CN114427001A - 基于78个snp位点评估阿达木单抗治疗银屑病有效性的试剂盒 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了一种阿达木单抗药物作用的78个SNP位点，所提供的78个SNP位点更加适合亚洲人群，对亚洲人群具有指导意义；还提供了一种评估阿达木单抗在治疗银屑病有效性中的应用，当患者携带78个SNP位点中的一个或多个变异位点时，则说明其使用阿达木单抗有效；还提供了一种基于78个SNP位点评估阿达木单抗治疗银屑病有效性的检测试剂盒，含有用于检测银屑病患者是否携带78个SNP位点的成套单链DNA，成套单链DNA由序列表中SEQ ID No.1～234条单链组成。
Description
技术领域
本发明涉及生物技术领域，更具体地，涉及一种基于78个SNP位点评估阿达木单抗治疗银屑病有效性的试剂盒。
背景技术
银屑病是一种多基因遗传性疾病，为治疗银屑病，市场上出现了阿达木单抗药物，阿达木单抗是TNF-α的全人源IgG1抗体，阿达木单抗通过与游离的TNF-α结合，阻断TNF-α与细胞表面TNF-α受体的相互作用，从而调控TNF-α诱导或调节应答。
阿达木单抗在治疗银屑病的过程中，携带不同突变基因的患者表现出不同的应答率。为实现精准治疗，让患者在治疗中少走弯路，进而减轻患者的经济负担，本申请通过公共数据库查找，发现当前有多篇文章分析了携带不同突变基因的患者对阿达木单抗药物的应答率，但是都缺乏系统性的评估，对银屑病患者的指导意义较低，且这些研究主要针对的是欧美人群，对亚洲人群尚未有明确的指导。
发明内容
本发明的一个目的是解决至少上述问题，并提供至少后面将说明的优点。
本发明还有一个目的是提供一种阿达木单抗作用的78个SNP位点，所提供的78个SNP位点更加适合亚洲人群，对亚洲人群具有指导意义；
还提供了一种阿达木单抗作用的78个SNP位点在评估阿达木单抗在治疗银屑病有效性中的应用，当患者携带78个SNP位点中的一个或多个变异位点时，则说明其使用阿达木单抗有效；
还提供了一种基于78个SNP位点评估阿达木单抗治疗银屑病有效性的试剂盒，含有用于检测银屑病患者是否携带78个SNP位点的成套单链DNA，成套单链DNA由序列表中SEQID No.1～234条单链组成。
为了实现根据本发明的这些目的和其它优点，提供一种阿达木单抗作用的78个SNP 位点，78个SNP位点包括：rs2071303位点、rs28371759位点、rs1801274位点、rs3761847位点、rs1800795位点、rs352139位点、rs2145623位点、rs33980500位点、rs4810485位点、rs3794271位点、rs396991位点、rs10903129位点、rs2546890位点、rs510432位点、rs1295686位点、rs885814位点、rs1043879位点、rs3735451位点、rs10210302位点、rs17301249位点、rs6427528位点、rs548234位点、rs27524位点、rs1061622位点、rs2736340位点、rs17716942位点、rs6920220位点、rs394581位点、rs9373839位点、rs2476601位点、rs1061624位点、rs2734440位点、rs6691117位点、rs10499194位点、rs2246709位点、rs35599367位点、rs2812378位点、rs1799852位点、rs7527798位点、rs11586238位点、rs11209026位点、rs3218253位点、rs767455位点、rs240993位点、rs20575位点、rs10512734位点、rs8049439位点、rs2104286位点、rs12081765位点、rs645544位点、rs13393173位点、rs3087243位点、rs12721622位点、rs2228145位点、rs1350948位点、rs1267067位点、rs7234029位点、rs4750316位点、rs7927894位点、rs2302489位点、rs1980422位点、rs7574865 位点、rs9828223位点、rs1126535位点、rs10919563位点、rs3213094位点、rs9304742位点、rs2230926位点、rs610604位点rs6822844位点、rs13031237位点、rs3814057位点、 rs6661932位点、rs4646437位点、rs2740574位点、rs1130864位点、rs12777960位点、rs25648 位点。
一种阿达木单抗作用的78个SNP位点在评估阿达木单抗在治疗银屑病有效性中的应用。
一种基于78个SNP位点评估阿达木单抗治疗银屑病有效性的试剂盒，用于检测银屑病患者是否携带78个SNP位点的物质为含有成套单链DNA的试剂盒，其中，成套单链 DNA由序列表中SEQ ID No.1～234条单链组成。
一种基于78个SNP位点评估阿达木单抗治疗银屑病有效性的试剂盒的使用方法，包括以下具体步骤：
S1、从银屑病患者的外周血中提取DNA，获得待测DNA；
S2、对待测DNA采用PCR技术进行扩增，获得PCR扩增产物；
S3、将PCR产物使用碱性磷酸酶处理，获得处理后的PCR产物；
S4、将获得的处理后的PCR产物进行单碱基延伸，获得延伸后产物；
S5、将获得的延伸产物进行纯化，获得纯化产物；
S6、将纯化产物放置在检测仪上进行检测银屑病患者是否携带一个或多个阿达木单抗作用的78个SNP位点。
优选的是，步骤S6中的具体检测过程为，先将纯化产物放置在SpectroCHIP芯片上，将SpectroCHIP芯片使用MALDI-TOF进行分析，检测结果使用TYPER软件分型并输出结果。
优选的是，步骤S1中将采取的DNA的浓度调整至50ng/μL，-20℃存储备用。
本发明至少包括以下有益效果：
第一、提供了一种阿达木单抗作用的78个SNP位点，所提供的78个SNP位点更加适合亚洲人群，对亚洲人群具有指导意义；
第二、提供了一种阿达木单抗作用的78个SNP位点在评估阿达木单抗在治疗银屑病有效性中的应用，当患者携带78个SNP位点中的一个或多个变异位点时，则说明其使用阿达木单抗有效；
第三、提供了一种基于78个SNP位点评估阿达木单抗治疗银屑病有效性的试剂盒，含有用于检测银屑病患者是否携带78个SNP位点的成套单链DNA，成套单链DNA由序列表中SEQ ID No.1～234条单链组成。
本发明的其它优点、目标和特征将部分通过下面的说明体现，部分还将通过对本发明的研究和实践而为本领域的技术人员所理解。
具体实施方式
下面结合实施例对本发明做进一步的详细说明，以令本领域技术人员参照说明书文字能够据以实施。
本发明提供了一种阿达木单抗作用的78个SNP位点，78个SNP位点包括：rs2071303位点、rs28371759位点、rs1801274位点、rs3761847位点、rs1800795位点、rs352139位点、rs2145623位点、rs33980500位点、rs4810485位点、rs3794271位点、rs396991位点、rs10903129位点、rs2546890位点、rs510432位点、rs1295686位点、rs885814位点、rs1043879 位点、rs3735451位点、rs10210302位点、rs17301249位点、rs6427528位点、rs548234位点、rs27524位点、rs1061622位点、rs2736340位点、rs17716942位点、rs6920220位点、 rs394581位点、rs9373839位点、rs2476601位点、rs1061624位点、rs2734440位点、rs6691117 位点、rs10499194位点、rs2246709位点、rs35599367位点、rs2812378位点、rs1799852 位点、rs7527798位点、rs11586238位点、rs11209026位点、rs3218253位点、rs767455位点、rs240993位点、rs20575位点、rs10512734位点、rs8049439位点、rs2104286位点、 rs12081765位点、rs645544位点、rs13393173位点、rs3087243位点、rs12721622位点、 rs2228145位点、rs1350948位点、rs1267067位点、rs7234029位点、rs4750316位点、rs7927894 位点、rs2302489位点、rs1980422位点、rs7574865位点、rs9828223位点、rs1126535位点、rs10919563位点、rs3213094位点、rs9304742位点、rs2230926位点、rs610604位点 rs6822844位点、rs13031237位点、rs3814057位点、rs6661932位点、rs4646437位点、 rs2740574位点、rs1130864位点、rs12777960位点、rs25648位点。
上述的78个SNP位点对亚洲人群具有指导意义，其中，rs28371759位点、rs3735451位点、rs2246709位点、rs35599367位点、rs12721622位点、rs4646437位点、rs2740574 位点为本发明找出的新的SNP位点，这些新的SNP位点更加适合亚洲人群。
本发明提供了一种阿达木单抗作用的78个SNP位点在评估阿达木单抗在治疗银屑病有效性中的应用，当患者携带78个SNP位点中的一个或多个变异位点时，则说明其使用阿达木单抗有效。
本发明提供了一种基于78个SNP位点评估阿达木单抗治疗银屑病有效性的试剂盒，用于检测银屑病患者是否携带78个SNP位点的物质为含有成套单链DNA的试剂盒，其中，成套单链DNA由序列表中SEQ ID No.1～234条单链组成，这234条单链包括用于扩增78个SNP位点基因片段的PCR引物对，以及特异性检测这78个SNP位点基因型的 78条对应Sequenom MassARRAY单碱基延伸引物，具体如表1所示。
试剂盒的使用方法：
S1、从银屑病患者的身体上利用EDTA抗凝管采血2mL，利用商品化的试剂盒从采集的血液中提取基因组DNA，对于提取的DNA利用分光光度计定量、琼脂糖凝胶电泳质检DNA质量，质量合格的DNA将浓度调整到50ng/μL，-20℃存储备用，获得待测DNA；
