CN116157392A - 靶向rna结合蛋白或rna修饰蛋白的化合物 - Google Patents

靶向rna结合蛋白或rna修饰蛋白的化合物 Download PDF

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CN116157392A CN202180032685.6A CN202180032685A CN116157392A CN 116157392 A CN116157392 A CN 116157392A CN 202180032685 A CN202180032685 A CN 202180032685A CN 116157392 A CN116157392 A CN 116157392A
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S·戈什
D·M·哈维
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Abstract

本发明涉及一种由式(I)表示的化合物或其药学上可接受的盐,包含所述化合物或其药学上可接受的盐的组合物,以及其制备和使用方法。变量描述于本文中。

Description

靶向RNA结合蛋白或RNA修饰蛋白的化合物
相关申请
本申请要求2020年3月3日提交的美国临时申请号62/984,677的权益,所述申请的全部教示内容以引用的方式并入本文中。
发明背景
RNA结合蛋白和RNA修饰蛋白在转录后基因调节过程(诸如RNA剪接、转运、翻译和定位)中扮演重要的作用。近期研究已证明这些蛋白质中的一些表达失调可以造成疾病发生,诸如癌症。
已知Let 7miRNA是靶向致癌基因K-Ras、c-myc和HMGA2的miRNA的肿瘤抑制因子。多种人癌症细胞系和原发性肿瘤表达低含量的let-7家族miRNA。已证明,增加的let-7表达可有效地抑制肺癌和乳腺癌小鼠模型中的癌生长。Lin28蛋白质在调节细胞中的let-7miRNA含量中起重要作用。Lin28B在细胞核中起作用并且通过螯合初级let-7转录本来抑制miRNA微处理器。相比之下,Lin28A介导的let-7表达抑制涉及将3'端尿苷酰转移酶(TUTase)(例如,Zcchc11/TUTase4/TUT4/Z11或Zcchc6/TUTase7/TUT7/Z6)募集至let-7前体RNA以阻断细胞质中的Dicer加工。TUTase活性是Lin28介导的let-7生物合成抑制所需的。已发现与正常组织相比,Zcchc11表达在原发性人肝脏和大肠直肠肿瘤中会上调。另外,Zcchc11减弱已显示可抑制人乳腺癌、卵巢癌、黑素瘤、前列腺癌和肝癌细胞在小鼠异种移植模型中的肿瘤发生和肝癌细胞的肺部转移。
因此,需要调节TUTase活性以治疗由let 7miRNA介导的疾病或病症的靶向疗法。
发明内容
本发明提供可调节TUTase Zcchc11(或Z11)活性的化合物。在某些实施方案中,本发明化合物具有针对Z11 TUTase的抑制活性。本发明化合物具有与喹啉酮抗生素类似的喹啉酮核心。然而,某些本发明化合物展现降低或极小的抗生素活性。
在第一方面,本发明针对一种由式(I)表示的化合物:
Figure BDA0003923073830000021
或其药学上可接受的盐,其中:
W为-CH2Y-R3、-S(O)2R3、-SCH2R3、Y-R3、-OC(=O)NR11R12或-N(C=O)NR11R12
V为-C(=O)-、-S(=O)2-或CR13R14
X为CR4R5、NR6或O;
Y为NR7或O;
Z为CR8或N;
R1为卤基、-CN、-OR1a、-C≡CH、C3-6碳环基或C1-6烷基,其中所述C1-6烷基任选地经一个或多个R10取代;
R1a为H或任选地经一个或多个R10取代的C1-6烷基;
R10在每次出现时独立地选自卤基、-CN和-OR10a
R10a在每次出现时独立地选自H和C1-6烷基;
R2为-CN、-CHRzCN、-C(O)NH2、-CHRzC(O)NH2、3元至12元碳环基、-(CHRz)-(3元至12元碳环基)、3元至12元杂环基或-(CHRz)-(3元至12元杂环基),其中由R2表示或由R2表示的基团中的所述3元至12元碳环基和所述3元至12元杂环基任选地经一个或多个R20取代,并且Rz为H或甲基;
R20在每次出现时独立地选自H、卤基、CN、氧代、-C(O)R20a、-C(O)2R20a、-C(O)NR20a、-N(R20a)2、-N(R20a)C(O)R20a、-N(R20a)C(O)2R20a、-N(R20a)C(O)N(R20a)2、-N(R20a)S(O)2R20a、-OR20a、-OC(O)R20a、-OC(O)N(R20a)2、-SR20a、-S(O)2R20a、-S(O)N(R20a) 2、-S(O)2N(R20a)2、C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元单环杂环基,其中由R20表示的所述C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元单环杂环基各自任选地经一个或多个R25取代;
R20a在每次出现时独立地选自H、C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元单环杂环基,其中由R20a表示的所述C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元单环杂环基各自任选地经一个或多个R25取代,或两个R20a连同其所连接的氮原子一起形成任选地经一个或多个R25取代的4元至7元杂环基;
R25在每次出现时独立地为H、C1-6烷基、卤基、-C=O、-C(O)O(C1-C6烷基)、任选地经OH取代的4元至6元杂环基、-N(R25a)2、-OR25a、任选地经C1-6烷基、卤基、-N(R25a)2或-OR25a取代的苯基;并且
R25a为H、C1-6烷基;或两个R25a连同其所连接的氮原子一起形成4元至7元杂环基,其中所述C1-6烷基任选地经-OCH3取代;
R3为3元至12元碳环基或3元至12元杂环基,其中由R3表示的所述3元至12元碳环基和所述3元至12元杂环基任选地经一个或多个R30取代;
R30在每次出现时独立地选自H、卤基、氧代、-CN、-C(O)R30a、-C(O)2R30a、-C(O)NR30a、-N(R30a)2、-N(R30a)C(O)R30a、-N(R30a)C(O)2R30a、-N(R30a)C(O)N(R30a)2、-N(R30a)S(O)2R30a、-OR30a、-OC(O)R30a、-OC(O)N(R30a)2、-SR30a、-S(O)2R30a、-S(O)N(R30a) 2、-S(O)2N(R30a)2、C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元单环杂环基,其中由R30表示的所述C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元单环杂环基各自任选地经一个或多个R35取代;
R30a在每次出现时独立地选自H、C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元单环杂环基,其中由R30a表示的所述C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元单环杂环基各自任选地经一个或多个R35取代;
R35在每次出现时独立地为H、-NH2、C1-6烷基、卤基和-OR35a;并且
R35a为H或C1-6烷基;
或者,当Y为NR7时,R7和R3连同R7所连接的N原子一起可形成任选地经一个或多个R30取代的4元至12元杂环基;
R4、R5、R15、R16、R17和R18各自独立地选自H、C1-6烷基、卤基、-NHC(O)CH3、4元至6元碳环基或4元至6元杂环基,其中所述C1-6烷基任选地经一个或多个独立地选自卤基的取代基取代,并且其中所述杂环基和碳环基任选地经卤基、-CN、-OR4a、C1-C6烷基或=O取代(当所述碳环基或杂环基为非芳族时),或其中R15与R16合起来或R17与R18合起来为=NOH或=NHOCH3
R4a为H或任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基;
R6为H或任选地经一个或多个独立地选自卤基、-CN和-OR6a的取代基取代的C1-6烷基;
R6a为H或任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基;
R7为H或任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基;
R8为H、卤基、-CN、-OR8a或任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基;
R8a为H或任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基;
R9、R13和R14各自独立地选自H、C1-6烷基和C3-6环烷基,其中所述C1-6烷基和所述C3-6环烷基各自任选地经一个或多个独立地选自卤基、-CN、-OR9a和任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基的取代基取代;
R9a为H或任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基;
R11和R12各自独立地为H或C1-6烷基,或R11和R12连同其所连接的氮原子一起形成4元至7元单环杂环基,所述4元至7元单环杂环基任选地经一个或多个独立地选自C1-6烷基、卤基、-OH和C1-6烷氧基的取代基取代;
或R4、R5、R9、R13、R14、R15、R16、R17和R18中的任两者一起形成-C1-5亚烷基-,所述-C1-5亚烷基-任选地经一个或多个独立地选自卤基、-ORa、-N(Ra)2和C1-6烷基的取代基取代;
或R4和R15与其介入碳原子合起来形成苯基或6元杂芳基;并且
Ra在每次出现时独立地为H或任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基;
R19a和R19b各自独立地为H或任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基,或R19a和R19b连同其所连接的碳原子一起形成-C(=O);或
一个R20基团和一个R30基团合起来形成-O-CH2CH2-O-或-O-CH2CH2-NH-;并且
n1为0、1或2;并且
n2为0、1或2,其限制条件在于当X为NR6或O时,n1和n2不能为0。
在第二方面,本发明针对一种由式(I')表示的化合物,
Figure BDA0003923073830000061
/>
或其药学上可接受的盐,其中:
W为Y-R3、-OC(=O)NR11R12或-N(C=O)NR11R12
V为-C(=O)-、-S(=O)2-或CR13R14
X为CR4R5、NR6或O;
Y为NR7或O;
Z为CR8或N;
R1为卤基、CN、-OR1a、-C≡CH或C1-6烷基,其中所述C1-6烷基任选地经一个或多个R10取代;
R1a为H或任选地经一个或多个R10取代的C1-6烷基;
R10在每次出现时独立地选自卤基、CN和OR10a
R10a在每次出现时独立地选自H和C1-6烷基;
R2为3元至12元碳环基或3元至12元杂环基,其中由R2表示的所述3元至12元碳环基和所述3元至12元杂环基任选地经一个或多个R20取代;
R20在每次出现时独立地选自H、卤基、CN、氧代、-C(O)R20a、-C(O)2R20a、-C(O)NR20a、-N(R20a)2、-N(R20a)C(O)R20a、-N(R20a)C(O)2R20a、-N(R20a)C(O)N(R20a)2、-N(R20a)S(O)2R20a、-OR20a、-OC(O)R20a、-OC(O)N(R20a)2、-SR20a、-S(O)2R20a、-S(O)N(R20a) 2、-S(O)2N(R20a)2、C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元单环杂环基,其中由R20表示的所述C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元单环杂环基各自任选地经一个或多个R25取代;
R20a在每次出现时独立地选自H、C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元单环杂环基,其中由R20a表示的所述C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元单环杂环基各自任选地经一个或多个R25取代,或两个R20a连同其所连接的氮原子一起形成任选地经一个或多个R25取代的4元至7元杂环基;
R25在每次出现时独立地为H、C1-6烷基、卤基、-N(R25a)2、-OR25a、任选地经C1-6烷基、卤基、-N(R25a)2或-OR25a取代的苯基;并且
R25a为H或C1-6烷基;
R3为3元至12元碳环基或3元至12元杂环基,其中由R3表示的所述3元至12元碳环基和所述3元至12元杂环基任选地经一个或多个R30取代;
R30在每次出现时独立地选自H、卤基、氧代、-CN、-C(O)R30a、-C(O)2R30a、-C(O)NR30a、-N(R30a)2、-N(R30a)C(O)R30a、-N(R30a)C(O)2R30a、-N(R30a)C(O)N(R30a)2、-N(R30a)S(O)2R30a、-OR30a、-OC(O)R30a、-OC(O)N(R30a)2、-SR30a、-S(O)2R30a、-S(O)N(R30a) 2、-S(O)2N(R30a)2、C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元单环杂环基,其中由R30表示的所述C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元单环杂环基各自任选地经一个或多个R35取代;
R30a在每次出现时独立地选自H、C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元单环杂环基,其中由R30a表示的所述C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元单环杂环基各自任选地经一个或多个R35取代;
R35在每次出现时独立地为H、C1-6烷基、卤基和-OR35a;并且
R35a为H或C1-6烷基;
或者,当Y为NR7时,R7和R3连同R7所连接的N原子一起可形成任选地经一个或多个R30取代的4元至12元杂环基;
R4、R5、R15、R16、R17和R18各自独立地选自H、C1-6烷基、卤基、-CN和-OR4a,其中所述C1-6烷基任选地经一个或多个独立地选自卤基、CN和-OR4a的取代基取代;
R4a为H或任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基;
R6为H或任选地经一个或多个独立地选自卤基、CN和-OR6a的取代基取代的C1-6烷基;
R6a为H或任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基;
R7为H或任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基;
R8为H、卤基、CN、-OR8a或任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基;
R8a为H或任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基;
R9、R13和R14各自独立地选自H、C1-6烷基和C3-6环烷基,其中所述C1-6烷基和所述C3-6环烷基各自任选地经一个或多个独立地选自卤基、CN、-OR9a和任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基的取代基取代;
R9a为H或任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基;
R11和R12各自独立地为H或C1-6烷基,或R11和R12连同其所连接的氮原子一起形成4元至7元单环杂环基,所述4元至7元单环杂环基任选地经一个或多个独立地选自C1-6烷基、卤基、OH和C1-6烷氧基的取代基取代;
或R4、R5、R9、R13、R14、R15、R16、R17和R18中的任两者一起形成-C1-5亚烷基-,所述-C1-5亚烷基-任选地经一个或多个独立地选自卤基、-ORa、-N(Ra)2和C1-6烷基的取代基取代;
Ra在每次出现时独立地为H或任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基;
R19a和R19b各自独立地为H或任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基,或R9a和R9b连同其所连接的碳原子一起形成-C(=O)-;
n1为0、1或2;并且
n2为0、1或2,其限制条件在于当X为NR6或O时,n1和n2不能为0。
在第三方面,本发明提供一种组合物(例如药物组合物),其包含本文所公开的化合物或其盐(例如药学上可接受的盐)。所述组合物也可包括载体(例如,药学上可接受的载体)。
在第四方面,本发明还包括一种治疗受试者的疾病或病症的方法,所述方法包括向有需要的受试者施用治疗有效量的本文所公开的化合物或其盐(例如,药学上可接受的盐),其中所述疾病或病症是由Z11 TUTase介导。本发明还包括本文所公开的化合物或其盐(例如药学上可接受的盐),其用于治疗受试者的疾病或病症的方法中,其中所述疾病或病症是由Z11 TUTase介导。本发明还包括本文所公开的化合物或其盐(例如药学上可接受的盐)的用途,其用于制造供治疗受试者的疾病或病症用的药剂,其中所述疾病或病症是由Z11 TUTase介导。
具体实施方式
现将详细参考本发明的某些实施方案,其实施例在随附结构和各式中说明。虽然本发明将结合所列举的实施方案描述,但应理解其不打算将本发明限于那些实施方案。相反地,本发明意图涵盖所有替代方案、修改和等效物,其可包括在如权利要求书所界定的本发明范畴内。所属领域的技术人员将识别类似或等效于本文所描述的多种方法和材料,其可用于本发明的实践中。在所并入的文献参考、专利或类似材料中的一者或多者与本申请(包括但不限于定义的术语、术语用法、所描述的技术等)不同或抵触的情况下,以本申请为准。
应理解,除非明确否认或不当,否则本文所描述的任一实施方案,包括在本发明的不同方面(例如,化合物、组合物、制造和使用方法)和本说明书的不同部分中所描述的那些实施方案,均可与本发明的一个或多个其他实施方案组合。实施方案的组合并不限于经由多个附属项要求保护的那些特定组合。
定义和通用术语
如本文所用,术语“烷基”是指具有1至20个碳原子的完全饱和分支链或直链烃部分。优选地,烷基包含1至6个碳原子或1至4个碳原子。烷基的代表性实例包括但不限于甲基、乙基、1-丙基、2-丙基、1-丁基、2-甲基-1-丙基、2-丁基、2-甲基-2-丙基、1-戊基、2-戊基、3-戊基、2-甲基-2-丁基、3-甲基-2-丁基、3-甲基-1-丁基、2-甲基-1-丁基、1-己基、2-己基、3-己基、2-甲基-2-戊基、3-甲基-2-戊基、4-甲基-2-戊基、3-甲基-3-戊基、2-甲基-3-戊基、2,3-二甲基-2-丁基、3,3-二甲基-2-丁基、1-庚基、1-辛基等。
本文中由前缀“Cx-xx”指定基团中的碳原子数目,其中x和xx为整数。举例说来,“C1-4烷基”是具有1至4个碳原子的烷基。
如本文所用的“亚烷基”是指具有一至二十个碳原子(C1-20)的饱和直链或分支链二价烃基,其实例包括但不限于具有如以上所例示的烷基的相同核心结构的那些基团。“二价”意指亚烷基与分子的其余部分具有两个连接点。优选地,亚烷基具有一至十六个碳原子(C1-16)或一至十个碳原子(C1-10)。更优选地,亚烷基具有一至七个碳原子(C1-7)、一至六个碳原子(C1-6)、一至五个碳原子(C1-5)、一至四个碳原子(C1-4)或一至三个碳原子(C1-3)。在某些实施方案中,亚烷基优选为-(CH2)-、-(CH2)2-或-(CH2)3-。
如本文所用,术语“碳环基”是指具有3-12个环碳原子的饱和或不饱和单环或双环(例如稠合、桥连或螺双环)烃环。术语“碳环基”涵盖环烷基和芳族基团(即,芳基)。在某些实施方案中,碳环基为3元至7元单环碳环基。例示性3元至7元单环碳环基包括但不限于环丙基、环丁基、环戊基、环己基、环庚基、环丙烯基、环丁烯基、环戊烯基、环己烯基、环庚烯基、环丁二烯基、环戊二烯基、环己二烯基、环庚二烯基、苯基和环庚三烯基。
术语“环烷基”是指具有3-12个环碳原子、3-8个环碳原子、3-6个环碳原子或5-7个环碳原子的完全饱和单环或双环(例如稠合、桥连或螺双环)烃环。示例性双环碳环基包括双环[2.1.1]己基、双环[2.2.1]庚基、双环[2.2.1]庚烯基、6,6-二甲基双环[3.1.1]庚基或2,6,6-三甲基双环[3.1.1]庚基、螺[2.2]戊基和螺[3.3]庚基。单环环烷基的实例包括但不限于环丙基、环丁基、环戊基、环己基、环庚基、环辛基、环壬基、环癸基、环十一烷基、环十二烷基等。优选地,环烷基为3元至8元单环、3元至7元单环或3元至6元单环。更优选地,环烷基为环丙基、环丁基、环戊基或环己基。
术语“芳基”是指具有六至十四个碳环原子的芳族烃环系统。术语“芳基(aryl)”可与术语“芳基环(aryl ring)”、“芳族环(aromatic ring)”、“芳基(aryl group)”和“芳族基(aromatic group)”可互换地使用。“芳基”还包括与非芳族碳环系统(诸如环烷基)稠合的芳族烃环系统。实例包括苯基、萘基、蒽基、1,2-二氢萘基、1,2,3,4-四氢萘基、芴基、二氢茚基、茚基等。芳基为单价的,即与分子的其余部分具有一个连接点。“经取代的芳基”在任何一个或多个可取代环原子处被取代,所述可取代环原子是键结至氢的环碳原子。优选地,芳基为苯基。
如本文所用,术语“烷氧基”是指基团-OR,其中R为如上文所定义的烷基。优选地,烷基具有一至十六个碳原子(C1-16)或一至十个碳原子(C1-10)。更优选地,烷基具有一至八个碳原子(C1-8)、一至七个碳原子(C1-7)、一至六个碳原子(C1-6)、一至四个碳原子(C1-4)或一至三个碳原子(C1-3)。非限制性实例包括:-OCH3、-OCH2CH3、-OCH2CH2CH3、-OCH(CH3)2、-OCH(CH2)2、-O-环丙基、-O-环丁基、-O-环戊基和-O-环己基。
术语“杂环(heterocycle)”、“杂环基(heterocyclyl)”、“杂环(heterocyclic)”和“杂环(heterocyclic ring)”在本文中可互换地使用并且是指含有至少一个杂原子(例如N、O或S)的环基,并且可为芳族(杂芳基)或非芳族的。其可为单环或双环(例如稠合、桥连或螺双环),具有3至12个环成员,优选4至12个环成员、3至7个环成员、3至6个环成员、4至7个环成员、5至7个环成员或4至6个环成员,其中至少一者为杂原子,并且其中至多4个(例如1、2、3或4个)可为杂原子,其中所述杂原子独立地选自O、S和N,并且其中C可经氧化(例如C(O)),N可经氧化(例如N(O))或季铵化,并且S可任选地经氧化为亚砜和砜。不饱和杂环包括杂芳基环。
在一个实施方案中,杂环基是具有1-2个选自O、S和N的杂原子的3元至7元单环杂环基(饱和或部分不饱和(即,非芳族))。3元至7元单环杂环基的实例包括但不限于氮杂环丙烷基、环氧乙烷基、硫杂丙环基(thirranyl)、氧氮环丙烷基(oxaziridinyl)、氮杂环丁烷基、氧杂环丁烷基、硫杂环丁烷基、吡咯烷基、四氢呋喃基、硫杂环戊烷基、咪唑烷基、吡唑烷基、噁唑烷基、异噁唑烷基、噻唑烷基、异噻唑烷基、二氧杂环戊烷基、二硫杂环戊烷基、氧硫杂环戊烷基、哌啶基、四氢吡喃基、硫杂环己烷基、哌嗪基、吗啉基、硫代吗啉基、二氧杂环己烷基、二硫杂环己烷基、三噁烷基(trioxanyl)、三硫杂环己烷基、氮杂环庚烷基、氧杂环庚烷基、硫杂环庚烷基、二氢呋喃基、咪唑啉基和二氢吡喃基。在一个实施方案中,杂环基为4元至7元单环杂环基(饱和或部分不饱和(即,非芳族))。在一个实施方案中,杂环基为5元至7元单环杂环基(饱和或部分不饱和)。
在一个实施方案中,杂环基是具有1-2个选自O、S和N的杂原子的4元至6元单环杂环基(饱和或部分不饱和)。4元至6元单环杂环的实例包括但不限于氮杂环丁烷基、吡咯烷基、四氢呋喃基、硫杂环戊烷基、咪唑烷基、吡唑烷基、噁唑烷基、异噁唑烷基、噻唑烷基、异噻唑烷基、二氧杂环戊烷基、二硫杂环戊烷基、氧硫杂环戊烷基、哌啶基、四氢吡喃基、硫杂环己烷基、哌嗪基、吗啉基、硫代吗啉基、二氧杂环己烷基、二噻烷基、二氢呋喃基、咪唑啉基、二氢吡喃基、吡咯基、呋喃基、噻吩基(thiophenyl/thienyl)、咪唑基、吡唑基、噁唑基、异噁唑基、噻唑基、异噻唑基、呋咱基、噁二唑基、噻二唑基、二噻唑基、三唑基、四唑基、吡啶基、吡喃基、硫代吡喃基、吡嗪基、嘧啶基、哒嗪基、噁嗪基、噻嗪基、二氧杂环己烯基、二硫杂环己二烯基(dithiinyl)、氧硫杂环己烷基、三嗪基和四嗪基。
在另一实施方案中,杂环基为4元至6元饱和单环杂环基。在一个实施方案中,4元至6元饱和单环杂环基含有1-2个独立地选自O、S和N的杂原子。饱和4元至6元单环杂环系统的实例包括但不限于氮杂环丁烷基、吡咯烷基、四氢呋喃基、硫杂环戊烷基、咪唑烷基、吡唑烷基、噁唑烷基、异噁唑烷基、噻唑烷基、异噻唑烷基、二氧杂环戊烷基、二硫杂环戊烷基、氧硫杂环戊烷基、哌啶基、四氢吡喃基、硫杂环己烷基、哌嗪基、吗啉基、硫代吗啉基、二氧杂环己烷基和二硫杂环己二烯基。在一个实施方案中,饱和4元至6元单环杂环基为氮杂环丁烷基、氧杂环丁烷基、吡咯烷基、四氢呋喃基、硫杂环戊烷基、咪唑烷基、吡唑烷基、噁唑烷基、异噁唑烷基、噻唑烷基、异噻唑烷基、二氧杂环戊烷基、二硫杂环戊烷基、氧硫杂环戊烷基、哌啶基、四氢吡喃基、硫杂环己烷基、哌嗪基、吗啉基、硫代吗啉基或二氧杂环己烯基。在另一实施方案中,饱和4元至6元单环杂环基为氮杂环丁烷基、吡咯烷基、哌啶基、氧杂环丁烷基、四氢呋喃基或四氢吡喃基。
在一个实施方案中,杂环基为7元至10元饱和或部分饱和双环(例如稠合、桥连或螺)杂环基。在一个实施方案中,7元至10元饱和或部分饱和双环杂环基为单环杂环与碳环或杂环稠合的稠合双环杂环基,其中所述环中的至少一者为非芳族的。7元至10元饱和或部分饱和稠合双环杂环基的实例包括但不限于2,3-二氢苯并呋喃基、吲哚啉基(或2,3-二氢吲哚基)、2,3-二氢苯并噻吩基、2,3-二氢苯并噻唑基、1,2,3,4-四氢喹啉基、1,2,3,4-四氢异喹啉基、5,6,7,8-四氢吡啶并[3,4-b]吡嗪基、1,3-二氢异苯并呋喃基和异色满基。在一个实施方案中,7元至10元饱和或部分饱和双环杂环基为螺双环杂环基,诸如氧杂螺[2.4]庚基、2,6-二氮杂螺[3.3]庚基、氧杂-6-氮杂螺[3.3]庚基、2,2,6-二氮杂螺[3.3]庚基、3-氮杂螺[5.5]十一烷基、3,9-二氮杂螺[5.5]十一烷基、7-氮杂螺[3.5]壬基、2,6-二氮杂螺[3.4]辛基、8-氮杂螺[4.5]癸基、1,6-二氮杂螺[3.3]庚基、5-氮杂螺[2.5]辛基、4,7-二氮杂螺[2.5]辛基、5-氧杂-2-氮杂螺[3.4]辛基、6-氧杂-1-氮杂螺[3.3]庚基、3-氮杂螺[5.5]十一烷基、3,9-二氮杂螺[5.5]十一烷基等。在一个实施方案中,7元至10元饱和或部分饱和双环杂环基为2-氮杂螺[3.3]庚-6-基。
如本文所用,“杂芳基(heteroaryl)”可与“杂芳族(heteroaromatic)”、“杂芳基环(heteroaryl ring)”、“杂芳基(heteroaryl group)”、“杂芳族环(heteroaromatic ring)”和“杂芳族基团(heteroaromatic group)”可互换地使用。它是指具有五至十四个选自碳和至少一个(通常1至4个,更通常1或2个)杂原子(例如氧、氮或硫)的环原子的芳族环系统。“杂芳基”包括单环和多环(例如双环),其中单环杂芳环与一个或多个其他芳族或杂芳族环稠合。优选地,杂芳基为5元至10元。
在一个实施方案中,杂芳基为“5元或6元单环杂芳基”,其意指具有五个或六个选自碳和至少一个(通常1至3个,更通常1或2个)杂原子(例如氧、氮或硫)的环原子的单环芳族环系统。5元或6元单环杂芳基的实例包括呋喃基(例如2-呋喃基、3-呋喃基)、咪唑基(例如N-咪唑基、2-咪唑基、4-咪唑基、5-咪唑基)、异噁唑基(例如3-异噁唑基、4-异噁唑基、5-异噁唑基)、噁二唑基(例如2-噁二唑基、5-噁二唑基)、噁唑基(例如2-噁唑基、4-噁唑基、5-噁唑基)、吡唑基(例如3-吡唑基、4-吡唑基)、吡咯基(例如1-吡咯基、2-吡咯基、3-吡咯基)、吡啶基(或吡啶基(pyridyl),例如2-吡啶基、3-吡啶基、4-吡啶基)、嘧啶基(例如2-嘧啶基、4-嘧啶基、5-嘧啶基)、哒嗪基(例如3-哒嗪基)、噻唑基(例如2-噻唑基、4-噻唑基、5-噻唑基)、异噻唑基、三唑基(例如2-三唑基、5-三唑基)、四唑基(例如四唑基)、噻吩基(例如2-噻吩基、3-噻吩基)、吡喃基、硫代吡喃基、吡嗪基、噁嗪基、噻嗪基、二氧杂环己烯基、二硫杂环己二烯基、氧硫杂环己烷基、三嗪基和四嗪基。优选地,5元或6元单环杂芳基为吡啶基、哒嗪基或吡嗪基。
在一个实施方案中,杂芳基为“9元或10元双环杂芳基”,它是指具有9或10个选自碳和至少一个(通常1至3个,更通常1或2个)杂原子(例如氧、氮或硫)的环原子的双环芳族环系统,其中单环杂芳族环与芳族或杂芳族环稠合。9元或10元双环杂芳基的实例包括但不限于氮杂吲哚基、苯并咪唑基、苯并呋喃基、苯并异噁唑基、苯并异噻唑基、苯并噻二唑基、苯并噻唑基、苯并噻吩基、苯并三唑基、苯并噁二唑基、苯并噁唑基、呋喃并吡啶基、咪唑并吡啶基、咪唑并嘧啶基、吲唑基、吲哚嗪基、吲哚基、异喹啉基、噁唑并吡啶基、嘌呤基、吡唑并嘧啶基、吡唑并吡嗪基、吡啶并吡嗪基、吡啶并嘧啶基、吡咯并[2,3]嘧啶基、吡咯并吡唑基、吡咯并咪唑基、吡咯并三唑基、喹唑啉基、喹喔啉基、喹啉基、异喹啉基、噻唑并吡啶基、噻吩并吡啶基、噻吩并嘧啶基、噻吩并吡嗪基、萘并吡啶基(napthyridyl)等。优选地,9元或10元双环杂芳基为吲哚基、吲唑基或苯并咪唑基。
如本文所用,术语“稠环系统”是具有两个环的环系统,所述环中每一者独立地选自碳环基或杂环基,其中两个环结构共用两个相邻环原子。在一个实施方案中,稠环系统具有9至12个环成员。
如本文所用,术语“桥接环系统”是具有碳环基环或杂环基环的环系统,其中环的两个非邻接原子通过一个或多个(优选一至三个)选自C、N、O和S的原子连接(桥接)。在一个实施方案中,桥接环系统具有6至12个环成员。
如本文所用,术语“螺环系统”是具有两个环的环系统,所述环中每一者独立地选自碳环基或杂环基,其中两个环结构具有共同的一个环原子。在一个实施方案中,螺环系统具有5至12个环成员。
杂环或杂芳基在可能的情况下经碳(碳键联)或氮(氮键联)连接。作为实例而非限制,碳键结的杂环或杂芳基在吡啶的位置2、3、4、5或6处,哒嗪的位置3、4、5或6处,嘧啶的位置2、4、5或6处,吡嗪的位置2、3、5或6处,呋喃、四氢呋喃、噻吩、吡咯或四氢吡咯的位置2、3、4或5处,噁唑、咪唑或噻唑的位置2、4或5处,异噁唑、吡唑或异噻唑的位置3、4或5处,氮丙啶的位置2或3处,氮杂环丁烷的位置2、3或4处,喹啉的位置2、3、4、5、6、7或8处或异喹啉的位置1、3、4、5、6、7或8处键结。
作为实例而非限制,氮键结的杂环或杂芳基亚杂芳基在氮丙啶、氮杂环丁烷、吡咯、吡咯烷、2-吡咯啉、3-吡咯啉、咪唑、咪唑烷、2-咪唑啉、3-咪唑啉、吡唑、吡唑啉、2-吡唑啉、3-吡唑啉、哌啶、哌嗪、吲哚、吲哚啉、1H-吲唑的位置1处,异吲哚或异吲哚啉的位置2处或吗啉的位置4处键结。
杂芳基或杂环基中所存在的杂原子可包括诸如NO、SO和SO2的氧化形式。
如本文所用,术语“卤素”或“卤基”是指F、Cl、Br或I。优选地,卤基为F、Cl或Br。
如果将基团描述为“任选地经取代”,那么所述基团可(1)未经取代,或(2)经取代。如果将基团中的碳描述为任选地经一系列取代基中的一者或多者取代,那么碳上的一个或多个氢原子(如果存在)可单独和/或共同地经独立选择的任选的取代基置换。如果基团经一个或多个取代基取代,那么它可经1、2、3、4、5、6个或更多个独立选择的取代基取代。在某些实施方案中,它可经1、2、3、4、5或6个独立选择的取代基取代。在某些实施方案中,它可经1、2或3个独立选择的取代基取代。
烷基、烯基、炔基、环烷基、碳环基、芳基、杂芳基和杂环基的适合取代基为并未显著不利地影响双官能化合物的生物活性的取代基。除非另外规定,否则这些基团的示例性取代基包括具有1至10个碳原子的直链、分支链或环状烷基、烯基或炔基,芳基,杂芳基,杂环基,卤素,胍[-NH(C=NH)NH2],-OR100,NR101R102,-NO2,-NR101COR102,-SR100,由-SOR101表示的亚砜,由-SO2R101表示的砜,磺酸根-SO3M,硫酸根-OSO3M,由-SO2NR101R102表示的磺酰胺,氰基,叠氮基,-COR101,-OCOR101,-OCONR101R102和聚乙二醇单元(-OCH2CH2)nR101,其中M为H或阳离子(诸如Na+或K+);R101、R102和R103各自独立地选自H,具有1至10个碳原子的直链、分支链或环状烷基、烯基或炔基,聚乙二醇单元(-OCH2CH2)n-R104(其中n为1至24的整数),具有6至10个碳原子的芳基,具有3至10个碳原子的杂环和具有5至10个碳原子的杂芳基;并且R104为H或具有1至4个碳原子的直链或分支链烷基,其中在由R100、R101、R102、R103和R104表示的基团中的烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基和杂环基任选地经一个或多个(例如2、3、4、5、6或更多个)独立地选自卤素、-OH、-CN、-NO2和具有1至4个碳原子的未经取代直链或分支链烷基的取代基取代。优选地,上文所描述的任选地经取代的烷基、亚烷基、亚环烷基、亚芳基和亚杂芳基的取代基选自由以下组成的组:卤素、-CN、-NR101R102、-CF3、-OR100、芳基、杂芳基、杂环基、-SR101、-SOR101、-SO2R101和-SO3M。或者,适合取代基选自由以下组成的组:-卤素、-OH、-NO2、-CN、C1-4烷基、-OR100、NR101R102、-NR101COR102、-SR100、-SO2R101、-SO2NR101R102、-COR101、-OCOR101和-OCONR101R102,其中R100、R101和R102各自独立地为-H或C1-4烷基。
如本文所用,除非另外相反地规定,否则“介于”x与y之间的整数包括整数x和y。举例说来,“介于1与5之间的整数”可为1、2、3、4或5。
如本文所用,术语“盐”是指本发明的双官能化合物的有机盐或无机盐。优选地,盐为药学上可接受的盐。其他非药学上可接受的盐还包括于本发明中。盐包括通过使包含碱基的本发明的双官能化合物与无机酸或有机酸(诸如羧酸)反应所形成的盐,和通过使包含酸基的本发明的双官能化合物与无机碱或有机碱(诸如胺)反应所形成的盐。示例性盐包括下文即将描述的那些药学上可接受的盐。
如本文所用,术语“药学上可接受的盐”是指本发明的双官能化合物的药学上可接受的有机盐或无机盐。示例性盐包括但不限于硫酸盐、柠檬酸盐、乙酸盐、草酸盐、氯化物、溴化物、碘化物、硝酸盐、硫酸氢盐、磷酸盐、酸式磷酸盐、异烟酸盐、乳酸盐、水杨酸盐、酸式柠檬酸盐、酒石酸盐、油酸盐、丹宁酸盐、泛酸盐、酒石酸氢盐、抗坏血酸盐、丁二酸盐、顺丁烯二酸盐、龙胆酸盐、反丁烯二酸盐、葡糖酸盐、葡萄糖醛酸盐、葡糖二酸盐、甲酸盐、苯甲酸盐、谷氨酸盐、甲烷磺酸盐(“甲磺酸盐”)、乙烷磺酸盐、苯磺酸盐、对甲苯磺酸盐、双羟萘酸盐(即,1,1'-亚甲基-双-(2-羟基-3-萘甲酸盐))、碱金属(例如钠和钾)盐、碱土金属(例如镁)盐和铵盐。药学上可接受的盐可涉及包括另一分子,诸如乙酸根离子、丁二酸根离子或其他抗衡离子。抗衡离子可为使母体化合物上的电荷稳定的任何有机或无机部分。此外,药学上可接受的盐在其结构中可具有超过一个带电原子。多个带电原子是药学上可接受的盐的一部分的情况可具有多个抗衡离子。因此,药学上可接受的盐可具有一个或多个带电原子和/或一个或多个抗衡离子。
如果本发明化合物含有一个或多个碱性部分,那么可通过本领域中可用的任何适合的方法制备所需盐(例如药学上可接受的盐),例如用无机酸(诸如盐酸、氢溴酸、硫酸、硝酸、甲烷磺酸、磷酸等)或有机酸(诸如乙酸、顺丁烯二酸、丁二酸、杏仁酸、反丁烯二酸、丙二酸、丙酮酸、草酸、乙醇酸、水杨酸、吡喃糖苷酸(诸如葡糖醛酸或半乳糖醛酸)、α羟基酸(诸如柠檬酸或酒石酸)、氨基酸(诸如天冬氨酸或谷氨酸)、芳族酸(诸如苯甲酸或肉桂酸)、磺酸(诸如对甲苯磺酸或乙烷磺酸)等)处理游离碱。
如果本发明化合物含有一个或多个酸性部分,那么可通过任何适合的方法制备所需盐(例如药学上可接受的盐),例如用无机碱(诸如碱金属氢氧化物或碱土金属氢氧化物)、有机碱(诸如胺(伯胺、仲胺或叔胺))等处理游离酸。适合盐的说明性实例包括但不限于由氨基酸(诸如甘氨酸和精氨酸)、氨、伯胺、仲胺和叔胺以及环胺(诸如哌啶、吗啉和哌嗪)衍生的有机盐,和由钠、钙、钾、镁、锰、铁、铜、锌、铝和锂衍生的无机盐。
措辞“药学上可接受”指示物质或组合物必须与构成制剂的其他成分和/或正用其治疗的哺乳动物化学上和/或毒理学上可相容。
术语“治疗(treat/treatment/treating)”是指逆转、缓解疾病或病症或其一种或多种症状、降低发展所述疾病或病症或其症状的可能性或抑制其进展。在一些实施方案中,治疗可在已出现一种或多种症状之后施用,即治疗性治疗。在一些实施方案中,治疗可在不存在症状的情况下施用。举例说来,治疗可在症状发作之前向易感受试者施用(例如,根据症状病史和/或根据基因或其他易感性因素),即预防性治疗。也可在症状已消退之后继续治疗,例如以预防或延缓其复发。
术语“有效量”是指足以进行特定陈述的目的(例如抑制Z11的活性)的活性化合物的量。
术语“治疗有效量”意指引发受试者中的所需生物反应的活性化合物的量,例如“治疗”受试者的疾病或病症。所述反应包括缓解所治疗的疾病或病症的症状;抑制或延迟疾病的症状或疾病本身复发;与不存在治疗相比的受试者的寿命增加;或预防、抑制或延迟疾病的症状或疾病本身进展。对治疗有效量的确定完全在所属领域的技术人员的能力范围内,尤其根据本文中所提供的详细公开内容来确定。本发明化合物的毒性和治疗功效可通过标准医药程序在细胞培养物和实验动物中确定。待向受试者施用的本发明化合物或其他治疗剂的治疗有效量将视疾病的阶段、类别和状态以及受试者的特征(诸如一般健康状况、年龄、性别、体重和药物耐受性)而定。待施用的本发明化合物或其他治疗剂的治疗有效量也将视施用途径和剂型而定。可个别地调节剂量和时间间隔以提供足以维持所需治疗效应的活性化合物的血浆含量。
示例性化合物
在第一方面,本发明涉及由式(I)或(I')表示的化合物或其药学上可接受的盐,其中上文针对式(I)或(I')描述变量。
在某些实施方案中,对于上文所描述的式(I)和(I')化合物,R4、R5、R9、R13、R14、R15、R16、R17和R18中的任两者一起形成-C1-5亚烷基-,所述-C1-5亚烷基-任选地经一个或多个独立地选自卤基和C1-6烷基的取代基取代。举例说来,R13和R15连同其所连接的碳原子可形成与含有变量V和X的环稠合的环烷基。在另一实施例中,R13和R9连同其所连接的碳原子和含有变量V和X的环形成桥连双环。
在第一实施方案中,本发明化合物由式(Ia)或(Ib)表示:
Figure BDA0003923073830000191
或其药学上可接受的盐,其中:
X为CR4R5、NR6或O;
Y为NR7或O;
Z为CR8或N;
R1为卤基、CN、-OR1a、-C≡CH或C1-6烷基,其中所述C1-6烷基任选地经一个或多个R10取代;
R1a为H或任选地经一个或多个R10取代的C1-6烷基;
R10在每次出现时独立地选自卤基、CN和OR10a
R10a在每次出现时独立地选自H和C1-6烷基;
R2为3元至12元碳环基或3元至12元杂环基,其中由R2表示的所述3元至12元碳环基和所述3元至12元杂环基任选地经一个或多个R20取代;
R20在每次出现时独立地选自H、卤基、CN、氧代、-C(O)R20a、-C(O)2R20a、-C(O)NR20a、-N(R20a)2、-N(R20a)C(O)R20a、-N(R20a)C(O)2R20a、-N(R20a)C(O)N(R20a)2、-N(R20a)S(O)2R20a、-OR20a、-OC(O)R20a、-OC(O)N(R20a)2、-SR20a、-S(O)2R20a、-S(O)N(R20a) 2、-S(O)2N(R20a)2、C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元单环杂环基,其中由R20表示的所述C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元单环杂环基各自任选地经一个或多个R25取代;
R20a在每次出现时独立地选自H、C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元单环杂环基,其中由R20a表示的所述C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元单环杂环基各自任选地经一个或多个R25取代,或两个R20a连同其所连接的氮原子一起形成任选地经一个或多个R25取代的4元至7元杂环基;
R25在每次出现时独立地为H、C1-6烷基、卤基、-N(R25a)2、-OR25a、任选地经C1-6烷基、卤基、-N(R25a)2或-OR25a取代的苯基;和
R25a为H或C1-6烷基;
R3为3元至12元碳环基或3元至12元杂环基,其中由R3表示的所述3元至12元碳环基和所述3元至12元杂环基任选地经一个或多个R30取代;
R30在每次出现时独立地选自H、卤基、氧代、-CN、-C(O)R30a、-C(O)2R30a、-C(O)NR30a、-N(R30a)2、-N(R30a)C(O)R30a、-N(R30a)C(O)2R30a、-N(R30a)C(O)N(R30a)2、-N(R30a)S(O)2R30a、-OR30a、-OC(O)R30a、-OC(O)N(R30a)2、-SR30a、-S(O)2R30a、-S(O)N(R30a) 2、-S(O)2N(R30a)2、C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元单环杂环基,其中由R30表示的所述C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元单环杂环基各自任选地经一个或多个R35取代;
R30a在每次出现时独立地选自H、C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元单环杂环基,其中由R30a表示的所述C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元单环杂环基各自任选地经一个或多个R35取代;
R35在每次出现时独立地为H、C1-6烷基、卤基和-OR35a;并且
R35a为H或C1-6烷基;
或者,当Y为NR7时,R7和R3连同R7所连接的N原子一起可形成任选地经一个或多个R30取代的4元至12元杂环基;
R4和R5各自独立地选自H、C1-6烷基、卤基、-CN和-OR4a,其中所述C1-6烷基任选地经一个或多个独立地选自卤基、CN和-OR4a的取代基取代;
R4a为H或任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基;
R6为H或任选地经一个或多个独立地选自卤基、CN和-OR6a的取代基取代的C1-6烷基;
R6a为H或任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基;
R7为H或任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基;
R8为H、卤基、CN、-OR8a或任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基;
R8a为H或任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基;
n1为0、1或2;并且
n2为0、1或2,
或对于式(I)或(Ia),R4、R5、R9、R13、R14、R15、R16、R17和R18中的任两者一起形成-C1-5亚烷基-,所述-C1-5亚烷基-任选地经一个或多个独立地选自卤基、-ORa、-N(Ra)2和C1-6烷基的取代基取代;其中Ra在每次出现时独立地为H或任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基。
在第二实施方案中,对于第一方面或第一实施方案中所描述的式(I)、(I')、(Ia)或(Ib)化合物或其药学上可接受的盐,X为CH2;并且其余变量如第一方面或第一实施方案中所定义。
在第三实施方案中,对于第一方面或第一或第二实施方案中所描述的式(I)、(I')、(Ia)或(Ib)化合物或其药学上可接受的盐,n1和n2均为0;n1和n2均为1;n1为0并且n2为1;或n1为1并且n2为0;并且其余变量如第一方面或第一或第二实施方案中所定义。
在第四实施方案中,对于第一方面或第一或第二实施方案中所描述的式(I)、(I')、(Ia)或(Ib)化合物或其药学上可接受的盐,X为O;并且n1和n2均为1;并且其余变量如第一方面或第一实施方案中所定义。
在第五实施方案中,本发明提供式(IIa)或(IIb)化合物:
Figure BDA0003923073830000221
或其药学上可接受的盐,其中变量如第一实施方案中对于式(Ia)或(Ib)所描述。
在第六实施方案中,式(IIa)或(IIb)化合物或其药学上可接受的盐分别由式(II-1a)或(II-1b)表示:
Figure BDA0003923073830000222
或其药学上可接受的盐,其中变量如第五实施方案中对于式(IIa)或(IIb)所定义。
在特定实施方案中,对于第五或第六实施方案中所描述的式(IIa)、(IIb)、(II-1a)或(II-1b)化合物或其药学上可接受的盐,Y为NH或O;并且变量如第五或第六实施方案中。
在第七实施方案中,本发明提供式(IIIa)或(IIIb)化合物:
Figure BDA0003923073830000231
或其药学上可接受的盐,其中变量如第一实施方案中对于式(Ia)或(Ib)所定义。
在第八实施方案中,式(IIIa)或(IIIb)化合物或其药学上可接受的盐分别由式(III-1a)或(III-1b)表示:
Figure BDA0003923073830000232
或其药学上可接受的盐,其中变量如第七实施方案中所定义。
在第九实施方案中,第七实施方案中所描述的式(IIIa)或(IIIb)化合物或其药学上可接受的盐由式(IVa)或(IVb)表示:
Figure BDA0003923073830000233
或其药学上可接受的盐,其中变量如第七实施方案中对于式(IIIa)或(IIIb)所定义。
在第十实施方案中,第九实施方案中所描述的式(IVa)或(IVb)化合物或其药学上可接受的盐由式(IV-1a)或(IV-1b)表示:
Figure BDA0003923073830000241
或其药学上可接受的盐,其中变量如第九实施方案中对于式(IVa)或(IVb)所定义。
在第十一实施方案中,对于本文所描述的化合物或药学上可接受的盐(例如,式(I)、(I')、(Ia)、(Ib)、(IIa)、(IIb)、(II-1a)、(II-1b)、(IIIa)、(IIIb)、(III-1a)、(III-1b)、(IVa)、(IVb)、(IV-1a)和(IV-1b)化合物或其药学上可接受的盐),R8为H、卤基或OR8a;并且其余变量如第一方面或第一、第二、第三、第四、第五、第六、第七、第八、第九或第十实施方案或本文中所描述的任何特定实施方案中所定义。
在第十二实施方案中,对于本文所描述的化合物或药学上可接受的盐(例如,式(I)、(I')、(Ia)、(Ib)、(IIa)、(IIb)、(II-1a)、(II-1b)、(IIIa)、(IIIb)、(III-1a)、(III-1b)、(IVa)、(IVb)、(IV-1a)和(IV-1b)化合物或其药学上可接受的盐),R8为H、F、Cl或-OCH3;并且其余变量如第一方面或第一、第二、第三、第四、第五、第六、第七、第八、第九或第十实施方案或本文中所描述的任何特定实施方案中所定义。在特定实施方案中,R8为H。
在第十三实施方案中,对于本文所描述的化合物或药学上可接受的盐(例如,式(I)、(I')、(Ia)、(Ib)、(IIa)、(IIb)、(II-1a)、(II-1b)、(IIIa)、(IIIb)、(III-1a)、(III-1b)、(IVa)、(IVb)、(IV-1a)和(IV-1b)化合物或其药学上可接受的盐),R1为F、Cl、Br、CN、-OR9或C1-6烷基;并且其余变量如第一方面或第一、第二、第三、第四、第五、第六、第七、第八、第九、第十、第十一或第十二实施方案或本文中所描述的任何特定实施方案中所定义。在特定实施方案中,R1为Cl、Br、CN、-OR9或C1-6烷基。在更特定实施方案中,R1为Cl、CN或CH3
在第十四实施方案中,本发明提供由下式表示的化合物:
Figure BDA0003923073830000251
/>
或其药学上可接受的盐,其中R8为H或F;并且其余变量如第一实施方案中所定义。
在第十五实施方案中,本发明提供由下式表示的化合物:
Figure BDA0003923073830000261
或其药学上可接受的盐,其中变量如第十四实施方案中所定义。
在第十六实施方案中,对于本文所描述的化合物或药学上可接受的盐(例如,式(I)、(I')、(Ia)、(Ib)、(IIa)、(IIb)、(II-1a)、(II-1b)、(IIIa)、(IIIb)、(III-1a)、(III-1b)、(IVa)、(IVb)、(IV-1a)、(IV-1b)、(IVAa)、(IVBa)、(IVCa)、(IVDa)、(IVAb)、(IVBb)、(IVCb)、(IVDb)、(IVA-1a)、(IVB-1a)、(IVC-1a)、(IVD-1a)、(IVA-1b)、(IVB-1b)、(IVC-1b)或(IVD-1b)化合物或其药学上可接受的盐),R3为苯基、5元或6元单环杂芳基或9元或10元双环杂芳基,其中由R3表示的苯基、5元或6元单环杂芳基和9元或10元双环杂芳基各自任选地经一至三个R30取代;并且其余变量如第一、第二、第三、第四、第五、第六、第七、第八、第九、第十、第十一、第十二、第十三、第十四或第十五实施方案或本文中所描述的任何特定实施方案中所定义。
在第十七实施方案中,对于本文所描述的化合物或药学上可接受的盐(例如,式(I)、(I')、(Ia)、(Ib)、(IIa)、(IIb)、(II-1a)、(II-1b)、(IIIa)、(IIIb)、(III-1a)、(III-1b)、(IVa)、(IVb)、(IV-1a)、(IV-1b)、(IVAa)、(IVBa)、(IVCa)、(IVDa)、(IVAb)、(IVBb)、(IVCb)、(IVDb)、(IVA-1a)、(IVB-1a)、(IVC-1a)、(IVD-1a)、(IVA-1b)、(IVB-1b)、(IVC-1b)或(IVD-1b))化合物或其药学上可接受的盐),R3为苯基、吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、哒嗪基、1H-吡咯并[2,3-c]吡啶基或1H-咪唑并[4,5-c]吡啶基,其中每一者任选地经一至三个R30取代;并且其余变量如第十六实施方案中所定义。
在第十八实施方案中,对于第十六或第十七实施方案中所描述的化合物或其药学上可接受的盐,R30在每次出现时为H、卤基、CN、-C(O)NR30a、-N(R30a)2、-N(R30a)C(O)R30a、-N(R30a)S(O)2R30a、-OR30a和C1-6烷基,其中所述C1-6烷基任选地经一至三个R35取代;
R30a在每次出现时独立地为H或任选地经一至三个R35取代的C1-6烷基;
R35在每次出现时独立地为H、卤基和-OR35a;并且
R35a为H或C1-3烷基;并且其余变量如第十六或第十七实施方案中所定义。
在特定实施方案中,对于第十八实施方案中所描述的化合物或其药学上可接受的盐,R30在每次出现时为H、卤基、CN、-OR30a和任选地经一至三个卤基取代的C1-6烷基;R30a为H或任选地经一至三个卤基取代的C1-6烷基;并且其余变量如第十八实施方案中所定义。
在另一特定实施方案中,对于第十八实施方案中所描述的化合物或其药学上可接受的盐,R30在每次出现时为H、F、Cl、Br、CN、-OCH3、-CH3、-CH2CH3或-CF3;并且其余变量如第十八实施方案中所定义。
在第十九实施方案中,对于本文所描述的化合物或药学上可接受的盐(例如,式(I)、(I')、(Ia)、(Ib)、(IIa)、(IIb)、(II-1a)、(II-1b)、(IIIa)、(IIIb)、(III-1a)、(III-1b)、(IVa)、(IVb)、(IV-1a)、(IV-1b)、(IVAa)、(IVBa)、(IVCa)、(IVDa)、(IVAb)、(IVBb)、(IVCb)、(IVDb)、(IVA-1a)、(IVB-1a)、(IVC-1a)、(IVD-1a)、(IVA-1b)、(IVB-1b)、(IVC-1b)或(IVD-1b)化合物或其药学上可接受的盐),R3选自3-氯吡啶-2-基、3-甲基吡啶-2-基、3-溴吡啶-2-基、3-氰基吡啶-2-基、3-乙基吡啶-2-基、3-氟吡啶-2-基、3-甲氧基吡啶-2-基、3-三氟甲基吡啶-2-基、吡啶-2-基、1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-5-基、1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-7-基、1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-6-基、1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-4-基、2,6-二甲基苯基、苯基、哒嗪-3-基(pyradzin-3-yl)、嘧啶-4-基、5-甲基吡啶-2-基、4-甲基吡啶-2-基、嘧啶-2-基、吡嗪-2-基、哒嗪-3-基和吡啶-3-基;并且其余变量如第一、第二、第三、第四、第五、第六、第七、第八、第九、第十、第十一、第十二、第十三、第十四或第十五实施方案或本文中所描述的任何特定实施方案中所定义。
在第二十实施方案中,本发明提供由式(Va)或(Vb)表示的化合物:
Figure BDA0003923073830000281
或其药学上可接受的盐,其中m为0、1或2;并且其余变量如第一方面或第一、第十一、第十二或第十三实施方案或其中所描述的任何特定实施方案中所定义。
在第二十一实施方案中,式(Va)或(Vb)化合物或其药学上可接受的盐由式(V-1a)或(V-1b)表示:
Figure BDA0003923073830000291
或其药学上可接受的盐,其中变量如第二十实施方案中所定义。
在第二十二实施方案中,式(Va)或(Vb)化合物或其药学上可接受的盐由式(VAa)、(VBa)、(VCa)、(VDa)、(VAb)、(VBb)、(VCb)或(VDb)表示:
Figure BDA0003923073830000301
或其药学上可接受的盐,其中变量如第二十实施方案中所定义。
在第二十三实施方案中,式(Va)或(Vb)化合物或其药学上可接受的盐由式(VA-1a)、(VB-1a)、(VC-1a)、(VD-1a)、(VA-1b)、(VB-1b)、(VC-1b)或(VD-1b)表示:
Figure BDA0003923073830000311
或其药学上可接受的盐,其中R8为H或F;并且其余变量如第二十实施方案中所定义。
在第二十四实施方案中,本发明提供式(VIa)或(VIb)化合物:
Figure BDA0003923073830000321
或其药学上可接受的盐,其中R30为H、卤基、CN、-OR30a和任选地经一至三个卤基取代的C1-6烷基;并且R30a为H或任选地经一至三个卤基取代的C1-6烷基;并且其余变量如第二十实施方案中所定义
在第二十五实施方案中,式(VIa)或(VIb)化合物或其药学上可接受的盐由式(VI-1a)或(VI-1b)表示:
Figure BDA0003923073830000322
或其药学上可接受的盐,其中变量如第二十四实施方案中所定义。
在第二十六实施方案中,式(VIa)或(VIb)化合物或其药学上可接受的盐由式(VIAa)、(VIBa)、(VICa)、(VIDa)、(VIAb)、(VIBb)、(VICb)或(VIDb)表示:
Figure BDA0003923073830000331
或其药学上可接受的盐,其中变量如第二十四实施方案中所定义。
在第二十七实施方案中,式(VIa)或(VIb)化合物或其药学上可接受的盐由式(VIA-1a)、(VIB-1a)、(VIC-1a)、(VID-1a)、(VIA-1b)、(VIB-1b)、(VIC-1b)或(VID-1b)表示:
Figure BDA0003923073830000341
或其药学上可接受的盐,其中变量如第二十四实施方案中所定义。
在第二十八实施方案中,对于式(Va)、(Vb)、(V-1a)、(V-1b)、(VAa)、(VAb)、(VBa)、(VBb)、(VCa)、(VCb)、(VDa)、(VDb)、(VA-1a)、(VA-1b)、(VB-1a)、(VB-1b)、(VC-1a)、(VC-1b)、(VID-1a)、(VID-1b)、(VIa)、(VIb)、(VI-1a)、(VI-1b)、(VIAa)、(VIAb)、(VIBa)、(VIBb)、(VICa)、(VICb)、(VIDa)、(VIDb)、(VIA-1a)、(VIA-1b)、(VIB-1a)、(VIB-1b)、(VIC-1a)、(VIC-1b)、(VID-1a)或(VID-1b)化合物或其药学上可接受的盐,R30在每次出现时独立地为H、F、Cl、Br、CN、-CH3、-CH2CH3、-OCH3或-CF3;并且其余变量如第二十、第二十一、第二十二、第二十三、第二十四、第二十五、第二十六或第二十七实施方案或本文中所描述的任何特定实施方案中所定义。
在第二十九实施方案中,对于本文所描述的化合物或药学上可接受的盐(例如式(I)、(I')、(Ia)、(Ib)、(IIa)、(IIb)、(II-1a)、(II-1b)、(IIIa)、(IIIb)、(III-1a)、(III-1b)、(IVa)、(IVb)、(IV-1a)、(IV-1b)、(IVAa)、(IVBa)、(IVCa)、(IVDa)、(IVAb)、(IVBb)、(IVCb)、(IVDb)、(IVA-1a)、(IVB-1a)、(IVC-1a)、(IVD-1a)、(IVA-1b)、(IVB-1b)、(IVC-1b)、(IVD-1b)、(Va)、(Vb)、(V-1a)、(V-1b)、(VAa)、(VAb)、(VBa)、(VBb)、(VCa)、(VCb)、(VDa)、(VDb)、(VA-1a)、(VA-1b)、(VB-1a)、(VB-1b)、(VC-1a)、(VC-1b)、(VID-1a)、(VID-1b)、(VIa)、(VIb)、(VI-1a)、(VI-1b)、(VIAa)、(VIAb)、(VIBa)、(VIBb)、(VICa)、(VICb)、(VIDa)、(VIDb)、(VIA-1a)、(VIA-1b)、(VIB-1a)、(VIB-1b)、(VIC-1a)、(VIC-1b)、(VID-1a)或(VID-1b)化合物或其药学上可接受的盐):
R2为C3-8环烷基、苯基、4元至6元饱和单环杂环基、7元至10元饱和或部分饱和双环杂环基、5元或6元单环杂芳基或9元至10元双环杂芳基,其中每一者任选地经一至三个R20取代;
R20在每次出现时独立地选自H、卤基、-CN、氧代、-C(O)R20a、-C(O)NR20a、-N(R20a)2、-N(R20a)C(O)R20a、-N(R20a)S(O)2R20a、-OR20a、C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元饱和单环杂环基,其中由R20表示的所述C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元饱和单环杂环基各自任选地经一或两个R25取代;
R20a在每次出现时独立地选自H和C1-6烷基,其中由R20a表示的所述C1-6烷基任选地经一个或多个R25取代;
R25在每次出现时独立地为H、C1-6烷基、卤基、-N(R25a)2、-OR25a、任选地经C1-6烷基、卤基、-N(R25a)2或-OR25a取代的苯基;并且
R25a为H或C1-6烷基;并且其余变量如上文在第一方面或第一、第二、第三、第四、第五、第六、第七、第八、第九、第十、第十一、第十二、第十三、第十四、第十五、第十六、第十七、第十八、第十九、第二十、第二十一、第二十二、第二十三、第二十四、第二十五、第二十六、第二十七或第二十八实施方案或本文中所描述的任何特定实施方案中所定义。
在第三十实施方案中,对于本文所描述的化合物或药学上可接受的盐(例如式(I)、(I')、(Ia)、(Ib)、(IIa)、(IIb)、(II-1a)、(II-1b)、(IIIa)、(IIIb)、(III-1a)、(III-1b)、(IVa)、(IVb)、(IV-1a)、(IV-1b)、(IVAa)、(IVBa)、(IVCa)、(IVDa)、(IVAb)、(IVBb)、(IVCb)、(IVDb)、(IVA-1a)、(IVB-1a)、(IVC-1a)、(IVD-1a)、(IVA-1b)、(IVB-1b)、(IVC-1b)、(IVD-1b)、(Va)、(Vb)、(V-1a)、(V-1b)、(VAa)、(VAb)、(VBa)、(VBb)、(VCa)、(VCb)、(VDa)、(VDb)、(VA-1a)、(VA-1b)、(VB-1a)、(VB-1b)、(VC-1a)、(VC-1b)、(VID-1a)、(VID-1b)、(VIa)、(VIb)、(VI-1a)、(VI-1b)、(VIAa)、(VIAb)、(VIBa)、(VIBb)、(VICa)、(VICb)、(VIDa)、(VIDb)、(VIA-1a)、(VIA-1b)、(VIB-1a)、(VIB-1b)、(VIC-1a)、(VIC-1b)、(VID-1a)或(VID-1b)化合物或其药学上可接受的盐),R2为苯基或含有1至3个氮原子的6元单环杂芳基,其中苯基和6元单环杂芳基各自任选地经一至三个R20取代;并且其余变量如第二十九实施方案中所定义。
在第三十一实施方案中,对于本文所描述的化合物或药学上可接受的盐(例如式(I)、(I')、(Ia)、(Ib)、(IIa)、(IIb)、(II-1a)、(II-1b)、(IIIa)、(IIIb)、(III-1a)、(III-1b)、(IVa)、(IVb)、(IV-1a)、(IV-1b)、(IVAa)、(IVBa)、(IVCa)、(IVDa)、(IVAb)、(IVBb)、(IVCb)、(IVDb)、(IVA-1a)、(IVB-1a)、(IVC-1a)、(IVD-1a)、(IVA-1b)、(IVB-1b)、(IVC-1b)、(IVD-1b)、(Va)、(Vb)、(V-1a)、(V-1b)、(VAa)、(VAb)、(VBa)、(VBb)、(VCa)、(VCb)、(VDa)、(VDb)、(VA-1a)、(VA-1b)、(VB-1a)、(VB-1b)、(VC-1a)、(VC-1b)、(VID-1a)、(VID-1b)、(VIa)、(VIb)、(VI-1a)、(VI-1b)、(VIAa)、(VIAb)、(VIBa)、(VIBb)、(VICa)、(VICb)、(VIDa)、(VIDb)、(VIA-1a)、(VIA-1b)、(VIB-1a)、(VIB-1b)、(VIC-1a)、(VIC-1b)、(VID-1a)或(VID-1b)化合物或其药学上可接受的盐),R2选自环丙基、环丁基、环戊基、环己基、苯基、氮杂环丁烷基、吡咯烷基、哌啶基、2-氮杂螺[3.3]庚基、1H-吲哚基、2,3-二氢-1H-苯并[d]咪唑基、1H-苯并[d]咪唑基、1,3,4-噻二唑基、吲哚啉基、四氢-2H-吡喃基、吡啶基、哒嗪基、吡嗪基、氧杂环丁烷基、四氢-2H-吡喃基、1H-苯并[d]咪唑基、1H-吲唑基、异色满基和1,3-二氢异苯并呋喃基,其中每一者任选地经一或两个R20取代;并且其余变量如第二十九实施方案中所定义。
在第三十二实施方案中,对于本文所描述的化合物或药学上可接受的盐(例如式(I)、(I')、(Ia)、(Ib)、(IIa)、(IIb)、(II-1a)、(II-1b)、(IIIa)、(IIIb)、(III-1a)、(III-1b)、(IVa)、(IVb)、(IV-1a)、(IV-1b)、(IVAa)、(IVBa)、(IVCa)、(IVDa)、(IVAb)、(IVBb)、(IVCb)、(IVDb)、(IVA-1a)、(IVB-1a)、(IVC-1a)、(IVD-1a)、(IVA-1b)、(IVB-1b)、(IVC-1b)、(IVD-1b)、(Va)、(Vb)、(V-1a)、(V-1b)、(VAa)、(VAb)、(VBa)、(VBb)、(VCa)、(VCb)、(VDa)、(VDb)、(VA-1a)、(VA-1b)、(VB-1a)、(VB-1b)、(VC-1a)、(VC-1b)、(VID-1a)、(VID-1b)、(VIa)、(VIb)、(VI-1a)、(VI-1b)、(VIAa)、(VIAb)、(VIBa)、(VIBb)、(VICa)、(VICb)、(VIDa)、(VIDb)、(VIA-1a)、(VIA-1b)、(VIB-1a)、(VIB-1b)、(VIC-1a)、(VIC-1b)、(VID-1a)或(VID-1b)化合物或其药学上可接受的盐),R2选自苯基、吡啶基和吡嗪基,其中每一者任选地经一或两个R20取代;并且其余变量如第二十九实施方案中所定义。
在第三十三实施方案中,对于本文所描述的化合物或药学上可接受的盐(例如式(I)、(I')、(Ia)、(Ib)、(IIa)、(IIb)、(II-1a)、(II-1b)、(IIIa)、(IIIb)、(III-1a)、(III-1b)、(IVa)、(IVb)、(IV-1a)、(IV-1b)、(IVAa)、(IVBa)、(IVCa)、(IVDa)、(IVAb)、(IVBb)、(IVCb)、(IVDb)、(IVA-1a)、(IVB-1a)、(IVC-1a)、(IVD-1a)、(IVA-1b)、(IVB-1b)、(IVC-1b)、(IVD-1b)、(Va)、(Vb)、(V-1a)、(V-1b)、(VAa)、(VAb)、(VBa)、(VBb)、(VCa)、(VCb)、(VDa)、(VDb)、(VA-1a)、(VA-1b)、(VB-1a)、(VB-1b)、(VC-1a)、(VC-1b)、(VID-1a)、(VID-1b)、(VIa)、(VIb)、(VI-1a)、(VI-1b)、(VIAa)、(VIAb)、(VIBa)、(VIBb)、(VICa)、(VICb)、(VIDa)、(VIDb)、(VIA-1a)、(VIA-1b)、(VIB-1a)、(VIB-1b)、(VIC-1a)、(VIC-1b)、(VID-1a)或(VID-1b)化合物或其药学上可接受的盐),R2由下式表示:
Figure BDA0003923073830000381
其中R21为H、卤基、-CN、-C(O)R20a、-C(O)NR20a、-N(R20a)2、-N(R20a)C(O)R20a、-N(R20a)S(O)2R20a、-OR21a、C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元饱和单环杂环基,其中由R21表示的所述C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元饱和单环杂环基各自任选地经一或两个R25取代;
R21a为H或C1-6烷基,其中由R21a表示的所述C1-6烷基任选地经一个或多个R25取代;
R25在每次出现时独立地为C1-6烷基、卤基、-N(R25a)2、-OR25a、任选地经C1-6烷基、卤基、-N(R25a)2或-OR25a取代的苯基;
R25a为H或C1-6烷基;并且
r为0、1或2;并且其余变量如第二十九实施方案中所定义。
在一个实施方案中,对于第三十三实施方案中所描述的化合物或药学上可接受的盐,R21a为任选地经一个或多个R25取代的C1-6烷基;并且其余变量如第三十三实施方案中所定义。
在另一实施方案中或第三十三实施方案中所描述的化合物或药学上可接受的盐中,R21为H、-F、-Cl、-CH3、-CH2OH、-OCH3、-OH、-OCH2CH2OCH3、-OCH2CH2OH、-OCH2CH2N(CH3)2、(4-甲氧基苯甲基)氧基、-NHCH2CH2OMe、-NHSO2CH3或-NHC(O)CH3;并且其余变量如第三十三实施方案中所定义。
在第三十四实施方案中,对于本文所描述的化合物或药学上可接受的盐(例如式(I)、(I')、(Ia)、(Ib)、(IIa)、(IIb)、(II-1a)、(II-1b)、(IIIa)、(IIIb)、(III-1a)、(III-1b)、(IVa)、(IVb)、(IV-1a)、(IV-1b)、(IVAa)、(IVBa)、(IVCa)、(IVDa)、(IVAb)、(IVBb)、(IVCb)、(IVDb)、(IVA-1a)、(IVB-1a)、(IVC-1a)、(IVD-1a)、(IVA-1b)、(IVB-1b)、(IVC-1b)、(IVD-1b)、(Va)、(Vb)、(V-1a)、(V-1b)、(VAa)、(VAb)、(VBa)、(VBb)、(VCa)、(VCb)、(VDa)、(VDb)、(VA-1a)、(VA-1b)、(VB-1a)、(VB-1b)、(VC-1a)、(VC-1b)、(VID-1a)、(VID-1b)、(VIa)、(VIb)、(VI-1a)、(VI-1b)、(VIAa)、(VIAb)、(VIBa)、(VIBb)、(VICa)、(VICb)、(VIDa)、(VIDb)、(VIA-1a)、(VIA-1b)、(VIB-1a)、(VIB-1b)、(VIC-1a)、(VIC-1b)、(VID-1a)或(VID-1b)化合物或其药学上可接受的盐),R20在每次出现时独立地选自-F、-OH、-Cl、-CH3、-CH2CH3、-CH2OH、-CH2OCH3、-CH2CH2OCH3、-CH2CH2OH、-CH2CH2N(CH3)2、-CF3、-OCH3、-OCH2CH2OCH3、-OCH2CH2OH、-OCH2CH2N(CH3)2、(4-甲氧基苯甲基)氧基、氧代、-C(O)CH3、-NH2、-NHCH3、-N(CH3)2、-N(CH3)(CH2CH2OCH3)、-NHCH2CH2OMe、-NHCH2CH2NHCH3、-NHCH2CH2N(CH3)2、-NHSO2CH3、-NHSO2CH2CH3、-NHC(O)CH3、氮杂环丁烷-基、3-氨基氮杂环丁烷-1-基、哌啶-1-基、吗啉基和吡咯烷-1-基;并且其余变量如第二十九、第三十、第三十一、第三十二或第三十三实施方案中所定义。
在第三十五实施方案中,本发明提供由式(VIIA-1a)、(VIIB-1a)、(VIIC-1a)、(VIID-1a)、(VIIA-1b)、(VIIB-1b)、(VIIC-1b)、(VIID-1b)表示的化合物:
Figure BDA0003923073830000401
或其药学上可接受的盐,其中:
R30为H、卤基、CN、-OR30a和任选地经一至三个卤基取代的C1-6烷基;并且R30a为H或任选地经一至三个卤基取代的C1-6烷基;
R2为苯基或含有1至3个氮原子的6元单环杂芳基,其中所述苯基和所述6元单环杂芳基各自任选地经一至三个R20取代;
R20在每次出现时独立地选自卤基和-N(R20a)2;并且
R20a在每次出现时独立地选自H和C1-3烷基,或两个R20a连同其所连接的氮原子一起形成任选地经一个或多个R25取代的4元至7元杂环基;
R25在每次出现时独立地为H、C1-6烷基、卤基、-N(R25a)2或-OR25a;和
R25a为H或C1-6烷基。
在第三十六实施方案中,对于式(VIIA-1a)、(VIIB-1a)、(VIIC-1a)、(VIID-1a)、(VIIA-1b)、(VIIB-1b)、(VIIC-1b)、(VIID-1b)化合物或其药学上可接受的盐,R30为卤基或C1-3烷基;R2为苯基、吡啶基或吡嗪基,其中每一者任选地经-N(R20a)2取代;R20a在每次出现时为H或甲基,或两个R20a连同其所连接的氮原子一起形成任选地经一个R25取代的4元至6元杂环基;R25为-N(R25a)2;并且R25a为H或Me;并且其余变量如第三十五实施方案中所定义。在特定实施方案中,R30为Cl或甲基;并且R2为苯基、吡啶-3-基或吡嗪-2-基,其中每一者任选地经-NH2、氮杂环丁烷-1-基、3-氨基氮杂环丁烷-1-基或3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基取代。
在第三十七实施方案中,对于第五至第三十六实施方案中的任一者中所描述的式(I)、(I')、(IIa)、(II-1a)、(IIIa)、(III-1a)、(IVa)、(IV-1a)、(IVAa)、(IVBa)、(IVCa)、(IVDa)、(IVA-1a)、(IVB-1a)、(IVC-1a)、(IVD-1a)、(Va)、(V-1a)、(VAa)、(VBa)、(VCa)、(VDa)、(VA-1a)、(VB-1a)、(VC-1a)、(VD-1a)、(VIa)、(VI-1a)、(VIAa)、(VIBa)、(VICa)、(VIDa)、(VIA-1a)、(VIB-1a)、(VIC-1a)、(VID-1a)、(VIIA-1a)、(VIIB-1a)、(VIIC-1a)或(VIID-1a)化合物或其药学上可接受的盐,R4、R5、R13、R14、R17和R18皆为H,并且R9为C1-6烷基或C3-6环烷基,其中C1-6烷基和C3-6环烷基各自任选地经一个或多个独立地选自卤基、CN、-OR9a和任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基的取代基取代;其中R9a为H或任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基;并且其余变量如第五至第三十六实施方案中所定义。在特定实施方案中,R9为任选地经一至三个卤基取代的C1-6烷基。在更特定实施方案中,R9为-CH3
在第三十八实施方案中,对于第五至第三十六实施方案中的任一者中所描述的式(I)、(I')、(Ia)、(IIa)、(II-1a)、(IIIa)、(III-1a)、(IVa)、(IV-1a)、(IVAa)、(IVBa)、(IVCa)、(IVDa)、(IVA-1a)、(IVB-1a)、(IVC-1a)、(IVD-1a)、(Va)、(V-1a)、(VAa)、(VBa)、(VCa)、(VDa)、(VA-1a)、(VB-1a)、(VC-1a)、(VD-1a)、(VIa)、(VI-1a)、(VIAa)、(VIBa)、(VICa)、(VIDa)、(VIA-1a)、(VIB-1a)、(VIC-1a)、(VID-1a)、(VIIA-1a)、(VIIB-1a)、(VIIC-1a)或(VIID-1a)化合物或其药学上可接受的盐,R5、R9、R13、R14、R17和R18皆为H,并且R4为C1-6烷基、卤基、-CN或-OR4a,其中C1-6烷基任选地经一个或多个独立地选自卤基、CN和-OR4a的取代基取代;并且R4a为H或任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基;并且其余变量如第五至第三十六实施方案中所定义。在特定实施方案中,R4为卤基。在更特定实施方案中,R4为F。
在第三十九实施方案中,对于第五至第三十六实施方案中的任一者中所描述的式(I)、(I')、(Ia)、(IIa)、(II-1a)、(IIIa)、(III-1a)、(IVa)、(IV-1a)、(IVAa)、(IVBa)、(IVCa)、(IVDa)、(IVA-1a)、(IVB-1a)、(IVC-1a)、(IVD-1a)、(Va)、(V-1a)、(VAa)、(VBa)、(VCa)、(VDa)、(VA-1a)、(VB-1a)、(VC-1a)、(VD-1a)、(VIa)、(VI-1a)、(VIAa)、(VIBa)、(VICa)、(VIDa)、(VIA-1a)、(VIB-1a)、(VIC-1a)、(VID-1a)、(VIIA-1a)、(VIIB-1a)、(VIIC-1a)或(VIID-1a)化合物或其药学上可接受的盐,R4、R5、R14、R17和R18皆为H,并且R13和R9一起形成-C1-3亚烷基-,所述-C1-3亚烷基-任选地经一个或多个独立地选自卤基、-ORa、-N(Ra)2和C1-6烷基的取代基取代;其中Ra在每次出现时独立地为H或任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基;并且其余变量如第五至第三十六实施方案中所定义。在特定实施方案中,R13和R9一起形成-CH2CH2-,其任选地经一或两个独立地选自卤基、-ORa、-N(Ra)2和C1-3烷基的取代基取代;其中Ra在每次出现时独立地为H或任选地经一个或多个卤基取代的C1-3烷基。在更特定实施方案中,R13和R9一起形成-CH2CH2-。
在第四十实施方案中,所述化合物由式(IV-1a)表示:
Figure BDA0003923073830000431
或其药学上可接受的盐,其中:
R1为F、Cl、CN或CH3;
R2选自环丙基、环丁基、环戊基、环己基、苯基、氮杂环丁烷基、吡咯烷基、哌啶基、2-氮杂螺[3.3]庚基、1H-吲哚基、2,3-二氢-1H-苯并[d]咪唑基、1H-苯并[d]咪唑基、1,3,4-噻二唑基、吲哚啉基、四氢-2H-吡喃基、吡啶基、嘧啶基、哒嗪基、吡嗪基、氧杂环丁烷基、四氢-2H-吡喃基、1H-苯并[d]咪唑基、1H-吲唑基、异色满基和1,3-二氢异苯并呋喃基,其中每一者任选地经一或两个R20取代;
R20在每次出现时独立地选自H、卤基、-CN、氧代、-C(O)R20a、-C(O)NR20a、-N(R20a)2、-N(R20a)C(O)R20a、-N(R20a)S(O)2R20a、-OR20a、C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元饱和单环杂环基,其中由R20表示的所述C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元饱和单环杂环基各自任选地经一或两个R25取代;
R20a在每次出现时独立地选自H和C1-6烷基,其中由R20a表示的所述C1-6烷基任选地经一个或多个R25取代;
R25在每次出现时独立地为H、C1-6烷基、卤基、-N(R25a)2、-OR25a、任选地经C1-6烷基、卤基、-N(R25a)2或-OR25a取代的苯基;并且
R25a为H、C1-6烷基或经-OCH3取代的C1-6烷基;
R3为苯基、吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、哒嗪基、1H-吡咯并[2,3-c]吡啶基、1H-咪唑并[4,5-c]吡啶基、1H-吡咯并[2,3-b]吡啶基、1H-咪唑并[4,5-b]吡啶基、1H-吡咯并[3,2-b]吡啶基、3H-咪唑并[4,5-b]吡啶基或1H-咪唑并[4,5-c]吡啶基,其中每一者任选地经一至三个R30取代;
R30在每次出现时为H、卤基、CN、-C(O)NR30a、-N(R30a)2、-N(R30a)C(O)R30a、-N(R30a)S(O)2R30a、-OR30a和C1-6烷基,其中所述C1-6烷基任选地经一至三个R35取代;
R30a在每次出现时独立地为H、任选地经一至三个R35取代的C1-6烷基或C3-6环烷基;
R35在每次出现时独立地为H、卤基和-OR35a;并且
R35a为H或C1-3烷基;
R4为H、卤基、CN、-OR4a、C1-6烷基、吡啶基或吡唑基,其中所述C1-6烷基任选地经一个或多个独立地选自卤基、CN和-OR4a的取代基取代;其中所述吡啶基或吡唑基任选地经-OH、-C1-C6烷基或-O-C1-C6烷基取代;并且
R4a为H、任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基或C3-C6环烷基;
R5为H或卤基,或R4和R5合起来为=NOH或=NHOCH3,或R4和R5与其所连接的碳合起来形成C3-C6环烷基,或R5和R13与其介入原子合起来形成环丙基;并且
R8、R13和R14各自为H;
R9为H、C1-C6烷氧基或C1-C6烷基,或R9与R13一起形成C1-3亚烷基-,所述C1-3亚烷基-任选地经一个或多个独立地选自卤基、ORa、N(Ra)2和C1-6烷基的取代基取代;其中Ra在每次出现时独立地为H或任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基;
R17为H、卤基或C1-6烷基;并且
R18为H、-OH、-O(C1-C6烷基)或C1-6烷基,或R17与R18合起来为=NOH或=NHOCH3
在第四十一实施方案中,所述化合物由式(IV-1a)表示:
Figure BDA0003923073830000451
或其药学上可接受的盐,其中:
R1为F、Cl、CN或CH3
R2选自环丙基、环丁基、环戊基、环己基、苯基、氮杂环丁烷基、吡咯烷基、哌啶基、2-氮杂螺[3.3]庚基、1H-吲哚基、2,3-二氢-1H-苯并[d]咪唑基、1H-苯并[d]咪唑基、1,3,4-噻二唑基、吲哚啉基、四氢-2H-吡喃基、吡啶基、嘧啶基、哒嗪基、吡嗪基、氧杂环丁烷基、四氢-2H-吡喃基、1H-苯并[d]咪唑基、1H-吲唑基、异色满基和1,3-二氢异苯并呋喃基,其中每一者任选地经一或两个R20取代;
R20在每次出现时独立地选自-F、-OH、-Cl、-CH3、-CH2CH3、-CH2OH、-CH2OCH3、-CH2CH2OCH3、-CH2CH2OH、-CH2CH2N(CH3)2、-CF3、-OCH3、-OCH2CH2OCH3、-OCH2CH2OH、-OCH2CH2N(CH3)2、(4-甲氧基苯甲基)氧基、氧代、-C(O)CH3、-NH2、-NHCH3、-N(CH3)2、-N(CH3)(CH2CH2OCH3)、-NHCH2CH2OMe、-NHCH2CH2NHCH3、-NHCH2CH2N(CH3)2、-NHSO2CH3、-NHSO2CH2CH3、-NHC(O)CH3、氮杂环丁烷-基、3-氨基氮杂环丁烷-1-基、哌啶-1-基、吗啉基、吡咯烷-1-基;和3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基或
Figure BDA0003923073830000452
/>
R3为苯基、吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、哒嗪基、1H-吡咯并[2,3-c]吡啶基、1H-吡咯并[3,2-c]吡啶基或1H-咪唑并[4,5-c]吡啶基、1H-咪唑并[4,5-c]吡啶基、1H-吡咯并[2,3-b]吡啶基、1H-咪唑并[4,5-b]吡啶基;1H-吡咯并[3,2-b]吡啶基或3H-咪唑并[4,5-b]吡啶基,其中每一者任选地经一至三个R30取代;
R30在每次出现时为H、F、Cl、Br、CN、-OCH3、-O(环丙基)、-NH2、-NH(CH3)2、-CH3、-CH2CH3或-CF3
R4为H、卤基、-CN、OR4a、C1-6烷基、吡啶基或吡唑基,其中所述C1-6烷基任选地经一个或多个独立地选自卤基、CN和-OR4a的取代基取代;其中所述吡啶基或吡唑基任选地经-OH、-CH3或-OCH3取代;并且
R4a为H、-CH3、环丙基或任选地经一个或多个卤基或环丙基取代的-CH2CH3
R5为H或F,或R4和R5合起来为=NHOCH3,或R4和R5与其所连接的碳合起来形成环丙基,或R5和R13与其介入原子合起来形成环丙基;并且
R8、R13和R14各自为H;
R9为H或-CH3,或R9和R13一起形成-C2亚烷基-;
R17为H、F或-CH3;并且
R18为H、-OH、-OCH3或-CH3,或R17与R18合起来为=NHOCH3
在第四十二实施方案中,所述化合物由式(IV-1a)表示:
Figure BDA0003923073830000461
或其药学上可接受的盐,其中:
R1为F或Cl;
R2选自吡啶基、嘧啶基和哒嗪基,其中每一者经R20取代;
R20在每次出现时独立地选自-NH2、-NHCH3、N(CH3)2和4元至7元饱和单环杂环基,其中由R20表示的所述4元至7元饱和单环杂环基经-N(R25a)2取代;
R25a为H、C1-6烷基或经-OCH3取代的C1-6烷基;
R3为吡啶基、1H-咪唑并[4,5-c]吡啶基、1H-吡咯并[2,3-b]吡啶基、1H-吡咯并[3,2-b]吡啶基、3H-咪唑并[4,5-b]吡啶基,其中每一者任选地经一至三个R30取代;
R30在每次出现时为H、卤基、C1-C6烷基、-N(R30a)2或-OR30a
R30a在每次出现时独立地为H、C1-6烷基或C3-6环烷基;
R4为H、卤基、-OR4a、C1-6烷基、吡啶基或吡唑基,其中所述吡啶基或吡唑基任选地经-OH、-C1-C6烷基或-O-(C1-C6烷基)取代;
R4a为H、C1-6烷基或C3-C6环烷基;
R5为H或卤基,或R4和R5合起来为=NOH或=NHOCH3,或R4和R5与其所连接的碳合起来形成C3-C6环烷基,或R5和R13与其介入原子合起来形成环丙基;和;
R8、R13和R14各自为H;
R9为H或C1-C6烷基;
R17为H、卤基、C1-C6烷氧基或C1-6烷基;
R18为H或C1-6烷基
在第四十三实施方案中,所述化合物由式(IV-1a)表示:
Figure BDA0003923073830000481
或其药学上可接受的盐,其中:
R1为F或Cl;
R2选自吡啶基、嘧啶基和哒嗪基,其中每一者经R20取代;
R20为-NH2、-NHCH3、N(CH3)2、3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基或
Figure BDA0003923073830000482
R3为吡啶基、1H-咪唑并[4,5-c]吡啶基、1H-吡咯并[2,3-b]吡啶基、1H-吡咯并[3,2-b]吡啶基或3H-咪唑并[4,5-b]吡啶基,其中每一者任选地经一至三个R30取代;
R30在每次出现时为H、Cl、CH3、-OCH3、-O(环丙基)、-NH2、-NHCH3或-N(CH3)2
R4为H、F、OH、-OCH3、-O-(环丙基)、-C1-C3烷基、吡啶基或吡唑基,其中所述吡啶基或吡唑基任选地经-OH、-CH3、-OCH3或-O(环丙基)取代;
R5为H或F,或R4和R5合起来为=NHOCH3,或R4和R5与其所连接的碳合起来形成环丙基,或R5和R13与其介入原子合起来形成环丙基;并且
R8、R13和R14各自为H;
R9为H或-CH3
R17为H、F、-OCH3或-CH3;并且
R18为H或-CH3
在一个实施方案中,本发明提供选自实施例部分(例如实施例1-1至1-43、实施例2-1至2-89和实施例3-1至3-116)中所描述的那些化合物的化合物,包括其药学上可接受的盐和中性形式。
如本文所描述的化合物或其药学上可接受的盐可在分子中含有一个或多个不对称中心。根据本发明,不指明立体化学的任何结构均应理解为包涵呈纯或大体上纯形式的所有各种立体异构体(例如,非对映异构体和对映异构体)以及其混合物(诸如外消旋混合物或对映异构性增浓混合物)。本领域中众所周知如何制备所述光学活性形式(例如通过再结晶技术解析外消旋形式、由光学活性起始材料合成、通过手性合成或使用手性固定相进行色谱分离)。
当通过名称或结构描绘化合物的特定立体异构体时,所述化合物的立体异构体纯度为至少20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、95%、97%、99%、99.5%或99.9%。“立体异构体纯度”意指所需立体异构体相对于所有立体异构体的组合重量的重量百分比。
当通过结构命名或描绘所公开化合物的立体化学,并且经命名或经描绘的结构涵盖多于一个立体异构体(例如,作为非对映异构对)时,应理解包括所涵盖立体异构体或所涵盖立体异构体的任何混合物中的一者。应进一步理解,经命名或经描绘的立体异构体的立体异构体纯度至少20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、95%、97%、99%、99.5%或99.9%。立体异构体纯度是所述名称或结构涵盖的所需立体异构体相对于所有立体异构体的组合重量的重量百分比。
当所公开化合物由不指示立体化学的结构命名或描绘,并且所述化合物具有一个或多个手性中心时,应理解,所述名称或结构涵盖呈纯或大体上纯形式的化合物的一种对映异构体以及其混合物(诸如所述化合物的外消旋混合物、一种对映异构体相对于其对应光学异构体增浓的混合物、立体异构体的混合物以及其中一种或多种立体异构体相对于其他立体异构体增浓的立体异构体的混合物)。
