CN116121250A - 一种抗Ⅰ型单纯疱疹病毒的重组siRNAs及其应用 - Google Patents

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Abstract

本发明公开了一种抗Ⅰ型单纯疱疹病毒的重组siRNAs,所述重组siRNAs的序列为SEQ ID NO:1至SEQ ID NO:10所示序列中的一种,或者为与SEQ ID NO:1至SEQ ID NO:10所示序列中的一种相似度达90%以上的序列。另外,本发明还公开了该重组siRNAs的应用。本发明的重组siRNAs具有很好的生物学活性,并且能够在体外显著降低Ⅰ型单纯疱疹病毒的滴度,在体内显著降低皮肤表面病毒载量,提高动物存活率,且具有产量高、成本低、功能性好等优点。

Description

一种抗Ⅰ型单纯疱疹病毒的重组siRNAs及其应用
技术领域
本发明属于生物医学技术领域,具体涉及一种抗Ⅰ型单纯疱疹病毒的重组siRNAs及其应用。
背景技术
Ⅰ型单纯疱疹病毒(Herpes Simplex Virus,HSV1)是一种传染率极高的人α亚科-疱疹病毒。感染HSV1主要导致口唇疱疹,在少数免疫缺陷患者中可导致角膜炎、脑炎等并发症,人群普遍易感(成年人血清阳性率高达85%以上)。该病毒主要通过口对口接触传播,绝大多数人感染HSV1是在儿童时期感染上的,持续终生。当前,HSV1防治方法仍存在重大挑战,尚无特效治疗药物,也无疫苗上市。
RNAi(RNA interference)是指由RNA分子介导的基因抑制,RNAi在基因功能研究和疾病治疗方面都有广泛的应用,目前已有多种基于RNAi的药物获得FDA批准或进入临床试验。逐年增加的RNA类药物获批数量充分证明了RNA疗法的可行性,也说明了RNA疗法作为新一代治疗方案正在快速发展当中。
RNA类新药开发以及RNA的功能研究已经掣肘于RNA原料的获取。目前用于ncRNA研究的RNA试剂,主要采用化学或体外转录合成。这些合成方法生产的RNA,不仅价格昂贵,而且产率很低。因此,RNA疗法的开展,还需新兴生物技术的介入,以大大降低研究/医疗成本。利用重组tRNA支架在活细胞内生产表达小分子RNA已经应用于多个研究领域,取得了良好的发展。
发明内容
本发明所要解决的技术问题在于针对上述现有技术的不足,提供一种抗Ⅰ型单纯疱疹病毒的重组siRNAs。该重组siRNAs具有很好的生物学活性,并且能够在体内外显著降低HSV1的病毒滴度,在动物实验中能够显著降低皮肤表面病毒载量,延长动物存活率,且具有产量高、成本低、功能性好等优点。与传统的小分子药物相比,siRNA药物可以直接作用于病毒的基因组,利用碱基互补配对原则来干扰病毒mRNA表达,显著抑制病毒的复制,降低病毒载量。
为解决上述技术问题,本发明采用的技术方案是:一种抗Ⅰ型单纯疱疹病毒的重组siRNAs,其特征在于,所述重组siRNAs的序列为SEQ ID NO:1至SEQ ID NO:10所示序列中的一种,或者为与SEQ ID NO:1至SEQ ID NO:10所示序列中的一种相似度达90%以上的序列。
上述的一种抗Ⅰ型单纯疱疹病毒的重组siRNAs,其特征在于,所述重组siRNAs生产过程中以HSV1基因组不同位置为靶点,设计小干扰RNA,所述小干扰RNA的序列如SEQ IDNO:11至SEQ ID NO:20所示。
进一步地,本发明提供了一种上述重组siRNAs在制备具有体外/内降低Ⅰ型单纯疱疹病毒滴度,延长动物存活率的基因组试剂、前药、药物、原料药或药物组合中的应用。
更进一步地,本发明提供了一种上述重组siRNAs在制备具有抗Ⅰ型单纯疱疹病毒活性的试剂、前药、药物、原料药或药物组合中的应用。
本发明的抗Ⅰ型单纯疱疹病毒的重组siRNAs的生产方法,包括以下步骤:
步骤一、设计合成嵌合siRNAs序列的hsa-miR-34a前体引物;
步骤二、利用pBSKrnaSeph质粒在tRNA反密码子环处具有的酶切位点,将重组siRNAs的前体序列插入pBSKrnaSeph质粒中,构建表达载体;
步骤三、将嵌合目标序列的表达载体转化感受态大肠杆菌;
