CN1376204B - 亚麻种子特异性启动子 - Google Patents

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Abstract

本发明提供了在亚麻种子和其它植物种类种子中表达非天然基因的新方法。这些方法涉及从亚麻得到的种子特异性启动子的应用。同时提供的有新的亚麻种子特异性启动子,含有新的亚麻种子特异性启动子的嵌合核酸构建体,含有新的亚麻种子特异性启动子的转基因植物细胞,转基因植物和转基因植物的种子。这些启动子和方法可用于例如改变亚麻种子或其它植物种子中的种子油和蛋白质组成。

Description

亚麻种子特异性启动子
发明领域
本发明涉及用于改变植物种子成分的植物基因工程方法,更具体地说,本发明涉及已经从亚麻中得到,并且能够指导亚麻种子以及其它植物种子中非天然基因的表达的启动子。
发明背景
亚麻或亚麻子(Linum usitataissimum)是具有经济价值的重要油料种子作物。亚麻油和粉是从亚麻种子得到的有价值的原材料。另一种有经济价值的原材料,亚麻纤维,是可以从该植物的茎中得到的。亚麻油组分可用于非食用目的,例如用于制造清漆和油料,并且通过新培育称为Linola的新品种,最近已经可用于制造许多食用产品,如黄油和色拉油和调味品(Green(1986年)《Can.J.Plant Sci.》,66卷:499-503页)。亚麻粉首先可用作反刍动物的饲料中的成分,而亚麻纤维可用于制造亚麻布纺织品。了解了亚麻作为原材料来源的经济重要性,考虑到农业上的性能,例如:种子产量,对病原体和低温的抗性,和适于后加工应用中的原材料的产量和质量,进一步改良和区分可利用的亚麻作物是需要的。虽然如开发Linola品种所证实的,通过传统的植物育种,得到改良的亚麻品种是可能的,但由于需要的时间长,开发优良的农业植物品系需要在植物育种中大量投资,植物遗传工程技术允许直接从不相关的种类中分离基因并将这些基因转移到良好的农学背景中,从而显著地减少开发新的品种所需要的时间。另外,植物遗传工程允许生产自然情况下不能从亚麻得到的产品如治疗剂。
为了通过植物遗传工程开发新的亚麻品种,控制导入的外源或非天然基因的表达是十分重要的。根据开发的植物品系的用途,需要的非天然基因的表达特征,如非天然基因的表达水中,非天然基因表达的特定植物组织或器官,和植物生命周期中非天然基因表达的特定时间是会改变的。例如,改变种子的油组成可能需要种子发育早期中脂肪酸代谢中参与的酶低水平地种子特异性表达。(参见例如:美国专利5,420,034)。另一方面,收获该植物的叶子,药用蛋白质的表达可能优选地需要高水平的叶子特异性表达。(参见例如,美国专利:5,929,304)。
为了控制非天然基因的表达特征,可以利用许多因子。一个因子是所利用的转录启动子的选择。目前有效的植物兼容启动子很多,详细文献记载的启动子中的一些包括组成性启动子如35-SCaMv启动子(Rothstein等人,(1987年)《基因》53卷:153-161页),和泛素启动子(美国专利5,614,399),组织特异性启动子如种子特异性启动子,如菜豆蛋白启动子(Sengupta-Gopalan等人,(1985年),PNAS USA 82卷:3320-3324页)和可诱导启动子,如热(Czarneacka等人,(1989年),《分子细胞生物学》,9(8):3457-3464页),紫外光,诱导物和创伤(Lois等人,(1989年)EMBO J.8(6):1641-1648页),或化学物如内源激素(Skriver等人(1991年),美国国家科学院院报,88(16)卷:7266-7270页)可诱导的那些启动子.为了控制植物中非天然基因的表达特征,可利用的其它因子包括转录修饰因子如:内含子,多聚腺苷酸化位点和转录终止位点.非天然基因的表达特征可以进一步利用影响翻译的因子如,核糖体结合位点和宿主显示的密码子偏倚性来掌握.另外,非天然基因本身可以影响转基因植物的存活,从而特定地限制可以达到的表达水平.在一些情况中,通过特异于组织的方式,如在叶子或种子中表达蛋白质,或由于存在或缺乏能够将蛋白质送到不同亚细胞部分的特异靶序列来限制蛋白质在不同的亚细胞部分如细胞质,内质网或液泡中的积累,可能能够克服这一问题.另一个影响表达特征的因子是构建体将自身插入宿主染色体中的座位.这一因子的效果可以提供关于为什么用同一重组构建体转化的不同植物会使重组蛋白质表达水平有波动.
就本发明人所知,亚麻种子中非天然基因的表达只在PCT专利申请WO 98/18948中有记载。这一申请公开了从亚麻得到的两个硬脂酰-酰基载体蛋白质去饱和酶(SAD)基因。相关的SAD启动子序列可用于修饰亚麻和其它植物以表达内源或外源基因。但是WO 98/18948所教授的方法受到SAD启动子在亚麻中是非种子特异的,并且使其在叶子,茎,花和种子中表达的限制。所以非天然基因的表达可能在非种子组织中产生不需要的副作用。另外,利用SAD启动子允许有限地控制表达水平和表达时间。
所以,本领域需要进一步改进亚麻种子和其它植物种子中非天然基因的表达方法。
发明概述
本发明涉及改良的植物中非天然基因的种子特异性表达方法。本发明特别涉及了亚麻中非天然基因的种子特异性表达的已改良的方法。
所以,在一方面,本发明提供了亚麻种子中需要的核酸序列的表达方法,该方法包括步骤:
(a)制备在5’到3’转录方向含有作为可操作地连接的下列成分的嵌合核酸构建体:
(1)从亚麻中得到的种子特异性启动子;和
(2)需要的核酸序列,其中所述的需要的核酸对于所述的亚麻种子特异性启动子是非天然的;
(b)将所述的嵌合核酸构建体导入亚麻植物细胞;和
(c)使所述的亚麻植物细胞生长成能够结种子的成熟的亚麻植物,其中所述的需要的核酸序列是在所述的亚麻种子特异性启动子控制下在种子中表达的。
在本发明的优选的实施方案中,启动子给予非天然核酸序列的至少一个表达特征,如植物生命周期中表达的计时是和给予天然核酸序列时的表达特征相似的。在其它优选的实施方案中,亚麻种子特异性启动子是油质蛋白启动子,2S贮藏蛋白启动子或类豆球蛋白种子贮藏蛋白启动子。
在其它方面,本发明提供了包括下面步骤的方法的转基因亚麻种子:
(a)制备在5’到3’转录方向含有作为可操作地连接的下列成分的嵌合核酸构建体:
(1)从亚麻得到的种子特异性启动子;和
(2)需要的核酸序列,其中需要的所述核酸对于所述的种子特异性启动子是非天然的;
(b)在亚麻植物细胞中导入所述的嵌合核酸构建体;和
(c)使所述的亚麻植物细胞生长成能够长种子的成熟的亚麻植物,其中所述的需要的核酸序列是在所述的种子特异性启动子的控制下,在种子中表达的.
在本发明的优选的实施方案中,至少一种启动子给予非天然核酸序列的表达特征,例如:在植物的生命周期中,表达的计时是与给予天然核酸序列时的表达特征相似的。在其它的实施方案中,亚麻种子特异性启动子是油质蛋白启动子,2S贮藏蛋白启动子或类豆球蛋白种子贮藏蛋白启动子。
在另一个方面,本发明提供根据下面方法制备的转基因亚麻种子:
(a)制备在5’到3’转录方向含有下面可操作地连接的成分的嵌合核酸构建体:
(1)从亚麻得到的种子特异性启动子;和
(2)需要的核酸序列,其中所述的需要的核酸对所述的种子特异性启动子是非天然的;
(b)将所述的嵌合核酸构建体导入亚麻植物细胞;和
(c)使所述的亚麻植物细胞生长成能够结种子的成熟亚麻植物,其中所述的需要的核酸序列是在所述的种子特异性启动子的控制下,在种子中表达的。
在另一方面,本发明提供了由下列方法制备的能够结种子的亚麻植物:
(a)制备在5’到3’转录方向含有下面可操作连接的成分的嵌合核酸构建体:
(1)从亚麻得到的种子特异性启动子;和
(2)需要的核酸序列,其中所述的需要的核酸对所述的种子特异性启动子是非天然的;
(b)将所述的嵌合核酸构建体导入亚麻植物细胞;和
(c)使所述的亚麻植物细胞生长成能够结种子的成熟亚麻植物,其中所述的需要的核酸序列在所述的种子特异性启动子的控制下,在种子中表达。
在另一方面,本发明提供了用于亚麻种子和其它植物种类的种子中非天然基因的表达,例如用于种子的蛋白质或油组成的修饰的新的亚麻种子特异性启动子。
在优选的实施方案中,种子特异性启动子包含:
(a)如图1(SEQ.ID.NO.:1),图2(SEQ.ID.NO.:4),图3(SEQ.ID.NO.:6)或图4(SEQ.ID.NO.:8)所示的核酸序列,其中T也可以是U;
(b)与(a)的核酸序列互补的核酸序列;
(c)具有与(a)或(b)的核酸序列的基本序列同源性的核酸序列;
(d)是(a),(b)或(c)的核酸序列类似物的核酸序列;
(e)与(a),(b),(c)或(d)的核酸序列在严格杂交条件下杂交的核酸序列。
在另一方面,本发明提供了含有与对所述的第一个核酸序列是非天然的第二个核酸序列可操作地连接的从亚麻得到的第一个核酸序列的嵌合核酸序列,其中所述的第一个核酸序列含有新的亚麻种子特异性启动子。
本发明的其它特征和优点从下面的详细说明中可以容易地了解。但是,应该理解,因为本详细说明书的领域中的技术人员将能够了解本发明的精神和范围内的各种变化和修改,所以当表示本发明的优选实施方案时,只通过说明的方式给出了详述和具体的实施例。
附图的简要说明
下面根据附图描述本发明,其中:
图1表示了编码16.0kDa油质蛋白(SEQ.ID.NO.:2和3)的亚麻基因组克隆的DNA序列,(SEQ.ID.NO.:1)。
图2表示编码18.6kDa油质蛋白(SEQ.ID.NO.:5)的亚麻基因组克隆的DNA序列(SEQ.ID.NO.:4)。
图3表示编码2S贮藏蛋白(SEQ.ID.NO.:7)的亚麻基因组克隆的DNA序列(SEQ.ID.NO.:6)。
图4表示编码54.5kDa类豆球蛋白贮藏蛋白(SEQ.ID.NOS:9-12)的亚麻基因组克隆的DNA序列(SEQ.ID.NO.:8)。
图5表示了用亚麻油质蛋白DNA序列探测的亚麻基因组DNA的Southern印迹分析结果。
图6表示了对亚麻油质蛋白的种子特异性表达的Northern印迹分析的结果。
图7表示了对种子发育过程中亚麻油质蛋白的发育表达的Northern印迹分析的结果。
图8表示了用亚麻油质蛋白启动子-GUS-亚麻终止子基因构建体轰击的亚麻胚的GUS活性。
图9表示了用2S蛋白质基因启动子GUS融合体转化的植物的发育中的亚麻胚和拟南芥属种子中的GUS表达。
图10表示用核丝启动子-GUS-核丝终止子基因构建体转化的转基因亚麻植物中GUS的组织特异性表达。
图11表示了用核丝启动子-GUS-核丝终止子基因构建体转化的转基因亚麻植物中GUS的暂时表达。
图12表示在用核丝启动子-GUS-核丝终止子基因构建体转化的转基因油菜植物(L1到L9)中GUS的表达。
图13表示了用核丝启动子-GUS-核丝终止子基因构建体转化的转基因拟南芥属植物在种子发育的不同时期中GUS的表达。
本发明的详细描述
如上文提到,本发明涉及植物中,特别是亚麻中非天然基因的表达的改良方法。本发明提供了允许在亚麻中非天然基因的种子特异性表达的方法。本发明的方法的优势是,得到了对亚麻种子中非天然基因的表达的更好的控制。非天然基因的表达局限于种子,因此,限制了在其它植物器官或组织中表达产生的潜在的不尽人意的影响。另外,提供的方法允许更好地控制表达特征,如非天然基因的表达水平和植物发育周期中非天然基因的表达计时。本发明的方法特别有用,因为根据本发明,与有价值的原材料如油,蛋白质和多糖相关的种子组成是可以在量和性上发生改变的。
