CN113046364A - 水稻OsATL9基因在调控水稻抗性中的应用 - Google Patents

水稻OsATL9基因在调控水稻抗性中的应用 Download PDF

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Abstract

本发明植物基因工程技术领域,具体涉及水稻OsATL9基因在调控水稻抗性中的应用。本发明的目的在于为改良水稻抗性提供一种新选择。本发明的技术方案是水稻OsATL9基因在调控水稻抗性中的应用。本发明通过实验验证了水稻OsATL9基因的功能。该基因可正向调控水稻对冷害逆境的耐性。并进一步研究发现,该调控是通过调节丙二醛含量、相对电导率和冷害相关基因表达水平。

Description

水稻OsATL9基因在调控水稻抗性中的应用
技术领域
本发明植物基因工程技术领域,具体涉及水稻OsATL9基因在调控水稻抗性中的应用。
背景技术
水稻是世界上重要的粮食作物,也是研究单子叶植物功能基因组学的模式植物。在自然生长条件下水稻经常会受到非生物逆境(干旱、低温)和生物逆境(稻瘟菌、白叶枯菌)的危害。
在北方特别是东北稻区,水稻生长期短,气温低,从播种到秋季成熟各生育阶段,随时都可能遭受低温危害。1949年以来,东北稻区水稻产量就受到了低温冷害的影响。2002年,黑龙江省东部三江平原遭受历史上70年未遇的混合型低温冷害,造成80万公顷水稻平均减产40%左右,严重的地块几乎绝产。在全球温度升高的大背景下,低温冷害的隐蔽性显著增强,在现实生产中,应充分重视低温冷害的危害性,在我国东北和西南等低温冷凉稻区尤其要加强防范。选育耐冻的水稻品种就显得尤为重要。
发明内容
本发明的目的在于为改良水稻抗性提供一种新选择。
本发明的技术方案是水稻OsATL9基因在调控水稻抗性中的应用。
具体的,所述水稻OsATL9基因的核苷酸序列如SEQ ID No.17所示。
其中,所述调控为正调控。
进一步,所述抗性为抗冷害性。
具体的,所述调控为调控水稻丙二醛含量、相对电导率和/或冷害相关基因表达水平。
优选的,所述冷害有关基因Myb、CDPK7、Fer1、Trx23和Lti6a。
本发明的下有益效果:本发明通过实验验证了水稻OsATL9基因的功能。该基因的编码产物为一种E3泛素连接酶。采用病毒诱导的基因沉默的方法,发现沉默植株与对照植株相比,对冷害的抗性下降,这表明了OsATL9正向调控了水稻对冷害逆境的耐性。并进一步研究发现,该调控是通过调节丙二醛含量、相对电导率和冷害相关基因表达水平。
附图说明
图1、冷冻处理下,OsATL9基因的表达量的变化;CK为对照,Cold为冷冻处理。
图2、冷害处理后,BMV:OsATL9植株降低对冷害的耐性。(A)遭受冷害后,BMV:OsATL9沉默植株和对照植株的表型,BMV:00就是指对照植株,也就是该基因没有沉默的植株;BMV:OsATL9指的是该基因沉默的植株;左边的图指的是,在没有遭受冷害时,BMV:OsATL9沉默植株和对照植株无明显差异,右边的图表示,在遭受了冷害后,恢复6天后,BMV:OsATL9沉默植株的恢复率比对照低(B)BMV:OsATL9沉默植株中,OsATL9基因的沉默效率;(C)冷害逆境下,BMV:OsATL9沉默植株和对照植株的存活率;(D)正常(Normal)和冷害(Cold)逆境下,BMV:OsATL9沉默植株和对照植株的叶绿素含量。
图3、BMV:OsATL9沉默植株通过调控丙二醛和相对电导率来调控对冷害逆境的耐性。(A)正常和冷害逆境下,BMV:OsATL9沉默植株和对照植株中丙二醛的含量;(B)正常和冷害逆境下,BMV:OsATL9沉默植株和对照植株中相对电导率。
图4、正常(Nor)和冷害(Cold)处理下,BMV:OsATL9沉默植株和对照植株中冷害相关基因的表达情况。
具体实施方式
下述实施例中用到的主要实验材料与方法:
1、植物材料
所采用的水稻品种为原丰早和IR64,“原丰早”用于冷害逆境处理的表达分析;IR64用于病毒诱导的基因沉默(VIGS)。
2、主要实验试剂
Trizol试剂购买于Thermofisher,实时荧光定量PCR(qRT-PCR)相关的试剂购买于Takara公司。其他常规的试剂购买于北京鼎国生物技术有限责任公司。
3、植物种植方法
水稻(Oryza sativa)品种原丰早经过催芽后种植在塑料营养钵(直径8cm,高10cm,每盆播种10株),置于培养箱中培养。幼苗的生长条件是:28℃,16h光照/8h黑暗。一周龄的水稻幼苗用冷害处理。
水稻品种IR64将水稻种子播种于塑料营养钵中,每钵播种5株,生长温度控制在22~24℃,光周期为14h/10h。待植株生长10~14天时,用于VIGS侵染实验。
