CN1458170A - 具有抑癌功能的新的人蛋白及其编码序列 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了一类新的具有抑癌功能的人蛋白,编码此多肽的多核苷酸和经重组技术产生该多肽的方法。本发明还公开了此多肽用于治疗多种疾病如癌症等的方法。本发明还公开了抗此多肽的拮抗剂及其治疗作用。本发明还公开了编码这类新的具有抑癌功能的人蛋白的多核苷酸的用途。
Description
技术领域
本发明属于生物技术领域,具体地说,本发明涉及新的编码具有抑癌功能的人蛋白的多核苷酸和此多核苷酸编码的多肽。本发明还涉及此多核苷酸和多肽的用途和制备。
背景技术
人基因组学研究目前是国际上的热点,除人染色体DNA大规模测序,表达序列测序(EST)的方法外,还缺少从功能开始的筛选具有功能基因的高通量的方法。
癌症是危害人类健康的主要疾病之一。为了有效地治疗和预防肿瘤,目前人们已越来越关注肿瘤的基因治疗。因此,本领域迫切需要开发研究具有抑癌功能的人蛋白及其激动剂/抑制剂。
发明内容
本发明的目的是提供一类新的具有抑癌功能的人蛋白多肽以及其片段、类似物和衍生物。
本发明的另一目的是提供编码这些多肽的多核苷酸。
本发明的另一目的是提供生产这些多肽的方法以及该多肽和编码序列的用途。
在本发明的第一方面,提供新颖的分离出的具有抑癌功能的蛋白多肽,它包含具有选自下组的氨基酸序列的多肽:SEQ ID NO:3、6、9;或其保守性变异多肽、或其活性片段、或其活性衍生物。
较佳地,该多肽是具有选自下组的氨基酸序列的多肽:SEQ ID NO:3、6、9。
在本发明的第二方面,提供了一种分离的多核苷酸,它包含一核苷酸序列,该核苷酸序列与选自下组的一种核苷酸序列有至少85%相同性:(a)编码上述的具有抑癌功能的蛋白多肽的多核苷酸;(b)与多核苷酸(a)互补的多核苷酸。较佳地,该多核苷酸编码的多肽具有选自下组的氨基酸序列:SEQ ID NO:3、6、9。更佳地,该多核苷酸的序列选自下组:SEQ ID NO:2、5、8的编码区序列或全长序列。
在本发明的第三方面,提供了含有上述多核苷酸的载体,以及被该载体转化或转导的宿主细胞或者被上述多核苷酸直接转化或转导的宿主细胞。
在本发明的第四方面,提供了制备具有抑癌功能的蛋白活性的多肽的制备方法,该方法包含:(a)在适合表达具有抑癌功能的蛋白的条件下,培养上述被转化或转导的宿主细胞;(b)从培养物中分离出具有抑癌功能的蛋白活性的多肽。
在本发明的第五方面,提供了与上述的具有抑癌功能的蛋白多肽特异性结合的抗体。还提供了可用于检测的核酸分子,它含有上述的多核苷酸中连续10个核苷酸至全长核苷酸,较佳地它含有连续的约15-1000个核苷酸。
在本发明的第六方面,提供了一种药物组合物,它含有安全有效量的本发明的具有抑癌功能的蛋白多肽以及药学上可接受的载体。这些药物组合物可治疗癌症以及细胞异常增殖等病症。
本发明的其它方面由于本文的公开内容,对本领域的技术人员而言是显而易见的。
具体实施方式
3T3细胞是一种小鼠成纤维细胞(J.Cell.Biol.,17:299,1963)(也称为NIH/3T3细胞)。在癌症研究领域中,常将外源基因(尤其是人基因)引入3T3细胞,观察其对3T3细胞生长的影响情况。现普遍认为,对3T3细胞生长有影响的基因是癌症相关基因,其中对3T3细胞生长有抑制作用的基因大多是抑癌基因,而对3T3细胞生长有促进作用的基因大多是(原)癌基因。
本发明采用大规模cDNA克隆转染小鼠胚胎成纤维细胞,在获得具有抑癌作用的基础上,经测序证明为新的基因,进一步得到全长cDNA克隆。DNA转染试验证明,本发明的具有抑癌功能的蛋白对3T3细胞具有抑制克隆形成的作用,其抑制率≥50%。
如本文所用,“分离的”是指物质从其原始环境中分离出来(如果是天然的物质,原始环境即是天然环境)。如活体细胞内的天然状态下的多聚核苷酸和多肽是没有分离纯化的,但同样的多聚核苷酸或多肽如从天然状态中同存在的其他物质中分开,则为分离纯化的。
如本文所用,“分离的具有抑癌功能的蛋白或多肽”是指具有抑癌功能的蛋白多肽基本上不含天然与其相关的其它蛋白、脂类、糖类或其它物质。本领域的技术人员能用标准的蛋白质纯化技术纯化具有抑癌功能的蛋白。基本上纯的多肽在非还原聚丙烯酰胺凝胶上能产生单一的主带。
本发明的多肽可以是重组多肽、天然多肽、合成多肽,优选重组多肽。本发明的多肽可以是天然纯化的产物,或是化学合成的产物,或使用重组技术从原核或真核宿主(例如,细菌、酵母、高等植物、昆虫和哺乳动物细胞)中产生。根据重组生产方案所用的宿主,本发明的多肽可以是糖基化的,或可以是非糖基化的。本发明的多肽还可包括或不包括起始的甲硫氨酸残基。
本发明还包括具有抑癌功能的人蛋白的片段、衍生物和类似物。如本文所用,术语“片段”、“衍生物”和“类似物”是指基本上保持本发明的天然具有抑癌功能的人蛋白相同的生物学功能或活性的多肽。本发明的多肽片段、衍生物或类似物可以是(i)有一个或多个保守或非保守性氨基酸残基(优选保守性氨基酸残基)被取代的多肽,而这样的取代的氨基酸残基可以是也可以不是由遗传密码编码的,或(ii)在一个或多个氨基酸残基中具有取代基团的多肽,或(iii)成熟多肽与另一个化合物(比如延长多肽半衰期的化合物,例如聚乙二醇)融合所形成的多肽,或(iv)附加的氨基酸序列融合到此多肽序列而形成的多肽(如前导序列或分泌序列或用来纯化此多肽的序列或蛋白原序列)。根据本文的教导,这些片段、衍生物和类似物属于本领域熟练技术人员公知的范围。
本发明的多核苷酸可以是DNA形式或RNA形式。DNA形式包括cDNA、基因组DNA或人工合成的DNA。DNA可以是单链的或是双链的。DNA可以是编码链或非编码链。以FP3361蛋白(在本申请中,蛋白质的命名采用其克隆编号)为例,编码成熟多肽的编码区序列可以与SEQ ID NO:2所示的编码区序列相同或者是简并的变异体。如本文所用,“简并的变异体”对于FP3361而言是指编码具有SEQ ID NO:3的蛋白质,但与SEQ ID NO:2所示的编码区序列有差别的核酸序列。再以FP7072蛋白为例,编码成熟多肽的编码区序列可以与SEQ ID NO:5所示的编码区序列相同或者是简并的变异体;“简并的变异体”对于FP7072而言是指编码具有SEQ ID NO:6的蛋白质,但与SEQ ID NO:5所示的编码区序列有差别的核酸序列。对于本发明的其他具有抑癌功能的蛋白,可依此类推。
编码成熟多肽的多核苷酸包括:只编码成熟多肽的编码序列;成熟多肽的编码序列和各种附加编码序列;成熟多肽的编码序列(和任选的附加编码序列)以及非编码序列。
术语“编码多肽的多核苷酸”可以是包括编码此多肽的多核苷酸,也可以是还包括附加编码和/或非编码序列的多核苷酸。
本发明还涉及上述多核苷酸的变异体,其编码与本发明有相同的氨基酸序列的多肽或多肽的片段、类似物和衍生物。此多核苷酸的变异体可以是天然发生的等位变异体或非天然发生的变异体。这些核苷酸变异体包括取代变异体、缺失变异体和插入变异体。如本领域所知的,等位变异体是一个多核苷酸的替换形式,它可能是一个或多个核苷酸的取代、缺失或插入,但不会从实质上改变其编码的多肽的功能。
本发明还涉及与上述的序列杂交且两个序列之间具有至少50%,较佳地至少70%,更佳地至少80%相同性的多核苷酸。本发明特别涉及在严格条件下与本发明所述多核苷酸可杂交的多核苷酸。在本发明中,“严格条件”是指:(1)在较低离子强度和较高温度下的杂交和洗脱,如0.2×SSC,0.1%SDS,60℃;或(2)杂交时加有变性剂,如50%(v/v)甲酰胺,0.1%小牛血清/0.1%Ficoll,42℃等;或(3)仅在两条序列之间的相同性至少在95%以上,更好是97%以上时才发生杂交。并且,可杂交的多核苷酸编码的多肽与SEQ IDNO:3所示的成熟多肽具有相同的生物学功能(以FP3361蛋白为例)和活性。
本发明还涉及与上述的序列杂交的核酸片段。如本文所用,“核酸片段”的长度至少含15个核苷酸,较好是至少30个核苷酸,更好是至少50个核苷酸,最好是至少100个核苷酸以上。核酸片段可用于核酸的扩增技术(如PCR)以确定和/或分离编码具有抑癌功能的蛋白的多聚核苷酸。
本发明中的多肽和多核苷酸优选以分离的形式提供,更佳地被纯化至均质。
本发明的DNA序列能用几种方法获得。例如,用本领域熟知的杂交技术分离DNA。这些技术包括但不局限于:1)用探针与基因组或cDNA文库杂交以检出同源性核苷酸序列,和2)表达文库的抗体筛选以检出具有共同结构特征的克隆的DNA片段。
编码具有抑癌功能的蛋白的特异DNA片段序列产生也能用下列方法获得:1)从基因组DNA分离双链DNA序列;2)化学合成DNA序列以获得所需多肽的双链DNA。
当需要的多肽产物的整个氨基酸序列已知时,DNA序列的直接化学合成是经常选用的方法。如果所需的氨基酸的整个序列不清楚时,DNA序列的直接化学合成是不可能的,选用的方法是cDNA序列的分离。分离感兴趣的cDNA的标准方法是从高表达该基因的供体细胞分离mRNA并进行逆转录,形成质粒或噬菌体cDNA文库。提取mRNA的方法已有多种成熟的技术,试剂盒也可从商业途径获得(Qiagene)。而构建cDNA文库也是通常的方法(Sambrook,et al.,Molecular Cloning,A Laboratory Manual,Cold SpringHarbor Laboratory.New York,1989)。还可得到商业供应的cDNA文库,如Clontech公司的不同cDNA文库。当结合使用聚合酶反应技术时,即使极少的表达产物也能克隆。
可用常规方法从这些cDNA文库中筛选本发明的基因。这些方法包括(但不限于):(1)DNA-DNA或DNA-RNA杂交;(2)标志基因的功能出现或丧失;(3)测定具有抑癌功能的蛋白的转录本的水平;(4)通过免疫学技术或测定生物学活性,来检测基因表达的蛋白产物。上述方法可单用,也可多种方法联合应用。
在第(1)种方法中,杂交所用的探针是与本发明的多核苷酸的任何一部分同源,其长度至少15个核苷酸,较好是至少30个核苷酸,更好是至少50个核苷酸,最好是至少100个核苷酸。此外,探针的长度通常在2kb之内,较佳地为1kb之内。此处所用的探针通常是在本发明的基因DNA序列信息的基础上化学合成的DNA序列。本发明的基因本身或者片段当然可以用作探针。DNA探针的标记可用放射性同位素,荧光素或酶(如碱性磷酸酶)等。
在第(4)种方法中,检测具有抑癌功能的蛋白基因表达的蛋白产物可用免疫学技术如Western印迹法,放射免疫沉淀法,酶联免疫吸附法(ELISA)等。
应用PCR技术扩增DNA/RNA的方法(Saiki,et al.Science 1985;230:1350-1354)被优选用于获得本发明的基因。特别是很难从文库中得到全长的cDNA时,可优选使用RACE法(RACE-cDNA末端快速扩增法),用于PCR的引物可根据本文所公开的本发明的序列信息适当地选择,并可用常规方法合成。可用常规方法如通过凝胶电泳分离和纯化扩增的DNA/RNA片段。
如上所述得到的本发明的基因,或者各种DNA片段等的核苷酸序列的测定可用常规方法如双脱氧链终止法(Sanger et al.PNAS,1977,74:5463-5467)。这类核苷酸序列测定也可用商业测序试剂盒等。为了获得全长的cDNA序列,测序需反复进行。有时需要测定多个克隆的cDNA序列,才能拼接成全长的cDNA序列。
本发明也涉及包含本发明多核苷酸的载体,以及用本发明载体或具有抑癌功能的蛋白编码序列经基因工程产生的宿主细胞,以及经重组技术产生本发明所述多肽的方法。
通过常规的重组DNA技术,可利用本发明的多聚核苷酸序列可用来表达或生产重组的具有抑癌功能的蛋白多肽。一般来说有以下步骤:
(1).用本发明的编码具有抑癌功能的人蛋白的多核苷酸(或变异体),或用含有该多核苷酸的重组表达载体转化或转导合适的宿主细胞;
(2).在合适的培养基中培养的宿主细胞;
(3).从培养基或细胞中分离、纯化蛋白质。
本发明中,具有抑癌功能的人蛋白多核苷酸序列可插入到重组表达载体中。术语“重组表达载体”指本领域熟知的细菌质粒、噬菌体、酵母质粒、植物细胞病毒、哺乳动物细胞病毒如腺病毒、逆转录病毒或其他载体。在本发明中适用的载体包括但不限于:在细菌中表达的基于T7的表达载体;在哺乳动物细胞中表达的pMSXND表达载体和在昆虫细胞中表达的来源于杆状病毒的载体。总之,只要能在宿主体内复制和稳定,任何质粒和载体都可以用。表达载体的一个重要特征是通常含有复制起点、启动子、标记基因和翻译控制元件。
本领域的技术人员熟知的方法能用于构建含具有抑癌功能的人蛋白编码DNA序列和合适的转录/翻译控制信号的表达载体。这些方法包括体外重组DNA技术、DNA合成技术、体内重组技术等。所述的DNA序列可有效连接到表达载体中的适当启动子上,以指导mRNA合成。这些启动子的代表性例子有:大肠杆菌的lac或trp启动子;λ噬菌体PL启动子;真核启动子包括CMV立即早期启动子、早期和晚期SV40启动子、反转录病毒的LTRs和其他一些已知的可控制基因在原核或真核细胞或其病毒中表达的启动子。表达载体还包括翻译起始用的核糖体结合位点和转录终止子。
此外,表达载体优选地包含一个或多个选择性标记基因,以提供用于选择转化的宿主细胞的表型性状,如真核细胞培养用的二氢叶酸还原酶、新霉素抗性以及绿色荧光蛋白(GFP),或用于大肠杆菌的四环素或氨苄青霉素抗性。
包含上述的适当DNA序列以及适当启动子或者控制序列的载体,可以用于转化适当的宿主细胞,以使其能够表达蛋白质。
宿主细胞可以是原核细胞,如细菌细胞;或是低等真核细胞,如酵母细胞;或是高等真核细胞,如哺乳动物细胞。代表性例子有:大肠杆菌,链霉菌属;鼠伤寒沙门氏菌的细菌细胞;真菌细胞如酵母;植物细胞;果蝇S2或Sf9的昆虫细胞;CHO、COS或Bowes黑素瘤细胞的动物细胞等。
本发明的多核苷酸在高等真核细胞中表达时,如果在载体中插入增强子序列时将会使转录得到增强。增强子是DNA的顺式作用因子,通常大约有10到300个碱基对,作用于启动子以增强基因的转录。可举的例子包括在复制起始点晚期一侧的100到270个碱基对的SV40增强子、在复制起始点晚期一侧的多瘤增强子以及腺病毒增强子等。
