CN115666276A - 纤维混合物调配物和其用途 - Google Patents

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Abstract

本公开涉及一种纤维混合物调配物,其包括麸皮、菊粉和抗消化麦芽糊精的混合物,所述纤维混合物调配物可用于恢复更健康肠道微生物群并缓解患有肠道微生物群失衡的受试者的症状。以一定不可溶性膳食纤维(ISDF):可溶性膳食纤维(SDF)比率(0.5:1至1:0.5)混合的SDF和ISDF的混合物对肠道微生物群组合物具有协同作用,从而促进产生乙酸盐和产生丁酸盐的细菌的生长并抑制病原体和有害细菌的生长。

Description

纤维混合物调配物和其用途
相关申请交叉引用
本专利申请要求于2020年4月8日提交的美国临时专利申请序列号63/006,896的权益和优先权,所述美国临时专利申请的全部内容以全文引用的方式并入。
序列表
本申请含有已经以ASCII格式电子提交的序列表,并且特此以全文引用的方式并入。创建于2021年4月7日的所述ASCII副本命名为117465-016701PCT_SL.txt并且大小为49,521字节。
技术领域
本公开涉及一种可用于体外和体内适应症的纤维混合物调配物。
背景技术
肠道生态系统被视为人类健康的基础。开发促进和维持健康肠道微生物群的策略是最近医学
研究的关键优先事项之一。微生态失调(有益和有害肠道微生物的失衡)与代谢疾病相关,包含肥胖症和2型糖尿病。
发明内容
所涵盖的实施例由权利要求限定,而不是由本发明内容限定。本发明内容是各个方面的高级概述并且介绍了在下文具体实施方式部分中进一步描述的概念中的一些概念。本发明内容不旨在标识所要求保护的主题的关键或必要特征,也不旨在单独用于确定所要求保护的主题的范围。应当通过参考整个说明书的适当部分、任何附图或所有附图以及每个权利要求来理解主题。
本公开的各方面涉及一种调配物,其包括麸皮、菊粉和抗消化麦芽糊精的混合物,其中所述麸皮基本上由玉米麸皮、小麦麸皮、高粱麸皮和燕麦麸皮组成,其中所述混合物的来自麸皮的膳食纤维:来自菊粉的膳食纤维:来自抗消化麦芽糊精的膳食纤维的比率在约1:1:1至约4:1:1的范围内,其中所述菊粉以占所述混合物的总重量的5-10%的范围存在,并且其中所述混合物的均匀粒度介于150μm与300μm之间。
在一些实施例中,按重量计,由所述玉米麸皮、所述小麦麸皮、所述高粱麸皮和所述燕麦麸皮中的每一种贡献的纤维的比率为约1:1:1:1。
在一些实施例中,所述调配物包括约7-8重量%菊粉。在一些实施例中,所述包括约7.8重量%菊粉。在一些实施例中,总纤维含量为约47%(w/w)。在一些实施例中,所述抗消化麦芽糊精是Fibersol-2。在一些实施例中,所述Fibersol-2以约7.8%(w/w)的最终百分比存在。
在一些实施例中,所述调配物进一步包括黄原胶。在一些实施例中,所述黄原胶以约4%(w/w)的最终百分比存在。
本公开的其它方面涉及用于促进有需要的受试者的健康肠道微生物组的方法,所述方法包括向所述受试者肠内施用有效量的调配物,所述调配物包括麸皮、菊粉和抗消化麦芽糊精的混合物,其中所述麸皮基本上由玉米麸皮、小麦麸皮、高粱麸皮和燕麦麸皮组成,其中所述混合物的来自麸皮的膳食纤维:来自菊粉的膳食纤维:来自抗消化麦芽糊精的膳食纤维的比率在约1:1:1至约4:1:1的范围内,其中所述菊粉以占所述混合物的总重量的5-10%的范围存在,并且其中所述混合物的均匀粒度介于150μm与300μm之间,其中所述有效量足以增加产生乙酸盐和产生丁酸盐的肠道细菌在所述受试者的肠道中的增殖,由此促进所述受试者的所述健康肠道微生物组。
在一些实施例中,所述有效量的调配物包括每天30-90克纤维。在一些实施例中,所述有效量的调配物包括每天30-60克纤维。在一些实施例中,所述有效量的调配物包括每天30-120克纤维。
在一些实施例中,所述产生乙酸盐和产生丁酸盐的肠道细菌物种被分类为包括以下中的至少一个的细菌属:双歧杆菌属(Bifidobacterium)、瘤胃球菌属(Ruminococcus)、真杆菌属(Eubacterium)、梭菌属(Clostridium)、另枝菌属(Alistipes)、拟杆菌属(Bacteroides)、布劳特氏菌属(Blautia)、丁酸球菌属(Butyricicoccus)、丁酸单胞球菌属(Butyricimonas)、柯林斯菌属(Collinsella)、粪球菌属(Coprococcus)、多尔氏菌属(Dorea)、埃格特菌属(Eggerthella)、粪杆菌属(Faecalibacterium)、纺锤链杆菌属(Fusicatenibacter)、肠单胞球菌属(Intestinimonas)、毛梭菌属(Lachnoclostridium)、毛螺菌科(Lachnospiraceae)、巨型球菌属(Megasphaera)、副拟杆菌属(Parabacteroides)、副普氏菌属(Paraprevotella)、考拉杆菌属(Phascolarctobacterium)、罗斯氏菌属(Roseburia)、瘤胃梭菌属(Ruminiclostridium)或罕见小球菌属(Subdoligranulum),其中所述产生乙酸盐和产生丁酸盐的肠道细菌物种被分类为包括以下中的至少一个的细菌科:氨基酸球菌科(Acidaminococcaceae)、拟杆菌科(Bacteroidaceae)、双歧杆菌科(Bifidobacteriaceae)、梭菌科(Clostridiaceae)、梭菌目(Clostridiales)、红蝽菌科(Coriobacteriaceae)、埃格特菌科(Eggerthellaceae)、肠杆菌科(Enterobacteriaceae)、丹毒丝菌科(Erysipelotrichaceae)、毛螺菌科(Lachnospiraceae)、海洋丝菌科(Marinifilaceae)、普雷沃菌科(Prevotellaceae)、理研菌科(Rikenellaceae)、瘤胃球菌科(Ruminococcaceae)、坦纳菌科(Tannerellaceae)或韦荣氏菌科(Veillonellaceae)。
在一些实施例中,通过靶向如V4、V3-V4等可变区或全长基因中的一个或几个的16S rRNA扩增子测序检测所述产生乙酸盐和产生丁酸盐的肠道细菌物种。在一些实施例中,16S rRNA V4扩增子测序鉴定产生乙酸盐和产生丁酸盐的肠道细菌的扩增子序列变体(ASV)特性中的至少一个。在一些实施例中,所述ASV中的每一个表示所述产生乙酸盐和产生丁酸盐的肠道细菌的独特的菌株或高度相似的菌株组。
在一些实施例中,所述有需要的受试者患有肠道微生物群失衡。在一些实施例中,所述肠道微生物群失衡的特征在于低水平的产生乙酸盐和产生丁酸盐的肠道细菌。在一些实施例中,所述低水平的产生乙酸盐和产生丁酸盐的肠道细菌少于所述有需要的受试者的总肠道微生物群的5%。例如,所述产生乙酸盐和产生丁酸盐的肠道细菌物种被分类为包括以下中的至少一个的细菌属:双歧杆菌属、瘤胃球菌属或真杆菌属。在一些实施例中,通过16SrRNA V4扩增子测序检测所述产生乙酸盐和产生丁酸盐的肠道细菌物种。在一些实施例中,16S rRNA V4扩增子测序鉴定产生乙酸盐和产生丁酸盐的肠道细菌的扩增子序列变体(ASV)特性中的至少一个。在一些实施例中,所述ASV中的每一个表示所述产生乙酸盐和产生丁酸盐的肠道细菌的独特的菌株或高度相似的菌株组。
在一些实施例中,所述施用增加所述产生乙酸盐和产生丁酸盐的肠道细菌。
本公开的各方面涉及一种纤维混合物调配物,其包括有用的麸皮、菊粉和抗消化麦芽糊精的混合物。不可溶性膳食纤维(ISDF):可溶性膳食纤维(SDF)的比率在约0.5:1至约1:0.5范围内的SDF和ISDF的混合物对肠道微生物群组合物具有协同作用,从而促进产生乙酸盐和产生丁酸盐的细菌的生长并抑制病原体和有害细菌的生长。在一些实施例中,所述纤维混合物调配物恢复更健康肠道微生物群。在一些实施例中,所述纤维混合物调配物恢复更健康肠道微生物群并缓解已知患有肠道微生物群失衡的患有各种疾病或适应症的患者的症状,如肥胖症、前期糖尿病、2型糖尿病、多发性硬化症、帕金森病(Parkinsondisease)、普拉德·威利综合征(Prader-Willi syndrome)、缓解癌症化疗的副作用(腹泻、恶心、呕吐、便血等)。
在一些实施例中,所述有需要的受试者是肥胖者。在一些实施例中,所述有需要的受试者患有2型糖尿病。在一些实施例中,所述有需要的受试者患有糖尿病肾病。在一些实施例中,所述有需要的受试者是患有如COVID-19等呼吸道病毒感染的肥胖者。在一些实施例中,所述有需要的受试者是患有如COVID-19等呼吸道病毒感染的2型糖尿病患者。在一些实施例中,所述有需要的受试者是患有如COVID-19等呼吸道病毒感染的前期糖尿病患者。在一些实施例中,所述有需要的受试者患有多发性硬化症。在一些实施例中,所述有需要的受试者患有帕金森病。在一些实施例中,所述有需要的受试者患有普拉德·威利综合征。在一些实施例中,所述有需要的受试者患有癌症,并且施用所述调配物缓解与癌症化疗相关的副作用。
附图说明
本文参考附图仅通过举例来描述本公开的一些实施例。现在详细地具体参考附图,应当强调的是通过举例并且出于本公开的实施例的说明性讨论的目的示出实施例。在这方面,结合附图所进行的描述使可以如何实践本公开的实施例对本领域的技术人员显而易见。
图1A和1B描绘了健康对照(图1A)和前期糖尿病/2型糖尿病(图1B)的餐后血糖反应。*相对于同一时间点的白面包,P<0.05。
图2示出了基于布雷柯蒂斯距离(Bray-Curtis distance)的基线和48小时发酵后β多样性的主坐标分析图。N=3-5/组。空白是发酵的基线。其它符号指示48小时发酵后所有15个纤维组的位置。
图3示出了在体外发酵中1%麸皮混合物与2%麸皮混合物之间的应答者比较。
图4示出了在体外发酵中1%菊粉与2%菊粉之间的应答者比较。
图5示出了在体外发酵中1%Fibersol-2与2%Fibersol-2之间的应答者比较。
图6示出了在体外发酵中0.5%Fibersol-2:0.5%菊粉与1%Fibersol-2:1%菊粉之间的应答者比较。
图7示出了在体外发酵中0.5%Fibersol-2:0.5%菊粉、1%Fibersol-2:1%菊粉、1%Fibersol-2、2%Fibersol-2、1%菊粉与2%菊粉组之间的阳性应答者比较。
图8示出了在体外发酵中1%Fibersol-2:1%麸皮混合物、1%Fibersol-2、1%麸皮混合物、2%Fibersol-2与2%麸皮混合物之间的阳性应答者比较。
图9示出了在体外发酵中1%菊粉:1%麸皮混合物、1%菊粉、1%麸皮混合物、2%菊粉与2%麸皮混合物之间的阳性应答者比较。
图10示出了在体外发酵中0.5%Fibersol-2:0.5%菊粉、0.5%Fibersol-2:0.5%菊粉:0.1%麸皮混合物、0.5%Fibersol-2:0.5%菊粉:0.5%麸皮混合物与0.5%Fibersol-2:0.5%菊粉:1%麸皮混合物之间的阳性应答者比较。
图11示出了在体外发酵中0.5%Fibersol-2:0.5%菊粉、0.5%Fibersol-2:0.5%菊粉:0.1%麸皮混合物、0.5%Fibersol-2:0.5%菊粉:0.5%麸皮混合物与0.5%Fibersol-2:0.5%菊粉:1%麸皮混合物之间的阴性应答者比较。
图12示出了在体外发酵中1%麸皮混合物、0.5%Fibersol-2:0.5%菊粉:1%麸皮混合物、0.25%Fibersol-2:0.25%菊粉:1%麸皮混合物与0.05%Fibersol-2:0.05%菊粉:1%麸皮混合物之间的阳性应答者比较。
图13示出了在体外发酵中1%麸皮混合物、0.5%Fibersol-2:0.5%菊粉:1%麸皮混合物、0.25%Fibersol-2:0.25%菊粉:1%麸皮混合物与0.05%Fibersol-2:0.05%菊粉:1%麸皮混合物之间的阴性应答者比较。
图14是示出了对纤维和16S rRNA V4区序列(SEQ ID NO:1-117)的不同组合的阳性应答者和阴性应答者的表格。
具体实施方式
在已经公开的那些益处和改进当中,根据结合附图进行的以下描述,本公开的其它目的和优点将变得显而易见。本文公开了本公开的详细实施例;然而,应理解,所公开的实施例仅是可以各种形式体现的本公开的说明。另外,关于本公开的各个实施例给出的实例中的每个实例旨在是说明性的,而不是限制性的。
贯穿本说明书和权利要求书,除非上下文另有明确指出,否则以下术语采用与本文明确相关的含义。尽管本文使用的短语“在一个实施例中(in one embodiment或in anembodiment)”和“在一些实施例中”虽然可以,但是不一定指代相同的实施例。此外,本文使用的短语“在另一个实施例中”和“在一些其它实施例中”虽然可以,但是不一定指代不同的实施例。本公开的所有实施例在不背离本公开的范围或精神的情况下旨在是可组合的。
如本文所使用的,除非上下文另外明确指出,否则术语“基于”不是排他性的并且允许基于未描述的另外的因素。另外,在整个说明书中,、“一个(a)”、“一种(an)”和“所述(the)”的含义包含复数指代物。“在……中”的含义包含“在……中”和“在……上”。
如本文所使用的,如“包括”、“包含”和“具有”等术语不将具体权利要求的范围限制为权利要求所述的材料或步骤。
如本文所使用的,术语“基本上由……组成”将具体权利要求的范围限制为指定的材料或步骤以及实质上并不影响具体权利要求的一种或多种基本且新颖的特性的那些材料或步骤,例如,纤维混合物调配物和其用于恢复和/或维持支持人类健康的肠道微生物群的用途。例如,通过使用“基本上由…组成”,本文所描述的纤维混合物调配物不含有对治疗与肠道微生物群失调相关的病症具有直接有益或不利治疗效果的任何未指定成分。另外,通过使用术语“基本上由……组成”,组合物可以包括对治疗与肠道微生物群失调相关的病症不具有治疗效果的物质;此类成分包含不影响肠道微生物群的载体、赋形剂、佐剂、调味剂等。
如本文所使用的,如“由……组成”和“由……构成”等术语将具体权利要求的范围限制为权利要求所述的材料和步骤。
如本文所使用的,术语“治疗(treatment)”或其任何语法变型(例如,治疗(treat、treating和treatment)等)包含但不限于缓解疾病或病状的症状;和/或减少、压制、抑制、减轻或影响疾病或病状的进展、严重程度和/或范围。
如本文所使用的,术语“改善”或其任何语法变体(例如,改善(ameliorate、ameliorating和amelioration)等)包含但不限于延迟疾病或病状(例如,腹泻、菌血症和/或内毒素血症)的发作或降低其严重程度。如本文所使用的,改善不需要完全没有症状。
如本文所使用的,术语“有效量”是指能够治疗或改善疾病或病状或在其它方面能够产生预期治疗效果的量。
如本文所使用的,如但不限于“约”、“基本”或“基本上”等近似词语是指某种条件,所述条件在如此修饰时被理解为未必是绝对或完善的,但会被视为足够接近以使本领域普通技术人员保证指定所存在的条件。一般来说,本文中由如“约”等近似词语修饰的数值可以由所陈述的值变化至少或等于±1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%或10%。
纤维混合物
在一些实施例中,本发明提供了一种用于恢复和/或维持支持人类健康的肠道微生物群的方法,其中所述方法包括:向有需要的受试者施用包括燕麦麸皮、玉米麸皮、高粱麸皮、小麦麸皮、菊粉和抗消化麦芽糊精的纤维混合物调配物;以及任选地治疗上可接受的载体、电解质、维生素、缓冲剂和调味剂。在一些实施例中,所述抗消化麦芽糊精是Fibersol-2。在具体实施例中,施用通过肠内途径进行。在具体实施例中,纤维混合物调配物进一步包括水。
本发明的发明人已经收集关于膳食纤维在建立和维持支持人类健康的肠道微生物群中的作用的全面证据。通过掺入富含全谷物的食品、传统中药食品和益生元,本发明的发明人证明,具有多样化物理化学结构的高膳食纤维的膳食恢复了更健康肠道微生物群,这继而又赋予了临床益处,包含体重减轻、炎症减少和葡萄糖稳态改善。如本文所示,在数百种具有利用膳食纤维的遗传能力的肠道细菌中,本文所描述的纤维混合物调配物选择性地促进产生乙酸盐和产生丁酸盐的细菌小组。来自细菌碳水化合物发酵的乙酸盐和丁酸盐为结肠细胞局部提供能量底物,并且在许多代谢通路中充当信号传导分子,包含那些调节免疫应答、食欲和胰岛素分泌的代谢通路。本发明的发明人将这一细菌组称为健康肠道微生物群结构的“基础联盟(foundation guild)”。基础联盟包括来自不同组的细菌。当基础联盟在肠道微生物群落中占据主导地位时,所述联盟会产生乙酸盐和丁酸盐以创造弱酸性肠道环境,这种环境可以抑制许多有害细菌或病原体并且因此使肠道微生物群朝着更健康结构发展。
然而,如果可能的话,在日常生活中采用高纤维膳食方案是具有挑战性的。本文所描述的纤维混合物调配物经过精心调配以包含大量具有不同物理化学结构的多样化纤维,从而使由肠道细菌产生的短链脂肪酸(SCFA)最大化,所述肠道细菌在其优选的发酵底物方面不同。
在本发明的发明人使用本文所描述的纤维混合物调配物的临床试验中,平均纤维摄入量为33-44g/天,这大大超过了美国成人15g/天的典型纤维摄入量。健康益处可能需要的纤维量与常规消耗的纤维量之间的此类显著差异强调了本文所描述的纤维混合物调配物对普通群体的潜在益处。
本文所描述的纤维混合物调配物提供了可溶性膳食纤维和不可溶性膳食纤维作为恢复和/或维持支持人类健康的肠道微生物群的发酵底物。纤维混合物主要由富含多样化物理化学结构的可溶性纤维和不可溶性纤维的成分组成。在一些实施例中,纤维混合物调配物包括一种或多种可溶性纤维。在一些实施例中,可溶性纤维可以是低聚果糖(FOS)、低聚半乳糖(GOS)、反式低聚半乳糖(TOS)、抗性淀粉(RS)、果胶低聚糖(POS)、棉子糖家族低聚糖(RFO)、聚葡萄糖、菊粉、fibersol-2或前述的任何组合。
在一些实施例中,纤维混合物调配物包括麸皮(不可溶性膳食纤维)、菊粉(可溶性膳食纤维)和/或抗消化麦芽糊精(可溶性膳食纤维)的混合物。在一些实施例中,纤维混合物调配物进一步包括黄原胶。
在一些实施例中,麸皮混合物包括燕麦麸皮、玉米麸皮、高粱麸皮、小麦麸皮或其组合。在一些实施例中,纤维混合物包括的来自麸皮的膳食纤维:来自菊粉的膳食纤维:来自抗消化麦芽糊精的膳食纤维的比率在约1:1:1至约4:1:1的范围内。在一些实施例中,纤维混合物包括的来自麸皮的膳食纤维:来自菊粉的膳食纤维:来自抗消化麦芽糊精的膳食纤维的比率在约2:1:1至约4:1:1的范围内。在一些实施例中,纤维混合物包括的来自麸皮的膳食纤维:来自菊粉的膳食纤维:来自抗消化麦芽糊精的膳食纤维的比率在约3:1:1至约4:1:1的范围内。在一些实施例中,纤维混合物包括的来自麸皮的膳食纤维:来自菊粉的膳食纤维:来自抗消化麦芽糊精的膳食纤维的比率在约1:1:1至约2:1:1的范围内。在一些实施例中,纤维混合物包括的来自麸皮的膳食纤维:来自菊粉的膳食纤维:来自抗消化麦芽糊精的膳食纤维的比率在约1:1:1至约3:1:1的范围内。在一些实施例中,纤维混合物包括的来自麸皮的膳食纤维:来自菊粉的膳食纤维:来自抗消化麦芽糊精的膳食纤维的比率在约2:1:1至约3:1:1的范围内。在一些实施例中,纤维混合物包括的来自麸皮的膳食纤维:来自菊粉的膳食纤维:来自抗消化麦芽糊精的膳食纤维的比率在约3:1:1至约4:1:1的范围内。例如,纤维混合物包括的来自麸皮的膳食纤维:来自菊粉的膳食纤维:来自抗消化麦芽糊精(例如,Fibersol-2)的膳食纤维的比率可以为1:1:1、3:1:1、4:1:1。在一些实施例中,纤维混合物包括的不可溶性膳食纤维与可溶性膳食纤维的比率在约0.5:1至约1:0.5的范围内。在一些实施例中,纤维混合物包括的不可溶性膳食纤维与可溶性膳食纤维的比率在约0.5:1至约1:1的范围内。在一些实施例中,纤维混合物包括的不可溶性膳食纤维与可溶性膳食纤维的比率在约1:1至约1:0.5的范围内。例如,纤维混合物包括的不可溶性膳食纤维与可溶性膳食纤维的比率为约0.5:1、约0.6:1、约0.7:1、约0.8:1、约0.9:1、约1:1、约1:0.9、约1:0.8、约1:0.7、约1:0.6或约1:0.5。
