CN112501318B - 鸡生长性状相关的tmem18基因分子标记及应用 - Google Patents

鸡生长性状相关的tmem18基因分子标记及应用 Download PDF

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Abstract

本发明公开了鸡生长性状相关的TMEM18基因分子标记,该分子标记包括如下分子标记中的至少一种:以SEQ ID NO:1所示的TMEM18基因核苷酸序列5’端第一个碱基为第1位点,第765位点的C>T碱基突变,第775位点的G>A碱基突变,第823位点的G>A碱基突变,第904位点的T>C碱基突变,第930位点的G>T碱基突变,第973位点的C>G碱基突变,第981位点的T>C碱基突变,第1014位点的A>G碱基突变。本发明还提供了该分子标记在种鸡遗传改良中的应用,该应用可促进杏花鸡的快速生长,尤其对加快杏花鸡生长性状选育的遗传进展,缩短杏花鸡的饲养时间,提高经济效益。

Description

鸡生长性状相关的TMEM18基因分子标记及应用
技术领域
本发明涉及分子标记辅助选择及动物遗传育种技术领域,具体涉及鸡生长性状相关的TMEM18基因分子标记及应用。
背景技术
杏花鸡是广东省名鸡,其因产于封开县杏花镇而得名。杏花鸡的特点是“两细(头细、骨细)、三黄(嘴黄、脚黄、毛黄)、三短(颈短、脚短、身短)”,体型丰满,项鸡的体重一般为2.3市斤左右。杏花鸡风味独特,与众不同。它皮薄脆口、肉嫩骨软、脂肪均匀、味道鲜美,尤以白切烹制更佳。由于杏花鸡饲养的时间较长(一般要150-180天),成本较高,味道又与众不同,因而它的价格要比其他本地鸡高出50%左右。杏花鸡质地特优,在全省众多的家禽品种中名列三甲。杏花鸡属肉质特佳的优良地方品种之一。但尚存在产蛋量少、繁殖力低、早期生长缓慢等缺点。
因而促进杏花鸡生长性能的遗传改良,不仅可以满足人们对于杏花鸡的需求,大大缩短养殖周期,节约饲养成本,增加经济效益,还可以在保证杏花鸡肉质等优良性状的前提下,培育出肉质好、生长性状好的杏花鸡或其杂交品系。
发明内容
本申请提供了一种鸡生长性状相关的TMEM18基因分子标记,所述分子标记包括如下分子标记中的至少一种:以SEQ ID NO:1所示的TMEM18基因核苷酸序列5’端第一个碱基为第1位点,第765位点的C>T碱基突变,第775位点的G>A碱基突变,第823位点的G>A碱基突变,第904位点的T>C碱基突变,第930位点的G>T碱基突变,第973位点的C>G碱基突变,第981位点的T>C碱基突变,第1014位点的A>G碱基突变。
在某些实施方式中,鸡生长性状相关的TMEM18基因分子标记为以SEQ ID NO:1所示的TMEM18基因核苷酸序列5’端第一个碱基为第1位点,第765位点的C>T碱基突变,所述的分子标记影响鸡头宽、56日龄体重、63日龄体重、70日龄体重、77日龄体重、77日龄胫长、84日龄体重、84日龄胫直径性状,其中TC为优势基因型。由此,可以通过该位点的SNP来选育鸡品系,可提高该品系的头宽、56日龄体重、63日龄体重、70日龄体重、77日龄体重、77日龄胫长、84日龄体重、84日龄胫直径等生长性状。
在某些实施方式中,鸡生长性状相关的TMEM18基因分子标记为以SEQ ID NO:1所示的TMEM18基因核苷酸序列5’端第一个碱基为第1位点,第775位点的G>A碱基突变,所述的分子标记影响鸡头宽、56日龄体重、63日龄体重、70日龄体重、77日龄体重、77日龄胫长、84日龄体重、84日龄胫直径性状,其中GA为优势基因型。由此,可以通过该位点的SNP来选育鸡品系,可提高该品系的头宽、56日龄体重、63日龄体重、70日龄体重、77日龄体重、77日龄胫长、84日龄体重、84日龄胫直径等生长性状。
在某些实施方式中,鸡生长性状相关的TMEM18基因分子标记为以SEQ ID NO:1所示的TMEM18基因核苷酸序列5’端第一个碱基为第1位点,第823位点的G>A碱基突变,所述的分子标记影响鸡头宽、7日龄体重、84日龄胫直径性状,其中GG为优势基因型。由此,可以通过该位点的SNP来选育鸡品系,可提高该品系的头宽、7日龄体重、84日龄胫直径等生长性状。
在某些实施方式中,鸡生长性状相关的TMEM18基因分子标记为以SEQ ID NO:1所示的TMEM18基因核苷酸序列5’端第一个碱基为第1位点,第904位点的T>C碱基突变,所述的分子标记影响鸡头宽、63日龄体重、70日龄体重、84日龄体重性状,其中TC为优势基因型。由此,可以通过该位点的SNP来选育鸡品系,可提高该品系的头宽、63日龄体重、70日龄体重、84日龄体重等生长性状。