本领域一般技术人员都清楚如何选择适当的载体、启动子、增强子和宿主细胞。
用重组DNA转化宿主细胞可用本领域技术人员熟知的常规技术进行。当宿主为原核生物如大肠杆菌时,能吸收DNA的感受态细胞可在指数生长期后收获,用CaCl2法处理,所用的步骤在本领域众所周知。可供选择的是用MgCl2。如果需要,转化也可用电穿孔的方法进行。当宿主是真核生物,可选用如下的DNA转染方法:磷酸钙共沉淀法,常规机械方法如显微注射、电穿孔、脂质体包装等。
获得的转化子可以用常规方法培养,表达本发明的基因所编码的多肽。根据所用的宿主细胞,培养中所用的培养基可选自各种常规培养基。在适于宿主细胞生长的条件下进行培养。当宿主细胞生长到适当的细胞密度后,用合适的方法(如温度转换或化学诱导)诱导选择的启动子,将细胞再培养一段时间。
在上面的方法中的重组多肽可包被于细胞内、细胞外或在细胞膜上表达或分泌到细胞外。如果需要,可利用其物理的、化学的和其它特性通过各种分离方法分离和纯化重组的蛋白。这些方法是本领域技术人员所熟知的。这些方法的例子包括但并不限于:常规的复性处理、用蛋白沉淀剂处理(盐析方法)、离心、渗透破菌、超处理、超离心、分子筛层析(凝胶过滤)、吸附层析、离子交换层析、高效液相层析(HPLC)和其它各种液相层析技术及这些方法的结合。
重组的具有抑癌功能的人蛋白或多肽有多方面的用途。这些用途包括(但不限于):直接做为药物治疗具有抑癌功能的蛋白功能低下或丧失所致的疾病,和用于筛选促进或对抗具有抑癌功能的蛋白功能的抗体、多肽或其它配体。例如,抗体可用于激活或抑制具有抑癌功能的人蛋白的功能。用表达的重组具有抑癌功能的人蛋白筛选多肽库可用于寻找有治疗价值的能抑制或刺激具有抑癌功能的人蛋白功能的多肽分子。
本发明也提供了筛选药物以鉴定提高(激动剂)或阻遏(拮抗剂)具有抑癌功能的人蛋白的药剂的方法。激动剂提高具有抑癌功能的人蛋白刺激细胞增殖等生物功能,而拮抗剂阻止和治疗与细胞过度增殖有关的紊乱如各种癌症。例如,能在药物的存在下,将哺乳动物细胞或表达具有抑癌功能的人蛋白的膜制剂与标记的具有抑癌功能的人蛋白一起培养。然后测定药物提高或阻遏此相互作用的能力。
具有抑癌功能的人蛋白的拮抗剂包括筛选出的抗体、化合物、受体缺失物和类似物等。具有抑癌功能的人蛋白的拮抗剂可以与具有抑癌功能的人蛋白结合并消除其功能,或是抑制具有抑癌功能的人蛋白的产生,或是与多肽的活性位点结合使多肽不能发挥生物学功能。具有抑癌功能的人蛋白的拮抗剂可用于治疗用途。
在筛选作为拮抗剂的化合物时,可以将本发明蛋白加入生物分析测定中,通过测定化合物影响具有抑癌功能的蛋白和其受体之间的相互作用来确定化合物是否是拮抗剂。用上述筛选化合物的同样方法,可以筛选出起拮抗剂作用的受体缺失物和类似物。
本发明的多肽可直接用于疾病治疗,例如,各种恶性肿瘤、和细胞异常增殖等。
本发明的多肽,及其片段、衍生物、类似物或它们的细胞可以用来作为抗原以生产抗体。这些抗体可以是多克隆或单克隆抗体。多克隆抗体可以通过将此多肽直接注射动物的方法得到。制备单克隆抗体的技术包括杂交瘤技术,三瘤技术,人B-细胞杂交瘤技术,EBV-杂交瘤技术等。
可以将本发明的多肽和拮抗剂与合适的药物载体组合后使用。这些载体可以是水、葡萄糖、乙醇、盐类、缓冲液、甘油以及它们的组合。组合物包含安全有效量的多肽或拮抗剂以及不影响药物效果的载体和赋形剂。这些组合物可以作为药物用于疾病治疗。
本发明还提供含有一种或多种容器的药盒或试剂盒,容器中装有一种或多种本发明的药用组合物成分。与这些容器一起,可以有由制造、使用或销售药品或生物制品的政府管理机构所给出的指示性提示,该提示反映出生产、使用或销售的政府管理机构许可其在人体上施用。此外,本发明的多肽可以与其它的治疗化合物结合使用。
药物组合物可以以方便的方式给药,如通过局部、静脉内、腹膜内、肌内、皮下、鼻内或皮内的给药途径。具有抑癌功能的蛋白以有效地治疗和/或预防具体的适应症的量来给药。施用于患者的具有抑癌功能的蛋白的量和剂量范围将取决于许多因素,如给药方式、待治疗者的健康条件和诊断医生的判断。
具有抑癌功能的人蛋白的多聚核苷酸也可用于多种治疗目的。基因治疗技术可用于治疗由于具有抑癌功能的蛋白的无表达或异常/无活性的具有抑癌功能的蛋白的表达所致的细胞增殖、发育或代谢异常。重组的基因治疗载体可用于治疗具有抑癌功能的蛋白表达或活性异常所致的疾病。来源于病毒的表达载体如逆转录病毒、腺病毒、腺病毒相关病毒、单纯疱疹病毒、细小病毒等可用于将具有抑癌功能的蛋白基因转移至细胞内。构建携带具有抑癌功能的蛋白基因的重组病毒载体的方法可见于已有文献(Sambrook,etal.)。另外重组具有抑癌功能的人蛋白基因可包装到脂质体中转移至细胞内。
抑制具有抑癌功能的人蛋白mRNA的寡聚核苷酸(包括反义RNA和DNA)以及核酶也在本发明的范围之内。核酶是一种能特异性分解特定RNA的酶样RNA分子,其作用机制是核酶分子与互补的靶RNA特异性杂交后进行核酸内切作用。反义的RNA和DNA及核酶可用已有的任何RNA或DNA合成技术获得,如固相磷酸酰胺化学合成法合成寡核苷酸的技术已广泛应用。反义RNA分子可通过编码该RNA的DNA序列在体外或体内转录获得。这种DNA序列已整合到载体的RNA聚合酶启动子的下游。为了增加核酸分子的稳定性,可用多种方法对其进行修饰,如增加两侧的序列长度,核糖核苷之间的连接应用磷酸硫酯键或肽键而非磷酸二酯键。
多聚核苷酸导入组织或细胞内的方法包括:将多聚核苷酸直接注入到体内组织中;或在体外通过载体(如病毒、噬菌体或质粒等)先将多聚核苷酸导入细胞中,再将细胞移植到体内等。
本发明的多肽还可用作肽谱分析,例如,多肽可用物理的、化学或酶进行特异性切割,并进行一维或二维或三维的凝胶电泳分析。
本发明还提供了针对具有抑癌功能的人蛋白抗原决定簇的抗体。这些抗体包括(但不限于):多克隆抗体、单克隆抗体、嵌合抗体、单链抗体、Fab片段和Fab表达文库产生的片段。这些抗体可用常规方法制备。抗具有抑癌功能的人蛋白的抗体可用于免疫组织化学技术中,检测活检标本中的具有抑癌功能的人蛋白。
与具有抑癌功能的人蛋白结合的单克隆抗体也可用放射性同位素标记,注入体内可跟踪其位置和分布。本发明中的抗体可用于治疗或预防与具有抑癌功能的人蛋白相关的疾病。给予适当剂量的抗体可以刺激或阻断具有抑癌功能的人蛋白的产生或活性。
抗体也可用于设计针对体内某一特殊部位的免疫毒素。如具有抑癌功能的人蛋白高亲和性的单克隆抗体可与细菌或植物毒素(如白喉毒素,蓖麻蛋白,红豆碱等)共价结合。
多克隆抗体的生产可用具有抑癌功能的人蛋白或多肽免疫动物,如家兔,小鼠,大鼠等。多种佐剂可用于增强免疫反应,包括但不限于弗氏佐剂等。
具有抑癌功能的人蛋白单克隆抗体可用杂交瘤技术生产(Kohler and Milstein.Nature,1975,256:495-497)。将人恒定区和非人源的可变区结合的嵌合抗体可用已有的技术生产(Morrison et al,PNAS,1985,81:6851)。而已有的生产单链抗体的技术(U.S.PatNo.4946778)也可用于生产抗具有抑癌功能的人蛋白的单链抗体。
能与本发明蛋白结合的多肽分子可通过筛选由各种可能组合的氨基酸结合于固相物组成的随机多肽库而获得。筛选时,必须对具有抑癌功能的人蛋白分子进行标记。
本发明还涉及定量和定位检测具有抑癌功能的人蛋白水平的诊断试验方法。这些试验是本领域所熟知的,且包括FISH测定和放射免疫测定。试验中所检测的具有抑癌功能的人蛋白水平,可以用作解释具有抑癌功能的人蛋白在各种疾病中的重要性和用于诊断具有抑癌功能的蛋白起作用的疾病。
具有抑癌功能的蛋白的多聚核苷酸可用于具有抑癌功能的蛋白相关疾病的诊断和治疗。在诊断方面,具有抑癌功能的蛋白的多聚核苷酸可用于检测具有抑癌功能的蛋白的表达与否或在疾病状态下具有抑癌功能的蛋白的异常表达。如具有抑癌功能的蛋白DNA序列可用于对活检标本的杂交以判断具有抑癌功能的蛋白的表达异常。杂交技术包括Southern印迹法,Northern印迹法、原位杂交等。这些技术方法都是公开的成熟技术,相关的试剂盒都可从商业途径得到。本发明的多核苷酸的一部分或全部可作为探针固定在微阵列(Microarray)或DNA芯片(又称为“基因芯片”)上,用于分析组织中基因的差异表达分析和基因诊断。用具有抑癌功能的蛋白特异的引物进行RNA-聚合酶链反应(RT-PCR)体外扩增也可检测具有抑癌功能的蛋白的转录产物。
检测具有抑癌功能的蛋白基因的突变也可用于诊断具有抑癌功能的蛋白相关的疾病。具有抑癌功能的蛋白突变的形式包括与正常野生型具有抑癌功能的蛋白DNA序列相比的点突变、易位、缺失、重组和其它任何异常等。可用已有的技术如Southern印迹法、DNA序列分析、PCR和原位杂交检测突变。另外,突变有可能影响蛋白的表达,因此用Northern印迹法、Western印迹法可间接判断基因有无突变。
本发明的序列对染色体鉴定也是有价值的。这些序列会特异性地针对某条人染色体具体位置且并可以与其杂交。目前,需要鉴定染色体上的各基因的具体位点。然而现在只有很少的基于实际序列数据(重复多态性)的染色体标记物可用于标记染色体位置。为了将这些序列与疾病相关基因相关联。第一步就是将本发明DNA序列定位于染色体上。
简而言之,根据cDNA制备PCR引物(优选15-35bp),可以将序列定位于染色体上。然后,将这些引物用于PCR筛选含各条人染色体的体细胞杂合细胞。只有那些含有相应于引物的人基因的杂合细胞会产生扩增的片段。
体细胞杂合细胞的PCR定位法,是将DNA定位到具体染色体的快捷方法。使用本发明的的寡核苷酸引物,通过类似方法,可利用一组来自特定染色体的片段或大量基因组克隆而实现亚定位。可用于染色体定位的其它类似策略包括原位杂交、用标记的流式分选的染色体预筛选和杂交预选,从而构建染色体特异的cDNA库。
将cDNA克隆与中期染色体进行荧光原位杂交(FISH),可以在一个步骤中精确地进行染色体定位。此技术的综述,参见Verma等,Human Chromosomes:a Manual of BasicTechniques,Pergamon Press,New York(1988)。
一旦序列被定位到准确的染色体位置,此序列在染色体上的物理位置就可以与基因图数据相关联。这些数据可见于例如,V.Mckusick,Mendelian Inheritance in Man(可通过与Johns Hopkins University Welch Medical Library联机获得)。然后可通过连锁分析,确定基因与业已定位到染色体区域上的疾病之间的关系。
接着,需要测定患病和未患病个体间的cDNA或基因组序列差异。如果在一些或所有的患病个体中观察到某突变,而该突变在任何正常个体中未观察到,则该突变可能是疾病的病因。比较患病和未患病个体,通常涉及首先寻找染色体中结构的变化,如从染色体水平可见的或用基于cDNA序列的PCR可检测的缺失或易位。
本发明的具有抑癌功能的蛋白核苷酸全长序列或其片段通常可以用PCR扩增法、重组法或人工合成的方法获得。对于PCR扩增法,可根据本发明所公开的有关核苷酸序列,尤其是开放阅读框序列来设计引物,并用市售的cDNA库或按本领域技术人员已知的常规方法所制备的cDNA库作为模板,扩增而得有关序列。当序列较长时,常常需要进行两次或多次PCR扩增,然后再将各次扩增出的片段按正确次序拼接在一起。
一旦获得了有关的序列,就可以用重组法来大批量地获得有关序列。这通常是将其克隆入载体,再转入细胞,然后通过常规方法从增殖后的宿主细胞中分离得到有关序列。
此外,还可用人工合成的方法来合成有关序列,尤其是片段长度较短时。通常,通过先合成多个小片段,然后再进行连接可获得序列很长的片段。
目前,已经可以完全通过化学合成来编码本发明蛋白(或其片段,或其衍生物)的DNA序列。然后可将该DNA序列引入本领域中的各种DNA分子(如载体)和细胞中。此外,还可通过化学合成将突变引入本发明蛋白序列中。
此外,由于本发明的具有抑癌功能的蛋白具有源自人的天然氨基酸序列,因此,与来源于其他物种的同族蛋白相比,预计在施用于人时将具有更高的活性和/或更低的副作用(例如在人体内的免疫原性更低或没有)。
下面结合具体实施例,进一步阐述本发明。应理解,这些实施例仅用于说明本发明而不用于限制本发明的范围。下列实施例中未注明具体条件的实验方法,通常按照常规条件如Sambrook等人,分子克隆:实验室手册(New York:Cold Spring Harbor LaboratoryPress,1989)中所述的条件,或按照制造厂商所建议的条件。
实施例1:cDNA基因的获得及对小鼠NIH/3T3细胞克隆形成的抑制作用
FP3361、FP7072和FP8080来自于用常规方法构建的人胎儿cDNA文库。取3、6、9月龄的胎儿组织,用Trizol试剂(GIBCO BRL公司)按厂方说明书提取总RNA,用mRNA提纯试剂盒(Pharmacia公司)提取mRNA。用pCMV-script TMXR cDNA文库构建试剂盒(Stratagene公司)构建上述mRNA的cDNA文库。其中反转录酶改用MMLV-RT-Superscript II(GIBCO BRL),反转录反应在42℃进行。转化XL 10-Gold感受细胞,获得了1×106cfu/μg滴度的cDNA文库。第一轮随机挑取cDNA克隆,其后以高丰度cDNA克隆和已证明有抑制癌细胞生长功能的cDNA克隆为探针,杂交筛选cDNA文库,挑取弱阳性及阴性克隆。用Qiagen 96孔板质粒抽提试剂盒,按厂家说明书进行质粒DNA的提取。质粒DNA和空载体同时转染小鼠NIH/3T3细胞。100ng DNA酒精沉淀干燥后,加6μlH2O溶解,待转染。每份DNA样品中加0.74μl脂质体及9.3μl无血清培液,混匀后,室温放置10分钟。每管中加150μl无血清培液,均分加入3孔生长于96孔板的小鼠NIH/3T3细胞中,37℃放置2小时,每孔再加50μl无血清培液,37℃24小时。每孔换100μl全培液,37℃24小时,换含G418的全培液100μl,37℃24-48小时,边观察,边换G418浓度不等的培液。约2-3次后,直到镜检细胞有克隆形成,计数。发现上述克隆有抑制细胞克隆形成作用,结果如下表所示。