4、实施例中用到的引物见表1。
表1实施例中用到的引物
Figure BDA0003007808370000021
Figure BDA0003007808370000031
实施例1基因的表达模式分析
冷害胁迫采用三周龄左右的“原丰早”水稻放置于4℃光照培养箱中,冷害处理后0、6、12和24h取样,液氮速冻后于-80℃保存备用。
总RNA的提取采用Trizol的方法,具体操作如下:取叶片在液氮中充分研(研磨要迅速,最好不要超过1分钟);然后将研磨号的粉末装入离心管中;每使用1mL Trizol加0.2mL氯仿,盖好管盖,剧烈振荡15秒,室温放置3分钟;4℃,10000rpm离心10~15分钟;把水相转移到新管中并加入等体积异丙醇,混匀,室温放置20~30分钟;4℃,10000rpm离心10分钟,去上清;加入1mL 75%乙醇洗涤沉淀(每使用1mL Trizol至少用1mL 75%乙醇对沉淀进行洗涤);4℃,5000rpm离心3分钟,倒出液体;室温放置晾干,根据实验需要,加入30~100μL无RNase水,溶解RNA。按照Takara反转录试剂盒说明先去除RNA中DNA的污染。然后按照试剂盒说明书进行反转录,获得相应的cDNA。qRT-PCR反应采用SYBR Green I作为反应荧光染料。反应在CFX96TM Real-time System(Bio-Rad,Hercules,CA,USA)仪器中进行。以水稻Actin基因作为内参基因,检测OsATL9基因的表达量。扩增Actin基因的引物为表1中SEQ IDNo.1和SEQ ID No.2,扩增OsATL9基因的引物为表1中SEQ ID No.3和SEQ ID No.4。扩增体系:Fast Essential DNA Green Master(2×)12.5μL,引物1(10μM)0.5μL,引物2(10μM)0.5μL,cDNA模板0.5μL,ddH2O(双蒸水)补足至25μL。扩增程序:反应程序为95℃10min;95℃20s,60℃20s,72℃延伸20s,进行40个循环。
OsATL9基因的表达受到了冷害逆境的诱导:冷害逆境下,OsATL9基因的表达受到了强烈的诱导。冷害6h后,OsATL9基因的表达量显著增加,且在测定范围内,持续增加(图1)。
实施例2基因沉默VIGS载体的构建
水稻OsATL9基因的系统座位标识码为Os05g01940(http://rice.plantbiology.msu.edu/)。该基因的核苷酸序列如SEQ ID No.17所示,其编码蛋白的氨基酸序列SEQ ID No.18所示。基因沉默表达载体BMV载体由浙江大学农业与生物技术学院宋凤鸣课题组提供。
采用表1中SEQ ID No.15和SEQ ID No.16为引物,以水稻基因组DNA为模板,扩增OsATL9基因,并将其连接到T/A克隆载体pMD19上。经测序验证正确后,以pMD19-OsATL9质粒为模板,用特异性引物SEQ ID No.15和SEQ ID No.16进行PCR扩增。PCR产物经l%琼脂糖胶电泳后,采用DNA Gel Purification Kit(Sangon,Shanghai,China)回收目标条带,用NcoI和AvrⅡ(购于NEB公司)双酶切回收的目标片段和沉默载体BMV,在37℃温浴4h,酶切的体系分别为:4μL Buffer,1.5μL NcoI,1.5μL AvrⅡ,10μL BMV载体质粒或者目标片段,添加水补充至40μL。酶切后回收载体质粒或者目标片段,16度T4(Takara)连接酶过夜连接,连接体系为:1μL连接缓冲液,1μL T4连接酶,2μL酶切后回收的载体质粒,6μL酶切后回收的目标片段。42℃热击转化大肠杆菌JM109(含50mg/L的卡那霉素的LB平板筛选),挑取单菌落进行菌落PCR鉴定进行初筛,最终提取质粒进行测序验证,并命名为BMV:OsATL9。经电击法将所述沉默表达载体BMV:OsATL9转入农杆菌。挑取单菌落进行菌落PCR鉴定,选取阳性菌斑,在液体培养基中培养,获得农杆菌菌液,-80℃保存备用。
实施例3 VIGS沉默植株的获得
取实施例2得到的于-80℃保存的菌株,在含有50mg/L Kan的YEP固体养基上28℃划线培养2~3d;挑取单克隆于含抗生素的50mL YEP培养基中,250rpm,28℃培养,使菌液浓度达到OD595为1.0,将分别含有BMV:OsATL9和病毒粒子p1300m/RNA1+2(该病毒粒子可帮助携带基因的病毒载体在植物体内的移动,由浙江大学农业与生物技术学院宋凤鸣课题组提供)农杆菌液等体积混合。对照组使用分别含BMV和p1300m/RNA1+2的农杆菌混合液。混合后农杆菌菌液4000rpm离心10min,去上清,并用等体积的诱导缓冲液重悬,28℃培养3h后,添加100μM乙酰丁香酮(AS),0.4g/L L-半胱氨酸,0.15g/L二巯基苏糖醇(DTT),0.75mg/L硝酸银。诱导缓冲液配方:10mM 2-吗啉乙磺酸(MES),10mM MgCl2,200μM乙酰丁香酮(AS)。
