CN117512093A - 用于人抗凝相关药物的基因位点检测的引物组、试剂及其方法 - Google Patents
用于人抗凝相关药物的基因位点检测的引物组、试剂及其方法 Download PDFInfo
- Publication number
- CN117512093A CN117512093A CN202311473393.3A CN202311473393A CN117512093A CN 117512093 A CN117512093 A CN 117512093A CN 202311473393 A CN202311473393 A CN 202311473393A CN 117512093 A CN117512093 A CN 117512093A
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- seq
- primer
- extension
- amplification
- primer shown
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
- 239000003814 drug Substances 0.000 title claims abstract description 54
- 241000282414 Homo sapiens Species 0.000 title claims abstract description 33
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 title claims abstract description 33
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 title claims abstract description 24
- 230000010100 anticoagulation Effects 0.000 title claims abstract description 22
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims description 36
- 238000001514 detection method Methods 0.000 claims abstract description 44
- 229940079593 drug Drugs 0.000 claims abstract description 44
- 230000003321 amplification Effects 0.000 claims description 69
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 claims description 69
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims description 42
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 claims description 24
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 claims description 24
- 108010000178 IGF-I-IGFBP-3 complex Proteins 0.000 claims description 19
- 238000003556 assay Methods 0.000 claims description 19
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims description 17
- 239000000872 buffer Substances 0.000 claims description 13
- 239000007795 chemical reaction product Substances 0.000 claims description 12
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 claims description 12
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 claims description 11
- 239000003146 anticoagulant agent Substances 0.000 claims description 11
- 229940127219 anticoagulant drug Drugs 0.000 claims description 11
- 238000012408 PCR amplification Methods 0.000 claims description 10
- 229910021642 ultra pure water Inorganic materials 0.000 claims description 10
- 239000012498 ultrapure water Substances 0.000 claims description 10
- 230000029087 digestion Effects 0.000 claims description 9
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 claims description 9
- 239000011259 mixed solution Substances 0.000 claims description 8
- 239000000047 product Substances 0.000 claims description 6
- 238000001269 time-of-flight mass spectrometry Methods 0.000 claims description 6
- 239000005552 B01AC04 - Clopidogrel Substances 0.000 claims description 5
- GKTWGGQPFAXNFI-HNNXBMFYSA-N clopidogrel Chemical compound C1([C@H](N2CC=3C=CSC=3CC2)C(=O)OC)=CC=CC=C1Cl GKTWGGQPFAXNFI-HNNXBMFYSA-N 0.000 claims description 5
- 229960003009 clopidogrel Drugs 0.000 claims description 5
- BSYNRYMUTXBXSQ-UHFFFAOYSA-N Aspirin Chemical compound CC(=O)OC1=CC=CC=C1C(O)=O BSYNRYMUTXBXSQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 229960001138 acetylsalicylic acid Drugs 0.000 claims description 4
- 238000011033 desalting Methods 0.000 claims description 4
- 230000008676 import Effects 0.000 claims description 4
- OEKWJQXRCDYSHL-FNOIDJSQSA-N ticagrelor Chemical compound C1([C@@H]2C[C@H]2NC=2N=C(N=C3N([C@H]4[C@@H]([C@H](O)[C@@H](OCCO)C4)O)N=NC3=2)SCCC)=CC=C(F)C(F)=C1 OEKWJQXRCDYSHL-FNOIDJSQSA-N 0.000 claims description 4
- 229960002528 ticagrelor Drugs 0.000 claims description 4
