CN114703190A - 一种靶向抑制KIAA1429基因表达的ShRNA在慢性髓细胞白血病中的应用 - Google Patents

一种靶向抑制KIAA1429基因表达的ShRNA在慢性髓细胞白血病中的应用 Download PDF

Info

Publication number
CN114703190A
CN114703190A CN202210378985.6A CN202210378985A CN114703190A CN 114703190 A CN114703190 A CN 114703190A CN 202210378985 A CN202210378985 A CN 202210378985A CN 114703190 A CN114703190 A CN 114703190A
Authority
CN
China
Prior art keywords
shrna
kiaa1429
cml
cells
gene
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Granted
Application number
CN202210378985.6A
Other languages
English (en)
Other versions
CN114703190B (zh
Inventor
姚芳苡
黄波
刘静
王小中
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Second Affiliated Hospital to Nanchang University
Original Assignee
Second Affiliated Hospital to Nanchang University
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Second Affiliated Hospital to Nanchang University filed Critical Second Affiliated Hospital to Nanchang University
Priority to CN202210378985.6A priority Critical patent/CN114703190B/zh
Publication of CN114703190A publication Critical patent/CN114703190A/zh
Application granted granted Critical
Publication of CN114703190B publication Critical patent/CN114703190B/zh
Active legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Images

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/113Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
    • C12N15/1137Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing against enzymes
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/70Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
    • A61K31/7088Compounds having three or more nucleosides or nucleotides
    • A61K31/713Double-stranded nucleic acids or oligonucleotides
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • A61P35/02Antineoplastic agents specific for leukemia
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/113Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
    • C12N15/1135Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing against oncogenes or tumor suppressor genes
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/10Type of nucleic acid
    • C12N2310/14Type of nucleic acid interfering N.A.
    • C12N2310/141MicroRNAs, miRNAs
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/50Physical structure
    • C12N2310/53Physical structure partially self-complementary or closed
    • C12N2310/531Stem-loop; Hairpin

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

本发明公开了一种靶向抑制KIAA1429基因表达的ShRNA在制备治疗慢性髓细胞白血病药物疗中的应用。所述靶向抑制KIAA1429基因表达的ShRNA是以KIAA1429基因中SEQ ID NO.1所示核苷酸序列为靶点设计的核酸分子,所述的核酸分子为SEQ ID NO.2‑3所示的ShRNA‑1或SEQ ID NO.4‑5所示的ShRNA‑2,本发明提供的针对靶向抑制KIAA1429基因表达的ShRNA通过细胞和动物实验,证实其能抑制KIAA1429基因表达,并在抑制慢性髓细胞白血病细胞的增殖、转移等多方面具有显著效果,具有潜在的克服Imatinib耐药性的价值,为慢性髓细胞白血病的临床治疗提供新的靶向治疗药物。