将燕麦麸皮、玉米麸皮、高粱麸皮、小麦麸皮、菊粉和Fibersol-2混合,使得来自麸皮的总膳食纤维与来自菊粉和Fibersol-2的总膳食纤维的比率介于约1:1:1与约4:1:1之间,例如约1:1:1、约2:1:1、约3:1:1或约4:1:1。
需要注意的是,每种麸皮的膳食纤维含量不同。在一些实施例中,每种麸皮在纤维混合物调配物中贡献等量的膳食纤维。在一些实施例中,纤维混合物1的组合物包括介于约30%至50%(w/w)之间的总膳食纤维含量。总膳食纤维含量包含不可溶性纤维和可溶性纤维。在一些实施例中,纤维混合物1的组合物包括介于约36%至47%(w/w)之间的总膳食纤维含量。在一些实施例中,如表1所示的纤维混合物的组合物包括36.8%(w/w)的总膳食纤维含量。
表1
重量[%]
燕麦麸皮 43.7
玉米麸皮 11.2
高粱麸皮 16.4
小麦麸皮 13.0
菊粉 7.8
Fibersol-2 7.8
在一些实施例中,然后可以向该混合物中添加如黄原胶等增稠剂以改善质地和适口性。(参见表2)
表2
Figure BDA0003954184680000091
Figure BDA0003954184680000101
在一些实施例中,相对于纤维混合物的总重量,如菊粉等可溶性纤维的量在1%至30%(w/w)的范围内。在一些实施例中,相对于纤维混合物的总重量,菊粉的量在5%至25%(w/w)的范围内。在一些实施例中,相对于纤维混合物的总重量,菊粉的量在10%至20%(w/w)的范围内。在一些实施例中,相对于纤维混合物的总重量,菊粉的量在7%至8%(w/w)的范围内。根据某些示例性实施例,相对于纤维混合物的总重量,菊粉的量在5%至15%(w/w)的范围内。在一些实施例中,相对于纤维混合物的总重量,菊粉的量在7%至8%(w/w)的范围内。在一些实施例中,相对于纤维混合物的总重量,菊粉的量在7.5%(w/w)的范围内。在一些实施例中,相对于纤维混合物的总重量,菊粉的量在5%至15%、6%至15%、7%至15%、8%至15%、9%至15%、10%至15%、11%至15%、12%至15%、13%至15%和14%至15%(w/w)的范围内。每种可能性表示本文所描述的调配物、方法和用途的单独实施例。
在一些实施例中,麸皮、菊粉和抗消化麦芽糊精的混合物的均匀粒度介于150μm与300μm之间。在一些实施例中,混合物的均匀粒度高于150μm且低于300μm。例如,平均粒度可以为160、170、180、190、200、210、220、230、240、250、260、270、280或290μm。
所有成分均来源于商业食品供应商。为了制备纤维混合物,首先以特定比率将麸皮成分混合,然后研磨混合物以产生介于150与300μm之间的均匀粒度并且然后在135℃下烘烤5分钟以进行灭菌。不可溶性麸皮纤维混合物可以进一步与可溶性纤维混合。由ISO17025认可的食品营养实验室(Eurofins营养分析中心)对已完成项目的样品进行营养素度量法、微生物负荷检查以及稳定性和保质期测试。将剩余的纤维混合物包装成小袋并保持在4℃和60-70%湿度下,以便长期储存。在一些实施例中,纤维混合物在室温下稳定至少1年。
本文所描述的纤维混合物包括有效地促进基础联盟的成员增加SCFA产生的多样化物理化学结构的纤维。多样化物理化学结构赋予纤维促进微生物基础联盟的能力,尽管在个体之间的联盟成员中存在无数预期的差异。肠道细菌的基础联盟能够利用不可消化但可发酵的碳水化合物,并且作为健康肠道微生物群的基础在肠道生态系统中占据主导地位。肠道细菌的基础联盟提供支持人类健康的SCFA,包含但不限于乙酸、丁酸和丙酸酯。在一些实施例中,SCFA生产者通过产生SCFA在肠道生态系统中发挥结构性作用,所述SCFA使肠道酸化并创造不利于致病和有害细菌的肠道环境,从而产生抗微生物剂并占据可用的生态位(竞争排斥效应)等。
许多肠道细菌具有发酵碳水化合物的遗传能力,但并非所有肠道细菌都同样有效地产生SCFA。肠道细菌对酸化的肠道环境的耐受性也不同。不受理论的束缚,在许多具有产生SCFA的遗传能力的肠道细菌中,只有一个选择组是活跃的SCFA生产者,所述生产者可以形成相互作用的组(例如,通过交叉喂养或其它机制),所述相互作用的组共同作为“联盟”来发酵碳水化合物并产生SCFA。这个SCFA生产者联盟可以被视为健康肠道微生物群的基础。在一些实施例中,可以使用靶向如V4、V3-V4等可变区或全长基因中的一个或几个的16SrRNA扩增子测序来分析微生物群。微生物群也可以基于鸟枪宏基因组学来分析。
纤维混合物主要旨在作为补充物消耗(例如,与水混合并且作为饮料消耗),或者可以将其掺入到日常食品中(例如,作为常规面粉的替代物)以恢复和/或维持支持人类健康的肠道微生物群。例如,纤维混合物可以作为冰沙、烘焙产品,作为面粉的部分的替代物消耗。
在施用本文所描述的纤维混合物调配物的每个和每一个实施例中,纤维混合物调配物可以作为包括所有组分的单个组合单位或作为多个单位施用或消耗,其中所述单位中的每个单位包括纤维混合物调配物的组分中的至少一种组分,使得所述多个单位的施用/消耗总共提供纤维混合物调配物的单个组合单位的所有组分。例如,纤维混合物调配物可以以多个单位消耗或施用:包括麸皮的一个单位、包括菊粉的一个单位和包括抗消化麦芽糊精的一个单位。在另一个实施例中,纤维混合物调配物可以以多个单位消耗或施用:包括麸皮和菊粉的一个单位和包括抗消化麦芽糊精的一个单位。本文涵盖另外的多个单位施用。
本文所描述的纤维混合物调配物适用于普通群体。在一个实施例中,可以向希望维持健康肠道微生物群的健康个体施用本文所描述的纤维混合物调配物。在另一个实施例中,向患有肠道微生物群失调或有风险患有肠道微生物群失调的有需要的个体施用本文所描述的纤维混合物调配物。
本公开的其它方面涉及用于促进有需要的受试者的健康肠道微生物组的方法,所述方法包括向所述受试者肠内施用有效量的调配物,所述调配物包括麸皮、菊粉和抗消化麦芽糊精的混合物,其中所述麸皮基本上由玉米麸皮、小麦麸皮、高粱麸皮和燕麦麸皮组成,其中所述混合物的来自麸皮的膳食纤维:来自菊粉的膳食纤维:来自抗消化麦芽糊精的膳食纤维的比率在约1:1:1至约4:1:1的范围内,其中所述菊粉以占所述混合物的总重量的5-10%的范围存在,并且其中所述混合物的均匀粒度介于150μm与300μm之间,其中所述有效量足以增加产生乙酸盐和产生丁酸盐的肠道细菌在所述受试者的肠道中的增殖,由此促进所述受试者的所述健康肠道微生物组。在一些实施例中,纤维混合物包括的来自麸皮的膳食纤维:来自菊粉的膳食纤维:来自抗消化麦芽糊精的膳食纤维的比率在约1:1:1至约4:1:1的范围内,其中菊粉以占混合物的总重量的7-8%的范围存在,并且其中混合物的均匀粒度介于150μm与300μm之间,其中有效量足以增加产生乙酸盐和产生丁酸盐的肠道细菌在所述受试者的肠道中的增殖,由此促进所述受试者的健康肠道微生物组。
在一些实施例中,所述产生乙酸盐和产生丁酸盐的肠道细菌物种被分类为包括以下中的至少一个的细菌属:双歧杆菌属、瘤胃球菌属、真杆菌属、梭菌属、另枝菌属、拟杆菌属、布劳特氏菌属、丁酸球菌属、丁酸单胞球菌属、柯林斯菌属、粪球菌属、多尔氏菌属、埃格特菌属、粪杆菌属、纺锤链杆菌属、肠单胞球菌属、毛梭菌属、毛螺菌科、巨型球菌属、副拟杆菌属、副普氏菌属、考拉杆菌属、罗斯氏菌属、瘤胃梭菌属或罕见小球菌属,其中所述产生乙酸盐和产生丁酸盐的肠道细菌物种被分类为包括以下中的至少一个的细菌科:氨基酸球菌科、拟杆菌科、双歧杆菌科、梭菌科、梭菌目、红蝽菌科、埃格特菌科、肠杆菌科、丹毒丝菌科、毛螺菌科、海洋丝菌科、普雷沃菌科、理研菌科、瘤胃球菌科、坦纳菌科或韦荣氏菌科。
在一些实施例中,通过靶向如V4、V3-V4等可变区或全长基因中的一个或几个的16S rRNA扩增子测序检测所述产生乙酸盐和产生丁酸盐的肠道细菌物种。在一些实施例中,16S rRNA V4扩增子测序鉴定产生乙酸盐和产生丁酸盐的肠道细菌的扩增子序列变体(ASV)特性中的至少一个。在一些实施例中,所述ASV中的每一个表示所述产生乙酸盐和产生丁酸盐的肠道细菌的独特的菌株或高度相似的菌株组。
在一些实施例中,所述有需要的受试者患有肠道微生物群失衡。在一些实施例中,所述肠道微生物群失衡的特征在于低水平的产生乙酸盐和产生丁酸盐的肠道细菌。在一些实施例中,所述低水平的产生乙酸盐和产生丁酸盐的肠道细菌少于所述有需要的受试者的总肠道微生物群的5%。在一些实施例中,所述施用增加所述产生乙酸盐和产生丁酸盐的肠道细菌。
在一些实施例中,可溶性膳食纤维(SDF):不可溶性膳食纤维(ISDF)比率在约0.5:1至约1:0.5的范围内的包括ISDF和SDF的混合物的纤维混合物调配物对肠道微生物群组合物具有协同作用,从而促进产生乙酸盐和产生丁酸盐的细菌的生长并抑制病原体和有害细菌的生长。在一些实施例中,所述纤维混合物调配物恢复更健康肠道微生物群。在一些实施例中,纤维混合物调配物恢复更健康肠道微生物群并缓解已知患有肠道微生物群失衡的患有各种疾病或适应症的受试者的症状。在一些实施例中,纤维混合物调配物缓解患有肥胖、前期糖尿病、2型糖尿病、多发性硬化症、帕金森病、普拉德·威利综合征或癌症化疗的副作用缓解的患者的症状。
在一些实施例中,所述有需要的受试者患有前期糖尿病。在一些实施例中,所述有需要的受试者是肥胖者。在一些实施例中,所述有需要的受试者患有2型糖尿病。在一些实施例中,所述有需要的受试者患有糖尿病肾病。在一些实施例中,所述有需要的受试者是患有如COVID-19等呼吸道病毒感染的肥胖者。在一些实施例中,所述有需要的受试者患有前期糖尿病与如COVID-19等呼吸道病毒感染。在一些实施例中,所述有需要的受试者是患有如COVID-19等呼吸道病毒感染的糖尿病患者。
糖尿病患者或前期糖尿病患者的肠道中的病原体过度生长可能会导致更严重的COVID-19形式。此类病原体可能导致细胞因子风暴和败血症,所述细胞因子风暴和败血症是这些高风险患者死亡的主要原因。
在一些实施例中,所述有需要的受试者患有多发性硬化症。在一些实施例中,所述有需要的受试者患有多发性硬化症。在一些实施例中,所述有需要的受试者患有帕金森病。在一些实施例中,所述有需要的受试者患有普拉德·威利综合征。
纤维混合物也可以在体外系统中用作标准化试剂(在已知浓度下具有多样化物理化学结构的可发酵碳水化合物的供应),例如图2中的体外发酵,以直接对不同个体的肠道微生物群的细菌发酵能力进行比较。此类发酵测定可以用作肠道微生物群功能的诊断测试测定。
剂型
本文所描述的纤维混合物调配物的剂量单位可以混合在一起或组合,使得在调配物的组分之间和/或之中形成离子键或共价键。本文所描述的纤维混合物调配物可以使用制药领域普通技术人员已知的剂型肠内施用(例如,通过口服或直肠途径)。根据递送的特定位置或方法,可以使用不同的剂型(例如,片剂、胶囊、丸剂、粉末、颗粒剂、酏剂、酊剂、悬浮液、糖浆和乳液)向有需要的患者提供本文所描述的纤维混合物调配物。本文所描述的纤维混合物调配物也可以作为本文所描述的组分中的任一种的盐形式施用。
本文所描述的纤维混合物调配物可以与基于预期施用形式和常规药学实践选择的合适的药用盐、缓冲剂、稀释剂、增补剂、赋形剂和/或载体(在本文中统称为药学上可接受的载体或载体材料)混合施用。根据施用模式,本文所描述的纤维混合物调配物可以被调配成提供例如口服或直肠施用的最大和/或一致剂量。虽然本文所描述的纤维混合物调配物可以单独施用,但其通常以与药学上可接受的载体混合的稳定盐形式提供。载体可以是固体或液体,取决于所选择的施用的类型和/或位置。
在以下参考文献中的一个或多个中描述了用于制备有用的剂型——本文所描述的纤维混合物调配物的技术和组合物:Anderson,Philip O.;Knoben,James E.;Troutman,William G,编辑,《临床药物数据手册(Handbook of Clinical Drug Data)》,第10版,麦格劳-希尔出版社(McGraw-Hill),2002;Pratt和Taylor编辑,《药物作用原理(Principles ofDrug Action)》,第3版,纽约的丘吉尔利文斯通(Churchill Livingston,New York),1990;Katzung编辑,《基础与临床药理学(Basic and Clinical Pharmacology)》,第9版,麦格劳-希尔出版社,2007;Goodman和Gilman,编辑,《治疗学的药理学基础(The PharmacologicalBasis of Therapeutics)》,第10版,麦格劳-希尔出版社,2001;《雷明顿氏药物科学(Remington's Pharmaceutical Sciences)》,第20版,利平科特·威廉斯和威尔金斯出版公司(Lippincott Williams&Wilkins.),2000;《马丁代尔大药典(Martindale,The ExtraPharmacopoeia)》,第32版(伦敦的医药出版社(The Pharmaceutical Press,London),1999);所述参考文献中的每一个以全文引用的方式并入本文。
例如,本文所描述的纤维混合物调配物可以包含在片剂中。片剂可以含有例如合适的粘合剂、润滑剂、崩解剂、着色剂、调味剂、流动诱导剂和/或熔化剂。例如,口服施用可以呈片剂、凝胶胶囊、囊片或胶囊的剂量单位形式,其中活性药物组分与无毒的药学上可接受的惰性载体(如乳糖、明胶、琼脂、淀粉、蔗糖、葡萄糖、甲基纤维素、硬脂酸镁、磷酸二钙、硫酸钙、甘露醇、山梨糖醇、其混合物等)组合。与本文所描述的纤维混合物调配物一起使用的合适的粘合剂包含:淀粉、明胶、天然糖(例如,葡萄糖或β-乳糖)、玉米甜味剂、羧甲基纤维素、聚乙二醇、蜡等。与本文所描述的纤维混合物调配物一起使用的润滑剂可以包含:油酸钠、硬脂酸钠、硬脂酸镁、苯甲酸钠、乙酸钠、氯化钠、其混合物等。崩解剂可以包含:淀粉、甲基纤维素、琼脂、膨润土、其混合物等。
本文所描述的纤维混合物调配物可以以脂质体递送系统的形式施用,例如小单层囊泡、大单层囊泡和多层囊泡,无论是带电的还是不带电的。脂质体可以包含一种或多种:磷脂(例如,胆固醇)、硬脂胺和/或磷脂酰胆碱、其混合物等。
本文所描述的纤维混合物调配物也可以与一种或多种可溶性、可生物降解、生物可接受聚合物偶联作为药物载体或作为前药。此类聚合物可以包含:聚乙烯吡咯烷酮、吡喃共聚物、聚(N-(2-羟丙基)甲基丙烯酰胺)-苯酚、聚羟基乙基天冬氨酸-间苯二酚或被棕榈酰基残基取代的聚氧化乙烯-聚赖氨酸、其混合物等。此外,本文所描述的纤维混合物调配物可以与一种或多种可生物降解聚合物偶联以实现本文所描述的纤维混合物调配物的控释。与本文所描述的纤维混合物调配物一起使用的可生物降解聚合物包含:聚乳酸、聚乙醇酸、聚乳酸和聚乙醇酸的共聚物、聚ε己内酯、聚羟基丁酸、聚原酸酯、聚缩醛、聚二氢吡喃、聚氰基丙烯酸酯以及水凝胶的交联或两亲嵌段共聚物、其混合物等。
在一个实施例中,明胶胶囊(凝胶胶囊)可以包含本文所描述的纤维混合物调配物和粉末状载体,如乳糖、淀粉、纤维素衍生物、硬脂酸镁、硬脂酸等。类似的稀释剂可以用于制造压制片剂。片剂和胶囊两者都可以作为速释、混释或缓释调配物制造以在几分钟至几小时的时间段内提供本文所描述的纤维混合物调配物的一定范围的释放。压制片剂可以是糖包衣的或膜包衣的,以掩蔽任何令人不愉快的味道并且保护片剂免受大气影响。肠溶包衣可以用于在例如胃肠道中提供选择性崩解。
对于液体剂型的口服施用,本文所描述的纤维混合物调配物的组分可以与任何口服的、无毒的、药学上可接受的惰性载体(如乙醇、甘油、水等)组合。合适的液体剂型的实例包含在水、药学上可接受的脂肪和油、醇或其它有机溶剂中的溶液或悬浮液,包含酯、乳剂、糖浆剂或酏剂、悬浮液、由非泡腾颗粒重构的溶液和/或悬浮液以及由泡腾颗粒重构的泡腾制剂。此类液体剂型可以含有例如合适的溶剂、防腐剂、乳化剂、悬浮剂、稀释剂、甜味剂、增稠剂和熔化剂、其混合物等。
本文所描述的用于口服施用的纤维混合物调配物的液体剂型还可以包含增加患者对调配物的耐受性并且因此促进对给药方案的依从性的着色剂和调味剂。通常,水、合适的油、盐水、右旋糖水溶液(例如,葡萄糖、乳糖和相关糖溶液)和乙二醇(例如,丙二醇或聚乙二醇)可以用作肠胃外溶液的合适载体。用于肠胃外施用的溶液通常包含活性成分的水溶性盐、合适的稳定剂和必要时的缓冲盐。如亚硫酸氢钠、亚硫酸钠和/或抗坏血酸等抗氧化剂,无论是单独使用还是组合使用,都是合适的稳定剂。还可以包含柠檬酸和其盐以及EDTA钠以增加稳定性。另外,肠胃外溶液可以包含药学上可接受的防腐剂,例如苯扎氯铵、对羟基苯甲酸甲酯或对羟基苯甲酸丙酯和/或氯丁醇。合适的药物载体描述于《雷明顿氏药物科学》,马克出版有限公司(Mack Publishing Company),这是本领域的标准参考文本,所述参考文献的相关部分通过引用并入本文。
胶囊:胶囊可以例如通过用本文所描述的纤维混合物调配物、10至500毫克粉末状活性成分、5至150毫克乳糖、5至50毫克纤维素和6毫克硬脂酸镁各自填充标准两件式硬明胶胶囊来制备。
软明胶胶囊:活性成分(本文所描述的纤维混合物调配物)的混合物溶于如大豆油、棉籽油或橄榄油等可消化的油。制备活性成分并通过使用正排量泵将其注射到明胶中以形成含有例如10-500毫克活性成分的软明胶胶囊。将胶囊洗涤并干燥。
片剂:通过常规程序批量制备片剂,使得剂量单位可以是例如100-1,500毫克本文所描述的纤维混合物调配物、0.2毫克胶体二氧化硅、5毫克硬脂酸镁、50-275毫克微晶纤维素、11毫克淀粉和98.8毫克乳糖。可以施加适当的包衣以增加适口性或延迟吸收。
为了提供具有本文所描述的纤维混合物调配物的泡腾片,将适当量的例如柠檬酸一钠和碳酸氢钠共混在一起,并且然后在不存在水的情况下辊压以形成薄片,然后将所述薄片压碎以得到粒化物。然后将粒化物与活性成分、药物和/或其盐、常规珠粒或填充剂以及任选地甜味剂、调味剂和润滑剂组合。
悬浮液:制备用于口服施用的水性悬浮液,使得每5ml含有100mg细分的活性成分(本文所描述的纤维混合物调配物)、200mg羧甲基纤维素钠、5mg苯甲酸钠、1.0g山梨糖醇溶液、U.S.P.和0.025ml香草醛。
对于微型片剂,本文所描述的纤维混合物调配物被压制成硬度在6至12Kp的范围内。最终片剂的硬度受用于制备颗粒剂或粒化物的线性辊压强度的影响,所述线性辊压强度受例如碳酸氢一钠和碳酸氢钠的粒度的影响。对于较小粒度,可以使用约15至20KN/cm的线性辊压强度。
合适的口服剂型的实例包含在水、药学上可接受的脂肪和油、醇或其它有机溶剂中的溶液或悬浮液,包含酯、乳剂、糖浆剂或酏剂、悬浮液、由非泡腾颗粒重构的溶液和/或悬浮液以及由泡腾颗粒重构的泡腾制剂。此类液体剂型可以含有例如合适的溶剂、防腐剂、乳化剂、悬浮剂、稀释剂、甜味剂、增稠剂和熔化剂。口服剂型任选地含有调味剂和着色剂。肠胃外形式还可以包含矿物质和其它材料,以使其与所选择的递送系统相容。
本文所描述的纤维混合物调配物的组合物可以被调配用于速释、快释、缓释、两相释放等。“速释”意指一旦释放开始并且释放在施用后不超过约2分钟内开始,在数秒至不超过约30分钟的时间段内将活性剂释放到环境中。速释在药物释放中未表现出显著延迟。“快释”意指一旦释放开始并且释放可以在施用后几分钟内或施用后延迟期(滞后时间)期满后开始,在1-59分钟或0.1分钟至三小时的时间段内将活性剂释放到环境中。如本文所使用的,术语“缓释”特性假设如制药科学领域中广泛公认的定义。缓释剂型将在延长时间段内以基本上恒定的速率释放药物或将在延长时间段内递增地释放基本上恒定量的药物。与以常规剂型(例如,溶液或快释常规固体剂型)呈现的药物相比,缓释片剂通常影响给药频率的至少两倍降低。“控释”意指在约八小时至约12小时、16小时、18小时、20小时、一天或一天以上的时间段内将活性剂释放到环境中。“缓释”意指在装置施用于的受试者的血液或靶组织中维持恒定的药物水平的活性剂的缓释。关于药物释放,术语“控释”包含术语“缓释(extended release、prolonged release、sustained release或slow release)”,因为这些术语用于制药科学。控释可以在施用后几分钟内或在延迟期(滞后时间)期满后开始。
缓释剂型是提供缓慢的药物释放速率,使得药物例如在3小时、6小时、12小时、18小时、一天、2天或更多天、一周或2周或更多周的时间段内缓慢且大致连续地释放的剂型。
定时释放剂型是在从最初暴露于使用环境的时刻起测量的预定时间段后开始释放药物的剂型。
