CN117265092A - 用于预测重症急性胰腺炎的标志物组合及其应用 - Google Patents
用于预测重症急性胰腺炎的标志物组合及其应用 Download PDFInfo
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Abstract
本发明提供了用于预测重症急性胰腺炎的标志物组合及其应用。具体地,本发明提供了重症急性胰腺炎评判的风险标志物的基因、mRNA、cDNA、蛋白或其检测试剂的用途,用于制备/建立判断重症急性胰腺炎发生风险的诊断试剂或试剂盒/设备。研究表明,重症急性胰腺炎风险标志物可作为早期判断急性胰腺炎患者是否发展为重症急性胰腺炎的标志物,具有高灵敏度和特异性,可以在相对较早的疾病进展阶段快速诊断重症急性胰腺炎,为疾病的早期治疗干预提供有力的协助。
Description
技术领域
本发明涉及医学诊断领域,更具体地涉及用于预测重症急性胰腺炎的标志物组合及其应用。
背景技术
急性胰腺炎(acute pancreatitis,AP)是指多种病因引起体内胰酶激活,继以胰腺局部炎性反应为主要特征的急腹症。胆结石、酗酒和高甘油三酯血症是AP的主要病因。大量研究表明,症状出现后的最初24小时对于识别有发生严重并发症或死亡风险的患者至关重要。至今为止,科学家已经开发了许多预后模型来判断病程早期急性胰腺炎的严重程度,包括简单的实验室血液生化标志物(如淀粉酶)、成像方法和一些临床评分系统。近几十年来AP的早期诊断和治疗取得了较大进展,但仍有高达10%-20%的AP会发展成为重症急性胰腺炎(severe acute pancreatitis,SAP),其死亡率高达30%。
免疫细胞启动宿主防御病原体感染。细胞免疫在AP的发病机制中起着至关重要的作用。外周血清炎症细胞和细胞因子的变化是AP诊断和预后的重要指标。有证据表明,AP的特征是人类外周血中T和B淋巴细胞显着减少[7]。多种免疫细胞在AP的发生过程中发生了变化,但很难确定特定种类免疫细胞的确切作用。此外,AP中外周血免疫细胞显著消耗或增加的原因及其与人类疾病严重程度的关系仍知之甚少。
与轻症急性胰腺炎(mild acute pancreatitis,MAP)不同的是,SAP伴随全身炎症反应综合征和多器官功能障碍甚至衰竭,具有高发病率和死亡率。早期诊断仍然是系统性管理SAP的主要挑战。值得注意的是,早期诊断、有效预防和及时治疗对SAP预后至关重要。
因此,本领域迫切需要开发能够更有效、更早期和更准确地对重症急性胰腺炎进行早期筛查和诊断的方法,实现重症急性胰腺炎的及时干预治疗。
发明内容
本发明的目的就是提供一种更有效、更早期和更准确地对重症急性胰腺炎进行早期筛查和诊断的方法。
在本发明的第一方面,提供了一种重症急性胰腺炎风险标志物的基因、mRNA、cDNA、蛋白、或其检测试剂的用途,用于制备一诊断试剂或试剂盒,所述诊断试剂或试剂盒用于诊断急性胰腺炎患者是否为重症急性胰腺炎;
其中,所述的重症急性胰腺炎风险标志物选自下组:
(A)选自A1至A7的任一标志物、或其组合:(A1)DUSP1;(A2)JUN;(A3)HBA2;(A4)CYBA;(A5)FOS;(A6)WDR83OS;(A7)FOSB。
在另一优选例中,所述重症急性胰腺炎风险标志物还包括选自下组B的任一标志物、或其组合:(B1)S100A8;(B2)JUNB;(B3)S100A9。
在另一优选例中,所述重症急性胰腺炎风险标志物还包括选自组A的7种和选自组B的3种标志物的组合。
在另一优选例中,所述诊断试剂或试剂盒用于检测血液中的重症急性胰腺炎风险标志物。
在另一优选例中,所述诊断试剂或试剂盒用于检测血液中B细胞中的重症急性胰腺炎风险标志物。
在另一优选例中,所述检测试剂包括:
(a)针对所述重症急性胰腺炎风险标志物的特异性抗体、特异性结合分子;和/或
