061 SLC11A3   溶质载体家族11(质子-偶联的二价金属离子转运物),成员3(solute carrier family 11(proton-coupleddivalent metal ion transporters),member 3)
 566   A5900   AI091372   AXUD1   AXIN1上调的(AXIN1 up-regulated)
567 A1453 M37721 PAM   肽基甘氨酸α-酰胺化单加氧酶(peptidylglycinealpha-amidating monooxygenase)
568 A9514 Z39135   人cDNA:FLJ22735 fis,克隆HUV00180(Homosapiens cDNA:FLJ22735 fis,clone HUV00180
569 B9504 AA521163   人cDNA:FLJ21333 fis,克隆COL02535(Homosapiens cDNA:FLJ21333 fis,clone COL02535)
570 B8028 AA701478   人cDNA:FLJ23332 fis,克隆HEP 12754(Homosapiens cDNA:FLJ23332 fis,clone HEP12754)
 571   D0786   AB011115   KIAA0543   KIAA0543蛋白
572 B7289N AA379112 SBBI42   BCM-样膜蛋白前体(BCM-like membrane proteinprecursor)
 573   A4367   AF020043   CSPG6   硫酸软骨素蛋白聚糖6(bamacan)(chondroitin
  sulfate proteoglycan 6(bamacan))
574 A3150 M97370   ADORA2A 腺苷A2a受体(adenosine A2a receptor)
  575   A5253   AA261780   ESTs
  576   B4938   W56507   KIAA0251   KIAA0251蛋白(KIAA0251 protein)
577 A9295 AI266286   ESTs,略微近似于IRX2_HUMANIROQUOIS-CLASS HOMEODOMAIN PROTEINIRX-2[人](ESTs,Weakly similar toIRX2_HUMAN IROQUOIS-CLASSHOMECODOMAIN PROTEIN IRX-2[H.sapiens])
  578   A6532   AA449335   ESTs
  579   A4597   U97519   PODXL   足细胞特异性标志蛋白-样(podocalyxin-like)
B4053 K03191 CYP1A1   细胞色素p450,亚家族I(芳香族化合物-可诱导的),多肽1(cytochrome P450,subfamily I(aromaticcompound-inducible),polypeptide 1)
581 B5138 AI364974 FCN3 ficolin(胶原蛋白/含有纤维蛋白原结构域)3(Hakata抗原)(ficolin(collagen/fibrinogen domain-containing)3(Hakata antigen))
582 A6427 AA402425   人cDNA:FLJ22343 fis,克隆HRC06043(Homosapiens cDNA:FLJ22343 fis,clone HRC06043)
  583   A0970   U44403   SLA   Src-样-衔接子(Src-like-adapter)
  584   A4680   U40282   ILK   整联蛋白-连接激酶(integrin-linked kinase)
  585   A5015   U13219   FOXF1   forkhead box F1(forkhead box F1)
586 A4769 AF004562 STXBP1   突触融合蛋白结合蛋白1(syntaxin binding protein1)
587 A0056 AF061836 RASSF1   Ras结合(Ra1GDS/AF-6)结构域家族1(Rasassociation(RalGDS/AF-6)domain family 1)
588 A7051 AA429070 ISLR   含有富亮氨基酸重复单元的免疫球蛋白超家族(immunoglobulin superfamily containing leucine-richrepeat)
 589   A7795   AA508749   UBL3   泛素-样3(ubiquitin-like 3)
 590   A8561   AA699666   Melanophilin
 591   A7764
592 B9056 AI025137 ARHGEF3   Rho鸟苷酸交换因子(GEF)3(Rho guaninenucleotide exchange factor(GEF)3)
 593   B4277   AA147512   STX7   突触融合蛋白7(syntaxin 7)
 594   B6265   AA902739   ESTs
595 A0925N Z69028 PPP2R5B   蛋白磷酸酶2,调节亚基B(B56),β同种型(proteinphosphatase 2,regulatory subunit B(B56),betaisoform)
 596   B3833   AI337078   MacGAP蛋白(MacGAP protein)
 597   B5623   AA505359   MYO1E   肌球蛋白IE(myosin IE)
 598   B7105   AA707941   ESTs
599 B5917N W23481 FLJ20271   不确定蛋白FLJ20271(hypothetical proteinFLJ20271)
600 B5291 AA481924 TYROBP   TYRO蛋白酪氨酸激酶结合蛋白(TYRO proteintyrosine kinase binding protein)
601 C0211 AA306716 FLJ11937   不确定蛋白FLJ11937(hypothetical proteinFLJ11937)
602 A4115 AA290738 GSTM4   谷胱甘肽S-转移酶M4(glutathione S-transferaseM4)
 603   A9993   AB007903   KIAA0443   KIAA0443基因产物(KIAA0443gene product)
 604   D7150   AA909959   NESH   NESH蛋白(NESH protein)
605 B4090 M34175 AP2B1   衔接子-相关蛋白复合体2,β1亚单位(adaptor-related protein complex 2,beta 1 subunit)
606 B4352N T46905   人克隆23649及23755未知的mRNA,部分cds(Homo sapiens clone 23649 and 23755 unknownmRNA,partial cds)
607 A3390 L35240 ENIGMA   enigma(LIM结构域蛋白)(enigma(LIM domainprotein))
608 B4076 AA293636 GJA1   间隙连接蛋白α1,43kD(连接蛋白43)(gapjunctionprotein,alpha 1,43kD(connexin 43))
609 B1535 AI161137   人cDNA:FLJ22743 fis,克隆HUV00901(Homosapiens cDNA:FLJ22743 fis,clone HUV00901)
  610   B8678   AA759306   KIAA1249   KIAA1249蛋白(KIAA1249protein)
  611   A1445   M27492   IL1R1   白细胞介素1受体,II型(interleukin lreceptor,type I)
  612   A6886   W76482   ESTs
613 E0242 AI093526   EST,略微近似于Fcγ受体I[人](EST,Weaklysimilar to Fc gamma receptorI[H.sapiens])
614 A1710 X06985 HMOX1   血红素加氧酶(去环化)1(heme oxygenase(decycling)1)
615 B4278 AI198543   ESTs,高度近似于KIAA1395蛋白[人](ESTs,Highlysimilar to KIAA1395 protein[H.sapiens])
  616   B4497   W88815   LOC57406   脂肪酶蛋白人(lipase protein)
  617   B7559   N98940   ESTs
  618   B5481   AI274152   LOC51762   RAB-8b蛋白(RAB-8b protein)
619 E0721 Z95331 MLLT2   脊髓的/淋巴的或混合-谱系白血病(三空腔蛋白(果蝇)同源物);移位至-,2(myeloid/lymphoid ormixed-lineage leukemia (trithorax (Drosophila)homolog);translocated to,2)
  620   A7301N   W37605   ESTs
  621   C9246   AI348094   KIAA0882   KIAA0882蛋白(KIAA0882protein)
622 B9394 H59903   DJ1057B20.2   不确定蛋白dJ1057B20.2(hypothetical proteindJ1057B20.2)
  623   C6040   H05226   EST
624 E0880 H12644 NFRKB   与KB结合蛋白相关的核因子(nuclear factor relatedto kappa B binding protein)
  625   A2467   AF035752   CAV2   小窝蛋白2(caveolin 2)
626 A6234 M12963 ADH1   乙醇脱氢酶1(I类)α多肽(alcohol dehydrogenase 1(class I),alpha polypeptide)
 627  A2531   V00493   HBA2   血红蛋白,α2(hemoglobin,alpha 2)
 628  C4765   N67091   ESTs
 629  A5084   M86511   CD14   CD14抗原(CD14 antigen)
 630  A4545   M22299   PLS3   网素3(T同种型)(plastin 3(Tisoform))
631 A2534 M21119 LYZ   溶菌酶(肾的淀粉样变性)(lysozyme(renalamyloidosis))
 632  B4633   AA634261   CLIC4   氯化物胞内通道4(chloride intracellular channel 4)
 633  B8081   AA528190   ESTs
 634  C0533   AA760720   SPAG6   精子相关抗原6(sperm associated antigen 6)
635 A0323 X03438 CSF3   集落刺激因子3(粒性白细胞)(colony stimulatingfactor 3(granulocyte))
 636  A8596   AA632025   ESTs
 637  A9093   N80081   ESTs
638 B4285 AA812063   人cDNA FLJ13698 fis,克隆PLACE2000176(Homosapiens cDNA FLJ13698 fis,clone PLACE2000176)
 639  A2363   U03274   BTD   生物素化酶(biotinidase)
640 A2518 M62402 IGFBP6   胰岛素-样生长因子-结合蛋白(insulin-like growthfactor binding protein 6)
641 B0327 AI038322   ESTs,中度近似于KIAA1058蛋白[人](ESTs,Moderately similar to KIAA 1058protein[H.sapiens])
642 B4245 AF052101   人克隆23872mRNA序列(Homo sapiens clone 23872mRNA sequence)
 643  B9433   AA031379   ESTs
 644  B9992   AA191449   KIAA1254   KIAA1254蛋白
645 C8175 X00129 RBP4   视黄醇-结合蛋白4,间质的(retinol-binding protein4,interstitial)
 646  A0890   L11329   DUSP2   双重特异性磷酸酶2(dual specificity phosphatase 2)
647 B4213 X65460 ATP5A1   ATP合成酶,H+转运,线粒体F1复合体,α亚单位,同种型1,心肌(ATP synthase,H+ transporting,
  mitochondrial F1 complex,alpha subunit,isoform 1,cardiae muscle)
  648   B6035N   AA424407   ZFP106   锌指蛋白106(zinc finger protein 106)
  649   A6003   AA678103   FKBP5   FK506-结合蛋白5(FK506-binding protein 5)
  650   A7454   AF007162   CRYAB   晶状体蛋白,αB(crystallin,alpha B)
651 B9457 AA340728 NR2F2   核受体亚家族2,C群,成员(nuclear receptorsubfamily 2,group F,member 2)
  652   B6552   AA678830   KIAA1035   KIAA1035蛋白
653 A2087N X16940 ACTG2   肌动蛋白,γ2,平滑肌,肠的(actin,gamma 2,smooth muscle,enteric)
654 A5785 AA776284 PSMB7   蛋白酶体(prosome,macropain)亚单位,β型,7(Proteasome(prosome,macropain)subunit,beta type,7)
  655   A1891   L13720   GAS6   生长抑止-特异性6(growth arrest-specific 6)
656 A1183 U28833 DSCR1   综合症关键区域基因1(Down syndrome criticalregion gene 1)
657 A0905 M64722 CLU   clusterin(补体溶解抑制因子,SP-40,40,硫酸化糖蛋白2,睾丸激素-阻抑的前列腺信息2,脱脂蛋白J)(clusterin(complement lysis inhibitor,SP-40,40,sulfated glycoprotein 2,testosterone-repressed prostatemessage 2,apolipoprotein J))
  658   A2516   M77016   TMOD   原肌球调节蛋白(tropomodulin)
  659   A6626   AA197086   ESTs
  660   A9357   AA682274   FLJ20093   不确定蛋白FLJ20093
661 B4077 M81635 EPB72   红细胞膜蛋白带7.2(气孔蛋白)(erythrocytemembrane protein band 7.2(stomatin))
662 A9451 AF055066 HLA-A   主要组织相容性复合体,I类,A(majorhistocompatibility complex,class I,A)
663 A8883 N24759 LOC51170   视网膜短链的脱氢酶/还原酶retSDR2(retinalshort-chain dehydrogenase/reductase retSDR2)
664 A8209 AA293061   人cDNA:FLJ21559 fis,克隆COL06406(Homosapiens cDNA:FLJ21559 fis,clone COL06406)
665 A9564 AI1149131 CDKN1C   细胞周期蛋白-依赖性激酶抑制因子1C(p57,Kip2)(cyclin-dependent kinase inhibitor 1C(p57,Kip2))
666 A1490N AI097058   人cDNA:FLJ23538 fis,克隆LNG08010,高度近似于BETA2人MEN1区域克隆ε/βmRNA(Homosapiens cDNA:FLJ23538 fis,clone LNG08010,highlysimilar to BETA2 Human MEN1 region cloneepsilon/beta mRNA)
 667   B9739   X94770   EMP2   上皮膜蛋白2(epithelial membrane protein 2)
668 A8504 AI367368 FACL5   长链脂肪酸辅酶A连接酶5(long-chain fatty acidcoenzyme A ligase 5)
 669   B3883   AA121351   RAI2   视黄酸诱导的2(retinoic acid induced 2)
 670   B4335   D59837   KIAA1565   KIAA1565蛋白
671 A4360N U83461 SLC31A2   溶质载体家族31(铜转运物),成员2(solute carrierfamily 31(coppertransporters),member 2)
 672   B9836   R79561   KIAA1376   KIAA1376蛋白
673 B5151 AI189343   人cDNA FLJ13511 fis,克隆PLACE1005331,高度近似于人7h3蛋白mRNA(Homo sapiens cDNAFLJ13511 fis,clone PLACE1005331,highly similar toHomo sapiens 7h3 protein mRNA)
 674   A6320N   AF070616   HPCAL1   hippocalcin-样1
675 B6752 AA156797   人mRNA;cDNA DKFZp434E109(来自克隆DKFZp434E109)(Homo sapiens mRNA;cDNADKFZp434E109(from clone DKFZp434E109))
676 C8698 AA903358 CGGBP1   CGG三联体重复单元结合蛋白1(CGG tripletrepeat binding protein 1)
 677   E0789   AI969467   ESTs
678 A7498 AA115280 LOC55901   带有血小板反应蛋白组件的跨膜分子的TMTSP(TMTSP for transmembrane molecule withthrombospondin module)
679 E0783 AI146697 MAPK7   有丝分裂原-活化的蛋白激酶(mitogen-activatedprotein kinase 7)
680 A6602 W87690   人cDNA:FLJ23173 fis,克隆LNG10019(Homosapiens cDNA:FLJ23173 fis,clone LNG10019)
  681   A7605   R15801   LOC51299   neuritin
682 A1437N W37188 H2AFL   H2A组蛋白家族,成员L(H2A histone family,member L)
683 B9007 AI203211 ESTs
684 D9915 AI079175   人mRNA;cDNA DKFZp564F053(来自克隆DKFZp564F053)(Homo sapiens mRNA;cDNADKFZp564F053(from clone DKFZp564F053))
  685   B2663   AA953615   ACTC   肌动蛋白,α,心肌(actin,alpha,cardiac muscle)
  686   B7193N   AI261663   ESTs
687 A1622N X75918 NR4A2 核受体亚家族A,成员2(nuclear receptor subfamily 4,group A,member 2)
688 C6826 L02326   人克隆Huλ7λ-样蛋白(IGLL2)基因,部分cds(Homo sapiens clone Hu lambda7 lambda-likeprotein(IGLL2)gene,partial cds)
689 A3739 X14420 COL3A1   胶原蛋白,III型,α1(Ehlers-当洛斯氏综合征IV型,常染色体显性)(collagen,type III,alpha 1(Ehlers-Danlos syndrome type IV,autosomaldominant))
  690   A3297   X01410   TRB@   T细胞受体β基因座(T cell receptorbeta locus)
  691   A7293   N48811   KIAA0786   latrophilin
  692   B8295   AI359344   PCAF   P300/CBP-相关因子(P300/CBP-associated factor)
  693   A2429   M61715   WARS   色氨酰-tRNA合成酶(tryptophanyl-tRNA synthetase)
  694   A9007   AA037452   KIAA0992   palladin
695 B0176N W56480 SOS1   son of sevenless(果蝇)同源物1(son of sevenless(Drosophila)homolog 1)
  696   C7506   AI025678   人克隆25228mRNA序列(Homo sapiens clone 25228
  mRNA sequence)
697 E0498 AK025773   人cDNA:FLJ22120 fis,克隆HEP18874(Homsapiens cDNA:FLJ22120 fis,clone HEP18874)
  698   A7291   AA594600   CTL2   CTL2基因
  699   C8442   AA910738   KIAA0579   KIAA0579蛋白
700 A4472 AF042081 SH3BGRL   SH3结构域结合型富含谷氨酸的蛋白样的(SH3domain binding glutamic acid-rich protein like)
  701   A1669   M95787   TAGLN   transgelin
  702   A8155   T34177   LOC51255   不确定蛋白(hypothetical protein)
703 E0176 AI090671   人cDNA FLJ12057 fis,克隆HEMBB1002068(Homosapiens cDNA FLJ12057 fis,clone HEMBB1002068)
704 A2452 M33146 CSRP1   富含半胱氨酸及甘氨酸的蛋白1(cysteine andglycine-rich protein 1)
  705   A5016   U13220   FOXF2   叉头盒(forkhead box F2)
  706   A8843   AA235920   ESTs
  707   B4092   AB011126   KIAA0554   KIAA0554蛋白
  708   A8493   AA780301   CTSF   组织蛋白酶F(cathepsin F)
709 A9051 AB007934 ACF7   肌动蛋白结合蛋白;macrophin(微丝及肌动蛋白微丝交联蛋白)(actin binding protein;macrophin(microfilament and actin filament cross-linkerprotein))
  710   B9813   AI221110   FLJ10980   不确定蛋白FLJ10980
  711   B7487   AA036947   人cDNA FLJ10229 fis,克隆HEMBB1000136
  712   B9712   AI002977   ESTs
  713   B5430   AA290920   ESTs
714 A2632N D14665 ADAM9   一种去整联蛋白及金属硫蛋白酶结构域9(meltrinγ)(a disintegrin and metalloproteinase domain 9(meltrin gamma))
715 A0225N M93426 PTPRZ1   蛋白酪氨酸磷酸酶,受体-型,Z多肽1(proteintyrosine phosphatase,receptor-type,Z polypeptide 1)
716 A0704N AA156840 MAP3K8   有丝分裂原-活化蛋白激酶激酶激酶8(mitogen-activated protein kinase kinage kinase 8)
  717   A8969   AA039563   KIAA1415   KIAA1415蛋白
  718   B7478   AA443202   KIAA1053   KIAA1053蛋白
  719   A3554   K01160   ESTs
  720   B9536   AI333662   ESTs
721 C9685 AI275584   大鼠富含脯氨酸突触的相关蛋白2的很可能的直向同源物(Likely ortholog of rat proline rich synapseassociated protein 2)
722 C0335 X13839 ACTA2   肌动蛋白,α2平滑肌,主动脉(actin,alpha 2,smoothmuscle,aorta)
723 C4163 AA912674 VE-JAM   血管的内皮连接-相关分子(vascular endotheliajunction-associated molecule)
  724   D7516   AI074524   ESTs
  725   E1492   R27799   BMP6   骨形态发生蛋白6(bone morphogenetic protein 6)
  726   A7782   N44246   PRKCH   蛋白激酶C,eta(protein kinase C,eta)
727 A5154 M55543 GBP2   guanylate结合蛋白2,干扰素-可诱导的(guanylatebinding protein 2,interferon-inducible)
728 C6278 AA641454 SART-2   由T细胞识别的鳞状细胞癌抗原(squamous cellcarcinoma antigen recognized by T cell)
  729   A1693   X94991   ZYX   zyxin
  730   A0808   M58285   HEM1   生血蛋白1(hematopoietic protein 1)
731 A1704N D21254 CDH11   钙粘着蛋白11,型2,OB-钙粘着蛋白(成骨细胞)(cadherin 11,type 2,OB-cadherin(osteoblast))
732 B4614 AI093734 TAZ   带有PDZ-结合基序的翻译共-活化因子(TAZ)(Transcriptional co-activator with PDZ-binding motif(TAZ))
733 B5081N AA419490   人mRNA  全长插入互补DNA  克隆EUROIMAGE248114(Homo sapiens mRNA fulllength insert cDNA clone EUROIMAGE 24811)
734 A0568 X60957 TIE   带有免疫球蛋白及表皮生长因子同源结构域的酪氨酸激酶(tyrosine kinase with immunoglobulin andepidermal growth factorhomology domains)
735 A8796 AA479330 SLC7A7   溶质载体家族7(阳离子的氨基酸转运物,y+系统),成员7(solute carrier family 7(cationic amino acidtransporter,y+ system),member 7)
 736   B9265   AI346969  TRIM14   含有三分基序的14(Tripartite motif-containing 14)
 737   A9013N   D62275  ITM2B   整体蛋白2B(integral membrane protein 2B)
738 B5202N T78873   人cDNA:FLJ22290 fis,克隆HRC04405(Homosapiens cDNA:FLJ22290 fis,clone HRC04405)
739 C8299 AA600814 PTPN9   蛋白酪氨酸磷酸酶,非-受体型,9(protein tyrosinephosphatase,non-receptor type 9)
740 A2926 X96719 CLECSF2   C-型(钙依赖的,碳水化合物-识别结构域)凝集素,超家族成员2(活化-诱导的)(C-type(calciumdependent,carbohydrate-recognition domain)lectin,superfamily member 2(activation-induced))
741 A4681 U02020 PBEF   前-B 细胞集落-增强因子(pre-B-cellcolony-enhancing factor)
 742   A1217   X14454  IRF1   干扰素调节因子1(interferon regulatory factorl)
 743   C4981   X05908  ANXA1   膜联蛋白Al(annexin A1)
744 B0293 AA037349 LAMR1   层粘连蛋白受体1(67kD,核糖体蛋白SA)(lamininreceptor1(67kD,ribosomal protein SA))
 745   A8128   M78933  MY047   MY047蛋白
746 C8090 AF052685 PCDHGC3   proto钙粘素γ亚家族C,3(protocadherin gammasubfamily C,3)
 747   C4610   N66498   EST
 748   B7221N   AA706790   ESTs
749 A6623 R64431 RYBP   RING1及YY1结合蛋白(RING1 and YY1 bindingprotein)
 750   A8823   N26005  PPP1R5   蛋白磷酸酶1,调节的(抑制因子)亚单位5(protein
  phosphatase 1,regulatory(inhibitor)subunit 5)
 751   B3694   AA745720   ESTs
752 A5459 AA393478 NFAT5   活化的T细胞5的核因子,张力-应答性(Nuclearfactor of activated T-cells 5,tonicity-responsive)
753 A6360 W69716   人mRNA;cDNA DKFZp761P06121(来自克隆DKFZp761P06121)(Homo sapiens mRNA;cDNADKFZp761P06121(from clone DKFZp761P06121))
 754   A0944   Z24725   MIG2   有丝分裂原可诱导的2(mitogen inducible 2)
755 A5484 AA634825 PINK1   PTEN诱导的推定的激酶1(PTEN induced putativekinase 1)
756 A2503 S60099 APLP2   淀粉样β(A4)前体-样蛋白2(amyloid beta(A4)precursor-like protein 2)
 757   A0205   M69066   MSN   膜突蛋白(moesin)
 758   A5850   AA282650   SAC1   肌动蛋白1的抑制基因(Suppressor of actin 1)
759 A5423 AA773731   人cDNA:FLJ21028 fis,克隆CAE07155(Homosapiens cDNA:FLJ21028 fis,clone CAE07155)
 760   A2887   M22865   CYB5   细胞色素b-5(cytochrome b-5)
761 A6629 AI366509 HSMNP1   非典型的下丘脑蛋白HSMNP1(uncharacterizedhypothalamus protein HSMNP 1)
762 A4543N AB001636 DDX15   DEAD/H(Asp-Glu-Ala-Asp/His)框多肽15(DEAD/H(Asp-Glu-Ala-Asp/His)box polypeptide15)
763 B5480 AA044842 AHCP   常染色体的高度保守蛋白(Autosomal HighlyConserved Protein)
764 B4084 AA916826 APP   淀粉样β(A4)前体蛋白(蛋白酶连接蛋白-II,阿尔茨海默病)(amyloid beta (A4)precursor protein(protease nexin-II,Alzheimer disease))
765 A0224N D13380 PTPN12   蛋白酪氨酸磷酸酶,非-受体型12(protein tyrosinephosphatase,non-receptor type 12)
 766   B4552   AA812671   CDC14B   CDC14(细胞分裂周期14,酿酒酵母)同源物
  B(CDC14(cell division cycle 14,S.cerevisiae)homolog B)
  767   B3700   AA443786   SYTL2   突触结合蛋白-样2(Synaptotagmin-like 2)
768 B4891 W19216 PKIG   蛋白激酶(cAMP-依赖的,催化的)抑制因子γ(protein kinase(cAMP-dependent,catalytic)inhibitorgamma)
  769   B5366N   AA291036   KIAA0164   KIAA0164基因产物(KIAA0164 gene product)
  770   A8477N   W44716   HSPC055   HSPC055蛋白
  771   C8058   N62855   ESTs
  772   E1374   AK000752   KIAA1181   KIAA1181蛋白
  773   A2287   U09577   HYAL2   透明质氨基葡糖苷酶2(hyaluronoglucosaminidase 2)
774 A2118 J04130 SCYA4   小的可诱导的细胞因子A4(同源于小鼠Mipb)(smallinducible cytokine A4(homologous to mouse Mipb))
  775   A2511   D49547   HSPF1   热休克40kD蛋白1(heat shock 40kD protein 1)
776 A6236 L04656 CA8 碳酸酐酶VIII(carbonic anhydrase VIII)
777 A1795 J03004 GNAI2   鸟苷酸结合蛋白(G蛋白),α抑制性活性多肽2(guanine nucleotide binding protein(G protein),alphainhibiting activity polypeptide 2)
778 A4171 AA772230   人cDNA:FLJ23538 fis,克隆LNG08010,高度近似于BETA2人MEN1区域克隆ε/βmRNA(Homosapiens cDNA:FLJ23538 fis,clone LNG08010,highlysimilar to BETA2Human MEN1 region cloneepsilon/beta mRNA)
  779   A4766   AF001434   EHD1   含有EH结构域的蛋白1(EH domain containing 1)
  780   A1999   D00172   ANXA5   膜联蛋白A5
  781   A6187   AA412555   KIAA1536   KIAA1536蛋白
  782   A1452   M35198   ITGB6   整联蛋白,β6
783 A3288 M12670 TIMP1   金属硫蛋白酶1的组织抑制因子(红细胞增强活性(erythroid potentiating activity),胶原酶抑制因子)(tissue inhibitor of metalloproteinase 1(erythroid
  potentiating activity,collagenase inhibitor))
  784   A4279   AI222322   TOB2   ERBB2,2的转导蛋白(tFansducer of ERBB2,2)
785 A8063 H98203 KIAA0987   差异性表达于肺腺癌(differentially expressed inadenocarcinoma of the lung)
786 B0911 W72053   人cDNA:FLJ21904 fis,克隆HEP03585(Homosapiens cDNA:FLJ21904 fis,clone HEP03585)
787 B4831 M31210 EDG1   内皮分化,鞘脂类G-蛋白-偶联受体,1(endotheliadifferentiation,sphingolipid G-protein-coupledreceptor,1)
  788   B3748   D88153   HYA22   HYA22蛋白
789 A6715 U83463 SDCBP   多配体蛋白聚糖结合蛋白(syntenin)(syndecanbinding protein(syntenin))
  790   A9327   AA447864   KIAA1055   KIAA1055蛋白
  791   B1490   AI199405   ZNF266   锌指蛋白266(zinc finger protein 266)
  792   A9412   AA523727   ESTs
793 A6411 AA303231 LOC64744   不确定蛋白AL133206(hypothetical proteinAL133206)
  794   B1647   AA242740   SCEL   sciellin
795 A1992 Z11697 CD83 CD83抗原(活化的B淋巴细胞,免疫球蛋白超家族)(CD83 antigen(activated B lymphocytes,immunoglobulin superfamily))
  796   A8921   R38569   ESTs
  797   B6472   AI288772   DREV1   CGI-81蛋白
  798   B7213N   D86982   KIAA0229   KIAA0229蛋白
  799   B7575   W42910   SEC22C   小泡运输蛋白(vesicle trafficking protein)
800 B9287 AA885480   人的来自染色体lq42.13-43上克隆RP5-858B6的DNA序列含有ESTs、STSs、GSSs和一个CpG岛。含有3个新基因(Human DNA sequence from cloneRP5-858B6 on chromosome 1q42.13-43ContainsESTs,STSs,GSSs and a CpG island.Contains three
  novel genes)
801 B3891 C06051 JAK1   Janus激酶1(一种蛋白酪氨酸激酶)(Janus kinase 1(aprotein tyrosinekinase))
802 B4491 AA148566   人cDNA:FLJ22790 fis,克隆KAIA2176,高度近似于HUMPMCA人血浆膜钙-泵ATPase(PMCA4)mRNA(Homo sapiens cDNA:FLJ22790fis,cloneKAIA2176,highly similar to HUMPMCA Humanplasma membrane calcium-pumping ATPase(PMCA4)mRNA)
803 C8127 AA478197 MAN2A2   甘露糖苷酶,α,2A类,成员2(mannosidase,alpha,class 2A,member 2)
 804  C8456   U90912   KIAA1128   人克隆23865mRNA序列
805 C0570 H12297   人cDNA:FLJ22167 fis,克隆HRC00584(HomosapienscDNA:FLJ22167 fis,clone HRC00584)
 806  D1436   AI341482   RNB6   RNB6
表2上调的基因(≥×5,≥50%的病例)
  NSC编号 LMMID Acc 代号 名称
807 A1589   NM_006547 KOC1   IGF-II mRNA-结合蛋白3(IGF-II mRNA-bindingprotein 3)
  808  A0042   AF029082   SFN   stratifin 805
809 A1063 M19888 SPRR1B   小的富含脯氨酸的蛋白1b(角质蛋白)(smalproline-rich protein 1B(cornifin))
810 A3243   NM_003318 TTK TTK蛋白激酶(TTK protein kinase)
811 A0418   NM_002997 SDC1 多配体蛋白聚糖1(syndecan 1)
  812  A2932   M21551   NMB   神经调节肽B(neuromedin B)
813 A3547 J04739 BPI   杀菌的/通透性-提高蛋白(bactericidal/permeability-increasing protein)
814 A2282 D79997   KIAA0175 KIAA0175基因产物
815 A4383 Z97029 RNAEHI   核糖核酸酶HI,大亚基(ribonuclease HI,largesubunit)
  816   A1257   AF006259   PIR51   RAD51-相互作用性蛋白(RAD51-interacting protein)
817 B4368 AI082560 FLJ20450   不确定蛋白FLJ20450(hypothetical proteinFLJ20450)
  818   B7725   C20910   CCNB1   细胞周期蛋白B1(cyclin B1)
819 A8043 W72411 TP63   与p53强同源的肿瘤蛋白63kda(tumor protein 63kDa with strong homology to p53)
820 B6769 AA461217 HMMR   透明质酸-介导的运动性受体(RHAMM)(hyaluronan-mediated motility receptor(RHAMM))
821 A6695 AF035444 TSSC3   肿瘤抑制亚可转移的候选物3(tumor suppressingsubtransferable candidate 3)
822 C4330 AA234722   ESTs(MGC12536),中度近似于CANS_人钙-依赖的蛋白酶,小亚基[人](ESTs(MGC12536),Moderatelysimilar to CANS_HUMANCALCIUM-DEPENDENT PROTEASE,SMALLSUBUNIT[H.sapiens])
  823   B1406   AA483082   XAGE   XAGE蛋白
824 A0771N M69225 BPAG1   大疱的类天疱疮抗原1(230/240kD)(bullouspemphigoid antigen 1(230/240kD))
825 B8870 NM_018685 ANLN   anillin(果蝇Scraps同源物),肌动蛋白结合蛋白(anillin(Drosophila Scraps homolog),actin bindingprotein)
826 B9760 R73030   ESTs,略微近似于ALU1_HUMAN ALUSUBFAMILY J SEQUENCE CONTAMINATIONWARNING ENTRY[人](ESTs,Weakly similar toALU1_HUMAN ALU SUBFAMILY J SEQUENCE
  CONTAMINATION WARNING ENTRY[H.sapiens])
827 B5915 T79582   ESTs,略微近似于KIAA0479蛋白[人](ESTs,Weakly similar to KIAA0479 protein[H.sapiens])
828 A8893N AA460182 PPP1R16A   蛋白磷酸酶1,调节性(抑制因子)亚单位516A(Protein phosphatase 1,regulatory(inhibitor)subunit 16A)
 829   B5301   W44796   ESTs
 830   B7439   AI318098   ESTs
831 B8547 AI125938   接近ALD基因座的人X28区域,其中含有双重特异性磷酸酶9(DUSP9)、核糖体蛋白L18a(RPL18a)、Ca2+/钙调蛋白-依赖的蛋白激酶I(CAMKI)、肌酸转运物(CRTR)、CDM蛋白(CDM)、肾上腺脑白质营养不良蛋白(Homo sapiens X28 region near ALDlocus containing dual specificity phosphatase 9(DUSP9),ribosomal protein L18a (RPL18a),Ca2+/Calmodulin-dependent protein kinase I(CAMKI)creatine transporter(CRTR),CDM protein(CDM),adrenoleukodystrophy protein)
 832   B8743   AI261284   ESTs
 833   B7163   R06794   ESTs
834 B8909 AA552690   人cDNA:FLJ21274fis,克隆COL0178l(Homosapiens cDNA:FLJ21274fis,clone COL01781)
 835   B4688   AA411315   FLJ10604   不确定蛋白FLJ10604
 836   B4788N   AA776829   ESTs
 837   B6264   T91195   ESTs
 838   B4186N   AI189587   ESTs
839 B7771 AA427818 HMGIC   高-迁移率群(非组蛋白染色体的)蛋白同种型I-C(high-mobility group(nonhistone chromosomal)protein isoform I-C)
 840   C1730   AA847662   GNAS   GNAS,复合基因座(GNAS,complex locus)
 841   C4539   AB101204  URLC2   在肺癌中上调的2(up-regulated in lung cancer 2)
842 C8214 AA047315  KIAA0887 KIAA0887蛋白
843 C6987 AI123912   人cDNA FLJ10041 fis,克隆HEMBA1001022(Homosapiens cDNA FLJ10041 fis,clone HEMBA1001022)
 844   C7403   AI359511   ESTs,中度类似于smoothelin[人]
845 D0773 AA425730   ESTs,略微近似于ALU1_HUMAN ALUSUBFAMILY J SEQUENCE CONTAMINATIONWARNING ENTRY[人](ESTs,Weakly similar toALU1_HUMAN ALU SUBFAMILY J SEQUENCECONTAMINATION WARNING ENTRY[H.sapiens])
846 D0006 AI015982   ESTs,略微近似于AF1551351新型视网膜色素上皮细胞蛋白[人](ESTs,Weakly similar toAF155135 1 novel retinal pigment epithelial cellprotein[H.sapiens])
847 C0488 AA781195 PRAME   黑色素瘤中优选表达的抗原(preferentially expressedantigen in melanoma)
 848   C6902   AA479648   ESTs
849 C7601 NM005268 GJB5   间隙连接蛋白,β5(连接蛋白31.1)(gap junctionprotein,beta 5(connexin 31.1))
 850   D1135   AA447744   ESTs
 851   C5005   AA625553   ESTs
 852   C6143   AA678356   ESTs
 853   C6664   AI142832   ESTs
854 C1442 AA807192   ESTs,高度近似于未命名的蛋白产品[人](ESTs,Highly similar to unnamed protein product[H.sapiens])
855 C6719 AB105191 LNIR Ig超家族受体LNIR(Ig superfamily receptor LNIR)
 856   D0010   AA358397   EST
857 C7630   NM_032862 TIGD5   触发可转位元件来源的5(tiggertransposable elementderived5)
858 C6447 AA079262   人mRNA;cDNA DKFZp566C0546(来自克隆DKFZp566C0546)(Homo sapiens mRNA;cDNADKFZp566C0546(from clone DKFZp566C0546))
  859   C7444   AB101205   URLC3   在肺癌上调的3(up-regulated in lung cancer 3)
  860   D9683   AI057353   ESTs
861 D9437 W67209 KIAA0251   ESTs,中度近似于p53调节的PA26-T2核蛋白[人](ESTs,Moderately similar to p53 regulated PA26-T2nuclear protein[H.sapiens])
  862   D3230   AA780074   ESTs
  863   E0904   AI394016   FLJ20116   不确定蛋白FLJ20116
  864   D5363   AA954567   ESTs
865 A2691N X63629 CDH3   钙粘着蛋白3,1型,P-钙粘着蛋白(胎盘的)(cadherin 3,type 1,P-cadherin(placental))
  866   A4693   U42408   LAD1   ladinin 1
867 C3760 U75285 BIRC5   含有杆状病毒IAP重复单元的基因5(survivin)(baculoviral IAP repeat-containing 5(survivin))
868 A2603N Z46629 SOX9   SRY(性别决定区域Y)-框9(campomelic发育异常,常染色体性-颠倒)(SRY(sex determining regionY)-box 9(campomelic dysplasia,autosomasex-reversal))
869 A3529N D89016 NBR   推定的神经母细胞瘤蛋白(putative neuroblastomaprotein)
870 C8633 AI161159   人mRNA;cDNA DKFZp566N034(来自克隆DKFZp566N034);部分cds(Homo sapiens mRNA;cDNA DKFZp566N034(from cloneDKFZp566N034);partial cds)
871 D5753 AA971042   KIAA1929 ESTs
872 A9044 AA775667   LOC51659 HSPC037蛋白
  873   C8799   AA219172   ESTs
  874   B7197N   R07614   ESTs
875 B4414 AA765913 DECR2 2,4-dienoyl辅酶A还原酶2,过氧化物酶体的(2,4-dienoyl CoA reductase 2,peroxisomal)
