CN116283960A - 取代的稠杂环化合物及其制备方法与应用 - Google Patents

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Abstract

本发明提供了一种取代的稠杂环化合物及其制备方法与应用,具体地,本发明提供了一种具有结构式I的化合物或其药学上可接受的盐,其中Y1、Y2、Y3、Y4、R1、R2分别如说明书所定义。本发明的化合物、或其药学上可接受的盐可作为ATR抑制剂,具有较高活性。

Description

取代的稠杂环化合物及其制备方法与应用
技术领域
本发明是关于一种取代的稠杂环化合物及其制备方法与应用。
背景技术
在每个细胞周期中,人类细胞必须准确而有效地复制整个基因组。这是一项极具挑战性的复杂工程,因为它意味着要复制超过60亿个DNA片断(碱基),而且对准确率和效率的要求极高。在这个过程中,不可避免地会有许多障碍阻止或影响DNA的正常复制。因此,正常的人类细胞具有强大的应答机制,以确保整个基因组在每个细胞周期中准确地复制一次(Saldivar J.C.et al,2017,Nat.Rev.Mol.Cell Biol.18,622-636)。
人类细胞中有诸多调控分子参与维持基因组的稳定性和完整性,其中的重要一员是共济失调毛细血管扩张突变基因和Rad3相关(ATR)蛋白激酶。当细胞内DNA损伤或复制压力产生时,ATR被募集至适当位置,继而被激活。激活后的ATR在诸多方面发挥重要的调控作用,包括阻滞细胞周期、抑制复制起点、促进脱氧核苷酸的合成、启动复制叉等等。
与正常细胞不同,癌细胞由于存在DNA损伤应答的缺陷和/或复制压力的增加,其基因组具有不稳定性,这也正是癌症的一个关键标志。癌细胞有别于正常细胞的这些特点,使得癌细胞在分裂过程中,基因的突变、重排、拷贝数变化等事件更容易积累,进而有可能促进癌细胞的克隆进化;但与此同时,这些特点也是缺陷,会造成癌细胞特异性的脆弱性。充分利用这些脆弱性,有望增强抗癌治疗的效果,从而改善癌症患者的预后(Pilié.P.G.etal,2019,Nat.Rev.Clin.Oncol.16,81-104)。
癌细胞相较于正常细胞更依赖于ATR,这就是上述脆弱性之一。鉴于癌基因诱导的复制压力是癌症基因组不稳定性的主要来源,癌细胞的生存变得高度依赖于熟练完善的复制压力应答,因此容易受到ATR抑制剂的影响。细胞系和小鼠模型的早期工作已经为这一概念提供了临床前支持。此外,还有证据表明,ATR水平降低的小鼠对癌症的发展具有高度抵抗力。这些结果突出了在癌症治疗中靶向ATR的潜力。因此,开发高活性且具有良好成药性的ATR抑制剂,有望为人类提供抗击癌症的新武器(Lecona,E.et al,2018,Nat.Rev.Cancer18,586–595)。
现有技术WO2014089379A1、WO2011154737A1、WO2016020320A1等分别公开了具有ATR激酶抑制活性的化合物,有数个ATR激酶抑制剂已经进入临床试验阶段,其中包括:
Figure BDA0003423149360000021
此外,现有技术(ACS Med.Chem.Lett.2015,6,42-46)中还公开了以下具有ATR激酶抑制活性的化合物:
Figure BDA0003423149360000022
但到目前为止,尚无ATR激酶抑制剂上市,因此本领域仍然亟需新的ATR抑制剂,特别是具有高活性以及良好成药性的ATR抑制剂。
发明内容
本发明的一个目的在于提供一种新的化合物,以作为ATR抑制剂。
本发明的另一目的在于提供所述化合物的制备方法。
本发明的另一目的在于提供所述化合物的应用。
本发明的另一目的在于提供包含所述化合物的药物组合物及其应用。
本发明的另一目的在于提供制备所述化合物的中间体。
本发明的另一目的在于提供所述中间体的制备方法。
一方面,本发明提供了一种具有结构式I的化合物或其药学上可接受的盐,
Figure BDA0003423149360000023
其中:
Y1、Y2、Y3、Y4各自独立地为CH或N,并且,Y1和Y2中至少之一为N,Y3和Y4中至少之一为CH;
R1为含n个杂原子的5元并6元杂芳环基或6元并6元杂芳环基、或含m个杂原子的5元或6元芳环基,其中,n选自1-4的整数,m选自0-3的整数,杂原子选自O、N、S中的一种或两种;所述含n个杂原子的5元并6元杂芳环基或6元并6元杂芳环基中,杂芳环基任选被选自卤素、-OH、-OMe、-NH2、-NHMe、-NMe2、-CN、-CONH2、-Me中的一个或多个取代基所取代;所述含m个杂原子的5元或6元芳环基中,芳环基任选被选自4-6元杂环烷基、卤素、-OH、-OMe、-NH2、-NHMe、-NMe2、-CN、-CONH2、-Me中的一个或多个取代基所取代;上述芳环基在被4-6元杂环烷基取代时,可以以单键相连,也可以彼此形成并环;
R2为-OH、C1-6烷氧基、-NR3R4、-CN、C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C3-6环烷基或4-6元杂环烷基,杂原子选自O、N中的一种;所述C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C3-6环烷基或4-6元杂环烷基任选被选自卤素、-OH、C1-6烷氧基、-NR5R6、-CN中的一个或多个取代基所取代;
R3、R4各自独立地为氢或C1-6烷基;
R5、R6各自独立地为氢或C1-6烷基,或者,-NR5R6一起代表氮杂环丁烷基、四氢吡咯基、哌啶基、吗啉基或4-甲基哌嗪基。
根据本发明的一些具体实施方案,本发明的所述式I化合物或其药学上可接受的盐中,Y3和Y4分别为CH;Y1、Y2各自独立地为CH或N,且Y1与Y2中至少之一为N。即,本发明的这些具体实施方案提供了如下式I-1所示结构的化合物:
Figure BDA0003423149360000031
式I-1中,Y1、Y2、R1、R2各自独立地如前述所定义。
根据本发明的一些具体实施方案,本发明的所述式I化合物或其药学上可接受的盐中,Y1和Y2分别为N。
根据本发明的一些具体实施方案,本发明的所述式I化合物或其药学上可接受的盐中,Y1和Y2分别为N,Y3和Y4分别为CH。即,本发明的这些具体实施方案提供了如下式I-2所示结构的化合物:
Figure BDA0003423149360000041
式I-2中,R1、R2各自独立地如前述所定义。
根据本发明的一些具体实施方案,本发明的所述式I化合物或其药学上可接受的盐中,R1为含n个杂原子的5元并6元杂芳环基,n选自1-4的整数,杂原子选自O、N、S中的一种或两种;所述杂芳环基任选被选自卤素、-OH、-OMe、-NH2、-NHMe、-NMe2、-CN、-CONH2、-Me中的一个或多个取代基所取代。
根据本发明的一些具体实施方案,本发明的所述式I化合物或其药学上可接受的盐中,R1为选自以下的基团:
Figure BDA0003423149360000042
根据本发明的一些具体实施方案,本发明的所述式I化合物或其药学上可接受的盐中,R2为羟基、甲氧基、乙氧基、氨基、甲胺基、二甲胺基、氰基、甲基、乙基、丙基、异丙基、乙烯基、丙烯基、烯丙基、乙炔基、丙炔基、炔丙基、环丙基、羟甲基、甲氧基甲基、2-羟乙基、2-甲氧基乙基、2-二甲胺基乙基、N-吗啉基或4-甲基哌嗪基。
根据本发明的一些具体实施方案,本发明的所述式I化合物或其药学上可接受的盐中,所述化合物可选自:
Figure BDA0003423149360000051
Figure BDA0003423149360000061
另一方面,本发明还提供了一种中间体化合物,所述的中间体包括但不限于:上述制备所述的化合物或其药学上可接受的盐的合成路线中的任一中间体。优选地,所述中间体具有与式I的化合物、或其药学上可接受的盐相同的基本结构单元(基本相同的基本核心部分或者基本的环),或者中间体的基本结构单元包含在了式I的化合物、或其药学上可接受的盐的化学结构中。
在本发明的一些具体实施方案中,所述中间体化合物具有式II所示结构:
Figure BDA0003423149360000071
式II中,Y1、Y2、Y3、Y4与R2各自独立地如前述所定义;
R3为卤素或
Figure BDA0003423149360000072
其中所述卤素优选为氯。
另一方面,本发明还提供了一种制备式I所示结构的化合物或其药学上可接受的盐的方法,该方法包括:
Figure BDA0003423149360000073
以式II所示的中间体化合物,与R1-M发生偶联反应,制备具有结构式I的化合物。
其中:
R3为卤素时,M为
Figure BDA0003423149360000074
R3
Figure BDA0003423149360000075
时,M为卤素优选为溴;
Y1、Y2、Y3、Y4、R1和R2各自独立地如前述所定义。
根据本发明的具体实施方案,本发明的制备式I所示结构的化合物或其药学上可接受的盐的方法,还包括制备所述的中间体化合物的过程。
根据本发明的一些具体实施方案,本发明的制备式I所示结构的化合物或其药学上可接受的盐的方法,包括但不限于:按照制备实施例1至制备实施例27中任一合成路线制备得到式I的化合物或其药学上可接受的盐。其中,所制备得到的化合物的各取代基并不限于制备实施例1至制备实施例27中具体化合物的范围,各取代基的定义可参照前述式I的化合物的各取代基的定义范围。
另一方面,本发明还提供了一种药物组合物,其包括:本发明所述的式I所示结构的化合物或其药学上可接受的盐,以及药学上可接受的载体。
本发明还提供了所述的化合物或其药学上可接受的盐或所述的药物组合物作为ATR激酶抑制剂的应用。本发明的化合物或其药学上可接受的盐或所述的药物组合物作为ATR抑制剂具体应用时,可以是非治疗目的的(如体外实验研究目的等),也可以是治疗目的的。即,本发明提供了所述的化合物或其药学上可接受的盐或所述的药物组合物在制备用于抑制ATR激酶的药物中的应用。
本发明还提供了所述的化合物或其药学上可接受的盐或所述的药物组合物在制备用于治疗过度增殖性疾病的药物中的应用。本发明所述的化合物或其药学上可接受的盐在作为药物活性成分用于治疗过度增殖性疾病时,包括向有需要的受试者给予所述的化合物或其药学上可接受的盐或所述的药物组合物的步骤。
本发明提供的所述应用中,其中所述过度增殖性疾病包括癌症。所述癌症例如可包括黑色素瘤、脑瘤、食管癌、胃癌、肝癌、胰腺癌、结肠直肠癌、肺癌、肾癌、乳腺癌、宫颈癌、卵巢癌、前列腺癌、皮肤癌、神经母细胞瘤、神经胶质瘤、肉瘤、骨癌、子宫癌、子宫内膜癌、头颈肿瘤、多发性骨髓瘤、B-细胞淋巴瘤、真性红细胞增多症、白血病、甲状腺肿瘤、膀胱癌或胆囊癌等。
定义和说明
除非另有说明,本文所用的下列术语和短语旨在具有下列含义。一个特定的术语或短语在没有特别定义的情况下不应该被认为是不确定的或不清楚的,而应该按照普通的含义去理解。当本文中出现商品名时,意在指代其对应的商品或其活性成分。