所公开化合物可以互变异构体形式和混合物存在并且涵盖单独的个别互变异构体。另外,一些化合物可展现多形现象。
药物组合物和施用方法
在第二方面,本文所公开的化合物和其药学上可接受的盐可配制为药物组合物或“制剂”。
典型制剂通过将本文所描述的化合物或其药学上可接受的盐与载体、稀释剂或赋形剂混合来制备。适合载体、稀释剂和赋形剂是所属领域的技术人员众所周知的。所使用的特定载体、稀释剂或赋形剂将视配制本文所描述的化合物的手段和目的而定。
制剂可使用常规溶解和混合程序来制备。
关于本发明的化合物、组合物或剂型的术语“施用(administer/administering/administration)”意指将化合物引入至受试者或需要治疗的患者的系统中。当以与一种或多种其他活性剂的组合提供本发明化合物时,“施用”和其变化形式各自理解为包括同时和/或依序引入化合物和其他活性剂。
视所治疗的疾病的严重程度和类型而定,本文所描述的组合物可全身性或局部施用,例如口服(包括但不限于固体剂型,包括硬或软胶囊(例如明胶胶囊)、片剂、丸剂、粉剂、舌下片剂、糖衣锭、口含剂和颗粒剂;和液体剂型,包括但不限于药学上可接受的乳液、微乳液、水性或油性溶液、悬浮液、糖浆和酏剂;通过吸入(例如利用气溶胶、气体、吸入器、喷雾器等);经耳(例如使用滴耳剂);经表面(例如使用乳膏、凝胶、吸入剂、擦剂、洗剂、软膏、贴片、糊剂、粉剂、溶液、喷雾剂、经皮贴片等);眼用(例如利用滴眼剂、眼用凝胶、眼用软膏);经直肠(例如使用灌肠剂或栓剂);经鼻;经颊;经阴道(例如使用冲洗剂、子宫内装置、阴道栓剂、阴道环或片剂等);经由滴耳剂;经由植入式贮器等;或肠胃外。如本文所用,术语“肠胃外”包括但不限于皮下、静脉内、肌肉内、关节内、滑膜内、胸骨内、鞘内、肝内、病灶内和颅内注射或输注技术。优选地,所述组合物是口服、腹膜内或静脉内施用。
另一方面,本文所描述的化合物或其药学上可接受的盐可在包含兽医用载体的兽医用组合物中配制。兽医用载体是适用于施用所述组合物的目的的材料并且可为固体、液体或以其他方式呈惰性的气态材料。在兽医学领域中并且与活性成份可相容。这些兽医用组合物可以肠胃外、口服或通过任何其他所需途径施用。
治疗方法
在第三方面,本发明还提供治疗受试者的疾病或病症的方法,其中所述疾病或病症是由Z11 TUTase介导。所述方法包括向受试者施用治疗有效量的本文所描述的化合物或组合物、其溶剂化物和其盐。
术语“疾病”或“病症”在本文中可互换地使用,是指对于患病的人或与人接触者,身体或某些器官的状态的任何改变、中断或干扰功能的性能和/或引起症状,诸如不适、功能障碍、痛苦或甚至死亡。疾病或病症也可与瘟(distemper)、生病(ailing)、病痛、沉痾(malady)、病症、恶心、疾病、不适、违和(indisposition)或病变(affection)相关。
术语“恶性肿瘤”和“癌症”在本文中可互换使用,是指特征在于细胞的不可控、异常生长的疾病。癌细胞可局部扩散或经由血流和淋巴系统扩散至身体的其他部分。术语“恶性肿瘤”或“癌症”在本文中可互换使用并且是指哺乳动物中的器官或组织的任何疾病,其特征在于所述组织中的正常或异常细胞的受控不良增殖或不受控增殖和其对整体身体的影响。在所述定义的范畴内的癌症疾病包含良性赘瘤、发育不良、增生以及显示转移性生长或任何其他转化的赘瘤,如通常在癌症爆发之前出现的白斑病。术语“肿瘤”或“肿瘤细胞”在本文中可互换使用,是指经历异常增殖的组织质量或组织类型的细胞。
“癌细胞”是指体内、离体和组织培养物中具有不必涉及新遗传物质的吸收的自发性或诱导性表型变化的癌性、癌前或转化细胞。尽管转化可由转化病毒的感染和新基因组核酸的并入或外源核酸的吸收引起,它也可自发地或在暴露于诱癌物之后产生,由此使内源性基因突变。转化/癌症在适合动物宿主(诸如裸小鼠)等中在体外、体内和离体与例如以下相关:形态变化、细胞的永生化、异常生长控制、病灶形成、锚定依赖性、增殖、恶性肿瘤、生长的接触抑制和密度限制、生长因子或血清依赖性、肿瘤特异性标记物含量、侵袭性、肿瘤生长或抑制。还参见Freshney,Culture Animal Cells:A Man.Basic Tech.(第3版,1994)。
如本文所用,术语“生物样品”可意指包含核酸的生物组织或体液样品。所述样品包括但不限于从动物分离的组织。生物样品也可包括组织切片(诸如活组织检查和尸检样品)、出于组织学目的获取的冷冻切片、血液、血浆、血清、痰液、粪便、泪液、粘液、毛发和皮肤。生物样品还包括源自患者组织的外植体以及初级和/或转化细胞培养物。生物样品可通过从动物取出细胞样品来提供,但也可通过使用先前分离的细胞(例如,在另一时间和/或出于另一目的由另一个人分离)或通过体内进行本发明的方法来实现。如本文所用,术语“生物样品”也指来自受试者的细胞或细胞群或一定量的组织或体液。“生物样品”也可指体内分析的细胞或组织,即未从受试者取出。术语“组织”意图包括完整细胞、血液、诸如血浆和血清的血液制剂、骨胳、关节、肌肉、平滑肌和器官。
术语“患者”、“受试者”和“个体”在本文中可互换地使用,并且是指接受治疗的动物,尤其人。如本文所用,术语“受试者”是指人和非人动物,诸如猿、猴、马、牛、绵羊、山羊、狗、猫、兔、天竺鼠、大鼠和小鼠。在一个实施方案中,受试者为人。
如本文所用,“参考水平”是指无本文所描述的疾病或病症(例如癌症)的生物样品中的蛋白质(例如Z11、Lin28A、Lin28B)水平或RNA水平(例如let 7miRNA)。在某些实施方案中,生物样品获自无癌症的健康受试者(例如健康人)。在某些实施方案中,生物样品由同一受试者(例如待治疗的患者)在受试者无癌症的早期时间获得。或者,生物样品是获自同一受试者(例如待治疗的患者)、优选属于与癌组织相同的组织类型的非癌组织。
在某些实施方案中,疾病或病症的特征在于与参考水平相比,Lin28A或Lin28B水平增加。在某些实施方案中,疾病或病症的特征在于与参考水平相比,let 7miRNA水平降低。在另一实施方案中,let 7miRNA水平的降低是由Z11 TUTase介导的。
在某些实施方案中,本发明的化合物或组合物可用于增加癌细胞中的let 7miRNA水平的方法中。
在某些实施方案中,本发明的化合物或组合物可用于治疗成人和/或儿科肿瘤学,包括固相肿瘤/恶性肿瘤;局部晚期肿瘤;人软组织肉瘤;转移性癌症,包括淋巴癌转移;血球恶性肿瘤,包括多发性骨髓瘤;急性和慢性白血病;淋巴瘤;头颈癌,包括口腔癌、喉癌和甲状腺癌;肺癌,包括小细胞癌和非小细胞癌;乳腺癌,包括小细胞癌和乳腺管癌;肠胃癌,包括食道癌、胃癌、结肠癌、大肠直肠癌和与结直肠瘤形成相关的息肉;胰腺癌;肝癌;泌尿道癌,包括膀胱癌和前列腺癌;雌性生殖道的恶性肿瘤,包括卵巢癌、子宫(包括子宫内膜)癌和卵巢囊中的实体肿瘤;肾脏癌,包括肾细胞癌;脑癌,包括内源性脑瘤、神经母细胞瘤、星形细胞脑瘤、神经胶质瘤、中枢神经系统中的转移性肿瘤细胞侵袭;骨骼癌,包括骨瘤;皮肤癌,包括恶性黑素瘤、人皮肤角质细胞的肿瘤进展、鳞状细胞癌、基底细胞癌、血管外皮瘤和卡波西氏肉瘤。
在某些实施方案中,本文所描述的化合物或组合物可用于治疗癌症。癌症包括但不限于胆道癌;膀胱癌;乳腺癌;脑癌,包括神经胶母细胞瘤和神经管胚细胞瘤;子宫颈癌;绒膜癌;结肠癌,包括大肠直肠癌;子宫内膜癌;食道癌;胃癌;头颈癌;血液肿瘤,包括急性淋巴球性和骨髓性白血病、多发性骨髓瘤、AIDS相关的白血病和成人T细胞白血病淋巴瘤;上皮内肿瘤,包括鲍温病(Bowen's disease)和佩吉特氏病(Paget's disease);肝癌;肺癌,包括小细胞肺癌和非小细胞肺癌;淋巴瘤,包括霍奇金氏病(Hodgkin's disease)和淋巴球性淋巴瘤;神经母细胞瘤;口腔癌,包括鳞状细胞癌;骨肉瘤;卵巢癌,包括由上皮细胞、基质细胞、生殖细胞和间叶细胞引起的卵巢癌;胰腺癌;前列腺癌;直肠癌;肉瘤,包括平滑肌肉瘤、横纹肌肉瘤、脂肪肉瘤、纤维肉瘤、滑膜肉瘤和骨肉瘤;皮肤癌,包括黑素瘤、卡波西氏肉瘤、基底细胞癌和鳞状细胞癌;睾丸癌,包括胚胎肿瘤,诸如精原细胞瘤、非精原细胞瘤(畸胎瘤、绒膜癌)、基质肿瘤和生殖细胞肿瘤;甲状腺癌,包括甲状腺腺癌和髓质癌;过渡性癌症和肾癌,包括腺癌和威尔姆斯肿瘤(Wilms's tumor)。在某些实施方案中,癌症为乳腺癌、前列腺癌、肺癌、卵巢癌、大肠直肠癌或脑癌。在一些实施方案中,癌细胞为转移性的。在一些实施方案中,癌症不表达LIN28A/B。
在某些实施方案中,本发明的化合物或组合物可用于治疗乳腺癌。在某些实施方案中,本发明的化合物或组合物可用于治疗肺癌、肝癌或白血病,例如但不限于肺癌、慢性骨髓性白血病(CML)和HCC(肝细胞癌)。
在某些实施方案中,本文所描述的化合物或组合物适用于向具有癌症消退的受试者施用。在某些实施方案中,本文所描述的化合物或组合物适用于向患有抗疗法癌症,例如抗化学疗法癌症的受试者施用。在一些实施方案中,本文所描述的化合物或组合物适用于向患有癌症并且已暴露于辅助癌症疗法的受试者施用。
在一些实施方案中,本文所描述的化合物或组合物适用于向患有恶性癌症的受试者施用。在一些实施方案中,本文所描述的化合物或组合物也适用于向患有包含癌症干细胞的癌症或肿瘤的受试者施用并且用于治疗所述受试者。
在一些实施方案中,本文所描述的化合物或组合物也适用于治疗与干细胞的异常细胞增殖或分化相关的其他疾病或病症。因此,治疗可针对患有癌症的受感染但无症状的受试者,例如受试者的器官或组织疾病,其特征在于所述组织中的正常或异常细胞的受控不良增殖或不受控增殖和其对身体整体的影响。可由本文所描述的化合物或组合物治疗的癌症疾病包括例如但不限于良性赘瘤、发育不良、增生以及显示转移性生长或任何其他转化的赘瘤,例如通常在癌症爆发之前出现的白斑病。
在一些实施方案中,本文所描述的化合物或组合物可用于治疗炎症性病症,诸如哮喘(Kumar,M.,Ahmad,T.,Sharma,A.等人Let-7microRNA-mediated regulation of IL-13and allergic airway inflammation.J.Allergy Clin.Immunol.128(5),1077-1085(2011))、慢性阻塞性肺病(COPD)(Van Pottelberge,G.R.,Mestdagh,P.,Bracke,K.R.等人MicroRNA Expression in Induced Sputum of Smokers and Patients with ChronicObstructive Pulmonary Disease.Am.J.Respir.Crit.Care Med.183,898-906,(2010);Conickx,G.,Cogos,F.A.,van den Berge,M.等人Sci Rep 7,12871(2017))、子宫内膜异位症(Sahin,C.,Mamillapalli,R.,Yi,K.W.和Taylor,H.S.microRNA Let-7b:A Noveltreatment for endometriosis.J Cell Mol Med.22,5346-5353(2018))等。
在一些实施方案中,本文所描述的化合物或组合物可用于治疗动脉粥样硬化,诸如糖尿病相关的动脉粥样硬化(Brennan,E.,Wang,Bo.,McClelland,A.等人ProtectiveEffect of let-7 miRNA Family in Regulating Inflammation in Diabetes-Associated Atherosclerosis.Diabetes 66,2266-2277(2017))。
在一些实施方案中,本文所描述的化合物或组合物可用于治疗肝病(McDaniel,K.,Hall,C.,Sato,K.等人Lin28 and let-7:roles and regulation in liverdiseases.Am J Physiol Gastrointes Liver Physiol.310(10),G757(2016))。肝病的实例包括但不限于肝纤维化(Matsuura K.,De Giorgi,V.,Schechterly,C.等人Circulatinglet-7levels in plasma and extracellular vesicles correlate with hepaticfibrosis progression in chronic hepatitis C.Hepatology 64(3),732-745(2016);Matsuura K.,Aizawa,N.,Enomoto,H.等人Circulating let-7Levels in SerumCorrelate With the Severity of Hepatic Fibrosis in Chronic Heptatis C.OpenForum Infectious Diseases 5,11(2018);Zhang,Y.,Guo,J.,Li,Y.等人let-7asuppresses liver fibrosis via TGFβ/SMAD signaling transductionpathway.Experimental and Therapeutic Medicine 17,3935-3942(2019))、肝炎、酒精性肝病(ALD)(McDanile K.,Huang L.,Sato,K.等人The let-7/Lin28 axis regulatesactivation of hepatic stellate cells in alcoholic liverinjury.J.Biol.Chem.292(27),11336-11347(2017))、非酒精性脂肪肝病(NAFLD)、肝细胞癌(HCC)、胆病(例如原发性胆汁性肝硬化(PBC)和原发性硬化性胆管炎(PSC))、多囊性肝病(PCLD)等。
在一些实施方案中,本文所描述的化合物或组合物可用于治疗肾病,诸如肾纤维化(Wang,B.,Ja,J.C.,Hagiwara,S.等人Transforming growth factor-β1-mediatedrenal fibrosis is dependent on the regulation of transforming growth factorreceptor 1expression by let-7b.Kidney International,85,352-361(2014);Nagai,T.,Kanasaki,M.,Srivastava,S.P.等人N-acetyl-seryl-aspartyl-lysyl-prolineInhibits Diabetes-Associated Kidney Fibrosis and Endothelial-MesenchymalTransition.BioMed Research International,2014,696475(2014);Brenna,E.P.,Nolan,K.A.,Borgeson,E.等人Lipoxins Attenuate Renal Fibrosis by Inducing let-7c andSuppressing TGFβR1.J Am Soc Nephrol 24,627-637(2013))、糖尿病肾病变(Bhatt,K.,Kato,Mi.和Natarajan,R.Mini-review:emerging roles of microRNAs in thepathophysiology of renal diseases.Am J Physiol Renal Physiol 310,F109-F118(2016);Park,J.T.,Kato,M.,Lating,L.等人Repression of let-7by transforminggrowth factor-β1-induced Lin28 upregulates collagen expression in glomerularmesangial cells under diabetic conditions.Am J Physiol Renal Physiol,307,F1390-F1403(2014))、慢性肾病(CKD)(Lv,W.,Fan,F.,Wang,Y.等人Therapeuticpotential of microRNAs for the treatment of renal fibrosis and CKD.PhysiolGenomics.50(1),20-34(2018))、糖尿病性肾病(DKD)(Kato,M.Noncoding RNAs astherapeutic targets in early stage diabetic kidney disease.Kidney Res ClinPract 37,197-200(2018))。
在一些实施方案中,本文所描述的化合物或组合物可用于治疗全身性硬皮病(SSc)(参见例如Makino,K.,Jinnin,M.,Hirano,A.等人The Downregulation of microRNAlet-7a Contributes to the Excessive Expression of Type I Collagen in Systemicand Localized Scleroderma.J Immunol 190,3905-3915(2013))。在一些实施方案中,本文所描述的化合物或组合物可用于治疗患有全身性硬皮病(SSc)的患者的肺高血压(Izumiya,Y.,Jinnn,M.,Kimura,Y.等人Expression of Let-7family microRNAs in skincorrelates negatively with severity of pulmonary hypertension in patientswith systemic scleroderma.IJC Heart&Vasculature 8,98-102(2015))。
在一些实施方案中,本文所描述的化合物或组合物可用于治疗肺纤维化(Huleihel,L.,Ben-Yehudah,A.,Milosevic,J.等人Let-7d microRNA affectsmesenchymal phenotypic properties of lung fibroblasts.Am J Physiol Lung CellMol Physiol 306,L534-542(2014)),诸如特发性肺纤维化(IPF)(Liang,H.,Liu,S.,Chen,Y.等人miR-26a suppresses EMT by disrupting the Lin28B/let-7d axis:potentialcross-talks among miRNAs in IPF.J.Mol.Med.94,655-665(2016);Pandit,K.V.,Corcoran,D.,Yousef,H.等人Inhibition and Role of Let-7d in IdiopathicPulmonary Fibrosis.Am J respire Crit Care Med 182,220-229(2010))。
在一些实施方案中,本文所描述的化合物或组合物可用于治疗多发性硬化(Angelou,C.C.,Wells,A.C.,Vijayaraghavan,J.等人Differentiation of PathogenicTh17 Cells Is Negative Regulated by Let-7 MicroRNAs in a Mouse Model ofMultiple Sclerosis.Front.Immunol.10,3125(2019);Kimura,K.,Hohjoh,H.,Fukuoka,M.等人Circulating exosomes suppress the induction of regulatory T cells vialet-7i in multiple sclerosis.Nature Communications 9,17(2018))。
在一些实施方案中,本文所描述的化合物或组合物可用于预防有需要的受试者的骨质流失和/或刺激骨伤复原。在某些实施方案中,本文所描述的化合物或组合物可用于加速骨折愈合,包括大型骨质缺陷的骨再生,预防和/或治疗骨关节炎和其他与骨病有关的疾患(例如,炎症诱发的与衰老和类风湿性关节炎有关的骨质流失),预防和/或治疗成骨不全和骨质软化,脊柱融合以及下颌骨、上颌骨和颅骨的颅面重建(Ansari,M.Y.,Khan,N.M.,Ahmad,N.等人Genetic Inactivation of ZCCHC6 Suppresses Interleukin-6Expression and Reduces the Severity of Experimental Osteoarthritis inMice.Arthritis&Rheumatology 71(4),第583-593页(2019);US2019/0101533;US2019/0101533;WO 2017/156557;和WO 2018/005608)。
在一些实施方案中,本文所描述的化合物或组合物可用于治疗IL-6介导的疾病,例如US756011、US2012/0253016和WO 92/19759中所描述的疾病,其皆以引用的方式并入本文中。IL-6介导的疾病的实例包括但不限于类风湿性关节炎、青少年特发性关节炎、全身型青少年特发性关节炎、卡索氏病(Castleman's disease)、全身性红斑狼疮(SLE)、狼疮性肾炎、克罗恩氏病(Crohn's disease)、淋巴瘤、溃疡性结肠炎、贫血、脉管炎、川崎病(Kawasaki disease)、史迪尔氏病(Still's disease)、淀粉样变性、多发性硬化、移殖、年龄相关性黄斑变性、关节粘连性脊椎炎、牛皮癣、牛皮癣性关节炎、慢性阻塞性肺病(COPD)、IgA肾病、骨关节炎、哮喘、糖尿病肾病变、GVHD、子宫内膜异位症、肝炎(NASH)、心肌梗塞、动脉硬化、败血症、骨质疏松、糖尿病、多发性骨髓瘤、前列腺癌、肾癌、B细胞非霍奇金氏淋巴瘤(B-cell non-Hodgkin's lymphoma)、胰腺癌、肺癌、食道癌、结肠癌、癌症恶病质、癌症神经侵袭、心肌梗塞、近视脉络膜新生血管、特发性脉络膜新生血管、葡萄膜炎、慢性甲状腺炎、迟发型过敏、接触性皮炎、异位性皮炎、间皮瘤、多发性肌炎、皮肌炎、全葡萄膜炎、前葡萄膜炎、中间葡萄膜炎、巩膜炎、角膜炎、眼眶炎症、视神经炎、糖尿病视网膜病变、增生性玻璃体视网膜病变、干眼和术后炎症。
在一些实施方案中,IL-6介导的疾病是选自以下的IL-6介导的免疫相关疾病:类风湿性关节炎、青少年类风湿性关节炎、全身发作的青少年类风湿性关节炎、牛皮癣性关节炎、僵直性脊椎炎、胃溃烂、血清阴性关节病、骨关节炎、骨质溶解、矫形外科植入物的无菌性松动、炎症性肠病、溃疡性结肠炎、全身性红斑性狼疮症、皮肤红斑性狼疮、狼疮性肾炎、抗磷脂综合征、虹膜睫状体炎/葡萄膜炎/视神经炎、特发性肺纤维化、全身性脉管炎/韦格纳氏肉芽肿病(wegener's granulomatosis)、类肉瘤病、睾丸炎/输精管切除恢复程序、过敏性/异位性疾病、哮喘、过敏性鼻炎、湿疹、过敏性接触性皮炎、过敏性结膜炎、过敏性肺炎、移植、器官移植排斥、移植物抗宿主病、全身性炎症反应综合征、败血症综合征、革兰氏阳性败血症、革兰氏阴性败血症、培养阴性的败血症、真菌败血症、嗜中性粒细胞减少性发热、尿路性败血症、脑膜炎球菌血症、外伤/出血、灼痛、电离辐射曝露、急性胰腺炎、成人呼吸窘迫综合征、类风湿性关节炎、酒精诱发的肝炎、慢性炎性病变、类肉瘤病、克罗恩氏病变(Crohn's pathology)、镰状细胞贫血、糖尿病、肾病变、异位性疾病、过敏反应、过敏性鼻炎、花粉热、常年性鼻炎、结膜炎、子宫内膜异位症、哮喘、风疹、全身性过敏性反应、皮炎、恶性贫血、溶血性疾病、血小板减少、任何器官或组织的移植排斥、肾脏移植排斥、心脏移植排斥、肝脏移植排斥、胰腺移植排斥、肺部移植排斥、骨髓移植(BMT)排斥、皮肤同种异体移植排斥、软骨移植排斥、移植骨排斥、小肠移植排斥、胎儿胸腺植入排斥、副甲状腺移植排斥、任何器官或组织的异种移植排斥、同种异体移植排斥、抗受体过敏反应、格雷夫斯病(Graves disease)、雷诺氏病(Raynaud's disease)、抗B型胰岛素糖尿病、哮喘、重症肌无力、抗体介导的细胞毒性、III型过敏反应、POEMS综合征(多发性神经病变、器官巨大、内分泌病变,单克隆免疫球蛋白增生病和皮肤变化综合征)、多发性神经病变、器官巨大、内分泌病变、单克隆免疫球蛋白增生病、皮肤变化综合征、抗磷脂综合征、天疱疮、硬皮病、混合型结缔组织病、特发性艾迪森氏病(idiopathic Addison's disease)、糖尿病、慢性活性肝炎、原发性胆汁性肝硬化症、白斑病、脉管炎、MI后心切开术综合征、IV型过敏、接触性皮炎、过敏性肺炎、同种异体移植排斥、由细胞内生物所致的肉芽肿、药物过敏、代谢/特发性、威尔森氏病(Wilson's disease)、血色沉着病、α-1-抗胰蛋白酶缺陷、糖尿病视网膜病变、桥本氏甲状腺炎(hashimoto's thyroiditis)、骨质疏松、下丘脑-垂体-肾上腺轴评估、原发性胆汁性肝硬化、甲状腺炎、脑脊髓炎、恶病质、囊肿纤维化、新生慢性肺病、慢性阻塞性肺病(COPD)、家族性噬血淋巴组织细胞瘤病、皮肤病疾患、牛皮癣、秃发、肾病综合征、肾炎、肾小球肾炎、急性肾衰竭、血液透析、尿毒症、毒性和子痫前症。
在一些实施方案中,IL介导的疾病为心血管疾病,诸如心肌顿抑综合征、心肌梗塞、充血性心力衰竭、中风、缺血性中风、出血、急性冠状动脉综合征、动脉硬化、动脉粥样硬化、再狭窄、糖尿病动脉硬化病、高血压、动脉性高血压、肾血管性高血压、晕厥、休克、心血管系统的梅毒、心力衰竭、肺原性心脏病、原发性肺高血压、心律不整、心房异位跳动、心房颤动、心房微颤(持续性或阵发性)、灌注后综合征、心肺绕道炎症反应、混乱或多焦点心房心动过速、规则性窄QRS心动过速、特异性心律失常、心室纤颤、His束心律失常、房室传导阻滞、束支传导阻滞、心肌缺血性病症、冠状动脉疾病、心绞痛、心肌梗塞、心肌病变、扩张充血性心肌病变、限制型心肌病变、瓣膜心脏疾病、心内膜炎、心包病、心脏肿瘤、主动脉和外周动脉瘤、主动脉剥离、主动脉炎症、腹主动脉和其分支的闭塞、外周血管病症、闭塞性动脉病症、外周动脉粥样硬化病、血栓闭塞性脉管炎(thromboangitis obliterans)、功能性外周动脉病症、雷诺氏现象和疾病(Raynaud's phenomenon and disease)、手足发绀、红斑性肢痛、静脉疾病、静脉血栓、静脉曲张、动静脉瘘、淋巴性水肿、脂肪水肿、不稳定性心绞痛、再灌注损伤、泵后综合征(post pump syndrome)、局部缺血-再灌注损伤等。
在一些实施方案中,IL介导的疾病为传染病,诸如急性或慢性细菌感染、急性和慢性寄生性或感染性过程,包括细菌性、病毒性和真菌性感染、HIV感染/HIV神经病变、脑膜炎、肝炎(例如,A、B或C等)、败血性关节炎、腹膜炎、肺炎、会厌炎、大肠杆菌O157:h7型、溶血性尿毒综合征/溶栓剂血小板减少性紫癫、疟疾、出血性登革热、利什曼体病、麻风、中毒性休克综合征、链球菌肌炎、气性坏疽、结核分支杆菌、胞内鸟分枝杆菌、卡氏肺囊虫肺炎(pneumocystis carinii pneumonia)、骨盆炎症性疾病、睾丸炎/副睾炎、退伍军人杆菌(legionella)、莱姆病(lyme disease)、A型流感、埃-巴二氏病毒(epstein-barr virus)、病毒相关的嗜血综合征、病毒脑炎/无菌脑膜炎等。
在一些实施方案中,IL介导的疾病为恶性疾病,诸如白血病、急性白血病、急性淋巴母细胞白血病(ALL)、急性淋巴球性白血病、B细胞、T细胞或FAB ALL、急性髓性白血病(AML)、急性骨髓性白血病、铬骨髓细胞性白血病(CML)、慢性淋巴球性白血病(CLL)、毛细胞白血病、骨髓增生异常综合征(MDS)、淋巴瘤、霍奇金氏疾病(Hodgkin's disease)、恶性淋巴瘤、非霍奇金氏淋巴瘤(non-Hodgkin's lymphoma)、伯克特氏淋巴瘤(Burkett'slymphoma)、多发性骨髓瘤、卡波西氏肉瘤、大肠直肠癌、胰腺癌、鼻咽癌、恶性组织细胞增多症、肿瘤形成征兆综合征/恶性血钙过多、实体肿瘤、膀胱癌、乳腺癌、大肠直肠癌、子宫内膜癌、头癌、颈癌、遗传性非息肉性癌症、霍奇金氏淋巴瘤、肝癌、肺癌、非小细胞肺癌、卵巢癌、胰腺癌、前列腺癌、肾细胞癌、睾丸癌、腺癌、肉瘤、恶性黑素瘤、血管瘤、转移性疾病、癌症相关的骨胳再吸收、癌症相关的骨痛等。
在一些实施方案中,IL介导的疾病为神经性疾病,诸如神经退化性疾病、多发性硬化、偏头痛、AIDS痴呆综合征、脱髓鞘疾病,诸如多发性硬化和急性横贯性脊髓炎;锥体外和小脑病症,诸如皮质脊髓系统的损伤;底节的病症;过动性运动障碍,诸如亨廷顿氏舞蹈症和老年舞蹈症;药物诱发的运动障碍,诸如通过阻断CNS多巴胺受体的药物诱发的运动障碍;运动功能减退性运动障碍,诸如帕金森氏病(Parkinson's disease);进行性核上性麻痹;小脑的结构部损伤;脊髓小脑退化,诸如脊髓共济失调、弗里德希氏共济失调(Friedreich's ataxia)、小脑皮质退化、多系统退化(Mencel、Dejerine-Thomas、Shi-Drager和Machado-Joseph);全身性病症(雷夫叙姆氏病(Refsum's disease)、无β脂蛋白血症、共济失调、毛细管扩张和粒线体多系统病症);脱髓鞘核心病症,诸如多发性硬化、急性横贯性脊髓炎;和运动单位的病症,诸如神经性肌肉萎缩症(前角细胞退化症,诸如肌肉萎缩性侧索硬化、婴儿脊髓性肌萎缩和青少年脊髓性肌萎缩);阿尔茨海默氏病(Alzheimer'sdisease);中年唐氏综合征(Down's Syndrome);泛发性路易体疾病(Diffuse Lewy bodydisease);路易体型老年痴呆症;韦尼克-科尔萨克夫综合征;慢性酒精中毒;克-亚二氏症(Creutzfeldt-Jakob disease);亚急性硬化性泛脑炎、哈洛弗登-史巴兹氏疾病(Hallerrorden-Spatz disease);拳击手型痴呆(Dementia pugilistica);神经创伤性损伤(例如脊髓损伤、脑损伤、脑震荡、反复性脑震荡);疼痛;炎症性疼痛;自闭症;抑郁症;中风;认知病症;癫痫;等。
在一些实施方案中,IL介导的疾病包括例如人身伤害或口腔手术相关的创伤,口腔手术包括牙周手术、拔牙、牙髓治疗、牙齿植入物的嵌入、牙齿假体的应用和用途;或其中创口选自由以下组成的组:无菌创口、挫伤创口、裂开创口、撕裂创口、非穿透创口、崩开创口、穿透创口、穿孔创口、刺破创口、感染性创口、梗塞形成和皮下创口;或其中创口选自由以下组成的组:缺血性溃烂、压疮、瘘、严重咬伤、热灼伤和供皮处创口;或其中创口为口疮创口、创伤创口或疱疹相关的创口。
上文所描述的治疗方法的剂量介于每kg受试者体重1μg至1000mg化合物或其药学上可接受的盐的范围内。
例证
缩写:
d 二重峰
dd 双二重峰
m 多重峰
s 单峰
t 三重峰
q 四重峰
brs/bs 宽单峰
dd 双二重峰
td 三双重峰
dt 双三重峰
DEAD 氮杂二甲酸二乙酯
DCM 二氯甲烷
DIPEA N,N-二异丙基乙胺
DMF N,N-二甲基甲酰胺
DMSO 二甲亚砜
eq 当量
g 公克
h 小时
NaH 氢化钠
THF 四氢呋喃
BBr3 三溴化硼
CDI 羰基二咪唑
EtOAc 乙酸乙酯
ACN 乙腈
TLC 薄层色谱
RT 室温
℃摄氏度
mmol 毫莫耳
μmol 微莫耳
ESI 电喷雾电离
EtOAc 乙酸乙酯
HCl 盐酸
IPA异丙醇
K2CO3 碳酸钾
LiOH 氢氧化锂
MeOH 甲醇
MS 质谱
RBF 圆底烧瓶
TEA 三乙胺
一般分析方法
LC-MS条件
Figure BDA0003923073830000631
制备型HPLC条件
Figure BDA0003923073830000641
HPLC条件
Figure BDA0003923073830000642
实施例1:合成(R)-1-环丙基-6-氟-5-甲基-4-氧代-7-(2-((吡啶-2-基氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830000643
步骤1.合成3,4,6-三氟-2-甲基苯甲酰氯
Figure BDA0003923073830000651
在0℃下向3,4,6-三氟-2-甲基苯甲酸(100mg,0.52mmol,1.0当量)和(COCl)2(133mg,1.05mmol,2.0当量)于DCM(2ml)中的混合物添加DMF(0.1mL)。将所得混合物在25℃下搅拌过夜。在真空下浓缩所得混合物。残留物直接用于下一步骤。
步骤2.合成3-氧代-3-(3,4,6-三氟-2-甲基苯基)丙酸乙酯
Figure BDA0003923073830000652
向3,4,6-三氟-2-甲基苯甲酰氯(100mg,0.48mmol,1.0当量)和3-丙二酸1-乙酯钾盐(163mg,0.96mmol,2.0当量)于MeCN(5ml)中的混合物添加TEA(97mg,0.96mmol,2.0当量)和MgCl2(91mg,0.96mmol,2.00当量)。将所得混合物在25℃下搅拌4h。在真空下浓缩所得混合物。在减压下浓缩所得混合物。用HCl(水溶液)将混合物酸化至pH 4。用甲基苯(10mL×3)萃取水层。将有机溶液在真空下浓缩。这产生呈黄色油状的3-氧代-3-(3,4,6-三氟-2-甲基苯基)丙酸乙酯(100mg,80.15%)。
步骤3.合成1-环丙基-6,7-二氟-5-甲基-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830000653
向3-氧代-3-(3,4,6-三氟-2-甲基苯基)丙酸乙酯(100mg,0.38mmol,1.0当量)于乙酸酐(117mg,1.15mmol,3.0当量)中的混合物添加原甲酸三乙酯(85mg,0.57mmol,1.5当量)。将所得混合物在100℃下搅拌2h。在真空下浓缩所得混合物。接着向DMSO(3mL)中的所得混合物添加氨基环丙烷(22mg,0.38mmol,1.0当量)。将所得混合物在25℃下搅拌2h。接着,向所得混合物添加K2CO3(26mg,0.19mmol,0.5当量)。在100℃下搅拌所得混合物1h。通过添加20mL水淬灭反应物。通过过滤来收集沉淀的固体。这产生呈黄色固体状的1-环丙基-6,7-二氟-5-甲基-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯(100mg,84.68%)。
步骤4.合成1-环丙基-6,7-二氟-5-甲基-4-氧代喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830000661
向1-环丙基-6,7-二氟-5-甲基-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯(100mg,0.325mmol,1.0当量)于THF(2mL)和H2O(0.5mL)中的混合物添加LiOH(39mg,1.62mmol,5.0当量)。将所得混合物在25℃下搅拌过夜。在减压下浓缩所得混合物。用HCl(水溶液)将混合物酸化至pH 4。通过过滤来收集沉淀的固体并且用水(10mL×3)洗涤。这产生呈黄色固体状的1-环丙基-6,7-二氟-5-甲基-4-氧代喹啉-3-甲酸(90mg,99.0%)。
步骤5.合成1-环丙基-6-氟-5-甲基-4-氧代-7-[(2R)-2-[(吡啶-2-基氧基)甲基]吡咯烷-1-基]喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830000662
向1-环丙基-6,7-二氟-5-甲基-4-氧代喹啉-3-甲酸(40mg,0.14mmol,1.0当量)于DMSO(2mL)中的混合物添加2-[(2R)-吡咯烷-2-基甲氧基]吡啶(25mg,0.14mmol,1.0当量)。在100℃下搅拌所得混合物1h。通过制备型HPLC在以下条件下纯化混合物(柱:XSelect CSHPrep C18 OBD柱,5μm,19*150mm;流动相A:水(0.05%FA),流动相B:ACN;流动速率:25mL/min;梯度:8min内48B至67B;254nm;RT1:7.02;RT2:;注射体积:ml;运行数:;),得到呈黄色固体状的1-环丙基-6-氟-5-甲基-4-氧代-7-[(2R)-2-[(吡啶-2-基氧基)甲基]吡咯烷-1-基]喹啉-3-甲酸(11.6mg)。LCMS(ESI)[M+H]+:438.1 1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ15.99(s,1H),8.56(s,1H),8.14-7.99(m,1H),7.75-7.63(m,1H),7.19(d,J=8.1Hz,1H),6.99-6.89(m,1H),6.77-6.70(m,1H),4.65(s,1H),4.51-4.40(m,1H),4.38-4.20(m,1H),3.71(d,J=25.2Hz,2H),3.53(d,J=8.7Hz,1H),2.74(d,J=3.5Hz,3H),2.20-1.88(m,4H),1.24(d,J=6.3Hz,2H),1.18-0.91(m,2H)。
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)+
实施例2:合成(R)-6-氯-4-氧代-7-(2-((吡啶-2-基氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-1-(嘧啶-2-基)-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830000671
步骤1.合成5-氯-2,4-二氟苯甲酰氯
Figure BDA0003923073830000672
在0℃下在空气气氛下向5-氯-2,4-二氟苯甲酸(5.0g,26.0mmol,1.0当量)和(COCl)2(19.8g,155.80mmol,6.0当量)于DCM(50mL)中的搅拌混合物中逐滴添加DMF(1mL)。将所得混合物在室温下在氮气气氛下搅拌过夜。在减压下浓缩所得混合物。粗产物不经进一步纯化直接用于下一步骤。
步骤2.合成3-(5-氯-2,4-二氟苯基)-3-氧代丙酸乙酯
Figure BDA0003923073830000681
在0℃下在空气气氛下向3-丙二酸1-乙酯钾盐(8.07g,47.41mmol,2.00当量)和MgCl2(5.64g,49.25mmol,2.5当量)于MeCN(100mL)中的搅拌混合物中逐滴添加TEA(4.80g,47.41mmol,2.0当量)。将所得混合物在室温下在氮气气氛下搅拌过夜。在0℃下向以上混合物中逐份添加5-氯-2,4-二氟苯甲酰氯(5.0g,23.70mmol,1.00当量)。将所得混合物在室温下再搅拌2.5h。用浓HCl将混合物酸化至pH 5。将所得混合物用甲苯(40mL×3)萃取。将合并的有机层用水(20mL×2)洗涤,经无水Na2SO4干燥。过滤之后,在减压下浓缩滤液。通过硅胶柱色谱用己烷/EtOAc(6:1)洗脱来纯化残留物,得到呈白色固体状的3-(5-氯-2,4-二氟苯基)-3-氧代丙酸乙酯(3.1g,48%)。LCMS(ESI)[M+H]+:263.1。
步骤3.合成6-氯-7-氟-4-氧代-1-(嘧啶-2-基)喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830000682
在100℃下在氮气气氛下搅拌3-(5-氯-2,4-二氟苯基)-3-氧代丙酸乙酯(2.0g,7.62mmol,1.0当量)和原甲酸三乙酯(1.7g,11.40mmol,1.5当量)于Ac2O(2.3g,22.85mmol,3.0当量)中的溶液1.5h。在减压下浓缩所得混合物。将残留物溶解于DMSO(20mL)中。在室温下经2min向以上混合物中逐份添加2-氨基嘧啶(720mg,7.62mmol,1.0当量)。将所得混合物在室温下搅拌过夜。在室温下向以上混合物中逐份添加K2CO3(530mg,3.81mmol,0.5当量)。将所得混合物在40℃下再搅拌2h。使混合物冷却至室温。将所得混合物用EtOAc(20mL×3)萃取。将合并的有机层用水(15mL×2)洗涤,经无水Na2SO4干燥。过滤之后,在减压下浓缩滤液。通过硅胶柱色谱用CH2Cl2/MeOH(10:1)洗脱来纯化残留物,得到呈红色固体状的6-氯-7-氟-4-氧代-1-(嘧啶-2-基)喹啉-3-甲酸乙酯(500mg,19%)。LCMS(ESI)[M+H]+:348.1。
步骤4.合成6-氯-7-氟-4-氧代-1-(嘧啶-2-基)喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830000691
在室温下在氮气气氛下搅拌6-氯-7-氟-4-氧代-1-(嘧啶-2-基)喹啉-3-甲酸乙酯(300mg,0.86mmol,1.0当量)和LiOH(83mg,3.45mmol,4.0当量)于THF(4.0mL)和H2O(1.0mL)中的混合物5h。用浓HCl将混合物酸化至pH 6。将所得混合物用EtOAc(10mL×3)萃取。将合并的有机层用水(5mL×2)洗涤,经无水Na2SO4干燥。过滤之后,在减压下浓缩滤液。用(5mL×3)的己烷/EtOAc(5:1)洗涤所得混合物,得到呈红色固体状的6-氯-7-氟-4-氧代-1-(嘧啶-2-基)喹啉-3-甲酸(160mg,58%)。LCMS(ESI)[M+H]+:320.2。
步骤5.合成6-氯-4-氧代-7-[(2R)-2-[(吡啶-2-基氧基)甲基]吡咯烷-1-基]-1-(嘧啶-2-基)喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830000692
在100℃下在氮气气氛下搅拌6-氯-7-氟-4-氧代-1-(嘧啶-2-基)喹啉-3-甲酸(80mg,0.25mmol,1.0当量)和2-[(2R)-吡咯烷-2-基甲氧基]吡啶(357mg,2.00mmol,8.0当量)于DMSO(4.0mL)中的溶液过夜。使混合物冷却至室温。通过制备型HPLC在以下条件下纯化粗产物(100mg)(柱:XSelect CSH Prep C18 OBD柱,5μm,19*150mm;流动相A:水(0.05%FA),流动相B:ACN;流动速率:25mL/min;梯度:8min内42B至73B;254nm;RT1:7.67),得到呈黄色固体状的6-氯-4-氧代-7-[(2R)-2-[(吡啶-2-基氧基)甲基]吡咯烷-1-基]-1-(嘧啶-2-基)喹啉-3-甲酸(25.7mg,21.5%)。LCMS(ESI)[M+H]+:478.1。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ14.73(s,1H),9.18(s,1H),8.98(s,2H),8.14(s,1H),8.00-7.85(m,1H),7.74(s,1H),7.67-7.53(m,1H),7.47(s,1H),6.87(t,J=5.7Hz,1H),6.61(d,J=7.9Hz,1H),4.58(s,1H),4.40-4.11(m,2H),3.74(s,1H),3.33-3.30(m,1H),2.23(s,1H),2.10-1.65(m,3H)。
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)+++
实施例3:合成(R)-1-环丙基-6-氟-8-甲氧基-4-氧代-7-(2-((吡啶-2-基氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830000701
步骤1.合成2,4,5-三氟-3-甲氧基苯甲酰氯
Figure BDA0003923073830000702
在0℃下向2,4,5-三氟-3-甲氧基苯甲酸(500mg,2.43mmol,1.0当量)于甲苯(8.0mL)中的溶液添加SOCl2(866mg,7.28mmol,3.0当量)。将所得混合物在25℃下搅拌过夜。在真空下浓缩所得混合物。这产生呈黄色半固体状的2,4,5-三氟-3-甲氧基苯甲酰氯(500mg,粗产物)。
步骤2.合成3-氧代-3-(2,4,5-三氟-3-甲氧基苯基)丙酸乙酯
Figure BDA0003923073830000711
在氮气下将3-丙二酸1-乙酯钾盐(758mg,4.45mmol,2.0当量)于无水乙腈(10mL)中的搅拌溶液冷却至10-15℃。向这一混合物添加TEA(451mg,4.45mmol,2.0当量),之后添加MgCl2(530mg,5.57mmol,2.5当量),并且在20-25℃下继续搅拌2.5h。将所得浆液再冷却至0℃并且经15min逐滴添加2,4,5-三氟-3-甲氧基苯甲酰氯(500mg,2.23mmol,1.0当量),之后添加TEA(23mg,0.22mmol,0.1当量)。将混合物在室温下搅拌18h并且接着在减压下浓缩以去除乙腈。添加甲苯(8mL)并且在减压下浓缩混合物。添加更多甲苯(8mL),并且搅拌混合物并冷却至10-15℃。添加HCl水溶液(13%,10mL),同时保持温度低于25℃。将水层分离,并且将有机层用HCl水溶液(12%,10mL)之后用水(8mL)洗涤,并且接着在减压下浓缩,得到呈黄色油状的3-氧代-3-(2,4,5-三氟-3-甲氧基苯基)丙酸乙酯(1.0g,粗产物)。LCMS(ESI)[M+H]+:276。
步骤3.合成1-环丙基-6,7-二氟-8-甲氧基-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830000712
/>
向3-氧代-3-(2,4,5-三氟-3-甲氧基苯基)丙酸乙酯(1.0g,3.62mmol,1.0当量)于乙酸酐(1.1g,10.86mmol,3.0当量)中的混合物添加原甲酸三乙酯(0.8g,5.43mmol,1.5当量)。将所得混合物在100℃下搅拌2h。在真空下浓缩所得混合物。向DMSO(12mL)中的所得混合物添加氨基环丙烷(0.2g,3.62mmol,1.0当量)。将所得混合物在25℃下搅拌2h。向所得混合物添加K2CO3(0.3g,1.81mmol,0.5当量)。在100℃下搅拌所得混合物1h。通过添加15mL水淬灭反应物。通过过滤来收集沉淀的固体。这产生呈黄色固体状的1-环丙基-6,7-二氟-8-甲氧基-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯(300mg,26%)。LCMS(ESI)[M+H]+:324。
步骤4.合成1-环丙基-6,7-二氟-8-甲氧基-4-氧代喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830000721
向1-环丙基-6,7-二氟-8-甲氧基-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯(300mg,0.93mmol,1.0当量)于THF(5.0mL)中的混合物添加LiOH(89mg,3.71mmol,4.0当量)和H2O(1.0mL)。将所得混合物在室温下搅拌3h。用HCl(水溶液)将混合物中和至pH 6。将所得混合物过滤。这产生呈白色固体状的1-环丙基-6,7-二氟-8-甲氧基-4-氧代喹啉-3-甲酸(250mg,91%)。LCMS(ESI)[M+H]+:296。
步骤5.合成1-环丙基-6-氟-8-甲氧基-4-氧代-7-[(2R)-2-[(吡啶-2-基氧基)甲基]吡咯烷-1-基]喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830000722
向1-环丙基-6,7-二氟-8-甲氧基-4-氧代喹啉-3-甲酸(220mg,0.75mmol,1.0当量)于DMSO(8.0mL)中的混合物添加2-[(2R)-吡咯烷-2-基甲氧基]吡啶(199mg,1.12mmol,1.5当量)。将所得混合物在80℃下搅拌48h。使混合物冷却至室温。在真空下浓缩所得混合物。通过制备型HPLC在以下条件下纯化粗产物(柱:XBridge Shield RP18 OBD柱,5μm,19*150mm;流动相A:水(0.1%FA),流动相B:ACN;流动速率:25mL/min;梯度:8min内60% B至90% B;254/220nm;Rt:7.31min),得到呈淡黄色固体状的1-环丙基-6-氟-8-甲氧基-4-氧代-7-[(2R)-2-[(吡啶-2-基氧基)甲基]吡咯烷-1-基]喹啉-3-甲酸(56.9mg,16.84%)。LCMS(ESI)[M+H]+:454.35。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.66(s,1H),8.04-7.95(m,1H),7.68-7.53(m,2H),6.88(d,J=7.1,5.0,1.0Hz,1H),6.55(s,1H),4.62-4.53(m,1H),4.36-4.21(m,2H),4.14(d,J=7.4,4.0Hz,1H),3.92-3.83(m,1H),3.59(s,3H),3.37(s,1H),2.37-2.21(m,1H),2.06(d,J=12.5Hz,1H),2.01-1.72(m,2H),1.29-1.06(m,2H),0.99-0.67(m,2H)。
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)+
实施例4:合成(R)-6-氟-4-氧代-7-(2-(苯氧基甲基)吡咯烷-1-基)-1-苯基-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830000731
步骤1.合成(2R)-2-(2-氯苯氧基甲基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830000732
向酚(3.0g,31.87mmol,1.0当量)、(2R)-2-(羟甲基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(6.4g,31.87mmol,1.0当量)和PPh3(16.7g,63.75mmol,2.0当量)于THF(50mL)中的混合物添加DIAD(8.2g,63.75mmol,2.0当量)。将所得溶液在25℃下搅拌过夜。在真空下浓缩所得混合物。通过逆相急骤色谱用5-60%于水中的乙腈洗脱来纯化残留物,得到呈无色油状的叔丁基(2R)-2-(苯氧基甲基)吡咯烷(1.1g,20%)。LCMS(ESI)[M+H]+:278.1
步骤2.合成(2R)-2-(苯氧基甲基)吡咯烷
Figure BDA0003923073830000733
向叔丁基(2R)-2-(苯氧基甲基)吡咯烷(500mg,1.60mmol,1.0当量)于DCM(10mL)中的混合物添加TFA(2mL)。在25℃下搅拌所得溶液1h。将所得混合物浓缩。这产生呈黄色油状的(2R)-2-(苯氧基甲基)吡咯烷(840mg,粗产物)。LCMS(ESI)[M+H]+:178.1。
步骤3.合成6-氟-4-氧代-7-[(2R)-2-(苯氧基甲基)吡咯烷-1-基]-1-苯基喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830000741
向6,7-二氟-4-氧代-1-苯基喹啉-3-甲酸(100mg,0.33mmol,1.0当量)于DMSO(2mL)中的混合物添加(2R)-2-(苯氧基甲基)吡咯烷(58mg,0.33mmol,1.0当量)。将所得溶液在80℃下搅拌1h。收集沉淀的固体并且通过Prep.-HPLC在以下条件下纯化(柱:XSelectCSH Prep C18 OBD柱,5μm,19*150mm;流动相A:水(0.05%FA),流动相B:ACN;流动速率:25mL/min;梯度:8min内50B至75B;254nm;RT1:6.86)。这产生呈黄色固体状的6-氟-4-氧代-7-[(2R)-2-(苯氧基甲基)吡咯烷-1-基]-1-苯基喹啉-3-甲酸(59.4mg 39.0%)。LCMS(ESI)[M+H]+:459.1。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ15.41(s,1H),8.53(s,1H),7.92(d,J=14.5Hz,1H),7.66(m,4H),7.41(t,J=7.7Hz,1H),7.26(t,J=7.7Hz,2H),6.94(t,J=7.4Hz,1H),6.82(d,J=8.0Hz,2H),6.09(d,J=7.5Hz,1H),4.34-4.24(m,1H),3.90(q,J=3.7Hz,1H),3.82(t,J=8.4Hz,1H),3.38-3.36(m,1H),3.27-3.14(m,1H),2.20-1.76(m,4H)。
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)+
实施例5:合成(R)-6-氟-7-(2-(((3-甲基吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-4-氧代-1-苯基-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830000751
步骤1.合成6,7-二氟-4-氧代-1-苯基-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830000752
向3-氧代-3-(2,4,5-三氟苯基)丙酸乙酯(5.0g,20.31mmol,1.0当量)于乙酸酐(6.2g,60.93mmol,3.0当量)中的混合物添加原甲酸三乙酯(4.5g,30.46mmol,1.5当量)。将所得混合物在100℃下搅拌2h。在真空下浓缩所得混合物。向DMSO(50mL)中的所得混合物添加苯胺(2.2g,24.37mmol,1.2当量),将所得混合物在25℃下搅拌2h。向所得混合物添加K2CO3(2.8g,20.31mmol,1.0当量)。在100℃下搅拌所得混合物1h。通过添加500mL水淬灭反应物。通过过滤来收集沉淀的固体。这产生呈黄色固体状的6,7-二氟-4-氧代-1-苯基-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(4.7g 70.2%)。LCMS(ESI)[M+H]+:330.1。
步骤2.合成6,7-二氟-4-氧代-1-苯基-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830000753
向6,7-二氟-4-氧代-1-苯基-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(2.0g,6.07mmol,1.0当量)于THF(100mL)和H2O(10mL)中的混合物添加LiOH(1.1g,48.58mmol,8.0当量)。将所得混合物在25℃下搅拌过夜。在减压下浓缩所得混合物。用HCl(水溶液)将混合物酸化至pH 4。将沉淀的固体通过过滤来收集并且用水(50mL×3)洗涤。这产生呈黄色固体状的6,7-二氟-4-氧代-1-苯基-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(1.6g89.6%)。LCMS(ESI)[M+H]+:302.1
步骤3.合成(R)-6-氟-7-(2-(((3-甲基吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-4-氧代-1-苯基-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830000761
向6,7-二氟-4-氧代-1-苯基-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(100mg,0.33mmol,1.0当量)于DMSO(10mL)中的溶液添加(R)-3-甲基-2-(吡咯烷-2-基甲氧基)吡啶(63mg,0.33mmol,1.0当量)。将所得溶液在100℃下搅拌1h。通过Prep.-HPLC纯化混合物(柱:SunFire PrepC18 OBD柱,19×150mm 5μm 10nm;流动相A:水(0.05%FA),流动相B:ACN;流动速率:25mL/min;梯度:8min内52B至82B;254/220nm;RT1:7.77;RT2:;注射体积:ml;运行数:;)。这产生呈黄色固体状的(R)-6-氟-7-(2-(((3-甲基吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-4-氧代-1-苯基-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(42.6mg,27%)。LCMS(ESI)[M+H]+:474.1。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ15.51-15.37(m,1H),8.54-8.50(m,1H),7.95-7.82(m,2H),7.73-7.55(m,4H),7.54-7.41(m,2H),6.93-6.82(m,1H),6.09-5.99(m,1H),4.47-4.34(m,1H),4.30-4.16(m,2H),3.36-3.35(m,1H),3.24-3.11(m,1H),2.15-1.84(m,7H)。
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例6:合成(R)-7-(2-(((3-乙基吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-6-氟-4-氧代-1-苯基-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830000771
步骤1.合成(2R)-2-[[(3-碘吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830000772
向2-氟-3-碘吡啶(5.0g,22.42mmol,1.0当量)于THF(50mL)中的混合物添加NaH(1.6g,67.26mmol,3.0当量)和(2R)-2-(羟甲基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(22.56g,112.11mmol,1.0当量)。将所得混合物在70℃下搅拌过夜。用水淬灭反应物。将所得混合物用EtOAc(3×50mL)萃取。收集合并的有机层并且经无水Na2SO4干燥。在真空下浓缩所得混合物。通过硅胶柱色谱用石油醚/EtOAc(1:1)洗脱来纯化残留物。这产生呈无色油状的(2R)-2-[[(3-碘吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(5.2g,11%)。LCMS(ESI)[M+H]+:405.0
步骤2.合成(R)-2-(((3-乙烯基吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830000773
向(2R)-2-[[(3-碘吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(2.0g,4.94mmol,1.0当量)于甲苯(7mL)、EtOH(2mL)、H2O(1mL)中的混合物添加K2CO3(2.0g,14.84mmol,3.0当量)、Pd(dppf)Cl2(360mg,0.49mmol,0.1当量)和乙烯基三氟-λ4-硼烷钾(990mg,7.42mmol,1.5当量)。在80℃下在氮气气氛下将所得混合物再搅拌1h。在真空下浓缩所得混合物。通过硅胶柱色谱用石油醚/EtOAc(1:1)洗脱来纯化残留物。这产生呈无色油状的(R)-2-(((3-乙烯基吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(1.0g,69%)。LCMS(ESI)[M+H]+:307.1
步骤3.合成(R)-2-(((3-乙基吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830000781
向(R)-2-(((3-乙烯基吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(1.0g,3.28mmol,1.0当量)于MeOH(100mL)、Pd/C(349mg,0.328mmol,0.1当量,10%)中的混合物中,将所得混合物在室温下在氢气气氛下搅拌0.5h。过滤所得混合物;用DCM(100mL)洗涤滤饼。在减压下浓缩滤液。通过硅胶柱色谱用石油醚/EtOAc(1:1)洗脱来纯化残留物。这产生呈无色油状的(R)-2-(((3-乙基吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(507mg,50%)。LCMS(ESI)[M+H]+:307.1
步骤4.合成(R)-3-乙基-2-(吡咯烷-2-基甲氧基)吡啶
Figure BDA0003923073830000782
向(R)-2-(((3-乙基吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(200mg,0.65mmol,1.0当量)于DCM(5mL)中的溶液中逐滴添加TFA(2mL)。将所得混合物在室温下搅拌0.5h。将所得混合物浓缩。这产生呈无色油状的(R)-3-乙基-2-(吡咯烷-2-基甲氧基)吡啶(206mg,粗产物)。LCMS(ESI)[M+H]+:207.1
步骤5.合成7-[(2R)-2-[[(3-乙基吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-基]-6-氟-4-氧代-1-苯基喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830000791
向3-乙基-2-[(2R)-吡咯烷-2-基甲氧基]吡啶(68mg,0.33mmol,1.0当量)于DMSO(5mL)中的混合物添加TEA(100mg,0.98mmol,3当量)和6,7-二氟-4-氧代-1-苯基喹啉-3-甲酸(99mg,0.33mmol,1.0当量)。将所得混合物在80℃下再搅拌1h。收集沉淀的固体并且通过Prep.-HPLC在以下条件下纯化粗产物(柱:SunFire Prep C18 OBD柱,19×150mm 5μm10nm;流动相A:水(0.1%FA),流动相B:ACN;流动速率:25mL/min;梯度:10min内62B至70B;254nm;RT1:9.48)。这产生呈黄色固体状的7-[(2R)-2-[[(3-乙基吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-基]-6-氟-4-氧代-1-苯基喹啉-3-甲酸(25.1mg,15.3%)。LCMS(ESI)[M+H]+:488.11H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ15.42(s,1H),8.52(s,1H),7.99-7.81(m,2H),7.76-7.55(m,4H),7.49(d,J=7.3Hz,2H),6.90(dd,J=7.2,4.9Hz,1H),6.05(d,J=7.4Hz,1H),4.50-4.33(m,1H),4.17(qd,J=10.9,9.9,3.4Hz,2H),3.24-3.14(m,2H),2.37(q,J=7.6Hz,2H),2.14-1.84(m,4H),1.01(t,J=7.5Hz,3H)
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)+
实施例7:合成6-氟-1-(4-羟苯基)-7-((2R)-4-甲基-2-(((3-甲基吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830000792
步骤1.合成1-叔丁基2-甲基(2R)-4-(氧杂环己烷-2-基氧基)吡咯烷-1,2-二甲酸酯
Figure BDA0003923073830000801
向1-叔丁基2-甲基(2R)-4-羟基吡咯烷-1,2-二甲酸酯(10g,40.77mmol)于DCM(100.00mL)中的混合物添加DHP(5.14g,61.10mmol)和TsOH-Py(1.02g,4.05mmol)。将所得混合物在室温下搅拌4h。将反应混合物用500ml H2O稀释。用DCM(300mL×3)萃取所得溶液并且合并有机层。用盐水(200mL×2)洗涤有机层。经无水硫酸钠干燥有机层并且在真空下浓缩。通过硅胶急骤色谱用EtOAc/石油醚(0-50%)洗脱来纯化残留物,得到呈黄色油状的1-叔丁基2-甲基(2R)-4-(氧杂环己烷-2-基氧基)吡咯烷-1,2-二甲酸酯(13g,89.0%产率)。LCMS(ESI)[M+H]+:330.20。
步骤2.合成(2R)-2-(羟甲基)-4-(氧杂环己烷-2-基氧基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830000802
在0℃下向1-叔丁基2-甲基(2R)-4-(氧杂环己烷-2-基氧基)吡咯烷-1,2-二甲酸酯(6g,18.21mmol)于THF(50.00mL)中的混合物添加LiAlH4(0.83g,21.85mmol),在室温下搅拌混合物0.5h。在0℃下用Na2SO4.10 H2O淬灭反应物。将混合物过滤,并且将滤饼用EtOAc洗涤。经无水硫酸钠干燥滤液并且在真空下浓缩。通过硅胶急骤色谱用EtOAc/石油醚(40%-50%)洗脱来纯化残留物,得到呈黄色油状的(2R)-2-(羟甲基)-4-(氧杂环己烷-2-基氧基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(2.5g,41.0%产率)。LCMS(ESI)[M+H]+:302.21。
步骤3.合成(2R)-2-[(苯甲氧基)甲基]-4-(氧杂环己烷-2-基氧基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830000811
在0℃下,向(2R)-2-(羟甲基)-4-(氧杂环己烷-2-基氧基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(2.50g,8.29mmol)于THF(30.00mL)中的混合物添加NaH(0.80g,33.33mmol)。将混合物在室温下搅拌0.5h。添加溴甲苯(1.70g,9.93mmol)并且在室温下搅拌混合物2h。在0℃下,用H2O淬灭反应物。接着将反应混合物用200mL H2O稀释。用EtOAc(200mL×3)萃取所得溶液并且合并有机层。将有机层用盐水洗涤,经无水硫酸钠干燥并且在真空下浓缩。通过Prep.-HPLC纯化残留物,得到呈黄色油状的(2R)-2-[(苯甲氧基)甲基]-4-(氧杂环己烷-2-基氧基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(1.3g,41.0%产率)。LCMS(ESI)[M+H]+:392.25。
步骤4.合成(2R)-2-[(苯甲氧基)甲基]-4-羟基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830000812
向(2R)-2-[(苯甲氧基)甲基]-4-(氧杂环己烷-2-基氧基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(1.3g,3.32mmol)于THF(4.00mL)中的混合物添加AcOH(4mL)和H2O(4.00mL)。将混合物在室温下搅拌2h。将反应混合物用50ml H2O稀释。用EtOAc(300mL×3)萃取所得溶液并且合并有机层。用盐水(200mL×2)洗涤有机层。经无水硫酸钠干燥有机层并且在真空下浓缩。通过硅胶急骤色谱用EtOAc/石油醚(40-60%)洗脱来纯化残留物,得到呈黄色油状的(2R)-2-[(苯甲氧基)甲基]-4-羟基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(800mg,70%产率)。LCMS(ESI)[M+H]+:308.15。
步骤5.合成(2R)-2-[(苯甲氧基)甲基]-4-氧代吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830000813
向(2R)-2-[(苯甲氧基)甲基]-4-羟基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(800mg,2.60mmol)于ACN(10.00mL)中的混合物添加IBX(1.09g,3.90mmol)。将混合物在80℃下搅拌2h。通过逆相急骤色谱纯化残留物,得到呈黄色油状的(2R)-2-[(苯甲氧基)甲基]-4-氧代吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(500mg,59%产率)。LCMS(ESI)[M+H]+:306.15。
步骤6.合成(2R)-2-[(苯甲氧基)甲基]-4-亚甲基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830000821
在0℃下向溴化甲基三苯基鏻(874mg,2.45mmol)于THF(3.00mL)中的混合物添加t-BuOK(551mg,4.91mmol)。将混合物在室温下搅拌1h。接着添加(2R)-2-[(苯甲氧基)甲基]-4-氧代吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(500mg,1.63mmol)并且在室温下搅拌混合物3h。通过逆相急骤色谱纯化残留物,得到呈无色油状的(2R)-2-[(苯甲氧基)甲基]-4-亚甲基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(450mg,90%产率)。LCMS(ESI)[M+H]+:304.18。
步骤7.合成(2R)-2-(羟甲基)-4-甲基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830000822
在氢气下,向(2R)-2-[(苯甲氧基)甲基]-4-亚甲基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(450mg,1.48mmol)于MeOH(10mL)中的混合物添加Pd/C(60mg,0.56mmol)。将所得混合物在室温下搅拌1h。过滤之后,浓缩滤液,得到呈无色油状的(2R)-2-(羟甲基)-4-甲基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(300mg,93%)。LCMS(ESI)[M+H]+:216.19
步骤8.合成3-甲基-2-(((2R)-4-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)吡啶
Figure BDA0003923073830000831
在0℃下向(2R)-2-(羟甲基)-4-甲基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(300mg,1.39mmol)于THF(10mL)中的混合物添加NaH(133mg,5.54mmol)。将所得混合物在室温下搅拌0.5h。接着添加2-溴-3-甲基吡啶并且在70℃下搅拌过夜。在0℃下用20mL水淬灭反应物。将所得混合物用EtOAc(200mL×3)萃取。经无水硫酸钠干燥合并的有机层并且在真空下浓缩。通过逆相急骤色谱用ACN/H2O(0.1%FA)(80%~90%)洗脱来纯化残留物,得到呈暗黄色油状物的3-甲基-2-(((2R)-4-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)吡啶(200mg,69%)。LCMS(ESI)[M+H]+:307.21
步骤9.合成6-氟-1-(4-羟苯基)-7-[(2R)-4-甲基-2-[[(3-甲基吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830000832
向6,7-二氟-1-(4-羟苯基)-4-氧代喹啉-3-甲酸(150mg,0.47mmol)于DMSO(3mL)中的混合物添加3-甲基-2-[[(2R)-4-甲基吡咯烷-2-基]甲氧基]吡啶(117mg,0.56mmol)和TEA(287mg,2.83mmol)。将所得混合物在室温下搅拌16h。通过Prep.-HPLC纯化残留物(柱:SunFire Prep C18 OBD柱,19×150mm 5μm 10nm;流动相A:水(0.1%FA),流动相B:ACN;流动速率:25mL/min;梯度:8min内50B至70B;254/220nm;RT1:7.73/8.22),得到呈黄色固体状的6-氟基-1-(4-羟苯基)-7-[(2R)-4-甲基-2-[[(3-甲基吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸(8.2mg,3.4%产率)。LCMS(ESI)[M+H]+:504.2。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ15.41(s,1H),8.51(s,1H),7.98-7.82(m,2H),7.76-7.54(m,4H),7.49(d,J=7.3Hz,2H),7.02-6.81(m,1H),6.04(d,J=7.4Hz,1H),4.39(m,1H),4.29-4.04(m,2H),3.23-3.12(m,2H),2.36(q,J=7.6Hz,2H),2.14-1.85(m,4H),1.00(t,J=7.5Hz,3H)。
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例8:合成(R)-6-氯-7-(2-(1-((3-氯吡啶-2-基)氧基)乙基)吡咯烷-1-基)-4-氧代-1-苯基-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830000841
步骤1.合成(2R)-2-[甲氧基(甲基)氨甲酰基]吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830000842
向(2R)-1-(叔丁氧羰基)吡咯烷-2-甲酸(1.0g,4.65mmol,1.0当量)于DMF(12mL)中的混合物添加N,O-二甲基羟胺(0.3g,5.58mmol,1.2当量)、DIEA(2.4g,18.58mmol,4.0当量)和HATU(2.7g,6.97mmol,1.5当量)。将所得混合物在室温下在氮气气氛下搅拌3h。通过添加水(10mL)淬灭反应物。在真空下浓缩所得混合物。通过逆相急骤色谱在以下条件下纯化残留物:柱,C18硅胶;流动相,含MeCN的水,30min内5%至100%梯度;检测器,UV 254nm和UV 220nm。这产生呈无色油状的(2R)-2-[甲氧基(甲基)氨甲酰基]吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(1.0g,83.3%)。LCMS(ESI)[M+H]+:259。
步骤2.合成(2R)-2-乙酰基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830000851
在-78℃下,向(2R)-2-[甲氧基(甲基)氨甲酰基]吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(900mg,3.48mmol,1.0当量)于THF(9mL)中的混合物添加MeMgBr(1.2g,10.45mmol,3.0当量)。将所得混合物在室温下在氮气气氛下搅拌2h。通过添加水(8mL)来淬灭反应物。将所得混合物用EtOAc(3×10mL)萃取。经无水Na2SO4干燥合并的有机层。在浓缩之后,通过硅胶柱色谱用石油醚/EtOAc(3:1)洗脱来纯化残留物,得到呈淡黄色油状的(2R)-2-乙酰基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(700mg,94.2%)。
步骤3.合成(2R)-2-(1-羟乙基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830000852
在0℃下向(2R)-2-乙酰基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(700mg,3.28mmol,1.0当量)于MeOH(7mL)中的混合物添加NaBH4(248mg,6.56mmol,2.0当量)。将所得混合物在室温下搅拌2h。通过添加水(6mL)来淬灭反应物。将所得混合物用EtOAc(3×8mL)萃取。经无水Na2SO4干燥合并的有机层。通过硅胶柱色谱用石油醚/EtOAc(1:1)洗脱来纯化残留物,得到呈无色油状的(2R)-2-(1-羟乙基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(600mg,84.9%)。LCMS(ESI)[M+H]+:216。
步骤4.合成(2R)-2-[1-[(3-氯吡啶-2-基)氧基]乙基]吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830000853
在0℃下在氮气气氛下向(2R)-2-(1-羟乙基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(500mg,2.32mmol,1.0当量)于THF(6mL)中的混合物添加NaH(167mg,6.97mmol,3.0当量)。将所得混合物在室温下在氮气气氛下搅拌30min。向以上混合物添加3-氯-2-氟吡啶(367mg,2.79mmol,1.2当量)。将所得混合物在70℃下再搅拌2.5h。使混合物冷却至室温。在0℃下通过添加水(6mL)来淬灭反应物。在真空下浓缩所得混合物。通过逆相急骤色谱在以下条件下纯化残留物:柱,C18硅胶;流动相,含MeCN的水,30min内5%至100%梯度;检测器,UV 254nmUV 220nm。这产生呈淡黄色油状的(2R)-2-[1-[(3-氯吡啶-2-基)氧基]乙基]吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(126mg,29.6%)。LCMS(ESI)[M+H]+:327。
步骤5.合成3-氯-2-[1-[(2R)-吡咯烷-2-基]乙氧基]吡啶
Figure BDA0003923073830000861
向(2R)-2-[1-[(3-氯吡啶-2-基)氧基]乙基]吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(126mg,0.39mmol,1.0当量)于DCM(3mL)中的混合物添加TFA(0.6mL)。将所得混合物在室温下搅拌1.5h。在真空下浓缩所得混合物。这产生呈淡黄色油状的3-氯-2-[1-[(2R)-吡咯烷-2-基]乙氧基]吡啶(100mg,粗产物)。LCMS(ESI)[M+H]+:227。
步骤6.合成6-氯-7-[(2R)-2-[1-[(3-氯吡啶-2-基)氧基]乙基]吡咯烷-1-基]-4-氧代-1-苯基喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830000862
向6-氯-7-氟-4-氧代-1-苯基喹啉-3-甲酸(80mg,0.25mmol,1.0当量)于DMSO(3.5mL)中的混合物添加TEA(127mg,1.26mmol,5.0当量)和3-氯-2-[1-[(2R)-吡咯烷-2-基]乙氧基]吡啶(86mg,0.38mmol,1.5当量)。将所得混合物在80℃下搅拌2h。使混合物冷却至室温。在真空下浓缩所得混合物。通过Prep.-HPLC在以下条件下纯化粗产物(柱:XBridgeShield RP18 OBD柱,5μm,19*150mm;流动相A:水(0.1%FA),流动相B:ACN;流动速率:25mL/min;梯度:8min内60% B至90% B;254/220nm;Rt:7.31min),得到呈淡黄色固体状的6-氯-7-[(2R)-2-[1-[(3-氯吡啶-2-基)氧基]乙基]吡咯烷-1-基]-4-氧代-1-苯基喹啉-3-甲酸(14.4mg,10.91%)。LCMS(ESI)[M+H]+:524.0。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ15.07(s,1H),8.53(s,1H),8.12(s,1H),7.82(dd,J=7.7,1.7Hz,1H),7.78-7.53(m,5H),7.34(d,J=7.2Hz,1H),6.78(dd,J=7.7,4.9Hz,1H),6.06(s,1H),5.44-5.31(m,1H),4.50-4.37(m,1H),3.28-3.15(m,1H),3.03(t,J=7.8Hz,1H),2.25-2.07(m,2H),2.01(dd,J=9.9,4.1Hz,1H),1.81-1.66(m,1H),1.17(d,J=6.5Hz,3H)。
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)+++
实施例9:合成(R)-6-氯-7-(2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-8-氟-1-(1-甲基环丙基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830000871
步骤1.合成2,3,4-三氟-5-硝基苯甲酸甲酯
Figure BDA0003923073830000872
向2,3,4-三氟-5-硝基苯甲酸(5.00g,22.62mmol)于甲醇(30.0mL)中的溶液添加亚硫酰氯(8.07g,67.84mmol)并且在60℃下搅拌4小时。在真空下浓缩溶剂。将残留物溶解于DCM中并且用碳酸氢钠溶液洗涤。经无水硫酸钠干燥有机层并且在真空下浓缩,得到呈淡黄色油状的2,3,4-三氟-5-硝基苯甲酸甲酯(5.1g,95.9%)。
步骤2.合成5-氨基-2,3,4-三氟苯甲酸甲酯
Figure BDA0003923073830000881
在氢气下,在室温下向2,3,4-三氟-5-硝基苯甲酸甲酯(5.80g,24.67mmol)于乙酸乙酯(100.0mL)中的溶液添加Pd/C(1.00g,9.39mmol)。将所得溶液在室温下搅拌3小时。滤出固体。在真空下浓缩有机层。通过硅胶急骤色谱用EtOAc/石油醚(0%-20%)洗脱来纯化残留物,得到呈白色固体状的5-氨基-2,3,4-三氟苯甲酸甲酯(4.5g,88.9%)。LCMS:m/z=206[M+H]+
步骤3.合成5-氯-2,3,4-三氟苯甲酸甲酯
Figure BDA0003923073830000882
在氮气下,在70℃下向5-氨基-2,3,4-三氟苯甲酸甲酯(5.00g,24.37mmol)和CuCl2(6.55g,48.75mmol)于ACN(100.0mL)中的溶液添加t-BuONO(5.03g,48.78mmol)。将所得溶液在70℃下搅拌1小时。冷却溶剂并且添加盐酸(3M)以将pH调节至3。将混合物用水淬灭,用DCM萃取并且用盐水洗涤。经无水硫酸钠干燥有机层并且在真空下浓缩。通过硅胶急骤色谱用EtOAc/石油醚(0%-10%)洗脱来纯化残留物,得到呈白色固体状的5-氯-2,3,4-三氟苯甲酸甲酯(3.5g,63.9%)。
步骤4.合成5-氯-2,3,4-三氟苯甲酸
Figure BDA0003923073830000891
向5-氯-2,3,4-三氟苯甲酸甲酯(5.00g,22.26mmol)于THF(50.0mL)中的溶液添加于H2O(25.0mL)中的氢氧化锂水合物(3.74g,89.13mmol)并且在室温下搅拌2小时。在真空下浓缩溶剂。将残留物溶解于水中。用盐酸(3M)将pH调节至3。过滤固体,用水洗涤并且在真空下浓缩,得到呈白色固体状的5-氯-2,3,4-三氟苯甲酸(3.7g,78.9%)。
步骤5.合成5-氯-2,3,4-三氟苯甲酰氯
Figure BDA0003923073830000892
在80℃下搅拌5-氯-2,3,4-三氟苯甲酸(600.0mg,2.85mmol)于亚硫酰氯(10.0mL)中的溶液3小时。在真空下浓缩溶剂,得到呈淡黄色油状的5-氯-2,3,4-三氟苯甲酰氯(630mg,96.5%)。
步骤6.合成3-(5-氯-2,3,4-三氟苯基)-3-氧代丙酸乙酯
Figure BDA0003923073830000893
在氮气下,在5℃下向3-丙二酸1-乙酯钾盐(936.58mg,5.50mmol)和MgCl2(654.9mg,6.88mmol)于ACN(50.0mL)中的溶液添加TEA(835.2mg,8.25mmol)并且在室温下搅拌2小时。接着在5℃下逐滴添加于ACN中的5-氯-2,3,4-三氟苯甲酰氯(630.0mg,2.75mmol)并且在室温下搅拌16小时。用盐酸(3M)淬灭反应混合物以将pH调节至3。将反应混合物用DCM萃取并且用盐水洗涤。经无水硫酸钠干燥有机层并且在真空下浓缩。通过硅胶急骤色谱用EtOAc/石油醚(0%-30%)洗脱来纯化残留物,得到呈白色固体状的3-(5-氯-2,3,4-三氟苯基)-3-氧代丙酸乙酯(450mg,58.2%)。
步骤7.合成(Z)-2-(5-氯-2,3,4-三氟苯甲酰基)-3-乙氧基丙烯酸乙酯
Figure BDA0003923073830000901
在100℃下搅拌3-(5-氯-2,3,4-三氟苯基)-3-氧代丙酸乙酯(450.0mg,1.60mmol)和原甲酸三乙酯(356.4mg,2.41mmol)于乙酸酐(982.2mg,9.62mmol)中的溶液2小时。在真空下浓缩溶剂,得到呈黄色油状的(2Z)-2-[(Z)-5-氯-2,3,4-三氟苯甲酰基]-3-乙氧基丙-2-烯酸乙酯(500mg,92.6%)。LCMS:m/z=337[M+H]+
步骤8.合成6-氯-7,8-二氟-1-(1-甲基环丙基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830000902
在室温下搅拌(2Z)-2-[(Z)-5-氯-2,3,4-三氟苯甲酰基]-3-乙氧基丙-2-烯酸乙酯(500.0mg,1.49mmol)和1-甲基环丙-1-胺(105.6mg,1.49mmol)于DMSO(8.0mL)中的溶液2小时。接着添加K2CO3(205.2mg,1.49mmol)并且在室温下搅拌2小时。将反应混合物用水淬灭,用EtOAc萃取并且用盐水洗涤。经无水硫酸钠干燥有机层并且在真空下浓缩。通过硅胶急骤色谱用EtOAc/石油醚(0%-60%)洗脱来纯化残留物,得到呈白色固体状的6-氯-7,8-二氟-1-(1-甲基环丙基)-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯(200mg,39.4%)。LCMS:m/z=342[M+H]+
步骤9.合成6-氯-7,8-二氟-1-(1-甲基环丙基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830000911
向10-mL密封管中置入6-氯-7,8-二氟-1-(1-甲基环丙基)-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯(100.0mg,0.29mmol)、THF(2.0mL)、H2O(1.0mL)、氢氧化锂水合物(61.4mg,1.46mmol)。在室温下搅拌所得溶液2小时。通过过滤来收集固体。这产生90mg(98.05%)呈白色固体状的6-氯-7,8-二氟-1-(1-甲基环丙基)-4-氧代喹啉-3-甲酸。LCMS:m/z=314[M+H]+
步骤10.合成(R)-6-氯-7-(2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-8-氟-1-(1-甲基环丙基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830000912
向10-mL密封管中置入6-氯-7,8-二氟-1-(1-甲基环丙基)-4-氧代喹啉-3-甲酸(80.0mg,0.26mmol)、DMSO(2.0mL)、3-氯-2-[(2R)-吡咯烷-2-基甲氧基]吡啶(65.1mg,0.31mmol)、N,N-二异丙基乙胺(98.9mg,0.77mmol)。在60℃下搅拌所得溶液5小时。通过逆相急骤色谱用ACN/水(0%-40%,碱性系统)洗脱来纯化残留物。这产生30mg(20.65%)呈白色固体状的6-氯-7-[(2R)-2-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-基]-8-氟-1-(1-甲基环丙基)-4-氧代喹啉-3-甲酸。LCMS:m/z=506[M+H]+1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ14.63(s,1H),8.86(d,J=1.7Hz,1H),8.19-7.91(m,2H),7.71(m,1H),6.92(m,1H),4.65(s,1H),4.42-4.11(m,2H),3.91-3.72(m,1H),3.23(s,1H),2.27(m,1H),2.08(s,1H),2.00-1.75(m,2H),1.61(s,3H),1.28(d,J=16.3Hz,2H),1.11(m,2H)。