在某些实施方式中,鸡生长性状相关的TMEM18基因分子标记为以SEQ ID NO:1所示的TMEM18基因核苷酸序列5’端第一个碱基为第1位点,第930位点的G>T碱基突变,所述的分子标记影响鸡7日龄体重、14日龄体重、21日龄体重、28日龄体重、0-4周日增重性状,其中GT为优势基因型。由此,可以通过该位点的SNP来选育鸡品系,可提高该品系的7日龄体重、14日龄体重、21日龄体重、28日龄体重、0-4周日增重等生长性状。
在某些实施方式中,鸡生长性状相关的TMEM18基因分子标记为以SEQ ID NO:1所示的TMEM18基因核苷酸序列5’端第一个碱基为第1位点,第973位点的C>G碱基突变,所述的分子标记影响鸡56日龄体重、70日龄体重、77日龄体重、84日龄体重、84日龄胫直径性状,其中CG为优势基因型。由此,可以通过该位点的SNP来选育鸡品系,可提高该品系的56日龄体重、70日龄体重、77日龄体重、84日龄体重、84日龄胫直径等生长性状。
在某些实施方式中,鸡生长性状相关的TMEM18基因分子标记为以SEQ ID NO:1所示的TMEM18基因核苷酸序列5’端第一个碱基为第1位点,第981位点的T>C碱基突变,所述的分子标记影响鸡头宽、21日龄体重、28日龄体重、49日龄体重、84日龄胫直径、0-4周日增重性状,其中TT为优势基因型。由此,可以通过该位点的SNP来选育鸡品系,可提高该品系的头宽、21日龄体重、28日龄体重、49日龄体重、84日龄胫直径、0-4周日增重等生长性状。
在某些实施方式中,鸡生长性状相关的TMEM18基因分子标记为以SEQ ID NO:1所示的TMEM18基因核苷酸序列5’端第一个碱基为第1位点,第1014位点的A>G碱基突变,所述的分子标记影响鸡77日龄体重、84日龄体重性状,其中AG为优势基因型。由此,可以通过该位点的SNP来选育鸡品系,可提高该品系的77日龄体重、84日龄体重等生长性状。
本申请还提供了一种鸡生长性状相关的TMEM18基因分子标记在鸡遗传育种中的应用;优选地,所述鸡为杏花鸡或其后代繁育品系。
本申请还提供了一种提高鸡生长性状的方法,该方法包括如下步骤:
1)检测鸡TMEM18基因上与鸡生长性状相关的分子标记;
2)以SEQ ID NO:1所示的TMEM18基因核苷酸序列5’端第一个碱基为第1位点,分子标记在765位点处的CT基因型;分子标记在775位点处的GA基因型;分子标记在823位点处的GG基因型;分子标记在904位点处的TC基因型;分子标记在930位点处的GT基因型;分子标记在973位点处的CG基因型;分子标记在981位点处的TT基因型;分子标记在1014位点处的AG基因型;选择其中的一个基因型或者多个基因型组合的个体;
3)将选择出的个体作为种鸡,进行繁育,培育出高生长性状的鸡品系。
在某些实施方式中,该鸡品系为杏花鸡或其后代繁育品系。
本申请还提供了一种鸡的遗传改良的方法,该方法包括如下步骤:
1)检测鸡TMEM18基因上与鸡生长性状相关的分子标记;
2)以SEQ ID NO:1所示的TMEM18基因核苷酸序列5’端第一个碱基为第1位点,分子标记在765位点处的CT基因型;分子标记在775位点处的GA基因型;分子标记在823位点处的GG基因型;分子标记在904位点处的TC基因型;分子标记在930位点处的GT基因型;分子标记在973位点处的CG基因型;分子标记在981位点处的TT基因型;分子标记在1014位点处的AG基因型;选择其中的一个基因型或者多个基因型组合的个体;
3)将选择出的个体作为种鸡,进行繁育,培育出高生长性状的鸡品系。
4)将选育出的上述鸡品系作为种鸡,经过繁育,逐代提高该位点的优势等位基因的频率,从而改良后代鸡的生长性状。
在某些实施方式中,该鸡品系为杏花鸡或其后代繁育品系。
本申请的有益效果:
1、本申请研究了影响鸡生长性状的分子标记,验证其对于鸡生长性状,尤其包括头宽、56日龄体重、63日龄体重、70日龄体重、77日龄体重、77日龄胫长、84日龄体重、84日龄胫直径等性状的影响,有利于快速建立对生长性状快速改良的分子标记辅助选择育种技术,极大地改良鸡,尤其可以极大改善杏花鸡×隐性白洛克鸡F2代及其合成系的选育进程,可更好的适应市场需求,提高市场竞争力。
2、本申请通过优选该分子标记的优势等位基因,提供了一种选育方法,可促进杏花鸡的快速生长,尤其对加快杏花鸡生长性状选育的遗传进展,缩短杏花鸡的饲养时间,提高经济效益。
附图说明
图1为不同组织中TMEM18基因的mRNA水平;
图2鸡TMEM18基因11个SNP位点的测序图。
具体实施方式
1、实验样品
