CN112533945A - 优化的结合gp41的分子及其用途 - Google Patents

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Abstract

本发明涉及具有降低的免疫原性的优化的结合HIV‑1 gp41的分子。更具体地,本发明涉及包括结合gp41的可变轻链(VL)结构域和/或结合gp41的可变重链(VH)结构域的优化的结合gp41的分子,其已经被优化以在施用至接受受试者时降低这种结构域的免疫原性。本发明特别涉及为多特异性结合gp41的分子(包括双特异性双抗体(包括
Figure DDA0002902883610000011
双抗体)、
Figure DDA0002902883610000012
双特异性抗体、三价结合分子(包括TRIDENTTM分子)等)的结合gp41的分子,其包括:(i)这种优化的结合gp41的可变结构域和(ii)能够结合存在于效应细胞的表面上的分子的表位的结构域。本发明还涉及包括任何这种结合gp41的分子的药物组合物,和涉及任何这种结合gp41的分子在治疗HIV‑1感染中的用途的方法。

Description

优化的结合gp41的分子及其用途
相关申请的交叉引用
本申请要求美国专利申请系列号62/673,462(于2019年5月18日提交;未决的)的优先权,该申请通过引用以其整体并入本文。
序列表的引用
按照37 C.F.R.1.821以及下面条款,本申请包括一个或多个序列表,其以计算机可读介质(文件名:1301_0155PCT_ST25.txt,创建于2019年5月11日,并且大小为158,835个字节)公开,该文件以其整体并入本文。
技术领域
本发明涉及具有降低的免疫原性的优化的结合HIV-1gp41的分子。更具体地,本发明涉及包括结合gp41的可变轻链(VL)结构域和/或结合gp41的可变重链(VH)结构域的优化的结合gp41的分子,其已经被优化以在施用至接受受试者时降低这种结构域的免疫原性。本发明特别地涉及作为多特异性的结合gp41的分子(包括双特异性双抗体(包括
Figure BDA0002902883590000011
双抗体)、
Figure BDA0002902883590000012
双特异性抗体、三价结合分子(包括TRIDENTTM分子)等)的结合gp41的分子,其包括:(i)这种优化的结合gp41的可变结构域和(ii)能够结合存在于效应细胞的表面上的分子的表位的结构域。本发明还涉及包括任何这种结合gp41的分子的药物组合物,以及涉及任何这种结合gp41的分子在治疗HIV-1感染中的用途的方法。
背景技术
高活性抗逆转录病毒疗法(HAART)已经有效减轻病毒载荷和改善感染的个体中HIV 1型(HIV-1)感染的效果。然而,HAART不能根除HIV-1感染,并且其不能加速感染细胞的消除。在感染的个体中,作为静息的记忆CD4+T细胞中整合的原病毒,HIV-1以潜伏的状态持续,使HAART无法容易接近。因此,尽管施用这种疗法,但是HIV-1病毒持续在已经逃避治疗的HIV-1感染的细胞潜伏库内的个体中。CD8+T细胞具有有限的能力以消除这种潜伏的感染的细胞中的HIV-1。
因此,需要用于治疗HIV-1感染的个体的治疗剂,特别是这样的试剂,其靶向病毒感染的细胞并且具有减少HIV-1感染的细胞的潜伏库的潜力,以及适于重复施用。
HIV-1病毒的包膜糖蛋白(“Env”)对于病毒感染性(经其结合CD4受体的能力)和用于驱动膜融合是至关重要的。HIV-1Env基因产物由两个亚单位gp120和gp41的三聚复合物组成。合成Env蛋白质作为糖基化gp160前体蛋白质,其被折叠成三聚体并且蛋白水解地切割以产生成熟的gp120和gp41蛋白质。切割的Env与其他病毒组分一起装配,用于病毒粒子从细胞表面出芽并且存在于感染的细胞的表面上(Miranda,L.,等,2002“Cell SurfaceExpression Of The HIV-1Envelope Glycoproteins Is Directed From IntracellularCTLA-4-Containing Regulated Secretory Granules.”Proc Natl Acad Sci U S A.99(12):8031-8036)。因此,HIV Env,和特别是其gp41亚单位,为经抗体介导的细胞杀伤用于治疗性消除持续的HIV感染库的高度特异性病毒靶(Sloane,D.,等,2015,“Targeting HIVReservoir in Infected CD4 T Cells by Dual-Affinity Re-targeting Molecules(DARTs)that Bind HIV Envelope and Recruit Cytotoxic T Cells”PLOS Pathogens|DOI:10.1371/journal.ppat.1005233。
然而,尽管所有先前的进展,但是仍需要具有增强的抗HIV活性和/或降低的免疫原性的优化的结合gp41的分子。本发明满足了这种需求以及对于用于HIV-1治疗和预防的改善的疗法的需求。
发明内容
本发明涉及具有降低的免疫原性的优化的结合HIV-1gp41的分子。更具体地,本发明涉及包括结合gp41的可变轻链(VL)结构域和/或结合gp41的可变重链(VH)结构域的优化的结合gp41的分子,其已经被优化以在施用至接受受试者时降低这种结构域的免疫原性。本发明特别地涉及作为多特异性结合gp41的分子(包括双特异性双抗体(包括
Figure BDA0002902883590000021
双抗体)、
Figure BDA0002902883590000022
双特异性抗体、三价结合分子(包括TRIDENTTM分子)等)的结合gp41的分子,其包括:(i)这种优化的结合gp41的可变结构域和(ii)能够结合存在于效应细胞的表面上的分子的表位的结构域。本发明还涉及包括任何这种结合gp41的分子的药物组合物,和涉及任何这种结合gp41的分子在治疗HIV-1感染中的用途的方法。
详细地,本发明提供了结合gp41的分子,其包括可变轻链(VL)结构域和可变重链(VH)结构域,其中VL结构域包括SEQ ID NO:57的氨基酸序列和/或VH结构域包括SEQ IDNO:58的氨基酸序列。
本发明进一步涉及以上指示的结合gp41的分子的实施方式,其中结合gp41的分子包括:
(a)包括SEQ ID NO:57的氨基酸序列的VL结构域;和
(b)包括SEQ ID NO:58的氨基酸序列的VH结构域。
本发明进一步涉及以上指示的结合gp41的分子的实施方式,其中分子为抗体或包括其结合gp41表位的部分。
本发明进一步涉及以上指示的结合gp41的分子的实施方式,其中分子为:
(a)双特异性抗体;或
(b)双抗体,双抗体为包括两条、三条、四条或五条多肽链的共价结合的复合物;或
(c)三价结合分子,三价结合分子为包括三条、四条、五条或大于五条多肽链的共价结合的复合物。
本发明进一步涉及以上指示的结合gp41的分子的实施方式,其中分子为双抗体并且包括结合白蛋白的结构域(ABD)。
本发明进一步涉及以上指示的结合gp41的分子的实施方式,其中分子包括Fc区。本发明进一步涉及这种结合gp41的分子的实施方式,其中Fc区为变体Fc区,其包括:
(a)降低变体Fc区对FcγR的亲和性的一个或多个氨基酸修饰;和/或
(b)增强变体Fc区的血清半衰期的一个或多个氨基酸修饰。
本发明进一步涉及这种结合gp41的分子的实施方式,其中降低变体Fc区对FcγR的亲和性的修饰包括L234A;L235A;或L234A和L235A的替换,其中编号为如Kabat中的EU索引的编号。
本发明进一步涉及这种结合gp41的分子的实施方式,其中增强变体Fc区的血清半衰期的修饰包括M252Y;M252Y和S254T;M252Y和T256E;M252Y、S254T和T256E;或K288D和H435K的替换,其中编号为如Kabat中的EU索引的编号。
本发明进一步涉及以上指示的结合gp41的分子的实施方式,其中分子为双特异性的并且包括能够免疫特异性结合gp41的表位的一个结合表位的位点和能够免疫特异性结合存在于效应细胞的表面上的分子的表位的一个结合表位的位点。
本发明进一步涉及以上指示的结合gp41的分子的实施方式,其中分子为双特异性的并且包括能够免疫特异性结合gp41的表位的两个结合表位的位点和能够免疫特异性结合存在于效应细胞的表面上的分子的表位的两个结合表位的位点。
本发明进一步涉及以上指示的结合gp41的分子的实施方式,其中分子为三特异性的并且包括:
(a)能够免疫特异性结合gp41的表位的一个结合表位的位点;
(b)能够免疫特异性结合存在于效应细胞的表面上的第一分子的表位的一个结合表位的位点;和
(c)能够免疫特异性结合存在于效应细胞的表面上的第二分子的表位的一个结合表位的位点。
本发明进一步涉及这种结合gp41的分子的实施方式,其中存在于效应细胞的表面上的第一分子为CD3并且存在于效应细胞的表面上的第二分子为CD8。
本发明进一步涉及以上指示的结合gp41的分子的实施方式,其中分子为三特异性的并且包括:
(a)能够免疫特异性结合gp41的第一表位的一个结合表位的位点;
(b)能够免疫特异性结合gp41的第二表位或不同的HIV-1蛋白质的表位的一个结合表位的位点;和
(c)能够免疫特异性结合存在于效应细胞的表面上的分子的表位的一个结合表位的位点;
其中gp41的第一表位和第二表位为不同的。
本发明进一步涉及以上指示的结合gp41的分子的实施方式,其中分子能够同时结合gp41和存在于效应细胞的表面上的分子。本发明进一步涉及这种结合gp41的分子的实施方式,其中存在于效应细胞的表面上的分子为CD2、CD3、CD8、CD16、TCR、NKp46或NKG2D。
本发明进一步涉及以上指示的结合gp41的分子的实施方式,其中效应细胞为细胞毒性T细胞或天然杀伤(NK)细胞。
本发明进一步涉及以上指示的结合gp41的分子的实施方式,其中分子介导表达gp41的细胞和细胞毒性T细胞的协调的结合。
本发明进一步涉及这种结合gp41的分子的实施方式,其中分子包括第一多肽链、第二多肽链和第三多肽链,并且其中:
I)(a)第一多肽链包括SEQ ID NO:113;
b)第二多肽链包括SEQ ID NO:114;并且
(c)第三多肽链包括SEQ ID NO:112;
II)(a)第一多肽链包括SEQ ID NO:115;
(b)第二多肽链包括SEQ ID NO:116;并且
(c)第三多肽链包括SEQ ID NO:112。
本发明进一步涉及这种结合gp41的分子的实施方式,其中分子包括第一多肽链、第二多肽链、第三多肽链和第四多肽链并且其中:
(a)第一多肽链包括SEQ ID NO:113;
(b)第二多肽链包括SEQ ID NO:114;
(c)第三多肽链包括SEQ ID NO:117;并且
(d)第四多肽链包括SEQ ID NO:118。
本发明进一步涉及这种结合gp41的分子的实施方式,其中分子包括第一多肽链、第二多肽链、第三多肽链和第四多肽链并且其中:
I)(a)第一多肽链包括SEQ ID NO:113;
(b)第二多肽链包括SEQ ID NO:114;
(c)第三多肽链包括SEQ ID NO:119;并且
(d)第四多肽链包括SEQ ID NO:120;
II)(a)第一多肽链包括SEQ ID NO:115;
(b)第二多肽链包括SEQ ID NO:116;
(c)第三多肽链包括SEQ ID NO:119;并且
(d)第四多肽链包括SEQ ID NO:120。
本发明进一步涉及药物组合物,其包括有效量的权利要求1-22中任一项的结合gp41的分子和药学上可接受的载体。
本发明进一步涉及在需要其的受试者中治疗或预防HIV-1感染的方法,其包括向受试者施用治疗有效量的包括以上指示的结合gp41的分子的任一项的组合物或以上指示的药物组合物。
本发明进一步涉及治疗或预防HIV-1感染的这种方法的实施方式,其进一步包括施用潜伏期激活剂(比如伏立诺他、罗米地辛、帕比司他、双硫仑、JQ1、苔藓抑素、PMA、伊诺霉素或其任何组合)。
附图简述
图1A-1B提供了具有由两条多肽链组成的两个表位结合结构域的代表性共价结合的双抗体示意图,每条多肽链具有E-螺旋或K-螺旋异源二聚体促进结构域(下面提供交替的异源二聚体促进结构域)。半胱氨酸残基可存在于连接体中(图1A)和/或存在于异源二聚体促进结构域中(图1B)。识别相同表位的VL结构域和VH结构域使用相同的阴影或填充图案显示。在这个图中以及在提供结合分子结构域的示意性呈现的所有图中的波浪线(WWW)代表一个或多个任选的异源二聚体促进结构域,其是优选地存在的。
图2提供了具有由两条多肽链组成的两个表位结合结构域的代表性共价结合的双抗体分子的示意图,每条多肽链具有CH2结构域和CH3结构域,使得缔合的链形成Fc区的全部或部分。识别相同表位的VL结构域和VH结构域使用相同的阴影或填充图案显示。
图3A-图3C提供了显示具有由两对多肽链(即,总共四条多肽链)组成的四个表位结合结构域的代表性共价结合的四价双抗体的示意图。每一对中的一条多肽链具备CH2结构域和CH3结构域,使得缔合的链形成Fc区的全部或部分。识别相同表位的VL结构域和VH结构域使用相同的阴影或填充图案显示。两对多肽链可为相同的。在这种实施方式中,其中两对多肽链为相同的并且VL结构域和VH结构域识别不同的表位(如图3A-图3B中显示),所得分子具备四个表位结合结构域并且就每个结合的表位而言为双特异性的和二价的。在这种实施方式中,其中VL结构域和VH结构域识别相同的表位(例如,在两条链上使用相同的VL结构域CDR和相同的VH结构域CDR),所得分子具备四个表位结合结构域并且就单个表位而言为单特异性的和四价的。可选地,两对多肽可为不同的。在这种实施方式中,其中两对多肽链为不同的并且每对多肽的VL结构域和VH结构域识别不同的表位(如图3C中通过不同的阴影和图案显示),所得分子具备四个表位结合结构域并且就每个结合表位而言为四特异性的和单价的。图3A显示了含有Fc区的双抗体,其含有包括半胱氨酸残基的肽异源二聚体促进结构域。图3B显示了含有Fc区的双抗体,其含有包括半胱氨酸残基的E-螺旋和K-螺旋异源二聚体促进结构域和连接体(具有任选的半胱氨酸残基)。图3C显示了含有Fc区的双抗体,其含有抗体CH1结构域和CL结构域。如下面提供的,通过多肽链的缔合形成的VL/VH结合位点可为相同的或不同的,以便允许作为单特异性、双特异性、三特异性或四特异性的四价结合。
图4A-图4B提供了具有由三条多肽链组成的两个表位结合结构域的代表性共价结合的双抗体分子的示意图。多肽链中的两条具备CH2结构域和CH3结构域,使得缔合的链形成Fc区的全部或部分。包括VL结构域和VH结构域的多肽链进一步包括异源二聚体促进结构域。识别相同表位的VL结构域和VH结构域使用相同的阴影或填充图案显示。
图5提供了具有由五条多肽链组成的四个表位结合结构域的代表性共价结合的结合分子的示意图。多肽链中的两条具备CH2结构域和CH3结构域,使得缔合的链形成包括Fc区的全部或部分的Fc区。包括连接的VL结构域和VH结构域的多肽链进一步包括异源二聚体促进结构域。识别相同表位的VL结构域和VH结构域使用相同的阴影或填充图案显示。如下面提供的,通过多肽链的缔合形成的VL/VH结合位点可为相同的或不同的,以便允许四价结合为单特异性、双特异性、三特异性或四特异性。
图6A-图6F提供了具有三个表位结合结构域的代表性含有Fc区的三价结合分子的示意图。图6A示意性阐释了包括具有不同结构域定向的两个双抗体型结合结构域和Fab型结合结构域的三价结合分子的结构域,其中双抗体型结合结构域为N-末端至Fc区。图6B示意性阐释了包括具有不同结构域定向的两个双抗体型结合结构域和Fab型结合结构域的三价结合分子的结构域,其中双抗体型结合结构域为Fc区的C-末端。图6A-图6B中的分子包括四条链。图6C和图6D分别示意性阐释了包括N-末端至Fc区的两个双抗体型结合结构域和其中轻链和重链经多肽间隔子连接的Fab型结合结构域或scFv型结合结构域的三价结合分子的结构域。图6E和图6F中的三价结合分子分别示意性阐释了包括C-末端至Fc区的两个双抗体型结合结构域和其中轻链和重链经多肽间隔子连接的Fab型结合结构域或scFv型结合结构域的三价结合分子的结构域。图6C-图6F中的三价结合分子包括三条链。识别相同表位的VL结构域和VH结构域使用相同的阴影或填充图案显示。
图7A-图7B显示了7B2、种系化7B2(7B2GL)和指示的人种系的氨基酸序列的比对。与7B2的差异被加了阴影,指出了框架(FW)区和CDR区并且提供了Kabat编号。VL结构域在图7A中呈现并且VL结构域在图7B中呈现。
图8A-图8B显示了如通过Attana Cell A200 QCM测量的,结合固定的7B2 IgG(图8A)和7B2GL IgG(图8B)的重组体HIV-1 JRFL gp140(100,50,25nM)的传感图。
图9显示了DART-A(包括优化的以使免疫原性最小化的7B2GL VL结构域和VH结构域)和DART-1(包括亲本7B2 VL结构域和VH结构域)结合表达gp140的HEK 293/D371细胞的表面的能力。
图10显示了如在Jurkat T细胞报告测试中测量的,DART-A(包括优化的以使免疫原性最小化的7BGL VL结构域和VH结构域)和DART-1(包括亲本7B2VL结构域和VH结构域)激活T细胞的能力。
图11显示了在CTL测试中,DART-A(包括优化的以使免疫原性最小化的7BGL VL结构域和VH结构域)和DART-1(包括亲本7B2 VL结构域和VH结构域)介导表达HIV gp41的靶细胞的T细胞重定向杀伤的能力。
具体实施方式
本发明涉及具有降低的免疫原性的优化的结合HIV-1gp41的分子。更具体地,本发明涉及包括已经被优化的结合gp41的可变轻链(VL)结构域和/或结合gp41的可变重链(VH)结构域的优化的结合gp41的分子,以在施用至接受受试者时降低这种结构域的免疫原性。本发明特别地涉及为多特异性结合gp41的分子(包括双特异性双抗体(包括
Figure BDA0002902883590000081
双抗体)、
Figure BDA0002902883590000082
双特异性抗体、三价结合分子(包括TRIDENTTM分子)等)的结合gp41的分子,其包括:(i)这种优化的结合gp41的可变结构域和(ii)能够结合存在于效应细胞的表面上的分子的表位的结构域。本发明还涉及包括任何这种结合gp41的分子的药物组合物,以及涉及任何这种结合gp41的分子在HIV-1感染的治疗中的用途的方法。
I.抗体和其他结合分子
A.抗体
本发明的结合gp41的分子可为抗体,或可为由结合gp41的抗体衍生的(例如,通过抗体多肽的片段化、切割等),或从抗体分子的一条或多条多肽链的氨基酸序列的使用获得的,或通过编码这种多肽的多核苷酸表达的,或从这种多核苷酸的核苷酸序列获得的。
抗体为能够特异性结合分子,比如碳水化合物、多核苷酸、脂质、多肽等的特定结构域或部分(moiety)或构造(“表位”)的免疫球蛋白分子。含表位的分子可具有免疫原性活性,使得其引起动物中的抗体产生应答;这种分子被称为“抗原”。如本文使用的,术语“抗体(antibody)”和“抗体(antibodies)”指单克隆抗体、多特异性抗体、人抗体、人源化抗体、合成抗体、嵌合抗体、多克隆抗体、骆驼源化抗体(camelized antibody)、单链Fvs(scFv)、单链抗体、Fab部分、F(ab')部分、二硫键连接的双特异性Fv(sdFv)、胞内抗体(intrabodies)和任何上述表位结合结构域。这种免疫球蛋白分子可为任何类型(例如,IgG、IgE、IgM、IgD、IgA和IgY);类别(例如,IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1和IgA2)或亚类;或种类(牛、马、猫、犬、啮齿动物、灵长类(例如,包括猴子比如,食蟹猴、人等))。
术语“单克隆抗体”指同源性抗体群,其中单克隆抗体包括涉及抗原的选择性结合的氨基酸(天然存在的或非天然存在的)。单克隆抗体为高度特异性,针对单个表位(或抗原位点)。术语“单克隆抗体”不仅仅涵盖完整的单克隆抗体和全长单克隆抗体,而且也涵盖其部分(比如Fab、Fab'、F(ab')2、(Fv)、单链(scFv)、其突变体、包括抗体部分的融合蛋白、人源化单克隆抗体、嵌合单克隆抗体和包括结合抗原所需特异性和能力的抗原识别位点的免疫球蛋白分子的任何其他修饰构型。就抗体的来源或其制备的方式(例如,通过杂交瘤、噬菌体选择、重组表达、转基因动物等)而言,不旨在是限制性的。术语包括完整的免疫球蛋白以及上面根据“抗体”的定义描述的部分等。
制备单克隆抗体的方法是本领域已知的。可采用的一种方法是Kohler,G.等(1975)“Continuous Cultures Of Fused Cells Secreting Antibody Of PredefinedSpecificity,”Nature 256:495-497的方法或其修饰。典型地,单克隆抗体在小鼠、大鼠或兔子中开发。通过用免疫原性量的细胞、细胞提取物或包含期望表位的蛋白质制品免疫动物而产生抗体。免疫原可为但不限于原代细胞、培养细胞系、癌细胞、蛋白质、肽、核酸或组织。在其用作免疫原之前,用于免疫的细胞可被培养一段时间(例如,至少24小时)。细胞它们本身或联合非变性佐剂(比如Ribi)可用作免疫原(见,例如,Jennings,V.M.(1995)“Review of Selected Adjuvants Used in Antibody Production,”ILAR J.37(3):119-125)。一般而言,在用作免疫原时,细胞应保持完整并且优选地是活的。相比于破裂的细胞,完整的细胞可允许抗原被免疫的动物更好地检测到。变性佐剂或烈性佐剂(harshadjuvants),例如,弗氏佐剂的使用,可使细胞破裂并且因此受阻。以周期性间隔免疫原可被施用多次,比如两周一次或一周一次,或可以以在动物中(例如,在组织重组体中)维持生存力的这种方式被施用。可选地,对于期望的致病表位是免疫特异性的现有单克隆抗体和任何其他等效抗体可被测序,并通过本领域中已知的任何手段重组产生。在一个实施方式中,对这种抗体测序,然后将多核苷酸序列克隆到载体中用于表达或增殖。编码感兴趣的抗体的序列可在宿主细胞内保持在载体中,然后可扩增和冷冻宿主细胞,用于将来的使用。这种抗体的多核苷酸序列可用于基因操作,以产生本发明的单特异性或多特异性(例如,双特异性、三特异性和四特异性)分子以及亲和力优化的嵌合抗体、人源化抗体和/或犬源化(caninized)抗体,以改善抗体的亲和力或其他特征,如下所详述。
本发明的抗体和结合分子以“免疫特异性”方式经它们的结合结构域结合表位。如本文所用,如果分子相对于可选的表位与该表位更频繁、更迅速、以更长的持续时间和/或以与该表位更大的亲和力结合或缔合,则认为该分子以免疫特异性的方式(或“免疫特异性地”)结合另一分子的该表位。例如,免疫特异性结合病毒表位的抗体是相比于其免疫特异性结合其他病毒表位或非病毒表位以更大的亲和力、亲合性、更容易地和/或以更长的持续时间结合该病毒表位的抗体。通过阅读该定义也应理解,例如,免疫特异性结合第一靶的抗体(或部分或表位)可特异性地或优先地结合第二靶标或可不特异性地或不优先地结合第二靶标。正因如此,“免疫特异性结合”并不一定要求(尽管其可包括)排他性结合。一般地,但不一定,提及结合意味着“免疫特异性”结合。天然抗体仅能够结合一种表位种类(即,它们为“单特异性的”),尽管它们可免疫特异性结合该种类的多个拷贝(即,展示出“二价”或“多价”)。如果这种结合展示出受体结合它们各自配体的特异性,则两个分子视为能够以“生理特异性的”方式彼此结合。
过去几十年已经看出对抗体的治疗潜力的关注的复苏,并且抗体已经变成生物技术衍生的药物的主导类别之一(Chan,C.E.等(2009)“The Use Of Antibodies In TheTreatment Of Infectious Diseases,”Singapore Med.J.50(7):663-666)。超过200种基于抗体的药物已经被批准使用或在开发中。
1.抗体的一般结构属性
天然存在的免疫球蛋白(例如,IgG)的基本结构单元是由两条较短“轻链”与两条较长的“重链”复合组成的四聚物,并且通常表达为约150,000Da的糖蛋白。每条链由包含“可变结构域”的氨基末端(“N-末端”)部分和包含至少一个“恒定结构域”的羧基末端(“C-末端”)部分组成。IgG轻链由单个“轻链可变结构域”(“VL”)和单个“轻链恒定结构域”(“CL”)组成。因此,IgG分子的轻链的结构是n-VL-CL-c(其中n和c分别代表多肽的N-末端和C-末端)。IgG重链由单个“重链可变结构域”(“VH”)、三个“重链恒定结构域”(“CH1”、“CH2”和“CH3”)和位于CH1和CH2结构域之间的“铰链”区(“H”)组成。因此,IgG重链的结构是n-VH-CH1-H-CH2-CH3-c(其中n和c分别代表多肽的N-末端和C-末端)。完整的、未修饰的抗体(例如,IgG抗体)结合抗原表位的能力取决于可变结构域的存在和序列。除非特别地说明,否则本文所述的蛋白质分子的结构域的顺序为“N-末端至C-末端”方向。
(a)恒定结构域
(i)轻链恒定结构域
优选的CL结构域为人IgG CLκ结构域。示例性人CLκ结构域的氨基酸序列为(SEQID NO:1):
RTVAAPSVFI FPPSDEQLKS GTASVVCLLN NFYPREAKVQ WKVDNALQSG NSQESVTEQDSKDSTYSLSS TLTLSKADYE KHKVYACEVT HQGLSSPVTK SFNRGEC
可选地,示例性CL结构域为人IgG CLλ结构域。示例性人CLλ结构域的氨基酸序列为(SEQ ID NO:2):
QPKAAPSVTL FPPSSEELQA NKATLVCLIS DFYPGAVTVA WKADSSPVKA GVETTPSKQSNNKYAASSYL SLTPEQWKSH RSYSCQVTHE GSTVEKTVAP TECS
(ii)重链CH1结构域
抗体的两条重链的CH1结构域与抗体的轻链的“CL”恒定区复合,并且经间插铰链结构域附接至重链的CH2结构域。
示例性CH1结构域为人IgG1 CH1结构域。示例性人IgG1 CH1结构域的氨基酸序列为(SEQ ID NO:3):
ASTKGPSVFP LAPSSKSTSG GTAALGCLVK DYFPEPVTVS WNSGALTSGV HTFPAVLQSSGLYSLSSVVT VPSSSLGTQT YICNVNHKPS NTKVDKRV
示例性CH1结构域为人IgG2 CH1结构域。示例性人IgG2 CH1结构域的氨基酸序列为(SEQ ID NO:4):
ASTKGPSVFP LAPCSRSTSE STAALGCLVK DYFPEPVTVS WNSGALTSGV HTFPAVLQSSGLYSLSSVVT VPSSNFGTQT YTCNVDHKPS NTKVDKTV
示例性CH1结构域为人IgG3 CH1结构域。示例性人IgG3 CH1结构域的氨基酸序列为(SEQ ID NO:5):
ASTKGPSVFP LAPCSRSTSG GTAALGCLVK DYFPEPVTVS WNSGALTSGV HTFPAVLQSSGLYSLSSVVT VPSSSLGTQT YTCNVNHKPS NTKVDKRV
示例性CH1结构域为人IgG4 CH1结构域。示例性人IgG4 CH1结构域的氨基酸序列为(SEQ ID NO:6):
ASTKGPSVFP LAPCSRSTSE STAALGCLVK DYFPEPVTVS WNSGALTSGV HTFPAVLQSSGLYSLSSVVT VPSSSLGTKT YTCNVDHKPS NTKVDKRV
(b)重链铰链区
一个示例性铰链结构域为人IgG1铰链结构域。示例性人IgG1铰链结构域的氨基酸序列为(SEQ ID NO:7):EPKSCDKTHTCPPCP。
另一示例性铰链结构域为人IgG2铰链结构域。示例性人IgG2铰链结构域的氨基酸序列为(SEQ ID NO:8):ERKCCVECPPCP。
另一示例性铰链结构域为人IgG3铰链结构域。示例性人IgG3铰链结构域的氨基酸序列为(SEQ ID NO:9):
ELKTPLGDTT HTCPRCPEPK SCDTPPPCPR CPEPKSCDTP PPCPRCPEPK SCDTPPPCPR CP。
另一示例性铰链结构域为人IgG4铰链结构域。示例性人IgG4铰链结构域的氨基酸序列为(SEQ ID NO:10):ESKYGPPCPSCP。如本文描述的,IgG4铰链结构域可包括稳定突变比如S228P替换。示例性S228P-稳定的人IgG4铰链结构域的氨基酸序列为(SEQ ID NO:11):ESKYGPPCPPCP。
(c)重链CH2结构域和CH3结构域
两条重链的CH2结构域和CH3结构域相互作用以形成被细胞Fc受体识别的IgG抗体的“Fc结构域”,Fc受体包括但不限于Fcγ受体(FcγR)。如本文使用的,术语“Fc区”用于限定IgG重链的C-末端区。Fc区的一部分(包括涵盖完整的Fc区的部分)在本文中称为“Fc结构域”。如果Fc区的氨基酸序列相对于其他IgG同种型与该同种型最同源,则认为Fc区具有特定的IgG同种型、类别或亚类。除其已知的在诊断中的用途外,抗体还显示可用作治疗剂。
示例性人IgG1的CH2-CH3结构域的氨基酸序列为(SEQ ID NO:12):
Figure BDA0002902883590000131
如通过Kabat中所示的EU索引所编号,其中X是赖氨酸(K)或不存在。
示例性人IgG2的CH2-CH3结构域的氨基酸序列为(SEQ ID NO:13):
Figure BDA0002902883590000141
如通过Kabat中所示的EU索引所编号,其中X是赖氨酸(K)或不存在。
示例性人IgG3的CH2-CH3结构域的氨基酸序列为(SEQ ID NO:14):
Figure BDA0002902883590000142
如通过Kabat中所示的EU索引所编号,其中X是赖氨酸(K)或不存在。
示例性人IgG4的CH2-CH3结构域的氨基酸序列为(SEQ ID NO:15):
Figure BDA0002902883590000151
如通过Kabat中所示的EU索引所编号,其中X是赖氨酸(K)或不存在。
遍及本申请说明书,IgG重链的恒定区中的残基的编号是按照Kabat等的Sequences of Proteins of Immunological Interest,第5版,公共卫生署(PublicHealth Service),NH1,MD(1991)(“Kabat”)中EU索引的编号,其通过引用明确地并入本文。术语“如Kabat中的EU索引”指人IgG1 EU抗体的恒定结构域的编号。在抗体恒定区内在许多不同位置(例如,Fc位置,包括但不限于通过Kabat中所示的EU索引所编号的位置270、272、312、315、356和358)已经观察到多态性,并且因此在所展示出的序列和现有技术中的序列之间可存在轻微差异。已经很好地表征了人免疫球蛋白的多态形式。目前,18Gm同种异型是已知的:G1m(1、2、3、17)或G1m(a、x、f、z)、G2m(23)或G2m(n)、G3m(5、6、10、11、13、14、15、16、21、24、26、27、28)或G3m(b1、c3、b3、b0、b3、b4、s、t、g1、c5、u、v、g5)(Lefranc等“The HumanIgG Subclasses:Molecular Analysis Of Structure,Function And Regulation.”Pergamon,Oxford,pp.43-78(1990);Lefranc,G.等1979,Hum.Genet.:50,199-211)。具体地,考虑本发明的抗体可并入任何免疫球蛋白基因的任何同种异型(allotype)、异种型(isoallotype)或单体型(haplotype),并且不限于本文提供的序列的同种异型、异种型或单体型。而且,在一些表达系统中,CH3结构域的C-末端氨基酸残基(上文粗体)可在翻译后去除。相应地,在本发明的结合gp41的分子中,CH3结构域的C-末端残基为任选的氨基酸残基。具体地,本发明涵盖的为缺少CH3结构域的C-末端残基的结合gp41的分子。同样具体地,本发明涵盖的为包括CH3结构域的C-末端赖氨酸残基的这种构建体。
(d)可变结构域
IgG分子的可变结构域由三个“互补决定区”(“CDR”)以及称为“框架区”(“FR”)的间插非-CDR区段组成,CDR包含抗体的将与表位接触的氨基酸残基,FR大体上保持CDR环(loop)的结构和确定CDR环的定位以允许这种接触(尽管某些框架残基也可接触表位)。因此,VL结构域和VH结构域具有结构n-FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4-c。CDR的氨基酸序列确定抗体是否将能够结合特定的表位。抗体轻链与抗体重链的相互作用,并且具体地,它们的VL结构域和VH结构域的相互作用形成抗体的表位结合结构域。
来自免疫球蛋白的成熟的重链和轻链的可变结构域的氨基酸也是通过链中氨基酸的位置命名。Kabat描述了关于抗体的许多氨基酸序列、鉴定了每个亚组的氨基酸共有序列并且为每个氨基酸指定了残基编号,并且鉴定CDR,如通过Kabat定义(应理解,通过Chothia,C.&Lesk,A.M.((1987)“Canonical Structures For The HypervariableRegions Of Immunoglobulins,”J.Mol.Biol.196:901-917)定义的CDRH1提前五个残基开始)。Kabat的编号方案可通过参照保守氨基酸将考虑的抗体与Kabat中的共有序列之一比对而扩展至不包括在其纲要中的抗体。用于指定残基编号的该方法在本领域中已经变成了标准,并且易于鉴定在包括嵌合或人源化变体的不同抗体中在等同位置处的氨基酸。例如,在人抗体轻链的位置50处的氨基酸占据与小鼠抗体轻链的位置50处的氨基酸等同的位置。
是(或可用作)抗体轻链的第一CDR、第二CDR和第三CDR的多肽在本文中分别命名为:CDRL1结构域、CDRL2结构域和CDRL3结构域。类似地,是(或可用作)抗体重链的第一CDR、第二CDR和第三CDR的多肽在本文中分别命名为:CDRH1结构域、CDRH2结构域和CDRH3结构域。因此,术语CDRL1结构域、CDRL2结构域、CDRL3结构域、CDRH1结构域、CDRH2结构域和CDRH3结构域涉及这种多肽:当其并入到蛋白中时,引起该蛋白能够结合特定表位,而无论这种蛋白是具有轻链和重链的抗体或是双抗体或单链结合分子(例如,scFv、
Figure BDA0002902883590000161
等),或是另一类型蛋白。
术语“表位结合结构域”(例如,结合gp41的结构域)意指有助于结合分子免疫特异性结合表位(例如,gp41的表位)的能力的结合分子的一部分(或具有这种部分的氨基酸序列的多肽)。表位结合结构域可含有抗体的VL结构域或VH结构域,或抗体的任何1个、2个、3个、4个或5个CDR结构域,或可含有抗体的全部6个CDR结构域,并且,尽管能够免疫特异性结合这种表位,但对不同于这种抗体的表位的这种表位可展示出免疫特异性、亲和力或选择性。表位结合结构域可仅含有部分CDR,即对于结合所需的CDR残基的子集,称为SDR(Kim,J.H.等(2012)“Humanization By CDR Grafting And Specificity-Determining ResidueGrafting,”Methods Mol.Biol.907:237-245;Kim,K.S.等(2010)“Construction Of AHumanized Antibody To Hepatitis B Surface Antigen By Specificity-DeterminingResidues(SDR)-Grafting And De-Immunization,”Biochem.Biophys.Res.Commun.396(2):231-237;Kashmiri,S.V.等(2005)“SDR Grafting–A New Approach To AntibodyHumanization,”Methods 36(1):25-34;Gonzales,N.R.等(2004)“SDR Grafting Of AMurine Antibody Using Multiple Human Germline Templates To Minimize ItsImmunogenicity,”Mol.Immunol.41:863-872)。然而,优选地,表位结合结构域将含有这种抗体的全部6个CDR结构域。表位结合结构域可为单个多肽链(例如,scFv),或可包括两条或更多条多肽链,其各自可具有氨基末端和羟基末端(例如,双抗体、Fab部分、Fab2部分等),并且其可经二硫键彼此共价结合。
2.抗体的人源化
本发明还特别地涵盖包括抗体的VL结构域或VH结构域,并且优选地抗体的VL结构域和VH结构域二者的结合分子。优选地,这种抗体为人源化抗体。单克隆抗体通常在如小鼠或兔的非人物种中制备。这种抗体的可变结构域和/或恒定结构域可被识别为免疫原,从而诱发针对它们的免疫应答。然而,这种分子可通过引入一个或多个氨基酸替换而被“人源化”,以便使得这种抗体更像由人产生的抗体,从而减少或消除它们的免疫原性。术语“人源化”抗体指通常使用重组技术制备的嵌合分子,其具有来自非人物种的免疫球蛋白的表位结合位点和剩余的基于人免疫球蛋白的结构和/或序列的分子的免疫球蛋白结构。这种抗体的可变结构域的多核苷酸序列可用于遗传操纵以产生这种衍生物并且改善这种抗体的亲和力或其他特征。已经通过LoBuglio,A.F.等(1989)“Mouse/Human ChimericMonoclonal Antibody In Man:Kinetics And Immune Response,”Proc.Natl.Acad.Sci.(U.S.A.)86:4220-4224;Sato,K.等(1993)Cancer Res 53:851-856.Riechmann,L.等(1988)“Reshaping Human Antibodies for Therapy,”Nature332:323-327;Verhoeyen,M.等(1988)“Reshaping Human Antibodies:Grafting An Antilysozyme Activity,”Science 239:1534-1536;Kettleborough,C.A.等(1991)“Humanization Of A MouseMonoclonal Antibody By CDR-Grafting:The Importance Of Framework Residues OnLoop Conformation,”Protein Engineering4:773-3783;Maeda,H.等(1991)“Construction Of Reshaped Human Antibodies With HIV-Neutralizing Activity,”Human Antibodies Hybridoma 2:124-134;Gorman,S.D.等(1991)“Reshaping ATherapeutic CD4 Antibody,”Proc.Natl.Acad.Sci.(U.S.A.)88:4181-4185;Tempest,P.R.等(1991)“Reshaping A Human Monoclonal Antibody To Inhibit HumanRespiratory Syncytial Virus Infection in vivo,”Bio/Technology 9:266-271;Co,M.S.等(1991)“Humanized Antibodies For Antiviral Therapy,”Proc.Natl.Acad.Sci.(U.S.A.)88:2869-2873;Carter,P.等(1992)“Humanization Of An Anti-p185her2Antibody For Human Cancer Therapy,”Proc.Natl.Acad.Sci.(U.S.A.)89:4285-4289;and Co,M.S.等(1992)“Chimeric And Humanized Antibodies With Specificity ForThe CD33 Antigen,”J.Immunol.148:1149-1154报道了这种方式对各种抗体的应用。在一些实施方式中,人源化抗体保留全部的CDR序列(例如,包含来自小鼠抗体的全部六个CDR的人源化小鼠抗体)。在其他实施方式中,人源化抗体相对于原抗体具有序列不同的一个或多个(一个、两个、三个、四个、五个或六个)CDR。
使抗体人源化的一般原则涉及保留抗体的表位结合结构域的基本序列,同时用人抗体序列交换该抗体的非人剩余部分。使单克隆抗体人源化有四个常规步骤。这些步骤是:(1)确定起始抗体轻链可变结构域和重链可变结构域的核苷酸和预测的氨基酸序列;(2)设计人源化抗体或犬源化抗体,即决定在人源化或犬源化过程期间使用哪个抗体框架区;(3)实际的人源化或犬源化方法/技术;和(4)人源化抗体的转染和表达。见,例如美国专利号4,816,567、5,807,715、5,866,692和6,331,415。
已经描述了包括源自非人免疫球蛋白的表位结合结构域的许多人源化抗体分子,包括具有啮齿动物可变结构域或修饰的啮齿动物可变结构域和与人恒定结构域融合的它们缔合的互补决定区(CDR)的嵌合抗体(见,例如Winter等(1991)“Man-made Antibodies,”Nature 349:293-299;Lobuglio等(1989)“Mouse/Human Chimeric Monoclonal AntibodyIn Man:Kinetics And Immune Response,”Proc.Natl.Acad.Sci.(U.S.A.)86:4220-4224(1989);Shaw等(1987)“Characterization Of A Mouse/Human Chimeric MonoclonalAntibody(17-1A)To A Colon Cancer Tumor-Associated Antigen,”J.Immunol.138:4534-4538;和Brown等(1987)“Tumor-Specific Genetically Engineered Murine/HumanChimeric Monoclonal Antibody,”Cancer Res.47:3577-3583)。其他参考文献描述了在与适当的人抗体恒定结构域融合之前移植到人支撑框架区(FR)中的啮齿动物CDR(见,例如Riechmann,L.等(1988)“Reshaping Human Antibodies for Therapy,”Nature332:323-327;Verhoeyen,M.等(1988)“Reshaping Human Antibodies:Grafting An AntilysozymeActivity,”Science 239:1534-1536;和Jones等(1986)“Replacing TheComplementarity-Determining Regions In A Human Antibody With Those From AMouse,”Nature 321:522-525)。另一参考文献描述了通过重组修饰的啮齿动物框架区支撑的啮齿动物CDR。见,例如欧洲专利公开号519,596。这些“人源化”分子被设计为使得对啮齿动物抗人抗体分子的不期望的免疫应答最小化,该不期望的免疫应答限制了那些部分在人接受者中治疗应用的持续时间和功效。也可使用的使抗体人源化的其他方法公开在下面文献中:Daugherty等(1991)“Polymerase Chain Reaction Facilitates The Cloning,CDR-Grafting,And Rapid Expression Of A Murine Monoclonal Antibody DirectedAgainst The CD18Component Of Leukocyte Integrins,”Nucl.Acids Res.19:2471-2476和美国专利号6,180,377、6,054,297、5,997,867和5,866,692。本发明特别地涵盖包括“人源化”抗体的VL结构域和/或VH结构域的结合分子(包括抗体和双抗体)。
尽管取得了这种成功,通过仔细考虑和放置在多肽链中采用的结构域,可以进一步改善为治疗用途优化的稳定的、功能性异源二聚化的、非单特异性双抗体的制备。因此,本发明涉及提供特异性的多肽,所述多肽经特别地设计以经共价结合形成能够同时结合gp41和存在于免疫效应细胞的表面上的分子的稳定且在治疗上有用的异源二聚化双抗体和异源二聚化Fc双抗体。
B.双特异性抗体
如以上指示,天然抗体能够结合仅一种表位种类(即,它们为单特异性),尽管它们可结合该种类的多个拷贝(即,展示出二价或多价)。抗体结合抗原表位的能力取决于抗体的VL结构域和VH结构域的存在和氨基酸序列。抗体的轻链和重链的相互作用并且,特别地,其VL结构域和VH结构域的相互作用形成天然抗体,比如IgG的两个表位结合结构域之一。
抗体的官能度可通过产生可同时结合两个分开且不同抗原(或相同抗原的不同表位)的基于多特异性抗体的分子和/或通过产生对于相同表位和/或抗原具有更高价(即,大于两个结合结构域)的基于抗体的分子增强。
为了提供比天然抗体具有更高能力的分子,已经开发了各种重组双特异性抗体形式(见,例如PCT公开号WO 2008/003116、WO 2009/132876、WO 2008/003103、WO 2007/146968、WO 2009/018386、WO 2012/009544、WO 2013/070565)。大多数这类方法使用连接体肽以将另外的结合结构域(例如,scFv、VL、VH等)与抗体核心(IgA、IgD、IgE、IgG或IgM)融合或融合到抗体核心内,或以使多个抗体结合部分(例如,两个Fab部分或scFv)彼此融合。可选的形式使用连接体肽以将结合蛋白(例如,scFv、VL、VH等)与二聚结构域比如CH2-CH3结构域或可选的多肽融合(WO 2005/070966、WO 2006/107786A、WO 2006/107617A、WO 2007/046893)。典型地,这种方法涉及折中(compromises)和权衡(trade-offs)。例如,PCT公开号WO 2013/174873、WO 2011/133886和WO 2010/136172公开了连接体的使用可能引起治疗设置中的问题并且教导了这种三特异性抗体:其中CL结构域和CH1结构域从各自天然位置转换以及VL结构域和VH结构域已经被多样化(WO 2008/027236、WO 2010/108127),以允许它们结合多于一个抗原。从而,在这些文件中公开的分子以结合特异性换取结合另外的抗原种类的能力。PCT公开号WO 2013/163427和WO 2013/119903公开了修饰CH2结构域以包含包括结合结构域的融合蛋白加合物(adduct)。文件指出CH2结构域可能在介导效应子功能中仅起到最小的作用。PCT公开号WO 2010/028797、WO2010028796和WO 2010/028795公开了其Fc区已经用另外的VL结构域和VH结构域替换以形成三价结合分子的重组抗体。PCT公开号WO 2003/025018和WO2003012069公开其单个链包含scFv结构域的重组双抗体。PCT公开号WO 2013/006544公开了多价Fab分子,其被合成为单个多肽链且然后经历蛋白水解以产生异源二聚体结构。因此,在这些文件中公开的分子以介导效应子功能的能力的全部或一些换取结合另外的抗原种类的能力。PCT公开号WO 2014/022540、WO 2013/003652、WO 2012/162583、WO 2012/156430、WO 2011/086091、WO 2008/024188、WO 2007/024715、WO 2007/075270、WO 1998/002463、WO 1992/022583和WO 1991/003493公开了将另外的结合结构域或官能团添加至抗体或抗体部分(例如,添加双抗体至抗体的轻链,或添加另外的VL结构域和VH结构域至抗体的轻链和重链,或添加异源融合蛋白或将多个Fab结构域彼此连接)。因此,在这些文件中公开的分子以天然的抗体结构换取结合另外的抗原种类的能力。
II.双特异性双抗体
本领域还已经指出在能够结合两个或更多个不同表位种类方面(即,除了二价或多价外,还展示出双特异性或多特异性)产生不同于天然抗体的双抗体的能力(见,例如Holliger等(1993)“’Diabodies’:Small Bivalent And Bispecific AntibodyFragments,”Proc.Natl.Acad.Sci.(U.S.A.)90:6444-6448;US 2004/0058400(Hollinger等);US 2004/0220388(Mertens等);Alt等(1999)FEBS Lett.454(1-2):90-94;Lu,D.等(2005)“A Fully Human Recombinant IgG-Like Bispecific Antibody To Both TheEpidermal Growth Factor Receptor And The Insulin-Like Growth Factor ReceptorFor Enhanced Antitumor Activity,”J.Biol.Chem.280(20):19665-19672;WO 02/02781(Mertens等);Olafsen,T.等(2004)“Covalent Disulfide-Linked Anti-CEA DiabodyAllows Site-Specific Conjugation And Radiolabeling For Tumor TargetingApplications,”Protein Eng Des Sel.17(1):21-27;Wu,A.等(2001)“MultimerizationOf A Chimeric Anti-CD20 Single Chain Fv-Fv Fusion Protein Is Mediated ThroughVariable Domain Exchange,”Protein Engineering 14(2):1025-1033;Asano等(2004)“ADiabody For Cancer Immunotherapy And Its Functional Enhancement By Fusion OfHuman Fc Domain,”Abstract 3P-683,J.Biochem.76(8):992;Takemura,S.等(2000)“Construction Of A Diabody(Small Recombinant Bispecific Antibody)Using ARefolding System,”Protein Eng.13(8):583-588;Baeuerle,P.A.等(2009)“BispecificT cell Engaging Antibodies For Cancer Therapy,”Cancer Res.69(12):4941-4944)。
双抗体的设计基于单链可变结构域部分(scFv)的结构,其中使用短的连接肽将轻链和重链可变结构域彼此连接。Bird等(1988)(“Single-Chain Antigen-BindingProteins,”Science 242:423-426)描述了连接肽的示例,所述连接肽在一个可变结构域的羧基末端和另一个可变结构域的氨基末端之间桥接约3.5nm。已经设计和使用其他序列的连接体(Bird等(1988)“Single-Chain Antigen-Binding Proteins,”Science 242:423-426)。为了另外功能,比如药物的附接或附接至固体载体,连接体可又被修饰。可重组地或合成地产生单链变体。对于scFv的合成产生,可使用自动合成仪。对于scFv的重组产生,可将适当的编码scFv的含有多核苷酸的质粒引入适当的宿主细胞,真核细胞,比如酵母、植物、昆虫或哺乳动物细胞;或原核细胞,比如大肠杆菌。编码感兴趣的scFv的多核苷酸可通过常规操作比如多核苷酸的连接(ligation)制造。所得scFv可使用本领域已知的标准蛋白质纯化技术分离。
提供非单特异性“双抗体”对抗体带来了显著的优势:共连接和共定位表达不同表位的细胞的能力。因此,双特异性双抗体具有包括治疗和免疫诊断的广泛的应用。双特异性使双抗体在各种应用中的设计和工程化允许极大的灵活性,从而提供增强的对多聚体抗原的亲和力、不同抗原的交联以及依赖于靶抗原二者的存在对特定细胞类型的定向靶向。由于它们的二价、低解离速率和从循环中的快速清除(对于小尺寸的双抗体,等于或低于~50kDa),本领域已知的双抗体分子也已显示在肿瘤成像领域中的特殊用途(Fitzgerald等(1997)“Improved Tumour Targeting By Disulphide Stabilized Diabodies ExpressedIn Pichia pastoris,”Protein Eng.10:1221)。
产生双特异性双抗体的能力导致它们用于(以“反式(trans)”)将两个细胞共连接一起,例如,通过共连接存在于不同细胞的表面上的受体(例如,将细胞毒性T细胞交联至靶细胞,比如表达疾病抗原的癌细胞或感染病原体的细胞)(Staerz等(1985)“HybridAntibodies Can Target Sites For Attack By T Cells,”Nature 314:628-631,andHolliger等(1996)“Specific Killing Of Lymphoma Cells By Cytotoxic T-CellsMediated By A Bispecific Diabody,”Protein Eng.9:299-305;Marvin等(2005)“Recombinant Approaches To IgG-Like Bispecific Antibodies,”ActaPharmacol.Sin.26:649-658;Sloan等(2015)“Targeting HIV Reservoir in InfectedCD4 T Cells by Dual-Affinity Re-targeting Molecules(DARTs)that Bind HIVEnvelope and Recruit Cytotoxic T Cells,”PLoS Pathog 11(11):e1005233.doi:10.1371/journal.ppat.1005233))。可选地(或另外地),双特异性(或多特异性)双抗体可用于(以“顺式(cis)”)共连接存在于相同细胞的表面上的分子,比如受体等。不同的细胞和/或受体的共连接用于调节效应器功能和/或免疫细胞信号传导。包括表位结合结构域的多特异性分子(例如,双特异性双抗体)可针对T淋巴细胞、天然杀伤(NK)细胞、抗原呈递细胞或其他单核细胞上表达的任何免疫细胞的表面决定子,比如CD2、CD3、CD8、CD16、TCR、NKG2D等,或针对B细胞的表面决定子,比如CD19、CD20、CD22、CD30、CD37、CD40和CD74(Moore,P.A.等(2011)“Application Of Dual Affinity Retargeting Molecules ToAchieve Optimal Redirected T cell Killing Of B-Cell Lymphoma,”Blood117(17):4542-4551;Cheson,B.D.等(2008)“Monoclonal Antibody Therapy For B-Cell Non-Hodgkin’s Lymphoma,”N.Engl.J.Med.359(6):613-626;Castillo,J.等(2008)“NewerMonoclonal Antibodies For Hematological Malignancies,”Exp.Hematol.36(7):755-768)。特别地,针对存在于免疫效应细胞上的细胞表面受体的表位结合结构域用于产生能够介导重定向细胞杀伤的多特异性结合分子。
在许多研究中,还发现了结合效应细胞决定子,例如,Fcγ受体(FcγR)的双抗体激活效应细胞(Holliger等(1996)“Specific Killing Of Lymphoma Cells By CytotoxicT-Cells Mediated By A Bispecific Diabody,”Protein Eng.9:299-305;Holliger等(1999)“Carcinoembryonic Antigen(CEA)-Specific T-cell Activation In ColonCarcinoma Induced By Anti-CD3 x Anti-CEA Bispecific Diabody And B7 x Anti-CEABispecific Fusion Proteins,”Cancer Res.59:2909-2916以及PCT公布号WO 2006/113665;WO 2008/157379;WO 2010/080538;WO 2012/018687和WO 2012/162068)。通常地,效应细胞激活是通过结合抗原的抗体通过Fc-FcγR相互作用与效应细胞的结合而触发;因此,就此而言,双抗体分子可展现出Ig样官能度,而不依赖它们是否包括Fc结构域(例如,如在本领域已知的或本文举例说明的任何效应子功能测试中(例如,ADCC测试)分析的)。通过使肿瘤细胞和效应细胞交联,双抗体不仅仅使效应细胞进入肿瘤细胞的附近内,而且导致有效的肿瘤杀伤(见,例如Cao等(2003)“Bispecific Antibody Conjugates InTherapeutics,”Adv.Drug.Deliv.Rev.55:171-197)。