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)+++
实施例10:合成(R)-7-(2-(((3-氯吡啶-2-基)(甲基)氨基)甲基)吡咯烷-1-基)-6-氟-1-(4-羟苯基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830000921
步骤1.合成(2R)-2-[[(3-氯吡啶-2-基)(甲基)氨基]甲基]吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830000922
向(2R)-2-[[(3-氯吡啶-2-基)氨基]甲基]吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(1.0g,3.21mmol,1.0当量)于DMF(10mL)中的溶液添加NaH(120mg,4.81mmol,1.5当量)和CH3I(910mg,6.41mmol,2.0当量)。在0℃下搅拌反应物2h。接着通过添加水来淬灭反应物。用30mL×3乙酸乙酯萃取所得溶液。经无水硫酸钠干燥合并的有机层并且在真空下浓缩。将残留物应用于硅胶柱色谱上,用乙酸乙酯/石油醚(1/3)洗脱。这产生呈黄色油状的(2R)-2-[[(3-氯吡啶-2-基)(甲基)氨基]甲基]吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(850mg,81.3%)。
LCMS(ESI)[M+H]+:326。
步骤2.合成3-氯-N-甲基-N-[(2R)-吡咯烷-2-基甲基]吡啶-2-胺
Figure BDA0003923073830000923
向(2R)-2-[[(3-氯吡啶-2-基)(甲基)氨基]甲基]吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(800mg,2.46mmol,1.0当量)于DCM(5mL)中的溶液添加TFA(1mL)。将所得溶液在室温下搅拌2h。将溶液的pH值调节至10。在真空下浓缩所得混合物。这产生呈黄色油状的3-氯-N-[(2R)-吡咯烷-2-基甲基]吡啶-2-胺(500mg,粗产物)。LCMS(ESI)[M+H]+:226。
步骤3.合成7-[(2R)-2-[[(3-氯吡啶-2-基)(甲基)氨基]甲基]吡咯烷-1-基]-6-氟-1-(4-羟苯基)-4-氧代喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830000931
向6,7-二氟-1-(4-羟苯基)-4-氧代喹啉-3-甲酸(100mg,0.32mmol,1.0当量)于DMSO(2mL)中的溶液添加TEA(96mg,0.95mmol,3.0当量)和3-氯-N-甲基-N-[(2R)-吡咯烷-2-基甲基]吡啶-2-胺(85mg,0.38mmol,1.2当量)。在80℃下搅拌反应物2h。通过Prep.-HPLC在以下条件下纯化混合物:柱:X Bridge Shield RP18 OBD柱,5μm,19*150mm;流动相A:水(0.1%FA),流动相B:乙腈;流动速率:25mL/min;梯度:15min内25B至45B;254nm。这产生呈黄色固体状的7-[(2R)-2-[[(3-氯吡啶-2-基)氨基]甲基]吡咯烷-1-基]-6-氟-1-(4-羟苯基)-4-氧代喹啉-3-甲酸(60.8mg,36.88%)。LCMS(ESI):[M+H]+:523.1。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ15.53(s,1H),10.15(s,1H),8.42(s,1H),7.84-7.72(m,2H),7.49-7.35(m,3H),7.01(d,J=7.9Hz,1H),6.96-6.86(m,1H),6.53-6.44(m,1H),6.43-6.35(m,1H),6.02(d,J=7.4Hz,1H),4.45(s,1H),3.59-3.49(m,1H),3.32-3.29(m,1H),3.28-3.22(m,1H),3.13-3.04(m,1H),2.06-1.79(m,4H)。
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)+++
实施例11:合成(R)-7-(2-((1H-吡咯并[3,2-b]吡啶-1-基)甲基)吡咯烷-1-基)-6-氟-1-(4-羟苯基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830000941
步骤1.合成(2R)-2-[[(4-甲基吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830000942
在室温下在氮气气氛下向(2R)-2-[[(4-甲基苯磺酰基)氧基]甲基]吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(200mg,0.56mmol,1.0当量)和4-氮杂吲哚(133mg,1.13mmo,2.0当量)于DMSO(2.0mL)中的混合物添加Cs2CO3(550mg,1.69mmol,3.0当量)。将所得混合物在80℃下在氮气气氛下搅拌过夜。在0℃下通过添加水(1mL)来淬灭反应物。在真空下浓缩所得混合物。通过逆相急骤色谱在以下条件下纯化残留物:柱,C18硅胶;流动相,于水中的ACN,30min内5%至95%梯度;检测器,UV 254nm和UV 220nm。这产生(2R)-2-[[(4-甲基吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(100mg,59%产率)。LCMS(ESI)[M+H]+:302.1
步骤2.合成(2R)-2-[吡咯并[3,2-b]吡啶-1-基甲基]吡咯烷
Figure BDA0003923073830000943
在0℃下在氮气气氛下向(2R)-2-[吡咯并[3,2-b]吡啶-1-基甲基]吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(100mg,0.33mmol,1.0当量)于DCM(5mL)中的混合物添加TFA(2mL)。将所得混合物在室温下在氮气气氛下搅拌1.5h。在真空下浓缩所得混合物。粗产物(2R)-2-[吡咯并[3,2-b]吡啶-1-基甲基]吡咯烷(160mg,粗产物)不经进一步纯化直接用于下一步骤。LCMS(ESI)[M+H]+:202.12。
步骤3.合成6-氟-1-(4-羟苯基)-4-氧代-7-[(2R)-2-[吡咯并[3,2-b]吡啶-1-基甲基]吡咯烷-1-基]喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830000951
在室温下在氮气气氛下向(2R)-2-[吡咯并[3,2-b]吡啶-1-基甲基]吡咯烷(60mg,0.30mmol,1.0当量)和6,7-二氟-1-(4-羟苯基)-4-氧代喹啉-3-甲酸(32mg,0.10mmol,0.3当量)于DMSO(1.0mL)中的混合物添加TEA(181mg,1.79mmol,6.0当量)。将所得混合物在80℃下在氮气气氛下搅拌过夜。通过制备型HPLC在以下条件下纯化粗产物(80mg)(柱:XSelect CSH Prep C18 OBD柱,5μm,19*150mm;流动相A:水(0.05% FA),流动相B:ACN;流动速率:25mL/min;梯度:8min内9B至30B;254nm;RT1:7.9),得到呈白色固体状的6-氟-1-(4-羟苯基)-4-氧代-7-[(2R)-2-[吡咯并[3,2-b]吡啶-1-基甲基]吡咯烷-1-基]喹啉-3-甲酸(46.9mg,31.3%)。LCMS(ESI)[M+H]+:499.20。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ10.24(s,1H),8.48(s,1H),8.35(d,J=4.8Hz,1H),7.90-7.76(m,2H),7.52-7.43(m,3H),7.21(s,1H),7.09-6.99(m,2H),6.59(d,J=3.2Hz,1H),6.12(d,J=7.5Hz,1H),4.47(d,J=6.7Hz,1H),4.27(d,J=6.0Hz,2H),3.15(d,J=8.7Hz,2H),1.94-1.72(m,3H),1.71-1.60(m,1H)。
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例12:合成(R)-7-(2-(((1H-吡咯并[3,2-c]吡啶-6-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-6-氟-1-(4-羟苯基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830000961
步骤1.合成6-氯-1-[[2-(三甲基硅烷基)乙氧基]甲基]吡咯并[3,2-c]吡啶
Figure BDA0003923073830000962
在0℃下在氮气气氛下向6-氯-1H-吡咯并[3,2-c]吡啶(2.0g,13.11mmol,1.0当量)于DMF(15mL)中的混合物添加NaH(0.4g,15.73mmol,1.2当量)。将所得混合物在室温下在氮气气氛下搅拌15min。在0℃下,向以上混合物添加SEM-Cl(2.6g,15.73mmol,1.2当量)。将所得混合物在室温下再搅拌1.5h。在0℃下通过添加水(15mL)来淬灭反应物。将所得混合物用EtOAc(3×15mL)萃取。将合并的有机层用盐水(5×10mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥。在减压下浓缩所得混合物。通过硅胶柱色谱用石油醚/EtOAc(4:1)洗脱来纯化残留物,得到呈黄色油状的6-氯-1-[[2-(三甲基硅烷基)乙氧基]甲基]吡咯并[3,2-c]吡啶(2.7g,72.8%)。LCMS(ESI)[M+H]+:283。
步骤2.合成(2R)-2-[[(1-[[2-(三甲基硅烷基)乙氧基]甲基]吡咯并[3,2-c]吡啶-6-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830000971
向6-氯-1-[[2-(三甲基硅烷基)乙氧基]甲基]吡咯并[3,2-c]吡啶(1.0g,3.54mmol,1.0当量)于甲苯(12mL)中的混合物添加(2R)-2-(羟甲基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(4.3g,21.21mmol,6.0当量)、Cs2CO3(3.5g,10.61mmol,3.0当量)、Pd2(烯丙基)2Cl2(0.1g,0.35mmol,0.1当量)和t-BuBrettPhos(0.2g,0.35mmol,0.1当量)。在80℃下在氮气气氛下将所得混合物搅拌3.5h。使混合物冷却至室温。过滤所得混合物,用MeOH(3×8mL)洗涤滤饼。在减压下浓缩滤液。通过硅胶柱色谱用石油醚/EtOAc(2:1)洗脱来纯化残留物,得到呈淡黄色油状的(2R)-2-[[(1-[[2-(三甲基硅烷基)乙氧基]甲基]吡咯并[3,2-c]吡啶-6-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(590mg,37.3%)。LCMS(ESI)[M+H]+:448。
步骤3.合成(2R)-2-([1H-吡咯并[3,2-c]吡啶-6-基氧基]甲基)吡咯烷
Figure BDA0003923073830000972
在0℃下,向在1,4-二噁烷(6mL)中的(2R)-2-[[(1-[[2-(三甲基硅烷基)乙氧基]甲基]吡咯并[3,2-c]吡啶-6-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(590mg,1.32mmol,1.0当量)的混合物中添加HCl(气体)。将所得混合物在室温下搅拌2h。在减压下浓缩所得混合物。在0℃下向以上混合物添加氨溶液(5mL,7M于MeOH中)。将所得混合物在室温下再搅拌3.5h。在真空下浓缩所得混合物。这产生呈淡黄色油状的(2R)-2-([1H-吡咯并[3,2-c]吡啶-6-基氧基]甲基)吡咯烷(300mg,粗产物)。LCMS(ESI)[M+H]+:218。
步骤4.合成6-氟-1-(4-羟苯基)-4-氧代-7-[(2R)-2-([1H-吡咯并[3,2-c]吡啶-6-基氧基]甲基)吡咯烷-1-基]喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830000981
向6,7-二氟-1-(4-羟苯基)-4-氧代喹啉-3-甲酸(300mg,0.95mmol,1.0当量)于DMSO(6mL)中的混合物添加TEA(287mg,2.84mmol,3.0当量)和(2R)-2-([1H-吡咯并[3,2-c]吡啶-6-基氧基]甲基)吡咯烷(411mg,1.89mmol,2.0当量)。将所得混合物在80℃下搅拌2h。使混合物冷却至室温。在真空下浓缩所得混合物。通过Prep.-HPLC在以下条件下纯化粗产物(柱:XBridge Shield RP18 OBD柱,5μm,19*150mm;流动相A:水(0.05%FA),流动相B:ACN;流动速率:25mL/min;梯度:8min内60% B至90% B;254/220nm;Rt:7.31min),得到呈黄色固体状的6-氟-1-(4-羟苯基)-4-氧代-7-[(2R)-2-([1H-吡咯并[3,2-c]吡啶-6-基氧基]甲基)吡咯烷-1-基]喹啉-3-甲酸(25.0mg,5.14%)。LCMS(ESI)[M+H]+:515.25。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ15.49(s,1H),11.12(s,1H),10.16(s,1H),8.43(s,1H),8.22(d,J=19.7Hz,1H),7.88(d,J=14.5Hz,1H),7.40(d,J=8.5,2.7Hz,1H),7.31-7.19(m,2H),6.96(s,1H),6.90-6.78(m,1H),6.52-6.38(m,2H),6.07(d,J=7.5Hz,1H),4.45(s,1H),4.25(d,J=5.3Hz,2H),3.13(d,J=7.0Hz,2H),2.13-1.87(m,4H)。
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例13:合成(R)-1-(6-氨基吡啶-3-基)-6-氟-7-(2-(((3-甲基吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830000991
步骤1.合成(R)-1-(6-乙酰胺基吡啶-3-基)-6-氟-7-(2-(((3-甲基吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830000992
向(R,Z)-2-(2,5-二氟-4-(2-(((3-甲基吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)苯甲酰基)-3-乙氧基丙烯酸乙酯(350mg,0.63mmol)于DMSO(5mL)中的混合物添加N-(5-氨基吡啶-2-基)乙酰胺(114mg,0.75mmol)。将所得混合物在室温下搅拌1h。接着添加K2CO3(87mg,0.62mmol)并且在100℃下搅拌1h。在室温下用水淬灭反应物。通过过滤收集固体,用水洗涤并且干燥,得到呈黄色固体状的(R)-1-(6-乙酰胺基吡啶-3-基)-6-氟-7-(2-(((3-甲基吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(200mg,粗产物)。LCMS(ESI)[M+H]+:560.3。
步骤2.合成(R)-1-(6-氨基吡啶-3-基)-6-氟-7-(2-(((3-甲基吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001001
在氮气下向(R)-1-(6-乙酰胺基吡啶-3-基)-6-氟-7-(2-(((3-甲基吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(200mg,0.12mmol)于THF(3mL)中的混合物添加于H2O(1mL)中的LiOH.H2O(131mg,3.12mmol)。将混合物在100℃下搅拌2h。通过Prep.-HPLC纯化残留物(柱:Gemini-NX C18 AXAI Packed,21.2*150mm 5μm;流动相A:水(0.1%FA),流动相B:ACN;流动速率:25mL/min;梯度:15min内51B至71B;254nm;RT1:17.1;RT2:;注射体积:ml;运行数:;),得到呈黄色固体状的(R)-1-(6-氨基吡啶-3-基)-6-氟-7-(2-(((3-甲基吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(79.2mg,29.5%产率)。LCMS(ESI)[M+H]+:490.15。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ15.41(s,1H),8.48(s,1H),8.11(d,J=2.8Hz,1H),7.94-7.81(m,2H),7.57(t,J=7.4Hz,1H),7.47(d,J=7.2Hz,1H),6.93-6.79(m,1H),6.71-6.36(m,3H),6.16(d,J=7.4Hz,1H),4.66-4.45(m,1H),4.34-4.16(m,2H),3.31-3.15(m,2H),2.19-1.84(m,7H)。
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例14:合成6-氟-7-[(2R)-2-[[(3-甲基吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-基]-1-(氧杂环己烷-4-基)-4-氧代喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001002
步骤1.合成3-甲基-2-[(2R)-吡咯烷-2-基甲氧基]吡啶
Figure BDA0003923073830001011
在0℃下,向(2R)-2-(羟甲基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(10.0g,49.71mmol,1.0当量)于THF(20mL)中的混合物添加NaH(7.9g,199.22mmol,4.0当量)。将所得混合物在室温下搅拌0.5h。接着添加2-溴-3-甲基吡啶并且在70℃下搅拌过夜。在0℃下用20mL水淬灭反应物。用EtOAc(200mL×3)萃取所得混合物并且合并有机层。经无水硫酸钠干燥有机层并且在真空下浓缩。通过逆相急骤色谱用ACN/H2O(0.1%FA)(80%-90%)洗脱来纯化残留物,得到呈暗黄色油状物的3-甲基-2-[(2R)-吡咯烷-2-基甲氧基]吡啶(7.50g,78%)。LCMS(ESI)[M+H]+:193.1和呈淡黄色油状的(2R)-2-[[(3-甲基吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(1.6g)。LCMS(ESI)[M+H]+:293.1。
步骤2.合成3-[2,5-二氟-4-[(2R)-2-[[(3-甲基吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-基]苯基]-3-氧代丙酸酯
Figure BDA0003923073830001012
向甲基3-甲基-2-[(2R)-吡咯烷-2-基甲氧基]吡啶(1.00g,5.20mmol,1.0当量)于ACN(10mL)中的混合物添加3-氧代-3-(2,4,5-三氟苯基)丙酸乙酯(1.28g,5.20mmol,1.0当量)和TEA(1.58g,15.60mmol,3.0当量)。在80℃下搅拌所得混合物2h。通过逆相急骤色谱用ACN/H2O(0.05% NH4HCO3)(60%-80%)洗脱来纯化残留物,得到呈黄色油状的3-[2,5-二氟-4-[(2R)-2-[[(3-甲基吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-基]苯基]-3-氧代丙酸乙酯(600mg,25.4%产率)。LCMS(ESI)[M+H]+:419.17。
步骤3.合成(2Z)-2-[(Z)-2,5-二氟-4-[(2R)-2-[[(3-甲基吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-基]苯甲酰基]-3-乙氧基丙-2-烯酸乙酯
Figure BDA0003923073830001021
向3-[2,5-二氟-4-[(2R)-2-[[(3-甲基吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-基]苯基]-3-氧代丙酸乙酯(200mg,0.47mmol,1.0当量)于乙酸酐(146mg,1.43mmol,2.99当量)中的混合物添加原甲酸三乙酯(106mg,0.71mmol,1.5当量)。将所得混合物在80℃下搅拌8h。在真空下浓缩溶剂,得到呈黄色油状的(2Z)-2-[(Z)-2,5-二氟-4-[(2R)-2-[[(3-甲基吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-基]苯甲酰基]-3-乙氧基丙-2-烯酸乙酯(250mg,粗产物)。LCMS(ESI)[M+H]+:475.20。
步骤4.合成6-氟-7-[(2R)-2-[[(3-甲基吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-基]-1-(氧杂环己烷-4-基)-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830001022
向(2Z)-2-[(Z)-2,5-二氟-4-[(2R)-2-[[(3-甲基吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-基]苯甲酰基]-3-乙氧基丙-2-烯酸乙酯(250mg,0.52mmol,1.0当量)于DMSO(5.00mL)中的混合物添加氧杂环己烷-4-胺(64mg,0.63mmol,1.20当量)。将所得混合物在室温下搅拌1h。接着添加K2CO3(73mg,0.52mmol,1.00当量)并且在100℃下搅拌1h。在室温下用水淬灭反应物。通过过滤收集固体,用水洗涤并且干燥,得到呈黄色固体状的6-氟-7-[(2R)-2-[[(3-甲基吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-基]-1-(氧杂环己烷-4-基)-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯(200mg,粗产物)。LCMS(ESI)[M+H]+:510.23。
步骤5.合成6-氟-7-[(2R)-2-[[(3-甲基吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-基]-1-(氧杂环己烷-4-基)-4-氧代喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001031
向6-氟-7-[(2R)-2-[[(3-甲基吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-基]-1-(氧杂环己烷-4-基)-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯(200mg,0.39mmol,1.0当量)于THF(3.00mL)中的混合物添加LiOH.H2O(131.0mg,3.12mmol,8.0当量)和H2O(1.00mL)。在室温下搅拌混合物2h。通过Prep.-HPLC纯化残留物,得到呈黄色固体状的6-氟-7-[(2R)-2-[[(3-甲基吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-基]-1-(氧杂环己烷-4-基)-4-氧代喹啉-3-甲酸(34.4mg,18%)。LCMS(ESI)[M+H]+:482.20。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ15.52(s,1H),8.65(s,1H),7.92-7.81(m,2H),7.48(d,J=7.1Hz,1H),6.96(d,J=7.2Hz,1H),6.86-6.82(m,1H),5.01(s,1H),4.79(s,1H),4.39-4.28(m,2H),4.02(d,J=11.2Hz,1H),3.91(d,J=11.3Hz,1H),3.79(s,1H),3.65-3.48(m,3H),2.19(s,2H),2.03(d,J=10.4Hz,9H)。
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例15:合成(R)-6-氟-7-(2-(((3-甲基吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-4-氧代-1-(吡嗪-2-基)-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001032
步骤1.合成(R,Z)-2-(2,5-二氟-4-(2-(((3-甲基吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)苯甲酰基)-3-乙氧基丙烯酸乙酯
Figure BDA0003923073830001041
向(R)-3-(2,5-二氟-4-(2-(((3-甲基吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)苯基)-3-氧代丙酸乙酯(300mg,0.69mmol,1.0当量)于乙酸酐(220mg,2.65mmol,2.99当量)中的混合物添加原甲酸三乙酯(159mg,106mmol,1.5当量)。将所得混合物在80℃下搅拌8h。在真空下浓缩溶剂,得到呈黄色油状的(R,Z)-2-(2,5-二氟-4-(2-(((3-甲基吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)苯甲酰基)-3-乙氧基丙烯酸乙酯(350mg,粗产物)。LCMS(ESI)[M+H]+:475.20。
步骤2.合成(R)-6-氟-7-(2-(((3-甲基吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-4-氧代-1-(吡嗪-2-基)-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830001042
向(R,Z)-2-(2,5-二氟-4-(2-(((3-甲基吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)苯甲酰基)-3-乙氧基丙烯酸乙酯(350mg,0.73mmol,1.0当量)于DMSO(5.00mL)中的混合物添加2-氨基吡嗪(84mg,0.88mmol,1.20当量)。将所得混合物在室温下搅拌1h。接着添加K2CO3(101mg,0.73mmol,1.00当量)并且在100℃下搅拌1h。在室温下用水淬灭反应物。通过过滤收集固体,用水洗涤并且干燥,得到呈黄色固体状的(R)-6-氟-7-(2-(((3-甲基吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-4-氧代-1-(吡嗪-2-基)-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(350mg,粗产物)。LCMS(ESI)[M+H]+:504.20。
步骤3.合成(R)-6-氟-7-(2-(((3-甲基吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-4-氧代-1-(吡嗪-2-基)-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001051
向(R)-6-氟-7-(2-(((3-甲基吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-4-氧代-1-(吡嗪-2-基)-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(350mg,0.69mmol,1.0当量)于THF(5.00mL)中的混合物添加LiOH.H2O(233mg,5.55mmol,7.99当量)和H2O(1.70mL)。在室温下搅拌混合物2h。浓缩混合物得到残留物,通过Prep.-HPLC纯化,得到呈黄色固体状的(R)-6-氟-7-(2-(((3-甲基吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-4-氧代-1-(吡嗪-2-基)-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(69.7mg,23%)。LCMS(ESI)[M+H]+:476.10。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ15.18(s,1H),9.15(s,1H),8.92(d,J=2.4Hz,1H),8.91(s,1H),8.75(s,1H),7.90(d,J=14.5Hz,1H),7.85(dd,J=5.1,1.8Hz,1H),7.49(d,J=7.1Hz,1H),6.85(dd,J=7.1,5.0Hz,1H),6.29(d,J=7.3Hz,1H),4.62-4.48(m,1H),4.32-4.12(m,2H),3.52-3.40(m,1H),3.30-3.21(m,1H),2.17-1.82(m,7H)。
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例16:合成(R)-7-(2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-1-(5-(2-(二甲氨基)乙氧基)吡嗪-2-基)-6-氟-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001061
步骤1.合成N-(5-氯吡嗪-2-基)氨基甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830001062
向5-氯-吡嗪胺(5g,38.59mmol)于二噁烷(50mL)中的混合物添加Boc2O(12g,54.98mmol)、DMAP(9g,73.66mmol)和TEA(3.51g,10.78mmol)。在100℃下搅拌所得混合物1h。将反应混合物用500ml H2O稀释。用EtOAc(300mL×3)萃取所得溶液并且合并有机层。经无水硫酸钠干燥有机层并且在真空下浓缩。通过逆相急骤色谱用ACN/H2O(0.05% NH4HCO3)(80%-100%)洗脱来纯化残留物,得到呈黄色固体状的N-(5-氯吡嗪-2-基)氨基甲酸叔丁酯(8g,90%产率)。LCMS(ESI)[M+H]+:230.27。
步骤2.合成N-[5-[2-(二甲氨基)乙氧基]吡嗪-2-基]氨基甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830001063
向N-(5-氯吡嗪-2-基)氨基甲酸叔丁酯(1g,4.35mmol)于甲苯(10mL)中的混合物添加二甲氨基乙醇(1.55g,17.41mmol)、t-BuBrettPhos(211mg,0.43mmol)、Pd2(烯丙基)2Cl2(159mg,0.43mmol)和Cs2CO3(4.26g,13.06mmol)。在80℃下搅拌所得混合物2h。将反应混合物用200mL H2O稀释。用EtOAc(100mL×3)萃取所得溶液并且合并有机层。经无水硫酸钠干燥有机层并且在真空下浓缩。通过逆相急骤色谱用ACN/H2O(0.05% NH4HCO3)(80%-100%)洗脱来纯化残留物,得到呈黄色油状的N-[5-[2-(二甲氨基)乙氧基]吡嗪-2-基]氨基甲酸叔丁酯(300mg,22%产率)。LCMS(ESI)[M+H]+:601.24。
步骤3.合成5-[2-(二甲氨基)乙氧基]吡嗪-2-胺
Figure BDA0003923073830001071
/>
向N-[5-[2-(二甲氨基)乙氧基]吡嗪-2-基]氨基甲酸叔丁酯(180mg,0.63mmol)于DCM(2mL)中的混合物添加TFA(2mL)。将所得混合物在室温下搅拌1h。通过过滤收集滤液并且浓缩,得到呈黄色油状的5-[2-(二甲氨基)乙氧基]吡嗪-2-胺(200mg,粗产物)。LCMS(ESI)[M+H]+:183.24。
步骤4.合成(R)-7-(2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-1-(5-(2-(二甲氨基)乙氧基)吡嗪-2-基)-6-氟-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830001072
向(R,Z)-2-(4-(2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-2,5-二氟苯甲酰基)-3-乙氧基丙烯酸乙酯(200mg,0.42mmol)于DMSO(5.00mL)中的混合物添加5-[2-(二甲氨基)乙氧基]吡嗪-2-胺(92mg,0.50mmol)。将所得混合物在室温下搅拌1h。接着添加K2CO3(58mg,0.42mmol)并且在100℃下搅拌1h。在室温下用水淬灭反应物。通过过滤收集固体,用水洗涤并且干燥,得到呈黄色固体状的(R)-7-(2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-1-(5-(2-(二甲氨基)乙氧基)吡嗪-2-基)-6-氟-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(100mg,粗产物)。LCMS(ESI)[M+H]+:589.24。
步骤5.合成(R)-7-(2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-1-(5-(2-(二甲氨基)乙氧基)吡嗪-2-基)-6-氟-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001081
向(R)-7-(2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-1-(5-(2-(二甲氨基)乙氧基)吡嗪-2-基)-6-氟-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(100mg,0.17mmol)于THF(3mL)中的混合物添加LiOH.H2O(35mg,0.83mmol,)和H2O(1.00mL)。在室温下搅拌混合物2h。通过Prep.-HPLC(柱:YMC-Actus Triart C18,20*250mm,5μm,12nm;流动相A:水(10mmol/LNH4HCO3),流动相B:ACN;流动速率:25mL/min;梯度:2min内5B至61B;254nm;RT1:8.72)纯化残留物,得到呈黄色固体状的(R)-7-(2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-1-(5-(2-(二甲氨基)乙氧基)吡嗪-2-基)-6-氟-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(6.0mg,6%)。LCMS(ESI)[M+H]+:583.25。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.89-8.48(m,2H),8.30(s,1H),8.14-7.53(m,3H),6.99(s,1H),6.28-6.17(m,1H),4.65-4.40(m,3H),4.35-4.15(m,2H),3.35(s,1H),3.21(s,1H),2.68(s,2H),2.27-2.22(m,6H),2.08(s,2H),1.99-1.81(m,2H)。
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例17:合成(R)-1-(4-(2-(二甲氨基)乙氧基)苯基)-6-氟-7-(2-(((3-甲基吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001091
步骤1.合成二甲基[2-(4-硝基苯氧基)乙基]胺
Figure BDA0003923073830001092
向4-硝基酚(500mg,3.59mmol)于DMF(10mL)中的混合物添加二甲氨基乙基氯盐酸盐(776mg,5.38mmol)和Cs2CO3(3.51g,10.78mmol)。在100℃下搅拌所得混合物1h。将反应混合物用50ml H2O稀释。用EtOAc(100mL×3)萃取所得溶液并且合并有机层。经无水硫酸钠干燥有机层并且在真空下浓缩。通过逆相急骤色谱用ACN/H2O(0.05% NH4HCO3)(80%-100%)洗脱来纯化残留物,得到呈白色固体状的二甲基[2-(4-硝基苯氧基)乙基]胺(400mg,47%产率)。LCMS(ESI)[M+H]+:211.24。
步骤2.合成4-[2-(二甲氨基)乙氧基]苯胺
Figure BDA0003923073830001093
在氮气下,向二甲基[2-(4-硝基苯氧基)乙基]胺(400mg,1.90mmol)于MeOH(10mL)中的混合物添加Pd/C(99mg,0.93mmol)。接着,由氢气气氛置换氮气气氛。将所得混合物在室温下搅拌1h。通过过滤收集滤液并且浓缩,得到呈黄色油状的4-[2-(二甲氨基)乙氧基]苯胺(250mg,粗产物)。LCMS(ESI)[M+H]+:181.24。
步骤3.合成1-[4-[2-(二甲氨基)乙氧基]苯基]-6-氟-7-[(2R)-2-[[(3-甲基吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830001101
向(2Z)-2-[(Z)-2,5-二氟-4-[(2R)-2-[[(3-甲基吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-基]苯甲酰基]-3-乙氧基丙-2-烯酸乙酯(200mg,0.42mmol)于DMSO(5.00mL)中的混合物添加4-[2-(二甲氨基)乙氧基]苯胺(91mg,0.50mmol)。将所得混合物在室温下搅拌1h。接着添加K2CO3(58mg,0.42mmol)并且在100℃下搅拌1h。在室温下用水淬灭反应物。通过过滤收集固体,用水洗涤并且干燥,得到呈黄色固体状的1-[4-[2-(二甲氨基)乙氧基]苯基]-6-氟-7-[(2R)-2-[[(3-甲基吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯(250mg,粗产物)。LCMS(ESI)[M+H]+:589.24。
步骤4.合成(R)-1-(4-(2-(二甲氨基)乙氧基)苯基)-6-氟-7-(2-(((3-甲基吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001102
向1-[4-[2-(二甲氨基)乙氧基]苯基]-6-氟-7-[(2R)-2-[[(3-甲基吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯(250mg,0.42mmol)于THF(3mL)中的混合物添加LiOH.H2O(142mg,3.38mmol)和H2O(1.00mL)。将混合物在室温下搅拌2h。通过Prep.-HPLC纯化残留物(柱:Gemini-NX C18 AXAI Packed,21.2*150mm 5μm;流动相A:水(0.1%FA),流动相B:ACN;流动速率:25mL/min;梯度:9min内23B至30B;254nm;RT1:6.67),得到呈黄色固体状的(R)-1-(4-(2-(二甲氨基)乙氧基)苯基)-6-氟-7-(2-(((3-甲基吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(46.2mg,19%)。LCMS(ESI)[M+H]+:561.25。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ8.47(s,1H),8.19(s,1H),7.94-7.83(m,2H),7.57-7.45(m,3H),7.21(s,1H),6.98(s,1H),6.92-6.82(m,1H),6.10(m,1H),4.43(s,1H),4.23(m,1H),4.13(m,3H),3.37(s,1H),3.21(s,1H),2.69(m,2H),2.06(s,6H),2.04(s,2H),1.99-1.85(s,5H)。
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例18:合成(R)-6-氯-7-(2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-1-(1,3-二氢异苯并呋喃-5-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001111
步骤1.合成(R)-3-(5-氯-4-(2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-2-氟苯基)-3-氧代丙酸乙酯
Figure BDA0003923073830001112
向3-(5-氯-2,4-二氟苯基)-3-氧代丙酸乙酯(500mg,1.90mmol)于ACN(5mL)中的混合物添加3-氯-2-[(2R)-吡咯烷-2-基甲氧基]吡啶(485mg,2.28mmol)和TEA(1.16g,11.42mmol)。在80℃下搅拌所得混合物2h。通过逆相急骤色谱用ACN/H2O(0.05% NH4HCO3)(60%-80%)洗脱来纯化残留物,得到呈黄色油状的(R)-3-(5-氯-4-(2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-2-氟苯基)-3-氧代丙酸乙酯(300mg,33%产率)。LCMS(ESI)[M+H]+:455.24。
步骤2.合成(R,Z)-2-(5-氯-4-(2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-2-氟苯甲酰基)-3-乙氧基丙烯酸乙酯
Figure BDA0003923073830001121
向(R)-3-(5-氯-4-(2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-2-氟苯基)-3-氧代丙酸乙酯(300mg,0.65mmol)于乙酸酐(146mg,1.43mmol)中的混合物添加原甲酸三乙酯(106mg,0.71mmol)。将所得混合物在80℃下搅拌8h。在真空下浓缩溶剂,得到呈黄色油状的(R,Z)-2-(5-氯-4-(2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-2-氟苯甲酰基)-3-乙氧基丙烯酸乙酯(360mg,粗产物)。LCMS(ESI)[M+H]+:511.24。
步骤3.合成(R)-6-氯-7-(2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-1-(1,3-二氢异苯并呋喃-5-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830001122
向(R,Z)-2-(5-氯-4-(2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-2-氟苯甲酰基)-3-乙氧基丙烯酸乙酯(360mg,0.70mmol)于DMSO(5.00mL)中的混合物添加1,3-二氢-2-苯并呋喃-5-胺(114mg,0.84mmol)。在100℃下搅拌所得混合物1h。接着添加K2CO3(97mg,0.70mmol)并且在100℃下搅拌1h。在室温下用水淬灭反应物。通过过滤收集固体,用水洗涤并且干燥,得到呈黄色固体状的(R)-6-氯-7-(2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-1-(1,3-二氢异苯并呋喃-5-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(350mg,粗产物)。LCMS(ESI)[M+H]+:580.20。
步骤4.合成(R)-6-氯-7-(2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-1-(1,3-二氢异苯并呋喃-5-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001131
向(R)-6-氯-7-(2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-1-(1,3-二氢异苯并呋喃-5-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(350mg,0.60mmol)于THF(3mL)中的混合物添加LiOH.H2O(57mg,2.38mmol)和H2O(1.00mL)。在室温下搅拌混合物2h。通过Prep.-HPLC纯化残留物(柱:XSelect CSH Prep C18 OBD柱,5μm,19*150mm;流动相A:水(0.1%FA),流动相B:ACN;流动速率:25mL/min;梯度:8min内53B至77B;254nm;RT1:7.2),得到呈黄色固体状的(R)-6-氯-7-(2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-1-(1,3-二氢异苯并呋喃-5-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(70mg,21%)。LCMS(ESI)[M+H]+:552.0。1HNMR(300MHz,DMSO-d6)δ15.08(s,1H),8.55(s,1H),8.17(s,1H),7.89(d,J=4.8Hz,1H),7.83(dd,J=7.7,1.6Hz,1H),7.74-7.27(m,3H),7.03-6.87(m,1H),6.37(d,J=4.3Hz,1H),5.11(s,3H),5.04-4.84(m,1H),4.71-4.55(m,1H),4.36-4.19(m,2H),3.58-3.40(m,1H),3.26-3.09(m,1H),2.26(d,J=15.5Hz,1H),2.05-1.65(m,3H)。
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例19:合成(R)-6-氯-7-(2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-4-氧代-1-(吡嗪-2-基)-1,4-二氢-1,8-萘啶-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001141
步骤1.合成3-氧代-3-(2,5,6-三氯吡啶-3-基)丙酸乙酯
Figure BDA0003923073830001142
在氮气气氛下,在60℃下搅拌2,5,6-三氯吡啶-3-甲酸(1.8g,7.95mmol)和CDI(1.6g,9.54mmol)于THF(40mL)中的混合物3h。接着将混合物添加至3-丙二酸1-乙酯钾盐(1.4g,7.93mmol)、Et3N(116mg,1.15mmol)、MgCl2(1.1g,12.00mmol)于THF(40mL)中的悬浮液中并且在室温下搅拌混合物过夜。接着用1N HCl(水溶液)将反应物的pH调节至3-4。将混合物用EtOAc(200mL)稀释,用水(80mL)、盐水(80mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,浓缩并且通过硅胶急骤色谱用EtOAc/石油醚(0-100%)洗脱来纯化,得到呈淡黄色油状的3-氧代-3-(2,5,6-三氯吡啶-3-基)丙酸乙酯(300mg,12.73%)。LCMS(ESI)[M+H]+:296。
步骤2.合成6,7-二氯-4-氧代-1-(吡嗪-2-基)-1,8-萘啶-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830001143
在氮气气氛下,在100℃下搅拌3-氧代-3-(2,5,6-三氯吡啶-3-基)丙酸乙酯(300mg,1.01mmol)和原甲酸三乙酯(225mg,1.52mmol)于Ac2O(620mg,6.07mmol)中的混合物1h。接着蒸发混合物,得到残留物。将残留物溶解于DMSO(5mL)中并且添加2-氨基吡嗪(96mg,1.01mmol)并且搅拌混合物1h。接着将K2CO3(140mg,1.01mmol)添加至混合物中并且在室温下再搅拌1h。接着用1N HCl(水溶液)将反应物的pH调节至3-4。将混合物用EtOAc(200mL)稀释,用水(80mL)、盐水(80mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,浓缩并且通过硅胶急骤色谱用EtOAc/石油醚(0-100%)洗脱来纯化,得到呈红色固体的6,7-二氯-4-氧代-1-(吡嗪-2-基)-1,8-萘啶-3-甲酸乙酯(240mg,64.96%)。LCMS(ESI)[M+H]+:365。
步骤3.合成(R)-6-氯-7-(2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-4-氧代-1-(吡嗪-2-基)-1,4-二氢-1,8-萘啶-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830001151
在氮气气氛下,在80℃下搅拌6,7-二氯-4-氧代-1-(吡嗪-2-基)-1,8-萘啶-3-甲酸乙酯(70mg,0.19mmol)、3-氯-2-[(2R)-吡咯烷-2-基甲氧基]吡啶(61mg,0.29mmol)、Et3N(116mg,1.15mmol)和ACN(3mL)的混合物过夜。将反应物冷却至室温并且不经进一步纯化即直接使用。LCMS(ESI)[M+H]+:541。
步骤4.合成6-氯-7-[(2R)-2-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-基]-4-氧代-1-(吡嗪-2-基)-1,8-萘啶-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001152
将于水中的LiOH·H2O(1N,0.38mL,0.38mmol)添加至来自前一步骤的混合物中并且搅拌混合物2h。接着将反应物的pH调节至3-4。过滤混合物,用水和ACN洗涤。在减压下蒸发滤液,得到呈淡黄色固体状的6-氯-7-[(2R)-2-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-基]-4-氧代-1-(吡嗪-2-基)-1,8-萘啶-3-甲酸(23.4mg,22.59%)。LCMS(ESI)[M+H]+:513.1。1H NMR(300MHz,氯仿-d)δ14.60(s,1H),9.09(d,J=1.4Hz,1H),9.02(s,1H),8.61(d,J=2.5Hz,1H),8.53(dd,J=2.5,1.5Hz,1H),8.48(s,1H),7.91(dd,J=4.9,1.7Hz,1H),7.63(dd,J=7.6,1.7Hz,1H),6.85(dd,J=7.6,4.9Hz,1H),4.86(m,1H),4.34-4.19(m,2H),4.15-3.97(m,1H),3.95-3.78(m,1H),2.28-2.03(m,3H),2.02-1.84(m,J=7.2Hz,1H)。
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例20:合成(R)-6,8-二氟-1-(2-氟-4-羟苯基)-7-(2-(((3-甲基吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001161
/>
步骤1.合成6,7,8-三氟-1-(2-氟-4-羟苯基)-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830001162
在100℃下3-氧代-3-(2,3,4,5-四氟苯基)丙酸乙酯(300mg,1.13mmol)、原甲酸三乙酯(252mg,1.70mmol)和乙酸酐(347mg,3.40mmol)的混合物。使混合物冷却至室温。在真空下浓缩所得混合物。粗产物不经进一步纯化直接用于下一步骤。向DMSO(5mL)中的残留物添加4-氨基-3-氟酚(129mg,1.02mmol)并且在室温下搅拌混合物12h。接着添加K2CO3(156mg,1.13mmol)并且在室温下搅拌所得混合物2h。接着用水(5mL)淬灭反应物。通过过滤来收集沉淀的固体并且用水(2×10mL)洗涤。这产生呈黄色固体状的6,7,8-三氟-1-(2-氟-4-羟苯基)-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯(140mg,32.4%)。LCMS(ESI)[M+H]+:382。
步骤2.合成6,8-二氟-1-(2-氟-4-羟苯基)-7-[(2R)-2-[[(3-甲基吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830001171
在氮气气氛下在100℃下搅拌3-甲基-2-[(2R)-吡咯烷-2-基甲氧基]吡啶(212mg,1.10mmol)、Et3N(223mg,2.20mmol)、DMSO(2mL)和6,7,8-三氟-1-(2-氟-4-羟苯基)-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯(210mg,0.55mmol)的混合物12h。所需产物可由LCMS检测。使混合物冷却至室温。用EtOAc(3×10mL)萃取水层。在真空下浓缩所得混合物。通过逆相急骤色谱用ACN/H2O(0-95%)洗脱来纯化残留物,得到呈淡黄色固体状的6,8-二氟-1-(2-氟-4-羟苯基)-7-[(2R)-2-[[(3-甲基吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯(60mg,19.7%)。LCMS(ESI)[M+H]+:554。
步骤3.合成6,8-二氟-1-(2-氟-4-羟苯基)-7-[(2R)-2-[[(3-甲基吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001181
/>
向6,8-二氟-1-(2-氟-4-羟苯基)-7-[(2R)-2-[[(3-甲基吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯(60.0mg,0.10mmol)于THF(2mL)中的搅拌溶液添加LiOH.H2O(23mg,0.54mmol)和H2O(0.5mL)并且在室温下搅拌混合物2h。通过Prep.-HPLC在以下条件下纯化所得混合物(柱:Gemini-NX C18 AXAI Packed,21.2*150mm 5μm;流动相A:水(0.1%FA),流动相B:ACN;流动速率:25mL/min;梯度:8min内60B至65B;254nm),得到呈淡黄色固体状的6,8-二氟-1-(2-氟-4-羟苯基)-7-[(2R)-2-[[(3-甲基吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸(10.4mg,18.26%)。LCMS(ESI)[M+H]+:526.2。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ14.75(s,1H),10.51(s,1H),8.47(s,1H),7.90-7.71(m,2H),7.62-7.47(m,1H),7.43(d,J=7.3Hz,1H),6.91-6.64(m,3H),4.61-4.42(m,1H),4.33-4.12(m,2H),3.77-3.61(m,1H),3.41-3.36(m,1H),2.25-2.13(m,1H),2.03-1.90(m,1H),1.86-1.71(m,5H)。
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例21:合成(R)-7-(2-(((3-溴吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-6-氟-1-(4-(2-羟基乙氧基)苯基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001182
步骤1.合成2-(4-硝基苯氧基)乙-1-醇
Figure BDA0003923073830001191
向1-氟-4-硝基苯(3.0g,21.27mmol)和乙烷-1,2-二醇(2.6g,42.55mmol)于DMF(40mL)中的混合物添加K2CO3(8.8g,63.81mmol)。在室温下搅拌混合物16h。将混合物倒入冰水中。过滤混合物。用EtOAc(50mL×3)萃取滤液。将合并的有机相经Na2SO4干燥并且浓缩,得到呈黄色固体状的2-(4-硝基苯氧基)乙-1-醇(1.0g,26%)。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ8.26-8.16(m,2H),7.21-7.12(m,2H),4.97(t,J=5.5Hz,1H),4.19-4.10(m,2H),3.75(q,J=5.1Hz,2H)。
步骤2.合成2-(4-氨基苯氧基)乙-1-醇
Figure BDA0003923073830001192
向2-(4-硝基苯氧基)乙-1-醇(1.0g,5.46mmol)于MeOH(15mL)中的溶液添加Pd/C(200mg)。使混合物脱气并且在室温下在H2下搅拌1.5h。过滤混合物。浓缩滤液,得到呈黄色油状的2-(4-氨基苯氧基)乙-1-醇(700mg,84%)。LCMS(ESI)[M+H]+:154。
步骤3.合成6,7-二氟-1-(4-(2-羟基乙氧基)苯基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830001193
向(Z)-3-乙氧基-2-(2,4,5-三氟苯甲酰基)丙烯酸乙酯(1.2g,4.07mmol)于DMSO(25mL)中的溶液添加2-(4-氨基苯氧基)乙-1-醇(622mg,4.07mmol)。在室温下搅拌溶液1h。接着添加K2CO3(673mg,4.88mmol)。在室温下再搅拌混合物1h。将反应混合物倒入水中。将固体通过过滤来收集并且干燥,得到呈淡黄色固体状的6,7-二氟-1-(4-(2-羟基乙氧基)苯基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(1.4g,88%)。LCMS(ESI)[M+H]+:390。
步骤4.合成(R)-7-(2-(((3-溴吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-6-氟-1-(4-(2-羟基乙氧基)苯基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830001201
向6,7-二氟-1-(4-(2-羟基乙氧基)苯基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(500mg,1.28mmol)和TEA(648mg,6.40mmol)于DMSO(10mL)中的溶液添加(R)-3-溴-2-(吡咯烷-2-基甲氧基)吡啶(987mg,3.85mmol)。在100℃下搅拌混合物3h。通过逆相急骤柱用40-80%于水中的乙腈纯化反应溶液,得到呈淡黄色固体状的(R)-7-(2-(((3-溴吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-6-氟-1-(4-(2-羟基乙氧基)苯基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(670mg,84%)。LCMS(ESI)[M+H]+:626。
步骤5.合成(R)-7-(2-(((3-溴吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-6-氟-1-(4-(2-羟基乙氧基)苯基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001211
在室温下在氮气下向(R)-7-(2-(((3-溴吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-6-氟-1-(4-(2-羟基乙氧基)苯基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(60mg,0.10mmol)于THF(1mL)中的搅拌溶液添加于水(1mL)中的LiOH·H2O(16mg,0.38mmol)。在室温下搅拌混合物1h。通过添加HOAc淬灭反应物以调节pH 5。通过制备型HPLC纯化混合物(柱:XSelectCSH Prep C18 OBD柱,5μm,19*150mm;流动相A:水(0.1%FA),流动相B:ACN;流动速率:25mL/min;梯度:8min内38B至68B;254nm;RT1:7.65),得到呈灰白色固体状的(R)-7-(2-(((3-溴吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-6-氟-1-(4-(2-羟基乙氧基)苯基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(32.3mg,54%)。LCMS(ESI)[M+H]+:600.10。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ15.43(s,1H),8.47(s,1H),8.06-7.95(m,2H),7.88(d,J=14.4Hz,1H),7.58-7.49(m,2H),7.24-7.14(m,1H),7.09-6.99(m,1H),6.98-6.88(m,1H),6.08(d,J=7.5Hz,1H),4.97(t,J=5.4Hz,1H),4.50-4.44(m,1H),4.35-4.29(m,2H),4.11-4.02(m,2H),3.83-3.72(m,2H),3.33-3.25(m,1H),3.21-3.13(m,1H),2.14-2.02(m,2H),2.04-1.81(m,2H)。
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例22:合成(R)-6-氟-1-(2-氟-4-羟苯基)-4-氧代-7-(2-((嘧啶-2-基氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001221
步骤1.合成6,7-二氟-1-[2-氟-4-[(4-甲氧基苯基)甲氧基]苯基]-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830001222
向6,7-二氟-1-(2-氟-4-羟苯基)-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯(10.0g,27.53mmol,1.0当量)于DMF(100mL)中的溶液添加K2CO3(11.4g,82.58mmol,3.0当量)和4-甲氧基苯甲氯(6.5g,41.29mmol,1.5当量)。在70℃下搅拌反应物2h。接着通过水来淬灭反应物。用150×3mL乙酸乙酯萃取所得溶液。将有机层合并且经无水硫酸钠干燥,在真空下浓缩。将残留物施用至具有二氯甲烷/乙酸乙酯(1/2)的硅胶柱上。这产生呈黄色油状的6,7-二氟-1-[2-氟-4-[(4-甲氧基苯基)甲氧基]苯基]-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯(4.2g,31.6%)。LCMS(ESI)[M+H]+:484。
步骤2.合成6-氟-7-[(2R)-2-(羟甲基)吡咯烷-1-基]-1-[4-[(4-甲氧基苯基)甲氧基]苯基]-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830001223
向6,7-二氟-1-[4-[(4-甲氧基苯基)甲氧基]苯基]-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯(2.0g,4.30mmol,1.0当量)于DMSO(25mL)中的溶液添加K2CO3(1.8g,12.89mmol,3.0当量)和(R)-吡咯烷-2-基甲醇(650mg,6.45mmol,1.5当量)。在100℃下在N2气氛下搅拌反应物2h。通过Flash-Prep-HPLC纯化粗产物,其中NH4HCO3/乙腈=40%在15min内增加至50%;检测器,254/220nm。这产生呈黄色油状的6-氟-7-[(2R)-2-(羟甲基)吡咯烷-1-基]-1-[4-[(4-甲氧基苯基)甲氧基]苯基]-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯(1.5g,63.9%)。LCMS(ESI)[M+H]+:547。
步骤3.合成(R)-6-氟-1-(2-氟-4-((4-甲氧基苯甲基)氧基)苯基)-4-氧代-7-(2-((嘧啶-2-基氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001231
/>
向6-氟-1-[2-氟-4-[(4-甲氧基苯基)甲氧基]苯基]-7-[(2R)-2-(羟甲基)吡咯烷-1-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯(150mg,0.27mmol,1.0当量)于THF(5mL)中的溶液添加NaH(10mg,0.40mmol,1.5当量)。在室温下搅拌反应物0.5h。接着,将2-氯嘧啶(37mg,0.32mmol,1.2当量)添加至溶液中。在室温下搅拌反应物2h。接着通过添加水来淬灭反应物。通过逆相急骤色谱来纯化残留物,得到呈淡黄色固体状的(R)-6-氟-1-(2-氟-4-((4-甲氧基苯甲基)氧基)苯基)-4-氧代-7-(2-((嘧啶-2-基氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(12.3mg,7.53%)。LCMS(ESI):[M+H]+:615.15。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.52(d,J=4.7Hz,2H),8.38(s,1H),7.82(d,J=14.8Hz,1H),7.69-7.57(m,1H),7.44(d,J=8.5Hz,2H),7.34-7.26(m,0.5H),7.16-7.03(m,2H),7.03-6.96(m,2H),6.92-6.86(m,0.5H),6.00-5.91(m,1H),5.19-5.04(m,2H),4.37-4.17(m,3H),3.79(s,3H),3.31-3.29(m,1H),3.21-3.13(m,1H),2.14-1.85(m,4H)。
步骤4.合成(R)-6-氟-1-(2-氟-4-羟苯基)-4-氧代-7-(2-((嘧啶-2-基氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001241
向(R)-6-氟-1-(2-氟-4-((4-甲氧基苯甲基)氧基)苯基)-4-氧代-7-(2-((嘧啶-2-基氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(30mg,0.05mmol,1.0当量)于DCM(2mL)中的溶液添加TFA(0.5mL)。将反应物在室温下搅拌2h。在真空下浓缩溶液。通过制备型HPLC在以下条件下纯化残留物:柱:X Select CSH Prep C18 OBD柱,5μM,19*150mm;流动相A:水(0.05%FA),流动相B:乙腈;流动速率:25mL/min;梯度:8min内30B至55B;254nm。这产生呈黄色固体状的(R)-6-氟-1-(2-氟-4-羟苯基)-4-氧代-7-(2-((嘧啶-2-基氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(10.3mg,42.68%)。LCMS(ESI)[M+H]+:495.30。1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ15.29(s,1H),10.62(s,1H),8.60(d,J=2.8Hz,1H),8.52(dd,J=4.8,1.8Hz,2H),7.88(dd,J=14.5,2.2Hz,1H),7.60-7.50(m,1H),7.17-7.08(m,4.8Hz,1H),6.94-6.81(m,1H),6.73-6.65(m,1H),6.08-6.00(m,1H),4.44(s,1H),4.35-4.22(m,2H),3.32-3.30(m,1H),3.26-3.17(m,1H),2.17-1.88(m,4H)。
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)+++
实施例23:合成(R)-6-氟-1-(4-羟苯基)-7-(2-((5-甲基-6-氧代哒嗪基-1(6H)-基)甲基)吡咯烷-1-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001242
步骤1.合成(R)-6-氟-7-(2-(羟甲基)吡咯烷-1-基)-1-(4-((4-甲氧基苯甲基)氧基)苯基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830001251
向10-mL密封管中置入6,7-二氟-1-(4-((4-甲氧基苯甲基)氧基)苯基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(820.0mg,1.762mmol)、DMSO(5.0mL)、Et3N(1782.7mg,17.617mmol)、(R)-吡咯烷-2-基甲醇(213.8mg,2.114mmol)。在80℃下搅拌所得溶液15小时。通过逆相急骤色谱用ACN/水(0%-70%,碱性系统)洗脱来纯化残留物。这产生780mg(81.00%)呈黄色固体状的(R)-6-氟-7-(2-(羟甲基)吡咯烷-1-基)-1-(4-((4-甲氧基苯甲基)氧基)苯基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯。LCMS(ESI)[M+H]+:547。
步骤2.合成(R)-7-(2-(溴甲基)吡咯烷-1-基)-6-氟-1-(4-((4-甲氧基苯甲基)氧基)苯基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830001252
向40-mL密封管中置入(R)-6-氟-7-(2-(羟甲基)吡咯烷-1-基)-1-(4-((4-甲氧基苯甲基)氧基)苯基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(500.0mg,0.915mmol)、DCM(10.0mL)、PPh3(719.8mg,2.744mmol)、CBr4(910.1mg,2.744mmol)。在0℃下搅拌所得溶液2小时。所得溶液用3×50mL二氯甲烷萃取。将有机相合并且在减压下浓缩。将残留物施用至用乙酸乙酯/石油醚(1:2)洗脱的硅胶柱上。这产生400mg(71.74%,粗产物)呈棕色固体状的(R)-7-(2-(溴甲基)吡咯烷-1-基)-6-氟-1-(4-((4-甲氧基苯甲基)氧基)苯基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯。LCMS(ESI)[M+H]+:569。
步骤3.合成(R)-6-氟-1-(4-((4-甲氧基苯甲基)氧基)苯基)-7-(2-((5-甲基-6-氧代哒嗪-1(6H)-基)甲基)吡咯烷-1-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830001261
向40-mL密封管中置入(R)-7-(2-(溴甲基)吡咯烷-1-基)-6-氟-1-(4-((4-甲氧基苯甲基)氧基)苯基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(300.0mg,0.492mmol)、DMF(10.0mL)、K2CO3(204.1mg,1.477mmol)、4-甲基哒嗪-3-醇(54.2mg,0.492mmol)。在80℃下搅拌所得溶液2小时。通过逆相急骤色谱用ACN/水(0%-50%,碱性系统)洗脱来纯化残留物。这产生200mg(63.62%,粗产物)呈黄色固体状的(R)-6-氟-1-(4-((4-甲氧基苯甲基)氧基)苯基)-7-(2-((5-甲基-6-氧代哒嗪-1(6H)-基)甲基)吡咯烷-1-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯。LCMS(ESI)[M+H]+:639。
步骤4.合成(R)-6-氟-1-(4-((4-甲氧基苯甲基)氧基)苯基)-7-(2-((5-甲基-6-氧代哒嗪-1(6H)-基)甲基)吡咯烷-1-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001262
向10-mL密封管中置入(R)-6-氟-1-(4-((4-甲氧基苯甲基)氧基)苯基)-7-(2-((5-甲基-6-氧代哒嗪-1(6H)-基)甲基)吡咯烷-1-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(200.0mg,0.313mmol)、LiOH.H2O(65.7mg,1.566mmol)、THF(4.0mL)、H2O(2.0mL)。在室温下搅拌所得溶液2小时。用AcOH将溶液的pH值调节至4-5。通过过滤来收集固体。这产生160mg(83.68%)呈黄色固体状的(R)-6-氟-1-(4-((4-甲氧基苯甲基)氧基)苯基)-7-(2-((5-甲基-6-氧代哒嗪-1(6H)-基)甲基)吡咯烷-1-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸。LCMS(ESI)[M+H]+:611。
步骤5.合成(R)-6-氟-1-(4-羟苯基)-7-(2-((5-甲基-6-氧代哒嗪-1(6H)-基)甲基)吡咯烷-1-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001271
向10-mL密封管中置入(R)-6-氟-1-(4-((4-甲氧基苯甲基)氧基)苯基)-7-(2-((5-甲基-6-氧代哒嗪-1(6H)-基)甲基)吡咯烷-1-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(80.0mg,0.131mmol)和TFA(2.0mL)。在室温下搅拌所得溶液2小时。通过逆相急骤色谱用ACN/水(0%-40%,碱性系统)洗脱来纯化残留物。这产生20mg(31.12%)呈固体状的(R)-6-氟-1-(4-羟苯基)-7-(2-((5-甲基-6-氧代哒嗪-1(6H)-基)甲基)吡咯烷-1-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸。LCMS(ESI)[M+H]+:491。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ15.42(s,1H),10.17(s,1H),8.45(s,1H),7.80(d,J=14.4Hz,1H),7.66(d,J=3.9Hz,1H),7.45(s,2H),7.20(d,J=3.7Hz,1H),7.00(m,2H),6.31(d,J=7.4Hz,1H),4.38(s,1H),4.27-4.07(m,1H),3.96-3.72(m,1H),3.52(s,1H),3.28(s,1H),2.00(s,3H),1.92(s,3H),1.76(s,1H)。
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例24:合成(R)-6-氯-1-(1-甲基环丙基)-4-氧代-7-(2-氧代-5-((吡啶-2-基氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001281
步骤1.合成(R)-5-((吡啶-2-基氧基)甲基)吡咯烷-2-酮
Figure BDA0003923073830001282
在氮气下,向40-mL密封管中置入(R)-5-(羟甲基)吡咯烷-2-酮(500.0mg,4.343mmol)、DMF(10.0mL)、2-氟吡啶(506.0mg,5.211mmol)、叔丁氧基钾(1462.0mg,13.029mmol)。在80℃下搅拌所得溶液5小时。通过逆相急骤色谱用ACN/水(0%-40%,碱性系统)洗脱来纯化残留物。这产生600mg(71.9%)呈灰白色固体状的(R)-5-((吡啶-2-基氧基)甲基)吡咯烷-2-酮。LCMS(ESI)[M+H]+:193。
步骤2.合成(R)-6-氯-1-(1-甲基环丙基)-4-氧代-7-(2-氧代-5-((吡啶-2-基氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001283
/>
在氮气下,向10-mL密封管中置入6-氯-7-氟-1-(1-甲基环丙基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(100.0mg,0.338mmol)、DMSO(3.0mL)、(R)-5-((吡啶-2-基氧基)甲基)吡咯烷-2-酮(78.0mg,0.406mmol)、叔丁氧基钾(113.9mg,1.015mmol)。在室温下搅拌所得溶液15小时。通过逆相急骤色谱用ACN/水(0%-50%,碱性系统)洗脱来纯化残留物。这产生36.8mg(23.26%)呈白色固体状的(R)-6-氯-1-(1-甲基环丙基)-4-氧代-7-(2-氧代-5-((吡啶-2-基氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-1,4-二氢喹啉-3-甲酸。LCMS(ESI)[M+H]+:468.2。1HNMR(300MHz,DMSO-d6)δ14.66(s,1H),8.86(d,J=1.8Hz,1H),8.40(d,J=2.5Hz,1H),8.29-8.05(m,2H),7.56(d,J=9.0Hz,1H),6.92(m,1H),6.46(d,J=8.0Hz,1H),4.71(s,1H),4.54-4.19(m,2H),2.82-2.55(m,3H),2.12(m,1H),1.42(m,4H),1.22-0.90(m,3H)。
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)+
实施例25:6-氟-1-[3-(甲氧基甲基)环丁基]-4-氧代-7-[(2R)-2-[(吡啶-2-基氧基)甲基]吡咯烷-1-基]-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001291
步骤1:合成N,N-二苯甲基-3-(甲氧基甲基)环丁-1-胺
Figure BDA0003923073830001292
在0℃下,向氢化钠(63.5mg,2.65mmol)于THF(10mL)中的搅拌悬浮液添加[3-(二苯甲基氨基)环丁基]甲醇(500mg,1.77mmol)并且在相同温度下搅拌30min,随后添加硫酸二甲酯(200μL,2.12mmol)。使反应混合物缓慢升温至室温并且搅拌2h。用冰冷饱和氯化铵溶液淬灭反应混合物并且用EtOAc萃取产物。经无水硫酸钠干燥合并的有机层并且在减压下蒸发。通过硅胶柱色谱使用10%EtOAc/己烷来纯化所获得的粗物质。将含有产物的相关洗脱份合并且在真空下蒸馏成呈无色液体状的N,N-二苯甲基-3-(甲氧基甲基)环丁-1-胺(300mg,56%)。MS(ESI)m/z:296.5[M+H]+
步骤2:合成3-(甲氧基甲基)环丁-1-胺盐酸盐
Figure BDA0003923073830001301
/>
在氮气气氛下,向N,N-二苯甲基-3-(甲氧基甲基)环丁-1-胺(2.4g,8.12mmol)于EtOH(30mL)中的搅拌溶液添加乙酸(1mL),之后添加10% Pd/C(864mg,8.12mmol)。在室温下在气球压力下氢化反应混合物16h。将反应混合物经由硅藻土垫过滤并且蒸发滤液,得到粗产物。将粗物质溶解于二噁烷中,并且添加4M于二噁烷中的HCl,搅拌10min。蒸发挥发物,并且用二乙醚湿磨粗残留物,在真空下干燥,得到呈无色粘性胶状物的3-(甲氧基甲基)环丁-1-胺盐酸盐(800mg,65%),其无需任何纯化即用于下一步骤。
步骤3:合成6-氟-1-[3-(甲氧基甲基)环丁基]-4-氧代-7-[(2R)-2-[(吡啶-2-基氧基)甲基]吡咯烷-1-基]-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830001302
向(R,Z)-2-(2,5-二氟-4-(2-((吡啶-2-基氧基)甲基)吡咯烷-1-基)苯甲酰基)-3-乙氧基丙烯酸乙酯(300mg,0.652mmol)于DMSO(3mL)中的搅拌溶液添加3-(甲氧基甲基)环丁-1-胺盐酸盐(134mg,889μmol)、三乙胺(0.18ml,1.78mmol),接着搅拌1h。添加碳酸钾(153mg,1.11mmol),将反应混合物加热至80℃并且搅拌2h。在反应完成之后,使反应混合物冷却至室温并且用冰冷的水稀释。通过过滤收集沉淀的固体,用水洗涤并且在真空下干燥,得到呈灰白色固体状的6-氟-1-[3-(甲氧基甲基)环丁基]-4-氧代-7-[(2R)-2-[(吡啶-2-基氧基)甲基]吡咯烷-1-基]-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(77.7mg,20.6%)。MS(ESI)m/z:510.2[M+H]+
步骤4:合成6-氟-1-[3-(甲氧基甲基)环丁基]-4-氧代-7-[(2R)-2-[(吡啶-2-基氧基)甲基]吡咯烷-1-基]-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001311
实验程序如上文所描述,以获得呈浅棕色固体状的6-氟-1-[3-(甲氧基甲基)环丁基]-4-氧代-7-[(2R)-2-[(吡啶-2-基氧基)甲基]吡咯烷-1-基]-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(17.4mg,23%)。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)15.55(s,1H),8.53(s,1H),8.08-8.05(m,1H),7.84(d,J=14.8Hz,1H),7.69-7.65(m,1H),6.96-6.93(m,1H),6.81(d,J=7.2Hz,1H),6.72(d,J=7.2Hz,1H),5.00-4.92(m,1H),4.72-4.64(m,1H),4.45-4.38(m,1H),4.31-4.22(m,1H),3.80-3.70(m,1H),3.54-3.46(m,1H),3.34-3.28(m,2H),3.24(s,3H),2.77-2.67(m,2H),2.43-2.30(m,1H),2.25-1.95(m,6H),MS(ESI)m/z:482.4[M+H]+
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++
实施例26:6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-1-(6-甲烷磺酰胺吡啶-3-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001321
步骤1:合成6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-1-[6-(N-甲烷磺酰基甲烷磺酰胺基)吡啶-3-基]-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830001322
向1-(6-氨基吡啶-3-基)-6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯盐酸盐(180mg,0.304mmol)于DCM(5mL)中的搅拌溶液添加三乙胺(0.13mL,0.914mmol)并且冷却至0℃,随后添加甲烷磺酰氯(0.03mL,0.365mmol)。使反应混合物缓慢升温至室温并且在室温下搅拌2h。用水淬灭反应混合物,并且用DCM(2×10mL)萃取产物。经无水硫酸钠干燥合并的有机层并且蒸发,得到呈浅棕色固体状的6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-1-[6-(N-甲烷磺酰基甲烷磺酰胺基)吡啶-3-基]-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(200mg,粗产物)。MS(ESI)m/z:710.2[M+H]+
步骤2.合成6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-1-(6-甲烷磺酰胺基吡啶-3-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001331
实验程序如上文所描述,以获得呈灰白色固体状的6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}-吡咯烷-1-基]-1-(6-甲烷磺酰胺基吡啶-3-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(20mg,12%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)15.03(brs,1H),11.15(s,1H),8.64(d,J=8.4Hz,1H),8.54(t,J=6.4Hz,1H),8.17(s,1H),8.02-7.95(m,1H),7.90-7.89(dd,J=5.2,1.6Hz,1H),7.79(d,J=5.6Hz,1H),7.19-7.03(m,1H),6.94(dd,J=7.6,5.2Hz,1H),6.37(s,1H),4.78(s,1H),4.34-4.25(m,2H),3.51-3.47(m,1H),3.40(s,3H),3.19-3.18(m,1H),2.34-2.24(m,1H),1.99-1.91(m,2H),1.85-1.78(m,1H),MS(ESI)m/z:604.2[M+H]+
