CN114854803A - 镰刀菌对3,6-二氯咔唑生物降解的方法 - Google Patents

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Abstract

本发明公开了一种镰刀菌对3,6‑二氯咔唑生物降解的方法,该降解方法包括以下步骤:(1)筛选出能够以3,6‑二氯咔唑为唯一碳源生长的菌株;(2)将筛选的的菌株扩大培养,收集扩大培养后的菌体,将菌体接种至灭菌的MSM液体培养基进行培养;(3)筛选出3,6‑二氯咔唑高效降解菌株,将降解菌保藏备用;(4)将保藏的降解菌制成孢子悬液;(5)调整含有3,6‑二氯咔唑的环境介质的PH值为5.0‑9.0,温度为20℃‑40℃,并在孢子悬液中加入碳源,然后将孢子悬液接种至含有3,6‑二氯咔唑的环境介质中。本发明从土壤中筛选3,6‑二氯咔唑高效降解菌,为3,6‑二氯咔唑的降解提供了一种更有效的方法。

Description

镰刀菌对3,6-二氯咔唑生物降解的方法
技术领域
本发明属于微生物技术领域,具体地说,尤其涉及一种镰刀菌对3,6-二氯咔唑生物降解的方法。
背景技术
卤代咔唑是咔唑环上的氢原子被卤素原子取代的一种化合物。近年来,卤代咔唑在自然 环境中的检出率越来越高,才作为一类新型污染物逐渐引起研究者的重视。
卤代咔唑在环境中分布广泛,特别是在河流湖泊的沉积物、土壤以及一些生物样品中能 检测出较高浓度的卤代咔唑。基于卤代咔唑的生物累积性、持久性和类二恶英毒性,亟待寻 找关于卤代咔唑的降解及污染环境修复的方法。目前已有关于卤代咔唑光降解及化学氧化分 解等修复方法,但对于修复土壤和沉积物的卤代咔唑污染有一定的局限性。利用微生物降解 有机物的方法不仅成本低,且对环境产生的二次污染较小,近年来,越来越多的人通过筛选 出能够以目标污染物为唯一碳源的降解菌,利用降解菌的代谢活动降解污染物。微生物修复 可以作为修复环境中卤代咔唑污染的有效补充手段,然而目前关于3,6-二氯咔唑这一污染物 的微生物降解方法仍为空白。
发明内容
本发明目的是提供一种镰刀菌对3,6-二氯咔唑生物降解的方法,该方法是从土壤中筛选 降解菌,并将降解菌投放到含有3,6-二氯咔唑的环境介质中,为3,6-二氯咔唑的降解提供了 一种更有效的方法,该方法对3,6-二氯咔唑的去除效果显著。
为了实现上述目的,本发明是采用以下技术方案实现的:
一种镰刀菌对3,6-二氯咔唑生物降解的方法,该降解方法包括以下步骤:
(1)将受3,6-二氯咔唑污染的土壤加入到 MSM 液体培养基中,筛选出能够以3,6-二氯 咔唑为唯一碳源生长的菌株;
(2)将步骤(1)中筛选的的菌株在LB固体培养基上活化,挑取菌株至已灭菌的LB液体培养基扩大培养,收集扩大培养后的菌体,用已灭菌的MSM液体培养基清洗并重悬若干次, 将最后一次重悬的菌体接种至灭菌的 MSM液体培养基进行培养;
(3)对步骤(2)的MSM液体培养基的菌落取样,提取并检测MSM液体培养基中残留的3,6-二氯咔唑含量,计算各菌株降解率,直至筛选出 3,6-二氯咔唑高效降解菌株,将降解菌 保藏备用;
(4)利用步骤(3)中保藏的降解菌制成孢子悬液;
(5)调整含有3,6-二氯咔唑的环境介质的PH值为5.0-9.0,温度20℃-40℃,并在上述孢子悬液中加入碳源,然后将孢子悬液接种至含有3,6-二氯咔唑的环境介质中。