S2、对待测DNA进行PCR扩增，其中，引物如表1所示，扩增技术在384孔板中进行，每个孔板中的液体总体积为5μL，每个孔板中含有20-50ng DNA、0.5pmol每条扩增引物、0.1μL的25mM dNTPs，PCR反应条件为：94℃4min；94℃20s，56℃30s，72℃1min， 45个循环；72℃3min；4℃保持，获得PCR扩增产物；
S3、将PCR扩增产物用虾碱性磷酸酶(SAP)处理，去除反应体系中游离的dNTPs，SAP反应体系为7μL，其包括PCR产物5μL，SAP混合液2μL(SAP 0.5U，缓冲液0.17μL)。利用PCR仪器进行虾碱性磷酸酶处理，PCR反应条件：37℃40min，85℃5min，4℃维持，获得处理后的PCR产物；
S4、将获得的处理后的PCR产物进行单碱基延伸，反应体系的总体积为9μL，其包括处理后的PCR产物7μL，EXTEND Mix 2μL(引物0.94μL，iPLEX酶0.04μL，延伸混合物0.2μL)，PCR反应条件为：Ⅰ94℃30s；Ⅱ94℃5s；Ⅲ52℃5s；Ⅳ80℃5s；Ⅴgo toⅢ 4more times；ⅥgotoⅡ39more times；Ⅶ72℃3min，4℃forever，获得延伸后产物；
S5、将Clean Resin树脂平铺到6mg的树脂板中，再将延伸产物放置在树脂板的孔内，向含有延伸产物的孔内加入16μL的水，最后加入干燥后的树脂到含有延伸产物的孔内，封膜，将树脂板低速垂直旋转30min，使孔内的树脂和延伸产物充分接触，然后离心使竖树脂沉入孔底部，得到的纯化后的纯化产物浮在上层；
S6、先将纯化产物放置在SpectroCHIP芯片上，将SpectroCHIP芯片使用MALDI-TOF进行分析，检测结果使用TYPER软件分型并输出结果。
尽管本发明的实施方案已公开如上，但其并不仅仅限于说明书和实施方式中所列运用，它完全可以被适用于各种适合本发明的领域，对于熟悉本领域的人员而言，可容易地实现另外的修改，因此在不背离权利要求及等同范围所限定的一般概念下，本发明并不限于特定的细节和这里示出与描述的实例。
SEQUENCE LISTING
<110> 中日友好医院（中日友好临床医学研究所）
<120> 基于78个SNP位点评估阿达木单抗治疗银屑病有效性的试剂盒
<130> 1
<160> 234
<170> PatentIn version 3.5
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<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 10
acgttggatg atctgtgggt cccttctctc 30
<210> 11
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 11
acgttggatg ttgatgtccg tgggaatgag 30
<210> 12
<211> 16
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 12
agggtggtat tgaggc 16
<210> 13
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 13
acgttggatg agcctcaatg acgacctaag 30
<210> 14
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 14
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<211> 17
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 15
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<210> 16
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<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 16
acgttggatg tgggagggct gtgtgagtg 29
<210> 17
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 17
acgttggatg gaagatgcta gaagatgccc 30
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<211> 17
<212> DNA
<213> 人工合成
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ttggagtggg tggaggt 17
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<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
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acgttggatg tgacagccag tcagctttcg 30
<210> 20
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
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<213> 人工合成
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<400> 22
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<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
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<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
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<211> 30
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<213> 人工合成
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gggagggctg tagattcc 18
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<213> 人工合成
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<213> 人工合成
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<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 31
acgttggatg atggtgatgt tcacagtctc 30
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<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 32
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<212> DNA
<213> 人工合成
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cgacacattt ttactcccaa 20
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<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
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acgttggatg agatggatgg ctactagcag 30
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<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
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acgttggatg ttccctaggc agactaatgg 30
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<211> 20
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 36
actaatggcc atttagttca 20
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<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 37
acgttggatg tggaacaggg ctctgaattg 30
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<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 38
acgttggatg catcctagat gctcagagtc 30
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<211> 20
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 39
atagacaagt gatttcactg 20
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<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 40