术语“药学上可接受的”是针对那些化合物、材料、组合物和/或剂型而言,它们在可靠的医学判断的范围之内,适用于与人类和动物的组织接触使用,而没有过多的毒性、刺激性、过敏性反应或其它问题或并发症,与合理的利益/风险比相称。
术语“药学上可接受的盐”是指本发明化合物的盐,由本发明发现的具有特定取代基的化合物与相对无毒的酸或碱制备。当本发明的化合物中含有相对酸性的功能团时,可以通过在纯的溶液或合适的惰性溶剂中用足够量的碱与这类化合物的中性形式接触的方式获得碱加成盐。药学上可接受的碱加成盐包括钠、钾、钙、铵、有机氨或镁盐或类似的盐。当本发明的化合物中含有相对碱性的官能团时,可以通过在纯的溶液或合适的惰性溶剂中用足够量的酸与这类化合物的中性形式接触的方式获得酸加成盐。药学上可接受的酸加成盐的实例包括无机酸盐,所述无机酸包括例如盐酸、氢溴酸、硝酸、碳酸、碳酸氢根、磷酸、磷酸-氢根、磷酸二氢根、硫酸、硫酸氢根、氢碘酸、亚磷酸等;以及有机酸盐,所述有机酸包括如乙酸、丙酸、异丁酸、马来酸、丙二酸、苯甲酸、琥珀酸、辛二酸、反丁烯二酸、乳酸、扁桃酸、邻苯二甲酸、苯磺酸、对甲苯磺酸、柠檬酸、酒石酸和甲磺酸等类似的酸;还包括氨基酸(如精氨酸等)的盐,以及如葡萄糖醛酸等有机酸的盐。本发明的某些特定的化合物含有碱性和酸性的官能团,从而可以被转换成任一碱或酸加成盐。
本发明的药学上可接受的盐可由含有酸根或碱基的母体化合物通过常规化学方法合成。一般情况下,这样的盐的制备方法是:在水或有机溶剂或两者的混合物中,经由游离酸或碱形式的这些化合物与化学计量的适当的碱或酸反应来制备。
除非另有说明,用楔形实线键
Figure BDA0003423149360000091
和楔形虚线键
Figure BDA0003423149360000092
表示一个立体中心的绝对构型,用直形实线键
Figure BDA0003423149360000093
和直形虚线键
Figure BDA0003423149360000094
表示立体中心的相对构型,用波浪线
Figure BDA0003423149360000095
表示楔形实线键
Figure BDA0003423149360000096
或楔形虚线键
Figure BDA0003423149360000097
或用波浪线
Figure BDA0003423149360000098
表示直形实线键
Figure BDA0003423149360000099
和直形虚线键
Figure BDA00034231493600000910
“任选”或“任选地”指的是随后描述的事件或状况可能但不是必需出现的,并且该描述包括其中所述事件或状况发生的情况以及所述事件或状况不发生的情况。
术语“被取代”是指特定原子上的任意一个或多个氢原子被取代基取代,可以包括重氢和氢的变体,只要特定原子的价态是正常的并且取代后的化合物是稳定的。当取代基为氧(即=O)时,意味着两个氢原子被取代。氧取代不会发生在芳香基上。术语“任选被取代”是指可以被取代,也可以不被取代,除非另有规定,取代基的种类和数目在化学上可以实现的基础上可以是任意的。
当任何变量(例如R)在化合物的组成或结构中出现一次以上时,其在每一种情况下的定义都是独立的。因此,例如,如果一个基团被0-2个R所取代,则所述基团可以任选地至多被两个R所取代,并且每种情况下的R都有独立的选项。此外,取代基和/或其变体的组合只有在这样的组合会产生稳定的化合物的情况下才是被允许的。
当其中一个变量选自键时,表示其连接的两个基团直接相连,比如A-L-Z中L代表键时表示该结构实际上是A-Z。
当其中一个变量选自缺失时,表示其不存在,比如C-R3中R3选自缺失时表示该结构实际上是C。
当所列举的取代基中没有指明其通过哪一个原子连接到被取代的基团上时,这种取代基可以通过其任何原子相键合,例如,苯基作为取代基可以通过苯环上任意一个碳原子连接到被取代的基团上。
除非另有规定,术语“烷基”用于表示直链或支链的饱和烃基,可以是单取代(如-CH2F)或多取代的(如-CF3),可以是一价(如甲基)、二价(如亚甲基)或者多价(如次甲基)。烷基的例子包括甲基(Me),乙基(Et),丙基(如,n-丙基和异丙基),丁基(如,n-丁基,异丁基,s-丁基,t-丁基),戊基(如,n-戊基,异戊基,新戊基)等。
除非另有规定,“环烷基”包括任何稳定的环状或多环烃基,任何碳原子都是饱和的,可以是单取代或多取代的,可以是一价、二价或者多价。这些环烷基的实例包括,但不限于,环丙基、降冰片烷基、[2.2.2]二环辛烷、[4.4.0]二环癸烷等。
除非另有规定,术语“烯基”表示具有至少一个碳碳双键的直链或支链烃基,“C2-6烯基”表示具有2、3、4、5或6个碳原子的上述烃基、“C2-4烯基”表示具有2、3或4个碳原子的上述烃基,应当理解,在所述烯基含有多于一个碳碳双键的情况下,所述双键可以彼此分离或彼此共轭。示例性“C2-6烯基”包括但不限于,乙烯基、烯丙基、丁烯基、戊烯基、己烯基、丁二烯基、戊二烯基、己二烯基等。
除非另有规定,术语“炔基”表示具有至少一个碳碳三键的直链或支链烃基,“C2-6炔基”表示具有2、3、4、5或6个碳原子的上述烃基、“C2-4炔基”表示具有2、3或4个碳原子的上述烃基,示例性“C2-6炔基”包括但不限于,乙炔基、丙炔基、丁炔基、戊炔基、己炔基、甲基丙炔基、4-甲基-1-丁炔基等。
除非另有规定,术语“卤素”本身或作为另一取代基的一部分表示氟(F)、氯(Cl)、溴(Br)或碘(I)原子。
除非另有规定,术语“烷氧基”表示烷基基团通过氧原子与分子其余部分相连,其中烷基基团具有如本发明所述的含义。除非另有规定,C1-5烷氧基包括C1、C2、C3、C4和C5的烷氧基。烷氧基的例子包括但不限于:甲氧基、乙氧基、正丙氧基、异丙氧基、正丁氧基、仲丁氧基、叔丁氧基、正戊氧基和S-戊氧基。所述烷氧基基团可以任选地被一个或多个本发明描述的取代基所取代。
除非另有规定,术语“胺基(氨基)”是指是-NH2、-NH(烷基)或者-N(烷基)(烷基)。
除非另有规定,术语“芳环”表示多不饱和的芳香族烷烃单环,可以是单取代或多取代的。
除非另有规定,术语“4-6元杂环烷基”表示饱和的单价的单环烃环,其环上含有3、4或5个碳原子,以及一或多个选自O、NRa的杂原子基团,其中,Ra代表氢原子或C1-6烷基;所述“4-6元杂环烷基”可以通过任何一个碳原子,或,如果存在的话,氮原子,与分子的其余部分相连接。
除非另有规定,术语“杂芳环”表示含有一至四个杂原子的芳环,杂原子选自N、O和S中的一种或多种。
除非另有规定,术语“稠杂芳环”表示含有两个以上芳香性的稠杂环。
除非另有规定,术语“5元并6元杂芳环”表示5元并6元的稠合杂芳环,2个并环中至少有1个环含有1个以上的杂原子(包括但不限于O、S或N),整个基团具有芳香性,非限制实施例包括了苯并5元杂芳基、6元杂芳环并5元杂芳环。
除非另有规定,术语“6元并6元杂芳环”表示6元并6元的稠合杂芳环,2个并环中至少有1个环含有1个以上的杂原子(包括但不限于O、S或N),整个基团具有芳香性,非限制实施例包括了苯并6元杂芳基、6元杂芳环并6元杂芳环。
除非另有规定,术语“药学上可接受的盐”或者“其药学上可接受的盐”是指本发明化合物保持游离酸或者游离碱的生物有效性和特性,且所述的游离酸通过与无毒的无机碱或者有机碱,所述的游离碱通过与无毒的无机酸或者有机酸反应获得的盐。
除非另有规定,术语“药物组合物”是指一种或多种本发明所述化合物或药学上可接受的盐与其它化学组分形成的混合物,其中,“其它化学组分”是指药学上可接受的载体、赋形剂和/或一种或多种其它治疗剂。“载体”是指不会对生物体产生明显刺激且不会消除所给予化合物的生物活性和特性的材料。“赋形剂”是指加入到药物组合物中以促进化合物给药的惰性物质。非限制性实施例包括碳酸钙、磷酸钙、糖、淀粉、纤维素衍生物(包括微晶纤维素)、明胶、植物油、聚乙二醇类、稀释剂、成粒剂、润滑剂、粘合剂和崩解剂。
本发明化合物具有良好的ATR酶抑制活性,以及对肿瘤细胞增殖的抑制活性,在治疗与细胞增殖相关的疾病中具有潜在的应用价值。
具体实施方式
下面将结合实施例对本发明的实施方案进行详细描述,但是本领域技术人员会理解,下列实施例仅用于说明本发明,而不应视为限制本发明的范围。实施例中未注明具体条件者,按照常规条件或制造商建议的条件进行。所用试剂或仪器未注明生产厂商者,均为可以通过市购获得的常规产品。
化合物的结构通过核磁共振或质谱来确定。核磁共振使用BRUKER 400M核磁仪测定,测定溶剂为氘代二甲基亚砜(DMSO-d6)或氘代氯仿(CDCl3),内标为四甲基硅烷(TMS),化学位移(δ)以10-6(ppm)作为单位给出。质谱使用Waters ACQUITY Arc/ACQUITY QDa或Thermo U3000-ISQ EC液质联用仪测定。
高效液相色谱法分析使用Thermo U3000高压液相色谱仪。高效液相制备使用汉邦DAC-50或岛津LC-20AP制备型色谱仪。
反应监测使用薄层色谱或液质联用。薄层色谱使用的展开剂体系有:二氯甲烷和甲醇体系,石油醚和乙酸乙酯体系,溶剂的体积比根据化合物的极性不同而进行调节,或者加入少量三乙胺等进行调节。液质联用使用Waters ACQUITY Arc/ACQUITY QDa或ThermoU3000-ISQ EC液质联用仪。
柱层析一般使用200~300目硅胶为载体。洗脱剂的体系包括:二氯甲烷和甲醇体系,石油醚和乙酸乙酯体系,溶剂的体积比根据化合物的极性不同而进行调节,或者加入少量三乙胺等进行调节。
以下实施例中无特殊说明,反应的温度为室温(20℃~30℃),溶剂均按照标准方法干燥纯化。
在常规的合成法以及本发明的实施例中,下述缩写的含义如下所示:
缩写 含义
Pd(dppf)Cl2 [1,1’-双(二苯基膦)二茂铁]二氯化钯
Pd(XantPhos)Cl2 4,5-双二苯基膦-9,9-二甲基氧杂蒽二氯化钯
实施例1:(R)-3-甲基-4-(1’-(甲基磺酰基)-1H,1’H-[4,6’-二吡咯并[2,3-b]吡啶]-4’-基)吗啉(化合物1)
Figure BDA0003423149360000121
第一步:4-溴-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-7-氧化物
将4-溴-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(10.0g,50.8mmol)溶于四氢呋喃(200mL)中,冷却至0℃,加入间氯过氧苯甲酸(17.5g,101.5mmol),然后在室温下搅拌反应4小时,有固体析出。过滤收集固体,将其溶解后经硅胶柱层析纯化,得到标题化合物(7.8g,收率72%)。
LC-MS(ESI)m/z 213.0,215.0[M+H]+.