进一步的,步骤(1)中菌株富集和纯化的方法:在30℃和180 r/min的摇床中培养5d, 5d 后取5.00 mL富集培养液的上清液转接至新的含100.00 mg/L 3,6-二氯咔唑的MSM液体培养基中,重复操作3次,取最后一次富集的培养液1.00 mL加入灭菌的去离子水中,按照10-1、10-2、10-3的比例进行逐级梯度稀释,吸取稀释后的培养液50.00μL涂布于含3,6-二氯咔唑100.00mg/L 的MSM固体培养基中,将其倒置于30℃培养箱中培养;待菌落形成后,用灭菌牙签挑取不同形态的单菌落在LB固体培养基中划线,经过反复的挑选分离,直至分离出纯菌。
进一步的,所述MSM液体培养基的制作方法:以1000mL去离子水计,称取硫酸铵1.00g、氯化钠1.00g、磷酸氢二甲1.50g、磷酸二氢钾0.50g、硫酸镁0.20g,加入1000mL去离子水中溶解,再加入1.00mL微量元素溶液,用氢氧化钠调节pH至7.0左右,121℃高温高压灭菌30 min;
所述MSM固体培养基的制作方法:在MSM液体培养基基础上添加琼脂粉制成;所述微量元素溶液的制备方法:以1000 mL去离子水计,称取钼酸钠0.15g、一水硫酸锰0.13g、结晶氯化铝0.05g、氯化锌0.23g、一水硫酸铜0.03g、六水合氯化钴0.42g,加1000mL去离子水溶解,用氢氧化钠或盐酸调节pH至7.0左右。
进一步的,所述 LB 液体培养基的制作方法:以1000mL去离子水计,向氯化钠10.00g、酵母浸膏5.00g、蛋白胨10.00g,加1000mL去离子水溶解,用氢氧化钠调节pH 至7.0左 右,121℃高温高压灭菌30 min;
所述LB固体培养基的制作方法:在LB液体培养基基础上添加琼脂粉制成。
进一步的,步骤(2)中,LB液体培养基扩大培养的条件:在30℃,180r/min的条件下扩大培养3d;收集扩大培养后的菌体的方法:在20℃,5000r/min条件离心5min收集 菌体。
进一步的,步骤(2)中的MSM液体培养基培养的条件:调整菌液浓度为OD600 = 1.0左右,使培养基中3,6-二氯咔唑浓度为10.00mg/L,在30℃,180r/min的条件下培养8d。
进一步的,步骤(3)中降解菌的保藏方法:配制质量分数30%的甘油,取30%的甘油加入冻存管中,将甘油以及冻存管121℃高温高压灭菌30min后,加入与甘油等体积的菌液,将液体充分混匀后密封,冷冻保存在-40℃的冰箱备用。
进一步的,步骤(4)中孢子悬液的制备方法:将冻存的菌株冰浴解冻,在无菌室中用灭 菌过的牙签蘸取适量菌液,在PDA固体培养基中进行平板划线,将划线后的平板倒扣在生化培养箱中培养,直至长出丰富的白色分生孢子,用牙签刮取平板表面的孢子至灭菌后的MSM液体培养基,涡旋振荡使菌丝在培养基溶液中分布均匀,使孢子悬液的OD600 =0.16 ~ 0.165。
进一步的,所述PDA固体培养基的制备方法:以1000mL去离子水计,取马铃薯200.00g、葡萄糖20.00g、琼脂粉15.00g,加1000mL去离子水溶解,121℃高温高压灭菌30min。
进一步的,步骤(5)中接种环境最适降解条件为:温度为30℃,pH为7.0,孢子悬液外加碳源为1 g/L蔗糖溶液。
与现有技术相比,本发明的有益效果是:本发明从土壤中分离得到了一株3,6-二氯咔唑高效降解菌,经鉴定为镰刀菌,经过降解条件优化,镰刀菌 K1对10.00 mg/L3,6-二氯咔唑的8d降解率达到84%,为环境中卤代咔唑污染提供了新的修复方法,并且通过对3,6-二氯 咔唑降解产物的测定,推测镰刀菌K1对3,6二氯咔唑的降解存在脱氯和有角度双加氧两种途径,其中有角度双加氧途径是降解菌K1分解利用3,6-二氯咔唑的主要途径,为卤代咔唑在 环境中生物转化的认知做了有效补充。
附图说明
图 1 为本发明镰刀菌 K1 菌落图。
图 2 为本发明镰刀菌 K1 扫描电镜图片。
图 3 为本发明镰刀菌 K1 与同源菌株的进化关系。
