CN113373237A - 一种利用qPCR技术检测绵羊FecB基因多态性的引物组及其方法 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了一种利用qPCR技术检测绵羊FecB基因多态性的引物组及其方法。所述的引物组由引物对1和引物对2组成,其中,引物对1的下游引物3’端和++型的基因位点相匹配;引物对2的下游引物的3’端和BB型的基因位点相匹配。将待测样品分别用引物对1和引物对2进行qPCR扩增,扩增结束后根据两个荧光信号达到阈值的顺序即可判断出FecB基因型。该方法与传统的PCR‑Sanger测序及Taqman探针方法检测相比,节省检测成本、缩短检测周期和提高检测精准性。本发明提供的方法能快速有效地检测出绵羊FecB的BB基因型,为从大群体中筛选出产羔率更高的FecB的BB基因型亲本提供了一种简便易行、廉价有效的方法。
Description
技术领域
本发明涉及一种检测绵羊FecB基因多态性的引物组及其方法,特别涉及一 种利用qPCR技术检测绵羊FecB基因多态性的引物组及其方法。本发明属于分 子生物学辅助育种领域。
背景技术
绵羊产羔数是一个极其复杂的性状,受诸多因素影响。目前,国内外学者已 对影响绵羊产羔数的众多候选基因进行了深入研究,已定位的主要基因包括骨形 态发生蛋白受体1B(Bone morphogenetic protein receptor 1B,BMPR1B,FecB)、 骨形态发生蛋白15(Bone morpho-genetic protein 15,BMP15,FecX)、生长分 化因子9基因(Growthdifferentiation factor-9,GDF9,FecG)和糖基化酶β-1, 4-N-乙酰半乳糖胺转移酶2(Glycosylation enzymebeta-1, 4-N-acetyl-galactosaminyltransferase2,B4GA-LNT2,FecL)等,这些基因在调控 绵羊产羔性状方面起到至关重要的作用。目前全世界仅有少数绵羊品种产羔率能 达200%,大多数绵羊属于季节性发情、单羔品种。同时绵羊产羔性状的遗传力 较低(仅为0.1左右)。
研究表明,FecB基因(BMPR-1B)编码区第746位碱基发生A-G的突变, 导致第249位氨基酸由谷氨酰胺变为精氨酸(Q249R),降低了其对配体BMP4 和GDF5的敏感性,进而高浓度的GDF5抑制孕酮分泌,促使排卵数增加。FecB 基因是第一个被发现的绵羊高繁殖力主效基因,与绵羊排卵数和产羔数紧密相关。 一个FecB基因拷贝可以增加排卵数1.3~1.6枚,产羔数增加0.9~1.2只;两个FecB 基因拷贝可以增加排卵数2.73枚,产羔数增加1.1~1.7只。继布鲁拉羊中发现FecB 基因之后,进一步的研究发现,在亚洲绵羊品种中FecB基因的分布较为广泛。 在印度绵羊品种Kendrapada、Garole和Bonpala,印度尼西亚Javenese羊,中国 的小尾寒羊等绵羊品种中均存在该基因。Chen等利用FecB基因效应,使用小尾 寒羊和杜泊羊进行杂交培育多羔新品系,杂交后代平均产羔数显著高于杜泊羊(P<0.05)。
目前常用的检测FecB基因多态性的常用方法包括PCR-Sanger测序、 PCR-RFLP、PCR-SSCP、Taqman MGB探针及ELISA等方法。PCR-Sanger技术 准确率高,但价格昂贵,且Sanger测序需要一定的时间周期,相对而言速度较慢。 PCR-RFLP、PCR-SSCP及ELISA技术程序繁琐、通量低。PCR-RFLP技术引入 了限制性内切酶,在实际操作中限制性内切酶在工作中易因为切割条件的变化出 现星活性,故假阳性率相对较高。PCR-SSCP分析技术需要对PCR产物进行变性 处理后于不含变性剂的中性聚丙烯酰胺凝胶中进行电泳。变性后单链DNA形成 不同的二级结构,其在电泳中的迁移速率不同,但该方法对电泳条件要求较为严苛,同时PCR产物中其他位置的突变会对目标突变的判断产生干扰,准确率相 对较低。Taqman MGB探针法准确率高,但成本也高,不适用于大规模的检测。 ELISA的方法需要制备或购买相对应的单克隆抗体,检测过程繁琐,假阳性率高, BB型个体的检出率仅能达到96%左右,且不能很好的鉴别杂合性个体与BB型 个体。