acgttggatg ctggcatcac acaacagtat 30
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<212> DNA
<213> 人工合成
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acgttggatg cggtggttcc aacaaagtag 30
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<211> 21
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 42
ggactttccc atccattttc t 21
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<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 43
acgttggatg atgagacagt ccctggaaag 30
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<212> DNA
<213> 人工合成
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acgttggatg aactgctgca ggacaaagag 30
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<213> 人工合成
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ggatgacaaa gaggtcagca c 21
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<212> DNA
<213> 人工合成
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acgttggatg attcagcctt tcggcgtttg 30
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<212> DNA
<213> 人工合成
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ggggtggtgg tcttttgagg c 21
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<212> DNA
<213> 人工合成
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<212> DNA
<213> 人工合成
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acgttggatg cttaacctgt ctagctgtcg 30
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<213> 人工合成
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<212> DNA
<213> 人工合成
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acgttggatg caaagtgagt gagacactcc 30
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<213> 人工合成
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<213> 人工合成
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<212> DNA
<213> 人工合成
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<212> DNA
<213> 人工合成
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<213> 人工合成
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<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 58
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<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 59
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<212> DNA
<213> 人工合成
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gaacggggaa gcagtcagtc cta 23
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<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
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<212> DNA
<213> 人工合成
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<211> 23
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 63
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<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 64
acgttggatg ggaaattagc tgggctcttc 30
<210> 65
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 65
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<211> 24
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 66
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<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 67
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<210> 68
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 68
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<211> 24
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 69
tcatagtagc tatactcctt taca 24
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<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 70
acgttggatg tggtggccat ccctgggaat 30
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<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 71
acgttggatg ggtaagtgta ctgcccctg 29
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<211> 24
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 72
ccgcaatccc tgggaatgca agca 24
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<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 73
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<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 74
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<211> 25
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 75
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<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 76
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<211> 30
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<213> 人工合成
<400> 77
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<211> 25
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 78
gctgtgtata gtatagtgga aatag 25
