CN1295621A - 病原体诱导型启动子 - Google Patents

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Abstract

本发明描述了正常驱动植物己糖氧化酶表达的病原体诱导型启动子,特别是可从向日葵(Helianthus annuus)和莴苣(Lactuca sativa)中分离的启动子,更特别地是天然地是分别驱动己糖氧化酶表达的调节区的启动子MS59和WL64。这些病原体诱导型启动子驱动抗病原蛋白质表达或驱动能引发过敏反应的蛋白质表达的嵌合构建体也要求保护。

Description

病原体诱导型启动子
                      发明领域
本发明涉及病原体诱导型启动子领域,和含有该启动子的嵌合DNA序列,特别是在植物生物工程领域。
                      背景技术
诱导型启动子包括在接触诱导物后,能够提高特定基因产生的基因产物的量之任一启动子。在无诱导物时,DNA序列不被转录。一般而言,能与诱导型启动子特异结合而激活转录的因子以失活形式存在,然后被诱导物直接或间接地转化为活性形式。诱导物可以是化学试剂,如蛋白质、代谢物(糖、醇等)、生长调节剂、除草剂或酚类化合物,或者通过热、盐、创伤、有毒成分等直接施加的生理压力,或通过病原体或致病因素如病毒的作用间接施加的生理应力。可通过对细胞外部施用诱导物如通过喷施、浇水、加热或类似方法使含有诱导型启动子的植物细胞接触诱导物。诱导型启动子为技术人员所知,并存在能用来驱动目的基因表达的几种启动子。诱导型启动子的实例包括果蝇(Drosophilamelanogaster)的诱导型70kD热休克启动子(Freeling,M.等人,遗传学年述(Ann.Rev.Genet.)19,297-323)和乙醇诱导的醇脱氢酶启动子(Nagao,R.T.等人,于:Miflin,B.J.(编)《植物分子与细胞生物学牛津概论》(Oxford Surveys of Plant Molecular and Cell Biology),第3卷,384-438页,牛津大学出版社,1986)。可由简单化学试剂诱导的启动子的实例是WO 90/08826、WO 93/21334、WO 93/031294和WO 96/37609中描述的启动子。
诱导型启动子的一个重要亚类是在病原体感染后在植物中诱导的启动子。作为病原体诱导型启动子的实例,可提到可从马铃薯中获得的PRP1启动子(也称为gst1启动子)(Martini N.等人(1993),分子普通遗传学263,179-186)、Fis1启动子(WO 96/34949)、Bet v1启动子(Swoboda,I.等人,植物、细胞与环境(Plant,Cell and Env.)18,865-874,1995)、Vst1启动子(Fischer,R.,学位论文,Hohenheim大学,1994;Schubert,R.等人,植物分子生物学(Plant Mol.Biol.)34,417-426,1997)、倍半萜环化酶启动子(Yin,S.等人,植物生理学(Plant Physiol.)115,437-451,1997)和gstA1启动子(Mauch,F.和Dudler,R.,植物生理学102,1193-1201,1993)。这些启动子中某些的缺点是,它们也是组成性活性的,或者它们不能与某些类型的病原体反应。此外,含有在病原体感染后很快(即以尽可能短的诱导时间)调节表达的启动子是有利的。
因此,仍需要能克服现有技术缺陷的病原体诱导型启动子。
                      发明概述
现在我们已经发现了编码己糖氧化酶的植物基因的上游调节区之DNA片段,当再引入植物中时它们能促进相关DNA序列的病原体诱导型转录。优选地该片段可从向日葵(Helianthus annuns)中获得。该DNA片段特别是编码己糖氧化酶的基因的上游调节区,被称为MS59,更特别地,其特征在于它包含SEQ ID NO:15所示的核苷酸序列1-1889。
本发明的另一部分是可从莴苣(Lactuca sativa)中获得的DNA片段,当再引入植物中时,它能促进相关DNA序列的病原体诱导型转录,所述DNA片段尤其是编码己糖氧化酶基因的上游调节区的DNA片段,被称为WL64(SEQ ID NO:18)。
本发明也包括根据上述任一的DNA片段的部分或变体,当再引入植物中时它能促进相关DNA序列的病原体诱导型转录。
本发明的一个实施方案是嵌合DNA序列,其以转录方向含有根据上述任一种DNA片段的DNA片段,和在其转录控制下表达的DNA序列,它不是天然地位于该DNA片段的转录控制之下。一个优选实施方案是这样一种嵌合DNA序列,其中欲表达的DNA序列导致一种抗病原蛋白质的产生,该蛋白质优选地选自壳多糖酶、葡聚糖酶、渗透蛋白、爪蟾抗菌肽、凝集素、糖氧化酶、草酸氧化酶、苏云金芽孢杆菌(Bacillusthuringiensis)毒素、从紫茉莉(mirabilis jalapa)、苋属(Amaranthus)、萝卜属(Raphanus)、芸苔属(Brassica)、芥属(Sinapis)、拟南芥属(Arabidopsis)、大丽花属(Dahlia)、Cnicus、山黧豆属(Lathyrus)、蝶豆属(Clitoria)、葱属(Allium)种子、葱木属(Aralia)和凤仙花属(Impatiens)中分离的抗真菌蛋白质,和白蛋白型蛋白质,如硫堇、napin、大麦胰蛋白酶抑制剂、谷类麦醇溶蛋白和小麦α-淀粉酶。
本发明的嵌合DNA序列的另一个实施方案是一种嵌合DNA序列,其中欲表达的DNA序列导致一种能诱导过敏反应的蛋白质的产生,该蛋白质优选地选自番茄的CF和Pto蛋白、黄枝孢(Cladosporium fulvum)的avr蛋白、假单胞菌属(Pseudomonas)或黄单胞菌属(Xanthomonas)的引发蛋白。
本发明的另一部分是含有上述嵌合DNA序列的复制子,其优选地具有至少一个限制性内切核酸酶的识别位点,用于将在该DNA片段控制下表达的DNA序列的插入。本发明也包括含有这种复制子的微生物、在基因组中掺入了根据上述的嵌合DNA序列的植物细胞、和基本上由该细胞组成的植物。该植物优选地是双子叶植物。选自种子、花、块茎、根、叶、果实、花粉和木材的该植物的部分也形成了本发明的一部分。
本发明的再另一个实施方案是上述DNA片段在鉴定能促进植物中病原体诱导型转录的同源物中的应用。
根据本发明的嵌合DNA序列在转化植物中的进一步应用,根据本发明的DNA片段的部分或变体在制备杂合调节DNA序列中的应用,也是本发明的一部分。
本发明的另一个目的是上述嵌合DNA序列在赋予植物病原体抗性中的应用。
                      附图描述
图1:(基因组)ms59基因和启动子区的示意图。
                      发明详述
本发明的主要方面是天然存在于植物中并驱动编码己糖氧化酶的基因表达的调节序列。特别是在向日葵和/或莴苣中存在的区域,尤其分别是MS59基因(SEQ ID NO:15)或WL64基因(SEQ ID NO:17)的5’(上游)区。这些基因编码发现对(真菌)病原体有毒的己糖氧化酶,在WO 98/13478中公开,由此引入作为参考。发现在病原体感染后,这些基因高度表达,表明病原体诱导性。病原体诱导型启动子在生物技术抗性工程中很有价值。
尽管特别用驱动己糖氧化酶在向日葵中表达的启动子,称为“ms59”,来说明本发明,但认为驱动与ms59同源的基因的所有启动子都具有与ms59启动子或多或少相同的性质,即,由病原体感染优选地真菌感染诱导的表达活性。通常认为同源基因的启动子共有相似的性质,尤其是与病原体诱导相关的性质。其实例是驱动发病相关蛋白质渗透蛋白在马铃薯(Zhu等人,植物生理学(Plant Physiol.)108,929-937,1995)、烟草(Liu等人,植物分子生物学(Plant Mol.Biol.)29,1015-1026,1995)和番茄(Ruiz-Medrano等人,植物分子生物学20,1199-1202,1992)中表达的启动子,病原体的诱导性已经明确;驱动PR-10组的基因表达的启动子,马铃薯中的pSTH-2启动子(Matton,D.P.和Brisson,N.,分子植物微生物相互作用(Mol. Plant-Microbe Interac.)2,325-331,1989)、Asparagus officinalis的AoPR-1启动子(Warner等人,植物杂志(ThePlant J.)3,191-201,1993)和Betula verrucosa的Bet v 1启动子(Swoboda等人,植物、细胞与环境(Plant,Cell and Env.)18,865-874,1995)显示是病原体可诱导的。
在本说明书中,术语“调节序列”和“启动子”可交换使用。
本发明尤其提供包含根据本发明的调节序列的嵌合DNA序列。表达嵌合DNA序列是指包括包含未在自然界天然发现的DNA序列的任一DNA序列。例如,嵌合DNA是指包括包含调节区的DNA,该调节区在植物基因组的非天然位置中是病原体可诱导的,虽然事实是该植物基因组通常在其天然染色体位置中含有一个拷贝的该调节区。类似地,该调节区可掺入未天然发现它的植物基因组中,或者掺入未天然发现它的复制子或载体中,如细菌质粒或病毒载体。嵌合DNA不限于可在宿主中复制的DNA分子,但也是指包括能连接到复制子中的DNA,例如通过特异的连接体序列,与根据本发明的调节区物理连接。该调节区可以与或者可以不与其天然下游开放阅读框连接。
表达受本发明的病原体诱导型调节区驱动的基因的开放阅读框可以来源于一种基因组文库。在后者中,它可含有一个或多个内含子,内含子分隔组成编码根据本发明的蛋白质的开放阅读框的外显子。开放阅读框也可由一种非间断的外显子编码,或由编码根据本发明的蛋白质mRNA的cDNA编码。根据本发明的嵌合DNA序列也包括人工去除或添加了一个或多个内含子的序列。本发明包括这些变体中的每一种。
为了能够在宿主细胞中表达,根据本发明的调节区通常具有可能适当地来源于能够在所选宿主细胞中表达的任一基因的转录起始区,以及用于核糖体识别和附着的翻译起始区。在真核细胞中,表达盒通常另外包含位于该开放阅读框下游的转录终止区,其使得转录终止并发生初级转录物的聚腺苷酸化。另外,密码子使用可能适合所选宿主的公认的密码子使用。此外,常常可编码一种信号序列,其担负基因表达产物向亚细胞区室的导向。控制嵌合DNA构建体在所选宿主细胞中表达的原理通常为本领域的技术人员所了解,可表达的嵌合DNA构建体的构建现在对于任一种类的宿主细胞,无论原核的或真核的,都是常规。
嵌合DNA序列为了能在宿主细胞中保留,通常以复制子的形式提供,其包含与DNA连接的根据本发明的嵌合DNA序列,可由所选宿主细胞识别并复制。因此,复制子的选择主要取决于选择的宿主细胞。为所选特定宿主选择适当复制子的原则处于本领域技术人员的理解范围之内。
一种特殊类型的复制子是能够将其自身或其一部分转移到另一种宿主细胞如植物细胞中,由此将根据本发明的开放阅读框共转移到该植物细胞中的复制子。具有这种能力的复制子在此被称为载体。这种载体的一个实例是Ti质粒载体,当存在于适当的宿主如根癌农杆菌(Agrobacterium tumefaciens)中时,它能够将其部分,即所谓的T区,转移到植物细胞中。不同类型的Ti质粒载体(参见:EP 0 116 718 B1)现在已常规用于向植物细胞或原生质体中转移嵌合DNA序列,由此可产生在基因组中稳定地掺入了该嵌合DNA的新植物。Ti质粒载体的一种特别优选的形式是(EP 0 120 516 B1和US 4,940,838)中要求保护的所谓二元载体。可用于向植物宿主中引入根据本发明的DNA的其他适当载体可选自病毒载体,例如非整合型植物病毒载体,如可来源于双链植物病毒(例如CaMV)和单链病毒、双生病毒等。这些载体的应用可能是有利的,特别是在难以稳定地转化植物宿主时。当是木本种特别是树和藤本植物时尤其如此。
表述“在其基因组中掺入根据本发明的嵌合DNA序列的宿主细胞”是指包括细胞,以及包含这些细胞或基本上由这些细胞组成的多细胞生物,它们在其基因组中稳定地掺入了所述嵌合DNA,由此保留该嵌合DNA,并且优选地通过有丝分裂或减数分裂将一个拷贝的这种嵌合DNA传递给子代细胞。根据本发明的一个优选实施方案,提供了这样的植物,其基本上由在基因组中掺入了一个或多个拷贝的所述嵌合DNA的细胞组成,并且能够优选地以孟德尔方式将一个或多个拷贝传递给子代。由于根据本发明的嵌合DNA在某些或所有植物细胞中的转录和翻译,含有该调节区的细胞可应答病原体攻击,从而产生由该调节区控制下的开放阅读框编码的蛋白质。在本发明的具体实施方案中,该蛋白质是能够提供对病原体感染抗性的抗病原蛋白质。
本领域的技术人员众所周知,植物基因的调节区由具有令人关注的基因表达特性的不同亚区组成。此处所指亚区的实例是转录的增强子以及沉默子。这些元件能以普通(组成型)的方式或者以组织特异的方式起作用。可以在根据本发明的调节DNA序列中进行缺失,并且可以测试亚片段的相关DNA的表达模式。这样获得的不同亚片段,乃至其组合,可用于工程化改造病原体抗性的方法,或者与异源DNA在植物中表达相关的其他应用。本发明也包括根据本发明的DNA序列鉴定功能亚区的应用,和随后其促进或抑制植物中基因表达的应用。
关于转录终止区的必要性,通常认为该区域增强了植物细胞中转录的可靠性和效率。因此其应用在本发明的说明书中是特别优选的。