- QNZCBYKSOIHPEH-UHFFFAOYSA-N Apixaban Chemical compound C1=CC(OC)=CC=C1N1C(C(=O)N(CC2)C=3C=CC(=CC=3)N3C(CCCC3)=O)=C2C(C(N)=O)=N1 QNZCBYKSOIHPEH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- 239000005465 B01AC22 - Prasugrel Substances 0.000 claims description 3
- 229960003886 apixaban Drugs 0.000 claims description 3
- RRGUKTPIGVIEKM-UHFFFAOYSA-N cilostazol Chemical compound C=1C=C2NC(=O)CCC2=CC=1OCCCCC1=NN=NN1C1CCCCC1 RRGUKTPIGVIEKM-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- 229960004588 cilostazol Drugs 0.000 claims description 3
- 229960003850 dabigatran Drugs 0.000 claims description 3
- YBSJFWOBGCMAKL-UHFFFAOYSA-N dabigatran Chemical compound N=1C2=CC(C(=O)N(CCC(O)=O)C=3N=CC=CC=3)=CC=C2N(C)C=1CNC1=CC=C(C(N)=N)C=C1 YBSJFWOBGCMAKL-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- DTGLZDAWLRGWQN-UHFFFAOYSA-N prasugrel Chemical compound C1CC=2SC(OC(=O)C)=CC=2CN1C(C=1C(=CC=CC=1)F)C(=O)C1CC1 DTGLZDAWLRGWQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- 229960004197 prasugrel Drugs 0.000 claims description 3
- 229960001148 rivaroxaban Drugs 0.000 claims description 3
- KGFYHTZWPPHNLQ-AWEZNQCLSA-N rivaroxaban Chemical compound S1C(Cl)=CC=C1C(=O)NC[C@@H]1OC(=O)N(C=2C=CC(=CC=2)N2C(COCC2)=O)C1 KGFYHTZWPPHNLQ-AWEZNQCLSA-N 0.000 claims description 3
- 238000001228 spectrum Methods 0.000 claims description 3
- 229960005080 warfarin Drugs 0.000 claims description 3
- PJVWKTKQMONHTI-UHFFFAOYSA-N warfarin Chemical compound OC=1C2=CC=CC=C2OC(=O)C=1C(CC(=O)C)C1=CC=CC=C1 PJVWKTKQMONHTI-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- 238000001816 cooling Methods 0.000 claims description 2
- -1 acenicoumarin Chemical compound 0.000 claims 2
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 claims 1
- 229960002939 metizoline Drugs 0.000 claims 1
- NDNKHWUXXOFHTD-UHFFFAOYSA-N metizoline Chemical compound CC=1SC2=CC=CC=C2C=1CC1=NCCN1 NDNKHWUXXOFHTD-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 230000008901 benefit Effects 0.000 abstract description 8
- 230000004907 flux Effects 0.000 abstract description 8
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 11
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 6
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 6
- 206010067484 Adverse reaction Diseases 0.000 description 5
- 206010064571 Gene mutation Diseases 0.000 description 5
- 101710148592 PTS system fructose-like EIIA component Proteins 0.000 description 5
- 230000006838 adverse reaction Effects 0.000 description 5
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 5
- 208000032843 Hemorrhage Diseases 0.000 description 4
- 208000034158 bleeding Diseases 0.000 description 4
- 230000000740 bleeding effect Effects 0.000 description 4
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 3
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 3
- KYITYFHKDODNCQ-UHFFFAOYSA-M sodium;2-oxo-3-(3-oxo-1-phenylbutyl)chromen-4-olate Chemical compound [Na+].[O-]C=1C2=CC=CC=C2OC(=O)C=1C(CC(=O)C)C1=CC=CC=C1 KYITYFHKDODNCQ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- 238000010257 thawing Methods 0.000 description 3
- 229960002647 warfarin sodium Drugs 0.000 description 3
- 206010002383 Angina Pectoris Diseases 0.000 description 2
- 206010008479 Chest Pain Diseases 0.000 description 2
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 2
- 238000002586 coronary angiography Methods 0.000 description 2
- 238000013461 design Methods 0.000 description 2
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 2
- 238000004949 mass spectrometry Methods 0.000 description 2
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 2