因此,找到一种简便宜行、廉价有效鉴定FecB的不同基因型(BB型、B+ 型和++型)的方法极其重要,不仅能够筛选出高繁绵羊群体,而且能够极大提高 了养羊业的经济效益。
发明内容
本发明的目的在于提供一种利用qPCR技术检测绵羊FecB基因多态性的引 物组及其方法,从而加快高繁绵羊良种的选育速度。
为达到上述目的,本发明采用了以下技术方案:
首先,本发明提出了一种用于检测绵羊FecB基因多态性的引物组,所述的 引物组由引物对1和引物对2组成,其中,引物对1的下游引物3’端和++型的基 因位点相匹配;引物对2的下游引物的3’端和BB型的基因位点相匹配;BB型 代表FecB基因的编码区第746位碱基发生A-G的突变(g.A746G),导致第249 位氨基酸由谷氨酰胺转变为精氨酸(p.Q249R);++型代表FecB基因的编码区第 746位碱基未发生改变,仍为A;
所述引物对的核苷酸序列如下:
引物对1:
上游引物:5’-ATTGGAAAAGGTCGCTATGGG-3’
下游引物:5’-TGCCTCATCAACACCGTCt-3’
引物对2:
上游引物:5’-ATTGGAAAAGGTCGCTATGGG-3’
下游引物:5’-TGCCTCATCAACACCGTCc-3’。
进一步的,本发明还提出了一种含有所述引物组的用于检测绵羊FecB基因 多态性的试剂盒。
其中,优选的,所述的试剂盒还包括荧光染料。
其中,优选的,所述的荧光染料为SYBR GreenI荧光染料。
其中,优选的,所述试剂盒还包括dNTPs、TaqDNA聚合酶、Mg2+以及PCR 反应缓冲液中的一种或多种。
更进一步的,本发明还提出了一种利用qPCR技术检测绵羊FecB基因多态 性的方法,包括以下步骤:
1)提取待测绵羊的基因组DNA;
2)以待测绵羊的基因组DNA为模板,分别进行两个体系的qPCR扩增,体 系1采用所述的引物对1,体系2采用所述的引物对2,扩增后待测样品在体系1 和体系2中分别产生一个荧光信号强度变化曲线;
3)根据体系1和体系2中检测到的荧光阈值出现的顺序辨别出待测样品的 FecB基因型,当体系1先达到荧光阈值时,即可判定待测样品的FecB基因型为 ++型(即FecB正常型);当体系2先达到荧光阈值时,即可判定待测样品的FecB 基因型为BB型(即FecB突变纯合型);当体系1和体系2的荧光信号同时达 到阈值时,即可判定待测样品的FecB基因型为B+型(即FecB突变杂合型)。
其中,优选的,步骤2)中实时荧光定量PCR反应使用的扩增体系以10μl 计为:5-1000ng/μL基因组DNA 1μL,2×SYBR FAST qPCR Master Mix 5μL, 10μmol/L上游引物0.3μL,10μmol/L下游引物0.3μL,去离子水3.4μL,总体系 为10μL。
其中,优选的,步骤2)中实时荧光定量PCR反应的扩增程序为:95℃预变 性10min;95℃变性30sec,60℃退火1min,40个循环。
再进一步的,本发明还提出了所述的引物组在绵羊分子标记辅助育种中的应 用。以及
所述的试剂盒在绵羊分子标记辅助育种中的应用。
相较于现有技术,本发明的有益效果是:
本发明提出了一种利用错配引物的qPCR检测FecB多态性的一种方法。该 方法与传统的PCR-Sanger测序及Taqman探针方法检测相比,节省检测成本、缩 短检测周期和提高检测精准性。本发明提供的方法能快速有效地检测出绵羊FecB 的BB基因型,为从大群体中筛选出产羔率更高的FecB的BB基因型亲本提供了 一种简便宜行、廉价有效的方法。
附图说明
为了更清楚地说明本发明实施过程中的技术方案,下面结合附图和实施例对 本发明做进一步详细说明,所述实施例是对本发明的解释,而不是对本发明保护 范围的限制。
图1为实施例1中样品PCR过程中的荧光信号变化图。体系1的荧光信号 强度先达到阈值,即可判定待测样品FecB基因为++型(FecB正常型)。
图2为实施例1中样品PCR过程中的荧光信号变化图。体系1和体系2的 荧光信号强度同时达到阈值,即可判定待测样品FecB基因为B+型(FecB突变 杂合型)。
图3为实施例1中样品PCR过程中的荧光信号变化图。体系2的荧光信号 强度先达到阈值,即可判定待测样品FecB基因为BB型(FecB突变纯合型)。
具体实施方式