16周龄杏花鸡进行屠宰取样,采集大脑、下丘脑、垂体、心、肝、脾、肺、肾、胸肌、腿肌、皮脂、腹脂、卵巢组织,液氮保存,用于RNA提取和mRNA的定量检测。
杏花鸡×隐性白洛克肉鸡F2代资源群由杏花鸡和隐性白洛克鸡杂交而得到(LEI,M M,NIE,Q H and PENG,X,et al.,2005)。隐性白洛克鸡是一种快大型肉鸡,而杏花鸡是中国本土的品种肉鸡。由杏花鸡和隐性白洛克鸡杂交出来的第二代肉鸡采用平养的饲养方式,饲喂符合NRC标准的玉米大豆饲料。然后分别在小鸡7日龄,14日龄,21日龄,28日龄,35日龄,42日龄,49日龄,56日龄和90日龄时测量其体重(BW,单位为g)。总共434只第二代个体(其中有221只雄的和213只雌的)在90日龄时被屠宰取样,然后记录它们的胫长、头宽、胸宽、胸深、体长、胸角宽、屠宰重量、皮质厚度、去内脏重、膛重、胸肌重、腿肌重、羽重、腹脂重、头颈重、心脏重、肝重、胃重和小肠长。其中胫长、头宽、胸宽、胸深、体长用游标卡尺测量;胸角用胸角器测量;皮下脂肪厚在靠近尾的背部测量,脂肪宽测量腿和胸肌之间宽度,这两性状用游标卡尺测量。
2、杏花鸡样品组织总RNA提取
(1)匀浆处理:取出组织,剪约100mg组织放入已事先加入1mL Trizol的离心管中,并将离心管至于冰上,用匀浆机将组织匀浆,匀浆后样品静置5min。
(2)往离心管中加入200μL氯仿,震荡15s,室温静置5min,于4℃下12000rpm离心15min。
(3)移上清液至另一新的RNase-free的1.5mL离心管中,加入0.5mL异丙醇,混匀后静置10min,于4℃下12000rpm离心10min。
(4)弃上清,可看到管底有白色沉淀,加入1mL 75%乙醇洗涤,于4℃下7500rpm离心5min。
(5)弃上清,室温放置干燥3-5min,加入30-50μL DEPC水,-80℃冻存备用。
3、反转录PCR
TakaRa反转录试剂盒说明书进行,反应体系如表1和表2所示,反应程序分为两步:第一步去除基因组DNA,反应程序为42℃2min(或者室温5min);第二步反转录反应,程序为37℃15min,85℃5s,4℃forever。
表1反转录反应体系Ⅰ
Figure BDA0002871788650000051
表2反转录应体系Ⅱ
Figure BDA0002871788650000052
4、PCR扩增
PCR反应程序:94℃预变性5min;94℃变性30s,62℃退火30s,72℃延伸50s,36个循环;72℃后延伸10min;4℃保存。引物信息如表3,PCR反应体系如表4:
表3引物信息
Figure BDA0002871788650000061
表4 PCR扩增反应体系
Figure BDA0002871788650000062
5、鸡TMEM18基因的组织表达差异
本实验采用比较Ct值法检测各基因的表达,校正内参为鸡的β-actin/GAPDH基因,使用KAPA
Figure BDA0002871788650000063
FAST qPCR Master Mix,扩增体系如表5所示,采用两步法PCR,反应程序为:95℃/30s→(95℃/10s→60℃/30s)40个循环→65℃/5s→95℃,搜集荧光信号,做溶解曲线分析PCR产物的特异性。
6、SNP的鉴定和分型
将F2代资源群体(杏花鸡×隐性白洛克肉鸡)进行PCR实验以及PCR-RFLP(限制性片段长度多态性PCR)分型。PCR扩增体系如表4,反应程序为94℃预变性3min,32个循环(94℃变性30s,X℃退火30s,72℃延伸30s),最后72℃延伸5min,16℃保存。
表5荧光定量PCR反应体系
Figure BDA0002871788650000071
7、关联分析
用SAS软件的GLM程序(General Linear Models Procedure)对各位点基因型频率在群体中进行多重比较。模型如下:
Yijkl=μ+Gi+Sj+Fk+Hl+eijkl
其中Y表示性状表型值,μ为群体均值,G为基因型效应,S为性别效应,F为家系效应,H为孵化批次效应,e表示随机残差。
8、TMEM18基因的mRNA在杏花鸡各组织中的特异性表达
用实时荧光定量PCR(Real-time PCR)检测杏花鸡不同组织中TMEM18基因的mRNA水平,得到的结果是TMEM18基因的mRNA在13个组织中(大脑、下丘脑、垂体、心、肝、脾、肺、肾、胸肌、腿肌、皮下脂肪、腹脂、卵巢)都有表达;鸡TMEM18基因的mRNA在垂体中表达量最高,在皮下脂肪、腹脂和胸肌中也有较高表达;TMEM18基因的mRNA在其余组织中表达量比较低,而在心脏中的表达量是最低的(结果如图1所示)。
