CN111918870B - 氘代的低聚核苷酸及前体药物 - Google Patents
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- C07H19/20—Purine radicals with the saccharide radical esterified by phosphoric or polyphosphoric acids
Abstract
本发明属于药物化学领域，涉及一种氘代的低聚核苷酸及前体药物，具体而言，涉及式I所示的化合物、或其药学上可接受的盐、制备方法、药物组合物及医药用途，包括用于治疗乙型肝炎病毒感染、尤其是乙型肝炎病毒感染引起的肝脏疾病的用途。
Description
技术领域
本申请涉及氘代的低聚核苷酸及前体药物、其制备方法、含有该化合物的药物组合物、以及其在预防或者治疗乙型肝炎病毒(HBV)感染和与HBV有关的肝脏疾病方面的用途。
背景技术
当前，慢性乙型病毒性肝炎不可治愈只能控制，目前已经认可三种抗HBV药物进行临床应用，包括α干扰素、一种遗传工程蛋白质和核苷类似物，但是通常存在抗药性的快速出现和与治疗有关的剂量限制的毒性问题。另外很多当前的药物受到吸收、分布、代谢和/或排泄(ADME)特性差的困扰，妨碍了它们更广泛的应用。ADME特性差也是候选药物在临床试验中失败的一大原因。
WO2007070598公开了一系列低聚核苷酸前体药物如SB 9200，在未经治疗无肝硬化的慢性乙肝患者中兼具安全性和抗病毒效用，但是仍需要进一步开发具有较好的溶解性，胃液中稳定，肠液及血浆中前药快速释放活性结构，体内较好的生物利用率、Tmax及Cmax，且具有一定的肝靶向性的新型化合物。
发明详述
本申请涉及式I化合物或其药学上可接受的盐，
其中，
R1选自
其中R选自以下基团：C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C3-6环烷基、3-6元杂环烷基、C5-10芳基或5-10元杂芳基，所述R基团任选地被以下基团取代：-F、-Cl、-Br、-I、-OH、C1-6烷基、C1-6烷氧基、-NO2、-CN、-NH2、-NH(C1-6烷基)、-N(C1-6烷基)2、-C(O)C1-6烷基、-C(O)OC1-6烷基、-CONHC1-6烷基、-SH、-SC1-6烷基；
R2、R3、R4、R5、R6、R7、R8或R9分别独立地选自氢原子或氘原子；
R10选自CH3、CH2D、CHD2或CD3；
条件是式I化合物至少含有一个氘原子。
在一些实施方案中，R选自以下基团：C1-4烷基、C2-4烯基、C2-4炔基、C3-6环烷基、3-6元杂环烷基、C5-6芳基或5-6元杂芳基，所述R基团任选地被以下基团取代：-F、-Cl、-Br、-I、-OH、C1-4烷基、C1-4烷氧基、-NO2、-CN、-NH2、-NH(C1-4烷基)、-N(C1-4烷基)2、-C(O)C1-4烷基、-C(O)OC1-4烷基、-CONHC1-4烷基、-SH、-SC1-4烷基；在一些实施方案中，R选自以下基团：C1-4烷基、C2-4烯基或C2-4炔基；在一些实施方案中，R选自甲基、乙基、正丙基、异丙基、1-甲基丙基、2-甲基丙基、n-丁基或叔丁基；在一些实施方案中，R选自异丙基或叔丁基。
在一些实施方案中，式I化合物含有一至九个氘原子；优选式I化合物含有一至七个氘原子；优选式I化合物含有一至五个氘原子；优选式I化合物含有一至三氘原子；优选式I化合物含有三个氘原子；具体的，式I化合物含有一个、两个、三个、四个、五个、六个、七个、八个、九个、十个或十一个氘原子。
在一些实施方案中，R2和R3选自氘原子；在一些实施方案中，R2和R3选自氘原子，R4、R5、R6、R7、R8或R9分别独立地选自氢原子；在一些实施方案中，R2和R3选自氘原子，R4、R5、R6、R7、R8或R9分别独立地选自氢原子，R10选自CH3。
在一些实施方案中，R4和R5选自氘原子；在一些实施方案中，R4和R5选自氘原子，R2、R3、R6、R7、R8或R9分别独立地选自氢原子；在一些实施方案中，R4和R5选自氘原子，R2、R3、R6、R7、R8或R9分别独立地选自氢原子，R10选自CH3。