可与根据本发明的ICS调节区结合使用的蛋白质的实例包括但不限于,可从大麦(Swegle M.等人,植物分子生物学12,403-412,1989;Balance G.M.等人,加拿大植物科学杂志(Can.J.Plant Sci.)56,459-466,1976;Hoj P.B.等人,FEBS Lett.230,67-71,1988;Hoj P.B.等人,植物分子生物学13,31-42,1989)、菜豆(Boller T.等人,植物(Planta)157,22-31,1983;Broglie K.E.等人,美国国家科学院院报(Proc.Natl.Acad.Sci.USA)83,6820-6824,1986;Vogeli U.等人,植物174,364-372,1988;Mauch F.和Staehelin L.A.,植物细胞1,447-457,1989)、黄瓜(Metraux J.P.和Boller T.,生理学与分子植物病理学(Phsiol.Mol.Plant Pathol.)28,161-169,1986)、韭菜(Spanu P.等人,植物177,447-455,1989)、玉米(Nasser W.等人,植物分子生物学11,529-538,1988)、燕麦(Fink W.等人,植物生理学88,270-275,1988)、豌豆(MauchF.等人,植物生理学76,607-611,1984;Mauch F.等人,植物生理学87,325-333,1988)、白杨(Parsons T.J.等人,美国国家科学院院报86,7895-7899,1989)、马铃薯(Gaynor J.J.,核酸研究(Nucl.Acids Res.)16,5210,1988;Kombrink E.等人,美国国家科学院院报85,782-786,1988;Laflamme D.和Roxby R.,植物分子生物学13,249-250,1989)、烟草(例如,Legrand M.等人,美国国家科学院院报84,6750-6754,1987;Shinshi H.等人,美国国家科学院院报84,89-93,1987)、番茄(JoostenM.H.A.和De Wit P.J.G.M.,植物生理学89,945-951,1989)、小麦(MolanoJ.等人,生物化学杂志(J.Biol.Chem.)254,4901-4907,1979)中获得的β-1,3-葡聚糖酶和壳多糖酶、爪蟾抗菌肽、凝集素、从苏云金芽孢杆菌中分离的毒素、从紫茉莉(EP 0 576 483)和苋属(EP 0 593 501和US5,514,779)中分离的抗真菌蛋白质、白蛋白型蛋白质(如硫堇、napin、大麦胰蛋白酶抑制剂、谷类麦醇溶蛋白和小麦α-淀粉酶,EP 0 602 098)、从萝卜属、芸苔属、芥属、拟南芥属、大丽花属、Cnicus、山黧豆属和蝶豆属中分离的蛋白质(EP 0 603 216)、从辣椒属(Capsicum)、凌风草属(Briza)、翠雀属(Delphinium)、Catapodium、赝靛属(Baptisia)和Microsensis中分离的蛋白质(PCT/GB93/02179)、草酸氧化酶(EP 0 636181和EP 0 673 416)、糖氧化酶(PCT/EP 97/04923)、从葱属种子分离的抗微生物蛋白质(PCT/GB94/01636)、葱木属和凤仙花属的蛋白质(PCT/GB95/00509)、矾根属(Heuchera)和七叶树属(Aesculus)的蛋白质(PCT/GB94/02766)、上述蛋白质的突变肽(PCT/GB96/03065和PCT/GB96/03068)等等。
诱导型启动子的另一个用途是驱动在基因-基因抗性相互作用中起作用的蛋白质(如WO 91/15585所述)。这些蛋白质是,例如,如Karrer,E.E.等人(植物分子生物学36,681-690,1998)所公开的植物蛋白质、激活的ndr1、激活的eds1和激活的Xa21、番茄的Cf蛋白、BS3蛋白和Pto蛋白、拟南芥的Rpm1和Rps2蛋白、烟草的N-基因、黄枝孢的avr引发蛋白、黄单胞菌属的avrBs3、欧文氏菌属(Erwinia)的harpin和假单胞菌属的avrPto蛋白。
本发明的实际适用性不限于特定的植物种。经受某种形式病原体攻击的任何植物种都可用根据本发明的嵌合DNA序列转化,使调节区被病原体感染诱导,由此引发将在某些或所有植物细胞中产生的抗病原蛋白质的产生。
尽管本发明的某些实施方案目前尚不可行,例如,因为某些植物种至今尚且不能进行基因转化,但本发明在这些植物种中的实施只是时间问题而不是原则问题,因为基因转化的适用性与本发明的下列实施方案无关。
植物种的转化现在对于大量植物种包括双子叶植物和单子叶植物而言都是常规。原则上任何转化方法都可用来向适当的祖细胞中引入根据本发明的嵌合DNA,只要这些细胞能够再生为完整的植物。方法可适当地选自原生质体的钙/聚乙二醇法(Krens,F.A.等人,自然296,72-74,1982;Negrutiu I.等人,植物分子生物学8,363-373,1987)、原生质体的电穿孔(Shillito R.D.等人,生物技术(Bio/Technol.)3,1099-1102,1985)、向植物物质中的显微注射(Crossway A.等人,分子普通遗传学202,179-185,1986)、对不同植物物质的DNA(或RNA包被的)颗粒轰击(Klein T.M.等人,自然327,70,1987)、(非整合型)病毒感染等。根据本发明的一种优选方法包括农杆菌介导的DNA转移。特别优选的是如EP A 120 516和美国专利4,940,838中公开的所谓的二元载体技术的应用。
番茄转化优选地基本如Van Roekel等人(植物细胞报道(Plant CellRep.)12,644-647,1993)所述进行。马铃薯转化优选地基本如Hoekema等人(Hoekema A.等人,生物技术7,273-278,1989)所述进行。通常,转化后,针对一种或多种标记的存在筛选植物细胞或细胞组,该标记由与编码根据本发明的蛋白质的核酸序列共转移的植物表达基因编码,之后转化的材料再生为完整的植物。
尽管认为更不适于基因转化,但单子叶植物可进行转化,并且能从转化的细胞或胚或其他植物材料再生为可育的转基因植物。目前,单子叶植物转化的优选方法是对胚、外植体或悬浮细胞的微粒轰击,和直接DNA摄取或电穿孔(Shimamoto等人,自然338,274-276,1989)。已经获得转基因玉米植物,方法是通过微粒轰击(Gordon-Kamm,植物细胞,2,603-618,1990)将编码phosphinothricin乙酰转移酶(一种灭活除草剂phosphinothricin的酶)的吸水链霉菌(Streptomyceshygroscopicus)bar基因引入玉米悬浮培养物的胚发生细胞中。曾经报道过遗传物质向其他单子叶作物如小麦和大麦的糊粉原生质体中的引入(Lee,植物分子生物学13,21-30,1989)。已由胚发生悬浮培养液再生为小麦植物,方法是只选择老龄、致密的和结状的胚发生愈伤组织用于胚发生悬浮培养液的形成(Vasil,生物技术8,429-434,1990)。与用于这些作物的转化系统的组合能使本发明应用于单子叶植物。
单子叶植物,包括重要的商业作物如稻和玉米,也适于用农杆菌株进行DNA转移(参见WO 94/00977;EP 0 159 418 B1;Gould J.等人,植物生理学95,426-434,1991)。
DNA转移和再生后,可评估推定转化的植物,例如应用Southern分析,评估根据本发明的嵌合DNA的存在,拷贝数和/或基因组组成。另外,用Northern和/或Western分析-本领域技术人员众所周知的技术,可以估计新引入的DNA的表达水平。任选的,在最初的分析后,可以对显示希望的拷贝数和根据本发明的新引入嵌合DNA表达水平的转化植物检测病原体抗性水平。此外,选择的植物可进行另一轮转化,例如引入其他基因,以增强抗性水平,或扩大抗性谱。
其他评价可能包括现场条件下病原体抗性的检测、核实生育力、产量和其他特征。这些检测现在可由本领域的技术人员常规进行。
在这些评价后,转化的植物可以直接生长,但通常它们可作为亲本系用于新品种的培育或杂种的建立等。
为了获得能组成型表达多于一种嵌合基因的转基因植物,多种选择是可利用的,包括下列方法:
A.DNA例如二元质粒上的T-DNA的应用,其含有与选择性标记基因物理偶联的多个修饰基因。该方法的优点是,嵌合基因是物理偶联的,因此作为单一的孟德尔基因座迁移。
B.用含有一种或多种与另一种选择性标记结合的嵌合基因之转基因植物的花粉,对每一种均已能表达一种或多种(优选地与一种选择性标记基因偶联的)嵌合基因的转基因植物异花传粉。之后,可以根据两种选择性标记的存在,或者根据嵌合基因本身的存在来筛选这种杂交获得的种子。由筛选的种子获得的植物随后能用于进一步的杂交。通常,嵌合基因不是位于单一基因座上,因此基因可能以独立的基因座分离。
C.许多多重嵌合DNA分子如质粒的应用,其中每一个都含有一种或多种嵌合基因和选择性标记。如果共转化的频率高,则只根据一种标记的筛选就足够了。在其他情况中,根据多于一种标记的筛选是优选的。
D.含有第一种、第二种(等)嵌合基因和新嵌合DNA,任选地含有一种选择性标记基因的转基因植物的连续转化。如方法B所述,嵌合基因通常不是位于单一基因座上,因此嵌合基因可能以独立的基因座分离。
E.上述策略的组合。
实际策略可能取决于易于确定的几种考虑,如亲本系的目的(直接生长、在培育过程中的应用、产生杂种的应用),但对于所述的本发明不是关键的。
在本说明书中,应当强调,含有嵌合DNA的植物可形成适当的遗传背景,用于引入根据本发明的其他嵌合DNA,例如增强抗病原物质的产生,由此增强抗性水平。相应于能与调节DNA片段一起适当使用的蛋白质的其他基因的克隆,能相对过量表达该基因的转基因植物的获得,以及对植物病原体抗性的影响的评价,现在都处于本领域技术人员的范围之内。
具有提高的病原体抗性的植物可以在田地、温室中或在室内或别处生长。植物或其可食用部分可用作动物饲料或用于人类消费,或者可加工为食物、饲料或任何形式的农业或工业中的其他用途。农业是指包括园艺、树木栽培、花栽培等。可从根据本发明的植物材料中获益的工业包括但不限于制药工业、造纸纸浆工业、制糖工业、饲料与食品工业、酶制造等。
根据本发明的植物或其部分的优点是对杀生物剂处理的需求降低,从而降低了原料成本、劳动力和环境污染,或者延长了这些植物的产物(例如果实、种子等)的储存期限。用于本发明的植物是指能进行光合作用并且经受某种形式的病原体攻击的多细胞生物。它们至少包括被子植物以及裸子植物、单子叶植物以及双子叶植物。
                      实施例1
            ms59信使在向日葵植物中的诱导
通过喷施5次5mM水杨酸(SA),喷施1次1mM水杨酸,1次0.1mM茉莉酸(JA),1次1mM ACC(1-氨基环丙烷-1-羧酸,植物激素乙烯的前体),或者创伤,诱导7-8周龄向日葵植物(Helianthus annuus cvZebulon)的叶。24小时后(1mM SA、0.1mM JA、1mM ACC和创伤)和5天后(5mM SA)从诱导的叶中收集叶样品。诱导24小时后在非诱导植物中采取对照样品。
                      实施例2
            向日葵叶组织的RNA提取和cDNA合成
用热酚法从10g叶物质中提取总RNA,并用Qiagen RNA缓冲液系列和tip-100柱(Qiagen GmbH,德国)纯化。通过Dnase Ⅰ(Gibco BRL)处理降解污染的DNA。
如制造商所述,用1μg总RNA、1μl oligo(dT)12-18引物(500μg/ml,Gibco BRL)和200单位Superscript ⅡRT RNAse H-反转录酶(GibcoBRL)制备cDNA。
                      实施例3
ms59 PCR MIMIC的构建和利用竞争性RT-PCR对样品的分析
利用竞争性RT-PCR技术测定ms59的转录水平。在该技术中,cDNA靶与人工PCR MIMIC之间的竞争使转录物水平的定量成为可能(Paul D.Siebert和James W.Larrick(1992),自然359,557-558)。
为了PCR MIMIC的构建,制备下列引物:FR-pUC-208(SEQ IDNO:1)5’GTT CCG GAG GTT GTG ACC GTG GGA TGT GCT GCAAGG CG 3’、FR-pUC-209(SEQ ID NO:2)5’CTG GGG AAG CCC GTGTAG TAA AGC CCC CGC GCG TTG GCC GAT TC 3’、FR-MS59-47(SEQ ID NO:3)5’CTG GGG AAG CCC GTG TAG TAA AGC 3’和FR-MS59-77(SEQ ID NO:4)5’GTT CCG GAG GTT GTG ACC GTG3’。引物FR-pUC-208和FR-pUC-209用来通过PCR(95℃ 1’,55℃ 1’,72℃ 2’,10个循环)从质粒pUC18(Yanisch-Perron,C.,Vieira,J.和Messing,J.(1985)基因33,103-119)扩增387bp的片段。利用引物FR-MS59-47和FR-MS59-77通过PCR扩增1μl该PCR产物,产生大量的PCR MIMIC(95℃ 1’,55℃ 1’,72℃ 2’,30个循环)。
引物FR-MS59-47和FR-MS59-77将从ms59 cDNA扩增出一条312bp的带,因此当在2%琼脂糖凝胶中分离时它能与387bp MIMIC轻易地区分开来。在含有0.2μg/μl糖原作为载体的H2O中以100ng/μl-0.1ag/μl的范围进行PCR MIMIC稀释。表1:不同应激处理后,与对照相比,ms59信使在向日葵叶中的诱导水平
    诱导方法     诱导倍数