然而,上述双特异性双抗体的优势的成本是显著的。这种非单特异性双抗体的形成要求两条或更多条独特且不同的多肽的成功组装(即,这种形成要求通过不同多肽链种类的异源二聚化而形成双抗体)。该事实与通过相同的多肽链的同源二聚化形成的单特异性双抗体相反。因为必须提供至少两条不同的多肽(即,两种多肽种类),以便形成非单特异性双抗体,并且因为这种多肽的同源二聚化而导致不活跃的分子(Takemura,S.等(2000)“Construction Of A Diabody(Small Recombinant Bispecific Antibody)Using ARefolding System,”Protein Eng.13(8):583-588),必须以防止相同种类的多肽之间的共价结合(即,以便防止同源二聚化)的方式完成这种多肽的产生(Takemura,S.等(2000)“Construction Of A Diabody(Small Recombinant Bispecific Antibody)Using ARefolding System,”Protein Eng.13(8):583-588)。因此,本领域已经教导了这种多肽的非共价缔合(见,例如,Olafsen等(2004)“Covalent Disulfide-Linked Anti-CEA DiabodyAllows Site-Specific Conjugation And Radiolabeling For Tumor TargetingApplications,”Prot.Engr.Des.Sel.17:21-27;Asano等(2004)“A Diabody For CancerImmunotherapy And Its Functional Enhancement By Fusion Of Human Fc Domain,”Abstract 3P-683,J.Biochem.76(8):992;Takemura,S.等(2000)“Construction Of ADiabody(Small Recombinant Bispecific Antibody)Using A Refolding System,”Protein Eng.13(8):583-588;Lu,D.等(2005)“A Fully Human Recombinant IgG-LikeBispecific Antibody To Both The Epidermal Growth Factor Receptor And TheInsulin-Like Growth Factor Receptor For Enhanced Antitumor Activity,”J.Biol.Chem.280(20):19665-19672)。
然而,本领域认识到,由非共价缔合的多肽组成的双特异性双抗体是不稳定的并且容易离解成非功能性单多肽链单体(见,例如,Lu,D.等(2005)“A Fully HumanRecombinant IgG-Like Bispecific Antibody To Both The Epidermal Growth FactorReceptor And The Insulin-Like Growth Factor Receptor For Enhanced AntitumorActivity,”J.Biol.Chem.280(20):19665-19672)。
面对该挑战时,本领域已经成功开发了稳定的共价结合的异源二聚化非单特异性双抗体,称为
Figure BDA0002902883590000241
双抗体,见,例如,Liu.L等(2017)“MGD011,A CD19 x CD3 Dual-Affinity Retargeting Bi-specific Molecule Incorporating Extended CirculatingHalf-life for the Treatment of B-Cell Malignancies,”Clin Cancer Res.23(6):1506-1518;Tsai,P.等(2016)“CD19xCD3 DART Protein Mediates Human B-CellDepletion In Vivo In Humanized BLT Mice,”Mol.Ther.Oncolytics 3:15024.doi:10.1038/mto.2015.24;Chen,X.等(2016)“Mechanistic Projection of First-in-HumanDose for Bispecific Immunomodulatory P-Cadherin LP-DART:An Integrated PK/PDModeling Approach,”Clin.Pharmacol.Ther.100(3):232-241;Sloan,D.D.等(2015)“Targeting HIV Reservoir in Infected CD4 T Cells by Dual-Affinity Re-targeting Molecules(DARTs)that Bind HIV Envelope and Recruit Cytotoxic TCells,”PLoS Pathog.11(11):e1005233.doi:10.1371/journal.ppat.1005233;AlHussaini,M.等(2015)“Targeting CD123 In AML Using A T-Cell Directed Dual-Affinity Re-Targeting
Figure BDA0002902883590000251
Platform,”Blood pii:blood-2014-05-575704;Chichili,G.R.等(2015)“A CD3xCD123 Bispecific DART For Redirecting Host TCells To Myelogenous Leukemia:Preclinical Activity And Safety In NonhumanPrimates,”Sci.Transl.Med.7(289):289ra82;Johnson,S.等(2010)“Effector CellRecruitment With Novel Fv-Based Dual-Affinity Re-Targeting Protein Leads ToPotent Tumor Cytolysis And In Vivo B-Cell Depletion,”J.Molec.Biol.399(3):436-449;Veri,M.C.等(2010)“Therapeutic Control Of B Cell Activation ViaRecruitment Of Fcgamma Receptor IIB(CD32B)Inhibitory Function With A NovelBispecific Antibody Scaffold,”Arthritis Rheum.62(7):1933-1943;Moore,P.A.等(2011)“Application Of Dual Affinity Retargeting Molecules To Achieve OptimalRedirected T cell Killing Of B-Cell Lymphoma,”Blood 117(17):4542-4551;美国专利号9,932,400;9,908,938;9,889,197;9,884,921;9,822,181;9,296,816;9,284,375;8,795,667;8,187,593;8,669,349;8,784,808;8,795,667;8,802,091;8,802,093;8,946,387和8,968,730,以及美国专利公布号2009/0060910;2010/0174053;2011/0081347;2011/0097323;2011/0117089;2012/0034221;2012/0294796;2013/0149236;2013/0295121;2014/0017237;2014/0099318;2014/0255407;2015/0175697;2016/0017038;2016/0159908;2016/0159908;2016/0194396;2016/0194396;2016/0200827;2016/0200827;2016/0222105;2016/0222105;2016/0333111;2016/0355586;2016/0355586;2017/0157251;2017/0157251;2017/0198037;2017/0198037;2017/0198045;2017/0204176;2017/0204176;2017/0247452和2018/0094072;欧洲专利文件号EP 1868650;EP 2158221;EP 2247304;EP 2252631;EP 2282770;EP 2328934;EP 2376109;EP 2542256;EP 2601216;EP 2714079;EP 2714733;EP 2786762;EP 2839842;EP 2840091;和PCT公布号WO 2006/113665;WO 2008/157379;WO 2010/027797;WO 2010/033279;WO 2010/080538;WO 2011/109400;WO 2012/018687;WO 2012/162067;WO 2012/162068;WO 2014/159940;WO 2015/021089;WO 2015/026892和WO 2015/026894)。这种双抗体包含两条或更多条共价复合的多肽并且涉及将一个或多个半胱氨酸残基工程化进入每个采用的多肽种类,其允许形成二硫键并且从而彼此共价地结合一对或多对这种多肽链。例如,已经显示半胱氨酸残基添加至这种构建体的C-末端以允许涉及的多肽链之间的二硫键键合,从而稳定化所得的双抗体且不受双抗体的结合特征的干扰。
最简单的
Figure BDA0002902883590000261
双抗体包括两条多肽链,每条多肽链包括三个结构域(图1A-图1B)。第一多肽链包括:(i)包含第一免疫球蛋白的轻链可变结构域的结合区的结构域(VL1),(ii)包含第二免疫球蛋白的重链可变结构域的结合区的第二结构域(VH2),和(iii)用来促进与第二多肽链的异源二聚化并且将双抗体的第一多肽链共价结合第二多肽链的第三结构域(“异源二聚体促进结构域”)。第二多肽链包含互补的第一结构域(VL2结构域)、互补的第二结构域(VH1结构域)和与第一多肽链的第三结构域复合以促进异源二聚化和与第一多肽链的共价结合的第三结构域(“异源二聚体促进结构域”)。这种分子是稳定的、强效的并且具有同时结合两个或更多个抗原的能力。在一个实施方式中,第一多肽链和第二多肽链的第三结构域各自包含半胱氨酸
Figure BDA0002902883590000266
残基,其用于经二硫键将多肽结合在一起。
多肽链中的一条或两条的第三结构域可另外地具有CH2-CH3结构域的序列,使得双抗体多肽的复合形成能够结合细胞(如,B淋巴细胞、树突细胞、天然杀伤细胞、巨噬细胞、嗜中性粒细胞、嗜酸性粒细胞、嗜碱性粒细胞和肥大细胞)的Fc受体的Fc结构域。已经描述了这种分子的许多变型(见,例如,美国专利公布号2013-0295121;2010-0174053;2007-0004909;2009-0060910;欧洲专利公布号EP 2714079;EP 2601216;EP 2376109;EP2158221和PCT公布号WO 2012/162068;WO 2012/018687;WO 2010/080538;WO 2006/113665)并且在本文提供。已经描述了这种分子的许多变型(见,例如,美国专利公布号2015/0175697;2014/0255407;2014/0099318;2013/0295121;2010/0174053;2009/0060910;2007-0004909;欧洲专利公布号EP 2714079;EP 2601216;EP 2376109;EP2158221;EP 1868650和PCT公布号WO 2012/162068;WO 2012/018687;WO 2010/080538;WO2006/113665)并且在本文提供。
对于在期望双特异性或四价分子但不需要Fc的应用,可选的构建体在本领域中是已知的,其包括但不限于双特异性T细胞接合分子,也称为
Figure BDA0002902883590000262
(见,例如,PCT公布号:WO 1993/11161和WO 2004/106381)和四价串联抗体,也称为
Figure BDA0002902883590000263
(见,例如,美国专利公布号:2011-0206672;欧洲专利公布号EP 2371866和PCT公布号WO 1999/057150、WO 2003/025018和WO 2013/013700)。
Figure BDA0002902883590000264
由包括串联连接的scFv的单条多肽链形成,而
Figure BDA0002902883590000265
由两条相同的多肽链的同型二聚化形成,每条多肽链具备VH1结构域、VL2结构域、VH2结构域和VL2结构域。
III.本发明的实施方式
本发明涉及“结合表位的分子”,其包括“结合表位的结构域”,比如CDRL1结构域、CDRL2结构域、CDRL3结构域、CDRH1结构域、CDRH2结构域或CDRH3结构域,或足以形成允许分子结合表位的“结合表位的位点”的其任何组合或其子组合。例如,“结合gp41表位的分子”包括“结合表位的结构域”,比如CDRL1结构域、CDRL2结构域、CDRL3结构域、CDRH1结构域、CDRH2结构域或CDRH3结构域,或足以形成允许分子结合gp41的表位的“结合gp41表位的位点”的其任何组合或其子组合。然而,优选地,这种结合gp41的分子将具备免疫特异性结合gp41的表位的“抗gp41抗体”的CDRL1结构域、CDRL2结构域、CDRL3结构域、CDRH1结构域、CDRH2结构域和CDRH3结构域。在一些实施方式中,这种分子可包括仅这种抗gp41抗体的gp41-VL结合结构域或仅这种抗gp41抗体的gp41-VH结合结构域,其结构域可与其他结合结构域相互作用以介导免疫特异性结合gp41的表位,或可足以通过它们自己介导这种结合。在一些实施方式中,这种分子可包括可源自相同抗体或不同抗体的抗gp41抗体的gp41-VL结合结构域和抗gp41抗体的gp41-VH结合结构域两者。
本发明的一个实施方式涉及“多特异性”结合gp41的分子,其为双特异性的并且能够结合“第一表位”和“第二表位”,这种表位彼此不相同。表位表示为“第一表位”、“第二表位”等仅旨在给它们的描述提供前提基础并且不意味实质性区别。这种多特异性分子包括能够结合第一表位的“VL1”结构域/“VH1”结构域,和能够结合第二表位的“VL2”结构域/“VH2”结构域。符号“VL1”和“VH1”分别表示结合这种双特异性分子的第一表位的可变轻链结构域和可变重链结构域。类似地,符号“VL2”和“VH2”分别表示结合这种双特异性分子的第二表位的轻链可变结构域和重链可变结构域。是否特定的表位被命名为第一表位、第二表位等无关紧要;这种符号仅相对于本发明的结合分子的多肽链的结构域的存在和定向具有关联。在一个实施方式中,一个这种表位为人gp41的表位,并且另一个这种表位为gp41的不同表位或为不是gp41的分子的表位。在特别的实施方式中,一个这种表位为人gp41的表位,并且另一个这种表位为存在于效应细胞,比如T淋巴细胞、天然杀伤(NK)细胞或其他单核细胞的表面上的分子(例如,CD2、CD3、CD8、CD16、T-细胞受体(TCR)、NKG2D等)的表位。在某些实施方式中,多特异性分子包括大于两个表位结合结构域。在某些实施方式中,本发明的多特异性分子为三特异性并且能够结合第一表位、第二表位和“第三表位”。这种三特异性分子包括能够结合第一表位的VL1结构域/VH1结构域、能够结合第二表位的VL2结构域/VH2结构域和能够结合第三表位的“VL3”结构域和“VH3”结构域。在其他实施方式中,本发明的多特异性分子为四特异性的并且能够结合第一表位、第二表位、第三表位和“第四表位”。这种四特异性分子包括能够结合第一表位的VL1结构域/VH1结构域、能够结合第二表位的VL2结构域/VH2结构域、能够结合第三表位的VL3结构域/VH3结构域和能够结合第四表位的“VL4”结构域/“VH4”结构域。这种多特异性分子将结合至少一个gp41的表位和至少一个不是gp41的分子的表位,并且可进一步结合gp41的另外表位和/或不是gp41的分子的另外表位。本发明特别涵盖使用任何本文提供的方法产生的双特异性双抗体、
Figure BDA0002902883590000281
抗体、
Figure BDA0002902883590000282
和三价分子。
多特异性结合gp41的分子
在一个实施方式中,本发明的结合gp41的分子将为多特异性的结合gp41的分子,其能够结合两个或更多个不同的表位,并且将包括:
(1)第一表位结合结构域,其免疫特异性结合gp41的表位(即,结合gp41的结构域,优选地包括本发明的优化的结合gp41的VL结构域和/或本发明的优化的结合gp41的VH结构域);和
(2)第二表位结合结构域,其免疫特异性结合第二表位,其中这种第二表位为(i)gp41的不同表位或(ii)不是gp41的分子的表位;和
(3)任选地,一个或多个另外表位结合结构域,其免疫特异性结合第三另外表位、第三另外表位和第四另外表位等,其中这种另外表位结合结构域可与第一表位或第二表位相同或不同。
这种结合gp41的分子优选地包括识别对靶细胞或免疫效应细胞独特的一组抗原的表位结合结构域的组合。特别地,本发明涉及多特异性结合gp41的分子,其能够结合gp41的表位和存在于效应细胞(即,效应细胞分子(“ECM”))的表面的分子的表位,尤其存在于T淋巴细胞、天然杀伤(NK)细胞或其他单核细胞的表面的分子的表位。例如,可构建本发明的这种结合gp41的分子以包括免疫特异性结合gp41的表位的第一表位结合结构域和免疫特异性结合ECM,尤其是CD2、CD3、CD8、CD16、T-细胞受体(TCR)或NKG2D的表位的第二表位结合结构域。在本发明的其他实施方式中,这种结合分子将另外含有足以允许这种分子结合ECM的另外表位和/或存在于HIV-1感染细胞的表面上的分子的另外表位(例如,gp41的第二表位或HIV-1包膜蛋白质的其他表位)的表位结合结构域。本发明还涉及包括这种分子的药物组合物。
在一个实施方式中,这种结合gp41的分子将为双特异性的但是为单价的,以便具备结合gp41的仅单个表位和存在于效应细胞(ECM)的表面上的分子的仅单个表位的能力。可选地,这种分子可为多特异性的且多价的,即,能够结合总计一个、两个、三个或四个表位,其可以任何方式分配以结合gp41的一个、两个或三个表位(其中两个或三个gp41表位可为相同的或不同的)和一个或多个ECM的三个、两个或一个表位;或gp41的一个或两个表位(其中两个gp41表位可为相同的或不同的)和一个或多个ECM的两个或一个表位,和任选地一个或多个不同HIV-1分子的一个或两个表位,特别是其中这种分子在HIV-1感染细胞的表面上表达。
因此,其中这种分子能够免疫特异性结合仅单个ECM,它们能够免疫特异性结合:
(1)仅一个gp41表位和ECM的一个、两个或三个表位(其中两个表位可为相同的或不同的,和其中三个表位可为相同的,或可为不同的,或可为两个相同的表位和一个不同的表位),或
(2)仅两个gp41表位(其中两个表位可为相同的或不同的)和ECM的一个或两个表位(其中两个表位可为相同的或不同的);或
(3)三个gp41表位(其中三个表位可为相同的,或可为不同的或可为两个相同的表位和一个不同的表位)和ECM的一个表位,或任选地它们能够结合一个或两个gp41表位(其中表位可为相同的或不同的)和不同HIV-1分子的两个或一个表位(其中两个表位可为相同的或不同的)。
类似地,其中这种分子能够免疫特异性结合两个不同的ECM(例如,第一ECM和第二ECM),它们能够免疫特异性结合:
(1)仅一个gp41表位和第一ECM的一个或两个表位(其中两个第一ECM表位可为相同的或不同的)和第二ECM的两个或一个表位(其中两个第二ECM可为相同的或不同的),或
(2)仅两个gp41表位(其中两个表位可为相同的或不同的)和第一ECM的一个表位和第二ECM的一个表位,或任选地它们能够结合一个gp41表位和不同HIV-1分子的一个表位。
下面描述了能够结合两个表位的这种多特异性分子的非限制性示例并且包括:
(1)DART-A,其结合gp41的一个表位,和ECM,CD3的一个表位;和
(2)DART-B,其结合gp41的一个表位,和ECM,CD16的一个表位。
下面描述了能够结合三个表位的这种多特异性分子的非限制性示例并且包括:
(1)TRIDENT-A,其结合gp41的一个表位,和两个不同ECM(CD3和CD8)的表位;
(2)TRIDENT-B,其结合gp41的一个表位、ECM(CD3)的一个表位,以及不同HIV-1分子(gp120)的一个表位;
(3)TRIDENT-C,其结合gp41的一个表位、ECM(CD16)的一个表位,以及不同HIV-1分子(gp120)的一个表位;和
(4)TRIDENT-D,其结合gp41的两个表位,和ECM(CD3)的一个表位。
表1进一步阐释了本发明的示例性分子的可能组合结合特异性。
Figure BDA0002902883590000301
通过形成更复杂的分子,可获得具备大于四个表位结合结构域的能够结合一个或多个ECM和任选地一个或多个不同HIV-1分子的结合gp41的分子。因此,不限制可被本发明的分子结合的表位和另外表位的性质,只要这种另外的结合能力不防止能够结合gp41的表位的分子或其结合结构域的这种结合并且不防止能够结合ECM的表位的分子或其结合结构域的这种结合即可。因此,本发明的结合gp41的分子可具备可选的或另外的表位结合结构域。作为示例,本发明考虑包括能够免疫特异性结合gp41的表位的第一表位结合结构域和能够免疫特异性结合ECM的表位的第二表位结合结构域和能够免疫特异性结合不同ECM或任选地不同HIV-1分子的第三表位结合结构域的结合gp41的分子。
1.缺少Fc结构域的多特异性结合gp41的双抗体
在一个实施方式中,本发明的多特异性结合gp41的分子将为双特异性双抗体并且将包括能够结合第一表位和第二表位二者的结构域,但是将缺少Fc结构域,并且因此将不能经Fc-FcγR相互作用结合FcγR分子。然而,这种分子能够经它们的gp41结合结构域的SDR或CDR结合gp41。因此,Fc结构域的缺失用于防止分子结合FcγR,比如抑制受体CD32B。
双特异性双抗体的这种实施方式的第一多肽链优选地在N-末端至C-末端方向上包括:N-末端、能够结合第一表位或第二表位的单克隆抗体的VL结构域(即,VLgp41或VL第二表位)、第一间插间隔肽(连接体1)、能够结合第二表位的单克隆抗体的VH结构域(如果这种第一多肽链含有VLgp41)或能够结合gp41的单克隆抗体的VH结构域(如果这种第一多肽链含有VL第二表位)、任选地含有半胱氨酸残基的第二间插间隔肽(连接体2)、异源二聚体促进结构域和C-末端(图1A-图1B)。
双特异性双抗体的该实施方式的第二多肽链在N-末端至C-末端方向上包括:N-末端、能够结合第一表位或第二表位的单克隆抗体的VL结构域(即,VLgp41或VL第二表位,并且为未被选择包含在双抗体的第一多肽链中的VL结构域)、间插间隔肽(连接体1)、能够结合第一表位或第二表位的单克隆抗体的VH结构域(即,VHgp41或VH第二表位,并且为未被选择包含在双抗体的第一多肽链中的VH结构域)、任选地含有半胱氨酸残基第二间插间隔肽(连接体2)、异源二聚体促进结构域和C-末端(图1A-图1B)。对特定的表位特异性的采用的VL结构域和VH结构域优选地从相同单克隆抗体获得或源自相同单克隆抗体。然而,这种结构域可源自不同单克隆抗体,前提是它们缔合以形成能够免疫特异性结合这种表位的功能结合结构域。这种不同抗体在本文被称为“相应的”抗体。
这种双抗体的第一多肽链的VL结构域与这种双抗体的第二多肽链的VH结构域相互作用以形成对一个表位(例如,第一表位或第二表位)特异性的第一功能表位结合结构域。相似地,第二多肽链的VL结构域与第一多肽链的VH结构域相互作用以便形成对另一个表位(即,第二表位或第一表位)特异性的第二功能表位结合结构域。因此,第一多肽链和第二多肽链的VL结构域和VH结构域的选择是“协调的”,使得双抗体的两条多肽链共同包括能够结合第一表位和第二表位二者的VL结构域和VH结构域(即,它们共同包括VL第一表位/VH第一表位和VL第二表位/VH第二表位),比如VLgp41/VHgp41和VL第二表位/VH第二表位
最优选地,将这种VL结构域和VH结构域分开的间插间隔肽(即,“连接体1”)的长度被选择为基本上或完全防止多肽链的VL结构域和VH结构域彼此结合(例如,由0、1、2、3、4、5、6、7、8或9个间插连接体氨基酸残基组成)。因此,第一多肽链的VL结构域和VH结构域基本上或完全不能彼此结合。相似地,第二多肽链的VL结构域和VH结构域基本上或完全不能彼此结合。优选的间插间隔肽(连接体1)具有序列(SEQ ID NO:16):GGGSGGGG。
基于促进这种二聚化的一个或多个多肽结构域(即,“异源二聚体促进结构域”)的选择来选择第二间插间隔肽(“连接体2”)的长度和组成。典型地,第二间插间隔肽(“连接体2”)的长度将在3和20个氨基酸残基之间。特别地,在采用的异源二聚体促进结构域不包括半胱氨酸残基的情况下,利用含半胱氨酸的第二间插间隔肽(连接体2)。含半胱氨酸的第二间插间隔肽(连接体2)将含有1、2、3或大于3个半胱氨酸。优选的含半胱氨酸的间隔肽(连接体2)具有序列GGCGGG(SEQ ID NO:17)。可选地,连接体2不包括半胱氨酸(例如,GGG、GGGS(SEQ ID NO:18)、LGGGSG(SEQ ID NO:19)、GGGSGGGSGGG(SEQ ID NO:20)、ASTKG(SEQ IDNO:21)、LEPKSS(SEQ ID NO:22)、APSSS(SEQ ID NO:23)等)并且使用如下面描述的含半胱氨酸的异源二聚体促进结构域。任选地,使用含半胱氨酸的连接体2和含半胱氨酸的异源二聚体促进结构域二者。
异源二聚体促进结构域可为一条多肽链上的GVEPKSC(SEQ ID NO:24)或VEPKSC(SEQ ID NO:25)或AEPKSC(SEQ ID NO:26)和另一条多肽链上的GFNRGEC(SEQ ID NO:27)或FNRGEC(SEQ ID NO:28)(US2007/0004909)。
在优选的实施方式中,异源二聚体促进结构域将包括相反电荷的串联重复的螺旋结构域,例如,“E-螺旋”异源二聚体促进结构域(SEQ ID NO:29:EVAALEK-EVAALEK-EVAALEK-EVAALEK),在pH 7其谷氨酸残基将形成负电荷;或“K-螺旋”异源二聚体促进结构域(SEQ ID NO:30:KVAALKE-KVAALKE-KVAALKE-KVAALKE),在pH 7其赖氨酸残基将形成正电荷。这种带电的结构域的存在促进第一多肽和第二多肽之间的缔合,并且因此促进异源二聚体形成。可利用包括上述E-螺旋和K-螺旋序列的修饰的异源二聚体促进结构域,以便包括一个或多个半胱氨酸残基。这种半胱氨酸残基的存在允许存在于一条多肽上链的螺旋与存在于另一多肽链上的互补的螺旋共价结合,从而将多肽链彼此共价结合并且增加双抗体的稳定性。这种特别地优选的示例为包括具有氨基酸序列EVAACEK-EVAALEK-EVAALEK-EVAALEK(SEQ ID NO:31)的修饰的E-螺旋,和具有氨基酸序列KVAACKE-KVAALKE-KVAALKE-KVAALKE(SEQ ID NO:32)的修饰的K-螺旋的异源二聚体促进结构域。
如WO 2012/018687中公开的,为了改善双抗体的体内药物代谢动力学的特性,双抗体可被修饰以在双抗体的一个或多个末端包含结合血清的蛋白的多肽部分。最优选地,这种结合血清的蛋白的多肽部分将置于双抗体的多肽链的C-末端处。白蛋白是在血浆中最丰富的蛋白,并且在人中具有19天的半衰期。白蛋白具备数个小分子结合结构域,其允许白蛋白与其他蛋白非共价结合从而延长了它们的血清半衰期。链球菌(Streptococcus)菌株G148的蛋白G的结合白蛋白的结构域3(ABD3)由形成稳定的三螺旋束的46个氨基酸残基组成并且具有广泛的结合白蛋白的特异性(Johansson,M.U.等(2002)“Structure,Specificity,And Mode Of Interaction For Bacterial Albumin-Binding Modules,”J.Biol.Chem.277(10):8114-8120)。因此,用于改善双抗体的体内药物代谢动力学特性的结合血清的蛋白的特别地优选的多肽部分为来自链球菌蛋白G的结合白蛋白的结构域(ABD),并且更优选地为链球菌菌株G148的蛋白G的结合白蛋白的结构域3(ABD3)(SEQ IDNO:33):LAEAKVLANR ELDKYGVSDY YKNLIDNAKS AEGVKALIDE ILAALP。
如WO 2012/162068中公开的(通过引用并入本文),SEQ ID NO:33的“去免疫化”变体具有减弱或消除MHC II类结合的能力。基于组合的突变结果,下列的替换组合被认为是用于形成这种去免疫化ABD的优选替换:66D/70S+71A;66S/70S+71A;66S/70S+79A;64A/65A/71A;64A/65A/71A+66S;64A/65A/71A+66D;64A/65A/71A+66E;64A/65A/79A+66S;64A/65A/79A+66D;64A/65A/79A+66E。变体ABD具有修饰L64A、I65A和D79A或修饰N66S、T70S和D79A。特别优选具有氨基酸序列:
LAEAKVLANR ELDKYGVSDY YKNLID 66NAKS 70 A 71EGVKALIDE ILAALP(SEQ ID NO:34),
或氨基酸序列:
LAEAKVLANR ELDKYGVSDY YKNA 64 A 65NNAKT VEGVKALIA 79E ILAALP(SEQ ID NO:35),
或氨基酸序列:
LAEAKVLANR ELDKYGVSDY YKNLIS 66NAKS 70 VEGVKALIA 79E ILAALP(SEQ ID NO:36)的变体去免疫化ABD,因为这种去免疫化ABD展示出基本上野生型的结合,同时提供减弱的MHC II类结合。因此,具有ABD的这种双抗体的第一多肽链含有第三连接体(连接体3),其优选地定位在这种多肽链的E-螺旋(或K-螺旋)结构域的C-末端,以便间插在E-螺旋(或K-螺旋)结构域和ABD(其优选地为去免疫化ABD)之间。用于这种连接体3的优选的序列为SEQ IDNO:18:GGGS。
2.包括Fc结构域的多特异性的结合gp41的双抗体
本发明的一个实施方式涉及包括Fc结构域并且能够同时结合gp41的表位和第二表位(例如,不同HIV-1包膜蛋白质的表位,或在效应细胞的表面上表达的表位)的多特异性双抗体(例如,双特异性、三特异性、四特异性等)。这种分子的Fc结构域可为任何同种型的(例如,IgG1、IgG2、IgG3或IgG4)。分子可进一步包括CH1结构域和/或铰链结构域。当存在时,CH1结构域和/或铰链结构域可为任何同种型(例如,IgG1、IgG2、IgG3,或IgG4),并且优选地为与期望的Fc结构域相同的同种型。
将IgG CH2-CH3结构域添加至一条或两条双抗体多肽链,使得双抗体链复合导致Fc结构域的形成,增加了生物半衰期和/或改变了双抗体的效价。这种双抗体包括两条或更多条多肽链,其序列允许多肽链彼此共价结合以形成共价缔合的能够同时结合gp41和第二表位的双抗体。将IgG CH2-CH3结构域并入双抗体的两条多肽上将允许形成两链的双特异性的含Fc结构域的双抗体(图2)。
可选地,将IgG CH2-CH3结构域并入双抗体的仅一条多肽上将允许形成更复杂的四链的双特异性的含Fc结构域的双抗体(图3A-图3C)。图3C显示了具有恒定轻(CL)结构域和恒定重CH1结构域的代表性四链的双抗体,然而,可选地可采用这种结构域的部分以及其他多肽(见,例如,图3A和图3B,美国专利公布号2013-0295121;2010-0174053和2009-0060910;欧洲专利公布号EP 2714079;EP 2601216;EP 2376109;EP 2158221和PCT公布号WO 2012/162068;WO 2012/018687;WO 2010/080538)。因此,例如,代替CH1结构域,可采用源自人IgG的铰链结构域的具有氨基酸序列GVEPKSC(SEQ ID NO:24)、VEPKSC(SEQ ID NO:25)或AEPKSC(SEQ ID NO:26)的肽,并且代替CL结构域,可采用人κ轻链的C-末端6个氨基酸GFNRGEC(SEQ ID NO:27)或FNRGEC(SEQ ID NO:28)。在图3A中显示了含有代表性肽的四链双抗体。可选地,或另外地,可采用包括相反电荷的串联螺旋结构域比如“E-螺旋”螺旋结构域(SEQ ID NO:29:EVAALEK-EVAALEK-EVAALEK-EVAALEK或SEQ ID NO:31:EVAACEK-EVAALEK-EVAALEK-EVAALEK);和“K-螺旋”结构域(SEQ ID NO:30:KVAALKE-KVAALKE-KVAALKE-KVAALKE或SEQ ID NO:32:KVAACKE-KVAALKE-KVAALKE-KVAALKE)的肽。在图3B中显示了含有代表性螺旋结构域的四链双抗体。
本发明的含Fc结构域的双抗体分子可包括另外的间插间隔肽(连接体),一般这种连接体将并入异源二聚体促进结构域(例如,E-螺旋或K-螺旋)和CH2-CH3结构域之间和/或CH2-CH3结构域和可变结构域(即,VH或VL)之间。典型地,另外的连接体将包括3-20个氨基酸残基并且可任选地含有全部或一部分IgG铰链结构域(优选地IgG铰链结构域的含半胱氨酸的部分具有1、2、3或更多个半胱氨酸残基)。在本发明的双特异性含Fc结构域的双抗体分子中可采用的连接体包括:GGGS(SEQ ID NO:18)、LGGGSG(SEQ ID NO:19)、GGGSGGGSGGG(SEQ ID NO:20)、ASTKG(SEQ ID NO:21)、LEPKSS(SEQ ID NO:22)、APSSS(SEQ ID NO:23)、APSSSPME(SEQ ID NO:37)、VEPKSADKTHTCPPCP(SEQ ID NO:38)、LEPKSADKTHTCPPCP(SEQ IDNO:39)、DKTHTCPPCP(SEQ ID NO:40);scFv连接体:GGGGSGGGGSGGGGS(SEQ ID NO:41);“长”连接体:GGGGSGGGSGGG(SEQ ID NO:42)、GGC和GGG。为了易于克隆,可使用连接体LEPKSS(SEQ ID NO:22)代替GGG或GGC。另外,肽GGG或LEPKSS(SEQ ID NO:22)可紧随着DKTHTCPPCP(SEQ ID NO:40)以形成交替连接体:GGGDKTHTCPPCP(SEQ ID NO:43)和LEPKSSDKTHTCPPCP(SEQ ID NO:44)。除了或代替连接体,本发明的双特异性含Fc结构域的分子可并入IgG铰链结构域。示例性铰链结构域包括:来自IgG1的EPKSCDKTHTCPPCP(SEQ ID NO:7)、来自IgG2的ERKCCVECPPCP(SEQ ID NO:8)、来自IgG3的ELKTPLGDTTHTCPRCPEPKSCDTPPPCPRCPEPKSCDTPPPCPRCPEPKSCDTPPPCPRCP(SEQ ID NO:9)、来自IgG4的ESKYGPPCPSCP(SEQ ID NO:10)和ESKYGPPCPPCP(SEQ ID NO:11)、包括稳定的S228P替换(加下划线显示)(如通过Kabat中所示的EU索引所编号)的IgG4铰链变体,以减少链交换。
如图3A-图3C中提供的,本发明的含Fc结构域的双抗体可包括四条链。这种双抗体的第一多肽链和第三多肽链含有三个结构域:(i)含VL1的结构域、(ii)含VH2的结构域、(iii)异源二聚体促进结构域和(iv)含CH2-CH3序列的结构域。第二多肽链和第四多肽链含有:(i)含VL2的结构域、(ii)含VH1的结构域和(iii)异源二聚体促进结构域,其中异源二聚体促进结构域促进第一多肽链/第三多肽链与第二多肽链/第四多肽链的二聚化。第三多肽链和第四多肽链的VL结构域和/或VH结构域和第一多肽链和第二多肽链的VL结构域和/或VH结构域可为相同的或不同的,以便允许单特异性、双特异性或四特异性的四价结合。符号“VL3”和“VH3”分别表示这种双抗体的结合“第三表位”的轻链可变结构域和可变重链结构域。类似地,符号“VL4”和“VH4”分别表示这种双抗体的结合“第四表位”的轻链可变结构域和可变重链结构域。本发明的代表性四链双特异性含Fc结构域的双抗体的多肽链的总体结构提供在表2中:
Figure BDA0002902883590000361
Figure BDA0002902883590000371
HPD=异源二聚体促进结构域
在具体的实施方式中,本发明的双抗体为双特异性的、四价的(即,具备四个表位结合结构)、含Fc的双抗体,其由总计四条多肽链组成(图3A-图3C)。本发明的双特异性的、四价的、含Fc的双抗体包括两个第一表位结合结构域和两个第二表位结合结构域。
在进一步的实施方式中,本发明的含Fc结构域的双抗体可包括三条多肽链。这种双抗体的第一多肽含有三个结构域:(i)含VL1的结构域、(ii)含VH2的结构域和(iii)含CH2-CH3序列的结构域。这种双抗体的第二多肽含有:(i)含VL2的结构域、(ii)含VH1的结构域和(iii)促进与双抗体的第一多肽链的异源二聚化和共价结合的结构域。这种双抗体的第三多肽包括CH2-CH3序列。因此,这种双抗体的第一多肽链和第二多肽链缔合在一起以形成能够结合第一表位或第二表位的VL1/VH1表位结合结构域,以及能够结合另一个这种表位的VL2/VH2表位结合结构域。第一多肽和第二多肽通过涉及它们各自第三结构域中的半胱氨酸残基的二硫键彼此结合。注意,第一多肽链和第三多肽链经二硫键彼此复合以形成稳定的Fc结构域。这种双特异性双抗体具有增强的功效。图4A和图4B阐释了这种双抗体的结构。这种含Fc结构域的双抗体可具有两个定向中的一个(表3):
Figure BDA0002902883590000372
HPD=异源二聚体促进结构域
在具体的实施方式中,本发明的双抗体为双特异性的、二价的(即,具备两个结合表位的结构域)、含Fc的双抗体,其由总计三条多肽链组成(图4A-图4B)。本发明的双特异性的、二价的含Fc的双抗体包括对第一表位或第二表位免疫特异性的一个表位结合结构域,以及能够结合另一个这种表位的VL2/VH2表位结合结构域。
在进一步的实施方式中,含Fc结构域的双抗体可包括总计五条多肽链。在特别的实施方式中,五条多肽链的两条具有相同的氨基酸序列。这种双抗体的第一多肽链含有:(i)含VH1的结构域、(ii)含CH1的结构域和(iii)含CH2-CH3序列的结构域。第一多肽链可为含有VH1和重链恒定区的抗体的重链。这种双抗体的第二多肽链和第五多肽链含有:(i)含VL1的结构域和(ii)含CL的结构域。这种双抗体的第二多肽链和/或第五多肽链可为含有与第一多肽链/第三多肽链的VH1互补的VL1的抗体的轻链。第一多肽链、第二多肽链和/或第五多肽链可从天然存在的抗体分离。可选地,它们可重组地构建。这种双抗体的第三多肽链含有:(i)含VH1的结构域、(ii)含CH1的结构域、(iii)含CH2-CH3序列的结构域、(iv)含VL2的结构域、(v)含VH3的结构域和(vi)异源二聚体促进结构域,其中异源二聚体促进结构域促进第三链与第四链的二聚化。这种双抗体的第四多肽含有:(i)含VL3的结构域、(ii)含VH2的结构域和(iii)促进与双抗体的第三多肽链的异源二聚化和共价结合的结构域。
因此,这种双抗体的第一多肽链和第二多肽链以及第三多肽链和第五多肽链缔合在一起以形成两个能够结合第一表位的VL1/VH1表位结合结构域。这种双抗体的第三多肽链和第四多肽链缔合在一起以形成能够结合第二表位的VL2/VH2表位结合结构域,以及能够结合第三表位的VL3/VH3表位结合结构域。第一多肽和第三多肽通过涉及它们各自恒定区中的半胱氨酸残基的二硫键彼此结合。注意,第一多肽链和第三多肽链彼此复合以形成Fc结构域。这种多特异性双抗体具有增强的功效。图5阐释了这种双抗体的结构。应当理解,VL1/VH1结构域、VL2/VH2结构域和VL3/VH3结构域可为相同的或不同的,以便允许单特异性、双特异性或三特异性的结合。
选择多肽链的VL结构域和VH结构域,以便形成对期望的表位特异性的VL/VH表位结合结构域。由多肽链的缔合形成的VL/VH表位结合结构域可为相同的或不同的,以便允许单特异性的、双特异性的、三特异性的或四特异性的四价结合。特别地,可以选择VL结构域和VH结构域,使得多价双抗体可包括针对第一表位的两个结合结构域和针对第二表位的两个结合结构域,或针对第一表位的三个结合结构域和针对第二表位的一个结合结构域,或针对第一表位的两个结合结构域、针对第二表位的一个结合结构域和针对第三表位的一个结合结构域(如图5中描绘的)。本发明的代表性五链含Fc结构域的双抗体的多肽链的总体结构提供在表4中:
Figure BDA0002902883590000391
HPD=异源二聚体促进结构域
在具体的实施方式中,本发明的双抗体为双特异性的、四价的(即,具有四个结合表位的结构域)、含Fc的双抗体,其由总计五条多肽链组成,具有对第一表位免疫特异性的两个表位结合结构域和对第二表位特异性的两个表位结合结构域。在另一实施方式中,本发明的双特异性的、四价的、含Fc的双抗体包括对第一表位免疫特异性的三个表位结合结构域和对第二表位特异性的一个表位结合结构域。如以上提供的,可选择VL结构域和VH结构域以允许三特异性结合。相应地,本发明也涵盖三特异性的、四价的、含Fc的双抗体。本发明的三特异性的、四价的、含Fc的双抗体包括对第一表位免疫特异性的两个表位结合结构域、对第二表位免疫特异性的一个表位结合结构域和对第三表位免疫特异性的一个表位结合结构域。
在传统的免疫功能中,抗体-抗原复合物与免疫系统的细胞的相互作用导致各种各样的应答,范围从效应子功能比如抗体-依赖性细胞毒性、大细胞脱粒和吞噬至免疫调节信号比如调节淋巴细胞增殖和抗体分泌。所有这些相互作用通过抗体或免疫复合物的Fc结构域与造血细胞上特有的细胞表面受体的结合被启动。如以上讨论的,通过抗体和免疫复合物触发的细胞应答的多样性由三种Fc受体:FcγRI(CD64)、FcγRII(CD32)和FcγRIII(CD16)的结构异质性引起。FcγRI(CD64)、FcγRIIA(CD32A)和FcγRIII(CD16)为激活(即,免疫系统增强)受体;FcγRIIB(CD32B)为抑制(即,免疫系统降低)受体。另外,与新生Fc受体(FcRn)的相互作用介导IgG分子由内体至细胞表面的再循环并且释放至血液。以上呈现了示例性野生型IgG1(SEQ ID NO:12)、IgG2(SEQ ID NO:13)、IgG3(SEQ ID NO:14)和IgG4(SEQ ID NO:15)的氨基酸序列。
Fc结构域的修饰可导致改变的表型,例如改变的血清半衰期、改变的稳定性、改变的对细胞酶的敏感性或改变的效应子功能。所以,针对效应子功能,可期望修饰本发明的含Fc结构域的结合分子,例如,以便增强这种分子在治疗癌症中的功效。在某些情况下,Fc结构域介导的效应子功能的减少或消除是期望的,例如在抗体的作用机理涉及阻断或拮抗作用但不杀死携带靶抗原的细胞的情况下。当针对非期望的细胞,比如其中FcγRs在低水平表达的肿瘤和外源细胞,例如,具有低水平的FcγRIIB的肿瘤特异性B细胞(例如,非霍奇金淋巴瘤、CLL和Burkitt淋巴瘤)时,通常期望增加的效应子功能。具备这种赋予的或改变的效应子功能活性的本发明的分子用于治疗和/或预防其中期望增强功效的效应子功能活性的疾病、不适(disorder)或感染。
相应地,在某些实施方式中,本发明的结合gp41的含Fc结构域的分子的Fc结构域可为工程化的变体Fc结构域。尽管本发明的双特异性含Fc结构域的分子的Fc结构域可具备结合一个或多个Fc受体(例如,FcγR)的能力,但是更优选地这种变体Fc结构域具有改变的结合FcγRIA(CD64)、FcγRIIA(CD32A)、FcγRIIB(CD32B)、FcγRIIIA(CD16A)或FcγRIIIB(CD16B)(相对于野生型Fc结构域展示出的结合),例如,将具有增强的结合激活受体和/或将具有基本上减少的结合抑制受体或没有结合抑制受体的能力。因此,本发明的含Fc结构域的分子的Fc结构域可包括完整Fc结构域的部分或全部CH2结构域和/或部分或全部CH3结构域,或可包括变体CH2和/或变体CH3序列(其可包括,例如,相对于完整Fc结构域的CH2结构域或CH3结构域的一个或多个插入和/或一个或多个删除)。这种Fc结构域可包括非Fc多肽部分,或可包括部分非天然完整的Fc结构域,或可包括非天然存在的定向的CH2结构域和/或CH3结构域(比如,例如,两个CH2结构域或两个CH3结构域,或在N-末端至C-末端方向上,连接至CH2结构域的CH3结构域等)。
鉴定为改变效应子功能的Fc结构域修饰在本领域是已知的,其包括增加结合激活受体(例如,FcγRIIA(CD16A)和减少结合抑制受体(例如,FcγRIIB(CD32B)的修饰(见,例如,Stavenhagen,J.B.等(2007)“Fc Optimization Of Therapeutic AntibodiesEnhances Their Ability To Kill Tumor Cells In Vitro And Controls TumorExpansion In Vivo Via Low-Affinity Activating Fcgamma Receptors,”CancerRes.57(18):8882-8890)。表5列出了增加结合激活受体和/或减少结合抑制受体的示例性修饰的示例性单重、双重、三重、四重或五重替换((根据EU索引的)编号和替换为相对于如以上呈现的SEQ ID NO:12的氨基酸序列)
Figure BDA0002902883590000411
Figure BDA0002902883590000421
具有减少的结合CD32B和/或增加的结合CD16A的人IgG1 Fc结构域的示例性变体含有F243L、R292P、Y300L、V305I或P396L替换,其中编号为如Kabat中的EU索引的编号。这些氨基酸替换可以任何组合存在于人IgG1 Fc结构域中。在一个实施方式中,变体人IgG1 Fc结构域含有F243L、R292P和Y300L替换。在另一实施方式中,变体人IgG1 Fc结构域含有F243L、R292P、Y300L、V305I和P396L替换。
在某些实施方式中,本发明的含Fc结构域的结合分子的Fc结构域优选地展示出减少的(或基本上不)结合FcγRIA(CD64)、FcγRIIA(CD32A)、FcγRIIB(CD32B)、FcγRIIIA(CD16A)或FcγRIIIB(CD16B)(相对于由野生型IgG1 Fc结构域(SEQ ID NO:12)展示出的结合)。在具体的实施方式中,本发明的含Fc结构域的结合分子包括IgG Fc结构域,其展示出减少的抗体-依赖性细胞-介导细胞毒性(ADCC)效应子功能。在优选的实施方式中,这种结合分子的CH2-CH3结构域包括下列替换中的任何1个、2个、3个或4个:L234A、L235A、D265A、N297Q和N297G,其中编号为如Kabat中的EU索引的编号。在另一实施方式中,CH2-CH3结构域含有N297Q替换、N297G替换、L234A和L235A替换或D265A替换,因为这些突变消除了FcR结合。可选地,利用固有地展示出减少的(或基本上不)结合FcγRIIIA(CD16A)和/或减少的效应子功能(相对于由野生型IgG1 Fc结构域(SEQ ID NO:12)展示出的结合和效应子功能)的天然存在的Fc结构域的CH2-CH3结构域。在具体的实施方式中,本发明的含Fc结构域的结合分子包括IgG2 Fc结构域(SEQ ID NO:13)、IgG3 Fc结构域(SEQ ID NO:14)或IgG4 Fc结构域(SEQ ID NO:15)。当利用IgG4 Fc结构域时,本发明也涵盖引入稳定的突变,比如上述铰链区S228P替换(见,例如,SEQ ID NO:11)。因为N297G、N297Q、L234A、L235A和D265A替换消除了效应子功能,在其中期望效应子功能的情形下,可优选地不采用这些替换。
具有减少或消除效应子功能的本发明的含Fc结构域的分子的CH2结构域和CH3结构域的优选的IgG1序列将包括替换L234A/L235A(SEQ ID NO:45):APEAAGGPSV FLFPPKPKDTLMISRTPEVT CVVVDVSHED PEVKFNWYVDGVEVHNAKTK PREEQYNSTY RVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPA PIEKTISKAK GQPREPQVYT LPPSREEMTK NQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENN YKTTPPVLDS DGSFFLYSKL TVDKSRWQQGNVFSCSVMHE ALHNHYTQKS LSLSPGX
其中X是赖氨酸(K)或不存在。
包括Fc结构域的蛋白质的血清半衰期可通过增加Fc结构域对FcRn的结合亲和力而增加。如本文使用的术语“半衰期”意指分子的药物代谢动力学特性,其是分子在其施用后平均存活时间的度量。半衰期可表示为从受试者(例如,人患者或其他哺乳动物)的身体或其特定区室消除已知量的分子的百分之五十(50%)需要的时间,例如,如在血清中测量的,即循环半衰期,或在其他组织中测量的。一般而言,半衰期的增加导致施用的分子在循环中的平均停留时间(MRT)的增加。
在一些实施方式中,本发明的含Fc结构域的结合分子包括变体Fc结构域,其包括相对于野生型Fc结构域的至少一个氨基酸修饰,使得分子具有增加的半衰期(相对于如果包括野生型Fc结构域的这种分子)。在一些实施方式中,本发明的含Fc结构域的结合分子包括变体IgG Fc结构域,其在选自由下列组成的组中的一个或多个位置处包括延长半衰期的氨基酸替换:238、250、252、254、256、257、256、265、272、286、288、303、305、307、308、309、311、312、317、340、356、360、362、376、378、380、382、413、424、428、433、434、435和436,其中编号为如Kabat中的EU索引的编号。能够增加含Fc结构域的分子的半衰期的许多突变在本领域是已知的,并且其包括,例如M252Y、S254T、T256E和其组合。例如,见下列中描述的突变:美国专利号6,277,375、7,083,784、7,217,797、8,088,376;美国公开号2002/0147311、2007/0148164;和PCT公开号WO 98/23289、WO 2009/058492和WO 2010/033279,其通过引用以其整体并入本文。
在一些实施方式中,展示出增加的半衰期的本发明的含Fc结构域的结合分子具有变体Fc结构域,其包括在Fc结构域残基250、252、254、256、257、288、307、308、309、311、378、428、433、434、435和436的两个或更多个处的替换。特别地,两个或更多个替换选自:T250Q、M252Y、S254T、T256E、K288D、T307Q、V308P、A378V、M428L、N434A、H435K和Y436I,其中编号为如Kabat中的EU索引的编号。在具体的实施方式中,这种分子可具有变体IgG Fc结构域,其包括替换:
(A)M252Y、S254T和T256E;
(B)M252Y和S254T;
(C)M252Y和T256E;
(D)T250Q和M428L;
(E)T307Q和N434A;
(F)A378V和N434A;
(G)N434A和Y436I;
(H)V308P和N434A;或
(I)K288D和H435K。
在优选的实施方式中,本发明的结合gp41的含Fc结构域的分子具有变体IgG Fc区,其包括下列替换中的任何1个、2个或3个:M252Y、S254T和T256E。本发明进一步涵盖具有变体Fc区的结合gp41的分子,其包括:
(A)改变效应子功能和/或FcγR的一个或多个突变;和
(B)延长血清半衰期的一个或多个突变。
提供增加的半衰期的(并且其在结合食蟹猴和人FcRn二者具有10倍的增加)(Dall’Acqua,W.F.等(2006)“Properties of Human IgG1s Engineered for EnhancedBinding to the Neonatal Fc Receptor(FcRn),”J.Biol.Chem.281(33):23514-23524)的本发明的含Fc结构域的分子的CH2结构域和CH3结构域的IgG1序列将包括替换M252Y/S254T/T256E(SEQ ID NO:46):
APELLGGPSV FLFPPKPKDT LYITREPEVT CVVVDVSHED PEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTY RVVSVLTVLH QDWLNGKEYKCKVSNKALPA PIEKTISKAK GQPREPQVYT LPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVE WESNGQPENN YKTTPPVLDS DGSFFLYSKL TVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKS LSLSPGX
其中X是赖氨酸(K)或不存在。
组合由替换L234A/L235A提供的减少或消除的效应子功能和由替换M252Y/S254T/T256E提供的增加的血清半衰期的本发明的含Fc结构域的分子的CH2结构域和CH3结构域的可选IgG1序列由SEQ ID NO:47提供:
APEAAGGPSV FLFPPKPKDT LYITREPEVT CVVVDVSHED PEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTY RVVSVLTVLH QDWLNGKEYKCKVSNKALPA PIEKTISKAK GQPREPQVYT LPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVE WESNGQPENN YKTTPPVLDS DGSFFLYSKL TVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKS LSLSPGX
其中X是赖氨酸(K)或不存在。
对于期望具有不同氨基酸序列的含Fc结构域的多肽链(例如,期望其含Fc结构域的多肽链是不相同的)的某些抗体、双抗体和三价结合分子,期望减少或防止在相同链的CH2-CH3结构域之间(例如,两条第一多肽链或两条第三多肽链的CH2-CH3结构域之间)发生同源二聚化。这种多肽链的CH2结构域和/或CH3结构域的序列不需要为相同的,并且有利地被修饰以促进两条多肽链之间的异源二聚体复合。例如,氨基酸替换(优选地,用包括形成“杵(knob)”的庞大侧基的氨基酸,例如色氨酸替换)可引入至CH2或CH3结构域,使得空间干扰将防止与类似突变的结构域的相互作用,并且将迫使突变的结构域与互补的或适应性的突变已经被工程化至其中的结构域即“臼(hole)”(例如,用甘氨酸替换)配对。这种突变的组可被工程化进入任何对的多肽,其包括形成Fc结构域的CH2-CH3结构域以促进异源二聚化。相对于同源二聚化,支持异源二聚化的蛋白质工程化方法是本领域熟知的,特别是关于免疫球蛋白样的分子的工程化,并且被涵盖在本文中(见,例如,Ridgway等(1996)“‘Knobs-Into-Holes’Engineering Of Antibody CH3 Domains For Heavy ChainHeterodimerization,”Protein Engr.9:617-621,Atwell等(1997)“Stable HeterodimersFrom Remodeling The Domain Interface Of A Homodimer Using A Phage DisplayLibrary,”J.Mol.Biol.270:26-35,和Xie等(2005)“A New Format Of BispecificAntibody:Highly Efficient Heterodimerization,Expression And Tumor CellLysis,”J.Immunol.Methods 296:95-101;其每一篇通过引用以其整体并入本文)。
优选的杵通过修饰IgG Fc结构域以含有修饰T366W形成。优选的臼通过修饰IgGFc结构域以含有修饰T366S、L368A和Y407V形成。为了有助于从最终的双特异性异源二聚体的含Fc结构域的分子中纯化携带臼的多肽链同源二聚体,多肽链的携带臼的CH2结构域和CH3结构域的蛋白A结合结构域优选地通过在位置435处的氨基酸替换(H435R)而突变。因此,携带臼的多肽链同源二聚体将不结合蛋白A,而双特异性异源二聚体将经蛋白A结合结构域而保留其结合蛋白A的能力。在可选的实施方式中,携带臼的多肽链可在位置434和435处并入氨基酸替换(N434A/N435K)。
本发明的含Fc结构域的分子的一条含Fc结构域的多肽链的CH2结构域和CH3结构域的优选的IgG1氨基酸序列将具有“携带杵”的序列(SEQ ID NO:48):