(b)特异性扩增所述重症急性胰腺炎风险标志物的mRNA或cDNA的引物或引物对、探针或芯片(如核酸芯片或蛋白质芯片)。
在另一优选例中,所述重症急性胰腺炎风险标志物表A和/或表B中所示的任一标志物的基因、mRNA、cDNA、或蛋白来源于人。
在另一优选例中,所述的对象为人。
在另一优选例中,所述的A1-A7标志物选自表A:
表A
在另一优选例中,所述的B1-B3标志物选自表B:
表B
本发明的第二方面,提供一种试剂盒,所述试剂盒含有一检测试剂,所述检测试剂用于检测待测样品中重症急性胰腺炎风险标志物的基因、mRNA、cDNA、蛋白、或其组合;
其中,所述的重症急性胰腺炎风险标志物选自下组:
(A)选自A1至A7的任一标志物、或其组合:(A1)DUSP1;(A2)JUN;(A3)HBA2;(A4)CYBA;(A5)FOS;(A6)WDR83OS;(A7)FOSB。
在另一优选例中,所述待测样品来自选自下组的对象:无胰腺炎对象、轻症急性胰腺炎对象,重症急性胰腺炎对象。
在另一优选例中,所述的检测试剂偶联有或带有可检测标记。
在另一优选例中,所述可检测标记选自下组:生色团、化学发光基团、荧光团、同位素或酶。
在另一优选例中,所述的抗体是单克隆抗体或多克隆抗体。
在另一优选例中,所述诊断试剂包括抗体、引物、探针、测序文库、核酸芯片(如DNA芯片)或蛋白质芯片。
在另一优选例中,所述的核酸芯片包括基片和点样在基片上的特异性寡核苷酸探针,所述的特异性寡核苷酸探针包括与任一所述的重症急性胰腺炎风险标志物的多核苷酸(mRNA或cDNA)特异性结合的探针。
在另一优选例中,所述的蛋白质芯片包括基片和点样在基片上的特异性抗体,所述的特异性抗体包括抗所述重症急性胰腺炎风险标志物的特异性抗体。
在另一优选例中,所述的抗体是单克隆抗体或多克隆抗体。
在另一优选例中,所述的试剂盒含有重症急性胰腺炎风险标志物的基因、mRNA、cDNA和/或蛋白作为对照品或质控品。
在另一优选例中,所述的试剂盒还包括标签或说明书,所述标签或说明书注明所述试剂盒用于(a)判断重症急性胰腺炎的发生风险,和/或(b)对重症急性胰腺炎治疗效果进行评价。
在另一优选例中,所述的试剂包括引物、探针、gRNA或其组合,更佳地为用于PCR、qPCR、RT-PCR的引物对或探针。
在另一优选例中,所述重症急性胰腺炎风险标志物的检测可通过如下的方法进行检测:测序、PCR、或其组合。
在另一优选例中,所述重症急性胰腺炎风险标志物的检测可定量检测。
本发明的第三方面,提供了一种检测方法,包括步骤:
(a)提供一检测样本;
(b)检测所述检测样本中重症急性胰腺炎风险标志物基因的表达量,记为C1;和
(c)将所述重症急性胰腺炎风险的标志物浓度C1与对照参比值C0进行比较,其中,所述的重症急性胰腺炎风险标志物选自下组:
(A)选自A1至A7的任一标志物、或其组合:(A1)DUSP1;(A2)JUN;(A3)HBA2;(A4)CYBA;(A5)FOS;(A6)WDR83OS;(A7)FOSB;
如果检测对象的重症急性胰腺炎风险的检测结果满足以下条件时,则提示所述对象发展为重症急性胰腺炎风险高;
当某一标志物在检测对象中表A和表B中的标志物的表达水平与参比值或标准值有显著差异时,所述急性胰腺炎患者发展为重症急性胰腺炎的风险高。
在另一优选例中,所述检测样本,选自血液样本;
在另一优选例中,所述检测样本选自血液样本中的B细胞;
本发明的第四方面,提供了一种重症急性胰腺炎早期筛查的设备,所述设备包括:
(a)输入模块,所述输入模块用于输入某急性胰腺炎患者特征基因的表达数据;
其中,所述的特征基因包括选自下组:
(A)选自A1至A7的任一标志物、或其组合:(A1)DUSP1;(A2)JUN;(A3)HBA2;(A4)CYBA;(A5)FOS;(A6)WDR83OS;(A7)FOSB;