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例27:合成(R)-6-氟-1-(6-羟基吡嗪-2-基)-4-氧代-7-(2-((吡啶-2-基氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001332
步骤1:合成6-氟-1-(6-羟基吡嗪-2-基)-4-氧代-7-[(2R)-2-[(吡啶-2-基氧基)甲基]吡咯烷-1-基]-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830001341
在氮气气氛下向1-[6-(苯甲氧基)吡嗪-2-基]-6-氟-4-氧代-7-[(2R)-2-[(吡啶-2-基氧基)甲基]吡咯烷-1-基]-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(300mg,503μmol)于MeOH(10mL)中的搅拌溶液添加10% Pd/C(106mg,1.00mmol)。在室温下使反应混合物经受氢化(在氢气、气球压力下)6h。使反应混合物经由硅藻土垫过滤,用10%MeOH/DCM(100mL)洗涤硅藻土垫。在减压下浓缩合并的滤液,得到呈灰白色固体状的6-氟-1-(6-羟基吡嗪-2-基)-4-氧代-7-[(2R)-2-[(吡啶-2-基氧基)甲基]吡咯烷-1-基]-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(140mg,55.1%)。MS(ESI)m/z:506.1[M+H]+
步骤2:合成6-氟-1-(6-羟基吡嗪-2-基)-4-氧代-7-[(2R)-2-[(吡啶-2-基氧基)甲基]吡咯烷-1-基]-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001342
将6-氟-1-(6-羟基吡嗪-2-基)-4-氧代-7-[(2R)-2-[(吡啶-2-基氧基)甲基]吡咯烷-1-基]-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(150mg,296μmol)于THF(5mL)和水(1mL)中的经搅拌溶液冷却至0℃,向其添加LiOH.H2O(62.1mg,1.48mmol)并且使反应混合物缓慢升温至室温并且搅拌16h。在减压下蒸馏过量溶剂。将所获得的残留物用水稀释并且用1N HCl酸化至pH3-4,并且用10% MeOH/DCM萃取产物。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥、过滤并且在减压下蒸发。所获得的粗物质用IPA和醚(1:1比率,50mL)湿磨并且在真空下干燥,得到呈浅绿色固体状的6-氟-1-(6-羟基吡嗪-2-基)-4-氧代-7-[(2R)-2-[(吡啶-2-基氧基)甲基]吡咯烷-1-基]-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(58.1mg,41.2%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ15.20(s,1H),12.80(brs,1H),8.81(s,1H),8.41(brs,1H),8.25(brs,1H),8.01-7.99(m,1H),7.88(d,J=14.8Hz,1H),7.67-7.63(m,1H),6.94-6.91(m,1H),6.66(d,J=8.0Hz,1H),6.48(d,J=7.6Hz,1H),4.52-4.48(m,1H),4.27-4.19(m,2H),3.47-3.42(m,1H),3.16(brs,1H),2.09-1.89(m,4H),MS:478.3[M+H]+
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)+++
实施例28:合成(R)-1-(6-(3-氨基氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-6-氯-7-(2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001351
步骤1:合成(1-(5-硝基吡啶-2-基)氮杂环丁-3-基)氨基甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830001352
在0℃下向2-氯-5-硝基吡啶(1g,6.30mmol)于ACN(10mL)中的搅拌溶液添加N-(氮杂环丁-3-基)氨基甲酸叔丁酯(1.30g,7.56mmol)和碳酸钾(1.74g,12.6mmol)。将反应混合物加热至80℃并且搅拌16h。将反应混合物冷却至室温,添加冰冷水并且用乙酸乙酯萃取产物。将合并的有机层经Na2SO4干燥并且在减压下浓缩。通过柱色谱(以20-25% EtOAc/己烷洗脱)纯化所得粗物质。将含有产物的相关洗脱份合并且在减压下蒸发至干燥,得到呈黄色固体状的(1-(5-硝基吡啶-2-基)氮杂环丁-3-基)氨基甲酸叔丁酯(800mg,44%),MS(ESI)m/z:294.9[M+H]+
步骤2:合成((1-(5-氨基吡啶-2-基)氮杂环丁-3-基)氨基甲酸叔丁酯)
Figure BDA0003923073830001361
在氮气气氛下在室温下向N-[1-(5-硝基吡啶-2-基)氮杂环丁-3-基]氨基甲酸叔丁酯(800mg,2.71mmol)于MeOH(20mL)中的搅拌溶液添加Pd/C(433mg,2.71mmol)。使用H2气球将反应混合物氢化6h的时间段。反应完成后,将反应混合物经由硅藻土垫过滤,进一步用MeOH洗涤硅藻土垫并且在减压下浓缩滤液,得到呈棕色液体状的N-[1-(5-氨基吡啶-2-基)氮杂环丁-3-基]氨基甲酸叔丁酯(600mg,85%)并且无需纯化即采用。
步骤3:合成(R)-1-(6-(3-((叔丁氧羰基)氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-6-氯-7-(2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830001362
在室温下向(2Z)-2-[(Z)-5-氯-4-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-2-氟苯甲酰基]-3-乙氧基丙-2-烯酸乙酯(400mg,782μmol)于DMSO(3mL)中的搅拌溶液添加N-[1-(5-氨基吡啶-2-基)氮杂环丁-3-基]氨基甲酸叔丁酯(399mg,1.51mmol)并且在室温下搅拌2h。接着,在相同温度下将碳酸钾(161mg,1.25mmol)添加至反应混合物中,将混合物加热至80℃并且搅拌6h。将反应混合物冷却至室温并且添加冰冷水,将沉淀的固体通过过滤收集,用水洗涤并且干燥。将所得物质用于乙酸乙酯中的木炭处理并且搅拌10min,经由硅藻土垫过滤并且用EtOAc洗涤硅藻土垫。将合并的滤液在减压下浓缩,得到呈棕色固体状的1-[6-(3-{[(叔丁氧基)羰基]氨基}氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基]-6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(280mg,50%),MS(ESI)m/z:709.3[M+H]+
步骤4:合成(R)-1-(6-(3-((叔丁氧羰基)氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-6-氯-7-(2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001371
在0℃下向1-[6-(3-{[(叔丁氧基)羰基]氨基}氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基]-6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(250mg,352μmol)于THF(2mL)和水(2mL)中的搅拌溶液添加LiOH.H2O(41.9mg,1.75mmol)。使反应混合物缓慢升温至室温并且搅拌4h。在减压下去除过量溶剂,将所得粗物质用水(5mL)稀释并且用1N HCl酸化。将沉淀的固体通过过滤收集,用水洗涤并且在真空下干燥,得到呈棕色固体状的1-[6-(3-{[(叔丁氧基)羰基]氨基}氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基]-6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(200mg,74%),MS m/z:681.2[M+H]+
步骤5:合成(R)-1-(6-(3-氨基氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-6-氯-7-(2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001381
在0℃下将4M于二噁烷(2mL)中的HCl添加至1-[6-(3-{[(叔丁氧基)羰基]氨基}氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基]-6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(200mg,366μmol)的经搅拌溶液。使反应混合物缓慢升温至室温并且搅拌6h。在减压下去除溶剂并且通过制备型HPLC纯化粗物质。将洗脱份冻干,得到呈灰白色固体状的1-[6-(3-氨基氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基]-6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(50.0mg 29%)。
1H-NMR(400MHz,DMSO-d6):δ8.48(d,J=8.0Hz,1H),8.24(d,J=2.4Hz,1H),8.15(s,1H),7.89-7.90(m,1H),7.81(dd,J=8.0,1.60Hz,1H),7.71-7.64(m,1H),6.96-6.91(m,1H),6.58-6.33(m,2H),4.76-4.66(m,1H),4.36-4.19(m,4H),3.99-3.93(m,1H),3.76-3.72(m,2H),3.57-3.47(m,1H),3.21-3.17(m,1H),2.26-2.24(m,1H),1.98-1.90(m,2H),1.81-1.78(m,1H)。(未观测到COOH和NH2质子)MS m/z:581.3[M+H]+
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例29:合成(R)-1-环丙基-6,8-二氟-4-氧代-7-(2-((哒嗪-3-基氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001391
在室温下,向3-{[(2R)-吡咯烷-2-基]甲氧基}哒嗪盐酸盐(200mg,927μmol)于DMSO(4mL)中的搅拌溶液添加三乙胺(233mg,2.31mmol),之后添加1-环丙基-6,7,8-三氟-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(131mg,463μmol)。将反应混合物在100℃下搅拌16h。接着,冷却至室温,添加水(10ml)并且用EtOAc(2×20mL)萃取产物。将合并的有机层用H2O(15mL),之后盐水溶液(15mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥并且在减压下浓缩。使粗产物经受硅胶色谱(100-200目)并且通过使用5-10% MeOH/DCM自柱洗脱。将含有产物的相关洗脱份合并且蒸发至干燥,得到呈浅黄色固体状的1-环丙基-6,8-二氟-4-氧代-7-[(2R)-2-[(哒嗪-3-基氧基)甲基]吡咯烷-1-基]-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(7.71mg,2%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ14.89(s,1H),8.80(dd,J=4.4,1.2Hz,1H),8.63(s,1H),7.71(dd,J=12.8,1.2Hz,1H),7.49(dd,J=8.8,1.2Hz,1H),6.90(dd,J=8.8,1.2Hz,1H),4.67(brs,1H),4.56-4.54(m,1H),4.49-4.47(m,1H),4.10-4.02(m,1H),3.90-3.82(m,1H),3.50-3.40(m,1H),2.38-2.28(m,1H),2.10-2.00(m,1H),1.92-1.82(m,2H),1.18-1.11(m,4H),MS(ESI)m/z:443.3[M+H]+
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)+++
实施例30:合成3(R)-6-氟-1-(3-甲氧基环丁基)-7-(2-(((3-甲基吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001401
步骤1:合成(2Z)-2-[(Z)-2,5-二氟-4-[(2R)-2-{[(3-甲基吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]苯甲酰基]-3-(二甲氨基)丙-2-烯酸乙酯
Figure BDA0003923073830001402
向3-{2,5-二氟-4-[(2R)-2-{[(3-甲基吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]苯基}-3-氧代丙酸乙酯(300mg,716μmol)于甲苯(5mL)中的搅拌溶液添加(二甲氧基甲基)二甲胺(85.3mg,716μmol),将反应混合物加热至80℃并且搅拌6h。将反应混合物冷却至室温,蒸发溶剂并且使所获得的残留物与甲苯(10mL)共沸,得到呈棕色液体状的(2Z)-2-[(Z)-2,5-二氟-4-[(2R)-2-{[(3-甲基吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]苯甲酰基]-3-(二甲氨基)丙-2-烯酸乙酯(248mg,粗产物)。所述物质不经进一步纯化即用于下一步骤。MS(ESI)474.1[M+H]+
步骤2:合成(R)-乙基6-氟-1-(3-甲氧基环丁基)-7-(2-(((3-甲基吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸酯
Figure BDA0003923073830001403
向(2Z)-2-[(Z)-2,5-二氟-4-[(2R)-2-{[(3-甲基吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]苯甲酰基]-3-(二甲氨基)丙-2-烯酸乙酯(250mg,527μmol)于THF(5mL)中的搅拌溶液添加3-甲氧基环丁-1-胺盐酸盐(86.9mg,632μmol)和三乙胺(95.5μL,685μmol)。在室温下搅拌反应混合物6h。在反应完成之后,在减压下去除溶剂。将所获得的粗物质溶解于DMF(5mL)中,添加碳酸钾(72.8mg,527μmol)并且将反应混合物加热至85℃,搅拌2h。冷却反应混合物,添加冰冷水(10mL)并且用乙酸乙酯(2×30mL)萃取产物。将合并的有机层用盐水溶液(15mL)洗涤,经硫酸钠干燥并且蒸发,得到粗产物。通过硅胶柱色谱(100-200目)使用45-50% EtOAc/己烷来纯化粗产物。将含有产物的相关洗脱份合并且在减压下蒸馏,得到呈棕色固体状的6-氟-1-(3-甲氧基环丁基)-7-[(2R)-2-{[(3-甲基吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(163mg,61%)。MS(ESI)510.2[M+H]+
步骤3:合成(R)-6-氟-1-(3-甲氧基环丁基)-7-(2-(((3-甲基吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001411
在0℃下向6-氟-1-(3-甲氧基环丁基)-7-[(2R)-2-{[(3-甲基吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(115mg,225μmol)于THF:水(1:1,6mL)中的搅拌溶液添加LiOH.H2O(28.3mg,675μmol)并且将反应混合物在室温下搅拌6h。将反应混合物再冷却至0℃并且通过使用1N HCl将pH调节至2-3,将沉淀的固体过滤,用于二乙醚中的10% IPA洗涤并且在真空下干燥。此外,使用ACN/水冻干固体物质,得到呈浅棕色固体状的6-氟-1-(3-甲氧基环丁基)-7-[(2R)-2-{[(3-甲基吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(50.8mg 47%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ15.52(s,1H),8.52(s,1H),7.89(d,J=4.0Hz,1H),7.83(d,J=14.8Hz,1H),7.48(d,J=6.4Hz,1H),6.86-6.83(m,1H),6.78(d,J=7.2Hz,1H),4.73-4.68(m,2H),4.40-4.37(m,1H),4.32-4.28(m,1H),3.83-3.76(m,2H),3.59-3.50(m,1H),3.18(s,3H),3.12-3.03(m,2H),2.32-2.12(m,4H),2.10-2.03(m,2H),2.01(s,3H)。MS(ESI)m/z:482.4[M+H]+
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例31:(R)-6-氯-7-(2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-1-(4-(乙基磺酰胺基)苯基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001421
步骤1:合成(R)-乙基6-氯-7-(2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-1-(4-(乙基磺酰胺基)苯基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸酯
Figure BDA0003923073830001422
在0℃下向1-(4-氨基苯基)-6-氯-4-氧代-7-[(2R)-2-[(吡啶-2-基氧基)甲基]吡咯烷-1-基]-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯盐酸盐(100mg,169μmol)于DCM(5mL)中的搅拌溶液添加吡啶(41.2μL,507μmol),之后添加乙烷磺酰氯(32.2μL,338μmol)。使反应混合物缓慢升温至室温并且搅拌3h。在反应完成后,添加冰冷水(15mL)并且用DCM(2×15mL)萃取产物。将合并的有机层用盐水(15mL)洗涤并且经硫酸钠干燥并且蒸发至干燥。将所得粗物质用二乙醚和戊烷湿磨,得到呈浅黄色固体状的(R)-6-氯-7-(2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-1-(4-(乙基磺酰胺基)苯基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(73.3mg,71.1%)。MS(ESI)m/z:645.2[M+H]+
步骤2:合成(R)-6-氯-7-(2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-1-(4-(乙基磺酰胺基)苯基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001431
实验程序如上文所描述,以获得呈浅黄色固体状的(R)-6-氯-7-(2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-1-(4-(乙基磺酰胺基)苯基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(42.7mg,61.2%)。1H-NMR(400MHz,DMSO-d6):δ15.07(s,1H),10.26(bs,1H),8.55(s,1H),8.16(s,1H),7.87-7.88(m,1H),7.81-7.79(m,1H),7.58-7.46(m,3H),7.35(d,J=8.0Hz,1H),6.94-6.91(m,1H),6.34(s,1H),4.74(bs,1H),4.29-4.25(m,2H),3.42-3.38(m,1H),3.22(q,J=7.2Hz,2H),3.14(t,J=8.0Hz,1H),2.33-2.21(m,1H),2.02-1.88(m,2H),1.82-1.75(m,1H),1.23(t,J=7.6Hz,3H),MS(ESI)m/z:617.2[M+H]+
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例32:(R)-6-氟-1-(4-氟吲哚啉-5-基)-4-氧代-7-(2-((吡啶-2-基氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001432
步骤1:合成4-氟吲哚啉-5-胺
Figure BDA0003923073830001441
在室温下向4-氟-5-硝基-2,3-二氢-1H-吲哚(550mg,3.01mmol,参考:WO2017/153952)于乙酸乙酯(5mL)和水(5mL)中的搅拌溶液添加铁(670mg,12.0mmol)和氯化铵(1.28g,24.0mmol)并且将反应混合物在60℃下搅拌12h。将反应混合物冷却至室温并且经由硅藻土床过滤,用EtOAc(50mL)洗涤硅藻土垫。将有机层用盐水洗涤,经硫酸钠干燥并且蒸发至干燥。通过硅胶柱色谱(100-200目)通过使用10-15% EtOAc/己烷作为洗脱剂来纯化粗产物。将含有产物的相关洗脱份合并且蒸发至干燥,得到呈棕色固体状的4-氟-2,3-二氢-1H-吲哚-5-胺(280mg,61%)。MS(ESI)m/z:153.5
步骤2:合成(R)-6-氟-1-(4-氟吲哚啉-5-基)-4-氧代-7-(2-((吡啶-2-基氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830001442
实验程序如上文所描述,以获得呈棕色固体状的(R)-6-氟-1-(4-氟吲哚啉-5-基)-4-氧代-7-(2-((吡啶-2-基氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(200mg,56.17%)。MS(ESI)m/z:547.3[M+H]+
步骤3:合成(R)-6-氟-1-(4-氟吲哚啉-5-基)-4-氧代-7-(2-((吡啶-2-基氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001451
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实验程序如上文所描述,以获得呈浅棕色固体状的(R)-6-氟-1-(4-氟吲哚啉-5-基)-4-氧代-7-(2-((吡啶-2-基氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(45mg,23.8%)。1H-NMR(400MHz,DMSO-d6):δ15.32(bs,1H),8.52(bs,1H),8.04(bs,1H),7.88(d,J=13.6Hz,1H),7.68-7.66(m,1H),7.24-7.18(m,1H),6.96(s,1H),6.72-6.67(m,1H),6.45(d,J=8.0Hz,0.5H),6.34(bs,1H),6.26(d,J=8.0Hz,0.5H),6.19-6.16(m,1H),4.41-4.33(m,1H),4.23-4.16(m,2H),3.64-3.51(m,2H),3.42(s,1H),3.10-5.08(m,1H),2.93-2.90(m,1H),2.68-2.50(m,1H),2.06-1.93(m,4H),MS(ESI)m/z:519.3[M+H]+
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例33:6-氯-1-(5-羟基吡嗪-2-基)-4-氧代-7-[(2R)-2-[(吡啶-2-基氧基)甲基]吡咯烷-1-基]-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001452
步骤1:合成1-[5-(苯甲氧基)吡嗪-2-基]-6-氯-4-氧代-7-[(2R)-2-[(吡啶-2-基氧基)甲基]吡咯烷-1-基]-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830001461
向(R,Z)-2-(5-氯-2-氟-4-(2-((吡啶-2-基氧基)甲基)吡咯烷-1-基)苯甲酰基)-3-乙氧基丙烯酸乙酯(450mg,1.06mmol)于DMSO(7mL)中的搅拌溶液添加5-(苯甲基氧-基)吡嗪-2-胺(213mg,1.06mmol)并且在室温下搅拌反应混合物2h。在起始物质完成(通过TLC监测)后,添加碳酸钾(146mg,1.06mmol)并且在80℃下搅拌反应混合物2h。将反应混合物冷却至室温,倒入冰冷水(15mL)中,这产生沉淀。通过过滤收集所沉淀的固体并且用水(50mL)和己烷(10mL)洗涤,得到呈浅棕色固体状的1-[5-(苯甲氧基)吡嗪-2-基]-6-氯-4-氧代-7-[(2R)-2-[(吡啶-2-基氧基)甲基]吡咯烷-1-基]-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(260mg,424μmol,40%)。MS(ESI)m/z:612.3[M+H]+
步骤2:合成[6-氯-1-(5-羟基吡嗪-2-基)-4-氧代-7-[(2R)-2-[(吡啶-2-基氧基)甲基]吡咯烷-1-基]-1,4-二氢喹啉-3-甲酸]
Figure BDA0003923073830001462
在0℃下在N2气氛下向1-[5-(苯甲氧基)吡嗪-2-基]-6-氯-4-氧代-7-[(2R)-2-[(吡啶-2-基氧基)甲基]吡咯烷-1-基]-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(500mg,816μmol)于DCM(30mL)中的搅拌溶液添加于DCM中的三溴化硼溶液1.0M(20.7mL,122mmol)。在室温下搅拌所得混合物16h。反应完成(通过TLC监测)后,将反应混合物用冰冷水(20mL)淬灭并且用EtOAc(3×25mL)萃取。将合并的有机层用木炭(200mg)处理,接着经由硅藻土垫过滤并且在减压下浓缩,得到粗化合物,其通过制备型HPLC纯化来纯化,得到呈灰白色固体状的6-氯-1-(5-羟基吡嗪-2-基)-4-氧代-7-[(2R)-2-[(吡啶-2-基氧基)甲基-l]吡咯烷-1-基]-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(27.3mg,7%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ15.05(brs,1H),8.79(s,1H),8.16(s,1H),8.08(brs,1H),8.00-7.97(m,1H),7.75(brs,1H),7.65-7.59(m,1H),6.92-6.88(m,1H),6.67(s,1H),6.60(d,J=8.0Hz,1H),4.70-4.60(m,1H),4.25-4.13(m,2H),3.71-3.67(m,1H),3.53-3.43(m,1H),2.24-2.21(m,1H),1.92-1.89(m,1H),1.88-1.77(m,2H);MS(ESI)m/z:494.3[M+H]+
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例34:6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-1-[1-(2-羟乙基)氮杂环丁-3-基]-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001471
步骤1:合成1-{1-[(叔丁氧基)羰基]氮杂环丁-3-基}-6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830001472
在室温下向(2Z)-2-[(Z)-5-氯-4-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-2-氟苯甲酰基]-3-乙氧基丙-2-烯酸乙酯(800mg,1.56mmol)于DMSO(8mL)中的搅拌溶液添加3-氨基氮杂环丁-1-甲酸叔丁酯(322mg,1.87mmol)。在室温下搅拌反应混合物2h。起始物质完成(通过TLC监测)后,添加碳酸钾(538mg,3.90mmol)并且在80℃下搅拌16h。反应完成(通过LCMS监测)后,使反应混合物逐渐冷却,用冰冷水淬灭并且过滤所沉淀的固体,并且用水(20ml)洗涤。将所获得固体产物溶解于EtOAc(25ml)中并且用木炭处理并且经由硅藻土床过滤。在真空下浓缩滤液并且用10% EtOAc/戊烷(20ml)湿磨,得到呈棕色固体状的1-{1-[(叔丁氧基)羰基]氮杂环丁-3-基}-6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(398mg,41%)。MS(ESI)m/z 617.3[M+H]+
步骤2:合成1-(氮杂环丁-3-基)-6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830001481
1-{1-[(叔丁氧基)羰基]氮杂环丁-3-基}-6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(500mg,809μmol)于二噁烷(5mL)中的经搅拌溶液在冰浴下冷却并且向其添加4.0M于二噁烷(5mL)中的HCl。在室温下搅拌反应混合物2h。将过量溶剂在真空下去除并且用二乙醚(2×20ml)湿磨,得到呈黄色固体状的1-(氮杂环丁-3-基)-6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(328mg,78%)。MS(ESI)m/z 517.2[M+H]+
步骤3:合成1-(1-{2-[(叔丁基二甲基硅烷基)氧基]乙基}氮杂环丁-3-基)-6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830001491
向1-(氮杂环丁-3-基)-6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(150mg,289μmol)于ACN(5mL)中的搅拌溶液添加三乙胺(200μL,1.44mmol)并且在室温下搅拌15分钟并且在室温下添加(2-溴乙氧基)(叔丁基)二甲基硅烷(82.7mg,346μmol)。在80℃下搅拌反应混合物24h。反应完成(通过TLC监测)后,将过量溶剂在真空下去除并且用EtOAc(20ml)稀释并且用水(20ml)和盐水(20ml)洗涤。经无水硫酸钠干燥有机层并且经木炭处理并且经由硅藻土床过滤并且在真空下浓缩,得到呈黄色油状的1-(1-{2-[(叔丁基二甲基硅烷基)氧基]乙基}氮杂环丁-3-基)-6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(100mg,46%)。MS(ESI)m/z 675.4[M+H]+
步骤4:合成6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-1-[1-(2-羟乙基)氮杂环丁-3-基]-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001492
在10-15℃下向1-(1-{2-[(叔丁基二甲基硅烷基)氧基]乙基}氮杂环丁-3-基)-6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(100mg,132μmol)于DCM(10mL)中的经搅拌溶液逐滴添加于DCM(1mL)中的BBr31.0M。在室温下搅拌反应混合物4h。反应完成(通过TLC监测)后,将过量溶剂在真空下去除并且用EtOAc(30ml)稀释并且用水(2×20mL)洗涤。经无水硫酸钠干燥有机层并且在真空下浓缩,得到粗化合物。通过制备型HPLC纯化粗产物并且将所收集的纯洗脱份冻干,得到呈灰白色固体状的6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-1-[1-(2-羟乙基)氮杂环丁-3-基]-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(10.6mg,15%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)15.25(brs,1H),8.66(s,1H),8.13(s,1H),7.97(dd,J=4.8,1.6Hz,1H),7.79(dd,J=7.9,1.6Hz,1H),6.98(brs,1H),6.92(dd,J=7.6,4.8Hz,1H),5.26-5.15,(m,1H),4.97-4.92(m,1H),4.48(t,J=5.6Hz,1H),4.42-4.36(m,2H),3.95(t,J=6.8Hz,1H),3.88-3.19(m,2H),3.43-3.28(m,5H),2.68-2.49(m,2H),2.34-2.29(m,1H),2.09-1.85(m,3H)。MS(ESI)m/z 533.3[M+H]+
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)+++
实施例35:6-氰基-1-(1-甲基环丙基)-7-[(2R)-2-{[(3-甲基吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001501
步骤1:合成3-(5-溴-2,4-二氟苯基)-3-氧代丙酸乙酯
Figure BDA0003923073830001502
在0℃下向5-溴-2,4-二氟苯甲酸(2.5g,10.5mmol)于THF(50mL)中的搅拌溶液添加羰基二咪唑(3.40g,21.0mmol)并且在室温下搅拌2h。接着,向反应混合物添加三乙胺(4.38mL,31.5mmol)、1-乙基3-丙二酸钾(2.67g,15.7mmol)和氯化镁(799mg,8.40mmol)并且在室温下搅拌16h。反应完成后,反应混合物用冰冷水(50mL)淬灭并且用EtOAc(2×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(20mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥,在真空下浓缩,得到粗化合物。通过柱色谱用10%EtOAC/己烷作为洗脱剂纯化粗化合物,得到呈浅黄色固体状的3-(5-溴-2,4-二氟苯基)-3-氧代丙酸乙酯(2.00g,62%)。1H NMR(400MHz,CDCl3):δ8.20(t,J=7.6Hz,1H),7.00-6.93(m,1H),4.23-4.18(m,2H),3.94(d,J=3.6Hz,2H),1.28(t,J=3.2Hz,3H)
步骤2:合成6-溴-7-氟-1-(1-甲基环丙基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830001511
在室温下向3-(5-溴-2,4-二氟苯基)-3-氧代丙酸乙酯(1.5g,4.88mmol)于原甲酸三乙酯(1.21mL,7.32mmol)中的搅拌溶液添加乙酸酐(691μL,7.32mmol)。接着将反应物加热至155℃并且搅拌4h。起始物质完成后(通过TLC监测),在减压下浓缩反应混合物并且与甲苯(2×5mL)共蒸馏,得到粗化合物。将粗化合物溶解于DMSO(15mL)中,在室温下添加1-甲基环丙-1-胺·HCl(347mg,4.88mmol)和三乙胺(882μL,6.34mmol),并且搅拌2h。接着,在室温下将碳酸钾(674mg,4.88mmol)添加至反应混合物中。在80℃下搅拌混合物2h。反应完成后,使反应混合物冷却至室温,用冰冷水(50mL)淬灭,这产生沉淀。将沉淀的固体过滤,用水和二乙醚洗涤,在减压下干燥,得到呈棕色固体状的6-溴-7-氟-1-(1-甲基环丙基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(1.47g,82%)。MS(ESI)m/z:367.9[M+H]+
步骤3:合成6-溴-1-(1-甲基环丙基)-7-[(2R)-2-{[(3-甲基吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830001521
在室温下向3-甲基-2-{[(2S)-吡咯烷-2-基]甲氧基}吡啶盐酸盐(651mg,2.85mmol)于DMF(14mL)中的搅拌溶液添加三乙胺(264μL,1.90mmol)和三级丁醇钾(639mg,5.70mmol)并且搅拌10min。接着,在室温下将6-溴-7-氟-1-(1-甲基环丙基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(700mg,1.90mmol)添加至反应混合物,并且在130℃下搅拌反应物16h。反应完成后,使反应混合物冷却至0℃,用冰冷水(5mL)淬灭,这产生沉淀。将沉淀的固体过滤,用水和二乙醚洗涤,在减压下干燥,得到呈棕色固体状的6-溴-1-(1-甲基环丙基)-7-[(2R)-2-{[(3-甲基吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(108mg,10%)。MS(ESI)m/z:540.2[M+H]+
步骤4:合成6-氰基-1-(1-甲基环丙基)-7-[(2R)-2-{[(3-甲基吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830001522
在室温下向6-溴-1-(1-甲基环丙基)-7-[(2R)-2-{[(3-甲基吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(108mg,199μmol)于NMP(3mL)中的搅拌溶液添加氰化铜(I)(35.6mg,398μmol)并且在密封管中用氩气脱气10min。在160℃下搅拌反应物16h。反应完成后,使反应混合物冷却至室温,用冰冷水(10mL)稀释并且用10%MeOH/DCM(2×10mL)萃取。将合并的有机层用盐水(15mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥,在减压下浓缩,得到呈棕色固体状的6-氰基-1-(1-甲基环丙基)-7-[(2R)-2-{[(3-甲基吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(72.0mg,74%)。MS(ESI)m/z:487.4[M+H]+
步骤5:合成6-氰基-1-(1-甲基环丙基)-7-[(2R)-2-{[(3-甲基吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001531
向6-氰基-1-(1-甲基环丙基)-7-[(2R)-2-{[(3-甲基吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(72mg,147μmol)于THF(0.72mL)、EtOH(0.72mL)和水(0.72mL)的混合物中的经搅拌溶液加LiOH.H2O(30.8mg,735μmol)。在室温下搅拌反应混合物2h。在起始物质完成后,将反应混合物在减压下浓缩,并且将粗化合物用冰冷水淬灭并且用1N HCl(pH~3)酸化,这产生沉淀。将沉淀的固体过滤,干燥并且通过制备型HPLC纯化,并且将洗脱份冻干,得到呈灰白色固体状的6-氰基-1-(1-甲基环丙基)-7-[(2R)-2-{[(3-甲基吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(44.5mg,66%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6,VT):δ14.78(s,1H),8.71(s,1H),8.40(s,1H),7.84-7.82(m,1H),7.46-7.43(m,1H),7.14(s,1H),6.80(dd,J=6.8,4.8Hz 1H),4.93-4.90(m,1H),4.50(d,J=5.2Hz,2H),3.94-3.91(m,1H),3.73-3.69(m,1H),2.35-2.06(m,4H),2.07(s,3H),1.57(s,3H),1.41-1.16(m,4H)。MS(ESI)m/z:459.4[M+H]+
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例36:1-(1-乙酰基氮杂环丁-3-基)-6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-甲基吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001541
在0℃下向1-(氮杂环丁-3-基)-6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-甲基吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(100mg,196μmol)于DCM(6mL)中的搅拌溶液添加三乙胺(81.9μL,588μmol),之后添加氯化乙酰基(13.9μL,196μmol),接着将反应混合物在室温下搅拌3h。起始物质完成后,用冰冷水淬灭反应混合物并且用DCM(2×50mL)萃取。将合并的有机层用水(10mL)和盐水(10mL)溶液洗涤,经无水硫酸钠干燥并且在减压下浓缩,得到粗化合物。通过制备型HPLC纯化粗化合物,得到呈粉棕色固体状的所需1-(1-乙酰基氮杂环丁-3-基)-6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-甲基吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(19.6mg,20%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6,VT)δ14.90(s,1H),8.73(s,1H),8.16(s,1H),7.81(dd,J=3.6,1.2Hz,1H),7.39(dd,J=7.2,0.8Hz,1H),6.91(s,1H),6.76(dd,J=7.2,4.8Hz,1H),5.59-5.09(m,1H),4.98-4.91(m,1H),4.69-4.49(m,3H),4.39(dd,J=11.2,4.8Hz,1H),4.29(dd,J=11.2,5.2Hz,1H),3.91-3.82(m,1H),3.46-3.39(m,1H),2.32-2.28(m,1H),2.08-1.92(m,4H),1.98(s,3H),1.80(s,3H),MS(ESI)m/z:511.3[M+H]+
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)+++
实施例37:6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-1-[1-(2-甲氧基乙基)-3-甲基氮杂环丁-3-基]-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001542
步骤1:合成1-{1-[(叔丁氧基)羰基]-3-甲基氮杂环丁-3-基}-6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830001551
向(2Z)-2-[(Z)-5-氯-4-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-2-氟苯甲酰基]-3-乙氧基丙-2-烯酸乙酯(300mg,586μmol)于DMSO(6mL)中的搅拌溶液添加3-氨基-3-甲基氮杂环丁-1-甲酸叔丁酯(109mg,586μmol)并且在室温下在N2气氛下搅拌2h。在起始物质完成之后,添加碳酸钾(80.9mg,586μmol)并且在80℃下搅拌所得混合物2h。反应完成后,将反应混合物用冰冷水(10mL)淬灭并且用EtOAc(3×20mL)萃取。将合并的有机层用冰冷水(2×10mL)、盐水(10mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥,在减压下浓缩,得到呈浅棕色固体状的1-{1-[(叔丁氧基)羰基]-3-甲基氮杂环丁-3-基}-6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(210mg,57%)。MS(ESI)m/z:631.3[M+H]+
步骤2:合成6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-1-(3-甲基氮杂环丁-3-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯HCl。
Figure BDA0003923073830001552
在0℃下将于二噁烷中的4N HCl添加至1-{1-[(叔丁氧基)羰基]-3-甲基氮杂环丁-3-基}-6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(300mg,332μmol)。将反应混合物在室温下搅拌16h。反应完成后,在减压下浓缩反应混合物,得到粗残留物,其用二乙醚洗涤,得到呈灰白色固体状的6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-1-(3-甲基氮杂环丁-3-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯HCl(180mg,96%)。MS(ESI)m/z:531.2[M+H]+
步骤3:合成6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-1-[1-(2-甲氧基乙基)-3-甲基氮杂环丁-3-基]-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯。
Figure BDA0003923073830001561
在0℃下向6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-1-(3-甲基氮杂环丁-3-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(250mg,338μmol)于乙腈(5mL)中的搅拌溶液添加三乙胺(47.1μL,338μmol)和1-溴-2-甲氧基乙烷(31.7μL,338μmol)。使反应混合物升温至室温并且搅拌16h。在反应完成之后,将反应混合物用冰冷水(5mL)淬灭并且用乙酸乙酯(2×25mL)萃取。将合并的有机层用水(10mL)和盐水溶液(10mL)洗涤,过滤并且在减压下浓缩,得到粗化合物。通过硅胶柱色谱(60-120目)用30%乙酸乙酯洗脱来纯化粗化合物,得到呈黄色固体状的6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-1-[1-(2-甲氧基乙基)-3-甲基氮杂环丁-3-基]-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(250mg,93%)。MS(ESI)m/z:589.2[M+H]+
步骤4:合成6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-1-[1-(2-甲氧基乙基)-3-甲基氮杂环丁-3-基]-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001571
向6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-1-[1-(2-甲氧基乙基)-3-甲基氮杂环丁-3-基]-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(250mg,317μmol)于THF(2.5mL)中的搅拌溶液添加LiOH.H2O(66.2mg,1.58mmol)于水(2.5mL)中的溶液。将所得混合物在室温下搅拌6h。反应完成后,在减压下浓缩直至去除THF,接着用1N HCl(pH>2)酸化水层,这产生沉淀。将所沉淀的固体过滤并且用水之后用己烷洗涤,得到粗化合物。用异丙醇、二乙醚和正戊烷的混合物湿磨粗化合物,得到呈灰白色固体状的6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-1-[1-(2-甲氧基乙基)-3-甲基氮杂环丁-3-基]-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(27mg,15%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ15.16(s,1H),8.34(s,1H),8.16(s,1H),7.92(d,J=4.0Hz,1H),7.80(dd,J=8.0,1.6Hz,1H),6.94-6.91(m,1H),6.47(s,1H),4.92-4.87(m,1H),4.38-4.34(m,2H),3.93-3.79(m,3H),3.52-3.38(m,5H),3.21(s,3H),2.67-2.54(m,2H),2.36-2.29(m,1H),2.10-2.01(m,2H),1.99-1.92(m,1H),1.88(s,3H)。MS(ESI)m/z:561.3[M+H]+
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)+++
实施例38:6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}-吡咯烷-1-基]-1-[1-(2-甲氧基乙基)吡咯烷-3-基]-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001581
步骤1:合成N-[1-(2-甲氧基乙基)吡咯烷-3-基]氨基甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830001582
在室温下在N2气氛下向N-(吡咯烷-3-基)氨基甲酸叔丁酯(200mg,1.07mmol)于MeCN(5mL)中的溶液添加碳酸钾(147mg,1.07mmol)、碘化钾(177mg,1.07mmol)和1-溴-2-甲氧基乙烷(162mg,1.17mmol)。接着将所得溶液在80℃下搅拌16h。在减压下浓缩过量溶剂并且用冰冷水淬灭。用EtOAc(3×10mL)萃取水层。将合并的有机层经硫酸钠干燥并且在减压下浓缩,得到呈黄色液体状的N-[1-(2-甲氧基乙基)吡咯烷-3-基]氨基甲酸叔丁酯(240mg粗产物)。产物未经纯化即可进行下一步骤。MS(ESI)m/z:245.5[M+H]+
步骤2:合成1-(2-甲氧基乙基)吡咯烷-3-胺盐酸盐
Figure BDA0003923073830001583
在0℃下在N2气氛下向N-[1-(2-甲氧基乙基)吡咯烷-3-基]氨基甲酸叔丁酯(250mg,1.02mmol)于二噁烷(3mL)中的搅拌溶液添加4M于1,4-二噁烷(354μL,10.2mmol)中的HCl。使所得混合物缓慢升温至室温并且搅拌6h。在反应完成之后,在减压下浓缩反应混合物。用二乙醚(3×10mL)湿磨粗固体,得到呈浅黄色固体状的1-(2-甲氧基乙基)吡咯烷-3-胺盐酸盐(150mg,81%)。MS(ESI)m/z:145.5[M+H]+
步骤3:合成6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲-基}吡咯烷-1-基]-1-[1-(2-甲氧基乙基)吡咯烷-3-基]-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830001591
向(2Z)-2-[(Z)-5-氯-4-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]-甲基}吡咯烷-1-基]-2-氟苯甲酰基]-3-乙氧基丙-2-烯酸乙酯(300mg,586μmol)于DMSO(4mL)中的搅拌溶液添加1-(2-甲氧基乙基)吡咯烷-3-胺盐酸盐(105mg,586μmol),之后添加三乙胺(59.2mg,586μmol)并且在室温下在N2气氛下搅拌反应混合物2h。接着,添加碳酸钾(80.9mg,586μmol)。将所得混合物在80℃下搅拌2h。反应完成(通过TLC监测)后,将反应混合物用冰冷水(5mL)淬灭,这产生沉淀。通过过滤收集所沉淀的固体并且用水之后用己烷洗涤,接着在真空下干燥,过滤,得到固体。将固体溶解于EtOH中,用木炭处理并且经由硅藻土垫过滤。在减压下浓缩滤液,得到呈浅棕色固体状的6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-1-[1-(2-甲氧基乙基)吡咯烷-3-基]-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(114mg,33%)。MS(ESI)m/z:589.2[M+H]+
步骤4:合成6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}-吡咯烷-1-基]-1-[1-(2-甲氧基乙基)吡咯烷-3-基]-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001601
向6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}-吡咯烷-1-基]-1-[1-(2-甲氧基乙基)吡咯烷-3-基]-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(125mg,212μmol)于THF(3mL)中的搅拌溶液添加LiOH.H2O(44.0mg,1.05mmol)于水(2mL)中的溶液。将所得混合物在室温下搅拌6h。反应完成(通过LCMS监测)后,在减压下浓缩反应混合物,接着用1N HCl(pH为约3)酸化水层,这产生沉淀。通过过滤收集所沉淀的固体并且用水之后用己烷洗涤,得到粗化合物。将其用异丙醇、二乙醚和正戊烷的混合物湿磨,得到呈灰白色固体状的6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}-吡咯烷-1-基]-1-[1-(2-甲氧基乙基)吡咯烷-3-基]-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(24.0mg,20%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6,VT)δ8.93(brs,1H),8.15(s,1H),7.92-7.88(m,1H),7.70(d,J=8.0Hz,1H),7.26(brs,1H),6.90-6.86(m,1H),5.50(brs,1H),5.04(brs,1H),4.47-4.39(m,2H),3.95-3.90(m,1H),3.75-3.50(m,5H),3.49-3.40(m,5H),3.34-3.20(m,2H),2.65-2.55(m,1H),2.55-2.50(m,1H),2.38-2.30(m,1H),2.17-1.85(m,3H)。MS(ESI)m/z:561.3[M+H]+
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)+++
实施例39:6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-1-{1-[2-(二甲氨基)乙基]吡咯烷-3-基}-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001611
步骤1:合成N-{1-[2-(二甲氨基)乙基]吡咯烷-3-基}氨基甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830001612
在室温下在N2气氛下向N-(吡咯烷-3-基)氨基甲酸叔丁酯(500mg,2.68mmol)于乙腈(20mL)中的溶液添加三乙胺(1.11mL,8.04mmol)和1-(2-溴乙基)二甲胺(407mg,2.68mmol)。将所得反应混合物在80℃下在N2气氛下搅拌8h。反应完成(通过TLC监测)后,将反应混合物在减压下浓缩并且用冰冷水淬灭。用EtOAc(2×100mL)萃取水层。将合并的有机层经硫酸钠干燥并且在减压下浓缩,得到呈黄色液体状的N-{1-[2-(二甲氨基)乙基]吡咯烷-3-基}氨基甲酸叔丁酯(550mg,粗产物)。产物未经纯化即可进行下一步骤。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ6.91(s,1H),3.93-3.82(m,1H),2.72-2.66(m,1H),2.56-2.40(m,4H),2.30-2.19(m,3H),2.12(s,6H),2.02-1.94(m,1H),1.55-1.48(m,1H),1.37(s,9H)。
步骤2:合成1-[2-(二甲氨基)乙基]吡咯烷-3-胺盐酸盐
Figure BDA0003923073830001621
在0℃下在N2气氛下将4N于二噁烷(5mL)中的HCl添加至N-{1-[2-(二甲氨基)乙基]吡咯烷-3-基}氨基甲酸酯叔丁酯(500mg,1.94mmol)并且在室温下搅拌2h。反应完成(通过TLC监测)后,在减压下浓缩反应混合物以去除挥发性溶剂。用二乙醚(3×50mL)和正戊烷洗涤粗固体,得到呈棕色固体状的1-[2-(二甲氨基)乙基]吡咯烷-3-胺盐酸盐(250mg,67%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.50(brs,2H),3.93-3.87(m,1H),3.56-3.39(m,4H),3.29-3.21(m,4H),2.81(s,6H),2.33-2.16(m,1H),2.08-1.98(m,1H)。
步骤3:合成6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-1-{1-[2-(二甲氨基)乙基]吡咯烷-3-基}-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830001622
/>
向(2Z)-2-[(Z)-5-氯-4-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-2-氟苯甲酰基]-3-乙氧基丙-2-烯酸乙酯(300mg,586μmol)于DMSO(3mL)中的搅拌溶液添加1-[2-(二甲氨基)乙基]吡咯烷-3-胺盐酸盐(138mg,878μmol),之后添加三乙胺(162μL,1.17mmol)并且在室温下在N2气氛下搅拌反应混合物2h。起始物质完成后,添加碳酸钾(241mg,1.75mmol)并且在80℃下搅拌混合物2h。接着,使反应混合物冷却并且用冰冷水(5mL)淬灭,这产生沉淀。通过过滤收集所沉淀的固体并且用水之后用己烷洗涤,接着在真空下干燥,过滤,得到固体。将固体溶解于EtOH中,用木炭处理并且经由硅藻土垫过滤。在减压下浓缩滤液,得到呈浅棕色固体状的6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-1-{1-[2-(二甲氨基)乙基]吡咯烷-3-基}-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(124mg,35%)。MS(ESI)m/z:602.3[M+H]+
步骤4:合成6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-1-{1-[2-(二甲氨基)乙基]吡咯烷-3-基}-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001631
向6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-1-{1-[2-(二甲氨基)乙基]吡咯烷-3-基}-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(100mg,165μmol)于THF(3mL):水(3mL)的混合物中的搅拌溶液添加LiOH.H2O(34.6mg,825μmol)。将所得反应混合物在室温下搅拌2h。反应完成(通过TLC监测)后,在减压下浓缩反应混合物,接着用1N HCl(pH为约3)酸化水层,这产生沉淀。通过过滤收集所沉淀的固体并且通过制备型HPLC纯化,得到呈黄色固体状的6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-1-{1-[2-(二甲氨基)乙基]吡咯烷-3-基}-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(14.2mg,15%)。1HNMR(400MHz,DMSO-d6,VT)δ15.31(brs,1H),9.04(s,1H),8.14(s,1H),7.90-7.88(m,1H),7.73-7.70(m,1H),7.52-7.41(m,1H),6.90-6.86(m,1H),5.41(brs,1H),4.95(brs,1H),4.44-4.41(m,2H),3.92-3.89(m,1H),3.37-3.32(m,2H),3.19-3.15(m,1H),2.68-2.54(m,4H),2.49-2.42(m,2H),2.32-2.27(m,3H),2.19(s,6H),2.07-2.01(m,1H),1.92-1.85(m,2H),MS(ESI)m/z:574.3[M+H]+
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++
实施例40:(R)-1-(6-氨基吡啶-3-基)-6-氯-7-(2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001641
步骤1:合成3-(5-氯-2,4-二氟苯基)-3-氧代丙酸乙酯
Figure BDA0003923073830001642
在0℃下向5-氯-2,4-二氟苯甲酸(100g,519mmol)于THF(1000mL)中的搅拌溶液逐滴添加于THF(1000mL)中的CDI(168g,1.03mol)。使反应混合物缓慢升温至室温并且在相同温度下搅拌1h。反应完成(通过TLC)后,在室温下添加丙二酸单乙酯钾盐(132.6g,775mmol)、氯化镁(39.4g,413mmol,之后添加三乙胺(220mL,1.57mmol)并且持续搅拌16h的时间段。反应完成(通过TLC)后,在减压下蒸发反应混合物。用水(4000mL)稀释所得残留物并且用EtOAc(3×3000mL)萃取。将合并的有机层用盐水溶液(2000mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥并且蒸发至干燥,得到粘性物质。此外,将其用甲醇(400mL)湿磨,将所沉淀的固体通过过滤收集并且在真空下干燥,得到呈灰白色固体状的3-(5-氯-2,4-二氟苯基)-3-氧代丙酸乙酯(85.8g,63%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ7.86(dd,J=8.8,1.2Hz,1H),7.47(t,J=10.4Hz,1H),5.12(s,1H),4.01(q,J=7.2Hz,2H),1.16(t,J=7.2Hz,3H)。
步骤2:合成(R)-叔丁基2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-甲酸酯
Figure BDA0003923073830001651
在0℃下将于THF(500mL)中的叔丁基(R)-2-(羟甲基)吡咯烷-1-甲酸酯(80g,397mmol)添加至氢化钠(15g,357mmol)于THF(150mL)中的搅拌悬浮液并且在相同温度下持续搅拌1h,随后添加于THF(30mL)中的2,3-二氯吡啶(64.6g,437mmol)。将反应混合物在65℃下搅拌16h的时间段。反应完成后,将反应混合物缓慢倒入至冰水(500mL)中并且用乙酸乙酯(2×500mL)萃取产物,将合并的有机层连续用盐水(250mL)洗涤,经硫酸钠干燥并且在减压下蒸发,得到粗物质。使粗化合物经受硅胶柱色谱(100-200目)并且用5-10% EtOAc-己烷洗脱。合并含有产物的相关洗脱份并且蒸发至干燥,得到呈浅黄色液体状的(R)-2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(61g,50%)。MS(ESI)m/z:313.0[M+H]+
合并相关洗脱份并且在减压下浓缩,得到呈灰白色固体状的(2R)-2-[(吡啶-3-基氧基)甲基]吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(2.75g,99%),MS(ESI)m/z:279.4[M+H]+
步骤3:合成(R)-3-氯-2-(吡咯烷-2-基甲氧基)吡啶.HCl
Figure BDA0003923073830001652
在0℃下搅拌于4M 1,4二噁烷-HCl(30mL)中的(R)2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(61.0g,195.01mmol)溶液。使反应混合物缓慢升温至室温并且在室温下搅拌12h的时间段。在减压下去除过量溶剂,得到粗物质。另外,用二乙醚(2×150ml)和戊烷(2×150ml)湿磨粗物质,最后在真空下干燥,得到呈白色固体状的(R)-3-氯-2-[(吡咯烷-2-基)甲氧基]吡啶.HCl(49g,定量)。MS(ESI)m/z:213.1[M+H]+(针对游离碱)。
步骤4:合成(R)-3-(5-氯-4-(2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-2-氟苯基)-3-氧代丙酸乙酯。
Figure BDA0003923073830001661
将三乙胺(28.7mL,206.1mmol)添加至3-(5-氯-2,4-二氟苯基)-3-氧代丙酸乙酯(36g,138.679mmol)和(R)-3-氯-2-(吡咯烷-2-基甲氧基)吡啶(49g,231.132mmol)于ACN(200mL)中的搅拌溶液,接着将反应混合物在80℃下搅拌16h的时间段。接着,将反应混合物冷却至室温,在减压下去除过量溶剂,用水(300mL)稀释残留物并且用DCM(2×500mL)萃取产物。将合并的有机层用盐水(500ml)洗涤,经Na2SO4干燥并且蒸发。使所获得的粗物质经受硅胶柱色谱(100-200目)并且用10% EtOAc/己烷自柱洗脱。合并含有产物的相关洗脱份并且蒸发至干燥,得到呈绿色液体状的3-{5-氯-4-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-2-氟苯基}-3-氧代丙酸乙酯(30g,77%),MS(ESI)m/z:455.0[M+H]+
步骤5:合成(R,Z)-2-(5-氯-4-(2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-2-氟苯甲酰基)-3-乙氧基丙烯酸乙酯
Figure BDA0003923073830001662
在室温下向3-{5-氯-4-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-2-氟苯基}-3-氧代丙酸乙酯(900mg,1.97mmol)于乙酸酐(117μL,2.07mmol)中的搅拌溶液添加原甲酸三乙酯(184μL,1.11mmol)并且在155℃下搅拌反应混合物4h。反应完成后,将反应混合物冷却至室温,去除溶剂并且使残留物与甲苯(2×10mL)共沸,得到呈棕色液体状的(R,Z)-2-(5-氯-4-(2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-2-氟苯甲酰基)-3-乙氧基丙烯酸乙酯(747mg,74%)。粗化合物不经进一步纯化即用于下一步骤。
步骤6:合成(R)-乙基1-(6-乙酰胺基吡啶-3-基)-6-氯-7-(2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸酯
Figure BDA0003923073830001671
向(2Z)-2-[(Z)-5-氯-4-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-2-氟苯甲酰基]-3-乙氧基丙-2-烯酸乙酯(5g,9.77mmol)于DMSO(40mL)中的搅拌溶液添加N-(5-氨基吡啶-2-基)乙酰胺(1.76g,11.7mmol)并且在27℃下搅拌1h。将碳酸钾(1.35g,9.77mmol)添加至以上反应混合物中并且加热所述反应混合物至90℃并且搅拌2h。反应完成后,将反应混合物冷却至室温,用冰冷水稀释反应混合物并且用乙酸乙酯(2×150mL)萃取产物。将合并的有机层用盐水溶液(70mL)洗涤,经硫酸钠干燥并且蒸发,得到粗产物。将粗产物通过硅胶柱色谱(100-200目)纯化并且通过使用60-70% EtOAc/己烷自柱洗脱。将含有所需产物的相关洗脱份合并且在减压下蒸馏,得到呈棕色固体状的6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-1-(6-乙酰胺基吡啶-3-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(1.71g,29%)。MS(ESI)m/z:596.5[M+H]+
步骤7:合成(R)-1-(6-氨基吡啶-3-基)-6-氯-7-(2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001681
在0℃下向6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-1-(6-乙酰胺基吡啶-3-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(2.4g,4.02mmol)于THF和水(1:1,50mL)中的搅拌溶液添加氢氧化钠(479mg,12.0mmol)。将反应混合物加热至50℃持续6h的时间段。将反应混合物冷却至室温,在减压下去除过量溶剂,用水(20ml)稀释反应混合物并且在0℃下用1N HCl酸化水层。通过过滤收集所沉淀的固体,用水洗涤并且在真空下干燥。用二乙醚(50mL)中的10% IPA和丙酮(2×50mL)洗涤所得物质并且在真空下干燥并且最后冻干,得到呈灰白色固体状的1-(6-氨基吡啶-3-基)-6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(1.23g,58%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ8.69(d,J=16.4Hz,1H),8.35(s,1H),8.15(d,J=2.8Hz,1H),7.95-7.82(m,2H),7.81-7.78(m,1H),7.01-6.89(m,2H),6.45(d,J=8.4Hz,1H),4.84-4.80(m,1H),4.30(s,2H),3.66-3.52(m,1H),3.25-3.16(m,1H),2.28-2.22(m,1H),2.00-1.91(m,2H),1.89-1.83(m,1H)(未观测到-CO2H和-NH2质子);MS(ESI)m/z:526.2[M+H]+
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例41:6-氯-7-[(2R,4S)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}-4-氟吡咯烷-1-基]-4-氧代-1-(吡嗪-2-基)-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001691
步骤1:合成1-叔丁基2-甲基(2R,4S)-4-氟吡咯烷-1,2-二甲酸酯
Figure BDA0003923073830001692
在-78℃下向1-叔丁基2-甲基(2R,4R)-4-羟基吡咯烷-1,2-二甲酸酯(3g,12.2mmol)于二氯甲烷(30mL)中的溶液逐滴添加二乙氨基三氟化硫(2.40mL,18.2mmol)。将混合物在-78℃下搅拌2h并且接着在室温下再搅拌16h。反应完成后,将反应物用NH4Cl水溶液(5mL)淬灭并且用DCM(25mL×3)萃取。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥并且在真空中浓缩。通过中性氧化铝柱色谱(PE/EtOAc(v/v)=20/1)纯化残留物,得到呈无色液体状的1-叔丁基2-甲基(2R,4S)-4-氟吡咯烷-1,2-二甲酸酯(1.89g,7.64mmol,63%产率)。TLC系统:10% EtOAc/己烷,Rf:0.5。1H NMR(400MHz,CDCl3):δ5.28-5.13(m,1H),4.49-4.38(m,1H),3.95-3.86(m,1H),3.74(s,3H),3.69-3.55(dd,J=12.8,3.2Hz,1H),2.62-2.54(m,1H),2.19-2.02(m,1H),1.42(s,9H)。
步骤2:合成(2R,4S)-4-氟-2-(羟甲基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830001693
在0℃下,向1-叔丁基2-甲基(2R,4S)-4-氟吡咯烷-1,2-二甲酸酯(2.1g,7.64mmol)于THF(50mL)中的搅拌溶液添加硼氢化锂(10.9mL,21.8mmol)。在10min之后,使反应混合物达到室温并且搅拌5h。反应完成后,用乙酸(1mL)和水(3mL)淬灭反应混合物,用乙酸乙酯萃取。将合并的有机层用水、饱和NaHCO3溶液和盐水溶液洗涤,经硫酸钠干燥,过滤并且浓缩,得到呈无色液体状的(2R,4S)-4-氟-2-(羟甲基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(1.62g,7.38mmol,97%产率)。其不经更进一步纯化即用于下一步骤。
TLC系统:20% EtOAc/己烷,Rf:0.3。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δ5.16-5.03(d,J=52.8Hz,1H),4.84(d,J=4.0Hz,1H),4.16-4.14(m,1H),3.89-3.74(m,2H),3.60-3.55(m,2H),2.36-2.29(m,1H),1.81-1.70(m,1H),1.48(s,9H)。
步骤3:合成(2R,4S)-4-氟吡咯烷-2-基]甲醇盐酸盐
Figure BDA0003923073830001701
在0℃下向(2R,4S)-4-氟-2-(羟甲基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(1.8g,7.38mmol)于1,4-二噁烷(15mL)中的搅拌溶液添加盐酸(3.67mL,14.7mmol)。使反应物达到室温并且搅拌5h。反应完成后,在真空下去除所有挥发物,用二乙醚(2×15mL)洗涤所获得的固体,得到呈灰白色固体状的[(2R,4S)-4-氟吡咯烷-2-基]甲醇盐酸盐(888mg,5.70mmol,78%)。
TLC系统:于DCM中的5% MeOH,Rf:0.2。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ9.96(bs,1H),9.33(bs,1H),5.51-5.36(d,J=57.2Hz,1H),3.78-3.72(m,2H),3.62-3.53(m,1H),3.51-3.40(m,2H),2.29-2.19(m,1H),2.06-1.88(m,1H)。
步骤4:合成6-氯-7-氟-4-氧代-1-(吡嗪-2-基)-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯。
Figure BDA0003923073830001711
向3-(5-氯-2,4-二氟苯基)-3-氧代丙酸乙酯(2.0g,7.61mmol)于原甲酸三乙酯(1.88mL,11.4mmol)中的搅拌溶液添加乙酸酐(1.07mL,11.4mmol)并且在155℃下搅拌所得混合物2h。反应完成后,在减压下浓缩并且与甲苯(2×25ml)共沸,得到呈棕色液体状的粗化合物。
在室温下向以上粗化合物于DMSO(20mL)中的搅拌溶液添加吡嗪-2-胺(868mg,9.13mmol)并且搅拌1h。SM完成(通过TLC监测)后,在室温下向反应混合物添加碳酸钾(1.05g,7.61mmol)。将反应混合物加热至80℃并且搅拌2h。反应完成后,将反应混合物用冰冷水(50mL)淬灭,这产生沉淀。将所沉淀的固体过滤,并且用水之后用二乙醚洗涤,并且在真空下干燥,得到呈浅黄色固体状的6-氯-7-氟-4-氧代-1-(吡嗪-2-基)-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(1.98g,5.69mmol,75%)。
TLC系统:于己烷中的70% EtOAc;Rf:0.3。
对于C16H11ClFN3O3所计算的MS(ESI):347.05;实验值:347.9[M+H]+(rt:2.74min)。
步骤5:合成6-氯-7-[(2R,4S)-4-氟-2-(羟甲基)吡咯烷-1-基]-4-氧代-1-(吡嗪-2-基)-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯。
Figure BDA0003923073830001721
向[(2R,4S)-4-氟吡咯烷-2-基]甲醇盐酸盐(1.11g,5.70mmol)于二甲亚砜(15mL)中的搅拌溶液添加三乙胺(1.88mL,14.3mmol)并且搅拌5min。在5min之后,添加6-氯-7-氟-4-氧代-1-(吡嗪-2-基)-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(1g,2.87mmol)并且在密封管中在130℃下搅拌16h。反应完成后,将反应混合物用水淬灭并且用EtOAc(3×25mL)萃取。将合并的有机层用冷水、盐水溶液洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤并且浓缩,得到粗化合物。将所获得的粗化合物通过柱色谱(用5%MeOH/DCM洗脱)纯化,得到呈淡黄色胶质物质状的6-氯-7-[(2R,4S)-4-氟-2-(羟甲基)吡咯烷-1-基]-4-氧代-1-(吡嗪-2-基)-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(445mg,995μmol,35%)。
TLC系统:5% MeOH/DCM,Rf:0.5
对于C21H20ClFN4O4所计算的MS(ESI):446.1;实验值:447.0[M+H]+(rt:2.50min)。
步骤6:合成6-氯-7-((2R,4S)-2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)-4-氟吡咯烷-1-基)-4-氧代-1-(吡嗪-2-基)-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830001722
在室温下向6-氯-7-[(2R,4S)-4-氟-2-(羟甲基)吡咯烷-1-基]-4-氧代-1-吡嗪-2-基)-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(500mg,995μmol)于DMSO(10mL)中的搅拌溶液添加3-氯-2-氟吡啶(653mg,4.97mmol)和碳酸钾(686mg,4.97mmol)。在130℃下搅拌反应混合物3h。反应完成后,将反应混合物用水淬灭并且用EtOAc(3×20mL)萃取。将合并的有机层用冷水、盐水溶液洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤并且浓缩,得到粗化合物。将所获得的粗化合物通过柱色谱纯化,得到呈浅黄色胶质物质状的6-氯-7-[(2R,4S)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}-4-氟吡咯烷-1-基]-4-氧代-1-(吡嗪-2-基)-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(105mg,188μmol,19%)。
TLC系统:100% EtOAc,Rf:0.5
对于C26H22Cl2FN5O4所计算的MS(ESI):557.10;实验值:558.1[M+H]+(rt:3.21min)。
步骤7:合成6-氯-7-[(2R,4S)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}-4-氟吡咯烷-1-基]-4-氧代-1-(吡嗪-2-基)-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001731
在室温下向6-氯-7-[(2R,4S)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}-4-氟吡咯烷-1-基]-4-氧代-1-(吡嗪-2-基)-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(300mg,188μmol)于二氯化乙烯(10mL)中的搅拌溶液添加三甲基氢氧化锡(136mg,752μmol)。将反应混合物加热至80℃并且搅拌16h。反应完成后,将反应混合物用DCM(20mL)稀释并且将有机层用水、盐水溶液洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤并且浓缩,得到粗产物。将所获得的粗化合物通过逆相制备型HPLC纯化并且使纯洗脱份冻干干燥,得到呈灰白色固体状的6-氯-7-[(2R,4S)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}-4-氟吡咯烷-1-基]-4-氧代-1-(吡嗪-2-基)-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(25.4mg,48.0μmol,25%产率)。
TLC系统:10% MeOH/DCM,Rf:0.5
对于C24H18Cl2FN5O4所计算的MS(ESI):529.07;实验值:530.3[M+H]+(rt:5.977min)。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ14.8(bs,1H),9.13(s,1H),8.95(d,J=3.2Hz,2H),8.79(d,J=1.2Hz,2H),8.21(s,1H),7.86-7.85(dd,J=4.8,1.6Hz,1H),7.80-7.77(dd,J=4.0,1.4Hz,1H),6.94-6.91(q,J=5.2Hz,1H),6.67(s,1H),5.46-5.33(d,J=53.2Hz,1H),4.85-4.83(m,1H),4.43-4.39(dd,J=12.0,3.8Hz,1H),4.29-4.26(dd,J=11.8,3.4Hz,1H),3.91-3.75(m,1H),2.42-2.40(m,1H),2.24-2.20(m,1H)。
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例42:合成6-氰基-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-7-(1-(((3-氟吡啶-2-基)氧基)甲基)-7-氮杂双环[2.2.1]庚烷-7-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001741
步骤1:合成(反式)-4-((叔丁氧羰基)氨基)环己基甲磺酸酯
Figure BDA0003923073830001742
在0℃下向((反式)-4-羟基环己基)氨基甲酸叔丁酯(4.0g,18.59mmol)和TEA(5.6g,55.77mmol)于DCM(50mL)中的搅拌溶液添加MsCl(3.2g,27.89mmol)。将混合物在室温下搅拌3h。通过添加100mL水淬灭反应物。用DCM(50mL×3)萃取水溶液。将合并的有机相经Na2SO4干燥并且浓缩,得到残留物,通过急骤柱用0-50%于石油醚中的EtOAc纯化,得到呈白色固体状的(反式)-4-((叔丁氧羰基)氨基)环己基甲磺酸酯(3.3g,61%)。LCMS(ESI)[M+H]+:294。
步骤2:合成7-氮杂双环[2.2.1]庚烷-7-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830001751
于N2下向(反式)-4-((叔丁氧羰基)氨基)环己基甲磺酸酯(4.0g,13.65mmol)于无水THF(100mL)中的搅拌溶液添加t-BuOK(4.6g,40.94mmol)。在室温下搅拌混合物3h。在减压下浓缩混合物,得到残留物,通过急骤色谱用0-50%于石油醚中的EtOAc洗脱来纯化,得到呈无色油状的7-氮杂双环[2.2.1]庚烷-7-甲酸叔丁酯(1.5g,56%)。LCMS(ESI)[M+H]+:198。
步骤3:合成1-甲酰基-7-氮杂双环[2.2.1]庚烷-7-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830001752
于N2下在-78℃下向7-氮杂双环[2.2.1]庚烷-7-甲酸叔丁酯(1.4g,7.10mmol)和TMEDA(989mg,8.52mmol)于无水THF(20mL)中的搅拌溶液添加s-BuLi(4.3mL,10.65mmol)。在此温度下搅拌混合物1h。接着添加DMF(622mg,8.52mmol)。将所得物搅拌1h。通过添加40mL水淬灭反应物。用EtOAc(50mL×3)萃取水溶液。将合并的有机相经Na2SO4干燥并且在减压下浓缩,得到残留物,通过急骤色谱用0-50%于石油醚中的EtOAc洗脱来纯化,得到呈无色油状的1-甲酰基-7-氮杂双环[2.2.1]庚烷-7-甲酸叔丁酯(700mg,44%)。LCMS(ESI)[M+H]+:226。
步骤4:合成1-(羟甲基)-7-氮杂双环[2.2.1]庚烷-7-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830001761
在0℃下向1-甲酰基-7-氮杂双环[2.2.1]庚烷-7-甲酸叔丁酯(700mg,3.10mmol)于EtOH(10mL)中的搅拌溶液添加NaBH4(236mg,6.20mmol)。将混合物在室温下搅拌1h。通过添加20mL水淬灭反应物。用EtOAc(20mL×3)萃取水溶液。经Na2SO4干燥合并的有机溶液并且并且在减压下浓缩,得到残留物,通过急骤色谱用0-50%于石油醚中的EtOAc洗脱来纯化,得到呈无色油状的1-(羟甲基)-7-氮杂双环[2.2.1]庚烷-7-甲酸叔丁酯(500mg,71%)。LCMS(ESI)[M+H]+:228。