靶向释放剂型通常是指设计成将本文所描述的纤维混合物调配物递送到受试者的胃肠道的特定部分的口服剂型。示例性靶向剂型是将药物递送到受试者的中间至下部肠道但不递送到受试者的胃或口中的肠道剂型。其它靶向剂型可以递送到胃肠道的其它部分,如胃、空肠、回肠、十二指肠、盲肠、大肠、小肠、结肠或直肠。
在一些实施例中,将纤维混合物调配物与水溶液混合。在一些实施例中,将有效量的纤维混合物调配物与水溶液混合。例如,纤维混合物调配物可以通过在500ml水中混合30g纤维混合物来制备。在一些实施例中,30g纤维混合物包括约11g膳食纤维。
在一些实施例中,本文所描述的调配物可以以约60克/天服用而没有不良肠道反应。在一些实施例中,调配物可以以在约1g至约120g/天的范围内的剂量向有需要的受试者施用而没有不良肠道反应。在一些实施例中,本文所描述的调配物可以以约30-120克、约30-90克、约30-60克、约30-50克或约30-40克/天服用而没有不良肠道反应。
在一些实施例中,有效量的调配物包括每天约10至50克膳食纤维。在一些实施例中,有效量的调配物包括每天约10至120克膳食纤维。在一些实施例中,有效量的调配物包括每天11至44克膳食纤维。例如,有效量的调配物包括每天11克膳食纤维、每天22克膳食纤维、每天33克膳食纤维或每天44克膳食纤维。在一些实施例中,有效量的调配物包括每天10、20、30、40、50、60、70、80、90、100、110、120或更多克纤维。
在一些实施例中,所述方法包括每天一次、每天两次、每天三次、每天四次向有需要的受试者口服施用有效量的调配物。在一些实施例中,所述方法包括每天四次向有需要的受试者口服施用调配物。例如,所述方法包括在每次主餐之前和晚餐之后2小时向有需要的受试者口服施用调配物。
在一些实施例中,施用使肠道中的病原体减少。例如,施用使病原体减少至少10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%或更多。在一些实施例中,施用使肠道中的病原体减少到检测不到的水平。在一些实施例中,施用使炎症水平降低。在一些实施例中,施用使细菌性败血症风险降低。
实例
以上所述的本公开的实施例的变化、修改和变更将使其对于本领域的技术人员是显而易见的。所有此类变化、修改、变更等都旨在落入仅由所附权利要求所限定的本公开的精神和范围内。
实例1-制造纤维混合物的方法
组分包含小麦麸皮、燕麦麸皮、玉米麸皮、高粱麸皮、菊粉、Fibersol-2和黄原胶。
制备了包括表3中所列比率的燕麦麸皮、玉米麸皮、高粱麸皮和小麦麸皮的纤维混合物(麸皮混合物)的不可溶性组分的示例性批次。
表3:麸皮混合物组合物。
成分 重量[%]
燕麦麸皮 51.9
玉米麸皮 13.3
高粱麸皮 19.4
小麦麸皮 15.4
将麸皮混合物送到美国安全消毒公司(Safe Sterilization USA)以进行如上文所描述的混合、研磨和烘烤。在一些实施例中,小麦麸皮、燕麦麸皮、玉米麸皮和高粱麸皮呈粉末或薄片的形式。在一些实施例中,对小麦麸皮、燕麦麸皮、玉米麸皮和高粱麸皮进行筛分以去除粒度小于150μm或大于300μm的麸皮。
可以对小麦麸皮、燕麦麸皮、玉米麸皮和高粱麸皮的样品进行加工和筛分以确认特定大小为150-300μm。
此后,以7.5%、7.5%和4%(w/w)的最终百分比将菊粉、fibersol-2和黄原胶添加到麸皮混合物中。
在一些实施例中,菊粉、fibersol-2和黄原胶呈粉末形式。
将小麦麸皮、燕麦麸皮、玉米麸皮和高粱麸皮混合,使得每种麸皮对相同量的膳食纤维做出贡献。然后将该麸皮混合物与菊粉和Fibersol-2组合,使得来自麸皮混合物的膳食纤维与来自菊粉的膳食纤维与来自Fibersol-2的膳食纤维的比率为4:1:1。最后,添加黄原胶以实现4%(w/w)的总百分比。
纤维混合物的每个组分的百分比(w/w)为:燕麦麸皮42.0%、高粱麸皮15.8%、小麦麸皮12.5%、玉米麸皮10.8%、菊粉7.5%、Fibersol-2 7.5%和黄原胶4.0%,如表2所示。
燕麦麸皮、高粱麸皮、小麦麸皮和玉米麸皮首先以特定比率混合。对该麸皮混合物进行研磨以产生介于150与300μm之间的均匀粒度,以特定比率与菊粉和Fibersol-2混合,以4%(w/w)的百分比添加黄原胶,并且最终在135℃下烘烤5分钟以进行灭菌。然后将NBT-NM108包装到热密封的箔袋内并保持在4℃和60-70%湿度下,以便长期储存。
每种成分和最终产物的营养特性(包含总膳食纤维含量)可以由ISO17025认可的食品营养实验室(Eurofins营养分析中心)确定。
每种成分的微生物负荷、稳定性和保质期可以由ISO 17025认可的食品营养实验室确定。
实例2发酵特性
为了探索不同纤维组合的发酵特性和其与肠道微生物群的相互作用,将15种不同的纤维配方与来自健康供体的人类粪便样品一起在体外厌氧发酵48小时。这些纤维配方是以不同比率组合的可溶性膳食纤维(SDF)和不可溶性膳食纤维(ISDF)(表4)。SDF通过菊粉和fibersol-2例示;并且ISDF通过麸皮混合物例示(玉米麸皮:高粱麸皮:燕麦麸皮:小麦麸皮的纤维含量比率=1:1:1:1)。
体外培养设置
使用体外发酵确定纤维混合物组合物对人类肠道微生物群的直接影响。以1:3比率(w/v)将人类粪便物质(在收集2小时内)悬浮于基于磷酸盐缓冲盐水(PBS)的培养基(表5)中。然后,在厌氧条件下在
Figure BDA0003954184680000202
下以1:4比率将悬浮液与具有每种纤维混合物的基于PBS的纤维溶液(表4)混合6、12、24和48小时。表4中示出了麸皮混合物(w/v)的最终浓度。该系统被设置为一式三份或一式五份。
在培养之前,麸皮混合物用消化酶(胃蛋白酶、淀粉葡糖苷酶和胰酶)预处理并透析以模拟人肠胃系统中宏量营养物的消化和吸收。
表4.15种纤维配方的组合物。
Figure BDA0003954184680000201
Figure BDA0003954184680000211
*重量百分比是发酵系统中这些纤维的重量[w/v]。
表5.PBS培养基(1000ml)。
Figure BDA0003954184680000212
在发酵的基线和不同时间点收集或测量发酵样品、气体产量和pH数据。用Iontorrent平台对这些发酵样品的16S rRNA基因V4区进行测序。所有样品尺寸都缩小到20,000个读段。保留1499个ASV以供分析。每个ASV表示独特类型的肠道细菌。根据这些序列的新颖性,每个ASV的分类位置以不同水平分配。
与具有相同浓度的SDF的那些混合物相比,使用ISDF与SDF的混合物的发酵具有更高的气体产量。
在48小时发酵后记录所有15种不同纤维配方的气体产量(表6)。气体产量可以反映纤维和其配方的可发酵性。相较于fibersol-2,菊粉发酵产生更多的气体,指示菊粉可以是快速可发酵SDF,而fibersol-2是缓慢可发酵SDF。两个SDF比ISDF,即麸皮混合物产生更多的气体,指示SDF比ISDF更具可发酵性。1%F1%I和2%菊粉比1%菊粉产生更少的气体,这可能是由于由这两种纤维配方诱导的低pH抑制产生气体的细菌的存活或生长(表7)。
表6示出了用不同纤维进行48小时发酵后的气体产量。图基检验(Tukey test)用于气体产量比较。显著性差异用字母表示。空白仅用粪便样品进行发酵,空白组中不添加纤维。
表6
Figure BDA0003954184680000213
Figure BDA0003954184680000221
*P<0.05。如果组具有相同的字母,这意味着这两个组之间没有显著差异。例如,1%菊粉和0.5%F0.5%I1%B组两者具有f,这意味着其气体产量结果没有显著差异。
ISDF与SDF的组合比相同浓度的SDF具有更高的气体产量,这示出了SDF与ISDF之间的协同发酵作用。例如,所产生的气体体积:1%I1%B>2%菊粉;1%F1%B≈2%Fibersol2;0.5%F0.5%I1%B>1%F1%I。但是具有低ISDF/SDF比率的纤维没有示出此类促进。例如,0.5%F0.5%I0.1%B组产生与0.5%F0.5%I类似的气体。
用SDF发酵比用具有相同浓度的ISDF发酵产生更多的酸。
据报道,pH能够调节发酵模式(Mohd-Zaki,Z.等人,葡萄糖发酵中pH调节模式对产物选择和过程稳定性的影响(Influence of pH Regulation Mode in GlucoseFermentation on Product Selection and Process Stability.)《微生物(Microorganisms)》,2016.4(1):第2页)。在高pH下,丙酸盐类型发酵是主要过程,在不产生任何大量气体的情况下产生丙酸盐和乙酸盐。当pH降低时,发酵类型可以转变为丁酸盐类型或乙醇类型发酵,从而产生丁酸盐或乙醇和乙酸盐,其中氢气和二氧化碳作为副产物。表7中报告了基线处的pH数据和发酵终点。SDF比ISDF更显著地降低pH。关于SDF,菊粉比fibersol-2更显著地降低pH。将气体产量和pH数据组合,2%菊粉比1%菊粉产生更少的气体,这可能是因为2%菊粉组的3.78±0.02的较低pH对许多产生气体的细菌具有抑制力。在此类低pH下,一些产生气体的细菌的生长和存活可能被阻止或减少并且不能产生比1%菊粉组更多的气体。与菊粉相比,Fibersol-2产生的酸和气体更少,这也与先前的研究一致(lickinger,E.A.等人,基于葡萄糖的低聚糖表现出不同的体外发酵模式并影响狗的体内表观营养消化率和微生物群体(Glucose-Based Oligosaccharides Exhibit DifferentIn Vitro Fermentation Patterns and Affect In Vivo Apparent NutrientDigestibility and Microbial Populations in Dogs.)《营养学杂志(The Journal ofNutrition)》,2000.130(5):第1267-1273页)。将ISDF与SDF组合的配方优化pH,使得可以如高量气体产量所指示进行更多发酵。
表7示出了基线处的pH和用不同纤维发酵的终点。威尔科克森检验(Wilcoxontest)用于比较发酵前后的pH。星号指示发酵前(时间0小时)与发酵后(时间48小时)之间的显著差异。**P<0.01。在基线处或在48小时发酵后,图基检验用于所有处理之间的pH比较。在发酵前,16个组的pH之间没有显著差异。在发酵后,16个组的pH之间的显著差异用字母表示。
表7
Figure BDA0003954184680000231
气体的产生和pH值的变化是反映发酵程度的两个主要指标。出乎意料的是,本发明的发明人发现SDF可以增加ISDF的可发酵性,如协同气体产量所指示的。不受理论的束缚,当细菌与SDF和ISDF的混合物一起培养时,一些产生气体的细菌比仅用SDF或ISDF单独培养时生长得更快。这显示SDF和ISDF的组合对发酵的协同作用。
实例3:由纤维配方诱导的粪便微生物群组合物变化
在用不同的纤维组合发酵粪便微生物群后,评估微生物群组合物的变化。总共鉴定了1499个ASV,包含可以在所有处理组和时间点检测到的所有独特的细菌。
肠道微生物群组合物在用所有15种纤维配方进行48小时发酵后示出显著的偏移,如基于布雷柯蒂斯距离的主坐标分析(PCoA,多变量方差分析(MANOVA)测试)所示。基于ASV的布雷柯蒂斯距离的β多样性示出,与基线样品相比,用纤维配方进行的48小时发酵诱导微生物群沿着PC1偏移(图2)。在48小时时,将所有基线样品与空白组聚集在一起。对于来自沿着PC1的48小时发酵的样品,通过处理组存在显著的聚类并且这些组基于其可发酵性被分离。将最慢的可发酵ISDF组,即1%麸皮混合物和2%麸皮混合物聚类在一起并定位在PCoA图的右侧。来自具有更快的可发酵SDF和更高量的SDF的组的微生物群沿着PC1朝着左侧偏移。具有菊粉的组朝着左侧定位,其中2%fibersol-2组位于PCoA图的左侧。
实例4:对纤维混合物的阳性应答者或阴性应答者
鉴定了对不同纤维组合的阳性应答者和阴性应答者(参见图14的表格)。
执行主坐标分析(PCoA)以基于布雷柯蒂斯距离比较和可视化发酵前和发酵后样品的变化模式。选择主坐标以供进一步分析,可以沿着所述主坐标分离发酵前和发酵后样品。在每个ASV的丰度与所选择的主坐标的评分之间执行皮尔逊相关性(Pearsoncorrelation)(de Goffau等人《糖尿病(Diabetes)》,2013,62(4):1238-44)。通过Benjamini-Hochberg程序调整P值以控制由多重统计比较产生的假阳性。与所选择的主坐标具有显著相关性(经调整的P<0.05)的ASV被鉴定为应答者。
ISDF的发酵:当用1%麸皮混合物培养时,53个ASV为阳性应答者并且43个为阴性应答者。在2%麸皮混合物中,83个为阳性应答者并且44个为阴性应答者。当麸皮混合物剂量从1%倍增时,42个新ASV阳性地应答(图3)。一个ASV,即粪球菌属ASV004E在2%麸皮混合物中为阳性应答者,但在1%麸皮混合物中为阴性应答者。1%或2%麸皮混合物共享33个阴性应答者,但两者都有约10个独特的阴性应答者(图3)。数据表明,底物剂量与微生物群组合物之间的关系是动态的,而不是简单的线性关系。
SDF的发酵:菊粉浓度的增加减少了阳性应答ASV的数量(在1%菊粉中为43个而在2%菊粉中为34个),但增加了阴性应答ASV的数量(在1%菊粉中为50个而在2%菊粉中为75个)。在1%菊粉中的43个阳性应答者中,当菊粉剂量倍增时,15个应答者不再应答(图4),这可能是因为这15个ASV在由2%菊粉诱导的较低pH下无法良好生长。
另一种可溶性纤维,即fibersol-2浓度的增加也减少了阳性应答ASV的数量(在1%fibersol-2中为73而在2%fibersol-2中为60;图5),但增加了阴性应答ASV的数量(在1%fibersol-2中为38而在2%fibersol-2中为48;图5)。
将不同的SDF、菊粉和fibersol-2与粪便微生物群组合并发酵。SDF浓度的增加增加了阳性应答ASV的数量(在0.5%F0.5%I中为26而在1%F1%I中为34;图6)和阴性应答ASV的数量(在0.5%F0.5%I中为24而在1%F1%I中为55;图6)。
对来自0.5%fibersol-2:0.5%菊粉、1%fibersol-2:1%菊粉、1%fibersol-2、2%fibersol-2、1%菊粉和2%菊粉组的阳性应答者进行比较(图7)。来自1%fibersol-2:1%菊粉的独特的10个阳性应答者含有4种潜在的产生丁酸盐的细菌,包含布劳特氏菌属ASV005H、马赛布劳特氏菌ASV002F(Blautiamassiliensis ASV002F)、布劳特氏菌属ASV006C、马赛布劳特氏菌ASV04LB(Blautiamassiliensis ASV04LB)和一种有益细菌,即双歧杆菌属ASV06TU。来自0.5%fibersol-2:0.5%菊粉的独特的2个阳性应答者含有一种有益细菌,即双歧杆菌属ASV0004。
数据显示,与单个SDF组相比,两种不同SDF的组合促进了更多有益细菌。数据显示,底物剂量与微生物群组合物之间的关系是动态的,而不是简单的线性关系。
单个SDF与ISDF的组合发酵:与单独的SDF或单独的ISDF组相比,单个SDF、菊粉或fibersol-2与ISDF的组合引入了新的阴性应答者和阳性应答者。与1%或2%Fibersol-2和1%或2%麸皮混合物组相比,fibersol-2和麸皮混合物的组合具有8个独特的阳性应答者(图8)。这8个独特的阳性应答者包含三种潜在的产生丁酸盐的细菌,如丁酸梭菌ASV07RL(Clostridium butyricum ASV07RL)、粪杆菌属ASV002D和布劳特氏菌属ASV006C。
与1%或2%菊粉和1%或2%麸皮混合物组相比,菊粉和麸皮混合物的组合具有9个独特的阳性应答者(图9)。这9个独特的阳性应答者含有有益细菌,即双歧杆菌属ASV0004和三种潜在的产生丁酸盐的细菌,包含厌氧棒杆菌属ASV001P(Anaerostipes ASV001P)、厌氧棒杆菌属ASV002J(Anaerostipes ASV002J)和丁酸梭菌ASV07RL。
这些数据显示,协同作用存在于单个SDF与ISDF的组合中。与单独的单个SDF或ISDF相比,单个SDF与ISDF的组合促进独特的有益细菌。
SDF与ISDF的组合发酵:用粪便微生物群发酵两种SDF、菊粉和fibersol-2与ISDF的组合。鉴定了其阳性应答者和阴性应答者。对SDF与ISDF之间的不同比率进行比较。
首先,将SDF:ISDF=1:1(0.5%F0.5%I1%B)、SDF:ISDF=1:0.5(0.5%F0.5%I0.5%B)和SDF:ISDF=1:0.1(0.5%F0.5%I0.1%B)与SDF配方(0.5%F0.5%I)组进行比较。
SDF:ISDF=1:0.1(0.5%F0.5%I0.1%B)组中的15个阳性应答者中的1个阳性应答者未由0.5%F0.5%I组促进。由SDF:ISDF=1:0.1(0.5%F0.5%I0.1%B)组促进的唯一一个新ASV是潜在的产生丁酸盐的细菌,即副拟杆菌属ASV000Q(图10)。
SDF:ISDF=1:0.5(0.5%F0.5%I0.5%B)组中的38个阳性应答者中的18个阳性应答者未由0.5%F0.5%I组促进(图10)。SDF:ISDF=1:0.5(0.5%F0.5%I0.5%B)组的10个独特的阳性应答者还含有三种潜在的产生丁酸盐的细菌,即副拟杆菌属ASV000L、副拟杆菌属ASV001J和丁酸球菌属ASV0067。
SDF:ISDF=1:1(0.5%F0.5%I1%B)组中的18个阳性应答者中的10个阳性应答者未由0.5%F0.5%I组促进(图10)。SDF:ISDF=1:1(0.5%F0.5%I1%B)组的3个独特的阳性应答者含有一种潜在的产生丁酸盐的细菌,即布劳特氏菌属ASV005H。7个ASV由SDF:ISDF=1:1(0.5%F0.5%I1%B)和SDF:ISDF=1:0.5(0.5%F0.5%I0.5%B)组两者促进(图10),所述组包含有益细菌,即双歧杆菌属ASV000J和三种潜在的产生丁酸盐的细菌,即布劳特氏菌属ASV001A、丁酸梭菌ASV07IF(Clostridiumbutyricum ASV07IF)和狄氏副拟杆菌ASV000V(Parabacteroides distasonis ASV000V)。
SDF:ISDF=1:1(0.5%F0.5%I1%B)和SDF:ISDF=1:0.5(0.5%F0.5%I0.5%B)组共享不被SDF:ISDF=1:0.1(0.5%F0.5%I0.1%B)和0.5%F0.5%I组抑制的14个阴性应答者(图11)。这14种独特的细菌中有阿克曼菌属ASV0007(Akkermansia ASV0007)和嗜胆菌属ASV0022(Bilophila ASV0022)。据报道,紧紧粘附到肠上皮的一些阿克曼菌属物种与葡聚糖硫酸钠诱导的复发性结肠炎相关(Berry,D.等人,在经历复发性结肠炎的小鼠中与炎症史相关的肠道微生物群特征(Intestinal Microbiota Signatures Associated withInflammation History in Mice Experiencing Recurring Colitis.)《微生物学前沿(Frontiers in microbiology)》,2015,6:第1408-1408页)。
嗜胆菌属的成员通过产生如硫化氢等有毒代谢物和如内毒素等促炎性抗原已经被证明是致病的且有害的(Devkota,S.等人,膳食脂肪诱导的牛磺胆酸促进Il10-/-小鼠的致病共生菌扩张和结肠炎(Dietary-fat-induced taurocholic acid promotespathobiont expansion and colitis in Il10-/-mice.)《自然(Nature)》,2012.487(7405):第104-108页)。
