CN113444111A - 新型苯二氮杂䓬衍生物及其用途 - Google Patents

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CN113444111A CN202110592302.2A CN202110592302A CN113444111A CN 113444111 A CN113444111 A CN 113444111A CN 202110592302 A CN202110592302 A CN 202110592302A CN 113444111 A CN113444111 A CN 113444111A
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Abstract

本发明涉及新型苯二氮杂
Figure DDA0003089692210000012
衍生物及其用途。本发明提供了一种具有式(I)的结构的化合物、包含所述化合物的缀合物和药物组合物及其使用方法。本发明提供的化合物、缀合物、药物组合物可用在于哺乳动物中抑制异常细胞生长或治疗增殖性病症,也可用于治疗哺乳动物的病症诸如癌症、类风湿性关节炎、多发性硬化、移植物抗宿主病(GVHD)、移植排斥、狼疮、肌炎、感染、免疫缺陷诸如AIDS和炎性疾病,从而延长寿命。
Figure DDA0003089692210000011

Description

新型苯二氮杂䓬衍生物及其用途
本申请是2019年05月29日递交的PCT国际申请PCT/IB2019/000691 于2020年11月24日进入中国国家阶段的中国专利申请号为 201980035084.3、发明名称为“新型苯二氮杂
Figure BDA0003089692190000013
衍生物及其用途”的发明专 利申请的分案申请。
相关申请
本申请要求2018年5月29日提交的美国临时申请第62/677,498号的权 益,其内容通过引用整体并入本文。
技术领域
本申请涉及一种新型苯二氮杂
Figure BDA0003089692190000014
衍生物及其用途。
背景技术
抗体-药物缀合物(ADC)是新兴的一类对多种癌症都有疗效的强大的抗 肿瘤药物。ADC通常包括三种不同的特征:细胞结合剂或靶向部分;接头; 和细胞毒性剂。ADC的接头组分是开发靶向抗癌剂的重要特征,所述抗癌 剂具有所需的靶特异性,即在肿瘤细胞中具有高活性,但在健康细胞中具有 低活性。靶向部分与细胞毒性剂(如果未靶向,可能损害健康组织)的联合使 用也改变了此类细胞毒性剂所需特征的演算。因此,需要用于制备ADC的 改进的接头和细胞毒性剂。
发明内容
在某些方面,本文提供了具有式(I)结构的化合物:
Figure BDA0003089692190000011
或其药学上可接受的盐,
其中:
A1和A2各自独立地表示杂环,优选为五元环或六元环,任选地与一个 或多个芳基环或杂芳基环稠合或被其取代;
R1和R2各自独立地为烷基,优选为低级烷基;
Z1为亚甲基或连接基团;并且
n1和n2各自独立地为值为1至5的整数。
在一些实施方案中,A1选自:
Figure BDA0003089692190000021
其中:
RA1a为H、烷基、烯基、环烷基、杂环烷基、芳基或杂芳基;
RA1b为CHRA1ba
RA1ba为H、卤素、烷基、-CO2-烷基、CHO或CO2H;
Ar1为芳基或杂芳基,优选为六元芳基或杂芳基,任选地被卤素、羟基、氰 基、硝基、烷基、卤代烷基、环烷基、羧基、氨基、芳基或杂芳基取代一次或多 次;并且
o为值为1或2的整数。
在一些实施方案中,式(I)的化合物选自:
Figure BDA0003089692190000022
Figure BDA0003089692190000031
或其药学上可接受的盐。
在某些方面,本文提供一种缀合物,其包含上述化合物、可裂解的接头 和靶向剂,其中所述可裂解的接头将所述化合物可裂解地连接至所述靶向 剂。
在某些方面,本文提供包含式(I)的化合物、可切割的接头和靶向剂的缀 合物,其中可切割的接头将化合物可切割地连接至活性剂靶向剂。在优选实 施方案中,靶向剂是细胞结合剂。
在某些方面,本文提供了具有式(II)、(IIa)和(IIb)的结构的化合物:
Figure BDA0003089692190000032
或其药学上可接受的盐,
其中:
A1和A2各自独立地表示杂环,优选为五元环或六元环,任选地与一个 或多个芳基环或杂芳基环稠合或被其取代;
R1和R2各自独立地为烷基;
Z1为连接基团;
Z2不存在或为连接基团;
L1为通过选自O、S和N(优选为O或N)的杂原子与SO2附接的连接基团, 并且被选择为使得L1与SO2之间的键的断裂促进L1与Z1之间的键断裂以释放活 性剂;
X1为-O-、-CRb 2-或-NRa-,优选为-O-;
Ar代表环,诸如芳基、杂芳基、环烷基或杂环烷基,优选为芳基或杂芳基;
Y1为-(CRb 2)yN(Ra)-、-(CRb 2)yO-或-(CRb 2)yS-,被定位为使得如果y为1至5, 则N、O或S原子与TG附接;其中X1和Y1位于Ar的相邻原子上;
TG为触发基团,当被激活时,生成能够与SO2反应以取代Z2并形成包括 X-SO2和Ar的居间原子的5-6元环的N、O或S原子;
每个Ra都是氢或低级烷基;并且
每个Rb独立地为氢或低级烷基;或者
两个Rb与它们所附接的碳原子一起形成3-5元环,优选为3-4元环;
n1和n2各自独立地为值为1至5的整数;
w和x各自独立地为值为0或1的整数;并且
y为值为0至5的整数。
在一些实施方案中,TG为-NO2、-OC(O)(CH2)rC(O)R1、-NHNH2、-BR2R3
Figure BDA0003089692190000041
其中:
R1为C1-C6烷基;
R2和R3各自独立地为氢、C1-C6烷基、C1-C6烷氧基或羟基;
R4、R5、R6和R7各自独立地为氢或C1-C6烷基;并且
r为值为1、2、3、4或5的整数。
在一些实施方案中,TG选自:
Figure BDA0003089692190000042
其中:
每个R21独立地为氢或乙酰基;并且
R22为氢或低级烷基。
在一些实施方案中,TG选自-NO2、-C(O)-(CH2)2C(O)-烷基和硝基苄基。
在某些方面,本文提供了具有式(III)的结构的缀合物:
(D-L)dl-LG-(CB)cb
(III)
或其药学上可接受的盐,
其中:
LG为连接基团;
CB为细胞结合剂;
cb和dl各自独立地为值为1至约20,优选1至约10,诸如为1的整数; 并且
每个D-L独立地为具有式(I)或(II)的化合物的结构的基团。
在一些实施方案中,LG为C10–C100直链或支链、饱和或不饱和亚烷基 部分,其包含以下的至少两种:
(i)至少一种选自-NH-、-C(=O)、-O-、-S-和-P-的杂原子;
(ii)至少一种杂亚芳基;
(iii)至少一种氨基酸部分、糖键、肽键或酰胺键;以及
(iv)一种或多种选自由以下组成的组的取代基:C1–C20烷基、C6–C20芳基C1–C8烷基、-(CH2)sCOOH和-(CH2)pNH2,s为值为0至10的整数,并 且p为值为1至约10的整数。
在一些实施方案中,LG为能够通过点击化学反应产生的官能团,诸如 三唑。
在一些实施方案中,LG为:
Figure BDA0003089692190000051
其中:
*表示与(D-L)dl的附接点;
**表示与CB的附接点;
每个V独立地为单键、-O-、-S-、-NR21-、-C(O)NR22-、-NR23C(O)-、 -NR24SO2-或-SO2NR25-;
R21、R22、R23、R24和R25各自独立地为氢、(C1-C6)烷基、(C1-C6)烷基(C6-C20) 芳基、或(C1-C6)烷基(C3-C20)杂芳基;
r为值为1至约10的整数;
p为值为0至约10的整数;
q为值为1至约10的整数;并且
L3为单键。
在一些实施方案中,LG包含在直链中通过共价键彼此连接的(CH2)b、Lc、 (P1)a、Wa1、Wa2、Wa3、Y3和Y4基团,其中:
Wa1、Wa2和Wa3各自独立地为-NH-、-C(O)-或-CH2-;
Wb1为酰胺键或三唑烯;
P1为酰胺键、氨基酸残基或肽;
Lc为亚烷基;
Y1为-(CH2)q-(CH2CH2X4)o-或-(CH2)q-(X4CH2CH2X3)o-;
X4为-O-、-S-、-NH-或-CH2-;
Y2为单键或选自以下的基团:
Figure BDA0003089692190000061
Wb2为酰胺键或三唑烯;
a为0至10;
b、c和d各自独立地为值为1至约10的整数;并且
o和q各自独立地为值为1至约10的整数。
在一些实施方案中,细胞结合剂结合至靶细胞,所述靶细胞选自肿瘤细胞、 病毒感染的细胞、微生物细胞、活化的细胞、髓样细胞、活化的T细胞、B细胞 或黑素细胞;表达CD4、CD6、CD19、CD20、CD22、CD30、CD33、CD37、 CD38、CD40、CD44、CD56、EpCAm、CanAg、CALLA或Her-2抗原;Her-3 抗原的细胞或表达胰岛素生长因子受体、表皮生长因子受体和叶酸受体的细胞。
在一些实施方案中,肿瘤细胞选自乳腺癌细胞、前列腺癌细胞、卵巢癌细胞、 结直肠癌细胞、胃癌细胞、鳞状细胞癌细胞、小细胞肺癌细胞和睾丸癌细胞。
在一些实施方案中,细胞结合剂为抗体、单链抗体、特异性结合至所述靶细 胞的抗体片段、单克隆抗体、单链单克隆抗体、或特异性结合靶细胞的单克隆抗 体片段、嵌合抗体、特异性结合至所述靶细胞的嵌合抗体片段、结构域抗体、特 异性结合至所述靶细胞的结构域抗体片段、淋巴因子、激素、维生素、生长因子、 集落刺激因子或营养物转运分子。
在一些实施方案中,抗体是表面重修的抗体、表面重修的单链抗体或表面重 修的抗体片段;单克隆抗体、单链单克隆抗体或其单克隆抗体片段;嵌合抗体片 段、结构域抗体或结构域抗体片段;人源化抗体、人源化单链抗体或人源化抗体 片段。
本公开还涉及包含式(I)、(II)、(IIa)、(IIb)的化合物或式(III)的缀合物和载体(例 如,药学上可接受的载体)的组合物(例如,药物组合物)。
本公开还涉及包含式(I)、(II)、(IIa)、(IIb)的化合物或其药学上可接受的盐,或式(III)的缀合物和载体(例如,药学上可接受的载体)的组合物(例如,药物 组合物)。
在一些实施方案中,药物组合物还包含为化学治疗剂的第二化合物。
在某些方面,本公开提供了一种治疗哺乳动物的癌症的方法,方法包括 向所述哺乳动物施用治疗有效量的式(I)、(II)、(IIa)、(IIb)的化合物或其药学 上可接受的盐,或式(III)的缀合物。
在一些实施方案中,方法还包括向哺乳动物施用为化学治疗剂的第二化 合物。
在一些实施方案中,依次地向所述哺乳动物施用所述化学治疗剂。
在某些方面,本公开提供了将活性剂递送至细胞的方法,包括施用式(III) 的缀合物或其药物组合物,其中选择靶向部分以结合与靶细胞相关联的分 子。在某些方面,本发明提供了式(III)的缀合物及其药物组合物,用于将活 性剂递送至细胞的方法中,其中选择靶向部分以结合与靶细胞相关联的分 子。特别地,本发明的化合物、缀合物和组合物可用在于哺乳动物(例如, 人)中抑制异常细胞生长或治疗增殖性病症,诸如其中靶细胞是癌细胞且靶 向部分经选择以结合与癌细胞相关联(且不与健康细胞相关联,或至少优先与肿瘤细胞而非健康细胞相关联)的分子。
式(III)的缀合物及其药物组合物可用于治疗哺乳动物(例如,人)的病症 诸如癌症、类风湿性关节炎、多发性硬化、移植物抗宿主病(GVHD)、移植 排斥、狼疮、肌炎、感染、免疫缺陷诸如AIDS和炎性疾病。
附图说明
图1显示化合物D-1、D-2、D-3、D-4、D-5和D-6对NCI-N87的体外 细胞毒性活性。
图2显示了化合物D-1、D-2、D-3、D-4、D-5和D-6对JIMT-1的体外 细胞毒性活性。
图3显示化合物D-1、D-2、D-3和D-5对Calu-6的体外细胞毒性活性。
图4显示了化合物D-1、D-2、D-3和D-5对A-498的体外细胞毒性活 性
图5显示了化合物D-1、D-2、D-3和D-5对HCT-116的体外细胞毒性 活性。
图6显示了化合物D-1、D-2、D-3和D-5对MIA-PaCa-2的体外细胞毒 活性。
图7显示了化合物D-1、D-2、D-3和D-5对PC-3的体外细胞毒性活性。
图8显示了化合物D-1、D-2、D-3和D-5对HEK-293E的体外细胞毒 性活性。
图9显示了化合物D-1、D-2、D-3和D-5对SK-OV-3的体外细胞毒性 活性。
图10显示了针对NCI-N87的缀合物T-2-AB、T-3-AB和T-7-AB的体外分析。
图11显示了针对JIMT-1的缀合物T-2-AB、T-3-AB和T-7-AB的体外分析。
图12显示了针对SK-BR-3的缀合物T-2-AB、T-3-AB和T-7-AB的体外分析。
图13和14显示了缀合物T-2-AB的体内测试。
具体实施方式
一些吡咯并苯二氮
Figure BDA0003089692190000082
类(PBD)具有识别并结合DNA的特定序列的能力;优 选序列为PuGPu。1965年发现了第一种PBD抗肿瘤抗生素氨茴霉素(Leimgruber 等人,J.Am.Chem.Soc,87:5793-5795(1965);Leimgruber等人,J.Am.Chem.Soc., 87:5791-5793(1965))。自那时起,已报告了许多种天然存在的PBD,并开发了 10多种合成途径来合成各种类似物(Thurston等人,Chem.Rev.1994:433-465 (1994))。家族成员包括阿比霉素(Hochlowski等人,J.Antibiotics,40:145-148 (1987))、奇卡霉素(Konishi等人,J.Antibiotics,37:200-206(1984))、DC-81(Japanese Patent 58-180 487;Thurston等人,Chem.Brit,26:161-112(1990);Bose等人, Tetrahedron,48:751-758(1992))、甲基氨茴霉素(mazethramycin)(Kuminoto等人, J.Antibiotics,33:665-667(1980))、新丝菌素(neothramycin)A和B(Takeuchi等人, J.Antibiotics,29:93-96(1976))、泊罗霉素(porothramycin)(Tsunakawa等人,J. Antibiotics,41:1366-1373(1988))、普拉卡素(prothracarcin)(Shimizu等人,J. Antibiotics,29:2492-2503(1982);Langley和Thurston,/.Org.Chem.,52:91-97 (1987))、西班米星(sibanomicin)(DC-102)(Hara等人,J.Antibiotics,41:702-704 (1988);Itoh等人,J.Antibiotics,41:1281-1284(1988))、西伯利亚霉素 (sibiromycin)(Leber等人,J.Am.Chem.Soc,110:2992-2993(1988))和托马霉素 (tomamycin)(Arima等人,J.Antibiotics,25:437-444(1972))。
PBD的一般结构为:
Figure BDA0003089692190000081
它们的芳香族A环和吡咯并C环两者中的取代基的数目、类型和位置不同, C环的饱和程度也不同。在B-环中,在N10-C11位(其为负责烷化DNA的亲电 中心)存在亚胺(N=C)、甲醇胺(NH-CH(OH))或甲醇胺甲基醚(NH-CH(OMe))。所 有已知的天然产物在手性CI la位置都具有(S)-构型,当从C环向A环看时,所 述构型为它们提供了右手扭转(right-handed twist)。这赋予它们适当的三维形状以 实现与B型DNA的小沟的等螺旋度(isohelicity),导致在结合位点处的适贴配合 (snug fit)(Kohn,In AntibioticsIII.Springer-Verlag,New York,第3-11页(1975); Hurley和Needham-VanDevanter,Acc.Chem.Res.,19:230-237(1986))。它们在小 沟中形成加合物的能力使其能够干扰DNA加工,因此它们可用作抗肿瘤剂。
吲哚啉苯并二氮
Figure BDA0003089692190000091
类(IBD)与PBD的不同之处在于,PBD C环被吲哚啉 环替代。为方便起见,IBD中的某些A环和B环位置采用与PBD中相同的 命名法,诸如C6-C9、N10和C11位置。
本文提供了包含PBD或IBD化合物和任选的可切割接头的化合物及其 缀合物,及其用途。在某些实施方案中,本文公开的化合物和缀合物包含活 性剂(例如,式(I)的化合物)和SO2官能团,所述活性剂包含在预定条件下经 历化学反应(例如,物理化学反应和/或生物反应)以释放亲核杂原子的官能 团,所述SO2官能团位于亲核杂原子附近,使得其可在分子内环化反应中与 亲核杂原子反应以释放活性剂。在一些实施方案中,本文公开的化合物和缀 合物还包含靶向部分(例如,寡肽、多肽、抗体等),所述靶向部分对所需靶 受体或与靶细胞相关联的其它分子具有结合特异性。
定义
除非本文另有定义,否则本申请中使用的科学和技术术语应具有本领域 普通技术人员通常理解的含义。通常,本文所述的与化学、细胞和组织培养、 分子生物学、细胞和癌症生物学、神经生物学、神经化学、病毒学、免疫学、 微生物学、药理学、遗传学以及蛋白质和核酸化学结合使用的术语以及所述 学科的技术是本领域公知的和常用的术语及技术。
除非另有说明,本公开的方法和技术通常根据本领域公知的常规方法并 且如在贯穿本说明书引用和论述的各种一般和更具体的参考文献中所述来 执行。参见,例如,“Principles of Neural Science”,McGraw-Hill Medical,New York,N.Y.(2000);Motulsky,“Intuitive Biostatistics”,Oxford University Press, Inc.(1995);Lodish等人,“Molecular Cell Biology,第4版”,W.H.Freeman& Co.,New York(2000);Griffiths等人,“Introduction to Genetic Analysis,第7 版”,W.H.Freeman&Co.,N.Y.(1999);和Gilbert等人,“Developmental Biology,第6版”,Sinauer Associates,Inc.,Sunderland,MA(2000).
除非本文另有定义,否则本文使用的化学术语均按照本领域常规用法使 用,如由“The McGraw-Hill Dictionary of Chemical Terms”,Parker S.,编辑, McGraw-Hill,San Francisco,C.A.(1985)所列举的。
在本申请中提及的所有上述以及任何其它出版物、专利和已公布的专利 申请明确地通过引用并入本文。如有冲突,以本说明书(包括其具体定义)为 准。
术语“试剂”在本文中用于表示化学化合物(例如有机或无机化合物、化 合物的混合物)、生物大分子(诸如核酸、抗体,包括其部分以及人源化抗体、 嵌合抗体和人抗体及单克隆抗体、蛋白质或其部分,例如肽、脂质、碳水化 合物)或由生物材料诸如细菌、植物、真菌或动物(特别是哺乳动物)细胞或组 织制备的提取物。剂包括例如其结构已知的剂和其结构未知的剂。
“患者”、“受试者”或“个体”可互换使用,指人或非人动物。这些术语包 括哺乳动物,诸如人、灵长类动物、家畜动物(包括牛、猪等)、伴侣动物(例如, 犬科动物、猫科动物等)和啮齿动物(例如,小鼠和大鼠)。
“治疗”疾患或患者是指采取步骤以获得有益或期望的结果,包括临床结果。 如本文中所用以及本领域所充分理解的,“治疗”是用于获得有益的或期望的结 果,包括临床结果的方法。有益的或期望的临床结果可包括但不限于缓解或改善 一种或多种症状或疾患、减轻疾病程度、稳定(即不恶化)疾病状态、防止疾病传 播、延迟或减慢疾病进展、改善或减轻疾病状态以及缓解(无论是部分还是完全), 无论是可检测的还是不可检测的。“治疗”还可意指与未接受治疗的预期生存期相 比延长生存期。
术语“预防”是本领域公认的,并且当与疾患诸如局部复发(例如,疼痛)、疾 病诸如癌症、综合征(syndrome complex)诸如心力衰竭或任何其它医学病症相关 时,在本领域中是公知的,并且包括施用组合物,所述组合物相对于未接受所述 组合物的受试者减少受试者中医学疾患症状的频率或延迟其发作。因此,癌症的 预防包括例如根据统计学上和/或临床上显著的量,例如,相对于未治疗的对照 群体,减少接受预防性治疗的患者群体中可检测的癌性生长的数量,和/或相对 于未治疗的对照群体,延迟治疗群体中可检测的癌性生长的出现。
向受试者“施用”物质、化合物或剂或物质、化合物或剂“的施用”可使用本领 域技术人员已知的多种方法之一来进行。例如,可通过静脉内、动脉内、皮内、 肌内、腹膜内、皮下、眼内、舌下、口服(通过摄入)、鼻内(通过吸入)、脊柱内、 大脑内和经皮肤(通过吸收,例如通过皮肤导管)施用化合物或剂。化合物或剂还 可适当地通过可再装填或可生物降解的聚合物装置或其它装置(例如,贴片和泵 或制剂)引入,所述装置提供化合物或剂的延长、缓慢或受控释放。施用还可例 如进行一次、多次和/或在一个或多个延长的时期内进行。
向受试者施用物质、化合物或剂的适当方法还将取决于例如受试者的年龄和 /或身体状况以及化合物或剂的化学和生物性质(例如,溶解度、消化率、生物利 用度、稳定性和毒性)。在一些实施方案中,化合物或剂通过口服施用,例如通 过摄入向受试者施用。在一些实施方案中,口服施用的化合物或剂是缓释制剂或 缓慢释放制剂,或使用用于这种缓慢或延长释放的装置施用。
如本文中所用,短语“联合施用”是指两种或多种不同治疗剂的任何施用形 式,所述施用形式使得在先前施用的治疗剂在体内仍有效的同时施用第二种剂 (例如,两种剂在患者体内同时有效,这可包括两种剂的协同作用)。例如,不同 的治疗性化合物可以在同一制剂中施用或以单独的制剂同时或依次施用。因此, 接受这种治疗的个体可受益于不同治疗剂的联合作用。
药物或剂的“治疗有效量”或“治疗有效剂量”是指当向受试者施用时将具有 预期治疗效果的药物或剂的量。一个剂量的施用不一定产生完全的治疗效果,完 全的治疗效果只有在一系列剂量施用后才可能产生。因此,可以一次或多次施用 治疗有效量。受试者所需的精确有效量将取决于,例如,受试者的体型大小、健 康状况和年龄,以及所治疗疾患的性质和程度,诸如癌症或MDS。熟练技术人 员可通过常规实验容易地确定给定状况下的有效量。
如本文中所用,术语“烯基”是指含有至少一个双键的脂肪族基团,并旨 在包括“未取代的烯基”和“取代的烯基”,后者是指在烯基的一个或多个碳上 具有取代氢的取代基的烯基部分。此类取代基可出现在包含在或未包含在一 个或多个双键中的一个或多个碳上。此外,如下文所论述,此类取代基包括 所有设想用于烷基的取代基,除非稳定性是禁止的。例如,设想了一个或多 个烷基、碳环基、芳基、杂环基或杂芳基对烯基的取代。
“烷基”基团或“烷烃”是完全饱和的直链或支链非芳族烃。通常,除非另 有定义,否则直链或支链烷基具有1至约20个碳原子,优选1至约10个碳 原子。直链和支链烷基的实例包括甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、 仲丁基、叔丁基、戊基、己基、戊基和辛基。C1-C6直链或支链烷基也称为“低 级烷基”。
此外,如说明书、实施例和权利要求通篇中所用,术语“烷基”(或“低级 烷基”)旨在包括“未取代的烷基”和“取代的烷基”,其后者是指在烃主链的一 个或多个碳上具有替代氢的取代基的烷基部分。如果没有另外说明,此类取 代基可包括例如卤素(例如,氟)、羟基、羰基(诸如羧基、烷氧基羰基、甲酰 基或酰基)、硫代羰基(诸如硫酯、硫代乙酸酯或硫代甲酸酯)、烷氧基、磷酰 基、磷酸酯、膦酸酯、次膦酸酯、氨基、酰氨基、脒、亚胺、氰基、硝基、叠氮基、巯基、烷硫基、硫酸酯、磺酸酯、氨磺酰基(sulfamoyl)、磺酰氨基 (sulfonamido)、磺酰基(sulfonyl)、杂环基、芳烷基或芳族或杂芳族部分。在 优选实施方案中,取代的烷基上的取代基选自C1-6烷基、C3-6环烷基、卤素、 羰基、氰基或羟基。在更优选实施方案中,取代的烷基上的取代基选自氟、 羰基、氰基或羟基。本领域技术人员将理解,如果合适,烃链上取代的部分 本身可以被取代。例如,取代的烷基的取代基可包括取代和未取代形式的氨基、叠氮基、亚氨基、酰氨基、磷酰基(包括膦酸酯和次膦酸酯)、磺酰基(包 括硫酸酯、亚磺酰氨基(sulfonamido)、氨磺酰基和磺酸酯)和甲硅烷基,以及 醚、烷硫基、羰基(包括酮、醛、羧酸酯和酯)、-CF3、-CN等。下面描述示 例性取代的烷基。环烷基可进一步被烷基、烯基、烷氧基、烷硫基、氨基烷 基、羰基取代的烷基、-CF3、-CN等取代。
当与化学部分诸如酰基、酰氧基、烷基、烯基、炔基或烷氧基结合使用 时,术语“Cx-y”意指包括链中含有x至y个碳的基团。例如,术语“Cx-y烷基” 是指取代或未取代的饱和烃基,包括链中含有x至y个碳的直链烷基和支链 烷基,包括卤代烷基。优选的卤代烷基包括三氟甲基、二氟甲基、2,2,2-三 氟乙基和五氟乙基。C0烷基表示氢(当基团位于末端位置时),如果位于内部 则表示键。术语“C2-y烯基”和“C2-y炔基”是指在长度和可能的取代方面与上 述烷基类似,但分别含有至少一个双键或三键的取代或未取代的不饱和脂族 基团。
如本文中所用,术语“酰胺”是指其中
Figure BDA0003089692190000121
每个RA独立地表示氢或烃基,或两个RA与它们所连接的N原子一起构成 环结构中具有4-8个原子的杂环的基团。
术语“胺”和“氨基”是本领域公认的,并且是指未取代的和取代的胺及其盐, 例如可以由下式表示的部分
Figure BDA0003089692190000122
其中每个RA独立地表示氢或烃基,或两个RA与它们所连接的N原子一起 构成环结构中具有4-8个原子的杂环。
如本文中所用,术语“芳基”包括取代或未取代的单环芳族基团,其中环的每 个原子是碳。优选地,所述环是6元或10元环,更优选为6元环。术语“芳基” 还包括具有两个或更多个环的多环环体系,其中两个或更多个碳对于两个邻接的 环是共同的,其中至少一个环是芳族的,例如,另外的环可以是环烷基、环烯基、 环炔基、芳基、杂芳基和/或杂环基。芳基包括苯、萘、菲、苯酚、苯胺等。
“环烷基”基团为完全饱和的环烃。“环烷基”包括单环和双环环。通常,除非 另有定义,否则单环烷基具有3至约10个碳原子,更常见地为3至8个碳原子。 双环环烷基的第二环可选自饱和环、不饱和环和芳族环。环烷基包括其中在两个 环之间共有一个、两个或三个或更多个原子的双环分子。术语“稠合环烷基”是指 其中每个环与另一个环共有两个相邻原子的双环环烷基。稠合双环环烷基的第二 环可选自饱和环、不饱和环和芳族环。“环烯基”基团为含有一个或多个双键的环 状烃。
如本文中所用,术语“卤代”和“卤素”意指卤素,包括氯、氟、溴和碘。
术语“杂芳基(heteroaryl)”和“杂芳基(hetaryl)”包括取代或未取代的芳族单环结构,优选5至7元环,更优选5至6元环,其环结构包括至少一个杂原子,优 选1至4个杂原子,更优选1或2个杂原子。术语“杂芳基(heteroaryl)”和“杂芳基 (hetaryl)”还包括具有两个或更多个环的多环环体系,其中两个或更多个碳对于两 个邻接的环是共同的,其中至少一个环是杂芳族的,例如,另外的环可以是环烷 基、环烯基、环炔基、芳基、杂芳基和/或杂环基。杂芳基包括例如吡咯、呋喃、 噻吩、咪唑、噁唑、噻唑、吡唑、吡啶、吡嗪、哒嗪和嘧啶等。
如本文中所用,术语“杂原子”意指除碳或氢外的任何元素的原子。优选杂原 子是氮、氧和硫。
术语“杂环基”、“杂环”和“杂环的”是指取代或未取代的非芳族环结构,优选 为3元至10元环,更优选为3元至7元环,其环结构包括至少一个杂原子,优 选1至4个杂原子,更优选1或2个杂原子。术语“杂环基”和“杂环的”还包括具 有两个或更多个环的多环环体系,其中两个或更多个碳对于两个邻接的环是 共同的,其中至少一个环是杂环的,例如,另外的环可以是环烷基、环烯基、 环炔基、芳基、杂芳基和/或杂环基。杂环基包括例如哌啶、哌嗪、吡咯烷、 四氢吡喃、四氢呋喃、吗啉、内酯类、内酰胺类等。
当与化学部分诸如酰基、酰氧基、烷基、烯基、炔基或烷氧基结合使用 时,术语“低级”意指包括其中取代基中有十个或更少,优选六个或更少的非 氢原子的基团。例如,“低级烷基”是指含有十个或更少,优选六个或更少碳 原子的烷基。在某些实施方案中,本文定义的酰基、酰氧基、烷基、烯基、 炔基或烷氧基取代基分别为低级酰基、低级酰氧基、低级烷基、低级烯基、 低级炔基或低级烷氧基,无论它们单独出现还是与其它取代基组合出现,诸如在羟基烷基和芳烷基的叙述中(在该情况下,例如当计算烷基取代基中的 碳原子数时,不计算芳基中的原子数)。
术语“取代的”是指在主链的一个或多个碳上具有替代氢的取代基的部 分。应当理解,“取代”或“被取代的”包括隐含的条件,即这种取代与被取代 的原子和取代基的允许价一致,并且取代产生稳定的化合物,例如,其不会 自发地经历诸如通过重排、环化、消除等的转化。如本文中所用,设想了术 语“取代的”包括有机化合物的所有可允许的取代基。在广泛方面,可允许的 取代基包括有机化合物的无环和环状、支化和非支化、碳环和杂环、芳族和 非芳族取代基。对于适当的有机化合物,可允许的取代基可以是一个或多个 以及可以相同或不同。为了本发明的目的,杂原子诸如氮可具有氢取代基和 /或满足杂原子的价态的本文所述有机化合物的任何可允许的取代基。取代 基可包括本文所述的任何取代基,例如卤素、羟基、羰基(诸如羧基、烷氧 基羰基、甲酰基或酰基)、硫代羰基(诸如硫酯、硫代乙酸酯或硫代甲酸酯)、 烷氧基、磷酰基、磷酸酯、膦酸酯、次膦酸酯、氨基、酰氨基、脒、亚胺、 氰基、硝基、叠氮基、巯基、烷硫基、硫酸酯、磺酸酯、氨磺酰基、磺酰氨 基、磺酰基、杂环基、芳烷基或芳族或杂芳族部分。在优选实施方案中,取 代的烷基上的取代基选自C1-6烷基、C3-6环烷基、卤素、羰基、氰基或羟基。 在更优选实施方案中,取代的烷基上的取代基选自氟、羰基、氰基或羟基。 本领域技术人员将理解,如果合适,取代基本身可以被取代。除非特别指出 为“未取代的”,否则本文中提及的化学部分应理解为包括取代的变体。例如, 提及“芳基”基团或部分隐含地包括取代的和未取代的变体。
“保护基团”是指当与分子中的反应性官能团连接时,掩蔽、降低或阻止 该官能团的反应性的一组原子。通常,在合成过程中可以根据需要选择性地 除去保护基团。保护基团的实例可见于Greene和Wuts,Protective Groups in Organic Chemistry,第3版,1999,John Wiley&Sons,NY和Harrison等人, Compendium of Synthetic Organic Methods,第1-8卷,1971-1996,John Wiley &Sons,NY。代表性氮保护基团包括但不限于甲酰基、乙酰基、三氟乙酰基、 苄基、苄氧基羰基(“CBZ”)、叔丁氧羰基(“Boc”)、三甲基甲硅烷基(“TMS”)、2-三甲基甲硅烷基-乙磺酰基(“TES”)、三苯甲基和取代的三苯甲基、烯丙氧基羰基、9-芴甲氧羰基(“FMOC”)、硝基-藜芦基氧羰基(“NVOC”)等。代表性羟基保护 基团包括但不限于其中羟基被酰化(酯化)或烷基化的那些,诸如苄基醚和三苯甲 基醚,以及烷基醚、四氢吡喃基醚、三烷基甲硅烷基醚(例如,TMS或TIPS基 团)、乙二醇醚,诸如乙二醇和丙二醇衍生物和烯丙基醚。
如本文中所用,术语“调节”包括功能或活性(诸如细胞增殖)的抑制或压制以 及功能或活性的增强。
短语“药学上可接受的”是本领域公认的。在某些实施方案中,该术语包括组 合物、赋形剂、佐剂、聚合物和其它材料和/或剂型,其在合理的医学判断范围 内,适合用于与人类和动物的组织接触,而没有过度的毒性、刺激、过敏反应或 其它问题或并发症,与合理的效益/风险比相称。
“药学上可接受的盐”或“盐”在本文中用于指适用于患者治疗或与患者治疗 相容的酸加成盐或碱加成盐。
如本文中所用,术语“药物可接受的酸加成盐”意指由式I表示的任何碱化合 物的任何无毒有机或无机盐。形成合适盐的示例性无机酸包括盐酸、氢溴酸、硫 酸和磷酸,以及金属盐诸如正磷酸单氢钠和硫酸氢钾。形成合适盐的示例性有机 酸包括单羧酸、二羧酸和三羧酸,诸如乙醇酸、乳酸、丙酮酸、丙二酸、琥珀酸、 戊二酸、富马酸、苹果酸、酒石酸、柠檬酸、抗坏血酸、马来酸、苯甲酸、苯乙 酸、肉桂酸和水杨酸以及磺酸,诸如对甲苯磺酸和甲磺酸。可形成单酸盐或二酸 盐,并且此类盐可以以水合、溶剂化或基本无水的形式存在。一般而言,式I的 化合物的酸加成盐与其游离碱形式相比在水和各种亲水有机溶剂中更易溶解,并 且通常显示出更高的熔点。合适的盐的选择是本领域技术人员已知的。其它非学 上可接受的盐,例如草酸盐,可用于例如分离供实验室使用或随后转化为药学上 可接受的酸加成盐的式I的化合物。