图 4 为初始 pH 值对镰刀菌 K1 降解能力的影响。
图 5 为温度对镰刀菌 K1 降解能力的影响。
图 6 为外加碳源对镰刀菌 K1 降解能力的影响。
图 7 为本发明中 3,6-二氯咔唑降解产物离子图。
具体实施方式
下面结合具体实施案例对本发明进行进一步描述,本实施案例在以本发明技术方案为前 提下进行实施,给出了详细的实施方式和具体的操作过程,但本发明的保护范围不限于下述 的实施案例。
实施例 1:本实施例提供了一种镰刀菌对3,6-二氯咔唑生物降解的方法,该降解方法包括以下步骤:
(1)本实施例所筛选到的菌种来源于土壤,实验土壤采集于山东省滨州市某农药厂周边 排污口附近的农田土壤以或实验室中用 100.00 mg/L3,6-二氯咔唑污染驯化 120d 的土壤。 称取菌种土壤 5 g,加入到 50.00 mL 的含3,6-二氯咔唑 100.00 mg/L 的MSM 液体培养基中, 通过富集和纯化筛选出能够以3,6-二氯咔唑为唯一碳源生长的菌株。
其中,富集和纯化的方法:在 30℃和 180 r/min 的摇床中培养 5 d,5 d 后取5.00 mL富集培养液的上清液转接至新的含 100.00 mg/L3,6-二氯咔唑的 MSM 液体培养基中,重复操作3次,取最后一次富集的培养液 1.00 mL 加入灭菌的去离子水中,按照 10-1、10-2、10-3的 比例进行逐级梯度稀释,吸取稀释后的培养液 50.00 μL 涂布于含3,6-二氯咔唑 100.00 mg/L 的 MSM 固体培养基中,将其倒置于 30℃培养箱中培养;待菌落形成后,平板培养基上生长有 各种形态的菌落,用灭菌牙签挑取不同形态的单菌落在 LB 固体培养基中划线,经过反复的挑 选分离,直至分离出纯菌,获得能够以3,6-二氯咔唑为唯一碳源生长的菌株。
MSM 液体培养基(无机盐培养基)的制作方法:以 1000 mL 去离子水计,称取硫酸铵 1.00 g、氯化钠 1.00 g、磷酸氢二甲 1.50 g、磷酸二氢钾 0.50 g、硫酸镁 0.20 g,加入 1000 mL 去离子水溶解,再加入 1.00 mL 微量元素溶液,用氢氧化钠调节 pH 至 7.0左右,121℃高温 高压灭菌 30 min;
MSM 固体培养基的制作方法:在 MSM 液体培养基基础上添加 18 g 琼脂粉制成。
微量元素溶液的制备方法:以 1000 mL 去离子水溶液计,称取钼酸钠 0.15 g、一水硫酸 锰 0.13 g、结晶氯化铝 0.05 g、氯化锌 0.23 g、一水硫酸铜 0.03 g、六水合氯化钴 0.42 g,加 1000 mL 去离子水溶解,用氢氧化钠或盐酸调节 pH 至 7.0 左右。
(2)将步骤(1)中筛选的菌株在 LB 固体培养基上活化,挑取菌株至已灭菌的 LB液体 培养基扩大培养,在 30℃,180 r/min 的条件下扩大培养3 d,于 20℃,5000 r/min条件离 心 5 min 收集菌体,用等体积已灭菌的 MSM 液体培养基清洗并重悬两次,将最后一次重悬的 菌体接种至灭菌的 MSM 液体培养基,调整菌液浓度为 OD600 = 1.0 左右,使培养基中,6-二氯咔唑浓度为 10.00 mg/L,30℃,180 r/min 的条件下培养 8 d。
LB 液体培养基(Luria-Bertani 培养基)的制作方法:以 1000 mL 去离子水溶液计,向 氯化钠 10.00 g、酵母浸膏 5.00 g、蛋白胨 10.00 g,加 1000 mL 去离子水溶解,用氢氧 化钠调节 pH 至 7.0 左右,121℃高温高压灭菌 30 min。 LB 固体培养基的制作方法:在 LB 液体培养基基础上 18 g 添加琼脂粉制成。
