CN112961850A - 高效分泌表达几丁二糖脱乙酰酶的枯草芽孢杆菌及其应用 - Google Patents

高效分泌表达几丁二糖脱乙酰酶的枯草芽孢杆菌及其应用 Download PDF

Info

Publication number
CN112961850A
CN112961850A CN202110160901.7A CN202110160901A CN112961850A CN 112961850 A CN112961850 A CN 112961850A CN 202110160901 A CN202110160901 A CN 202110160901A CN 112961850 A CN112961850 A CN 112961850A
Authority
CN
China
Prior art keywords
bacillus subtilis
deacetylase
chitobiose
chitobiose deacetylase
seq
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Granted
Application number
CN202110160901.7A
Other languages
English (en)
Other versions
CN112961850B (zh
Inventor
刘龙
陈坚
吕雪芹
卢伟
堵国成
李江华
张弘治
刘延峰
卢健行
毛馨竹
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Jiangnan University
Shandong Runde Biotechnology Co Ltd
Original Assignee
Jiangnan University
Shandong Runde Biotechnology Co Ltd
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Jiangnan University, Shandong Runde Biotechnology Co Ltd filed Critical Jiangnan University
Priority to CN202110160901.7A priority Critical patent/CN112961850B/zh
Publication of CN112961850A publication Critical patent/CN112961850A/zh
Application granted granted Critical
Publication of CN112961850B publication Critical patent/CN112961850B/zh
Active legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Images

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14Hydrolases (3)
    • C12N9/78Hydrolases (3) acting on carbon to nitrogen bonds other than peptide bonds (3.5)
    • C12N9/80Hydrolases (3) acting on carbon to nitrogen bonds other than peptide bonds (3.5) acting on amide bonds in linear amides (3.5.1)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/74Vectors or expression systems specially adapted for prokaryotic hosts other than E. coli, e.g. Lactobacillus, Micromonospora
    • C12N15/75Vectors or expression systems specially adapted for prokaryotic hosts other than E. coli, e.g. Lactobacillus, Micromonospora for Bacillus
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12PFERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P19/00Preparation of compounds containing saccharide radicals
    • C12P19/26Preparation of nitrogen-containing carbohydrates
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide
    • C07K2319/01Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif
    • C07K2319/02Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif containing a signal sequence

Landscapes

  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Enzymes And Modification Thereof (AREA)

Abstract

本发明公开了一种高效分泌表达几丁二糖脱乙酰酶的枯草芽孢杆菌及其应用,本发明通过对几丁二糖脱乙酰酶Dac的分子结构及表达载体pP43mut‑N1‑yncM‑Dac的RBS序列进行改造,提高几丁二糖脱乙酰酶Dac的催化速率及翻译表达速率,提高酶活,并构建了可以高产氨基葡萄糖GlcN的枯草芽孢杆菌。与现有技术相比,几丁二糖脱乙酰酶胞外酶活可达3769.5U/mL。本转化方法条件温和,对环境污染小,而且底物选择性高,目标产物专一,反应速率快,产物得率高。此法有利于解决化学合成法中污染严重,步骤繁琐等问题,而且工艺简单,易于控制,方便推广应用。