(b)处理模块,所述处理模块对于输入的特征基因,进行分析计算,从而获得风险评判;通过差异表达情况分析发现,其中,当出现显著差异表达情况时,则提示该急性胰腺炎患者为重症急性胰腺炎患者的风险高;当差异表达情况不显著时,则提示该急性胰腺炎患者为重症急性胰腺炎患者的风险低;和
(c)输出模块,所述输出模块用于输出所述的辅助筛查结果。
在另一优选例中,所述表达数据来自于血液样本;
在另一优选例中,所述的表达数据来自于血液样本中的B细胞;
在另一优选例中,所述设备还包括一检测模块,所述检测模块用于检测所述风险标志物的mRNA水平、蛋白水平、或蛋白活性。
在另一优选例中,所述的检测模块选自下组:ELISA分析仪、PCR检测仪、测序仪、或其组合。
应理解,在本发明范围内中,本发明的上述各技术特征和在下文(如实施例)中具体描述的各技术特征之间都可以互相组合,从而构成新的或优选的技术方案。限于篇幅,在此不再一一累述。
附图说明
图1显示了本发明模型构建的工作流程。
图2显示了本发明模型构建过程中,第1天MAP/SAP B细胞的二维嵌入(主要成分1和2)。根据疾病类型以不同颜色标记细胞起源。
图3显示了本发明模型构建过程中,使用不同数量的基因作为输入的随机森林模型的AUROC值。
图4显示了本发明模型构建过程中,以10个基因作为输入的最终随机森林模型的AUROC曲线。
图5显示了本发明模型构建过程中,最终选择的10个特征基因在第1天在MAP/SAPB细胞中的表达。
具体实施方式
本发明人经过广泛而深入的研究,首次开发了一种有效、准确地基于特定特征基因对重症急性胰腺炎进行早期筛查的方法和设备。具体的,本发明人通过构建轻症急性胰腺炎患者和重症急性胰腺炎患者外周血B细胞的单细胞转录组图谱,并根据基因的互信息分数对基因进行权重排序,意外地筛选出多个与重症急性胰腺炎密切相关的特征基因,从而构建了可对重症急性胰腺炎进行简单、准确、高效的早期筛查体系。本发明的方法和筛查系统可以有效的将急性胰腺炎患者划分为轻症急性胰腺炎和重症急性胰腺炎,便于对重症急性胰腺炎高风险患者尽早地进行对应的治疗干预。在此基础上完成了本发明。
本发明将单细胞图谱中的B细胞数据用作构建预测模型的输入,并使用少至10个基因作为输入,最终该模型早在采样第1天就对轻症和重症病例进行分类的准确率为92.9%,表明具有强大的性能。该模型的实施可能有助于临床医生及时做出SAP诊断。治疗干预可以在早期进行并阻止急性胰腺炎患者的疾病进展。这项工作的意义将有机会解决早期急性胰腺炎的分类筛选,对于患者和医院针对急性胰腺炎的管理具有重大临床意义。
术语
本文中使用的术语“样品”或“样本”是指与受试者特异地相关联的材料,从其中可以确定、计算或推断出与受试者有关的特定信息。样本可以全部或部分由来自受试者的生物材料构成。
如本文所用,术语“表达”包括mRNA从基因或基因部分的产生,并且包括由RNA或基因或基因部分所编码的蛋白质的产生,还包括与表达相关的检测物质的出现。例如,cDNA,结合配体(如抗体)与基因或其它寡核苷酸、蛋白质或蛋白质片段的结合以及结合配体的显色部分都包括在术语“表达”的范围内。因此,在免疫印迹如Western印迹上半点密度的增加也处于以生物学分子为基础的术语“表达”的范围内。
如本文所用,术语“参比值”或“对照参比值”是指当与分析结果相比时与特定结果统计学相关的值。在优选的实施方案中,参比值是根据对比较重症急性胰腺炎风险标志物的mRNA表达和/或蛋白的表达,并进行统计学分析来确定的。在本文的实施例部分中显示了一些这样的研究。但是,来自文献的研究和本文公开的方法的用户经验也可用于生产或调整参比值。参比值也可以通过考虑与患者的族群、医疗史、遗传学、年龄和其它因素特别相关的情况和结果来确定。