    对照5mM水杨酸1mM水杨酸1mM ACC0.1mM茉莉酸创伤     1a10001a101010
注意:a:不可检测,人为设为1。
通过竞争性RT-PCR分析cDNA样品。因此在0.5ml试管中将2μl样品与1μl稀释的PCR MIMIC(量:0.1pg、10fg、1.0fg、0.1fg、10ag和1.0ag)合并。用10μM引物FR-MS59-47和FR-MS59-77、0.5μl 20mMdNTP’s、1×PCR缓冲液、MgCl2和2.5单位重组Taq DNA聚合酶(GibcoBRL)进行cDNA和MIMIC的扩增,95℃ 1’、55℃ 1’、72℃ 2’进行35个循环。PCR产物在2%琼脂糖凝胶上分离,并通过溴化乙锭染色和UV照明装置显示。
                      实施例4
         用不同真菌对向日葵植物的感染试验
对7-8周龄的植物进行真菌感染。通过将小滴(15-20μl)的灰葡萄孢(Botrytis cinerea)孢子悬液、Diaporthe helianthi(PH9905)菌丝片段悬液或核盘菌(Sclerotinia sclerotiorum)菌丝片段悬液置于在叶上形成的小切口上,使真菌能够渗入植物,来接种叶子。真菌感染在18℃和高相对湿度(±90%)下进行。接种大约4天后收获具有感染部位的叶(直径=13mm)。在第一个小叶盘的孔周围,收集25mm的另一个环。也在未感染的叶子的叶切口周围收集叶盘作为对照。
                      实施例5
从向日葵叶组织中的PolyA+-RNA提取和cDNA合成
用Quickprep Micro mRNA纯化试剂盒(Amersham PharmaciaBiotech,Uppsala,瑞典)从100mg叶组织中收获Poly-A+RNA。通过在UV照明装置上用4μl 1μg/ml溴化乙锭加于10μl样品,通过核酸显示测定mRNA的相对量。
如制造商所述,使用200单位Superscript Ⅱ RT RNAse H-反转录酶(Gibco BRL)和1μl oligo(dT)12-18引物(500μg/ml,Gibco BRL),用等量Poly-A+RNA(±100ng)合成cDNA。
                      实施例6
         通过竞争性RT-PCR对样品的分析
如实施例3所述分析不同的cDNA样品。表2:用不同真菌感染向日葵叶后,ms59信使的诱导水平
    样品     诱导倍数叶盘b     诱导倍数外部感染区域c
    对照Diaporthe helianthi灰葡萄孢核盘菌     1a100010001000     1a10001a1a
注意:a:人为设为1。b:真菌感染部位周围13mm的叶片。c:真菌感染部位周围第13mm至第25mm的叶环。
                      实施例7
向日葵gapC PCR MIMIC的构建及通过竞争性RT-PCR对样品的分析
我们使用与实施例4、5、6所述相同的样品对管家基因GapC进行竞争性RT-PCR,作为对mRNA质量和cDNA制备的内部对照。
为了PCR MIMIC的构建,制备下列引物:FR-pUC-224(SEQ IDNO:5)5’CCA TGG GCT CAA ACT GGA GCC GGC CGG GAG CAGACA AGC CCG 3’、FR-pUC-225(SEQ ID NO:6)5’CGA GAC GTCAAC AGT CGG GAC CCA CTC ATT AGG CAC CCC AGG C 3’、FR-gapC-211(SEQ ID NO:7)5’CCA TGG GCT CAA ACT GGA GCC G3’和FR-gapC-212(SEQ ID NO:8)5’CGA GAC GTC AAC AGT CGGGAC C 3’。引物FR-pUC-224和FR-pUC-225用来通过PCR(95℃ 1’,55℃ 1’,72℃ 2’,10个循环)从质粒pUC18(Yanisch-Perron,C.,Vieira,J.和Messing,J.(1985)基因33,103-119)扩增527bp的片段。用引物FR-gapC-211和FR-gapC-212通过PCR扩增1μl该PCR产物,产生大量的PCR MIMIC(95℃ 1’,55℃ 1’,72℃ 2’,30个循环)。
引物FR-gapC-211和FR-gapC-212将从gapC cDNA扩增一条470bp的带,因此当在2%琼脂糖凝胶上分离时它能与527bp MIMIC轻易地区分开来。在含有0.2μg/μl糖原作为载体的H2O中以100ng/μl-0.01ag/μl的范围进行PCR MIMIC稀释。
以竞争性PCR分析cDNA样品。因此在0.5ml试管中将2μl样品与1μl稀释的PCR MIMIC(量:0.1pg、10fg、1.0fg、0.1fg、10ag和1.0ag)合并。用10μM引物FR-gapC-211和FR-gapC-212、0.5μl 20mMdNTP’s、1×PCR缓冲液、MgCl2和2.5单位重组Taq DNA聚合酶(GibcoBRL)进行cDNA和MIMIC的扩增,95℃ 1’、55℃ 1’、72℃ 2’进行35个循环。PCR产物在2%琼脂糖凝胶上分离,并通过溴化乙锭染色和UV照明装置显示。表3:用不同真菌感染向日葵叶后,对照GapC信使的诱导水平
    样品     在13mm叶盘中的诱导倍数
    对照Diaporthe helianthi灰葡萄孢核盘菌     1a101010
注意:a:人为设为1。
结果表明,RNA质量和cDNA制备不受这些真菌感染的影响。植物病原体和环境压力因素对GapC信使的诱导以前在Laxalt等人(1996)植物分子生物学30:961-972中有述。
                      实施例8
        ms59启动子从向日葵基因组中的分离
为了ms59启动子的分离,用CTAB提取法从向日葵叶中分离基因组DNA。大约10μg基因组DNA用限制酶BspH Ⅰ、EcoR Ⅴ、Nla Ⅳ、Hph Ⅰ、Rsa Ⅰ、Ssp Ⅰ和Hind Ⅲ在37℃下消化16小时。这些限制位点都位于ms59 cDNA的第一部分内。消化混合物用1倍体积的酚∶氯仿∶异戊醇(25∶24∶1,v/v,Gibco BRL)抽提,并用0.1倍体积的3M NaAc(pH=5.2)和2.5倍体积的96%乙醇沉淀。DNA沉淀用70%乙醇洗涤,然后将沉淀溶解于50μl蒸馏水中。
25μl每种样品于40伏特下在0.7%琼脂糖凝胶中分离16小时。通过应用0.4M NaOH的Southern印迹将DNA转移到尼龙膜(Hybond-N+,Amersham Life Science)上。用32P-dCTP标记的320bp片段(从ATG起始密码子到BspH Ⅰ位点)作为探针杂交(16小时,65℃)该印迹。然后在65℃下用0.2×SSC的严格条件洗涤该印迹。Southern印迹的结果列于表4中。
连接剩下的25μl消化混合物,使得DNA片段的环化受到刺激。实现方法是以300μl的(大)体积在1×T4连接缓冲液和5weiss单位T4 DNA连接酶(Gibco BRL)中将DNA 16℃连接16小时。再次用酚∶氯仿∶异戊醇抽提该混合物,用乙醇沉淀,并将DNA沉淀溶解于50μl水中。
在cDNA的第一部分中(ATG起始密码子与使用的第一个限制位点(BspHⅠ)之间)设计引物,并向外延伸。引物FR-MS59-11(SEQ IDNO:9)5’CAG GCA GCT GTG GTT TGT GGC 3’和FR-MS59-49(SEQID NO:10)5’CGG GAA GTT GCA GAA GAT TGG GTT G 3’在对1μl连接混合物的PCR反应中使用,其中使用Advantage Klentaq聚合酶混合物(Clontech laboratories,Inc.,Palo Alto,CA)、200μM dNTP和10μM每种引物。该聚合酶混合物于94℃激活1分钟,随后在94℃30秒、55℃1分钟、68℃3分钟条件下扩增35个循环。在1%琼脂糖凝胶上分析PCR产物,未检测到特异带。因此如上所述使用第一轮PCR的1μl PCR产物进行巢式PCR,但其中使用巢式引物FR-MS59-34(SEQ ID NO:11)5’ACG TAG ATA TCG AAC AAG AAA CCG C 3’和FR-MS59-50(SEQID NO:12)5’GAG CAA GAG AAG AAG GAG AC 3’。在1%琼脂糖凝胶上分析PCR产物后,检测到非常特异的单一带。反向PCR的结果列于表4中。表4:反向PCR的结果和Southern印迹带的大小(nd=未测定)
反向PCR限制酶     带大小Southern印迹     带大小巢式PCR
    BspHⅠEcoRⅤNlaⅣHphⅠRsaⅠSspⅠHindⅢ     >7kb>7kb1.0kb1.2kb0.5kb1.3kb2.3kb     ndnd0.6kb0.8kb0.2kb0.9kb1.9kb
从凝胶中分离1.9kb Hind Ⅲ iPCR带,并在自动DNA测序仪(Applied Biosystems)上用引物FR-MS59-34和FR-MS59-50测定末端的DNA序列。
根据该DNA序列,为从向日葵基因组中扩增ms59启动子区设计新的引物。引物FR-MS59-226(SEQ ID NO:13)5’GCA AGC TTT ATAGTT TAC GAT CC 3’向下游延伸,位于与Hind Ⅲ限制位点重叠的ms59启动子区的上游部分。引物FR-MS59-227(SEQ ID NO:14)5’TTG CCATGG TGC ATG GTT TAG CG 3’能在与ATG翻译起点重叠的ms59启动子/前导区的最下游部分退火,引入一个横跨ATG起始密码子的NcoⅠ限制位点。应用自动DNA序列分析(Applied Biosystems)测定从上游Hind Ⅲ到NcoⅠ位点的完整启动子片段的DNA序列(SEQ ID NO:15,核苷酸1-1889)。
应用Pfu DNA聚合酶(Stratagene)和两种引物,从向日葵基因组DNA扩增ms59启动子区。1.9kb PCR产物用Hind Ⅲ和NcoⅠ消化,并连接到也用Hind Ⅲ和NcoⅠ消化的多拷贝克隆载体中。利用限制位点NcoⅠ和EcoRⅠ,使该启动子与GUS内含子报道基因(Jefferson等人(1987)EMBO J 6:3901-3907)融合,其后为含有聚腺苷酸化所需序列(An等人,1989,植物细胞1,115-122)的马铃薯蛋白酶抑制剂Ⅱ基因(Thornburg等人,1987,美国国家科学院院报84,744-748)的3’非翻译区,产生pMOG1367。然后将侧翼为限制位点EcoRⅠ和Hind Ⅲ的完整嵌合基因转移到用EcoRⅠ和Hind Ⅲ消化的pMOG800(相关该质粒的描述参见例如WO 97/42326)中。
将得到的二元载体pMOG1368引入根癌农杆菌株EHA105中用于目标作物马铃薯和番茄的转化,引入菌株MOG101中用于烟草和拟南芥的转化,引入MOG301中用于Brassica napus的转化。
                      实施例9
            pMOG1368对马铃薯cv Kardal的转化
基本如Hoekema等人(Hoekema,A.等人,生物技术7,273-278,1989)所述向马铃薯中转化pMOG1368。简言之,马铃薯(Solanumtuberosum cv.Kardal)用农杆菌株EHA 105 pMOG 1368转化。基本培养基是由MS盐(Murashige和Skoog(1962)植物生理学(Physiol.Plant)14,473)、R3维生素(Ooms等人(1987)理论与应用遗传学(Theor.Appl.Genet.)73,744)、30g/l蔗糖、0.5g/l MES组成的MS30R3培养基,终pH 5.8(用KOH调节),必要时用8g/l Daichin琼脂凝固。将马铃薯cv.Kardal的块茎去皮,通过在96%乙醇中燃烧5秒种消毒表面。用无菌水熄灭火焰,并切下大约2mm厚的切片。将片从维管组织切开一个孔,在含有含二元载体的1-5×108细菌/ml农杆菌EHA 105之MS30R3培养基中温育20分钟。块茎片用MS30R3培养基洗涤,转移到凝固的后培养基(PM)中。PM由补充了3.5mg/l玉米素核糖核苷和0.03mg/l吲哚乙酸(IAA)的MS30R3培养基组成。两天后,将片转移到含有200mg/l头孢噻肟和100mg/l万古霉素的新鲜PM培养基中。三天后,将块茎片转移到含有250mg/l羧苄青霉素和100mg/l卡那霉素的PM培养基组成的幼苗诱导培养基(SIM)中。4-8周后,切下从片上长出的幼苗,置于生根培养基(含有100mg/l头孢噻肟、50mg/l万古霉素和50mg/l卡那霉素的MS30R3培养基)中。通过分生组织插条无菌繁殖幼苗。
                      实施例10
          转基因马铃薯植物中启动子功能的检测
在试管中体外培养含有pMOG1368 ms59启动子-GUS构建体的转基因马铃薯植物,测定GUS基因的表达。为此采取并染色叶、茎和根样品(表5中的结果)。按0-5的等级目测GUS表达水平,0是没有可检测的表达,5是在转基因植物的叶中观察到的最高水平的GUS,该植物是罕见的烟草35S-GUS-转基因植物(系96306)。在全部实验中包括该植物的叶样品作为内部参考。表5:ms59启动子驱动的GUS基因在体外小植物的叶、茎和根中的表达
    植物编号     叶     茎     根