因此,在一个方面,本发明提供了在亚麻种子中表达需要的核酸序列的方法,方法包括步骤:
(a)制备在5’到3’转录方向含有可操作地连接的成分的嵌合核酸构建体;
这些成分有:
(1)从亚麻得到的种子特异性启动子;和
(2)需要的核酸序列,其中所述的需要的核酸对于所述的亚麻种子特异性启动子是非天然的;
(b)在亚麻植物细胞中导入所述的嵌合核酸构建体;和
(c)使所述的亚麻植物细胞生长成能够结种子的成熟植物,其中所述的需要的核酸序列是在所述的亚麻种子特异性启动子的控制下在种子中表达的。
如本文所用,术语“非天然”指任何核酸序列,包括任何RNA或DNA序列,该序列与种子特异性启动子正常情况不相结合。此核酸序列包括从不同于启动子的植物种类得到的异源核酸序列,以及从相同于启动子的植物种类得到的同源核酸序列,但这些核酸序列与野生型(非转基因)植物的启动子无关。
与从亚麻得到的种子特异性启动子连接时,非天然核酸序列产生了嵌合构建体。将嵌合构建体导入亚麻植物细胞中产生转基因亚麻植物细胞,从而产生了与非转基因亚麻植物细胞或从中生长成的亚麻植物相比明显不同表现型的亚麻植物细胞或从中生长成的亚麻植物。在非转化亚麻植物细胞或从中生长成的亚麻植物中不存在与嵌合构建体的核酸序列相同的邻接核酸序列。在这一方面,嵌合核酸序列包括的那些序列含有一个亚麻启动子,与从另一个植物种类得到的核酸序列连接,或与来自亚麻,但与该启动子的连接是不正常的核酸序列连接。如本文所用的嵌合核酸序列进一步包括的序列含有亚麻启动子和与该启动子正常连接但还含有非天然核酸序列的核酸序列。例如,如果启动子是亚麻种子特异性油质蛋白启动子,对亚麻油质蛋白启动子是“非天然”的序列也包括含有与油质启动子天然连接的亚麻油质基因和与该启动子非天然连接的需要的编码序列之间的融合体的序列。术语非天然也指含有上文中的融合基因,该基因另外含有分隔与启动子序列正常连接的核酸序列和编码需要的蛋白质的基因的切割序列。
术语“核酸序列”指含有天然存在的碱基,糖和糖之间(支链)的键的核苷酸或核苷单体的序列。该术语也包括含有发挥相似功能的非天然存在的单体或其部分的修饰的或取代的序列。本发明的核酸序列可以是核糖核酸(RNA)或脱氧核糖核酸(DNA),并且可以含有天然存在的碱基,包括腺嘌呤,鸟嘌呤,胞嘧啶,胸腺嘧啶和尿嘧啶。序列也可以含有修饰碱基,如黄嘌呤,次黄嘌呤,2-氨基腺嘌呤,6-甲基,2-丙基,和其它烷基腺嘌呤,5-卤素尿嘧啶,5-卤素胞嘧啶,6-氮尿嘧啶,6-氮胞嘧啶和6-氮胸腺嘧啶,假尿嘧啶,4-硫尿嘧啶,8-卤素腺嘌呤,8-氨基腺嘌呤,8-硫醇腺嘌呤,8-硫烷基腺嘌呤,8-羟基腺嘌呤和其它8-取代基腺嘌呤,8-卤素鸟嘌呤,8-氨基鸟嘌呤,8-硫醇鸟嘌呤,8-硫烷基鸟嘌呤,8-羟基鸟嘌呤和其它8-取代基鸟嘌呤,其它氮和脱氮尿嘧啶,胸腺嘧啶,胞嘧啶,腺嘌呤,或鸟嘌呤,5-三氟甲基尿嘧啶和5-三氟胞嘧啶。
术语“种子特异性启动子”,指在该启动子控制下表达的基因在植物种子中优势表达,而在其它植物组织中没有表达或没有实质性表达,典型地少于整个表达水平的5%。
在其它方面,本发明提供了在亚麻种子和其它植物种类的种子中用于表达非天然基因的新的亚麻种子特异性启动子。这些启动子可以用于修饰例如种子的蛋白质,油或多糖组成。在优选的实施方案中,种子特异性启动子包括:
(a)如图1(SEQ.ID.NO.:1),图2(SEQ.ID.NO.:4),图3(SEQ.ID.NO.:6)或图4(SEQ.ID.NO.:8)中所示的核酸序列,其中T也可以是U;
(b)与(a)的核酸序列互补的核酸序列;
(c)与(a)或(b)的核酸序列具有基本序列同源性的所属核酸序列;
(d)是(a),(b)或(c)的核酸序列的类似物的核酸序列;或
(e)与(a),(b),(c)或(d)的核酸序列在严格杂交条件下杂交的核酸序列。
术语“具有基本序列同源性的序列”指与(a)或(b)中的序列相比有轻微的或无关紧要的序列变化的那些核酸序列,这些序列以基本相同的方式发挥作用并且能够驱动非天然核酸序列的种子特异性表达。这些变化可能是由于局部的突变或结构上的修饰。具有基本同源性的核酸序列包括与图1(SEQ.ID.NO.:1),图2(SEQ.ID.NO.:4),图3(SEQ.ID.NO.:6)或图4(SEQ.ID.NO.:8)所示的核酸序列至少有65%,更优选地至少85%,最优选地90-95%的同一性的核酸序列。
术语“杂交的序列”指可以在严格杂交条件下与(a),(b),(c)或(d)的序列杂交的核酸序列。促进DNA杂交的适当的严格杂交条件”是本领域技术人员已知的,或者可以在《分子生物学》,John Wiley和Sons,纽约(1989年),6.3.1-6.3.6中的通用方案中找到。例如,可以利用下面的条件:6.0×氯化钠/柠檬酸钠(SSC),约45℃,接着于50℃用2.0×SSC洗。根据洗涤步骤利用的条件可以选择严格度。例如,可以从高严格度:约0.2×SSC,在50℃下选择洗涤步骤中的盐浓度。另外,洗涤步骤中的温度可以是在约65℃的高严格度条件下。
术语“作为类似物的核酸序列”指与(a),(b)或(c)的序列相比,已经修饰的核酸序列,其中的修饰不改变如上所述的序列(即作为种子特异性启动子)的用途。修饰的序列或类似物可能具有比(a),(b)或(c)所示的序列更好的特性。修饰制备类似物的一个例子是用修饰的碱基如黄嘌呤,次黄嘌呤,2-氨基腺嘌呤,6-甲基,2-丙基和其它烷基腺嘌呤,5-卤素尿嘧啶,5-卤素胞嘧啶,6-氮尿嘧啶,6-氮胞嘧啶和6-氮胸腺嘧啶,假尿嘧啶,4-硫尿嘧啶,8-卤素腺嘌呤,8-氨基腺嘌呤,8-硫醇腺嘌呤,8-硫醇烷基腺嘌呤,8-羟基腺嘌呤和其它8-取代基腺嘌呤,8-卤素鸟嘌呤,8-氨基鸟嘌呤,8-硫醇鸟嘌呤,8-硫醇烷基鸟嘌呤,8-羟基鸟嘌呤和其它8-取代基鸟嘌呤,其它氮和脱氮尿嘧啶,胸腺嘧啶,胞嘧啶,腺嘌呤,或鸟嘌呤,5-三氟甲基尿嘧啶和5-三氟胞嘧啶取代图1,图2,图3或图4中所示的序列的一个天然存在的碱基(即,腺嘌呤,鸟嘌呤,胞嘧啶或胸腺嘧啶)。
修饰的另一个例子是包括在图1,图2,图3或图4中所示的核酸分子中的磷酸主链,短链烷基或环烷基糖间键或短链杂原子或杂环糖间键中的修饰的磷或氧杂原子。例如,核酸序列可以含有硫代磷酸酯,磷酸三酯,甲基膦酸酯,和二硫代磷酸酯。
本发明的核酸分子类似物的另一个例子是肽核酸(PNA),其中用与肽中发现的相似的聚酰胺主链代替DNA(或RNA)中的脱氧核糖(或核糖)磷酸主链(P.E.Nielsen,等人,《科学》1991年,254卷,1997)。PNA类似物已经显示对酶的降解具有抗性和在体内和体外具有延长的生命。由于在PNA链和DNA链之间缺乏电荷排斥,PNA与互补的DNA序列的结合也更强。其它核酸类似物可以含有具有聚合物主链,环状主链,或无环主链的核苷酸。例如,核苷酸可以具有吗啉主链结构(美国专利号,5,034,506)。类似物也可以含有基团,如报道基团,一个改进核酸序列的药物动力学或药物动态学特性的基团。
在另一个方面,本发明提供了嵌合核酸序列,含有与第二个核酸序列可操作地连接的从亚麻得到的第一个核酸序列,其中第二个核酸序列对所述第一个核酸序列是非天然的,其中所述的第一个核酸序列含有新的亚麻种子特异性启动子。优选地,启动子是从图1,图2,图3和图4的启动子的组中选择的或是在严格条件下与它们杂交的核酸序列。
根据本发明,可以将嵌合核酸序列以已知的方法掺入能保证在种子细胞中有良好的表达的重组表达载体。因此,本发明包括含有适于在种子细胞中表达的本发明的嵌合核酸序列的重组表达载体。
术语“适于在种子细胞中表达”指重组表达载体含有本发明的嵌合核酸序列,调节区和终止区,是根据用于表达的种子细胞选择的,它与编码需要的氨基酸组成的多肽的核酸序列操作性地连接。操作性地连接指编码多肽的嵌合核酸序列与调节序列和允许在种子细胞中表达的终止区连接。典型的构建体在5’到3’方向由用能够指导植物中的表达的启动子完成的调节区,多肽编码区和在植物细胞中发挥功能的转录终止区组成。这些构建体可以根据分子生物学领域的技术人员已知的方法来制备(参见例如:Sambrook等人,(1990年),《分子克隆》第二版,冷泉港出版社)。构建体的制备中可以涉及到如限制消化,连接,凝胶电泳,DNA测序和PCR等技术。许多克隆载体是进行必要的克隆步骤能够采用的。特别适用于本目的的是带有在大肠杆菌中发挥功能的复制系统的克隆载体如pBR322,pUC系列,M13mp系列,pACYC184,pBluescript等。可以将核酸序列导入这些载体,并且这些载体可以用于转化大肠杆菌,大肠杆菌可以在适当的培养基中生长。在收获和溶解细胞后,可以从细胞中回收质粒。最后的构建体可以导入适合于整合进入植物的植物载体,如Ti和Ri质粒。
根据本发明在亚麻种子中表达非天然基因的方法可以利用任何亚麻种子特异性启动子实施并且不受选择的具体的亚麻种子特异性启动子的限制。在本发明的优选的实施方案中,亚麻种子特异性启动子给予非天然核酸序列至少一个与天然启动子给予天然核酸序列的表达特征相似或相同的表达特征。如本文所用,术语“表达特征”指亚麻种子特异性启动子给予与亚麻种子特异性启动子可操作地连接的核酸序列的任何可检测的特性或效果。所以,在优选的实施方案中,非天然核酸序列在植物生命周期中表达的计时是与天然核酸序列中的表达计时相似或相同的。在其它优选的实施方案中,异源核酸序列的表达水平与天然核酸序列的表达水平相似或相同。在其它特定的实施方案中,非天然基因对光照条件的改变,波长或光强度的改变,例如温度的改变,组织创伤,化学试剂例如植物激素和杀虫剂的浓度变化的反应,是与天然核酸序列对这些刺激的反应相似的。亚麻种子特异性启动子给予的其它需要的表达特征是能够被本领域技术人员认识到的,并且因此可以选择亚麻种子特异性启动子。
可以根据本发明使用的亚麻种子特异性启动子包括与种子贮藏蛋白如所有清蛋白和球蛋白,包括豌豆球蛋白和类豆球蛋白相关的启动子,以及与种子贮藏蛋白,如油质蛋白不相关的种子特异性启动子。其它特别需要的是与脂肪酸代谢,如酰基载体蛋白(ACP),饱和酶,去饱和酶,延伸酶等等相关的启动子。
在本发明的优选的实施方案中,所用的种子特异性启动子是油质蛋白启动子,类豆球蛋白种子贮藏蛋白启动子或2S贮藏蛋白启动子。在特别优选的实施方案中,种子特异性启动子具有图1,图2,图3或图4所示的序列或可从亚麻得到并在严格条件下与这四种核酸序列的任一种杂交的任何核酸序列。
根据本发明可以利用其它亚麻种子特异性启动子.这些启动子可以用许多方法得到.分离了亚麻种子蛋白质后,可以部分地测序,从而设计核酸探针用于鉴定种子特异性RNA.为了进一步增加与种子特异性相关的RNA,可以从种子细胞制备cDNA,cDNA可以减掉来自非种子细胞的mRNA或cDNA.剩余的种子cDNA然后可以用于为互补序列探测基因组DNA文库.与cDNA杂交的序列随后就可以得到,相关的启动子区也可以分离.利用来自其它植物种类的已知种子特异性基因筛选从亚麻种子组织制备的基因组DNA文库并随后分离它们的相关启动子也是可能的.由于种子中种子贮藏蛋白相对富裕,通过随机测序亚麻种子cDNA文库来获得序列信息也是可能的.与已知的种子贮藏蛋白的序列相匹配的cDNA序列可以用于鉴定相关的启动子.对已知的种子特异性蛋白质和/或启动子可以寻找含有来自大规模的例如拟南芥属和玉米的测序得到的序列信息的数据库,该信息可以用于鉴定具有序列相似性的亚麻中的启动子序列.分离其它亚麻种子特异性启动子的备选方法可以利用,本领域技术人员可以发现新的亚麻种子特异性启动子并且根据本发明使用.
