CN1541334A - 心血管安全测定方法 - Google Patents

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Abstract

本发明涉及筛选试验化合物在受试验者中诱发心脏毒性能力用的测定方法与试剂盒。所述测定方法与试剂盒基于下述发现:可利用阿司咪唑与HERG钾通道的相互作用,以在新的治疗剂和其它试剂的开发过程中预计化合物的潜在心脏毒性。

Description

心血管安全测定方法
本发明涉及心血管安全测定领域,和提供筛选试验化合物在受试验者中诱发心脏毒性能力用的测定方法与试剂盒。所述测定方法与试剂盒基于下述发现:可利用阿司咪唑与HERG钾通道的相互作用,以在新的治疗剂和其它试剂的开发过程中预计化合物的潜在心脏毒性。在化合物库的高通量筛选中,本发明尤其有利。
发明背景
证据表明数种药物可延长心脏的复极化(因此以表面心电图的QT间期形式测量)到潜在地威胁生命的心室心律不齐的程度,例如可出现尖端扭转(TdP)(torsades de pointes),尤其在过剂量或药代动力学相互作用的情况下。
在有或无TdP情况下,所报道的诱发QT间期延长的药物数量持续增加(W.Haverkamp等(2000)Cardiovascular Research 47,219-233)。已经牵涉到多至50种临床可获得的或仍在研究的非-心血管药物和心血管非-抗-心律不齐药物。许多药物,既有老的,也有新的,已从市场上撤回或具有它们的销售限制。关心的是从这些药物上市到最初意识到它们与QT间期延长和/或TdP有关的时间间隔,通常以年为单位来测量。因此,在新的治疗剂和/或其它试剂开发的早期阶段,在人类中初次使用之前,研究任何新的化学物质的这一潜在副作用将是有益的。
本发明开发的新型治疗剂的关键组分由化合物库的高通量筛选(HTS)组成。药物公司已建立了结构不同的化合物的大型集合,它充当药物靶向先导鉴定程序的起始点。典型的公司化合物集合现包括100000至1000000种不同的化学物质。尽管数年前,认为每天和每次测定数千种化合物的用量是足够的,但当今药物公司旨在具有每周测试数以十万计的化合物的超高通量的筛选技术。在涉及筛选形式的典型HTS中,在多-孔微量滴定板,如96、384或1536个孔的板中进行测定。使用这些板有助于自动化,如自动的试剂分配器和自动虹吸仪的使用。此外,为了降低周期时间、成本和生物化学物质的原料如重组蛋白质,对于在测定方法中测试的各化合物,优选在室温下,使用单一的测量,进行HTS有关的筛选。
先导评价方法中的决定性标准将是早期识别它们与QT延长和/或TdP有关的可能性。然而,目前没有评价心脏毒性可获得的可靠、快速容易筛选方法,其中所述方法可对付在目前推广使用的HTS技术中鉴定的许多化合物。本发明的目的是通过提供测定和试剂盒来解决本领域的该问题,其中所述测定与试剂盒基于下述发现:可利用阿司咪唑与HERG钾通道的相互作用,以预计在新的治疗剂和其它试剂的开发过程中化合物的心脏毒性。
目前可获得的体外模型包括异源表达系统、解聚的细胞、分离的组织和分离的完整(兰根朵夫灌注的)心脏。在所有模型中,通过使用双电极电压钳记录,测量离子电流(DasscalN.(1987)Crit.Rev.Biochem.22,341-356),或使用微电极或共焦显微镜(Dall`Asta V.等(1997)Exp.Cell Research 231,260-268),测量膜电势的膜片钳记录(Zhou Z等(1998)Biophysical Journal74,230-241),从而评价钾电流受阻的效果。鉴于实验程序的复杂性、慢的周期时间、原料的性质(即分离的组织及其解聚细胞)和试验结果的可靠性,在HTS筛选中不能使用前述方法。
本发明者令人惊奇地发现,可使用利用标记的阿司咪唑作为HERG通道的特异配体的结合测定方法,来预计化合物与QT延长和/或TdP的潜在关系。这一结合测定方法解决了前述问题,并且可在HTS有关的筛选形式中推广使用。
Chadwick C.等已描述了类似的测定方法(Chadwick C等,(1993)Circulation Research 72,707-714),其中已鉴定[3H]-多非利特作为心脏延迟整流器K+-通道的特异放射配体。这篇文章进一步证明了多非利特的置换与许多抗心律不齐化合物的钾通道阻断活性之间具有良好的关联。这一结合测定有助于在分子水平上表征药物-通道的相互作用。
在这一测定中,已由二溴前体,通过3H-交换制备标记的多非利特,从而在每个分子上掺入2个3H-标记。每个分子上3H-标记的数量与结合测定的敏感性之间存在直接的关联。本发明提供相对以上方法的改进结合测定,因为在与[33H]-碘化甲烷反应中使用去甲阿司咪唑前体导致在每分子的阿司咪唑中掺入3个3H-标记。由此获得的放射配体的比活性比[3H]-多非利特的比活性高1.5-2倍。
此外,在HTS有关的筛选形式中不可能使用多非利特测定,因为从成年雄性豚鼠中分离的心室肌细胞必须在分离的6小时内使用。另外,仅36%分离的细胞是能存活的和可在结合测定中使用。为了在HTS有关的筛选中使用,起始材料应当可容易且足量地获得。本发明解决了该问题,因为使用了稳定表达HERG钾通道的HEK293细胞的膜制备物。所述细胞可足量地维持在温育物中,从而避免了需要并供应动物模型,并且由于在结合测定中使用细胞膜,所以可在-80℃下,在结合测定现成的等分试样中储存后者,用于随后使用。Chadwick等所述的多非利特结合测定的进一步的缺点是与温育程序有关。由于使用可存活的肌细胞,所以必须在34℃的生理温度下进行温育。若要在HTS有关的筛选形式中进行的话,后者毫无疑问增加了测定的成本、可能的周期时间和复杂性。本发明解决该问题,因为令人惊奇地证明,可在室温下温育膜制备物。特别地鉴于Zhoe Z.等,Zhou Z.等(1998)Biophysical Journal 74,230-241的研究,其中得出结论,对于HERG,所测量的动力学特性显著依赖于温度,当在生理温度,即35℃下进行研究时,在数个报告中观察到的差别减少。
以下将描述本发明的这一和其它方面。
发明概述
本发明提供一种筛选试验化合物在受试验者中诱发心脏毒性能力用的测定方法。该方法包括:用参考化合物和试验化合物温育含HERG或其片段的原料,其时间足以使参考化合物与HERG多肽通道结合和试验化合物与HERG多肽通道结合,并测量试验化合物对结合于HERG的参考化合物数量的影响。
在本发明的优选实施方案中,测定方法包括:用标记的参考化合物温育细胞,优选HEK293细胞的膜制备物,其中所述细胞在其表面上表达含SEQ ID NO:2的氨基酸序列或其片段的HERG多肽通道,其中所述标记的参考化合物是在受试验者中能诱发心律不齐的药物,优选所述标记的参考化合物是[3H]-阿司咪唑。与试验化合物一起温育,并测量试验化合物对结合到HERG多肽通道上的参考化合物的数量的影响。在进一步的实施方案中,测量装置由从温育混合物中除去未结合的标记的参考化合物的分离装置;和检测标记的参考化合物用的装置组成,其中后者优选包括由使用闪烁计数的放射标记测量装置组成。
本发明进一步提供筛选化合物在受试验者中诱发心脏毒性能力用的高通量的测定方法,该测定方法包括:
a)使细胞的膜制备物与标记的参考化合物接触,其时间足以使参考化合物与HERG多肽通道结合,其中所述细胞在其表面上表达具有与SEQ ID NO:2具有至少80%同一性的氨基酸序列的HERG多肽通道或其片段;
b)使细胞的膜制备物与步骤a)的标记的参考化合物以及试验化合物接触,其时间足以使参考化合物与HERG多肽通道结合和试验化合物与HERG多肽通道结合,其中所述细胞在其表面上表达具有与SEQ IDNO:2具有至少80%同一性的氨基酸序列的HERG多肽通道或其片段;
c)测量步骤a)中结合到HERG通道上的标记的参考化合物的数量;
d)测量步骤b)中结合到HERG通道上的标记的参考化合物的数量;和
e)比较步骤a)中测量的结合到HERG通道上的标记的参考化合物的数量和步骤b)中测量的结合到HERG多肽通道上的标记的参考化合物的数量。
在高通量筛选测定方法的优选实施方案中,膜制备物来自于细胞,优选HEK293细胞,该细胞在其表面上表达由SEQ ID NO:2组成的氨基酸序列编码的HERG多肽通道。在高通量筛选测定方法的进一步实施方案中,标记的参考化合物是阿司咪唑,优选[3H]-阿司咪唑。