876 C9030 AI086906   ESTs,高度近似于LRP1人低密度脂蛋白受体-相关蛋白1前体[人]/高度近似于S02392α-2-巨球蛋白受体前体[人](ESTs,Highly similar toLRP1_HUMAN LOW-DENSITY LIPOPROTEINRECEPTOR-RELATED PROTEIN 1 PRECURSOR[H.sapiens]/Highly similar to S02392alpha-2-macroglobulin receptor precursor[H.sapiens])
  877   A2709N   D85376   ESTs
878 D9621 AI349804   ESTs,略微近似于IQGA_HUMAN RASGTPASE-ACTIVATING-LIKE PROTEIN IQGAP1[人](ESTs,Weakly similar to IQGA_HUMAN RASGTPASE-ACTIVATING-LIKE PROTEIN IQGAP1[H.sapiens])
  879   C7956   AA172001   FLJ10901   不确定蛋白FLJ10901
880 A2759N X16260 ITIH1   α(球蛋白)间抑制因子,H1多肽(inter-alpha(globulin)inhibitor,H1 polypeptide)
881 C3813 NM_017650 FLJ20068 不确定蛋白FLJ20068(hypothetical proteinFLJ20068)
882 D4920 AI247180   GUCY1B   鸟苷酸环化酶1,可溶解的,β2(guanylate cyclase 1,soluble,beta 2)
883 A7675 U26726 HSD11B2   羟类固醇(11-β)脱氢酶2(hydroxysteroid(11-beta)dehydrogenase 2)
884 B8059 AA625338 RAD51   RAD51(酿酒酵母)同源物(大肠菌RecA同源物)(RAD51(S.cerevisiae)homolog(E coli RecAhomolog))
885 C7616 AB101211 BAG5   BCL2相关athanogene5(BCL2-associated athanogene5)
  886  D2176   AI138545   ESTs
887 A2801 X68314 GPX2   谷胱甘肽过氧化物酶2(胃肠的)(glutathioneperoxidase 2(gastrointestinal))
  888  A3937   AF044309   STX11   突触融合蛋白11(syntaxin 11)
889 A5657 AA005074 HSPC150   类似于泛素-偶联型酶的HSPC150蛋白(HSPC150protein similar to ubiquitin-conjugating enzyme)
890 B4064 X83573 ARSE   芳基硫酸酯酶e(软骨发育不良punctata 1)(arylsulfatase E(chondrodysplasia punctata 1))
  891  C6559   AA011131   ESTs
892 E0975 AI816535   人cDNA FLJ12827fis,克隆NT2RP2002939,略微近似于锌指蛋白136(Homo sapiens cDNAFLJ12827 fis,clone NT2RP2002939,weakly similarto ZINC FINGER PROTEIN 136)
893 A3059   NM_016195   MPHOSPH1 M-阶段磷蛋白1(M-phase phosphoprotein 1)
  894  A0480   X54941   CKS1   CDC28蛋白激酶1(CDC28 protein kinase 1)
895 C6675 AB105189 FAM3D   带有序列类似3的家族,成员D(family withsequence similarity 3,member D)
896 C7537 AA121546 PRO0971   不确定蛋白PRO0971(hypothetical proteinPRO0971)
  897  C4166   M64247   TNNI3   肌钙蛋白I,心(troponin I,cardiac)
  898  C9393   AB101209   URLC7   在肺癌中上调的7(up-regulated in lung cancer 7)
899 D0182 AA639491 KRTHB6   角蛋白,毛发,碱性,6(念珠形发)(keratin,hair,basic,6(monilethrix))
900 B5912 W04554 FLJ20615   低氧-可诱导因子1,α亚单位抑制因子(Hypoxia-inducible factor1,alpha subunit inhibitor)
901 C3839 AW166519 MAN1B1   甘露糖苷酶,α,1B类,成员1(mannosidase,alpha,class1B,member 1)
902 A2462 AF054987 ALDOC   醛缩酶C,果糖-二磷酸(aldolase C,fructose-bisphosphate)
  903  A8287   AB105186   URLC9   在肺癌中上调的9(up-regulated in lung cancer 9)
904 A8335 AA448270   人,克隆IMAGE:3690478,mRNA,部分cds(Homosapiens,clone IMAGE:3690478,mRNA,partial cds)
  905  B6905   AB101203   URLC1   在肺癌中上调的1(up-regulated in lung cancer 1)
906 A2840 M68867 CRABP2   细胞视黄酸-结合蛋白2(cellular retinoicacid-binding protein 2)
907 C9468 AA885242   人,克隆CDABP0014mRNA序列(Homo sapiensclone CDABP0014mRNA sequence)
908 B4239 N51411 PSA   磷酸丝氨酸氨基转移酶(phosphoserineaminotransferase)
909 B3876   NM_018101 FLJ10468 不确定蛋白FLJ10468
  910  C0709   AA047768   ESTs
  911  D3319   AA768607   ESTs
912 A7432 M32313 SRD5A1   类固醇-5-α-还原酶,α多肽1(3-oxo-5α-类固醇Δ4-脱氢酶α1)(steroid-5-alpha-reductase,alphapolypeptide 1(3-oxo-5alpha-steroid delta4-dehydrogenase alpha 1))
913 A3962 AF057034 RODH-4   微粒体的NAD+-依赖性的视黄醇脱氢酶4(microsomal NAD+-dependent retinol dehydrogenase4)
  914  A7908   AA490691   HOXD11   同源框D11(homeo box D11)
  915  C7457   AB105187   URLC10   在肺癌中上调的10(up-regulated in lung cancer 10)
  916  B9429   Z39229   EST
917 D7212 AA132702   KIAA1096 KIAA1096蛋白
918 A2254 U63743 KNSL6   驱动蛋白-样6(有丝分裂中心-相关驱动蛋白)(kinesin-like 6(mitotic centromere-associated
  kinesin))
  919   B4345   AA576959   ESTs
920 A1957   NM_005483 CHAF1A   染色质装配因子1,亚单位A(p150)(chromatinassembly factor 1,subunit A(p150))
921 A4076 AF044961 AKR1B11   氧代酮还原酶家族1,成员B11(醛糖还原酶-样)(aldo-keto reductase family 1,member B11(aldosereductase-like))
922 A9518N AA570186   ESTs,ESTs,略微近似于MUC_2人粘蛋白2前体(ESTs,ESTs,Weakly similar to MUC2_HUMANMUCIN 2 PRECURSOR)
923 B4593 AA946930 SNRPG   小的核核糖核酸蛋白多肽G(small nuclearribonucleoprotein polypeptide G)
  924   C4878   AA446064   ESTs
  925   B1898   AA496118   EST
  926   C6506   AA004412   ESTs
  927   D6607   AI000650   ESTs
928 E1138 N80859 ERBB2   v-erb-b2鸟类成红细胞的白血病病毒癌基因同源物2(神经/glioblastoma衍生的癌基因同源物)(v-erb-b2 avian erythroblastic leukemia viraloncogene homolog 2(neuro/glioblastoma de rivedoncogene homolog))
929 B8882 D14657  KIAA0101 KIAA0101基因产物
  930   A5223   AA453716   ESTs
  931   A0437   AF047002  ALY   翻译共活化剂(transcriptional coactivator)
932 B0303 AA731891  KIAA1517 KIAA1517蛋白
933 B2824 AA115381   人cDNA FLJ12640 fis,克隆NT2RM4001940,高度近似于人永恒的同源物mRNA(Homo sapienscDNA FLJ12640 fis,clone NT2RM4001940,highly
  similar to Homo sapiens timeless homolog mRNA)
934 B6283 AA677294 CIT   柠檬(ρ-相互作用,丝氨酸/苏氨酸激酶21)(citron(rho-interacting,serine/threonine kinase 21))
  935   C0716   AI097310   ESTs
  936   C8776   AA766028   AF15Q14   AF15q14蛋白
937 C0671 AI091125 FZD10   卷曲(果蝇)同源物10(frizzled(Drosophila)homolog10)
  938   C6173   W72182   FLJ13852   不确定蛋白FLJ13852
  939   D8061   AA555306   ESTs
940 D5016 AI191724   KIAA1443 KIAA1443蛋白
  941   C7353   AA587766   FLJ21935   不确定蛋白FLJ21935
942 A4139 AA566069 ARPC4   肌动蛋白相关蛋白2/3复合体,亚单位4(20kD)(actin related protein 2/3complex,subunit 4(20kD))
  943   B7138   AA429262   ESTs
  944   C6222   W74371   ESTs
945 C0912 AJ001014 RAMP1   受体(降钙素)活性调节蛋白1(receptor(calcitonin)activity modifying protein 1)
  946   D9981   N30381   ESTs
947 B0259   NM_007183 PKP3 plakophilin 3
948 D5142   NM_003740 KCNK5   钾通道,K亚家族,成员5(TASK-2)(potassiumchannel,subfamily K,member 5(TASK-2))
  949   A2391   L38961   ITM1   整合型膜蛋白1(integral membrane protein 1)
  950   B0323   AI363295   ESTs
  951   B6053   AA916007   ESTs
  952   C4825   AA287862   ESTs
  953   C6562   AA012883   ESTs
  954   D0684   AA420960   EST
  955   C9886   AI034428   ESTs
956 D6488 NM_078480 SIAHBP1   siah结合蛋白1;FBP相互作用阻遏物;嘧啶序列段结合;拼接因子;Ro核糖核蛋白-结合蛋白1(siahbinding protein 1;FBP interacting repressor;pyrimidine tract binding splicing factor;Roribonucleoprotein-binding protein 1)
  957  E0502   AI240520   ESTs
  958  C4060   N35250   ESTs
959 C9858 AA748883 DNMT3B   DNA(胞嘧啶-5-)-甲基转移酶(DNA(cytosine-5-)-methyltransferase 3 beta)
  960  C0903   X81420  KRTHB1   角蛋白,毛发,碱性,1(keratin,hair,basic,1)
  961  C6634   AA398740   ESTs
  962  D9500   AI361654   ESTs
963 C5995 W58277   人mRNA;cDNA DKFZp586P2321(来自克隆DKFZp586P2321)
  964  A3765   X60673  AK3   腺苷酸激酶3(adenylate kinase 3)
965 A2448 AF010314 ENC1   外胚层-神经皮层(带有BTB-样结构域)(ectodermal-neural cortex(with BTB-like domain))
  966  C0573   H12479   ESTs
967 D0587 AA872040 INHBB   抑制素,βB(活化素ABβ多肽)(inhibin,beta B(activin AB beta polypeptide))
968 C7590 AB005989 CYP27B1   细胞色素P450,亚家族XXVIIB(25-羟基维生素,D-α-羟化酶),多肽1(cytochrome P450,subfamilyXXVIIB(25-hydroxyvitamin D-alpha-hydroxylase),polypeptide 1)
  969  B7749   AI346758  GYG2   glycogenin 2
  970  C6959   AA054259   EST
  971  A0447   U14973  RPS29   核糖体蛋白S29(ribosomal protein S29)
972 C0247 AI352156  LOC51690   U6snRNA-相关Sm-样蛋白LSm7(U6snRNA-associated Sm-like protein LSm7)
  973  C8682   AA227919  HAS3   透明质酸合成酶3(hyaluronan synthase 3)
974 A2352 M77836 PYCR1   吡咯啉-5-羧化物还原酶1(pyrroline-5-carboxylatereductase 1)
 975  B7680   AI342628   FLJ12517   不确定蛋白FLJ12517
976 A1640 X98400 MASP2   甘露聚糖-结合凝集素丝氨酸蛋白酶2(mannan-binding lectin serine protease 2)
977 A6282 AI076128 ARHD   ras同源物基因家族,成员(ras homolog gene family,member)
978 A6884 AA523543 CRABP1   细胞的视黄酸-结合蛋白1(cellular retinoicacid-binding protein 1)
979 B4361 AA989104 NDUFB2   NADH脱氢酶(泛醌)1β子复合形,2(8kD,AGGG)(NADH dehydrogenase (ubiquinone)1betasubcomplex,2(8kD,AGGG))
 980  B3971   AI298472   ANKT   核仁蛋白ANKT(Nucleolar protein ANKT)
 981  C6522   AI249019   ESTs
 982  C2298   AA357675   HES6   不确定蛋白HES6
983 C7939 X17620 NME1   非转移性细胞1,蛋白(NM23A)表达于其中(non-metastatic cells 1,protein(NM23A)expressedin)
984 D3205 AA077280 MLL3   脊髓的/淋巴的或混合-细胞系白血病3(myeloid/lymphoid or mixed-lineageleukemia 3)
985 A1618 X70683 SOX4   SRY(性别决定区域Y)-框4(SRY(sex determiningregion Y)-box 4)
986 B4397 AA873067   人cDNA:FLJ22940 fis,克隆KAT08051(Homosapiens cDNA:FLJ22940 fis,clone KAT08051)
 987  A2755   AF006043   PHGDH   磷酸甘油酸脱氢酶(phosphoglycerate dehydrogenase)
988 A4873 U10688 MAGEA4   黑色素瘤抗原,家族A,4(elanoma antigen,family A,4)
 989  A3058   L16783   FOXM1   叉头盒M1(forkhead box M1)
990 B4217 AA079060 WFDC2   WAP四-二硫化物核心结构域2(WAPfour-disulfide core domain 2)
991 B6595N XM209944 DOLPP1  连接于Fugu rubripes 2中Surfeit基因;LSFR2基因2(linked to Surfeit genes in Fugu rubripes 2;LSFR2gene 2)
992 A7411 M12849 SERPIND1  丝氨酸(或半胱氨酸)蛋白酶抑制因子,进化枝D(肝素辅因子),成员1(erine(or cysteine)proteinaseinhibitor,clade D(heparin cofactor),member 1)
  993   A2753N   U26662   NPTX2  二乙基溴乙酰胺pemraxin II(neuronal pentraxin II)
994 C7028   NM_032138   DKFZp434E2318 不确定蛋白DKFZp434E2318
995 B8207 AA411341  人3β-羟Δ5-c27-类固醇氧化还原酶mRNA,完整cds(Homo sapiens 3beta-hydroxy-delta5-C27-steroid oxidoreductase mRNA,complete cds)
996 A7691 X04325 GJB1  间隙连接蛋白,β1,32kD(连接蛋白32,Charcot-Marie-牙齿神经病,X-连接的)(gapjunction protein,beta 1,32kD(connexin 32,Charcot-Marie-Tooth neuropathy,X-linked))
  997   B5904   AA806630   FLJ10540  不确定蛋白FLJ10540
  998   B8643   AA781393  ESTs
  999   A0812   M16937   HOXB7  同源框B7(homeo box B7)
1000 A5513 AB105376 PSK-1  I型跨膜受体(捕捉-相关蛋白)(type I transmembranereceptor(seizure-related protein))
1001 A0725 U02082   ARHGEF5  Rho鸟苷酸交换因子(GEF)5(Rho guanineucleotide exchange factor(GEF)5)
1002 A7887 AF070588   LOC55565 不确定蛋白LOC55565
  1003   B5018   T47612  ESTs
1004 A0061 AF068760 BUB1B  不受苯并咪唑1抑制的发芽(酵母同源物),β(budding uninhibited by benzimidazoles 1(yeasthomolog),beta)
1005 C6805 AA040734  人,克隆MGC:16466IMAGE:3952569,mRNA,完整cds(Homo sapiens,clone MGC:16466
  IMAGE:3952569,mRNA,complete cds)
  1006   C0811   W69611   ESTs
1007 C9517 AA586922 POLR2J   聚合酶(RNA)II(针对DNA的)多肽J(13.3kD)(polymerase(RNA)II(DNA directed)polypeptide J(13.3kD))
  1008   C1590   AI249914   ESTs
  1009   C6086   AA235149   ESTs
  1010   D9504   AA928656   NTS   神经降压素(neurotensin)
1011 A0329 X07819 MMP7   基质金属硫蛋白7(基质裂解蛋白,子宫的)(matrixmetalloproteinase 7(matrilysin,uterine))
  1012   C8953   AA293513   FLJ12428   不确定蛋白FLJ12428
  1013   C0802   H63947   ESTs
1014 B0864 AI343440   ESTs,略微近似于Ydr472wp[酿酒酵母](ESTs,Weakly similar to Ydr472wp[S.cerevisiae])
  1015   C6852   AI335883   PHB   抑制素(prohibitin)
1016 C6225 W74482   ESTs,略微近似于KIAA1362蛋白[人](ESTs,Weakly similar to KIAA1362 protein[H.sapiens])
  1017   D8147   AI142227   CS   柠檬酸合酶(citrate synthase)
1018 D4112 AA648521   ESTs,高度近似于前mRNA拼接SR蛋白rA4[人(ESTs,Highly similar to pre-mRNA splicing SRprotein rA4[H.sapiens])
1019 A0490 L10612 MIF   巨噬细胞移行抑制因子(糖基化作用-抑制因子)(macrophage migration inhibitory factor(glycosylation-inhibiting factor))
  1020   C1555   AI243620   ESTs
1021 A5740 AI304392   KIAA1436   前列腺素子F2受体阴性的调节因子(ProstaglandinF2receptor negative regulator)
  1022   A7245   AI275857   ESTs
  1023   B1516   AA885961   CLDN2   封闭蛋白2(Claudin 2)
  1024   B0436N   AA625794   MTX1   metaxin 1
  1025   B3987N   N30179  PLAB   前列腺分化因子(prostate differentiation factor)
1026 B4030 AA056180   来自染色体20q11.222上的克隆RP4-616B8的人DNA序列其中含有RNA蜗牛酶基因、NPMlP19(nucleophosmin 1(核仁磷蛋白B23,numatrin)假基因19)、KIAA0823蛋白、ESTs、STSs、GSSs和CpG岛的部分mRNA(Human DNAsequence from clone RP4-616B8 on chromosome20q11.222 Contains a gene for an RNA helicase,NPM1P19(nucleophosmin 1(nucleolarphosphoprotein B23,numatrin)pseudogene 19),partof an mRNA for KIAA0823 protein,ESTs,STSs,GSSs and CpG Islands)
  1027   B4587   AA504314   ESTs
1028 C3815 BE261922   人cDNA FLJ14154 fis,克隆NT2RM1000341(Homosapiens cDNA FLJ14154 fis,clone NT2RM1000341)
  1029   A3534   J00269  KRT6A   角蛋白6A
1030 C0778 AI310465   人的推定的核糖体蛋白L36 mRNA(Human putativeribosomal protein L36 mRNA)
  1031   C8481   AA604841   ESTs
  1032   A0238   U01828  MAP2   微管-相关蛋白2(microtubule-associated protein 2)
  1033   A6127   AI356291  ST5   抑制肿瘤发生5(Suppression of tumorigenicity 5)
1034 A0494 M94556 SSBP   单链DNA-结合蛋白(single-stranded DNA-bindingprotein)
  1035   A2123   K03515  GPI   磷酸葡糖异构酶(glucose phosphate isomerase)
1036 A2954 L05096 RPL39   人核糖体蛋白L39 mRNA,完整cds(Homo sapiensribosomal proteinL39 mRNA,complete cds)
1037 A2822 X05978 CSTA   半胍氨酸蛋白酶抑制剂A(stefin A)(cystatin A(stefinA))
  1038   B0292   AA375432  CLDN1   封闭蛋白1
1039 A7172 Y10043 HMG4   高-迁移率群(非组蛋白染色体的)蛋白4(high-mobility group(nonhistone chromosomal)
  protein 4)
1040 B3500 AA725807   ESTs,人cDNA FLJ33104 fis,克隆TRACH2000923(ESTs,Homo sapiens cDNAFLJ33104 fis,clone TRACH2000923)
1041 A6005N AA531437 MLLT4   脊髓的/淋巴的或混合-谱系白血病(三空腔蛋白(果蝇)同源物);移位至,4(myeloid/lymphoid ormixed-lineage leukemia(trithorax (Drosophila)homolog);translocated to,4)
1042 D0491 AA815427 SLC6A8   溶质载体家族6(神经递质转运物,肌酸),成员8(solute carrier family 6(neurotransmitter transporter,ereatine),member 8)
  1043   C2112   AI022193   A1BG   α-B糖蛋白(alpha-B glycoprotein)
1044 C0844 AA954657   ESTs,略微近似于胶凝素34[人](ESTs,Weaklysimilar to collectin 34[H.sapiens])
  1045   C6180   AA775500   HsPOX2   脯氨酸氧化酶2(proline oxidase 2)
1046 D1375 AA287860 E2F5   E2F转录因子5,p130-结合(E2F transcription factor5,p130-binding)
1047 D7587 AI096953 SLC7A5   溶质载体家族7(阳离子的氨基酸转运物,y+系统),成员5(Solute carrier family 7(cationic amino acidtransporter,y+ system),member 5)
1048 A2673 X16135 HNRPL   核不均一核糖核蛋白L(heterogeneous nuclearribonucleoprotein L)
1049 A2565 Y00278 S100A8   S100钙-结合蛋白A8(钙粒蛋白A)(S100calcium-binding protein A8(calgranulin A))
1050 A2088 D38583 S100A11   S100钙-结合蛋白a11(calgizzarin)(S100calcium-binding protein A11(calgizzarin))
  1051   A5518   AA058761   FLJ20550   不确定蛋白FLJ20550
1052 B4870 AA308062 S100P   S100钙-结合蛋白P(S100calcium-binding proteinP)
1053 A8597N AA649986 SNRPF   小的核核糖核酸蛋白多肽F(small nuclearribonucleoprotein polypeptide F)
  1054   C1463   AA001735   ESTs
  1055   C0651   AI086281   ESTs
  1056   D0952   AI014551   ESTs
  1057   A2255   J03826   FDXR   铁氧化还原蛋白还原酶(ferredoxin reductase)
1058 A5292 AC004770 FEN1   flap结构-特异性核酸内切酶1(flap structure-specificendonuclease 1)
  1059   B6346   AA235074   TCF19   转录因子19(SC1)(transcription factor19(SC1))
1060 C6722 AA977296   ESTs,略微近似于未知的[酿酒酵母](ESTs,Weaklysimilar to unknown[S.cerevisiae])
1061 C4081 Z40760   人甘露糖基转移酶的PIG-M mRNA,完整cds(Homosapiens PIG-M mRNA for mannosyltransferase,complete cds)
1062 D4812 AA923368 PTK2   PTK2蛋白酪氨酸激酶2(PTK2 protein tyrosinekinase 2)
  1063   D9731   AI056637   ESTs
1064 A6139 AI356558 PAFAH1B3   血小板活化因子乙酰水解酶,同种型Ib,γ亚单位(29kD)(platelet-activating factor acetylhydrolase,isoform Ib,gamma subunit(29kD))
  1065   A8270   AA501416   ESTs
  1066   B5461   AJ439063   MCM8   微型染色体保持8(minichromosome maintenance 8)
  1067   D6549   AA994711   FLJ10052   不确定蛋白FLJ10052
1068 A6202 AA524968   ESTs,略微近似于T2D3_人转录物起动因子TFIID13kda亚型[人](ESTs,Weakly similar toT2D3_HUMAN TRANSCRIPTION INITIATIONFACTOR TFIID 135KDA SUBUNIT[H.sapiens])
1069 B4121 AA877534 GPRC5C   G蛋白-偶联受体,家族C,群5,成员C(Gprotein-coupled receptor,family C,group 5,memberC)
1070 B4478 AA910946 AP1M2   衔接子-相关蛋白复合体1,mu2亚单位(adaptor-related protein complex 1,mu 2 subunit)
  1071   C7114   T16226   ESTs
  1072   C7965   AA173172   FLJ13163   不确定蛋白FLJ13163
  1073   C7122   AA235710   NJMU-R1   蛋白激酶Njmu-R1(protein kinase Njmu-R1)
  1074   D4789   AA921896   ESTs
  1075   D6248   AB101206   URLC4   在肺癌中上调的4(up-regulated in lung cancer 4)
1076 A7409 L41559 PCBD   6-丙酮酰-四氢蝶呤合成酶/二聚化辅助因子的肝细胞核因子1α(TCF1)(6-pyruvoyl-tetrahydropterinsynthase/dimerization cofactor of hepatocyte nuclearfactor 1alpha(TCF1))
1077 B6379 AA443685   人mRNA;cDNA DKFZp564H142(来自克隆DKFZp564H142)(Homo sapiens mRNA;cDNADKFZp564H142(from clone DKFZp564H142))
  1078   A0429   U73379   UBCH10   泛素载体蛋白E2-C(ubiquitin carrier protein E2-C)
1079 C4909 W79821   人HSPC265mRNA,部分cds(Homo sapiensHSPC265mRNA,partial cds)
1080 A4146 AA586974 PI3   蛋白酶抑制因子3,皮肤-衍生的(SKALP)(proteaseinhibitor 3,skin-derived(SKALP))
  1081   A1215   X07696   KRT15   角蛋白15
1082 A2978 X04741 UCHL1   泛素羧基末端酯酶L1(泛素巯基酯酶)(ubiquitincarboxyl-terminal esterase L1(ubiquitin thiolesterase))
1083 A4013 D26485 UQCRC1   泛醇(ubiquinol)-细胞色素c还原酶核心蛋白I(ubiquinol-cytochrome c reductase core protein I)
1084 A5377 AA339976 TSSC1   肿瘤抑制可亚转移的侯选物1(tumor suppressingsubtransferable candidate 1)
  1085   B4069   AA128470   DSP   桥粒斑蛋白(DPI,DPII)(desmoplakin(DPI,DPII))
  1086   A7780   AB006630   TCF20   转录因子20(AR1)(transcription factor 20(AR1))
1087 B2909 AA568223 top2A   拓扑异构酶(DNA)IIα(170kD)(topoisomerase(DNA)II alpha(170kD))
1088 A9040 K03195 SLC2A1   溶质载体家族2(促进葡萄糖转运物),成员1(solutecarrier family 2(facilitated glucose transporter),
  member 1)
1089 B9480 W56303   KIAA0802 KIAA0802蛋白
1090 B4932 AA909294   LOC51243 不确定蛋白
  1091   B5787   AA514606   FLJ10633   不确定蛋白FLJ10633
  1092   B5534N   AA758653   ESTs
1093 A2694N D31628 HPD   4-羟苯丙酮酸双加氧酶(4-hydroxyphenylpyruvatedioxygenase)
1094 B5382N Y09836   KIAA0374 syntaphilin
1095 C6679 AI168147   人HSPC289mRNA,部分cds(Homo sapiensHSPC289 mRNA,partial cds)
  1096   D1477   T82181   EST
  1097   B2980   AI339770   ESTs
  1098   C8586   AI014673   FLJ10709   不确定蛋白FLJ10709
1099 C1388 AI244237 H2BFB   H2B组蛋白家族,成员B(H2B histone family,member B)
1100 A3156 L02870 COL7A1   胶原蛋白,VII型,α1(表皮水疱症,营养不良,显性和隐性的)(collagen,type VII,alpha 1(epidermolysis bullosa,dystrophic,dominant andrecessive))
1101 A1677 U58766 TSTA3   组织特异性移植抗原P35B(tissue specifictransplantation antigen P35B)
1102 B1887 AA642480 SMG1   PI-3-激酶-相关激酶SMG-1(PI-3-kinase-relatedkinase SMG-1)
1103 A2013N   NM_002245 KCNK1   钾通道,K亚家族,成员1(TWIK)(potassiumchannel,subfamily K,member 1(TWIK))
1104 A2967 X54473 COX6B   细胞色素c氧化酶亚单位VIb(cytochrome c oxidasesubunit VIb)
  1105   A4356   Y00503   KRT19   角蛋白19
1106 A6311 AI090753 SHMT2   丝氨酸羟甲基转移酶2(线粒体)(serinehydroxymethyltransferase 2(mitochondrial))
  1107   B4260   AB101210   URLC8   在肺癌中上调的8(up-regulated in lung cancer 8)
1108 A7435N X16302 IGFBP2   胰岛素-样生长因子-结合蛋白2(36kD)(insulin-likegrowth factor binding protein 2(36kD))
  1109   A6519N   AA703988   ZNF259   锌指蛋白259(zinc finger protein 259)
  1110   B4034   AA523881   ESTs
1111 B7362 AA579959 CYP2S1   从ESTs预测的细胞色素p540家族成员(cytochromeP540family member predicted from ESTs)
  1112   B8716   AA766315   FLJ10461   不确定蛋白FLJ10461
  1113   C6219   AB101207   URLC5   在肺癌中上调的5(up-regulated in lung cancer 5)
1114 C2132 AA468538 BRPF3   含有溴结构域和PHD指,3(bromodomain and PHDfinger containing,3)
1115 A2837 L27711 CDKN3   细胞周期蛋白-依赖性激酶抑制因子3(CDK2-相关双重特异性磷酸酶)(cyclin-dependent kinaseinhibitor 3(CDK2-associated dual specificityphosphatase))
1116 C1434 N22773 KIAA0852   人mRNA;cDNA DKFZp434J1618(来自克隆DKFZp434J1618);部分cds(Homo sapiens mRNA;cDNA DKFZp434J1618(from cloneDKFZp434J1618);partial cds)
  1117   C6321   W86781   ESTs
1118 B7768 AA583339 GCNT3   葡糖氨酰(氮-乙酰基)转移酶3,粘蛋白型(glucosaminyl(N-acetyl)transferase 3,mucin type)
  1119   A1379   D49742   HABP2   透明质酸-结合蛋白2(hyaluronan-binding protein 2)
  1120   A0623   Y08302   DUSP9   双重特异性磷酸酶9(dual specificityphosphatase 9)
1121 A6800 AI223817   ESTs,略微近似于分泌粘腺蛋白XAG-2同源物[人](ESTs,Weakly similar to secreted cement glandprotein XAG-2homolog[H.sapiens])
  1122   B4227   AI189576   FLJ10439   不确定蛋白FLJ10439
1123 B5890 T78421   EST,略微近似于KIAA1498蛋白[人](EST,Weakly similar to KIAA1498protein[H.sapiens])
1124 B6599 AI083771 PFKFB2   6-果糖磷酸-2-激酶/果糖-2,6-二磷酸酶2(6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-biphosphatase 2)
1125 B5013 T90472   LOC51256 不确定蛋白
  1126   D1400   AA481072   ESTs
1127 C8507 N66159 COX6C   细胞色素c氧化酶亚单位VIc(cytochrome c oxidasesubunit VIc)
  1128   D6136   AA740188   ESTs
  1129   D2882   AA777954   ESTs
1130 C7435 AA573892   KIAA1359 KIAA1359蛋白
1131 A9323N   NM_018373 SYNJ2BP   synaptojanin 2结合蛋白(synaptojanin 2 bindingprotein)
  1132   C7257   AI192528   ESTs
  1133   B2900   AI305234   ESTs
1134 C1890 AA308562 PLEK2   普列克底物蛋白2(小鼠)同源物(pleckstrin 2(mouse)homolog)
  1135   A0918   U24183   PFKM   磷酸果糖激酶,肌肉(phosphofructokinase,muscle)
1136 A0516 U12597 TRAF2   TNF受体-相关因子2(TNF receptor-associatedfactor 2)
1137 A9262 AI160327 MRPL12   线粒体核糖体蛋白L12(mitochondrial ribosomalprotein L12)
1138 B0335N R32035   人PAK2mRNA,完整cds(Homo sapiens PAK2mRNA,complete cds)
1139 B8344 AA164836   ESTs,中度近似于使用外显子13a的替代拼接产物[人](ESTs,Moderately similar to altematively
 spliced product using exon 13A[H.sapiens])
1140 B4915N AA459264 CBFA2T2  核心-结合因子,runt结构域,α亚单位2;移位至,2(core-binding factor,runt domain,alpha subunit 2;translocated to,2)
  1141   C4362   AB105188  URLC11  在肺癌中上调的11(up-regulated in lung cancer 11)
1142 C6551 NM_003826 NAPG  N-乙基马来酰亚胺-敏感因子附着蛋白,γ(N-ethylmaleimide-sensitive factor attachment protein,gamma)
1143 E1497 AA291604 SLC16A3  溶质载体家族16(单羧酸转运物),成员3(solutecarrier family 16(monocarboxylic acid transporters),member 3)
1144 D8920 AI038231 USP13  泛素特异性蛋白酶13(异构蛋白酶T-3)(Ubiquitinspecific protease 13(isopeptidase T-3))
  1145   D4215   AA883311  ESTs
1146 C3759 AW504047 SMARCA4  染色质的SWI/SNF相关、基质相关、肌动蛋白依赖的调节因子,亚家族a,成员4(SWI/SNF related,matrix associated,actin dependent regulator ofchromatin,subfamily a,member 4)
  1147   D3522   AA813590  RPLP2  核糖体蛋白,大的P2(ribosomal protein,large P2)
1148 A2805 Z49254 MRPL23  线粒体核糖体蛋白L23(mitochondrial ribosomaprotein L23)
  1149   A0365   U17077  BENE  BENE蛋白
1150 B4616 AA534943 SCYB14  小的可诱导的细胞因子亚家族B(Cys-X-Cys),成员14(BRAK)(small inducible cytokine subfamily B(Cys-X-Cys),member 14(BRAK))
  1151   C0986   AA699879  ESTs
1152 A5623 AF044588 PRC1  胞质分裂1的蛋白调节因子(protein regulator ofcytokinesis 1)
1153 A2678 Z29074 KRT9  角蛋白9(表皮松解的掌跖角化病)(keratin 9(epidermolytic palmoplantar keratoderma))
1154 A2498 L11932 SHMT1   丝氨酸羟甲基转移酶1(serinehydroxymethyltransferase)
  1155   A6942   AA521342   ESTs
1156 B1253N D84557 MCM6   微型染色体保持缺陷的(mis5,裂变酵母)6(minichromosome maintenance deficient(mis5,S.pombe)6)
  1157   B7145N   AI088095  NINJ2   ninjurin 2
  1158   C1881   H77737   EST
  1159   C0969   AI205093   ESTs
1160 D8285 AA748613 SMARCC1   染色质的SWI/SNF相关、基质相关、肌动蛋白依赖的调节因子,亚家族c,成员1(SWI/SNF related,matrix  associated,actin dependent regulator ofchromatin,subfamily c,member 1)
1161 C8167 AA860277   ESTs,略微近似于TB2[人](ESTs,Weakly similarto TB2[H.sapiens])
  1162   C0400   AA031695  IMP-2   IGF-II mRNA-结合蛋白2
1163 A7791 AA578427   ESTs,略微近似于BGAM人β-半乳糖苷酶-相关蛋白前体[人](ESTs,Weakly similar toBGAM_HUMANBETA-GALACTOSIDASE-RELATED PROTEINPRECURSO[H.sapiens])
  1164   A1198   NM002522  NPTX1   神经元pentraxin I(neuronal pentraxin I)
1165 A7165 X92896 DXS9879E   染色体X(独特的)9879表达序列上的DNA片段(DNA segment on chromosome X(unique)9879expressed sequence)
  1166   B1194   AA657405   ESTs
1167 A7724 AA609417  DKFZp762M136 不确定蛋白DKFZp762M136
1168 B3984 U69141 GCDH   戊二酰辅酶A脱氢酶(glutaryl-Coenzyme Adehydrogenase)
  1169   B3086   AA743688   FLJ12892   不确定蛋白FLJ12892
  1170   B6535   AA654506   HLA-A   主要组织相容性复合体,I类,A
  1171   A8885N   H61951   APMCF1   APMCF1蛋白
1172 B7360 AA876375   ESTs,高度近似于LB4D人NADP-依赖的白细胞三烯B412-羟脱氢酶[人](ESTs,Highly similar toLB4D_HUMAN NADP-DEPENDENTLEUKOTRIENE B412-HYDROXYDEHYDROGENASE[H.sapiens])
  1173   B7710   AI341146   ESTs
  1174   B9455   AI299327   ESTs
1175 C7085 AI139873   KIAA0134 KIAA0134基因产物
  1176   C9720   AA121245   RANBP7   RAN结合蛋白7
1177 C4408 AA418644   ESTs,略微近似于C4HU补体C4A前体[人](ESTs,Weakly similar to C4HU complement C4Aprecursor[H.sapiens])
  1178   D3747   AA843607   ESTs
  1179   D9933   AI079544   ESTs
  1180   D8458   AA830668   EST
1181 C7801 AI299827   人互补DNA FLJ13782 fis,克隆PLACE4000489,略微近似于蛋白GRAINY-HEAD(Homo sapiens cDNAFLJ13782 fis,clone PLACE4000489,weakly similarto PROTEIN GRAINY-HEAD)
1182 D9317 AA532638   ESTs,中度近似于ALU2人ALU亚家族SB序列污染警告条目[人](ESTs,Moderately similar toALU2_HUMAN ALU SUBFAMILY SB SEQUENCECONTAMINATION WARNING ENTRY[H.sapiens])
1183 B0203   NM_004053 BYSL bystin-like
  1184   B8260   R27303  SURF6   Surfeit 6
  1185   B8930   AB101208  URLC6   在肺癌中上调的6(up-regulated in lung cancer 6)
1186 A2788 X63187 HE4   附睾-特异性,乳清-酸性蛋白型,四-二硫化物核心;推定的卵巢的癌标记(epididymis-specific,whey-acidic protein type,four-disulfide core;putativeovarian carcinoma marker)
1187 B8232 AA666114   人假尿嘧啶核苷合成酶1(PUS1)mRNA,部分cds(Homo sapiens pseudouridine synthase 1(PUS1)mRNA,partial cds)
  1188   A7045   AA096332   ESTs
1189 B8807 AA214125 NAP1L4   核小体装配蛋白1-样4(nucleosome assemblyprotein 1-like 4)
1190 B9040 R52161   人mRNA;cDNA DKFZp434A2410(来自克隆DKFZp434A2410);部分cds(Homo sapiens mRNA;cDNA DKFZp434A2410(from cloneDKFZp434A2410);partial cds)
1191 A6241N   NM_005694 COX17 COX17(酵母)同源物,细胞色素c氧化酶装配蛋白
  1192   B8443   AA602585   ESTs
  1193   B3749   AA394175   RAR(RAS样的GTPASE)
1194 C0772 AI215719  KIAA0442 KIAA0442蛋白
1195 C1511 AA905266  LOC51250 不确定蛋白
1196 C7658 AA143060   ESTs,高度近似于i38945黑色素瘤遍在突变蛋白[人](ESTs,Highly similar to I38945 melanomaubiquitous mutated protein[H.sapiens])