(3)对步骤(2)的 MSM 液体培养基的菌落在 8 d 时取样,提取并采用气相色谱-质谱联 用仪检测 MSM 中残留的3,6-二氯咔唑,计算各菌株降解率,直至筛选出3,6-二氯咔唑高效降 解菌,将降解菌保藏备用。
3,6-二氯咔唑降解菌的保藏方法:为了使筛选出的降解菌能够长时间保存并且能够在活 化后能恢复细菌活性,本实施例使用甘油保藏法将筛选分离出的降解菌进行保存。配制质量分数 30%的甘油,取 1.00 mL30%的甘油加入 2 mL 冻存管中,将甘油以及冻存管121℃高温高 压灭菌 30 min 后,加入 1.00 mL 菌液,将液体充分混匀后密封,冷冻保存在-40℃的冰箱备用。
(4)利用步骤(3)中保藏的降解菌制备孢子悬液。
孢子悬液制备方法:将冻存在-40℃冰箱中的菌株冰浴解冻,在无菌室中用灭菌过的牙签 蘸取适量菌液,在 PDA 固体培养基中进行平板划线,将划线后的平板倒扣在 30℃的生化培养 箱中培养,直至长出丰富的白色分生孢子。用牙签刮取平板表面的孢子至灭菌后的 MSM 液体 培养基,涡旋振荡使菌丝在培养基溶液中分布均匀制成孢子悬液,使孢子悬液的 OD600 = 0.16 ~0.165 左右。
(5)调整含有3,6-二氯咔唑的环境介质的 PH 值为 7.0,温度为 30℃,并在上述孢子悬液中加入 1 g/L 的蔗糖作为碳源,然后将孢子悬液接种至含有3,6-二氯咔唑的环境介质中。
3,6-二氯咔唑降解菌的鉴定:
I.3,6-二氯咔唑降解菌的形态学观察:
将保藏的高效降解菌在 LB 固体培养基上活化,挑选培养过程中长势较好、菌落外观生长 形状丰满的细菌单菌株进行形态学观察。肉眼观察细菌的大小、形状、颜色、透明度等形态 学特征。经观察该降解菌菌落呈圆形,白色绒毛状,参见图1。
II.3,6-二氯咔唑降解菌的扫描电镜观察:
①样品制备:将筛选的高效降解菌株在 LB 液体培养基中扩大培养 3 d,5000r/min 离心 5 min 收集菌体至 1.5 mL 离心管中,加入锇酸固定,放入 4 ℃冰箱保存过夜,将菌株充分固定。
②样品前处理:将固定了一夜的菌株用 PBS 缓冲液冲洗 5 次,每次静置时间为20 min, 冲洗前将菌株在 5000 r/min 离心 5 min。冲洗结束后分别用 45%、55%、75%、85%、95%、100% 的乙醇脱水,每次脱水时间为 30 min,将菌株在 100%乙醇中脱水并放入 4℃冰箱保存过夜。 最后加入醋酸异戊酯溶液置换,每次 20 min,共置换两次。
③CO2 临界点干燥:利用菌体在临界状态下表面系数张力为零,能够 最大限度保持菌体 的自然形态。将干燥了的样品粘贴到样品台上,方便后续操作。
④离子喷涂:将处理后的样品用低真空镀膜仪喷金镀膜,使用扫描电子显微镜观察(蔡 司场发射)进行扫描观察并拍照留存,参见图2。
III.3,6-二氯咔唑降解菌 ITS 鉴定:
将保存的降解菌活化后在 LB 固体培养基上划线扩大培养,选取长势良好的细菌,将降解菌送至生工生物工程(上海)股份有限公司进行菌株 ITS 测序,鉴定菌株的种属。经菌株 ITS 测序鉴定,K1 菌鉴定为镰刀菌,命名为镰刀菌 K1,参见图3。
3,6-二氯咔唑降解菌的降解特性:
I. 不同初始 pH 值对降解菌降解 3,6-二氯咔唑的影响,参见图4:
配制不同初始 pH 的 MSM 培养基,调节 pH 分别为 5.0、6.0、7.0、8.0 和 9.0,不同 pH 条件下各 150 mL,接种降解菌调整降解液吸光度至 OD600 = 0.16 左右,使降解液中 3,6-二氯 咔唑浓度为 10.00 mg/L,于 30℃, 180 r/min 条件下的摇床中培养,以不接种降解菌的培养 基为对照,每个pH 条件下设置三组平行,8 d 后取样用 GC-MS 测定剩余 3,6-二氯咔唑含量。 计算降解率,确定最佳降解 pH 条件为 pH=7.0。