本发明也包括筛选化合物在受试验者中诱发心脏毒性能力用的试剂盒,以及在本发明的测定方法中,包括多核苷酸、多肽和合适的参考化合物在内的试剂的用途。
附图简述
图1A示出了[3H]-阿司咪唑与用HERG通道cDNA稳定转染的HEK293细胞的细胞的膜制备物的饱和结合。TB表示所测量的总的结合,NSB表示所测量的非特异结合,SB表示所测量的特异结合。
图1B示出了饱和结合实验的斯卡查德图。根据拟合线,可用3260±900fmol/mg蛋白质(n=11)的Bmax(最大结合)确定3.07±2.26nM(n=11)的KD
图2示出了与电生理膜片钳数据相比,42个参考化合物的结合亲和力。可获得0.87的Spearman秩相关系数。
详细说明
本发明涉及心血管安全测定领域,并提供筛选试验化合物在受试验者中诱发心脏毒性能力用的测定方法与试剂盒。所述测定方法与试剂盒基于下述发现:可利用阿司咪唑与HERG钾通道的相互作用,以预计在新的治疗剂和其它试剂的开发过程中化合物的心脏毒性。在化合物库的高通量筛选中,本发明尤其有利。
在本发明的一个实施方案中,筛选试验化合物的测定方法包括:a)用i)参考化合物,ii)试验化合物温育含HERG或其片段的原料;和b)测量试验化合物对结合到HERG上的参考化合物的数量。
在本发明的具体实施方案中,使用测定方法,以评价在受试验者中试验化合物诱发心律不齐的能力。
此处所使用的术语“试验化合物”是指在化学上定义的分子,其中在本发明的测定方法中评价该分子诱发心律不齐的能力。试验化合物包括,但不限于药物、配体(天然或合成)、多肽、肽、肽模拟物、多糖、糖、糖蛋白、核酸、多核苷酸和小的有机分子。在一个实施方案中,试验化合物包括已有的化合物库。在另一实施方案中,试验化合物包括新型的化合物库。
此处所使用的术语“参考化合物”是指能在受试验者中诱发心脏毒性的药物。参考化合物包括,但不限于阿司咪唑、特非那定、红霉素、斯氟沙星(sparfloxain)、普罗布考、特罗地林和舍吲哚。
此处所使用的术语“HERG”是指Human Ether-a-go-go-RelatedGene通道。它是延迟整流器(rectifier)钾通道,在许多细胞类型中,所述通道在控制作用电势复极化方面起重要作用。最初从人类海马中克隆出HERG,它在心脏中被强烈地表达。本发明的HERG多肽包括分离并纯化的蛋白质或其片段,所述蛋白质具有与SEQ ID NO:2具有至少80%同一性的氨基酸序列。在进一步的实施方案中,本发明的HERG多肽通道具有含SEQ ID NO:2氨基酸序列的氨基酸序列。在优选的实施方案中,本发明的HERG多肽由SEQ ID NO:2组成。
所定义的序列和片段的变体也形成本发明的一部分。变体包括通过保守氨基酸改变,来改变母体序列的那些,其中“保守氨基酸改变”是指基于一些氨基酸的可取代性被公认的领域,在没有影响母体分子生物活性情况下,置换母体序列中的一个或多个氨基酸残基(参见例如M.Dayhoff,In Atlas of Protein Sequence andStructure,Vol.5,Supp.3,p345-352,1987)。进一步的变体是其中以任何组合方式取代、缺失或添加数个、5-10、1-5或1-2个氨基酸的变体。
比较两种或多种序列的同一性或相似性的方法是本领域公知的。因此,可使用例如,在Winconsin序列分析软年包,9.1版本(DevreuxJ.等,Nucleic acid Res.,12,387-395,1984)中获得的程序,例如BESTFIT和GAP程序,来确定两种多核苷酸之间的同一性%以及两种多肽序列之间的同一性%和相似性%。BESTFIT利用Smith和Waterman的“局部同源性”算法(J.Mol.Biol.,147,195-197,1981),并发现在两个序列之间相似性的最好单一区域。BESTFIT更适于比较长度不同的两种多核苷酸或两种多肽,该程序假定较短的序列表示较长的部分。相比之下,根据Neddlemen和Wunsch的算法(J.Mol.Biol.,48,443-453,1970),GAP比对两个序列,结果发现“最大的相似性”。GAP更适于比对长度接近相同的序列,预期整个长度内比对。优选地,在各程序内使用的参数“空位权重”和“长度权重”,对于多核苷酸序列来说,分别为50和3,对于多肽序列来说,分别为12和4。优选地,当最佳地比对被比较的两个序列时,确定同一性%和相似性%。确定序列间同一性和/或相似性的其它程序也是本领域已知的,例如BLAST系列程序(Altschul S F等,Nucleic AcidsRes.,25:3389-3402,1997)。
本领域的技术人员将意识到可通过多种重组DNA技术,其中包括例如杂交、聚合物酶链反应(PCR)扩增或DNA的从头合成,获得本发明的多肽,即HERG多肽通道(参见例如T.Maniatis等,MolecularCloning:A Laboratory Manual,2d Ed.,Chap14(1989))。因此,本发明进一步的实施方案提供在本发明的测定方法或试剂盒中编码HERG多肽或其片段的分离并纯化的多核苷酸的应用。本发明另一实施方案提供含SEQ ID NO:1的多核苷酸序列的编码HERG多肽通道或其片段的分离并纯化的多核苷酸的应用。本发明的优选实施方案提供由SEQ IDNO:1的多核苷酸序列组成的编码HERG多肽通道的分离并纯化的多核苷酸的应用。
术语“其片段”描述一段或亚区域的蛋白质或多核苷酸分子,其序列在此处被公开,以便所述片段包括在母体蛋白质内相邻的5个或更多个氨基酸,或以便所述片段包括在母体多核苷酸内相邻的15个或更多个核苷酸。术语“其片段”拟包括“功能片段”,其中分离的片段、段或亚-区域包括在功能上不同的区域,如受体蛋白质的活性位点、结合位点或磷酰化位点。可通过克隆技术,或作为可供替代的剪接技术的天然产物,来生产功能片段。
此处所使用的“分离的”是指已从体内环境中分离出所讨论的多核苷酸、蛋白质和多肽或其各自的片段,以便熟练的技术人员可操作它的事实,例如,但不限于测序、限制消化、定点诱变,和亚克隆至核酸片段的表达载体,以及获得提供产生多克隆抗体、单克隆抗体、氨基酸测序和肽消化机会的大量蛋白质或蛋白质片段。因此,此处所述的核酸可以以完整细胞或以细胞溶菌液或以部分、基本上或完全纯化的形式存在。
当多肽从环境污染物中纯化而来时,认为它是“纯化的”。因此,当通过标准方法从细胞组分中纯化时,从细胞中分离的多肽被认为基本上是纯化的,而当由它的化学前体纯化时,化学合成的多肽序列被认为是基本上纯化的。“基本上纯的”蛋白质或核酸将典型地包括样品的至少85%,其中优选更大的百分数。确定蛋白质或核酸分子纯度的一种方法是在基质如聚丙烯酰胺或琼脂中电泳制备物。通过在染色之后单一条带的外观来证明纯度。评价纯度的其它方法包括色谱法和分析离心。
此处所使用的术语“足以使得结合的时间”是指产生结合到HERG多肽通道上的可检测量的标记的参考化合物所需要的时间。产生这一可检测量所需要的时间将随测定体系而变化。基于测定体系,本领域的技术人员将知道足以产生结合到HERG多肽通道上的可检测量的标记的参考化合物所需要的时间。
测定方法
可按照许多形式设计本发明的测定方法,其中所述形式在筛选结合多肽通道用的化合物领域中通常是公知的。
本发明的测定方法有利地利用事实:可利用阿司咪唑与HERG钾通道的相互作用,以预计在新的治疗剂和其它试剂的开发过程中化合物的心脏毒性。
因此,本发明提供筛选试验化合物的测定方法,该测定方法包括:a)用i)参考化合物,ii)试验化合物温育含HERG或其片段的原料,和b)测量试验化合物对结合到HERG上的参考化合物数量的影响。
在本发明的第一个实施方案中,含HERG的原料是分离并纯化的蛋白质,该蛋白质编码与SEQ ID NO:2具有至少80%同一性的氨基酸序列的HERG或其片段。
在本发明的第二个实施方案中,含HERG的原料是分离并纯化的蛋白质,该蛋白质编码含SEQ ID NO:2氨基酸序列的HERG或其片段。
在本发明进一步的实施方案中,含HERG的原料是在其表面上表达HERG多肽通道或其片段的细胞。
在本发明的又一实施方案中,含HERG的原料是在其表面上表达HERG多肽通道或其片段的细胞的膜制备物。
在本发明可供替代的实施方案中,参考化合物是能在受试验者诱发心脏毒性的化合物,它优选选自阿司咪唑、特非那定、红霉素、斯氟沙星、普罗布考、特罗地林和舍吲哚。在优选的实施方案中,参考化合物是阿司咪唑。本发明进一步的目的是提供测定方法,其中标记,优选放射性标记参考化合物。
