CN1548552A - 精神分裂症易感基因检测方法及易感基因和用途 - Google Patents
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Abstract
本发明提供了精神分裂症易感基因NRG1基因的检测方法，体外检测试验者精神分裂症易感性的方法以及精神分裂症易感基因NRG1基因和用途。本发明提供的检测精神分裂症易感基因的方法为通过聚合酶链式反应－直接测序法和/或聚合酶链式反应－限制性片断长度多态性分析方法体外检测NRG1基因序列，其中有位于第二个外显子第12位的rs3924999多态性位点和/或位于第五个内含子的rs2954041多态性位点。本发明满足了本领域对于正确识别精神分裂症易感基因的需求，为精神分裂症的深入研究和防治，甚至诊断治疗提供了新的思路。
Description
技术领域
本发明涉及精神分裂症易感基因检测方法，体外检测试验者精神分裂症易感性的方法以及精神分裂症易感基因和用途，具体的说，本发明涉及精神分裂症易感基因NRG1基因多态性位点的检测方法，体外检测试验者精神分裂症易感性的方法以及精神分裂症易感基因NRG1基因和用途。
背景技术
据1999年底，我国卫生部的统计资料显示：按伤残所调整的生命年限指标，评价各类疾病在我国疾病社会负担中所占的比例，精神疾患约占疾病总负担的1/5，已超过心血管、呼吸系统及恶性肿瘤等疾患，排名居首位。精神分裂症发病率仅次于抑郁症，占整个精神疾患的第二位。精神分裂症的症状包括：思维紊乱、狂想以及情绪与行动改变等。
一个世纪以来，人们对精神疾病的生理、生化、影像、药物治疗以及社会家庭、环境等方面的观察，对精神疾病的发病机理作出了各种假说和推断。随着科技的进步，人们越来越认识到基因缺陷是许多严重精神疾病产生的重要原因，人在遇到心理和社会环境压力时，那些携带疾病易感基因的人比不携带疾病易感基因的人更可能罹患精神卫生疾患。遗传因素还基本上得到家系、双生子及寄养子的流行病学调查结果的支持，80年代后期，对精神疾病遗传流行病学的大规模调查，更充分显示了精神疾病的遗传基础。在科技日益发展的今天如何对精神疾患，尤其是精神分裂症，如何从遗传角度检测易感基因以及个体的疾病易感性，以至于进行进一步风险预测和诊断治疗，成为广大科技人员和医疗卫生人员面临的严峻问题。尽管国内外疾病易感基因研究开展多年，但尚未取得突破性进展，鲜有价值的研究结果。对于怎样鉴定遗传易感基因以及鉴定试验者的遗传易感性，本领域一直缺乏全面、系统、有效的识别方法，对于精神分裂症易感性的研究成果更少。
最近基因组扫描结果提示，8p22-21是精神分裂症的易感区域之一。neu基因调节剂1基因(Neuregulin 1，NRG1)，基因定位于8p21，genbank登记号：GI：22048149，全长216361bp，已知在神经发育、分化、营养和突触可塑性调节及学习记忆中占有重要的作用，为一种多功能因子。
发明内容
针对上述问题，本发明提供一种检测精神分裂症易感基因的方法，从而，满足了本领域对于正确识别精神分裂症易感基因的需求，为精神分裂症的深入研究和防治，甚至诊断治疗提供了新的思路。
本发明同时提供了一种体外检测试验者精神分裂症易感性的方法。
本发明还提供了按照本发明的方法制备而成的试剂盒。
另一方面，本发明进一步提供了一种精神分裂症易感基因。
本发明提供的体外检测精神分裂症易感基因的方法还可以用于精神分裂症的预防、诊断和治疗。
本发明提供的体外检测试验者精神分裂症易感性的方法可以用于精神分裂症的患病风险预测、诊断和治疗。
本发明提供的本发明的精神分裂症易感基因可以用于精神分裂症的预防、诊断和治疗。
本发明通过大样本的统计分析，研究了NRG1基因序列第二个外显子第12位的rs3924999多态性位点和第五个内含子的rs2954041多态性位点在精神分裂症核心家系的等位基因频率，并根据父母基因型在患病子女中的传递情况，进行传递不平衡检验(TDT)和单体型分析。结果发现，全部样本的基因型分布和等位基因频率均符合Hardy-Weinburg平衡；经过Bonferroni法矫正后，两个多态性位点的TDT分析仍然有显著的统计学显著性；单个单体型的分析也显示在患者中AG单体型传递过多，差异有显著型；从而以试验证明了NRG1基因序列的rs3924999多态性位点和/或rs2954041多态性位点影响精神分裂症的易感性，其中NRG1基因序列中rs3924999多态性位点和/或rs2954041多态性位点为精神分裂症易感基因。
