CN116083418A - 一种磁珠型核酸提取试剂盒及提取核酸的方法 - Google Patents

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Abstract

本发明公开了一种磁珠型核酸提取试剂盒,由裂解液、磁珠液、洗涤液和洗脱液组成。本发明的试剂盒配制方法简单,安全无污染,既可以手工操作进行提取,也可以用于自动化平台,方便快捷,且提取出来的核酸纯度高、得率高,具有较高的推广应用价值。全自动核酸提取时,只需15分钟即可一次实现96个样本的提取,经裂解、洗涤、洗脱后得到高纯度核酸。

Description

一种磁珠型核酸提取试剂盒及提取核酸的方法
技术领域
本发明涉及分子生物学检测领域,具体为一种磁珠型核酸提取试剂盒及提取核酸的方法。
背景技术
核酸提取作为病毒检测的方法,发挥着至关重要的作用,相对于过滤柱式法,磁珠法核酸提取能实现大批量自动化提取,提取速度快、效率高、操作简便、成本低廉,能够满足病毒大批量检测的要求。
发明内容
本发明要解决的技术问题是克服现有技术的缺陷,提供一种。
为了解决上述技术问题,本发明提供了如下的技术方案:
一种磁珠型核酸提取试剂盒,由裂解液、磁珠液、洗涤液和洗脱液组成;
所述裂解液由异硫氰酸胍、三羟甲基氨基甲烷、氯化钠、二水乙二胺四乙酸二钠、曲拉通X-100、聚乙二醇6000、氢氧化钠、超纯水和盐酸组成;
所述磁珠液由磁珠、DEPC水组成;
所述洗涤液由三羟甲基氨基甲烷、乙酸钠、超纯水、无水乙醇和盐酸组成;
所述洗脱液由三羟甲基氨基甲烷、二水乙二胺四乙酸二钠、DEPC水和盐酸组成。
优选的,所述裂解液包括以下质量分数的各组分:
异硫氰酸胍41.36%、三羟甲基氨基甲烷0.6057%、氯化钠1.753%、18.62%、曲拉通X-100 5%、聚乙二醇6000 5%、氢氧化钠5%、余量为超纯水,用盐酸调节pH至8.5。
优选的,所述磁珠液中的磁珠用量为50mg/ml,磁珠为迈德泰克100nm磁珠。
进一步的,所述洗涤液包括以下质量分数的各组分:
三羟甲基氨基甲烷0.12114%、乙酸钠3.533%、无水乙醇80%、余量为超纯水,用盐酸调节pH至7.5。
进一步的,所述洗脱液包括以下质量分数的各组分:
三羟甲基氨基甲烷0.12114%、三羟甲基氨基甲烷18.62%,余量为DEPC水,用盐酸调节pH至8.0。
采用该磁珠型核酸提取试剂盒提取核酸的方法,包括以下步骤:
S1、向装有样本的离心管中加入裂解液、磁珠液,65℃混匀裂解;
S2、将离心管置于磁力架,待磁珠完全被吸附后,弃掉上清液;
S3、加入洗涤液混匀后,将离心管置于磁力架,待磁珠完全被吸附后,弃掉上清液;
S4、将磁珠晾干后,加入所述洗脱液,75℃温浴洗脱后,收集核酸并保存。
进一步的,所述的样本为拭子、全血、血浆、血清、唾液、组织液、尿液或各种保存液保存的生物样本中的任意一种。
本发明所达到的有益效果是:本发明的试剂盒配制方法简单,安全无污染,既可以手工操作进行提取,也可以用于自动化平台,方便快捷,且提取出来的核酸纯度高、得率高,具有较高的推广应用价值。全自动核酸提取时,只需15分钟即可一次实现96个样本的提取,经裂解、洗涤、洗脱后得到高纯度核酸。
具体实施方式
以下对本发明的优选实施例进行说明,应当理解,此处所描述的优选实施例仅用于说明和解释本发明,并不用于限定本发明。
实施例
新型冠状病毒核酸提取
手工法操作步骤如下:
取出试剂盒中的各组分,混匀备用。若裂解液中含有少量结晶,待结晶充分溶解后再使用。
根据提取的样本数,每人份按照400μL“裂解液”+100μL“磁珠液”混匀获得“工作溶液”。
每人份按照500μL“工作溶液”加入200μL待测样本至1.5mL离心管中,震荡混匀5s后置于65℃恒温混匀仪上加热裂解5min。
瞬时离心后,将离心管置于磁性分离器上吸磁1min,然后将上清液吸除(注:吸除上清液时不要碰到管壁的磁珠)。
加入600μL洗涤液,盖上管盖,震荡混匀30s后瞬时离心,之后将离心管置于磁性分离器上吸磁1min,然后将上清液吸除(注:吸除上清液时不要碰到管壁的磁珠)。
静置1min后,将管底残余的液体吸除。
加入50-100μL洗脱液,盖上管盖,震荡混匀5s后瞬时离心。
将离心管置于75℃恒温混匀仪上加热洗脱2min。
将离心管置于磁性分离器上吸磁1min,取上清用于后续实验。核酸样品可以立即使用或用封口膜封闭后保存于2℃-8℃备用。
裂解液包括:异硫氰酸胍41.36%、三羟甲基氨基甲烷0.6057%、氯化钠1.753%、18.62%、曲拉通X-100 5%、聚乙二醇6000 5%、氢氧化钠5%、余量为超纯水,用盐酸调节pH至8.5。
磁珠液包括磁珠(100nm购自迈德泰克,50mg/ml)、DEPC水;
洗涤液包括以下质量分数的各组分:三羟甲基氨基甲烷0.12114%、乙酸钠3.533%、无水乙醇80%、余量为超纯水,用盐酸调节pH至7.5。
洗脱液包括以下质量分数的各组分:
三羟甲基氨基甲烷0.12114%、三羟甲基氨基甲烷18.62%,余量为DEPC水,用盐酸调节pH至8.0。
本发明也可配合全自动核酸提取仪,程序如下表1所示:
表1核酸提取运行程序1
其中,样本采用广东和信健康科技有限公司的《新型冠状病毒核酸室内质控品》(L1弱阳,浓度约为1000Copies/ml)。
