CN114657257B - 用于乌梢蛇药材、标准汤剂及中药配方颗粒pcr鉴别的引物组合及其应用、鉴别方法 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了一种用于乌梢蛇药材、标准汤剂及中药配方颗粒PCR鉴别的引物组合,其包括引物一和引物二,其中,引物一为核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示的DNA分子,引物二为核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示的DNA分子。本发明还公开了上述引物组合的应用,以及基于该引物组合的鉴别方法。实施本发明,可有效鉴别乌梢蛇药材、标准汤剂以及中药配方颗粒。
Description
技术领域
本发明涉及中药鉴别技术领域,尤其涉及一种用于乌梢蛇药材、标准汤剂及中药配方颗粒PCR鉴别的引物组合及其应用、鉴别方法。
背景技术
我国蛇类物种约有两百余种,其中有20余种为常见蛇类,包括蕲蛇Agkistrodonacutus、乌梢蛇Zaocys dhumnades、金钱白花蛇Bungarus multicinctus、金环蛇Bungarusfasciatus、滑鼠蛇Ptyas mucosus、圆斑蝰Daboia russelii、眼镜蛇Naja naja、赤链蛇Lycodon rufozonatus、王锦蛇Elaphe carinata、灰鼠蛇Ptyas korros、短尾蝮蛇Gloydiusbrevicaudus、黑眉锦蛇Elaphe taeniura、百花锦蛇Elaphe moellendorffi等,其多数不具有临床药效。由于多种蛇类形态近似,药材鉴别困难,特别是加工处理时剖去内脏后,要进行干燥熏黑处理,皮上的花纹特征、颜色几近消失,难以辨认,尤其是经过水提取制成标准汤剂,进一步加工成中药配方颗粒后,在失去药材性状后,更难以进行有效的鉴别。
一些研究指出,可采用PCR法(聚合酶链式反应法)对乌梢蛇药材进行鉴定。然而,对于乌梢蛇标准汤剂、中药配方颗粒而言,一者其往往含有一定比例的辅料,导致现有方法DNA提取效率不高;二者标准汤剂、中药配方颗粒在制备过程中,往往需要加热提取,导致DNA降解,难以存留超过200bp的DNA片段,导致现有方法检测精度低。
发明内容
本发明所要解决的技术问题在于,提供一种用于乌梢蛇药材、标准汤剂及中药配方颗粒PCR鉴别的引物组合,其专属性良好,可有效解决DNA失去形态后难以鉴别的问题。
本发明还要解决的技术问题在于,提供一种上述引物组合在鉴别乌梢蛇药材、乌梢蛇标准汤剂、或乌梢蛇中药配方颗粒中的应用。
本发明还要解决的技术问题在于,提供一种上述引物组合在鉴别乌梢蛇药材、乌梢蛇标准汤剂、或乌梢蛇中药配方颗粒的试剂盒中的应用。
本发明还要解决的技术问题在于,提供一种基于上述的用于乌梢蛇药材、标准汤剂及中药配方颗粒PCR鉴别的引物组合的鉴别方法。
为了解决上述技术问题,本发明提供了一种用于乌梢蛇药材、标准汤剂及中药配方颗粒PCR鉴别的引物组合,其包括引物一和引物二,所述引物一为核苷酸序列如SEQ IDNO:1所示的DNA分子;所述引物二为核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示的DNA分子。
相应的,本发明还公开了上述的用于乌梢蛇药材、标准汤剂及中药配方颗粒PCR鉴别的引物组合在鉴别乌梢蛇药材、乌梢蛇标准汤剂、或乌梢蛇中药配方颗粒中的应用。
相应的,本发明还公开了上述的用于乌梢蛇药材、标准汤剂及中药配方颗粒PCR鉴别的引物组合在鉴别乌梢蛇药材、乌梢蛇标准汤剂、或乌梢蛇中药配方颗粒的试剂盒中的应用。
相应的,本发明还公开了一种基于上述的用于乌梢蛇药材、标准汤剂及中药配方颗粒PCR鉴别的引物组合的鉴别方法,其包括:
提取待检测样品的基因组DNA;