与启动子连接的需要的核酸序列可以是任何需要的核酸序列,包括编码需要的肽或蛋白质,例如酶的任何RNA或DNA序列,或与基因组序列互补的序列,其中基因组序列可以是至少一种可读框,内含子,非编码前导序列,或其中的互补序列将抑制转录,信使RNA加工,例如拼接或翻译的任何序列。该需要的核酸序列可以是合成的,自然起源的或它们的结合体。另外,需要的核酸序列可以是天然序列的片段,例如只包括催化区或特别重要的结构。根据需要的核酸序列的特性,合成具有植物优选密码子的序列可能是需要的。植物优选密码子可以从在需要的特定植物种类中以最大量表达的蛋白质中频度最高的密码子中确定。
需要的核酸序列可以编码任何种类的重组蛋白质,通过本发明的方法可以表达的重组蛋白质的例子包括具有有利的催化功能的蛋白质或将积累到高水平并需要时提取的有价值蛋白质。具有催化功能的蛋白质包括,但不限于给予结种子新的生化表现型的蛋白质。新表现型可以包括如下的修饰:如改变种子蛋白质或种子油组成或种子多糖组成,提高预存在的需要产物或特性的生产,和利用反义,核酶或共抑制技术减少或甚至抑制不需要的基因产物(Izant和Weintraub(1984年)《细胞》26卷:1007-1015页,反义;Hazelhoff和Gerlach(1988年)《自然》334卷:585-591页,核酶;Napoli等人(1990年)《植物细胞》2卷:279-289页,共抑制)。
尽管在不同的胚组织如胚轴和子叶中可以检测到改变的细胞表达,但仍然期望需要的蛋白质在所有的胚组织中表达。需要的核酸序列可以在种子发育的任何时期表达。表达的计时可能依据本发明的特定用途而不同。参与油修饰的酶的表达可能在种子发育的早期就需要,例如在种子贮藏蛋白的累积之前。
除了需要的启动子区和核酸序列,能够终止转录的核酸序列通常也包括在表达载体中。转录终止子优选地约为200到1,000个核苷酸碱基对,可以含有在植物中发挥功能的任何这样的序列,如胭脂碱合酶终止区(Bevan等人,(1983年)《核酸研究》11卷:369-385页),菜豆蛋白终止子(Van der Geest等人,(1994年)《植物杂志》6(3):413-423页),根癌土壤杆菌的章鱼氨酸合酶基因的终止子或其它相似地发挥功能的元件。这些转录终止区可以如An(1987年),《酶学方法》153卷:292页所述得到,或已经存在于从商业源如ClonTech,Palo Alto,加利福尼亚得到的质粒中。合适的终止区的选择可能对转录速率有影响。
嵌合构建体可以进一步含有如AMV前导区(Jobling和Gehrke(1987年),《自然》32卷:622-625页)的增强子或内含子.应该理解的是表达载体的设计可根据如植物种类选择和/或待表达的多肽的类型这样的因素而不同.
表达载体正常情况下也将含有标记基因。标记基因包含能够区别已转化植物细胞与非转化细胞的所有基因,包括可选择并可筛选的标记基因。为了方便,标记可以是针对除草剂如甘氨磷或磷丝菌素,或针对抗生素如给予通过化学方法可以选择的特性的卡那霉素,G418,博来霉素,潮霉素,氯霉素等等的抗性标记。可筛选的标记可用于观察鉴定转化体。它们包括但不限于β-葡糖醛酸糖苷酶或uidA基因,β-内酰胺酶基因或绿荧光蛋白质(Niedz等人(1995年)Plant Cell Rep.;14卷:403页)。
为了在植物细胞中导入核酸序列,通常,技术人员可以利用各种技术。土壤杆菌介导的亚麻植物细胞转化已经有报道,虽然其它各种技术(参见下面)也可以用于需要时在亚麻细胞中导入嵌合DNA构建体,但根据Dong和McHughen(1993年)《植物科学》88卷:61-77页教授的方法可以得到亚麻转化体。
根据本领域的技术人员已知的常规农业实践培养的转化亚麻植物是允许结种子的。从而可从成熟的亚麻植物得到亚麻种子,并分析其需要的相对于野生型种子已改变的特性。
可以使两代或更多代植物生长并且杂交或自交,从而能鉴定出具有需要的表现型特征的植物和品系包括产生重组多肽。保证植物的纯合性以保证重组特性能够连续地遗传是需要的。选择纯合的植物的方法是植物育种领域的技术人员已知的,包括轮回自花授粉和选择和花药及小孢子培养。通过转化单倍体细胞或组织,接着繁殖单倍体小植物,随后通过任何已知的各种方法(例如,用秋水仙素或其它微管裂解试剂处理)转化成二倍体植物也可以得到纯合植物。
本发明也可以包括根据下列方法制备的转基因亚麻种子,所述方法包括:
(a)制备5’到3’转录方向上含有下列可操作地连接的成分的嵌合核酸构建体:
(1)从亚麻得到的种子特异性启动子;和
(2)需要的核酸序列,其中所述的需要的核酸对所述的种子特异性启动子是非天然的;
(b)在亚麻植物细胞中导入所述的嵌合核酸构建体;和
(c)使所述的亚麻植物细胞生长成能够结种子的成熟亚麻植物,
其中所述的需要的核酸序列是在所述的种子特异性启动子的控制下在种子中表达的。
在本发明的优选的实施方案中,种子特异性启动子是从亚麻种子特异性启动子的组,包括2S贮藏蛋白启动子,球蛋白启动子,油质蛋白启动子,和类豆球蛋白种子贮藏蛋白启动子中选择的。图1(SEQ.ID.NO.:1),图2(SEQ.ID.NO.:4),图3(SEQ.ID.NO.:6)和图4(SEQ.ID.NO.:8)中表示了特定的启动子序列。
本发明进一步提供能够用下列方法制备的能够结种子的亚麻植物:
(a)制备在5’到3’转录方向含有下列可操作连接成分的嵌合核酸构建体:
(1)从亚麻得到的种子特异性启动子;和
(2)需要的核酸序列,其中需要的所述核酸对所述的种子特异性启动子是非天然的;
(b)在亚麻植物细胞中导入所述嵌合核酸构建体;和
(c)使所述的亚麻植物细胞生长成能结种子的成熟亚麻植物,
其中所述的需要的核酸序列是在所述的种子特异性启动子的控制下在种子中表达的。
本发明进一步提供了图1(SEQ.ID.NO.:1),图2(SEQ.ID.NO.:4),图3(SEQ.ID.NO.:6)和图4(SEQ.ID.NO.:8)中所示的新启动子在亚麻以外的植物种类中的使用方法。因此,本发明也包括含有从图1,图2,图3和图4所示的启动子的组中选择的启动子和需要的核酸序列的嵌合核酸构建体的制备,和以种子特异性方法,将需要的核酸序列在亚麻以外的植物种类中并且在亚麻启动子的控制下进行表达。
在本发明的另一方面,提供了在植物种子中表达需要的核酸序列的方法,该方法包括:
(a)制备在5’到3’转录方向含有下列可操作地连接的成分的嵌合核酸构建体:
(1)从由下面成分组成的种子特异性启动子的组中选择的种子特异性启动子:
(i)图1(SEQ.ID.NO.:1),图2(SEQ.ID.NO.:4),图3(SEQ.ID.NO.:6)或图4(SEQ.ID.NO.:8)所示的核酸序列,其中T也可以是U;
(ii)与(i)的核酸序列互补的核酸序列;
(iii)与(i)或(ii)的核酸序列具有基本序列同源性的核酸序列;和
(iv)是(i),(ii)或(iii)的核酸序列的类似物的核酸序列;
(v)与(i),(ii),(iii)或(iv)的核酸序列,在严格条件下杂交的核酸序列;和
(2)所述的需要的核酸;
(b)将嵌合核酸构建体导入植物细胞;
(c)使所述的植物细胞生长成能够结种子的成熟植物;其中所述的需要的核酸序列是在所述的种子特异性启动子的控制下在种子中表达的。
为了将核酸序列,特别是DNA导入植物宿主细胞,通常可以利用各种技术,例如,可以利用如Moloney等人(1989年),Plant Cell Rep.;8卷:238-242页或Hinchee等人(1988年)《生物技术》6卷:915-922页所述的转化方案,或本领域技术人员已知的其它技术,利用标准土壤杆菌载体,可以将嵌合DNA构建体导入从双子叶植物,如烟草和产生油的种类,如欧洲油菜(Brassica napus)得到的宿主细胞。例如,利用T-DNA转化植物细胞已经进行了广泛的研究并且已经在EP 0 120 516,Hoekema等人,(1985年),第V章:《二元植物载体系统》Offset-drukkerij Kanters BV,Alblasserdam)中;Knauf等人,(1983年),《土壤杆菌的宿主表达的遗传学分析》,245页,《细菌-植物的相互作用的分子遗传学》,Puhler,A编辑,Springer-Verlag,纽约中心;和An等人,(1985年),《EMBO杂志》,4卷:277-284页)中充分叙述。土壤杆菌转化也可以用于转化单子叶植物种类(美国专利5,591,616)。
为了方便,利用根癌土壤杆菌或发根病土壤杆菌培养外植体能够使转录构建体转移进植物宿主细胞。在利用土壤杆菌转化后,将植物细胞分散在适当的培养基中选择,然后回收愈伤组织,茎干和最终的植物。土壤杆菌宿主细胞将含有质粒,该质粒含有将T-DNA转移到植物细胞所必需的vir基因。为了注入和电穿孔(参见如下),可以将去臂的Ti质粒(缺乏肿瘤基因),特别是T-DNA区)可以导入植物细胞。
非土壤杆菌技术的利用允许利用本文所述的构建体获得在许多单子叶和双子叶植物种类中的转化和表达.这些技术特别可用于土壤杆菌转化系统中难处理的植物种类的转化.基因转移的其它技术包括粒子轰击(Sanford,(1988),《生物技术趋势》6卷:299-302页,电穿孔(Fromm等人,(1985年),《美国国家科学院院报》,82卷:5824-5828页;Riggs和Bates,(1986年),《美国国家科学院院报》,83卷:5602-5606页),PEG介导的DNA吸收(Potrykus等人,(1985年),《分子基因遗传学》,199卷:169-177页),显微注射(Reich等人,《生物技术》(1986年)4卷:1001-1004页)和硅氧烷碳化物细丝(Kaeppler等人(1990年)PlantCell Rep.,9卷:415-418页)。
在其它特定的应用中,如在欧洲油菜中,如Moloney等人,(1989年)Plant Cell Rep.,8卷:238-242页所述,被靶击接受重组DNA构建体的宿主细胞通常将是从子叶的叶柄得到的。利用有商业用途的油种子的其它例子包括在大豆外植体中转化子叶(Hinchee等人,(1988年)《生物技术》,6:915-922页)和棉花的茎转化(Umbeck等人,(1987年)《生物技术》,5卷:263-266页)。
在转化后,细胞,例如叶片是在选择培养基上生长的。一旦茎干开始出现,就把它们切下,放置在长根的培养基上。在形成足够的根后,将植物转移到土壤中。然后,测试推定的转化植物中标记的存在。利用适当的探针对基因组DNA进行Southern印迹分析,表明整合到宿主细胞的基因组中。