如本文中所用,术语“药物可接受的碱性加成盐”意指式I所示的任何酸化合 物或其任何中间体的任何无毒有机或无机碱加成盐。形成合适盐的示例性无机碱 包括氢氧化锂、氢氧化钠、氢氧化钾、氢氧化钙、氢氧化镁或氢氧化钡。形成合 适盐的示例性有机碱包括脂肪族、脂环族或芳香族有机胺,诸如甲胺、三甲胺和 甲基吡啶或氨。合适的盐的选择是本领域技术人员已知的
在本公开的方法和组合物中有用的许多化合物在其结构中具有至少一个立 构中心(stereogenic center)。该立构中心可以以R或S构型存在,所述R和S符 号按PureAppl.Chem.(1976),45,11-30中描述的规则使用。本公开设想了化合物、 其盐、前药或混合物的所有立体异构形式,诸如对映异构体和非对映异构体形式 (包括所有可能的立体异构体混合物)。参见,例如,WO 01/062726。
此外,某些含有烯基的化合物可以以Z(同侧(zusammen))或E(异侧 (entgegen))异构体的形式存在。在每种情况下,本公开包括混合物和单独的各异 构体。
所述化合物中的一些还可以以互变异构形式存在。尽管在本文所述的公式中 未明确指出,但此类形式意欲包含在本发明的范围内。
“前药”或“药学上可接受的前药”是指施用后在宿主中代谢(例如水解或 氧化)以形成本公开的化合物(例如,式I化合物)的化合物。前药的典型实例 包括在活性化合物的功能部分上具有生物不稳定或可裂解(保护)基团的化 合物。前药包括可被氧化、还原、胺化、脱氨基、羟基化、脱羟基化、水解、 脱水、烷基化、脱烷基化、酰化、脱酰化、磷酸化或脱磷酸化以产生活性化 合物的化合物。在美国专利6,875,751、7,585,851和7,964,580中公开了使用 酯或氨基磷酸酯作为生物不稳定或可裂解(保护)基团的前药的实例,所述美 国专利的公开内容通过引用并入本文。本公开的前药被代谢以产生式I的化 合物。本公开在其范围内包括本文所述化合物的前药。选择和制备合适的前 药的常规程序描述于例如“Design of Prodrugs”H.Bundgaard编辑,Elsevier, 1985中。
如本文中所用,短语“药学上可接受的载体”意指药学上可接受的材料、 组合物或媒介物,诸如液体或固体过滤器、稀释剂、赋形剂、溶剂或用于配 制药用或治疗用途的药物的包封材料。
术语“异常细胞生长”和“增殖性病症”在本申请中可互换使用。除非另有 说明,否则如本文中所用,“异常细胞生长”是指不依赖于正常调控机制(例 如,失去接触抑制)的细胞生长。这包括,例如,以下的异常生长:(1)通过 表达突变的酪氨酸激酶或过表达受体酪氨酸激酶而增殖的肿瘤细胞(多个肿 瘤);(2)其中发生异常酪氨酸激酶激活的其它增殖性疾病的良性和恶性细胞; (3)通过受体酪氨酸激酶增殖的任何肿瘤;(4)通过异常丝氨酸/苏氨酸激酶激 活而增殖的任何肿瘤;和(5)其中发生异常丝氨酸/苏氨酸激酶激活的其它增 殖性疾病的良性和恶性细胞。
术语“癌症”和“癌性”是指或描述哺乳动物中特征通常在于细胞生长不 受调控的生理状况。“肿瘤”包含一个或多个癌细胞。癌症的实例包括但不限 于癌、淋巴瘤、母细胞瘤、肉瘤和白血病或淋巴样恶性肿瘤(lymphoid malignancies)。此类癌症的更特定实例包括鳞状细胞癌(例如,上皮鳞状细胞 癌)、包括小细胞肺癌、非小细胞肺癌(“NSCLC”)、肺腺癌和肺鳞状细胞癌在 内的肺癌、腹膜癌、肝细胞癌、包括胃肠癌在内的胃癌(gastriccancer)或胃 癌(stomach cancer)、胰腺癌、胶质母细胞瘤、宫颈癌、卵巢癌、肝癌、膀胱癌、肝瘤、乳腺癌、结肠癌、直肠癌、结直肠癌、子宫内膜癌或子宫癌、唾 液腺癌、肾癌(kidney cancer)或肾癌(renal cancer)、前列腺癌、外阴癌、甲状 腺癌、肝癌、肛门癌、阴茎癌、急性白血病以及头/脑和颈癌。
本发明的化合物和缀合物
式(I)的化合物
本发明提供具有式(I)的结构的化合物:
Figure BDA0003089692190000161
或其药学上可接受的盐,
其中:
A1和A2各自独立地表示杂环,优选为五元环,任选地与一个或多个芳基环 或杂芳基环稠合;
R1和R2各自独立地为烷基,优选为低级烷基;
Z1为亚甲基或连接基团;并且
n1和n2各自独立地为值为1至5的整数。
在一些实施方案中,A1选自:
Figure BDA0003089692190000162
其中:
RA1a为H、烷基、烯基、环烷基、杂环烷基、芳基或杂芳基;
RA1b为CHRA1ba
RA1ba为H、卤素、烷基、-CO2-烷基、CHO或CO2H;
Ar1为芳基或杂芳基,优选为六元芳基或杂芳基,任选地被卤素、羟基、氰 基、硝基、烷基、卤代烷基、环烷基、羧基、氨基、芳基或杂芳基取代一次或多 次;并且
o为值为1或2的整数;并且
p为值为0至5的整数。
在一些此类实施方案中,Ar1为任选被一个或多个RA1c取代的芳基或杂芳基, 其中RA1c为卤素、OH、CN、NO2、烷基、烷氧基、CO2H、CO2-烷基或(CH2)pN(RA1ca)2; 每个RA1ca独立地选自H或烷基;并且p为值为0至5的整数。
在一些实施方案中,A1
Figure BDA0003089692190000163
其中W1为CRW1或N;且RW1为H、 烷基或环烷基。
在一些实施方案中,A1
Figure BDA0003089692190000164
其中每个W2为独立地为CRA1aa或N;并且RA1aa为H、OH、烷基、烷氧基、烷基氨基或二烷基氨基。
在一些实施方案中,A1
Figure BDA0003089692190000171
Figure BDA0003089692190000172
在一些这样的实施方案中,A1
Figure BDA0003089692190000173
在优选的此类 实施方案中,A1
Figure BDA0003089692190000174
在一些实施方案中,A2
Figure BDA0003089692190000175
其中:
RA2a为H、烷基、烯基、环烷基、杂环烷基、芳基或杂芳基;
RA2b为CHRA2ba
RA2ba为H、卤素、烷基、-CO2-烷基、CHO或CO2H;
Ar2为芳基或杂芳基,优选为六元芳基或杂芳基,任选地被一个或多个 RA2c取代;
RA2c为卤素、OH、CN、NO2、烷基、烷氧基、CO2H、CO2-烷基、或 (CH2)rN(RA2ca)2
每个RA2ca独立地选自H或烷基;
q为值为1或2的整数;并且
r为值为0至5的值的整数。
在一些实施方案中,A2
Figure BDA0003089692190000176
其选自
Figure BDA0003089692190000177
Figure BDA0003089692190000178
其中:
W3是CRW3或N,条件是不超过三个W4为N,优选不超过一个W4为 N;
RW3为H、烷基或环烷基;
每个W4独立地为CRA2aa或N;并且
RA2aa为H、OH、烷基、烷氧基、烷基氨基或二烷基氨基。
在一些实施方案中,A2
Figure BDA0003089692190000181
其中每个W4独立地为CRA2aa或N;并且RA2aa为H、OH、烷基、烷氧基、烷基氨基或二烷基氨基。
在一些实施方案中,A2
Figure BDA0003089692190000182
Figure BDA0003089692190000183
在一些此类实施方案中,A2
Figure BDA0003089692190000184
在优选的此类实施 方案中,A2
Figure BDA0003089692190000185
在某些实施方案中,式(I)的化合物是具有式(Ia)、(Ib)或(Ic)的结构的化合物:
Figure BDA0003089692190000186
或其药学上可接受的盐,其中:
RA1aa和RA2aa各自独立地为H、OH、烷基、烷氧基、烷基氨基或二烷基氨 基;
RA1b为CHRA1ba
RA1ba为H、卤素、烷基、-CO2-烷基、CHO或CO2H;
RA2b为CHRA2ba
RA2ba为H、卤素、烷基、-CO2-烷基、CHO或CO2H;
Ar1为芳基或杂芳基,优选为六元芳基或杂芳基,任选地被卤素、羟基、 氰基、硝基、烷基、卤代烷基、环烷基、羧基、氨基、芳基或杂芳基取代一 次或多次;
RA1c为卤素、OH、CN、NO2、烷基、烷氧基、CO2H、CO2-烷基或 (CH2)pN(RA1ca)2
每个RA1ca独立地选自H或烷基;
Ar2为芳基或杂芳基,优选为六元芳基或杂芳基,任选地被卤素、羟基、 氰基、硝基、烷基、卤代烷基、环烷基、羧基、氨基、芳基或杂芳基取代一 次或多次;
RA2c为卤素、OH、CN、NO2、烷基、烷氧基、CO2H、CO2-烷基、或 (CH2)rN(RA2ca)2
每个RA2ca独立地选自H或烷基;
o和q为各自独立地具有1或2的值的整数。
在一些此类实施方案中,Ar1为任选地被一个或多个RA1c取代的芳基或 杂芳基,其中RA1c为卤素、OH、CN、NO2、烷基、烷氧基、CO2H、CO2- 烷基或(CH2)pN(RA1ca)2;每个RA1ca独立地选自H或烷基;并且p为值为0 至5的整数。类似地,在某些实施方案中,Ar2是任选地被一个或多个RA1c取代的芳基或杂芳基,其中RA2c是卤素、OH、CN、NO2、烷基、烷氧基、 CO2H、CO2-烷基或(CH2)rN(RA2ca)2;每个RA2ca独立地选自H或烷基;并且 r为值为0至5的整数。
在一些实施例中,R1和R2相同。在优选实施方案中,R1和R2为甲基。
在一些实施方案中,Z1提供用于缀合的胺或酚。因此,在某些此类实施 方案中,例如,Z1包括氨基、羟基取代的芳基或含氮杂芳基,并且可任选地 被进一步取代。在其它此类实施方案中,RY1a或RZ1a提供用于缀合的胺或酚。 例如,RZ1a可选自氨基(例如,烷基取代的氨基)、羟基取代的芳基或含氮杂 芳基,并且可任选地被进一步取代。
在某些实施方案中,Z1为亚甲基。
在其它实施方案中,Z1
Figure BDA0003089692190000191
其中:
Y1为CRY1或N,优选地其中只有一个Y1为N;
RY1为H、羟基、氨基、酰氨基或(CH2)y(RY1a);
RY1a为氨基(例如,仲氨基或叔氨基)、芳基(例如,苯基)或杂芳基;
Y为值为1至约10的整数。在优选实施方案中,Z1
Figure BDA0003089692190000192
其 中RZ1不存在、为羟基、氨基、酰氨基或(CH2)z(RZ1a);并且RZ1a为氨基(例 如,仲氨基或叔氨基)、芳基或杂芳基;并且z为值为0至约10的整数。
在更优选实施方案中,Z1
Figure BDA0003089692190000201
Figure BDA0003089692190000202
在其它实施方案中,Z1
Figure BDA0003089692190000203
其中:
Y2为CRY2或N;
RY2为H或烷基,优选为低级烷基;
RZ2为(CH2)zRZ2a
RZ2a为氨基(例如,仲氨基或叔氨基)、芳基(例如苯基)或杂芳基;并且 z为值为0至约10的整数。
在某些优选实施方案中,Z1
Figure BDA0003089692190000204
在某些实施方案中,式(I)的化合物选自:
Figure BDA0003089692190000205
Figure BDA0003089692190000211
或其药学上可接受的盐。
式(I)的缀合物
在一些实施方案中,本文提供包了含式(I)的化合物、可切割的接头和靶 向剂的缀合物,其中可切割的接头将化合物可切割地连接至靶向剂。在优选 实施方案中,靶向剂是细胞结合剂。在一些实施方案中,接头包含在预定条 件下经历化学反应(例如,物理化学反应和/或生物反应)以释放亲核杂原子的 官能团,和位于亲核杂原子附近的SO2官能团。在优选实施方案中,SO2官 能团在分子内环化反应中与亲核杂原子反应以释放活性剂。在一些实施方案 中,缀合物还包含对所需靶受体或与靶细胞相关联的其它分子具有结合特异 性的靶向部分(例如,寡肽、多肽、抗体等)。
式(II)、(IIa)和(IIb)的化合物
本文还提供了具有式(II)、(IIa)和(IIb)结构的化合物
Figure BDA0003089692190000212
Figure BDA0003089692190000221
或其药学上可接受的盐,
其中:
A1和A2各自独立地表示杂环,优选为五元环或六元环,任选地与芳基环或 杂芳基环稠合或被芳基环或杂芳基环取代;
R1和R2各自独立地为烷基;
Z1为连接基团;并且
n1和n2各自独立地为值为1至5的整数。
Z2不存在或为连接基团;
L1为通过选自O、S和N(优选为O或N)的杂原子与SO2附接的连接基团, 并且被选择为使得L1与SO2之间的键的断裂促进L1与Z1之间的键断裂以释放活 性剂;
X1为-O-、-CRb 2-或-NRa-,优选为-O-;
Ar表示环,诸如芳基、杂芳基、环烷基或杂环烷基,优选为芳基或杂芳基;
Y1为-(CRb 2)yN(Ra)-、-(CRb 2)yO-或-(CRb 2)yS-,被定位为使得如果y为1,则 N、O或S原子与TG附接;其中X1和Y1位于Ar的相邻原子上;
TG为触发基团,当被激活时生成能够与SO2反应替代Z并形成包括X-SO2和Ar的居间原子的5-6元环的N、O或S原子;
w和x各自独立地为值为0或1的整数;
每个Ra为氢或低级烷基;
每个Rb独立地为氢或低级烷基;或者
两个Rb与它们所附接的碳原子一起形成3-5元环,优选3-4元环;并且
y为值为1至约10的整数。
在一些实施方案中,X1为-O-。
在其它实施方案中,Ar为芳基。在优选实施方案中,Ar为苯基或萘基。
在又一其它实施方案中,Z2为连接基团,其包含一个或多个选自以下的基团: 异腈、异硫氰酸酯、2-吡啶基二硫化物、卤代乙酰胺(-NHC(O)CH2-卤代)、马来 酰亚胺、二烯、烯烃、卤化物、甲苯磺酸根(TsO-)、醛、磺酸根(R-SO3 -)、
Figure BDA0003089692190000222
膦酸(-P(=O)(OH)2)、酮、C8-C10环炔基、-OH、-NHOH、-NHNH2、-SH、羧酸(-COOH)、乙炔(-C≡CH)、叠氮化 物(-N3)、氨基(-NH2)、磺酸(-SO3H)、炔酮衍生物(-C(O)C≡C-Ra)和磷酸二氢酯(-OP(=O)(OH)2)。
在其它实施方案中,x为0。
在各种实施方案中,式(II)、(IIa)和(IIb)的变量与上述式(I)中定义的相同。
在美国临时申请第62/597,226号中提供了缀合物、连接基团、触发基团 等的其它实施方案,所述美国临时申请通过引用特此整体并入。
活性剂的释放
如上所述,在某些实施方案中,本文公开的化合物和缀合物能够通过激 活触发基团的化学反应之后的分子内环化反应来解离由式(II)表示的一种或 多种活性剂。在某些实施方案中,化学反应是物理化学反应和/或生物化学 反应。
在一些实施方案中,本文公开的化合物和缀合物包含在Ar上相对于 X(例如,O)的相邻原子处引入的亲核官能团(Y或Y’)。通常,亲核官能团被 触发基团(TG)掩蔽,如下文进一步详述。激活后,触发基团释放亲核官能团, 与附近的SO2部分发生分子内环化反应,最终释放一种或多种式(II)、(IIa) 或(IIb)和化合物。在一些此类实施方案中,一种或多种活性剂在化学反应、 物理化学反应和/或生物化学反应之后通过分子内环化反应释放(参见例如反 应方案1),或者活性剂在分子内环化反应之后通过1,6-消除或1,4-消除释放(参见例如反应方案2)。
例如,当Y为-Y'-TG且Q与SO2基团直接缀合时,可通过反应方案1 中所示的机制释放活性剂:
反应方案1
Figure BDA0003089692190000231
当Q为
Figure BDA0003089692190000232
时,可通过反应方案2所示的机制释放 Q1
反应方案2
Figure BDA0003089692190000241
在一些实施方案中,释放时的Q1是包含至少一个选自-OH、-NH-、-SH和 –COOH的官能团的活性剂。根据这些实施方案,如本文进一步描述的,Q1通过 -OH、-NH-、-SH和–COOH,例如通过选自酯、酰胺、硫酯、氨基甲酸酯、脲、 肟、腙等的官能团与本文所述的化合物缀合。在一些此类实施方案中,使用Q2代替Q1,并且Q2为含胺基的药物。在其它实施方案中,Q2为能够与铵单元结合 的活性剂。在其它实施方案中,当释放Q2释放物时,Q2能够以其具有胺基的原 始形式解离,其中活性剂可以是药物、毒素、亲和配体、用于检测的探针或其组 合。
在一些实施方案中,本文公开的化合物和缀合物是在化学和生理方面稳定 的。在一些此类实施方案中,本文公开的化合物和缀合物在血液中几乎没有活性 剂解离的状态下到达所需靶细胞,从而选择性地释放药物。
触发基团(TG)
在一些实施方案中,本发明的缀合物包括触发基团(TG)。TG为能够通过化 学反应诸如生物反应裂解,优选选择性裂解的基团。通常,触发基团用于掩蔽Y 或Y’基团的亲核性质,从而为本文公开的化合物和缀合物提供稳定性(例如,通 过阻止缀合物在到达靶位置或经历预定触发条件之前自蚀(self-immolation)或分 子内环化)。激活后,触发基团释放亲核Y基团,并允许发生自蚀或分子内环化, 如上所述的。
在一些实施方案中,TG包含可被TEV、胰蛋白酶、凝血酶、组织蛋白酶B、 组织蛋白酶D、组织蛋白酶K、半胱天冬酶1、基质金属蛋白酶(MMP)等识别的 序列(诸如肽序列)或部分,其可被酶(例如,氧化还原酶、转移酶、水解酶、裂解 酶、异构酶、连接酶等)水解和/或可包括选自磷酸二酯、磷脂、酯、β-半乳糖、β- 葡萄糖、岩藻糖、寡糖等的部分。
在一些实施方案中,TG包含可在亲核试剂条件下裂解的反应性化学部 分或官能团(例如,甲硅烷基醚、2-N-酰基硝基苯磺酰胺、不饱和乙烯基硫 化物、激活后的磺酰胺、丙二醛-吲哚衍生物、乙酰丙酸酯(levulinoyl ester)、 腙或酰基腙)。
在一些实施方案中,TG可包含可在碱性试剂条件下裂解的反应性化学 部分或官能团(例如,2-氰乙基酯、乙二醇基二琥珀酸酯(ethylene glycolyl disuccinate)、2-磺酰基乙基酯、烷基硫代酯或噻吩基酯)。
在一些实施方案中,TG可包含可通过光照射裂解的反应性化学部分或 官能团(例如,2-硝基苄基衍生物、苯酰基酯、8-喹啉基苯磺酸酯、香豆素、 磷酸三酯、双芳基腙或双满双硫代丙酸衍生物(bimane bi-thiopropionic acid derivative))。
在一些实施方案中,TG可包含可被还原剂条件裂解的反应性化学部分 或官能团(例如,羟胺、二硫化物、乙酰丙酸酯、硝基或4-硝基苄基衍生物)。
在一些实施方案中,TG可包含可使用酸性条件裂解的反应性化学部分 或官能团(例如,糖、叔丁基氨基甲酸酯类似物、二烷基或二芳基二烷氧基 硅烷、原酸酯、缩醛、乌头基、腙、β-硫代丙酸酯、氨基磷酸酯、亚胺、三 苯甲基、乙烯基醚、聚缩酮和2-(二苯基膦基)苯甲酸烷基酯衍生物;烷基酯、 8-羟基喹啉酯和吡啶甲酸酯)。
在一些实施方案中,TG可包含可在氧化条件下裂解的反应性化学部分 或官能团(例如,硼酸盐、邻二醇、对甲氧基苄基衍生物或硒化合物)。
在某些优选实施方案中,TG包含糖,其可在酸性或酶促条件下裂解。 在某些优选实施方案中,触发基团为-NO2,其可在还原条件下裂解。在某些 优选的实施方案中,触发基团是硼酸盐,其可在氧化条件下裂解。在某些优 选实施方案中,触发基团为酯,其可在酸性、碱性或酶促条件下裂解。在某 些优选实施方案中,触发基团为腙,其可在亲核条件或酸性条件下裂解。在 某些优选实施方案中,触发基团为羟胺,其可在还原条件下裂解。
糖类触发基团
在一些实施方案中,本文公开的化合物和缀合物包含糖触发基团,例如 选自以下的触发基团:
Figure BDA0003089692190000251
Figure BDA0003089692190000261
其中每个R21独立地为氢或经选择使得O-R21为羟基保护基团(例如,乙酰 基);且R22为氢或低级烷基(例如,C1–C6-烷基)。在某些实施方案中,羟基保护 基团能够用于有机合成,包括但不限于:甲基醚、甲氧基甲基醚、甲基硫代甲基 醚、2-甲氧基乙氧基甲基醚、双(2-氯乙氧基)甲基醚、四氢吡喃基醚、四氢硫代 吡喃基醚、4-甲氧基四氢吡喃基醚、4-甲氧基四氢硫代吡喃基醚、四氢呋喃基醚、 1-乙氧基乙基醚、1-甲基-1-甲氧基乙基醚、2-(苯基硒基)乙基醚、叔丁基醚、烯 丙基醚、苄基醚、邻硝基苄基醚、三苯基甲基醚、α-萘基二苯基甲基醚、对甲氧 基苯基二苯基甲基醚、9-(9-苯基-10-氧代)蒽基醚、三甲基甲硅烷基醚、异丙基二 甲基甲硅烷基醚、叔丁基二甲基甲硅烷基醚、叔丁基二苯基甲硅烷基醚、三苄基 甲硅烷基醚、三异丙基甲硅烷基醚、甲酸酯、乙酸酯、三氯乙酸酯、苯氧基乙酸 酯、异丁酸酯、新戊酸酯、金刚烷酸酯、苯甲酸酯、2,4,6-三甲基苯甲酸酯、碳 酸甲酯、碳酸2,2,2-三氯乙酯、碳酸烯丙酯、碳酸对硝基苯酯、碳酸苄酯、碳酸 对硝基苄酯、S-苄基硫代碳酸酯、N-苯基氨基甲酸酯、硝酸酯、2,4-二硝基苯基 磺酸酯等,但不限于此。
作为触发基团的保护基团
在一些实施方案中,TG为能够被化学反应、物理化学反应和/或生物反应裂 解的基团。在某些实施方案中,TG为保护基团。在一些此类实施方案中,保护 基为胺基保护基团、醇保护基团或硫醇保护基。
胺保护基团
在某些实施方案中,胺保护基团是能够用于有机合成的一般保护基团,包括 但不限于:氨基甲酸间硝基苯酯、氨基甲酸3,5-二甲氧基苄酯、氨基甲酸邻硝基 苯酯、氨基甲酸苯基(邻硝基苯基)甲酯、氨基甲酸烷基酯、氨基甲酸9-芴基甲酯、 氨基甲酸2,2,2-三氯乙酯、氨基甲酸2-三甲基甲硅烷基乙酯(Teoc)、氨基甲酸叔 丁酯(Boc)、氨基甲酸乙烯酯(Voc)、氨基甲酸烯丙酯(Alloc)、氨基甲酸1-异丙基 烯丙酯(Ipaoc)、氨基甲酸8-喹啉酯、氨基甲酸N-羟基哌啶酯、氨基甲酸苄酯、 氨基甲酸对甲氧基苄酯、氨基甲酸对硝基苄酯、氨基甲酸二苯基甲酯、乙酰胺、 氯乙酰胺、三氯乙酰胺、苯基乙酰胺、苯甲酰胺、N-邻苯二甲酰亚胺、N-2,3-二 苯基马来酰亚胺、N-2,5-二甲基吡咯、N-1,1-二甲基硫代亚甲基胺、N-亚苄基胺、 苯亚磺酰胺、邻硝基苯亚磺酰胺、三苯基甲基亚磺酰胺、对甲苯磺酰胺、甲磺酰 胺等。但不限于此。
醇保护基团
在某些实施方案中,醇保护基团是能够用于有机合成的一般保护基团,其包 括但不限于:甲醚、甲氧基甲基醚(MOM醚)、苄基氧基甲基醚(BOM醚)、 2-(三甲基硅烷基)乙氧基甲基醚(SEM醚)、苯基硫代甲基醚(PTM醚)、2,2- 二氯-1,1-二氟乙基醚、对溴苯酰基醚、氯丙基甲基醚、异丙基醚、环己基醚、 4-甲氧基苄基、2,6-二氯苄基醚、4-(二甲基氨基羰基)苄基醚、9-蒽基甲醚、 4-甲基吡啶基醚、甲硫基甲基醚(MTM醚)、2-甲氧基乙氧基甲基醚(MEM醚)、 双(2-氯乙氧基)甲基醚、四氢吡喃基醚(THP醚)、四氢硫代吡喃基醚、4-甲 氧基四氢吡喃基醚、四氢呋喃基醚、1-乙氧基乙基醚、1-甲基-1-甲氧基乙基 醚、2-(苯基硒基)乙基醚)、叔丁基醚、烯丙基醚、苄基醚、邻硝基苄基醚、 三苯基甲基醚、α-萘基二苯基甲基醚、对-甲氧基苯基二苯基甲基醚、9-(9- 苯基-10-氧代)蒽基醚、三甲基甲硅烷基醚(TMS醚)、异丙基二甲基甲硅烷基 醚、叔丁基二甲基甲硅烷基醚(TBDMS醚)、叔丁基二苯基甲硅烷基醚、三 苄基甲硅烷基醚、三异丙基甲硅烷基醚、甲酸酯、乙酸酯、三氯乙酸酯、苯 氧基乙酸酯、异丁酸酯、新戊酸酯、金刚烷酸酯、苯甲酸酯、2,4,6-三甲基 苯甲酸(Mesitoate)酯、碳酸甲酯、碳酸2,2,2-三氯乙酯、碳酸烯丙酯、碳酸 对硝基苯酯、苄基碳酸酯、对硝基苄基碳酸酯、S-苄基碳酸酯、N-苯基氨基 甲酸酯、硝酸酯、2,4-二硝基苯基亚磺酸酯、二甲基膦酰酯(DMP酯)、二甲 基硫代膦酰酯(MPT酯)、甲磺酸芳基酯、甲苯磺酸芳基酯等,但不限于此。
巯基保护基
在某些实施方案中,硫醇保护基团能够用于有机合成,包括但不限于: S-苄基硫醚、S-对甲氧基苄基硫醚、S-邻或对羟基或乙酰氧基苄基硫醚、S- 对硝基苄基硫醚、S-4-吡啶甲基硫醚、S-2-吡啶甲基N-氧化物硫醚、S-9-蒽 基甲基硫醚、S-9-芴基甲基硫醚、S-甲氧基甲基单缩硫醛、A-乙酰基衍生物、 S-苯甲酰基衍生物、S-(N-乙基氨基甲酸酯)、S-(N-甲氧基甲基氨基甲酸酯) 等,但不限于此。
连接基团
在一些实施方案中,本文公开的化合物和缀合物包含通过共价键连接每 个CB与Ar的连接基团。典型的连接基团是稳定的、不可水解的部分,诸 如,例如C10–C100直链或支链、饱和或不饱和亚烷基。在某些实施方案中, 所述连接单元满足以下标准中的四个标准中的至少两个,更优选至少三个标 准:
(i)亚烷基部分中的至少一个-CH2-被一个或多个选自-NH-、-C(=O)、 -O-、-S-和-P-的杂原子取代(即被取代);
(ⅱ)至少一个杂亚芳基包含在亚烷基部分中;
(ⅲ)至少一个氨基酸部分、糖键、肽键或酰胺键包含在亚烷基部分中; 以及
(ⅳ)亚烷基可进一步被一个或多个选自由以下组成的组的取代基取 代:C1–C20烷基、C6–C20芳基C1–C8烷基、-(CH2)sCOOH和-(CH2)pNH2,其 中s为值为0至10的整数,并且p为值为1至约10的整数。
在某些实施方案中,所述连接单元包括以下中的至少两种,更优选至少三种:
(i)至少一种选自-NH-、-C(=O)、-O-、-S-和-P-的杂原子;
(ii)至少一种杂亚芳基;
(iii)至少一种氨基酸部分、糖键、肽键或酰胺键;以及
(ⅳ)亚烷基可进一步被一个或多个选自由以下组成的组的取代基取代: C1–C20烷基、C6–C20芳基C1–C8烷基、-(CH2)sCOOH和-(CH2)pNH2,其中s为值 为0至10的整数,并且p为值为1至约10的整数。
在其它实施方案中,连接每个CB和Ar的连接基团包含通过点击化学反应 产生的官能团。
在替代实施方案中,连接单元包含能够参与点击化学反应的反应性官能团。
点击化学反应是可在温和条件下进行的反应,并且对于在生物分子中不常见 的官能团(例如,叠氮化物基团、乙炔基团等)具有极高的选择性。因此,该反应 可在复合触发基团、靶向部分等存在的情况下进行。另外,点击化学具有高反应 特异性。例如,叠氮化物基团与乙炔基团之间的点击化学反应可选择性地进行, 而不受分子中存在的其它官能团的干扰。例如,叠氮化物-乙炔点击化学可以以 高产率提供三唑部分。
因此,在一些实施方案中,连接每个CB与Ar的连接基团包括
Figure BDA0003089692190000281
Figure BDA0003089692190000282
V可以是单键、-O-、-S-、-NR21-、-C(O)NR22-、 -NR23C(O)-、-NR24SO2-或-SO2NR25-,R21至R25可各自独立地为氢、(C1-C6)烷基、 (C1-C6)烷基(C6-C20)芳基或(C1-C6)烷基(C3-C20)杂芳基,r可为值为1至约10的整 数,p可为值为0至约10的整数,q可为值为1至约10的整数,并且L”可以是 单键。
在其它实施方案中,连接每个CB与Ar的连接单元是由式(A)表示的连接基 团:
**-Lc-Wb1-(CH2)b-Wa3-(P1)a-Y2-Wa2-Y1-Wa1-*
(A)
其中:
*为与CB的附接点;
**为与Ar的附着点;
Wa1、Wa2和Wa3各自独立地为-NH-、-C(=O-)或(-CH2-)b
Wb1为酰胺键或三唑烯;
P1为连接Wa3与Y2的接头,并且为氨基酸部分、肽键或酰胺键;
Lc为亚烷基;
Y2为单键、-Wa4-(CH2)c-Wb2-(CH2)d-Wa5-或-Wa6-(CH2)e-CReRf-X-;
Re为C1-C8烷基或CB-Wa7-Y3-Wc1-(CH2)f-;
Rf为B-Wa7-Y3-Wc1-(CH2)f-;
X为-NHC(=O)-(CH2)g-Wa8-或-C(=O)NH-(CH2)h-Wa9-;
Wa4、Wa5、Wa6、Wa7、Wa8和Wa9各自独立地为-NH-、-C(=O-)或-CH2-;
Wb2为酰胺键或三唑烯;
Wc1为-NHC(=O)-或-C(=O)NH-;
Y3为-(CH2)i-(X’CH2CH2)j-(CH2)k-;
X’为-O-、-S-、-NH-或-CH2-;
CB与如上定义的相同;
b、c、d、e、f、g、h、i和j各自独立地为值为1至约10的整数;
k和y各自独立地为值为0至约10的整数;
Y1为-(CH2)q-(CH2CH2X”)o-或-(CH2)q-(X”CH2CH2)o-;
X”为-O-、-S-、-NH-或-CH2-;并且
o和q为值为1至约10的整数。
在一些实施方案中,P1包含至少一个由式(B)或(C)表示的单元:
Figure BDA0003089692190000291
其中:
R12为氢、C1–C8-烷基、氨基酸侧链,诸如天然氨基酸侧链(例如,H、 甲基、异丙基、异丁基、仲丁基、S-甲基硫醚、苄基、吲哚、吡咯烷、吡咯 啉、羟基甲基、酪氨酰基、赖氨酰基、咪唑、甘氨酰基、谷氨酰基、氨甲酰 基丁酸、甲酰胺、天冬氨酸、1-羟基乙基和2-羟基乙基)、-(CH2)sCOR13或 -(CH2)pNR14R15
R13为OH或-NH(CH2)s’(X”CH2CH2)s”Z;
R14和R15各自独立地为氢或–(C(O)(CH2)s’(X”CH2CH2)s”Z)m-CB;
X”为-O-、-S-、-NH-或-CH2-;
Z和CB与上述定义相同;
p为值为1至约10的整数;
s和s”为值为0至约10的整数;
s’为值为1至约10的值的整数;并且
m为值为0或1的整数。
在式(B)或(C)的一些实施方案中:
R12为氢、烷基、氨基酸侧链、-(CH2)sC(O)R13或-(CH2)pNR14R15
p为值为1至约10的整数;
s为值为0至约10的整数;
R13为OH或-NH(CH2)s’(X”’CH2CH2)s”Z”-(CB)m
R14和R15各自独立地为氢或-C(O)(CH2)s’(X”’CH2CH2)s”Z”-(CB)m
s”为值为0至约10的整数;
s’为值为1至约10的整数;
m为值为0或1的整数;
X”’为-O-、-S-、-NH-或-CH2-;并且
Z”为连接CB与R14或R15的其余部分的连接基团;或者Z”为包含反应性 基团的连接基团。
在式(B)或(C)的一些此类实施方案中:
R13为OH或-NH(CH2)s’(X”’CH2CH2)s”Z”;
R14和R15各自独立地为氢或-C(O)(CH2)s’(X”’CH2CH2)s”Z”;并且
Z”为连接单元的反应性前体,其选自异氰酸酯、异硫氰酸酯、2-吡啶基二硫 化物、卤代乙酰胺(-NHC(O)CH2-hal)、马来酰亚胺、二烯、烯烃、卤化物、甲苯 磺酸根(TsO-)、醛、磺酸根(R-SO3 -)、
Figure BDA0003089692190000301
Figure BDA0003089692190000302
膦酸(-P(=O)(OH)2)、酮、C8-C10环炔基、-OH、-NHOH、 -NHNH2、-SH、羧酸(-COOH)、乙炔(-C≡CH)、叠氮化物(-N3)、氨基(-NH2)、磺 酸(-SO3H)、炔酮衍生物(-C(O)C≡C-Ra,其中Ra为C1–C10-烷基)和磷酸二氢盐 (-OP(=O)(OH)2)。
在式(B)或(C)的其它此类实施方案中:
R13为OH或-NH(CH2)s’(X”’CH2CH2)s”Z”CB;
R14和R15各自独立地为氢或-C(O)(CH2)s’(X”’CH2CH2)s”Z”CB;并且
Z”为连接CB与R14或R15的其余部分的连接单元,所述连接单元由前体形 成,所述前体选自异氰酸酯、异硫氰酸酯、2-吡啶基二硫化物、卤代乙酰胺 (-NHC(O)CH2-hal)、马来酰亚胺、二烯、烯烃、卤化物、甲苯磺酸根(TsO-)、醛、 磺酸根(R-SO3 -)、
Figure BDA0003089692190000303
膦酸 (-P(=O)(OH)2)、酮、C8-C10环炔基、-OH、-NHOH、-NHNH2、-SH、羧酸(-COOH)、 乙炔(-C≡CH)、叠氮化物(-N3)、氨基(-NH2)、磺酸(-SO3H)、炔酮衍生物(-C(O)C ≡C-Ra,其中Ra为C1–C10-烷基)和磷酸二氢盐(-OP(=O)(OH)2)。
在一些实施方案中,Y2为单键或选自:
Figure BDA0003089692190000311
其中:
Wb2为–C(O)NH-、-NHC(O)-、
Figure BDA0003089692190000312
Re为C1–C8-烷基或-(L1’-Z-)mCB;
Rf为B-Wb2 -(CH2)i-(X”CH2CH2)j-NH-C(=O)-(CH2)f-;
Xa为-NHC(=O)-(CH2)g-NH-或-C(O)NH-(CH2)h-NH-;
Wb2为-C(O)NH-或-NHC(=O)-;
c、d、e、f、g、h、i和j各自独立地为值为1至约10的整数;
X”为-O-、-S-、-NH-或-CH2-;并且
L1’、Z、m和B与上述定义相同。
在某些实施方案中,连接每个CB与Ar的连接单元为包含通过共价键 彼此连接的(CH2)b、Lc、(P1)a、Wa1、Wa2、Wa3、Y1和Y2基团的连接基团, 其中:
Wa1、Wa2和Wa3各自独立地为-NH-、-C(O)-或-CH2-;
Wb1为酰胺键或三唑烯;
P1为酰胺键、氨基酸残基或肽;
Lc为亚烷基;