以所述基因组DNA为DNA模板,采用上述的用于乌梢蛇药材、标准汤剂及中药配方颗粒PCR鉴别的引物组合进行PCR扩增,若扩增产物中含有135bp的DNA片段,则待检测样品为乌梢蛇药材、乌梢蛇标准汤剂或乌梢蛇中药配方颗粒。
作为上述技术方案的改进,提取待检测样品的基因组DNA的方法如下:
取待检测样品,加入CTAB沉淀液、蛋白酶K沉淀提取2~3次;取沉淀物加入CTAB提取液、β-巯基乙醇提取,然后加入氯仿-异戊醇萃取2~3次,取萃取后上清液,加入异丙醇或异丙醇-乙酸钠沉淀提取,沉淀物经洗涤、孵育后用水溶解,即得待检测样品的基因组DNA。
作为上述技术方案的改进,提取待检测样品的基因组DNA的方法如下:
取待检测样品0.3~0.8g,研磨成粉末,置离心管中,加入1~1.8mL的CTAB沉淀液、15~25μL蛋白酶K,混合均匀,在60~70℃下加热45~65min,冷却至室温后离心,弃去上清液;加入800~1000μL CTAB沉淀液,15~25μL蛋白酶K,混合均匀,在60~70℃下加热45~65min,冷却至室温后离心,弃去上清液;取沉淀加入800~1000μL CTAB提取液,5~15μLβ-巯基乙醇,混合均匀,在60~70℃下加热100~150min,离心,冷却至室温,取提取后上清液,加入等体积的氯仿-异戊醇混合液,震荡混匀后离心,取上清液700~800μL,再加入等体积的氯仿-异戊醇混合液,震荡混匀后离心,取上清液400~500μL,加入等体积的异丙醇或异丙醇-乙酸钠混合液,于-30~-20℃静置30~60min,离心后弃去上清液,再用乙醇洗涤沉淀2~4次,弃去上清液,沉淀于35~38℃孵育20~40min,待乙醇挥发后,加入30~50μL灭菌水溶解,即得到待检测样品的基因组DNA。
作为上述技术方案的改进,所述CTAB沉淀液包括CTAB、Tris-HCl、EDTA和水;其中,CTAB的浓度为1~3%(w/v),Tris-HCl的浓度为80~120mmol/L,EDTA的浓度为10~30mmol/L;
所述CTAB提取液包括CTAB、Tris-HCl、EDTA、NaCl、PVP40和水;其中,CTAB的浓度为1~3%(w/v),Tris-HCl的浓度为80~120mmol/L,EDTA的浓度为10~30mmol/L,NaCl的浓度为1~3mol/L,PVP40的浓度为10~30%(w/v)。
作为上述技术方案的改进,将DNA模板、引物组合、PCR缓冲液、dNTP、rTaq、水混合均匀,得到PCR扩增体系;
将所述PCR扩增体系按照预设扩增程序进行扩增,得到扩增产物;
将所述扩增产物进行电泳分析,记录其电泳图谱,若图谱中含有135bp的DNA片段,则待检测样品为乌梢蛇药材、乌梢蛇标准汤剂或乌梢蛇中药配方颗粒。
作为上述技术方案的改进,所述PCR扩增体系由下述物质组成:
10×PCR BufferⅠ(Mg2+pulse)2.5μL,dNTP Mixture 0.6μL,引物一0.3μL,引物二0.3μL,rTaq 0.3μL,DNA模板1μL,去离子水20μL。
作为上述技术方案的改进,所述PCR扩增程序为:
将所述扩增体系在90~95℃预变性3~7min,然后在预设程序下循环30~40次,最后在70~75℃延伸3~7min;
其中,所述预设程序为:将扩增体系在90~95℃变性25~32s,然后在59~61℃退火25~32s,再在70~73℃延伸28~35s。
作为上述技术方案的改进,所述PCR扩增程序为:
将所述扩增体系在95℃预变性5min,然后在预设程序下循环35次,最后在72℃延伸5min;
其中,所述预设程序为:将扩增体系在95℃变性30s,然后在59~61℃退火30s,再在72℃延伸30s。
作为上述技术方案的改进,所述电泳分析方法为:将所述扩增产物稀释后点样于1.5%的琼脂糖凝胶上,于115~125V电压条件下电泳45~60min,经Gelred显色,得到电泳图谱。
实施本发明,具有如下有益效果:
本发明设计了针对乌梢蛇药材、标准汤剂、中药配方颗粒的引物组合,并采用特定的PCR扩增方法,实现了乌梢蛇药材、标准汤剂和中药配方颗粒的快速鉴别。本发明中的引物组合、鉴别方法,可有效克服DNA提取过程中辅料干扰的问题,且可解决标准汤剂、中药配方颗粒在失去形态后难以鉴别的难题。
附图说明
图1是实施例3中各种蛇类样品进行PCR扩增后电泳检测结果图;其中,M为DNA分子量标准,1-6为乌梢蛇药材,7-9为乌梢蛇标准汤剂(冻干粉),10-12为乌梢蛇中药配方颗粒,13-14为金钱白花蛇药材,15-16为蕲蛇药材,17-18为百花锦蛇药材,19-20为赤链蛇药材,21-22为短尾蝮蛇药材,23-24为黑眉锦蛇药材,25-26为灰鼠蛇药材,27-28为滑鼠蛇药材,29-30为金环蛇药材,31-32为王锦蛇药材,33-34为圆斑蝰蛇药材,35-36为眼镜蛇药材,37-38为竹叶青蛇药材,N为空白对照(ddH2O);
图2是实施例4中灵敏度试验结果图;其中,M为DNA分子量标准,1-8为乌梢蛇中药配方颗粒(广东省佛山市),其DNA模板量为300ng;9-10为乌梢蛇中药配方颗粒(江苏省江阴市),其DNA模板量为100ng;11-12为乌梢蛇中药配方颗粒(四川省成都市),其DNA模板量为80ng;13-14:11-12为乌梢蛇中药配方颗粒(广东省深圳市),其DNA模板量为400ng;N:空白对照(ddH2O);
图3是实施例5中各种蛇类样品进行PCR扩增后电泳检测结果图;其中,M为DNA分子量标准,1-2为乌梢蛇药材,3-4为乌梢蛇中药配方颗粒,5为王锦蛇药材,6为滑鼠蛇药材,7为圆斑蝰蛇药材,8为空白对照(ddH2O);
图4是实施例6中各种蛇类样品进行PCR扩增后电泳检测结果图;其中,M为DNA分子量标准,1-2为乌梢蛇药材,3-4为乌梢蛇中药配方颗粒,5为王锦蛇药材,6为滑鼠蛇药材,7为圆斑蝰蛇药材,8为空白对照(ddH2O)。
具体实施方式
为使本发明的目的、技术方案和优点更加清楚,下面将结合附图及具体实施方式对本发明作进一步地详细描述。
本发明提供一种用于检测乌梢蛇药材、标准汤剂、中药配方颗粒的引物组合,具体的,其包括:引物一(正向引物)和引物二(反向引物),其中,引物一为如下核苷酸序列如SEQID NO:1所示的DNA分子;引物二为核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示的DNA分子。
通过对常见蛇类物种的Cytochrome Oxidase I序列的同源比对分析,确定乌梢蛇的SNP位点,再根据含有该SNP位点的碱基序列设计引物,并综合考虑高温提取对DNA碱基序列的破坏作用、产物条带、引物评分等信息,得到上述引物组合。根据上述引物组合对乌梢蛇药材、乌梢蛇标准汤剂、乌梢蛇中药配方颗粒进行PCR扩增,可获得135bp大小的特异性片段。
本发明还提供了上述引物组合在鉴别乌梢蛇药材、乌梢蛇标准汤剂、或乌梢蛇中药配方颗粒中的应用。需要说明的是,本发明中的引物组合可用于鉴定含有乌梢蛇的各种物质,如药材、标准汤剂、中药配方颗粒、饮片、含乌梢蛇的中药复方(如风湿祛痛胶囊)等。
本发明还提供了上述引物组合鉴别乌梢蛇药材、乌梢蛇标准汤剂、或乌梢蛇中药配方颗粒的试剂盒中的应用。具体的,该试剂盒包括上述的引物组合,还包括PCR缓冲液、dNTP、rTaq和水。
本发明还公开了一种基于上述用于乌梢蛇药材、标准汤剂及中药配方颗粒PCR鉴别的引物组合的鉴别方法,其包括:
(1)提取待检测样品的基因组DNA;
其中,待检测样品以固态形式提供,标准汤剂以冻干粉的形式提供(即将标准汤剂冷冻干燥后得到冻干粉)。
具体的,提取方法如下:
A、取待检测样品,加入CTAB沉淀液、蛋白酶K沉淀提取2~3次,得到沉淀物;