1197 C7479 AF019413 CYP21A2   细胞色素P450,亚家族XXIA(类固醇21-羟化酶,肾上腺),多肽2(cytochrome P450,subfamily XXIA(steroid 21-hydroxylase,congenital adrenalhyperplasia),polypeptide 2)
1198 A0607N AI347538 BIK   BCL2-相互作用致死因子(凋亡-诱导型)(BCL2-interacting killer(apoptosis-inducing))
1199 A2154 X59617 RRM1   核糖核苷酸还原酶M1多肽(ribonucleotide reductaseM1 polypeptide)
  1200   A6724   AI193969   FLJ22759   不确定蛋白FLJ22759
1201 A9581 AB105377 SLC7A1   溶质载体蛋白家族7(阳离子氨基酸转运物,y+系统),成员1(solute carrer family 7(catiomc ammo acidtransporter,y+ system),member 1)
  1202   A7303   N50517   ESTs
1203 B1397 AI366215   人mRNA;cDNA DKFZp434C0126(来自克隆DKFZp434C0126);部分cds(Homo sapiens mRNA;cDNA DKFZp434C0126(from cloneDKFZp434C0126);partial cds)
1204 B3912 AA405413 SLC25A10   溶质载体家族25(线粒体载体;乙基酯转运物),成员10(solute carrier family 25(mitochondrial carrier;dicarboxylate transporter),member 10)
  1205   B3198   AI199919   FLJ20657   不确定蛋白FLJ20657
  1206   B4062   X14640   KRT13   角蛋白13
1207 C0531 N20321 D19S1177E   染色体19(独特的)1177表达序列上的DNA片段(DNA segment on chromosome 19(unique)1177expressed sequence)
  1208   C0639   H17516   ESTs
1209 C7434 AI333599   LOC5628 CA11
  1210   D5382   H90132   ESTs
  1211   A1604   X52186   ITGB4   整联蛋白,β4
1212 A0024 AF017790 HEC   在癌症中高表达,富含亮氨酸七联重复(highlyexpressed in cancer,rich in leucine heptad repeats)
1213 A2728 X87342 LLGL2   致命的巨幼虫(果蝇)同源物2(lethal giant larvae(Drosophila)homolog 2)
1214 A3410 L77566 DGSI   DiGeorge综合症关键区域基因DGSI(DiGeorgesyndrome critical region gene DGSI)
  1215   B5730   AI367310   ESTs,略微近似于dJ37E16.5[人]
  1216   B6539   AI239432   ESTs
1217 A4009 D17793 AKR1C3   氧代酮还原酶家族1,成员C3(3-α羟基类固醇脱氢酶,II型))(aldo-keto reductase family 1,member C3(3-alpha hydroxysteroid dehydrogenase,type II))
1218 A2832 D13118 ATP5G1   ATP合成酶,H+转运,线粒体F0复合体,亚单位c(亚单位9),同种型1(ATP synthase,H+ transporting,mitochondrial F0 complex,subunit c(subunit 9),isoform 1)
1219 A5666 AA457022 E2IG5   不确定蛋白,雌二醇-诱导的(hypothetical protein,estradiol-induced)
  1220   A1434   M10036  TPI1   磷酸丙糖异构化酶1(triosephosphate isomerase 1)
1221 A4593 U94836 ERPROT213-21   带有聚谷氨酸重复的蛋白;钙(ca2+)内环境平衡内质网蛋白(protein with polyglutamine repeat;calcium(ca2+)homeostasis endoplasmic reticulum protein)
1222 A2150 D89618 KPNA3   核转运蛋白α3(输入蛋白α4)(karyopherin alpha3(importin alpha 4))
  1223   A4536   Y09723  ZNF151   锌指蛋白151(pHZ-67)
  1224   B2589   AA586814   ESTs
1225 A8643 AA701659 HUGT1   UDP-葡萄糖:糖蛋白葡糖基转移酶1(UDP-glucose:glycoprotein glucosylttansferase 1)
  1226   B9253   R59595   ESTs
  1227   B5279   AA700186  FST   follistatin
  1228   B7214N   AA741058   ESTs
1229 A2411N AI312652 MRPS24   线粒体核糖体蛋白S24(Mitochondrial ribosomalprotein S24)
1230 B7343N AA521052   ESTs,略微近似于ALU1人ALU2SB序列污染警告条目[人](ESTs,Weakly similar to
  ALU1_HUMAN ALU SUBFAMILY J SEQUENCECONTAMINATION WARNING ENTRY[H.sapiens])
1231 C2021 N40918   人mRNA;cDNA DKFZp761G1111(来自克隆DKFZp761G1111)(Homo sapiens mRNA;cDNADKFZp761G1111(from clone DKFZp761G1111))
  1232   C9732   AA019655   EST
1233 C3905 L48863   人mRNA;cDNA DKFZp434P0235(来自克隆DKFZp434P0235)(Homo sapiens mRNA;cDNADKFZp434P0235(from clone DKFZp434P0235))
1234 C9495 R99122   ESTs,高度近似于CBF_人CCAAT-结合因子[人](ESTs,Highly similar to CBF_HUMAN CCAAT-BINDINGFACTOR[H.sapiens])
  1235   D8547   AI018498   FLJ20591   不确定蛋白
  1236   D5388   AI301490   HSPC135   HSPC135蛋白
1237 D3023 AA781745   ESTs,中度近似于KIAA0638蛋白[人](ESTs,Moderately similar to KIAA0638protein[H.sapiens])
  1238   D8837   AI025916   FSP-2   fibrousheathin II
  1239   A3311   L04483   RPS21   核糖体蛋白S21(ribosomal protein S21)
  1240   C3979   AK074088   FLJ00159   人cDNA:FLJ00159
  1241   B1719   AA634294   ESTs
1242 B8220 AF074264 LRP6   低密度脂蛋白受体-相关蛋白6(ow densitylipoprotein receptor-related protein 6)
  1243   C9360   AI366259   ESTs
1244 C7637 AA491000   人mRNA;cDNA DKFZp586N1720(来自克隆DKFZp586N1720)(Homo sapiens mRNA;cDNADKFZp586N1720(from clone DKFZp586N1720))
  1245   A4460   AF037335   CA12   碳酸酐酶XII(carbonic anhydrase XII)
  1246   A0060   NM_00359   SUPT3H   Ty 3同源物的抑制基因(酿酒酵母)(suppressor of Ty
  9   3homolog(S.cerevisiae))
  1247  A5640   AA047322   MGC5585   不确定蛋白MGC5585
  1248  B7466   AA128378   ESTs
1249 B3907 AA913298   KIAA0969 KIAA0969蛋白
1250 B3698 AA234475   具有甲基转移酶结构域的PRIP--相互作用蛋白(PRIP-interacting protein with methyltransferasedomain)
1251 C8029 M19309 TNNT1   肌钙蛋白T1,骨骼的,缓慢的(troponin T1,skeletal,slow)
1252 C9747 AA420675   ESTs,中度近似于RL39_人60S核糖体蛋白L3[人](ESTs,Moderately similar to RL39_HUMAN50S RIBOSOMAL PROTEIN L3[H.sapiens])
  1253  D6683   AI361048   ESTs
1254 E1250   NM_018231 FLJ10815 不确定蛋白FLJ10815
1255 B5640 AA759219   人cDNA FLJ13123 fis,克隆NT2RP3002763(Homosapiens cDNA FLJ13123 fis,clone NT2RP3002763)
1256 D8485 AI277810 PSMC2   蛋白酶体(prosome,macropain)26S亚单位,ATPase,2(proteasome(prosome,macropain)26S subunit,ATPase,2)
1257 C1487 N50938   人cDNAFLJ20428 fis,克隆KAT03458,高度近似于Z184_人锌指蛋白(Homo sapiens cDNA FLJ20428fis,clone KAT03458,highly similar toZ184_HUMAN ZINC FINGER PROTEIN 184)
1258 C3716 AK025906   人cDNA:FLJ22253 fis,克隆HRC02763(Homosapiens cDNA:FLJ22253 fis,clone HRC02763)
  1259  C2294   AI018174   ESTs
  1260  E0161   AI090079   EST
  1261  D8466   AA642343   ESTs
  1262   A0458   U14968   RPL27A   核糖体蛋白L27a(ribosomal protein L27a)
  1263   A0345   X52943   ATF7   活化转录因子7(activating transcription factor 7)
1264 A0333 X13293 MYBL2   v-myb鸟类的成髓细胞血症病毒癌基因同源物-样2(v-myb avian myeloblastosis viral oncogenehomolog-like 2)
1265 A3919 NM_004212 SLC28A2   溶质载体家族28(钠-偶联核苷转运物),成员2(solute carrier family 28(sodium-coupled nucleosidetransporter),member 2)
  1266   A3982   AJ000553   SH2D2A   SH2结构域蛋白2A
1267 A2219 M55265 CSNK2A1   酪蛋白激酶2,α1多肽(casein kinase 2,alpha 1polypeptide)
1268 A4181 AA847250 SSR4   信号顺序受体,δ(易位子-相关蛋白δ)(signalsequence receptor,delta(translocon-associated proteindelta))
  1269   B4899   AI366597   ESTs
1270 B0906 H05704 HCR   HCR(α-螺旋卷曲-coil rod同源物)(HCR(a-helixcoiled-coil rod homologue))
1271 B4480 W29089   ESTs,中度近似于未命名的蛋白产物[人](ESTs,Moderately similar to unnamed protein product[H.sapiens])
  1272   B4535   AI125927   FLJ13441   不确定蛋白FLJ13441
  1273   B7505   NM152440   FLJ32549   不确定蛋白FLJ32549
  1274   C4593   AI192455   ESTs
1275 C6763 AA032253 ESTs
  1276   C1901   AA649063   FLJ21865   不确定蛋白FLJ21865
  1277   C4573   AA952902   ESTs
1278 C4172 AA477870 B4GALT7   xylosylproteinβ1,4-半乳糖基转移酶,多肽7(半乳糖基转移酶I)(xylosylproteinbetal,4-galactosyltransferase,polypeptide 7(galactosyltransferase I))
1279 E1007 Z82244 TOM1   myb1(小鸡)同源物的靶标(target of mybl(chicken)homolog)
1280 C6687 AA043093   ESTs,略微近似于S10590半胱氨酸蛋白酶[人](ESTs,Weakly similar to S10590cysteine protemase[H.sapiens])
  1281   B9303   AI271678   ESTs
  1282   C4388   H59788   PBP   前列腺的结合蛋白(prostatic binding protein)
  1283   A3553   J05581   MUC1   粘蛋白1,跨膜(mucin 1,transmembrane)
1284 A5644 W76105   ESTs,略微近似于AF151840 1 CGI-82蛋白[人](ESTs,Weakly similar to AF1518401CGI-82protein[H.sapiens])
1285 A4962 S76474 NTRK2   亲神经的酪氨酸激酶,受体,2型(neurotrophictyrosine kinase,receptor,type 2)
  1286   B3873N   AA703211   FLJ20736   不确定蛋白FLJ20736
  1287   B4531   N62451   人cDNA FLJ11883 fis,克隆HEMBA1007178
1288 B5091 AB037857 PTGFRN   前列腺素F2受体阴性调节因子(prostaglandin F2receptor negative regulator)
1289 C0691 AA132089   ESTs,高度近似于未命名的蛋白产物[人](ESTs,Highly similar to unnamed protein product[H.sapiens])
1290 E0560 AA701308 GALNT2   UDP-N-乙酰-α-D-半乳糖胺:多肽氮-乙酰氨基半乳糖基转移酶2(GalNAc-T2)(UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptideN-acetylgalactosaminyltransferase 2(GalNAc-T2))
1291 A0831 M21389 KRT5   角蛋白5(单纯性大疱性表皮松解,Dowling-Meara/Kobner/Weber-Cockayne型)(keratin 5(epidermolysis bullosa simplex,Dowling-Meara/Kobner/Weber-Cockayne types))
1292 A7765 BC035631 C17orf26   染色体17开放阅读框26(chromosome 17 openreading frame 26)
  1293   A2507   D13757   PPAT   磷酸核糖焦磷酸盐酰胺转移酶(phosphoribosyl
  pyrophosphate amidotransferase)
1294 A7115 U78082 MED6   RNA聚合酶II翻译调节介体(Med6,酿酒酵母,同源物)(RNA polymerase II transcriptional regulationmediator(Med6,S.cerevisiae,homolog of))
1295 A4114N NM001109 ADAM8   一种去整联蛋白和金属硫蛋白酶结构域8(adisintegrin and metalloproteinase domain 8)
  1296   B4017   AA088857   ESTs
  1297   B7165N   AA194384   ESTs
  1298   C4548   N64368   ESTs
1299 B8237 H49431  KIAA0720 KIAA0720蛋白
  1300   B8883   AF070546  IL14   白细胞介素14
  1301   A2955   L15203  TFF3   三叶形因子3(肠的)(trefoil factor 3(intestinal))
1302 A6673 AA020936  LOC51754 NAG-5蛋白
1303 A6979 AI357616   人mRNA;cDNA DKFZp434C107(来自克隆DKFZp434C107)
1304 B6651 N47861 PDP   丙酮酸脱氢酶磷酸酶(pyruvate dehydrogenasephosphatase)
  1305   C1558   AI201953   ESTs
1306 C2000 AF000148 ABCA4   ATP-结合框,亚家族A(ABC1),成员4(ATP-bindingcassette,sub-family A(ABC1),member 4)
1307 C8101 N47307 NDUFA1   NADH脱氢酶(泛醌)1α子复合形,1(7.5kD,MWFE)(NADH dehydrogenase(ubiquinone)1alphasubcomplex,1(7.5kD,MWFE))
  1308   D1346   AI091975   ESTs
1309 A7046 W04300   ESTs,高度近似于未知的基因产物[人](ESTs,Highly similar to Unknown gene product[H.sapiens])
  1310   C1849   AI338625  FJX1   与fjx1同源的推定的分泌型配体(putative secreted
  ligand homologous to fjx1)
1311 A1259 AF007170  KIAA0452 DEME-6蛋白
1312 A4474 AF047433 ITGB4BP   整联蛋白β4结合蛋白(integrin beta 4 bindingprotein)
  1313   B8016   AA528243   ESTs
1314 B3530N AI333192 GJB2   间隙连接蛋白,β2,26kD(连接蛋白26)(gapjunction protein,beta 2,26kD(connexin 26))
  1315   C7582   AA461250   ESTs
1316 D8905 AI021894   ESTs,略微近似于ALU8)_人ALU2SB序列污染警告条目[人](ESTs,Weakly similar toALU8_HUMAN ALU SUBFAMILY SX SEQUENCECONTAMINATION WARNING ENTRY[H.sapiens])
1317 A1139 L24203 ATDC   共济失调-毛细血管扩张D群-相关蛋白(ataxia-telangiectasia group D-associated protein)
1318 A8614 AA521149 PSAP   prosaposin(Gaucher病变体和异染性脑白质营养不良变体)(prosaposin(variant Gaucher disease andvariantmetachromatic leukodystrophy))
1319 C7495 D81606   人mRNA;cDNA DKFZp434M0531(来自克隆DKFZp434M0531)(Homo sapiens mRNA;cDNADKFZp434M0531(from clone DKFZp434M0531))
  1320   C9099   AA505974   ESTs
  1321   A7204   AA315827  TXN   硫氧还蛋白
1322 B7369 AI289480   人cDNA FLJ13044 fis,克隆NT2RP3001355,略微近似于tricarboxylate转运蛋白前体(Homo sapienscDNA FLJ13044 fis,clone NT2RP3001355,weaklysimilar to TRICARBOXYLATE TRANSPORTPROTEIN PRECURSOR)
1323 C9024 AA281364   DKFZp434D177不确定蛋白DKFZp434D177(DKFZp434D177 Hypothetical
  protein DKFZp434D177)
  1324   B4647   AA625270   FLJ20640   不确定蛋白FLJ20640
1325 C7351 AI357002 FACL5   长链脂肪酸辅酶A连接酶5(long-chain fatty acidcoenzyme A ligase 5)
  1326   C0764   AA045020   FLJ13576   不确定蛋白FLJ13576
  1327   C1018   AA970651   人cDNA:FLJ22256 fis,克隆HRC02860
1328 E0465 AA421724 CDC20   CDC20(细胞分裂周期20,酿酒酵母,同源物)(CDC20(cell division cycle 20,S.cerevisiae,homolog))
1329 A0309 U85658 TFAP2C   转录因子AP-2γ(活化增强子-结合蛋白2γ)(transcription factor AP-2gamma(activatingenhancer-binding protein 2gamma))
  1330   B2602   AA810725   FLJ11273   不确定蛋白FLJ11273
1331 B2951 L16785 NME2   非转移性细胞2,蛋白(NM23B)表达于(non-metastatic cells 2,protein(NM23B)expressed in)
1332 A5136N AA029950 ST14   抑制肿瘤发生14(结肠癌,基质降解蛋白酶,epithin)(suppression of tumorigenicity 14(coloncarcinoma,matriptase,epithin))
  1333   B9980   AI284476   ESTs
1334 A3526 D87957 RQCD1   细胞分化1同源物需要的RCD1(粟酒裂殖酵母)(RCD 1required for cell differentiationl homolog(S.pombe))
  1335   A1054   M13755   ISG15   干扰素-刺激蛋白,15kDa
  1336   A1803   M31159   IGFBP3   胰岛素-样生长因子结合蛋白3
1337 A4699 U49260 MVD   甲羟戊酸(二磷酸)脱羧酶(mevalonate(diphospho)decarboxylase)
1338 A2108 U05861 AKR1C1   氧代酮还原酶家族1,成员Cl(二氢二醇脱氢酶1;20-α(3-α)-羟基类固醇脱氢酶)(aldo-keto reductasefamily 1,member C1(dihydrodiol dehydrogenase 1;20-alpha(3-alpha)-hydroxysteroid dehydrogenase))
  1339   A4072   AF040105  RCL   推定的c-Myc-Myc-应答性
  1340   A5567   AA236980   人cDNA FLJ11856 fis,克隆HEMBAl006789
1341 A4011 D26125 AKR1C4   氧代酮还原酶家族1,成员C4(十氯酮还原酶;3-α羟基类固醇脱氢酶,I型;二氢二醇脱氢酶4)(aldo-keto reductase family 1,member C4(chlordecone reductase;3-alpha hydroxysteroiddehydrogenase,type I;dihydrodiol dehydrogenase 4))
  1342   A4122   AA315816  RBX1   环-盒(ring-box)1
1343 A3970 AB105190 GPR49   GG蛋白-偶联受体49(G protein-coupled receptor49)
  1344   A4695   U44427  TPD52L1   肿瘤蛋白D52-样1
1345 A5660 AA780068 HT002   HT002蛋白;高血压-相关钙-调节基因(HT002protein;hypertension-related calcium-regulated gene)
  1346   A2595   Y00281  RPN1   核糖体亲和蛋白I(ribophorin I)
1347 A2402 M61831 AHCY   S-腺苷高半胱氨酸水解酶(S-adenosylhomocysteinehydrolase)
1348 A3246 M57899 UGT1A1   UDP多肽糖苷基转移酶1家族,多肽Al(UDPglycosyltransferase 1 family,polypeptide A1)
1349 A0587 X74795 MCM5   微型染色体保持缺陷的(酿酒酵母)5(细胞分裂周期46)(minichromosome maimenance deficient (S.cerevisiae)5(cell division cycle 46))
1350 A3009 M30704 AREG   双调蛋白(许旺氏细胞瘤-来源的生长因子)(amphiregulin(schwannoma-derived growthfactor))
  1351   A0374   M61764  TUBG1   微管蛋白,γ1
  1352   A2323   V00494  ALB   白蛋白
1353 A7608 AI338589   人mRNA;cDNA DKFZp434B0425(来自克隆DKFZp434B0425)(Homo sapiens mRNA;cDNADKFZp434B0425(from clone DKFZp434B0425))
  1354   A6625   AB002341  NRCAM   二乙基溴乙酰胺细胞粘着分子(neuronal cell
  adhesion molecule)
1355 B5638 AI242496   人cDNA FLJ12827 fis,克隆NT2RP2002939,略微近似于锌指蛋白136(Homo sapiens cDNAFLJ12827 fis,clone NT2RP2002939,weakly similarto ZINC FINGER PROTEIN 136)
1356 A9077 AA233853 E1B-AP5   E1B-55kDa-相关蛋白5(E1B-55kDa-associatedprotein 5)
  1357   B4311   T55926   ESTs
1358 B3857 AA418779 POLR2F   聚合酶(RNA)II(DNA指导的)多肽F(polymerase(RNA)II(DNA directed)polypeptide F)
1359 B8243 AB011090   KIAA0518 Max-相互作用蛋白(Max-imteracting protein)
1360 B5455 AA847227 NUBP2   核苷酸结合蛋白2(大肠杆菌MinD样)(nucleotidebinding protein 2(E.coli MinD like))
1361 B4495 AI146846 PAR3   含有类似于线虫PAR3的蛋白的三-PDZ(分割缺陷)(three-PDZ containing protein similar to C.elegansPAR3(partitioning defect))
1362 A6636 AB105192 SCAMP5   分泌型载体膜蛋白5(secretory carrier membraneprotein 5)
  1363   B4430   AI147455   H17   不确定蛋白
  1364   B8276   AI246699   CATX-8   CATX-8蛋白
1365 A9513N AA775810   ESTs,中度近似于ALUB_HUMAN!!!!ALUB类警告条目!!![人](ESTs,Moderately similar toALUB_HUMAN !!!!ALU CLASS B WARNINGENTRY!!![H.sapiens])
  1366   B3935   AA514317   FLJ11090   不确定蛋白FLJ11090
  1367   B3554   AA720678   ESTs
1368 B4262 AI066536   ESTs,略微近似于ALU8_人ALU SX亚家族序列污染警告条目[人](ESTs,Weakly similar toALU8_HUMAN ALU SUBFAMILY SX SEQUENCECONTAMINATION WARNING ENTRY
 [H.sapiens])
1369 B4094 R47458   KIAA1151 KIAA1151蛋白
1370 B6577N AI086204 TM4SF6  跨膜4超家族成员6(transmembrane 4 superfamilymember 6)
1371 B7305 AA342649   LOC56755 不确定蛋白LOC56755
  1372   B4469   N76634   FLJ20315  不确定蛋白FLJ20315
  1373   B5212   AA468294  ESTs
  1374   B4508   R55793  ESTs
1375 B6879 N72576  ESTs,略微近似于ALU8_人ALU SX亚家族序列污染警告条目[人](ESTs,Weakly similar toALU8_HUMAN ALU SUBFAMILY SX SEQUENCECONTAMINATION WARNING ENTRY[H.sapiens])
1376 C2251 AA923049  ESTs,略微近似于ALU4_人ALU SB2亚家族序列污染警告条目[人](ESTs,Weakly similar toALU4_HUMAN ALU SUBFAMILY SB2SEQUENCE CONTAMINATION WARNINGENTRY[H.sapiens])
  1377   C9596   AA830354  ESTs
1378 C0427 AA402968 LTBP3  潜在转化生长因子β结合蛋白3(latent transforminggrowth factor beta binding protein 3)
1379 C8624 AA827213 AKAP8  一种激酶(PRKA)锚定蛋白8(A kinase(PRKA)anchor protein 8)
  1380   C1958   W31174  ESTs
1381 D0767 AA625387  ESTs,中度近似于ALU7_人ALU SQ亚家族序列污染警告条目[人](ESTs,Moderately similar toALU7_HUMAN ALU SUBFAMILY SQ SEQUENCECONTAMINATION WARNING ENTRY
  [H.sapiens])
  1382   C2226   N20968   ESTs
1383 C8280 D79995  KIAA0173 KIAA0173基因产物
1384 C6985 AA055971 KIAA0810   人cDNA FLJ12407 fis,克隆MAMMA1002843(Homo sapiens cDNA FLJ12407fis,clone MAMMA1002843)
  1385   E1371   AI700180  SES2   sestrin 2
1386 D8019 AA502265 RRP4   酵母RRP4的同源物(核蛋白体RNA加工4),3′-5′-核糖核酸外切酶(homolog of Yeast RRP4(ribosomal RNA processing 4),3′-5′-exoribonuclease)
  1387   D3571   AI208033   ESTs
  1388   D9210   AA921763   ESTs
  NSC编号   LMMID Acc 代号 名称
1389 A2796   NM_006681 NMU 神经调节肽U(neuromedin U)
  1390   A6122   AA332510   MAGE-E1蛋白
1391 A1564 U70370 PITX1   成对的-样同型域转录因子1(p aired-likehomeodomain transcription factor 1)
1392 A4242 AI094346 LGALS7   凝集素,半乳糖苷-结合,可溶解的,7(galectin7)(lectin,galactoside-binding,soluble,7(galectin 7))
1393 B1836 AI093275   人cDNA FLJ14259 fis,克隆PLACE1001076(Homosapiens cDNA FLJ14259 fis,clone PLACE1001076)
  1394   B5412N   AA604379   FLJ10156   不确定蛋白
1395   A2033N U03272 FBN2   原纤蛋白2(先天性挛缩蜘蛛脚样指)(fibrillin 2(congenital contractural arachnodactyly))
  1396   C1701   H60869   ESTs
1397 C4786 N72266   人mRNA;cDNA DKFZp564O2364(来自克隆DKFZp564O2364)(Homo sapiens mRNA;cDNADKFZp564O2364(from clone DKFZp564O2364))
1398 C7152 AI338356   DKFZP586C1324 DKFZP586C1324蛋白
  1399   D1223   AI278397   DLX5   末梢的-较少同源框5(distal-less homeo box 5)
  1400   C7676   AA148929   ESTs
  1401   C7747   AI282097   ESTs
  1402   C6149   W70242   ESTs
  1403   C9574   AA813008   FOP   FGFR1癌基因配对物FR1 oncogene partner)
  1404   C6936   AI028661   ESTs
  1405   C2011   AI087330   ESTs
  1406   C3800   AA122217   LOC51654   CGI-05蛋白
  1407   C4296   AI193975   ESTs
1408 C6211 AI127359 HSPCA   热休克90kD蛋白1,α(heat shock 90kD protein 1,alpha)
1409 C7751 AA159920   ESTs,略微近似于ALU7_人ALU亚家族SQ序列污染警告条目[人](ESTs,Weakly similar toALU7_HUMAN ALU SUBFAMILY SQ SEQUENCECONTAMINATION WARNING ENTRY)
  1410   C8372   AI243594   ESTs
  1411   C7048   R43598   ESTs
  1412   C0589   N20480   HSPC157   HSPC157蛋白
  1413   C2309   AI351898   ESTs
  1414   C7610   AA446866   ESTs
1415 C7681 AA151182 LOC58495   从EUROIMAGE 566589推定的锌指蛋白(putativezinc finger protein from EUROIMAGE 566589)
  1416   D1352   AA465341   ESTs
  1417   C1938   AI332412   HOXC9   同源框C9(homeo box C9)
  1418   C7399   AA195941   ESTs
1419 C9071 AA423972   人cDNA:FLJ22562fis,克隆HSI01814(Homosapiens cDNA:FLJ22562fis,clone HSI01814)
1420 C8926   NM_024944 CHODL 软骨凝集素(chondrolectin)
  1421   C6055   AA001450   ESTs
  1422   C7422   AA131918   TMEM3   跨膜蛋白3(transmembrane protein 3)
  1423   D4376   AA883952   ESTs
1424 E0451 U10691 MAGEA6   黑色素瘤抗原,家族A,6(melanoma antigen,familyA,6)
  1425   D4637   AA740747   ESTs
  1426   D5215   AA937589   ESTs
  1427   D6767   AA904882   ESTs
1428 D3103 AA760780   人,克隆FLC0675 PRO2870 mRNA,完整cds(Homosapiens clone FLC0675PRO2870mRNA,completecds)
1429 E1110   AW187989 ESTs
  1430   B9320   AI360163   ESTs
1431 B6707 AA514538 EIF2C2   真核的翻译起始因子2C,2(eukaryotic translationinitiation factor 2C,2)
1432 B6526 AA634299 PAK6   p21-活化的蛋白激酶6(p21-activated protein kinase6)
  1433   C1796   AA019195   ESTs
  1434   C4520   N63600   ESTs
1435 C6421 AI050743   DKFZp586H0623   不确定蛋白DKFZp586H0623(hypothetical proteinDKFZp586H0623)
1436 D9991 AI074567 FLJ10858   不确定蛋白FLJ10858(hypothetical  proteinFLJ10858)
  1437   C4449   N62731   ESTs
  1438   D1425   T03044   EST
  1439   A3477   U30891   PC   丙酮酸羧化酶(pyruvate carboxylase)
1440 B6854 AI243321   高-迁移率群(非组蛋白染色体的)蛋白2(High-mobility group (nonhistone chromosomal)protein 2)
  1441   B4301   BC039195   HSNOV1   新蛋白(novel protein)
  1442   C6020   AA863228   KIAA0493   KIAA0493蛋白
  1443   C9940   AA923485   ESTs
1444   A5678N AI219861 TMPO 胸腺生成素(thymopoietin)
  1445   C3787   AI439055   RANBP3   RAN结合蛋白3(RAN binding protein 3)
  1446   A0574   X66363   PCTK1   PCTAIRE蛋白激酶1
1447 A6518 AB009672 ADAM23   一种去整联蛋白和金属硫蛋白酶结构域23(adisintegrin and metalloproteinase domain 23)
  1448   B2579N   N70341   KIAA0672   ESTs
非小细胞肺癌的诊断
可以使用取自受试者的生物样品,通过测定各种NSC基因的表达水平,确定该受试者患有非小细胞肺癌或具有患非小细胞肺癌的倾向性。
本发明包括对表1-3所列NSC序列中的至少一个直至所有序列的表达水平进行测定(例如,检测)。
按照本发明对非小细胞肺癌-相关基因的基因转录物进行检测,以测定所述基因的表达水平。可以在已知序列GenBank数据库登录(entry)提供的序列信息基础上,使用本领域普通技术人员熟知的技术对所述非小细胞肺癌相关基因进行检测和测定。所述方法检测的基因转录物包括转录和翻译产物,例如mRNA和蛋白。例如:可以使用与NSC多核苷酸相应的序列数据库登录中的序列构建探针用于通过例如Northern印迹杂交分析的探针检测NSC mRNA。探针与受试者生物样品中基因转录物间的杂交还可以在DNA阵列上进行。优选使用阵列检测大量NSC基因的表达水平。作为另一个实例,在例如以扩增为基础的检测方法如反转录聚合酶链反应(RT-PCR)中,可以用所述序列构建用来特异性扩增NSC多核苷酸用的引物。另外,还可以根据所述基因编码蛋白的生物活性或量对NSC的表达水平进行分析。可用于测定蛋白量的方法包括免疫测定方法。
任何生物材料都可以作为用于测定表达水平的生物样品,只要该样品中能够检测出NSC基因即可,其中包括受试细胞群(即,取自受试者的组织样品)。优选地,所述生物样品中含有肺细胞(从肺得到的细胞)。基因表达还可以在血液、血清其它体液例如痰液中测定。另外,所述受试样品还可以是纯化自组织的细胞。
用于根据本发明所述方法诊断非小细胞肺癌所针对的受试者优选为哺乳动物,包括人、非人灵长类动物、小鼠、大鼠、狗、猫、马和母牛。
将生物样品中的一种或多种NSC基因的表达水平与参照样品中所述基因的表达水平进行比较。所述参照样品包括一种或多种参数已知的细胞,即,癌性或非癌性细胞。所述参照样品应取自与受受试样品品所来源组织类似的组织。可选,还可以根据来自细胞的分子信息数据库测定对照表达水平,其中测定参数或条件已知。
生物样品中基因表达水平的模式是否表明存在NSCLC取决于参照细胞群的组成。例如,当参照细胞群体是由非癌性细胞组成时,受试生物样品中基因表达水平与参照的所述水平近似表明所述受试生物样品是非癌的。反之,当对照细胞群是由癌性细胞组成时,受试生物样品中基因表达水平与参照的所述水平近似表明所述受试生物样品包含癌性细胞。
可以将受试生物样品与多个参照样品进行比较。所述多种参照样品中的每一种的已知参数可不相同。因此,可以将受试样品与已知含有例如非小细胞肺癌细胞的参照样品进行比较,而且同时与已知含有例如非-非小细胞肺癌(non-non-small cell lung cancer)细胞(正常细胞)的第二参照样品进行比较。
根据本发明,对生物样品中的一种或多种非小细胞肺癌-相关基因例如NSC 1-1448的表达进行测定,并与相同基因的正常对照水平进行比较。术语“正常对照水平“是指通常见于未患非小细胞肺癌群体的生物样品中的非小细胞肺癌-相关基因的表达图谱。对照和受试者的生物样品中NSC基因表达水平可以同时测定,或者正常对照水平可以基于对此前从对照组收集的样品中的基因表达水平进行分析所获结果,通过统计学方法测定。源自患者组织样品的生物样品中非小细胞肺癌-相关基因的表达水平与正常对照水平相比升高或降低,表明该受试者患有或易患非小细胞肺癌。例如,与正常对照水平相比,受试生物样品中NSC 807-1448的表达水平升高,表明该该受试者患有或易患非小细胞肺癌。反之,受试生物样品中NSC 1-806的表达水平与正常对照水平相比降低,表明该受试者患有或易患非小细胞肺癌。
当受试生物样品中NSC基因的表达水平与对照水平之间差别超过1.0,1.5,2.0,5.0,10.0或更多倍时,可以认为该受试生物样品中NSC基因的表达水平发生了变化。可选,与对照水平相比,当受试生物样品中NSC基因的表达水平升高或降低至少50%,60%,80%,90%或更多时,就可以认为该受试生物样品中NSC基因的表达水平发生了变化。
可以根据对照使受试样品和标准样品之间的基因表达差异标准化,所述对照例如持家基因(housekeeping gene)。例如,对照多核苷酸可以包括那些已知其表达水平在癌性和非癌性细胞之间没有差异的多核苷酸。受试核参比样品中的对照多核苷酸表达水平可用于将所检测到的NSC基因表达水平标准化。本发明中使用的对照基因包括β-肌动蛋白、甘油醛3磷酸脱氢酶和核糖体蛋白P1。
本申请中鉴定的差异性表达的NSC基因还可用于监测非小细胞肺癌的治疗过程。这些方法中,从正在接受非小细胞肺癌治疗的受试者获得受试生物样品。如果需要,可以在所述治疗之前、期间或之后的不同时间点从受试者获取多个受试生物样品。然后,对样品中一种或多种NSC基因的表达进行测定,并与处于还未暴露于所述治疗的非小细胞肺癌已知状态的参照样品进行比较。
如果所述参照样品不包含非小细胞肺癌细胞,受试生物样品和参照样品中NSC基因的表达水平近似则表明所述治疗是有效的。但是,NSC基因的表达水平在受试样品和参照样品中的差异则表明临床结果或预后很差。
术语“有效的”是指所述治疗导致:病理性上调的基因(NSC 807-1448)的表达减少,病理性下调的基因(NSC 1-806)的表达升高,或者受试者中非小细胞肺癌的大小、发病率或转移可能性降低。当一种治疗为预性给予时,“有效的”意味着所述治疗延迟或者阻止了非小细胞肺癌的发生或者减轻了非小细胞肺癌的临床症状。所述非小细胞肺癌的评定可以使用标准临床方法来完成。另外,可以与用于诊断或治疗非小细胞肺癌的任何已知方法结合对治疗的有效性进行测定。例如,从组织病理学或者通过鉴别症状来诊断非小细胞肺癌,所述症状例如慢性咳嗽(chronic cough),嘶哑(hoarseness),咳血(coughing up blood),体重减少,食欲不振,气短(shortness of breath),哮喘(wheezing),反复发作的支气管炎或肺炎和胸痛。
此外,本发明用于诊断非小细胞肺癌的方法还可用于通过比较源自患者的生物样品中NSC基因的表达水平来评估癌症患者的预后。可选,可以在疾病各个阶段过程中对生物样品中所述基因的表达水平进行测定从而评定患者的预后情况。
与正常对照水平相比,NSC 807-1448的表达水平升高或者NSC 1-806的表达水平降低表明预后不良。与正常对照水平相比,NSC 807-1448或者NSC 1-806的表达水平近似则表明该患者预后良好。优选地,可以通过比较NSC 807-1448或者NSC 1-806的表达图谱对受试者的预后情况进行评定。
表达图谱
本发明还提供了一种非小细胞肺癌参照表达图谱,其中NSC 1-1448中两种或多种基因表达水平的模式。所述表达图谱可用作下列用途的对照:诊断非小细胞肺癌或患所述疾病倾向性,监测治疗过程,以及评定患该疾病受试者的预后。
鉴定可抑制或增强非小细胞肺癌-相关基因表达的化合物
通过下述方法鉴定可抑制非小细胞肺癌-相关基因表达或活性的化合物:使表达非小细胞肺癌-相关基因的受试细胞与受试化合物接触,测定该非小细胞肺癌-相关基因的表达水平或活性。其表达与正常对照水平相比降低表明该化合物是该非小细胞肺癌-相关基因的抑制因子。当所述受试细胞中表达的非小细胞肺癌-相关基因是上调的基因时,根据该方法鉴定的化合物可用于抑制非小细胞肺癌。
可选,通过下述操作可以将提高非小细胞肺癌-相关基因表达或活性的化合物鉴定为该基因的增强子:使表达非小细胞肺癌-相关基因的受试细胞群与受试化合物接触,测定该非小细胞肺癌-相关基因的表达水平或活性。当所述受试细胞中表达的非小细胞肺癌-相关基因是下调的基因时,根据该方法鉴定的化合物可用于抑制非小细胞肺癌。
所述受试细胞可以是细胞群,包括任何细胞,只要该细胞表达靶非小细胞肺癌-相关基因。例如,所述受试细胞含有上皮细胞,所述细胞可源自肺组织、血液、血清或痰。所述受试细胞可以是一种源自非小细胞肺癌细胞的无限增殖细胞系。可选,所述受试细胞可以是用NSC基因转染的细胞或者是已经用NSC基因的调控序列(例如启动子)转染的细胞,所述调控序列可操作地连接于报道基因。
筛选化合物
可以使用NSC基因、该基因编码的蛋白或该基因的转录调控区域,筛选能够改变所述基因表达或者所述基因编码多肽的生物活性的化合物。该化合物可用作能够用于治疗或者预防非小细胞肺癌的药物。
因此,本发明还提供了一种使用本发明所述多肽筛选用于治疗或预防非小细胞肺癌的化合物的方法。这种筛选方法的实施方案中含有下列步骤:(a)使受试化合物与本发明所述多肽接触;(b)检测本发明所述多肽与所述受试化合物之间的结合活性;以及(c)选择能与本发明所述多肽结合的化合物。
筛选使用的多肽可以是一种重组多肽或者一种天然来源的蛋白或者其部分的肽。用于与受试化合物接触的多肽可以是,例如,纯化的多肽、可溶解的蛋白,与载体结合的形式或者与其它多肽融合在一起的融合蛋白。
作为筛选可结合NSC多肽的蛋白的方法,本领域技术人员熟知的许多方法都可使用。所述筛选可以通过例如免疫沉淀法法(immunoprecipitation)实施,具体而言是用下列方式。可以通过下述操作在动物细胞等中表达编码任一所述NSC多肽的基因:将所述基因插入外来基因的表达载体,诸如pSV2neo、pcDNA I、pcDNA3.1、pCAGGS和pCD8。所述表达用的启动子可以是通常使用的任一启动子,包括,例如,SV40早期启动子(Rigby inWilliamson(ed.),Genetic Engineering,vol.3.Academic Press,London,83-141(1982))、EF-α启动子(Kim et al.,Gene 91:217-23(1990)),CAG启动子(Niwa et al.,Gene 108:193-200(1991))、RSV LTR启动子(Cullen,Methodsin Enzymology 152:684-704(1987))SRα启动子(Takebe et al.,Mol Cell Biol8:466(1988))、CMV即时早期(immediate early)启动子(Seed and Aruffo,Proc Natl Acad Sci USA 84:3365-9(1987))、SV40晚期启动子(Gheysen andFiers,J Mol Appl Genet 1:385-94(1982))、腺病毒启动子(Kaufman et al.,Mol Cell Biol 9:946(1989))、HSV TK启动子等等。将所述基因导入表达外源基因的动物细胞可以用任一方法完成,例如,电穿孔方法(Chu et al.,Nucleic Acids Res 15:1311-26(1987))、磷酸钙方法(Chen and Okayama,Mol Cell Biol 7:2745-52(1987))、DEAE葡聚糖方法(Lopata et al.,NucleicAcids Res 12:5707-17(1984);Sussman and Milman,Mol Cell Biol 4:1642-3(1985))、脂质转染(Lipofectin)方法(Derijard,B Cell 7:1025-37(1994);Lambet al.,Nature Genetics 5:22-30(1993):Rabindran et al.,Science 259:230-4(1993))等。还可以将所述NSC多肽表达为含有单克隆抗体识别位点的融合蛋白,可通过将特异性已知该单克隆抗体的表位引入所述多肽的N或C-末端进行。可以使用商品化的表位-抗体系统(实验医学13:85-90(1995))。可利用其多克隆位点而表达带有例如β-半乳糖苷酶、麦芽糖结合蛋白、谷胱甘肽S-转移酶、绿色荧光蛋白(GFP)等的融合蛋白的载体,可以从商业渠道获得。
另外,还报道了通过引入仅由数个到十数个(dozen)氨基酸组成的小表位制备的融合蛋白,其中NSC多肽的特性不至因融合而改变。表位例如聚组氨酸(His-标记)、流感病毒血凝素(influenza aggregate)HA、人C-myc标记、水泡性口膜炎病毒(Vesicular stomatitis virus)糖蛋白(VSV-GP),T7基因10蛋白(T7-标记)、人单纯疱疹病毒(human simple herpes virus)糖蛋白(HSV-标记),E-标记(去单克隆噬菌体上的表位)等,以及识别它们的单克隆抗体都可用作表位-抗体系统来筛选能结合所述NSC多肽的蛋白(实验医学13:85-90(1995))。
在免疫沉淀法中,通过向用合适的去污剂制备的细胞裂解物中添加这些抗体从而形成免疫复合物。所述免疫复合物是由所述NSC多肽、具有能与该多肽结合能力的多肽和抗体组成。除使用抗上述表位的抗体之外,免疫沉淀还可以使用抗NSC多肽的抗体实施,所述抗NSC多肽抗体可以用上述方法制备。