cDNA克隆转染细胞(3T3)克隆形成情况
cDNA克隆名称 | cDNA克隆数(三个重复) | 空载体克隆数(三个重复) | ||||
FP3361 | 7 | 6 | 3 | 30 | 32 | 29 |
FP7072 | 2 | 0 | 5 | 21 | 28 | 20 |
FP8080 | 3 | 1 | 2 | 21 | 25 | 27 |
对cDNA克隆采用双脱氧终止法,在ABI377 DNA自动测序仪上测定其一端近500bp的核苷酸序列。分析后,确定为新基因克隆,进行另一端测序,如仍未获得全长cDNA序列,则设计引物,再次进行测序,直到获得全长序列(SEQ ID NO:1、4、7)。
实施例2:从胎盘或胎儿cDNA中PCR获得全长基因:
取3、6、9月龄的胎儿组织(FP克隆),用Trizol试剂(GIBCO BRL公司)按厂方说明书提取总RNA,用mRNA提纯试剂盒(Pharmacia公司)提取mRNA。用MMLV-RT-Superscript II(GIBCO BRL),反转录酶在42℃进行反转录反应,获得胎盘或胎儿cDNA。利用各个基因的特异引物(如下表所示),按97℃3′,1个循环。94℃30″,60℃30″,72℃1′,共35个循环;72℃10′,1个循环进行PCR扩增,获得含有完整开放阅读框序列的各蛋白基因的扩增产物。扩增产物经测序验证,与实施例1测得的序列相符,随后用常规技术将扩增产物转入宿主细胞,获得重组蛋白(SEQ ID NO:3、6、9)。
基因特异引物
注:括号内为引物在各基因DNA序列中的对应位置。
克隆名称 | 特异引物1(5’→3’) | SEQ IDNO: | 特异引物2(3’→5’) | SEQ IDNO: |
FP3361 | (10)atgatggtcaggctggtcaa | 10 | (2947)tcgaaagtacaacgctttattgaa | 11 |
FP7072 | (27)ggccgttgacctggtgac | 12 | (2192)aaagcaaatgtattcttcctcca | 13 |
FP8080 | (44)tttcaatcccagtctgcctc | 14 | (2886)ggctggcgctattgtttatt | 15 |
实施例3:cDNA克隆序列分析
1.FP3361蛋白
A:核苷酸序列(SEQ ID NO:1)长度:3046个碱基1 GGTTTCACCA TGATGGTCAG GCTGGTCAAG ATCTCCTGAC CTCAAGTGAT CTGCCCGCCT61 CGGCCTCCCA AAGTGCTGGG ATTACAGACA TGAACCACAA CACCTGCCAA GCCCAGGTGT121 TTTGAATCCA GCACGGGCAA TGGCAAGACC CTGTCCCAAC AAACAAAAAA ACACTGGTGC181 CTGAGGCCCA CCCCGAGAGA TTCTGATTGA GTTGATTTGG ATTTGAATTA TCTTTAAAAT241 TTTGGATGTG AATTTTTTTT TTTTTTCTTG GAATGGAGTT TCACTCTTGT TCCCCAGGCT301 GGAGTGCAAC GGGACGATCT TGGCTCACCG CAACCTCCGC CTACTGGGTT CAAGCCATTC361 TCCTGCCTCA GCTTCCCAAG TAGCTGGGAT TACAGGCATG TGCTACCATG CCCAGCTAAT421 TTTGTATTTT TAGTAGAGAC AGGGTTTCTC CATGTTGCTC AGGCTGGTCT TGAACTCCTG481 ACCTCAGGTG ATCCGCCCGC CTCGGACTCC CAAAGTGCTG GGATTACAGG CATGAGCCAC541 CATGCCTGGC CGGATGTGAA TTATCTTAAA AATTTTCAGG TAATTCTAAT GGGCCAAGGT601 TGAGAACCCC TGCTCTGGGC CCATCCGAGC ACCAGGCTGT CACAAACGCA TGCATGCACT661 CACGCCCGTG GGCTTGGGGG GCTTCGGAAA TGTGCTTCTG CTTTTTTGAG ATGGGGTCTT721 TCTGTTGCCC ATCCCGGAGC ACAGTGGCAC GATCACAGCT CACTGCAGCC TCGACCTCCT781 GGGCTCAGGT GATCCTCCCG CCTCAGCCTC CTGAGTGTCT GCTTCTGGTT TTCATGATGA841 CCTGGGGCCC AGGCATACTA CACTTGTGCT GTTCAGGGGC CAGTCCTGCA CCAGGAGCCC901 ATCAGCCACA GCTCCGCCGA GAAGCACTGA TATGCAGAGC TAAGCAGCTT TGTTTCCACG961 TGGATCCTGC GTAGGTTTTC TTGGTCCATC CGTAGACACC GCACTCCTGC AGAGGATCTT1021 CTCGGGATGC CCCACTGTCT CTGTTTTCCC TCTTCACTGA ACACTCAGTC GGGGCTCGCC1081 ATGATGCCTC TGTGTCTGCT GGCTTCTCCC CCATTGGAAC AGCCTTCTTG GCACGCCACA1141 CTGCTAGCTG CTGGGCACTG TGCTTTCTGC CTTTACCGTT CTGCCGTGAT GTTGCCAAAA1201 TAGCAGCAAC AACAACAACA ACAAAGGCTG GGCACCTGGC TCATGCCTGT ATTCCCAGCA1261 GTTCGAGATC AGCCTGGGCA ACATGGTGAG ACCCTATCTC TACAAAAATA AAAAATGAAA1321 TGAGCTGGGT GGGGTGGCGC ATGCATGCCT GTGGTCCCAG CTACTTGGGA GGCTGAGGTC1381 GGAAGCTCGC TGGTCGGAAG ATCGCTGGAG CTTAGCCTTG AGGTCAAGGT TGCAGTGAGC1441 CGAGATTACA TCACTGCACT CCAGCGTGGG AGACAGAGAC CCTGTATTAA CAAACAAAAA1501 CACAAACCAC AAAGGGCAGG TCTGAAACTG CCATTTAAAA AAAAATTTGA TAAACTTAAA1561 AAAATATATA TCCACAGATG CAGGTGAAGA ACCTGTTGTC TTCCTCAAGC CTCTTTTTCA1621 CCCATGGGTG GAAATGGTGC CCTGGACACC CAGGCCCACG AGGTCTTTGC GTGGGGTCCC1681 TACACAGGGC TTTAGCTTAC ACTGTGCTGC CCTCCTGTCC CCCGAGTTCC CAGTCTGTCA1741 AAATCCAACC TGGTCTCCCA GGCCCAGGGC AAATGCCACC TCCTCCATGA AGCCTGCCAC1801 ATCCTTTGCA CACCCTTGGG CGCTGACCTT GTTCTCCCAG CGCACAGGCA CGGGTAGTTT1861 GCCCCTGTAG TAGTAACTCA GGCACAAAAC GAACTCTTGC TGAGGCTCGG CCGCGCAGAG1921 CTGAGGGTTG CCGCTTCCAG GTTCAAGTGC ATTTTGAGTT TCATTCCCAG CTTCCTTCTT1981 TTTCTGGTCT TTAATTTCTT CTCCGGATTA GGTCCCACTC AATGCTTTCC TTCTCAATTT2041 CCAAAAGAGT ATGGTCAGAG CCAGCAGCAC ACCACCTTCC CCATGGGTGG GGGGGGGGCC2101 AGCCTGTGGC GGGGGTGCGG GTCCCATCTT TTCGAAGGAA TTGACCCACA GTGGGCGGGT2161 CCACCTTTGA CCTTGCCCCA GGGAGCGCAG ACAGAAAAAA GATCCTTGCT TAGTTTGAGG2221 GGCCGCTGGG GTGCTCGGTT TGTCTTCAGA GGCCTGTCTG TAACACCAAT GCCAACCCGG2281 TGGCACTGAC TGGTCACCCT GAAGGCCACG GCCAGTGTCC TAGGAAGGGA CTCAATTTCT2341 AGCTGTGCCA CCTGAGATTC TGGGGTTAGG CTGGTTGTGC TTCTGAAGTT CCACTGTGCT2401 CAAAGTGCTT GGTGAAAGTT AGCGAAGGTG ATTTTACAAA AATAGATGCA TAAAATGTCT2461 AGGAAACACA AAAAATCCTC ATTACTCTTC TCTCCAAATA TTTTTTAAGC CCCAACTGGA2521 CCCTAGGCAA AAGTGAGTGG CACTCCTCTG CCAGGACTCC AGGCAAGCCC CGGCATCTTC2581 TTGCTGCCGT CCCAGACAAC AGAAGTTACC AGATGAACAG ACTTGGATGG GCCACGGGGG2641 TGGAGAGCTG GAAAGCTTGG CTGTGCCTCT CGATGATGAT TAAGATTTCA ATATTTACAG2701 CAAAACCACA AAGCAAATGA TAGAATAAAG CAAAACAATG GAAAATGTGA GTTCACTCGT2761 GAGAGAGGTA CGTATGTGAG CTCTGAGGAA ATTACAGAGG GAACGCATGC AGCGGGACAG2821 CTCTCCCAAT CGCAGCGTGC AAAGTAGACA TCCATAGTGT CTTTTGAAAA ATGAAAAACA2881 CATTACTTTG AACAGCCAAG AAAAAAATTG CAATTTATTA AGATTCAATA AAGCGTTGTA2941 CTTTCGAAAG CCAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA3001 AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAB:氨基酸序列(SEQ ID NO:3)长度:106个氨基酸1 MHSRPWAWGA SEMCFCFFEM GSFCCPSRST VARSQLTAAS TSWAQVILPP QPPECLLLVF61 MMTWGPGILH LCCSGASPAP GAHQPQLRRE ALICRAKQLC FHVDPAC.核苷酸及氨基酸组合序列(SEQ ID NO:2)克隆号和蛋白名称:FP3361起始编码子:654 ATG终止编码子:972 TAG蛋白质分子量:11650.08Da1 GG TTT CAC CAT GAT GGT CAG GCT GGT CAA GAT CTC CTG ACC TCA AGT GAT CTG CCC GCC 5960 TCG GCC TCC CAA AGT GCT GGG ATT ACA GAC ATG AAC CAC AAC ACC TGC CAA GCC CAG GTG 119120 TTT TGA ATC CAG CAC GGG CAA TGG CAA GAC CCT GTC CCA ACA AAC AAA AAA ACA CTG GTG 179180 CCT GAG GCC CAC CCC GAG AGA TTC TGA TTG AGT TGA TTT GGA TTT GAA TTA TCT TTA AAA 239240 TTT TGG ATG TGA ATT TTT TTT TTT TTT CTT GGA ATG GAG TTT CAC TCT TGT TCC CCA GGC 299300 TGG AGT GCA ACG GGA CGA TCT TGG CTC ACC GCA ACC TCC GCC TAC TGG GTT CAA GCC ATT 359360 CTC CTG CCT CAG CTT CCC AAG TAG CTG GGA TTA CAG GCA TGT GCT ACC ATG CCC AGC TAA 419420 TTT TGT ATT TTT AGT AGA GAC AGG GTT TCT CCA TGT TGC TCA GGC TGG TCT TGA ACT CCT 479480 GAC CTC AGG TGA TCC GCC CGC CTC GGA CTC CCA AAG TGC TGG GAT TAC AGG CAT GAG CCA 539540 CCA TGG CTG GCC GGA TGT GAA TTA TCT TAA AAA TTT TCA GGT AAT TCT AAT GGG CCA AGG 599600 TTG AGA ACC CCT GCT CTG GGC CCA TCC GAG CAC CAG GCT GTC ACA AAC GCA TGC ATG CAC 6591 Met His 2660 TCA CGC CCG TGG GCT TGG GGG GCT TCG GAA ATG TGC TTC TGC TTT TTT GAG ATG GGG TCT 7193 Ser Arg Pro Trp Ala Trp Gly Ala Ser Glu Met Cys Phe Cys Phe Phe Glu Met Gly