将生长两周的幼苗倒置于农杆菌浸入缓冲液中,进行抽真空处理。真空压力为-4000Pa,侵染时间为7min。侵染完后,将缓冲液叶面喷施于幼苗,将幼苗置于24/22℃(白天/黑夜),14h光照/10h黑暗的培养箱内培养。
参照实施例1中的方法提取总RNA样品。按照Takara反转录试剂盒说明先去除RNA中DNA的污染。然后按照试剂盒说明书进行反转录,获得相应的cDNA。qRT-PCR反应采用SYBRGreen I作为反应荧光染料。反应在CFX96TM Real-time System(Bio-Rad,Hercules,CA,USA)仪器中进行。用qRT-PCR检测基因的沉默效率。以水稻Actin基因作为内参基因,检测OsATL9基因的表达量。扩增Actin基因的引物为表1中SEQ ID No.1和SEQ ID No.2,扩增OsATL9基因的引物为表1中SEQ ID No.3和SEQ ID No.4。扩增体系:Fast Essential DNAGreen Master(2×)12.5μL,引物1(10μM)0.5μL,引物2(10μM)0.5μL,cDNA模板0.5μL,ddH2O(双蒸水)补足至25μL。扩增程序:反应程序为95℃10min;95℃20s,60℃20s,72℃延伸20s,进行40个循环。
结果见图2B,从图中可以看出OsATL9基因在BMV:OsATL9沉默植株中的沉默效率约为60%。
实施例4水稻OsATL9基因在调控水稻抗冷害性中应用
将30天苗龄的沉默植株和对照植株移到4℃培养箱(光照条件为14h/10h的光周期)放置2天,然后在25℃条件下恢复生长6天,测定植株的存活率,叶绿素含量,MDA含量,电导率和抗冷害基因表达情况。
叶绿素含量的测定:称取水稻叶片0.2g左右,液氮研磨后将粉末置于含有5mL80%丙酮溶液中,混合均匀并静置过夜,4℃(4000rpm)离心20min,取上清,以80%丙酮溶液为空白对照测定663nm和645nm波长下的吸光度值。叶绿素含量根据公式[8.02×A663+20.20×A645]×V/1000×W。V是提取液体积;W是样品鲜重。
丙二醛(MDA)含量的测定:称取水稻叶片组织0.5g,放入研钵中经液氮研磨充分,将粉末转移到含5mL无菌水的离心管中,再向离心管中加入0.5%的TBA 5mL使得总体积为10mL。沸水浴煮沸10min,静置冷却后离心10min(4000rpm)。测定上清液在532nm和600nm处的吸光度值。单位鲜重组织MDA含量C(μmol/g)根据公式A532-A600=155000×C×L算的,其中L为比色杯厚度(cm)。
相对电导率的测定:称取0.2g-0.5g左右水稻叶片,用自来水清洗数遍,后用蒸馏水清洗,用滤纸吸干表面水分,置于含10mL去离子水试管中,盖上试管塞置于室温静置12h,测定其电导率R1,在将试管置于沸水浴中煮沸30min,冷却至室温,再次测定电导率R2,相对电导率为R1/R2×100%。
BMV:OsATL9沉默植株,与对照植株相比,对冷害的抗性降低:沉默植株和对照植株同时转移到同一个容器,容器的一侧种上沉默植株,另一侧则种上对照植株。恢复生长10天后转入4℃2天,后转移到正常的生长情况,10天后观察现象。OsATL9确实沉默的植株,与对照植株相比,对冷害的抗性降低。与对照植株相比,BMV:OsATL9沉默植株的存活率下降,叶绿素含量减少(图2),这些都表明OsATL9正向调控对冷害的耐性。
OsATL9沉默调控了丙二醛含量和电导率:冷害逆境下,检测BMV:OsATL9沉默植株和对照植株体内的丙二醛含量和相对电导率结果显示,干旱条件下,BMV:OsATL9沉默植株体内的丙二醛含量(图3A)和相对电导率(图3B)比对照植株显著增加。这表明了OsATL9沉默会增加植株体内丙二醛含量和相对电导率。
参照实施例1中的方法提取总RNA样品。按照Takara反转录试剂盒说明先去除RNA中DNA的污染。然后按照试剂盒说明书进行反转录,获得相应的cDNA。qRT-PCR反应采用SYBRGreen I作为反应荧光染料。反应在CFX96TM Real-time System(Bio-Rad,Hercules,CA,USA)仪器中进行。