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<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 79
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<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 80
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<212> DNA
<213> 人工合成
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tttcgcaggt aacttctcca ctaaaa 26
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<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 82
acgttggatg tccagccaga tttcaggctc 30
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<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 83
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<211> 26
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 84
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<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 85
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<210> 86
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 86
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<211> 26
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 87
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<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 88
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<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 89
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<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 90
ggttgaatcc cccctccact tcctgta 27
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<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
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<211> 29
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 92
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<211> 26
<212> DNA
<213> 人工合成
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gaggcaggcc aagagcagag gcagcg 26
<210> 94
<211> 29
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 94
acgttggatg agttcacata tttgcaaac 29
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<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
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acgttggatg cagcccatga agatgtatag 30
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<213> 人工合成
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ctgaagatgt atagatatgt tgcatac 27
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<213> 人工合成
<400> 97
acgttggatg gagtaccagg aaacaggagt 30
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<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 98
acgttggatg accctaccat gacaaacccg 30
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<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 99
acaaccccgg gctgacatct aaatctga 28
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<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 100
acgttggatg agctatcagt ttcattacc 29
<210> 101
<211> 29
<212> DNA
<213> 人工合成
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acgttggatg acatgactac tttttgaac 29
<210> 102
<211> 28
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 102
gaccatattg attttcttca aatgtgtt 28
<210> 103
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 103
acgttggatg catttctatg aagtgtccag 30
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<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 104
acgttggatg ccctgtcatc atatgcaacc 30
<210> 105
<211> 28
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 105
aagggtccag aataggcaaa tccataga 28
<210> 106
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 106
acgttggatg cagaaggtgt tatcaggtgc 30
<210> 107
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 107
acgttggatg ctccttgatc tcagaggtag 30
<210> 108
<211> 15
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 108
ctccatcaca cccag 15
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<211> 30
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<213> 人工合成
<400> 109
acgttggatg ctgaaagctg gatttgctgg 30
<210> 110
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 110
acgttggatg aaaatttggc agctgaggac 30
<210> 111
<211> 15
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 111
gctgaggact gtcca 15
<210> 112
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 112
acgttggatg acttggcaaa caaggctgac 30
<210> 113
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 113
acgttggatg ccttgtattc atctaccggc 30
<210> 114
<211> 16
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 114
ttccgggtgt tgtcca 16
<210> 115
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 115