Ser 22720 TTC TGT TGC CCA TCC CGG AGC ACA GTG GCA CGA TCA CAG CTC ACT GCA GCC TCG ACC TCC 77923 Phe Cys Cys Pro Ser Arg Ser Thr Val Ala Arg Ser Gln Leu Thr Ala Ala Ser Thr Ser 42780 TGG GCT CAG GTG ATC CTC CCG CCT CAG CCT CCT GAG TGT CTG CTT CTG GTT TTC ATG ATG 83943 Trp Ala Gln Val Ile Leu Pro Pro Gln Pro Pro Glu Cys Leu Leu Leu Val Phe Met Met 62840 ACC TGG GGC CCA GGC ATA CTA CAC TTG TGC TGT TCA GGG GCC AGT CCT GCA CCA GGA GCC 89963 Thr Trp Gly Pro Gly Ile Leu His Leu Cys Cys Ser Gly Ala Ser Pro Ala Pro Gly Ala 82900 CAT CAG CCA CAG CTC CGC CGA GAA GCA CTG ATA TGC AGA GCT AAG CAG CTT TGT TTC CAC 95983 His Gln Pro Gln Leu Arg Arg Glu Ala Leu Ile Cys Arg Ala Lys Gln Leu Cys Phe His 102960 GTG GAT CCT GCG TAG GTT TTC TTG GTC CAT CCG TAG ACA CCG CAC TCC TGC AGA GGA TCT 1019103 Val Asp Pro Ala *** 1071020 TCT CGG GAT GCC CCA CTG TCT CTG TTT TCC CTC TTC ACT GAA CAC TCA GTC GGG GCT CGC 10791080 CAT GAT GCC TCT GTG TCT GCT GGC TTC TCC CCC ATT GGA ACA GCC TTC TTG GCA CGG CAC 11391140 ACT GCT AGC TGC TGG GCA CTG TGC TTT CTG CCT TTA CCG TTC TGC CGT GAT GTT GCC AAA 11991200 ATA GCA GCA ACA ACA ACA ACA ACA AAG GCT GGG CAC CTG GCT CAT GCC TGT ATT CCC AGC 12591260 AGT TCG AGA TCA GCC TGG GCA ACA TGG TGA GAC CCT ATC TCT ACA AAA ATA AAA AAT GAA 13191320 ATG AGC TGG GTG GGG TGG CGC ATG CAT GCC TGT GGT CCC AGC TAC TTG GGA GGC TGA GGT 13791380 CGG AAG CTC GCT GGT CGG AAG ATC GCT GGA GCT TAG CCT TGA GGT CAA GGT TGC AGT GAG 14391440 CCG AGA TTA CAT CAC TGC ACT CCA GCG TGG GAG ACA GAG ACC CTG TAT TAA CAA ACA AAA 14991500 ACA CAA ACC ACA AAG GGC AGG TCT GAA ACT GCC ATT TAA AAA AAA ATT TGA TAA ACT TAA 15591560 AAA AAT ATA TAT CCA CAG ATG CAG GTG AAG AAC CTG TTG TCT TCC TCA AGC CTC TTT TTC 16191620 ACC CAT GGG TGG AAA TGG TGC CCT GGA CAC CCA GGC CCA CGA GGT CTT TGC GTG GGG TCC 16791680 CTA CAC AGG GCT TTA GCT TAC ACT GTG CTG CCC TCC TGT CCC CCG AGT TCC CAG TCT GTC 17391740 AAA ATC CAA CCT GGT CTC CCA GGC CCA GGG CAA ATG CCA CCT CCT CCA TGA AGC CTG CCA 17991800 CAT CCT TTG CAC ACC CTT GGG CGC TGA CCT TGT TCT CCC AGC GCA CAG GCA CGG GTA GTT 18591860 TGC CCC TGT AGT AGT AAC TCA GGC ACA AAA CGA ACT CTT GCT GAG GCT CGG CCG CGC AGA 19191920 GCT GAG GGT TGC CGC TTC CAG GTT CAA GTG CAT TTT GAG TTT CAT TCC CAG CTT CCT TCT 19791980 TTT TCT GGT CTT TAA TTT CTT CTC CGG ATT AGG TCC CAC TCA ATG CTT TCC TTC TCA ATT 20392040 TCC AAA AGA GTA TGG TCA GAG CCA GCA GCA CAC CAC CTT CCC CAT GGG TGG GGG GGG GGC 20992100 CAG CCT GTG GCG GGG GTG CGG GTC CCA TCT TTT CGA AGG AAT TGA CCC ACA GTG GGC GGG 21592160 TCC ACC TTT GAC CTT GCC CCA GGG AGC GCA GAC AGA AAA AAG ATC CTT GCT TAG TTT GAG 22192220 GGG CCG CTG GGG TGC TCG GTT TGT CTT CAG AGG CCT GTC TGT AAC ACC AAT GCC AAC CCG 22792280 GTG GCA CTG ACT GGT CAC CCT GAA GGC CAC GGC CAG TGT CCT AGG AAG GGA CTC AAT TTC 23392340 TAG CTG TGC CAC CTG AGA TTC TGG GGT TAG GCT GGT TGT GCT TCT GAA GTT CCA CTG TGC 23992400 TCA AAG TGC TTG GTG AAA GTT AGC GAA GGT GAT TTT ACA AAA ATA GAT GCA TAA AAT GTC 24592460 TAG GAA ACA CAA AAA ATC CTC ATT ACT CTT CTC TCC AAA TAT TTT TTA AGC CCC AAC TGG 25192520 ACC CTA GGC AAA AGT GAG TGG CAC TCC TCT GCC AGG ACT CCA GGC AAG CCC CGG CAT CTT 25792580 CTT GCT GCC GTC CCA GAC AAC AGA AGT TAC CAG ATG AAC AGA CTT GGA TGG GCC ACG GGG 26392640 GTG GAG AGC TGG AAA GCT TGG CTG TGC CTC TCG ATG ATG ATT AAG ATT TCA ATA TTT ACA 26992700 GCA AAA CCA CAA AGC AAA TGA TAG AAT AAA GCA AAA CAA TGG AAA ATG TGA GTT CAC TCG 27592760 TGA GAG AGG TAC GTA TGT GAG CTC TGA GGA AAT TAC AGA GGG AAC GCA TGC AGC GGG ACA 28192820 GCT CTC CCA ATC GCA GCG TGC AAA GTA GAC ATC CAT AGT GTC TTT TGA AAA ATG AAA AAC 28792880 ACA TTA CTT TGA ACA GCC AAG AAA AAA ATT GCA ATT TAT TAA GAT TCA ATA AAG CGT TGT 29392940 ACT TTC GAA AGC CAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA 29993000 AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AA 30462.FP7072A:核苷酸序列(SEQ ID NO:4)长度:2224个碱基1 GGGACCTGGG GGCTGTGGCC GGGGGCGGCC GTTGACCTGG TGACCGCGGC GCCGCCCCAG61 ACCGGGGGCG CAGTCCCACT CGCTCCGAGC CCCGGTCCCC CAAGCCTCCC TCCCGGGTAC121 CTGGGGCCGC GCCCGCCCTG CGCCCAGCTC CGCCCTCCGT CGGCCCAGGC CTGACAGAGC181 CCGGCAGCCA TGAGTGCCAA CCCCCGGTGG GACATCAGCA GGGCGCTGGG GGTGGCCAAG241 CTCTTCCACC TGGTGTGCGG GGTGCGGGAA GCCTGCGTGA CCCCGTTCCT GACCCTTTAC301 CTGAGGCACC TGGGCTTGGC CGCGCCCTGG GTGGGCACCC TAATGGGAAC CAAGCACCTA361 ATCGCTGCCT TCTGGGCTCC CGTCTGTGCC TTCCTGGCCA AAAGCTACCG GAAAAGGAGA421 GCGCTTCTGA TCGGCTCCCT GCTCGGCTCG GTGGGGGCCA GCCTGCTGAT GGTCCTGGTC481 CCACCGGTAG ACAAAAATCG GGTGCACTTC CCTTGTAATG GAAGCAGCGG CCTGACCAGC541 ACAGACGCAC TCCCGGGGGT CACGCTACCT GTGAACATCA CCTCGGCCCA AGAGTCTGCC601 TCCAGCCACC CAGCCAAGAG GACTGCAGAG GTGGAAATGC CTGGCTTCAG AAACCCACCT661 GGTGAAAGTG ACCGAGAAAC TTTCCGTGAT CTGCACGTCT ACTTAGCGCC CTCCGTTGAA721 GGAGCTAGGA CCACATCCCA AGCTCTCCTC CATCCTGTCA CTTCGGGGCT GAAAGATCAT781 CCCTGGGAAG TTACTTTTGA GGTGGTCAAG ACAGCCCTCC CCTTGCTTCC TGGGGGGAAA841 GGGCCCGGGA ATCCAGCCAA TTTGTCAGGG ACCAAGGGGA AAGCCTGGGC TTTTGACCTG901 TCCTTGGAGG CGTTGCGGCG GACTTTTATC CTCTCCTTGG GGTCCGTGGC GTTCTGGGAG961 CTGCTGACAG CGCCTCTGGA GCAGGTGGCA GATGACAGCC TTTATGAGTT CCTGGATTTT1021 GTGGATGCCA CTGACCGATA CAGAAGCCTG TGGGTCTGGA GGTTGCTGGG CATGTCGGCA1081 GGCGTGTGTG GCATCACAGC CTTGGTGGGG CAGCTGGACT GCTTCCTGAT GACCAGTGGC1141 CCCCGAGGTG TGGTCCACTT CTATGGGTAC TCGGTGGTCA GCACCCTGGC CTTACTGGTG1201 AGCATTGCCT TTCCCATTCC CATCTGTCAG CAGTGGGAGC CCAGCTACAA AAGGGTCAAA1261 GCACTGTCCA TTGTGGGGGG GGTGACCCCC ACCTCATTCT CCTCGCCTCC ACCACTGTTT1321 TGGTAGGAGC CATCGTCAGT ACTGTCCAGA ACTTTCTGTT CTGGCACATG AAGGACCATG1381 GGAGCGGCGA GCTGGTCATG GGTTTCTCGG TCGCCCTCAG CTTGCTGGGG GAAATTCTGC1441 TTCATCCGTT CAAAGCTACA TTGCTTAGGA AACTGTCCAG GACGGGCCTG GTGGGGCTGG1501 GGCTGAGCTG CCTCGCTGGG CAGCTGCTGT ACTACTCTTT CCTCTGGAGC TGGTGGTCCG1561 TCCTCCCCAT TCAGATCTTG AGTGCCATTA GCAACAGAGC TTTGTGGTGG GCTGTGGGGG1621 CCTCAGTAGA GGACCTGGCC ACTCCCCGCA TGGAGAGGGC TCTGAGTGCC TTGTTCCGAG1681 GCCACTTTTA CGGGAGTGGC TGTAGCCTGG GCAGCTTTGT CGGGGGCTTC GTGGTGATGC1741 GCTTCAGCCT GGCTGTGCTC TACCAGGCCT GCTGTGTGGC CCTGTTGCTC TGGTTGGCCT1801 TGCTCCTGTC CATACAGCGG AGGCTGCCCC GAGAGCGGAA AATCAAGTAC TCGAAGCTGC1861 TGTCCATGGA GGTGAGTGAC ACCAGTGACT CTGAGCAGGG GACAGAACAG GACTGGCTTG1921 TGAAGGCCAT GAGGGAGGAA CACTCAGACT GAAAGGGCTG AGAAATCCAG AGTGTGCTGA1981 TCCAGCAAGG AACGAATGGA CTGAACAAAA CTCAGCCTGC TGAGGACAGA AACCTGCCCT2041 GGACTGCTGG GAGCCGGGGA AGAGAGGATG GGTCTGTGCT GAAGGCCCAA CAGGATCATC2101 TCATTGCATG ATTTTCTTTA CTTTTGAAGT AAAAGGAGAT TTAACTTTTT GCCAATCTTT2161 TTTAGATAAT GGAGGAAGAA TACATTTGCT TTTTAAAAAG TTAAAAAAAA AAAAAAAAAA2221 AAAAB:氨基酸序列(SEQ ID NO:6)长度:378个氨基酸1 MSANPRWDIS RALGVAKLFH LVCGVREACV TPFLTLYLRQ LGLAAPWVGT LMGTKHLIAA61 FWAPVCAFLA KSYRKRRALL IGSLLGSVGA SLLMVLVPPV DKNRVHFPCN GSSGLTSTDA121 LPGVTLPVNI TSAQESASSH PAKRTAEVEM PGFRNPPGES DRETFRDLHV YLAPSVEGAR181 TTSQALLHPV TSGLKDHPWE VTFEVVKTAL PLLPGGKGPG NPANLSGTKG KAWAFDLSLE241 ALRRTFILSL GSVAFWELLT APLEQVADDS LYEFLDFVDA TDRYRSLWVW RLLGMSAGVC301 GITALVGQLD CFLMTSGPRG VVHFYGYSVV STLALLVSIA FPIPICQQWE PSYKRVKALS361 IVGGVTPTSF SSPPPLFWC.