步骤5:合成1-(((3-氟吡啶-2-基)氧基)甲基)-7-氮杂双环[2.2.1]庚烷-7-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830001762
于N2下向1-(羟甲基)-7-氮杂双环[2.2.1]庚烷-7-甲酸叔丁酯(500mg,2.20mmol)于无水THF(10mL)中的溶液添加NaH(264mg,6.60mmol)和2,3-二氟吡啶(380mg,3.30mmol)。将混合物在室温下搅拌16h。通过添加20mL水淬灭反应物。用EtOAc(20mL×3)萃取水溶液。将合并的有机相经Na2SO4干燥并且在减压下浓缩,得到残留物,通过急骤色谱用0-50%于石油醚中的EtOAc洗脱来纯化,得到呈淡黄色油状的1-(((3-氟吡啶-2-基)氧基)甲基)-7-氮杂双环[2.2.1]庚烷-7-甲酸叔丁酯(520mg,73%)。LCMS(ESI)[M+H]+:323。
步骤6:合成1-(((3-氟吡啶-2-基)氧基)甲基)-7-氮杂双环[2.2.1]庚烷
Figure BDA0003923073830001771
向1-(((3-氟吡啶-2-基)氧基)甲基)-7-氮杂双环[2.2.1]庚烷-7-甲酸叔丁酯(520mg,1.61mmol)于DCM(10mL)中的溶液添加TFA(5mL)。在室温下搅拌溶液2h。在减压下浓缩反应溶液,得到残留物,将其溶解于MeOH中。添加NH3·H2O以调节pH 9。在减压下浓缩混合物,得到残留物,通过急骤色谱用0-10%于DCM中的MeOH洗脱来纯化,得到呈淡黄色油状的1-(((3-氟吡啶-2-基)氧基)甲基)-7-氮杂双环[2.2.1]庚烷(400mg,粗物质)。LCMS(ESI)[M+H]+:223。
步骤7:合成6-氰基-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-7-(1-(((3-氟吡啶-2-基)氧基)甲基)-7-氮杂双环[2.2.1]庚烷-7-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830001772
向8-mL密封管添加6-氰基-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-7-氟-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(200mg,0.46mmol)、1-(((3-氟吡啶-2-基)氧基)甲基)-7-氮杂双环[2.2.1]庚烷(204mg,0.92mmol)和DMSO(0.2mL)。在约50℃下在真空下加热所得混合物1h。接着将DIEA(119mg,0.92mmol,2当量)添加至所述混合物中。将所得混合物在100℃下于N2下搅拌3天。将混合物通过逆相急骤色谱用20-80%于水中的乙腈洗脱来纯化,得到呈黄色固体状的6-氰基-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-7-(1-(((3-氟吡啶-2-基)氧基)甲基)-7-氮杂双环[2.2.1]庚烷-7-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(55mg,19%)。LCMS(ESI)[M+H]+:638。
步骤8:合成6-氰基-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-7-(1-(((3-氟吡啶-2-基)氧基)甲基)-7-氮杂双环[2.2.1]庚烷-7-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001781
在室温下于N2下向6-氰基-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-7-(1-(((3-氟吡啶-2-基)氧基)甲基)-7-氮杂双环[2.2.1]庚烷-7-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(85mg,0.13mmol)于THF(2mL)中的搅拌溶液添加LiOH.H2O(56mg,1.33mmol)于H2O(2mL)中的溶液。将所得混合物在室温下搅拌过夜。通过AcOH酸化混合物。通过制备型HPLC纯化混合物,得到呈黄色固体状的6-氰基-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-7-(1-(((3-氟吡啶-2-基)氧基)甲基)-7-氮杂双环[2.2.1]庚烷-7-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(45.5mg,57%)。LCMS(ESI)[M+H]+:610.35。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ8.59(d,J=14.4Hz,2H),8.24(m,1H),7.89(d,J=4.7Hz,1H),7.78-7.52(m,2H),7.10-6.96(m,1H),6.74(s,1H),6.42(d,J=8.9Hz,1H),4.62(s,2H),4.31(s,1H),3.98(t,J=7.8Hz,2H),3.81-3.68(m,2H),3.26-3.11(m,1H),2.12(s,6H),1.73(dd,J=24.4,14.4Hz,6H),1.54(d,J=9.2Hz,2H)。
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例43:合成(S)-6-氰基-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-7-(2-(((3-氟吡啶-2-基)氧基)甲基)-2-甲基吡咯烷-1-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001791
步骤1:合成(S)-1-(叔丁氧羰基)-2-甲基吡咯烷-2-甲酸
Figure BDA0003923073830001792
向(S)-2-甲基吡咯烷-2-甲酸(3.6g,27.87mmol)于DCM(100mL)中的搅拌溶液添加(Boc)2O(18.25g,83.61mmol,3当量)和Et3N(8.46g,83.61mmol,3当量)。将所得混合物在室温下搅拌5h。接着通过添加盐水(200mL)淬灭反应物。用DCM(100mL×3)萃取混合物。将合并的有机相经MgSO4干燥。过滤之后,在减压下浓缩滤液。这产生呈无色晶体状的粗产物(S)-1-(叔丁氧羰基)-2-甲基吡咯烷-2-甲酸(6.38g,27.8mmol)。LCMS(ESI)[M+H]+:230。
步骤2:合成(S)-2-(羟甲基)-2-甲基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830001793
在室温下于N2下向(S)-1-(叔丁氧羰基)-2-甲基吡咯烷-2-甲酸(6.38g,27.8mmol)于无水THF(100mL)中的溶液添加BH3.Me2S(10.56g,139mmol,5当量)。接着将所得混合物在70℃下搅拌1h。在冷却至室温之后。将混合物在减压下浓缩。通过硅胶柱色谱用石油醚/EtOAc=1:1洗脱来纯化残留物,得到呈无色油状的(S)-2-(羟甲基)-2-甲基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(4.1g,19.04mmol)。LCMS(ESI)[M+H]+:216。
步骤3:合成(S)-2-(((3-氟吡啶-2-基)氧基)甲基)-2-甲基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830001801
在0℃下于N2下向(S)-2-(羟甲基)-2-甲基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(4.1g,19.04mmol)于无水THF(100mL)中的搅拌溶液添加KOtBu(6.41g,57.12mmol,3当量)。在10min之后,将2,3-二氟吡啶(2.63g,22.85mmol,1.2当量)添加至混合物中并且在0℃下搅拌所得混合物半小时,并且之后在室温下搅拌4h。接着通过添加盐水(200mL)淬灭反应物。用EtOAc(100mL×3)萃取混合物。将合并的有机相经MgSO4干燥。过滤之后,在减压下浓缩滤液。通过硅胶柱色谱用石油醚/EtOAc=2:1洗脱来纯化残留物,得到呈无色油状的(S)-2-(((3-氟吡啶-2-基)氧基)甲基)-2-甲基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(4.3g,13.85mmol)。LCMS(ESI)[M+H]+:311。
步骤4:合成(S)-3-氟-2-((2-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)吡啶
Figure BDA0003923073830001802
向(S)-2-(((3-氟吡啶-2-基)氧基)甲基)-2-甲基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(4.3g,13.85mmol)于DCM(10mL)中的搅拌溶液添加TFA(15mL)。在室温下搅拌混合物4h。在减压下浓缩混合物。将残留物溶解于饱和NaHCO3(200mL)中并且用EtOAc(100mL×3)萃取。将合并的有机相经MgSO4干燥。过滤之后,在减压下浓缩滤液。这产生呈无色油状的(S)-3-氟-2-((2-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)吡啶(2.6g,12.36mmol)。LCMS(ESI)[M+H]+:211。
步骤5:合成(S)-6-氰基-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-7-(2-(((3-氟吡啶-2-基)氧基)甲基)-2-甲基吡咯烷-1-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830001811
向8-mL密封管添加6-氰基-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-7-氟-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(500mg,1.148mmol)、(S)-3-氟-2-((2-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)吡啶(724mg,3.445mmol,3当量)和DMSO(1mL)。在约50℃下在真空下加热所得混合物1h。接着将DIEA(297mg,2.296mmol,2当量)添加至混合物中。将所得混合物在100℃下于N2下搅拌48h。通过逆相色谱用乙腈/水=7:3洗脱来纯化混合物,得到呈黄色固体状的(S)-6-氰基-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-7-(2-(((3-氟吡啶-2-基)氧基)甲基)-2-甲基吡咯烷-1-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(150mg,0.2397mmol)。LCMS(ESI)[M+H]+:626。
步骤6:合成(S)-6-氰基-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-7-(2-(((3-氟吡啶-2-基)氧基)甲基)-2-甲基吡咯烷-1-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001812
在室温下于N2下向(S)-6-氰基-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-7-(2-(((3-氟吡啶-2-基)氧基)甲基)-2-甲基吡咯烷-1-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(150mg,0.2397mmol)于THF(4mL)中的搅拌溶液添加NaOH(19mg,0.4794mmol,2当量)于H2O(2mL)中的溶液。将所得混合物在室温下搅拌过夜。通过AcOH酸化混合物。通过制备型HPLC纯化混合物,得到呈黄色固体状的(S)-6-氰基-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-7-(2-(((3-氟吡啶-2-基)氧基)甲基)-2-甲基吡咯烷-1-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(32.8mg)。LCMS(ESI)[M+H]+:598.25。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ14.69(s,1H),8.63-8.07(m,3H),7.91-7.51(m,3H),7.01(m,1H),6.60-6.25(m,2H),4.34(m,2H),4.08-3.83(m,4H),3.81-3.59(m,2H),3.21(d,J=4.7Hz,1H),2.28-2.19(m,1H),2.13(s,6H),1.97(dd,J=19.6,9.9Hz,3H),1.22(d,J=11.5Hz,3H)。
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例44:合成外消旋-6-氯-7-((2R,3S)-2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)-3-甲基吡咯烷-1-基)-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001821
步骤1:合成1-叔丁基2-甲基3-溴吡咯-1,2-二甲酸酯
Figure BDA0003923073830001822
在室温下在氮气气氛下搅拌3-溴-1H-吡咯-2-甲酸甲酯(5.0g,24.51mmol,1.0当量)、二碳酸二(叔丁酯)(8.0g,36.76mmol,1.5当量)、DMAP(299mg,2.45mmol,0.1当量)和Et3N(7.4g,73.52mmol,3当量)于DCM(45mL)中的混合物1h。在真空下浓缩所得混合物。残留物通过硅胶柱色谱纯化,用PE/EtOAc(5:1)洗脱,得到呈黄色油状的1-叔丁基2-甲基3-溴吡咯-1,2-二甲酸酯(6.5g,87.21%)。
步骤2:合成1-叔丁基2-甲基3-甲基吡咯-1,2-二甲酸酯
Figure BDA0003923073830001831
在100℃下在氮气气氛下搅拌1-叔丁基2-甲基3-溴吡咯-1,2-二甲酸酯(6.50g,21.372mmol,1.00当量)和三甲基-1,3,5,2,4,6-三氧杂三硼杂环己烷(trioxatriborinane)(26827.94g,213.717mmol,10当量)和K2CO3(8861.07g,64.115mmol,3当量)和Pd(PPh3)4(2469.63g,2.137mmol,0.1当量)于二噁烷(50.00mL,590.204mmol,27.62当量)和H2O(10.00mL,555.084mmol,25.97当量)中的混合物1h。在真空下浓缩所得混合物。残留物通过硅胶柱色谱纯化,用PE/EtOAc(5:1)洗脱,得到呈黄色油状的1-叔丁基2-甲基3-甲基吡咯-1,2-二甲酸酯(2g,39.11%)。
步骤3:合成外消旋-1-(叔丁基)2-甲基(2R,3S)-3-甲基吡咯烷-1,2-二甲酸酯
Figure BDA0003923073830001832
在50℃下在氮气气氛下搅拌6,7-二氯-1-(1-甲基吡唑-4-基)-4-氧代-1,8-萘啶-3-甲酸乙酯(400.00mg,1.089mmol,1.00当量)和3-氯-2-[(2R)-吡咯烷-2-基甲氧基]吡啶(347.53mg,1.634mmol,1.5当量)和K2CO3(451.66mg,3.268mmol,3当量)于DMSO(3.50mL,49.275mmol,45.23当量)中的混合物2h。通过逆相急骤色谱在以下条件下纯化残留物:柱,C18硅胶;流动相,含MeOH的水,10min内10%至50%梯度;检测器,UV 254nm,得到呈黄色油状的外消旋-1-(叔丁基)2-甲基(2R,3S)-3-甲基吡咯烷-1,2-二甲酸酯(300mg,50.68%)。
步骤4:合成外消旋-(2R,3S)-2-(羟甲基)-3-甲基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830001841
在100℃下在氮气气氛下搅拌外消旋-1-(叔丁基)2-甲基(2R,3S)-3-甲基吡咯烷-1,2-二甲酸酯(150.00mg,0.276mmol,1.00当量)和Zn(CN)2(162.09mg,1.380mmol,5当量)和Pd(PPh3)4(31.90mg,0.028mmol,0.1当量)于DMSO(2.00mL,28.157mmol,102.01当量)中的混合物2h。通过逆相急骤色谱在以下条件下纯化残留物:柱,C18硅胶;流动相,含MeOH的水,20min内10%至80%梯度;检测器,UV 254nm,得到呈黄色固体状的外消旋-(2R,3S)-2-(羟甲基)-3-甲基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(70mg,47.49%)。
步骤5:合成外消旋-(2R,3S)-2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)-3-甲基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830001842
在室温下在氮气气氛下搅拌外消旋-(2R,3S)-2-(羟甲基)-3-甲基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(1.00g,4.645mmol,1.00当量)和3-氯-2-氟吡啶(1221.87g,9.290mmol,2当量)和NaH(334.40mg,13.934mmol,3当量)于THF(30.00mL,370.290mmol,79.72当量)中的混合物过夜。接着通过添加30mL MeOH淬灭反应物。
在减压下浓缩所得混合物。通过逆相急骤色谱在以下条件下纯化残留物:柱,C18硅胶;流动相,含MeOH的水,20min内10%至80%梯度;检测器,UV 254nm,得到呈黄色油状的外消旋-(2R,3S)-2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)-3-甲基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(600mg,39.53%)。
步骤6:合成外消旋-3-氯-2-(((2R,3S)-3-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)吡啶
Figure BDA0003923073830001851
在室温下搅拌外消旋-(2R,3S)-2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)-3-甲基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(600.00mg,1.836mmol,1.00当量)和TFA(0.50mL,6.732mmol,3.67当量)于DCM(2.00mL,31.460mmol,17.14当量)中的混合物1h。用EtOAc(3×5mL)萃取水层,得到呈黄色油状的外消旋-3-氯-2-(((2R,3S)-3-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)吡啶(300mg,72.08%)。
步骤7:合成外消旋-6-氯-7-((2R,3S)-2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)-3-甲基吡咯烷-1-基)-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830001852
在80℃下在氮气气氛下搅拌外消旋-3-氯-2-(((2R,3S)-3-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)吡啶(70mg,1.5当量)和6-氯-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-7-氟-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯(110mg,1.00当量)和DIEA(290mg,3当量)于DMSO(2.5mL)中的混合物1h。通过逆相急骤色谱在以下条件下纯化残留物:柱,C18硅胶;流动相,含MeOH的水,10min内10%至50%梯度;检测器,UV 254nm,得到呈黄色固体状的外消旋-6-氯-7-((2R,3S)-2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)-3-甲基吡咯烷-1-基)-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(70mg,43.45%)。
步骤8:合成外消旋-6-氯-7-((2R,3S)-2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)-3-甲基吡咯烷-1-基)-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001861
在室温下在氮气气氛下搅拌外消旋-6-氯-7-((2R,3S)-2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)-3-甲基吡咯烷-1-基)-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(70.00mg,0.107mmol,1.00当量)和NaOH(12.89mg,0.322mmol,3当量)于EtOH(2.00mL,34.427mmol,320.46当量)中的混合物1h。通过制备型TLC纯化残留物(柱:XBridge Prep C18 OBD柱,5um,19*150mm;流动相A:水(10MMOL/LNH4HCO3),流动相B:ACN;流动速率:25mL/min;梯度:8min内48B至62B;254nm;RT1:7.83;RT2:;注射体积:ml;运行数:;),得到呈黄色固体状的外消旋-6-氯-7-((2R,3S)-2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)-3-甲基吡咯烷-1-基)-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(23.8mg,35.53%)。LCMS(ESI)[M+H]+:623.2。1HNMR(300MHz,DMSO-d6)δ8.43(s,2H),8.11(s,1H),8.06-7.91(m,4H),7.79(s,2H),7.55(s,2H),6.98(s,2H),6.52(s,1H),6.31(d,J=9.0Hz,2H),6.15(s,1H),4.67(s,1H),4.54(s,1H),4.37(s,2H),4.17(s,3H),4.07-3.96(m,4H),3.78(s,5H),3.23(s,1H),3.08(s,2H),2.15(s,12H),2.04(s,2H),1.73(s,2H),1.24(s,0H),1.07(d,J=6.6Hz,6H)。
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例45:6-氯-7-[(2R)-2-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-基]-1-[5-(2-羟基乙氧基)吡嗪-2-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001871
步骤1:合成2-[(5-氨基吡嗪-2-基)氧基]乙醇
Figure BDA0003923073830001872
在160℃下搅拌5-溴吡嗪-2-胺(500mg,2.87mmol,1当量)、乙二醇(267mg,4.31mmol,1.5当量)和叔丁氧基钾(967mg,8.62mmol,3当量)的混合物1h。在减压下浓缩所得混合物。通过爬片板(climbing board)纯化残留物,得到呈黄色固体状的2-[(5-氨基吡嗪-2-基)氧基]乙醇(100mg,22.43%)。LCMS(ESI)[M+H]+:156.07。
步骤2:合成(2Z)-2-[(Z)-5-氯-2,4-二氟苯甲酰基]-3-乙氧基丙-2-烯酸乙酯
Figure BDA0003923073830001881
在100℃下搅拌3-(5-氯-2,4-二氟苯基)-3-氧代丙酸乙酯(200mg,0.76mmol,1当量)、Ac2O(233mg,2.28mmol,3当量)和原甲酸三乙酯(169mg,1.14mmol,1.5当量)的混合物1h。通过真空浓缩所得混合物,得到呈黄色油状的(2Z)-2-[(Z)-5-氯-2,4-二氟苯甲酰基]-3-乙氧基丙-2-烯酸乙酯(150mg,粗产物)。LCMS(ESI)[M+H]+:319.05。
步骤3:合成6-氯-7-氟-1-[5-(2-羟基乙氧基)吡嗪-2-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830001882
在室温下搅拌(2Z)-2-[(Z)-5-氯-2,4-二氟苯甲酰基]-3-乙氧基丙-2-烯酸乙酯(150mg,0.47mmol,1当量)和2-[(5-氨基吡嗪-2-基)氧基]乙醇(109mg,0.70mmol,1.5当量)于DMSO(3mL)中的混合物1h。随后,再供应K2CO3(65mg,0.47mmol,1当量)并且保持1h并且继续反应1h。通过RP急骤色谱用ACN/H2O(0.1%FA)(70%-80%)洗脱来纯化所得混合物,得到呈黄色固体状的6-氯-7-氟-1-[5-(2-羟基乙氧基)吡嗪-2-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯(50mg,26.05%)。LCMS(ESI)[M+H]+:408.07。
步骤4:合成6-氯-7-[(2R)-2-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-基]-1-[5-(2-羟基乙氧基)吡嗪-2-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830001891
在110℃下搅拌6-氯-7-氟-1-[5-(2-羟基乙氧基)吡嗪-2-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯(50mg,0.12mmol,1当量)、3-氯-2-[(2R)-吡咯烷-2-基甲氧基]吡啶(130mg,0.61mmol,5当量)和TEA(37mg,0.36mmol,3当量)于DMSO(1mL)中的混合物3天。使混合物冷却至室温并且用水淬灭。通过RP急骤色谱用ACN/H2O(0.1%FA)(40%-50%)洗脱来纯化所得混合物,得到呈黄色固体状的6-氯-7-[(2R)-2-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-基]-1-[5-(2-羟基乙氧基)吡嗪-2-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯(30mg,40.75%)。LCMS(ESI)[M+H]+:600.13。
步骤5:合成6-氯-7-[(2R)-2-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-基]-1-[5-(2-羟基乙氧基)吡嗪-2-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001892
向6-氯-7-[(2R)-2-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-基]-1-[5-(2-羟基乙氧基)吡嗪-2-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯(50mg,0.08mmol,1当量)于H2O(0.3mL)和THF(0.9mL)中的搅拌混合物添加LiOH.H2O(13mg,0.33mmol,4当量)。将混合物在室温下搅拌1h。将所得混合物在减压下浓缩并且用水洗涤。通过湿磨获得产物,得到呈黄色固体状的6-氯-7-[(2R)-2-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-基]-1-[5-(2-羟基乙氧基)吡嗪-2-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸(9.1mg,19.09%)。LCMS(ESI)[M+H]+:572.10。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ8.59(d,J=15.8Hz,2H),8.33(s,1H),8.12(s,1H),7.92-7.84(m,1H),7.83-7.74(m,1H),6.97-6.87(m,1H),6.54(s,1H),5.02(t,J=5.5Hz,1H),4.63(s,1H),4.42(t,J=5.0Hz,2H),4.26(t,J=3.9Hz,2H),3.86-3.75(m,2H),3.59(d,J=8.4Hz,1H),3.17(d,J=5.6Hz,1H),2.30-2.19(m,1H),1.98-1.74(m,3H)。
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例46:合成6-氯-7-[(2R)-2-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-基]-1-[5H,7H-呋喃并[3,4-b]吡嗪-2-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001901
步骤1:合成碘(碘甲氧基)甲烷
Figure BDA0003923073830001902
在室温下搅拌三噁烷(15.0g,166.52mmol)和TMSI(100.0g,499.76mmol)的混合物过夜。浓缩混合物并且通过硅胶柱色谱用石油醚洗脱来纯化,得到呈黄色油状的碘(碘甲氧基)甲烷(15g,30.24%)。
步骤2:合成三丁基([[(三丁基锡烷基)甲氧基]甲基])锡烷
Figure BDA0003923073830001903
在N2下,向三丁基锡(25.8g,88.64mmol)于THF(120.0mL)中的溶液添加LDA(44.3mL,88.63mmol),并且在-78℃下搅拌混合物30min。接着在-78℃下添加碘(碘甲氧基)甲烷(12.0g,40.28mmol)并且在室温下搅拌混合物2h。将反应物用NH4Cl(240mL)淬灭并且用EtOAc(3*200mL)萃取。将合并的有机层用水(200mL)、盐水(200mL)洗涤,浓缩并且通过硅胶急骤色谱用石油醚洗脱来纯化,得到呈无色油状的三丁基([[(三丁基锡烷基)甲氧基]甲基])锡烷(5.0g,19.88%)。
步骤3:合成5H,7H-呋喃并[3,4-b]吡嗪-2-胺
Figure BDA0003923073830001911
在氮气气氛下,在100℃下搅拌5-溴-6-氯吡嗪-2-胺(1.6g,8.01mmol)、三丁基([[(三丁基锡烷基)甲氧基]甲基])锡烷(5.0g,8.01mmol)、Pd2(dba)3·CHCl3(82mg,0.08mmol)、XPhos(76mg,0.16mmol)和二噁烷(50.0mL)的混合物过夜。将反应物用EtOAc(300mL)稀释,用水(50mL)、盐水(50mL)洗涤,浓缩并且通过硅胶急骤色谱用EtOAc/石油醚(0-100%)洗脱来纯化,得到呈白色固体状的5H,7H-呋喃并[3,4-b]吡嗪-2-胺(170mg,15.66%)。LCMS(ESI)[M+H]+:138。
步骤4:合成6-氯-7-氟-1-[5H,7H-呋喃并[3,4-b]吡嗪-2-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830001912
在室温下搅拌(2Z)-2-[(Z)-5-氯-2,4-二氟苯甲酰基]-3-乙氧基丙-2-烯酸乙酯(181mg,0.56mmol)、5H,7H-呋喃并[3,4-b]吡嗪-2-胺(77mg,0.56mmol)、DMSO(5.0mL)的混合物过夜。接着添加K2CO3(78mg,0.56mmol)并且在50℃下搅拌混合物过夜。通过RPFC纯化所述混合物,得到呈红色固体状的6-氯-7-氟-1-[5H,7H-呋喃并[3,4-b]吡嗪-2-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯(160mg,72.50%)。LCMS(ESI)[M+H]+:390。
步骤5:合成6-氯-7-[(2R)-2-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-基]-1-[5H,7H-呋喃并[3,4-b]吡嗪-2-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830001921
在80℃下搅拌6-氯-7-氟-1-[5H,7H-呋喃并[3,4-b]吡嗪-2-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯(100mg,0.25mmol)、3-氯-2-[(2R)-吡咯烷-2-基甲氧基]吡啶(109mg,0.51mmol)、Et3N(103mg,1.02mmol)和DMSO(4.0mL)的混合物过夜。将混合物冷却并且通过RPFC纯化,得到呈淡黄色固体状的6-氯-7-[(2R)-2-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-基]-1-[5H,7H-呋喃并[3,4-b]吡嗪-2-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯(113mg,75.62%)。LCMS(ESI)[M+H]+:582。
步骤6:合成6-氯-7-[(2R)-2-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-基]-1-[5H,7H-呋喃并[3,4-b]吡嗪-2-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001922
向6-氯-7-[(2R)-2-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-基]-1-[5H,7H-呋喃并[3,4-b]吡嗪-2-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯(108mg,0.18mmol)于MeOH(2.0mL)中的混合物添加NaOH(0.93mL,0.93mmol),并且在室温下搅拌混合物过夜。用1N HCl将反应物的pH调节至3-4。接着浓缩混合物并且通过制备型HPLC纯化,得到呈白色固体状的6-氯-7-[(2R)-2-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-基]-1-[5H,7H-呋喃并[3,4-b]吡嗪-2-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸(29.4mg,28.29%)。LCMS(ESI)[M+H]+:554.20。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ14.83(s,1H),8.95(s,1H),8.88(s,1H),8.18(s,1H),7.88(dd,J=4.9,1.7Hz,1H),7.79(dd,J=7.7,1.7Hz,1H),6.93(dd,J=7.7,4.9Hz,1H),6.66(s,1H),5.20(d,J=1.7Hz,2H),5.12(d,J=4.2Hz,2H),4.75(s,1H),4.31(qd,J=11.4,4.3Hz,2H),3.70-3.57(m,1H),3.31-3.15(m,1H),2.31-2.17(m,1H),2.08-1.69(m,3H)。效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例47:合成6-氯-7-(3-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)-1,1-二氧离子基异噻唑烷-2-基)-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001931
步骤1:合成3-(羟甲基)异噻唑烷1,1-二氧化物
Figure BDA0003923073830001932
向异噻唑烷-3-甲酸1,1-二氧化物(600mg,3.64mmol)于THF(15mL)中的搅拌溶液逐滴添加BH3-THF(14.5mL,14.5mmol)。在室温下搅拌溶液2h。通过添加MeOH来淬灭反应物。浓缩溶液,得到残留物,通过急骤柱用0-10%于DCM中的MeOH纯化,得到呈无色油状的3-(羟甲基)异噻唑烷1,1-二氧化物(510mg,93%)。LCMS(ESI)[M+H]+:152。
步骤2:合成3-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)异噻唑烷1,1-二氧化物
Figure BDA0003923073830001941
向3-(羟甲基)异噻唑烷1,1-二氧化物(510mg,3.38mmol)和3-氯-2-氟吡啶(663mg,5.07mmol)于DMSO(10mL)中的搅拌混合物添加t-BuOK(1.14g,10.14mmol)。在室温下搅拌混合物1h。通过逆相急骤柱用20-80%于水中的乙腈来纯化混合物,得到呈淡黄色固体状的3-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)异噻唑烷1,1-二氧化物(280mg,32%)。LCMS(ESI)[M+H]+:263。
步骤3:合成6-氯-7-(3-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)-1,1-二氧离子基异噻唑烷-2-基)-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830001942
向6-氯-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-7-氟-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(100mg,0.23mmol)和3-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)异噻唑烷1,1-二氧化物(118mg,0.45mmol)于DMSO(3mL)中的混合物添加t-BuOK(76mg,0.68mmol)。在80℃下搅拌混合物2h。通过逆相急骤柱用5-30%于水中的乙腈来纯化混合物,得到呈黄色固体状的6-氯-7-(3-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)-1,1-二氧离子基异噻唑烷-2-基)-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(100mg,63%)。LCMS(ESI)[M+H]+:687。
步骤4:合成6-氯-7-(3-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)-1,1-二氧离子基异噻唑烷-2-基)-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001951
在氮气下向6-氯-7-(3-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)-1,1-二氧离子基异噻唑烷-2-基)-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(60mg,0.09mmol)于EtOH(1mL)中的搅拌混合物添加NaOH(14mg,0.35mmol)于H2O(1mL)中的溶液。在室温下搅拌混合物2h。添加HOAc以调节pH 5。将混合物溶解于DMSO中并且通过制备型HPLC纯化(柱:XSelect CSH Prep C18 OBD柱,19*150mm,5μm;流动相A:水(0.1%FA),流动相B:ACN;流动速率:25mL/min;梯度:8min内15% B至32% B,32% B;波长:254nm;RT1(min):6.70;运行数:0),得到呈黄色固体状的6-氯-7-(3-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)-1,1-二氧离子基异噻唑烷-2-基)-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(14.6mg,25%)。LCMS(ESI):[M+H]+:659.0。1HNMR(300MHz,DMSO-d6)δ14.54(s,1H),8.66(s,1H),8.41(s,1H),8.25-8.07(m,1H),8.05-7.94(m,1H),7.83-7.72(m,1H),7.61-7.40(m,1H),7.33(d,J=6.1Hz,1H),7.04-6.96(m,1H),6.58-6.37(m,1H),4.65-4.59(m,1H),4.46-4.25(m,2H),4.11(t,J=8.0Hz,2H),3.91-3.81(m,2H),3.68-3.45(m,2H),3.29-3.23(m,1H),2.82-2.63(m,0H),2.34-2.25(m,1H),2.19(s,6H)。
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例48:合成6-氯-7-(1-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]-2-氮杂双环[3.1.0]己-2-基)-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001961
步骤1:合成2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830001962
在-78℃下向THF(100mL)中置有4-氯哌啶-1-甲酸叔丁酯(9.0g,40.96mmol,1.0当量)的溶液添加TMEDA(5.71g,49.16mmol,1.2当量)、s-BuLi(37.8mL,1.3M,49.16mmol,1.2当量)。在N2气氛下在-78℃下搅拌所得混合物6h。LCMS(ESI)[M+H]+:184。
步骤2:合成1-甲酰基-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830001963
在-78℃下向THF(50.00mL)中置有2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯(粗物质)的溶液添加TMEDA(11.9g,102.32mmol,2.5当量)和s-BuLi(78.5mL,1.3M,102.319mmol,2.50当量)。在N2气氛下在-78℃下搅拌所得混合物2h。接着,将DMF(3.59g,49.115mmol,1.20当量)添加至溶液中并且在N2气氛下在-78℃下搅拌15min。LCMS(ESI)[M+H]+:212。
步骤3:合成1-(羟甲基)-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830001971
向MeOH(100mL)中置有1-甲酰基-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯(粗物质)的溶液添加NaBH4(6.2g,162.82mmol,4.0当量)。将所得混合物在室温下搅拌2h。用水将反应物淬灭。将所得混合物用脱水的乙酸乙酯(50mL×3)萃取,经无水硫酸钠干燥并且在真空下浓缩。将残留物施用至具有乙酸乙酯/石油醚(1/3)的硅胶柱。这产生呈黄色油状的1-甲酰基-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯(260mg,3.0%)。LCMS(ESI)[M+H]+:214。
步骤4:合成1-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830001972
向THF(2mL)中置有1-(羟甲基)-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯(260mg,1.22mmol,1.0当量)的溶液添加NaH(87.76mg,3.657mmol,3.00当量)。将所得混合物在室温下搅拌0.5h。接着,将3-氯-2-氟吡啶(240.52mg,1.829mmol,1.50当量)添加至溶液中并且在室温下搅拌1h。用水将反应物淬灭。在真空下浓缩所得溶液。通过逆相纯化粗产物,其中在5min内的水(10mmol/L NH4HCO3)/乙腈=80%-90;220nm。这产生呈黄色油状的1-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯(100mg,25.3%)。LCMS(ESI)[M+H]+:326。
步骤5:合成1-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]-2-氮杂双环[3.1.0]己烷
Figure BDA0003923073830001981
向DCM(2mL)中置有1-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯(100mg,0.31mmol,1.0当量)的溶液添加TFA(0.4mL)。在真空下浓缩所得溶液。通过逆相纯化粗产物,其中在5min内的水(10mmol/L NH4HCO3)/乙腈=40%-50;220nm。这产生呈黄色油状的1-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]-2-氮杂双环[3.1.0]己烷(40mg,57.8%)。LCMS(ESI)[M+H]+:226。
步骤6:合成6-氯-7-(1-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]-2-氮杂双环[3.1.0]己-2-基)-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001982
向DMSO(2mL)中置有6-氯-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-7-氟-4-氧代喹啉-3-甲酸(75mg,0.18mmol,1.0当量)的溶液添加TEA(55mg,0.54mmol,3.0当量)和1-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]-2-氮杂双环[3.1.0]己烷(40mg,0.18mmol,1.0当量)。在80℃下搅拌所得混合物5h。通过Flash-Prep-HPLC在以下条件(IntelFlash-1)下纯化粗产物:柱:Gemini-NX C18 AXAI Packed,21.2*150mm 5um;流动相A:水(0.1%FA),流动相B:乙腈;流动速率:25mL/min;梯度:2min内10B至10B;254nm。这产生呈淡黄色固体状的26-氯-7-(1-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]-2-氮杂双环[3.1.0]己-2-基)-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸(16.8mg,11.27%)。LCMS(ESI)[M+H]+:621.10。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ15.03(s,1H),8.64(d,J=3.4Hz,1H),8.30(t,J=3.3Hz,1H),8.21(s,1H),7.93-7.72(m,3H),7.00-6.82(m,2H),6.47(dd,J=89.5,8.8Hz,1H),4.69(dd,J=18.5,12.0Hz,1H),4.26-3.99(m,4H),3.91-3.74(m,2H),2.83(p,J=7.7Hz,1H),2.22(s,1H),2.14(s,7H),1.92-1.72(m,2H),1.08-0.90(m,2H)。
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例49:合成6-氯-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-7-[(2R)-2-[[(二甲基氨甲酰基)氧基]甲基]吡咯烷-1-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830001991
步骤1:合成6-氯-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-7-[(2R)-2-(羟甲基)吡咯烷-1-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830002001
在80℃下在氮气气氛下向6-氯-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-7-氟-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯(200.00mg,0.450mmol,1.00当量)和Et3N(136.47mg,1.349mmol,3.00当量)于DMSO中的搅拌溶液逐份添加(R)-吡咯烷-2-基甲醇(136.41mg,1.349mmol,3.00当量)。使混合物冷却至室温。通过逆相急骤色谱在以下条件下纯化残留物:柱,C18硅胶;流动相,含MeOH的水,10min内10%至50%梯度;检测器,UV 254nm,得到6-氯-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-7-[(2R)-2-(羟甲基)吡咯烷-1-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯(160mg,67.66%)。
步骤2:合成6-氯-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-7-[(2R)-2-(羟甲基)吡咯烷-1-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002002
搅拌6-氯-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-7-[(2R)-2-(羟甲基)吡咯烷-1-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯(110.00mg,0.209mmol,1.00当量)和NaOH(25.09mg,0.627mmol,3.00当量)于MeOH(1.50mL)、H2O(0.05mL)中的溶液1h。通过逆相急骤色谱在以下条件下纯化残留物:柱,C18硅胶;流动相,含MeOH的水,10min内10%至50%梯度;检测器,UV 254nm。这产生呈黄色固体状的6-氯-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-7-[(2R)-2-(羟甲基)吡咯烷-1-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸(80mg,76.82%)。
步骤3:合成6-氯-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-7-[(2R)-2-[[(二甲基氨甲酰基)氧基]甲基]吡咯烷-1-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002011
在室温下在氮气气氛下向6-氯-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-7-[(2R)-2-(羟甲基)吡咯烷-1-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸(60.00mg,0.120mmol,1.00当量)和二甲基胺甲酰氯(38.87mg,0.361mmol,3.00当量)于THF中的搅拌溶液逐份添加NaH(14.46mg,0.361mmol,3.00当量,60%)。通过制备型HPLC在以下条件下纯化粗产物(60mg)(柱:Gemini-NX C18 AXAI Packed,21.2*150mm5um;流动相A:水(0.1%FA),流动相B:ACN;流动速率:25mL/min;梯度:9min内11B至30B;254nm;RT1:8.4;),得到呈黄色固体状的6-氯-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-7-[(2R)-2-[[(二甲基氨甲酰基)氧基]甲基]吡咯烷-1-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸(15.9mg)。LCMS(ESI)[M+H]+:569.35。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ15.10(s,1H),8.56(d,J=6.2Hz,1H),8.30(d,J=2.3Hz,1H),8.21(s,1H),8.15(s,1H),7.84-7.71(m,1H),4.46(d,J=18.4Hz,1H),4.09(d,J=8.0Hz,2H),4.02-3.90(m,1H),3.90-3.70(m,3H),3.47(s,1H),3.26-3.19(m,2H),2.69(d,J=5.8Hz,3H),2.61(s,3H),2.15(s,7H),1.94(s,1H),1.83-1.55(m,2H)。
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例50:合成(R)-7-(2-(((3-(2-氨基乙氧基)吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-1-(6-溴吡啶-3-基)-6-氯-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002021
步骤1:合成2-((4-甲氧基苯甲基)氨基)乙-1-醇
Figure BDA0003923073830002022
/>
向2-氨基乙-1-醇(3.0g,49.4mmol)于MeOH(60mL)中的溶液添加4-甲氧基苯甲醛(10.0g,73.71mmol)。在室温下搅拌混合物过夜。将NaBH4(2.8g,73.71mmol)逐份添加至混合物中。将混合物再搅拌1h。通过添加水来淬灭反应物。浓缩混合物,得到残留物,通过逆相急骤柱用5-50%于水中的乙腈来纯化,得到呈黄色油状的2-((4-甲氧基苯甲基)氨基)乙-1-醇(4.5g,56%)。LCMS(ESI)[M+H]+:182。
步骤2:合成(2-羟乙基)(4-甲氧基苯甲基)氨基甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830002023
向2-((4-甲氧基苯甲基)氨基)乙-1-醇(1.0g,5.52mmol)于CHCl3(10mL)中的搅拌溶液添加Boc2O(1.32g,6.07mmol)。在室温下搅拌溶液4h。浓缩溶液,得到残留物,通过急骤柱用0-40%于石油醚中的EtOAc来纯化,得到呈无色油状的(2-羟乙基)(4-甲氧基苯甲基)氨基甲酸叔丁酯(1.4g,90%)。LCMS(ESI)[M+H]+:282。
步骤3:合成(2-((2-氟吡啶-3-基)氧基)乙基)(4-甲氧基苯甲基)氨基甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830002031
在0℃下向2-氟吡啶-3-醇(3.0g,26.54mmol)、(2-羟乙基)(4-甲氧基苯甲基)氨基甲酸叔丁酯(11.2g,39.81mmol)和PPh3(13.9g,53.08mmol)于THF(50mL)中的搅拌混合物添加DIAD(10.7g,53.08mmol)。搅拌混合物2h。通过添加100mL水来淬灭反应物。用EtOAc(40mL×3)萃取水溶液。经Na2SO4干燥合并的有机溶液并且并且浓缩,得到残留物,通过逆相急骤柱用5-75%于水中的乙腈来纯化,得到呈黄色油状的(2-((2-氟吡啶-3-基)氧基)乙基)(4-甲氧基苯甲基)氨基甲酸叔丁酯(4.5g,45%)。LCMS(ESI)[M+H]+:377。
步骤4:合成(R)-(2-((2-((1-乙酰基吡咯烷-2-基)甲氧基)吡啶-3-基)氧基)乙基)(4-甲氧基苯甲基)氨基甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830002032
向(2-((2-氟吡啶-3-基)氧基)乙基)(4-甲氧基苯甲基)氨基甲酸叔丁酯(2.0g,5.32mmol)和(R)-1-(2-(羟甲基)吡咯烷-1-基)乙-1-酮(1.1g,7.97mmol)于THF(40mL)中的混合物添加t-BuOK(1.8g,15.96mmol)。将混合物在室温下搅拌2h。通过添加100mL水来淬灭反应物。用EtOAc(40mL×3)萃取水溶液。经Na2SO4干燥合并的有机溶液并且并且浓缩,得到残留物,通过急骤柱用0-8%于DCM中的MeOH来纯化,得到呈无色油状的(R)-(2-((2-((1-乙酰基吡咯烷-2-基)甲氧基)吡啶-3-基)氧基)乙基)(4-甲氧基苯甲基)氨基甲酸叔丁酯(2.4g,90%)。LCMS(ESI)[M+H]+:500。
步骤5:合成(R)-(4-甲氧基苯甲基)(2-((2-(吡咯烷-2-基甲氧基)吡啶-3-基)氧基)乙基)氨基甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830002041
在-78℃下向(R)-(2-((2-((1-乙酰基吡咯烷-2-基)甲氧基)吡啶-3-基)氧基)乙基)(4-甲氧基苯甲基)氨基甲酸叔丁酯(2.3g,4.61mmol)于THF(20mL)中的搅拌溶液逐滴添加MeMgBr(23mL,23mmol)。在-78℃至室温下搅拌溶液过夜。通过添加50mL水来淬灭反应物。用EtOAc(40mL×3)萃取水溶液。经Na2SO4干燥合并的有机溶液并且并且浓缩,得到残留物,通过制备型HPLC纯化,得到呈黄色油状的(R)-(4-甲氧基苯甲基)(2-((2-(吡咯烷-2-基甲氧基)吡啶-3-基)氧基)乙基)氨基甲酸叔丁酯(560mg,27%)。LCMS(ESI)[M+H]+:458。
步骤6:合成(R)-1-(6-溴吡啶-3-基)-7-(2-(((3-(2-((叔丁氧羰基)(4-甲氧基苯甲基)氨基)乙氧基)吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-6-氯-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830002051
向1-(6-溴吡啶-3-基)-6-氯-7-氟-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(200mg,0.47mmol)和(R)-(4-甲氧基苯甲基)(2-((2-(吡咯烷-2-基甲氧基)吡啶-3-基)氧基)乙基)氨基甲酸叔丁酯(431mg,0.94mmol)于DMSO(5mL)中的混合物添加TEA(239mg,2.36mmol)。在90℃下搅拌混合物20h。通过逆相急骤柱用20-90%于水中的乙腈纯化溶液,得到呈黄色固体状的(R)-1-(6-溴吡啶-3-基)-7-(2-(((3-(2-((叔丁氧羰基)(4-甲氧基苯甲基)氨基)乙氧基)吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-6-氯-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(120mg,30%)。LCMS(ESI)[M+H]+:862。
步骤7:合成(R)-7-(2-(((3-(2-氨基乙氧基)吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-1-(6-溴吡啶-3-基)-6-氯-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830002052
将TfOH(2mL)和TFA(2mL)的混合物溶液添加至(R)-1-(6-溴吡啶-3-基)-7-(2-(((3-(2-((叔丁氧羰基)(4-甲氧基苯甲基)氨基)乙氧基)吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-6-氯-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(120mg,0.14mmol)。在室温下搅拌混合物2h。将溶液用MeOH(5mL)稀释并且通过制备型HPLC纯化(柱:YMC-Actus Triart C18,20*250mm,5μm,12nm;流动相A:水(0.1%FA),流动相B:ACN;流动速率:25mL/min;梯度:8min内25% B至50% B,50%B;波长:254nm,RT1(min):5.65;运行数:0),得到呈黄色油状的(R)-7-(2-(((3-(2-氨基乙氧基)吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-1-(6-溴吡啶-3-基)-6-氯-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(59mg,66%)。LCMS(ESI)[M+H]+:642。
步骤8:合成(R)-7-(2-(((3-(2-氨基乙氧基)吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-1-(6-溴吡啶-3-基)-6-氯-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002061
在氮气下向(R)-7-(2-(((3-(2-氨基乙氧基)吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-1-(6-溴吡啶-3-基)-6-氯-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(59mg,0.09mmol)于MeOH(4mL)中的搅拌溶液添加NaOH(37mg,0.92mmol)于水(2mL)中的溶液。在室温下搅拌溶液4h。添加1M HCl以调节pH 3。通过制备型HPLC纯化混合物(柱:XSelect CSH Prep C18OBD柱,19*150mm,5μm;流动相A:水(0.1%FA),流动相B:ACN;流动速率:25mL/min;梯度:8min内22% B至28% B,28% B;波长:254/220nm;RT1(min):6.83;运行数:0),得到呈黄色固体状的(R)-7-(2-(((3-(2-氨基乙氧基)吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-1-(6-溴吡啶-3-基)-6-氯-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(18.7mg,33%)。LCMS(ESI):[M+H+2]+:616.15。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ8.93-8.65(m,2H),8.26(s,1H),8.21-7.97(m,2H),7.84-7.52(m,1H),7.45-7.29(m,1H),6.97(s,1H),6.31(s,1H),4.89-4.61(m,1H),4.49-4.32(m,1H),4.23-3.99(m,3H),3.74-3.53(m,2H),3.26-3.01(m,2H),2.34-2.18(m,1H),2.15-1.75(m,3H)。
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例51:合成(S)-6-氰基-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-7-(2-(((3-氟吡啶-2-基)氧基)甲基)-2-甲基吡咯烷-1-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002071
步骤1:合成(S)-1-(叔丁氧羰基)-2-甲基吡咯烷-2-甲酸
Figure BDA0003923073830002072
向(S)-2-甲基吡咯烷-2-甲酸(3.6g,27.87mmol)于DCM(100mL)中的搅拌溶液添加(Boc)2O(18.25g,83.61mmol,3当量)和Et3N(8.46g,83.61mmol,3当量)。将所得混合物在室温下搅拌5h。接着通过添加盐水(200mL)淬灭反应物。用DCM(100mL×3)萃取混合物。将合并的有机相经MgSO4干燥。过滤之后,在减压下浓缩滤液。这产生呈无色晶体状的粗产物(S)-1-(叔丁氧羰基)-2-甲基吡咯烷-2-甲酸(6.38g,27.8mmol)。LCMS(ESI)[M+H]+:230。
步骤2:合成(S)-2-(羟甲基)-2-甲基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830002073
在室温下于N2下向(S)-1-(叔丁氧羰基)-2-甲基吡咯烷-2-甲酸(6.38g,27.8mmol)于无水THF(100mL)中的溶液添加BH3.Me2S(10.56g,139mmol,5当量)。接着在70℃下搅拌所得混合物1h。在冷却至室温之后。将混合物在减压下浓缩。通过硅胶柱色谱用石油醚/EtOAc=1:1洗脱来纯化残留物,得到呈无色油状的(S)-2-(羟甲基)-2-甲基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(4.1g,19.04mmol)。LCMS(ESI)[M+H]+:216。
步骤3:合成(S)-2-(((3-氟吡啶-2-基)氧基)甲基)-2-甲基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830002081
/>
在0℃下于N2下向(S)-2-(羟甲基)-2-甲基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(4.1g,19.04mmol)于无水THF(100mL)中的搅拌溶液添加KOtBu(6.41g,57.12mmol,3当量)。在10min之后,将2,3-二氟吡啶(2.63g,22.85mmol,1.2当量)添加至混合物中并且在0℃下搅拌所得混合物半小时,并且之后在室温下搅拌4h。接着通过添加盐水(200mL)淬灭反应物。用EtOAc(100mL×3)萃取混合物。将合并的有机相经MgSO4干燥。过滤之后,在减压下浓缩滤液。通过硅胶柱色谱用石油醚/EtOAc=2:1洗脱来纯化残留物,得到呈无色油状的(S)-2-(((3-氟吡啶-2-基)氧基)甲基)-2-甲基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(4.3g,13.85mmol)。LCMS(ESI)[M+H]+:311。
步骤4:合成(S)-3-氟-2-((2-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)吡啶
Figure BDA0003923073830002082
向(S)-2-(((3-氟吡啶-2-基)氧基)甲基)-2-甲基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(4.3g,13.85mmol)于DCM(10mL)中的搅拌溶液添加TFA(15mL)。在室温下搅拌混合物4h。在减压下浓缩混合物。将残留物溶解于饱和NaHCO3(200mL)中并且用EtOAc(100mL×3)萃取。将合并的有机相经MgSO4干燥。过滤之后,在减压下浓缩滤液。这产生呈无色油状的(S)-3-氟-2-((2-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)吡啶(2.6g,12.36mmol)。LCMS(ESI)[M+H]+:211。
步骤5:合成(S)-6-氰基-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-7-(2-(((3-氟吡啶-2-基)氧基)甲基)-2-甲基吡咯烷-1-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830002091
向8-mL密封管添加6-氰基-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-7-氟-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(500mg,1.148mmol)、(S)-3-氟-2-((2-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)吡啶(724mg,3.445mmol,3当量)和DMSO(1mL)。在约50℃下在真空下加热所得混合物1h。接着将DIEA(297mg,2.296mmol,2当量)添加至混合物中。将所得混合物在100℃下于N2下搅拌48h。通过逆相色谱用乙腈/水=7:3洗脱来纯化混合物,得到呈黄色固体状的(S)-6-氰基-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-7-(2-(((3-氟吡啶-2-基)氧基)甲基)-2-甲基吡咯烷-1-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(150mg,0.2397mmol)。LCMS(ESI)[M+H]+:626。
步骤6:合成(S)-6-氰基-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-7-(2-(((3-氟吡啶-2-基)氧基)甲基)-2-甲基吡咯烷-1-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002101
在室温下于N2下向(S)-6-氰基-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-7-(2-(((3-氟吡啶-2-基)氧基)甲基)-2-甲基吡咯烷-1-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(150mg,0.2397mmol)于THF(4mL)中的搅拌溶液添加NaOH(19mg,0.4794mmol,2当量)于H2O(2mL)中的溶液。在室温下搅拌所得混合物过夜。通过AcOH酸化混合物。通过制备型HPLC纯化混合物,得到呈黄色固体状的(S)-6-氰基-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-7-(2-(((3-氟吡啶-2-基)氧基)甲基)-2-甲基吡咯烷-1-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(32.8mg)。LCMS(ESI):[M+H]+:598.25。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ14.69(s,1H),8.69-8.08(m,3H),7.94-7.51(m,3H),7.07-6.91(m,1H),6.61-6.27(m,2H),4.46-4.22(m,2H),4.06-3.87(m,3H),3.80-3.61(m,2H),3.26-3.12(m,1H),2.35-2.22(m,1H),2.13(d,J=1.5Hz,6H),2.08-1.80(m,3H),1.29-1.15(m,3H)。
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例52:合成1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-6-甲基-4-氧代-7-(2-氧代-4-((吡啶-2-基氧基)甲基)氮杂环丁烷-1-基)-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002102
步骤1:合成4-溴-2-氟-5-甲基苯甲酰氯
Figure BDA0003923073830002111
在50℃下在氮气气氛下向4-溴-2-氟-5-甲基苯甲酸(5g,21.4mmol,1当量)和亚硫酰氯(15.31g,128.7mmol,6当量)于DCM中的搅拌溶液逐滴逐份添加DMF(20mg,0.2mmol,0.01当量)。在真空下浓缩所得混合物。这产生呈黄色固体状的4-溴-2-氟-5-甲基苯甲酰氯(5g,92.67%)。
步骤2:合成3-(4-溴-2-氟-5-甲基苯基)-3-氧代丙酸乙酯
Figure BDA0003923073830002112
在室温下在氮气气氛下向1-乙基3-丙二酸钾(6.77g,39.7mmol,2当量)和TEA(4.02g,39.7mmol,2当量)于乙腈中的搅拌溶液逐滴逐份添加4-溴-2-氟-5-甲基苯甲酰氯(5g,19.8mmol,1当量)。用浓HCl将混合物酸化/碱化/中和至pH5。用EtOAc(3×100mL)萃取水层。通过硅胶柱色谱用PE/EA(10:1)洗脱来纯化残留物,得到呈黄色固体状的3-(4-溴-2-氟-5-甲基苯基)-3-氧代丙酸乙酯(5g,82.96%)。LCMS(ESI)[M+H]+:303。
步骤3:合成(Z)-2-(4-溴-2-氟-5-甲基苯甲酰基)-3-乙氧基丙烯酸乙酯
Figure BDA0003923073830002113
在100℃下在氮气气氛下搅拌3-(4-溴-2-氟-5-甲基苯基)-3-氧代丙酸乙酯(3g,9.8mmol,1.00当量)和(二乙氧基甲氧基)乙烷(1.4g,9.8mmol,1当量)于乙酸酐(1g,9.8mmol,1当量)中的溶液1h。在真空下浓缩所得混合物。这产生呈黄色油状的(2Z)-2-[(Z)-4-溴-2-氟-5-甲基苯甲酰基]-3-乙氧基丙-2-烯酸乙酯(3g,84.39%)。LCMS(ESI)[M+H]+:359。
步骤4:合成7-溴-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-6-甲基-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830002121
在室温下在氮气气氛下搅拌(2Z)-2-[(Z)-4-溴-2-氟-5-甲基苯甲酰基]-3-乙氧基丙-2-烯酸乙酯(3g,8.352mmol,1.00当量)和6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-胺(1.6g,8.3mmol,1当量)于DMSO中的溶液1h。接着在室温下向溶液添加K2CO3(1.1g,8.3mmol,1当量)持续1h。所得混合物用水(20mL)稀释。将所沉淀的固体通过过滤收集并且用水(3×10mL)洗涤。这产生呈黄色固体状的7-溴-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-6-甲基-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(3g,86.69%)。LCMS(ESI)[M+H]+:485。
步骤5:合成7-溴-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-6-甲基-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002122
在室温下在氮气气氛下搅拌7-溴-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-6-甲基-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(200mg,0.148mmol,1当量)和NaOH(23mg,0.6mmol,2当量)于乙醇和H2O中的溶液1h。用浓HCl将混合物酸化/碱化/中和至pH7。通过逆相急骤色谱在以下条件下纯化残留物:柱,硅胶;流动相,含MeCN的水,10min内10%至50%梯度;检测器,UV 254nm。这产生呈黄色固体状的7-溴-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-6-甲基-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(150mg,76.6%)。MS(ESI):m/z 457[M+H]+
步骤6:合成4-((吡啶-2-基氧基)甲基)氮杂环丁-2-酮
Figure BDA0003923073830002131
在室温下在氮气气氛下搅拌4-(羟甲基)氮杂环丁-2-酮(1g,10mmol,1当量)和2-氟吡啶(1.16g,12mmol,1.2当量)、t-BuOK(3.36g,30mmol,3当量)于DMSO(5mL)中的溶液1h。通过逆相急骤色谱在以下条件下纯化残留物:柱,硅胶;流动相,含MeCN的水,10min内10%至50%梯度;检测器,UV 254nm。这产生呈黄色油状的4-((吡啶-2-基氧基)甲基)氮杂环丁-2-酮(200mg,16.5%)。MS(ESI):m/z 179[M+H]+
步骤7:合成1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-6-甲基-4-氧代-7-(2-氧代-4-((吡啶-2-基氧基)甲基)氮杂环丁烷-1-基)-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002132
在80℃下在氮气气氛下搅拌7-溴-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-6-甲基-4-氧代喹啉-3-甲酸(30mg,0.066mmol,1当量)和4-[(吡啶-2-基氧基)甲基]氮杂环丁-2-酮(17.53mg,0.099mmol,1.5当量)、第3代RuPhos预催化剂(5mg,0.007mmol,0.1当量)、Cs2CO3(64.12mg,0.198mmol,3当量)于二噁烷中的溶液1h。将粗产物(30mg)通过制备型HPLC在以下条件下纯化(柱:Welch XB-C18,21.2*250mm,5μm;流动相A:水(0.1%FA),流动相B:ACN;流动速率:25mL/min;梯度:2min内5% B至5% B,2.5min内5% B至15%B,10.5min内15% B至40% B,40% B;波长:254nm;RT1(min):8.2;运行数:0),得到呈黄色固体状的1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-6-甲基-4-氧代-7-[2-氧代-4-[(吡啶-2-基氧基)甲基]氮杂环丁烷-1-基]喹啉-3-甲酸(27.8mg,76.41%)。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ15.08(s,1H),8.62(s,1H),8.36-8.15(m,2H),8.04-7.90(m,1H),7.73-7.59(m,2H),7.14(s,1H),7.03-6.86(m,1H),6.63-6.44(m,2H),4.72-4.65(m,1H),4.54-4.41(m,2H),4.19-4.05(m,2H),3.89-3.77(m,2H),3.24-3.17(m,2H),3.08-2.94(m,1H),2.47(s,3H),2.16(s,6H)。MS(ESI):m/z555.0[M+H]+
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++
实施例53:合成7-[(2R)-2-([[3-(2-氨基乙氧基)吡啶-2-基]氧基]甲基)吡咯烷-1-基]-6-氯-1-[6-(二甲氨基)吡啶-3-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002141
步骤1:合成N,N-二甲基-5-硝基吡啶-2-胺
Figure BDA0003923073830002142
向2-氯-5-硝基-吡啶(2.0g,12.62mmol,1.0当量)于n-BuOH(65mL)中的混合物添加氯二甲胺(1.1g,13.88mmol,1.1当量)和TEA(3.8g,37.85mmol,3.0当量)。将所得混合物在100℃下在氮气气氛下搅拌1.5h。使混合物冷却至室温。在真空下浓缩所得混合物。通过硅胶柱色谱用CH2Cl2/MeOH(10:1)洗脱来纯化残留物。这产生呈红色固体状的N,N-二甲基-5-硝基吡啶-2-胺(2.5g,粗物质)。LCMS(ESI)[M+H]+:168.1。
步骤2:合成N2,N2-二甲基吡啶-2,5-二胺
Figure BDA0003923073830002151
向N,N-二甲基-5-硝基吡啶-2-胺(2.5g,14.96mmol,1.0当量)于MeOH(50mL)中的混合物添加Pd/C(1.6g,14.96mmol,1.0当量)。将所得混合物在室温下在氢气气氛下搅拌1.5h。过滤所得混合物,用MeOH(3×30mL)洗涤滤饼。在减压下浓缩滤液。这产生呈红色固体状的N2,N2-二甲基吡啶-2,5-二胺(850mg,41%)。LCMS(ESI)[M+H]+:138.1。
步骤3:合成6-氯-1-[6-(二甲氨基)吡啶-3-基]-7-氟-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830002152
向3-(5-氯-2,4-二氟苯基)-3-氧代丙酸乙酯(1.0g,3.81mmol,1.0当量)于Ac2O(1.2g,11.42mmol,3.0当量)中的混合物添加原甲酸三乙酯(0.9g,5.71mmol,1.5当量)。将所得混合物在100℃下搅拌2h。在真空下浓缩所得混合物。向DMSO(60mL)中的所得混合物添加N2,N2-二甲基吡啶-2,5-二胺(0.5g,3.81mmol,1.0当量)。将所得混合物在25℃下搅拌2h。向所得混合物添加K2CO3(0.3g,1.90mmol,0.5当量)。在100℃下搅拌所得混合物1h。通过添加65mL水淬灭反应物。通过过滤来收集沉淀的固体。这产生呈黄色固体状的6-氯-1-[6-(二甲氨基)吡啶-3-基]-7-氟-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯(800mg,54%)。LCMS(ESI)[M+H]+:390.1。
步骤4:合成7-[(2R)-2-{[(3-{2-[(叔丁氧羰基)[(4-甲氧基苯基)甲基]氨基]乙氧基}吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-6-氯-1-[6-(二甲氨基)吡啶-3-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830002161
向6-氯-1-[6-(二甲氨基)吡啶-3-基]-7-氟-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯(500mg,1.28mmol,1.0当量)于DMSO(15mL)中的混合物添加N-[(4-甲氧基苯基)甲基]-N-[2-({2-[(2R)-吡咯烷-2-基甲氧基]吡啶-3-基}氧基)乙基]氨基甲酸叔丁酯(704mg,1.54mmol,1.2当量)和TEA(389mg,3.85mmol,3.0当量)。将所得混合物在100℃下在氮气气氛下搅拌2h。使混合物冷却至室温。通过逆相急骤色谱在以下条件下纯化残留物:柱,C18硅胶;流动相,含MeCN的水,30min内5%至100%梯度;检测器,UV 254nm和UV 220nm。这产生呈黄色固体状的7-[(2R)-2-{[(3-{2-[(叔丁氧羰基)[(4-甲氧基苯基)甲基]氨基]乙氧基}吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-6-氯-1-[6-(二甲氨基)吡啶-3-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯(400mg,38%)。LCMS(ESI)[M+H]+:827.4。
步骤5:合成7-[(2R)-2-({[3-(2-氨基乙氧基)吡啶-2-基]氧基}甲基)吡咯烷-1-基]-6-氯-1-[6-(二甲氨基)吡啶-3-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830002171
向7-[(2R)-2-{[(3-{2-[(叔丁氧羰基)[(4-甲氧基苯基)甲基]氨基]乙氧基}吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-6-氯-1-[6-(二甲氨基)吡啶-3-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯(360mg,0.44mmol,1.0当量)于三氟甲磺酸(2.5mL)中的混合物。将所得混合物在室温下搅拌2h。在真空下浓缩所得混合物。通过逆相急骤色谱在以下条件下纯化残留物:柱,C18硅胶;流动相,含MeCN的水,30min内5%至100%梯度;检测器,UV 254nm和UV 220nm。这产生呈黄色固体状的7-[(2R)-2-({[3-(2-氨基乙氧基)吡啶-2-基]氧基}甲基)吡咯烷-1-基]-6-氯-1-[6-(二甲氨基)吡啶-3-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯(50mg,19%)。LCMS(ESI)[M+H]+:607.2。
步骤6:合成7-[(2R)-2-([[3-(2-氨基乙氧基)吡啶-2-基]氧基]甲基)吡咯烷-1-基]-6-氯-1-[6-(二甲氨基)吡啶-3-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002172