    1368-11368-21368-31368-41368-51368-61368-71368-81368-91368-101368-11     00000000000     00000000000     00000000000
    1368-121368-131368-141368-151368-161368-171368-181368-191368-201368-211368-221368-231368-241368-251368-261368-271368-281368-291368-30     0000000000000000000     0000000000001000000     1000001000000000000
用引起马铃薯晚期枯萎病的真菌致病疫霉(Phytophthorainfestans)感染选择的相同年龄的体外小植物。将含有高浓度真菌孢子的小滴水施加于叶表面。感染在室温下进行96小时。从小植物中取下表现病害特征的叶,并通过组织化学GUS分析(Goddijn等人,植物杂志(ThePlant Journal)(1993)4(5):863-873)对GUS基因的表达染色。在真菌感染引起的病斑处,在原发区(感染部位周围的区域),在叶的未感染部分(背景),监测表达。表6:ms59启动子驱动的GUS基因在致病疫霉感染的马铃薯体外小植物叶中的表达
植物编号 感染前 病斑 原发区     背景
    1368-11368-31368-41368-51368-61368-71368-81368-9     00000000     00000000     00110001     00000000
也在致病疫霉感染之前及之后检测完全生长的马铃薯植物叶中的启动子表现。接种前,分离叶,并对GUS的表达染色。然后对植物喷施5×105孢子/ml的孢子悬液,感染进行4天(96小时)。再次分离叶,并对GUS的表达染色。结果列于表7中。在病斑、原发区和背景区域中监测表达。表7:致病疫霉感染之前及之后,ms59启动子驱动的GUS基因在转基因马铃薯植物叶中的表达
植物编号 感染前     病斑     原发区     背景
    1368-11368-21368-31368-41368-51368-61368-71368-91368-101368-111368-121368-13     000000000020     000000000000     000000000020     110000000020
    1368-141368-151368-161368-171368-181368-191368-201368-211368-221368-231368-241368-251368-26     0000000000000     0000000000000     0000200000003     0000000000000
结果表明,ms59启动子可应答真菌感染。诱导表达的水平相当低,在某些情况中可能低于检测水平。这可解释可检测到的诱导型GUS表达的低频率。
                      序列表
<110>MOGEN International nv
<120>New pathogen-inducible promoter.
<130>46062 PCT
<140>
<141>
<150>EP 98201024.1
<151>1998-04-01
<160>18
<170>PatentIn Ver.2.1
<210>1
<211>38
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列的描述:引物
<400>1
gttccggagg ttgtgaccgt gggatgtgct gcaaggcg                        38
<210>2
<211>44
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列的描述:引物
<400>2
ctggggaagc ccgtgtagta aagcccccgc gcgttggccg attc                 44
<210>3
<211>24
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列的描述:引物
<400>3
ctggggaagc ccgtgtagta aagc                                       24
<210>4
<211>21
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列的描还:引物
<400>4
gttccggagg ttgtgaccgt g                                          21
<210>5
<211>42
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列的描述:引物
<400>5
ccatgggctc aaactggagc cggccgggag cagacaagcc cg                   42
<210>6
<211>43
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列的描述:引物
<400>6
cgagacgtca acagtcggga cccactcatt aggcacccca ggc                  43
<210>7
<211>22
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列的描述:引物
<400>7
ccatgggctc aaactggagc cg                                         22
<210>8
<211>22
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列的描述:引物
<400>8
cgagacgtca acagtcggga cc                                         22
<210>9
<211>21
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列的描述:引物
<400>9
caggcagctg tggtttgtgg c                                          21
<210>10
<211>25
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列的描述:引物
<400>10
cgggaagttg cagaagattg ggttg                                      25
<210>11
<211>25
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列的描述:引物
<400>11
acgtagatat cgaacaagaa accgc                                      25
<210>12
<211>20
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列的描述:引物
<400>12
gagcaagaga agaaggagac                                            20
<210>13
<211>23
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列的描述:引物
<400>13
gcaagcttta tagtttacga tcc                                        23
<210>14
<211>23
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列的描述:引物
<400>14
ttgccatggt gcatggttta gcg                                        23
<210>15
<211>3680
<212>DNA
<213>向日葵
<220>
<221>启动子
<222>(1)..(1889)
<220>
<221>CDS
<222>(1890)..(3503)
<400>15
aagctttata gtttacgatc caaggttcga tgtgttagtt ccaacaacgt tggagtcgaa  60
gttcttttta ggagtttttt tttttttttc aaactagtgt tggtagaaaa agtatttact 120
aaagtggtgt tccttgaaaa atatttacca aaataatgtt tttgtctcct ttctcatctt 180
aatgaatata aactaaatta ctaattctat tatttatttc tgttaacact ttatttacta 240
ttatttttta gaaacccaat aaaactaaat tagtaatttt attatttatt atattgacac 300
tttattttct ttttgaaact cagacttgag gttctccatt atgtcaccta atattatctt 360
atctaataat ttatacatga ttaacataat ttactcaatt tataattata tctaaattca 420
ctttaacata tattttgtta tttttagttg taacaataaa agtgttaagt tagttagtta 480
taaaaaaggt cagaaagtaa aatagtttag tatgtttgtt aatataagat tacaaaaaag 540
taaaaaaagt aagccataaa aataaaattt gggagttcgt tttctatgac ttgacaacac 600
tttaaagtag tttaatcgat caaaaataca tgatatatta tttatctagt aaaaaataaa 660
aataaaacaa tattagcgta gataagagtg ataaataatt tttttattaa ataattgaaa 720
tttttaaaaa agatcatttt ctaaaaatcc gtagcgagta aagttatgat gtttgtctaa 780
cttttttatg tttcttattt catactgttt aatatataaa aagataagga gttggtaaaa 840
caaaatataa agagttggtt aaaggtaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaacc 900
tataatggat tgattggagc aaaacaaaat attttattga ttgaataaaa aaatataaca 960
aaaacataat gaataagaag tattacatta cattggcttt aaaaaataat caagtattaa 1020
tagaaataaa taatgaatta ctaaattagt ttttattcaa tgagataaga atagagaaaa 1080
aaacaccatt ttagtaaata cttttgaaaa acaccatttg atgaatattt tttttcacca 1140
tcactacttt aggaaaaaaa aaaaaaactc ttctttttag tctaatattg agtttttaaa 1200
atacttatca tacttattag acaaaacaat cattttagag taaccttccc ctatacccta 1260
aagtatatat agacgattct aattaaggta ccatataata cagtttaaaa tgatttcatt 1320
aattatccaa aatttttact tttgtttaat tctttttggt tcgtatgtac ttgtataatt 1380
caaagtcttc gtggatttaa attactttga atcaaaaata tgtttgaaat agctgacatg 1440
tgtatttttt caaattgtac ataaatatac gcaaactcga aattgaaaag ttgaaagaaa 1500
acgtgtttca ttttttgaaa agtaggcctt atgcaacttg ctattttctc gactatccat 1560
gtttatctcc agatttttaa tttatttgtg tttctttata tctttaacaa gttacaagca 1620
tatggaatta tgtacctatg cactttcact taaaatttat gtcttgttag gagaaattat 1680
tttaaaatca atgttctaat atataaaaat ccaaattaag caatgacact taaaacatat 1740
gaccaatgac acgatatgat gagtacgtac ccaatatgaa ttttcaactt tgattagtta 1800
tatttggtat gtcatttttg aaggtcaaac attacgactt tcaattgcct ataaattgca 1860