以下的实施例便于更好地理解本发明,但不限定本发明。下述实施例中的实 验方法,若无特殊说明,均为常规方法。下述实施例中所用的实验材料,如无特 殊说明,均为常规生化试剂商处购得。实施例中,SYBR FAST qPCR Master Mix: 北京全式金生物技术有限公司;所用的绵羊基因组DNA样本来自滩羊的血液或 湖羊的血液;提取试剂盒:康为世纪血液基因组试剂盒进行基因组DNA提取试 剂盒。
实施例1引物设计
根据FecB基因的核苷酸序列,设计引物对1和引物对2,其中引物对1的下 游引物3’端和++型的基因位点相匹配,命名为++型引物;引物对2的下游引物的 3’端和BB型的基因位点相匹配,命名为BB型引物;两对引物的上游引物相同。
其中,BB型代表FecB基因的编码区第746位碱基发生A-G的突变(g.A746G), 导致第249位氨基酸由谷氨酰胺转变为精氨酸(p.Q249R);++型代表FecB基因 的编码区第746位碱基未发生改变,仍为A。
所述的BB型引物的下游引物序列为:5’-TGCCTCATCAACACCGTCc-3’; ++型引物的下游引物序列为:5’-TGCCTCATCAACACCGTCt-3’;BB型和++型 引物的共同上游引物序列为:5’-ATTGGAAAAGGTCGCTATGGG-3’。
实施例2绵羊FecB基因多态性的qPCR检测
1、绵羊基因组DNA的提取
使用康为世纪血液基因组试剂盒进行待测绵羊血液基因组DNA的提取,具 体操作如下:
(1)取100-200μL待测绵羊血液加入2ml离心管中,继续添加500μl RCL 进行吹打混匀,10000rpm离心1min,弃上清,留下沉淀;继续添加500μl RCL, 振荡至彻底混匀,10000rpm离心1min,弃上清,直到留下白色沉淀为止。
(2)加入200μl BufferGR,同时添加20μLProteinase K,振荡至混匀,放在 56℃摇床,直至沉淀完全溶解。
(3)从摇床取出后短暂离心,加入200μL的Buffer GL,上下颠倒混匀,放 在65℃的水浴锅中10min,期间不断上下颠倒混匀。
(4)水浴锅中取出后短暂离心,加入200μL无水乙醇,上下颠倒混匀后, 进行短暂离心。
(5)将所得的溶液全部加入吸附柱中,12000rpm离心1min,弃废液。
(6)向吸附柱中添加500μL的GW1缓冲液进行洗涤,12000rpm离心1min, 弃废液。
(7)向吸附柱中添加500μL的GW2缓冲液进行洗涤,12000rpm离心1min, 弃废液。
(8)12000rpm空离2min。
(9)把吸附柱放回新的1.5ml的离心管中,在室温下放置10min,彻底晾干 吸附柱。
(10)向吸附柱的中间部位悬空滴加50μL的超纯水(已灭菌),室温静置 5min,10000rpm离心1min,收集溶液并涡旋离心。
(11)用核酸定量仪测定DNA浓度。
2、qPCR检测
将已知FecB基因型为++的滩羊基因组DNA分别在体系1和体系2中同时 进行qPCR扩增并采集荧光信号,监测每个样品在体系1和体系2中的荧光信号 强度变化。
其中体系1采用所述的++型引物,即引物对1(上游引物: 5’-ATTGGAAAAGGTCGCTATGGG-3’;下游引物: 5’-TGCCTCATCAACACCGTCt-3’),体系2采用所述的BB型引物,即引物对2 (上游引物:5’-ATTGGAAAAGGTCGCTATGGG-3’;下游引物: 5’-TGCCTCATCAACACCGTCc-3’)。
qPCR反应的操作如下:取待测样品基因组DNA 1μl作为模板,加入2×SYBR FASTqPCR Master Mix 5μL,10μmol/L的上游引物0.3μL,10μmol/L下游引物 0.3μL,去离子水3.4μL,总体系为10μL进行qPCR扩增,扩增体系的反应程序 为:95℃预变性10min;95℃变性30sec,60℃退火1min,40个循环。
随着qPCR反应的进行,体系1和体系2中反应产物不断累积,每扩增一次 收集一次荧光信号,荧光信号强度呈比例增加,根据体系1和体系2中荧光信号 达到阈值的先后顺序判定FecB的基因型。当体系1的荧光信号强度先达到阈值 时,即可判定待测样品FecB基因为++型(即FecB正常型);当体系2的荧光信 号强度先达到阈值时,即可判定待测样品FecB基因为BB型(即FecB突变纯合 型);当体系1和体系2的荧光信号同时达到阈值时,即可判定待测样品FecB 基因为B+型(即FecB突变杂合型)。