核苷酸及氨基酸组合序列(SEQ ID NO:5)克隆号和蛋白名称:FP7072起始编码子:190 ATG终止编码子:1324 TAG蛋白质分子量:40874.15Da1 GGG ACC TGG GGG CTG TGG CCG GGG GCG GCC GTT GAC CTG GTG ACC GCG GCG CCG CCC CAG 6061 ACC GGG GGC GCA GTC CCA CTC GCT CCG AGC CCC GGT CCC CCA AGC CTC CCT CCC GGG TAC 120121 CTG GGG CCG CGC CCG CCC TGC GCC CAG CTC CGC CCT CCG TCG GCC CAG GCC TGA CAG AGC 180181 CCG GCA GCC ATG AGT GCC AAC CCC CGG TGG GAC ATC AGC AGG GCG CTG GGG GTG GCC AAG 2401 Met Ser Ala Asn Pro Arg Trp Asp Ile Ser Arg Ala Leu Gly Val Ala Lys 17241 CTC TTC CAC CTG GTG TGC GGG GTG CGG GAA GCC TGC GTG ACC CCG TTC CTG ACC CTT TAC 30018 Leu Phe His Leu Val Cys Gly Val Arg Glu Ala Cys Val Thr Pro Phe Leu Thr Leu Tyr 37301 CTG AGG CAG CTG GGC TTG GCC GCG CCC TGG GTG GGC ACC CTA ATG GGA ACC AAG CAC CTA 36038 Leu Arg Gln Leu Gly Leu Ala Ala Pro Trp Val Gly Thr Leu Met Gly Thr Lys His Leu 57361 ATC GCT GCC TTC TGG GCT CCC GTC TGT GCC TTC CTG GCC AAA AGC TAC CGG AAA AGG AGA 42058 Ile Ala Ala Phe Trp Ala Pro Val Cys Ala Phe Leu Ala Lys Ser Tyr Arg Lys Arg Arg 77421 GCG CTT CTG ATC GGC TCC CTG CTC GGC TCG GTG GGG GCC AGC CTG CTG ATG GTC CTG GTC 48078 Ala Leu Leu Ile Gly Ser Leu Leu Gly Ser Val Gly Ala Ser Leu Leu Met Val Leu Val 97481 CCA CGG GTA GAC AAA AAT GGG GTG CAC TTC CCT TGT AAT GGA AGC AGC GGC CTG ACC AGC 54098 Pro Pro Val Asp Lys Asn Arg Val His Phe Pro Cys Asn Gly Ser Ser Gly Leu Thr Ser 117 541 ACA GAC GCA CTC CCG GGG GTC ACG CTA CCT GTG AAC ATC ACC TCG GCC CAA GAG TCT GCC 600118 Thr Asp Ala Leu Pro Gly Val Thr Leu Pro Val Asn Ile Thr Ser Ala Gln Glu Ser Ala 137601 TCC AGC CAC CCA GCC AAG AGG ACT GCA GAG GTG GAA ATG CCT GGC TTC AGA AAC CCA CCT 660138 Ser Ser His Pro Ala Lys Arg Thr Ala Glu Val Glu Met Pro Gly Phe Arg Asn Pro Pro 157661 GGT GAA AGT GAC CGA GAA ACT TTC CGT GAT CTG CAC GTC TAC TTA GCG CCC TCC GTT GAA 720158 Gly Glu Ser Asp Arg Glu Thr Phe Arg Asp Leu His Val Tyr Leu Ala Pro Ser Val Glu 177721 GGA GCT AGG ACC ACA TCC CAA GCT CTC CTC CAT CCT GTC ACT TGG GGG CTG AAA GAT CAT 780178 Gly Ala Arg Thr Thr Ser Gln Ala Leu Leu His Pro Val Thr Ser Gly Leu Lys Asp His 197781 CCC TGG GAA GTT ACT TTT GAG GTG GTC AAG ACA GCC CTC CCC TTG CTT CCT GGG GGG AAA 840198 Pro Trp Glu Val Thr Phe Glu Val Val Lys Thr Ala Leu Pro Leu Leu Pro Gly Gly Lys 217841 GGG CCC GGG AAT CCA GCC AAT TTG TCA GGG ACC AAG GGG AAA GCC TGG GCT TTT GAC CTG 900218 Gly Pro Gly Asn Pro Ala Asn Leu Ser Gly Thr Lys Gly Lys Ala Trp Ala Phe Asp Leu 237901 TCC TTG GAG GCG TTG CGG CGG ACT TTT ATC CTC TCC TTG GGG TCC GTG GCG TTC TGG GAG 960238 Ser Leu Glu Ala Leu Arg Arg Thr Phe Ile Leu Ser Leu Gly Ser Val Ala Phe Trp Glu 257961 CTG CTG ACA GCG CCT CTG GAG CAG GTG GCA GAT GAC AGC CTT TAT GAG TTC CTG GAT TTT 1020258 Leu Leu Thr Ala Pro Leu Glu Gln Val Ala Asp Asp Ser Leu Tyr Glu Phe Leu Asp Phe 2771021 GTG GAT GCC ACT GAC CGA TAC AGA AGC CTG TGG GTC TGG AGG TTG CTG GGC ATG TCG GCA 1080278 Val Asp Ala Thr Asp Arg Tyr Arg Ser Leu Trp Val Trp Arg Leu Leu Gly Met Ser Ala 2971081 GGC GTG TGT GGC ATC ACA GCC TTG GTG GGG CAG CTG GAC TGC TTC CTG ATG ACC AGT GGC 1140298 Gly Val Cys Gly Ile Thr Ala Leu Val Gly Gln Leu Asp Cys Phe Leu Met Thr Ser Gly 3171141 CCC CGA GGT GTG GTC CAC TTC TAT GGG TAC TCG GTG GTC AGC ACC CTG GCC TTA CTG GTG 1200318 Pro Arg Gly Val Val His Phe Tyr Gly Tyr Ser Val Val Ser Thr Leu Ala Leu Leu Val 3371201 AGC ATT GCC TTT CCC ATT CCC ATC TGT CAG CAG TGG GAG CCC AGC TAC AAA AGG GTC AAA 1260338 Ser Ile Ala Phe Pro Ile Pro Ile Cys Gln Gln Trp Glu Pro Ser Tyr Lys Arg Val Lys 3571261 GCA CTG TCC ATT GTG GGG GGG GTG ACC CCC ACC TCA TTC TCC TCG CCT CCA CCA CTG TTT 1320358 Ala Leu Ser Ile Val Gly Gly Val Thr Pro Thr Ser Phe Ser Ser Pro Pro Pro Leu Phe 3771321 TGG TAG GAG CCA TCG TCA GTA CTG TCC AGA ACT TTC TGT TCT GGC ACA TGA AGG ACC ATG 1380378 Trp *** 3791381 GGA GCG GCG AGC TGG TCA TGG GTT TCT CGG TCG CCC TCA GCT TGC TGG GGG AAA TTC TGC 14401441 TTC ATC CGT TCA AAG CTA CAT TGC TTA GGA AAC TGT CCA GGA CGG GCC TGG TGG GGC TGG 15001501 GGC TGA GCT GCC TGG CTG GGC AGC TGC TGT ACT ACT CTT TCC TCT GGA GCT GGT GGT CCG 15601561 TCC TCC CCA TTC AGA TCT TGA GTG CCA TTA GCA ACA GAG CTT TGT GGT GGG CTG TGG GGG 16201621 CCT CAG TAG AGG ACC TGG CCA CTC CCC GCA TGG AGA GGG CTC TGA GTG CCT TGT TCC GAG 16801681 GCC ACT TTT ACG GGA GTG GCT GTA GCC TGG GCA GCT TTG TCG GGG GCT TCG TGG TGA TGC 17401741 GCT TCA GCC TGG CTG TGC TCT ACC AGG CCT GCT GTG TGG CCC TGT TGC TCT GGT TGG CCT 18001801 TGC TCC TGT CCA TAC AGC GGA GGC TGC CCC GAG AGC GGA AAA TCA AGT ACT CGA AGC TGC 18601861 TGT CCA TGG AGG TGA GTG ACA CCA GTG ACT CTG AGC AGG GGA CAG AAC AGG ACT GGC TTG 19201921 TGA AGG CCA TGA GGG AGG AAC ACT CAG ACT GAA AGG GCT GAG AAA TCC AGA GTG TGC TGA 19801981 TCC AGC AAG GAA CGA ATG GAC TGA ACA AAA CTC AGC CTG CTG AGG ACA GAA ACC TGC CCT 20402041 GGA CTG CTG GGA GCC GGG GAA GAG AGG ATG GGT CTG TGC TGA AGG CCC AAC AGG ATC ATC 21002101 TCA TTG CAT GAT TTT CTT TAC TTT TGA AGT AAA AGG AGA TTT AAC TTT TTG CCA ATC TTT 21602161 TTT AGA TAA TGG AGG AAG AAT ACA TTT GCT TTT TAA AAA GTT AAA AAA AAA AAA AAA AAA 22202221 AAA A 22243.FP8080蛋白A:核苷酸序列(SEQ ID NO:7)长度:2916个碱基1 GAAAAGACGT TTAATAAAAC AGCTTTACCT TTTAAAAATA AAATTTCAAT CCCAGTCTGC61 CTCAGGTACG