当所述抗体是一种小鼠IgG抗体时,可以用例如蛋白A琼脂糖或蛋白G琼脂糖沉淀免疫复合物。如果所述NSC多肽被制备成为带有表位例如GST的融合蛋白时,可以用与使用抗NSC多肽抗体相同的方式形成免疫复合物,这时要使用能与这些表位特异性结合的物质,例如谷胱甘肽-琼脂糖4B。
免疫沉淀可以通过按照或根据文献(Harlow and Lane,Antibodies,511-52,Cold Spring Harbor Laboratory publications,New York(1988))中记载的方法进行。
通常使用SDS-PAGE对免疫沉淀的蛋白进行分析,结合蛋白可以使用合适浓度的凝胶通过该蛋白的分子量进行分析。由于与NSC多肽结合的蛋白用常规染色法例如考马氏染色或银染色很难检测,因而可以通过下述方法提高所述蛋白的检测灵敏度:将细胞培养在含有放射性同位素35S-甲硫氨酸或35S-半胱氨酸的培养基中,标记所述细胞中的蛋白,然后检测该蛋白。蛋白可以直接用SDS-聚丙烯酰胺凝胶纯化,然后可以在该蛋白分子量已知时测定其序列。
使用任意NSC多肽筛选能与该多肽结合的蛋白的方法可用Western印迹分析(Skolnik et al,Cell 65:83-90(1991))。具体而言,可以通过下述方法获得能结合NSC多肽的蛋白:使用噬菌体载体(例如ZAP),从期望表达能与NSC多肽结合的蛋白的细胞、组织、器官(例如,组织如睾丸和前列腺)或者培养的细胞(例如LNCaP、PC3、DU145)制备cDNA文库;将该蛋白表达于LB-琼脂糖上,将该蛋白固定在滤膜上,使经过纯化和标记的NSC多肽与上述滤膜反应,然后根据所述标记来检测表达与NSC多肽结合的蛋白的噬斑。可以用下述方法对NSC多肽进行标记:利用生物素与抗生物素蛋白之间的结合,或者使用能特异性结合该NSC多肽的抗体,或者与NSC多肽融合的肽或者多肽(例如,GST)。也可以使用采用放射性同位素或者荧光等标记的方法。
可选,在本发明所述筛选方法的另一实施方案中,可以使用双杂交系统(“MATCHMAKER双杂交系统”,“Mammalian MATCHMAKER双杂交测定试剂盒”,“MATCHMAKER单杂交系统”(Clontech);“HybriZAP双杂交载体系统”(Stratagene);参照“Dalton and Treisman,Cell 68:597-612(1992)”,“Fields and Stemglanz,Trends Genet 10:286-92(1994)”)。
在双杂交系统中,将NSC多肽与SRF-结合区或GAL4-结合区融合,并表达于酵母细胞中。从预期表达与NSC多肽结合的蛋白的细胞制备cDNA文库,从而使得该文库在表达时与VP16或GAL4转录活化区域融合。然后将cDNA文库导入上述酵母细胞,从检测为阳性的克隆分离出源自所述文库的cDNA(当能与本发明所述多肽结合的蛋白表达于酵母细胞时,这两者的结合能够活化报道基因使得阳性克隆可检测)。可以通过将上述的分离的cDNA导入大肠杆菌并表达所述蛋白来制备所述cDNA编码的蛋白。
就报道基因而言,除HIS3基因外,还可使用例如Ade2基因、lacZ基因、CAT基因、荧光素酶基因等。
能与NSC多肽结合的化合物还可以使用亲和层析法筛选。例如,可以将NSC多肽固定于亲和层析柱的载体,然后将包括能与NSC多肽结合的蛋白的受试化合物加于该层析柱。本申请中的受试化合物可以是,例如细胞提取物、细胞裂解物等。在将所述受试化合物上样后,对柱体进行洗涤,这样就能制备出与NSC多肽结合在一起的化合物。
当受试化合物是一种蛋白时,对获得的蛋白的氨基酸序列进行分析,然后基于该序列合成寡聚DNA,用该寡聚DNA作探针筛选cDNA文库获得编码所述蛋白的DNA。
可以将利用表面胞质团共振现象(surface plasmon resonancephenomenon)的生物传感器(biosensor)用作对本发明中结合的化合物进行检测或定量的手段。当使用这类生物传感器时,NSC多肽和受试化合物之间的相互作用可以作为一种表面胞质团共振现象进行实时观察,只使用极少量的多肽且不需标记(例如,BIAcore,Pharmacia)。因此,可以使用生物传感器诸如BIAcore对NSC多肽和受试化合物之间的结合情况进行测评。
筛选当固定化的NSC多肽暴露于合成化合物、或天然物质库、或随机噬菌体肽展示文库时发生结合的分子的方法,以及根据组合化学技术(Wrighton等,Science 273:458-64(1996);Verdine,Nature 384:11-13(1996);Hogan,Nature 384:17-9(1996))利用高通量分离与NSC蛋白(包括激动剂和拮抗剂)结合的蛋白以及化合物的筛选方法是本领域技术人员熟知的。
另外,本发明提供了一种利用NSC多肽筛选用于治疗或预防非小细胞肺癌的化合物的方法,包括以下步骤:
(a)将受试化合物与NSC多肽接触;
(b)检测步骤(a)中NSC多肽的生物活性;和
(c)选择使与没有受试化合物时检测到的多肽生物活性相比NSC多肽生物活性被抑制或增强的化合物。
因为NSC1-1448之一编码的蛋白具有促进非小细胞肺癌细胞增生的活性,所以用这种活性作为指标可以筛选化合物,所述化合物促进或抑制这些蛋白之一的这种活性。
可用任何多肽进行筛选只要它们有NSC蛋白的生物活性。这种生物活性包括NSC 807-1448之一编码的人蛋白的细胞增生活性。例如,也可使用NSC 807-1448之一编码的人蛋白及其功能等价多肽。这种多肽可由细胞内源性或外源性表达。
通过这种筛选分离的化合物是NSC多肽的激动剂或拮抗剂。术语“激动剂“指通过与其结合活化NSC多肽的功能的分子。术语“拮抗剂”指通过与其结合抑制NSC多肽功能的分子。而且,通过这种筛选分离的化合物是抑制NSC多肽与分子(包括DNA和蛋白)在体内的相互作用的候选化合物。
当本发明方法中所检测的生物活性是细胞增生时,可例如下述进行检测:制备表达NSC多肽(例如NSC 807-1448)的细胞,在存在受试化合物的情况下培养所述细胞,测定细胞增生速度,测定细胞周期等,以及测定集落形成活性。
如前文所详细讨论的,通过控制NSC基因的表达水平,我们可以控制非小细胞肺癌的发病和进程。因此,通过以NSC基因表达水平作为标志进行筛选可鉴定用于治疗或预防非小细胞肺癌的化合物。在本发明的上下文中,这种筛选包括,例如下述步骤:
a)将受试化合物与表达一或多种NSC基因的细胞接触;和
b)筛选使得NSC 807-1448基因的的一或多种的表达水平与没有该受试化合物时检测到所述水平相比降低或升高的化合物。
表达至少一种NSC基因的细胞包括,例如从非小细胞肺癌建立的细胞系;这种细胞可用于本发明上述的筛选方法(例如A549,NCI-H226,NCI-H522,LC319)。根据本领域技术人员熟知的方法估计所述表达水平。筛选方法中,选择降低至少一种NSC基因表达水平的化合物作为治疗或预防非小细胞肺癌的候选试剂。
或者,本发明筛选方法包括以下步骤:
a)使受试化合物与导入了载体的细胞接触,该载体含有一或多种标记基因的转录调节区以及在该转录调节区控制下表达的报道基因,其中一或多种标记基因是NSC 1-1448,
b)测定所述报道基因的活性;和
c)当所述报道基因是上调的基因(例如NSC 807-1448)时,选择使得与对照相比所述报道基因表达水平降低的化合物,或当所述报道基因是下调的基因(例如NSC 1-806)时,选择使得与对照相比所述报道基因表达水平升高的化合物。
适合的报道基因和宿主细胞是本领域已知的。筛选所需的报道构建体可利用标记基因的转录调节区来制备。如果标记基因的转录调节区是本领域技术人员已知的,可利用前面的序列信息制备报道构建体。当标记基因的转录调节区是未确定的,可根据该标记基因的核苷酸序列信息从基因组文库分离含有转录调节区的核苷酸片段。
任何受试化合物,例如,细胞提取物,细胞培养上清液,微生物发酵产物,海洋生物提取物,植物提取物,纯化的或粗制的蛋白,肽,非肽化合物,合成的小分子化合物以及天然化合物都可用在本发明的筛选方法中。本发明受试化合物可使用本领域已知的组合文库中的多种方法之一获得,所述文库包括(1)生物学文库,(2)空间定位平行固相或液相文库(spatiallyaddressable parallel solid phase or solution phase libraries)(3)需要重叠合法(deconvolution)的合成文库法,(4)“一珠一化合物(one bead one compound)”文库法和(5)使用亲和层析筛选的合成文库法。使用亲和层析筛选的生物学文库法仅限于肽文库,而其它四种方法适用于肽,非肽寡聚体或化合物小分子文库(Lam(1997)Anticancer Drug Des.12:145)。合成分子文库的方法的举例见于下述文献(DeWitt等(1993)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 90:6909;Erb等(1994)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 91:11422;Zuckermann等(1994)J.Med.Chem.37:2678;Cho等(1993)Science 261:1303;Carell等(1994)Angew.Chem,Int.Ed.Engl.33:2059;Carell等(1994)Angew.Chem.Int.Ed.Engl.33:2061;Gallop等(1994)J.Med.Chem.37:1233)。化合物文库可存在于溶液(参见Houghten(1992)Bio/Techniques 13:412)或珠(Lam(1991)Nature 354:82),芯片(Fodor(1993)Nature 364:555),细菌(美国专利5,223,409),孢子(美国专利5,571,698;5,403,484,and 5,223,409),质粒(Cull等(1992)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 89:1865)或噬菌体(Scott and Smith(1990)Science 249:386;Delvin(1990)Science 249:404;Cwirla等(1990)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 87:6378;Felici(1991)J.Mol.Biol.222:301;美国专利申请2002103360)。根据本发明所述筛选方法,暴露于细胞或蛋白的受试化合物可以是单个化合物或化合物的组合。当本发明筛选方法中使用的是化合物的组合时,所述化合物可以依次或同时接触。
通过本发明所述筛选方法分离的化合物是促进或抑制NSC多肽活性的药物的候选物,可用于治疗或预防因细胞增生性疾病引发的疾病,诸如非小细胞肺癌。用本发明筛选方法获得的化合物的部分结构由于添加、缺失和/或取代发生了变化,这样的化合物也包括在用本发明筛选方法获得的化合物中。能有效刺激低表达(under-expressed)基因(例如,NSC 1-806)或者能有效抑制过表达的基因(例如,NSC 807-1448)表达的化合物被认为具有临床效果,而且可以进一步测定其能否阻止动物模型或者受试对象中癌细胞的生长。
选择适于具体个体的非小细胞肺癌治疗药物
个体基因组成的不同能导致其代谢各种药物的相对能力的差异。一种能在受试者中作为抗非小细胞肺癌药物而被代谢的化合物,能够通过在该受试者细胞中诱导基因表达模式改变而显示出来,所述改变为由具有癌性状态特征的基因表达模式为具有非癌性状态特征的基因表达模式。因此,本申请中公开的差异性表达的NSC基因使得能够通过在源自所选择受试者的受试细胞(或受试细胞群)中检测候选化合物,选出适合具体受试者的非小细胞肺癌的推定的治疗或预防性抑制物。
为了鉴定适合于具体受试者的抗非小细胞肺癌药物,将源自该受试者的受试细胞或受试细胞群暴露于该治疗剂,然后测定一种或多种NSC1-1448基因的表达。
所述受试细胞是表达非小细胞肺癌相关基因的非小细胞肺癌细胞,或者所述受试细胞群中含有表达非小细胞肺癌相关基因的非小细胞肺癌细胞。优选地,所述受试细胞是一种上皮细胞或者所述受试细胞群含有上皮细胞。例如,将所述受试细胞或者受试细胞群在有候选药物存在的条件下进行保温,然后测定所述受试细胞或细胞群的基因表达模式,并与一种或多种对照图谱进行比较,例如,非小细胞肺癌参照表达图谱或者非-非小细胞肺癌肺癌参照表达图谱。
与含有非小细胞肺癌的对照细胞群相比,NSC 807-1448中一种或多种的表达降低或者NSC1-806中一种或多种的表达升高表明所述药物是有疗效的。
所述测试药物可以是任一化合物或组合物。例如:所述测试药物是一种免疫调节剂。
试剂盒
本发明还提供了一种试剂盒,其中含有NSC-检测试剂,例如,一种能特异性结合或者鉴定一种或多种NSC多核苷酸的核酸。所述的能特异性结合或者鉴定一种或多种NSC多核苷酸的核酸例如,与部分NSC多核苷酸互补的寡核苷酸序列,或能与NSC多核苷酸所编码多肽结合的抗体。可以将所述试剂一起包装在试剂盒中。所述试剂,诸如核酸或抗体(结合在固体基质上或者同用于将其结合至所述基质上的试剂分开包装)、对照试剂(阳性和/或阴性的)和/或检测所述核酸或抗体用的手段(means),优选包装在分开的容器中。可以将实施所述测定用的说明书(例如,文字、磁带、VCR、CD-ROM等)包括在所述试剂盒中。所述试剂盒的测定方式可以是本领域已知的Northern杂交或夹心ELISA。
例如,将NSC检测试剂固定于固体基质例如多孔条带上形成至少一个NSC检测位点。所述多孔条带的测定或检测区域可以包括大量的检测位点,每个检测位点含有一种NSC检测试剂。测试条带还可以包含阴性和/或阳性对照位点。可选,对照位点可位于与所述测试条带分开的带。任选地,所述不同的检测位点可以包含不同量的固定化试剂,即第一检测位点中的含量较高,随后的位点中的量较低。当加入受试生物样品时,显示可检测信号的位点数提供了存在于样品中的NSC含量的定量指标。可以将所述检测位点设置为任一合适的可检测形状,通常为条形或者横跨测试条带宽度的斑点。
可选,所述试剂盒包含一种核酸底物阵列,其中含有一种或多种NSC多核苷酸序列。所述阵列上的核酸能够特异性鉴定NSC 1-1448代表的一种或多种多核苷酸序列。NSC 1-1448代表的基因的2,3,4,5,6,7,8,9,10,15,20,25,40或50或更多种基因的表达,可以通过与阵列测试条带或芯片的结合水平来鉴定。所述底物阵列可以位于例如固体基底例如美国专利US5,744,305中描述的“芯片”上。
阵列及复数形式(Pluralities)
本发明还包括一种核酸底物阵列,其中含有一种或多种NSC多核苷酸序列。所述阵列上的核酸特异性地对应于NSC 1-1448表示的一种或多种多核苷酸序列。NSC 1-1448表示基因中的2,3,4,5,6,7,8,9,10,15,20,25,40或50或更多种基因的表达水平可以通过检测核酸与所述阵列的结合来鉴定。
本发明还包括一种分离的核酸复数形式(即两种或多种核酸的混合物)。所述核酸处于液相或固相,例如,固定于固体支持物例如硝化纤维膜。所述复数形式包含NSC 1-1448代表的一种或多种多核苷酸。根据本发明的另一实施方案,所述复数形式包含NSC 1-1448代表的多核苷酸中的2,3,4,5,6,7,8,9,10,15,20,25,40或50或更多种多核苷酸。
芯片
DNA芯片是一种便于同时对许多基因的表达水平进行比较的装置。以DNA芯片为基础的表达图谱的构建可以利用例如“Microarray BiochipTechnology”(Mark Schena,Eaton出版,2000)中公开的方法等。
DNA芯片中含有检测大量基因用的经过固定化高-密度探针。因此,通过单轮分析就能同时测定出许多基因的表达水平。即,样品的表达图谱可以用DNA芯片测定。本发明所述以DNA芯片为基础的方法包括下列步骤:
(1)合成与标记基因相应的aRNA或cDNA;
(2)将上述aRNA或cDNA与标记基因的探针杂交;以及
(3)检测与所述探针杂交的aRNA或cDNA,然后对其mRNA进行定量。
aRNA是指用RNA聚合酶从模板cDNA转录得到的RNA。用于基于DNA芯片的表达图谱的aRNA转录试剂盒可购得。用所述试剂盒,可以使用T7RNA聚合酶以连有T7启动子的cDNA为模板合成aRNA。另一方面,可以通过使用随机引物,用从mRNA合成的cDNA为模板通过PCR扩增cDNA。
可选,所述DNA芯片中含有已点于所述芯片上的探针,用于检测本发明所述标记基因的探针。点在所述DNA芯片上的标记基因的数目没有限制。例如,可以从本发明所述标记基因中挑选5%或更多,优选20%或更多,更多优选50%或更多,甚至更优选70%或更多。可以将任何其它基因与所述标记基因一起点在所述DNA芯片上。例如,可以将表达水平几乎不变的基因的探针点于所述DNA芯片上。当意欲比较多个芯片或不同测定之间的测定结果时,可以用这样的基因将测定结果标准化。
为所选的每一种标记基因设计探针,然后将所述探针点于DNA芯片上。所述探针可以是,例如含有5-50个核苷酸残基的寡核苷酸。用于在DNA芯片上合成所述寡核苷酸的方法已为本领域技术人员所知。较长的DNA可以通过PCR或化学方法合成。用于将用PCR或其它方法合成的长DNA点于载玻片上的方法也已为本领域技术人员已知。通过上述方法获得的DNA芯片可用于诊断本发明所述的非小细胞肺癌。
使制备得到的DNA芯片与aRNA接触,然后对上述探针与aRNA之间的杂交情况进行检测。可以提前用荧光染料标记aRNA。可以用荧光染料诸如Cy3(红色)和Cy5(绿色)等标记aRNA。将来自受试者和对照的aRNA分别用不同的荧光染料标记。可以根据上述信号强度的差异测算出上述二者之间表达水平的差异。DNA芯片上的荧光染料信号可以用扫描器检测,然后用专门的程序进行分析。例如,来自Affymetrix的Suite是一种DNA芯片分析用的软件包。
用于治疗或预防非小细胞肺癌的方法
本发明提供了一种用于治疗、减轻或预防受试者非小细胞肺癌的方法。治疗化合物可以预防或治疗性给予患有或易患非小细胞肺癌(或对非小细胞肺癌敏感)的受试者。用常规临床方法或通过检测NSC 1-1448表达或活性的水平异常对所述受试者进行鉴定。在显现明显的疾病临床症状之前进行预防给药,从而阻止或者延迟疾病或病症的进程。
所述治疗方法包括提高基因的一种或多种基因产物的表达或/和功能,所述基因在非小细胞肺癌细胞中的表达与在正常细胞(来自与非小细胞肺癌细胞所来源组织类型相同的组织)的表达相比降低(“低-表达的基因”)。这些方法中,用有效量的化合物治疗所述受试者,该化合物能使所述受试者中一种或多种低表达的基因(NSC 1-806)的表达量升高。该化合物的给药可以是全身性的或局部性的。所述治疗化合物包括:低表达的基因的多肽产物,或其生物活性片段;位于表达调控元件下游的编码低表达基因的核酸,该调控元件使得所述基因能够在非小细胞肺癌细胞中表达;以及能使内源性存在于非小细胞肺癌细胞中的所述基因的表达水平提高的化合物(即,上调低表达的基因的表达的化合物)。施用所述治疗化合物能够对抗受试者肺细胞中异常低表达的基因的作用,改善该受试者的临床状况。所述化合物可以通过本发明上述筛选方法获得。
所述方法还包括基因的一种或多种基因产物的表达或/和功能,所述基因在非小细胞肺癌细胞中的表达与在正常细胞(来自与非小细胞肺癌细胞所来源组织类型相同的组织)的表达相比升高(“过-表达的基因”)。所述表达可以用本领域已知的任一方法抑制。例如,用有效量的化合物治疗所述受试者,该化合物能使所述受试者中一种或多种过表达基因(NSC 807-1448)的表达量降低。该化合物的给药可以是全身性的或局部性的。所述治疗化合物包括能使内源性存在于非小细胞肺癌细胞中的所述基因的表达水平降低的化合物(即下调过表达的基因的表达的化合物)。施用所述治疗化合物能够对抗受试者肺细胞中异常过表达基因的作用,改善该受试者的临床状况。所述化合物可以通过本发明上述的筛选方法获得。
能够调节用于治疗或预防本发明所述非小细胞肺癌的蛋白(NSC1-1448)的活性的化合物包括蛋白、这些蛋白的天然同源配体、肽、肽模拟物以及其它小分子。
可选,可以用下述方法抑制所述过表达的基因(NSC 807-1448)的表达:向受试者施用一种能抑制或拮抗所述过表达的基因的表达的核酸。能够干扰过表达的基因的表达的反义寡核苷酸、siRNA或核酶可用于抑制所述过表达的基因的表达。
如上所述,与NSC 807-1448中任一核苷酸序列对应的反义-寡核苷酸可用于降低所述NSC 807-1448的表达水平。与非小细胞肺癌中表达上调的NSC 807-1448对应的反义-寡核苷酸可用于治疗或预防非小细胞肺癌。具体而言相应mRNA结合发挥作用,从而抑制所述基因的转录或翻译,促进mRNA的降解,和/或抑制NSC核苷酸编码蛋白的表达,并且最终抑制所述蛋白的功能。在本申请中的术语“反义-寡核苷酸”包括与靶序列完全互补的核苷酸和有一处或多处错配的核苷酸,只要所述反义-寡核苷酸能与所述靶序列特异性杂交即可。例如,本发明所述反义-寡核苷酸包括具有SEQ IDNO:423,425,427,429,431,433,435,437,439,441,443,445,447,449,451,453,455,457,459,461,463,465,467,469,471,473,475,477,479,481,483,485,487,489,491,493,495,497,499,501,503,505,507,509,511,513,515,517,519,521,523,525,527,529和531所示的核苷酸序列,现已证明这些核苷酸序列都能有效抑制NSCLC细胞系的转化灶形成。此外,本发明所述反义-寡核苷酸包括具有下述特征的多核苷酸:在至少15个连续核苷酸范围内与任一NSC807-1448所示核苷酸序列具有至少70%或更高,优选为80%或更高,更优选为90%或更高,甚至更优选为95%或更高同源性。所述同源性可以使用本领域已知的算法测定。另外,所述反义寡核苷酸的衍化物或修饰产物也可用作本发明所述的反义寡核苷酸。所述修饰产物包括例如低级烷基膦酸酯(low alkyl phosphnote modification)修饰,例如甲基膦酸酯-型(methyl-phosphonate type)或乙膦酸酯-型(ethyl-phosphonate-type),硫代磷酸修饰(phosphorothioate)以及磷酰胺(phosphoroamidate)修饰。
所述反义-寡核苷酸及其衍生物通过下述过程对生成NSC 807-1448编码蛋白的细胞发挥作用:与编码所述蛋白的DNA或mRNA结合,抑制它们的转录或翻译,促进所述mRNA的降解并抑制所述蛋白的表达,从而使所述蛋白的功能受到抑制。
可以通过与相对所述衍生物无活性的合适基底材料混合,将反义-寡核苷酸及其衍生物制备成外用制剂,例如搽剂(liniment)或膏药(poultice)。
本发明所述反义-寡核苷酸可抑制NSC 807-1448中任一编码的至少一种NSC蛋白,因而可用于抑制所述蛋白的生物活性。
可抑制过表达基因的一种或多种基因产物的多核苷酸还包括小干扰RNA(siRNA),这种RNA中含有编码过表达的NSC蛋白的核苷酸序列例如NSC 807-1448的有义链核酸与反义链核酸的结合。术语″siRNA″是指一种能阻止靶mRNA翻译的双链RNA。将siRNA导入细胞的常规技术可用于本发明所述的治疗或预防,包括那些其中DNA是RNA转录模板的技术。构建siRNA从而使得单个转录物同时具有来自靶基因的有义序列和互补的反义序列,所述靶基因例如发夹结构。
所述方法可用于抑制其中NSC基因的表达上调的细胞的基因表达。所述siRNA与靶细胞中NSC基因转录物的结合导致该细胞的NSC蛋白产量减少。所述寡核苷酸的长度为至少10个核苷酸,也可以与天然生成转录物等长。优选地,所述寡核苷酸的长度为19-25个核苷酸。最优选地,所述寡核苷酸长度小于75个、50个或25个核苷酸。本发明优选的siRNA包括以具有SEQ ID NO:533,534,535,536,537,538,539,540,541,542,543,544,545,546,547,548,549,550,551或552所示核苷酸序列的作为靶序列的多核苷酸。
另外,所述的siRNA核苷酸序列可以用siRNA设计电脑程序设计,该程序可以从Ambion站点(http:∥www.ambion.com/techlib/misc/sirna_finder.html)获得。以下列方案为基础,通过计算机程序选择所述siRNA的核苷酸序列:
siRNA靶位点的选择:
1.从目标转录物的AUG起始密码开始,向下游扫描寻找AA双核苷酸序列。记录每个AA的出现,临近3′的19个核苷酸作为可能的siRNA靶位点。Tuschl等建议不要涉及针对5′和3′非翻译区(UTR)和邻近起始密码子的区域(75个碱基之内)的siRNA,因为上述区域可能较为富含调节性蛋白结合位点,由此设计为针对这些区域的核酸内切酶与siRNA的复合物可干扰UTR结合蛋白和/或翻译起始复合物的结合。
2.将所述潜在靶位与人类基因组数据库进行比较,不考虑与其它编码序列显著同源的任何靶序列。利用BLAST进行同源搜索,BLAST可在NCBI服务器找到,网址是 www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/
3.选择合格的靶序列用于合成。在Ambion网站,沿该基因选择数个优选靶序列进行评估。
所述siRNA可抑制过表达的NSC蛋白的表达,从而能够用于抑制所述蛋白的生物活性。因此,含有所述siRNA的组合物可用于治疗或预防非小细胞肺癌。
可抑制过表达的基因的一种或多种基因产物的核酸还包括针对所述过表达的基因(NSC 807-1448)的核酶。
所述核酶可抑制过表达NSC蛋白的表达,从而能够用于抑制所述蛋白的生物活性。因此,含有所述核酶的组合物可用于治疗或预防非小细胞肺癌。
通常,核酶分为大核酶和小核酶。大核酶是裂解核酸磷酸酯键的酶。与大核酶反应后,反应位点由5’-磷酸基团和3’-羟基基团组成。大核酶进一步分为(1)催化鸟苷在5’-剪接位点的酯基转移作用的组I内含子RNA;(2)催化经由套索样(lariat-like)结构经过两步反应自我剪接的组II内含子RNA;和(3)通过水解在5’位点切割tRNA前体的核糖核酸酶P的RNA组件。另一方面,小核酶与大核酶相比较较小(约40bp),并且小核酶切割RNA产生5’-羟基和2’-3’环状磷酸酯。锤头型核酶(Koizumi等,(1988)FEBS LErr 228:225)和发夹型核酶(Buzayan,(1986)Nature 323:349;Kikuchi and Sasaki,(1992),Nucleic Acids Res 19:6751)都包括在小核酶中。设计和构建核酶的方法是本领域中已知的(参见Koizumi等,FEBS Lett 228:225(1988);Koizumi等,Nucleic Acids Res 17:7059(1989);Kikuchi and Sasaki,(1992),Nucleic AcidsRes 19:6751),而且抑制过表达的NSC蛋白的核酶也可以根据编码所述NSC蛋白的核苷酸序列的序列信息(SEQ ID NO:1,3或5)和制备核酶的常规方法来构建。
所述核酶可抑制过表达NSC蛋白的表达,因而能够用于抑制所述蛋白的生物活性。因此,含有所述核酶的组合物可用于治疗或预防非小细胞肺癌。
可选,通过施用可结合或者可抑制所述基因产物功能的化合物,抑制所述过表达的基因的一种或多种基因产物的功能。例如,所述化合物是一种能与一或多种过表达的基因的产物结合的抗体。
本发明涉及抗体具体而言为针对一种上调基因编码蛋白的抗体或该抗体的片段的用途。在本申请中,术语“抗体”是指一种具有特异性结构的免疫球蛋白分子,该结构能够与其中含有用于合成该抗体的抗原(即,上调的基因的产物)的分子或与同其密切相关的抗原特异性相互作用(结合)。结合过表达的NSC核苷酸的抗体可以是任一形式,例如单克隆或多克隆抗体,包括通过用所述多肽免疫动物例如兔获得的抗血清,所有种类的多克隆和单克隆抗体,人抗体和通过基因重组制备的人源化抗体。
另外,本发明的抗体可以是抗体片段或修饰的抗体,只要它结合一或多种本发明NSC蛋白。例如,所述抗体片段可以是Fab,F(ab’)2,Fv或单链Fv(scFv),其中H链和L链的Fv片段通过合适的接头连接(Huston等,ProcNatl Acad Sci USA 85:5879-83(1988))。更具体地,抗体片段可用酶如木瓜蛋白酶或胃蛋白酶处理抗体而生成。或者可构建编码该抗体片段的基因,将其插入合适的表达载体,并在适合的宿主细胞中表达(参见,如Co等,JImmunol 152:2968-76(1994);Better and Horwitz,Methods Enzymol 178:476-96(1989);Pluckthun and Skerra,Methods Enzymol 178:497-515(1989);Lamoyi,Methods Enzymo1121:652-63(1986);Rousseaux等,MethodsEnzymol 121:663-9(1986);Bird and Walker,Trends Biotechnol 9:132-7(1991))。
抗体可通过与各种分子,如聚乙二醇(PEG)连接进行修饰。本发明提供了这种修饰的抗体。也可通过化学修饰抗体而获得修饰的抗体。这些修饰方法是本领域常规的。
或者,本发明的抗体可作为嵌合抗体而获得,所述嵌合抗体可变区来自非人抗体而恒定区来自人抗体;或者作为人源化抗体而获得,所述人源化抗体包括来自非人抗体的互补决定区(CDR),来自人抗体的框架区(FR)以及恒定区。利用已知技术制备这种抗体。
本发明提供了一种用于治疗或者预防非小细胞肺癌的方法,该方法使用抗过表达的NSC多肽的抗体。按照所述方法,施用药学有效量的抗所述NSC多肽的抗体。抗过表达的NSC多肽的抗体以足以能减弱所述NSC蛋白活性的剂量进行施用。可选,能与肿瘤细胞特异性细胞表面标记结合的抗体可用于药物递送。因此,例如,施用足以破坏肿瘤细胞剂量的、细胞毒素因子偶联型抗过表达的NSC多肽的抗体。
本发明还涉及一种在受试者中治疗或预防非小细胞肺癌的方法,该方法包括:对所述受试者施用一种疫苗,该疫苗中含有选自NSC 807-1448的核酸编码的多肽或所述多肽的免疫活性片段,或者编码所述多肽或其片段的多核苷酸。所述多肽的给药在受试者体内诱导抗肿瘤免疫。因此,本发明进一步还提供了一种用于诱导抗肿瘤免疫的方法。所述多肽或其免疫活性片段可用作针对非小细胞肺癌的疫苗。一些情况下,所述蛋白或其片段可以与T细胞受体(TCR)结合的形式或者由抗原递呈细胞(APC)呈递的形式施用。由于DC具有强的提呈能力,因此在APC中优选使用DC。
本发明中,“针对非小细胞肺癌的疫苗”是指那些在接种入动物体内时能够诱导抗-肿瘤免疫或抑制非小细胞肺癌免疫的物质。通常,抗肿瘤免疫包括下列等免疫应答:
-诱导针对肿瘤的细胞毒淋巴细胞,
-诱导可识别肿瘤的抗体,和
-诱导抗肿瘤细胞因子的生成。
因此,如果具体蛋白接种入动物体内时能够诱导这些免疫应答中的任意一种,那么就可以认为该蛋白具有抗肿瘤免疫诱导效力。一种蛋白对抗肿瘤免疫的诱导可以通过体内或体外观察宿主免疫系统针对该蛋白的应答来检测。
例如,检测诱导细胞毒T淋巴细胞的方法是已知的。进入活体的外来物质经过抗原呈递细胞(APC)的作用呈递到T细胞和B细胞。对APC以抗原特异性方式呈递的抗原有反应的T细胞由于受到该抗原的刺激,分化成细胞毒T细胞(或细胞毒T淋巴细胞,CTL),随后进行增殖(本文中称为T细胞激活)。因此,具体肽对CTL的诱导可通过由APC将肽呈递到T细胞来评估,并检测对CTL的诱导。另外,APC能激活CD4+T细胞,CD8+T细胞,巨噬细胞,嗜酸性粒细胞和NK细胞。因为CD4+T细胞对抗肿瘤免疫也很重要,所以肽的抗肿瘤免疫诱导作用可利用这些细胞的活化效应作为指示物进行评价。
用树突细胞(DC)作为APC评价对CTL的诱导作用的方法是本领域已知的。DC是一种代表性APC,它的CTL诱导活性在APC中最强。在本方法中,受试多肽首先与DC接触,然后该DC与T细胞接触。与DC接触后若检测到T细胞对感兴趣的细胞有细胞毒效应,则说明受试多肽具有诱导细胞毒T细胞的活性。CTL的抗肿瘤活性可利用例如,51Cr-标记的肿瘤细胞的溶解作为指示进行检测。或者,利用3H-胸苷吸收活性或LDH(乳糖脱氢酶)-释放作为指示物,评价肿瘤细胞损伤程度的方法也是本领域已知的。
除了DC,外周血单核细胞(PBMC)也可作为APC。有报道当存在GM-CSF和IL-4时培养PBMC能促进CTL的诱导。类似地,当存在匙孔血蓝蛋白(keyhole limpet hemocyanin)(KLH)和IL-7时培养PBMC也能诱导CTL。
经这些方法证实具有CTL诱导活性的受试多肽是具备DC活化效应以及随后的CTL诱导活性的多肽。因此,诱导抗肿瘤细胞CTL的多肽可用作抗非小细胞肺癌的疫苗。另外,通过与该多肽接触而获得了诱导抗非小细胞肺癌的CTL能力的APC也可用作抗非小细胞肺癌的疫苗。此外,由于APC对多肽抗原的呈递而获得了细胞毒性的CTL也可作为抗非小细胞肺癌的疫苗。这种利用由APC和CTL造成的抗肿瘤免疫治疗非小细胞肺癌的方法称作细胞免疫疗法。
通常,当使用多肽进行细胞免疫疗法时,已知联合使用具有不同结构的多种多肽并将它们与DC接触可以增加CTL诱导的效率。因此,当用蛋白片段刺激DC时,使用多种类型片段的混合物是有利的。
或者,多肽的抗肿瘤免疫诱导作用可通过观察到诱导抗肿瘤抗体的产生而证实。例如,当在用多肽免疫的实验室动物中诱导了抗多肽的抗体时,以及肿瘤细胞的生长、增殖或转移被这些抗体抑制时,则确定该多肽具有诱导抗肿瘤免疫的能力。
通过给予本发明的疫苗诱导抗肿瘤免疫,并且抗肿瘤免疫的诱导使得可以治疗和预防非小细胞肺癌。治疗癌症或预防非小细胞肺癌发病包括下述任意步骤,诸如抑制NSCLC细胞的生长,NSCLC细胞的退化以及抑制NSCLC细胞的出现。降低非小细胞肺癌患者受试者的死亡率,减少血液中的NSC标志物,减轻伴随非小细胞肺癌的可检测的症状等,都包括在治疗或预防非小细胞肺癌的效果中。这种治疗或预防效果优选是统计学上显著的。例如,在观察中,显著性水平是5%或更低时,将非小细胞肺癌的疫苗的治疗或预防效果与不给予疫苗的对照组进行比较。如,Student’s t-检验,曼-惠特尼U-检验或ANOVA都可用来进行统计分析。
上述具有免疫活性的蛋白或者编码该蛋白的多核苷酸或载体可与佐剂联合。佐剂指当与具有免疫活性的蛋白同时给予(或相继给予)时,能促进针对该蛋白的免疫反应的化合物。佐剂包括霍乱毒素,沙门氏菌毒素,铝等,但并不限于这些。此外,本发明疫苗可与适当的可药用载体联合。这种载体例如无菌水,生理盐水,磷酸盐缓冲液,培养液等。而且,如果必要,疫苗可包含稳定剂,混悬剂,防腐剂,表面活性剂等。疫苗全身性或局部给药。给予疫苗可以是单次给药或通过多次给药进行强化。
当使用APC或CTL作为本发明的疫苗,可例如通过体外方法治疗或预防非小细胞肺癌。更具体地,收集正接受治疗或预防疗法的受试者的PBMC,在离体条件下将该细胞与所述多肽接触,诱导APC或CTL之后,再将该细胞给予受试者。也可通过在离体条件下将编码所述多肽的载体导入PBMC从而诱导APC。可在给药之前克隆在体外诱导的APC或CTL。通过克隆对靶细胞有高损伤活性的细胞并使其生长,细胞免疫疗法可以更加有效地进行。另外,以这种方式分离的APC和CTL可用于细胞免疫疗法,所述疗法不仅针对所述细胞来源的受试者,也针对其它受试者相似类型的疾病。
用于治疗或预防非小细胞肺癌的药物组合物
本发明提供了用于治疗或预防非小细胞肺癌的组合物,其中含有用本发明所述方法选出的化合物,该方法用于筛选能改变非小细胞肺癌-相关基因的表达或活性的化合物。
当将由本发明筛选方法分离的化合物施用给人及其它哺乳动物用于治疗细胞增生性疾病(例如,非小细胞肺癌)时,可以将所述分离化合物直接给药或者用常规药物制剂方法配制成剂型,其中所述哺乳动物诸如小鼠、大鼠、豚鼠、兔子、猫、狗、绵羊、猪、牛,猴子、狒狒或黑猩猩等。本发明组合物的剂型包括适于口服、直肠、鼻腔、局部(包括面颊和舌下)、阴道或肠胃外(包括经肌肉内、皮下和静脉内)给药的剂型,或者适于通过吸入或吹入给药的剂型。可任选地将制剂包装在分离的剂量单位内。
适合于口服的剂型包括胶囊剂、扁囊剂(cachet)或片剂,每一种都含有预定量的活性成分。剂型还包括粉末、颗粒、溶液、悬液或乳剂。可以选择以药糖丸(bolus electuary)或药膏的形式给药。口服用的片剂和胶囊剂可以包含惯用的赋形剂例如粘合剂、填料、润滑剂、崩解剂或润湿剂。可任选与一种或多种制剂成分一起,通过压制或模制制成片剂。压制片(compressedtablet)可以通过将自由流动形式的例如粉末或颗粒的活性成分压入合适机器里制成,所述活性成分还可任选与一种结合剂、润滑剂、惰性稀释剂、润滑剂、表面活性或分散剂混合。模制片(molded tablet)可以用由惰性液态稀释剂润湿后的粉末化合物在合适机器内进行模制而成。所述片剂可以用本领域熟知的方法来包被。口服流体制剂的形式可以是,例如,含水或含油的悬液、溶液、乳剂、糖浆或酏剂,或者可以是无水产物,在使用前用水或其它合适载体重配。所述液体药剂可以包含惯用的添加剂例如悬浮剂、乳化剂、无水载体(包括食用油)或者防腐剂。可以任选配制所述片剂使得其中的活性成分在体内能够缓慢或有控制地释放。片剂的包装可以包括每月一次的单个药片。这些制剂中药物的剂型或剂量使得这些制备物为所述可得范围中的合适剂量。
可肠胃外给药的剂型包括:含水和无水的无菌注射液,其中含有抗氧化剂、缓冲液、抑菌剂和使剂型与目的接受者的血液等张的溶质;以及含水和无水悬液,其中可以包括悬浮剂和稠化剂。所述剂型可以存在于单位剂量或多剂量容器中,例如密封的安瓿和小瓶,并且可以保存在冷冻干燥(冻干)条件下,在使用前只需添加无菌液态载体例如盐水、注射用水,即配即用。可选,所述剂型可以是连续输注的形式。即用即配的注射液和悬液可以用上述的无菌粉末、颗粒和片剂制备而成。
直肠给药剂的剂型包括带有标准载体的栓剂,例如可可脂(cocoa butter)或聚乙二醇。口腔局部给药例如经颊或舌下给药用的剂型,包括糖锭(lozenges),其中含有的活性成分存在于加香基剂(flavored base)例如蔗糖和阿拉伯胶(acacia)或黄芪胶(tragacath)中;和软锭剂(pastille),其中含有的活性成分存在于基剂例如白明胶、甘油,蔗糖或阿拉伯胶中。对于活性成分的鼻内给药,可以使用液体喷雾剂或可分散性粉剂或滴剂。滴剂可以用含水或非含水的(non-aqueous)基剂配制而成,其中还含有一种或多种分散剂、增溶剂或悬浮剂。
对于通过吸入给药,所述组合物要能便利地从吹入器、雾化器(nebulizer)、加压包装(pressured package)或者递送气溶胶喷剂的其它便利器具中释放出来。加压包装可以包括一种合适推进剂例如二氯二氟甲烷(dichlorodifluoromethane)、三氯氟甲烷(trichlorofluromethane)、二氯四氟乙烷(dichiorotetrafluoroethane)、二氧化碳或其它合适气体。就加压气溶胶而言,可以通过提供一种可定量递送的阀确定剂量单位。
可选,就吸入或吹入给药而言,所述组合物可以采用干粉组合物的形式,例如,活性成分和合适的粉末基剂例如乳糖或淀粉的粉末混合物。所述粉末组合物可以单位剂型存在例如胶囊、药筒(cartridge)、白明胶或发泡药包(blister pack)中,所述粉末可通过吸入器或吹入器从中给药。
其它剂型包括可植入用具(implantable device)和粘性补片(adhesivepatch);它释放治疗药剂。
当需要时,可以采用经改进能持续释放活性成分的上述剂型。所述药物组合物还可含有其它活性成分,例如抗微生物药剂(antimicrobial agent)、免疫抑制剂或防腐剂。
应理解,除上面具体提及的成分之外,本发明所述制剂还可包括根据目的制剂类型的本领域其它惯用药剂,例如,适于口服的制剂可以包括增香剂。
优选的单位剂量制剂是如下所述含有有效剂量的活性成分或其合适部分的那些制剂。
对于上述每种疾病,所述组合物例如多肽和有机化合物可通过口服或注射以约0.1-约250mg/kg/天的用量给药。成人的剂量范围通常为约5mg-约17.5g/天,优选为约5mg-约10g/天,最优选为约100mg-约3g/天。本发明以离散单位提供的片剂或其它单位剂型可方便地包含这样的量,使得在所述剂量或所述剂量的倍数时所述组合物有效,例如每个单位含有约5毫克-约500毫克,通常为约100毫克-约500毫克。
采用的剂量取决于许多因素,包括受试者的年龄和性别,要治疗的具体病症及其严重程度。另外,给药途径还可以随病症及其严重程度而变化。
本发明进一步还提供了一种用于治疗或预防非小细胞肺癌的组合物,其中含有能抑制选自NSC 807-1448中任一基因表达的活性成分。所述活性成分可以是一种反义-寡核苷酸、针对所述基因的siRNA或核酶,或者所述反义-寡核苷酸、siRNA或核酶的衍生物,诸如表达载体等。所述活性成分可通过与一种针对所述衍生物无活性的合适基底材料混合而制成外用制剂,比如搽剂或膏药。
另外,如果需要,可以通过添加赋形剂、等渗剂、增溶剂、防腐剂、镇痛剂等将所述活性成分配制为片剂、粉末、颗粒、胶囊、脂质体胶囊、注射液、溶液、滴鼻剂及冻干药剂。这些可以利用制备含核酸药物的常用方法制备。
优选地,所述反义-寡核苷酸衍生物,siRNA衍生物或核酶衍生物可以通过在患处直接用药,或者通过注射入血管从而到达患处而给予患者。另外,还可以向所述组合物加入封固剂用于增加持久性和膜-可通透性。封固剂的实施例包括脂质体、聚L-赖氨酸、脂质、胆固醇、脂转染及其衍生物。
所述组合物剂量可以根据患者身体状况适当调整,以所需的量使用。例如,可施用0.1-100mg/kg,优选0.1-50mg/kg的剂量。
本发明的另一实施方案是一种用于治疗或预防非小细胞肺癌的组合物,其中含有抗选自NSC 807-1448任一基因所编码多肽的抗体,或能与所述多肽结合的抗体的片段。
尽管会因症状不同而有所差异,但是当正常成人(重量60公斤)口服用药时,用于治疗或预防非小细胞肺癌的抗体或其片段的剂量为约0.1毫克-约100毫克/天,优选为约1.0毫克-约50毫克/天,更优选为约1.0毫克-约20毫克/天。
当通过注射向正常成人(重量60公斤)以胃肠道外方式给药时,尽管会因患者疾病、疾病症状和给药方法的不同而有所差异,一般情况下,静脉内注射量为约0.01毫克-约30毫克/天,优选为约0.1-约20毫克/天,更优选为约0.1-约10毫克/天。另外,就其它动物来说,可以施用按60kg体重转换的量。
多肽
根据本发明,提供了新的人基因URLC1(NSC 905),该基因在非小细胞肺癌中的表达与在相应的非癌组织中相比显著升高。
URLC 1(NSC 905)编码一种TUDOR结构域。TUDOR结构域具有RNA结合和核酸结合功能。这种基因的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,该基因编码的氨基酸序列如SEQ ID NO:2所示。
T正是这些基因使得癌细胞具有了致癌活性,所以抑制这些蛋白的活性可以是一种治疗癌症,特别是非小细胞肺癌的有效手段。
本发明提供了新型人基因,包括选自SEQ ID NO:1的核苷酸序列及其简并体和突变体,这些基因编码NSC蛋白,包括如SEQ ID NO:2所示的氨基酸序列,或其功能等效物。在下文中,这些基因编码的多肽统称为NSC蛋白。NSC蛋白的多肽功能等价物的实例包括,例如,与所述人NSC蛋白相应的其它生物体的同源蛋白,以及人NSC蛋白的突变体。
本发明中,术语“功能等价物”是指这样的目的多肽,它们具有与任一种NSC蛋白一样的能促进细胞增殖的活性,而且能赋予癌细胞致癌活性。可以通过下述方法判断目的多肽是否具有细胞增殖活性:将编码目的多肽的DNA导入能编码相应多肽的细胞,然后检测所述细胞的增殖或集落形成活性的升高。
制备指定蛋白的功能等价多肽的方法是本领域技术人员已知的,包括在蛋白中导入突变的已知方法。例如,本领域技术人员可通过定点诱变在这些蛋白之一的氨基酸序列中导入合适的突变,来制备人类NSC蛋白的功能等价多肽(Hashimoto-Gotoh等,Gene 152:271-5(1995);Zoller and Smith,Methods Enzymol 100:468-500(1983);Kramer等,Nucleic Acids Res.12:9441-9456(1984);Kramer and Fritz,Methods Enzymol 154:350-67(1987);Kunkel,Proc Natl Acad Sci USA 82:488-92(1985);Kunkel,Methods Enzymol85:2763-6(1988))。氨基酸突变也会自然发生。本发明的多肽包括具有人类NSC蛋白氨基酸序列的蛋白,其中一或多个氨基酸发生突变,产生的突变多肽与人类NSC蛋白功能等价。这种突变体中突变氨基酸的数量通常是10个或更少,优选6个或更少,最优选3个或更少。
已知突变或修饰的蛋白保持原来的生物活性,所述蛋白为具有通过对具体氨基酸序列的一或多个氨基酸残基进行取代,缺失,插入和/或添加修饰而成的氨基酸序列的蛋白(Mark等,Proc Natl Acad Sci USA 81:5662-6(1984);Zoller and Smith,Nucleic Acids Res  10:6487-500(1982);Dalbadie-McFarland等,Proc Natl Acad Sci USA 79:6409-13(1982))。
被突变的氨基酸残基优选突变为不同的氨基酸,其氨基酸侧链的性质是保守的(即保守氨基酸取代过程)。氨基酸侧链的性质例如疏水性氨基酸(A,I,L,M,F,P,W,Y,V),亲水性氨基酸(R,D,N,C,E,Q,G,H,K,S,T),以及侧链带有下述功能基团或具有共有性质:脂肪族侧链(G,A,V,L,I,P);含有羟基的侧链(S,T,Y);含有硫原子的侧链(C,M);含有羧酸和酰胺的侧链(D,N,E,Q);含碱基的侧链(R,K,H);含芳香基的侧链(H,F,Y,W)。注意,括号中的字母是指氨基酸的单字母密码。
在人NSC蛋白的氨基酸序列中添加了一或多个氨基酸残基的多肽的例子是包含人NSC蛋白的融合蛋白。融合蛋白是人NSC蛋白与其它肽或蛋白的融合体,并且包括在本发明的范围。可用本领域技术人员熟知的技术制备融合蛋白,如将编码本发明人NSC蛋白的DNA与编码其它肽或蛋白的DNA连接,使编码框匹配,将该融合DNA插入表达载体并在宿主细胞中表达。对于与本发明蛋白融合的肽或蛋白没有限制。
可用作与本发明NSC蛋白进行融合的已知的肽包括,例如FLAG(Hopp等,Biotechnology 6:1204-10(1988)),含6个His(组氨酸)残基的6×His,10×His,流感血凝素(Influenza agglutinin)(HA),人c-myc片段,VSP-GP片段,p18HIV片段,T7-标记,HSV-标记,E-标记,SV40抗原片段,lck标记,α-微管蛋白片段,B-标记,蛋白C片段及类似物。可与本发明蛋白融合的蛋白包括例如GST(谷胱甘肽-S-转移酶),流感血凝素(HA),免疫球蛋白恒定区,β-半乳糖苷酶,MBP(麦芽糖结合蛋白)等。
融合蛋白可如下制备:将编码上述融合肽或蛋白的可购得DNA,与编码本发明NSC多肽的DNA融合,并表达制备的融合DNA。
本领域中已知另一分离功能等价多肽的方法是例如,使用杂交技术的方法(Sambrook等,Molecular Cloning 2nd ed.9.47-9.58,Cold Spring HarborLab.Press(1989))。本领域技术人员可以很容易地分离与NSC蛋白(即SEQID NO:1)高度同源的DNA,并从分离的DNA中分离人NSC蛋白的功能等价多肽。本发明NSC蛋白包括由这样的DNA所编码的多肽,所述NDA与编码人NSC蛋白的DNA序列的全部或部分杂交,并且本发明多肽与人NSC蛋白的功能等价。这些多肽包括与衍生自人的蛋白对应的哺乳动物同源物(例如,猴,鼠,兔和牛基因编码的多肽)。当从动物分离与编码人NSC蛋白DNA高度同源的cDNA时,具体优选使用来自肺癌的组织。
本领域技术人员可以常规选择用来分离编码人NSC蛋白功能等价多肽的DNA的杂交条件。例如,杂交如下进行:用“Rapid-hyb缓冲液”在68℃预杂交30min或更长,加入标记探针,68℃保温1h或更长。随后的洗涤步骤可在例如低严谨条件进行。低严谨条件是,例如42℃,2×SSC,0.1%SDS,或优选50℃,2×SSC,0.1%SDS。更优选,采用高严谨条件。高严谨条件是,例如室温、于2×SSC,0.01%SDS中洗涤3次每次20min,随后37℃,于1×SSC,0.1%SDS中洗涤3次每次20min,然后50℃,于1×SSC,0.1%SDS洗涤2次每次20min。虽然一些因素如温度和盐浓度会影响杂交的严谨性,本领域技术人员可以适当的选择这些因素以获得必要的严谨度。
可利用基因扩增方法如聚合酶链式反应(PCR)代替杂交,来分离编码NSC蛋白功能等价多肽的DNA,使用根据编码该蛋白的DNA的序列信息(SEQ ID NO:1)合成的引物。
通过上述杂交技术或基因扩增技术分离的DNA编码的人NSC蛋白的功能等价多肽通常与人NSC蛋白的氨基酸序列高度同源。“高度同源”通常指40%同源性或更高,优选60%或更高,更优选80%或更高,甚至优选95%或更高。多肽的同源性可用“Wilbur and Lipman,Proc Natl Acad Sci USA80:726-30(1983)”的算法确定。
本发明多肽的氨基酸序列,分子量,等电点,糖链的存在或缺失,或形态可能发生变异,这取决于制备该多肽所使用的细胞或宿主或使用的纯化方法。不过,只要它的功能等同于本发明的人NSC蛋白,它就属于本发明的范围。
可用本领域技术人员熟知的方法以重组蛋白或天然蛋白的形式制备本发明的多肽。重组蛋白如下制备:将编码本发明多肽的DNA(例如,含SEQID NO:1的核苷酸序列的DNA)插入合适的表达载体,将该载体导入合适的宿主细胞,获得提取物,使用其上固定有抗本发明蛋白抗体的柱或联合使用多个上述柱,对该提取物进行层析从而纯化所述多肽,所述层析如离子交换层析,反相层析,凝胶过滤或亲和层析。
当本发明多肽在宿主细胞(例如动物细胞和大肠杆菌)中被表达为与谷胱甘肽-S-转移酶蛋白融合的融合蛋白或附加了多个组氨酸的重组蛋白时,该表达的重组蛋白可用谷胱甘肽柱或镍柱纯化。或者,当本发明的多肽被表达为c-myc、多组氨酸或FLAG标记的蛋白时,其可分别使用抗c-myc、His或FLAG抗体检测和纯化。
纯化该融合蛋白后,还可能通过按需切除凝血酶或因子Xa除去与受试多肽不同的区域。
分离天然蛋白可采用本领域技术人员已知的方法,例如与亲和柱接触,其中与下述NSC蛋白结合的抗体与表达本发明多肽的组织或细胞的提取物相结合。所述抗体可以是多克隆抗体或单克隆抗体。
本发明还包括本发明多肽的部分肽。该部分肽含有本发明NSC蛋白的特异性氨基酸序列,并由至少7个氨基酸,优选8个或更多氨基酸,更优选9个或更多氨基酸组成。所述部分肽可用于,例如制备抗本发明NSC蛋白的抗体,筛选与本发明NSC蛋白结合的化合物,筛选本发明NSC蛋白的促进剂(accelerator)或抑制剂。
可通过基因工程方法,已知的肽合成方法,或用合适的肽酶消化本发明多肽来制备本发明的部分肽。对于肽合成,可使用例如固相肽合成或液相肽合成。
此外,本发明提供了编码本发明NSC蛋白的多核苷酸。本发明的NSC蛋白可用于在体内或体外制备上述本发明的NSC蛋白,或者应用于疾病的基因治疗,所述疾病归因于编码本发明多肽的基因的遗传异常。可利用本发明多核苷酸的任意一种形式,只要它编码本发明的NSC蛋白或其等价物,所述形式包括mRNA,RNA,cDNA,基因组DNA,化学合成的多核苷酸。本发明的多核苷酸包括含有给定核苷酸序列的DNA及其简并序列,只要形成的DNA编码本发明的NSC蛋白或其等价物。
可用本领域技术人员已知的方法制备本发明的多核苷酸。例如,本发明的多核苷酸可如下制备:从表达本发明NSC蛋白的细胞中制备cDNA文库,用本发明DNA的部分序列(如SEQ ID NO:1)作为探针进行杂交。cDNA文库可依照Sambrook等,Molecular Cloning,Cold Spring Harbor LaboratoryPress(1989)描述的方法制备;或者也可以使用可购得的cDNA文库。cDNA文库还可如下制备:从表达本发明NSC蛋白的细胞中提取RNA,根据本发明DNA序列(如SEQ ID NO:1)合成寡DNA,以该寡DNA为引物进行PCR,扩增编码本发明NSC蛋白的cDNA。
另外,通过测序获得的cDNA的核苷酸序列,可以常规的确定cDNA编码的翻译区,也就可以容易地获得本发明NSC蛋白的氨基酸序列。而且,用获得的cDNA或其部分作为探针筛选基因组DNA文库,可以分离基因组DNA。
更具体地,可以首先从表达本发明受试NSC蛋白的细胞,组织或器官中制备mRNA。用已知的方法分离mRNA;例如用胍超速离心(guanidineultracentrifugation)(Chirgwin等,Biochemistry 18:5294-9(1979))或AGPC方法(Chomczynski and Sacchi,Anal Biochem 162:156-9(1987))制备总RNA。另外,用mRNA纯化试剂盒(Pharmacia)从总RNA中纯化mRNA。或者,用QuickPrep mRNA纯化试剂盒(Pharmacia)直接纯化mRNA。
利用逆转录酶从获得的mRNA合成cDNA。cDNA的合成可使用可购得的试剂盒,如AMV逆转录酶第一链cDNA合成试剂盒(Seikagaku Kogyo)。或者,用5’-RACE方法合成并扩增cDNA(Frohman等,Proc Natl Acad SciUSA 85:8998-9002(1988);Belyavsky等,Nucleic Acids Res 17:2919-32(1989)),其中使用本文所述的引物,5’-Ampli FINDER RACE试剂盒(Clontech)以及聚合酶链式反应(PCR)。
从PCR产物制备所需的DNA片段并与载体DNA连接。重组载体用于转化大肠杆菌等,并从选出的集落中制备所需的重组载体。通过常规方法验证所需的DNA的核苷酸序列,例如双脱氧核苷酸链终止法(dideoxynucleotide chain termination)。
考虑到用于表达的宿主细胞中的密码子利用频率,设计本发明多核苷酸的核苷酸序列,使其更有效地表达(Grantham等,Nucleic Acids Res 9:43-74(1981))。可用商品化试剂盒或常规方法改变本发明多核苷酸的序列。例如,可用限制酶消化,插入合成的寡核苷酸或合适的多核苷酸片段,增加接头,或插入起始密码子(ATG)和/或终止密码子(TAA,TGA或TAG)来改变所述序列。
具体地,本发明的多核苷酸包括含有SEQ ID NO:1的核苷酸序列的DNA。
另外,本发明提供了多核苷酸,其在严谨条件下与具有SEQ ID NO:1所示核苷酸序列的多核苷酸杂交,并编码上述与本发明NSC蛋白功能等价的多肽。本领域技术人员可以适当选择严谨条件。例如,可采用低严谨条件。更优选,可采用高严谨条件。这些条件与前文所述条件相同。上述用于杂交的DNA优选cDNA或染色体DNA。
载体及宿主细胞
本发明还提供了其中插入了本发明上述多核苷酸的载体。本发明的载体用于在宿主细胞中保留本发明的多核苷酸具体是DNA、用于表达本发明的NSC蛋白,或用于给予本发明的多核苷酸进行基因治疗。