对照提取试剂选用硕世生物科技股份有限公司的《核酸快速提取试剂盒(磁珠法)》(货号:SDKF60101)。
对上述提取得到的核酸使用硕世生物科技股份有限公司的《新型冠状病毒2019-nCoV核酸检测试剂盒(荧光PCR法)》进行PCR扩增,利用QuantStudio5荧光定量PCR仪进行扩增检测,扩增体系见表2,扩增程序见表3。
表2核酸扩增体系
表3核酸扩增程序
结果如下表4。
表4实施例1结果
由以上结果分析可得,本发明的提取效率已具备同类产品的水平,满足后续试验的要求。
实施例2人血液DNA提取
本实施例试剂盒组分与实施例1基本相同,区别在于样本需先加蛋白酶K消化,以及多两步洗涤。
手工法操作步骤如下:
取出试剂盒中的各组分,混匀备用。若裂解液中含有少量结晶,待结晶充分溶解后再使用。
根据提取的样本数,每人份按照400μL“裂解液”+10μL“蛋白酶K”混匀获得“工作溶液”。
每人份按照400μL“工作溶液”加入200μL待测样本至1.5mL离心管中,震荡混匀5s后置于65℃恒温混匀仪上加热裂解15min。
加入100μL“磁珠液”,震荡混匀1min,共静置9min,其中每3min震荡混匀1min。
注:磁珠液在使用前充分混匀。
瞬时离心后,将离心管置于磁性分离器上吸磁1min,待磁珠完全吸附后将上清液吸除。注:可适当延长吸磁时间,吸除上清液时不要碰到管壁的磁珠,下同。
加入600μL洗涤液1,盖上管盖,震荡混匀30s后瞬时离心,之后将离心管置于磁性分离器上吸磁1min,待磁珠完全吸附后将上清液吸除。
加入600μL洗涤液2,盖上管盖,震荡混匀30s后瞬时离心,之后将离心管置于磁性分离器上吸磁1min,待磁珠完全吸附后将上清液吸除。
重复上一步骤。
将离心管开盖继续置于磁力架上室温晾干5min,再将管底残余的液体吸除。
注:乙醇残留会抑制后续的酶反应,故要尽量使乙醇挥发干净,但也不要过于干燥,以免难以洗脱DNA。
将离心管从磁力架上取下,加入50-100μL洗脱液,盖上管盖,震荡混匀5s后瞬时离心。
将离心管置于75℃恒温混匀仪上加热洗脱10min。
将离心管置于磁性分离器上吸磁1min,取上清用于后续实验。DNA样品可以立即使用或用封口膜封闭后保存于2℃-8℃备用。
试剂盒的配置同实施例1。
本发明也可配合全自动核酸提取仪,程序如下表5所示:
表5核酸提取运行程序2
其中,样本采用某医院病人新鲜全血,对照提取试剂选用北京天根生化科技有限公司的《磁珠法通用型基因组DNA提取试剂盒》(货号:DP705)。
对上述提取到的核酸用NanoDrop2000进行浓度与纯度的测定,结果如下表6。
表6实施例2结果
由以上结果分析可得,本发明的提取效率已接近同类产品的水平,满足后续试验的要求。
实施例3人宫颈脱落细胞HPV-DNA提取
本实施例试剂盒组分与实施例2基本相同,区别在于样本需先加核酸保护剂消化,而非蛋白酶K。
手工法操作步骤如下:
取出试剂盒中的各组分,混匀备用。若“裂解液”中含有少量结晶,待结晶充分溶解后再使用。
先按每1mL液基细胞保存液加入5μL核酸保护剂,混匀后室温放置10分钟,每人份按照400μL“裂解液”加入200μL待测样本至1.5mL离心管中,震荡混匀5s后置于65℃恒温混匀仪上加热裂解15min。
加入100μL“磁珠液”,震荡混匀1min,共静置9min,其中每3min震荡混匀1min。
注:磁珠液在使用前充分混匀。
瞬时离心后,将离心管置于磁性分离器上吸磁1min,待磁珠完全吸附后将上清液吸除。注:可适当延长吸磁时间,吸除上清液时不要碰到管壁的磁珠,下同。
加入600μL洗涤液1,盖上管盖,震荡混匀30s后瞬时离心,之后将离心管置于磁性分离器上吸磁1min,待磁珠完全吸附后将上清液吸除。
加入600μL洗涤液2,盖上管盖,震荡混匀30s后瞬时离心,之后将离心管置于磁性分离器上吸磁1min,待磁珠完全吸附后将上清液吸除。
重复上一步骤。
将离心管开盖继续置于磁力架上室温晾干5min,再将管底残余的液体吸除。
注:乙醇残留会抑制后续的酶反应,故要尽量使乙醇挥发干净,但也不要过于干燥,以免难以洗脱DNA。
将离心管从磁力架上取下,加入50-100μL洗脱液,盖上管盖,震荡混匀5s后瞬时离心。
将离心管置于75℃恒温混匀仪上加热洗脱10min。
将离心管置于磁性分离器上吸磁1min,取上清用于后续实验。DNA样品可以立即使用或用封口膜封闭后保存于2℃-8℃备用。
试剂盒的配置同实施例1。
本发明也可配合全自动核酸提取仪,程序与实施例2相同,见表5。
其中,样本采用某医院病人新鲜宫颈脱落细胞,对照提取方法为热裂解法。
对上述提取到的核酸用Qubit3.0进行浓度的测定,结果如下表7。
表7实施例3结果
由以上结果分析可得,本发明的提取效率已满足同类方法的水平,满足后续试验的要求。
综上所述,本发明提供的核酸提取试剂盒及核酸提取方法,可广泛使用于多种样本的核酸提取,亦适用于多种自动化核酸提取仪,最快仅需13min即可完成提取,快速高效,且试剂中不含有氯仿等有毒试剂,对人友好,且提取的核酸浓度高、纯度好,具有较高的推广应用价值。
最后应说明的是:以上所述仅为本发明的优选实施例而已,并不用于限制本发明,尽管参照前述实施例对本发明进行了详细的说明,对于本领域的技术人员来说,其依然可以对前述各实施例所记载的技术方案进行修改,或者对其中部分技术特征进行等同替换。凡在本发明的精神和原则之内,所作的任何修改、等同替换、改进等,均应包含在本发明的保护范围之内。