在优选的实施方案中,筛选试验化合物在受试验者中诱发心脏毒性能力的测定方法包括:a)用i)[3H]阿司咪唑,ii)待测试的化合物,温育在其表面上表达由SEQ ID NO:2组成的氨基酸序列编码的HERG多肽通道的细胞的膜制备物;并测量试验化合物对结合到HERG上的参考化合物的数量的影响。使用参考化合物的标记,来测量这一效果,其中尤其可使用闪烁计数法测量所述标记。
本发明的测定方法的具体实施方案包括筛选试验化合物的高产量测定方法,所述测定方法包括:a)使细胞的膜制备物与标记的参考化合物接触,其时间足以使参考化合物与HERG多肽通道结合,其中所述细胞在其表面上表达具有与SEQ ID NO:2具有至少80%同一性的氨基酸序列的HERG多肽通道或其片段;b)使细胞的膜制备物与步骤a)的标记的参考化合物以及试验化合物接触,其时间足以使参考化合物与HERG多肽通道结合和试验化合物与HERG多肽通道结合,其中所述细胞在其表面上表达具有与SEQ ID NO:2具有至少80%同一性的氨基酸序列的HERG多肽通道或其片段;c)测量步骤a)中结合到HERG通道上的标记的参考化合物的数量;d)测量步骤b)中结合到HERG通道上的标记的参考化合物的数量;和e)比较步骤a)中测量的结合到HERG通道上的标记的参考化合物的数量和步骤b)中测量的结合到HERG多肽通道上的标记的参考化合物的数量。
在进一步的实施方案中,高通量筛选测定方法的膜制备物由在其表面上表达含SEQ ID NO:2氨基酸序列的HERG多肽通道或其片段的细胞的膜制备物组成。
在本发明的优选实施方案中,高通量筛选测定方法的膜制备物由细胞,优选HEK293细胞的膜制备物组成,所述细胞在其表面上表达由SEQ ID NO:2的氨基酸序列组成的HERG多肽通道。
在进一步优选的实施方案中,在高通量筛选测定方法中的标记的参考化合物由[3H]-标记的阿司咪唑组成。可尤其使用闪烁计数测量所述标记。
在本发明的另一具体实施方案中,提供了一种筛选试验化合物的高通量亲近检测(proximity detection)测定方法,该测定方法包括:
i)能参与亲近检测测定方法的用第一种标记进行标记的HERG;
ii)能参与亲近检测测定方法的用第二种标记进行标记的参考化合物;
iii)使步骤i)的HERG和步骤ii)的参考化合物与试验化合物一起接触,其时间足以使参考化合物与HERG结合以及试验化合物与HERG结合;和
iv)当HERG和参考化合物相互作用时,通过第一种标记与第二种标记的亲近,来检测步骤i)的HERG和步骤ii)的参考化合物之间的相互作用。
由HERG与参考化合物的相互作用引起的第一种标记与第二种标记的亲近导致产生可检测的信号。这可例如通过闪烁亲近测定(SPA)体系来实现,在该体系中,标记之一是适用于SPA的放射性标记,而另一标记是包含在固相内的荧光增白剂。当标记的HERG蛋白质与标记的参考化合物相互作用时,可检测的信号是发射出的光能,这引起放射性标记足够接近荧光增白剂。在US4568649中公开了闪烁亲近测定技术。
或者,可检测的信号可以是在已有的信号输出,例如荧光中的变量。荧光共振能量传递(FRET)是基于这一原理工作的方法,且Tsien R.等(Tsien R.等(1993)Trends Cell Biol.3:242-245)描述过它。它使用两种不同的荧光分子、供体和受体,以便当这些彼此足够接近时,供体分子的荧光被受体分子吸收,并发射出另一波长的光。因此,当在两个分子如HERG和参考化合物之间存在相互作用时,它们各自用这些荧光分子之一标记,产生可检测的信号。
通过以上所述的这种亲近测定方法,可以以单一的步骤进行本发明的筛选测定方法,即不需分离步骤,以便使用分离方法如过滤,从温育混合物中除去过量的标记的参考化合物。
在高通量的亲近检测测定方法的优选实施方案中,用包含在固相内的荧光增白剂,如包被的闪烁亲近测定珠来标记HERG,和用放射性标记来标记参考化合物,优选地,参考化合物是放射性标记的式(III)的阿司咪唑。
本领域的技术人员容易理解,阿司咪唑与HERG的结合也可用于基于结构或合理设计影响前述结合的化合物的方法,这是通过:
a)用阿司咪唑探测HERG多肽通道的结合位点的结构;
b)鉴定在HERG多肽通道的结合位点内的接触原子,其中所述HERG多肽通道在结合过程中与阿司咪唑相互作用;
c)设计与(b)中鉴定的原子相互作用,从而影响HERG-阿司咪唑相互作用的试验化合物;和
d)使所述设计的试验化合物与含HERG或其片段的原料接触,以测量所述化合物影响结合到HERG上的标记的阿司咪唑数量的能力。
将进一步理解这通常是一种叠接(iterative)方法。
试剂盒
本发明也提供可在上述测定方法中使用的试剂盒。在一个实施方案中,试剂盒包括a)含HERG的原料;b)参考化合物。
在第一个实施方案中,试剂盒包括含HERG的原料,所述原料选自:i)分离并纯化的蛋白质,该蛋白质编码具有与SEQ ID NO:2具有至少80%同一性的氨基酸序列的HERG或其片段;ii)分离并纯化的蛋白质,该蛋白质编码含SEQ ID NO:2氨基酸序列的HERG或其片段;iii)在其表面上表达HERG多肽通道或其片段的细胞;或iv)在其表面上表达HERG多肽通道或其片段的细胞的膜制备物。
在进一步的实施方案中,试剂盒包括参考化合物,所述参考化合物选自阿司咪唑、特非那定、红霉素、斯氟沙星、普罗布考、特罗地林和舍吲哚。在优选的实施方案中,参考化合物是阿司咪唑。本发明进一步的目的是提供试剂盒,其中标记,优选放射性标记参考化合物。
在具体的实施方案中,分离并纯化的HERG多肽通道结合到固体载体上,优选结合到含固体支持物的荧光增白剂,如涂布的闪烁亲近珠上。
因此,在具体的实施方案中,试剂盒包括a)结合到固体支持物上的分离并纯化的HERG多肽通道或其片段,和b)标记的参考化合物。优选地,这一具体实施方案由试剂盒组成,该试剂盒包括:a)由SEQ IDNO:2的氨基酸序列组成的分离并纯化的HERG多肽通道,所述HERG多肽通道被结合到含固体支持物的荧光增白剂上;和b)放射性标记的参考化合物,优选[3H]-标记的阿司咪唑。
在另一具体实施方案中,试剂盒包括;a)细胞,优选HEK293细胞的膜制备物,所述细胞在其表面上表达由SEQ ID NO:2的氨基酸序列组成的HERG多肽通道;b)[3H]-标记的阿司咪唑;和c)测量结合到HERG上的标记的参考化合物数量的装置。
测量装置由分离装置和检测标记的参考化合物的装置组成,其中分离装置用于从温育混合物中除去过量未结合的标记参考化合物。本领域的技术人员知道从温育混合物中除去过量未结合的标记参考化合物用的分离装置。所述分离装置包括,但不限于磁珠、离心技术和过滤技术。检测标记的参考化合物的装置将取决于所使用的标记。所述标记可以是荧光或放射性标记。本领域的技术人员知道根据所使用的标记而变化的检测装置。
在具体的实施方案中,分离装置由GF/B过滤器(WhatmanInc.,Clifton,N.J.)组成。在另一具体的实施方案中,检测装置由在Topcount内的闪烁计数(Packard,Meriden,CT)组成。
在进一步的实施方案中,本发明的试剂盒进一步包括进行测定用的仪器和/或多孔板。
参考下述实验细节将更好地理解本发明,但本领域的技术人员容易理解,这些仅仅是本发明的例举,在随后的权利要求中更充分地描述本发明的范围。另外,在整个说明书中,引用各种公开出版物。这些公开出版物披露的内容在此通过参考引入本申请中,以便更充分地描述本发明所属领域的状态。
实施例1:DNA构建体和HEK293细胞的稳定转染
将HERG cDNA(Genbank Accession No.:U04270(SEQ ID NOI:1))亚克隆至pcDNA3载体(Invitrogen)的bamHI/EcoRI位点。这一载体含有CMV启动子和SV40启动子,它们分别驱动插入的cDNA(HERG)和抗新霉素基因的表达。通过磷酸钙沉淀方法(Gibco)或脂质转染胺方法(Gibco),用这一构建体转染HEK293细胞。在800μg/ml遗传霉素(G418;Gibco)中选择15-20天之后,用克隆量筒收集单一的集落,并测试HERG电流。在补加有10%胎牛血清和400μg/ml遗传霉素的最小基本温育基(MEM)中温育稳定转染的细胞。
为了电生理研究,通过胰蛋白酶消化,从温育皿中采集细胞,用标准的MEM温育基洗涤两次,并在用聚-L-赖氨酸涂布的小温育皿中播种。在板上1-2天之后,在细胞上进行实验。