在一些实施方案中，R6和R7选自氘原子；在一些实施方案中，R6和R7选自氘原子，R2、R3、R4、R5、R8或R9分别独立地选自氢原子；在一些实施方案中，R6和R7选自氘原子，R2、R3、R4、R5、R8或R9分别独立地选自氢原子，R10选自CH3。
在一些实施方案中，R8和R9选自氘原子；在一些实施方案中，R8和R9选自氘原子，R2、R3、R4、R5、R6或R7分别独立地选自氢原子；在一些实施方案中，R8和R9选自氘原子，R2、R3、R4、R5、R6或R7分别独立地选自氢原子，R10选自CH3。
在一些实施方案中，R10选自CH2D、CHD2或CD3；在一些实施方案中，R10选自CHD2或CD3；在一些实施方案中，R10选自CD3；在一些实施方案中，R10选自CD3，R2、R3、R4、R5、R6、R7、R8或R9分别独立地选自氢原子。
在一些实施方案中，本申请的式I化合物或其药学上可接受的盐选自式II化合物或其药学上可接受的盐：
其中，R1同式I化合物中的定义，R10选自CH2D、CHD2或CD3。
在一些实施方式中，R1选自
其中R选自以下基团：C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C3-6环烷基或3-6元杂环烷基；在优选的实施方式中，R1选自
其中R选自以下基团：C1-4烷基、C2-4烯基、C2-4炔基、C3-6环烷基或3-6元杂环烷基。
在一些实施方案中，R10选自CHD2或CD3；在一些实施方案中，R10选自CD3。
在一些实施方案中，本申请涉及以下的化合物或其药学上可接受的盐：
另一方面，本申请涉及药物组合物，其包含本申请的化合物或其药学上可接受的盐。在一些实施方案中，本申请的药物组合物还包括药学上可接受的辅料。
另一方面，本申请描述了治疗或抑制哺乳动物、优选人类乙型肝炎病毒(HBV)感染方法，包括对需要该治疗的哺乳动物、优选人类给予治疗有效量的本文的化合物或其药学上可接受的盐、或其药物组合物。
另一方面，本申请描述了本文的化合物或其药学上可接受的盐、或其药物组合物在制备预防或者治疗哺乳动物、优选人类乙型肝炎病毒(HBV)感染的药物中的用途。
另一方面，本申请描述了本文的化合物或其药学上可接受的盐、或其药物组合物用于预防或者治疗哺乳动物、优选人类乙型肝炎病毒(HBV)感染的用途。
另一方面，本申请描述了预防或者治疗哺乳动物、优选人类乙型肝炎病毒(HBV)感染的本文的化合物或其药学上可接受的盐、或其药物组合物。
在本申请的部分实施方式中，所述预防或者治疗乙型肝炎病毒(HBV)感染指控制、降低或清除HBV以预防、缓解或治愈受感染患者的肝脏疾病。
定义
除非另有说明，本申请中所用的下列术语具有下列含义。一个特定的术语在没有特别定义的情况下不应该被认为是不确定的或不清楚的，而应该按照本领域普通的含义去理解。当本文中出现商品名时，意在指代其对应的商品或其活性成分。
术语“被取代”是指特定原子上的任意一个或多个氢原子被取代基取代，只要特定原子的价态是正常的并且取代后的化合物是稳定的。
术语“任选”或“任选地”是指随后描述的事件或情况可以发生或不发生，该描述包括发生所述事件或情况和不发生所述事件或情况。例如，乙基“任选”被卤素取代，指乙基可以是未被取代的(CH2CH3)、单取代的(如CH2CH2F)、多取代的(如CHFCH2F、CH2CHF2等)或完全被取代的(CF2CF3)。本领域技术人员可理解，对于包含一个或多个取代基的任何基团，不会引入任何在空间上不可能存在和/或不能合成的取代或取代模式。
本文中的Cm-n，是该部分具有给定范围(m至n，且m＜n)中的整数个碳原子。例如“C1-6”是指该基团可具有1个碳原子、2个碳原子、3个碳原子、4个碳原子、5个碳原子或6个碳原子。
当任何变量(例如R)在化合物的组成或结构中出现一次以上时，其在每一种情况下的定义都是独立的。因此，例如，如果一个基团被2个R所取代，则每个R都有独立的选项。
术语“卤”或“卤素”是指氟、氯、溴和碘。