因此，本发明提供了一种检测精神分裂症易感基因的方法，该方法为通过聚合酶链式反应-直接测序法和/或聚合酶链式反应-限制性片断长度多态性分析方法体外检测NRG1基因序列，其中有位于NRG1基因第二个外显子第12位的rs3924999多态性位点和/或位于第五个内含子的rs2954041多态性位点。
所谓“基因多态性”指的是在人群中，各个体基因的核苷酸序列存在的差异。本领域普通技术人员已知，本发明所述的多态性位点为单核苷酸多态性(SNP)位点，即基因组序列中单个核苷酸发生改变；核苷酸序列的差异可以体现在DNA水平上或者RNA水平上，所以，可以通过检测DNA、RNA检测多态性，优选DNA，更优选基因组DNA。
本领域技术人员已知，可以用多种技术在DNA水平上体外检测NRG1基因序列的多态性位点。可以经与用放射性标记的反义RNA或DNA探针与扩增后的DNA序列杂交，以鉴别点多态性。也可以基于已知的核苷酸顺序的改变，合成正常的和多态性的PCR引物，在聚合酶链式反应(PCR反应)的底物中加入荧光标记的核苷酸，根据反应产物中有无荧光出现，确定在扩增所用的引物中有无碱基变化，从而检测多态性。通过DNA直接测序可以直接揭示对照基因和携带多态性基因之间的序列差异。当与PCR结合使用时，这种方法的灵敏性大大提高。例如，将测序引物和双链PCR产物或者不对称扩增法产生的单链模板分子一起使用。各种DNA及DNA片段的核苷酸序列的测定也可用常规方法如双脱氧链终止法(Sanger等人，PNAS，1977，74：5463-5467)。此外，核苷酸序列测定也可用商业测序试剂盒或自动测序仪等。常规的自动测序法用放射性标记或荧光标记来确定核酸序列。
由于基因多态性，导致限制性内切酶酶切位点改变、消失或产生新的位点，若用某种限制性内切酶酶切基因组DNA，则酶切后产生与正常基因组不同长度的DNA片段，经用适当的探针杂交检测，就可检测这些条带的位置和大小。聚合酶链式反应-限制性片断长度多态性分析(PCR-RFLP)方法的原理为：在设计PCR扩增实验时，引物位于基因多态性部位的两侧，现将目的基因扩增，使其易于检测，由于多态性引起已有的限制性内切酶位点改变，则可先用相应的限制性内切酶酶切扩增产物，再进行琼脂糖凝胶电泳观察，根据产物片断大小或数量与正常对照作出判断。本发明优选采用聚合酶链式反应-直接测序法，聚合酶链式反应-限制性片断长度多态性分析方法。更优选聚合酶链式反应-限制性片断长度多态性分析方法。
在本发明的一个实施方式中，利用聚合酶链式反应-限制生片断长度多态性分析方法检测精神分裂症易感基因的方法，所述多态性分析方法包括：
A：提取DNA，在rs3924999多态性位点和/或rs2954041多态性位点附近设计PCR引物，进行PCR反应；
B：针对上述多态性位点，利用限制性内切酶进行酶切；
C：凝胶电泳分离与鉴定酶切结果；
其中，rs3924999多态性位点和/或rs2954041多态性位点为精神分裂症易感性等位基因。
本发明所述的检测精神分裂症易感基因的方法，可以进一步包括在多态性分析之后，利用传递不平衡检验分析NRG1基因的等位基因的传递频率和单体型传递频率，具有显著性差异为精神分裂症易感基因。如实施例1所述，本发明对246个家系(每例都含有血缘关系的父母双亲和1个患病子/女)中的2个单核苷酸多态性位点进行了单体型频率分析。结果得出，经过Bonferroni法矫正后，两个多态性位点的TDT分析仍然有统计学显著性(rs3924999：X2＝9.0905，P＝0.005168；rs2954041：X2＝22.0458，P＝0.0006206)；单个单体型的分析也显示在患者中AG单体型传递过多，差异有显著性(X2＝26.114，自由度＝1，p＜0.00001)。
本发明同时提供了一种体外检测试验者精神分裂症遗传易感性的方法，该方法为检测试验者NRG1基因序列rs3924999和/或rs2954041多态性，其中rs3924999位点核苷酸传递G，和/或rs2954041位点核苷酸传递T的试验者，为精神分裂症易感性高者。
这里所说的“遗传易感性”是指由遗传决定的易于罹患某种(某类)疾病的倾向性(susceptibility)，即过去人们常谓的“素质”(diathesis)。遗传易感基因的存在，是遗传易感性的基础。人在遇到心理和社会环境压力时，那些携带精神分裂症易感基因的人比不携带易感基因的人更可能罹患精神分裂症疾患。
含有待测NRG1基因序列的样品可以从来自试验者的细胞获得，如来自血液、尿、唾液、胃液、头发，活组织检查和尸体解剖材料的细胞。优选来自血液。