实施例2:用HERG钾通道稳定地转染的HEK293细胞的膜制备物
使用HERG通道cDNA稳定地转染的HEK293细胞在富含10%胎牛血清和抗生素的DMEM温育基内生长。使用Ultraturrax均化器,在Tris-HCl 50mM pH7.4中均化收集的细胞,并在Sorvall离心机内,在23500×g下离心均化物。通过再-均化和再-离心洗涤细胞膜一次。将膜悬浮在Tris-HCl 50mM pH7.4中,等分试样,并在-80℃下储存。
实施例3:放射性标记阿司咪唑
Figure A0281399500191
搅拌在48%氢溴酸水溶液(80ml)内的4.6g阿司咪唑(I)(10mmol)的溶液,并回流2小时。使反应混合物冷却到室温,过滤所形成的沉淀,并用水洗涤。将固体溶解在N,N-二甲基甲酰胺(20ml)和水(20ml)的混合物中,在搅拌下,通过缓慢引入浓氢氧化铵的水溶液使混合物成碱性。然后加入水(100ml)和搅拌混合物1小时。过滤掉沉淀并在空气中干燥18小时,得到去甲阿司咪唑(II)。
从这一用量中取出一部分,并通过制备型HPLC,在HypersylODS(5μm)结合相的不锈钢柱(7.1mmID×300mm)上分批彻底纯化,得到不含阿司咪唑的去甲阿司咪唑。在282nm处检测,并在4.0ml/min的流速下,用乙腈-水-二异丙胺(56∶44∶0.2,v/v)进行洗脱。
将HPLC纯化的去甲阿司咪唑(II)(26.7mg,60μmol)级分溶解在N,N-二甲基甲酰胺(1.0ml)中。向该溶液中加入1N氢氧化钠水溶液(60μl,60μmol)。在室温下搅拌混合物25分钟,并逐滴加入到[33H]-碘代甲烷(370MBq)在甲苯内的预冷却溶液(-78℃)中。旋流反应混合物,然后在没有冷却的情况下静置3小时。在40℃的水浴中,在吸气压力下,将甲苯从反应混合物中蒸发掉,并如上所述通过制备型HPLC,分批纯化残留物。合并含级分的产品,并用甲醇提取到70ml,得到总放射性为198MBq和比活性为3.14TBq/mmol(85Ci/mmol)的[3H]-阿司咪唑(III)。
实施例4:放射配体结合测定方法
解冻膜,并在温育缓冲液(Hepes 10nM pH7.4,40mM KCl,20mMKH2PO4,5mM MgCl2,0.5mm KHCO3,10mM葡萄糖,50mM谷氨酸盐,20mM天冬氨酸盐,14mM庚酸,1mM EGTA,0.1%BSA)中再-均化,并且在有或无竞争剂下,在25℃下,用[3H]-阿司咪唑温育20-100μg蛋白质,接着使用Filtermatel96采集器(Packard,Meriden,CT),在GF/B过滤器上快速过滤。用冰冷的漂洗缓冲液(Tris-HCl 25mMpH7.4,130mM NaCl,5.5mM KCl,5mM葡萄糖,0.8mM MgCl2,50μm CaCl2,0.1%BSA)彻底漂洗过滤器。通过在Topcount(Packard,Meriden,CT)内的闪烁计数测定过滤器结合的放射性,以每分钟的计数(cpm)表达结果。
最初,研究包括缓冲液、放射配体和要测定非特异结合的化合物在内的各种参数,以便选择最佳的条件。
在饱和结合实验中,用膜来温育浓度增加的[3H]-阿司咪唑,再-悬浮在缓冲液中。在10μM R66204存在下测量非特异结合(图1)。
通过比较22种参考化合物的结合亲和力和电生理数据,研究在温育缓冲液内存在的BSA和/或环糊精的影响,以及在实验之前化合物的各种添加方式的影响。将化合物溶解在DMSO中,并使用MultiprobeII移液器(Pachard,Meriden,CT),进一步在相同的溶剂中稀释。在所有的实验中,最终的DMSO浓度为1%。根据这一分析得出,可直接从由DMSO储液添加化合物。通过添加BSA和/或环糊精试图增加化合物的溶解度没有显著改进相关性。
实施例5:完整细胞的电压钳技术(膜片钳)
溶液:浴液包含150NaCl,4KCl,5葡萄糖,10HEPES,1.8CaCl2和1MgCl2(使用NaOH,pH7.4)(单位mM)。移取的溶液包含120KCl,5EGTA,10HEPES,4MgATP,0.5CaCl2和2MgCl2(使用KOH,pH7.2)(单位mM)。将化合物溶解在DMSO中,获得10-2M或10-1M的储液。对照(=浴液+DMSO)和实验溶液(=浴液+DMSO+待测试的化合物)包含0.3%,0.1%或0.03%的DMSO。使用Y-管体系,将试验和对照溶液施加到研究的细胞上,从而使得在研究的细胞附近可快速改变溶液(小于0.5秒)。
电生理测量:将含表达HERG的附着HEK293细胞的温育皿固定在膜片钳塔(Patch Clamp Tower)的台面上。使用反相显微镜观察细胞。在室温下用浴液持续灌注温育皿。
使用水平的Flaming/Brown微型移液管拉制器,在没有进一步的火焰-抛光情况下,从硼硅酸盐玻璃毛细管中拉制膜片移液管。当用移液填充时,所使用的微电极的输入电阻为1.5至3MΩ。
使用膜片箝术,通过EPC-9膜片钳放大器,在不同的膜电势下测量细胞的膜电流。使用程序Pulse和Pulsefit(HEKA),DataAccess(Bruxton)和Igor(Wavemetrics)获得并分析数据。电流信号被低通过滤和随后数字化。在密封之前,电校正液体接界电势。在膜破裂之后,使用EPC-9膜片钳放大器,补偿细胞的电容和串联电阻。
保持电势为-80mV。HERG电流(K+-选择的外向电流)测定为在-40mV到2秒的去极化之后的+60mV下的最大尾电流。脉冲周期速度为15秒。在各试验脉冲之前,得到从保持电势到-60mV的短脉冲(0.5秒),以测定漏泄电流。在确定完整细胞的结构之后,允许5分钟的平衡时间段,用移取的溶液内部灌注细胞。之后,给出5分钟的试验脉冲,在控制条件下定量确定HERG电流。在持续脉冲程序的同时,将灌注由对照溶液变化为含药物的溶液。在施加药物5分钟之后测量药物的效果。对于每个细胞测试药物的1-3种浓度(累积施加)。
测量的参数分析:HERG电流测定为从-80mV的保持电势开始,在-40mV到2秒的去极化之后的+60mV下的最大尾电流。
在对照溶液存在下测量的最初5分钟内,HERG-介导的膜K+电流的振幅随时间逐渐降低(减少)。为了精确地定量化合物的阻断程度,必须考虑到这种K+电流的持续减少。因此,在对照溶液内,在最初的5分钟的时间段内,K+电流的时间曲线(在-40mV下测量)按指数拟合,并外推实验的其余部分。若没有给定药物,这些外推得到电流的估计振幅。为了测定化合物的阻断程度,通过用各次测量的电流振幅除以在同一时间点处拟合的电流值,来计算测量的电流比。
实施例6:结合测定的药理学评价
为了进行结合测定的药理学评价,在8种浓度下测试322种化合物抑制[3H]-阿司咪唑结合到HERG通道上的能力,和通过非线性回归分析计算pIC50-值。若获得pIC50-值,则比较结合和膜片钳的效力的秩(Spearman)。
若在膜片钳分析中,仅在<4种浓度下测试了化合物,则根据下述标准对结合和膜片钳数据的分数归类:
分数1:pIC50<6或在10-6M或更高浓度下,阻断率<50%
分数2:pIC50为6至8或在10-6和10-8M之间,阻断率<50%
分数3:pIC50>8或在10-8M或更低浓度下,阻断率>50%
42种参考化合物从HERG通道中置换[3H]-阿司咪唑结合的效力的秩与快速激活的延迟整流器K+电流的功能性阻断的电生理数据非常相关(rsp=0.87)(图2)。
对于测试的94%化合物来说,结合数据与膜片钳数据相关。在2%的化合物中,结合测定得分高于膜片钳测定,而对于其余的4%来说,情况相反,即膜片钳测定得分高于结合测定。
根据结合数据与电生理数据的这种良好相关性,可得出结论,可使用放射配体结合测定作为主要的筛选工具,用于预测潜在的心脏毒性副作用。
                            序列表
<110>詹森药业有限公司
<120>心血管安全测定方法
<130>心血管安全测定方法
<140>
<141>
<160>2
<170>PatentIn Ver.2.1
<210>1
<211>4070
<212>DNA
<213>人(Homo sapiens)
<220>
<221>CDS
<222>(184)..(3663)
<300>
<301>Warmke,J.W.
<302>推定的人钾通道亚基(h-erg)mRNA,
     完整的cds.