具体的,取待检测样品0.3~0.8g,研磨成粉末,置离心管中,加入1~1.8mL在65℃预热的CTAB沉淀液、15~25μL蛋白酶K,混合均匀,在60~70℃下加热45~65min,冷却至室温后离心,弃去上清液;加入800~1000μL CTAB沉淀液,15~25μL蛋白酶K,混合均匀,在60~70℃下加热45~65min,冷却至室温后离心,弃去上清液,即得;
其中,CTAB沉淀液的组成为2%(w/v)CTAB,100mmol/L Tris-HCl(pH=8.0),20mmol/L EDTA(pH=8.0)。
B、取沉淀物加入CTAB提取液、β-巯基乙醇提取,然后加入氯仿-异戊醇萃取2~3次,得萃取后上清液;
具体的,在沉淀物中加入800~1000μL CTAB提取液,5~15μLβ-巯基乙醇,混合均匀,在60~70℃下加热100~150min,离心,冷却至室温,取提取后上清液,加入等体积的氯仿-异戊醇(24:1)混合液,震荡混匀后离心,取上清液700~800μL,再加入等体积的氯仿-异戊醇(24:1)混合液,震荡混匀后离心,取上清液400~500μL,即得。
需要说明的是,在本步骤中,在采用CTAB提取液、β-巯基乙醇提取结束后,可直接加入氯仿-异戊醇,也可取提取后所得上清液再加入氯仿-异戊醇,取上清液再加入氯仿-异戊醇可提升提取准确度。
其中,CTAB提取液:1~3%(w/v)CTAB,80~120mmol/L Tris-HCl(pH=8.0),10~30mmol/L EDTA(pH=8.0),1~3mol/LNaCl,10~30%(w/v)PVP40。
C、取提取液加入异丙醇或异丙醇-乙酸钠沉淀提取,沉淀物经洗涤、孵育后用水溶解,即得待检测样品的基因组DNA。
具体的,取提取液,加入等体积的异丙醇或异丙醇-3mol/L乙酸钠混合液,于-30~-20℃静置30~60min,离心后弃去上清液,再用乙醇洗涤沉淀2~4次,弃去上清液,沉淀于35~38℃孵育20~40min,待乙醇挥发后,加入30~50μL灭菌水溶解,即得到待检测样品的基因组DNA,作为DNA模板。
需要说明的是,申请人在面临乌梢蛇标准汤剂、乌梢蛇中药配方颗粒中基因组DNA提取时,尝试了传统的CTAB法、螯合树脂法、曲拉通-100法、SDS法、碱式裂解法、DNeasyBlood&Tissue Kit法、磁珠法,但均得到了不溶性沉淀。故,本发明人在传统CTAB法的基础上,对CTAB沉淀液、CTAB提取液以及提取程序加以改进,得到了上述提取方法。上述提取方法尽量多地保留乌梢蛇标准汤剂、乌梢蛇中药配方颗粒中的基因组DNA信息,同时可克服辅料干扰的问题。
(2)形成PCR扩增体系,并进行扩增,得到扩增产物;
具体的,将DNA模板、引物组合、PCR缓冲液、dNTP、rTaq、水混合均匀,得到PCR扩增体系;
更具体的,PCR扩增体系的总体积为25μL,其包括:10×PCR BufferⅠ(Mg2+pulse)2.5μL,dNTP Mixture 0.6μL,引物一0.3μL,引物二0.3μL,rTaq 0.3μL,DNA模板1μL,去离子水20μL。
扩增程序为:90~95℃预变性3~7min;90~95℃变性25~32s,59~61℃退火25~32s,70~73℃延伸28~35s,循环30~40次;最后在70~75℃延伸3~7min。
优选的,扩增程序为:95℃预变性5min;95℃变性30s,59~61℃退火30s,72℃延伸30s,共35个循环;最后在72℃延伸5min。
(3)将扩增产物进行分析;
具体的,可采用电泳法或荧光染色法对扩增产物进行分析,但不限于此。
优选的,采用电泳法对扩增产物进行分析,具体如下:
取扩增产物,加入5μL 6×loading buffer,混匀,取混合产物5~10μL点样于1.5%的琼脂糖凝胶上,于115~125V电压条件下电泳45~60min,经Gelred显色,得到电泳图谱。若电泳图谱中含有135bp的DNA片段,则待检测样品为乌梢蛇药材、乌梢蛇标准汤剂或乌梢蛇中药配方颗粒。
下面以具体实施例对本发明进行说明。
实施例1引物设计