9、鸡TMEM18基因SNP位点的鉴定与分型
鸡TMEM18基因核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,以TMEM18基因核苷酸序列5′端第一个碱基为第1位点,第765位点的C>T碱基突变记为C765T,第775位点的G>A碱基突变记为G775A,第823位点的G>A碱基突变记为G823A,第904位点的T>C碱基突变记为T904C,第930位点的G>T碱基突变记为G930T,第973位点的C>G碱基突变记为C973G,第981位点的T>C碱基突变记为T981C,第989位点的T>C碱基突变记为T989C,第1003位点的A>G碱基突变记为A1003G,第1014位点的A>G碱基突变记为A1014G,第1037位点的A>G碱基突变记为A1037G。且鸡TMEM18基因11个SNP位点的位置信息如表6所示,鸡TMEM18基因11个SNP位点的测序图(纯合子为单峰,杂合子为双峰)如图2所示。
表6 SNPs Location
Figure BDA0002871788650000081
对11个SNP位点(C765T、G775A、G823A、T904C、G930T、C973G、T981C、T989C、A1003G、A1014G和A1037G)在杏花鸡×隐性白洛克鸡F2代资源群体(群体大小为300个个体)中的基因型频率和等位基因频率进行统计,结果如表7所示。
表7基因型频率和等位基因频率进行统计
Figure BDA0002871788650000082
Figure BDA0002871788650000091
从表7中可以得到:
(1)基因型频率高的基因型是群体中原本存在的,是野生基因型,在群体中分布最多,基因型频率居中的基因型是突变后的杂合子,基因型频率较低的是突变基因型的纯合子,如G823A的GG型为群体原有的基因型,在群体中分布最多(占81.5%),GA型是杂合子,分布居中(占12.8%),AA型突变基因型的纯合子,分布最少(占5.7%),其他的SNP位点同理。另外,G930T、C973G、T981C这3个位点只有两种基因型,一种是野生基因型(分别是GG、CC和TT),另一种是突变后的杂合子(分别是GT、CG和TC),并且野生基因型占很大的优势。A1003G这个位点也只存在两种基因型(AA和GG),AG型的杂合子类型在实验中的300多个个体中没有发现,并且AA型(91.7%)占绝对优势。
(2)基因频率高的是野生型基因,基因频率低的是突变型基因。其中G823A、G930T、T981C和A1003G这4个位点的野生型基因是占绝对优势的,它们的突变型基因的频率均在10%以下;而T904C和A1037G这两个位点的野生型基因(T,56.4%;A,57.9%)只是略高于突变型基因(C,43.6%;G,42.1%)。
10、鸡TMEM18基因的11个SNP位点与各性状的关联分析
将杏花鸡×隐性白洛克鸡F2代资源群体测定生长性状,并按照C765T、G775A、G823A、T904C、G930T、C973G、T981C、T989C、A1003G、A1014G和A1037G的不同基因型分组后,用SAS软件分析,结果显示:
在与生长性状的关联分析中,(1)T989C、A1003G、A1037G与关联分析的生长性状无显著相关,C765T、G775A、G823A、T904C、G930T、C973G、T981C和A1014G与大部分性状显著相关;(2)其中C765T与BW56、BW70、BW77、BW84显著相关(P<0.05);与HW、BW63、SL77、SD84极显著相关(P<0.01)(3)G775A与BW56、BW70、BW77、SL77、BW84显著相关(P<0.05);与HW、BW63、SD84极显著相关(P<0.01);(4)G823A仅与HW、BW7、SD84这三个性状极显著相关(P<0.01);(5)T904C仅与BW70显著相关(P<0.05);与HW、BW63、BW84这三个性状极显著相关(P<0.01);(6)G930T与BW7、BW21显著相关(P<0.05);与BW14、BW28、0-4WKs ADG(g/week)极显著相关(P<0.01);(7)C973G与BW56、BW77、BW84、SD84显著相关(P<0.05);仅与BW70极显著相关(P<0.01);(8)T981C与BW21、BW28、BW49、0-4WKs ADG(g/week)显著相关(P<0.05);与HW、SD84极显著相关(P<0.01);(9)A1014G与BW77、BW84极显著相关(P<0.01)(表8-表10)。