Description

一种靶向抑制KIAA1429基因表达的ShRNA在慢性髓细胞白血 病中的应用
技术领域
本发明属于生物医药领域,具体涉及一种靶向抑制KIAA1429基因表达的ShRNA及其在慢性髓细胞白血病中的应用。
背景技术
慢性髓细胞白血病(chronic myeloid leukemia,CML)是一种起源于骨髓多能造血干细胞的恶性克隆性骨髓增生性疾病,以成熟髓系细胞的异常增殖为主,在我国发病率高,约占成年人白血病的20%,Bcl/Abl融合基因是其特征及关键致病基因。目前CML治疗主要包括骨髓移植、基因治疗、免疫治疗和分子靶向药物治疗等。但分别存在着费用高、成功率低、副作用大等问题亟待解决,目前使用最广泛的酪氨酸激酶抑制剂(TKIs),如Imatinib,也存在约1/5的CML患者耐药,疗效不佳疾病则可能进一步恶性进展,出现急变,预后极差。目前CML演变及TKI耐药性阻碍着彻底治愈CML最终理想的实现。因此,深入研究CML恶性进展演变机制,寻找新的靶点和治疗方向,将更好的提高治疗效果,改善患者的生存质量。
表观遗传学是血液肿瘤的重要推动因素,N6-甲基腺苷(m6A)甲基化是真核生物mRNA中最常见的修饰,据报道,m6A修饰血液系统恶性肿瘤起重要调控作用,可能成为血液肿瘤分子诊断及治疗靶标。KIAA1429是m6A甲基转移酶,位于人染色体8q22.1,是一种介导m6A修饰的复合物(WMM)的主要成分,为m6A甲基化的关键调节因子,是目前发现的甲基转移酶复合体中分子量最大的蛋白,可以以依赖或不依赖m6A甲基化的方式,调控RNA剪接、出核运输、加工、翻译及稳定性,进而影响肿瘤、生殖、生物节律等多种生物学功能。已有研究显示KIAA1429表达异常与肝癌、胃癌、乳腺癌、头颈部鳞状细胞癌、睾丸生殖细胞瘤等多种癌症类型的不良预后密切相关,KIAA1429高表达参与并促进癌症进展,在这些癌症类型中观察到明显的致癌作用,提示KIAA1429可能是癌症治疗中潜在的治疗靶点。但目前,KIAA1429在CML的发生发展及耐药中的作用及机制国内外尚未见报道。
发明内容
鉴于现有技术存在的问题,本发明的目的在于提供一种靶向抑制KIAA1429基因表达的ShRNA及其在制备治疗CML的药物中的应用。本发明通过利用RNA干扰技术,设计并合成一种特异性抑制KIAA1429基因的ShRNA。上述ShRNA可以特异性地抑制靶基因KIAA1429的表达,从而抑制CML细胞的增殖、转移和Imatinib耐药,达到CML的基因靶向治疗的目的。本发明经试验和数据分析,KIAA1429基因在CML急变期患者中高表达,抑制CML细胞中KIAA1429基因的表达可以抑制细胞的增殖、转移和Imatinib耐药。本发明通过构建一种靶向抑制KIAA1429基因表达的ShRNA可以用于CML治疗试剂的开发。KIAA1429基因的靶向抑制ShRNA在CML基因治疗与分子靶向治疗领域将发挥重要作用,为CML的临床治疗提供新的靶向治疗药物。
为了实现上述目的,本发明采用以下技术方案。
本发明提供了一种靶向抑制KIAA1429基因表达的ShRNA,所述ShRNA是以KIAA1429基因中SEQ ID No.1所示核苷酸序列为靶点设计的核酸分子。
进一步,所述ShRNA为ShRNA-1或ShRNA-2,所述ShRNA-1包含正义链:
5’-CCGGCGGAATATGAAGCAACAAATTCTCGAGAATTTGTTGCTTCATATTCCGTTTTTG-3’和反义链:
5’-AATTCAAAAACGGAATATGAAGCAACAAATTCTCGAGAATTTGTTGCTTCATATTCCG-3’;所述ShRNA-2包含正义链:
5’-CCGGCGCTGAGCAAAGTTCTCATATCTCGAGATATGAGAACTTTGCTCAGCGTTTTTG-3’和反义链:
5’-AATTCAAAAACGCTGAGCAAAGTTCTCATATCTCGAGATATGAGAACTTTGCTCAGCG-3’。
本发明还提供了上述ShRNA在制备治疗慢性髓细胞白血病的药物中的应用。
进一步,本发明所述制备治疗慢性髓细胞白血病的药物中的应用,其中所述ShRNA为ShRNA-1和/或ShRNA-2,其中ShRNA-1和ShRNA-2如前所述。
进一步,本发明所述治疗是指抑制慢性髓细胞白血病细胞的增殖、抑制慢性髓细胞白血病细胞的迁移和/或抑制Imatinib耐药能力。
进一步,本发明所述药物的剂型为任何药物治疗学上可接受的剂型。
进一步,本发明所述药物的剂量为任何药物治疗学上可接受的剂量。
进一步,本发明所述药物包含所述的ShRNA以及药学上可接受的载体。
进一步,本发明所述药物包含ShRNA-1和/或ShRNA-2以及药学上可接受的载体。
本发明人首次研究发现,相较于CML初发期患者,KIAA1429在CML急变期患者样本中表达显著上调,提示KIAA1429可能与CML病情进展密切相关。本发明进一步通过细胞动物实验,验证KIAA1429功能,结果显示通过ShRNA沉默KIAA1429表达,能够抑制CML细胞增殖、迁移,促进细胞的凋亡,并能在体内有效的抑制CML成瘤能力。当前临床上酪氨酸激酶抑制剂是治疗的CML的重要手段,而沉默KIAA1429表达,能够提高CML细胞株对Imatinib的敏感性,基于以上研究成果,表明KIAA1429在CML疾病进展中起重要作用,是一个可用于CML的治疗的分子靶标,开发针对该靶标的治剂将推动CML,特别是CML急变期患者的治疗。
与现有技术相比,本发明的有益效果如下。
1)本发明首次提出利用RNA干扰技术开发特异性靶向抑制KIAA1429基因的ShRNA,可以显著地抑制CML细胞的增殖、转移和Imatinib耐药,是治疗CML的一种新型靶向药物制剂,与传统化疗药物相比具有显著特异性。
2)本发明提供的靶向抑制KIAA1429基因表达的ShRNA通过细胞和动物实验证实,在抑制CML细胞的增殖、转移和Imatinib耐药方面具有显著效果,能有效发挥抑制KIAA1429基因表达的作用,对CML起到基因治疗的目的,为CML的临床治疗提供新的靶向治疗药物。
附图说明
图1为本发明实施例中KIAA1429基因在CML患者中表达情况图。
图2为本发明实施例中利用RT-qPCR和WB实验检测K562/G01细胞接受ShRNA处理组与空白对照组的细胞KIAA1429表达情况图。
图3为本发明实施例中利用CCK-8实验检测K562/G01细胞接受ShRNA处理组与空白对照组的细胞增殖能力图。
图4为本发明实施例中利用EdU染色检测K562/G01细胞接受ShRNA处理组与空白对照组的细胞增殖能力图。
图5为本发明实施例中利用流式细胞术检测K562/G01细胞接受ShRNA处理组与空白对照组的细胞凋亡情况图。
图6为本发明实施例中利用Transwell实验检测K562/G01细胞接受ShRNA处理组与空白对照组的细胞迁移能力图。
图7为本发明实施例中利用IC50实验检测K562/G01细胞接受ShRNA处理组与空白对照组的细胞Imatinib耐药能力图。
图8为本发明实施例中利用K562/G01细胞接受ShRNA处理组与空白对照组细胞在在体情况下细胞的增殖能力图。
具体实施方式
下面结合具体实施例对本发明作进一步的详细描述。但不应将此理解为本发明上述主题的范围仅限于以下的实施例,凡基于本发明内容所实现的技术均属于本发明的范围。除了特别指明,以下实施例中所使用的技术手段和操作方法为本领域技术人员所熟知的常规手段和方法,所使用原料均为市售商品。