第二步:4-溴-6-氯-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶
将4-溴-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-7-氧化物(5.0g,23.5mmol)溶于N,N-二甲基甲酰胺(250mL)中,加热至50℃,加入甲磺酰氯(13.5g,118.0mmol),再加热至75℃搅拌反应1小时。将反应液冷却至室温,减压浓缩,经制备HPLC纯化,得到标题化合物(2.2g,收率41%)。
LC-MS(ESI)m/z 230.9,232.9[M+H]+.
第三步:4-溴-6-氯-1-(2-(三甲基硅基)乙氧基甲基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶
将4-溴-6-氯-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(1.1g,4.8mmol)溶于四氢呋喃(35mL)中,在室温下缓慢加入60%的氢化钠(400mg,10.0mmol),搅拌反应5分钟,再加入2-(三甲基硅基)乙氧基甲基氯(2.5g,15.0mmol),继续在室温下搅拌反应,直至原料完全转化。加少量水淬灭反应,再加入二氯甲烷(100mL),然后用水洗涤。分液,有机相用无水硫酸钠干燥。过滤,滤液减压浓缩,经硅胶柱层析纯化,得到标题化合物(1.5g,收率87%)。
LC-MS(ESI)m/z 361.0,363.0[M+H]+.
第四步:(R)-4-(6-氯-1-(2-(三甲基硅基)乙氧基甲基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-3-甲基吗啉
将4-溴-6-氯-1-(2-(三甲基硅基)乙氧基甲基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(1.0g,2.8mmol)、(R)-3-甲基吗啉(280mg,2.8mmol)溶于1,4-二氧六环(20mL)中。用氮气除气并在氮气保护下,加入Pd(XantPhos)Cl2(210mg,0.28mmol)和叔丁醇钠(270mg,2.8mmol),然后加热至80℃,在氮气保护下搅拌反应6小时。将反应液冷却至室温,加入二氯甲烷(100mL),再用水洗涤。分液,有机相用无水硫酸钠干燥。过滤,滤液减压浓缩,经硅胶柱层析纯化,得到标题化合物(437mg,收率41%)。
LC-MS(ESI)m/z 382.2[M+H]+.
第五步:(R)-4-(6-氯-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-3-甲基吗啉
向反应瓶中加入(R)-4-(6-氯-1-(2-(三甲基硅基)乙氧基甲基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-3-甲基吗啉(110mg,0.29mmol)和三氟乙酸(1mL)。该混合物在室温下搅拌反应,直至原料完全转化。将反应液减压浓缩,加入四氢呋喃(5mL)和1M氢氧化钠水溶液(2mL),所得混合物在室温下搅拌30分钟,再加入乙酸乙酯(50mL),然后用水洗涤。分液,有机相用无水硫酸钠干燥。过滤,滤液减压浓缩,得到标题化合物粗品。对其不作进一步纯化,直接用于下一步。
LC-MS(ESI)m/z 252.1[M+H]+.
第六步:(R)-4-(6-氯-1-(甲基磺酰基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-3-甲基吗啉
将上一步所得的(R)-4-(6-氯-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-3-甲基吗啉粗品全部溶于四氢呋喃(6mL)中,在室温下缓慢加入60%的氢化钠(48mg,1.2mmol),搅拌反应5分钟,再逐滴加入甲磺酰氯(172mg,1.5mmol),继续在室温下搅拌反应3小时。加少量水淬灭反应,再加入乙酸乙酯(40mL),然后用水洗涤。分液,有机相用无水硫酸钠干燥。过滤,滤液减压浓缩,经硅胶柱层析纯化,得到标题化合物(76mg,收率80%)。
LC-MS(ESI)m/z 330.1[M+H]+.
第七步:(R)-3-甲基-4-(1’-(甲基磺酰基)-1H,1’H-[4,6’-二吡咯并[2,3-b]吡啶]-4’-基)吗啉向反应瓶中加入(R)-4-(6-氯-1-(甲基磺酰基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-3-甲基吗啉(50mg,0.15mmol),4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(73.5mg,0.3mmol),Pd(dppf)Cl2(22mg,0.03mmol)和碳酸钠(47.5mg,0.45mmol),再加入1,4-二氧六环(2.5mL)和水(0.5mL)。用氮气除气并在氮气保护下,将上述混合物加热至100℃,搅拌反应3小时。将反应液冷却至室温,加入二氯甲烷(20mL),再用水洗涤。分液,有机相用无水硫酸钠干燥。过滤,滤液减压浓缩,经制备HPLC纯化,得到化合物1(51mg,收率82%)。
LC-MS(ESI)m/z 412.2[M+H]+.
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ11.77(s,1H),8.32(d,J=5.0Hz,1H),7.67(d,J=5.1Hz,1H),7.61(d,J=4.1Hz,1H),7.57(dd,J=3.5,2.5Hz,1H),7.31(s,1H),7.27(dd,J=3.4,1.9Hz,1H),6.98(d,J=4.2Hz,1H),4.42-4.34(m,1H),4.03-3.95(m,1H),3.84(dd,J=11.3,2.7Hz,1H),3.79(s,3H),3.73(d,J=11.3Hz,1H),3.69-3.59(m,2H),3.51(td,J=12.3,3.5Hz,1H),1.18(d,J=6.7Hz,3H).
13C NMR(100MHz,DMSO-d6)δ153.11,152.00,150.79,149.64,143.44,139.42,127.84,123.59,118.25,114.68,111.58,105.64,104.16,101.94,71.45,67.08,51.42,43.70,42.51,13.89.
采用与实施例1第七步相类似的偶联反应,将4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶换作其他芳香基硼酸频哪醇酯或芳香基硼酸,可由中间体(R)-4-(6-氯-1-(甲基磺酰基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-3-甲基吗啉合成化合物2至化合物11。芳香基硼酸频哪醇酯为市售或采用Miyaura硼化反应由芳基卤代物与联硼酸频哪醇酯制备。芳香基硼酸为市售或由芳基卤代物与丁基锂、硼酸酯反应制备。
实施例2:(R)-4-(6-(1H-吲哚-4-基)-1-(甲基磺酰基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-3-甲基吗啉(化合物2)
Figure BDA0003423149360000141
按如上所示反应,得到化合物2(54mg,收率87%)。
LC-MS(ESI)m/z 411.2[M+H]+.
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ11.26(s,1H),7.57(dd,J=7.4,0.9Hz,1H),7.55(d,J=4.1Hz,1H),7.48(d,J=8.1Hz,1H),7.44(t,J=2.8Hz,1H),7.24–7.18(m,2H),7.16(s,1H),6.94(d,J=4.2Hz,1H),4.36–4.28(m,1H),4.02–3.94(m,1H),3.87–3.78(m,4H),3.72(d,J=11.4Hz,1H),3.65(td,J=11.2,3.3Hz,1H),3.55(d,J=12.1Hz,1H),3.48(td,J=11.8,3.4Hz,1H),1.17(d,J=6.6Hz,3H).
实施例3:(R)-3-甲基-4-(1-(甲基磺酰基)-6-(1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-4-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)吗啉(化合物3)
Figure BDA0003423149360000151
按如上所示反应,得到化合物3(102mg,收率82%)。
LC-MS(ESI)m/z 412.3[M+H]+.