acgttggatg tcagtgaaac tccaagcctg 30
<210> 116
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 116
acgttggatg gcttggtcac atgatagtcc 30
<210> 117
<211> 16
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 117
tcaaggagat ggtggc 16
<210> 118
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 118
acgttggatg gcctgcttga acctcttttg 30
<210> 119
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 119
acgttggatg gcccagatca tgaacagact 30
<210> 120
<211> 17
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 120
ccattgcctt cagcata 17
<210> 121
<211> 29
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 121
acgttggatg gctgttatgt tgtcaattc 29
<210> 122
<211> 29
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 122
acgttggatg aaattctgca aaaacctac 29
<210> 123
<211> 18
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 123
gcaaaaacct acccagtt 18
<210> 124
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 124
acgttggatg tgaggagact aagaaacggg 30
<210> 125
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 125
acgttggatg aactgcacct gaccaggttc 30
<210> 126
<211> 19
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 126
cccgcaacct ctcacccag 19
<210> 127
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 127
acgttggatg tcttcccttt gtccctggtc 30
<210> 128
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 128
acgttggatg tgagaggcca tagctgtctg 30
<210> 129
<211> 19
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 129
ttcatgacct gctgctgcc 19
<210> 130
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 130
acgttggatg aaggtgaagt gtgagggtgt 30
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<212> DNA
<213> 人工合成
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acgttggatg ggcagtatag attagaaggg 30
<210> 132
<211> 19
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 132
aaagatccct aggtcattg 19
<210> 133
<211> 29
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 133
acgttggatg agccccttgg ctgttgtct 29
<210> 134
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 134
acgttggatg accaggaact ttccggaatg 30
<210> 135
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 135
ccctgctgtt gtctcaccct 20
<210> 136
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 136
acgttggatg gcctctgtat tctccatgag 30
<210> 137
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 137
acgttggatg cagtcatgga atctgccttc 30
<210> 138
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 138
cagtctgaaa tgggaactaa 20
<210> 139
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 139
acgttggatg tgtgaaaagt ttgggaaggg 30
<210> 140
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 140
acgttggatg cacacccatg ggtcagtttc 30
<210> 141
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 141
cagttctatt tttgccttca c 21
<210> 142
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 142
acgttggatg ccatgctcag tagatcttac 30
<210> 143
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 143
acgttggatg gtcataagtt ggtgaggagg 30
<210> 144
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 144
ctcagtagat cttaccacat a 21
<210> 145
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 145
acgttggatg acaccaacta tagaaagccc 30
<210> 146
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 146
acgttggatg gtgataccgt agagtcacag 30
<210> 147
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 147
gggattccca gaactgaata cc 22
<210> 148
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 148
acgttggatg aagaccatgg cctccaatct 30
<210> 149
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 149
acgttggatg agccatctgg aagtttcctc 30
<210> 150
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 150
cactgcctcc aatctccatg ctc 23
<210> 151
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 151
acgttggatg tgtctcagtc acagtgtagc 30
<210> 152
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 152
acgttggatg aacatggaaa gccctgagac 30
<210> 153
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 153
ccgctacaat ttagctaact cca 23
<210> 154
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 154
acgttggatg tttcttcacc actatttggg 30
<210> 155
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 155
acgttggatg cctgtgttaa acagcatgcc 30
<210> 156
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 156
gtcaccacta tttgggatat aac 23
<210> 157
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 157
acgttggatg tgatgatggt cacacatatc 30
<210> 158
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 158