术语“羟基”指-OH基团。
术语“氰基”指-CN基团。
术语“巯基”指-SH基团。
术语“氨基”指-NH2基团。
术语“硝基”指-NO2基团。
术语“D”指氘原子。
术语“H”指氢原子。
术语“烷基”是指通式为CnH2n+1的烃基。该烷基可以是直链或支链的。例如，术语“C1-6烷基”指含有1至6个碳原子的烷基(例如甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基、仲丁基、叔丁基、正戊基、1-甲基丁基、2-甲基丁基、3-甲基丁基、新戊基、己基、2-甲基戊基等)。类似地，烷氧基、烷基氨基、二烷基氨基、烷基磺酰基和烷硫基的烷基部分(即烷基)具有与上述相同的定义。
术语“烷氧基”指-O-烷基。
术语“烯基”是指由碳原子和氢原子组成的直链或支链的具有至少一个双键的不饱和脂肪族烃基。烯基的非限制性实例包括但不限于乙烯基、1-丙烯基、2-丙烯基、1-丁烯基、异丁烯基、1，3-丁二烯基等。
术语“炔基”是指由碳原子和氢原子组成的直链或支链的具有至少一个三键的不饱和脂肪族烃基。炔基的非限制性实例包括但不限于乙炔基(-C≡CH)、1-丙炔基(-C≡C-CH3)、2-丙炔基(-CH2-C≡CH)、1，3-丁二炔基(-C≡C-C≡CH)等。
术语“环烷基”指完全饱和的并且可以以单环、桥环或螺环存在的碳环。除非另有指示，该碳环通常为3至10元环。环烷基非限制性实例包括但不限于环丙基、环丁基、环戊基、环己基、降冰片基(双环[2.2.1]庚基)、双环[2.2.2]辛基、金刚烷基等。
术语“杂环烷基”是指完全饱和的并且可以以单环、桥环或螺环存在的环状基团。除非另有指示，该杂环通常为含有1至3个独立地选自硫、氧和/或氮的杂原子(优选1或2个杂原子)的3至7元环。3元杂环烷基的实例包括但不限于环氧乙烷基、环硫乙烷基、环氮乙烷基，4元杂环烷基的非限制性实例包括但不限于吖丁啶基、噁丁环基、噻丁环基，5元杂环烷基的实例包括但不限于四氢呋喃基、四氢噻吩基、吡咯烷基、异噁唑烷基、噁唑烷基、异噻唑烷基、噻唑烷基、咪唑烷基、四氢吡唑基，6元杂环烷基的实例包括但不限于哌啶基、四氢吡喃基、四氢噻喃基、吗啉基、哌嗪基、1，4-噻噁烷基、1，4-二氧六环基、硫代吗啉基、1，3-二噻烷基、1，4-二噻烷基，7元杂环烷基的实例包括但不限于氮杂环庚烷基、氧杂环庚烷基、硫杂环庚烷基。优选为具有5或6个环原子的单环杂环烷基。
术语“芳基”是指具有共轭的π电子体系的全碳单环或稠合多环的芳香环基团。例如，芳基可以具有6-20个碳原子，6-14个碳原子或6-12个碳原子。芳基的非限制性实例包括但不限于苯基、萘基、蒽基和1，2，3，4-四氢化萘等。
术语“杂芳基”是指单环或稠合多环体系，其中含有至少一个选自N、O、S的环原子，其余环原子为C，并且具有至少一个芳香环。优选的杂芳基具有单个4至8元环，尤其是5至8元环，或包含6至14个、尤其是6至10个环原子的多个稠合环。杂芳基的非限制性实例包括但不限于吡咯基、呋喃基、噻吩基、咪唑基、噁唑基、吡唑基、吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、喹啉基、异喹啉基、四唑基、三唑基、三嗪基、苯并呋喃基、苯并噻吩基、吲哚基、异吲哚基等。
除非另有说明，当本申请的式I化合物的结构中某一位置的取代基被定义为氘(即D)时，并不涵盖该位置为天然丰度的氘的情况，而是意味着该位置的氘的量远远超过(例如至少超过1000倍)天然存在的氘的丰度。
术语“预防或者治疗”意为将本申请所述化合物或制剂进行给药以预防、改善或消除疾病或与所述疾病相关的一个或多个症状，且包括：
(i)预防疾病或疾病状态在哺乳动物中出现，特别是当这类哺乳动物易患有该疾病状态，但尚未被诊断为已患有该疾病状态时；
(ii)抑制疾病或疾病状态，即遏制其发展；
(iii)缓解疾病或疾病状态，即使该疾病或疾病状态消退。