Claims (7)

1.一种磁珠型核酸提取试剂盒,其特征在于,由裂解液、磁珠液、洗涤液和洗脱液组成;
所述裂解液由异硫氰酸胍、三羟甲基氨基甲烷、氯化钠、二水乙二胺四乙酸二钠、曲拉通X-100、聚乙二醇6000、氢氧化钠、超纯水和盐酸组成;
所述磁珠液由磁珠、DEPC水组成;
所述洗涤液由三羟甲基氨基甲烷、乙酸钠、超纯水、无水乙醇和盐酸组成;
所述洗脱液由三羟甲基氨基甲烷、二水乙二胺四乙酸二钠、DEPC水和盐酸组成。
2.如权利要求1所述的磁珠型核酸提取试剂盒,其特征在于,所述裂解液包括以下质量分数的各组分:
异硫氰酸胍41.36%、三羟甲基氨基甲烷0.6057%、氯化钠1.753%、18.62%、曲拉通X-100 5%、聚乙二醇6000 5%、氢氧化钠5%、余量为超纯水,用盐酸调节pH至8.5。
3.如权利要求1所述的磁珠型核酸提取试剂盒,其特征在于,所述磁珠液中的磁珠用量为50mg/ml,磁珠为迈德泰克100nm磁珠。
4.如权利要求1所述的磁珠型核酸提取试剂盒,其特征在于,所述洗涤液包括以下质量分数的各组分:
三羟甲基氨基甲烷0.12114%、乙酸钠3.533%、无水乙醇80%、余量为超纯水,用盐酸调节pH至7.5。
5.如权利要求1所述的磁珠型核酸提取试剂盒,其特征在于,所述洗脱液包括以下质量分数的各组分:
三羟甲基氨基甲烷0.12114%、三羟甲基氨基甲烷18.62%,余量为DEPC水,用盐酸调节pH至8.0。
6.权利要求1-5任一项的磁珠型核酸提取试剂盒提取核酸的方法,其特征在于,包括以下步骤:
S1、向装有样本的离心管中加入裂解液、磁珠液,65℃混匀裂解;
S2、将离心管置于磁力架,待磁珠完全被吸附后,弃掉上清液;
S3、加入洗涤液混匀后,将离心管置于磁力架,待磁珠完全被吸附后,弃掉上清液;
S4、将磁珠晾干后,加入所述洗脱液,75℃温浴洗脱后,收集核酸并保存。
7.权利要求6任一项的磁珠型核酸提取试剂盒提取核酸的方法,其特征在于,所述的样本为拭子、全血、血浆、血清、唾液、组织液、尿液或各种保存液保存的生物样本中的任意一种。
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