Description

高效分泌表达几丁二糖脱乙酰酶的枯草芽孢杆菌及其应用
技术领域
本发明属于代谢工程技术领域,尤其涉及一种高效分泌表达几丁二糖脱乙酰酶的枯草芽孢杆菌及其应用。
背景技术
氨基葡萄糖GlcN作为一种天然的水溶性单糖,在医药保健、皮肤美容、农业生产等领域有着重要应用。目前,在许多国家,氨基葡萄糖GlcN已被列为医药品行列。此外,利用氨基葡萄糖GlcN与阿魏酸结合,可获得具有良好水溶性的新型化妆品材料,具有美白补水的功效。另一方面,氨基葡萄糖GlcN可作为农作物的排毒剂的主要成分,当在植物生长期内使用时,可排出植物体内的重金属及农药污染物等有害物质。
近年来,氨基葡萄糖GlcN的市场需求量逐年递增,人们开始对氨基葡萄糖GlcN的工业化生产进行关注。目前工业上氨基葡萄糖GlcN的生产方法是化学水解法及微生物发酵法。其中化学水解法常用强酸热解几丁质脱除乙酰基,容易导致严重的环境污染问题,且获得产品中乙酰基的脱除程度不一致,产品均一性差。利用微生物发酵法生产氨基葡萄糖GlcN,安全无毒,大大降低了强酸强碱的使用量,但发酵液中无法实现高浓度的积累,众多研究将研究重点放在生产氨基葡萄糖GlcN的前体物质N-乙酰氨基葡萄糖GlcNAc上,实现在发酵液中大量积累N-乙酰氨基葡萄糖GlcNAc后,再利用酸解法将N-乙酰氨基葡萄糖GlcNAc水解为氨基葡萄糖GlcN,但该过程需利用盐酸进行加热反应,使用大量强酸试剂,依然会造成环境污染及设备腐蚀等问题。综上所述,这两种方法普遍存在制备步骤复杂、反应条件苛刻、环境污染严重、生产设备易腐蚀和制备周期长等问题。因此,为了解决目前存在的问题,需要找到一种安全高效且以环境友好型的方式生产氨基葡萄糖GlcN。
相较于上述两种方法,酶法催化具有底物来源充足,不受原材料限制,制备条件温和,环境污染小,反应专一性高,体系中杂质少易于下游分离纯化,生产成本低等优点。目前市场上存在的脱乙酰酶,多是针对以寡聚体或多聚体形式存在的乙酰氨基葡萄进行作用的,而针对单体形式作用的脱乙酰酶鲜有报道。而来源于热球菌属的几丁二糖脱乙酰酶Dac属于糖类酯酶,可以利用N-乙酰氨基葡萄糖GlcNAc为底物进行单酶催化反应,实现氨基葡萄糖GlcN的一步生产。因此,建立几丁二糖脱乙酰酶Dac高效表达体系能够为氨基葡萄糖GLcN的生产提供便利。
枯草芽孢杆菌已经被美国食品和药物管理局(FDA)列为原则上认为安全的微生物(GRAS)。作为非致病的土壤微生物,其细胞壁组成成分简单,只含有肽聚糖和磷壁质,当分泌蛋白跨过细胞膜后,就被加工和直接释放到培养基中。但野生型的枯草芽孢杆菌Bacillus subtilis 168会在其对数生长末期大量表达和分泌各种蛋白酶,造成外源蛋白降解,有时甚至得不到目标蛋白,因此当生产胞外表达的外源蛋白时,一般选用枯草芽孢杆菌Bacillus subtilis WB600作为表达宿主。课题组在前期的工作中,构建重组质粒p43NMKmut-yncm-Dac,当以B.subtilis WB600为表达宿主时,摇瓶中胞外酶活达到1548.7U/mL,但是仍难以满足工业化利用酶法制备氨基葡萄糖GlcN的最低酶活需求,氨基葡萄糖GlcN在转化过程中的产量和转化率还较低,所以需要进一步提高氨基葡萄糖GlcN的产量。
发明内容
为解决几丁二糖脱乙酰酶Dac催化效率有限,酶活不够高的问题,本发明提供了一种提高几丁二糖脱乙酰酶Dac催化效率,进而提升胞外酶活的方法。
本发明的第一个目的是提供一种几丁二糖脱乙酰酶,其氨基酸序列如SEQ IDNO.2所示。
本发明的第二个目的是提供一种编码所述的几丁二糖脱乙酰酶的基因。
本发明的第三个目的是提供一种包括所述的基因的表达载体。
本发明的第四个目的是提供一种高效分泌表达所述的几丁二糖脱乙酰酶的枯草芽孢杆菌,所述的枯草芽孢杆菌以p43NMK为载体,融合表达了氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示的几丁二糖脱乙酰酶与核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示的yncM信号肽,并在几丁二糖脱乙酰酶基因的5’非翻译区引入SEQ ID NO.4所示的DNA片段,引入位点位于启动子P43的+1转录起始位点后的8个碱基之后。
进一步地,所述的枯草芽孢杆菌还包括采用核苷酸序列如SEQ ID NO.5或SEQ IDNO.6所示的RBS序列调控几丁二糖脱乙酰酶的表达。
进一步地,所述的枯草芽孢杆菌的宿主为B.subtilis WB600。
本发明的第五个目的是提供所述的枯草芽孢杆菌在提高氨基葡萄糖产量中的应用,以所述的枯草芽孢杆菌发酵上清液作为催化剂,以N-乙酰氨基葡糖为底物,在35~45℃催化底物,得到氨基葡萄糖。
进一步地,所述的枯草芽孢杆菌发酵上清液是通过将枯草芽孢杆菌种子液按照3~5%接种量接种至发酵培养基中,在35~38℃培养50~70h,经10000~15000rpm离心1~3min得到。
进一步地,所述的发酵培养基成分包括:蛋白胨10~15g/L、酵母提取物20~30g/L、甘油3~5mL,KH2PO4 2~2.5g/L和K2HPO4 12~13g/L。
进一步地,所述的种子液为OD600为4.0~6.0的枯草芽孢杆菌。
进一步地,N-乙酰氨基葡萄糖的添加量为80~120g/L。
借由上述方案,本发明至少具有以下优点:
本发明通过对几丁二糖脱乙酰酶Dac的分子结构及表达载体pP43mut-N1-yncM-Dac的RBS序列进行改造,提高几丁二糖脱乙酰酶Dac的催化速率及翻译表达速率,提高酶活,并构建了可以高产氨基葡萄糖GlcN的枯草芽孢杆菌。与现有技术相比,几丁二糖脱乙酰酶胞外酶活可达3769.5U/mL。本转化方法条件温和,对环境污染小,而且底物选择性高,目标产物专一,反应速率快,产物得率高。此法有利于解决化学合成法中污染严重,步骤繁琐等问题,而且工艺简单,易于控制,方便推广应用。
上述说明仅是本发明技术方案的概述,为了能够更清楚了解本发明的技术手段,并可依照说明书的内容予以实施,以下以本发明的较佳实施例并配合详细说明如后。
附图说明
图1为底物分子GlcNAc与蛋白分子Dac三维结构分子对接示意图;
图2为蛋白分子Dac中与底物分子GlcNAc相互作用的关键位点;
图3为蛋白分子Dac定点饱和突变体库的大肠杆菌Escherichia coli DH5α转化菌落图;
图4为蛋白分子Dac突变菌株摇瓶放大实验的胞外酶活;
图5为蛋白分子Dac原始菌株及突变菌株的动力学检测参数;
图6为构建RBS优化库时的核酸电泳验证;
图7为RBS优化库的大肠杆菌Escherichia coli DH5α转化菌落图;
图8为RBS优化筛选出的突变菌株摇瓶放大实验的胞外酶活。
具体实施方式
涉及的检测方法:
(1)几丁二糖脱乙酰酶酶活力定义
在40℃反应条件下,1h能转化1μmol底物N-乙酰氨基葡萄糖GlcNAc为1μmol产物氨基葡萄糖GlcN所需的酶量,称为一个酶活力单位,即1U=1μmol/h。
(2)几丁二糖脱乙酰酶酶酶活力检测方法
邻苯二甲醛显色法
(3)检测试剂
底物N-乙酰氨基葡萄糖溶液(100g/L):5g N-乙酰氨基葡萄糖GlcNAc溶于PB1中,用PB1定容至50mL。
PB1磷酸钠缓冲液(200mmol/L,pH 8.0):配制浓度为200mmol/L的NaH2PO4溶液和Na2HPO4溶液。18mL NaH2PO4溶液与390mL Na2HPO4溶液混匀。用pH测定仪测定pH值,确定pH8.0,室温储存。
PB2碳酸钠缓冲液(100mmol/L,pH 10.5):配制浓度为100mmol/L的NaCO3溶液和NaHCO3溶液。18mL NaH2PO4溶液与390mL Na2HPO4溶液混匀。用pH测定仪测定pH值,确定pH10.5,室温储存。
DTT二硫苏糖醇(2mol/L):称取308.5mg二硫苏糖醇于1mL dd H2O中,混合均匀,密封低温保存。
10×OPA检测试剂:500mg邻苯二甲醛OPA加入100mL PB2中,混合均匀,密封低温避光保存。
1×OPA检测试剂:3mL 10×OPA,300μL无水乙醇,15μLDTT,加PB2定容到30mL,混匀后,密封低温避光保存。现用现配。
HCl终止剂(0.5mol/L):取1800μL盐酸于40mL dd H2O中。
实施例1:分子对接及饱和突变位点的选择
利用软件Discovery Studio的CDOCKER模块进行分子对接,根据DiscoveryStudio软件的操作手册,将几丁二糖脱乙酰酶Dac模型的三维蛋白结构文件和配体N-乙酰氨基葡萄糖GlcNAc的三维结构文件,进行分子对接,如图1所示。
当底物分子与蛋白分子成功对接后,在底物分子GlcNAc与蛋白分子Dac结合位置周围,与GlcNAc存在相互作用力的氨基酸是蛋白分子Dac中与底物分子GlcNAc相互作用的关键位点,如图2所示。
根据文献报道,影响几丁二糖脱乙酰酶催化效应的关键位点为152位组氨酸H152及120位酪氨酸Y120。结合软件Discovery Studio模拟的氨基酸饱和突变结果,160位苯丙氨酸F160是与底物分子相互作用的重要位点,选择R156、R157、H152、Y120和F160五个位点进行定点饱和突变。
实施例2:定点饱和突变库的建立
根据几丁二糖脱乙酰酶Dac的碱基序列,设计简并引物,如表1。以pP43mut-yncM-Dac(构建方法参见申请号为CN201910193636.5)为模板,进行PCR扩增,及大肠杆菌Escherichia coli DH5α转化(如图3),将全部大肠转化子制备混合菌液并提质粒后,转入表达宿主枯草芽孢杆菌Bacillus subtilis WB600。
表1
Figure BDA0002936569630000041
Figure BDA0002936569630000051
实施例3:定点饱和突变库的高通量筛选与放大验证
(1)高通量筛选:
使用灭菌牙签在每个饱和突变点库中挑选100个左右单克隆到48孔板进行种子培养。每孔含有600μl添加卡那抗生素(10mg/mL)的液体LB培养基,(LB培养基成分如下:胰蛋白胨10g/L、酵母粉5g/L、NaCl 10g/L),于37℃孔板摇床培养12h得到种子液,之后在新的48孔板中,将200μl种子液转接至每孔含有600μl添加卡那抗生素(10mg/mL)的液体TB培养基进行发酵培养,(TB培养基成分如下:甘油4g/L、胰蛋白胨12g/L、酵母粉24g/L、磷酸氢二钾12.54g/L、磷酸二氢钾2.31g/L),于37℃,700rpm培养6h后结束发酵,以4200rpm,4℃的条件进行孔板离心30min,取离心后得到的上清液100μL加入每孔装有100μL 50g/L GlcNAc溶液(溶剂为PB1缓冲液)的96孔板中,于40℃,900rpm震荡摇床上反应10min,然后每孔加入100μL终止剂(0.5mol/L HCl)终止反应。每孔加入300μL ddH2O对反应液进行稀释,混合均匀后,4200rpm,离心5min,吸取上清液10μL加入到100μL 1×OPA检测试剂中,在330nm下检测吸光值。