本发明提供的方法可以和大范围的植物种类结合使用。根据本发明使用的特别优选的植物细胞包括来自下列植物的细胞:大豆(Glycinemax),油菜(Brassica napus,Brassica campestris),向日葵(Helianthus annuus),棉花(Gossypium hirsutum),玉米(Zea mays),烟草(Nicotiana,tobacum),苜蓿(Medicago Sativa),小麦(Triticumsp.),大麦(Hordeum vulgare),燕麦(Avena Sativa L.),高粱(Sorghumbicolor),拟南芥(Arabidopsis thaliana),土豆(Solanum sp.),亚麻/亚麻子(Linum usitatissimum),红花(Carthamus tinctorius),油棕榈(Eleais guineeis),落花生(Arachis hypogaea),巴西坚果(Bertholletia excelsa),椰子(Cocus nucifera),蓖麻(Ricinuscommunis),芜荽(Coriandrum sativum),南瓜(Cucurbita maxima),灌木(Simmondsia chinensis)和水稻(Oryza sativa)。
本发明具有各种用途,包括通过积累已改变的多肽或新的重组肽或通过引入或去除代谢步骤,提高植物种子的内在价值.利用本发明可能导致提高蛋白质的质量(例如,增高必需的或稀有的氨基酸的浓度),通过修饰脂肪组成提高液体质量,或改良或增多的碳水化合物组成.例子包括富硫蛋白质如在含硫氨基酸缺乏的种子中,在白羽扇豆或巴西坚果中发现的那些富硫蛋白质的表达.蛋白质质量的改良也可以通过必需氨基酸,包括赖氨酸,半胱氨酸,甲硫氨酸和色氨酸丰富的蛋白质或蛋白质片段的表达来实现.或者,可以表达脂肪酰基辅酶A,一种能够改变甘油三酯(贮藏脂)中脂肪酸的比例的转移酶.在种子中允许积累重组蛋白质的情况中,蛋白质也可以是具有药学或工业价值的肽.在这种情况中,可以从种子中提取肽,并且如果对预期用途合适,可以粗品或纯化的形式利用.同样,在种子中表达的多肽可以是天然蛋白质的片段或衍生物.可药用的蛋白质可以包括,但不限于抗凝剂,如水蛭素,抗体,包括单克隆抗体和抗体片段,疫苗,细胞因子或生长因子如牛生长因子,胆碱能分化因子(CDF),睫状神经营养因子(CNTF),成纤维细胞生长因子(FGF),鱼生长因子,促性腺激素,粒细胞集落刺激因子(G-CSF),粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子(GM-CSF),人生长激素,干扰素α(IFN-α),干扰素β(IFN-β),干扰素γ(IFN-γ),白介素1-α(IL1-α),白介素1-β(IL1-β),白介素-2(IL-2),白介素-3(IL-3),白介素-4(IL-4),白介素-5(IL-5),白介素-6(IL-6),白介素-10(IL-10),白血病抑制因子(LIF),硫氧还蛋白,巨噬细胞集落刺激因子(M-CSF),骨髓单核细胞生长因子,神经生长因子(NGF),制癌蛋白M,血小板起源生长因子(PDGF),促乳素,转化生长因子α(TGF-α),转化生长因子β2(TGF-β2),肿瘤坏死因子α(TNF-α),肿瘤坏死因子β(TNF-β).药物用途的蛋白质也可以包括哺乳动物蛋白质,例如,但不限于α-1-抗胰蛋白酶,抗肥胖蛋白,血液蛋白,胶原蛋白,胶原酶,弹性蛋白,弹性蛋白酶,肠肽酶,纤维蛋白原,血红蛋白,人血清白蛋白,胰岛素,乳铁蛋白,肌红蛋白和肺表面活性蛋白.
有工业用途的肽可能包括,但不限于α-淀粉酶或其它淀粉酶,淀粉葡糖苷酶,阿拉伯聚糖酶,过氧化氢酶,纤维二糖水解酶,纤维素酶,几丁质酶,胰凝乳蛋白酶,脱氢酶,内葡聚糖酶,凝乳酶,内半乳聚糖酶,酯酶,β-半乳糖苷酶,α-半乳糖苷酶或其它半乳糖苷酶,胃脂肪酶,葡聚糖酶,葡糖异构酶,半纤维素酶,水解酶,异构酶,木素酶,脂酶,裂解酶,溶菌酶,氧化酶,氧化还原酶,木瓜蛋白酶,果胶酶,果胶裂合酶,过氧化物酶,磷酸酶,植酸酶,蛋白酶,支链淀粉酶,还原酶,丝氨酶蛋白酶,硫氧还蛋白,转移酶,胰蛋白酶,和木聚糖酶。
下面的非限制实施例是本发明的解释:
实施例
实施例1
种子特异性亚麻启动子的分离
种子特异cDNA克隆是从亚麻种子特异性cDNA文库中分离到的。将这些cDNA克隆测序,利用Basic Local Alignment Search Tool(BLAST)比较这些序列和公共数据库如基因库中的其它序列。这一比较发现,几个分离的cDNA的推测的氨基酸序列与低的和高的分子量类别的油质蛋白,2S-白蛋白和类豆球蛋白的贮藏蛋白具有高度的相似性。分别从编码油质蛋白,2S白蛋白和类豆球蛋白的贮藏蛋白的cDNA部分制备探针,并利用这些探针筛选从亚麻品系Forge制备的基因组文库,该品系对于四个锈病抗性基因是纯合的(Anderson等人,(1997年),《植物细胞》9卷:641-651页)。在高度严格筛选后,鉴定对于每个探针的几个阳性λ克隆。将插入片段亚克隆进质粒载体pBluescript并测序。序列信息揭露,我们已经分离到了基因组中油质蛋白,2S白蛋白的相当部分和cDNA类豆球蛋白cDNA。图1到4分别表示了含有编码高和低分子量油质蛋白同工型,2S白蛋白的序列的基因组克隆和类豆球蛋白基因的序列信息。
图1和SEQ.ID.NO.:1表示了编码16.0kDa油质蛋白(低分子量或L-同工型)的亚麻基因组克隆的DNA序列.推测的调节元件得到了鉴定并指示出.这些调节元件包括倒转重复(碱基对805到813和821到829;碱基对1858到1866和1877到1885),同向重复(碱基对184到193和1102和1111;碱基对393到402和1701到1710;碱基对683到692和1546到1555;碱基对770到781和799到810;碱基对955到964和1936到1945;碱基对1483到1496和1513到1526),抗坏血酸应答元件(ABRE)(碱基对1859到1866),CACA盒子(碱基对1933到1936),TATA盒(碱基对1925到1931)和CAT盒(碱基对3020到3025).可读框是用1个短内含子(已标记)中断的并且2个外显子翻泽了,并且IUPAC单字母氨基酸密码表示.
图2和SEQ.ID.NO.:4表示了编码18.6kDa的油质蛋白(高分子量或H-同工型)的亚麻基因组克隆的DNA序列。推测的调节元件鉴定并指示了。这些元件包括同向重复(碱基对14-25和1427-1438;碱基对80-89和1242-1251;碱基对177-186和837-846;碱基对1281-1290和1242-1251;碱基对1591-1600和1678-1287)。这一可读框没有被内含子中断,翻译了和用IUPAC单字母氨基酸密码表示了。
图3和SEQ.ID.NO.:6表示了编码2S贮藏蛋白的亚麻基因组克隆的DNA序列。对这一克隆的核苷酸序列分析表明它具有一个174个氨基酸的可读框,这些氨基酸表现出与植物2S贮藏蛋白组有同源性。该序列编码与甘蓝(Brassica oleracea)2S贮藏蛋白具有38%的整体相似性,包括完全保守的一段富谷氨酸序列QQQGQQQGQQQ(SEQ.ID.NO.:13)一个可读框。另外,2S贮藏蛋白基因启动子含有几个推测的启动子调节元件。这些元件包括富AT的重复(碱基对25-36,97-108和167-190),RY类似重复(碱基对240-247),G-盒-类似元件(碱基对274-280),种子特异性盒类似基序(碱基对285-290)和TATA盒(碱基对327-333)。
图4和SEQ.ID.NO.:8表示了编码54.4kDa的类亚麻豆球蛋白种子贮藏蛋白的亚麻基因组克隆的DNA序列。这一类豆球蛋白种子贮藏蛋白基因也可称为“核丝”。将核丝基因的推测的氨基酸序列与来自R.Communis的类豆球蛋白蛋白质,来自M.salicifolia.Q.robur和G.hirsutum的豆球蛋白前体,来自O.Sativa的谷蛋白前体和来自A.thaliana的12S种子贮藏蛋白比较。核丝基因表现出与来自R.Communis,M.salicifolia,Q.robur,G.hirsutum,O.Saliva和A.thaliana的相应的蛋白质分别具有59/15,47/16,50/17,45/17,43/18和43/18百分数的序列同一性/相似性。在启动子区中的推测的调节元件被鉴定和指明。这些元件包括倒转重复(碱基对265到276和281到292;碱基对513到524和535到545),重复(碱基对1349到1360和1367到1378;碱基对1513到1529和1554到1572),抗坏血酸应答元件(ABRE)(碱基对1223和1231),豆球蛋白盒(RY重复)(在碱基对1223和1231之间),可能的豌豆球蛋白盒区(碱基对1887到1894),CAAT盒(碱基对1782到1785)和TATA盒(碱基对1966到1970)。同样,指示了用于ER膜导向的信号肽(碱基对2034-2080)。可读框是用3个短内含子(被标记的)中断的,并且4个外显子被翻译并用IUPAC单字母氨基酸代码表示。
图5表示了亚麻基因组DNA的Southern印迹分析。从叶子中分离了60μg亚麻基因组DNA,用EcoRI(泳道1),HindIII(泳道2)和BamHI(泳道3)消化,并加载于各自的泳道上。A)用随机引导的32P-标记的3TcDNA(高分子量亚麻油质蛋白同工型)进行杂交。B)用随机引导的32P-标记的7R cDNA(低分子量油质蛋白同工型)进行杂交。结果证明,3T(高分子量油质蛋白同工型)和7R(低分子量油质蛋白同工型)油质蛋白cDNA与亚麻基因组DNA杂交。更具体地说,这些结果表明,3T似乎是代表亚麻中的2-拷贝基因,正如每条消化泳道中的两条带所见到的。同样,7R似乎代表了亚麻中的多个基因家族,因为每条消化泳道都检测到多个条带。
实施例2
亚麻油质蛋白基因的种子特异性表达
图6表示了对亚麻油质蛋白的种子特异性表达的Northern印迹分析.在不同组织中的两种油质蛋白mRNA的Northern杂交.从不同的组织,R,根;C,子叶;L,叶子;S,种子荚膜;E,胚胎提取10μg总RNA.用(A)编码高分子量(H)-同工型的cDNA(与图2中所示的编码序列相同)和(B)编码低分子量(L)同工型的cDNA(与图1所示的编码序列相同)探测膜.两种转录物只在胚和含有胚的种子荚膜中表达.