<308>GenBank/U04270
<309>1993-12-09
<313>1-4070
<400>1
acgcggcctg ctcaggcctc cagcggccgg tcggagggga ggcgggaggc gagcgaggac 60
ccgcgcccgc agtccagtct gtgcgcgccc gtgctcgctt ggcgcggtgc gggaccagcg 120
ccggccaccc gaagcctagt gcgtcgccgg gtgggtgggc ccgcccggcg ccatgggctc 180
agg atg ccg gtg cgg agg ggc cac gtc gcg ccg cag aac acc ttc ctg   228
    Met Pro Val Arg Arg Gly His Val Ala Pro Gln Asn Thr Phe Leu
      1               5                  10                  15
gac acc atc atc cgc aag ttt gag ggc cag agc cgt aag ttc atc atc   276
Asp Thr Ile Ile Arg Lys Phe Glu Gly Gln Ser Arg Lys Phe Ile Ile
                 20                  25                  30
gcc aac gct cgg gtg gag aac tgc gcc gtc atc tac tgc aac gac ggc   324
Ala Asn Ala Arg Val Glu Asn Cys Ala Val Ile Tyr Cys Asn Asp Gly
             35                  40                  45
ttc tgc gag ctg tgc ggc tac tcg cgg gcc gag gtg atg cag cga ccc    372
Phe Cys Glu Leu Cys Gly Tyr Ser Arg Ala Glu Val Met Gln Arg Pro
         50                  55                  60
tgc acc tgc gac ttc ctg cac ggg ccg cgc acg cag cgc cgc gct gcc    420
Cys Thr Cys Asp Phe Leu His Gly Pro Arg Thr Gln Arg Arg Ala Ala
     65                  70                  75
gcg cag atc gcg cag gca ctg ctg ggc gcc gag gag cgc aaa gtg gaa    468
Ala Gln Ile Ala Gln Ala Leu Leu Gly Ala Glu Glu Arg Lys Val Glu
 80                  85                  90                  95
atc gcc ttc tac cgg aaa gat ggg agc tgc ttc cta tgt ctg gtg gat    516
Ile Ala Phe Tyr Arg Lys Asp Gly Ser Cys Phe Leu Cys Leu Val Asp
                100                 105                 110
gtg gtg ccc gtg aag aac gag gat ggg gct gtc atc atg ttc atc ctc    564
Val Val Pro Val Lys Asn Glu Asp Gly Ala Val Ile Met Phe Ile Leu
            115                 120                 125
aat ttc gag gtg gtg atg gag aag gac atg gtg ggg tcc ccg gct cat    612
Asn Phe Glu Val Val Met Glu Lys Asp Met Val Gly Ser Pro Ala His
        130                 135                 140
gac acc aac cac cgg ggc ccc ccc acc agc tgg ctg gcc cca ggc cgc    660
Asp Thr Asn His Arg Gly Pro Pro Thr Ser Trp Leu Ala Pro Gly Arg
    145                 150                 155
gcc aag acc ttc cgc ctg aag ctg ccc gcg ctg ctg gcg ctg acg gcc    708
Ala Lys Thr Phe Arg Leu Lys Leu Pro Ala Leu Leu Ala Leu Thr Ala
160                 165                 170                 175
cgg gag tcg tcg gtg cgg tcg ggc ggc gcg ggc ggc gcg ggc gcc ccg    756
Arg Glu Ser Ser Val Arg Ser Gly Gly Ala Gly Gly Ala Gly Ala Pro
                180                 185                190
ggg gcc gtg gtg gtg gac gtg gac ctg acg ccc gcg gca ccc agc agc    804
Gly Ala Val Val Val Asp Val Asp Leu Thr Pro Ala Ala Pro Ser Ser
            195                 200                 205
gag tcg ctg gcc ctg gac gaa gtg aca gcc atg gac aac cac gtg gca    852
Glu Ser Leu Ala Leu Asp Glu Val Thr Ala Met Asp Asn His Val Ala
        210                 215                 220
ggg ctc ggg ccc gcg gag gag cgg cgt gcg ctg gtg ggt ccc ggc tct    900
Gly Leu Gly Pro Ala Glu Glu Arg Arg Ala Leu Val Gly Pro Gly Ser
    225                 230                 235
ccg ccc cgc agc gcg ccc ggc cag ctc cca tcg ccc cgg gcg cac agc     948
Pro Pro Arg Ser Ala Pro Gly Gln Leu Pro Ser Pro Arg Ala His Ser
240                 245                 250                 255
ctc aac ccc gac gcc tcg ggc tcc agc tgc agc ctg gcc cgg acg cgc     996
Leu Asn Pro Asp Ala Ser Gly Ser Ser Cys Ser Leu Ala Arg Thr Arg
                260                 265                 270
tcc cga gaa agc tgc gcc agc gtg cgc cgc gcc tcg tcg gcc gac gac    1044
Ser Arg Glu Ser Cys Ala Ser Val Arg Arg Ala Ser Ser Ala Asp Asp
            275                 280                 285
atc gag gcc atg cgc gcc ggg gtg ctg ccc ccg cca ccg cgc cac gcc    1092
Ile Glu Ala Met Arg Ala Gly Val Leu Pro Pro Pro Pro Arg His Ala
        290                 295                 300
agc acc ggg gcc atg cac cca ctg cgc agc ggc ttg ctc aac tcc acc    1140
Ser Thr Gly Ala Met His Pro Leu Arg Ser Gly Leu Leu Asn Ser Thr
    305                 310                 315
tcg gac tcc gac ctc gtg cgc tac cgc acc att agc aag att ccc caa    1188
Ser Asp Ser Asp Leu Val Arg Tyr Arg Thr Ile Ser Lys Ile Pro Gln
320                 325                 330                 335
atc acc ctc aac ttt gtg gac ctc aag ggc gac ccc ttc ttg gct tcg    1236
Ile Thr Leu Asn Phe Val Asp Leu Lys Gly Asp Pro Phe Leu Ala Ser
                340                 345                 350
ccc acc agt gac cgt gag atc ata gca cct aag ata aag gag cga acc    1284
Pro Thr Ser Asp Arg Glu Ile Ile Ala Pro Lys Ile Lys Glu Arg Thr
            355                 360                 365
cac aat gtc act gag aag gtc acc cag gtc ctg tcc ctg ggc gcc gac    1332
His Asn Val Thr Glu Lys Val Thr Gln Val Leu Ser Leu Gly Ala Asp
        370                 375                 380
gtg ctg cct gag tac aag ctg cag gca ccg cgc atc cac cgc tgg acc    1380
Val Leu Pro Glu Tyr Lys Leu Gln Ala Pro Arg Ile His Arg Trp Thr
    385                 390                 395
atc ctg cat tac agc ccc ttc aag gcc gtg tgg gac tgg ctc atc ctg    1428
Ile Leu His Tyr Ser Pro Phe Lys Ala Val Trp Asp Trp Leu Ile Leu
400                 405                 410                 415
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Leu Leu Val Ile Tyr Thr Ala Val Phe Thr Pro Tyr Ser Ala Ala Phe
                420                 425                 430
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Leu Leu Lys Glu Thr Glu Glu Gly Pro Pro Ala Thr Glu Cys Gly Tyr
            435                 440                 445
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Ala Cys Gln Pro Leu Ala Val Val Asp Leu Ile Val Asp Ile Met Phe
        450                 455                 460
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Ile Val Asp Ile Leu Ile Asn Phe Arg Thr Thr Tyr Val Asn Ala Asn
    465                 470                 475
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Glu Glu Val Val Ser His Pro Gly Arg Ile Ala Val His Tyr Phe Lys
480                 485                 490                 495
ggc tgg ttc ctc atc gac atg gtg gcc gcc atc ccc ttc gac ctg ctc    1716
Gly Trp Phe Leu Ile Asp Met Val Ala Ala Ile Pro Phe Asp Leu Leu
                500                 505                 510
atc ttc ggc tct ggc tct gag gag ctg atc ggg ctg ctg aag act gcg    1764
Ile Phe Gly Ser Gly Ser Glu Glu Leu Ile Gly Leu Leu Lys Thr Ala
            515                 520                 525
cgg ctg ctg cgg ctg gtg cgc gtg gcg cgg aag ctg gat cgc tac tca    1812