以中国药典2020年版乌梢蛇及常见蛇类NADH;Cytochrome Oxidase I;12SrRNA;16S rRNA;Cytochrome b序列分析为基础,利用BioEdit软件对GeneBank数据库中常见蛇类物种的Cytochrome Oxidase I序列进行同源比对,校对后分析乌梢蛇的特异性SNP位点,将包含SNP位点的碱基序列导入到Primer Premier 5软件中,进行引物设计。
经序列对比发现,乌梢蛇特异性位点为T而其他为A或C,确定该SNP位点后,使SNP位点接近正向引物3’端,通过移动上游引物位置,调节引物得分及GC含量,并借助PrimerPremier 5软件,进一步调节反向引物位置,通过最终引物评分、产物条带得分以确定最佳组合。在设计过程中,还需考虑到经高温提取后,对DNA碱基序列的破坏作用。综合以上因素,获得的引物组合如下:
引物一:5’-CCCCTAATAATCGGAGCG-3;
引物二:5’-TACTGTTCACCCAGTGCC-3’。
实施例2鉴定方法建立
(1)DNA提取及浓度调节
取干燥的样品0.5g,研磨成粉末,置2mL离心管中,加入1.5mL在65℃预热的CTAB沉淀液、20μL蛋白酶K,混匀,65℃水浴加热60min,冷却至室温后,以10000r/min离心5min,弃上清液,再加入900μL CTAB沉淀液、20μL蛋白酶K,同法操作。向该离心管中依次加入900μLCTAB提取液、10μLβ-巯基乙醇,混匀,65℃水浴加热120min,离心,待冷却至室温后取上清液;加入等体积的氯仿-异戊醇(24﹕1),震荡3min,混匀;再以12000r/min,4℃离心10min,取上清液750μL加入新的2mL离心管中,加入等体积的氯仿-异戊醇(24﹕1),震荡3min,混匀;再以12000r/min,4℃离心10min;再取上清液450μL于1.5mL离心管中,加入等体积异丙醇,于-20℃静置30~60min。取出该离心管以12000r/min离心5min,弃上清液,再分别用75%乙醇、无水乙醇洗涤沉淀两次,弃上清液,沉淀于37℃孵育30min,待乙醇挥发后,加灭菌水30μL使溶解。
其中,CTAB沉淀液组成如下:2%(w/v)CTAB(上海源叶生物科技有限公司),100mMTris-HCl(pH=8.0)(Beijing Solarbio),20mM EDTA(pH=8.0)(Shanghai Yu Bo BiotechCo.,Ltd)。
CTAB提取液组成如下:2%(w/v)CTAB(上海源叶生物科技有限公司),100mM Tris-HCl(pH=8.0)(Beijing Solarbio),20mM EDTA(pH=8.0)(Shanghai Yu Bo Biotech Co.,Ltd),2.5mol/LNaCl(西陇科学股份有限公司),20%PVP40(上海源叶生物科技有限公司)。
取上述DNA样品,采用BioSpec-nano微量紫外分光光度计测定DNA浓度,同时记录OD260/OD230,OD260/OD280,并调整浓度到50ng/μL,得到DNA模板。
(2)设计引物组合
引物组合的序列为:引物一(正向引物)如SEQ ID NO:1所示;引物二(反向引物)如SEQ ID NO:2所示。
(3)PCR扩增
PCR扩增体系:10×PCR Buffer I(Mg2+pluse)2.5μL,2.5mmol/L的dNTP Mixture0.6μL,10μmol/L的引物一0.3μL,10μmol/L的引物二0.3μL,5U/μL的rTaq聚合酶0.3μL,50ng/μL的DNA模板1μL,去离子水20μL。上述液体震荡混匀,瞬时离心,即得PCR扩增体系。
PCR扩增程序:95℃预变性5min;95℃变性30s;61℃退火30s,72℃延伸30s,共35个循环;最后72℃延伸5min。
(4)电泳检测