通过本发明大样本的统计分析，可以单独使用本发明的方法，即检测试验者NRG1基因序列rs3924999和/或rs2954041多态性来检测相关精神分裂症遗传易感性，同时，本领域技术人员已知，精神分裂症的发生、发展是多因素共同作用的结果，遗传易感性也有其自身的复杂性，所以本发明也可以与其它方法联合使用，以达到检测精神分裂症易感性的目的。
本发明提供的体外检测试验者精神分裂症遗传易感性的方法，检测NRG1基因序列rs3924999和/或rs2954041多态性的方法可以采用上述检测基因序列的多态性位点的方法，例如直接测序法，限制性片断长度多态性分析方法。优选聚合酶链式反应-直接测序法，聚合酶链式反应-限制性片断长度多态性分析方法，更优选聚合酶链式反应-限制性片断长度多态性分析方法。
在本发明的一个实施方式中，利用聚合酶链式反应-限制性片断长度多态性分析方法检测试验者精神分裂症易感性，其中所述多态性分析方法包括：
A：提取试验者DNA，在rs3924999多态性位点和/或rs2954041多态性位点附近设计PCR引物，进行PCR反应；
B：针对上述多态性位点，利用限制性内切酶进行酶切；
C：凝胶电泳分离与鉴定酶切结果。
本发明还提供一种用于检测精神分裂症易感性的试剂盒。所述试剂盒内装有一个或多个容器，容器内装有用以检测NRG1基因序列rs3924999和/或rs2954041多态性的一种或多种组分。按照具体检测方法及检测多态性位点的不同，试剂盒可含有不同组分。与之同时提供的可以是经政府药物管理机构审核的、有关药品或生物制品制造、使用及销售的信息。优选含有利用聚合酶链式反应-限制性片断长度多态性分析方法，检测NRG1基因序列rs3924999和rs2954041多态性的组分：
1)扩增rs3924999多态性位点和/或rs2954041多态性位点的引物；
2)PCR扩增酶，酶切多态性位点相应的限制性内切酶，及相应缓冲液；
3)dNTP；
4)所述多态性位点酶切图谱。
本领域普通技术人员已知，上述扩增引物，可以依据已知的核苷酸序列设计，通常为15-30个碱基，GC含量为45％-50％左右，在适当的温度下与模板特异性结合，其可以利用专门的计算机程序设计，例如(OLIGO 4.06引物分析软件)；如本发明实施例1所示，
扩增rs3924999多态性的引物可以分别为：
AACTGGTTTCACACCGAAGGAC；(SEQ ID No 3)
CCAAGATGAGATCCATTTTCGC；(SEQ ID No 4)
扩增rs2954041多态性的引物可以分别为：
TGACATTATTCATTGTTTGTTGCTGA；(SEQ ID No 5)
GGATGCCATGGATATACTATGCAGA；(SEQ ID No 6)
所述的TagDNA聚合酶可以是Klenow片段，Tth DNA聚合酶，VENT DNA聚合酶等能够用于PCR扩增的酶。酶切多态性位点相应的限制性内切酶本领域普通技术人员也可以按照已知技术设计，例如，按照实施例1中所述的可以分别为限制性内切酶MunI和Tru1I，限制性内切酶确定后，与之相对的内切图谱也相应确定。
本发明同时提出一种精神分裂症易感基因，其为NRG1基因序列，并且有一位于NRG1基因第二个外显子第12位的rs3924999多态性位点，和/或位于第五个内含子的rs2954041多态性位点。本发明NRG1基因的多态性可以表现在DNA水平或RNA水平。优选DNA，更优选基因组DNA。
本发明提供的体外检测精神分裂症易感性的方法可以用于精神分裂症的预防、诊断和治疗。
本发明提供的体外检测试验者精神分裂症易感基因的方法可以用于精神分裂症患病的风险预测、诊断和治疗。
本发明提供的精神分裂症易感基因可以用于精神分裂症的预防、诊断和治疗。
附图说明
图1显示NRG1基因的基因示意图，其中黑色条形框代表外显子，白色条形框代表内含子，箭头所指为单核苷酸多态性位点(SNP)所在位置。
图2显示利用聚合酶链式反应-限制性片断长度多态性分析方法检测试验者精神分裂症易感性的流程图。
图3显示多态性位点rs3924999位点的酶切图，其中，1为100bp分子量标准(marker)，2为246/65/181杂合子，3为246纯合子，4为65/181纯合子。
图4显示多态性位点rs2954041位点的酶切图，其中，1为25bp分子量标准(marker)，2为60/127纯合子，3为30/31/60/126/127杂合子，4为30/31/126纯合子。
具体实施方式
实施例1
1.研究对象