以下结合附图和实施例对本发明的技术方案做进一步的说明。下列实施例中未注明具体条件的实验方法,通常按照常规条件如Sambrook等人,分子克隆实验室手册(NewYork:Cold Spring Harbor Laboratory Press,1989)中所述的条件,或按照制造厂商所建议的条件。
实验材料:人慢性髓细胞白血病细胞Imatinib耐药株K562/G01系重庆医科大学检验学院惠赠,ShRNA慢病毒购自中国吉凯公司,Anti KIAA1429(#88358)和Anti GAPDH(#5174)购自美国CST公司,Imatinib购自中国索莱宝公司,EDU试剂购自中国锐博公司,CCK8试剂购自中国汉恒生物技术公司,流式凋亡试剂盒购自美国BD公司,Tanswell小室购自美国康宁公司,Trizol购自中国TaKaRa公司,Ficoll淋巴细胞分离液购自北京索莱宝科技有限公司,Trizol试剂购自美国Invitrogen公司,Takara逆转录试剂盒和荧光定量试剂盒购自日本Takara公司。
实施例1
KIAA1429基因在CML患者中表达情况分析。
1、CML病患组标本采集。据2016年CML的NCCN诊断标准,收集初次诊断并未进行治疗CML慢性期患者样本(CML-CP)40例和CML急变期患者样本(CML-BP)18例。
2、提取患者外周血单个核细胞(PBMC)。Ficoll密度梯度离心法:①将2.5ml全血置入15ml离心管中,2.5ml PBS溶液稀释,轻轻混匀;②取15ml离心管先加入5ml Ficoll溶液。然后将稀释的血液用移液管轻轻加到Ficoll上层(避免两种溶液混合);③离心2000rpm,20min;④用吸管吸取白色细胞层(即PBMC)放入干净的15ml离心管中;⑤加入PBS至10-15ml,1500rpm,10min离心后去掉上清,备用。
3、RT-qPCR检测mRNA表达量
(1)通过时实荧光定量PCR方法,对各组间KIAA1429 mRNA表达量进行定量检测。来自各组样本的PBMC采用Trizol法提取总RNA。测定总RNA纯度和浓度,备用。
(2)模板DNA即cDNA的合成:按Takara逆转录反应试剂盒说明对制备的总RNA进行逆转录,扩增产物即为模板cDNA,-20℃保存备用。
(3)SYBR Green法RT-qPCR检测:①KIAA1429引物及内参基因GAPDH引物由华大基因公司合成,分别用无核酶水溶解为10nmol/ml,备用;②按Takara荧光定量试剂盒配制RT-qPCR反应体系如下表:
Figure BDA0003591469980000051
③反应条件:首先95℃30s,然后按95℃5s、60℃34s的顺序循环40次,最后95℃15s、60℃60s、95℃15s;④为减少试验误差,每例样本进行3次重复试验。⑤分析结果:结合扩增曲线及溶解曲线判断扩增效果,利用2-ΔΔCt法计算目的基因表达量。
结果如图1所示,KIAA1429 mRNA在CML急变期患者外周血单个核细胞PBMC中表达较CML初发期患者显著上调。
实施例2
针对KIAA1429基因ShRNA的设计、制备和验证。
1、首先设计针对KIAA1429基因的干扰序列,靶向抑制人KIAA1429基因表达的ShRNA-1正义链序列如下:
5’-CCGGCGGAATATGAAGCAACAAATTCTCGAGAATTTGTTGCTTCATATTCCGTTTTTG-3’(SEQID No.2)。ShRNA-1反义链序列如下:
5’-AATTCAAAAACGGAATATGAAGCAACAAATTCTCGAGAATTTGTTGCTTCATATTCCG-3’(SEQID No.3)。ShRNA-2正义链序列如下:
5’-CCGGCGCTGAGCAAAGTTCTCATATCTCGAGATATGAGAACTTTGCTCAGCGTTTTTG-3’(SEQID No.4)。ShRNA-2反义链序列如下:
5’-AATTCAAAAACGCTGAGCAAAGTTCTCATATCTCGAGATATGAGAACTTTGCTCAGCG-3’(SEQID No.5)。通过NCBI网站的同源序列对比分析软件nucleotide blast进行对比分析,结果表明该序列和人的其他mRNA基因没有高度同源性,可以用于特异性地干扰KIAA1429基因的表达。基于上述靶向抑制KIAA1429基因表达的序列,由中国吉凯公司进一步设计并合成用于靶向抑制KIAA1429基因表达ShRNA-1/ShRNA-2质粒,并包装为ShRNA-1/ShRNA-2慢病毒的形式用于细胞、动物和治疗等实验。
2、验证ShRNA慢病毒能够靶向抑制KIAA1429基因表达。接受ShRNA-1/ShRNA-2慢病毒转染的细胞分别命名为ShRNA-1/ShRNA-2实验组,接受空载质粒慢病毒处理的细胞为Sh-NC空白对照组。
3、RT-qRCR检测各组细胞KIAA1429基因mRNA表达量,方法如前所述。结果如图2-A所示,ShRNA组细胞KIAA1429 mRNA表达水平较空白对照组显著降低。
4、.Western Blot检测法各组细胞KIAA1429基因蛋白质表达量。收集各组细胞,用PBS洗涤后,以RIPA裂解法提取细胞总蛋白,以BCA法检测总蛋白浓度。取40μg蛋白溶于6×SDS上样缓冲液中,100℃煮沸,10min后,将上述各样品经8%SDS-PAGE凝胶电泳,湿转法将蛋白转移至PVDF膜,5%脱脂奶粉在室温下封闭1h,然后将PVDF膜与1:1000稀释的一抗KIAA1429和GAPDH于4℃孵育过夜,用TBST洗3次后将膜与1:5000稀释的兔二抗室温孵育1h。TBST漂洗后,加入显影剂用Bio-Rad图象分析系统曝光成像。结果如图2-B所示,ShRNA组细胞KIAA1429蛋白质表达水平较空白对照组显著降低。
实施例3
ShRNA作用于K562/G01对其增殖、迁移、凋亡及耐药影响的实验研究。
1、CCK-8实验检测细胞增殖能力:用于检测细胞增殖情况。取各组转染细胞,调整细胞密度为1×105/ml,取0.1ml/孔接种96孔细胞培养板,在37℃、5%CO2培养箱中分别培养0h、12h、24h和48h后,每孔加10微升CCK8试剂,培养箱继续培养3h后,酶标仪测定450nm/630nm处的各孔吸光度OD值,每组实验复孔3孔,计算绘制细胞增殖曲线。结果如图3所示,ShRNA组细胞增殖能力显著低于空白对照组。
2、EDU染色法检测细胞增殖能力。根据试剂说明书操作,取1×106对数生长期细胞,完全培养基1:1000稀释的EdU溶液共同孵育2小时,PBS洗涤两遍,4%多聚甲醛室温固定30分钟,2mg/ml甘氨酸脱色;0.5%Triton X渗透剂孵育后,加入Apollo染色反应液,室温避光孵育30分钟、0.5%Triton X渗透剂脱色摇床孵育10min,加入Hoechst33342室温避光孵育30分钟,PBS洗涤,染色完成,然后荧光显微镜拍照。结果如图4所示,ShRNA组细胞增殖能力显著低于空白对照组。
3、流式细胞术检测细胞凋亡情况。依据试剂盒说明书,分别离心收集各组1×106细胞,预冷的PBS漂洗2次,加0.1ml 1×Binding Buffer重悬细胞。加入5微升Annexin V-PE和5微升7-AAD避光孵育10分钟,加入0.4ml 1×Binding Buffer。1小时内流式细胞仪检测激发波长488nm下,FL2和FL3通道的荧光强度。结果如图5所示,ShRNA组细胞凋亡率显著高于空白对照组。