备注:HW表示head width,头宽;BW表示body weight,体重,数字表示日龄;SD表示shank diameter,胫直径,数字表示日龄;SL表示shanklength胫长,数字表示日龄;0-4WKsADG表示0-4wks average daily gain,0-4周日增重;4-8Wks ADG表示4-8wks averagedaily gain,4-8周日增重;详见附录。表8-10中基因型后面的数字表示资源群体中检测的该基因型的个体数。
表8生长性状关联分析结果(C765T,G775A)
Figure BDA0002871788650000111
表9生长性状关联分析结果(G823A、T904C、G930T)
Figure BDA0002871788650000121
表10生长性状关联分析结果(C973G、T981C、A1014G)
Figure BDA0002871788650000122
Figure BDA0002871788650000131
11、提高鸡生长性状的选育方法
该方法包括如下步骤:
1)检测鸡TMEM18基因上与鸡生长性状相关的分子标记;
2)以SEQ ID NO:1所示的TMEM18基因核苷酸序列5’端第一个碱基为第1位点,分子标记在765位点处的CT基因型;分子标记在775位点处的GA基因型;分子标记在823位点处的GG基因型;分子标记在904位点处的TC基因型;分子标记在930位点处的GT基因型;分子标记在973位点处的CG基因型;分子标记在981位点处的TT基因型;分子标记在1014位点处的AG基因型;选择其中的一个基因型或者多个基因型组合的个体;
3)将选择出的个体作为种鸡,进行繁育,培育出高生长性状的鸡品系。
12、优势生长性状种鸡的遗传改良方法
该方法包括如下步骤:
1)检测鸡TMEM18基因上与鸡生长性状相关的分子标记;
2)以SEQ ID NO:1所示的TMEM18基因核苷酸序列5’端第一个碱基为第1位点,分子标记在765位点处的CT基因型;分子标记在775位点处的GA基因型;分子标记在823位点处的GG基因型;分子标记在904位点处的TC基因型;分子标记在930位点处的GT基因型;分子标记在973位点处的CG基因型;分子标记在981位点处的TT基因型;分子标记在1014位点处的AG基因型;选择其中的一个基因型或者多个基因型组合的个体;
3)将选择出的个体作为种鸡,进行繁育,培育出高生长性状的鸡品系。
4)将选育出的上述鸡品系作为种鸡,经过繁育,逐代提高该位点的优势等位基因的频率,从而改良后代鸡的生长性状。
附录
Figure BDA0002871788650000141
Figure BDA0002871788650000151
最后应当说明的是,以上实施例仅用以说明本发明的技术方案而非对本发明保护范围的限制,对于本领域的普通技术人员来说,在上述说明及思路的基础上还可以做出其他不同形式的变化或变动,这里无需也无法对所有的实施方式予以穷举。凡在本发明的精神和原则之类所作的任何修改、等同替换和改进等,均应包含在本发明权利要求的保护范围之类。
序列表
<110> 华南农业大学
<120> 鸡生长性状相关的TMEM18基因分子标记及应用
<130> 20201229
<160> 1
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 4688
<212> DNA
<213> Gallus gallus
<400> 1
ggcttcggcc gtgcggatgc ggagtgttgc cgtcgccatg gagcagccgc tgcacggtcc 60
gcctgggctg tccaccatcc tggcggtgag gaaccgtccg tgggagggaa ggggagaagg 120
taccgacccc tgcgtgtagc gggagccttc ccgtctgttg ggggaggggt gctcgcgttg 180
ggtgctcggt cacgcaggtg agcgcgctcc gtgacagagc tgggttttgg ttgcggtgcg 240
ggaggcggca ggccgctcgt cacggctggg gatgcgtctc ccgtggtcgc cacatctcct 300
ttctcttcct ccacagagga cggactgggc tgagccctgg ctgctggggc tggcgggttt 360
ccacgtcctg tgtttcctcc tgacttgctt ctccttccag cactaccggg tgcaaatagg 420