将产量高于对照组的菌株按上述方法复筛两遍后进行锥形瓶发酵放大验证。
(2)放大验证:
使用灭菌牙签将高通量筛选得到的157-2、157-5、157-16 3株菌克隆子在50mL离心管中进行种子培养。每管含有5mL添加卡那抗生素(10mg/mL)的液体LB培养基,于37℃弹簧摇床培养12h得到种子液,在500mL锥形瓶中,将种子液以4%的接种量转接至96mL添加卡那抗生素(10mg/mL)的液体TB培养基进行发酵培养,通过邻苯二甲醛显色法进行粗酶液酶活检测,具体方式如下:
取发酵60h的发酵液1mL,以1200rpm,4℃,2min条件离心,上清液即为粗酶液,底物为100g/L的N-乙酰氨基葡萄糖GlcNAc溶液。将待测粗酶液与底物各100μL分装于1.5mL EP管中,40℃预热5min。将预热后的100μL粗酶液加入100μL底物中,40℃震荡反应2min,精确计时,加入0.5mol/L HCl终止剂终止反应。以1200rpm,2min条件离心,取上清50μL于950μLPB1中,稀释20倍,混合均匀后取5μL加入100μL 1×OPA检测试剂中,震荡2min。利用酶标仪检测其在330nm处的吸光值。以失活后的酶液为反应空白对照。
GlcN的标准曲线绘制,精确称取标准品(精确到0.0001g)配制0.5g/L、1g/L、2g/L、3g/L、4g/L、5g/L GlcN溶液,取5μL加入100μL OPA检测试剂中,震荡1min,30℃保温2min。利用酶标仪检测其在330nm处的吸光值,绘制标准曲线。
酶活力计算公式如下所示:
Figure BDA0002936569630000061
式中:
X:粗酶液酶活力(U/mL);
A:粗酶液体积0.1(mL);
B:底物溶液体积0.1(mL);
M:加入终止剂后样品稀释倍数1.5;
C:反应液GlcN浓度(g/L);
D:空白液GlcN浓度(g/L)。
T:反应时间2(min);
60:1h为60min;
215.6:标准样品氨基葡萄糖盐酸盐摩尔质量(g/mol);
0.1:底物溶液体积数(mL)
x:酶液稀释倍数20。
通过锥形瓶放大验证,157-2、157-5、157-16 3株突变菌株胞外酶活均有提升,如图4,发酵60h菌株157-5胞外酶活达到2042.8U/mL,提升31.9%;菌株157-2达1609.9U/mL,提升3.95%;菌株157-16达1573.4U/mL,提升1.59%。提质粒送测后发现菌株157-2为157位的精氨酸突变为色氨酸(R157W),菌株157-5为157位的精氨酸突变为苏氨酸(R157T),菌株157-16为157位的精氨酸突变为组氨酸(R157H),得到突变质粒p43NMK-R157T-Dac、p43NMK-R157W-Dac和p43NMK-R157H-Dac。
实施例4:几丁二糖脱乙酰酶的动力学参数的测定
(1)将实施例3中筛到的R157T、R157W、R157H 3株菌进行蛋白纯化
取60h发酵液50mL以8000rpm离心15min,取上清液于85℃条件下进行水浴加热,再以8000rpm离心15min,将上清液置于PB1缓冲液中进行过夜透析。将所得透析液利用0.45μm的滤膜进行过滤,过滤所得粗酶液通过阴离子交换柱(HiTrap Q HP柱),利用AKTA蛋白纯化仪进行纯化,具体纯化步骤如下:
a)利用5-10个柱体积的ddH2O清洗柱子,流速2mL/min。
b)利用5-10个柱体积的蛋白纯化A液平衡柱子,流速2mL/min。
c)将准备好的蛋白样品加入到蛋白纯化柱中,流速1mL/min。
d)待上完适量的蛋白样品后,利用蛋白纯化B液梯度洗脱,流速1mL/min。
e)将所获蛋白液置于PB1缓冲液进行过夜透析。
f)获得目标蛋白,4℃保存。
(2)在40℃反应温度下,以不同浓度的底物GlcNAc溶液(浓度范围:0.9-22.6mmol/L),进行动力学参数的Km和Vmax值的测定,根据下述公式,利用双倒数作图法进行作图,如图5,计算动力学参数,如表2。
Figure BDA0002936569630000071
式中:
V:反应速率(μM/s)
Km:米氏常数(mM)
[S]:底物浓度(mM)
Vmax:最大反应速率(μM/s)
表2
Figure BDA0002936569630000072
Figure BDA0002936569630000081
突变体R157T表现出最高的催化效率。突变体R157T的Km值从原始Dac的值6.75mM降低为5.15mM,Vmax值由原来的4.94μM/s提高到了7.56μM/s。
实施例5:RBS优化库的建立
借助工具在线网站RBS Calculator进行反向工程,预测实施例3中所述突变质粒p43NMK-R157T-Dac上已有的mRNA翻译强度,以提供的翻译速率作为参考,对数据区间上下游浮动进行正向工程设计,优化RBS翻译强度,以p43NMK-R157T-Dac为模板,设计简并引物,如表3,进行PCR扩增,如图6,进行大肠杆菌Escherichia coli DH5α转化,如图7,将全部大肠转化子制备混合菌液并提质粒后,转入表达宿主枯草芽孢杆菌Bacillus subtilisWB600。
表3
Figure BDA0002936569630000082
实施例6:RBS优化库的高通量筛选与放大验证
参照实施例3中所述的方法,获得枯草芽孢杆菌重组菌株(p43NMK-R2-R157T-Dac),胞外酶活达3769.5U/mL,较原始菌株提升了1.43倍,较实施例3中获得的菌株,胞外酶活提升了84.53%,如图8,其中R1~R5的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.5~9所示。