Y1为-(CH2)q-(CH2CH2X”)o-或-(CH2)q-(X”CH2CH2X”)o-;
X”为O-、-S-、-NH-或-CH2-;
Y2为单键或选自以下的基团:
Figure BDA0003089692190000313
Wb2为酰胺键或三唑烯;
a为0至10;
b、c和d各自独立地为值为1至约10的整数;并且
o和q各自独立地为值为1至约10的整数。
在一些实施方案中,R12为天然氨基酸侧链。在其它实施方案中,R12为非天然氨基酸侧链。
在一些实施方案中,连接每个CB和Ar的连接单元是由式(A)表示的连 接基团:
**-Lc-Wb1-(CH2)b-Wa3-(P1)a-Y2-Wa2-Y1-Wa1-*
(A)
其中:
*为CB的附接点;并且
**为Ar的附接点。
在一些此类实施方案中,P1
Figure BDA0003089692190000321
其中:
R12为氢、烷基、氨基酸侧链、-(CH2)sCOOH或-(CH2)pNH2
p为值为1至约10的整数;并且
s和s”各自独立地为值为0至约10的整数。
在一些实施方案中,P1
Figure BDA0003089692190000322
其中:
R12为氢、烷基、氨基酸侧链、-(CH2)sC(O)R13或-(CH2)pNR14R15
p为值为1至约10的整数;
s为值为0至约10的整数;
R13为OH或–NH(CH2)s’(X”’CH2CH2)s”Z”-(CB)m
R14和R15各自独立地为氢或-C(O)(CH2)s’(X”’CH2CH2)s”Z”-(CB)m
s”为值为0至约10的整数;
s’为值为1至约10的整数;
m为值为0或1的整数;
X”’为-O-、-S-、-NH-或-CH2-;并且
Z”为连接CB与R14或R15的其余部分的连接基团;或者Z”为包含反应性 基团的连接基团。
在P1的一些此类实施方案中:
R13为OH或–NH(CH2)s’(X”’CH2CH2)s”Z”;
R14和R15各自独立地为氢或-C(O)(CH2)s’(X”’CH2CH2)s”Z”;并且
Z”为连接单元的反应性前体,其选自异氰酸酯、异硫氰酸酯、2-吡啶基二硫 化物、卤代乙酰胺(-NHC(O)CH2-hal)、马来酰亚胺、二烯、烯烃、卤化物、甲苯 磺酸根(TsO-)、醛、磺酸根(R-SO3 -)、
Figure BDA0003089692190000323
Figure BDA0003089692190000331
膦酸(-P(=O)(OH)2)、酮、C8-C10环炔基、-OH、 -NHOH、-NHNH2、-SH、羧酸(-COOH)、乙炔(-C≡CH)、叠氮化物(-N3)、 氨基(-NH2)、磺酸(-SO3H)、炔酮衍生物(-C(O)C≡C-Ra,其中Ra为C1–C10- 烷基)和磷酸二氢盐(-OP(=O)(OH)2)。
在P1的其它此类实施方案中:
R13为OH或-NH(CH2)s’(X”’CH2CH2)s”Z”CB;
R14和R15各自独立地为氢或-C(O)(CH2)s’(X”’CH2CH2)s”Z”CB;并且
Z”为连接CB与R14或R15的其余部分的连接单元,所述连接单元由前 体形成,所述前体选自异氰酸酯、异硫氰酸酯、2-吡啶基二硫化物、卤代乙 酰胺(-NHC(O)CH2-hal)、马来酰亚胺、二烯、烯烃、卤化物、甲苯磺酸根(TsO-)、 醛、磺酸根(R-SO3 -)、
Figure BDA0003089692190000332
膦 酸(-P(=O)(OH)2)、酮、C8-C10环炔基、-OH、-NHOH、-NHNH2、-SH、羧酸 (-COOH)、乙炔(-C≡CH)、叠氮化物(-N3)、氨基(-NH2)、磺酸(-SO3H)、炔酮 衍生物(-C(O)C≡C-Ra,其中Ra为C1–C10-烷基)和磷酸二氢盐 (-OP(=O)(OH)2)。
在替代实施方案中,连接CB和Ar的连接单元为由式(IIIb)、(IIIc)、(IIId)、(IIIe)、(IIIf)、(IIIh)、(IIIh)或(IIIj)表示的连接基团:
Figure BDA0003089692190000333
Figure BDA0003089692190000341
其中:
Re为烷基;
X5为-O-、-S-、-NH-或-CH2-;
Wb1和Wb2各自独立地为-C(O)NH-、-NHC(O)-、
Figure BDA0003089692190000342
Figure BDA0003089692190000343
R12为氢、烷基、氨基酸侧链、-(CH2)sC(O)R13或-(CH2)pNR14R15
R13为OH或–NH(CH2)s’(X4CH2CH2)s”Z”-(CB)m
R14和R15各自独立地为氢或-C(O)(CH2)s’(X”’CH2CH2)s”Z”-(CB)m
s和s”各自独立地为值为0至约10的整数;
m为值为0或1的整数;
X4和X5各自独立地为-O-、-S-、-NH-或-CH2-;并且
b、c、d、e、g、h、o和q各自独立地为值为1至约10的整数。
在式(IIIb)、(IIIc)、(IIId)、(IIIe)、(IIIf)、(IIIh)、(IIIh)或(IIIj)的一此类实施方 案中:
R13为OH或–NH(CH2)s’(X”’CH2CH2)s”Z”CB;
R14和R15各自独立地为氢或-C(O)(CH2)s’(X”’CH2CH2)s”Z”CB;并且
Z”为连接CB与R14或R15的其余部分的连接单元,所述连接单元由前体形 成,所述前体选自异氰酸酯、异硫氰酸酯、2-吡啶基二硫化物、卤代乙酰胺 (-NHC(O)CH2-hal)、马来酰亚胺、二烯、烯烃、卤化物、甲苯磺酸根(TsO-)、醛、 磺酸根(R-SO3 -)、
Figure BDA0003089692190000344
膦酸 (-P(=O)(OH)2)、酮、C8-C10环炔基、-OH、-NHOH、-NHNH2、-SH、羧酸(-COOH)、 乙炔(-C≡CH)、叠氮化物(-N3)、氨基(-NH2)、磺酸(-SO3H)、炔酮衍生物(-C(O)C ≡C-Ra,其中Ra为C1–C10-烷基)和磷酸二氢盐(-OP(=O)(OH)2)。
靶向部分
本发明的化合物和缀合物还可包含配体或靶向部分CB。在一些实施方 案中,配体或靶向部分是任何分子识别元件,其可以通过例如非共价键合(诸 如氢键合、金属配位、疏水力、范德华力、π-π相互作用、卤素键合、静电 和/或电磁效应)与至少一种其他分子发生特定的相互作用。在某些实施方案 中,CB选自纳米颗粒、免疫球蛋白、核酸、蛋白质、寡肽、多肽、抗体、 抗原性多肽的片段、重复体(repebody)等。
本发明的化合物和缀合物可包含一个或多个靶向部分。也就是说,变量 cb可具有选自1、2、3、4、5、1-10或1-20的整数值。
在一些实施方案中,CB包含通过共价键(例如,肽键)缀合的两个或更 多个独立选择的天然氨基酸或非天然氨基酸,并且肽可以包含通过肽键缀合 的2个、3个、4个、5个、6个、7个、8个、9个、10个、11个、12个、 13个、14个、15个、16个、17个、18个、19个、20个或更多个天然氨基 酸或非天然氨基酸。在一些实施方案中,配体包含较短的氨基酸序列(例如,天然蛋白质的片段或合成多肽片段)以及全长蛋白质(例如,工程化前的蛋白 质)。
在一些实施方案中,CB选自抗体、激素、药物、抗体类似物(例如,非 -IgG)、蛋白质、寡肽、多肽等,其与受体结合。在某些实施方案中,CB选 择性地将药物靶向特定的器官、组织或细胞。在其它实施方案中,与正常细 胞相比,CB特异性结合在癌细胞中过表达的受体,并且可以分类为单克隆 抗体(mAb)或抗体片段和低分子非抗体。优选地,CB选自肽、肿瘤细胞特 异性肽、肿瘤细胞特异性适体、肿瘤细胞特异性碳水化合物、肿瘤细胞特异 性单克隆抗体、多克隆抗体和在文库筛选中鉴定的抗体片段。
示例性配体或靶向部分包括但不限于肉碱、肌醇、硫辛酸、吡哆醛、抗 坏血酸、烟酸、泛酸、叶酸、核黄素、硫胺素、生物素、维生素B12、其它 水溶性维生素(维生素B)、脂溶性维生素(维生素A、D、E、K)、 RGD(Arg-Gly-Asp)、NGR(Asn-Gly-Arg)、转铁蛋白、VIP(血管活性肠肽)受 体、APRPG(Ala-Pro-Arg-Pro-Gly)肽、TRX-20(硫氧还蛋白-20)、整联蛋白、 核仁素、氨肽酶N(CD13)、内皮糖蛋白(endoglin)、血管上皮生长因子受体、 低密度脂蛋白受体、转铁蛋白受体、生长抑素受体、铃蟾肽、神经肽Y、黄 体生成素释放激素受体、叶酸受体、表皮生长因子受体、转化生长因子、成 纤维细胞生长因子受体、无唾液酸糖蛋白受体、半乳凝素-3受体、E-选择素 受体、透明质酸受体、前列腺特异性膜抗原(PSMA)、胆囊收缩素A受体、 胆囊收缩素B受体、盘状结构域受体(discoidin domain receptor)、粘蛋白受 体、阿片样物质受体、纤溶酶原受体、缓激肽受体、胰岛素受体、胰岛素样 生长因子受体、血管紧张素AT1受体、血管紧张素AT2受体、粒细胞巨噬 细胞集落刺激因子受体(GM-CSF受体)、半乳糖胺受体、σ-2受体、δ样3 (DLL-3)、氨肽酶P、黑素转铁蛋白、瘦素、破伤风毒素Tet1、破伤风毒素G23,RVG(狂犬病毒糖蛋白)肽、HER2(人表皮生长因子受体2)、GPNMB(糖蛋 白非转移性b)、Ley、CA6、CanAng、SLC44A4(溶质载体家族44成员4)、 CEACAM5(癌胚抗原相关细胞粘附分子5)、连接素-4(Nectin-4)、碳酸酐酶9、 TNNB2、5T4、CD30、CD37、CD74、CD70、PMEL17、EphA2(EphrinA2受体)、 Trop-2、SC-16、组织因子、ENPP-3(AGS-16)、SLITRK6(SLIT和NTRK样家族 成员6)、CD27、Lewis Y抗原、LIV1、GPR161(G蛋白偶联受体161)、PBR(外 周型苯并二氮
Figure BDA0003089692190000361
受体)、MERTK(Mer受体酪氨酸激酶)受体、CD71、LLT1(凝集 素样转录物1或CLED2D)、白细胞介素-22受体、σ1受体、过氧化物酶体增殖 物激活受体、DLL3、C4.4a、cKIT、EphrinA、CTLA4(细胞毒性T淋巴细胞相关 蛋白4)、FGFR2b(成纤维细胞生长因子受体2b)、N-乙酰胆碱受体、促性腺激素 释放激素受体、胃泌素释放肽受体、骨形态发生蛋白受体1B型(BMPR1B)、E16 (LAT1、SLC7A5)、STEAP1(前列腺的6次跨膜上皮抗原)、0772P(CA125、MUC16)、 MPF(MSLN,间皮素)、Napi3b(SLC34A2)、Sema5b(臂板蛋白5b)、ETBR(内皮 素B型受体)、MSG783(RNF124)、STEAP2(前列腺的6次跨膜上皮抗原2)、 TrpM4(瞬时受体电位阳离子5通道、M亚家族,成员4)、CRIPTO(畸胎瘤衍生 生长因子)、CD21、CD79b、FcRH2(IFGP4)、HER2(ErbB2)、NCA(CEACM6)、 MDP(DPEP1)、IL20R-α(IN20Ra)、短蛋白聚糖(BCAN)、EphB2R、ASLG659(B7h)、 CD276、PSCA(前列腺干细胞抗原前体)、GEDA、BAFF-R(BR3)、CD22 (BL-CAM)、CD79a、CXCR5、HLA-DOB、P2X5、CD72、LY64、FcRH1、IRTA2、 TENB2、SSTR2、SSTR5、SSTR1、SSTR3、SSTR4、ITGAV(整联蛋白,α5)、ITGB6 (整联蛋白,β6)、MET、MUC1、EGFRvIII、CD33、CD19、IL2RA(白细胞介素 2受体,α)、AXL、BCMA、CTA(癌症睾丸抗原)、CD174、CLEC14A、GPR78、 CD25、CD32、LGR5(GPR49)、CD133(普罗明(Prominin))、ASG5、ENPP3(外核 苷酸焦磷酸酶/磷酸二酯酶3)、PRR4(富含脯氨酸的蛋白质4)、GCC(鸟苷酸环化 酶2C)、Liv-1(SLC39A6)、CD56、CanAg、TIM-1、RG-1、B7-H4、PTK7、CD138、 密蛋白(Claudins)、Her3(ErbB3)、RON(MST1R)、CD20、TNF(生腱蛋白C)、FAP、 DKK-1、CD52、CS1(SLAMF7)、膜联蛋白A1、V-CAM、gp100、MART-1、 MAGE-1(黑色素瘤抗原编码基因-1)、MAGE-3(黑色素瘤相关抗原3)、BAGE、 GAGE-1、MUM-1(多发性骨髓瘤癌基因1)、CDK4、TRP-1(gp75)、TAG-72(肿瘤 相关糖蛋白-72)、神经节苷脂GD2、GD3、GM2、GM3、VEP8、VEP9、My1、 VIM-D5、D156-22、OX40、RNAK、PD-L1、TNFR1、TNFR2等。
靶标
在一些实施方案中,分子识别元件的一种或多种靶标与一种或多种特定细胞 或组织类型特异性相关联。在一些实施方案中,靶标与一种或多种特定疾病状态 特异性相关联。在一些实施方案中,靶标与一个或多个特定发育阶段特异性相关 联。例如,细胞类型特异性标志物在该细胞类型中的表达水平通常为参考细胞群 中的表达水平的至少2倍。在一些实施方案中,细胞类型特异性标志物存在的水 平为其在参考群体中的平均表达的至少3倍、至少4倍、至少5倍、至少6倍、 至少7倍、至少8倍、至少9倍、至少10倍、至少50倍、至少100倍或至 少1000倍。细胞类型特异性标志物的检测或测量可使得将一种或多种目标 细胞类型与许多、大多数或所有其它类型的细胞区分开来成为可能。在一些 实施方案中,如本文所述,靶标可包括蛋白质、碳水化合物、脂质和/或核 酸。
在一些实施方案中,如果物质特异性结合靶向部分,诸如核酸靶向部分, 则该物质被认为是“靶向的”。在一些实施方案中,靶向部分,诸如核酸靶向 部分,在严格条件下特异性结合靶。
在某些实施方案中,本文所述的缀合物和化合物包含靶向部分,其特异 性结合与器官、组织、细胞、细胞外基质组分和/或细胞内区室相关联的一 种或多种靶标(例如抗原)。在一些实施方案中,本文所述的缀合物和化合物 包含靶向部分,其特异性结合与特定器官或器官系统相关联的靶标。在一些 实施方案中,本文所述的缀合物和化合物包含靶向部分,其特异性结合一种 或多种细胞内靶标(例如,细胞器、细胞内蛋白质)。在一些实施方案中,本 文所述的缀合物和化合物包含靶向部分,其特异性结合与患病器官、组织、 细胞、细胞外基质组分和/或细胞内区室相关的靶标。在一些实施方案中, 本文所述的缀合物和化合物包含靶向部分,其特异性结合与特定细胞类型 (例如,内皮细胞、癌细胞、恶性细胞、前列腺癌细胞等)相关联的靶标。
在一些实施方案中,本文所述的缀合物和化合物包含靶向部分,其结合 对一种或多种特定组织类型(例如,肝组织对比前列腺组织)特异的靶标。在 一些实施方案中,本文所述的缀合物和化合物包含靶向部分,其结合对一种 或多种特定细胞类型(例如,T细胞对比B细胞)特异的靶标。在一些实施方 案中,本文所述的缀合物和化合物包含靶向部分,其结合对一种或多种特定 疾病状态(例如,肿瘤细胞对比健康细胞)特异的靶标。在一些实施方案中, 本文所述的缀合物和化合物包含靶向部分,其结合对一个或多个特定发育阶 段(例如,干细胞对比已分化的细胞)特异的靶标。
在一些实施方案中,靶标可以是专门或主要与一种或几种细胞类型、一 种或几种疾病和/或一个或几种发育阶段相关联的标志物。细胞类型特异性 标志物在该细胞类型中的表达水平通常为参考细胞群中的至少2倍,所述参 考细胞群可由例如以近似相等的量包含来自多个(例如,5至10个或更多) 不同组织或器官的细胞的混合物组成。在一些实施方案中,细胞类型特异性 标志物存在的水平为其在参考群体中的平均表达的至少3倍、至少4倍、至 少5倍、至少6倍、至少7倍、至少8倍、至少9倍、至少10倍、至少50 倍、至少100倍或至少1000倍。细胞类型特异性标志物的检测或测量可使 得将一种或多种目标细胞类型与许多、大多数或所有其它类型的细胞区分开 来成为可能。
在一些实施方案中,靶标包括蛋白质、碳水化合物、脂质和/或核酸。 在一些实施方案中,靶标包含蛋白质和/或其特征部分,诸如肿瘤标志物、 整联蛋白、细胞表面受体、跨膜蛋白、细胞间蛋白、离子通道、膜转运蛋白、酶、 抗体、嵌合蛋白、糖蛋白等。在一些实施方案中,靶标包括碳水化合物和/或其 特征部分,诸如糖蛋白、糖(例如,单糖、二糖、多糖)、糖萼(即,大多数真核细 胞外表面上富含碳水化合物的外围区)等。在一些实施方案中,靶标包括脂质和/ 或其特征部分,诸如油、脂肪酸、甘油酯、激素、类固醇(例如,胆固醇、胆汁酸)、维生素(例如,维生素E)、磷脂、鞘脂、脂蛋白等。在一些实施方案中,靶 标包括核酸和/或其特征部分,诸如DNA核酸、RNA核酸、经修饰的DNA核酸、 经修饰的RNA核酸、包括DNA、RNA、经修饰的DNA和经修饰的RNA的任 何组合的核酸。
本领域中已知许多标志物。常见标志物包括细胞表面蛋白,例如受体。示例 性受体包括但不限于转铁蛋白受体;LDL受体;生长因子受体,诸如表皮生长 因子受体家族成员(例如,EGFR、Her2、Her3、Her4)或血管内皮生长因子受体、 细胞因子受体、细胞粘附分子、整联蛋白、选择素和CD分子。所述标志物可以 是仅存在于恶性细胞上或以更高的量存在于恶性细胞上的分子,例如肿瘤抗原。
抗体-药物结合物(ADC)
在一些实施方案中,CB为抗体,Q为药物。因此,本文公开的化合物和缀 合物可用于将抗体与药物部分缀合,以形成抗体-药物缀合物(ADC)。由于ADC 能够选择性地将一种或多种药物部分递送至靶组织,诸如肿瘤相关抗原,因此抗 体-药物缀合物(ADC)可提高治疗疾病(例如癌症)的治疗效果。因此,在某些实施 方案中,本发明提供了用于治疗用途(例如,癌症治疗)的ADC。
本发明的ADC包含与一个或多个药物部分连接的抗体。ADC的特异性由抗 体的特异性来定义。在一个实施方案中,抗体与一种或多种细胞毒性药物连接, 所述细胞毒性药物被内部递送至癌细胞。
下面提供了可用于本发明的ADC的药物实例。术语“药物”、“剂”和“药物部 分”在本文中可互换使用。术语“连接的”和“缀合的”在本文中也可互换使用,表 示抗体与部分共价连接。
在某些方面,本公开涉及ADC、包含ADC的组合物、治疗方法和配制ADC 组合物的方法。ADC包含与细胞毒性化合物缀合的抗体或抗体片段。在一些实 施方案中,通过接头将细胞毒性化合物与抗体缀合。在其它实施方案中,将细胞 毒性化合物与抗体直接连接。下面描述本公开所包含的抗体、接头和细胞毒性化 合物的类型。
在一些实施方案中,ADC具有下式(式(III)):
(D-L)dl-LG-(CB)cb
(III)
或其药学上可接的受盐,
其中:
LG为连接基团;
CB为细胞结合剂;
cb和dl各自独立地为值为1至约20,优选1至约10的整数;并且
每个D-L独立地为具有式(I)或(II)的化合物的结构的基团。
抗体
ADC的抗体可以是通常特异性地但不一定特异性地结合目标靶细胞表 面上表达的抗原的任何抗体。抗原不必能够,但是在一些实施方案中,能够 将与其结合的ADC内化到细胞中。目标靶细胞可包括其中需要诱导细胞凋 亡的细胞。靶抗原可以是在目标靶细胞上表达的任何蛋白质、糖蛋白、多糖、 脂蛋白等,但通常是这样的蛋白质,其仅在靶细胞上表达而在正常或健康细 胞上不表达,或者与正常或健康细胞相比在靶细胞上过表达,使得ADC选 择性地靶向特定的目标细胞,例如肿瘤细胞。本领域技术人员将会理解,所 选择的特定的抗原以及由此特定的抗体将取决于所需目标靶细胞的身份。在 具体的实施方案中,ADC的抗体是适于向人施用的抗体。
抗体(Ab)和免疫球蛋白(Ig)是具有相同结构特征的糖蛋白。虽然抗体表 现出对特定靶标的结合特异性,但免疫球蛋白包括抗体和其它缺乏靶标特异 性的抗体样分子。天然抗体和免疫球蛋白通常为约150,000道尔顿的异四聚 糖蛋白,由两条相同的轻(L)链和两条相同的重(H)链组成。每条重链的一端 具有可变结构域(VH),后面是许多恒定结构域。每条轻链的一端具有可变结 构域(VL),并且另一端具有恒定结构域。
“VH”是指抗体的免疫球蛋白重链(包括Fv、scFv或Fab的重链)的可变 区。“VL”是指免疫球蛋白轻链(包括Fv、scFv、dsFv或Fab的轻链)的可变 区。
术语“抗体”在本文中以最广泛的意义使用,是指特异性结合特定抗原或 与特定抗原发生免疫反应的免疫球蛋白分子,包括多克隆、单克隆、基因工 程或以其它方式修饰的形式的抗体,包括但不限于鼠抗体、嵌合抗体、人源 化抗体、异源缀合的抗体(heteroconjugate antibody)(例如,双特异性抗体、 双抗体、三抗体和四抗体),以及抗体的抗原结合片段,包括例如Fab’、 F(ab’)2、Fab、Fv、rIgG和scFv片段。术语“scFv”是指单链Fv抗体,其中 来自常规抗体的重链和轻链的可变结构域已连接形成一条链。
抗体可以是鼠抗体、人抗体、人源化抗体、嵌合抗体或源自其它物种的 抗体。抗体是由免疫系统产生的蛋白质,其能够识别并结合特定的抗原。 (Janeway,C.,Travers,P.,Walport,M.,Shlomchik(2001)Immuno Biology,第5 版,Garland Publishing,New York)。靶抗原通常具有许多结合部位,也称为 表位,由多种抗体上的CDR识别。每种特异性结合不同表位的抗体都有不 同的结构。因此,一种抗原可能具有不止一种相应的抗体。抗体包括全长免 疫球蛋白分子或全长免疫球蛋白分子的免疫活性部分,即包含抗原结合部位 的分子,所述抗原结合部位免疫特异性地结合目标靶标或其部分的抗原,此 类靶标包括但不限于癌细胞或产生与自身免疫性疾病相关联的自身免疫抗 体的细胞。本文公开的免疫球蛋白可以是免疫球蛋白分子的任何类型(例如,IgG、IgE、IgM、IgD和IgA)、类别(例如,IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1和 IgA2)或亚类。免疫球蛋白可源自任何物种。然而,一个方面,免疫球蛋白来源 于人、鼠或兔。
术语“抗体片段”是指全长抗体的一部分,通常为靶结合区域或可变区。抗体 片段的实例包括Fab、Fab′、F(ab′)2和Fv片段。“Fv”片段是包含完整靶识别 和结合部位的最小抗体片段。该区域由紧密的非共价缔合的一个重链可变结构域 和一个轻链可变结构域的二聚体(VH-VL二聚体)组成。正是在这种构型中,每个 可变结构域的三个CDR相互作用以在VH-VL二聚体的表面上限定靶结合部位。 通常,六个CDR赋予抗体靶结合特异性。然而,在一些情况下,甚至单个可变 结构域(或仅包含三个对靶标特异的CDR的Fv的一半)也可具有识别和结合靶标 的能力。“单链Fv”或“scFv”抗体片段在单个多肽链中包含抗体的VH和VL结构 域。一般来说,Fv多肽还在VH与VL结构域之间包含多肽接头,这使得scFv 能够形成用于靶标结合的所需结构。“单结构域抗体”由单个VH或VL结构域组 成,所述结构域表现出足够的对靶标的亲和力。在具体的实施方案中,单结构域 抗体是骆驼化抗体(参见,例如,Riechmann,1999,Journal of Immunological Methods 231:25-38)。
Fab片段包含轻链的恒定区和重链的第一个恒定区(CH1)。Fab’片段与Fab 片段相异在于在重链CH1结构域的羧基末端添加了几个残基,包括来自抗体铰 链区的一个或多个半胱氨酸。F(ab′)片段是由F(ab′)2胃蛋白酶消化产物的铰 链半胱氨酸处的二硫键断裂产生的。抗体片段的额外化学偶联是本领域普通技术 人员已知的。
轻链和重链可变区都有互补决定区(CDR),也称为高变区。可变结构域的更 高度保守的部分被称为框架(FR)。如本领域中已知的,根据上下文和本领域已知 的各种定义,描绘抗体高变区的氨基酸位置/边界可以变化。可变结构域内的一 些位置可被视为混合高变位置(hybrid hypervariable position),因为根据一组标准, 这些位置可被视为在高变区内,而根据一组不同的标准,这些位置可被视为在高 变区外。这些位置中的一个或多个也可在扩展的高变区中找到。每条链中的CDR 由FR区紧密地保持在一起,并且与来自另一条链的CDR一起,促成抗体的靶 结合部位形成(参见Kabat等人,Sequences of Proteinsof Immunological Interest (National Institute of Health,Bethesda,Md.1987)。如本文中所用,除非另有说明, 否则免疫球蛋白氨基酸残基的编号是根据Kabat等人的免疫球蛋白氨基酸残基 编号系统进行的。
在某些实施方案中,本发明的ADC的抗体是单克隆抗体。术语“单克隆抗 体”(mAb)是指源自单个拷贝或克隆(包括例如任何真核、原核或噬菌体克隆)而不 是籍以产生其的方法的抗体。优选地,本公开的单克隆抗体存在于同质或基本上 同质的群体中。单克隆抗体既包括完整分子以及抗体片段(例如,Fab和F(ab’)2 片段),其能够特异性结合蛋白质。Fab和F(ab’)2片段缺少完整抗体的Fc片段, 从动物循环中清除更快,并且可能比完整抗体具有更少的非特异性组织结合(Wahl等人,1983,J.Nucl.Med 24:316)。可用于本公开的单克隆抗体可使 用本领域已知的多种技术制备,包括使用杂交瘤、重组和噬菌体展示技术或其组合。本公开的抗体包括嵌合抗体、灵长类化抗体、人源化抗体或人抗体。
虽然在大多数情况下,抗体仅由遗传编码的氨基酸组成,但在一些实施 方案中,可以特异性地掺入非编码的氨基酸。在Tian等人,2014,Proc Nat’l Acad Sci USA 111(5):1766-1771和Axup等人,2012,Proc Nat’l Acad Sci USA 109(40):16101-16106中论述了可掺入抗体中用于控制化学计量和附接位置 的非编码氨基酸以及制备此类经修饰的抗体的方法的实例,所述文献的全部 内容通过引用并入本文。
在某些实施方案中,本文所述的ADC的抗体是嵌合抗体。如本文中所 用,术语“嵌合”抗体是指具有源自非人免疫球蛋白(诸如大鼠或小鼠抗体)的 可变序列和人免疫球蛋白恒定区(通常选自人免疫球蛋白模板)的抗体。用于 产生嵌合抗体的方法是本领域已知的。参见,例如,Morrison,1985,Science 229(4719):1202-7;Oi等人,1986,BioTechniques4:214-221;Gillies等人, 1985,J.Immunol.Methods125:191-202;美国专利第5,807,715号、第4,816,567 号和第4,816397号,所述参考文献和美国专利通过引用整体并入本文。
在某些实施方案中,本文所述的ADC的抗体是人源化抗体。非人(例如, 鼠)抗体的“人源化”形式是嵌合免疫球蛋白、免疫球蛋白链或其片段(诸如 Fv、Fab、Fab’、F(ab’)2或抗体的其它靶结合亚结构域),其包含源自非人免 疫球蛋白的最小序列。一般而言,人源化抗体将包含基本上所有的至少一个 (通常是两个)可变结构域,其中所有或基本上所有的CDR区对应于非人免 疫球蛋白的那些可变结构域,并且所有或基本上所有的FR区是人免疫球蛋 白序列的那些FR区。人源化抗体还可包含免疫球蛋白恒定区(Fc)的至少一 部分,通常是人免疫球蛋白共有序列的一部分。抗体人源化的方法是本领域 已知的。参见,例如,Riechmann等人,1988,Nature 332:323-7;美国专利 第5,530,101号、第5,585,089号、第5,693,761号、第5,693,762和属于Queen 等人的美国专利第6,180,370号;EP239400;PCT公布WO 91/09967;美国 专利第5,225,539号;EP592106、EP519596;Padlan,1991,Mol.Immunol., 28:489-498;Studnicka等人,1994,Prot.Eng.7:805-814;Roguska等人,1994, Proc.Natl.Acad Sci.USA 91:969-973;以及美国专利第5,565,332号,将所有 所述文献、专利、公布据此通过引用整体并入。
在某些实施方案中,本文所述的ADC的抗体是人抗体。完全“人”抗体 对于人患者的治疗性治疗可以是合乎需要的。如本文中所用,“人抗体”包括 具有人免疫球蛋白的氨基酸序列的抗体,并包括从人免疫球蛋白文库或从不 表达内源免疫球蛋白的一种或多种人免疫球蛋白的转基因动物分离的抗体。 人抗体可通过本领域已知的多种方法制备,所述方法包括使用源自人免疫球 蛋白序列的抗体文库的噬菌体展示方法。参见美国专利第4,444,887号、第 4,716,111号、第6,114,598号、第6,207,418号、第6,235,883号、第7,227,002 号、第8,809,151号和美国公布申请第2013/189218号,所述专利或公布申请的 内容通过引用整体并入本文。还可使用转基因小鼠来产生人抗体,所述转基因小 鼠不能表达功能性内源免疫球蛋白但能表达人免疫球蛋白基因。参见,例如,美 国专利第5,413,923号、第5,625,126号、第5,633,425号、第5,569,825号、第 5,661,016号、第5,545,806号、第5,814,318号、第5,885,793号、第5,916,771 号、第5,939,598号、第7,723,270号、第8,809,051和美国公布的申请第 2013/117871号,所述专利或申请通过引用整体并入本文。另外,诸如Medarex (Princeton,N.J.)、Astellas Pharma(Deerfield,Ill.)和Regeneron(Tarrytown,N.Y.)等 公司可以签约以使用与上述技术相似的技术提供针对所选择抗原的人抗体。可使 用称作“导向选择”的技术产生识别所选择表位的完全人抗体。在这种方法中,选 择的非人单克隆抗体(例如小鼠抗体)用于指导识别相同表位的完全人抗体的选 择(Jespers等人,1988,Biotechnology 12:899-903)。
在某些实施方案中,本文所述的ADC的抗体是灵长类化抗体。术语“灵长类 化抗体”是指包含猴可变区和人恒定区的抗体。用于产生灵长类化抗体的方法是 本领域已知的。参见,例如,美国专利第5,658,570号、第5,681,722号和第5,693,780 号,所述专利通过引用整体并入本文。
在某些实施方案中,本文所述的ADC的抗体是双特异性抗体或双重可变结 构域抗体(DVD)。双特异性和DVD抗体是单克隆(通常是人或人源化的)抗体, 其对至少两种不同的抗原具有结合特异性。例如,在美国专利第7,612,181号(其 公开内容通过引用并入本文)中描述了DVD。
在某些实施方案中,本文所述的ADC的抗体是衍生抗体。例如,但不限于, 衍生抗体通常通过糖基化、乙酰化、聚乙二醇化、磷酸化、酰胺化、通过已知的 保护/封闭基团的衍生化、蛋白水解切割、与细胞配体或其它蛋白质的键联等来 进行修饰。许多化学修饰中的任一种都可通过已知技术来进行,所述技术包括但 不限于特定的化学裂解、乙酰化、甲酰化、衣霉素的代谢合成等。另外,所述衍 生物可以例如使用ambrx技术(例如,参见,Wolfson,2006,Chem.Biol. 13(10):1011-2)来包含一种或多种非天然氨基酸。
在某些实施方案中,本文所述的ADC的抗体具有经修饰以相对于相应的野 生型序列改变至少一种恒定区介导的生物效应子功能的序列。例如,在一些实施 方案中,,抗体可被修饰来相对于未修饰的抗体降低至少一种恒定区介导的生物 效应子功能,例如减少的与Fc受体(FcR)的结合。可通过在FcR相互作用所必需 的特定区域中突变抗体的免疫球蛋白恒定区区段来减少FcR结合(参见,例如, Canfield和Morrison,1991,J.Exp.Med 173:1483-1491;以及Lund等人,1991,J. Immunol.147:2657-2662)。
在某些实施方案中,相对于未修饰的抗体,本文所述的ADC的抗体经修饰 以获得或改善至少一种恒定区介导的生物效应子功能,例如,以增强FcγR相互 作用(参见,例如,美国2006/0134709)。例如,根据本文所述的方法,可以产生 具有恒定区的抗体,所述恒定区以比相应的野生型恒定区更大的亲和力结合FcγRIIA、FcγRIIB和/或FcγRIIIA。
在某些特定的实施方案中,本文所述的ADC的抗体是结合肿瘤细胞的 抗体,诸如针对细胞表面受体或肿瘤相关抗原(TAA)的抗体。在试图发现用 于癌症诊断和疗法的有效细胞靶标的过程中,研究人员已经寻求鉴定跨膜多 肽或另外地肿瘤相关多肽,与一种或多种正常非癌细胞相比,所述多肽在一 种或多种特定类型癌细胞的表面上特异性表达。通常,与非癌细胞表面相比, 此类肿瘤相关多肽在癌细胞表面上更丰富地表达。这种细胞表面受体和肿瘤 相关抗原是本领域已知的,并且可以使用本领域公知的方法和信息制备用于 产生抗体。
示例性细胞表面受体和TAA
本文所述的ADC的抗体可靶向的细胞表面受体和TAA的实例包括但 不限于下表1中列出的各种受体和TAA。为方便起见,将与这些抗原相关 的信息(其均为本领域所知)列于下面,所述信息包括名称、别称、Genbank 登录号和一个或多个主要参考文献,遵循国家生物技术信息中心(NCBI)的核 酸和蛋白质序列鉴定惯例。对应于所列细胞表面受体和TAA的核酸和蛋白 质序列可在公共数据库如GenBank中获得。
表I.