本文中使用的术语“样品”或“样本”是指与受试者特异地相关联的材料,从其中可以确定、计算或推断出与受试者有关的特定信息。样本可以全部或部分由来自受试者的生物材料构成。
如本文所用,术语“表达”包括mRNA从基因或基因部分的产生,并且包括由RNA或基因或基因部分所编码的蛋白质的产生,还包括与表达相关的检测物质的出现。例如,cDNA,结合配体(如抗体)与基因或其它寡核苷酸、蛋白质或蛋白质片段的结合以及结合配体的显色部分都包括在术语“表达”的范围内。因此,在免疫印迹如Western印迹上半点密度的增加也处于以生物学分子为基础的术语“表达”的范围内。
重症急性胰腺炎风险标志物
如本文所用,术语“本发明的重症急性胰腺炎风险标志物”指表A和/或表B中所示的一种或多种标志物。
在本发明中,术语“本发明的重症急性胰腺炎风险标志物蛋白”、“本发明蛋白”、“本发明的多肽”、或“表A和/或表B中所示的标志物”可互换使用,都指具有本发明的重症急性胰腺炎风险标志物中任何一种或多种。
在本发明中,术语“重症急性胰腺炎风险标志物基因”、“重症急性胰腺炎风险标志物的多核苷酸”可互换使用,都指表A和/或表B中所示的任一重症急性胰腺炎风险标志物的核苷酸序列。
需理解的是,当编码相同的氨基酸时,密码子中核苷酸的取代是可接受的。另外需理解的是,由核苷酸取代而产生保守的氨基酸取代时,核苷酸的变换也是可被接受的。
在得到了重症急性胰腺炎风险标志物的信息的情况下,可根据其构建出编码它的核酸序列,并且根据核苷酸序列来设计特异性探针。核苷酸全长序列或其片段通常可以用PCR扩增法、重组法或人工合成的方法获得。对于PCR扩增法,可根据本发明所公开的重症急性胰腺炎风险标志物的核苷酸序列,尤其是开放阅读框序列来设计引物,并用市售的cDNA库或按本领域技术人员已知的常规方法所制备的cDNA库作为模板,扩增而得有关序列。当序列较长时,常常需要进行两次或多次PCR扩增,然后再将各次扩增出的片段按正确次序拼接在一起。
一旦获得了有关的序列,就可以用重组法来大批量地获得有关序列。这通常是将其克隆入载体,再转入细胞,然后通过常规方法从增殖后的宿主细胞中分离得到有关序列。
此外,还可用人工合成的方法来合成有关序列,尤其是片段长度较短时。通常,通过先合成多个小片段,然后再进行连接可获得序列很长的片段。
目前,已经可以完全通过化学合成来得到编码本发明蛋白(或其片段,衍生物)的DNA序列。然后可将该DNA序列引入本领域中已知的各种现有的DNA分子(如载体)和细胞中。
通过常规的重组DNA技术,可利用本发明的多核苷酸序列可用来表达或生产重组的重症急性胰腺炎风险标志物。
检测方法
基于重症急性胰腺炎风险标志物血液B细胞中差异表达,本发明还提供了相应的判断重症急性胰腺炎风险的方法。
本发明涉及定量和定位检测重症急性胰腺炎风险标志物的蛋白水平或mRNA水平的诊断试验方法。这些试验是本领域所熟知的。试验中所检测的人重症急性胰腺炎风险标志物蛋白水平或mRNA水平,可以用于判断(包括辅助判断)是否具有重症急性胰腺炎风险。
一种优选的方法是对mRNA或cDNA,进行PCR/qPCR/RT-PCR进行定量检测。
一种优选的方法是对mRNA或cDNA,测序进行定量检测。
重症急性胰腺炎风险标志物的多核苷酸可用于重症急性胰腺炎风险的诊断。本发明的多核苷酸的一部分或全部可作为探针固定在微阵列或DNA芯片上,用于分析中基因的差异表达分析和基因诊断。
此外,本发明还可以在蛋白水平进行检测。例如,抗重症急性胰腺炎风险标志物的抗体可以固定在蛋白质芯片上,用于检测样本中的重症急性胰腺炎风险蛋白。
检测试剂盒
基于重症急性胰腺炎风险标志物与重症急性胰腺炎风险的相关性,因此重症急性胰腺炎风险标志物可以作为重症急性胰腺炎风险的判断标志物。