当以大肠杆菌作为宿主细胞并在大肠杆菌中(例如JM109,DH5α,HB101或XL1Blue)大量的扩增和生产载体时,该载体应当具有在大肠杆菌中扩增的“复制起始点ori”,以及用于筛选转化的大肠杆菌的标记基因(例如,通过例如氨卡青霉素,四环素,卡那霉素,氯霉素等药物进行筛选的抗药基因)。例如,可使用M13系列载体,pUC系列载体,pBR322,pBluescript,pCR-Script等等。另外,也可使用pGEM-T,pDIRECT和pT7来进行亚克隆及提取cDNA和上述载体。当利用载体制备本发明的NSC蛋白时,表达载体特别有用。例如,在大肠杆菌中表达的表达载体应当具备上述性质以便在大肠杆菌中扩增。当以大肠杆菌如JM109,DH5α,HB101或XL1Blue作为宿主细胞时,载体应当具有启动子,如lacZ启动子(Ward等,Nature 341:544-6(1989);FASEB J 6:2422-7(1992)),araB启动子(Better等,Science 240:1041-3(1988)),或T7启动子等,它们能在大肠杆菌中有效的表达所需的基因。在这方面,可使用例如pGEX-5X-1(Pharmacia),“QIAexpress system”(Qiagen),pEGFP和pET(在这种情况中,宿主优选表达T7RNA聚合酶的BL21)代替上述载体。另外,该载体还可包含蛋白分泌的信号肽序列。指导NSC蛋白分泌到大肠杆菌周质的信号肽序列的实例是pelB信号序列(Lei等,J Bacteriol 169:4379(1987))。将所述载体导入靶宿主细胞的方法包括,例如氯化钙法和电穿孔法。
除了大肠杆菌,还可利用例如哺乳动物表达载体(如pcDNA3(Invitrogen)和pEGF-BOS(Nucleic Acids Res 18(17):5322(1990)),pEF,pCDM8),昆虫细胞表达载体(如“Bac-to-BAC杆状病毒表达系统”(GIBCO BRL),pBacPAK8),植物表达载体(如pMH1,pMH2),动物病毒表达载体(如pHSV,pMV,pAdexLcw),逆转录病毒表达载体(如pZIpneo),酵母表达载体(毕赤酵母(如“Pichia)表达试剂盒”(Jnvitrogen),pNV11,SP-Q01),枯草杆菌(Bacillus subtilis)表达载体(如pPL608,pKTH50)制备本发明的多肽。
为了在动物细胞如CHO,COS或NIH3T3细胞中表达所述载体,该载体应当具有在这些细胞中表达所必需的启动子,例如SV40启动子(Mulligan等,Nature 277:108(1979)),MMLV-LTR启动子,EF1α启动子(Mizushima等,Nucleic Acids Res 18:5322(1990)),CMV启动子等,并优选具有用于筛选转化体的标记基因(如,经药物(例如新霉素,G418)选出的抗药基因)。已知具备这些性质的载体包括,例如pMAM,pDR2,pBK-RSV,pBK-CMV,pOPRSV和pOP13。
制备NSC蛋白
本发明还提供了制备本发明NSC蛋白的方法。可通过培养宿主细胞来制备所述NSC蛋白,所述宿主细胞含有包含编码所述NSC蛋白的基因的表达载体。根据需要采用方法使所述基因稳定表达,同时增加细胞中该基因的拷贝数。例如,将含有互补DHFR基因的载体(如pCHO I)导入核酸合成途径被缺失的CHO细胞,然后由甲氨蝶呤(MTX)进行扩增。另外,当瞬时表达基因时,可采用下述方法:将含有SV40复制起始点的载体(pcD等)转化入COS细胞,该细胞染色体包含SV40T抗原表达基因。
如上所述获得的本发明NSC蛋白可以从宿主细胞内或外(如培养基)分离,并纯化为基本纯的均质的多肽。本文给定多肽所用的术语“基本纯”是指该多肽基本上与其它生物大分子分离。基本纯的多肽指干重至少75%(如至少80,85,95,或99%)是纯的。用合适的标准方法测定纯度,所述方法例如柱层析,聚丙烯酰胺凝胶电泳或HPLC分析。多肽分离纯化的方法并不限于任何具体方法;事实上,可采用任何标准方法。
例如,可以适当选择并联合使用柱层析,过滤,超滤,盐沉淀,溶剂沉淀,溶剂提取,蒸馏,免疫沉淀,SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳,等电点电泳,透析和重结晶以分离纯化所述NSC蛋白。
层析的实例包括,例如亲和层析,离子交换层析,疏水层析,凝胶过滤,反相层析,吸附层析等(Strategies for Protein Purification andCharacterization:A Laboratory Course Manual.Ed.Daniel R.Marshak等,ColdSpring Harbor Laboratory Press(1996))。这些层析法可以液相层析如HPLC和FPLC进行。因此,本发明提供了上述方法制备的高纯度的多肽。
在纯化之前或之后用合适的蛋白修饰酶处理本发明的NSC蛋白,可任选修饰或部分缺失所述多肽。有用的蛋白修饰酶包括、但不限于胰蛋白酶,糜蛋白酶,赖氨酰内肽酶,蛋白激酶,糖苷酶等等。
抗体
本发明提供了与本发明NSC蛋白结合的抗体。本发明的抗体可以任意形式如单克隆抗体或多克隆抗体进行使用,并且包括用本发明NSC蛋白免疫动物如兔获得的抗血清,所有类型的多克隆和单克隆抗体,人抗体以及通过基因重组制备的人源化抗体。
以本发明NSC蛋白作为抗原可以从任何动物种系获得抗体,但优选从哺乳动物诸如人、小鼠或大鼠,更优选从人获得抗体。来自人的NSC蛋白可从本文所述的核苷酸或氨基酸序列获得。如本发明所述,用作免疫抗原的多肽可以是完整的NSC蛋白或NSC蛋白的部分肽。部分肽包括,例如本发明NSC蛋白的氨基端(N)或羧基端(C)片段。
本文中,抗体定义为与本发明NSC蛋白的全长或其片段反应的蛋白。
将编码本发明NSC蛋白或其片段的基因插入到已知的表达载体,然后用该载体转化本文所述的宿主细胞。用任意标准方法从宿主细胞内或外回收所需NSC蛋白或其片段,并随后将所述NSC蛋白或其片段用作抗原。或者,以表达该NSC蛋白的整个细胞或其裂解物或化学合成多肽作为抗原。
用所述抗原免疫任意哺乳动物,但优选考虑与用于细胞融合的亲本细胞的相容性。通常使用啮齿目(Rodentia),兔类(Lagomorpha)或灵长类(Primates)的动物。啮齿目动物包括,如小鼠,大鼠和仓鼠。兔类动物包括兔。灵长类动物包括,例如狭鼻猿(Catarrhini)(东半球猴(old world monkey))如Macaca fascicularis,恒河猴(rhesus monkey),狒狒(sacred baboon)和黑猩猩(chimpanzee)。
用抗原免疫动物的方法是本领域中已知的。腹腔注射或皮下注射抗原是免疫动物的标准方法。更具体地,可以用适量的磷酸盐缓冲液(PBS),生理盐水等稀释和悬浮抗原。如果需要,将抗原悬液与适量的标准佐剂如福氏(Freund’s)完全佐剂混合,形成乳液,然后给予哺乳动物。优选,将与适量福氏完全佐剂混合的抗原每4至21天给药数次。也可使用合适的载体进行免疫。上所述免疫后,用标准方法检验血清中所需的抗体数量的增加。
本发明NSC蛋白的多克隆抗体可如下制备:从经免疫的动物(该动物经检测其血清中所需的抗体增加)收集血液,用任意常规的方法从所述血液中分离血清。多克隆抗体包括含多克隆抗体的血清且可从所述血清中分离含有该多克隆抗体的级分。利用例如与本发明NSC蛋白偶联的亲和层析柱,从仅识别本发明NSC蛋白的级分制备免疫球蛋白G或M,随后进一步用蛋白A或蛋白G柱纯化该级分。
为制备单克隆抗体,从用所述抗原免疫、并且如上述经检测血清中所需抗体水平增高的动物中收集免疫细胞,并进行细胞融合。用于细胞融合的免疫细胞优选获自脾。其它待与上述免疫细胞融合的优选亲本细胞包括,例如哺乳动物骨髓瘤细胞,更优选具备获得的特性以便用药物筛选融合细胞的骨髓瘤细胞。
根据已知的方法。如Milstein等(Galfre and Milstein,Methods Enzymol 73:3-46(1981))的方法将上述免疫细胞与骨髓瘤细胞融合。
通过在标准选择性培养基诸如HAT培养基(含次黄嘌呤,氨基蝶呤和胸苷的培养基)等中进行培养来选择细胞融合所得的杂交瘤。通常,细胞培养物在HAT培养基中连续培养数天至数周,该时间要足以使除了所需的杂交瘤细胞之外的所有其它细胞(非融合的细胞)死亡。然后,以标准有限稀释法筛选并克隆生产所需抗体的杂交瘤细胞。
除了上述以抗原免疫非人动物制备杂交瘤的方法外,人淋巴细胞诸如EB病毒感染的淋巴细胞也可在体外用NSC蛋白,表达NSC蛋白的细胞或其裂解物进行免疫。然后,被免疫的淋巴细胞与能模糊分裂的(indefinitedividing)、人来源的骨髓瘤细胞诸如U266融合,以获得产生可与所述NSC蛋白结合的所需人抗体的杂交瘤细胞(未审查的日本专利申请(UnexaminedPublished Japanese Patent Application No.)(JP-A)Sho 63-17688)。
获得的杂交瘤细胞随后移植到小鼠的腹腔,并抽提腹水。获得的单克隆抗体可通过,例如硫酸铵沉淀、蛋白A或蛋白G柱、DEAE离子交换层析或偶联了本发明NSC蛋白的亲和柱进行纯化。本发明的抗体不仅可以用于纯化和检测本发明的NSC蛋白,还可以作为本发明NSC蛋白的候选激动剂和拮抗剂。另外,该抗体可应用于本发明NSC蛋白相关疾病的抗体治疗,所述疾病包括非小细胞肺癌。当将获得的抗体给予人体(抗体治疗)时,优选人抗体或人源化抗体以降低免疫原性。
例如,用抗原诸如NSC蛋白,表达NSC蛋白的细胞或其裂解物的来免疫具有人抗体基因库的转基因动物。然后从该动物收集产生抗体的细胞,将其与骨髓瘤细胞融合获得杂交瘤,从该杂交瘤制备抗所述多肽的人抗体(参见WO92-03918,WO93-2227,WO94-02602,WO94-25585,WO96-33735和WO96-34096)。
或者,用癌基因使产生抗体的免疫细胞如经免疫的淋巴细胞永生化,用于制备单克隆抗体。
如此获得的单克隆抗体也可以利用基因工程技术通过重组方法制备(参见,如Borrebaeck and Larrick,Therapeutic Monoclonal Antibodies,published in the United Kingdom by MacMillan Publishers LTD(1990))。例如,可从免疫细胞,如产生抗体的杂交瘤或经免疫的淋巴细胞来克隆编码该抗体的DNA,将该DNA插入合适的载体,并转入宿主细胞制备重组抗体。
本发明还提供了如上所述制备的重组抗体。
另外,本发明的抗体可以是抗体片段或修饰的抗体,只要它结合一或多种本发明的NSC蛋白。例如,所述抗体片段可以是Fab,F(ab’)2,Fv或单链Fv(scFv),其中H链和L链的Fv片段通过合适的接头连接(Huston等,ProcNatl Acad Sci USA 85:5879-83(1988))。更具体地,抗体片段可用酶如木瓜蛋白酶或胃蛋白酶处理抗体而生成。或者可构建编码该抗体片段的基因,将其插入合适的表达载体,并在适合的宿主细胞中表达(参见,如Co等,JImmunol 152:2968-76(1994);Better and Horwitz,Methods Enzymol 178:476-96(1989);Pluckthun and Skerra,Methods Enzymol 178:497-515(1989);Lamoyi,Methods Enzymol 121:652-63(1986);Rousseaux等,MethodsEnzymol 121:663-9(1986);Bird and Walker,Trends Biotechnol 9:132-7(1991))。
抗体可通过与各种分子,如聚乙二醇(PEG)连接进行修饰。本发明提供了这种修饰的抗体。也可通过化学修饰抗体而获得修饰的抗体。这些修饰方法是本领域常规的。
或者,本发明的抗体可作为嵌合抗体而获得,所述嵌合抗体可变区来自非人抗体而恒定区来自人抗体;或者作为人源化抗体而获得,所述人源化抗体包括来自非人抗体的互补决定区(CDR),来自人抗体的框架区(FR)以及恒定区。通过利用已知技术制备这种抗体。
如上所述获得的抗体可以纯化成均质的。例如,以用于普通蛋白的分离纯化方法进行抗体的分离纯化。例如,抗体可通过适当地选择并联合使用柱层析来分离及纯化,所述层析诸如亲和层析,过滤,超滤,盐析,透析,SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳及等电聚焦(Antibodies:A Laboratory Manual.Ed Harlow and David Lane,Cold Spring Harbor Laboratory(1988))等,但不限于此。蛋白A柱和蛋白G柱可用作亲和柱。可利用的示例性蛋白A柱包括,如Hyper D,POROS和Sepharose F.F.(Pharmacia)。
除了亲和层析,层析的实例还包括,如离子交换层析,疏水层析,凝胶过滤,反相层析,吸附层析等(Strategies for Protein Purification andCharacterization:A Laboratory CourseManual.Ed.Daniel R.Marshak等,ColdSpring Harbor Laboratory Press(1996))。层析过程可以通过液相层析诸如HPLC和FPLC等实施。
例如,通过测定吸光度,酶联免疫吸附分析(ELISA),酶免疫分析(EIA),放射免疫分析(RIA)和/或免疫荧光来测定本发明抗体的抗原结合活性。ELISA中,本发明的抗体固定在平板上,本发明的NSC蛋白加于平板上,然后施加含有所需抗体的样品(诸如产生抗体的细胞的培养上清或纯化的抗体)。接着施加识别第一抗体并用酶诸如碱性磷酸酶标记的第二抗体,温育所述平板。洗涤后,向平板添加酶底物如磷酸对硝基苯酯,测定吸光度以评价样品的抗原结合活性。NSC蛋白的片段,如C末端或N末端片段也可用作抗原来评价抗体的结合活性。根据本发明,可用BIAcore(Pharmacia)评价抗体的活性。
上述方法可以检测或测定本发明的NSC蛋白,这是通过将本发明的抗体暴露于推定含有本发明NSC蛋白的样品,检测或测定抗体和蛋白形成的免疫复合物。
因为本发明所述的检测或测定NSC蛋白的方法可以特异性的检测或测定所述蛋白,所以该方法能用于各种使用了蛋白的实验。
下列实例的给出是为了阐述本发明,帮助本领域普通技术人员实施和利用本发明。所述实施例无论如何都不应该对本发明的范围构成限制。
除另有说明外,本申请中的所有科技术语的都具有与本发明所属领域普通技术人员通常理解相同的含义。尽管与本申请中描述类似或等同的方法及材料都可用于实施或检验本发明,但是下文仍还是对合适的方法和材料进行了描述。本申请中引用的任一专利、专利申请和出版物在此引入作为参考。
实施本发明的最佳方式
本发明通过下列实施例进行了详细阐述,但是本发明决不局限于这些实施例。
对获自患病组织(例如,来自非小细胞肺癌的上皮细胞)和正常组织的组织进行评估从而鉴定出在疾病状态例如非小细胞肺癌中差异表达的基因。所述实验操作如下。
[实施例1]通用方法
(1)患者及组织样品
遵照知情同意原则,从接受了肺叶切除术(lobectomy)的37个患者(15个女性和22个男性,46-79岁;平均年龄为66.0)获取原代(primary)肺癌组织。从病案记录中获得临床信息,根据组织病理学亚型及病理学家分级对每一肿瘤进行诊断;37个肿瘤中的22个归类为腺癌,14个为SCC,余下的1个为腺鳞癌。根据UICC TNM分级标准判断每一肿瘤的临床阶段。将所有样品立即冷冻并包埋入TissueTek OCT介质(medium)(Sakura,Tokyo,Japan),然后保存于-80℃。
(2)激光-俘获显微切割(laser-capture microdissection),RNA提取和基 于T7的RNA扩增
使用激光-俘获显微切割(Kitahara et al.,Cancer Res 61:3544-9(2001))从所保存的样品选择性收集癌细胞。按照此前描述的方法(Okabe et al.,Cancer Res 61:2129-37(2001))完成总RNA的提取和基于T7的扩增。作为对照探针,以同样方法扩增正常人肺聚(A)RNA(CLONTECH)。来自每种癌组织和对照的扩增的RNA(aRNA)的每份均为2.5-μg的等分试样,分别在Cy5-dCTP和Cy3-dCTP存在的条件下进行逆转录。
(3)cDNA微阵列的制备
为了获得用于在载玻片上点样的cDNA,用此前描述的方法对每一种基因进行RT-PCR扩增(Kitahara et al.,Cancer Res 61:3544-9(2001))。用Microarray Spotter Generation III(Amersham Biosciences)将PCR产物点样于玻片上。将4,608个基因以一式两份的方式点在单个载玻片上。制备5套不同的载玻片(总共23,040个基因),每一套都点有相同的52个持家基因以及2种阴性对照基因。
(4)杂交和数据的获得
按照此前的描述进行杂交、洗涤和检测(Yanagawa et al.,Neoplasia 3:395-401(2001))。调整每个靶斑点(target spot)的Cy5(肿瘤)和Cy3(对照)的荧光强度,使得所述52个持家基因的平均Cy3/Cy5比等于1。源自低信号强度的数据不可靠。因此,测定每一载玻片上信号强度的截留值(cut-off value)。当Cy3和Cy5染料发出的信号强度都低于该截留值时,将这样的基因排除在进一步分析之外。
(5)根据基因-表达图谱对37个NSCLC进行群集分析(cluster analysis)
对基因和肿瘤都用分级群集(hierachical clustering)方法进行分析。为了获得所述37个样品的可复制集群,选出899个基因,这些基因已经在95%的实验中获得了可信数据,而且其表达比值变化的标准偏差大于1.0。使用M.Eisen编制的软件(″Cluster″和″TreeView″)进行分析,该软件可从网站获得(http:∥genome-www5.stanford.edu/MicroArray/SMD/restech.html)。在应用群集算法(clustering aligorithm)之前,将每一斑点的荧光比值转化为对数值,然后对每一样品的数据向中位数集中(median-centere)以排除实验的偏差。
[实施例2]利用非小细胞肺癌细胞中临床相关表达模式鉴定基因
使用从所有37个NSCLC样品的表达图谱获得的数据,应用二维分级群集算法分析样品和基因间的相似度。当Cy3-或Cy5-荧光强度低于所述截留值时,将这样的基因排除在进一步的分析之外,如前所述(yanagawa etal.,Neoplasia 3:395-401(2001)),选出在95%以上受试病例中获得了可信值的基因。将观察(observed)标准偏差<1.0的基因也排除在外。对通过这种截留滤纸的899个基因作进一步的分析。
在样品轴(横轴)上,将来自37个病例的39份样品(对2个病例作一式两份平行测定以验证实验方法的再现性和可靠性)根据它们的表达图谱划分为2个主组(major group)。树状图显示了个体病例表达模式之间的相似性。分支越短,相似性就越高。在独立实验中被标记并杂交的2个重复病例(第6号和12号)在同一组中最为接近。根据所述分析,是所述基因分群为相邻的一排排基因,其中每排基因是相同的且所述基因被点在载玻片不同的位置上(数据未显示)。37个病例中,22个腺癌病例分入了一个主组,14个SCC病例分入了另一个主组。唯一的腺鳞细胞癌(第25号)分入了SCC群。显然,腺癌和SCC看来具有特定且不同的基因表达图谱,这可能揭示了病因学差异的分子特性。
为了搜索NSCLC中表达下调的基因,对在70%以上的NSCLC中的表达降低了<0.2倍或更低的基因进行了筛选。鉴定了806个在NSCLC中表达下调的基因,这些基因可能具有肿瘤抑制功能因而可能可用于将来的基因治疗(参见,表1)。总共鉴定了582个上调的基因,其Cy5/Cy3比值在50%以上的NSCLC中大于5.0(表2)。在该表中,在70%以上的NSCLC中表达高5倍的基因是潜在的诊断标记,在50%以上的病例中具有5倍的过表达的基因是药物的潜在靶标。作为药物的靶标,数据存在于33%-50%的病例的基因也被选出,并且还测定了在90%以上的NSCLC中显示高5倍的表达的60中基因(表3)。进一步选择的标准如下:(1)血清中可检测的肿瘤标记:仅在人睾丸、卵巢和4份胎儿组织中显示表达的基因;(2)痰中可检测的肿瘤标记:在气道组织(即,肺、气管和唾液腺)中无表达的基因;以及(3)治疗的靶标:在人最重要脏器如肝和肾中无表达的基因。利用含有23,040个人基因的cDNA微阵列,从25份成人及4份胎儿人组织的表达图谱获得了这些基因的正常组织分布数据。
[实施例3]用于抑制非小细胞肺癌细胞生长的分子靶标的鉴定和定性
为了对那些可调节癌细胞生长、增殖和存活的新分子靶标进行鉴定和定性,如下应用反义S-寡核苷酸技术选择靶基因。
(1)全长序列的鉴定
使用Marathon cDNA扩增试剂盒(BD Biosciences Clontech,Palo Alto,CA,USA),按照生产商推荐的方法,通过数据库筛选及cDNA的5′快速扩增,对Cy5/Cy3信号强度比值较高的基因的全长序列进行测定。用所述试剂盒中的基因-特异性反向引物和AP1引物,从人睾丸mRNA(BDBiosciences Clontech)合成cDNA模板。用ABI PRISM 3700DNA测序仪(Appiied Biosystems,Foster City,CA,USA),按照生产商说明测定核苷酸序列。
(2)Northern印迹分析
将被选用于在微阵列实验上进行研究的每种基因的相应32P标记的PCR产物,与人多-组织印迹(BD Biosciences Clontech)进行了杂交。按照生产商推荐的方法进行预杂交、杂交和洗涤。-80℃下将所述印迹在增感屏上放射自显影24-168小时。
为了测定每种基因的组织分布和大小,使用人cDNA作为探针进行人多组织northern印迹分析(图4),从每种基因得到的结果如下:
NSC 807:单一的(single)4.4kb mRNA,发现于胎盘和睾丸;
NSC 810:单一的3.1kb mRNA,发现于睾丸;
NSC 811:2.4和2.7kb mRNA,发现于胎盘和舌,并且在肾、肝、肾上腺、膀胱、脑(全)、淋巴结、前列腺、胃、甲状腺和气管中检测到了弱表达;
NSC 822:单一的1.3kb mRNA,发现于心、肝和睾丸;
NSC 825:单一的4.3kb mRNA,发现于睾丸和脊髓;
NSC 841:2.8kb转录物的弱表达发现于心、肾上腺、脑(全(whole))、淋巴结、脊髓、胃、甲状腺、舌和气管;
NSC 849:单一的1.4kb mRNA,发现于胎盘、前列腺和气管;
NSC 855:3.6kb mRNA,发现于胎盘、前列腺和气管;
NSC 859:2.1kb转录物的弱表达发现于骨骼肌和淋巴结;
NSC 885:单一的5.0kb mRNA,发现于睾丸;
NSC 895:单一的1.5kb mrna,发现于胎盘、胃和气管;
NSC 903:单一2.7kb mRNA发现于睾丸,并且在胸腺、小肠、结肠和骨髓中检测到了弱表达;
NSC 904:单一的4.4kb mRNA,发现于睾丸和骨骼肌;
NSC 905:单一2.5kb mRNA,发现于心、骨骼肌、肝、胃和舌,并且在胎盘和甲状腺中检测到了弱表达;
NSC 915:单一的1.5kb mRNA,发现于睾丸;
NSC 948:单一3.8kb mRNA,发现于肾、肝、胎盘、胃、甲状腺、舌和气管;
NSC 956:单一的2.1kb mRNA,发现于心、骨骼肌、睾丸、胃、甲状腺和肾上腺,并且在肝、胰腺、胸腺、前列腺和脊髓中检测到了弱表达;
NSC 994:单一的3.3kb mRNA,发现于骨骼肌和睾丸,并且在心、肝和胰腺中检测到了弱表达;
NSC 1000:单一3.5kb mRNA,发现于脑、胰腺、前列腺和睾丸,并且在胃、脊髓和肾上腺中检测到了弱表达;
NSC 1066:单一的3.6kb mRNA,发现于骨骼肌和睾丸;
NSC 1075:单一的1.9kb mRNA,发现于睾丸;
NSC 1107:单一的2.2kb mRNA,发现于睾丸;
NSC 1131:1.6kb和1.4kb的转录物,发现于睾丸;
NSC 1141:单一的2.9kb mRNA,发现于胎盘,并且在骨骼肌和睾丸中检测到了弱表达;
NSC 1164:单一的5.2kb mRNA,发现于脑和肾上腺;
NSC 1183:单一的2.0kb mRNA,发现于骨骼肌和心;
NSC 1201:心、骨骼肌、脊髓、前列腺、睾丸、甲状腺、脾、淋巴结、气管和肾上腺中发现的弱表达的7.8kb转录物;
NSC 1240:胃、脊髓和淋巴结中发现的弱表达的5.7kb转录物;
NSC 1246:单一的1.4kb mRNA,发现于睾丸;
NSC 1254:单一的3.0kb mRNA,发现于睾丸;
NSC 1265:3.0kb转录物的弱表达,发现于胃中;
NSC 1277:单一的1.8kb mRNA,发现于睾丸;
NSC 1295:单一的3.5kb mRNA,发现于白细胞、淋巴结和骨髓;
NSC 1306:单一的7.4kb mRNA,发现于心和骨骼肌;
NSC 1343:单一的4.7kb mRNA,发现于胎盘和骨骼肌;
NSC 1362:单一的3.6kb mRNA,发现于脑和全脑;
NSC 1389:单一的0.9kb mRNA,发现于舌;
NSC 1399:单一的0.9kb mRNA,发现于胎盘;
NSC 1406:单一的2.4kb mRNA,发现于心、骨骼肌和前列腺;
NSC 1413:单一的4.0kb mRNA,发现于肝和前列腺;
NSC 1420:单一的2.8kb mRNA,发现于睾丸。
(2)半定量的RT-PCR分析
对50%以上的NSCLC中的mRNA表达水平升高5倍或更多倍的情况用半定量的RT-PCR进行验证,如上所述(Akashi et al.Int J Cancer 88:873-80(2000))。使用Trizol试剂(Life Technologies,Inc.Gaithersburg,MD,USA),按照生产商推荐的方法,从培养的细胞和临床组织提取总RNA。提取的RNA的用DNase I(Roche Diagnostics,Basel,Switzerland)处理,然后使用寡聚(dT)12-18引物用Superscript II反转录酶(Life Technologies,Inc.)反转录为单链的cDNA。通过监测β-肌动蛋白(ACTB)或β-2-微球蛋白(microglobulin)基因(B2M)作为定量对照,对每一种单链cDNA都进行适当稀释用于后续的PCR扩增。所有反应都在GeneAmp PCR system 9700(Applied Biosystems)上进行,使用以下方案:94℃初始变性2min;接着以94℃、30秒,58-62C、30秒和72℃、45秒,进行18个(对于ACTB或B2M)或25-30个循环(对于本发明每种基因)。所述引物序列见表4。
表4:用于半定量RT-PCR实验的引物序列
NSC编号 代号 RT-PCR引物   SEQIDNO:
807 KOC1  F   5′-TAAATGGCTTCAGGAGACTTCAG-3′   3
 R   5′-GGTTTTAAATGCAGCTCCTATGTG-3′   4
810 TTK F   5′-ATGGAATCCGAGGATTTAAGTGGCAGAGAATTGA-3′ 5
R   5′-TTTTTTTCCCCTTTTTTTTTCAAAAGTCTTGGAGGAT-3′ 6
811 SDC1  F   5′-GCTTCCTCCTGGAAATTGAC-3′   7
 R   5′-TCTACTGTACAGGGAAAAACCCA-3′   8
812 NMB  F   5′-AGTCGTGGTTCAGAAGTTACAGC-3′   9
 R   5′-TCTCTTACCAAATGCTGTTGAGC-3′   10
816 PIR51  F   5′-CATCTGGCATTTCTGCTCTCTAT-3′   11
 R   5′-CTCAGGGAAAGGAGAATAAAAGAAC-3′   12
820 HMMR  F   5′-GAAGTATCAAAACTCCGCTGTCA-3′   13
 R   5′-ATGCTGAGTAGACATGCAGATGA-3′   14
822  F   5′-CGGTATGCTAATGAAGATGGAGA-3′   15
 R   5′-CACAGGGTATCAGCAACTGTGTA-3′   16
824 BPAG1  F   5′-AGAAGTATCTGAGCCCCTGATG-3′   17
 R   5′-GTCTAACCTCCCAGCTGTTCC-3′   18
825 ANLN  F   5′-GCTGCGTAGCTTACAGACTTAGC-3′   19
 R   5′-AAGGCGTTTAAAGGTGATAGGTG-3′   20
830  F   5′-GTTTGCAACCAGGAGATACAAAG-3′   21
 R   5′-GCTGTGAGGTACAACAAATCACA-3′   22
837  F   5′-CCTCCTTTCCCTAGAGACTCAAT-3′   23
 R   5′-AGAAGCAACAGCAAGACCACTAC-3′   24
840 GNAS  F   5′-TTGCCTATGAAAGATAGGTCCTG-3′   25
 R   5′-GTTTTAATGCCCAGATAGCACAG-3′   26
841 URLC2  F   5′-AGGAGAAGTTGGAGGTGGAAA-3′   27
 R   5′-CAGATGAAAGATCCAAATTCCAA-3′   28
842 KIAA0887  F   5′-TCCACGACTTCTTATTCTCCTTG-3′   29
 R   5′-CATTTCTTTTAGGGACTGGGGTA-3′   30
846  F   5′-GAGAAACTGAAGTCCCAGGAAAT-3′   31
 R   5′-CTGATACTTCCATTCGCTTCAAC-3′   32
849 GJB5 F 5′-AGCTAAGCCATGAGGTAGGG-3′ 33
 R   5′-CGCATGTGTGTTCTTCTATGA-3′   34
850  F   5′-CCAAGACAGGCAGAGTAGGTAAA-3′   35
 R   5′-CATTTTCATTGTGATCAGCCAG-3′   36
853  F   5′-TGTATGGGGGATTACCTACACAC-3′   37
 R   5′-AAAGGAGCACAACAAACATGC-3′   38
  854  F   5′-TGTCCAAGGAGTCTGAAGTTCTC-3′   39
 R   5′-CTTGCCACCATACCTTTATTCTG-3′   40
855 LNIR  F   5′-CGAGAGAGTAGGAGTTGAGGTGA-3′   41
 R   5′-CAGAAATCCAGCAGATTTCAGAC-3′   42
857 TIGD5  F   5′-GAACAGGTGGCTGTGTTCCT-3′   43
 R   5′-ATAGAATCAAGTGGTGTGCTTCG-3′   44
859 URLC3  F   5′-CTGAGACTTTGAGTCCTTGGGAG-3′   45
 R   5′-TTCCTCATTTCTCTCAGTAACCG-3′   46
861 KIAA0251 F 5′-AACAATGCAAAGTAGTGCTCCTC-3′ 47
 R   5′-GCTGAACTTCTTTATGCTCTTCG-3′   48
864  F   5′-ACCTTTGATTTTAGACTGAGGGC-3′   49
 R   5′-ACACTGGGTTGTGTGTTATTTCC-3′   50
870  F   5′-ATGAGCCTCTCATCCATGTCTTT-3′   51
 R   5′-AGTAAGAGTCTGCCTGAGACACG-3′   52
871 KIAA1929  F   5′-AGAAAATGGGGGTGCAAGTAG-3′   53
 R   5′-TAACCAAATTAACACGTGCTGG-3′   54
872 LOC51659  F   5′-AGAAAAGTTGGAGAAGATGAGGG-3′   55
 R   5′-GCCACCTCTGTGAGAGAGTCTAA-3′   56
881 FLJ20068 F 5′-AGAACTAGTGTGACCCCACCC-3′ 57
 R   5′-GCTTGCCTTTTCCCTTAGTAGG-3′   58
882 GUCY1B2  F   5′-AGGGAAATGAAGACAGGAGAACT-3′   59
 R   5′-GAGACACGGCTTAAGAAGTTTTG-3′   60
884 RAD51  F   5′-GCTTGTAAAGTCCTCGGAAAGTT-3′   61
 R   5′-ATCTCAACTCTGCATCATCTGGT-3′   62
885 BAG5   F   5′-ATAAGAGAAATATTGGCCATCG-3′   63
  R   5′-GCAAGCGTAAGAGACTGGTTTTA-3′   64
889 HSPC150   F   5′-CAAATATTAGGTGGAGCCAACAC-3′   65
  R   5′-TAGATCACCTTGGCAAAGAACAC-3′   66
892   F   5′-ACACACAGAGAGGAGGAAGTCT-3′   67
  R   5′-GAGTCTTTATGGAGCTGTGTCA-3′   68
893   MPHOSPH1   F   5′-CAGGCCAAGTGATTTTAATGG-3′   69
  R   5′-CAATACAGGATGCAAGTTCCAA-3′   70
895 FAM3D   F   5′-ACAGCCCAGACACAAACAAATAC-3′   71
  R   5′-ACCCCATTCTCTCCACAGAC-3′   72
896 PRO0971   F   5′-TACAGGCCAGGATTAGAAACACTC-3′   73
  R   5′-GTTCAAATATTGAAAGGGCCAC-3′   74
898 URLC7   F   5′-AGTTATGGGTTCCTGTGTGCTTA-3′   75
  R   5′-AAAGGCCTGTTCACAAGCTAAGT-3′   76
901 MAN1B1   F   5′-CTCGTGAAGCCTCAGATGTCC-3′   77
  R   5′-CTCCACCGAAAAGACCCATTC-3′   78
902 ALDOC   F   5′-AGCGTACACCCTCTGCACTTG-3′   79
  R   5′-TTTGCTGTATGGTATGTACTCAAGG-3′   80
903 URLC9   F   5′-CAGAAGAGAGAGGAGAGAACACG-3′   81
  R   5′-GAGGTTATCTCTGATGGAACCAA-3′   82
904   F   5′-CTTGAAGAAGAACTTCCAGACGA-3′   83
  R   5′-AATGTTCTAAAGATGAGAGGGGG-3′   84
905 URLC1   F   5′-AGGAGGCTGCTGGTACAAATACT-3′   85
  R   5′-GCAGGAAATACAGCAGGAACATA-3′   86
909 FLJ10468   F   5′-ATTCATTCTGGACCAAAGATCC-3′   87
  R   5′-TCTACTGTGGACAAGAAGCCTGT-3′   88
912 SRD5A1   F   5′-GTGATCTCTTCAAGGTCAACTGC-3′   89
  R   5′-CCAGATGAGATGATAAGGCAAAG-3′   90
915 URLC10   F   5′-ATTCGCTACTGCAATTTAGAGG-3′   91
  R   5′-GTTTAATGCAACAGGTGACAACG-3′   92
917 KIAA1096 F 5′-CACTTGGATTCCTTGCTTGTTAC-3′ 93
 R   5′-GGGAAAAAGTATGCAACACTCAG-3′   94
920 CHAF1A  F   5′-AGGCGATGACCTGAAGGTACTG-3′   95
 R   5′-CAATAGGCCAGCAATCTCAATA-3′   96
921 AKR1B11  F   5′-AGGTTCTGATCCGTTTCCATATC-3′   97
 R   5′-ATCTTTACATCCTCAGTGTTGGC-3′   98
924  F   5′-GAAGACAAATGGTGTCCACAAA-3′   99
 R   5′-CCACTGGAAGTTTTCTTCGTACA-3′   100
929 KIAA0101  F   5′-TTCGTTCTCTCCTCTCCTCTCTT-3′   101
 R   5′-GGCAGCAGTACAACAATCTAAGC-3′   102
930  F   5′-CAGCACAGAGTAGGTGAACACAG-3′   103
 R   5′-CCTCAGTACATTTTCAACCCATC-3′   104
933  F   5′-AGGATGATGAGGATGACTGAAGA-3′   105
 R   5′-GAATGGGCCTCTATCTGGTATCT-3′   106
934 CIT  F   5′-TGTGTCTCATCTGTGAACTGCTT-3′   107
 R   5′-TTCGTGTTACGGTATATCCTGCT-3′   108
936 AF15Q14  F   5′-CTTCTGTTCCGTAAACTCCTTGA-3′   109
 R   5′-CAATTGTGTACTCCAAACCCAA-3′   110
938 FLJ13852  F   5′-GCCCTTCCAACTTGTCCTTAAC-3′   111
 R   5′-GCCTCTTTATTCCCATCTCCTTA-3′   112
940 KIAA1443  F   5′-GAACAGATCACTGGTTTACCTCG-3′   113
 R   5′ATCTTTCAGTAACAGACCTCCCC-3′   114
944  F   5′-ACAAGATGGCTAGCTCAAAAGTG-3′   115
 R   5′-CAACACGTGGTGGTTCTAATTT-3′   116
947 PKP3  F   5′-ATGCAGGACGGTAACTTCCTGC-3′   川7
 R   5′-TGGGCCCAGGAAGTCCTCCTT-3′   118
948 KCNK5  F   5′-CCCAACATGTGAAGACAGTGAT-3′   119
 R   5′-CCTGTCCACCTCATGTTTTATTG-3′   120
956 SIAHBP1  F   5′-GCTGAAGTGTACGACCAGGAG-3′   121
 R   5′-CACCTTTATCCGCACTGTAGG-3′   122
957  F   5′-AAAGCTGATGAGGACAGACCAG-3′   123
 R   5′-GGCAGAGGCACAATCATTTTAG-3′   124
958  F   5′-GAAGAGAATGCAGGTGTTGAGTT-3′   125
 R   5′-GTCCACAGCATTCATAAAACAGG-3′   126
963  F   5′-CTCCTCAGTGTCCACACTTCAA-3′   127
 R   5′-GTTACTTGCAGCCAAAAGCAG-3′   128
964 AK3  F   5′-AGTCTCTCCTTTTCAGACATCCC-3′   129
 R   5′-TCCATAAAGTCAGACCAGCAGTT-3′   130
965 ENC1  F   5′-CCTTCTGGGAGGACAGACTTT-3′   131
 R   5′-TTTCTCTTCATTAGACTTGGCCTCT-3′   132
966  F   5′-AACCTAGCCTCCCTTCAAACTTA-3′   133
 R   5′-GAGACAGGATGGAAAAATCTGTG-3′   134
970  F   5′-CCTTTCCTGACCCTTTTAGTCTT-3′   135
 R   5′-CAAATCCTGTATTTCTCACAGGC-3′   136
972 LOC51690  F   5′-GAAAAAGGAGAGCATCTTGGACT-3′   137
 R   5′-AAAGGAAAATGCTTCCGTTCC-3′   138
973 HAS3  F   5′-TAATGTAGGATGACAGGCTCTCC-3′   139
 R   5′-CCAATTGTATAAAGGCTCTTCCC-3′   140
974 pYCR1  F   5′-AGGACAACGTCAGCTCTCCTG-3′   141
 R   5′-TCCACTATTCCACCCACAGTAAC-3′   142
975 FLJ12517  F   5′-GACCGAGAGTCCAGCATTTTT-3′   143
 R   5′-ACTGAACAGAGCAGACAGAAACC-3′   144
980 ANKT  F   5′-CTGCTGTTATTACCCCATTCAAG-3′   145
 R   5′-GTGAGTGACAGATGGCAATTACA-3′   146
984 MLL3  F   5′-CTCGGGTAGAATTTGATGACAAC-3′   47
 R   5′-GCTGGTAAAGCAGGTGTAAAAGA-3′   148
989 FOXM1  F   5′-CCCTGACAACATCAACTGGTC-3′   149
 R   5′-GTCCACCTTCGCTTTTATTGAGT-3′   150
990 WFDC2  F   5′-CTCTCTGCCCAATGATAAGGAG-3′   151
 R   5′-GAAACTTTCTCTCCTCACTGCTC-3′   152
991 DOLPP1  F   5′-CAGAAGTTTTGAGGACTGAACTG-3′   153
 R   5′-CCGACCTACCTTCCCTAGAAAT-3′   154
994   DKFZp434E2318  F   5′-GGGGTTTTGAAGGATGTGTACTT-3′   155
 R   5′-TATGAGGCCATTCTGCACATTA-3′   156
1000 PSK-1  F   5′-GGGAGTATGAAGTTTCCATCTG-3′   157
 R   5′-GGATGCTGGTTTATTTACTGTAGG-3′   158
1002 LOC55565  F   5′-AATATGGAATCCCTACCCACAGT-3′   159
 R   5′-TTTGACTTCACAACTTCATGGG-3′   160
1003  F   5′-GAGGCCATTTTAGTTCTGAGGTT-3′   161
 R   5′-CTTTACTGCATATGGATTCTGGG-3′   162
1004 BUB1B  F   5′-TCAACCTCAAGTTAAAGGAACG-3′   163
 R   5′-AGGGAAAAGTAGAGACAAATGGG-3′   164
1005  F   5′-TCTAGGCAAAGTGGAAGTCAAAG-3′   165
 R   5′-CTCCTAGAGAAATGGGTTGGATT-3′   166
1012 FLJ12428  F   5′-ATACACTGAATGTGGAAGAACCG-3′   167
 R   5′-GGGCACACAATTTCATGTAGTCT-3′   168
1015 PHB  F   5′-AGACATTGCATACCAGCTCTCAT-3′   169
 R   5′-CCTTTACTTCCTTCACTTTAAGCC-3′   170
1016  F   5′-GTAACAAACGCCACCTTACACTC-3′   171
 R   5′-TTCTGTTCTTGCAACTGAGTCCT-3′   172
1018  F   5′-ACCTCCAGTAAAAGTTTCTTCCG-3′   173
 R   5′-GTAAATTCAGCTTCAAACCCTGG-3′   174
1023 CLDN2  F   5′-CATTGAGCCTTCTCTGATCACTC-3′   175
 R   5′-GCACTGTTACAGATAGTCTGGGG-3′   176
1026  F   5′-TATCAGTAACTGCTCCGTGTTCA-3′   177
 R   5′-GGTCTGTCATTGACCAAAACATC-3′   178
1027  F   5′-TCCTGAATAAAGGCCTAGTACCC-3′   179
 R   5′-AAACCAGAATCCAACACTACCCT-3′   180
1030  F   5′-GAGCCCTCTCCACATTTCTATTT-3′   181
 R   5′-ACACTGAAACGTGATGGGTAACT-3′   182
1034 SSBP   F   5′-GACATGAGTCCGAAACAACTACC-3′   183
  R   5′-ATGAGACTGTACCAAATGATGGC-3′   184
1037 CSTA   F   5′-TGATACCTGGAGGCTTATCTGAG-3′   185
  R   5′-GACTCAGTAGCCAGTTGAAGGAA-3′   186
1038 CLDN1   F   5′-TCTTGCAGGTCTGGCTATTTTAG-3′   187
  R   5′-TATATTTAAGGAGCACCCCTTCC-3′   188
1047 SLC7A5   F   5′-ACAAGCAAGTGCATTTTCAGTC-3′   189
  R   5′-GAACAGGGTAGCCATTAACACAA-3′   190
1049 S100A8   F   5′-TCTATCATCGACGTCTACCACAA-3′   191
  R   5′-GCTACTCTTTGTGGCTTTCTTCA-3′   192
1052 S100P   F   5′-GCATGATCATAGACGTCTTTTCC-3′   193
  R   5′-GATGAACTCACTGAAGTCCACCT-3′   194
1057 FDXR   F   5′-TCTCCAGGACAAGATCAAGGA-3′   195
  R   5′-GTTTTATTTCCAGCATGTTCCC-3′   196
1058 FEN1   F   5′-AGAGCTGATCAAGTTCATGTGTG-3′   197
  R   5′-ACATAGCAAGTTCGAGTTTCTGC-3′   198
1059 TCF19   F   5′-GAGCTGGAGGTAGGAATACAGGT-3′   199
  R   5′-CAATAGTTTGGCTTGGTGTAAGG-3′   200
1064   PAFAH1B3   F   5′-CTCCTCTGCATGCACTTAACTTT-3′   201
  R   5′-GAGAGTTTAATGTTGTGGGAAGG-3′   202
1066 MCM8   F   5′-CCGGGCAATAAAGTAACTCTTG-3′   203
  R   5′-GTATTTGTCTGTATGCCTACATCTG-3′   204
1067 FLJ10052   F   5′-TCTGCGTATCTTGAGTGCTTACA-3′   205
  R   5′-ACAGAGATGTGGTGGTGCTAGTT-3′   206
1071   F   5′-AGCAGAGGATCAGAGCTTTCTTT-3′   207
  R   5′-AGAAAAGGTGTGAACAGAGTTGC-3′   208
1072 FLJ13163   F   5′-AGAGCCATAGAAACTGCTCCTCT-3′   209
  R   5′-CATAACTGCATAGACAGCACGTC-3′   210
1075 URLC4   F   5′-TACCTGCTCTATGTGGGTGCT-3′   211
  R   5′-CCTCAGAACTCTCAGTTTATTCCTG-3′   212
1077  F   5′-ATAAGCCACAGAGACAAACCAGA-3′   213
 R   5′-GGGAGGTTATTTTCACAGAACAC-3′   214
1078 UBCH10  F   5′-GAGTTCCTGTCTCTCTGCCAAC-3′   215
 R   5′-TAATATACAAGGGCTCAACCGAG-3′   216
1086 TCF20  F   5′-GTCATAGCTGTGTCCTGGGTC-3′   217
 R   5′-CTATTTTATCCCCATGGCAGAGT-3′   218
1089 KIAA0802  F   5′-CAGATATTCTGTATGCTGGAGGG-3′   219
 R   5′-CCATCTCAGAAGGGCTTTATTTC-3′   220
1090 LOC51243  F   5′-GATTTCCATACTTCGGGAGAAAC-3′   221
 R   5′-TATCAGATGCCACACATACGAGA-3′   222
1103 KCNK1  F   5′-ATGGAACAAAGAAGCTGTGACC-3′   223
 R   5′-GGGTACATGCAAACCAGTACAC-3′   224
1107 URLC8  F   5′-TGAACAGTTTGCTGGTCTTG-3′   225
 R   5′-AATGTCAGGTTGGGGAGTTA-3′   226
1109 ZNF259  F   5′-TTCTGGACAGACGGAGAGACTAC-3′   227
 R   5′-AGTGATGACATACCCCTGGTTC-3′   228
1113 URLC5  F   5′-CAAGACTTCTCAGATCCTTGGG-3′   229
 R   5′-ACTCACATGTGGAAGTGTTCCTT-3′   230
1116 K1AA0852  F   5′-TCAAGCAATATGAAGTAGGGCTC-3′   231
 R   5′-AACACAAATGTCCCGTGTAAGTC-3′   232
1121  F   5′-CTGCCTCTTACTCGTCACAGTTT-3′   233
 R   5′-TGACTTCTTTGAAGTGAAGGCT-3′   234
1125 LOC51256  F   5′-CCCTAGTTTTTGTAGCTGTCGAA-3′   235
 R   5′-GATCACATGCCAAGAACACAAT-3′   236
1131 SYNJ2BP  F   5′-CTACGTACCTGGGTGCCTATATC-3′   237
 R   5′-GTCCTCTTATAAGGCTCACTCCC-3′   238
1133  F   5′-GATGTTAGAGACTCCTTCACCCA-3′   239
 R   5′-CGGTATTCTTAACACATCTTGCC-3′   240
1136 TRAF2  F   5′-GTGTCTGCGTATCTACCTGAACG-3′   241
 R   5′-ATAACTCTGTCTTCGTGAGCTGG-3′   242
1141 URLC11  F   5′-GTATTTGGCTTACTGTCCCAAAC-3′   243
 R   5′-CTAGGAAGAAATCATGCTGGGTT-3′   244
1142 NAPG  F   5′-CAGTTTGAGCAAGCAAAAGATG-3′   245
 R   5′-CGGATATCCCTAATCTATTCCCA-3′   246
1157 NINJ2  F   5′-GACAGTATAGCTGCCCTTGCTC-3′   247
 R   5′-AAGCAGTGGGGTAGAGTCAGAAC-3′   248
1162 IMP-2  F   5′-ACAGAAGAAGCTACCTCAGGTGT-3′   249
 R   5′-CTAGCGGAAGACAATTCAGAAC-3′   250
1164 NPTX1  F   5′-TAACCTTGATAGAAGAACCTTGG-3′   251
 R   5′-GCAAATGAGACAAAATTGGGAC-3′   252
1167   DKFZp762M136  F   5′-ATCTCCACTCTACGGCCTTTTAC-3′   253
 R   5′-TAATGACTTAAACACCAGCACGG-3′   254
1169 FLJ12892  F   5′-GTGTTCTCCTAATCCCAGAACCT-3′   255
 R   5′-AAGAGTTGTGGCCTATTACCTCC-3′   256
1173  F   5′-TGGTCCTACTAAGAGAATGCAGC-3′   257
 R   5′-AGCCATTAGGAAAAAGAGCAGAG-3′   258
1176 RANBP7  F   5′-GACTGCTATACTCCAACTCTGGG-3′   259
 R   5′-GCCAAAGACATGGTTTAGTCATAC-3′   260
1183 BYSL  F   5′ACACTGAGCTTTAATGGCTGAAG-3′   261
 R   5′-TCCACAGTGACCTGACACAATAG-3′   262
1184 SURF6  F   5′-GTCCTCATTCCCTTTCTGTTCC-3′   263
 R   5′-CTGTTTTCTTTCAACCTGCACTC-3′   264
1185 URLC6  F   5′AAGAGAGGCCAGAAACTGAGC-3′   265
 R   5′-AACTAGCAGCTTTATTGCCCTTC-3′   266
1191 COX17  F   5′-GTGGACATCTAATTGAGGCC-3′   267
 R   5′-GAAGATCTTCCACTAGTAATATT-3′   268
1195 LOC51250  F   5′-CAGAGGACTCTGATGAAGAAAGC-3′   269
 R   5′-TTTCCACAAACGCTAAGAGAAC-3′   270
1196  F   5′-ATGTCTGCTCCGTGAGTGTCT-3′   271
 R   5′-GCAAATCCTACTTTCAACTGCAC-3′   272
1201 SLC7A1  F   5′-GCCTTAAAGCTGGACACAGAAG-3′   273
 R   5′-CTCCAGACACCATTGCTTAAATC-3′   274
1205 FLJ20657  F   5′-AGACTTTAAAATCCCACCTGGAC-3′   275
 R   5′-CACCCAGCCTTCTCTTTATTTTC-3′   276
1207   D19S1177F  F   5′-AGGGGATTCTGGAACTGAATG-3′   277