步骤四、大肠杆菌培养扩增后,提取菌内总RNA,以FPLC分离纯化目标重组siRNAs。
本发明以人角质形成细胞(HaCaT)、人视网膜色素上皮细胞(ARPE19)、人神经母细胞瘤细胞(SY5Y)为细胞模型,检测了重组siRNAs抗HSV1的活性,包括:
一、利用表达的重组siRNAs在HaCaT、ARPE19、SY5Y中进行转染,利用Stem loopqPCR技术检测重组siRNAs成熟体表达量;
二、将重组siRNAs在HaCaT、ARPE19、SY5Y中进行转染并感染HSV1病毒,利用qPCR技术检测重组siRNAs对靶基因的抑制情况;
三、将重组siRNAs在HaCaT、ARPE19、SY5Y中进行转染并感染HSV1病毒,利用空斑法检测重组siRNA抗病毒效果;
四、在疱疹性皮肤病动物感染模型中,将HSV1滴加在小鼠皮肤上后并连续5天在小鼠皮肤上涂抹柔性脂质体包裹的重组siRNAs,评价重组siRNAs对小鼠体内病毒载量和保护率的影响。
本发明与现有技术相比具有以下优点:
1、本发明利用新型tRNA支架表达的具有生物学活性的siRNAs相比于化学合成的siRNA,产量高,价格低廉,活性和安全性更高。
2、本发明的重组siRNAs具有很好的生物学活性,并且能够在体内外显著降低HSV1的病毒滴度,在动物实验中能够显著降低皮肤表面病毒载量,延长动物存活率,且具有产量高、成本低、功能性好等优点。与传统的小分子药物相比,siRNA药物可以直接作用于病毒的基因组,利用碱基互补配对原则来干扰病毒mRNA表达,显著抑制病毒的复制,降低病毒载量。
下面结合附图和实施例,对本发明的技术方案做进一步的详细描述。
附图说明
图1为本发明实施例1利用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测大肠杆菌中重组siRNA的表达;
图2为本发明实施例2利用Bio-Rad NGCTM Chromatography System纯化重组siRNA,以变性聚丙烯酰胺凝胶电泳鉴定所收集组分的纯度;
图3为本发明实施例3利用Stem loop qPCR技术检测在HaCaT、ARPE19、SY5Y后成熟体表达含量结果图;
图4为本发明实施例4利用qPCR技术在mRNA水平检测在HaCaT、ARPE19、SY5Y转染重组siRNA 24h后,感染HSV1病毒48h后,其对靶基因的抑制结果图;
图5为本发明实施例5利用空斑法检测HaCaT、ARPE19、SY5Y转染重组siRNA 24h后,感染HSV1病毒48h后,其对病毒滴度影响结果图;
图6为本发明实施例6利用免疫荧光实验技术检测转染重组siRNA 48h后,感染HSV1的ARPE19中的病变细胞数量,以评价重组siRNA的抗病毒效果的结果图;
图7为本发明实施例7利用qPCR技术检测HSV1感染小鼠经过重组SSA(重组r/si-UL8-1的阴性对照)、r/si-UL8-1和阿昔洛韦(ACV)治疗后,小鼠皮肤表面病毒载量的结果图;
图8为本发明实施例7观察HSV1感染后小鼠经过重组SSA、r/si-UL8-1治疗后,小鼠存活率的结果图。
具体实施方式
以下通过具体实施例来说明本发明的实施方式,除非另外说明,本发明中所公开的实验方法均采用本技术领域常规技术。
本发明的重组siRNAs的序列为SEQ ID NO:1至SEQ ID NO:10所示序列中的一种,或者为与SEQ ID NO:1至SEQ ID NO:10所示序列中的一种相似度达90%以上的序列。
本发明的小干扰RNA的序列如SEQ ID NO:11至SEQ ID NO:20所示。
本发明的重组siRNAs的生产方法包括:
步骤一、针对HSV1基因组设计了10对siRNA,合成嵌合siRNAs序列的hsa-miR-34a前体引物;
步骤二、利用pBSKrnaSeph质粒在tRNA反密码子环处具有的酶切位点,将重组siRNAs的前体序列插入pBSKrnaSeph质粒中,构建表达载体;所述tRNA支架的序列为基于与人丝氨酸tRNA序列设计,其tRNA部分为与人丝氨酸tRNA序列相似度达90%以上的序列,所述人丝氨酸tRNA序列如SEQ ID NO:21所示;重组siRNAs的前体序列为成熟序列部分被取代的hsa-miR-34a前体序列,所述hsa-miR-34a前体序列如SEQ ID NO:22所示;