Arg Leu Leu Arg Leu Val Arg Val Ala Arg Lys Leu Asp Arg Tyr Ser
        530                 535                 540
gag tac ggc gcg gcc gtg ctg ttc ttg ctc atg tgc acc ttt gcg ctc    1860
Glu Tyr Gly Ala Ala Val Leu Phe Leu Leu Met Cys Thr Phe Ala Leu
    545                 550                 555
atc gcg cac tgg cta gcc tgc atc tgg tac gcc atc ggc aac atg gag    1908
Ile Ala His Trp Leu Ala Cys Ile Trp Tyr Ala Ile Gly Asn Met Glu
560                 565                 570                 575
cag cca cac atg gac tca cgc atc ggc tgg ctg cac aac ctg ggc gac    1956
Gln Pro His Met Asp Ser Arg Ile Gly Trp Leu His Asn Leu Gly Asp
                580                 585                 590
cag ata ggc aaa ccc tac aac agc agc ggc ctg ggc ggc ccc tcc atc    2004
Gln Ile Gly Lys Pro Tyr Asn Ser Ser Gly Leu Gly Gly Pro Ser Ile
            595                 600                 605
aag gac aag tat gtg acg gcg ctc tac ttc acc ttc agc agc ctc acc    2052
Lys Asp Lys Tyr Val Thr Ala Leu Tyr Phe Thr Phe Ser Ser Leu Thr
        610                 615                 620
agt gtg ggc ttc ggc aac gtc tct ccc aac acc aac tca gag aag atc    2100
Ser Val Gly Phe Gly Asn Val Ser Pro Asn Thr Asn Ser Glu Lys Ile
    625                 630                 635
ttc tcc atc tgc gtc atg ctc att ggc tcc ctc atg tat gct agc atc    2148
Phe Ser Ile Cys Val Met Leu Ile Gly Ser Leu Met Tyr Ala Ser Ile
640                 645                 650                 655
ttc ggc aac gtg tcg gcc atc atc cag cgg ctg tac tcg ggc aca gcc    2196
Phe Gly Asn Val Ser Ala Ile Ile Gln Arg Leu Tyr Ser Gly Thr Ala
                660                 665                  670
cgc tac cac aca cag atg ctg cgg gtg cgg gag ttc atc cgc ttc cac    2244
Arg Tyr His Thr Gln Met Leu Arg Val Arg Glu Phe Ile Arg Phe His
            675                 680                 685
cag atc ccc aat ccc ctg cgc cag cgc ctc gag gag tac ttc cag cac    2292
Gln Ile Pro Asn Pro Leu Arg Gln Arg Leu Glu Glu Tyr Phe Gln His
        690                 695                 700
gcc tgg tcc tac acc aac ggc atc gac atg aac gcg gtg ctg aag ggc    2340
Ala Trp Ser Tyr Thr Asn Gly Ile Asp Met Asn Ala Val Leu Lys Gly
    705                 710                 715
ttc cct gag tgc ctg cag gct gac atc tgc ctg cac ctg aac cgc tca    2388
Phe Pro Glu Cys Leu Gln Ala Asp Ile Cys Leu His Leu Asn Arg Ser
720                 725                 730                 735
ctg ctg cag cac tgc aaa ccc ttc cga ggg gcc acc aag ggc tgc ctt    2436
Leu Leu Gln His Cys Lys Pro Phe Arg Gly Ala Thr Lys Gly Cys Leu
                740                 745                 750
cgg gcc ctg gcc atg aag ttc aag acc aca cat gca ccg cca ggg gac    2484
Arg Ala Leu Ala Met Lys Phe Lys Thr Thr His Ala Pro Pro Gly Asp
            755                 760                 765
aca ctg gtg cat gct ggg gac ctg ctc acc gcc ctg tac ttc atc tcc    2532
Thr Leu Val His Ala Gly Asp Leu Leu Thr Ala Leu Tyr Phe Ile Ser
        770                 775                 780
cgg ggc tcc atc gag atc ctg cgg ggc gac gtc gtc gtg gcc atc ctg    2580
Arg Gly Ser Ile Glu Ile Leu Arg Gly Asp Val Val Val Ala Ile Leu
    785                 790                 795
ggg aag aat gac atc ttt ggg gag cct ctg aac ctg tat gca agg cct    2628
Gly Lys Asn Asp Ile Phe Gly Glu Pro Leu Asn Leu Tyr Ala Arg Pro
800                 805                 810                 815
ggc aag tcg aac ggg gat gtg cgg gce ctc acc tac tgt gac cta cac    2676
Gly Lys Ser Asn Gly Asp Val Arg Ala Leu Thr Tyr Cys Asp Leu His
                820                 825                 830
aag atc cat cgg gac gac ctg ctg gag gtg ctg gac atg tac cct gag    2724
Lys Ile His Arg Asp Asp Leu Leu Glu Val Leu Asp Met Tyr Pro Glu
            835                 840                 845
ttc tcc gac cac ttc tgg tcc agc ctg gag atc acc ttc aac ctg cga    2772
Phe Ser Asp His Phe Trp Ser Ser Leu Glu Ile Thr Phe Asn Leu Arg
        850                 855                 860
gat acc aac atg atc ccg ggc tcc ccc ggc agt acg gag tta gag ggt    2820
Asp Thr Asn Met Ile Pro Gly Ser Pro Gly Ser Thr Glu Leu Glu Gly
    865                 870                 875
ggc ttc agt cgg caa cgc aag cgc aag ttg tcc ttc cgc agg cgc acg    2868
Gly Phe Ser Arg Gln Arg Lys Arg Lys Leu Ser Phe Arg Arg Arg Thr
880                 885                 890                 895
gac aag gac acg gag cag cca ggg gag gtg tcg gcc ttg ggg ccg ggc    2916
Asp Lys Asp Thr Glu Gln Pro Gly Glu Val Ser Ala Leu Gly Pro Gly
                900                 905                 910
cgg gcg ggg gca ggg ccg agt agc cgg ggc cgg ccg ggg ggg ccg tgg    2964
Arg Ala Gly Ala Gly Pro Ser Ser Arg Gly Arg Pro Gly Gly Pro Trp
            915                 920                 925
ggg gag agc ccg tcc agt ggc ccc tcc agc cct gag agc agt gag gat    3012
Gly Glu Ser Pro Ser Ser Gly Pro Ser Ser Pro Glu Ser Ser Glu Asp
        930                 935                 940
gag ggc cca ggc cgc agc tcc agc ccc ctc cgc ctg gtg ccc ttc tcc    3060
Glu Gly Pro Gly Arg Ser Ser Ser Pro Leu Arg Leu Val Pro Phe Ser
    945                 950                 955
agc ccc agg ccc ccc gga gag ccg ccg ggt ggg gag ccc ctg atg gag    3108
Ser Pro Arg Pro Pro Gly Glu Pro Pro Gly Gly Glu Pro Leu Met Glu
960                 965                 970                 975
gac tgc gag aag agc agc gac act tgc aac ccc ctg tca ggc gcc ttc    3156
Asp Cys Glu Lys Ser Ser Asp Thr Cys Asn Pro Leu Ser Gly Ala Phe
                980                 985                 990
tca gga gtg tcc aac att ttc agc ttc tgg ggg gac agt cgg ggc cgc    3204
Ser Gly Val Ser Asn Ile Phe Ser Phe Trp Gly Asp Ser Arg Gly Arg
            995                1000                1005
cag tac cag gag ctc cct cga tgc ccc gcc ccc acc ccc agc ctc ctc    3252
Gln Tyr Gln Glu Leu Pro Arg Cys Pro Ala Pro Thr Pro Ser Leu Leu
       1010                1015                1020
aca atc ccc ctc tcc agc ccg ggt cgg cgg ccc cgg ggc gac gtg gag    3300
Asn Ile Pro Leu Ser Ser Pro Gly Arg Arg Pro Arg Gly Asp Val Glu
   1025                1030                1035
agc agg ctg gat gcc ctc cag cgc cag ctc aac agg ctg gag acc cgg    3348
Ser Arg Leu Asp Ala Leu Gln Arg Gln Leu Asn Arg Leu Glu Thr Arg
1040               1045                1050                1055
ctg agt gca gac atg gcc act gtc ctg cag ctg cta cag agg cag atg    3396
Leu Ser Ala Asp Met Ala Thr Val Leu Gln Leu Leu Gln Arg Gln Met
               1060                1065                1070
acg ctg gtc ccg ccc gcc tac agt gct gtg acc acc ccg ggg cct ggc    3444