 R   5′-TTATACCGAGGAGATGGGAAAGT-3′   278
1210  F   5′-GTTGCAGTACCAATCCTTTCTTG-3′   279
 R   5′-GTCCTATGTTAATTTCCACCAAGC-3′   280
1214 DGSI  F   5′-TATCCAGAGGGTGTCCCTGAC-3′   281
 R   5′-GTTCTTTAATGACAGTTCAAGGGG-3′   282
1234  F   5′-ATCGGATCGATATTACACAGCA-3′   283
 R   5′-CCCATCAGGGAAACAAAGATTA-3′   284
1236 HSPC135  F   5′-TGCATCTGTAACTTCAGGAGGAT-3′   285
 R   5′-TCCATCAACTTACCTATCGATGC-3′   286
1237  F   5′-AAACCTACGAACGCCTTTTCTAC-3′   287
 R   5′-GGTATCACAGGAGCACCAATAAA-3′   288
1238 FSP-2  F   5′-CTTTCTGTTGCTTTCCCAGTAGA-3′   289
 R   5′-TTGATACATTACACTGGTGGCAG-3′   290
1240 FLJ00159  F   5′-ACCCACAGAACTGGGAGTGAG-3′   291
 R   5′-ATTTTACTGCAGAAACGGGTTG-3′   292
1242 LRP6  F   5′-GATGGGGAAACTATGACTAATGAC-3′   293
 R   5′-GGTATCAATAAAGCCCAGATATTCC-3′   294
1246 SUPT3H  F   5′-TTAGTGGATCTGGCTCTTCTTGT-3′   295
 R   5′-CAGGCACATCACAGTTGTCAC-3′   296
1247 MGC5585  F   5′-GATTTGGAACTTGGAAGGAGTG-3′   297
 R   5′-ACTTCAGTCACCCAAAACAACAG-3′   298
1250  F   5′-CGGGAGGATTGTAAGATACTGTG-3′   299
 R   5′-ACTTCTCATGAGTTCAGCCTCAG-3′   300
1254 FLJ10815  F   5′-GTGAGTATTCCTCCGTTAGCTT-3′   301
 R   5′-CAGGGAGAAGAGAAAACATCAC-3′   302
1265 SLC28A2   F   5′-AGCTGAAGCTGACTGTGTCT-3′   303
  R   5′-AGGCACAGACGGTATTGTTGTAG-3′   304
1271   F   5′-GACTTTCAAACAACCCAGTGTCT-3′   305
  R   5′-CTCTAGCCAGCTTCTTCCTCAC-3′   306
1273 FLJ32549   F   5′-GGTCTTCATACGCTGTACTTGCT-3′   307
  R   5′-TATGCCTTCACTGATCCACCTAC-3′   308
1277   F   5′-TCCTGTGGAAATAGAACTGTCGT-3′   309
  R   5′-CACAAAGTTCAAGGAAGCAGTCT-3′   310
1279 TOM1   F   5′-AAGGTTCTCTACCGCCTCAAGT-3′   311
  R   5′-CTGAACACACCGTGGCTTTAT-3′   312
1288 PTGFRN   F   5′-AAGAAGCCACCACTATTCCTCTC-3′   313
  R   5′-CCTGAAGGACTGAAAAGGTCATA-3′   314
1289   F   5′-CCTGTCTCCAAAGGAAAAACAA-3′   315
  R   5′-CTCAGTTTCATCAAGTCCTTTGC-3′   316
1290 GALNT2   F   5′-AGCGAGGAGAACTCTTGAAATC-3′   317
  R   5′-GTGTCCCACCATAGAAAACTTC-3′   318
1292 C17orf26   F   5′-GAAGCCAGCCTACTCCTTCTTAC-3′   319
  R   5′-TAGCATTCACAGAGCAGGAGATT-3′   320
1293 PPAT   F   5′-CATATGTGGAGGTGCTGTGTAAA-3′   321
  R   5′-GTCTACAGTTAGACAGGGAAGCC-3′   322
1294 MED6   F   5′-GACAGCTCTTGGATCCCTATTTT-3′   323
  R   5′-AGAGTGAACTTGCATCTGTTCCT-3′   324
1295 ADAM8   F   5′-GTGTGTGTACGTGTCTCCAGGT-3′   325
  R   5′-CAGACAAGATAGCTGACTCTCCC-3′   326
1299 KIAA0720   F   5′-GAAGTCTGGGGGTGTTGGTCT-3′   327
  R   5′-ATAAAGACTTGTCTAGACTCCACTGGG-3′   328
1302 LOC51754   F   5′-GAACAGTGTTTGGTCTGGAATGT-3′   329
  R   5′-GGATATGAGAAAGGAAGGCAAGT-3′   330
1306 ABCA4   F   5′-ATCGTGAGCATCATCAGAGAAG-3′   331
  R   5′-AGACACACAGACAAACATGCAGA-3′   332
1309  F   5′-GCACTACCCAGACATCTTCGAG-3′  333
 R   5′-TGGGTGGCAAGTCTAATCTATTC-3′  334
1310 FJX1  F   5′-GATCCGAAGAAACTGGCTACTG-3′  335
 R   5′-AGGTCCTGCTCTCTTTGTCCTAT-3′  336
1315  F   5′-GAGTCTTCCCCATTTTCAGTCAT-3′  337
 R   5′-CTACATTTATGTGGCACGAAGG-3′  338
1320  F   5′-CTTTGGCTTATTTACAGAGCTGG-3′  339
 R   5′-AGGAGGCTAAAGGCAATGAATAG-3′  340
1321 TXN  F   5′-GAGTCTTGAAGCTCTGTTTGGTG-3′  341
 R   5′-AACATCCTGACAGTCATCCACAT-3′  342
1323  F   5′-AGTGTCTGCAACCTTGCTTTAAC-3′  343
 R   5′-AGTCCAGGGCATAAAACCTAAAC-3′  344
1325 FACL5  F   5′-ATGTGTGTGTGTTCATCTTCCAG-3′  345
 R   5′-ATCCATTTTCTCACAAGCAGTG-3′  346
1328 CDC20  F   5′-GGGGAATATATATCCTCTGTGGC-3′  347
 R   5′-AAAAACAACTGAGGTGATGGGT-3′  348
1337 MVD  F   5′-ATGAAGGACAGCAACCAGTTC-3′  349
 R   5′-CAATGCTGGTTTATTCCCCAT-3′  350
1342 RBX1  F   5′-GTGAAAAAGTGGAATGCAGTAGC-3′  351
 R   5′-TTAGGTAACAGCAGGGAAAGTCA-3′  352
1343 GPR49  F   5′-CAGTCCTGTGACTCAACTCAA-3′  353
 R   5′-CGAGTTTCACCTCAGCTCTTCT-3′  354
1345 HT002  F   5′-GGATGTAGCAATCTCCACCAGT-3′  355
 R   5′-GTTCAAACACTCACTGAAGAGCC-3′  356
1350 AREG  F   5′-CTCCACTCGCTCTTCCAACAC-3′  357
 R   5′-CTTTTTACCTTCGTGCACCTTT-3′  358
1353  F   5′-GACAGCAAAGTCTTGACTCCTTC-3′  359
 R   5′-AAAGTGGCTGGGAGTAAGGTATC-3′  360
1362 SCAMP5  F   5′-AGGGCACACATTCATCTTTGTA-3′  361
 R   5′-GTTACCAAAGACAGACACATTGG-3′  362
1371 LOC56755   F   5′-CTCAGCAAGAGAAGAACCGTTTA-3′   363
  R   5′-CCACTTAGAAATCGAATACGTCC-3′   364
1375   F   5′-TACCCAAGTCAGAAAGACTCTGC-3′   365
  R   5′-GGTGGCCTTCTCTCAAAATTAGT-3′   366
1377   F   5′-CGCTGATAATATTCCTCGTCCTA-3′   367
  R   5′-AGTTTTTAGAGTTTCAGGGGGTC-3′   368
1378 LTBP3   F   5′-CTCCCTAGGGGTAGACTCTTCTG-3′   369
  R   5′-GAGACTAGGCCTCTTTTCTGGAT-3′   370
1384 KIAA0810   F   5′-TTCCAGCTATTCTTCAGATGCTC-3′   371
  R   5′-TATATGGCAGGTTTGTGTGTCTG-3′   372
1389 NMU   F   5′-ATGCTGCGAACAGAGAGCTG-3′   373
  R   5′AATGAACCCTGCTGACCTTC-3′   374
1390   F   5′-TGAGTCTCCTCTTGGTGATTCTG-3′   375
  R   5′-GGAAGAGCAAAGAGAGCTTCATC-3′   376
1391 PITX1   F   5′-GCTCAAGTCCAAACAGCACTC-3′   377
  R   5′-ACATACACAGGGACGCTGTAAAC-3′   378
1394 FLJ10156   F   5′-TCCTAGGGGACTCTTGAGCTTAG-3′   379
  R   5′-ATAAATAGGTACCCGTGAGCCC-3′   380
1395 FBN2   F   5′-TATGTGCTACCCACAACACCTC-3′   381
  R   5′-GTTTGAGAGGAACAACCAGGAG-3′   382
1398   DKFZP586C1324   F   5′-AGTCTTGGTTTACCTGTGGTGAC-3′   383
  R   5′-AAAACAAAACCCCAGAAACCC-3′   384
1399 DLX5   F   5′-GGGACTACTGTGTTTTGCTGTTC-3′   385
  R   5′-TGAGGTCATAGATTTCAAGGCAC-3′   386
1403 FOP   F   5′-TAATAGTACCAGCCATCGCTCAG-3′   387
  R   5′-ATCCTACGGCTTTATTGACACCT-3′   388
1406 LOC51654   F   5′-CAGCCAGTTCTCAGACACTTAGG-3′   389
  R   5′-GTACTCGAGCCATCTGGCCTT-3′   390
1407   F   5′-ACTTTTGTGGTGTCCCCAAGTA-3′   391
  R   5′-CTGTGTACCCTTTACCCATTCCT-3′   392
1410  F   5′-ACTAGAGAAATGAGGGGCGTATC-3′   393
 R   5′-ATCTCTAACCAAACATCGTAGCG-3′   394
1412 HSPC157  F   5′-CTGAGGCAGCTTTATTTCCTACA-3′   395
 R   5′-ACTGGTGGGGTTACATAACCTTT-3′   396
1413  F   5′-GGTAGTGAAATATGGACAAAGGACA-3′   397
 R   5′-ACTTCTGCCATGTCGTCTTTTT-3′   398
1417 HOXC9  F   5′-ACAAAGAGGAGAAGGCTGACCT-3′   399
 R   5′-CTCCTCGCTGGGTAGAACTAACT-3′   400
1420 CHODL  F   5′-GGAAGGAAAGGAACTACGAAATC-3′   401
 R   5′-GTTAAAAGGAGCACAGGGACATA-3′   402
1422 TMEM3  F   5′-CTCCTTACTTGTGGGATCAAATG-3′   403
 R   5′-ATGTGCTAGAATTACAGCCCTGA-3′   404
1424 MAGEA6  F   5′-AGGAGCTGAGTGTGTTAGAGGTG-3′   405
 R   5′ATAAACCTGGATGCTGACGCTC-3′   406
1435   DKFZp586H0623  F   5′-AGACCTAAGTCTGGAACAGAGCC-3′   407
 R   5′-CTACAGCACTCATTTGGAAAAGG-3′   408
1436 FLJ10858  F   5′-TTGGTCCTCCTCTGTTTCATAGA-3′   409
 R   5′-GCTTCTCCCCAGTTACAAGAGAC-3′   410
1439 PC  F   5′-GTACTGAAGGACCTGCCAAGG-3′   411
 R   5′-GGGAAAGCCAGCTTTATTGAGTA-3′   412
1440  F   5′-AGTTTTGGATGACTCTGCTCAAG-3′   413
 R   5′-GGCATTTACGAGCATTATCTGAC-3′   414
1441 HSNOV1  F   5′-CAGTTTCAGTCCCAGGTCATACT-3′   415
 R   5′-GGCATACTCTTTGGTGAGAAATG-3′   416
1444 TMPO  F   5′-CTACCCTGAAGGGGAAGAAAAG-3′   417
 R   5′-AACACACCCTACATCCAAGGTC-3′   418
1445 RANBP3  F   5′-CTTCAGAGGAAATCTCCCAGTC-3′   419
 R   5′-GGCGTTATCTCGTTGTACTCGT-3′   420
1447 ADAM23  F   5′-AAAGCTGAATACAGAAGGCACTG-3′   421
 R   5′-TTTACTGACAGGTGGTGAAAGGT-3′   422
从肺癌患者获取的癌组织中每一种基因的表达(图2)用半定量的RT-PCR进行验证。得到的结果如下:
NSC 807:9个NSCLC病例中的6个出现了NSC 807表达上调;
NSC 810:10个NSCLC病例中的6个出现了NSC 810表达上调;
NSC 811:9个NSCLC病例全部出现了NSC 811表达上调;
NSC 812:15个NSCLC病例全部出现了NSC 812表达上调;
NSC 816:8个NSCLC病例全部出现了NSC 816表达上调;
NSC 820:9个NSCLC病例中的8个出现了NSC 820表达上调;
NSC 822:10个NSCLC病例中的3个出现了NSC 822表达上调;
NSC 824:9个NSCLC病例全部出现了NSC 824表达上调;
NSC 825:12个NSCLC病例全部出现了NSC 825表达上调;
NSC 830:10个NSCLC病例中的7个出现了NSC 830表达上调;
NSC 837:9个NSCLC病例中的7个出现了NSC 837表达上调;
NSC 840:10个NSCLC病例中的9个出现了NSC 840表达上调;
NSC 841:11个NSCLC病例中的9个出现了NSC 841表达上调;
NSC 842:8个NSCLC病例中的7个出现了NSC 842表达上调;
NSC 846:10个NSCLC病例中的9个出现了NSC 846表达上调;
NSC 849:10个NSCLC病例中的7个出现了NSC 849表达上调;
NSC 850:7个NSCLC病例全部出现了NSC 850表达上调;
NSC 853:10个NSCLC病例中的8个出现了NSC 853表达上调;
NSC 854:7个NSCLC病例全部出现了NSC 854表达上调;
NSC 855:11个NSCLC病例中的10个出现了NSC 855表达上调;
NSC 857:8个NSCLC病例全部出现了NSC 857表达上调;
NSC 859:8个NSCLC病例全部出现了NSC 859表达上调;
NSC 861:7个NSCLC病例中的5个出现了NSC 861表达上调;
NSC 864:半定量RT-PCR证实了10个NSCLC病例全部出现了NSC 864表达上调;
NSC 870:11个NSCLC病例中的10个出现了NSC 870表达上调;
NSC 871:13个NSCLC病例中的12个出现了NSC 871表达上调;
NSC 872:12个NSCLC病例中的9个出现了NSC 872表达上调;
NSC 881:10个NSCLC病例全部出现了NSC 881表达上调;
NSC 882:10个NSCLC病例中的7个出现了NSC 882表达上调;
NSC 884:9个NSCLC病例全部出现了NS C884表达上调;
NSC 885:8个NSCLC病例全部出现了NSC 885表达上调;
NSC 889:8个NSCLC病例中的7个出现了NSC 889表达上调;
NSC 893:9个NSCLC病例中的7个出现了NSC 893表达上调;
NSC 895:6个NSCLC病例中的5个出现了NSC 895表达上调;
NSC 898:6个NSCLC病例中的5个出现了NSC 898表达上调;
NSC 901:14个NSCLC病例全部出现了NSC 901表达上调;
NSC 902:8个NSCLC病例中的7个出现了NSC 902表达上调;
NSC 903:10个NSCLC病例中的9个出现了NSC 903表达上调;
NSC 904:10个NSCLC病例中的7个出现了NSC 904表达上调;
NSC 905:13个NSCLC病例全部出现了NSC 905表达上调;
NSC 909:13个NSCLC病例中的9个出现了NSC 909表达上调;
NSC 912:7个NSCLC病例全部出现了NSC 912表达上调;
NSC 915:9个NSCLC病例全部出现了NSC 915表达上调;
NSC 917:9个NSCLC病例全部出现了NSC 917表达上调;
NSC 920:10个NSCLC病例中的8个出现了NSC 920表达上调;
NSC 921:8个NSCLC病例全部出现了NSC 921表达上调;
NSC 924:8个NSCLC病例全部出现了NSC 924表达上调;
NSC 929:12个NSCLC病例中的10个出现了NSC 929表达上调;
NSC 930:10个NSCLC病例中的9个出现了NSC 930表达上调;
NSC 933:10个NSCLC病例中的9个出现了NSC 933表达上调;
NSC 934:8个NSCLC病例中的7个出现了NSC 934表达上调;
NSC 936:8个NSCLC病例全部出现了NSC 936表达上调;
NSC 938:10个NSCLC病例中的9个出现了NSC 938表达上调;
NSC 940:10个NSCLC病例中的2个出现了NSC 940表达上调;
NSC 944:10个NSCLC病例全部出现了NSC 944表达上调;
NSC 947:10个NSCLC病例中的9个出现了NSC 947表达上调;
NSC 948:10个NSCLC病例中的8个出现了NSC 948表达上调;
NSC 956:8个NSCLC病例全部出现了NSC 956表达上调;
NSC 957:8个NSCLC病例中的7个出现了NSC 957表达上调;
NSC 958:10个NSCLC病例全部出现了NSC 958表达上调;
NSC 963:10个NSCLC病例全部出现了NSC 963表达上调;
NSC 964:8个NSCLC病例全部出现了NSC 964表达上调;
NSC 965:11个NSCLC病例中的10个出现了NSC 965表达上调;
NSC 966:8个NSCLC病例中的3个出现了NSC 966表达上调;
NSC 970:12个NSCLC病例中的7个出现了NSC 970表达上调;
NSC 972:10个NSCLC病例中的9个出现了NSC 972表达上调;
NSC 973:9个NSCLC病例中的3个出现了NSC 973表达上调;
NSC 974:10个NSCLC病例中的9个出现了NSC 974表达上调;
NSC 975:12个NSCL病例出现了NSC 975表达上调;
NSC 980:8个NSCLC病例中的7个出现了NSC 980表达上调;
NSC 984:9个NSCLC病例中的8个出现了NSC 984表达上调;
NSC 989:9个NSCLC病例全部出现了NSC 989表达上调;
NSC 990:8个NSCLC病例中的4个出现了NSC 990表达上调;
NSC 991:10个NSCLC病例中的3个出现了NSC 991表达上调;
NSC 994:8个NSCLC病例全部出现了NSC 994表达上调;
NSC 1000:13个NSCLC病例中的12个出现了NSC 1000表达上调
NSC 1002:8个NSCLC病例全部出现了NSC 1002表达上调;
NSC 1003:10个NSCLC病例全部出现了NSC 1003表达上调;
NSC 1012:8个NSCLC病例出现了NSC 1012表达上调;
NSC 1015:10个NSCLC病例出现了NSC 1015表达上调;
NSC 1016:9个NSCLC病例中的8个出现了NSC 1016表达上调;
NSC 1018:6个NSCLC病例中的3个出现了NSC 1018表达上调;
NSC 1023:12个NSCLC病例中的7个出现了NSC 1023表达上调;
NSC 1026:9个NSCLC病例中的7个出现了NSC 1026表达上调;
NSC 1027:8个NSCLC病例中的5个出现了NSC 1027表达上调;
NSC 1030:6个NSCLC病例中的5个出现了NSC 1030表达上调;
NSC 1034:8个NSCLC病例中的5个出现了NSC 1034表达上调;
NSC 1037:9个NSCLC病例全部出现了NSC 1037表达上调;
NSC 1038:7个NSCLC病例中的6个出现了NSC 1038表达上调;
NSC 1047:6个NSCLC病例中的4个出现了NSC 1047表达上调;
NSC 1049:6个NSCLC病例都检测到了NSC 1049表达上调;
NSC 1052:8个NSCLC病例全部出现了NSC 1052表达上调;
NSC 1057:8个NSCLC病例全部出现了NSC 1057表达上调;
NSC 1058:10个NSCLC病例中的8个出现了NSC 1058表达上调;
NSC 1059:9个NSCLC病例中的8个出现了NSC 1059表达上调;
NSC 1064:13个NSCLC病例全部出现了NSC 1064表达上调;
NSC 1066:10个NSCLC病例中的8个出现了NSC 1066表达上调;
NSC 1067:10个NSCLC病例全部出现了NSC 1067表达上调;
NSC 1071:10个NSCLC病例全部出现了NSC 1071表达上调;
NSC 1072:10个NSCLC病例中的7个出现了NSC 1072表达上调;
NSC 1075:9个NSCLC病例全部出现了NSC 1075表达上调;
NSC 1077:11个NSCLC病例中的8个出现了NSC 1077表达上调;
NSC 1078:9个NSCLC病例中的8个出现了NSC 1078表达上调;
NSC 1086:11个NSCLC病例中的10个出现了NSC 1086表达上调;
NSC 1089:9个NSCLC病例中的6个出现了NSC 1089表达上调;
NSC 1090:7个NSCLC病例中的3个出现了NSC 1090表达上调;
NSC 1103:8个NSCLC病例中的7个出现了NSC 1103表达上调;
NSC 1107:9个NSCLC病例中的8个出现了NSC 1107表达上调;
NSC 1109:9个NSCLC病例中的8个出现了NSC 1109表达上调;
NSC 1113:11个NSCLC病例中的10个出现了NSC 1113表达上调;
NSC 1116:9个NSCLC病例中的8个出现了NSC 1116表达上调;
NSC 1125:10个NSCLC病例出现了NSC 1125表达上调;
NSC 1131:6个NSCLC病例中的2个检测到了NSC 1131表达上调;
NSC 1133:10个NSCLC病例全部出现了NSC 1133表达上调;
NSC 1136:9个NSCLC病例中的8个出现了NSC 1136表达上调
NSC 1141:10个NSCLC病例中的6个出现了NSC1141表达上调;
NSC 1142:11个NSCLC病例中的9个检测到了NSC 1142表达上调;
NSC 1157:11个NSCLC病例中的1个出现了NSC 1157表达上调;
NSC 1162:10个NSCLC病例中的9个出现了NSC 1162表达上调;
NSC 1164:7个NSCLC病例全部出现了NSC 1164表达上调;
NSC 1167:9个NSCLC病例中的8个出现了NSC 1167表达上调
NSC 1169:7个NSCLC病例中的3个出现了NSC 1169表达上调;
NSC 1173:7个NSCLC病例中的5个出现了NSC 1173表达上调;
NSC 1176:9个NSCLC病例中的8个出现了NSC 1176表达上调;
NSC 1183:10个NSCLC病例全部检测到了NSC 1183表达上调;
NSC 1184:9个NSCLC病例中的8个出现了NSC 1184表达上调;
NSC 1185:6个NSCLC病例中的5个检测到了NSC 1185表达上调;
NSC 1191:8个NSCLC病例中的7个出现了NSC 1191表达上调;
NSC 1195:9个NSCLC病例中的5个出现了NSC 1195表达上调;
NSC 1196:6个NSCLC病例全部出现了NSC 1196表达上调;
NSC 1201:9个NSCLC病例全部出现了NSC 1201表达上调;
NSC 1205:9个NSCLC病例中的7个出现了NSC 1205表达上调;
NSC 1207:10个NSCLC病例中的8个出现了NSC 1207表达上调;
NSC 1210:10个NSCLC病例中的9个出现了NSC 1210表达上调;
NSC 1214:9个NSCLC病例中的7个出现了NSC 1214表达上调;
NSC 1234:10个NSCLC病例中的9个出现了NSC 1234表达上调;
NSC 1236:8个NSCLC病例中的6个出现了NSC 1236表达上调;
NSC 1237:6个NSCLC病例中的5个出现了NSC 1237表达上调;
NSC 1238:7个NSCLC病例中的6个出现了NSC 1238表达上调;
NSC 1240:7个NSCLC病例全部出现了NSC 1240表达上调;
NSC 1242:7个NSCLC病例中的4个出现了NSC 1242表达上调;
NSC 1246:10个NSCLC病例中的6个出现了NSC 1246表达上调;
NSC 1247:8个NSCLC病例中的5个出现了NSC 1247表达上调;
NSC 1250:8个NSCLC病例出现了NSC 1250表达上调;
NSC 1254:10个NSCLC病例出现了NSC 1254表达上调;
NSC 1265:5个NSCLC病例中的4个检测到了NSC 1265表达上调;
NSC 1273:6个NSCLC病例中的5个检测到了NSC 1273表达上调;
NSC 1277:10个NSCLC病例全部出现了NSC 1277表达上调;
NSC 1279:7个NSCLC病例全部出现了NSC 1279表达上调;
NSC 1288:9个NSCLC病例中的6个出现了NSC 1288表达上调;
NSC 1289:9个NSCLC病例中的6个出现了NSC 1289表达上调;
NSC 1290:10个NSCLC病例全部出现了NSC 1290表达上调;
NSC 1292:8个NSCLC病例全部出现了NSC 1292表达上调;
NSC 1293:6个NSCLC病例中的4个检测到了NSC 1293表达上调;
NSC 1294:8个NSCLC病例中的7个出现了NSC 1294表达上调;
NSC 1295:7个NSCLC病例中的5个出现了NSC 1295表达上调;
NSC 1299:6个NSCLC病例中的5个检测到了NSC 1299表达上调;
NSC 1302:7个NSCLC病例全部出现了NSC 1302表达上调;
NSC 1306:6个NSCLC病例中的5个检测到了NSC 1306表达上调;
NSC 1309:8个NSCLC病例中的7个出现了NSC 1309表达上调;
NSC 1310:10个NSCLC病例中的9个出现了NSC 1310表达上调;
NSC 1315:9个NSCLC病例中的6个出现了NSC 1315表达上调;
NSC 1320:9个NSCLC病例中的5个出现了NSC 1320表达上调;
NSC 1323:10个NSCLC病例全部出现了NSC 1323表达上调;
NSC 1325:9个NSCLC病例中的2个出现了NSC1325表达上调;
NSC 1328:9个NSCLC病例全部出现了NSC 1328表达上调;
NSC 1337:9个NSCLC病例全部出现了NSC 1337表达上调;
NSC 1345:8个NSCLC病例中的3个出现了NSC1345表达上调;
NSC 1350:8个NSCLC病例中的6个出现了NSC 1350表达上调;
NSC 1353:10个NSCLC病例中的3个出现了NSC 1353表达上调;
NSC 1362:7个NSCLC病例中的6个出现了NSC 1362表达上调;
NSC 1371:10个NSCLC病例全部出现了NSC 1371表达上调;
NSC 1375:8个NSCLC病例全部出现了NSC 1375表达上调;
NSC 1377:8个NSCLC病例中的5个出现了NSC1377表达上调;
NSC 1378:9个NSCLC病例中的8个出现了NSC1378表达上调;
NSC 1384:11个NSCLC病例中的8个出现了NSC 1384表达上调;
NSC 1389:9个NSCLC病例中的8个出现了NSC 1389表达上调;
NSC 1390:10个NSCLC病例中的8个出现了NSC 1390表达上调;
NSC 1391:8个NSCLC病例全部出现了NSC 1391表达上调;
NSC 1394:10个NSCLC病例中的6个出现了NSC 1394表达上调;
NSC 1395:7个NSCLC病例中的4个出现了NSC 1395表达上调;
NSC 1398:9个NSCLC病例中的8个出现了NSC 1398表达上调;
NSC 1399:10个NSCLC病例中的4个出现了NSC 1399表达上调;
NSC 1403:8个NSCLC病例中的6个出现了NSC 1403表达上调;
NSC 1406:10个NSCLC病例全部出现了NSC 1406表达上调;
NSC 1407:10个NSCLC病例全部出现了NSC 1407表达上调;
NSC 1410:10个NSCLC病例中的5个出现了NSC 1410表达上调;
NSC 1412:9个NSCLC病例中的6个出现了NSC 1412表达上调;
NSC 1417:7个NSCLC病例中的3个出现了NSC 1417表达上调;
NSC 1420:7个NSCLC病例全部检测到了NSC 1420表达上调;
NSC 1422:10个NSCLC病例中的4个出现了NSC 1422表达上调;
NSC 1424:6个NSCLC病例中的5个出现了NSC1424表达上调;
NSC 1435:8个NSCLC病例中的4个出现了NSC 1435表达上调;
NSC 1436:7个NSCLC病例全部出现了NSC 1436表达上调;
NSC 1439:8个NSCLC病例全部出现了NSC 1439表达上调;
NSC 1440:9个NSCLC病例中的8个出现了NSC 1440表达上调;
NSC 1441:11个NSCLC病例中的9个出现了NSC 1441表达上调;
NSC 1444:6个NSCLC病例中的4个出现了NSC 1444表达上调;
NSC 1445:7个NSCLC病例中的6个出现了NSC 1445表达上调;
NSC 1447:7个NSCLC病例全部出现了NSC 1447表达上调。
(3)反义S-寡核苷酸测定
制备每种基因的相应3-5对反向(对照)和反义S-寡核苷酸对。四种NSCLC细胞系A549、NCI-H226、NCI-H522和/或LC319铺板于6-孔平板或10cm培养皿,使用脂转染试剂(Life Technologies,Inc,Inc.)、用与每种基因相应的合成S-寡核苷酸转染上述细胞系,使转染后的细胞系在含有10%胎牛血清的培养基中维持2天。然后,用100%甲醇固定上述细胞,并用Giemsa溶液染色。针对26个基因的反义S-寡核苷酸与对照相比抑制病灶形成。因此,这些基因的抑制表现为转染后细胞生长、增殖和/或存活降低。有效(effective)反义S-寡核苷酸和对照反向寡核苷酸的序列显示于表5。进行了一式三份的MTT实验,采用本领域已知的方法(Akashi et al.(2000)Int.J.Cancer 88:873-80)。每一基因对应的方法和结果如下所示:
NSC 810:TTK;合成了相应于TTK的有效的反义S-寡核苷酸(SEQ IDNO:423)和反向S-寡核苷酸(对照)(SEQ ID NO:424)。将所述S-寡核苷酸都转染入以最高水平表达TTK的NSCLC细胞系A549和LC319。转染后两天,通过MTT实验可见,所述反义-S寡核苷酸与对照相比明显抑制了细胞增殖(图2)。由此可见,对TTK的抑制导致了细胞生长、增殖和/或存活降低。该结果还得到了病灶形成实验(focus formation)(用Giemsa染色)的证实(数据未给出)。
NSC 811:SDC1;合成了相应于SDC1的3对有效的反义S-寡核苷酸(AS1(SEQ ID NO:425)、AS2(SEQ ID NO:427)及AS4(SEQ ID NO:429))和反向S-寡核苷酸(对照)(R1(SEQ ID NO:426)、R2(SEQ ID NO:428)及R4(SEQNO:430)),将它们分别转染入以最高水平表达SDC1的NSCLC细胞系A549。转染后两天,通过MTT实验明显看到,这些反义-S寡核苷酸与对照相比明显抑制抑制了细胞增殖(图2)。因此可见,SDC1的抑制导致了细胞生长、增殖和/或存活的减弱。该结果还得到了病灶形成实验(用Giemsa染色)的证实(数据未给出)。
NSC 812:NMB;合成了相应于NMB的2对有效的反义S-寡核苷酸(AS1(SEQ ID NO:431)及AS2(SEQID NO:433))和反向S-寡核苷酸(对照)(R1(SEQ ID NO:432)及R2(SEQ ID NO:434))。将每种S-寡核苷酸都转染入以最高水平表达NMB的NSCLC细胞系A549、NCI-H226和NCI-H522。转染后两天,通过MTT实验可见,这些反义-S寡核苷酸与对照相比明显抑制了细胞增殖(图2)。因此可见,NMB的抑制导致了细胞生长、增殖和/或存活的降低。这些结果还得到了病灶形成实验(用Giemsa染色)的证实(数据未给出)。
NSC 816:PIR51;合成了相应于PIR51的有效的反义S-寡核苷酸AS1(SEQ ID NO:435)和反向S-寡核苷酸(对照)R1(SEQ ID NO:436)。将所述S-寡核苷酸都转染入以最高水平表达NMB的NSCLC细胞系A549、NCI-H226和NCI-H522。转染后两天,通过病灶形成实验(用Giemsa染色)可见,这些反义-S寡核苷酸与对照相比明显抑制了细胞增殖(数据未给出)。由此可见,对PIR51的抑制导致了细胞生长、增殖和/或存活的降低。
NSC 825:ANLN;合成了相应于ANLN的3对有效的反义S-寡核苷酸(AS1(SEQ ID NO:437)、AS3(SEQ ID NO:439)及AS5(SEQ ID NO:441))和反向S-寡核苷酸(对照)(R1(SEQ ID NO:438)、R3(SEQ ID NO:440)及R5(SEQID NO:442))。将每种S-寡核苷酸都转染入以最高水平表达ANLN的NSCLC细胞系A549、NCI-H226和NCI-H522。转染后两天,通过MTT实验可见,这些反义-S寡核苷酸与对照相比明显抑制了细胞增殖(图2)。由此可见,对ANLN的抑制导致了细胞生长、增殖和/或存活的降低。
NSC 841:URLC2;合成了相应于URLC2的2对有效的反义S-寡核苷酸(AS4(SEQ ID NO:443)及AS5(SEQ ID NO:445))和反向S-寡核苷酸(对照)(R4(SEQ ID NO:444)及R5(SEQ ID NO:446))。将每种S-寡核苷酸都转染入以最高水平表达URLC2的NSCLC细胞系A549、NCI-H226和NCI-H522。转染后两天,通过MTT实验可见,这些反义-S寡核苷酸与对照相比明显抑制了细胞增殖(图2)。由此可见,对URLC2的抑制导致了细胞生长、增殖和/或存活的降低。该结果还得到了病灶形成实验(用Giemsa染色)的证实(数据未给出)。
NSC 857:TIGD5;合成了相应于TIGD5的2对有效的反义S-寡核苷酸(AS3(SEQ ID NO:447)及AS4(SEQ ID NO:449))和反向S-寡核苷酸(对照)(R3(SEQ ID NO:448)及R4(SEQ ID NO:450))。将每种S-寡核苷酸都转染入以最高水平表达TIGD5的NSCLC细胞系A549、NCI-H226和NCI-H522。转染后两天,通过MTT实验可见,这些反义-S寡核苷酸与对照相比明显抑制了细胞增殖(图2)。由此可见,对TIGD5的抑制导致了细胞生长、增殖和/或存活的降低。该结果还得到了病灶形成实验(用Giemsa染色)的证实(数据未给出)。
NSC 859:URLC3;合成了相应于URLC3的3对有效的反义S-寡核苷酸(AS2(SEQ ID NO:451)、AS3(SEQ ID NO:453)及AS5(SEQ ID NO:455))和反向S-寡核苷酸(对照)(R2(SEQ ID NO:452)及R5(SEQ ID NO:456))。将每种S-寡核苷酸都转染入以最高水平表达URLC3的NSCLC细胞系A549、NCI-H226和NCI-H522。转染后两天,通过MTT实验可见,这些反义-S寡核苷酸与对照相比明显抑制了细胞增殖(图2)。由此可见,对URLC3的抑制导致了细胞生长、增殖和/或存活的降低。该结果还得到了病灶形成实验(用Giemsa染色)的证实(数据未给出)。
NSC 885:BAG5;合成了相应于BAG5的2对有效的反义S-寡核苷酸(AS1(SEQ ID NO:457)及AS2(SEQ ID NO:459))和反向S-寡核苷酸(R1(SEQID 458),R3(SEQ ID NO:448)及R2(SEQ ID 460))。将每种S-寡核苷酸都转染入以最高水平表达BAG5的NSCLC细胞系A549、NCI-H226和NCI-H522。转染后两天,通过病灶形成实验(用Giemsa染色)可见,这些反义-S寡核苷酸与对照相比明显抑制了细胞增殖(数据未给出)。由此可见,对BAG5的抑制导致了细胞生长、增殖和/或存活的降低。
NSC 893:MPHOSPH1;合成了相应于MPHOSPH1的2对有效的反义S-寡核苷酸(AS1(SEQ ID NO:461)及AS2(SEQ ID NO:463))和反向S-寡核苷酸(R1(SEQ ID NO:462)及R2(SEQ ID NO:464))。将每种S-寡核苷酸都转染入以最高水平表达MPHOSPH1的NSCLC细胞系A549、NCI-H226和NCI-H522。转染后两天,通过MTT实验可见,这些反义-S寡核苷酸与对照相比明显抑制了细胞增殖(图2)。由此可见,对MPHOSPH1的抑制导致了细胞生长、增殖和/或存活的降低。该结果还得到了病灶形成实验(用Giemsa染色)的证实(数据未给出)。
NSC 905:URLC1;合成了相应于URLC1的3对有效的反义S-寡核苷酸(AS2(SEQ ID NO:465)、AS3(SEQ ID NO:467)及AS5(SEQ ID NO:469))和反向S-寡核苷酸(对照)(R2(SEQ ID NO:466)、R3(SEQ ID NO:468)及R5(SEQ ID NO:470))。将每种S-寡核苷酸都转染入以最高水平表达URLC1的NSCLC细胞系A549、NCI-H226和NCI-H522。转染后两天,通过MTT实验可见,这些反义-S寡核苷酸与对照相比明显抑制了细胞增殖(图2)。由此可见,对URLC1的抑制导致了细胞生长、增殖和/或存活的降低。该结果还得到了病灶形成实验(用Giemsa染色)的证实(数据未给出)。
NSC 909:FLJ10468;合成了相应于FLJ1O468的一对有效的反义S-寡核苷酸AS1(SEQ ID NO:471)和反向S-寡核苷酸(对照)R1(SEQ ID NO:472)。将每种S-寡核苷酸都转染入以最高水平表达FLJ10468的NSCLC细胞系A549、NCI-H226和NCI-H522。转染后两天,通过病灶形成实验(用Giemsa染色)可见,这些反义-S寡核苷酸与对照相比明显抑制了细胞增殖(数据未给出)。由此可见,对FLJ1O468的抑制导致了细胞生长、增殖和/或存活的降低。
NSC 920:CHAF1A;合成了相应于CHAF1A的2对有效的反义S-寡核苷酸(AS1(SEQ ID NO:473)及AS4(SEQ ID NO:459))和反向S-寡核苷酸(R1(SEQ ID NO:474)及R4(SEQ ID NO:476))。将每种S-寡核苷酸都转染入以最高水平表达CHAF1A的NSCLC细胞系A549、NCI-H226和NCI-H522。转染后两天,通过病灶形成实验(用Giemsa染色)可见,这些反义-S寡核苷酸与对照相比明显抑制了细胞增殖(数据未给出)。由此可见,对CHAF1A的抑制导致了细胞生长、增殖和/或存活的降低。
NSC 947:PKP3;合成了相应于PKP3的4对有效的反义S-寡核苷酸(AS1(SEQ ID NO:477)、AS2(SEQ ID NO:479)、AS3(SEQ ID NO:481)及AS4(SEQ ID NO:483))和反向S-寡核苷酸(对照)((R1(SEQ ID NO:478)、R2(SEQ ID NO:480)、R3(SEQ ID 482)及R4(SEQ ID NO:484))。将每种S-寡核苷酸都转染入以最高水平表达PKP3的NSCLC细胞系A549和LC319。转染后两天,通过MTT实验可见,这些反义-S寡核苷酸与对照相比明显抑制了细胞增殖(图2)。由此可见,对PKP3的抑制导致了细胞生长、增殖和/或存活的降低。该结果还得到了病灶形成实验(用Giemsa染色)的证实(数据未给出)。
NSC 956:SIAHBP1;合成了相应于SIAHBP1的2对有效的反义S-寡核苷酸(AS1(SEQ ID NO:485)及AS2(SEQ ID NO:487))和反向S-寡核苷酸(对照)(R1(SEQ ID NO:486)及R2(SEQ ID NO:488))。将每种S-寡核苷酸都转染入以最高水平表达SIHBP1的NSCLC细胞系A549、NCI-H226和NCI-H522。转染后两天,通过MTT实验可见,这些反义-S寡核苷酸与对照相比明显抑制了细胞增殖(图2),这表明对SIAHBP1的抑制降低了细胞的生长,增殖和/或存活。该结果还得到了病灶形成实验(用Giemsa染色)的证实(数据未给出)。
NSC 994:DKFZP434E2318;合成了相应于DKFZP434E2318的4对有效的反义S-寡核苷酸((AS1(SEQ ID NO:489)、AS3(SEQ ID NO:491)、AS4(SEQ ID NO:493)及AS5(SEQ ID NO:495))和反向S-寡核苷酸(对照)((R1(SEQ ID NO:490)、R3(SEQ ID NO:492)、R4(SEQ ID 494)及R5(SEQID NO:496))。将每种S-寡核苷酸都转染入以最高水平表达DKFZP434E2318的NSCLC细胞系A549、NCI-H226和NCI-H522。转染后两天,通过MTT实验可见,这些反义-S寡核苷酸与对照相比明显抑制了细胞增殖(图2)。由此可见,对DKFZP434E2318的抑制降低了细胞生长、增殖和/或存活。该结果还得到了病灶形成实验(用Giemsa染色)的证实(数据未给出)。
NSC 1075:URLC4;合成了相应于URLC4的一对有效的反义S-寡核苷酸AS5(SEQ ID NO:497)和反向S-寡核苷酸(对照)R1(SEQ ID NO:498)。将每种S-寡核苷酸都转染入以最高水平表达URLC4的NSCLC细胞系A549、NCI-H226和NCI-H522。转染后两天,通过MTT实验明显看到,所述反义-S寡核苷酸与对照相比明显抑制了细胞增殖(图2)。由此可见,对URLC4的抑制导致了细胞生长、增殖和/或存活的降低。所述结果还得到了病灶形成实验(用Giemsa染色)的证实(数据未给出)。
NSC 1107:URLC8;合成了相应于URLC8的2对有效的反义S-寡核苷酸(AS1(SEQID NO:499)及AS4(SEQ ID NO:501))和反向S-寡核苷酸(对照)(R1(SEQ ID NO:500)及R4(SEQ ID NO:502)),将每对S-寡核苷酸分别转染入以最高水平表达URLC8的NSCLC细胞系A549。转染后两天,通过MTT实验可见,这些反义-S寡核苷酸与对照相比明显抑制了细胞增殖(图2)。由此可见,对URLC8的抑制导致了细胞生长、增殖和/或存活的降低。该结果还得到了病灶形成实验(用Giemsa染色)的证实(数据未给出)。
NSC 1113:URLC5;合成了相应于URLC5的2对有效的反义S-寡核苷酸(AS1(SEQ ID NO:503)及AS2(SEQ ID NO:505))和反向S-寡核苷酸(R1(SEQ ID NO:504)及R2(SEQ ID NO:506))。将每种S-寡核苷酸都转染入以最高水平表达URLC5的NSCLC细胞系A549、NCI-H226和NCI-H522。转染后两天,通过病灶形成实验(用Giemsa染色)可见,所述反义-S寡核苷酸与对照相比明显抑制细胞增殖(数据未给出)。这表明对URLC5的抑制降低了细胞的生长,增殖和/或存活。
NSC 1131:SYNJ2BP;合成了相应于SYNJ2BP的一对有效的反义S-寡核苷酸(AS1(SEQ ID NO:507))和反向S-寡核苷酸(对照)(R1(SEQ TDNO:508))。将每种S-寡核苷酸都转染入以最高水平表达SYNJ2BP的细胞系A549和NCI-H226。转染后两天,通过病灶形成实验(用Giemsa染色)可见,所述反义-S寡核苷酸与对照相比明显抑制细胞增殖(数据未给出)。这表明对SYNJ2BP的抑制降低了细胞的生长,增殖和/或存活。
NSC1142:NAPG;合成了相应于NAPG的一对有效的反义S-寡核苷酸(AS1(SEQ ID NO:509))和反向S-寡核苷酸(对照)(R1(SEQ ID NO:510))。将每种S-寡核苷酸都转染入以最高水平表达NAPG的NSCLC细胞系A549、NCI-H226和NCI-H522。转染后两天,通过病灶形成实验(用Giemsa染色)可见,所述反义-S寡核苷酸与对照相比明显抑制细胞增殖(数据未给出)。这表明对NAPG的抑制降低了细胞的生长,增殖和/或存活。
NSC 1183:BYSL;合成了相应于BYSL的3对有效的反义S-寡核苷酸(AS1(SEQ ID NO:511)、AS2(SEQ ID NO:513)及AS3(SEQ ID NO:515))和反向S-寡核苷酸(对照)(R1(SEQ ID NO:512)、R2(SEQ ID NO:514)及R3(SEQ ID NO:516))。将每种S-寡核苷酸都转染入以最高水平表达BYSL的NSCLC细胞系A549、NCI-H226和NCI-H522。转染后两天,通过病灶形成实验(用Giemsa染色)可见,这些反义S-寡核苷酸与对照相比明显抑制了细胞增殖(数据未给出),这表明对BYSL的抑制降低了细胞的生长,增殖和/或存活。
NSC 1185:URLC6;合成了相应于URLC6的2对有效的反义S-寡核苷酸(AS4(SEQ ID NO:517)及AS6(SEQ ID NO:519))和反向S-寡核苷酸(对照)(R4(SEQ ID NO:518)及R6(SEQ ID NO:520))。将每种S-寡核苷酸都转染入以最高水平表达URLC6的细胞系A549和NCI-H226。转染后两天,通过病灶形成实验(用Giemsa染色)可见,这些反义S-寡核苷酸与对照相比明显抑制了细胞增殖(数据未给出),这表明对URLC6的抑制降低了细胞的生长,增殖和/或存活。
NSC 1191:COX17;合成了相应于COX17的3对有效的反义S-寡核苷酸(AS2(SEQ ID NO:521)、AS4(SEQ ID NO:523)及AS5(SEQ ID NO:525))和反向S-寡核苷酸(对照)(R2(SEQ ID NO:522)、R4(SEQ ID NO:524)及R5(SEQ ID NO:526))。将每种S-寡核苷酸都转染入以最高水平表达COX17的NSCLC细胞系A549、NCI-H226和NCI-H522。转染后两天,通过MTT实验可见,这些反义-S寡核苷酸与对照相比明显抑制了细胞增殖(图2),这表明对COX17的抑制降低了细胞的生长,增殖和/或存活。该结果还得到了病灶形成实验(用Giemsa染色)的证实(数据未给出)。
NSC 1273:FLJ32549;合成了相应于FLJ32549的2对有效的反义S-寡核苷酸(AS1(SEQ ID NO:527)及AS2(SEQ ID NO:529))和反向S-寡核苷酸(R1(SEQ ID NO:528)及R2(SEQ ID NO:530))。将每种S-寡核苷酸都转染入以最高水平表达FLJ32549的NSCLC细胞系A549、NCI-H226和NCI-H522。转染后两天,通过病灶形成实验(用Giemsa染色)可见,所述反义-S寡核苷酸与对照相比明显抑制细胞增殖(数据未给出)。这表明对FLJ32549的抑制降低了细胞的生长,增殖和/或存活。
NSC 1389:NMU:合成了相应于NMU的一对有效的反义S-寡核苷酸AS(SEQ ID NO:531)和反向S-寡核苷酸(对照)R(SEQ ID NO:532)。将每种S-寡核苷酸都转染入以最高水平表达NMU的NSCLC细胞系A549和LC319。转染后两天,通过MTT实验可见,所述反义-S寡核苷酸与对照相比明显抑制了细胞增殖(图2),这表明对NMU的抑制降低了细胞的生长,增殖和/或存活。该结果还得到了病灶形成实验(用Giemsa染色)的证实(数据未给出)。
表5有效的S-寡核苷酸对的序列
  NSC编号 代号 No S-寡聚AS   SEQ IDNO: S-寡聚REV(对照)   SEQ IDNO:
810 TTK   5′-TAAATCCTCGGATTCCAT-3′ 423   5′-TACCTTAGGCTCCTAAAT-3′ 424
811 SDC1 1   5′-CGCCGCGCGCCTCATGCT-3′ 425   5′-TCGTACTCCGCGCGCCGC-3′ 426
2   5′-CGGCCGCACTCACCGGCA-3′ 427   5′-ACGGCCACTCACGCCGGC-3′ 428
4   5′-ACGACTGCTTGAAAGAGG-3′ 429   5′-GGAGAAAGTTC GTCAGCA-3′ 430
812 NMB 1   5′-AGTGCACTCGGATCTTGCT-3′ 431   5′-TCGTTCTAGGCTCACGTGA-3′ 432
2   5′-GCCTCCTGTACTGGATTT-3′ 433   5′-TTTAGGTCATGTCCTCCG-3′ 434
816 PIR51 1   5′-TTGACTGGTTTCTTATGT-3′ 435   5′-TGTATTCTTTGGTCAGTT-3′ 436
825 ANLN 1   5′-CTCCGTAAACGGATCCAT-3′ 437   5′-TACCTAGGCAAATGCCTC-3′ 438
3   5′-CGGATCCATCGCCCCAGG-3′ 439   5′-GGACCCCGCTACCTAGGC-3′ 440
5   5′-ACCAAAGACGCATCATCA-3′ 441   5′-ACTACTACGCAGAAACCA-3′ 442
841 URLC2 4   5′-CCCTCGATTCCTCCGAGT-3′ 443   5′-TGAGCCTCCTTAGCTCCC-3′ 444
5   5′-AACTGCCACACAGTAGTA-3′ 445   5′-ATGATGACACACCGTCAA-3′ 446
857 TIGD5 3   5′-ATCCTCGCTGTCCAGGGC-3′ 447   5′-CGGGACCTGTCGCTCCTA-3′ 448
4   5′-CGTCCAGGTGCAGCCACT-3′ 449   5′-TCACCGACGTGGACCTGC-3′ 450
859 URLC3 2   5′-GTTCCCATTCAAGAACAT-3′ 451   5′-TACAAGAACTTACCCTTG-3′ 452
3   5′-CATGAGTGATGGTGGCTC-3′ 453   5′-CTCGGTGGTAGTGAGTAC-3′ 454
5   5′-CCTCTCCCATGGCTTCAA-3′ 455   5′-AACTTCGGTACCCTCTCC-3′ 456
885 BAG5 1   5′-GGACAGGAACCAATGTAC-3′ 457   5′-CATGTAACCAAGGACAGG-3′ 458
2   5′-ACAATACAATGTGACAAG-3′ 459   5′-GAACAGTGTAACATAACA-3′ 460
893 MPHOSPH1 1   5′-AGATTCCATTCTGCAAAC-3′ 461   5′-CAAACGTCTTACCTTAGA-3′ 462
2   5′-GATTAAAATTAGATTCCAT-3′ 463   5′-TACCTTAGATTAAAATTAG-3′ 464
905 URLC1 2   5′-CATCTTGAGATCCTATTC-3′ 465   5′-CTTATCCTAGAGTTCTAC-3′ 466
3   5′-TGGGGGCTTTTTACTCAT-3′ 467   5′-TACTCATTTTTCGGGGGT-3′ 468
5   5′-AGGTACTTTAAACCACTT-3′ 469   5′-TTCACCAAATTTCATGGA-3′ 470
909 FLJ10468 1   5′-AGGAGCCATGGCGCTCGG-3′ 471   5′-GGCTCGCGGTACCGAGGA-3′ 472
920 CHAF1A 1   5′-GCAATCCATGGCTGTGGC-3′ 473   5′-CGGTGTCGGTACCTAACG-3′ 474