步骤三、将嵌合目标序列的表达载体转化感受态大肠杆菌;
步骤四、大肠杆菌培养扩增后,提取菌内总RNA,以FPLC分离纯化目标重组siRNAs。
下面以重组r/si-UL8-1(SEQ ID NO:1)为例,具体介绍本发明重组siRNAs的生产方法:
实施例1:以pBSKrnaSeph/has-mir-34a表达载体构建重组siRNA表达质粒,表达重组siRNAs。
(1)根据重组r/si-UL8-1的有效序列,以及pBSKrnaSeph/has-mir-34a表达载体上的序列设计引物,命名为mir-34a/重组r/si-UL8-1,同时在引物的两端加上1-15nt载体插入位点两侧的同源序列。
(2)插入片段的合成
以表1中的两条引物互为模板,利用pBSKrnaSeph质粒在tRNA反密码子环处具有的酶切位点,将重组r/si-UL8-1的前体序列插入pBSKrnaSeph质粒中,构建表达载体;反应体系如表1所示,反应过程如表2所示:
表1聚合酶体外扩增链反应体系(50μL)
Figure BDA0003998297310000051
Figure BDA0003998297310000061
表2聚合酶体外扩增链反应过程
Figure BDA0003998297310000062
(3)pBSKrnaSeph/has-mir-34a载体的双酶切
用Eag I-HFTM,Sac II限制性内切酶对载体进行37℃酶切,反应体系如表3所示。
表3 50μL双酶切体系
Figure BDA0003998297310000063
(4)酶切质粒以及PCR片段的回收及纯化
将PCR产物和酶切后的质粒进行琼脂糖凝胶电泳鉴定后,使用OMEGA公司的胶回收试剂盒(OMEGA Gel Extraction Kit)进行回收纯化。在凝胶成像系统中用365nm的紫外光观察琼脂糖凝胶电泳后的DNA分离结果,用刀片小心切下带有目的DNA区带的凝胶,尽可能切下更少的胶,放入1.5mL的EP离心管中;称取凝胶的质量;按照1:1的体积比向装有琼脂糖凝胶的离心管中加入Binding Buffer结合缓冲液,并将混合物放于60℃-65℃水浴中7min,期间每隔两到三分钟振荡混合一次,直至凝胶完全融化;将融化后得到的溶液转移到DNAMini Column离心柱中,并将离心柱放入2mL的Collection Tube收集管中;10000rpm离心1min。每次离心的溶液体积最多为700μL,可将溶液分多次离心,直至全部离心完,并弃去收集管中的滤液,重复利用收集管;在离心柱中加入700μL的添加过无水乙醇的SPW WashBuffer。放于离心机中10000rpm,室温离心1min,重复此步骤一次;弃去滤液,将离心柱以13000rpm的转速室温下离心2min,以彻底除去纯化柱中的乙醇;将离心柱置于全新干净的离心管中。向离心柱中央悬空滴加30~100μL的Elution Buffer洗脱液,静置2min使DNA完全溶解在洗脱液中。放于离心机中以13000rpm的转速室温离心1min,回收管底的洗脱液。取少量洗脱液进行DNA凝胶电泳测定是否为目的产物,贮存于-20℃。
(5)插入片段与载体的连接
胶回收片段用
Figure BDA0003998297310000072
Ligation-Free Cloning System进行连接,反应体系如表4所示。
表4无缝连接反应体系(20μL)
Figure BDA0003998297310000071
混匀后,置于37℃孵育30min;转化大肠杆菌HST08感受态细菌;对克隆菌落进行氨苄青霉素抗性筛选。
(6)DNA测序鉴定重组r/si-UL8-1表达载体
挑取单克隆菌落,于含有氨苄的LB培养基中培养约8h。取100μL菌液,送擎科生物科技有限公司,用测序引物M13Fow-GTAAAACGACGGCCAGT,Rev-CAGGAAACAGCTATGAC进行DNA测序鉴定。