II.不同温度条件对镰刀菌 K1 降解3,6-二氯咔唑的影响,参见图 5:
配制初始 pH 值为 7.0 的 MSM 培养基,接种降解菌调整降解液吸光度至 OD600= 0.16 左右, 使降解液中3,6-二氯咔唑浓度为 10.00 mg/L,分别在 20℃、25℃、30℃、35℃和 40℃的温 度条件,180 r/min 的摇床中培养,以不接种降解菌的培养基为对照,每个温度设置三组平 行,8 d 后取样用 GC-MS 测定剩余3,6-二氯咔唑含量。计算降解率,确定最佳降解温度条件 为 30℃。
III.不同外加碳源对镰刀菌 K1 降解3,6-二氯咔唑的影响,参见图6:
配制初始 pH 值为 7.0 的 MSM 培养基,接种降解菌调整降解液吸光度至 OD600= 0.16 左右, 使降解液中3,6-二氯咔唑浓度为 10.00 mg/L,分别加入 1 g/L、1 g/L、2g/L 的葡萄糖、蔗糖、可溶性淀粉作为外加碳源,在 30℃、180 r/min 的摇床中培养,以不接种降解菌的培养 基为对照,不同外加碳源条件设置三组平行,8 d 后取样用 GC-MS 中检测剩余 3,6-二氯咔唑 的含量。计算降解率,确定镰刀菌 K1 的最佳外加碳源为添加 1g/L 的蔗糖。
3,6-二氯咔唑降解产物分析:
参见图7,本实施例中对菌株 K1 降解3,6-二氯咔唑降解产物提取分别用二氯甲烷提取和 用乙腈提取,提取后用气相色谱质谱联用仪(GC-MS)定性分析。
利用二氯甲烷提取降解产物的前处理方法为:将高效降解菌接种配制降解液,在最佳 pH, 最适温度以及加入 1 g/L 蔗糖外加碳源条件下培养,以不加 3,6-二氯咔唑的样品为对照,分 别在降解前期(3 d)、降解中期(6 d)取样和降解后期(9 d)取样。取 1.00mL 降解液, 于 10 mL 离心管中,加入 2.00 mL 色谱二氯甲烷,涡旋 10 min 后在 4℃、6000 r/min 条件下 离心 5 min 使体系分层,吸取下层有机相,重复此提取步骤 3 次,将提取出的有机相定容到 10.00 mL,用高纯氮气氮吹干后用 5.00 mL 丙酮复溶,过 0.22 μm 有机滤头后用 GC-MS 检测。 经鉴定,二氯甲烷提取到的降解产物为 3-氯咔唑。
利用乙腈提取降解产物的前处理方法为:将高效降解菌接种配制降解液,在最佳pH,最 适温度以及加入 1 g/L 蔗糖外加碳源条件下培养,以不加3,6-二氯咔唑的样品为对照,分别 在降解前期(3 d)、降解中期(6 d)取样和降解后期(9 d)取样。取 1.00 mL 降解液,于 10 mL 离心管中,加入 2.00 mL 乙腈,涡旋 10 min 后加入 1.00 g NaCl 盐析,在 4℃、6000 r/min 条件下离心 5 min 使体系分层,吸取上层有机相,重复此提取步骤 2次,将提取出的有机相 过 0.22 μm 有机滤头后用 GC-MS 检测。经 GC-MS 鉴定识别到(E)-4-氯-2-羟基戊-2,4-二烯 酸、2-氨基-5-氯-3,4-二羟基苯甲酸、3-氯咔唑和(2E,4E)-6-(2-氨基-5-氯-3,4-二羟基 苯基)-4-氯-2-羟基-6-氧代六-2,4-二烯酸四种主要的降解产物,推测镰刀菌 K1 对3,6二氯 咔唑的降解存在脱氯和有角度双加氧两种途径,其中有角度双加氧途径是降解菌 K1 分解利用 3,6-二氯咔唑的途径。