tgcatcaagc aaacgctaaa ccatgcaaa atg gca aat atc aca tct tct ttc   1913
                                Met Ala Asn Ile Thr Ser Ser Phe
                                  1               5
aac atg caa act tcc att ctt act ctc ctt ctt ctc ttg ctc tca acc   1961
Asn Met Gln Thr Ser Ile Leu Thr Leu Leu Leu Leu Leu Leu Ser Thr
     10                  15                  20
caa tct tct gca act tcc cgt tcc att aca gat cgc ttc att caa tgt   2009
Gln Ser Ser Ala Thr Ser Arg Ser Ile Thr Asp Arg Phe Ile Gln Cys
 25                  30                  35                  40
tta cac gac cgg gcc gac cct tca ttt ccg ata acc gga gag gtt tac   2057
Leu His Asp Arg Ala Asp Pro Ser Phe Pro Ile Thr Gly Glu Val Tyr
                 45                  50                  55
act ccc gga aac tca tct ttt cct acc gtc ttg caa aac tac atc cga   2105
Thr Pro Gly Asn Ser Ser Phe Pro Thr Val Leu Gln Asn Tyr Ile Arg
             60                  65                  70
aac ctt cgg ttc aat gaa act acc aca cca aaa ccc ttt tta atc atc   2153
Asn Leu Arg Phe Asn Glu Thr Thr Thr Pro Lys Pro Phe Leu Ile Ile
         75                  80                  85
aca gcc gaa cat gtt tcc cac att cag gca gct gtg gtt tgt ggc aaa   2201
Thr Ala Glu His Val Ser His Ile Gln Ala Ala Val Val Cys Gly Lys
     90                  95                 100
caa aac cgg ttg cta ctg aaa acc aga agc ggt ggt cat gat tat gaa   2249
Gln Asn Arg Leu Leu Leu Lys Thr Arg Ser Gly Gly His Asp Tyr Glu
105                 110                 115                 120
ggt ctt tcc tac ctt aca aac aca aac caa ccc ttc ttc att gtg gac    2297
Gly Leu Ser Tyr Leu Thr Asn Thr Asn Gln Pro Phe Phe Ile Val Asp
                125                 130                 135
atg ttc aat tta agg tcc ata aac gta gat atc gaa caa gaa acc gca    2345
Met Phe Asn Leu Arg Ser Ile Asn Val Asp Ile Glu Gln Glu Thr Ala
            140                 145                 150
tgg gtc caa gcc ggt gcg act ctt ggt gaa gtg tac tat cga ata gcg    2393
Trp Val Gln Ala Gly Ala Thr Leu Gly Glu Val Tyr Tyr Arg Ile Ala
        155                 160                 165
gag aaa agt aac aag cat ggt ttt ccg gca ggg gtt tgt cca acg gtt    2441
Glu Lys Ser Asn Lys His Gly Phe Pro Ala Gly Val Cys Pro Thr Val
    170                 175                 180
ggc gtt ggt ggg cat ttt agt ggt ggt ggg tat ggt aat ttg atg aga    2489
Gly Val Gly Gly His Phe Ser Gly Gly Gly Tyr Gly Asn Leu Met Arg
185                 190                 195                 200
aaa tat ggt ttg tcg gtt gat aat att gtt gat gct caa ata ata gat    2537
Lys Tyr Gly Leu Ser Val Asp Asn Ile Val Asp Ala Gln Ile Ile Asp
                205                 210                 215
gtg aat ggc aag ctt ttg gat cga aag agt atg ggt gag gat ttg ttt    2585
Val Asn Gly Lys Leu Leu Asp Arg Lys Ser Met Gly Glu Asp Leu Phe
            220                 225                 230
tgg gcg atc acc ggc ggt ggt ggt gtt agt ttt ggt gtg gtt cta gcc    2633
Trp Ala Ile Thr Gly Gly Gly Gly Val Ser Phe Gly Val Val Leu Ala
        235                 240                 245
tac aaa atc aaa cta gtt cgt gtt ccg gag gtt gtg acc gtg ttt acc    2681
Tyr Lys Ile Lys Leu Val Arg Val Pro Glu Val Val Thr Val Phe Thr
    250                 255                 260
att gaa aga aga gag gaa caa aac ctc agc acc atc gcg gaa cga tgg    2729
Ile Glu Arg Arg Glu Glu Gln Asn Leu Ser Thr Ile Ala Glu Arg Trp
265                 270                 275                 280
gta caa gtt gct gat aag cta gat aga gat ctt ttc ctt cga atg acc    2777
Val Gln Val Ala Asp Lys Leu Asp Arg Asp Leu Phe Leu Arg Met Thr
                285                  290                 295
ttt agt gtc ata aac gat acc aac ggt gga aag aca gtc cgt gct atc    2825
Phe Ser Val Ile Asn Asp Thr Asn Gly Gly Lys Thr Val Arg Ala Ile
            200                 305                 310
ttt cca acg ttg tac ctt gga aac tcg agg aat ctt gtt aca ctt ttg    2873
Phe Pro Thr Leu Tyr Leu Gly Asn Ser Arg Asn Leu Val Thr Leu Leu
        315                 320                 325
aat aaa gat ttc ccc gag tta ggg ttg caa gaa tcg gat tgt act gaa    2921
Asn Lys Asp Phe Pro Glu Leu Gly Leu Gln Glu Ser Asp Cys Thr Glu
    330                 335                 340
atg agt tgg gtt gag tct gtg ctt tac tac acg ggc ttc ccc agt ggt    2969
Met Ser Trp Val Glu Ser Val Leu Tyr Tyr Thr Gly Phe Pro Ser Gly
345                 350                 355                 360
act cca acc acg gcg ctc tta agc cgt act cct caa aga ctc aac cca    3017
Thr Pro Thr Thr Ala Leu Leu Ser Arg Thr Pro Gln Arg Leu Asn Pro
                365                 370                 375
ttc aag atc aaa tcc gat tat gtg caa aat cct att tct aaa cga cag    3065
Phe Lys Ile Lys Ser Asp Tyr Val Gln Asn Pro Ile Ser Lys Arg Gln
            380                 385                 390
ttc gag ttc atc ttc gaa agg ctg aaa gaa ctt gaa aac caa atg ttg    3113
Phe Glu Phe Ile Phe Glu Arg Leu Lys Glu Leu Glu Asn Gln Met Leu
        395                 400                 405
gct ttc aac cca tat ggt ggt aga atg agt gaa ata tcc gaa ttc gca    3161
Ala Phe Asn Pro Tyr Gly Gly Arg Met Ser Glu Ile Ser Glu Phe Ala
    410                 415                 420
aag cct ttc cca cat aga tcg ggt aac ata gcg aaa att caa tac gaa    3209
Lys Pro Phe Pro His Arg Ser Gly Asn Ile Ala Lys Ile Gln Tyr Glu
425                 430                 435                 440
gta aac tgg gag gat ctt agc gat gaa gcc gaa aat cgt tac ttg aat    3257
Val Asn Trp Glu Asp Leu Ser Asp Glu Ala Glu Asn Arg Tyr Leu Asn
                445                  450                 455
ttc aca agg ctg atg tat gat tac atg acc cca ttt gtg tcg aaa aac    3305
Phe Thr Arg Leu Met Tyr Asp Tyr Met Thr Pro Phe Val Ser Lys Asn
            460                 465                 470
cct aga aaa gca ttt ttg aac tat agg gat ttg gat att ggt atc aac    3353