促进产生丁酸盐的细菌和抑制潜在的有害细菌指示,SDF:ISDF=1:1(0.5%F0.5%I1%B)和SDF:ISDF=1:0.5(0.5%F0.5%I0.5%B)组可以对宿主产生更多益处。再次,这些数据表明,与单个SDF或ISDF组相比,SDF和ISDF组的组合中存在的协同作用可以带来更多益处。
其次,将SDF:ISDF=1:1(0.5%F0.5%I1%B)、SDF:ISDF=0.5:1(0.25%F0.25%I1%B)和SDF:ISDF=0.1:1(0.05%F0.05%I1%B)组与1%麸皮混合物组进行比较。
SDF:ISDF=1:1(0.5%F0.5%I1%B)组中的18个阳性应答者中的11个阳性应答者未由1%麸皮混合物组促进(图12)。在这11个ASV中,5个ASV也由SDF:ISDF=0.5:1(0.25%F0.25%I1%B)组促进,所述组包含两种潜在的有益细菌,即粪杆菌属ASV0014和布劳特氏菌属ASV001A。1个ASV由SDF:ISDF=1:1(0.5%F0.5%I1%B)组促进,所述组为双歧杆菌属ASV000J。独特的5个ASV仅由SDF:ISDF=1:1(0.5%F0.5%I1%B)促进,其含有一种有益细菌,即双歧杆菌属ASV0004以及一种潜在的产生丁酸盐的细菌,即布劳特氏菌属ASV005H。
SDF:ISDF=0.5:1(0.25%F0.25%I1%B)组中的44个阳性应答者中的24个阳性应答者未由1%麸皮混合物组(图12)促进。在这24个ASV中,8个ASV也由SDF:ISDF=1:1(0.5%F0.5%I1%B)组促进,所述组包含三种潜在的产生丁酸盐的细菌,即丁酸单胞球菌属ASV0036、霍氏真杆菌组ASV003U(Eubacteriumhallii group ASV003U)和布劳特氏菌属ASV001A。仅由SDF:ISDF=0.5:1(0.25%F0.25%I1%B)促进的独特的12个ASV含有一种潜在的产生丁酸盐的细菌,即丁酸梭菌ASV07RL。
虽然在SDF:ISDF=0.1:1(0.05%F0.05%I1%B)组中的ISDF中仅添加了1/10的SDF,但该组中的50个阳性应答者中的16个阳性应答者未由1%麸皮混合物组促进(图12),所述组包含上述三种潜在的产生丁酸盐的细菌。这表明,可溶性纤维(即,fibersol-2和菊粉)的1/10仍然相对于1%麸皮混合物组改变特定ASV的应答,并且SDF和ISDF的组合比单独的ISDF组促进了更多的有益细菌。
在SDF:ISDF=1:1(0.5%F0.5%I1%B)组的7个独特的阴性应答者中发现一种潜在的有害细菌,即阿克曼菌属ASV0007(图13)。
总之,与1%麸皮混合物组相比,SDF:ISDF=1:1(0.5%F0.5%I1%B)、SDF:ISDF=0.5:1(0.25%F0.25%I1%B)和SDF:ISDF=0.1:1(0.05%F0.05%I1%B)组促进了更多的有益细菌。
结论
促进产生丁酸盐的细菌和抑制潜在的有害细菌指示,SDF与ISDF以SDF:ISDF=1:0.5(Fibersol:菊粉:麸皮混合物=1:1:1)和SDF:ISDF=1:1(Fibersol:菊粉:麸皮混合物=1:1:2)和SDF:ISDF=0.5:1(Fibersol:菊粉:麸皮混合物=1:1:4)组的比率组合促进了更多的有益细菌并抑制了致病细菌。
实例5
在一些实施例中,将一批包括燕麦麸皮、玉米麸皮、高粱麸皮和小麦麸皮的纤维混合物(麸皮混合物)的不溶性组分送到美国安全消毒公司以进行如实例1中所描述的混合、研磨和烘烤。此后,添加一种、两种、三种或更多种可溶性纤维。在一些实施例中,一种或多种可溶性纤维包括低聚果糖(FOS)、低聚半乳糖(GOS)、反式低聚半乳糖(TOS)、抗性淀粉(RS)、果胶低聚糖(POS)、棉子糖家族低聚糖(RFO)、聚葡萄糖、菊粉和/或fibersol-2。在一些实施例中,所述一种或多种可溶性纤维包括低聚果糖(FOS)、低聚半乳糖(GOS)、反式低聚半乳糖(TOS)、抗性淀粉(RS)、果胶低聚糖(POS)、棉子糖家族低聚糖(RFO)和/或聚葡萄糖。
所得调配物改变发酵的动力学,使得选择性地促进产生SCFA的细菌的独特组合,如实例2中所描述的。
当单独使用可溶性纤维时,剂量不能太高,因为所述可溶性纤维易于发酵并且产生可能诱导腹胀、腹泻作为不良肠道效应的大量气体。人类不能耐受高剂量的此类可溶性纤维(例如,超过20克/天)。
当与麸皮纤维混合物组合时,发酵过程减缓并且产生更少的气体,使得副作用被最小化。
在一些实施例中,本文所描述的调配物可以以60克/天服用而没有不良肠道反应。
实例6-2型糖尿病
由于患有2型糖尿病的患者是可能受益于肠道微生物群靶向干预的关键群体之一,本发明的发明人测试了表1的麸皮混合物对餐后血糖反应的影响。本发明的发明人表明,麸皮混合物在血糖控制正常、患有前期糖尿病或2型糖尿病的个体中诱导血糖的极小变化(图1A-1B),表明该纤维混合物不会对葡萄糖稳态产生负面影响。
实例7-COVID-19
所有入组的参与者年龄介于18与69岁之间,具有以下特征:(1)前期糖尿病或2型糖尿病;以及(2)基于来自CDC的症状列表的轻度至中度COVID-19样症状。轻度COVID-19症状包含发烧或寒战、咳嗽、呼吸急促或呼吸困难、疲劳、肌肉或身体疼痛、头痛、味觉或嗅觉的新丧失、喉咙痛、鼻塞或流鼻涕、恶心或呕吐以及腹泻、没有指示中度、重度或危重疾病严重程度的临床体征。中度Covid-19症状包含轻度疾病或用力时呼吸急促的任何症状,提示中度COVID-19疾病的临床体征,如呼吸速率≥20次/分钟,海平面上室内空气的氧饱和度>93%,心率≥90次/分钟,没有指示重度或危重疾病严重程度的临床体征。
具有以下情况的个体被排除在研究之外:
接受万古霉素单一疗法或口服广谱抗生素
无法接受口服流体
自我报告对调配物中的任何成分过敏或不耐受
过去30天内涉及肠腔的外科手术
乳糜泻、炎性肠病或肠易激综合征的诊断记录
怀孕或哺乳期
减肥手术
慢性肺病或中度/重度哮喘
心力衰竭、冠状动脉疾病、先天性心脏病、心肌病或肺高压
透析时的慢性肾病
慢性肝病(肝硬化)
免疫功能低下,例如癌症治疗、骨髓/器官移植、免疫缺陷、HIV/AIDS控制不佳、长期使用类固醇或其它免疫抑制药物
所有入组的参与者都接受用于治疗COVID-19的自我支持护理并且他们可以获得访问一系列针对其指定组的视频,所述视频为他们提供了研究时间表的概述以及研究期间对他们的要求。研究小组为参与者提供了用于监测体温的数字口腔温度计(美国密苏里州的Medtus公司(Medtus,MO))、用于监测氧饱和度水平和脉搏率的脉搏血氧仪(中国深圳的英美迪克医疗科技有限公司(IMDK,Shenzhen,China))以及用于监测血糖的血糖仪(美国加利福尼亚州约巴林达市的Curo Fit公司(Curo Fit,Yorba Linda,CA)),附有逐步说明。治疗组采用表2中描述的调配物,所述调配物提供可发酵的膳食纤维作为扰动以改善肠道微生物群。从第1天至第28天,调配物以饮料的形式每天服用四次(每次主餐前和晚餐后2小时)。通过将一小袋调配物混合物(30g)与500ml水混合来制备每种饮料。对照组遵循相同的时间表,除了其在没有调配物的情况下服用相同体积的水之外。在干预28天后,所有参与者留在研究中以进行随访直到第56天为止。如果参与者在研究期间需要住院,则其在住院期间停止所有研究程序,但继续留在研究中以进行随访直到第56天为止。参与者可以访问交互式在线个人仪表板以查看其研究进展和其已经报告的数据。
本文引用的所有先前的专利、出版物和测试方法均以全文引用的方式并入。
虽然已经描述了本公开的若干个实施例,但是应该理解,这些实施例仅仅是说明性的,而不是限制性的,并且许多修改对于本领域普通技术人员来说是显而易见的。例如,本文所讨论的所有尺寸仅作为实例提供,并且旨在是说明性的而不是限制性的。
此描述中明确鉴定的任何特征或元素还可以被具体地排除作为权利要求中定义的本发明的实施例的特征或元素。
序列表
<110> 拉特格斯,新泽西州立大学
<120> 纤维混合物调配物和其用途
<130> 117465-016701/PCT
<140>
<141>
<150> 63/006,896
<151> 2020-04-08
<160> 117
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 215
<212> DNA
<213> 拟杆菌属某种
<400> 1
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ctcaactgca ctcaagatat ccagtatcaa ctgcaatttt acggttgagc cgcaaacttt 180
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<210> 2
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<212> DNA
<213> 考拉杆菌属某种
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<213> 双歧杆菌属某种
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<213> 拟杆菌属某种
<400> 4
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<400> 5
cctgtttgat acccacactt tcgagcatca gcgtcagtta cagtccagca agctgccttc 60
gcaatcggag ttcttcgtga tatctaagca tttcaccgct acaccacgaa ttccgcctgc 120
ctctactgta ctcaagacac ccagtatcaa ctgcaatttt acggttgagc cgcaaacttt 180
cacaactgac ttaagcgtcc gcctacgctc ccttt 215
<210> 6
<211> 215
<212> DNA
<213> 另枝菌属某种
<400> 6
cctgtttgct ccccacgctt tcgtgcctca acgtcagata tagtttggta agctgccttc 60
gcaatcggtg ttctgtatga tctctaagca tttcaccgct acaccataca ttccgcctac 120
cgcaactact ctctagtcta acagtattag aggcagttcc ggagttaagc cccgggattt 180
cacctctaac ttatcaaacc gcctacgcac ccttt 215
<210> 7
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
[瘤胃球菌属]扭链组序列
<400> 7
cctgtttgct ccccacgctt tcgagcctca acgtcagtta ccgtccagta agccgccttc 60
gccactggtg ttcctcctaa tatctacgca tttcaccgct acactaggaa ttccgcttac 120
ctctccggta ctctagattg acagtttcca atgcagtccc ggggttgagc cccgggtttt 180
cacatcagac ttgccactcc gtctacgctc ccttt 215
<210> 8
<211> 215
<212> DNA
<213> 副拟杆菌属某种
<400> 8
cctgtttgat ccccacgctt tcgtgcttca gtgtcagtta tggtttagta agctgccttc 60
gcaatcggag ttctgcgtga tatctatgca tttcaccgct acaccacgca ttccgcctac 120
ctcaaacaca ctcaagtaac ccagtttcaa cggcaatttt atggttgagc cacaaacttt 180
caccgctgac ttaaatcacc acctacgcac ccttt 215
<210> 9
<211> 215
<212> DNA
<213> 双歧杆菌属某种
<400> 9
cctgttcgct ccccacgctt tcgctcctca gcgtcagtaa cggcccagag acctgccttc 60
gccattggtg ttcttcccga tatctacaca ttccaccgtt acaccgggaa ttccagtctc 120
ccctaccgca ctcaagcccg cccgtacccg gcgcggatcc accgttaagc gatggacttt 180
cacaccggac gcgacgaacc gcctacgagc ccttt 215
<210> 10
<211> 215
<212> DNA
<213> 罕见小球菌属某种
<400> 10
cctgtttgct acccatgctt tcgagcctca gcgtcagttg gtgcccagta gaccgccttc 60
gccactggtg ttcctcccga tatctacgca ttccaccgct acaccgggaa ttccatctac 120
ctctgcacta ctcaagaaaa acagttttga aagcaattca tgggttgagc ccatggtttt 180
cacttccaac ttgtcttccc gcctgcgctc ccttt 215
<210> 11
<211> 215
<212> DNA
<213> 副拟杆菌属某种
<400> 11
cctgtttgat ccccacgctt tcgtgcttca gtgtcagtta tagtttagta agctgccttc 60
gcaatcggag ttctgcgtga tatctatgca tttcaccgct acaccacgca ttccgcctac 120
ctcaaatata ctcaagtcaa ccagtttcaa cggcaatttt atggttgagc cacaaacttt 180
caccgctgac ttaattaacc acctacgcac ccttt 215
<210> 12
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
毛螺菌科NK4A136组序列
<400> 12
cctgtttgct ccccacgctt tcgagcctca acgtcagtta ccgtccagta agccgccttc 60
gccactggtg ttcttcctaa tatctacgca tttcaccgct acactaggaa ttccgcttac 120
ctctccggca ctccagccaa acagtttcca aagcagtccc ggcgttaagc accgggcttt 180
cacttcagac ttgccttgcc gtctacgctc ccttt 215
<210> 13
<211> 215
<212> DNA
<213> 拟杆菌属某种
<400> 13
cctgtttgat acccacactt tcgagcatca gtgtcagttg cagtccagtg agctgccttc 60
gcaatcggag ttcttcgtga tatctaagca tttcaccgct acaccacgaa ttccgcccac 120
ctctactgta ctcaagacag ccagtatcaa ctgcaatttt acggttgagc cgcaaacttt 180
cacaactgac ttaactgtcc acctacgctc ccttt 215
<210> 14
<211> 215
<212> DNA
<213> 罗斯氏菌属某种
<400> 14
cctgtttgct ccccacgctt tcgagcctca gcgtcagtaa tcgtccagta agccgccttc 60
gccactggtg ttcctcctaa tatctacgca tttcaccgct acactaggaa ttccacttac 120
ccctccgaca ctctagtccg acagtttcca atgcagtacc ggggttgagc cccgggattt 180
cacatcagac ttgccgtacc gcctgcgctc ccttt 215
<210> 15
<211> 215
<212> DNA
<213> 副拟杆菌属某种
<400> 15
cctgtttgat ccccacgctt tcgtgcatca gcgtcagtca tggcttggca ggctgccttc 60
gcaatcgggg ttctgcgtga tatctatgca tttcaccgct acaccacgca ttccgcctgc 120
ctcaaacata ctcaagcccc ccagtttcaa cggcaattct atggttgagc cacagacttt 180
caccgctgac ttaaaaggcc gcctacgcac ccttt 215
<210> 16
<211> 215
<212> DNA
<213> 拟杆菌属某种
<400> 16
cctgtttgat acccacactt tcgagcatca atgtcagtta caggttagta agctgccttc 60
gcaatcggag ttcttcgtga tatctaagca tttcaccgct acaccacgaa ttccgcctac 120
ctcaactgta ctcaagactg ccagtatcaa ttgcaatttt acggttgagc cgcaaacttt 180
cacaactgac ttaacaaccc atctacgctc ccttt 215
<210> 17
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
毛螺菌科序列
<400> 17
cctgtttgct ccccacgctt tcgagcctca gcgtcagtta tcgtccagta agccgccttc 60
gccactggtg ttcctcctaa tatctacgca tttcaccgct acactaggaa ttccacttac 120
ccctccgaca ctctagtacg acagtttcca atgcagtacc ggggttgagc cccgggcttt 180
cacatcagac ttgccgcacc gcctgcgctc ccttt 215
<210> 18
<211> 215
<212> DNA
<213> 副拟杆菌属某种
<400> 18
cctgtttgat ccccacgctt tcgtgcatca gcgtcagtca tggcttggca ggctgccttc 60
gcaatcgggg ttctgcgtga tatctaagca tttcaccgct acaccacgca ttccgcctgc 120
ctcaaacata ctcaagcccc ccagtttcaa cggcaattct atggttgagc cacagacttt 180
caccgctgac ttaaaaggcc gcctacgcac ccttt 215
<210> 19
<211> 215
<212> DNA
<213> 副拟杆菌属某种
<400> 19
cctgtttgat ccccacgctt tcgtgcatca gcgtcagtca tggcttggca ggctgccttc 60
gcgatcgggg ttctgcgtga tatctaagca tttcaccgct acaccacgca ttccgcctgc 120
ctcaaacata ctcaagcccc ccagtttcaa cggcaattct atggttgagc cacagacttt 180
caccgctgac ttaaaaggcc gcctacgcac ccttt 215
<210> 20
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
埃希氏菌属-志贺氏菌属序列
<400> 20