实施例3
种子发育过程中亚麻油质蛋白基因的发育表达
图7表示了对种子发育过程中亚麻油质蛋白的发育表达的Northern印迹分析。在琼脂糖/甲醛凝胶上的每个泳道中加载15μg总RNA,并在Hybond N+膜上印迹。10J:用32P dCTP标记的亚麻油质蛋白cDNA克隆(低分子量同工型)探测该膜。表示的各时期是开花期后的天数(DPA)。3T)在琼脂糖/甲醛凝胶上的每泳道中加载15μg的总RNA,并且Hybond N+膜上印迹。3T:用32P dCTP标记的亚麻油质蛋白cDNA克隆(高分子量同工型)探测该膜。转录物在发育的很早期(6DPA,早子叶时期)表达。在16到20DPA(晚子叶时期)表达最大,并且在22DPA(成熟的胚)中表达下降。
实施例4
当在亚麻油质蛋白调节序列的调节控制下时,β-葡糖醛酸糖苷酶(GUS)的瞬时种子特异性表达
利用标准的分子生物学技术(例如参见:Sambrook等人,(1990年),《分子克隆》,第二版,冷泉港出版社),包括限制酶消化,连接和聚合酶链反应(PCR)制备两个构建体。
构建体pSC54:将来自载体GUSN358>S(Clontech实验室)的β-葡糖醛酸糖苷酶报道基因编码序列放置在核苷酸21到1852的启动子序列和核苷酸2395到3501的终止子序列之间(如图1所示)。这一插入片段克隆进pBluescript,得到的载体称为pSC54。
构建体pSC60:将来自载体GUSN 358>S(Clontech实验室)的β-葡糖醛酸糖苷酶报道基因的编码序列放置于核苷酸1到2023的启动子序列和核苷酸2867到3925的终止子序列之间(如图2所示)。将这一插入片段克隆进pBluescript,得到的载体称为pSC60。
利用标准方案进行粒子轰击(例如参见Abenes等人(1997年)PlantCell Rep.;17卷:1-7页)将pSC54,pSC60和一个无启动子的GUS构建体(对照)导入亚麻胚。图8表示了在粒子轰击后48小时时测量的用pSC54,pSC60和无启动子GUS构建体轰击的亚麻胚的GUS活性。正如可见的,亚麻油质蛋白调节序列足以启动亚麻胚中GUS的表达。
实施例5
当在亚麻2S贮藏蛋白基因启动子的调节控制下时,亚麻和拟南芥中β-葡糖醛酸糖苷酶(GUS)的稳定的种子特异性表达
如下,将来自图3所述的DNA片段的5’和3’区掺入无启动子-GUSpBI101载体制备GUS报道基因构建体。
利用了下面的引物(在图3中表示了位置)将来自图3所述的DNA片段的5’末端的400bp的扩增子进行PCR扩增:
5’引物(1):5′-TCCACTATGTAGGTCATA-3′(SEQ.ID.NO.:14)
3’引物(1):5′-CTITAAGGTGTGAGAGTC-3′(SEQ.I.NO.:15)
PCR引物也含有HindIII和BamHI的限制位点,可用于将400bp的5’UTR扩增子克隆进GUS报道基因前面,pBI101载体的HindIII/BamHI位点中.利用下面的引物(在图3中表示了位置),将来自图3所述的DNA片段的3’未翻译区(3’UTR)的736bp的扩增子进行PCR扩增:
5’引物(2):5′-AGGGGTGATCGATTA-3′(SEQ.ID.NO.:16)
3’引物(2):5′-GATAGAACCCACACGAGC-3′(SEQ.ID.NO.:17)
这些PCR引物也含有SacI和EcoRI的限制位点。用SacI/EcoRI消化切出pBI101载体的NOS终止区,并用图3所述的DNA片段的相似消化的736bp的3’UTR扩增子替代。
然后,根据前面所述的方案,将GUS报道基因构建体电穿孔进根癌土壤杆菌菌株AGL1并且进行亚麻(Finnegam等人,(1993年)《植物分子生物学》22(4):625-633页)和拟角芥属(Valvekens等人《美国国家科学院院报》,85卷:5536-5540页)的转化。
将带有GUS报道基因构建体的亚麻和拟南芥属植物的各种组织在组织学上进行GUS活性迹象的测定。在亚麻中,将从发育的种子中切出的叶子组织,根组织和中等成熟的胚都染色用于GUS活性测定。对于拟南芥属,将发育的种子在长角果中进行原位GUS染色。
将各种组织浸泡在含有0.5mM的X-gluc,0.5M磷酸钾缓冲液(pH7.0),1mM EDTA,0.5M山梨糖醇,0.5mM的铁氰化钾和0.5mM的亚铁氰化钾的组织化学缓冲液中,进行GUS染色。在37℃下,进行染色反应12-16小时,加入95%的乙醇终止反应。随后在95%的乙醇中反复清洗除去组织中的叶绿素,再照相。图9表示了在发育的亚麻胚和拟南芥属种子中有明显的强GUS活性的迹象,而在亚麻的根或叶子,或拟南芥属长角果的壁中没有明显的GUS报道基因表达的迹象。
实施例6
当在亚麻类豆球蛋白贮藏蛋白基因调节序列的调节控制下时,亚麻,拟南芥属和欧洲油菜中β-葡糖醛酸糖苷酶(GUS)的稳定的种子特异性表达
利用标准的分子生物学技术,包括限制酶消化,连接和聚合酶链反应(PCR)可以制备构建体。为了得到在适于与GUS编码序列连接的构型中含有来自类亚麻豆球蛋白种子贮藏蛋白的5’转录起始区的约2千个碱基的DNA片段,利用了基于PCR的途径。其中包括利用聚合酶链反应扩增表达分析需要的准确序列。为了进行必要的PCR扩增,合成两个低聚核苷酸引物(Beckman Oligo 1000M DNA合成器),它们具有下面的序列:
5’引物:5′TATCTAGA 3′(SJ-634)(SEQ.ID.NO.:18)
斜体的碱基对应的是图4中报告的序列中的核苷酸1到21。在引物中的这一序列中的其它5’核苷酸与启动子序列是不同的,但为了将一个XbaI位点放置在扩增产物的5’末端,这些核苷酸也包括在其中。XbaI位点(5’-TCTAGA-3’)(SEQ.ID.NO.:19)是下面划线的。
合成的第二个(3’)引物具有下面序列:
3’引物:5′3′(SJ-618)(SEQ.ID.NO.:20)
这一引物含有图4中报告的碱基2343到2363的序列的精确补体(用斜体表示)。因为天然NcoI位点(5’-CCATGG-3’)(SEQ.ID.NO.:21)跨越了碱基对2034和2039之间的起始密码,所以这一引物不是用附加的限制酶位点设计的,从而允许贮藏蛋白启动子插入适当的克隆载体。
将这两个引物用于PCR扩增反应,产生了含有在5’末端带有XbaI位点和距3’末端302个碱基对的NcoI位点的亚麻种子贮藏蛋白基因的1和2342核苷酸之间的序列的DNA片段。利用酶制造商建议的条件和94℃(变性)1分钟,55℃(退火)1分钟,和72℃(延伸)3.5分钟的温度程序,利用酶Pfu(Strategene)进行PCR扩增。模板是图4表示的豆球蛋白种子贮藏蛋白基因组克隆。
随后,用XbaI和NcoI消化得到的扩增产物以移取需要的2kb启动子区。将这一启动子片段克隆进命名的pGUS1318的XbaI和NcoI消化的质粒的XbaI和NcoI位点,(用NcoI和EcoRI切割质粒pGUSN358S(Clontech实验室)并且将GUS插入片段克隆进用来在多克隆位点含有NcoI位点的pBluescript KS+(Strategene)。得到的含有启动子-GUS融合体的质粒称为pPGUS1318。同样从上面提到的基因组克隆扩增了来自亚麻的豆球蛋白种子贮藏蛋白的终止子。为了进行必要的PCR扩增,合成了具有下列序列的寡聚核苷酸引物:
5’引物:5′GCAAGCTTAATGTGACGGTGAAATAATAACGG 3′(SJ620)(SEQ.ID.NO.:22)
斜体碱基对应于图4报告的序列中核苷酸位置3780到3803。引物中的这一序列的其它5’核苷酸与启动子序列是不同的,但为了在扩增产物的5’末端放置一个HindIII位点,这些核苷酸包括在其中。HindIII位点(5’-AAGCTT-3’)(SEQ.ID.NO.:23)下面是划线的。
合成的第二个(3’)引物具有下面序列:
3’引物:5′TAGGTACCTGGCAGGTAAAGACTCTGCTC3′(SJ-618)(SEQ.ID.NO.:.24)
这一引物含有图4报告的碱基4311到4290的序列的精确补体(用斜体表示)。引物中的这一序列的其它5’核苷酸与启动子序列不同,但为了在扩增产物的5’末端放置一个KpnI位点,这些核苷酸也包括其中。KpnI位点(5’-GGTACC-3’)(SEQ.ID.NO.:25)是下面划线的。
将这两个引物用于PCR扩增反应,产生含有在5’末端带有HindIII位点和3’末端带有KpnI位点的亚麻种子贮藏蛋白基因终止子的核苷酸3779和4311之间的序列的DNA片段。利用PCT的扩增如上所述。用XhoI消化上面的含有扩增的启动子的pPGUS1318载体,并用Klenow处理产生一个钝化的末端。随后用KpnI消化载体,将上面的扩增终止子序列插入,使它定位在GUS编码序列的3’端。得到的含有亚麻贮藏蛋白启动子,GUS和亚麻种子贮藏蛋白终止子的载体称为pPGUST。
将含有核丝启动子-GUS编码序列-核丝终止子序列的pPGUST的XbaI-KpnI插入片段连接进从土壤杆菌二元质粒pPZP221衍生的载体pSBS3000的XbaI-KpnI位点(Hajdukiewicz等人,(1994年),《植物分子生物学》,25:989-994页).在pSBS3000中,用芹菜泛素启动子-膦丝菌素乙酰基转移酶基因-芹菜泛素终止子序列代替pPZP221的植物庆大霉素抗性基因,以给予对除草剂(草铵膦)的抗性.得到的载体称为pSBS2089.另外,将含有核丝启动子-GUS编码序列-核丝终止子序列的pPGUST的XbaI-KpnI插入片段连接进土壤杆菌二元质粒pCGN1559的XbaI-KpnI位点(MacBride和Summerfield,1990年,《植物分子生物学》,14卷:269-276页,给予了对抗生素庆大霉素的抗性).得到的载体称为pSBS2083.将质粒pSBS2089和pSBS2083通过电穿孔进入土壤杆菌菌株EHA101.土壤杆菌菌株EHA101(pSBS2089)用于转化亚麻和拟南芥属,土壤杆菌菌株EHA101(pSBS2083)用于转化欧洲油菜.除了在10μM的L-膦丝菌素而不是卡那霉素上选择转基因茎干,亚麻转化基本上如Jordan和McHughen(1988年),Plant Cell Rep.7卷:281-284页所述进行。除了在含有80μM的L-膦丝菌素的琼脂糖平板上选择推测的转基因植物,拟南芥属转化基本上是如“拟南芥属方案;分子生物学中的方法”82卷,Martinez-Zapater JM和Salinas J.ISBN 0-89603-391-0pg 259-266(1988年)中所述进行。欧洲油菜转化基本上如Moloney等人,(1989年)Plant Cell Rep.8卷:238-242页所述进行。
图10表示了在用核丝-GUS基因构建体(pSBS2089)转化的转基因亚麻植物中GUS的组织特异性表达在根(R),茎(S),叶(L),芽(B)和胚(E)中检测GUS表达。在芽中可见一些表达,而最大的表达是在胚组织中。在任何未转化的(WT)组织中未看到可检测的表达。
图11表示了在用核丝-GUS基因构建体(pSBS2089)转化的转基因亚麻植物中GUS的暂时表达。正如所看到的,在成熟的(预先干燥的)亚麻胚中有最大的表达。
图12表示了在用核丝-GUS基因构建体(pSBS2083)转化的转基因欧洲油菜植物(L1到L9)中的GUS的绝对表达。正如所见的,在欧洲油菜植物中有高水平的表达。当比较各个转基因植物时,也可以看到由于位置效应产生的表达中的典型变化。
图13表示了种子发育过程中,转基因拟南芥属长角果(用核丝-GUS基因构建体(pSBS2089)转化)中的GUS的表达。正如可以看到的,在拟南芥属种子组织中也可以获得高水平的表达。在种子发育的时期4(成熟但没有完全干燥)达到最大的表达。在非种子组织,如叶子,茎,根和长角果壁中没有观察到可检测的表达(结果未表示)。
尽管参照目前认为是优选的实施例已经叙述了本发明,但是应当要理解的是本发明不局限于公开的实施例。相反,本发明将覆盖附加的权利要求的精神和范围内包括的各种变化和等同的修改安排。
所有公开物,专利和专利申请以它们的整体引入本文作为参考的程度和具体地和个别地指出每篇单独的出版物,专利或专利申请以它的整体引入本文作为参考的程度相同。
序列表
<110>Chaudhary,Sarita
van Rooijen,Gijs
Moloney,Maurice
Singh,Surinder
SemBioSys Genetics Inc.