以上仅是本发明的优选实施方式,并不用于限制本发明,应当指出,对于本技术领域的普通技术人员来说,在不脱离本发明技术原理的前提下,还可以做出若干改进和变型,这些改进和变型也应视为本发明的保护范围。
序列表
<110> 山东润德生物科技有限公司,江南大学
<120> 高效分泌表达几丁二糖脱乙酰酶的枯草芽孢杆菌及其应用
<160> 21
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 272
<212> PRT
<213> (人工序列)
<400> 1
Met Val Val Asn Met Phe Glu Asp Ile Asp Thr Phe Glu Glu Ala Phe
1 5 10 15
Asn Lys Leu Leu Arg Glu Val Leu Glu Phe Asp Leu Gln Asn Pro Phe
20 25 30
Lys Asp Ala Lys Lys Val Leu Cys Ile Glu Pro His Pro Asp Asp Cys
35 40 45
Val Ile Gly Met Gly Gly Thr Ile Lys Lys Leu Ser Asp Met Gly Val
50 55 60
Glu Val Ile Tyr Val Cys Met Thr Asp Gly Tyr Met Gly Thr Thr Asp
65 70 75 80
Glu Ser Leu Ser Gly His Glu Leu Ala Ala Ile Arg Arg Lys Glu Glu
85 90 95
Glu Glu Ser Ala Arg Leu Leu Gly Val Lys Lys Ile Tyr Trp Leu Asn
100 105 110
Tyr Arg Asp Thr Glu Leu Pro Tyr Ser Arg Glu Val Arg Lys Asp Leu
115 120 125
Thr Lys Ile Leu Arg Lys Glu Gln Pro Asp Gly Val Phe Ala Pro Asp
130 135 140
Pro Trp Leu Pro Tyr Glu Ser His Pro Asp His Arg Arg Thr Gly Phe
145 150 155 160
Leu Ala Ile Glu Ser Val Ala Phe Ser Gln Leu Pro Asn Phe Ser Asn
165 170 175
Thr Asp Leu Asp Ile Gly Leu Asn Pro Tyr Asn Ser Gly Ser Phe Ile
180 185 190
Ala Leu Tyr Tyr Thr His Lys Pro Asn Tyr Ile Val Asp Ile Thr Asp
195 200 205
Leu Met Glu Leu Lys Leu Lys Ala Ile Arg Val His Arg Ser Gln Phe
210 215 220
Pro Asp Asp Ile Trp Glu Lys Trp Glu Pro Phe Leu Arg Thr Ile Ala
225 230 235 240
Met Phe Tyr Gly Glu Lys Ile Gly Val Arg Tyr Gly Glu Gly Phe Arg
245 250 255
Ile Met Pro Gly Leu Phe Tyr His Ile Thr Pro Phe Thr Asp Leu Ile
260 265 270
<210> 2
<211> 272
<212> PRT
<213> (人工序列)
<400> 2
Met Val Val Asn Met Phe Glu Asp Ile Asp Thr Phe Glu Glu Ala Phe
1 5 10 15
Asn Lys Leu Leu Arg Glu Val Leu Glu Phe Asp Leu Gln Asn Pro Phe
20 25 30
Lys Asp Ala Lys Lys Val Leu Cys Ile Glu Pro His Pro Asp Asp Cys
35 40 45
Val Ile Gly Met Gly Gly Thr Ile Lys Lys Leu Ser Asp Met Gly Val
50 55 60
Glu Val Ile Tyr Val Cys Met Thr Asp Gly Tyr Met Gly Thr Thr Asp
65 70 75 80
Glu Ser Leu Ser Gly His Glu Leu Ala Ala Ile Arg Arg Lys Glu Glu
85 90 95
Glu Glu Ser Ala Arg Leu Leu Gly Val Lys Lys Ile Tyr Trp Leu Asn
100 105 110
Tyr Arg Asp Thr Glu Leu Pro Tyr Ser Arg Glu Val Arg Lys Asp Leu
115 120 125
Thr Lys Ile Leu Arg Lys Glu Gln Pro Asp Gly Val Phe Ala Pro Asp
130 135 140
Pro Trp Leu Pro Tyr Glu Ser His Pro Asp His Arg Thr Thr Gly Phe