取扩增产物,加入6×loading buffer 5μL,混匀,取混合产物8μL点样于1.5%的琼脂糖凝胶上,于120V电压的条件下电泳50min,经Gelred显色,最后于凝胶成像仪观察记录结果。
如果电泳图谱中含有135bp的DNA片段,则待检测样品为乌梢蛇药材、乌梢蛇标准汤剂或乌梢蛇中药配方颗粒。
实施例3鉴定方法验证
选取14个已知物种的蛇类样品(具体如表1所示)。
采用实施例2建立的鉴别方法对样品进行鉴定。其中,PCR体系中,DNA模板量为50ng。
表1样品表
鉴定结果如图1所示,从图中可以看出,乌梢蛇药材、乌梢蛇标准汤剂(冻干粉)、乌梢蛇中药配方颗粒均存在135bp的条带;而其他样品均未得到该条带。该结果表明,本发明中的鉴别方法准确率达到100%。
实施例4灵敏度试验
分别取不同厂家生产的乌梢蛇中药配方颗粒(表1中样品4~6)。提取待检测样品的基因组DNA,并采用ddH2O对基因组DNA进行稀释,然后采用实施例2中步骤3~4的方法进行测试。
其中,乌梢蛇中药配方颗粒(广东省佛山市)相关样品测试的PCR扩增体系中,DNA模板的含量为300ng;
乌梢蛇中药配方颗粒(江苏省江阴市)相关样品测试的PCR扩增体系中,DNA模板的含量为100ng;
乌梢蛇中药配方颗粒(四川省成都市)相关样品测试的PCR扩增体系中,DNA模板的含量为80ng;
乌梢蛇中药配方颗粒(广东省深圳市)相关样品测试的PCR扩增体系中,DNA模板的含量为400ng;
测试结果如图2所示,从图中可以看出,各厂家生产的乌梢蛇中药配方颗粒均存在135bp的条带;可见本发明的方法对于80~400ng的DNA模板量均具有良好的适用性。
实施例5方法学验证-退火温度
(1)取表1中编号为1~2、4~5的乌梢蛇样品,编号为17的王锦蛇,编号为15的滑鼠蛇,编号为18的圆斑蝰蛇作为样品;
(2)采用实施例2所建立的方法对样品进行鉴定;其中,鉴定过程中,分别采用57℃、59℃、61℃和63℃的退火温度。
测试结果如图3所示,从图中可以看出,当退火温度分别为57℃、59℃、61℃、63℃时,PCR扩增条带差异较小且均空白对照无假阳性出现。当退火温度达到63℃时,条带有减弱趋势,但空白对照无假阳性出现;当退火温度为57℃时,条带较弱。因此,退火温度为59~61℃。
实施例6方法学验证-PCR扩增体系
(1)取表1中编号为1~2、4~5的乌梢蛇样品,编号为17的王锦蛇,编号为15的滑鼠蛇,编号为18的圆斑蝰蛇作为样品;
(2)采用实施例2所建立的方法对样品进行鉴定;其中,鉴定过程中,其中,鉴定过程中,分别采用0.3μL的浓度为5U/μL的rTaq酶、ExTaq酶、SpeedSTAR酶、MightyAMP酶与10×PCR Buffer I(Mg2+pluse)2.5μL,2.5mmol/L的dNTP Mixture 0.6μL,10μmol/L的引物一0.3μL,10μmol/L的引物二0.3μL,50ng/μL的DNA模板1μL,去离子水20μL组成扩增体系。
测试结果如图4所示,从图中可以看出,rTaq酶和SpeedSTAR酶均获得PCR扩增条带,为保证条带的亮度,故选DNA聚合酶为rTaq酶。
以上所述是发明的优选实施方式,应当指出,对于本技术领域的普通技术人员来说,在不脱离本发明原理的前提下,还可以做出若干改进和润饰,这些改进和润饰也视为本发明的保护范围。
SEQUENCE LISTING
<110> 广东一方制药有限公司
<120> 用于乌梢蛇药材、标准汤剂及中药配方颗粒PCR鉴别的引物组合及其应用、
鉴别方法
<130> Zaocys dhumnades
<160> 2
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 18
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 1
cccctaataa tcggagcg 18