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ11.76(s,1H),8.79(s,1H),8.71(s,1H),7.71(t,J=2.8Hz,1H),7.56(d,J=4.2Hz,1H),7.32-7.27(m,1H),7.25(s,1H),6.96(d,J=4.2Hz,1H),4.41-4.33(m,1H),3.94-4.02(m,1H),3.83(dd,J=11.6,2.8Hz,1H),3.79(s,3H),3.73(d,J=11.5Hz,1H),3.69–3.59(m,2H),3.50(td,J=12.4,3.4Hz,1H),1.19(d,J=6.6Hz,3H).
实施例4:(R)-3-甲基-4-(1’-(甲基磺酰基)-1H,1’H-[5,6’-二吡咯并[2,3-b]吡啶]-4’-基)吗啉(化合物4)
Figure BDA0003423149360000152
按如上所示反应,得到化合物4(50mg,收率80%)。
LC-MS(ESI)m/z 412.2[M+H]+.
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ11.79(s,1H),9.02(d,J=2.1Hz,1H),8.66(d,J=2.2Hz,1H),7.55–7.48(m,2H),7.25(s,1H),6.91(d,J=4.2Hz,1H),6.56(dd,J=3.4,1.8Hz,1H),4.43–4.35(m,1H),3.98(dd,J=10.7,3.0Hz,1H),3.87–3.79(m,4H),3.73(d,J=11.6Hz,1H),3.69–3.60(m,2H),3.51(td,J=12.8,3.6Hz,1H),1.18(d,J=6.6Hz,3H).
实施例5:(R)-3-甲基-4-(1’-(甲基磺酰基)-1H,1’H-[3,6’-二吡咯并[2,3-b]吡啶]-4’-基)吗啉(化合物5)
Figure BDA0003423149360000161
按如上所示反应,得到化合物5(53mg,收率85%)。
LC-MS(ESI)m/z 412.2[M+H]+.
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ12.01(d,J=2.1Hz,1H),8.99(dd,J=7.9,1.7Hz,1H),8.37(d,J=2.8Hz,1H),8.27(dd,J=4.7,1.7Hz,1H),7.45(d,J=4.1Hz,1H),7.21–7.14(m,2H),6.87(d,J=4.2Hz,1H),4.38–4.29(m,1H),3.98(d,J=11.3Hz,1H),3.83(dd,J=11.3,3.0Hz,1H),3.77–3.69(m,4H),3.65(td,J=11.2,3.2Hz,1H),3.57–3.42(m,2H),1.16(d,J=6.6Hz,3H).
实施例6:(R)-3-甲基-4-(3-甲基-1’-(甲基磺酰基)-1H,1’H-[4,6’-二吡咯并[2,3-b]吡啶]-4’-基)吗啉(化合物6)
Figure BDA0003423149360000162
按如上所示反应,得到化合物6(33mg,收率34%)。
LC-MS(ESI)m/z 426.2[M+H]+.
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ11.47(s,1H),8.24(d,J=4.8Hz,1H),7.58(d,J=4.2Hz,1H),7.30–7.23(m,1H),7.08(d,J=4.8Hz,1H),6.98(d,J=4.2Hz,1H),6.82(s,1H),4.37–4.29(m,1H),3.97–3.89(m,1H),3.80(dd,J=11.3,2.8Hz,1H),3.74–3.67(m,4H),3.61(td,J=11.3,3.0Hz,1H),3.55–3.41(m,2H),1.94(s,3H),1.16(d,J=6.6Hz,3H).
实施例7:(R)-4-(6-(6-氟-1H-吲哚-4-基)-1-(甲基磺酰基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-3-甲基吗啉(化合物7)
Figure BDA0003423149360000163
按如上所示反应,得到化合物7(56mg,收率86%)。
LC-MS(ESI)m/z 429.2[M+H]+.
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ11.32(s,1H),7.57(d,J=4.1Hz,1H),7.47(dd,J=11.2,2.3Hz,1H),7.45–7.43(m,1H),7.26(dd,J=9.5,2.2Hz,1H),7.23–7.20(m,1H),7.18(s,1H),6.95(d,J=4.2Hz,1H),4.40–4.32(m,1H),4.02–3.94(m,1H),3.83(dd,J=11.4,2.7Hz,1H),3.79(s,3H),3.72(d,J=11.2Hz,1H),3.69–3.57(m,2H),3.49(td,J=12.4,3.5Hz,1H),1.18(d,J=6.7Hz,3H).
实施例8:(R)-4-(6-(7-氟-1H-吲哚-4-基)-1-(甲基磺酰基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-3-甲基吗啉(化合物8)
Figure BDA0003423149360000171
按如上所示反应,得到化合物8(35mg,收率54%)。
LC-MS(ESI)m/z 429.2[M+H]+.
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ11.75(s,1H),7.59–7.53(m,2H),7.51(t,J=2.7Hz,1H),7.33–7.29(m,1H),7.13(s,1H),7.04(dd,J=11.0,8.2Hz,1H),6.93(d,J=4.2Hz,1H),4.37–4.29(m,1H),4.02–3.94(m,1H),3.83(dd,J=11.3,2.9Hz,1H),3.79(s,3H),3.72(d,J=10.6Hz,1H),3.65(td,J=11.3,2.9Hz,1H),3.56(d,J=11.6Hz,1H),3.48(td,J=12.2,3.5Hz,1H),1.17(d,J=6.6Hz,3H).
实施例9:(R)-3-甲基-4-(1-(甲基磺酰基)-6-(1H-吡唑-5-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)吗啉(化合物9)
Figure BDA0003423149360000172
按如上所示反应,得到化合物9(45mg,收率82%)。
LC-MS(ESI)m/z 362.2[M+H]+.
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ12.98(s,1H),7.82(s,1H),7.51(d,J=4.1Hz,1H),7.31(s,1H),6.90(d,J=4.2Hz,1H),6.83(s,1H),4.34–4.22(m,1H),3.98(d,J=10.8Hz,1H),3.93–3.77(m,4H),3.71(d,J=11.2Hz,1H),3.67–3.57(m,1H),3.50–3.39(m,2H),1.14(d,J=6.5Hz,3H).
实施例10:(R)-3-甲基-4-(1-(甲基磺酰基)-6-(1H-吡唑-4-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)吗啉(化合物10)
Figure BDA0003423149360000181
按如上所示反应,得到化合物10(43mg,收率78%)。
LC-MS(ESI)m/z 362.2[M+H]+.
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ13.03(s,1H),8.35(s,1H),8.08(s,1H),7.44(d,J=4.1Hz,1H),6.98(s,1H),6.84(d,J=4.1Hz,1H),4.35–4.27(m,1H),3.96(d,J=13.1Hz,1H),3.85–3.77(m,4H),3.71(d,J=11.3Hz,1H),3.62(td,J=11.5,3.3Hz,1H),3.51(d,J=12.1Hz,1H),3.45(dd,J=11.4,3.4Hz,1H),1.13(d,J=6.6Hz,3H).
实施例11:(R)-4-(6-(1H-苯并[d]咪唑-2-基)-1-(甲基磺酰基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-3-甲基吗啉(化合物11)
Figure BDA0003423149360000182
按如上所示反应,得到化合物11(23mg,收率40%)。
LC-MS(ESI)m/z 412.2[M+H]+.
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ12.68(s,1H),7.73–7.68(m,2H),7.66–7.61(m,2H),7.30–7.19(m,2H),6.99(d,J=4.2Hz,1H),4.39–4.31(m,1H),4.06–3.96(m,4H),3.84(dd,J=11.5,2.5Hz,1H),3.74(d,J=11.2Hz,1H),3.65(td,J=11.0,3.8Hz,1H),3.59–3.50(m,2H),1.18(d,J=6.6Hz,3H).
实施例12:(R)-3-甲基-4-(1-(甲基磺酰基)-6-(7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-吗啉(化合物12)
Figure BDA0003423149360000183
第一步:(R)-3-甲基-4-(1-(甲基磺酰基)-6-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)吗啉
向反应瓶中加入(R)-4-(6-氯-1-(甲基磺酰基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-3-甲基吗啉(200mg,0.61mmol),联硼酸频哪醇酯(230mg,0.91mmol),Pd(dppf)Cl2(88mg,0.12mmol)和醋酸钾(101mg,1.03mmol),再加入1,4-二氧六环(4mL)。用氮气除气并在氮气保护下,将上述混合物加热至110℃,搅拌反应1.5小时。将反应液冷却至室温,加入乙酸乙酯(20mL),所得混合物用硅藻土过滤,滤液减压浓缩,得到标题化合物粗品(300mg)。对其不作进一步纯化,直接用于下一步。
第二步:(R)-3-甲基-4-(1-(甲基磺酰基)-6-(7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-吗啉
向反应瓶中加入(R)-3-甲基-4-(1-(甲基磺酰基)-6-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)吗啉(200mg粗品,按0.40mmol计),4-溴-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(48mg,0.24mmol),Pd(dppf)Cl2(51mg,0.07mmol)和碳酸钠(153mg,1.44mmol),再加入1,4-二氧六环(5mL)和水(1mL)。用氮气除气并在氮气保护下,将上述混合物加热至85℃,搅拌反应1小时。将反应液冷却至室温,加入二氯甲烷(25mL),再用水洗涤。分液,有机相用无水硫酸钠干燥。过滤,滤液减压浓缩,经制备HPLC纯化,得到化合物12(40mg,收率40%)。
LC-MS(ESI)m/z 413.2[M+H]+.
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ12.19(s,1H),8.85(s,1H),8.01(s,1H),7.72–7.63(m,3H),7.02(d,J=4.2Hz,1H),4.40–4.32(m,1H),4.02(d,J=11.0Hz,1H),3.85(dd,J=11.5,2.8Hz,1H),3.79–3.70(m,4H),3.65(td,J=10.7,4.0Hz,1H),3.59–3.50(m,2H),1.18(d,J=6.6Hz,3H).
实施例13:(R)-4-(6-(3H-咪唑并[4,5-b]吡啶-7-基)-1-(甲基磺酰基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-3-甲基吗啉(化合物13)
Figure BDA0003423149360000191
按如上所示反应(与实施例12第二步相类似),得到化合物13(20mg,收率35%)。
LC-MS(ESI)m/z 413.1[M+H]+.