gcactttctc tgcatgggtg agtaacgcat ctgtgcttcc tcgtgaactc cttcctctct 480
taatgtcatc agggttaatt gcatttacat tatgttaggg atagttttct tgtttagcaa 540
agagttctgt aataagctta gcaactgata aagtgagtgc aaagtgtttc tcttgtggtc 600
atgtgtgtgt ctgtacatta tgtatttaac tgtttcagag cagctctaag ctacagatac 660
ttagtttaca agactgtatg aagcagaggc ttgaaactat tagtattgat aggagggata 720
ggtgtataga tacacatgct tagtactgcg tgttacacag cagcccagga aactgttgat 780
gcactggaga agcagacaag aaattgaaaa acagacagaa gcggttttct actctgcatt 840
atttcaatgt tgcagtgtga tcaatacagt cagctttcag atgggttcat ttctggagca 900
gggttaccat aggccctgct gccagctgtg acagtggtgt ggcagagcaa gactagttcc 960
aaatgttaca gacaccattt tatttaaatt aagatagcat ggatttgagt taaatctgtg 1020
ttttacaagt aaacccatgt atgctttatg agaacccttg gttcttgcca tgggttgggt 1080
tttcctcatt gtattttttg ttgttgtttt tacccaatac ctcagttccg acatatttct 1140
gcagtagtgg aggtaggata aacaattcaa agaggtttgc agtcaatgct tgaaggctat 1200
gttgacattt aaaaatgcca cttaactaat caaattggtg aaagaatcat agcttcatta 1260
aaactgcaga tacataactc agctaaagcc agagtttcag tgacagaaat ttcccccaag 1320
ggaaatttcc ctacaaatca gtaatttctg tacattactt ttaactgcgg agtttacagt 1380
gatccacaga gggccaaatc aaaatgccct atacagggtt ttctttctca gcttcgttac 1440
tagacataca gaattcccac aacattctag gtctacttac ctcaggctat ctaaagtatt 1500
cctagtgtta ctaacactag cttgaatgcc caagttctaa gtgcacttga aatacaatgg 1560
aactgatcat tgctggtttt ttaacccaga tgtggttaat gtgtgatggt tgttaacgag 1620
aagagtggat aaaaataccc acattaagtc ccagtcagtt tatatctgaa aaactgtact 1680
acttttggta tgtctgcaat aaaaataact ttgtattgca ggtagtaata cgtaactaaa 1740
aaaatatgtt aaatagtcac attgattcac cttgacaact gaacagctgt agaggtgttt 1800
atagtgtgta tgtatactga gattctctca gtgccatgct gagtgaatcc agctgatggc 1860
aaaaacaaga tagcatatcc actgtcatgg cgctcctcct tcttgcatca ccaaactatc 1920
tgttcagtta ccttgtgcag gtcatctcta aagtcactga atatgatttt tgctgggttt 1980
ttttttgggg ggggggggag taaaaaatga tacaaactta acattttgtg attttgttgc 2040
tttcctgtta agcttgtgat ctcattatgt tgtcttactg gtttggaatt cttatactgc 2100