本发明还提供了一种判断重症急性胰腺炎风险的试剂盒,所述的试剂盒含有一检测试剂,所述检测试剂用于检测重症急性胰腺炎风险标志物的基因、mRNA、cDNA、蛋白、或其组合。优选地,所述试剂盒含有本发明的抗重症急性胰腺炎风险标志物的抗体或免疫偶联物,或其活性片段;或者含有特异性扩增重症急性胰腺炎风险标志物的mRNA或cDNA的引物或引物对、探针或芯片。
在另一优选例中,所述的试剂盒还包括标签或说明书。
本发明的主要优点包括:
(1)本发明采用血液样本,更适用于早期筛查诊断,且具有更快速、更便捷、低成本的特点。
(2)与现有急性胰腺炎的检测方法相比,本发明建立的标志物组合具有更高的特异性,检测结果更准确。
下面结合具体实施例,进一步阐述本发明。应理解,这些实施例仅用于说明本发明而不用于限制本发明的范围。下列实施例中未注明具体条件的实验方法,通常按照常规条件,例如Sambrook等人,分子克隆:实验室手册(New York:Cold Spring HarborLaboratory Press,1989)中所述的条件,或按照制造厂商所建议的条件。除非另外说明,否则百分比和份数是重量百分比和重量份数。
材料和方法
本发明使用CD19作为指针基因分选出所有的B细胞。根据B细胞基因表达谱,为了构建预测模型,首先采取选择高度可变的基因以去除信息较少的基因并提高计算效率。然后使用互信息分数作为度量来选择用于构建随机森林分类器的占比最大的基因。使用AUROC来评估模型性能以最终确定模型选择,同时还计算了其他指标,包括召回分数、精度分数等。所有模型均使用5-fold交叉验证进行评估。
实施例1.测序样本准备
在诊断的第1、3和7天,从三例MAP和四例SAP病例中获取外周血样本。使用Ficoll-Paque Plus(编号17-1440-03;GE Healthcare Pharmacia,Little Chalfont,UK)从抗凝剂处理的外周血样品中分离PBMCs(外周血单个核细胞)。将血液稀释并与等量的非补充RPMI1640(No.22400089;Gibco,Grand Island,NY,USA)混合以增加细胞活力。
然后将混合物轻轻倾析到Ficoll-Paque Plus中,并在关闭制动器的情况下以800×g离心20分钟。将中间层转移到新的离心管中并以2,000rpm离心10分钟。弃上清,收集PBMCs,计数并保存在液氮中,直至进行流式细胞术和单细胞测序分析。
实施例2.单细胞测序
单细胞测序和V(D)J文库使用10X Genomics Chromium Controller Instrument、Chromium Single Cell 5'文库、凝胶珠试剂盒和V(D)J富集试剂盒(10X Genomics公司,Pleasanton,CA)。将细胞悬液浓缩至1,000个细胞/μL,并将其中约10,000个加载到每个通道中以生成单细胞凝胶珠在乳液(GEM)中。输出是每个样本6,000个细胞的mRNA条形码。反转录步骤后,GEM被破坏,条形码cDNA被纯化、扩增,并用于构建5'基因表达和TCR和BCR富集文库。对于5'文库构建,将扩增的条形码cDNA片段化、A尾、与接头连接并进行索引PCR扩增。对于V(D)J文库,人类T细胞和B细胞V(D)J序列从扩增的cDNA中富集、片段化、A尾、接头连接和索引PCR扩增。
使用Qubit高灵敏度DNA测定(No.Q33231;Thermo Fisher Scientific,Waltham,MA,USA)对最终文库进行定量。在Bioanalyzer 2200(Agilent Technologies,SantaClara,CA,USA)中使用高灵敏度DNA芯片测定文库大小分布。所有文库均在Illumina测序仪(Illumina,San Diego,CA,USA)上使用150bp配对末端运行进行测序。
实施例3.基因选择和聚类