术语“治疗有效量”意指能够(i)治疗或预防特定疾病、病况或障碍，(ii)减轻、改善或消除特定疾病、病况或障碍的一种或多种症状，或(iii)预防或延迟本文中所述的特定疾病、病况或障碍的一种或多种症状发作的本申请化合物的用量。构成“治疗有效量”的本申请化合物的量取决于该化合物、疾病状态及其严重性、给药方式以及待被治疗的哺乳动物的年龄而改变，但可例行性地由本领域技术人员根据其自身的知识及本公开内容而确定。
术语“药学上可接受的”是针对那些化合物、材料、组合物和/或剂型而言，它们在可靠的医学判断的范围之内，适用于与人类和动物的组织接触使用，而没有过多的毒性、刺激性、过敏性反应或其它问题或并发症，与合理的利益/风险比相称。
作为药学上可接受的盐，例如，可以提及金属盐、铵盐、与有机碱形成的盐、与无机酸形成的盐、与有机酸形成的盐、与碱性或者酸性氨基酸形成的盐等。
术语“药物组合物”是指包含一种或多种本申请的化合物或其盐与药学上可接受的辅料的混合物。药物组合物的目的是有利于对有机体给予本申请的化合物。
术语“药学上可接受的辅料”是指对有机体无明显刺激作用，而且不会损害该活性化合物的生物活性及性能的那些辅料。合适的辅料是本领域技术人员熟知的，例如碳水化合物、蜡、水溶性和/或水可膨胀的聚合物、亲水性或疏水性材料、明胶、油、溶剂、水等。
词语“包括(comprise)”或“包含(comprise)”及其英文变体例如comprises或comprising应理解为开放的、非排他性的意义，即“包括但不限于”。
本申请的化合物和中间体还可以以不同的互变异构体形式存在，并且所有这样的形式包含于本申请的范围内。术语“互变异构体”或“互变异构体形式”是指可经由低能垒互变的不同能量的结构异构体。例如，质子互变异构体(也称为质子转移互变异构体)包括经由质子迁移的互变，如酮-烯醇及亚胺-烯胺异构化。质子互变异构体的具体实例是咪唑部分，其中质子可在两个环氮原子间迁移。价互变异构体包括通过一些成键电子的重组的互变。
本申请化合物可以是不对称的，例如，具有一个或多个立体异构体。除非另有说明，所有立体异构体都包括，如对映异构体和非对映异构体。本申请的含有不对称碳原子的化合物可以以光学活性纯的形式或外消旋形式被分离出来。光学活性纯的形式可以从外消旋混合物拆分，或通过使用手性原料或手性试剂合成。
本申请的化合物可以存在特定的几何异构体或立体异构体形式。本申请设想所有的这类化合物(包括互变异构体、顺式和反式异构体、(-)-和(+)-对映体、(R)-和(S)-对映体、非对映异构体、(D)-异构体、(L)-异构体，及其外消旋混合物和其他混合物，例如对映异构体或非对映体富集的混合物)都属于本申请的范围之内。烷基等取代基中可以存在另外的不对称碳原子。所有这些异构体以及它们的混合物均包括在本申请的范围之内。
本申请的药物组合物可通过将本申请的化合物与适宜的药学上可接受的辅料组合而制备，例如可配制成固态、半固态、液态或气态制剂，如片剂、丸剂、胶囊剂、粉剂、颗粒剂、膏剂、乳剂、悬浮剂、栓剂、注射剂、吸入剂、凝胶剂、微球及气溶胶等。
给予本申请化合物或其药学上可接受的盐或其药物组合物的典型途径包括但不限于口服、直肠、局部、吸入、肠胃外、舌下、阴道内、鼻内、眼内、腹膜内、肌内、皮下、静脉内给药。
本申请的药物组合物可以采用本领域众所周知的方法制造，如常规的混合法、溶解法、制粒法、制糖衣药丸法、磨细法、乳化法、冷冻干燥法等。
在一些实施方案中，药物组合物是口服形式。对于口服给药，可以通过将活性化合物与本领域熟知的药学上可接受的辅料混合，来配制该药物组合物。这些辅料能使本申请的化合物被配制成片剂、丸剂、锭剂、糖衣剂、胶囊剂、液体、凝胶剂、浆剂、悬浮剂等，用于对患者的口服给药。
可以通过常规的混合、填充或压片方法来制备固体口服组合物。例如，可通过下述方法获得：将所述的活性化合物与固体辅料混合，任选地碾磨所得的混合物，如果需要则加入其它合适的辅料，然后将该混合物加工成颗粒，得到了片剂或糖衣剂的核心。适合的辅料包括但不限于：粘合剂、稀释剂、崩解剂、润滑剂、助流剂、甜味剂或矫味剂等。
药物组合物还可适用于肠胃外给药，如合适的单位剂型的无菌溶液剂、混悬剂或冻干产品。
本文所述的通式I化合物的所有施用方法中，每天给药的剂量为0.01到200mg/kg体重，以单独或分开剂量的形式。