结果如图1所示,体系1(即++型引物)的荧光强度先达到阈值,说明待测 样品来自FecB基因型为++的绵羊,与实际情况相符。
实施例3绵羊FecB基因多态性的qPCR检测
1、绵羊基因组DNA的提取
具体操作同实施例2。
2、qPCR检测
将已知FecB基因型为B+的滩羊基因组DNA分别在体系1和体系2中同时 进行qPCR扩增并采集荧光信号,监测每个样品在体系1和体系2中的荧光信号 强度变化。
其中体系1采用所述的++型引物,即引物对1(上游引物: 5’-ATTGGAAAAGGTCGCTATGGG-3’;下游引物: 5’-TGCCTCATCAACACCGTCt-3’),体系2采用所述的BB型引物,即引物对2 (上游引物:5’-ATTGGAAAAGGTCGCTATGGG-3’;下游引物: 5’-TGCCTCATCAACACCGTCc-3’)。
qPCR反应的操作如下:取待测样品基因组DNA 1μl作为模板,加入2×SYBR FASTqPCR Master Mix 5μL,10μmol/L的上游引物0.3μL,10μmol/L下游引物 0.3μL,去离子水3.4μL,总体系为10μL进行qPCR扩增,扩增体系的反应程序 为:95℃预变性10min;95℃变性30sec,60℃退火1min,40个循环。
随着qPCR反应的进行,体系1和体系2中反应产物不断累积,每扩增一次 收集一次荧光信号,荧光信号强度呈比例增加,根据体系1和体系2中荧光信号 达到阈值的先后顺序判定FecB的基因型。当体系1的荧光信号强度先达到阈值 时,即可判定待测样品FecB基因为++型(即FecB正常型);当体系2的荧光信 号强度先达到阈值时,即可判定待测样品FecB基因为BB型(即FecB突变纯合 型);当体系1和体系2的荧光信号同时达到阈值时,即可判定待测样品FecB 基因为B+型(即FecB突变杂合型)。
结果如图2所示,体系1(即++型引物)和体系2(即BB型引物)的荧光 强度同时达到阈值,说明待测样品来自FecB基因型为B+的绵羊,与实际情况相 符。
实施例4绵羊FecB基因多态性的qPCR检测
1、绵羊基因组DNA的提取
具体操作同实施例2。
2、qPCR检测
将已知FecB基因型为BB型的滩羊基因组DNA分别在体系1和体系2中同 时进行qPCR扩增并采集荧光信号,监测每个样品在体系1和体系2中的荧光信 号强度变化。
其中体系1采用所述的++型引物,即引物对1(上游引物: 5’-ATTGGAAAAGGTCGCTATGGG-3’;下游引物: 5’-TGCCTCATCAACACCGTCt-3’),体系2采用所述的BB型引物,即引物对2 (上游引物:5’-ATTGGAAAAGGTCGCTATGGG-3’;下游引物: 5’-TGCCTCATCAACACCGTCc-3’)。
qPCR反应的操作如下:取待测样品基因组DNA 1μl作为模板,加入2×SYBR FASTqPCR Master Mix 5μL,10μmol/L的上游引物0.3μL,10μmol/L下游引物 0.3μL,去离子水3.4μL,总体系为10μL进行qPCR扩增,扩增体系的反应程序 为:95℃预变性10min;95℃变性30sec,60℃退火1min,40个循环。
随着qPCR反应的进行,体系1和体系2中反应产物不断累积,每扩增一次 收集一次荧光信号,荧光信号强度呈比例增加,根据体系1和体系2中荧光信号 达到阈值的先后顺序判定FecB的基因型。当体系1的荧光信号强度先达到阈值 时,即可判定待测样品FecB基因为++型(即FecB正常型);当体系2的荧光信 号强度先达到阈值时,即可判定待测样品FecB基因为BB型(即FecB突变纯合 型);当体系1和体系2的荧光信号同时达到阈值时,即可判定待测样品FecB 基因为B+型(即FecB突变杂合型)。
结果如图3所示,体系2(即BB型引物)的荧光强度先达到阈值,说明待 测样品来自FecB基因型为BB的绵羊,与实际情况相符。
实施例5本发明方法与PCR-Sanger测序法准确率的比较
1、绵羊基因组DNA的提取
具体操作同实施例2。
2、qPCR检测
将已知FecB基因型的85只滩羊基因组DNA作为待测样品分别在体系1和 体系2中同时进行qPCR扩增并采集荧光信号,监测每个样品在体系1和体系2 中的荧光信号强度变化。