以水稻Actin基因作为内参基因,对已报道的跟冷害有关基因Myb、CDPK7、Fer1、Trx23和Lti6a的表达量进行检测。扩增Actin的引物为表1中SEQ ID No.1和SEQ ID No.2,扩增Myb、CDPK7、Fer1、Trx23和Lti6a的引物为表1中SEQ ID No.5~14。扩增体系:FastEssential DNA Green Master(2×)12.5μL,引物1(10μM)0.5μL,引物2(10μM)0.5μL,cDNA模板0.5μL,ddH2O(双蒸水)补足至25μL。扩增程序:反应程序为95℃10min;95℃20s,60℃20s,72℃延伸20s,进行40个循环。
如图4所示,冷害逆境条件下,BMV:OsATL9沉默植株,与对照植株相比,抑制了冷害相关基因的表达情况。这些都表明了OsATL9沉默降低对冷害的逆境的耐性,是通过对冷害反应基因表达的调控来实现的。
序列表
<110> 台州学院
<120> 水稻OsATL17基因在调控水稻抗性中的应用
<160> 18
<170> SIPOSequenceListing 1.0
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atgtcctcgc cgccgtctga tccgagctcc ggtggtggcg atggcggctc ggccgtgccg 60
gggacggcga gctccaactt cacgctgctg tacatcatca tcgccgtcct cgtcggcgtg 120
atcctgtaca tggcgatccg gtacggccgg tcggtgatgt cggagtggcg ccagctgcag 180
gccggcggcg gcggcggcga gccgcgcgcc gcgctgctcg ggctgagctc ggacgacatc 240
gacgcgctcc ccacgttcac gtaccgggcg cgcggggcgg cggcgtcgcc gctggtcggc 300
ggcggcggga ggaggggcgg cggcagcggc aaggggaagg gggcgacgac ggtggtggtg 360
gagtgcgtgg tgtgcctgca ggagctcgcc gacggcgacg tggtgcgcgt gctgccggcg 420
tgcaggcact tcttccacgg cggctgcatc gacctctggc tgcgcgccca ctccacgtgc 480
ccggtgtgcc gcgcgcaccc ggagcccgac ggcgtgcggc tcagcgacgt cgtggccgtg 540
tcgccgccgc tgccgcagct gcgccggtgc ggcctgtcgc cggagcggcc cacggcggcg 600
tcgcgcgccc tggcggacat cctggcacgt tctccattga ggggcaacac cacctcgacg 660
acgacgacca ccaccaccgg cggaccgatc acgtcgacgt cgtcgaagtc gccgtcgtca 720
ccggttcaag cggcgatcat caactacgtg caggcctcac gttcgccgtc tccgacggcg 780
taccacagcc tgaacgagcg gtggccgagc tcgccgacgc cggttgtggt tgtgcggtcg 840
aagtcgccgt cgccgtcgtc gccaccgata ggtggtctga gtctgcagac gacgacggcg 900
gcggcggcga gaggcgtcgg cgtggtggaa ggggtggatg caggtgcaac cacgtcggcg 960
tcggcgtcgg cgccaacgca ggtggtggcg ctgtcaaggg aaggtggtgg ttcgcggtcc 1020
aagtcgccgt cgccggtgcc acattaa 1047
<210> 18
<211> 348
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 18
Met Ser Ser Pro Pro Ser Asp Pro Ser Ser Gly Gly Gly Asp Gly Gly
1 5 10 15
Ser Ala Val Pro Gly Thr Ala Ser Ser Asn Phe Thr Leu Leu Tyr Ile
20 25 30
Ile Ile Ala Val Leu Val Gly Val Ile Leu Tyr Met Ala Ile Arg Tyr
35 40 45
Gly Arg Ser Val Met Ser Glu Trp Arg Gln Leu Gln Ala Gly Gly Gly
50 55 60