本申请的化合物可以通过本领域技术人员所熟知的多种合成方法来制备，包括下面列举的具体实施方式、其与其他化学合成方法的结合所形成的实施方式以及本领域技术上人员所熟知的等同替换方式，优选的实施方式包括但不限于本申请的实施例。
本申请具体实施方式的化学反应是在合适的溶剂中完成的，所述的溶剂须适合于本申请的化学变化及其所需的试剂和物料。为了获得本申请的化合物，有时需要本领域技术人员在已有实施方式的基础上对合成步骤或者反应流程进行修改或选择。
本领域合成路线规划中的一个重要考量因素是为反应性官能团(如本申请中的羟基)选择合适的保护基，例如，可参考Greene′s Protective Groups in OrganicSynthesis(4th Ed).Hoboken，New Jersey：John Wiley&Sons，Inc.。本申请引用的所有参考文献整体上并入本申请。
在一些实施方案中，本申请的式II化合物可以由有机合成领域技术人员通过以下路线来制备：
其中，X选自卤素或甲磺酰基，R及R10同式II化合物中的定义。
本申请采用下述缩略词：
PBS缓冲液代表磷酸缓冲盐溶液；DMF代表N，N-二甲基甲酰胺；h代表小时；i.g.代表灌胃；LC/MS/MS代表液相色谱-二级质谱连用；EDTA-K2代表乙二胺四乙酸二钾。
为清楚起见，进一步用实施例来阐述本发明，但是实施例并非限制本申请的范围。本申请所使用的所有试剂是市售的，无需进一步纯化即可使用。
具体实施方式
实施例1：(((((2R，3S，5R)-5-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-3-羟基四氢呋喃-2-基)甲氧基)(((2R，3R，4R，5R)-(2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-2-(羟基甲基)-4-(甲氧基-d3)四氢呋喃-3-基)氧基)磷酰基)硫基)甲基异丙基碳酸酯
步骤1：(2R，3R，3aS，9aR)-2-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-羟基-2，3，3a，9a-四氢-6H-呋喃并[2′，3′：4，5]噁唑并[3，2-a]嘧啶-6-酮
向反应瓶中依次加入(2R，3R，3aS，9aR)-3-羟基-2-(羟甲基)-2，3，3a，9a-四氢-6H-呋喃并[2′，3′：4，5]噁唑并[3，2-a]嘧啶-6-酮(30g)、4，4′-(氯(苯基)亚甲基)双(甲氧基苯)(49.4g)、N，N-二甲基吡啶-4-胺(0.12g)、DMF(120mL)及吡啶(360mL)，室温反应。反应结束后，反应液浓缩，残余物以二氯甲烷溶解，5wt％碳酸氢钠溶液洗涤。有机相干燥、过滤、浓缩得粗品，经甲基叔丁基醚打浆纯化得化合物1-2(45.74g)。
1H-NMR(500MHz，DMSO-d6)：δ7.94(d，J＝7.5Hz，1H)，7.31-7.26(m，4H)，7.21-7.14(m，5H)，6.86-6.83(m，4H)，6.34(d，J＝6Hz，1H)，5.95(d，J＝4.5Hz，1H)，5.89(d，J＝7Hz，1H)，5.22(d，J＝5.5Hz，1H)，4.34-4.31(m，1H)，4.25-4.20(m，1H)，3.74(s，6H)，2.98-2.95(m，1H)，2.86-2.82(m，1H).MS(ESI)m/z 529.4[M+H]+.
步骤2：1-((2R，3R，4R，5R)-5-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-4-羟基-3-(甲氧基-d3)四氢呋喃-2-基)嘧啶-2，4(1H，3H)-二酮
向反应瓶中加入镁条(3.68g)及甲醇-d4(150ml)，65℃反应1小时。浓缩反应液，向残余物中加入化合物I-2(22.22g)的DMF(240mL)溶液，加热至100℃反应。反应完成，反应液冷至室温，浓缩，残余物用乙酸乙酯溶解，5wt％碳酸氢钠溶液洗涤。有机相干燥，过滤及浓缩得化合物1-3(22g)。MS(ESI)m/z 586.4[M+Na]+.