- 231100000252 nontoxic Toxicity 0.000 description 2
- 230000003000 nontoxic effect Effects 0.000 description 2
- 238000003753 real-time PCR Methods 0.000 description 2
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 2
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 2
- 231100000331 toxic Toxicity 0.000 description 2
- 230000002588 toxic effect Effects 0.000 description 2
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 2
- YTCVPEZECJYZRK-UHFFFAOYSA-N 3-nitrochromen-2-one Chemical compound C1=CC=C2OC(=O)C([N+](=O)[O-])=CC2=C1 YTCVPEZECJYZRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 208000024172 Cardiovascular disease Diseases 0.000 description 1
- 101000617479 Escherichia coli (strain K12) PTS system fructose-like EIIA component Proteins 0.000 description 1
- 208000031481 Pathologic Constriction Diseases 0.000 description 1
- 102100032008 Solute carrier family 40 member 1 Human genes 0.000 description 1
- 101710111423 Solute carrier family 40 member 1 Proteins 0.000 description 1
- 208000007536 Thrombosis Diseases 0.000 description 1
- 238000013176 antiplatelet therapy Methods 0.000 description 1
- ZYGHJZDHTFUPRJ-UHFFFAOYSA-N benzo-alpha-pyrone Natural products C1=CC=C2OC(=O)C=CC2=C1 ZYGHJZDHTFUPRJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000007853 buffer solution Substances 0.000 description 1
- 208000026106 cerebrovascular disease Diseases 0.000 description 1
- 235000001671 coumarin Nutrition 0.000 description 1
- 150000004775 coumarins Chemical class 0.000 description 1
- 230000007547 defect Effects 0.000 description 1
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 description 1
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 1
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 1
- 238000001647 drug administration Methods 0.000 description 1
- 230000000857 drug effect Effects 0.000 description 1
- 230000036267 drug metabolism Effects 0.000 description 1
- 230000002526 effect on cardiovascular system Effects 0.000 description 1
- 230000007613 environmental effect Effects 0.000 description 1
- 238000001704 evaporation Methods 0.000 description 1
- 230000008020 evaporation Effects 0.000 description 1
- 238000003205 genotyping method Methods 0.000 description 1
- 210000003709 heart valve Anatomy 0.000 description 1
- 238000002513 implantation Methods 0.000 description 1
- 230000006872 improvement Effects 0.000 description 1
- 238000009413 insulation Methods 0.000 description 1
- 238000001819 mass spectrum Methods 0.000 description 1
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 1
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 1
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 1
- 230000002974 pharmacogenomic effect Effects 0.000 description 1
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 1
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 1
- 238000003908 quality control method Methods 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- 239000011347 resin Substances 0.000 description 1
- 229920005989 resin Polymers 0.000 description 1
- 230000004044 response Effects 0.000 description 1
- 238000012552 review Methods 0.000 description 1
- 238000007480 sanger sequencing Methods 0.000 description 1
- 238000007789 sealing Methods 0.000 description 1
- 230000036262 stenosis Effects 0.000 description 1
- 208000037804 stenosis Diseases 0.000 description 1
- 229940124597 therapeutic agent Drugs 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
- C12Q1/6858—Allele-specific amplification
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