Gly Gly Glu Pro Arg Ala Ala Leu Leu Gly Leu Ser Ser Asp Asp Ile
65 70 75 80
Asp Ala Leu Pro Thr Phe Thr Tyr Arg Ala Arg Gly Ala Ala Ala Ser
85 90 95
Pro Leu Val Gly Gly Gly Gly Arg Arg Gly Gly Gly Ser Gly Lys Gly
100 105 110
Lys Gly Ala Thr Thr Val Val Val Glu Cys Val Val Cys Leu Gln Glu
115 120 125
Leu Ala Asp Gly Asp Val Val Arg Val Leu Pro Ala Cys Arg His Phe
130 135 140
Phe His Gly Gly Cys Ile Asp Leu Trp Leu Arg Ala His Ser Thr Cys
145 150 155 160
Pro Val Cys Arg Ala His Pro Glu Pro Asp Gly Val Arg Leu Ser Asp
165 170 175
Val Val Ala Val Ser Pro Pro Leu Pro Gln Leu Arg Arg Cys Gly Leu
180 185 190
Ser Pro Glu Arg Pro Thr Ala Ala Ser Arg Ala Leu Ala Asp Ile Leu
195 200 205
Ala Arg Ser Pro Leu Arg Gly Asn Thr Thr Ser Thr Thr Thr Thr Thr
210 215 220
Thr Thr Gly Gly Pro Ile Thr Ser Thr Ser Ser Lys Ser Pro Ser Ser
225 230 235 240
Pro Val Gln Ala Ala Ile Ile Asn Tyr Val Gln Ala Ser Arg Ser Pro
245 250 255
Ser Pro Thr Ala Tyr His Ser Leu Asn Glu Arg Trp Pro Ser Ser Pro
260 265 270
Thr Pro Val Val Val Val Arg Ser Lys Ser Pro Ser Pro Ser Ser Pro
275 280 285
Pro Ile Gly Gly Leu Ser Leu Gln Thr Thr Thr Ala Ala Ala Ala Arg
290 295 300
Gly Val Gly Val Val Glu Gly Val Asp Ala Gly Ala Thr Thr Ser Ala
305 310 315 320
Ser Ala Ser Ala Pro Thr Gln Val Val Ala Leu Ser Arg Glu Gly Gly
325 330 335
Gly Ser Arg Ser Lys Ser Pro Ser Pro Val Pro His
340 345

Claims (6)

1.水稻OsATL9基因在调控水稻抗性中的应用。
2.如权利要求1所述的应用,其特征在于,所述水稻OsATL9基因的核苷酸序列如SEQ IDNo.17所示。
3.如权利要求1或2所述的应用,其特征在于,所述调控为正调控。
4.如权利要求1或2所述的应用,其特征在于,所述抗性为抗冷害性。
5.如权利要求4所述的应用,其特征在于,所述调控为调控水稻活丙二醛含量、相对电导率和/或冷害相关基因表达水平。
6.如权利要求5所述的应用,其特征在于,所述冷害有关基因Myb、CDPK7、Fer1、Trx23和Lti6a。
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Application publication date: 20210629

Assignee: Taizhou nuoli Agricultural Machinery Co.,Ltd.

Assignor: TAIZHOU University

Contract record no.: X2022330000873

Denomination of invention: Application of OsATL9 Gene in Controlling Rice Resistance

Granted publication date: 20220628

License type: Common License

Record date: 20221226