Pro Arg Lys Ala Phe Leu Asn Tyr Arg Asp Leu Asp Ile Gly Ile Asn
        475                  480                 485
agc cat ggc agg aat gct tat act gaa gga atg gtt tat ggg cac aag    3401
Ser His Gly Arg Asn Ala Tyr Thr Glu Gly Met Val Tyr Gly His Lys
    490                 495                 500
tat ttc aaa gag aca aat tac aag agg cta gta agt gtg aag act aaa    3449
Tyr Phe Lys Glu Thr Asn Tyr Lys Arg Leu Val Ser Val Lys Thr Lys
505                 510                 515                 520
gtt gat cct gac aac ttc ttt agg aat gag caa agc atc cca act ttg    3497
Val Asp Pro Asp Asn Phe Phe Arg Asn Glu Gln Ser Ile Pro Thr Leu
                525                 530                 535
tca tct tgaagaacgt acatatataa ataaatacct ttgtgcatgg tattttcagg     3553
Ser Ser
gtgttaaagt gatattcaga tatttatgat agaattttga cttgtatttt atacaatcaa  3613
aattgtatgg ttctccgaat ttctcttttt aattctgaaa aatacatatt agtattgtca  3673
aaaaaaa                                                            3680
<210>16
<211>538
<212>PRT
<213>向日葵
<400>16
Met Ala Asn Ile Thr Ser Ser Phe Asn Met Gln Thr Ser Ile Leu Thr
  1               5                  10                  15
Leu Leu Leu Leu Leu Leu Ser Thr Gln Ser Ser Ala Thr Ser Arg Ser
             20                  25                  30
Ile Thr Asp Arg Phe Ile Gln Cys Leu His Asp Arg Ala Asp Pro Ser
         35                  40                  45
Phe Pro Ile Thr Gly Glu Val Tyr Thr Pro Gly Asn Ser Ser Phe Pro
     50                  55                  60
Thr Val Leu Gln Asn Tyr lle Arg Asn Leu Arg Phe Asn Glu Thr Thr
 65                  70                  75                  80
Thr Pro Lys Pro Phe Leu Ile Ile Thr Ala Glu His Val Ser His Ile
                 85                  90                  95
Gln Ala Ala Val Val Cys Gly Lys Gln Asn Arg Leu Leu Leu Lys Thr
            100                 105                 110
Arg Ser Gly Gly His Asp Tyr Glu Gly Leu Ser Tyr Leu Thr Asn Thr
        115                 120                 125
Asn Gln Pro Phe Phe Ile Val Asp Met Phe Asn Leu Arg Ser Ile Asn
    130                 135                 140
Val Asp Ile Glu Gln Glu Thr Ala Trp Val Gln Ala Gly Ala Thr Leu
145                 150                 155                 160
Gly Glu Val Tyr Tyr Arg Ile Ala Glu Lys Ser Asn Lys His Gly Phe
                165                 170                 175
Pro Ala Gly Val Cys Pro Thr Val Gly Val Gly Gly His Phe Ser Gly
            180                 185                 190
Gly Gly Tyr Gly Asn Leu Met Arg Lys Tyr Gly Leu Ser Val Asp Asn
        195                 200                 205
Ile Val Asp Ala Gln Ile Ile Asp Val Asn Gly Lys Leu Leu Asp Arg
    210                 215                 220
Lys Ser Met Gly Glu Asp Leu Phe Trp Ala Ile Thr Gly Gly Gly Gly
225                 230                 235                 240
Val Ser Phe Gly Val Val Leu Ala Tyr Lys Ile Lys Leu Val Arg Val
                245                 250                 255
Pro Glu Val Val Thr Val Phe Thr Ile Glu Arg Arg Glu Glu Gln Asn
            260                 265                 270
Leu Ser Thr Ile Ala Glu Arg Trp Val Gln Val Ala Asp Lys Leu Asp
         275                 280                 285
Arg Asp Leu Phe Leu Arg Met Thr Phe Ser Val Ile Asn Asp Thr Asn
    290                 295                 300
Gly Gly Lys Thr Val Arg Ala Ile Phe Pro Thr Leu Tyr Leu Gly Asn
305                 310                 315                320
Ser Arg Asn Leu Val Thr Leu Leu Asn Lys Asp Phe Pro Glu Leu Gly
                325                 330                 335
Leu Gln Glu Ser Asp Cys Thr Glu Met Ser Trp Val Glu Ser Val Leu
            340                 345                 350
Tyr Tyr Thr Gly Phe Pro Ser Gly Thr Pro Thr Thr Ala Leu Leu Ser
        355                 360                 365
Arg Thr Pro Gln Arg Leu Asn Pro Phe Lys Ile Lys Ser Asp Tyr Val
    370                 375                 380
Gln Asn Pro Ile Ser Lys Arg Gln Phe Glu Phe Ile Phe Glu Arg Leu
385                 390                 395                 400
Lys Glu Leu Glu Asn Gln Met Leu Ala Phe Asn Pro Tyr Gly Gly Arg
                405                 410                 415
Met Ser Glu Ile Ser Glu Phe Ala Lys Pro Phe Pro His Arg Ser Gly
            420                 425                 430
Asn Ile Ala Lys Ile Gln Tyr Glu Val Asn Trp Glu Asp Leu Ser Asp
        435                 440                 445
Glu Ala Glu Asn Arg Tyr Leu Asn Phe Thr Arg Leu Met Tyr Asp Tyr
    450                 455                 460
Met Thr Pro Phe Val Ser Lys Asn Pro Arg Lys Ala Phe Leu Asn Tyr
465                 470                 475                 480
Arg Asp Leu Asp Ile Gly Ile Asn Ser His Gly Arg Asn Ala Tyr Thr
                485                 490                 495
Glu Gly Met Val Tyr Gly His Lys Tyr Phe Lys Glu Thr Asn Tyr Lys
            500                 505                 510
Arg Leu Val Ser Val Lys Thr Lys Val Asp Pro Asp Asn Phe Phe Arg
        515                 520                 525
Asn Glu Gln Ser Ile Pro Thr Leu Ser Ser
    530                 535         538
<210>17
<211>1981
<212>DNA
<213>莴苣
<220>
<221>CDS
<222>(7)..(1626)
<220>
<221>未定
<222>( 372)
<223>替换(372,″g″)
<221>未定
<223>替换(379,″g″)
<220>
<221>未定
<222>(786)
<223>替换(786 ,″t″)
<220>
<221>未定
<223>替换(1105..1106,″ga″或″gg″或″aa″)
<400>17
acaaaa atg gca att acc tat tct ttc aac ttc aaa tct tat att ttt     48
       Met Ala Ile Thr Tyr Ser Phe Asn Phe Lys Ser Tyr Ile Phe
         1               5                  10
cct ctc ctc ctt gtc ttg ctc tct acc cat tca tca gcg act tca act    96
Pro Leu Leu Leu Val Leu Leu Ser Thr His Ser Ser Ala Thr Ser Thr
 15                  20                  25                  30
tcc att ata gat cgc ttc acc caa tgt cta aac aac cga gct gac cct    144
Ser Ile Ile Asp Arg Phe Thr Gln Cys Leu Asn Asn Arg Ala Asp Pro
                 35                  40                  45