- G16B15/00—ICT specially adapted for analysing two-dimensional or three-dimensional molecular structures, e.g. structural or functional relations or structure alignment
- G16B15/30—Drug targeting using structural data; Docking or binding prediction
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
- G16B20/00—ICT specially adapted for functional genomics or proteomics, e.g. genotype-phenotype associations
- G16B20/30—Detection of binding sites or motifs
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
- G16B25/00—ICT specially adapted for hybridisation; ICT specially adapted for gene or protein expression
- G16B25/20—Polymerase chain reaction [PCR]; Primer or probe design; Probe optimisation
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16H—HEALTHCARE INFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR THE HANDLING OR PROCESSING OF MEDICAL OR HEALTHCARE DATA
- G16H70/00—ICT specially adapted for the handling or processing of medical references
- G16H70/40—ICT specially adapted for the handling or processing of medical references relating to drugs, e.g. their side effects or intended usage
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/106—Pharmacogenomics, i.e. genetic variability in individual responses to drugs and drug metabolism
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Spectroscopy & Molecular Physics (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Medical Informatics (AREA)
- Theoretical Computer Science (AREA)
- Evolutionary Biology (AREA)
- Bioinformatics & Computational Biology (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Immunology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Public Health (AREA)
- Primary Health Care (AREA)
- Pathology (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
本发明公开了一种用于人抗凝相关药物的基因位点检测的引物组、试剂及其应用,旨在提供一种具有中高通量,成本低,检测速度快,操作简便的检测方法,该方法包括引物组合1‑引物组合18中的一种或多种的组合,涉及生物检查技术领域。
Description
技术领域
本发明公开了一种引物组、试剂,具体地说,是一种指导人抗凝用药的引物组、试剂,涉及生物技术领域。
背景技术
心脑血管疾病具有“四高一多”即“发病率高、致残率高、死亡率高、复发率高,并发症多”的特点。
传统医疗模式是“试误法”“千人一药”“万人一量”的经验用药模式,但药物疗效和不良反应呈个体化差异。相同的病症、相同的治疗药物、相同的剂量,有的人有效且无毒性、有的人无毒且无效、有的人有效但有毒,有的人无效且有毒。影响药物反应个体差异的原因有:性别、年龄、体重、身高、环境因素、病程、器官功能、并发症、遗传因素等,其中遗传因素是主要原因。遗传因素导致的个体间药物代谢与效应差异平均高达60%-95%。随着人类基因组学计划的完成,后基因组学的深入研究,药物基因组学迅速发展起来。
大量的临床数据也显示神经科开展个体化药物基因检测的必要性,药物基因组学的检测的常用方法有一代测序、二代测序、荧光定量PCR技术和飞行时间质谱检测技术。
一代测序,也称Sanger法测序,主要基于桑格发明的双脱氧链终止法和PCR反应。缺点测序通量低,一个反应只能得到一条序列;成本略高,虽然单个反应价格低廉,但获得大量序列的成本很高;灵敏度较低,仅20%。
二代测序,特点是检测通量大,检测价格昂贵,操作繁琐,可检测未知的基因突变,生信分析复杂,目前主要适用于多基因位点的突变检测,在临床上主要用于肿瘤靶向用药基因突变检测,肿瘤易感性基因突变检测等。药物基因检测一般检测20-40个已知基因位点,如果二代测序技术用于药物基因检测样本,时间和人力成本会大大增加。
荧光定量PCR技术,检测通量低,检测基因位点一般在4-6个,若要检测多个位点,探针成本高,且具有一定的局限性。
上述方法均存在经济效益低,操作繁琐,灵敏度低,检测通量过大或者太低的问题。
因此,开发一种具有中高通量,成本低,检测速度快,操作简便,并且不需要复杂的生信分析的特点的检测方法显得尤为必要。
发明内容
本发明的第一个目的在于提供一种用于人抗凝相关药物的基因位点检测的引物组,该引物具有高特异性、高灵敏性的特点,满足对目标位点特异性扩增和单碱基延伸的要求。
本发明的第二个目的是一种用于人抗凝相关药物的基因位点检测的试剂盒,该试剂盒具有使用方便、检测位点多、成本低的优点,满足对抗凝相关药物多基因多位点检测的要求。
本发明的第三个目的是一种用于人抗凝相关药物的基因位点检测的方法,该检测方法具有中高通量,成本低,检测速度快,操作简便。
为此,本发明提供的第一个技术方案是这样的:
一种用于人抗凝相关药物的基因位点检测的引物组,包括引物组合1-引物组合18中的一种或多种的组合;
其中,引物组合1包括:SEQIDNO.1-2所示的扩增引物和SEQIDNO.37所示的延伸引物;
引物组合2包括:SEQIDNO.3-4所示的扩增引物和SEQIDNO.38所示的延伸引物;
引物组合3包括:SEQIDNO.5-6所示的扩增引物和SEQIDNO.39所示的延伸引物;
引物组合4包括:SEQIDNO.7-8所示的扩增引物和SEQIDNO.40所示的延伸引物;
引物组合5包括:SEQIDNO.9-10所示的扩增引物和SEQIDNO.41所示的延伸引物;
引物组合6包括:SEQIDNO.11-12所示的扩增引物和SEQIDNO.42所示的延伸引物;
引物组合7包括:SEQIDNO.13-14所示的扩增引物和SEQIDNO.43所示的延伸引物;
引物组合8包括:SEQIDNO.15-16所示的扩增引物和SEQIDNO.44所示的延伸引物;
引物组合9包括:SEQIDNO.17-18所示的扩增引物和SEQIDNO.45所示的延伸引物;
引物组合10包括:SEQIDNO.19-20所示的扩增引物和SEQIDNO.46所示的延伸引物;
引物组合11包括:SEQIDNO.21-22所示的扩增引物和SEQIDNO.47所示的延伸引物;
引物组合12包括:SEQIDNO.23-24所示的扩增引物和SEQIDNO.48所示的延伸引物;
引物组合13包括:SEQIDNO.25-26所示的扩增引物和SEQIDNO.49所示的延伸引物;