acgttggatg ccacttaaaa tatacagttc 30
<210> 159
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 159
atatacagtt cagtgatttg tag 23
<210> 160
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 160
acgttggatg tctcctcttc ctcctctatc 30
<210> 161
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 161
acgttggatg ctccagcaac caggaatgtg 30
<210> 162
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 162
gggacagtgg tactgaagaa gaa 23
<210> 163
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 163
acgttggatg taagtaggca tagtcaactc 30
<210> 164
<211> 31
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 164
acgttggatg gtaagttgag agtcagacta c 31
<210> 165
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 165
tttgggtcag actactcttt cattc 25
<210> 166
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 166
acgttggatg aagacttttt gtggcctaac 30
<210> 167
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 167
acgttggatg gcattccacc ccaaaaaagc 30
<210> 168
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 168
gccaccccaa aaaagctgaa tatac 25
<210> 169
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 169
acgttggatg cccagttatg acactagcag 30
<210> 170
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 170
acgttggatg aggaaacact gggccaatac 30
<210> 171
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 171
acaatagcag atattgtaac atcag 25
<210> 172
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 172
acgttggatg cagctgatac atttggaagg 30
<210> 173
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 173
acgttggatg aaccagaccc tcattgtcac 30
<210> 174
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 174
ggaggtgtca cctaatggtg gtact 25
<210> 175
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 175
acgttggatg ggagggagga ggatagagtt 30
<210> 176
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 176
acgttggatg cttgacccca gatttctgag 30
<210> 177
<211> 26
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 177
cactacttca tacacatcaa atgccc 26
<210> 178
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 178
acgttggatg gtctcaccaa tagatgattc 30
<210> 179
<211> 29
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 179
acgttggatg ctgaaagttg agtatgaag 29
<210> 180
<211> 27
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 180
ctttaaatac acaatttttc attctct 27
<210> 181
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 181
acgttggatg atatccgcaa gctattttgg 30
<210> 182
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 182
acgttggatg gtcctcaatt ttcccaagtc 30
<210> 183
<211> 27
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 183
cactattttg gtttttgaca aattaga 27
<210> 184
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 184
acgttggatg gagtgtgtat gcagtaaaag 30
<210> 185
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 185
acgttggatg aatcccctga aattccactg 30
<210> 186
<211> 28
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 186
cccacactga aataagataa ccactatt 28
<210> 187
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 187
acgttggatg tctccctgcc tgtaaatacg 30
<210> 188
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 188
acgttggatg ggactactat atgaaaaggc 30
<210> 189
<211> 28
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 189
cgatcattca atttataaaa aatgtaac 28
<210> 190
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 190
acgttggatg atcacccaga tgattgggtc 30
<210> 191
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 191
acgttggatg aggcttgtgg ttcatcttac 30
<210> 192
<211> 28
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 192
agaagtgtgg ttcatcttac cttgtcca 28
<210> 193
<211> 31
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 193
acgttggatg tatagtaatt gctataaaat g 31
<210> 194
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 194
acgttggatg gatcccagac caaacatcac 30
<210> 195
<211> 28
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 195
ggatagtaat tgctataaaa tgcatata 28
<210> 196
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 196
acgttggatg gttaaaagct cagggtgtcg 30
<210> 197
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 197
acgttggatg taccttgttc caaatccccc 30
<210> 198
<211> 15
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 198
gggtgtcgag aacaa 15
<210> 199
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 199
acgttggatg atttattacc gaacctagcc 30
<210> 200
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 200
acgttggatg cacccctatc tggagagttg 30
<210> 201
<211> 16
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 201