4、Transwell实验检测细胞迁移能力。收集各组细胞,PBS洗涤后,加入无血清的RPMI-1640培养基,饥饿培养24小时。饥饿培养的细胞离心去培养基,以无血清的RPMI-1640培养基重悬,调整细胞浓度至1×106/ml。Transwell小室置于24孔板中,下室中加入550μl含20%胎牛血清的RPMI-1640培养基,上室加入200μl无血清培养基细胞悬液。恒温细胞培养箱37℃培养48h后。取出Transwell小室以甲醇固定30min,用0.1%甲紫染色后,显微镜下观察拍照。结果如图6所示,ShRNA组细胞迁移能力显著低于空白对照组。
5、IC50实验检测细胞Imatinib耐药能力。收集各组细胞,调整细胞悬液浓度至1×105/ml。96孔板每孔加入100μl细胞悬液,并在相应的孔位分别加入不同浓度梯度相应药物,每样每个药物浓度设置三个复孔,并设置调零孔。将96孔板置于恒温细胞培养箱培养48h后,每孔加入10μl CCK-8溶液,在细胞培养箱内继续孵育2-4小时后,然后用酶标仪上以450nm/630nm读取吸光度,绘制IC50曲线。结果如图7所示,ShRNA组细胞Imatinib敏感性显著高于空白对照组。
实施例4
利用裸鼠皮下荷瘤模型验证ShRNA在体内情况下抑制CML进展的情况。
为进一步探究该抑制剂在在体情况下对CML进展的影响,采用小鼠皮下荷瘤模型进行研究。实验组每组各准备4只BALB/c裸鼠,ShRNA-1/ShRNA-2组和Sh-NC组各准备细胞悬液,细胞悬液的浓度为5×107/ml,细胞的悬浮液采用1640培养基,不含有FBS;向每组每只裸鼠的皮下注入0.2ml的细胞;在SPF级无菌动物饲养间进行30天的饲养;之后将上述裸鼠处死并记录裸鼠皮下成瘤的体积。统计数据分析提示ShRNA组裸鼠皮下成瘤率较Sh-NC组显著降低,瘤体体积显著缩小,提示ShRNA-1/ShRNA-2处理CML细胞可以在在体内情况下抑制CML的进展,如图8所示。
上述实施例各组间变化均有统计学差异(*P<0.05,**P<0.05,***P<0.001)。
上述步骤为本专利的较佳实施方式,但是本专利并不限于上述实施方式,在本领域的技术或研究人员,可在各所处知识领域内,且不脱离本专利宗旨的前提下作出相应的变化。
序列表
<110> 南昌大学第二附属医院
<120> 一种靶向抑制KIAA1429基因表达的ShRNA在慢性髓细胞白血病中的应用
<160> 5
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 6478
<212> DNA
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 1
ctgttccccg cccgcggcaa acatggcggt ggactcggcg atggagctgt tatttttaga 60
tacttttaaa cacccgagcg ctgagcaaag ttctcatata gatgtggttc gttttccatg 120
tgtggtttat atcaatgaag tccgagtcat acccccagga gtaagagccc atagcagtct 180
gccagacaat agagcatatg gagagacatc tccccataca tttcaattag acttattctt 240
caacaatgta agcaaaccaa gtgcccctgt tttcgatagg ttgggaagcc tggaatatga 300
tgagaatact tccatcatct ttagacctaa ctcaaaggtg aatactgatg gtctggtgct 360
aagaggctgg tataactgtc tgacactggc aatatatgga tcagtggata gagtgataag 420
tcatgacaga gactctccac caccaccacc tccaccgcca ccacctcccc agccacaacc 480
aagtttgaaa aggaatccaa aacatgctga tggggagaaa gaagatcagt ttaatggaag 540
ccctccaaga ccacagccaa ggggaccaag aactcctcca ggaccccctc cacctgatga 600
tgatgaagat gatcctgtgc ctctgccagt gtctggtgac aaggaagagg atgctcctca 660
tagagaagat tactttgagc ccatttctcc tgatcggaat tctgttcccc aggaagggca 720
atattctgat gaaggagaag tagaagagga acaacaagaa gaaggagaag aagatgaaga 780
tgatgtggat gtagaggaag aagaggatga ggatgaggat gatcgacgaa cagtagacag 840
tattcctgag gaggaagagg aagatgaaga ggaagaaggt gaagaggatg aagaaggtga 900
aggggatgat ggttatgaac aaatttccag tgatgaagat ggaattgctg acttggaacg 960
tgaaacattt aagtatccaa actttgatgt tgaatacact gctgaagact tagcttcagt 1020
tcctcctatg acatatgatc catatgacag ggagcttgta ccactcttat acttcagttg 1080
tccatacaag actacttttg aaattgaaat cagtagaatg aaggatcaag gtccagataa 1140
agaaaattca ggggcaatcg aagcctcagt gaagttaaca gaactcttag atttgtatag 1200
agaagataga ggtgcaaaat gggtaacagc tttagaagaa attccaagtt taataataaa 1260
agggttaagc tatttgcaat tgaaaaacac aaaacaagac tcccttggcc agttggtaga 1320
ctggaccatg caagctttaa atttacaagt agcgcttcgc caacctatcg ccttaaatgt 1380
tcgacagctc aaagctggga ccaaattagt gtcctcacta gcagaatgtg gggctcaagg 1440
agttacagga ctgctacaag caggagtgat cagtggatta tttgaacttc tgtttgctga 1500
tcacgtatca tcttctctta agttaaatgc ttttaaagct ttggacagtg tcattagtat 1560
gacagaagga atggaagctt ttttaagagg taggcagaat gaaaaaagtg gttatcaaaa 1620