引物组合14包括:SEQIDNO.27-28所示的扩增引物和SEQIDNO.50所示的延伸引物;
引物组合15包括:SEQIDNO.29-30所示的扩增引物和SEQIDNO.51所示的延伸引物;
引物组合16包括:SEQIDNO.31-32所示的扩增引物和SEQIDNO.52所示的延伸引物;
引物组合17包括:SEQIDNO.33-34所示的扩增引物和SEQIDNO.53所示的延伸引物;
引物组合18包括:SEQIDNO.35-36所示的扩增引物和SEQIDNO.54所示的延伸引物。
其中,上述的引物组合1-18所检测的基因的扩增引物以及相应的SNP位点信息见下表1。
表1
其中,上述的引物组合1-18所检测的基因的延伸引物序列以及相应的SNP位点信息见下表2。
表2
SEQ ID NO. | 检测位点 | 延伸引物序列(5’-3’) |
37 | rs730012 | ACCTTATCTGTCCC |
38 | rs6065 | AGCTTGGGTTGGGC |
39 | rs12248560 | TCTTCTGTCTCAAAG |
40 | rs12041331 | CAGAGAGTAAGGTGA |
41 | rs1057910 | caGAGGTCCAAGATAC |
42 | rs4986893 | GAGAAACTTGCCTTACCTGGAT |
43 | rs71647871 | aTGGATCCACGGGGG |
44 | rs8192935 | cAACAATATATTACCATAAT |
45 | rs1045642 | TCACAGGAAGAT |
46 | rs9923231 | AGTATAGGCGAGCCACCGCACC |
47 | rs10306114 | TAACTGAGCACCCTACATGCTGG |
48 | rs1695 | ATAGTTGGTGTAGGAGGGAGA |
49 | rs776746 | ccGAGCTCTTTTGTTTCA |
50 | rs2231142 | aggcCGGTGAGAAAACTTA |
51 | rs13306198 | CTCACTTTACCGAAGA |
52 | rs62471956 | ACCTTCCATGGCCCCAAGGACC |
53 | rs1801253 | GCGCGCAGCAGCAGTC |
54 | rs4244285 | ggagTTTGTTAGGTTCC |
进一步的,上述的用于人抗凝相关药物的基因位点检测的引物组,所述的人抗凝相关药物包括氯吡格雷、普拉格雷、华法林、醋硝香豆素、苯丙香豆素、阿司匹林、阿哌沙班、西洛他唑、达比加群、利伐沙班、艾多沙班、替格瑞洛中的一种或者多种,共检测12个药物15个基因18个位点;具体如表3所示。
表3
本发明提供的第二个技术方案是上述用于人抗凝相关药物的基因位点检测的试剂盒,包括第一个技术方案的引物组。
本发明提供的第三个技术方案是上述用于人抗凝相关药物的基因位点检测的方法,依次包括如下步骤:
(1)采用第一个技术方案中引物组中的扩增引物对样品进行PCR扩增,得到PCR扩增产物;
(2)采用SAP酶混合液对步骤(1)的PCR扩增产物进行SAP反应,得到消化反应产物;
(3)对步骤(2)消化反应产物进行EXT延伸反应,得到延伸反应产物;
(4)对延伸反应产物进行样本脱盐后,采用飞行时间质谱检测系统对样本进行分析和检测。
进一步的,上述的用于人抗凝相关药物的基因位点检测的方法,在步骤(1)中,PCR扩增的采用的试剂及其用量如下:
超纯水0.8μL;
10×PCR缓冲液0.5μL;
MgCL2 0.4μL;
dNTP混合液0.1μL;
引物组1-引物组18扩增引物的混合液1μL;
PCR酶0.2μL;
DNA 2μL;
PCR扩增的反应程序为:95℃:2min;95℃:30s,56℃:30s,72℃:60s,重复43个循环;再在72℃保持5min,后冷却4℃∞。
进一步的,上述的用于人抗凝相关药物的基因位点检测的方法,各个扩增引物浓度见表4。
表4
进一步的,上述的用于人抗凝相关药物的基因位点检测的方法,SAP反应采用的SAP酶混合液包括下述组分及其含量:超纯水1.53μL;SAP缓冲液0.17μL;SAP酶0.3μL;反应程序如下:37℃,40分钟;然后升温85℃,5分钟,后冷却4℃∞。
进一步的,上述的用于人抗凝相关药物的基因位点检测的方法,延伸反应采用的试剂及其用量如下:
超纯水0.619μL;
iPLEX缓冲液0.2μL;
iPLEX Terminationmix 0.2μL;
引物组1-引物组18的延伸引物混合液0.94μL;
iPLEX酶0.041μL;
延伸反应的程序为:94℃:40min;94℃:5s,52℃:5s,80℃:5s,52℃:5s,80℃:5s,52℃:5s,80℃:5s,52℃:5s,80℃:5s,52℃:5s,80℃:5s,重复40个循环;再在72℃保持3min,后冷却4℃∞。
进一步的,上述的用于人抗凝相关药物的基因位点检测的方法,延伸引物各个引物浓度见表5。
表5
进一步的,上述的用于人抗凝相关药物的基因位点检测的方法,52℃:5s,52℃:5s,52℃:5s,52℃:5s,52℃:5s,是在52℃:5s,80℃:5s,重复5个循环。
进一步的,上述的用于人抗凝相关药物的基因位点检测的方法,飞行时间质谱检测程序为:
1)使用Assay Editor导入Assay Design文件
2)打开软件
双击软件图标,输入密码,进入操作界面;
3)创建文件夹
在Assay处右键选择Project Administrator,在name栏内输入project的名字,点击Add;
4)导入assay
在对应的project处右键,选择Import Assay Group Designer format…,只勾选Assay Group,点击Browse,选择assay group file,点击import;
5)创建plate
双击打开软件,选择Plate Editor,输入密码,进入软件界面;
6)为Plate添加Assay
在对应的Project处右键,选择New Plate,输入Plate ID,选择96Wells,点击OK;
7)设置Chip Linker
双击Chip Linker按钮,输入密码,进入软件界面,在左侧选择设置好的plate,在右侧分别选择IPLEX,Genotype+area,Nanodispenser96to96,输入Experiment Name,芯片号Chip Barcode,点击Add,再点击Create;
8)在CPM的Deck中放入MTP板和SpectroCHIP
在系统中找到SpectroACQUIRE界面,点击Chip prep module Deck In/Out,CPM的Deck会自动弹出,放入芯片和MTP板。在SpectroACQUIRE中点击RunSetup tab,在Experiment Name处选择对应的文档,设置完毕后点击软件上方的Start Chip PrepModule按钮开始实验。实验结束后点击Remove Old Chips from MA4按钮将芯片返回CPM的Deck内。
9)填写相关实验记录表;
10)下机数据拷贝
将分析文件和分析数据文件拷贝到U盘,转交给审核组审核。
与现有的方法相比,本发明具有以下优点及有益效果:
1.本发明提供的技术方案一次反应可同时检测10-40个SNP位点,与传统检测技术PCR检测方法相比,无需荧光标记,耗材成本和样本用量低;具有中高通量,成本低的优点。
2、本发明提供的技术方案检测速度快和准确度高,操作简便,在24小时内即可出具结果报告,快速高效,通过正反双向设计引物,能达到快速有效检测;
3、本发明提供的技术方案,数据处理简单,不需要复杂的生信分析,全自动分析数据,赋予质谱获得数据质控状态及结果可信度分析,并完成基因分型报告。
4、本发明提供的技术方案通过检测报告查看患者的基因突变情况,患者服用哪种药物可以达到更好的疗效和最低的不良反应,从而达到预测药物的疗效、预测药物的剂量,规避药物的不良反应。
具体实施方式
下面结合实施例对本发明作进一步详细描述,但本发明实施方式不限于此。
本检测技术采用DRMassARRAY飞行时间质谱检测系统(广州市达瑞生物技术股份有限公司,DR)进行分析和检测
所述的10×PCR缓冲液采购于Agena Bioscience;
所述的dNTP混合液采购于Agena Bioscience;
所述的PCR酶采购于Agena Bioscience;