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ12.00(s,1H),8.66(d,J=5.1Hz,1H),8.41(s,1H),7.65(d,J=5.2Hz,1H),7.51(d,J=4.1Hz,1H),7.29(s,1H),6.74(d,J=4.1Hz,1H),4.31–4.23(m,1H),4.15–4.08(m,1H),3.97(dd,J=11.4,3.0Hz,1H),3.85(d,J=11.0Hz,1H),3.80(td,J=11.4,2.9Hz,1H),3.68(td,J=11.7,3.5Hz,1H),3.53(d,J=12.1Hz,1H),3.40(s,3H),1.34(d,J=6.7Hz,3H).
实施例14:(R)-4-(1’-(异丙基磺酰基)-1H,1’H-[4,6’-二吡咯并[2,3-b]吡啶]-4’-基)-3-甲基吗啉(化合物14)
Figure BDA0003423149360000201
采用与实施例1第六步、第七步相类似的反应,将实施例1第六步中的甲磺酰氯换作异丙基磺酰氯,由中间体(R)-4-(6-氯-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-3-甲基吗啉经如上所示的两步反应,得到化合物14(111mg,两步收率分别为92%、45%)。
LC-MS(ESI)m/z 440.2[M+H]+.
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ11.74(s,1H),8.31(d,J=5.0Hz,1H),7.68(d,J=5.1Hz,1H),7.61–7.56(m,2H),7.36(dd,J=3.5,2.0Hz,1H),7.33(s,1H),7.00(d,J=4.2Hz,1H),4.45–4.35(m,2H),3.99(dd,J=11.7,2.5Hz,1H),3.83(dd,J=11.4,2.8Hz,1H),3.73(d,J=11.3Hz,1H),3.69–3.60(m,2H),3.51(td,J=12.7,3.4Hz,1H),1.29(d,J=6.9Hz,3H),1.23(d,J=6.8Hz,3H),1.19(d,J=6.6Hz,3H).
实施例15:(R)-4-(1’-(环丙基磺酰基)-1H,1’H-[4,6’-二吡咯并[2,3-b]吡啶]-4’-基)-3-甲基吗啉(化合物15)
Figure BDA0003423149360000202
采用与实施例1第六步、第七步相类似的反应,将实施例1第六步中的甲磺酰氯换作环丙基磺酰氯,由中间体(R)-4-(6-氯-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-3-甲基吗啉经如上所示的两步反应,得到化合物15(109mg,两步收率分别为90%、50%)。
LC-MS(ESI)m/z 438.2[M+H]+.
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ11.75(s,1H),8.32(d,J=5.0Hz,1H),7.68(d,J=5.1Hz,1H),7.60–7.55(m,2H),7.35(dd,J=3.5,1.9Hz,1H),7.32(s,1H),6.96(d,J=4.2Hz,1H),4.41–4.33(m,1H),4.02–3.96(m,1H),3.84(dd,J=11.4,2.8Hz,1H),3.73(d,J=11.1Hz,1H),3.70–3.59(m,2H),3.51(td,J=12.5,3.7Hz,1H),3.47–3.39(m,1H),1.43–1.29(m,2H),1.19(d,J=6.6Hz,3H),1.14–1.06(m,2H).
实施例16:(R)-N,N-二甲基-4’-(3-甲基吗啉基)-1H,1’H-[4,6’-二吡咯并[2,3-b]吡啶]-1’-磺酰胺(化合物16)
Figure BDA0003423149360000211
采用与实施例1第六步、第七步相类似的反应,将实施例1第六步中的甲磺酰氯换作二甲胺基磺酰氯,由中间体(R)-4-(6-氯-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-3-甲基吗啉经如上所示的两步反应,得到化合物16(148mg,两步收率分别为91%、60%)。
LC-MS(ESI)m/z 441.2[M+H]+.
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ11.74(s,1H),8.31(d,J=5.0Hz,1H),7.61(d,J=5.1Hz,1H),7.59–7.55(m,2H),7.28(dd,J=3.4,1.9Hz,1H),7.25(s,1H),6.91(d,J=4.2Hz,1H),4.39–4.31(m,1H),4.02–3.95(m,1H),3.84(dd,J=11.4,2.7Hz,1H),3.72(d,J=11.2Hz,1H),3.69–3.56(m,2H),3.50(td,J=12.0,3.4Hz,1H),2.89(s,6H),1.18(d,J=6.6Hz,3H).
实施例17:(R)-3-甲基-4-(7-(甲基磺酰基)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)吗啉(化合物17)
Figure BDA0003423149360000212
第一步:(R)-4-(2-氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉
将2,4-二氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(1.00g,5.3mmol)和(R)-3-甲基吗啉(2.70g,26.7mmol)溶于1,4-二氧六环(25mL)中。缓慢加入三乙胺(3.80g,37.6mmol),再加热至90℃搅拌反应8小时。将反应液冷却至室温,加入二氯甲烷(100mL),再用水洗涤。分液,有机相用无水硫酸钠干燥。过滤,滤液减压浓缩,经硅胶柱层析纯化,得到标题化合物(1.02g,收率76%)。
LC-MS(ESI)m/z 253.1[M+H]+.
第二步:(R)-4-(2-氯-7-(甲基磺酰基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉
将(R)-4-(2-氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉(152mg,0.6mmol)溶于四氢呋喃(7.5mL)中,在室温下缓慢加入60%的氢化钠(48mg,1.2mmol),搅拌反应5分钟,再逐滴加入甲磺酰氯(137mg,1.2mmol)。继续在室温下搅拌反应,直至原料完全转化。加少量水淬灭反应,再加入二氯甲烷(100mL),然后用水洗涤。分液,有机相用无水硫酸钠干燥。过滤,滤液减压浓缩,经硅胶柱层析纯化,得到标题化合物(149mg,收率75%)。
LC-MS(ESI)m/z 331.1[M+H]+.
第三步:(R)-3-甲基-4-(7-(甲基磺酰基)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)吗啉
向反应瓶中加入(R)-4-(2-氯-7-(甲基磺酰基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉(180mg,0.54mmol),4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(264mg,1.08mmol),Pd(dppf)Cl2(80mg,0.11mmol)和碳酸钾(299mg,2.16mmol),再加入1,4-二氧六环(17.5mL)和水(3.5mL)。用氮气除气并在氮气保护下,将上述混合物加热至90℃,搅拌反应1小时。将反应液冷却至室温,加入二氯甲烷(100mL),再用水洗涤。分液,有机相用无水硫酸钠干燥。过滤,滤液减压浓缩,经制备HPLC纯化,得到化合物17(130mg,收率58%)。
LC-MS(ESI)m/z 413.1[M+H]+.
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ11.79(s,1H),8.35(d,J=5.0Hz,1H),8.04(d,J=5.0Hz,1H),7.63–7.57(m,2H),7.48(dd,J=3.2,1.9Hz,1H),7.02(d,J=4.1Hz,1H),4.92–4.80(m,1H),4.62–4.50(m,1H),4.04(dd,J=11.1,3.0Hz,1H),3.85–3.71(m,5H),3.60(td,J=12.2,3.2Hz,1H),3.55–3.45(m,1H),1.36(d,J=6.8Hz,3H).
13C NMR(100MHz,DMSO-d6)δ158.60,157.15,153.14,151.17,143.19,137.50,128.22,123.07,118.76,115.52,105.90,104.00,102.74,71.17,67.13,48.81,48.79,42.64,15.25.
采用与实施例17第三步相类似的偶联反应,将4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶换作其他芳香基硼酸频哪醇酯或芳香基硼酸,可由中间体(R)-4-(2-氯-7-(甲基磺酰基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉合成化合物18至化合物20以及化合物27。
实施例18:(R)-4-(2-(1H-吲哚-4-基)-7-(甲基磺酰基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉(化合物18)
Figure BDA0003423149360000231
按如上所示反应,得到化合物18(52mg,收率42%)。
LC-MS(ESI)m/z 412.2[M+H]+.
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ11.26(s,1H),8.15(d,J=7.5Hz,1H),7.62–7.42(m,4H),7.21(t,J=7.7Hz,1H),6.97(d,J=4.1Hz,1H),4.92–4.77(m,1H),4.61–4.46(m,1H),4.09–3.99(m,1H),3.85–3.70(m,5H),3.65–3.55(m,1H),3.53–3.42(m,1H),1.35(d,J=6.7Hz,3H).
实施例19:(R)-3-甲基-4-(7-(甲基磺酰基)-2-(1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-4-基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)吗啉(化合物19)
Figure BDA0003423149360000232
按如上所示反应,得到化合物19(81mg,收率65%)。
LC-MS(ESI)m/z 413.2[M+H]+.
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ11.79(s,1H),9.17(s,1H),8.83(s,1H),7.74(t,J=2.6Hz,1H),7.56–7.51(m,2H),6.99(d,J=4.1Hz,1H),4.91–4.80(m,1H),4.61–4.48(m,1H),4.04(dd,J=10.8,2.9Hz,1H),3.85–3.71(m,5H),3.60(td,J=11.8,2.8Hz,1H),3.55–3.45(m,1H),1.36(d,J=6.7Hz,3H).
实施例20:(R)-4-(2-(6-氟-1H-吲哚-4-基)-7-(甲基磺酰基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉(化合物20)
Figure BDA0003423149360000233
按如上所示反应,得到化合物20(35mg,收率34%)。
LC-MS(ESI)m/z 430.2[M+H]+.
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ11.33(s,1H),7.92(dd,J=11.5,2.5Hz,1H),7.59(brs,1H),7.55(d,J=4.0Hz,1H),7.48(t,J=2.8Hz,1H),7.32(dd,J=9.2,2.5Hz,1H),6.99(d,J=4.2Hz,1H),4.90–4.76(m,1H),4.59–4.46(m,1H),4.08–4.00(m,1H),3.85–3.71(m,5H),3.64–3.55(m,1H),3.53–3.43(m,1H),1.35(d,J=6.8Hz,3H).