acctagccaa ccaatg 16
<210> 202
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 202
acgttggatg acacagactt ggtactgagg 30
<210> 203
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 203
acgttggatg gccagcggaa tttaaagttg 30
<210> 204
<211> 17
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 204
ggtccttgag cgtgctg 17
<210> 205
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 205
acgttggatg cttgactcga acatgttggg 30
<210> 206
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 206
acgttggatg tgaaatgcag gcctgtgatg 30
<210> 207
<211> 17
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 207
tgttgcgtga aaagtgt 17
<210> 208
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 208
acgttggatg gactgattct aaggctggtg 30
<210> 209
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 209
acgttggatg acacagggca tttacagtgg 30
<210> 210
<211> 18
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 210
cgctctccat agcaaaaa 18
<210> 211
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 211
acgttggatg aaagcctttc cttacaactg 30
<210> 212
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 212
acgttggatg gcttcgaaaa ctctgactgc 30
<210> 213
<211> 19
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 213
ttgaaaaaat ggctcatgt 19
<210> 214
<211> 29
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 214
acgttggatg tagccacttg tgagtaaaa 29
<210> 215
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 215
acgttggatg agggctacat ttcccaaaac 30
<210> 216
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 216
acatttccca aaactagttc 20
<210> 217
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 217
acgttggatg gctctctgtg tactcctatg 30
<210> 218
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 218
acgttggatg tggaagcaca gggtggaaac 30
<210> 219
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 219
gggagtaacc agtggttgtc 20
<210> 220
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 220
acgttggatg agggcaggtc tatgcataag 30
<210> 221
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 221
acgttggatg cttcaaaaga tgcacaaggg 30
<210> 222
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 222
attctgatct cactgctgta g 21
<210> 223
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 223
acgttggatg atcagaaact caagtggagc 30
<210> 224
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 224
acgttggatg atgaggacag ccatagagac 30
<210> 225
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 225
catctattaa atcgcctctc tc 22
<210> 226
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 226
acgttggatg atctccaaga tctgtccaac 30
<210> 227
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 227
acgttggatg ctgggagctc gttaactatg 30
<210> 228
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 228
caaattctga ttcttttgga cc 22
<210> 229
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 229
acgttggatg cacacaagat actgctggac 30
<210> 230
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 230
acgttggatg ttctataaat gccctcaagc 30
<210> 231
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 231
actgctggac actgatatca atc 23
<210> 232
<211> 29
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 232
acgttggatg cacagcccga gccggagag 29
<210> 233
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 233
acgttggatg aaggctccaa tgcacccaag 30
<210> 234
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 234
ggagacggcc ccggtcgggc ctc 23
Claims (6)
1.阿达木单抗作用的78个SNP位点，其特征在于，78个SNP位点包括：rs2071303位点、rs28371759位点、rs1801274位点、rs3761847位点、rs1800795位点、rs352139位点、rs2145623位点、rs33980500位点、rs4810485位点、rs3794271位点、rs396991位点、rs10903129位点、rs2546890位点、rs510432位点、rs1295686位点、rs885814位点、rs1043879位点、rs3735451位点、rs10210302位点、rs17301249位点、rs6427528位点、rs548234位点、rs27524位点、rs1061622位点、rs2736340位点、rs17716942位点、rs6920220位点、rs394581位点、rs9373839位点、rs2476601位点、rs1061624位点、rs2734440位点、rs6691117位点、rs10499194位点、rs2246709位点、rs35599367位点、rs2812378位点、rs1799852位点、rs7527798位点、rs11586238位点、rs11209026位点、rs3218253位点、rs767455位点、rs240993位点、rs20575位点、rs10512734位点、rs8049439位点、rs2104286位点、rs12081765位点、rs645544位点、rs13393173位点、rs3087243位点、rs12721622位点、rs2228145位点、rs1350948位点、rs1267067位点、rs7234029位点、rs4750316位点、rs7927894位点、rs2302489位点、rs1980422位点、rs7574865位点、rs9828223位点、rs1126535位点、rs10919563位点、rs3213094位点、rs9304742位点、rs2230926位点、rs610604位点rs6822844位点、rs13031237位点、rs3814057位点、rs6661932位点、rs4646437位点、rs2740574位点、rs1130864位点、rs12777960位点、rs25648位点。
2.根据权利要求1所述的阿达木单抗作用的78个SNP位点在评估阿达木单抗在治疗银屑病有效性中的应用。
3.基于78个SNP位点评估阿达木单抗治疗银屑病有效性的试剂盒，其特征在于，用于检测银屑病患者是否携带78个SNP位点的物质为含有成套单链DNA的试剂盒，其中，成套单链DNA由序列表中SEQ ID No.1～234条单链组成。