<210> 2
<211> 18
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 2
tactgttcac ccagtgcc 18
Claims (3)
1.一种乌梢蛇药材、乌梢蛇标准汤剂及乌梢蛇中药配方颗粒的PCR鉴别方法,其特征在于,包括:
取待检测样品0.3~0.8g,研磨成粉末,置离心管中,加入1~1.8mL的CTAB沉淀液、15~25μL蛋白酶K,混合均匀,在60~70℃下加热45~65min,冷却至室温后离心,弃去上清液;加入800~1000μL CTAB沉淀液,15~25μL蛋白酶K,混合均匀,在60~70℃下加热45~65min,冷却至室温后离心,弃去上清液;取沉淀加入800~1000μL CTAB提取液,5~15μLβ-巯基乙醇,混合均匀,在60~70℃下加热100~150min,离心,冷却至室温;取提取后上清液,加入等体积的氯仿-异戊醇混合液,震荡混匀后离心,取上清液700~800μL,再加入等体积的氯仿-异戊醇混合液,震荡混匀后离心,取上清液400~500μL,加入等体积的异丙醇或异丙醇-乙酸钠混合液,于-30~-20℃静置30~60min,离心后弃去上清液,再用乙醇洗涤沉淀2~4次,弃去上清液,沉淀于35~38℃孵育20~40min,待乙醇挥发后,加入30~50μL灭菌水溶解,即得到待检测样品的基因组DNA;其中,所述CTAB沉淀液的组成为:2%(w/v)CTAB,100mmol/LTris-HCl,20mmol/LEDTA;所述CTAB提取液的组成为:2%(w/v)CTAB,100mmol/L Tris-HCl,20mmol/L EDTA,2.5mol/L NaCl,20%(w/v)PVP40;其中,Tris-HCl、EDTA的pH均为8.0;
以所述基因组DNA为DNA模板,采用核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示的引物一、核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示的引物二进行PCR扩增,若扩增产物中含有135bp的DNA片段,则待检测样品为乌梢蛇药材、乌梢蛇标准汤剂或乌梢蛇中药配方颗粒;
其中,PCR扩增体系由下述物质组成:
10×PCR BufferⅠMg2+plus 2.5μL,dNTP Mixture 0.6μL,引物一0.3μL,引物二0.3μL,rTaq 0.3μL,DNA模板1μL,去离子水20μL;
PCR扩增程序为:
将所述扩增体系在95℃预变性5min,然后在预设程序下循环35次,最后在72℃延伸5min;
其中,所述预设程序为:将扩增体系在95℃变性30s,然后在59~61℃退火30s,再在72℃延伸30s。
2.如权利要求1所述的PCR鉴别方法,其特征在于,将所述扩增产物进行电泳分析,记录其电泳图谱,若图谱中含有135bp的DNA片段,则待检测样品为乌梢蛇药材、乌梢蛇标准汤剂或乌梢蛇中药配方颗粒。
3.如权利要求2所述的PCR鉴别方法,其特征在于,所述电泳分析方法为:将所述扩增产物稀释后点样于1.5%的琼脂糖凝胶上,于115~125V电压条件下电泳45~60min,经Gelred显色,得到电泳图谱。
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乌梢蛇实时荧光定量PCR法的建立及与普通PCR鉴别方法的比较研究;杨宝等;药学研究(第11期);摘要,正文第637页左栏第2段至640页左栏第2段 * |
杨宝等.乌梢蛇实时荧光定量PCR法的建立及与普通PCR鉴别方法的比较研究.药学研究.2020,(第11期),摘要,正文第637页左栏第2段至640页左栏第2段. * |
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