145 150 155 160
Leu Ala Ile Glu Ser Val Ala Phe Ser Gln Leu Pro Asn Phe Ser Asn
165 170 175
Thr Asp Leu Asp Ile Gly Leu Asn Pro Tyr Asn Ser Gly Ser Phe Ile
180 185 190
Ala Leu Tyr Tyr Thr His Lys Pro Asn Tyr Ile Val Asp Ile Thr Asp
195 200 205
Leu Met Glu Leu Lys Leu Lys Ala Ile Arg Val His Arg Ser Gln Phe
210 215 220
Pro Asp Asp Ile Trp Glu Lys Trp Glu Pro Phe Leu Arg Thr Ile Ala
225 230 235 240
Met Phe Tyr Gly Glu Lys Ile Gly Val Arg Tyr Gly Glu Gly Phe Arg
245 250 255
Ile Met Pro Gly Leu Phe Tyr His Ile Thr Pro Phe Thr Asp Leu Ile
260 265 270
<210> 3
<211> 126
<212> DNA
<213> (人工序列)
<400> 3
atggcgaaac cactatcaaa agggggaatt ttggtgaaaa aagtattgat tgcaggtgca 60
gtaggaacag cagttctttt cggaaccctt tcatcaggta taccaggttt acccgcggca 120
gacgct 126
<210> 4
<211> 73
<212> DNA
<213> (人工序列)
<400> 4
ggtaccatta taggtaagag aggaatgtac acatggtcgt caacatgttc gaggacatcg 60
acacgttcga gga 73
<210> 5
<211> 19
<212> DNA
<213> (人工序列)
<400> 5
ggaaaggagg aatagagac 19
<210> 6
<211> 19
<212> DNA
<213> (人工序列)
<400> 6
ggaagggagg aatagagac 19
<210> 7
<211> 19
<212> DNA
<213> (人工序列)
<400> 7
ggaaaggagg aattgagac 19
<210> 8
<211> 19
<212> DNA
<213> (人工序列)
<400> 8
ggaagggagg catagagac 19
<210> 9
<211> 19
<212> DNA
<213> (人工序列)
<400> 9
ggaaaggagg aacagagac 19
<210> 10
<211> 33
<212> DNA
<213> (人工序列)
<400> 10
tcacatccgg atcatnnkcg cacaggcttt ctg 33
<210> 11
<211> 33
<212> DNA
<213> (人工序列)
<400> 11
cagaaagcct gtgcgmnnat gatccggatg tga 33
<210> 12
<211> 32
<212> DNA
<213> (人工序列)
<400> 12
atccggatca tcgtnnkacc ggttttttag cc 32
<210> 13
<211> 32
<212> DNA
<213> (人工序列)
<400> 13
ggctaaaaaa ccggtmnnac gatgatccgg at 32
<210> 14
<211> 32
<212> DNA
<213> (人工序列)
<400> 14
catagacgca caggcnnkct ggcgattgaa tc 32
<210> 15
<211> 32
<212> DNA
<213> (人工序列)
<400> 15
gattcaatcg ccagmnngcc tgtgcgtcta tg 32
<210> 16
<211> 34
<212> DNA
<213> (人工序列)
<400> 16
gaattagcag caatcnnkcg caaagaagaa gaag 34
<210> 17
<211> 34
<212> DNA
<213> (人工序列)
<400> 17
cttcttcttc tttgcgmnng attgctgcta attc 34
<210> 18
<211> 33
<212> DNA
<213> (人工序列)
<400> 18
cttccgtacg aatcannkcc ggatcataga cgc 33
<210> 19
<211> 33
<212> DNA
<213> (人工序列)
<400> 19
gcgtctatga tccggmnntg attcgtacgg aag 33
<210> 20
<211> 49
<212> DNA
<213> (人工序列)
<400> 20
aabsgaggaa twrabacatg aaaaaaatca caacaaacga acaatttaa 49
<210> 21
<211> 45
<212> DNA
<213> (人工序列)
<400> 21
catgtvtywa ttcctcsvtt bcctataatg gtacctcctc gaacg 45