实施例21:(R)-2-((4-(3-甲基吗啉基)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)磺酰基)乙醇(化合物21)
Figure BDA0003423149360000241
第一步:(R)-4-(2-氯-7-((2-甲氧基乙基)磺酰基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉
将(R)-4-(2-氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉(200mg,0.79mmol)溶于四氢呋喃(5mL)中,在室温下缓慢加入60%的氢化钠(63mg,1.58mmol),搅拌反应5分钟,再逐滴加入2-甲氧基乙基磺酰氯(251mg,1.58mmol)。继续在室温下搅拌反应,直至原料完全转化。加少量水淬灭反应,再加入乙酸乙酯(50mL),然后用水洗涤。分液,有机相用无水硫酸钠干燥。过滤,滤液减压浓缩,经硅胶柱层析纯化,得到标题化合物(273mg,收率92%)。
LC-MS(ESI)m/z 375.1[M+H]+.
第二步:(R)-2-((2-氯-4-(3-甲基吗啉基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)磺酰基)乙醇
将(R)-4-(2-氯-7-((2-甲氧基乙基)磺酰基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉(270mg,0.72mmol)溶于二氯甲烷(20mL)中,冷却至0℃后加入三溴化硼(1.21g,4.83mmol),继续在室温下搅拌反应1小时。加入水(20mL)淬灭反应,减压浓缩除去二氯甲烷,再用乙酸乙酯(50mL)萃取,分液,有机相用无水硫酸钠干燥。过滤,滤液减压浓缩,经硅胶柱层析纯化,得到标题化合物(223mg,收率86%)。
LC-MS(ESI)m/z 361.1[M+H]+.
第三步:(R)-2-((4-(3-甲基吗啉基)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)磺酰基)乙醇
向反应瓶中加入(R)-2-((2-氯-4-(3-甲基吗啉基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)磺酰基)乙醇(100mg,0.28mmol),4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(135mg,0.55mmol),Pd(dppf)Cl2(40mg,0.055mmol)和醋酸钾(27mg,0.28mmol),再加入1,4-二氧六环(4mL)。用氮气除气并在氮气保护下,将上述混合物加热至85℃,搅拌反应4小时。将反应液冷却至室温,加入乙酸乙酯(50mL),再用水(20mL)洗涤。分液,有机相用无水硫酸钠干燥。过滤,滤液减压浓缩,经制备HPLC纯化,得到化合物21(49mg,收率40%)。
LC-MS(ESI)m/z 443.2[M+H]+.
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ11.77(s,1H),8.34(d,J=5.0Hz,1H),8.04(d,J=5.0Hz,1H),7.60(t,J=3.0Hz,1H),7.54(d,J=4.1Hz,2H),7.51(dd,J=3.4,2.0Hz,1H),6.99(d,J=4.1Hz,1H),4.94–4.80(m,2H),4.62–4.48(m,1H),4.13(t,J=5.9Hz,2H),4.04(dd,J=11.3,3.5Hz,1H),3.81(d,J=11.5Hz,1H),3.78–3.68(m,3H),3.60(td,J=11.6,2.7Hz,1H),3.55–3.45(m,1H),1.36(d,J=6.7Hz,3H).
实施例22:(R)-3-甲基-4-(9-(甲基磺酰基)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-9H-嘌呤-6-基)吗啉(化合物22)
Figure BDA0003423149360000251
第一步:(R)-4-(2-氯-9H-嘌呤-6-基)-3-甲基吗啉
将2,6-二氯-9H-嘌呤(1.0g,5.3mmol)溶于N,N-二甲基甲酰胺(15mL)中,缓慢加入(R)-3-甲基吗啉(2.1g,21mmol)和三乙胺(5.4g,53mmol),再加热至120℃搅拌反应1小时。将反应液冷却,减压浓缩,残余物经硅胶柱层析纯化,得到标题化合物(1.2g,收率89%)。
LC-MS(ESI)m/z 254.1[M+H]+.
第二步:(R)-4-(2-氯-9-(甲基磺酰基)-9H-嘌呤-6-基)-3-甲基吗啉
将(R)-4-(2-氯-9H-嘌呤-6-基)-3-甲基吗啉(800mg,3.15mmol)溶于四氢呋喃(15mL)中,在室温下缓慢加入60%的氢化钠(505mg,12.6mmol),搅拌反应5分钟,再逐滴加入甲磺酰氯(1.44g,12.6mmol)。继续在室温下搅拌反应3小时。加少量水淬灭反应,再加入乙酸乙酯(50mL),然后用水洗涤。分液,有机相用无水硫酸钠干燥。过滤,滤液减压浓缩,经硅胶柱层析纯化,得到标题化合物(785mg,收率75%)。
LC-MS(ESI)m/z 332.1[M+H]+.
第三步:(R)-3-甲基-4-(9-(甲基磺酰基)-2-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-9H-嘌呤-6-基)吗啉
向反应瓶中加入(R)-4-(2-氯-9-(甲基磺酰基)-9H-嘌呤-6-基)-3-甲基吗啉(100mg,0.30mmol),4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(183mg,0.75mmol),Pd(dppf)Cl2(44mg,0.060mmol)和醋酸钾(118mg,1.20mmol),再加入1,4-二氧六环(10mL)和水(0.25mL)。用氮气除气并在氮气保护下,将上述混合物加热至85℃,搅拌反应1小时。将反应液冷却至室温,加入乙酸乙酯(20mL),再用水洗涤。分液,有机相用无水硫酸钠干燥。过滤,滤液减压浓缩,经制备HPLC纯化,得到化合物22(31mg,收率25%)。
LC-MS(ESI)m/z 414.2[M+H]+.
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ11.83(s,1H),8.55(s,1H),8.36(d,J=5.0Hz,1H),8.04(d,J=5.0Hz,1H),7.63(t,J=3.0Hz,1H),7.39(dd,J=3.4,2.0Hz,1H),5.56–5.38(br,1H),5.18–5.06(br,1H),4.05(d,J=8.6Hz,1H),3.88(s,3H),3.84(d,J=11.2Hz,1H),3.75(dd,J=11.5,3.0Hz,1H),3.65–3.47(m,2H),1.40(d,J=6.8Hz,3H).
实施例23:(R)-3-甲基-4-(1-(甲基磺酰基)-6-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-4-基)吗啉(化合物23)
Figure BDA0003423149360000261
第一步:(R)-4-(6-氯-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉
将4,6-二氯-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶(0.40g,2.1mmol)溶于1,4-二氧六环(2mL)中,缓慢加入(R)-3-甲基吗啉(0.86g,8.5mmol)和三乙胺(2.14g,21.1mmol),再加热至120℃搅拌反应2小时。将反应液冷却,减压浓缩,残余物经硅胶柱层析纯化,得到标题化合物(0.50g,收率93%)。
LC-MS(ESI)m/z 254.1[M+H]+.
第二步:(R)-4-(6-氯-1-(甲基磺酰基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉
将(R)-4-(6-氯-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉(650mg,2.56mmol)溶于四氢呋喃(4mL)中,在室温下缓慢加入60%的氢化钠(205mg,5.13mmol),搅拌反应5分钟,再逐滴加入甲磺酰氯(587mg,5.12mmol)。继续在室温下搅拌反应1小时。加少量水淬灭反应,再加入乙酸乙酯(30mL),然后用水洗涤。分液,有机相用无水硫酸钠干燥。过滤,滤液减压浓缩,经硅胶柱层析纯化,得到标题化合物(765mg,收率90%)。
LC-MS(ESI)m/z 332.1[M+H]+.
第三步:(R)-3-甲基-4-(1-(甲基磺酰基)-6-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-4-基)吗啉
向反应瓶中加入(R)-4-(6-氯-1-(甲基磺酰基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉(100mg,0.30mmol),4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(147mg,0.60mmol),Pd(dppf)Cl2(44mg,0.060mmol)和氟化钾(70mg,1.20mmol),再加入1,4-二氧六环(5mL)。用氮气除气并在氮气保护下,将上述混合物加热至90℃,搅拌反应1小时。将反应液冷却至室温,加入乙酸乙酯(20mL),再用水洗涤。分液,有机相用无水硫酸钠干燥。过滤,滤液减压浓缩,经制备HPLC纯化,得到化合物23(19mg,收率15%)。
LC-MS(ESI)m/z 414.1[M+H]+.
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ11.84(s,1H),8.70(s,1H),8.37(d,J=5.0Hz,1H),8.10(d,J=5.0Hz,1H),7.66–7.62(m,1H),7.55–7.51(m,1H),4.72–7.42(br,2H),4.07(d,J=8.4Hz,1H),3.84(d,J=12.0Hz,1H),3.77(d,J=12.0Hz,1H),3.70(s,3H),3.67–3.48(m,2H),1.40(d,J=6.7Hz,3H).
实施例24:(R)-3-甲基-4-(3-(甲基磺酰基)-5-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-3H-咪唑并[4,5-b]吡啶-7-基)吗啉(化合物24)
Figure BDA0003423149360000271
第一步:(R)-4-(5-氯-3H-咪唑并[4,5-b]吡啶-7-基)-3-甲基吗啉
将5,7-二氯-3H-咪唑并[4,5-b]吡啶(500mg,2.66mmol)溶于N,N-二异丙基乙胺(9mL,51.7mmol)中,室温下加入(R)-3-甲基吗啉(3mL,26.4mmol),再加热至145℃搅拌反应8天。将反应液冷却至室温,加入乙酸乙酯(50mL),再用水洗涤。分液,有机相用无水硫酸钠干燥。过滤,滤液减压浓缩,经硅胶柱层析纯化,得到标题化合物(605mg,收率90%)。
LC-MS(ESI)m/z 253.1[M+H]+.
第二步:(R)-4-(5-氯-3-(甲基磺酰基)-3H-咪唑并[4,5-b]吡啶-7-基)-3-甲基吗啉
将(R)-4-(5-氯-3H-咪唑并[4,5-b]吡啶-7-基)-3-甲基吗啉(350mg,1.39mmol)溶于四氢呋喃(20mL)中,在室温下缓慢加入60%的氢化钠(180mg,4.50mmol),搅拌反应5分钟,再逐滴加入甲磺酰氯(518mg,4.52mmol)。继续在室温下搅拌反应,直至原料完全转化。加少量水淬灭反应,再加入二氯甲烷(100mL),然后用水洗涤。分液,有机相用无水硫酸钠干燥。过滤,滤液减压浓缩,经硅胶柱层析纯化,得到标题化合物(357mg,收率78%)。
LC-MS(ESI)m/z 331.1[M+H]+.