步骤3：(2R，3R，4R，5R)-2-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-5-(2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-4-(甲氧基-d3)四氢呋喃-3-基(2-氰乙基)二异丙基亚磷酰胺
化合物1-3(36.18g)溶于二氯甲烷(180ml)，依次加入3-((二(二异丙基氨基)膦酰基)氧基)丙腈(23.69g)和吡啶-1-鎓2，2，2-三氟乙酸盐(15.18g)的二氯甲烷(60ml)溶液，室温反应。反应完成，反应液浓缩，浓缩物经柱层析(石油醚∶乙酸乙酯＝1∶1)纯化，得到化合物1-4(34.85g)。
1H-NMR(500MHz，DMSO-d6)：δ11.37(s，1H)，7.82-7.76(m，1H)，7.42-7.38(m，2H)，7.35-7.32(m，2H)，7.29-7.24(m，5H)，6.93-6.89(m，4H)，5.85-5.82(m，1H)，5.33-5.28(m，1H)，4.48-4.43(m，1H)，4.15-4.13(m，1H)，4.02-3.99(m，1H)，3.83-3.78(m，1H)，3.76-3.73(m，6H)，3.68-3.50(m，3H)，3.40-3.32(m，2H)，2.80-2.78(m，1H)，2.64-2.58(m，1H)，1.20-1.17(m，1H)，1.16-1.14(m，3H)，1.13-1.11(m，5H)，0.99-0.98(m，3H).MS(ESI)m/z 764.4[M+H]+.
步骤4：((2R，3S，5R)-5-(6-苯甲酰氨基-9H-嘌呤-9-基)-3-羟基四氢呋喃-2-基)甲基((2R，3R，4R，5R)-2-((二(3S，5R)-5-(6-苯甲酰氨基-9H-嘌呤-9-基)-3-羟基四氢呋喃-2-基)(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-5-(2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-4-(甲氧基-d3)四氢呋喃-3-基)2-氰乙基)亚磷酸酯
反应瓶中，化合物1-4(34.85g)溶于无水乙腈(750ml)，依次加入N-(9-((2R，4S，5R)-4-羟基-5-(羟甲基)四氢呋喃-2-基)-9H-嘌呤-6-基)苯甲酰胺(24.82g)的DMF(150mL)溶液和1H-四唑(6.4g)的乙腈溶液(203ml)，室温反应至结束。反应液浓缩，浓缩物经柱层析(二氯甲烷∶甲醇＝20∶1)纯化，得到化合物1-5(13.82g)。MS(ESI)m/z 1018.6[M+H]+.
步骤5：O-((2R，3S，5R)-5-(6-苯甲酰氨基-9H-嘌呤-9-基)-3-羟基四氢呋喃-2-基)甲基)O-((2R，3R，4R，5R)-2-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-5-(2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-4-(甲氧基-d3)四氢呋喃-3-基)O-(2-氰乙基)硫代磷酸酯
化合物1-5(0.64g)溶于乙腈(10ml)，滴加3H-苯并[c][1，2]二硫醇-3-酮1，1-二氧化物(0.126g)的乙腈(2ml)溶液，室温反应至结束。反应液浓缩，浓缩物经柱层析(二氯甲烷∶甲醇＝20∶1)纯化，得到化合物1-6(0.32g)。MS(ESI)m/z 1050.6[M+H]+.
步骤6：O-((2R，3S，5R)-5-(6-苯甲酰氨基-9H-嘌呤-9-基)-3-羟基四氢呋喃-2-基)甲基)O-(2-氰乙基)O-((2R，3R，4R，5R)-5-(2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-2-(羟甲基)-4-(甲氧基-d3)四氢呋喃-3-基)硫代磷酸酯
化合物1-6(0.3g)溶于二氯甲烷(4ml)，滴加2，2-二氯乙酸(0.074g)，室温搅拌反应至结束。反应液浓缩，浓缩物经柱层析(二氯甲烷∶甲醇＝10∶1)纯化，得到化合物1-7(0.12g)。
1H-NMR(500MHz，DMSO-d6)：δ11.41(s，1H)，11.17(s，1H)，8.76(s，1H)，8.63(s，1H)，8.05(d，J＝8.0Hz，2H)，7.89(d，J＝8.0Hz，1H)，7.65(t，J＝7.5Hz，1H)，7.56(t，J＝7.5Hz，2H)，6.54-6.52(m，1H)，5.93-5.91(m，1H)，5.86(s，1H)，5.72-5.71(m，1H)，5.59(s，1H)，5.39-5.34(m，1H)，5.08-5.02(m，1H)，4.56(s，1H)，4.43-4.32(m，1H)，4.27-4.12(m，5H)，3.59(s，2H)，2.95-2.91(m，3H)，2.51-2.42(m，1H).MS(ESI)m/z 748.3[M+H]+.