Commonwealth Scientific and Industrial Research Organisation
<120>亚麻种子特异性启动子
<130>9369-147
<140>
<141>
<150>60/151044
<151>1999-08-27
<150>60/161,722
<151>1999-10-27
<160>25
<170>PatentIn Ver.2.0
<210>1
<211>4305
<212>DNA
<213>亚麻
<400>1
ttcaaaaccc gattcccgag gcggccctat tgaagatatg ggggaagttc gacgagatcg 60
atgtcgggtc gagtgctatg gtgatggtgc cgtttggggg gaggatgagc gagatagcca 120
agactagcat tccgttccca cacagagttg ggaatttgta ccaaatccaa cacttgtcgt 180
attggagcga cgatagggac gcggaaaaac acatccgttg gatcagggag ttgtacgatg 240
atctcgagcc ttatgtgtcg aagaatccga ggtatgctta cgtgaactac agggatctcg 300
acatcgggat gaatggagga ggtgaagggg atgagaaggg tacttatggt gaggctaagg 360
tgtgggggga gaagtacttt ggggtcaact ttgatcggtt ggttcgggtg aagacgattg 420
ttgatcccaa taatgtgttt cgaaacgagc agagcattcc ctcaattcca actcggttat 480
aaggatcaat gatcaatgag aattttcctt tccaatgtga ttacaagttc tattgggtca 540
gctttctcaa ctgctcctat tcatttagat taattcataa caactattaa tttaccagcc 600
ttttatccgg cccgttggcc gatttatttt cttaagtttt agatgaaatg aaaccgattt 660
agtttttatt gagatgagat taatcttaat ttgcttgaaa tttactcacg gttgatgtga 720
tatttggaat taactaaaat gataaatatc ggataaaaat aaaaatattt aaaataaata 780
acataaacat aagaacaata aaataaataa atttaatttt aatttatttc cttgttttct 840
ttctgtatca tacatctctt ctcttacttc ttaaaggctt ttcaattatc acttaattaa 900
atacaataga taaatcgtta attctataac attaacctat acacttgcac ggtgaacaat 960
caatatgata atataataat aatataataa ttcaattatt aatctacaat tttttaatta 1020
taaagtttat gcggtcagtt tctgcaagct ccgagctcct tgtcatcgtt agtttctgcg 1080
gtctcaaggt ataacgactc ggagcgacga gccctttgct tccaatggac gggttgcatt 1140
tctgccgtcg ttgagctcga ttggcgtgtc atgctggagt cagagttcct acaaaaaaac 1200
cctaaactag agggtgatta gggtgaaatt agggtgttgg cctgggttcc attgtccaaa 1260
gttttagtca acttaaaaac agacttaaat tttatgcttc aaaatagttt atctgttatt 1320
atattagcgt gtaattagtc ttgacaatgg ggccggacgg gtacggattc gggaccccga 1380
tccccgccca tagtgtaatg gctcaactgc caagtcagca ttggaccgaa attattggac 1440
acgaagtact aatgtgaaaa actttacatt tgttattttc tactttaata ctatgctatt 1500
ttcaaaattt gaactttaat actatgtttt tatatagttt agtatatctt aatttttatg 1560
caaattcatc taattgtatt aaactatttt cgatccgtag ctaattattt cgaaggcaag 1620
tcaaagtgtt attgtggact atgtgagcta atattgaacc tttatctctc ccaaccactc 1680
aagttaattg aaccaaactc gatcggttgg gtttcgagct atttcgagcc attgttgtta 1740
tatgcacgtg agatatcaag attgacccga acactttatt atgataatgt agaaaaagaa 1800
aacatattct aagactacat gcatgcaaag tgcaacccct gcatggaaag ctgctcaaca 1860
cgtggcatag actcccgcca cgtgtccatt ccacctcatc acctcacccc caccgttcac 1920
ctcttattat atcacaacaa tcaatcaatc ctactcctcc atactcgaac aaatccgacc 1980
aacttatacc aatattccca aacttgatta atttctcagc aatatggatc agacgcacca 2040
gacatacgcc ggaaccacgc agaacccgag ctatggcggc gggggcacaa tgtaccagca 2100
gcagcagccg aggtcttacc aggcggtgaa ggcggccact gcagccaccg cgggtggatc 2160
cctcatcgtt ctgtccggtc tcatccttac ggccaccgtc atttcactca tcatagccac 2220
ccctctcctt gtcatcttca gccctgttct tgtcccggct ctcatcaccg tcgggctctt 2280
gatcaccggg tttcttgctt ccggtgggtt cggagtcgcc gccgtcaccg tcttgtcctg 2340
gatctatagg tatgtataag ctttggactt tagtattgtt ataaaataca taagctgatt 2400
tatgaacatg gatctcccaa caagagttat ttaaatgcat tctcggtctg actcgatcgg 2460
ttgggttttg agctactcgg tcacaatggt cgggtcggct ctggatctgt tatactaata 2520
tttggaagcc tgaagtttca ttgttctgcc ccaacttccc actacctttt gagggtgtta 2580
agaagccata caaactaatt atgaatccct cccaacaact cagaactcga gtcagtgggt 2640
tgtgacggtt ctctataaac atttcgaaaa tctttgttca atgaacgtag aaatgaccat 2700
gcttgatgat tgtgggtctt ataaggtacg tgaccggcgg gcacccggcg ggaggggatt 2760
cgctggacca ggctaggtcg aagctggccg gaaaggccag ggaggtgaag gacagggcgt 2820
cggagttcgc acagcagcat gtcacaggtg gtcaacagac ctcttaaaga gagtcctcta 2880
gttaaattgg tcttcgtttc tgtttcgtgg cggcttgtaa actctctttt aagtgtgctg 2940
ttttcctttt gtctcgtgtg ttgtaagtga aagtgtaatc gaagttccaa gttggagatg 3000
tttgtaacga tgatgttttc taataatcag agatattaaa agggttgcta atttagtatt 3060
gcgtctgatc tcggaccaaa ctcgcaagta aaattgcaga ggatgagttg tacagaacaa 3120
gcgtgcattg ttctggaagt tcatctcctt ggagccgacc ttgttgcttg cagtttcgcc 3180
aagtccacta gacaatgtta cgagttaagc ctctgtcaaa cagatcgctc tagcgtccca 3240
gaaaacacca gatttttcga aaaccatcgg ggatcaattt tcgattcaat tccgatcttg 3300
gaagtacttg aacagaagca tgatgctaaa agataataga aaatcgaagc ctagaaaagt 3360
tgtacagaaa gcaacaagtc aaaaatatag atcaacttca aaggttcaaa ttacatctta 3420
cagaccccaa aaaatgacag ttaacagaag tcgactaaac agaaaccagc cagcttcacc 3480
tggaatgaag gagctttgat caatccatcc tagcttcatt cccctttgaa attgcagaca 3540
gagctctcat cctgctaaag ctggtggctt attcttaacc ctgcaatcaa taagcatgaa 3600
ctaacattgg acaccttcat cggcggattg ctcgaaaatc agtgagcgag ggatttacct 3660
gtgtgtgtag taacctctct ccttgtacat aaaatctgga aattccggca tcaactactg 3720
ccacctttct gcttaaggtg attttatcac caaggctgag cgtgattcct tgcgtcttgc 3780
tccgaatcct gatgtatcca ctgagctttc catctccttc cttctccagg cttatgttca 3840
ccaatgcgtc ctcgccgaac acactcttgg cgtacaagtt cgcagccagg aatccacact 3900
ctccatcaag tgcagacctg caaaccccaa ataagaacac aaactccaaa gtcaacgatc 3960
aattctccgc cttttatgaa gaaaaggaaa cttctgggta cttacggtgc cgtcagacac 4020
ttcatatttg tagacttgat gatatggtcc aggaattcct tctcgttctg aattgttgtg 4080
ttaacagcaa cctgacagac agaaagatat cgcaaattta agatactggg atgactaggc 4140
acagagaaat gaaatctaat tctagaagta aaaccttatt ttcccattca aattctgccc 4200
acatagtccg gaacgcagca tccgagcaag aagcaggaga gatgtaatcc atgatatcga 4260
tgtggatatc gttgaggacg acaactgaac gttccatcac attgg                 4305
<210>2
<211>109
<212>PRT
<213>亚麻
<400>2
Met Asp Gln Thr His Gln Thr Tyr Ala Gly Thr Thr Gln Asn Pro Ser
  1               5                  10                  15
Tyr Gly Gly Gly Gly Thr Met Tyr Gln Gln Gln Gln Pro Arg Ser Tyr
             20                  25                  30
Gln Ala Val Lys Ala Ala Thr Ala Ala Thr Ala Gly Gly Ser Leu Ile
         35                  40                  45
Val Leu Ser Gly LeuIle Leu Thr Ala Thr Val Ile Ser Leu Ile Ile
     50                  55                  60
Ala Thr Pro Leu Leu Val Ile Phe Ser Pro Val Leu Val Pro Ala Leu
 65                  70                  75                  80
Ile Thr Val Gly Leu Leu Ile Thr Gly Phe Leu Ala Ser Gly Gly Phe
                 85                  90                  95
Gly Val Ala Ala Val Thr Val Leu Ser Trp Ile Tyr Arg
            100                 105
<210>3
<211>46
<212>PRT
<213>亚麻
<400>3
Tyr Val Thr Gly Gly His Pro Ala Gly Gly Asp Ser Leu Asp Gln Ala
  1               5                  10                  15
Arg Ser Lys Leu Ala Gly Lys Ala Arg Glu Val Lys Asp Arg Ala Ser
             20                  25                  30
Glu Phe Ala Gln Gln His Val Thr Gly Gly Gln Gln Thr Ser
         35                  40                  45
<210>4
<211>3501
<212>DMA
<213>亚麻
<400>4
tctagacatt tgacataaac cgaattcaaa gaacacaaca ttgactaaca ccaaaaagaa 60
atagagtagt gaaatttgga agattaaaaa atagaaacaa actgattctt agaaagaaga 120
gatgattagg tgctttcagt tcggtctgtc aggaaatcga gatgttcact tatttacatt 180
gtcgattcat ctcccaattg tcctggttcc tttactgtcc gacgcttttt tgaatcccag 240
ttaattccca tcaagtcttc cttcagctgc gtagcactgc tagctccaac atggagcgtg 300
gagtctactc gttcatgggg catcgcaaag gtttgccttc atgttctgct accagccagc 360
gcccaccgcc tcttggttgt gtggacaatt gcggtgaagc gcgcaagttg acatcccata 420
gtctcgacac ttcaccatat ggatgtttaa aacgtatatc acgagtgcga tctacatgtc 480
ccatcacacc acatataaag caatagtttg ggagcttttc atatttgaaa cgggcattga 540
cgacttgccc tctcgataat ttaatctttt tttctcttca gctgattgtg tgcatccatt 600
cgggctcaga agcacatcaa agggatctct ccatcgtagt attgggtcgt gtcgtatgat 660
acgaagcagt cgatgaagtt tcctaatgtg cgagctacag gctccgcaaa gaacccgcga 720
ggtagatcgt atgctagtac ccaaaaatca gtttgtcgta gcggaatcaa cactagagac 780