(7)200ng重组r/si-UL8-1表达质粒转化HST08感受态细菌后,加入5mL LB培养基在37℃,200rpm震荡培养过夜。菌液经10000g离心2min后,收集沉淀。于沉淀中加入180μL10mM醋酸镁-Tris·HCl溶液重悬,再加入200μL的饱和苯酚,室温振摇20-60min。10000g离心10min后收集水相,加入0.1倍水相体积的5M NaCl沉淀大分子杂质。上清液再加入2倍体积无水乙醇,10000g离心10min后,弃掉上清。吸水纸吸干残留乙醇,待RNA干燥后加入DEPC水溶解RNA,测定浓度,-80℃冰箱保存。
(8)变性聚丙烯酰胺凝胶电泳鉴定
将2μg RNA样品与2×RNA上样缓冲液混合,加入变性胶样品孔内。120~150V电泳40~60min后,放入含0.5μg/mL溴化乙锭的溶液中轻摇20~30min,于凝胶成像系统下观测,拍照保存。
图1是本实施例利用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测大肠杆菌中重组r/si-UL8-1的表达。转化重组r/si-UL8-1表达质粒的细菌总RNA在150-300nt之间多了一条带。结果表明,重组siRNA表达质粒在大肠杆菌中可以高表达重组r/si-UL8-1。
实施例2:FPLC纯化重组r/si-UL8-1
(1)采用Bio-Rad NGCTM Chromatography System,以离子交换柱(ENrichTM Q10×100Column)纯化重组r/si-UL8-1。
流动相A:10mM NaH2PO4溶液,pH7.0。流动相B:10mM NaH2PO4溶液,1M NaCl溶液,pH7.0。流速为2.0mL/min。以DEPC水,流动相A,流动相B分别交替冲洗色谱柱约1h。每次冲洗5柱体积。
运行以下程序对总RNA进行分离:0~8.9min(0% B),8.9~13.7min(55% B),13.7~53.7min(55~75% B),53.7~73.7min(75~85% B),73.7~83.7min(100% B),83.7~93.7min(0%B)。以260nm的吸光度检测RNA,并收集重组RNA所对应的峰。用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳鉴定纯度。
(2)RNA样品处理方法
总RNA提取步骤同上。所提取的总RNA于4℃13000rpm离心10min后,上清液经0.22μm微孔滤膜过滤后,每次进样5-10mg。
(3)FPLC组分收集及浓缩去盐
以变性聚丙烯酰胺凝胶电泳鉴定所收集组分的纯度。混合后的各组分用2倍体积无水乙醇沉淀RNA,-80℃冰箱放置约1h。以10000g转速于4℃离心10min收集RNA。将所得RNA沉淀用DEPC水溶解,用tra-2mL Centrifugal Filters 4℃7500g离心10min,去滤液,重复此步骤直至所有溶液离心完,再将Filters倒置,2000g离心2min,收集所得溶液,测定浓度后于-80℃保存。
图2是本实施例利用Bio-Rad NGCTM Chromatography System纯化重组siRNAs(重组r/si-UL8-1),以变性聚丙烯酰胺凝胶电泳鉴定所收集组分的纯度。结果表明,经FPLC纯化后,可得到高纯的重组r/si-UL8-1。
实施例3:重组r/si-UL8-1在细胞内的加工、成熟
(1)重组siRNAs转染
将HaCaT、ARPE19和SY5Y以1×105接种到12孔板中,待细胞贴壁展开后,更换培养基为空白DMEM,将重组r/si-UL8-1加入到一定量的空白DMEM培养基及转染试剂lipo2000加入到一定量的空白DMEM培养基中各自孵育5min,然后将lipo2000与DMEM孵育物加入到重组r/si-UL8-1与DMEM孵育物中,混匀静置20min,然后将孵育物加入到对应的12孔板中,重组r/si-UL8-1终浓度为10nM,6h后更换为10% FBS DMEM培养基。
(2)RNA提取
按照RNA提取说明书提取RNA,所得RNA后冻于-80℃冰箱保存。
(3)qPCR检测检测重组r/si-UL8-1在细胞内的表达
利用反转录试剂盒对RNA进行反转录,反转录产物冻于-20℃,具体过程如下:
a:gDNA消化,在RNase-free离心管中配制如下混合液,用移液枪轻轻吹打混匀。42℃2min。
表5Stem loop qPCR gDNA消化反应体系
Figure BDA0003998297310000101
b:反转录反应体系配制(20μL体系)
表6Stem loop qPCR cDNA逆转录反应体系
Figure BDA0003998297310000102
取上述已反转录好的cDNA,稀释5倍,以GAPDH为内参,利用stem loop qPCR方法检测细胞内重组siRNA的表达量,qPCR反应程序如下:95℃,2min;95℃,5s,60℃,30s,39个循环;95℃,5s;65℃,5s;95℃,50s。所使用的引物序列如下:
表7Stem loop qPCR引物
Figure BDA0003998297310000103
Figure BDA0003998297310000111
图3是本实施例利用Stem loop qPCR技术检测重组r/si-UL8-1在ARPE19中的加工和成熟(数值以“均值±标准差”表示,两组间的显著性采用Students’t检验,***P<0.001)。与阴性对照(SSA)相比,成熟si-UL8-1表达显著升高,表明重组r/si-UL8-1在ARPE19细胞中被加工为成熟siRNA。
实施例5:重组r/si-UL8-1对靶基因(UL8)的调控作用
根据HSV1基因组(X04370.1)设计siRNA序列,检测利用tRNA支架表达重组r/si-UL8-1是否能够特异性敲低靶基因的表达。
1.qPCR检测靶基因的敲低效果
(1)重组siRNAs转染及病毒感染
将HaCaT、ARPE19和SY5Y以1×105接种到12孔板中,待细胞贴壁展开后,更换培养基为空白DMEM/,将重组r/si-UL8-1加入到一定量的空白DMEM培养基及转染试剂lipo2000加入到一定量的空白DMEM培养基中各自孵育5min,然后将lipo2000与DMEM孵育物加入到重组r/si-UL8-1与DMEM孵育物中,混匀静置20min,然后将孵育物加入到对应的12孔板中,重组r/si-UL8-1为10nM,转染6h后换为10% FBS DMEM培养基,24h后弃去培养基并感染HSV1病毒(moi=0.1),感染2h后,DPBS洗2遍后加入含2% FBS的DMEM培养基中。
(2)RNA提取
RNA提取说明书提取RNA,所得RNA后冻于-80℃冰箱保存。
(3)qPCR检测靶基因(UL8)表达
利用反转录试剂盒对RNA进行反转录,反转录产物冻于-20℃,具体过程如下:
a:gDNA消化
在RNase-free离心管中配制如下混合液,用移液器轻轻吹打混匀。42℃2min。
表8Real time qPCR gDNA消化反应体系
Figure BDA0003998297310000121
b:逆转录反应体系配制(20μL体系)
表9Real time qPCR cDNA逆转录反应体系
Figure BDA0003998297310000122
取上述已反转录好的cDNA,稀释5倍,以18S为内参,利用qPCR方法检测细胞内靶基因(UL8)表达量,qPCR反应程序如下:95℃,2min;95℃,5s,60℃,30s,39个循环;95℃,5s;65℃,5s;95℃50s。所使用的引物序列如下:
表10重组r/si-UL8-1 qPCR引物
Figure BDA0003998297310000123
图4是本实施例中利用qPCR技术检测检测重组r/si-UL8-1对Ⅰ型-单纯疱疹病毒(HSV1)靶基因UL8的敲低作用(数值以“均值±标准差”表示,两组间的显著性采用Students’t检验,**P<0.01,***P<0.001)。与阴性对照(SSA)组相比,重组r/si-UL8-1能够显著抑制靶基因的表达,表明重组r/si-UL8-1具有生物学活性。
对本发明其他重组siRNAs进行实验,结果显示同样能够显著抑制靶基因的表达,表明本发明的重组siRNAs具有生物学活性。
实施例6:重组r/si-UL8-1体外抗病毒效果评价