Thr Leu Val Pro Pro Ala Tyr Ser Ala Val Thr Thr Pro Gly Pro Gly
           1075                1080                1085
ccc act tcc aca tcc ccg ctg ttg ccc gtc agc ccc ctc ccc acc ctc    3492
Pro Thr Ser Thr Ser Pro Leu Leu Pro Val Ser Pro Leu Pro Thr Leu
       1090                1095                1100
acc ttg gac tcg ctt tct cag gtt tcc cag ttc atg gcg tgt gag gag    3540
Thr Leu Asp Ser Leu Ser Gln Val Ser Gln Phe Met Ala Cys Glu Glu
   1105                1110                1115
ctg ccc ccg ggg gcc cca gag ctt ccc caa gaa ggc ccc aca cga cgc    3588
Leu Pro Pro Gly Ala Pro Glu Leu Pro Gln Glu Gly Pro Thr Arg Arg
1120               1125                1130                1135
ctc tcc cta ccg ggc cag ctg ggg gcc ctc acc tcc cag ccc ctg cac    3636
Leu Ser Leu Pro Gly Gln Leu Gly Ala Leu Thr Ser Gln Pro Leu His
               1140                1145                1150
aag cac ggc tcg gac ccg ggc agt tag tggggctgcc cagtgtggac          3683
Arg His Gly Ser Asp Pro Gly Ser
           1155                1160
acgtggctca cccagggatc aaggcgctgc tgggccgctc cccttggagg ccctgctcag  3743
gaggccctga ccgtggaagg ggagaggaac tcgaaagcac agctcctccc ccagcccttg  3803
ggaccatctt ctcctgcagt cccctgggcc ccagtgagag gggcaggggc agggccggca  3863
gtaggtgggg cctgtggtcc ccccactgcc ctgagggcat tagctggtct aactgcccgg 3923
aggcacccgg ccctgggcct taggcacctc aaggactttt ctgctattta ctgctcttat 3983
tgttaaggat aataattaag gatcatatga ataattaatg aagatgctga tgactatgaa 4043
taataaataa ttatcctgag gagaaaa                                     4070
<210>2
<211>1159
<212>PRT
<213>人(Homo sapiens)
<400>2
Met Pro Val Arg Arg Gly His Val Ala Pro Gln Asn Thr Phe Leu Asp
  1               5                  10                  15
Thr Ile Ile Arg Lys Phe Glu Gly Gln Ser Arg Lys Phe Ile Ile Ala
             20                  25                  30
Asn Ala Arg Val Glu Asn Cys Ala Val Ile Tyr Cys Asn Asp Gly Phe
         35                  40                  45
Cys Glu Leu Cys Gly Tyr Ser Arg Ala Glu Val Met Gln Arg Pro Cys
     50                  55                  60
Thr Cys Asp Phe Leu His Gly Pro Arg Thr Gln Arg Arg Ala Ala Ala
 65                  70                  75                  80
Glu Ile Ala Gln Ala Leu Leu Gly Ala Glu Glu Arg Lys Val Glu Ile
                 85                  90                  95
Ala Phe Tyr Arg Lys Asp Gly Ser Cys Phe Leu Cys Leu Val Asp Val
            100                 105                 110
Val Pro Val Lys Asn Glu Asp Gly Ala Val Ile Met Phe Ile Leu Asn
        115                 120                 125
Phe Glu Val Val Met Glu Lys Asp Met Val Gly Ser Pro Ala His Asp
    130                 135                 140
Thr Asn His Arg Gly Pro Pro Thr Ser Trp Leu Ala Pro Gly Arg Ala
145                 150                 155                 160
Lys Thr Phe Arg Leu Lys Leu Pro Ala Leu Leu Ala Leu Thr Ala Arg
                165                 170                 175
Glu Ser Ser Val Arg Ser Gly Gly Ala Gly Gly Ala Gly Ala Pro Gly
            180                 185                 190
Ala Val Val Val Asp Val Asp Leu Thr Pro Ala Ala Pro Ser Ser Glu
        195                 200                 205
Ser Leu Ala Leu Asp Glu Val Thr Ala Met Asp Asn His Val Ala Gly
    210                 215                 220
Leu Gly Pro Ala Glu Glu Arg Arg Ala Leu Val Gly Pro Gly Ser Pro
225                 230                 235                 240
Pro Arg Ser Ala Pro Gly Gln Leu Pro Ser Pro Arg Ala His Ser Leu
            245                 250                 255
Asn Pro Asp Ala Ser Gly Ser Ser Cys Ser Leu Ala Arg Thr Arg Ser
            260                 265                 270
Arg Glu Ser Cys Ala Ser Val Arg Arg Ala Ser Ser Ala Asp Asp Ile
        275                 280                 285
Glu Ala Met Arg Ala Gly Val Leu Pro Pro Pro Pro Arg His Ala Ser
    290                 295                 300
Thr Gly Ala Met His Pro Leu Arg Ser Gly Leu Leu Asn Ser Thr Ser
305                 310                 315                 320
Asp Ser Asp Leu Val Arg Tyr Arg Thr Ile Ser Lys Ile Pro Gln Ile
                325                 330                 335
Thr Leu Asn Phe Val Asp Leu Lys Gly Asp Pro Phe Leu Ala Ser Pro
            340                 345                 350
Thr Ser Asp Arg Glu Ile Ile Ala Pro Lys Ile Lys Glu Arg Thr His
        355                 360                 365
Asn Val Thr Glu Lys Val Thr Gln Val Leu Ser Leu Gly Ala Asp Val
    370                 375                 380
Leu Pro Glu Tyr Lys Leu Gln Ala Pro Arg Ile His Arg Trp Thr Ile
385                 390                 395                 400
Leu His Tyr Ser Pro Phe Lys Ala Val Trp Asp Trp Leu Ile Leu Leu
                405                 410                 415
Leu Val Ile Tyr Thr Ala Val Phe Thr Pro Tyr Ser Ala Ala Phe Leu
            420                 425                 430
Leu Lys Glu Thr Glu Glu Gly Pro Pro Ala Thr Glu Cys Gly Tyr Ala
        435                 440                 445
Cys Gln Pro Leu Ala Val Val Asp Leu Ile Val Asp Ile Met Phe Ile
    450                 455                 460
Val Asp Tle Leu Ile Asn Phe Arg Thr Thr Tyr Val Asn Ala Asn Glu
465                 470                 475                 480
Glu Val Val Ser His Pro Gly Arg Ile Ala Val His Tyr Phe Lys Gly
                485                 490                 495
Trp Phe Leu Ile Asp Met Val Ala Ala Ile Pro Phe Asp Leu Leu Ile
            500                 505                 510
Phe Gly Ser Gly Ser Glu Glu Leu Ile Gly Leu Leu Lys Thr Ala Arg
        515                 520                 525
Leu Leu Arg Leu Val Arg Val Ala Arg Lys Leu Asp Arg Tyr Ser Glu
    530                 535                 540
Tyr Gly Ala Ala Val Leu Phe Leu Leu Met Cys Thr Phe Ala Leu Ile
545                 550                 555                 560
Ala His Trp Leu Ala Cys Ile Trp Tyr Ala Ile Gly Asn Met Glu Gln
                565                 570                 575
Pro His Met Asp Ser Arg Ile Gly Trp Leu His Asn Leu Gly Asp Gln
            580                 585                 590
Ile Gly Lys Pro Tyr Asn Ser Ser Gly Leu Gly Gly Pro Ser Ile Lys
        595                 600                 605
Asp Lys Tyr Val Thr Ala Leu Tyr Phe Thr Phe Ser Ser Leu Thr Ser
    610                 615                 620
Val Gly Phe Gly Asn Val Ser Pro Asn Thr Asn Ser Glu Lys Ile Phe
625                 630                 635                 640
Ser Ile Cys Val Met Leu Ile Gly Ser Leu Met Tyr Ala Ser Ile Phe
                645                 650                 655