cctgtttgct ccccacgctt tcgcacctga gcgtcagtct tcgtccaggg ggccgccttc 60
gccaccggta ttcctccaga tctctacgca tttcaccgct acacctggaa ttctaccccc 120
ctctacgaga ctcaagcttg ccagtatcag atgcagttcc caggttgagc ccggggattt 180
cacatctgac ttaacaaacc gcctgcgtgc gcttt 215
<210> 21
<211> 215
<212> DNA
<213> 粪杆菌属某种
<400> 21
cctgtttgct acccacactt tcgagcctca gcgtcagttg gtgcccagta ggccgccttc 60
gccactggtg ttcctcccga tatctacgca ttccaccgct acaccgggaa ttccgcctac 120
ctctgcacta ctcaagaaaa acagttttga aagcagttca tgggttgagc ccatggattt 180
cacttccaac ttgttctccc gcctgcgctc ccttt 215
<210> 22
<211> 215
<212> DNA
<213> 拟杆菌属某种
<400> 22
cctgtttgat acccacactt tcgagcatca gcgtcagtta cactccagtg agctgccttc 60
gcaatcggag ttcttcgtga tatctaagca tttcaccgct acaccacgaa ttccgcccac 120
ctctactgca ctcaagactg ccagtatcaa ctgcaatttt acggttgagc cgcaaacttt 180
cacaactgac ttaacaatcc gcctacgctc ccttt 215
<210> 23
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
毛梭菌属序列
<400> 23
cctgtttgct ccccacgctt tcgagcctca acgtcagtta tcgtccagta agccgccttc 60
gccactggtg ttcctcctaa tatctacgca tttcaccgct acactaggaa ttccacttac 120
ctctccgaca ctctagcaaa acagtttcca aagcagtccc agggttgagc cctgggtttt 180
cacttcagac ttgcttcgcc gtctacgctc ccttt 215
<210> 24
<211> 215
<212> DNA
<213> 拟杆菌属某种
<400> 24
cctgtttgat acccacactt tcgagcatca gtgtcagtga cagtctagtg agctgccttc 60
gcaatcggag ttcttcgtga tatctaagca tttcaccgct acaccacgaa ttccgcccac 120
ctctactgta ctcaagactc ccagtttcaa ctgcaatttt acggttgagc cgcaaacttt 180
cacaactgac ttaacaatcc acctacgctc ccttt 215
<210> 25
<211> 215
<212> DNA
<213> 布劳特氏菌属某种
<400> 25
cctgtttgct ccccacgctt tcgagcctca acgtcagtta ccgtccagta agccgccttc 60
gccactggtg ttcctcctaa tatctacgca tttcaccgct acactaggaa ttccgcttac 120
ccctccggca ctcaagcaca gcagtttcca atgcagtcca ggggttaagc ccctgccttt 180
cacatcagac ttgctgcgcc gtctacgctc ccttt 215
<210> 26
<211> 215
<212> DNA
<213> 双歧杆菌属某种
<400> 26
cctgttcgct ccccacgctt tcgctcctca gcgtcagtga cggcccagag acctgccttc 60
gccattggtg ttcttcccga tatctacaca ttccaccgtt acaccgggaa ttccagtctc 120
ccctaccgca ctcaagcccg cccgtacccg gcgcggatcc accgttaagc gatggacttt 180
cacaccggac gcgacgaacc gcctacgagc ccttt 215
<210> 27
<211> 215
<212> DNA
<213> 粪杆菌属某种
<400> 27
cctgtttgct acccacactt tcgagcctca gcgtcagttg gtgcccagta ggccgccttc 60
gccactggtg ttcctcccga tatctacgca ttccaccgct acaccgggaa ttccgcctac 120
ctctgcacta ctcaagaaaa acagttttga aagcagttta tgggttgagc ccatagattt 180
cacttccaac ttgtcttccc gcctgcgctc ccttt 215
<210> 28
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
巨型球菌属;模糊_分类群序列
<400> 28
cccgttcgct cccctggctt tcgtgcctca gcgtcagttg tcgtccagaa agccgctttc 60
gccactggta ttcctcctaa tatctacgca tttcaccgct acactaggaa ttctgctttc 120
ctctccgata ctccagtctc ccagtttccg tcccctcacg gggttaagcc ccgcactttt 180
aagacagact taagagaccg cctgcgcacc cttta 215
<210> 29
<211> 215
<212> DNA
<213> 副拟杆菌属某种
<400> 29
cctgtttgat ccccacgctt tcgtgcttca gtgtcagtta tagtttagta agctgccttc 60
gcaatcggag ttctgcgtga tatctatgca tttcaccgct acaccacgca ttccgcctac 120
ctcaaatata ctcaagctaa ccagtttcaa cggcaatttt atggttaagc cacaaacttt 180
caccgctgac ttaataagcc acctacgcac ccttt 215
<210> 30
<211> 215
<212> DNA
<213> 拟杆菌属某种
<400> 30
cctgtttgat acccacactt tcgagcatca gcgtcagtta cagtccagta agctgccttc 60
gcaatcggag ttcttcgtga tatctaagca tttcaccgct acaccacgaa ttccgcctac 120
ctctactgca ctcaagacga ccagtatcaa ctgcaatttt acggttgagc cgcaaacttt 180
cacagctgac ttaatagtcc gcctacgctc ccttt 215
<210> 31
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
纺锤链杆菌属序列
<400> 31
cctgtttgct ccccacgctt tcgagcctca acgtcagtta ccgtccagta agccgccttc 60
gccactggtg ttcttcctaa tatctacgca tttcaccgct acactaggaa ttccgcttac 120
ctctccggca ctcgagccag acagtttcca atgcagtccc agggttaagc cctgggtttt 180
cacatcagac ttgccttgcc gtctacgctc ccttt 215
<210> 32
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
粪球菌属2序列
<400> 32
cctgtttgct ccccacgctt tcgtgcctca gtgtcagtag cagtccagta agtcgccttc 60
gccactggtg ttcctcctaa tatctacgca tttcaccgct acactaggaa ttccacttac 120
ctctcctgta ctctagtcag gcagtttcca aagcagttcc ggggttaagc cccggatttt 180
cacttcagac ttgtctcacc acctacgcac ccttt 215
<210> 33
<211> 215
<212> DNA
<213> 拟杆菌属某种
<400> 33
cctgtttgat acccacactt tcgagcatca gtgtcagtaa cagtctagtg agctgccttc 60
gcaatcggag ttcttcgtga tatctaagca tttcaccgct acaccacgaa ttccgcccac 120
ctctactgta ctcaagactg ccagtttcaa ctgcaatttt acggttgagc cgcaaacttt 180
cacaactgac ttaacaatcc acctacgctc ccttt 215
<210> 34
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
毛螺菌科序列
<400> 34
cctgtttgct ccccacgctt tcgagcctca acgtcagtta cagtccagta agccgccttc 60
gccactggtg ttcctcctaa tatctacgca tttcaccgct acactaggaa ttccacttac 120
ctctcctgca ctctagcttg acagtttcca aagcagtccc agggttgagc cctgggtttt 180
cacttcagac ttgccatgcc gtctacgctc ccttt 215
<210> 35
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
肠单胞球菌属序列
<400> 35
cctgtttgct ccccacgctt tcgcgcctca gcgtcagtta tcgtccagca atccgccttc 60
gccactggtg ttcctccgta tatctacgca tttcaccgct acacacggaa ttccgattgc 120
ctctccgaca ctcaagaact acagtttcaa atgcaggcta tgggttgagc ccatagtttt 180
cacatctgac ttgcagtccc gcctacacgc ccttt 215
<210> 36
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
UBA1819序列
<400> 36
cctgtttgct acccatgctt tcgagcctca gcgtcagtta gtgcccagta ggccgccttc 60
gccactggtg ttcctcccga tatctacgca ttccaccgct acaccgggaa ttccgcctac 120
ctctacacca ctcaagactg acagttttga aagcaattta tgggttgagc ccatagattt 180
cactcccaac ttgccaatcc gcctgcgctc ccttt 215
<210> 37
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
副普氏菌属;模糊_分类群序列
<400> 37
cctgtttgat acccgcactt tcgagcctca gcgtcagtgc tgccccggca caatgccttc 60
gcgatcggag ttcttcgtga tatctaagca tttcaccgct acaccacgaa ttccatgtgc 120
cctgtgcaga ctcaaggctt acagtttcaa cggctggcca cggttgagcc gtggcatttg 180
accgctgact taaaagcccg cctacgctcc cttta 215
<210> 38
<211> 215
<212> DNA
<213> 丁酸单胞球菌属某种
<400> 38
cctgttcgct acccacgctc tcgcgcatca gcgtcagatc gagcctggga agctgccttc 60
gctatcgggg ttccaagtga tatctaagca tttcaccgct acttcacttg ttccgcctcc 120
ctcgtctcgt ctccaggtcg ccagtttcaa cggcgtgcta cagtttagct gcagtctttt 180
accgctgact tggcgtcccg cctacgcgcc cttta 215
<210> 39
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
瘤胃梭菌属5序列
<400> 39
cctgtttgct acccacactt tcgtgcctca gcgtcagtta aagcccagta ggccgccttc 60
gccactggtg ttcctcccga tctctacgca tttcaccgct acaccgggaa ttccgcctac 120
ctctacttca ctcaagacta acagtttcaa aagcagttca tgggttaagc ccatggattt 180
cacttctgac ttgccaatcc gcctacgcac ccttt 215
<210> 40
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
毛梭菌属序列
<400> 40
cctgtttgct ccccacgctt tcgagcctca acgtcagtta tcgtccagta agtcgccttc 60
gccactggtg ttcctcctaa tatctacgca tttcaccgct acactaggaa ttccacttac 120
ctctccgaca ctccagttaa acagtttcca aagcagtccc gcagttgagc cgcgggcttt 180
cacttcagac ttgctttacc gtctacgctc ccttt 215
<210> 41
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
毛螺菌科UCG-004;模糊_分类群序列
<400> 41
cctgtttgct ccccacgctt tcgagcctca acgtcagtta ctgtccagta agccgccttc 60
gccactggtg ttcttcctaa tatctacgca tttcaccgct acactaggaa ttccgcttac 120
ctctccagca ctctagcaac acagtttcca aagcagttcc caggttgagc ccgggtattt 180
cacttcagac ttgcgtcgcc gtctacgctc ccttt 215
<210> 42
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
未培养的序列
<400> 42
cctgtttgct ccccacgctt tcgagcctca acgtcagtta ctgtccagta agccgccttc 60
gccactggtg ttcctcctaa tatctacgca tttcaccgct acactaggaa ttccgcttac 120
ctctccagca ctccagtcaa acagtttcaa aagcagtccc ggggttgagc cccagccttt 180
cacttctgac ttgcttgacc gtctacgctc ccttt 215
<210> 43
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
[真杆菌属]霍氏组序列
<400> 43
cctgtttgct ccccacgctt tcgtgcctca gtgtcagtaa cagtccagca ggccgccttc 60
gccactggtg ttcctcctaa tatctacgca tttcaccgct acactaggaa ttccgcctgc 120
ctctcctgta ctctagccga gcagtttcaa atgcagctcc ggggttgagc cccggccttt 180
cacatctgac ttgcactgcc acctacgcac ccttt 215
<210> 44
<211> 215
<212> DNA
<213> 拟杆菌属某种
<400> 44
cctgtttgat acccacactt tcgagcctca gtgtcagtaa cagtccagtg agctgccttc 60
gcaatcggag ttcttcgtga tatctaagca tttcaccgct acaccacgaa ttccgcccac 120
ctctactgta ctcaagacac acagtatcaa ctgcaatttt acggttgagc cgcaaacttt 180
cacaactgac ttacatgtcc acctacgctc ccttt 215
<210> 45
<211> 215
<212> DNA
<213> 多尔氏菌属某种
<400> 45
cctgtttgct ccccacgctt tcgagcctca acgtcagtca tcgtccagca agccgccttc 60
gccactggtg ttcctcctaa tatctacgca tttcaccgct acactaggaa ttccacttgc 120
ctctccgaca ctctagctct acagttccaa atgcagtccc ggggttgagc cccgggcttt 180
cacatctggc ttgcaatgcc gtctacgctc ccttt 215
<210> 46
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
未培养的序列
<400> 46
cctgtttgct ccccacgctt tcgtgcctca gcgtcagttt cagtccagaa agccgccttc 60
gccactggtg ttcttcccaa tatctacgca tttcaccgct acactgggaa ttccgctttc 120
ctctcctgta ctctagctca acagtttaaa atgcaatccc gtggttaagc cacgggcttt 180
cacatcttac ttgtcatgcc gcctactcac ccttt 215
<210> 47
<211> 215
<212> DNA
<213> 柯林斯菌属某种
<400> 47
cctgttcgct cccccagctt tcgcgcctca gcgtcggtct cggcccagag ggccgccttc 60