gcttctggaa ctcatacttt tagatcagac tgtgagggtt gttactgctg gttcagctat 1680
tctccaaaaa tgccatttct atgaagtctt gtcagagatt aaaagacttg gtgaccattt 1740
agcagagaag acttcatctc ttcctaacca cagtgaacct gatcacgaca cagatgctgg 1800
acttgagaga acaaacccag aatatgaaaa tgaggtggaa gcttctatgg atatggatct 1860
tttggaatcc tcaaatataa gtgaagggga aatagaaagg cttattaacc tcctagaaga 1920
agtttttcat ttaatggaaa ctgcccctca tacaatgatc caacaacctg ttaagtcttt 1980
cccaacgatg gcacgaatta ctggacctcc agagagggat gatccatacc ctgttctctt 2040
tagatatctt cacagtcatc acttcttgga gttggttacc ttgcttctgt caattccagt 2100
aacaagtgct caccctggtg tgctgcaagc cacaaaagat gttttgaagt ttcttgcaca 2160
gtcacagaag ggtcttcttt tttttatgtc ggaatatgaa gcaacaaatt tattgatccg 2220
agctctgtgt cacttttatg atcaagatga ggaggaaggt ctccaatctg atggtgttat 2280
tgatgatgca tttgccttgt ggctacagga ctcaacacag acattgcaat gtattacaga 2340
actgttcagc cattttcagc gttgtacagc cagtgaagaa acagaccatt cagatctctt 2400
gggaaccctg cacaatcttt atttgattac ttttaatcct gtgggaagat cagctgttgg 2460
ccatgttttt agtctggaga aaaatctcca aagtcttatt actctaatgg agtactattc 2520
caaagaagcc ttgggtgatt ccaaatctaa gaagtcagta gcttataatt acgcatgcat 2580
acttattttg gtggtggttc agtcttccag tgatgttcaa atgctagaac aacatgcagc 2640
atctctcttg aagctttgta aagcagatga aaataatgct aaattgcaag aacttggcaa 2700
gtggcttgaa cctctgaaaa accttagatt tgaaattaac tgcatcccaa acttaattga 2760
gtatgttaag cagaatatcg ataacttgat gaccccagaa ggagttggcc ttaccactgc 2820
cttacgtgtt ctctgtaatg ttgcatgccc accacctcct gttgaaggtc aacagaaaga 2880
tctgaaatgg aatcttgccg ttattcagct tttttctgct gaaggaatgg acacgtttat 2940
tcgagttctg caaaaattga acagtattct gactcagcct tggaggctcc atgtcaacat 3000
ggggactacc cttcacagag ttactactat ttcaatggct cgctgcacac tcactcttct 3060
taaaactatg ttaacggaac tcctgagagg tggatccttt gagtttaagg acatgcgtgt 3120
tccttcagcg cttgttactt tacatatgct cctgtgctct atccccctct caggtcgttt 3180
ggatagtgat gaacagaaaa ttcagaatga tatcattgat attttactga cttttacaca 3240
aggagttaat gaaaaactca caatctcaga agagactctg gccaataata cttggtcttt 3300
aatgttaaaa gaagttcttt cttcaatctt gaaggttcct gaaggatttt tttctggact 3360
catactcctt tcagagctgc tgcctcttcc attgcccatg caaacaactc aggttattga 3420
gccacatgat atatcagtgg cactcaacac ccgaaaattg tggagcatgc accttcatgt 3480
tcaagcaaag ttgctccaag aaatagttcg ctctttctct ggcacaacct gccagcccat 3540
tcaacatatg ttacggcgta tttgtgttca attgtgtgac cttgcctcac caactgcact 3600
tctgattatg agaactgtgt tggatttgat tgtagaagac ttgcaaagca cttcagaaga 3660
taaagaaaaa cagtatacta gccaaaccac caggttgctt gctcttcttg atgctctggc 3720
ttcacacaaa gcttgtaaat tagctatttt gcatctaatt aatggaacta ttaaaggtga 3780
tgaaagatat gcagagatat tccaggatct tttagctttg gtgcggtctc ctggagacag 3840
tgttattcgc caacagtgtg ttgaatatgt cacatccatt ttgcagtctc tctgtgatca 3900
ggacattgca cttatcttac caagctcttc tgaaggttct atttctgaac tggagcagct 3960
ctccaattct ctaccaaata aagaattgat gacctcaatc tgtgactgtc tgttggctac 4020
gctagctaac tctgagagca gttacaactg tttactgaca tgtgtcagaa caatgatgtt 4080
tcttgcagag catgattatg gattatttca tttaaaaagt tctttaagga aaaacagtag 4140
tgctctgcat agtttactga aacgagtggt cagcacattt agtaaggaca caggagagct 4200
tgcatcttca tttttagaat ttatgagaca aattcttaac tctgacacaa ttggatgctg 4260
tggagatgat aatggtctca tggaagtaga gggagctcat acatcacgga cgatgagtat 4320