其中体系1采用所述的++型引物,即引物对1(上游引物: 5’-ATTGGAAAAGGTCGCTATGGG-3’;下游引物: 5’-TGCCTCATCAACACCGTCt-3’),体系2采用所述的BB型引物,即引物对2 (上游引物:5’-ATTGGAAAAGGTCGCTATGGG-3’;下游引物:5’-TGCCTCATCAACACCGTCc-3’)。
qPCR反应的操作如下:取待测样品基因组DNA 1μl作为模板,加入2×SYBR FASTqPCR Master Mix 5μL,10μmol/L的上游引物0.3μL,10μmol/L下游引物 0.3μL,去离子水3.4μL,总体系为10μL进行qPCR扩增,扩增体系的反应程序 为:95℃预变性10min;95℃变性30sec,60℃退火1min,40个循环。
随着qPCR反应的进行,体系1和体系2中反应产物不断累积,每扩增一次 收集一次荧光信号,荧光信号强度呈比例增加,根据体系1和体系2中荧光信号 达到阈值的先后顺序判定FecB的基因型。当体系1的荧光信号强度先达到阈值 时,即可判定待测样品FecB基因为++型(即FecB正常型);当体系2的荧光信 号强度先达到阈值时,即可判定待测样品FecB基因为BB型(即FecB突变纯合 型);当体系1和体系2的荧光信号同时达到阈值时,即可判定待测样品FecB 基因为B+型(即FecB突变杂合型)。
同时对已知FecB基因型的85只滩羊进行FecB基因扩增,并进行Sanger测 序。扩增所用的引物,F:AGGTCCAGAGGACGATAGCA;R: AGGAAACCCTGAACATCGCTAA。扩增体系为:取待测样品基因组DNA50ng 作为模板,加入KOD polymerase 0.5μL,Buffer 2.5μL,dNTPs 2.5μL,MgSO41.5μL, 10μmol/L的上游引物0.5μL,10μmol/L下游引物0.5μL,总体系为10μL,其余用去离子水补齐,进行qPCR扩增。扩增程序:98℃预变性2min;98℃变性30sec, 60℃退火1min,40个循环。
qPCR法检测的结果如图1、2、3所示,在待测样品为++型时,体系1的荧 光强度先达到阈值;在待测样品为B+型时,体系1和体系2荧光强度同时达到 阈值;在待测样品为BB型时,体系2的荧光强度先达到阈值;PCR-Sanger测序 法检测的结果显示,在待测样品为++型时,目标位点测得的碱基为A;在待测样 品为B+型时,目标位点测得的碱基为A和G的套峰;在待测样品为BB型时, 目标位点测得的碱基为G。对85只已知基因型的个体通过两种方法检测后进行 检测准确率统计,如表1所示。qPCR法对BB型、B+型及++型的检测准确率均 为100%,PCR-Sanger测序法对BB型、B+型及++型的检测准确率分别为100%、 94.7%和100%,表明本发明提供的检测方法对三种基因型的准确率均为100%。
表1两种检测方法准确率的比较
实施例6绵羊FecB基因多态性的qPCR检测
1、绵羊基因组DNA的提取
具体操作同实施例2。
2、qPCR检测
将2039个待检测的湖羊基因组DNA和2916个待检测的滩羊DNA样品分别 在体系1和体系2中同时进行qPCR扩增并采集荧光信号,监测每个样品在体系 1和体系2中的荧光信号强度变化。
其中体系1采用所述的++型引物,即引物对1(上游引物: 5’-ATTGGAAAAGGTCGCTATGGG-3’;下游引物: 5’-TGCCTCATCAACACCGTCt-3’),体系2采用所述的BB型引物,即引物对2 (上游引物:5’-ATTGGAAAAGGTCGCTATGGG-3’;下游引物: 5’-TGCCTCATCAACACCGTCc-3’)。
其中qPCR反应的操作如下:取待测样品基因组DNA 1μl作为模板,加入 2×SYBRFAST qPCRMasterMix 5μL,10μmol/L的上游引物0.3μL,10μmol/L下 游引物0.3μL,去离子水3.4μL,总体系为10μL进行qPCR扩增,扩增体系的反 应程序为:95℃预变性10min;95℃变性30sec,60℃退火1min,40个循环。
随着qPCR反应的进行,体系1和体系2中反应产物不断累积,每扩增一次 收集一次荧光信号,荧光信号强度呈比例增加,根据体系1和体系2中荧光信号 达到阈值的先后顺序判定FecB的基因型。当体系1的荧光信号强度先达到阈值 时,即可判定待测样品FecB基因为++型(即FecB正常型);当体系2的荧光信 号强度先达到阈值时,即可判定待测样品FecB基因为BB型(即FecB突变纯合 型);当体系1和体系2的荧光信号同时达到阈值时,即可判定待测样品FecB 基因为B+型(即FecB突变杂合型)。