Figure BDA0003089692190000431
Figure BDA0003089692190000441
Figure BDA0003089692190000451
Figure BDA0003089692190000461
示例性抗体
与本公开的ADC一起使用的示例性抗体包括但不限于3F8(GD2)、阿 巴伏单抗(Abagovomab)(CA-125(模仿))、阿德木单抗(EpCAM)、阿夫珠单抗 (Afutzumab)(CD20)、阿来珠单抗聚乙二醇(Alacizumab pegol)(VEGFR2)、 ALD518(IL-6)、阿仑珠单抗(Alemtuzumnab)(CD52)、阿妥莫单抗-喷替酸 (Altumomab pentetate)(CEA)、阿马妥昔单抗(Amatuximab)(间皮素)、马安那 莫单抗(Anatumomnab mafenatox)(TAG-72)、阿泊珠单抗 (Apolizumab)(HLA-DR)、阿西莫单抗(CEA)、巴维昔单抗(磷脂酰丝氨酸)、 贝妥莫单抗(CD22)、贝利木单抗(BAFF)、贝索单抗(CEA相关抗原)、贝伐 珠单抗(VEGF-A)、比伐珠单抗-美登素(Bivatuzumab mertansine)(CD44v6)、 兰妥莫单抗(CD19)、本妥昔单抗(Brentuximab vedotin)((CD30(TNFRSF8))、 坎妥珠单抗-美登素(Cantuzumabmertansine)(Mucin CanAg)、坎妥珠单抗-丹 参素(cantuzumab ravtansine)(MUC1)、卡罗单抗喷地肽(Capromab pendetide)(前列腺癌细胞)、卡芦单抗(MCP-1)、卡妥索单抗(EpCAM,CD3)、 CC49(Tag-72)、cBR96-DOX ADC(Lewis-Y抗原)、西妥昔单抗(EGFR)、西 他珠单抗-bogatox(Citatuzumab bogatox)(EpCAM)、西妥木单抗(IGF-1受体)、 克莱维足单抗四氢西泮(Clivatuzumab tetraxetan)(MUC1)、可那妥木单抗 (Conatumumab)(TRAIL-E2)、达西珠单抗(CD40)、达洛珠单抗(胰岛素样生长 因子1受体)、达拉他珠单抗((CD38(环状ADP核糖水解酶))、地昔单抗 (DLL4)、地诺单抗(RANKL)、地莫单抗(B淋巴瘤细胞)、卓齐妥单抗 (Drozitumab)(DR5)、杜斯基单抗(Dusigitumab)(ILGF2)、依美昔单抗(Ecromeximab)(D3神经节苷脂)、依库珠单抗(Eculizumab)(C5)、依决洛单抗(Edrecolomab)(EpCAM)、埃罗妥珠单抗(Elotuzumab)(SLAMF7)、艾西莫单 抗(IL-6)、恩那珠单抗(Enavatuzumab)(TWEAK受体)、Enoticumab(DLL4)、 恩昔妥昔单抗(Ensituximab)(5AC)、依匹莫单抗-西坦(Epitumomab cituxetan) (Episialin)、依帕珠单抗(CD22)、厄妥索单抗((HER2/neu,CD3))、依那西珠 单抗(Etancizumab)(整联蛋白αvβ3)、法勒珠单抗(Farletuzumab)(叶酸受体1)、 FBTA05(CD20)、非卡妥珠单抗(Ficlatuzumab)(HGF)、弗吉妥姆单抗 (Figitumumab)(IGF-1受体)、Flanvotumab((TYRP1(糖蛋白75))、非苏木单抗(Fresolimumab)(TGF-1)、加利昔单抗(Galiximab)(CD80)、Ganitumab(IGF-I)、 吉妥珠单抗奥唑米星(Gemtuzumab ozogamicin)(CD33)、吉瑞昔单抗 (Girentuximab)((碳酸酐酶9(CA-IX))、格莱木单抗-维多汀(Glembatumumab vedotin)(GPNMB)、替伊莫单抗-泰坦(Ibritumomab tiuxetan)(CD20)、伊库鲁 单抗(VEGFR-1)、伊戈伏单抗(CA-125)、IMAB362(CLDN18.2)、伊格单抗 (EGFR)、英达妥昔单抗-丹参素(Indatuximab ravtansine)(SDC1)、英妥木单抗 (CD51)、伊珠单抗奥加米星(Inotuzumab ozogamicin)(CD22)、伊匹木单抗(CD152)、伊妥木单抗((CD30(TNFRSF8))、拉贝珠单抗(CEA)、兰博单抗 (Lambrolizumab)(PDCD1)、来沙木单抗(Lexatumumab)(TRAIL-R2)、林妥珠 单抗(CD33)、洛妥珠单抗-美登素(Lorvotuzumab mertansine)(CD56)、鲁卡木单抗 (Lucatumumab)(CD40)、鲁昔单抗(Lumiliximab)((CD23(IgE受体))、马帕木单抗 (TRAIL-R1)、马格妥昔单抗(Margetuximab)(ch4DS)、马妥珠单抗(EGFR)、米拉 珠单抗(CD74)、米妥莫单抗(GD3神经节苷脂)、莫加单抗 (Mogamulizumab)(CCR4)、莫妥单抗假毒素(Moxetumomab pasudotox)(CD22)、他 那可单抗(Nacolomab tafenato)(C2-42抗原)、他那莫单抗(Naptumomabestafenatox)(5T4)、纳那妥单抗(Narnatumab)(RON)、那他珠单抗(整联蛋白α4)、 奈昔木单抗(EGFR)、耐斯伐库单抗(Nesvacumab)(血管生成素2)、尼妥珠单抗 (Nimotuzumab)(EGFR)、纳武单抗(IgG4)、奥卡珠单抗(Ocaratuzumab)(CD20)、奥 法木单抗、奥拉图单抗(PDGF-Rα)、恩妥珠单抗(Onartuzumab)(人散射因子受体 激酶)、恩妥昔单抗(Ontuxizumab)(TEM1)、奥珠单抗-莫纳托(Oportuzumab monato)(EpCAM)、奥瑞戈单抗(Oregovomab)(CA-125)、奥特托珠单抗 (Otlertuzumab)(CD37)、帕尼单抗(Panitumumab)(EGFR)、Pankomab(MUC1的肿 瘤特异性糖基化)、帕沙妥珠单抗(Parsatuzumab)(EGFL7)、帕曲妥单抗 (Patritumab)(HER3)、培妥莫单抗(Pemtumomab)(MUC1)、培妥珠单抗(Pertuzumab) (HER2/neu)、匹地珠单抗(Pidilizumab)(PD-1)、品妥珠单抗维多汀(Pinatuzumab vedotin)(CD22)、普立木单抗(Pritumumab)(波形蛋白)、雷妥莫单抗(N-羟乙酰神 经氨酸)、拉吉妥姆单抗(Radretumab)(纤连蛋白额外结构域-B)、雷莫芦单抗(VEGFR2)、利妥木单抗(Rilotumumab)(HGF)、利妥昔单抗(CD20)、罗妥木单抗(Robatumumab)(IGF-1受体)、萨马珠单抗(Samalizumab)(CD200)、沙妥莫单抗喷 地肽(Satumomab pendetide)(TAG-72)、司里班妥单抗(Seribantumab)(ERBB3)、 西罗珠单抗(FAP)、SGN-CD19A(CD19)、SGN-CD33A(CD33)、司妥昔单抗(IL-6)、 索利托单抗(EpCAM)、索能单抗(Sonepcizumab)(鞘氨醇-1-磷酸酯)、他贝芦单抗 (Tabalumb)(BAFF)、他卡妥珠单抗四氢西泮(Tacatuzumab tetraxetan)(甲胎蛋白)、 塔普单抗-帕他莫(Taplitumomabpaptox)(CD19)、替妥莫单抗(生腱蛋白C)、替妥 木单抗(Teprotumumab)(CD221)、TGN1412(CD28)、替西莫单抗(CTLA-4)、替加 珠单抗(Tigatuzumab)(TRAIL-R2)、TNX-650(IL-13)、托维图单抗(Tovetumab) (CD40a)、曲妥珠单抗(HER2/neu)、TRBS07(GD2)、曲美木单抗(CTLA-4)、曲妥 珠单抗-西莫白介素(Tucotuzumab celmoleukin)(EpCAM)、乌布妥昔单抗(Ublituximab)(MS4A)、乌瑞芦单抗(Urelumab)(4-1BB)、凡他尼布 (Vandetanib)(VEGF)、Vantictumab(Frizzled受体)、伏洛昔单抗(整联蛋白α5β1)、 伏司妥珠单抗-马佛多汀(Vorsetuzumab mafodotin)(CD70)、伏妥莫单抗(肿瘤抗原 CTAA16.88)、扎鲁木单抗(Zalutumumab)(EGFR)、扎木单抗(Zanolimumab)(CD4) 和扎土希单抗(Zatuximab)(HER1)。
制造抗体的方法
ADC的抗体可以通过在宿主细胞中重组表达免疫球蛋白轻链和重链基因来 制备。例如,为了重组表达抗体,用一种或多种携带编码抗体免疫球蛋白轻链和 重链的DNA片段的重组表达载体转染宿主细胞,使得轻链和重链在宿主细胞中 表达,并任选地分泌到培养宿主细胞的培养基中,可从该培养基中回收抗体。 标准重组DNA方法用于获得抗体重链和轻链基因,将这些基因整合到重组 表达载体中,并将载体引入宿主细胞,诸如MolecularCloning;A Laboratory Manual,第2版(Sambrook、Fritsch和Maniatis(编辑),ColdSpring Harbor,N. Y.,1989),Current Protocols in Molecular Biology(Ausubel,F.M.等人,编辑, Greene Publishing Associates,1989)和美国专利第4,816,397号中描述的那些。
在一个实施方案中,Fc变体抗体与其野生型等同物相似,但其Fc结构 域发生了变化。为了产生编码此类Fc变体抗体的核酸,可以合成编码野生 型抗体的Fc结构域(称为“野生型Fc结构域”)或Fc结构域的部分的DNA片 段,并将其用作诱变的模板,以使用常规诱变技术产生本文所述的抗体;或 者,可以直接合成编码抗体的DNA片段。
一旦获得编码野生型Fc结构域的DNA片段,就可通过标准重组DNA 技术进一步操作这些DNA片段,例如,以将恒定区基因转化为全长抗体链 基因。在这些操作中,编码CH的DNA片段与编码另一种蛋白质(诸如抗体 可变区或柔性接头)的另一个DNA片段可操作地连接。如本说明书中所用, 术语“可操作地连接的”旨在指连接两个DNA片段,使得由两个DNA片段 编码的氨基酸序列保持在框内。
为了表达Fc变体抗体,将如上所述获得的编码部分或全长轻链和重链 的DNA插入表达载体,使得基因可操作地连接至转录和翻译控制序列。在 本说明书中,术语“可操作地连接的”旨在指将抗体基因连接至载体中,使得 载体中的转录和翻译控制序列发挥其调控抗体基因的转录和翻译的预期功 能。选择与所用表达宿主细胞相容的表达载体和表达控制序列。变体抗体轻 链基因和抗体重链基因可被插入到不同的载体中,或者更常见地,两个基因 被插入到同一表达载体中。
通过标准方法(例如,抗体基因片段和载体上互补限制性位点的连接, 或者如果不存在限制性位点,则为平端连接)将抗体基因插入表达载体。在 插入变体Fc结构域序列之前,表达载体可以已经携带抗体可变区序列。另 外地或可选地,重组表达载体可编码促进抗体链从宿主细胞分泌的信号肽。 可将抗体链基因克隆到载体中,使得信号肽与抗体链基因的氨基端框内连 接。信号肽可以是免疫球蛋白信号肽或异源信号肽(即,来自非免疫球蛋白 蛋白质的信号肽)。
除了抗体链基因以外,重组表达载体还携带控制抗体链基因在宿主细胞 中表达的调控序列。术语“调控序列”旨在包括控制抗体链基因转录或翻译的 启动子、增强子和其它表达控制元件(例如,多腺苷酸化信号)。此类调控序 列描述于例如Goeddel,GeneExpression Technology:Methods in Enzymology 185(Academic Press,San Diego,Calif.,1990)中。本领域技术人员将会理解, 表达载体的设计,包括调控序列的选择,可取决于诸如待转化的宿主细胞的 选择、所需蛋白质的表达水平等因素。哺乳动物宿主细胞表达的合适调控序 列包括在哺乳动物细胞中指导高水平蛋白质表达的病毒元件,诸如源自巨细胞病 毒(CMV)(诸如CMV启动子/增强子)、猿猴病毒40(SV40)(诸如SV40启动子/增 强子)、腺病毒(例如,腺病毒主要晚期启动子(AdMLP))和多瘤病毒的启动子和/ 或增强子。关于病毒调控元件及其序列的进一步描述,参见例如Stinski的美国 专利第5,168,062号、Bell等人的美国专利第4,510,245号专利和Schaffner的美 国专利第4,968,615号。
除了抗体链基因和调控序列以外,重组表达载体可携带额外的序列,诸如调 控载体在宿主细胞中复制的序列(例如,复制起始点)和选择标记基因。选择标记 基因有助于选择已引入了载体的宿主细胞(参见,例如,美国专利第4,399,216号、 第4,634,665号和第5,179,017号,均属于Axel等人)。例如,通常地,选择标记 基因为已引入了载体的宿主细胞赋予对药物诸如G418、嘌呤霉素、灭瘟素 (blasticidin)、潮霉素或甲氨蝶呤的抗性。合适的选择标记基因包括二氢叶酸还原 酶(DHFR)基因(以用于利用甲氨蝶呤选择/扩增的DHFR-宿主细胞)和neo基因 (以用于G418选择)。为了表达轻链和重链,通过标准技术将编码重链和轻链的 表达载体转染到宿主细胞中。术语“转染”的各种形式旨在涵盖通常用于将外源DNA引入原核或真核宿主细胞的多种技术,例如电穿孔、脂转染、磷酸钙沉淀、 DEAE-葡聚糖转染等。
在原核或真核宿主细胞中表达抗体是可能的。在某些实施方案中,在真核细 胞,例如哺乳动物宿主细胞中进行抗体的表达,以最佳地分泌适当折叠的具有免 疫活性的抗体。用于表达重组抗体的示例性哺乳动物宿主细胞包括中国仓鼠卵巢 (CHO)细胞(包括DHFR-CHO细胞,描述于Urlaub和Chasin,1980,Proc.Natl.Acad. Sci.USA 77:4216-4220中,与DHFR选择标记一起使用,例如,如Kaufman和 Sharp,1982,Mol.Biol.159:601-621中所述)、NS0骨髓瘤细胞、COS细胞、293 细胞和SP2/0细胞。当将编码抗体基因的重组表达载体引入哺乳动物宿主细胞 时,通过将宿主细胞培养足以允许抗体在宿主细胞中表达或将抗体分泌到宿主细 胞生长的培养基中的一段时间来产生抗体。可使用标准的蛋白质纯化方法从培养 基中回收抗体。还可将宿主细胞用来产生完整抗体的一部分,诸如Fab片段或scFv分子。
在一些实施方案中,ADC的抗体可以是双功能抗体。此类抗体(其中一条重 链和一条轻链对一种抗原是特异的,而另一条重链和轻链对第二种抗原是特异的) 可通过标准化学交联方法将抗体与第二种抗体交联来生产。双功能抗体也可通过 表达经工程化以编码双功能抗体的核酸来制备。
在某些实施方案中,双特异性抗体,即使用同一结合部位结合一种抗原和第 二种无关抗原的抗体,可通过突变轻链和/或重链CDR中的氨基酸残基来产生。 示例性第二抗原包括促炎细胞因子(诸如,淋巴毒素、干扰素-γ或白细胞介素-1)。 双特异性抗体可以例如通过突变抗原结合部位周围的氨基酸残基来产生(例如, 参见Bostrom等人,2009,Science323:1610-1614)。双功能抗体可通过表达经工 程化以编码双特异性抗体的核酸来制备。
抗体还可以通过化学合成(例如,通过Solid Phase Peptide Synthesis,第 2版,1984The Pierce Chemical Co.,Rockford,Ill中描述的方法)产生。抗体 还可使用无细胞平台(参见,例如,Chu等人,Biochemia No.2,2001(Roche Molecular Biologicals))产生。
Fc融合蛋白的重组表达方法描述于Flanagan等人,Methods in MolecularBiology,378卷:Monoclonal Antibodies:Methods and Protocols中。
一旦通过重组表达产生了抗体,就可通过本领域已知的用于纯化免疫球 蛋白分子的任何方法,例如,通过色谱法(例如,离子交换、亲和(特别是通 过在选择蛋白质A或蛋白质G后对抗原的亲和),以及分级柱色谱(sizing column chromatography))、离心法、差异溶解度法(differential solubility),或 通过用于纯化蛋白质的任何其它标准技术来纯化其。
一旦分离,如果需要,可将抗体进一步纯化,例如通过高效液相色谱法 (参见,例如,Fisher,Laboratory Techniques In Biochemistry And Molecular Biology(Work和Burdon,编辑,Elsevier,1980)),或通过SuperdexTM75柱 上的凝胶过滤色谱PharmaciaBiotech AB,Uppsala,Sweden)进行纯化。
治疗方法
靶标导向治疗(Target-Oriented Treatment)
缀合物的靶向部分可被细胞识别,从而提供所谓的靶标导向治疗。
在一些实施方案中,本文所述的缀合物包含本文所述的活性剂,例如式 (I)的活性剂。在一些此类实施方案中,活性剂是:
Figure BDA0003089692190000511
Figure BDA0003089692190000521
细胞增殖和凋亡
本文公开的化合物和缀合物可用于诱导细胞凋亡的方法中。
细胞凋亡失调与多种疾病相关,所述疾病包括例如自身免疫性疾病(例如, 系统性红斑狼疮、类风湿性关节炎、移植物抗宿主病、重症肌无力或
Figure BDA0003089692190000522
综 合征)、慢性炎症(例如,银屑病、哮喘或克罗恩病)、过度增殖性疾病(例如,乳腺癌、 肺癌)、病毒感染(例如,疱疹、乳头状瘤或HIV)和其它疾患,诸如骨关节炎和动 脉粥样硬化。本文所述的化合物、缀合物和组合物可用于治疗或改善任何这些疾 病。此类治疗通常包括向患有该疾病的受试者施用足以提供治疗益处的量的本文 所述的化合物、缀合物或组合物。施用的化合物、缀合物或组合物的抗体的身份 将取决于所治疗的疾病,因此抗体应当结合在其中抑制将是有益的细胞类型中表 达的细胞表面抗原。达到的治疗效果也将取决于所治疗的具体疾病。在某些情况 下,当作为单一疗法施用时,本文公开的化合物和组合物可以治疗或改善疾病本 身或疾病的症状。在其它情况下,本文公开的化合物和组合物可以是包括其它剂 的整体治疗方案的一部分,所述其它剂与本文公开的抑制剂或化合物和组合物一 起治疗或改善所治疗的疾病或疾病的症状。可作为本文公开的化合物和组合物的 辅助或与之一起施用的可用于治疗或改善特定疾病的剂,对本领域技术人员来说 是显而易见的。
尽管绝对治愈在任何治疗方案中总是可取的,但获得治愈并不需要提供治疗 益处。治疗益处可包括停止或减缓疾病的进展,使疾病消退而不治愈,和/或改 善或减缓疾病症状的进展。与统计平均值相比的延长的生存期和/或提高的生活 质量也可被视为治疗益处。
癌症是一类特殊的疾病,其涉及失调的细胞凋亡,并且是全球范围内的 重大健康负担。在具体的实施方案中,本文公开的化合物和组合物可用于治 疗癌症。癌症可以是例如实体瘤或血液肿瘤。可用本文公开的化合物和组合 物治疗的癌症包括但不限于膀胱癌、脑癌、乳腺癌、骨髓癌、宫颈癌、慢性 淋巴细胞性白血病、结直肠癌、食道癌、肝细胞癌、淋巴母细胞性白血病、 滤泡性淋巴瘤、T细胞或B细胞来源的淋巴样恶性肿瘤、黑色素瘤、骨髓性白血病、骨髓瘤、口腔癌、卵巢癌、非小细胞肺癌、慢性淋巴细胞性白血病、 骨髓瘤、前列腺癌、小细胞肺癌和脾癌。本文公开的化合物和组合物在癌症 治疗方面可能特别有益,因为抗体可用于特异性靶向肿瘤细胞,从而潜在地 避免或改善可能与未缀合的抑制剂的全身性施用相关的不良副作用和/或毒 性。一个实施方案涉及治疗涉及失调的内在细胞凋亡的疾病的方法,所述方 法包括向患有涉及失调的细胞凋亡的疾病的受试者施用有效地提供治疗 益处的量的本文公开的化合物和组合物,其中本文公开的化合物和组合物的 配体结合其内在细胞凋亡失调的细胞上的细胞表面受体。一个实施方案涉及 治疗癌症的方法,所述方法包括以有效提供治疗益处的量向患有癌症的受试 者施用本文公开的化合物和组合物,其中所述配体能够结合细胞表面受体或 在癌细胞表面上表达的肿瘤相关抗原。
在致瘤性癌症的情况下,与所治疗癌症的类型和分期的统计平均值相 比,治疗益处除了包括上述效果之外,还可特别地包括停止或减缓肿瘤生长 的进程、使肿瘤生长消退、根除一个或多个肿瘤和/或提高患者存活率。在 一个实施方案中,被治疗的癌症是致瘤性癌症。
本文公开的化合物和缀合物可以作为单一疗法施用以提供治疗益处,或 者可以作为其它化学治疗剂和/或放射疗法的辅助施用或与所述其它化学治 疗剂和/或放射疗法一起施用。本文公开的化合物和组合物可用作其辅助疗 法的化学治疗剂可以是靶向的(例如,ADC、蛋白激酶抑制剂等)或非靶向的 (例如,非特异性细胞毒性剂诸如放射性核苷酸、烷化剂和嵌入剂)。本文公 开的化合物和组合物可以辅助给药的非靶向化学治疗剂包括但不限于甲氨 蝶呤、紫杉醇、L-天冬酰胺酶、巯基嘌呤、硫鸟嘌呤、羟基脲、阿糖胞苷、 环磷酰胺、异环磷酰胺、亚硝脲类、顺铂、卡铂、丝裂霉素、达卡巴嗪、丙 卡巴嗪(procarbizine)、拓扑替康、氮芥、环磷酰胺(Cytoxan)、依托泊苷、5- 氟尿嘧啶、BCNU、伊立替康、喜树碱、博莱霉素、多柔比星、伊达比星、 柔红霉素、更生霉素、普卡霉素、米托蒽醌、asperaginase、长春碱、长春新 碱、长春瑞滨、紫杉醇、加利车霉素和多西他赛。
本文公开的化合物和缀合物可能不能有效地作为单一疗法来治疗癌症, 可以作为其它化学治疗剂或放射疗法的辅助施用或与其它化疗剂或放射疗 法一起施用,以提供治疗益处。一个实施方案涉及其中以有效地使肿瘤细胞 对标准化学疗法和/或放射疗法敏感的量施用本文公开的化合物或组合物的 方法。因此,在治疗癌症的背景下,“治疗益处”包括在尚未开始这种疗法或 已经始这种疗法但尚未表现出抗性体征的患者中,将本文公开的化合物和组合物 作为化学治疗剂和/或放射疗法的辅助施用或与化学治疗剂和/或放射疗法一起施 用,或者在已开始表现出抗性体征的患者中,将所述化合物和组合物作为使肿瘤 对化学疗法和/或放射疗法敏感的手段施用。
药物组合物及其施用
本文公开的化合物和缀合物可用于治疗有此需要的个体。在某些实施方案 中,个体是哺乳动物,诸如人,或非人类哺乳动物。当向动物诸如人施用时,组 合物或化合物优选以包含例如公开的化合物和药学上可接受的载体的药物组合 物的形式施用。
药学上可接受的载体是本领域公知的,包括例如水溶液,诸如水或生理缓冲 盐水或其它溶剂或媒介物,诸如乙二醇、甘油、油诸如橄榄油或可注射的有机酯。 在优选实施方案中,当此类药物组合物用于人施用,特别是用于侵入性施用途径 (即绕过上皮屏障转运或扩散的途径,诸如注射或植入)时,水溶液是无热原的, 或基本上无热原的。可以选择赋形剂,例如,以实现药物的延迟释放或选择性地 靶向一种或多种细胞、组织或器官。药物组合物可呈剂量单位形式,诸如片剂、 胶囊(包括喷洒胶囊和明胶胶囊)、颗粒剂、用于复原的冻干剂、粉剂、溶液、糖 浆剂、栓剂、注射剂等。组合物也可存在于经皮肤递送系统中,例如皮肤贴剂。 组合物也可存在于适合局部施用的溶液中,诸如软膏或霜剂。
药学上可接受的载体可包含生理上可接受的剂,所述剂例如用于稳定化合物 诸如本发明的化合物、增加其溶解度或增加其吸收。此类生理上可接受的剂包括, 例如,碳水化合物,诸如葡萄糖、蔗糖或葡聚糖、抗氧化剂,诸如抗坏血酸或谷 胱甘肽、螯合剂,低分子量蛋白质或其它稳定剂或赋形剂。药学上可接受的载体 (包括生理上可接受的剂)的选择取决于例如组合物的给药途径。药物组合物的制 剂可以是自乳化药物递送系统或自微乳化药物递送系统。药物组合物(制剂)也可 以是脂质体或其它聚合物基质,其可在其中掺入例如本发明的化合物。例如,包 含磷脂或其它脂质的脂质体是无毒的、生理上可接受的和可代谢的载体,其制备 和施用相对简单。
短语“药学上可接受的”在本文中用于指在合理的医学判断范围内,适合用于 与人类和动物的组织接触而没有过度毒性、刺激、过敏反应或其它问题或并发症, 与合理的益处/风险比相称的那些化合物、材料、组合物和/或剂型。
如本文中所用,短语“药学上可接受的载体”是指药学上可接受的材料、组合 物或媒介物,诸如液体或固体填料、稀释剂、赋形剂、溶剂或包封材料。每种载 体必须在与制剂的另外的成分相容并且对患者无害的意义上是“可接受的”。可用 作药学上可接受的载体的材料的一些实例包括:(1)糖类,诸如乳糖、葡萄糖和 蔗糖;(2)淀粉,诸如玉米淀粉和马铃薯淀粉;(3)纤维素及其衍生物,诸如羧甲 基纤维素钠、乙基纤维素和醋酸纤维素;(4)粉末黄芪胶;(5)麦芽;(6)明胶;(7) 滑石;(8)赋形剂,诸如可可脂和栓剂蜡;(9)油类,诸如花生油、棉籽油、红花 油、芝麻油、橄榄油、玉米油和大豆油;(10)二醇类,诸如丙二醇;(11)多元醇 类,诸如甘油、山梨醇、甘露醇和聚乙二醇;(12)酯类,诸如油酸乙酯和月 桂酸乙酯;(13)琼脂;(14)缓冲剂类,诸如氢氧化镁和氢氧化铝;(15)藻酸; (16)无热原水;(17)等渗盐水;(18)林格氏溶液;(19)乙醇;(20)磷酸盐缓冲 溶液;和(21)药物制剂中使用的其它无毒相容性物质。
可通过多种施用途径中的任一种向受试者施用药物组合物(制剂),所述 施用途径包括例如口服(例如,以水溶液或非水溶液或悬浮液、片剂、胶囊(包 括喷洒胶囊和明胶胶囊)、药丸剂、粉剂、颗粒剂、涂于舌头的糊剂的形式 给药);通过口腔粘膜的吸收(例如,舌下);经肛门、经直肠或经阴道(例如, 作为阴道栓剂、霜剂或泡沫);胃肠外(包括肌内、静脉内、皮下或鞘内,例 如无菌溶液或悬浮液);经鼻;腹膜内;皮下;经皮肤(例如作为涂于皮肤的 贴片);和局部(例如,作为涂在皮肤上的霜剂、软膏或喷雾剂,或作为滴眼 剂)。所述化合物也可以配制用于吸入。在某些实施方案中,可以仅将化合 物溶解或悬浮在无菌水中。合适的施用途径和适合所述施用途径的组合物的 细节可见于例如美国专利第6,110,973号、第5,763,493号、第5,731,000号、 第5,541,231号、第5,427,798号、第5,358,970号和第4,172,896号,以及其 中引用的专利中。
制剂可以方便地以单位剂量形式存在,并且可通过制药领域公知的任何 方法来制备。可与载体材料结合以产生单一剂型的活性成分的量将根据被治 疗的宿主、特定的施用方式而变化。可与载体材料结合以产生单一剂型的活 性成分的量通常是产生治疗效果的化合物的那个量。通常,以百分数计,该 量的范围为约1%至约99%的活性成分,优选约5%至约70%,最优选约10% 至约30%。
制备这些制剂或组合物的方法包括将活性化合物诸如本发明的化合物 与载体和任选的一种或多种辅助成分结合的步骤。一般而言,制剂是通过将 本发明的化合物与液体载体或细碎固体载体或两者均匀而密切地结合,然 后,如果需要,将产品成型来制备的。
适于口服施用的本发明的制剂可呈胶囊(包括喷洒胶囊和明胶胶囊)、扁 囊剂、丸剂、片剂、锭剂(使用调味基质,通常为蔗糖和阿拉伯胶或黄蓍胶)、 亲液剂、粉剂、颗粒的形式,或作为水溶液或非水溶液中的溶液或悬浮液, 或作为水包油或油包水的液体乳液,或作为酏剂或糖浆剂,或作为软锭剂 (pastille)(使用惰性基质,诸如明胶和甘油,或蔗糖和阿拉伯胶)和/或作为漱 口剂等,每种含有预定量的本发明化合物作为活性成分。化合物、缀合物或 其组合物还可作为药丸剂、干药糖剂或糊剂施用。
为了制备用于口服施用的固体剂型(胶囊(包括喷洒胶囊和明胶胶囊)、片 剂、丸剂、锭剂、粉剂、颗粒剂等),将活性成分与一种或多种药学上可接 受的载体(诸如柠檬酸钠或磷酸二钙)和/或以下的任一种混合:(1)填充剂或增 充剂,诸如淀粉、乳糖、蔗糖、葡萄糖、甘露醇和/或硅酸;(2)粘合剂,诸 如羧甲基纤维素、藻酸盐类、明胶、聚乙烯吡咯烷酮、蔗糖和/或阿拉伯胶;(3)保湿剂,诸如甘油;(4)崩解剂,诸如琼脂、碳酸钙、马铃薯或木薯淀粉、藻 酸、某些硅酸盐和碳酸钠;(5)溶液阻溶剂,诸如石蜡;(6)吸收促进剂,诸如季 铵化合物类;(7)润湿剂,例如鲸蜡醇和单硬脂酸甘油酯;(8)吸附剂,诸如高岭 土和膨润土;(9)润滑剂,诸如滑石、硬脂酸钙、硬脂酸镁、固体聚乙二醇、十 二烷基硫酸钠及其混合物;(10)络合剂,诸如改性和未改性的环糊精;和(11)着 色剂。在胶囊(包括喷洒胶囊和明胶胶囊)、片剂和丸剂的情况下,药物组合物还 可包含缓冲剂。类似类型的固体组合物也可用作软填充和硬填充明胶胶囊中的填 充剂,使用诸如乳糖或乳糖的赋形剂,以及高分子量聚乙二醇等。
片剂可通过压缩或模塑制成,任选地具有一种或多种辅助成分。压缩片剂可 使用粘合剂(例如,明胶或羟丙基甲基纤维素)、润滑剂、惰性稀释剂、防腐剂、 崩解剂(例如,淀粉羟乙酸钠或交联的羧甲基纤维素钠)、表面活性剂或分散剂来 制备。模制片剂可通过在合适的机器中对用惰性液体稀释剂润湿的粉末状化合物 的混合物进行模制来制备。
片剂和药物组合物的其它固体剂型,诸如锭剂、胶囊(包括喷洒胶囊和明胶 胶囊)、丸剂和颗粒剂,可以任选地用包衣和壳,诸如肠溶包衣和药物配制领域 中熟知的其它包衣进行刻痕或制备。还可使用例如不同比例的羟丙基甲基纤维素 (以提供所需的释放曲线)、其它聚合物基质、脂质体和/或微球将它们配制成提供 其中的活性成分的缓慢或受控释放。它们可以通过例如通过保菌过滤器过滤来灭 菌,或者通过以无菌固体组合物的形式加入灭菌剂来灭菌,可在使用前立即将所 述无菌固体组合物溶解在无菌水或一些其它无菌注射介质中。这些组合物还可任 选地包含遮光剂,并且可以是这样的组合物,即它们仅或优先在胃肠道的特定部 分释放(任选地以延迟的方式)一种或多种活性成分。可使用的埋植组合物 (embedding composition)的实例包括聚合物质和蜡类。如果合适的话,活性成分 还可以与一种或多种上述赋形剂一起为微囊形式。
用于口服施用的液体剂型包括药学上可接受的乳剂、用于复原的冻干剂(lyophiles)、微乳剂、溶液、悬浮液、糖浆剂和酏剂。除了活性成分之外,液体 剂型还可包含本领域常用的惰性稀释剂,例如水或其它溶剂、环糊精及其衍生物、 增溶剂和乳化剂,诸如乙醇、异丙醇、碳酸乙酯、乙酸乙酯、苯甲醇、苯甲酸苄 酯、丙二醇、1,3-丁二醇、油(特别是棉籽油、花生油、玉米油、胚芽油、橄榄油、 蓖麻油和芝麻油)、甘油、四氢糠醇、聚乙二醇及脱水山梨糖醇的脂肪酸酯,以 及其混合物。
除了惰性稀释剂以外,口服组合物还可以包括佐剂,例如润湿剂、乳化剂和 助悬剂、甜味剂、调味剂、着色剂、芳香剂和防腐剂。
除了活性化合物以外,悬浮液还可包含助悬剂,例如乙氧基化异硬脂醇、聚 氧乙烯山梨醇和脱水山梨糖醇酯、微晶纤维素、偏氢氧化铝、膨润土、琼脂和黄 蓍胶,以及其混合物。
用于直肠、阴道或尿道施用的药物组合物的制剂可作为栓剂提供,其可通过 将一种或多种活性化合物与一种或多种合适的非刺激性赋形剂或载体混合来制 备,所述赋形剂或载体包括例如可可脂、聚乙二醇、栓剂蜡或水杨酸酯,并 且其在室温下是固体,但在体温下是液体,因此将在直肠或阴道腔中熔化并 释放活性化合物。
用于口腔施用的药物组合物的制剂可作为漱口水或口腔喷雾剂或口腔 软膏提供。
可选地或加外地,组合物可被配制成通过导管、支架、线或其它管腔内 装置递送。通过此类装置的递送对于递送至膀胱、尿道、输尿管、直肠或肠 可以是特别有用的。
适于阴道施用的制剂还包括阴道栓剂、棉塞、霜剂、凝胶、糊剂、泡沫 或喷雾制剂,其含有本领域已知的合适的此类载体。
局部或经皮肤施用的剂型包括粉剂、喷雾剂、软膏、糊剂、霜剂、洗剂、 凝胶、溶液、贴剂和吸入剂。可将活性化合物在无菌条件下与药学上可接受 的载体以及可能需要的任何防腐剂、缓冲剂或喷射剂混合。
除了活性化合物以外,软膏、糊剂、霜剂和凝胶还可包含赋形剂,诸如 动物和植物脂肪、油、蜡、石蜡、淀粉、黄蓍胶、纤维素衍生物、聚乙二醇、 硅酮、膨润土、硅酸、滑石和氧化锌,或其混合物。
除了活性化合物以外,粉剂和喷雾剂还可包含赋形剂,诸如乳糖、滑石、 硅酸、氢氧化铝、硅酸钙和聚酰胺粉末,或这些物质的混合物。喷雾剂还可 包含常规喷射剂,诸如氯氟烃和挥发性未取代的烃,诸如丁烷和丙烷。
透皮贴剂具有额外的优点,即向身体提供本发明化合物的受控递送。此 类剂型可通过将活性化合物溶解或分散在合适的介质中来制备。吸收促进剂 也可用来增加化合物穿过皮肤的流动。这种通动的速率可通过提供速率控制 膜或将化合物分散在聚合物基质或凝胶中来控制。
眼科制剂、眼膏、粉剂、溶液等也被认为在本发明的范围内。示例性眼 科制剂描述于美国公布第2005/0080056号、第2005/0059744号、第 2005/0031697号和第2005/004074号以及美国专利第6,583,124号中,所述 公布和专利的内容通过引用并入本文。如果需要,液体眼科制剂具有与泪液、 房水或玻璃体液相似的性质,或者与此类流体相容。
如本文中所用,短语“胃肠外施用”和“胃肠外地施用”意指除了肠内和局 部施用以外的施用方式,通常是通过注射,并且包括但不限于静脉内、肌内、 动脉内、鞘内、囊内、眶内、心内、真皮内、腹膜内、经气管、皮下、关节 内、包囊下、蛛网膜下、椎管内和胸骨内注射和输注。
适于胃肠外施用的药物组合物包含一种或多种活性化合物与一种或多 种药学上可接受的无菌等渗水性或非水性溶液、分散体、悬浮液或乳液或无 菌粉末的组合,可在即将使用时将所述无菌粉末复原为无菌注射溶液或分散 体,所述无菌注射溶液或分散体可包含抗氧化剂、缓冲剂、抑菌剂、使制剂 与预期受者的血液等渗的溶质或助悬剂或增稠剂。
可用于本发明的药物组合物的合适的水性和非水性载体的实例包括水、 乙醇、多元醇(诸如甘油、丙二醇、聚乙二醇等)及其合适的混合物、植物油(诸如 橄榄油)和可注射的有机酯(诸如油酸乙酯)。例如,可以通过使用包衣材料诸如卵 磷脂,通过在分散体的情况下保持所需的粒度,以及通过使用表面活性剂来保持 适当的流动性。
这些组合物还可包含佐剂,诸如防腐剂、润湿剂、乳化剂和分散剂。通过包 含各种抗细菌和抗真菌剂,例如对羟基苯甲酸酯、氯丁醇、苯酚山梨酸等,可以 确保防止微生物的作用。还可能期望在将等渗剂,诸如糖、氯化钠等包含到组合 物中。另外,可注射药物形式的延长吸收可通过包含延迟吸收的试剂诸如单硬脂 酸铝和明胶来实现。
在一些情况下,为了延长药物的作用,需要减缓药物从皮下或肌内注射中的 吸收。这可通过使用水溶性差的晶体或无定形材料的液体悬浮液来实现。因此药 物的吸收速率取决于其溶解速率,而溶解速率又取决于晶体尺寸和晶体形式。或 者,胃肠外施用的药物形式的延迟吸收通过将药物溶解或悬浮在油媒介物中来实 现。
可注射储库形式是通过在生物可降解聚合物诸如聚丙交酯-聚乙交酯(polylactide-polyglycolide)中形成主题化合物的微囊化基质来制备的。根据药物与 聚合物的比例以及所用特定聚合物的性质,可以控制药物释放的速率。其它生物 可降解聚合物的例子包括聚(原酸酯)和聚(酸酐)。还通过将药物包裹在与身体组 织相容的脂质体或微乳剂中来制备可注射储库制剂。
为了在本发明的方法中使用,可将活性化合物本身单独施用或将其作为药 物组合物施用,所述药物组合物包含例如0.1%至约99.5%(更优选约0.5%至约 90.0%)的与药学上可接受的载体组合的活性成分。
在本发明的一些实施方案中,可将本发明的化合物与一种或多种另外的化合 物/剂联合施用。
在某些此类实施方案中,联合施用是同时的。在某些此类实施方案中,将本 发明的化合物与一种或多种另外的化合物共同配制。在某些其它此类实施方案 中,将本发明的化合物与一种或多种另外的化合物分开但同时施用。在某些此类 实施方案中,联合施用是连续的,在施用一种或多种另外的化合物之前或之后数 分钟或数小时,施用本发明的化合物。
引入本发明化合物的方法还可由可再装填或可生物降解的装置提供。近年 来,已经开发了各种缓释聚合物装置,并在体内测试了其药物(包括蛋白质生物 药物)的受控递送。各种生物相容性聚合物(包括水凝胶),包括生物可降解和不可 降解的聚合物,可用于形成植入物,用于在特定的靶部位持续释放化合物。
药物组合物中活性成分的实际剂量水平可以变化,以获得对特定患者、组合 物和施用方式实现所需治疗反应有效而对患者无毒的活性成分的量。
所选择的剂量水平将取决于多种因素,包括所使用的特定化合物、缀合物或 化合物和/或缀合物的组合、或其酯、盐或酰胺的活性、施用途径、施用时间、 所使用的一种或多种特定化合物的排泄速率、治疗持续时间、与所使用的一种或 多种特定化合物结合使用的其它药物、化合物和/或材料、所治疗患者的年 龄、性别、体重、状况、一般健康状况和既往病史,以及医学领域中公知的 类似因素。
具有本领域普通技术的医生或兽医可以容易地确定和开出所需药物组 合物的治疗有效量。例如,医生或兽医可以将药物组合物或化合物的起始剂 量设定在低于达到所需治疗效果所需的水平,并逐渐增加剂量,直到达到所 需效果。“治疗有效量”是指足以引起所需治疗效果的化合物浓度。一般认为, 化合物的有效量将根据受试者的体重、性别、年龄和病史而变化。影响有效 量的其它因素可包括但不限于患者疾患的严重程度、所治疗的病症、化合物 的稳定性,以及如果需要,与本发明的化合物一起施用的另一种类型的治疗剂。可通过多次施用剂来递送更大的总剂量。确定功效和剂量的方法是本领 域技术人员已知的(Isselbacher等人(1996)Harrison’s Principles of Internal Medicine第13版,1814-1882,通过引用并入本文)。
一般而言,用于本发明的组合物和方法的活性化合物的合适日剂量将是 有效产生治疗效果的最低剂量的化合物的那个量。这种有效剂量通常取决于 上述因素。
如果需要,可将活性化合物或缀合物的有效日剂量以合适的间隔在一天 中以1个、2个、3个、4个、5个、6个或更多个分开施用的亚剂量施用, 任选地以单位剂型施用。在本发明的某些实施方案中,可以每天施用活性化 合物两次或三次。在优选实施方案中,将每天施用活性化合物一次。
接受这种治疗的患者是任何有需要的动物,包括灵长类动物,特别是人, 以及其它哺乳动物诸如马、牛、猪和绵羊;以及家禽和宠物。
在某些实施方案中,可将本文公开的化合物或缀合物单独使用或与另一 种类型的治疗剂联合施用。如本文中所用,短语“联合施用”是指两种或更多 种不同治疗性化合物或缀合物的任何施用形式,所述施用形式使得在先前施 用的治疗性化合物或缀合物在体内仍然有效的同时施用第二种化合物或缀 合物(例如,两种化合物或缀合物在患者体内同时有效,这可包括两种化合 物或缀合物的协同作用)。例如,可将不同的治疗性化合物或缀合物在同一 制剂中或在单独的制剂中同时或依次施用。在某些实施方案中,可在1小时内、12小时内、24小时内、36小时内、48小时内、72小时内、一周内或 一周以上的时间内施用不同的治疗性化合物或缀合物。因此,接受这种治疗 的个体可以受益于不同治疗性化合物或缀合物的联合作用。
本发明包括本文公开的化合物或缀合物的药学上可接受的盐的用途。在 某些实施方案中,本发明的设想的盐包括但不限于烷基、二烷基、三烷基或 四烷基铵盐。在某些实施方案中,本发明的设想的盐包括但不限于L-精氨 酸、苯乙苄胺(benenthamine)、苄星、甜菜碱、氢氧化钙、胆碱、地阿诺(deanol)、 二乙醇胺、二乙胺、2-(二乙基胺基)乙醇、乙醇胺、乙二胺、N-甲基葡糖胺、 海巴明(hydrabamine)、1H-咪唑、锂、L-赖氨酸、镁、4-(2-羟乙基)吗啉、哌 嗪、钾、1-(2-羟乙基)吡咯烷、钠、三乙醇胺、氨丁三醇和锌盐。在某些实施方 案中,本发明的设想的盐包括但不限于Na、Ca、K、Mg、Zn或其它金属盐。
药学上可接受的酸加成盐还可以以各种溶剂化物的形式(诸如与水、甲醇、 乙醇、二甲基甲酰胺等一起)存在。还可制备此类溶剂化物的混合物。这种溶剂 化物的来源可来自结晶的溶剂、制备或结晶的溶剂中固有的、或者外加入这类溶 剂中的。
湿润剂、乳化剂和润滑剂,诸如十二烷基硫酸钠和硬脂酸镁,以及着色剂、 脱模剂、包衣剂、甜味剂、调味剂和芳香剂、防腐剂和抗氧化剂也可以存在于组 合物中。
药学上可接受的抗氧化剂的实例包括:(1)水溶性抗氧化剂,诸如抗坏血酸、 半胱氨酸盐酸盐、硫酸氢钠、偏亚硫酸氢钠、亚硫酸钠等;(2)油溶性抗氧化剂, 诸如抗坏血酸棕榈酸酯、丁基化羟基苯甲醚(BHA)、丁基化羟基甲苯(BHT)、卵 磷脂、没食子酸丙酯、α-生育酚等;和(3)金属螯合剂,诸如柠檬酸、乙二胺四乙 酸(EDTA)、山梨糖醇、酒石酸、磷酸等。
实施例
现已总体描述了本发明,通过参考以下实施例,将更易于理解本发明,将所 述实施例包括在内仅仅是为了阐明本发明的某些方面和实施方案,并不意图限制 本发明。
合成方案
缩写
AcO: 乙酰基
AcOH: 乙酸
EA: 乙酸乙酯
DCM: 二氯甲烷
m-CPBA: 间氯过氧苯甲酸
TBDMSOTf: 三氟甲磺酸叔丁基二甲基甲硅烷基酯
TBDMS: 叔丁基二甲基甲硅烷基
DMF: 二甲基甲酰胺
EDCI: 1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺
HOBt: 1-羟基苯并三唑水合物
ACN: 乙腈
TBDMS-Cl: 叔丁基二甲基甲硅烷基氯
DBU: 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯
THF: 四氢呋喃
DCC: N,N’-二环己基碳二亚胺
DMAP: 4-二甲基氨基吡啶
NHS: N-羟基琥珀酰亚胺
DIPEA: 二异丙基乙胺
TEA: 三乙胺
DEAD: 偶氮二甲酸二乙酯
Boc: 叔丁氧羰基
LAH: 氢化锂铝
CDI: 1,1’-羰基二咪唑
BEMP: 2-叔丁基亚氨基-2-二乙基氨基-1,3-二甲基全氢-1,3,2-二氮 杂膦
TPSCl: 三苯基氯硅烷
tfa: 三氟乙酰基
PyBop: 苯并三唑-1-基-氧基三吡咯烷子基鏻六氟磷酸盐
HBTU: N,N,N’,N’-四甲基-O-(1H-苯并三唑-1-基)脲鎓六氟磷酸盐
TFA: 三氟乙酸
DIC: N,N’-二异丙基碳二亚胺
DMPA: 2,2-二甲氧基-2-苯基苯乙酮
TBAF: 四正丁基氟化铵
AgOTf: 三氟甲磺酸银
(BimC4A)3: 5,5’,5”-[2,2’,2”-次氮三(亚甲基)三(1H-苯并咪唑-2,1-二基
)]三戊酸三钾水合物 表A
Figure BDA0003089692190000611
Figure BDA0003089692190000621
Figure BDA0003089692190000631
接头的制备
实施例1:化合物L-1的制备
Figure BDA0003089692190000632
化合物L-1-1的制备
在-78℃和N2气氛下,向5-羟基间苯二甲酸二甲酯(5g,23.79mmol)在 无水THF(300mL)中的溶液中滴加LAH(3.6g,95.15mmol)。将反应混合物 在室温下搅拌17小时。反应完成后,加入15%NaOH溶液(4mL)、H2O(8mL) 和EA(100mL),然后将反应混合物搅拌1小时。过滤混合物,并减压浓缩。 将残留物通过柱色谱纯化,得到化合物L-1-1(3.02g,82%)。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ6.66(s,1H),6.58(s,2H),4.38(s,4H)。
化合物L-1-2的制备
在N2气氛下,将化合物L-1-1(2g,12.97mmol)的溶液溶解在HBr(5.0 mL,在AcOH中33%)中。在60℃搅拌18小时后,通过加入NaHCO3溶液 (pH~8)猝灭反应物。然后在反应混合物中加入蒸馏水(50mL)和EA(100mL ×2)。将有机层经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。将残留物通过柱色 谱纯化,得到化合物L-1-2(2.9g,80%)。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ6.99(s,1H),6.81(s,2H),4.85(s,2H),4.41 (s,2H)。