步骤7：O-((2R，3S，5R)-5-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-3-羟基四氢呋喃-2-基)甲基)O-((2R，3R，4R，5R))-5-(2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-2-(羟甲基)-4-(甲氧基-d3)四氢呋喃-3-基)硫代磷酸铵
化合物1-7(5.8g)溶于氨水(30ml)，室温搅拌反应至结束。冰浴下，反应液用50％醋酸水溶液调节pH至8，乙酸乙酯萃取。水相用Biotage C18 120g反相色谱柱进行分离纯化(水∶乙腈＝3∶1)，得到化合物1-8(3.44g)。
1H-NMR(500MHz，DMSO-d6)：δ8.46(d，J＝15Hz，1H)，8.15(s，1H)，7.92(d，J＝8Hz，1H)，7.23(s，2H)，6.66(brs，4H)，6.39-6.36(m，1H)，5.88(d，J＝6Hz，1H)，5.69-5.68(m，1H)，4.80-4.78(m，1H)，4.52-4.45(m，1H)，4.20-4.15(m，1H)，4.02-3.98(m，1H)，3.95-3.85(m，3H)，3.67-3.59(m，2H)，2.81-2.71(m，1H)，2.31-2.25(m，1H).HRMS(ESI)m/z 591.1494[M+H]+.
步骤8：(((((2R，3S，5R)-5-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-3-羟基四氢呋喃-2-基)甲氧基)(((2R，3R，4R，5R)-5-(2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-2-(羟基甲基)-4-(甲氧基-d3)四氢呋喃-3-基)氧基)磷酰基)硫基)甲基异丙基碳酸酯
化合物1-8(2.5g)溶于水(260ml)和异丙醇(65ml)的混合溶液，滴加碘代甲基异丙基碳酸酯(3.01g)，室温反应至结束。浓缩除去异丙醇，残余物用正已烷萃取三次，水相用Biotage C18 120g反相色谱柱进行分离纯化(水∶乙睛＝3∶1)，得到化合物I-1(2.2g)。
1H-NMR(500MHz，CD3OD)：δ8.29(d，J＝14.5Hz，1H)，8.22(s，1H)，7.99(d，J＝8Hz，1H)，6.47(q，J＝6.5Hz，1H)，6.04-5.98(m，1H)，5.73(d，J＝8Hz，1H)，5.48-5.45(m，1H)，5.44-5.41(m，1H)，5.13-5.06(m，1H)，4.88-4.84(m，1H)，4.72-4.67(m，1H)，4.54(brs，2H)，4.44-4.35(m，2H)，4.28-4.20(m，2H)，4.15-4.09(m，1H)，2.79-2.73(m，2H)，2.95-2.87(m，1H)，2.56-2.50(m，1H)，1.25-1.21(m，6H).HRMS(ESI))m/z 707.1899[M+H]+.