gccaccggtg ttccacccga tatctgcgca ttccaccgct acaccgggtg ttccaccctc 120
ccctaccgga cccaagccgc ggaggttccg ggggcttcgg ggggttgagc cccccgcttc 180
gacccccggc ctgccgggcc gcctacgcgc gcttt 215
<210> 48
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
[真杆菌属]凸腹组序列
<400> 48
cctgtttgct ccccacgctt tcgagcctca gcgtcagtaa tcgtccagta agccgccttc 60
gccaccggtg ttcctcctaa tatctacgca tttcaccgct acactaggaa ttccgcttac 120
ccctccgaca ctctagcctg acagtttcaa aagcaattcc ggggttgagc cccaggcttt 180
cacttctgac ttgccatgcc gcctacgctc ccttt 215
<210> 49
<211> 215
<212> DNA
<213> 布劳特氏菌属某种
<400> 49
cctgtttgct ccccacgctt tcgagcctca acgtcagtta ccgtccagta agccgccttc 60
gccactggtg ttcctcctaa tatctacgca tttcaccgct acactaggaa ttccgcttac 120
ccctccggca ctcaagctca acagtttcca atgcagtcca ggggttaagc ccctgccttt 180
cacatcagac ttgctgcgcc gtctacgctc ccttt 215
<210> 50
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
[瘤胃球菌属]扭链组序列
<400> 50
cctgtttgct ccccacgctt tcgagcctca acgtcagtca tcgtccagta agccgccttc 60
gccactggtg ttcctcctaa tatctacgca tttcaccgct acactaggaa ttccgcttac 120
ctctccgaca ctctagaaaa acagtttcca atgcagtccc ggggttgagc cccgggtttt 180
cacatcagac ttgcctctcc gtctacgctc ccttt 215
<210> 51
<211> 215
<212> DNA
<213> 丁酸球菌属某种
<400> 51
cctgtttgct ccccacgctt tcgcgcctca gcgtcagtta atgtccagca ggccgccttc 60
gccactggtg ttcctccgta tatctacgca tttcaccgct acacacggaa ttccgcctgc 120
ctctccatca ctcaagacca gcagttttga aagcagttta tgggttaagc ccatagattt 180
cacttccaac ttaccggccc gcctgcgcgc ccttt 215
<210> 52
<211> 215
<212> DNA
<213> 丁酸球菌属某种
<400> 52
cctgtttgct ccccacgctt tcgcgcctca gcgtcagtta atgtccagca ggccgccttc 60
gccactggtg ttcctccgta tatctacgca tttcaccgct acacacggaa ttccgcctgc 120
ctctccatca ctcaagacca gcagttttga aagcagttta tgggttaagc ccatagattt 180
cacttccaac ttgccggccc gcctgcgcgc ccttt 215
<210> 53
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
[真杆菌属]断链组序列
<400> 53
cctgtttgct ccccacgctt tcgagcctca acgtcagtca tcgtccagta agccgccttc 60
gccactggtg ttcctcctaa tatctacgca tttcaccgct acactaggaa ttccacttac 120
ctctccgaca ctctagttac atagtttcca atgcagtccc ggggttgagc cccgggtttt 180
cacatcagac ttacataacc gtctacgctc ccttt 215
<210> 54
<211> 215
<212> DNA
<213> 埃格特菌属某种
<400> 54
cctgttcgct cccctagctt tcgcgcctca gcgtcagttg cggcccagca ggctgccttc 60
gccatcggtg ttcttcccga tatctgcgca ttccaccgct acaccgggaa ttccgcctgc 120
ctctaccgaa ctcgagcctc ccagttcggg atccggccgg gggttgagcc ctcggattag 180
agatcccgct tgagaggccg cctacgcgct cttta 215
<210> 55
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
瘤胃球菌科UCG-005序列
<400> 55
cctgtttgct ccccacgctt tcgcgcctca gcgtcagttg tcgtccagca ggccgccttc 60
gccactggtg ttcctcctaa tatctacgca tttcaccgct acactaggaa ttccgcctgc 120
ctctccgata ctcaagggat acagtttcaa aagcagtttg ggggttgagc ccccagattt 180
cactcctgac ttgcatctcc gcctacacgc ccttt 215
<210> 56
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
未培养的细菌序列
<400> 56
cctgtttgct ccccacgctt tcgagcctca gtgtcagtta cagtccagta agccgccttc 60
gcctctggtg ttcttcctaa tatctacgca ttccaccgct acactaggaa ttccgcttac 120
ctctcctgca ctcaagctta acagttttat atgcagttcc gcagttaagc cacgggcttt 180
cacatataac ttattatgcc acctacactc ccttt 215
<210> 57
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
肠杆菌科序列
<400> 57
cctgtttgct ccccacgctt tcgcacctga gcgtcagtct ttgtccaggg ggccgccttc 60
gccaccggta ttcctccaga tctctacgca tttcaccgct acacctggaa ttctaccccc 120
ctctacaaga ctctagcctg ccagtttcga atgcagttcc caggttgagc ccggggattt 180
cacatccgac ttgacagacc gcctgcgtgc gcttt 215
<210> 58
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
瘤胃球菌属2序列
<400> 58
cctgtttgct acccacgctt tcgtgcctca gcgtcagtta aagcccagca ggccgccttc 60
gccactggtg ttcctcccca tctctacgca tttcaccgct acacggggaa ttccgcctgc 120
ctctacttca ctcaagctct gcagtttcaa atgcaggcta tgggttgagc ccatagattt 180
cacatctgac ttgcaaagcc gcctacgcac ccttt 215
<210> 59
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
[瘤胃球菌属]扭链组序列
<400> 59
cctgtttgct ccccacgctt tcgagcctca acgtcagtta ctgtccagta agccgccttc 60
gccactggtg ttcctcctaa tatctacgca tttcaccgct acactaggaa ttccacttac 120
ctctccagca ctctagatga acagtttcca atgcagtccc ggggttgagc cccgggtttt 180
cacatcagac ttgcccatcc gtctacgctc ccttt 215
<210> 60
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
狭义梭菌属1序列
<400> 60
cctgtttgct ccccacgctt tcgagcctca gcgtcagtta cagtccagag aagcgccttc 60
gccactggtg ttcttcctaa tctctacgca tttcaccgct acactaggaa ttcccttctc 120
ctctcctgca ctctagactt ccagtttgaa atgcagcact caggttaagc ccgagtattt 180
cacatctcac ttaaaaatcc gcctacgctc ccttt 215
<210> 61
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
[梭菌属]无害组序列
<400> 61
cctatttgct ccccacgctt tcgtgcctca gtgtcagtta cagaccaggc gaccgccttc 60
gccactggtg ttcctccata tatctacgca ttttaccgct acacatggaa ttccatcgcc 120
ctcttctgca ctctagcata ccagtttcca tagcttacaa tggttgagcc attgcctttt 180
actacagact tagtacgcca cctacgcacc cttta 215
<210> 62
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
[瘤胃球菌属]扭链组序列
<400> 62
cctgtttgct ccccacgctt tcgagcctca acgtcagtta ctgtccagta agccgccttc 60
gccactggtg ttcctcctaa tatctacgca tttcaccgct acactaggaa ttccacttac 120
ctctccagca ctctagatga acagtttcca atgcagtccc ggggttgagc cccgggtttt 180
cacatcagac ttgccatccg tctacgctcc cttac 215
<210> 63
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
狭义梭菌属1序列
<400> 63
cctgtttgct ccccacgctt tcgagcctca gtgtcagtta cagtccagaa aggcgccttc 60
gccactggta ttcttcctaa tctctacgca tttcaccgct acactaggaa ttctcctttc 120
ctctcctgca ctctagatat ccagtttgga atgcagcacc caggttaagc ccgggtattt 180
cacatcccac ttaaatatcc acctacgctc ccttt 215
<210> 64
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
瘤胃球菌科UCG-002序列
<400> 64
cctgtttgct ccccacgctt tcgcgcctca ccgtcagttg tcgtccagca atccgccttc 60
gccactggtg ttcctcctaa tatctacgca tttcaccgct acactaggaa ttccgattgc 120
ctctccgata ctcaagaaga gtagtttcaa atgcagttca cgagttgagc ccgtggattt 180
cacatctgac ttgccctccc ggctacacgc ccttt 215
<210> 65
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
克里斯滕森菌科R-7组序列
<400> 65
cctgtttgct ccccacgctt tcgtgcctca gcgtcagtta cagtccagaa agccgccttc 60
gccaccggtg ttcctcctaa tatctacgca tttcaccgct acactaggaa ttccgctttc 120
ctctcctgca ctcaagtccg acagtattgg atgcagcccc caagttaagc ccgggtattt 180
cacatccaac ttaccaaacc gcctacgcac ccttt 215
<210> 66
<211> 215
<212> DNA
<213> 阿克曼菌属某种
<400> 66
ccctttcgct cccctggcct tcgtgcctca gcgtcagtta atgtccagga acccgccttc 60
gccacgagtg ttcctctcga tatctacgca tttcactgct acaccgagaa ttccggttcc 120
ccctccatta ctctagtctc gcagtatcat gtgccgtccg cgggttgagc ccgcgccttt 180
cacacacgac ttacgaaaca gcctacgcac gcttt 215
<210> 67
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
瘤胃球菌科UCG-002序列
<400> 67
cctgtttgct ccccacactt tcgcgcctca ccgtcagtta tcgtccagca atccgccttc 60
gccactggtg ttcctcctaa tatctacgca tttcaccgct acactaggaa ttccgattgc 120
ccctccgaca ctcaagatct acagtttcaa atgcagttca tgggttgagc ccatggattt 180
cacatctgac ttgcagaccc ggctgcacgc ccttt 215
<210> 68
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
瘤胃球菌科UCG-002序列
<400> 68
cctgtttgct ccccacactt tcgcgcctca ccgtcagttg ctgtccagca atccgccttc 60
gccactggtg ttcctcctaa tatctacgca tttcaccgct acactaggaa ttccgattgc 120
ctctccagta ctcaagaaat acagtttcaa atgcagttca tgggttaagc ccatggattt 180
cacatctgac ttgcattccc ggctgcacgc ccttt 215
<210> 69
<211> 215
<212> DNA
<213> 巴恩斯氏菌某种
<400> 69
cctgttcgat acccacgctt tcgtgcctca gcgtctgtcg caccctagca ggctgccttc 60
gcaatcgggg ttctgcgtga tatctatgca tttcaccgct acaccacgca ttccgcctgc 120
ctcttgtgca ctctagctcg ccagtttcaa cggcacagtc cgggttgagc ccggaaattt 180
caccgctgac ttggcgtgcc gcctacgcac ccttt 215
<210> 70
<211> 215
<212> DNA
<213> 布劳特氏菌属某种
<400> 70
cctgtttgct ccccacgctt tcgagcctca acgtcagtta ccgtccagta agccgccttc 60
gccactggtg ttcctcctaa tatctacgca tttcaccgct acactaggaa ttccgcttac 120
ccctccggca ctcaagtatg acagtttcca atgcagtcca caggttgagc ccatgccttt 180
cacatcagac ttgccacacc gtctacgctc ccttt 215
<210> 71
<211> 215
<212> DNA
<213> 拟杆菌属某种
<400> 71
cctgtttgat acccacactt tcgagcatga acgtcagtta cggcttagtg tgctgccttc 60
gcaatcggag ttcttcgtga tatctaagca tttcaccgct acaccacgaa ttccgcacac 120
ctcaaccgca ctcaaggacg ccagtatcaa ctgcaatttt aaggttgagc cccaaacttt 180
cacagctgac ttaacgaccc gtctgcgctc ccttt 215
<210> 72
<211> 215
<212> DNA
<213> 嗜胆菌属某种
<400> 72
cctgtttgct acccacgctt tcgcacctca gcgtcagtta ccgtccaggt ggccgccttc 60
gccaccggtg ttcctccaga tatctacgga tttcactcct acacctggaa ttccgccacc 120
ctctccggta ctcaagcctg gcagtatcaa aggcagttcc acagttgggc tgtgggattt 180
cacccctgac ttaccaggcc gcctacgtgc gcttt 215
<210> 73
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
艾森伯格菌序列
<400> 73
cctgtttgct ccccacgctt tcgagcctca acgtcagtta cagtccagta agccgccttc 60
gccactggtg ttcctcctaa tatctacgca tttcaccgct acactaggaa ttccgcttac 120
ctctcctgca ctccagcctg gcagttccaa atgcaatccc aaggttgagc cctgggtttt 180
cacatctggc ttgccatgcc gtctacgctc ccttt 215
<210> 74
<211> 215
<212> DNA
<213> 颤杆菌属某种
<400> 74
cctgtttgct ccccacgctt tcgcgcctca ccgtcagttg ccgtccagtt atccgccttc 60