化合物L-1的制备
在室温和N2气氛下,向化合物L-1-2(100mg,0.36mmol)在无水DCM(3 mL)中的溶液中加入咪唑(27mg,0.39mmol)和TBDMS-Cl(59mg,0.39 mmol)。搅拌16小时后,在反应混合物中加入蒸馏水(50mL)和EA(100mL)。 将有机层经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。将残留物通过柱色谱纯化, 得到化合物L-1(110mg,79%)。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.00(s,1H),6.80(s,2H),4.41(s,4H),0.99 (s,9H),0.21(s,6H)。
实施例2:化合物L-2的制备
Figure BDA0003089692190000633
化合物L-2-1的制备
在0℃和N2气氛下,向3,5-吡啶二羧酸(1.0g,5.98mmol)在无水THF(50 mL)中的溶液中加入三氟化硼四氢呋喃络合物(30.0mL,30.0mmol,1M THF)。使 反应物升温至室温并搅拌18小时。将混合物用2N HCl猝灭直至pH 2,并用蒸 馏水(20mL)和EA(50mL×2)萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥,过滤并减压 浓缩。将残留物通过制备型TLC纯化,得到化合物L-2-1(363mg,48%)。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.38(s,2H),7.99(s,1H),5.59(t,J=4.0Hz, 2H),4.61(d,J=5.2Hz,2H)。
化合物L-2的制备
将L-2-1(100mg,0.72mmol)和HBr(1.5mL,在AcOH中48%)的混合物在 120℃搅拌3小时。用NaHCO3溶液猝灭反应物直至pH~8。向其中加入蒸馏水(20 mL)和EA(50mL×2)。将有机层经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。将残留 物通过制备型TLC纯化,得到化合物L-2(123.5mg,65%)。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ8.56(s,2H),7.77(s,1H),4.47(s,2H)。
实施例3:化合物L-3的制备
Figure BDA0003089692190000641
化合物L-3-1的制备
在室温和N2气氛下,用NaOH(1.07g,26.67mmol)处理4-氯吡啶-盐酸盐(1.0 g,6.67mmol)和二乙醇胺(1.05g,10.00mmol)在H2O(12mL)中的溶液,并使用微 波反应器加热至110℃,持续1小时。将反应物用蒸馏水(18mL)/甲醇(10mL)猝 灭并用EA(200mL)萃取之后。将有机层经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。 将残留物通过柱色谱纯化,得到化合物L-3-1(160mg,13%)。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.10(d,J=5.6Hz,2H),6.83(d,J=6.0Hz, 2H),4.91(br s,2H),3.57(s,8H)。EI-MS m/z:183(M++1)。
化合物L-3的制备
将化合物L-3-1(10mg,0.05mmol)和HBr(2.0mL,在水中48%)的混合物在 微波中于150℃下反应3小时。在混合物减压浓缩后,将化合物L-3直接用于下 一步骤而无需进一步纯化。(20mg)。EI-MS m/z:309(M++1)。
实施例4:化合物Int-1的制备
Figure BDA0003089692190000651
化合物Int-1-1的制备
向香草酸(50.0g,0.30mol)在MeOH(700mL)中的溶液中滴加SOCl2 (207mL,2.85mol),并在0℃和N2气氛下搅拌。使反应混合物升温至室温并 搅拌过夜。将混合物减压浓缩,并将pH调节至7-8。用蒸馏水(100mL)和 EA(200mL×2)萃取混合物。将有机层经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓 缩。将残留物通过柱色谱纯化,得到化合物Int-1-1(54.2g,定量)
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.64(dd,J=6.4,1.6Hz,1H),7.55(s,1H), 6.94(d,J=8.4Hz,1H),6.05(s,1H),3.95(s,3H),3.89(s,3H)。
化合物Int-1-2的制备
在N2气氛下,向化合物Int-1-1(54.2g,0.30mol)在DMF(200mL)中的 溶液中加入K2CO3(61.6g,0.45mol)和苄基溴(39.0mL,0.33mol)。在100℃ 搅拌6小时后,将混合物冷却至室温,并用蒸馏水(100mL)和EA(200mL× 2)稀释。将有机层经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。将残留物通过柱 色谱纯化,得到化合物Int-1-2(79.8g,98%)。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.60(dd,J=6.4,2.0Hz,1H),7.56(d,J= 2.0Hz,1H),7.44-7.31(m,5H),6.89(d,J=8.4Hz,1H),5.22(s,2H),3.94(s, 3H),3.88(s,3H)。
化合物Int-1-3的制备
在0℃和N2气氛下,向化合物Int-1-2(79.8g,0.29mol)在乙酸酐(550mL) 中的溶液中加入硝酸铜(II)半-(五水合物)(75.0g,0.32mol)。将混合物在0℃ 搅拌6小时,用冰水(800mL)猝灭反应物,并且固体析出。将固体过滤并用 蒸馏水(100mL)和己烷(200mL X2)洗涤,得到化合物Int-1-3(85.5g,92%)。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.52(s,1H),7.45-7.35(m,5H),7.08(s,1H), 5.22(s,2H),3.98(s,3H),3.91(s,3H)。
化合物Int-1-4的制备
向化合物Int-1-3(85.5g,0.27mol)在THF(800mL)和MeOH(300mL)中 的溶液中加入2N NaOH(404mL,0.81mol)。在65℃下搅拌5小时后,将反 应物冷却至室温,并通过加入2NHCl溶液调节至pH 2,然后用蒸馏水(100 mL)和EA(300mL X2)萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓 缩。将残余固体收集,并用己烷洗涤,得到化合物Int-1-4(79.2g,97%)。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ7.69(s,1H),7.47-7.35(m,5H),7.03(s,1H), 5.24(s,2H),3.91(s,3H)。
化合物Int-1的制备
向化合物Int-1-4(100mg,0.33mmol)在无水THF(500μL)和无水DCM(1.5 mL)中的溶液中缓慢滴加草酰氯(42.4μL),并在0℃和N2气氛下加入1滴DMF。 搅拌30分钟后,将反应混合物减压浓缩。将化合物Int-1直接用于下一步骤而无 需进一步纯化。
实施例5:化合物L-4的制备
Figure BDA0003089692190000661
在室温和N2气氛下,向化合物L-1-2(1.0g,3.57mmol)在DCM(35mL)中的 溶液中加入TEA(0.45mL,3.21mmol)。通过气球引入SO2F2气体,并将混合物 在室温下搅拌1小时。然后将混合物用DCM(50mL)洗涤,并加入水(30mL)。 将有机层用NaHCO3水溶液洗涤,用无水Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将 残留物通过柱色谱纯化,得到化合物L-4(941.7mg,73%)。
1H NMR(400Hz,CDCl3)δ7.47(s,1H),7.32(s,2H),4.46(s,4H)。
实施例6:化合物L-5的制备
Figure BDA0003089692190000662
化合物L-5-1的制备
在N2气氛下,将KI(294mg,1.77mmol)和Ag2O(4.92g,19.48mmol)加入到 六乙二醇(5.0g,17.71mmol)在无水DCM(178mL)中的溶液中。将混合物在室温 下搅拌过夜。反应完成后,将混合物通过硅藻土过滤,并用DCM(100mL)洗涤。 将滤液减压浓缩。将残留物通过柱色谱纯化,得到化合物L-5-1(5.98g,73%)。
1H NMR(400Hz,CDCl3)δ7.80(d,J=8.4Hz,2H),7.35(d,J=8.4Hz,2H), 4.16(t,J=4.8Hz,2H),3.71-3.58(m,22H),2.88(br,1H),2.45(s,3H)。
化合物L-5-2的制备
在N2气氛下,向化合物L-5-1(5.98g,13.7mmol)在DMF(30mL)中的溶液 中加入NaN3(1.34g,20.55mmol)。将混合物在110℃搅拌1小时,并减压浓缩。 将残留物通过柱色谱纯化,得到化合物L-5-2(4.1g,97%)。
1H NMR(400Hz,CDCl3)δ3.72-3.60(m,22H),3.39(t,J=4.8Hz,2H),2.78 (br,1H)。
化合物L-5的制备
在室温下,将5%Pd/C(1.04g,0.49mmol)加入到搅拌的L-5-2(1.0g,3.25 mmol)在EtOH(5mL)中的溶液中。将氢气鼓泡通过反应混合物4小时。将混合 物通过硅藻土过滤以除去Pd/C,并减压浓缩。在将残留物溶解在DCM(25 mL)中后,向其中加入BOC2O(852.1mg,3.9mmol)。将混合物在室温下搅拌 3小时。将混合物减压浓缩。将残留物通过柱色谱纯化,得到化合物L-5(330 mg,28%)。
1H NMR(400Hz,CDCl3)δ5.19(br s,1H),3.73(t,J=4.8Hz,2H),3.67(s, 12H),3.63-3.60(m,6H),3.54(t,J=5.2Hz,2H),3.34-3.27(m,1H),1.44(s, 9H)。
EI-MS m/z:382(M++1)。
实施例7:化合物L-6的制备
Figure BDA0003089692190000671
通过与Journal of Polymer Science,Part A:Polymer Chemistry,2012, 50(19),3986-3995(通过引用并入本文)中所述类似的合成途径合成了化合物 L-6。
化合物L-6-1的制备
收率为30%
1H NMR(400Hz,CDCl3)δ7.80(d,J=8.4Hz,2H),7.34(d,J=8.4Hz, 2H),4.16(t,J=4.8Hz,2H),3.74-3.58(m,14H),2.45(s,3H)。
化合物L-6-2的制备
收率68%
1H NMR(400Hz,CDCl3)δ3.74-3.61(m,14H),3.40(t,J=4.8Hz,2H), 2.45(t,J=6.0Hz,2H)。
化合物L-6-3的制备
收率为63%
1H NMR(400Hz,CDCl3)δ4.21(d,J=2.4Hz,2H),3.72-3.67(m,14H), 3.39(t,J=5.2Hz,2H),2.43(t,J=2.4Hz,1H)。
化合物L-6的制备
收率为76%
1H NMR(400Hz,CDCl3)δ4.20(d,J=2.4Hz,2H),3.71-3.61(m,12H), 3.51(t,J=4.8Hz,2H),2.87(t,J=5.6Hz,2H),2.43(t,J=2.4Hz,1H)。
实施例8:化合物L-7的制备
Figure BDA0003089692190000681
化合物L-7-1的制备
在N2气氛下,将化合物L-5-2(1.9g,6.18mmol)溶解在DCM(20mL)中。向 其中加入三乙胺(2.0mL,14.22mmol)和p-TsCl(2.4g,12.36mmol),并将混合物在 室温下搅拌过夜。反应完成后,将混合物减压浓缩。将残留物通过柱色谱纯化, 得到化合物L-7-1(2.58g,91%)。
1H NMR(400Hz,CDCl3)δ7.80(d,J=8.4Hz,2H),7.35(d,J=8.4Hz,2H), 4.16(t,J=4.8Hz,2H),3.70-3.61(m,16H),3.56(s,1H),3.39(t,J=4.8Hz,2H), 2.45(s,3H)。
EI-MS m/z:462(M++1)。
化合物L-7-2的制备
在N2气氛下,将L-6(1.1g,3.4mmol)在无水THF(30mL)中的均匀溶液用 NaH(在矿物油中60%的分散体,135mg,3.4mmol)处理,并冷却至0℃。在将混 合物在0℃下搅拌20分钟后,向其中加入L-7-1(1.56g,3.4mmol)。使反应物升 温至室温并搅拌过夜。
使反应物冷却,用MeOH(5mL)猝灭,并减压浓缩。将残留物通过柱色谱纯 化,得到化合物L-7-2(1.91g,93%)。
EI-MS m/z:610(M++1)。
化合物L-7的制备
在0℃和N2气氛下,向化合物L-7-2(906.7mg,1.49mmol)在EA(4mL)和醚 (4mL)中的溶液中缓慢加入5%HCl溶液(8mL)和三苯基膦(390mg,1.49mmol)。 将混合物在0℃下搅拌过夜。用DCM(10mL)稀释混合物。用DCM(10mL×3) 萃取水层。在高真空下浓缩水相,得到化合物L-7(495mg,54%)。
EI-MS m/z:584(M++1)。
实施例9:化合物L-8的制备
Figure BDA0003089692190000682
化合物L-8-1的制备
在-20℃和N2气氛下,向KOtBu(943mg,8.41mmol)在无水THF(50mL) 中的溶液中加入四乙二醇(4.35mL,25.22mmol),然后加入炔丙基溴(1.0g, 8.41mmol)。使反应物升温至室温并搅拌17小时。将反应物通过在冰浴中 冷却并加入MeOH(1mL)和H2O(50mL)猝灭,并用EA(100mL)萃取。将 有机层经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。将残留物通过柱色谱纯化,得到化合物L-8-1(1.46g,75%)。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ4.26-4.20(m,2H),3.78-3.60(m,16H), 2.42-2.40(m,1H)。
化合物L-8-2的制备
向在冰浴中冷却的CBr4(1.43g,4.31mmol)在无水DCM(20mL)中的溶 液中加入三苯基膦(1.13g,4.31mmol),然后加入L-8-1(500mg,2.15mmol)。 使混合物升温至室温,并搅拌18小时。将反应物用水(50mL)稀释,并用 DCM(100mL)进行萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。 将残留物通过柱色谱纯化,得到化合物L-8-2(410mg,65%)。
1H NMR(400Hz,CDCl3)δ4.21(s,2H),3.82(t,J=6.4Hz,2H),3.74- 3.64(m,12H),3.45(t,J=6.4Hz,2H),2.45-2.42(m,1H)。
化合物L-8的制备
在室温和N2气氛下,向化合物L-8-2(300mg,1.02mmol)在DMF(10mL) 中的溶液中加入N,N-二甲基乙二胺(555μL,5.08mmol)。将混合物在室温下 搅拌5小时。反应完成后,将混合物减压浓缩。将残留物通过柱色谱纯化, 得到化合物L-8(218mg,71%)。
EI-MS m/z:303(M+1)。
实施例10:化合物L-9的制备
Figure BDA0003089692190000691
化合物L-9-1的制备
在0℃和N2气氛下,向L-5(450mg,1.18mmol)在无水THF(10mL)中 的溶液中加入NaH(60%于矿物油中的分散体,47.2mg,1.18mmol),然后加 入L-7-1(544.5mg,1.18mmol)。使反应物升温至室温,并搅拌过夜,然后在 冰浴中冷却,并滴加MeOH(5mL)。在将混合物减压浓缩后,将残留物通过 柱色谱纯化,得到化合物L-9-1(582.9mg,74%)。
EI-MS m/z:671(M++1).
化合物L-9-2的制备
在0℃和N2气氛下用三苯基膦(44mg,0.17mmol,1.0当量)处理L-9-1(112.3mg,0.17mmol)在醚(1.5mL)、THF(3.0mL)和H2O(1.5mL)中的混浊 溶液并在室温下将其搅拌过夜。将混合物用水(20mL)稀释,并用DCM(100mL× 3)萃取。减压浓缩水层,得到为无色油状物的化合物L-9-2(107mg,定量)。
EI-MS m/z:645(M++1)。
化合物L-9的制备
在0℃和N2气氛下,向化合物L-9-1(582.9mg,0.87mmol)在DCM(3mL) 中的溶液中加入4M-HCl(在1,4-二噁烷中,1mL)。将混合物在室温下搅拌2小 时。将混合物浓缩得到化合物L-9(527.6mg,定量)。
EI-MS m/z:571(M++1)
实施例11:化合物L-10的制备
Figure BDA0003089692190000701
化合物L-10-1的制备
在室温和N2气氛下,向2,4-二溴丁酸甲酯(10g,38.47mmol)在无水THF(100 mL)中的均匀溶液中滴加硫代乙酸(2.75mL,38.47mmol,1.0当量)和DIPEA(8.5 mL,48.9mmol,1.3当量)在无水THF(50mL)中的混合物,持续1.5小时。在-20℃ 和N2气氛下搅拌4小时后,浓缩混合物,用水(100mL)稀释并用EA(200mL×3) 萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。将残留物通过柱色谱 (Hex:EA=12:1)纯化,得到为白色固体的化合物L-10-1(9.67g,98%)。
1H NMR(600MHz,CDCl3)δ4.38(t,J=7.6Hz,1H),3.46-3.39(m,2H),2.56- 2.47(m,1H),2.36(s,3H),2.32-2.23(m,1H)。
化合物L-10-2的制备
在室温和N2气氛下,向于AcOH(80mL)中的L-10-1(9.67g,37.90mmol)中 加入35%的过氧化氢(40mL)。将混合物搅拌过夜,然后浓缩,用水(20mL)稀释, 用NaHCO3中和,并用EA/Hex(1/1,30mL X2)洗涤。将水层减压浓缩。将残留 物通过柱色谱(DCM:MeOH:AcOH=8:1:0.01至5:1:0.01)纯化,得到为白色固体的 化合物L-10-2(7.0g,71%)。
1H NMR(600MHz,D2O)δ4.11(dd,J=5.4,4.8Hz,1H),3.82(s,3H),3.65- 3.62(m,1H),3.52-3.47(m,1H),2.62-2.48(m,2H)。
化合物L-10-3的制备
在N2气氛下,向L-10-2(7.0g,26.81mmol)在DMF(20mL)中的溶液中 加入NaN3(4.5g,69.71mmol,2.6当量),并将混合物在室温下搅拌过夜。反 应完成后,将混合物减压浓缩。将残留物通过柱色谱(DCM:MeOH:AcOH= 7:1:0.01至5:1:0.01)纯化,得到为白色固体的化合物L-10-3(5.4g,90%)。
1H NMR(600MHz,D2O)δ3.82(dd,J=4.2,6.0Hz,1H),3.63(s,3H), 3.36-3.26(m,2H),2.29-2.02(m,2H)。
化合物L-10-4的制备
在50mL的圆瓶装烧瓶中加入L-10-3(500mg,2.24mmol)、10mL MeOH、5%Pd/C(715mg,0.34mmol,0.15当量)和Boc2O(538mg,2.46mmol, 1.1当量)。吸出空气后,将混合物在室温于H2下搅拌15小时。将催化剂通 过硅藻土过滤,并用MeOH(20mL x2)洗涤硅藻土。通过旋转蒸发器除去溶 剂,并将残留物通过柱色谱(DCM:MeOH:AcOH=7:1:0.01至5:1:0.01)纯化, 得到为白色固的化合物L-10-4(450.2mg,68%)。
1H NMR(600MHz,DMSO-d6)δ6.79(s,1H),4.13(br s,1H),3.55(s,3H), 2.88-2.80(m,2H),1.96-1.88(m,2H),1.3 6(s,9H)。
化合物L-10-5的制备
在室温于N2下用LiOH(21.2mg,0.50mmol,1.5当量)处理L-10-4(100 mg,0.34mmol)在THF/水(4mL/8mL)中的均匀溶液,并搅拌8小时。用2N HCl溶液中和反应混合物,并减压浓缩。将化合物L-10-5直接用于下一步 骤而无需进一步纯化。
EI-MS m/z:284(M++1)。
化合物L-10-6的制备
在室温和N2气氛下,将L-10-5(0.34mmol)、N-羟基琥珀酰亚胺(77.4mg,0.67mmol,2.0当量)和EDCI-HCl(260.7mg,1.36mmol,4.0当量)在DMF(2 mL)中的均匀溶液搅拌过夜。用L-7(210.8mg,0.34mmol,1.0当量)、DIPEA (177.6uL,1.02mmol,3.0当量)处理混合物,并将其搅拌过夜。将反应物减压 浓缩。将残留物通过柱色谱(DCM:MeOH:AcOH=12:1:0.01至5:1:0.01)纯化, 得到为黄色油状物的化合物L-10-6(159.1mg,55%)。
EI-MS m/z:850(M++1)。
化合物L-10的制备
在室温和N2气氛下,用c-HCl(500uL)处理L-10-6(100mg 0.12mmol) 在1,4-二噁烷(2mL)中的均匀溶液,并搅拌30分钟。将反应混合物减压浓 缩,得到为黄色油状物的化合物L-10(92mg,99%)。
EI-MS m/z:749(M++1)。
实施例12:化合物L-11的制备
Figure BDA0003089692190000721
化合物L-11-1的制备
在室温和N2气氛下,用吡啶(8mL)、对甲苯磺酰氯(5.22g,27.4mmol,1.2 当量)处理Boc-L-丝氨酸甲酯(5.0g,22.8mmol)在DCM(30mL)中的均匀溶液,并 搅拌过夜。通过加入水(50mL)来猝灭反应物,并用EA(100mL×3)萃取。将合 并的有机层经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。将残留物通过柱色谱(Hex:EA =9:1至2:1)纯化,得到为白色固体的化合物L-11-1(7.0g,82%)。
1H NMR(600MHz,CDCl3)δ7.76(d,J=8.4Hz,2H),7.35(d,J=7.8Hz,2H), 5.29(S,1H),4.53-4.47(m,1H),4.39(dd,J=2.4,7.8Hz,1H),4.29(d,J=7.2,2.4 Hz,1H),3.69(s,3H),2.45(s,3H)。
化合物L-11-2的制备
在室温和N2气氛下,用DMF(8mL)中的硫代乙酸(498uL,6.96mmol,1.3当 量)和L-11-1(2.0g,5.36mmol)处理CsCO3(1.05g,3.21mmol,0.6当量)在DMF (12mL)中的悬浮液,并搅拌过夜。通过加入水(50mL)猝灭混合物,并用EA(100 mL×3)萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。将残留物通过柱 色谱(Hex:EA=5:1)纯化,得到为白色固体的化合物L-11-2(1.4g,95%)。
1H NMR(600MHz,CDCl3)δ5.24(s,1H),4.53-4.49(m,1H),3.75(s,3H),2.45 (s,3H),4.41-4.31(m,2H)。
化合物L-11-3的制备
在室温和N2气氛下,向于AcOH(10mL)中的L-11-2(1.2g,4.33mmol)中加 入35%过氧化氢(4mL)。将混合物搅拌7小时,然后减压浓缩。将残留物用水(5 mL)稀释,并在0℃下使用NaHCO3的饱和水溶液碱化至pH 9。加入Boc2O(1.4g, 6.49mmol,1.5当量)并搅拌所得混合物过夜。将混合物在0℃用2N HCl中和, 并减压浓缩。将残留物通过柱色谱(DCM:MeOH:AcOH=8:1:0.01至5:1:0.01)纯 化,得到为白色固体的化合物L-11-3(521.5mg,42%)。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ6.96(d,J=7.2Hz,1H),4.20(q,J=6.8,4.8 Hz,1H),3.58(s,3H),2.84(dd,J=14,6.4Hz,1H),2.76(dd,J=9.2,4.4Hz,1H), 1.37(s,9H)。
化合物L-11-4的制备
在室温和N2气氛下,用LiOH(17.3mg,0.41,1.5当量)处理L-11-3(71mg,0.25mmol)在THF/H2O(2.0mL/4.0mL)中的均匀溶液,并搅拌3小时。在0℃ 下,用2N HCl中和混合物,并减压浓缩,得到为白色固体的化合物L-11-4(67 mg,99%)。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ6.40(d,J=7.2Hz,1H),3.96(q,J=6.4, 5.6Hz,1H),2.88-2.78(n,2H),1.36(s,9H)。
化合物L-11-5的制备
在室温和N2气氛下,将L-11-4(35mg,0.13mmol)、N-羟基琥珀酰亚胺 (22.4mg,0.19mmol,1.5当量)和EDCI-HCl(50mg,0.26mmol,2.0当量)溶 解在DMF(2mL)中。在将混合物搅拌过夜后,将化合物L-11-5直接用于下 一步骤而无需进一步纯化。
EI-MS m/z:367(M++1)。
化合物L-11-6的制备
在室温和N2气氛下,向搅拌的L-11-5(0.13mmol)在DMF(2mL)中的 溶液中加入N-羟基琥珀酰亚胺(22.4mg,0.19mmol,1.5当量)和EDCI-HCl (50mg,0.26mmol,2.0当量)。将混合物在室温下搅拌过夜。在将所得混合物 减压浓缩后,将残留物通过柱色谱纯化(DCM:MeOH:AcOH=12:1:0.01至 5:1:0.01)纯化,得到为黄色油状物的化合物L-11-6(34.8mg,64%)。
EI-MS m/z:483(M++1)。
化合物L-11的制备
在室温和N2气氛下,将c-HCl(300uL)加入到搅拌的L-11-6(29.6mg 0.061mmol)在1,4-二噁烷(1.2mL)中的溶液中,并搅拌混合物30分钟。将混 合物减压浓缩,得到为黄色油状物的化合物L-11(25.4mg,99%)。
EI-MS m/z:382(M++1)。
实施例13:化合物L-12的制备
Figure BDA0003089692190000731
化合物L-12-1的制备
在室温和N2气氛下,用NaHCO3(3.8g,45.8mmol,2.0当量)和BOC2O (6.0g,27.5mmol,1.2当量)处理11-叠氮基-3,6,9-三氧杂十一烷-1-胺(Aldrich, CAS 134179-38-7,5.0g,22.9mmol)在1,4-二噁烷(100mL)和H2O(25mL)中 的澄清溶液,然后搅拌6小时。将反应物用水(50mL)猝灭,并用DCM(100 mL x3)萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。将残留物通 过柱色谱纯化(1%至3%的于DCM中的MeOH),得到为无色油状物的化合 物L-12-1(7.2g,99%)。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ5.03(br s,1H),3.72-3.60(m,10H),3.98- 3.52(m,1H),3.43-3.36(m,1H),3.35-3.24(m,1H),1.26(s,9H)。
EI-MS m/z:319(M++1)。
化合物L-12的制备
在室温和N2气氛下,用三苯基膦(6.5g,24.9mmol,1.1当量)处理L-12-1(7.2g,22.6mmol)在THF(30mL)、醚(15mL)和H2O(15mL)中的澄清溶液,然后搅拌 过夜。将反应混合物用水(10mL)稀释,并用DCM(60mL x3)萃取。将水层减压 浓缩,得到为无色油状物的化合物L-12-1(6.3g,95%)。
EI-MS m/z:293(M++1)
实施例14:化合物L-13的制备
Figure BDA0003089692190000741
在0℃和N2气氛下,用1M PBr3(2.0mL,2.10mmol,5.0当量)处理N-甲基二 乙醇胺(50mg,0.42mmol)在DCM(3.0mL)中的均匀溶液,并在37℃下搅拌过夜。 将反应混合物用DCM(50mL)萃取,并用饱和NaHCO3(50mL)和水(50mL)洗涤。 在将有机层经无水Na2SO4干燥,过滤,并经N2鼓泡以除去溶剂后,将化合物 L-13直接用于下一步骤而无需进一步纯化。
EI-MS m/z:245(M++1)。
实施例15:化合物Int-2的制备
Figure BDA0003089692190000742
化合物Int-2-1的制备
在-78℃和N2气氛下,向化合物Int-1-3(24.8g,78.2mmol)在DCM(500mL) 中的棕色溶液中加入1M的于DCM中的BCl3(93.8mL,93.8mmol,1.2当量), 并搅拌3小时。在用MeOH(100mL)猝灭反应物后,使混合物升温至室温,然后 减压浓缩。将所得残留物溶解在DCM(600mL)中。将所得混合物用饱和NaHCO3 (100mL)和盐水(100mL)洗涤,然后经无水Na2SO4干燥,过滤。除去溶剂,得 到为黄色固体的Int-2-1(17.5g,98%)。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.47(s,1H),7.14(s,1H),6.03(s,1H),4.02(s, 3H),3.90(s,3H)。
化合物Int-2-2的制备
在室温和N2气氛下,用6N NaOH(38.5mL,231.0mmol)处理化合物Int-2-1 (17.5g,77.03mmol)在1,4-二噁烷(250mL)中的棕色溶液。在40℃下搅拌5小时 后,使混合物冷却至0℃,并用2N HCl酸化。将混合物用H2O(150mL)稀 释,并用EA(300mL X3)萃取。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥,过滤 并减压浓缩。将所得沉淀通过过滤收集,用己烷洗涤,并真空干燥,得到为 黄色固体的化合物Int-2-2(15.9g,97%)。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ10.6(br s,1H),7.31(s,1H),7.25(s,1H), 3.90(s,3H),3.57(s,3H)。
化合物Int-2-3的制备
在室温和N2气氛下,用DMAP(1.8g,14.92mmol,0.2当量)、乙酸酐 (8.5mL,87.5mmol,1.2当量)和TEA(15.6mL,111.9mmol,1.5当量)处理化 合物Int-2-2(15.9g,74.6mmol)在无水THF(370mL)中的棕色溶液,并搅拌 6小时。将反应混合物用水(150mL)稀释,并用EA(300mL×2)萃取。将合 并的有机层经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,得到为黄色固体的化合 物Int-2-3(18g,95%)。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ7.99(s,1H),7.46(s,1H),3.94(s,3H), 2.30(s,3H)。
化合物Int-2的制备
在0℃和N2气氛下,用草酰氯(7.6mL,84.64mmol,1.5当量)和DMF(2 滴)处理化合物Int-2-3(14.4g,56.43mmol)在无水THF(15mL)和无水DCM (40mL)中的棕色溶液,并搅拌6小时。将反应混合物减压浓缩。将化合物 Int-2直接用于下一步而无需进一步纯化。
实施例16:BGal-Br(在下文中为“Int-TG”)的制备
Figure BDA0003089692190000751
在0℃和N2气氛下,将β-D-半乳糖五乙酸酯(Alfa,CAS 4163-60-4,5.0g,12.81mmol)溶解在33%的于AcOH中的HBr(20mL)中。使混合物升温至室 温,并搅拌4小时。通过旋转蒸发器除去所有挥发性物质。将所得残留物用 饱和碳酸氢钠(1000mL)猝灭,并用EA(1000mL)萃取。将有机层经无水 Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。将残留物通过柱色谱纯化,得到化合物Int-TG (5.2g,99%)。
1H NMR(400Hz,CDCl3)δ6.70(d,J=4.0Hz,1H),5.52(d,J=2.4Hz, 1H),5.41(dd,J=7.6,2.8Hz,1H),5.05(dd,J=6.4,4.0Hz,1H),4.49(t,J=6.4 Hz,1H),4.22-4.09(m,2H),2.16-2.01(m,12H)。
实施例17:化合物Int-TG1和Int-TG2的制备
Figure BDA0003089692190000761
化合物Int-TG1-1的制备
在室温和N2气氛下,向3-甲酰基-4-羟基苯甲酸(5g,43.06mmol)在DMF(100 mL)中的溶液中加入苄基溴(5.1mL,43.06mmol)和NaHCO3(2.53g,43.06mmol)。 将混合物在室温和N2气氛下搅拌过夜。将反应物用水(100mL)稀释,并用EA(200 mL×2)萃取。将所得有机层经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。将残留物通 过柱色谱纯化,得到化合物Int-TG1-1(2.56g,39%)。
1H NMR(400Hz,CDCl3)δ11.41(s,1H),9.95(s,1H),8.34(d,J=2.0Hz,1H), 8.23(dd,J=6.4Hz,2.4Hz,1H),7.46-7.35(m,5H),7.04(d,J=9.2Hz,1H),5.37 (s,2H)。
化合物Int-TG1-2的制备
在室温和N2气氛下,向化合物Int-TG-1(1.0g,3.90mmol)和化合物Int-TG (1.6g,3.90mmol)在无水ACN(30mL)中的溶液中加入分子筛(8g)和Ag2O(3.62g, 15.61mmol)。搅拌1小时后,将混合物用ACN(30mL)稀释,并通过硅藻土过滤。 将滤液减压浓缩,并通过柱色谱纯化,得到化合物Int-TG1-2(2.1g,92%)。
1H NMR(400Hz,CDCl3)δ10.34(s,1H),8.55(d,J=2.0Hz,1H),8.26(dd,J= 6.8,2.0Hz,1H),7.45-7.35(m,5H),7.17(d,J=8.8Hz,1H),5.63-5.60(m,1H), 5.50(d,J=3.6Hz,1H),5.37(s,2H),5.23(d,J=8.0Hz,1H),5.16(dd,J=7.2,3.6 Hz,1H)4.24-4.10(m,4H),2.20(s,3H),2.10-2.03(m,9H)。
化合物Int-TG1-3的制备
在0℃和N2气氛下,向化合物Int-TG1-2(2.1g,3.58mmol)在DCM(30mL) 中的溶液中加入间CPBA(2.65g,10.74mmol)。在0℃搅拌7小时后,通过加入 饱和碳酸氢钠(40mL×2)将混合物猝灭。分离混合物,并将有机层用盐水洗涤, 经Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。将残留物溶解在DCM(5mL)中,然后在 冰浴中冷却,并加入水合肼(261μL,5.37mmol)。在0℃下搅拌1小时后, 将反应用1M HCl(10mL)猝灭,并用EA(30mL x2)萃取。将有机层经无水 Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,得到化合物Int-TG1-3(1.1g,55%)。
EI-MS m/z:574(M++Na)
化合物Int-TG1-4的制备
在0℃和N2气氛下,向化合物Int-TG1-3(280mg,0.49mmol)在DCM(5 mL)中的溶液中加入TBDMS-OTf(224μL,0.97mmol)和Et3N(207μL,1.46 mmol)。将混合物在室温下搅拌1.5小时,然后通过加入柠檬酸(20mL)进行 猝灭。将有机层用盐水(20mL)和水(20mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并 减压浓缩。将残留物通过柱色谱纯化,得到化合物Int-TG1-4(246.3mg, 68%)。
1H NMR(400Hz,CDCl3)δ7.67(d,J=8.4Hz,1H),7.57(s,1H),7.44- 7.34(m,5H),7.02(d,J=8.4Hz,1H),5.49-5.44(m,2H),5.30(s,2H),5.19(d, J=7.6Hz,1H),5.10(dd,J=6.8,3.2Hz,1H)4.20-4.11(m,2H),4.05(t,J= 6.8Hz,2H),2.19(s,3H),2.04(s,3H),2.01(d,J=6.0Hz,6H),1.02(s,9H),0.20 (d,J=15.6Hz,6H)。
化合物Int-TG1-5的制备
在N2气氛下,将碳载钯5%Pd/C(87.5mg,0.04mmol)加入到搅拌的 Int-TG1-4(283.2mg,0.41mmol)在EA(5mL)中的溶液中。通过在室温下将 氢气鼓泡通过溶液来冲洗烧瓶。将混合物在相同温度下搅拌1小时。将混合 物用EA(30mL)稀释,通过硅藻土过滤,硅藻土塞用EA(50mL x2)洗涤。 将滤液减压浓缩。将化合物Int-TG1-5直接用于下一步骤而无需进一步纯化 (246mg,定量)。
1H NMR(400Hz,CDCl3)δ7.67(d,J=8.8Hz,1H),7.57(s,1H),7.05(d, J=8.4Hz,1H),5.49-5.45(m,2H),5.22(d,J=7.6Hz,1H),5.12(dd,J=7.2, 3.6Hz,1H)4.20-4.06(m,4H),2.19(s,3H),2.05(s,3H),2.02(d,J=7.6Hz, 6H),1.01(s,9H),0.21(d,J=15.2Hz,6H)。
化合物Int-TG1的制备
在室温和N2气氛下,向化合物Int-TG1-5(243.2mg,0.41mmol)和11- 叠氮基-3,6,9-三氧杂十一烷-1-胺(Aldrich,CAS 134179-38-7,89.5mg,0.41 mmol)在DMF(5mL)中的溶液中加入PyBOP(275mg,0.53mmol)和DIPEA (176uL,1.02mmol)。将混合物在室温和N2气氛下搅拌2小时。反应物为蒸 馏水(10mL),并用EA(30mL×2)萃取。将所得有机层经无水Na2SO4干燥, 过滤并减压浓缩。将残留物通过柱色谱纯化,得到化合物Int-TG1(272.8mg, 84%)。
1H NMR(400Hz,CDCl3)δ7.34(s,1H),7.31(d,J=9.2Hz,1H),7.02(d, J=8.0Hz,1H),6.73(s,1H),5.48-5.44(m,2H),5.19(d,J=7.6Hz,1H),5.10 (dd,J=6.4,3.6Hz,1H),4.20-4.10(m,2H),4.06(t,J=6.4Hz,2H),3.66(s,14H), 3.38(t,J=4.4Hz,2H),2.19(s,3H),2.02(t,J=8.4Hz,9H),1.00(s,9H),0.20(d,J =14.4Hz,6H)。
EI-MS m/z:799(M++1)。
化合物Int-TG2的制备
在室温和N2气氛下,向化合物Int-TG1-5(246mg,0.41mmol)和L-9(249.5 mg,0.41mmol)在DMF(3mL)中的溶液中加入PyBOP(278mg,0.53mmol)和 DIPEA(179uL,1.02mmol)。将混合物搅拌2小时后,将反应混合物进行制备型 HPLC(柱:Innoval ODS-210um,
Figure BDA0003089692190000782
50x250mm;流速:40mL/min,A缓冲 液0.1%的于水中的甲酸/B缓冲液0.1%的于ACN中的甲酸,方法梯度,溶剂A: 溶剂B 80:20至20:80,45分钟,波长214nm),得到化合物Int-TG2(384.6mg, 81%)。EI-MS m/z:1152(M+1)。
实施例18:化合物Int-TG3的制备
Figure BDA0003089692190000781
化合物Int-TG3a的制备
在室温和N2气氛下,向4-羟基苯甲醛(1g,8.19mmol)在DCM(3mL)中的溶 液中加入Et3N(2.28mL,16.38mmol)。通过气球引入SO2F2气体,并将混合物在 室温下搅拌2小时。用DCM(30mL×3)和盐水(30mL)萃取混合物,将有机层经 无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。将残留物通过柱色谱纯化,得到化合物 Int-TG3a(790mg,63%)。
1H NMR(400Hz,CDCl3)δ10.06(s,1H),8.05(d,J=8.0Hz,2H),7.55(d,J= 8.8Hz,2H)。
化合物Int-TG3-1的制备
向化合物Int-TG1(100mg,0.13mmol)和化合物Int-TG3a(26mg,0.13mmol) 在无水ACN(3mL)中的溶液中加入DBU(4μL,25μmol)。将混合物在室温下搅 拌1小时,用蒸馏水(10mL)洗涤,并用EA(15mL×2)萃取。将有机层经无水 Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。将残留物通过柱色谱纯化,得到化合物Int-TG3-1 (103mg,94%)。
EI-MS m/z:869(M++1)。
化合物Int-TG3-2的制备
在0℃和N2气氛下,向化合物Int-TG3-1(103mg,0.12mmol)在THF(8 mL)中的溶液中加入NaBH4(9mg,0.24mmol)。搅拌2小时后,用蒸馏水(10 mL)猝灭反应物并用EA(10mL×2)萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥,过 滤并减压浓缩,得到化合物Int-TG3-2(101mg,98%)。