此阶段的研究对象均为2001年-2002年在北京大学精神卫生研究所门诊和住院部进行诊治的患者，和前一阶段的样本合并后共有精神分裂症核心家系246例(每例都含有血缘关系的父母双亲和1个患病子/女)，均为汉族。所有患者都符合国际疾病分类手册第10版(ICD-10)中精神分裂症的诊断标准，并接受了结构式临床访谈。在患者中，男性为138例(56％)，女性108例(44％)，平均年龄为29岁。平均病程为5年。
所有研究对象都签署了知情同意书。该研究得到北京大学医学部伦理委员会批准。
2.方法
用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-based RFLP)分析方法检测所有研究对象2个多态性位点rs3924999、rs2954041的基因型。流程参见附图2。
2.1血液标本的采集及处理
所有患者都抽取了外周静脉血5-10ml，置于抗凝管中，于4℃冰箱保存，1周内提取基因组DNA。
2.2基因组DNA的提取及鉴定
2.2.1基因组DNA的提取
在前一阶段基因组DNA的提取中，需要5ml血液，未能留下部分血液冻存。为了减少血液用量，此阶段的提取用基因组DNA抽提纯化试剂盒(上海华舜生物工程有限公司，血液基因组DNA抽提纯化试剂盒)完成。方法如下：在5ml离心管中加入1ml含抗凝剂的新鲜全血，再加入3ml预冷的1*BP(红细胞裂解液)液，来回颠倒离心管以彻底混匀。冰浴10分钟后，4500g离心2分钟，将上层液体彻底吸出，在离心管中加入1ml预冷的1*BP(红细胞裂解液)液。彻底混匀后，4500g离心2分钟，将上层液体彻底吸出。在沉淀中加入200μl DT(悬浮液)液，彻底振荡悬浮。加入400μl DL(裂解液)液和25μl蛋白酶K，迅速振荡混匀，置65℃温浴15-30分钟，期间来回颠倒离心管多次。加入400μl异丙醇，剧烈颠倒离心管使溶液混匀后，移取600μl至吸附柱中，离心30秒，弃去收集管中的液体，将吸附柱放入同一个收集管中，将剩余的全部移至吸附柱中，离心30秒。弃掉收集管中的液体，将吸附柱放入同一个收集管中。加入500μl W1(洗涤液)液，静置1分钟后，离心30秒。将吸附柱移入另一个干净的收集管中，加入500μl W1液，离心15秒。弃掉收集管中的液体，再将吸附柱放入同一个收集管中，离心1分钟。将吸附柱移入一个干净的1.5ml离心管中，在吸附膜中央加入100μl T1(洗脱液)液，65℃静置5分钟后，离心1分钟。加入60μl T1液，离心1分钟。将1.5ml离心管(DNA)放于-20℃保存。
2.3目的片段的扩增
2.3.1聚合酶链式反应(PCR)
25-μl的PCR扩增反应体系如下：10mM Tris-HCl(pH 8.3)，50mM KCl，1.5mM氯化镁，200μM每种dNTP，0.4μM引物，1.0U Taq DNA聚合酶，30-50ng基因组DNA。PCR扩增反应条件为：94℃变性5分钟，94℃变性30秒，55℃-62℃退火40秒，72℃延伸1分钟，35个循环，最后72℃后延伸7分钟。
2.3.2引物
通过生物信息学的检索，分别选取了NRG1基因上的2个单核苷酸多态性位点：rs3924999和rs2954041，具体资料见表1。
表1 2个SNPs引物的序列及相关信息
| SNP | 引物序列(5’→3’) | 产物(bp) | 退火温度(℃) | 内切酶 | 等位基因(bp) | |
| rs3924999 | AACTGGTTTCACACCGAAGGAC(SEQ ID No 3)CCAAGATGAGATCCATTTTCGC(SEQ ID No 4) | 246 | 55 | MunI | A65/181 | G246 |
| rs2954041 | TGACATTATTCATTGTTTGTTGCTGA(SEQ ID No 5)GGATGCCATGGATATACTATGCAGA(SEQ ID No 6) | 187 | 62 | Tru1I | G60/127 | T30/31/126 |
2.3.3PCR产物的全序列
rs3924999：参见(SEQ ID No 1)
rs2954041：参见(SEQ ID No 2)
2.4多态性位点在基因上的位置
rs3924999位于NRG1基因的第二外显子第12位(G38A)，rs2954041位于第五内含子，具体位置见图1。
2.5限制性片段长度多态性分析
2.5.1限制性内切酶酶切反应
取15μl PCR产物置于5μl内切酶及酶切缓冲液体系中，于37℃温箱过夜反应。