Claims (10)

1.一种几丁二糖脱乙酰酶,其特征在于,其氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示。
2.一种编码权利要求1所述的几丁二糖脱乙酰酶的基因。
3.一种包括权利要求2所述的基因的表达载体。
4.一种高效分泌表达权利要求1所述的几丁二糖脱乙酰酶的枯草芽孢杆菌,其特征在于,所述的枯草芽孢杆菌以p43NMK为载体,融合表达了氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示的几丁二糖脱乙酰酶与核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示的yncM信号肽,并在几丁二糖脱乙酰酶基因的5’非翻译区引入SEQ ID NO.4所示的DNA片段,引入位点位于启动子P43的+1转录起始位点后的8个碱基之后。
5.根据权利要求4所述的枯草芽孢杆菌,其特征在于,所述的枯草芽孢杆菌还包括采用核苷酸序列如SEQ ID NO.5或SEQ ID NO.6所示的RBS序列调控几丁二糖脱乙酰酶的表达。
6.根据权利要求4所述的枯草芽孢杆菌,其特征在于,所述的枯草芽孢杆菌的宿主为B.subtilis WB600。
7.权利要求4~6任一项所述的枯草芽孢杆菌在提高氨基葡萄糖产量中的应用,其特征在于,以所述的枯草芽孢杆菌发酵上清液作为催化剂,以N-乙酰氨基葡糖为底物,在35~45℃催化底物,得到氨基葡萄糖。
8.根据权利要求7所述的应用,其特征在于,所述的枯草芽孢杆菌发酵上清液是通过将枯草芽孢杆菌种子液按照3~5%接种量接种至发酵培养基中,在35~38℃培养50~70h,经10000~15000rpm离心1~3min得到。
9.根据权利要求8所述的应用,其特征在于,所述的发酵培养基成分包括:蛋白胨10~15g/L、酵母提取物20~30g/L、甘油3~5mL,KH2PO4 2~2.5g/L和K2HPO4 12~13g/L。
10.根据权利要求7所述的应用,其特征在于,N-乙酰氨基葡萄糖的添加量为80~120g/L。
CN202110160901.7A 2021-02-05 2021-02-05 高效分泌表达几丁二糖脱乙酰酶的枯草芽孢杆菌及其应用 Active CN112961850B (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN202110160901.7A CN112961850B (zh) 2021-02-05 2021-02-05 高效分泌表达几丁二糖脱乙酰酶的枯草芽孢杆菌及其应用