EI-MS m/z:871(M++1)。
化合物Int-TG3的制备
在0℃和N2气氛下,向化合物Int-TG3-2(320.5mg,0.0.37mmol)在DCM (3ml)中的溶液中加入1M的于DCM中的PBr3(165ul,0.19mmol)。搅拌2 小时后,通过加入饱和碳酸氢钠(8mL×2)猝灭混合物。将有机层用盐水洗涤, 经Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。将残留物通过柱色谱纯化,产生化合物 Int-TG3(202.6mg,59%)
EI-MS m/z:934(M++1)。
实施例19:化合物Int-TG4的制备
Figure BDA0003089692190000791
化合物Int-TG4-1的制备
在室温和N2气氛下,用1M的于THF中的TBAF(315μL,0.32mmol,1.2 当量)处理化合物Int-TG1(210mg,0.26mmol)在无水THF(2mL)中的均匀溶 液,并搅拌1小时。将反应混合物用水(100mL)稀释,并用EA(200mL x2) 萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。将残留物通过柱色 谱(Hex:EA =2:1)纯化,得到为白色泡沫固体的化合物Int-TG4-1(151mg, 84%)。
1H NMR(400Hz,CDCl3)δ7.36-7.33(m,2H),7.00(d,J=7.6Hz,1H), 6.72-6.64(m,1H),6.05(s,1H),5.52-5.44(m,2H),5.18-5.12(m,1H),4.98 (d,J=8.0Hz,1H),4.28-4.07(m,3H),3.70-3.62(m,14H),3.36(t,J=4.8Hz, 2H),2.22(s,3H),2.12(s,3H),2.0(s,3H),2.03(s,3H);EI-MS m/z:685 (M++1)。
化合物Int-TG4的制备
在室温和N2气氛下,用TEA(92.4μL,0.66mmol,3.0当量)处理化合物 Int-TG4-1(151mg,0.22mmol)在DCM(5mL)中的均匀溶液,通过气球引入 SO2F2气体,并搅拌16小时。然后将混合物用EA(100mL)和水(100mL)萃 取。将有机层经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。将残留物通过柱色谱 (Hex:EA=1:1)纯化,得到为白色泡沫固体的化合物Int-TG4(137mg,81%)。
1H NMR(400Hz,CDCl3)δ7.88(s,1H),7.68(d,J=8.8Hz,1H),7.30(d,J= 8.8Hz,1H),7.05(br s,1H),5.62-5.56(m,1H),5.48(d,J=2.8Hz 1H),5.17(d,J= 8.0Hz,1H),5.12(dd,J=7.2,3.2Hz,1H),4.26-4.08(m,3H),3.72-3.60(m,14H), 3.36(t,J=4.8Hz,2H),2.20(s,3H),2.08(s,6H),2.02(s,3H);EI-MS m/z:767 (M++1)。
实施例20:化合物Int-TG5和TG-6的制备
Figure BDA0003089692190000801
化合物Int-TG5-1的制备
在室温和N2气氛下,用PyBOP(1.13g,2.17mmol,1.3当量)、DIPEA(873uL,5.01mmol,3.0当量)处理化合物Int-TG1-5(1.0g,0.26mmol)和L-12(586mg,2.0 mmol,1.2当量)在DMF(10mL)中的均匀溶液,并搅拌4小时。将反应物用水(20 mL)猝灭,并用EA(30mL×2)萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥,过滤并减压 浓缩。将残留物通过柱色谱(Hex:EA=1:1至1:3)纯化,得到为白色泡沫固体的化 合物Int-TG5-1(1.05g,72%)。
EI-MS m/z:874(M++1)。
化合物Int-TG5-2的制备
在室温和N2气氛下,用BEMP(66.3μL,0.23mmol,0.4当量)处理化合物 Int-TG5-1(500mg,0.57mmol)和化合物Int-TG3a(140mg,0.69mmol,1.2当量) 在无水ACN(10mL)中的均匀溶液,并搅拌4小时。将反应物用水(20mL)猝灭, 并用EA(30mL×2)萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。将 残留物通过柱色谱(4%的于DCM中的MeOH)纯化,得到为白色泡沫固体的化合 物Int-TG5-2(495mg,85%)。
EI-MS m/z:869(M++1)。
化合物Int-TG5-3的制备
在0℃和N2气氛下,用NaBH4(39.7mg,1.05mmol,2.0当量)处理化合物 Int-TG5-2(495mg,0.52mmol)在无水THF(5.0mL)中的溶液,并搅拌2小时。将 反应物用水(20mL)猝灭,并用EA(30mL×2)萃取。将有机层经无水Na2SO4干 燥,过滤并减压浓缩。将残留物通过柱色谱(2%至3%的于DCM中的MeOH)纯 化,得到为白色泡沫固体的化合物Int-TG5-3(418mg,91%)。
EI-MS m/z:945(M++1)。
化合物Int-TG5-4的制备
在0℃和N2气氛下,用甲烷磺酰氯(24.6uL,0.32mmol,1.4当量)和TEA (79.2uL,0.57mmol,1.5当量)处理化合物Int-TG5-3(214.2mg,0.23mmol)在 无水THF(5.0mL)中的溶液,并在室温下搅拌过夜。用水(10mL)猝灭反应 物,并用DCM(20mL×2)萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥,过滤并减 压浓缩。将残留物通过柱色谱(100%DCM至5%的于DCM中的MeOH)纯 化,得到为白色泡沫固体的化合物Int-TG5-4(164mg,70%)。
EI-MS m/z:1024(M++1)。
化合物Int-TG5的制备
在室温和N2气氛下,用LiBr(69.6mg,0.80mmol,5.0当量)处理化合物 Int-TG5-4(164mg,0.16mmol)在无水THF(10mL)中的溶液,并搅拌3小时。 将反应物用水(10mL)稀释,并用DCM(20mL×2)萃取。将有机层经无水 Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。将残留物通过柱色谱(3%至5%的于DCM 中的MeOH)纯化,得到为白色泡沫固体的化合物Int-TG5(161mg,99%)。
EI-MS m/z:1008(M++1).F
通过与化合物Int-5的制备方法类似的方式合成化合物Int-6。
化合物Int-TG6-1的制备
收率为72%,无色油状物
EI-MS m/z:1226(M++1)。
化合物Int-TG6-2的制备
收率为82%,无色油状物
EI-MS m/z:1296(M++1)。
化合物Int-TG6-3的制备
收率为75%,无色油状物
EI-MS m/z:1298(M++1)。
化合物Int-TG6-4的制备
收率为82%,无色油状物
EI-MS m/z:1376(M++1)。
化合物Int-TG6的制备
收率为82%,无色油状物
EI-MS m/z:1361(M++1)。
实施例21:化合物MPS-D1的制备
Figure BDA0003089692190000821
化合物MPS-D1-1的制备
在室温和N2气氛下,向4-乙酰基苯甲酸(9g,54.82mmol)在EtOH(50mL) 中的溶液中加入哌啶盐酸盐(6.66g,54.82mmol)、多聚甲醛(4.95g,164.5mmol) 和浓HCl(0.6mL)。在100℃下搅拌16小时后,将混合物冷却至室温,滴加丙酮 (90mL)。将混合物在0℃搅拌1小时。过滤固体并用二乙基醚(30mL X2)洗涤, 得到化合物MPS-D1-1(6.11g,38%)。
1H NMR(400Hz,DMSO-d6)δ8.08(s,4H),5.73(s,1H),3.65(t,J=7.2Hz, 2H),3.35(t,J=7.2Hz,2H),3.31(m,6H),1.74(s,4H)。
化合物MPS-D1-2的制备
在室温下,向MPS-D1-1(6.11g,20.52mmol)在EtOH(40mL)和MeOH(26 mL)中的溶液中加入4-甲氧基苯硫醇(2.55g,20.52mmol)和哌啶(0.3mL,3.08 mmol)。在100℃下搅拌16小时后,将混合物冷却至0℃,并另外搅拌1小时。 将固体过滤并用醚(30mL×2)洗涤,得到化合物MPS-D1-2(5.56g,90%)。
1H NMR(400Hz,CDCl3)δ8.04-7.99(m,4H),7.27(d,J=8.4Hz,2H),7.15(d, J=7.6Hz,2H),3.39-3.36(m,2H),3.25-3.21(m,2H),2.27(s,3H)。
化合物MPS-D1的制备
在0℃和N2气氛下,向MPS-D1b(5.56g,18.51mmol)在MeOH(90mL)和蒸 馏水(90mL)中的溶液中加入单过硫酸氢钾复合盐(oxone)(25.03g,40.72mmol)。 在于室温下搅拌14小时后,用蒸馏水(100mL)和氯仿(150mL X3)猝灭混合物。 将有机层用盐水(200mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,得到化 合物MPS-D1(5.29g,86%)。
1H NMR(400Hz,CDCl3)δ8.04-7.99(m,4H),7.81(d,J=8.4Hz,2H),7.46(d, J=8.4Hz,2H),3.63(t,J=7.2Hz,2H),3.41(t,J=7.2Hz,2H),2.44(s,3H)。EI-MS m/z:333(M++1)。
实施例22:化合物MPS-D2的制备
Figure BDA0003089692190000822
化合物MPS-D2的制备
在N2气氛下,将化合物MPS-D1(652.4mg,1.96mmol)和化合物L-6(500mg,1.96mmol)溶解在DMF(5mL)中。向其中加入HBTU(893.3mg,2.36mmol) 和DIPEA(0.684mL,3.93mmol),并将混合物在室温下搅拌3小时。将混合 物用H2O(20mL)稀释,并用EA(30mL×2)萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。将残留物通过柱色谱纯化,得到化合物MPS-D2 (854.1mg,80%)。
1H NMR(400Hz,CDCl3)δ8.11-7.94(m,4H),7.83(d,J=7.6Hz,2H), 7.44(br s,1H),7.38(d,J=8.0Hz,2H),4.15(s,2H),3.69-3.65(m,14H),3.58- 3.48(m,4H),2.80(s,1H),2.46(s,3H)。EI-MS m/z:546(M++1)。
实施例23:化合物MPS-D3的制备
Figure BDA0003089692190000831
化合物MPS-D3通过与实施例22中所述类似的合成途径来合成。
收率为72%
EI-MS m/z:899(M++1)。
实施例24:化合物MPS-D4的制备
Figure BDA0003089692190000832
在0℃和N2气氛下,向化合物L-8(60mg,0.20mmol)在DMF(1mL)中 的溶液中加入MPS-D1(79mg,0.0.24mmol)、HBTU(90mg,0.24mmol)和 DIPEA(103μL,0.59mmol)。将反应混合物在室温下搅拌2天。将混合物用 H2O(50mL)稀释,并用EA(100mL)萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥, 过滤并减压浓缩。将残留物通过柱色谱纯化,得到化合物MPS-D4(59mg,48%)。EI-MS m/z:617(M++1)。
实施例25:化合物POS-D1的制备
Figure BDA0003089692190000833
化合物POS-D1-1的制备
在N2气氛下,向4-氢苯甲酸乙酯(20g,120.35mmol)在EtOH(60mL) 中的溶液中加入NH2NH2·H2O(88mL,1805.4mmol)。在回流下将混合物搅 拌过夜。将混合物冷却至室温,并减压浓缩,然后用EtOH研磨,从而得到 化合物POS-D1-1(17.54g,96%)。
1H NMR(400Hz,DMSO-d6)δ9.50(s,1H),7.68(d,J=8.4Hz,2H),6.78 (d,J=8.8Hz,2H),4.37(s,2H)。EI-MS m/z:431(M++1)。
化合物POS-D1-2的制备
在N2气氛下,向化合物POS-D1-1(17.54g,115.28mmol)在EtOH(200mL) 和DMF(100mL)中的溶液中加入CS2(45mL,749.32mmol)和KOH(6.5g,115.28 mmol)。在85℃下搅拌18小时后,通过加入1M HCl溶液将反应混合物调节至 pH 4,并用蒸馏水(500mL)和EA(500mL2)稀释。将有机层用H2O(500mL)和盐 水(500mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。使残留物经受醚/己烷 研磨,得到化合物POS-D1-2(20.7g,93%)。
1H NMR(400Hz,DMSO-d6)δ10.44(s,1H),7.72(d,J=8.4Hz,2H),6.94(d, J=8.0Hz,2H)。EI-MS m/z:195(M++1)。
化合物POS-D1-3的制备
在0℃下,向化合物POS-D1-2(5g,25.75mmol)在THF(100mL)中的溶液中 滴加Et3N(4.3mL,30.9mmol)和MeI(1.76mL,28.33mmol)。在0℃下搅拌10分 钟后,使混合物升温至室温并搅拌2小时。将混合物用H2O(150mL)稀释,并用 EA(100mL X2)萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。将残留 物进行醚研磨,得到化合物POS-D1-3(5.15g,96%)。
1H NMR(400Hz,DMSO-d6)δ7.80(d,J=8.4Hz,2H),6.94(d,J=8.4Hz,2H), 2.74(s,3H)。EI-MS m/z:209(M++1)。
化合物POS-D1-4的制备
在0℃和N2气氛下,向化合物POS-D1-3(3.2g,15.37mmol)在EtOH(150mL) 中的溶液中加入70%间-CPBA(11.4g,46.11mmol)。在室温下搅拌5小时后,进 一步加入70%间-CPBA(11.4g,46.11mmol)。然后将混合物在室温下搅拌过夜, 并用H2O(500mL)、饱和NaHCO3(300mL)猝灭,并用EA(500mL X2)萃取。 将有机层用盐水(300mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。将残留 物进行Hex/EA=1:1(100mL)研磨,得到化合物POS-D1-4(3.2g,89%)。
1H NMR(400Hz,DMSO-d6)δ7.95(d,J=8.8Hz,2H),7.01(d,J=8.8Hz,2H), 3.69(4s,3H)。EI-MS m/z:241(M++1)。
化合物POS-D1的制备
向POS-D1-4(310mg,1.29mmol)和L-8-1(660mg,2.84mmol)在THF(8mL) 和DMF(0.8mL)中的溶液中加入PPh3(667mg,2.58mmol)。将混合物冷却至0℃, 并向其中加入DEAD(1.17mL,2.58mmol),并将混合物在0℃搅拌3小时。将混 合物用水(15mL)稀释,并用EA(15mL×2)萃取。将所得的有机层经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,得到化合物POS-D1(205mg,30%)。
EI-MS m/z:455(M++1)。
实施例26:化合物MPS-D5的制备
Figure BDA0003089692190000841
化合物MPS-D5-1的制备
在室温和N2气氛下,将MPS-D1(100mg,0.30mmol)溶解在DMF(1mL) 中,然后加入N-羟基琥珀酰亚胺(41.6mg,0.36mmol,1.2当量),然后加入 EDCI-HCl(115.4mg,0.60mmol,2.0当量)。在将混合物搅拌过夜后,将化合 物MPS-D5-1直接用于下一步骤而无需进一步纯化。
EI-MS m/z:430(M++1)。
化合物MPS-D5的制备
在室温和N2气氛下,用DIPEA(25.4uL,0.15mmol,3.0当量)处理L-10 (38.2mg,0.05mmol)和MPS-D5-1(23mg,0.54mmol,1.1当量)在DMF(1mL) 中的均匀溶液,并搅拌2小时。将混合物通过制备型HPLC(柱:Innoval ODS-2 10um,
Figure BDA0003089692190000851
21.2x250mm;流速:40mL/min,A缓冲液0.1%的于 水中的甲酸/B缓冲液0.1%的于ACN中的甲酸,方法梯度,溶剂A:溶剂B 95:5 至5:95,1小时,波长214nm)纯化,得到为黄色油状物的化合物MPS-D5(10.3 mg,20%)。
EI-MS m/z:1064(M++1)。
实施例27:化合物MPS-D6、MPS-D7、MPS-D8和MPS-D9的制备
Figure BDA0003089692190000852
通过与实施例22中所述类似的合成途径合成了化合物MPS-D6、 MPS-D7、MPS-D8和MPS-D9。
化合物MPS-D6的制备
收率为53%,浅黄色固体
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.98(d,J=8.4Hz,2H),7.88(d,J=8.4Hz, 2H),7.83(d,J=8.0Hz,2H),7.38(d,J=8.0Hz,2H),6.75(br s,1H),3.74- 3.66(m,10H),3.58-3.48(m,4H),3.37(t,J=5.2Hz,2H),2.46(s,3H);EI-MS m/z:489(M++1)。
化合物MPS-D7的制备
收率为52%,黄色固体
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.98(d,J=8.4Hz,2H),7.90(d,J=8.4Hz, 2H),7.83(d,J=8.0Hz,2H),7.38(d,J=8.0Hz,2H),6.93(br s,1H),3.74- 3.62(m,14H),3.58-3.47(m,4H),3.34(t,J=5.2Hz,2H),2.46(s,3H);EI-MS m/z:533(M++1)。
化合物MPS-D8的制备
收率为53%,黄色油状物
EI-MS m/z:753(M++1)。
化合物MPS-D9的制备
收率为84%,浅黄色油状物
EI-MS m/z:621(M++1)。
实施例28:化合物mMPS-D1的制备
Figure BDA0003089692190000861
化合物mMPS-D1-1的制备
在室温和N2气氛下,用浓HCl(0.2mL)处理3-乙酰基苯甲酸(3g,18.28 mmol)、哌啶HCl(2.22g,18.28mmol,1当量)和多聚甲醛(1.65g,54.83mmol,3 当量)在EtOH(18mL)中的混合物,并加热至回流过夜。将混合物冷却至室温, 用丙酮(30mL)猝灭,并在0℃搅拌1小时。将固体通过过滤收集,用二乙基醚(70 mL)洗涤,并在高真空下干燥,得到为白色固体的化合物mMPS-D1-1(2.78g, 51%)。
EI-MS m/z:262(M++1)。
化合物mMPS-D1-2的制备
在室温和N2气氛下,用哌啶(72uL,0.73mmol,0.15当量)处理mMPS-D1-1 (1.45g,4.87mmol)和4-甲基苯硫醇(605mg,4.87mmol,1当量)在EtOH(11mL) 和MeOH(7.5mL)中的混浊混合物,并加热至回流6小时。将反应混合物冷却至 0℃持续1小时,得到白色固体。加入二乙基醚以析出出更多的固体,将所述固 体通过过滤收集,用二乙基醚(70mL)洗涤并在高真空下干燥,得到为白色固体 的化合物mMPS-D1-2(1.05g,72%)。
1H NMR(600Hz,DMSO-d6)δ8.40(s,1H),8.18-8.15(m,2H),7.66-7.63(m, 1H),7.26(d,J=7.8Hz,2H),7.14(d,J=7.8Hz,2H),3.40-3.37(m,2H),3.26- 3.23(m,2H),2.27(s,3H)。
EI-MS m/z:301(M++1)。
化合物mMPS-D1的制备
在0℃和N2气氛下,用单过硫酸氢钾复合盐(2.25g,3.66mmol,2.2当量)处 理mMPS-D1-2(500mg,1.67mmol)在MeOH(30mL)和H2O(30mL)中的混浊溶 液。将混合物升温至室温并搅拌过夜。将反应混合物用H2O(120mL)猝灭,并用 CHCl3(100mL X3)萃取。将合并的有机提取物用盐水(200mL)洗涤,经无水 Na2SO4干燥,过滤并真空浓缩,得到为黄色固体的化合物mMPS-D1(258mg, 47%)。
1H NMR(600Hz,DMSO-d6)δ8.37-8.36(m,1H),8.20-8.16(m,2H),7.81(d, J=7.8Hz,2H),7.68-7.65(m,1H),7.46(d,J=8.4Hz,2H),3.66-3.63(m,2H), 3.44-3.41(m,2H),2.41(s,3H)。
EI-MS m/z:333(M++1)。
实施例29:化合物mMPS-D2和mMPS-D3的制备
Figure BDA0003089692190000871
化合物mMPS-D2-1的制备
在室温和N2气氛下,用N-羟基琥珀酰亚胺(21mg,0.18mmol,1.2当量) 和EDCI-HCl(58mg,0.30mmol,2.0当量)处理mMPS-D1(50mg,0.15mmol) 在DMF(1mL)中的混浊溶液。在将混合物搅拌过夜后,将化合物 mMPS-D2-1直接用于下一步骤而无需进一步纯化。
EI-MS m/z:430(M++1)。
化合物mMPS-D2的制备
在室温和N2气氛下,用DIPEA(23.4uL,0.135mmol,3.0当量)处理L-10 (35.3mg,0.045mmol)和mMPS-D2-1(21.3mg,0.05mmol,1.1当量)在DMF (1mL)中的均匀溶液,并搅拌2小时。将反应混合物通过制备型HPLC (柱:Innoval ODS-2 10um,
Figure BDA0003089692190000872
21.2x250mm;流速:40mL/min,A缓冲液 0.1%的于水中的甲酸/B缓冲液0.1%的于ACN中的甲酸,方法梯度,溶剂 A:溶剂B 95:5至5:95,1小时,波长214nm)纯化,得到为黄色油状物的化 合物mMPS-D2(10.8mg,22%)。
EI-MS m/z:1064(M++1)。
化合物mMPS-D3的制备
在室温和N2气氛下,用DIPEA(20.8uL,0.12mmol,5.0当量)处理L-11 (10mg,0.024mmol)和mMPS-D2-1(11.3mg,0.026mmol,1.1当量)在DMF(1 mL)中的均匀溶液,并搅拌过夜。将反应混合物通过制备型HPLC(柱:Innoval ODS-2 10um,
Figure BDA0003089692190000873
21.2x250mm;流速:15mL/min,A缓冲液0.1%的于 水中的甲酸/B缓冲液0.1%的于ACN中的甲酸,方法梯度,溶剂A:溶剂B 95:5 至5:95,1小时,波长214nm)纯化,得到为黄色油状物的化合物mMPS-D3(10.8mg,22%)。
EI-MS m/z:697(M++1)。
实施例30:化合物mMPS-D4的制备
Figure BDA0003089692190000874
在室温和N2气氛下,用DIPEA(0.13mL,0.75mmol,2当量)和HBTU (178.6mg,0.45mmol,1.2当量)处理mMPS-D1(124.6mg,0.37mmol)和L-7 (120.4mg,0.45mmol,1.2当量)在无水DMF中的均匀溶液,并搅拌3.5小时。 用H2O(40mL)猝灭反应物,并用DCM(50mLX3)萃取。将合并的有机层用H2O (40mL X2)、盐水(40mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤并真空浓缩。将残留 物通过快速色谱(Hex:EA=1:1至1:5)纯化,得到为白色固体的化合物mMPS-D4 (123.1mg,60%)。
EI-MS m/z:546(M++1)。
实施例31:化合物mMPS-D5的制备
Figure BDA0003089692190000881
化合物mMPS-D5-1的制备
将在室温和N2气氛下的5-溴烟酸甲酯(3g,13.89mmol)、PdCl2(PPh3)2(487 mg,0.96mmol,0.05当量)和三丁基(1-乙氧基乙烯基)锡(5.86mL,17.36mmol,1.25 当量)在无水甲苯(60mL)中的溶液加热至回流3小时。将混合物冷却至0℃后, 通过硅藻土过滤,并用MeOH(100mL)洗涤。将滤液减压浓缩。在室温和N2气 氛下,将溶解在MeOH(30mL)和10M HCl(30mL)中的残留物静置2小时。用饱 和Na2CO3(120mL)猝灭反应物,并用EA(150mL X3)萃取。将有机层用盐水(250 mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。将残留物通过快速色谱(EA:HEX =1:2)纯化,得到白色固体的化合物mMPS-D5-1(2.22g,89%)。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ9.37(s,1H),9.31(s,1H),8.79(s,1H),4.00(s, 3H),2.69(s,3H)。
化合物mMPS-D5-2的制备
在室温和N2气氛下,用1N NaOH(10.64mL)处理mMPS-D5-1(636mg,3.55 mmol)在MeOH(11mL)中的均匀溶液,并搅拌1小时。在将混合物减压浓缩后, 用1N HCl(pH 2)猝灭反应物,并用EA(80mL X3)萃取。将有机层用盐水(150mL) 洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,得到为白色固体的化合物 mMPS-D5-2(粗制物)。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.31(s,1H),9.25(s,1H),8.64(s,1H),2.69(s, 3H)。
经由与实施例21的化合物MPS-D1的制备方法类似的方式合成化合物 mMPS-D5-3、mMPS-D5-4和mMPS-D5。
化合物mMPS-D5-3的制备
收率为30%,白色固体。
EI-MS m/z:264(M++1)。
化合物mMPS-D5-4的制备
收率为11%,白色固体。
1H NMR(400Hz,DMSO-d6)δ9.26(d,J=2Hz,1H),9.23(d,J=2Hz, 1H),8.58(m,1H),7.26(d,J=8Hz,2H),7.13(d,J=8.4Hz,2H),3.46(t,J= 7.2Hz,2H),3.24(d,J=7.2Hz,2H),2.26(s,3H);EI-MS m/z:302(M++1)。
化合物mMPS-D5的制备
收率为43%,白色固体。
EI-MS m/z:334(M++1)。
实施例32:化合物mMPS-D5的制备
Figure BDA0003089692190000891
通过与实施例27的化合物MPS-D9的制备方法类似的方式合成化合物 mMPS-D6。
收率为13%,黄色油状物。
EI-MS m/z:622(M++1)。
实施例33:化合物BCN-PNP的制备
Figure BDA0003089692190000892
在室温和N2气氛下,将(1R,8S,9s)-双环[6.1.0]壬-4-炔-9-基甲醇(800mg,5.3mmol)溶解在DCM(125mL)中。向其中添加吡啶(1.22mL,15.9mmol, 3.0当量)和氯甲酸4-硝基苯酯(1.75g,8.74mmol,1.6当量)。在相同温度下 搅拌混合物4小时后,将反应物通过加入饱和NH4Cl溶液(100mL)猝灭,并 用EA(100mL x4)萃取。将有机层经Na2SO4干燥,过滤并真空浓缩。将残 留物通过柱色谱(Hex:EA=10:1)纯化,得到为白色固体的化合物BCN-PNP(1.34g,84%)。
1H NMR(600MHz,CDCl3)δ8.29(d,J=9Hz,2H),7.39(d,J=9Hz,2H), 4.41(d,J=8.4Hz,2H),2.36-2.24(m,6H),1.62-1.55(m,2H),1.53-1.49(m, 1H),1.07(t,J=10.2Hz,2H)。
实施例34:化合物MPS-D10和MPS-D11的制备
Figure BDA0003089692190000901
通过与实施例22的化合物MPS-D2的制备方法类似的方式合成化合物 MPS-D10-1和MPS-D11-1。
化合物MPS-D10-1的制备
收率为71%,浅黄色油状物
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.99-7.93(m,4H),7.83(d,J=8.0Hz,2H),7.39 (d,J=8.0Hz,2H),7.30(br s,1H),5.01(br s,1H),3.74-3.46(m,26H),3.34-3.26 (m,2H),2.46(s,3H),1.43(s,9H);EI-MS m/z:695(M++1)。
化合物MPS-D11-1的制备
收率为71%,浅黄色油状物
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ8.02–7.86(m,4H),7.83(d,J=7.6Hz,2H), 7.38(d,J=8.0Hz,2H),6.91(br s,1H),4.98(br s,1H),3.72-3.44(m,10H),3.36- 3.24(m,2H),2.46(s,3H),1.43(s,9H);EI-MS m/z:563(M++1)。
通过与实施例10的化合物L-9的制备方法类似的方式合成化合物 MPS-D10-2和MPS-D11-2。
化合物MPS-D10-2的制备
收率为99%,浅黄色油状物。
1H NMR(400MHz,DMSO-D6)δ8.74(t,J=8.0Hz,1H),7.98(dd,J=12,8.4 Hz,2H),7.82(d,J=8.4Hz,2H),7.46(d,J=8.0Hz,2H),3.68-3.36(m,24H),3.01 –2.94(m,2H),2.22(s,3H);EI-MS m/z:595(M++1)。
化合物MPS-D11-2的制备
收率为定量,浅黄色油状物。
EI-MS m/z:463(M++1)。
化合物MPS-D10的制备
在室温和N2气氛下,用DIPEA(52uL,0.3mmol,3当量)和HBTU(57mg, 0.15mmol,1.5当量)处理MPS-D10-2(63mg,0.10mmol)和BCN-PNP(31.5mg, 0.10mmol,1.0当量)在无水DMF(2.0mL)中的均匀溶液,并搅拌2小时。将反应 物用H2O(20mL)猝灭,并用EA(30mL X3)萃取。将合并的有机层用盐水(10mL) 洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。将残留物通过制备型TLC纯化, 得到化合物mMPS-D10(57mg,74%)。EI-MS m/z:771(M++1)。
化合物MPS-D11的制备
通过与化合物MPS-D10的制备方法类似的方式合成化合物MPS-D11。
收率为82%,浅黄色油状物。
EI-MS m/z:639(M++1)。
单体的制备
实施例35:吡咯并-苯二氮杂
Figure BDA0003089692190000913
单体(在下文中称为“PBD单体”)的制备
Figure BDA0003089692190000911
通过以EP20071813614中描述的类似方法进行反应获得PBD单体。
实施例36:四氢异喹啉并-苯并二氮杂
Figure BDA0003089692190000914
单体(在下文中简称“TBD-单体”)的制备
Figure BDA0003089692190000912
化合物M-1-1的制备
在N2气氛下,向(s)-(-)-1,2,3,4-四氢异喹啉-3-羧酸(5.0g,28.22mmol) 在MeOH(140mL)中的溶液中滴加SOCl2(2.30mL,31.04mmol)至0℃。在 40℃下搅拌21小时后,将混合物减压浓缩。加入二乙基醚(50mL)以得到沉 淀,用二乙基醚过滤所述沉淀,得到化合物M-1-1(6.42g,收率为99%)。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ10.02(s,2H),7.27(s,4H),4.60-4.56 (m,1H),4.39-4.29(m,2H),3.82(s,3H),3.19-3.12(m,2H);EI-MS m/z:192 (M++1)。
化合物M-1-2的制备
在0℃下向化合物Int-1(9.07g,28.22mmol)在无水THF(50mL)中的溶 液中加入化合物M-1-1(6.42g,28.22mmol)在THF(100mL)和TEA(7.9mL, 56.43mmol)中的溶液。在于室温下搅拌2小时后,将反应物用蒸馏水(500mL) 稀释,并用EA(800mL)萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓 缩。将残留物通过柱色谱纯化,得到化合物M-1-2(12.01g,90%。EI-MS m/z: 477(M++1)。
化合物M-1-3的制备
在-78℃和N2气氛下,向化合物M-1-2(4g,8.39mmol)在无水DCM(18 mL)和甲苯(52mL)中的溶液中滴加DIBAL(16.8mL,16.79mmol,在甲苯中 1.0M)。在-78℃搅拌4小时后,在-78℃下用MeOH(0.4mL)和2N HCl(25mL) 猝灭反应物。将混合物用水(100mL)稀释,并用EA(500mL)萃取。将有机层经 无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。将残留物通过柱色谱纯化,得到化合物 M-1-3(3.07g,82%)。EI-MS m/z:447(M++1)。
化合物M-1-4的制备
在室温下,向化合物M-1-3(3g,6.72mmol)在THF(130mL)和蒸馏水(86mL) 中的溶液中加入Na2S2O4·2H2O(11.3g,53.76mmol)。搅拌5小时后,通过使用甲 苯作为共溶剂,将反应物减压浓缩4次,从而除去水。然后,将获得的黄色固体 溶解在无水MeOH(220mL)中,并向其中加入乙酰基氯(4.8mL,67.19mmol)。搅 拌15分钟后,将反应混合物通过加入饱和NaHCO3溶液调节至pH 7,并用蒸馏 水(100mL)稀释并用EA(250mL×2)萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥,过滤 并减压浓缩。将残留物通过柱色谱纯化,得到化合物M-1-4(2.48g,93%)。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.55(s,1H),7.45-7.27(m,10H),6.84(s,1H), 5.24-5.15(m,2H),5.00(d,J=15.2,1H),4.56(d,J=15.6,1H),3.97(s,3H),3.93- 3.92(m,1H),3.31-3.12(m,2H)。EI-MS m/z:399(M++1)。
化合物M-1的制备
在0℃下,向化合物M-1-4(1g,2.51mmol)在无水DCM(10mL)中的溶液中 加入甲磺酸(5mL)在DCM(10mL)中的溶液。在0℃下搅拌3小时后,将混合物 用NaHCO3溶液、水(100mL)猝灭,并用EA(400mL)萃取。将有机层经无水 Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。将残留物通过柱色谱纯化,得到化合物M-1(703 mg,91%)。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.54(s,1H),7.48(d,J=4.8Hz,1H),7.37-7.26 (m,4H),6.88(s,1H),6.03(s,1H),5.00(d,J=15.6Hz,1H),4.56(d,J=15.6Hz, 1H),3.98(s,3H),3.95-3.90(m,1H),3.30-3.13(m,2H)。EI-MS m/z:309(M++1)。
实施例37:二氢吲哚啉-苯并二氮杂
Figure BDA0003089692190000922
单体(在下文中为“IBD-单体”)的制备
Figure BDA0003089692190000921
通过以WO2010091150中描述的类似合成方法进行反应获得IBD单体。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ8.27(d,J=7.6Hz,1H),7.88(d,J=4.4Hz,1H), 7.56(s,1H),7.33-7.30(m,1H),7.11(t,J=7.6Hz,1H),6.92(s,1H),4.50-4.46(m, 1H),3.99(s,3H),3.78-3.67(m,1H),3.53-3.50(m,1H)。EI-MS m/z:295(M++1)。
实施例38:具有C2-芳基取代基的PBD化合物的制备
Figure BDA0003089692190000931
化合物M-2-1的制备
在室温和N2气氛下,向搅拌的反式-4-羟基-L-脯氨酸(30g,230mmol) 和NaHCO3(43g,570mmol,2.5当量)在H2O/甲苯(500mL/120mL)中的溶液 中加入Cbz-Cl(37.4mL,260mmol,1.15当量)。添加后,将混合物在此温度 下搅拌过夜。用EA(500mL×3)萃取混合物。将有机层用水(500mL x2)洗 涤,并经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,得到为浅棕色油状物的化合 物M-2-1(57.5g,95%)。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ12.7(br s,1H),7.40-7.28(m,5H),5.18 -5.02(m,2H),4.31-4.24(m,2H),3.51-3.35(m,2H),2.23-2.10(m,1H), 2.00-1.87(m,1H);EI-MS m/z:266(M++1)。
化合物M-2-2的制备
在0℃和N2气氛下,用亚硫酰氯(45.3mL,610mmol,2.8当量)处理化 合物M-2-1(57.5g,220mmol)在MeOH(400mL)中的棕色溶液。使反应混合 物升温至室温并搅拌过夜。将混合物减压浓缩,得到为浅棕色油状物的化合 物M-2-2(60.5g,定量)。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.38-7.28(m,5H),5.23-5.09(m,2H),4.56 -4.47(m,2H),3.80(s,1H),3.76-3.66(m,2H),3.58-3.52(m,1H)2.38-2.26 (m,1H),2.16-2.08(m,1H);EI-MS m/z:270(M++1)。
化合物M-2-3的制备
在0℃和N2气氛下,用LiBH4(3.9g,180mmol,0.8当量)处理化合物M-2-2 (60.5g,220mmol)在无水THF(500mL)中的棕色溶液,并搅拌30分钟。然后将 混合物在室温下再搅拌2天。将混合物用水(200mL)和2N HCl(100mL)猝灭。 通过旋转蒸发器除去有机溶剂。将残留物用EA(500mL×3)萃取,然后将有机层 经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,得到为浅棕色油状物的化合物M-2-3(54.6 g,98%)。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.39-7.30(m,5H),5.21-5.12(m,2H),4.66(d,J =7.2Hz,1H),4.39(s,1H),4.21(q,J=7.6,7.2Hz,1H),3.76(t,J=9.6Hz,2H), 3.66-3.58(m,1H),3.50(dd,J=8.0,4.0Hz,1H),2.10-2.23(m,1H),1.78-1.64(m, 1H);EI-MS m/z:252(M++1)。
化合物M-2-4的制备
在室温和N2气氛下,用叔丁基二甲基甲硅烷基氯(25.4g,170mmol,0.8当 量)、TEA(30mL,210mmol,1.0当量)和DBU(6.3mL,42.2mmol,0.2当量)处 理M-2-3(53g,210mmol)在无水DCM(500mL)中的棕色溶液。添加后,将混合 物搅拌过夜。用NH4Cl(300mL)洗涤反应混合物,然后用盐水(300mL)洗涤,然 后将有机层经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。将残留物通过柱色谱(Hex:EA =1:1)纯化,得到为浅棕色油状物的化合物M-2-4(48.2g,63%)。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.38-7.28(m,5H),5.20-5.08(m,2H),4.50(s, 1H),4.12-4.00(m,1H),3.97(dd,J=6.4,4.0Hz,1H),3.71(dd,J=5.6,4.8Hz,1H), 3.66-3.58(m,1H),3.52-3.48(m,1H),2.28-2.18(m,1H),2.02-1.92(m,1H),0.10 -0.08(m,6H);EI-MS m/z:366(M++1)。
化合物M-2-5的制备
在N2气氛下将碳载钯5%钯/碳(1.3g,1.23mmol,0.03当量)加入到搅拌的 M-2-4(15g,41.0mmol)在EA(50mL)中的溶液中。通过在室温下将氢气鼓泡通 过溶液来冲洗烧瓶。将混合物在相同温度下搅拌5小时。将混合物用EA(30mL) 稀释,通过硅藻土过滤,硅藻土塞用EA(50mL x2)洗涤。将滤液减压浓缩,得 到为浅棕色油状物的化合物M-2-5(9.5g,定量)。