第三步:(R)-3-甲基-4-(3-(甲基磺酰基)-5-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-3H-咪唑并[4,5-b]吡啶-7-基)吗啉
向反应瓶中加入(R)-4-(5-氯-3-(甲基磺酰基)-3H-咪唑并[4,5-b]吡啶-7-基)-3-甲基吗啉(20mg,0.06mmol),4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(30mg,0.12mmol),Pd(dppf)Cl2(9mg,0.012mmol)和氟化钾(20mg,0.344mmol),再加入1,4-二氧六环(2mL)和水(0.1mL)。用氮气除气并在氮气保护下,将上述混合物加热至85℃,搅拌反应2小时。将反应液冷却至室温,加入二氯甲烷(50mL),再用水洗涤。分液,有机相用无水硫酸钠干燥。过滤,滤液减压浓缩,经制备HPLC纯化,得到化合物24(11mg,收率44%)。
LC-MS(ESI)m/z 413.1[M+H]+.
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ11.79(s,1H),8.51(s,1H),8.32(d,J=5.0Hz,1H),7.66(d,J=5.0Hz,1H),7.58(dd,J=3.4,2.5Hz,1H),7.30(s,1H),7.17(dd,J=3.4,1.9Hz,1H),5.25–5.14(m,1H),4.48–4.33(m,1H),4.02(dd,J=11.5,3.5Hz,1H),3.87(s,3H),3.79(d,J=2.2Hz,2H),3.64(td,J=11.7,2.7Hz,1H),3.45(td,J=12.7,3.6Hz,1H),1.26(d,J=6.7Hz,3H).
实施例25:(R)-3-甲基-4-(1-(甲基磺酰基)-6-(1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-4-基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-4-基)吗啉(化合物25)
Figure BDA0003423149360000281
(R)-4-(6-氯-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-4-基)-3-甲基吗啉按照文献(ACSMed.Chem.Lett.2015,6,42–46)所述合成路线制得。
第一步:(R)-4-(6-氯-1-(甲基磺酰基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-4-基)-3-甲基吗啉
将(R)-4-(6-氯-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-4-基)-3-甲基吗啉(150mg,0.59mmol)溶于四氢呋喃(10mL)中,在室温下缓慢加入60%的氢化钠(48mg,1.20mmol),搅拌反应5分钟,再逐滴加入甲磺酰氯(136mg,1.19mmol),继续在室温下搅拌反应,直至原料完全转化。加少量水淬灭反应,再加入乙酸乙酯(200mL),然后用水洗涤。分液,有机相用无水硫酸钠干燥。过滤,滤液减压浓缩,经硅胶柱层析纯化,得到标题化合物(150mg,收率76%)。
LC-MS(ESI)m/z 331.1[M+H]+.
第二步:(R)-3-甲基-4-(1-(甲基磺酰基)-6-(1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-4-基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-4-基)吗啉
向反应瓶中加入(R)-4-(6-氯-1-(甲基磺酰基)-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-4-基)-3-甲基吗啉(50mg,0.15mmol),(1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-4-基)硼酸(49mg,0.30mmol),Pd(dppf)Cl2(11mg,0.015mmol)和碳酸钠(32mg,0.30mmol),再加入1,4-二氧六环(1.5mL)和水(0.5mL)。用氮气除气并在氮气保护下,将上述混合物加热至80℃,搅拌反应2小时。将反应液冷却至室温,加入乙酸乙酯(50mL),再用水洗涤。分液,有机相用无水硫酸钠干燥。过滤,滤液减压浓缩,经制备HPLC纯化,得到化合物25(20mg,收率32%)。
LC-MS(ESI)m/z 413.1[M+H]+.
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ11.79(s,1H),8.78(s,1H),8.66(s,1H),8.49(s,1H),7.73(t,J=2.7Hz,1H),7.64(s,1H),6.94–6.89(m,1H),5.48–5.38(m,1H),4.89(d,J=13.4Hz,1H),4.01(dd,J=11.1,2.7Hz,1H),3.83–3.72(m,5H),3.60(td,J=11.7,2.6Hz,1H),3.47–3.38(m,1H),1.31(d,J=6.7Hz,3H).
实施例26:(R)-3-甲基-4-(1-(甲基磺酰基)-6-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-1H-吡咯并[3,2-c]吡啶-4-基)吗啉(化合物26)
Figure BDA0003423149360000291
第一步:(R)-4-(6-氯-1H-吡咯并[3,2-c]吡啶-4-基)-3-甲基吗啉
将4,6-二氯-1H-吡咯并[3,2-c]吡啶(500mg,2.67mmol)溶于N,N-二异丙基乙胺(9mL,51.7mmol)中,室温下加入(R)-3-甲基吗啉(3mL,26.4mmol),再加热至145℃搅拌反应8天。将反应液冷却至室温,加入乙酸乙酯(50mL),再用水洗涤。分液,有机相用无水硫酸钠干燥。过滤,滤液减压浓缩,经硅胶柱层析纯化,得到标题化合物(603mg,收率90%)。
LC-MS(ESI)m/z 252.1[M+H]+.
第二步:(R)-4-(6-氯-1-(甲基磺酰基)-1H-吡咯并[3,2-c]吡啶-4-基)-3-甲基吗啉
将(R)-4-(6-氯-1H-吡咯并[3,2-c]吡啶-4-基)-3-甲基吗啉(550mg,2.19mmol)溶于四氢呋喃(20mL)中,在室温下缓慢加入60%的氢化钠(367mg,9.18mmol),搅拌反应5分钟,再逐滴加入甲磺酰氯(740mg,6.46mmol)。继续在室温下搅拌反应,直至原料完全转化。加少量水淬灭反应,再加入二氯甲烷(100mL),然后用水洗涤。分液,有机相用无水硫酸钠干燥。过滤,滤液减压浓缩,经硅胶柱层析纯化,得到标题化合物(591mg,收率82%)。
LC-MS(ESI)m/z 330.1[M+H]+.
第三步:(R)-3-甲基-4-(1-(甲基磺酰基)-6-(1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)-1H-吡咯并[3,2-c]吡啶-4-基)吗啉
向反应瓶中加入(R)-4-(6-氯-1-(甲基磺酰基)-1H-吡咯并[3,2-c]吡啶-4-基)-3-甲基吗啉(20mg,0.06mmol),4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(30mg,0.12mmol),Pd(dppf)Cl2(9mg,0.012mmol)和碳酸钠(20mg,0.19mmol),再加入1,4-二氧六环(1mL)和水(0.2mL)。用氮气除气并在氮气保护下,将上述混合物加热至100℃,搅拌反应2小时。将反应液冷却至室温,加入二氯甲烷(20mL),再用水洗涤。分液,有机相用无水硫酸钠干燥。过滤,滤液减压浓缩,经制备HPLC纯化,得到化合物26(10mg,收率40%)。
LC-MS(ESI)m/z 412.2[M+H]+.
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ11.79(s,1H),8.31(d,J=5.0Hz,1H),7.93(s,1H),7.64–7.61(m,2H),7.59(t,J=3.0Hz,1H),7.08(d,J=3.8Hz,1H),6.90(dd,J=3.5,1.9Hz,1H),4.66–4.58(m,1H),4.08(d,J=12.8Hz,1H),4.02–3.96(m,1H),3.80(dd,J=11.4,2.9Hz,1H),3.73(d,J=10.8Hz,1H),3.63(td,J=11.3,2.6Hz,1H),3.58(s,3H),3.49(td,J=12.5,3.4Hz,1H),1.26(d,J=6.7Hz,3H).
实施例27:(R)-4-(2-(1H-苯并[d]咪唑-2-基)-7-(甲基磺酰基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)-3-甲基吗啉(化合物27)
Figure BDA0003423149360000301
按如上所示反应(与实施例17第三步相类似),得到化合物27(30mg,收率35%)。
LC-MS(ESI)m/z 413.2[M+H]+.
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.19(s,1H),8.65(d,J=8.0Hz,1H),7.78(d,J=7.9Hz,1H),7.52(d,J=4.1Hz,1H),7.45–7.39(m,1H),7.38–7.32(m,1H),7.03(d,J=4.1Hz,1H),4.91–4.75(br,1H),4.65–4.49(br,1H),4.02(dd,J=11.2,3.0Hz,1H),3.80(d,J=11.5Hz,1H),3.77–3.70(m,4H),3.59(td,J=11.6,2.5Hz,1H),3.54–3.45(m,1H),1.37(d,J=6.8Hz,3H).