APEAAGGPSV FLFPPKPKDT LMISRTPEVT CVVVDVSHED PEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTY RVVSVLTVLH QDWLNGKEYKCKVSNKALPA PIEKTISKAK GQPREPQVYT LPPSREEMTKNQVSLWCLVKGFYPSDIAVE WESNGQPENN YKTTPPVLDS DGSFFLYSKL TVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKS LSLSPGX
其中X是赖氨酸(K)或不存在。
本发明的具有M252Y/S254T/T256E替换和“携带杵”的序列的含Fc结构域的分子的一条含Fc结构域的多肽链的CH2结构域和CH3结构域的可选的IgG1氨基酸序列为SEQ IDNO:49:
APEAAGGPSV FLFPPKPKDT LYITREPEVT CVVVDVSHED PEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTY RVVSVLTVLH QDWLNGKEYKCKVSNKALPA PIEKTISKAK GQPREPQVYT LPPSREEMTKNQVSLWCLVKGFYPSDIAVE WESNGQPENN YKTTPPVLDS DGSFFLYSKL TVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKS LSLSPGX
其中X是赖氨酸(K)或不存在。
本发明的具有两条多肽链的含Fc结构域的分子的另一条含Fc结构域的多肽链(或具有三条、四条或五条多肽链的含Fc结构域的分子的第三多肽链)的CH2结构域和CH3结构域的优选的IgG1氨基酸序列将具有“携带臼”的序列(SEQ ID NO:50):
APEAAGGPSV FLFPPKPKDT LMISRTPEVT CVVVDVSHED PEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTY RVVSVLTVLH QDWLNGKEYKCKVSNKALPA PIEKTISKAK GQPREPQVYT LPPSREEMTKNQVSLSCAVKGFYPSDIAVE WESNGQPENN YKTTPPVLDS DGSFFLVSKL TVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNRYTQKS LSLSPGX
其中X是赖氨酸(K)或不存在。
本发明的具有M252Y/S254T/T256E替换和“携带臼”的序列的含Fc结构域的分子的另一条含Fc结构域的多肽链的CH2结构域和CH3结构域的可选的IgG1氨基酸序列为SEQ IDNO:51:
APEAAGGPSV FLFPPKPKDT LYITREPEVT CVVVDVSHED PEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTY RVVSVLTVLH QDWLNGKEYKCKVSNKALPA PIEKTISKAK GQPREPQVYT LPPSREEMTKNQVSLSCAVKGFYPSDIAVE WESNGQPENN YKTTPPVLDS DGSFFLVSKL TVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNRYTQKS LSLSPGX
其中X是赖氨酸(K)或不存在。
本发明的含Fc结构域的分子的一条含Fc结构域的多肽链的CH2结构域和CH3结构域的IgG4氨基酸序列具有增加的血清半衰期(相对于IgG1 CH2结构域和CH3结构域),原因是其具备Y252/T254/E256(SEQ ID NO:52):
APEFLGGPSV FLFPPKPKDT LYITREPEVT CVVVDVSQED PEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTY RVVSVLTVLH QDWLNGKEYKCKVSNKGLPS SIEKTISKAK GQPREPQVYT LPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVE WESNGQPENN YKTTPPVLDS DGSFFLYSRL TVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKS LSLSLGX
其中X是赖氨酸(K)或不存在。
这种IgG4 CH2-CH3氨基酸序列的“携带杵”的变体具有SEQ ID NO:53的氨基酸序列:
APEFLGGPSV FLFPPKPKDT LYITREPEVT CVVVDVSQED PEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTY RVVSVLTVLH QDWLNGKEYKCKVSNKGLPS SIEKTISKAK GQPREPQVYT LPPSQEEMTKNQVSLWCLVKGFYPSDIAVE WESNGQPENN YKTTPPVLDS DGSFFLYSRL TVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKS LSLSLGX
其中X是赖氨酸(K)或不存在。
这种IgG4 CH2-CH3氨基酸序列的“携带臼”的变体具有SEQ ID NO:54的氨基酸序列:
APEFLGGPSV FLFPPKPKDT LYITREPEVT CVVVDVSQED PEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTY RVVSVLTVLH QDWLNGKEYKCKVSNKGLPS SIEKTISKAK GQPREPQVYT LPPSQEEMTKNQVSLSCAVKGFYPSDIAVE WESNGQPENN YKTTPPVLDS DGSFFLVSRL TVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNRYTQKS LSLSLGX
其中X是赖氨酸(K)或不存在。
如将指出的,SEQ ID NO:51、SEQ ID NO:52、SEQ ID NO:53和SEQ ID NO:54的CH2-CH3结构域包括在位置234处用丙氨酸和在位置235处用丙氨酸的替换,并且因此形成展示出减少的(或基本上不)结合FcγRIA(CD64)、FcγRIIA(CD32A)、FcγRIIB(CD32B)、FcγRIIIA(CD16A)或FcγRIIIB(CD16B)(相对于由野生型Fc结构域(SEQ ID NO:12)展示的结合)的Fc结构域。本发明也涵盖这种CH2-CH3结构域,其包括野生型丙氨酸残基,修饰Fc结构域的效应子功能和/或FγR结合活性的可选的替换和/或另外的替换。本发明也涵盖这种CH2-CH3结构域,其进一步包括一个或多个延长半衰期的氨基酸替换。特别地,本发明涵盖进一步包括M252Y/S254T/T256E的这种携带臼的和这种携带杵的CH2-CH3结构域。
优选地,第一多肽链将具有“携带杵”的CH2-CH3序列,比如SEQ ID NO:48或SEQ IDNO:49的序列。然而,如将认识到,“携带臼”的CH2-CH3结构域(例如,SEQ ID NO:50或SEQ IDNO:51)可被采用在第一多肽链中,在这种情况下,“携带杵”的CH2-CH3结构域(例如,SEQ IDNO:48或SEQ ID NO:49)将被采用在具有两条多肽链的本发明的含Fc结构域的分子的第二多肽链中(或在具有三条、四条或五条多肽链的含Fc结构域的分子的第三多肽链中)。
在其他实施方式中,本发明涵盖含Fc结构域的结合分子,其包括已经使用本领域已知的突变进行工程化以比同源二聚化更利于异源二聚化的CH2结构域和/或CH3结构域,比如在PCT公开号WO 2007/110205、WO 2011/143545、WO 2012/058768、WO 2013/06867、WO2014/081955、WO 2016/086189公开的那些,其所有通过引用以其整体并入本文。
3.含有Fc结构域的三价结合分子
本发明的进一步实施方式涉及三价结合分子,其包括Fc结构域并且能够同时结合第一表位、第二表位和第三表位,其中这些表位的至少一个与另一个表位是不相同的。这种三价结合分子包括三个表位结合结构域,其中两个为双抗体型结合结构域,其提供结合结构域A和结合结构域B,并且其中之一为Fab型结合结构域或scFv-型结合结构域,其提供结合结构域C(见,例如,图6A-图6F,PCT公布号WO 2015/184207和WO 2015/184203)。这种三价结合分子因此包括这种三价结合分子的能够结合第一表位的“VL1”/“VH1”结构域和能够结合第二表位的“VL2”/“VH2”结构域和能够结合第三表位的“VL3”和“VH3”结构域。“双抗体型结合结构域”为存在于双抗体中的表位结合结构域类型,如上述,其中单个多肽链包括VL结构域和VH结构域二者,但是这种结构域不相互作用以形成表位结合位点。“Fab型结合结构域”和“scFv型结合结构域”中的每一种为存在于抗体中的表位结合结构域的类型,如上述,其中单个多肽链包括(1)VL结构域或VH结构域,并且第二多肽链包括相应的VH结构域或VL结构域,以便形成表位结合位点,或(2)VL结构域和VH结构域二者,其中这种结构域相互作用以形成表位结合位点。Fab型结合结构域也与双抗体型结合结构域的区别在于形成Fab型结合结构域的两条多肽链仅包括单个表位结合结构域,而形成双抗体型结合结构域的两条多肽链包括至少两个表位结合结构域。类似地,scFv型结合结构域与双抗体型结合结构域的区别也在于它们仅包括单个表位结合结构域。因此,如本文使用的Fab型和scFv型结合结构域与双抗体型结合结构域是不同的。
典型地,本发明的三价结合gp41的分子将包括四条不同多肽链(见图6A-图6B),然而,分子可包括更少或更多数目的多肽链,例如通过将这种多肽链彼此融合(例如,经肽键),或通过将这种多肽链分开以形成另外的多肽链,或通过将更少或另外的多肽链经二硫键缔合。图6C-图6F通过示意性描绘具有三条多肽链这种分子而阐释了本发明的该方面。如图6A-图6F中提供的,本发明的三价结合分子可具有可选的定向,其中双抗体型结合结构域在Fc结构域的N-末端(图6A、图6C和图6D)或C-末端(图6B、图6E和图6F)。可用于产生三价结合分子的CH2结构域和CH3结构域在上文提供并且包括携带杵的和携带臼的结构域。
在某些实施方式中,本发明的这种三价结合gp41的分子的第一多肽链含有:(i)含VL1的结构域、(ii)含VH2的结构域、(iii)异源二聚体促进结构域和(iv)含CH2-CH3序列的结构域。VL1结构域和VL2结构域位于含CH2-CH3的结构域的N-末端或C-末端,如表5中所示(也见,图6A和图6B)。这种实施方式的第二多肽链含有:(i)含VL2的结构域、(ii)含VH1的结构域和(iii)异源二聚体促进结构域。这种实施方式的第三多肽链含有:(i)含VH3的结构域、(ii)含CH1的结构域和(iii)含CH2-CH3序列的结构域。第三多肽链可为含有VH3和重链恒定区的抗体或含有这种结构域的多肽的重链。这种实施方式的第四多肽含有:(i)含VL3的结构域和(ii)含CL的结构域。第四多肽链可为含有与第三多肽链的VH3互补的VL3的抗体或含有这种结构域的多肽的轻链。第三多肽链或第四多肽链可从天然存在的抗体分离。可选地,它们可重组地、合成地或通过其他手段构建。
第一多肽链和第二多肽链的轻链可变结构域通过间插间隔肽与这种多肽链的重链可变结构域分开,所述间插间隔肽具有的长度太短而不允许它们的VL1/VH2(或它们的VL2/VH1)结构域缔合在一起以形成能够结合第一表位或第二表位的表位结合结构域。用于该目的的优选的间插间隔肽(连接体1)具有序列(SEQ ID NO:16):GGGSGGGG。三价结合分子的其他结构域可通过任选地包括半胱氨酸残基的一个或多个间插间隔肽(连接体)分开。特别地,如以上提供的,这种连接体将通常被并入在可变结构域(即,VH或VL)和肽异源二聚体促进结构域(例如,E-螺旋或K-螺旋)之间以及这种肽异源二聚体促进结构域(例如,E-螺旋或K-螺旋)和CH2-CH3结构域之间。上面提供了用于产生三价结合分子的示例性连接体并且也提供在国际专利公布号:WO 2015/184207和WO 2015/184203。因此,这种三价结合分子的第一多肽链和第二多肽链缔合在一起以形成能够结合第一表位的VL1/VH1结合结构域,以及能够结合第二表位的VL2/VH2结合结构域。这种三价结合分子的第三多肽链和第四多肽链缔合在一起以形成能够结合第三表位的VL3/VH3结合结构域。
如上所述,本发明的三价结合gp41的分子可包括三条多肽。包括三条多肽链的三价结合分子可通过N-末端的第四多肽的结构域连接至第三多肽的含VH3的结构域(例如,使用间插间隔肽(连接体4))获得。可选地,利用本发明的含有下列结构域的三价结合分子的第三多肽链:(i)含VL3的结构域、(ii)含VH3的结构域和(iii)含CH2-CH3序列的结构域,其中VL3和VH3通过间插间隔肽彼此间隔开,所述间插间隔肽足够长(至少9个或更多个氨基酸残基)以便允许这些结构域缔合以形成表位结合结构域。用于该目的一个优选的间插间隔肽具有序列:GGGGSGGGGSGGGGS(SEQ ID NO:41)。
应当理解,这种三价结合分子的VL1/VH1、VL2/VH2和VL3/VH3结构域可不同,以便允许单特异性、双特异性或三特异性的结合。特别地,可选择VL结构域和VH结构域,使得三价结合分子包括针对第一表位的两个结合结构域和针对第二表位的一个结合结构域,或针对第一表位的一个结合结构域和针对第二表位的两个结合结构域,或针对第一表位的一个结合结构域、针对第二表位的一个结合结构域和针对第三表位的一个结合结构域。
本发明的代表性三价结合分子的多肽链的总体结构提供在图6A-图6H中和
表6中:
Figure BDA0002902883590000511
HPD=异源二聚体促进结构域
如以上提供的,这种三价结合分子可包括三条、四条、五条或更多条多肽链。
IV.本发明的示例性结合gp41的分子
本发明涉及能够结合gp41 HIV-1包膜(Env)蛋白质的表位的结合gp41的分子(例如,抗体、双抗体、scFv、抗体、
Figure BDA0002902883590000521
tridentTM等),因为它们具备具有7B2抗体的结合特异性的优化的gp41结合结构域。
A.HIV的包膜(Env)糖蛋白
HIV的包膜(Env)糖蛋白在多产地感染的细胞的表面上表达。HIV 1型(HIV-1)通过被称为转胞吞作用的过程中的所有传播中的粘膜进入宿主(Shen,R.等(2010)“GP41-Specific Antibody Blocks Cell-Free HIV Type 1Transcytosis Through HumanRectal Mucosa And Model Colonic Epithelium,”J.Immunol.184(7):3648-3655)。已经报道,跨肠和生殖器上皮的HIV-1转胞吞作用涉及病毒组分,其包括gp41 env蛋白质(Bomsel,M.等(1998)“Intracellular Neutralization Of HIV Transcytosis AcrossTight Epithelial Barriers By Anti-HIV Envelope Protein dIgA Or IgM,”Immunity9:277-287;Alfsen,A.等(2002)“HIV-1Gp41 Envelope Residues 650-685Exposed OnNative Virus Act As A Lectin To Bind Epithelial Cell Galactosyl Ceramide,”J.Biol.Chem.277:25649-25659;Alfsen,A.等(2001)“Secretory IgA Specic For AConserved Epitope On gp41 Envelope Glycoprotein Inhibits EpithelialTranscytosis Of HIV-1,”J.Immunol.166:6257-6265;Tudor,D.等(2009)“HIV-1gp41-Specific Monoclonal Mucosal IgAs Derived from Highly Exposed But IgG-Seronegative Individuals Block HIV-1Epithelial Transcytosis And NeutralizeCD4+Cell Infection:An IgA Gene And Functional Analysis,”Mucosal Immunol.2:412-426)、gp120和gp160;和宿主上皮细胞受体和附接分子,包括糖鞘脂半乳糖神经酰胺、辅助受体CCR5和硫酸肝素蛋白聚糖附接受体、多配体聚糖和集聚蛋白(Shen,R.等(2010)“GP41-Specific Antibody Blocks Cell-Free HIV Type 1Transcytosis Through HumanRectal Mucosa and Model Colonic Epithelium,”J.Immunol.184(7):3648-3655。
因此,gp41可用作用于细胞毒素免疫缀合物(IC)的靶,其中包括毒素、药物或放射性核素的细胞-杀伤部分化学或基因连接至结合gp41的分子(见,例如,Pincus,S.H.等(2017)“Design and In Vivo Characterization of Immunoconjugates Targeting HIVgp160,”J.Virol.91(3).pii:e01360-16.doi:10.1128/JVI.01360-16)。
B.抗体7B2
抗体7B2(Genbank登记号JX188438和JX188439)为在分子的免疫显性的螺旋-环-螺旋区中598-604处结合HIV gp41的抗HIV env人IgG1抗体(Sadraeian,M.等(2017)“Selective Cytotoxicity Of A Novel Immunotoxin Based On Pulchellin A ChainFor Cells Expressing HIV Envelope,”Sci.Rep.7(1):7579doi:10.1038/s41598-017-08037-3)。使用Epstein-Barr(EB)病毒B细胞转化和异种杂交瘤产生而从HIV-1慢性感染的受试者分离抗体(Pincus,S.H.等(2003)“In Vivo Efficacy Of Anti-Glycoprotein 41,But Not Anti-Glycoprotein 120,Immunotoxins In A Mouse Model Of HIVInfection,”J.Immunol.170(4):2236-2241)。已经发现抗体7B2能够识别病毒颗粒和感染细胞二者(Santra,S.等(2015)“Human Non-neutralizing HIV-1Envelope MonoclonalAntibodies Limit the Number of Founder Viruses during SHIV Mucosal Infectionin Rhesus Macaques,”PLoS Pathog.11(8):e1005042.doi:10.1371/journal.ppat.1005042;Tay,M.Z.等(2016)“Antibody-Mediated Internalization ofInfectious HIV-1Virions Differs among Antibody Isotypes and Subclasses,”PLoSPathog.12(8):e1005817.doi:10.1371/journal.ppat.1005817)。
7B2抗体的VL结构域的氨基酸序列(SEQ ID NO:55)在下面和图7A中显示(CDRL残基用下划线显示):
DIVMTQSPDS LAVSPGERAT IHCKSSQTLL YSSNNRHSIA WYQQRPGQPPKLLLYWASMR LSGVPDRFSG SGSGTDFTLT INNLQAEDVA IYYCHQYSSHPPTFGHGTRV EIK
7B2抗体的VH结构域的氨基酸序列(SEQ ID NO:56)在下面和图7B中显示(CDRH残基用下划线显示):
QVQLVQSGGG VFKPGGSLRL SCEASGFTFT EYYMTWVRQAPGKGLEWLAY ISKNGEYSKY SPSSNGRFTI SRDNAKNSVF LQLDRLSADDTAVYYCARAD GLTYFSELLQ YIFDLWGQGA RVTVSS
C.优化的7B2GL
优化的7B2GL抗体的VL结构域的氨基酸序列(SEQ ID NO:57)在下面和图7A中显示(CDRL残基用下划线显示):
DIVMTQSPDS LAVSLGERAT INCKSSQTLL YSSNNRHSIA WYQQKPGQPP KLLIYWASMR LSGVPDRFSG SGSGTDFTLT ISSLQAEDVA VYYCHQYSSH PPTFGQGTKV EIK
优化的7B2GL抗体的VH结构域的氨基酸序列(SEQ ID NO:58)在下面和图7B中显示(CDRH残基用下划线显示):
QVQLVESGGG LVKPGGSLRL SCAASGFTFS EYYMTWIRQA PGKGLEWVSY ISKNGEYSKY SPSSNGRFTI SRDNAKNSLY LQMNSLRAED TAVYYCARAD GLTYFSELLQ YIFDLWGQGT LVTVSS
V.示例性效应细胞结合能力
如本文提供的,本发明涉及能够结合gp41的表位和效应细胞表面分子(“ECM”)的表位的多特异性结合gp41的分子。如本文使用的,术语“效应细胞”表示直接或间接介导靶细胞(例如,外源细胞、感染细胞或癌细胞)的杀伤的细胞。效应细胞的示例包括辅助T细胞、细胞毒性T细胞、天然杀伤(NK)细胞、浆细胞(分泌抗体的B细胞)、巨噬细胞和粒细胞。优选的效应细胞表面分子(“ECM”)包括CD2、CD3、CD8、CD16、TCR和NKG2D受体。相应地,按照本发明的原理,可使用能够免疫特异性结合这种分子的表位,或其他效应细胞表面分子的分子。下面提供了示例性抗体,它的VH和/或VL结构域,和/或VL区的CDRL的1个、2个或全部3个和/或VH结构域的CDRH的1个、2个或全部3个,可用于构建能够介导靶细胞的重定向杀伤的分子。
A.示例性CD2结合能力
在一个实施方式中,本发明的分子能够结合存在于这种效应细胞的表面上的CD2的表位。CD2为在T-细胞和天然杀伤(NK)细胞的表面上发现的细胞粘附分子。CD2增强NK细胞的细胞毒性,可能作为NK细胞纳米管形成的促进子(Mace,E.M.等(2014)“CellBiological Steps and Checkpoints in Accessing NK Cell Cytotoxicity,”Immunol.Cell.Biol.92(3):245-255;Comerci,C.J.等(2012)“CD2 Promotes HumanNatural Killer Cell Membrane Nanotube Formation,”PLoS One7(10):e47664:1-12)。特异性结合CD2的分子包括抗CD2抗体“CD2 mAb Lo-CD2a”。
CD2 mAb Lo-CD2a的VH结构域的氨基酸序列(ATCC登记号:HB-11423);SEQ ID NO:59)显示在下面(CDRH残基用下划线显示):EVQLQQSGPE LQRPGASVKL SCKASGYIFTEYYMYWVKQR PKQGLELVGRIDPEDGSIDY VEKFKKKATL TADTSSNTAY MQLSSLTSEDTATYFCARGKFNYRFAYWGQ GTLVTVSS
CD2 mAb Lo-CD2a的VL结构域的氨基酸序列(ATCC登记号:11423;SEQ ID NO:60)显示在下面(CDRL残基用下划线显示):
DVVLTQTPPT LLATIGQSVS ISCRSSQSLL HSSGNTYLNW LLQRTGQSPQPLIYLVSKLE SGVPNRFSGS GSGTDFTLKI SGVEAEDLGV YYCMQFTHYPYTFGAGTKLE LK
B.示例性CD3结合能力
在一个实施方式中,本发明的分子能够结合CD3的表位。CD3为由四条不同的链组成的T-细胞共受体(Wucherpfennig,K.W.等(2010)“Structural Biology Of The T-CellReceptor:Insights Into Receptor Assembly,Ligand Recognition,And Initiation OfSignaling,”Cold Spring Harb.Perspect.Biol.2(4):a005140;1-14页)。在哺乳动物中,复合物含有CD3γ链、CD3δ链和两条CD3ε链。这些链与被称为T-细胞受体(TCR)的分子缔合以便在T淋巴细胞中产生激活信号。在缺少CD3的情况下,TCR不适合组装并且被分解(Thomas,S.等(2010)“Molecular Immunology Lessons From Therapeutic T-CellReceptor Gene Transfer,”Immunology 129(2):170–177)。发现CD3结合所有成熟的T-细胞的膜,并且几乎不在其他细胞类型中(见,Janeway,C.A.等(2005)In:Immunobiology:TheImmune System In Health And Disease,”6th ed.Garland Science Publishing,NY,pp.214-216;Sun,Z.J.等(2001)“Mechanisms Contributing To T Cell ReceptorSignaling And Assembly Revealed By The Solution Structure Of An EctodomainFragment Of The CD3ε:γHeterodimer,”Cell 105(7):913-923;Kuhns,M.S.等(2006)“Deconstructing The Form And Function Of The TCR/CD3 Complex,”Immunity.2006Feb;24(2):133-139)。特异性结合CD3的分子包括抗CD3抗体“CD3 mAb 1”和“OKT3”。抗CD3抗体CD3 mAb 1能够结合非人灵长类(例如,食蟹猴)。
人源化CD3 mAb 1的VH结构域的氨基酸序列(SEQ ID NO:61)显示在下面(CDRH残基用下划线显示):
EVQLVESGGG LVQPGGSLRL SCAASGFTFS TYAMNWVRQA PGKGLEWVGR IRSKYNNYAT YYADSVKDRF TISRDDSKNS LYLQMNSLKT EDTAVYYCVR HGNFGNSYVS WFAYWGQGTL VTVSS
人源化CD3 mAb 1的VL结构域的氨基酸序列(SEQ ID NO:62)显示在下面(CDRL残基用下划线显示):
QAVVTQEPSL TVSPGGTVTL TCRSSTGAVT TSNYANWVQQ KPGQAPRGLI GGTNKRAPWTPARFSGSLLG GKAALTITGA QAEDEADYYC ALWYSNLWVF GGGTKLTVLG
可并入人源化变体“CD3 mAb 1(D65G)”。CD3 mAb 1(D65G)包括CD3mAb 1的VL结构域(SEQ ID NO:62)和具有D65G替换的VH CD3 mAb 1结构域(Kabat位置65,对应于SEQ IDNO:63的残基68)。
CD3 mAb 1(D65G)的VH的氨基酸序列(SEQ ID NO:63)显示在下面(CDRH残基用下划线显示,替换的位置(D65G)以双下划线显示):
EVQLVESGGG LVQPGGSLRL SCAASGFTFS TYAMNWVRQA PGKGLEWVGR IRSKYNNYAT YYADSVKGRF TISRDDSKNS LYLQMNSLKT EDTAVYYCVR HGNFGNSYVS WFAYWGQGTL VTVSS
可选地,可并入CD3 mAb 1的人源化亲和性变体。变体包括命名为“CD3mAb 1低”的低亲和性变体和命名为“CD3 mAb 1快”的具有更快的解离速率(off rate)的变体。CD mAb1的VL结构域(SEQ ID NO:62)对于CD3 mAb 1低和CD3mAb1快是通用的并且在以上提供。下面提供每个CD3 mAb 1低和CD3 mAb1快的VH结构域的氨基酸序列。
抗人CD3 mAb 1低的可变重链结构域的氨基酸序列(SEQ ID NO:64)显示在下面(CDRH残基用下划线显示):
EVQLVESGGG LVQPGGSLRL SCAASGFTFS TYAMNWVRQA PGKGLEWVGR IRSKYNNYAT YYADSVKGRF TISRDDSKNS LYLQMNSLKT EDTAVYYCVR HGNFGNSYVT WFAYWGQGTL VTVSS
抗人CD3 mAb 1快的可变重链结构域的氨基酸序列(SEQ ID NO:65)显示在下面(CDRH残基用下划线显示):
EVQLVESGGG LVQPGGSLRL SCAASGFTFS TYAMNWVRQA PGKGLEWVGR IRSKYNNYAT YYADSVKGRF TISRDDSKNS LYLQMNSLKT EDTAVYYCVR HKNFGNSYVT WFAYWGQGTL VTVSS
可利用的另一抗CD3抗体为抗体莫罗单抗-CD3“OKT3”。(Xu等(2000)“In VitroCharacterization Of Five Humanized OKT3 Effector Function VariantAntibodies,”Cell.Immunol.200:16-26);Norman,D.J.(1995)“Mechanisms Of ActionAnd Overview Of OKT3,”Ther.Drug Monit.17(6):615-620;Canafax,D.M.等(1987)“Monoclonal Antilymphocyte Antibody(OKT3)Treatment Of Acute Renal AllograftRejection,”Pharmacotherapy 7(4):121-124;Swinnen,L.J.等(1993)“OKT3 MonoclonalAntibodies Induce Interleukin-6And Interleukin-10:A Possible Cause OfLymphoproliferative Disorders Associated With Transplantation,”Curr.Opin.Nephrol.Hypertens.2(4):670-678)。
OKT3的VH结构域的氨基酸序列(SEQ ID NO:66)显示在下面(CDRH残基用下划线显示):
QVQLQQSGAE LARPGASVKM SCKASGYTFT RYTMHWVKQR PGQGLEWIGY INPSRGYTNY NQKFKDKATL TTDKSSSTAY MQLSSLTSED SAVYYCARYY DDHYCLDYWG QGTTLTVSS
OKT3的VL结构域的氨基酸序列(SEQ ID NO:67)显示在下面(CDRL残基用下划线显示):
QIVLTQSPAI MSASPGEKVT MTCSASSSVS YMNWYQQKSG TSPKRWIYDTSKLASGVPAHFRGSGSGTSY SLTISGMEAE DAATYYCQQW SSNPFTFGSGTKLEINR
可利用的另外抗CD3抗体包括但不限于PCT公布号WO 2008/119566和WO 2005/118635中描述的那些。
C.示例性CD8结合能力
在一个实施方式中,本发明的分子能够结合存在于这种效应细胞的表面上的CD8的表位。CD8为由在细胞毒性T细胞上表达的两条不同的链组成的T-细胞共受体(Leahy,D.J.,(1995)“A Structural View of CD4 and CD8,”FASEB J.,9:17-25)。已经发现通过抗原:在靶细胞的表面上排列的主要组织相容性I类(MHC I)分子复合物和在CD8+T-细胞的表面上排列的CD8和T-细胞受体的复合物之间的共刺激相互作用来介导CD8+T-细胞的激活(Gao,G.和Jakobsen,B.,(2000)."Molecular interactions of coreceptor CD8 and MHCclass I:the molecular basis for functional coordination with the T-CellReceptor".Immunol Today 21:630–636)。不像仅通过某些免疫系统细胞表达的MHC II分子,MHC I分子被非常广泛地表达。因此,细胞毒性T细胞能够结合各种细胞类型。激活的细胞毒性T细胞通过它们细胞毒素穿孔蛋白、颗粒酶和粒溶蛋白的释放介导细胞杀伤。特异性结合CD8的抗体包括抗CD8抗体“OKT8”和“TRX2”。
OKT8的VH结构域的氨基酸序列(SEQ ID NO:68)显示在下面(CDRH残基用下划线显示):
QVQLLESGPE LLKPGASVKM SCKASGYTFT DYNMHWVKQS HGKSLEWIGY IYPYTGGTGY NQKFKNKATL TVDSSSSTAY MELRSLTSED SAVYYCARNF RYTYWYFDVW GQGTTVTVSS
OKT8的VL结构域的氨基酸序列(SEQ ID NO:69)显示在下面(CDRL残基用下划线显示):
DIVMTQSPAS LAVSLGQRAT ISCRASESVD SYDNSLMHWY QQKPGQPPKVLIYLASNLESGVPARFSGSG SRTDFTLTID PVEADDAATY YCQQNNEDPYTFGGGTKLEI KR
TRX2的VH结构域的氨基酸序列(SEQ ID NO:70)显示在下面(CDRH残基用下划线显示):
QVQLVESGGG VVQPGRSLRL SCAASGFTFS DFGMNWVRQA PGKGLEWVAL IYYDGSNKFY ADSVKGRFTI SRDNSKNTLY LQMNSLRAED TAVYYCAKPHYDGYYHFFDS WGQGTLVTVS S
TRX2的VL结构域的氨基酸序列(SEQ ID NO:71)显示在下面(CDRL残基用下划线显示):
DIQMTQSPSS LSASVGDRVT ITCKGSQDIN NYLAWYQQKP GKAPKLLIYN TDILHTGVPSRFSGSGSGTD FTFTISSLQP EDIATYYCYQ YNNGYTFGQG TKVEIK
D.示例性CD16结合能力
在一个实施方式中,本发明的分子能够结合CD16的表位。CD16由结合聚集的人IgG但不结合单体人IgG生物嗜中性粒细胞、嗜酸性粒细胞、天然杀伤(NK)细胞和组织巨噬细胞表达(Peltz,G.A.等(1989)“Human Fc Gamma RIII:Cloning,Expression,AndIdentification Of The Chromosomal Locus Of Two FcReceptors For IgG,”Proc.Natl.Acad.Sci.(U.S.A.)86(3):1013-1017;Bachanova,V.等(2014)“NK Cells InTherapy Of Cancer,”Crit.Rev.Oncog.19(1-2):133-141;Miller,J.S.(2013)“Therapeutic Applications:Natural Killer Cells In The Clinic,”Hematology Am.Soc.Hematol.Educ.Program.2013:247-253;Youinou,P.等(2002)“Pathogenic EffectsOf Anti-Fc Gamma Receptor IIIB(CD16)On Polymorphonuclear Neutrophils In Non-Organ-Specific Autoimmune Diseases,”Autoimmun Rev.1(1-2):13-19;Peipp,M.等(2002)“Bispecific Antibodies Targeting Cancer Cells,”Biochem.Soc.Trans.30(4):507-511)。特异性结合CD16的分子包括抗CD16抗体“3G8”和“A9”。人源化3G8(“h3G8”)抗体描述在PCT公布号WO 03/101485中。
鼠3G8的VH结构域的氨基酸序列(SEQ ID NO:72)显示在下面(CDRH残基用下划线显示):
QVTLKESGPG ILQPSQTLSL TCSFSGFSLR TSGMGVGWIR QPSGKGLEWL AHIWWDDDKR YNPALKSRLT ISKDTSSNQV FLKIASVDTA DTATYYCAQI NPAWFAYWGQ GTLVTVSA
鼠3G8的VL结构域的氨基酸序列(SEQ ID NO:73)显示在下面(CDRL残基用下划线显示):
DTVLTQSPAS LAVSLGQRAT ISCKASQSVD FDGDSFMNWY QQKPGQPPKLLIYTTSNLESGIPARFSASG SGTDFTLNIH PVEEEDTATY YCQQSNEDPYTFGGGTKLEI K
h3G8的VH结构域的氨基酸序列(SEQ ID NO:74)显示在下面(CDRH残基用下划线显示):
QVTLRESGPA LVKPTQTLTL TCTFSGFSLS TSGMGVGWIR QPPGKALEWLAHIWWDDDKR YNPALKSRLT ISKDTSKNQV VLTMTNMDPVDTATYYCAQI NPAWFAYWGQ GTLVTVSS
鼠h3G8的VL结构域的氨基酸序列(SEQ ID NO:75)显示在下面(CDRL残基用下划线显示):
DIVMTQSPDS LAVSLGERAT INCKASQSVD FDGDSFMNWYQQKPGQPPKL LIYTTSNLESGVPDRFSGSG SGTDFTLTIS SLQAEDVAVYYCQQSNEDPY TFGQGTKLEI K
A9的VH结构域的氨基酸序列(SEQ ID NO:76)显示在下面(CDRH残基用下划线显示):
QVQLQQSGAE LVRPGTSVKI SCKASGYTFT NYWLGWVKQR PGHGLEWIGD IYPGGGYTNY NEKFKGKATV TADTSSRTAY VQVRSLTSED SAVYFCARSASWYFDVWGAR TTVTVSS
A9的VL结构域的氨基酸序列(SEQ ID NO:77)显示在下面(CDRL残基用下划线显示):
DIQAVVTQES ALTTSPGETV TLTCRSNTGT VTTSNYANWV QEKPDHLFTGLIGHTNNRAPGVPARFSGSL IGDKAALTIT GAQTEDEAIY FCALWYNNHWVFGGGTKLTVL
美国专利号9,035,026描述了能够结合CD16A但不结合CD16B的抗CD16抗体。这种抗体特别地用作定向针对疾病相关的细胞的双特异性结合分子或多特异性结合分子的组分,因为其主要招募NK细胞,并且不被循环可溶性CD16B结合或通过结合嗜中性粒细胞或激活嗜酸性粒细胞而从NK细胞结合转移。
美国专利号9,035,026的抗CD16A抗体的VH结构域的氨基酸序列(SEQ ID NO:78)显示在下面(CDRH残基用下划线显示):
EVQLVQSGAE VKKPGESLKV SCKASGYTFT SYYMHWVRQAPGQGLEWMGI INPSGGSTSY AQKFQGRVTM TRDTSTSTVY MELSSLRSEDTAVYYCARGS AYYYDFADYW GQGTLVTVSS
美国专利号9,035,026的这种抗CD16A抗体的七个合适的VL结构域的氨基酸序列下面显示为SEQ ID NO:79-85:
SYELMQPPSV SVSSGQTASI PCSGDKLEEK YVSWYQQRPG QSPVLVIYQD NKRPSGIPERFSGSNSGNTA TLTISGTQAM DEADYYCQVW DNYSVLFGGG TKLTVL(SEQ ID NO:79)
SYELTQPLSE SVAQGQTARI TCGGNNIESR NVHWYQQKPG QAPVLVIYRD NNRPSGIPERFSGSNSGNMA TLTISRAQAG DAADYYCQVW DNYTVLFGGG TKLTVL(SEQ ID NO:80)
SYELTQPPSV AVAPGKTARI TCGGNNIGSK NVHWYQQKPG QAPVLVIYRD SNRPSGIPERFSGSNSGNTA TLTISRAQAG DEADFYCQVW DNYIVLFGGG TKLTVL(SEQ ID NO:81)
QAVLTQPPSV SVAPGQTARI PCEGNNIGSK NVHWYRQKPG QVPVLVMYDD SDRPSGIPERFSGSNSGNTA TLTISGTQAM DEADYYCQVW DNYSVLFGGG TKLTVL(SEQ ID NO:82)
QPVLTQPLSV SVAPGQTARI TCGGNNIGSK NVHWYQQKPG QAPVLVIYRD SSRPSGIPERLSGSNSGDTA TLTISRAQAG DEADYYCQVW DDYIVVFGGG TKLTVL(SEQ ID NO:83)
SYELTQPPSV SVTPGQTATI TCGANDIGKR NVHWYQQRPG QSPVLVIYQD NKRPSGIPERFSGSNSGNTA TLTISGTQAM DEADYYCQVW DNYSVLFGGG TKLTVL(SEQ ID NO:84)
QPVLTQPSSV SVAPGQTATI SCGGHNIGSK NVHWYQQRPG QSPVLVIYQD NKRPSGIPERFSGSNSGNTA TLTISGTQAM DEADYYCQVW DNYSVLFGGG TKLTVL(SEQ ID NO:85)
在进一步的实施方式中,可采用人源化抗CD16抗体,hCD16-M1或人源化抗CD16抗体,hCD16-M2的结合CD16的结构域与结合gp41的结构域配合以产生能够结合CD16和gp41的多特异性结合分子。hCD16-M1的VH结构域的氨基酸序列(SEQ ID NO:127)显示在下面(CDRH残基用下划线显示):
EVQLVESGGG LVKPGGSLRL SCAASGFTFS NYGMSWVRQAPGKGLEWVAT ISGGGSYTFY PDSVKGRFTI SRDNAKNSLY LQMNSLRTEDTALYYCVRQS ARAPEPYWGQ GTLVTVSS
hCD16-M1的VL结构域的氨基酸序列(SEQ ID NO:128)显示在下面(CDRL残基用下划线显示):
DIQMTQSPSF LSASVGDRVT ITCRASQNVG THVAWYQQKP GKAPKSLLYSASYRYSGVPSRFSGSGSGTD FTLTISSLQS EDIATYYCQQ YKSYPLTFGQGTKLEIK
抗体hCD16-M2为鼠抗人CD16单克隆抗体CD16-M2的人源化衍生物。人源化产生两个合适的VH结构域(hCD16-M2 VH1和hCD16-M2 VH2),其任一个都可与获得的人源化VL结构域(hCD16-M2 VL1)一起使用。
hCD16-M2 VH1的VH结构域的氨基酸序列(SEQ ID NO:129)显示在下面(CDRH残基用下划线显示):
QVQLVQSGAE VKKPGASVKV SCKASGYTFT SSAMHWVRQAPGQGLEWMGY INHYNDGIKY NERFKGRVTI TADKSTSTAYMELSSLRSED TAVYYCATGY RYASWFASWG QGTLVTVSS
hCD16-M2 VH2的VH结构域的氨基酸序列(SEQ ID NO:130)显示在下面(CDRH残基用下划线显示):
QVQLVQSGAE VKKPGASVKV SCKASGYTFT SSAMHWVRQAPGQGLEWMGY INHYNDGIKY NERFKGRVTI TADKSTSTAYMELSSLRSED TAVYYCA
Figure BDA0002902883590000621
GY RYASWFASWG QGTLVTVSS
如将认识到,hCD16-M2 VH1的氨基酸序列(SEQ ID NO:129)与hCD16-M2VH2的氨基酸序列(SEQ ID NO:130)的不同在于就在CDRH3之前的残基中具有T98R替换(上面框中显示)。
hCD16-M2 VL1的VL结构域的氨基酸序列(SEQ ID NO:131)显示在下面(CDRL残基用下划线显示):
EIVLTQSPAT LSVSPGERAT LSCRASQNIG TSIHWYQQKP DQSPKLLIKSVSESISGVPSRFSGSGSGTD FTLTINSLEA EDFATYYCQQ SNSWPLTFGQGTKLEIK
可利用的另外抗CD16抗体包括但不限于商业上可得的抗体DJ130c(Tamm,A.等(1996)“The Binding Epitopes Of Human CD16(Fc Gamma RIII)MonoclonalAntibodies.Implications For Ligand Binding,”J.Immunol.157(4):1576-1581)、eBioCB16(ThermoFisher)或1D3(Abcam),或PCT公布号WO 03/101485和WO 2006/125668中描述的那些。
E.示例性TCR结合能力
在一个实施方式中,本发明的分子能够结合T细胞受体(TCR)的表位。T细胞受体由CD4+T细胞或CD8+T细胞天然表达,并且允许这种细胞识别由抗原呈递细胞的I型或II型MHC蛋白质结合并且呈递的抗原肽。TCR对pMHC(肽-MHC)复合物的识别启动细胞免疫应答的传播,其导致细胞因子的产生和抗原呈递细胞的裂解(见,例如,Armstrong,K.M.等(2008)“Conformational Changes And Flexibility In T-Cell Receptor Recognition OfPeptide–MHC Complexes,”Biochem.J.415(Pt 2):183–196;Willemsen,R.(2008)“Selection Of Human Antibody Fragments Directed Against Tumor T-Cell EpitopesFor Adoptive T-Cell Therapy,”Cytometry A.73(11):1093-1099;Beier,K.C.等(2007)“Master Switches Of T-Cell Activation And Differentiation,”Eur.Respir.J.29:804-812;Mallone,R.等(2005)“Targeting T Lymphocytes For Immune Monitoring AndIntervention In Autoimmune Diabetes,”Am.J.Ther.12(6):534–550).CD3 is thereceptor that binds to the TCR(Thomas,S.等(2010)“Molecular Immunology LessonsFrom Therapeutic T-Cell Receptor Gene Transfer,”Immunology 129(2):170-177;Guy,C.S.等(2009)“Organization Of Proximal Signal Initiation At The TCR:CD3Complex,”Immunol.Rev.232(1):7-21;St.Clair,E.W.(Epub 2009Oct 12)“NovelTargeted Therapies For Autoimmunity,”Curr.Opin.Immunol.21(6):648-657;Baeuerle,P.A.等(Epub 2009Jun 9)“Bispecific T-Cell Engaging Antibodies ForCancer Therapy,”Cancer Res.69(12):4941-4944;Smith-Garvin,J.E.等(2009)“T CellActivation,”Annu.Rev.Immunol.27:591-619;Renders,L.等(2003)“Engineered CD3Antibodies For Immunosuppression,”Clin.Exp.Immunol.133(3):307-309)。
特异性结合T细胞受体的分子包括抗TCR抗体“BMA 031”。(EP 0403156;Kurrle,R.等(1989)“BMA 031–A TCR-Specific Monoclonal Antibody For ClinicalApplication,”Transplant Proc.21(1Pt 1):1017-1019;Nashan,B.等(1987)“FineSpecificity Of A Panel Of Antibodies Against The TCR/CD3 Complex,”TransplantProc.19(5):4270-4272;Shearman,C.W.等(1991)“Construction,Expression,AndBiologic Activity Of Murine/Human Chimeric Antibodies With Specificity ForThe Humanα/βT Cell,”J.Immunol.146(3):928-935;Shearman,C.W.等(1991)“Construction,Expression And Characterization of Humanized AntibodiesDirected Against The Humanα/βT Cell Receptor,”J.Immunol.147(12):4366-4373)。
BMA 031的VH结构域的氨基酸序列(SEQ ID NO:86)显示在下面(CDRH残基用下划线显示):
QVQLVQSGAE VKKPGASVKV SCKASGYKFT SYVMHWVRQA PGQGLEWIGY INPYNDVTKY NEKFKGRVTI TADKSTSTAY LQMNSLRSED TAVHYCARGS YYDYDGFVYW GQGTLVTVSS
BMA 031的VL结构域的氨基酸序列(SEQ ID NO:87)显示在下面(CDRL残基用下划线显示):
EIVLTQSPAT LSLSPGERAT LSCSATSSVS YMHWYQQKPG KAPKRWIYDT SKLASGVPSRFSGSGSGTEF TLTISSLQPE DFATYYCQQW SSNPLTFGQG TKLEIK
F.示例性NKG2D结合能力
在一个实施方式中,本发明的分子能够结合NKG2D受体的表位。NKG2D受体在所有人(和其他哺乳动物)天然杀伤细胞上表达(Bauer,S.等(1999)“Activation Of NK CellsAnd T Cells By NKG2D,A Receptor For Stress-Inducible MICA,”Science 285(5428):727-729;Jamieson,A.M.等(2002)“The Role Of The NKG2D Immunoreceptor In ImmuneCell Activation And Natural Killing,”Immunity17(1):19-29)以及在所有CD8+T细胞上表达(Groh,V.等(2001)“Costimulation Of CD8αβT Cells By NKG2D Via EngagementBy MIC Induced On Virus-Infected Cells,”Nat.Immunol.2(3):255-260;Jamieson,A.M.等(2002)“The Role Of The NKG2D Immunoreceptor In Immune Cell ActivationAnd Natural Killing,”Immunity17(1):19-29)。特异性结合NKG2D受体的分子包括抗NKG2D抗体“KYK-1.0”和“KYK-2.0”。(Kwong,KY等(2008)“Generation,AffinityMaturation,And Characterization Of A Human Anti-Human NKG2D MonoclonalAntibody With Dual Antagonistic And Agonistic Activity,”J.Mol.Biol.384:1143-1156)。
KYK-1.0的VH结构域的氨基酸序列(SEQ ID NO:88)显示在下面(CDRH残基用下划线显示):
EVQLVESGGG VVQPGGSLRL SCAASGFTFS SYGMHWVRQAPGKGLEWVAF IRYDGSNKYY ADSVKGRFTI SRDNSKNTKYLQMNSLRAED TAVYYCAKDR FGYYLDYWGQ GTLVTVSS
KYK-1.0的VL结构域的氨基酸序列(SEQ ID NO:89)显示在下面(CDRL残基用下划线显示):
QPVLTQPSSV SVAPGETARI PCGGDDIETK SVHWYQQKPG QAPVLVIYDDDDRPSGIPERFFGSNSGNTA TLSISRVEAG DEADYYCQVWDDNNDEWVFG GGTQLTVL
KYK-2.0的VH结构域的氨基酸序列(SEQ ID NO:90)显示在下面(CDRH残基用下划线显示):
QVQLVESGGG LVKPGGSLRL SCAASGFTFS SYGMHWVRQAPGKGLEWVAF IRYDGSNKYY ADSVKGRFTI SRDNSKNTLYLQMNSLRAED TAVYYCAKDR GLGDGTYFDY WGQGTTVTVS S
KYK-2.0的VL结构域的氨基酸序列(SEQ ID NO:91)显示在下面(CDRL残基用下划线显示):
QSALTQPASV SGSPGQSITI SCSGSSSNIG NNAVNWYQQL PGKAPKLLIYYDDLLPSGVSDRFSGSKSGT SAFLAISGLQ SEDEADYYCA AWDDSLNGPVFGGGTKLTVL
G.示例性NKp46结合能力
在一个实施方式中,本发明的分子能够结合NKp46(CD335)的表位。NKp46为主要的NK细胞-激活受体,其涉及靶细胞的消除(Sivori S,等(1997)."p46,aNovel NaturalKiller Cell–specific Surface Molecule That Mediates Cell Activation,"J.Exp.Med.186(7):1129–36.)。NKp46是在所有NK细胞子集合上唯一地表达(Narni-Mancinelli E,等(2011).“Fate mapping analysis of lymphoid cells expressing theNKp46 cell surface receptor,”Proc Natl Acad Sci U S A 108:18324–9)。特异性结合NKp46的分子包括抗NKp46抗体“BAB281”和“NKp46-3”(WO2015/197593)。
BAB281的VH结构域的氨基酸序列(SEQ ID NO:92)显示在下面(CDRH残基用下划线显示):
QIQLVQSGPE LQKPGETVKI SCKASGYTFT NYGMNWVKQA PGKGLKWMGW INTNTGEPTY AEEFKGRFAF SLETSASTAY LQINNLKNED TATYFCARDY LYYFDYWGQG TTLTVSS
BAB281的VL结构域的氨基酸序列(SEQ ID NO:93)显示在下面(CDRL残基用下划线显示):
DNIVMTQSPK SMSMSVGERV TLTCKASENV VTYVSWYQQK PEQSPKLLIY GASNRYTGVPDRFTGSGSAT DFTLTISSVQ AEDLADYHCG QGYSYPYTFG GGTKLEIK
NKp46-3的VH结构域的氨基酸序列(SEQ ID NO:94)显示在下面(CDRH残基用下划线显示):
EVQLQQSGPE LVKPGASVKI SCKTSGYTFT EYTMHWVKQS HGKSLEWIGG ISPNIGGTSY NQKFKGKATL TVDKSSSTAY MELRSLTSED SAVYYCARRG GSFDYWGQGT TLTVSS
NKp46-3的VL结构域的氨基酸序列(SEQ ID NO:95)显示在下面(CDRL残基用下划线显示):
DIVMTQSPAT LSVTPGDRVS LSCRASQSIS DYLHWYQQKS HESPRLLIKY ASQSISGIPSRFSGSGSGSD FTLSINSVEP EDVGVYYCQN GHSFPLTFGA GTKLELK