得到测序原始数据后,本发明使用Cell Ranger v.3.0.2vdj流程(10X Genomics)对单细胞测序数据进行比对和条形码解复用。然后在Scanpy计算框架下分析表达矩阵数据。根据QC标准过滤数据。去除了<500个检测到的基因的细胞和<5个细胞/数据集中检测到的基因。线粒体基因表达占总表达水平>10%的细胞也被排除在外。通过去除具有前5%总转录本(UMI)的细胞来避免双峰。Scrublets软件也用于去除双峰。
然后根据基因的可变性选择基因进行降维和聚类。合并所有数据,选择前2,000个可变基因,并回归出每个细胞的总UMI计数和线粒体基因表达比例,以消除这些因素对聚类的影响。BBKNN方法用于使用供体作为批密钥执行批校正。在Scanpy中进行Leiden聚类,分辨率设置为1。
实施例4.模型建立
本发明模型构建采用基于机器学习算法的基本结果,选择B细胞作为模型的输入(图1)。
(1)寻找疾病预测因子的可行性:使用CD19作为分选B细胞的主要marker,仅从第1天收集的MAP和SAP数据中提取B细胞,并进行PCR分析(图2);结果表明轻症急性胰腺炎患者和重症急性胰腺炎患者的细胞显示PCR空间差异,证明有可行性;并以B细胞作为模型输入。
(2)根据基因的互信息分数对基因进行排序,将基因的数量限制在相对较小的范围内。
(3)基于不同数量的特征(基因)构建随机森林分类器并评估性能,观察到在特征基因数为10时,模型的性能评估出现拐点(图3)。
(4)选择互信息分数最大的前10个基因,获得分类器模型,在此分类器下,AUROC的面积达0.929(图4)。
(5)绘制这10个基因在来自MAP和SAP样本的第1天B细胞中的表达,发现基于Wilcoxon检验,它们的表达都不同(图5)。这10个基因分别是选自表A的七个基因和选自表B的三个基因:(A1)DUSP1;(A2)FOS;(A3)HBA2;(A4)CYBA;(A5)JUNB;(A6)WDR83OS;(A7)FOSB;(B1)S100A8;(B2)JUN;(B3)S100A9。其中各基因权重占比如表A、表B所示。
实施例5.模型验证
模型输入为选自表A的七个基因和选自表B的三个基因:(A1)DUSP1;(A2)FOS;(A3)HBA2;(A4)CYBA;(A5)JUNB;(A6)WDR83OS;(A7)FOSB;(B1)S100A8;(B2)JUN;(B3)S100A9。
本发明使用建立的模型针对4比1分选的不同的样本集(80%测试集,20%训练集),进行了100次验证试验,每一次的AUROC的值都在90%以上,证明了本发明的模型具有较好的鲁棒性,支持了结论的可靠性(实验结果见表C)。
表C验证结果数据
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讨论
在本发明中,提供了一种判定方法来分析急性胰腺炎发展为重症急性胰腺炎的风险高低,并开发了一种预测重症急性胰腺炎发生风险的分析设备。
在本发明中,本发明人首次意外地发现了新的重症急性胰腺炎风险标志物,所述重症急性胰腺炎风险标志物包括组(A)中(A1)DUSP1、(A2)JUN、(A3)HBA2、(A4)CYBA、(A5)FOS、(A6)WDR83OS、(A7)FOSB、和/或组B中(B1)S100A8、(B2)JUN、(B3)S100A9。
在本发明中,通过选择外周血B细胞中选自包含组(A)及组(B)中的标记物作为生物标记物对急性胰腺炎患者发展为重症急性胰腺炎的风险进行评估,实现了对于重症急性胰腺炎的客观诊断,对重症急性胰腺炎诊断有较高的灵敏性和特异性。
在本发明提及的所有文献都在本申请中引用作为参考,就如同每一篇文献被单独引用作为参考那样。此外应理解,在阅读了本发明的上述讲授内容之后,本领域技术人员可以对本发明作各种改动或修改,这些等价形式同样落于本申请所附权利要求书所限定的范围。
Claims (10)