taatgctgca gagttaaaac agcttctaca aagcaaagaa gaaagtccag aaaatttgtt 4380
ccttgaacta gagaagcttg ttttggaaca ttcaaaagat gatgacaatc tggattcttt 4440
gttggacagt gtagttggac ttaagcagat gctggagtca tcaggtgacc ctttacctct 4500
cagtgaccag gatgtagaac cagtactttc agctccagaa tctcttcaga atctgtttaa 4560
caataggact gcctatgtgc ttgctgatgt catggatgat cagttgaaat ctatgtggtt 4620
cactccattt caggctgaag agatagatac agatctggat ttggtaaagg ttgacttaat 4680
tgaactctct gaaaaatgct gtagtgactt tgatttgcac tcagaattag agcgctcatt 4740
tttgtcagaa ccatcatctc caggaagaac caagactact aaaggattca aacttgggaa 4800
gcacaagcat gagaccttta taacgtcaag tggaaaatct gaatacattg aacctgccaa 4860
aagagctcat gttgtgccac caccaagagg aaggggcagg ggaggatttg gacagggtat 4920
acgacctcat gatatttttc gtcagagaaa acagaacaca agtagaccac catctatgca 4980
tgtggatgac tttgttgctg ctgaaagtaa agaagtggtt cctcaagatg gaatacctcc 5040
accaaaacgg ccactcaaag tatcacagaa gatttcttcc cgtggtgggt tttcaggcaa 5100
tagaggagga cggggtgctt tccacagtca gaataggttt ttcacaccac ctgcttcaaa 5160
aggaaactac agtcgtcggg aaggaacaag aggctccagt tggagtgctc agaatactcc 5220
tcgaggaaat tacaatgaaa gtcgtggagg ccagagcaat tttaacagag gccctcttcc 5280
accattacga ccccttagtt ctacaggtta ccgcccaagt cctcgggacc gtgcttctag 5340
aggtcgtggg ggacttggac cttcctgggc tagtgcaaat agcggcagtg gaggctcaag 5400
aggaaagttt gttagtggag gcagtggtag aggtcgtcat gtacgctcct ttacacgata 5460
aaaatccttt tgggaacatc ttaactgtat atgaacattt cacgaggaca ataaaaataa 5520
gacattgaag gaccaattta gacttagcag ttatctggag acatctgaga gaatattttt 5580
atctgaagaa agcagaattt gtttgatacc taacaagatt tcaataaaaa tccaaacttt 5640
gtatgtacgt ttgtatatat tttccctttt ttgtatgact atttatttag aaaatttcta 5700
ggtgaaaaac taaatgatgt tttgtatttt tcttgcctat agcacagata ttctcaaact 5760
ttctcagctc atgacactat ttagtgcctc agtacttttt tcacagcata cctggtccaa 5820
aagaaatatc taatacttgt gtttattaag cagttagatc caacagctta ataagaatgt 5880
acatcatcac cactagtaac tgtggacact gcatgtctca aaccttggaa tcagtatcat 5940
tttcttttcc tctctgcttc ttgcacagta ctttttatca aactgctgaa aacccagttt 6000
tgtaaagata tgttgttata gaaaggaata taatgctatt taatgttgaa aatgtaaact 6060
acctcaaagt agtagtttat gtgatgtcca acaggtgttg ctatgttttt ctcaaaaatt 6120
ttaaaatatt gtgtggcacc catgttaatt tgctaaggtg ccctgctaca cagtttggga 6180
accatggctg taccaaaaga aacaaaatac tcctctcctt tgtattagaa atctgaactt 6240
tgcatttcag ctttggacct actgacacta ttttattata caaattattt aaagcctaaa 6300
ataaggaata tcctaatact attattttgg gaatcagaaa catctaataa agctggactt 6360
tatacataga aataaagctt acaactttga gaaagtagcc atattttccc caagatacgt 6420
cttaacacac tgagtctata taagtggcgt aaaatacaga gttatcttaa tcagaaaa 6478
<210> 2
<211> 38
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> misc_RNA
<223> shRNA
<400> 2
ccggcggaaa gaagcaacaa accgagaagg ccaaccgg 38
<210> 3
<211> 41
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> misc_RNA
<223> shRNA
<400> 3
aacaaaaacg gaaagaagca acaaaccgag aaggccaacc g 41
<210> 4
<211> 40
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> misc_RNA
<223> shRNA
<400> 4
ccggcgcgag caaagccaac cgagaagaga acgccagcgg 40
<210> 5
<211> 43
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> misc_RNA
<223> shRNA
<400> 5
aacaaaaacg cgagcaaagc caaccgagaa gagaacgcca gcg 43