结合NKp46的另外抗体在WO 2015/197593和WO 2017/016805中描述。结合天然杀伤细胞的细胞表面的其他示例性抗体包括抗体:A1、AC2、EPR3678(2)、EPR20461、EPR20627和IMG17B5F11(其结合CD39);TB01、HNK-1/Leu-7和NK1(其结合CD57);FN50(其结合CD69);5B5、B-L2、TS82b和C33(其结合CD82);3B3、B199.2和EP7169(其结合CD161);17D9(其结合CLEC1B);2F9(其结合KIR2DL1);EPR8825(其结合KIR2DL2);mAb 33(其结合KIR2DL4);11E3、17B4、EPR4392(2)、EPR20261和EPR20627(其结合淋巴细胞激活基因3);A10、C7、CX5、1D11和MM0489-10R27(其结合NKG2D);BMK13(其结合PRG2);EPR9916(其结合SLAMF6)等。能够结合每种这种NK细胞表面分子的抗体是从Abcam plc和其他来源商业上可得的,并且可容易地适应于本发明的目的。
VI.示例性可选的HIV-1结合分子
成熟的人免疫缺陷病毒类型1(HIV-1)包膜(Env)糖蛋白三聚体包括由病毒gp160前体蛋白质的切割产生的非共价连接gp120/gp41异源二聚体的三份拷贝。在一个实施方式中,本发明的分子能够结合不同于7B2的表位的HIV-1Env蛋白质gp120、gp160和/或gp41的表位。
单克隆抗体A32识别HIV-1Env gp120的C1区中的构象表位(Wyatt等(1995)“Involvement Of The V1/V2 Variable Loop Structure In The Exposure Of HumanImmunodeficiency Virus Type 1gp120 Epitopes Induced By Receptor Binding,”J.Virol.69:5723-5733)并且介导有效的ADCC活性以及可阻断相当比例的HIV-1感染的个体中可检测的ADCC-介导Ab活性(Ferrari,G.等(2011)“An HIV-1gp120 Envelope HumanMonoclonal Antibody That Recognizes a C1 Conformational Epitope MediatesPotent Antibody-Dependent Cellular Cytotoxicity(ADCC)Activity and Defines aCommon ADCC Epitope in Human HIV-1Serum,”J.Virol.85(14):7029-7036)。
在本领域中已经报道了抗体A32的多种VH结构域,报道的框架区1和/或4中具备最小的变化(见,例如,蛋白质数据库登记号PDB:4YBL_H、US2015/0239961和WO 2006/044410)。按照本发明可采用任何这些变体抗体A32VH结构域。A32的阐释性VH结构域的氨基酸序列(SEQ ID NO:96)显示在下面(CDRH残基用下划线显示):
QVQLQESGPG LVKPSQTLSL SCTVSGGSSS SGAHYWSWIRQYPGKGLEWI GYIHYSGNTY YNPSLKSRIT ISQHTSENQF SLKLNSVTVA DTAVYYCARG TRLRTLRNAF DIWGQGTLVT VSS
A32的VL结构域的氨基酸序列(SEQ ID NO:97)显示在下面(CDRL残基用下划线显示):
QSALTQPPSA SGSPGQSVTI SCTGTSSDVG GYNYVSWYQH HPGKAPKLII SEVNNRPSGVPDRFSGSKSG NTASLTVSGL QAEDEAEYYC SSYTDIHNFV FGGGTKLTVL
可采用A32的VL结构域的氨基酸序列(SEQ ID NO:97)与A32的阐释性VH结构域(SEQ ID NO:96)或与任何变体抗体A32 VH结构域(见,例如,蛋白质数据库登记号PDB:4YBL_H,US 2015/0239961和WO 2006/044410)以形成抗HIV-1Env gp120表位结合位点。
单克隆抗体10-1074靶向HIV-1Env gp120的V3环的基础部分(见,例如,WO 2014/063059)并且在最有效的分离的抗HIV-1中和抗体之中,并且在早期临床试验中已经显示出一些体内活性(Caskey,M.,等,(2017)“Antibody 10-1074Suppresses Viremia In HIV-1-infected individuals.”Nat Med.23:185-191)。
10-1074的VH结构域的氨基酸序列(SEQ ID NO:98)显示在下面(CDRH残基用下划线显示):
QVQLQESGPG LVKPSETLSV TCSVSGDSMN NYYWTWIRQS PGKGLEWIGY ISDRESATYN PSLNSRVVIS RDTSKNQLSL KLNSVTPADT AVYYCATARR GQRIYGVVSF GEFFYYYSMD VWGKGTTVTVSS
10-1074的VL结构域的氨基酸序列(SEQ ID NO:99)显示在下面(CDRL残基用下划线显示):
SYVRPLSVAL GETARISCGRQALGSRAVQW YQHRPGQAPI LLIYNNQDRP SGIPERFSGTPDINFGTRAT LTISGVEAGD EADYYCHMWD SRSGFSWSFG GATRLTVL
单克隆抗体3BNC117靶向gp120的CD4结合位点并且为广泛地中和抗HIV-1抗体(见,例如,WO 2013/016468),其在早期临床试验中已经显示出一些体内活性(Caskey,M.,等(2015)“Viraemia Suppressed In HIV-1-Infected Humans By Broadly NeutralizingAntibody 3BNC117,”Nature 522:487-491)。
3BNC117的VH结构域的氨基酸序列(SEQ ID NO:100)显示在下面(CDRH残基用下划线显示):
QVQLLQSGAA VTKPGASVRV SCEASGYNIR DYFIHWWRQA PGQGLQWVGW INPKTGQPNN PRQFQGRVSL TRHASWDFDT FSFYMDLKAL RSDDTAVYFC ARQRSDYWDFDVWGSGTQVT VSS
3BNC117的VL结构域的氨基酸序列(SEQ ID NO:101)显示在下面(CDRL残基用下划线显示):
DIQMTQSPSS LSASVGDTVT ITCQANGYLN WYQQRRGKAP KLLIYDGSKL ERGVPSRFSGRRWGQEYNLT INNLQPEDIA TYFCQVYEFV VPGTRLDLK
单克隆抗体PGT121和PGT145为广泛地中和HIV-1抗体,其主要取决于用于Env识别的gp120聚糖(Mouquet H,等,(2012)“Complex-type N-glycan recognition by potentbroadly neutralizing HIV antibodies.”Proc Natl Acad Sci U S A 109:E3268–3277;Yasmeen,A.,等(2014)“Differential Binding Of Neutralizing And Non-NeutralizingAntibodies To Native-Like Soluble HIV-1Env Trimers,Uncleaved Env Proteins,AndMonomeric Subunits.”Retrovirology 11:41;WO2012/030904)。
PGT121的VH结构域的氨基酸序列(SEQ ID NO:102)显示在下面(CDRH残基用下划线显示):
QMQLQESGPG LVKPSETLSL TCSVSGASIS DSYWSWIRRS PGKGLEWIGY VHKSGDTNYS PSLKSRVNLS LDTSKNQVSL SLVAATAADS GKYYCARTLH GRRIYGIVAF NEWFTYFYMD VWGNGTQVTVSS
PGT121的VL结构域的氨基酸序列(SEQ ID NO:103)显示在下面(CDRL残基用下划线显示):
SDISVAPGET ARISCGEKSL GSRAVQWYQH RAGQAPSLII YNNQDRPSGI PERFSGSPDSPFGTTATLTI TSVEAGDEAD YYCHIWDSRV PTKWVFGGGT TLTVL
PGT145的VH结构域的氨基酸序列(SEQ ID NO:104)显示在下面(CDRH残基用下划线显示):
QVQLVQSGAE VKKPGSSVKV SCKASGNSFS NHDVHWVRQA TGQGLEWMGW MSHEGDKTGL AQKFQGRVTI TRDSGASTVY MELRGLTADD TAIYYCLTGS KHRLRDYFLY NEYGPNYEEW GDYLATLDVWGHGTAVTVSS
PGT145的VL结构域的氨基酸序列(SEQ ID NO:105)显示在下面(CDRL残基用下划线显示):
EVVITQSPLF LPVTPGEAAS LSCKCSHSLQ HSTGANYLAW YLQRPGQTPRLLIHLATHRASGVPDRFSGS GSGTDFTLKI SRVESDDVGT YYCMQGLHSP WTFGQGTKVE IK
单克隆抗体VRC01为定向针对gp120的CD4结合位点的广泛地中和抗HIV-1抗体(Wu,X.等(2010)“Rational Design Of Envelope Identifies Broadly NeutralizingHuman Monoclonal Antibodies To HIV-1,”Science 329:856-861and Zhou,T.等(2010)“Structural Basis For Broad And Potent Neutralization Of HIV-1By AntibodyVRC01,”Science 329:811-817;WO 2013/163427)。
VRC01的VH结构域的氨基酸序列(SEQ ID NO:106)显示在下面(CDRH残基用下划线显示):
QVQLVQSGGQ MKKPGESMRI SCRASGYEFI DCTLNWIRLA PGKRPEWMGW LKPRGGAVNY ARPLQGRVTM TRDVYSDTAF LELRSLTVDD TAVYFCTRGK NCDYNWDFEH WGRGTPVIVS S
VRC01的VL结构域的氨基酸序列(SEQ ID NO:107)显示在下面(CDRL残基用下划线显示):
EIVLTQSPGT LSLSPGETAI ISCRTSQYGS LAWYQQRPGQ APRLVIYSGS TRAAGIPDRFSGSRWGPDYN LTISNLESGD FGVYYCQQYE FFGQGTKVQV DIKR
单克隆抗体10E8为广泛地中和HIV-1 gp41膜-邻近的外部区(MPER)-特异性抗体(Huang,J.,等2012.“Broad And Potent Neutralization Of HIV-1 By A gp41-SpecificHuman Antibody.”Nature.491:406-12)。
10E8的VH结构域的氨基酸序列(SEQ ID NO:108)显示在下面(CDRH残基用下划线显示):
EVQLVESGGG LVKPGGSLRL SCSASGFDFD NAWMTWVRQP PGKGLEWVGR ITGPGEGWSV DYAAPVEGRF TISRLNSINF LYLEMNNLRM EDSGLYFCAR TGKYYDFWSG YPPGEEYFQD WGRGTLVTVSS
10E8的VL结构域的氨基酸序列(SEQ ID NO:109)显示在下面(CDRL残基用下划线显示):
SYELTQETGV SVALGRTVTI TCRGDSLRSH YASWYQKKPG QAPILLFYGK NNRPSGVPDRFSGSASGNRA SLTISGAQAE DDAEYYCSSR DKSGSRLSVF GGGTKLTVL
本发明特别地包括和涵盖包含以上提供的抗HIV-1单克隆抗体的VL结构域和/或VH结构域,和/或VL区的1个、2个或全部3个CDRL和/或VH结构域的1个、2个或全部3个CDRH的多特异性结合gp41的分子。
VII.示例性多特异性结合gp41的分子
本文提供了一系列并入对gp41的表位免疫特异性的第一表位结合结构域(即,结合gp41的结构域)和对ECM的表位免疫特异性的第二表位结合结构域的示例性结合gp41的分子。任选地这种分子并入对gp41的不同表位和/或不同HIV-1分子的表位和/或ECM的不同表位和/或不同ECM的表位免疫特异性的第三表位结合结构域(或第三表位结合结构域和第四表位结合结构域)。特别地优选的是包括7B2GL的优化的结合gp41的结构域的这种分子。这种阐释性结合gp41的分子的结构和序列总结在表7中并且下面详细地描述。如将认识到,可同样地构建类似的分子(通过采用期望的抗体的VL结构域和VH结构域代替阐释性结合gp41的分子中使用的VL结构域和VH结构域)。
Figure BDA0002902883590000711
Figure BDA0002902883590000721
Figure BDA0002902883590000731
A.gp41 x CD3结合分子,DART-1
命名为“DART-1”的gp41 x CD3结合分子为第一阐释性双特异性结合gp41的分子。DART-1为能够结合gp41和CD3抗原的含Fc结构域的双特异性双抗体。DART-1由三条多肽链组成并且具备包括抗人gp41抗体7B2的VL结构域和VH结构域的一个结合结构域(并且因此对gp41的表位免疫特异性)和包括CD3 mAb 1的VL结构域和VH结构域的一个结合结构域(并且因此对CD3抗原的表位免疫特异性)。三条多肽链缔合以形成能够免疫特异性结合gp41的表位和CD3抗原的表位的共价结合的双抗体(见,例如,图4A)。
DART-1的第一多肽链具有SEQ ID NO:110的氨基酸序列:DIVMTQSPDS LAVSPGERATIHCKSSQTLL YSSNNRHSIA WYQQRPGQPPKLLLYWASMR LSGVPDRFSG SGSGTDFTLT INNLQAEDVAIYYCHQYSSHPPTFGHGTRV EIKGGGSGGG GEVQLVESGG GLVQPGGSLR LSCAASGFTFSTYAMNWVRQAPGKGLEWVG RIRSKYNNYA TYYADSVKGRFTISRDDSKN SLYLQMNSLK TEDTAVYYCVRHGNFGNSYVSWFAYWGQGT LVTVSSASTK GEVAACEKEV AALEKEVAAL EKEVAALEKG GGDKTHTCPPCPAPEAAGGP SVFLFPPKPK DTLMISRTPEVTCVVVDVSH EDPEVKFNWY VDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTV LHQDWLNGKE YKCKVSNKAL PAPIEKTISK AKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLWCL VKGFYPSDIA VEWESNGQPE NNYKTTPPVLDSDGSFFLYS KLTVDKSRWQ QGNVFSCSVMHEALHNHYTQ KSLSLSPGK
DART-1的第一多肽链(SEQ ID NO:110)的残基1-113对应于7B2的VL结构域(SEQID NO:55)。第一多肽链的残基114-121(加双下划线的)对应于连接体1(GGGSGGGG;SEQ IDNO:16)。第一多肽链的残基122-246对应于CD3mAb 1(D65G)的VH结构域(SEQ ID NO:63)。残基247-251对应于连接体(SEQ ID NO:21,加下划线的)。第一多肽链的残基252-279对应于含半胱氨酸的E-螺旋(SEQ ID NO:31)。第一多肽链的残基280-292对应于连接体(SEQ IDNO:40)。第一多肽链的残基293-509对应于“携带杵”的(SEQ ID NO:48),其中最后的残基为赖氨酸。
DART-1的第二多肽链具有SEQ ID NO:111的氨基酸序列:QAVVTQEPSL TVSPGGTVTLTCRSSTGAVT TSNYANWVQQ KPGQAPRGLIGGTNKRAPWT PARFSGSLLG GKAALTITGAQAEDEADYYCALWYSNLWVF GGGTKLTVLG GGGSGGGGQV QLVQSGGGVFKPGGSLRLSC EASGFTFTEYYMTWVRQAPG KGLEWLAYIS KNGEYSKYSPSSNGRFTISR DNAKNSVFLQ LDRLSADDTA VYYCARADGLTYFSELLQYIFDLWGQGARV TVSSASTKGK VAACKEKVAA LKEKVAALKE KVAALKE
DART-1的第二多肽链(SEQ ID NO:111)的残基1-110对应于CD3 mAb 1的VL结构域(SEQ ID NO:62)。第二多肽链的残基111-118(加双下划线的)对应于连接体1(GGGSGGGG;SEQ ID NO:16)。第二多肽链的残基119-244对应于7B2的VH结构域(SEQ ID NO:56)。第二多肽链的残基245-249对应于连接体(SEQ ID NO:21,加下划线的)。第二多肽链的残基250-277对应于含半胱氨酸的K-螺旋(SEQ ID NO:32)。
DART-1的第三多肽链具有SEQ ID NO:112的氨基酸序列:DKTHTCPPCP APEAAGGPSVFLFPPKPKDT LMISRTPEVT CVVVDVSHEDPEVKFNWYVD GVEVHNAKTK PREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYK CKVSNKALPA PIEKTISKAK GQPREPQVYT LPPSREEMTKNQVSLSCAVKGFYPSDIAVE WESNGQPENN YKTTPPVLDS DGSFFLVSKLTVDKSRWQQG NVFSCSVMHE ALHNRYTQKSLSLSPGK
DART-1的第三多肽链(SEQ ID NO:112)的残基1-10对应于连接体(SEQ ID NO:40)。第三多肽链的残基11-227对应于含有H435R替换(显示加下划线的)的“携带臼”的IgG1CH2-CH3结构域(SEQ ID NO:50),并且其中最后的残基为赖氨酸。如以上叙述的,H435R替换消除了分子结合结合蛋白A的能力。
如将认识到,DART-1的第三多肽链不含有任何表位结合位点并且因此可在具有图4A-图4B中提供的总体结构的各种结合gp41的分子中采用。相应地,DART-1的第三多肽链在本文被称为“普通双抗体多肽链”。
B.gp41 x CD3结合分子,DART-A
命名为“DART-A”的第二阐释性gp41 x CD3结合分子类似于上述DART-1,但是含有代替亲本7B2 VL结构域和VH结构域的抗人gp41抗体7B2GL的VL结构域和VH结构域。
DART-A的第一多肽链具有SEQ ID NO:113的氨基酸序列:DIVMTQSPDS LAVSLGERATINCKSSQTLL YSSNNRHSIA WYQQKPGQPP KLLIYWASMR LSGVPDRFSG SGSGTDFTLT ISSLQAEDVAVYYCHQYSSH PPTFGQGTKV EIKGGGSGGG GEVQLVESGG GLVQPGGSLR LSCAASGFTF STYAMNWVRQAPGKGLEWVG RIRSKYNNYA TYYADSVKGR FTISRDDSKN SLYLQMNSLK TEDTAVYYCV RHGNFGNSYVSWFAYWGQGT LVTVSSASTK GEVAACEKEV AALEKEVAAL EKEVAALEKG GGDKTHTCPP CPAPEAAGGPSVFLFPPKPK DTLMISRTPEVTCVVVDVSH EDPEVKFNWY VDGVEVHNAK TKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKE YKCKVSNKAL PAPIEKTISK AKGQPREPQVYTLPPSREEM TKNQVSLWCL VKGFYPSDIAVEWESNGQPE NNYKTTPPVLDSDGSFFLYS KLTVDKSRWQ QGNVFSCSVM HEALHNHYTQ KSLSLSPGK
DART-A的第一多肽链(SEQ ID NO:113)的残基1-113对应于7B2GL的VL结构域(SEQID NO:57)。第一多肽链的残基114-121(加双下划线的)对应于连接体1(GGGSGGGG;SEQ IDNO:16)。第一多肽链的残基122-246对应于CD3mAb 1(D65G)的VH结构域(SEQ ID NO:63)。残基247-251对应于连接体(SEQ ID NO:21,加下划线的)。第一多肽链的残基252-279对应于含半胱氨酸的E-螺旋(SEQ ID NO:31)。第一多肽链的残基280-292对应于连接体(SEQ IDNO:40)。第一多肽链的残基293-509对应于“携带杵的”(SEQ ID NO:48),其中最后的残基为赖氨酸。
DART-A的第二多肽链具有SEQ ID NO:114的氨基酸序列:QAVVTQEPSL TVSPGGTVTLTCRSSTGAVT TSNYANWVQQ KPGQAPRGLIGGTNKRAPWT PARFSGSLLG GKAALTITGAQAEDEADYYCALWYSNLWVF GGGTKLTVLG GGGSGGGGQV QLVESGGGLVKPGGSLRLSC AASGFTFSEYYMTWIRQAPG KGLEWVSYIS KNGEYSKYSPSSNGRFTISR DNAKNSLYLQ MNSLRAEDTA VYYCARADGLTYFSELLQYIFDLWGQGTLV TVSSASTKGK VAACKEKVAA LKEKVAALKE KVAALKE
DART-A的第二多肽链(SEQ ID NO:114)的残基1-110对应于CD3 mAb 1的VL结构域(SEQ ID NO:62)。第二多肽链的残基111-118(加双下划线的)对应于连接体1(GGGSGGGG;SEQ ID NO:16)。第二多肽链的残基119-244对应于7B2GL的VH结构域(SEQ ID NO:58)。第二多肽链的残基245-249对应于连接体(SEQ ID NO:21,加下划线的)。第二多肽链的残基250-277对应于含半胱氨酸的K-螺旋(SEQ ID NO:32)。
DART-A的第三多肽链的氨基酸序列与DART-1的第三多肽链的氨基酸序列(即,SEQID NO:112)相同。
C.gp41 x CD16结合分子,DART-B
命名为“DART-B”的gp41 x CD16结合分子为第三阐释性双特异性结合gp41的分子。DART-B类似于上述DART-A,但是包括代替DART-A的结合CD3的结构域的结合CD16的结构域。因此,DART-B由三条多肽链组成并且具备包括抗人gp41抗体7B2GL的VL结构域和VH结构域的一个结合结构域(并且因此对gp41的表位是免疫特异性的),和包括抗人CD16抗体3G8的VL结构域和VH结构域的一个结合结构域(并且因此对CD16的表位是免疫特异性的)。
DART-B的第一多肽链具有SEQ ID NO:115的氨基酸序列:DIVMTQSPDS LAVSLGERATINCKSSQTLL YSSNNRHSIA WYQQKPGQPP KLLIYWASMR LSGVPDRFSG SGSGTDFTLT ISSLQAEDVAVYYCHQYSSH PPTFGQGTKV EIKGGGSGGG GQVTLRESGP ALVKPTQTLT LTCTFSGFSL STSGMGVGWIRQPPGKALEW LAHIWWDDDK RYNPALKSRL TISKDTSKNQ VVLTMTNMDP VDTATYYCAQ INPAWFAYWGQGTLVTVSSA STKGEVAACE KEVAALEKEV AALEKEVAAL EKGGGDKTHT CPPCPAPEAA GGPSVFLFPPKPKDTLMISR TPEVTCVVVDVSHEDPEVKF NWYVDGVEVH NAKTKPREEQ YNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSN KALPAPIEKT ISKAKGQPRE PQVYTLPPSREEMTKNQVSL WCLVKGFYPS DIAVEWESNGQPENNYKTTP PVLDSDGSFFLYSKLTVDKS RWQQGNVFSC SVMHEALHNH YTQKSLSLSP GK
DART-B的第一多肽链(SEQ ID NO:115)的残基1-113对应于7B2GL的VL结构域(SEQID NO:57)。第一多肽链的残基114-121(加双下划线的)对应于连接体1(GGGSGGGG;SEQ IDNO:16)。第一多肽链的残基122-239对应于h3G8的VH结构域(SEQ ID NO:74)。残基240-244对应于连接体(SEQ ID NO:21,加下划线的)。第一多肽链的残基245-272对应于含半胱氨酸的E-螺旋(SEQ ID NO:31)。第一多肽链的残基273-285对应于连接体(SEQ ID NO:40)。第一多肽链的残基286-502对应于“携带杵”的(SEQ ID NO:48),其中最后的残基为赖氨酸。
DART-B的第二多肽链具有SEQ ID NO:116的氨基酸序列:DIVMTQSPDS LAVSLGERATINCKASQSVD FDGDSFMNWY QQKPGQPPKLLIYTTSNLES GVPDRFSGSG SGTDFTLTIS SLQAEDVAVYYCQQSNEDPYTFGQGTKLEI KGGGSGGGGQ VQLVESGGGL VKPGGSLRLS CAASGFTFSEYYMTWIRQAPGKGLEWVSYI SKNGEYSKYS PSSNGRFTIS RDNAKNSLYLQMNSLRAEDT AVYYCARADG LTYFSELLQYIFDLWGQGTL VTVSSASTKGKVAACKEKVA ALKEKVAALK EKVAALKE
DART-B的第二多肽链(SEQ ID NO:116)的残基1-111对应于h3G8的VL结构域(SEQID NO:75)。第二多肽链的残基112-119(加双下划线的)对应于连接体1(GGGSGGGG;SEQ IDNO:16)。第二多肽链的残基120-245对应于7B2GL的VH结构域(SEQ ID NO:58)。第二多肽链的残基246-250对应于连接体(SEQ ID NO:21,加下划线的)。第二多肽链的残基251-278对应于含半胱氨酸的K-螺旋(SEQ ID NO:32)。
DART-B的第三多肽链的氨基酸序列与DART-1的第三多肽链的氨基酸序列(即,SEQID NO:112)相同。
D.gp41 x CD3 x CD8结合分子,TRIDENT-A
命名为“TRIDENT-A”的gp41 x CD3 x CD8结合分子为第一阐释性三价结合gp41的分子。TRIDENT-A由四多肽链组成并且具备包括抗人gp41抗体7B2GL的VL结构域和VH结构域的一个结合结构域(并且因此对gp41的表位是免疫特异性的)、包括CD3 mAb 1的VL结构域和VH结构域的一个结合结构域(并且因此对CD3抗原的表位是免疫特异性的)和包括TRX8的VL结构域和VH结构域的一个结合结构域(并且因此对CD8抗原的表位是免疫特异性的)。四条多肽链缔合以形成能够免疫特异性结合gp41的表位、CD3抗原的表位和CD8的表位的共价结合的三价分子(见,例如,图6A)。
TRIDENT-A的第一多肽链的氨基酸序列与上述DART-A双抗体的第一多肽链的氨基酸序列(SEQ ID NO:113)相同。类似地,TRIDENT-A的第二多肽链的氨基酸序列与上述DART-A双抗体的第二多肽链的氨基酸序列(SEQ ID NO:114)相同。
TRIDENT-A的第三多肽链具有SEQ ID NO:117的氨基酸序列:QVQLVESGGGVVQPGRSLRL SCAASGFTFS DFGMNWVRQAPGKGLEWVAL IYYDGSNKFY ADSVKGRFTI SRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAKPH YDGYYHFFDS WGQGTLVTVS SASTKGPSVF PLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTV SWNSGALTSG VHTFPAVLQS SGLYSLSSVVTVPSSSLGTQ TYICNVNHKP SNTKVDKRVEPKSCDKTHTC PPCPAPEAAGGPSVFLFPPK PKDTLMISRT PEVTCVVVDV SHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQY NSTYRVVSVL TVLHQDWLNG KEYKCKVSNK ALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRE EMTKNQVSLS CAVKGFYPSD IAVEWESNGQPENNYKTTPP VLDSDGSFFL VSKLTVDKSRWQQGNVFSCS VMHEALHNRYTQKSLSLSPG K
TRIDENT-A的第三多肽链的残基1-121对应于抗CD8抗体TRX2的VH结构域(SEQ IDNO:70)。残基121-219对应于IgG1 CH1结构域(SEQ ID NO:3)。残基220-234对应于IgG1铰链结构域(SEQ ID NO:7)。残基235-451对应于IgG1“携带臼”的CH2-CH3结构域(SEQ ID NO:50)。
TRIDENT-A的第四多肽链具有SEQ ID NO:118的氨基酸序列:DIQMTQSPSSLSASVGDRVT ITCKGSQDIN NYLAWYQQKP GKAPKLLIYNTDILHTGVPS RFSGSGSGTD FTFTISSLQPEDIATYYCYQ YNNGYTFGQGTKVEIKRTVA APSVFIFPPS DEQLKSGTAS VVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQE SVTEQDSKDS TYSLSSTLTL SKADYEKHKV YACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
TRIDENT-A的第四多肽链的残基1-106对应于抗CD8抗体TRX2的VL结构域(SEQ IDNO:71)。残基107-213对应于CLκ结构域(SEQ ID NO:1)。
E.gp41 x CD3 x gp120结合分子,TRIDENT-B
命名为“TRIDENT-B”的第二阐释性三价gp41 x CD3 x gp120结合分子类似于上述TRIDENT-A,但是含有代替TRIDENT-A的TRX8 VL结构域和VH结构域的抗人gp120抗体A32的VL结构域和VH结构域。因此,TRIDENT-B由四条多肽链组成并且具备包括抗人gp41抗体7B2GL的VL结构域和VH结构域的一个结合结构域(并且因此对gp41的表位是免疫特异性的)、包括CD3 mAb 1的VL结构域和VH结构域的一个结合结构域(并且因此对CD3抗的表位是免疫特异性的)和包括A32的VL结构域和VH结构域的一个结合结构域(并且因此对gp120抗的表位是免疫特异性的)。
TRIDENT-B的第一多肽链的氨基酸序列与上述DART-A双抗体的第一多肽链的氨基酸序列(SEQ ID NO:113)相同。类似地,TRIDENT-B的第二多肽链的氨基酸序列与上述DART-A双抗体的第二多肽链的氨基酸序列(SEQ ID NO:114)相同。
TRIDENT-B的第三多肽链的SEQ ID NO:119的氨基酸序列:QVQLQESGPGLVKPSQTLSL SCTVSGGSSS SGAHYWSWIR QYPGKGLEWIGYIHYSGNTY YNPSLKSRIT ISQHTSENQFSLKLNSVTVA DTAVYYCARGTRLRTLRNAF DIWGQGTLVT VSSASTKGPS VFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPV TVSWNSGALT SGVHTFPAVL QSSGLYSLSS VVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKR VEPKSCDKTH TCPPCPAPEA AGGPSVFLFPPKPKDTLMIS RTPEVTCVVV DVSHEDPEVKFNWYVDGVEV HNAKTKPREEQYNSTYRVVS VLTVLHQDWL NGKEYKCKVS NKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPS REEMTKNQVS LSCAVKGFYP SDIAVEWESN GQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLVSKLTVDK SRWQQGNVFS CSVMHEALHN RYTQKSLSLSPGK
TRIDENT-B的第三多肽链的残基1-123对应于抗gp120抗体A32的VH结构域(SEQ IDNO:96)。残基124-221对应于IgG1 CH1结构域(SEQ ID NO:3)。残基222-236对应于IgG1铰链结构域(SEQ ID NO:7)。残基237-453对应于IgG1“携带臼”的CH2-CH3结构域(SEQ ID NO:50)。
TRIDENT-B的第四多肽链具有SEQ ID NO:120的氨基酸序列:QSALTQPPSASGSPGQSVTI SCTGTSSDVG GYNYVSWYQH HPGKAPKLIISEVNNRPSGV PDRFSGSKSG NTASLTVSGLQAEDEAEYYC SSYTDIHNFVFGGGTKLTVL RTVAAPSVFI FPPSDEQLKS GTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSG NSQESVTEQD SKDSTYSLSS TLTLSKADYE KHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
TRIDENT-B的第四多肽链的残基1-110对应于抗gp120抗体A32的VL结构域(SEQ IDNO:97)。残基111-217对应于CLκ结构域(SEQ ID NO:1)。
F.gp41 x CD16 x gp120结合分子,TRIDENT-C
命名为“TRIDENT-C”的第三阐释性三价gp41 x CD16 x gp120结合分子类似于上述TRIDENT-B,但是含有代替TRIDENT-B的CD3 mAb 1(D65G)VL结构域和VH结构域的抗人CD16抗体h3G8的VL结构域和VH结构域。因此,TRIDENT-C由四条多肽链组成并且具备包括抗人gp41抗体7B2GL的VL结构域和VH结构域的一个结合结构域(并且因此对gp41的表位是免疫特异性的)、包括h3G8的VL结构域和VH结构域的一个结合结构域(并且因此对CD16抗原的表位是免疫特异性的)和包括A32的VL结构域和VH结构域的一个结合结构域(并且因此对gp120抗的表位是免疫特异性的)。
TRIDENT-C的第一多肽链的氨基酸序列与上述DART-B双抗体的第一多肽链的氨基酸序列(SEQ ID NO:115)相同。类似地,TRIDENT-C的第二多肽链的氨基酸序列与上述DART-B双抗体的第二多肽链的氨基酸序列(SEQ ID NO:116)相同。
TRIDENT-C的第三多肽和第四多肽的氨基酸序列与上述TRIDENT-B的第三多肽和第四多肽的氨基酸序列(SEQ ID NO:119和SEQ ID NO:120)相同。
G.gp41 x CD3 x gp41结合分子,TRIDENT-D
命名为“TRIDENT-D”的第三阐释性三价gp41 x CD3 x gp41结合分子类似于上述TRIDENT-A,但是含有代替TRIDENT-A的TRX2抗CD8 VL结构域和VH结构域的抗人gp41抗体7B2GL的VL结构域和VH结构域。因此,TRIDENT-D由四条多肽链组成并且具备包括抗人gp41抗体7B2GL的VL结构域和VH结构域的两个结合结构域(并且因此对gp41的表位是免疫特异性的)、包括hCD3 mAb 1的VL结构域和VH结构域的一个结合结构域(并且因此对CD3抗的表位是免疫特异性的)。
TRIDENT-D的第一多肽链的氨基酸序列与上述DART-A双抗体的第一多肽链的氨基酸序列(SEQ ID NO:113)相同。类似地,TRIDENT-D的第二多肽链的氨基酸序列与上述DART-A双抗体的第二多肽链的氨基酸序列(SEQ ID NO:114)相同。
TRIDENT-D的第三多肽链具有SEQ ID NO:121的氨基酸序列:QVQLVESGGGLVKPGGSLRL SCAASGFTFS EYYMTWIRQA PGKGLEWVSYISKNGEYSKY SPSSNGRFTI SRDNAKNSLYLQMNSLRAED TAVYYCARADGLTYFSELLQ YIFDLWGQGT LVTVSSASTK GPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFP EPVTVSWNSG ALTSGVHTFP AVLQSSGLYS LSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKV DKRVEPKSCD KTHTCPPCPA PEAAGGPSVFLFPPKPKDTL MISRTPEVTC VVVDVSHEDPEVKFNWYVDG VEVHNAKTKPREEQYNSTYR VVSVLTVLHQ DWLNGKEYKC KVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTL PPSREEMTKN QVSLSCAVKG FYPSDIAVEW ESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLVSKLT VDKSRWQQGN VFSCSVMHEA LHNRYTQKSLSLSPGK
TRIDENT-D的第三多肽链的残基1-126对应于优化的抗gp41抗体7B2GL的VH结构域(SEQ ID NO:58)。残基127-224对应于IgG1 CH1结构域(SEQ ID NO:3)。残基225-239对应于IgG1铰链结构域(SEQ ID NO:7)。残基240-456对应于IgG1“携带臼”的CH2-CH3结构域(SEQID NO:50)。
TRIDENT-D的第四多肽链具有SEQ ID NO:122的氨基酸序列:DIVMTQSPDSLAVSLGERAT INCKSSQTLL YSSNNRHSIA WYQQKPGQPPKLLIYWASMR LSGVPDRFSG SGSGTDFTLTISSLQAEDVA VYYCHQYSSHPPTFGQGTKV EIKRTVAAPS VFIFPPSDEQ LKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNAL QSGNSQESVT EQDSKDSTYS LSSTLTLSKADYEKHKVYAC EVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
TRIDENT-B的第四多肽链的残基1-113对应于抗gp41抗体7B2GL的VL结构域(SEQID NO:57)。残基114-220对应于CLκ结构域(SEQ ID NO:1)。
H.可选的多特异性结合gp41的分子
如鉴于本公开将认识到,具有包括7B2GL的VL结构域和VH结构域并且包括可选的ECM和/或HIV-1抗原的结合位点的任何上述示例性分子的总体结构的另外多特异性结合gp41的分子可通过采用可选的ECM和/或HIV-1抗体的VL结构域和VH结构域代替存在于上述分子中的VL结构域和VH结构域构建。本文提供了来自许多可选的ECM和HIV-1结合位点的VL结构域和VH结构域,另外的VL结构域和VH结构域是本领域已知的。类似地,如本文提供的,可选的多特异性结合gp41的分子可同样地被构建并入可选的连接体和/或异源二聚体促进结构域,特别是本文提供的那些。
VIII.产生方法
本发明的分子最优选地通过编码这种多肽的核酸分子的重组表达产生,如本领域所熟知的。
本发明的多肽可方便地使用固相肽合成制备(Merrifield,B.(1986)“SolidPhase Synthesis,”Science 232(4748):341-347;Houghten,R.A.(1985)“General MethodFor The Rapid Solid-Phase Synthesis Of Large Numbers Of Peptides:SpecificityOf Antigen-Antibody Interaction At The Level Of Individual Amino Acids,”Proc.Natl.Acad.Sci.(U.S.A.)82(15):5131-5135;Ganesan,A.(2006)“Solid-PhaseSynthesis In The Twenty-First Century,”Mini Rev.Med.Chem.6(1):3-10)。
抗体可使用本领域已知的任何方法被重组制备和表达。抗体可通过首先分离从宿主动物制备的抗体、获得它们的DNA序列和使用这种DNA序列在宿主细胞(例如CHO细胞)中重组表达抗体而重组制备。可采用的另一方法是在植物(例如,烟草)或转基因动物的奶中表达抗体序列。已经公开了在植物或奶中重组表达抗体的合适的方法(见,例如Peeters等(2001)“Production Of Antibodies And Antibody Fragments In Plants,”Vaccine 19:2756;Lonberg,N.等(1995)“Human Antibodies From Transgenic Mice,”Int.Rev.Immunol 13:65-93;和Pollock等(1999)“Transgenic Milk As A Method ForThe Production Of Recombinant Antibodies,”J.Immunol.Methods 231:147-157)。制备抗体衍生物,例如,人源化、单链等的合适的方法在本领域是已知的,并且在已经在上面描述了。在另一可选方案中,抗体可通过噬菌体展示技术重组制备(见,例如美国专利号5,565,332、5,580,717、5,733,743、6,265,150;和Winter,G.等(1994)“Making AntibodiesBy Phage Display Technology,”Annu.Rev.Immunol.12.433-455)。
含有感兴趣的多核苷酸(例如,编码本发明的结合分子的多肽链的多核苷酸)的载体可通过许多合适的手段中的任何一种引入宿主细胞中,所述手段包括电穿孔;采用氯化钙、氯化铷、磷酸钙、DEAE-葡聚糖或其他物质的转染;微粒轰击;脂质转染;和感染(例如,其中载体为感染剂,比如牛痘病毒)。引入载体或多核苷酸的选择将通常取决于宿主细胞的特征。
能够过表达异源DNA的任何宿主细胞可用于表达感兴趣的多肽或蛋白的目的。合适的哺乳动物宿主细胞的非限制性示例包括但不限于COS、HeLa和CHO细胞。
本发明包括包含本发明的结合分子的氨基酸序列的多肽。本发明的多肽可通过本领域已知的程序制备。多肽可通过抗体的蛋白水解或其他降解、通过如上述重组方法(即,单个多肽或融合多肽)或通过化学合成产生。抗体的多肽,尤其至多(up to)约50个氨基酸的较短多肽,通过化学合成方便制备。化学合成的方法在本领域是已知的并且是商业上可得的。
本发明包括公开的结合分子的变体,其包括不显著影响这种分子的特性的功能上等同的多肽以及具有增加的或减少的活性的变体。多肽的修饰在本领域是常规实践并且不需要在本文进行详细描述。修饰的多肽的示例包括具有氨基酸残基的保守替换、不显著地或不利地改变功能活性的氨基酸的一个或多个缺失或添加或化学类似物的使用的多肽。可彼此为保守替换的氨基酸残基包括但不限于:甘氨酸/丙氨酸;丝氨酸/苏氨酸;缬氨酸/异亮氨酸/亮氨酸;天冬酰胺/谷氨酰胺;天冬氨酸/谷氨酸;赖氨酸/精氨酸;和苯丙氨酸/酪氨酸。这些多肽也包括糖基化和非糖基化的多肽,以及具有其他翻译后修饰,比如,例如用不同糖的糖基化、乙酰化和磷酸化的多肽。优选地,氨基酸替换将是保守的,即替换的氨基酸将具有与原始氨基酸类似的电荷、尺寸等化学性质。这种保守替换是本领域已知的并且已经在上面提供了示例。氨基酸修饰的范围可从改变或修饰一个或多个氨基酸至完全重新设计区,比如可变结构域。可变结构域中的变化可改变结合亲和性和/或特异性。修饰的其他方法包括使用本领域已知的偶联技术,其包括但不限于酶促方式、氧化替换和螯合。修饰可用于,例如附接用于免疫测试的标签,比如附接用于放射性免疫测试的放射性部分。使用本领域建立的程序制备修饰的多肽并且可使用本领域已知的标准测试筛选。
在一种实施方式中,提供了包括轻链、重链或轻链和重链二者的融合多肽。在另一实施方式中,融合多肽含有异源免疫球蛋白恒定区。在另一实施方式中,融合多肽含有从公众保藏的杂交瘤中产生的抗体的VH结构域和VL结构域。为了本发明的目的,抗体融合蛋白含有能够使蛋白免疫特异性结合gp41和ECM(例如,CD3、CD16等)的多肽结构域,并且其含有天然分子中未连接到其上的另一氨基酸序列,例如来自另一区的异源序列或同源序列(例如,去免疫化结合白蛋白的结构域、蛋白A识别序列、肽标签等)。
本发明特别地涵盖缀合至诊断或治疗部分的这种结合分子(例如,抗体、双抗体、三价结合分子等)。为了诊断目的,本发明的结合分子可被偶联至可检测的物质。这种结合分子可作为临床测试程序的一部分,用于疾病的发展或进展的监测和/或预后,比如确定特定疗法的功效。可检测的物质的示例包括各种酶(例如,辣根过氧化物酶、β-半乳糖苷酶等)、辅基(例如,抗生物素蛋白/生物素)、荧光物质(例如,伞形酮、荧光素或藻红蛋白)、发光物质(例如,发光氨)、生物发光物质(例如,荧光素酶或发光蛋白质)、放射性物质(例如,碳14、锰54、锶85或锌65)、正电子发光金属和非放射性顺磁金属离子。可检测的物质可使用本领域已知的技术直接地或通过中间体(例如连接体)间接地被偶联或缀合至结合分子。
为了治疗目的,本发明的结合分子可被缀合至治疗部分,比如细胞毒素(例如,细胞抑制剂或杀细胞剂)、治疗剂或放射性金属离子,例如、α-发射剂。细胞毒素或细胞毒素剂包括对细胞有害的任何试剂,比如,例如假单胞菌外毒素、白喉毒素、肉毒杆菌毒素A至F、篦麻毒素、相思豆毒素、皂草素和这种试剂的细胞毒素片段。治疗剂包括具有治疗效果以预防性或治疗性治疗不适的任何试剂。这种治疗剂可为化学治疗剂、蛋白质或多肽治疗剂,并且包括具备期望的生物学活性和/或修饰给定的生物学应答的治疗剂。治疗剂的示例包括烷基化剂、血管生成抑制剂、抗有丝分裂剂、激素治疗剂和可用于治疗细胞增生性不适的抗体。治疗部分可使用本领域已知的技术直接地或通过中间体(例如,连接体)间接地被偶联或缀合至结合分子。
IX.本发明的结合分子的用途
如上所讨论,能够结合gp41和ECM二者的分子能够介导在其细胞表面上表达这种gp41的靶细胞(即,感染病原体的细胞)的重定向细胞杀伤。这种分子可用于治疗性目的,例如在患有感染,特别是潜伏HIV-1感染的受试者中。因此,本发明的结合分子具有治疗与gp41,特别是潜伏HIV-1感染的表达相关或特征在于gp41,特别是潜伏HIV-1感染的表达的疾病或病况的能力。因此,但不限于,本发明的结合分子可用于HIV-1感染,特别是潜伏HIV-1感染的治疗。
具体地,本发明涵盖这种方法,其中能够结合gp41的分子包括能够结合gp41的抗体的“结合表位的结构域”并且也包括能够结合免疫效应细胞的表面上的ECM(具体地,CD3和/或CD16)的结合表位的结构域以便介导表达gp41的靶细胞的重定向杀伤(例如,通过介导重定向细胞杀伤(例如,重定向的T-细胞细胞毒性))。
在某些方面中,本发明提供了本发明的结合gp41的分子,特别是多特异性结合gp41的分子比如但不限于双特异性和三特异性分子(例如,双特异性抗体、双特异性双抗体、三价结合分子等)在治疗和预防个体中HIV-1感染的方法中的用途,所述方法包括以药学上可接受的形式给个体施用治疗有效量的包括本发明的结合gp41的分子的组合物。在某些实施方式中,结合gp41的分子结合不同的HIV-1表位,优选地存在于HIV-1包膜上的不同表位。
本文描述的的各种结合gp41的分子具有实用性,例如,在包括但不限于下面的情形中:
i)在预期的已知暴露于HIV-1感染的情形下,可作为杀微生物剂预防性地施用(例如,IV、局部或鼻内)本发明的结合gp41的分子,
ii)在已知或怀疑暴露的情形下,比如在强奸受害者或商业性工作者的情形下发生的,或在没有避孕套保护的任何同性恋或异性恋传播中,可作为暴露后预防施用,例如,IV或局部施用本发明的结合gp41的分子,和
iii)在急性HIV-1感染(AHI)的情形下,本发明的结合gp41的分子可作为用于控制初始病毒载量的AHI,或用于消除感染病毒的CD4 T细胞的治疗施用。
按照本发明,本发明的结合gp41的分子可在受试者或受试者的免疫系统/细胞与HIV-1的接触之前或这种接触的约48小时内施用。该时间范围内施用可使受试者的易感细胞被HIV感染的抑制最大化。
另外,本发明的结合gp41的分子的各种形式可施用至慢性或急性感染的HIV-1受试者并且用于杀伤剩余感染病毒的细胞,原因是这些结合gp41的分子结合感染病毒的细胞的表面并且能够介导这种感染的细胞的重定向细胞杀伤。
在某些实施方式中,本发明的结合gp41的分子可以与潜伏期激活剂组合施用,以便激活可存在于受试者中的感染HIV的细胞的潜伏库。预期是通过激活静息细胞中的潜伏的前病毒的HIV-1DNA,先前不活跃的细胞将开始产生新的病毒并且将通过已经通过本发明的结合gp41的分子扩增的免疫系统识别且消除。潜伏期激活试剂的非限制性示例为HDAC抑制剂,例如,伏立诺他、罗米地辛、帕比司他、双硫仑、JQ1、苔藓抑素、PMA、离子霉素或其任何组合。见Bullen等Nature Medicine 20,425-429(2014)。
在某些实施方式中,本发明的结合gp41的分子可以与抗逆转录病毒剂组合施用。
在具体的实施方式中,能够结合gp41和ECM的分子为双特异性抗体、
Figure BDA0002902883590000861
Figure BDA0002902883590000862
在具体的实施方式中,能够结合gp41和ECM的分子为双特异性双抗体。
在具体的实施方式中,能够结合gp41和ECM的分子为三价结合分子。
如本文使用的,术语:“提供疗法”和“治疗”指与任何有利或期望结果的指征相关的组合物的任何施用,所述结果包括但不限于任何临床结果,比如减少疾病所引起的症状;减轻感染的症状(例如,病毒载量、发烧、疼痛、脓毒症等);疾病所引起的症状的减少;受体受试者生活质量的增加;提供以治疗受试者疾病的其他药物剂量的减少;另一药物效果比如经靶向和/或内化的增强;疾病进展的延迟;和/或受试者存活的延长。
用于治疗的受试者包括动物,最优选哺乳动物物种,比如非灵长类(例如,牛、马、猫、犬、啮齿动物等)或灵长类(例如,猴子如食蟹猴、人等)。在优选的实施方式中,受试者为人。
可通过本发明的各种实施方式治疗的示例性不适包括但不限于HIV-1感染(尤其是与由能够介导重定向细胞杀伤的分子结合的gp41的表达相关的潜伏HIV-1感染)。在各种实施方式中,本发明涵盖用于治疗、预防或管理受试者中的疾病或不适的方法或组合物,其包括向受试者施用治疗有效量的本发明的结合分子。这种分子特别地可用于减少HIV-1载量或消除感染HIV的细胞。尽管不期望受到特定作用机理的束缚,但是这种分子可介导针对靶细胞的效应子功能、促进免疫系统针对靶细胞的激活、使细胞表面抗原和/或受体在靶细胞上交联和增强细胞凋亡或负增长调节信号或其组合,引起靶细胞的清除和/或数量减少。
X.药物组合物
本发明涵盖包括本发明的结合gp41的分子的组合物。本发明的组合物包括可用于制造药物组合物的原料药组合物(例如,不纯的或非灭菌的组合物)和可以以单位剂型的制剂使用的药物组合物(即,适合于施用至受试者的组合物)。这种组合物包括预防或治疗有效量的能够结合gp41并且也能够结合ECM以便能够介导靶细胞(例如,感染HIV的细胞等)的重定向杀伤的分子(即,gp41 x ECM结合分子),或这种试剂和药学上可接受的载体的组合。优选地,本发明的组合物包括预防或治疗有效量的本发明的结合分子和药学上可接受的载体。在优选的方面中,这种组合物基本上是纯的(即,基本上不含限制其效果或产生不期望的副作用的物质)。
这种组合物的各种制剂可用于施用。除了药理学活性剂之外,本发明的组合物可含有包括赋形剂和辅料的合适的药学上可接受的载体,其是本领域熟知的并且其是有助于药理学有效物质的施用或有助于将活性化合物加工成可药学上用于递送至作用位点的制剂的相对惰性物质。例如,赋形剂可给予形状(form)或稠度(consistency)或充当稀释剂。合适的赋形剂包括但不限于稳定剂、润湿剂和乳化剂、用于改变渗透压的盐、胶囊化剂、缓冲剂和皮肤渗透增强剂。
在具体的实施方式中,术语“药学上可接受的”指被联邦政府或州政府管理机构许可的或列于美国药典或其他通常获得认可的用于动物,更特别是用于人的药典中。术语“载体”指与治疗剂一起施用的稀释剂、佐剂(例如,弗氏佐剂(完全和不完全))、赋形剂或媒介。一般而言,本发明组合物的成分被单独提供或以单位剂型混合在一起,例如作为在标明活性剂的量的气密密封容器比如安瓿或药囊(sachette)中的干燥冻干粉或无水浓缩物。当通过输注施用组合物时,其可以用含有无菌药物级水或生理盐水(saline)的输注瓶分配。当通过注射施用组合物时,则可提供注射用无菌水或生理盐水的安瓿,以便可以在施用前混合成分。
本发明也提供了药物包(pack)或试剂盒,其包括一个或多个容器,所述容器填充有单独的本发明的结合gp41的分子或填充有本发明的结合gp41的分子与这种药学上可接受的载体。另外,用于治疗疾病的一种或多种其他预防或治疗的试剂也可包括在药物包或试剂盒中。本发明也提供了药物包或试剂盒,其包括一个或多个容器,所述容器填充有本发明药物组合物的一种或多种成分。任选地与这种容器关联的可为以由管理药物或生物制品的制造、使用或销售的政府机构规定的形式的告示(notice),所述告示反映了管理机构许可制造、使用或销售,供人施用。
本发明提供可用于以上方法的试剂盒。试剂盒可包括本发明的结合分子中的任一种。试剂盒还可进一步在一个或多个容器中包括用于治疗癌症的一种或多种其他预防和/或治疗的试剂。
XI.施用的方法
通过向受试者施用有效量的包括本发明的结合gp41的分子的药物组合物,可提供本发明的组合物用于治疗、预防和改善与疾病、不适或感染相关的一种或多种症状。在优选的方面中,这种组合物基本上是纯的(即,基本上不含限制其效果或产生不期望的副作用的物质)。在具体的实施方式中,受试者为动物,优选哺乳动物,比如非灵长类(例如牛、马、猫、犬、啮齿动物等)或灵长类(例如,猴子如食蟹猴、人等)。在优选的实施方式中,受试者为人。
施用本发明的结合gp41的分子或包括这种结合gp41的分子的组合物的方法包括但不限于,肠胃外施用(例如,皮内、肌内、腹膜内、静脉内和皮下)、硬膜外和粘膜(例如,鼻内和口服路径)。在具体的实施方式中,肌内、静脉内或皮下施用本发明的结合分子。可通过任何方便的路径,例如通过输注或弹丸注射、通过经上皮或粘膜皮肤保护层(例如,口腔粘膜、直肠和肠道粘膜等)吸收,施用组合物,并且组合物可与其他生物活性剂一起施用。施用可为全身的或局部的。
本发明也提供了本发明的结合gp41的分子的制剂被包装在指示分子的量的气密密封容器,如安瓿或药囊中。在一个实施方式中,这种结合gp41的分子作为干燥灭菌的冻干粉或无水浓缩物提供在气密密封容器中并且可以例如用水或生理盐水重构至适当的浓度,以施用至受试者。优选地,本发明的结合gp41的分子作为无菌的冻干粉提供在气密密封容器中。
本发明的结合gp41的分子的冻干制剂应在它们的初始容器中储存在2℃和8℃之间并且该分子应在重构之后的12小时内、优选地6小时内、5小时内、3小时内或1小时内施用。在可选的实施方式中,这种分子以液体形式提供在指示分子、融合蛋白或缀合分子的量和浓度的气密密封容器中。优选地,液体形式提供时的这种结合分子提供在气密密封容器中。
可通过标准临床技术确定本发明的这种制剂有效治疗、预防或改善与不适相关的一种或多种症状的量。制剂中采用的精确剂量也取决于施用的路径和病症的严重性,并且应根据医师的判断和每个受体受试者的情况决定。有效的剂量可从源自体外或动物模型测试系统的剂量响应曲线推出。
如本文使用的,药物组合物的“有效量”是足以实现有益的或期望的结果的量,结果包括但不限于临床结果,比如减轻疾病引起的症状、缓解感染的症状(例如,病毒载量、发烧、疼痛、脓毒症等),从而提高遭受疾病的那些人的生活质量、减少治疗疾病需要的其他药物的剂量、增强另一药物治疗比如经靶向和/或内化的效果、延迟疾病的进展和/或延长个体的存活。当应用于单独施用时的单个活性成分,该术语指该单独的成分。当应用于组合时,该术语指无论组合、连续或同时施用,引起治疗效果的活性成分的组合量。
有效量可在一次或多次施用中施用。为了本发明的目的,药物、化合物或药物组合物的有效量是足够的量:以直接地或间接地杀死和/或减少感染HIV-1的细胞的增殖;或降低HIV-1病毒的增殖(或效果)和降低和/或延迟HIV-介导的疾病的发展。在一些实施方式中,药物、化合物或药物组合物的有效量可结合或不结合另一药物、化合物或药物组合物而实现。因此,“有效量”可在施用一种或多种化疗剂的背景下考虑,并且如果结合一种或多种其他试剂,期望的结果可以实现或被实现,则可以考虑以有效量给予单一试剂。尽管个体需求不同,但是确定每种组分的有效量的最佳范围在本领域技术人员的技能范围内。