GGTGGGGGTG TGCAGCGTGA CTCCTGGCTG TGTTCCTGTA CCGTTTGTGG121 CCTCCGGGGT CTTGCGCGTC CAGGGCCCAG ATACCGAGTA ACTGCCATGT GGTGTCGTGG181 TGGCGTCCAT AGGCCTCCGT GGTGGGGCGG GGGCGGGGCT GTGGGTGTGC AGGGCAGCTG241 CATTTTCCAA GAGTGGAGAT GGAGGATGGA GATTTGCTTC GTAAAGGCCT GGGAGCTACA301 TGGGAGGTAG GGAGGGGCCA GCCACACCCA GGGCTGGGGG GCCGGTGGAC TCTGCCCAGT361 GAAGCCAGGG GAGTGTCAGC AATGAGGGGC CTGGACAGCG ACGCGGGACC CGCACCTGGG421 AGCGGCAGAG ATGGAGCCCA GCTCGCTAAA CGTACCCTAA GGGTGCACGC TGACCGTCTT481 TGATCCCTGG ACAGTGTCCA TAGAGTTGTC TCCCCTTCGG TCACATTGTC CCTGGCCTTG541 GAGTTTCTGC CTCAGGGAAA GACCCACTAA AACCACCCGG GCTCTGGCGG CCTCCTCTTC601 TCCAGAGCAT GGTGGCGCTG CCTCCTGAGC AGAGTCACTG AGAGTGGGTC CAAGGAAGGG661 ACCCACTTAG CAAAGGTTGT TGTGTGGTGC TGTGCAGGCA CGGCGCCTGG AGTTGGCCCC721 GCCAGCATCG GGGTGGCTTG GGGCTCTGGT TCCTAAGCTT CTGCTTCTGA GTTGGTCAGC781 ACGTTGGCTC TGCGCCCTGC AGTGCCTGTC TTGATGGTGG TCCCTGGATG TGCTGAAGGG841 CTCCAGGAGC AAGGGGCCAG ACCACACTTT GGCTGAGTCC TTGGGTAGTT TCAGAGGGTC901 ACCTGCACAG TCTGCATTGA GCACCCTGGG GCTGAGGCCG TGGGTCAAGT 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GCTCATTCGC CTGGTCGCAT GTTCACTCCA TGAGGTTAGG ACACTGCGGG2701 TGGCTTTGGG ATGGGTGGTT TCAGGGACAA GGTGTCGCTG TGATCTCTGT ATTTGCTAAC2761 TAGTCTTGTT TTGATTTCTA ACGGTCTAGT GGAGTACAGT TAATGTTGTG TTTATTTCTG2821 TAACTGTAGG GGTGGAGTAT AAACCTAACT TTTGGAAACA TGAAGAAATA AACAATAGCG2881 CCAGCCGTTA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAB:氨基酸序列(SEQ ID NO:9)长度:103个氨基酸1 MFEPTEQSSC CLPDSHPKTK GASLSFVLLA WKTSSWLLGT HIGHWPQLLN GFTNVPGVCI61 CPLFYSLETL AGHGGSRLSS QHLGRPRQVD HKVKRSTPSW PTWC.核苷酸及氨基酸组合序列(SEQ ID NO:8)克隆号和蛋白名称:FP8080起始编码子:1337 ATG终止编码子:1646 TGA蛋白质分子量:11425.50Da1 G AAA AGA CGT TTA ATA AAA CAG CTT TAC CTT TTA AAA ATA AAA TTT CAA TCC CAG TCT 5859 GCC TCA GGT ACG GGT GGG GGT GTG CAG CGT GAC TCC TGG CTG TGT TCC TGT ACC GTT TGT 118119 GGC CTC CGG GGT CTT GCG CGT CCA GGG CCC AGA TAC CGA GTA ACT GCC ATG TGG TGT CGT 178179 GGT GGC GTC CAT AGG CCT CCG TGG TGG GGC GGG GGC GGG GCT GTG GGT GTG CAG GGC AGC 238239 TGC ATT TTC CAA GAG TGG AGA TGG AGG ATG GAG ATT TGC TTC GTA AAG GCC TGG GAG CTA 298299 CAT GGG AGG TAG GGA GGG 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TGA GTG CCA 10181019 GCT GCT GGG TGT CCC CAC CTC AAG AGC CAA GGG GAG GCC ACC CTG GAA CTG GTG CTT TGC 10781079 CCT TGG TGT CAT GGA GGT GTC TGG GTC CAC ACG TGG TGG GTG GGC TGG GCC TGC AGT CAC 11381139 CCA GCA TGG CCG GCG GGA TTG GAC CCA GCT GCA ACC TGG CAG GTT CCA TGG GGC TTC CTG 11981199 TGC CTG GGC CTG CCT GTG TCT CAT GCC TGT CAA TAA AGG AGA AAG CAA CCT GGG AAA AAC 12581259 ATT CCT CTC TGT ACC CAG GGG ACT GCC AAG TGT GCT TTA TAG AAG GCT GGA AGA CCG ACT 13181319 GAA GTA GGA AGC TGT CAC ATG TTT GAG CCA ACT GAG CAA AGC AGC TGT TGC CTG CCA GAC 1378
1 Met Phe Glu Pro Thr Glu Gln Ser Ser Cys Cys Leu Pro Asp 141379 AGC CAC CCC AAG ACC AAG GGA GCC AGC CTG TCG TTT GTC CTT CTA GCC TGG AAG ACC AGT 143815 Ser His Pro Lys Thr Lys Gly Ala Ser Leu Ser Phe Val Leu Leu Ala Trp Lys Thr Ser 341439 TCT TGG CTC TTG GGC ACT CAC ATT GGC CAC TGG CCG CAA CTG CTG AAT GGC TTC ACT AAT 149835 Ser Trp Leu Leu Gly Thr His Ile Gly His Trp Pro Gln Leu Leu Asn Gly Phe Thr Asn 541499 GTC CCT GGG GTC TGT ATC TGC CCT CTC TTC TAT TCC CTA GAA ACT CTG GCC GGG CAT GGC 155855 Val Pro Gly Val Cys Ile Cys Pro Leu Phe Tyr Ser Leu Glu Thr Leu Ala Gly His Gly 741559 GGC TCA CGC CTG TCA TCC CAG CAC TTA GGG AGG CCG AGG CAG GTG GAT CAC AAG GTC AAG 161875 Gly Ser Arg Leu Ser Ser Gln His Leu Gly Arg Pro Arg Gln Val Asp His Lys Val Lys 941619 AGA TCG ACA CCA TCC TGG CCA ACA TGG TGA AAC CCC ATC TCT ACT AAA AAT ACA AAA ATT 167895 Arg Ser Thr Pro Ser Trp Pro Thr Trp *** 1041679 AGC TGG ACA TGG TG G TGG GCG CCT GTA GTC CCA GCT ACT TGG GAG GCTGAG GCA GGA GAA 17381739 TTG CTT GAA CTC GGG AGG CGT AGG TTG CAG TGA GCC AAG ATC GCA CCA CTG CAC TCC AGC 17981799 CTG GCA ACA GAG CAA GAC TCC TCA AAA AAC AAA CAA ACA AAC AAA CAA ACT CTG ATC ATT 18581859 CAC CCG GTG GGA TCC CCG GCA GCT CCT TCT CCT TCC CGA GCT GTG GCT CAT GGG CCA TTG 19181919 GAT TCA GAG ACC TTG AGC TGG GTG CTG GCT GCC CTA AAG GAG CAC GAC CCC TCC AGC CTG 19781979 GTG ACC GGG AGG CAG AGA AGT ACA GCT GTC CTT GAC AAA GGC CCA GCC TCT GCT GCC TCA 20382039 GGC CAG CCT GGC CAC ACC CCG ATG CCA CAG TCA TCT GCC CCG CCC AGG CAT AAG CCT GAC 20982099 TCA GGT GAT ACA GGC GAG GCT TCT CCC ATG GGT CCT CCC CTT GTG AGA AAG GGT CTG TGC 21582159 TGT GTA CCT TCT CTC TGC ACA GCC ATT GTC AGT GTG GTT TGG AGT GAG TGA GCC TCC CGC 22182219 ACT GCT CAG GGG AGA GCT GGT GAG CAT GAC TCC ATG GCC TCC TGC TGG TTG GGG TCT TCT 22782279 TCT GAT TCT CAC CCG CAG GAG CAC CCA GAC CCC CCC TTT TCA GAA ATG ATT ACA TTT TCC 23382339 CTT CAA GAG TCA TCT GTG ACC TGG TGG TGT GGA GGG ACT GTC CCC TCC TAC AGC CTG GCC 23982399 GAC CCC CTT CCT CCA GGG CTG TGT GGA ATC ACC TCT CAG AAG CTC ACT CTG AAA AGC CAC 24582459 TCA CAG GGA TTT CAC CAG GAT GTT GCT GTT CCT GCC GAC ACC TGG GCT TTG TGA CAA ATG 25182519 CTG TTT GCT TCA AGC TGT TCA CAA GCA ACT TCA CCA GAA TCC CAA GCT GGT TCG TAC TTA 25782579 ATT TGT ATA CAT ACA TAT GCA TAA TAT ACA TGA CCA TGT ATG AGA TAC AGA CAC CAT GGC 26382639 TTC TGT CCA TTG GCT CAT TCG CCT GGT CGC ATG TTC ACT CCA TGA GGT TAG GAC ACT GCG 26982699 GGT GGC TTT GGG ATG GGT GGT TTC AGG GAC AAG GTG TCG CTG TGA TCT CTG TAT TTG CTA 27582759 ACT AGT CTT GTT TTG ATT TCT AAC GGT CTA GTG GAG TAC AGT TAA TGT TGT GTT TAT TTC 28182819 TGT AAC TGT AGG GGT GGA GTA TAA ACC TAA CTT TTG GAA ACA TGA AGA AAT AAA CAA TAG 28782879 CGC CAG CCG TTA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAAAA 2916
在本发明提及的所有文献都在本申请中引用作为参考,就如同每一篇文献被单独引用作为参考那样。此外应理解,在阅读了本发明的上述讲授内容之后,本领域技术人员可以对本发明作各种改动或修改,这些等价形式同样落于本申请所附权利要求书所限定的范围。