试验例
下列对照化合物A及化合物B分别参照WO2002092006及WO2007070598公开的相应方法制备得到。
1.体外溶解性评价
1000μL最终的体系中，含990μLpH 7.4的PBS缓冲液，10μL受试化合物的乙腈溶液(10mM)。在25℃下静置16h后离心(12000rpm，20℃)10min，取出20μL上清液，加入含内标(地西泮20ng/mL)的乙腈400μL。混匀后，吸取30μL，加入150μL50％(v/v)乙腈水稀释混匀，0.5μL进样分析。化合物在pH 7.4的PBS缓冲液中溶解度见表1。
表1化合物在pH 7.4的PBS缓冲液中溶解度
| 化合物编号 | 溶解度(μM) |
| 对照化合物B | 69.31 |
| I-1 | 72.47 |
2.体外胃液或肠液(含胰酶)稳定性评价
200μL最终的温孵体系中，含198μL人工胃液pH 1.4(或人工肠液pH 6.8)，2μL受试化合物工作液(溶剂为1μL乙腈+1μL水)，化合物终浓度为1μM。每个化合物平行做2份，每份0.2mL。每管配好总体积为200μL的含药人工胃液(或人工肠液)在37℃温孵并计时，分别于对应时间点取出40μL反应液，用含内标(地西泮20ng/mL)的冰乙腈400μL终止反应，震荡5min，于4℃、12000rpm离心10min，取50μL上清液，加入100μL超纯水稀释，混匀，进行LC-MS/MS分析，相关化合物在胃液或肠液(含胰酶)中的稳定性(即代谢剩余量％)或代诩产物生成量％分别见表2、3、4。
反应时间：人工胃液37℃温孵时间：0h、0.5h、1h、2h、4h。人工肠液(加胰酶)37℃温孵时间：0h、5min、15min、0.5h、1h。
表2化合物在体外人工胃液中的稳定性(1μM)
表3化合物在体外人工肠液(含胰酶)中的稳定性(1μM)
“-”表示未做检测。
表4人工肠液(含胰酶)中化合物代谢产物生成量(1μM)
3.体外血浆稳定性评价
300μL最终的温孵体系中，含297μL各种属受试者(小鼠、大鼠、人、犬、猴)血浆，3μL受试化合物(溶剂为1.5μL乙睛+1.5μL水)，化合物终浓度为1μM。每管在冰上分装成两份含药血浆，每份120μL，放入37℃温孵仪并计时，分别于0.25h、0.5h、1h时间点取样30μL至1.5mL EP管中，加入含内标(地西泮20ng/mL)的乙腈300μL终止反应，震荡5min，于4℃、12000rpm离心10min，取80μL上清液，加入80μL超纯水稀释，混匀，进行LC-MS/MS分析，相关化合物在各种属受试者的血浆中的稳定性(代谢剩余量％)见表5。
表5化合物在体外各种属血浆中稳定性(1μM)
“-”表示未做检测。
4.大鼠体内药代动力学评价
8只雄性SD大鼠，体重200～220g，随机分为2组(每组各4只)，按50mg/kg剂量分别灌胃给予对照化合物B、化合物I-1。受试动物(大鼠)给药前禁食12h，给药后4h给食物，实验前后和实验过程中均自由饮水。
在血样采集之前，预先在贴有标签的EDTA-K2抗凝管中加入30μL的2M氟化钠溶液(酯酶抑制剂)，于80℃烘箱内烘干后，置于4℃冰箱存放，共需准备90个。
分别于给药前(0h)及给药后0.167、0.5、1、2、3、4、6、8、10、24h于眼眶取血约0.1～0.15mL；所取全血置于加入含氟化钠的EDTA-K2离心管中，立即轻轻颠倒混匀5～6次后，0.5h内于4℃、4000rpm离心10min。立即吸取分离的血浆30μL，并加入300μL含内标(地西泮20ng/mL)的乙腈，振荡混匀5min，于4℃、12000rpm离心10min，取上清80μL，加入80μL超纯水稀释，混匀，吸取5μL用于LC/MS/MS测定目标化合物含量，计算受试化合物的药代动力学参数。结果见表6。
表6相关化合物在SD大鼠体内的药代参数
“相对F％”表示相对生物利用度％。
Claims (8)
1.式I化合物或其药学上可接受的盐，
其中，
R1选自
其中R选自以下基团：C1-6烷基；
R2、R3、R4、R5、R6、R7、R8或R9选自氢原子；
R10选自CD3。
2.如权利要求1所述的式I化合物或其药学上可接受的盐，其中R选自以下基团：C1-4烷基。
3.如权利要求2所述的式I化合物或其药学上可接受的盐，其中R选自甲基、乙基、正丙基、异丙基、1-甲基丙基、2-甲基丙基、n-丁基或叔丁基。
4.如权利要求3所述的式I化合物或其药学上可接受的盐，其中R选自异丙基或叔丁基。
5.以下的化合物或其药学上可接受的盐：
6.一种药物组合物，其包含权利要求1-5中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐。
7.权利要求6所述的药物组合物，其还包括药学上可接受的辅料。
8.权利要求1-5中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐、或者权利要求6-7所述的药物组合物在制备预防或者治疗哺乳动物乙型肝炎病毒感染的药物中的用途。
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| CN101437397A (zh) * | 2005-12-13 | 2009-05-20 | 斯普林银行 | 核苷酸和低聚核苷酸前体药物 |
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