Gly Asn Val Ser Ala Ile Ile Gln Arg Leu Tyr Ser Gly Thr Ala Arg
            660                 665                 670
Tyr His Thr Gln Met Leu Arg Val Arg Glu Phe Ile Arg Phe His Gln
        675                 680                 685
Ile Pro Asn Pro Leu Arg Gln Arg Leu Glu Glu Tyr Phe Gln His Ala
    690                 695                 700
Trp Ser Tyr Thr Asn Gly Ile Asp Met Asn Ala Val Leu Lys Gly Phe
705                 710                 715                 720
Pro Glu Cys Leu Gln Ala Asp Ile Cys Leu His Leu Asn Arg Ser Leu
                725                 730                 735
Leu Gln His Cys Lys Pro Phe Arg Gly Ala Thr Lys Gly Cys Leu Arg
            740                 745                 750
Ala Leu Ala Met Lys Phe Lys Thr Thr His Ala Pro Pro Gly Asp Thr
        755                 760                 765
Leu Val His Ala Gly Asp Leu Leu Thr Ala Leu Tyr Phe Ile Ser Arg
    770                 775                 780
Gly Ser Ile Glu Ile Leu Arg Gly Asp Val Val Val Ala Ile Leu Gly
785                 790                 795                 800
Lys Asn Asp Ile Phe Gly Glu Pro Leu Asn Leu Tyr Ala Arg Pro Gly
                805                 810                 815
Lys Ser Asn Gly Asp Val Arg Ala Leu Thr Tyr Cys Asp Leu His Lys
            820                 825                 830
Ile His Arg Asp Asp Leu Leu Glu Val Leu Asp Met Tyr Pro Glu Phe
        835                 840                 845
Ser Asp His Phe Trp Ser Ser Leu Glu Ile Thr Phe Asn Leu Arg Asp
    850                 855                 860
Thr Asn Met Ile Pro Gly Ser Pro Gly Ser Thr Glu Leu Glu Gly Gly
865                 870                 875                 880
Phe Ser Arg Gln Arg Lys Arg Lys Leu Ser Phe Arg Arg Arg Thr Asp
                885                 890                 895
Lys Asp Thr Glu Gln Pro Gly Glu Val Ser Ala Leu Gly Pro Gly Arg
            900                 905                 910
Ala Gly Ala Gly Pro Ser Ser Arg Gly Arg Pro Gly Gly Pro Trp Gly
        915                 920                 925
Glu Ser Pro Ser Ser Gly Pro Ser Ser Pro Glu Ser Ser Glu Asp Glu
    930                 935                 940
Gly Pro Gly Arg Ser Ser Ser Pro Leu Arg Leu Val Pro Phe Ser Ser
945                 950                 955                 960
Pro Arg Pro Pro Gly Glu Pro Pro Gly Gly Glu Pro Leu Met Glu Asp
                965                 970                 975
Cys Glu Lys Ser Ser Asp Thr Cys Asn Pro Leu Ser Gly Ala Phe Ser
            980                 985                 990
Gly Val Ser Asn Ile Phe Ser Phe Trp Gly Asp Ser Arg Gly Arg Gln
        995                1000                1005
Tyr Gln Glu Leu Pro Arg Cys Pro Ala Pro Thr Pro Ser Leu Leu Asn
   1010                1015                1020
Ile Pro Leu Ser Ser Pro Gly Arg Arg Pro Arg Gly Asp Val Glu Ser
1025               1030                1035                1040
Arg Leu Asp Ala Leu Gln Arg Gln Leu Asn Arg Leu Glu Thr Arg Leu
               1045                1050                1055
Ser Ala Asp Met Ala Thr Val Leu Gln Leu Leu Gln Arg Gln Met Thr
           1060                1065                1070
Leu Val Pro Pro Ala Tyr Ser Ala Val Thr Thr Pro Gly Pro Gly Pro
       1075                1080                1085
Thr Ser Thr Ser Pro Leu Leu Pro Val Ser Pro Leu Pro Thr Leu Thr
   1090                1095                1100
Leu Asp Ser Leu Ser Gln Val Ser Gln Phe Met Ala Cys Glu Glu Leu
1105               1110                1115                1120
Pro Pro Gly Ala Pro Glu Leu Pro Gln Glu Gly Pro Thr Arg Arg Leu
               1125                1130                1135
Ser Leu Pro Gly Gln Leu Gly Ala Leu Thr Ser Gln Pro Leu His Arg
           1140                1145                1150
His Gly Ser Asp Pro Gly Ser
       1155

Claims (36)

1.一种筛选试验化合物的测定方法,该测定方法包括:
a)用i)参考化合物,
ii)试验化合物
温育含HERG或其片段的原料;和
b)测量试验化合物对结合到HERG上的参考化合物数量的影响。
2.一种用于筛选试验化合物在受试验者中诱发心脏毒性能力的测定方法,该测定方法包括:
a)用i)参考化合物,
ii)试验化合物
温育含HERG或其片段的原料;和
b)测量试验化合物对结合到HERG上的参考化合物数量的影响。
3.一种用于筛选试验化合物在受试验者中诱发心律不齐的能力的测定方法,该测定方法包括:
a)用i)参考化合物,
ii)试验化合物
温育含HERG或其片段的原料;和
b)测量试验化合物对结合到HERG上的参考化合物数量的影响。
4.权利要求1-3之一的测定方法,其中含HERG的原料选自:
i)分离并纯化的蛋白质,该蛋白质编码具有与SEQ ID NO:2具有至少80%同一性的氨基酸序列的HERG或其片段;
ii)分离并纯化的蛋白质,该蛋白质编码含SEQ ID NO:2的氨基酸序列的HERG或其片段;
iii)在其表面上表达HERG多肽通道或其片段的细胞;或
iv)在其表面上表达HERG多肽通道或其片段的细胞的膜制备物。
5.权利要求1-3之一的测定方法,其中含HERG的原料是在其表面上表达由SEQ ID NO:2组成的HERG多肽通道的细胞的膜制备物。
6.权利要求1-3之一的测定方法,其中参考化合物能在受试验者诱发心脏毒性。
7.权利要求1-3之一的测定方法,其中参考化合物选自阿司咪唑、特非那定、红霉素、斯氟沙星、普罗布考、特罗地林和舍吲哚。
8.权利要求1-3之一的测定方法,其中参考化合物是阿司咪唑。
9.权利要求1-3之一的测定方法,其中参考化合物被标记。
10.权利要求9的测定方法,其中参考化合物被放射性标记。
11.权利要求10的测定方法,其中参考化合物是[3H]-阿司咪唑。
12.式(III)的放射性标记的阿司咪唑:
13.权利要求12的放射性标记的阿司咪唑的制备方法,其特征在于:
a)使用合适的试剂如48%的氢溴酸水溶液,使式(I)的阿司咪唑去甲基化;和
b)任选地在反应惰性溶剂中,和在碱存在下,使式(II)的中间体与[3H]-碘代甲烷(CT3I)反应,
14.筛选试验化合物的高通量测定方法,该测定方法包括:
a)使细胞的膜制备物与标记的参考化合物接触,其时间足以使参考化合物与HERG多肽通道结合,其中所述细胞在其表面上表达具有与SEQ ID NO:2具有至少80%同一性的氨基酸序列的HERG多肽通道或其片段;
b)使细胞的膜制备物与步骤a)的标记的参考化合物以及试验化合物接触,其时间足以使参考化合物与HERG多肽通道结合和试验化合物与HERG多肽通道结合,其中所述细胞在其表面上表达具有与SEQ IDNO:2具有至少80%同一性的氨基酸序列的HERG多肽通道或其片段;
c)测量步骤a)中结合到HERG通道上的标记的参考化合物的数量;
d)测量步骤b)中结合到HERG通道上的标记的参考化合物的数量;和
e)比较步骤a)中测量的结合到HERG通道上的标记的参考化合物的数量和步骤b)中测量的结合到HERG多肽通道上的标记的参考化合物的数量。
15.一种用于筛选试验化合物的高通量亲近检测测定方法,该测定方法包括:
i)用能参与亲近检测测定方法的第一种标记进行标记的HERG;
ii)用能参与亲近检测测定方法的第二种标记进行标记的参考化合物;
iii)使步骤i)的HERG和步骤ii)的参考化合物与试验化合物一起接触,其时间足以使参考化合物与HERG结合以及试验化合物与HERG结合;和
iv)当HERG和参考化合物相互作用时,通过第一种标记与第二种标记的亲近,来检测步骤i)的HERG和步骤ii)的参考化合物之间的相互作用。
16.一种试剂盒,它包括:
a)含HERG的原料;
b)参考化合物。
17.权利要求16的试剂盒,其中含HERG的原料选自:
i)分离并纯化的蛋白质,该蛋白质编码具有与SEQ ID NO:2的氨基酸序列具有至少80%同一性的氨基酸序列的HERG或其片段;
ii)分离并纯化的蛋白质,该蛋白质编码含SEQ ID NO:2的氨基酸序列的HERG或其片段;
iii)在其表面上表达HERG多肽通道或其片段的细胞;或
iv)在其表面上表达HERG多肽通道或其片段的细胞的膜制备物。
18.权利要求16的试剂盒,其中含HERG的原料是结合到固体支持物上的分离并纯化的HERG多肽通道或其片段。
19.权利要求18的试剂盒,其中固体支持物是含固体支持物的荧光增白剂。
20.权利要求16的试剂盒,其中含HERG的原料由细胞的膜制备物组成,所述细胞在其表面上表达由SEQ ID NO:2组成的氨基酸序列编码的HERG多肽通道。
21.权利要求20的试剂盒,其中所述细胞是HEK293细胞。
22.权利要求16-21之一的试剂盒,其中参考化合物选自阿司咪唑、特非那定、红霉素、斯氟沙星、普罗布考、特罗地林和舍吲哚。
23.权利要求16-21之一的试剂盒,其中参考化合物被标记。
24.权利要求23的试剂盒,其中参考化合物被放射性标记。
25.权利要求24的试剂盒,其中参考化合物是[H3]-阿司咪唑。
26.权利要求23的试剂盒,任选地包括从温育混合物中除去过量未结合的标记的参考化合物的装置。
27.权利要求23的试剂盒,其中分离装置由GF/B过滤器组成。
28.分离并纯化的蛋白质在权利要求1-3之一的测定方法中的用途,其中所述蛋白质编码含SEQ ID NO:2的氨基酸序列的HERG或其片段。
29.分离并纯化的多核苷酸在权利要求1-3之一的测定方法中的用途,其中所述多核苷酸编码含SEQ ID NO:1的核酸序列的HERG或其片段。
30.在其表面上表达含SEQ ID NO:2的氨基酸序列的HERG多肽通道或其片段的细胞在权利要求1-3之一的测定方法中的用途。
31.在其表面上表达含SEQ ID NO:2的氨基酸序列的HERG多肽通道或其片段的细胞的膜制备物在权利要求1-3之一的测定方法中的用途。
32.在其表面上表达由SEQ ID NO:2的氨基酸序列编码的HERG多肽通道的细胞的膜制备物在权利要求1-3之一的测定方法中的用途。
33.阿司咪唑在权利要求1-3之一的测定方法中的用途。
34.标记的阿司咪唑在权利要求1-3之一的测定方法中的用途。
35.放射性标记的阿司咪唑在权利要求1-3之一的测定方法中的用途。
36.[H3]-阿司咪唑在权利要求1-3之一的测定方法中的用途。
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