对于本发明涵盖的结合分子,优选基于接收受试者的体重(kg)确定施用至受体受试者的剂量。对于本发明涵盖的结合分子,施用至受体受试者的剂量通常是约0.01μg/kg受试者体重至约30mg/kg受试者体重或更高。
可通过修饰比如,例如脂质化增强分子的吸收和组织渗透而降低或改变施用本发明的结合分子的剂量和频率。
可计算用作单一试剂疗法的施用至受体受试者的本发明的结合分子的剂量。可选地,分子可以与其他治疗性组合物组合使用,并且施用至受体受试者的剂量小于当所述分子用作单一试剂疗法时使用的剂量。
本发明的药物组合物可局部施用至需要治疗的区;这可通过,例如,但不限于局部输注、通过注射或通过移植物实现,所述移植物是多孔的、无孔的或胶状的材料,其包括膜,比如
Figure BDA0002902883590000891
膜或纤维。优选地,当施用本发明的分子时,必须注意使用不吸附该分子的材料。
本发明的组合物可以在囊泡尤其脂质体中递送(见Langer(1990)“New MethodsOf Drug Delivery,”Science 249:1527-1533);Treat等,in Liposomes in the Therapyof Infectious Disease and Cancer,Lopez-Berestein and Fidler(eds.),Liss,NewYork,pp.353-365(1989);Lopez-Berestein,出处同上,pp.317-327)。
用治疗或预防有效量的本发明的结合分子治疗受试者可包括单次治疗,或优选地可包括一系列治疗。在优选的示例中,用本发明的药物组合物治疗受试者约1至10周之间,优选地2至8周之间,更优选地约3至7周之间,甚至更优选地约4周、5周或6周。可每天施用一次本发明的药物组合物,其中进行这种施用一周一次、一周两次、每两周一次、一月一次、每六周一次、每两月一次、一年两次或一年一次等。可选地,可一天两次施用本发明的药物组合物,其中进行这种施用一周一次、一周两次、每两周一次、一月一次、每六周一次、每两月一次、一年两次或一年一次等。可选地,可一天三次施用本发明的药物组合物,其中进行这种施用一周一次、一周两次、每两周一次、一月一次、每六周一次、每两月一次、一年两次或一年一次等。也将认识到用于治疗的分子的有效剂量可随着具体治疗过程的推移而增加或减少。
实施例
已经大体上描述了本发明,通过参考下列实施例将更容易理解本发明,除非指明,否则通过例证的方式提供下列实施例并且不期望限制本发明。
实施例1
优化
发现命名为“7B2 IgG”的抗HIV-1Env(gp41蛋白质)抗体(GenBank登记号AFQ31503;Buchacher,A.等(1994)“Generation Of Human Monoclonal AntibodiesAgainst HIV-1Proteins;Electrofusion And Epstein-Barr Virus Transformation ForPeripheral Blood Lymphocyte Immortalization,”AIDS Res.Hum.Retroviruses 10(4):359-369;Shen,R.(2010)“GP41-Specific Antibody Blocks Cell-Free HIV-1Type1Transcytosis Through Human Rectal Mucosa And Model Colonic Epithelium,”J.Immunol.184(7):3648-3655)在其框架区中包括许多人IgG种系库中稀有的氨基酸残基。这种稀有的非种系残基的存在可为免疫原性的并且当重复施用至受体受试者时导致抗药物-抗体的产生。为了减少或甚至消除这些结构域的免疫原性潜力,通过将突变引入其框架区以用种系氨基酸残基代替这种稀有的氨基酸残基而优化7B2可变区。
如图7A-图7B中显示,将九(9)个突变引入VL框架区中(图7A)并且将十七(17)个氨基酸替换引入VH框架区中(图7B),以产生分别命名为“7B2GL VL”和“7B2GL VH”的完全种系化的VL结构域和VH结构域。所得VL结构域/VH结构域共同地被称为“7B2GL”。
抗体7B2和抗体7B2GL的VL结构域的氨基酸序列已经在以上呈现(分别为SEQ IDNO:55和SEQ ID NO:57)。框架1-3供体(IGKV4-1)的VL结构域的氨基酸序列和框架4供体(IGKJ1-01)的框架4区的氨基酸序列为:
IGKV4-1(SEQ ID NO:123):
DIVMTQSPDS LAVSLGERAT INCKSSQSVL YSSNNKNYLA WYQQKPGQPP KLLIYWASTRESGVPDRFSG SGSGTDFTLT ISSLQAEDVA VYYCQQYYST P
和IGKJ1-01(SEQ ID NO:124):
FGQGTKVEIK。
抗体7B2和抗体7B2GL的VH结构域的氨基酸序列已经在以上呈现(分别为SEQ IDNO:56和SEQ ID NO:58)。框架1-3供体(IGVH3-11)的VH结构域的氨基酸序列和框架4供体(IGHJ4-01)的框架4区的氨基酸序列为:
IGVH3-11(SEQ ID NO:125):
QVQLVESGGG LVKPGGSLRL SCAASGFTFS DYYMSWIRQAPGKGLEWVSY ISSSSSYTNYADSVKGRFTI SRDNAKNSLY LQMNSLRAEDTAVYYCAR
和IGHJ4-01(SEQ ID NO:126):
WGQGTLVTVSS
通过Attana Cell A200 QCM检测包括完全种系化可变区的IgG(命名为“7B2GLIgG”)的结合。简言之,将HIV-1JRFL gp140重组蛋白质(HIV-1Env蛋白质减去跨膜和C-末端氨基酸残基,但是保留由7B2识别的gp41表位)以25nM、50nM和100nM经过独立地捕获在用抗人IgG Fc表面涂覆的Attana传感器芯片上的7B2 IgG(图8A)或7B2GL IgG(图8B)。对于动力学参数(ka,kd,KD)的分析,选择1:1结合作为合适的模型,因为其为数学上最少操作的模型。然而,因为JRFL gp140为单体(20-30%)、二聚体(40%)和三聚体(30%)的混合物,该模型不完全地描述相互作用。相应地,表8中提供的动力学参数(ka、kd、KD,使用1:1结合拟合)主要用于直接比较7B2和7B2GL构建体彼此的Ag结合活性的目的。尽管许多改变位于已知对抗原结合是重要的(例如,VH结构域Kabat位置:30、48、49和79,和VL结构域Kabat位置48)(Foote and Winter(1992)“Antibody Framework Residues Affecting TheConformation Of The Hypervariable Loops,”J.Mol.Biol.224:487-499),并且通常不改变(见,例如,Chromikova等(2015)“Introduction Of Germline Residues Improves TheStability Of Anti-HIV mAb2G12-IgM,”Biochim.Biophys.Acta 1854:1536-1544)的游标(Vernier)区中,但是这些研究显示,所有26个种系突变有良好的耐性,并且完全种系化的抗体展示出与野生型抗体7B2的那些几乎相同的表位结合动力学。
Figure BDA0002902883590000921
实施例2
HIV x CD3结合分子
产生了能够结合HIV Env gp41蛋白质和示例性免疫效应细胞靶,CD3的两个HIV xCD3结合分子。尤其,产生了包括7B2或7B2GL可变结构域且具有三条多肽链的两个双特异性双抗体(命名为“DART-1”和“DART-A”),每个包括CD3 mAb 1(D65G)可变结构域。DART-1和DART-A为能够结合HIV和CD3的具有图4A中显示的总体结构的含Fc结构域的双特异性双抗体。上面详细地描述了这些示例性分子的结构域和氨基酸序列。
在许多测试中检查了DART-1和DART-A的生物活性。通过流式细胞术评估DART-1和DART-A结合HEK/D371细胞的表面上表达的gp41的能力。简言之,表达gp140的HEK293/D371细胞(强力霉素-可诱导的表达的HIV-1CM244(亚型AE)gp140包膜,从Dr.John Kappes获得的(University of Alabama,Birmingham),在用1μg/mL强力霉素预孵育24小时后)用连续稀释(10μg/mL-0.0024μg/mL)的DART-1、DART-A或RSV x CD3阴性对照孵育。在冲洗后,用Alexa 488-抗人IgG1 Fc二抗孵育细胞并且通过流式细胞术(例如,使用Guava EasyCyte8HT(Millipore)和通过GraphPad Prism 7绘制的MFI)分析。如图9中显示,DART-1和DART-A以类似的剂量依赖性方式结合表达gp140的HEK293/D371细胞。
使用Jurkat T细胞报告测试(Promega)评估DART-1和DART-A激活T细胞的能力。简言之,在连续稀释(10μg/mL-0.0024μg/mL)的DART-1、DART-A或RSV x CD3阴性对照存在的情况下,用表达gp140的HEK293/D371细胞(20:1)共培养Jurkat IL2 Luc2P报告细胞,并且使用ONE-GLOTM荧光素酶分析系统(Promega)测量发光。如图10中显示,DART-1和DART-A展示出相当的T-细胞激活活性。
使用CTL测试评估DART-1和DART-A介导T细胞重定向靶细胞杀伤的能力。简言之,Pan T细胞是从健康的人PBMC分离的(例如,使用
Figure BDA0002902883590000931
UntouchedTM人T细胞试剂盒(Invitrogen))。以效应子:靶(E:T)比例=10:1,或以如指示的改变E:T比例的其他方式与人T细胞一起,用连续稀释的DART-1、DART-A或RSV x CD3阴性对照处理表达gp140的HEK293/D371(1-4x105细胞/mL),并且在37℃,5%CO2孵育24小时。通过乳酸脱氢酶(LDH)释放(例如,使用CytoTox
Figure BDA0002902883590000932
非放射性细胞毒性测试,Promega)测量细胞毒性。如图11中显示,DART-1和DART-A展示出相当的T细胞重定向靶细胞杀伤活性。
这些研究的结果表明,将许多替换引入7B2的VL结构域和VH结构域以产生优化的完全种系化7B2GL结构域,在上述测试中不影响gp140结合或生物活性。
本说明书中提及的所有出版物和专利以如同每个出版物或专利申请被明确且单独地指出以其全部内容通过引用并入的程度通过引用并入本文。尽管已经结合其具体实施方式描述了本发明,但是应当理解它能进一步改变,并且本申请意欲涵盖总体上遵循本发明的原理并且包括落入本发明所属领域内的已知或惯常实践内的并且可适用于前文所提出的实质特征的这种偏离的本发明的任何变化、应用或调整。
序列表
<110> 宏观基因股份有限公司
Lam, Chia-Yang
Diedrich, Gundo
<120> 优化的结合gp41的分子及其用途
<130> 1301.0155PCT
<150> US 62/673,462
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<160> 131
<170> PatentIn 版本 3.5
<210> 1
<211> 107
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (1)..(107)
<223> 人IgG CL κ结构域
<400> 1
Arg Thr Val Ala Ala Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu
1 5 10 15
Gln Leu Lys Ser Gly Thr Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe
20 25 30
Tyr Pro Arg Glu Ala Lys Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln
35 40 45
Ser Gly Asn Ser Gln Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser
50 55 60
Thr Tyr Ser Leu Ser Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu
65 70 75 80
Lys His Lys Val Tyr Ala Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser
85 90 95
Pro Val Thr Lys Ser Phe Asn Arg Gly Glu Cys
100 105
<210> 2
<211> 104
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (1)..(104)
<223> 人IgG CL λ结构域
<400> 2
Gln Pro Lys Ala Ala Pro Ser Val Thr Leu Phe Pro Pro Ser Ser Glu
1 5 10 15
Glu Leu Gln Ala Asn Lys Ala Thr Leu Val Cys Leu Ile Ser Asp Phe
20 25 30
Tyr Pro Gly Ala Val Thr Val Ala Trp Lys Ala Asp Ser Ser Pro Val
35 40 45
Lys Ala Gly Val Glu Thr Thr Pro Ser Lys Gln Ser Asn Asn Lys Tyr
50 55 60
Ala Ala Ser Ser Tyr Leu Ser Leu Thr Pro Glu Gln Trp Lys Ser His
65 70 75 80
Arg Ser Tyr Ser Cys Gln Val Thr His Glu Gly Ser Thr Val Glu Lys
85 90 95
Thr Val Ala Pro Thr Glu Cys Ser
100
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<213> 智人
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (1)..(98)
<223> 人IgG1 CH1结构域
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Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys
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Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr
20 25 30
Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser
35 40 45
Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser
50 55 60
Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr
65 70 75 80
Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys
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Arg Val
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<213> 智人
<220>
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<223> 人IgG2 CH1结构域
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Ser Thr Ser Glu Ser Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr
20 25 30
Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser
35 40 45
Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser
50 55 60
Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Asn Phe Gly Thr Gln Thr
65 70 75 80
Tyr Thr Cys Asn Val Asp His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys
85 90 95
Thr Val
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<213> 智人
<220>
<221> MISC_FEATURE
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Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr
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35 40 45
Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser
50 55 60
Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr
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<213> 智人
<220>
<221> MISC_FEATURE
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<223> 人IgG4 CH1结构域
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Ser Thr Ser Glu Ser Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr
20 25 30
Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser
35 40 45
Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser
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Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Lys Thr
65 70 75 80
Tyr Thr Cys Asn Val Asp His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys
85 90 95
Arg Val
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<213> 智人
<220>
<221> MISC_FEATURE
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Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro
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<213> 智人
<220>
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Glu Arg Lys Cys Cys Val Glu Cys Pro Pro Cys Pro
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<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (1)..(62)
<223> 人IgG3 铰链结构域
<400> 9
Glu Leu Lys Thr Pro Leu Gly Asp Thr Thr His Thr Cys Pro Arg Cys
1 5 10 15
Pro Glu Pro Lys Ser Cys Asp Thr Pro Pro Pro Cys Pro Arg Cys Pro
20 25 30
Glu Pro Lys Ser Cys Asp Thr Pro Pro Pro Cys Pro Arg Cys Pro Glu
35 40 45
Pro Lys Ser Cys Asp Thr Pro Pro Pro Cys Pro Arg Cys Pro
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<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (1)..(12)
<223> 人IgG4 铰链结构域
<400> 10
Glu Ser Lys Tyr Gly Pro Pro Cys Pro Ser Cys Pro
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<211> 12
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 包括稳定的S228P替换的IgG4铰链结构域
<400> 11
Glu Ser Lys Tyr Gly Pro Pro Cys Pro Pro Cys Pro
1 5 10
<210> 12
<211> 217
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (1)..(217)
<223> 示例性人IgG1 CH2-CH3结构域
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (217)..(217)
<223> Xaa是赖氨酸(K)或不存在
<400> 12
Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys
1 5 10 15
Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val
20 25 30
Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr
35 40 45
Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu
50 55 60
Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His
65 70 75 80
Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys
85 90 95
Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln
100 105 110
Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met
115 120 125
Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro
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Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn
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Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu
165 170 175
Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val
180 185 190
Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln
195 200 205
Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Xaa
210 215
<210> 13
<211> 216
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (1)..(216)
<223> 示例性人IgG2 CH2-CH3结构域
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (216)..(216)
<223> Xaa是赖氨酸(K)或不存在
<400> 13
Ala Pro Pro Val Ala Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro
1 5 10 15
Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val
20 25 30
Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Gln Phe Asn Trp Tyr Val
35 40 45
Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln
50 55 60
Phe Asn Ser Thr Phe Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Val His Gln
65 70 75 80
Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Gly
85 90 95
Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Thr Lys Gly Gln Pro
100 105 110
Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr
115 120 125
Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser
130 135 140
Asp Ile Ser Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr
145 150 155 160
Lys Thr Thr Pro Pro Met Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr
165 170 175
Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe
180 185 190
Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys
195 200 205
Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Xaa
210 215
<210> 14
<211> 217
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> 'MISC_FEATURE
<222> (1)..(217)
<223> 示例性人IgG3 CH2-CH3结构域
<220>
<221> 'MISC_FEATURE
<222> (217)..(217)
<223> Xaa是赖氨酸(K)或不存在
<400> 14
Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys
1 5 10 15
Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val
20 25 30
Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Gln Phe Lys Trp Tyr
35 40 45
Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu
50 55 60
Gln Tyr Asn Ser Thr Phe Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His
65 70 75 80
Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys
85 90 95
Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Thr Lys Gly Gln
100 105 110
Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met
115 120 125
Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro
130 135 140
Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Ser Gly Gln Pro Glu Asn Asn
145 150 155 160
Tyr Asn Thr Thr Pro Pro Met Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu
165 170 175
Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Ile
180 185 190
Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn Arg Phe Thr Gln
195 200 205
Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Xaa
210 215
<210> 15
<211> 217
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (1)..(217)
<223> 示例性人IgG4 CH2-CH3结构域
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (217)..(217)
<223> Xaa是赖氨酸(K)或不存在
<400> 15
Ala Pro Glu Phe Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys
1 5 10 15
Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val
20 25 30
Val Val Asp Val Ser Gln Glu Asp Pro Glu Val Gln Phe Asn Trp Tyr
35 40 45
Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu
50 55 60
Gln Phe Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His
65 70 75 80
Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys
85 90 95
Gly Leu Pro Ser Ser Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln
100 105 110
Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Gln Glu Glu Met
115 120 125
Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro
130 135 140
Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn
145 150 155 160
Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu
165 170 175
Tyr Ser Arg Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Glu Gly Asn Val
180 185 190
Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln
195 200 205
Lys Ser Leu Ser Leu Ser Leu Gly Xaa
210 215
<210> 16
<211> 8
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 优选的间插间隔肽(连接体 1)
<400> 16
Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly
1 5
<210> 17
<211> 6
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 优选的含半胱氨酸的间隔肽(连接体2)
<400> 17
Gly Gly Cys Gly Gly Gly
1 5
<210> 18
<211> 4
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 可选的不含半胱氨酸的连接体2间隔肽
<400> 18
Gly Gly Gly Ser
1
<210> 19
<211> 6
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 可选的不含半胱氨酸的连接体2间隔肽
<400> 19
Leu Gly Gly Gly Ser Gly
1 5
<210> 20
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 可选的不含半胱氨酸的连接体2间隔肽
<400> 20
Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly
1 5 10
<210> 21
<211> 5
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 可选的不含半胱氨酸的连接体2间隔肽
<400> 21
Ala Ser Thr Lys Gly
1 5
<210> 22
<211> 6
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 可选的不含半胱氨酸的连接体2间隔肽
<400> 22
Leu Glu Pro Lys Ser Ser
1 5
<210> 23
<211> 5
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 可选的不含半胱氨酸的连接体2间隔肽
<400> 23
Ala Pro Ser Ser Ser
1 5
<210> 24
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 异源二聚体促进结构域
<400> 24
Gly Val Glu Pro Lys Ser Cys
1 5
<210> 25
<211> 6
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 异源二聚体促进结构域
<400> 25
Val Glu Pro Lys Ser Cys
1 5
<210> 26
<211> 6
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 异源二聚体促进结构域
<400> 26
Ala Glu Pro Lys Ser Cys
1 5
<210> 27
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 异源二聚体促进结构域
<400> 27
Gly Phe Asn Arg Gly Glu Cys
1 5
<210> 28
<211> 6
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 异源二聚体促进结构域
<400> 28
Phe Asn Arg Gly Glu Cys
1 5
<210> 29
<211> 28
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> "E-螺旋" 异源二聚体促进结构域
<400> 29
Glu Val Ala Ala Leu Glu Lys Glu Val Ala Ala Leu Glu Lys Glu Val
1 5 10 15
Ala Ala Leu Glu Lys Glu Val Ala Ala Leu Glu Lys
20 25
<210> 30
<211> 28
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> "K-螺旋" 异源二聚体促进结构域
<400> 30
Lys Val Ala Ala Leu Lys Glu Lys Val Ala Ala Leu Lys Glu Lys Val
1 5 10 15
Ala Ala Leu Lys Glu Lys Val Ala Ala Leu Lys Glu
20 25
<210> 31
<211> 28
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 含半胱氨酸的"E-螺旋" 异源二聚体促进结构域
<400> 31
Glu Val Ala Ala Cys Glu Lys Glu Val Ala Ala Leu Glu Lys Glu Val
1 5 10 15
Ala Ala Leu Glu Lys Glu Val Ala Ala Leu Glu Lys
20 25
<210> 32
<211> 28
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 含半胱氨酸的"K-螺旋" 异源二聚体促进结构域
<400> 32
Lys Val Ala Ala Cys Lys Glu Lys Val Ala Ala Leu Lys Glu Lys Val
1 5 10 15
Ala Ala Leu Lys Glu Lys Val Ala Ala Leu Lys Glu
20 25
<210> 33
<211> 46
<212> PRT
<213> 停乳链球菌
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (1)..(46)
<223> 链球菌菌株G148的蛋白G的结合白蛋白的结构域 3 (ABD3)
<400> 33
Leu Ala Glu Ala Lys Val Leu Ala Asn Arg Glu Leu Asp Lys Tyr Gly
1 5 10 15
Val Ser Asp Tyr Tyr Lys Asn Leu Ile Asp Asn Ala Lys Ser Ala Glu
20 25 30
Gly Val Lys Ala Leu Ile Asp Glu Ile Leu Ala Ala Leu Pro
35 40 45
<210> 34
<211> 46
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 链球菌菌株G148的蛋白G的N66D / T70S / V71A变体去免疫化结合白蛋白的结构域 3 (ABD3)
<400> 34
Leu Ala Glu Ala Lys Val Leu Ala Asn Arg Glu Leu Asp Lys Tyr Gly
1 5 10 15
Val Ser Asp Tyr Tyr Lys Asn Leu Ile Asp Asn Ala Lys Ser Ala Glu
20 25 30
Gly Val Lys Ala Leu Ile Asp Glu Ile Leu Ala Ala Leu Pro
35 40 45
<210> 35
<211> 46
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 链球菌菌株G148的蛋白G的L64A / I65A / D79A变体去免疫化结合白蛋白的结构域 3 (ABD3)
<400> 35
Leu Ala Glu Ala Lys Val Leu Ala Asn Arg Glu Leu Asp Lys Tyr Gly
1 5 10 15
Val Ser Asp Tyr Tyr Lys Asn Ala Ala Asn Asn Ala Lys Thr Val Glu
20 25 30
Gly Val Lys Ala Leu Ile Ala Glu Ile Leu Ala Ala Leu Pro
35 40 45
<210> 36
<211> 46
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 链球菌菌株G148的蛋白G的N66S / T70S / D79A变体去免疫化结合白蛋白的结构域 3 (ABD3)
<400> 36
Leu Ala Glu Ala Lys Val Leu Ala Asn Arg Glu Leu Asp Lys Tyr Gly
1 5 10 15
Val Ser Asp Tyr Tyr Lys Asn Leu Ile Ser Asn Ala Lys Ser Val Glu
20 25 30
Gly Val Lys Ala Leu Ile Ala Glu Ile Leu Ala Ala Leu Pro
35 40 45
<210> 37
<211> 8
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 间插间隔肽(连接体)
<400> 37
Ala Pro Ser Ser Ser Pro Met Glu
1 5
<210> 38
<211> 16
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 间插间隔肽(连接体)
<400> 38
Val Glu Pro Lys Ser Ala Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro
1 5 10 15
<210> 39
<211> 16
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 间插间隔肽(连接体)
<400> 39
Leu Glu Pro Lys Ser Ala Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro
1 5 10 15
<210> 40
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 间插间隔肽(连接体)
<400> 40
Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro
1 5 10
<210> 41
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> scFv间隔肽连接体
<400> 41
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser
1 5 10 15
<210> 42
<211> 12
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> "长的"间插间隔肽连接体
<400> 42
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly
1 5 10
<210> 43
<211> 13
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 可替选的间插间隔肽(连接体)
<400> 43
Gly Gly Gly Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro
1 5 10
<210> 44
<211> 16
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 可替选的间插间隔肽(连接体)
<400> 44
Leu Glu Pro Lys Ser Ser Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro
1 5 10 15
<210> 45
<211> 217
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 具有L234A/L235A替换的示例性人IgG1 CH2-CH3结构域
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (217)..(217)
<223> Xaa是赖氨酸(K)或不存在
<400> 45
Ala Pro Glu Ala Ala Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys
1 5 10 15
Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val
20 25 30
Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr
35 40 45
Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu
50 55 60
Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His
65 70 75 80
Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys
85 90 95
Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln
100 105 110
Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met
115 120 125
Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro
130 135 140
Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn
145 150 155 160
Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu
165 170 175
Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val
180 185 190
Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln
195 200 205
Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Xaa
210 215
<210> 46
<211> 217
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 具有M252Y/S254T/T256E替换的示例性人IgG1 CH2-CH3结构域
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (217)..(217)
<223> Xaa是赖氨酸(K)或不存在
<400> 46
Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys
1 5 10 15
Pro Lys Asp Thr Leu Tyr Ile Thr Arg Glu Pro Glu Val Thr Cys Val
20 25 30
Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr
35 40 45
Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu
50 55 60
Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His
65 70 75 80
Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys
85 90 95
Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln
100 105 110
Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met
115 120 125
Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro
130 135 140
Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn
145 150 155 160
Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu
165 170 175
Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val
180 185 190
Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln
195 200 205
Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Xaa
210 215
<210> 47
<211> 217
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 具有L234A/L235A/M252Y/S254T/T256E替换的示例性人IgG1 CH2-CH3结构域
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (217)..(217)
<223> Xaa是赖氨酸(K)或不存在
<400> 47
Ala Pro Glu Ala Ala Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys
1 5 10 15
Pro Lys Asp Thr Leu Tyr Ile Thr Arg Glu Pro Glu Val Thr Cys Val
20 25 30
Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr
35 40 45
Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu
50 55 60
Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His
65 70 75 80
Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys
85 90 95
Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln
100 105 110
Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met
115 120 125
Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro
130 135 140
Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn
145 150 155 160
Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu
165 170 175
Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val
180 185 190
Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln
195 200 205
Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Xaa
210 215
<210> 48
<211> 217
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 具有L234A/L235A替换的示例性"携带杵"的 人IgG1 CH2-CH3结构域
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (217)..(217)
<223> Xaa是赖氨酸(K)或不存在
<400> 48
Ala Pro Glu Ala Ala Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys
1 5 10 15
Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val
20 25 30
Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr
35 40 45
Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu
50 55 60
Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His
65 70 75 80
Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys
85 90 95
Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln
100 105 110
Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met
115 120 125
Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Trp Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro
130 135 140
Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn
145 150 155 160
Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu
165 170 175
Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val
180 185 190
Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln
195 200 205
Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Xaa
210 215
<210> 49
<211> 217
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 具有L234A/L235A/M252Y/S254T/T256E替换的示例性"携带杵"的 人IgG1 CH2-CH3结构域
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (217)..(217)
<223> Xaa是赖氨酸(K)或不存在
<400> 49
Ala Pro Glu Ala Ala Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys
1 5 10 15
Pro Lys Asp Thr Leu Tyr Ile Thr Arg Glu Pro Glu Val Thr Cys Val
20 25 30
Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr
35 40 45
Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu
50 55 60
Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His
65 70 75 80
Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys
85 90 95
Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln
100 105 110
Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met
115 120 125
Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Trp Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro
130 135 140
Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn
145 150 155 160
Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu
165 170 175
Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val
180 185 190
Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln
195 200 205
Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Xaa
210 215
<210> 50
<211> 217
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 具有L234A/L235A替换的示例性"携带臼"的人IgG1 CH2-CH3结构域
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (217)..(217)
<223> XAA是赖氨酸(K)或不存在
<400> 50
Ala Pro Glu Ala Ala Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys
1 5 10 15
Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val
20 25 30
Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr
35 40 45
Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu
50 55 60
Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His
65 70 75 80
Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys
85 90 95
Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln
100 105 110
Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met
115 120 125
Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Ser Cys Ala Val Lys Gly Phe Tyr Pro
130 135 140
Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn
145 150 155 160
Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu
165 170 175
Val Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val
180 185 190
Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn Arg Tyr Thr Gln
195 200 205
Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Xaa
210 215
<210> 51
<211> 217
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 具有L234A/L235A/M252Y/S254T/T256E替换的示例性"携带臼"的人IgG1 CH2-CH3结构域
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (217)..(217)
<223> Xaa是赖氨酸(K)或不存在
<400> 51
Ala Pro Glu Ala Ala Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys
1 5 10 15
Pro Lys Asp Thr Leu Tyr Ile Thr Arg Glu Pro Glu Val Thr Cys Val
20 25 30
Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr
35 40 45
Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu
50 55 60
Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His
65 70 75 80
Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys
85 90 95
Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln
100 105 110
Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met
115 120 125
Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Ser Cys Ala Val Lys Gly Phe Tyr Pro
130 135 140
Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn
145 150 155 160
Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu
165 170 175
Val Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val
180 185 190
Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn Arg Tyr Thr Gln
195 200 205
Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Xaa
210 215
<210> 52
<211> 217
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 具有M252Y/S254T/T256E替换的示例性人IgG4 CH2-CH3结构域
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (217)..(217)
<223> Xaa是赖氨酸(K)或不存在
<400> 52
Ala Pro Glu Phe Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys
1 5 10 15
Pro Lys Asp Thr Leu Tyr Ile Thr Arg Glu Pro Glu Val Thr Cys Val
20 25 30
Val Val Asp Val Ser Gln Glu Asp Pro Glu Val Gln Phe Asn Trp Tyr
35 40 45
Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu
50 55 60
Gln Phe Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His
65 70 75 80
Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys
85 90 95
Gly Leu Pro Ser Ser Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln
100 105 110
Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Gln Glu Glu Met
115 120 125
Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro
130 135 140
Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn
145 150 155 160
Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu
165 170 175
Tyr Ser Arg Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Glu Gly Asn Val
180 185 190
Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln
195 200 205
Lys Ser Leu Ser Leu Ser Leu Gly Xaa
210 215
<210> 53
<211> 217
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 具有M252Y/S254T/T256E替换的示例性"携带杵"的人IgG4 CH2-CH3结构域
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (217)..(217)
<223> Xaa是赖氨酸(K)或不存在
<400> 53
Ala Pro Glu Phe Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys
1 5 10 15
Pro Lys Asp Thr Leu Tyr Ile Thr Arg Glu Pro Glu Val Thr Cys Val
20 25 30
Val Val Asp Val Ser Gln Glu Asp Pro Glu Val Gln Phe Asn Trp Tyr
35 40 45
Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu
50 55 60
Gln Phe Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His
65 70 75 80
Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys
85 90 95
Gly Leu Pro Ser Ser Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln
100 105 110
Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Gln Glu Glu Met
115 120 125
Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Trp Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro
130 135 140
Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn
145 150 155 160
Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu
165 170 175
Tyr Ser Arg Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Glu Gly Asn Val
180 185 190
Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln
195 200 205
Lys Ser Leu Ser Leu Ser Leu Gly Xaa
210 215
<210> 54
<211> 217
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 具有M252Y/S254T/T256E替换的示例性"携带臼"的人IgG4 CH2-CH3结构域
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (217)..(217)
<223> Xaa是赖氨酸(K)或不存在
<400> 54
Ala Pro Glu Phe Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys
1 5 10 15
Pro Lys Asp Thr Leu Tyr Ile Thr Arg Glu Pro Glu Val Thr Cys Val
20 25 30
Val Val Asp Val Ser Gln Glu Asp Pro Glu Val Gln Phe Asn Trp Tyr
35 40 45
Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu
50 55 60
Gln Phe Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His
65 70 75 80
Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys
85 90 95
Gly Leu Pro Ser Ser Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln
100 105 110
Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Gln Glu Glu Met
115 120 125
Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Ser Cys Ala Val Lys Gly Phe Tyr Pro
130 135 140
Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn
145 150 155 160
Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu
165 170 175
Val Ser Arg Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Glu Gly Asn Val
180 185 190
Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn Arg Tyr Thr Gln
195 200 205
Lys Ser Leu Ser Leu Ser Leu Gly Xaa
210 215
<210> 55
<211> 113
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (1)..(113)
<223> 抗-HIV Env 人IgG1 抗体7B2的VL结构域
<400> 55
Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Asp Ser Leu Ala Val Ser Pro Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Ile His Cys Lys Ser Ser Gln Thr Leu Leu Tyr Ser
20 25 30
Ser Asn Asn Arg His Ser Ile Ala Trp Tyr Gln Gln Arg Pro Gly Gln
35 40 45
Pro Pro Lys Leu Leu Leu Tyr Trp Ala Ser Met Arg Leu Ser Gly Val
50 55 60
Pro Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr
65 70 75 80
Ile Asn Asn Leu Gln Ala Glu Asp Val Ala Ile Tyr Tyr Cys His Gln
85 90 95
Tyr Ser Ser His Pro Pro Thr Phe Gly His Gly Thr Arg Val Glu Ile
100 105 110
Lys
<210> 56
<211> 126
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (1)..(126)
<223> 抗-HIV Env 人IgG1 抗体7B2的VH结构域
<400> 56
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Gly Gly Val Phe Lys Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Glu Ala Ser Gly Phe Thr Phe Thr Glu Tyr
20 25 30
Tyr Met Thr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Leu
35 40 45
Ala Tyr Ile Ser Lys Asn Gly Glu Tyr Ser Lys Tyr Ser Pro Ser Ser
50 55 60
Asn Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Ser Val Phe
65 70 75 80
Leu Gln Leu Asp Arg Leu Ser Ala Asp Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Ala Asp Gly Leu Thr Tyr Phe Ser Glu Leu Leu Gln Tyr Ile
100 105 110
Phe Asp Leu Trp Gly Gln Gly Ala Arg Val Thr Val Ser Ser
115 120 125
<210> 57
<211> 113
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 优化的抗-HIV Env 人IgG1 抗体7B2GL的VL结构域
<400> 57
Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Asp Ser Leu Ala Val Ser Leu Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Ile Asn Cys Lys Ser Ser Gln Thr Leu Leu Tyr Ser
20 25 30
Ser Asn Asn Arg His Ser Ile Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln
35 40 45
Pro Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Trp Ala Ser Met Arg Leu Ser Gly Val
50 55 60
Pro Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr
65 70 75 80
Ile Ser Ser Leu Gln Ala Glu Asp Val Ala Val Tyr Tyr Cys His Gln
85 90 95
Tyr Ser Ser His Pro Pro Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile
100 105 110
Lys
<210> 58
<211> 126
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 优化的抗-HIV Env 人IgG1 抗体7B2GL的VH结构域
<400> 58
Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Lys Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Glu Tyr
20 25 30
Tyr Met Thr Trp Ile Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Tyr Ile Ser Lys Asn Gly Glu Tyr Ser Lys Tyr Ser Pro Ser Ser
50 55 60
Asn Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Ser Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Ala Asp Gly Leu Thr Tyr Phe Ser Glu Leu Leu Gln Tyr Ile
100 105 110
Phe Asp Leu Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120 125
<210> 59
<211> 118
<212> PRT
<213> 小家鼠
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (1)..(118)
<223> 抗-人CD2 mAb Lo-CD2a的VH结构域
<400> 59
Glu Val Gln Leu Gln Gln Ser Gly Pro Glu Leu Gln Arg Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Leu Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Ile Phe Thr Glu Tyr
20 25 30
Tyr Met Tyr Trp Val Lys Gln Arg Pro Lys Gln Gly Leu Glu Leu Val
35 40 45
Gly Arg Ile Asp Pro Glu Asp Gly Ser Ile Asp Tyr Val Glu Lys Phe
50 55 60
Lys Lys Lys Ala Thr Leu Thr Ala Asp Thr Ser Ser Asn Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Gln Leu Ser Ser Leu Thr Ser Glu Asp Thr Ala Thr Tyr Phe Cys
85 90 95
Ala Arg Gly Lys Phe Asn Tyr Arg Phe Ala Tyr Trp Gly Gln Gly Thr
100 105 110
Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 60
<211> 112
<212> PRT
<213> 小家鼠
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (1)..(112)
<223> 抗-人CD2 mAb Lo-CD2a的VL结构域
<400> 60
Asp Val Val Leu Thr Gln Thr Pro Pro Thr Leu Leu Ala Thr Ile Gly
1 5 10 15
Gln Ser Val Ser Ile Ser Cys Arg Ser Ser Gln Ser Leu Leu His Ser
20 25 30
Ser Gly Asn Thr Tyr Leu Asn Trp Leu Leu Gln Arg Thr Gly Gln Ser
35 40 45
Pro Gln Pro Leu Ile Tyr Leu Val Ser Lys Leu Glu Ser Gly Val Pro
50 55 60
Asn Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Lys Ile
65 70 75 80
Ser Gly Val Glu Ala Glu Asp Leu Gly Val Tyr Tyr Cys Met Gln Phe
85 90 95
Thr His Tyr Pro Tyr Thr Phe Gly Ala Gly Thr Lys Leu Glu Leu Lys
100 105 110
<210> 61
<211> 125
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 人源化抗-人CD3 mAb 1的VH结构域
<400> 61
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Thr Tyr
20 25 30
Ala Met Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Gly Arg Ile Arg Ser Lys Tyr Asn Asn Tyr Ala Thr Tyr Tyr Ala Asp
50 55 60
Ser Val Lys Asp Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asp Ser Lys Asn Ser
65 70 75 80
Leu Tyr Leu Gln Met Asn Ser Leu Lys Thr Glu Asp Thr Ala Val Tyr
85 90 95
Tyr Cys Val Arg His Gly Asn Phe Gly Asn Ser Tyr Val Ser Trp Phe
100 105 110
Ala Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120 125
<210> 62
<211> 110
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 人源化抗-人CD3 mAb 1的VL结构域
<400> 62
Gln Ala Val Val Thr Gln Glu Pro Ser Leu Thr Val Ser Pro Gly Gly
1 5 10 15
Thr Val Thr Leu Thr Cys Arg Ser Ser Thr Gly Ala Val Thr Thr Ser
20 25 30
Asn Tyr Ala Asn Trp Val Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Gly
35 40 45
Leu Ile Gly Gly Thr Asn Lys Arg Ala Pro Trp Thr Pro Ala Arg Phe
50 55 60
Ser Gly Ser Leu Leu Gly Gly Lys Ala Ala Leu Thr Ile Thr Gly Ala
65 70 75 80
Gln Ala Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ala Leu Trp Tyr Ser Asn
85 90 95
Leu Trp Val Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu Gly
100 105 110
<210> 63
<211> 125
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 人源化抗-人CD3 mAb 1 (D65G)的VH结构域
<400> 63
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Thr Tyr
20 25 30
Ala Met Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Gly Arg Ile Arg Ser Lys Tyr Asn Asn Tyr Ala Thr Tyr Tyr Ala Asp
50 55 60
Ser Val Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asp Ser Lys Asn Ser
65 70 75 80
Leu Tyr Leu Gln Met Asn Ser Leu Lys Thr Glu Asp Thr Ala Val Tyr
85 90 95
Tyr Cys Val Arg His Gly Asn Phe Gly Asn Ser Tyr Val Ser Trp Phe
100 105 110
Ala Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120 125
<210> 64
<211> 125
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 人源化抗-人CD3 mAb 1 Low的VH结构域
<400> 64
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Thr Tyr
20 25 30
Ala Met Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Gly Arg Ile Arg Ser Lys Tyr Asn Asn Tyr Ala Thr Tyr Tyr Ala Asp
50 55 60
Ser Val Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asp Ser Lys Asn Ser
65 70 75 80
Leu Tyr Leu Gln Met Asn Ser Leu Lys Thr Glu Asp Thr Ala Val Tyr
85 90 95
Tyr Cys Val Arg His Gly Asn Phe Gly Asn Ser Tyr Val Thr Trp Phe
100 105 110
Ala Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120 125
<210> 65
<211> 125
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 人源化抗-人CD3 mAb 1快的VH结构域
<400> 65
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Thr Tyr
20 25 30
Ala Met Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Gly Arg Ile Arg Ser Lys Tyr Asn Asn Tyr Ala Thr Tyr Tyr Ala Asp
50 55 60
Ser Val Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asp Ser Lys Asn Ser
65 70 75 80
Leu Tyr Leu Gln Met Asn Ser Leu Lys Thr Glu Asp Thr Ala Val Tyr
85 90 95
Tyr Cys Val Arg His Lys Asn Phe Gly Asn Ser Tyr Val Thr Trp Phe
100 105 110
Ala Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120 125
<210> 66
<211> 119
<212> PRT
<213> 小家鼠
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (1)..(119)
<223> 抗-人CD3 抗体OKT3的VH结构域
<400> 66
Gln Val Gln Leu Gln Gln Ser Gly Ala Glu Leu Ala Arg Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Met Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Arg Tyr
20 25 30
Thr Met His Trp Val Lys Gln Arg Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Tyr Ile Asn Pro Ser Arg Gly Tyr Thr Asn Tyr Asn Gln Lys Phe
50 55 60
Lys Asp Lys Ala Thr Leu Thr Thr Asp Lys Ser Ser Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Gln Leu Ser Ser Leu Thr Ser Glu Asp Ser Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Tyr Tyr Asp Asp His Tyr Cys Leu Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Thr Leu Thr Val Ser Ser
115
<210> 67
<211> 107
<212> PRT
<213> 小家鼠
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (1)..(107)
<223> 抗-人CD3 抗体OKT3的VL结构域
<400> 67
Gln Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Ala Ile Met Ser Ala Ser Pro Gly
1 5 10 15
Glu Lys Val Thr Met Thr Cys Ser Ala Ser Ser Ser Val Ser Tyr Met
20 25 30
Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Ser Gly Thr Ser Pro Lys Arg Trp Ile Tyr
35 40 45
Asp Thr Ser Lys Leu Ala Ser Gly Val Pro Ala His Phe Arg Gly Ser
50 55 60
Gly Ser Gly Thr Ser Tyr Ser Leu Thr Ile Ser Gly Met Glu Ala Glu
65 70 75 80
Asp Ala Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Trp Ser Ser Asn Pro Phe Thr
85 90 95
Phe Gly Ser Gly Thr Lys Leu Glu Ile Asn Arg
100 105
<210> 68
<211> 120
<212> PRT
<213> 小家鼠
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (1)..(120)
<223> 抗-人CD8 抗体OKT8的VH结构域
<400> 68
Gln Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Pro Glu Leu Leu Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Met Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Asp Tyr
20 25 30
Asn Met His Trp Val Lys Gln Ser His Gly Lys Ser Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Tyr Ile Tyr Pro Tyr Thr Gly Gly Thr Gly Tyr Asn Gln Lys Phe
50 55 60
Lys Asn Lys Ala Thr Leu Thr Val Asp Ser Ser Ser Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Arg Ser Leu Thr Ser Glu Asp Ser Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Asn Phe Arg Tyr Thr Tyr Trp Tyr Phe Asp Val Trp Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 69
<211> 112
<212> PRT
<213> 小家鼠
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (1)..(112)
<223> 抗-人CD8 抗体OKT8的VL结构域
<400> 69
Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Ser Leu Ala Val Ser Leu Gly
1 5 10 15
Gln Arg Ala Thr Ile Ser Cys Arg Ala Ser Glu Ser Val Asp Ser Tyr
20 25 30
Asp Asn Ser Leu Met His Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Pro Pro
35 40 45
Lys Val Leu Ile Tyr Leu Ala Ser Asn Leu Glu Ser Gly Val Pro Ala
50 55 60
Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Arg Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Asp
65 70 75 80
Pro Val Glu Ala Asp Asp Ala Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Asn Asn
85 90 95
Glu Asp Pro Tyr Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Arg
100 105 110
<210> 70
<211> 121
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 人源化抗-人CD8 抗体TRX2的VH结构域
<400> 70
Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asp Phe
20 25 30
Gly Met Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Leu Ile Tyr Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Phe Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Pro His Tyr Asp Gly Tyr Tyr His Phe Phe Asp Ser Trp Gly
100 105 110
Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 71
<211> 106
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 人源化抗-人CD8 抗体TRX2的VL结构域
<400> 71
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Gly Ser Gln Asp Ile Asn Asn Tyr
20 25 30
Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Asn Thr Asp Ile Leu His Thr Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Phe Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Tyr Cys Tyr Gln Tyr Asn Asn Gly Tyr Thr
85 90 95
Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105
<210> 72
<211> 118
<212> PRT
<213> 小家鼠
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (1)..(118)
<223> 抗-人CD16 抗体3G8的VH结构域
<400> 72
Gln Val Thr Leu Lys Glu Ser Gly Pro Gly Ile Leu Gln Pro Ser Gln
1 5 10 15
Thr Leu Ser Leu Thr Cys Ser Phe Ser Gly Phe Ser Leu Arg Thr Ser
20 25 30
Gly Met Gly Val Gly Trp Ile Arg Gln Pro Ser Gly Lys Gly Leu Glu
35 40 45
Trp Leu Ala His Ile Trp Trp Asp Asp Asp Lys Arg Tyr Asn Pro Ala
50 55 60
Leu Lys Ser Arg Leu Thr Ile Ser Lys Asp Thr Ser Ser Asn Gln Val
65 70 75 80
Phe Leu Lys Ile Ala Ser Val Asp Thr Ala Asp Thr Ala Thr Tyr Tyr
85 90 95
Cys Ala Gln Ile Asn Pro Ala Trp Phe Ala Tyr Trp Gly Gln Gly Thr
100 105 110
Leu Val Thr Val Ser Ala
115
<210> 73
<211> 111
<212> PRT
<213> 小家鼠
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (1)..(111)
<223> 抗-人CD16 抗体3G8的VL结构域
<400> 73
Asp Thr Val Leu Thr Gln Ser Pro Ala Ser Leu Ala Val Ser Leu Gly
1 5 10 15
Gln Arg Ala Thr Ile Ser Cys Lys Ala Ser Gln Ser Val Asp Phe Asp
20 25 30
Gly Asp Ser Phe Met Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Pro Pro
35 40 45
Lys Leu Leu Ile Tyr Thr Thr Ser Asn Leu Glu Ser Gly Ile Pro Ala
50 55 60
Arg Phe Ser Ala Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Asn Ile His
65 70 75 80
Pro Val Glu Glu Glu Asp Thr Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Asn
85 90 95
Glu Asp Pro Tyr Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100 105 110
<210> 74
<211> 118
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 人源化抗-人CD16 抗体h3G8的VH结构域
<400> 74
Gln Val Thr Leu Arg Glu Ser Gly Pro Ala Leu Val Lys Pro Thr Gln
1 5 10 15
Thr Leu Thr Leu Thr Cys Thr Phe Ser Gly Phe Ser Leu Ser Thr Ser
20 25 30
Gly Met Gly Val Gly Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Ala Leu Glu
35 40 45
Trp Leu Ala His Ile Trp Trp Asp Asp Asp Lys Arg Tyr Asn Pro Ala
50 55 60
Leu Lys Ser Arg Leu Thr Ile Ser Lys Asp Thr Ser Lys Asn Gln Val
65 70 75 80
Val Leu Thr Met Thr Asn Met Asp Pro Val Asp Thr Ala Thr Tyr Tyr
85 90 95
Cys Ala Gln Ile Asn Pro Ala Trp Phe Ala Tyr Trp Gly Gln Gly Thr
100 105 110
Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 75
<211> 111
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 人源化抗-人CD16 抗体h3G8的VL结构域
<400> 75
Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Asp Ser Leu Ala Val Ser Leu Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Ile Asn Cys Lys Ala Ser Gln Ser Val Asp Phe Asp
20 25 30
Gly Asp Ser Phe Met Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Pro Pro
35 40 45
Lys Leu Leu Ile Tyr Thr Thr Ser Asn Leu Glu Ser Gly Val Pro Asp
50 55 60
Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser
65 70 75 80
Ser Leu Gln Ala Glu Asp Val Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Asn
85 90 95
Glu Asp Pro Tyr Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100 105 110
<210> 76
<211> 117
<212> PRT
<213> 小家鼠
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (1)..(117)
<223> 抗-人CD16 抗体A9的VH结构域
<400> 76
Gln Val Gln Leu Gln Gln Ser Gly Ala Glu Leu Val Arg Pro Gly Thr
1 5 10 15
Ser Val Lys Ile Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Asn Tyr
20 25 30
Trp Leu Gly Trp Val Lys Gln Arg Pro Gly His Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Asp Ile Tyr Pro Gly Gly Gly Tyr Thr Asn Tyr Asn Glu Lys Phe
50 55 60
Lys Gly Lys Ala Thr Val Thr Ala Asp Thr Ser Ser Arg Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Val Gln Val Arg Ser Leu Thr Ser Glu Asp Ser Ala Val Tyr Phe Cys
85 90 95
Ala Arg Ser Ala Ser Trp Tyr Phe Asp Val Trp Gly Ala Arg Thr Thr
100 105 110
Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 77
<211> 111
<212> PRT
<213> 小家鼠
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (1)..(111)
<223> 抗-人CD16 抗体A9的VL结构域
<400> 77
Asp Ile Gln Ala Val Val Thr Gln Glu Ser Ala Leu Thr Thr Ser Pro
1 5 10 15
Gly Glu Thr Val Thr Leu Thr Cys Arg Ser Asn Thr Gly Thr Val Thr
20 25 30
Thr Ser Asn Tyr Ala Asn Trp Val Gln Glu Lys Pro Asp His Leu Phe
35 40 45
Thr Gly Leu Ile Gly His Thr Asn Asn Arg Ala Pro Gly Val Pro Ala
50 55 60
Arg Phe Ser Gly Ser Leu Ile Gly Asp Lys Ala Ala Leu Thr Ile Thr
65 70 75 80
Gly Ala Gln Thr Glu Asp Glu Ala Ile Tyr Phe Cys Ala Leu Trp Tyr
85 90 95
Asn Asn His Trp Val Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu
100 105 110
<210> 78
<211> 120
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 美国专利9,035,026的抗-人CD16A 抗体的VH结构域
<400> 78
Glu Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Glu
1 5 10 15
Ser Leu Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr
20 25 30
Tyr Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Ile Ile Asn Pro Ser Gly Gly Ser Thr Ser Tyr Ala Gln Lys Phe
50 55 60
Gln Gly Arg Val Thr Met Thr Arg Asp Thr Ser Thr Ser Thr Val Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Gly Ser Ala Tyr Tyr Tyr Asp Phe Ala Asp Tyr Trp Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 79
<211> 106
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 美国专利9,035,026的抗-人CD16A 抗体的第一示例性VL结构域
<400> 79
Ser Tyr Glu Leu Met Gln Pro Pro Ser Val Ser Val Ser Ser Gly Gln
1 5 10 15
Thr Ala Ser Ile Pro Cys Ser Gly Asp Lys Leu Glu Glu Lys Tyr Val
20 25 30
Ser Trp Tyr Gln Gln Arg Pro Gly Gln Ser Pro Val Leu Val Ile Tyr
35 40 45
Gln Asp Asn Lys Arg Pro Ser Gly Ile Pro Glu Arg Phe Ser Gly Ser
50 55 60
Asn Ser Gly Asn Thr Ala Thr Leu Thr Ile Ser Gly Thr Gln Ala Met
65 70 75 80
Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Gln Val Trp Asp Asn Tyr Ser Val Leu
85 90 95
Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu
100 105
<210> 80
<211> 106
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 美国专利9,035,026的抗-人CD16A 抗体的第二示例性VL结构域
<400> 80
Ser Tyr Glu Leu Thr Gln Pro Leu Ser Glu Ser Val Ala Gln Gly Gln
1 5 10 15
Thr Ala Arg Ile Thr Cys Gly Gly Asn Asn Ile Glu Ser Arg Asn Val
20 25 30
His Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Val Leu Val Ile Tyr
35 40 45
Arg Asp Asn Asn Arg Pro Ser Gly Ile Pro Glu Arg Phe Ser Gly Ser
50 55 60
Asn Ser Gly Asn Met Ala Thr Leu Thr Ile Ser Arg Ala Gln Ala Gly
65 70 75 80
Asp Ala Ala Asp Tyr Tyr Cys Gln Val Trp Asp Asn Tyr Thr Val Leu
85 90 95
Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu
100 105
<210> 81
<211> 106
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 美国专利9,035,026的抗-人CD16A 抗体的第三示例性VL结构域
<400> 81
Ser Tyr Glu Leu Thr Gln Pro Pro Ser Val Ala Val Ala Pro Gly Lys
1 5 10 15
Thr Ala Arg Ile Thr Cys Gly Gly Asn Asn Ile Gly Ser Lys Asn Val
20 25 30
His Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Val Leu Val Ile Tyr
35 40 45
Arg Asp Ser Asn Arg Pro Ser Gly Ile Pro Glu Arg Phe Ser Gly Ser
50 55 60
Asn Ser Gly Asn Thr Ala Thr Leu Thr Ile Ser Arg Ala Gln Ala Gly
65 70 75 80
Asp Glu Ala Asp Phe Tyr Cys Gln Val Trp Asp Asn Tyr Ile Val Leu
85 90 95
Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu
100 105
<210> 82
<211> 106
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 美国专利9,035,026的抗-人CD16A 抗体的第四示例性VL结构域
<400> 82
Gln Ala Val Leu Thr Gln Pro Pro Ser Val Ser Val Ala Pro Gly Gln
1 5 10 15
Thr Ala Arg Ile Pro Cys Glu Gly Asn Asn Ile Gly Ser Lys Asn Val
20 25 30
His Trp Tyr Arg Gln Lys Pro Gly Gln Val Pro Val Leu Val Met Tyr
35 40 45
Asp Asp Ser Asp Arg Pro Ser Gly Ile Pro Glu Arg Phe Ser Gly Ser
50 55 60
Asn Ser Gly Asn Thr Ala Thr Leu Thr Ile Ser Gly Thr Gln Ala Met
65 70 75 80
Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Gln Val Trp Asp Asn Tyr Ser Val Leu
85 90 95
Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu
100 105
<210> 83
<211> 106
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 美国专利9,035,026的抗-人CD16A 抗体的第五示例性VL结构域
<400> 83
Gln Pro Val Leu Thr Gln Pro Leu Ser Val Ser Val Ala Pro Gly Gln
1 5 10 15
Thr Ala Arg Ile Thr Cys Gly Gly Asn Asn Ile Gly Ser Lys Asn Val
20 25 30
His Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Val Leu Val Ile Tyr
35 40 45
Arg Asp Ser Ser Arg Pro Ser Gly Ile Pro Glu Arg Leu Ser Gly Ser
50 55 60
Asn Ser Gly Asp Thr Ala Thr Leu Thr Ile Ser Arg Ala Gln Ala Gly
65 70 75 80
Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Gln Val Trp Asp Asp Tyr Ile Val Val
85 90 95
Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu
100 105
<210> 84
<211> 106
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 美国专利9,035,026的抗-人CD16A 抗体的第六示例性VL结构域
<400> 84
Ser Tyr Glu Leu Thr Gln Pro Pro Ser Val Ser Val Thr Pro Gly Gln
1 5 10 15
Thr Ala Thr Ile Thr Cys Gly Ala Asn Asp Ile Gly Lys Arg Asn Val
20 25 30
His Trp Tyr Gln Gln Arg Pro Gly Gln Ser Pro Val Leu Val Ile Tyr
35 40 45
Gln Asp Asn Lys Arg Pro Ser Gly Ile Pro Glu Arg Phe Ser Gly Ser
50 55 60
Asn Ser Gly Asn Thr Ala Thr Leu Thr Ile Ser Gly Thr Gln Ala Met
65 70 75 80
Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Gln Val Trp Asp Asn Tyr Ser Val Leu
85 90 95
Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu
100 105
<210> 85
<211> 106
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 美国专利9,035,026的抗-人CD16A 抗体的第七示例性VL结构域
<400> 85
Gln Pro Val Leu Thr Gln Pro Ser Ser Val Ser Val Ala Pro Gly Gln
1 5 10 15
Thr Ala Thr Ile Ser Cys Gly Gly His Asn Ile Gly Ser Lys Asn Val
20 25 30
His Trp Tyr Gln Gln Arg Pro Gly Gln Ser Pro Val Leu Val Ile Tyr
35 40 45
Gln Asp Asn Lys Arg Pro Ser Gly Ile Pro Glu Arg Phe Ser Gly Ser
50 55 60
Asn Ser Gly Asn Thr Ala Thr Leu Thr Ile Ser Gly Thr Gln Ala Met
65 70 75 80
Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Gln Val Trp Asp Asn Tyr Ser Val Leu
85 90 95
Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu
100 105
<210> 86
<211> 120
<212> PRT
<213> 小家鼠
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (1)..(120)
<223> 抗-人TCR 抗体BMA 031的VH结构域
<400> 86
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Lys Phe Thr Ser Tyr
20 25 30
Val Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Tyr Ile Asn Pro Tyr Asn Asp Val Thr Lys Tyr Asn Glu Lys Phe
50 55 60
Lys Gly Arg Val Thr Ile Thr Ala Asp Lys Ser Thr Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val His Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Gly Ser Tyr Tyr Asp Tyr Asp Gly Phe Val Tyr Trp Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 87
<211> 106
<212> PRT
<213> 小家鼠
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (1)..(106)
<223> 抗-人TCR 抗体BMA 031的VL结构域
<400> 87
Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Ser Ala Thr Ser Ser Val Ser Tyr Met
20 25 30
His Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Arg Trp Ile Tyr
35 40 45
Asp Thr Ser Lys Leu Ala Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser
50 55 60
Gly Ser Gly Thr Glu Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu
65 70 75 80
Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Trp Ser Ser Asn Pro Leu Thr
85 90 95
Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100 105
<210> 88
<211> 118
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (1)..(118)
<223> 人抗-人NKG2D受体抗体KYK-1.0的VH结构域
<400> 88
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30
Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Phe Ile Arg Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Lys Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Asp Arg Phe Gly Tyr Tyr Leu Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr
100 105 110
Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 89
<211> 108
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (1)..(108)
<223> 人抗-人NKG2D受体抗体KYK-1.0的VL结构域
<400> 89
Gln Pro Val Leu Thr Gln Pro Ser Ser Val Ser Val Ala Pro Gly Glu
1 5 10 15
Thr Ala Arg Ile Pro Cys Gly Gly Asp Asp Ile Glu Thr Lys Ser Val
20 25 30
His Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Val Leu Val Ile Tyr
35 40 45
Asp Asp Asp Asp Arg Pro Ser Gly Ile Pro Glu Arg Phe Phe Gly Ser
50 55 60
Asn Ser Gly Asn Thr Ala Thr Leu Ser Ile Ser Arg Val Glu Ala Gly
65 70 75 80
Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Gln Val Trp Asp Asp Asn Asn Asp Glu
85 90 95
Trp Val Phe Gly Gly Gly Thr Gln Leu Thr Val Leu
100 105
<210> 90
<211> 121
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (1)..(121)
<223> 人抗-人NKG2D受体抗体KYK-2.0的VH结构域
<400> 90
Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Lys Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30
Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Phe Ile Arg Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Asp Arg Gly Leu Gly Asp Gly Thr Tyr Phe Asp Tyr Trp Gly
100 105 110
Gln Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 91
<211> 110
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (1)..(110)
<223> 人抗-人NKG2D受体抗体KYK-2.0的VL结构域
<400> 91
Gln Ser Ala Leu Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln
1 5 10 15
Ser Ile Thr Ile Ser Cys Ser Gly Ser Ser Ser Asn Ile Gly Asn Asn
20 25 30
Ala Val Asn Trp Tyr Gln Gln Leu Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu
35 40 45
Ile Tyr Tyr Asp Asp Leu Leu Pro Ser Gly Val Ser Asp Arg Phe Ser
50 55 60
Gly Ser Lys Ser Gly Thr Ser Ala Phe Leu Ala Ile Ser Gly Leu Gln
65 70 75 80
Ser Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ala Ala Trp Asp Asp Ser Leu
85 90 95
Asn Gly Pro Val Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu
100 105 110
<210> 92
<211> 117
<212> PRT
<213> 小家鼠
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (1)..(117)
<223> 抗-人NKp46 抗体BAB281的VH结构域
<400> 92
Gln Ile Gln Leu Val Gln Ser Gly Pro Glu Leu Gln Lys Pro Gly Glu
1 5 10 15
Thr Val Lys Ile Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Asn Tyr
20 25 30
Gly Met Asn Trp Val Lys Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Lys Trp Met
35 40 45
Gly Trp Ile Asn Thr Asn Thr Gly Glu Pro Thr Tyr Ala Glu Glu Phe
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Ala Phe Ser Leu Glu Thr Ser Ala Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Ile Asn Asn Leu Lys Asn Glu Asp Thr Ala Thr Tyr Phe Cys
85 90 95
Ala Arg Asp Tyr Leu Tyr Tyr Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Thr
100 105 110
Leu Thr Val Ser Ser
115
<210> 93
<211> 108
<212> PRT
<213> 小家鼠
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (1)..(108)
<223> 抗-人NKp46 抗体BAB281的VL结构域
<400> 93
Asp Asn Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Lys Ser Met Ser Met Ser Val
1 5 10 15
Gly Glu Arg Val Thr Leu Thr Cys Lys Ala Ser Glu Asn Val Val Thr
20 25 30
Tyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Glu Gln Ser Pro Lys Leu Leu
35 40 45
Ile Tyr Gly Ala Ser Asn Arg Tyr Thr Gly Val Pro Asp Arg Phe Thr
50 55 60
Gly Ser Gly Ser Ala Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Val Gln
65 70 75 80
Ala Glu Asp Leu Ala Asp Tyr His Cys Gly Gln Gly Tyr Ser Tyr Pro
85 90 95
Tyr Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100 105
<210> 94
<211> 116
<212> PRT
<213> 小家鼠
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (1)..(116)
<223> 抗-人NKp46 抗体NKp46-3的VH结构域
<400> 94
Glu Val Gln Leu Gln Gln Ser Gly Pro Glu Leu Val Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Ile Ser Cys Lys Thr Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Glu Tyr
20 25 30
Thr Met His Trp Val Lys Gln Ser His Gly Lys Ser Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Gly Ile Ser Pro Asn Ile Gly Gly Thr Ser Tyr Asn Gln Lys Phe
50 55 60
Lys Gly Lys Ala Thr Leu Thr Val Asp Lys Ser Ser Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Arg Ser Leu Thr Ser Glu Asp Ser Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Arg Gly Gly Ser Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Thr Leu
100 105 110
Thr Val Ser Ser
115
<210> 95
<211> 107
<212> PRT
<213> 小家鼠
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (1)..(107)
<223> 抗-人NKp46 抗体NKp46-3的VL结构域
<400> 95
Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Val Thr Pro Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Ser Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Ser Asp Tyr
20 25 30
Leu His Trp Tyr Gln Gln Lys Ser His Glu Ser Pro Arg Leu Leu Ile
35 40 45
Lys Tyr Ala Ser Gln Ser Ile Ser Gly Ile Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Ser Asp Phe Thr Leu Ser Ile Asn Ser Val Glu Pro
65 70 75 80
Glu Asp Val Gly Val Tyr Tyr Cys Gln Asn Gly His Ser Phe Pro Leu
85 90 95
Thr Phe Gly Ala Gly Thr Lys Leu Glu Leu Lys
100 105
<210> 96
<211> 123
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (1)..(123)
<223> 人抗-HIV-1 Env gp120 抗体A32的VH结构域
<400> 96
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Gln
1 5 10 15
Thr Leu Ser Leu Ser Cys Thr Val Ser Gly Gly Ser Ser Ser Ser Gly
20 25 30
Ala His Tyr Trp Ser Trp Ile Arg Gln Tyr Pro Gly Lys Gly Leu Glu
35 40 45
Trp Ile Gly Tyr Ile His Tyr Ser Gly Asn Thr Tyr Tyr Asn Pro Ser
50 55 60
Leu Lys Ser Arg Ile Thr Ile Ser Gln His Thr Ser Glu Asn Gln Phe
65 70 75 80
Ser Leu Lys Leu Asn Ser Val Thr Val Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr
85 90 95
Cys Ala Arg Gly Thr Arg Leu Arg Thr Leu Arg Asn Ala Phe Asp Ile
100 105 110
Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 97
<211> 110
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (1)..(110)
<223> 人抗-HIV-1 Env gp120 抗体A32的VL结构域
<400> 97
Gln Ser Ala Leu Thr Gln Pro Pro Ser Ala Ser Gly Ser Pro Gly Gln
1 5 10 15
Ser Val Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr
20 25 30
Asn Tyr Val Ser Trp Tyr Gln His His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu
35 40 45
Ile Ile Ser Glu Val Asn Asn Arg Pro Ser Gly Val Pro Asp Arg Phe
50 55 60
Ser Gly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Val Ser Gly Leu
65 70 75 80
Gln Ala Glu Asp Glu Ala Glu Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Asp Ile
85 90 95
His Asn Phe Val Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu
100 105 110
<210> 98
<211> 132
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 人源化抗-HIV-1 Env gp120 抗体10-1074的VH结构域
<400> 98
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu
1 5 10 15
Thr Leu Ser Val Thr Cys Ser Val Ser Gly Asp Ser Met Asn Asn Tyr
20 25 30
Tyr Trp Thr Trp Ile Arg Gln Ser Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Tyr Ile Ser Asp Arg Glu Ser Ala Thr Tyr Asn Pro Ser Leu Asn
50 55 60
Ser Arg Val Val Ile Ser Arg Asp Thr Ser Lys Asn Gln Leu Ser Leu
65 70 75 80
Lys Leu Asn Ser Val Thr Pro Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala
85 90 95
Thr Ala Arg Arg Gly Gln Arg Ile Tyr Gly Val Val Ser Phe Gly Glu
100 105 110
Phe Phe Tyr Tyr Tyr Ser Met Asp Val Trp Gly Lys Gly Thr Thr Val
115 120 125
Thr Val Ser Ser
130
<210> 99
<211> 108
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 人源化抗-HIV-1 Env gp120 抗体10-1074的VL结构域
<400> 99
Ser Tyr Val Arg Pro Leu Ser Val Ala Leu Gly Glu Thr Ala Arg Ile
1 5 10 15
Ser Cys Gly Arg Gln Ala Leu Gly Ser Arg Ala Val Gln Trp Tyr Gln
20 25 30
His Arg Pro Gly Gln Ala Pro Ile Leu Leu Ile Tyr Asn Asn Gln Asp
35 40 45
Arg Pro Ser Gly Ile Pro Glu Arg Phe Ser Gly Thr Pro Asp Ile Asn
50 55 60
Phe Gly Thr Arg Ala Thr Leu Thr Ile Ser Gly Val Glu Ala Gly Asp
65 70 75 80
Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys His Met Trp Asp Ser Arg Ser Gly Phe Ser
85 90 95
Trp Ser Phe Gly Gly Ala Thr Arg Leu Thr Val Leu
100 105
<210> 100
<211> 123
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (1)..(123)
<223> 人源化抗-HIV-1 Env gp120 抗体3BNC117的VH结构域
<400> 100
Gln Val Gln Leu Leu Gln Ser Gly Ala Ala Val Thr Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Arg Val Ser Cys Glu Ala Ser Gly Tyr Asn Ile Arg Asp Tyr
20 25 30
Phe Ile His Trp Trp Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Gln Trp Val
35 40 45
Gly Trp Ile Asn Pro Lys Thr Gly Gln Pro Asn Asn Pro Arg Gln Phe
50 55 60
Gln Gly Arg Val Ser Leu Thr Arg His Ala Ser Trp Asp Phe Asp Thr
65 70 75 80
Phe Ser Phe Tyr Met Asp Leu Lys Ala Leu Arg Ser Asp Asp Thr Ala
85 90 95
Val Tyr Phe Cys Ala Arg Gln Arg Ser Asp Tyr Trp Asp Phe Asp Val
100 105 110
Trp Gly Ser Gly Thr Gln Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 101
<211> 99
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (1)..(99)
<223> 人源化抗-HIV-1 Env gp120 抗体3BNC117的VL结构域
<400> 101
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Thr Val Thr Ile Thr Cys Gln Ala Asn Gly Tyr Leu Asn Trp Tyr
20 25 30
Gln Gln Arg Arg Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Asp Gly Ser
35 40 45
Lys Leu Glu Arg Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Arg Arg Trp Gly
50 55 60
Gln Glu Tyr Asn Leu Thr Ile Asn Asn Leu Gln Pro Glu Asp Ile Ala
65 70 75 80
Thr Tyr Phe Cys Gln Val Tyr Glu Phe Val Val Pro Gly Thr Arg Leu
85 90 95
Asp Leu Lys
<210> 102
<211> 132
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (1)..(132)
<223> 人源化抗-HIV-1 Env gp120 抗体PGT121的VH结构域
<400> 102
Gln Met Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu
1 5 10 15
Thr Leu Ser Leu Thr Cys Ser Val Ser Gly Ala Ser Ile Ser Asp Ser
20 25 30
Tyr Trp Ser Trp Ile Arg Arg Ser Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Tyr Val His Lys Ser Gly Asp Thr Asn Tyr Ser Pro Ser Leu Lys
50 55 60
Ser Arg Val Asn Leu Ser Leu Asp Thr Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu
65 70 75 80
Ser Leu Val Ala Ala Thr Ala Ala Asp Ser Gly Lys Tyr Tyr Cys Ala
85 90 95
Arg Thr Leu His Gly Arg Arg Ile Tyr Gly Ile Val Ala Phe Asn Glu
100 105 110
Trp Phe Thr Tyr Phe Tyr Met Asp Val Trp Gly Asn Gly Thr Gln Val
115 120 125
Thr Val Ser Ser
130
<210> 103
<211> 105
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (1)..(105)
<223> 人源化抗-HIV-1 Env gp120 抗体PGT121的VL结构域
<400> 103
Ser Asp Ile Ser Val Ala Pro Gly Glu Thr Ala Arg Ile Ser Cys Gly
1 5 10 15
Glu Lys Ser Leu Gly Ser Arg Ala Val Gln Trp Tyr Gln His Arg Ala
20 25 30
Gly Gln Ala Pro Ser Leu Ile Ile Tyr Asn Asn Gln Asp Arg Pro Ser
35 40 45
Gly Ile Pro Glu Arg Phe Ser Gly Ser Pro Asp Ser Pro Phe Gly Thr
50 55 60
Thr Ala Thr Leu Thr Ile Thr Ser Val Glu Ala Gly Asp Glu Ala Asp
65 70 75 80
Tyr Tyr Cys His Ile Trp Asp Ser Arg Val Pro Thr Lys Trp Val Phe
85 90 95
Gly Gly Gly Thr Thr Leu Thr Val Leu
100 105
<210> 104
<211> 140
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (1)..(140)
<223> 人源化抗-HIV-1 Env gp120 抗体PGT145的VH结构域
<400> 104
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ser
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Asn Ser Phe Ser Asn His
20 25 30
Asp Val His Trp Val Arg Gln Ala Thr Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Trp Met Ser His Glu Gly Asp Lys Thr Gly Leu Ala Gln Lys Phe
50 55 60
Gln Gly Arg Val Thr Ile Thr Arg Asp Ser Gly Ala Ser Thr Val Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Arg Gly Leu Thr Ala Asp Asp Thr Ala Ile Tyr Tyr Cys
85 90 95
Leu Thr Gly Ser Lys His Arg Leu Arg Asp Tyr Phe Leu Tyr Asn Glu
100 105 110
Tyr Gly Pro Asn Tyr Glu Glu Trp Gly Asp Tyr Leu Ala Thr Leu Asp
115 120 125
Val Trp Gly His Gly Thr Ala Val Thr Val Ser Ser
130 135 140
<210> 105
<211> 112
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (1)..(112)
<223> 人源化抗-HIV-1 Env gp120 抗体PGT145的VL结构域
<400> 105
Glu Val Val Ile Thr Gln Ser Pro Leu Phe Leu Pro Val Thr Pro Gly
1 5 10 15
Glu Ala Ala Ser Leu Ser Cys Lys Cys Ser His Ser Leu Gln His Ser
20 25 30
Thr Gly Ala Asn Tyr Leu Ala Trp Tyr Leu Gln Arg Pro Gly Gln Thr
35 40 45
Pro Arg Leu Leu Ile His Leu Ala Thr His Arg Ala Ser Gly Val Pro
50 55 60
Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Lys Ile
65 70 75 80
Ser Arg Val Glu Ser Asp Asp Val Gly Thr Tyr Tyr Cys Met Gln Gly
85 90 95
Leu His Ser Pro Trp Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105 110
<210> 106
<211> 121
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (1)..(121)
<223> 人抗-HIV-1 Env gp120 抗体VRC01的VH结构域
<400> 106
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Gly Gln Met Lys Lys Pro Gly Glu
1 5 10 15
Ser Met Arg Ile Ser Cys Arg Ala Ser Gly Tyr Glu Phe Ile Asp Cys
20 25 30
Thr Leu Asn Trp Ile Arg Leu Ala Pro Gly Lys Arg Pro Glu Trp Met
35 40 45
Gly Trp Leu Lys Pro Arg Gly Gly Ala Val Asn Tyr Ala Arg Pro Leu
50 55 60
Gln Gly Arg Val Thr Met Thr Arg Asp Val Tyr Ser Asp Thr Ala Phe
65 70 75 80
Leu Glu Leu Arg Ser Leu Thr Val Asp Asp Thr Ala Val Tyr Phe Cys
85 90 95
Thr Arg Gly Lys Asn Cys Asp Tyr Asn Trp Asp Phe Glu His Trp Gly
100 105 110
Arg Gly Thr Pro Val Ile Val Ser Ser
115 120
<210> 107
<211> 104
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (1)..(104)
<223> 人抗-HIV-1 Env gp120 抗体VRC01的VL结构域
<400> 107
Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Gly Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
1 5 10 15
Glu Thr Ala Ile Ile Ser Cys Arg Thr Ser Gln Tyr Gly Ser Leu Ala
20 25 30
Trp Tyr Gln Gln Arg Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Val Ile Tyr Ser
35 40 45
Gly Ser Thr Arg Ala Ala Gly Ile Pro Asp Arg Phe Ser Gly Ser Arg
50 55 60
Trp Gly Pro Asp Tyr Asn Leu Thr Ile Ser Asn Leu Glu Ser Gly Asp
65 70 75 80
Phe Gly Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Glu Phe Phe Gly Gln Gly Thr
85 90 95
Lys Val Gln Val Asp Ile Lys Arg
100
<210> 108
<211> 131
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (1)..(131)
<223> 人抗-HIV-1 gp41 抗体10E8的VH结构域
<400> 108
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Lys Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ser Ala Ser Gly Phe Asp Phe Asp Asn Ala
20 25 30
Trp Met Thr Trp Val Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Gly Arg Ile Thr Gly Pro Gly Glu Gly Trp Ser Val Asp Tyr Ala Ala
50 55 60
Pro Val Glu Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Leu Asn Ser Ile Asn Phe
65 70 75 80
Leu Tyr Leu Glu Met Asn Asn Leu Arg Met Glu Asp Ser Gly Leu Tyr
85 90 95
Phe Cys Ala Arg Thr Gly Lys Tyr Tyr Asp Phe Trp Ser Gly Tyr Pro
100 105 110
Pro Gly Glu Glu Tyr Phe Gln Asp Trp Gly Arg Gly Thr Leu Val Thr
115 120 125
Val Ser Ser
130
<210> 109
<211> 109
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (1)..(109)
<223> 人抗-HIV-1 gp41 抗体10E8的VL结构域
<400> 109
Ser Tyr Glu Leu Thr Gln Glu Thr Gly Val Ser Val Ala Leu Gly Arg
1 5 10 15
Thr Val Thr Ile Thr Cys Arg Gly Asp Ser Leu Arg Ser His Tyr Ala
20 25 30
Ser Trp Tyr Gln Lys Lys Pro Gly Gln Ala Pro Ile Leu Leu Phe Tyr
35 40 45
Gly Lys Asn Asn Arg Pro Ser Gly Val Pro Asp Arg Phe Ser Gly Ser
50 55 60
Ala Ser Gly Asn Arg Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Ala Gln Ala Glu
65 70 75 80
Asp Asp Ala Glu Tyr Tyr Cys Ser Ser Arg Asp Lys Ser Gly Ser Arg
85 90 95
Leu Ser Val Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu
100 105
<210> 110
<211> 509
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> DART-1的第一多肽链
<400> 110
Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Asp Ser Leu Ala Val Ser Pro Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Ile His Cys Lys Ser Ser Gln Thr Leu Leu Tyr Ser
20 25 30
Ser Asn Asn Arg His Ser Ile Ala Trp Tyr Gln Gln Arg Pro Gly Gln
35 40 45
Pro Pro Lys Leu Leu Leu Tyr Trp Ala Ser Met Arg Leu Ser Gly Val
50 55 60
Pro Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr
65 70 75 80
Ile Asn Asn Leu Gln Ala Glu Asp Val Ala Ile Tyr Tyr Cys His Gln
85 90 95
Tyr Ser Ser His Pro Pro Thr Phe Gly His Gly Thr Arg Val Glu Ile
100 105 110
Lys Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Glu Val Gln Leu Val Glu Ser
115 120 125
Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala
130 135 140
Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Thr Tyr Ala Met Asn Trp Val Arg Gln
145 150 155 160
Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val Gly Arg Ile Arg Ser Lys Tyr
165 170 175
Asn Asn Tyr Ala Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val Lys Gly Arg Phe Thr
180 185 190
Ile Ser Arg Asp Asp Ser Lys Asn Ser Leu Tyr Leu Gln Met Asn Ser
195 200 205
Leu Lys Thr Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Val Arg His Gly Asn
210 215 220
Phe Gly Asn Ser Tyr Val Ser Trp Phe Ala Tyr Trp Gly Gln Gly Thr
225 230 235 240
Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Glu Val Ala Ala Cys
245 250 255
Glu Lys Glu Val Ala Ala Leu Glu Lys Glu Val Ala Ala Leu Glu Lys
260 265 270
Glu Val Ala Ala Leu Glu Lys Gly Gly Gly Asp Lys Thr His Thr Cys
275 280 285
Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Ala Ala Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu
290 295 300
Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu
305 310 315 320
Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys
325 330 335
Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys
340 345 350
Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu
355 360 365
Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys
370 375 380
Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys
385 390 395 400
Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser
405 410 415
Arg Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Trp Cys Leu Val Lys
420 425 430
Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln
435 440 445
Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly
450 455 460
Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln
465 470 475 480
Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn
485 490 495
His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys
500 505
<210> 111
<211> 277
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> DART-1的第二多肽链
<400> 111
Gln Ala Val Val Thr Gln Glu Pro Ser Leu Thr Val Ser Pro Gly Gly
1 5 10 15
Thr Val Thr Leu Thr Cys Arg Ser Ser Thr Gly Ala Val Thr Thr Ser
20 25 30
Asn Tyr Ala Asn Trp Val Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Gly
35 40 45
Leu Ile Gly Gly Thr Asn Lys Arg Ala Pro Trp Thr Pro Ala Arg Phe
50 55 60
Ser Gly Ser Leu Leu Gly Gly Lys Ala Ala Leu Thr Ile Thr Gly Ala
65 70 75 80
Gln Ala Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ala Leu Trp Tyr Ser Asn
85 90 95
Leu Trp Val Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu Gly Gly Gly
100 105 110
Gly Ser Gly Gly Gly Gly Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Gly Gly
115 120 125
Val Phe Lys Pro Gly Gly Ser Leu Arg Leu Ser Cys Glu Ala Ser Gly
130 135 140
Phe Thr Phe Thr Glu Tyr Tyr Met Thr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly
145 150 155 160
Lys Gly Leu Glu Trp Leu Ala Tyr Ile Ser Lys Asn Gly Glu Tyr Ser
165 170 175
Lys Tyr Ser Pro Ser Ser Asn Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn
180 185 190
Ala Lys Asn Ser Val Phe Leu Gln Leu Asp Arg Leu Ser Ala Asp Asp
195 200 205
Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Arg Ala Asp Gly Leu Thr Tyr Phe Ser
210 215 220
Glu Leu Leu Gln Tyr Ile Phe Asp Leu Trp Gly Gln Gly Ala Arg Val
225 230 235 240
Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Lys Val Ala Ala Cys Lys Glu
245 250 255
Lys Val Ala Ala Leu Lys Glu Lys Val Ala Ala Leu Lys Glu Lys Val
260 265 270
Ala Ala Leu Lys Glu
275
<210> 112
<211> 227
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> DART-1的第三多肽链
<400> 112
Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Ala Ala Gly
1 5 10 15
Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met
20 25 30
Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His
35 40 45
Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val
50 55 60
His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr
65 70 75 80
Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly
85 90 95
Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile
100 105 110
Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val
115 120 125
Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val Ser
130 135 140
Leu Ser Cys Ala Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu
145 150 155 160
Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro
165 170 175
Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Val Ser Lys Leu Thr Val
180 185 190
Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met
195 200 205
His Glu Ala Leu His Asn Arg Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser
210 215 220
Pro Gly Lys
225
<210> 113
<211> 509
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> DART-A的第一多肽链
<400> 113
Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Asp Ser Leu Ala Val Ser Leu Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Ile Asn Cys Lys Ser Ser Gln Thr Leu Leu Tyr Ser
20 25 30
Ser Asn Asn Arg His Ser Ile Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln
35 40 45
Pro Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Trp Ala Ser Met Arg Leu Ser Gly Val
50 55 60
Pro Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr
65 70 75 80
Ile Ser Ser Leu Gln Ala Glu Asp Val Ala Val Tyr Tyr Cys His Gln
85 90 95