1H NMR 400MHz,CDCl3)δ4.41(br s,1H),3.60-3.44(m,3H),3.12(dd,J= 7.2Hz,4.8Hz,1H),2.89(d,J=12Hz,1H),1.84-1.79(m,1H),1.74-1.67(m,1H), 0.89(s,9H),0.06(s,6H);EI-MS m/z:232(M++1)。
化合物M-2-6的制备
在0℃和N2气氛下,用DIPEA(26.9mL,154.3mmol,3.0当量)将化合物M-2-5(11.9g,51.42mmol)和Int-2(14.4g,56.6mmol,1.1当量)在无水THF(400ml)中 的棕色溶液,并搅拌5小时。将反应混合物用蒸馏水(50mL)稀释,并用EA(150 mL X2)萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。将残留物通过柱 色谱(Hex:EA=2:1至2:1)纯化,得到为黄色固体形式的化合物M-2-6(20g,83%)。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.95(s,1H),6.87(s,1H),4.60-4.51(m,1H), 4.49-4.41(m,1H),4.24-4.08(m,1H),3.91(s,3H),3.80-3.68(m,1H),3.37(dd, J=7.6Hz,4.0Hz,1H),3.14(d,J=10.4Hz,1H),2.35(s,3H),2.18-2.08(m, 1H),0.91(s,9H),0.1(s 6H);EI-MS m/z:469(M++1)。
化合物M-2-7的制备
在N2气氛下将碳载钯5%钯/碳(9.1g,4.27mmol,0.1当量)加入到搅拌 的M-2-6(20g,42.68mmol)在EA(213mL)中的溶液中。通过在室温下将氢 气鼓泡通过溶液来冲洗烧瓶。搅拌8小时后,将混合物用EA(50mL)稀释, 通过硅藻土过滤,硅藻土塞用EA(50mL x2)洗涤。将滤液减压浓缩,得到 为黄色固体形式的化合物M-2-7(18.5g,99%)。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ6.81(s,1H),6.44(s,1H),5.79(br s,1H), 4.58-4.50(m,1H),4.42-4.36(m,1H),4.10(br s,1H),3.79(s,3H),3.59(dd,J =8.4Hz,2.8Hz,1H),3.50(d,J=11.2Hz,1H),2.30-2.24(m,1H),2.06-2.01 (m,1H),0.89(s,9H),0.05(d,J=1.6Hz,6H);EI-MS m/z:439(M++1)。
化合物M-2-8的制备
在0℃和N2气氛下,用氯甲酸2,2,2-三氯乙酯(6.4mL,46.4mmol,1.1 当量)和吡啶(6.9mL,87.4mmol,2.0当量)处理M-2-7(18.5g,42.18mmol)在 无水DCM(210mL)中的黄色溶液,然后搅拌3小时。将混合物用CuSO4溶 液(50mL)和盐水(100mL X2)洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥,过滤并 减压浓缩。将残留物通过柱色谱(Hex:EA =2:1)纯化,得到为棕色固体形式 的化合物M-2-8(21.2g,82%)。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ8.87(br s,1H),7.86(s,1H),6.89(s,1H), 4.84(d,J=12.8Hz,1H),4.71(d,J=10.8Hz,1H),4.61(br s,1H),4.45(s,1H), 4.20(br s,1H),3.78(s,3H),3.70-3.62(m,1H),3.57(s,2H),2.32(s,4H),2.11- 2.02(m,1H),1.80(s,1H),0.90(s,9H),0.05(s,6H);EI-MS m/z:615(M++1)。
化合物M-2-9的制备
在-78℃和N2气氛下,用于无水DCM(20mL)中的DMSO(3.5mL,48.9 mmol,3.0当量)处理草酰氯(21mL,24.4mmol,1.5当量)在无水DCM(50mL) 中的均匀溶液,并搅拌1小时。将M-2-8(10g,0.33mmol)在无水DCM(100 mL)中的溶液滴加到反应混合物中,并搅拌2小时。将反应混合物用TEA (22.7mL,162.9mmol,10当量)处理,并在室温下搅拌1小时。将混合物用NH4Cl溶液(30mL)和DCM(100mL X2)萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥, 过滤并减压浓缩。将残留物通过柱色谱(Hex:EA =4:1至1:1)纯化,得到为棕 色固体形式的化合物M-2-9(8.2g,83%)。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ8.68(br s,1H),7.91(s,1H),6.86(s,1H), 5.12(br s,1H),4.80(s,2H),4.13(br s,1H),4.04(d,J=17.2Hz,1H),3.98 -3.86(m,1H),3.80(s,3H),3.76-3.62(m,1H),2.84-2.72(m,2H),2.54(d,J= 17.2Hz,1H),2.32(s,3H),2.08-1.98(m,1H),0.88(s,9H),0.21(s,6H);EI-MS m/z:612(M++1)。
化合物M-2-10的制备
在-10℃和N2气氛下,用三氟乙酸酐(5.5mL,32.68mmol,10当量)处理M-2-9(2.0g,3.27mmol)和2,6-二甲基吡啶(4.6mL,12当量)在无水DCM(100mL)中的 黄色溶液,并搅拌6小时。将反应混合物升温至室温,并再搅拌1小时。将混合 物用蒸馏水(50mL)稀释,并用DCM(100mL X2)萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。将残留物通过柱色谱(Hex:EA=4:1)纯化,得到为黄色 油状物的化合物M-2-10(502mg,21%)。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ8.78(br s,1H),7.97(s,1H),6.85(s,1H),6.80(s, 1H),4.86-4.72(m,3H),4.20-4.32(m,1H),3.80(s,3H),3.76-3.68(m,1H),3.20– 3.00(m,2H),2.33(s,3H),0.89(s,9H),0.06(d,J=10.6Hz 6H);EI-MS m/z:745 (M++1)。
化合物M-2-11的制备
在室温和N2气氛下,用4,4,5,5-四甲基-2-苯基-1,3,2-二氧硼杂环戊烷(164.6mg,0.81mmol,1.2当量)、Pd(TPP)4(77.5mg,0.067mmol,0.1当量)和TEA(234.2 uL,1.68mmol,2.5当量)处理M-2-10(500mg,0.67mmol)在甲苯(4.0mL)、H2O (0.6mL)和乙醇(4.0mL)中的黄色溶液,然后搅拌3小时。将混合物用蒸馏水(100 mL)稀释,并用EA(100mL)萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓 缩。将残留物通过柱色谱(Hex:EA=3:1)纯化,得到为黄色固体形式的化合物 M-2-11(343mg,76%)。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ8.76(br s,1H),7.96(s,1H),7.38-7.28(m,5H), 6.98(s,1H),6.93(s,1H),4.78-4.68(m,3H),4.16-4.04(m,2H),3.92-3.84(m, 1H),3.79(s,3H),3.24-3.12(m,1H),3.08-2.90(m,1H),2.34(s,3H),0.85(s,9H), 0.05(s,6H);EI-MS m/z:673(M++1)。
化合物M-2-12的制备
在室温和N2气氛下,用乙酸(8.0mL)处理M-2-11(340mg,0.505mmol)在 THF(4.0mL)和H2O(2.0mL)中的黄色溶液,并搅拌20小时。将混合物用蒸馏水 (10mL)稀释,并用EA(20mL X2)萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥,过滤并 减压浓缩。将残留物通过柱色谱(Hex:EA=2:1)纯化,得到为黄色固体形式的化 合物M-2-12(250mg,89%)。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ8.86(br s,1H),7.87(s,1H),7.36-7.28(m,5H), 7.00(s,1H),6.85(s,1H),4.93(br s,1H),4.75(s,2H),4.16-4.10(m,3H),3.82(s, 3H),3.64(s,1H),3.33(t,J=13.6,5.6Hz,1H),2.77(d,J=17.2Hz,1H)2.34(s,3H); EI-MS m/z:558(M++1)。
化合物M-2-13的制备
在-78℃和N2气氛下,用于无水DCM(1.0mL)中的DMSO(80uL,1.12mmol, 3.0当量)处理草酰氯(58uL,0.67mmol,1.5当量)在无水DCM(1.0mL)中的均匀 溶液,并搅拌15分钟。在室温下,将M-2-12(250mg,0.45mmol)在无水DCM(3.0 mL)中的溶液滴加到反应混合物中,并搅拌3小时,然后加入TEA(500uL, 3.58mmol,8.0当量),并在室温下再搅拌30分钟。将反应混合物用蒸馏水(5.0 mL)稀释,并用EA(15mL X2)萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥,过滤并 减压浓缩。将残留物通过柱色谱(Hex:EA =3:1)纯化,得到黄色固体形式的 化合物M-2-13(202mg,81%)。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.45(s,1H),7.38(s,5H),7.12(s,1H),5.84 (br s,1H),5.18(d,J=10.6Hz,1H),4.31(d,J=12.8Hz,1H),4.18-4.06(m, 3H),3.84(s,3H),3.72(s,1H),3.43(t,J=10.0Hz,1H),3.12(d,J=18.0Hz, 1H),2.32(s,3H);EI-MS m/z:556(M++1)
化合物M-2的制备
在室温和N2气氛下,用K2CO3(109mg,0.79mmol,2.5当量)处理M-2-13 (175mg,0.31mmol)在MeOH(16mL)和H2O(3.0mL)中的黄色溶液,并搅拌 2小时。将混合物用水(5mL)稀释,并用EA(10mL X2)萃取。将有机层经 无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。将残留物通过柱色谱(Hex:EA =2:1)纯 化,得到为黄色固体形式的化合物M-2(135mg,85%)。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.49(s,1H),7.37(s,5H),6.94(s,1H),5.93 (br s,1H),5.88-5.82(m,1H),5.14(d,J=11.6Hz,1H),4.32(d,J=10.8Hz, 1H),4.18-4.00(m,2H),3.97(s,3H),3.41(t,J=9.6Hz,1H),3.10(d,J=16.0 Hz,1H);EI-MS m/z:514(M++1)
实施例39:具有C2-芳基取代基的PBD化合物的制备
Figure BDA0003089692190000971
Figure BDA0003089692190000981
化合物M-2-15的制备
在0℃下向化合物Int-1(10.24g,31.85mmol)在无水THF(20ml)中的溶液中 加入在THF(20mL)中的化合物M-2-5(6.7g,28.95mmol)和DIPEA(15.1mL, 86.86mmol)。室温下搅拌5小时后,用蒸馏水(50mL)和EA(2X150mL)稀释反 应物。将有机层经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。将残留物通过柱色谱纯 化,得到化合物M-2-15(12g,82%)。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.74(s,1H),7.46-7.35(m,5H),6.78(s,1H), 5.21(s,2H),4.60-4.51(m,1H),4.41(br s,1H),4.16-4.09(m,1H),3.94(s,3H), 3.78-3.70(m,1H),3.37(dd,J=7.6Hz,4.0Hz,1H),3.09(d,J=11.6Hz,1H),2.37 -2.31(m,1H),2.14-2.08(m,1H),0.91(s,9H),0.1(d,J=4.4Hz,6H);EI-MS m/z: 517(M++1)。
化合物M-2-16的制备
在H2气氛下,向化合物M-2-15(12g,23.2mmol)在MeOH(200mL)和DMF (20mL)中的溶液中加入5%Pd/C(2.5g,1.16mmol)。将混合物在室温下搅拌5小 时。将混合物通过硅藻土过滤以除去Pd/C,并减压浓缩以获得化合物M-2-16。 (8.8g,96%)。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ6.71(s,1H),6.30(s,1H),5.79(br s,1H),4.58- 4.50(m,1H),4.42-4.36(m,1H),4.10(br s,1H),3.79(s,3H),3.59(dd,J=8.4Hz, 2.8Hz,1H),3.50(d,J=11.2Hz,1H),2.30-2.24(m,1H),2.06-2.01(m,1H),0.89 (s,9H),0.05(d,J=1.6Hz,6H);EI-MS m/z:397(M++1)。
化合物M-2-17的制备
在0℃下将氯甲酸2,2,2-三氯乙酯(555uL,4.03mmol)在无水DCM(20mL)中 的溶液滴加到M-2-16(2.0g,5.04mmol)和吡啶(2.0mL,25.2mmol)在无水DCM (30mL)中的溶液中。在0℃搅拌1小时后,用CuSO4溶液(50mL)和盐水(2X 100mL)洗涤反应物。将有机层经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。将残 留物通过柱色谱纯化,得到化合物M-2-17(1.23g,43%)。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ9.05(br s,1H),7.66(s,1H),6.79(s,1H), 5.92(s,1H),5.21(s,2H),4.385(d,J=12.4Hz,1H),4.70(d,J=11.6Hz,1H), 4.56(br s,1H),4.30(s,1H),4.14(br s,1H),3.84(s,3H),3.58(s,2H),2.36- 2.26(m,1H),2.12-2.0(m,1H),1.93(br s,1H),0.90(s,9H),0.04(s,6H); EI-MS m/z:593(M++1)。
化合物M-2-18的制备
在-78℃下,将DMSO(485.2uL,6.45mmol)在无水DCM(5mL)中的溶 液滴加到草酰氯(369uL,4.3mmol)在无水DCM(20mL)中的溶液中。在 -78℃下搅拌1小时后,将M-2-17(1.23g,2.15mmol)在无水DCM(20mL) 中的溶液滴加到反应混合物中,并在-78℃搅拌2小时。2小时后,在反应混 合物中加入TEA(3mL,21.5mmol),并在室温下搅拌1小时。用NH4Cl溶液(30mL)和DCM(2X50mL)萃取反应混合物。将有机层经无水Na2SO4干 燥,过滤并减压浓缩。将残留物通过柱色谱纯化,得到化合物M-2-18(906.7 mg,76%)。EI-MS m/z:571(M++1)。
具有C2-芳基取代基的PBD化合物的制备
通过WO2005/085251和Tetrahedron Letters 56(2015)4512-4515(所述两 篇文献均通过引用完全并入本文)中描述的类似合成途径合成PBD化合物。
实施例40:化合物M-3的制备
Figure BDA0003089692190000991
化合物M-3-1的制备
向(S)-2-氨基-3-(4-羟基-3,5-二碘苯基)丙酸(8.0g,18.48mmol)在浓HCl 水溶液(90mL)中的溶液中加入1,2-二甲氧基乙烷(7.5mL)和多聚甲醛(在 H2O中37重量%,92.38mmol)。将混合物剧烈搅拌并缓慢加热至72℃。将 反应混合物在72℃搅拌过夜。然后将悬浮液在冰浴中冷却,并将固体通过 过滤收集,用1,2-二甲氧基乙烷(3X10mL)彻底洗涤,并真空干燥,得到化 合物M-3-1(2.49g,收率为28%)。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ10.02(br s,1H),9.69(s,1H),7.73(s, 1H),4.31(dd,J=6.8Hz,4.4Hz,1H),4.05(q,J=18.8Hz,16Hz,2H),3.21(dd,J= 12Hz,4.8Hz,1H),3.12-3.02(m,1H);EI-MS m/z:446(M++1)。
化合物M-3-2的制备
在室温和H2气氛下,将M-3-1(1.4g,3.1mmol)、TEA(1.4mL,10.38mmol) 和5%Pd/C(335mg,0.16mmol)在EtOH/H2O(40mL/mL)中的混合物搅拌3小 时。将混合物通过硅藻土过滤,并浓缩滤液。用水稀释所得残留物,并过滤沉淀 物。将固体用冷水洗涤,并在高真空下干燥,得到化合物M-3-2(337.3mg,60%)。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.55(br s,1H),9.69(s,1H),6.98(d,J=9.0 Hz,1H),6.64(d,J=8.4Hz,1H),6.57(s,1H),4.06(s,2H),3.46(dd,J=6.0Hz,4.8 Hz,1H),3.46(dd,J=11.6Hz,5.2Hz,1H),2.82–2.75(m,1H);EI-MS m/z:194 (M++1)。
化合物M-3-3的制备
在N2气氛下,向M-3-2(337.3mg,1.74mmol)在MeOH(5.0mL)中的溶液中 滴加SOCl2(380uL,5.24mmol)至0℃。回流2小时后,将反应混合物减压浓缩, 并直接用于下一步骤而无需进一步纯化(406mg,收率为96%)。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.83(br s,2H),9.56(s,1H),7.05(d,J=8.0 Hz,1H),6.70(d,J=8.0Hz,1H),6.63(s,1H),4.53-4.49(m,1H),4.28-4.22(m, 2H),3.81(s,1H),3.18(dd,J=11.6Hz,5.2Hz,1H),3.04-2.97(m,1H);EI-MS m/z: 208(M++1)。
化合物M-3-4的制备
在0℃下向化合物Int-1(640.9mg,1.86mmol)在无水THF(4.0mL)中的溶液 中加入于DMF(5.0mL)中的化合物M-3-3(350mg,1.43mmol),然后加入DIPEA (750uL,4.3mmol)。在室温下搅拌2小时后,用蒸馏水(10mL)和EA(2X50mL) 洗涤混合物。将有机层经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。将残留物通过柱 色谱纯化,得到化合物M-3-4(616mg,87%);EI-MSm/z:493(M++1)。
化合物M-3-5的制备
在0℃下,将叔丁基二甲基甲硅烷基氯(188.5mg,1.25mmol)加入到M-3-4 (616mg,1.25mmol)和咪唑(102.2mg,1.50mmol)在无水DCM(6.0mL)中的溶液 中。在室温下搅拌反应混合物过夜。将反应物用2N HCl(5mL)和盐水(10mL)猝 灭,并用DCM(10mL x2)萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。 将残留物通过柱色谱纯化,得到化合物M-3-5(655.2mg,86%)。EI-MS m/z:607 (M++1)。
化合物M-3-6的制备
在-78℃和N2气氛下,向化合物M-3-5(309mg,0.51mmol)在无水DCM(1.5 mL)和甲苯(3.5mL)中的溶液中滴加DIBAL(990uL,0.99mmol,在甲苯中1.0M)。 搅拌1.5小时后,在-78℃下用MeOH(0.4mL)和2N HCl(15mL)猝灭反应物,然 后用H2O(20mL)和EA(30mL x2)萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥,过滤并 减压浓缩。将残留物通过柱色谱纯化,得到化合物M-3-6(280.4mg,95%);EI-MS m/z:577(M++1)。
化合物M-3-7的制备
在室温下,向化合物M-3-6(280.4mg,0.49mmol)在THF(6.0mL)和蒸 馏水(86mL)中的溶液中加入Na2S2O4(677.2mg,3.89mmol)。搅拌5小时后, 通过使用甲苯作为共溶剂将混合物减压浓缩4次,从而除去水。将获得的黄 色固体溶解在无水MeOH(12mL)中。向其中加入乙酰氯(345.6uL,4.86 mmol)。搅拌15分钟后,过滤反应混合物,并将滤液搅拌1小时。将反应 混合物通过加入饱和NaHCO3溶液调节至pH 7,并用蒸馏水(10mL)和EA(2 X50mL)稀释。将有机层经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。将残留物 通过柱色谱纯化,得到化合物M-3-7(107.7mg,42%)。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.55(s,1H),7.48-7.31(m,6H),7.16(d,J= 8.4Hz,1H),6.94(s,1H),6.82-6.76(m,2H),5.28-5.15(m,2H),4.93(d,J=15.6 Hz,1H),4.46(d,J=15.6Hz,1H),3.97(s,3H),3.92-3.86(m,1H),3.18(dd,J= 9.6Hz,5.6Hz,1H),3.10-3.02(m,1H),0.99(s,9H),0.21(s,6H);EI-MS m/z: 529(M++1)。
化合物M-3的制备
在N2气氛下,向化合物M-3-7(53.4mg,0.1mmol)在EtOH(6.0mL)中的 溶液中加入5%Pd/C(107.5mg,0.05mmol)。然后在反应混合物中加入1,4- 环己二烯(764.4uL,8.08mmol)。搅拌3小时后,将混合物通过硅藻土过滤以 除去Pd/C,并减压浓缩。将残留物通过柱色谱纯化,得到化合物M-3(30.3mg, 68%)。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.54(s,1H),7.47(d,J=5.2Hz,1H),7.20(d, J=8.82Hz,1H),6.87(s,1H),6.84-6.75(m,2H),5.98(s,1H),4.93(d,J=15.6 Hz,1H),4.47(d,J=15.2Hz,1H),3.98(s,3H),3.94-3.85(m,1H),3.19(dd,J= 11.2Hz,5.2Hz,1H),3.12-3.02(m,1H),0.99(s,9H),0.21(s,6H);EI-MS m/z: 439(M++1)。
实施例41:化合物M-4的制备
Figure BDA0003089692190001011
在室温和N2气氛下,用K2CO3(2.7mg,0.019mmol,1.0当量)处理化合 物M-1(6.0mg,0.019mmol)和1,5-二溴戊烷(5.26uL,0.038mmol,2.0当量) 在DMF(1mL)中的黄色溶液,并搅拌7小时。将反应混合物通过制备型 HPLC(柱:Innoval ODS-2 10um,
Figure BDA0003089692190001012
21.2x250mm;流速:15mL/min,A 缓冲液0.1%的于水中的甲酸/B缓冲液0.1%的于ACN中的甲酸,方法梯度, 溶剂A:溶剂B 95:5至5:95,1小时,波长214nm)纯化,得到为白色固体的 化合物115(7.3mg,82%)。
EI-MS m/z:458(M++1)。
同二聚体的制备
实施例42:化合物Ref-1的制备
Figure BDA0003089692190001021
通过WO2016/115191 A1中描述的类似合成途径合成Ref-1。在N2气氛下, 向化合物M-1(10.0mg,0.03mmol)和1,3-双(溴甲基)苯(4.1mg,0.015mmol)在 DMF(1.0mL)中的溶液中加入K2CO3(4.7mg,0.034mmol)。将混合物在室温下搅 拌过夜,并减压浓缩。将残留物通过制备型HPLC(柱:Innoval ODS-2 10um,
Figure BDA0003089692190001022
Figure BDA0003089692190001023
50x250mm;流速:40mL/min,A缓冲液0.1%的于水中的甲酸/B缓冲液0.1% 的于ACN中的甲酸,方法梯度,溶剂A:溶剂B 80:20至20:80,45分钟,波长 214nm)纯化,得到化合物Ref-1(8.0mg,71%)。
EI-MS m/z:719(M++1)。
实施例43:(苯酚)-PBD-二聚体(D-1)的制备
Figure BDA0003089692190001024
在室温和N2气氛下,向化合物PBD-单体(参考文献EP20071813614A1,29 mg,0.11mmol)和化合物L-1(20mg,0.05mmol)在DMF(2mL)中的溶液中加入 K2CO3(15.4mg,0.11mmol)。搅拌17小时后,用EA(1mL)稀释混合物,并加入 1M的于THF(51uL,0.05mmol)中的TBAF。将混合物再搅拌1小时,并用H2O (50mL)和2N HCl水溶液(5mL)洗涤,并用EA(100mL)萃取。将所得有机层经 无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。将残留物通过制备型HPLC(柱:Innoval ODS-2 10um,
Figure BDA0003089692190001026
50x250mm;流速:40mL/min,A缓冲液0.1%的于水中的 甲酸/B缓冲液0.1%的于ACN中的甲酸,方法梯度,溶剂A:溶剂B 80:20至20:80, 45分钟,波长214n m)纯化,得到化合物D-1(17mg,53%)。EI-MS m/z:635 (M++1)。
实施例44:(吡啶)-PBD-二聚体(D-2)的制备
Figure BDA0003089692190001025
在室温和N2气氛下,向化合物PBD-单体(参考文献EP20071813614A1,39 mg,0.15mmol)和化合物L-2(20mg,0.08mmol)在DMF(2mL)中的溶液中加入 K2CO3(21mg,0.15mmol)。搅拌5小时后,将混合物用EA(100mL)稀释。将有 机层用H2O(50mL)和2N HCl水溶液(5mL)洗涤,并经无水Na2SO4干燥, 过滤并减压浓缩。将残留物通过柱色谱纯化,得到化合物D-2(46.4mg,52%)。
EI-MS m/z:20(M+)。
实施例45:(苯酚)-TBD-二聚体(D-3)的制备
Figure BDA0003089692190001031
在N2气氛下,向化合物M-1(31mg,0.10mmol)和化合物L-1(20mg, 0.05mmol)在DMF(1.0mL)中的溶液中加入K2CO3(14mg,0.10mmol)。在 室温下搅拌7小时后,将反应混合物通过制备型HPLC(柱:Innoval ODS-2 10 um,
Figure BDA0003089692190001032
50x250mm;流速:40mL/min,A缓冲液0.1%的于水中的甲酸/B 缓冲液0.1%的于ACN中的甲酸,方法梯度,溶剂A:溶剂B 80:20至20:80, 45分钟,波长214nm)纯化,得到化合物D-3(13mg,30%)。
EI-MS m/z:734(M++1)。
实施例46:(吡啶)-TBD-二聚体(D-4)的制备
Figure BDA0003089692190001033
通过与实施例44中所述类似的合成途径合成了化合物D-4(收率为 85%)。
EI-MS m/z:720(M++1)。
实施例47:(N,N-二甲基苄基)-TBD-二聚体(D-5)的制备
Figure BDA0003089692190001034
化合物D-5-1的制备
在室温和N2气氛下,向化合物M-1(100mg,0.32mmol)和1,3,5-三(溴 甲基)苯(57mg,0.16mmol)在DMF(1mL)中的溶液中加入K2CO3(45mg, 0.32mmol)。搅拌4小时后,加入EA(100mL)、H2O(50mL)和2N HCl水溶液(5 mL)进行萃取,将所得有机层经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。将残留物 通过柱色谱纯化,得到化合物D-5-1(54mg,42%)。
EI-MS m/z:812(M+)。
化合物D-5的制备
在室温和N2气氛下,将化合物D-5-1(50mg,0.01mmol)溶解在二甲基胺(1 mL)中。搅拌1小时后,将混合物通过制备型HPLC(柱:Innoval ODS-2 10um,
Figure BDA0003089692190001041
Figure BDA0003089692190001042
50x250mm;流速:40mL/min,A缓冲液0.1%的于水中的甲酸/B缓冲液0.1% 的于ACN中的甲酸,方法梯度,溶剂A:溶剂B 80:20至20:80,45分钟,波长 214nm)纯化,得到化合物D-5(2.2mg,17%)。
EI-MS m/z:776(M++1)。
实施例48:(N-吡啶)-TBD-二聚体(D-6)的制备
Figure BDA0003089692190001043
在50℃和N2气氛下,向化合物M-1(16mg,0.05mmol)和化合物L-3(10mg,0.03mmol)在DMF(1mL)中的溶液中加入K2CO3(11mg,0.08mmol)。搅拌5小 时后,将混合物通过制备型HPLC(柱:Innoval ODS-210um,
Figure BDA0003089692190001046
50x250mm; 流速:15mL/min,A缓冲液0.1%的于水中的甲酸/B缓冲液0.1%的于ACN中的 甲酸,方法梯度,溶剂A:溶剂B 80:20至20:80,45分钟,波长214nm)纯化, 得到化合物D-6(10.5mg,53%)。EI-MS m/z:763(M+)。
实施例49:(苯酚)-IBD-二聚体(D-7)的制备
Figure BDA0003089692190001044
通过与实施例43中所述类似的合成途径合成了化合物D-7。EI-MS m/z:707 (M+1)。
实施例50:(N,N-二甲基苄基)-IBD-二聚体(D-8)的制备
Figure BDA0003089692190001045
通过与实施例47中所述类似的合成途径合成了化合物D-8(收率为50%)。 EI-MSm/z:748(M+1)。
实施例51:化合物D-9的制备
Figure BDA0003089692190001051
在室温和N2气氛下,用K2CO3(112mg,0.81mmol,5.0当量)处理化合 物M-1(50mg,0.16mmol)和化合物L-13(19.8mg,0.081mmol,0.5当量)在 DMF(3mL)中的黄色溶液,并搅拌3小时。将反应混合物通过制备型HPLC (柱:Innoval ODS-2 10um,
Figure BDA0003089692190001052
21.2x250mm;流速:40mL/min,A缓冲液 0.1%的于水中的甲酸/B缓冲液0.1%的于ACN中的甲酸,方法梯度,溶剂 A:溶剂B 95:5至5:95,1小时,波长214nm)纯化,得到为白色固体的化合 物D-9(31mg,55%)。
EI-MS m/z:700(M++1)。
实施例52:化合物D-10的制备
Figure BDA0003089692190001053
化合物D-10-1的制备
在室温和N2气氛下,用K2CO3(200.8mg,1.45mmol,1.5当量)处理化合 物PBD-OH(250mg,0.97mmol)和1,3,5-三溴甲基苯(172.7mg,0.48mmol, 0.5当量)在DMF(2.0mL)中的黄色溶液,并搅拌3小时。将化合物D-10-1 直接用于下一步骤而无需进一步纯化。
化合物D-10的制备
通过与实施例47中所述类似的合成途径合成了化合物D-10。
收率为23%,为白色固体。EI-MS m/z:658(M++1)。
实施例53:化合物D-11的制备
Figure BDA0003089692190001054
化合物D-11-1的制备
在室温和N2气氛下,用K2CO3(6.6mg,0.048mmol,4.0当量)处理化合 物M-2(20mg,0.038mmol)和L-1(7.6mg,0.019mmol,0.5当量)在DMF(1 mL)中的黄色溶液,并搅拌20小时。将反应混合物通过制备型HPLC(柱: Innoval ODS-2 10um,
Figure BDA0003089692190001055
21.2x250mm;流速:40mL/min,A缓冲液0.1% 的于水中的甲酸/B缓冲液0.1%的于ACN中的甲酸,方法梯度,溶剂A:溶剂B 95:5至5:95,1小时,波长214nm)纯化,得到为白色固体的化合物D-11-1 (10mg,46%)。
EI-MS m/z:1146(M++1)。
化合物D-11的制备
在室温和N2气氛下,用1N NH4OAc(500uL)处理化合物D-11-1(10mg, 0.009mmol)10%Cd/Pb(200mg)在THF(1.0mL)中的均匀溶液,并搅拌7天。将 反应混合物通过制备型HPLC(柱:Innoval ODS-2 10um,
Figure BDA0003089692190001061
21.2x250mm;流 速:15mL/min,A缓冲液0.1%的于水中的甲酸/B缓冲液0.1%的于ACN中的甲 酸,方法梯度,溶剂A:溶剂B 95:5至5:95,1小时,波长214nm)纯化,得到为 白色固体的化合物D-11(0.6mg,10%)。
EI-MS m/z:759(M++1)。
异二聚体的制备
表B
Figure BDA0003089692190001062
实施例54:化合物D-12的制备
Figure BDA0003089692190001063
化合物D-12-1的制备
在室温和N2气氛下,向化合物M-1(40mg,0.13mmol)和1,3,5-三(溴甲基) 苯(69.4mg,0.19mmol)在DMF(1mL)中的溶液中加入K2CO3(17.9mg,0.13 mmol)。搅拌5小时后,加入EA(2X10mL)、H2O(5mL)和2N HCl水溶液(3mL) 以进行萃取,将所得有机层经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。将残留物通 过柱色谱纯化,得到化合物D-12-1(54mg,42%)。
EI-MS m/z:585(M++1)。
化合物D-12-2的制备
在室温和N2气氛下,向化合物M-3(10mg,0.023mmol)和D-12-1(13.3mg,0.023mmol)在DMF(2.0mL)中的溶液中加入K2CO3(7.9mg,0.056mmol)。搅拌8小时后,加入EA(2X15mL)、H2O(5mL)和2N HCl水溶液(3mL)以进行 萃取,将所得有机层经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。将残留物通过 柱色谱纯化,得到化合物D-12-2(2.5mg,12%)。
EI-MS m/z:943(M++1)。
化合物D-12-3的制备
在室温和N2气氛下,将二甲基胺(5.2uL,0.008mmol)加入到化合物 D-12-2(2.5mg,0.003mmol)在DMF(0.5mL)中的溶液中。将混合物搅拌1 小时。反应完成后,将混合物通过制备型HPLC(柱:Innoval ODS-2 10um,
Figure BDA0003089692190001071
Figure BDA0003089692190001072
50x250mm;流速:15mL/min,A缓冲液0.1%的于水中的甲酸/B缓冲液 0.1%的于ACN中的甲酸,方法梯度,溶剂A:溶剂B 80:20至20:80,45 分钟,波长214nm)纯化,得到化合物D-12-3(1.5mg,63%)。
EI-MS m/z:907(M++1)。
化合物D-12的制备
在0℃和N2气氛下,向溶解在THF(1.0mL)和H2O(200uL)中的化合物 D-12-3(1.5mg,0.002mmol)的溶液中加入浓HCl(100uL),然后将混合物搅 拌1小时。将混合物通过制备型HPLC(柱:Innoval ODS-2 10um,
Figure BDA0003089692190001073
50x250mm;流速:15mL/min,A缓冲液0.1%的于水中的甲酸/B缓冲液0.1% 的于ACN中的甲酸,方法梯度,溶剂A:溶剂B 80:20至20:80,45分钟,波长214nm)纯化,得到化合物D-12(0.3mg,23%)。
EI-MS m/z:792(M++1)。
实施例55:化合物D-13的制备
Figure BDA0003089692190001074
在室温和N2气氛下,用K2CO3(3.9mg,0.028mmol,5.0当量)处理化合 物M-3(2.3mg,0.0056mmol)和M-4(3.8mg,0.0084mmol,1.5当量)在DMF (500uL)中的黄色溶液,并搅拌过夜。将混合物用蒸馏水(2.0mL)稀释,并用 EA(5mL X2)萃取。将有机层经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。将残 留物用MeOH(1.0mL)稀释,并加入AcCl(100uL),并将混合物在相同温度 和N2气氛下搅拌30分钟。将混合物通过制备型HPLC(柱:Innoval ODS-2 10 um,
Figure BDA0003089692190001075
21.2x250mm;流速:15mL/min,A缓冲液0.1%的于水中的甲酸 /B缓冲液0.1%的于ACN中的甲酸,方法梯度,溶剂A:溶剂B 80:20至 20:80,45分钟,波长214nm)直接纯化,得到为白色固体的化合物D-13(1.1 mg,28%)。EI-MS m/z:701(M++1)。
实施例56:化合物T-Int-1的制备
Figure BDA0003089692190001081
化合物T-Int-1-1的制备
在室温和N2气氛下,向化合物PBD-单体(参考文献EP20071813614A1,22 mg,0.08mmol)和化合物L-4(14mg,0.04mmol)在DMF(1mL)中的溶液中加入 K2CO3(12mg,0.08mmol)。在室温下搅拌15小时后,将反应混合物通过HPLC (柱:Innoval ODS-2 10um,
Figure BDA0003089692190001082
50x250mm;流速:15mL/min,A缓冲液0.1% 的于水中的甲酸/B缓冲液0.1%的于ACN中的甲酸,方法梯度,溶剂A:溶剂B 80:20至20:80,45分钟,波长214nm)纯化,得到化合物T-Int-1-1(13.8mg,51%)。 EI-MS m/z:717(M++1)。
化合物T-Int-1-2的制备
在室温和N2气氛下,向化合物T-Int-1-1(10mg,0.01mmol)和化合物Int-TG1(11mg,0.01mmol)在ACN(1mL)中的溶液中加入BEMP(0.8mg,0.003mmol)。 在室温下搅拌1小时后,将反应混合物通过HPLC纯化,得到化合物T-Int-1-2(12 mg,63%)。EI-MS m/z:1382(M+1)。
化合物T-Int-1的制备
在N2气氛下,向化合物T-Int-1-2(10mg,0.007mmol)在MeOH(1.0mL)中的 溶液中加入K2CO3(5mg,0.036mmol)。在室温下搅拌2小时后,将混合物通过 HPLC纯化,得到化合物T-Int-1(7.4mg,85%)。EI-MS m/z:1214(M+1)。
实施例57:化合物T-Int-2和T-Int-3的制备
Figure BDA0003089692190001091
化合物T-Int-2-1的制备
在室温和N2气氛下,向化合物M-1(179mg,0.58mmol)和化合物L-4 (100mg,0.28mmol)在DMF(5mL)中的溶液中加入K2CO3(80mg,0.58 mmol)。在室温下搅拌7小时后,加入EA(100mL)和H2O(50mL)以进行萃 取,将所得有机层经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。将残留物通过柱 色谱纯化,得到化合物T-Int-2-1(117mg,52%)。EI-MS m/z:817(M+)。
化合物T-Int-2-2的制备
在室温和N2气氛下,向化合物T-Int-2-1(45mg,0.06mmol)和化合物 Int-TG1(55mg,0.07mmol)在ACN(1mL)中的溶液中加入BEMP(20uL, 0.07mmol)。在室温下搅拌5小时后,将反应混合物通过HPLC(柱:Innoval ODS-2 10um,
Figure BDA0003089692190001092
50x250mm;流速:40mL/min,A缓冲液0.1%的于水 中的甲酸/B缓冲液0.1%的于ACN中的甲酸,方法梯度,溶剂A:溶剂B80:20至20:80,45分钟,波长214nm)纯化,得到化合物T-Int-2-2(67mg, 83%)。EI-MS m/z:1482(M+1)。
化合物T-Int-3-2的制备
收率为63%
EI-MS m/z:1834(M+1)。
化合物T-Int-2的制备
在N2气氛下,向化合物T-Int-2-2(67mg,0.05mmol)在MeOH(4mL)中 的溶液中加入K2CO3(31mg,0.27mmol)。在室温下搅拌2小时后,将反应 混合物通过HPLC纯化,得到化合物T-Int-2(42mg,71%)。EI-MS m/z:1314 (M+1)。
化合物T-Int-3的制备
收率为83%
EI-MS m/z:1666(M+1)。