向7-[(2R)-2-([[3-(2-氨基乙氧基)吡啶-2-基]氧基]甲基)吡咯烷-1-基]-6-氯-1-[6-(二甲氨基)吡啶-3-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯(40mg,0.07mmol,1.0当量)于THF(1mL)中的混合物添加NaOH(26mg,0.66mmol,10.0当量)和H2O(1mL)。将所得混合物在室温下在氮气气氛下搅拌1h。用HCl(水溶液)将混合物中和至pH 5。在真空下浓缩所得混合物。将粗产物通过制备型HPLC在以下条件下纯化(柱:XBridge Shield RP18 OBD柱,5um,19*150mm;流动相A:水(0.1%FA),流动相B:ACN;流动速率:25mL/min;梯度:8min内60% B至90% B;254/220nm;Rt:7.31min)。这产生呈淡黄色固体状的7-[(2R)-2-([[3-(2-氨基乙氧基)吡啶-2-基]氧基]甲基)吡咯烷-1-基]-6-氯-1-[6-(二甲氨基)吡啶-3-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸(5.7mg,14.94%)。LCMS(ESI)[M+H]+:579.25。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ8.59(d,J=6.1Hz,1H),8.34(d,J=9.1Hz,1H),8.24(s,1H),7.75(d,J=9.9Hz,1H),7.64(d,J=5.3Hz,1H),7.37(d,J=7.2Hz,1H),7.04-6.85(m,1H),6.60(d,J=9.0Hz,1H),6.46(d,J=5.2Hz,1H),4.76(d,J=27.5Hz,1H),4.45(s,1H),4.21-4.03(m,3H),3.74-3.53(m,1H),3.17(d,J=3.8Hz,7H),2.38-2.23(m,1H),2.12-1.75(m,3H)。
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例54:合成(R)-7-(2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)-5-氧代吡咯烷-1-基)-6-氰基-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸:
Figure BDA0003923073830002181
步骤1:合成(R)-5-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-2-酮
Figure BDA0003923073830002182
在0℃下向(5R)-5-(羟甲基)吡咯烷-2-酮(6.0g,52.11mmol,1.0当量)和t-BuOK(17.5g,156.34mmol,3.0当量)于DMSO(15ml)中的混合物添加3-氯-2-氟吡啶(8.2g,62.54mmol,1.2当量)。在室温下在氮气气氛下搅拌所得混合物1h。将残留物通过逆相急骤色谱在以下条件下纯化:柱,硅胶;流动相,含MeCN的水,20min内50%至70%梯度;检测器,UV 254nm。这产生呈黄色固体状的((R)-5-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-2-酮(6g,50.80%)。LCMS(ESI)[M+H]+:227.1。步骤2:合成(R)-7-(2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)-5-氧代吡咯烷-1-基)-6-氰基-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002191
在室温下在氮气气氛下,向(5R)-5-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-2-酮(80mg,0.35mmol,1.0当量)和t-BuOK(119mg,1.06mmol,3.0当量)于DMSO(1mL)中的混合物(在30min之后)逐份添加6-氰基-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-7-氟-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯(184mg,0.42mmol,1.20当量)。在80℃下在氮气气氛下搅拌所得混合物1h。用乙酸将混合物酸化至pH 6。通过制备型HPLC在以下条件下纯化粗产物(80mg)(柱:Gemini-NX C18 AXAI Packed,21.2*150mm 5um;流动相A:水(0.1%FA),流动相B:ACN;流动速率:25mL/min;梯度:8min内13B至35B;254nm;RT1:5.0;RT2:;注射体积:ml;运行数:;),得到呈黄色固体状的7-[(2R)-2-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]-5-氧代吡咯烷-1-基]-6-氰基-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸(9.7mg,4.48%)。LCMS(ESI)[M+H]+:614.0。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ9.99(s,1H),8.27(d,J=7.1Hz,1H),8.08-7.97(m,1H),7.88-7.76(m,1H),7.67(d,J=2.4Hz,2H),7.30-6.92(m,2H),6.62-6.15(m,2H),4.46(d,J=4.0Hz,1H),4.39-3.93(m,7H),2.73(s,6H),2.54(s,1H),2.45-2.41(m,1H),2.41-2.25(m,2H),1.97(s,1H)。
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++
实施例55:合成(R)-26,63-二氯-24-氧代-21,24-二氢-5,7-二氧杂-11-氮杂-2(1,7)-喹啉-1(5,2),6(2,6)-二吡啶-3(1,2)-吡咯烷环十一烷(pyrrolidinacycloundecaphane)-23-甲酸
Figure BDA0003923073830002201
步骤1:合成(R)-2-(((6-氯-3-硝基吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830002202
在0℃下在氮气气氛下向(2R)-2-(羟甲基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(12.g,62.183mmol,1.2当量)和NaH(2.4g,103.6mmol,2当量)于THF中的搅拌溶液逐滴逐份添加2,6-二氯-3-硝基吡啶(10g,51.8mmol,1当量)持续1h。在室温下用水淬灭反应物。用EtOAc(3×100mL)萃取水层。在减压下浓缩所得混合物。通过硅胶柱色谱用PE/EA(5:1)洗脱来纯化残留物,得到呈黄色固体状的(2R)-2-[[(6-氯-3-硝基吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(13g,70.12%)。LCMS(ESI)[M+H]+:358。
步骤2:合成(R)-2-(((3-氨基-6-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830002203
在80℃下在氮气气氛下搅拌(2R)-2-[[(6-氯-3-硝基吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(13g,36mmol,1当量)和Fe(10g,181mmol,5当量)、NH4Cl(5.5g,109mmol,3当量)于乙醇和H2O中的溶液1h。过滤所得混合物,用乙醇(3×100mL)洗涤滤饼。在减压下浓缩滤液。通过硅胶柱色谱用PE/EA(3:1)洗脱来纯化残留物,得到呈黄色固体状的(2R)-2-[[(3-氨基-6-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(6.6g,55.41%)。LCMS(ESI)[M+H]+:328。
步骤3:合成(R)-2-(((3,6-二氯吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830002211
在60℃下在氮气气氛下向CuCl(2391.85mg,24.161mmol,1.2当量)和LiCl(2560.63mg,60.402mmol,3当量)于乙腈中的搅拌混合物逐份添加t-BuNO2(3.6g,35.6mmol,1.7当量)和(2R)-2-[[(3-氨基-6-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(6.6g,20.1mmol,1当量)。在0℃下用HCL(水溶液)淬灭反应物。用EtOAc(3x100mL)萃取水层。通过硅胶柱色谱用PE/EA(5:1)洗脱来纯化残留物,得到呈黄色固体状的(2R)-2-[[(3,6-二氯吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(3.5g,50.06%)。LCMS(ESI)[M+H]+:347
步骤4:合成(R)-3,6-二氯-2-(吡咯烷-2-基甲氧基)吡啶
Figure BDA0003923073830002212
在室温下在氮气气氛下搅拌(2R)-2-[[(3,6-二氯吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(3.5g,10mmol,1当量)和TFA(11.49g,100.7mmol,10当量)于DCM中的溶液1h。在真空下浓缩所得混合物。这产生呈黄色油状的3,6-二氯-2-[(2R)-吡咯烷-2-基甲氧基]吡啶(2g,80.29%)。LCMS(ESI)[M+H]+:247。
步骤5:合成3-((5-硝基吡啶-2-基)氨基)丙-1-醇
Figure BDA0003923073830002221
在100℃下在氮气气氛下搅拌2-氯-5-硝基-吡啶(10g,63.0mmol,1当量)和丙醇胺(5g,75.6mmol,1.2当量)、TEA(19g,189.2mmol,3当量)于BuOH中的溶液1h。在真空下浓缩所得混合物。通过硅胶柱色谱用PE/EA(5:1)洗脱来纯化残留物,得到呈黄色固体状的3-[(5-硝基吡啶-2-基)氨基]丙-1-醇(11g,88.44%)。LCMS(ESI)[M+H]+:198。
步骤6:合成3-((5-氨基吡啶-2-基)氨基)丙-1-醇
Figure BDA0003923073830002222
在室温下在氢气气氛下搅拌3-[(5-硝基吡啶-2-基)氨基]丙-1-醇(4.5g,22.820mmol,1当量)和Pd/C(242mg,2.28mmol,0.1当量)于MeOH中的溶液1h。过滤所得混合物,用MeOH(3×100mL)洗涤滤饼。在减压下浓缩滤液。在真空下浓缩所得混合物。这产生呈黄色固体状的3-[(5-氨基吡啶-2-基)氨基]丙-1-醇(3.8g,99.59%)。LCMS(ESI)[M+H]+:168。
步骤7:合成(Z)-2-(5-氯-2,4-二氟苯甲酰基)-3-乙氧基丙烯酸乙酯
Figure BDA0003923073830002223
在100℃下在氮气气氛下搅拌3-(5-氯-2,4-二氟苯基)-3-氧代丙酸乙酯(5g,19.03mmol,1.00当量)和原甲酸三乙酯(4.2g,28.555mmol,1.5当量)于Ac2O(5.8g,57.111mmol,3当量)中的溶液1h。在真空下浓缩所得混合物。这产生呈黄色油状的(2Z)-2-[(Z)-5-氯-2,4-二氟苯甲酰基]-3-乙氧基丙-2-烯酸乙酯(5.5g,90.65%)。
步骤8:合成6-氯-7-氟-1-(6-((3-羟丙基)氨基)吡啶-3-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830002231
在室温下在氮气气氛下搅拌(2Z)-2-[(Z)-5-氯-2,4-二氟苯甲酰基]-3-乙氧基丙-2-烯酸乙酯(5.5g,17.258mmol,1当量)和3-[(5-氨基吡啶-2-基)氨基]丙-1-醇(2.8g,17.25mmol,1当量)于DMSO中的溶液1h。接着在室温下添加K2CO3(2.3g,17.25mmol,1当量)持续1h。将所得混合物用水(20mL)稀释。通过过滤收集所沉淀的固体并且用水(3×10mL)洗涤。这产生呈黄色固体状的6-氯-7-氟-1-[6-[(3-羟丙基)氨基]吡啶-3-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯(5g,69.01%)。LCMS(ESI)[M+H]+:420
步骤9:合成(R)-6-氯-7-(2-(((3,6-二氯吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-1-(6-((3-羟丙基)氨基)吡啶-3-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830002232
在100℃下在氮气气氛下搅拌6-氯-7-氟-1-[6-[(3-羟丙基)氨基]吡啶-3-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯(1g,2.38mmol,1当量)和3,6-二氯-2-[(2R)-吡咯烷-2-基甲氧基]吡啶(1.7g,7.14mmol,3当量)、TEA(0.72g,7.14mmol,3当量)于DMSO中的溶液1h。将残留物通过逆相急骤色谱在以下条件下纯化:柱,硅胶;流动相,含MeCN的水,10min内10%至50%梯度;检测器,UV 254nm。这产生呈黄色固体状的6-氯-7-[(2R)-2-[[(3,6-二氯吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-基]-1-[6-[(3-羟丙基)氨基]吡啶-3-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯(200mg,12.98%)。LCMS(ESI)[M+H]+:646
步骤10:合成(R)-26,63-二氯-24-氧代-21,24-二氢-5,7-二氧杂-11-氮杂-2(1,7)-喹啉-1(5,2),6(2,6)-二吡啶-3(1,2)-吡咯烷环十一烷-23-甲酸
Figure BDA0003923073830002241
在50℃下在氮气气氛下搅拌6-氯-7-[(2R)-2-[[(3,6-二氯吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-1-基]-1-[6-[(3-羟丙基)氨基]吡啶-3-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯(200mg,0.31mmol,1.00当量)和NaH(29mg,1.23mmol,4当量)于DMF中的溶液1h。在减压下浓缩所得混合物。粗产物(200mg)通过制备型HPLC在以下条件下纯化(柱:Gemini-NX C18 AXAIPacked,21.2*150mm 5um;流动相A:水(0.1%FA),流动相B:ACN;流动速率:25mL/min;梯度:8min内23% B至31% B,31%B;波长:254nm;RT1(min):9.23;运行数:0),得到呈黄色固体状的(R)-26,63-二氯-24-氧代-21,24-二氢-5,7-二氧杂-11-氮杂-2(1,7)-喹啉-1(5,2),6(2,6)-二吡啶a-3(1,2)-吡咯烷环十一烷-23-甲酸(8.5mg,4.72%)。1H NMR(300MHz,甲醇-d4)δ9.99(s,1H),8.03(s,1H),7.64-7.35(m,1H),7.27-6.93(m,2H),6.63(d,J=8.6Hz,1H),6.50-6.37(m,1H),6.06-5.87(m,1H),4.71-4.58(m,1H),4.38-4.04(m,4H),3.99-3.78(m,1H),3.68-3.49(m,1H),3.47-3.41(m,1H),3.20-3.06(m,1H),2.17-1.97(m,3H),1.89-1.76(m,3H),1.31(s,2H)。MS(ESI):m/z 581.95[M+H]+
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++
实施例56:合成6-氯-7-[(2R)-2-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]-2-甲基吡咯烷-1-基]-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-4-氧代-1,8-萘啶-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002251
步骤1:合成6,7-二氯-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-4-氧代-1,8-萘啶-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830002252
在室温下搅拌(2Z)-3-乙氧基-2-[(Z)-2,5,6-三氯吡啶-3-羰基]丙-2-烯酸乙酯(1.0g,2.83mmol)、6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-胺(0.5g,2.86mmol)和DMSO(15.0mL)的混合物过夜。接着添加Et3N(0.8g,8.40mmol)并且在室温下搅拌混合物过夜。通过RPFC纯化所得混合物,得到呈黄色固体状的6,7-二氯-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-4-氧代-1,8-萘啶-3-甲酸乙酯(600mg,46.24%)。LCMS(ESI)[M+H]+:462。
步骤2:合成6-氯-7-[(2R)-2-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]-2-甲基吡咯烷-1-基]-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-4-氧代-1,8-萘啶-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830002261
在120℃下搅拌6,7-二氯-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-4-氧代-1,8-萘啶-3-甲酸乙酯(200mg,0.43mmol)和3-氯-2-[[(2R)-2-甲基吡咯烷-2-基]甲氧基]吡啶(392mg,1.73mmol)的混合物2h。通过RPFC纯化所得混合物,得到呈黄色固体状的6-氯-7-[(2R)-2-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]-2-甲基吡咯烷-1-基]-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-4-氧代-1,8-萘啶-3-甲酸乙酯(60mg,21.25%)。LCMS(ESI)[M+H]+:652。
步骤3:合成6-氯-7-[(2R)-2-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]-2-甲基吡咯烷-1-基]-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-4-氧代-1,8-萘啶-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002262
向6-氯-7-[(2R)-2-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]-2-甲基吡咯烷-1-基]-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-4-氧代-1,8-萘啶-3-甲酸乙酯(60mg,0.09mmol)于EtOH(1.0mL)中的溶液添加NaOH(0.46mL,0.46mmol)并且在室温下搅拌混合物2h。用1mL 1N HCl淬灭反应物,并且浓缩混合物并且通过制备型HPLC纯化,得到呈白色固体状的6-氯-7-[(2R)-2-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]-2-甲基吡咯烷-1-基]-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-4-氧代-1,8-萘啶-3-甲酸(29.5mg,50.66%)。LCMS(ESI)[M+H]+:624.25。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ15.04(s,1H),8.57(s,1H),8.25(s,1H),8.20(d,J=2.5Hz,1H),8.00(s,1H),7.86(d,J=7.6Hz,1H),7.65(s,1H),6.98(s,1H),6.66-5.97(m,1H),4.51(s,1H),4.21-3.81(m,5H),3.68(q,J=6.5Hz,2H),3.18(s,1H),2.23-2.07(m,7H),2.06-1.65(m,3H),1.15(s,3H)。
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例57:合成6-氯-7-(7-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)-6-氮杂螺[3.4]辛-6-基)-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002271
步骤1:合成1-烯丙基环丁烷-1-甲腈
Figure BDA0003923073830002272
在0℃下在氮气气氛下向环丁腈(3g,36.98mmol,1.0当量)和烯丙基溴(5.37g,44.38mmol,1.2当量)于THF(20ml)中的混合物添加LDA(7.92g,73.97mmol,2当量)。在室温下在氮气气氛下搅拌所得混合物1h。通过硅胶柱色谱用PE/EA(1:1)洗脱来纯化残留物,得到呈黄色油状的1-烯丙基环丁烷-1-甲腈(1.4g,31.24%)。LCMS(ESI)[M+H]+:122.1。
步骤2:合成(1-烯丙基环丁基)甲胺
Figure BDA0003923073830002281
在0℃下在氮气气氛下向1-烯丙基环丁烷-1-甲腈(900mg,7.43mmol,1.0当量)于THF(5ml)中的搅拌混合物添加LAH(564mg,14.85mmol,2.0当量)。在0℃下在氮气气氛下搅拌所得混合物1h。在0℃下通过添加Na2SO4.10H2O淬灭反应物。通过MgSO4干燥所得混合物。并且将其在真空下浓缩。粗产物不经进一步纯化直接用于下一步骤。LCMS(ESI)[M+H]+:126.1。
步骤3:合成((1-烯丙基环丁基)甲基)氨基甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830002282
在0℃下在氮气气氛下向1-[1-(丙-2-烯-1-基)环丁基]甲胺(900mg,7.19mmol,1.0当量)和Boc2O(3.14g,14.38mmol,2.0当量)于DCM(5ml)中的混合物逐份添加TEA(3.64g,35.94mmol,5.0当量)和DMAP(88mg,0.72mmol,0.1当量)。在室温下在氮气气氛下搅拌所得混合物2h。在真空下浓缩所得混合物。通过硅胶柱色谱用PE/EA(1:1)洗脱来纯化残留物,得到呈淡黄色油状的N-{[1-(丙-2-烯-1-基)环丁基]甲基}氨基甲酸叔丁酯(800mg,49.39%)。LCMS(ESI)[M+H]+:226.2。
步骤4:合成(6-氮杂螺[3.4]辛-7-基)甲醇
Figure BDA0003923073830002283
在0℃下在氮气气氛下向N-{[1-(丙-2-烯-1-基)环丁基]甲基}氨基甲酸叔丁酯(800mg,3.55mmol,1.0当量)和TsOH(1.22g,7.10mmol,2.0当量)于MeCN(5ml)中的混合物添加过硫酸氢钾(1.79g,10.65mmol,3.0当量)。在50℃下在氮气气氛下搅拌所得混合物2h。在真空下浓缩所得混合物。粗产物不经进一步纯化直接用于下一步骤。LCMS(ESI)[M+H]+:142.1。
步骤5:合成7-(羟甲基)-6-氮杂螺[3.4]辛烷-6-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830002291
在0℃下在氮气气氛下向6-氮杂螺[3.4]辛-7-基甲醇(600mg,4.25mmol,1.0当量)和Boc2O(1.85g,8.50mmol,2.0当量)于DCM(5ml)中的混合物添加TEA(2.15g,21.25mmol,5.0当量)。在室温下在氮气气氛下搅拌所得混合物过夜。在真空下浓缩所得混合物。通过硅胶柱色谱用CH2Cl2/MeOH(10:1)洗脱来纯化残留物,得到呈淡黄色固体状的7-(羟甲基)-6-氮杂螺[3.4]辛烷-6-甲酸叔丁酯(240mg,23.41%)。LCMS(ESI)[M+H]+:242.2。
步骤6:合成7-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)-6-氮杂螺[3.4]辛烷-6-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830002292
在0℃下在氮气气氛下向7-(羟甲基)-6-氮杂螺[3.4]辛烷-6-甲酸叔丁酯(230mg,0.95mmol,1.0当量)于THF(5ml)中的混合物添加NaH(69mg,2.86mmol,3.0当量)和3-氯-2-氟吡啶(150mg,1.14mmol,1.2当量)。在室温下在氮气气氛下搅拌所得混合物1h。在0℃下用MeOH淬灭反应物。残留物通过逆相急骤色谱在以下条件下纯化:柱,硅胶;流动相,含MeCN的水,10min内50%至60%梯度;检测器,UV 254nm。这产生呈淡黄色油状的7-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}-6-氮杂螺[3.4]辛烷-6-甲酸叔丁酯(140mg,41.63%)。LCMS(ESI)[M+H]+:353.2。
步骤7:合成7-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)-6-氮杂螺[3.4]辛烷
Figure BDA0003923073830002301
在0℃下在氮气气氛下向7-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}-6-氮杂螺[3.4]辛烷-6-甲酸叔丁酯(140mg,0.40mmol,1.0当量)于DCM(3ml)中的混合物添加TFA(2mL)。在室温下搅拌所得混合物1h。在真空下浓缩所得混合物。这产生呈黄色固体状的7-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)-6-氮杂螺[3.4]辛烷(180mg,180%)。粗产物不经进一步纯化直接用于下一步骤。LCMS(ESI)[M+H]+:253.1。
步骤8:合成6-氯-7-(7-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)-6-氮杂螺[3.4]辛-6-基)-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002302
在氮气气氛下向1-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]-2-氮杂双环[2.1.1]己烷(150mg,0.5mmol,1.0当量)和6-氯-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-7-氟-4-氧代喹啉-3-甲酸(280mg,0.6mmol,1.2当量)于DMSO(1mL)中的混合物添加TEA(151mg,1.5mmol,3.0当量)。在100℃下在氮气气氛下搅拌所得混合物过夜。粗产物(100mg)通过制备型HPLC在以下条件下纯化(柱:Gemini-NX C18 AXAI Packed,21.2*150mm 5um;流动相A:水(10MMOL/L NH4HCO3),流动相B:ACN;流动速率:25mL/min;梯度:2min内10% B至10% B,2.5min内10% B至48% B,12min内48% B至88% B,88%B;波长:254nm;RT1(min):10.98;运行数:0),得到呈黄色固体状的6 6-氯-7-(7-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)-6-氮杂螺[3.4]辛-6-基)-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(59.5mg,18.36%)。LCMS(ESI)[M+H]+:649.15。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ15.08(s,1H),8.51(d,J=9.5Hz,1H),8.25(d,J=2.6Hz,1H),8.20(s,1H),8.17(s,2H),7.92-7.79(m,2H),7.73-7.64(m,1H),7.00-6.89(m,1H),6.57(d,J=8.9Hz,2H),6.42(d,J=13.5Hz,2H),4.56(s,1H),4.45(s,2H),4.37-4.22(m,2H),4.14-4.01(m,2H),3.88-3.77(m,2H),3.52(d,J=9.2Hz,1H),3.25(d,J=8.3Hz,2H),2.15(s,13H)。
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例58:合成6-氯-7-[(2R)-2-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]-4,4-二甲基吡咯烷-1-基]-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002311
步骤1:合成(5R)-5-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-2-酮
Figure BDA0003923073830002312
在80℃下搅拌(5R)-5-(羟甲基)吡咯烷-2-酮(10g,86.85mmol,1当量)、3-氯-2-氟吡啶(17.14g,130.31mmol,1.5当量)和t-BuOK(29.24g,260.57mmol,3当量)于DMSO(50mL)中的混合物过夜。用乙酸乙酯(3×100mL)萃取所得混合物。将合并的有机层用盐水(50mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并且在减压下浓缩。通过硅胶柱色谱用DCM/MeOH(20:1)洗脱来纯化残留物,得到呈黄色油状的(5R)-5-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-2-酮(6.8g,34.54%)。LCMS(ESI)[M+H]+:227.05。
步骤2:合成(2R)-2-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]-5-氧代吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830002321
在室温下搅拌(5R)-5-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]吡咯烷-2-酮(6.7g,29.56mmol,1当量)、Boc2O(12.9g,59.1mmol,2当量)、DMAP(0.72g,5.91mmol,0.2当量)和DIEA(7.64g,59.12mmol,2当量)于ACN(50mL)中的混合物2.5h。在减压下浓缩所得混合物。通过硅胶柱色谱用5%于DCM中的MeOH洗脱来纯化残留物,得到呈黄色固体状的(2R)-2-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]-5-氧代吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(6g,62.11%)。LCMS(ESI)[M+H]+:327.10。
步骤3:合成(5R)-5-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]-3,3-二甲基-2-氧代吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830002322
在0℃下向(2R)-2-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]-5-氧代吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(2g,6.12mmol,1当量)于THF(10mL)中的溶液逐滴添加LiHMDS(12mL,12mmol,2当量)。搅拌混合物30分钟。随后,供应MeI(1.91g,13.46mmol,2.2当量)并且在25℃下搅拌混合物2h。所得混合物用水淬灭并且用乙酸乙酯(3×100mL)萃取。将合并的有机层用水(3×150mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并且在减压下浓缩。通过硅胶柱色谱用30%于己烷中的乙酸乙酯洗脱来纯化残留物,得到呈灰色固体状的(5R)-5-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]-3,3-二甲基-2-氧代吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(590mg,27.17%)。LCMS(ESI)[M+H]+:355.13。
步骤4:合成(2R)-2-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]-4,4-二甲基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830002331
在室温下向(5R)-5-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]-3,3-二甲基-2-氧代吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(530mg,1.49mmol,1当量)于THF(5mL)中的搅拌溶液逐滴添加BH3-Me2S(0.99mL,13.05mmol,7当量)。搅拌混合物18h。将所得混合物在0℃下用MeOH(5mL)逐滴淬灭,并且在减压下浓缩。通过硅胶柱色谱用40%于己烷中的乙酸乙酯洗脱来纯化所得混合物,得到呈黄色油状的(2R)-2-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]-4,4-二甲基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(280mg,55%)。LCMS(ESI)[M+H]+:341.16。
步骤5:合成3-氯-2-[[(2R)-4,4-二甲基吡咯烷-2-基]甲氧基]吡啶
Figure BDA0003923073830002332
在室温下搅拌(2R)-2-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]-4,4-二甲基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(280mg,0.82mmol,1当量)于DCM(6mL)和TFA(2mL)中的混合物过夜。在减压下浓缩所得混合物。通过RP急骤色谱用ACN/H2O(0.1%FA)(10%-15%)洗脱来纯化残留物,得到呈黄色油状的3-氯-2-[[(2R)-4,4-二甲基吡咯烷-2-基]甲氧基]吡啶(130mg,65.74%)。LCMS(ESI)[M+H]+:241.10。
步骤6:合成6-氯-7-[(2R)-2-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]-4,4-二甲基吡咯烷-1-基]-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002341
在100℃下搅拌3-氯-2-[[(2R)-4,4-二甲基吡咯烷-2-基]甲氧基]吡啶(80mg,0.33mmol,1当量)、6-氯-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-7-氟-4-氧代喹啉-3-甲酸(69mg,0.16mmol,0.5当量)和TEA(50mg,0.49mmol,1.5当量)于DMSO(1mL)中的搅拌混合物10h。所得混合物通过制备型HPLC在以下条件下纯化(柱:SunFire Prep C18OBD柱,19×150mm 5um 10nm;流动相A:水(0.1%FA),流动相B:ACN;流动速率:25mL/min;梯度:8min内25B至45B;254nm;RT1:6.68;RT2:;注射体积:ml;运行数:;),得到呈黄色固体状的6-氯-7-[(2R)-2-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]-4,4-二甲基吡咯烷-1-基]-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸(6.6mg,2.82%)。LCMS(ESI)[M+H]+:637.20。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ15.07(s,1H),8.51(d,J=6.8Hz,1H),8.25(d,J=2.6Hz,1H),8.17(s,1H),7.91-7.80(m,2H),7.69(t,J=9.0Hz,1H),7.00-6.89(m,1H),6.58(d,J=8.5Hz,0.5H),6.41(d,J=5.8Hz,1H),6.34(d,J=9.1Hz,0.5H),4.67(d,J=23.1Hz,1H),4.30(s,2H),4.07(t,J=8.2Hz,2H),3.91-3.74(m,2H),3.43(d,J=11.0Hz,1H),3.25(t,J=6.2Hz,1H),2.92(d,J=9.3Hz,1H),2.15(s,6H),2.03(d,J=15.7Hz,1H),1.82(s,1H),1.13(s,3H),1.01(s,3H)。
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例59:合成6-氯-7-(2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}-3,3-二甲基吡咯烷-1-基)-1-{6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基}-4-氧代喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002351
步骤1:合成1,3-二乙基2-[[(苯甲氧基)羰基]氨基]丙二酸酯
Figure BDA0003923073830002352
向1,3-二乙基2-氨基丙二酸酯(30g,171.24mmol,1当量)和Na2CO3(21.78g,205mmol,1.2当量)于H2O(150mL)中的混合物逐滴添加CbzCl(43.82g,256.87mmol,1.5当量)。将混合物在0℃下搅拌2h并且接着在室温下搅拌过夜。将所得混合物用HCl(水溶液)酸化至pH 3并且用EtOAc(200mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水洗涤并且经Na2SO4干燥。粗产物在以下条件(PE:EA/3:1)下纯化,得到呈无色油状的1,3-二乙基2-[[(苯甲氧基)羰基]氨基]丙二酸酯(30g,56.64%)。LCMS(ESI)[M+H]+:310.12。
步骤2:合成1-苯甲基2,2-二乙基3,3-二甲基吡咯-1,2,2-三甲酸酯
Figure BDA0003923073830002353
向1,3-二乙基2-{[(苯甲氧基)羰基]氨基}丙二酸酯(35g,113.15mmol,1.00当量)于EtOH(200mL)中的溶液添加EtONa(9.24g,135.78mmol,1.2当量)于EtOH(50mL)中的溶液。搅拌混合物15min。随后,供应3-甲基-2-丁烯醛(prenal)(10.47g,124.46mmol,1.1当量)于EtOH(100mL)中的溶液。在25℃下搅拌反应物24h。所得混合物用H2O淬灭并且在减压下浓缩。通过硅胶柱色谱用30%于石油醚中的EtOAc洗脱来纯化残留物,得到呈黄色油状的1-苯甲基2,2-二乙基3,3-二甲基吡咯-1,2,2-三甲酸酯(11.2g,26.37%)。LCMS(ESI)[M+H]+:376.17。
步骤3:合成2,2-二乙基3,3-二甲基吡咯烷-2,2-二甲酸酯
Figure BDA0003923073830002361
在室温下在氢气气氛下搅拌1-苯甲基2,2-二乙基3,3-二甲基吡咯-1,2,2-三甲酸酯(11.2g,29.83mmol,1当量)和Pd/C(11.2g)于MeOH(150mL)中的混合物1h。过滤所得混合物并且在减压下浓缩滤液。2,2-二乙基3,3-二甲基吡咯烷-2,2-二甲酸酯的粗产物(7.2g,99.19%)不经进一步纯化直接用于下一步骤。LCMS(ESI)[M+H]+:244.15。
步骤4:合成3,3-二甲基吡咯烷-2-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830002362
向2,2-二乙基3,3-二甲基吡咯烷-2,2-二甲酸酯(7.2g,29.59mmol,1当量)于MeOH(7mL)和H2O(7mL)中的混合物添加NaOH(11.84g,295.93mmol,10当量)。在室温下搅拌混合物过夜。通过逆相急骤色谱在以下条件下纯化中间产物:柱,C18硅胶;流动相,于水中的ACN,10min内2%至3%梯度。随后,在100℃下搅拌分散于二噁烷中的中间产物3h。在减压下浓缩所得混合物,得到呈无色油状的3,3-二甲基吡咯烷-2-甲酸乙酯(4.8g,94.72%)。LCMS(ESI)[M+H]+:172.13。
步骤5:合成1-叔丁基2-乙基3,3-二甲基吡咯烷-1,2-二甲酸酯
Figure BDA0003923073830002371
在室温下搅拌3,3-二甲基吡咯烷-2-甲酸乙酯(900mg,5.25mmol,1当量)、Boc2O(1.72g,7.88mmol,1.5当量)、DMAP(0.13g,1.05mmol,0.2当量)和TEA(1.6g,15.76mmol,3当量)于DCM(10mL)中的混合物3h。在减压下浓缩所得混合物。通过硅胶柱色谱用15%于石油醚中的EtOAc洗脱来纯化残留物,得到呈黄色油状的1-叔丁基2-乙基3,3-二甲基吡咯烷-1,2-二甲酸酯(350mg,24.54%)。LCMS(ESI)[M+H]+:272.18。
步骤6:合成4-[(1E)-3-(4-氟苯基)丙-1-烯-1-基]苯甲腈
Figure BDA0003923073830002372
在0℃下向1-叔丁基2-乙基3,3-二甲基吡咯烷-1,2-二甲酸酯(350mg,1.29mmol,1当量)于THF(5mL)中的溶液逐滴添加LAH(1.93mL,1.93mmol,1.5当量)。搅拌混合物0.5h并且用Na2SO4.10 H2O淬灭。所得混合物用过滤处理并且在减压下浓缩滤液。通过RPFC用于水(15%-20%)中的MeOH洗脱来纯化残留物,得到呈黄色油状的2-(羟甲基)-3,3-二甲基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(250mg,84.52%)。LCMS(ESI)[M+H]+:230.17。
步骤7:合成2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}-3,3-二甲基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830002373
在0℃下向2-(羟甲基)-3,3-二甲基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(200mg,0.87mmol,1当量)于THF(5mL)中的溶液添加NaH(62mg,2.61mmol,3当量)。搅拌反应物1h并且用水淬灭。通过RPFC用于水(30%-35%)中的ACN洗脱来纯化所得混合物,得到呈无色油状的2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}-3,3-二甲基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(55mg,18.50%)。LCMS(ESI)[M+H]+:341.16。
步骤8:合成3-氯-2-[(3,3-二甲基吡咯烷-2-基)甲氧基]吡啶
Figure BDA0003923073830002381
搅拌2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}-3,3-二甲基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(55mg,0.16mmol,1当量)于DCM(3mL)和TFA(1mL)中的混合物5h。在减压下浓缩所得混合物。通过RP急骤色谱用ACN/H2O(0.1%FA)(5%-10%)洗脱来纯化残留物,得到呈黄色油状的3-氯-2-[(3,3-二甲基吡咯烷-2-基)甲氧基]吡啶(40mg,粗产物)。LCMS(ESI)[M+H]+:241.10。
步骤9:合成6-氯-7-(2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}-3,3-二甲基吡咯烷-1-基)-1-{6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基}-4-氧代喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002382
在100℃下搅拌6-氯-1-{6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基}-7-氟-4-氧代喹啉-3-甲酸(40mg,0.09mmol,1当量)、3-氯-2-[(3,3-二甲基吡咯烷-2-基)甲氧基]-6-甲氧基吡啶(36mg,0.13mmol,1.4当量)和TEA(29mg,0.28mmol,3当量)于DMSO(1mL)中的混合物2h。所得混合物通过制备型HPLC在以下条件下纯化(柱:XBridge Prep C18 OBD柱,19*150mm,5μm;流动相A:水(10MMOL/L NH4HCO3),流动相B:ACN;流动速率:25mL/min;梯度:2min内10% B至10% B,2.5min内10% B至36% B,10.5min内36% B至65% B,65%B;波长:220nm;RT1(min):11.2;运行数:0),得到呈黄色固体状的6-氯-7-(2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}-3,3-二甲基吡咯烷-1-基)-1-{6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基}-4-氧代喹啉-3-甲酸(1.8mg,2.85%)。LCMS(ESI)[M+H]+:637.20。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ8.46(s,1H),8.32-7.70(m,4H),7.68-7.15(m,1H),6.99(s,1H),6.66-5.83(m,2H),4.40(d,J=10.5Hz,1H),4.28-3.90(m,3H),3.77(s,3H),3.29-2.97(m,3H),2.14(s,6H),1.76(d,J=36.7Hz,2H),1.25-1.15(m,3H),1.10(s,3H),0.95(s,1H),0.90-0.72(m,1H)。
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例60:6-氯-7-[(2R)-2-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]-4,4-二氟吡咯烷-1-基]-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-4-氧代-1,8-萘啶-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002391
步骤1:合成1-(叔丁基)2-甲基(R)-4,4-二氟吡咯烷-1,2-二甲酸酯
Figure BDA0003923073830002392
在0℃下在氮气气氛下向1-(叔丁基)2-甲基(R)-4-氧代吡咯烷-1,2-二甲酸酯(3g,12.3mmol,1当量)于DCM中的搅拌溶液逐份添加DAST(18g,111.1mmol,9当量)持续1h。在0℃下用水淬灭反应物。用DCM(3×10mL)萃取水层。通过硅胶柱色谱用PE/EA(1:1)洗脱来纯化残留物,得到呈黄色固体状的(2R)-4,4-二氟-2-(羟甲基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(2.3g,85.72%)。LCMS(ESI)[M+H]+:266。
步骤2:合成(R)-4,4-二氟-2-(羟甲基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830002401
在0℃下在氮气气氛下向1-叔丁基2-甲基(2R)-4,4-二氟吡咯烷-1,2-二甲酸酯(3g,11.3mmol,1当量)于THF中的搅拌溶液逐份添加LiBH4(492mg,22.6mmol,2当量)持续1h。在0℃下用水淬灭反应物。用EtOAc(3×10mL)萃取水层。通过硅胶柱色谱用PE/EA(1:1)洗脱来纯化残留物,得到呈黄色固体状的(2R)-4,4-二氟-2-(羟甲基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(2.3g,85.72%)。LCMS(ESI)[M+H]+:238。
步骤3:合成(2R)-2-(((3-氯-1,2-二氢吡啶-2-基)氧基)甲基)-4,4-二氟吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830002402
在0℃下在氮气气氛下向(2R)-4,4-二氟-2-(羟甲基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(2.3g,9.6mmol,1当量)和NaH(465mg,19.3mmol,2当量)于THF中的搅拌溶液逐滴逐份添加3-氯-2-氟吡啶(1.5g,11.6mmol,1.2当量)持续1h。在0℃下用水淬灭反应物。用EtOAc(3×10mL)萃取水层。通过硅胶柱色谱用PE/EA(3:1)洗脱来纯化残留物,得到呈黄色固体状的(2R)-2-[[(3-氯-1,2-二氢吡啶-2-基)氧基]甲基]-4,4-二氟吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(2.3g,67.63%)。LCMS(ESI)[M+H]+:351。
步骤4:合成(R)-3-氯-2-((4,4-二氟吡咯烷-2-基)甲氧基)吡啶
Figure BDA0003923073830002411
在室温下在氮气气氛下搅拌(2R)-2-[[(3-氯-1,2-二氢吡啶-2-基)氧基]甲基]-4,4-二氟吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(1.1g,3.1mmol,1当量)和TFA(3575.52mg,31.3mmol,10当量)于DCM中的溶液1h。在真空下浓缩所得混合物。这产生呈黄色油状的3-氯-2-[[(2R)-4,4-二氟吡咯烷-2-基]甲氧基]吡啶(700mg,89.77%)。LCMS(ESI)[M+H]+:249。
步骤5:合成(R)-6-氯-7-(2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)-4,4-二氟吡咯烷-1-基)-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-4-氧代-1,4-二氢-1,8-萘啶-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830002412
在100℃下在氮气气氛下搅拌6,7-二氯-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-4-氧代-1,8-萘啶-3-甲酸乙酯(200mg,0.433mmol,1.00当量)和3-氯-2-[[(2R)-4,4-二氟吡咯烷-2-基]甲氧基]吡啶(129.08mg,0.520mmol,1.2当量)、TEA(131.32mg,1.299mmol,3当量)于DMSO中的溶液1h。残留物通过逆相急骤色谱在以下条件下纯化:柱,硅胶;流动相,含MeCN的水,10min内10%至50%梯度;检测器,UV 254nm。这产生呈黄色固体状的6-氯-7-[(2R)-2-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]-4,4-二氟吡咯烷-1-基]-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-4-氧代-1,8-萘啶-3-甲酸乙酯(100mg,34.27%)。LCMS(ESI)[M+H]+:674。
步骤6:合成6-氯-7-[(2R)-2-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]-4,4-二氟吡咯烷-1-基]-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-4-氧代-1,8-萘啶-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002421
在室温下在氮气气氛下搅拌6-氯-7-[(2R)-2-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]-4,4-二氟吡咯烷-1-基]-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-4-氧代-1,8-萘啶-3-甲酸乙酯(100mg,0.148mmol,1当量)和NaOH(11mg,0.3mmol,2当量)于乙醇和H2O中的溶液1h。用浓HCl将混合物酸化/碱化/中和至pH 7。粗产物(100mg)通过制备型HPLC在以下条件下纯化(柱:Gemini-NX C18 AXAI Packed,21.2*150mm 5um;流动相A:水(0.1%FA),流动相B:ACN;流动速率:25mL/min;梯度:10min内24% B至37% B,37% B;波长:254nm;RT1(min):8.97;运行数:0),得到呈黄色固体状的6-氯-7-[(2R)-2-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]-4,4-二氟吡咯烷-1-基]-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-4-氧代-1,8-萘啶-3-甲酸(38.3.mg,39.96%)。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ14.62(s,1H),8.68(s,1H),8.43(s,1H),8.20(s,1H),8.03-7.89(m,2H),7.78-7.65(m,1H),7.02(s,1H),6.30-6.06(m,1H),4.75(s,1H),4.41-4.12(m,4H),4.03-3.76(m,2H),3.76-3.59(m,2H),3.22-3.09(m,1H),2.78-2.68(m,1H),2.61-2.57(m,1H),2.13(s,6H)。MS(ESI):m/z 646.20[M+H]+
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例61:合成7-[(2R)-2-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]-4-(吡啶-3-基)吡咯烷-1-基]-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-6-氟-4-氧代喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002431
步骤1:合成1-叔丁基2-甲基(2R)-4-(三氟甲烷磺酰基氧基)-2,3-二氢吡咯-1,2-二甲酸酯
Figure BDA0003923073830002432
向1-叔丁基2-甲基(2R)-4-氧代吡咯烷-1,2-二甲酸酯(10.0g,41.11mmol,1.0当量)于THF(60mL)中的混合物添加1,1,1-三氟-N-苯基-N-三氟甲烷磺酰基甲烷磺酰胺(17.6g,49.33mmol,1.2当量)和NaHMDS(13.8g,82.22mmol,2.0当量)。将所得混合物在0℃下在氮气气氛下搅拌15min。在0℃下通过添加水(30mL)淬灭反应物。将所得混合物用EtOAc(3×50mL)萃取。经无水Na2SO4干燥合并的有机层。在真空下浓缩所得混合物。通过硅胶柱色谱用PE/EA(3:1)洗脱来纯化残留物。这产生呈黄色油状的1-叔丁基2-甲基(2R)-4-(三氟甲烷磺酰基氧基)-2,3-二氢吡咯-1,2-二甲酸酯(5.5g,36%)。LCMS(ESI)[M+H]+:376.1。
步骤2:合成1-叔丁基2-甲基(2R)-4-(吡啶-3-基)-2,3-二氢吡咯-1,2-二甲酸酯
Figure BDA0003923073830002433
向1-叔丁基2-甲基(2R)-4-(三氟甲烷磺酰基氧基)-2,3-二氢吡咯-1,2-二甲酸酯(5.5g,14.65mmol,1.0当量)于甲苯(140mL)中的混合物添加EtOH(40mL)、H2O(20mL)、吡啶-3-基硼酸(1.8g,14.65mmol,1.0当量)、Na2CO3(4.7g,43.96mmol,3.0当量)和Pd(dppf)Cl2CH2Cl2(6.0g,7.33mmol,0.5当量)。在60℃下在氮气气氛下搅拌所得混合物1.5h。使混合物冷却至室温。在真空下浓缩所得混合物。通过硅胶柱色谱用PE/EA(1:1)洗脱来纯化残留物。这产生呈黄色油状的1-叔丁基2-甲基(2R)-4-(吡啶-3-基)-2,3-二氢吡咯-1,2-二甲酸酯(1.7g,38%)。LCMS(ESI)[M+H]+:305.1。
步骤3:合成1-叔丁基2-甲基(2R)-4-(吡啶-3-基)吡咯烷-1,2-二甲酸酯
Figure BDA0003923073830002441
向1-叔丁基2-甲基(2R)-4-(吡啶-3-基)-2,3-二氢吡咯-1,2-二甲酸酯(1.7g,5.59mmol,1.0当量)于MeOH(25mL)中的混合物添加Pd/C(0.6g,5.59mmol,1.0当量)。在室温下在氢气气氛下搅拌所得混合物1h。过滤所得混合物,用MeOH(3×10mL)洗涤滤饼。在减压下浓缩滤液。这产生呈黄色粗油状物的1-叔丁基2-甲基(2R)-4-(吡啶-3-基)吡咯烷-1,2-二甲酸酯(1.5g,88%)。LCMS(ESI)[M+H]+:307.2。
步骤4:合成(2R)-2-(羟甲基)-4-(吡啶-3-基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830002442
在0℃下向1-叔丁基2-甲基(2R)-4-(吡啶-3-基)吡咯烷-1,2-二甲酸酯(1.5g,4.90mmol,1.0当量)于THF(20mL)中的混合物添加LAH(0.3g,7.34mmol,1.5当量)。将所得混合物在0℃下在氮气气氛下搅拌15min。在0℃下用硫酸钠十水合物淬灭反应物。所得混合物经无水MgSO4干燥。过滤所得混合物,用EtOAc(3×10mL)洗涤滤饼。在减压下浓缩滤液。通过硅胶柱色谱用PE/EtOAc(1:9)洗脱来纯化残留物。这产生呈淡黄色油状的(2R)-2-(羟甲基)-4-(吡啶-3-基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(1.0g,73%)。LCMS(ESI)[M+H]+:279.2。
步骤5:合成(2R)-2-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]-4-(吡啶-3-基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830002451
在0℃下向(2R)-2-(羟甲基)-4-(吡啶-3-基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(1.0g,3.59mmol,1.0当量)于DMF(12mL)中的混合物添加NaH(0.3g,10.78mmol,3.0当量)。将所得混合物在室温下在氮气气氛下搅拌30min。向以上混合物添加3-氯-2-氟吡啶(0.7g,5.39mmol,1.5当量)。将所得混合物在室温下再搅拌1.5h。在0℃下通过添加水(10mL)淬灭反应物。将所得混合物用EtOAc(3×10mL)萃取。经无水Na2SO4干燥合并的有机层。在真空下浓缩所得混合物。通过硅胶柱色谱用PE/EtOAc(5:1)洗脱来纯化残留物。这产生呈淡黄色油状的(2R)-2-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]-4-(吡啶-3-基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(700mg,50%)。LCMS(ESI)[M+H]+:390.2。
步骤6:合成3-氯-2-[[(2R)-4-(吡啶-3-基)吡咯烷-2-基]甲氧基]吡啶
Figure BDA0003923073830002452
向(2R)-2-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]-4-(吡啶-3-基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(700mg,1.80mmol,1.0当量)于DCM(8mL)中的混合物添加TFA(4mL)。将所得混合物在室温下在氮气气氛下搅拌1h。在真空下浓缩所得混合物。通过逆相急骤色谱在以下条件下纯化残留物:柱,C18硅胶;流动相,含MeCN的水,30min内5%至100%梯度;检测器,UV 254nm和UV220nm。这产生呈淡黄色油状的3-氯-2-[[(2R)-4-(吡啶-3-基)吡咯烷-2-基]甲氧基]吡啶(350mg,67%)。LCMS(ESI)[M+H]+:290.1。
步骤7:合成3-氯-2-(((2R,4S)-4-(吡啶-3-基)吡咯烷-2-基)甲氧基)吡啶和3-氯-2-(((2R,4R)-4-(吡啶-3-基)吡咯烷-2-基)甲氧基)吡啶
Figure BDA0003923073830002461
通过手性-HPLC分离3-氯-2-(((2R)-4-(吡啶-3-基)吡咯烷-2-基)甲氧基)吡啶(100mg),得到3-氯-2-(((2R,4S)-4-(吡啶-3-基)吡咯烷-2-基)甲氧基)吡啶(70mg)和3-氯-2-(((2R,4R)-4-(吡啶-3-基)吡咯烷-2-基)甲氧基)吡啶(10mg)。
步骤8:合成7-[(2R)-2-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]-4-(吡啶-3-基)吡咯烷-1-基]-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-6-氟-4-氧代喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002462
向1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-6,7-二氟-4-氧代喹啉-3-甲酸(65mg,0.16mmol,1.0当量)于DMSO(3.5mL)中的混合物添加TEA(49mg,0.49mmol,3.0当量)和3-氯-2-[[(2R,4S)-4-(吡啶-3-基)吡咯烷-2-基]甲氧基]吡啶(56mg,0.19mmol,1.2当量)。将所得混合物在100℃下在氮气气氛下搅拌1h。使混合物冷却至室温。在真空下浓缩所得混合物。将粗产物通过制备型HPLC在以下条件下纯化(柱:XBridge Shield RP18 OBD柱,5um,19*150mm;流动相A:水(0.1%FA),流动相B:ACN;流动速率:25mL/min;梯度:8min内60% B至90% B;254/220nm;Rt:7.31min)。这产生呈淡黄色固体状的7-[(2R)-2-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]-4-(吡啶-3-基)吡咯烷-1-基]-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-6-氟-4-氧代喹啉-3-甲酸(29.7mg,27.30%)。LCMS(ESI)[M+H]+:670.25。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ15.32(s,1H),8.56(d,J=2.5Hz,1H),8.53-8.44(m,2H),8.30-8.19(m,1H),7.99-7.86(m,3H),7.85-7.65(m,2H),7.45-7.35(m,1H),6.99(d,J=4.9Hz,1H),6.65-6.50(m,1H),6.36-6.20(m,2H),4.46(d,J=9.7Hz,3H),4.18-3.94(m,2H),3.88-3.67(m,3H),3.58-3.44(m,2H),3.21(s,1H),2.67(m,J=11.4,6.7Hz,1H),2.12(s,7H)。
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例62:合成7-[(2R,4R)-2-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]-4-(吡啶-3-基)吡咯烷-1-基]-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-6-氟-4-氧代喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002471
步骤1:合成7-[(2R,4R)-2-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]-4-(吡啶-3-基)吡咯烷-1-基]-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-6-氟-4-氧代喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002481
向1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-6,7-二氟-4-氧代喹啉-3-甲酸(8mg,0.02mmol,1.0当量)于DMSO(2mL)中的混合物添加TEA(6mg,0.06mmol,3.0当量)和3-氯-2-[[(2R,4R)-4-(吡啶-3-基)吡咯烷-2-基]甲氧基]吡啶(7mg,0.02mmol,1.2当量)。在100℃下在氮气气氛下搅拌所得混合物1h。使混合物冷却至室温。在真空下浓缩所得混合物。粗产物通过制备型HPLC在以下条件下纯化(柱:XBridge Shield RP18 OBD柱,5um,19*150mm;流动相A:水(0.1%FA),流动相B:ACN;流动速率:25mL/min;梯度:8min内60% B至90% B;254/220nm;Rt:7.31min),得到呈淡黄色固体状的7-[(2R,4R)-2-[[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基]-4-(吡啶-3-基)吡咯烷-1-基]-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-6-氟-4-氧代喹啉-3-甲酸(10.9mg,81.40%)。LCMS(ESI)[M+H]+:670.20。1HNMR(300MHz,DMSO-d6)δ15.30(s,1H),8.57(s,1H),8.54-8.45(m,2H),8.25(d,J=2.8Hz,1H),8.01-7.86(m,3H),7.85-7.64(m,2H),7.39(d,J=7.9,4.7Hz,1H),7.07-6.92(m,1H),6.59-6.19(m,2H),4.47(s,3H),4.02(d,J=6.6Hz,2H),3.88-3.66(m,3H),3.49(s,2H),3.22(d,J=5.6Hz,1H),2.79-2.62(m,1H),2.23(s,1H),2.12(s,6H)。
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例63:合成6-氯-7-((2R)-2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)-4-环丁基吡咯烷-1-基)-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002491
步骤1:合成1-(叔丁基)2-甲基(2R)-4-羟基吡咯烷-1,2-二甲酸酯
Figure BDA0003923073830002492
向1-(叔丁基)2-甲基(R)-4-氧代吡咯烷-1,2-二甲酸酯(5.0g,20.56mmol,1.0当量)于MeOH(50mL)中的混合物添加NaBH4(1.5g,41.13mmol,2.0当量)。所得混合物在0℃下搅拌1h。用水淬灭反应物。用EtOAc(3*50mL)萃取所得混合物。将合并的有机层收集并且用无水Na2SO4干燥。在真空下浓缩所得混合物。通过硅胶柱色谱用PE/EtOAc(1:1)洗脱来纯化残留物。这产生呈黄色固体状的1-(叔丁基)2-甲基(2R)-4-羟基吡咯烷-1,2-二甲酸酯(2.5g,49.7%)。LCMS(ESI)[M+H]+:246.1。
步骤2:合成1-(叔丁基)2-甲基(2R)-4-碘吡咯烷-1,2-二甲酸酯
Figure BDA0003923073830002493
向1-(叔丁基)2-甲基(2R)-4-羟基吡咯烷-1,2-二甲酸酯(2.5g,10.20mmol,1.0当量)于DCM(20mL)中的混合物添加咪唑(693.8mg,30.6mmol,3.0当量)、三苯基膦(6.3g,30.6mmol,3.0当量)和二碘(5.9g,30.6mmol,3.0当量)。在0℃下搅拌所得混合物过夜。用水淬灭反应物。用EtOAc(3*50mL)萃取所得混合物。将合并的有机层收集并且用无水Na2SO4干燥。在真空下浓缩所得混合物。通过硅胶柱色谱用PE/EtOAc(1:1)洗脱来纯化残留物。这产生呈黄色固体状的1-(叔丁基)2-甲基(2R)-4-碘吡咯烷-1,2-二甲酸酯(2.3g,63.8%)。LCMS(ESI)[M+H]+:356.1
步骤3:合成1-(叔丁基)2-甲基(2R)-4-环丁基吡咯烷-1,2-二甲酸酯
Figure BDA0003923073830002501
向1-(叔丁基)2-甲基(2R)-4-碘吡咯烷-1,2-二甲酸酯(2.3g,6.47mmol,1.0当量)于THF(30mL)中的溶液添加Co(acac)2(137.5mg,0.38mmol,0.6当量)、四甲基乙二胺(1.50g,12.9mmol,2.0当量)和环丁基溴化镁(2.4g,15.5mmol,2.4当量)。在0℃下搅拌所得混合物过夜。用水淬灭反应物。用EtOAc(3*50mL)萃取所得混合物。将合并的有机层收集并且用无水Na2SO4干燥。在真空下浓缩所得混合物。通过硅胶柱色谱用PE/EtOAc(1:1)洗脱来纯化残留物。这产生呈黄色固体状的1-(叔丁基)2-甲基(2R)-4-环丁基吡咯烷-1,2-二甲酸酯(979.8mg,53.5%)。LCMS(ESI)[M+H]+:284.1。
步骤4:合成(2R)-4-环丁基-2-(羟甲基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830002502
向1-(叔丁基)2-甲基(2R)-4-环丁基吡咯烷-1,2-二甲酸酯(900mg,3.18mmol,1.0当量)于THF(10mL)中的溶液添加氢化锂铝(1mol/L,5mL,4.77mmol,2.0当量)。在0℃下搅拌所得溶液1小时。用Na2SO4.10H2O淬灭反应物。过滤所得混合物,用EA(100mL)洗涤滤饼,在减压下浓缩滤液。这产生呈黄色固体状的(2R)-4-环丁基-2-(羟甲基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(429.7mg,53.2%)。LCMS(ESI)[M+H]+:256.1。
步骤5:合成(2R)-2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)-4-环丁基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830002511
向(2R)-4-环丁基-2-(羟甲基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(350mg,1.37mmol,1.0当量)于THF(5mL)中的溶液添加3-氯-2-氟吡啶(215.3mg,1.64mmol,1.2当量)和双(三甲基硅烷基)氨基钾(3mL,2.74mmol,2.0当量)。在0℃下搅拌所得溶液1小时。用水淬灭反应物。用EtOAc(3*20mL)萃取所得混合物。将合并的有机层收集并且用无水Na2SO4干燥。在真空下浓缩所得混合物。通过硅胶柱色谱用PE/EtOAc(1:1)洗脱来纯化残留物。这产生呈黄色固体状的(2R)-2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)-4-环丁基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(260.5mg,52.1%)。LCMS(ESI)[M+H]+:367.1。
步骤6:合成3-氯-2-(((2R)-4-环丁基吡咯烷-2-基)甲氧基)吡啶
Figure BDA0003923073830002512
向(2R)-2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)-4-环丁基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(150mg,0.40mmol,1.0当量)于DCM(3.0mL)中的溶液添加TFA(2.0mL)。将所得溶液在室温下搅拌1小时。在真空下浓缩所得混合物。这产生呈黄色固体状的3-氯-2-(((2R)-4-环丁基吡咯烷-2-基)甲氧基)吡啶(200mg,粗产物)。LCMS(ESI)[M+H]+:267.1。
步骤7:合成6-氯-7-((2R)-2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)-4-环丁基吡咯烷-1-基)-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002521
向3-氯-2-(((2R)-4-环丁基吡咯烷-2-基)甲氧基)吡啶(100mg,0.37mmol,1.0当量)于DMSO(2mL)中的溶液添加6-氯-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-7-氟-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(231.4mg,0.55mmol,1.5当量)和TEA(112.1mg,1.11mmol,3.0当量)。将所得溶液在100℃下搅拌1小时。混合物通过制备型HPLC(柱:XSelect CSH Prep C18 OBD柱,19*250mm,5μm;流动相A:水(0.05%FA),流动相B:ACN;流动速率:25mL/min;梯度:7min内25%B至55% B,55% B;波长:254/220nm;RT1(min):6.05;运行数:0)纯化。这产生呈黄色固体状的6-氯-7-((2R)-2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)-4-环丁基吡咯烷-1-基)-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(4.5mg,0.02%)。LCMS(ESI)[M+H]+:663.2。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ15.15(s,1H),8.59(m,1H),8.41-8.18(m,2H),8.03-7.85(m,2H),7.80-7.62(m,1H),7.02(m,1H),6.70-6.33(m,2H),4.77(m,1H),4.45-4.22(m,2H),4.13(m,2H),3.88(m,2H),3.28(m,2H),2.91(s,1H),2.39(s,2H),2.22(s,6H),2.05-1.77(m,4H),1.68(m,2H),1.35(s,1H).1.31(s,1H)。
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例64:合成6-氯-7-(3-(((3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基)甲基)-2-氮杂双环[2.1.1]己-2-基)-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002531
步骤1:合成2-(叔丁氧羰基)-2-氮杂双环[2.1.1]己烷-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002532
向2-氮杂双环[2.1.1]己烷-2-甲酸叔丁酯(600mg,3.27mmol,1.0当量)于二乙醚(5mL)中的混合物(屏蔽CO2气体)加入s-BuLi(9.8mL,1mol/L,9.81mmol,3.0当量)和四甲基乙二胺(1.13g,9.81mmol,3.0当量)。将所得混合物在室温下搅拌1h。用MeOH淬灭反应物。在真空下浓缩所得混合物。这产生呈黄色固体状的2-(叔丁氧羰基)-2-氮杂双环[2.1.1]己烷-3-甲酸(400mg,47.1%)。LCMS(ESI)[M+H]+:228.1。
步骤2:合成2-(叔丁基)3-甲基2-氮杂双环[2.1.1]己烷-2,3-二甲酸酯
Figure BDA0003923073830002533
向2-(叔丁氧羰基)-2-氮杂双环[2.1.1]己烷-3-甲酸(400mg,1.76mmol,1.0当量)于MeOH(5mL)中的混合物添加对于此结构可能未生成的A名称(298.6mg,2.64mmol,1.5当量)。将所得混合物在室温下搅拌16h。在真空下浓缩所得混合物。收集沉淀的固体并且通过制备型HPLC在以下条件下纯化粗产物(柱:XBridge Shield RP18 OBD柱,5um,19*150mm;流动相A:水(10MMOL/L NH4HCO3),流动相B:ACN;流动速率:25mL/min;梯度:7min内25B至48B;254/220nm;RT1:5.90;RT2:;注射体积:ml;运行数:;)。这产生呈黄色固体状的2-(叔丁基)3-甲基2-氮杂双环[2.1.1]己烷-2,3-二甲酸酯(200mg,47.1%)。LCMS(ESI)[M+H]+:242.1。
步骤3:合成3-(羟甲基)-2-氮杂双环[2.1.1]己烷-2-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830002541
向2-(叔丁基)3-甲基2-氮杂双环[2.1.1]己烷-2,3-二甲酸酯(200mg,0.82mmol,1.0当量)于THF(2mL)中的混合物添加氢化锂铝(1mol/L,1.23mL,1.23mmol,1.5当量)。在0℃下搅拌所得溶液1小时。用Na2SO4.10H2O淬灭反应物。用水淬灭反应物。用EtOAc(3*20mL)萃取所得混合物。将合并的有机层收集并且用无水Na2SO4干燥。在真空下浓缩所得混合物。通过硅胶柱色谱用PE/EtOAc(1:1)洗脱来纯化残留物。这产生呈黄色固体状的3-(羟甲基)-2-氮杂双环[2.1.1]己烷-2-甲酸叔丁酯(100mg,57.4%)。LCMS(ESI)[M+H]+:214.1。
步骤4:合成1-(叔丁基)2-甲基(2R)-4-碘吡咯烷-1,2-二甲酸酯
Figure BDA0003923073830002542
向3-(羟甲基)-2-氮杂双环[2.1.1]己烷-2-甲酸叔丁酯(100mg,0.46mmol,1.0当量)于THF(3mL)中的混合物添加2,3-二氯-6-甲氧基吡啶(122.1mg,0.69mmol,1.5当量)和双(三甲基硅烷基)氨基钾(0.1mL,0.92mmol,2.0当量)。在0℃下搅拌所得溶液1小时。用水淬灭反应物。用EtOAc(3*10mL)萃取所得混合物。将合并的有机层收集并且经无水Na2SO4干燥。在真空下浓缩所得混合物。通过硅胶柱色谱用PE/EtOAc(1:1)洗脱来纯化残留物。这产生呈黄色固体状的3-(((3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基)甲基)-2-氮杂双环[2.1.1]己烷-2-甲酸叔丁酯(90mg,55.5%)。LCMS(ESI)[M+H]+:355.1
步骤5:合成3-(((3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基)甲基)-2-氮杂双环[2.1.1]己烷
Figure BDA0003923073830002551
向3-(((3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基)甲基)-2-氮杂双环[2.1.1]己烷-2-甲酸叔丁酯(90mg,0.25mmol,1.0当量)于DCM(2mL)中的溶液添加TFA(2.0mL)。将所得溶液在室温下搅拌1小时。在真空下浓缩所得混合物。这产生呈黄色固体状的3-(((3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基)甲基)-2-氮杂双环[2.1.1]己烷(100mg,粗物质)。LCMS(ESI)[M+H]+:255.0。
步骤6:合成6-氯-7-(3-(((3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基)甲基)-2-氮杂双环[2.1.1]己-2-基)-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002552
向3-(((3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基)甲基)-2-氮杂双环[2.1.1]己烷(100mg,0.39mmol,1.0当量)于DMSO(2mL)中的溶液添加6-氯-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-7-氟-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(231.4mg,0.55mmol,1.5当量)和TEA(112.1mg,1.11mmol,3.0当量)。将所得溶液在100℃下搅拌1小时。混合物通过制备型HPLC(柱:XSelect CSH Prep C18 OBD柱,19*250mm,5μm;流动相A:水(0.05%FA),流动相B:ACN;流动速率:25mL/min;梯度:7min内25% B至55% B,55% B;波长:254/220nm;RT1(min):6.05;运行数:0)纯化。这产生呈黄色固体状的6-氯-7-(3-(((3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基)甲基)-2-氮杂双环[2.1.1]己-2-基)-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(3.3mg,0.01%)。LCMS(ESI)[M+H]+:651.1。1H NMR(300MHz,甲醇-d4)δ8.64(s,1H),8.25(m,2H),7.62(m,2H),6.74-6.18(m,3H),4.55(m,4H),4.19(m,2H),4.05(s,1H),3.95(m,2H),3.80(s,3H),3.37(s,1H),2.95(s,1H),2.30(s,6H),1.97(d,J=8.9Hz,3H),1.47(s,1H)。
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例65:合成1-(2-氨基吡啶-4-基)-6-氯-7-[(2R)-2-({[3-氯-6-(二甲氨基)吡啶-2-基]氧基}甲基)-3-甲基吡咯烷-1-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002561
步骤1:合成1-{2-[(叔丁氧羰基)氨基]吡啶-4-基}-6-氯-7-氟-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830002562
向3-(5-氯-2,4-二氟苯基)-3-氧代丙酸乙酯(1.0g,3.81mmol,1.0当量)于乙酸酐(1.2g,11.42mmol,3.0当量)中的混合物添加原甲酸三乙酯(0.9g,5.71mmol,1.5当量)。将所得混合物在100℃下搅拌2h。在真空下浓缩所得混合物。向DMSO(70mL)中的所得混合物添加N-(4-氨基吡啶-2-基)氨基甲酸叔丁酯(0.8g,3.81mmol,1.0当量)。将所得混合物在25℃下搅拌2h。向所得混合物添加K2CO3(1.1g,7.61mmol,2.0当量)。在100℃下搅拌所得混合物1h。通过添加80mL水淬灭反应物。通过过滤来收集沉淀的固体。这产生呈黄色固体状的1-{2-[(叔丁氧羰基)氨基]吡啶-4-基}-6-氯-7-氟-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯(1.8g,粗产物)。LCMS(ESI)[M+H]+:462.1。
步骤2:合成1-(2-氨基吡啶-4-基)-6-氯-7-氟-4-氧代喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002571
向1-{2-[(叔丁氧羰基)氨基]吡啶-4-基}-6-氯-7-氟-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯(900mg,1.95mmol,1.0当量)于溴化氢(10mL)中的混合物。在100℃下搅拌所得混合物1.5h。使混合物冷却至室温。通过过滤来收集沉淀的固体并且用水(3×2mL)洗涤。这产生呈白色固体状的1-(2-氨基吡啶-4-基)-6-氯-7-氟-4-氧代喹啉-3-甲酸(300mg,46%)。LCMS(ESI)[M+H]+:334.0。
步骤3:合成1-(2-氨基吡啶-4-基)-6-氯-7-[(2R)-2-({[3-氯-6-(二甲氨基)吡啶-2-基]氧基}甲基)-3-甲基吡咯烷-1-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002572