4   5′AATAATTACCTTGTATTA-3′ 475   5′-TACCTAACGTTTCTATCT-3′ 476
947 PKP3 1   5′-GAAGTTACCGTCCTGCAT-3′ 477   5′-TACGTCCTGCCATTGAAG-3′ 478
2   5′-GCAGGAAGTTACCGTCCT-3′ 479   5′-TCCTGCCATTGAAGGACG-3′ 480
3   5′-GTTGTTGAGCACAGCTAT-3′ 481   5′-TATCGACACGAGTTGTTG-3′ 482
4   5′-GAAGTCCTCCTTCCGATA-3′ 483   5′-ATAGCCTTCCTCCTGAAG-3′ 484
956 SIAHBP1 1   5′-CCGTCGCCATCTTGCGTC-3′ 485   5′-CTGCGTTCTACCGCTGCC-3′ 486
2   5′-TATGGTCGCCGTCGCCAT-3′ 487   5′-TACCGCTGCCGCTGGTAT-3′ 488
994 DKFZp434E2318 1   5′-GGACTGCATGGTGGAGAT-3′ 489   5′-TAGAGGTGGTACGTCAGG-3′ 490
3   5′-CATGGTGGAGATGGCGAC-3′ 491   5′-CAGCGGTAGAGGTGGTAC-3′ 492
4   5′-AGCAGGGCTGCAGAATGG-3′ 493   5′-GGTAAGACGTCGGGACGA-3′ 494
5   5′-TGCTCTTGAAGTCGGGAC-3′ 495   5′-CAGGGATGAAGTTCTCGT-3′ 496
1075 URLC4 5   5′-GCAGTTGAGATGATTATT-3′ 497   5′-TTATTAGTAGAGTTGACG-3′ 498
1107 URLC8 1   5′-CAAAATCATTTCCTCCTC-3′ 499   5′-CTCCTCCTTTACTAAAAC-3′ 500
4   5′-CGGGCCACCATCACGGAA-3′ 501   5′-AAGGCACTACCACCGGGC-3′ 502
1113 URLC5 1   5′-ACGATTCATTGCTGCCTT-3′ 503   5′-TTCCGTCGTTACTTAGCA-3′ 504
2   5′-ACACAAGACACGATTCAT-3′ 505   5′-TACTTAGCACAGAACACA-3′ 506
1131 SYNJ2BP 1   5′-ATCCACTCTTCCGTTCAT-3′ 507   5′-TACTTGCCTTCTCACCTA-3′ 508
1142 NAPG 1   5′-AGCCGCCATCTCCACAGT-3′ 509   5′-TGACACCTCTACCGCCGA-3′ 510
1183 BYSL 1   5′-CTTGTTCATGAACATCTCT-3′ 511   5′-TCTCTACAAGTACTTGTTC-3′ 512
2   5′-TGGCAGGAGGGTTCTTGT-3′ 513   5′-TACTTGTTCTTGGGAGGA-3′ 514
3   5′-CAGGCCTACCTGGCAGGA-3′ 515   5′-AGGACGGTCCATCCGGAC-3′ 516
1185 URLC6 4   5′-ACCGCTTACGGTTGGCTG-3′ 517   5′-GTCGGTTGGCATTCGCCA-3′ 518
6   5′-TCTGAAGAAAATAGATCA-3′ 519   5′-ACTAGATAAAAGAAGTCT-3′ 520
1191 COX17 2   5′-GTCAACCAGACCCGGCAT-3′ 521   5′-TACGGCCCAGACCAACTG-3′ 522
4   5′-TCTCCTTTCTCGATCATA-3′ 523   5′-ATAGTAGCTCTTTCCTCT-3′ 524
5   5′-ATTCCTTGTGGGCCTCAA-3′ 525   5′-AACTCCGGGTGTTCCTTA-3′ 526
1273 FLJ32549 1   5′-CCCATGCGAGCTGCGCC-3′ 527   5′-CCGCGTCGAGCGTACCC-3′ 528
2   5′-AGTGATAAACAGAAAGCG-3′ 529   5′-GCGAAAGACAAATAGTGA-3′ 530
1389 NMU   5′-TATCCTCGACTTTGACTT-3′ 531   5′-TTCAGTTTCAGCTCCTAT-3′ 532
(4)RNA干扰实验
psiH1BX3.0是一种基于载体的RNAi系统,它能够指导哺乳动物细胞中小干扰RNA(siRNA)的合成,使用该系统抑制NSCLC细胞中每种内源基因的表达。设计了5种载体,其用于指导合成针对每种基因靶序列的5个不同的19-碱基对双链核苷酸。使用Lipofectamin 2000试剂(Invitrogene,Car1sbad,CA,USA)将所述载体转染入四种NSCLC细胞系,所述转染的效率达到了60-90%以上。将细胞在有适当浓度遗传霉素(geneticin)存在的条件下(G418)培养5-9天。用Giemsa染色和/或MTT实验以一式三份的方式测定细胞数目或细胞存活力。
(5)流式细胞术
将细胞以5×105个细胞/100-毫米皿的浓度进行铺板,然后用上述的siRNA-表达载体转染所述细胞。24-48小时,胰蛋白酶消化细胞,收集于PBS种,并用70%冷乙醇固定30分钟。用100μg/ml RNAe(Sigma ChemicalCo.-Aldrich,St.Louis,MO)处理后,用PBS中的50μg/ml二碘化丙锭(propidiLm iodide)(Sigma-Aldrich)给细胞染色。在Becton Dickinson FACScan上进行流式细胞计数,然后用ModFit软件(Verity Software House,Inc.,Topsham,ME)进行分析。测定至少20,000个静止(ungated)细胞中处于细胞周期G0/G1、S和G2/M阶段的核及亚-G1群所占的百分比。还利用基于膜联蛋白V的结合的流式细胞术检测凋亡。
(6)RNAi
为了对那些可调节癌细胞生长、增殖和存活的新的分子靶标进行鉴定和定性,使用psiH1BX3.0载体实施RNA干扰技术,抑制通过上述方法选出的相应侯选基因的内源性表达。每神侯选基因的具体方法和结果如下所示:
NSC 807:KOC1:设计了3种有效载体,所述载体能指导靶向所示基因的19-碱基对双链序列的合成,将这些载体转染入NSCLC细胞系A549和LC319。转染后5天,与对照相比,将RNAi载体导入该基因抑制了集落(colony)数目(图3A和3B),这表明对KOC1的抑制降低了细胞的生长,增殖和/或存活。该结果还得到了病灶形成实验(Giemsa染色)的证实(数据未给出)。
NSC 810:TTK:设计了3种有效载体,所述载体能指导靶向所示基因的19-碱基对双链序列的合成,将这些载体转染入NSCLC细胞系A549和LC319。转染后5天,通过MTT实验发现:与对照相比,将RNAi载体导入该基因明显抑制了细胞增殖(图3A和3B),这表明对TTK的抑制降低了细胞的生长,增殖和/或存活。该结果还得到了病灶形成实验(Giemsa染色)的证实(数据未给出)。将用有效TTK RNAi转染的LC319细胞用显微术(microscopy)作进一步检验,每24或48天记录图像。所述TTK RNAi转染过的LC319细胞显示多核化(multi-nucleated)细胞表型,出现完全细胞死亡(complete cell death),而用上述EGFP RNAi转染的细胞显示单核化(mono-nucleated)细胞表型(图3C)。通过使用抗-TTK单克隆抗体的Western印迹分析,检测天然TTK蛋白在LC319细胞中的表达以及TTK RNAi对其表达的抑制(图3E)。
NSC 825:ANLN:设计了2种有效载体,所述载体能指导靶向所示基因的19-碱基对双链序列的合成,将这些载体转染入NSCLC细胞系A549和LC319。转染后5天,通过MTT实验发现:与对照相比,将RNAi载体导入该基因明显抑制了细胞增殖(图3A和3B),这表明对ANLN的抑制降低了细胞的生长,增殖和/或存活。该结果还得到了病灶形成实验(Giemsa染色)的证实(数据未给出)。用上述2种有效ANLN RNAi中任一个转染的LC319细胞具有多核化细胞表型,且出现完全细胞死亡,而用EGFP RNAi转染过的细胞显示单核化细胞表型(图3C)。通过流式细胞术测定ANLN RNAi转染的细胞的细胞周期图谱,显示异常的细胞周期和多倍性(>4N DNA含量)(图3D)。
NSC 841:URLC2:设计了2种能指导以该基因为靶标的19-碱基对双链序列合成的有效载体,将这些载体转染入NSCLC细胞系A549和LC319。转染后5天,通过MTT实验发现:与对照相比,该基因这些RNAi载体的导入明显抑制了细胞增殖(图3A和3B),这表明对URLC2的抑制降低了细胞的生长,增殖和/或存活。该结果还得到了病灶形成实验(Giemsa染色)的证实(数据未给出)。在所述siRNA转染后24小时进行流式细胞计数。结果,检测发现LC319细胞的亚-G1群增加了28%。上述URLC2-siRNA显著地减少了凋亡,凋亡还用以膜联蛋白V结合为基础的流式细胞计数实验做了评定(图3D)。
NSC 903:URLC9:设计了2种有效载体,所述载体能指导靶向所示基因的19-碱基对双链序列的合成,将这些载体转染入NSCLC细胞系A549和LC319。转染后5天,与对照相比,该基因的这些RNAi载体的导入明显地抑制了集落数目(图3A和3B),这表明对URLC9的抑制降低了细胞的生长,增殖和/或存活。该结果还得到了病灶形成实验(Giemsa染色)的证实(数据未给出)。
NSC 956:SIAHBP1:设计了2种有效载体,所述载体能指导靶向所示基因的19-碱基对双链序列的合成,将这些载体转染入NSCLC细胞系A549和LC319。转染后5天,通过MTT实验发现:与对照相比,将RNAi载体导入该基因明显抑制了细胞增殖(图3A和3B),这表明对SIAHBP1的抑制降低了细胞的生长,增殖和/或存活。该结果还得到了病灶形成实验(Giemsa染色)的证实(数据未给出)。
NSC 994:DKFZP434E2318:设计了2种有效载体,所述载体能指导靶向所示基因的19-碱基对双链序列的合成,将这些载体转染入NSCLC细胞系A549和LC319。转染后5天,通过MTT实验发现:与对照相比,该基因的RNAi载体(No.1)的导入明显抑制了细胞增殖(图3A和3B),这表明对DKFZP434E2318的抑制降低了细胞的生长,增殖和/或存活。该结果还得到了病灶形成实验(Giemsa染色)的证实(数据未给出)。
NSC 1107:URLC8:设计了5种有效载体,所述载体能指导靶向所示基因的19-碱基对双链序列的合成,将这些载体转染入NSCLC细胞系A549和LC319。转染后5天,与对照相比,该基因的这些RNAi载体的导入明显地抑制了集落数目(图3A和3B),这表明对URLC8的抑制降低了细胞的生长,增殖和/或存活。该结果还得到了病灶形成实验(Giemsa染色)的证实(数据未给出)。
NSC 1191:COX17:设计了2种有效载体,所述载体能指导靶向所示基因的19-碱基对双链序列的合成,将这些载体转染入NSCLC细胞系A549和LC319。转染后5天,通过MTT实验发现:与对照相比,该基因的RNAi载体(No.2)的导入明显抑制了细胞增殖(图3A和3B),这表明对COX17的抑制降低了细胞的生长,增殖和/或存活。该结果还得到了病灶形成实验(Giemsa染色)的证实(数据未给出)。
NSC 1246:SUPT3H:设计了3种有效载体,所述载体能指导靶向所示基因的19-碱基对双链序列的合成,将这些载体转染入NSCLC细胞系A549。转染后5天,通过MTT实验发现:与对照相比,该基因的RNAi载体(No.2)的导入明显抑制了细胞增殖(图3A和3B),这表明对SUPT3H的抑制降低了细胞的生长,增殖和/或存活。该结果还得到了病灶形成实验(Giemsa染色)的证实(数据未给出)。
NSC 1389:NMU:设计了2种有效载体,所述载体能指导靶向所示基因的19-碱基对双链序列的合成,将这些载体转染入NSCLC细胞系A549和LC319。转染后5天,通过MTT实验发现:与对照相比,该基因的RNAi载体(No.2)的导入明显抑制了细胞增殖(图3A和3B),这表明对NMU的抑制降低了细胞的生长,增殖和/或存活。该结果还得到了病灶形成实验(Giemsa染色)的证实(数据未给出)。然后,在siRNA转染后24小时,进行了流式细胞计数。结果,检测发现LC319细胞的亚-G1群增加了34.5%(图3D)。
NSC 1395:FBN2:设计了一种有效载体,所述载体能指导靶向所示基因的19-碱基对双链序列的合成,将该载体转染入NSCLC细胞系A549和LC319。转染后5天,通过病灶形成实验(Giemsa染色)发现:与对照相比,该基因的RNAi载体(No.2)的导入明显抑制了细胞增殖(数据未给出)。
(7)细胞色素c氧化酶活性
对A549细胞中的细胞色素c氧化酶(CCO)活性及所述活性被COX17抑制的情况进行了测定。图3F图示了测定CCO活性的方法。具体而言,用毛地黄皂苷(digotonin)将细胞分成线粒体及其它级分(Wako,Osaka,Japan)。将细胞色素c(63mM)在缓冲液(10mM Tris,0.2mM EDTA,0.05%n-十二烷基-b-D-麦芽糖苷,pH7.6)中与12.5mM L(+)-抗坏血酸室温(18℃)保温30分钟,将三价铁的细胞色素c转化为二价铁的细胞色素c。然后,37℃将20微升1mg/ml线粒体蛋白溶液加入2ml上述混合物。在550nm处测定上述反应的CCO活性。
为了说明人NSCLC细胞中上述天然COX17蛋白是否具有细胞色素c氧化酶(CCO)活性,将有效COX17RNAi载体转染入检测CCO活性用的A549细胞系。转染后2-5天,COX活性由于内源COX17基因被抑制而减弱。该结果证实了COX17发挥的CCO活性在人NSCLC中的重要性(图3F、G和H)。
起RNAi作用的合成寡核苷酸的序列如表6所示。鉴定了30个基因,其由于被反义S-寡核苷酸和/或RNAi转染而受到抑制将导致细胞的生长、增殖和存活受到抑制。
表6:起RNAi作用的合成寡核苷酸的序列
NSC编号 代号 NO. RNAi   SEQ IDNo:
 807   KOC1   1   5′-GGACCAAGCTAGACAAGCA-3′   533
 810   TTK   1   5′-ACAGTGTTCCGCTAAGTGA-3′   534
825 ANLN   1   5′-CCAGTTGAGTCGACATCTG-3′   535
  2   5′-GCAGCAGATACCATCAGTG-3′   536
841 URLC2   1   5′-CGCAGCTGCGAAGTGTTGTA-3′   537
  2   5′-GATACGAAAGCAGCTGCGA-3′   538
903 URLC9   1   5′-GAGCGATTCATCTTCATCA-3′   539
  2   5′-CTGCAATTGAGGCTCCTTC-3′   540
956 SIAHBP1   1   5′-GAGTGTGCTGGTGAAGCAG-3′   541
  2   5′-GATCAAGTCCTGCACACTG-3′   542
994   DKFZp434E2318 1 5′-CGTGCTAGCAGCTGCGTGT-3′ 543
 1107   URLC8   1   5′-TGAGGTGCTCAGCACAGTG-3′   544
  2   5′-CGGAGGATCTCATGACCAC-3′   545
  3   5′-GATTCGCATCCTGCCATCG-3′   546
  4   5′-CAGTATTCGGACATAGAGG-3′   547
  5   5′-CACCAAGTACTGCTTGTGC-3′   548
 1191   COX17   2   5′-GGAGAAGAACACTGTGGAC-3′   549
 1246   SUPT3H   2   5′-GACAAATTGAGTGGCAGCA-3′   550
 1389   NMU   2   5′-GAGATTCAGAGTGGACGAA-3′   551
 1395   FBN2   2   5′-GAGAGCAATGAGGATGACT-3′   552
(8)免疫细胞化学分析
为了制备c-myc-His标记的蛋白,合成了载体,所述载体含有编码位于每种蛋白C末端的c-myc-His表位序列(LDEESILKQE-HHHHHH)的基因,并将合成的载体转染入COS-7细胞。用含4%多聚甲醛的PBS固定重铺于带槽载玻片(chamber slides)的经瞬时转染的COS-7细胞,然后用含0.1%Triton X-100的PBS在4℃处理3分钟使得这些细胞可通透化。上述细胞在室温下用封闭溶液(2%牛血清白蛋白PBS溶液)覆盖30分钟,封闭非特异性的抗体-结合位点。然后,用小鼠抗-c-myc抗体(用封闭液1∶800倍稀释)保温上述细胞。用偶联有FITC的山羊抗-小鼠第二抗体对上述抗体进行染色,置于ECLIPSE E800显微镜(Nikon)下观察。为了验证c-myc-标记的蛋白在已经被转染的细胞中的表达,如前描述进行Western-印迹(Shiratsuchi eta1.,Biochem Biophys Res Commun 247:597-604(1998))。
(9)潜在靶基因的产物在哺乳动物细胞中的定位
为了研究这些候选基因编码的蛋白在哺乳动物细胞中的细胞定位,用pcDNA3.1(+)/c-myc-His转染COS-7细胞,pcDNA3.1(+)/c-myc-His是质粒,其含有编码位于每种蛋白C末端的c-myc-His-表位序列(LDEESILKQE-HHHHHH)基因。用抗-c-myc抗体,在不同的亚细胞位置检测到24种蛋白。这些蛋白其中一些在已被转染的细胞中的表达得到了免疫印迹实验的验证(图5A)。
(10)选择跨膜/分泌型蛋白作为抗-癌治疗和诊断的靶标
选择14种能于肿瘤细胞表面过表达的跨膜/分泌型蛋白。预期这些蛋白是受体-靶向的/基于抗体的癌症治疗及诊断方法的良好靶标。用免疫细胞化学分析验证了已被转染的COS-7细胞中所述蛋白其中一些的表达和细胞定位。
为了测定每种所述基因所编码蛋白的亚细胞定位,用表达c-myc-His或Flag标记的蛋白的质粒转染COS-7细胞。对每种基因进行免疫细胞化学分析的结果如下所示:
NSC 807:KOC1:KOC1/c-mvc-His蛋白主要见于(detected in)细胞质(cytoplasm)(数据未显示)。
NSC 810:TTK:TTK/c-myc-His蛋白主要见于细胞核(nucleus)(数据未显示)。
NSC 825:ANLN:ANLN-myc-His蛋白主要见于细胞核和细胞质(数据未显示)。
NSC 841:URLC2:URLC2/c-myc-.His蛋白主要见于细胞核和细胞质(数据未显示)。
NSC 849:GJB5:GJB5/c-myc-His蛋白主要见于细胞质膜(cytoplasmicmembrane)(图5a)。
NSC 855:LNIR:LNIR/c-myc-His蛋白主要见于细胞质膜(图5a)。
NSC 895:FAM3D:FAM3D/c-myc-His蛋白主要见于胞质颗粒(cytoplasmic granule)、高尔基体(golgi)和细胞质膜(图5a)。Western印迹检测到了FAM3D在培养基中的分泌(图5E;)。因此,可以认为FAM3D是一种分泌型蛋白。
NSC 903:URLC9:URLC9/c-myc-His蛋白主要见于细胞核(数据未显示)。
NSC 915:URLC10:URLC10/c-myc-His蛋白主要见于胞质颗粒和高尔基体,并且以斑点形式出现在细胞质膜表面(图5A)。
NSC 948:TASK-2:TASK-2/c-myc-His蛋白主要见于细胞质膜(图5A)。NSC 956:SIAHBP1:SIAHBP1/c-myc-His蛋白主要见于细胞质(数据未显示)。
NSC 994:DKFZp434E2318:DKFZp434E2318/c-myc-His蛋白主要见于细胞质(数据未显示)。
NSC 1000:PSK-1:PSK-1/c-myc-His蛋白主要见于细胞质膜(图5A)。
NSC 1103:KCNK1:KCNK1/c-myc-His蛋白主要见于细胞质膜(图5A)。
NSC 1107:URLC8:URLC8/c-myc-His蛋白主要见于细胞核(数据未显示)。
NSC 1164:NPTX1:NPTX1/c-myc-His蛋白主要见于胞质颗粒(图5A)。Western印迹检测到了NPTX1在培养基中的分泌(图5B)。因此,可以认为NPTX1是一种分泌型蛋白。
NSC 1191:COX17:COX17/c-myc-His蛋白主要见于线粒体(数据未显示)。
NSC 1201:SLC7A1:SLC7A1/C-myc-His蛋白主要见于细胞质膜和高尔基体(图5A)。
NSC 1246:SUPT3H:SUPT3H/c-myc-His蛋白主要见于细胞核和细胞质(数据未显示)。
NSC 1288:PTGFRN:PTGFRN/c-myc-His蛋白主要见于细胞质膜和高尔基体(图5A)。
NSC 1295:ADAM8:ADAM8/c-myc-His蛋白主要见于细胞质膜(图5A)。Westem印迹检测到了ADAM8的三种切割的形式(cleavaged form)在培养基中的分泌(图5B)。因此,可以认为ADAM8是一种分泌型蛋白。
NSC 1389:NMU:NMU/c-myc-His蛋白主要见于高尔基体,并且为分泌蛋白的形式(图5A)。
NSC 1420:CHDOL:CHDOL/c-myc-His蛋白主要见于细胞质膜和高尔基体(图5A)。
NSC 1441:HSCOV:HSNOV/c-myc-His蛋白主要见于细胞质膜和高尔基体(图5A)。
(12)细胞生长测定和菌落形成测定
按照常规方法建立稳定的转染子。具体而言,在将表达所述靶基因(pcDNA3.1/myc-His)或该基因互补链(pcDNA3.1-反义)的质粒或模拟质粒(pcDNA3.1)转染入COS-7细胞后,将该细胞与遗传霉素(G418)一起培养14天。然后,选择集落,通过Western印迹检测所述基因的表达。用抗c-myc抗体通过免疫染色验证了所建立的稳定转染子是单克隆的(数据未显示)。将COS-7细胞的稳定转染子接种于6-孔微量滴定板(5×104个细胞/孔),然后在加入抗生素的含10%FBS的培养基中维持24,48,72,96,120和144个小时。在每一时点,用细胞计数试剂盒(WAKO)或通过MTT实验评估细胞增殖活性。
(13)稳定的转化体的细胞生长测定和自分泌测定
NSC 810:TTK;为了测定TTK对哺乳动物细胞生长的影响,建立了表达外源TTK的COS-7细胞(COS-7-TTK1和2),并将其生长情况与用模拟载体转染的对照细胞进行对比。如图6所示,根据pcDNA3.1-TTK-c-myc-His蛋白的表达水平,COS-7-TTK细胞的生长与对照细胞的生长相比显著加快。该实验结果得到了3份独立实验的验证。所述COS-7-TTK细胞还表现出形成大于对照细胞集落的细胞集落的明显倾向(数据未显示)。
NSC 841:URLC2;为了测定URLC2对哺乳动物细胞生长的影响,建立了表达外源URLC2的NIH3T3细胞(NIH3T3-URLC2、3和5),并将其生长情况与用模拟载体(NIH3T3-模拟)转染的对照细胞进行对比。如图6所示,根据pcDNA3.1-URLC2-myc-His蛋白的表达水平,NIH3T3-URLC2细胞的生长与对照细胞的相比显著提高。该实验结果得到了3份独立实验的验证。所述N1H3T3-URLC2细胞还表现出形成大于对照细胞集落的细胞集落的明显倾向(数据未显示)。
NSC1389:NMU;为了测定NMU对哺乳动物细胞生长的影响,建立了表达外源NMU的COS-7细胞(COS-7-NMU-2,3和5),并且将它们的生长情况与用反义链或模拟载体(COS-7-AS-1和2;COS-7-模拟)转染的对照细胞的生长进行对比。如图6所示,根据pcDNA3.1-NMU-c-myc/His蛋白的表达水平,COS-7-NMU细胞的生长与对照细胞的生长相比显著提高。该实验结果得到了四份独立实验的验证。所述COS-7-NMU细胞还表现出形成大于对照细胞集落的细胞集落的明显倾向(数据未显示)。该结果表明过表达的NMU对于哺乳动物细胞具有转化效用(transforming effect)。
(14)自分泌测定
为了证实NMU在细胞生长中的自分泌功能,将COS-7细胞培养在含NMU的25氨基酸多肽之活性形式(NMU-25)的培养基中,NMU-25在培养基中的终浓度为1μg~50μg(3μM~15μM/ml)。用含相同浓度的牛血清白蛋白(BSA)的培养基作为对照。在为期7天的时间内,每48小时添加所述多肽或BSA,持续7天。在第24、48、72、96、120和144小时的时间点,通过MTT实验检测细胞存活力。为了验证NMU蛋白对COS-7细胞的生长促进作用,向含3μM/ml NMU-25的培养基中加入终浓度为0.5μM~7.5μM/ml的抗-NMU抗体。
结果发现,与NMU-25一同保温的COS-7细胞比与BSA一同保温的COS-7细胞生长得更大而且更快,并且表现为剂量依赖性方式(图7A)。
接着,向含3μM/mlNMU-25的COS-7细胞培养物中加入终浓度为0.5μM~7.5μM/ml的抗-NMU抗体。MTT实验结果发现,与NMU-25和抗-NMU抗体共保温的COS-7细胞比对照细胞生长得更为缓慢,并且表现为剂量依赖性方式(图7B)。
另外,向过表达内源NMU的LC319细胞培养物中加入相同浓度的抗-NMU抗体。MTT实验结果发现,与抗-NMU抗体一同保温的LC319细胞比对照细胞生长得更为缓慢,并且表现为剂量依赖性方式(图7C)。
(15)免疫组织化学分析
为了测定所述蛋白在包括正常肺和NSCLC在内的临床组织样品中的表达情况,用ENVISION+Kit/HRP(DAKO)对切片染色。具体而言,在内源过氧化物酶和蛋白封闭反应(protein blocking reaction)后,加入作为第一抗体的抗-人抗体,然后用HRP标记的抗-兔IgG作为第二抗体处理所述组织样品。然后,加入色原作为用苏木精对组织样品进行复染的底物。
为了验证TTK蛋白在NSCLC中的过表达,首先,通过Western印迹分析鉴定NSCLC细胞系A549、LC319和NCI中的所述蛋白(图8)。然后,对每种基因进行免疫组织化学染色,如下所述:
NSC 947:PKP3;用抗-PKP3抗体对用外科手术获得的NSCLC(鳞状细胞癌)样品进行免疫组织化学染色,该组织样品已经被冷冻并包埋入OCT培养基中。所有肿瘤组织样品的细胞质大部分都由抗-PKP3抗体染色,而正常肺组织未被染色(图9)。
NSC 1164:NPTX1;用抗-NPTX1抗体对用外科手术获得的NSCLC样品进行免疫组织化学染色,该组织样品已被冷冻并包埋入OCT培养基中。所有肿瘤组织样品的细胞质大部分都被抗-NPTX1抗体染色,而正常肺组织未被染色(图9)。
NSC 1295:ADAM8;用抗-ADAM8抗体对用外科手术获得的NSCLC样品进行免疫组织化学染色,该组织样品已被冷冻并包埋入OCT培养基中。所有肿瘤组织样品被抗-NPTX1抗体强染色,而正常肺组织仅被略微染色(图9)。
NSC1389:NMU;用抗-NMU抗体对用外科手术获得的NSCLC样品进行免疫组织化学染色,该组织样品已被冷冻并包埋入OCT培养基中。所有肿瘤组织样品的细胞质大部分都被抗-NMU抗体染色,而正常肺组织未被染色。在腺癌样品中,NMU主要见于导管细胞以及细胞核周围的鳞状细胞癌中,具体是胞质颗粒中(图9)。
(16)靶基因的全长测序、Northem印迹以及半定量RT-PCR分析
通过对在50%以上NSCLC中的表达与34份正常组织中的表达相比升高5倍的过表达的基因之列表进行组合,选择642个候选基因作为肿瘤标记或治疗的靶标,所选择的这些基因特异性表达于NSCLC中,而在除了对于存活并非至关重要或者可被取代的生殖组织或胎儿器官之外的正常组织中不表达。通过EST筛选测定所述靶基因的全长序列,而且用半定量RT-PCR验证它们在肿瘤及正常组织中的基因表达模式。
发现了一种新基因URLC1。它的核苷酸序列及其编码的氨基酸序列在序列表中具有以下SEQ ID NO:
               核苷酸序列氨基酸序列
URLC1   SEQ ID NO:1    SEQ ID NO:2
上述方法对每一种本发明所述基因获得的结果概括如下:
NSC807:KOC1;该基因编码一种hnRNA K-同源性(KH)结构域和一种RNA识别基序(RRM)结构域。KH结构域具有与IGF-II IGF2)前导3’mRNA的5’UTR结合的功能,因此可以抑制晚期发育期间IGF-II的翻译。该基因在正常组织中表达较低,但在NSCLC中高表达,而且抑制该基因使得经转染的细胞的生长、增殖和/或存活减弱,这些都表明该基因可以用作新诊断标记以及新药和免疫疗法的靶标。
NSC810:TTK;该基因编码一种S TKc结构域。该基因所编码的蛋白在丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸上磷酸化,这种磷酸化可能与细胞增殖有关。该基因在正常组织中表达较低,但在NSCLC中高表达,而且抑制该基因使得经转染的细胞的生长、增殖和/或存活减弱,这些都表明该基因可以用作新诊断标记以及新药和免疫疗法的靶标。按照本发明,表达于稳定的转染子中的TTK蛋白以剂量依赖性方式促进了COS-7细胞的生长。这一结果表明TTK的过表达对于哺乳动物细胞有促转化(transforming)作用。这些数据表明:TTK是NSCLC的一种新的癌基因,可以通过靶向TTK建立治疗肺癌的有希望的治疗手段。
NSC 811:SDC1;该基因编码一种推定的条带4.1同源物结合基序(4.1m)结构域。该基因编码的蛋白是一种细胞表面蛋白聚糖,多配体蛋白聚糖,是一种可充当细胞外基质受体的整合型膜蛋白。它属于跨膜硫酸乙酰肝素蛋白聚糖(heparan sulfate proteoglycan)群体。该基因在正常组织中表达较低,但在NSCLC中高表达,而且抑制该基因使得经转染的细胞的生长、增殖和/或存活减弱,这些都表明该基因可以用作新诊断标记以及新药和免疫疗法的靶标。
NSC 812:NMB;该基因编码一种信号肽和一种跨膜结构域。该基因编码的蛋白可以发挥神经调节肽(neuromedin)B的功能,其为铃蟾肽(bombesin)家族的一个成员,是一种肺癌的自分泌生长因子。该基因在正常组织中表达较低,但在NSCLC中高表达,而且抑制该基因使得经转染的细胞的生长、增殖和/或存活减弱,这些都表明该基因可以用作新诊断标记以及新药和免疫疗法的靶标。
NSC 816:PIR51;该基因编码的蛋白定位于细胞核,并且在该蛋白中未发现任何结构域。该蛋白可以充当DNA-和RNA-结合蛋白;并且与参与DNA重组和修复的RAD51重组酶蛋白相互作用。该基因在正常组织中表达较低,但在NSCLC中高表达,而且抑制该基因使得经转染的细胞的生长、增殖和/或存活减弱,这些都表明该基因可以用作新诊断标记以及新药和免疫疗法的靶标。
NSC 825:ANLN;这些基因编码一种PH结构域,现已发现其数种推定的功能:(1)与异源三聚体G蛋白的β/γ亚单位结合;(2)与脂质例如,磷脂酰肌醇-4,5-二磷酸结合;(3)与磷酸化的Ser/Thr残基结合;以及(4)通过一种未知的机理附着于膜上。该基因编码一种肌动蛋白结合蛋白,这种蛋白与卵裂沟(cleavage furrow)蛋白例如septins相互作用,能够在胞质分裂(cytokenesis)中发挥作用。该基因在正常组织中表达较低,但在NSCLC中高表达,而且抑制该基因使得经转染的细胞的生长、增殖和/或存活减弱,这些都表明该基因可以用作新诊断标记以及新药和免疫疗法的靶标。
NSC 841:URLC2;该基因编码一种Jmic结构域(部分cupin金属酶(metalloenzyme)的结构域家族)。该基因编码的蛋白可能是一种功能未知的酶,这种酶能够调节染色质重构(reorganization)过程。该基因在正常组织中表达较低,但在NSCLC中高表达,而且抑制该基因使得经转染的细胞的生长、增殖和/或存活减弱,这些都表明该基因可以用作新诊断标记以及新药和免疫疗法的靶标。根据本实验,URLC2的抑制诱导了LC319细胞的凋亡。而且,表达于稳定的转染子中的URLC2蛋白以剂量依赖性方式促进了NIH3T3细胞的生长。这一结果表明过表达的URLC2对于哺乳动物细胞具有转化作用。这些数据表明URLC2是NSCLC的一种新的癌基因,并提示可以通过以URLC2为焦点建立一种治疗肺癌的有希望的治疗手段。
NSC 849:GJB5;该基因编码一种间隙连接蛋白,β5(连接蛋白(connexin)31.1)。GJB5连接蛋白家族(β-型(i群)亚家族)的一个成员。据报导一个间隙连接由一簇紧密堆积的成对跨膜通道连接子(connexon)组成,低分子量物质通过它从一个细胞扩散至邻接细胞。连接子由连接蛋白六聚物组成。通过免疫细胞化学分析检测,发现该基因编码的蛋白主要存在于细胞质膜。该基因在正常组织中表达较低但高表达于NSCLC,这表明该基因可以用作诊断标记(即,在使用血清或痰的诊断中)以及NSCLC的治疗靶标。
NSC 855:LNIR;该基因编码信号肽、免疫球蛋白、免疫球蛋白C2结构域和一种跨膜结构域。该基因编码的跨膜蛋白过表达于肿瘤细胞表面上,但不表达于正常细胞。因此,该基因是靶向受体的治疗或诊断的良好靶。
NSC 857:TIGD5;该基因编码一种着丝点蛋白(CentromereProtein)B(CENP-B)。CENP-B是一种定位至着丝点的DNA-结合蛋白。在该蛋白N-末端的125个残基中,存在着DNA-结合结构域,该结构域能结合相应的17bp CENP-B框序列。在C-末端59个残基中,CENP-B具有一个二聚化结构域。CENP-B二聚体既可以结合两个分离的DNA分子,也可以结合位于一个DNA分子上的两个CENP-B框,其中DNA的插入片段(intervening stretch)形成环结构。该基因属于人DNA-介导的转座子pogo超家族的tigger亚家族。属于该亚家族的蛋白与见于真菌及线虫(nematode)中的DNA转座子相关,与Tcl和水手转座酶(mariner transposase)之间的关系较远。该基因编码的蛋白还非常类似于主要(major)哺乳动物着丝点蛋白B。该基因的确切功能还是未知的。该基因在正常组织中表达较低,但在NSCLC中高表达,而且抑制该基因使得经转染的细胞的生长、增殖和/或存活减弱,这些都表明该基因可以用作新诊断标记以及新药和免疫疗法的靶标。
NSC 859:URLC3;该基因不编码任一已知的结构域,该基因编码的蛋白在56个氨基酸范围上与真核翻译起始因子3亚单位(人)之间具有70%相似性。该亚单位结合40s核糖体,能促进甲硫氨酰-tRNAi与mRNA的结合(通过相似性)。该基因在正常组织中表达较低,但在NSCLC中高表达,而且抑制该基因使得经转染的细胞的生长、增殖和/或存活减弱,这些都表明该基因可以用作新诊断标记以及新药和免疫疗法的靶标。
NSC 885:BAG5;该基因编码一种BAG结构域。因此,该基因编码的蛋白是BAG1-相关蛋白家族的一个成员。该基因在正常组织中表达较低,但在NSCLC中高表达,而且抑制该基因使得经转染的细胞的生长、增殖和/或存活减弱,这些都表明该基因可以用作新诊断标记以及新药和免疫疗法的靶标。
NSC 893:MPHOSP1;该基因编码一种KISc结构域及微管-依赖性的分子马达(motor),其在细胞器的胞内运输以及细胞分裂中发挥重要作用。该基因编码的蛋白属于驱动蛋白(kenesin)-样蛋白家族,与rab6a及rab6b的鸟苷三磷酸gtp)-结合形式相互作用。该蛋白可以充当高尔基体膜及相关小泡沿rab6调节的后退性(retrograde)转运所需的马达(motor)。该蛋白具有微管正端-导向移动(microtubule plus end-directed motility),在细胞周期的M阶段被磷酸化。该基因在正常组织中表达较低,但在NSCLC中高表达,而且抑制该基因使得经转染的细胞的生长、增殖和/或存活减弱,这些都表明该基因可以用作新诊断标记以及新药和免疫疗法的靶标。
NSC 895:FAM3D;该基因编码一种N-末端带有信号肽结构域的蛋白,该蛋白被认为是一种分泌型蛋白,尽管它的功能还有待阐明。在免疫细胞化学分析中,该蛋白主要见于胞质颗粒和高尔基体,这表明该蛋白是分泌型的。该基因在正常组织中表达较低但高表达于NSCLC,这表明该基因可以用作NSCLC的诊断标记(即,在使用血清或痰的诊断中)。
NSC 898:URLC7;该基因编码的蛋白定位于细胞核,并且该蛋白中不存在任何已知的结构域。该基因在正常组织中表达较低,但在NSCLC中高表达,而且抑制该基因使得经转染的细胞的生长、增殖和/或存活减弱,这些都表明该基因可以用作新诊断标记以及新药和免疫疗法的靶标。
NSC 903:URLC9;该基因编码的蛋白定位于细胞核,并且该蛋白中不存在任何已知的结构域。该基因在正常组织中表达较低,但在NSCLC中高表达,而且抑制该基因使得经转染的细胞的生长、增殖和/或存活减弱,这些都表明该基因可以用作新诊断标记以及新药和免疫疗法的靶标。
NSC 905:URLC1;这些基因编码一种TUDOR结构域,现已发现其数种推定的功能:(1)RNA-结合;以及(2)核酸结合。该基因在正常组织中表达较低,但在NSCLC中高表达,而且抑制该基因使得经转染的细胞的生长、增殖和/或存活减弱,这些都表明该基因可以用作新诊断标记以及新药和免疫疗法的靶标。
NSC 909:FLJ10468;该基因编码的蛋白定位于细胞核,并且该蛋白中不存在任何已知的结构域。该基因在正常组织中表达较低,但在NSCLC中高表达,而且抑制该基因使得经转染的细胞的生长、增殖和/或存活减弱,这些都表明该基因可以用作新诊断标记以及新药和免疫疗法的靶标。
NSC 915:URLC10;该基因编码2个跨膜结构域。该基因编码的蛋白具有一与GML具有低相似性的区域。通过免疫细胞化学分析发现,该蛋白主要存在于胞质颗粒和高尔基体,并以斑点形式出现在细胞质膜上。推定该基因编码的跨膜蛋白过表达于肿瘤细胞表面上,但不表达于正常细胞。因此,该蛋白可以用作靶向受体的治疗或诊断的良好靶。
NSC 920:CHAF1A;未检测到该基因编码任一已知的结构域。该基因编码的蛋白具有150kDa亚单位染色质装配因子1,其将有助于组蛋白H3乙酰化H4沉积到正在复制的DNA上。该基因在正常组织中表达较低,但在NSCLC中高表达,而且抑制该基因使得经转染的细胞的生长、增殖和/或存活减弱,这些都表明该基因可以用作新诊断标记以及新药和免疫疗法的靶标。
NSC 947:PKP3;该基因编码一种犰狳(armadillo)/β-连环蛋白(catenin)-样重复单元结构域(ARM)。犰狳重复单元是一种大约40氨基酸长串联重复序列基序,其首先见于果蝇节段极性基因犰狳(armadillo)中。后来在哺乳动物犰狳同源物β-连环蛋白即连接型噬斑蛋白斑珠蛋白(junctional plaqueprotein plakoglobin)、腺瘤的息肉病大肠菌(APC)肿瘤抑制基因蛋白以及许多其它蛋白中发现了类似的重复。该基因编码的蛋白可以发挥plakophillin 3的作用,介导蛋白-蛋白相互作用,是犰狳蛋白家族的一个成员。该基因在正常组织中表达较低,但在NSCLC中高表达,而且抑制该基因使得经转染的细胞的生长、增殖和/或存活减弱,这些都表明该基因可以用作新诊断标记以及新药和免疫疗法的靶标。免疫组织化学染色显示:PKP3在鳞状细胞癌细胞的细胞质中被强染色。这些数据表明PKP3可以作为治疗肺癌的一种有效的治疗及诊断靶标。
NSC 948:TASK-2;该基因编码一种离子转运物结构域,信号肽(SOSUI)。该基因编码一种蛋白,该蛋白属于含两个成孔P结构域的钾通道蛋白超家族。该基因的mRNA主要表达于肾的皮质远段(distal)小管和集合管。该基因编码的蛋白对外界pH高度敏感,这一点结合其表达模式表明:该基因在肾脏的钾转运中发挥重要作用。该基因编码的跨膜蛋白过表达于肿瘤细胞表面上,但不表达于正常细胞。因此,该蛋白可以用作靶向受体的治疗或诊断的良好靶。
NSC 956:SIAHBP1;该基因编码一种RNA识别基序(RRM)结构域,已知该结构域是一种核酸结合结构域。该基因编码的蛋白是一种Ro RNS-结合蛋白。它与Ro RNPs相互作用从而活化Ro RNPs的功能。该蛋白还与远上游元件(FUSE)以及FUSE-结合蛋白形成一种三元络合物。它能够通过结合FUSE抑制c-myc报道物。转录因子IIH也是该蛋白的靶标,因而该蛋白能够抑制经活化的转录。该基因还与着色性干皮病(xerodermapigmentosum disorder)有关。该基因存在两种可选拼接转录物变体,所述变体编码不同的同种型。该基因上存在多个腺苷酸化位点。该基因在正常组织中表达较低,但在NSCLC中高表达,而且抑制该基因使得经转染的细胞的生长、增殖和/或存活减弱,这些都表明该基因可以用作新诊断标记以及新药和免疫疗法的靶标。
NSC 991:DOLPP1;该基因编码一种信号肽和一种酸性磷酸酶同源物结构域。该基因编码的跨膜蛋白过表达于肿瘤细胞表面上,但不表达于正常细胞。因此,该蛋白可以用作靶向受体的治疗或诊断的良好靶。
NSC 994:DKFZP434E2318;该基因编码BTB/POZ结构域和Kelch结构域。BTB/POZ结构域是蛋白-蛋白相互作用基序。BTB/POZ结构域能介导同聚二聚化(homomeric dimerization),而且在一些情况下还能介导杂聚二聚化。数种锌指蛋白的POZ结构域介导转录抑制,并且与包括N-CoR及SMART的组蛋白去乙酰化酶共-阻遏物复合体的组分相互作用。Kelch结构域是一种参与蛋白-蛋白相互作用的β螺桨(propeller)结构域,具有某些类似于gycolate氧化酶的酶促活性。该基因在正常组织中表达较低,但在NSCLC中高表达,而且抑制该基因使得经转染的细胞的生长、增殖和/或存活减弱,这些都表明该基因可以用作新诊断标记以及新药和免疫疗法的靶标。
NSC 1000:PSK-1;这基因编码信号肽、CUB结构域,Sushi结构域(SCR重复单元)以及一种跨膜结构域。该基因编码的蛋白高度近似于鼠Sez6,鼠7Sez6是一种粘附蛋白蛋白,其含有5个sushi(SCR)结构域和一个细胞外的CUB结构域。推定该基因编码的跨膜蛋白过表达于肿瘤细胞表面上,但不表达于正常细胞。因此,该蛋白可以用作靶向受体的治疗或诊断的良好靶。
NSC 1066:MCM8;该基因编码与多种细胞活性结构域及微型染色体保持(MCM)结构域相关的ATPase(AAA)。该基因在正常组织中表达较低但高表达于正常组织,这些都表明该基因可以用作新诊断标记以及新药和免疫疗法的靶标。
NSC 1075:URLC4;未检测到该基因编码的任一已知结构域。该基因在正常组织中表达较低,但在NSCLC中高表达,而且抑制该基因使得经转染的细胞的生长、增殖和/或存活减弱,这些都表明该基因可以用作新诊断标记以及新药和免疫疗法的靶标。
NSC 1103:KCNK1;该基因编码一种蛋白,该蛋白属于含两个成孔P结构域的钾通道蛋白超家族。没有显示该基因的产物是一种功能通道。其它非孔道形成蛋白对于发挥功能通道活性可能为必要的。推定该跨膜蛋白过表达于肿瘤细胞表面上,但不表达于正常细胞。因此,该蛋白可以用作靶向受体的治疗或诊断的良好靶。
NSC 1107:URLC8;该基因编码一种双链RNA结合基序(DSRM)结构域。该基因在正常组织中表达较低,但在NSCLC中高表达,而且抑制该基因使得经转染的细胞的生长、增殖和/或存活减弱,这些都表明该基因可以用作新诊断标记以及新药和免疫疗法的靶标。
NSC 1113:URLC5;未检测到该基因编码的任一已知结构域。该基因在正常组织中表达较低,但在NSCLC中高表达,而且抑制该基因使得经转染的细胞的生长、增殖和/或存活减弱,这些都表明该基因可以用作新诊断标记以及新药和免疫疗法的靶标。
NSC 1131:SYNJ2BP;该基因编码一种PDZ跨膜结构域。该基因编码的蛋白可能是一种靶向膜的信号蛋白,其含有PDZ结构域。该基因在正常组织中表达较低,但在NSCLC中高表达,而且抑制该基因使得经转染的细胞的生长、增殖和/或存活减弱,这些都表明该基因可以用作新诊断标记以及新药和免疫疗法的靶标。
NSC 1141;URLC11;该基因编码9个跨膜结构域。该基因编码的跨膜蛋白过表达于肿瘤细胞表面上,但不表达于正常细胞。因此,该蛋白可以用作靶向受体的治疗或诊断的良好靶。
NSC 1142:NAPG;未检测到该基因编码的已知结构域。NAPG编码的推定312-氨基酸人蛋白的序列与牛γSNAP之间具有95%的同一性。NAPG蛋白介导血小板胞吐作用并且控制该过程的膜融合事件。该基因在正常组织中表达较低,但在NSCLC中高表达,而且抑制该基因使得经转染的细胞的生长、增殖和/或存活减弱,这些都表明该基因可以用作新诊断标记以及新药和免疫疗法的靶标。
NSC 1164:NPTX1;该基因编码一种Pentaxin/C-反应蛋白。NPTX1是神经元(neuronal)pentraxin基因家族的成员。神经元pentraxin 1类似于大鼠NP1基因,后者编码蛇毒毒素结合蛋白。免疫细胞化学分析主要在胞质颗粒中检测到该基因编码的蛋白。该基因在正常组织中表达较低但高表达于正常组织,这表明该基因可以用作诊断标记(即,在使用血清或痰的诊断中)以及NSCLC的治疗靶标。免疫组织化学染色表明:在腺癌细胞的细胞质中NPTX1被强染色。这些数据表明NPTX1可以作为治疗肺癌的一种有效的治疗及诊断靶标。
NSC 1183:BYSL;未检测到该基因编码的已知结构域。该基因编码的蛋白具有bystin的功能,其与trophinin(TRO)以及TASTIN形成一种细胞粘着分子复合体,该复合体对于胚胎植入具有重要意义。该基因在正常组织中表达较低,但在NSCLC中高表达,而且抑制该基因使得经转染的细胞的生长、增殖和/或存活减弱,这些都表明该基因可以用作新诊断标记以及新药和免疫疗法的靶标。
NSC 1185:URLC6;该基因编码一种锌指RNA识别基序结构域。该基因在正常组织中表达较低,但在NSCLC中高表达,而且抑制该基因使得经转染的细胞的生长、增殖和/或存活减弱,这些都表明该基因可以用作新诊断标记以及新药和免疫疗法的靶标。
NSC 1191:COX17;该基因编码的蛋白定位于线粒体膜间腔(mitochondrial intermemebrane space)(通过相似性),并且能将铜转运至线粒体。而且,该蛋白可能是细胞色素氧化酶表达所需的。该基因在正常组织中表达较低,但在NSCLC中高表达,而且抑制该基因使得经转染的细胞的生长、增殖和/或存活减弱,这些都表明该基因可以用作新诊断标记以及新药和免疫疗法的靶标。
NSC 1201:SLC7A1;该基因编码14个跨膜结构域。该基因编码的蛋白高度类似于鼠Rec-1(Atrc 1),其发挥阳离子氨基酸转运蛋白(cationicamino acid transporter)(生态型(ecotropic)反转录病毒受体),转运精氨酸、赖氨酸和鸟氨酸通过质膜。通过免疫细胞化学分析,该蛋白主要见于细胞质膜和高尔基体。该基因编码的跨膜蛋白过表达于肿瘤细胞表面上,但不表达于正常细胞。因此,该蛋白可以用作靶向受体的治疗或诊断的良好靶。
NSC 1240:FLJ00159;该基因编码4个跨膜结构域。该基因编码的跨膜蛋白过表达于肿瘤细胞表面上,但不表达于正常细胞。因此,该蛋白可以用作靶向受体的治疗或诊断的良好靶。
NSC 1246:SUPT3H;该基因编码转录物启动因子αD,18kD亚单位。含该基因编码蛋白在内的家族包括Spt3酵母转录因子以及人转录物起动因子αD的18kD亚单位(TFαD-18)。晶体结构测定显示其是一种非典型的组蛋白折叠。该基因在正常组织中表达较低但高表达于正常组织,这些都表明该基因可以用作新诊断标记以及新药和免疫疗法的靶标。
NSC 1254:FLJ10815;该基因编码一种跨膜氨基酸转运蛋白。该跨膜区在包括UNC-47和MTR的许多氨基酸转运蛋白中都已发现。UNC-47编码一种囊泡状的(vesicular)氨基丁酸(GABA)转运蛋白(VGAT)。该基因编码的蛋白的功能略微类似于氨基酸/植物生长激素通
透酶(auxin permease)(AAAP)家族的膜转运蛋白。该基因编码的跨膜蛋白过表达于肿瘤细胞表面上,但不表达于正常细胞。因此,该蛋白可以用作靶向受体的治疗或诊断的良好靶。
NSC 1265:SLC28A2;该基因编码Na+依赖性核苷转运蛋白。该基因编码的蛋白能发挥钠-偶联的核苷转运蛋白2的作用,其可转运嘌呤核苷和尿嘧啶核苷。该基因编码的跨膜蛋白过表达于肿瘤细胞表面上,但不表达于正常细胞。因此,该蛋白可以用作靶向受体的治疗或诊断的良好靶。
NSC 1273:FLJ32549;未检测到该基因编码的任一已知结构域。该基因在正常组织中表达较低,但在NSCLC中高表达,而且抑制该基因使得经转染的细胞的生长、增殖和/或存活减弱,这些都表明该基因可以用作新诊断标记以及新药和免疫疗法的靶标。
NSC 1288:PTGFRN;该基因编码信号肽、6个免疫球蛋白结构域和一个跨膜结构域。该基因编码的蛋白是通过减少受体数目而非通过降低亲合常数来抑制前列腺素f2-α(pgf2-α)与其特异性fp受体的结合。该蛋白看上去能与前列腺素f2-α受体功能性偶联。通过免疫细胞化学分析检测出,该蛋白主要见于细胞质膜和高尔基体。该基因编码的跨膜蛋白过表达于肿瘤细胞表面上,但不表达于正常细胞。因此,该蛋白可以用作靶向受体的治疗或诊断的良好靶。
NSC 1292:C17orf26;该基因编码3个跨膜结构域、锌转运蛋白结构域和信号肽(SOSUI)。该基因编码的跨膜蛋白过表达于肿瘤细胞表面上,但不表达于正常细胞。因此,该蛋白可以用作靶向受体的治疗或诊断的良好靶。
NSC 1295:ADAM8;该基因编码蛇去整联蛋白同源蛋白、Reprolysin家族原肽和Reprolysin(M12B)家族锌金属蛋白酶。ADAM家族的成员是具有独特结构的细胞表面蛋白,该结构含有潜在的粘附和蛋白酶结构域。ADAM8的胞外区显示与蛇毒蛋白的显著氨基酸顺序同源性,其中含有金属蛋白酶和去整联蛋白结构域。该基因在正常组织中表达较低但在NSCLC中高表达,这表明该基因可以用作诊断标记(即,在使用血清或痰的诊断中)以及NSCLC的治疗靶标。免疫组织化学染色表明:腺癌细胞中ADAM8被强染色。这些数据表明ADAM8可以作为治疗肺癌的一种有效的治疗及诊断靶标。
NSC 1306:ABCA4;该基因编码信号肽和AAA结构域。该基因编码的膜-结合蛋白是ATP-结合框(ABC)转运蛋白超家族的成员。所述ABC蛋白转运各种分子通过胞外膜和胞内膜。ABC基因分为7种不同的亚家族(ABC1,MDR/TAP,MRP,ALD,OABP,GCN20和White)。该基因编码的蛋白是ABC1亚家族的成员。ABC1亚家族的成员包括只出现于多细胞真核生物中的唯一主要ABC亚家族。该蛋白是一种视网膜-特异性ABC转运蛋白,其使用N-retinylidene-PE作为底物。该蛋白仅仅表达于视网膜感光细胞,表明该基因产物介导必需分子通过感光细胞膜。该基因的突变见于诊断患有Stargardt病的患者,与色素性视网膜炎(retinis pigmentosa)-19和黄斑变性年龄-相关2(macular degeneration age-related 2)有关。该基因编码的跨膜蛋白过表达于肿瘤细胞表面上,但不表达于正常细胞。因此,该蛋白可以用作靶向受体的治疗或诊断的良好靶。
NSC 1343:GPR49;该基因编码信号肽,富含亮氨酸的修复N-末端结构域和7跨膜受体(视紫红质家族)。该基因编码的蛋白属于G蛋白-偶联的受体家族,该家族成员带有大的包含富含亮氨酸受体的胞外区域。该基因编码的跨膜蛋白过表达于肿瘤细胞表面上,但不表达于正常细胞。因此,该蛋白可以用作靶向受体的治疗或诊断的良好靶。
NSC 1362:SCAMP5;该基因编码4个跨膜结构域。推定该基因编码的跨膜蛋白过表达于肿瘤细胞表面上,但不表达于正常细胞。因此,该蛋白可以用作靶向受体的治疗或诊断的良好靶。
NSC 1389:NMU;该基因编码NMU结构域。与大多数活性肽一样,该基因编码的蛋白是由较大前体蛋白通过蛋白水解处理而成。该蛋白的成熟肽长度为8-25个残基,其C-末端被酰胺化。该蛋白刺激肌肉收缩,特别是胃肠道的肌肉,并抑制摄食。该基因在正常组织中表达较低,但在NSCLC中高表达,而且抑制该基因使得经转染的细胞的生长、增殖和/或存活减弱,这些都表明该基因可以用作新诊断标记以及新药和免疫疗法的靶标。根据本实验,稳定转化体分泌入培养基的NMU蛋白,或添加入培养基中的NMU肽活性形式,以剂量依赖性方式促进COS-7细胞的生长。根据免疫组织化学染色,在腺癌细胞和鳞状癌细胞的细胞质中NMU蛋白都被强染色。这些数据表明NMU可能是NSCLC的一种重要的自分泌生长因子,提示可以以NMU配体-受体系统中心发展一种治疗肺癌行之有效的治疗及诊断策略。另外,对NMU的抑制诱导LC319细胞凋亡。而且,与对照LC319细胞相比,抗-NMU抗体对NMU蛋白的抑制诱导生长抑制。这些结果表明肺癌可以使用抗体或靶向NMU的siRNA来治疗。
NSC 1395:FBN2;该基因编码钙-结合EGF-样(EGF CA)结构域和一EGF样(未分类的亚家族)结构域。该基因编码的蛋白发挥原纤蛋白2的作用,原纤蛋白2是一种胞外基质蛋白,能调节胞外微纤丝的形成和保持。FBN2的突变会引发先天性先天性挛缩蜘蛛脚样指(congeintal contractualarachnodactyly)。该基因在正常组织中表达较低,但在NSCLC中高表达,而且抑制该基因使得经转染的细胞的生长、增殖和/或存活减弱,这些都表明该基因可以用作新诊断标记以及新药和免疫疗法的靶标。
NSC 1420:CHDOL;该基因编码一种带有碳水化合物识别结构域的1型膜蛋白,该结构域是其胞外部分中C-型植物凝集素的特征。在其它蛋白中,该结构域参与糖蛋白和外源含糖病原的细胞内吞。该机因编码的蛋白主要位于核周区。通过免疫细胞化学分析,该蛋白主要见于细胞质膜和高尔基体。推定该基因编码的跨膜蛋白过表达于肿瘤细胞表面上,但不表达于正常细胞。因此,该蛋白可以用作靶向受体的治疗或诊断的良好靶。
NSC 1441:HSNOV1;该基因编码整合型(integral)膜蛋白DFU6结构域。通过免疫细胞化学分析检测,发现该基因编码的蛋白主要存在于细胞质膜和高尔基体。该基因编码的跨膜蛋白过表达于肿瘤细胞表面上,但不表达于正常细胞。因此,该蛋白可以用作靶向受体的治疗或诊断的良好靶。
工业实用性
通过激光-俘获解剖和基因组范围cDNA阵列的结合,对本申请所述的非小细胞肺癌进行的基因表达分析鉴定出了可作为预防和治疗非小细胞肺癌靶标的具体基因。根据这些差异表达的基因的亚组的表达,本发明提供了用于鉴定或检测非小细胞肺癌的分子诊断标记。
本申请所述方法还可用于鉴定可用于预防、诊断和治疗非小细胞肺癌的其它分子靶标。本申请报道的数据使得对非小细胞肺癌的理解更全面,有助于开发新的诊断策略,并为鉴定治疗药物和预防药剂的分子靶标提供了线索。这些信息使得对癌发生有了更加深入的认识,并为开发诊断、治疗及最终预防非小细胞肺癌新策略提供了启示。
尽管结合本发明具体实施方案对本发明进行了详细描述,但是本领域技术人员显然明白在不脱离本发明实质和范围的前提下可以对本发明进行各种变动和修改。
                            序列表
<110>肿瘤疗法科学股份有限公司(ONCOTHERAPY SCIENCE,INC.)