tct ttc ccg ctc agt gga caa ctt tac act ccc gat aac tcc tct ttt    192
Ser Phe Pro Leu Ser Gly Gln Leu Tyr Thr Pro Asp Asn Ser Ser Phe
             50                  55                  60
cca tcc gtc ttg caa gct tac atc cgg aac ctc cga ttc aat gaa tcc    240
Pro Ser Val Leu Gln Ala Tyr Ile Arg Asn Leu Arg Phe Asn Glu Ser
         65                  70                  75
acg act ccc aaa ccc atc tta atc atc acc gcc tta cac cct tca cac    288
Thr Thr Pro Lys Pro Ile Leu Ile Ile Thr Ala Leu His Pro Ser His
     80                  85                  90
att caa gca gct gtt gtg tgc gcc aaa aca cac cgc ctg cta atg aaa    336
Ile Gln Ala Ala Val Val Cys Ala Lys Thr His Arg Leu Leu Met Lys
 95                 100                 105                 110
acc aga agc gga ggc cat gat tat gag ggg ctt tcc tat gtg acc aat    384
Thr Arg Ser Gly Gly His Asp Tyr Glu Gly Leu Ser Tyr Val Thr Asn
                115                 120                 125
tcg aac caa ccc ttt ttt gtt gtt gac atg ttc aac tta cgc tcc ata    432
Ser Asn Gln Pro Phe Phe Val Val Asp Met Phe Asn Leu Arg Ser Ile
            130                 135                 140
aac gtg agt att gaa gat gaa act gca tgg gtc caa gct ggt gcg act    480
Asn Val Ser Ile Glu Asp Glu Thr Ala Trp Val Gln Ala Gly Ala Thr
        145                 150                 155
ctt ggt gaa gtc tac tac cga ata gca gag aaa agc aac agt cat gct    528
Leu Gly Glu Val Tyr Tyr Arg Ile Ala Glu Lys Ser Asn Ser His Ala
    160                 165                 170
ttt ccg gct ggc gtt tgc cct act gtt gga gtt ggt ggc cat ttt agt    576
Phe Pro Ala Gly Val Cys Pro Thr Val Gly Val Gly Gly His Phe Ser
175                 180                 185                 190
ggt ggt ggt tat ggt aac ttg atg gga aaa tac ggc ctt tct gtt gac    624
Gly Gly Gly Tyr Gly Asn Leu Met Gly Lys Tyr Gly Leu Ser Val Asp
                195                 200                 205
aat att gtc gat gct cag tta atc gat gtg aat ggt aaa ctt ctg aat    672
Asn Ile Val Asp Ala Gln Leu Ile Asp Val Asn Gly Lys Leu Leu Asn
            210                 215                 220
cgg aaa tca atg ggt gaa gat ctt ttt tgg gcc atc aca ggt ggt ggt    720
Arg Lys Ser Met Gly Glu Asp Leu Phe Trp Ala Ile Thr Gly Gly Gly
        225                 230                 235
ggt gtc agc ttt ggt gtg gtt gta gcg tac aag atc aaa ctg gtt cgt    768
Gly Val Ser Phe Gly Val Val Val Ala Tyr Lys Ile Lys Leu Val Arg
    240                 245                 250
gtt cct acc act gtg acc gtt ttt aac gta caa aga aca tcc gag cag    816
Val Pro Thr Thr Val Thr Val Phe Asn Val Gln Arg Thr Ser Glu Gln
255                 260                 265                 270
aac cta agc acc ata gcc cac cga tgg ata caa gtt gcg gat aag ctc    864
Asn Leu Ser Thr Ile Ala His Arg Trp Ile Gln Val Ala Asp Lys Leu
                275                 280                 285
gat aat gac ctt ttc ctt cga atg acc ttt aac gtg ata aac aac aca    912
Asp Asn Asp Leu Phe Leu Arg Met Thr Phe Asn Val Ile Asn Asn Thr
            290                 295                 300
aat ggc gaa aag acg ata cgt ggt ttg ttt cca aca ctg tac ctc gga    960
Asn Gly Glu Lys Thr Ile Arg Gly Leu Phe Pro Thr Leu Tyr Leu Gly
        305                 310                 315
aac tct acc gct ctt gtt gcc ctc ctg aac aag gat ttc cct gaa tta    1008
Asn Ser Thr Ala Leu Val Ala Leu Leu Asn Lys Asp Phe Pro Glu Leu
    320                 325                 330
ggt gta gaa att tca gat tgt att gaa atg agt tgg atc gag tct gtt    1056
Gly Val Glu Ile Ser Asp Cys Ile Glu Met Ser Trp Ile Glu Ser Val
335                340                  345                 350
ctt ttc tac aca aac ttc ccc att ggt act ccg acc act gct ctt cta    1104
Leu Phe Tyr Thr Asn Phe Pro Ile Gly Thr Pro Thr Thr Ala Leu Leu
                355                 360                 365
agc cgt aca cct caa aga cta aac cca ttc aaa atc aaa tct gat tac    1152
Ser Arg Thr Pro Gln Arg Leu Asn Pro Phe Lys Ile Lys Ser Asp Tyr
            370                 375                 380
gta aaa aac act att tcc aaa cag gga ttc gaa tcc ata ttt gaa agg    1200
Val Lys Asn Thr Ile Ser Lys Gln Gly Phe Glu Ser Ile Phe Glu Arg
        385                 390                 395
atg aaa gaa ctc gaa aac caa atg cta gcc ttc aac cct tat ggt gga    1248
Met Lys Glu Leu Glu Asn Gln Met Leu Ala Phe Asn Pro Tyr Gly Gly
    400                 405                 410
aga atg agc gaa att tcc gaa ttt gca aag cct ttt ccc cat cga tca    1296
Arg Met Ser Glu Ile Ser Glu Phe Ala Lys Pro Phe Pro His Arg Ser
415                 420                 425                 430
ggg aat ata gcg aag atc caa tac gaa gta aac tgg gat gaa ctt ggc    1344
Gly Asn Ile Ala Lys Ile Gln Tyr Glu Val Asn Trp Asp Glu Leu Gly
                435                 440                 445
gtt gaa gca gcc aat cgg tac ttg aac ttc aca agg gtg atg tat gat    1392
Val Glu Ala Ala Asn Arg Tyr Leu Asn Phe Thr Arg Val Met Tyr Asp
            450                 455                 460
tat atg act ccg ttt gtt tct aag aac ccc agg gaa gca ttt ctg aac    1440
Tyr Met Thr Pro Phe Val Ser Lys Asn Pro Arg Glu Ala Phe Leu Asn
        465                 470                 475
tac agg gat tta gat att ggt gtc aac agt cat ggc aag aat gct tac    1488
Tyr Arg Asp Leu Asp Ile Gly Val Asn Ser His Gly Lys Asn Ala Tyr
    480                 485                 490
ggt gaa gga atg gtt tat ggg cac aag tat ttc aaa gag acg aat tat    1536
Gly Glu Gly Met Val Tyr Gly His Lys Tyr Phe Lys Glu Thr Asn Tyr
495                 500                 505                 510
aag agg cta acg atg gtg aag acg agg gtt gat cct agc aat ttt ttt    1584
Lys Arg Leu Thr Met Val Lys Thr Arg Val Asp Pro Ser Asn Phe Phe
                515                 520                 525
agg aat gag caa agt atc cca act ttg tca tct tca tgg aag            1626
Arg Asn Glu Gln Ser Ile Pro Thr Leu Ser Ser Ser Trp Lys