gccactggtg ttcttcctta tatctacgca tttcaccgct acacaaggaa ttccgataac 120
ctctccggta ctcaagacct acagtttcaa atgcagtttg gaggttaagc ctccagattt 180
cacatctgac ttgccggccc ggctgcacgc ccttt 215
<210> 75
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
肠单胞球菌属序列
<400> 75
cctgtttgct ccccacgctt tcgcgcctca gcgtcagtta ctgtccagca atccgccttc 60
gccactggtg ttcctccgta tatctacgca tttcaccgct acacacggaa ttccgattgc 120
ctctccagca ctcaagaact acagtttcaa atgcaggcta tgagttgagc tcatagtttt 180
cacatctgac ttgcagtccc gcctacacgc ccttt 215
<210> 76
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
泰泽雷拉菌属3序列
<400> 76
cctgtttgct ccccacgctt tcgtgactca gcgtcagtaa cagtccagta agccgccttc 60
gccaccggtg ttcttcctaa tatctacgca tttcaccgct acactaggaa ttccgcttac 120
ctctcctgca ctctagtcat acagtttctt atgcagcgcc aaggttaagc cctgacattt 180
cacatatgac ttgcatgacc gcctactcac ccttt 215
<210> 77
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
毛螺菌科序列
<400> 77
cctgtttgct ccccacgctt tcgagcctca acgtcagtta cagtccagta agccgccttc 60
gccactggtg ttcctcctaa tatctacgca tttcaccgct acactaggaa ttccacttac 120
ctctcctgca ctccagcctg acagtttcca aagcagttca ggggttgagc ccccgcattt 180
cacttcagac ttgccatgcc gtctacgctc ccttt 215
<210> 78
<211> 215
<212> DNA
<213> 黄杆菌属某种
<400> 78
cctgtttgct ccccacgctt tcgcgcctca gcgtcagtta ctgtccagca atccgccttc 60
gccactggtg ttcctccgta tatctacgca tttcaccgct acacacggaa ttccgattgc 120
ctctccagca ctcaagaact acagtttcaa atgcaggctg gaggttgagc ccccagtttt 180
cacatctgac ttgcaatccc gcctacacgc ccttt 215
<210> 79
<211> 215
<212> DNA
<213> 嗜胆菌属某种
<400> 79
cctgtttgct acccacgctt tcgcacctca gcgtcagtta ccgtccaggt ggccgccttc 60
gccaccggtg ttcctccaga tatctacgga tttcactcct acacctggaa ttccgccacc 120
ctctccggta ctcaagcctg gcagtatcaa aggcagttcc acagttgggc tgtgggattt 180
cacccctgac ttaccaagcc gcctacgtgc gcttt 215
<210> 80
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
丹毒丝菌科UCG-003序列
<400> 80
cctatttgct ccccacgctt tcgggactga gcgtcagtta tgcgccagat cgtcgccttc 60
gccactggtg ttcctccata tatctacgca tttcaccgct acacatggaa ttccacgatc 120
ctctcacaca ctctagctct acggtttcca tggcttaccg aagttaagct tcgatctttc 180
accacagacc cttagtgccg cctgctccct cttta 215
<210> 81
<211> 215
<212> DNA
<213> 布劳特氏菌属某种
<400> 81
cctgtttgct ccccacgctt tcgagcctca acgtcagtta ccgtccagta agccgccttc 60
gccactggtg ttcctcctaa tatctacgca tttcaccgct acactaggaa ttccgcttac 120
ctctccggca ctcaagacta acagtttcca atgcagtcca ggggttgagc ccccgccttt 180
cacatcagac ttgccagtcc gtctacgctc ccttt 215
<210> 82
<211> 215
<212> DNA
<213> 布劳特氏菌属某种
<400> 82
cctgtttgct ccccacgctt tcgagcctca acgtcagtta ccgtccagta agccgccttc 60
gccactggtg ttcctcctaa tatctacgca tttcaccgct acactaggaa ttccgcttac 120
ctctccggca ctcaagacgg gcagtttcca atgcagtccc ggggttgagc cccagccttt 180
cacatcagac ttgtccatcc gtctacgctc ccttt 215
<210> 83
<211> 215
<212> DNA
<213> 草酸杆菌属某种
<400> 83
cctgtttgct ccccacgctt tcgtgcatga gcgtcagtgt tatcccaggg ggctgccttc 60
gccatcggta ttcctccaca tatctacgca tttcactgct acacgtggaa ttctaccccc 120
ctctgacaca ctctagccgt gcagtcacaa atgcaattcc caggttaagc ccgggcattt 180
cacatctgtc ttacacaacc gcctgcgcac gcttt 215
<210> 84
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
瘤胃球菌属1序列
<400> 84
cctgtttgct ccccacgctt tcgagcctca gcgtcagtaa aggcccagta agccgccttc 60
gccaccgatg ttcctcctga tctctacgca tttcaccgct acaccaggaa ttccgcttac 120
ctctacctca ctcaagaaca acagtttcaa atgcagtcta tgggttgagc ccatagtttt 180
cacatctgac ttgccgtccc gcctacgctc ccttt 215
<210> 85
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
瘤胃球菌科UCG-003;模糊_分类群序列
<400> 85
cctgtttgct ccccacgctt tcgcgcctca ccgtcagtta ccgtccagta atccgccttc 60
gccactggtg ttcttcctta tatctacgca tttcaccgct acacaaggaa ttccgattac 120
ctctccggca ctcaagatgc acagtttcaa atgcagtttc agggttgagc cctgagattt 180
cacatctgac ttgcgcaccc ggctgcacgc ccttt 215
<210> 86
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
克里斯滕森菌科R-7组序列
<400> 86
cctgtttgct ccccacgctt tcgcgcctca acgtcagtta cagtccagaa agccgccttc 60
gccactggtg ttcctcctaa tatctacgca tttcaccgct acactaggaa ttccgcttcc 120
ctctcctgca ctcaagccat gcagtattac aggcagttcc aaccttgaaa gttgggcttt 180
cacctataac ttacacagcc gtctacgcgc ccttt 215
<210> 87
<211> 215
<212> DNA
<213> 颤杆菌属某种
<400> 87
cctgtttgct ccccacgctt tcgcgcctca ccgtcagttg ccgtccagtc atccgccttc 60
gccactggtg ttcttcctta tatctacgca tttcaccgct acacaaggaa ttccgatgac 120
ctctccggta ctcaagacca gcagtttcaa acgcagttcc agggttgagc cctgggattt 180
cacgcctgac ttgccagccc ggctgcacgc ccttt 215
<210> 88
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
瘤胃球菌科UCG-014序列
<400> 88
cctgtttgct ccccacactt tcgtgcctca acgtcagttt ctgtccagaa agtcgccttc 60
gccactggtg ttcctcctaa tatctacgca tttcaccgct acactaggaa ttccactttc 120
ctctccagta ctcaagaaaa acagttttag ttgcagttcc tcagttaagc cgagggattt 180
cacaactaac ttatcttccc gtctacgcac ccttt 215
<210> 89
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
毛螺菌科ND3007组序列
<400> 89
cctgtttgct ccccacgctt tcgagcctca gtgtcagtta cagtccagtg agccgccttc 60
gcctccggtg ttcctcctaa tatctacgca tttcaccgct acactaggaa ttccgctcac 120
ccctcctgca ctctagcatg acagttccaa aagcaatccc gcggttgagc cccgggtttt 180
cacttctggc ttgccttgcc acctacgctc ccttt 215
<210> 90
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
瘤胃梭菌属9序列
<400> 90
cctgtttgct ccccacactt tcgcgcctca gcgtcagtta ctgtccagca aatcgccttc 60
gccactggtg ttcttcctaa tatctacgca tttcaccgct acactaggag ttccatttgc 120
ctctccagca ctcaagaact acagtttcaa atgcaggcta tgagttgagc ccatagtttt 180
cacatctgac ttgcagtccc gcctacacgc ccttt 215
<210> 91
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
克里斯滕森菌属R-7组序列
<400> 91
cctgtttgct ccccacgctt tcgtgcctca gcgtcagttg tcgtccagta agccgccttc 60
gccactggtg ttcctcccga tatctacgca tttcaccgct acaccgggaa ttccgcttac 120
ctctccgaca ctcaagtccg aaagtttcga atgcagctcc catgttaagc acggggattt 180
cacatccgac ttttcagacc gcctacgcac ccttt 215
<210> 92
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
瘤胃梭菌属9;模糊_分类群序列
<400> 92
cctgtttgct ccccacgctt tcgcgcctca gcgtcagttg ctgtccagca gatcgccttc 60
gccactggtg ttcctcctaa tatctacgca tttcaccgct acactaggaa ttccatctgc 120
ctctccagta ctcaagaaaa acagtttcaa atgcaggctg tgggttgagc ccacagtttt 180
cacatctgac ttgctttccc gcctacacgc ccttt 215
<210> 93
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
瘤胃梭菌属9序列
<400> 93
cctgtttgct ccccacgctt tcgcgcctca gcgtcagttg ctgtccagtt gaccgccttc 60
gccactggtg ttcctcctaa tatctacgca tttcaccgct acactaggaa ttccgtcaac 120
ctctccagta ctcaagaact acagtttcaa acgcaggcca gaggttgagc ccctggtttt 180
cacgcctgac ttgcaatccc gcctacacgc ccttt 215
<210> 94
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
XIII科AD3011组序列
<400> 94
cctgtttgct ccccacgctt tcgtacctca gtgtcagtta cagtccagaa agccgccttc 60
gccactggtg ttcctcctaa tatctacgca tttcaccgct acactaggaa ttccgctttc 120
ctctcctgca ctcaagtagc ccagttcaca aggcgaacaa tggttaagcc attgccttat 180
acctcgtgct taggtaacca cctacgtact cttta 215
<210> 95
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
肠道宏基因组序列
<400> 95
cctgtttgct ccccacgctt tcgtgcttca gtgtcagtta cggcccagta tgtcgctttc 60
gccaccggtg ttcctcctaa tatctacgca ttccaccgct acactaggaa ttccacatac 120
ccctgccgca ctcaagccta tcagttttgg cagtagttcc gcggttaagc cacggaatta 180
cgctgccaac ttgacaaacc acctacgcac ccttt 215
<210> 96
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
直肠无杆菌属序列
<400> 96
cctgtttgct ccccacgctt tcgagcctca gcgtcagtta tcgtccagta agccgccttc 60
gccactggtg ttcctcctaa tatctacgca tttcaccgct acactaggaa ttccgcttac 120
ccctccgaca ctctagtacg acagtttcca atgcagtacc gaggttgagc cccgggtttt 180
cacatcagac ttgccgcacc gcctgcgctc ccttt 215
<210> 97
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
瘤胃球菌科UCG-005序列
<400> 97
cctgtttgct ccccacgctt tcgcgcctca gcgtcagttg tcgtccagca ggccgccttc 60
gccactggtg ttcctcctaa tatctacgca tttcaccgct acactaggaa ttccgcctgc 120
ctctccgata ctcaagaaaa acggtttcaa atgcagttcc ggggttgagc cccgacattt 180
cacatctgac ctgtcttccc gcctacacgc ccttt 215
<210> 98
<211> 215
<212> DNA
<213> 黄杆菌属某种
<400> 98
cctgtttgct ccccacgctt tcgcgcctca gcgtcagtta tcgtccagcg atccgccttc 60
gccactggtg ttcctccgta tatctacgca tttcaccgct acacacggaa ttccgatcgc 120
ctctccgaca ctcaagaact acagtttcaa atgcaggctg gaggttgagc ccccagtttt 180
cacatctgac ttgcagtccc gcctacacgc ccttt 215
<210> 99
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
废水杆状菌科UCG-011序列
<400> 99
cctgtttgct ccccacgctt tcgtgcctca gcgtcagttg cagtccagaa agccgccttc 60
gccactggtg ttcttcctaa tatctacgca tttcaccgct acactaggaa ttccgctttc 120
ctctcctgca ctctagctcc gcagtttcca ttgcacttcg atggttaagc catcgccttt 180
cacaacagac ttacggtgcc gcctacgcac ccttt 215
<210> 100
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
瘤胃梭菌属9序列
<400> 100
cctgtttgct ccccacgctt tcgcgcctca gcgtcagttg ctgtccagca gaccgccttc 60
gccactggtg ttcctcctaa tatctacgca tttcaccgct acactaggaa ttccgtctgc 120
ctctccagta ctcaagaact acagtttcaa atgcaggcca caggttgagc ccatggtttt 180
cacatctgac ttgcagtccc gcctacacgc ccttt 215