所述的SAP缓冲液采购于Agena Bioscience;
所述的SAP酶采购于Agena Bioscience;
所述的iPLEX缓冲液采购于Agena Bioscience;
所述的iPLEX Termination mix采购于Agena Bioscience;
所述的iPLEX酶采购于Agena Bioscience;
实施例1
本实施例提供的一种用于人抗凝相关药物的基因位点检测的引物组,包括引物组合1-引物组合18中的一种或多种的组合;
其中,引物组合1包括:SEQIDNO.1-2所示的扩增引物和SEQIDNO.37所示的延伸引物;
引物组合2包括:SEQIDNO.3-4所示的扩增引物和SEQIDNO.38所示的延伸引物;
引物组合3包括:SEQIDNO.5-6所示的扩增引物和SEQIDNO.39所示的延伸引物;
引物组合4包括:SEQIDNO.7-8所示的扩增引物和SEQIDNO.40所示的延伸引物;
引物组合5包括:SEQIDNO.9-10所示的扩增引物和SEQIDNO.41所示的延伸引物;
引物组合6包括:SEQIDNO.11-12所示的扩增引物和SEQIDNO.42所示的延伸引物;
引物组合7包括:SEQIDNO.13-14所示的扩增引物和SEQIDNO.43所示的延伸引物;
引物组合8包括:SEQIDNO.15-16所示的扩增引物和SEQIDNO.44所示的延伸引物;
引物组合9包括:SEQIDNO.17-18所示的扩增引物和SEQIDNO.45所示的延伸引物;
引物组合10包括:SEQIDNO.19-20所示的扩增引物和SEQIDNO.46所示的延伸引物;
引物组合11包括:SEQIDNO.21-22所示的扩增引物和SEQIDNO.47所示的延伸引物;
引物组合12包括:SEQIDNO.23-24所示的扩增引物和SEQIDNO.48所示的延伸引物;
引物组合13包括:SEQIDNO.25-26所示的扩增引物和SEQIDNO.49所示的延伸引物;
引物组合14包括:SEQIDNO.27-28所示的扩增引物和SEQIDNO.50所示的延伸引物;
引物组合15包括:SEQIDNO.29-30所示的扩增引物和SEQIDNO.51所示的延伸引物;
引物组合16包括:SEQIDNO.31-32所示的扩增引物和SEQIDNO.52所示的延伸引物;
引物组合17包括:SEQIDNO.33-34所示的扩增引物和SEQIDNO.53所示的延伸引物;
引物组合18包括:SEQIDNO.35-36所示的扩增引物和SEQIDNO.54所示的延伸引物。
其中,上述的引物组合1-18所检测的基因的扩增引物以及相应的SNP位点信息见下表6。
表6
/>
其中,上述的引物组合1-18所检测的基因的延伸引物序列以及相应的SNP位点信息见下表7。
表7
/>
上述的用于人抗凝相关药物的基因位点检测的引物组,所述的人抗凝相关药物包括氯吡格雷、普拉格雷、华法林、醋硝香豆素、苯丙香豆素、阿司匹林、阿哌沙班、西洛他唑、达比加群、利伐沙班、艾多沙班、替格瑞洛中的一种或者多种,共检测12个药物15个基因18个位点;具体如表7所示。
表7
/>
/>
实施例2
一种用于人抗凝相关药物的基因位点检测的试剂盒,包括第一个技术方案的引物组。
还可以包括反应基础试剂、芯片、扩增引物试剂、延伸引物试剂。
需要说的是:反应基础试剂和芯片采购于Agena Bioscience,扩增引物试剂和延伸引物试剂由英潍捷基公司合成。
实施例3
上述用于人抗凝相关药物的基因位点检测的方法,依次包括如下步骤:
(1)采用表6所述的引物组中的扩增引物对样品进行PCR扩增,得到PCR扩增产物;具体步骤如下:
1.1将扩增反应试剂(表8中的10*PCR缓冲液、MgCL2、扩增反应试剂dNTP混合液、PCR酶,均属于扩增反应试剂的组成部分)解冻至完全溶解,振荡混匀,短暂离心(PCR酶除外),置冰盒备用。
1.2在冰盒上根据下表配制混合液,见表8。
表8
/>
其中各个扩增引物浓度见表9。
表9
/>
1.3完成加样工作后,把板用膜封好,涡旋振荡和离心。
1.4将反应板置于PCR仪上,按照如下反应程序进行反应,见表10。
表10
1.5反应结束时,取出反应板。
(2)采用SAP酶混合液对步骤(1)的PCR扩增产物进行SAP反应,得到消化反应产物,所述的SAP反应具体步骤如下:
2.1将PCR反应后的反应板用微孔板离心机短暂离心,观察液面,防止蒸发状况出现。
2.2将消化反应试剂(表11中的SAP缓冲液、SAP酶均属消化反应试剂的组成部分)解冻,短暂离心(SAP酶除外),置冰盒备用。
2.3在冰盒上根据下表配制SAP酶混合液,见表11。
表11
Reagent试剂 | 体积[μL] |
超纯水 | 1.53 |
SAP缓冲液 | 0.17 |
SAP酶 | 0.3 |
2.4加2μl SAP酶混合液到每一个孔里(加混液后总体积:7μL)。
2.5把板用膜封好,涡旋振荡和离心(4000rpm 5秒)。
2.6将板放上PCR仪进行以下反应程序,见表12。
表12
37℃ | 40分钟 | 1循环 |
85℃ | 5分钟 | 1循环 |
4℃ | 保温 | 1循环 |
(3)对步骤(2)消化反应产物进行EXT延伸反应,得到延伸反应产物,所述的EXT延伸反应的具体步骤如下:
3.1将消化反应后的反应板用微孔板离心机短暂离心。
3.2将延伸反应试剂(延伸反应试剂包括表13中的iPLEX缓冲液、iPLEXTermination mix、iPLEX酶)解冻,短暂离心(iPLEX酶除外),置冰盒备用。
3.3在冰盒上根据下表配制延伸混合液,见表13。
表13
延伸混合液 | 2μL混合液中试剂的体积[μL] |
超纯水 | 0.619 |
iPLEX缓冲液 | 0.2 |
iPLEX Termination mix | 0.2 |
延伸引物混合液 | 0.94 |
iPLEX酶 | 0.041 |
各个延伸引物浓度见表14。
表14
3.4在反应板中每孔加入2μL的延伸Mix,用封口膜封紧。
3.5将反应板离心1min。
3.6将上述反应板置于PCR仪上,按照如下反应程序进行反应见表15。
表15
(4)对延伸反应产物进行样本脱盐后,采用飞行时间质谱检测系统对样本进行分析和检测。
四、质谱检测前准备(样本脱盐)
4.1将延伸反应后的反应板用微孔板离心机短暂离心。
4.2在反应板的每一个有样本的孔里加入超纯水(96孔板加16μL超纯水)然后离心30秒备用。
4.3将反应板放入飞行时间质谱仪的MTP holders,点击运行界面Run Setup tab,勾选Transfer Resin to MTP1和Transfer Resin MTP 2,仪器自动对样本进行脱盐。
五、质谱上机检测
5.1使用Assay Editor导入Assay Design文件(此模板由技术支持负责导入)
5.2打开软件
双击软件图标,输入密码,进入操作界面;
5.3创建文件夹
在Assay处右键选择Project Administrator,在name栏内输入project的名字,点击Add。
5.4导入assay
在对应的project处右键,选择Import Assay Group Designer format…,只勾选Assay Group,点击Browse,选择assay group file,点击import。
5.5创建plate
双击打开软件,选择Plate Editor,输入密码,进入软件界面。
5.6为Plate添加Assay
在对应的Project处右键,选择New Plate,输入Plate ID,选择96Wells,点击OK。
5.7设置Chip Linker
双击Chip Linker按钮,输入密码,进入软件界面,在左侧选择设置好的plate,在右侧分别选择IPLEX,Genotype+area,Nanodispenser 96to96,输入Experiment Name,芯片号Chip Barcode,点击Add,再点击Create。
5.8在CPM的Deck中放入MTP板和SpectroCHIP
在系统中找到SpectroACQUIRE界面,点击Chip prep module Deck In/Out,CPM的Deck会自动弹出,放入芯片和MTP板。在SpectroACQUIRE中点击Run Setup tab,在Experiment Name处选择对应的文档,设置完毕后点击软件上方的Start Chip PrepModule按钮开始实验。实验结束后点击Remove Old Chips from MA4按钮将芯片返回CPM的Deck内。