ttgtatttgt tgagtaagaa tatagtagct tttatctcac tgcaacagaa tattctgctg 2160
tacacctgtt gaaaacctgc tagcatttta agattcagac aatgcagtac aggaagggtt 2220
tggtgtaact tcataaatgt actttaagtg tttagtaccc taatttatat agtaatcatt 2280
gatacaaaag tgtgcactag agcatgatat catacaaaca tgcagaagaa cttctttatg 2340
gtaagggtga cggagcactg gaacaggttg cccagaaagg tgctggagtc tccttctatg 2400
gagctattca agacccatct gaacacctac ctctgtgact tattgtaggg taactgcttt 2460
agcaggagtg ttggactcaa tgatctcttg aggtcctttc caacccctgt gattctttga 2520
tatctgagtt ccataccagt tatagggaag ctttgatatt tctttttaca gacataactt 2580
gaaagcagtc acagagaaga ttgttggaaa aaaaaatgtt ttttttttaa ttgataattt 2640
attttctgag ctcttgtaag ctcaattaac taagatattg cattgtgttt ggtttggtgg 2700
gtttttgggg gggtcttttt tttttttggc ctgtaatgta ttaatttttt ttttcttact 2760
acttgttagt aactatatgg gatgttaatt cagatctgct tttgtagcgg attgtagcgg 2820
attaaatagt gaatgtgtag tgaatgcata gttttatctt ctacagacca acaaattata 2880
ctgtgtgata tatatgtatt atacacaagg cagaactaat ggcagattgt tttcaaaggg 2940
atattgaatc taatactttt ttttttttta cagtgtgttt agtgtactgt gctgaatata 3000
taaatgaatt agcagccatg aactggaggt aaatgttttt aatttcacat ttataagcac 3060
gttctaaaat gtttttttca tattgttccc taagaagcct ttaacaaaga ggaaagccac 3120
ttagcagtag aacgggatgg caaggagtct gttgcatgga tacaaagctt ttgagaaagt 3180
ctgaatggta cacgtaaaag agcagacagg atgtgagctt tgggtttttg tcttggttgg 3240
gtgggtggtg gtgggttgtt tttttttctg gtttttgttg tttgtttgtt tgtttttgta 3300
cattttccca atgtaactga aaattatatg attagcaatt aagtttatct atagaaagta 3360
ctgtaaatct atgcttcagt tacctaaatt acaactttat tacacttagt aaccacttag 3420
ttacctcttc taagatgaat aaccaaaatg aatatcaaaa aagtaattta aaagacttca 3480
ggataagcat gatttaaaca ggcacaaata tatctgcctg tttatatagt cacagtatgt 3540
tactttatct gtggttgtta tgtggggtct tgagccttaa agaaacctta tacagtctat 3600
ttcttcaagc tttgtatagt agaatgcttg tgtatgtttg gagatcccaa gaagtaggat 3660
tgtctgtata atatccacat tgaatagata ttgtgaaggt ataatgttct gtgaatcatg 3720
ctgaataaag atttctcttc tttattcttc ttctttcagg ctgttttcga aataccagta 3780