序列表<110>上海新世界基因技术开发有限公司<120>具有抑癌功能的新的人蛋白及其编码序列<130>022535<160>15<170>PatentIn version 3.0<210>1<211>3046<212>DNA<213>智人(Homo sapiens)<400>1ggtttcacca tgatggtcag gctggtcaag atctcctgac ctcaagtgat ctgcccgcct 60cggcctccca aagtgctggg attacagaca tgaaccacaa cacctgccaa gcccaggtgt 120tttgaatcca gcacgggcaa tggcaagacc ctgtcccaac aaacaaaaaa acactggtgc 180ctgaggccca ccccgagaga ttctgattga gttgatttgg atttgaatta tctttaaaat 240tttggatgtg aatttttttt ttttttcttg gaatggagtt tcactcttgt tccccaggct 300ggagtgcaac gggacgatct tggctcaccg caacctccgc ctactgggtt caagccattc 360tcctgcctca gcttcccaag tagctgggat tacaggcatg tgctaccatg cccagctaat 420tttgtatttt tagtagagac agggtttctc catgttgctc aggctggtct tgaactcctg 480acctcaggtg atccgcccgc ctcggactcc caaagtgctg ggattacagg catgagccac 540catgcctggc cggatgtgaa ttatcttaaa aattttcagg taattctaat gggccaaggt 600tgagaacccc tgctctgggc ccatccgagc accaggctgt cacaaacgca tgcatgcact 660cacgcccgtg ggcttggggg gcttcggaaa tgtgcttctg cttttttgag atggggtctt 720tctgttgccc atcccggagc acagtggcac gatcacagct cactgcagcc tcgacctcct 780gggctcaggt gatcctcccg cctcagcctc ctgagtgtct gcttctggtt ttcatgatga 840cctggggccc aggcatacta cacttgtgct gttcaggggc cagtcctgca ccaggagccc 900atcagccaca gctccgccga gaagcactga tatgcagagc taagcagctt tgtttccacg 960tggatcctgc gtaggttttc ttggtccatc cgtagacacc gcactcctgc agaggatctt 1020ctcgggatgc cccactgtct ctgttttccc tcttcactga acactcagtc ggggctcgcc 1080atgatgcctc tgtgtctgct ggcttctccc ccattggaac agccttcttg gcacgccaca 1140ctgctagctg ctgggcactg tgctttctgc ctttaccgtt ctgccgtgat gttgccaaaa 1200tagcagcaac aacaacaaca acaaaggctg ggcacctggc tcatgcctgt attcccagca 1260gttcgagatc agcctgggca acatggtgag accctatctc tacaaaaata aaaaatgaaa 1320tgagctgggt ggggtggcgc atgcatgcct gtggtcccag ctacttggga ggctgaggtc 1380ggaagctcgc tggtcggaag atcgctggag cttagccttg aggtcaaggt tgcagtgagc 1440cgagattaca tcactgcact ccagcgtggg agacagagac cctgtattaa caaacaaaaa 1500cacaaaccac aaagggcagg tctgaaactg ccatttaaaa aaaaatttga taaacttaaa 1560aaaatatata tccacagatg caggtgaaga acctgttgtc ttcctcaagc ctctttttca 1620cccatgggtg gaaatggtgc cctggacacc caggcccacg aggtctttgc gtggggtccc 1680tacacagggc tttagcttac actgtgctgc cctcctgtcc cccgagttcc cagtctgtca 1740aaatccaacc tggtctccca ggcccagggc aaatgccacc tcctccatga agcctgccac 1800atcctttgca cacccttggg cgctgacctt gttctcccag cgcacaggca cgggtagttt 1860gcccctgtag tagtaactca ggcacaaaac gaactcttgc tgaggctcgg ccgcgcagag 1920ctgagggttg ccgcttccag gttcaagtgc attttgagtt tcattcccag cttccttctt 1980tttctggtct ttaatttctt ctccggatta ggtcccactc aatgctttcc ttctcaattt 2040ccaaaagagt atggtcagag ccagcagcac accaccttcc ccatgggtgg ggggggggcc 2100agcctgtggc gggggtgcgg gtcccatctt ttcgaaggaa ttgacccaca gtgggcgggt 2160ccacctttga ccttgcccca gggagcgcag acagaaaaaa gatccttgct tagtttgagg 2220ggccgctggg gtgctcggtt tgtcttcaga ggcctgtctg taacaccaat gccaacccgg 2280tggcactgac tggtcaccct gaaggccacg gccagtgtcc taggaaggga ctcaatttct 2340agctgtgcca cctgagattc tggggttagg ctggttgtgc ttctgaagtt ccactgtgct 2400caaagtgctt ggtgaaagtt agcgaaggtg attttacaaa aatagatgca taaaatgtct 2460aggaaacaca aaaaatcctc attactcttc tctccaaata ttttttaagc cccaactgga 2520ccctaggcaa aagtgagtgg cactcctctg ccaggactcc aggcaagccc cggcatcttc 2580ttgctgccgt cccagacaac agaagttacc agatgaacag acttggatgg gccacggggg 2640tggagagctg gaaagcttgg ctgtgcctct cgatgatgat taagatttca atatttacag 2700caaaaccaca aagcaaatga tagaataaag caaaacaatg gaaaatgtga gttcactcgt 2760gagagaggta cgtatgtgag ctctgaggaa attacagagg gaacgcatgc agcgggacag 2820ctctcccaat cgcagcgtgc aaagtagaca tccatagtgt cttttgaaaa atgaaaaaca 2880cattactttg aacagccaag aaaaaaattg caatttatta agattcaata aagcgttgta 2940ctttcgaaag ccaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3000aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaa 3046<210>2<211>3046<212>DNA<213>智人(Homo sapiens)<220><221>CDS<222>(654)..(971)<400>2ggtttcacca tgatggtcag gctggtcaag atctcctgac ctcaagtgat ctgcccgcct 60cggcctccca aagtgctggg attacagaca tgaaccacaa cacctgccaa gcccaggtgt 120tttgaatcca gcacgggcaa tggcaagacc ctgtcccaac aaacaaaaaa acactggtgc 180ctgaggccca ccccgagaga ttctgattga gttgatttgg atttgaatta tctttaaaat 240tttggatgtg aatttttttt ttttttcttg gaatggagtt tcactcttgt tccccaggct 300ggagtgcaac gggacgatct tggctcaccg caacctccgc ctactgggtt caagccattc 360tcctgcctca gcttcccaag tagctgggat tacaggcatg tgctaccatg cccagctaat 420tttgtatttt tagtagagac agggtttctc catgttgctc aggctggtct tgaactcctg 480acctcaggtg atccgcccgc ctcggactcc caaagtgctg ggattacagg catgagccac 540catgcctggc cggatgtgaa ttatcttaaa aattttcagg taattctaat gggccaaggt 600tgagaacccc tgctctgggc ccatccgagc accaggctgt cacaaacgca tgc atg 656
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20 25 30tca cag ctc act gca gcc tcg acc tcc tgg gct cag gtg atc ctc ccg 800Ser Gln Leu Thr Ala Ala Ser Thr Ser Trp Ala Gln Val Ile Leu Pro
35 40 45cct cag cct cct gag tgt ctg ctt ctg gtt ttc atg atg acc tgg ggc 848Pro Gln Pro Pro Glu Cys Leu Leu Leu Val Phe Met Met Thr Trp Gly50 55 60 65cca ggc ata cta cac ttg tgc tgt tca ggg gcc agt cct gca cca gga 896Pro Gly Ile Leu His Leu Cys Cys Ser Gly Ala Ser Pro Ala Pro Gly
70 75 80gcc cat cag cca cag ctc cgc cga gaa gca ctg ata tgc aga gct aag 944Ala His Gln Pro Gln Leu Arg Arg Glu Ala Leu Ile Cys Arg Ala Lys
85 90 95cag ctt tgt ttc cac gtg gat cct gcg taggttttct tggtccatcc 991Gln Leu Cys Phe His Val Asp Pro Ala
100 105gtagacaccg cactcctgca gaggatcttc tcgggatgcc ccactgtctc tgttttccct 1051cttcactgaa cactcagtcg gggctcgcca tgatgcctct gtgtctgctg gcttctcccc 1111cattggaaca gccttcttgg cacgccacac tgctagctgc tgggcactgt gctttctgcc 1171tttaccgttc tgccgtgatg ttgccaaaat agcagcaaca acaacaacaa caaaggctgg 1231gcacctggct catgcctgta ttcccagcag ttcgagatca gcctgggcaa catggtgaga 1291ccctatctct acaaaaataa aaaatgaaat gagctgggtg gggtggcgca tgcatgcctg 1351tggtcccagc tacttgggag gctgaggtcg gaagctcgct ggtcggaaga tcgctggagc 1411ttagccttga ggtcaaggtt gcagtgagcc gagattacat cactgcactc cagcgtggga 1471gacagagacc ctgtattaac aaacaaaaac acaaaccaca aagggcaggt ctgaaactgc 1531catttaaaaa aaaatttgat aaacttaaaa aaatatatat ccacagatgc aggtgaagaa 1591cctgttgtct tcctcaagcc tctttttcac ccatgggtgg aaatggtgcc ctggacaccc 1651aggcccacga ggtctttgcg tggggtccct acacagggct ttagcttaca ctgtgctgcc 1711ctcctgtccc ccgagttccc agtctgtcaa aatccaacct ggtctcccag gcccagggca 1771aatgccacct cctccatgaa gcctgccaca tcctttgcac acccttgggc gctgaccttg 1831ttctcccagc gcacaggcac gggtagtttg cccctgtagt agtaactcag gcacaaaacg 1891aactcttgct gaggctcggc cgcgcagagc tgagggttgc cgcttccagg ttcaagtgca 1951ttttgagttt cattcccagc ttccttcttt ttctggtctt taatttcttc tccggattag 2011gtcccactca atgctttcct