1.空斑法检测重组r/si-UL8-1抗病毒效果
(1)重组r/si-UL8-1转染及病毒感染
将HaCaT、ARPE19和SY5Y以1×105接种到12孔板中,待细胞贴壁展开后,更换培养基为空白DMEM,将重组r/si-UL8-1加入到一定量的空白DMEM培养基及转染试剂lipo2000加入到一定量的空白DMEM培养基中各自孵育5min,然后将lipo2000与DMEM孵育物加入到重组r/si-UL8-1与DMEM孵育物中,混匀静置20min,然后将孵育物加入到对应的12孔板中,重组r/si-UL8-1终浓度为10nM,转染6h后换液为10% FBS DMEM培养基,24h后弃掉培养基并感染HSV1病毒(moi=0.1or 1),感染2h后用DPBS洗2遍后加入含2% FBS的DMEM培养基中。
(2)空斑法检测
在12板中接种Vero E6细胞,待细胞长至90%密度以上时,将上述(1)感染24h后的样本分别梯度稀释(10-1至10-7次方)后感染Vero E6细胞,感染2h后,弃掉病毒液,加入维持培养基覆盖液—1.6%甲基纤维素-DMEM(2% FBS)后放置细胞培养箱培养3d,最后弃掉覆盖液,用DPBS清洗3-5遍,将残留覆盖液清洗干净后加入结晶紫染液室温染色10min,用自来水轻轻将残留的结晶紫洗干净,晾干,数空斑,计算病毒滴度。病毒原液滴度(PFU/mL)=12孔板斑点数×病毒稀释倍数/12孔板接种病毒量(mL)。
图5是本实施例中利用空斑法检测重组r/si-UL8-1对Ⅰ型-单纯疱疹病毒滴度的影响(数值以“均值±标准差”表示,两组间的显著性采用Students’t检验,***P<0.001,****P<0.001)。如图所示,与阴性对照SSA相比,重组r/si-UL8-1能够显著降低病毒滴度,表明重组r/si-UL8-1具有显著的抗病毒活性。
2.免疫荧光(IF)实验评价重组r/si-UL8-1抗病毒效果
(1)重组siRNAs转染及病毒感染
将ARPE19以1×105接种到12孔板中,待细胞贴壁展开后,更换培养基为空白DMEM,将重组r/si-UL8-1加入到一定量的空白DMEM培养基及转染试剂lipo2000加入到一定量的空白DMEM培养基中各自孵育5min,然后将lipo2000与DMEM孵育物加入到重组r/si-UL8-1与DMEM孵育物中,混匀静置20min,然后将孵育物加入到对应的12孔板中,重组r/si-UL8-1终浓度为10nM,转染6h后换液为10% FBS DMEM培养基,24h后弃掉培养基并感染HSV1病毒(moi=0.1),感染2h后用DPBS洗2遍后加入含2% FBS的DMEM培养基中。
(2)免疫荧光染色
感染24h后,弃掉12孔板中的培养基,DPBS洗2遍,加入4%多聚甲醛固定30min,DPBS洗2遍,加入0.5% Triton-X100室温破膜10min,DPBS洗2遍,加入3% BSA封闭30min(现配现用),DPBS洗2遍,加入HSV1 gD一抗(1:100,Santa)4℃过夜,第二天DPBS洗5遍,加入cy5标记的鼠源二抗(1:500,CST)室温避光孵育1h,弃去二抗,DPBS洗5遍,加入细胞核染料DAPI(1:10000)室温孵育5min,弃去染料,DPBS洗5遍,利用荧光倒置显微镜进行观察拍照(如图6)。
图6是本实施例中利用免疫荧光技术(IF)检测重组r/si-UL8-1对Ⅰ型-单纯疱疹病毒(HSV1)荧光数量的影响(数值以“均值±标准差”表示,两组间的显著性采用Students’t检验,*P<0.05)。如图所示,与阴性对照SSA相比,重组r/si-UL8-1能够显著降低病毒荧光数量,表明重组r/si-UL8-1具有显著的抗病毒活性。
对本发明其他重组siRNAs进行实验,结果相似,表面本发明其他重组siRNAs同样能够显著降低病毒滴度,显著降低病毒荧光数量,表明本发明的重组siRNAs具有显著的抗病毒活性。本发明的重组siRNAs可用于制备具有体外/内降低Ⅰ型单纯疱疹病毒滴度,延长动物存活率的基因组试剂、前药、药物、原料药或药物组合;可用于制备具有抗Ⅰ型单纯疱疹病毒活性的试剂、前药、药物、原料药或药物组合。