ctttgattca agaggaatgt ttatttcact tgtattttca gcacctctgc tggtgaatac 3840
gatcataatt gtggtgtgta ttcatatgga tacttcttaa gttgataatt aagtgtatat 3900
ggatggattt aaatgtaatg attttcctat ttttcaggtc aactgggttt acagaacttt 3960
aaatgtaatg actgaactga agacactaca gcagagaata aaagcagaaa aagataaaaa 4020
gaagtgaaag tgcctaatac tgtttcattt ttaattttca taatacttgt ccagatagtc 4080
agtccttctc cttgtttatc cagaagcagc aattttttgt ctgatatctg ggactttgca 4140
acttgtgact atggacagtg aagaaaggaa gtacccatag gccatctgat cttcatgaaa 4200
ctgagaaaac tgggcttacc aggtctttgt atccttcaat acaagctaat tttttcacca 4260
tgaccaagtc tgttaatagc attgtaaaag aaccttccag tttccatttg cctatatctt 4320
tttttttccc cacaaaaact atgttgaatt gtatttatca agtatccagt cttctgttaa 4380
cttatgccaa tgggagctac gttgtgaatt caagtaaatg gaagaattac attcagaata 4440
cctcaggaat ccatgcttct gtgaagcatt tcacttcttt ataaatcatg tttcatagtt 4500
catttatgta ttgagtgtca gtagatagtt ctgatacagt agcattttat aaataaaaat 4560
atccacagta acttaagtga acttgaggtt tttttaatct ttctgtctct catgcaagat 4620
tttaccaaat cagttatttt tattttgtgt aagcaattaa aatgatgatt ttaatgctgt 4680
tatataaa 4688

Claims (2)

1.鸡生长性状相关的TMEM18基因分子标记检测试剂在选育优势生长性状鸡品系中的应用,其特征在于,所述应用为在提高杏花鸡×隐性白洛克肉鸡F2代群体生长性状上选育的应用,所述的生长性状为21日龄体重、28日龄体重、84日龄胫直径、0-4周日增重性状中的至少一种,所述的分子标记为SEQ ID NO:1所示的TMEM18基因核苷酸序列第981位点的T>C碱基突变,所述的应用包括如下步骤:
1)在杏花鸡×隐性白洛克肉鸡F2代雏鸡阶段,检测所述分子标记;
2)筛选及保留TT优势基因型的个体,进行饲养,培育出高生长性状的杏花鸡×隐性白洛克肉鸡F2代个体。
2.一种优势生长性状种鸡的遗传改良方法,其特征在于,所述方法包括如下步骤:
1)检测鸡TMEM18基因上与鸡生长性状相关的分子标记,所述分子标记为SEQ ID NO:1所示的TMEM18基因核苷酸序列第981位点的T>C碱基突变,所述的生长性状为21日龄体重、28日龄体重、84日龄胫直径、0-4周日增重性状中的至少一种;
2)筛选出基因型为TT的个体;
3)将选择出的个体作为种鸡,进行繁育,培育出高生长性状的鸡品系;
4)将选育出的上述鸡品系作为种鸡,经过繁育,逐代提高该位点的优势等位基因的频率,从而改良后代鸡的生长性状,所述的鸡品系为杏花鸡×隐性白洛克肉鸡F2个体。
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rs734449139;无;《Ensembl》;20201130;第1页Alleles、Location、Flanking sequence部分,第2页Region in detail部分 *
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无.rs13699267.《Ensembl》.2020, *
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