Claims (8)

1.一种靶向抑制KIAA1429基因表达的ShRNA,其特征在于,所述ShRNA是以KIAA1429基因中SEQ ID No.1所示核苷酸序列为靶点设计的核酸分子。
2.如权利要求1所述的ShRNA,其特征在于,所述ShRNA为ShRNA-1或ShRNA-2,所述ShRNA-1包含正义链:
5’-CCGGCGGAATATGAAGCAACAAATTCTCGAGAATTTGTTGCTTCATATTCCGTTTTTG-3’和反义链:
5’-AATTCAAAAACGGAATATGAAGCAACAAATTCTCGAGAATTTGTTGCTTCATATTCCG-3’;所述ShRNA-2包含正义链:
5’-CCGGCGCTGAGCAAAGTTCTCATATCTCGAGATATGAGAACTTTGCTCAGCGTTTTTG-3’和反义链:
5’-AATTCAAAAACGCTGAGCAAAGTTCTCATATCTCGAGATATGAGAACTTTGCTCAGCG-3’。
3.权利要求1或2所述的ShRNA在制备治疗慢性髓细胞白血病的药物中的应用。
4.如权利要求3所述的应用,其特征在于,所述ShRNA为ShRNA-1和/或ShRNA-2,其中ShRNA-1和ShRNA-2如权利要求2所述。
5.如权利要求3所述的应用,其特征在于,所述治疗是指抑制慢性髓细胞白血病细胞的增殖、抑制慢性髓细胞白血病细胞的迁移和/或抑制Imatinib耐药能力。
6.如权利要求3所述的应用,其特征在于,所述药物的剂型为任何药物治疗学上可接受的剂型。
7.如权利要求3所述的应用,其特征在于,所述药物的剂量为任何药物治疗学上可接受的剂量。
8.如权利要求3所述的应用,其特征在于,所述药物包含权利要求1或2所述的ShRNA以及药学上可接受的载体。
CN202210378985.6A 2022-04-12 2022-04-12 一种靶向抑制KIAA1429基因表达的ShRNA在慢性髓细胞白血病中的应用 Active CN114703190B (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN202210378985.6A CN114703190B (zh) 2022-04-12 2022-04-12 一种靶向抑制KIAA1429基因表达的ShRNA在慢性髓细胞白血病中的应用