            530                535                  540
taaattctaa attcacttgt gaaattgaat aaaagtatgg ctttttcaag gtcatggtat  1686
ccagattcag atgatattga tataattttg acttgtattt atacaaacaa aattatatta  1746
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ggtttttttt ataagtatgt aatagcatgt ctttaatcaa gataaccgat cattggatgc  1926
aatttattat tataaacctt atttaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaa       1981
<210>18
<211>540
<212>PRT
<213>莴苣
<400>18
Met Ala Ile Thr Tyr Ser Phe Asn Phe Lys Ser Tyr Ile Phe Pro Leu
  1               5                  10                  15
Leu Leu Val Leu Leu Ser Thr His Ser Ser Ala Thr Ser Thr Ser Ile
             20                  25                  30
Ile Asp Arg Phe Thr Gln Cys Leu Asn Asn Arg Ala Asp Pro Ser Phe
         35                  40                  45
Pro Leu Ser Gly Gln Leu Tyr Thr Pro Asp Asn Ser Ser Phe Pro Ser
     50                  55                  60
Val Leu Gln Ala Tyr Ile Arg Asn Leu Arg Phe Asn Glu Ser Thr Thr
 65                  70                  75                  80
Pro Lys Pro Ile Leu Ile Ile Thr Ala Leu His Pro Ser His Ile Gln
                 85                  90                  95
Ala Ala Val Val Cys Ala Lys Thr His Arg Leu Leu Met Lys Thr Arg
            100                 105                 110
Ser Gly Gly His Asp Tyr Glu Gly Leu Ser Tyr Val Thr Asn Ser Asn
        115                 120                 125
Gln Pro Phe Phe Val Val Asp Met Phe Asn Leu Arg Ser Ile Asn Val
    130                 135                 140
Ser Ile Glu Asp Glu Thr Ala Trp Val Gln Ala Gly Ala Thr Leu Gly
145                 150                 155                 160
Glu Val Tyr Tyr Arg Ile Ala Glu Lys Ser Asn Ser His Ala Phe Pro
                165                 170                 175
Ala Gly Val Cys Pro Thr Val Gly Val Gly Gly His Phe Ser Gly Gly
            180                 185                 190
Gly Tyr Gly Asn Leu Met Gly Lys Tyr Gly Leu Ser Val Asp Asn Ile
        195                 200                 205
Val Asp Ala Gln Leu Ile Asp Val Asn Gly Lys Leu Leu Asn Arg Lys
    210                 215                 220
Ser Met Gly Glu Asp Leu Phe Trp Ala Ile Thr Gly Gly Gly Gly Val
225                 230                 235                 240
Ser Phe Gly Val Val Val Ala Tyr Lys Ile Lys Leu Val Arg Val Pro
                245                 250                 255
Thr Thr Val Thr Val Phe Asn Val Gln Arg Thr Ser Glu Gln Asn Leu
            260                 265                 270
Ser Thr Ile Ala His Arg Trp Ile Gln Val Ala Asp Lys Leu Asp Asn
        275                 280                 285
Asp Leu Phe Leu Arg Met Thr Phe Asn Val Ile Asn Asn Thr Asn Gly
    290                 295                 300
Glu Lys Thr Ile Arg Gly Leu Phe Pro Thr Leu Tyr Leu Gly Asn Ser
305                 310                 315                 320
Thr Ala Leu Val Ala Leu Leu Asn Lys Asp Phe Pro Glu Leu Gly Val
                325                 330                 335
Glu Ile Ser Asp Cys Ile Glu Met Ser Trp Ile Glu Ser Val Leu Phe
            340                 345                 350
Tyr Thr Asn Phe Pro Ile Gly Thr Pro Thr Thr Ala Leu Leu Ser Arg
        355                 360                 365
Thr Pro Gln Arg Leu Asn Pro Phe Lys Ile Lys Ser Asp Tyr Val Lys
    370                 375                 380
Asn Thr Ile Ser Lys Gln Gly Phe Glu Ser Ile Phe Glu Arg Met Lys
385                 390                 395                 400
Glu Leu Glu Asn Gln Met Leu Ala Phe Asn Pro Tyr Gly Gly Arg Met
                405                 410                 415
Ser Glu Ile Ser Glu Phe Ala Lys Pro Phe Pro His Arg Ser Gly Asn
            420                 425                 430
Ile Ala Lys Ile Gln Tyr Glu Val Asn Trp Asp Glu Leu Gly Val Glu
        435                 440                 445
Ala Ala Asn Arg Tyr Leu Asn Phe Thr Arg Val Met Tyr Asp Tyr Met
    450                 455                 460
Thr Pro Phe Val Ser Lys Asn Pro Arg Glu Ala Phe Leu Asn Tyr Arg
465                 470                 475                 480
Asp Leu Asp Ile Gly Val Asn Ser His Gly Lys Asn Ala Tyr Gly Glu
                485                 490                 495
Gly Met Val Tyr Gly His Lys Tyr Phe Lys Glu Thr Asn Tyr Lys Arg
            500                 505                 510
Leu Thr Met Val Lys Thr Arg Val Asp Pro Ser Asn Phe Phe Arg Asn
        515                 520                 525
Glu Gln Ser Ile Pro Thr Leu Ser Ser Ser Trp Lys
    530                 535                 540

Claims (22)

1.一种天然驱动编码己糖氧化酶的植物基因表达的DNA片段,当再引入植物中时,它能促进相关DNA序列的病原体诱导型转录。
2.根据权利要求1的DNA片段,其特征在于它可从向日葵中获得。
3.根据权利要求1的DNA片段,其特征在于它可从莴苣中获得。
4.根据权利要求2的DNA片段,其特征在于它是编码己糖氧化酶的基因的上游调节区,被称为MS59。
5.根据权利要求3的DNA片段,其特征在于它是编码己糖氧化酶的基因的上游调节区,被称为WL64。
6.一种根据权利要求4的DNA片段,其特征在于它包含SEQ ID NO:15所示的核苷酸序列1-1889。
7.根据权利要求4-6任一项的DNA片段的一部分或变体,当再引入植物中时,它能促进相关DNA序列的病原体诱导型转录。
8.一种嵌合DNA序列,其以转录方向含有根据权利要求1-7任一项的DNA片段,和在其转录控制下表达的DNA序列,并且该DNA序列不是天然处于该DNA片段的转录控制之下。
9.根据权利要求8的嵌合DNA序列,其中待表达的DNA序列导致一种抗病原蛋白质的产生。
10.根据权利要求9的嵌合DNA序列,其中所述抗病原蛋白质选自壳多糖酶、葡聚糖酶、渗透蛋白、爪蟾抗菌肽、凝集素、糖氧化酶、草酸氧化酶、苏云金芽孢杆菌毒素、从紫茉莉、苋属、萝卜属、芸苔属、芥属、拟南芥属、大丽花属、Cnicus、山黧豆属、蝶豆属、葱属种子、葱木属和凤仙花属中分离的抗真菌蛋白质,和白蛋白型蛋白质,如硫堇、napin、大麦胰蛋白酶抑制剂、谷类麦醇溶蛋白和小麦α-淀粉酶。
11.根据权利要求8的嵌合DNA序列,其中欲表达的DNA序列导致能诱导过敏反应的蛋白质的产生,该蛋白质优选地选自番茄的Cf、Bs3和Pto蛋白,拟南芥的Rpm1和Rps2,烟草的N-蛋白,黄枝孢的avr蛋白,欧文氏菌属的harpin和假单胞菌属或黄单胞菌属的引发蛋白(avrBs3、avrRpm1、avrRpt2)。
12.一种包含根据权利要求8-11任一项的嵌合DNA序列的复制子。
13.一种复制子,其以转录方向包含根据权利要求1-7任一项的DNA片段,和至少一个限制性内切核酸酶的识别位点,用于在该DNA片段控制下表达的DNA序列的插入。
14.一种含有根据权利要求12或13任一项的复制子的微生物。
15.一种植物细胞,它在基因组中掺入了根据权利要求8-11任一项的嵌合DNA序列。
16.一种基本上由根据权利要求15的细胞组成的植物。
17.根据权利要求16的植物,它是一种双子叶植物。
18.从根据权利要求16或17的植物中获得的植物的一部分,其选自种子、花、块茎、根、叶、果实、花粉和木材。
19.根据权利要求1-7任一项的DNA序列在鉴定能促进植物中病原体诱导转录的同源物中的应用。
20.根据权利要求8-11任一项的嵌合DNA序列在转化植物中的应用。
21.根据权利要求7的部分或变体在制备杂合调节DNA序列中的应用。
22.根据权利要求9-11任一项的嵌合DNA序列在赋予植物病原体抗性中的应用。
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