对比例
分别合成表1中所示结构的化合物1’至化合物6’作为对比例化合物。
表1对比例化合物
Figure BDA0003423149360000311
Figure BDA0003423149360000321
化合物1’为已知化合物,按照文献(ACS Med.Chem.Lett.2015,6,42–46)所述合成路线制得。
化合物2’按照以下合成路线制得:
Figure BDA0003423149360000322
化合物3’按照以下合成路线制得:
Figure BDA0003423149360000323
化合物4’按照以下合成路线制得:
Figure BDA0003423149360000324
化合物5’按照以下合成路线制得:
Figure BDA0003423149360000331
化合物6’按照以下合成路线制得:
Figure BDA0003423149360000332
生物学测试例
在常规的生物学测试以及以下测试例中,下述缩写的含义如下所示:
缩写 含义
ATP 腺嘌呤核苷三磷酸
HEPES 4-羟乙基哌嗪乙磺酸
Brij-35 聚氧乙烯月桂醚
EDTA 乙二胺四乙酸
DMSO 二甲基亚砜
测试例1:体外ATR激酶抑制实验
实验方法:利用Caliper EZ Reader基于微流体芯片技术的迁移率检测技术,在ATP浓度为Km的情况下,用迁移率改变法(Mobility Shift Assay)测定化合物在体外对ATR激酶的抑制活性。
实验材料和仪器:ATR激酶(Eurofins,产品目录号14-953);5-FAM-AK-17(吉尔生化,产品目录号524315);1倍激酶缓冲液(50 mM HEPES pH 7.5,0.0015%Brij-35,1MMnCl2);终止缓冲液(100mM HEPES pH 7.5,0.015%Brij-35,0.2%Coating Reagent#3,50mM EDTA);Caliper EZ Reader(Caliper Life Sciences)。
实验步骤:(1)将待测化合物用DMSO溶解并连续进行4倍稀释,共10个浓度;(2)使用Echo移液系统移取0.06μL不同浓度的化合物至384孔板中;(3)用ATR激酶与1倍激酶缓冲液配成ATR激酶浓度为10nM的2倍激酶溶液;用5-FAM-AK-17、ATP与1倍激酶缓冲液配成5-FAM-AK-17浓度为6μM、ATP浓度为4μM的2倍底物溶液;(4)在上述384孔板中加入2倍激酶溶液10μL,室温下孵育10分钟;再加入2倍底物溶液10μL,28℃下孵育4小时;(5)加入终止缓冲液30μL以终止反应,再将384孔板放入Caliper EZ Reader,读取转化率数据。
数据处理:(1)通过转化率计算抑制率:“max”为DMSO空白对照组(未加化合物)的转化率,“min”为无酶对照组(未加ATR激酶)的转化率,“conversion”为化合物测试组的转化率,抑制率=(max-conversion)/(max-min)×100%;(2)使用Excel插件XLFit(版本号5.4.0.8)拟合曲线并计算IC50值。
实验结果:实施例化合物对ATR激酶的抑制作用,如表2所示。
表2
Figure BDA0003423149360000341
由上述结果可知,实施例化合物对ATR激酶具有良好的抑制作用。
对比例化合物1’至化合物6’对ATR激酶的抑制作用,如表3所示。
表3
对比例化合物编号 ATR IC50(nM)
化合物1’ 56
化合物2’ 63
化合物3’ 31
化合物4’ 20
化合物5’ 15
化合物6’ 268
测试例2:细胞增殖抑制实验
实验方法:采用CellTiter-Glo细胞活力检测试剂盒,测试化合物对人结肠癌细胞LoVo体外增殖的抑制作用。
实验材料:LoVo细胞(ATCC,产品目录号CCL-29);F-12K培养基(Invitrogen,产品目录号21127-022);胎牛血清(Biological Industries,产品目录号04-002-1A);GlutaMAX(Gibco,产品目录号35050-061);0.25%胰酶-EDTA(Invitrogen,产品目录号25200-072);CellTiter-Glo试剂盒(Promega,产品目录号G7558)。
实验步骤:(1)将F-12K培养基、胎牛血清、GlutaMAX配制成完全培养基,用于培养LoVo细胞;(2)取生长状态良好的LoVo细胞,用胰酶消化后转至离心管中,离心,弃去上清,加入新鲜培养基重悬细胞,用Vi-CELL XR细胞计数仪计数,将细胞悬液的密度调至25000~30000细胞/mL,在96孔细胞培养板中按100μL/孔加入细胞悬液,同时设未加细胞的空白对照组,将培养板置于二氧化碳培养箱中孵育过夜;(3)使用HP D300超微量加样器将待测化合物的DMSO溶液分配到上述96孔细胞培养板中,每孔加入0.5μL,每个化合物10个浓度(3倍稀释),同时设未加化合物的DMSO对照组,将培养板继续在二氧化碳培养箱中孵育96小时;(4)将培养板取出,平衡至室温,每孔加入CellTiter-Glo试剂100μL,避光振荡10分钟,孵育10分钟;(5)将培养板放入EnSpire读板,记录发光值RLU。
数据处理:(1)通过发光值计算抑制率:“RLUDMSO”为未加化合物的DMSO对照组的发光值,“RLUblank”为未加细胞的空白对照组的发光值,“RLUcompound”为化合物测试组的发光值,抑制率=[1-(RLUcompound-RLUblank)/(RLUDMSO-RLUblank)]×100%;(2)使用Excel插件XLFit拟合曲线并计算IC50值。
实验结果:实施例化合物对LoVo细胞体外增殖的抑制作用,如表4所示。
表4
Figure BDA0003423149360000361
由上述结果可知,本发明实施例化合物对LoVo细胞的增殖具有良好的抑制作用。
将本发明实施例化合物1对ATR激酶的抑制活性及对LoVo细胞增殖的抑制活性与对比例化合物4’、化合物5’进行比较,如表5所示。
表5
Figure BDA0003423149360000362
以上所述仅是本发明的具体实施方式,应当指出,对于本技术领域的普通技术人员来说,在不脱离本发明原理的前提下,还可以做出若干改进和润饰,这些改进和润饰也应视为本发明的保护范围。

Claims (15)

1.一种具有结构式I的化合物或其药学上可接受的盐,
Figure FDA0003423149350000011
其中:
Y1、Y2、Y3、Y4各自独立地为CH或N,并且,Y1和Y2中至少之一为N,Y3和Y4中至少之一为CH;
R1为含n个杂原子的5元并6元杂芳环基或6元并6元杂芳环基、或含m个杂原子的5元或6元芳环基,其中,n选自1-4的整数,m选自0-3的整数,杂原子选自O、N、S中的一种或两种;所述含n个杂原子的5元并6元杂芳环基或6元并6元杂芳环基中,杂芳环基任选被选自卤素、-OH、-OMe、-NH2、-NHMe、-NMe2、-CN、-CONH2、-Me中的一个或多个取代基所取代;所述含m个杂原子的5元或6元芳环基中,芳环基任选被选自4-6元杂环烷基、卤素、-OH、-OMe、-NH2、-NHMe、-NMe2、-CN、-CONH2、-Me中的一个或多个取代基所取代;上述芳环基在被4-6元杂环烷基取代时,以单键相连或彼此形成并环;
R2为-OH、C1-6烷氧基、-NR3R4、-CN、C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C3-6环烷基或4-6元杂环烷基,杂原子选自O、N中的一种;所述C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C3-6环烷基或4-6元杂环烷基任选被选自卤素、-OH、C1-6烷氧基、-NR5R6、-CN中的一个或多个取代基所取代;
R3、R4各自独立地为氢或C1-6烷基;
R5、R6各自独立地为氢或C1-6烷基,或者,-NR5R6一起代表氮杂环丁烷基、四氢吡咯基、哌啶基、吗啉基或4-甲基哌嗪基。
2.根据权利要求1所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中:
Y3和Y4分别为CH;Y1、Y2各自独立地为CH或N,且Y1与Y2中至少之一为N。
3.根据权利要求1或2所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中:
Y1和Y2分别为N。
4.根据权利要求1-3任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中:
R1为含n个杂原子的5元并6元杂芳环基,n选自1-4的整数,杂原子选自O、N、S中的一种或两种;所述杂芳环基任选被选自卤素、-OH、-OMe、-NH2、-NHMe、-NMe2、-CN、-CONH2、-Me中的一个或多个取代基所取代。
5.根据权利要求1-3任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中:
R1为选自以下的基团:
Figure FDA0003423149350000021
6.根据权利要求1-5任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中,
R2为-OH、C1-3烷氧基、-NR3R4、-CN、C1-4烷基、C2-4烯基、C2-4炔基、C3-4环烷基或4-6元杂环烷基,杂原子选自O、N中的一种;所述C1-4烷基、C2-4烯基、C2-4炔基、C3-4环烷基或4-6元杂环烷基任选被选自卤素、-OH、C1-3烷氧基、-NR5R6、-CN中的一个或多个取代基所取代;
R3、R4各自独立地为氢或C1-3烷基;
R5、R6各自独立地为氢或C1-3烷基,或者,-NR5R6一起代表氮杂环丁烷基、四氢吡咯基、哌啶基、吗啉基或4-甲基哌嗪基。
7.根据权利要求1-6任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中:
R2为羟基、甲氧基、乙氧基、氨基、甲胺基、二甲胺基、氰基、甲基、乙基、丙基、异丙基、乙烯基、丙烯基、烯丙基、乙炔基、丙炔基、炔丙基、环丙基、羟甲基、甲氧基甲基、2-羟乙基、2-甲氧基乙基、2-二甲胺基乙基、N-吗啉基或4-甲基哌嗪基。
8.根据权利要求1所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中,所述化合物选自:
Figure FDA0003423149350000031
Figure FDA0003423149350000041
Figure FDA0003423149350000051
9.一种中间体化合物,其具有式II所示结构:
Figure FDA0003423149350000052
式II中,Y1、Y2、Y3、Y4与R2各自独立地如权利要求1-8任一项所定义;
R3为卤素或
Figure FDA0003423149350000053
其中所述卤素优选为氯。
10.一种制备权利要求1-8任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐的方法,该方法包括:
Figure FDA0003423149350000054
以权利要求9所述的中间体化合物,与R1-M发生偶联反应,制备具有结构式I的化合物;
其中:
R3为卤素时,M为
Figure FDA0003423149350000055
R3
Figure FDA0003423149350000056
时,M为卤素优选为溴;
Y1、Y2、Y3、Y4、R1和R2各自独立地如权利要求1-8任一项中所定义。
11.根据权利要求10所述的方法,该方法还包括制备权利要求9所述的中间体化合物的过程。
12.一种药物组合物,其包括:权利要求1-8任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐,以及药学上可接受的载体。
13.权利要求1-8任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐或权利要求12所述的药物组合物在制备用于抑制ATR激酶的药物中的应用。
14.权利要求1-8任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐或权利要求12所述的药物组合物在制备用于治疗过度增殖性疾病的药物中的应用。
15.根据权利要求14所述的应用,其中所述过度增殖性疾病包括癌症;
所述癌症例如可包括黑色素瘤、脑瘤、食管癌、胃癌、肝癌、胰腺癌、结肠直肠癌、肺癌、肾癌、乳腺癌、宫颈癌、卵巢癌、前列腺癌、皮肤癌、神经母细胞瘤、神经胶质瘤、肉瘤、骨癌、子宫癌、子宫内膜癌、头颈肿瘤、多发性骨髓瘤、B-细胞淋巴瘤、真性红细胞增多症、白血病、甲状腺肿瘤、膀胱癌或胆囊癌。
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