2.5.2琼脂糖凝胶电泳分离、鉴定
取6-8μl酶切产物，用3％琼脂糖凝胶电泳分离目的片段，经凝胶成相系统扫描后读取基因型。
结论：
如图3所示，为3％琼脂糖凝胶电泳后，多态性位点rs3924999位点的酶切图，其中，1为100bp分子量标准(marker)，2为246/65/181杂合子，3为246纯合子，4为65/181纯合子。
如图4所示，为3％琼脂糖凝胶电泳后，多态性位点rs2954041的酶切图，其中1为25bp marker，2为60/127纯合子，3为30/31/60/126/127杂合子，4为30/31/126纯合子。
2.6统计学分析
遗传统计数理分析
用传递不平衡检验(the transmission disequilibrium test，TDT)分析所有精神分裂症核心家系中等位基因与疾病的关系，分析过程与第一阶段研究相同。在以连锁不平衡为基础的关联研究中，由于单体型比单个的SNP位点更精确，而且具有更高的统计效力，因此本发明用2个单核苷酸多态性位点进行了单体型频率的分析。单体型频率采用TRANSMIT软件(2.5.2)进行分析。在多次统计分析后，用Bonferroni法进行矫正。
结果：
1.三个SNPs基因型分布和等位基因频率
表2 NRG1基因2个多态性位点的基因型分布和等位基因频率
| 基因型分布(％) | 等位基因频率(％) | |
| rs3924999患者父母总数 | GG GA AA26 126 9433 243 21659 369 310 | G A178(0.36) 314(0.64)309(0.31) 675(0.69)487(0.33) 989(0.67) |
| rs2954041患者父母总数 | TT TG GG51 131 6464 262 166115 393 230 | T G233(0.47) 259(0.53)390(0.40) 594(0.60)623(0.42) 853(0.58) |
2.三个SNPs的TDT检验
根据父母基因型在患病子女中的传递情况，在246个家系中进行传递不平衡检验(TDT)。如表3所示，经过Bonferroni法矫正后，两个多态性位点的TDT分析仍然有统计学显著性(rs3924999：X2＝9.0905，P＝0.005168；rs2954041：X2＝22.0458，P＝0.0006206)。
表3 NRG1基因的等位基因的传递不平衡检验
| SNPs | 等位基因 | 传递 | 不传递 | X2 | P值 |
| Rs3924999 | GA | 14598 | 98145 | 9.0905 | 0.002584 |
| Rs2954041 | TG | 16993 | 93169 | 22.0458 | 0.0003103 |
3.NRG1基因的单体型分析
单体型传递的总体检验显示NRG1基因与精神分裂症有较强的关联(X2＝33.651，自由度＝3，p＜0.000001)。单个单体型的分析也显示在患者中AG单体型传递过多，差异有显著性(X2＝26.114，自由度＝1，p＜0.00001)(见表4)。
表4 NRG1基因的单体型传递频率分析
| 单体型 | 观察值 | 期望值 | X2 | P值 |
| 总X2检验 | 33.651 | ＜0.000001 | ||
| GT | 74.314 | 52.507 | 22.032 | |
| GG | 103.69 | 101.99 | 0.071993 | |
| AT | 158.69 | 142.49 | 5.1339 | |
| AG | 155.31 | 195.01 | 26.114 |
注：GT为rs3924999的G+rs2954041的T；GG为rs3924999 G+rs2954041的G；AT为rs3924999的A+rs2954041的T；AG为rs3924999的A+rs2954041的G。
结论：
上述试验证明了NRG1基因序列的rs3924999多态性位点和/或rs2954041多态性位点影响精神分裂症的易感性，其中NRG1基因序列中rs3924999多态性位点和/或rs2954041多态性位点为精神分裂症易感基因。
实施例2检测试验者精神分裂症易感性的方法
方法
用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-based RFLP)分析方法检测试验者2个多态性位点rs3924999、rs2954041的基因型。
主要方法如下：
1.血液标本的采集及处理