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN202210378985.6A CN114703190B (zh) 2022-04-12 2022-04-12 一种靶向抑制KIAA1429基因表达的ShRNA在慢性髓细胞白血病中的应用

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CN114703190A true CN114703190A (zh) 2022-07-05
CN114703190B CN114703190B (zh) 2023-01-10

Family

ID=82175261

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN202210378985.6A Active CN114703190B (zh) 2022-04-12 2022-04-12 一种靶向抑制KIAA1429基因表达的ShRNA在慢性髓细胞白血病中的应用

Country Status (1)

Country Link
CN (1) CN114703190B (zh)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN116212019A (zh) * 2022-09-07 2023-06-06 南方医科大学 Kiaa1429在制备吉非替尼抗非小细胞肺癌增敏剂中的应用

Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN104946646A (zh) * 2014-03-25 2015-09-30 中国医学科学院基础医学研究所 用于预防和/或治疗埃博拉病毒性出血热的小核酸分子、dna 分子、蛋白及应用
US20180010192A1 (en) * 2016-07-06 2018-01-11 Youhealth Biotech, Limited Leukemia methylation markers and uses thereof
US20200101057A1 (en) * 2017-03-28 2020-04-02 The General Hospital Corporation Combination therapy against chemoresistance in leukemia
CN113528528A (zh) * 2021-08-03 2021-10-22 南昌大学第二附属医院 一种促进耐伊马替尼慢性髓细胞白血病细胞K562/G01凋亡shRNA及其应用

Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN104946646A (zh) * 2014-03-25 2015-09-30 中国医学科学院基础医学研究所 用于预防和/或治疗埃博拉病毒性出血热的小核酸分子、dna 分子、蛋白及应用
US20180010192A1 (en) * 2016-07-06 2018-01-11 Youhealth Biotech, Limited Leukemia methylation markers and uses thereof
US20200101057A1 (en) * 2017-03-28 2020-04-02 The General Hospital Corporation Combination therapy against chemoresistance in leukemia
CN113528528A (zh) * 2021-08-03 2021-10-22 南昌大学第二附属医院 一种促进耐伊马替尼慢性髓细胞白血病细胞K562/G01凋亡shRNA及其应用

Non-Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
LI-RONG YANG ET AL.: "The prognosis biomarkers based on m6A-related lncRNAs for myeloid leukemia patients", 《CANCER CELL INT》 *
WENHUA ZHAO ET AL.: "KIAA1429 promotes the progression of lung adenocarcinoma by regulating the m6A level of MUC3A", 《PATHOL RES PRACT》 *
XIAOYU CHENG ET AL.: "KIAA1429 regulates the migration and invasion of hepatocellular carcinoma by altering m6A modification of ID2 mRNA", 《ONCO TARGETS THER》 *
代聪聪等: "干扰VIRMA基因对胃癌细胞迁移的影响和机制研究", 《安徽医科大学学报》 *

Cited By (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN116212019A (zh) * 2022-09-07 2023-06-06 南方医科大学 Kiaa1429在制备吉非替尼抗非小细胞肺癌增敏剂中的应用
CN116212019B (zh) * 2022-09-07 2024-02-02 南方医科大学 Kiaa1429在制备吉非替尼抗非小细胞肺癌增敏剂中的应用

Also Published As

Publication number Publication date
CN114703190B (zh) 2023-01-10

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN111979290B (zh) Spp1基因在制备增强卵巢癌患者对parp抑制剂敏感性的药物中的应用
Li et al. Expression of the chemokine receptor CXCR4 in human hepatocellular carcinoma and its role in portal vein tumor thrombus
CN111718995B (zh) 一种鼻咽癌转移诊断和/或预后评估的生物标记
CN114703190B (zh) 一种靶向抑制KIAA1429基因表达的ShRNA在慢性髓细胞白血病中的应用
Bongolo et al. Exosomes derived from microRNA-27a-3p overexpressing mesenchymal stem cells inhibit the progression of liver cancer through suppression of Golgi membrane protein 1
CN112618564B (zh) hsa_circ_0001400的抑制剂及其在制备抗肿瘤药物中的应用
CN110251529A (zh) miR-124-3p与其类似物在制备抗乳腺癌疾病药物中的应用
Zhang et al. Immortalized mesenchymal stem cells: a safe cell source for cellular or cell membrane-based treatment of glioma
CN113584173A (zh) lncRNA SLC25A21-AS1在作为食管鳞癌标志物中的应用
CN114672460B (zh) 一种靶向cd44的异质型cic细胞模型的制备方法及应用
CN110317878A (zh) 一种用于膀胱癌诊治监测的长链非编码rna及其应用
CN113881674B (zh) Linc00958在制备诊断及监测慢性髓细胞白血病的试剂及试剂盒中的应用
CN113528528B (zh) 一种促进耐伊马替尼慢性髓细胞白血病细胞K562/G01凋亡shRNA及其应用
Xu et al. ApoM suppresses kidney renal clear cell carcinoma growth and metastasis via the Hippo-YAP signaling pathway
CN115887668A (zh) 一种控制kif15基因表达的组合物或抑制剂的应用
Dasgupta et al. Global analysis of contact-dependent human-to-mouse intercellular mRNA and lncRNA transfer in cell culture
CN111529690B (zh) 人cd133蛋白1-108肽段的新用途
CN111575384B (zh) 人glt8d1基因在肿瘤临床诊疗中的应用
CN105457041B (zh) miR-26a在非小细胞肺癌中的应用
CN113908283A (zh) Prmt5抑制剂及其与pd-l1抗体阻断剂联合在治疗肺癌上的应用
CN108949974B (zh) E3泛素连接酶asb3在制备肝癌治疗药物中的应用
CN108918874A (zh) MiR-210在胶质瘤中相关靶点预测的实验方法
CN115287359B (zh) Mcoln2在结直肠癌中的应用
CN114908172B (zh) Apobec3b在前列腺癌诊断、预后预测及治疗中的应用
CN116855607B (zh) circCHPT1在制备非小细胞肺癌早期诊断或预后检测试剂盒中的应用

Legal Events

Date Code Title Description
PB01 Publication
PB01 Publication
SE01 Entry into force of request for substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
GR01 Patent grant
GR01 Patent grant