4.根据权利要求3所述的基于78个SNP位点评估阿达木单抗治疗银屑病有效性的试剂盒的使用方法，其特征在于，包括以下具体步骤：
S1、从银屑病患者的外周血中提取DNA，获得待测DNA；
S2、对待测DNA采用PCR技术进行扩增，获得PCR扩增产物；
S3、将PCR产物使用碱性磷酸酶处理，获得处理后的PCR产物；
S4、将获得的处理后的PCR产物进行单碱基延伸，获得延伸后产物；
S5、将获得的延伸产物进行纯化，获得纯化产物；
S6、将纯化产物放置在检测仪上进行检测银屑病患者是否携带一个或多个阿达木单抗作用的78个SNP位点。
5.根据权利要求4所述的基于78个SNP位点评估阿达木单抗治疗银屑病有效性的试剂盒的使用方法，其特征在于，步骤S6中的具体检测过程为，先将纯化产物放置在SpectroCHIP芯片上，将SpectroCHIP芯片使用MALDI-TOF进行分析，检测结果使用TYPER软件分型并输出结果。
6.根据权利要求4所述的基于78个SNP位点评估阿达木单抗治疗银屑病有效性的试剂盒的使用方法，其特征在于，步骤S1中将采取的DNA的浓度调整至50ng/μL，-20℃存储备用。
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Cited By (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN114703279A (zh) * | 2022-05-14 | 2022-07-05 | 安徽医科大学第一附属医院 | 一种银屑病基因筛查试剂盒及其检测方法 |
| CN116287193A (zh) * | 2023-01-17 | 2023-06-23 | 中日友好医院(中日友好临床医学研究所) | 一组用于评估阿达木单抗治疗银屑病效果的snp位点及其试剂盒和应用 |
Citations (8)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| JP2010088432A (ja) * | 2008-09-09 | 2010-04-22 | Kansetsu Saisei Kenkyusho:Kk | Ｔｎｆ阻害薬治療による有効性・副作用発現に関する多型、およびその利用 |
| TW201343176A (zh) * | 2012-04-16 | 2013-11-01 | Novartis Ag | 使用ｉｌ－１７拮抗劑治療乾癬性關節炎之方法 |
| US20150064193A1 (en) * | 2011-11-21 | 2015-03-05 | Novartis Ag | Methods of treating psoriatic arthritis (psa) using il-17 antagonists and psa response or non-response alleles |
| CN105274222A (zh) * | 2015-10-19 | 2016-01-27 | 上海洛施生物科技有限公司 | 一种与非甾体类消炎药预防结直肠癌相关的snp标志物及其应用 |
| WO2016097961A1 (en) * | 2014-12-17 | 2016-06-23 | Università degli Studi di Roma “La Sapienza” | Genetic markers predictive of clinical response to biological drugs in psoriasis. |
| US20170145501A1 (en) * | 2015-11-20 | 2017-05-25 | Lasse Folkersen | Apparatus and methods of using of biomarkers for predicting tnf-inhibitor response |
| CN110029162A (zh) * | 2019-05-22 | 2019-07-19 | 中国科学院生物物理研究所 | 一种用于检测系统性红斑狼疮易感性位于非编码基因区的snp标志物及其应用 |
| CN112708669A (zh) * | 2021-01-22 | 2021-04-27 | 南昌豪仕医学检验实验室有限公司 | 用于检测阿达木单抗用药相关基因多态性的引物对及试剂盒 |
Family Cites Families (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| JP2013081448A (ja) * | 2011-05-02 | 2013-05-09 | Arkray Inc | 遺伝子変異検出用プローブ |
| CN106222281A (zh) * | 2016-08-10 | 2016-12-14 | 中南大学湘雅三医院 | 基于基因多态性指导儿童患者精准用药的试剂盒、应用和方法 |
| CN109097459B (zh) * | 2018-08-16 | 2021-08-20 | 深圳一道医学检验实验室 | 一种基于snp位点的成人常用抗感染药物用药分析的检测方法及其应用 |
-
2022
- 2022-01-29 CN CN202210111329.XA patent/CN114427001A/zh active Pending
-
2023
- 2023-01-18 CN CN202310058466.6A patent/CN116411062A/zh active Pending
Patent Citations (8)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| JP2010088432A (ja) * | 2008-09-09 | 2010-04-22 | Kansetsu Saisei Kenkyusho:Kk | Ｔｎｆ阻害薬治療による有効性・副作用発現に関する多型、およびその利用 |
| US20150064193A1 (en) * | 2011-11-21 | 2015-03-05 | Novartis Ag | Methods of treating psoriatic arthritis (psa) using il-17 antagonists and psa response or non-response alleles |
| TW201343176A (zh) * | 2012-04-16 | 2013-11-01 | Novartis Ag | 使用ｉｌ－１７拮抗劑治療乾癬性關節炎之方法 |
| WO2016097961A1 (en) * | 2014-12-17 | 2016-06-23 | Università degli Studi di Roma “La Sapienza” | Genetic markers predictive of clinical response to biological drugs in psoriasis. |
| CN105274222A (zh) * | 2015-10-19 | 2016-01-27 | 上海洛施生物科技有限公司 | 一种与非甾体类消炎药预防结直肠癌相关的snp标志物及其应用 |
| US20170145501A1 (en) * | 2015-11-20 | 2017-05-25 | Lasse Folkersen | Apparatus and methods of using of biomarkers for predicting tnf-inhibitor response |
| CN110029162A (zh) * | 2019-05-22 | 2019-07-19 | 中国科学院生物物理研究所 | 一种用于检测系统性红斑狼疮易感性位于非编码基因区的snp标志物及其应用 |
| CN112708669A (zh) * | 2021-01-22 | 2021-04-27 | 南昌豪仕医学检验实验室有限公司 | 用于检测阿达木单抗用药相关基因多态性的引物对及试剂盒 |
Non-Patent Citations (4)
| Title |
|---|
| LILI MAGYARI等: "Interleukins and interleukin receptors in rheumatoid arthritis: Research, diagnostics and clinical implications", 《WORLD JOURNAL OF ORTHOPEDICS》 * |
| MARÍA CARMEN OVEJERO-BENITO等: ""Polymorphisms associated with adalimumab and infiximab response in moderate-to-severe plaque psoriasis"", 《PHARMACOGENETICS》 * |
| NULL: ""rs28371759、rs3735451、rs2246709、rs35599367、rs12721622、rs4646437和rs2740574"", 《HTTPS://WWW.NCBI.NLM.NIH.GOV/SNP/》 * |
| 陆超凡等: "银屑病关节炎易感基因", 《中华临床免疫和变态反应杂志》 * |
Cited By (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN114703279A (zh) * | 2022-05-14 | 2022-07-05 | 安徽医科大学第一附属医院 | 一种银屑病基因筛查试剂盒及其检测方法 |
| CN116287193A (zh) * | 2023-01-17 | 2023-06-23 | 中日友好医院(中日友好临床医学研究所) | 一组用于评估阿达木单抗治疗银屑病效果的snp位点及其试剂盒和应用 |
| CN116287193B (zh) * | 2023-01-17 | 2024-03-26 | 中日友好医院(中日友好临床医学研究所) | 一组用于评估阿达木单抗治疗银屑病效果的snp位点及其试剂盒和应用 |
Also Published As
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