实施例7:重组r/si-UL8-1体内抗病毒效果评价
(1)动物造模
将6-8周大小的雌性C57/B6 J小鼠腹腔注射100μL浓度为8%的戊巴比妥钠麻醉剂,利用脱毛膏将小鼠左侧毛发脱离干净,随后在小鼠脊椎外侧,脾上方滴入10μL HSV1病毒(2×106p.f.u/只),用27G大小针头来回刮20下促进病毒吸收。
(2)药物治疗
在攻毒6h后首次在小鼠皮肤上涂抹40μg柔性脂质体包裹的SSA和r/si-UL8-1,随后每隔24h在小鼠皮肤上涂抹利用柔性脂质体包裹的SSA和r/si-UL8-1或给小鼠进行灌胃(阿昔洛韦组,6mg/只),连续5天药物治疗后,停止药物治疗,对小鼠病毒载量和小鼠体重、存活率进行统计。
(3)病毒载量检测
1)RNA提取
将上述动物皮肤组织样本加入trizol裂解液后,加入磁珠后,利用组织研磨仪进行破碎研磨,利用Omega RNA提取说明书进行后续RNA提取,所得RNA后冻于-80℃冰箱保存。
2)皮肤组织病毒载量测定
利用反转录试剂盒对RNA进行反转录,反转录产物冻于-20℃,具体过程如下:
a:gDNA消化
在RNase-free离心管中配制如下混合液,用移液器轻轻吹打混匀。42℃2min。
表8Real time qPCR gDNA消化反应体系
Figure BDA0003998297310000161
b:逆转录反应体系配制(20μL体系)
表9Real time qPCR cDNA逆转录反应体系
Figure BDA0003998297310000162
取上述已反转录好的cDNA,稀释5倍,以18S为内参,利用qPCR方法检测细胞内靶基因(UL8)表达量,qPCR反应程序如下:95℃,2min;95℃,5s,60℃,30s,39个循环;95℃,5s;65℃,5s;95℃50s。所使用的引物序列如下:
表10重组r/si-UL8-1 qPCR引物
Figure BDA0003998297310000163
图7是本实施例中利用qPCR技术检测检测重组r/si-UL8-1对HSV1病毒载量的检测(数值以“均值±标准差”表示,两组间的显著性采用Students’t检验,**P<0.01)。与阴性对照(SSA)组相比,重组r/si-UL8-1能够显著降低病毒载量,表明重组r/si-UL8-1具有生物学活性。
(4)小鼠体重、存活率影响
按照上述(1)和(2)步骤对小鼠进行造模和药物治疗,每天观察小鼠体重和生存情况
图8是本实施例中的对小鼠存活率的统计。与空白对照(Blank)阴性对照(SSA)组相比,重组r/si-UL8-1能够显著降低病毒载量,表明重组r/si-UL8-1具有生物学活性。
对本发明其他重组siRNAs进行实验,结果相似,说明本发明其他重组siRNAs能够显著降低病毒载量,表明本发明的重组siRNAs具有生物学活性。本发明的重组siRNAs可用于制备具有抗Ⅰ型单纯疱疹病毒活性的试剂、前药、药物、原料药或药物组合。
以上所述,仅是本发明的较佳实施例,并非对本发明做任何限制,凡是根据发明技术实质对以上实施例所作的任何简单修改、变更以及等效结构变化,均仍属于本发明技术方案的保护范围内。

Claims (4)

1.一种抗Ⅰ型单纯疱疹病毒的重组siRNAs,其特征在于,所述重组siRNAs的序列为SEQID NO:1至SEQ ID NO:10所示序列中的一种,或者为与SEQ ID NO:1至SEQ ID NO:10所示序列中的一种相似度达90%以上的序列。
2.根据权利要求1所述的一种抗Ⅰ型单纯疱疹病毒的重组siRNAs,其特征在于,所述重组siRNAs生产过程中以HSV1基因组不同位置为靶点,设计小干扰RNA,所述小干扰RNA的序列如SEQ ID NO:11至SEQ ID NO:20所示。
3.一种如权利要求1所述重组siRNAs在制备具有体外/内降低Ⅰ型单纯疱疹病毒滴度,延长动物存活率的基因组试剂、前药、药物、原料药或药物组合中的应用。
4.一种如权利要求1所述重组siRNAs在制备具有抗Ⅰ型单纯疱疹病毒活性的试剂、前药、药物、原料药或药物组合中的应用。
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