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN202110160901.7A CN112961850B (zh) 2021-02-05 2021-02-05 高效分泌表达几丁二糖脱乙酰酶的枯草芽孢杆菌及其应用

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CN112961850A true CN112961850A (zh) 2021-06-15
CN112961850B CN112961850B (zh) 2022-11-18

Family

ID=76274383

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN202110160901.7A Active CN112961850B (zh) 2021-02-05 2021-02-05 高效分泌表达几丁二糖脱乙酰酶的枯草芽孢杆菌及其应用

Country Status (1)

Country Link
CN (1) CN112961850B (zh)

Cited By (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN113528495A (zh) * 2021-07-05 2021-10-22 江南大学 一种稳定表达几丁二糖脱乙酰酶的枯草芽孢杆菌及其构建方法与应用
CN114591881A (zh) * 2022-03-17 2022-06-07 山东润德生物科技有限公司 一种分泌几丁二糖脱乙酰酶的枯草芽孢杆菌及其应用

Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN109777761A (zh) * 2019-03-14 2019-05-21 江南大学 一种分泌表达几丁二糖脱乙酰酶的工程菌构建及其应用
CN111662857A (zh) * 2020-06-12 2020-09-15 江南大学 人工甲基营养型枯草芽孢杆菌及其构建方法

Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN109777761A (zh) * 2019-03-14 2019-05-21 江南大学 一种分泌表达几丁二糖脱乙酰酶的工程菌构建及其应用
CN111662857A (zh) * 2020-06-12 2020-09-15 江南大学 人工甲基营养型枯草芽孢杆菌及其构建方法

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
姜竹: "几丁二糖脱乙酰酶的克隆表达与生物转化合成氨基葡萄糖的研究", 《中国优秀博硕士学位论文全文数据库(硕士) 基础科学辑》 *

Cited By (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN113528495A (zh) * 2021-07-05 2021-10-22 江南大学 一种稳定表达几丁二糖脱乙酰酶的枯草芽孢杆菌及其构建方法与应用
CN114591881A (zh) * 2022-03-17 2022-06-07 山东润德生物科技有限公司 一种分泌几丁二糖脱乙酰酶的枯草芽孢杆菌及其应用
CN114591881B (zh) * 2022-03-17 2023-07-21 山东润德生物科技有限公司 一种分泌几丁二糖脱乙酰酶的枯草芽孢杆菌及其应用

Also Published As

Publication number Publication date
CN112961850B (zh) 2022-11-18

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN106755209A (zh) 一种酶法制备β‑烟酰胺单核苷酸的方法
CN112961850B (zh) 高效分泌表达几丁二糖脱乙酰酶的枯草芽孢杆菌及其应用
CN107937365B (zh) 一种β-半乳糖苷酶的突变体及其制备方法和应用
CN107739734A (zh) 一种酶活提高的谷氨酰胺转氨酶突变体
CN111172127A (zh) 一种蔗糖磷酸化酶在制备甘油葡萄糖苷中的应用
CN112877307B (zh) 一种氨基酸脱氢酶突变体及其应用
CN112725319B (zh) polyG底物特异性的褐藻胶裂解酶FaAly7及其应用
CN111690624A (zh) 一种利用微生物合成2-O-α-D-甘油葡糖苷的方法
CN110938580A (zh) 一种提高d-酪氨酸生产效率的方法
CN113337495B (zh) 一种提高唾液酸产量的方法与应用
CN114107341B (zh) 真菌来源的α-L-鼠李糖苷酶在生产淫羊藿苷中的应用
CN114410605B (zh) 一种利用角质酶突变体促进重组蛋白胞外表达的方法
CN113151135A (zh) 一种食品安全级枯草芽孢杆菌及其在生产几丁二糖脱乙酰酶中的应用
CN113106112A (zh) 一种异源表达黄原胶内切酶的基因工程菌及应用
CN111394410A (zh) 一种高催化活性神经氨酸合酶及应用
CN115896206A (zh) 一种d-甘露糖的合成方法
CN109652396A (zh) 一种类芽孢杆菌甲壳素酶及其制备方法和应用
CN109694892A (zh) 制备红景天苷的方法和试剂盒
CN110804602B (zh) 一种L-天冬氨酸β-脱羧酶突变体及其应用
CN113373135B (zh) 一种d-阿洛酮糖3-差向异构酶的突变体及其应用
CN110656054A (zh) 一种胞外分泌褐藻胶裂解酶的重组里氏木霉菌及其应用
CN113528495A (zh) 一种稳定表达几丁二糖脱乙酰酶的枯草芽孢杆菌及其构建方法与应用
CN109371003B (zh) 一种对胃蛋白酶抗性提高的β-葡萄糖苷酶
CN115011622A (zh) 一种d-阿洛酮糖3-差向异构酶突变体的筛选方法及其应用
CN114107270B (zh) 一种L-天冬氨酸β-脱羧酶突变体

Legal Events

Date Code Title Description
PB01 Publication
PB01 Publication
SE01 Entry into force of request for substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
GR01 Patent grant
GR01 Patent grant