<210> 101
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
未培养的序列
<400> 101
cctgtttgct ccccacgctt tcgtgcctca gcgtcagtta cagtccagaa agccgccttc 60
gccactggtg ttcctcctaa tatctacgca tttcaccgct acactaggaa ttccgctttc 120
ctctcctgca ctcaagccta acagtatcag atgcaccccc catgttgagc acgggtattt 180
cacatctgac ttaccaggcc gcctacgcac ccttt 215
<210> 102
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
DTU089序列
<400> 102
cctgtttgct acccatgctt tcgtgcctca gcgtcagtta aggcccagca ggccgccttc 60
gccactggtg ttcctcccga tctctacgca tttcaccgct acaccgggaa ttccgcctgc 120
ctctacctca ctcaagaccc acagtttcaa tagcagttcc agggttaagc cctgggattt 180
cactactgac ttgcagatcc gcctacgcac ccttt 215
<210> 103
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
安吉拉基斯氏菌属序列
<400> 103
cctgtttgct ccccacactt tcgagcctca gcgtcagtaa aagcccagca agccgccttc 60
gccactggtg ttcctcctaa tatctacgca tttcaccgct acactaggaa ttccgcttgc 120
ctctacttca ctcaagaaaa acagttttga atgcagtctg taggttgagc ccacagtttt 180
cacatccaac ttgccttccc gcctacgctc ccttt 215
<210> 104
<211> 215
<212> DNA
<213> 马文布氏菌属某种
<400> 104
cctgtttgct ccccacgctt tcgagcctca acgtcagtta ccgtccagta agccgccttc 60
gccactggtg ttcctcctaa tatctacgca tttcaccgct acactaggaa ttccgcttac 120
ctctccggca ctccagcagg acagtttcca atgcagtccc ggggttgagc cccagccttt 180
cacatcagac ttgccttgcc gtctacgctc ccttt 215
<210> 105
<211> 215
<212> DNA
<213> 链球菌属某种
<400> 105
cctgttcgct ccccacgctt tcgagcctca gcgtcagtta cagaccagag agccgctttc 60
gccaccggtg ttcctccata tatctacgca tttcaccgct acacatggaa ttccactctc 120
cccttctgca ctcaagtttg acagtttcca aagcgaacta tggttgagcc acagccttta 180
acttcagact tatcaaaccg cctgcgctcg cttta 215
<210> 106
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
瘤胃球菌科序列
<400> 106
cctgtttgct ccccacgctt tcgcgcctca gcgtcagtta ctgtccagca atccgccttc 60
gccactggtg ttcctccgta tatctacgca tttcaccgct acacacggaa ttccgattgc 120
ctctccagca ctcaagaaaa acagtttcaa atgcaggcta tgagttgagc ccatagtttt 180
cacatctgac ttgccttccc gcctacacgc ccttt 215
<210> 107
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
梭菌目序列
<400> 107
cctgtttgct acccacgctt tcgtgcctca gcgtcagttt tggtccagca agccgccttc 60
gccactggtg ttcctcccga tctctacgca tttcaccgct acaccgggaa ttccgcttgc 120
ctctcccata ctcaagccaa ccagtttcaa gtgcaacccc catgttaagc acgggtcttt 180
cacacctgac ttgatcggcc gcctacgcac ccttt 215
<210> 108
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
未培养的序列
<400> 108
cctgtttgct acccacgctt tcgtgcctca gcgtcagtta cagtccagta agtcgccttc 60
gccactggtg ttcctcctaa tatctacgca ttccaccgct acactaggaa ttccacttac 120
ctctcctgca ctcaagcaca gcagtatcag aagcagtccc gaggttaagc cccgatattt 180
cacttctgac taactgcgcc gcctacgcac ccttt 215
<210> 109
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
瘤胃球菌科UCG-002序列
<400> 109
cctgtttgct ccccacgctt tcgcgcctca ccgtcagttg tcgtccagca atccgccttc 60
gccactggtg ttcctcctaa tatctacgca tttcaccgct acactaggaa ttccgattgc 120
ctctccgata ctcaagaaaa gtagtttcaa atgcagttca cgagttaagc ccgtggattt 180
cacatctgac ttgccttccc ggctacacgc ccttt 215
<210> 110
<211> 215
<212> DNA
<213> 罕见小球菌属某种
<400> 110
cctgtttgct acccatgctt tcgagcctca gcgtcagttg gtgcccagta ggtcgccttc 60
gccactggtg ttcctcccga tatctacgca ttccaccgct acaccgggaa ttccacctac 120
ctctgcacta ctcaaggcca gcagttttga aagcaattca cgggttgagc ccatggattt 180
cacttccaac ttgccggtcc gcctgcgctc ccttt 215
<210> 111
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
瘤胃球菌科NK4A214组序列
<400> 111
cctgtttgct ccccacgctt tcgcgcctca gcgtcagtta tcgtccagtt gaccgccttc 60
gccactggtg ttcctcctaa tatctacgca tttcaccgct acactaggaa ttccgtcaac 120
ctctccgaca ctcaagaaat acagtttcaa atgcagttca agggttgagc ccttggattt 180
cacatctgac ttgcattccc gcctacgcgc ccttt 215
<210> 112
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
XIII科UCG-001序列
<400> 112
cctgtttgct ccccacgctt tcgtacctca gcgtcagtta cagtccagaa agtcgccttc 60
gccactggtg ttcctcctaa tatctacgca tttcaccgct acactaggaa ttccactttc 120
ccctcctgca ctcaagtctg acagttcgca aggctgacat tggttgagcc tatgcctttc 180
accttgcgct taccagaccg cctacgtact cttta 215
<210> 113
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
未培养的序列
<400> 113
cctgtttgct ccccacgctt tcgcgcctca gtgtcagtta cggtccaggc agccgccttc 60
gccactggtg ttcctcccaa tctctacgca tttcaccgct acactgggaa ttccactgcc 120
ctctcccgca ctcaagactg accgtatcgg atgcggttcc caggttaagc ctggggcttt 180
cacatccgac tgatcagtcc acctacacgc ccttt 215
<210> 114
<211> 215
<212> DNA
<213> 脱硫弧菌属某种
<400> 114
cctgtttgct ccccacgctt tcgcacctca gcgtcaatac cggtccaggt ggccgccttc 60
gccactgatg ttcctccaga tatctacgga tttcactcct acacctggaa ttccgccacc 120
ctctcccgga ttcaagttgt gcagtatcaa aggcagttcc acggttgagc cgtgggattt 180
cacccctgac ttacactaca gcctacgtgc gcttt 215
<210> 115
<211> 215
<212> DNA
<213> 未知
<220>
<223> 对未知的描述:
瘤胃梭菌属1序列
<400> 115
cctgtttgct ccccacgctt tcgcgcctca gcgtcagttt ctgtccagaa agccgccttc 60
gccaccggtg ttcctcctaa tatctacgca tttcaccgct acactaggaa ttccactttc 120
ctctccagta ctcaagatcc acagtttcag atgcagttcc ggagttaagc cccggcattt 180
cacatctgac ttgcagaccc gcctacgcgc ccttt 215
<210> 116
<211> 215
<212> DNA
<213> 布劳特氏菌属某种
<400> 116
cctgtttgct ccccacgctt tcgagcctca acgtcagtta ccgtccagta agccgccttc 60
gccactggtg ttcctcctaa tatctacgca tttcaccgct acactaggaa ttccgcttac 120
ctctccggca ctcaagaaaa acagtttcca atgcagtcct ggggttaagc cccagccttt 180
cacatcagac ttgctcttcc gtctacgctc ccttt 215
<210> 117
<211> 215
<212> DNA
<213> 布劳特氏菌属某种
<400> 117
cctgtttgct ccccacgctt tcgagcctca acgtcagtta ccgtccagta agccgccttc 60
gccactggtg ttcctcctaa tatctacgca tttcaccgct acactaggaa ttccgcttac 120
ccctccggca ctcaagtatg acagtttcca atgcagtcca cgggttgagc ccatgccttt 180
cacatcagac ttgccacacc gtctacgctc ccttt 215

Claims (34)

1.一种调配物,其包括:
麸皮、菊粉和抗消化麦芽糊精的混合物;
其中所述麸皮基本上由玉米麸皮、小麦麸皮、高粱麸皮和燕麦麸皮组成;
其中所述混合物的来自麸皮的膳食纤维:来自菊粉的膳食纤维:来自抗消化麦芽糊精的膳食纤维的比率在约1:1:1至约4:1:1的范围内;
其中所述菊粉以占所述混合物的总重量的5-10%的范围存在;并且
其中所述混合物的均匀粒度介于150μm与300μm之间。
2.根据权利要求1所述的调配物,其中按重量计,由所述玉米麸皮、所述小麦麸皮、所述高粱麸皮和所述燕麦麸皮中的每一种贡献的纤维的比率为约1:1:1:1。
3.根据权利要求1所述的调配物,其中所述调配物包括约7-8重量%的菊粉。
4.根据权利要求1所述的调配物,其中所述调配物包括约7.8重量%的菊粉。
5.根据权利要求1所述的调配物,其中总纤维含量为约36%至约47%(w/w)。
6.根据权利要求1所述的调配物,其中所述抗消化麦芽糊精是Fibersol-2。
7.根据权利要求6所述的调配物,其中所述Fibersol-2以约7.5%(w/w)的最终百分比存在。
8.根据权利要求1至7中任一项所述的调配物,其进一步包括黄原胶。
9.根据权利要求8所述的调配物,其中所述黄原胶以约4%(w/w)的最终百分比存在。
10.一种用于促进有需要的受试者的健康肠道微生物组的方法,所述方法包括:
向所述受试者肠内施用有效量的根据权利要求1至9中任一项所述的调配物,
其中所述有效量足以增加产生乙酸盐和产生丁酸盐的肠道细菌物种在所述受试者的肠道中的增殖,由此促进所述受试者的所述健康肠道微生物组。
11.根据权利要求10所述的方法,其中所述有效量的调配物包括每天30-90克纤维。
12.根据权利要求10所述的方法,其中所述有效量的调配物包括每天30-60克纤维。
13.根据权利要求10所述的方法,其中所述产生乙酸盐和产生丁酸盐的肠道细菌物种被分类为包括以下属中的至少一个属的细菌属:双歧杆菌属(Bifidobacterium)、瘤胃球菌属(Ruminococcus)、真杆菌属(Eubacterium)、梭菌属(Clostridium)、另枝菌属(Alistipes)、拟杆菌属(Bacteroides)、布劳特氏菌属(Blautia)、丁酸球菌属(Butyricicoccus)、丁酸单胞球菌属(Butyricimonas)、柯林斯菌属(Collinsella)、粪球菌属(Coprococcus)、多尔氏菌属(Dorea)、埃格特菌属(Eggerthella)、粪杆菌属(Faecalibacterium)、纺锤链杆菌属(Fusicatenibacter)、肠单胞球菌属(Intestinimonas)、毛梭菌属(Lachnoclostridium)、毛螺菌科(Lachnospiraceae)、巨型球菌属(Megasphaera)、副拟杆菌属(Parabacteroides)、副普氏菌属(Paraprevotella)、考拉杆菌属(Phascolarctobacterium)、罗斯氏菌属(Roseburia)、瘤胃梭菌属(Ruminiclostridium)或罕见小球菌属(Subdoligranulum),其中所述产生乙酸盐和产生丁酸盐的肠道细菌物种被分类为包括以下中的至少一个的细菌科:氨基酸球菌科(Acidaminococcaceae)、拟杆菌科(Bacteroidaceae)、双歧杆菌科(Bifidobacteriaceae)、梭菌科(Clostridiaceae)、梭菌目(Clostridiales)、红蝽菌科(Coriobacteriaceae)、埃格特菌科(Eggerthellaceae)、肠杆菌科(Enterobacteriaceae)、丹毒丝菌科(Erysipelotrichaceae)、毛螺菌科(Lachnospiraceae)、海洋丝菌科(Marinifilaceae)、普雷沃菌科(Prevotellaceae)、理研菌科(Rikenellaceae)、瘤胃球菌科(Ruminococcaceae)、坦纳菌科(Tannerellaceae)或韦荣氏菌科(Veillonellaceae)。
14.根据权利要求10所述的方法,其中通过靶向可变区V4、V3-V4或全长基因中的一个或多个的16S rRNA扩增子测序检测所述产生乙酸盐和产生丁酸盐的肠道细菌物种。
15.根据权利要求14所述的方法,其中16S rRNA V4扩增子测序鉴定产生乙酸盐和产生丁酸盐的肠道细菌的一个或多个扩增子序列变体(ASV)特性。
16.根据权利要求15所述的方法,其中所述一个或多个ASV中的每一个表示所述产生乙酸盐和产生丁酸盐的肠道细菌的独特的菌株或高度相似的菌株组。
17.根据权利要求10所述的方法,其中所述有需要的受试者患有肠道微生物群失衡。
18.根据权利要求17所述的方法,其中所述肠道微生物群失衡的特征在于低水平的产生乙酸盐和产生丁酸盐的肠道细菌。
19.根据权利要求18所述的方法,其中所述低水平的产生乙酸盐和产生丁酸盐的肠道细菌少于所述有需要的受试者的总肠道微生物群的5%。
20.根据权利要求18所述的方法,其中所述产生乙酸盐和产生丁酸盐的肠道细菌物种被分类为包括以下中的至少一个的细菌属:双歧杆菌属、瘤胃球菌属、真杆菌属、梭菌属、另枝菌属、拟杆菌属、布劳特氏菌属、丁酸球菌属、丁酸单胞球菌属、柯林斯菌属、粪球菌属、多尔氏菌属、埃格特菌属、粪杆菌属、纺锤链杆菌属、肠单胞球菌属、毛梭菌属、毛螺菌科、巨型球菌属、副拟杆菌属、副普氏菌属、考拉杆菌属、罗斯氏菌属、瘤胃梭菌属或罕见小球菌属。
21.根据权利要求18所述的方法,其中通过16S rRNA V4扩增子测序检测所述产生乙酸盐和产生丁酸盐的肠道细菌物种。
22.根据权利要求21所述的方法,其中16S rRNA V4扩增子测序鉴定产生乙酸盐和产生丁酸盐的肠道细菌的一个或多个扩增子序列变体(ASV)特性。
23.根据权利要求22所述的方法,其中所述一个或多个ASV中的每一个表示所述产生乙酸盐和产生丁酸盐的肠道细菌的独特的菌株或高度相似的菌株组。
24.根据权利要求17所述的方法,其中所述施用增加所述产生乙酸盐和产生丁酸盐的肠道细菌。
25.根据权利要求17所述的方法,其中所述有需要的受试者是肥胖者。
26.根据权利要求17所述的方法,其中所述有需要的受试者患有2型糖尿病。
27.根据权利要求17所述的方法,其中所述有需要的受试者患有糖尿病肾病。
28.根据权利要求17所述的方法,其中所述有需要的受试者是患有如COVID-19等呼吸道病毒感染的肥胖者。
29.根据权利要求17所述的方法,其中所述有需要的受试者是患有如COVID-19等呼吸道病毒感染的糖尿病患者。
30.根据权利要求17所述的方法,其中所述有需要的受试者是患有如COVID-19等呼吸道病毒感染的前期糖尿病患者。
31.根据权利要求17所述的方法,其中所述有需要的受试者患有多发性硬化症。
32.根据权利要求17所述的方法,其中所述有需要的受试者患有帕金森病(Parkinsondisease)。
33.根据权利要求17所述的方法,其中所述有需要的受试者患有普拉德·威利综合征(Prader-Willi syndrome)。
34.根据权利要求17所述的方法,其中所述有需要的受试者患有癌症,并且其中施用缓解与癌症化疗相关的副作用。
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