JAPAN AS REPRESENTED BY THE PRESIDENT OF THE UNIVERSITY OF TOKYO
<120>非小细胞肺癌的诊断方法
<130>ONC-A0212Y2P
<150>US 60/414,673
<151>2002-09-30
<150>US 60/451,374
<151>2003-02-28
<150>US 60/466,100
<151>2003-04-28
<160>552
<170>PatentIn version 3.1
<210>1
<211>2235
<212>DNA
<213>人(Homo sapiens)
<400>1
ggcacgaggc ggcggaggcg gcggcggcgg cggcgatggc agcggaccct gagcgagctt     60
gagggctcgg acccagctcc ctcccgcgaa accttgggcg gatccggcgc tgcggcccca    120
gctcgctccg ctcctgctcc ctccccggcc gctgcctggg cggaggcaga ggcagaggcc    180
cgggctggcc gccctgctcg tgccccagct cggccccgga cggcccggct gctgtgcaga    240
gaggaggccg agtcggtagt gaaaagagaa tactgaagaa taggatctca agatgagtaa    300
aaagccccca aatcgccctg gaatcacttt tgagattggt gctcgtttgg aggcactgga    360
ctacttacaa aaatggtatc catcacgaat tgaaaaaatt gactatgagg agggcaagat    420
gttggtccat tttgagcgct ggagtcatcg ttatgatgag tggatttact gggatagcaa    480
tagattgcga ccccttgaga gaccagcact aagaaaagaa gggctaaaag atgaggaaga     540
tttctttgat tttaaagctg gagaagaagt tctggctcgt tggacagact gtcgctatta     600
ccctgccaag attgaagcaa ttaacaaaga aggaacattt acagttcagt tttatgatgg     660
agtaattcgt tgtttaaaaa gaatgcacat taaagccatg cccgaggatg ctaaggggca     720
ggtgaaatcc cagcatccac taagctggtg ttgtcctatc gacccagctg gatcgtgtaa     780
ccagtctatg ggaagtgagg attggatagc tttagtcaaa gcagctgctg cagctgcagc     840
caagaacaaa acagggagta aacctcgaac cagcgctaac agcaataaag ataaggataa     900
agatgagaga aagtggttta aagtaccttc aaagaaggag gaaacttcaa cttgtatagc     960
cacaccagac gtagagaaga aggaagatct gcctacatct agtgaaacat ttggacttca    1020
tgtagagaac gttccaaaga tggtctttcc acagccagag agcacattat caaacaagag    1080
gaaaaataat caaggcaact cgtttcaggc aaagagagct cgacttaaca agattactgg    1140
tttgttggca tccaaagctg ttggggttga tggtgctgaa aaaaaggaag actacaatga    1200
aacagctcca atgctggagc aggcgatttc acctaaacct caaagtcaga aaaaaaatga    1260
agctgacatt agcagttctg ccaacactca gaaacctgca ctgttatcct caactttgtc    1320
ttcagggaag gctcgcagca agaaatgcaa acatgaatct ggagattctt ctgggtgtat    1380
aaaaccccct aaatcaccac tttccccaga attaatacaa gtcgaggatt tgacgcttgt    1440
atctcagctt tcttcttcag tgataaataa aactagtcct ccacagcctg tgaatccccc    1500
tagacctttc aagcatagtg agcggagaag aagatctcag cgtttagcca ccttacccat    1560
gcctgatgat tctgtagaaa aggtttcttc tccctctcca gccactgatg ggaaagtatt    1620
ctccatcagt tctcaaaatc agcaagaatc ttcagtacca gaggtgcctg atgttgcaca    1680
tttgccactt gagaagctgg gaccctgtct ccctcttgac ttaagtcgtg gttcagaagt    1740
tacagcaccg gtagcctcag attcctctta ccgtaatgaa tgtcccaggg cagaaaaaga    1800
ggatacacag atgcttccaa atccttcttc caaagcaata gctgatggaa gaggagctcc    1860
agcagcagca ggaatatcga aaacagaaaa aaaagtgaaa ttggaagaca aaagctcaac    1920
agcatttggt atcaggagtt gggatttctc agcactgcta atgaagatcc cctcttatag    1980
tccaataagc ttatcaggac ttccagagtc atgacatgaa cagtttaatt gaacccatcc    2040
actctgggca ggtgactgga atagctgatt aaaacataaa tgctgctttt aggttaacca    2100
caaaggaaca actcaggatc agtcgtgatt gctaaagtat tcacttttat cttttaggta    2160
agagaaaaga aaaagataag gaaagaagag agaagagaga caaagatcac tacagaccaa    2220
aacagaagaa gaaga                                                     2235
<210>2
<211>573
<212>PRT
<213>人(Homo sapiens)
<400>2
Met Ser Lys Lys Pro Pro Asn Arg Pro Gly Ile Thr Phe Glu Ile Gly
1               5                   10                  15
Ala Arg Leu Glu Ala Leu Asp Tyr Leu Gln Lys Trp Tyr Pro Ser Arg
            20                  25                  30
Ile Glu Lys Ile Asp Tyr Glu Glu Gly Lys Met Leu Val His Phe Glu
        35                  40                  45
Arg Trp Ser His Arg Tyr Asp Glu Trp Ile Tyr Trp Asp Ser Asn Arg
    50                  55                  60
Leu Arg Pro Leu Glu Arg Pro Ala Leu Arg Lys Glu Gly Leu Lys Asp
65                  70                  75                  80
Glu Glu Asp Phe Phe Asp Phe Lys Ala Gly Glu Glu Val Leu Ala Arg
                85                  90                  95
Trp Thr Asp Cys Arg Tyr Tyr Pro Ala Lys Ile Glu Ala Ile Asn Lys
            100                 105                 110
Glu Gly Thr Phe Thr Val Gln Phe Tyr Asp Gly Val Ile Arg Cys Leu
        115                 120                 125
Lys Arg Met His Ile Lys Ala Met Pro Glu Asp Ala Lys Gly Gln Val
    130                 135                 140
Lys Ser Gln His Pro Leu Ser Trp Cys Cys Pro Ile Asp Pro Ala Gly
145                 150                 155                 160
Ser Cys Asn Gln Ser Met Gly Ser Glu Asp Trp Ile Ala Leu Val Lys
                165                 170                 175
Ala Ala Ala Ala Ala Ala Ala Lys Asn Lys Thr Gly Ser Lys Pro Arg
            180                 185                 190
Thr Ser Ala Asn Ser Asn Lys Asp Lys Asp Lys Asp Glu Arg Lys Trp
        195                 200                 205
Phe Lys Val Pro Ser Lys Lys Glu Glu Thr Ser Thr Cys Ile Ala Thr
    210                 215                 220
Pro Asp Val Glu Lys Lys Glu Asp Leu Pro Thr Ser Ser Glu Thr Phe
225                 230                 235                 240
Gly Leu His Val Glu Asn Val Pro Lys Met Val Phe Pro Gln Pro Glu
                245                 250                 255
Ser Thr Leu Ser Asn Lys Arg Lys Asn Asn Gln Gly Asn Ser Phe Gln
            260                 265                 270
Ala Lys Arg Ala Arg Leu Asn Lys Ile Thr Gly Leu Leu Ala Ser Lys
        275                 280                 285
Ala Val Gly Val Asp Gly Ala Glu Lys Lys Glu Asp Tyr Asn Glu Thr
    290                 295                 300
Ala Pro Met Leu Glu Gln Ala Ile Ser Pro Lys Pro Gln Ser Gln Lys
305                 310                 315                 320
Lys Asn Glu Ala Asp Ile Ser Ser Ser Ala Asn Thr Gln Lys Pro Ala
                325                 330                 335
Leu Leu Ser Ser Thr Leu Ser Ser Gly Lys Ala Arg Ser Lys Lys Cys
            340                 345                 350
Lys His Glu Ser Gly Asp Ser Ser Gly Cys Ile Lys Pro Pro Lys Ser
        355                 360                 365
Pro Leu Ser Pro Glu Leu Ile Gln Val Glu Asp Leu Thr Leu Val Ser
    370                 375                 380
Gln Leu Ser Ser Ser Val Ile Asn Lys Thr Ser Pro Pro Gln Pro Val
385                 390                 395                 400
Asn Pro Pro Arg Pro Phe Lys His Ser Glu Arg Arg Arg Arg Ser Gln
                405                 410                 415
Arg Leu Ala Thr Leu Pro Met Pro Asp Asp Ser Val Glu Lys Val Ser
            420                 425                 430
Ser Pro Ser Pro Ala Thr Asp Gly Lys Val Phe Ser Ile Ser Ser Gln
        435                 440                 445
Asn Gln Gln Glu Ser Ser Val Pro Glu Val Pro Asp Val Ala Hi s Leu
    450                 455                 460
Pro Leu Glu Lys Leu Gly Pro Cys Leu Pro Leu Asp Leu Ser Arg Gly
465                 470                 475                 480
Ser Glu Val Thr Ala Pro Val Ala Ser Asp Ser Ser Tyr Arg Asn Glu
                485                 490                 495
Cys Pro Arg Ala Glu Lys Glu Asp Thr Gln Met Leu Pro Asn Pro Ser
            500                 505                 5l0
Ser Lys Ala Ile Ala Asp Gly Arg Gly Ala Pro Ala Ala Ala Gly Ile
        515                 520                 525
Ser Lys Thr Glu Lys Lys Val Lys Leu Glu Asp Lys Ser Ser Thr Ala
    530                 535                 540
Phe Gly Ile Arg Ser Trp Asp Phe Ser Ala Leu Leu Met Lys Ile Pro
545                 550                 555                 560
Ser Tyr Ser Pro Ile Ser Leu Ser Gly Leu Pro Glu Ser
                565                 570
<210>3
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>3
taaatggctt caggagactt cag                                              23
<210>4
<211>24
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>4
ggttttaaat gcagctccta tgtg                                             24
<210>5
<211>34
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>5
atggaatccg aggatttaag tggcagagaa ttga                                  34
<210>6
<211>37
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>6
tttttttccc cttttttttt caaaagtctt ggaggat                               37
<210>7
<211>20
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>7
gcttcctcct ggaaattgac                                                  20
<210>8
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>8
tctactgtac agggaaaaac cca                                              23
<210>9
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>9
agtcgtggtt cagaagttac agc                                              23
<210>10
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>10
tctcttacca aatgctgttg agc                                              23
<210>11
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>11
catctggcat ttctgctctc tat                                              23
<210>12
<211>25
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>12
ctcagggaaa ggagaataaa agaac                                            25
<210>13
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>13
gaagtatcaa aactccgctg tca                                              23
<210>  14
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  14
atgctgagta gacatgcaga tga                                 23
<210>  15
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  15
cggtatgcta atgaagatgg aga                                 23
<210>  16
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  16
cacagggtat cagcaactgt gta                                 23
<210>  17
<211>  22
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人合成的引物序列
<400>  17
agaagtatct gagcccctga tg                                   22
<210>  18
<211>  21
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  18
gtctaacctc ccagctgttc c                                    21
<210>  19
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  19
gctgcgtagc ttacagactt agc                                  23
<210>  20
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  20
aaggcgttta aaggtgatag gtg                                  23
<210>  21
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  21
gtttgcaacc aggagataca aag                                23
<210>  22
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  22
gctgtgaggt acaacaaatc aca                                23
<210>  23
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  23
cctcctttcc ctagagactc aat                                23
<210>  24
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  24
agaagcaaca gcaagaccac tac                                23
<210>  25
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  25
ttgcctatga aagataggtc ctg                             23
<210>  26
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  26
gttttaatgc ccagatagca cag                             23
<210>  27
<211>  21
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  27
aggagaagtt ggaggtggaa a                               21
<210>  28
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  28
cagatgaaag atccaaattc caa                           23
<210>  29
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  29
tccacgactt cttattctcc ttg                           23
<210>  30
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  30
catttctttt agggactggg gta                           23
<210>  31
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  31
gagaaactga agtcccagga aat                           23
<210>  32
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  32
ctgatacttc cattcgcttc aac                            23
<210>  33
<211>  20
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  33
agctaagcca tgaggtaggg                                20
<210>  34
<211>  21
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  34
cgcatgtgtg ttcttctatg a                              21
<210>  35
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  35
ccaagacagg cagagtaggt aaa                         23
<210>  36
<211>  22
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  36
cattttcatt gtgatcagcc ag                          22
<210>  37
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  37
tgtatggggg attacctaca cac                         23
<210>  38
<211>  21
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  38
aaaggagcac aacaaacatg c                           21
<210>  39
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  39
tgtccaagga gtctgaagtt ctc                           23
<210>  40
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  40
cttgccacca tacctttatt ctg                           23
<210>  41
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  41
cgagagagta ggagttgagg tga                           23
<210>  42
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  42
cagaaatcca gcagatttca gac                           23
<210>  43
<211>  20
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  43
gaacaggtgg ctgtgttcct                                20
<210>  44
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  44
atagaatcaa gtggtgtgct tcg                            23
<210>  45
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  45
ctgagacttt gagtccttgg gag                             23
<210>  46
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  46
ttcctcattt ctctcagtaa ccg                               23
<210>  47
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  47
aacaatgcaa agtagtgctc ctc                               23
<210>  48
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  48
gctgaacttc tttatgctct tcg                               23
<210>  49
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  49
acctttgatt ttagactgag ggc                               23
<210>  50
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  50
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<210>  51
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  51
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<210>  52
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  52
agtaagagtc tgcctgagac acg                              23
<210>  53
<211>  21
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  53
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<210>  54
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  54
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<210>  55
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  55
agaaaagttg gagaagatga ggg                               23
<210>  56
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  56
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  57
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  58
gcttgccttt tcccttagta gg                        22
<210>  59
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  59
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<210>  60
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  60
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<210>  61
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  61
gcttgtaaag tcctcggaaa gtt                               23
<210>  62
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  62
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<210>  63
<211>  22
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  63
ataagagaaa tattggccat cg                                22
<210>  64
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  64
gcaagcgtaa gagactggtt tta                               23
<210>  65
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  65
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<210>  66
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  66
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<210>  67
<211>  22
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  67
acacacagag aggaggaagt ct                               22
<210>  68
<211>  22
<212>  DNA
<213> 人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  68
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<210>  69
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  69
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<210>  70
<211>  22
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  70
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<210>  71
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  71
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<210>  72
<211>  20
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  72
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<210>  73
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  73
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<210>  74
<211>  22
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  74
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<210>  75
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<212>  DNA
<213>  人工
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<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  75
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<210>  76
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<212>  DNA
<213>  人工
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<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  76
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  77
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<210>  78
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  78
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<210>  79
<211>  21
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  79
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<210>  80
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  80
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<210>  81
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  81
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<210>  82
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  82
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<2t0>  83
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  83
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<210>  84
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  84
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<210>  85
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  85
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<210>  86
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  86
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<210>  87
<211>  22
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  87
attcattctg gaccaaagat cc                                  22
<210>  88
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  88
tctactgtgg acaagaagcc tgt                                 23
<210>  89
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  89
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  90
ccagatgaga tgataaggca aag                                   23
<210>  91
<211>  22
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  91
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<210>  92
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  92
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<210>  93
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  93
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<210>  94
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  94
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<210>  95
<211>  22
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  95
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<210>  96
<211>  22
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  96
caataggcca gcaatctcaa ta                                       22
<210>  97
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  97
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<210>  98
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  98
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  99
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<210>  100
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  100
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<210>  101
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  101
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<210>  102
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  102
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  103
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<210>  104
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  104
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<210>  105
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  105
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<210>  106
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  106
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<210>  107
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  107
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<210>  108
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  108
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<210>  109
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  109
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<210>  110
<211>  22
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  110
caattgtgta ctccaaaccc aa                                      22
<210>  111
<211>  22
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  111
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<210>  112
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  112
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<210>  113
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  113
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<210>  114
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  114
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<210>  115
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  115
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<210>  116
<211>  22
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  116
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<210>  117
<211>  22
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  117
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<210>  118
<211>  21
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  118
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<210>  119
<211>  22
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  119
cccaacatgt gaagacagtg at                                    22
<210>  120
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  120
cctgtccacc tcatgtttta ttg                                      23
<210>  121
<211>  21
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  121
gctgaagtgt acgaccagga g                                        21
<210>  122
<211>  21
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  122
cacctttatc cgcactgtag g                                        21
<210>  123
<211>  22
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  123
aaagctgatg aggacagacc ag                                      22
<210>  124
<211>  22
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  124
ggcagaggca caatcatttt ag                                      22
<210>  125
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  125
gaagagaatg caggtgttga gtt                                    23
<210>  126
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  126
gtccacagca ttcataaaac agg                                    23
<210>  127
<211>  22
<212> DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  127
ctcctcagtg tccacacttc aa                                    22
<210>  128
<211>  21
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  128
gttacttgca gccaaaagca g                                     21
<210>  129
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  129
agtctctcct tttcagacat ccc                                   23
<210>  130
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  130
tccataaagt cagaccagca gtt                                   23
<210>  131
<211>  21
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  131
ccttctggga ggacagactt t                                    21
<210>  132
<211>  25
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  132
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<210>  133
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  133
aacctagcct cccttcaaac tta                                  23
<210>  134
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  134
gagacaggat ggaaaaatct gtg                                23
<210>  135
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  135
cctttcctga cccttttagt ctt                                23
<210>  136
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  136
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<210>  137
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  137
gaaaaaggag agcatcttgg act                                23
<210>  138
<211>  21
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  138
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<210>  139
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  139
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<210>  140
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  140
ccaattgtat aaaggctctt ccc                                    23
<210>  141
<211>  21
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  141
aggacaacgt cagctctcct g                                      21
<210>  142
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
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<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  142
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<210>  143
<211>  21
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  143
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<210>  144
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  144
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<210>  145
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  145
ctgctgttat taccccattc aag                                     23
<210>  146
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  146
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<210>  147
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  147
ctcgggtaga atttgatgac aac                                     23
<210>  148
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  148
gctggtaaag caggtgtaaa aga                                     23
<210>  149
<211>  21
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  149
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<210>  150
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  150
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<210>  151
<211>  22
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  151
ctctctgccc aatgataagg ag                                        22
<210>  152
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  152
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<210>  153
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  153
cagaagtttt gaggactgaa ctg                                        23
<210>  154
<211>  22
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  154
ccgacctacc ttccctagaa at                                         22
<210>  155
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  155
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<210>  156
<211>  22
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  156
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<211>  22
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  157
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<210>  158
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  158
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<210>  159
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  159
aatatggaat ccctacccac agt                                       23
<210>  160
<211>  22
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  160
tttgacttca caacttcatg gg                                         22
<210>  161
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  161
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<210>  162
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  162
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<210>  163
<211>  22
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  163
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<210>  164
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  164
agggaaaagt agagacaaat ggg                                     23
<210>  165
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  165
tctaggcaaa gtggaagtca aag                                     23
<210>  166
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  166
ctcctagaga aatgggttgg att                                     23
<210>  167
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  167
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<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  168
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  169
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<210>  170
<211>  24
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  170
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<210>  171
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  171
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<210>  172
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  172
ttctgttctt gcaactgagt cct                                       23
<210>  173
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  173
acctccagta aaagtttctt ccg                                       23
<210>  174
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  174
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<210>  175
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  175
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<210>  176
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  176
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<210>  177
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  177
tatcagtaac tgctccgtgt tca                                   23
<210>  178
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  178
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<210>  179
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  179
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<210>  180
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  180
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<210>  181
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序
<400>  181
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  182
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  183
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<210>  184
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  184
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<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  187
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  188
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  189
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  190
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<210>  191
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  191
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  192
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<210>  193
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  193
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<210>  194
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  194
gatgaactca ctgaagtcca cct                                         23
<210>  195
<211>  21
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  195
tctccaggac aagatcaagg a                                           21
<210>  196
<211>  22
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  196
gttttatttc cagcatgttc cc                                       22
<210>  197
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  197
agagctgatc aagttcatgt gtg                                      23
<210>  198
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  198
acatagcaag ttcgagtttc tgc                                      23
<210>  199
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  199
gagctggagg taggaataca ggt                                      23
<210>  200
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  200
caatagtttg gcttggtgta agg                                          23
<210>  201
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  201
ctcctctgca tgcacttaac ttt                                          23
<210>  202
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  202
gagagtttaa tgttgtggga agg                                          23
<210>  203
<211>  22
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  203
ccgggcaata aagtaactct tg                                       22
<210>  204
<211>  25
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  204
gtatttgtct gtatgcctac atctg                                    25
<210>  205
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  205
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<210>  206
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  206
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<210>  207
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  207
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<210>  208
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  208
agaaaaggtg tgaacagagt tgc                                         23
<210>  209
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  209
agagccatag aaactgctcc tct                                         23
<210>  210
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  210
cataactgca tagacagcac gtc                                         23
<210>  211
<211>  21
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  211
tacctgctct atgtgggtgc t                                            21
<210>  212
<211>  25
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  212
cctcagaact ctcagtttat tcctg                                        25
<210>  213
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  213
ataagccaca gagacaaacc aga                                          23
<210>  214
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  214
gggaggttat tttcacagaa cac                                       23
<210>  215
<211>  22
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  215
gagttcctgt ctctctgcca ac                                        22
<210>  216
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  216
taatatacaa gggctcaacc gag                                       23
<210>  217
<211>  21
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  217
gtcatagctg tgtcctgggt c                                         21
<210>  218
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  218
ctattttatc cccatggcag agt                                         23
<210>  219
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  219
cagatattct gtatgctgga ggg                                         23
<210>  220
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  220
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<210>  221
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  221
gatttccata cttcgggaga aac                                         23
<210>  222
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  222
tatcagatgc cacacatacg aga                                          23
<210>  223
<211>  22
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  223
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<210>  224
<211>  22
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  224
gggtacatgc aaaccagtac ac                                           22
<210>  225
<211>  20
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  225
tgaacagttt gctggtcttg                                             23
<210>  226
<211>  20
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  226
aatgtcaggt tggggagtta                                             20
<210>  227
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  227
ttctggacag acggagagac tac                                          23
<210>  228
<211>  22
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  228
agtgatgaca tacccctggt tc                                           22
<210>  229
<211>  22
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  229
caagacttct cagatccttg gg                                       22
<210>  230
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  230
actcacatgt ggaagtgttc ctt                                      23
<210>  231
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  231
tcaagcaata tgaagtaggg ctc                                      23
<210>  232
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  232
aacacaaatg tcccgtgtaa gtc                                      23
<210>  233
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  233
ctgcctctta ctcgtcacag ttt                                         23
<210>  234
<211>  22
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  234
tgacttcttt gaagtgaagg ct                                          22
<210>  235
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  235
ccctagtttt tgtagctgtc gaa                                         23
<210>  236
<211>  22
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  236
gatcacatgc caagaacaca at                                       22
<210>  237
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  237
ctacgtacct gggtgcctat atc                                      23
<210>  238
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  238
gtcctcttat aaggctcact ccc                                      23
<210>   239
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  239
gatgttagag actccttcac cca                                      23
<210>  240
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  240
cggtattctt aacacatctt gcc                                          23
<210>  241
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  241
gtgtctgcgt atctacctga acg                                          23
<210>  242
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  242
ataactctgt cttcgtgagc tgg                                          23
<210>  243
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  243
gtatttggct tactgtccca aac                                          23
<210>  244
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  244
ctaggaagaa atcatgctgg gtt                                         23
<210>  245
<211>  22
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  245
cagtttgagc aagcaaaaga tg                                          22
<210>  246
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  246
cggatatccc taatctattc cca                                         23
<210>  247
<211>  22
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  247
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<210>  248
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  248
aagcagtggg gtagagtcag aac                                         23
<210>  249
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  249
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<210>  250
<211>  22
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  250
ctagcggaag acaattcaga ac                                          22
<210>  251
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  251
taaccttgat agaagaacct tgg                                          23
<210>  252
<211>  22
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  252
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<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  253
atctccactc tacggccttt tac                                          23
<210>  254
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  254
taatgactta aacaccagca cgg
<210>  255
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  255
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<210>  256
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  256
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<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  257
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<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  258
agccattagg aaaaagagca gag                                        23
<210>  259
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  259
gactgctata ctccaactct ggg                                        23
<210>  260
<211>  24
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  260
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<210>  261
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  261
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<210>  262
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT PCR的人工合成的引物序列
<400>  262
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  263
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<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  264
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<210>  265
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  266
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  267
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  268
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  269
cagaggactc  tgatgaagaa agc                                          23
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<211>  22
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  270
tttccacaaa cgctaagaga ac                                            22
<210>  271
<211>  21
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  271
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<210>  272
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  272
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  273
gccttaaagc tggacacaga ag                                            22
<210>  274
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  274
ctccagacac cattgcttaa atc                                          23
<210>  275
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  275
agactttaaa atcccacctg gac                                          23
<210>  276
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  276
cacccagcct tctctttatt ttc                                          23
<210>  277
<211>  21
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  277
aggggattct ggaactgaat g                                          21
<210>  278
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  278
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<210>  279
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  279
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<210>  280
<211>  24
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  280
gtcctatgtt aatttccacc aagc                                       24
<210>  281
<211>  21
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT PCR的人工合成的引物序列
<400>  281
tatccagagg gtgtccctga c                                          21
<210>  282
<211>  24
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  282
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<210>  283
<211>  22
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  283
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<210>  284
<211>  22
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  284
cccatcaggg aaacaaagat ta                                        22
<210>  285
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  285
tgcatctgta acttcaggag gat                                       23
<210>  286
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  286
tccatcaact tacctatcga tgc                                       23
<210>  287
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  287
aaacctacga acgccttttc tac                                       23
<210>  288
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  288
ggtatcacag gagcaccaat aaa                                      23
<210>  289
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  289
ctttctgttg ctttcccagt aga                                      23
<210>  290
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  290
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<210>  291
<211>  21
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  291
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<210>  292
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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attttactgc agaaacgggt tg                                            22
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<212>  DNA
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<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  294
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<212>  DNA
<213>  人工
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<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  295
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<212>  DNA
<213>  人工
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<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  296
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<213>  人工
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<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  297
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<212>  DNA
<213>  人工
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<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>  人工
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<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<212>  DNA
<213>  人工
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<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  300
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<212>  DNA
<213>  人工
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<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  301
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<211>  22
<212>  DNA
<213>  人工
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<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  302
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<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  303
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<210>  304
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  304
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<210>  305
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  305
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<210>  306
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  306
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<210>  307
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  307
ggtcttcata cgctgtactt gct                                          23
<210>  308
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  308
tatgccttca ctgatccacc tac                                          23
<210>  309
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  309
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<210>  310
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  310
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  311
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  312
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  313
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<210>  314
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  314
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  315
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<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  316
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  317
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<210>  318
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  318
gtgtcccacc atagaaaact tc                                         22
<210>  319
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  319
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<210>  320
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>    320
tagcattcac agagcaggag att                                        23
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  321
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  322
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<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  323
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<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  324
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<210>  325
<211>  22
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  325
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  326
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  327
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  328
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  329
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<210>  330
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  330
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  331
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  333
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<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  334
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<210>  335
<211>  22
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  335
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<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  336
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<210>  337
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  337
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<210>  338
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  338
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  339
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<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>  人工
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<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  341
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<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>  人工
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<213>  人工
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<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<212>  DNA
<213>  人工
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<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>  人工
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<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<210>  353
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  353
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<210>  354
<211>  22
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  354
cgagtttcac ctcagctctt ct                                         22
<210>  355
<211>  22
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  355
ggatgtagca atc tccacca gt                                        22
<210>  356
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  356
gttcaaacac tcactgaaga gcc                                        23
<210>  357
<211>  21
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  357
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<210>  358
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  358
ctttttacct tcgtgcacct tt                                        22
<210>  359
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<210>  360
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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aaagtggctg ggagtaaggt atc                                       23
<210>  361
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  361
agggcacaca ttcatctttg ta                                         22
<210>  362
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<210>  363
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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ctcagcaaga gaagaaccgt tta                                        23
<210>  364
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  364
ccacttagaa atcgaatacg tcc                                        23
<210>  365
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  365
tacccaagtc agaaagactc tgc                                           23
<210>  366
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<210>  367
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<212>  DNA
<213>  人工
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<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<210>  368
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  368
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<210>  369
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<212>  DNA
<213>  人工
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<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  369
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<212>  DNA
<213>  人工
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<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  370
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<213>  人工
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<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  373
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<213>  人工
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<213>  人工
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<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>  人工
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<213>  人工
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<213>  人工
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<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>  人工
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<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>  人工
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<213>  人工
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<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  387
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<213>  人工
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<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  388
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<213>  人工
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<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  389
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<212>  DNA
<213>  人工
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<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>  人工
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<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>  人工
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<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>  人工
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<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>  人工
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<213>  人工
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<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  395
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<213>  人工
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  398
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<212>  DNA
<213>  人工
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<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  399
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  400
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<213>  人工
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<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  401
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<212>  DNA
<213>  人工
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<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>  人工
<220>
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<213>  人工
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<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  405
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<213>  人工
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<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  407
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<213>  人工
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<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  409
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<213>  人工
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<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<213>  人工
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<213>  人工
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<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<212>  DNA
<213>  人工
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<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  414
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  415
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<222>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  416
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<210> 417
<211>  22
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  417
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<210>  418
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  418
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<210>  419
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<212>  DNA
<213>  人工
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<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  419
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<210>  420
<211>  22
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  420
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  421
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<210>  422
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于RT-PCR的人工合成的引物序列
<400>  422
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<210>  423
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  423
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<210>  424
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  424
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<210>  425
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  425
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<210>  426
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  426
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<210>  427
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  427
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<210>  428
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400> 428
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<210>  429
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  429
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<210>  430
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  430
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<210>  431
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<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  431
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<210>  432
<211>  19
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  432
tcgttctagg ctcacgtga                                            19
<210>  433
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  433
gcctcctgta ctggattt                                              18
<210>  434
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  434
tttaggtcat gtcctccg                                              18
<210>  435
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  435
ttgactggtt tcttatgt                                              18
<210>  436
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  436
tgtattcttt ggtcagtt                                              18
<210>  437
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  437
ctccgtaaac ggatccat                                             18
<210>  438
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  438
tacctaggca aatgcctc                                             18
<210>  439
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  439
cggatccatc gccccagg                                              18
<210>  440
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  440
ggaccccgct acctaggc                                             18
<210>  441
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  441
accaaagacg catcatca                                             18
<210>  442
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  442
actactacgc agaaacca                                             18
<210>  443
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  443
ccctcgattc ctccgagt                                             18
<210>  444
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  444
tgagcctcct tagctccc                                             18
<210>  445
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  445
aactgccaca cagtagta                                             18
<210>  446
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  446
atgatgacac accgtcaa                                             18
<210>  447
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  447
atcctcgctg tccagggc                                             18
<210>  448
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  448
cgggacctgt cgctccta                                             18
<210>  449
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  449
cgtccaggtg cagccact                                             18
<210>  450
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  450
tcaccgacgt ggacctgc                                            18
<210>  451
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  451
gttcccattc aagaacat                                            18
<210>  452
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  452
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<210>  453
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  453
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<210>  454
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  454
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<210>  455
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  455
cctctcccat ggcttcaa                                              18
<210>  456
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  456
aacttcggta ccctctcc                                              18
<210>  457
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  457
ggacaggaac caatgtac                                                18
<210>  458
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  458
catgtaacca aggacagg                                                18
<210>  459
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  459
acaatacaat gtgacaag                                                18
<210>  460
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  460
gaacagtgta acataaca                                                18
<210>  461
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  461
agattccatt ctgcaaac                                                18
<210>  462
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  462
caaacgtctt accttaga                                                18
<210>  463
<211>  19
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  463
gattaaaatt agattccat                                               19
<210>  464
<211>  19
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  464
taccttagat taaaattag                                                19
<210>  465
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  465
catcttgaga tcctattc                                                 18
<210>  466
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  466
cttatcctag agttctac                                                 18
<210>  467
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  467
tgggggcttt ttactcat                                               18
<210>  468
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  468
tactcatttt tcgggggt                                               18
<210>  469
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  469
aggtacttta aaccactt                                               18
<210>  470
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  470
ttcaccaaat ttcatgga                                               18
<210>  471
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  471
aggagccatg gcgctcgg                                                18
<210>  472
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  472
ggctcgcggt accgagga                                                18
<210>  473
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  473
gcaatccatg gctgtggc                                                18
<210>  474
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  474
cggtgtcggt acctaacg                                                  18
<210>  475
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  475
aataattacc ttgtatta                                                  18
<210>  476
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  476
tacctaacgt ttctatct                                                  18
<210>  477
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  477
gaagttaccg tcctgcat                                              18
<210>  478
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  478
tacgtcctgc cattgaag                                              18
<210>  479
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  479
gcaggaagtt accgtcct                                              18
<210>  480
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  480
tcctgccatt gaaggacg                                              18
<210>  481
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  481
gttgttgagc acagctat                                               18
<210>  482
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  482
tatcgacacg agttgttg                                               18
<210>  483
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  483
gaagtcc tcc ttccgata                                              18
<210>  484
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  484
atagccttcc tcctgaag                                                 18
<210>  485
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  485
ccgtcgccat cttgcgtc                                                 18
<210>  486
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  486
ctgcgttcta ccgctgcc                                                 18
<210>  487
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  487
tatggtcgcc gtcgccat                                               18
<210>  488
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  488
taccgctgcc gctggtat                                               18
<210>  489
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  489
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<210>  490
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  490
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<210>  491
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  491
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<210>  492
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  492
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<210>  493
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  493
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<210>  494
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  494
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<210>  495
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  495
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<210>  496
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  496
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<210>  497
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  497
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<210>  498
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  498
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<210>  499
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  499
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<210>  500
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  500
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<210>  501
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  501
cgggccacca tcacggaa                                                18
<210>  502
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  502
aaggcactac caccgggc                                                18
<210>  503
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  503
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<210>  504
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  504
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<210>  505
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  505
acacaagaca cgattcat                                                 18
<210>  506
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  506
tacttagcac agaacaca                                                18
<210>  507
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  507
atccactctt ccgttcat                                                18
<210>  508
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  508
tacttgcctt ctcaccta                                                18
<210>  509
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  509
agccgccatc tccacagt                                                18
<210>  510
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  510
tgacacctct accgccga                                                18
<210>  511
<211>  19
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  511
cttgttcatg aacatctct                                              19
<210>  512
<211>  19
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  512
tctctacaag tacttgttc                                              19
<210>  513
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  513
tggcaggagg gttcttgt                                               18
<210>  514
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  514
tacttgttct tgggagga                                              18
<210>  515
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  515
caggcctacc tggcagga                                               18
<210>  516
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  516
aggacggtcc atccggac                                               18
<210>  517
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  517
accgcttacg gttggctg                                               18
<210>  518
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  518
gtcggttggc attcgcca                                               18
<210>  519
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  519
tctgaagaaa atagatca                                               18
<210>  520
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  520
actagataaa agaagtct                                               18
<210>  521
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  521
gtcaaccaga cccggcat                                                18
<210>  522
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工
<220>
<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
<400>  522
tacggcccag accaactg                                                18
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<223>  用于反义方法的人工合成的S-寡核苷酸序列
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tctcctttct cgatcata                                                18
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ttcagtttca gctcctat                                                18
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ggaccaagct agacaagca                                               19
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acagtgttcc gctaagtga                                               19
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ccagttgagt cgacatctg                                             19
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gcagcagata ccatcagtg                                             19
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cgcagctgcg aagtgttgta                                            20
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gatacgaaag cagctgcga                                             19
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gagcgattca tcttcatca                                                19
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ctgcaattga ggctccttc                                                19
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<223>  用于RNAi的人工合成的寡核苷酸序列
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gagtgtgctg gtgaagcag                                                19
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<223>  用于RNAi的人工合成的寡核苷酸序列
<400>  542
gatcaagtcc tgcacactg                                                 19
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cgtgctagca gctgcgtgt                                                 19
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tgaggtgctc agcacagtg                                                 19
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cggaggatct catgaccac                                                 19
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gagattcaga gtggacgaa                                               19
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<223>  用于RNAi的人工合成的寡核苷酸序列
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gagagcaatg aggatgact                                               19

Claims (52)

1.一种诊断受试者中的非小细胞肺癌或患非小细胞肺癌倾向性的方法,该方法包括测定源自该受试者的生物样品中非小细胞肺癌相关基因的表达水平,其中所述水平与该基因的正常对照水平相比升高或降低表明该受试者患有或易患非小细胞肺癌。
2.权利要求1所述方法,其中所述非小细胞肺癌相关基因选自NSC807-1448,其中所述水平与正常对照水平相比升高表明该受试者患有或易患非小细胞肺癌。
3.权利要求2所述方法,其中所述的升高为比所述正常对照水平高至少10%。
4.权利要求1所述方法,其中所述非小细胞肺癌相关基因选自NSC1-806,其中所述水平与正常对照水平相比降低表明该受试者患有或易患非小细胞肺癌。
5.权利要求4所述方法,其中所述的降低为比所述正常对照水平低至少10%。
6.权利要求1所述方法,其中该方法还包括测定多个非小细胞肺癌相关基因的所述水平。
7.权利要求1所述方法,其中所述水平用选自下组的任一方法测定:
(1)检测非小细胞肺癌相关基因的mRNA;
(2)检测非小细胞肺癌相关基因编码的蛋白;以及
(3)检测非小细胞肺癌相关基因所编码蛋白的生物活性。
8.权利要求1所述方法,其中所述水平是通过检测非小细胞肺癌相关基因探针与所述来自患者的生物样品的基因转录物之间的杂交而测定的。
9.权利要求8所述方法,其中所述的杂交步骤是在DNA阵列上实施的。
10.权利要求1所述方法,其中所述生物样品包括痰或血液。
11.一种非小细胞肺癌参照表达图谱,包括选自NSC 1-1448的两或多个基因的表达模式。
12.鉴定能抑制非小细胞肺癌-相关基因的表达或活性的化合物的方法,该方法包括下列步骤:
(1)使表达所述非小细胞肺癌相关基因的受试细胞与受试化合物接触;
(2)检测所述非小细胞肺癌相关基因的表达水平;以及
(3)检测使所述表达水平与所述基因的正常对照水平相比受抑制的化合物,所述化合物可作为所述非小细胞肺癌相关基因的抑制剂。
13.权利要求12所述方法,其中所述受试细胞为NSCLC细胞。
14.鉴定增强非小细胞肺癌-相关基因的表达或活性的化合物的方法,该方法包括下列步骤:
(1)使表达非小细胞肺癌相关基因的受试细胞与受试化合物接触;
(2)检测所述非小细胞肺癌相关基因的表达水平;以及
(3)测定使所述表达水平与所述基因的正常对照水平相比升高的化合物,所述化合物可作为所述非小细胞肺癌相关基因的增强物。
15.权利要求14所述方法,其中所述受试细胞为NSCLC细胞。
16.一种筛选用于治疗或预防非小细胞肺癌的化合物的方法,该方法包括下列步骤:
(1)使受试化合物与选自NSC 1-1448的多核苷酸所编码的多肽接触;
(2)测定所述多肽与受试化合物之间的结合活性;以及
(3)选出与所述多肽结合的化合物。
17.一种筛选用于治疗或预防非小细胞肺癌的化合物的方法,该方法包括下列步骤:
(a)使受试化合物与选自NSC 1-1448的多核苷酸所编码的多肽接触;
(b)检测步骤(a)的多肽的生物活性;以及
(c)选出这样的化合物,所述化合物使选自NSC 807-1448的多核苷酸所编码多肽的生物活性与没有该受试化合物时检测到的生物活性相比受到抑制,或者使选自NSC 1-806的多核苷酸所编码多肽的生物活性与没有该受试化合物时检测到的生物活性相比升高。
18.权利要求17所述方法,其中所述的生物活性为细胞增殖活性。
19一种筛选用于治疗或预防非小细胞肺癌的化合物的方法,该方法包括下列步骤:
(1)使受试化合物与表达一或多个标记基因的细胞接触,其中所述的一个或多个标记基因选自NSC 1-1448;以及
(2)选出化合物,其可降低选自NSC 807-1448的一个或多个标记基因的表达水平或者提高选自NSC 1-806的一个或多个标记基因的表达水平。
20.权利要求19所述方法,其中所述细胞为NSCLC细胞。
21.一种筛选用于治疗或预防非小细胞肺癌的化合物的方法,该方法包括下列步骤::
(1)使受试化合物与导入了一种载体的细胞接触,该载体含有一个或多个标记基因的转录调控区以及在所述转录调控区控制下表达的报道基因,其中所述一种或多个标记基因选自NSC 1-1448;
(2)测定所述报道基因的活性;以及
(3)选出化合物,其中当所述报道基因是选自NSC 807-1448的上调的基因时所述化合物使所述报道基因的表达水平与对照相比降低,或者当所述报道基因是选自NSC 1-806的下调型标记基因时所述化合物使所述报道基因的表达水平与对照相比升高。
22.一种试剂盒,其中含有两种或多种检测试剂,所述检测试剂能够与选自NSC1-1448的一种或多种基因或其编码的多肽结合。
23.一种阵列,其包含两种或多种多核苷酸,所述多核苷酸能够与选自NSC1-1448的一种或多种基因结合。
24.一种治疗或预防受试者中的非小细胞肺癌的方法,该方法包括对所述受试者施用一种反义组合物,其中所述组合物含有与选自NSC 807-1448的基因的编码序列互补的核苷酸序列。
25.一种治疗或预防受试者中的非小细胞肺癌的方法,该方法包括对所述受试者施用一种siRNA组合物,其中所述组合物能降低选自NSC807-1448的基因的表达。
26.一种治疗或预防受试者中的非小细胞肺癌的方法,该方法包括对所述受试者施用一种药学有效量的抗体或其片段,该抗体或其片段能与选自NSC 807-1448的基因编码的多肽结合。
27.一种治疗或预防受试者中的非小细胞肺癌的方法,该方法包括对所述受试者施用一种疫苗,该疫苗含有选自NSC 807-1448的基因编码的多肽或所述多肽的免疫活性片段,或者编码所述多肽的多核苷酸。
28.一种治疗或预防受试者中的非小细胞肺癌的方法,该方法包:对所述受试者施用一种化合物,该化合物能够提高选自NSC 1-806的基因的表达或活性。
29.一种治疗或预防受试者中的非小细胞肺癌的方法,该方法包括施用一种化合物的步骤,该化合物是用权利要求12-21中任一项所述方法获得的。
30.一种治疗或预防受试者中的非小细胞肺癌的方法,该方法包括向受试者施用药学有效量的选自NSC 1-806的多核苷酸或其编码的多肽。
31.一种用于治疗或预防非小细胞肺癌的组合物,该组合物含有药学有效量的针对选自NSC 807-1448的基因的反义多核苷酸或siRNA。
32.一种用于治疗或预防非小细胞肺癌的组合物,该组合物含有药学有效量的抗体或其片段,所述抗体或其片段能与选自NSC 807-1448的基因编码的多肽结合。
33.一种用于治疗或预防非小细胞肺癌的组合物,该组合物含有药学有效量的用权利要求12-21之一的方法选出的化合物作为活性成分,并包含可药用的载体。
34.一种基本上纯化的多肽,该多肽选自:
(a)包含SEQ ID NO:2所示氨基酸序列的多肽;
(b)一种多肽,其包含SEQ ID NO:2所示氨基酸序列,其中最多有5%的氨基酸被取代、缺失、插入和/或添加,且所述多肽具有与由SEQ ID NO:2所示氨基酸序列组成的蛋白等同的生物活性;以及
(c)多核苷酸编码的多肽,所述多核苷酸在严谨条件下与SEQ ID NO:1所示核苷酸序列组成的基因杂交,其中该多肽具有与由SEQ ID NO:2所示氨基酸序列组成的蛋白等同的生物活性。
35.一种分离的多核苷酸,该多核苷酸编码权利要求34所述的多肽。
36.权利要求35所述的分离的多核苷酸,其包含SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列。
37.一种载体,其中含有权利要求35所述多核苷酸。
38.一种宿主细胞,其中包含权利要求35所述多核苷酸或者含有该多核苷酸的载体。
39.一种用于制备权利要求34所述多肽的方法,该方法包括下列步骤:
(1)培养宿主细胞,该宿主细胞包含编码权利要求34所述多肽的多核苷酸或者含该多核苷酸的载体;
(2)使所述宿主细胞表达所述多肽;以及
(3)收集所表达的多肽。
40.一种能与权利要求34所述多肽结合的抗体。
41.一种多核苷酸,所述多核苷酸与权利要求35所述多核苷酸或其互补链互补,且含有至少15个核苷酸。
42.一种针对权利要求35所述多核苷酸的反义多核苷酸或siRNA。
43.一种反义多核苷酸,选自包含SEQ ID NO:423,425,427,429,431,433,435,437,439,441,443,445,447,449,451,453,455,457,459,461,463,465,467,469,471,473,475,477,479,481,483,485,487,489,491,493,495,497,499,501,503,505,507,509,511,513,515,517,519,521,523,525,527,529或531所示核苷酸序列的多核苷酸。
44.一种siRNA,选自包含作为靶序列的SEQ ID NO:533,534,535,536,537,538,539,540,541,542,543,544,545,546,547,548,549,550,551或552所示核苷酸序列的多核苷酸。
45.一种用于治疗或预防非小细胞肺癌的组合物,该组合物含有药学有效量的权利要求43所述反义多核苷酸。
46.一种用于治疗或预防非小细胞肺癌的组合物,该组合物含有药学有效量的权利要求44所述siRNA。
47.一种治疗或预防受试者中的非小细胞肺癌的方法,该方法包括对所述受试者施用权利要求45所述反义组合物。
48.一种治疗或预防受试者中的非小细胞肺癌的方法,该方法包括对所述受试者施用权利要求46所述siRNA组合物。
49.一种用于治疗或预防非小细胞肺癌的药物组合物,该组合物含有药学有效量的权利要求34所述多肽或编码该多肽的多核苷酸。
50.权利要求49所述药物组合物,其中所述的多核苷酸被掺入表达载体。
51.用于诱导抗肿瘤免疫的方法,该方法包括下述步骤:施用选自NSC807-1448的基因编码的多肽或所述多肽的免疫活性片段,或者编码该多肽或片段的多核苷酸。
52.权利要求51所述诱导抗肿瘤免疫的方法,其中所述方法还包括向受试者施用抗原呈递细胞的步骤。
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