向1-(2-氨基吡啶-4-基)-6-氯-7-氟-4-氧代喹啉-3-甲酸(100mg,0.17mmol,1.0当量)于DMSO(6mL)中的混合物添加TEA(104mg,1.03mmol,6.0当量)和5-氯-N,N-二甲基-6-[(3-甲基吡咯烷-2-基)甲氧基]吡啶-2-胺(55mg,0.21mmol,1.2当量)。将所得混合物在100℃下在氮气气氛下搅拌2h。使混合物冷却至室温。通过制备型HPLC纯化粗产物。这产生呈淡黄色固体状的1-(2-氨基吡啶-4-基)-6-氯-7-[(2R)-2-({[3-氯-6-(二甲氨基)吡啶-2-基]氧基}甲基)-3-甲基吡咯烷-1-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸(96.3mg)。LCMS(ESI)[M+H]+:583.15。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ15.05(s,1H),8.55(d,J=7.9Hz,1H),8.29-7.93(m,2H),7.42(s,1H),6.78-6.46(m,4H),6.36(d,J=12.2Hz,1H),6.14-5.71(m,1H),5.01-4.77(m,1H),4.72-3.91(m,2H),3.47(d,J=29.4Hz,1H),3.27-3.02(m,1H),2.78(d,J=25.1Hz,6H),2.60(s,1H),2.19-2.02(m,1H),1.52(s,1H),1.27-1.08(m,3H)。
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例66:合成1-(2-氨基吡啶-4-基)-7-((3R)-3-(((3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基)甲基)-2-氮杂双环[3.1.0]己-2-基)-6-氟-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002581
步骤1:合成N-(4-氨基吡啶-2-基)氨基甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830002582
向N-(4-硝基吡啶-2-基)氨基甲酸叔丁酯(2.7g,11.29mmol,1.0当量)于MeOH(20ml)中的混合物添加Pd/C(200mg)。在室温下在氢气气氛下搅拌所得混合物1h。过滤所得混合物,用MeOH(3×20mL)洗涤滤饼。在减压下浓缩滤液。粗产物不经进一步纯化直接用于下一步骤。
步骤2:合成1-{2-[(叔丁氧羰基)氨基]吡啶-4-基}-6,7-二氟-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830002591
向1-乙氧基-3-(2,4,5-三氟苯基)丙烷-1,3-二醇(85.0g,0.34mol,1.0当量)和原甲酸三乙酯(2.71g,18.279mmol,1.5当量)的混合物添加Ac2O(3.73g,36.56mmol,3.0当量)。将所得混合物在100℃下在氮气气氛下搅拌2h。在真空下浓缩所得混合物。向以上混合物添加于DMSO(10ml)中的N-(4-氨基吡啶-2-基)氨基甲酸叔丁酯(3.82g,18.28mmol,1.5当量)。在室温下在氮气气氛下搅拌所得混合物2h。向以上混合物添加K2CO3(228.6g,1.66mol,5.0当量)。将所得混合物搅拌过夜。在室温下用水淬灭反应物。通过过滤来收集沉淀的固体并且用水洗涤。通过硅胶柱色谱用石油醚/EtOAc(5:1)洗脱来纯化残留物,得到呈黄色固体状的1-{2-[(叔丁氧羰基)氨基]吡啶-4-基}-6,7-二氟-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯(1.32g,24.32%)。LCMS(ESI)[M+H]+:446.1。
步骤3:合成1-(2-氨基吡啶-4-基)-6,7-二氟-4-氧代喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002592
在0℃下在氮气气氛下向1-{2-[(叔丁氧羰基)氨基]吡啶-4-基}-6,7-二氟-4-氧代喹啉-3-甲酸乙酯(1.32g,2.96mmol,1.0当量)于HBr(5mL)中的混合物中。在100℃下用微波辐射辐照最终反应混合物1h。通过过滤收集沉淀的固体并用水(3×10mL)洗涤。这产生呈淡黄色固体状的1-(2-氨基吡啶-4-基)-6,7-二氟-4-氧代喹啉-3-甲酸(630mg,67.01%)。LCMS(ESI)[M+H]+:318.1。
步骤4:合成1-(2-氨基吡啶-4-基)-7-((3R)-3-(((3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基)甲基)-2-氮杂双环[3.1.0]己-2-基)-6-氟-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002601
在氮气气氛下向1-(2-氨基吡啶-4-基)-6,7-二氟-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(40mg,0.13mmol,1.0当量)和(3R)-3-(((3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基)甲基)-2-氮杂双环[3.1.0]己烷(38mg,0.15mmol,1.2当量)于DMSO(1mL)中的混合物添加TEA(40mg,0.39mmol,3.0当量)。在80℃下在氮气气氛下搅拌所得混合物过夜。粗产物(80mg)通过制备型HPLC在以下条件下纯化(柱:XSelect CSH Prep C18 OBD柱,19*250mm,5μm;流动相A:水(0.1%FA),流动相B:ACN;流动速率:25mL/min;梯度:7min内35% B至61% B,61% B;波长:254/220nm;RT1(min):6.97;运行数:0),得到呈黄色固体状的1-(2-氨基吡啶-4-基)-7-((3R)-3-(((3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基)甲基)-2-氮杂双环[3.1.0]己-2-基)-6-氟-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(12.4mg,17.34%)。LCMS(ESI)[M+H]+:552.15。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ15.28(s,1H),8.55(s,1H),8.09(s,1H),7.89(d,J=14.2Hz,1H),7.74(d,J=8.4Hz,1H),6.73(d,J=7.8Hz,2H),6.64(s,1H),6.52(s,2H),6.42(d,J=8.4Hz,1H),4.46(d,J=12.4Hz,3H),3.77(s,3H),3.09(s,1H),2.33-2.20(m,1H),2.05(s,1H),1.79(s,1H),0.90-0.81(m,1H),0.39(s,1H)。
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例67:1-(5-氨基哒嗪-3-基)-6-氯-7-(2-(((3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基)甲基)-3,3-二甲基吡咯烷-1-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002611
步骤1:合成1-(5-氨基哒嗪-3-基)-6-氯-7-氟-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002612
在0℃的氮气气氛下将1-(5-氨基哒嗪-3-基)-6-氯-7-氟-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(120mg,0.33mmol,1.0当量)添加至HBr水溶液(0.5mL)中。在100℃下用微波辐射辐照最终反应混合物1h。通过过滤收集沉淀的固体并用水(3×10mL)洗涤。这产生1-(5-氨基哒嗪-3-基)-6-氯-7-氟-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(68mg,60.9%)。LCMS(ESI)[M+H]+:335.0。
步骤2:合成1-(5-氨基哒嗪-3-基)-6-氯-7-(2-(((3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基)甲基)-3,3-二甲基吡咯烷-1-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002613
在氮气气氛下向1-(5-氨基哒嗪-3-基)-6-氯-7-氟-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(60mg,0.17mmol,1.0当量)和3-氯-2-((3,3-二甲基吡咯烷-2-基)甲氧基)-6-甲氧基吡啶(58mg,0.21mmol,1.2当量)于DMSO(1mL)中的混合物添加TEA(52mg,0.51mmol,3.0当量)。在80℃下在氮气气氛下搅拌所得混合物过夜。粗产物(80mg)通过制备型HPLC在以下条件下纯化(柱:XSelect CSH Prep C18 OBD柱,19*250mm,5μm;流动相A:水(0.1%FA),流动相B:ACN;流动速率:25mL/min;梯度:7min内35% B至61% B,61% B;波长:254/220nm;RT1(min):6.97;运行数:0),得到呈黄色固体状的1-(5-氨基哒嗪-3-基)-6-氯-7-(2-(((3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基)甲基)-3,3-二甲基吡咯烷-1-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(30.4mg,30.71%)。LCMS(ESI)[M+H]+:585.15。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ14.95(s,1H),8.74-8.61(m,2H),8.12(s,1H),7.60(d,J=8.4Hz,1H),7.04(s,2H),6.33(d,J=8.4Hz,2H),4.61(s,1H),4.46(d,J=4.5Hz,2H),3.69(s,4H),3.22(d,J=7.5Hz,1H),1.97(s,1H),1.82-1.67(m,1H),1.18(d,J=12.4Hz,6H)。
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例68:合成7-((1R,3R,5R)-3-(((3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基)甲基)-2-氮杂双环[3.1.0]己-2-基)-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-6-氟-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002621
步骤1:合成3-氯-6-甲氧基吡啶-2-胺
Figure BDA0003923073830002622
向置有于乙醇(200mL)和H2O(20mL)中的3-氯-6-甲氧基-2-硝基吡啶(20.0g,106.06mmol)的500mL 3颈圆底烧瓶中,添加Fe(29.62g,530.32mmol)和NH4Cl(34.04g,636.38mmol),在80℃下搅拌反应混合物5小时。过滤所得混合物,在减压下蒸发滤液并且将残留物施用至用乙酸乙酯/石油醚(1:2)洗脱的硅胶柱上。这产生13.75g(81.75%)呈棕色固体状的3-氯-6-甲氧基吡啶-2-胺。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ7.22(d,J=8.5Hz,1H),6.64(d,J=8.5Hz,1H),4.97(s,2H),3.73(s,3H)。
步骤2:合成2,3-二氯-6-甲氧基吡啶
Figure BDA0003923073830002631
将3-氯-6-甲氧基吡啶-2-胺(10.0g,63.06mmol)于浓盐酸(160mL)中的溶液冷却至-5℃。在此温度下,在30min内添加NaNO2(17.40g,252.23mmol)于水(80mL)中的溶液。搅拌30min后,在30min内缓慢添加CuCl(49.94g,504.46mmol)。在室温下持续搅拌16h并且在10℃下缓慢添加氨(25%水溶液,300mL)。用EtOAc萃取反应混合物。接着在减压下蒸发混合物溶剂并且将残留物施用至具有石油醚的硅胶柱上。这产生5.2g(46.33%)呈白色固体状的2,3-二氯-6-甲氧基吡啶。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ8.00(dd,J=8.6,2.5Hz,1H),6.93(dd,J=8.5,2.3Hz,1H),3.87(s,3H)。
步骤3:合成1-(叔丁基)2-甲基(R)-2,3-二氢-1H-吡咯-1,2-二甲酸酯
Figure BDA0003923073830002632
在-78℃下向1-(叔丁基)2-甲基(R)-5-氧代吡咯烷-1,2-二甲酸酯(550g,2.26mol)于甲苯(1L)中的搅拌溶液添加三乙基锂硼烷(1M于THF中)(2.5L,2.5mol)并且在室温下搅拌混合物1h。接着,将混合物重新冷却至-78℃,添加4-二甲氨基吡啶(5.5g,45.05mmol)、N,N-二异丙基乙胺(2.25L,13.60mol),之后添加三氟乙酸酐(380mL,5.65mol),并且在-78℃至15℃下搅拌混合物16h。所得混合物用水淬灭并且用乙酸乙酯萃取。将合并的有机层经Na2SO4干燥,过滤并且在减压下浓缩。残留物通过硅胶柱色谱用5%于己烷中的EtOAc洗脱来纯化,得到呈黄色油状的1-(叔丁基)2-甲基(R)-2,3-二氢-1H-吡咯-1,2-二甲酸酯(270g,53%)。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ6.64-6.45(m,1H),5.09-4.91(m,1H),4.60(dd,J=12.0,5.2Hz,1H),3.68(d,J=7.7Hz,3H),3.14-2.95(m,1H),2.65-2.53(m,1H),1.39(d,J=19.1Hz,9H)。
步骤4:合成2-(叔丁基)3-甲基(1R,3R,5R)-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2,3-二甲酸酯
Figure BDA0003923073830002641
在0℃下向置有于二氯甲烷(1000mL)中的1-(叔丁基)2-甲基(R)-2,3-二氢-1H-吡咯-1,2-二甲酸酯(50.0g,220.01mmol)的3000mL 3颈圆底烧瓶中,添加二乙基锌(1M于庚烷中,484.04mL,484.04mmol),之后经30分钟的时间段添加二碘甲烷(235.7g,880.05mmol)并且搅拌30分钟。将反应混合物逐渐升温至室温并且搅拌16小时。在减压下浓缩所得混合物。向以上混合物添加1000mL二氯甲烷、Boc2O(72.03g,330.03mmol)和Et3N(66.79g,660.06mmol)。将所得混合物在室温下再搅拌2h。接着在减压下蒸发混合物溶剂并且将残留物施用至用乙酸乙酯/石油醚(1:5)洗脱的硅胶柱上。这产生呈黄色油状的2-(叔丁基)3-甲基(1R,3R,5R)-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2,3-二甲酸酯(13.5g,25.43%,TLC上斑点较高)和呈黄色油状的副产物2-(叔丁基)3-甲基(1S,3R,5S)-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2,3-二甲酸酯(5.3g,9.98%,TLC上斑点较低)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ4.55-4.44(m,1H),3.62(d,J=9.7Hz,3H),3.43-3.33(m,1H),2.68-2.52(m,1H),1.94-1.83(m,1H),1.60-1.45(m,1H),1.37(d,J=39.6Hz,9H),0.75-0.62(m,2H)。
步骤5:合成(1R,3R,5R)-3-(羟甲基)-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830002651
在氮气下,在0℃下向置有于无水THF(100mL)中的2-(叔丁基)3-甲基(1R,3R,5R)-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2,3-二甲酸酯(9.7g,40.20mmol)的500mL 3颈圆底烧瓶中,添加LiAlH4(1M于THF中,48.24mL,48.24mmol)的溶液,搅拌反应混合物15min。接着在0℃下用Na2SO4.10H2O淬灭反应物。过滤所得混合物,在减压下蒸发滤液并且将残留物施用至用乙酸乙酯/石油醚(1:2)洗脱的硅胶柱上。这产生7.3g(85.14%)呈黄色油状的(1R,3R,5R)-3-(羟甲基)-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ4.78-4.68(m,1H),4.03-3.88(m,1H),3.48-3.34(m,2H),3.22-3.10(m,1H),2.31-2.14(m,1H),1.97-1.82(m,1H),1.52-1.29(m,10H),0.69-0.57(m,2H)。
步骤6:合成(1R,3R,5R)-3-(((3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基)甲基)-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830002652
在氮气下,在0℃下向置有于无水THF(100mL)中的(1R,3R,5R)-3-(羟甲基)-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯(7.3g,34.23mmol)的500mL 3颈圆底烧瓶中,添加2,3-二氯-6-甲氧基吡啶(6.07g,37.65mmol),之后添加KHMDS(1M于THF中,68mL,68.00mmol)并且搅拌20分钟。所得混合物用EtOAc萃取。将有机层施用至用乙酸乙酯/石油醚(1:4)洗脱的硅胶柱上。这产生8.2g(67.52%)呈黄色油状的(1R,3R,5R)-3-(((3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基)甲基)-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ7.76(dd,J=8.5,2.7Hz,1H),6.42(dd,J=8.6,2.7Hz,1H),4.48-4.20(m,3H),3.84(s,3H),3.53-3.40(m,1H),2.49-2.32(m,1H),1.99-1.86(m,1H),1.56-1.46(m,1H),1.38(d,J=24.1Hz,9H),0.94-0.84(m,1H),0.79-0.66(m,1H)。
步骤7:合成(1R,3R,5R)-3-(((3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基)甲基)-2-氮杂双环[3.1.0]己烷盐酸盐
Figure BDA0003923073830002661
在0℃下向置有二噁烷(100ml)中的(1R,3R,5R)-3-(((3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基)甲基)-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯(8.2g,23.16mmol)的500mL 3颈圆底烧瓶中,添加HCl(4M于二噁烷中,150mL)的溶液,使反应混合物逐渐升温至室温并且搅拌1小时。在减压下浓缩所得混合物。用Et2O洗涤以上混合物。接着过滤所得混合物,这产生6.5g(96.06%)呈白色固体状的(1R,3R,5R)-3-(((3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基)甲基)-2-氮杂双环[3.1.0]己烷盐酸盐。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ10.50(s,1H),9.25(s,1H),7.81(d,J=8.4Hz,1H),6.49(d,J=8.4Hz,1H),4.56-4.29(m,3H),3.86(s,3H),3.34-3.23(m,1H),2.60-2.52(m,1H),1.95-1.77(m,2H),1.14-0.99(m,2H)。
步骤8:合成7-((1R,3R,5R)-3-(((3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基)甲基)-2-氮杂双环[3.1.0]己-2-基)-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-6-氟-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002662
向1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-6,7-二氟-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(4.0g,10.00mmol,1.0当量)于DMSO(60mL)中的混合物添加(1R,3R,5R)-3-(((3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基)甲基)-2-氮杂双环[3.1.0]己烷盐酸盐(3.2g,11.00mmol,1.1当量)和Et3N(7.1g,70.00mmol,7.0当量)。在110℃下搅拌混合物3h。溶液通过逆相急骤色谱用20%-80%于水中的乙腈(NH4HCO3)洗脱来纯化,得到呈淡黄色固体状的7-((1R,3R,5R)-3-(((3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基)甲基)-2-氮杂双环[3.1.0]己-2-基)-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-6-氟-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(1.0838g,17%)。LCMS(ESI)[M+H]+:635.20。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ15.34(s,1H),8.52(d,J=3.4Hz,1H),8.32-8.23(m,1H),7.88(d,J=13.3Hz,1H),7.82-7.63(m,2H),6.62-6.33(m,3H),4.79-4.73(m,1H),4.31-4.14(m,2H),4.11-4.00(m,2H),3.87-3.75(m,2H),3.73(d,J=2.1Hz,3H),3.28-3.13(m,2H),2.70-2.59(m,1H),2.14(s,6H),2.10-1.99(m,1H),1.65-1.59(m,1H),1.03-0.91(m,1H),0.77-0.69(m,1H)。
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例69:合成6-氯-7-[(2R,4Z)-2-[[(3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基]-4-(甲氧基亚氨基)吡咯烷-1-基]-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002671
步骤1:合成1-叔丁基2-甲基(2R)-4,4-二甲氧基吡咯烷-1,2-二甲酸酯
Figure BDA0003923073830002681
向1-叔丁基2-甲基(2R)-4-氧代吡咯烷-1,2-二甲酸酯(1.0g,4.11mmol,1.0当量)于MeOH(5mL)中的溶液添加TsOH(35.3mg,0.20mmol,0.05当量)和三甲氧基甲烷(510.1mg,4.93mmol,1.20当量)将所得混合物在80℃下再搅拌1h。在真空下浓缩所得混合物。通过硅胶柱色谱用PE/EtOAc(1:1)洗脱来纯化残留物。这产生呈黄色油状的1-叔丁基2-甲基(2R)-4,4-二甲氧基吡咯烷-1,2-二甲酸酯(780.2mg,65.58%)。LCMS(ESI)[M+H]+:290.1。
步骤2:合成(2R)-2-(羟甲基)-4,4-二甲氧基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830002682
向1-叔丁基2-甲基(2R)-4,4-二甲氧基吡咯烷-1,2-二甲酸酯(770.0mg,2.661mmol,1.0当量)于THF(5mL)中的搅拌溶液添加LAH(121.2mg,3.19mmol,1.2当量)。将所得混合物在0℃下再搅拌1h。用水淬灭反应物。用EtOAc(3*50mL)萃取所得混合物。收集合并的有机层并且经无水Na2SO4干燥。在过滤之后,在真空下浓缩滤液。通过硅胶柱色谱用石油醚/EtOAc(1:1)洗脱来纯化残留物。这产生呈黄色油状的(2R)-2-(羟甲基)-4,4-二甲氧基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(500mg,71.9%)。LCMS(ESI)[M+H]+:262.1。
步骤3:合成(2R)-2-[[(3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基]-4,4-二甲氧基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830002683
向(2R)-2-(羟甲基)-4,4-二甲氧基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(500.0mg,1.91mmol,1.0当量)于THF(5mL)中的搅拌溶液添加2,3-二氯-6-甲氧基吡啶(408.7mg,2.29mmol,1.2当量)和KHMDS(763.3mg,3.82mmol,2.0当量)。将所得混合物在0℃下再搅拌1h。用水淬灭反应物。用EtOAc(3*10mL)萃取所得混合物。将合并的有机层收集并且经无水Na2SO4干燥。在真空下浓缩所得混合物。通过硅胶柱色谱用PE/EtOAc(1:1)洗脱来纯化残留物。这产生呈黄色油状的(2R)-2-[[(3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基]-4,4-二甲氧基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(300mg,38.9%)。LCMS(ESI)[M+H]+:403.1。
步骤4:合成3-氯-2-[[(2R)-4,4-二甲氧基吡咯烷-2-基]甲氧基]-6-甲氧基吡啶
Figure BDA0003923073830002691
向(2R)-2-[[(3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基]-4,4-二甲氧基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(300.0mg,0.74mmol,1.0当量)于MeOH(2mL)中的混合物添加TsOH(128.2mg,0.74mmol,1.0当量)和原甲酸三甲酯(39.5mg,0.37mmol,0.5当量)。将所得混合物在60℃下再搅拌2h。用水淬灭反应物。用EtOAc(3*10mL)萃取所得混合物。将合并的有机层收集并且经无水Na2SO4干燥。在真空下浓缩所得混合物。通过硅胶柱色谱用PE/EtOAc(1:1)洗脱来纯化残留物。这产生呈黄色油状的3-氯-2-[[(2R)-4,4-二甲氧基吡咯烷-2-基]甲氧基]-6-甲氧基吡啶(282mg,98.2%)。LCMS(ESI)[M+H]+:303.1。
步骤5:合成6-氯-7-[(2R)-2-[[(3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基]-4,4-二甲氧基吡咯烷-1-基]-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002701
向3-氯-2-[[(2R)-4,4-二甲氧基吡咯烷-2-基]甲氧基]-6-甲氧基吡啶(120.0mg,0.39mmol,1.0当量)于DMSO(2mL)中的混合物添加TEA(120.3mg,1.18mmol,3.0当量)和6-氯-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-7-氟-4-氧代喹啉-3-甲酸(165.2mg,0.39mmol,1.0当量)。将所得混合物在100℃下再搅拌1h。在真空下浓缩所得混合物。残留物通过逆相急骤柱用5-60%于水中的乙腈纯化。这产生呈黄色固体状的6-氯-7-[(2R)-2-[[(3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基]-4,4-二甲氧基吡咯烷-1-基]-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸(130mg,46.8%)。LCMS(ESI)[M+H]+:699.2。
步骤6:合成6-氯-7-[(2R)-2-[[(3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基]-4-氧代吡咯烷-1-基]-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002702
向6-氯-7-[(2R)-2-[[(3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基]-4,4-二甲氧基吡咯烷-1-基]-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸(120.0mg,0.17mmol,1.0当量)于THF(5mL)中的混合物添加H2O(2mL)和HCl(5mL)。在25℃下搅拌所得溶液1h。在真空下浓缩所得混合物。残留物通过逆相急骤柱用5-60%于水中的乙腈纯化。这产生呈黄色固体状的6-氯-7-[(2R)-2-[[(3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基]-4-氧代吡咯烷-1-基]-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸(38mg,33.90%)。LCMS(ESI)[M+H]+:653.1。
步骤7:合成6-氯-7-[(2R,4Z)-2-[[(3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基]-4-(甲氧基亚氨基)吡咯烷-1-基]-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002711
向6-氯-7-[(2R)-2-[[(3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基]-4-氧代吡咯烷-1-基]-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸(38.0mg,0.05mmol,1.0当量)于EtOH(2mL)中的混合物添加K2CO3(16.0mg,0.11mmol,2.0当量)和O-甲基羟胺盐酸盐(19.4mg,0.23mmol,4.0当量)。将所得混合物在室温下搅拌1h。将所得混合物浓缩。这产生呈白色固体状的6-氯-7-[(2R,4Z)-2-[[(3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基]-4-(甲氧基亚氨基)吡咯烷-1-基]-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-4-氧代喹啉-3-甲酸(3.2mg,8.0%)。LCMS(ESI)[M+H]+:682.1。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ8.57(m,1H),8.30-8.14(m,2H),7.79-7.54(m,2H),6.50(m,2H),6.37(m,1H),5.16(m,1H),4.45(m,1H),4.37-4.18(m,2H),4.11(m,2H),3.94-3.74(m,6H),3.67(s,4H),3.27-3.20(m,1H),3.06(s,1H),2.68(s,1H),2.16(s,6H)。
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例70:合成7-[(3R)-3-{[(3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基}-2-氮杂双环[3.1.0]己-2-基]-1-{6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基}-6-氟-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002721
步骤1:合成(5R)-5-[[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]甲基]吡咯烷-2-酮
Figure BDA0003923073830002722
在0℃下向5-羟甲基吡咯烷-2-酮(30.0g,260.57mmol,1.0当量)于二氯甲烷(100mL)中的溶液添加咪唑(19.5g,286.62mmol,1.10当量)、4-二甲氨基吡啶(3.1g,26.05mmol,0.10当量),之后添加叔丁基二苯基硅烷基氯化物(157.5g,573.25mmol,2.20当量)。使反应混合物逐渐升温至室温,并且在完成2h后,用二氯甲烷稀释,用水、盐水洗涤并且经无水硫酸钠干燥。这产生呈黄色油状的(5R)-5-[[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]甲基]吡咯烷-2-酮(92.1g,99.98%),LCMS(ESI)[M+H]+:354.1。1H NMR(300MHz,氯仿-d)δ7.73-7.60(m,4H),7.48-7.34(m,6H),5.65-5.32(m,1H),4.10-3.49(m,3H),1.52(m,2H),1.35-1.23(m,2H),1.13-1.01(m,9H)。
步骤2:合成(2R)-2-[[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]甲基]-5-氧代吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830002723
向以上所获得的化合物(92.1g,260.51mmol,1.0当量)于乙腈(200mL)中的搅拌溶液添加4-二甲氨基吡啶(35.0g,286.56mmol,1.1当量)和二碳酸叔丁酯(62.5g,286.56mmol,1.1当量)。将所得混合物在室温下搅拌过夜。用水淬灭反应物。用EtOAc(3*300mL)萃取所得混合物。收集合并的有机层并且经无水Na2SO4干燥。在过滤之后,在真空下浓缩滤液。通过硅胶柱色谱用石油醚/EtOAc(1:1)洗脱来纯化残留物。这产生呈黄色固体状的(2R)-2-[[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]甲基]-5-氧代吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(79.8g,67.5%)。LCMS(ESI)[M+H]+:454.2。1H NMR(300MHz,氯仿-d)δ7.70-7.59(m,4H),7.50-7.35(m,6H),4.28-4.18(m,1H),3.91(dd,J=10.4,4.2Hz,1H),3.72(dd,J=10.4,2.5Hz,1H),2.81(dt,J=17.6,10.4Hz,1H),2.53-2.38(m,1H),2.25-2.04(m,2H),1.45(s,9H),1.07(s,9H)。
步骤3:合成(2R)-2-[[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]甲基]-2,3-二氢吡咯-1-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830002731
在-50℃下在氮气气氛下经30min将三乙基硼氢化锂(11mL的1.0M/THF,11.40mmol,1.0当量)逐滴添加至(2R)-2-[[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]甲基]-5-氧代吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(5.0g,11.02mmol,1.0当量)于甲苯(20mL)中的混合物并且再搅拌混合物35min,同时将内部温度维持在-50℃与-45℃之间。经10min逐滴添加休尼格氏碱(Hunig's base)(3.7g,28.6mmol,2.0当量)。接着,一次性添加DMAP(20.0mg,0.14mmol,0.01当量),之后经15min添加三氟乙酸酐(2.6g,12.7mmol,1.1当量),同时将内部温度维持在-50℃与-45℃之间。10min后移出冷浴并且搅拌反应混合物14h,同时使其升高至环境温度。其用甲苯(20mL)稀释,用冰水浴冷却,并且用水(40mL)缓慢处理5min。分离各相,并且用水(100mL,2次)洗涤有机层并且在真空中浓缩。粗物质通过急骤色谱(硅胶;5%于己烷中的EtOAc)纯化。这产生呈黄色油状的(2R)-2-[[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]甲基]-2,3-二氢吡咯-1-甲酸叔丁酯(2.5g,52.0%)。LCMS(ESI)[M+H]+:438.2。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ7.60m,4H),7.44(m,6H),6.48(s,1H),5.05(m,1H),4.12(m,1H),3.69(s,2H),2.74(m,2H),1.32(m,9H),0.99(m,9H)。
步骤4:合成(3R)-3-[[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]甲基]-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830002741
经15分钟的时间段向(2R)-2-[[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]甲基]-2,3-二氢吡咯-1-甲酸叔丁酯(2.5g,5.68mmol,1.0当量)于二氯甲烷(20mL)中的混合物添加二乙基锌的溶液(1M于己烷中,6.2mL,1.4当量)之后加二碘甲烷(0.68mL,8.55mmol,1.5当量)并且搅拌30分钟。将反应混合物逐渐升温至室温并且搅拌3小时。通过添加饱和碳酸氢钠溶液将反应混合物的pH调节至8。用水淬灭反应物。用EtOAc(3*200mL)萃取所得混合物。收集合并的有机层并且经无水Na2SO4干燥。在真空下浓缩所得混合物。通过硅胶柱色谱用石油醚/EtOAc(1:1)洗脱来纯化残留物。这产生(1.7g,65.8%)呈黄色油状的(3R)-3-[[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]甲基]-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯。LCMS(ESI)[M+H]+:452.2。1HNMR(400MHz,氯仿-d)δ7.69-7.62(m,4H),7.39(m,6H),3.92-3.61(m,3H),3.18(s,1H),2.33(s,1H),2.04(m,1H),1.51(m,1H),1.48-1.22(m,9H),1.05(s,9H),0.87(m,1H),0.34(s,1H)。
步骤5:合成(3R)-3-(羟甲基)-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830002742
经10分钟的时间段向(3R)-3-(((叔丁基二苯基硅烷基氧基)甲基)-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯(1.5g,3.32mmol,1.00当量)于无水四氢呋喃(20mL)中的混合物添加氟化四丁铵(1M,于四氢呋喃中,3.3mL,1.00当量)。使反应混合物逐渐升温至室温并且搅拌30min。用水淬灭反应物。用EtOAc(3*50mL)萃取所得混合物。收集合并的有机层并且经无水Na2SO4干燥。在真空下浓缩所得混合物。通过硅胶柱色谱用石油醚/EtOAc(1:1)洗脱来纯化残留物。这产生呈黄色油状的(3R)-3-(羟甲基)-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯(618mg,90.50%)。LCMS(ESI)[M+H]+:214.1。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ4.86-4.60(m,1H),3.71-3.53(m,1H),3.52-3.42(m,1H),3.30-3.18(m,1H),3.06(s,1H),2.08(s,1H),2.00-1.78(m,1H),1.55-1.46(m,1H),1.40(d,J=2.1Hz,9H),0.84-0.68(m,1H),0.37-0.07(m,1H)。
步骤6:合成(3R)-3-(((3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基)甲基)-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830002751
向(3R)-3-(羟甲基)-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯(500.0mg,2.34mmol,1.0当量)于THF(5mL)中的混合物添加2,3-二氯-6-甲氧基吡啶(623.2mg,3.52mmol,1.5当量)。在0℃下搅拌所得溶液1h。用水淬灭反应物。用EtOAc(3*10mL)萃取所得混合物。收集合并的有机层并且经无水Na2SO4干燥。在真空下浓缩所得混合物。通过硅胶柱色谱用石油醚/EtOAc(1:1)洗脱来纯化残留物。这产生呈黄色油状的(3R)-3-(((3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基)甲基)-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯(432.2mg,51.7%)。LCMS(ESI)[M+H]+:355.1。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ6.97m,1H),6.17(m,1H),4.36-4.26(m,2H),4.11-3.94(m,2H),3.72(s,3H),3.17-3.04(m,1H),2.21-1.99(m,2H),1.49-1.26(m,9H),0.90-0.75(m,1H),0.42-0.24(m,1H)。
步骤7:合成(3R)-3-{[(3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基}-2-氮杂双环[3.1.0]己烷
Figure BDA0003923073830002752
在0℃下向(3R)-3-{[(3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基}-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯(200mg,0.56mmol,1.0当量)于1,4-二噁烷(3mL)中的混合物添加4M于1,4-二噁烷(1mL)中的HCl并且在室温下搅拌混合物2h。用水淬灭反应物。用EtOAc(3*10mL)萃取所得混合物。收集合并的有机层并且经无水Na2SO4干燥。在真空下浓缩所得混合物。通过硅胶柱色谱用石油醚/EtOAc(1:1)洗脱来纯化残留物。这产生呈白色固体状的(3R)-3-{[(3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基}-2-氮杂双环[3.1.0]己烷(121.6mg,84.5%)。LCMS(ESI)[M+H]+:255.1。
步骤8:合成7-[(3R)-3-{[(3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基}-2-氮杂双环[3.1.0]己-2-基]-1-{6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基}-6-氟-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002761
向(3R)-3-{[(3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基}-2-氮杂双环[3.1.0]己烷(100mg,0.39mmol,1.0当量)于DMSO(2mL)中的搅拌混合物添加三乙胺(118.8mg,1.17mmol,3.0当量)和1-{6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基}-6,7-二氟-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(172mg,0.43mmol,1.1当量)并且在100℃下搅拌16h。收集沉淀的固体并且通过制备型HPLC在以下条件下纯化粗产物(柱:XBridge Shield RP18 OBD柱,5um,19*150mm;流动相A:水(10MMOL/L NH4HCO3),流动相B:ACN;流动速率:25mL/min;梯度:7min内25B至48B;254/220nm;RT1:5.90;RT2:;注射体积:ml;运行数:;)。这产生呈黄色固体状的7-[(3R)-3-{[(3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基}-2-氮杂双环[3.1.0]己-2-基]-1-{6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基}-6-氟-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(9.3mg,3.7%)。LCMS(ESI)[M+H]+:635.2 1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ8.68-7.92(m,2H),8.56-7.52(m,3H),6.85-6.25(m,3H),4.65-4.23(m,3H),4.15-3.87(m,2H),3.79-3.65(m,5H),3.30-3.11(m,2H),2.31-1.92(m,8H),1.82-1.62(m,1H),0.62-0.95(m,1H),0.36-0.28(m,1H)。
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例71:合成7-[(2R)-2-[[(3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基]-4-(1H-吡唑-4-基)吡咯烷-1-基]-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-6-氟-4-氧代喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002771
步骤1:合成1-叔丁基2-甲基(2R)-4-[1-(氧杂环己烷-2-基)吡唑-4-基]-2,3-二氢吡咯-1,2-二甲酸酯
Figure BDA0003923073830002772
在100℃下在氮气气氛下搅拌1-叔丁基2-甲基(2R)-4-(三氟甲烷磺酰基氧基)-2,3-二氢吡咯-1,2-二甲酸酯(3g,7.993mmol,1.00当量)和1-(氧杂环己烷-2-基)-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧硼口东-2-基)吡唑(2.22g,7.993mmol,1当量)、Na2CO3(2.54g,23.979mmol,3当量)、Pd(dppf)Cl2 CH2Cl2(651mg,0.8mmol,0.1当量)于1,4-二噁烷中的混合物1h。过滤所得混合物,用乙醇(3×10mL)洗涤滤饼。在减压下浓缩滤液。通过硅胶柱色谱用PE/EA(5:1)洗脱来纯化残留物,得到呈黄色固体状的1-叔丁基2-甲基(2R)-4-[1-(氧杂环己烷-2-基)吡唑-4-基]-2,3-二氢吡咯-1,2-二甲酸酯(3g,99.44%)。LCMS(ESI)[M+H]+:378。
步骤2:合成(2R)-4-[1-(氧杂环己烷-2-基)吡唑-4-基]吡咯烷-1,2-二甲酸1-叔丁基2-甲酯
Figure BDA0003923073830002781
在室温下在氢气气氛下搅拌1-叔丁基2-甲基(2R)-4-[1-(氧杂环己烷-2-基)吡唑-4-基]-2,3-二氢吡咯-1,2-二甲酸酯(3g,7.9mmol,1当量)于MeOH中的溶液1h。过滤所得混合物,用MeOH(3×10mL)洗涤滤饼。在减压下浓缩滤液。这产生呈黄色固体状的(2R)-4-[1-(氧杂环己烷-2-基)吡唑-4-基]吡咯烷-1,2-二甲酸1-叔丁基2-甲酯(2.8g,92.84%)。LCMS(ESI)[M+H]+:380。
步骤3:合成(2R)-2-(羟甲基)-4-[1-(氧杂环己烷-2-基)吡唑-4-基]吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830002782
在0℃下在氮气气氛下向(2R)-4-[1-(氧杂环己烷-2-基)吡唑-4-基]吡咯烷-1,2-二甲酸1-叔丁基2-甲酯(2.8g,7.3mmol,1当量)于THF中的搅拌溶液逐滴逐份添加LiBH4(241mg,11mmol,1.5当量)。在室温下用水淬灭反应物。用EtOAc(3×100mL)萃取水层。在减压下浓缩所得混合物。通过硅胶柱色谱用PE/EA(1:1)洗脱来纯化残留物,得到呈黄色固体状的(2R)-2-(羟甲基)-4-[1-(氧杂环己烷-2-基)吡唑-4-基]吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(1.5g,57.84%)。LCMS(ESI)[M+H]+:352。
步骤4:合成(2R)-2-[[(3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基]-4-[1-(氧杂环己烷-2-基)吡唑-4-基]吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830002791
在80℃下在氮气气氛下向(2R)-2-(羟甲基)-4-[1-(氧杂环己烷-2-基)吡唑-4-基]吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(400mg,1.1mmol,1当量)和3-氯-2-氟-6-甲氧基吡啶(220mg,1.3mmol,1.2当量)于DMSO中的搅拌溶液逐滴逐份添加t-BuOK(383mg,3.4mmol,3当量)。残留物通过逆相急骤色谱在以下条件下纯化:柱,硅胶;流动相,含MeCN的水,10min内10%至50%梯度;检测器,UV 254nm。这产生呈黄色固体状的(2R)-2-[[(3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基]-4-[1-(氧杂环己烷-2-基)吡唑-4-基]吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(130mg,23.17%)。LCMS(ESI)[M+H]+:493。
步骤5:合成3-氯-6-甲氧基-2-[[(2R)-4-(1H-吡唑-4-基)吡咯烷-2-基]甲氧基]吡啶
Figure BDA0003923073830002792
在室温下在氮气气氛下搅拌(2R)-2-[[(3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基]-4-[1-(氧杂环己烷-2-基)吡唑-4-基]吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(60mg,0.1mmol,1当量)和TFA(1mL)于DCM中的溶液1h。在真空下浓缩所得混合物。这产生呈黄色固体状的3-氯-6-甲氧基-2-[[(2R)-4-(1H-吡唑-4-基)吡咯烷-2-基]甲氧基]吡啶(30mg,79.83%)。LCMS(ESI)[M+H]+:393。
步骤6:合成7-[(2R)-2-[[(3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基]-4-(1H-吡唑-4-基)吡咯烷-1-基]-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-6-氟-4-氧代喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002801
在100℃下在氮气气氛下搅拌3-氯-6-甲氧基-2-[[(2R)-4-(1H-吡唑-4-基)吡咯烷-2-基]甲氧基]吡啶(55.53mg,0.180mmol,1.2当量)和1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-6,7-二氟-4-氧代喹啉-3-甲酸(60mg,0.15mmol,1当量)、TEA(45mg,0.45mmol,3当量)于DMSO中的溶液1h。粗产物(mg)通过制备型HPLC在以下条件下纯化(柱:Gemini-NX C18 AXAI Packed,21.2*150mm 5um;流动相A:水(0.1%FA),流动相B:ACN;流动速率:25mL/min;梯度:12min内24% B至44% B,44% B;波长:220nm;RT1(min):11.68;运行数:0),得到呈黄色固体状的7-[(2R)-2-[[(3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基]-4-(1H-吡唑-4-基)吡咯烷-1-基]-1-[6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基]-6-氟-4-氧代喹啉-3-甲酸(31.2mg,30.21%)。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ12.53(s,1H)8.58-8.35(m,1H),8.34-8.07(m,1H),7.76-7.29(m,5H),6.67-6.28(m,2H),6.17-5.99(m,1H),4.66-4.26(m,3H),4.08-3.94(m,2H),3.90-3.75(m,2H),3.66-3.47(m,5H),3.28-3.10(m,2H),2.72-2.54(m,1H),2.13(s,7H)。MS(ESI):m/z 689.25[M+H]+
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例72:合成7-[(3R)-3-{[(3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基}-2-氮杂双环[3.1.0]己-2-基]-1-{6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基}-6-氟-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002811
步骤1:合成1-叔丁基2-乙基(2R)-2,3-二氢-1H-吡咯-1,2-二甲酸酯
Figure BDA0003923073830002812
在-78℃下向1-叔丁基2-乙基(2R)-5-氧代吡咯烷-1,2-二甲酸酯(6g,23.3mmol)于甲苯(10mL)中的搅拌溶液添加三乙基锂硼烷(1M于THF中)(25.6mL,25.6mmol)并且将混合物在室温下搅拌1h。接着,使混合物再冷却至-78℃,添加4-二甲氨基吡啶(56.9mg,466μmol)、N,N-二异丙基乙胺(25.5mL,139mmol)之后添加三氟乙酸酐(3.92mL,27.9mmol),并且使混合物至室温并且搅拌16h。反应完成后,用水(50mL)淬灭反应混合物(在0℃下缓慢添加),并且用乙酸乙酯(2×100mL)萃取。将合并的有机层经Na2SO4干燥,过滤并且浓缩,得到粗化合物。通过100-200目硅胶柱色谱使用5% EtOAc/己烷作为洗脱剂纯化粗产物,得到呈无色液体状的1-叔丁基2-乙基(2R)-2,3-二氢-1H-吡咯-1,2-二甲酸酯(4.05g,72%)。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ6.66-6.51(m,1H),4.96-4.90(m,1H),4.70-4.54(m,1H),4.28-4.15(m,2H),3.12-3.00(m,1H),2.69-2.60(m,1H),1.48-1.44(m,9H),1.31-1.24(m,3H)。
步骤2:合成(3R)-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2,3-二甲酸2-叔丁基3-乙酯
Figure BDA0003923073830002821
将二碘甲烷(8.86g,33.1mmol)于甲苯(30mL)中的搅拌混合物冷却至-40℃,缓慢添加二乙基锌(1M于己烷中)(18.2mL,18.2mmol)并且搅拌60min。接着添加1-叔丁基2-乙基(2R)-2,3-二氢-1H-吡咯-1,2-二甲酸酯(2g,8.28mmol)并且使混合物至室温持续6h。用饱和碳酸氢铵(20mL)淬灭反应物质,经由硅藻土垫过滤并且用乙酸乙酯(2×35mL)萃取滤液将合并的有机层用盐水(30mL)洗涤,经硫酸钠干燥,在减压下浓缩,得到粗物质。通过100-200目硅胶柱色谱使用7%EtOAc/己烷作为洗脱剂纯化粗产物,得到呈黄色液体状的(3R)-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2,3-二甲酸2-叔丁基3-乙酯(510mg,24%)(异构体混合物)。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ4.61-4.51(m,1H),4.25-4.09(m,2H),3.56-3.52(m,1H),2.65-2.58(m,1H),2.04-2.00(m,1H),1.46-1.40(m,10H),1.31-1.24(m,3H)0.92-0.88(m,1H),0.75-0.73(m,1H)。
步骤3:合成(3R)-3-(羟甲基)-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830002822
在0℃下向(3R)-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2,3-二甲酸2-叔丁基3-乙酯(550mg,2.15mmol)于THF(10mL)中的搅拌溶液添加硼氢化锂(1M于THF中)(3.22mL,3.22mmol)。将反应物维持在室温下6h。反应完成后,将反应混合物用饱和氯化铵(10mL)淬灭(在0℃下缓慢添加)并且用乙酸乙酯(2×40mL)萃取。将合并的有机层经Na2SO4干燥,过滤并且浓缩,得到呈黄色液体状的(3R)-3-(羟甲基)-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯(410mg),其足够纯以用于下一步骤。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ4.86-4.85(m,1H),4.40-4.34(m,1H),3.62-3.61(m,1H),3.50-3.47(m,2H),2.47-2.41(m,1H),1.78-1.71(m,1H),1.47-1.43(m,10H),0.89-0.85(m,1H),0.40-0.39(m,1H)。
步骤4:合成(3R)-3-{[(6-甲氧基-3-硝基吡啶-2-基)氧基]甲基}-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830002831
将(3R)-3-(羟甲基)-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯(800mg,3.75mmol)于THF(15mL)中的搅拌混合物冷却至0℃,向其缓慢添加氢化钠(223mg,5.62mmol)并且搅拌5min。接着,添加2-氯-6-甲氧基-3-硝基吡啶(848mg,4.50mmol)并且在室温下搅拌混合物3h。将反应物质用饱和氯化铵(5ml)淬灭并且用乙酸乙酯(2×40mL)萃取。将合并的有机层用盐水(40mL)洗涤,经硫酸钠干燥。在减压下浓缩,得到粗物质。通过100-200目硅胶柱色谱使用7% EtOAc/己烷作为洗脱剂纯化粗产物,得到呈黄色液体状的(3R)-3-{[(6-甲氧基-3-硝基吡啶-2-基)氧基]甲基}-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯(720mg,52%)。
MS(ESI):m/z 366.0[M+H]+
步骤5:合成(3R)-3-{[(3-氨基-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基}-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830002832
向(3R)-3-{[(6-甲氧基-3-硝基吡啶-2-基)氧基]甲基}-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯(600mg,1.64mmol)的搅拌溶液添加10%钯/碳(174mg,1.64mmol)并且在氢气气氛(气球压力)下搅拌混合物6h。将反应混合物经由硅藻土垫过滤,所述硅藻土垫用EtOAc:MeOH(1:1,40mL)洗涤若干次并且在减压下浓缩合并的滤液,得到呈棕色液体状的(3R)-3-{[(3-氨基-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基}-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯(342mg,62%)。
MS(ESI)336.0m/z[M+H]+
步骤6:合成(3R)-3-{[(3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基}-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830002841
将(3R)-3-{[(3-氨基-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基}-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯(500mg,1.49mmol)于ACN(5mL)中的搅拌溶液冷却至0-5℃,向其添加2-甲基-2-亚硝酸丙酯(263μL,2.23mmol)并且搅拌10min.,向此反应混合物,添加氯化铜(II)(299mg,2.23mmol)并且在25-30℃下搅拌混合物10min.,接着在50-55℃下搅拌30min。添加氯化锂(126mg,2.98mmol)并且持续加热30min。将反应混合物冷却至室温,在减压下浓缩,使用硅胶(100-200目)柱色谱纯化,用5%于己烷中的乙酸乙酯洗脱,得到呈浅黄色胶状物的(3R)-3-{[(3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基}-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯(138mg,26%)。
MS(ESI):m/z 355.0[M+H]+
步骤7:合成(3R)-3-{[(3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基}-2-氮杂双环[3.1.0]己烷
Figure BDA0003923073830002851
/>
在0℃下向(3R)-3-{[(3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基}-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯(150mg,422μmol)于1,4-二噁烷(1mL)中的搅拌溶液添加4M于1,4-二噁烷(0.5mL)中的HCl并且在室温下搅拌混合物6h。在减压下蒸发挥发物,用二乙醚(20mL)湿磨粗化合物,得到呈灰白色固体状的(3R)-3-{[(3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基}-2-氮杂双环[3.1.0]己烷(102mg,95%)。
MS(ESI):m/z 255.0[M+H]+
步骤8:合成7-[(3R)-3-{[(3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基}-2-氮杂双环[3.1.0]己-2-基]-1-{6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基}-6-氟-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002852
将(3R)-3-{[(3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基}-2-氮杂双环[3.1.0]己烷(83.5mg,328μmol)于DMSO(0.5mL)中的搅拌混合物冷却至0℃,向其缓慢添加三乙胺(195μL,1.36mmol)并且搅拌5min。接着添加1-{6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基}-6,7-二氟-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(110mg,274μmol)并且在130℃下搅拌16h。将反应混合物用冰冷水(10mL)淬灭并且用乙酸乙酯(2×25mL)萃取。将合并的有机层用盐水(10mL)洗涤,经硫酸钠干燥。在减压下浓缩,得到粗物质。粗产物用二乙醚湿磨并且在真空下干燥。通过制备型RP HPLC纯化所获得固体。将含有产物的相关洗脱份冻干,得到呈浅黄色固体状的7-[(3R)-3-{[(3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基}-2-氮杂双环[3.1.0]己-2-基]-1-{6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基}-6-氟-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(34.3mg,20%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ15.40(br s,1H),8.51(d,J=4.8Hz,1H),8.28-8.26(m,1H),7.87(d,J=13.2Hz,1H),7.78-7.73(m,1H),7.71-7.66(m,1H),6.58-6.47(m,2H),6.37-6.34(m,1H),4.78-4.71(m,1H),4.26-4.12(m,2H),4.09-4.03(m,2H),3.84-3.77(m,2H),3.72(d,J=3.2Hz,3H),3.22-3.13(m,2H),2.61-2.58(m,1H),2.13(s,6H),2.08-2.02(m,1H),1.63-1.60(m,1H),0.97-0.94(m,1H),0.74-0.70(m,1H);MS(ESI):m/z 635.4[M+H]+
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例73:合成7-((1R,3R,5R)-3-(((3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基)甲基)-2-氮杂双环[3.1.0]己-2-基)-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-6-氟-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002861
步骤1:合成3-氯-6-甲氧基吡啶-2-胺
Figure BDA0003923073830002862
向2-氯-6-甲氧基-3-硝基吡啶(15g,79.5mmol)于H2O(75mL)和EtOH(75mL)中的搅拌溶液添加氯化铵(21.2g,397mmol)并且冷却至0℃。接着逐份添加铁(22.1g,397mmol)并且加热以在80℃下搅拌6h。经由硅藻土垫过滤反应混合物并且蒸发滤液。将粗残留物溶解于DCM(500mL)中并且用水(2×100mL)洗涤。经无水硫酸钠干燥有机层并且蒸发至干燥,得到粗产物。粗化合物通过100-200目硅胶柱色谱使用5% EtOAc/己烷作为洗脱剂纯化。将所收集的纯洗脱份蒸发至干燥,得到呈黄色固体状的2-氯-6-甲氧基吡啶-3-胺(12.0g,95%)
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.08(d,J=8.4Hz,1H),6.57(d,J=8.4Hz,1H),3.88(s,3H),3.88(brs,2H)。
步骤2:合成2,3-二氯-6-甲氧基吡啶
Figure BDA0003923073830002871
将2-氯-6-甲氧基吡啶-3-胺(8g,50.4mmol)于ACN(50mL)中的搅拌溶液冷却至0-5℃,向其添加2-甲基-2-亚硝酸丙酯(8.95mL,75.6mmol)并且搅拌10min。将氯化铜(II)(10.1g,75.6mmol)和氯化锂(4.23g,100mmol)于ACN(30mL)中同时混合并且加热至55-60℃持续20min,将所述混合物添加至以上所得溶液并且再维持相同温度30min,通过TLC监测RM。RM在减压下浓缩,使用硅胶(100-200目)柱色谱用5%于己烷中的乙酸乙酯洗脱来纯化。浓缩各别洗脱份,得到呈灰白色固体状的2,3-二氯-6-甲氧基吡啶(2.80g,31%)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.59(d,J=8.4Hz,1H),6.64(d,J=8.4Hz,1H),3.93(s,3H)。
步骤3:合成1-(叔丁基)2-甲基(R)-2,3-二氢-1H-吡咯-1,2-二甲酸酯
Figure BDA0003923073830002872
/>
在-78℃下向1-叔丁基2-乙基(2R)-5-氧代吡咯烷-1,2-二甲酸酯(50g,194mmol)于甲苯(400mL)中的搅拌溶液添加三乙基硼氢化锂(213mL,213mmol)(1M于THF中)。在室温下维持反应1h。在添加4-二甲氨基吡啶(709mg,5.81mmol)、N,N-二异丙基乙胺(212mL,1.16mol)之后,随后在-78℃下添加三氟乙酸酐(32.6mL,232mmol)并且使其缓慢至室温并且搅拌16h。反应完成后,将反应混合物用水(150mL)淬灭(在0℃下缓慢添加),并且用乙酸乙酯(2×200mL)萃取,将合并的有机层经Na2SO4干燥,过滤并且浓缩,得到粗化合物。通过100-200目硅胶柱色谱使用5% EtOAc/己烷作为洗脱剂纯化粗产物,得到呈无色液体状的1-叔丁基2-乙基(2R)-2,3-二氢-1H-吡咯-1,2-二甲酸酯(27.0g,58%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ6.65-6.51(m,1H),4.95-4.90(m,1H),4.66-4.54(m,1H),4.28-4.15(m,2H),3.12-3.00(m,1H),2.69-2.60(m,1H),1.48-1.44(m,9H),1.31-1.24(m,3H)。
步骤4:合成2-(叔丁基)3-甲基(1R,3R,5R)-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2,3-二甲酸酯
Figure BDA0003923073830002881
将1-叔丁基2-乙基(2R)-2,3-二氢-1H-吡咯-1,2-二甲酸酯(20g,82.8mmol)于甲苯(300mL)中的搅拌混合物冷却至-40℃,向其缓慢添加二乙基锌(1M于己烷中)(182mL,182mmol)并且搅拌60min。接着添加于甲苯(100mL)中的二碘甲烷(26.6mL,331mmol)(形成白色悬浮液)并且在-40℃至室温(同时使其达至室温,反应物在性质上温和放热)下搅拌6小时。通过TLC来监测反应物。将反应物质用饱和NaHCO3(200mL)淬灭并且经由硅藻土垫过滤,并且用乙酸乙酯(2×250mL)萃取滤液。将合并的有机层用盐水(100mL)洗涤,经硫酸钠干燥并且在减压下浓缩,得到粗物质。粗产物通过230-400目硅胶柱色谱使用2-3% EtOAc/己烷作为洗脱剂纯化,得到呈黄色液体状的2-叔丁基3-乙基(1R,3R,5R)-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2,3-二甲酸酯(6.30g,24.6mmol,顶部斑点)和2-叔丁基3-乙基(1S,3R,5S)-2-氮杂双环[3.1.0]己烷2,3-二甲酸酯(3.00g,11.7mmol,底部斑点)。主要异构体的1HNMR:(400MHz,90℃下的VT,DMSO-d6)δ4.45(dd,J=3.2,11.6Hz,1H),4.10(q,J=6.8Hz,2H),3.42-3.37(m,1H),2.56-2.46(m,1H),1.92-1.86(m,1H),1.58-1.50(m,1H),1.37(s,9H),1.18(t,J=6.8Hz,3H),0.75-0.70(m,1H),0.69-0.62(m,1H)。
步骤5:合成(1R,3R,5R)-3-(羟甲基)-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830002891
在0℃下向2-叔丁基3-乙基(1R,3R,5R)-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2,3二甲酸酯(3.3g,12.9mmol)于THF(25mL)中的搅拌溶液添加硼氢化锂(9.65mL,19.3mmol)(2m于THF中)。将反应物维持在室温下6h。反应完成后,将反应混合物用饱和氯化铵(20mL)淬灭(在0℃下缓慢添加),并且用乙酸乙酯(2×50mL)萃取,将合并的有机层经Na2SO4干燥,过滤并且浓缩,得到呈黄色液体状的粗(1R,3R,5R)3-(羟甲基)-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯(2.70g))。1H NMR(400MHz,CDCl3-d)δ4.87-4.85(m,1H),4.36-4.32(m,1H),3.53-3.42(m,4H),2.49-2.42(m,1H),1.50-1.49(m,10H),0.82-0.77(m,1H),0.41-0.40(m,1H)
步骤6:合成(1R,3R,5R)-3-(((3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基)甲基)-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830002892
在0℃下向(1R,3R,5R)-3-(羟甲基)-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯(8g,37.5mmol)于THF(80mL)中的搅拌溶液添加2,3-二氯-6-甲氧基吡啶(8.01g,45.0mmol)和双(三甲基硅烷基)胺基钾(75.0mL,75.0mmol)。使反应物达至室温1h。通过TLC监测反应物。将反应物质用水(50mL)淬灭并且用乙酸乙酯(2×70mL)萃取,将有机层用盐水(50mL)洗涤,经硫酸钠干燥。在减压下浓缩,得到粗物质。通过100-200目硅胶柱色谱使用7% EtOAc/己烷作为洗脱剂纯化粗产物,得到呈黄色液体状的(1R,3R,5R)-3-{[(3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基}-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯(6.40g,48%)。MS(ESI):m/z355.0[M+H]+
步骤7:合成(1R,3R,5R)-3-(((3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基)甲基)-2-氮杂双环[3.1.0]己烷盐酸盐
Figure BDA0003923073830002901
在0℃下向(1R,3R,5R)-3-{[(3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基}-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯(10g,28.1mmol)于1,4-二噁烷(30mL)中的搅拌溶液添加4M于1,4-二噁烷(40mL)中的HCl并且在室温下搅拌混合物6h。在减压下蒸发挥发物,用二乙醚(100mL)湿磨粗化合物,得到呈灰白色固体状的(1R,3R,5R)-3-{[(3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基}-2-氮杂双环[3.1.0]己烷盐酸盐(7.51g,92%)。MS(ESI):m/z 255.0[M+H]+(对于游离碱)。
步骤8:合成7-((1R,3R,5R)-3-(((3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基)甲基)-2-氮杂双环[3.1.0]己-2-基)-1-(6-(3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基)吡啶-3-基)-6-氟-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002902
将(1R,3R,5R)-3-{[(3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基}-2-氮杂双环[3.1.0]己烷(6.52g,22.5mmol)于DMSO(100mL)中的搅拌混合物冷却至0℃,向其缓慢添加三乙胺(15.65mL,112.5mmol)并且搅拌5min。接着添加1-{6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基}-6,7-二氟-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(9g,22.5mmol)并且在100℃下搅拌16小时。通过TLC来监测反应物。将反应物质用冰冷水(20mL)淬灭并且用乙酸乙酯(2×50mL)萃取,将有机层用盐水(20mL)洗涤,经硫酸钠干燥。在减压下浓缩,得到粗物质。将粗产物用二乙醚洗涤并且在真空下干燥,接着通过制备型HPLC进一步纯化并且冻干洗脱份,得到呈浅棕色固体状的7-[(1R,3R,5R)-3-{[(3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基}-2-氮杂双环[3.1.0]己-2-基]-1-{6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基}-6-氟-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(5.65g,39.6%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ15.40(br s,1H),8.51(d,J=4.8Hz,1H),8.27-8.26(m,1H),7.87(d,J=13.2Hz,1H),7.73-7.71(m,1H),7.69-7.65(m,1H),6.58-6.52(m,1H),6.49-6.33(m,2H),4.78-4.71(m,1H),4.24-4.14(m,2H),4.07-4.03(m,2H),3.81-3.78(m,2H),3.72(d,J=3.2Hz,3H),3.22-3.13(m,2H),2.61-2.58(m,1H),2.13(s,6H),2.08-2.02(m,1H),1.63-1.60(m,1H),0.97-0.94(m,1H),0.74-0.70(m,1H);MS(ESI):m/z 635.1.[M+H]+
制备型HPLC条件:Kinetex,C-18柱,250×21.2×5μm,A:0.1% FA缓冲液,B:ACN,0/10,10/30,20/40;稀释剂:水/乙腈。
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例74:合成7-[(1S,3R,5S)-3-{[(3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基}-2-氮杂双环[3.1.0]己-2-基]-1-{6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基}-6-氟-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002921
/>
步骤1:合成(5R)-5-{[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]甲基}吡咯烷-2-酮
Figure BDA0003923073830002922
向(5R)-5-(羟甲基)吡咯烷-2-酮(5g,43.4mmol)于DCM(150mL)中的搅拌溶液添加咪唑(6.5g,95.4mmol),之后添加4-二甲氨基吡啶(530mg,4.33mmol)并且冷却至0℃。接着逐滴添加叔丁基(氯)二苯基硅烷(11.8mL,45.4mmol)并且使其在室温下缓慢搅拌16h。将反应混合物用水稀释并且用DCM萃取。将有机层用盐水溶液洗涤并且经无水硫酸钠干燥,蒸发至干燥,得到呈胶质液体状的粗(5R)-5-{[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]甲基}吡咯烷-2-酮(18.0g),其不经进一步纯化即进行下一步骤。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.78-7.72(m,1H),7.68-7.60(m,3H),7.48-7.34(m,6H),5.78(s,1H),3.64-3.61(m,1H),3.52-3.51(m,1H),3.50-3.48(m,1H),2.36-2.31(m,2H),2.16-2.01(m,1H),1.73-1.61(m,1H),1.05(s,9H)。
步骤2:合成(2R)-2-{[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]甲基}-5-氧代吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830002923
向(5R)-5-{[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]甲基}吡咯烷-2-酮(18g,50.9mmol)于ACN(180mL)中的搅拌溶液添加4-二甲氨基吡啶(7.45g,61.0mmol)并且冷却至0℃。接着逐滴添加二碳酸二叔丁酯(12.8mL,55.9mmol)并且使其在室温下搅拌16h。将反应混合物用EtOAc稀释并且用水之后用盐水溶液洗涤。经无水硫酸钠干燥有机层并且蒸发,得到粗物质。粗化合物通过100-200目硅胶柱色谱使用2-5% EtOAc/己烷作为洗脱剂纯化。将所收集的纯洗脱份蒸发至干燥,得到呈白色结晶固体状的(2R)-2-{[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]甲基}-5-氧代吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(16.0g,69%)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.65-7.59(m,4H),7.44-7.26(m,6H),4.22-4.19(m,1H),3.91-3.87(m,1H),3.72-3.68(m,1H),2.81-2.77(m,1H),2.44-2.38(m,1H),2.15-2.10(m,2H),1.43(s,9H),1.04(s,9H)。
步骤3:合成(2R)-2-{[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]甲基}-5-羟基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830002931
在-78℃下向(2R)-2-{[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]甲基}-5-氧代吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(16g,35.2mmol)于THF(160mL)中的搅拌溶液逐滴添加三乙基硼氢化锂(38.7mL,38.7mmol)并且在相同温度下搅拌1h。将反应混合物用饱和NaHCO3溶液(60mL)淬灭并且使其在0℃下缓慢搅拌,接着添加过氧化氢(1.14mL,48.9mmol)。在相同温度下再搅拌反应混合物30min并且用DCM稀释。将有机层用水之后用盐水溶液洗涤并且经无水硫酸钠干燥,蒸发至干燥,得到呈浅黄色胶状物的粗(2R)-2-{[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]甲基}-5-羟基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(14.0g,88%)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.68-7.66(m,4H),7.45-7.26(m,6H),5.56-5.42(m,1H),4.05-3.96(m,1H),3.90-3.82(m,1H),3.76-3.52(m,2H),2.25-2.12(m,1H),2.10-1.92(m,1H),1.88-1.82(m,2H),1.52(s,3H),1.34(s,6H),1.06(s,9H).