利用气相色谱质谱联用仪(GC-MS)定性分析降解产物,质谱仪检测条件为:色谱柱为 TG-5MS(30m*0.25mm*0.25μm)。3,6-二氯咔唑通过选择离子监测(SIM)模式检测,扫描质荷比范围为 20 ~500 m/z。GC 进样器以脉冲不分流模式运行,升温程序设定初始温度为80℃, 保留 3 min,以 10℃/min 升至 150℃,再以 5℃/min 升至 250℃,保留 10 min,最后以 5℃ /min 升温至 300℃,保留 10 min。进样口温度、柱箱温度、四极杆温度、离子源分别为 280 ℃、80℃、250℃、230℃。每次进样量为 2.00 μL,载气为高纯氦气,载气流速为 1.20 mL/min。 实施例 2:本实施例与实施例 1 基本相同,其不同之处在于:步骤(5)中含有3,6-二氯 咔唑的环境介质的PH 值为 5.0,温度为 20℃,并在孢子悬液中加入 1 g/L的葡萄糖作为碳源。
实施例3:本实施例与实施例 1 基本相同,其不同之处在于:步骤(5)中含有3,6-二氯 咔唑的环境介质的 PH 值为 9.0,温度为 40℃,并在孢子悬液中加入 2 g/L 的可溶性淀粉作为碳源。

Claims (10)

1.一种镰刀菌对3,6-二氯咔唑生物降解的方法,其特征在于:该降解方法包括以下步骤:
(1)将受 3,6-二氯咔唑污染的土壤加入到 MSM 液体培养基中,通过富集和纯化筛选出 能够以 3,6-二氯咔唑为唯一碳源生长的菌株;
(2)将步骤(1)中筛选的的菌株在 LB 固体培养基上活化,挑取菌株至已灭菌的 LB 液体培养基扩大培养,收集扩大培养后的菌体,用已灭菌的 MSM 液体培养基清洗并重悬若干次, 将最后一次重悬的菌体接种至灭菌的 MSM 液体培养基进行培养;
(3)对步骤(2)中 MSM 液体培养基的菌落取样,提取并检测 MSM 液体培养基中残留的3,6-二氯咔唑含量,计算各菌株降解率,直至筛选出 3,6-二氯咔唑高效降解菌株,将降解菌 保藏备用;
(4)利用步骤(3)中保藏的降解菌制成孢子悬液;
(5)调整含有 3,6-二氯咔唑的环境介质的 PH 值为 5.0-9.0,温度为 20℃-40℃,并在 上述孢子悬液中加入碳源,然后将孢子悬液接种至含有 3,6-二氯咔唑的环境介质中。
2.根据权利要求 1 所述的镰刀菌对3,6-二氯咔唑生物降解的方法,其特征在于:步骤(1)中菌株富集和纯化的方法:在 30℃和 180 r/min 的摇床中培养 5 d,5 d 后取 5.00mL 富集培养液的上清液转接至新的含 100.00 mg/L 3,6-二氯咔唑的 MSM 液体培养基中,重复操 作 3 次,取最后一次富集的培养液 1.00 mL 加入灭菌的去离子水中,按照10-1、10-2、10-3的 比例进行逐级梯度稀释,吸取稀释后的培养液 50.00 μL 涂布于含 3,6-二氯咔唑 100.00 mg/L 的 MSM 固体培养基中,将其倒置于 30℃培养箱中培养;待菌落形成后,用灭菌牙签挑取不同 形态的单菌落在 LB 固体培养基中划线,经过反复的挑选分离,直至分离出纯菌。
3.根据权利要求 2 所述的镰刀菌对3,6-二氯咔唑生物降解的方法,其特征在于: 所述 MSM 液体培养基的制作方法:以 1000 mL 去离子水计,称取硫酸铵 1.00 g、氯化钠1.00 g、磷酸氢二甲 1.50 g、磷酸二氢钾 0.50 g、硫酸镁 0.20 g,加入 1000 mL 去离子水 溶解,再加入 1.00 mL 微量元素溶液,用氢氧化钠调节 pH 至 7.0 左右,121℃高温高压灭菌 30 min;
所述 MSM 固体培养基的制作方法:在 MSM 液体培养基基础上添加琼脂粉制成;