2.基因组DNA的提取及鉴定
3.目的片段的扩增
4.限制性片段长度多态性分析
具体方法参见实施例1的2.1-2.5。
其中rs3924999位点核苷酸为G，和/或rs2954041位点核苷酸为T的试验者，为精神分裂症易感性高者。
实施例3体外检测精神分裂症易感基因的试剂盒
1)引物：扩增rs3924999多态性的引物可以分别为：
AACTGGTTTCACACCGAAGGAC；(SEQ ID No 3)
CCAAGATGAGATCCATTTTCGC；(SEQ ID No 4)
扩增rs2954041多态性的引物可以分别为：
TGACATTATTCATTGTTTGTTGCTGA；(SEQ ID No 5)
GGATGCCATGGATATACTATGCAGA；(SEQ ID No 6)
2)PCR扩增酶，限制性内切酶MunI和Tru1I，以及相应缓冲液
3)dNTP
4)所述多态性位点酶切图谱：
| SNP | 等位基因(bp) | |
| rs3924999 | A65/181 | G246 |
| rs2954041 | G60/127 | T30/31/126 |
并说明使用方法如下包括：
1.血液标本的采集及处理
2.基因组DNA的提取及鉴定
3.目的片段的扩增
4.限制性片段长度多态性分析
具体方法参见实施例1方法2.1-2.5。
应理解，在阅读了本发明的上述讲述内容之后，本领域技术人员可以对本发明作各种改动或修改，但改动或修改的等价形式同样落在本申请权利要求书所限定的范围内。
序列表
<110>张岱
北京大学精神卫生研究所
<120>精神分裂症易感基因检测方法及易感基因和用途
<130>D0305022F
<160>6
<170>PatentIn version 3.1
<210>1
<211>246
<212>DNA
<213>Homo sapiens(智人)
<400>1
ccaagatgag atccattttc gctcatccat tttgaaattg tttttctctc tgttaataaa 60
acctttggaa tggtgccttg atcaggctaa ctccagatta aatgtttctc tttgaaagat 120
tgcctggtga tcagagttgt ttttcattct cttttcttct tttagccttg cctccccgat 180
tgaaagagat gaaaagccag gaatcggctg caggttccaa actagtcctt cggtgtgaaa 240
ccagtt 246
<210>2
<211>187
<212>DNA
<213>Homo sapiens(智人)
<400>2
tgacattatt cattgtttgt tgctgatgaa tgaaacctct tttcgagtgt gtgttccctt 60
taataggcac tggtaattta tgtactaaga tttatttctg tatggaaatt acaagtgaaa 120
tttcatattg aatttatatt tagcctgttc tagtacatag tctctgcata gtatatccat 180
ggcatcc 187
<210>3
<211>22
<212>DNA
<213>artificial(人工序列)
<220>
<223>引物
<400>3
aactggtttc acaccgaagg ac 22
<210>4
<211>22
<212>DNA
<213>artificial(人工序列)
<220>
<223>引物
<400>4
ccaagatgag atccattttc gc 22
<210>5
<211>26
<212>DNA
<213>artificial(人工序列)
<220>
<223>引物
<400>5
tgacattatt cattgtttgt tgctga 26
<210>6
<211>25
<212>DNA
<213>artificial(人工序列)
<220>
<223>引物
<400>6
ggatgccatg gatatactat gcaga 25
Claims (10)
1、一种检测精神分裂症易感基因的方法，该方法为通过聚合酶链式反应-直接测序法和/或聚合酶链式反应-限制性片断长度多态性分析方法体外检测NRG1基因序列，其中有位于NRG1基因第二个外显子第12位的rs3924999多态性位点和/或位于第五个内含子的rs2954041多态性位点。