5.9填写相关实验记录表。
6.0下机数据拷贝
将分析文件和分析数据文件拷贝到U盘,转交给审核组同事审核。
本发明提供的技术方案在患者确诊后,临床医生处方时使用,辅助临床医生选择药物和剂量,通过检测报告查看患者的基因突变情况,患者服用哪种药物可以达到更好的疗效和最低的不良反应,从而预测药物的疗效、预测药物的剂量,规避药物的不良反应。
为了更好的证明本申请提供的技术方案的优点,下面给出临床试验案例:
案例1:患者胡某某,男,62岁,汉族。半年前出现心绞痛,发作频率以及发生次数明显增加。去医院就医,进行冠状动脉造影术检查。主要血管狭窄程度>70%,对患者进行支架植入。术后按医嘱规律服用氯吡格雷,20天后再次发生心绞痛,冠状动脉造影显示支架内有血栓形成。采用本发明的检测套餐得到如下结果见表16。
表16
/>
根据上面的检测结果,给出如下用药建议:
/>
/>
/>
药物调整方案:停用氯吡格雷,换用替格瑞洛联合阿司匹林抗血小板治疗。
结果:未再出现胸闷、胸痛等症状。
医生建议:1个月后复查
案例2:母某某,62,女,羌族。进行机械心脏瓣膜置换术,医生处方为华法林钠片(5mg/天)。服药2天后有轻微出血,检测INR值为3.5。INR值3.5意味着出血风险较高。医生处方为华法林钠片剂量为4mg/天。服药2天后,出血无改善,检测INR值为3.4。采用本发明的检测套餐得到如下结果,见表17。
表17
根据上面的检测结果,给出如下用药建议见表18。
表18
/>
/>
药物调整方案:更改华法林钠片剂量为2mg/天。结果:未再出现出血症状,INR值降为2.5。医生建议:继续住院观察。
Claims (9)
1.用于人抗凝相关药物的基因位点检测的引物组,其特征在于,包括引物组合1-引物组合18中的一种或多种的组合;
其中,引物组合1包括:SEQIDNO.1-2所示的扩增引物和SEQIDNO.37所示的延伸引物;
引物组合2包括:SEQIDNO.3-4所示的扩增引物和SEQIDNO.38所示的延伸引物;
引物组合3包括:SEQIDNO.5-6所示的扩增引物和SEQIDNO.39所示的延伸引物;
引物组合4包括:SEQIDNO.7-8所示的扩增引物和SEQIDNO.40所示的延伸引物;
引物组合5包括:SEQIDNO.9-10所示的扩增引物和SEQIDNO.41所示的延伸引物;
引物组合6包括:SEQIDNO.11-12所示的扩增引物和SEQIDNO.42所示的延伸引物;
引物组合7包括:SEQIDNO.13-14所示的扩增引物和SEQIDNO.43所示的延伸引物;
引物组合8包括:SEQIDNO.15-16所示的扩增引物和SEQIDNO.44所示的延伸引物;
引物组合9包括:SEQIDNO.17-18所示的扩增引物和SEQIDNO.45所示的延伸引物;
引物组合10包括:SEQIDNO.19-20所示的扩增引物和SEQIDNO.46所示的延伸引物;
引物组合11包括:SEQIDNO.21-22所示的扩增引物和SEQIDNO.47所示的延伸引物;
引物组合12包括:SEQIDNO.23-24所示的扩增引物和SEQIDNO.48所示的延伸引物;
引物组合13包括:SEQIDNO.25-26所示的扩增引物和SEQIDNO.49所示的延伸引物;
引物组合14包括:SEQIDNO.27-28所示的扩增引物和SEQIDNO.50所示的延伸引物;
引物组合15包括:SEQIDNO.29-30所示的扩增引物和SEQIDNO.51所示的延伸引物;
引物组合16包括:SEQIDNO.31-32所示的扩增引物和SEQIDNO.52所示的延伸引物;
引物组合17包括:SEQIDNO.33-34所示的扩增引物和SEQIDNO.53所示的延伸引物;
引物组合18包括:SEQIDNO.35-36所示的扩增引物和SEQIDNO.54所示的延伸引物。
2.根据权利要求1所述的用于人抗凝相关药物的基因位点检测的引物组,其特征在于,所述的人抗凝相关药物包括氯吡格雷、普拉格雷、华法林、醋硝香豆素、苯丙香豆素、阿司匹林、阿哌沙班、西洛他唑、达比加群、利伐沙班、多沙班、替格瑞洛中的一种或者多种。
3.一种用于人抗凝相关药物的基因位点检测的试剂盒,其特征在于,包括权利要求1所述的引物组。
4.一种用于人抗凝相关药物的基因位点检测的方法,其特征在于,依次包括如下步骤:
(1)采用权利要求1所述的引物组中的扩增引物对样品进行PCR扩增,得到PCR扩增产物;
(2)采用SAP酶混合液对步骤(1)的PCR扩增产物进行SAP反应,得到消化反应产物;
(3)对步骤(2)消化反应产物进行EXT延伸反应,得到延伸反应产物;
(4)对延伸反应产物进行样本脱盐后,采用飞行时间质谱检测系统对样本进行分析和检测。
5.根据权利要求4所述的用于人抗凝相关药物的基因位点检测的方法,其特征在于,在步骤(1)中,PCR扩增的采用的试剂及其用量如下:
超纯水0.8μL;
10×PCR缓冲液0.5μL;
MgCL2 0.4μL:
dNTP混合液0.1μL;
引物组1-引物组18扩增引物的混合液1μL;
PCR酶0.2μL;
DNA 2μL;
PCR扩增的反应程序为:95℃:2min;95℃:30s,56℃:30s,72℃:60s,重复43个循环;再在72℃保持5min,后冷却4℃∞。
6.根据权利要求4所述的用于人抗凝相关药物的基因位点检测的方法,其特征在于,SAP反应采用的SAP酶混合液包括下述组分及其含量:超纯水1.53μL;SAP缓冲液0.17μL;SAP酶0.3μL;反应程序如下:37℃,40分钟;然后升温85℃,5分钟,后冷却4℃∞。
7.根据权利要求4所述的用于人抗凝相关药物的基因位点检测的方法,其特征在于,延伸反应采用的试剂及其用量如下:
超纯水0.619μL;
iPLEX缓冲液0.2μL;
iPLEX Terminationmix 0.2μL;
引物组1-引物组18的延伸引物混合液0.94μL;
iPLEX酶0.041μL;
延伸反应的程序为:94℃:40min;94℃:5s,52℃:5s,80℃:5s,52℃:5s,80℃ 5s,52℃:5s,80℃:5s,52℃:5s,80℃:5s,52℃:5s,80℃:5s,重复40个循环;再在72℃保持3min,后冷却4℃∞。
8.根据权利要求7所述的用于人抗凝相关药物的基因位点检测的方法,其特征在于,52℃:5s,52℃:5s,52℃:5s,52℃:5s,52℃:5s是在52℃:5s,80℃:5s,重复5个循环。
9.根据权利要求6所述的用于人抗凝相关药物的基因位点检测的方法,其特征在于,飞行时间质谱检测程序为:
1)使用AssayEditor导入AssayDesign文件
2)打开软件
双击软件图标,输入密码,进入操作界面;
3)创建文件夹
在Assay处右键选择ProjectAdministrator,在name栏内输入project的名字,点击Add;
4)导入assay
在对应的project处右键,选择ImportAssayGroupDesignerformat…,只勾选AssayGroup,点击Browse,选择assaygroupfile,点击import;
5)创建plate
双击打开软件,选择PlateEditor,输入密码,进入软件界面;
6)为Plate添加Assay
在对应的Project处右键,选择NewPlate,输入PlateID,选择96Wells,点击OK;
7)设置ChipLinker
双击ChipLinker按钮,输入密码,进入软件界面,在左侧选择设置好的plate,在右侧分别选择IPLEX,Genotype+area,Singlepin96to96,输入ExperimentName,芯片号ChipBarcode,点击Add,再点击Create;
8)在CPM的Deck中放入MTP板和SpectroCHIP
在系统中找到SpectroACQUIRE界面,点击Chipprep module Deck In/Out,CPM的Deck会自动弹出,放入芯片和MTP板。在SpectroACQUIRE中点击Run Setup tab,在ExperimentName处选择对应的文档,设置完毕后点击软件上方的Start Chip Prep Module按钮开始实验。实验结束后点击Remove Old ChipsfromMA4按钮将芯片返回CPM的Deck内。
9)填写相关实验记录表;
10)下机数据拷贝