Tyr Ser Ser His Pro Pro Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile
100 105 110
Lys Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Glu Val Gln Leu Val Glu Ser
115 120 125
Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala
130 135 140
Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Thr Tyr Ala Met Asn Trp Val Arg Gln
145 150 155 160
Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val Gly Arg Ile Arg Ser Lys Tyr
165 170 175
Asn Asn Tyr Ala Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val Lys Gly Arg Phe Thr
180 185 190
Ile Ser Arg Asp Asp Ser Lys Asn Ser Leu Tyr Leu Gln Met Asn Ser
195 200 205
Leu Lys Thr Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Val Arg His Gly Asn
210 215 220
Phe Gly Asn Ser Tyr Val Ser Trp Phe Ala Tyr Trp Gly Gln Gly Thr
225 230 235 240
Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Glu Val Ala Ala Cys
245 250 255
Glu Lys Glu Val Ala Ala Leu Glu Lys Glu Val Ala Ala Leu Glu Lys
260 265 270
Glu Val Ala Ala Leu Glu Lys Gly Gly Gly Asp Lys Thr His Thr Cys
275 280 285
Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Ala Ala Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu
290 295 300
Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu
305 310 315 320
Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys
325 330 335
Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys
340 345 350
Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu
355 360 365
Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys
370 375 380
Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys
385 390 395 400
Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser
405 410 415
Arg Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Trp Cys Leu Val Lys
420 425 430
Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln
435 440 445
Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly
450 455 460
Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln
465 470 475 480
Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn
485 490 495
His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys
500 505
<210> 114
<211> 277
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> DART-A的第二多肽链
<400> 114
Gln Ala Val Val Thr Gln Glu Pro Ser Leu Thr Val Ser Pro Gly Gly
1 5 10 15
Thr Val Thr Leu Thr Cys Arg Ser Ser Thr Gly Ala Val Thr Thr Ser
20 25 30
Asn Tyr Ala Asn Trp Val Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Gly
35 40 45
Leu Ile Gly Gly Thr Asn Lys Arg Ala Pro Trp Thr Pro Ala Arg Phe
50 55 60
Ser Gly Ser Leu Leu Gly Gly Lys Ala Ala Leu Thr Ile Thr Gly Ala
65 70 75 80
Gln Ala Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ala Leu Trp Tyr Ser Asn
85 90 95
Leu Trp Val Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu Gly Gly Gly
100 105 110
Gly Ser Gly Gly Gly Gly Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly
115 120 125
Leu Val Lys Pro Gly Gly Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly
130 135 140
Phe Thr Phe Ser Glu Tyr Tyr Met Thr Trp Ile Arg Gln Ala Pro Gly
145 150 155 160
Lys Gly Leu Glu Trp Val Ser Tyr Ile Ser Lys Asn Gly Glu Tyr Ser
165 170 175
Lys Tyr Ser Pro Ser Ser Asn Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn
180 185 190
Ala Lys Asn Ser Leu Tyr Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp
195 200 205
Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Arg Ala Asp Gly Leu Thr Tyr Phe Ser
210 215 220
Glu Leu Leu Gln Tyr Ile Phe Asp Leu Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val
225 230 235 240
Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Lys Val Ala Ala Cys Lys Glu
245 250 255
Lys Val Ala Ala Leu Lys Glu Lys Val Ala Ala Leu Lys Glu Lys Val
260 265 270
Ala Ala Leu Lys Glu
275
<210> 115
<211> 502
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> DART-B的第一多肽链
<400> 115
Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Asp Ser Leu Ala Val Ser Leu Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Ile Asn Cys Lys Ser Ser Gln Thr Leu Leu Tyr Ser
20 25 30
Ser Asn Asn Arg His Ser Ile Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln
35 40 45
Pro Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Trp Ala Ser Met Arg Leu Ser Gly Val
50 55 60
Pro Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr
65 70 75 80
Ile Ser Ser Leu Gln Ala Glu Asp Val Ala Val Tyr Tyr Cys His Gln
85 90 95
Tyr Ser Ser His Pro Pro Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile
100 105 110
Lys Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Gln Val Thr Leu Arg Glu Ser
115 120 125
Gly Pro Ala Leu Val Lys Pro Thr Gln Thr Leu Thr Leu Thr Cys Thr
130 135 140
Phe Ser Gly Phe Ser Leu Ser Thr Ser Gly Met Gly Val Gly Trp Ile
145 150 155 160
Arg Gln Pro Pro Gly Lys Ala Leu Glu Trp Leu Ala His Ile Trp Trp
165 170 175
Asp Asp Asp Lys Arg Tyr Asn Pro Ala Leu Lys Ser Arg Leu Thr Ile
180 185 190
Ser Lys Asp Thr Ser Lys Asn Gln Val Val Leu Thr Met Thr Asn Met
195 200 205
Asp Pro Val Asp Thr Ala Thr Tyr Tyr Cys Ala Gln Ile Asn Pro Ala
210 215 220
Trp Phe Ala Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Ala
225 230 235 240
Ser Thr Lys Gly Glu Val Ala Ala Cys Glu Lys Glu Val Ala Ala Leu
245 250 255
Glu Lys Glu Val Ala Ala Leu Glu Lys Glu Val Ala Ala Leu Glu Lys
260 265 270
Gly Gly Gly Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu
275 280 285
Ala Ala Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp
290 295 300
Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp
305 310 315 320
Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly
325 330 335
Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn
340 345 350
Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp
355 360 365
Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro
370 375 380
Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu
385 390 395 400
Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr Lys Asn
405 410 415
Gln Val Ser Leu Trp Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile
420 425 430
Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr
435 440 445
Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys
450 455 460
Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys
465 470 475 480
Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu
485 490 495
Ser Leu Ser Pro Gly Lys
500
<210> 116
<211> 278
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> DART-B的第二多肽链
<400> 116
Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Asp Ser Leu Ala Val Ser Leu Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Ile Asn Cys Lys Ala Ser Gln Ser Val Asp Phe Asp
20 25 30
Gly Asp Ser Phe Met Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Pro Pro
35 40 45
Lys Leu Leu Ile Tyr Thr Thr Ser Asn Leu Glu Ser Gly Val Pro Asp
50 55 60
Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser
65 70 75 80
Ser Leu Gln Ala Glu Asp Val Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Asn
85 90 95
Glu Asp Pro Tyr Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Gly
100 105 110
Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly
115 120 125
Gly Leu Val Lys Pro Gly Gly Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser
130 135 140
Gly Phe Thr Phe Ser Glu Tyr Tyr Met Thr Trp Ile Arg Gln Ala Pro
145 150 155 160
Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val Ser Tyr Ile Ser Lys Asn Gly Glu Tyr
165 170 175
Ser Lys Tyr Ser Pro Ser Ser Asn Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp
180 185 190
Asn Ala Lys Asn Ser Leu Tyr Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu
195 200 205
Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Arg Ala Asp Gly Leu Thr Tyr Phe
210 215 220
Ser Glu Leu Leu Gln Tyr Ile Phe Asp Leu Trp Gly Gln Gly Thr Leu
225 230 235 240
Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Lys Val Ala Ala Cys Lys
245 250 255
Glu Lys Val Ala Ala Leu Lys Glu Lys Val Ala Ala Leu Lys Glu Lys
260 265 270
Val Ala Ala Leu Lys Glu
275
<210> 117
<211> 451
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> TRIDENT-A的第三多肽链
<400> 117
Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asp Phe
20 25 30
Gly Met Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Leu Ile Tyr Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Phe Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Pro His Tyr Asp Gly Tyr Tyr His Phe Phe Asp Ser Trp Gly
100 105 110
Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser
115 120 125
Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala
130 135 140
Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val
145 150 155 160
Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala
165 170 175
Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val
180 185 190
Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn His
195 200 205
Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Arg Val Glu Pro Lys Ser Cys
210 215 220
Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Ala Ala Gly
225 230 235 240
Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met
245 250 255
Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His
260 265 270
Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val
275 280 285
His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr
290 295 300
Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly
305 310 315 320
Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile
325 330 335
Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val
340 345 350
Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val Ser
355 360 365
Leu Ser Cys Ala Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu
370 375 380
Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro
385 390 395 400
Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Val Ser Lys Leu Thr Val
405 410 415
Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met
420 425 430
His Glu Ala Leu His Asn Arg Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser
435 440 445
Pro Gly Lys
450
<210> 118
<211> 213
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> TRIDENT-A的第四多肽链
<400> 118
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Gly Ser Gln Asp Ile Asn Asn Tyr
20 25 30
Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Asn Thr Asp Ile Leu His Thr Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Phe Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Tyr Cys Tyr Gln Tyr Asn Asn Gly Tyr Thr
85 90 95
Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Arg Thr Val Ala Ala Pro
100 105 110
Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu Gln Leu Lys Ser Gly Thr
115 120 125
Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe Tyr Pro Arg Glu Ala Lys
130 135 140
Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln Ser Gly Asn Ser Gln Glu
145 150 155 160
Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser Thr Tyr Ser Leu Ser Ser
165 170 175
Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu Lys His Lys Val Tyr Ala
180 185 190
Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser Pro Val Thr Lys Ser Phe
195 200 205
Asn Arg Gly Glu Cys
210
<210> 119
<211> 453
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> TRIDENT-B的第三多肽链
<400> 119
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Gln
1 5 10 15
Thr Leu Ser Leu Ser Cys Thr Val Ser Gly Gly Ser Ser Ser Ser Gly
20 25 30
Ala His Tyr Trp Ser Trp Ile Arg Gln Tyr Pro Gly Lys Gly Leu Glu
35 40 45
Trp Ile Gly Tyr Ile His Tyr Ser Gly Asn Thr Tyr Tyr Asn Pro Ser
50 55 60
Leu Lys Ser Arg Ile Thr Ile Ser Gln His Thr Ser Glu Asn Gln Phe
65 70 75 80
Ser Leu Lys Leu Asn Ser Val Thr Val Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr
85 90 95
Cys Ala Arg Gly Thr Arg Leu Arg Thr Leu Arg Asn Ala Phe Asp Ile
100 105 110
Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly
115 120 125
Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly
130 135 140
Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val
145 150 155 160
Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe
165 170 175
Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val
180 185 190
Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val
195 200 205
Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Arg Val Glu Pro Lys
210 215 220
Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Ala
225 230 235 240
Ala Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr
245 250 255
Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val
260 265 270
Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val
275 280 285
Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser
290 295 300
Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu
305 310 315 320
Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala
325 330 335
Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro
340 345 350
Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln
355 360 365
Val Ser Leu Ser Cys Ala Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala
370 375 380
Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr
385 390 395 400
Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Val Ser Lys Leu
405 410 415
Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser
420 425 430
Val Met His Glu Ala Leu His Asn Arg Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser
435 440 445
Leu Ser Pro Gly Lys
450
<210> 120
<211> 217
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> TRIDENT-B的第四多肽链
<400> 120
Gln Ser Ala Leu Thr Gln Pro Pro Ser Ala Ser Gly Ser Pro Gly Gln
1 5 10 15
Ser Val Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr
20 25 30
Asn Tyr Val Ser Trp Tyr Gln His His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu
35 40 45
Ile Ile Ser Glu Val Asn Asn Arg Pro Ser Gly Val Pro Asp Arg Phe
50 55 60
Ser Gly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Val Ser Gly Leu
65 70 75 80
Gln Ala Glu Asp Glu Ala Glu Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Asp Ile
85 90 95
His Asn Phe Val Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu Arg Thr
100 105 110
Val Ala Ala Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu Gln Leu
115 120 125
Lys Ser Gly Thr Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe Tyr Pro
130 135 140
Arg Glu Ala Lys Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln Ser Gly
145 150 155 160
Asn Ser Gln Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser Thr Tyr
165 170 175
Ser Leu Ser Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu Lys His
180 185 190
Lys Val Tyr Ala Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser Pro Val
195 200 205
Thr Lys Ser Phe Asn Arg Gly Glu Cys
210 215
<210> 121
<211> 456
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> TRIDENT-D的第三多肽链
<400> 121
Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Lys Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Glu Tyr
20 25 30
Tyr Met Thr Trp Ile Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Tyr Ile Ser Lys Asn Gly Glu Tyr Ser Lys Tyr Ser Pro Ser Ser
50 55 60
Asn Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Ser Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Ala Asp Gly Leu Thr Tyr Phe Ser Glu Leu Leu Gln Tyr Ile
100 105 110
Phe Asp Leu Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser
115 120 125
Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr
130 135 140
Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro
145 150 155 160
Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val
165 170 175
His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser
180 185 190
Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile
195 200 205
Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Arg Val
210 215 220
Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala
225 230 235 240
Pro Glu Ala Ala Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro
245 250 255
Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val
260 265 270
Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val
275 280 285
Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln
290 295 300
Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln
305 310 315 320
Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala
325 330 335
Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro
340 345 350
Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr
355 360 365
Lys Asn Gln Val Ser Leu Ser Cys Ala Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser
370 375 380
Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr
385 390 395 400
Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Val
405 410 415
Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe
420 425 430
Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn Arg Tyr Thr Gln Lys
435 440 445
Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys
450 455
<210> 122
<211> 220
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> TRIDENT-D的第四多肽链
<400> 122
Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Asp Ser Leu Ala Val Ser Leu Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Ile Asn Cys Lys Ser Ser Gln Thr Leu Leu Tyr Ser
20 25 30
Ser Asn Asn Arg His Ser Ile Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln
35 40 45
Pro Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Trp Ala Ser Met Arg Leu Ser Gly Val
50 55 60
Pro Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr
65 70 75 80
Ile Ser Ser Leu Gln Ala Glu Asp Val Ala Val Tyr Tyr Cys His Gln
85 90 95
Tyr Ser Ser His Pro Pro Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile
100 105 110
Lys Arg Thr Val Ala Ala Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp
115 120 125
Glu Gln Leu Lys Ser Gly Thr Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn
130 135 140
Phe Tyr Pro Arg Glu Ala Lys Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu
145 150 155 160
Gln Ser Gly Asn Ser Gln Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp
165 170 175
Ser Thr Tyr Ser Leu Ser Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr
180 185 190
Glu Lys His Lys Val Tyr Ala Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser
195 200 205
Ser Pro Val Thr Lys Ser Phe Asn Arg Gly Glu Cys
210 215 220
<210> 123
<211> 101
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (1)..(101)
<223> 框架 1-3 供体 (IGKV4-1)的VL结构域
<400> 123
Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Asp Ser Leu Ala Val Ser Leu Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Ile Asn Cys Lys Ser Ser Gln Ser Val Leu Tyr Ser
20 25 30
Ser Asn Asn Lys Asn Tyr Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln
35 40 45
Pro Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Trp Ala Ser Thr Arg Glu Ser Gly Val
50 55 60
Pro Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr
65 70 75 80
Ile Ser Ser Leu Gln Ala Glu Asp Val Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln
85 90 95
Tyr Tyr Ser Thr Pro
100
<210> 124
<211> 10
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (1)..(10)
<223> 框架 4 供体 (IGKJ1-01)的VL结构域
<400> 124
Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
1 5 10
<210> 125
<211> 98
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (1)..(98)
<223> 框架 1-3 供体 (IGVH3-11)的VH结构域
<400> 125
Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Lys Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asp Tyr
20 25 30
Tyr Met Ser Trp Ile Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Tyr Ile Ser Ser Ser Ser Ser Tyr Thr Asn Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Ser Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg
<210> 126
<211> 11
<212> PRT
<213> 智人
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (1)..(11)
<223> 框架 4 供体 (IGHJ4-01)的VH结构域
<400> 126
Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
1 5 10
<210> 127
<211> 118
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 人源化抗-人CD16 抗体hCD16-M1的VH结构域
<400> 127
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Lys Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asn Tyr
20 25 30
Gly Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Thr Ile Ser Gly Gly Gly Ser Tyr Thr Phe Tyr Pro Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Ser Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Thr Glu Asp Thr Ala Leu Tyr Tyr Cys
85 90 95
Val Arg Gln Ser Ala Arg Ala Pro Glu Pro Tyr Trp Gly Gln Gly Thr
100 105 110
Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 128
<211> 107
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 人源化抗-人CD16 抗体hCD16-M1的VL结构域
<400> 128
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Phe Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Asn Val Gly Thr His
20 25 30
Val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Ser Leu Leu
35 40 45
Tyr Ser Ala Ser Tyr Arg Tyr Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Ser
65 70 75 80
Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Lys Ser Tyr Pro Leu
85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100 105
<210> 129
<211> 119
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 人源化抗-人CD16 抗体CD16-M2 VH1的VH结构域
<400> 129
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Ser
20 25 30
Ala Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Tyr Ile Asn His Tyr Asn Asp Gly Ile Lys Tyr Asn Glu Arg Phe
50 55 60
Lys Gly Arg Val Thr Ile Thr Ala Asp Lys Ser Thr Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Thr Gly Tyr Arg Tyr Ala Ser Trp Phe Ala Ser Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 130
<211> 119
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 人源化抗-人CD16 抗体CD16-M2 VH2的VL结构域
<400> 130
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Ser
20 25 30
Ala Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Tyr Ile Asn His Tyr Asn Asp Gly Ile Lys Tyr Asn Glu Arg Phe
50 55 60
Lys Gly Arg Val Thr Ile Thr Ala Asp Lys Ser Thr Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Gly Tyr Arg Tyr Ala Ser Trp Phe Ala Ser Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 131
<211> 107
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 人源化抗-人CD16 抗体hCD16-M2 VL1的VL结构域
<400> 131
Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Val Ser Pro Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asn Ile Gly Thr Ser
20 25 30
Ile His Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Asp Gln Ser Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Lys Ser Val Ser Glu Ser Ile Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Asn Ser Leu Glu Ala
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Asn Ser Trp Pro Leu
85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100 105

Claims (26)

1.一种结合gp41的分子,其包括可变轻链(VL)结构域和可变重链(VH)结构域,其中VL结构域包括SEQ ID NO:57的氨基酸序列和/或VH结构域包括SEQ ID NO:58的氨基酸序列。
2.根据权利要求1所述的结合gp41的分子,其中所述结合gp41的分子包括:
(a)包含SEQ ID NO:57的氨基酸序列的所述VL结构域;和
(b)包含SEQ ID NO:58的氨基酸序列的所述VH结构域。
3.根据权利要求1-2中任一项所述的结合gp41的分子,其中所述分子为抗体或包括其结合gp41表位的部分。
4.根据权利要求1-3中任一项所述的结合gp41的分子,其中所述分子为:
(a)双特异性抗体;或
(b)双抗体,所述双抗体为包括两条、三条、四条或五条多肽链的共价结合的复合物;或
(c)三价结合分子,所述三价结合分子为包括三条、四条、五条或大于五条多肽链的共价结合的复合物。
5.根据权利要求4所述的结合gp41的分子,其中所述分子为所述双抗体并且包括结合白蛋白的结构域(ABD)。
6.根据权利要求1-4中任一项所述的结合gp41的分子,其中所述分子包括Fc区。
7.根据权利要求5所述的结合gp41的分子,其中所述Fc区为变体Fc区,其包括:
(a)降低所述变体Fc区对FcγR的亲和性的一个或多个氨基酸修饰;和/或
(b)增强变体Fc区的血清半衰期的一个或多个氨基酸修饰。
8.根据权利要求7所述的结合gp41的分子,其中降低所述变体Fc区对FcγR的所述亲和性的所述修饰包括L234A;L235A;或L234A和L235A的替换,其中所述编号为如Kabat中的EU索引的编码。
9.根据权利要求7或8中任一项所述的结合gp41的分子,其中增强所述变体Fc区的所述血清半衰期的所述修饰包括M252Y;M252Y和S254T;M252Y和T256E;M252Y、S254T和T256E;或K288D和H435K的替换,其中所述编号为如Kabat中的EU索引的编码。
10.根据权利要求1-9中任一项所述的结合gp41的分子,其中所述分子为双特异性的并且包括能够免疫特异性结合gp41的表位的一个结合表位的位点和能够免疫特异性结合存在于效应细胞的表面上的分子的表位的一个结合表位的位点。
11.根据权利要求1-9中任一项所述的结合gp41的分子,其中所述分子为双特异性的并且包括能够免疫特异性结合gp41的表位的两个结合表位的位点和能够免疫特异性结合存在于效应细胞的表面上的分子的表位的两个结合表位的位点。
12.根据权利要求1-9中任一项所述的结合gp41的分子,其中所述分子为三特异性的并且包括:
(a)能够免疫特异性结合gp41的表位的一个结合表位的位点;
(b)能够免疫特异性结合存在于效应细胞的表面上的第一分子的表位的一个结合表位的位点;和
(c)能够免疫特异性结合存在于效应细胞的表面上的第二分子的表位的一个结合表位的位点。
13.根据权利要求1-9中任一项所述的结合gp41的分子,其中所述分子为三特异性的并且包括:
(a)能够免疫特异性结合gp41的第一表位的一个结合表位的位点;
(b)能够免疫特异性结合gp41的第二表位或不同的HIV-1蛋白质的表位的一个结合表位的位点;和
(c)能够免疫特异性结合存在于效应细胞的表面上的分子的表位的一个结合表位的位点;
其中所述gp41的第一表位和第二表位为不同的。
14.根据权利要求10-13中任一项所述的结合gp41的分子,其中所述分子能够同时结合gp41和存在于效应细胞的表面上的所述分子。
15.根据权利要求10-14中任一项所述的结合gp41的分子,其中存在于效应细胞的表面上的所述分子为CD2、CD3、CD8、CD16、TCR、NKp46或NKG2D。
16.根据权利要求10-15中任一项所述的结合gp41的分子,其中所述效应细胞为细胞毒性T细胞或天然杀伤(NK)细胞。
17.根据权利要求15所述的结合gp41的分子,其中存在于效应细胞的所述表面上的所述分子为CD3。
18.根据权利要求12所述的结合gp41的分子,其中所述存在于效应细胞的所述表面上的第一分子为CD3并且所述存在于效应细胞的表面上的第二分子为CD8。
19.根据权利要求10-18中任一项所述的结合gp41的分子,其中所述分子介导表达gp41的细胞和细胞毒性T细胞的协调的结合。
20.根据权利要求1-4和6-9中任一项所述的结合gp41的分子,其中所述分子包括第一多肽链、第二多肽链和第三多肽链,并且其中:
I)(a)所述第一多肽链包括SEQ ID NO:113;
(b)所述第二多肽链包括SEQ ID NO:114;并且
(c)所述第三多肽链包括SEQ ID NO:112;
II)(a)所述第一多肽链包括SEQ ID NO:115;
(b)所述第二多肽链包括SEQ ID NO:116;并且
(c)所述第三多肽链包括SEQ ID NO:112。
21.根据权利要求1-4和6-9中任一项所述的结合gp41的分子,其中所述分子包括第一多肽链、第二多肽链、第三多肽链和第四多肽链,并且其中:
(a)所述第一多肽链包括SEQ ID NO:113;
(b)所述第二多肽链包括SEQ ID NO:114;
(c)所述第三多肽链包括SEQ ID NO:117;并且
(d)所述第四多肽链包括SEQ ID NO:118。
22.根据权利要求1-4和6-9中任一项所述的结合gp41的分子,其中所述分子包括第一多肽链、第二多肽链、第三多肽链和第四多肽链,并且其中:
I)(a)所述第一多肽链包括SEQ ID NO:113;
(b)所述第二多肽链包括SEQ ID NO:114;
(c)所述第三多肽链包括SEQ ID NO:119;并且
(d)所述第四多肽链包括SEQ ID NO:120;
II)(a)所述第一多肽链包括SEQ ID NO:115;
(b)所述第二多肽链包括SEQ ID NO:116;
(c)所述第三多肽链包括SEQ ID NO:119;并且
(d)所述第四多肽链包括SEQ ID NO:120。
23.一种药物组合物,其包括有效量的根据权利要求1-22中任一项所述的结合gp41的分子和药学上可接受的载体。
24.一种在需要其的受试者中治疗或预防HIV-1感染的方法,其包括向所述受试者施用治疗有效量的包括根据权利要求1-22中任一项所述的结合gp41的分子的组合物或根据权利要求23所述的药物组合物。
25.根据权利要求24所述的方法,其中所述方法进一步包括施用潜伏期激活剂。
26.根据权利要求25所述的方法,其中所述潜伏期激活剂为伏立诺他、罗米地辛、帕比司他、双硫仑、JQ1、苔藓抑素、PMA、离子霉素或其任何组合。
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