2、如权利要求1所述的方法，其为通过聚合酶链式反应-限制性片断长度多态性分析方法，所述多态性分析方法包括：
A：提取DNA，在rs3924999多态性位点和/或rs2954041多态性位点附近设计PCR引物，进行PCR反应；
B：针对上述多态性位点，利用限制性内切酶进行酶切；
C：凝胶电泳分离与鉴定酶切结果；
其中，rs3924999多态性位点和/或rs2954041多态性位点为精神分裂症易感性等位基因。
3、如权利要求2所述的检测精神分裂症易感基因的方法，所述方法进一步包括在多态性分析之后，利用传递不平衡检验分析NRG1基因的等位基因的传递频率和单体型传递频率，具有显著性差异为精神分裂症易感基因。
4、一种体外检测试验者精神分裂症遗传易感性的方法，该方法包括检测试验者NRG1基因序列rs3924999和/或rs2954041多态性，其中rs3924999位点传递G，和/或rs2954041位点传递T的试验者，为精神分裂症易感性高者。
5、如权利要求4所述的体外检测试验者精神分裂症遗传易感性的方法，其中检测NRG1基因序列rs3924999和/或rs2954041多态性的方法为聚合酶链式反应-直接测序法和/或聚合酶链式反应-限制性片断长度多态性分析方法。
6、如权利要求5所述的体外检测试验者精神分裂症遗传易感性的方法，其中检测rs3924999和rs2954041多态性的方法，为通过聚合酶链式反应-限制性片断长度多态性分析方法，所述多态性分析方法包括：
A：提取DNA，在rs3924999多态性位点和/或rs2954041多态性位点附近设计PCR引物，进行PCR反应；
B：针对上述多态性位点，利用限制性内切酶进行酶切；
C：凝胶电泳分离与鉴定酶切结果。
7、一种用于检测精神分裂症易感性的试剂盒，其包括：
1)扩增NRG1基因rs3924999多态性位点和/或rs2954041多态性位点的引物；
2)PCR扩增酶，酶切多态性位点相应的限制性内切酶，及相应缓冲液；
3)dNTP；
4)所述多态性位点酶切图谱。
8、如权利要求7所述的检测精神分裂症易感性的试剂盒，其包括
1)引物：扩增rs3924999多态性的引物可以分别为：
AACTGGTTTCACACCGAAGGAC；(SEQ ID No 3)
CCAAGATGAGATCCATTTTCGC；(SEQ ID No 4)；
扩增rs2954041多态性的引物可以分别为：
TGACATTATTCATTGTTTGTTGCTGA；(SEQ ID No 5)
GGATGCCATGGATATACTATGCAGA；(SEQ ID No 6)；
2)PCR扩增酶和限制性内切酶MunI和Tru1I，以及相应缓冲液；
3)dNTP；
4)所述多态性位点酶切图谱。
9、一种精神分裂症易感基因，其为NRG1基因序列，并且有位于第二个外显子第12位的rs3924999多态性位点，和/或位于第五个内含子的rs2954041多态性位点。
10、如权利要求9所述的精神分裂症易感基因，其为基因组DNA。
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| CN1548552A true CN1548552A (zh) | 2004-11-24 |
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Cited By (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN106434881A (zh) * | 2016-08-30 | 2017-02-22 | 张建华 | 一种检测紧张型精神分裂症易感性的引物及试剂盒 |
| CN106434880A (zh) * | 2016-08-30 | 2017-02-22 | 张建华 | 一种检测单纯型精神分裂症易感性的引物及试剂盒 |
| CN107988347A (zh) * | 2017-12-19 | 2018-05-04 | 光瀚健康咨询管理(上海)有限公司 | 一种阿尔兹海默症易感基因的检测方法及其应用 |
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2003
- 2003-05-20 CN CN 03136093 patent/CN1548552B/zh not_active Expired - Fee Related
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