所述微量元素溶液的制备方法:以 1000 mL 去离子水计,称取钼酸钠 0.15 g、一水硫酸 锰 0.13 g、结晶氯化铝 0.05 g、氯化锌 0.23 g、一水硫酸铜 0.03 g、六水合氯化钴0.42 g,加 1000 mL 去离子水溶解,用氢氧化钠或盐酸调节 pH 至 7.0 左右。
4. 根据权利要求 1 所述的镰刀菌对3,6-二氯咔唑生物降解的方法,其特征在于: 所述 LB 液体培养基的制作方法:以 1000 mL 去离子水计,向氯化钠 10.00 g、酵母浸膏5.00 g、蛋白胨 10.00 g,加 1000 mL 去离子水溶解,用氢氧化钠调节 pH 至 7.0 左右,121 ℃高温高压灭菌 30 min; 所述 LB 固体培养基的制作方法:在 LB 液体培养基基础上添加琼脂粉制成。
5. 根据权利要求 1 所述的镰刀菌对3,6-二氯咔唑生物降解的方法,其特征在于:步骤 (2)中, LB 液体培养基扩大培养的条件:在 30℃,180 r/min 的条件下扩大培养 3 d;收集扩大培养后的菌体的方法:在 20℃,5000 r/min 条件离心 5 min 收集菌体。
6.根据权利要求 1 所述的镰刀菌对3,6-二氯咔唑生物降解的方法,其特征在于:步骤(2)中,MSM 液体培养基培养的条件:调整菌液浓度为 OD600 = 1.0 左右,使培养基中 3,6- 二氯咔唑浓度为 10.00 mg/L,在 30℃,180 r/min 的条件下培养 8 d。
7.根据权利要求 1 所述的镰刀菌对3,6-二氯咔唑生物降解的方法,其特征在于:步骤(3)中降解菌的保藏方法:配制质量分数 30%的甘油,取 30%的甘油加入冻存管中,将甘油以及冻存管 121℃高温高压灭菌 30 min 后,加入与甘油等体积的菌液,将液体充分混匀后密 封,冷冻保存在-40℃的冰箱备用。
8.根据权利要求 1 所述的镰刀菌对3,6-二氯咔唑生物降解的方法,其特征在于:步骤(4)中孢子悬液的制备方法:将冻存的菌株冰浴解冻,在无菌室中用灭菌过的牙签蘸取适量菌液,在 PDA 固体培养基中进行平板划线,将划线后的平板倒扣在生化培养箱中培养,直至 长出丰富的白色分生孢子,用牙签刮取平板表面的孢子至灭菌后的 MSM 液体培养基,涡旋振 荡使菌丝在培养基溶液中分布均匀,使孢子悬液的 OD600 = 0.16~0.165。
9.根据权利要求 8 所述的镰刀菌对3,6-二氯咔唑生物降解的方法,其特征在于:所述PDA 固体培养基的制备方法:以 1000 mL 去离子水计,取马铃薯 200.00 g、葡萄糖 20.00g、 琼脂粉 15.00 g,加 1000 mL 去离子水溶解,121℃高温高压灭菌 30 min。
10.根据权利要求 1 所述的镰刀菌对3,6-二氯咔唑生物降解的方法,其特征在于:步骤 (5)中接种环境最适降解条件为:温度为 30℃,pH 为 7.0,孢子悬液外加碳源为 1 g/L蔗 糖溶液。
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Citations (8)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN102925362A (zh) * 2012-09-17 2013-02-13 中国农业科学院农业环境与可持续发展研究所 一种尖孢镰刀菌的筛选方法及其应用
CN103074238A (zh) * 2013-02-08 2013-05-01 云南省农业科学院花卉研究所 一种从土壤中分离尖孢镰刀菌的方法