tctcaatttc caaaagagta tggtcagagc cagcagcaca 2071ccaccttccc catgggtggg gggggggcca gcctgtggcg ggggtgcggg tcccatcttt 2131tcgaaggaat tgacccacag tgggcgggtc cacctttgac cttgccccag ggagcgcaga 2191cagaaaaaag atccttgctt agtttgaggg gccgctgggg tgctcggttt gtcttcagag 2251gcctgtctgt aacaccaatg ccaacccggt ggcactgact ggtcaccctg aaggccacgg 2311ccagtgtcct aggaagggac tcaatttcta gctgtgccac ctgagattct ggggttaggc 2371tggttgtgct tctgaagttc cactgtgctc aaagtgcttg gtgaaagtta gcgaaggtga 2431ttttacaaaa atagatgcat aaaatgtcta ggaaacacaa aaaatcctca ttactcttct 2491ctccaaatat tttttaagcc ccaactggac cctaggcaaa agtgagtggc actcctctgc 2551caggactcca ggcaagcccc ggcatcttct tgctgccgtc ccagacaaca gaagttacca 2611gatgaacaga cttggatggg ccacgggggt ggagagctgg aaagcttggc tgtgcctctc 2671gatgatgatt aagatttcaa tatttacagc aaaaccacaa agcaaatgat agaataaagc 2731aaaacaatgg aaaatgtgag ttcactcgtg agagaggtac gtatgtgagc tctgaggaaa 2791ttacagaggg aacgcatgca gcgggacagc tctcccaatc gcagcgtgca aagtagacat 2851ccatagtgtc ttttgaaaaa tgaaaaacac attactttga acagccaaga aaaaaattgc 2911aatttattaa gattcaataa agcgttgtac tttcgaaagc caaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2971aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3031aaaaaaaaaa aaaaa 3046<210>3<211>106<212>PRT<213>智人(Homo sapiens)<400>3Met His Ser Arg Pro Trp Ala Trp Gly Ala Ser Glu Met Cys Phe Cys1 5 10 15Phe Phe Glu Met Gly Ser Phe Cys Cys Pro Ser Arg Ser Thr Val Ala
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50 55 60Gly Pro Gly Ile Leu His Leu Cys Cys Ser Gly Ala Ser Pro Ala Pro65 70 75 80Gly Ala His Gln Pro Gln Leu Arg Arg Glu Ala Leu Ile Cys Arg Ala
85 90 95Lys Gln Leu Cys Phe His Val Asp Pro Ala
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Met Ser Ala Asn Pro Arg Trp Asp Ile Ser Arg Ala Leu Gly
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35 40 45Gly Thr Leu Met Gly Thr Lys His Leu Ile Ala Ala Phe Trp Ala Pro
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100 105 110Ser Gly Leu Thr Ser Thr Asp Ala Leu Pro Gly Val Thr Leu Pro Val
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Met Phe Glu Pro Thr Glu Gln Ser Ser Cys Cys Leu
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30 35 40tgg ccg caa ctg ctg aat ggc ttc act aat gtc cct ggg gtc tgt atc 1516Trp Pro Gln Leu Leu Asn Gly Phe Thr Asn Val Pro Gly Val Cys Ile45 50 55 60tgc cct ctc ttc tat tcc cta gaa act ctg gcc ggg cat ggc ggc tca 1564Cys Pro Leu Phe Tyr Ser Leu Glu Thr Leu Ala Gly His Gly Gly Ser
65 70 75cgc ctg tca tcc cag cac tta ggg agg ccg agg cag gtg gat cac aag 1612Arg Leu Ser Ser Gln His Leu Gly Arg Pro Arg Gln Val Asp His Lys
80 85 90gtc aag aga tcg aca cca tcc tgg cca aca tgg tgaaacccca tctctactaa 1665Val Lys Arg Ser Thr Pro Ser Trp Pro Thr Trp
95 100aaatacaaaa attagctgga catggtggtg ggcgcctgta gtcccagcta cttgggaggc 1725tgaggcagga gaattgcttg aactcgggag gcgtaggttg cagtgagcca agatcgcacc 1785actgcactcc agcctggcaa cagagcaaga ctcctcaaaa aacaaacaaa caaacaaaca 1845aactctgatc attcacccgg tgggatcccc ggcagctcct tctccttccc gagctgtggc 1905tcatgggcca ttggattcag agaccttgag ctgggtgctg gctgccctaa aggagcacga 1965cccctccagc ctggtgaccg ggaggcagag aagtacagct gtccttgaca aaggcccagc 2025ctctgctgcc tcaggccagc ctggccacac cccgatgcca cagtcatctg ccccgcccag 2085gcataagcct gactcaggtg atacaggcga ggcttctccc atgggtcctc cccttgtgag 2145aaagggtctg tgctgtgtac cttctctctg cacagccatt gtcagtgtgg tttggagtga 2205gtgagcctcc cgcactgctc aggggagagc tggtgagcat gactccatgg cctcctgctg 2265gttggggtct tcttctgatt ctcacccgca ggagcaccca gaccccccct tttcagaaat 2325gattacattt tcccttcaag agtcatctgt gacctggtgg tgtggaggga ctgtcccctc 2385ctacagcctg gccgaccccc ttcctccagg gctgtgtgga atcacctctc agaagctcac 2445tctgaaaagc cactcacagg gatttcacca ggatgttgct gttcctgccg acacctgggc 2505tttgtgacaa atgctgtttg cttcaagctg ttcacaagca acttcaccag aatcccaagc 2565tggttcgtac ttaatttgta tacatacata tgcataatat acatgaccat gtatgagata 2625cagacaccat ggcttctgtc cattggctca ttcgcctggt cgcatgttca ctccatgagg 2685ttaggacact gcgggtggct ttgggatggg tggtttcagg gacaaggtgt cgctgtgatc 2745tctgtatttg ctaactagtc ttgttttgat ttctaacggt ctagtggagt acagttaatg 2805ttgtgtttat ttctgtaact gtaggggtgg agtataaacc taacttttgg aaacatgaag 2865aaataaacaa tagcgccagc cgttaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa a 2916<210>9<211>103<212>PRT<213>智人(Homo sapiens)<400>9Met Phe Glu Pro Thr Glu Gln Ser Ser Cys Cys Leu Pro Asp Ser His1 5 10 15Pro Lys Thr Lys Gly Ala Ser Leu Ser Phe Val Leu Leu Ala Trp Lys
20 25 30Thr Ser Ser Trp Leu Leu Gly Thr His Ile Gly His Trp Pro Gln Leu
35 40 45Leu Asn Gly Phe Thr Asn Val Pro Gly Val Cys Ile Cys Pro Leu Phe
50 55 60Tyr Ser Leu Glu Thr Leu Ala Gly His Gly Gly Ser Arg Leu Ser Ser65 70 75 80Gln His Leu Gly Arg Pro Arg Gln Val Asp His Lys Val Lys Arg Ser
85 90 95Thr Pro Ser Trp Pro Thr Trp
100<210>10<211>20<212>DNA<213>人工序列<220><221>misc_feature<223>引物<400>10atgatggtca ggctggtcaa 20<210>11<211>24<212>DNA<213>人工序列<220><221>misc_feature<223>引物<400>11tcgaaagtac aacgctttat tgaa 24<210>12<211>18<212>DNA<213>人工序列<220><221>misc_feature<223>引物<400>12ggccgttgac ctggtgac 18<210>13<211>23<212>DNA<213>人工序列<220><221>misc_feature<223>引物<400>13aaagcaaatg tattcttcct cca 23<210>14<211>20<212>DNA<213>人工序列<220><221>misc_feature<223>引物<400>14tttcaatccc agtctgcctc 20<210>15<211>20<212>DNA<213>人工序列<220><221>misc_feature<223>引物<400>15ggctggcgct attgtttatt 20
Claims (10)
1.一种分离的具有抑癌功能的人蛋白,其特征在于,它包含具有选自下组的氨基酸序列的多肽:SEQ ID NO:3、6、9;
或其保守性变异多肽、或其活性片段、或其活性衍生物。
2.如权利要求1所述的多肽,其特征在于,该多肽是具有选自下组的氨基酸序列的多肽:SEQ ID NO:3、6、9。
3.一种分离的多核苷酸,其特征在于,它包含一核苷酸序列,该核苷酸序列与选自下组的一种核苷酸序列有至少85%相同性:
(a)编码如权利要求1和2所述多肽的多核苷酸;
(b)与多核苷酸(a)互补的多核苷酸。
4.如权利要求3所述的多核苷酸,其特征在于,该多核苷酸编码的多肽具有选自下组的氨基酸序列:SEQ ID NO:3、6、9。
5.如权利要求3所述的多核苷酸,其特征在于,该多核苷酸的序列选自下组:
SEQ ID NO:2、5、8的编码区序列或全长序列。
6.一种载体,其特征在于,它含有权利要求3所述的多核苷酸。
7.一种遗传工程化的宿主细胞,其特征在于,它是选自下组的一种宿主细胞:
(a)用权利要求6所述的载体转化或转导的宿主细胞;
(b)用权利要求3所述的多核苷酸转化或转导的宿主细胞。
8.一种具有抑癌功能的人蛋白活性的多肽的制备方法,其特征在于,该方法包含:
(a)在适合表达具有抑癌功能的人蛋白的条件下,培养权利要求7所述的宿主细胞;
(b)从培养物中分离出具有抑癌功能的人蛋白活性的多肽。
9.一种能与权利要求1所述的具有抑癌功能的人蛋白特异性结合的抗体。
10.一种药物组合物,其特征在于,它含有安全有效量的权利要求1所述的多肽以及药学上可接受的载体。
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