tcaccctaat gcatctcatg tgtgatgaac agtttatcat ttgtgagtct aggggtcatt 840
gtcgatgacc caatgcacat tgagcttatg atagaatttg aataggaagc gttttccacc 900
cagatcacga atagctaccc ctttttcggg cgccaaattt ccggcatcct atcttccacc 960
acaacttaaa gatgcgatcg gtaaggaact caccgaccac acacatcgaa taatcttcgg 1020
tgaccggttc ctgttgatca agtccctcaa tttcctcaac ctagtcttca atcgccgcta 1080
gcgttatccc ccgcatatgg actttcatag cgcggagcgt agccggagac gacgagcaag 1140
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gcagatttct gagttgatgg tgatggattt gtgatgtgga cacttttaat ttaagttgat 1260
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ttacgttatc taattttttg aaagattaaa actttgatat aggcaagatc atgacacgtc 1380
gaagttaagt gaatgagact cctaacaagg taataacaaa gcagttcata aaccgaatga 1440
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ttccttactg cttacttctc tatgcatatc acaagacgcc cttgaaactt gttagtcatg 1680
cagagccctt actcgccagg tcaccgcacc acgtgttact ctatcacttc tcctcccttt 1740
cctttaaaga accaccacgc cacctccctc tcacaaacac tcataaaaaa accacctctt 1800
gcatttctcc caagttcaaa ttagttcaca gctaagcaag aactcaacaa caatggcgga 1860
tcgtacaaca cagccacacc aagtccaggt ccacacccag caccactatc ccaccggcgg 1920
ggctttcggc cgttatgaag gtggactcaa aggcggtcca catcaccagc aaggatcagg 1980
cagcggccca tcagcttcca aggtgttagc agtcatgacc gcgctcccca tcggcgggac 2040
cctccttgcc ttggccggga taaccttggc tgggacgatg atcgggctgg cgatcaccac 2100
cccgattttt gtcatctgca gccctgttct agtcccggcc gctctgctca tcgggtttgc 2160
cgtgagcgcg tttctggcct cggggatggc cgggctgaca gggctgacct cgctgtcgtg 2220
gtttgcgagg tatctgcagc aggctgggca gggagttgga gtgggggtgc cggatagttt 2280
cgagcaggcg aagaggcgca tgcaggatgc tgctgggtat atggggcaga agaccaagga 2340
agttgggcag gagatccaga ggaagtctca ggatgtgaaa gcatcagaca aataaggtga 2400
taataagggg ttttgggttc gtgtgtaaac tggtaaaatg gaaattctgg gttttactgt 2460
acttttgcat gtagtggaat gaatgagttc ttgttctctt ttgtctttta atcataaagt 2520
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tttagaataa attacaacga tggcagattg tacaaaactg gagtcgagat catgtaaatt 2760
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aactggatgc tgatatgaat ccgccaggtg tgcggagttc tttacaggca ggatctataa 3060
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attggctcaa ggctctctag a                                           3501
<210>5
<211>180
<212>PRT
<213>亚麻
<400>5
Met Ala Asp Arg Thr Thr Gln Pro His Gln Val Gln Val His Thr Gln
  1               5                  10                  15
His His Tyr Pro Thr Gly Gly Ala Phe Gly Arg Tyr Glu Gly Gly Leu
             20                  25                  30
Lys Gly Gly Pro His His Gln Gln Gly Ser Gly Ser Gly Pro Ser Ala
         35                  40                  45
Ser Lys Val Leu Ala Val Met Thr Ala Leu Pro Ile Gly Gly Thr Leu
     50                  55                  60
Leu Ala Leu Ala Gly Ile Thr Leu Ala Gly Thr Met Ile Gly Leu Ala
 65                  70                  75                  80
Ile Thr Thr Pro Ile Phe Val Ile Cys Ser Pro Val Leu Val Pro Ala
                 85                  90                  95
Ala Leu Leu Ile Gly Phe Ala Val Ser Ala Phe Leu Ala Ser Gly Met
            100                 105                 110
Ala Gly Leu Thr Gly Leu Thr Ser Leu Ser Trp Phe Ala Arg Tyr Leu
        115                 120                 125
Gln Gln Ala Gly Gln Gly Val Gly Val Gly Val Pro Asp Ser Phe Glu
    130                 135                 140
Gln Ala Lys Arg Arg Met Gln Asp Ala Ala Gly Tyr Met Gly Gln Lys
145                 150                 155                 160
Thr Lys Glu Val Gly Gln Glu Ile Gln Arg Lys Ser Gln Asp Val Lys
                165                 170                 175
Ala Ser Asp Lys
            180
<210>6
<211>1676
<212>DNA
<213>亚麻
<400>6
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ctttagggat gtgaatatga acggccaagg taagagaata aaaataatcc aaattaaagc 120
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cgcggcatat tgtattccca cacattatta aaataccgta tatgtattgg ctgcatttgc 240
atgaataata ctacgtgtaa gcccaaaaga acccacgtgt agcccatgca aagttaacac 300
tcacgacccc attcctcagt ctccactata taaacccacc atccccaatc ttaccaaacc 360
caccacacga ctcacaactc gactctcaca ccttaaagaa ccaatcacca ccaaaaaatg 420
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aggcaggaaa tccagcagca gggacagcag cagggacagc agcaggaagt tcagaggtgg 840
atccagcaag ctaaacaaat cgctaaggac ctccccggac agtgccgcac ccagcctagc 900
caatgccagt tccagggcca gcagcaatct gcatggtttt gaaggggtga tcgattatga 960
gatcgtacaa agacactgct aggtgttaag gatggataat aataataata atgagatgaa 1020
tgtgttttaa gttagtgtaa cagctgtaat aaagagagag agagagagag agagagagag 1080
agagagagag agagagagag agaggctgat gaaatgttat gtatgtttct tggtttttaa 1140
aataaatgaa agcacatgct cgtgtggttc tatcgaatta ttcggcggtt cctgtgggaa 1200
aaagtccaga agggcggccg cagctactac tacaaccaag gccgtggagg agggcaacag 1260
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agtggtgatc gatgagatcg tataaagaca ctgctaggtg ttaaggatgg gataataaga 1560
tgtgttttaa gtcattaacc gtaataaaaa gagagagagg ctgatggaat gttatgtatg 1620
tatgtttctt ggtttttaaa attaaatgga aagcacatgc tcgtgtgggt tctatc     1676
<210>7
<211>174
<212>PRT
<213>亚麻
<400>7
Met Ala Lys Leu Met Ser Leu Ala Ala Val Ala Thr Gln Phe Leu Phe
  1               5                  10                  15
Leu Ile Val Val Asp Ala Ser Val Arg Thr Thr Val Ile Ile Asp Glu
             20                  25                  30
Glu Thr Asn Gln Gly Arg Gly Gly Gly Lys Val Ala Gly Thr Ala Ala
         35                  40                  45
Val Cys Glu Gln Gln Ile Gln Gln Arg Asp Phe Leu Arg Ser Cys Gln
     50                  55                  60
Gln Phe Met Trp Glu Lys Val Gln Arg Gly Gly His Ser His Tyr Tyr
 65                  70                  75                  80
Asn Gln Gly Arg Gly Gly Gly Glu Gln Ser Gln Tyr Phe Glu Gln Leu
                 85                  90                  95
Phe Val Thr Thr Leu Ser Asn Cys Ala Pro Arg Cys Thr Met Pro Gly
            100                 105                 110
Asp Leu Lys Arg Ala Ile Gly Gln Met Arg Gln Glu Ile Gln Gln Gln
        115                 120                 125
Gly Gln Gln Gln Gly Gln Gln Gln Glu Val Gln Arg Trp Ile Gln Gln
    130                 135                 140
Ala Lys Gln Ile Ala Lys Asp Leu Pro Gly Gln Cys Arg Thr Gln Pro
145                 150                 155                 160
Ser Gln Cys Gln Phe Gln Gly Gln Gln Gln Ser Ala Trp Phe
                165                 170
<210>8
<211>4999
<212>DMA
<213>亚麻
<400>8
ctcaagcata cggacaaggg taaataacat agtcaccaga acataataaa caaaaagtgc 60
agaagcaaga taaaaaaatt agctatggac attcaggttc atattggaaa catcattatc 120
ctagtcttgt gaccatcctt cctcctgctc tagttgagag gccttgggac taacgagagg 180
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gccgccgtct acatctatct ccattaggtc tgaagatgac tcttcacacc aacgacgttt 300
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caaacaaagc agaagacagg taatctttca tacttatact gacaagtaat agtcttaccg 660
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<210>9
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<212>pRT
<213>亚麻
<400>9
Met Ala Arg Ser Ser Ser Pro Leu Leu Leu Ser Leu Cys Ile Phe Ala
  1               5                  10                  15
Ile Leu Phe His Ser Ser Leu Gly Arg Gln Gln Phe Gln Gln Gly Asn
             20                  25                  30
Glu Cys Gln Ile Asp Arg Ile Asp Ala Ser Glu Pro Asp Lys Thr Ile
         35                  40                  45
Gln Ala Glu Ala Gly Glu Val Trp Asp Gln Asn Arg Gln Gln Phe Gln
     50                  55                  60