结果如表2所示,2039个湖羊样本FecB基因为BB型、B+型及++型的个体 分别为1555个、429个和55个,2916个滩羊样本FecB基因为BB型、B+型及 ++型的个体分别为20个,309个和2587个。表明本发明提供的方法简单、快速、 低成本的检测出绵羊FecB的基因型。
表2 qPCR法检测绵羊FecB基因型结果统计表
以上所述,仅为本发明的具体实施方式,但本发明的保护范围并不局限于此, 任何熟悉本领域技术的技术人员在本发明公开的技术范围内,可轻易想到的变化 或替换,都应涵盖在本发明的保护范围之内。
Claims (10)
1.用于检测绵羊FecB基因多态性的引物组,其特征在于,所述的引物组由引物对1和引物对2组成,其中,引物对1的下游引物3’端和++型的基因位点相匹配;引物对2的下游引物的3’端和BB型的基因位点相匹配;BB型代表FecB基因的编码区第746位碱基发生A-G的突变(g.A746G),导致第249位氨基酸由谷氨酰胺转变为精氨酸(p.Q249R);++型代表FecB基因的编码区第746位碱基未发生改变,仍为A;
所述引物对的核苷酸序列如下:
引物对1:
上游引物:5’-ATTGGAAAAGGTCGCTATGGG-3’
下游引物:5’-TGCCTCATCAACACCGTCt-3’
引物对2:
上游引物:5’-ATTGGAAAAGGTCGCTATGGG-3’
下游引物:5’-TGCCTCATCAACACCGTCc-3’。
2.含有权利要求1所述引物组的用于检测绵羊FecB基因多态性的试剂盒。
3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述的试剂盒还包括荧光染料。
4.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述的荧光染料为SYBR Green I荧光染料。
5.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述的试剂盒还包括dNTPs、Taq DNA聚合酶、Mg2+以及PCR反应缓冲液中的一种或多种。
6.一种利用qPCR技术检测绵羊FecB基因多态性的方法,其特征在于,包括以下步骤:
1)提取待测绵羊的基因组DNA;
2)以待测绵羊的基因组DNA为模板,分别进行两个体系的qPCR扩增,体系1采用权利要求1中所述的引物对1,体系2采用权利要求1中所述的引物对2,扩增后待测样品在体系1和体系2中分别产生一个荧光信号强度变化曲线;
3)根据体系1和体系2中检测到的荧光阈值出现的顺序辨别出待测样品的FecB基因型,当体系1先达到荧光阈值时,即可判定待测样品的FecB基因型为++型;当体系2先达到荧光阈值时,即可判定待测样品的FecB基因型为BB型;当体系1和体系2的荧光信号同时达到阈值时,即可判定待测样品的FecB基因型为B+型。
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,步骤2)中实时荧光定量PCR反应使用的扩增体系以10μl计为:5-1000ng/μL基因组DNA 1μL,2×SYBR FAST qPCR Master Mix 5μL,10μmol/L上游引物0.3μL,10μmol/L下游引物0.3μL,去离子水3.4μL,总体系为10μL。
8.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,步骤2)中实时荧光定量PCR反应的扩增程序为:95℃预变性10min;95℃变性30sec,60℃退火1min,40个循环。
9.权利要求1所述的引物组在绵羊分子标记辅助育种中的应用。
10.权利要求2-5任一项所述的试剂盒在绵羊分子标记辅助育种中的应用。
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CN103333948A (zh) * | 2013-05-09 | 2013-10-02 | 赵兴波 | 一种检测绵羊高繁殖力基因bmpr1b的分子诊断方法 |
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