1.一种重症急性胰腺炎风险标志物的基因、mRNA、cDNA、蛋白、或其检测试剂的用途,其特征在于,用于制备一诊断试剂或试剂盒,所述诊断试剂或试剂盒用于诊断急性胰腺炎患者是否为重症急性胰腺炎;
其中,所述的重症急性胰腺炎风险标志物选自下组:
(A)选自A1至A7的任一标志物、或其组合:(A1)DUSP1;(A2)JUN;(A3)HBA2;(A4)CYBA;(A5)FOS;(A6)WDR83OS;(A7)FOSB。
2.如权利要求1所述的用途,其特征在于,所述重症急性胰腺炎风险标志物还包括选自下组B的任一标志物、或其组合:(B1)S100A8;(B2)JUNB;(B3)S100A9。
3.如权利要求1所述的用途,其特征在于,所述重症急性胰腺炎风险标志物还包括选自组A的7种和选自组B的3种标志物的组合。
4.如权利要求1所述的用途,其特征在于,所述诊断试剂或试剂盒用于检测血液中的重症急性胰腺炎风险标志物。
5.一种试剂盒,其特征在于,所述试剂盒含有一检测试剂,所述检测试剂用于检测待测样品中重症急性胰腺炎风险标志物的基因、mRNA、cDNA、蛋白、或其组合;
其中,所述的重症急性胰腺炎风险标志物选自下组:
(A)选自A1至A7的任一标志物、或其组合:(A1)DUSP1;(A2)JUN;(A3)HBA2;(A4)CYBA;(A5)FOS;(A6)WDR83OS;(A7)FOSB。
6.如权利要求5所述的试剂盒,其特征在于,所述待测样品来自选自下组的对象:无胰腺炎对象、轻症急性胰腺炎对象,重症急性胰腺炎对象。
7.一种检测方法,其特征在于,包括步骤:
(a)提供一检测样本;
(b)检测所述检测样本中重症急性胰腺炎风险标志物基因的表达量,记为C1;和
(c)将所述重症急性胰腺炎风险的标志物浓度C1与对照参比值C0进行比较,其中,所述的重症急性胰腺炎风险标志物选自下组:
(A)选自A1至A7的任一标志物、或其组合:(A1)DUSP1;(A2)JUN;(A3)HBA2;(A4)CYBA;(A5)FOS;(A6)WDR83OS;(A7)FOSB;
如果检测对象的重症急性胰腺炎风险的检测结果满足以下条件时,则提示所述对象发展为重症急性胰腺炎风险高:
当某一标志物在检测对象中表A和表B中的标志物的表达水平与参比值或标准值有显著差异时,所述急性胰腺炎患者发展为重症急性胰腺炎的风险高。
8.一种重症急性胰腺炎早期筛查的设备,其特征在于,所述设备包括:
(a)输入模块,所述输入模块用于输入某急性胰腺炎患者特征基因的表达数据;
其中,所述的特征基因包括选自下组:
(A)选自A1至A7的任一标志物、或其组合:(A1)DUSP1;(A2)JUN;(A3)HBA2;(A4)CYBA;(A5)FOS;(A6)WDR83OS;(A7)FOSB;
(b)处理模块,所述处理模块对于输入的特征基因,进行分析计算,从而获得风险评判;通过差异表达情况分析发现,其中,当出现显著差异表达情况时,则提示该急性胰腺炎患者为重症急性胰腺炎患者的风险高;当差异表达情况不显著时,则提示该急性胰腺炎患者为重症急性胰腺炎患者的风险低;和
(c)输出模块,所述输出模块用于输出所述的辅助筛查结果。
9.如权利要求8所述的设备,其特征在于,所述设备还包括一检测模块,所述检测模块用于检测所述风险标志物的mRNA水平、蛋白水平、或蛋白活性。
10.如权利要求9所述的设备,其特征在于,所述的检测模块选自下组:ELISA分析仪、PCR检测仪、测序仪、或其组合。
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Legal Events
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PB01 | Publication | ||
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