WO2013138523A1 (en) * 2012-03-15 2013-09-19 The Regents Of The University Of California Methods for altering lipids in algae and yeast
CN104640856A (zh) * 2012-05-11 2015-05-20 复位治疗公司 作为隐花色素调节剂的含有咔唑的磺酰胺类
CN106591185A (zh) * 2016-12-13 2017-04-26 山东农业大学 一株解淀粉芽孢杆菌植物亚种及其菌剂的制备和应用
CN108624513A (zh) * 2018-06-15 2018-10-09 成都本则生科技有限公司 一种高密度培养d-泛解酸内酯水解酶产生菌的方法及应用
CN110607237A (zh) * 2019-10-14 2019-12-24 湖北省农业科学院粮食作物研究所 一种镰刀菌孢子的保存方法
CN112592335A (zh) * 2021-01-15 2021-04-02 贵州大学 一类含1,2,3-三氮唑的咔唑异丙醇二胺类化合物及其制备方法和应用

Patent Citations (8)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2013138523A1 (en) * 2012-03-15 2013-09-19 The Regents Of The University Of California Methods for altering lipids in algae and yeast
CN104640856A (zh) * 2012-05-11 2015-05-20 复位治疗公司 作为隐花色素调节剂的含有咔唑的磺酰胺类
CN102925362A (zh) * 2012-09-17 2013-02-13 中国农业科学院农业环境与可持续发展研究所 一种尖孢镰刀菌的筛选方法及其应用
CN103074238A (zh) * 2013-02-08 2013-05-01 云南省农业科学院花卉研究所 一种从土壤中分离尖孢镰刀菌的方法
CN106591185A (zh) * 2016-12-13 2017-04-26 山东农业大学 一株解淀粉芽孢杆菌植物亚种及其菌剂的制备和应用
CN108624513A (zh) * 2018-06-15 2018-10-09 成都本则生科技有限公司 一种高密度培养d-泛解酸内酯水解酶产生菌的方法及应用
CN110607237A (zh) * 2019-10-14 2019-12-24 湖北省农业科学院粮食作物研究所 一种镰刀菌孢子的保存方法
CN112592335A (zh) * 2021-01-15 2021-04-02 贵州大学 一类含1,2,3-三氮唑的咔唑异丙醇二胺类化合物及其制备方法和应用

Non-Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
ZHONGKUN DU等: "Effects of 3, 6-dichlorocarbazole on microbial ecology and its degradation in soil", JOURNAL OF HAZARDOUS MATERIALS, vol. 424, no. 15, pages 127 - 315 *
陈悦等: "沙棘枝枯病的定量检测体系构建和应用", 经济林研究, vol. 40, no. 1, pages 258 - 264 *

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