步骤4:合成(2R)-2-{[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]甲基}-2,3-二氢-1H-吡咯-1-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830002941
向(2R)-2-{[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]甲基}-5-羟基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(14g,30.7mmol)于甲苯(100mL)中的搅拌溶液添加N,N-二异丙基乙胺(53.3mL,307mmol)并且冷却至0℃。逐滴缓慢添加三氟乙酸酐(6.48mL,46.0mmol)并且在室温下搅拌1h,接着加热至110℃持续16h。使反应混合物冷却至室温并且用EtOAc稀释。将有机层用水之后用盐水溶液洗涤并且经无水硫酸钠干燥,蒸发,得到粗物质。粗化合物通过100-200目硅胶柱色谱使用2% EtOAc/己烷作为洗脱剂纯化。将所收集的纯洗脱份蒸发至干燥,得到呈浅棕色液体状的(2R)-2-{[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]甲基}-2,3-二氢-1H-吡咯-1-甲酸叔丁酯(10.0g,75%)。MS(ESI):m/z 438[(M+H]+
步骤5:合成(1S,3R,5S)-3-{[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]甲基}-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830002942
在0℃下向二碘甲烷(5.0mL,59.2mmol)于DCM(20mL)中的搅拌溶液逐滴添加双(乙基)锌(1M于己烷中,27.3mL,27.3mmol)并且搅拌30min。接着在相同温度下逐滴添加(2R)-2-{[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]甲基}-2,3-二氢-1H-吡咯-1-甲酸叔丁酯(10g,22.8mmol)于DCM(80mL)中的溶液并且使其在室温下缓慢搅拌3h。将反应混合物冷却至0℃并且用饱和NaHCO3溶液缓慢淬灭,接着用DCM稀释。将有机层分离并且用盐水溶液洗涤,经无水硫酸钠干燥,蒸发,得到粗物质。粗化合物通过100-200目硅胶柱色谱使用2% EtOAc/己烷作为洗脱剂纯化。将所收集的纯洗脱份蒸发至干燥,得到呈浅黄色胶状物的(1S,3R,5S)-3-{[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]甲基}-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯(6.5g,63%)。1HNMR(400MHz,CDCl3)δ7.68-7.62(m,4H),7.44-7.34(m,6H),3.92-3.80(m,1H),3.74-3.68(m,2H),3.22-3.13(m,1H),2.40-2.27(m,1H),2.10-1.96(m,1H),1.54-1.48(m,1H),1.40(s,9H),1.05(s,9H),0.90-0.78(m,1H),0.38-0.30(m,1H);MS(ESI):m/z 452[M+H]+。
步骤6:合成(1S,3R,5S)-3-(羟甲基)-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830002951
在室温下向(3R)-3-{[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]甲基}-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯(6.5g,14.3mmol)于THF(40mL)中的搅拌溶液添加1M于THF中的氟化四正丁基铵(54.3mL,54.3mmol)并且搅拌16h。反应混合物在减压下蒸发并且使粗物质经受使用15% EtOAc/己烷作为洗脱剂的100-200目硅胶柱色谱。将所收集的纯洗脱份蒸发,得到呈棕色液体状的(1S,3R,5S)-3-(羟甲基)-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯(2.80g,92%)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ4.85(bs,1H),3.72-3.68(m,1H),3.64-3.58(m,2H),3.28-3.21(m,1H),2.18-2.12(m,1H),1.80-1.72(m,1H),1.58-1.42(m,10H),0.78-0.64(m,1H),0.42-0.38(m,1H)。
步骤7:合成T-902-int-01B[[(1S,3R,5S)-3-{[(6-甲氧基-3-硝基吡啶-2-基)氧基]甲基}-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯]
Figure BDA0003923073830002952
在0℃下向(1S,3R,5S)-3-(羟甲基)-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯(2.8g,13.1mmol)于THF(30mL)中的搅拌混合物添加氢化钠(626mg,15.7mmol),接着添加2-氯-6-甲氧基-3-硝基吡啶(2.47g,13.1mmol)并且使其在室温下搅拌3小时。通过TLC来监测反应物。将反应混合物用冰冷水淬灭并且用乙酸乙酯(2×10mL)萃取。将合并的有机层用盐水洗涤,经无水硫酸钠干燥并且在减压下浓缩,得到粗物质。通过100-200目硅胶柱色谱使用10% EtOAc/己烷作为洗脱剂纯化粗产物,得到呈黄色液体状的(1S,3R,5S)-3-{[(6-甲氧基-3-硝基吡啶-2-基)氧基]甲基}-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯(3.50g,73%)。MS(ESI):m/z 266[(M-Boc)+H]+。
步骤8:合成(1S,3R,5S)-3-{[(3-氨基-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基}-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830002961
向(1S,3R,5S)-3-{[(6-甲氧基-3-硝基吡啶-2-基)氧基]甲基}-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯(1.1g,3.01mmol)于甲醇(20mL)中的搅拌溶液添加10%钯/碳(500mg,469μmol)并且在室温下在H2气球压力下氢化3h。将反应混合物经由硅藻土床过滤,用EtOAc洗涤,并且蒸发滤液,得到粗物质。粗化合物通过100-200目硅胶柱色谱使用50%EtOAc/己烷作为洗脱剂纯化。将所收集的纯洗脱份蒸发至干燥,得到呈棕色胶状物的(1S,3R,5S)-3-{[(3-氨基-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基}-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯(587mg,59%)。MS(ESI):m/z336.1[M+H]+。
步骤9:合成(1S,3R,5S)-3-{[(3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基}-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830002962
在0℃下向(1S,3R,5S)-3-{[(3-氨基-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基}-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯(1.1g,3.27mmol)于ACN(6mL)中的搅拌溶液逐滴添加2-甲基-2-亚硝酸丙酯(582μL,4.90mmol)并且在相同温度下搅拌15min。在60℃下加热氯化铜(II)(658mg,4.90mmol)和氯化锂(415mg,9.80mmol)于ACN(4mL)中的悬浮液5min,接着冷却至室温。在0℃下将溶液逐滴添加至以上反应混合物并且使其在室温下搅拌2h。将过量溶剂在减压下蒸发并且将所获得的粗物质通过100-200目硅胶柱色谱使用2% EtOAc/己烷作为洗脱剂纯化。将所收集的纯洗脱份蒸发至干燥,得到呈黄色固体状的(1S,3R,5S)-3-{[(3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基}-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯(560mg,48%)。MS(ESI):m/z 355[(M+H]+。
步骤10:合成(1S,3R,5S)-3-{[(3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基}-2-氮杂双环[3.1.0]己烷盐酸盐
Figure BDA0003923073830002971
向(1S,3R,5S)-3-{[(3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基}-2-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-甲酸叔丁酯(560mg,1.57mmol)于1,4-二噁烷(5mL)中的搅拌溶液添加4M于1,4-二噁烷中的盐酸盐(1.96mL,7.84mmol)并且在室温下搅拌2h。将反应混合物蒸发至干燥,并且将所获得的固体用二乙醚洗涤,在真空下干燥,得到呈浅黄色固体的(1S,3R,5S)-3-{[(3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基}-2-氮杂双环[3.1.0]己烷盐酸盐(380mg,83%)。MS(ESI):m/z 255[(M-HCl)+H]+。
步骤11:合成7-[(1S,3R,5S)-3-{[(3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基}-2-氮杂双环[3.1.0]己-2-基]-1-{6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基}-6-氟-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002981
在密封管中向1-{6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基}-6,7-二氟-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(180mg,449μmol)于DMSO(0.5mL)中的搅拌溶液添加(1S,3R,5S)-3-{[(3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基}-2-氮杂双环[3.1.0]己烷(114mg,449μmol)之后添加三乙胺(311μL,2.24mmol)并且加热至120℃持续16h。将反应混合物冷却至室温并且用冰冷水稀释,接着用10% MeOH/DCM萃取两次。将合并的有机层用冷盐水洗涤,经无水硫酸钠干燥并且蒸发,得到粗物质。通过制备型HPLC纯化粗化合物并且将所收集的纯洗脱份冻干,得到呈灰白色固体状的7-[(1S,3R,5S)-3-{[(3-氯-6-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基}-2-氮杂双环[3.1.0]己-2-基]-1-{6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基}-6-氟-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(64.1mg,22%)。制备型HPLC条件:Gemini,C-18柱,250×21.2×5μm,A:0.1% FA缓冲液,B:ACN,0/20,10/40,20/60,25/90;稀释剂:ACN/MeOH。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ15.36(s,1H),8.52(s,1H),8.34-8.25(m,1H),7.95-7.84(m,1H),7.84-7.72(m,2H),6.58-6.34(m,3H),4.50-4.30(m,3H),4.12-3.98(m,2H),3.90-3.80(m,2H),3.77(s,3H),3.18-3.05(m,2H),2.33-2.18(m,6H),2.12-2.07(m,2H),1.82-1.74(m,1H),0.82-0.74(m,1H),0.38(d,J=14.0Hz,1H);MS(ESI):m/z 635.4[(M+H]+。
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例75:合成6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯-4-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-1-{6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基}-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830002991
步骤1:合成2-氯-4-甲氧基-3-硝基吡啶
Figure BDA0003923073830002992
在10mL密封管中,向2,4-二氯-3-硝基吡啶(500mg,2.59mmol)于MeOH(5mL)中的搅拌溶液添加甲醇钠(167mg,3.10mmol)并且在室温下于N2下搅拌2h。在起始物质完成之后,在减压下浓缩反应混合物,并且将粗化合物溶解于EtOAc(100mL)中。将有机层用水(20mL)和盐水溶液(20mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥,在减压下浓缩,得到粗化合物。通过硅胶(100-200目)柱色谱使用缓冲液10%于己烷中的EtoAC作为洗脱剂纯化粗化合物,得到呈浅黄色固体状的2-氯-4-甲氧基-3-硝基吡啶(400mg,2.12mmol,81%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ8.37(d,J=5.6Hz,1H),6.97(d,J=6.8Hz,1H),4.00(s,3H)。
步骤2:合成(2R)-2-{[(4-甲氧基-3-硝基吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830003001
在0℃下向2-氯-4-甲氧基-3-硝基吡啶(400mg,2.12mmol)于DMF(5mL)中的搅拌溶液添加氢化钠(127mg,3.18mmol)之后添加(2R)-2-(羟甲基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(511mg,2.54mmol)。使反应物达至室温,接着搅拌16h。反应完成后,将反应混合物用冰冷水(20mL)淬灭并且用EtOAc(2×100mL)萃取。将合并的有机层用盐水(20mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥,在减压下浓缩,得到粗化合物。通过硅胶(100-200目)柱色谱用30%于己烷中的EtOAc作为洗脱剂来纯化粗化合物,得到呈油状化合物的(2R)-2-{[(4-甲氧基-3-硝基吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(285mg,806μmol,38%)。MS(ESI):m/z 354[M+H]+
步骤3:合成(2R)-2-{[(3-氨基-4-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830003002
在室温下向(2R)-2-{[(4-甲氧基-3-硝基吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(300mg,806μmol)于MeOH(5mL)中的搅拌溶液添加10% Pd-C(85.7mg,80.6μmol)并且在氢气气氛下搅拌16h。反应完成(通过TLC监测)后,将反应混合物经由硅藻土垫过滤并且用甲醇洗涤。在减压下浓缩滤液,得到粗化合物,并且将其用正戊烷湿磨,得到呈棕色油状化合物的(2R)-2-{[(3-氨基-4-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(88.7mg,274μmol,34%)。MS(ESI):m/z324.0[M+H]+
步骤4:合成(2R)-2-{[(3-氯-4-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830003011
向(2R)-2-{[(3-氨基-4-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(500mg,1.54mmol)于ACN(10mL)中的搅拌溶液添加亚硝酸叔丁酯(274μL,2.31mmol)并且在0℃下搅拌10min。在N2下将氯化铜(II)(310mg,2.31mmol)添加至反应混合物中,并且在50℃下搅拌所得混合物30min。用乙酸乙酯和水萃取所得溶液。浓缩有机相并且将残留物施用至用乙酸乙酯/己烷(1:5)洗脱的硅胶(100-200目)柱上,得到呈油状化合物的(2R)-2-{[(3-氯-4-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(127mg,371μmol,24%)。MS(ESI):m/z 342.9[M+H]+
步骤5:合成3-氯-4-甲氧基-2-{[(2R)-吡咯烷-2-基]甲氧基}吡啶
Figure BDA0003923073830003012
在0℃下在N2气氛下向(2R)-2-{[(3-氯-4-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(30mg,71.7μmol)于DCM(0.5mL)中的搅拌溶液添加三氟乙酸(13.6μL,179μmol)。将所得混合物在室温下搅拌1hr。反应进程系(通过TLC监测)。反应完成后,在减压下浓缩反应混合物直至去除DCM。接着用二乙醚湿磨残留物,得到呈棕色油状化合物的3-氯-4-甲氧基-2-{[(2R)-吡咯烷-2-基]甲氧基}吡啶(14.5mg,59.9μmol,83%)。MS(ESI):m/z242.9[M+H]+(对于游离碱)。
步骤6:合成6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯-4-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-1-{6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基}-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830003021
在10mL密封管中,在室温下向6-氯-1-{6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基}-7-氟-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(150mg,347μmol)于DMSO(3mL)中的溶液添加三乙胺(241μL,1.73mmol)之后添加3-氯-4-甲氧基-2-{[(2R)-吡咯烷-2-基]甲氧基}吡啶(100mg,416μmol)。接着将反应物加热至100℃并且搅拌16h。反应完成后,将反应混合物用冰冷水(10mL)淬灭并且用5% MeOH/DCM(2×100mL)萃取。将合并的有机层用盐水溶液(10mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥,在减压下浓缩,得到粗化合物。通过制备型HPLC纯化来纯化粗化合物,得到呈灰白色固体状的6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯-4-甲氧基吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-1-{6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基}-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(51.4mg,80.4μmol,23%)。制备型HPLC条件:Atlantis,C-18柱,250×21.2×5μm,A:0.1% FA缓冲液,B:ACN,0/10,10/40,20/60;稀释剂:MeOH/水/乙腈。1H-NMR(400MHz,DMSO-d6):δ15.11(s,1H),8.52(d,J=11.2Hz,1H),8.24(dd,J=11.6,6.0Hz,1H),8.14(s,1H),7.83-7.77(m,1H),7.68-7.64(m,1H),6.85-6.80(m,1H),6.53(d,J=9.2Hz,0.5H),6.38(d,J=12.8Hz,1H),6.23(d,J=8.8Hz,0.5H),4.74(br s,0.5H),4.58(br s,0.5H),4.43-4.31(m,1H),4.20-4.01(m,3H),3.87(s,3H),3.85-3.77(m,2H),3.58-3.47(m,1H),3.28-3.16(m,2H),2.32-2.24(m,1H),2.14(s,6H),2.01-192(m,1H),1.88-1.76(m,2H);MS(ESI):m/z 639.3[M+H]+。效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例76:合成(R)-6-氯-7-(2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-1-(6,7-二氢-4H-吡唑并[5,1-c][1,4]噁嗪-2-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830003031
步骤1:合成(3-硝基-1H-吡唑-5-基)甲醇
Figure BDA0003923073830003032
在0℃下向3-硝基-1H-吡唑-5-甲酸(5g,31.8mmol)于THF(40mL)中的搅拌溶液添加于1M THF中的硼烷(8.10g,95.4mmol)。将反应物维持在室温下16小时。此后,使用冰/丙酮浴将反应物冷却至0℃,添加水(1.5mL)和4N盐酸(1.5mL)并且在回流下搅拌反应物1h以便用吡唑破坏硼烷复合物。将反应物冷却至室温并且在减压下浓缩至大约5mL的体积。添加乙酸乙酯(50mL)并且搅拌混合物15min。将水层分离并且用乙酸乙酯(4×20mL)萃取。将合并的有机层用碳酸氢钠饱和水溶液(2×20mL)、盐水(20mL)洗涤并且经硫酸钠干燥,通过过滤去除干燥剂,并且在减压下浓缩滤液,得到呈灰白色固体状的(3-硝基-1H-吡唑-5-基)甲醇(2.30g,16.0mmol)。1HNMR(400MHz,DMSO-d6):δ13.90(bs,1H),6.87(s,1H),4.53(s,2H)(未观测到-OH质子)。
步骤2:合成(1-(2-溴乙基)-3-硝基-1H-吡唑-5-基)甲醇
Figure BDA0003923073830003033
在0℃下向(3-硝基-1H-吡唑-5-基)甲醇(100mg,698μmol)于DMF(1mL)中的搅拌溶液添加碳酸铯(272mg,837μmol)和1,2-二溴乙烷(1.30g,6.97mmol)。在0℃下搅拌反应物1h并且在室温下搅拌4h。此后,添加乙酸乙酯(20mL)和水(15mL)。将水层分离并且用乙酸乙酯(2×10mL)萃取。将合并的有机层用水(10mL)、盐水(10mL)洗涤,经硫酸钠干燥,过滤并且在减压下浓缩,得到粗产物,其通过硅胶柱色谱纯化,得到呈黄色液体状的[1-(2-溴乙基)-3-硝基-1H-吡唑-5-基]甲醇(80.0mg,319μmol)。1HNMR(400MHz,CDCl3):δ6.85(s,1H),4.97(s,2H),4.66(t,J=6.4Hz,2H),3.83(t,J=6.4Hz,2H),2.15(bs,1H)。
步骤3:合成2-硝基-6,7-二氢-4H-吡唑并[5,1-c][1,4]噁嗪
Figure BDA0003923073830003041
在130℃下搅拌[1-(2-溴乙基)-3-硝基-1H-吡唑-5-基]甲醇(800mg,3.19mmol)于NMP(3.2mL)中的溶液6h。将反应物冷却至室温,接着添加水(60mL)并且用60mL的DCM萃取两次。将合并的有机层用盐水溶液洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并且浓缩,并且通过硅胶柱色谱纯化粗化合物,得到呈灰白色固体状的2-硝基-4H,6H,7H-吡唑并[3,2-c][1,4]噁嗪(380mg,2.24mmol)。1HNMR(400MHz,DMSO-d6):δ6.88(s,1H),4.83(s,2H),4.24(t,J=6.4Hz,2H),4.13(t,J=6.4Hz,2H),2.15(bs,1H).
步骤4:合成6,7-二氢-4H-吡唑并[5,1-c][1,4]噁嗪-2-胺
Figure BDA0003923073830003042
在室温下向2-硝基-4H,6H,7H-吡唑并[3,2-c][1,4]噁嗪(300mg,1.77mmol)于MeOH(5mL)中的搅拌溶液添加Pd/C(100mg,625μmol)。于H2气球下将反应物维持在室温下3小时。在反应完成之后,经由硅藻土垫过滤反应混合物。浓缩滤液,得到呈黄色液体状的4H,6H,7H-吡唑并[3,2-c][1,4]噁嗪-2-胺(220mg,1.58mmol)。MS(ESI):m/z 140.4[M+H]+。
步骤5:合成(R)-6-氯-7-(2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-1-(6,7-二氢-4H-吡唑并[5,1-c][1,4]噁嗪-2-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830003051
在室温下向(2Z)-2-[(Z)-5-氯-4-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-2-氟苯甲酰基]-3-乙氧基丙-2-烯酸乙酯(50mg,97.7μmol)于DMSO(0.5mL)中的搅拌溶液添加4H,6H,7H-吡唑并[3,2-c][1,4]噁嗪-2-胺(16.2mg,117μmol)并且搅拌混合物2小时。在起始物质完成之后,在相同温度下将碳酸钾(20.1mg,146μmol)添加至反应混合物中,将反应物维持在80℃下6小时。反应完成后,将混合物冷却至室温,将冰水添加至反应混合物中,过滤所沉淀固体并且干燥,得到呈棕色固体状的6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-4-氧代-1-{4H,6H,7H-吡唑并[3,2-c][1,4]噁嗪-2-基}-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(20.0mg,34.2μmol)。用木炭处理此固体。MS(ESI):m/z 584.2[M+H]+。
步骤6:合成(R)-6-氯-7-(2-(((3-氯吡啶-2-基)氧基)甲基)吡咯烷-1-基)-1-(6,7-二氢-4H-吡唑并[5,1-c][1,4]噁嗪-2-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸]
Figure BDA0003923073830003052
在室温下向6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-4-氧代-1-{4H,6H,7H-吡唑并[3,2-c][1,4]噁嗪-2-基}-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(280mg,479μmol)于THF(2mL)和水(2mL)中的搅拌溶液添加氢氧化锂(57.2mg,2.39mmol)并且在相同温度下搅拌混合物6h。在反应完成之后,蒸发溶剂并且用1N HCl酸化,用乙酸乙酯萃取。将合并的有机层经Na2SO4干燥,过滤并且浓缩,得到粗化合物。粗化合物通过制备型HPLC纯化并且冻干洗脱份,得到呈灰白色固体状的6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-4-氧代-1-{4H,6H,7H-吡唑并[3,2-c][1,4]噁嗪-2-基}-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(30.0mg,53.9μmol)。制备型HPLC条件:Gemini,C-18柱,250×21.2×5μm,A:0.1%甲酸缓冲液,B:ACN,0/50,20/70,25/95;稀释剂:THF/ACN+水
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ14.98(s,1H),8.60(s,1H),8.13(s,1H),7.87(dd,J=4.8,1.6Hz,1H),7.77(dd,J=7.6,1.6Hz,1H),6.98(s,1H),6.90(dd,J=8.0,5.2Hz,1H),6.51(s,1H),4.85(d,J=2.4Hz,2H),4.80-4.73(m,1H),4.34(d,J=4.0Hz,2H),4.22-4.13(m,4H),3.70-3.62(m,1H),3.35-3.24(m,1H),2.34-2.25(m,1H),2.08-1.90(m,2H),1.88-1.70(m,1H);MS(ESI):m/z 556.3[M+H]+。
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例77:合成6-氯-7-[(2S,4S)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}-4-氟吡咯烷-1-基]-4-氧代-1-(吡嗪-2-基)-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830003061
步骤1:合成1-叔丁基2-甲基(2S,4S)-4-氟吡咯烷-1,2-二甲酸酯
Figure BDA0003923073830003062
在-78℃下向1-叔丁基2-甲基(2S,4R)-4-羟基吡咯烷-1,2-二甲酸酯(5g,20.3mmol)于二氯甲烷(25mL)中的搅拌溶液添加二乙氨基三氟化硫(3.98mL,30.4mmol)并且搅拌2h,接着在室温下搅拌16h。在起始物质完成之后,将反应混合物用NH4Cl饱和水溶液淬灭并且用DCM(2×50mL)萃取。将合并的有机层用水(10mL)和盐水溶液(10mL)洗涤,经硫酸钠干燥并且在真空中浓缩,得到粗化合物。通过硅胶柱色谱用于己烷中的乙酸乙酯洗脱来纯化粗化合物并且浓缩含有化合物的洗脱份,得到呈浅黄色油状物的1-叔丁基2-甲基(2S,4S)-4-氟吡咯烷-1,2-二甲酸酯(3.00g,12.1mmol,54%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ5.33-5.19(m,1H),4.42-4.36(m,1H),3.67(s,3H),3.62-3.51(m,2H),2.56-2.40(m,1H),2.27-2.17(m,1H),1.42(s,9H)。
步骤2:合成(2S,4S)-4-氟-2-(羟甲基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
Figure BDA0003923073830003071
在0℃下向1-叔丁基2-甲基(2S,4S)-4-氟吡咯烷-1,2-二甲酸酯(3.0g,12.1mmol)于THF(10m)中的搅拌溶液缓慢添加硼氢化锂(9.05mL,18.1mmol)持续10min。使反应混合物达至室温并且搅拌6h。将混合物冷却至0℃,用经稀释的乙酸淬灭,接着用EtOAc(2×50mL)萃取。将合并的有机层用饱和NaHCO3和饱和NaCl溶液洗涤,经硫酸钠干燥,过滤并且浓缩,获得呈浅黄色油状物的(2S,4S)-4-氟-2-(羟甲基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(2.30g,10.4mmol,68%)。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ5.33-5.17(m,1H),4.45(t,J=5.6Hz,1H),3.86-3.81(m,1H),3.72-3.59(m,1H),3.49-3.40(m,1H),3.30-3.27(m,1H),2.31-2.11(m,3H),1.45(s,9H)。
步骤3:合成(2S,4S)-4-氟吡咯烷-2-基]甲醇盐酸盐
Figure BDA0003923073830003072
在0℃下在N2气氛下搅拌(2S,4S)-4-氟-2-(羟甲基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(1.7g,7.75mmol)于4N HCl/二噁烷(5mL)中的溶液15min,接着在室温下搅拌2h。在起始物质完成后,在减压下浓缩反应混合物以得到粗化合物,并且用二乙醚和正戊烷湿磨,得到呈白色固体状的[(2S,4S)-4-氟吡咯烷-2-基]甲醇盐酸盐(1g,6.42mmol,83%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ10.19(brs,1H),9.19(brs,1H),5.47-5.32(d,J=63.2Hz,1H),3.69-3.47(m,5H),2.42-2.31(m,1H),2.01-1.89(m,1H)。
步骤4:合成6-氯-7-[(2S,4S)-4-氟-2-(羟甲基)吡咯烷-1-基]-4-氧代-1-(吡嗪-2-基)-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830003081
在室温下向6-氯-7-氟-4-氧代-1-(吡嗪-2-基)-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(500mg,1.43mmol)于二甲亚砜(10mL)中的搅拌溶液添加三乙胺(796μL,5.72mmol),之后添加[(2R,4R)-4-氟吡咯烷-2-基]甲醇(511mg,4.29mmol)。接着将反应物加热至130℃并且搅拌16h。反应完成后,使反应混合物冷却至室温,用冰冷水(20mL)淬灭并且用EtOAc(2×100mL)萃取。将合并的有机层用盐水(20mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥,在减压下浓缩,得到粗化合物。粗化合物通过柱色谱用2%于DCM中的MeOH作为洗脱剂纯化,得到黄色油状化合物的6-氯-7-[(2S,4S)-4-氟-2-(羟甲基)吡咯烷-1-基]-4-氧代-1-(吡嗪-2-基)-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(216mg,483μmol,34%)。MS(ESI):m/z 447.1[M+H]+
步骤5:合成6-氯-7-[(2S,4S)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}-4-氟吡咯烷-1-基]-4-氧代-1-(吡嗪-2-基)-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830003091
在室温下向6-氯-7-[(2S,4S)-4-氟-2-(羟甲基)吡咯烷-1-基]-4-氧代-1-(吡嗪-2-基)-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(200mg,362μmol)于DMSO(5mL)中的搅拌溶液添加碳酸钾(248mg,1.80mmol)之后添加3-氯-2-氟吡啶(157μL,1.80mmol)。接着将反应物加热至130℃并且搅拌3h。反应完成后,将反应混合物用冰冷水(10mL)淬灭并且用EtOAc(2×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水溶液(10mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥,在减压下浓缩,得到粗化合物。粗化合物通过硅胶柱色谱使用2%于DCM中的MeOH作为洗脱剂纯化,得到呈黄色固体状的6-氯-7-[(2S,4S)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}-4-氟吡咯烷-1-基]-4-氧代-1-(吡嗪-2-基)-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(36.0mg,64.4μmol,26%)。
MS(ESI):m/z 558.2[M+H]+
步骤6:合成6-氯-7-[(2S,4S)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}-4-氟吡咯烷-1-基]-4-氧代-1-(吡嗪-2-基)-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830003092
在室温下向6-氯-7-[(2S,4S)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}-4-氟吡咯烷-1-基]-4-氧代-1-(吡嗪-2-基)-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(100mg,109μmol)于1,2-二氯乙烷(5mL)中的搅拌溶液添加三甲基氢氧化锡(196mg,1.08mmol),接着使其加热至100℃搅拌持续16h。反应完成后,将反应混合物冷却至室温,用冰冷水(10mL)淬灭并且用5%于DCM中的MeOH(2×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(10mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥,在减压下浓缩,得到粗化合物。粗化合物通过制备型HPLC纯化来纯化,得到呈灰白色固体状的6-氯-7-[(2S,4S)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}-4-氟吡咯烷-1-基]-4-氧代-1-(吡嗪-2-基)-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(39.6mg,74.6μmol,68%)。
制备型HPLC条件:Gemini,C-18柱,250×21.2×5μm,A:0.1%甲酸缓冲液,B:ACN,0/5,20/50;稀释剂:MeOH/CAN。1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ14.77(brs,1H),9.11(s,1H),8.92(d,J=2.4Hz,1H),8.89(s,1H),8.77(d,J=1.2Hz,1H),8.20(s,1H),7.89(dd,J=4.8,1.6Hz,1H),7.70(dd,J=7.6,1.6Hz,1H),6.95-6.92(m,1H),6.65(s,1H),5.46-5.32(m,1H),4.93-4.91(m,1H),4.45-4.41(m,1H),4.31-4.27(m,1H),3.94-3.87(m,1H),3.62-3.52(m,1H),2.55-2.37(m,1H),2.19-2.05(m,1H);MS(ESI):m/z 530.2.[M+H]+
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
实施例78:合成6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-1-{6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基}-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸
Figure BDA0003923073830003101
步骤1:合成6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-1-(6-氯吡啶-3-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830003111
在室温下向(2Z)-2-[(Z)-5-氯-4-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-2-氟苯甲酰基]-3-乙氧基丙-2-烯酸乙酯(21g,41.0mmol)于DMSO(70mL)中的搅拌溶液添加6-氯吡啶-3-胺(5.27g,41.0mmol)并且搅拌1h。在1h之后,添加碳酸钾(8.49g,61.5mmol)并且在80℃下加热反应混合物持续12h。将反应混合物冷却至室温并且用冰冷水稀释,将所得固体过滤并且在真空下干燥,得到粗化合物。粗化合物可溶于10%甲醇-DCM(250mL)中并且用木炭(5g)处理,搅拌40min并且经由硅藻土垫过滤并且在减压下浓缩,将所获得固体用正戊烷和MTBE(2×40mL)湿磨,并且在高真空下干燥固体,得到呈黄色固体状的6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-1-(6-氯吡啶-3-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(12.2g,52%)。MS(ESI):m/z 579.4[M+H]+
步骤2:合成6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-1-{6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基}-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯
Figure BDA0003923073830003112
在0℃下向N,N-二甲基氮杂环丁-3-胺二盐酸盐(2.87g,16.6mmol)于DMSO(50mL)中的搅拌溶液添加碳酸钾(2.87g,20.8mmol)并且搅拌5min,之后添加6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-1-(6-氯吡啶-3-基)-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(8g,13.9mmol)。接着将反应物加热至90℃并且搅拌8h。将反应混合物用冰冷水淬灭并且用EtOAc(2×150mL)萃取。将合并的有机层用水(80mL)、盐水溶液(80mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥并且在减压下浓缩。粗化合物用20%于MTBE(3×50mL)中的丙酮洗涤并且在真空下干燥,得到呈浅棕色固体状的6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-1-{6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基}-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(6.97g,78%)。MS(ESI):m/z 637.1[M+H]+
步骤3:合成6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-1-{6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基}-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸盐酸盐
Figure BDA0003923073830003121
在0℃下向6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-1-{6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基}-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸乙酯(17g,26.6mmol)于THF:水(1:1,200mL)中的搅拌溶液添加氢氧化钠(3.19g,79.8mmol)并且在室温下搅拌反应混合物6h。将反应混合物在减压下浓缩,并且将反应物质用冰浴再冷却,用水(30mL)稀释,通过使用1N HCl将pH调节至4-5并且用10%于DCM(2×250mL)中的MeOH萃取,将有机层用盐水(100ml)洗涤,经硫酸钠干燥。并且在减压下浓缩,得到粗物质。粗物质用50%于MTBE(3×50mL)中的丙酮洗涤并且在真空下干燥并且冻干,得到呈浅棕色固体状的6-氯-7-[(2R)-2-{[(3-氯吡啶-2-基)氧基]甲基}吡咯烷-1-基]-1-{6-[3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基]吡啶-3-基}-4-氧代-1,4-二氢喹啉-3-甲酸(9.76g,60%)。化合物呈盐酸盐形式。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ15.07(s,1H),11.00(s,1H),8.51(d,J=8.4Hz,1H),8.31(s,1H),8.15(s,1H),7.90-7.89(m,1H),7.82-7.74(m,2H),6.96-6.92(m,1H),6.66-6.46(m,1H),6.37-6.36(m,1H),4.77-4.68(m,1H),4.35-4.25(m,7H),3.52-3.46(m,1H),3.18-3.16(m,1H),2.75(bs,6H),2.26-2.24(m,1H),1.96-1.90(m,2H),1.82-1.78(m,1H);MS(ESI):m/z 609.3[M+H]+
效力Lin28a-dep Z11 IC50(μM)++++
以下化合物根据与实施例1-78中所描述的程序类似的程序合成。
表1.
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Figure BDA0003923073830005481
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Figure BDA0003923073830005491
/>
Figure BDA0003923073830005501
/>
Figure BDA0003923073830005511
/>
Figure BDA0003923073830005521
/>
Figure BDA0003923073830005531
/>
Figure BDA0003923073830005541
实施例4-1.TUTase分析
Zcchc11分析的目的是通过测量IC50来确定针对Zcchc11酶的化合物效力。在存在活性TUTase、UTP和抑制剂的情况下,依据添加至RNA底物的多尿苷尾部来测量化合物抑制。Zcchc11分析是在黑色、非结合384孔板(Corning#3575)中进行的。所有步骤均在室温下进行。对于典型分析,将含有LIN28A蛋白质的分析缓冲液(50mM HEPES pH 7.3、150mM KCl、5mM MgCl2、10mM DTT、0.01% Triton X-100、40U/ml RNAsin(Promega))(最终浓度:10nM)的29ul等分试样添加至各孔中。接下来,从连续稀释化合物的化合物稀释板转移1ul于100%DMSO中的化合物。接下来,添加Zcchc11和RNA底物(5'-荧光素标记的前let-7 miRNA(Dharmacon))的10ul 5倍混合物(最终浓度:分别为0.2nM和2nM)。将板放置于盘式振荡器上30秒以产生混合,接着培育30分钟。接下来,添加UTP与淬灭探针(3'-玫瑰红(rhodamine)标记的A20,多腺苷核苷酸,(IDT))的10ul 5倍混合物(最终浓度:分别为5uM和4nM)。立即将板放置于Biotek Cytation 5板式读取器中,并且使用读取器的动力学模式记录由A20探针退火至多尿苷尾部而产生的荧光素荧光的时间依赖性降低。使用与进展曲线的早期部分的线性拟合获得反应速率。使用四参数拟合来计算IC50值,其中100%酶活性根据DMSO对照来确定并且0%活性来自不具有UTP的对照样品。
LIN28A蛋白在大肠杆菌(E.coli)菌株Rosetta II(Novagen)中表达并且从其中纯化。将人野生型蛋白质的整个编码序列克隆至来自麦芽糖结合蛋白标记下游的表达载体pMAL(NEB)中。接头序列含有TEV蛋白酶裂解位点。使用MBP-Trap柱(GE Healthcare LifeSciences)从细菌提取物纯化蛋白质,之后通过离子交换色谱法标记裂解和去除标记。必要时,使用以下描述的程序来去除污染性细菌RNA:Faehnle CR.等人(2017)Multi-domainutilization by TUT4 and TUT7 in control of let-7 biogenesis.Nat Struct MolBiol,24:658-665。
Zcchc11蛋白质在HEK293细胞中表达并且从其中纯化。将包含人序列的残基212-1420的截短蛋白质克隆至来自麦芽糖结合蛋白标记下游的表达载体pTT5(Viva Biotech)中。接头序列含有TEV蛋白酶裂解位点,并且将FLAG标记添加至蛋白质的羧基末端。使用MBP-Trap柱(GE Healthcare Life Sciences)从细胞提取物纯化蛋白质,之后使用抗FLAG亲和力培养基(Sigma Aldrich)标记裂解和全长构建体的进一步富集。
本文所描述的化合物针对Zcchc11酶的效力在上文表1中示出。“+”表示大于50μM的IC50值;“++”表示大于10μM并且等于或小于50μM的IC50值;“+++”表示大于1μM并且等于或小于10μM的IC50值;并且“++++”表示等于或小于1μM的IC50值。

Claims (65)

1.一种由式(I)表示的化合物:
Figure FDA0003923073820000011
或其药学上可接受的盐,其中:
W为-CH2Y-R3、-S(O)2R3、-SCH2R3、Y-R3、-OC(=O)NR11R12或-N(C=O)NR11R12
V为-C(=O)-、-S(=O)2-或CR13R14
X为CR4R5、NR6或O;
Y为NR7或O;
Z为CR8或N;
R1为卤基、-CN、-OR1a、-C≡CH、C3-6碳环基或C1-6烷基,其中所述C1-6烷基任选地经一个或多个R10取代;
R1a为H或任选地经一个或多个R10取代的C1-6烷基;
R10在每次出现时独立地选自卤基、-CN和-OR10a
R10a在每次出现时独立地选自H和C1-6烷基;
R2为-CN、-CHRzCN、-C(O)NH2、-CHRzC(O)NH2、3元至12元碳环基、-(CHRz)-(3元至12元碳环基)、3元至12元杂环基或-(CHRz)-(3元至12元杂环基),其中由R2表示或由R2表示的基团中的所述3元至12元碳环基和所述3元至12元杂环基任选地经一个或多个R20取代,并且Rz为H或甲基;
R20在每次出现时独立地选自H、卤基、CN、氧代、-C(O)R20a、-C(O)2R20a、-C(O)NR20a、-N(R20a)2、-N(R20a)C(O)R20a、-N(R20a)C(O)2R20a、-N(R20a)C(O)N(R20a)2、-N(R20a)S(O)2R20a、-OR20a、-OC(O)R20a、-OC(O)N(R20a)2、-SR20a、-S(O)2R20a、-S(O)N(R20a) 2、-S(O)2N(R20a)2、C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元单环杂环基,其中由R20表示的所述C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元单环杂环基各自任选地经一个或多个R25取代;
R20a在每次出现时独立地选自H、C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元单环杂环基,其中由R20a表示的所述C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元单环杂环基各自任选地经一个或多个R25取代,或两个R20a连同其所连接的氮原子一起形成任选地经一个或多个R25取代的4元至7元杂环基;
R25在每次出现时独立地为H、C1-6烷基、卤基、-C=O、-C(O)O(C1-C6烷基)、任选地经OH取代的4元至6元杂环基、-N(R25a)2、-OR25a、任选地经C1-6烷基、卤基、-N(R25a)2或-OR25a取代的苯基;并且
R25a为H、C1-6烷基;或两个R25a连同其所连接的氮原子一起形成4元至7元杂环基,其中所述C1-6烷基任选地经-OCH3取代;
R3为3元至12元碳环基或3元至12元杂环基,其中由R3表示的所述3元至12元碳环基和所述3元至12元杂环基任选地经一个或多个R30取代;
R30在每次出现时独立地选自H、卤基、氧代、-CN、-C(O)R30a、-C(O)2R30a、-C(O)NR30a、-N(R30a)2、-N(R30a)C(O)R30a、-N(R30a)C(O)2R30a、-N(R30a)C(O)N(R30a)2、-N(R30a)S(O)2R30a、-OR30a、-OC(O)R30a、-OC(O)N(R30a)2、-SR30a、-S(O)2R30a、-S(O)N(R30a) 2、-S(O)2N(R30a)2、C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元单环杂环基,其中由R30表示的所述C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元单环杂环基各自任选地经一个或多个R35取代;
R30a在每次出现时独立地选自H、C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元单环杂环基,其中由R30a表示的所述C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元单环杂环基各自任选地经一个或多个R35取代;
R35在每次出现时独立地为H、-NH2、C1-6烷基、卤基和-OR35a;并且
R35a为H或C1-6烷基;
或者,当Y为NR7时,R7和R3连同R7所连接的N原子一起可形成任选地经一个或多个R30取代的4元至12元杂环基;
R4、R5、R15、R16、R17和R18各自独立地选自H、C1-6烷基、卤基、-NHC(O)CH3、4元至6元碳环基或4元至6元杂环基,其中所述C1-6烷基任选地经一个或多个独立地选自卤基的取代基取代,并且其中所述杂环基和碳环基任选地经卤基、-CN、-OR4a、C1-C6烷基或=O取代(当所述碳环基或杂环基为非芳族时),或其中R15与R16合起来或R17与R18合起来为=NOH或=NHOCH3
R4a为H或任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基;
R6为H或任选地经一个或多个独立地选自卤基、-CN和-OR6a的取代基取代的C1-6烷基;
R6a为H或任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基;
R7为H或任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基;
R8为H、卤基、-CN、-OR8a或任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基;
R8a为H或任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基;
R9、R13和R14各自独立地选自H、C1-6烷基和C3-6环烷基,其中所述C1-6烷基和所述C3-6环烷基各自任选地经一个或多个独立地选自卤基、-CN、-OR9a和任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基的取代基取代;
R9a为H或任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基;
R11和R12各自独立地为H或C1-6烷基,或R11和R12连同其所连接的氮原子一起形成4元至7元单环杂环基,所述4元至7元单环杂环基任选地经一个或多个独立地选自C1-6烷基、卤基、-OH和C1-6烷氧基的取代基取代;
或R4、R5、R9、R13、R14、R15、R16、R17和R18中的任两者一起形成-C1-5亚烷基-,所述-C1-5亚烷基-任选地经一个或多个独立地选自卤基、-ORa、-N(Ra)2和C1-6烷基的取代基取代;
或R4和R15与其介入碳原子合起来形成苯基或6元杂芳基;并且
Ra在每次出现时独立地为H或任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基;
R19a和R19b各自独立地为H或任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基,或R19a和R19b连同其所连接的碳原子一起形成-C(=O);或
一个R20基团和一个R30基团合起来形成-O-CH2CH2-O-或-O-CH2CH2-NH-;并且
n1为0、1或2;并且
n2为0、1或2,其限制条件在于当X为NR6或O时,n1和n2不能为0。
2.如权利要求1所述的化合物,所述化合物由式(I')表示:
Figure FDA0003923073820000051
或其药学上可接受的盐,其中:
W为Y-R3、-OC(=O)NR11R12或-N(C=O)NR11R12
V为-C(=O)-、-S(=O)2-或CR13R14
X为CR4R5、NR6或O;
Y为NR7或O;
Z为CR8或N;
R1为卤基、CN、-OR1a、-C≡CH或C1-6烷基,其中所述C1-6烷基任选地经一个或多个R10取代;
R1a为H或任选地经一个或多个R10取代的C1-6烷基;
R10在每次出现时独立地选自卤基、CN和OR10a
R10a在每次出现时独立地选自H和C1-6烷基;
R2为3元至12元碳环基或3元至12元杂环基,其中由R2表示的所述3元至12元碳环基和所述3元至12元杂环基任选地经一个或多个R20取代;
R20在每次出现时独立地选自H、卤基、CN、氧代、-C(O)R20a、-C(O)2R20a、-C(O)NR20a、-N(R20a)2、-N(R20a)C(O)R20a、-N(R20a)C(O)2R20a、-N(R20a)C(O)N(R20a)2、-N(R20a)S(O)2R20a、-OR20a、-OC(O)R20a、-OC(O)N(R20a)2、-SR20a、-S(O)2R20a、-S(O)N(R20a) 2、-S(O)2N(R20a)2、C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元单环杂环基,其中由R20表示的所述C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元单环杂环基各自任选地经一个或多个R25取代;
R20a在每次出现时独立地选自H、C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元单环杂环基,其中由R20a表示的所述C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元单环杂环基各自任选地经一个或多个R25取代,或两个R20a连同其所连接的氮原子一起形成任选地经一个或多个R25取代的4元至7元杂环基;
R25在每次出现时独立地为H、C1-6烷基、卤基、-N(R25a)2、-OR25a、任选地经C1-6烷基、卤基、-N(R25a)2或-OR25a取代的苯基;并且
R25a为H或C1-6烷基;
R3为3元至12元碳环基或3元至12元杂环基,其中由R3表示的所述3元至12元碳环基和所述3元至12元杂环基任选地经一个或多个R30取代;
R30在每次出现时独立地选自H、卤基、氧代、-CN、-C(O)R30a、-C(O)2R30a、-C(O)NR30a、-N(R30a)2、-N(R30a)C(O)R30a、-N(R30a)C(O)2R30a、-N(R30a)C(O)N(R30a)2、-N(R30a)S(O)2R30a、-OR30a、-OC(O)R30a、-OC(O)N(R30a)2、-SR30a、-S(O)2R30a、-S(O)N(R30a) 2、-S(O)2N(R30a)2、C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元单环杂环基,其中由R30表示的所述C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元单环杂环基各自任选地经一个或多个R35取代;
R30a在每次出现时独立地选自H、C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元单环杂环基,其中由R30a表示的所述C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元单环杂环基各自任选地经一个或多个R35取代;
R35在每次出现时独立地为H、C1-6烷基、卤基和-OR35a;并且
R35a为H或C1-6烷基;
或者,当Y为NR7时,R7和R3连同R7所连接的N原子一起可形成任选地经一个或多个R30取代的4元至12元杂环基;
R4、R5、R15、R16、R17和R18各自独立地选自H、C1-6烷基、卤基、-CN和-OR4a,其中所述C1-6烷基任选地经一个或多个独立地选自卤基、CN和-OR4a的取代基取代;
R4a为H或任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基;
R6为H或C1-6烷基,其中所述C1-6烷基任选地经一个或多个独立地选自卤基、CN和-OR4a的取代基取代;
R6a为H或任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基;
R7为H或任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基;
R8为H、卤基、CN、-OR8a或任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基;
R8a为H或任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基;
R9、R13和R14各自独立地选自H、C1-6烷基和C3-6环烷基,其中所述C1-6烷基和所述C3-6环烷基各自任选地经一个或多个独立地选自卤基、CN、-OR9a和任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基的取代基取代;
R9a为H或任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基;
R11和R12各自独立地为H或C1-6烷基,或R11和R12连同其所连接的氮原子一起形成4元至7元单环杂环基,所述4元至7元单环杂环基任选地经一个或多个独立地选自C1-6烷基、卤基、OH和C1-6烷氧基的取代基取代;
或R4、R5、R9、R13、R14、R15、R16、R17和R18中的任两者一起形成-C1-5亚烷基-,所述-C1-5亚烷基-任选地经一个或多个独立地选自卤基、-ORa、-N(Ra)2和C1-6烷基的取代基取代;
Ra在每次出现时独立地为H或任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基;
R19a和R19b各自独立地为H或任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基,或R19a和R19b连同其所连接的碳原子一起形成-C(=O)-;
n1为0、1或2;并且
n2为0、1或2,其限制条件在于当X为NR6或O时,n1和n2不能为0。
3.如权利要求1或权利要求2所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述化合物由式(Ia)或(Ib)表示:
Figure FDA0003923073820000081
或其药学上可接受的盐,其中:
X为CR4R5、NR6或O;
Y为NR7或O;
Z为CR8或N;
R1为卤基、CN、-OR1a、-C≡CH或C1-6烷基,其中所述C1-6烷基任选地经一个或多个R10取代;
R1a为H或任选地经一个或多个R10取代的C1-6烷基;
R10在每次出现时独立地选自卤基、CN和OR10a
R10a在每次出现时独立地选自H和C1-6烷基;
R2为3元至12元碳环基或3元至12元杂环基,其中由R2表示的所述3元至12元碳环基和所述3元至12元杂环基任选地经一个或多个R20取代;
R20在每次出现时独立地选自H、卤基、CN、氧代、-C(O)R20a、-C(O)2R20a、-C(O)NR20a、-N(R20a)2、-N(R20a)C(O)R20a、-N(R20a)C(O)2R20a、-N(R20a)C(O)N(R20a)2、--N(R20a)S(O)2R20a、-OR20a、-OC(O)R20a、-OC(O)N(R20a)2、-SR20a、-S(O)2R20a、-S(O)N(R20a) 2、-S(O)2N(R20a)2、C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元单环杂环基,其中由R20表示的所述C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元单环杂环基各自任选地经一个或多个R25取代;
R20a在每次出现时独立地选自H、C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元单环杂环基,其中由R20a表示的所述C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元单环杂环基各自任选地经一个或多个R25取代,或两个R20a连同其所连接的氮原子一起形成任选地经一个或多个R25取代的4元至7元杂环基;
R25在每次出现时独立地为H、C1-6烷基、卤基、-N(R25a)2、-OR25a、任选地经C1-6烷基、卤基、-N(R25a)2或-OR25a取代的苯基;并且
R25a为H或C1-6烷基;
R3为3元至12元碳环基或3元至12元杂环基,其中由R3表示的所述3元至12元碳环基和所述3元至12元杂环基任选地经一个或多个R30取代;
R30在每次出现时独立地选自H、卤基、氧代、-CN、-C(O)R30a、-C(O)2R30a、-C(O)NR30a、-N(R30a)2、-N(R30a)C(O)R30a、-N(R30a)C(O)2R30a、-N(R30a)C(O)N(R30a)2、-N(R30a)S(O)2R30a、-OR30a、-OC(O)R30a、-OC(O)N(R30a)2、-SR30a、-S(O)2R30a、-S(O)N(R30a) 2、-S(O)2N(R30a)2、C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元单环杂环基,其中由R30表示的所述C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元单环杂环基各自任选地经一个或多个R35取代;
R30a在每次出现时独立地选自H、C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元单环杂环基,其中由R30a表示的所述C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元单环杂环基各自任选地经一个或多个R35取代;
R35在每次出现时独立地为H、C1-6烷基、卤基和-OR35a;并且
R35a为H或C1-6烷基;
或者,当Y为NR7时,R7和R3连同R7所连接的N原子一起可形成任选地经一个或多个R30取代的4元至12元杂环基;
R4和R5各自独立地选自H、C1-6烷基、卤基、-CN和-OR4a,其中所述C1-6烷基任选地经一个或多个独立地选自卤基、CN和-OR4a的取代基取代;
R4a为H或任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基;
R6为H或任选地经一个或多个独立地选自卤基、CN和-OR6a的取代基取代的C1-6烷基;
R6a为H或任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基;
R7为H或任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基;
R8为H、卤基、CN、-OR8a或任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基;
R8a为H或任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基;
n1为0、1或2;并且
n2为0、1或2,
或对于式(Ia),R4、R5、R9、R13、R14、R15、R16、R17和R18中的任两者一起形成-C1-5亚烷基-,所述-C1-5亚烷基-任选地经一个或多个独立地选自卤基、-ORa、-N(Ra)2和C1-6烷基的取代基取代;其中Ra在每次出现时独立地为H或任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基。
4.如权利要求1-3中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中X为CH2
5.如权利要求1-4中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中n1和n2两者为0;n1和n2两者为1;或n1为1并且n2为0。
6.如权利要求1、2或3所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中X为O;并且n1和n2两者为1。
7.如权利要求1或2所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述化合物由式(IIa)或(IIb)表示:
Figure FDA0003923073820000121
或其药学上可接受的盐。
8.如权利要求6所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述化合物由式(II-1a)或(II-1b)表示:
Figure FDA0003923073820000122
或其药学上可接受的盐。
9.如权利要求1-8中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中Y为NH或O。
10.如权利要求1-7中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述化合物由式(IIIa)或(IIIb)表示:
Figure FDA0003923073820000131
或其药学上可接受的盐。
11.如权利要求10所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述化合物由式(III-1a)或(III-1b)表示:
Figure FDA0003923073820000132
或其药学上可接受的盐。
12.如权利要求10所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述化合物由式(IVa)或(IVb)表示:
Figure FDA0003923073820000133
或其药学上可接受的盐。
13.如权利要求12所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述化合物由式(IV-1a)或(IV-1b)表示:
Figure FDA0003923073820000141
或其药学上可接受的盐。
14.如权利要求1-13中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R8为H、卤基或OR8a
15.如权利要求14所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R8为H、F、Cl或-OCH3
16.如权利要求14所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R8为H。
17.如权利要求1-16中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R1为Cl、Br、CN、-OR9或C1-6烷基。
18.如权利要求17所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R1为Cl、CN或CH3
19.如权利要求1-7、9、10、12、14和15中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述化合物由式(IVAa)、(IVBa)、(IVCa)、(IVDa)、(IVAb)、(IVBb)、(IVCb)或(IVDb)表示:
Figure FDA0003923073820000151
或其药学上可接受的盐,其中R8为H或F。
20.如权利要求19所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述化合物由式(IVA-1a)、(IVB-1a)、(IVC-1a)、(IVD-1a)、(IVA-1b)、(IVB-1b)、(IVC-1b)或(IVD-1b)表示:
Figure FDA0003923073820000161
或其药学上可接受的盐。
21.如权利要求1-20中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R3为苯基、5元或6元单环杂芳基或9元或10元双环杂芳基,其中由R3表示的所述苯基、5元或6元单环杂芳基和9元或10元双环杂芳基各自任选地经一至三个R30取代。
22.如权利要求21所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R3为苯基、吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、哒嗪基、1H-吡咯并[2,3-c]吡啶基或1H-咪唑并[4,5-c]吡啶基,其中每一者任选地经一至三个R30取代。
23.如权利要求1-22中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R30在每次出现时为H、卤基、CN、-C(O)NR30a、-N(R30a)2、-N(R30a)C(O)R30a、-N(R30a)S(O)2R30a、-OR30a和C1-6烷基,其中所述C1-6烷基任选地经一至三个R35取代;
R30a在每次出现时独立地为H或任选地经一至三个R35取代的C1-6烷基;
R35在每次出现时独立地为H、卤基和-OR35a;并且
R35a为H或C1-3烷基。
24.如权利要求23所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R30在每次出现时为H、卤基、CN、-OR30a和任选地经一至三个卤基取代的C1-6烷基;并且
R30a为H或任选地经一至三个卤基取代的C1-6烷基。
25.如权利要求24所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R30在每次出现时为H、F、Cl、Br、CN、-OCH3、-CH3、-CH2CH3或-CF3
26.如权利要求22所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R3选自3-氯吡啶-2-基、3-甲基吡啶-2-基、3-溴吡啶-2-基、3-氰基吡啶-2-基、3-乙基吡啶-2-基、3-氟吡啶-2-基、3-甲氧基吡啶-2-基、3-三氟甲基吡啶-2-基、吡啶-2-基、1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-5-基、1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-7-基、1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-6-基、1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-4-基、2,6-二甲基苯基、苯基、哒嗪-3-基(pyradzin-3-yl)、嘧啶-4-基、5-甲基吡啶-2-基、4-甲基吡啶-2-基、嘧啶-2-基、吡嗪-2-基、哒嗪-3-基和吡啶-3-基。
27.如权利要求1-7、9、10、12、14和15中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述化合物由式(Va)或(Vb)表示:
Figure FDA0003923073820000181
或其药学上可接受的盐,其中m为0、1或2。
28.如权利要求27所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述化合物由式(V-1a)或(V-1b)表示:
Figure FDA0003923073820000182
或其药学上可接受的盐。
29.如权利要求27所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述化合物由式(VAa)、(VBa)、(VCa)、(VDa)、(VAb)、(VBb)、(VCb)或(VDb)表示:
Figure FDA0003923073820000191
或其药学上可接受的盐。
30.如权利要求29所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述化合物由式(VA-1a)、(VB-1a)、(VC-1a)、(VD-1a)、(VA-1b)、(VB-1b)、(VC-1b)或(VD-1b)表示:
Figure FDA0003923073820000201
或其药学上可接受的盐,其中R8为H或F。
31.如权利要求27所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述化合物由式(VIa)或(VIb)表示:
Figure FDA0003923073820000211
或其药学上可接受的盐,其中R30为H、卤基、CN、-OR30a和任选地经一至三个卤基取代的C1-6烷基;并且R30a为H或任选地经一至三个卤基取代的C1-6烷基。
32.如权利要求31所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述化合物由式(VI-1a)或(VI-1b)表示:
Figure FDA0003923073820000212
或其药学上可接受的盐。
33.如权利要求31所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述化合物由式(VIAa)、(VIBa)、(VICa)、(VIDa)、(VIAb)、(VIBb)、(VICb)或(VIDb)表示:
Figure FDA0003923073820000221
或其药学上可接受的盐。
34.如权利要求33所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述化合物由式(VIA-1a)、(VIB-1a)、(VIC-1a)、(VID-1a)、(VIA-1b)、(VIB-1b)、(VIC-1b)或(VID-1b)表示:
Figure FDA0003923073820000231
或其药学上可接受的盐。
35.如权利要求27-34中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R30在每次出现时独立地为H、F、Cl、Br、CN、-CH3、-CH2CH3、-OCH3或-CF3
36.如权利要求1-35中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R2为C3-8环烷基、苯基、4元至6元饱和单环杂环基、7元至10元饱和或部分饱和双环杂环基、5元或6元单环杂芳基或9元至10元双环杂芳基,其中每一者任选地经一至三个R20取代;
R20在每次出现时独立地选自H、卤基、-CN、氧代、-C(O)R20a、-C(O)NR20a、-N(R20a)2、-N(R20a)C(O)R20a、-N(R20a)S(O)2R20a、-OR20a、C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元饱和单环杂环基,其中由R20表示的所述C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元饱和单环杂环基各自任选地经一或两个R25取代;
R20a在每次出现时独立地选自H和C1-6烷基,其中由R20a表示的所述C1-6烷基任选地经一个或多个R25取代;
R25在每次出现时独立地为H、C1-6烷基、卤基、-N(R25a)2、-OR25a、任选地经C1-6烷基、卤基、-N(R25a)2或-OR25a取代的苯基;并且
R25a为H或C1-6烷基。
37.如权利要求36所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R2为苯基或含有1至3个氮原子的6元单环杂芳基,其中所述苯基和所述6元单环杂芳基各自任选地经一至三个R20取代。
38.如权利要求36所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R2选自环丙基、环丁基、环戊基、环己基、苯基、氮杂环丁烷基、吡咯烷基、哌啶基、2-氮杂螺[3.3]庚基、1H-吲哚基、2,3-二氢-1H-苯并[d]咪唑基、1H-苯并[d]咪唑基、1,3,4-噻二唑基、吲哚啉基、四氢-2H-吡喃基、吡啶基、哒嗪基、吡嗪基、氧杂环丁烷基、四氢-2H-吡喃基、1H-苯并[d]咪唑基、1H-吲唑基、异色满基和1,3-二氢异苯并呋喃基,其中每一者任选地经一或两个R20取代。
39.如权利要求38所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R2选自苯基、吡啶基和吡嗪基,其中每一者任选地经一或两个R20取代。
40.如权利要求37所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R2由下式表示:
Figure FDA0003923073820000251
其中R21为H、卤基、-CN、-C(O)R20a、-C(O)NR20a、-N(R20a)2、-N(R20a)C(O)R20a、-N(R20a)S(O)2R20a、-OR21a、C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元饱和单环杂环基,其中由R21表示的所述C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元饱和单环杂环基各自任选地经一或两个R25取代;
R21a为H或C1-6烷基,其中由R21a表示的所述C1-6烷基任选地经一个或多个R25取代;
R25在每次出现时独立地为C1-6烷基、卤基、-N(R25a)2、-OR25a、任选地经C1-6烷基、卤基、-N(R25a)2或-OR25a取代的苯基;
R25a为H或C1-6烷基;并且
r为0、1或2。
41.如权利要求40所述的化合物,其中R21a为任选地经一个或多个R25取代的C1-6烷基。
42.如权利要求40所述的化合物,其中R21为H、-F、-Cl、-CH3、-CH2OH、-OCH3、-OH、-OCH2CH2OCH3、-OCH2CH2OH、-OCH2CH2N(CH3)2、(4-甲氧基苯甲基)氧基、-NHCH2CH2OMe、-NHSO2CH3或-NHC(O)CH3
43.如权利要求36-42中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R20在每次出现时独立地选自-F、-OH、-Cl、-CH3、-CH2CH3、-CH2OH、-CH2OCH3、-CH2CH2OCH3、-CH2CH2OH、-CH2CH2N(CH3)2、-CF3、-OCH3、-OCH2CH2OCH3、-OCH2CH2OH、-OCH2CH2N(CH3)2、(4-甲氧基苯甲基)氧基、氧代、-C(O)CH3、-NH2、-NHCH3、-N(CH3)2、-N(CH3)(CH2CH2OCH3)、-NHCH2CH2OMe、-NHCH2CH2NHCH3、-NHCH2CH2N(CH3)2、-NHSO2CH3、-NHSO2CH2CH3、-NHC(O)CH3、氮杂环丁烷-基、3-氨基氮杂环丁烷-1-基、哌啶-1-基、吗啉基和吡咯烷-1-基。
44.如权利要求1所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述化合物由式(VIIA-1a)、(VIIB-1a)、(VIIC-1a)、(VIID-1a)、(VIIA-1b)、(VIIB-1b)、(VIIC-1b)或(VIID-1b)表示:
Figure FDA0003923073820000261
/>
Figure FDA0003923073820000271
或其药学上可接受的盐,其中:
R30为H、卤基、CN、-OR30a和任选地经一至三个卤基取代的C1-6烷基;并且R30a为H或任选地经一至三个卤基取代的C1-6烷基;并且
R2为苯基或含有1至3个氮原子的6元单环杂芳基,其中所述苯基和所述6元单环杂芳基各自任选地经一至三个R20取代;
R20在每次出现时独立地选自卤基和-N(R20a)2;并且
R20a在每次出现时独立地选自H和C1-3烷基,或两个R20a连同其所连接的氮原子一起形成任选地经一个或多个R25取代的4元至7元杂环基;
R25在每次出现时独立地为H、C1-6烷基、卤基、-N(R25a)2或-OR25a;并且R25a为H或C1-6烷基。
45.如权利要求44所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中:
R30为卤基或C1-3烷基;
R2为苯基、吡啶基或吡嗪基,其中每一者任选地经-N(R20a)2取代;并且
R20a在每次出现时为H或甲基,或两个R20a连同其所连接的氮原子一起形成任选地经一个R25取代的4元至6元杂环基;
R25为-N(R25a)2;并且
R25a为H或Me。
46.如权利要求45所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R30为Cl或甲基;并且R2为苯基、吡啶-3-基或吡嗪-2-基,其中每一者任选地经-NH2、氮杂环丁烷-1-基、3-氨基氮杂环丁烷-1-基或3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基取代。
47.如权利要求7-46中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中对于式(IIa)、(II-1a)、(IIIa)、(III-1a)、(IVa)、(IV-1a)、(IVAa)、(IVBa)、(IVCa)、(IVDa)、(IVA-1a)、(IVB-1a)、(IVC-1a)、(IVD-1a)、(Va)、(V-1a)、(VAa)、(VBa)、(VCa)、(VDa)、(VA-1a)、(VB-1a)、(VC-1a)、(VD-1a)、(VIa)、(VI-1a)、(VIAa)、(VIBa)、(VICa)、(VIDa)、(VIA-1a)、(VIB-1a)、(VIC-1a)、(VID-1a)、(VIIA-1a)、(VIIB-1a)、(VIIC-1a)或(VIID-1a),R4、R5、R13、R14、R17和R18皆为H,并且R9为C1-6烷基或C3-6环烷基,其中所述C1-6烷基和所述C3-6环烷基各自任选地经一个或多个独立地选自卤基、CN、-OR9a和任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基的取代基取代;其中R9a为H或任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基。
48.如权利要求47所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R9为任选地经一至三个卤基取代的C1-6烷基。
49.如权利要求47所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R9为-CH3
50.如权利要求7-46中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中对于式(IIa)、(II-1a)、(IIIa)、(III-1a)、(IVa)、(IV-1a)、(IVAa)、(IVBa)、(IVCa)、(IVDa)、(IVA-1a)、(IVB-1a)、(IVC-1a)、(IVD-1a)、(Va)、(V-1a)、(VAa)、(VBa)、(VCa)、(VDa)、(VA-1a)、(VB-1a)、(VC-1a)、(VD-1a)、(VIa)、(VI-1a)、(VIAa)、(VIBa)、(VICa)、(VIDa)、(VIA-1a)、(VIB-1a)、(VIC-1a)、(VID-1a)、(VIIA-1a)、(VIIB-1a)、(VIIC-1a)或(VIID-1a),R5、R9、R13、R14、R17和R18皆为H,并且R4为C1-6烷基、卤基、-CN或-OR4a,其中所述C1-6烷基任选地经一个或多个独立地选自卤基、CN和-OR4a的取代基取代;并且R4a为H或任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基。
51.如权利要求50所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R4为卤基。
52.如权利要求50所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R4为F。
53.如权利要求7-46中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中对于式(IIa)、(II-1a)、(IIIa)、(III-1a)、(IVa)、(IV-1a)、(IVAa)、(IVBa)、(IVCa)、(IVDa)、(IVA-1a)、(IVB-1a)、(IVC-1a)、(IVD-1a)、(Va)、(V-1a)、(VAa)、(VBa)、(VCa)、(VDa)、(VA-1a)、(VB-1a)、(VC-1a)、(VD-1a)、(VIa)、(VI-1a)、(VIAa)、(VIBa)、(VICa)、(VIDa)、(VIA-1a)、(VIB-1a)、(VIC-1a)、(VID-1a)、(VIIA-1a)、(VIIB-1a)、(VIIC-1a)或(VIID-1a),R4、R5、R14、R17和R18皆为H,并且R13和R9一起形成-C1-3亚烷基-,所述-C1-3亚烷基-任选地经一个或多个独立地选自卤基、-ORa、-N(Ra)2和C1-6烷基的取代基取代;其中Ra在每次出现时独立地为H或任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基。
54.如权利要求53所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R13与R9一起形成-CH2CH2-,所述-CH2CH2-任选地经一或两个独立地选自卤基、-ORa、-N(Ra)2和C1-3烷基的取代基取代;其中Ra在每次出现时独立地为H或任选地经一个或多个卤基取代的C1-3烷基。
55.如权利要求53所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R13与R9一起形成-CH2CH2-。
56.一种药物组合物,所述药物组合物包含如权利要求1-55或62-65中任一项所述的化合物和药学上可接受的载体。
57.一种治疗受试者的疾病或病症的方法,所述方法包括向有需要的受试者施用治疗有效量的如权利要求1-55或62-65中任一项所述的化合物,其中所述疾病或病症是由RNA修饰蛋白Z11介导的。
58.如权利要求57所述的方法,其中所述疾病或病症的特征在于与参考水平相比,Lin28A或Lin28B水平增加。
59.如权利要求57所述的方法,其中所述疾病或病症的特征在于与参考水平相比,let7miRNA水平降低。
60.如权利要求57所述的方法,其中所述let 7miRNA水平降低是由Z11介导的。
61.如权利要求57-60中任一项所述的方法,其中所述方法用于治疗癌症。
62.如权利要求1所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述化合物由式(IV-1a)表示:
Figure FDA0003923073820000311
其中:
R1为F、Cl、CN或CH3
R2选自环丙基、环丁基、环戊基、环己基、苯基、氮杂环丁烷基、吡咯烷基、哌啶基、2-氮杂螺[3.3]庚基、1H-吲哚基、2,3-二氢-1H-苯并[d]咪唑基、1H-苯并[d]咪唑基、1,3,4-噻二唑基、吲哚啉基、四氢-2H-吡喃基、吡啶基、嘧啶基、哒嗪基、吡嗪基、氧杂环丁烷基、四氢-2H-吡喃基、1H-苯并[d]咪唑基、1H-吲唑基、异色满基和1,3-二氢异苯并呋喃基,其中每一者任选地经一或两个R20取代;
R20在每次出现时独立地选自H、卤基、-CN、氧代、-C(O)R20a、-C(O)NR20a、-N(R20a)2、-N(R20a)C(O)R20a、-N(R20a)S(O)2R20a、-OR20a、C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元饱和单环杂环基,其中由R20表示的所述C1-6烷基、C3-8环烷基和4元至7元饱和单环杂环基各自任选地经一或两个R25取代;
R20a在每次出现时独立地选自H和C1-6烷基,其中由R20a表示的所述C1-6烷基任选地经一个或多个R25取代;
R25在每次出现时独立地为H、C1-6烷基、卤基、-N(R25a)2、-OR25a、任选地经C1-6烷基、卤基、-N(R25a)2或-OR25a取代的苯基;并且
R25a为H、C1-6烷基或经-OCH3取代的C1-6烷基;
R3为苯基、吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、哒嗪基、1H-吡咯并[2,3-c]吡啶基、1H-咪唑并[4,5-c]吡啶基、1H-吡咯并[2,3-b]吡啶基、1H-咪唑并[4,5-b]吡啶基、1H-吡咯并[3,2-b]吡啶基、3H-咪唑并[4,5-b]吡啶基或1H-咪唑并[4,5-c]吡啶基,其中每一者任选地经一至三个R30取代;
R30在每次出现时为H、卤基、CN、-C(O)NR30a、-N(R30a)2、-N(R30a)C(O)R30a、-N(R30a)S(O)2R30a、-OR30a和C1-6烷基,其中所述C1-6烷基任选地经一至三个R35取代;
R30a在每次出现时独立地为H、任选地经一至三个R35取代的C1-6烷基或C3-6环烷基;
R35在每次出现时独立地为H、卤基或-OR35a;并且
R35a为H或C1-3烷基;
R4为H、卤基、-CN、-OR4a、C1-6烷基、吡啶基或吡唑基,其中所述C1-6烷基任选地经一个或多个独立地选自卤基、CN和-OR4a的取代基取代;其中所述吡啶基或吡唑基任选地经-OH、-C1-C6烷基或-O-C1-C6烷基取代;并且
R4a为H、任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基或C3-C6环烷基;
R5为H或卤基,或R4和R5合起来为=NOH或=NHOCH3,或R4和R5与其所连接的碳合起来形成C3-C6环烷基,或R5和R13与其介入原子合起来形成环丙基;并且;
R8、R13和R14各自为H;
R9为H、C1-C6烷氧基或C1-C6烷基,或R9与R13一起形成-C1-3亚烷基-,所述-C1-3亚烷基-任选地经一个或多个独立地选自卤基、-ORa、-N(Ra)2和C1-6烷基的取代基取代;其中Ra在每次出现时独立地为H或任选地经一个或多个卤基取代的C1-6烷基;
R17为H、卤基或C1-6烷基;并且
R18为H、-OH、-O(C1-C6烷基)或C1-6烷基,或R17与R18合起来为=NOH或=NHOCH3
63.如权利要求1所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述化合物由式(IV-1a)表示:
Figure FDA0003923073820000331
其中:
R1为F、Cl、CN或CH3
R2选自环丙基、环丁基、环戊基、环己基、苯基、氮杂环丁烷基、吡咯烷基、哌啶基、2-氮杂螺[3.3]庚基、1H-吲哚基、2,3-二氢-1H-苯并[d]咪唑基、1H-苯并[d]咪唑基、1,3,4-噻二唑基、吲哚啉基、四氢-2H-吡喃基、吡啶基、嘧啶基、哒嗪基、吡嗪基、氧杂环丁烷基、四氢-2H-吡喃基、1H-苯并[d]咪唑基、1H-吲唑基、异色满基和1,3-二氢异苯并呋喃基,其中每一者任选地经一或两个R20取代;
R20在每次出现时独立地选自-F、-OH、-Cl、-CH3、-CH2CH3、-CH2OH、-CH2OCH3、-CH2CH2OCH3、-CH2CH2OH、-CH2CH2N(CH3)2、-CF3、-OCH3、-OCH2CH2OCH3、-OCH2CH2OH、-OCH2CH2N(CH3)2、(4-甲氧基苯甲基)氧基、氧代、-C(O)CH3、-NH2、-NHCH3、-N(CH3)2、-N(CH3)(CH2CH2OCH3)、-NHCH2CH2OMe、-NHCH2CH2NHCH3、-NHCH2CH2N(CH3)2、-NHSO2CH3、-NHSO2CH2CH3、-NHC(O)CH3、氮杂环丁烷-基、3-氨基氮杂环丁烷-1-基、哌啶-1-基、吗啉基、吡咯烷-1-基;和3-(二甲氨基)氮杂环丁烷-1-基或
Figure FDA0003923073820000341
R3为苯基、吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、哒嗪基、1H-吡咯并[2,3-c]吡啶基、1H-吡咯并[3,2-c]吡啶基或1H-咪唑并[4,5-c]吡啶基、1H-咪唑并[4,5-c]吡啶基、1H-吡咯并[2,3-b]吡啶基、1H-咪唑并[4,5-b]吡啶基;1H-吡咯并[3,2-b]吡啶基或3H-咪唑并[4,5-b]吡啶基,其中每一者任选地经一至三个R30取代;
R30在每次出现时为H、F、Cl、Br、CN、-OCH3、-O(环丙基)、-NH2、-NH(CH3)2、-CH3、-CH2CH3或-CF3
R4为H、卤基、-CN、OR4a、C1-6烷基、吡啶基或吡唑基,其中所述C1-6烷基任选地经一个或多个独立地选自卤基、CN和-OR4a的取代基取代;其中所述吡啶基或吡唑基任选地经-OH、-CH3或-OCH3取代;并且
R4a为H、-CH3、环丙基或任选地经一个或多个卤基或环丙基取代的-CH2CH3
R5为H或F,或R4和R5合起来为=NHOCH3,或R4和R5与其所连接的碳合起来形成环丙基,或R5和R13与其介入原子合起来形成环丙基;并且
R8、R13和R14皆为H;
R9为H或-CH3,或R9和R13一起形成-C2亚烷基-;
R17为H、F或-CH3;并且
R18为H、-OH、-OCH3或-CH3,或R17与R18合起来为=NHOCH3
64.如权利要求1所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述化合物由式(IV-1a)表示:
Figure FDA0003923073820000351
其中:
R1为F或Cl;
R2选自吡啶基、嘧啶基和哒嗪基,其中每一者经R20取代;
R20在每次出现时独立地选自-NH2、-NHCH3、N(CH3)2和4元至7元饱和单环杂环基,其中由R20表示的所述4元至7元饱和单环杂环基经-N(R25a)2取代;
R25a为H、C1-6烷基或经-OCH3取代的C1-6烷基;
R3为吡啶基、1H-咪唑并[4,5-c]吡啶基、1H-吡咯并[2,3-b]吡啶基、1H-吡咯并[3,2-b]吡啶基或3H-咪唑并[4,5-b]吡啶基,其中每一者任选地经一至三个R30取代;
R30在每次出现时为H、卤基、C1-C6烷基、-N(R30a)2和-OR30a
R30a在每次出现时独立地为H、C1-6烷基或C3-6环烷基;
R4为H、卤基、-OR4a、C1-6烷基、吡啶基或吡唑基,其中所述吡啶基或吡唑基任选地经-OH、-C1-C6烷基或-O-(C1-C6烷基)取代;
R4a为H、C1-6烷基或C3-C6环烷基;
R5为H或卤基,或R4和R5合起来为=NOH或=NHOCH3,或R4和R5与其所连接的碳合起来形成C3-C6环烷基,或R5和R13与其介入原子合起来形成环丙基;并且;
R8、R13和R14各自为H;
R9为H或C1-C6烷基;
R17为H、卤基、C1-C6烷氧基或C1-6烷基;
R18为H或C1-6烷基。
65.如权利要求1所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述化合物由式(IV-1a)表示:
Figure FDA0003923073820000361
其中:
R1为F或Cl:
Figure FDA0003923073820000362
R3为吡啶基、1H-咪唑并[4,5-c]吡啶基、1H-吡咯并[2,3-b]吡啶基、1H-吡咯并[3,2-b]吡啶基或3H-咪唑并[4,5-b]吡啶基,其中每一者任选地经一至三个R30取代;
R30在每次出现时为H、Cl、CH3、-OCH3、-O(环丙基)、-NH2、-NHCH3或-N(CH3)2
R4为H、F、OH、-OCH3、-O-(环丙基)、-C1-C3烷基、吡啶基或吡唑基,其中所述吡啶基或吡唑基任选地经-OH、-CH3、-OCH3或-O(环丙基)取代;
R5为H或F,或R4和R5合起来为=NHOCH3,或R4和R5与其所连接的碳合起来形成环丙基,或R5和R13与其介入原子合起来形成环丙基;并且
R8、R13和R14各自为H;
R9为H或-CH3
R17为H、F、-OCH3或-CH3;并且
R18为H或-CH3
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