Cys Ala Gly Val Ala Val Val Arg Arg Thr Ile Glu Pro Lys Gly Leu
 65                  70                  75                  80
Leu Leu Pro Phe Tyr Ser Asn Thr Pro Gln LeuIle Tyr Ile Val Gln
                 85                  90                  95
<210>10
<211>85
<212>PRT
<213>亚麻
<400>10
Gly Arg Gly Val Thr Gly Ile Met Phe Pro Xaa Cys Pro Glu Thr Phe
  1               5                  10                  15
Glu Glu Ser Gln Gln Gln Gly Gln Gln Gly Gln Gln Gly Ser Ser Gln
             20                  25                  30
Asp Gln His Gln Lys Ile Arg Arg Phe Arg Glu Gly Asp Val Ile Ala
         35                  40                  45
Val Pro Ala Gly Val Ala His Trp Ser Tyr Asn Asp Gly Asn Glu Pro
     50                  55                  60
Val Met Ala Ile Val Val His Asp Thr Ser Ser His Leu Asn Gln Leu
 65                  70                  75                  80
Asp Asn Asn Pro Arg
                 85
<210>11
<211>165
<212>PRT
<213>亚麻
<400>11
Asn Phe Tyr Leu Ala Gly Asn Pro Arg Asp Glu Phe Glu Gln Ser Gln
  1               5                  10                  15
Gln Gly Gly Arg Leu Ser Arg Gly Glu Ser Glu Gly Gly Arg Gly Arg
             20                  25                  30
Arg Glu Pro Leu Gln Pro Ala Thr Thr Ser Ser Cys Gly Ile Asp Ser
         35                  40                  45
Lys Leu Ile Ala Glu Ala Phe Asn Val Asp Glu Asn Val Ala Arg Arg
     50                  55                  60
Leu Gln Ser Glu Asn Asp Asn Arg Gly Gln Ile Val Arg Val Glu Gly
 65                  70                  75                  80
Glu Leu Asp Ile Val Arg Pro Pro Thr Ser Ile Gln Glu Glu Ser Gln
                 85                  90                  95
Glu Gln Gly Gly Arg Gly Gly Gly Arg Tyr Tyr Ser Asn Gly Val Glu
            100                 105                 110
Glu Thr Phe Cys Ser Met Arg Leu Ile Glu Asn Ile Gly Asp Pro Ser
        115                 120                 125
Arg Ala Asp Ile Phe Thr Pro Glu Ala Gly Arg Val Arg Ser Leu Asn
    130                 135                 140
Ser His Asn Leu Pro Val Leu Gln Trp Ile Gln Leu Ser Ala Glu Arg
145                 150                 155                 160
Gly Val Leu Tyr Asn
                165
<210>12
<211>141
<212>PRT
<213>亚麻
<400>12
Glu AlaIle Arg Leu Pro His Trp Asn Ile Asn Ala His Ser Ile Val
  1              5                  10                  15
Tyr Ala Ile Arg Gly Gln Ala Arg Val Gln Ile Val Asn Glu Glu Gly
             20                  25                  30
Asn Ser Val Phe Asp Gly Val Leu Gln Glu Gly Gln Val Val Thr Val
         35                  40                  45
Pro Gln Asn Phe Ala Val Va1 Lys Arg Ser Gln Ser Glu Arg Phe Glu
     50                  55                  60
Trp Val Ala Phe Lys Thr Asn Asp Asn Ala Met Val Asn Ser Leu Ala
 65                  70                  75                  80
Gly Arg Thr Ser Ala Val Arg Ala Ile Pro Ala Asp Val Leu Ala Asn
                 85                  90                  95
Ala Trp Arg Val Ser Pro Glu Glu Ala Arg Arg Val Lys Phe Asn Arg
            100                 105                 110
Gln Glu Thr His Leu Ala Ser Thr Arg Gly Gln Ser Arg Ser Pro Gly
        115                 120                 125
Arg Leu Asn Val Val Lys Glu Val Ile Asn Leu Leu Met
    130                 135                 140
<210>13
<211>11
<212>PRT
<213>亚麻
<400>13
Gln Gln Gln Gly Gln Gln Gln Gly Gln Gln Gln
  1               5                  10
<210>14
<211>18
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列的说明:引物
<400>14
tccactatgt aggtcata    18
<210>15
<211>18
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列的说明:引物
<400>15
ctttaaggtg tgagagtc    18
<210>16
<211>15
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列的说明:引物
<400>16
aggggtgatc gatta                  15
<210>17
<211>18
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列的说明:引物
<400>17
gatagaaccc acacgagc               18
<210>18
<211>29
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列的说明:引物
<400>18
tatctagact caagcatacg gacaagggt    29
<210>19
<211>6
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列的说明:XbaI位点
<400>19
tctaga                             6
<210>20
<211>21
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列的说明:引物
<400>20
ggttatcatt gtatgaactg a            21
<210>21
<211>6
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列的说明:NcoI位点
<400>21
ccatgg                             6
<210>22
<211>32
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列的说明:引物
<400>22
gcaagcttaa tgtgacggtg aaataataac gg    32
<210>23
<211>6
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列的说明:HindIII位点
<400>23
aagctt                                 6
<210>24
<211>29
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列的说明:引物
<400>24
taggtacctg gcaggtaaag actctgctc       29
<210>25
<211>6
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列的说明:KpnI位点
<400>25
ggtacc                                 6

Claims (18)

1.在亚麻种子中表达需要的核酸序列的方法,该方法包括:
(a)制备在5′到3′转录方向含有下列可操作地连接的成分的嵌合核酸构建体:
(1)从亚麻得到的种子特异性启动子;和
(2)所述的需要的核酸序列,其中需要的核酸对所述的种子特异性启动子是非天然的;
(b)将所述的嵌合核酸构建体导入亚麻植物细胞;和
(c)使所述的亚麻植物细胞生长成能够结种子的成熟的亚麻植物,其中所述的需要的核酸序列是在所述的种子特异性启动子的控制下,在种子中表达的,且其中所述的亚麻种子特异性启动子选自:
(a)SEQ.ID.NO.:1的核苷酸1到2023、SEQ.ID.NO.:4的核苷酸1到1852、SEQ.ID.NO.:6的核苷酸1到417或SEQ.ID.NO.:8的核苷酸1到2037所示的核酸序列,其中T也可以是U;或
(b)与(a)的核酸序列互补的核酸序列。
2.根据权利要求1所述的方法,其中所述的种子特异性启动子给予其天然核酸序列的至少一个表达特征被给予所述的非天然核酸序列。
3.根据权利要求2所述的方法,其中所述的表达特征是表达的计时,表达水平,对光照条件变化的反应,对温度变化的反应,对化学试剂浓度变化的反应。
4.根据权利要求1所述的方法,其中所述的需要的核酸序列的表达导致所述的种子中蛋白质或脂肪酸组成的改变。
5.能够在植物中指导种子特异性表达的分离的核酸序列,选自:
(a)由如图1(SEQ.ID.NO.:1)所示的核苷酸1到2023组成的核酸序列,其中T也可以是U;或
(b)与(a)的核酸序列互补的核酸序列。
6.能够在植物中指导种子特异性表达的分离的核酸序列,选自:
(a)由如图2(SEQ.ID.NO.:4)所示的核苷酸1到1852组成的核酸序列,其中T也可以是U;或
(b)与(a)的核酸序列互补的核酸序列。
7.在植物中能够指导种子特异性表达的分离的核酸序列,选自:
(a)由如图3(SEQ.ID.NO.:6)中所示的核苷酸1到417组成的核酸序列,其中T也可以是U;或
(b)与(a)的核酸序列互补的核酸序列。
8.能够在植物中指导种子特异性表达的分离的核酸序列,选自:
(a)由如图4(SEQ.ID.NO.:8)所示的核苷酸1到2037组成的核酸序列,其中T也可以是U;或
(b)与(a)的核酸序列互补的核酸序列。
9.由下列核酸序列组成的分离的嵌合核酸序列:
(a)由从亚麻得到的种子特异性启动子组成的第一个核酸序列,选自:
(1)由如图1(SEQ.ID.NO.:1)所示的核苷酸1-2023组成的核酸序列,其中T也可以是U;或
(2)与(1)的核酸序列互补的核酸序列;和
(b)对所述的亚麻种子特异性启动子是非天然的第二个核酸序列。
10.由下列核酸序列组成的分离的嵌合核酸序列:
(a)由从亚麻得到的种子特异性启动子组成的第一个核酸序列,选自:
(1)由如图2(SEQ.ID.NO.:4)所示的核苷酸1-1852组成的核酸序列,其中T也可以是U;或
(2)与(1)的核酸序列互补的核酸序列;和
(b)对所述的亚麻种子特异性启动子是非天然的第二个核酸序列。
11.由以下核酸序列组成的分离的嵌合核酸序列:
(a)由从亚麻得到的种子特异性启动子组成的第一个核酸序列,选自:
(1)由如图3(SEQ.ID.NO.:6)所示的核苷酸1-417组成的核酸序列,其中T也可以是U;或
(2)与(1)的核酸序列互补的核酸序列;和
(b)对所述的亚麻种子特异性启动子是非天然的第二个核酸序列。
12.由以下核酸序列组成的分离的嵌合核酸序列:
(a)由从亚麻得到的种子特异性启动子组成的第一个核酸序列,选自:
(1)由如图4(SEQ.ID.NO.:8)所示的核苷酸1-2037组成的核酸序列,其中T也可以是U;或
(2)与(1)的核酸序列互补的核酸序列;和
(b)对所述的亚麻种子特异性启动子是非天然的第二个核酸序列。
13.在植物种子中表达需要的核酸序列的方法,包括:
(a)将根据权利要求9-12任一项所述的嵌合核酸序列导入植物细胞,和
(b)使所述的植物细胞生长成能够结种子的成熟植物,其中第二个核酸序列是在种子特异性启动子的控制下,在种子中表达的。
14.根据权利要求13所述的方法,其中所述的植物细胞选自包括下列植物的组:大豆(Glycine max),油菜(Brassia napus,BrassicaCampestris),向日葵(Helianthus annuus),棉花(Gossypium hirsutum),玉米(Zea mays),烟草(Nicotiana tobacum),苜蓿(Medicago Sativa),小麦(Triticum sp.),大麦(Hordeum vulgare),燕麦(Avena Sativa L.),高粱(Sorgham bicolor),拟南芥(Arabidopsis thaliana),土豆(Solanum sp.),亚麻/亚麻子(Linum usitatissimum),红花(Carthamus tinctorius),油棕榈(Eleais guineeis),落花生(Arachis hypogaea),巴西坚果(Bertholletiaexcelsa),椰子(Cocus nucifera),蓖麻(Ricinus communis),芜荽(Coriandrum sativum),南瓜(Cucurbita maxima),灌木(Simmondsiachinensis)和水稻(Oryza Sativa)。
15.含有权利要求9-12任一项所述的嵌合核酸序列的植物细胞。
16.含有根据权利要求5-8任一项所述的核酸序列的重组表达载体。
17.含有根据权利要求9-12任一项所述的嵌合核酸序列的重组表达载体。
18.分离的核酸序列,选自:
(a)如图1(SEQ.ID.NO.:1),图2(SEQ.ID.NO.:4),图3(SEQ.ID.NO.:6)或图4(SEQ.ID.NO.:8)所示的核酸序列,其中T也可以是U;或
(b)与(a)的核酸序列互补的核酸序列。
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