实施例58:化合物T-Int-4的制备
Figure BDA0003089692190001101
化合物T-Int-4-1的制备
在室温和N2气氛下,向化合物D-5(8.0mg,0.01mmol)和化合物Int-TG3 (11.5mg,0.01mmol)在DMF(1mL)中的溶液中加入DIPEA(5.4μL,0.03mmol)。 在室温下搅拌6小时后,将反应混合物通过HPLC纯化,得到化合物T-Int-4-1(11.9 mg,71%)。EI-MS m/z:1630(M+1)。
化合物T-Int-4的制备
在N2气氛下,向化合物T-Int-3-1(11.9mg,0.01mmol)在MeOH(1mL)中的 溶液中加入K2CO3(5mg,0.04mmol)。在室温下搅拌1小时后,将反应混合物通 过HPLC(柱:InnovalODS-2 10um,
Figure BDA0003089692190001102
50x250mm;流速:15mL/min,A缓冲 液0.1%的于水中的甲酸/B缓冲液0.1%的于ACN中的甲酸,方法梯度,溶剂A: 溶剂B 80:20至20:80,45分钟,波长214nm)纯化,得到化合物T-Int-4(6.4mg, 60%)。EI-MS m/z:1462(M+1)。
实施例59:化合物T-Int-5的制备
Figure BDA0003089692190001103
化合物T-int-5-1的制备
在室温和N2气氛下,向化合物D-6(5.0mg,0.006mmol)和Int-TG3(9.0mg,0.009mmol)在DMF(1mL)中的溶液中加入DIPEA(5.0uL,0.029mmol)。在 室温下搅拌6小时后,将反应混合物通过HPLC(反相,C18,梯度 H2O/ACN/0.1%甲酸)纯化,得到化合物T-Int-5-1(10.0mg,94%)。EI-MS m/z:1617(M+1)。
化合物T-int-5的制备
在N2气氛下,向化合物T-Int-5-1(10.0mg,0.006mmol)在MeOH(1mL) 中的溶液中加入K2CO3(4.3mg,0.031mmol)。在室温下搅拌1小时后,将反 应混合物通过HPLC(反相,C18,梯度H2O/ACN/0.1%甲酸)纯化,得到化 合物T-Int-5(6.1mg,68%)。EI-MS m/z:1449(M+1)。
实施例60:化合物T-Int-6的制备
Figure BDA0003089692190001111
化合物T-Int-6-1的制备
在室温和N2气氛下,用BEMP(5.0uL,0.017mmol,0.4当量)处理M-3-7 (23mg,0.043mmol)和Int-TG4(33.4mg,0.043mmol,1.0当量)在ACN(2.0 mL)中的均匀溶液,并搅拌2小时。将反应混合物通过制备型HPLC (柱:Innoval ODS-2 10um,
Figure BDA0003089692190001112
21.2x250mm;流速:15mL/min,A缓冲液 0.1%的于水中的甲酸/B缓冲液0.1%的于ACN中的甲酸,方法梯度,溶剂 A:溶剂B 95:5至5:95,1小时,波长214nm)纯化,得到为黄色固体的化合 物T-Int-6-1(37.8mg,75%)。
EI-MS m/z:1162(M++1)。
化合物T-Int-6-2的制备
在0℃和N2气氛下,用DCM(2mL)中的甲磺酸(0.5mL)处理T-Int-6-1 (36.8mg,0.032mmol)在无水DCM(3.0mL)中的均匀溶液,并搅拌2小时。 将反应混合物通过制备型HPLC(柱:Innoval ODS-2 10um,
Figure BDA0003089692190001113
21.2x250mm;流速:15mL/min,A缓冲液0.1%的于水中的甲酸/B缓冲液 0.1%的于ACN中的甲酸,方法梯度,溶剂A:溶剂B 95:5至5:95,1小时, 波长214nm)纯化,得到为白色固体的化合物T-Int-6-2(17.7mg,52%)。
EI-MS m/z:1072(M++1)。
化合物T-Int-6-3的制备
通过与实施例55所述类似的合成途径合成了化合物T-Int-6-3。
收率为64%,为白色固体。
EI-MS m/z:1448(M++1)。
化合物T-Int-6的制备
在0℃和N2气氛下,用K2CO3(11.9mg,0.086mmol,6.0当量)处理化合物 T-Int-6-3(20.7mg,0.014mmol)在MeOH(1.0mL)中的均匀溶液,并搅拌30分钟。 将反应混合物通过制备型HPLC(柱:Innoval ODS-2 10um,
Figure BDA0003089692190001121
21.2x250mm; 流速:15mL/min,A缓冲液0.1%的于水中的甲酸/B缓冲液0.1%的于ACN中的 甲酸,方法梯度,溶剂A:溶剂B 95:5至5:95,1小时,波长214nm)纯化,得 到为白色固体的化合物T-Int-6(18.3mg,67%)。
EI-MS m/z:1280(M++1)。
实施例61:化合物T-Int-7和T-Int-8的制备
Figure BDA0003089692190001122
化合物T-Int-7-1的制备
在室温和N2气氛下,用DIPEA(44.9uL,0.26mmol,4.0当量)处理D-5(50mg,0.064mmol)和Int-TG5(64.9mg,0.064mmol,1.0当量)在DMF(2.0mL)中的均匀 溶液,并搅拌4小时。将反应混合物通过制备型HPLC(柱:Innoval ODS-2 10um,
Figure BDA0003089692190001123
21.2x250mm;流速:15mL/min,A缓冲液0.1%的于水中的甲酸/B缓冲 液0.1%的于ACN中的甲酸,方法梯度,溶剂A:溶剂B 95:5至5:95,1小时, 波长214nm)纯化,得到为白色固体的化合物T-Int-7-1(77mg,70%)。
EI-MS m/z:1704(M++1)。
化合物T-Int-7-2的制备
通过与实施例60的化合物T-Int-6的制备方法类似的方式合成化合物 T-Int-7-2。
收率为81%,白色固体
EI-MS m/z:1536(M++1)。
化合物T-Int-7的制备
在0℃和N2气氛下,用DCM(1mL)中的TFA(0.2mL)处理化合物 T-Int-7-2(56mg,0.036mmol)在无水DCM(1.0mL)中的均匀溶液,并搅拌2 小时。将反应混合物通过制备型HPLC(柱:Innoval ODS-2 10um,
Figure BDA0003089692190001131
21.2x250mm;流速:15mL/min,A缓冲液0.1%的于水中的甲酸/B缓冲液 0.1%的于ACN中的甲酸,方法梯度,溶剂A:溶剂B 95:5至5:95,1小时, 波长214nm)纯化,得到为乳白色固体的化合物T-Int-7(44.4mg,82%)。
EI-MS m/z:1436(M++1)。
通过与化合物T-Int-7的制备方法类似的方式合成了T-Int-8。
化合物T-Int-8-1的制备
收率为84%,黄色固体
EI-MS m/z:2057(M++1),1029(M/2++1)。
化合物T-Int-8-2的制备
收率为84%,无色油状物
EI-MS m/z:1889(M++1),945(M/2++1)。
化合物T-Int-8的制备
收率为74%,乳白色固体
EI-MS m/z:1789(M++1),895(M/2++1)。
实施例62:化合物T-Int-9和T-Int-10的制备
Figure BDA0003089692190001132
化合物T-Int-9-1的制备
在室温和N2气氛下,用DIPEA(7.3uL,0.042mmol,3.0当量)处理T-Int-7 (20mg,0.014mmol)和L-11-4(5.1mg,0.014mmol,1.0当量)在DMF(2.0mL) 中的均匀溶液,并搅拌2小时。将混合物通过制备型HPLC(柱:Innoval ODS-2 10 um,
Figure BDA0003089692190001141
21.2x250mm;流速:15mL/min,A缓冲液0.1%的于水中的甲酸/B缓 冲液0.1%的于ACN中的甲酸,方法梯度,溶剂A:溶剂B 95:5至5:95,1小时, 波长214nm)纯化,得到为黄色固体的化合物T-Int-9-1(19.9mg,85%)。
EI-MS m/z:1687(M++1),844(M/2++1)。
化合物T-Int-9的制备
通过与实施例62中所述类似的合成途径合成T-Int-9。
收率为72%,乳白色固体
EI-MS m/z:1789(M++1),895(M/2++1)。
通过与化合物T-Int-9的制备方法类似的方式合成了T-Int-10。
化合物T-Int-10-1的制备
收率为75%,乳白色固体
EI-MS m/z:2040(M++1),1010(M/2++1)。
化合物T-Int-10的制备
收率为60%,乳白色固体
EI-MS m/z:1940(M++1),970(M/2++1)。
实施例63:化合物T-Int-11的制备
Figure BDA0003089692190001142
化合物T-Int-11-1的制备
在室温和N2气氛下,用K2CO3(44.8mg,0.32mmol,2.0当量)处理化合物 M-1(50mg,0.13mmol)和1,3,5-三(溴甲基)苯(173.6mg,0.49mmol,3.0当量)在 DMF(2mL)中的黄色溶液,并搅拌3小时。将反应混合物通过制备型HPLC (柱:Innoval ODS-2 10um,
Figure BDA0003089692190001143
21.2x250mm;流速:15mL/min,A缓冲液0.1% 的于水中的甲酸/B缓冲液0.1%的于ACN中的甲酸,方法梯度,溶剂A:溶剂B 95:5至5:95,1小时,波长214nm)纯化,得到为乳白色固体的化合物T-Int-11-1 (35mg,37%)
EI-MS m/z:585(M++1)。
化合物T-Int-11-2的制备
通过与实施例54的化合物D-12-2的制备方法类似的方式合成化合物 T-Int-11-2。
收率为60%,乳白色固体
EI-MS m/z:1539(M++1)。
化合物T-Int-11的制备
通过与实施例56的化合物T-Int-1的制备方法类似的方式合成化合物 T-Int-11。
收率为72%,白色固体
EI-MS m/z:1371(M++1)。
实施例64:化合物T-Int-12的制备
Figure BDA0003089692190001151
通过与实施例59所述类似的合成途径合成了化合物T-Int-12。
化合物T-Int-12-1的制备
收率为54%,乳白色固体
EI-MS m/z:1544(M++1)。
化合物T-Int-12的制备
收率为74%,黄色固体
EI-MS m/z:1386(M++1)。
实施例65:化合物T-Int-13的制备
Figure BDA0003089692190001152
通过与实施例59所述类似的合成途径合成了化合物T-Int-13。
化合物T-Int-13-1的制备
收率为53%,白色固体
EI-MS m/z:1530(M++1)。
化合物T-Int-13的制备
收率为81%,黄色固体
EI-MS m/z:1362(M++1)。
实施例66:化合物T-Int-14的制备
Figure BDA0003089692190001161
在室温和N2气氛下,用DIPEA(11uL,0.068mmol,2.0当量)处理化合物 T-Int-7(50mg,0.035mmol)和BCN-PNP(11mg,0.035mmol,1.0当量)在DMF(3.0 mL)中的均匀溶液,并搅拌2小时。将混合物通过制备型HPLC(柱:Innoval ODS-2 10um,
Figure BDA0003089692190001162
21.2x250mm;流速:15mL/min,A缓冲液0.1%的于水中的甲酸/B 缓冲液0.1%的于ACN中的甲酸,方法梯度,溶剂A:溶剂B 95:5至5:95,1小 时,波长214nm)纯化,得到为米色固体的化合物T-Int-14(22mg,39%)。
EI-MS m/z:1612(M++1)。
实施例67:化合物T-Int-15和T-Int-16的制备
Figure BDA0003089692190001163
通过如实施例66所述的类似合成途径合成了化合物T-Int-15和T-Int16。
化合物T-Int-15
收率为35%,白色固体;EI-MS m/z:1763(M++1),882(M/2++1)。
化合物T-Int-16
收率为11%,白色固体;EI-MS m/z:2116(M++1),1058(M/2++1)。
实施例68:化合物T-1的制备
Figure BDA0003089692190001164
在室温和氮气气氛下加入DMSO(8643μL),并将化合物T-Int-1(15mg, 0.012mmol)溶解在DMSO(1237μL)中并加入其中。以4207μL的量向其中 加入经制备浓度为10mmol的(BimC4A)3。然后,以1237μL的量向其中加 入经制备浓度为100mmol的CuBr。然后,将混合物搅拌2分钟。将POS-D1 (5.3mg,0.012mmol)溶解在DMSO(1176μL)中并加入其中,然后搅拌10分 钟。反应完成后,将混合溶液通过制备型HPLC(反相,C18,梯度 H2O/ACN/0.1%甲酸)分离和纯化,得到化合物T-1(2.5mg,12%)。
EI-MS m/z:1668(M+1)。
实施例69:化合物T-2的制备
Figure BDA0003089692190001171
将化合物T-Int-1与MPS-D2以与实施例68的化合物T-1的制备方法类 似的途径反应,从而获得化合物T-2(收率为7%)。
EI-MS m/z:1759(M+1)。
实施例70:化合物T3和T4的制备
Figure BDA0003089692190001172
通过如实施例68所述的类似合成途径合成了化合物T-3和T-4。
化合物T-3
收率为9.0%;EI-MS m/z:1860(M+1)。
化合物T-4
收率为26%;EI-MS m/z:1282(M/2+1)。
实施例71:化合物T-5的制备
Figure BDA0003089692190001173
通过与实施例68中所述类似的合成途径合成了化合物T-5。
收率为27%
EI-MS m/z:1945(M+1)。
实施例72:化合物T6和T7的制备
Figure BDA0003089692190001181
通过与实施例68中所述类似的合成途径合成了化合物T-6和T-7。
化合物T-6
收率为25%
EI-MS m/z:1004(M/2+1)。
化合物T-7
收率为62%
EI-MS m/z:1180(M/2+1)。
实施例73:化合物T-8的制备
Figure BDA0003089692190001182
通过与实施例68中所述类似的合成途径合成了化合物T-8。
收率为27%
EI-MS m/z:1174(M/2+1)。
实施例74:化合物T-9的制备
Figure BDA0003089692190001183
在室温和N2气氛下,用5mM的于DMSO中的(BimC4A)3(1120uL, 0.006mmol,3.5当量)处理T-Int-6(2.2mg,0.0017mmol)和MPS-D4(3.9mg, 0.004mmol,2.5当量)在DMSO(2720uL)中的均匀溶液,并搅拌10分钟。以及将 10mM的于DMSO中的CuBr(160uL,0.017mmol,10当量)加入到反应混合物中并 搅拌15分钟。将反应混合物通过制备型HPLC(柱:Innoval ODS-210um,
Figure BDA0003089692190001184
21.2x250mm;流速:15mL/min,A缓冲液0.1%的于水中的甲酸/B缓冲液 0.1%的于ACN中的甲酸,方法梯度,溶剂A:溶剂B 95:5至5:95,1小时, 波长214nm),得到为白色固体的化合物T-9(2.4mg,64%)。
EI-MS m/z:2178(M++1),1089(M/2++1)。
实施例75:化合物T-10的制备
Figure BDA0003089692190001191
通过与实施例74中所述类似的合成途径合成了为白色固体的化合物 T-10(收率为56%)。
EI-MS m/z:2269(M++1),1135(M/2++1)。
实施例76:化合物T-11的制备
Figure BDA0003089692190001192
通过与实施例74中所述类似的合成途径合成了为白色固体的化合物 T-11(收率为34%)。
EI-MS m/z:2377(M++1),1189(M/2++1)。
实施例77:化合物T-12的制备
Figure BDA0003089692190001193
通过与实施例74中所述类似的合成途径合成了为白色固体的化合物 T-12(收率为58%)。
EI-MS m/z:2377(M++1),1189(M/2++1)。
实施例78:化合物T-13的制备
Figure BDA0003089692190001201
通过与实施例74中所述类似的合成途径合成了为白色固体的化合物T-13(收 率为58%)。
EI-MS m/z:2434(M++1),1217(M/2++1).
实施例79:化合物T-14的制备
Figure BDA0003089692190001202
通过与实施例74中所述类似的合成途径合成了为白色固体的化合物T-14(收 率为72%)。
EI-MS m/z:2011(M++1),1006(M/2++1)。
实施例80:化合物T-15的制备
Figure BDA0003089692190001203
通过与实施例74中所述类似的合成途径合成了为淡黄色固体的化合物 T-15(收率为48%)。
EI-MS m/z:2284(M++1),1142(M/2++1)。
实施例81:化合物T-16的制备
Figure BDA0003089692190001204
通过与实施例74中所述类似的合成途径合成了为淡黄色固体的化合物T-16(收率为69%)。
EI-MS m/z:2360(M++1),1180(M/2++1)。
实施例82:化合物T-17的制备
Figure BDA0003089692190001211
通过与实施例74中所述类似的合成途径合成了为白色固体的化合物 T-17(收率为40%)。
EI-MS m/z:1759(M++1),880(M/2++1)。
实施例83:化合物T-18的制备
Figure BDA0003089692190001212
通过与实施例74中所述类似的合成途径合成了为乳白色固体的化合物 T-18(收率为71%)。
EI-MS m/z:1908(M++1),954(M/2++1)。
实施例84:(N,N-二甲基苄基)-PBD-二聚体(D-14)的制备
Figure BDA0003089692190001213
(R=H、OH、OMe、Br、 CN等)
通过与实施例47中所述类似的合成途径合成了化合物D-9(收率为 50%)。
EI-MS m/z:800(M++1)。
生物测试
实施例85:苯二氮杂
Figure BDA0003089692190001214
二聚体衍生物的体外分析
将A-498、HCT-116、JIMT-1、MIA-PaCa-2和HEK-293E以10x103个 细胞/1mL培养基/孔接种到24孔板中。将Calu-6、PC-3和SK-OV-3以15x 103个细胞/1mL培养基/孔接种到24孔板中。将NCI-N87以25x103个细胞/1mL 培养基/孔接种到24孔板中。将板在37℃下于潮湿的5%的空气中的CO2气氛中 孵育24小时。将苯二氮杂
Figure BDA0003089692190001223
二聚体衍生物最初以10mM的浓度溶解在DMSO 中。在DMSO中进行系列稀释。将DMSO中的系列化合物稀释液以每孔5μL 加入到24孔板的一式三份孔中。每个单独的板上的三个孔接受5μL的无化合物 的DMSO作为对照。每孔DMSO的最终浓度为0.5%。将板在37℃下于潮湿的 5%的空气中的CO2气氛中孵育6天。细胞活力通过MTT测定法测定,并且IC50使用S型剂量-响应非线性回归曲线拟合(GraphPadSoftware Inc.)生成。其结果如 表1A和表1B所示(见下文)。
表1A.体外生物学和药代动力学数据
Figure BDA0003089692190001221
表1B.体外生物学和药代动力学数据
Figure BDA0003089692190001222
Figure BDA0003089692190001231
实施例86:用于缀合的抗体的还原/氧化
在37℃下用约20-50倍过量的TCEP(三(2-羧乙基)膦盐酸盐或DTT(二 硫苏糖醇)在含有1mM EDTA的4mM Tris pH 7.3中还原半胱氨酸工程化的 单克隆抗体,持续1小时。将还原的硫代单抗(thiomab)稀释并加载到PBS 中的PD-10柱上。用pH 7.3的10mM PBS洗脱该柱。通过空气氧化重新建 立洗脱的还原的硫代单抗。硫醇/Ab值通过从溶液在280nm处的吸光度确 定还原的抗体浓度来检查,并且硫醇浓度通过与DTNB(Aldrich,CAS No D8130)反应和并确定412nm处的吸光度来检查。
实施例87:缀合物(白蛋白和抗体)的制备
缀合方法1:还原和再氧化反应后,将抗体溶解在PBS中。用还原的再 氧化抗体(1650uL,0.083mmol)处理化合物T-2(329.6uL,3.0mmol,作为接 头-毒素中间体)在DMSO中的溶液,并在室温下轻轻搅拌3小时。将羟胺 (329.6uL,1,500mmol)加入到反应混合物的溶液中,并在37℃孵育8小时, 以阻断可逆的解缀合(deconjugation)反应。加载缀合混合物,并通过PD-10 柱洗脱,以除去过量的药物-接头中间体和其它杂质。将混合物通过离心超滤浓缩,并将缀合物用HIC NPR柱(TOSOH#0007656TSKgel Phenyl-5PW, 21.5x150mm,13μm)纯化,并用从40%至100%B的线性梯度以0.8ml/min 洗脱(A缓冲液1.5M的于50mM磷酸钠(pH7.0)中的硫酸铵;B缓冲液:20% 的于50mM磷酸钠(pH 7.0)中的乙腈)。通过HIC分析缀合抗体的DAR(药 物与抗体的比率),并且分析结果如表2所示。
将实施例70、72、73、74、76、77、78、79、80、81和82中获得的化 合物T-3、T-7、T-8、T-9、T-11、T-12、T-13、T-14、T-15、T-16和T-17用 于与曲妥珠单抗(或人血清白蛋白等)的工程化半胱氨酸的巯基基团进行缀 合反应,从而参照文献中给出的方法分别制备T-3-AB、T-7-AB、T-8-AB、 T-9-AB、T-11-AB、T-12-AB、T-13-AB、T-14-AB、T-15-AB、T-16-AB和T-17-AB 作为硫代单抗药物缀合物(TDC)。[参见Nature Biotechnology,2008,26,925-932,Bioconjugate Chem.,2013,24,1256-1263,Bioconjugate Chem.,2016,27,1324-1331,Bioconjugate Chem.2014,25,460-469]。
缀合方法2:将实施例34中获得的MPS-D10、实施例27中获得的MPS-D9 和实施例32中获得的mMPS-D6中的每一种化合物用于与抗体(例如曲妥珠单抗) 的工程化半胱氨酸的巯基基团进行第一步缀合反应。
在实施例84的还原和再氧化程序之后,用DMSO中的每种化合物(6.62uL,3.0mmol)处理PBS中的抗体。3小时后,向缀合的溶液中加入硼氢化钠(6.62ul, 300mmol),以在室温下阻断可逆的解缀合反应1小时。并且用PD-10柱纯化第 一缀合的抗体。对于第二缀合,将实施例56中获得的T-Int-1(13.24uL,3.0mmol) 或实施例57中获得的T-Int-2(20.0uL,3.0mmol)(含官能团诸如在Cu(I)催化剂不 存在的情况下促进环加成的N3),经缀合有MPS-D10的抗体(7.4uL,0.117mmol) 处理并在37℃孵育。约24小时后,将抗体药物缀合物(T-Int-1-AB和T-Int-2-AB) 通过PD-10柱纯化并通过离心超滤浓缩。按照相同的方案,将实施例66中获得 的化合物T-int-14加入到缀合有MPS-D9或mMPS-D6的抗体中,以制备T-Int-14-AB或mT-Int-14-AB。通过HIC分析缀合的抗体的DAR(药物与抗体的 比率),并且分析结果如表2所示。
表2.抗体-药物缀合物(ADC)
Figure BDA0003089692190001241
Figure BDA0003089692190001251
实施例88:蛋白质-药物缀合物的体外分析
将NCI-N87、JIMT-2、SK-BR3和SK-OV3癌细胞以每孔2,000至8,000 个细胞的密度接种在96孔板中的100μL培养基中,并培养24小时。将实 施例46中获得的四种化合物用从600nM至0.009nM的1:4的系列稀释液 处理,并将抗体药物缀合物T-DM1用从200nM至0.003nM的1:4的系列 稀释液处理。以与测试实施例1类似的方式进行实验,以在96小时后定量 活细胞,并且结果如下表2中所示。另外,化合物T-2-AB、T-3-AB、T-7-AB、 T-8-AB、T-9-AB、T-11-AB、T-12-AB、T-13-AB、T-14-AB、T-15-AB、T-16-AB、 T-17-AB、T-Int-1-AB、T-Int-2-AB、T-Int-14-AB和mT-Int-1-AB的体外分 析结果如图10、图11、图12和表3所示。
表3.抗体-药物缀合物的细胞毒性
Figure BDA0003089692190001252
(*T-DM1:Roche CAS编号;1018448-65-1)
实施例89:体内功效
T-2-AB和T-7-AB采用15mg规模的反应来制备。通过HIC柱纯化后, LC/MS分析证实硫代单抗(曲妥珠单抗A121C)的分子量为145,324Da。对制 备的抗体药物缀合物T-2-AB的LC/MS分析显示存在约148,497Da的质量。这 些质量偏移与两个D-1分子的缀合一致。并且T-7-AB显示出存在约149,671Da 的质量,与两个D-4分子相似。
通过在小鼠中进行肿瘤异种移植研究来测量本发明的抗体-药物缀合物的体 内功效。在雄性BALB/c nu/nu的右侧腹部皮下注射分别在PBS中的5X106个 NCI-N87细胞的悬浮液。当肿瘤达到约95mm3时,将小鼠随机分至研究组中。 静脉内(i.v.)给予T-DM1(2mg/kg)和T-2-AB缀合物(0.5mg/kg或2mg/kg)(治疗的 第0天单次注射)。所有治疗组由每组6至10只动物组成,并使用测径器测量每 周监测肿瘤尺寸两次。肿瘤质量计算为体积=(宽X宽X长)/2。缀合物T-2-AB 在观察期内,即从实验开始后80天内,导致肿瘤消退。对照缀合物T-DM1的活 性低于本发明的缀合物。这些结果如图13和图14所示。
除了初始肿瘤尺寸为150mm3外,以相同的方法进行T-7-AB。缀合物使肿瘤 在实验开始后的120天内消退。
这些体内实验由CACT(阿桑医疗中心癌症治疗促进中心,项目代码: HI15C0972)进行
通过引用并入
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等同物
虽然已经讨论了本主题发明的具体实施方案,但以上说明书是说明性的而非 限制性的。通过阅读本说明书和下面的权利要求书,本发明的许多变化对于本领 域技术人员来说将变得显而易见。本发明的全部范围应该通过参考权利要求书连 同其等同物的全部范围、以及说明书连同此类变化来确定。

Claims (48)

1.一种具有式(I)的结构的化合物:
Figure FDA0003089692180000011
或其药学上可接受的盐,
其中:
A1和A2各自独立地表示杂环,优选为五元环或六元环,任选地与一个或多个芳基环或杂芳基环稠合或被一个或多个芳基环或杂芳基环取代;
R1和R2各自独立地为烷基基团,优选为低级烷基基团;
Z1为亚甲基或连接基团;并且
n1和n2各自独立地为值为1至5的整数。
2.如权利要求1所述的化合物,其中A1选自:
Figure FDA0003089692180000012
其中:
RA1a为H、烷基、烯基、环烷基、杂环烷基、芳基或杂芳基;
RA1b为CHRA1ba
RA1ba为H、卤素、烷基、-CO2-烷基、CHO或CO2H;
Ar1为芳基或杂芳基,优选为六元芳基或杂芳基,任选地被卤素、羟基、氰基、硝基、烷基、卤代烷基、环烷基、羧基、氨基、芳基或杂芳基取代一次或多次;并且
o为值为1或2的整数。
3.如权利要求2所述的化合物,其中Ar1为任选被一个或多个RA1c取代的芳基或杂芳基,其中RA1c为卤素、OH、CN、NO2、烷基、烷氧基、CO2H、CO2-烷基或(CH2)pN(RA1ca)2;每个RA1ca独立地选自H或烷基;并且p为值为0至5的整数。
4.如权利要求2或3所述的化合物,其中A1
Figure FDA0003089692180000013
其中每个W2独立地为CRA1aa或N;并且RA1aa为H、OH、烷基、烷氧基、烷基氨基或二烷基氨基。
5.如权利要求4所述的化合物,其中A1
Figure FDA0003089692180000021
Figure FDA0003089692180000022
6.如权利要求1-5中任一项所述的化合物,其中A2
Figure FDA0003089692180000023
Figure FDA0003089692180000024
其中:
RA2a为H、烷基、烯基、环烷基、杂环烷基、芳基或杂芳基;
RA2b为CHRA2ba
RA2ba为H、卤素、烷基、-CO2-烷基、CHO或CO2H;
Ar2为芳基或杂芳基,优选为六元芳基或杂芳基,任选地被一个或多个RA2c取代;
RA2c为卤素、OH、CN、NO2、烷基、烷氧基、CO2H、CO2-烷基、或(CH2)rN(RA2ca)2
每个RA2ca独立地选自H或烷基;
q为值为1或2的整数;并且
r为值为0至5的值的整数。
7.如权利要求1-5中任一项所述的化合物,其中A2
Figure FDA0003089692180000025
其中每个W4独立地为CRA2aa或N;并且RA2aa为H、OH、烷基、烷氧基、烷基氨基或二烷基氨基。
8.如权利要求7所述的化合物,其中A2
Figure FDA0003089692180000026
Figure FDA0003089692180000027
9.如权利要求1所述的化合物,所述化合物具有式(Ia)、(Ib)或(Ic)的结构:
Figure FDA0003089692180000031
或是其药学上可接受的盐,其中:
RA1aa和RA2aa各自独立地为H、OH、烷基、烷氧基、烷基氨基或二烷基氨基;
RA1b为CHRA1ba
RA1ba为H、卤素、烷基、-CO2-烷基、CHO或CO2H;
RA2b为CHRA2ba
RA2ba为H、卤素、烷基、-CO2-烷基、CHO或CO2H;
Ar1为芳基或杂芳基,优选为六元芳基或杂芳基,任选地被卤素、羟基、氰基、硝基、烷基、卤代烷基、环烷基、羧基、氨基、芳基或杂芳基取代一次或多次;
RA1c为卤素、OH、CN、NO2、烷基、烷氧基、CO2H、CO2-烷基或(CH2)pN(RA1ca)2
每个RA1ca独立地选自H或烷基;
Ar2为芳基或杂芳基,优选为六元芳基或杂芳基,任选地被卤素、羟基、氰基、硝基、烷基、卤代烷基、环烷基、羧基、氨基、芳基或杂芳基取代一次或多次;
RA2c为卤素、OH、CN、NO2、烷基、烷氧基、CO2H、CO2-烷基或(CH2)rN(RA2ca)2
每个RA2ca独立地选自H或烷基;
o和q为各自独立地具有1或2的值的整数。
10.如权利要求9所述的化合物,其中Ar1为任选被一个或多个RA1c取代的芳基或杂芳基,其中RA1c为卤素、OH、CN、NO2、烷基、烷氧基、CO2H、CO2-烷基或(CH2)pN(RA1ca)2;每个RA1ca独立地选自H或烷基;并且p为值为0至5的整数。
11.如权利要求9或10所述的化合物,其中Ar2为任选被一个或多个RA1c取代的芳基或杂芳基,其中RA2c为卤素、OH、CN、NO2、烷基、烷氧基、CO2H、CO2-烷基或(CH2)rN(RA2ca)2;每个RA2ca独立地选自H或烷基;并且r为值为0至5的整数。
12.如权利要求1-11中任一项所述的化合物,其中R1和R2相同。
13.如权利要求12所述的化合物,其中R1和R2为甲基。
14.如权利要求1-13中任一项所述的化合物,其中Z1为亚甲基。
15.如权利要求1-13中任一项所述的化合物,其中Z1
Figure FDA0003089692180000041
其中:
Y1为CRY1或N,条件是只有一个Y1为N;
RY1为H、羟基、氨基、酰氨基或(CH2)y(RY1a);
RY1a为氨基(例如,仲氨基或叔氨基)、芳基(例如,苯基)或杂芳基;并且
y为值为1至约10的整数。
16.如权利要求15所述的化合物,其中Z1
Figure FDA0003089692180000042
Figure FDA0003089692180000043
17.如权利要求1-13中任一项所述的化合物,其中Z1
Figure FDA0003089692180000044
其中:
Y2为CRY2或N;
RY2为H或烷基,优选为低级烷基;
RZ2为(CH2)zRZ2a
RZ2a为氨基(优选为叔氨基)、芳基(例如苯基)或杂芳基;并且
z为值为0至约10的整数。
18.如权利要求17所述的化合物,其中Z1
Figure FDA0003089692180000045
Figure FDA0003089692180000046
19.一种化合物,所述化合物选自:
Figure FDA0003089692180000051
或其药学上可接受的盐。
20.一种缀合物,其包含如权利要求1-19中任一项所述的化合物、可裂解的接头和靶向剂,其中所述可裂解的接头将所述化合物可裂解地连接至所述靶向剂。
21.如权利要求20所述的缀合物,其中所述靶向剂是细胞结合剂。
22.如权利要求20或21所述的缀合物,其中所述接头包含能够经历化学反应(例如,物理化学反应和/或生物反应)以释放亲核杂原子的官能团;和位于所述亲核杂原子附近的SO2官能团。
23.如权利要求22所述的缀合物,其中所述SO2官能团能够在分子内环化反应中与所述亲核杂原子反应以释放所述活性剂。
24.如权利要求20-23中任一项所述的缀合物,所述缀合物还包含靶向部分(例如,寡肽、多肽、抗体等),所述靶向部分具有对所需靶受体或与靶细胞相关联的其它分子的结合特异性。
25.一种具有式(II)、(IIa)或(IIb)的结构的化合物
Figure FDA0003089692180000061
或其药学上可接受的盐,
其中:
A1和A2各自独立地表示杂环,优选为五元环或六元环,任选地与芳基环或杂芳基环稠合或被芳基环或杂芳基环取代;
R1和R2各自独立地为烷基基团;
Z1为连接基团;并且
n1和n2各自独立地为值为1至5的整数。
Z2不存在或为连接基团;
L1为通过选自O、S和N,优选为O或N的杂原子与所述SO2附接的连接基团,并且被选择为使得L1与SO2之间的键的断裂促进L1与Z1之间的键断裂以释放活性剂;
X1为-O-、-CRb 2-或-NRa-,优选为-O-;
Ar表示环,诸如芳基、杂芳基、环烷基或杂环烷基,优选为芳基或杂芳基;
Y1为-(CRb 2)yN(Ra)-、-(CRb 2)yO-或-(CRb 2)yS-,被定位为使得如果y为1,则所述N、O或S原子与TG附接;其中X1和Y1位于Ar的相邻原子上;
TG为触发基团,当被激活时生成能够与所述SO2反应以替代Z并形成包括X-SO2和Ar的居间原子的5-6元环的N、O或S原子;
w和x各自独立地为值为0或1的整数;
每个Ra为氢或低级烷基;
每个Rb独立地为氢或低级烷基;或者
两个Rb与它们所附接的碳原子一起形成3-5元环,优选3-4元环;并且
y为值为1至约10的整数。
26.如权利要求25所述的化合物,其中X1为-O-。
27.如权利要求25或26所述的化合物,其中Ar为芳基。
28.如权利要求27所述的化合物,其中Ar为苯基或萘基。
29.如权利要求25-28中任一项所述的化合物,其中Z2为连接基团,其包含一个或多个选自以下的基团:异腈、异硫氰酸酯、2-吡啶基二硫化物、卤代乙酰胺(-NHC(O)CH2-卤代)、马来酰亚胺、二烯、烯烃、卤化物、甲苯磺酸根(TsO-)、醛、磺酸根(R-SO3 -)、
Figure FDA0003089692180000071
膦酸(-P(=O)(OH)2)、酮、C8-C10环炔基、-OH、-NHOH、-NHNH2、-SH、羧酸(-COOH)、乙炔(-C≡CH)、叠氮化物(-N3)、氨基(-NH2)、磺酸(-SO3H)、炔酮衍生物(-C(O)C≡C-Ra)和磷酸二氢酯(-OP(=O)(OH)2)。
30.如权利要求25-28中任一项所述的化合物,其中x为0。
31.如权利要求30所述的化合物,其中TG为-NO2、-OC(O)(CH2)rC(O)R1、-NHNH2、-BR2R3
Figure FDA0003089692180000072
其中:
R1为C1-C6烷基;
R2和R3各自独立地为氢、C1-C6烷基、C1-C6烷氧基或羟基;
R4、R5、R6和R7各自独立地为氢或C1-C6烷基;并且
r为值为1、2、3、4或5的整数。
32.如权利要求25-28中任一项所述的化合物,其中TG选自:
Figure FDA0003089692180000073
其中:
每个R21独立地为氢或乙酰基;并且
R22为氢或低级烷基。
33.如权利要求25-32中任一项所述的化合物,其中TG选自-NO2、-C(O)-(CH2)2C(O)-烷基和硝基苄基。
34.一种具有式(III)的结构的缀合物:
(D-L)dl-LG-(CB)cb
(III)
或其药学上可接受的盐,
其中:
LG为连接基团;
CB为细胞结合剂;
cb和dl各自独立地为值为1至约20、优选1至约10的整数;并且
每个D-L独立地为具有如权利要求1-16和22-30中任一项所述的化合物的结构的基团。
35.如权利要求34所述的缀合物,其中LG为C10–C100直链或支链、饱和或不饱和亚烷基部分,其包含以下的至少两种:
(i)至少一种选自-NH-、-C(=O)、-O-、-S-和-P-的杂原子;
(ii)至少一种杂亚芳基;
(iii)至少一种氨基酸部分、糖键、肽键或酰胺键;以及
(iv)一种或多种选自由以下组成的组的取代基:C1–C20烷基、C6–C20芳基C1–C8烷基、-(CH2)sCOOH和-(CH2)pNH2,s为值为0至10的整数,并且p为值为1至约10的整数。
36.如权利要求34所述的缀合物,其中LG为能够通过点击化学反应产生的官能团,诸如三唑。
37.如权利要求34或36所述的缀合物,其中LG为:
Figure FDA0003089692180000081
其中:
*表示与(D-L)dl的附接点;
**表示与CB的附接点;
每个V独立地为单键、-O-、-S-、-NR21-、-C(O)NR22-、-NR23C(O)-、-NR24SO2-或-SO2NR25-;
R21、R22、R23、R24和R25各自独立地为氢、(C1-C6)烷基、(C1-C6)烷基(C6-C20)芳基、或(C1-C6)烷基(C3-C20)杂芳基;
r为值为1至约10的整数;
p为值为0至约10的整数;
q为值为1至约10的整数;并且
L3为单键。
38.如权利要求34或36所述的缀合物,其中LG包含在直链中通过共价键彼此连接的(CH2)b、Lc、(P1)a、Wa1、Wa2、Wa3、Y3和Y4基团,其中:
Wa1、Wa2和Wa3各自独立地为-NH-、-C(O)-或-CH2-;
Wb1为酰胺键或三唑烯;
P1为酰胺键、氨基酸残基或肽;
Lc为亚烷基;
Y1为-(CH2)q-(CH2CH2X4)o-或-(CH2)q-(X4CH2CH2X3)o-;
X4为-O-、-S-、-NH-或-CH2-;
Y2为单键或选自以下的基团:
Figure FDA0003089692180000091
Wb2为酰胺键或三唑烯;
a为0至10;
b、c和d各自独立地为值为1至约10的整数;并且
o和q各自独立地为值为1至约10的整数。
39.如权利要求34-38中任一项所述的缀合物,其中LG为式(IIIb)、(IIIc)、(IIId)、(IIIe)、(IIIf)、(IIIh)、(IIIh)或(IIIj)的连接基团:
Figure FDA0003089692180000092
Figure FDA0003089692180000101
其中:
Re为烷基;
X5为-O-、-S-、-NH-或-CH2-;
Wb1和Wb2各自独立地为-C(O)NH-、-NHC(O)-、
Figure FDA0003089692180000102
Figure FDA0003089692180000103
R12为氢、烷基、氨基酸侧链、-(CH2)sC(O)R13或-(CH2)pNR14R15
R13为OH或–NH(CH2)s’(X4CH2CH2)s”Z”-(CB)m
R14和R15各自独立地为氢或-C(O)(CH2)s’(X”’CH2CH2)s”Z”-(CB)m
s和s”各自独立地为值为0至约10的整数;
m为值为0或1的整数;
X4和X5各自独立地为-O-、-S-、-NH-或-CH2-;并且
b、c、d、e、g、h、o和q各自独立地为值为1至约10的整数。
40.如权利要求34-39中任一项所述的缀合物,其中所述细胞结合剂结合至靶细胞,所述靶细胞选自肿瘤细胞、病毒感染的细胞、微生物细胞、活化的细胞、髓样细胞、活化的T细胞、B细胞或黑素细胞;表达CD4、CD6、CD19、CD20、CD22、CD30、CD33、CD37、CD38、CD40、CD44、CD56、EpCAm、CanAg、CALLA或Her-2抗原;Her-3抗原的细胞或表达胰岛素生长因子受体、表皮生长因子受体和叶酸受体的细胞。
41.如权利要求40所述的缀合物,其中所述肿瘤细胞选自乳腺癌细胞、前列腺癌细胞、卵巢癌细胞、结直肠癌细胞、胃癌细胞、鳞状细胞癌细胞、小细胞肺癌细胞和睾丸癌细胞。
42.如权利要求40所述的缀合物,其中所述细胞结合剂为抗体、单链抗体、特异性结合至所述靶细胞的抗体片段、单克隆抗体、单链单克隆抗体、或特异性结合靶细胞的单克隆抗体片段、嵌合抗体、特异性结合至所述靶细胞的嵌合抗体片段、结构域抗体、特异性结合至所述靶细胞的结构域抗体片段、淋巴因子、激素、维生素、生长因子、集落刺激因子或营养物转运分子。
43.如权利要求42所述的缀合物,其中所述抗体是表面重修的抗体、表面重修的单链抗体或表面重修的抗体片段;单克隆抗体、单链单克隆抗体或其单克隆抗体片段;嵌合抗体片段、结构域抗体或结构域抗体片段;人源化抗体、人源化单链抗体或人源化抗体片段。
44.一种药物组合物,其包含如权利要求1-19和25-33中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐,或如权利要求20-24或34-43中任一项所述的缀合物,以及药学上可接受的载体。
45.如权利要求44所述的药物组合物,所述药物组合物还包含为化学治疗剂的第二化合物。
46.一种治疗哺乳动物的癌症的方法,所述方法包括向所述哺乳动物施用治疗有效量的如权利要求1-19或25-33中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐,或如权利要求20-24或34-43中任一项所述的缀合物。
47.如权利要求46所述的方法,所述方法还包括向所述哺乳动物施用为化学治疗剂的第二化合物。
48.如权利要求47所述的方法,其中依次地向所述哺乳动物施用所述化学治疗剂。
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