将分析文件和分析数据文件拷贝到U盘,转交给审核组审核。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN202311473393.3A CN117512093A (zh) | 2023-11-07 | 2023-11-07 | 用于人抗凝相关药物的基因位点检测的引物组、试剂及其方法 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN202311473393.3A CN117512093A (zh) | 2023-11-07 | 2023-11-07 | 用于人抗凝相关药物的基因位点检测的引物组、试剂及其方法 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CN117512093A true CN117512093A (zh) | 2024-02-06 |
Family
ID=89744907
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN202311473393.3A Pending CN117512093A (zh) | 2023-11-07 | 2023-11-07 | 用于人抗凝相关药物的基因位点检测的引物组、试剂及其方法 |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
CN (1) | CN117512093A (zh) |
Citations (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN111118145A (zh) * | 2020-01-22 | 2020-05-08 | 武汉友芝友医疗科技股份有限公司 | 基于核酸质谱技术检测心血管疾病用药相关基因的核酸组合物、试剂盒和检测方法 |
WO2021029473A1 (ko) * | 2019-08-14 | 2021-02-18 | (주)에스피메드 | 암 및 만성질환 관련 다처방 약물에 대한 약물 부작용 예측 및 개인맞춤 약물치료를 위한 다중고속 약물유전자 진단용 키트 |
CN112553319A (zh) * | 2020-12-10 | 2021-03-26 | 北京大学人民医院 | 用于检测抗凝、抗血小板用药抗药性相关基因snp位点的专用引物及应用 |
CN115558713A (zh) * | 2022-10-20 | 2023-01-03 | 郑州远止生物研究院有限公司 | 一种检测心血管疾病药物反应相关基因位点的扩增引物组、试剂盒及检测方法 |
-
2023
- 2023-11-07 CN CN202311473393.3A patent/CN117512093A/zh active Pending
Patent Citations (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2021029473A1 (ko) * | 2019-08-14 | 2021-02-18 | (주)에스피메드 | 암 및 만성질환 관련 다처방 약물에 대한 약물 부작용 예측 및 개인맞춤 약물치료를 위한 다중고속 약물유전자 진단용 키트 |
CN111118145A (zh) * | 2020-01-22 | 2020-05-08 | 武汉友芝友医疗科技股份有限公司 | 基于核酸质谱技术检测心血管疾病用药相关基因的核酸组合物、试剂盒和检测方法 |
CN112553319A (zh) * | 2020-12-10 | 2021-03-26 | 北京大学人民医院 | 用于检测抗凝、抗血小板用药抗药性相关基因snp位点的专用引物及应用 |
CN115558713A (zh) * | 2022-10-20 | 2023-01-03 | 郑州远止生物研究院有限公司 | 一种检测心血管疾病药物反应相关基因位点的扩增引物组、试剂盒及检测方法 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Somineni et al. | Blood-derived DNA methylation signatures of Crohn's disease and severity of intestinal inflammation | |
Dias et al. | Molecular biomarkers for gestational diabetes mellitus | |
Jain | Textbook of personalized medicine | |
Madian et al. | Relating human genetic variation to variation in drug responses | |
CN111996257A (zh) | 基于二代测序技术的胃癌检测panel及其应用 | |
US20220356530A1 (en) | Methods for determining velocity of tumor growth | |
Shi et al. | Exploring the key genes and pathways of osteosarcoma with pulmonary metastasis using a gene expression microarray | |
CN1568425A (zh) | 选择人类肿瘤最佳疗法的分子诊断和计算机决策辅助系统 | |
MX2013008846A (es) | Metodo para descubrir biomarcadores farmacogenomicos. | |
KR20150042882A (ko) | 개인맞춤약물 적용을 위한 한국인 약물유전형 동시다중분석 및 분석 결과를 활용한 약물반응 예측 방법 | |
EP2973131A1 (en) | Method and system to predict response to pain treatments | |
CN111808944A (zh) | 一种儿童个体化用药基因检测方法 | |
Raza et al. | qPCR Analysis reveals association of differential expression of SRR, NFKB1, and PDE4B genes with type 2 diabetes mellitus | |
CN113528638B (zh) | 一种扩增儿童个体化用药基因位点用引物组、检测用引物组及其应用 | |
CN112553319B (zh) | 用于检测抗凝和/或抗血小板用药抗药性相关基因snp位点的专用引物及应用 | |
CN111321214B (zh) | 一种用于指导人抑郁症用药的试剂盒及其应用 | |
CN117512093A (zh) | 用于人抗凝相关药物的基因位点检测的引物组、试剂及其方法 | |
CN109355377B (zh) | 华法林个体化用药相关基因多态性检测试剂盒及其制备方法与应用 | |
Austin et al. | Genetic epidemiology: methods and applications | |
CN116716386A (zh) | 一种用于维生素c缺乏风险评估的检测试剂盒及其应用方法 | |
KR101933695B1 (ko) | 비스페놀 a 노출 진단용 바이오 마커를 포함하는 진단키트 | |
CN117248013A (zh) | 一种用于人慢性精神类疾病用药药物检测的引物组、试剂盒及其应用 | |
Karamperis et al. | Genetic testing | |
CN113403377A (zh) | 药物和营养代谢能力检测snp位点引物组合物及应用 | |
CN108300777B (zh) | 一种人类白细胞抗原基因检测试剂盒及其用途 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
PB01 | Publication | ||
PB01 | Publication | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination |